TW200848077A

TW200848077A - Compounds for the modulation of beta-cantenin expression

Info

Publication number: TW200848077A
Application number: TW097116039A
Authority: TW
Inventors: Jesper Worm
Original assignee: Santaris Pharma As
Priority date: 2007-05-01
Filing date: 2008-04-30
Publication date: 2008-12-16
Also published as: US7915401B2; KR20100024399A; US20120004288A1; JP2010524486A; NZ581200A; IL201865A0; AU2008244211A1; JP2014209915A; EP2152879A2; EP2152879B1; DK2152879T3; AU2008244211B2; CN101842483A; ES2399371T3; CA2685444A1; US20090203137A1; WO2008132234A4; WO2008132234A2; US20110086902A1; MX2009011878A

Description

200848077 九、發明說明：【發明所屬之技術領域】本發明係關於寡聚化合物（寡聚物），其靶向細胞中之β_ 連接蛋白mRNA，使得β_連接蛋白之表現降低。β_連接蛋白表現之降低對於眾多醫學病症（諸如過度增生性疾病，包括癌症）有益。本發明提供包含寡聚物之治療組合物及使用該等寡聚物來調節卜連接蛋白表現之方法包括治療方法。 h 本申請案主張2007年5月i曰申請之美國臨時申請案第 6〇/9丨5,371號及2008年i月24日申請之美國臨時申請案第 6!/〇23,244號之35 U.S.c. § 119⑷之權利，該等文獻之揭示内容係以引用的方式全部併入本文中。【先前技術】 β_連接蛋白（亦稱作鈣黏附蛋白相關蛋白）為胞内蛋白之連接蛋白家族之成員及由Wnt蛋白引發之信號轉導路徑之關鍵參與者，若干發育過程之介體。p_連接蛋白在生長因子刺激後經歷磷酸化作用，使得細胞黏附降低。已展不β_連接蛋白在癌症發展中之作用係由Apc(結腸腺瘤息肉病）基因之表現產物調節。ApC腫瘤抑制蛋白與卜連接蛋白結合，而展示連接蛋白與Tcf及Lef轉錄因子相互作用。Morin 等人（Morin等人，Science，1997，275，1787_ 1790)報導APC蛋白下調在結腸癌中由卜連接蛋白及Tcf_4 介導之轉錄活化。其結果指示β_連接蛋白之調節對Apc之腫瘤抑制作用為關鍵的且此調節可由Apc或卜連接蛋白之 131124.doc 200848077 突變而被阻遏。

Morin等人展示影響磷酸化位點之β_連接蛋白之突變使得細胞對β·連接蛋白之APC介導之下調不敏感且此破壞機制對結腸直腸腫瘤形成為關鍵的（Morin等人，Science 1997, 275, 1787-1790)。右干研究報導各種癌細胞株中β_連接蛋白突變之偵測且異常而之β-連接蛋白量已見於黑素瘤細胞株中。

Bennett等人之美國專利第6,〇66,5〇〇號描述調節卜連接蛋白表現之反義化合物、組合物及方法。因此仍需要能夠有考慮到癌症發展中涉及β_連接蛋白，效抑制β-連接蛋白功能之藥劑。【發明内容】本發明提供一種1〇_5〇個連續單體之寡聚物，其中該寡聚物之序列與編碼哺乳動物β_連接蛋白之核酸之目標區域的反向互補之序列有至少8〇%一致。

固醇基團（諸如膽固醇）或促進進 ’该結合部分係由固醇基 >中之其他部分組成或包含入細胞中之其他部分。 131124.doc 200848077 本發明提供一種包含根據本發明之寡聚物之結合物，其與含有帶正電基團之聚合結合部分（諸如聚乙二醇（PEG)) 共價鍵聯，亦即根據本發明之募聚物可視情況經聚乙二醇化。本發明提供醫藥組合物，其包含本發明之募聚物或結合物’及醫藥學上可接受之稀釋劑、載劑、鹽或佐劑。本發明進一步提供一種根據本發明之寡聚物或結合物，其係用於藥物中。本發明進一步提供本發明之寡聚物或結合物之用途，其係用於製造供治療一或多種本文中提及之疾病(諸如過度增生性疾病，例如癌症）用之藥物。本發明進一步提供一種根據本發明之募聚物或結合物，其係用於治療-或多種本文中提及之疾病，諸如癌症。亦提供包3本發明之养聚物或結合物之醫藥組合物及其他組合物。進一步提供下調細胞或組織中β_連接蛋白之表現的方法，其包含在活體外或活體内使該等細胞或組織與有效量之-或多種本發明之寡聚物、結合物或組合物接觸。亦揭示治療疑似患有或傾向於患上與卜連接蛋白表現或過度表現相關之疾病或病狀之動物或人的方法，其係藉由 ^該動物或人投與治療或㈣有效量之—或多種本發^之券聚物、結合物或組合物來進行。此外，提供使用寡聚物來抑制連接蛋白表現及治療與 β -連接蛋白活性相關之疾病的方法。 131124.doc 200848077 本發明提供一種抑制或降低細胞或組織中β_連接蛋白之表現的方法，該方法包含以下步驟：使該細胞或組織與有效量之根據本發明之寡聚物、結合物或醫藥組合物接觸，以使得β-連接蛋白之表現得以抑制或降低。本發明提供一種於細胞（諸如癌細胞）中引發細胞凋亡之方法，該方法包含以下步驟：使該細胞或組織與有效量之根據本發明之寡聚物、結合物或醫藥組合物接觸，以使得 β-連接蛋白之表現得以抑制或降低及/或引發細胞凋亡。本發明進一步提供一種募聚物，其包含連續共價鍵聯之單體或由連續共價鍵聯之單體組成，其中該寡聚物包含一第一區域，其中該第一區域之序列與SEQ ID NO: 1-132或 SEQ ID NO: 174-193之區域之序列有至少80%—致。在一些實施例中，該序列係選自由SEQ ID NO: 189、192、58 及103組成之群。本發明進一步提供一種募聚物，其包含一第一區域或由一第一區域組成，其中該第一區域之序列與SEQ ID NO: 174-193之區域（諸如SEQ ID NO: 189或192之區域）之序列一致。本發明進一步提供一種募聚物，其包含同樣存在於SEq ID NO: 133-174中（諸如同樣存在於SEq id NO: 168或171 中）之序列或由同樣存在於SEQ ID NO: 133-174中（諸如同樣存在於SEQ ID NO: 168或171中）之序列組成。【實施方式】寡聚物 131124.doc 200848077 在弟恶樣令’提供寡聚化合物(在本文中稱作募聚 =諸ΓΓ如適用於調節編碼哺乳動物β_連接蛋白之核酸分

η動1EQID Ν0:173中所示之卜連接蛋白核酸）及編碼 :二广連接蛋白之此等核酸分子之天然存在對偶基因艾-0功能。本發明之寡聚物包含共價鍵聯之單體。 _術語”單體"包括天然存在於核酸中且不含經修飾之糖或 ^修飾之核鹼基的核苦與去氧核苷（統稱為"核芽”），亦即核糖或去㈣糖與天然存在之未經㈣核驗基（驗基）部分 (亦卩不7及嘴啶雜環腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸嘧咬或尿哺幻共價鍵結之化合物及"核苦類似物"，其為確實天然存在於核酸中或不天然存在於核酸中之核苦，其中該糖部分不為核糖或去氧核糖(諸如雙環糖或2,修飾糖，諸如 2取代糖）’或该鹼基部分經修飾（例如，曱基胞嘧啶），或兩者皆有。 ”Rna單體”為含有核糖及未經修飾之核鹼基的核苷。 ’’DNA單體”為含有去氧核糖及未經修飾之核鹼基的核苷0 如下文中進一步描述，"鎖定核酸單體，，、”鎖定單體，，或 nLNA單體”為具有雙環糖之核苷類似物。術語”相應核苷類似物，，及”相應核苷，，指示核苷類似物中之鹼基部分與核苷中之驗基部分相同。舉例而言，當，，核苷’’含有與腺嘌呤鍵聯之2-去氧核糖時，”相應核苷類似物，， έ有（例如）與腺嘌呤鹼基部分鍵聯之經修飾之糖。術語’f寡聚物”、”寡聚化合物，，及，，寡核誓酸”在本發明之 131124.doc 200848077 上下文中可互換使用’且係指兩個或兩個以上連續單體由 (例如）磷酸酯基團（在核苷之間形成磷酸二酯鍵）或硫代碟酸酯基團（在核苷之間形成硫代磷酸酯鍵）共價鍵聯而形成之分子。寡聚物係由10-50個單體組成或包含1〇_5〇個單體。在一些實施例中，募聚物包含如本文中所提及之核普戍核苷類似物或其混合物。"LNA募聚物，，或"LNA寡核苦酸，，係指含有一或多個LNA單體之募核苷酸。視情況包括於寡聚物中之核苷類似物可類似地充當相應核芽，或可具有特定改良功能。其中一些或全部單體為核苷類似物之募聚物因此等募聚物之若干所需性質（諸如穿透細胞膜之能力、對細胞外及/或細胞内核酸酶之良好抵抗力及對核酸目標之高親和力及特異性）而通常優於天然形式。舉例而言，就上述性質之若干者而言，LNA單體尤其較佳。在各種實施例中，募聚物内存在之一或多種核苷類似物為’’沉默的，，或在功能上與相應天然核苷”等效，，，亦即對寡聚物用於抑制目標基因表現之方式不具有功能影響。然而，例如當此等’’等效”核苷類似物更易於製造或更廉價，或在儲存或製造條件下更穩定，或可併有標籤或標記時，其為有用的。然而，通常，該等類似物將對寡聚物用於抑 J表現之方式具有功能影響；舉例* t，藉由對目標核酸之目標區域產生增加之結合親和力及/或對細胞内核酸酶之抵抗力增加及/或更易於輸送至細胞中。 131124.doc 200848077 本發明之寡聚物包含核苦，諸如LNA單體或其他核口此，在各種實施例中，根據單體與至少一個核苷類似苦類似物單體。孕體術浯"至少一個”包含大於或等於1之整數，諸如i、2、 3、4、5、6、7、8、9、ι〇、η、12、13、14、15、16、 18 19、2G等等。在各種實施例中，諸如當提及本發明之化合物之核酸或蛋白質目標時，術語"至少一個"包‘ 術語"至少兩個，，及，，至少三個"及，，至少四個"。同樣，術扭，，至少兩個"可包含術語，，至少三個"及”至少四個"。 f各種實施例中，寡聚物係由1〇_5〇個單體、較佳㈣個早體、更佳1〇·16個單體及甚至更佳12-16個單體組成。在各種貫施例令，本發明之寡聚物不包含rna單體。當用於指示本發明之寡聚物時，術語"區域”意謂寡聚物内之多個連續單體’其中該"區域”中之單體數目小於寡聚物中單體之總數。根據本發明之寡聚物較佳為線性分子或合成為線性的。在此等實施例中，寡聚物為單鏈分子，且通常不包含(例士）至夕3、4或5個連續單體之短區域，其與同一寡聚物内之另區域互補以使得該寡聚物形成内部雙鏈體。在各種實施例中’寡聚物大體上不為雙鏈，㈣不為^财。在一些實施例中，本發明之寡聚物係由一段連續單體組成，其序列係由本文中所揭示之SEQ ID N〇鑑別（例如參見表14)。在其他實施例中，寡聚物包含一第一區域，該區域係由一段連績單體組成；及一或多個其他區域，其係由 131124.doc 200848077 至少一個其他單體組成。在一些實施例中，第一區域之序列係由本文中所揭示之SEQ ID No鑑別。目標核酸術語’’核酸’’及’’聚核苷酸π在本文中可互換使用，且經定義為由兩個或兩個以上如上文所述之單體共價鍵聯所形成之分子。包括2個或2個以上單體，’’核酸”可為任何長度，且術語統稱為π寡聚物”，其具有本文中所述之長度。術語 ’’核酸’’及’’聚核苷酸’’包括單鏈、雙鏈、部分雙鏈及環狀分子。如本文中所用，術語π目標核酸π係指編碼哺乳動物β-連接蛋白多肽（諸如人類β-連接蛋白（例如，具有寄存編號 Χ89579、Χ89593、Χ89592、Χ89591、Χ89588、Χ89585、 Χ895 84及Χ89578之人類基因外顯子））之核酸（諸如DNA)，或哺乳動物β-連接蛋白mRNA(諸如SEQ ID NO 173)。其他哺乳動物β-連接蛋白mRNA之實例包括（但不限於）具有寄存編號NM—001098209、NM—0010987210(人類 β-連接蛋白 mRNA) ; NM—007614(小鼠 β-連接蛋白 mRNA) ; ΝΜ—053357 (大鼠 β-連接蛋白 mRNA) ; NM-001122762、DQ267491(馬 β-連接蛋白mRNA) ; ΝΜ一214367(豬β-連接蛋白mRNA); BC119949、BT030683(牛β-連接蛋白mRNA)之β·連接蛋白 mRNA。”目標核酸”亦包括編碼β_連接蛋白之核酸或其天然存在之變異體，及自其衍生之RNA核酸，較佳為 mRNA，諸如mRNA前體，但成熟mRNA較佳。在各種實施例中’例如當用於研究或診斷中時，”目標核酸，，可為 131124.doc -12- 200848077 cDNA或自上述DNA或RNA核酸目標衍生之合成寡核芽酸。根據本發明之寡聚物較佳能夠與目標核酸雜交。術語”其天然存在之變異體”係指天然存在於指定分類學群組（例如哺乳動物，諸如小鼠、猴及較佳人）中之卜連接蛋白多肽或核酸序列之變異體。通常，當提及聚核苦酸之 ”天然存在之變異體"時，該術語亦可涵蓋編碼卜連接蛋白之基因組DNA(其係藉由染色體易位或複製而存在於毕色體⑽3: 41.22 - 41.26娜處）及職（諸如自盆衍生之灿财）的任何對偶基因變異體。當提及特定多肽序該術語亦包括蛋白質之天然存在形式，其因此可例精由共轉澤修飾或轉譯後修飾（諸如信號狀斷裂、蛋白水解斷裂、糖基化等）來加工。本發明之寡聚物藉由寡聚物之單體與目標核間的沃森-克里克（Watson心ick)驗基之 (Hoogsteen hydrogen bonH' 、+ f 隹氏虱鍵 gen b〇ndlng)或反向霍氏之區域Γ目標區域"）結合。，、目‘核酉夂卞开力外况明，否則έ士人由互補驗基之沃森-克里克配對進行，係糟列與目標區域之反向互補之處Μ 由於I來物之序與目標結合；就本文中之目的而言，據稱寡丄养聚物域”互補"或”部分互補"，且 Μ物與目標區的，，互補性”百分比為鱼 Α 。目標區域之序列性”百分比。為與目標區域之反向互補序列的”一致除非文中另外明確說明，否標之區域，其具有使用、目標區域，，將為目使用下文所述之比對程式及參數與指定 131124.doc 200848077 券t物（或其區域）之反向互補序列最佳比對的序列。

