相關申請案之交叉參考
本申請案主張於2016年6月9日申請之美國臨時申請案第62/348,054號之優先權，該申請案以全文引用之方式併入本文中。 腫瘤微環境含有多種基質細胞/支援細胞，包括造血源之彼等基質細胞/支援細胞。諸如T淋巴細胞、自然殺手(NK)細胞及各種骨髓細胞的特定細胞類型已在許多研究性模型中證明在使對抗癌細胞的免疫反應之病程成形中扮演不同角色(Adam, J.K等人，
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(4)：第285-300頁；Kroesen，2014；Licciardi，2012；Ropero，2007；West，2014)。泛HDAC抑制劑具有包括不佳耐受性之侷限性，尤其與標準護理藥物組合時。舉例而言，泛HDAC抑制劑帕比司他(panobinostat)經由誘導腫瘤細胞株中之細胞凋亡而導致直接細胞毒素效應(Di Fazio，2010)。除直接癌細胞自發殺滅以外，上皮腫瘤之鼠類模型已展示特定類或泛HDAC抑制劑可改變NKG2D配位體之表現，由此影響對抗癌細胞的NK細胞裂解功能。在腫瘤免疫微環境之細胞組分上的HDAC抑制劑之效應係不佳地理解。 溴結構域抑制劑為通過由轉錄機構調節乙醯化離胺酸殘基之識別而改變細胞表觀遺傳及轉錄程式的第二類分子。JQ1為含溴結構域蛋白質之BET族的充分表徵抑制劑且可藉由調變組蛋白乙醯基轉移酶(HAT)及HDAC與轉錄因子及涉及基因表現之蛋白質之相互作用而間接調節表觀遺傳佔據面積。BET抑制劑(例如，JQ1)在腫瘤相關免疫細胞上之效應大部分係未知的。 使用靶向免疫查核點(即PD-(L)1及CTLA4)的抗體產生之最新臨床前及臨床資料證明抗腫瘤抗擾性可藉由靶向T細胞、APC及腫瘤細胞群當中之抑制性相互作用而以多個腫瘤類型驅動。然而，雖然此等藥劑的使用表示癌症治療中之重大進步，在大部分腫瘤類型中僅少數患者有反應。另外，反應之障礙呈現多樣化且表徵不佳。愈來愈理解抗腫瘤免疫之耐久性隨免疫細胞比重而定。如本文所揭示，鑑別包括非選擇性及選擇性HDAC抑制劑及BET抑制劑之小分子表觀遺傳調節劑的某些免疫調節效應。本文中所描述的為關於外周組織中以及由HDAC6選擇性抑制劑(例如，化合物A)造成之腫瘤微環境中之T細胞及單核細胞/巨噬細胞的表型及功能之顯著動態改變。亦描述的為BET抑制劑之Treg特定效應。包含HDAC6選擇性抑制劑(例如，化合物A)及BET抑制劑(例如，JQ1)的醫藥組合有助於非小細胞肺癌(NSCLC)之具有免疫能力的基因工程改造小鼠模型中之持久抗腫瘤反應。在化合物A證明血液癌之當前臨床試驗中之有利安全性概況的情況下，與溴結構域抑制組合之其效用表示轉譯發展以藉由靶向除免疫查核點外之機制加強抗腫瘤免疫反應之合理組合。 本發明針對用於治療有需要個體之癌症的方法，該等方法包含向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。本文亦提供包含HDAC6選擇性抑制劑(例如，式I或式II化合物)及BET抑制劑的組合產品及醫藥組合。
定義
下文列舉用於本發明中之各種術語之定義。此等定義適用於術語，因為除非在特定情況下以其他方式加以限制，其單獨地或作為較大群組的一部分而用於整個說明書及申請專利範圍中。 如在本說明書中及申請專利範圍中所使用，術語「包含」可包括實施例「由……組成」及「基本上由……組成」。如本文中所使用，術語「包含」、「包括」、「具有(having/has)」、「可」、「含有」及其變體意欲為需要經命名成分/步驟之存在且准許其他成分/步驟之存在的開放式過渡片語、術語或詞。然而，此描述應視為亦描述如「由所枚舉化合物組成」及「基本上由所枚舉化合物組成」之組合物或製程，該描述僅允許經命名化合物以及任一醫藥學上可接受載劑之存在且不包括其他化合物。 術語「約」總體上指示不超過10%、5%或1%的值之可能變化。舉例而言，就其最廣義而言，「約25 mg/kg」將總體上指示22.5至27.5 mg/kg之值，亦即，25 ± 2.5 mg/kg。 術語「烷基」係指在某些實施例中含有一至六個碳原子或一至八個碳原子之飽和烴部分、直鏈烴部分或分支鏈烴部分。C
1 - 6
烷基部分之實例包括(但不限於)甲基、乙基、丙基、異丙基、正丁基、第三丁基、新戊基、正己基部分；且C
1 - 8
烷基部分之實例包括(但不限於)甲基、乙基、丙基、異丙基、正丁基、第三丁基、新戊基、正己基、庚基及辛基部分。 烷基取代基中之碳原子數目可由前綴「C
x - y
」指示，其中x為取代基中碳原子之最小數目且y為最大數目。同樣，C
x
鏈意謂含有x個碳原子之烷基鏈。 術語「芳基」係指具有一或多個稠合或非稠合芳環之單環或聚環碳環系統，該等芳環包括(但不限於)苯基、萘基、四氫萘基、二氫茚基、茚基及其類似者。 術語「雜芳基」係指具有至少一個芳環的稠合或非稠合單環或聚環(例如，二環或三環或更多環)部分或環系統，該等芳環具有五至十個環原子，其中之一個環原子係選自S、O及N；零、一個、或兩個環原子為獨立地選自S、O、及N之額外雜原子；且剩餘環原子為碳。雜芳基包括(但不限於)吡啶基、吡嗪基、嘧啶基、吡咯基、吡唑基、咪唑基、噻唑基、噁唑基、異噁唑基、噻二唑基、噁二唑基、噻吩基、呋喃基、喹啉基、異喹啉基、苯并咪唑基、苯并噁唑基、喹喏啉基及其類似者。 術語「鹵基」係指諸如氟、氯、溴及碘之鹵素。 術語「HDAC」係指組蛋白去乙醯基酶(histone deacetylase)，其為自核心組蛋白(core histone)中之離胺酸殘基移除乙醯基團之酶，由此導致形成凝聚態及轉錄沉默染色體。當前存在18種已知組蛋白去乙醯基酶，其歸類為四組。包括HDAC1、HDAC2、HDAC3及HDAC8之I類HDAC與酵母RPD3基因相關。包括HDAC4、HDAC5、HDAC6、HDAC7、HDAC9及HDAC10的II類HDAC與酵母Hda1基因相關。亦稱為瑟土因(sirtuin)之III類HDAC與Sir2基因相關且包括SIRT1-7。僅含有HDAC11之IV類HDAC具有I類及II類HDAC兩者之特徵。除非另外說明，否則術語「HDAC」係指18種已知組蛋白去乙醯基酶中之任何一或多者。 術語「HDAC6選擇性」意謂將化合物結合至HDAC6之程度實質上大於(諸如大5X、10X、15X、20X或更多)結合至諸如HDAC1或HDAC2之任何其他類型的HDAC酵之程度。亦即，化合物選擇性地用於HDAC6超過任何其他類型的HDAC酵。舉例而言，使用10 nM之IC
50
結合至HDAC6且使用50 nM之IC
50
結合至HDAC1的化合物為HDAC6選擇性。另一方面，使用50 nM之IC
50
結合至HDAC6且使用60 nM之IC
50
結合至HDAC1之化合物不為HDAC6選擇性。 術語「抑制劑」與術語拮抗劑同義。 「BET抑制劑」靶向包括BRD2、BRD3、BRD4及BRDT之溴結構域及額外端基元(BET)蛋白質。BET蛋白質含有識別乙醯化離胺酸殘基之溴結構域。BET抑制劑結合BET蛋白質之溴結構域且改變細胞表觀遺傳及轉錄程式。舉例而言，BET抑制劑包括(但不限於) ABBV-075、BAY1238097、BMS986158、布羅莫斯柏林、CBP30、CPI-203、CPI-0610、FT-1101、GSK2820151、I-BET151、I-BET726、I-BET-762 (GSK525762)、INCB054329、INCB057643、ISOX DUAL、JQ1、LY294002、LY303511、MS436、MK8628 (OTX-015)、OF-1、OXF BD 02、PFI-1、PFI-3、PF-6405761、RVX-208、TEN-010、XD 14及ZEN003694。 如本文所使用，術語「治療(treatment)」或「治療(treating)」指示本方法至少已緩和癌症。用於治療之方法包含向個體施加或投與包含HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑的醫藥組合。用於治療之方法包含向來自(例如，用於診斷或活體外應用)患有癌症之個體的經隔離組織或細胞株施加或投與包含HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合。施加或投與醫藥組合之目的為治療、治癒、減輕、緩解、改變、補救、改善、改進或影響癌症。該等治療可基於獲自藥物基因組學之知識而經特定調整或修改。本發明之方法至少可減少異常細胞增殖。舉例而言，本方法可降低患者中之癌症生長率或阻止癌症的持續生長或擴散或甚至降低癌症之總範圍。 如本文所使用，術語「患者」、「個人」「個體」係指人類或非人類哺乳動物。非人類哺乳動物包括(例如)家畜及寵物，諸如綿羊類、牛類、豬類、犬類、貓類及鼠類哺乳動物。較佳地，患者、個體或個人為人類。 如本文所使用，術語「醫藥學上可接受之」係指一種材料，諸如載劑或稀釋劑，其並不消除化合物之生物活性或特性，且相對無毒，亦即該材料可在不引起非所需生物效應或以有毒方式與含有其之組合物之組分中之任一者相互作用的情況下向個體投與。 如本文所使用，術語「醫藥學上可接受之鹽」係指所揭示之化合物之衍生物，其中母體化合物藉由將現有酸或鹼部分轉化為其鹽形式而經修飾。醫藥學上可接受之鹽的實例包括(但不限於)鹼性殘基(諸如胺)之無機或有機酸鹽；酸性殘基(諸如羧酸)之鹼鹽或有機鹽；及其類似鹽。本發明之醫藥學上可接受之鹽包括例如由無毒無機酸或有機酸形成之母體化合物的習知無毒鹽。本發明的醫藥上可接受之鹽可藉由習知化學方法自含有鹼性或酸性部分之母體化合物合成。通常，此等鹽可藉由使此等化合物之游離酸或鹼形式與水中或有機溶劑中或兩者之混合物中之化學計算量的適當鹼或酸反應來製備；通常，如醚、乙酸乙酯、醇、異丙醇或乙腈之非水媒介為較佳的。適合之鹽之清單可見於Remington's Pharmaceutical Sciences，第17版，Mack Publishing Company, Easton, Pa., 1985，第1418頁及醫藥科學雜誌(Journal of Pharmaceutical Science), 66, 2 (1977)，其中之每一者以全文引用之方式併入本文中。 如本文所使用，術語「組合物」或「醫藥組合」係指至少一種在本發明內有用之化合物與醫藥學上可接受之載劑之混合物。醫藥組合有助於向患者或個體投與化合物。此項技術中存在多種化合物投與技術，其包括(但不限於)靜脈內、經口、氣霧劑、非經腸、經眼、經肺及局部投與。 如本文所使用，術語「醫藥學上可接受之載劑」意謂醫藥學上可接受之物質、組合物或載劑，諸如液體或固體填充劑、穩定劑、分散劑、懸浮劑、稀釋劑、賦形劑、增稠劑、溶劑或囊封物質，涉及攜帶或運送本發明內有用之化合物於患者體內或至患者以使其可執行其預期功能。通常，該等構築體係自身體之一個器官或部分攜帶或運送至身體之另一器官或部分。各載劑必須在與調配物之其他成分(包括在本發明內有用之化合物)相容且對患者無害之意義上「可接受」。如本文所使用之術語「組合」、「治療組合」、「醫藥組合」或「組合產品」係指單位劑型之固定組合或非固定組合或用於組合投與的部分套組(kit of parts)，其中兩種或多於兩種治療劑可在時間間隔內獨立、同時或分別投與，尤其此等時間間隔允許組合搭配物顯示合作(例如協同)效應。 術語「組合療法」係指投與兩種或多於兩種治療劑以治療本發明中所述之治療病狀或病症。此投與涵蓋共同投與此等治療劑以實質上同時方式，諸如以具有固定比率活性成分之單一調配物或以各活性成分之各別調配物(例如膠囊及/或靜脈內調配物)。另外，此投與亦涵蓋以依序或分開方式在大約相同時間或在不同時間使用各類型治療劑。此投與亦涵蓋各組分經調配為各別調配物，可在不同時間投與。舉例而言，式I之HDAC6選擇性抑制劑可每天給藥。在任何情況下，該治療方案將提供該藥物組合在治療本文所述之病狀或病症中的有益效應。 術語「低於治療有效量」或「低於治療劑量」為活性成分(例如HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑)單獨地向患者投與時隨時間不完全抑制所欲標靶之生物活性之量或劑量。 術語「協同效應」係指諸如(例如) HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑產生(例如)減緩癌症之症狀性發展或其症狀的效應之兩種藥劑之作用，該效應大於各藥物獨自投與之效應的簡單累加。 如本文所使用，當指代癌症患者時，對治療劑之術語「抗性」或「屈光」意謂由於與治療劑接觸癌症對治療劑之效應具有固有或獲得性抗性。或者說，癌症患者抵抗與特定治療劑相關的普通標準治療。 如本文所使用，「未經治療者」係指未預先接收使用針對特定癌症之研究性或審批通過的藥物、BET抑制劑之治療的患者。 替代地，根據本發明之方法治療之患者可為「已經歷治療者」。如本文所使用，「已經歷治療者」係指已經受至少一次癌症治療(特定而言，BET抑制劑)之先前病程的患者。在一些實施例中，先前病程中之最後劑量至少出現在實施根據本發明之方法之前三個月。
組蛋白去乙醯基酶 ( HDAC ) 抑制劑
本文提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該等方法包含投與HDAC抑制劑及BET抑制劑。本文亦提供包含HDAC抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合。 本文所揭示之醫藥組合及方法包含組蛋白去乙醯基酶(HDAC)抑制劑。HDAC抑制劑可為任何HDAC抑制劑。由此，HDAC抑制劑對特定類型的組蛋白去乙醯基酶酵可為選擇性或非選擇性。較佳地，HDAC抑制劑為選擇性HDAC抑制劑。更佳地，HDAC抑制劑為HDAC6選擇性抑制劑。 在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式I化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， 環B為芳基或雜芳基； R
1
為芳基或雜芳基，其中之每一者可視情況經OH、鹵基或C
1 - 6
烷基取代； 及 R為H或C
1 - 6
烷基。 式I之代表化合物包括(但不限於)：
或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為化合物A或其醫藥學上可接受之鹽。化合物A亦稱為瑞科諾他(ricolinostat)。在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為化合物B或其醫藥學上可接受之鹽。 根據式I的選擇性HDAC6抑制劑之製備及特性提供於國際專利申請案第PCT/US2011/021982號及第PCT/US2014/059238號中，該申請案之全部內容以引用之方式併入本文中。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式II化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， R
x
及R
y
與各自所連接之碳一起形成環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基或環辛基； 各R
A
獨立地為C
1 - 6
烷基、C
1 - 6
烷氧基、鹵基、OH、-NO
2
、-CN或-NH
2
；及 m為0、1或2。 式I之代表化合物包括(但不限於)：
或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為化合物C或其醫藥學上可接受之鹽。在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為化合物D或其醫藥學上可接受之鹽。 根據式II之選擇性HDAC6抑制劑之製備及特性提供於國際專利申請案第PCT/US2011/060791號中，該申請案之全部內容以引用之方式併入本文中。 在另一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為土巴他汀A或其醫藥學上可接受之鹽。
溴結構域及額外端基元蛋白質 ( BET ) 抑制劑
本文所揭示之醫藥組合及方法的一些實施例包含BET抑制劑。BET抑制劑可為任何BET抑制劑。在某些實施例中，BET抑制劑係選自由以下組成之群：ABBV-075、BAY1238097、BMS986158、布羅莫斯柏林、CBP30、CPI-203、CPI-0610、FT-1101、GSK2820151、I-BET151、I-BET726、I-BET-762 (GSK525762)、INCB054329、INCB057643、ISOX DUAL、JQ1、LY294002、LY303511、MS436、MK8628 (OTX-015)、OF-1、OXF BD 02、PFI-1、PFI-3、PF-6405761、RVX-208、TEN-010、XD 14及ZEN003694或其醫藥學上可接受之鹽。在另一實施例中，BET抑制劑為JQ1或(+)-JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。在另一實施例中，BET抑制劑為JQ1：
