TR201815368T4 - Macrophomina Phaseolina'dan elde edilen selüloz ve hemiselüloz parçalama enzimleri ve bunların kullanımları. - Google Patents
Macrophomina Phaseolina'dan elde edilen selüloz ve hemiselüloz parçalama enzimleri ve bunların kullanımları. Download PDFInfo
- Publication number
- TR201815368T4 TR201815368T4 TR2018/15368T TR201815368T TR201815368T4 TR 201815368 T4 TR201815368 T4 TR 201815368T4 TR 2018/15368 T TR2018/15368 T TR 2018/15368T TR 201815368 T TR201815368 T TR 201815368T TR 201815368 T4 TR201815368 T4 TR 201815368T4
- Authority
- TR
- Turkey
- Prior art keywords
- seq
- protein
- polypeptide
- sequence
- reveals
- Prior art date
Links
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 title claims abstract description 74
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 title claims abstract description 67
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 title claims description 11
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 title claims description 7
- 241001495426 Macrophomina phaseolina Species 0.000 title abstract description 16
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 title description 28
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 title description 28
- 229920002488 Hemicellulose Polymers 0.000 title description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 229
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 186
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 claims abstract 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 161
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 160
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 159
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 26
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 26
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 14
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 14
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 14
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 13
- 241000233866 Fungi Species 0.000 claims description 8
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 claims description 8
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 3
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 2
- 241000685569 Ophiomyia phaseoli Species 0.000 claims 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 claims 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims 1
- 108010047754 beta-Glucosidase Proteins 0.000 abstract description 43
- 102000006995 beta-Glucosidase Human genes 0.000 abstract description 43
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 abstract description 39
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 abstract description 39
- 238000000034 method Methods 0.000 abstract description 36
- 235000013305 food Nutrition 0.000 abstract description 25
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 abstract description 16
- 239000013598 vector Substances 0.000 abstract description 11
- 108010008885 Cellulose 1,4-beta-Cellobiosidase Proteins 0.000 abstract description 10
- 108010059892 Cellulase Proteins 0.000 abstract description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 7
- 239000000446 fuel Substances 0.000 abstract description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 5
- 102100032487 Beta-mannosidase Human genes 0.000 abstract description 3
- 108010055059 beta-Mannosidase Proteins 0.000 abstract description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 abstract description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 abstract description 3
- -1 α#&-glucosidase Proteins 0.000 abstract description 2
- 101710121765 Endo-1,4-beta-xylanase Proteins 0.000 abstract description 2
- 108010051098 beta-galactanase Proteins 0.000 abstract description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 abstract 5
- 101710125279 Unsaturated 3S-rhamnoglycuronyl hydrolase Proteins 0.000 abstract 1
- 239000002551 biofuel Substances 0.000 abstract 1
- 229940106157 cellulase Drugs 0.000 abstract 1
- 108010038658 exo-1,4-beta-D-xylosidase Proteins 0.000 abstract 1
- 239000002029 lignocellulosic biomass Substances 0.000 abstract 1
- 235000021309 simple sugar Nutrition 0.000 abstract 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 183
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 128
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 126
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 description 121
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 102
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 102
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 102
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 95
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 91
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 51
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 50
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 49
- 229920001503 Glucan Polymers 0.000 description 31
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 24
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 21
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 21
- 229920001221 xylan Polymers 0.000 description 21
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 20
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 19
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 18
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 15
- 235000013365 dairy product Nutrition 0.000 description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 14
- 208000002064 Dental Plaque Diseases 0.000 description 13
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 13
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 13
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 13
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 13
- 239000002324 mouth wash Substances 0.000 description 13
- 229940051866 mouthwash Drugs 0.000 description 13
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 13
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 13
- 229940034610 toothpaste Drugs 0.000 description 13
- 239000000606 toothpaste Substances 0.000 description 13
- 108010022769 Glucan 1,3-beta-Glucosidase Proteins 0.000 description 12
- 150000004823 xylans Chemical class 0.000 description 12
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 102100024295 Maltase-glucoamylase Human genes 0.000 description 10
- WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N alpha-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N 0.000 description 10
- 108010028144 alpha-Glucosidases Proteins 0.000 description 10
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 10
- 125000000969 xylosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO1)* 0.000 description 10
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 9
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 9
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 description 8
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 description 8
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 8
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 8
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 8
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 8
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 8
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 7
- 201000010538 Lactose Intolerance Diseases 0.000 description 7
- 229920002000 Xyloglucan Polymers 0.000 description 7
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 7
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 7
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 7
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 7
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 7
- 125000000311 mannosyl group Chemical group C1([C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 7
- 108010001817 Endo-1,4-beta Xylanases Proteins 0.000 description 6
- 102000004366 Glucosidases Human genes 0.000 description 6
- 108010056771 Glucosidases Proteins 0.000 description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 6
- OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N N-acetyl-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N 0.000 description 6
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N beta-D-galactose Chemical class OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N 0.000 description 6
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 6
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 6
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 6
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 6
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 6
- GUBGYTABKSRVRQ-CUHNMECISA-N D-Cellobiose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-CUHNMECISA-N 0.000 description 5
- 102100021771 Endoplasmic reticulum mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase Human genes 0.000 description 5
- 108010093031 Galactosidases Proteins 0.000 description 5
- 102000002464 Galactosidases Human genes 0.000 description 5
- 150000008211 L-arabinosides Chemical class 0.000 description 5
- GZCGUPFRVQAUEE-SLPGGIOYSA-N aldehydo-D-glucose Chemical group OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O GZCGUPFRVQAUEE-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 5
- 108010084650 alpha-N-arabinofuranosidase Proteins 0.000 description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 5
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 5
- 108010009689 mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase Proteins 0.000 description 5
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 5
- 229920005640 poly alpha-1,3-glucan Polymers 0.000 description 5
- 108091022901 polysaccharide lyase Proteins 0.000 description 5
- 102000020244 polysaccharide lyase Human genes 0.000 description 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 5
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 5
- KIAPWMKFHIKQOZ-UHFFFAOYSA-N 2-[[(4-fluorophenyl)-oxomethyl]amino]benzoic acid methyl ester Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1NC(=O)C1=CC=C(F)C=C1 KIAPWMKFHIKQOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101710152845 Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase Proteins 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000000214 D-xylosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO1)* 0.000 description 4
- 101710147028 Endo-beta-1,4-galactanase Proteins 0.000 description 4
- 108010061314 alpha-L-Fucosidase Proteins 0.000 description 4
- 102000012086 alpha-L-Fucosidase Human genes 0.000 description 4
- 238000004061 bleaching Methods 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 4
- 235000015140 cultured milk Nutrition 0.000 description 4
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 4
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 4
- OCLOLUFOLJIQDC-UHFFFAOYSA-N 1,5-AF Natural products OCC1OCC(=O)C(O)C1O OCLOLUFOLJIQDC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OCLOLUFOLJIQDC-HSUXUTPPSA-N 1,5-anhydro-D-fructose Chemical compound OC[C@H]1OCC(=O)[C@@H](O)[C@@H]1O OCLOLUFOLJIQDC-HSUXUTPPSA-N 0.000 description 3
- 101710101545 Alpha-xylosidase Proteins 0.000 description 3
- 229920000189 Arabinogalactan Polymers 0.000 description 3
- 125000002353 D-glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 3
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 3
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 3
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 3
- 235000019312 arabinogalactan Nutrition 0.000 description 3
- 125000000188 beta-D-glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 3
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 3
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 3
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 3
- 238000013461 design Methods 0.000 description 3
- YERABYSOHUZTPQ-UHFFFAOYSA-P endo-1,4-beta-Xylanase Chemical compound C=1C=CC=CC=1C[N+](CC)(CC)CCCNC(C(C=1)=O)=CC(=O)C=1NCCC[N+](CC)(CC)CC1=CC=CC=C1 YERABYSOHUZTPQ-UHFFFAOYSA-P 0.000 description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 3
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 3
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 3
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 3
- 150000002303 glucose derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- 241000235349 Ascomycota Species 0.000 description 2
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 2
- 241000351920 Aspergillus nidulans Species 0.000 description 2
- 241000221198 Basidiomycota Species 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000233652 Chytridiomycota Species 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 2
- 229920000926 Galactomannan Polymers 0.000 description 2
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 description 2
- 229920002581 Glucomannan Polymers 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 2
- 241000758405 Zoopagomycotina Species 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 108010076955 arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000012219 cassette mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 235000014048 cultured milk product Nutrition 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N mannan Chemical class O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](O[C@H]3[C@H](O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]3O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 150000004804 polysaccharides Chemical class 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 2