在測定本發明之寡聚物（或其區域）與編碼哺乳動物卜連接蛋白之核酸（諸如本文中所揭示之核酸）之目標區域之間的’’互補性，，程度時，該"互補性"（亦為"同源性"）程度係表不為寡聚物（或其區域）之序列與其所最佳比對之目標區域之反向互補序列之間的一致性百分比。藉由計算兩個序列之間一致的比對鹼基之數目，除以寡聚物中連續單體之總數，且乘以100來計算該百分比。在此比較中，若存在間隙，則較佳此等間隙僅錯配，而並非間隙内之單體數在本發明之募聚物與目標區域之間不同的區域。就本發明之目的而言可使用Clustal w算法使用標準設定來測定胺基酸及聚核苦酸比對、序列—致性百分比及互補 http://www.ebi.ac.uk/emboss/aIign/index.html. 方法：EMBOSS:水（局部）：間隙打開=1〇〇,間隙延伸= 〇·5’使用Blosum 62(蛋白質）’ stDNAfuU(對於核苦酸/核鹼基序列而言）。如將瞭解，視上下文而定，，，錯配"係指序列之非一致性 (例如’寡聚物之核驗基序列與其所結合之目標區域之反向互補序列之間；例如’兩個經比對之編碼β連接蛋白之核酸的驗基序列之間）’或序列之非互補性(例如，寡聚物與其所結合之目標區域之間）。適宜地，募聚物（或結合物，如下文進一步描述）能夠抑制（諸如，下調）β-連接蛋白基因之表現。在各種實施例中，與正常表現量相比，本發明之寡聚物 131124.doc 14 200848077 實現抑制β-連接蛋白mRNA表現至少10%、至少20%、更佳至少 30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或 95% ° 在各種實施例中，與正常表現量相比，本發明之寡聚物實現抑制β-連接蛋白表現至少10%、至少20%、更佳至少30%、 40%、50%、60%、70%、80%、90% 或 95%。在一些實施例中，當使用1 ηΜ本發明之寡聚物或結合物時，可見此抑制作用。在各種實施例中，當使用25 ηΜ寡聚物或結合物時，可見此抑制作用。在各種實施例中，mRNA表現之抑制小於100%(亦即，小於完全表現抑制），諸如小於98%抑制、小於95%抑制、小於90%抑制、小於80%抑制、諸如小於70%抑制。在各種實施例中，蛋白質表現之抑制小於100%(亦即，小於完全表現抑制），諸如小於98%抑制、小於95%抑制、小於 90%抑制、小於80%抑制、諸如小於70%抑制。可例如藉由諸如SDS-PAGE、接著西方墨點法（western blotting)之方法，使用對抗目標蛋白而產生之適合抗體，藉由量測蛋白質含量來測定表現量之調節（亦即，抑制或增加）。或者，可例如藉由北方墨點法（northern blotting)或定量RT-PCR量測mRNA之含量來測定表現量之調節。當經由mRNA含量來量測時，在各種實施例中，在使用適當劑量（諸如1 ηΜ及25 ηΜ)時之抑制量通常為不存在本發明化合物之情況下正常含量之1〇%-20%之量。因此，本發明提供一種抑制（例如，下調）表現β-連接蛋白及/或mRNA之細胞中β-連接蛋白及/或mRNA之表現的方 131124.doc -15- 200848077 法，該方法包含使該細胞與有效抑制（例如，下調）該細胞中β_連接蛋白及/或mRNA之表現之量的根據本發明之寡聚物或結合物接觸。該細胞適宜地為哺乳動物細胞，諸如人類細胞。在某些實施例中，該接觸可在活體外發生。在其他貝施例中’可藉由向哺乳動物投與本發明之化合物或結合物而在活體内實現接觸。本1¾明之券聚物通常與人類β—連接蛋白mRNA之目標區域結合’且同樣包含具有與（例如）SEq id NO: 173之目標區域之驗基序列互補或部分互補的鹼基序列之區域或由具有與（例如）SEQ ID NO: 173之目標區域之鹼基序列互補或部分互補的驗基序列之區域組成。與SEq ID NO: 173之最佳比對目標區域之序列相比，本發明之寡聚物之序列可視情況包含1、2、3、4或4個以上鹼基錯配。在一些實施例中，本發明之寡聚物具有與選自由下文表 1中所示之SEQ ID NO: 1-132組成之群之序列一致的序列。在其他實施例中，與選自由SEQ ID NO: 1-132組成之群之序列相比，本發明之募聚物具有一個、兩個或三個鹼基不同之序列。在一些實施例中，募聚物係由1 〇-丨6個連績早體組成或包含1 0 -16個連績举體。由16個連續單體組成之寡聚物之實例為SEQ ID NO: 1、16、17、18、33、 34、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、73、 88、103及11 8。可自其衍生較短序列，例如，較短寡聚物之序列可同樣存在於SEQ ID NO: 1-132之區域中。較長募聚物可包括具有至少10個連續單體之序列（其同樣存在於 131124.doc -16- 200848077 SEQ ID NO: 1-132 中）的區域。 V- V；：； '：；：：>r'f，7\ -；；>^ 反義募核苷1列(基元） SEQ ID NO . 序列(5’-3〇 ί - . 長度 (驗基）： ' * SEQ ID NO: 1 GAAAGCTGATGGACCA 16 反義寡核苷酸序列 SEQ ID NO: 2 GAAAGCTGATGGACC 15 同上 SEQ ID NO: 3 AAAGCTGATGGACCA 15 同上 SEQ ID NO: 4 GAAAGCTGATGGAC 14 同上 SEQ ID NO: 5 AAAGCTGATGGACC 14 同上 SEQ ID NO: 6 AAGCTGATGGACCA 14 同上 SEQ ID NO: 7 GAAAGCTGATGGA 13 同上 SEQ ID NO: 8 AAAGCTGATGGAC 13 同上 SEQ ID NO: 9 AAGCTGATGGACC 13 同上 SEQ ID NO: 10 AGCTGATGGACCA 13 同上 SEQ ID NO: 11 GAAAGCTGATGG 12 同上 SEQ ID NO: 12 AAAGCTGATGGA 12 同上 SEQ ID NO: 13 AAGCTGATGGAC 12 同上 SEQ ID NO: 14 AGCTGATGGACC 12 同上 SEQ ID NO: 15 GCTGATGGACCA 12 同上 SEQ ID NO: 16 CAGACTTAAAGATGGC 16 同上 SEQ ID NO: 17 CAGAATCCACTGGTGA 16 同上 SEQ ID NO: 18 GCACTGCCATTTTAGC 16 同上 SEQ ID NO: 19 GCACTGCCATTTTAG 15 同上 SEQ ID NO: 20 CACTGCCATTTTAGC 15 同上 SEQ ID NO: 21 GCACTGCCATTTTA 14 同上 SEQ ID NO: 22 CACTGCCATTTTAG 14 同上 SEQ ID NO: 23 ACTGCCATTTTAGC 14 同上 SEQ ID NO: 24 GCACTGCCATTTT 13 同上 SEQ ID NO: 25 CACTGCCATTTTA 13 同上 SEQ ID NO: 26 ACTGCCATTTTAG 13 同上 SEQ ID NO: 27 CTGCCATTTTAGC 13 同上 SEQ ID NO: 28 GCACTGCCATTT 12 同上 SEQ ID NO: 29 CACTGCCATTTT 12 同上 SEQ ID NO: 30 ACTGCCATTTTA 12 同上 SEQ ID NO: 31 CTGCCATTTTAG 12 同上 SEQ ID NO: 32 TGCCATTTTAGC 12 同上 SEQ ID NO: 33 GTAATAGCCAAGAATT 16 同上 SEQ ID NO: 34 ACTCTGCTTGTGGTCC 16 同上 SEQ ID NO: 35 ACTCTGCTTGTGGTC 15 同上 SEQ ID NO: 36 CTCTGCTTGTGGTCC 15 同上 SEQ ID NO: 37 ACTCTGCTTGTGGT 14 同上 131124.doc -17- 200848077 袅1 反義募核苷酸序列(基元） ( SEQIDNO 序列(5’-3’）長度 (驗基） - 描述 SEQIDNO: 38 CTCTGCTTGTGGTC 14 同上 SEQ ID NO: 39 TCTGCTTGTGGTCC 14 同上 SEQ ID NO: 40 ACTCTGCTTGTGG 13 同上 SEQ ID NO: 41 CTCTGCTTGTGGT 13 同上 SEQ ID NO: 42 TCTGCTTGTGGTC 13 同上 SEQ ID NO: 43 CTGCTTGTGGTCC 13 同上 SEQ ID NO: 44 ACTCTGCTTGTG 12 同上 SEQ ID NO: 45 CTCTGCTTGTGG 12 同上 SEQ ID NO: 46 TCTGCTTGTGGT 12 同上 SEQ ID NO: 47 CTGCTTGTGGTC 12 同上 SEQ ID NO: 48 TGCTTGTGGTCC 12 同上 SEQ ID NO: 49 CCACCAGCTTCTACAA 16 同上 SEQ ID NO: 50 GAGTCCAAAGACAGTT 16 同上 SEQ ID NO: 51 ACCCACTTGGCAGACC 16 同上 SEQ ID NO: 52 GCACAAACAATGGAAT 16 同上 SEQ ID NO: 53 GCAGCTACTCTTTGGA 16 同上 SEQ ID NO: 54 CTCCCTCAGCTTCAAT 16 同上 SEQ ID NO: 55 GCAGTCTCATTCCAAG 16 同上 SEQ ID NO: 56 TATCCACCAGAGTGAA 16 同上 SEQ ID NO: 57 CATCCATGAGGTCCTG 16 同上 SEQ ID NO: 58 CCATCTTGTGATCCAT 16 同上 SEQ ID NO: 59 CCATCTTGTGATCCA 15 同上 SEQ ID NO: 60 CATCTTGTGATCCAT 15 同上 SEQ ID NO: 61 CCATCTTGTGATCC 14 同上 SEQ ID NO: 62 CATCTTGTGATCCA 14 同上 SEQ ID NO: 63 ATCTTGTGATCCAT 14 同上 SEQ ID NO: 64 CCATCTTGTGATC 13 同上 SEQ ID NO: 65 CATCTTGTGATCC 13 同上 SEQ ID NO: 66 ATCTTGTGATCCA 13 同上 SEQ ID NO: 67 TCTTGTGATCCAT 13 同上 SEQ ID NO: 68 CCATCTTGTGAT 12 同上 SEQ ID NO: 69 CATCTTGTGATC 12 同上 SEQ ID NO: 70 ATCTTGTGATCC 12 同上 SEQ ID NO: 71 TCTTGTGATCCA 12 同上 SEQ ID NO: 72 CTTGTGATCCAT 12 同上 SEQ ID NO: 73 AAGCAAGCAAAGTCAG 16 同上 SEQ ID NO: 74 AAGCAAGCAAAGTCA 15 同上 SEQ ID NO: 75 AGCAAGCAAAGTCAG 15 同上 SEQ ID NO: 76 AAGCAAGCAAAGTC 14 同上 SEQ ID NO: 77 AGCAAGCAAAGTC 14 同上 131124.doc -18- 200848077 :¾¾ SEQ ID NO 序列㈣ : 長度 (驗基） SEQ ID NO: 78 GCAAGCAAAGTCAG 14 同上 SEQ ID NO: 79 AAGCAAGCAAAGT 13 同上 SEQ ID NO: 80 AGCAAGCAAAGTC 13 同上 SEQ ID NO: 81 GCAAGCAAAGTCA 13 同上 SEQ ID NO: 82 CAAGCAAAGTCAG 13 同上 SEQ ID NO: 83 AAGCAAGCAAAG 12 同上 SEQ ID NO: 84 AGCAAGCAAAGT 12 同上 SEQ ID NO: 85 GCAAGCAAAGTC 12 同上 SEQ ID NO: 86 CAAGCAAAGTCA 12 同上 SEQ ID NO: 87 AAGCAAAGTCAG 12 同上 SEQ ID NO: 88 GAAATTGCTGTAGCAG 16 同上 SEQ ID NO: 89 GAAATTGCTGTAGCA 15 同上 SEQ ID NO: 90 AAATTGCTGTAGCAG 15 同上 SEQ ID NO: 91 GAAATTGCTGTAGC 14 同上 SEQ ID NO: 92 AAATTGCTGTAGCA 14 同上 SEQ ID NO: 93 AATTGCTGTAGCAG 14 同上 SEQ ID NO: 94 GAAATTGCTGTAG 13 同上 SEQ ID NO: 95 AAATTGCTGTAGC 13 同上 SEQ ID NO: 96 AATTGCTGTAGCA 13 同上 SEQ ID NO: 97 ATTGCTGTAGCAG 13 同上 SEQ ID NO: 98 GAAATTGCTGTA 12 同上 SEQ ID NO: 99 AAATTGCTGTAG 12 同上 SEQ ID NO: 100 AATTGCTGTAGC 12 同上 SEQ ID NO: 101 ATTGCTGTAGCA 12 同上 SEQ ID NO: 102 TTGCTGTAGCAG 12 同上 SEQ ID NO: 103 GTGTTCTACACCATTA 16 同上 SEQ ID NO: 104 GTGTTCTACACCATT 15 同上 SEQ ID NO: 105 TGTTCTACACCATTA 15 同上 SEQ ID NO: 106 GTGTTCTACACCAT 14 同上 SEQ ID NO: 107 TGTTCTACACCATT 14 同上 SEQ ID NO: 108 GTTCTACACCATTA 14 同上 SEQ ID NO: 109 GTGTTCTACACCA 13 同上 SEQ ID NO: 110 TGTTCTACACCAT 13 同上 SEQ ID NO: 111 GTTCTACACCATT 13 同上 SEQ ID NO: 112 TTCTACACCATTA 13 同上 SEQ ID NO: 113 GTGTTCTACACC 12 同上 SEQ ID NO: 114 TGTTCTACACCA 12 同上 SEQ ID NO: 115 GTTCTACACCAT 12 同上 SEQ ID NO: 116 TTCTACACCATT 12 同上 SEQ ID NO: 117 TCTACACCATTA 12 同上 131124.doc -19- 200848077 表1 反義寡核苷酸每列(基元） SEQ ID NO ，序列⑸力長度纖導痛:穆: SEQ ID NO: 118 AACATGAAATAGATCC 16 同上 SEQ ID NO: 119 AACATGAAATAGATC 15 同上 SEQ ID NO: 120 ACATGAAATAGATCC 15 同上 SEQ ID NO: 121 AACATGAAATAGAT 14 同上 SEQ ID NO: 122 ACATGAAATAGATC 14 同上 SEQ ID NO: 123 CATGAAATAGATCC 14 同上 SEQ ID NO: 124 AACATGAAATAGA 13 同上 SEQ ID NO: 125 ACATGAAATAGAT 13 同上 SEQ ID NO: 126 CATGAAATAGATC 13 同上 SEQ ID NO: 127 ATGAAATAGATCC 13 同上 SEQ ID NO: 128 AACATGAAATAG 12 同上 SEQ ID NO: 129 ACATGAAATAGA 12 同上 SEQ ID NO: 130 CATGAAATAGAT 12 同上 SEQ ID NO: 131 ATGAAATAGATC 12 同上 SEQ ID NO: 132 TGAAATAGATCC 12 同上進一步提供目標核酸（亦即，編碼β-連接蛋白之DNA或 mRNA)，其含有與SEQIDNO:l-132之募聚物之一或多者互補或部分互補的目標區域，其中該等寡聚物能夠抑制 (例如下調）β-連接蛋白或mRNA之表現。舉例而言，與具有 SEQ ID NO: 1、16、17、18、33、34、49、50、51、 52、53、54、55、56、57、58、73、88、103及 118之序列之反義寡聚物互補的人類β-連接蛋白mRNA之目標區域係展示於圖1中（粗體且加下劃線，其中相應寡聚物SEQ ID NO如上文所示）。本發明之寡聚物可適宜地包含具有特定序列（諸如選自 SEQ ID NO: 174-193之寡聚物，其同樣存在於本發明之較短寡聚物中）之區域。該區域較佳包含10-16個單體。舉例而言，SEQ ID NO: 174· 193各自包含一區域，其中該區域 131124.doc •20· 200848077 之序列同樣存在於分別具有SEQ ID NO: 1、16、17、18、 33、34、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、 73、88、103及11 8之較短募聚物中。在一些實施例中，具有少於16個單體（諸如1〇、η、12、13、14或15個單體）之寡聚物具有至少8個、至少9個、至少1 〇個、至少11個、至少12個、至少13個、至少14個或15個連續單體之區域，其中該區域之序列同樣存在於SEQ ID NO: 1、16、17、18、 33、 34、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、 73、88、103或11 8申。因此，在各種實施例中，較短寡聚物係衍生自較長寡聚物。在一些實施例中，根據SEq NO所例示，較長寡聚物包括全部或至少1〇個連續單體。通常’若本發明之寡聚物包含具有同樣存在於SEq ID N〇: 1、16、17、18、33、34、49、50、51、52、53、54、 55、56、57、58、73、88、103 或 118 中之序列之第一區域，且該寡聚物比該第一區域長，則該寡聚物之其他區域較佳側接同樣存在於SEQ ID NO: 1、16、17、18、33、 34、 49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、73、 88、103或118中之第一區域，該寡聚物之該側接區域具有與側接目標核酸之目標區域之序列互補的序列。兩種此等寡聚物為 SEQ ID NO·· 58及 SEQ ID NO: 103。亦揭示本發明之募聚物之特定設計，例如以SEQ π) N〇:

133-1 52，尤其 SEQ ID NO: 133、134、135、136、138、 141、148、149、150、151及152所示者。亦揭示LNA募核苷酸之特定設計，例如以SEQ ID NO: 153-172，尤其SEQ 131124.doc -21 - 200848077 ID NO: 153、154、155、1以, 156、158、161、168、169、、71及172所示者。在較佳實施例中，本發明之寡取物為β-連接蛋白_Α及蛋白質表現之有效抑制劑。來在各種實施例令，寡聚物包含與編碼哺乳動物β-連接蛋白之目標核酸之目標區域完全互補的單體之序列或由與編碼哺乳動物β·連接蛋白之目標核酸之目標區域完全互單體之序列組成。 /而，在一些實施例中，與最佳比對之目標區域相比，寡聚物之序列包括1、2、3或4個（或4個以上）錯配，且仍足以與該目標區域結合以實現Ρ·連接蛋白mRNA或蛋白質表現之抑制。錯配對沃森-克里克氫鍵雙鏈體之失穩影響可 (例如）由s聚物之長度增加及/或寡聚4勿中存在之核苦類似物（諸如LNA單體）之數目增加來補償。在各種實施例中，與（例如）編碼哺乳動物卜連接蛋白之核酸之最佳比對之目標區域的鹼基序列相比，募聚物鹼基序列包含不大於3個、諸如不大於2個錯配。在各種實施例中，與（例如）編碼哺乳動物β-連接蛋白之核酸之最佳比對之目標區域的驗基序列相比，募聚物驗基序列僅包含單一錯配。本發明之募聚物或其區域之驗基序列較佳與選自由g E Q ID NO: 1-132組成之群之序列有至少80%—致，諸如至少 85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少 94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少 99%、甚至 1〇〇%—致。 131124.doc -22- 200848077 本發明之养聚物或其區域之鹼基序列較佳與SEq ID 173中存在之目標區域之序列有至少8〇%互補，諸如至少 85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少 94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少 99%、甚至loo%互補。在各種實施例中，寡聚物（或其第一區域）之序列係選自由 SEQ ID NO: 1-132 或 SEQ ID NO: 174-193 組成之群，或選自由 SEQ ID NO: H32或 SEQ ID NO· 174-193之至少 10 個連續單體組成之群。在另一實施例中，當與該所選序列或其區域最佳比對時，本發明之寡聚物或其第一區域之序列視情況包含1、2或3個與SEQ ID NO·· 1-132或SEQ ID NO: 174-193或其至少ι〇個連續單體中的鹼基部分不同之驗基部分。在某些實施例中，單體區域係由i丨、12、1 3、14、i 5、 16 、 17 、 18 、 19 、 20 、 21 、 22 、 23 、 24 、 25 、 26 、 27 、 28 或29個連續單體，諸如1(M5個、個、^以個，諸如 12-1 8個單體組成。在各種實施例中，該區域適宜地與本發明之寡聚物具有相同長度。在一些實施例中，募聚物在5,或3’端包含其他單體，諸如’在寡聚物之5,端及/或3,端獨立地包含1、2、3、4或5 個其他單體，其與目標區域之序列不互補。在各種實施例中’本發明之寡聚物包含一個與目標互補之區域，其在5, 及/或3’側接其他單體。在各種實施例中，該區域之3，端側接1、2或3個DNA或RNA單體。在寡聚物之固態合成期間 131124.doc -23- 200848077 時常使用3’ DNA單體。在各種實施例中，其可相同或不同，养聚物之5’端側接1、2或3個DNA* RNA單體。在某些實施例中，其他5,或3,單體為核苷，諸如DNA或RNA單體。在各種實施例中，其他5,或3,單體可表示區域〇，如本文中間隙聚合物（gapmer)募聚物中所提及。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQ ID N0:1a根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續早體組成，具有根據SEQ ID n〇:16*根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEq ID n〇：174根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQIDN〇:33或根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQ ID N〇:3zUl根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續 131124.doc -24- 200848077 單體組成’具有根據SEQIDNO:49或根據其一區域之核鹼基序列。在某些實_中’㈣本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQIDNO:50或根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中’根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQIDN0:51或根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據沾〇1〇>^^52或根據其一區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQIDN〇:535l根據其一區域之核鹼基序列。 /某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續

C :體組成’具有根據SEq ID紙54或根據其—區域之核驗基序列。抑在，些實施例中’根據本發明之寡聚物係由或包含連續 =組成’具有根據SEQ ID肌55或根據其— 基序列。 ^ 。。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續 =組成，具有根據SEQIDN〇:56或根據其一區域之核鹼基序列。在某些實關中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續 131124.doc -25- 200848077 單體組成，具有根據SEQIDN㈣錄據其—區域之核驗基序列。在某些實施例中，根據本發明之募聚物係由或包含連續單體組成，具有根據SEQID N㈣或根據其__區域之核驗基序列。 ”在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續皁體組成’ *有根據SEq ID肌73或根據其一區域之核驗

基序列。 X ί 。。在某些實施例中’根據本發明之募聚物係由或包含連續單體組成’具有根據SEQlDN〇:885l根據其—區域之核驗基序列。 ”在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續早體組成，具有根據SEQ ID Ν〇:1〇3或根據其—區域之核鹼基序列。在某些實施例中，根據本發明之寡聚物係由或包含連續早體組成’具有根據SEQ m ν〇:118或根據其一區域之核驗基序列。序列比對可用於鑑別來自人類及一或多物細如猴、小鼠及/或大鼠)之編碼β_連接蛋區域，其中在該等物種之間存在足夠核酸段—致性以允許設計靶向(亦即’ |充分特異性下結合以㈣其表現)人類 β·連接蛋白目標核酸及在不同哺乳動物物種中存在之相應核酸的募核苷酸。 μ 在些貫施例中，此等寡聚物係由以下區域組成或包含 131124.doc -26- 200848077 以下區域：至少10個，諸如至少12個，諸如至少

如至少16個，諸如至少18個，諸如11、12、13、14、15 S !6、17或18個連續單體，其序列與編碼來自人類之㈣5接蛋白之核酸及編碼來自不同哺乳動物物種之β_連接蛋白之核酸的目標區域之序列丨〇〇%互補。在一些實施例中，本發明之寡聚物包含具有以下序列連續單體之區域或*且古，、,γd ^ , 匕4 ^由具有以下序列之連續單體之區域組

成：該序列與編碼人類β·連接蛋白之核酸及編碼來自不同哺礼動物物種之卜連接蛋白之核酸（諸如編碼β•連接蛋白之小咏核酸）的目標區域之序列至少8〇%、諸如至少以％、諸 ^至少㈣、諸如至少抓、諸如至少㈣或卿互補。目標區域1 0 0 %互補。長度券聚物之連續核鹼基序列較佳與人類卜連接蛋白被财之募聚物包含10-50個連續單體（諸如1〇、u、12、13 14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、 26、27、28、29或3 0個連續單體）或由1〇_5〇個連續單體（諸如10 、 11 、 12 、 13 、 14 、 15 、 16 、 17 、 18 、 19 、 2〇、 21 、 22 ' 23、24、25、26、27、28、29 或 30個連續單體）組成0 在各種實施例中，寡聚物包含以下各物或由以下各物組成：10-25個連續單體，12-25個或10_22個連續單體，諸如 12-18個連續單體，諸如13-17個或12-16個連續單體，諸如 13、14、15、16個連續單體。 131124.doc -27- 200848077 寡聚物包含1〇、11、12、13或14個連 12、13或14個連續單體組成。根據本發明之寡聚物係由不大於22個在各種實施例中續單體或由10、11 在各種實施例中連續單體，諸如不大於2〇個連續覃舻士口口疋只早體，诸如不大於1 8個連續單體，諸如1 5、1 6或1 7個連續單I#相士 —甘a虚、平般、、且成。在某些實施例中本舍明之券聚物包含小於2 0個連續單體。核苷及核苷類似物在各種實施例中’寡聚物中存在之單體之至少—者為含有經修飾之驗基（諸如選自由5_甲基胞_、異胞㈣、假異胞㈣、5•漠尿㈣、5_丙炔基尿㈣、6_胺基嗓吟、 2_胺基嗓呤、肌芽、二胺基嗓呤及2'氣_6，基π票呤、黃嗓 7人Η不7、5 _甲基胞嘧啶、異胞嘧啶、假異胞嘧啶、 5-演尿嘧啶、5_丙炔基尿嘧啶、6_胺基嗓呤、2_胺基嗓吟、肌#、二胺基嗓吟及2氯·6胺基。票吟組成之群之驗基）的核苷類似物。在各種實施例中’募聚物中存在之單體之至少—者為含有經修_之糖的核苦類似物。在一些實施例中，募聚物之至少2個連續單體之間的鍵不為攝酸二酯鍵。在某些實施例中，募聚物包括至少一個具有經修飾之鹼基的早體、至少一個具有經修飾之糖的單體（其可為同一單體）及至少一個非天然存在的單體間鍵。適用於本文中所述之募聚物中之核苷類似物的特定實例係由（例如）Freier及 Altmann; /· U997, 25, 131124.doc -28- 200848077 4429-4443 及 Uhlmann; CW· > Dr叹仏ve/叩膽,， 2000, 3(2)，293-2 13所述且描述於流程丨（其中一些核苷類似物展示為核苷酸）及2中：

n B 0=P-S'

0 0' 0=P-0' Β

硫代磷酸酯

2，-Μ0Ε

Η CeNA ΡΝΑ

Ν 0=Ρ-〇· 2’-(3-羥基）丙基 3’ -胺基鱗酸酯

硼烷磷酸酯〇tBH3 流程1 寡聚物因此可包含核苷（較佳DNA單體，但亦可能為 RN Α單體）之簡單序列或核苷與一或多種核苷類似物之組合或由核苷（較佳DNA單體，但亦可能為rna單體）之簡單序列或核苷與一或多種核苷類似物之組合組成。在一些實 131124.doc -29- 200848077 施例中’此等核苷類似物適宜地增強寡聚物對目標核酸之目標區域的親和力。