(JQ1)， 或其醫藥學上可接受之鹽。在又一實施例中，BET抑制劑為(+)-JQ1。在再一實施例中，BET抑制劑(+)-JQ1稱為JQ1。JQ1為熟知的BET抑制劑(Filippakopoulos, P.等人，
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：第1067-73頁；Belkina, A. C.等人，
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(7)：第465-77頁，其兩者以其全文引用之方式併入本文中)。 在一些實施例中，本文所描述之化合物為未溶劑化的。在其他實施例中，化合物中之一或多者呈溶劑化形式。如此項技術中已知，溶劑合物可為醫藥學上可接受之溶劑中之任一者，諸如水、乙醇及其類似者。 儘管以中性形式描繪式I及式II化合物，但在一些實施例中，此等化合物以醫藥上可接受之鹽的形式使用。
醫藥組合及組合物
因此，在另一態樣中，本文中提供包含組蛋白去乙醯基酶(HDAC)抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合。 在醫藥組合之一些實施例中，HDAC抑制劑為HDAC6選擇性抑制劑。在特定實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式I化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， 環B為芳基或雜芳基； R
1
為芳基或雜芳基，其中之每一者可視情況經OH、鹵基或C
1 - 6
烷基取代； 及 R為H或C
1 - 6
烷基。 在一些實施例中，式I化合物為化合物A
(A)， 或其醫藥學上可接受之鹽。 在又其他實施例中，式I化合物為化合物B
(B)， 或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式II化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， R
x
及R
y
與各自所連接之碳一起形成環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基或環辛基； 各R
A
獨立地為C
1 - 6
烷基、C
1 - 6
烷氧基、鹵基、OH、-NO
2
、-CN或-NH
2
；且 m為0、1或2。 在另一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在實施例中，醫藥組合用於治療個體內之癌症。在某些實施例中，癌症為抗性或難治癒之癌症。 在實施例中，醫藥組合用於治療個體內之癌症，其中個體為未經治療者。 在前述醫藥組合及組合物之其他實施例中，醫藥組合或組合物進一步包含一或多種醫藥學上可接受之載劑。
用於治療癌症的方法
在一個態樣中，本發明提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該等方法包含向個體投與治療有效量之包含HDAC抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合。 本文中所考慮的個體通常為人類。然而，個體可為需要治療之任何哺乳動物。由此，本文所描述之方法可應用於人類及獸醫應用兩者。 因而，在一個實施例中，本文提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑以低於治療劑量投與。 在另一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之式I之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之式II之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在本文所揭示之方法之一些實施例中，細胞為癌細胞。在另一實施例中，細胞為肺癌細胞。在再一實施例中，細胞為非小細胞肺癌細胞。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之肺癌的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之肺癌方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在前述方法的一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑誘導癌細胞之細胞凋亡。 在其他實施例中，提供用於藉由投與本文所揭示之醫藥組合而降低患有癌症個體內癌細胞之細胞存活率的方法。 在另一實施例中，提供用於藉由向個體投與本文所揭示之醫藥組合協同增加患有癌症之個體內癌細胞之細胞凋亡的方法。 在再一實施例中，提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑、治療有效量之BET抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而減少在患有癌症個體內之循環調節性T淋巴細胞(Treg)的方法。在一些實施例中，Treg為CD4+FOXP3+ Treg。 在又一實施例中，提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示的治療有效量之醫藥組合而改變患有癌症個體內之抗原呈現複合物的表現之方法。 在另一實施例中，提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而增加個體內抗原呈現細胞之協同刺激功能從而治療癌症之方法。在一些實施例中，呈現蛋白質為CD86，且表現增加。在另一實施例中，呈現蛋白質為MHC II，且表現增加。 在另一實施例中，本提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而活化個體內之T細胞從而治療癌症的方法。在一些實施例中，CD69之表現增加。在另一實施例中，T細胞為CD69陽性CD4+ T細胞。在另一實施例中，T細胞為CD69陽性CD8+ T細胞。 在另一態樣中，本文中提供用於藉由向個體投與本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而減少患有癌症個體內的癌細胞之細胞增殖之方法。 在又一態樣中，本發明係關於用於上調有需要個體之淋巴細胞功能活性的方法。特定言之，本發明係關於用於上調有需要個體之淋巴細胞功能活性，包含向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示的治療有效量之醫藥組合之方法。在一些實施例中，淋巴細胞為T細胞。在另一實施例中，功能活性為短暫TCR不依賴性活化。 在前述方法之某些實施例中，癌症為肺癌。在前述方法的另一實施例中，肺癌為非小細胞肺癌、小細胞肺癌或肺類癌腫瘤。在前述方法之另一實施例中，癌症為非小細胞肺癌。 在前述方法的一些實施例中，癌症為抗性或難治癒之癌症。 在前述方法的某些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑係選自由以下組成之群：化合物A、化合物B、化合物C、化合物D、土巴他汀A或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，BET抑制劑為JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。
投與 / 給藥
在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑(式I或式II化合物)與BET抑制劑同時投與。同時投與通常意謂兩種化合物在正好相同之時間進入患者。然而，同時投與亦包括HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在不同時間進入患者但時間差足夠小以至於第一投與化合物在第二投與化合物進入之前沒有時間在患者身上起作用之可能性。此等經延遲時間通常對應於小於1分鐘，且更通常小於30秒。在一個實例中，其中化合物呈溶液形式，同時投與可藉由投與含有化合物之醫藥組合的溶液來達成。在另一實例中，可採用單獨溶液之同時投與，其中之一種溶液含有HDAC6選擇性抑制劑且其中的另一種含有BET抑制劑。在一個實例中，其中化合物呈固體形式，同時投與可藉由投與含有化合物之醫藥組合的組合物來達成。替代地，同時投與可藉由投與兩種單獨組合物來達成，一種包含HDAC6選擇性抑制劑，且另一種包含BET抑制劑。在另一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在實質上相同時間投與。 在一些實施例中，化合物之醫藥組合在癌症的治療中呈現協同效應(亦即，大於累加效應)。術語「協同效應」係指諸如(例如) HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之兩種藥劑之作用，該等藥劑產生(例如)減緩癌症或其症狀之症狀性發展的效應，該效應大於單獨投與之各藥物之效應的簡單累加。協同效應可例如使用諸如Sigmoid-Emax方程式(Holford, N. H. G.及Scheiner, L. B., Clin. Pharmacokinet. 6: 429-453 (1981))、洛伊相加方程式(equation of Loewe additivity) (Loewe, S.及Muischnek, H., Arch. Exp. Pathol Pharmacol. 114: 313-326 (1926))及中值有效方程式(median-effect equation) (Chou, T. C.及Talalay, P., Adv. Enzyme Regul. 22: 27-55 (1984))之適合方法來計算。上文提及之各方程式可應用於實驗資料以產生幫助評估藥物組合之效應的對應圖表。與上文提及之方程式相關之對應圖表分別為濃度-效應曲線、等效線圖曲線及組合索引曲線。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑不同時投與，但兩種藥劑呈現協同效應。在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑在BET抑制劑之前投與。在其他實施例中，BET抑制劑在HDAC6選擇性抑制劑之前投與。非同時投與之時間差可大於1分鐘、5分鐘、10分鐘、15分鐘、30分鐘、45分鐘、60分鐘、兩個小時、三個小時、六個小時、九個小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、4天、5天、6天或7天。在其他實施例中，第一投與化合物在第二投與化合物投與之前有時間在患者身上起作用。通常，時間差並不延伸超出第一投與化合物在患者中完成其效應之時間或超出第一投與化合物完全或實質上在患者中消除或失活之時間。在另一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在不同時間投與。 在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑一起調配為單一調配物。 在其他實施例中HDAC抑制劑及BET抑制劑各自經調配為單獨調配物。 在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑中的一種或兩種以治療有效量或劑量投與。「治療有效量」為當單獨地向患者投與時有效地治療癌症之HDAC6選擇性抑制劑(式I或式II化合物)或BET抑制劑的量。在給出個例中證明為特定患者之「治療有效量」的量，可能對於類似研究中之疾病或病況治療之患者不為100%有效，儘管此類劑量被熟習從業者認為「治療有效量」。對應於治療有效量之化合物之量很大程度上取決於癌症之類型、癌症之階段、正經治療患者之年齡及其他事實。一般而言，此等化合物的治療有效量在此項技術中為熟知的，諸如提供於上文所引用之支援文獻中。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑中的一種或兩種以低於治療有效量或劑量投與。低於治療有效量為當單獨地向患者投與時隨時間推移HDAC6選擇性抑制劑(式I或式II化合物)或BET抑制劑不完全抑制既定靶向物之生物活性的量。 無論以治療量或低於治療量投與，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合應在治療癌症中有效。舉例而言，若低於治療量之BET抑制劑之化合物在與式I或式II化合物(HDAC6選擇性抑制劑)組合時可為有效量，則醫藥組合在癌症治療中有效。 在本發明的某些實施例中，醫藥組合及方法包括式I之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑。由此，在一個實施例中，醫藥組合及方法包括化合物A及BET抑制劑。在另一實施例中，醫藥組合及方法包括化合物B及BET抑制劑。在另一實施例中，醫藥組合及方法包括化合物C及BET抑制劑。在又一實施例中，醫藥組合及方法包括化合物D及BET抑制劑。這些實施例呈現協同作用，以使得可使用低於治療量之HDAC6選擇性抑制劑或低於治療量之BET抑制劑。在本發明的某些實施例中，醫藥組合及方法包括式II之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑。 在不同實施例中，取決於所使用之醫藥組合及有效量，化合物之醫藥組合可抑制癌症生長、實現癌症停滯或甚至實現顯著的或完全的癌症消退。 儘管HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之量應導致癌症之有效治療，當經組合時，量對於患者較佳地不具過大毒性(亦即，量較佳地在如由醫療指導原則所建立之毒性限制內)。在一些實施例中，或者為了阻止過大毒性及/或提供癌症的更有效治療，提供對總投與劑量之限制。通常，本文中考慮之量為每天的；然而，本文中亦考慮半天及兩天或三天之循環。 不同劑量方案可用於治療癌症。在一些實施例中，以日劑量(諸如，上文所描述之例示性劑量中之任一者)投與一日一次、兩次、三次或四次持續三天、四天、五天、六天、七天、八天、九天或十天。取決於癌症之階段及嚴重度，較短治療時間(例如，至多五天)可與較高劑量一起採用，或更長治療時間(例如，十或更多天、或數週、或1個月或更長)可與較小劑量一起採用。在一些實施例中，每隔一天投與一日一次或一日兩次劑量。在一些實施例中，各劑量含有作為單一劑量待遞送之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑兩種，而在其他實施例中，各劑量含有作為各別劑量待遞送的HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑。 純形式或適當醫藥組合之HDAC6選擇性抑制劑、BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽或溶劑合物形式可經由此項技術中已知的投與或藥劑之公認模式中之任一者投與。化合物可(例如)經口、經鼻、非經腸(靜脈內、肌肉內或皮下)、體表、經皮、陰道內、膀胱內、腦池內(intracistemally)或經直腸投與。劑型可為(例如)固體、半固體、凍乾粉末或液體劑型，諸如，錠劑、丸劑、軟彈性膠囊或硬明膠膠囊、粉末、溶液、懸浮液、栓劑、噴霧劑或其類似者，較佳地呈適合於精確劑量之簡單投與的單位劑型。特定投投與途徑為經口，尤其其中可根據待治療之疾病之嚴重度調整便利的日劑量方案之途徑。 如上文所論述，醫藥組合之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑可以單一單位劑量或單獨劑型而投與。因此，片語「醫藥組合」包括呈單一劑型或單獨劑型之兩種藥物之組合，亦即，貫穿本申請案所描述的醫藥學上可接受載劑及賦形劑可與單一單位劑量之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑組合，以及當此等化合物單獨地投與時個別地與HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑組合。 助劑及佐劑可包括(例如)保持劑、潤濕劑、懸浮劑、甜味劑、調味劑、芳香劑、乳化劑及調劑。微生物作用之阻止通常上由各種抗菌劑及抗真菌劑提供。等滲劑亦可包括在內。可注射醫藥形式之長期吸收可由使用藥劑延遲吸收實現。助劑亦可包括潤濕劑、乳化劑、pH緩衝劑及抗氧化劑。 可用包衣及殼(諸如腸溶包衣及此項技術中熟知的其他)來製備固體劑型。其可含有安撫劑(pacifying agents)且可為以延緩方式於腸道之某一部分中釋放活性化合物之組合物。可使用之包埋組合物之實例為聚合物質及蠟。若適當，活性化合物亦可呈具有一或多種上文提及之賦形劑之微囊封形式。 用於經口投與之液體劑型包括醫藥學上可接受之乳液、溶液、懸浮液、糖漿及酏劑。此等劑型係例如藉由將本文所述的HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽及視情況選用之醫藥佐劑溶解、分散等於載劑中以形成溶液或懸浮液而製備。 通常，取決於所欲投與模式，醫藥學上可接受之組合物將含有約1重量%至約99重量%之本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及99重量%至1重量%之醫藥學上可接受之賦形劑。在一個實例中，組合物將為在約5重量%與約75重量%之間之本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽，其餘為合適的醫藥賦形劑。 製備此等劑型之實際方法為熟習此項技術者已知或將顯而易見。參考例如Remington's Pharmaceutical Sciences 第18版(Mack Publishing Company, Easton, Pa., 1990)。