- 101150079601 recA gene Proteins 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 108010054539 unsaturated glucuronyl hydrolase Proteins 0.000 description 2
- 235000001674 Agaricus brunnescens Nutrition 0.000 description 1
- 241001136561 Allomyces Species 0.000 description 1
- 101710199313 Alpha-L-arabinofuranosidase Proteins 0.000 description 1
- 244000153158 Ammi visnaga Species 0.000 description 1
- 235000010585 Ammi visnaga Nutrition 0.000 description 1
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 101710204694 Beta-xylosidase Proteins 0.000 description 1
- 241000235432 Blastocladiella Species 0.000 description 1
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 1
- 102000005575 Cellulases Human genes 0.000 description 1
- 108010084185 Cellulases Proteins 0.000 description 1
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 1
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 description 1
- 241001279801 Coelomomyces Species 0.000 description 1
- 150000000901 D-xylose derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 101100408384 Danio rerio piwil2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710089384 Extracellular protease Proteins 0.000 description 1
- 102100022624 Glucoamylase Human genes 0.000 description 1
- 101150007144 Intu gene Proteins 0.000 description 1
- 241000235395 Mucor Species 0.000 description 1
- FUSGACRLAFQQRL-UHFFFAOYSA-N N-Ethyl-N-nitrosourea Chemical compound CCN(N=O)C(N)=O FUSGACRLAFQQRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000221960 Neurospora Species 0.000 description 1
- 108090000913 Nitrate Reductases Proteins 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 241000751974 Ochina Species 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- CYTYCFOTNPOANT-UHFFFAOYSA-N Perchloroethylene Chemical compound ClC(Cl)=C(Cl)Cl CYTYCFOTNPOANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100029812 Protein S100-A12 Human genes 0.000 description 1
- 101710110949 Protein S100-A12 Proteins 0.000 description 1
- 241000221535 Pucciniales Species 0.000 description 1
- 101710148480 Putative beta-xylosidase Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 241000235527 Rhizopus Species 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 101100370749 Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) trpC1 gene Proteins 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000008049 TAE buffer Substances 0.000 description 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 1
- 101710158370 Xylan 1,4-beta-xylosidase Proteins 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000005054 agglomeration Methods 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 108010057455 alpha-1,4-glucan lyase Proteins 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 238000003491 array Methods 0.000 description 1
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- YDQXYRCYDMRJGD-UHFFFAOYSA-N chloroform;phenol;thiocyanic acid Chemical compound SC#N.ClC(Cl)Cl.OC1=CC=CC=C1 YDQXYRCYDMRJGD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011098 chromatofocusing Methods 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 108010050200 endo-1,4-beta-D-mannanase Proteins 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 238000001125 extrusion Methods 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 229930182478 glucoside Natural products 0.000 description 1
- 150000008131 glucosides Chemical class 0.000 description 1
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 1
- 238000005469 granulation Methods 0.000 description 1
- 230000003179 granulation Effects 0.000 description 1
- 239000004519 grease Substances 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 108010002430 hemicellulase Proteins 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 125000001909 leucine group Chemical group [H]N(*)C(C(*)=O)C([H])([H])C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 101150004907 litaf gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- XZWYZXLIPXDOLR-UHFFFAOYSA-N metformin Chemical compound CN(C)C(=N)NC(N)=N XZWYZXLIPXDOLR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 101150095344 niaD gene Proteins 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 229940046166 oligodeoxynucleotide Drugs 0.000 description 1
- 238000002966 oligonucleotide array Methods 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 238000013081 phylogenetic analysis Methods 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000013341 scale-up Methods 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 238000012868 site-directed mutagenesis technique Methods 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000012064 sodium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000013042 solid detergent Substances 0.000 description 1
- 238000010563 solid-state fermentation Methods 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 1
- 238000001694 spray drying Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 101150016309 trpC gene Proteins 0.000 description 1
- 230000009105 vegetative growth Effects 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
- C12N9/244—Endo-1,3(4)-beta-glucanase (3.2.1.6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2428—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2437—Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2445—Beta-glucosidase (3.2.1.21)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2468—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1) acting on beta-galactose-glycoside bonds, e.g. carrageenases (3.2.1.83; 3.2.1.157); beta-agarase (3.2.1.81)
- C12N9/2471—Beta-galactosidase (3.2.1.23), i.e. exo-(1-->4)-beta-D-galactanase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2477—Hemicellulases not provided in a preceding group
- C12N9/248—Xylanases
- C12N9/2482—Endo-1,4-beta-xylanase (3.2.1.8)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2477—Hemicellulases not provided in a preceding group
- C12N9/2488—Mannanases
- C12N9/2494—Mannan endo-1,4-beta-mannosidase (3.2.1.78), i.e. endo-beta-mannanase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01003—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01006—Endo-1,3(4)-beta-glucanase (3.2.1.6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/0102—Alpha-glucosidase (3.2.1.20)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01024—Alpha-mannosidase (3.2.1.24)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01037—Xylan 1,4-beta-xylosidase (3.2.1.37)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01055—Alpha-N-arabinofuranosidase (3.2.1.55)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01051—Alpha-L-fucosidase (3.2.1.51)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01059—Glucan endo-1,3-alpha-glucosidase (3.2.1.59)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01075—Glucan endo-1,6-beta-glucosidase (3.2.1.75)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01089—Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase (3.2.1.89)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/0113—Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase (3.2.1.130)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01177—Alpha-D-xyloside xylohydrolase (3.2.1.177)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
Abstract
Mevcut buluş, selülaz aktivitesi, endoglukanaz, sellobiyohidrolaz, ß-glukozidaz, α#&-glukozidaz, ksilanaz, mannanaz, ß-ksilozidaz, α#&-ksilozidaz, α#&-galaktozidaz, arabinofuranozidaz, α#&-fukozidazlar, ß-galaktanaz, doymamış ß-glukuronil hidrolaz ve/veya oligomeraz aktivitesi de dahil selülolitik aktiviteye sahip proteinleri/enzimleri kodlayan Macrophomina phaseolina'nın ("M. phaseolina") nükleotid dizilerini sağlar. Enzim genlerinin nükleotid dizilerini içeren ve/veya bunlardan oluşan vektörler, ekspresyon yapıları ve konakçı hücreler de sağlanır. Buluş ayrıca, enzimlerin üretilmesine yönelik yöntemleri ve istenen karakteristiklerini geliştirmek amacıyla enzimlerin modifiye edilmesine yönelik yöntemleri sağlar. Buluşun enzimleri, bunlarla sınırlı olmamak üzere farmasötik, tarım, gıda ve yem işleme, biyoyakıt, enerji verimliliği ve endüstriyel bağlamlarda kullanılabilir. Bu enzimler aynı zamanda, lignoselülozik biyokütlenin akabinde sıvı yakıtlara ve kimyasal besleme stoklarına fermente edilebilen basit şekere tam hidrolizinde faydalıdır.
Description
Tarifname, endüstriyel Önemi olan M. phaseoli'ndnin enzimlerini kodlayan
genlerin genomik nükleotid dizilerini ve kodlama dizilerini kapsar. Buna bagli
olarak bir uygulamada tanimlanmis bir genin açik okuma çerçevesinin (ORF)
nükleotid dizisini tanimlayan SEQ ID No. 2 saglanir. SEQ ID No. 5, 8, 11, 14, 17,
01678-P-0005
saglanir, bunlardan her biri, tanimlanmis bir genin açik okuma çerçevesinin
(ORF) nükleotid dizisini tanimlar. Bir baska varyantta SEQ ID No. 1, 4, 7, 10, 13,
genlerin genomik dizileri saglanir.
Burada kullanildigi üzere “gen” ayni zamanda (i) SEQ ID No. 2, 5, 8, 11, 14, 17,
01678-P-0005
nükleotid dizileri ve/Veya parçalarindan en az birini içeren bir gene; (ii) SEQ 1D
verilen amino asit dizisini kodlayan herhangi bir nükleotid dizisine veya
orta-sertlikteki kosullar, örnegin, filtreye-bagli DNA'ya bir uygun/etkili 6x
sodyum klorür/sodyum sitrat (SSC) miktari içinde bir uygun/etkili sicaklik
düzeyinde (45°C gibi) hibridizasyonu, akabinde bir uygun/etkili SDS miktari,
örnegin, 0,2xSSC/%0,l SDS içinde, bir uygun/etkili sicaklik düzeyinde (50 ila
65°C gibi) bir veya birden fazla yikama altinda veya hayli-sert kosullar, örnegin,
filtreye-bagli nükleik aside bir uygun/etkili 6x SSC miktari içinde bir uygun/etkili
01678-P-0005
sicaklik düzeyinde (45°C gibi) hibridizasyonu, akabinde bir uygun/etkili SDS
miktari ( içinde, bir uygun/etkili sicaklik düzeyinde
(68°C gibi) bir veya birden fazla yikama altinda veya teknikte uzmanligi olan
kisiler için asikar olan diger hibridizasyon kosullari altinda (bakiniz, örnegin,
Ausubel FM, Brent R, Kingston RE, Moore DD, Seidman J G, Smith JA, Struhl K.
Current Protocols in Molecular Biology, 1994; Green Publishing Associates, Inc.
and John Wiley & Sons, Inc., New York) hibridize olan herhangi bir nükleotid
dizisine refere eder. Tercihen, burada açiklanan DNA dizilerinin komplemanlarina
hibridize olan polinükleotidler, gen ürünlerini, örn., enzim genlerinin veya bunlarin
fragmanlarinin biri tarafindan sifrelenen bir gen ürününe fonksiyonel olarak es-
deger olan gen ürünlerini, sifreler.
dizilerini kodlayan dejenere nükleotid dizilerini degil ayni zamanda M phaseolz'na
dizilerinden birini içeren bir polipeptidi veya bir parçasini verecek olan dejenere
nükleotid dizilerini içerir. Teknikte uzman bir kisi, M. phaseoli'na veya diger
01678-P-0005
ne sekilde modifiye edilecegini veya ne sekilde uygun kodonlarin seçilecegini
bilecektir. Örnegin Candida albicans°ta CTG kodonu, lösin kalintisi yerine bir
serin kalintisini kodlar.
Bulusun nükleotid dizileri ve tarifnainenin diger dizileri, M phaseolina
genomunun bir genetik, fiziksel veya dizi haritasinin gelistirilmesine yardimci
olmak için genetik beliiteçler ve/veya dizi belirteçleri olarak kullanilabilir.
Bulusun ve tarifnamenin nükleotid dizileri ve karsilik gelen gen ürünleri ayrica,
M. phaseoliria'nin varligini saptamak için de kullanilabilir. Teknikte iyi bilinen
hibridizasyon yöntemleri ve antikor-temelli yöntemler, nükleotid dizilerinin ve
karsilik gelen gen ürünlerinin varligini ve konsantrasyonunu belirlemek için
kullanilabilir.
Nükleotid dizileri ayrica, enzimlerin bir enfeksiyon sirasinda bir konagin
istilasinda bir rol oynayabilecegi gerçegi göz önünde bulunduruldugunda,
01678-P-0005
terapötik etkilere sahip olabilen enzimlerin inhibitörlerini tanimlamak için de
kullanilabilir.
Bir baska varyantta, yukarida tarif edilen M. phaseolina'nin nükleotid dizilerine ek
olarak, M. phaseoli'na'da ve diger fungal türlerde bulunabilen bulusun genlerinin
homologlari veya ortologlari da dahil edilir. Filamentöz funguslardaki homologlar
veya ortologlar özellikle tercih edilir. Bu enzim genleri teknikte iyi bilinen
moleküler biyoloji teknikleri ile tanimlanabilir ve izole edilebilir.
Burada kullanildigini sekliyle, "Funguslar" terimi, Ascomycota, Basidiomycota,
Chytridiomycota ve Zygomycota subelerini (Hawksworth DL, Kirk PM, Sutton
BC, Pegler DN. Ainsworth and Bisby's Dictionary of the Fungi (8th Ed). 1995;
CAB International, Wallingford, United Kingdom. 616p) ve mayalari içerir.
Ascomycota'nin temsili gruplari, örnegin, Neurospora, Penici'lli'um, Aspergillus'u,
içerir. Basidiomycota'nin temsili gruplari, yemeklik mantarlari, paslari ve isleri
(ekin hastaligi), içerir. Chytridiomycota'nin temsili gruplari, Allomyces,
Blastocladiella, Coelomomyces'i içerir. Zygomycota'nin temsili gruplari, örnegin,
Rhizopus ve Mucor'u, içerir.
F ilamentöz funguslar, kitinden, selülozdan, glukandan, kitozandan, mannandan ve
diger kompleks polisakkaritlerden olusan bir vejetatif miselyum ile karakterize
edilir. Vejetatif büyüme, hifal elongasyon yoluyladir ve karbon katabolizmasi
zorunlu bir sekilde aerobiktir.