V 適合且較佳核苷類似物之實例係描述於WO 2〇〇7/〇31()91 中，該文獻係以引用的方式全部併入本文中或於其中提及。在一些實施例中，核苷類似物包含經修飾以提供2，_取代基之糖部分，諸如2，-0-烷基-核糖、2，_胺基_去氧核糖及2，_ 氟-去氧核糖。在一些實施例中，核苷類似物包含其中存在產生雙環糖 (LNA)之橋接結構之糖，其增強結合親和力且亦可提供一些增加之核酸酶抵抗力。在各種實施例中，乙^^八單體係選自氧基-LNA(諸如β-D-氧基-LNA及α-L-氧基-LNA)及/或胺基-LNA(諸如β-D-胺基-LNA及a-L-胺基-LNA)及/或硫基_ LNA(諸如β-D-硫基乩财及a心硫基_LNA)及/或ENa(諸如 β-D-ENA及a-L-ENA)。在某些實施例中，LNA單體為氧基-LNA。LNA單體在下文中進一步描述。在募聚物中併入增強親和力之核苷類似物（諸如LNA單體或含有2，-取代糖之單體）可允許寡聚物之尺寸減小，且在發生非特異性或異常結合之前亦可將上限降至募聚物之尺寸。在某些實施例中，寡聚物包含至少2個核苷類似物。在一些實施例中，寡聚物包含3_8個核普類似物，例如6或7 個核苦類似物。在較佳實施例中，核苦類似物之至少一者為鎖定核酸（LNA)單體；例如至少3個或至少4個或至少5個 131124.doc -30- 200848077 或至少6個或至少7個或8個核苷類似物為lna單體。在一些實施例中，所有核苷類似物均為Lna單體。將認識到當提及較佳寡聚物鹼基序列時，在某些實施例中券聚物包含相應核苷類似物（諸如相應Lna單體）或其他相應核苦類似物，其提高寡聚物/目標區域雙鏈體之雙鏈體穩定性（Tm)(亦即增強親和力之核苷類似物）。在各種較佳實施例中，寡聚物之鹼基序列與目標區域之驗基序列之間的任何錯配（亦即非互補性X若存在）位於除含有增強親和力之核苷類似物之募聚物的區域（例如區域A 或區域C)之外的區域中，諸如在如下文中所提及之區域B 内，及/或在如下文中所提及之區域D内，及/或在僅含有核苷之寡聚物之區域中，及/或在與目標區域互補之寡聚物區域之5’或3’的區域中。在一些實施例中，本發明之寡聚物中（諸如在本文中提及之區域A及區域C中）存在之核苷類似物獨立地選自（例如）：含有2’-0-烷基-核糖之單體、含有2，_胺基-去氧核糖之單體、含有21-氟-去氧核糖之單體、[να單體、含有阿拉伯糖糖之單體（"ANA單體”）、含有2，_氟及NA糖之單體、含有d-阿拉伯糖-己糖醇糖之單體（”hna單體。、如 Chdstensen’ 胸c/· 办.及以· 3〇: 4918_4925 (2〇〇2从其係以引用的方式併入本文中）中所定義之插入單體及含有 2，ΜΟΕ糖之單體。在某些實施例中，僅存在本發明之募聚物或其區域中存在之上述類型核苷類似物中的一者。在某些實施例中，核苷類似物含有2，-〇_曱氧基乙美核 131124.doc 200848077 糖（2’MOE)或2’-說-去氧核糖或LNA糖，且同樣本發明之募核苷酸可包含獨立地選自此三種類型類似物之核苷類似物’或可僅包含選自此三種類型之一種類型類似物。在含有核苷類似物之某些募聚物實施例中，該等核苦類似物之至少一者含有2’-：\10丑-核糖，諸如2、3、4、5、6、7、8、 9或10個核苷類似物含有ΠΟΕ-核糖。在某些實施例中，該等核苷類似物之至少一者含有2，_氟-去氧核糖，諸如2、 3 ' 4、5、6、7、8、9或10個核苷類似物含有2，_氟_去氧核糖。在各種實施例中，根據本發明之募聚物包含至少一個鎖定核酸（LNA)單體，諸如i、2、3、4、5、6、7或8個LNA 單體，諸如3-7或4-8個LNA單體，或3、4、5、6或7個LNA 單體。在各種實施例中，所有核苷類似物均為lNA單體。在一些實施例中，募聚物包含p_D_氧基_LNA單體及以下 LNA單元之一或多者：硫基·LNA單體、胺基_lna單體、氧基-LNA單體及/或呈p_D或a_L構型之ena單體或其組合。在某些實施例中，寡聚物中所有LNA單體之胞+定驗基部分均為5-甲基胞㈣。在本發明之某些實施例中寡聚物包含LNA單體與DNA單體。通常’ LNA單體與dna單體之合併總數為H)-25、較佳㈣_2G、甚至更佳為12_16。在本：明之某些實施例中，寡聚物或其區域係由至少一個 LNA:體組成’且剩餘單體為舰單體。在某些實施例中寡來物僅包含視情況與經修飾之鍵聯基團（諸如硫代碌酸酿基）鍵聯之LNA單體與核芽（諸如rna或囊單體， 131124.doc •32· 200848077 最佳為DNA單體）。在各種μ %例中’寡聚物中存在之核苷類似物之至少一 /、有‘自由5甲基胞嘧啶、異胞嘧啶、假異胞嘧啶、5_ 、漠尿嘧啶、％丙炔基尿嘧啶、6-胺基嗓呤、2_胺基嗓呤、肌# 胺基不及2_氯-6_胺基嗓呤組成之群的經修飾之 ' 驗基。

LNA 術語"LNA單體"係指含有雙環糖（"lna糖"）之核苦類似物術e° LNA养核苷酸”及"LNA募聚物"係指含有一或多個LNA單體之募聚物。本發明之募聚物中所用iLNA單體較佳具有通式〗之結構： R5

其中 X係選自-0-、-S-、-N(Rn*)-、-C(R6R6*)- · B係選自氫、視情況經取代之Cl_4烷氧基、視情況經取代之C!·4烧基、視情況經取代之Cl_4醯氧基、核鹼基、 DNA嵌入劑、光化學活性基團、熱化學活性基團、螯合基團、報導體基團及配位體； P表示連接至後績單體之核苦間鍵或5’ -末端基團之基團位置’此核普間鍵或5f-末端基團視情況包括取代基r5或同 131124.doc -33- 200848077 樣可用之取代基r5+ ; P*表示連接至前接單體之核苷間鍵或3’-末端基團； R4*與R2*—起表示由1-4 、-C(Ra)=N_、_0_、-Si(Ra)2-、-S-、-S02-、_N(Ra)-及 >oz之基團/原子組成之雙基團；其中Z係選自-0-、-S-及-N(Ra)-，且Ra& Rb各自獨立地選自氫、視情況經取代之C 2烧基、視情況經取代之 Cm烯基、視情況經取代之Cm炔基、羥基、Ci i2烷氧基、C2」2烷氧基烷基、C2·〗2烯氧基、羧基、C丨·丨2烷氧基幾基、C】-】2烷基羰基、甲醯基、芳基、芳氧基-羰基、芳氧基、芳基羰基、雜芳基、雜芳氧基_羰基、雜芳氧基、雜芳基羰基、胺基、單（Cw烷基）胺基及二（Cl6烷基）胺基、胺f醯基、單（C1·6烷基）-胺基-羰基及二（C16烷基）_ 胺基-¾基、胺基-C!·6烧基•胺基羰基、單（CN6院基）胺基_ 1-6燒基-胺基|^基及一（(^1_6烧基）胺基_(^6燒基-胺基幾基、烷基-羰基胺基、胺甲醯胺基、Ci 6烷醯基氧基、砜基、Cw烷基磺醯基氧基、硝基、疊氮基、硫基、烷硫基、鹵素、DNA嵌入劑、光化學活性基團、熱化學活性基團、螯合基團、報導體基團及配位體，其中芳基雜务基可視情況經取代且其中兩個成對取代基汉&及Rb 起可表示視情況經取代之亞甲基（=CH2)，且存在之取代基R1*、R2、R3、r5、r5*、R6&R6*各自獨立地選自氫、視情況經取代之C112烷基、視情況經取代之稀基、視情況經取代之C2.12炔基、經基、CbW氧基、 131124.doc -34- 200848077 C2_12烷氧基烧基、Cm烯氧基、羧基、Cn12烧氧基羰基、 CN12烷基羰基、甲醯基、芳基、芳氧基-羰基、芳氧基、芳基羰基、雜芳基、雜芳氧基-羰基、雜芳氧基、雜芳基幾基、胺基、單（Cl-6烧基）胺基及二（Ci-6烧基）胺基、胺甲醯基、單（CN0烷基）_胺基-羰基及二（c〗_6烷基）-胺基-魏基、胺基-Ci_6烧基-胺基羰基、單（C〗·6烧基）胺基-cle6烧基-胺基罗厌基及一（Ci·6烧基基- C】·6烧基-胺基魏基、c1-6烧基-幾基胺基、胺甲醯胺基、C!.6烧醯基氧基、磯基、Cl6烧基石黃醯基氧基、硝基、疊氮基、硫基、c! 烧硫基、函素、 DNA嵌入劑、光化學活性基團、熱化學活性基團、整合基團、報導體基團及配位體，其中芳基及雜芳基可視情況經取代’且其中兩個成對取代基一起可表示側氧基、硫酮基、亞胺基或視情況經取代之亞曱基，或一起可形成由^ 5個碳原子伸烧基鏈組成之螺雙基團，該伸烷基鏈視情況穿插有一或多個選自-0-、_S-及雜原子/基團及/ 或由一或多個選自-0-、-S-及_(NRn)-之雜原子/基團終止’其中Rn係選自氫及Cl_4烧基’且其中兩個相鄰（非成對）取代基可表示產生雙鍵之另一鍵；且rN*(當存在且不乎及於雙基團中時）係選自氫及C1·4烧基；及其鹼性鹽及酸Z 成鹽。在某些實施例中，R”係選自Η、-CH3、、 -ch2-o-ch3及-CH=CH2。在各種實施例中，R4*及R2*—起表示選自以下各基團之雙基團·· -C(RaRb)-0-、-qRaR^CCReRc^i、_c(RaRb)- 131124.doc -35- 200848077 C(ReRd)_C(ReRf)-0-、-C(RaRb)-0-C(ReRd)-、-C(RaRb)-0-C(RcRd)-0-、-C(RaRb)-C(RcRd)-、-C(RaRb)-C(RcRd)-C(ReRf)-、-C(Ra)=C(Rb)-C(RcRd)-、-C(RaRb)-N(Re)-、-C(RaRb)-C(RcRd)-N(Re)-、-C(RaRb)-N(Rc)-〇-及-C(RaRb)-S-、 -C(RaRb)-C(RcRd)-S-，其中 Ra、Rb、Rc、Rd、RlRf各自獨立地選自氫、視情況經取代之C〗_i2烷基、視情況經取代之Cm烯基、視情況經取代之c2_12炔基、羥基、Chu烷氧基、Cm烷氧基烷基、C2-12烯氧基、羧基、（^_12烷氧基羰基、Cl基羰基、甲酿基、芳基、芳氧基-羰基、芳氧基、芳基羰基、雜芳基、雜芳氧基-羰基、雜芳氧基、雜芳基羰基、胺基、單（Ci-6烷基）胺基及二（Cw烷基）胺基、胺甲醯基、單（C〗·6烷基）-胺基-羰基及二（cK6烷基）_胺基-羰基、胺基-Cw烷基-胺基羰基、單（Cw烷基）胺基-Cl 6烷基_ 胺基幾基及二（Cw烷基）胺基-Cw烷基-胺基羰基、Cl_6烷基-¾基胺基、胺曱醯胺基、Cw烧醯基氧基、硬基、cK6 烧基續醯基氧基、硝基、疊氮基、硫基、C1-6烷硫基、鹵素、DNA嵌入劑、光化學活性基團、熱化學活性基團、螯合基團、報導體基團及配位體，其中芳基及雜芳基可視情況經取代且其中兩個成對取代基Ra&Rb一起可表示視情況經取代之亞甲基（=CH2)。在另一貫施例中，R4及R2 一起表示選自以下基團之雙基團：-ch2-〇-、-ch2_s_、-Ch2_nh…_CH2_N(CH3)、 -CH2-CHd、-CH2-CH(CH3)-、-ch2-ch2-s-、-ch2-ch2-

NH "CH2-CH2-CH2- % -CH2-CH2-CH2-O- ^ -CH2-CH 131124.doc -36- 200848077 CH(CH3). > -CH=CH-CH2· ^ -CH2-O-CH2-O- > -CH2-NH-0- 、-CH2-N(CH3)-〇-、-CH2-〇-CH2-、-CH(CH3)-0·、-CH(CHr 〇-CH3)-o … 對於所有對掌性中心而言，不對稱基團可見於π或s取向中本發明之寡聚物中所用之LNA單體較佳包含至少一個根據下式中任一者之LNA單體：

C

*z

叩丞ai私1示遴丞，B構成天然存在核酸中或不天然存在於、付於核酸中之未經修飾之鹼基部分或細修飾之鹼基部分，且rh 次、、二係選自氫及C!-4烷基。尤其較佳LNA單體展示於流程2中：