套組
在其他實施例中，提供套組。根據本發明之套組包括包含本發明化合物或組合物之封裝。在一些實施例中，套組包含HDAC6選擇性抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽。 詞組「封裝」意謂含有本文中所呈現的化合物或組合物之任何容器。在一些實施例中，封裝可為盒或包裹。用於封裝醫藥產品之封裝物質為熟習此項技術者所熟知。醫藥封裝物質之實例包括(但不限於)瓶子、管、吸入器、泵、袋、小瓶、容器、注射器、瓶子，及任何適合於所選擇之調配物及所欲投與及治療模式的封裝物質。 套組亦可含有並不含於封裝內但附接至封裝外部之物件，例如吸液管。 套組可進一步含有用於向患者投與本發明之化合物或組合物的說明書。套組亦可包含由諸如美國食品與藥物管理局之調控機構審批通過的本文中化合物之用途的說明書。套組亦可含有化合物之標記或產品插入件。封裝或任何產品插入件可自身由調控機構審批通過。套組可包括封裝中之呈固相或液相狀態(諸如所提供之緩衝液)的化合物。套組亦可包括用於製備用以進行該等方法之溶液的緩衝液及用於將液體自一個容器轉移至另一個容器的吸液管。
實例
已在下文中出於說明之目的闡述實例且描述某些特定實施例。。然而，申請專利範圍之範疇不以任何方式受本文中所闡述之實例限制。對所揭示實施例之各種改變及修改對熟習此項技術者將為顯而易見的，且可在不脫離本發明之精神及所附申請專利範圍之範疇的情況下作出此類改變及修改(包括(但不限於)與本發明之化學結構、取代基、衍生物、調配物及/或方法相關之彼等)。本文中之流程之結構中的變數之定義與本文中所呈現之式中之對應位置之彼等相稱。 式I化合物的合成將提供於國際專利申請案第PCT/US2011/021982號(化合物B)及第PCT/US2014/059238號(化合物A及B)中，該等申請案以其全文引用之方式併入本文中。式II化合物之合成(化合物C及D)將提供於第PCT/US2011/060791號中，該申請案以其全文引用之方式併入本文中。
實例 1 ： 2 -( 二苯胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 A ) 之合成 反應流程 中間物 2 之合成 ：
將苯胺(3.7 g，40 mmol)、化合物
1
(7.5 g，40 mmol)及K
2
CO
3
(11 g，80 mmol) 於DMF (100 ml)中之溶液的混合物在N
2
下在120℃下脫氣且攪拌隔夜。反應混合物冷卻至室溫且用EtOAc (200 ml)稀釋，隨後用飽和鹽水(200 ml × 3)洗滌。有機層經Na
2
SO
4
分離且乾燥，蒸發至乾燥且由矽膠層析法(石油醚/EtOAc = 10/1)純化以得到呈白色固體狀之所需產物(6.2 g，64%)。
中間物 3 之合成 ：
將化合物
2
(6.2 g，25 mmol)、碘苯(6.12 g，30 mmol)、CuI (955 mg，5.0 mmol)、Cs
2
CO
3
(16.3 g，50 mmol)於TEOS (200 ml)中之溶液的混合物脫氣且用氮氣吹掃。在140℃下攪拌所得混合物14小時。冷卻至室溫後，殘餘物用EtOAc (200 ml)稀釋。添加95% EtOH (200 ml)及矽膠上之NH
4
F-H
2
O [50 g，由將NH
4
F (100g)於水(1500 ml)中之溶液添加至矽膠(500 g，100至200目)來預製備]，且所得混合物在室溫下保持2小時。固化材料經過濾且用EtOAc洗滌。過濾物蒸發至乾燥，且殘餘物由矽膠層析法(石油醚/EtOAc = 10/1)純化，以得到黃色固體(3 g，38%)。
中間物 4 之合成 ：
將2N NaOH (200 ml)添加至化合物
3
(3.0 g，9.4 mmol)於EtOH (200 ml)中之溶液中。在60℃下攪拌混合物30分鐘。在蒸發溶劑之後，溶液用2N HCl中和，以得到白色沈澱物。懸浮液用(2 × 200 ml) EtOAc萃取，且有機層經分離、用水(2 × 100 ml)、鹽水(2 × 100 ml)洗滌且經Na
2
SO
4
乾燥。移除溶劑產生棕色固體(2.5 g，92%)。
中間物 6 之合成 ：
化合物
4
(2.5 g，8.58 mmol)、化合物
5
(2.52 g，12.87 mmol)、HATU (3.91 g，10.30 mmol)及DIPEA (4.43 g，34.32 mmol)之混合物在室溫下攪拌隔夜。在過濾反應混合物之後，過濾物蒸發至乾燥，且殘餘物由矽膠層析法(石油醚/EtOAc = 2/1)純化，以得到棕色固體(2 g，54%)。
2 -( 二苯胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 A ) 之合成 ：
化合物
6
(2.0 g，4.6 mmol)、氫氧化鈉(2N，20 ml)於MeOH (50 ml)及DCM (25 ml)中之溶液的混合物在0℃下攪拌10分鐘。羥胺(50%) (10 ml)冷卻至0℃且添加至混合物中。所得混合物在室溫下攪拌20分鐘。在移除溶劑之後，用1M HCl中和混合物，得到白色沈澱物。粗產物經過濾且由製備HPLC純化，以得到白色固體(950 mg，48%)。
實例 2 ： 2 -(( 2 - 氯苯基 )( 苯基 ) 胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 B ) 之合成 反應流程 ： 中間物 2 之 合成 ：
參見實例1中的中間物
2
之合成。
中間物 3 之合成 ：
化合物
2
(69.2 g，1當量)、1-氯-2-碘苯(135.7 g，2當量)、Li
2
CO
3
(42.04 g，2當量)、K
2
CO
3
(39.32 g，1當量)、Cu (1當量，45 µm)於DMSO (690 ml)中之溶液的混合物經脫氣且用氮氣吹掃。所得混合物在140℃攪拌。反應物之處理以93%之產率產生化合物3。
中間物 4 之 合成 ：
參見實例1中的中間物4之合成。
中間物 6 之 合成 ：
參見實例1中的中間物6之合成。
2 -(( 2 - 氯苯基 )( 苯基 ) 胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 B ) 之合成 ：
參見實例1中的化合物A之合成。
實例 3 ： 2 -(( 1 -( 3 - 氟苯基 ) 環己基 ) 胺基 )- N - 羥基嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 C ) 之合成 中間物 2 之合成：
向化合物
1
(100 g，0.74 mol)於無水DMF (1000 ml)中之溶液中添加1,5-二溴戊烷(170 g，0.74 mol)。在反應物在冰浴中冷卻時逐滴添加NaH (65 g，2.2當量)。所得混合物在50℃下劇烈攪拌隔夜。懸浮液小心地用冰水淬滅且用乙酸乙酯(3 × 500 ml)萃取。經合併之有機層經濃縮以得到粗產物，由急驟管柱層析法將其純化以得到呈淺色固體狀之化合物2 (100 g，67%)。
中間物 3 之 合成：
將化合物
2
(100 g，0.49 mol)於PPA (500 ml)中之溶液在110℃下加熱約5小時至6小時。完成後，所得混合物使用飽和NaHCO
3
溶液小心地調節至約8至9之pH。所得沈澱物經收集且用水(1000 ml)洗滌，以得到呈白色固體狀之化合物3 (95 g，87%)。
中間物 4 之 合成 ：
向化合物
3
(95 g，0.43 mol)於n-BuOH (800 ml)中之溶液中添加NaClO (260 ml，1.4當量)。隨後在0℃下添加3N NaOH (400 ml，2.8當量)，且反應物在室溫下攪拌隔夜。所得混合物用EA (2 × 500 ml)萃取，且經合併的有機層用鹽水洗滌。在真空中移除溶劑，以得到由用HCl鹽處理而進一步純化以得到呈白色粉末狀之化合物
4
(72 g，73%)之粗產物。
中間物 6 之合成 ：
向化合物
4
(2.29 g，10 mmol)於二噁烷(50 ml)中之溶液中添加化合物
5
(1.87 g，1.0當量)及DIPEA (2.58 g，2.0當量)。混合物在110至120℃下加熱隔夜。所得混合物直接地在矽膠管柱上純化，以得到呈白色固體狀之偶合產物，化合物
6
(1.37 g，40%)。
2 -(( 1 -( 3 - 氟苯基 ) 環己基 ) 胺基 )- N - 羥基嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 C ) 之合成 ：
向化合物
6
(100 mg，0.29 mmol)於MeOH/DCM (10 ml，1:1)中之溶液中添加含50% NH
2
OH之水(2 ml，盈餘)。隨後在0℃下添加含飽和的NaOH之MeOH (2 ml，盈餘)，且反應物經攪拌3小時至4小時。完成後，所得混合物經濃縮且使用2 N HCl酸化以達到4至5的pH。沈澱物經收集且用水(10 mL)洗滌以移除盈餘NH
2
OH。乾燥沈澱物得到呈白色粉末狀之2-((1-(3-氟苯基)環己基)胺基)-N-羥基嘧啶-5-甲醯胺(70 mg，73%)。
實例 4 ： N - 羥基 - 2 -(( 1 - 苯基環丙基 ) 胺基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 D ) 之合成 反應流程 中間物 2 之 合成 ：
將化合物
1
、苯甲腈(250 g，1.0當量)及Ti(OiPr)
4
(1330 ml，1.5當量)於MTBE (3750 ml)中之溶液在氮氣氛圍下冷卻至約‑10℃至-5℃。EtMgBr (1610 ml，3.0 M，2.3當量)在60分鐘時段內逐滴添加，在此期間反應物之內部溫度保持低於5℃。允許反應混合物升溫至15℃至20℃達1小時。BF
3
醚(1300 ml，2.0當量)在60分鐘時段內逐滴添加，同時內部溫度保持低於15℃。反應混合物在15℃至20℃攪拌1小時至2小時，且在存在較低含量苯甲腈時停止。1N HCl (2500 ml)在保持內部溫度低於30℃時逐滴添加。逐滴添加NaOH (20%，3000 ml)以使得pH至約9.0，同時仍保持溫度低於30℃。反應混合物用MTBE (3 L × 2)及EtOAc (3 L × 2)萃取，且經合併之有機層使用無水Na
2
SO
4
乾燥且在減壓下濃縮(低於45℃)，得到紅色油狀物。MTBE (2500 ml)經添加至油狀物以得到澄清溶液，且一旦使用乾燥HCl氣體鼓泡後，固體沈澱。此固體在真空中過濾且脫水產生143 g化合物2。
中間物 4 之 合成 ：
化合物
2
(620 g，1.0當量)及DIPEA (1080 g，2.2當量)溶解於NMP (3100 ml)中且攪拌20分鐘。添加化合物
3
(680 g，1.02當量)，且反應混合物經加熱至約85℃至95℃達4小時。使溶液緩慢冷卻至室溫。將此溶液倒入H
2
O (20 L)中，且許多固體在強攪拌之情況下自溶液沈澱出來。過濾混合物，且濾餅在減壓下在50℃下脫水24小時，產生896 g化合物
4
(固體，86.8%)。
N - 羥基 - 2 -(( 1 - 苯基環丙基 ) 胺基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 D ) 之合成 ：
MeOH (1000 ml)之溶液在攪拌情況下冷卻至約0℃至5℃。添加NH
2
OH HCl (1107 g，10當量)，隨後謹慎的添加NaOCH
3
(1000 g，12.0當量)。所得混合物在0℃至5℃下攪拌一個小時，且過濾該混合物以移除固體。將化合物
4
(450 g，1.0當量)一次性添加至反應混合物，且在10℃下攪拌兩個小時直至化合物
4
耗盡。反應混合物通過添加HCl (6N)而調節至約8.5至9之pH，產生沈澱物。在減壓下濃縮混合物。在劇烈攪拌之情況下將水(3000 ml)添加至殘留物，且沈澱物由過濾收集。產物在烘箱中在45℃脫水隔夜(340 g，79%產率)。
實例 5 ： HDAC 酶分析
用於測試的化合物在DMSO中稀釋至50倍最終濃度，且製得10.3倍稀釋系列。化合物在分析緩衝液(50 mM HOPES，pH 7.4，100 mM Kill，0.001% Tween-20，0.05%鹼，20 μΜ TEC)中稀釋至6倍其最終濃度。HDAC酶(購自BPS Biosciences)在分析緩衝液中稀釋至1.5倍其最終濃度。0.05 μΜ最終濃度的二肽基質及胰蛋白酶在6倍其最終濃度之分析緩衝液中稀釋。用於此等分析之最終酶濃度為3.3 ng/ml (HDAC1)、0.2 ng/ml (HDAC2)、0.08 ng/ml (HDAC3)及2 ng/ml (HDAC6)。所用最終基質濃度為16 μΜ (HDAC1)、10 μΜ (HDAC2)、17 μΜ (HDAC3)及14 μΜ (HDAC6)。五μl化合物及20 μl酶雙份添加至黑色不透光384孔培養盤之孔。酶及化合物一起在室溫下培養10分鐘。五μl基質添加至各孔，將盤搖晃60秒且放置於Victor 2 μl盤讀取器中。監測螢光之發展60分鐘，且計算反應的線性比率。使用Graph Pad Prism由四個參數曲線擬合判定IC
50
。
實例 6 ： PBMC 細胞及 NSCLC 細胞 中之 HDAC 抑制劑 及 T 淋巴細胞之活化
以下實例之目的為單獨評估HDAC6抑制劑化合物A之臨床前活性及在非小細胞肺癌細胞株中將化合物A與JQ1 (BET抑制劑)組合之可能性。在此等實例中，利用(+)-JQ1 (在實例中稱作JQ1)。
I . HDAC 抑制劑 對來自健康供體之外周血液單核細胞 ( PBMC ) 的 效應
HDAC抑制導致具有免疫能力的動物模型中之腫瘤生長停滯。I類及II類HDAC抑制對白細胞之效應使用自健康供體獲得的外周血液單核細胞(PBMC)研究。PBMC使用化合物A培養，且結果與具有HDAC6之變化的選擇率之HDAC抑制劑的板進行比較。此板包括HDAC6選擇性抑制劑化合物B、化合物C、化合物D及土巴他汀A；及HDAC1/2/3 (I類HDAC)選擇性抑制劑恩替諾特(MS-275) (表1)。
表 1 .
使用健康供體PBMC所測試之HDAC抑制劑及HDAC生物化學分析資料。
PBMC使用HDAC抑制劑培養24小時，其後T細胞亞群之頻率由FACS評估。DMSO用作對照。值得注意的是，使用此等HDAC抑制劑培養24小時之細胞的存活率很大程度上相似(圖1A)。關於細胞亞型，CD4+FOXP3-及CD8+習知T細胞之頻率由此等藥物不明顯地影響(圖1B)。PBMC內的CD4+FOXP3+ Treg之百分比在使用化合物A或化合物B培養時最明顯地減小，而使用化合物D或恩替諾特仍呈現該效應(圖1C)。有趣的是，高度選擇性HDAC6抑制劑化合物C及土巴他汀A不明顯地影響Treg頻率，表明由諸如化合物A、化合物B及恩替諾特之化合物的I類HDAC抑制有助於Treg頻率中之所觀測降低。
II . 化合物 A 或恩替諾 特對非小細胞肺癌細胞之效應
接著，自非小細胞肺癌(NSCLC)患者獲得的PBMC或自離散的剛經切除之腫瘤採集之塊體單細胞懸浮液使用2.5 µm化合物A或2.5 µm恩替諾特培養24小時，其後CD3-CD14+單核細胞或CD45+CD68+CD11b+腫瘤巨噬細胞之表型對應地由FACS評估。DMSO用作對照。對細胞培養基內的白細胞亞群之流式細胞量測術分析揭露化合物A實質上減小相對於患者PBMC (圖2A，p = 0.04)中及患者腫瘤細胞(圖2B，p = 0.05)中之DMSO治療的Treg比例，類似在健康供體PBMC (圖1C)中觀測之比例。用化合物A治療亦減小相對於患者PBMC (圖2A)中之恩替諾特治療的Treg比例。
III . 化合物 A 或恩替諾 特之額外效應