Bu dogrultuda, tarifname ayrica genlerin polinükleotidlerine hibridize olabilen
iiingal nükleotid dizileri de saglar. Açiklama, asagidakileri içeren ve/veya
asagidakilerden olusan gruptan seçilen bir nükleotid dizisine en az %50 özdes
01an bir nükleotid dizisini içeren ve/veya böyle bir nükleotid dizisinden olusan bir
01678-P-0005
Bir baska varyantta tarifname, orta sertlikteki kosullar altinda SEQ ID NO. 2, 5, 8,
içeren ve/veya bunlardan olusan gruptan seçilen bir nükleotid dizisini içeren
01678-P-0005
ve/Veya bundan olusan ikinci nükleik aside hibridize olan fungal bir nükleotid
dizisini içeren izole bir nükleik asidi içerir.
Bir baska varyantta açiklama, amino asit dizisi SEQ 1D NO.*lari: 3, 6, 9, 12, 15,
ve/veya bunlardan olusan gruptan seçilen bir amino asit dizisine en az %50 özdes
olan bir polipeptidi sifreleyen bir fungal nükleotid dizisi içeren bir izole edilmis
nükleik asit de içerir.
01678-P-0005
nükleotid dizilerini içerir.
Homolog genleri izole etmek için, yukarida tarif edilen M. phaseoli'na gen dizisi,
bunlarla sinirli kalmamak kaydiyla, M. phaseoli'na'yi, içeren, söz konusu
organizmadan elde edilen mRNA'dan yapilan bir cDNA kütüphanesini taramak
birini içeren, tercihen saptanabilir bir sekilde etiketlenmis, nükleik asit problari
dahil edilir. Hibridizasyon kosullari, cDNA kütüphanesi bundan etiketlenmis
dizinin türetildigi organizma tipinden farkli bir organizmadan türetildiginde, bir
düsük-sertlikte olmalidir. cDNA taramasi ayrica, ayni tür içinde alternatif olarak
uçlari-birlestirilmis transkriptlerden türetilen klonlari da tanimlayabilir. Alternatif
olarak, etiketlenmis prob, yine, uygun sekilde sertlikteki kosullar kullanilarak, söz
konusu organizmadan türetilen bir genomik kütüphaneyi taramak için
kullanilabilir. Düsük sertlikteki kosullar teknikte uzmanligi olan kisiler tarafindan
iyi bilinecektir ve bundan kütüphanenin ve etiketlenmis dizilerin türetildigi
spesifik organizmalara bagli olarak tahmin edilebilir bir sekilde çesitlilik
01678-P-0005
gösterecektir (Details in Sambrook J, Russell DW. Molecular Cloning, A
Laboratory Manual, Third edition, 2001, Cold Spring Harbor Press, N.Y. ve
Ausubel FM, Brent R, Kingston RE, Moore DD, Seidinan J G, Smith JA, Struhl K.
Current Protocols in Molecular Biology,l994; Green Publishing Associates, Inc.
and John Wiley & Sons, Inc., New York).
Ilaveten, bir homolog gen dizisi, söz konusu gen içindeki amino asit dizilerine
göre tasarlanan iki dejenerat oligonükleotid primer araci kullanilarak bir
polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) gerçeklestirme ile izole edilebilir. Reaksiyon
için sablon, söz konusu organizmadan hazirlanan mRNA'nin ters transkripsiyonu
ile elde edilen cDNA olabilir. PCR ürünü alt-klonlanabilir ve çogaltilmis dizilerin
bir hoinolog enzim geni dizisinin dizilerini temsil ettigini garanti etmek için
dizilenebilir.
PCR fragmani akabinde, teknikte normal uzmanligi olan kisiler tarafindan iyi
bilinen çesitli yöntemler ile bir tam boy cDNA klonunu izole etmek için
kullanilabilir. Alternatif olarak, etiketlenmis fragman bir genomik kütüphaneyi
taramak için kullanilabilir.
Açiklamanin bir baska varyantinda, M. phaseolina gen dizileri, özel olarak arzu
edilebilen kimyasal ve/veya fiziksel karakteristikler gösteren modifiye edilmis
veya yeni enzimleri gelistirrnede kullanilabilir. M. phaseoli'na'nin ve diger
filamentöz funguslarin enzimleri arasinda amino asit dizilerinin asikar
ilgililiginden dolayi, bir baska fungusun bir enzimin yapisi, M. phaseolina
enzimin yapisini tahmin etmek ve yararli ve üstün özellikler için M. phaseoli'na
enziminin akla uygun modifikasyonuna yardimci olmak için kullanilabilir.
Açiklama ile saglanan diziler ayrica, enzimlerin talep edilen proseslerde daha iyi
performans göstermesine olanak saglayan karakteristikleri olan yeni enzimlerin
akla uygun modifikasyonu veya tasarimi için baslangiç materyalleri olarak da
kullanilabilir.
01678-P-0005
Gen nükleotid dizileri, rastgele ve yere-yönlendirilmis mutajenez teknikelri veya
yönlendirilmis moleküler evrim teknikleri örnegin, bunlarla sinirli kalinainak
kaydiyla, (Arnold FH. Protein engineering for unusual environments. Curr.
0ligonükleotide-yönlendirilmis mutajenez (Reidhaar-Olson JF, Sauer RT.
Combinatorial cassette mutagenesis as a probe of the informational content of
Drinkwater NR. recA-dependent and recA-independent N-ethyl-N-nitrosourea
mutagenesis at a plasmid-encoded herpes simplex virus thymidine kinase gene in
(Kunkel TA. Rapid and efficient site-specific mutagenesis Without phenotypic
AL, Struhl K. Cloning of random-sequence oligodeoxynucleotides. Gene 1986g44
177-183), hataya-yatkin PCR (Cadwell RC, Joyce GF. Randomization of genes by
PCR mutagenesis. PCR Methods Appl. 1992;2:28-33), kaset mutajenezi (Stauss
Hj, Davies H, Sadovnikova E, Chain B, Horowitz N, Sinclair C. Induction of
cytotoxic T lymphocytes With peptides in vitro: identification of candidate T-cell
WP. DNA shuffling by random fragmentation and reassembly: in vitro
820 Numarali ABD Patentleri'nde tarif edildigi üzere yöntemler ile,
ile belirlenebilir.
Bir düzenlemede SEQ ID NO. 2,de gösterilen 699 hp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 24 kD”lik öngörülen moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO.
3”teki gibi 232 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen
ß-1,4-end0glukanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ
01678-P-0005
lD NO. 27nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini
spesifik olarak klevaj eden ß-1,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 5,te gösterilen 696 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 24
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 6ldaki gibi 231 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-end0glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 57in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 83de gösterilen 786 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 28
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 9,daki gibi 261 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 87in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 11”de gösterilen 873 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 32
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 12,deki gibi 290 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. ll”in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 14”te gösterilen 732 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 25
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 15*teki gibi 243 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-end0glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 147ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
01678-P-0005
SEQ 1D NO. 177de gösterilen 834 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 29
kD31ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 185deki gibi 277 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-end0glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. l7'nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 20'de gösterilen 1431 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 51
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 21 ,deki gibi 476 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 20°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 23”te gösterilen 762 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 27
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 24*teki gibi 253 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-end0glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 237ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-1,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 27”deki gibi 370 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 261n1n
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ lD NO. 29,da gösterilen 678 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 24
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 30,daki gibi 225 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-end0glukanaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 299un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 32”de gösterilen 669 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 24
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 337teki gibi 222 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 321nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-1,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 35,te gösterilen 963 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 35
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 365daki gibi 320 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-end0glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 35'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-end0glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 38'de gösterilen 1479 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 58
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 39,daki gibi 492 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 38”in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 417de gösterilen 1743 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 64
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 42°deki gibi 580 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-end0glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 41“in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-1,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
01678-P-0005
SEQ ID NO. 44,te gösterilen 1083 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 39
kD31ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 455teki gibi 360 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-endoglukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 44,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik olarak
klevaj eden ß-l,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 47`de gösterilen 1395 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
47.68 kDslik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 48Sdeki gibi 464
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-
endoglukanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO.
47,nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz zincirinin iç baglarini spesifik
olarak klevaj eden [3-] ,4-endoglukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 507de gösterilen 1368 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 48
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 51°deki gibi 455 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen sellobiyohidrolaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 50`nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz polimerinin indirgeyici veya indirgeyici
olmayan uçlarindan selüloza saldiran ve bir glukoz dimeri olan sellobiyozu üreten
sellobiyohidrolaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 53”te gösterilen 1392 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 50
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 54*teki gibi 463 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen sellobiyohidrolaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 53°ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz polimerinin indirgeyici veya indirgeyici
olmayan uçlarindan selüloza saldiran ve bir glukoz dimeri olan sellobiyozu üreten
sellobiyohidrolaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
01678-P-0005
SEQ 1D NO. 567da gösterilen 528 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 19
kD31ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 575deki gibi 175 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen sellobiyohidrolaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 56°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, selüloz polimerinin indirgeyici veya indirgeyici
olmayan uçlarindan selüloza saldiran ve bir glukoz dimeri olan sellobiyozu üreten
sellobiyohidrolaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ 1D NO. 59”da gösterilen 2448 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 87
kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 60,daki gibi 815 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 59,un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 62,de gösterilen 2511 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 90
kDalik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 63'teki gibi 836 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 62”nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 65'te gösterilen 2202 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 77
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 66°daki gibi 733 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 65`in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
01678-P-0005
SEQ lD NO. 68”de gösterilen 2712 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 96
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 69°daki gibi 903 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 681in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
kD°1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 72,deki gibi 1082 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 7l”in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 74°te gösterilen 2616 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 93
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 75°teki gibi 871 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 747ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden B-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 77,de gösterilen 2418 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 84
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 78,deki gibi 805 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 77”nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
01678-P-0005
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ 1D NO. 80”de gösterilen 2346 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 84
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 81°deki gibi 781 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 801nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 83”(6 gösterilen 2499 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 91
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 84lteki gibi 832 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 837ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 862da gösterilen 2337 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 84
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 87,deki gibi 778 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 86”nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 89”da gösterilen 2361 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 85
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 90,daki gibi 786 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 897un
01678-P-0005
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 927de gösterilen 1905 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 70
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 93,teki gibi 634 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 927nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 95,te gösterilen 1731 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 65
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 96sdaki gibi 576 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 95,in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ 1D NO. 98°de gösterilen 1443 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 55
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 99,daki gibi 480 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 98'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ lD NO. 101,de gösterilen 1617 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 61
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 102°deki gibi 538 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 101'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 104,te gösterilen 1863 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 69
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 105'teki gibi 620 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 104,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 107”de gösterilen 1629 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 61
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 108°deki gibi 542 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 107°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ 1D NO. 110°da gösterilen 654 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 25
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 1 l 1 ,deki gibi 217 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 110snun
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 113,te gösterilen 2406 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 77
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 114'teki gibi 801 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 113,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 116”da gösterilen 2214 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 78
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. ll7,deki gibi 737 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 116°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, sellobiyozu ve bazi durumlarda
sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eden ß-glukozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 119”da gösterilen 2664 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 97
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 120°deki gibi 887 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 1197un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan, terminal (l->4)-bagli (x-
D-glukoz kalintilarini oi-D-glukoz salimina hidroliz eden u-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 123”teki gibi 723 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 122,nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan, terminal (1->4)-bagli u-
D-glukoz kalintilarini oi-D-glukoz salimina hidroliz eden a-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 125,te gösterilen 2226 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 83
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 126°daki gibi 741 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-glukozidaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 125'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan, terminal (1->4)-bagli (1-
D-glukoz kalintilarini a-D-glukoz salimina hidroliz eden (x-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 128,de gösterilen 2967 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
112 lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 129”daki gibi 988
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 128'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan, terminal (l->4)-bagli a-
D-glukoz kalintilarini u-D-glukoz salimina hidroliz eden a-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 131°de gösterilen 3024 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen u-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 131,in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan, terminal (1->4)-bagli (x-
D-glukoz kalintilarini u-D-glukoz salimina hidroliz eden a-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. l35”teki gibi 847 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-glukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 134lün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan, terminal (1->4)-bagli u-
D-glukoz kalintilarini u-D-glukoz salimina hidroliz eden a-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 137,de gösterilen 1359 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 50
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 138°deki gibi 452 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-glukozidaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ 1D NO. 137,nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyioi olmayan, terminal (1->4)-bagli (1-
D-glukoz kalintilarini d-D-glukoz salimina hidroliz eden (x-glukozidaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 140ata gösterilen 1734 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 63
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 14] ,deki gibi 577 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-l,3-ß-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID NO. 140'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, (x-glukozu serbest birakarak (l->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-1,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 143,te gösterilen 1341 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 49
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. l44`teki gibi 446 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-1,3-ß-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID NO. 1437ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-glukozu serbest birakarak (1->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-1,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. l47sdeki gibi 416 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-1,3-ß-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 146,nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, d-glukozu serbest birakarak (1->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-1,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ lD NO. 149”da gösterilen 885 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 32
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 150°deki gibi 294 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen glukan-l,3-ß-
01678-P-0005
glukanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO.