B

β-D-硫基-LNA

B β-D-ENA 131124.doc -37- 200848077

β-D-胺基-LNA 流程2 術語’’硫基-LNA”係指上文通式中之Y係選自S或-CH2-S-之LNA單體。硫基-LNA可為β-D或α-L構型。術語π胺基-LNAM系指上文通式中之Y係選自-N(H)-、 N(R)-、CH2-N(H)-及-CH2-N(R)-之 LNA單體，其中 R係選自氫及Cw烷基。胺基-LNA可為β-D或a-L構型。術語’’氧基-LNA”係指上文通式中之Y表示-0-或-CH2-0-之LNA單體。氧基-LNA可為β-D或a-L構型。術語’ΈΝΑ”係指上文通式中之Y為-CH2-0-之LNA單體 (其中-CH2-0-之氧原子連接至相對於鹼基B之2’位上）。在一較佳實施例中，LNA單體係選自β-D-氧基-LNA單體、a-L-氧基-LNA單體、β-D-胺基-LNA單體及β-D-硫基-LNA單體，尤其β-D-氧基-LNA單體。在本發明之上下文中，術語”匸^烷基”意謂直鏈或支鏈飽和烴鏈，其中該鏈具有1至4個碳原子，諸如甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、第二丁基及第三丁基。 RNAseH募集認識到募聚物可經由目標mRNA之非RNase介導之降解 (諸如藉由轉譯之空間位阻或其他機制）起作用；然而，本 131124.doc -38- 200848077 發明之較佳寡聚物能夠募集核糖核酸内切酶（RNase)，諸如 RNase Η。通系，养聚物包含至少6個，諸如至少7個連續單體，諸如至少8個或至少9個連續單體（包括7、8、9、10、11、 12、13、14、15或16個連續單體）之區域，當與目標rna 之目標區域形成雙鏈體時，其能夠募集RNase。能夠募集 RNase之养聚物之區域可為如下文所述之間隙聚合物之情 . 況中所提及的區域B。在某些實施例中，能夠募集RNase 之寡聚物之區域（諸如區域B)係由1〇、η、a、13、14、 15、16、17、18、19或20個單體組成。 ΕΡ 1 222 309提供測定RNaseH活性之活體外方法，其可用於測定本發明之募聚物募集RNaseH之能力。若滿足以下條件則認為募聚物能夠募集RNaseH :使用ep i 222 3〇9(其係以引用的方式併入本文中）之實例91_95所提供之方法，當募聚物與RNA目標之互補目標區域接觸時，其具有擁有相同鹼基序列但僅含有DNA單體之寡核苷酸（募核苷酸中之所有單體之間不具有2，取代，具有硫代磷酸酯鍵聯基團）之至少1 %、諸如至少5%、諸如至少丨〇%或小於 20%之初始速率（如以pm〇w/min所量測）。在各種實施例中，若滿足以下條件則認為募聚物基本上不能募集RNaseH :使用EP 1 222 309之實例91-95所提供之方法’當寡聚物與RNA目標之互補目標區域及RNaseH接觸時’ RNaseH初始速率（如以pm〇i/i/min所量測）小於使用具有相同鹼基序列但僅含有DNA單體之寡核苷酸（寡核苷 131124.doc -39- 200848077 酉文中之所有單體之間不具有2,取代，具有硫代磷酸酯鍵聯基團）測定之初始速率的1%、諸如小於5°/。、諸如小於10% 或小於20%。在其他實施例中，若滿足以下條件則認為寡聚物能夠募 • 集RNaseH :使用EP } 222 3〇9之實例91·95所提供之方法，當募聚物與RNA目標之互補目標區域及RNaseH接觸時， RNaSeH初始速率（如以pmol/1/min所量測）為使用具有相同 r 驗基序列但僅含有DNA單體之寡核苷酸（募核苷酸中之所 ‘有單體之間不具有2’取代，具有硫代磷酸酯鍵聯基團）測定之初始速率的至少20%、諸如至少40%、諸如至少60%、諸如至少80%。通常，與目標RNA之互補目標區域形成雙鏈體且能夠募集RNase之募聚物之區域可含有DNA單體及LNA單體且可與目標區域形成DNA/RNA樣雙鏈體。LNA單體較佳為a-L 構型’尤其較佳為a-L-氧基LNA〇本發明之寡聚物可包含核苷與核苷類似物，且可為間隙聚合物、頭聚合物（headmer)或混合聚合物（mixmer)之形式。 • ”頭聚合物”係定義為包含第一區域及與其連續之第二區 • 域的募聚物，其中該第二區域之5’端單體與該第一區域之 3*端單體鍵聯。該第一區域包含一段連續之非RNase募集之核苦類似物，且該第二區域包含一段連續（諸如至少7個連續單體）之DNA單體或可由RNase識別及裂解之核苷類似物單體。 131124.doc -40- 200848077 ”尾聚合物（tailmer)"係定義為包含第一區域及與其連續之第二區域的募聚物，其中該第二區域之5,端單體與該第一區域之3’端單體鍵聯。該第一區域包含一段連續（諸如至少7個此等單體）之dna單體或可由RNase識別及裂解之核苦類似物單體，且該第二區域包含一段連續之非RNase募集之核皆類似物單體。其他’’嵌合’’寡聚物（稱作”混合聚合物”）係由（i)DNA單體或可由RNase識別及裂解之核苷類似物單體及（ii)非RNase 募集之核苷類似物單體之交替組合物組成。在一些實施例中，除增強寡聚物對目標區域之親和力之外些核普類似物亦介導RNase(例如，RNaseH)結合及裂解。在一些實施例中，因為a_L_LNA單體在特定程度上恢復RNase活性，所以含有a_L_LNA單體之募聚物之間隙區域（例如’如下文中所提及之區域B)係由較少可由識別及裂解之單體組成，且在混合聚合物結構中引入更大靈活性。間隙聚合物設計本發明之募聚物較佳為間隙聚合物。 ”間隙聚合物，，為包含能夠募集RNase(諸如RNaseH)之一段連續單體（諸如至少6或7個DNA單體之區域，在本文中稱作區域B)的寡聚物，其中區域B在其5，端與3，端上由分別稱作區域A及區域c之區域側接，區域a及區域c各自包含以下各物或由以下各物組成：核苷類似物，諸如增強親和力之核苷類似物，諸如1-6個核苷類似物。 131124.doc -41 - 200848077 該間隙聚合物較佳自5·至3,包含區域A_B_C4視情況a_b 一 C-D或D-A-B-C，其中：區域A係由以下各物組成或包含以下各物·至少一個核苷類似物，諸如至少一個Lna單體，諸如1-6個核苷類似物，諸如LNA單體；且區域B係由以下各物組成或包含以下各物：能夠募集RNase之至少五個連續單體（當與目標RNA分子（諸如mRNA目標）之互補目標區域形成雙鏈體時），諸如DNA單體；且區域c係由以下各物組成或包含以下各物：至少一個核苷類似物，諸如至少一個LNA單體，諸如丨_6個核苷類似物，諸如LNA單體；且區域D(若存在）係由以下各物組成或包含以下各物：1、2 或3個單體，諸如DNA單體。在各種實施例中，區域A係由1、2、3、4、5或6個核苦類似物，諸如LNA單體，諸如2-5個核苷類似物，諸如2巧個LNA單體，諸如3或4個核苷類似物，諸如3或4個11^八單體組成，及/或區域C係由1、2、3、4、5或ό個核苷類似物，諸如LNA單體，諸如2-5個核苷類似物，諸如2_5個 LNΑ單體’諸如3或4個核苦類似物，諸如3或4個LNΑ單體組成。在某些實施例中，區域B係由以下各物組成或包含以下各物·能夠募集RNase之5、6、7、8、9、1〇、11或12個連續單體，或能夠募集RNase之6-10個或7_9個、諸如8個連續單體。在某些實施例中，區域B係由以下各物組成或包含以下各物：至少一個DNA單體，諸如U2個DNA單體，較佳4-12個DNA單體，更佳6-10個DNA單體，諸如7_10個 131124.doc -42- 200848077 DNA單體，最佳8、9或i〇個DNA單體。在某些實施例中，區域A係由3或4個核苷類似物（諸如 LN A單體）組成，區域b係由7、8、9或10個DN A單體組成’且區域C係由3或4個核苷類似物（諸如LNA單體）組成。此等設計包括（八-丑-(：)3-10-3、3-10-4、4-10-3、3-9-3、3-9_4、4-9-3、3-8-3、3_8-4、4-8_3、3-7-3、3-7_4、4_ 7-3 ’且可進一步包括區域d，其可具有1或2個單體（諸如 DNA單體）。其他間隙聚合物設計係揭示於W〇 2004/046160中，該文獻係以引用的方式併入本文中。美國臨時申請案60/977,409(其係以引用的方式併入本文中）涉及’’短聚合物（sh〇rtmer)，，間隙聚合物寡聚物，在某些實施例中’其可為根據本發明之間隙聚合物募聚物。在某些貫施例中，寡聚物係由1 0、1 i、12、1 3或14個連縯單體組成’其中該寡聚物之區域具有類型（5，_3，）a_b_c 或視情況A-B-C-D或D-A-B-C，其中：區域a係由1、2或3 個核苷類似物單體（諸如LNA單體）組成；區域B係由在與互補RNA分子（諸如mRNA目標）形成雙鏈體時能夠募集 RNAse之7、8或9個連續單體組成；且區域c係由丨、2或3 個核苷類似物單體（諸如LNA單體）組成。若存在，則區域 D係由單一 DNA單體組成。在某些貫施例中’區域A係由1個LNA單體組成。在某此實施例中，區域A係由2個LNA單體組成。在某些實施例中，區域A係由3個LNA單體組成。在某些實施例中，區域 131124.doc -43- 200848077 C係由1個LNA單體組成。在某些實施例中，區域c係由2個 LNA單體組成。在某些實施例中，區域C係由3個LNA單體組成。在某些實施例中，區域B係由7個核苷單體組成。在某些實施例中，區域B係由8個核苷單體組成。在某些實施例中’區域B係由9個核普單體組成。在某些實施例中，區域B包含1-9個DNA單體，諸如2、3、4、5、6、7或8個 DNA單體。在某些實施例中，區域b係由DNA單體組成。在某些實施例中’區域B包含至少一個呈α-L構型之LNA單體，諸如2、3、4、5、6、7、8或9個呈a_L構型之LNA單

體。在某些實施例中，區域B包含至少一個a_L_氧基lNA 單體或其中呈a-L構型之所有LNA單體均為a-L-氧基LNA單體。在某些實施例中，募聚物之A_B_C區域中存在之單體的數目係選自由以下（核苷酸類似物單體_區域B _核苷類似物單體）組成之群·· ^、1_8_2、Μ」、2_8_2、3_8j、 2-8-3 、 3_8-2 、 4_8-1 9-2、2-9-1、2-9-2、、4-8_2 、 1-8-4 、 2-8-4 ;或 1-9-1 、 2-9-3、3-9-2、1-9-3、3-9-1、4-9-1

1-9-4 或 1-10-1 、 1_1〇_2 2-10-1 > 2-1〇-2 1-10-3及 3-10- 1。在某些實施例中，本發明寡聚物之A-B-C區域中存在之單體的數目係選自由m、 3-7-2、3-7-4及4-7-3組成之群。在某些實施财，區域a 及區域C各自由兩個厲單體組成，且區域B係由8或9個核苷早體、較佳DNA單體組成。其他間隙聚合物設計包括以下設計·其中區域A及/或區 VC係由3、4、5或6個核_類似物，諸如含有2，·〇-甲氧基 131124.doc -44- 200848077 乙基-核糖（2’MOE)之單體及含有2，_ ι _去氧核糖之單體組成，且區域B係由8、9、1〇、以12個核苷（諸如脈八單體）組成，其中區域A_B_C具有5_1〇_5或4_12_4單體。其他間隙聚合物設計係揭示於W〇 2007/1465 1 1A2中，該文獻係以引用的方式併入本文中。鍵聯基困本發明之募聚物之單體係經由鍵聯基團偶合在一起。各單體適宜地經由鍵聯基團與3,相鄰單體鍵聯。術語f’鍵聯基團”或”核苷間鍵”意謂能夠將兩個連續單體共價偶合在一起之基團。特定且較佳實例包括磷酸酯基團 (在相鄰核苦單體之間形成磷酸二酯）及硫代磷酸酯基團（在相鄰核苷單體之間形成硫代磷酸酯）。適合鍵聯基團包括WO 2007/03 1091内所列出之鍵聯基團，例如WO 2007/03 1091(其係以引用的方式併入本文中）之第34頁之第一段中列出之鍵聯基團。在各種實施例中，較佳將鍵聯基團自其正常磷酸二酯修飾為更抵抗核酸酶攻擊者（諸如硫代磷酸酯或硼烷磷酸酯），可由RNaseH裂解之此兩者允許RNase介導之目標基因表現之反義抑制。如本文中所提供之適合含硫（8)鍵聯基團可較佳。硫代磷酸酯鍵聯基團亦較佳，尤其對於間隙聚合物之間隙區域 (B)而言。硫代磷酸酯鍵亦可用於側接區域（適當時，A及 C，且對於將A或C與D鍵聯而言，且在區域D内）。然而，區域A、B及C可包含除硫代磷酸酯外之鍵聯基團 131124.doc -45- 200848077 (諸如磷酸二酯鍵），尤其例如當使用核苷類似物保護區域 A及區域C中之鍵聯基團免於核酸内切酶降解時，諸如當區域A及區域C包含LNA單體時。募聚物中之鍵聯基團可為磷酸二酯、硫代磷酸酯或硼烷辑ί文酉曰以允§午目標RNA之RNaseH裂解。出於改良核酸酶抗性及其他原因（諸如易於製造），硫代麟酸酯較佳。在各種實施例中，寡聚物之相鄰單體藉由硫代磷酸酯基團彼此鍵聯。認識到在具有硫代磷酸酯主鏈、尤其具有在核苷類似物單體之間或與核苷類似物單體相鄰（通常在區域A及/或區域C中）的硫代填酸酯鍵聯基團之寡聚物中包括鱗酸二酯鍵 (諸如一或兩個鍵）可修飾寡聚物之生物可用性及/或生物分布，參見WO 2008/053314，其係以引用的方式併入本文中。在一些實施例（諸如上文提及之實施例）中，若適當且未特定說明，則所有剩餘鍵聯基團為磷酸二酯或硫代磷酸酯或其混合物。在一些實施例中，所有核苷間鍵聯基團為硫代磷酸酯。當提及特定間隙聚合物募核苷酸序列（諸如本文中所提供之間隙聚合物募核苦酸序列）時，應瞭解，在各種實施例中，當鍵為硫代磷酸酯鍵時，可使用替代性鍵（諸如本文中所揭示之鍵）’例如可使用鱗酸g旨（碌酸二g旨）鍵，尤其對於核苷類似物（諸如LNA單體）之間的鍵而言。同樣，當提及特定間隙聚合物募核苷酸序列（諸如本文中所提供之 131124.doc -46- 200848077 間隙聚合物寡核苦酸序列）時，若胞σ密σ定鹼基之一或多者表示為5-甲基胞嘧啶，則寡聚物中存在之其他胞嘧啶鹼基可未經修飾。寡聚物 ’ 在某些實施例中，本發明之寡聚物係選自由如表2中所示之SEQ ID NO: 133-152組成之群。 • 在表2中，大寫字母指示核苷類似物單體且下標”s”表示硫代磷酸酯鍵。小寫字母表示核苷（DNA)單體。不存在 ^ ns”（若存在）指示磷酸二酯鍵。 1 表2 寡聚物設計 SEQ ID NO 序列(5’-3’）長度(鹼基） SEQIDNO: 133 GsAsAsasgscstsgsastsgsgsasCsCsA 16 SEQ ID NO: 134 CsAsGsascststsasasasgsastsGsGsC 16 SEQ ID NO: 135 CsAsGsasastscscsascstsgsgsTsGsA 16 SEQ ID NO: 136 GsCsAscstsgscscsaststststsAsGsC 16 SEQ ID NO: 137 GsTsAsastsasgscscsasasgsasAsTsT 16 SEQ ID NO: 138 AsCsTscstsgscststsgstsgsgsTsCsC 16 SEQ ID NO: 139 CsCsAscscsasgscststscstsasCsAsA 16 SEQ ID NO: 140 GsAsGstscscsasasasgsascsasGsTsT 16 SEQ ID NO: 141 AsCsCscsascststsgsgscsasgsAsCsC 16 SEQ ID NO: 142 GsCsAscsasasascsasastsgsgsAsAsT 16 SEQ ID NO: 143 GsCsAsgscstsascstscstststsGsGsA 16 SEQ ID NO: 144 CsTsCscscstscsasgscststscsAsAsT 16 SEQ ID NO: 145 GsCsAsgstscstscsaststscscsAsAsG 16 SEQ ID NO: 146 TsAsTscscsascscsasgsasgstsGsAsA 16 SEQ ID NO: 147 CsAsTscscsastsgsasgsgstscsCsTsG 16 SEQ ID NO: 148 CsCsAstscststsgstsgsastscsCsAsT 16 SEQ ID NO: 149 AsAsGscsasasgscsasasasgstsCsAsG 16 SEQ ID NO: 150 GsAsAsaststsgscstsgstsasgsCsAsG 16 SEQ ID NO: 151 GsTsGststscstsascsascscsasTsTsA 16 SEQ ID NO: 152 AsAsCsastsgsasasastsasgsasTsCsC 16 結合物在本揭示中，術語π結合物π指示一種由本文中所述之募聚物與一或多種自身不為核酸或單體之部分（π結合部分") 131124.doc -47- 200848077 共價連接（”結合丨丨）所來士 μ 人 )所形成的化合物。此等結合部分之匕括大分子化合物，諸如蛋、蛋白、聚合物或其組合。通常，蛋白質可為目標蛋白之：體。典型聚合物可為聚乙二醇。w7/咖91提供= 部分及結合物’該文獻係以引用的方式併入本文中。… 因此，本文中提供結合物’其包含如本文中所述之寡聚物及至少一個不為核酸連接。因* ― 之結合部分與該寡聚物共價續單體組成，罝有如太令由力本發明之养聚物係由連結合物亦可^ 文中所揭示之特定驗基序列，則該 / i3至少—個結合部分與該寡聚物共價連接。 …ΐ實施例中’該寡聚物與—個增加寡聚化合物之細胞攝取的部分結合。取結可增強本發明寡聚物之活性、細胞分布或細胞攝部分包括（但不限於）抗體；多肽；脂質部分，諸如膽固醇邱八么日貝口丨刀石1臃，硫醚，例如己基-s-三苯甲基硫醇，