與此等觀測相似，CD69活化標記物之表現實質上在患者(圖3A，p = 0.003；圖3B，p = 0.01)及健康供體PBMC培養基(圖3C，**指示p值 0.001；圖3D，*指示p值 0.05)兩者中在化合物A存在但恩替諾特不存在的情況下在習知CD8+及CD4+ T細胞經上調，表明經增加活化特徵由化合物A促進(圖3E)。 HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)降低CD4+FOXP3+ Treg之頻率且促進外周及腫瘤相關T淋巴細胞之短暫性活化。 實例7：HDAC6選擇性抑制劑及APC之功能性改變 HDAC6抑制可影響涉及調節發炎性細胞激素產生的機制中之APC的功能性改變。研究HDAC6選擇性抑制劑化合物A對APC的關於表型及功能之效應。特定言之，研究健康個體及NSCLC患者的外周血液中之CD14+CD11b+單核細胞之表型或解聚NSCLC腫瘤內之CD14CD68+CD11b+巨噬細胞之表型。在使用化合物A培養24小時後，CD14+單核球部分上調MHC II類分子以及CD86之表現但不上調CD80之表現、上調與經增加之APC激活能力相關之表型改變。對比而言，添加DMSO或恩替諾特兩者都不上調此等蛋白質之表現(圖4A；p = 0.04)。當與化合物A一起培育時，在2-D腫瘤細胞培養基內之CD14-CD68+CD11b+巨噬細胞(圖4B)上及來自健康供體獲得的PBMC (圖4C)中看見MHC II類及CD86的經增加表現之相似圖案。此發現證明化合物A對人類單核細胞性細胞及腫瘤相關巨噬細胞之獨特調節效應，且表明其促進將支援增強型抗原呈現及共刺激性能之表型改變。支援此概念，經曝露化合物A CD14+單核細胞在誘導混合淋巴細胞反應中之同種異體T細胞增殖性反應上為優良的(圖4D)。患者PBMC內已使用化合物A或恩替諾特培養24小時之經純化CD14+細胞在重組人類IL-2的20 IU/mL存在下與自同種異體供體PBMC之細胞跟蹤紫色(CTV)標記經純化T細胞一起培育6天。 HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)促進在人類單核細胞及腫瘤相關巨噬細胞上之MHC及共刺激分子的經增加表現且增加其功能以刺激更大T細胞增殖。 實例8：HDAC6選擇性抑制劑及腫瘤相關免疫細胞 腫瘤相關免疫細胞在使腫瘤進展之病程及抗腫瘤免疫成形中為重要的。研究HDAC6選擇性抑制劑對表型及功能改變，尤其在腫瘤抗原的環境中之效應。特定言之，研究HDAC6選擇性抑制劑對自發地在含有活化
Kras G12D
突變及並行
p53
缺失(特指為KP)之完全具有免疫能力之基因工程改造小鼠，或具有T790M/L858R EGFR突變(特指為TL)之彼等小鼠中發展的免疫細胞浸潤性肺腺癌之效應。自發地在含有LSL-KrasG12D/p53
f / f
(KP)或LSL-EGFR (TL)轉基因之小鼠中發育的肺腫瘤(如由MRI確認)在經鼻內傳遞腺病毒Cre重組酶後在用化合物A或媒劑治療7天之後切除。產生肺腫瘤節結之單細胞懸浮液且進行FACS分析以分析自KP及TL小鼠兩者隔離之腫瘤中的CD45+免疫細胞亞群之比例、表型及功能。 患有現有腺癌之小鼠在由全面多參數流式細胞量測術評估離散腫瘤之前每天使用化合物A治療一次持續七天。在此短期治療下，觀測腫瘤浸潤性CD8+ T細胞之頻率的適當提高及淋巴細胞當中的CD4+Foxp3+ Treg細胞的顯著減少，使得所治療腫瘤中之CD8:Treg比率之顯著提高(圖5A至圖5C)。CD8:Treg比率之此等增大常常與增強型抗腫瘤反應相關。儘管不存在關於抑制性受體分子表現的實質性表型改變(圖5D至圖5G)，但使用化合物A治療之小鼠中之腫瘤浸潤性CD8+ T細胞顯現CD69活化標記物之經增加表現量，且在與媒劑對照組中的等效細胞進行比較(圖5H)時，證明分泌效應細胞介素IFN-γ以及TNF-ɑ之增強的性能，接著離體刺激。 另外，類似於化合物A，化合物B增加腫瘤中之CD8:Treg比率、增加CD8 T細胞之活化(每經增加CD69活化標記物)，且增加MHC II在腫瘤相關巨噬細胞上之表現(圖5I)。將使用化合物B或媒劑治療7天的KP小鼠之肺腫瘤節結之單細胞懸浮液染色，接著進行FACS分析以分析CD45+免疫細胞亞群之比例、表型及功能。符合化合物A的發現，在與自媒劑組之腫瘤衍生的等效細胞相比時，單細胞RNA-Seq揭露與包括
Cd69 、 Sell ( Cd62L ) 、 Cd44
及
Prf1 ( 穿孔蛋白 )
之T細胞活化及效應功能相關之基因數目在來自用化合物A治療之KP小鼠之腫瘤浸潤性T細胞中上調(圖5N)。將使用化合物A或媒劑治療7天的KP小鼠及TL小鼠之肺腫瘤節結之單細胞懸浮液染色，接著進行FACS分析以分析CD45+免疫細胞亞群之比例、表型及功能。骨髓細胞群當中，CD11c+CD11b
lo
腫瘤相關巨噬細胞(TAM；圖5J)示出MHC II類以及共刺激分子CD86之明顯提高的表現量(圖5K至圖5M)。支援此表型，由單細胞RNA定序所分析之經化合物A曝露的TAMS示出與MHC II類表現相關之包括
Cd74
及
H2 - Aa 之
關鍵基因相對於其對照小鼠中的對應物之較高表現(圖5N)。 由此，與
活體外
觀測一致，此等發現指示在化合物A治療後，腫瘤浸潤性巨噬細胞經歷類似於呈更成熟狀態且周圍T細胞顯示更活化的/效應特徵之APC之改變。化合物A調介對免疫細胞亞群的陽性免疫動態及表型改變。當作為單一藥劑投與時，化合物A僅產生在含有具有並行
Kras
突變及
p53
缺陷或突變EGFR之肺腺癌之具有免疫能力的基因工程改造小鼠中之腫瘤生長之邊緣延遲(圖6，資料未圖示)。具有大約200 mm
3
的腫瘤負擔之KP小鼠每天一次腹膜內僅注入化合物A、僅JQ1或兩種藥物之組合。腫瘤生長由MRI每週監測。 HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)促進有助於NSCLC模型中之腫瘤浸潤性T細胞激活的表型改變。 實例9：在非小細胞肺癌細胞中與JQ1組合之化合物A HDAC6選擇性抑制劑與互補免疫調節劑的組合治療可實現此等NSCLC模型中更大水平之腫瘤生長之基於免疫的對照。預先展示JQ1以具有KP小鼠中之抗腫瘤效應，部分由於下調MYC及誘導腫瘤細胞中之細胞凋亡。自免疫細胞之透視圖，不同於習知CD8+ T細胞，曝露於JQ1的Treg展示PD-1及Foxp3之經降低的表現量，且與其未暴露的對應物相比更低抑制性(圖7A至圖7C)。此等JQ1效應在與化合物A之免疫調節效應組合時可促進有利於腫瘤浸潤性T細胞之更強刺激的腫瘤微環境及經增強抗腫瘤反應。T細胞與野生型小鼠之脾隔離且分類成CD3+CD25- (T細胞)或CD3+CD4+CD25hi (Treg)亞群且隨後在JQ1 (1 µM)存在或不存在的情況下培養。用100 IU/mL之重組IL-2補充培養基。細胞在培養兩天之後經洗滌，且其表型由FACS評估。對於圖7C中所示之CSFE稀釋而言，自原始小鼠的脾獲得之2×10
5
CFSE標記的純化T細胞與1.0×10
5
絲裂黴素C治療、充當APC之T耗乏脾細胞共培養。0.5 µg可溶抗CD3隨後與分級數目個Treg一起添加至各孔(由Treg:T細胞比率指示)。 在長期功效研究中，使用化合物A及/或JQ1來治療攜帶肺腺癌之小鼠。向攜帶腫瘤、免疫強的小鼠投與長期劑量之化合物A及/或JQ1，且腫瘤生長動力學在治療組比媒劑治療對照組之間評估。特定言之，在缺乏或不缺乏對抗CD4或CD8之抗體的情況下，具有大約200 mm
3
之腫瘤負擔的KP小鼠每天一次腹膜內注入僅化合物A、僅JQ1或兩種藥物之組合。腫瘤生長由MRI每週監測。KP小鼠中，化合物A或JQ1單藥療法分別使得腫瘤生長中之邊緣或適中遲緩，但兩種藥劑之組合治療導致腫瘤生長的顯著停滯(圖6及圖8A)。此等效應大部分取決於CD8+及CD4+ T細胞，因為兩種藥劑之組合的情況下所提及之腫瘤生長停滯在結合治療方案中之耗乏CD8或CD4之抗體後消除(圖8A)。另外，在與單一藥劑治療進行比較時，在與化合物A及JQ-1治療的醫藥組合情況下出現腫瘤細胞中減少的ki67表現及增加的cascape-3表現。特定而言，用媒劑、化合物A、JQ1或化合物A及JQ1之組合治療KP小鼠1週，且接著一個較小肺部分固定於10%
福馬林
(
formalin
)中。此導致在組合兩種藥劑後腫瘤細胞之經減少增殖及經增加細胞凋亡(圖8B)。此外，組合療法與僅任一藥劑相比導致更長無進展存活率(圖8C)，表明JQ1與化合物A協同以驅動T細胞調介抗腫瘤反應。類似於KP小鼠，由標記此等模型中之每一者中之腫瘤生長的抑制證明，組合在攜帶突變EGFR (TL)肺腫瘤以及路易肺(Lewis Lung)癌瘤之小鼠中亦有效(圖8D及圖8E)。具有大約200 mm
3
之腫瘤負擔的TL小鼠每天一次腹膜內注入化合物A及JQ1之組合，且腫瘤體積由MRI來量測(圖8D)。路易肺癌瘤(LLC)細胞(每植入500 k細胞)以每小鼠1植入而植入C57BL/6 (B6)小鼠中。在植入之後的三天，針對如圖8E中所指示之媒劑、JQ1及/或化合物A治療將小鼠任意分組成每組5隻。腫瘤每週量測兩次，且腫瘤體積由0.5*L*W*W計算。此等資料表明此組合方法之治療性益處延伸超出由GEMM中之驅動基因突變的異位表現驅動至表徵為自發發展之彼者及至黑素瘤之肺腺癌。 腫瘤節結的免疫分析進一步揭露相對於單一藥劑治療，用兩種藥劑之組合治療之KP小鼠之淋巴細胞浸潤性腫瘤大概由於高度減少之Treg部分含有明顯較高CD8:Treg比率(圖9A及圖9B)。針對免疫剖析，小鼠群在4至6週的治療之後處死，且腫瘤細胞懸浮液進行FACS分析。CD8+ T細胞由CD69之經增加表現證明更活化(圖9C)。另外，自用所指示藥物治療的小鼠之腫瘤隔離之免疫細胞在高基氏(golgi)栓塞的存在下離體刺激6小時。此等腫瘤浸潤性CD8+ T細胞證明分泌效應細胞介素IFN-γ之經增加的性能以及如由CD107a染色所指示的經增加之脫粒(圖9D及圖9E)。細胞懸浮液自腫瘤節結產生，該等腫瘤節結自用JQ1及/或化合物A治療之小鼠切除，該等節結分類成三個群：CD25-CD3+ T細胞、CD45-Epcam+腫瘤細胞及CD11b
lo
CD11c+ TAM。等效數目個此等群中之每一者在腫瘤細胞裂解液存在下共培養兩天。在自經化合物A及/或JQ1治療小鼠之腫瘤節結經分類的等效數目個T細胞、TAM及EpCam+腫瘤細胞與腫瘤細胞裂解液一起共培養時，在自經雙藥劑治療小鼠之腫瘤隔離的T細胞存在下觀測到較高比例之腫瘤細胞死亡(圖9F)。此證明組合治療產生腫瘤浸潤性T細胞之較大腫瘤殺滅可能性。關於TAM，僅化合物A治療或與JQ1組合之化合物A治療明顯地促進MHC II類分子及CD86之上調(圖9G及圖9H)。一起採用，此等發現證明HDAC6選擇性抑制劑化合物A與溴結構域抑制劑JQ1組合具有經協同以強化穩固免疫介導性抗腫瘤反應之免疫調節效應。亦即，BET溴結構域抑制劑(JQ1)與HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)增強腫瘤生長之免疫依賴性抑制。
實例 10 ： 其他方法
小鼠 先前已描述含有
Kras +/ LSL - G12D Trp53L/ L
(KP)或
EGFRLSL-T790M /L858R
(TL)之基因工程改造小鼠(DuPage，M.，A.L. Dooley及T. Jacks，
Conditional mouse lung cancer models using adenoviral or lentiviral delivery of Cre recombinase 。
Nat Protoc，2009.
4
(7)：第1064-72頁)。對於肺腫瘤誘導，小鼠在5至6週齡時經鼻內接收1×10
6
cfu cre編碼腺病毒。腫瘤形成(通常在接種後6至8週)且體積由MRI確認，且使用3D切片機軟體定量。C57BL/6小鼠購自Taconic Farms (Bejing, China)。全部小鼠在無特定病原體條件下保持。
藥物、抗體及試劑
化合物A (瑞科諾他)由Acetylon Pharmaceuticals (Boston, MA)提供。化合物A以10% DMSO及90%之5%右旋糖調配，且每天以50 mg/kg經腹膜內投與至小鼠。土巴他汀自APExBIO (Houston, TX)獲得。土巴他汀以10% DMSO及90%之0.9%生理食鹽水調配，且每天以25 mg/kg經腹膜內投與至小鼠。JQ1由James Bradner (Dana Farber Cancer Institute, Boston, MA)友情提供。JQ1以10% DMSO及90%的10% 2-羥丙基β-環糊精(Sigma)調配，且每天以25 mg/kg經腹膜內投與至小鼠。媒劑對照藉由將DMSO稀釋至相關藥物媒劑中來製備。抗CD4 (GK1.5)、抗CD8 (53-6.72)及大鼠IgG (LTF-2)購自BioXcell。小鼠在用化合物A及JQ1之組合治療之前連續兩日第一次投與抗體，且接著使用抗體每週兩次以400 μg/小鼠/次經腹膜內給藥。相關細胞類型的耗乏由流式細胞量測術在使用自尾靜脈獲得之外周血液的第二次給藥之後一天確認。用於流式細胞量測分析的研究之小鼠及人類抗體購自Biolegend、Ebioscience及BD pharmingen。重組人類細胞介素IL-2、IL-4及GM-CSF全部購自peprotech (NJ)。 腫瘤剖析及流式細胞量測術 為產生細胞懸浮液，腫瘤節結自KP及TL小鼠之肺切除且切割成小片，隨後在含有100 U/ml膠原蛋白酶類型IV (Invitrogen)及50 μg/ml DNA酶I (Roche)之RPMI-1640/5% FBS緩衝液中在37℃下進一步分解45分鐘。在培育之後，細胞用紅血球裂解緩衝液處理，且經由70 µm細胞過濾器過濾。在離心之後，細胞小球再懸浮於1×PBS/2% FBS中。對細胞進行計數，且針對PBS + 2% FBS中之表面標記物，將約0.5-1×10
6
個細胞在4℃下染色15分鐘。使用根據製造商的說明書之Foxp3染色緩衝液對Foxp3、Ki67、CTLA-4及Bcl-2進行胞內染色，而cytofix/cytoperm套組(BD Bioscience)用於胞內細胞介素染色。簡言之，針對包括CD4、CD8、CD3之表面標記物對細胞進行染色，隨後進行胞內染色，使用PE結合之抗IFN-γ、BV421結合之抗TNF-α、APC結合之IL-2、FITC結合之穿孔蛋白及CD107a(其中所示)，或同型匹配之mAbs，在滲透及固定之後。在全部染色樣本中，死亡細胞使用存活/死亡可固定的死亡細胞染色套組(Invitrogen)排除。細胞在LSR Fortessa (BD Biosciences)上獲得且使用flowjo軟體(Treestar)分析。用於FACS分析之閘控策略在圖10中展示。 細胞純化及活體外研究 外周血液單核細胞(PBMC)由菲科爾梯度(Ficoll gradient)自由健康供體及在IRB審批通過機構協定下同意的患者獲得之新鮮或凍結血液樣本隔離。在凍結時，PBMC解凍且在37℃下放置於10%完全培養基(用10%混合人類血清補充之RPMI 1640，100 U/mL青黴素，100 U/mL鏈黴素及2 mM L麩醯胺酸)中6小時，其後細胞(0.5×10
6
)使用化合物A (2.5 µm)、恩替諾特(2.5 µm)或JQ1 (1 µm)培養24小時或72小時。細胞隨後經洗滌且由FACS進行表型分析。在一些實驗中，此等培養基使用在純化之後自全PBMC之經純化CD14+單核細胞或CD3+ T細胞進行。 對於T細胞增殖分析，T細胞由陽性選擇使用T細胞增濃套組(Miltenyi Biotec)遵循製造商的說明書自PBMC隔離。細胞通常為約90%純度。純化T細胞隨後使用2.5 μM CFSE或細胞跟蹤紫色(CTV)在37℃下標記7分鐘。細胞使用RPMI+10% FBS洗滌三次、加以計數及用作應答細胞。由陽性選擇使用CD14微珠自患者PBMC隔離之經純化CD14+細胞使用化合物A或恩替諾特培養24小時，其後細胞在與在混合淋巴細胞反應中之同種異體T細胞共培養之前洗滌三次。 對於胞內細胞介素檢測分析，來自經治療或對照小鼠的腫瘤之免疫細胞如先前所描述在菲科爾梯度分離之後得到。1×10
6
個細胞在37℃下使用PMA (50 ng)及離子黴素(Ionomycin) (500 ng)培養6小時，且GolgiPlug (BD Pharmingen)在培養之最後5個小時添加。對於利用人類PBMC之等效分析，於分析之前以類似方式刺激0.5×10
6
個細胞。
腫瘤浸潤性 TAM 及 T 細胞 之單細胞 RNA 定序
腫瘤相關巨噬細胞(TAM；CD45+CD11c+CD11b
lo
)及CD45+CD3+CD25
lo/-
T細胞由FACS分類分類成含有具有自腫瘤組織分離的重組核糖核酸酶抑制劑(Life Technologies)的50 µl之1× PBS之96孔培養盤。簡言之，腫瘤細胞懸浮液在FcγR封鎖之後使用存活/死亡可固定的染料培育，且隨後使用對抗CD45、CD3、CD8、CD11b及CD11c之抗體染色。智慧型Seq2庫由Broad Technology Labs來製備且由Broad Genomics Platform定序。