l49”un biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-glukozu serbest birakarak (l->3)-ß-
D-glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden glukan-l,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 1521de gösterilen 921 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 33
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 153'teki gibi 306 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen glukan-1,3-ß-
glukanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
152”nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-glukozu serbest birakarak (l->3)-ß-
D-glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden glukan-l,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 155ite gösterilen 1242 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 46
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 156°daki gibi 413 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-1,3-ßeta-
glukanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
155 ,in biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-glukozu serbest birakarak (1 ->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-1,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ 1D NO. 158,de gösterilen 2757 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
105 kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 159”daki gibi 918
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-l,3-ß-
glukanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO.
1581in biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-glukozu serbest birakarak (1 ->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-l,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 161 ,de gösterilen 2334 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 86
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 162°deki gibi 777 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-l,3-ß-glukanaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ 1D NO. 161'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-glukozu serbest birakarak (l->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-l,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 164lte gösterilen 2529 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 91
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 165'teki gibi 842 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ekzo-l,3-ß-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID NO. 164,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, (x-glukozu serbest birakarak (1->3)-ß-D-
glukanlarin indirgeyici olmayan uçlarindan ß-D-glukoz birimlerini sirasiyla
hidroliz eden ekzo-1,3-ß-glukanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. l67°de gösterilen 3363 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen 0t-1,4-glukan
liyaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 167lnin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 1,5-anhidro-D-fruktoz ve D-glukozun serbest
birakilmasi ile indirgeyici olmayan uçtan (1->4)-0L-D-glukanlarin sirali olarak
parçalanmasini katalizleyen (x-l,4-glukan liyaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. l7l,deki gibi 1114
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen 0t-1,4-glukan
liyaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 170,in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 1,5-anhidro-D-fruktoz ve D-glukozun serbest
birakilmasi ile indirgeyici olmayan uçtan (l->4)-0i-D-glukanlarin sirali olarak
parçalanmasini katalizleyen a-1,4-glukaii liyaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 173,te gösterilen 2025 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 76
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 174'teki gibi 674 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen (x-ksilozidaz
01678-P-0005
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 173,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ksiloglukan yan zincirlerinin hidrolizini
katalizleyen ve indirgeyici olinayan terminalde bulunan glukoza bagli sübstitüe
edilmemis D-ksiloz kalintilarini uzaklastiran u-ksilozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. Bu enzim, ksiloglukan oligosakkaritlerin parçalanmasinda yer alir.
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 177°deki gibi 771 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID NO. 176Snin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ksiloglukan yan zincirlerinin hidrolizini
katalizleyen ve indirgeyici olmayan terrninalde bulunan glukoza bagli sübstitüe
edilmemis D-ksiloz kalintilarini uzaklastiran a-ksilozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. Bu enzim, ksiloglukan oligosakkaritlerin parçalanmasinda yer alir.
SEQ ID NO. l79°da gösterilen 1236 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 45
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 180,deki gibi 411 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-4,5-doymam1s ß-
glukuronil hidrolaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID
NO. 180°nin biyoinforrnatik analizi, bu dizinin, polisakkarit liyazlarin
reaksiyonlari ile üretilen oligosakkaritlerden doymamis glukuronik asitlerin
hidrolitik salimini katalizleyen d-4,5-d0ymamis ß-glukuronil hidrolaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 182”de gösterilen 1143 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 44
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 183`teki gibi 380 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-4,5-d0ymam1s ß-
glukuronil hidrolaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki çDNA klonudur. SEQ ID
NO. 182`nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, polisakkarit liyazlarin
reaksiyonlari ile üretilen oligosakkaritlerden doymamis glukuronik asitlerin
01678-P-0005
hidrolitik salimini katalizleyen d-4,5-d0ymamis ß-glukuronil hidrolaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ 1D NO. l85°te gösterilen 1248 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 47
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 1867daki gibi 415 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-4,5-doymamis ß-
glukuronil hidrolaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID
NO. 185'in biyoinfonnatik analizi, bu dizinin, polisakkarit liyazlarin reaksiyonlari
ile üretilen oligosakkaritlerden doymamis glukuronik asitlerin hidrolitik salimini
katalizleyen d-4,5-doymamis ß-glukuronil hidrolaz proteinini ürettigini ortaya
SEQ ID NO. 188”de gösterilen 1158 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 43
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. l89°daki gibi 385 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-4,5-doymam1s ß-
glukuronil hidrolaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID
NO. 188`in biyoinfonnatik analizi, bu dizinin, polisakkarit liyazlarin reaksiyonlari
ile üretilen oligosakkaritlerden doymamis glukuronik asitlerin hidrolitik salimini
katalizleyen d-4,5-d0ymamis ß-glukuronil hidrolaz proteinini ürettigini ortaya
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 192,deki gibi 370 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-4,5-doyinamiS ß-
glukuronil hidrolaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID
NO. 1911in biyoinformatik analizi, bu dizinin, polisakkarit liyazlarin reaksiyonlari
ile üretilen oligosakkaritlerden doymamis glukuronik asitlerin hidrolitik salimini
katalizleyen d-4,5-doymamis ß-glukuronil hidrolaz proteinini ürettigini ortaya
01678-P-0005
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. l95”teki gibi 560 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen glukan 1,4-(1-
glukozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO.
194lün biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-glukoz salimi ile zincirlerin
indirgeyici olmayan uçlarindan sirasiyla terminal (1->4)-bagli a-D-glukoz
kalintilarini hidroliz eden glukan 1,4-a-glukozidaz proteinini ürettigini ortaya
kD°lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 1989deki gibi 638 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen glukan 1,4-(1-
glukozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
l97*nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-glukoz salimi ile zincirlerin
indirgeyici olmayan uçlarindan sirasiyla terminal (1->4)-bagli u-D-glukoz
kalintilarini hidroliz eden glukan 1,4-0i-glukozidaz proteinini ürettigini ortaya
SEQ ID NO. 200,de gösterilen 2670 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 95
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 201°deki gibi 889 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-l,2-mannozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 200,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, hidroliz ile Man(9)(GlcNAc)(2)”den 0t-1,2-
bagli mannoz kalintilarini uzaklastiran oi-l,2-mannozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
kDalik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 204'teki gibi 786 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen 0t-1,2-mannozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 203ӟn
biyoinformatik analizi, bu dizinin, hidroliz ile Man(9)(GlcNAc)(2)”den 01-12-
01678-P-0005
bagli mannoz kalintilarini uzaklastiran a-1,2-mannozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 206,da gösterilen 23 82 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 88
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 2077deki gibi 793 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-l,2-mannozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 2067nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, hidroliz ile Man(9)(GleNAc)(2)”den (x-l,2-
bagli mannoz kalintilarini uzaklastiran (1-1,2-mannozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 209,da gösterilen 2415 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 88
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 210”daki gibi 804 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuina çerçevesi sergileyen (x-l,2-mannozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 209°un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, hidroliz ile Man(9)(GlcNAc)(2),den ü-l,2-
bagli mannoz kalintilarini uzaklastiran a-1,2-mannozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 213,teki gibi 762 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen (1-1,2-mannozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 212inin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, hidroliz ile Man(9)(GlcNAc)(2)°den (l-l,2-
bagli mannoz kalintilarini uzaklastiran oi-1,2-mannozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 215,te gösterilen 2484 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 92
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 216,daki gibi 827 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-1,2-mannozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 215”in
01678-P-0005
biyoinformatik analizi, bu dizinin, hidroliz ile Man(9)(GlcNAc)(2)'den (Ji-1,2-
bagli mannoz kalintilarini uzaklastiran (1-1,2-mannozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 218,de gösterilen 1485 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 52
kDtlik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 2197daki gibi 494 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID NO. 2181in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 0t-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 221”de gösterilen 1533 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 56
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 222,deki gibi 510 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen 0t-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 221“in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-l,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüin
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 224°te gösterilen 1344 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 49
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 225'teki gibi 447 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen 0t-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ lD NO. 218”in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 0t-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
01678-P-0005
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüin
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 227°de gösterilen 1365 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 49
ijlik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 228,deki gibi 454 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 227°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 0t-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüin
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 230,da gösterilen 765 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 29
kDalik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 231°deki gibi 254 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 230”un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 0t-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 233,te gösterilen 1485 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 55
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 234lteki gibi 494 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a.-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 233,ün
01678-P-0005
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir
SEQ ID NO. 236,da gösterilen 1503 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 54
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 237”deki gibi 500 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen (1.-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 2367nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-l,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
SEQ lD NO. 239”da gösterilen 810 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 29
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 240'taki gibi 269 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-l,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 239,un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-l,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan u-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 2427de gösterilen 783 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 29
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 243lteki gibi 260 amino
01678-P-0005
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-l,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 242,nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 0t-l,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan d-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
SEQ ID NO. 245'te gösterilen 1251 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 45
kD°1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 246,daki gibi 416 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-l,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 245'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, (1-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan (it-1,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 2493daki gibi 449 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 248'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-1,3-glukanlari parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
formlarinda faydali olabilir.