硫代膽固醆· nt H 知，知族鏈，例如十二烷二醇或十一烷基殘基；鱗月曰，例如_ —-十六烷基-rac_甘油或丨，2_二_鄰十六 rac_甘油其。烷乙酸.土膦酸三乙銨；多元胺或聚乙二醇鏈；金剛 _ γ &根1基部分；十八烧基胺或己基胺基-幾基-氧基膽固醇部分。本發明> t η 々忒物亦可與活性藥物物質（例如阿司匹林 (aspirin)、 p _ 々洛分（ibuProfen)、磺胺藥（sulfa drug)、抗糖 i/L、、母菌劑或抗生素）結合。在*某坦j # 汽也例中，結合部分為固醇，諸如膽固醇。 131124.doc -48- 200848077 在各種實施例中，結合部分包含帶正電聚合物或由帶正電聚合物組成，諸如長度為例如1-50、諸如2-20、諸如3-1〇個胺基酸殘基之帶正電肽，及/或聚烷醚（諸如聚乙二醇 (PEG)或聚丙二醇），參見w〇 2〇〇8/〇34123，其係以引用的方式併入本文中。帶正電聚合物（諸如聚烷醚）可適宜地經由連接子（諸如WO 2008/034123中所述之可釋放連接子）與本發明之寡聚物連接。活化募聚物如本文中所用，術語”活化寡聚物，，係指與至少一個允許秦聚物與一或多個結合部分（亦即，自身不為核酸或單體之部分）共價鍵聯之官能部分共價鍵聯（亦即官能化）形成本文中所述之結合物的本發明寡聚物。通常，官能部分將包含能夠經由（例如）3’-羥基或腺嘌呤鹼基之環外nh2基團與养♦物共彳貝鍵結之化學基團，在一些實施例中具有親水性之間隔基及能夠與結合部分（例如，胺基、巯基或羥基）結合之末端基團。在一些實施例中，此末端基團未經保護，例如為NH2基團。在其他實施例中，末端基團係由（例如）任何適合保護基（諸如Theodora W Greene及Peter G M Wuts 之’’Protective Groups in Organic Synthesis，，，第 3 版（John

Wiley & Sons，1999)中所述之保護基）保護。適合羥基保護基之實例包括酯，諸如乙酸酯；芳烷基，諸如苄基、二苯基甲基或三笨基甲基及四氫哌喃基。適合胺基保護基之實例包括苄基、α-甲基苄基、二苯基曱基、三苯基甲基、苄氧羰基、第三丁氧羰基及醯基（諸如三氯乙醯基或三氟乙 131124.doc -49- 200848077 醯基）。在二貝施例中，g能部分係自裂解。在其他實施例中g^刀可經生物降解。例如參見美國專利第 7,087,229號’其係以引用的方式全部併入本文中。在-些實施例中’本發明之募聚物在5,端經官能化以允許結合部分與募聚物之⑼共價連接。在其他實施例中，本發明之寡聚物可在3’端處經官能化。在其他實施例中，本發明之募聚物可沿主鏈或在雜環鹼基部分上經官能化。在其他實施例中，纟發明之募聚物可在一個以上獨立地選自5’端、31端、主鏈及鹼基之位置上經官能化。在一些實施例中，本發明之活化募聚物係藉由在合成期間併入一或多個與官能部分共價連接之單體來合成。在其他貝轭例中，本發明之活化寡聚物係以未經官能化之單體來合成’且寡聚物係在合成完成後經官能化。在一些實施例中，募聚物係以含有胺基烷基連接子之位阻酯來官能化，其中烷基部分具有式（CH2)w，其中〜為在1 至1〇之範圍内之整數，較佳為約6，其中烷基胺基之烷基部分可為直鏈或支鏈，且其中官能基係經由酯基（_〇_c(〇)_ (CH2)WNH)與募聚物連接。在其他實施例中，募聚物係以含有（CH2)W-巯基（SH)連接子之位阻酯來官能化，其中w為在1至10之範圍内之整數，較佳為約6，其中烷基胺基之烷基部分可為直鏈或支鏈，且其中官能基係經由酯基與募聚物連接。在一些實施例中，魏基活化之寡核苷酸係與諸如聚乙 131124.doc -50- 200848077 二醇之聚合物部分或肽（經由形成二硫鍵）結合。與至少一個官能部分共價鍵聯之活化寡聚物可藉由此項技術中已知之任何方法且尤其藉由美國專利公開案第 2004/023 5 773號（其係以引用的方式全部併入本文中）及

Zhao荨人 ’（2〇〇7) 1 19:143-152;及

Zhao寺人 ’（2005)价16:758-766 中所揭示之方法來合成。在其他實施例中，本發明之寡聚物係藉助於大體上如美國專利第4,962,029號及第4,914,210號中所述之官能化試劑 (亦即，在經由親水性間隔基鏈與相對端鍵聯之一端處具有胺基磷酸酯之大體上線性試劑，其包含經保護或未經保護之巯基、胺基或羥基）藉由將巯基、胺基或羥基引入募聚物中來官能化。此等試劑主要與募聚物之羥基反應。在一些實施例中’此等活化寡聚物具有與募聚物之5，_經基偶合之官能化試劑。在其他實施例中，活化寡聚物具有與3，_ 經基偶合之官能化試劑。在其他實施例中，本發明之活化募聚物具有與寡聚物主鏈上之羥基偶合之官能化試劑。在其他實施例中’本發明之募聚物係經一種以上如美國專利第4,962,029號及第4,914,210號（其係以引用的方式全部併入本文中）中所述之官能化試劑官能化。合成此等官能化試劑且將其併入單體或募聚物中之方法係揭示於美國專利第 4,962,029號及第 4,914,210號中。在一些實施例中’固相結合之募聚物之5 ’末端係經二稀基胺基磷酸酯衍生物官能化，接著去保護募聚物經由狄爾 131124.doc -51 - 200848077 斯-阿爾德（Diels-Alder)環加成反應與（例如）胺基酸或肽結合。在各種實施例中’將含有2f -糖修飾之單體（諸如2 胺基曱酸酯取代糖或2^(0-戊基-N-鄰苯二醯亞胺基）_去氧核糖）併入寡聚物中有助於結合部分與寡聚物之糖之共價連接。在其他實施例中，使用諸如5^二甲氧基三苯曱基_2，_〇-(e-鄰苯二醯亞胺基胺基戊基）-2’-去氧腺苷-3，-N，N-二異丙基一氣基乙氧基胺基鱗酸S旨之試劑來製備在一或多個單體之2，_ 位置處具有含胺基之連接子的募聚物。例如參見

Manoharan等人 ’ Tetrahedron Letters，1991，34，7 1 71 〇在其他實施例中’本發明之募聚物在核鹼基上（包括在 N 6σ示吟胺基上’在鳥σ示σ令之ί衣外N 2上或在胞σ密U定之n 4或5 位置上）具有含胺之官能部分。在一些實施例中，可藉由使用已在募聚物合成中經官能化之商業試劑來達成此官能化。一些官能部分可購得，例如，異雙官能及同雙官能鍵聯部分係獲自Pierce Co.(Rockford，111.)。其他市售鍵聯基團為5 ^胺基-修飾劑C 6及3 ’ -胺基-修飾劑試劑，兩者均獲自

Glen Research Corporation(Sterling，Va·)。5’-胺基-修飾劑 C6 亦以 Aminolink-2 獲自 ABI(Applied Biosystems Inc·， Foster City，Calif·)，且 3’-胺基-修飾劑亦獲自 ci〇ntech Laboratories Inc.(Palo Alto，Calif·)。組合物本發明之募聚物可以醫藥調配物及組合物形式使用。此 131124.doc -52- 200848077 等組合物適宜地包含醫藥學上可接受之稀釋劑、載劑、越或佐劑。wo _勒则提供適合且較佳之醫藥學上可接受之稀釋劑、載劑及佐劑，該文獻係以引用的方式併入本文中。適合劑量、調配物、投藥途徑、組合物、劑型、與其他治療劑之組合、前_配物亦提供於WO 2007/03^ 中，其亦係以引用的方式併入本文中。如本文中所用，術語丨丨馨龜與，文中所鑑別化合物之所之鹽"係指保持本初之所而生物活性且顯示可接受程度之性效應之鹽。此等鹽之非限制性實例可由有機胺基 : 下各物形成之鹼加成鹽形成：金屬陽離子，諸如辞、舞、祕、銷、鎮、銘、銅、始、録、锅、類似物；或由氨、一評及四乙銨或伸乙基二胺二基入^ 攻之％離子，或⑷⑷與（b)之組 &，例如，丹寧酸辞鹽或其類似物。應用提及之Γ =用之# m'係指現有疾病（例如如下文所 &及之疾m症）之治療或疾狀預將認識到：在某些實施例中，"治療"包括預防因此研:=之募聚物可用作用於（例如）診斷、治療及預防之中用於_p制細胞及實驗動物 m魏且&解—連接蛋白或其作為治療干預之目標i有效性的而=目標之功能分析 131124.doc -53· 200848077

現在診斷學中’寡聚物可用於藉由北方墨點法、原位雜交類似技術來偵測及定量細胞及組織中之β·連接蛋白表

對於治療學而言，藉由投與有效量之根據本發明之募聚物(或其結合物)來治療疑似患有可藉由調節β_連接蛋白之表現來治療之疾病或病症的非人動物或人。進一步提供藉由投與治療或預防有效量之—或多種本發明之募聚物或: 合物來治療疑似患有或傾向於患上與Ρ-連接蛋白表現相關之疾病或病狀之哺乳動物（諸如人）的方法。本發明亦提供如所述之本發明之化合物或結合物的用途’其係用於製造供治療如本文中所提及之病症用的藥物，或用於治療如本文中所提及之病症的方法中。本發明亦係關於一種如本文中所述之募聚物、組合物或結合物，其係用作藥物。本發明亦提供一種治療如本文中所提及之病症的方法，該方法包含向有需要之患者投與有效量之如本文中所述之根據本發明之化合物及/或有效量之根據本發明之結合物及/或根據本發明之醫藥組合物。在各種貝施例中，养聚物或其結合物經由（例如）與目標核酸氫鍵結而在人類中誘導所需治療作用。寡聚物經由與目標之mRNA氫鍵結（雜交）而使目標之表現降低（抑制），進而使得基因表現降低。亦預計本文中所揭示之寡聚物及結合物可具有非治療性應用，諸如診斷應用。本發明之化合物極佳能夠藉由沃森-克里克鹼基配對而 131124.doc -54- 200848077 與目標核酸（諸如β·連接蛋白mRNA)雜交醫學適應症在某些治療實施例中’待治療之病症係選自由過度辦生性病症（諸如癌症）組成之群，該癌症係、諸如選自由以;各病組成之群：結腸直腸癌、肝細胞癌、子宮内膜癌、惡性黑素瘤、卵巢癌、胰腺癌、垂體癌、食道癌、肺癌、乳癌、腎癌、造企系統癌症、子宮頸癌、CNs癌、骨癌、膽道癌及腎上腺癌。 °

在某些實施例中，病症為選自由結腸直腸癌、肝細胞癌子呂内膜癌及惡性黑素瘤組成之群的癌症。在某些實施例中，病症為選自由肝癌及腎癌組成之群的癌症。在某些實施例中，疾病或病症與卜連接蛋白基因或其蛋白質產物與卜連接蛋白相關或與卜連接蛋白相互作用之基因（諸如APC基因）的突變有關。因此，在各種實施例中，目標mRNA為β-連接蛋白序列之突變形式，舉例而言，其可包含一或多個單點突變，諸如與癌症相關之SNp。 β-連接蛋白或APC基因之突變導致異常程度之β_連接蛋白活性的此等疾病之實例為：（丨）結腸直腸癌，在所有情況之大於70%情況下，APC與β-連接蛋白共同突變（？0〜61丨等人，Nature，1992，· Morin等人，Science，1997 ;外純缚人’ Cancer Res，1998); (2)肝細胞癌，在大於25%之情況下，β-連接蛋白突變（de La Coste A，PNAS，1998); (3)子宮内膜癌’ β-連接蛋白突變>10% ;及（4)惡性黑素瘤，β一 131124.doc -55- 200848077 連接蛋白突變 >100/〇(Rubinfeld等人，Science，1997)。此等疾病之其他實例為卵巢癌、胰腺癌、垂體癌、食道癌、肺癌、乳癌、腎癌、造血系統癌症、子宮頸癌、cNS 癌、骨癌、膽道癌及腎上腺癌。已展示連接蛋白或APc 基因之突變與該等疾病相關（癌症中體細胞突變之目錄係獲自 Sanger lnstitute(英國）主頁 hUp://www sanger ac uk/)。在某些實施例中’疾病或病症與β_連接蛋白之突變形式之$ έ 1相關。在某些實施例中，疾病或病症與卜連接蛋白之野生型形式之異常含量相關。本發明之一態樣係關於一種治療罹患或易患上與β _連接蛋白之異常含量相關之病狀的哺乳動物之方法，其包含向該哺乳動物投與治療有效量之向β-連接蛋白之本發明寡聚物或其I種組合物或結合物。在一些實施例中，寡聚物包含一或多個[ΝΑ單元0 適合劑量、調配物、投藥途徑、組合物治療劑之組合、前藥調配物亦提供於w〇 2〇〇7/〇31〇91中，，文獻係以引用的方式併人本文中。本發明亦提供一種醫藥組合物，其包含如本文中所述之化合物或結合物或結合物及醫藥學上可接受之稀釋劑、载劑或佐劑。w〇 2007/〇31〇91提供適合且較佳之醫藥學上可接受之稀釋劑、載劑及佐劑’該文獻係以弓丨用的方式併人本文中。 :外直：文中所述之本發明涵蓋—種預防或治療疾病之二向需要此療法之人投與治療有效量之調節卜連接蛋白之募聚物。本發明進一步涵蓋短期投與調節卜連 131124.doc -56- 200848077 接蛋白之寡核苷酸化合物（募聚物或結合物）的用途。在各種實施例中，本發明係關於一種治療異常含量之β_ 連接蛋白之方法，其包含投與⑴有效量之本發明之結合物或其組合物’及（ii)有效量之第二藥劑。在一些實施例中，泫結合物與該第二藥劑之投與係同時進行。在其他實施例中，該結合物與該第二藥劑之投與係依次進行。通常，該第二藥劑與寡聚物共價鍵聯，形成結合物。其他實施例

以下為其他實施例，且可與上述實施例及隨附申請專利範圍中列出之實施例組合： 1· 一種反義寡核苷酸（諸如寡聚物），其能夠與seq ID NO: 173之β-連接蛋白基因或其對偶基因之目標序列結合且下調β·連接蛋自之表現，該募核:g：酸包含對應於該目標序列之10-50個核鹼基之序列。 2.如實施例1之反義寡核苷酸，其中該目標序列係選自由SEQ m NO: W32表示之β_連接蛋白基因或其對偶基因變異體之區域。 3·如實施例1或實施例2之寡核苷酸，其包含seq idn〇 1、16、17、18、33、34、49、50、51、52、53、54、之10-16個核 55、56、57、58、73、88、103 及 118 中所示驗基之序列或其對偶基因變異體。