統計分析
統計顯著性由用於兩組之間的對比之史都登氏(Student's) t測試或用於使用GraphPad Prism軟體多組比較之單因子變異數分析評估。
P
＜ 0.05值視為在統計學上顯著(*)，
P
＜ 0.01值視為極顯著(**)，且
P
＜ 0.001值視為高度顯著(***)。
以上實例之概述
上文之實驗證明恩替諾特、1類HDAC選擇性藥劑僅部分再現化合物A (具有對抗HDAC1/2/3之弱活性的HDAC6選擇性)之效應中之一些。由此，化合物A之所觀測免疫調節效應很可能為其對HDAC6及1類HDAC的相對抑制活動之獨特及出人意料的特徵。 化合物A具有精細調節與抗原呈現相關之免疫事件之可能性。在病理或疾病環境中，不成熟的專業抗原呈現細胞(APC)在進行表型改變至更成熟狀態時必須「獲取(pick up)」、處理及呈現相關抗原。當以此狀態呈現時，由於MHCII類及共刺激分子之其表現中之增加，其具有增強型抗原呈現及T細胞激活能力。在化合物A治療肺帶有腫瘤之小鼠後即刻觀測腫瘤相關巨噬細胞(TAM)時，MHC II類以及共刺激分子CD86之經增加的表現由此符合化合物A充當促進幫助共刺激信號的經改良之傳遞及抗原之呈現的表型改變之唯一調節藥劑之概念。支援此點的是來自患者PBMC之經化合物A曝露的CD14+單核細胞在驅動同種異體反應性T細胞增殖上較好的發現。此大部分為自外來MHC分子之T細胞接合衍生的刺激以及呈現於APC上之共刺激之程度的功能。此外，觀測到的磷醯基STAT3之增加及在經化合物A曝露的T細胞上之CD69表現亦表明其可以取決於STAT3活化之方式對T細胞具有直接激活效應。實際上，已經展示STAT3之活化以誘導CD69表現，且因此，誘導同種異體反應性T細胞模型中的T細胞活化。此類活化效應尤其在腫瘤相關抗原之環境中可有益於經誘導之TCR、經驅動的抗原T細胞激活的擴增。 化合物A之投與可使癌症病患中之經改良之T細胞激活便利。此概念由在用化合物A治療的帶有腫瘤之小鼠中觀測之腫瘤浸潤性CD8+ T細胞之經增加的活化及經增強之效應功能支援。儘管化合物A單獨地在NSCLC之GEM模型中抑制腫瘤生長中不穩固，但其當與JQ1偶合時產生顯著T細胞調介抗腫瘤功效。 隨著CD4+FOXP3+ T調節細胞積聚於許多固體癌中，具有靶向此等細胞之可能性的藥劑可提供治療性益處。如所揭示，HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)及BET抑制劑(JQ1)治療之組合減少Treg細胞之部分但不減少經治療的小鼠中之腫瘤微環境內之習知T細胞。此表明Treg細胞與其習知T細胞對應物相比可對表觀遺傳修飾更敏感。儘管Foxp3之量在活體外由化合物A節省的Treg細胞上降低，但此效應僅在活體內適中。在另一方面，JQ1展現由經減小Foxp3表現量證明之更深遠的效應及除JQ1所治療的小鼠之腫瘤中之Treg比例的更實質性減小之外，還有活體外Treg細胞之功能減少。化合物A及JQ1可優先調變FOXP3基因表現或蛋白質之穩定性，且因此，調變此等細胞之總存活率及活性。此等效應由現有報告支援，該等報告表明某些HDAC抑制劑影響Treg生物學，因為已知由HAT/HDAC之組蛋白之乙醯化狀態影響FOXP3基因表現及穩定性。由不同HDAC靶向的基因位點或蛋白質區域中之變體可回應於不同HDAC抑制劑影響Treg活性。另外，與不同疾病病況相關之發炎情境可指示某些HDAC抑制劑如何影響其活性。 在無意欲受任何理論束縛的情況下，化合物A可對免疫細胞扮演多效性角色，且可由減少Treg細胞數目、增加T細胞之短暫TCR不依賴性活化及促進APC功能起作用。在另一方面，JQ1進一步破壞Treg抑制活性，其視為阻礙免疫介導性抗腫瘤反應的關鍵機制。JQ1與化合物A協同，進一步減小Treg比例且妨礙在腫瘤床中呈現之殘餘Treg之抑制作用。淨效應為借助於優化抗原傳遞、增加共刺激信號同時降低抑制性細胞機制來促進白細胞安排抗腫瘤反應。在T細胞耗乏後，化合物A及JQ1治療下看見的腫瘤生長停滯之消除證明T細胞為在此模型中的組合治療之功效中之關鍵角色。 化合物A及JQ1之組合產生由不同突變基因型驅動的肺腫瘤中之穩固免疫介導性抗腫瘤效應，其延長帶有腫瘤之小鼠之存活率。此兩種藥劑之預先未描述免疫調節效應支援包含用於癌症(尤其肺腺癌)中之治療性干預的HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之合理醫藥組合。另外本文所使用的劑量符合當前臨床應用。未觀察到毒性之徵象。化合物A及JQ1可用作經由免疫細胞機構動力學及功能之外周重塑形不僅利用其直接抗腫瘤效應還利用間接效應的「混合」療法，聚合以有利於強抗癌益處。
參考文獻之併入
貫穿本申請案所引用之所有參考文獻(包括文獻參考、頒予之專利、公開之專利申請案及同在申請中之專利申請案)之全部內容在此以全文引用之方式明確地併入本文中。除非另外定義，否則本文所用之所有技術術語及科學術語與一般熟悉此項技術者通常已知之含義一致。
等效物
熟習此項技術者將認識到，或能夠僅使用習知實驗來確定本文中所描述之本發明之特定實施例的許多等效物。此類等效物欲由隨附申請專利範圍涵蓋。
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， 環B為芳基或雜芳基； R1
為芳基或雜芳基，其中之每一者可視情況經OH、鹵基或C1 - 6
烷基取代； 及 R為H或C1 - 6
烷基。 在其他實施例中，R1
為芳基或雜芳基。在另一實施例中，式I化合物為：
或其醫藥學上可接受之鹽。 在另一實施例中，R1
為芳基或雜芳基，其中之每一者經鹵基取代。在又一實施例中，式I化合物為：
或其醫藥學上可接受之鹽。 在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式II化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， Rx
及Ry
與各自所連接之碳一起形成環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基或環辛基； 各RA
獨立地為C1 - 6
烷基、C1 - 6
烷氧基、鹵基、OH、-NO2
、-CN或-NH2
；及 m為0、1或2。 在另一實施例中，式II化合物為：
或其醫藥學上可接受之鹽。在再一實施例中，式II化合物為：
或其醫藥學上可接受之鹽。在又一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為土巴他汀(Tubastatin) A或其醫藥學上可接受之鹽。 在其他實施例中，BET抑制劑係選自由以下組成之群：ABBV-075、BAY1238097、BMS986158、布羅莫斯柏林(bromosporine)、CBP30、CPI-203、CPI-0610、FT-1101、GSK2820151、I-BET151、I-BET726、I-BET-762 (GSK525762)、INCB054329、INCB057643、ISOX DUAL、JQ1、LY294002、LY303511、MS436、MK8628 (OTX-015)、OF-1、OXF BD 02、PFI-1、PFI-3、PF-6405761、RVX-208、TEN-010、XD 14及ZEN003694或其醫藥學上可接受之鹽。在另一實施例中，BET抑制劑為JQ1。 在又一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑以低於治療劑量投與。在再一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑誘導癌細胞之細胞凋亡。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。在一個實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式I化合物。在另一實施例中，式I化合物為化合物A或其醫藥學上可接受之鹽。在又一實施例中，式I化合物為化合物B或其醫藥學上可接受之鹽。在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式II化合物。在另一實施例中，式II化合物為化合物C或其醫藥學上可接受之鹽。在再一實施例中，式II化合物為化合物D或其醫藥學上可接受之鹽。在又一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為土巴他汀A或其醫藥學上可接受之鹽。 在一些實施例中，BET抑制劑係選自由以下組成之群：ABBV-075、BAY1238097、BMS986158、CPI-203、CPI-0610、FT-1101、GSK2820151、GSK525762、I-BET151、I-BET726、I-BET-762、INCB054329、INCB057643、JQ1、MS436、OF-1、MK8628、PFI-3、PF-6405761、RVX-208、TEN-010及ZEN003694或其醫藥學上可接受之鹽。在另一實施例中，BET抑制劑為JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中，醫藥組合進一步包含醫藥學上可接受之載劑。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之式II化合物或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。 在另一態樣中，本文提供包含治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽與治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的醫藥組合。 在其他實施例中，本文提供本文所揭示之用於製造用於治療癌症之醫藥製劑或藥劑的醫藥組合之用途。在一些實施例中，癌症為肺癌。 在另一實施例中，本文中提供醫藥組合，其中HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑一起調配為單一調配物。在又一實施例中，本文中提供醫藥組合，其中HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑各自調配為獨立調配物。 在其他實施例中，本文提供用於藉由投與本文所揭示之醫藥組合而降低患有癌症之個體內之癌細胞的細胞存活率的方法。在另一實施例中，本文提供用於藉由向個體投與本文所揭示之醫藥組合而協同加快患有癌症之個體內癌細胞之細胞凋亡的方法。在再一實施例中，本文提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑、治療有效量之BET抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而減少在患有癌症個體內之循環調節性T淋巴細胞(Treg)之方法。在一些實施例中，Treg為CD4+FOXP3+ Treg。在又一實施例中，本文提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示的治療有效量之醫藥組合而改變患有癌症個體內之抗原呈現複合物的表現之方法。在另一實施例中，本文提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而增加個體內抗原呈現細胞之協同刺激功能以治療癌症之方法。在一些實施例中，呈現蛋白質為CD86，且表現增加。在另一實施例中，呈現蛋白質為MHC II，且表現增加。在另一實施例中，本文提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而活化個體內之T細胞以治療癌症之方法。在一些實施例中，CD69之表現增加。在另一實施例中，T細胞為CD69陽性CD4+ T細胞。在另一實施例中，T細胞為CD69陽性CD8+ T細胞。 在另一態樣中，本文中提供用於藉由向個體投與本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而減少患有癌症個體內的癌細胞之細胞增殖之方法。在再一態樣中，本發明係關於用於上調有需要個體之淋巴細胞功能活性之方法，該等方法包含向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示的治療有效量之醫藥組合。在一些實施例中，淋巴細胞為T細胞。在另一實施例中，功能活性為短暫TCR不依賴性活化(transient TCR-independent activation)。 在前述方法之某些實施例中，癌症為肺癌。在前述方法的另一實施例中，肺癌為非小細胞肺癌、小細胞肺癌或肺類癌腫瘤。在前述方法之另一實施例中，癌症為非小細胞肺癌。 在前述方法之其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑一起調配為單一調配物。在前述方法的另一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑各自調配為獨立調配物。在前述方法之再一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在實質上相同時間投與。在前述方法的又一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在不同時間投與。 在前述方法的一些實施例中，癌症為抗性或難治癒之癌症。 在另一態樣中，本文中提供包含向個體投與包含式I化合物或其醫藥學上可接受之鹽與JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的治療有效量之醫藥組合的用於減少患有癌症個體內之癌細胞之細胞增殖的方法。 在另一態樣中，本文中提供包含向個體投與包含化合物A或其醫藥學上可接受之鹽與JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的治療有效量之醫藥組合的用於減少患有癌症個體內癌細胞之細胞增殖之方法。 在另一態樣中，本文中提供包含向個體投與包含化合物B或其醫藥學上可接受之鹽與JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的治療有效量之醫藥組合的用於減少患有癌症個體內癌細胞之細胞增殖之方法。 在另一態樣中，本文中提供包含向個體投與包含式II化合物或其醫藥學上可接受之鹽與JQ1或其醫藥學上可接受之鹽之治療有效量之醫藥組合的用於減少患有癌症個體內癌細胞之細胞增殖的方法。 在另一態樣中，本文中提供包含向個體投與包含化合物C或其醫藥學上可接受之鹽與JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的治療有效量之醫藥組合的用於減少患有癌症個體內癌細胞之細胞增殖之方法。 在另一態樣中，本文中提供包含向個體投與包含化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及JQ1或其醫藥學上可接受之鹽的治療有效量之醫藥組合的用於減少患有癌症個體內癌細胞之細胞增殖之方法。 其他目標、特徵及優點將自以下詳細描述變得顯而易見。詳細描述及特定實例僅用於說明而給出，此係因為對於熟習此項技術者，本發明精神及範疇內的各種改變及修改將自此詳細描述變得顯而易見。另外，實例證明本發明之原理。
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， 環B為芳基或雜芳基； R1
為芳基或雜芳基，其中之每一者可視情況經OH、鹵基或C1 - 6
烷基取代； 及 R為H或C1 - 6
烷基。 式I之代表化合物包括(但不限於)：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， Rx
及Ry
與各自所連接之碳一起形成環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基或環辛基； 各RA
獨立地為C1 - 6
烷基、C1 - 6
烷氧基、鹵基、OH、-NO2
、-CN或-NH2
；及 m為0、1或2。 式I之代表化合物包括(但不限於)：
(JQ1)， 或其醫藥學上可接受之鹽。在又一實施例中，BET抑制劑為(+)-JQ1。在再一實施例中，BET抑制劑(+)-JQ1稱為JQ1。JQ1為熟知的BET抑制劑(Filippakopoulos, P.等人，Selective Inhibition of BET Bromodomains .
Nature，2010.468
：第1067-73頁；Belkina, A. C.等人，BET domain co - regulators in obesity , inflammation and cancer .