01678-P-0005
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 252”deki gibi 494 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-1,3-glukanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 251'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, 0i-1,3-glukanlar1 parçalayan ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine sahip olan a-l,3-glukanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu enzim, glukoz biyopolimerlerinin
birikimini önlemek üzere agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya sakizda aktif
bilesenler olarak uygulanabilir ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin diger tüm
SEQ lD NO. 254,te gösterilen 2349 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 86
kD'lik hesaplanmis inoleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 255`teki gibi 782 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-L-fukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 254°ün
biyoinfonnatik analizi, bu dizinin, glikoproteinlerin karbohidrat kisimlarinin
indirgeyici uç N-asetilglukozamin ile birlesik 0t-1,6-bagli fukozun hidrolizinden
sorumlu olan a-L-fukozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu 0t-
L-ûikozidaz, lîikozile ksiloglukanlarin parçalanmasinda yer alir.
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 2583deki gibi 735 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-L-fukozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 257,nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, glikoproteinlerin karbohidrat kisimlarinin
indirgeyici uç N-asetilglukozamin ile birlesik a-l,6-bagli fukozun hidrolizinden
sorumlu olan d-L-fukozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir. Bu nedenle bu 0t-
L-ûikozidaz, fukozile ksiloglukanlarin parçalanmasinda yer alir.
SEQ ID NO. 260°ta gösterilen 1491 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 56
kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 261°deki gibi 496 amino
01678-P-0005
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ lD NO. 260,1n
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terininallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (l->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz eden ß-1,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 263°te gösterilen 1548 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 56
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 264'teki gibi 515 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 263'ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (l->4)-ß-D-ksi1anlari hidroliz eden ß-1,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 266”da gösterilen 1560 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 56
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 267,deki gibi 519 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 266”nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyioi olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (1->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz eden ß-l,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 269”da gösterilen 2403 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 87
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 270`teki gibi 800 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 2697un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (1->4)-ß-D-ksilanlar1 hidroliz eden ß-1,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
01678-P-0005
SEQ 1D NO. 272,de gösterilen 2916 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
104 kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 273”teki gibi 971
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-
ksilozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
272,nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden
ardisik D-ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (l->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz
eden ß-1,4-ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 275,te gösterilen 978 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 36
kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 2767daki gibi 325 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 2753in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terrninallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (l->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz eden ß-1,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
kDalik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 279°daki gibi 576 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 278”in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (l->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz eden ß-1,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 281”de gösterilen 1737 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 63
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 282,deki gibi 578 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 281“in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyioi olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirinak üzere (1->4)-ß-D-ksilanlar1 hidroliz eden ß-l,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
01678-P-0005
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 285`teki gibi 576 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 284,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilanni uzaklastirmak üzere (1->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz eden ß-l,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
kD°1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ lD NO. 288,deki gibi 325 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-1,4-ksilozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 2879nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden ardisik D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (1->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz eden ß-1,4-
ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 290idaki gösterilen 1623 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik
60 kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 29ladeki gibi 540
amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-l,4-
ksilozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
290,nm biyoinformatik analizi, bu dizinin, indirgeyici olmayan terminallerden
ardisik D-ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (l->4)-ß-D-ksilanlari hidroliz
eden ß-l,4-ksilozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 2931te gösterilen 960 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 35
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 294'teki gibi 319 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,5-0i-L-
arabinozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO.
01678-P-0005
arabinofuranozid omurgasinin hidrolizini katalizleyen endo-1,5-o-L-arabinozidaz
proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 296ida gösterilen 1056 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 38
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 2977deki gibi 351 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-l,5-u-L-
arabinozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
296“nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, (1->5)- arabinanlardaki 0t-1,5-bagli L-
arabinofuranozid omurgasinin hidrolizini katalizleyen endo-l,S-Q-L-arabinozidaz
proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 299,da gösterilen 957 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 34
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 300”deki gibi 318 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-l,5-0t-L-
arabinozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
299,un biyoinformatik analizi, bu dizinin, (l->5)- arabinanlardaki 0t-l,5-bagli L-
arabinofuranozid omurgasinin hidrolizini katalizleyen endo-l,5-0t-L-arabinozidaz
proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 302ide gösterilen 1110 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 40
kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 303,teki gibi 369 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-l,5-0t-L-
arabinozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
302”nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, (l->5)- arabinanlardaki d-l,5-bagli L-
arabinofuranozid omurgasinin hidrolizini katalizleyen endo-l,5-0t-L-arabinozidaz
proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 305,te gösterilen 972 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 34
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 306idaki gibi 323 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,4-ß-ksilanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 305”in
01678-P-0005
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ksilanlardaki (l->4)-ß-D-ksilozidik baglarin
endohidrolizini katalizleyen ve ksiloz üreten endo-l,4-ß-ksilanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu enzim, heiniselülozlarin depolimerizasyonu için
önemlidir ve biyo-beyazlatma, kagit yapimi ve besin ve hayvan yemi
endüstrilerindeki gibi potansiyel endüstriyel uygulamaya sahiptir. Diger
potansiyel uygulamalar, tarim ve gida endüstrilerinden elde edilen atiklardaki
ksilanin ksiloza dönüsümünü ve yakit ve kimyasal besleme stoklarinin üretimini
SEQ ID NO. 308'de gösterilen 987 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 35
kD°1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 309,daki gibi 328 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,4-ß-ksilanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 308'in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ksilanlardaki (1->4)-ß-D-ksilozidik baglarin
endohidrolizini katalizleyen ve ksiloz üreten endo-1,4-ß-ksilanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu enzim, hemiselülozlarin depoliinerizasyonu için
önemlidir ve biyo-beyazlatma, kagit yapimi ve besin ve hayvan yemi
endüstrilerindeki gibi potansiyel endüstriyel uygulamaya sahiptir. Diger
potansiyel uygulamalar, tarim ve gida endüstrilerinden elde edilen atiklardaki
ksilanin ksiloza dönüsümünü ve yakit ve kimyasal besleme stoklarinin üretimini
kD'lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 3 l2°deki gibi 450 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen end0-1,4-ß-ksilanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 3ll,in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ksilanlardaki (1->4)-ß-D-ksilozidik baglarin
endohidrolizini katalizleyen ve ksiloz üreten endo-1,4-ß-ksilanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu enzim, hemiselülozlarin depolimerizasyonu için
önemlidir ve biyo-beyazlatma, kagit yapimi ve besin ve hayvan yemi
endüstrilerindeki gibi potansiyel endüstriyel uygulamaya sahiptir. Diger
01678-P-0005
potansiyel uygulamalar, tarim ve gida endüstrilerinden elde edilen atiklardaki
ksilanin ksiloza dönüsümünü ve yakit ve kimyasal besleme stoklarinin üretimini
kDtlik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ_ ID NO. 3157teki gibi 505 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,4-ß-ksilanaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 314°ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ksilanlardaki (1->4)-ß-D-ksilozidik baglarin
endohidrolizini katalizleyen ve ksiloz üreten endo-l,4-ß-ksi1anaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir. Bu enzim, hemiselülozlarin depolimerizasyonu için
önemlidir ve biyo-beyazlatma, kagit yapimi ve besin ve hayvan yemi
endüstrilerindeki gibi potansiyel endüstriyel uygulamaya sahiptir. Diger
potansiyel uygulamalar, tarim ve gida endüstrilerinden elde edilen atiklardaki
ksilanin ksiloza dönüsümünü ve yakit ve kimyasal besleme stoklarinin üretimini
kDalik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 318°deki gibi 382 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-arabinofuranozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 317Snin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, d-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
terminal a-L-arabinofuranozid kalintilarinin hidrolizini katalizleyen a-
arabinofuranozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 320”de gösterilen 1149 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 41
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 32] ,deki gibi 371 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-arabinoturanozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 320°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
terminal a-L-arabinofuranozid kalintilarinin hidrolizini katalizleyen (1-
arabinofuranozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
01678-P-0005
SEQ ID NO. 323,te gösterilen 990 hp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 36
kD'lik hesaplanmis inoleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 324lteki gibi 329 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen d-arabinofuranozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 323,ün
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
terminal a-L-arabinofuranozid kalintilarinin hidrolizini katalizleyen (x-
arabinofuranozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
kD°1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 327,deki gibi 333 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-arabinofuranozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 3269nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
terminal a-L-arabinofuranozid kalintilarinin hidrolizini katalizleyen (1-
arabinofuranozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 329ida gösterilen 1527 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 57
kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 330,daki gibi 508 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-arabinofuranozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ 1D NO. 329,un
biyoinformatik analizi, bu dizinin, (i-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
terminal a-L-arabinofuranozid kalintilarinin hidrolizini katalizleyen 01-
arabinofuranozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 332”de gösterilen 2145 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 80
kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 333'teki gibi 714 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen a-arabinofuranozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO. 332°nin
biyoinformatik analizi, bu dizinin, a-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
01678-P-0005
terminal a-L-arabinofuranozid kalintilarinin hidrolizini katalizleyen &-
arabinofuranozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 3367daki gibi 997 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen ß-gataktozidaz
proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ ID NO. 3351in
biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-galaktozidlerin ve a-L-arabinozidlerin
hidrolizini katalizleyen ß-gataktozidaz proteinini ürettigini ortaya çikarir. ß-
gataktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza hidroliz etmeye yönelik katalitik
özellige sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve fermente süt ürünlerinin yapimi için
kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu önlemek, tatliligi gelistirmek, süt
ürünleri endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü arttirmak amaciyla
kullanilmistir. Ayrica düsük laktoz toleransli kisiler için düsük laktoz içeren gida
ürünlerinin üretilmesi amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle ß-gataktozidaz
kullanimi, enzimlerin gida endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
uygulamalarindan biridir. SEQ ID NO. 338°de gösterilen 1932 bp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 71 kDSlik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID
NO. 339'daki gibi 643 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi
sergileyen ß-gataktozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur.