其包含如SEQ ID 4·如實施例1-3中任一者之募核苷酸 NO: 1-132所示之序列。

其係由SEQ ID 5 ·如前述實施例中任一者之募核苷酸， 131124.doc -57- 200848077 NO: 133-172 表示。 6·如前述實施例中任一者之募核苷酸，其中該核鹼基序列包含獨立地選自磷酸二酯、硫代磷酸酯及硼烷磷酸酯之核驗基間鍵。 7·如前述實施例中任一者之寡核苷酸，其中該等核鹼基之至少兩者為核苷酸類似物。 ’ 8·如實施例5之募核苷酸，其中該核鹼基序列在5,至3,方向上包含⑴區域A : —段2-4個核苷酸類似物，接著（ii)區 1 域B •一段11個不同於區域A之核苷酸或核苷酸類似物，接著（ill)區域C : 一段2-4個核苷酸類似物，及視情況接著 (iv)區域D : —或兩個核苷酸。 9 ·如貫施例8之寡核苷酸，其中該區域a在兩個核苷酸類似物單元及/或一核苷酸類似物單元與區域B之一核鹼基單元之間包含至少一個磷酸二酯鍵。 10·如實施例8或實施例9之寡核苷酸，其中區域C在兩個 I 核苷酸類似物單元及/或一核苷酸類似物單元與區域B之一核鹼基單元之間包含至少一個磷酸二酯鍵。 11 ·如實施例1至6中任一者之寡核苷酸，其中所有該等 • 核鹼基間鍵均為硫代磷酸酯。 • 12 ·如實施例7至11中任一者之寡核苦酸，其中該等核苦酸類似物單元獨立地選自2’·0-烷基-RNA、2，-胺基-DNA、 2匕氟-DNA、鎖定核酸（LNA)、阿拉伯糖核酸（ΑΝΑ)、2，__ 氟·ΑΝΑ、HNA、INA及 2’-MOE。 13 ·如實施例12之寡核誓酸’其中該等核普酸類似物獨 131124.doc -58- 200848077 立地選自 2，-M0E-RNA、2，-氟-DNA 及 LNA。 14·如實施例13之寡核苷酸，其中該等核苷酸類似物之至少一者為鎖定核酸（LNA)。 1 5 ·如貫施例丨4之寡核苷酸，其中所有該等核苷酸類似物均為LNA。 16·如實施例丨2至15中任一者之募核苷酸，其中lNA係選自β-D-氧基_LNA、a_L-氧基_LNA、β_〇_胺基―以^及卜 D-硫基-LNA。

1 7· —種結合物，其包含如前述實施例中任一者之募核苷fee及至少一個與该养核苷酸共價連接之非核苷酸或非聚核苦酸部分。 18.如實施例17之結合物，其中該非核苦酸或非聚核苦酸部分係由諸如膽固醇之固醇基團組成或包含諸如膽固醇之固醇基團。 19·一種醫藥組合物，其包含如實施例丨至η中任一者之寡核苷酸或如實施例17或實施例18之結合物，及醫藥學上可接受之稀釋劑、載劑或佐劑。 2 0.如實施例1至1 8中任一者之寘松讧分 τ你有之养核苷酸或結合物，苴传用作藥物。八 21. 一種如實施例1至18中任-者之寡核苦酸或結合物之用途，其彻於製造供治療異f含量之μ接蛋白•連接蛋白表現下調所指示之疾病或病狀用的藥物。 22. 如實施例2!之用途’其，該疾病或病狀為癌症。 23. 一種治療罹患癌症之個體的方法，該方法包含以下 131124.doc •59- 200848077 步驟：向有需要之該個體投與如實施例丨至19中任一者之醫藥組合物、寡核苷酸或結合物。 24·如實施例21-23中任-者之用途或方法，其中該癌症惡性黑素乳癌、腎膽道癌及係選自結腸直腸癌、肝細胞癌、子宮内膜痒瘤、卵巢癌、胰腺癌、垂體癌、食道癌、肺癌癌、造血系統癌症、子宮頸癌、CNS癌、骨癌腎上腺癌。

25.-種β-連接蛋白基因内之目標序列，其中對應於該目標序列之反義募核苷酸能夠下調卜連接蛋白之表現。 26·如實施例25之目標序列，i中哕八Τ Θ目軚序列係選自與 SEQ ID NO: Μ32互補之β·連接蛋白基因或其對偶基因變異體之區域。 27·—種下調細胞中之β-連接蛋白表現的方法，其包含使該細胞與如實施例1-16中任一者之募核苷酸接觸。各實例實例1 :單艎合成根據公開程序及其中引用之參考文獻來製備LNA單體架構基塊及衍生物’參見WO 07/03 1081及其中引用之表' 獻。 $考文實例2 :寡核苷酸合成根據WO 07/〇31〇81中所述之方法來合成募核苦酸。表工展示本發明之反義寡核苷酸基元之實例。實例3 :寡核苷酸之設計根據本發明，使用公開序列（GenBank寄存編龙 131124.doc -60· 200848077 NM—001904，在本文中呈現為SEQ ID NO: 173)，設計一系列寡核苷酸以靶向人類β-連接蛋白mRNA之不同區域。表2展示本發明之寡聚物設計。表3展示24聚體序列基元，可自其設計本發明之寡聚物，粗體類型表示併入較長寡聚物中之如表1中所示之16聚體序列基元。表3 P-連接蛋白24聚體序列 16聚體SEQ ID 短聚合物 SEQ ID 化合物ID 24聚體SEQ ID 24聚體 SEQ ID SEQ ID NO: 1 2-15 133-153 tttagaaagcteatesaccataac 174 SEQ ID NO: 16 134-154 cctccagacttaaaeateeccagt 175 SEQ ID NO: 17 135-155 aacacagaatccactseteaacca 176 SEQ ID NO: 18 19-32 136-156 aaac2cact2ccatttta2ctcct 177 SEQ ID NO: 33 137-157 tgtcstaatagccaaeaatttaac 178 SEQ ID NO: 34 35-48 138-158 cagcactctgcttetsstccacag 179 SEQ ID NO: 49 139-159 cattccaccaecttctacaatagc 180 SEQ ID NO: 50 140-160 ctgagactccaaasacasttctga 181 SEQ ID NO: 51 141-161 taccacccacttsscasaccatca 182 SEQ ID NO: 52 142-162 asct2cacaaacaate2aatsgta 183 SEQ ID NO: 53 143-163 ccctgcasctactctttgsatgtt 184 SEQ ID NO: 54 144-164 gtggctccctcascttcaatagct 185 SEQ ID NO: 55 145-165 atcaecastctcattccaaeccat 186 SEQ ID NO: 56 146-166 sccatatccaccaeastcaaaaga 187 SEQ ID NO: 57 147-167 agcccatccateasstcctssgca 188 SEQ ID NO: 58 59-72 148-168 aattccatcttstcatccattctt 189 SEQ ID NO: 73 74-87 149-169 ttcaaagcaascaaaetcaetacc 190 SEQ ID NO: 88 89-102 150-170 attaeaaattgctgtagcagtatt 191 SEQ ID NO: 103 104-117 151-171 attaetsttctacaccattactca 192 SEQ ID NO: 118 119-132 152-172 caaaaacatsaaatacatccacct 193 實例4 :活體外模型：細胞培養物可於多種細胞類型之任一者中測試反義寡核苷酸對目標核酸表現之影響，其限制條件為存在可量測之量的目標核酸。可内源性表現目標核酸或藉由瞬間或穩定轉染來表現該目標核酸。可使用（例如）北方墨點分析、即時PCR、核糖核酸酶保護檢定來常規測定目標核酸之表現量。出於說 131124.doc -61 - 200848077 明性目的可提供以下細胞類型，但常規可使用其他細胞類型，其限制條件為目標係於所選細胞類型中表現。將細胞於如下文所述之適當培養基中培養且保持在37°C、95%-98%濕度及5% C02下。細胞常規每週傳代2-3次。 SW480 :將人類結腸直腸癌細胞株SW480於L-15培養基 (Leibovitz)+10%胎牛血清（FBS) + Glutamax I +pen/strep 中培養。 HCT116 :將人類結腸直腸癌細胞株HCT116於McCoy’s 5a改良培養基（Sigma)+1 0%月台牛血清（FBS) + Glutamax I +pen/strep 中培養。實例5 :活體外模型：用反義寡核苷酸處理使用陽離子脂質體調配物LipofectAMINE 2000(Gibco)作為轉染媒劑，用寡核苷酸來處理細胞。將細胞於6孔細胞培養盤（NUNC)中接種且在75°/。-90%長滿時進行處理。所用寡核苷酸濃度係在1 nM至25 nM最終濃度之範圍内。使用不含血清之OptiMEM(Gibco)及最終脂質濃度為10 pg/mL 之LipofectAMINE 2000，基本上如製造商所述進行寡核苷酸-脂質複合物之調配。將細胞在37°C下培育4小時且藉由移除含寡核苷酸之培養基來停止處理。洗滌細胞且添加含血清之培養基。在募核苦酸處理後，回收細胞歷時2 0小時，隨後將其收集以進行RNA分析。實例6 :活體外模型：RNA之萃取及cDNA合成對於自細胞株分離RN A而言，根據由製造商提供之方案來使用RNeasy微型套組（Qiagen目錄號74104)。 131124.doc -62- 200848077 使用來自Ambion之逆轉錄酶試劑根據製造商說明書來進行第一鏈合成。

Kg總RNA用不含RNase之H20調對於各樣品而言，將0.5 節至10·8 μΐ且與2 μΐ無規十聚體（5〇 _)及4 μ1 dNTP混合物

7熱至7〇C歷時3分鐘，隨後將該在於冰上冷卻樣品之後，將2 μΐ 緩衝液 RT、1 μΐ MMLV 逆轉錄酶（1〇〇 u/|lU)及〇25 μ1 RNase抑制劑（10 υ/μ1)添加至各樣品中，接著在42。〇下培月60刀名里，在95 C下將酶熱滅活！〇分鐘，且隨後將樣品冷卻至4°C。實例7 :活體外模型：藉由即時pCR分析卜連接蛋白表現之寡核苷酸抑制作用可以此項技術中已知之多種方式來檢定β_連接蛋白表現之反義調節。舉例而言，可藉由（例如）北方墨點分析、競爭性聚合酶鏈反應（PCR)或即時PCR來定量β_連接蛋白 mRNA含量。目前較佳為即時定量PCR。可對全細胞RNA 或mRNA進行RNA分析。RNA分離及RNA分析之方法（諸如北方墨點分析）為此項技術中之常規方法且教示於（例如）Current Protocols in Molecular Biology，j〇hn Wiley and

Sons 中。可使用獲自Applied Biosystem之市售多色即時PcR偵測系統（Multi-Color Real Time PCR Detection System)來便利地實現即時定量PCR。 131124.doc -63- 200848077 P-連接蛋白mRNA含量之即時定量PCR分析使用人類 β-連接蛋白 ABI Prism Pre-Developed TaqMan檢定試劑（Applied Biosystems 目錄號Hs00170025—ml)根據製造商說明書來定量人類β-連接蛋白mRNA之樣品含量。使用甘油酸-3-磷:酸酷脫氫酶（GAPDH)mRNA量作為内源性對照物以正規化樣品製備中之任何方差。使用人類 GAPDH ABI Prism Pre-Developed TaqMan檢定試劑（Applied Biosystems目錄號4310884E)根據製造商說明書來定量人類GAPDH mRNA之樣品含量。即時定量PCR為此項技術中熟知之技術且教示於（例如）Heid等人，Real time quantitative PCR, Genome Research (1996)，6: 986-994 中。

即時PCR 將來自如實例8中所述進行的第一鏈合成之CDNA稀釋2_ 20 次，且使用來自 Applied Biosystems 之 Taqman 7500 FAST藉由即時定量PCR來分析。將引子及探針與 2xTaqman Fast Universal PCR 母混合液（Applied Bio systems目錄號4364 103)混合兩次且添加至4 μΐ cDN A中至最終體積為1 〇 μΐ。一式三份來分析各樣品。檢定已自表現所關注RNA之細胞株純化之物質上製備的cdNA之2倍稀釋液，產生用於檢定之標準曲線。使用無菌H20替代cDNA 作為無模板對照物。PCR程式：95°C下30秒；接著40個週期之 95°C 下 3秒、60°C 下 30秒。使用 Applied Biosystems Fast System SDS軟體1·3·1·21版，根據所計算之臨限週期 131124.doc -64- 200848077 來測定目標mRNA序列之相對量。實例8 :活體外分析：寡核苷酸對人類p-連接蛋白表現之反義抑制在SW4 80細胞中在1 nM、5 nM及25 nM之濃度下對來自表2之寡核苷酸評估其敲除β-連接蛋白mRNA之能力（參見圖2)。結果列於表4中，其中資料係以在5 nM下β-連接蛋白mRNA相對於經模擬物轉染細胞之下調百分比形式呈現。小寫字母表示DNA單體，粗體大寫字母表示β-D-氧基-LNA單體。所有LNA單體之胞嘧啶鹼基均為^曱基胞嘧啶。下標nsn表示硫代磷酸酯鍵。表4. '、' 測試物質序列(5，·3，) . ' ' '' -,' P-連接蛋白谈制％) SEQIDNO: 153 GsAsAsasgscstsgsastsgsgsasCsCsA 88.11% SEQIDNO: 154 CsAsGsascststsasasasgsastsGsGsC 86.4% SEQ ID NO: 155 CsAsGsasastscscsascstsgsgsTsGsA 76.6% SEQ ID NO: 156 GsCsAscstsgscscsaststststsAsGsC 89.2% SEQ ID NO: 157 GsTsAsastsasgscscsasasgsasAsTsT 56.4% SEQ ID NO: 158 AsCsTscstsgscststsgstsgsgsTsCsC 77.6% SEQ ID NO: 159 CsCsAscscsasgscststscstsasCsAsA 49.7% SEQ ID NO: 160 GsAsGstscscsasasasgsascsasGsTsT 60.1% SEQ ID NO: 161 AsCsCscsascststsgsgscsasgsAsCsC 75.6% SEQ ID NO: 162 GsCsAscsasasascsasastsgsgsAsAsT 10.8% SEQ ID NO: 163 GsCsAsgscstsascstscstststsGsGsA 48.3% SEQ ID NO: 164 CsTsCscscstscsasgscststscsAsAsT 35.5% SEQ ID NO: 165 GsCsAsgstscstscsaststscscsAsAsG 25.5% SEQ ID NO: 166 TsAsTscscsascscsasgsasgstsGsAsA 27.3% SEQ ID NO: 167 CsAsTscscsastsgsasgsgstscsCsTsG 24.5% SEQ ID NO: 168 CsCsAstscststsgstsgsastscsCsAsT 74.4% SEQ ID NO: 169 AsAsGscsasasgscsasasasgstsCsAsG 87.5% SEQ ID NO: 170 GsAsAsaststsgscstsgstsasgsCsAsG 91.5% SEQ ID NO: 171 GsTsGststscstsascsascscsasTsTsA 94.9% SEQ ID NO: 172 AsAsCsastsgsasasastsasgsasTsCsC 93.6% SEQ ID NO: 194 CsGsTscsasgstsastsgscsgsAsAsTsc 131124.doc -65- 200848077 如表 4 中所示，SEq ID NO: 153、154、i55、、 H 161、168、169、170、171及172之寡核苦酸在該等實驗中在5 nM下顯示約74%或更大之β_連接蛋白出尺^^八表現之抑制且因此較佳。亦較佳為基於所說明之反義寡聚物序列之寡核苷酸，例如改變長度（較短或較長）及/或單體含量（例如，核苷類似物單體之類型及/或比例），其亦提供β_連接蛋白表現之良好抑制。實例9 :活體外分析：β_連接蛋白含量之西方墨點分析