Nature Reviews Cancer，2012.12
(7)：第465-77頁，其兩者以其全文引用之方式併入本文中)。 在一些實施例中，本文所描述之化合物為未溶劑化的。在其他實施例中，化合物中之一或多者呈溶劑化形式。如此項技術中已知，溶劑合物可為醫藥學上可接受之溶劑中之任一者，諸如水、乙醇及其類似者。 儘管以中性形式描繪式I及式II化合物，但在一些實施例中，此等化合物以醫藥上可接受之鹽的形式使用。醫藥組合及組合物
因此，在另一態樣中，本文中提供包含組蛋白去乙醯基酶(HDAC)抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合。 在醫藥組合之一些實施例中，HDAC抑制劑為HDAC6選擇性抑制劑。在特定實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式I化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， 環B為芳基或雜芳基； R1
為芳基或雜芳基，其中之每一者可視情況經OH、鹵基或C1 - 6
烷基取代； 及 R為H或C1 - 6
烷基。 在一些實施例中，式I化合物為化合物A
(A)， 或其醫藥學上可接受之鹽。 在又其他實施例中，式I化合物為化合物B
(B)， 或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑為式II化合物：
或其醫藥學上可接受之鹽， 其中， Rx
及Ry
與各自所連接之碳一起形成環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基或環辛基； 各RA
獨立地為C1 - 6
烷基、C1 - 6
烷氧基、鹵基、OH、-NO2
、-CN或-NH2
；且 m為0、1或2。 在另一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，醫藥組合包含HDAC6選擇性抑制劑化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在實施例中，醫藥組合用於治療個體內之癌症。在某些實施例中，癌症為抗性或難治癒之癌症。 在實施例中，醫藥組合用於治療個體內之癌症，其中個體為未經治療者。 在前述醫藥組合及組合物之其他實施例中，醫藥組合或組合物進一步包含一或多種醫藥學上可接受之載劑。用於治療癌症的方法
在一個態樣中，本發明提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該等方法包含向個體投與治療有效量之包含HDAC抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合。 本文中所考慮的個體通常為人類。然而，個體可為需要治療之任何哺乳動物。由此，本文所描述之方法可應用於人類及獸醫應用兩者。 因而，在一個實施例中，本文提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑以低於治療劑量投與。 在另一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之式I之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之式II之HDAC6選擇性抑制劑及治療有效量之BET抑制劑。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之癌症的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的癌症之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在本文所揭示之方法之一些實施例中，細胞為癌細胞。在另一實施例中，細胞為肺癌細胞。在再一實施例中，細胞為非小細胞肺癌細胞。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之肺癌的方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之肺癌方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物A或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在再一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物B或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體的非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物C或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在又一實施例中，本文中提供用於治療有需要個體之非小細胞肺癌之方法，該方法包含向個體投與治療有效量之化合物D或其醫藥學上可接受之鹽及治療有效量之JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。 在前述方法的一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑誘導癌細胞之細胞凋亡。 在其他實施例中，提供用於藉由投與本文所揭示之醫藥組合而降低患有癌症個體內癌細胞之細胞存活率的方法。 在另一實施例中，提供用於藉由向個體投與本文所揭示之醫藥組合協同增加患有癌症之個體內癌細胞之細胞凋亡的方法。 在再一實施例中，提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑、治療有效量之BET抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而減少在患有癌症個體內之循環調節性T淋巴細胞(Treg)的方法。在一些實施例中，Treg為CD4+FOXP3+ Treg。 在又一實施例中，提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示的治療有效量之醫藥組合而改變患有癌症個體內之抗原呈現複合物的表現之方法。 在另一實施例中，提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而增加個體內抗原呈現細胞之協同刺激功能從而治療癌症之方法。在一些實施例中，呈現蛋白質為CD86，且表現增加。在另一實施例中，呈現蛋白質為MHC II，且表現增加。 在另一實施例中，本提供用於藉由向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而活化個體內之T細胞從而治療癌症的方法。在一些實施例中，CD69之表現增加。在另一實施例中，T細胞為CD69陽性CD4+ T細胞。在另一實施例中，T細胞為CD69陽性CD8+ T細胞。 在另一態樣中，本文中提供用於藉由向個體投與本文所揭示之治療有效量之醫藥組合而減少患有癌症個體內的癌細胞之細胞增殖之方法。 在又一態樣中，本發明係關於用於上調有需要個體之淋巴細胞功能活性的方法。特定言之，本發明係關於用於上調有需要個體之淋巴細胞功能活性，包含向個體投與治療有效量之HDAC6選擇性抑制劑或本文所揭示的治療有效量之醫藥組合之方法。在一些實施例中，淋巴細胞為T細胞。在另一實施例中，功能活性為短暫TCR不依賴性活化。 在前述方法之某些實施例中，癌症為肺癌。在前述方法的另一實施例中，肺癌為非小細胞肺癌、小細胞肺癌或肺類癌腫瘤。在前述方法之另一實施例中，癌症為非小細胞肺癌。 在前述方法的一些實施例中，癌症為抗性或難治癒之癌症。 在前述方法的某些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑係選自由以下組成之群：化合物A、化合物B、化合物C、化合物D、土巴他汀A或其醫藥學上可接受之鹽。在一些實施例中，BET抑制劑為JQ1或其醫藥學上可接受之鹽。投與 / 給藥
在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑(式I或式II化合物)與BET抑制劑同時投與。同時投與通常意謂兩種化合物在正好相同之時間進入患者。然而，同時投與亦包括HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在不同時間進入患者但時間差足夠小以至於第一投與化合物在第二投與化合物進入之前沒有時間在患者身上起作用之可能性。此等經延遲時間通常對應於小於1分鐘，且更通常小於30秒。在一個實例中，其中化合物呈溶液形式，同時投與可藉由投與含有化合物之醫藥組合的溶液來達成。在另一實例中，可採用單獨溶液之同時投與，其中之一種溶液含有HDAC6選擇性抑制劑且其中的另一種含有BET抑制劑。在一個實例中，其中化合物呈固體形式，同時投與可藉由投與含有化合物之醫藥組合的組合物來達成。替代地，同時投與可藉由投與兩種單獨組合物來達成，一種包含HDAC6選擇性抑制劑，且另一種包含BET抑制劑。在另一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在實質上相同時間投與。 在一些實施例中，化合物之醫藥組合在癌症的治療中呈現協同效應(亦即，大於累加效應)。術語「協同效應」係指諸如(例如) HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之兩種藥劑之作用，該等藥劑產生(例如)減緩癌症或其症狀之症狀性發展的效應，該效應大於單獨投與之各藥物之效應的簡單累加。協同效應可例如使用諸如Sigmoid-Emax方程式(Holford, N. H. G.及Scheiner, L. B., Clin. Pharmacokinet. 6: 429-453 (1981))、洛伊相加方程式(equation of Loewe additivity) (Loewe, S.及Muischnek, H., Arch. Exp. Pathol Pharmacol. 114: 313-326 (1926))及中值有效方程式(median-effect equation) (Chou, T. C.及Talalay, P., Adv. Enzyme Regul. 22: 27-55 (1984))之適合方法來計算。上文提及之各方程式可應用於實驗資料以產生幫助評估藥物組合之效應的對應圖表。與上文提及之方程式相關之對應圖表分別為濃度-效應曲線、等效線圖曲線及組合索引曲線。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑不同時投與，但兩種藥劑呈現協同效應。在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑在BET抑制劑之前投與。在其他實施例中，BET抑制劑在HDAC6選擇性抑制劑之前投與。非同時投與之時間差可大於1分鐘、5分鐘、10分鐘、15分鐘、30分鐘、45分鐘、60分鐘、兩個小時、三個小時、六個小時、九個小時、12小時、24小時、36小時、48小時、3天、4天、5天、6天或7天。在其他實施例中，第一投與化合物在第二投與化合物投與之前有時間在患者身上起作用。通常，時間差並不延伸超出第一投與化合物在患者中完成其效應之時間或超出第一投與化合物完全或實質上在患者中消除或失活之時間。在另一實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑在不同時間投與。 在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑一起調配為單一調配物。 在其他實施例中HDAC抑制劑及BET抑制劑各自經調配為單獨調配物。 在一些實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑中的一種或兩種以治療有效量或劑量投與。「治療有效量」為當單獨地向患者投與時有效地治療癌症之HDAC6選擇性抑制劑(式I或式II化合物)或BET抑制劑的量。在給出個例中證明為特定患者之「治療有效量」的量，可能對於類似研究中之疾病或病況治療之患者不為100%有效，儘管此類劑量被熟習從業者認為「治療有效量」。對應於治療有效量之化合物之量很大程度上取決於癌症之類型、癌症之階段、正經治療患者之年齡及其他事實。一般而言，此等化合物的治療有效量在此項技術中為熟知的，諸如提供於上文所引用之支援文獻中。 在其他實施例中，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑中的一種或兩種以低於治療有效量或劑量投與。低於治療有效量為當單獨地向患者投與時隨時間推移HDAC6選擇性抑制劑(式I或式II化合物)或BET抑制劑不完全抑制既定靶向物之生物活性的量。 無論以治療量或低於治療量投與，HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之醫藥組合應在治療癌症中有效。舉例而言，若低於治療量之BET抑制劑之化合物在與式I或式II化合物(HDAC6選擇性抑制劑)組合時可為有效量，則醫藥組合在癌症治療中有效。 在本發明的某些實施例中，醫藥組合及方法包括式I之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑。由此，在一個實施例中，醫藥組合及方法包括化合物A及BET抑制劑。在另一實施例中，醫藥組合及方法包括化合物B及BET抑制劑。在另一實施例中，醫藥組合及方法包括化合物C及BET抑制劑。在又一實施例中，醫藥組合及方法包括化合物D及BET抑制劑。這些實施例呈現協同作用，以使得可使用低於治療量之HDAC6選擇性抑制劑或低於治療量之BET抑制劑。在本發明的某些實施例中，醫藥組合及方法包括式II之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑。 在不同實施例中，取決於所使用之醫藥組合及有效量，化合物之醫藥組合可抑制癌症生長、實現癌症停滯或甚至實現顯著的或完全的癌症消退。 儘管HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之量應導致癌症之有效治療，當經組合時，量對於患者較佳地不具過大毒性(亦即，量較佳地在如由醫療指導原則所建立之毒性限制內)。在一些實施例中，或者為了阻止過大毒性及/或提供癌症的更有效治療，提供對總投與劑量之限制。通常，本文中考慮之量為每天的；然而，本文中亦考慮半天及兩天或三天之循環。 不同劑量方案可用於治療癌症。在一些實施例中，以日劑量(諸如，上文所描述之例示性劑量中之任一者)投與一日一次、兩次、三次或四次持續三天、四天、五天、六天、七天、八天、九天或十天。取決於癌症之階段及嚴重度，較短治療時間(例如，至多五天)可與較高劑量一起採用，或更長治療時間(例如，十或更多天、或數週、或1個月或更長)可與較小劑量一起採用。在一些實施例中，每隔一天投與一日一次或一日兩次劑量。在一些實施例中，各劑量含有作為單一劑量待遞送之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑兩種，而在其他實施例中，各劑量含有作為各別劑量待遞送的HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑。 純形式或適當醫藥組合之HDAC6選擇性抑制劑、BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽或溶劑合物形式可經由此項技術中已知的投與或藥劑之公認模式中之任一者投與。化合物可(例如)經口、經鼻、非經腸(靜脈內、肌肉內或皮下)、體表、經皮、陰道內、膀胱內、腦池內(intracistemally)或經直腸投與。劑型可為(例如)固體、半固體、凍乾粉末或液體劑型，諸如，錠劑、丸劑、軟彈性膠囊或硬明膠膠囊、粉末、溶液、懸浮液、栓劑、噴霧劑或其類似者，較佳地呈適合於精確劑量之簡單投與的單位劑型。特定投投與途徑為經口，尤其其中可根據待治療之疾病之嚴重度調整便利的日劑量方案之途徑。 如上文所論述，醫藥組合之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑可以單一單位劑量或單獨劑型而投與。因此，片語「醫藥組合」包括呈單一劑型或單獨劑型之兩種藥物之組合，亦即，貫穿本申請案所描述的醫藥學上可接受載劑及賦形劑可與單一單位劑量之HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑組合，以及當此等化合物單獨地投與時個別地與HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑組合。 助劑及佐劑可包括(例如)保持劑、潤濕劑、懸浮劑、甜味劑、調味劑、芳香劑、乳化劑及調劑。微生物作用之阻止通常上由各種抗菌劑及抗真菌劑提供。等滲劑亦可包括在內。可注射醫藥形式之長期吸收可由使用藥劑延遲吸收實現。助劑亦可包括潤濕劑、乳化劑、pH緩衝劑及抗氧化劑。 可用包衣及殼(諸如腸溶包衣及此項技術中熟知的其他)來製備固體劑型。其可含有安撫劑(pacifying agents)且可為以延緩方式於腸道之某一部分中釋放活性化合物之組合物。可使用之包埋組合物之實例為聚合物質及蠟。若適當，活性化合物亦可呈具有一或多種上文提及之賦形劑之微囊封形式。 用於經口投與之液體劑型包括醫藥學上可接受之乳液、溶液、懸浮液、糖漿及酏劑。此等劑型係例如藉由將本文所述的HDAC6選擇性抑制劑或BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽及視情況選用之醫藥佐劑溶解、分散等於載劑中以形成溶液或懸浮液而製備。 通常，取決於所欲投與模式，醫藥學上可接受之組合物將含有約1重量%至約99重量%之本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽及99重量%至1重量%之醫藥學上可接受之賦形劑。在一個實例中，組合物將為在約5重量%與約75重量%之間之本文所述之化合物或其醫藥學上可接受之鹽，其餘為合適的醫藥賦形劑。 製備此等劑型之實際方法為熟習此項技術者已知或將顯而易見。參考例如Remington's Pharmaceutical Sciences 第18版(Mack Publishing Company, Easton, Pa., 1990)。套組