SEQ 1D NO. 338lin biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-galaktozidlerin ve (1-
L-arabinozidlerin hidrolizini katalizleyen ß-gataktozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. ß-gataktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza hidroliz etmeye
yönelik katalitik özellige sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve fermente süt
ürünlerinin yapimi için kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu önlemek,
tatliligi gelistirmek, süt ürünleri endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü
arttirmak amaciyla kullanilmistir. Ayrica düsük laktoz toleransli kisiler için düsük
laktoz içeren gida ürünlerinin üretilmesi amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle [3-
gataktozidaz kullanimi, enzimlerin gida endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
uygulamalarindan biridir. SEQ ID NO. 34l,de gösterilen 3135 bp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 118 kD,lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D
01678-P-0005
NO. 342Sdeki gibi 1044 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi
sergileyen ß-gataktozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur.
SEQ ID NO. 34llin biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-galaktozidlerin ve 01-
L-arabinozidlerin hidrolizini katalizleyen ß-gataktozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. ß-gataktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza hidroliz etmeye
yönelik katalitik özellige sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve fennente süt
ürünlerinin yapimi için kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu önlemek,
tatliligi gelistirmek, süt ürünleri endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü
arttirmak amaciyla kullanilmistir. Ayrica düsük laktoz toleransli kisiler için düsük
laktoz içeren gida ürünlerinin üretilmesi amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle [3-
gataktozidaz kullanimi, enzimlerin gida endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
uygulamalarindan biridir. SEQ ID NO. 344`te gösterilen 2070 bp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 78 kDalik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID
NO. 345'teki gibi 689 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi
sergileyen ß-gataktozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur.
SEQ ID NO. 344°ün biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-galaktozidlerin ve 0t-
L-arabinozidlerin hidrolizini katalizleyen ß-gataktozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. ß-gataktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza hidroliz etmeye
yönelik katalitik özellige sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve fermente süt
ürünlerinin yapimi için kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu önlemek,
tatliligi gelistirmek, süt ürünleri endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü
arttirmak ainaciyla kullanilmistir. Ayrica düsük laktoz toleransli kisiler için düsük
laktoz içeren gida ürünlerinin üretilmesi amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle [3-
gataktozidaz kullaniini, enzimlerin gida endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
uygulamalarindan biridir. SEQ ID NO. 3473de gösterilen 2994 bp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 108 kDslik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID
NO. 348°deki gibi 997 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi
sergileyen ß-gataktozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur.
SEQ ID NO. 347”nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-galaktozidlerin ve (1-
L-arabinozidlerin hidrolizini katalizleyen ß-gataktozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. ß-gataktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza hidroliz etmeye
01678-P-0005
yönelik katalitik özellige sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve fermente süt
ürünlerinin yapimi için kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu önlemek,
tatliligi gelistirmek, süt ürünleri endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü
arttirmak amaciyla kullanilmistir. Ayrica düsük laktoz toleransli kisiler için düsük
laktoz içeren gida ürünlerinin üretilmesi amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle [3-
gataktozidaz kullanimi, enzimlerin gida endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
uygulamalarindan biridir. SEQ ID NO. 350°de gösterilen 2985 bp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 109 kD”lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID
NO. 351,deki gibi 994 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi
sergileyen ß-gataktozidaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur.
SEQ 1D NO. 3503nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, ß-D-galaktozidlerin ve (1-
L-arabinozidlerin hidrolizini katalizleyen ß-gataktozidaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir. ß-gataktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza hidroliz etmeye
yönelik katalitik özellige sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve fermente süt
ürünlerinin yapimi için kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu önlemek,
tatliligi gelistirmek, süt ürünleri endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü
arttirmak amaciyla kullanilmistir. Ayrica düsük laktoz toleransli kisiler için düsük
laktoz içeren gida ürünlerinin üretilmesi amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle [3-
gataktozidaz kullanimi, enzimlerin gida endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
uygulamalarindan biridir. SEQ ID NO. 353”te gösterilen 1068 bp uzunlugundaki
polinükleotid, yaklasik 38 kD°lik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D
NO. 3543teki gibi 355 amino asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi
sergileyen end0-1,4-ß-galaktanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA
klonudur. SEQ ID NO. 353,ün biyoinformatik analizi, bu dizinin,
arabinogalaktanlarda bulunan (1->4)-ß-D-galaktozidik baglarin endohidrolizini
gerçeklestiren veya buna neden olan end0-1,4-ß-galaktanaz proteinini ürettigini
ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 356,da gösterilen 1068 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 38
kD,1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 357°deki gibi 354 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,4-ß-
01678-P-0005
galaktanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki CDNA klonudur. SEQ 1D NO.
356”nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, arabinogalaktanlarda bulunan (1->4)-
ß-D-galaktozidik baglarin endohidrolizini gerçeklestiren veya buna neden olan
endo-1,4-ß-galaktanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 359°da gösterilen 1146 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 42
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 360"taki gibi 381 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,4-ß-
galaktanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
3597un biyoinformatik analizi, bu dizinin, arabinogalaktanlarda bulunan (1->4)-ß-
D-galaktozidik baglarin endohidrolizini gerçeklestiren veya buna neden olan
endo-1,4-ß-galaktanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 362,de gösterilen 1281 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 48
lelik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ ID NO. 3637teki gibi 426 amino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-1,6-ß-
galaktanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
362'nin biyoinformatik analizi, bu dizinin, (1->6)-ß-D-glukanlardaki (1->6)
baglarin rastgele hidrolizini katalizleyen endo-l,6-ß-galaktanaz proteinini
ürettigini ortaya çikarir.
SEQ ID NO. 365lte gösterilen 1110 bp uzunlugundaki polinükleotid, yaklasik 40
kD”1ik hesaplanmis moleküler kütlesi olan, SEQ 1D NO. 366,daki gibi 369 ainino
asitlik polipeptidi kodlayan açik okuma çerçevesi sergileyen endo-l,4-ß-
mannanaz proteinini kodlayan tam uzunluktaki cDNA klonudur. SEQ ID NO.
365,in biyoinforrnatik analizi, bu dizinin, mannanlar, galaktomannanlar ve
glukomannanlardaki (l->4)-ß-D-mannozidik baglarin rastgele hidrolizini
katalizleyen end0-1,4-ß-mannanaz proteinini ürettigini ortaya çikarir.
Tarifname ile saglanan diziler ayni zamanda, enzimlerin zorlu proseslerde daha iyi
performans göstermesini saglayan karakteristikleri olan yeni enzimlerin uygun
01678-P-0005
modifikasyonuna veya tasarimina yönelik hazirlayici materyaller olarak
kullanilabilir.
Tarifnainenin enzimlerinin özeti, Tablo l,de verilmektedir.
Tablo 1. Bir bakista tarifname.
Enzim SEQ lD Fonksiyon
ß-1,4-endoglukanaz SEQ ID Selüloz zincirinin iç baglarini klevaj eder.
9, 12, 15,
18, 21, 24,
27, 30, 33,
36, 39, 42,
45 ve 48.
Sellobiyohidrolaz SEQ ID Selüloz polimerini klevaj eder ve bir glukoz
NO. 51, dimeri olan sellobiyozu üretir.
54 ve 57.
ß-glukozidaz SEQ ID Sellobiyozu ve bazi durumlarda
NO. 60, sellooligosakkaritleri glukoza hidroliz eder.
63, 66, 69,
72, 75, 78,
81, 84, 87,
90, 93, 96,
99, 102,
105, 108,
111, 114
ve 117.
oi-glukozidaz SEQ ID (x-D-glukoz salimi ile indirgeyici olmayan,
NO. 120, terminal (l->4)-bag11 a-D-glukoz
123, 126, kalintilarinin hidrolizi.
01678-P-0005
glukanaz
a-l,4-glukan liyaz
a-ksilozidaz
d-4,5-d0ymamis ß-
glukuronil hidrolaz
Glukan 1,4-oi-
glukozidaz
01- 1 ,2-mannozidaz
129, 132,
135 ve
144, 147,
150, 153,
156, 159,
162 ve
ve 171.
ve 177.
183, 186,
189 ve
ve 198.
Fonksiyon
OL-glukoz serbest birakilmak üzere (1->3)-ß-
D-glukanlarin indirgeyici olmayan
uçlarindan ß-D-glukoz birimlerinin sirali
hidrolizi.
1,5-anhidro-D-fruktoz ve D-glukoz salimi ile
birlikte indirgeyici olmayan uçtan (1->4)-0i-
D-glukanlarin sirali parçalanmasi.
Ksiloglukan yari zincirlerinin hidrolizi ve
indirgeyici olmayan terminalde bulunan
glukoza bagli sübstitüe edilmemis D-ksiloz
kalintilarinin uzaklastirilmasi.
Polsakkarit ile
liyazlarin reaksiyonlari
üretilen oligosakkaritlerden doymamis
glukuronik asitlerin hidrolitik salimi.
ß-D-glukoz salimi ile zincirlerin indirgeyici
olmayan uçlarindan sirasiyla terminal (1-
>4)-bagli a-D-glukoz kalintilarinin hidrolizi.
Hidroliz ile Man(9)(GlcNAc)(2)”den 01,-1,2-
bagli mannoz kalintilarinin uzaklastirilmasi.
01678-P-0005
a-1,3-glukanaz
(x-L-fukozidaz
Ksilan
ksilozidaz
End0-1,5-oi-L-
arabinozidaz
End0-1,4-ß-ksilanaz SEQ
13-1,4-
204, 207,
210, 213
ve 216.
222, 225,
228, 231,
234, 237,
240, 243,
246, 249
ve 252.
ve 258.
264, 267,
270, 273,
276, 279,
282, 285,
288 ve
297, 300
ve 303.
Fonksiyon
0L-1,3-glukanlar1 parçalar ve ayni zamanda
dis plaklarini uzaklastirma kapasitesine
sahiptir. Bu enzim, glukoz
biyopolimerlerinin birikimini önlemek üzere
agiz gargarasi, dis macunu, dis jeli veya
sakizda aktif bilesenler olarak uygulanabilir
ve ayni zamanda önleyici agiz hijyeninin
diger tüm formlarinda faydali olabilir.
Glikoproteinlerin karbohidrat kisimlarinin
indirgeyici uç
birlesik a-1,6-bagli ûikozu hidroliz eder.
N-asetilglukozamin ile
Indirgeyici olmayan terminallerden sirali D-
ksiloz kalintilarini uzaklastirmak üzere (1-
(1->5)-arabinanlardaki u-1,5-bagli L-
arabinofuranozid omurgasinin hidrolizi.