藉由西方墨點法來測定寡聚化合物對轉染細胞中卜連接蛋白含量之活體外影響。將200,000個如實例5中所述經寡核苷酸轉染之SW480細胞收集且溶解於補充有蛋白酶抑制片丨J k匕合液（Roche)之RIPA溶胞緩衝液（50 mM Tris-HCl pH 7·4、150 mM NaC卜 1 mM EDTA、1% Triton X-100、〇.1% SDS、1%去氧膽酸納）中。使用BCA蛋白質檢定套組 (Pierce)來量測總蛋白濃度。根據製造商說明書 (Invitrogen)將50 pg總蛋白於3%-8%三羥甲基胺基甲烧乙酸鹽（Tris Acetate)凝膠上操作且點塗於PVDF膜上。在於阻斷緩衝液（補充有5%低脂奶粉之PBS-T)中隔夜培育後，用抗-β-連接蛋白抗體（BD Transduction laboratories)將該等膜培育隔夜。使用來自Neomarker之單株抗體偵測作為對照物之負載微管蛋白。隨後用二次抗體培育膜且使用化學發光ECL+偵測套組（Amersham)來目測β-連接蛋白或微管蛋白。參見圖3。 131124.doc -66- 200848077 實例10:量測增殖活細胞（MTS檢定）在轉染前一天將HCT11 6結腸直腸癌細胞在6孔培養盤中在 McCoy’s 5a 改良培養基（Sigma M8403)+2 mM Glutamax I(Gibco 35050-038)+10% FBS(Brochrom #193575010)+25 pg/μΐ 健他黴素（Gentamicin)(Sigma G1397 50 mg/ml)中接種至每孔200,000個細胞之密度。第二天移除培養基，接著添加 1.2 ml 含有 7.5 pg/ml 月旨質體（Lipofectamine)2000 (Invitrogen)之OptiMEM。將細胞培育7分鐘，隨後添加0.3 f \ K ml稀釋於OptiMEM中之寡核苷酸。最終寡核苷酸濃度為25 nM。在處理4小時後，移除培養基且將細胞胰蛋白酶化且於清潔的96孔培養盤（Scientific Orange第1472030100號）中於 100 μΐ McCoy’s 5a改良培養基（Sigma M8403) + 2 mM Glutamax I(Gibco 35050-038)+10% FBS(Brochrom #193575010)+ 25 pg/μΐ健他黴素（Sigma G1397 50 mg/ml)中接種至每孔 5000個細胞之密度。在藉由添加10 μΐ四唑鑌化合物[3-g (4,5-二甲基-2-基）-5-(3 -叛基曱氧基苯基）-2_(4_石黃酸基苯基）-2H-四唑鏽内鹽；MTS]及電子偶合試劑（吩嗪硫酸乙酯；PES)(CellTiter 96⑧水性單溶液細胞增殖檢定 ’ (AQueous One Solution Cell Proliferation Assay)，、 Promega)所示之時刻量測活細胞。用Powerwave(Biotek

Instruments)在490 nm下量測活細胞。將OD490 nm對時間/ 小時繪圖（參見圖4)。實例11 :小鼠肝臟中β-連接蛋白mRNA之抑制作用連續三天經靜脈内向NMRI小鼠投與25 mg/kg募核苷酸 131124.doc -67- 200848077 (SEQ ID NO: 156、158、168、169、171)(組大小為 5 隻小鼠）。將反義寡核苷酸溶解於0.9%生理食鹽水（NaCl)中。在最後一次給藥後24小時將動物處死，且對肝組織取樣且將其儲存於RNA later中，直至RNA萃取及QPCR分析。萃 ’ 取總RNA且使用小鼠β-連接蛋白QPCR檢定（目錄號

Mm00483033—m 1，Applied Biosystems)藉由如實例 7 中所 • 述之QPCR來量測肝臟樣品中之β-連接蛋白mRNA表現。將結果正規化為小鼠GAPDH(目錄號4352339E，Applied f

Biosystems)且相對於經生理食鹽水處理之對照物繪圖，參見圖5。實例12 :製備SEQ ID NO: 161與聚乙二醇之結合物具有 SEQ ID NO: 161、SEQ ID NO: 168 及 SEQ ID NO: 1 7 1之寡聚物分別藉由使用常規胺基磷酸酯化學將胺基烷基（諸如經諸如Fmoc之阻斷基團阻斷之己-1-胺）與寡聚物之 5’磷酸酯基團連接，氧化所得化合物，將其去保護且將其 , 純化以達成官能化寡聚物而於5’末端上經官能化，該等官 1 能化募聚物具有式（ΙΑ)、（IB)及（1C): • 0

. II 一 Ρ一〇一 AsMeCsMeCscsascststsgsgscsa^sAsMeCsMeC——OH 〇 (ΙΑ) Ο

一Ρ — 〇-MeCsMeCsAstscststsgstsgsastscsMeC5AsT一OH 〇- (IB) 131124.doc -68- 200848077

0-P-Ο-G ST sGststsCs^asCsasCsCgagTs T SA-OH 〇- (1C) 其中SEQ ID NO: 161、168及171中之粗體大寫字母及下標 ”s”具有與上述相同之含義，且MeC為5-甲基胞嘧啶。將活化PEG(諸如式（II)中所示之活化PEG):

其中該PEG部分具有12,000之平均分子量，及各式（IA)、 (IB)及（C)之化合物於PBS緩衝液中之溶液在室溫下在單獨容器中攪拌12小時。將反應溶液用二氯甲烷萃取三次且將經合併之有機層經硫酸鎂乾燥且過濾，且在減壓下蒸發溶劑。將所得殘餘物溶解於雙蒸餾水中且裝載於陰離子交換管柱上。將未反應之PEG連接子用水溶離且將產物用 NH4HC03溶液溶離。將含有純產物之溶離份彙集且凍乾，分別得到結合物SEQ ID NO: 161、168及171，如式 (ΠΙΑ)、（IIIB)及（IIIC)中所示：

/X^N^^^^O-P-O-AsCsCsCsasCststsgsgsCsasgACsC-OH 〇- (ΠΙΑ)

131124.doc -69- 200848077 其中SEQ ID NO: 161、168及171之募聚物各自經由連接子與平均分子量為12,000之PEG聚合物連接。特定實施例，參考文獻之引用本發明之範,並*受本文巾所述之特定實施例限制。實際上，根據前述描述及隨附圖式，除本文中所述者之外的對本發明之各種修改對於熟習此項技術者而言將變得顯而易見。此等修改意欲處於隨时請專利範圍之範嘴内。包括專利中請案、專利及科學公開案之各種參考文獻係引用於本文中’各茶考文獻之揭示内容係以引用的方式全部併入本文中。【圖式簡單說明】圖 1 由分別具有 SEQ ID NO: h 16、17、18、33、34、 49、50、51、52、53、54、55、％、57、58、73、88、

1〇3及U8之序列之募聚㈣向的卜連接蛋白序列係以粗體且加下劃線展示’指示其〇•連接蛋白轉錄物（GenBanW 存編號 NM 一 001904-SEQIDNO: 173)中之位置。圖2在SW480細胞轉染後24小日寺時正規化為GApDH之卜連接蛋白表現。囷3由西方墨點法量測之經濃度為i咖及5 nM之募核苦酸轉染之SW彻細胞中之β_連接蛋白含量。使用微管蛋白染色作為裝載對照物且使用SEQIDn〇:194作為雜亂對照寡核苷酸。圖4在轉染後不同時間點在經濃度為25 nM之寡核芽酸轉染之HCTU6細胞中使用MTS檢以加例形式量測之細胞 131124.doc -70- 200848077 增殖。使用模擬物轉染細胞及經SEQ ID NO: 194(雜亂對照物）轉染之細胞作為對照物。圊5在用3x25 mg/kg寡核苷酸經靜脈内處理後由QPCR量測之小鼠肝中相對於生理食鹽水處理對照物之β-連接蛋白 ^ mRNA表現。β-連接蛋白表現經正規化為GAPDH且相對於 4 生理食鹽水處理對照物來繪製結果。

‘ 圊6具有寄存編號ΝΜ_001904.3之人類β-連接蛋白mRNA 之核苷酸序列。 f 131124.doc 71

Claims

200848077 十、申請專利範圍： 1· 一種由10至50個連續單體組成之寡聚物，其中相鄰單體係藉由鱗酸S旨基或硫代磷酸自旨基共價鍵聯，其中該寡聚物包含至少1 〇個連續單體之第一區域；其中該第一區域之至少一個單體為核苷類似物；，其中該第一區域之序列與哺乳動物β_連接蛋白 (catenin)基因或哺乳動物β_連接蛋白mRNA之最佳比對目標區域之反向互補序列至少8〇%一致。 2·如凊求項1之养聚物，其中該第一區域之序列與SEq出 NO: 1-132、174-192或193中存在之一個至少1〇個連續單體之區域的序列至少80%—致。 3·如凊求項2之泰聚物，其中該第一區域之序列與sEq出 NO: 58、103、189或192中存在之一個至少1〇個連續單體之區域的序列至少80% —致。 4·如請求項2之寡聚物，其中該第一區域之序列與SEQ m NO: 168或171中存在之一個至少10個連續單體之區域的 ^ 序列至少80%—致。 5·如請求項1或2之寡聚物，其中與哺乳動物卜連接蛋白基因或哺乳動物β-連接蛋白mRNA之反向互補之最佳比對區域的序列相比，該第一區域之序列包含〇至2個錯配。 6.如請求項1-4中任一項之募聚物，其中該寡聚物之第一區域係由1〇至18個連續單體組成。 7·如請求項6之寡聚物，其中該募聚物之第一區域係由16 個連續單體組成。 131124.doc 200848077 :求項1-4中任-項之募聚物，其中各核普類似物獨立地廷自由LNA單體、含有2，_〇-烷基_核糖之單體、含有一甲基核糖之單體、含有2’-胺基-去氧核糖之單體及含有2’氟-去氧核糖之單體組成之群。 9·如巧求項8之募聚物，其中該核苷類似物為LNA單體。 1。·如請求们之寡聚物，其中該寡聚物為間隙?:合物 (gapmer)，且其中該間隙聚合物自5,端至3,端包含：

(1)區域A，其係由丨_6個連續單體組成，其中至少一個單體為核苷類似物； (11)區域B，其5,端與區域A之3,端共價鍵聯，且其係由 -12個連續單體組成’其中至少—個單體為核苦；及㈣區域C ’其5,端與區域3之3,端共價鍵聯，且其係由1-6個連續單體組成，其中至少—個單體為核苦類似物0 11.如請求項H)之寡聚物，其中該寡聚物為間隙聚合物，且其中該間隙聚合物自5,端至3,端包含·· ⑴區域A，其係由2·5個連續單體組成，其中所有單體均為核苷類似物； _ (Π)區域Β’其5,端與區域八之3,端共價鍵聯，且其係由 6-10個連續單體組成’其中所有單體均為核芽；及㈣區域C，其5,端與區_之3,端共價鍵聯，且直係由2-5個連續單體組成，其中所有單體均為核普類似物^ 12·如請求項H)或^之寡聚物，纟中所有核|類似 LNA單體。 ^ 131124.doc 200848077 13·如請求項1之募聚物，其中該募聚物係選自： 5f-MeC Mep s CsAstsCststsgstsgsastscsMeCsAsT-3f(SEQ ID Ν〇· 168) •，及 · τ s sGststscstsascsascscsasTsTsA-3，（SEQ ID NO: 171)，其中大寫字母表示卜D-氧基_LNA單體，小寫字母表示 A單體，下標”s”表示硫代磷酸酯鍵，表示含有^ 甲基胞嘧啶鹼基之β-D-氧基_LNA單體。、'員1 4、1 〇、11及13中任一項之募聚物，其抑制表現卜連接蛋白之細胞中人類β_連接蛋白基因或mRNA之表現。 15. I種結合物，其包含如請求項丨_13中任一項之寡聚物共饧連接於至少一個不為核酸或單體之部分。種商藥組合物，其包含如請求項1-13中任一項之寡聚物或如請求項15之結合物，及醫藥學上可接受之稀釋劑、载劑、鹽或佐劑。抑制細胞中β_連接蛋白表現的活體外方法，其包含 =4細胞與有效量之一種由10至50個連續單體組成之寡接觸，其中相鄰單體係由磷酸酯基或硫代磷酸酯基共價鍵聯，其中該寡聚物包含至少10個連續單體之第一區域；其中該第一區域之至少一個單體為核苷類似物；其中該第一區域之序列與哺乳動物β-連接蛋白基因或甫礼動物卜連接蛋白mRNA之最佳比對目標區域之反向互補序列至少80%一致。 131124.doc 200848077 1 8· —種抑制細胞中卜連接蛋白表現的活體外方法，其包含使鑪細胞與有效量之如請求項。之結合物接觸。 19· 一種由1〇至5〇個連續單體組成之寡聚物之用途，其係用於製造供抑制哺乳動物組織中卜連接蛋白表現的藥物，其中該募聚物之相鄰單體係由磷酸酯基或硫代磷酸酯基共價鍵聯，其中该养聚物包含至少丨0個連續單體之第一區域；其中該第一區域之至少一個單體為核苷類似物；其中該第一區域之序列與哺乳動物卜連接蛋白基因或哺乳動物β-連接蛋白mRNA之最佳比對目標區域之反向互補序列至少80% —致。 2〇· —種如請求項15之結合物之用途，其係用於製造供抑制哺乳動物之組織中β-連接蛋白表現的藥物。 21·種由10至50個連續單體組成之寡聚物之用途，其係用於製造供治療哺乳動物癌症的藥物，其中該寡聚物之相 W單體係由球酸酯基或硫代磷酸酯基共價鍵聯，其中該寡聚物包含至少10個連續單體之第一區域；其中該第一區域之至少一個單體為核苷類似物；其中該第一區域之序列與哺乳動物卜連接蛋白基因或哺乳動物卜連接蛋白mRNA之最佳比對目標區域之反向互補序列至少80% —致。 22·如请求項21之用途，其中該癌症係選自結腸直腸癌、肝、、、田胞癌、子宮内膜癌、惡性黑素瘤、卵巢癌、胰腺癌、垂體癌、食道癌、肺癌、乳癌、腎癌、造血系統癌症、 131124.doc 200848077 子宮頸癌、中樞神經系統癌症、骨癌、膽道癌及腎上腺癌。 23· —種由10至50個連續單體組成之活化募聚物，其中相鄰單體係由鱗酸酯基或硫代罐酸酯基共價鍵聯，其中該活化募聚物包含至少一個官能基共價連接於一或多個獨立 ‘選自5’端、3’端、核糖之2，-〇h及鹼基之位置。 24· —種由10-25個單體組成之寡聚物，其中相鄰單體係由磷酸酯基或硫代磷酸酯基共價鍵聯，其中遠养聚物包含由1 0-24個單體組成之第一區域，其中該第一區域之序列同樣存在於SEq ID No: 189或 SEQ ID No: 192 中，或其中當與 SEq ID n〇: 189 或 SEQ ID No: 192之最佳比對區域相比時，該第一區域之序列包含不多於一個錯配。 131124.doc