在其他實施例中，提供套組。根據本發明之套組包括包含本發明化合物或組合物之封裝。在一些實施例中，套組包含HDAC6選擇性抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽及BET抑制劑或其醫藥學上可接受之鹽。 詞組「封裝」意謂含有本文中所呈現的化合物或組合物之任何容器。在一些實施例中，封裝可為盒或包裹。用於封裝醫藥產品之封裝物質為熟習此項技術者所熟知。醫藥封裝物質之實例包括(但不限於)瓶子、管、吸入器、泵、袋、小瓶、容器、注射器、瓶子，及任何適合於所選擇之調配物及所欲投與及治療模式的封裝物質。 套組亦可含有並不含於封裝內但附接至封裝外部之物件，例如吸液管。 套組可進一步含有用於向患者投與本發明之化合物或組合物的說明書。套組亦可包含由諸如美國食品與藥物管理局之調控機構審批通過的本文中化合物之用途的說明書。套組亦可含有化合物之標記或產品插入件。封裝或任何產品插入件可自身由調控機構審批通過。套組可包括封裝中之呈固相或液相狀態(諸如所提供之緩衝液)的化合物。套組亦可包括用於製備用以進行該等方法之溶液的緩衝液及用於將液體自一個容器轉移至另一個容器的吸液管。實例
已在下文中出於說明之目的闡述實例且描述某些特定實施例。。然而，申請專利範圍之範疇不以任何方式受本文中所闡述之實例限制。對所揭示實施例之各種改變及修改對熟習此項技術者將為顯而易見的，且可在不脫離本發明之精神及所附申請專利範圍之範疇的情況下作出此類改變及修改(包括(但不限於)與本發明之化學結構、取代基、衍生物、調配物及/或方法相關之彼等)。本文中之流程之結構中的變數之定義與本文中所呈現之式中之對應位置之彼等相稱。 式I化合物的合成將提供於國際專利申請案第PCT/US2011/021982號(化合物B)及第PCT/US2014/059238號(化合物A及B)中，該等申請案以其全文引用之方式併入本文中。式II化合物之合成(化合物C及D)將提供於第PCT/US2011/060791號中，該申請案以其全文引用之方式併入本文中。實例 1 ： 2 -( 二苯胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 A ) 之合成 
反應流程 
中間物 2 之合成 ：
將苯胺(3.7 g，40 mmol)、化合物1
(7.5 g，40 mmol)及K2
CO3
(11 g，80 mmol) 於DMF (100 ml)中之溶液的混合物在N2
下在120℃下脫氣且攪拌隔夜。反應混合物冷卻至室溫且用EtOAc (200 ml)稀釋，隨後用飽和鹽水(200 ml × 3)洗滌。有機層經Na2
SO4
分離且乾燥，蒸發至乾燥且由矽膠層析法(石油醚/EtOAc = 10/1)純化以得到呈白色固體狀之所需產物(6.2 g，64%)。中間物 3 之合成 ：
將化合物2
(6.2 g，25 mmol)、碘苯(6.12 g，30 mmol)、CuI (955 mg，5.0 mmol)、Cs2
CO3
(16.3 g，50 mmol)於TEOS (200 ml)中之溶液的混合物脫氣且用氮氣吹掃。在140℃下攪拌所得混合物14小時。冷卻至室溫後，殘餘物用EtOAc (200 ml)稀釋。添加95% EtOH (200 ml)及矽膠上之NH4
F-H2
O [50 g，由將NH4
F (100g)於水(1500 ml)中之溶液添加至矽膠(500 g，100至200目)來預製備]，且所得混合物在室溫下保持2小時。固化材料經過濾且用EtOAc洗滌。過濾物蒸發至乾燥，且殘餘物由矽膠層析法(石油醚/EtOAc = 10/1)純化，以得到黃色固體(3 g，38%)。中間物 4 之合成 ：
將2N NaOH (200 ml)添加至化合物3
(3.0 g，9.4 mmol)於EtOH (200 ml)中之溶液中。在60℃下攪拌混合物30分鐘。在蒸發溶劑之後，溶液用2N HCl中和，以得到白色沈澱物。懸浮液用(2 × 200 ml) EtOAc萃取，且有機層經分離、用水(2 × 100 ml)、鹽水(2 × 100 ml)洗滌且經Na2
SO4
乾燥。移除溶劑產生棕色固體(2.5 g，92%)。中間物 6 之合成 ：
化合物4
(2.5 g，8.58 mmol)、化合物5
(2.52 g，12.87 mmol)、HATU (3.91 g，10.30 mmol)及DIPEA (4.43 g，34.32 mmol)之混合物在室溫下攪拌隔夜。在過濾反應混合物之後，過濾物蒸發至乾燥，且殘餘物由矽膠層析法(石油醚/EtOAc = 2/1)純化，以得到棕色固體(2 g，54%)。2 -( 二苯胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 A ) 之合成 ：
化合物6
(2.0 g，4.6 mmol)、氫氧化鈉(2N，20 ml)於MeOH (50 ml)及DCM (25 ml)中之溶液的混合物在0℃下攪拌10分鐘。羥胺(50%) (10 ml)冷卻至0℃且添加至混合物中。所得混合物在室溫下攪拌20分鐘。在移除溶劑之後，用1M HCl中和混合物，得到白色沈澱物。粗產物經過濾且由製備HPLC純化，以得到白色固體(950 mg，48%)。實例 2 ： 2 -(( 2 - 氯苯基 )( 苯基 ) 胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 B ) 之合成 
反應流程 ： 
中間物 2 之 合成 ：
參見實例1中的中間物2
之合成。中間物 3 之合成 ：
化合物2
(69.2 g，1當量)、1-氯-2-碘苯(135.7 g，2當量)、Li2
CO3
(42.04 g，2當量)、K2
CO3
(39.32 g，1當量)、Cu (1當量，45 µm)於DMSO (690 ml)中之溶液的混合物經脫氣且用氮氣吹掃。所得混合物在140℃攪拌。反應物之處理以93%之產率產生化合物3。中間物 4 之 合成 ：
參見實例1中的中間物4之合成。中間物 6 之 合成 ：
參見實例1中的中間物6之合成。2 -(( 2 - 氯苯基 )( 苯基 ) 胺基 )- N -( 7 -( 羥胺基 )- 7 - 側氧基庚基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 B ) 之合成 ：
參見實例1中的化合物A之合成。實例 3 ： 2 -(( 1 -( 3 - 氟苯基 ) 環己基 ) 胺基 )- N - 羥基嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 C ) 之合成 
中間物 2 之合成：
向化合物1
(100 g，0.74 mol)於無水DMF (1000 ml)中之溶液中添加1,5-二溴戊烷(170 g，0.74 mol)。在反應物在冰浴中冷卻時逐滴添加NaH (65 g，2.2當量)。所得混合物在50℃下劇烈攪拌隔夜。懸浮液小心地用冰水淬滅且用乙酸乙酯(3 × 500 ml)萃取。經合併之有機層經濃縮以得到粗產物，由急驟管柱層析法將其純化以得到呈淺色固體狀之化合物2 (100 g，67%)。中間物 3 之 合成：
將化合物2
(100 g，0.49 mol)於PPA (500 ml)中之溶液在110℃下加熱約5小時至6小時。完成後，所得混合物使用飽和NaHCO3
溶液小心地調節至約8至9之pH。所得沈澱物經收集且用水(1000 ml)洗滌，以得到呈白色固體狀之化合物3 (95 g，87%)。中間物 4 之 合成 ：
向化合物3
(95 g，0.43 mol)於n-BuOH (800 ml)中之溶液中添加NaClO (260 ml，1.4當量)。隨後在0℃下添加3N NaOH (400 ml，2.8當量)，且反應物在室溫下攪拌隔夜。所得混合物用EA (2 × 500 ml)萃取，且經合併的有機層用鹽水洗滌。在真空中移除溶劑，以得到由用HCl鹽處理而進一步純化以得到呈白色粉末狀之化合物4
(72 g，73%)之粗產物。中間物 6 之合成 ：
向化合物4
(2.29 g，10 mmol)於二噁烷(50 ml)中之溶液中添加化合物5
(1.87 g，1.0當量)及DIPEA (2.58 g，2.0當量)。混合物在110至120℃下加熱隔夜。所得混合物直接地在矽膠管柱上純化，以得到呈白色固體狀之偶合產物，化合物6
(1.37 g，40%)。2 -(( 1 -( 3 - 氟苯基 ) 環己基 ) 胺基 )- N - 羥基嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 C ) 之合成 ：
向化合物6
(100 mg，0.29 mmol)於MeOH/DCM (10 ml，1:1)中之溶液中添加含50% NH2
OH之水(2 ml，盈餘)。隨後在0℃下添加含飽和的NaOH之MeOH (2 ml，盈餘)，且反應物經攪拌3小時至4小時。完成後，所得混合物經濃縮且使用2 N HCl酸化以達到4至5的pH。沈澱物經收集且用水(10 mL)洗滌以移除盈餘NH2
OH。乾燥沈澱物得到呈白色粉末狀之2-((1-(3-氟苯基)環己基)胺基)-N-羥基嘧啶-5-甲醯胺(70 mg，73%)。實例 4 ： N - 羥基 - 2 -(( 1 - 苯基環丙基 ) 胺基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 D ) 之合成 
反應流程 
中間物 2 之 合成 ：
將化合物1
、苯甲腈(250 g，1.0當量)及Ti(OiPr)4
(1330 ml，1.5當量)於MTBE (3750 ml)中之溶液在氮氣氛圍下冷卻至約‑10℃至-5℃。EtMgBr (1610 ml，3.0 M，2.3當量)在60分鐘時段內逐滴添加，在此期間反應物之內部溫度保持低於5℃。允許反應混合物升溫至15℃至20℃達1小時。BF3
醚(1300 ml，2.0當量)在60分鐘時段內逐滴添加，同時內部溫度保持低於15℃。反應混合物在15℃至20℃攪拌1小時至2小時，且在存在較低含量苯甲腈時停止。1N HCl (2500 ml)在保持內部溫度低於30℃時逐滴添加。逐滴添加NaOH (20%，3000 ml)以使得pH至約9.0，同時仍保持溫度低於30℃。反應混合物用MTBE (3 L × 2)及EtOAc (3 L × 2)萃取，且經合併之有機層使用無水Na2
SO4
乾燥且在減壓下濃縮(低於45℃)，得到紅色油狀物。MTBE (2500 ml)經添加至油狀物以得到澄清溶液，且一旦使用乾燥HCl氣體鼓泡後，固體沈澱。此固體在真空中過濾且脫水產生143 g化合物2。中間物 4 之 合成 ：
化合物2
(620 g，1.0當量)及DIPEA (1080 g，2.2當量)溶解於NMP (3100 ml)中且攪拌20分鐘。添加化合物3
(680 g，1.02當量)，且反應混合物經加熱至約85℃至95℃達4小時。使溶液緩慢冷卻至室溫。將此溶液倒入H2
O (20 L)中，且許多固體在強攪拌之情況下自溶液沈澱出來。過濾混合物，且濾餅在減壓下在50℃下脫水24小時，產生896 g化合物4
(固體，86.8%)。N - 羥基 - 2 -(( 1 - 苯基環丙基 ) 胺基 ) 嘧啶 - 5 - 甲醯胺 ( 化合物 D ) 之合成 ：
MeOH (1000 ml)之溶液在攪拌情況下冷卻至約0℃至5℃。添加NH2
OH HCl (1107 g，10當量)，隨後謹慎的添加NaOCH3
(1000 g，12.0當量)。所得混合物在0℃至5℃下攪拌一個小時，且過濾該混合物以移除固體。將化合物4
(450 g，1.0當量)一次性添加至反應混合物，且在10℃下攪拌兩個小時直至化合物4
耗盡。反應混合物通過添加HCl (6N)而調節至約8.5至9之pH，產生沈澱物。在減壓下濃縮混合物。在劇烈攪拌之情況下將水(3000 ml)添加至殘留物，且沈澱物由過濾收集。產物在烘箱中在45℃脫水隔夜(340 g，79%產率)。實例 5 ： HDAC 酶分析
用於測試的化合物在DMSO中稀釋至50倍最終濃度，且製得10.3倍稀釋系列。化合物在分析緩衝液(50 mM HOPES，pH 7.4，100 mM Kill，0.001% Tween-20，0.05%鹼，20 μΜ TEC)中稀釋至6倍其最終濃度。HDAC酶(購自BPS Biosciences)在分析緩衝液中稀釋至1.5倍其最終濃度。0.05 μΜ最終濃度的二肽基質及胰蛋白酶在6倍其最終濃度之分析緩衝液中稀釋。用於此等分析之最終酶濃度為3.3 ng/ml (HDAC1)、0.2 ng/ml (HDAC2)、0.08 ng/ml (HDAC3)及2 ng/ml (HDAC6)。所用最終基質濃度為16 μΜ (HDAC1)、10 μΜ (HDAC2)、17 μΜ (HDAC3)及14 μΜ (HDAC6)。五μl化合物及20 μl酶雙份添加至黑色不透光384孔培養盤之孔。酶及化合物一起在室溫下培養10分鐘。五μl基質添加至各孔，將盤搖晃60秒且放置於Victor 2 μl盤讀取器中。監測螢光之發展60分鐘，且計算反應的線性比率。使用Graph Pad Prism由四個參數曲線擬合判定IC50
。實例 6 ： PBMC 細胞及 NSCLC 細胞 中之 HDAC 抑制劑 及 T 淋巴細胞之活化
以下實例之目的為單獨評估HDAC6抑制劑化合物A之臨床前活性及在非小細胞肺癌細胞株中將化合物A與JQ1 (BET抑制劑)組合之可能性。在此等實例中，利用(+)-JQ1 (在實例中稱作JQ1)。I . HDAC 抑制劑 對來自健康供體之外周血液單核細胞 ( PBMC ) 的 效應
HDAC抑制導致具有免疫能力的動物模型中之腫瘤生長停滯。I類及II類HDAC抑制對白細胞之效應使用自健康供體獲得的外周血液單核細胞(PBMC)研究。PBMC使用化合物A培養，且結果與具有HDAC6之變化的選擇率之HDAC抑制劑的板進行比較。此板包括HDAC6選擇性抑制劑化合物B、化合物C、化合物D及土巴他汀A；及HDAC1/2/3 (I類HDAC)選擇性抑制劑恩替諾特(MS-275) (表1)。表 1 .
使用健康供體PBMC所測試之HDAC抑制劑及HDAC生物化學分析資料。
PBMC使用HDAC抑制劑培養24小時，其後T細胞亞群之頻率由FACS評估。DMSO用作對照。值得注意的是，使用此等HDAC抑制劑培養24小時之細胞的存活率很大程度上相似(圖1A)。關於細胞亞型，CD4+FOXP3-及CD8+習知T細胞之頻率由此等藥物不明顯地影響(圖1B)。PBMC內的CD4+FOXP3+ Treg之百分比在使用化合物A或化合物B培養時最明顯地減小，而使用化合物D或恩替諾特仍呈現該效應(圖1C)。有趣的是，高度選擇性HDAC6抑制劑化合物C及土巴他汀A不明顯地影響Treg頻率，表明由諸如化合物A、化合物B及恩替諾特之化合物的I類HDAC抑制有助於Treg頻率中之所觀測降低。II . 化合物 A 或恩替諾 特對非小細胞肺癌細胞之效應
接著，自非小細胞肺癌(NSCLC)患者獲得的PBMC或自離散的剛經切除之腫瘤採集之塊體單細胞懸浮液使用2.5 µm化合物A或2.5 µm恩替諾特培養24小時，其後CD3-CD14+單核細胞或CD45+CD68+CD11b+腫瘤巨噬細胞之表型對應地由FACS評估。DMSO用作對照。對細胞培養基內的白細胞亞群之流式細胞量測術分析揭露化合物A實質上減小相對於患者PBMC (圖2A，p = 0.04)中及患者腫瘤細胞(圖2B，p = 0.05)中之DMSO治療的Treg比例，類似在健康供體PBMC (圖1C)中觀測之比例。用化合物A治療亦減小相對於患者PBMC (圖2A)中之恩替諾特治療的Treg比例。III . 化合物 A 或恩替諾 特之額外效應
與此等觀測相似，CD69活化標記物之表現實質上在患者(圖3A，p = 0.003；圖3B，p = 0.01)及健康供體PBMC培養基(圖3C，**指示p值 0.001；圖3D，*指示p值 0.05)兩者中在化合物A存在但恩替諾特不存在的情況下在習知CD8+及CD4+ T細胞經上調，表明經增加活化特徵由化合物A促進(圖3E)。 HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)降低CD4+FOXP3+ Treg之頻率且促進外周及腫瘤相關T淋巴細胞之短暫性活化。 實例7：HDAC6選擇性抑制劑及APC之功能性改變 HDAC6抑制可影響涉及調節發炎性細胞激素產生的機制中之APC的功能性改變。研究HDAC6選擇性抑制劑化合物A對APC的關於表型及功能之效應。特定言之，研究健康個體及NSCLC患者的外周血液中之CD14+CD11b+單核細胞之表型或解聚NSCLC腫瘤內之CD14CD68+CD11b+巨噬細胞之表型。在使用化合物A培養24小時後，CD14+單核球部分上調MHC II類分子以及CD86之表現但不上調CD80之表現、上調與經增加之APC激活能力相關之表型改變。對比而言，添加DMSO或恩替諾特兩者都不上調此等蛋白質之表現(圖4A；p = 0.04)。當與化合物A一起培育時，在2-D腫瘤細胞培養基內之CD14-CD68+CD11b+巨噬細胞(圖4B)上及來自健康供體獲得的PBMC (圖4C)中看見MHC II類及CD86的經增加表現之相似圖案。此發現證明化合物A對人類單核細胞性細胞及腫瘤相關巨噬細胞之獨特調節效應，且表明其促進將支援增強型抗原呈現及共刺激性能之表型改變。支援此概念，經曝露化合物A CD14+單核細胞在誘導混合淋巴細胞反應中之同種異體T細胞增殖性反應上為優良的(圖4D)。患者PBMC內已使用化合物A或恩替諾特培養24小時之經純化CD14+細胞在重組人類IL-2的20 IU/mL存在下與自同種異體供體PBMC之細胞跟蹤紫色(CTV)標記經純化T細胞一起培育6天。 HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)促進在人類單核細胞及腫瘤相關巨噬細胞上之MHC及共刺激分子的經增加表現且增加其功能以刺激更大T細胞增殖。 實例8：HDAC6選擇性抑制劑及腫瘤相關免疫細胞 腫瘤相關免疫細胞在使腫瘤進展之病程及抗腫瘤免疫成形中為重要的。研究HDAC6選擇性抑制劑對表型及功能改變，尤其在腫瘤抗原的環境中之效應。特定言之，研究HDAC6選擇性抑制劑對自發地在含有活化Kras G12D
突變及並行p53
缺失(特指為KP)之完全具有免疫能力之基因工程改造小鼠，或具有T790M/L858R EGFR突變(特指為TL)之彼等小鼠中發展的免疫細胞浸潤性肺腺癌之效應。自發地在含有LSL-KrasG12D/p53f / f