Ksilanlardaki (1->4)-ß-D-ksilozidik baglarin
01678-P-0005
arabinofuranozidaz
ß-galaktozidaz
309, 312
ve 315.
321, 324,
327, 330
ve 333.
339, 342,
345, 348
ve 351.
Fonksiyon
endohidrolizi ve ksiloz üretimi. Bu enzim,
hemiselülozlarin depolimerizasyonu için
önemlidir ve biyo-beyazlatma, kagit yapimi
ve besin ve hayvan yemi endüstrilerindeki
gibi potansiyel endüstriyel uygulamaya
sahiptir. Diger potansiyel uygulamalar, tarim
ve gida endüstrilerinden elde edilen
atiklardaki ksilanin ksiloza dönüsümünü ve
yakit ve kimyasal besleme stoklarinin
üretimini içerir.
a-L-arabinozidlerdeki indirgeyici olmayan
terminal oi-L-arabinofuranozid kalintilarinin
hidrolizi.
ß-galaktozidaz, laktozu glukoz ve galaktoza
hidroliz etmeye yönelik katalitik özellige
sahiptir. Bu nedenle bu enzim, süt ve
fermente süt ürünlerinin yapimi için
kullanilmistir. Laktozun kristalizasyonunu
önlemek, tatliligi gelistirmek, süt ürünleri
endüstrisinde süt ürününün çözünürlügünü
arttirmak amaciyla kullanilmistir. Ayrica
düsük laktoz toleransli kisiler için düsük
laktoz içeren gida ürünlerinin üretilmesi
amaciyla kullanilmistir. Bu nedenle [3-
gataktozidaz kullanimi, enzimlerin gida
endüstrilerine yönelik en umut vaat edici
01678-P-0005
Enzim SEQ lD Fonksiyon
uygulamalarindan biridir
Endo-l,4-ß- SEQ ID Arabinogalaktanlardaki (1->4)-ß-D-
galaktanaz NO. 354, galaktozidik baglarin endohidrolizi.
357 ve
Endo-l,6-ß- SEQ ID (1->6)-ß-D-glukanlardaki (l->6) baglarinin
Endo-l,4-ß- SEQ [D Mannanlar, galaktomannanlar ve
mannanaz NO. 366. glukomannanlardaki (l->4)-ß-D-mannozidik
baglarin hidrolizi.
Mevcut bulus ve açiklama ayrica, (a) genlerin yukaridaki dizilerinin ve/veya
bunlarin komplemanlarinin herhangi birini içeren bir nükleotid dizisini içeren
ve/veya bu tarz bir nükleotid dizisinden olusan nükleik asit vektörleri; (b)
kodlama dizilerinin ekspresyonunu yönlendiren bir regülatör eleman ile operatif
olarak bagli olan genlerin yukaridaki kodlama dizilerinin herhangi herhangi birini
içeren bir nükleotid dizisi içeren ekspresyon yapilari ve (c) konak hücrelerde
kodlama dizilerinin ekspresyonunu yönlendiren bir regülatör eleman ile operatif
olarak bagli olan kodlama bölgelerini içeren, genin yukaridaki dizilerinin herhangi
birini içeren ve/veya bunlarin herhangi birinden olusan rekombinant konak
hücreler ile de ilgilidir.
Polinükleotid dizilerini rekombinant DNA yöntemlerinden yararlanarak modifiye
etmek için teknikler, teknikte iyi bilinir. Çesitli diziler, bilinen tekniklere, örnegin,
restriksiyona, komplementer restriksiyon yerlerini birlestirrneye ve baglamaya,
çikintilarda doldurma ile küt uç-yapmaya ve küt-uç ligasyonuna veya
benzerlerine, uygun sekilde birlestirilebilir. Poli baglayicilar ve uyarlayicilar,
uygun oldugunda, kullanilabilir ve DNA vektörlerinin ve ekspresyon yapilarinin
01678-P-0005
birlesmesinin kolayligina olanak saglamak için bilinen teknikler ile uygulanabilir
veya uzaklastirilabilir. Çok sayida vektör, klonlama ve genetik manipülasyon için
mevcuttur. Normalde, klonlama, E. 0011' içinde gerçeklestirilebilir.
Bulusun bir baska uygulamasinda, bulusun bir enzim gen dizisini içeren vektörler
ilaveten, bunlarla sinirli kalmamak kaydiyla, E. (3011' hücrelerini, filamentöz fungal
hücreleri, maya hücrelerini ve Bacillus hücrelerini, içeren, bir veya birden fazla
konak hücre türünde vektörlerin transferine, idamesine ve propagasyonuna olanak
saglayan replikasyon fonksiyonlari içerebilir. Vektör kendi kendine-replikasyonu
garanti etmek için herhangi bir araç içerebilir. Alternatif olarak, vektör, konak
hücre içine uygulandiginda, genom içine entegre edilen ve içine bunun entegre
edilmis oldugu kromozom (kromozomlar) ile birlikte kopyalanan bir vektör
olabilir. Vektör seçimi tipik olarak, vektörün içine vektörün uygulanacagi konak
hücre ile uygunluguna bagli olacaktir.
Bulusun ekspresyon yapisi, bir promotör, bulusun bir gen dizisini sifreleyen bir
nükleotid dizisi, bir transkripsiyon sonlandirma dizisi ve seçilebilen belirteç
(opsiyonel) içerir. Bu ekspresyon yapisini bir konak hücre içine uygulamak için
teknikte bilinen herhangi bir yöntem kullanilabilir. Fungal hücreler, kendi basina
bilinen bir sekilde, protoplast olusumunu, protoplastlarin transformasyonunu ve
hücre duvarinin yenilenmesini içeren bir proses ile transforine edilebilir.
Aspergillus ve T richoderma konak hücrelerinin transformasyonu için uygun
prosedürler, EP 238 023'te ve Yelton MM, Hames JE, Timberlake WE.
Transforination of Aspergillus nidulans by using a trpC plasmid. PNAS,1984;
uygun yöntemler Malardier L, Daboussi MJ, J ulien J, Roussel F, Scazzocchio C,
Brygoo Y. Cloning of the nitrate reductase gene (niaD) of Aspergillus nidulans
WO 96/00787, tarafindan tarif edilir. Mayalar, Becker DM, Guarente L. High-
efficiency transformation of yeast by electroporation. In: Abelson JN ve Simon
MI (eds), Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Methods in
01678-P-0005
Y, Murata K, Kimura A. Transformation of intact yeast cells treated With alkali
edilen prosedürler kullanilarak transforme edilebilir.
Endüstriyel uygulamalar için, mevcut bulusun enzimleri bir fungal hücre
tarafindan üretilir. Tercihen, ekspresyon konak hücresi, büyük ölçekte endüstriyel
fermentasyonda kullanilmakta olan bir filamentöz fungal hücredir. Uygun hücre
hatlari veya konak sistemleri, eksprese edilen yabanci proteinin dogru
modifikasyonunu ve islenmesini temin etmek için seçilebilir. Tercihen, bunlarin
endojen proteinlerinin etkili salgilamasini yapabilen bir ekspresyon konagi seçilir.
Bir konak hücre ayrica, salgilaninis enzim kültür vasati içinde
parçalanabileceginden, ekstraselüler proteaz aktivitelerindeki eksiklikler için de
seçilebilir.
Mevcut bulus ayni zamanda, mevcut bulusun bir polipeptidinin üretilmesine
yönelik olarak (i) dogal sus formunda polipeptidi üretebilen bir hücrenin,
polipeptidin üretimine uygun olan kosullar altinda kültürlenmesi ve (ii)
polipeptidin geri kazanilmasini içeren ve/veya bunlardan olusan yöntemler ile
ilgilidir. Tercih edilen bir açida hücre, M. phaseoli'naüir.
Bulusun bir baska düzenlemesi ayni zamanda mevcut bulusun polipeptidinin
üretilmesine yönelik olarak (i) konak hücrenin polipeptidin üretimine uygun olan
kosullar altinda kültürlenmesi, burada konak hücre, SEQ 1D No. 2”deki nükleotid
dizisini veya bu dizilerin komplemanini içerir, bu nükleotid dizisi, SEQ ID No.
3,ün olgun polipeptidinden herhangi birini içeren ve/veya bundan olusan bir
polipeptidi kodlar ve (ii) polipeptidin geri kazanilmasini içeren ve/veya bunlardan
olusan yöntemler ile ilgilidir. Tarifname ayni zamanda, mevcut bulusun
polipeptidinin üretilmesine yönelik olarak (i) konak hücrenin polipeptidin
üretimine uygun olan kosullar altinda kültürleninesi, burada konak hücre, SEQ ID
01678-P-0005
361 veya 364”teki nükleotid dizisini veya bu dizilerin komplemanini içerir, bu
ve/veya bundan olusan bir polipeptidi kodlar ve (ii) polipeptidin geri
kazanilmasini içeren ve/veya bunlardan olusan yöntemler ile ilgilidir.
Mevcut bulusun bir baska düzenlemesinde ekspresyon konak hücreleri veya
transformantlar, teknikte iyi bilinen yöntemler kullanilarak proteinlerin büyümesi
ve ekspresyonu için uygun bir besin vasati içinde yerlestirilir. Örnegin, hücre bir
uygun vasat içinde ve polipeptidin eksprese edilmesine ve/veya izole edilmesine
izin veren kosullar altinda gerçeklestirilen laboratuvar veya endüstriyel
fermentörler içinde sallama flask kültivasyonu ve (sürekli, kesikli, beslemeli-
01678-P-0005
kesikli fermentasyonlari veya kati hal fermentasyonlarini içeren) küçük-ölçekte
veya büyük-ölçekte fermentasyon ile yetistirilebilir. Kültivasyon, teknikte bilinen
prosedürler kullanilarak, karbon ve nitrojen kaynaklari ve inorganik tuzlar içeren
bir uygun besin vasati içinde gerçeklesir (bakiniz: More Gene Manipulations in
Fungi. Bennett J W, Lasure L., (eds). 1991; Academic Press, San Diego, CA).
Polipeptit besin vasatina salgilandiginda, polipeptit vasattan dogrudan geri-
kazanilabilir. Polipeptit vasata salgilanmadiginda, bu hücre lizatlarindan geri-
kazanilabilir.
Polipeptitler, polipeptitlere spesifik teknikte bilinen yöntemler kullanilarak
saptanabilir. Bu saptama yöntemleri, spesifik antikorlarin kullanimini, bir enzim
ürününün olusumunu veya bir enzim substratinin kaybolmasini içerebilir. Bir
enzim analizi, polipeptidin aktivitesini belirlemek için kullanilabilir.
Üretilen polipeptit teknikte bilinen yöntemler kullanilarak geri-kazanilabilir.