(KP)或LSL-EGFR (TL)轉基因之小鼠中發育的肺腫瘤(如由MRI確認)在經鼻內傳遞腺病毒Cre重組酶後在用化合物A或媒劑治療7天之後切除。產生肺腫瘤節結之單細胞懸浮液且進行FACS分析以分析自KP及TL小鼠兩者隔離之腫瘤中的CD45+免疫細胞亞群之比例、表型及功能。 患有現有腺癌之小鼠在由全面多參數流式細胞量測術評估離散腫瘤之前每天使用化合物A治療一次持續七天。在此短期治療下，觀測腫瘤浸潤性CD8+ T細胞之頻率的適當提高及淋巴細胞當中的CD4+Foxp3+ Treg細胞的顯著減少，使得所治療腫瘤中之CD8:Treg比率之顯著提高(圖5A至圖5C)。CD8:Treg比率之此等增大常常與增強型抗腫瘤反應相關。儘管不存在關於抑制性受體分子表現的實質性表型改變(圖5D至圖5G)，但使用化合物A治療之小鼠中之腫瘤浸潤性CD8+ T細胞顯現CD69活化標記物之經增加表現量，且在與媒劑對照組中的等效細胞進行比較(圖5H)時，證明分泌效應細胞介素IFN-γ以及TNF-ɑ之增強的性能，接著離體刺激。 另外，類似於化合物A，化合物B增加腫瘤中之CD8:Treg比率、增加CD8 T細胞之活化(每經增加CD69活化標記物)，且增加MHC II在腫瘤相關巨噬細胞上之表現(圖5I)。將使用化合物B或媒劑治療7天的KP小鼠之肺腫瘤節結之單細胞懸浮液染色，接著進行FACS分析以分析CD45+免疫細胞亞群之比例、表型及功能。符合化合物A的發現，在與自媒劑組之腫瘤衍生的等效細胞相比時，單細胞RNA-Seq揭露與包括Cd69 、 Sell ( Cd62L ) 、 Cd44
及Prf1 ( 穿孔蛋白 )
之T細胞活化及效應功能相關之基因數目在來自用化合物A治療之KP小鼠之腫瘤浸潤性T細胞中上調(圖5N)。將使用化合物A或媒劑治療7天的KP小鼠及TL小鼠之肺腫瘤節結之單細胞懸浮液染色，接著進行FACS分析以分析CD45+免疫細胞亞群之比例、表型及功能。骨髓細胞群當中，CD11c+CD11blo
腫瘤相關巨噬細胞(TAM；圖5J)示出MHC II類以及共刺激分子CD86之明顯提高的表現量(圖5K至圖5M)。支援此表型，由單細胞RNA定序所分析之經化合物A曝露的TAMS示出與MHC II類表現相關之包括Cd74
及H2 - Aa 之
關鍵基因相對於其對照小鼠中的對應物之較高表現(圖5N)。 由此，與活體外
觀測一致，此等發現指示在化合物A治療後，腫瘤浸潤性巨噬細胞經歷類似於呈更成熟狀態且周圍T細胞顯示更活化的/效應特徵之APC之改變。化合物A調介對免疫細胞亞群的陽性免疫動態及表型改變。當作為單一藥劑投與時，化合物A僅產生在含有具有並行Kras
突變及p53
缺陷或突變EGFR之肺腺癌之具有免疫能力的基因工程改造小鼠中之腫瘤生長之邊緣延遲(圖6，資料未圖示)。具有大約200 mm3
的腫瘤負擔之KP小鼠每天一次腹膜內僅注入化合物A、僅JQ1或兩種藥物之組合。腫瘤生長由MRI每週監測。 HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)促進有助於NSCLC模型中之腫瘤浸潤性T細胞激活的表型改變。 實例9：在非小細胞肺癌細胞中與JQ1組合之化合物A HDAC6選擇性抑制劑與互補免疫調節劑的組合治療可實現此等NSCLC模型中更大水平之腫瘤生長之基於免疫的對照。預先展示JQ1以具有KP小鼠中之抗腫瘤效應，部分由於下調MYC及誘導腫瘤細胞中之細胞凋亡。自免疫細胞之透視圖，不同於習知CD8+ T細胞，曝露於JQ1的Treg展示PD-1及Foxp3之經降低的表現量，且與其未暴露的對應物相比更低抑制性(圖7A至圖7C)。此等JQ1效應在與化合物A之免疫調節效應組合時可促進有利於腫瘤浸潤性T細胞之更強刺激的腫瘤微環境及經增強抗腫瘤反應。T細胞與野生型小鼠之脾隔離且分類成CD3+CD25- (T細胞)或CD3+CD4+CD25hi (Treg)亞群且隨後在JQ1 (1 µM)存在或不存在的情況下培養。用100 IU/mL之重組IL-2補充培養基。細胞在培養兩天之後經洗滌，且其表型由FACS評估。對於圖7C中所示之CSFE稀釋而言，自原始小鼠的脾獲得之2×105
CFSE標記的純化T細胞與1.0×105
絲裂黴素C治療、充當APC之T耗乏脾細胞共培養。0.5 µg可溶抗CD3隨後與分級數目個Treg一起添加至各孔(由Treg:T細胞比率指示)。 在長期功效研究中，使用化合物A及/或JQ1來治療攜帶肺腺癌之小鼠。向攜帶腫瘤、免疫強的小鼠投與長期劑量之化合物A及/或JQ1，且腫瘤生長動力學在治療組比媒劑治療對照組之間評估。特定言之，在缺乏或不缺乏對抗CD4或CD8之抗體的情況下，具有大約200 mm3
之腫瘤負擔的KP小鼠每天一次腹膜內注入僅化合物A、僅JQ1或兩種藥物之組合。腫瘤生長由MRI每週監測。KP小鼠中，化合物A或JQ1單藥療法分別使得腫瘤生長中之邊緣或適中遲緩，但兩種藥劑之組合治療導致腫瘤生長的顯著停滯(圖6及圖8A)。此等效應大部分取決於CD8+及CD4+ T細胞，因為兩種藥劑之組合的情況下所提及之腫瘤生長停滯在結合治療方案中之耗乏CD8或CD4之抗體後消除(圖8A)。另外，在與單一藥劑治療進行比較時，在與化合物A及JQ-1治療的醫藥組合情況下出現腫瘤細胞中減少的ki67表現及增加的cascape-3表現。特定而言，用媒劑、化合物A、JQ1或化合物A及JQ1之組合治療KP小鼠1週，且接著一個較小肺部分固定於10%福馬林
(formalin
)中。此導致在組合兩種藥劑後腫瘤細胞之經減少增殖及經增加細胞凋亡(圖8B)。此外，組合療法與僅任一藥劑相比導致更長無進展存活率(圖8C)，表明JQ1與化合物A協同以驅動T細胞調介抗腫瘤反應。類似於KP小鼠，由標記此等模型中之每一者中之腫瘤生長的抑制證明，組合在攜帶突變EGFR (TL)肺腫瘤以及路易肺(Lewis Lung)癌瘤之小鼠中亦有效(圖8D及圖8E)。具有大約200 mm3
之腫瘤負擔的TL小鼠每天一次腹膜內注入化合物A及JQ1之組合，且腫瘤體積由MRI來量測(圖8D)。路易肺癌瘤(LLC)細胞(每植入500 k細胞)以每小鼠1植入而植入C57BL/6 (B6)小鼠中。在植入之後的三天，針對如圖8E中所指示之媒劑、JQ1及/或化合物A治療將小鼠任意分組成每組5隻。腫瘤每週量測兩次，且腫瘤體積由0.5*L*W*W計算。此等資料表明此組合方法之治療性益處延伸超出由GEMM中之驅動基因突變的異位表現驅動至表徵為自發發展之彼者及至黑素瘤之肺腺癌。 腫瘤節結的免疫分析進一步揭露相對於單一藥劑治療，用兩種藥劑之組合治療之KP小鼠之淋巴細胞浸潤性腫瘤大概由於高度減少之Treg部分含有明顯較高CD8:Treg比率(圖9A及圖9B)。針對免疫剖析，小鼠群在4至6週的治療之後處死，且腫瘤細胞懸浮液進行FACS分析。CD8+ T細胞由CD69之經增加表現證明更活化(圖9C)。另外，自用所指示藥物治療的小鼠之腫瘤隔離之免疫細胞在高基氏(golgi)栓塞的存在下離體刺激6小時。此等腫瘤浸潤性CD8+ T細胞證明分泌效應細胞介素IFN-γ之經增加的性能以及如由CD107a染色所指示的經增加之脫粒(圖9D及圖9E)。細胞懸浮液自腫瘤節結產生，該等腫瘤節結自用JQ1及/或化合物A治療之小鼠切除，該等節結分類成三個群：CD25-CD3+ T細胞、CD45-Epcam+腫瘤細胞及CD11blo
CD11c+ TAM。等效數目個此等群中之每一者在腫瘤細胞裂解液存在下共培養兩天。在自經化合物A及/或JQ1治療小鼠之腫瘤節結經分類的等效數目個T細胞、TAM及EpCam+腫瘤細胞與腫瘤細胞裂解液一起共培養時，在自經雙藥劑治療小鼠之腫瘤隔離的T細胞存在下觀測到較高比例之腫瘤細胞死亡(圖9F)。此證明組合治療產生腫瘤浸潤性T細胞之較大腫瘤殺滅可能性。關於TAM，僅化合物A治療或與JQ1組合之化合物A治療明顯地促進MHC II類分子及CD86之上調(圖9G及圖9H)。一起採用，此等發現證明HDAC6選擇性抑制劑化合物A與溴結構域抑制劑JQ1組合具有經協同以強化穩固免疫介導性抗腫瘤反應之免疫調節效應。亦即，BET溴結構域抑制劑(JQ1)與HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)增強腫瘤生長之免疫依賴性抑制。實例 10 ： 其他方法
小鼠 先前已描述含有Kras +/ LSL - G12D Trp53L/ L
(KP)或EGFRLSL-T790M /L858R
(TL)之基因工程改造小鼠(DuPage，M.，A.L. Dooley及T. Jacks，Conditional mouse lung cancer models using adenoviral or lentiviral delivery of Cre recombinase 。
Nat Protoc，2009.4
(7)：第1064-72頁)。對於肺腫瘤誘導，小鼠在5至6週齡時經鼻內接收1×106
cfu cre編碼腺病毒。腫瘤形成(通常在接種後6至8週)且體積由MRI確認，且使用3D切片機軟體定量。C57BL/6小鼠購自Taconic Farms (Bejing, China)。全部小鼠在無特定病原體條件下保持。藥物、抗體及試劑
化合物A (瑞科諾他)由Acetylon Pharmaceuticals (Boston, MA)提供。化合物A以10% DMSO及90%之5%右旋糖調配，且每天以50 mg/kg經腹膜內投與至小鼠。土巴他汀自APExBIO (Houston, TX)獲得。土巴他汀以10% DMSO及90%之0.9%生理食鹽水調配，且每天以25 mg/kg經腹膜內投與至小鼠。JQ1由James Bradner (Dana Farber Cancer Institute, Boston, MA)友情提供。JQ1以10% DMSO及90%的10% 2-羥丙基β-環糊精(Sigma)調配，且每天以25 mg/kg經腹膜內投與至小鼠。媒劑對照藉由將DMSO稀釋至相關藥物媒劑中來製備。抗CD4 (GK1.5)、抗CD8 (53-6.72)及大鼠IgG (LTF-2)購自BioXcell。小鼠在用化合物A及JQ1之組合治療之前連續兩日第一次投與抗體，且接著使用抗體每週兩次以400 μg/小鼠/次經腹膜內給藥。相關細胞類型的耗乏由流式細胞量測術在使用自尾靜脈獲得之外周血液的第二次給藥之後一天確認。用於流式細胞量測分析的研究之小鼠及人類抗體購自Biolegend、Ebioscience及BD pharmingen。重組人類細胞介素IL-2、IL-4及GM-CSF全部購自peprotech (NJ)。 腫瘤剖析及流式細胞量測術 為產生細胞懸浮液，腫瘤節結自KP及TL小鼠之肺切除且切割成小片，隨後在含有100 U/ml膠原蛋白酶類型IV (Invitrogen)及50 μg/ml DNA酶I (Roche)之RPMI-1640/5% FBS緩衝液中在37℃下進一步分解45分鐘。在培育之後，細胞用紅血球裂解緩衝液處理，且經由70 µm細胞過濾器過濾。在離心之後，細胞小球再懸浮於1×PBS/2% FBS中。對細胞進行計數，且針對PBS + 2% FBS中之表面標記物，將約0.5-1×106
個細胞在4℃下染色15分鐘。使用根據製造商的說明書之Foxp3染色緩衝液對Foxp3、Ki67、CTLA-4及Bcl-2進行胞內染色，而cytofix/cytoperm套組(BD Bioscience)用於胞內細胞介素染色。簡言之，針對包括CD4、CD8、CD3之表面標記物對細胞進行染色，隨後進行胞內染色，使用PE結合之抗IFN-γ、BV421結合之抗TNF-α、APC結合之IL-2、FITC結合之穿孔蛋白及CD107a(其中所示)，或同型匹配之mAbs，在滲透及固定之後。在全部染色樣本中，死亡細胞使用存活/死亡可固定的死亡細胞染色套組(Invitrogen)排除。細胞在LSR Fortessa (BD Biosciences)上獲得且使用flowjo軟體(Treestar)分析。用於FACS分析之閘控策略在圖10中展示。 細胞純化及活體外研究 外周血液單核細胞(PBMC)由菲科爾梯度(Ficoll gradient)自由健康供體及在IRB審批通過機構協定下同意的患者獲得之新鮮或凍結血液樣本隔離。在凍結時，PBMC解凍且在37℃下放置於10%完全培養基(用10%混合人類血清補充之RPMI 1640，100 U/mL青黴素，100 U/mL鏈黴素及2 mM L麩醯胺酸)中6小時，其後細胞(0.5×106
)使用化合物A (2.5 µm)、恩替諾特(2.5 µm)或JQ1 (1 µm)培養24小時或72小時。細胞隨後經洗滌且由FACS進行表型分析。在一些實驗中，此等培養基使用在純化之後自全PBMC之經純化CD14+單核細胞或CD3+ T細胞進行。 對於T細胞增殖分析，T細胞由陽性選擇使用T細胞增濃套組(Miltenyi Biotec)遵循製造商的說明書自PBMC隔離。細胞通常為約90%純度。純化T細胞隨後使用2.5 μM CFSE或細胞跟蹤紫色(CTV)在37℃下標記7分鐘。細胞使用RPMI+10% FBS洗滌三次、加以計數及用作應答細胞。由陽性選擇使用CD14微珠自患者PBMC隔離之經純化CD14+細胞使用化合物A或恩替諾特培養24小時，其後細胞在與在混合淋巴細胞反應中之同種異體T細胞共培養之前洗滌三次。 對於胞內細胞介素檢測分析，來自經治療或對照小鼠的腫瘤之免疫細胞如先前所描述在菲科爾梯度分離之後得到。1×106
個細胞在37℃下使用PMA (50 ng)及離子黴素(Ionomycin) (500 ng)培養6小時，且GolgiPlug (BD Pharmingen)在培養之最後5個小時添加。對於利用人類PBMC之等效分析，於分析之前以類似方式刺激0.5×106
個細胞。腫瘤浸潤性 TAM 及 T 細胞 之單細胞 RNA 定序
腫瘤相關巨噬細胞(TAM；CD45+CD11c+CD11blo
)及CD45+CD3+CD25lo/-
T細胞由FACS分類分類成含有具有自腫瘤組織分離的重組核糖核酸酶抑制劑(Life Technologies)的50 µl之1× PBS之96孔培養盤。簡言之，腫瘤細胞懸浮液在FcγR封鎖之後使用存活/死亡可固定的染料培育，且隨後使用對抗CD45、CD3、CD8、CD11b及CD11c之抗體染色。智慧型Seq2庫由Broad Technology Labs來製備且由Broad Genomics Platform定序。統計分析
統計顯著性由用於兩組之間的對比之史都登氏(Student's) t測試或用於使用GraphPad Prism軟體多組比較之單因子變異數分析評估。P
＜ 0.05值視為在統計學上顯著(*)，P
＜ 0.01值視為極顯著(**)，且P
＜ 0.001值視為高度顯著(***)。以上實例之概述
上文之實驗證明恩替諾特、1類HDAC選擇性藥劑僅部分再現化合物A (具有對抗HDAC1/2/3之弱活性的HDAC6選擇性)之效應中之一些。由此，化合物A之所觀測免疫調節效應很可能為其對HDAC6及1類HDAC的相對抑制活動之獨特及出人意料的特徵。 化合物A具有精細調節與抗原呈現相關之免疫事件之可能性。在病理或疾病環境中，不成熟的專業抗原呈現細胞(APC)在進行表型改變至更成熟狀態時必須「獲取(pick up)」、處理及呈現相關抗原。當以此狀態呈現時，由於MHCII類及共刺激分子之其表現中之增加，其具有增強型抗原呈現及T細胞激活能力。在化合物A治療肺帶有腫瘤之小鼠後即刻觀測腫瘤相關巨噬細胞(TAM)時，MHC II類以及共刺激分子CD86之經增加的表現由此符合化合物A充當促進幫助共刺激信號的經改良之傳遞及抗原之呈現的表型改變之唯一調節藥劑之概念。支援此點的是來自患者PBMC之經化合物A曝露的CD14+單核細胞在驅動同種異體反應性T細胞增殖上較好的發現。此大部分為自外來MHC分子之T細胞接合衍生的刺激以及呈現於APC上之共刺激之程度的功能。此外，觀測到的磷醯基STAT3之增加及在經化合物A曝露的T細胞上之CD69表現亦表明其可以取決於STAT3活化之方式對T細胞具有直接激活效應。實際上，已經展示STAT3之活化以誘導CD69表現，且因此，誘導同種異體反應性T細胞模型中的T細胞活化。此類活化效應尤其在腫瘤相關抗原之環境中可有益於經誘導之TCR、經驅動的抗原T細胞激活的擴增。 化合物A之投與可使癌症病患中之經改良之T細胞激活便利。此概念由在用化合物A治療的帶有腫瘤之小鼠中觀測之腫瘤浸潤性CD8+ T細胞之經增加的活化及經增強之效應功能支援。儘管化合物A單獨地在NSCLC之GEM模型中抑制腫瘤生長中不穩固，但其當與JQ1偶合時產生顯著T細胞調介抗腫瘤功效。 隨著CD4+FOXP3+ T調節細胞積聚於許多固體癌中，具有靶向此等細胞之可能性的藥劑可提供治療性益處。如所揭示，HDAC6選擇性抑制劑(化合物A)及BET抑制劑(JQ1)治療之組合減少Treg細胞之部分但不減少經治療的小鼠中之腫瘤微環境內之習知T細胞。此表明Treg細胞與其習知T細胞對應物相比可對表觀遺傳修飾更敏感。儘管Foxp3之量在活體外由化合物A節省的Treg細胞上降低，但此效應僅在活體內適中。在另一方面，JQ1展現由經減小Foxp3表現量證明之更深遠的效應及除JQ1所治療的小鼠之腫瘤中之Treg比例的更實質性減小之外，還有活體外Treg細胞之功能減少。化合物A及JQ1可優先調變FOXP3基因表現或蛋白質之穩定性，且因此，調變此等細胞之總存活率及活性。此等效應由現有報告支援，該等報告表明某些HDAC抑制劑影響Treg生物學，因為已知由HAT/HDAC之組蛋白之乙醯化狀態影響FOXP3基因表現及穩定性。由不同HDAC靶向的基因位點或蛋白質區域中之變體可回應於不同HDAC抑制劑影響Treg活性。另外，與不同疾病病況相關之發炎情境可指示某些HDAC抑制劑如何影響其活性。 在無意欲受任何理論束縛的情況下，化合物A可對免疫細胞扮演多效性角色，且可由減少Treg細胞數目、增加T細胞之短暫TCR不依賴性活化及促進APC功能起作用。在另一方面，JQ1進一步破壞Treg抑制活性，其視為阻礙免疫介導性抗腫瘤反應的關鍵機制。JQ1與化合物A協同，進一步減小Treg比例且妨礙在腫瘤床中呈現之殘餘Treg之抑制作用。淨效應為借助於優化抗原傳遞、增加共刺激信號同時降低抑制性細胞機制來促進白細胞安排抗腫瘤反應。在T細胞耗乏後，化合物A及JQ1治療下看見的腫瘤生長停滯之消除證明T細胞為在此模型中的組合治療之功效中之關鍵角色。 化合物A及JQ1之組合產生由不同突變基因型驅動的肺腫瘤中之穩固免疫介導性抗腫瘤效應，其延長帶有腫瘤之小鼠之存活率。此兩種藥劑之預先未描述免疫調節效應支援包含用於癌症(尤其肺腺癌)中之治療性干預的HDAC6選擇性抑制劑及BET抑制劑之合理醫藥組合。另外本文所使用的劑量符合當前臨床應用。未觀察到毒性之徵象。化合物A及JQ1可用作經由免疫細胞機構動力學及功能之外周重塑形不僅利用其直接抗腫瘤效應還利用間接效應的「混合」療法，聚合以有利於強抗癌益處。參考文獻之併入
貫穿本申請案所引用之所有參考文獻(包括文獻參考、頒予之專利、公開之專利申請案及同在申請中之專利申請案)之全部內容在此以全文引用之方式明確地併入本文中。除非另外定義，否則本文所用之所有技術術語及科學術語與一般熟悉此項技術者通常已知之含義一致。等效物
熟習此項技術者將認識到，或能夠僅使用習知實驗來確定本文中所描述之本發明之特定實施例的許多等效物。此類等效物欲由隨附申請專利範圍涵蓋。