Polipeptit, bunlarla sinirli kalmamak kaydiyla, filtrasyonu, sentrifügasyonu,
ekstraksiyonu, sprey ile kurutmayi, buharlastirmayi ve presipitasyonu veya
bunlarin kombinasyonunu, içeren geleneksel prosedürler ile besin vasatindan
çesitli yöntemlerde geri-kazanilabilir.
Mevcut bulusun ve açiklamanin polipeptitleri, bunlarla sinirli kalmamak kaydiyla,
kromatografî yöntemini (örnegin, iyon degisimi, atinite, hidrofobik, kromato-
odaklanma ve boyut dislama), elektroforetik prosedürleri (örnegin, izoelektrik
odaklanma), diferansiyel çözünürlügü (örnegin, amonyum sülfat presipitasyonu),
SDS-PAGE'i veya büyük ölçüde saf polipeptitler elde etmek için ekstraksiyonu
(bakiniz, details in Protein Purification, Principles, High Resolution Methods and
Applications. J anson JC, Rydén L. (eds(). ,
içeren teknikte iyi bilinen çesitli prosedürler ile saflastirilabilir.
Mevcut bulus ayni zamanda, SEQ ID No. 2'de verilen gen dizileri tarafindan
kodlanan gen ürünleri (örnegin, RNA veya proteinler) ile ilgilidir. Tarifname ayni
01678-P-0005
(örnegin, RNA veya proteinler) ile ilgilidir. Tariûiamenin enzim gen ürünleri ayni
kodlanan RNA veya proteinleri içerir. Bulusun enzimleri, SEQ 1D No. 3”ü içeren
ve/veya bundan olusan gruptan seçilen bir amino asit dizisini içerir. Tarifnamenin
amino asit dizisini içerir.
Mevcut bulusun enzimleri, ß-1,4-end0glukanaz, sellobiyohidrolaz, ß-glukozidaz,
0t- glukozidaz, E0-1,3-ß-glukanaz, a-glukan liyaz, u-ksilozidaz, d-4,5-d0ymamiS
01678-P-0005
b-glukuronil hidrolaz, amiloglukozidaz, 01-1,2-mannozidaz, a-l,3-glukanaz, 01-
fukozidaz, ksilan 1,4-ß-Ksilozidaz, endo-l,5-a-arabinozidaz, End0-1,4-ß-ksilanaz,
d-arabinofuranozidaz, ß-galaktozidaz, End0-1,4-ß-galaktanaz, Endo-l,6-ß-
glukanaz ve endo-ß-1,4-mannanazi içeren ve/veya bunlardan olusan gruptan
seçilen bir enzimin aktivitelerinden en az birini sergiler. Bulusun enzim gen
ürünleri, örnegin sentetik teknikler ile veya teknikte (Bakiniz Creighton TE.
Proteins: Structures and Molecular Principles, 1983; W. H. Freeman and Co.,
N.Y.) iyi bilinen teknikler kullanilarak rekombinant DNA teknolojisi yöntemleri
ile kolay bir sekilde üretilebilir.
Bir baska varyantta tarifnamenin yöntemleri ve bilesimleri ayni zamanda,
fonksiyonel olarak esdeger gen ürünlerini temsil eden proteinleri ve polipeptitleri
içerir. Fonksiyonel olarak esdeger bu tür gen ürünleri bunlarla sinirli olmamak
varyantlarini içerir.
Bu tarz es-deger gen ürünleri, örnegin, yukarida tarif edilen enzim gen dizileri
tarafindan sifrelenen amino asit dizileri içindeki amino asit rezidülerinin
silinmelerini, eklenmelerini veya sübstitüsyonlarini içerebilir, ancak bir sessiz
degisim ile sonuçlanir, böylelikle bir fonksiyonel olarak es-deger ürün üretir.
Amino asit sübstitüsyonlari, dahil edilen rezidülerin polaritesindeki, yükündeki,
çözünürlügündeki, hidrofobisitesindeki, hidrofilisitesindeki ve/Veya amfipatik
dogasindaki benzerlige göre yapilabilir.
01678-P-0005
Yukarida tarif edilen gen ürünü kodlama dizilerinin diger modifikasyonlari bir
seçilen konak hücre içinde, örnegin, ekspresyon için, ölçek-büyütme için, vb.,
daha uygun olan polipeptitler üretmek için yapilabilir. Örnegin, sistein rezidüler
disülfit köprülerini elimine etmek ainaciyla silinebilir veya bir baska amino asit
ile sübstüte edilebilir.
Mevcut bulusun bir baska uygulamasi, mevcut bulusun, kati formdaki, enzimlerini
içerir. Kati formdaki enzimler veya enzim granülati, örnegin, kati deterjanda ve
hayvan yeminde, kullanilabilir. Enzimlerin kati formlarini yapmak için yöntemler,
bunlarla sinirli kalmamak kaydiyla, örnegin, prillestirme (bir mumlu materyal
içinde sprey ile sogutma), ekstrüzyon, aglomerasyon veya granülasyon (bir inert
materyal ve baglayicilar ile seyreltme), teknikte iyi bilinir. Bulusun bir enziminin
bir kati formunu, karistirilmis toz, tabletler ve benzerleri formunda, içeren kati
enzimatik bilesimler tasarlanir.
Asagidaki örnegin, bulusun orada tarif edilen spesifik uygulamalar ile
sinirlandirilmasi için herhangi bir niyet olmadan, bulusu ilaveten açiklamasi
amaçlanir.
Örnek 1 M phaseolina'dan Genomik DNA'nin Izolasyonu
Genomik DNA, Kieser T, Bibb MJ, Buttner MJ, Chater KF, Hopwood DA.
Practical Streptomyces Genetics, 2000; John Innes Foundation, Norwich, UK, pp.
162-208, tarafindan tarif edilen prosedürler kullanilarak M. phaseoli'na susu
ms6'dan izole edilmistir. Özet olarak, miselyumlar inoküle etme kivrimi
kullanilarak bir stok Petri plakasindan kazinmistir ve bir konikal Ilask içinde bir
sivi patates-dekstroz vasati içine inoküle edilmistir. Konikal flask, 30°C'de
yaklasik 72 saat boyunca sallama olmadan inkübe edilmistir. Miselyumlar hava-
vasat ara-yüzünde yüzey üzerinde büyümüstür. Miselyumlar, bir steril kürdan
01678-P-0005
kullanilarak hasat edilmistir ve steril kagit havlular arasina yerlestirilmistir ve bir
kaçi fizyolojik çözelti (Sodyum fosfat tamponu, pH 7,0) ile yikanmistir.
Miselyumlar, fazla siviyi uzaklastirmak için sikilmistir ve hasat edilinis
miselyumlar 30 dakika boyunca hava ile kurumaya birakilmistir. Yari-kuru
miselyumlar, sivi nitrojen içine yerlestirilmistir ve ince toz üretmek ve son olarak
Kieser T, Bibb MJ, Buttner MJ, Chater KF, Hopwood DA. Practical Streptomyces
tarif edilen protokol izlenerek DNA'yi izole etmek için ögütülmüstür.
Ornek 2 Primerlerin tasarlanmasi ve sentezi
Çalismada kullanilan primerler, manüel olarak düzenlenmis transkriptomdan ve
M. phaseolina msö susunun genomik dizisinden tahmin edilen "gen
modelleri'nden", dizileri tam ORF 'ler ile manüel olarak seçme veya burada benzer
genlerin diger bitkilerden basarili bir sekilde izole edilmis oldugu veri tabanlarinin
kullanilmasi ile, tasarlanmistir. Transkriptomdan elde edilen nükleotid dizilerinin
karsilastirmali biyoenformatik analizi, ilgili genlerin homologlarini tanimlamak
için ve genin uygun tanimlanmasi için NCBI BLAST, BLASTP, RPS-BLAST,
BLASTX ve PSl-BLAST kullanilarak yürütülmüstür. Nükleotid dizisi
hizalamalari, çok sayida dizi " gen havuzu'ndan" bulundugunda, clustalW versiyon
1.82 kullanilarak gerçeklestirilmistir. Gen spesifik primerler (hem ileri hem de
geri), manüel olarak veya Primer 3 plus araci yoluyla seçilmistir ve primerler
istege özel sentezlenmistir.
Bu çalismada kullanilan tüm oligonükleotidler, saglayici tarafindan
sentezlenmistir ve HPLC ile saflastirilmistir ve Integrated DNA Technologies
(IDT) firmasindan temin edilmistir. 100 pmol'lük stok çözeltisi, otoklavlanmis
dngO içinde hazirlanmistir ve kullanim için alikotlar halinde, yaklasik -20°C'de
saklanmistir. Oligonükleotid Dizileri, PCR için primerler olarak kullanilmistir.
01678-P-0005
Gen :idi FECI
534. 1,4- endoglukanaZ
g5-1,4-.endoglukanazg'
8 1.13- endoglukanazl
ß-1,4~end0glukanaz i
jß-1.-1-endoglukanaz }
g3-1,4-endogiukanaz ›
tü«1.4~endoglukanazs
lê Ileri
TAG/`CACC1TCCCCGCCI I (361
WGCGGCTAGCCCG TAGCCII
ACGGCCCGG ?GCCTTF'ITGA
GCCCGCTGAKIGAGCATTGA
C'E'CCGC'I CAGC': GGGGCACT
CATGiTC TCCGCTCGCGCI'YA
Çogaltilmis
. 7857
01678-P-0005
îIÄ~1.~'»endoç;lukanaz
gß-i,4~endoglukanaz
i131,::.endoglukanaz
IB~1,d--endoglukanaz
gp.1,4~endoglukanaz
âßiA-endoglukanaz
Sellobiyohidrolaz
ga-glukosidaz
Ileri AGCGG ICTGAA1I`1"I`CCGGGACA
giieri GCrcccccmmcc.:xrrccm
giien CGGCGATH'TGCTCCCACCG
Geri "(LGCCAGCCGGAACGCAGT?
gGerI CAAGAACCCGCÇTCGCAAACG
geen CACCCGCCGT'CCAATGITAGCC
Ileri AAGAGGGACGCTCAGGGGAG!
gGeri GCCGCGTACCTCCTCGCATC
Ileri ACCCGCCGAACACAGCMACA
1"i'i'ér'iww
Gen TGAGUACCCGGCGGWGTCC
slieri CAAGCCTGGACGATACTCCCGA
01678-P-0005
g3~1,d-endoglukanaz
ißrilßýendoglukanaz
81,4-endoglukanaz
gSeIlob'iyohidrolaz
E Ileri
A6CGGTCIGAACTTCCGGGACA
TCGCCMECCGGAAGGCAGTT
TCTGAE TGCTCGACAGÂCCTGCT
GCTCCCGCCTTCSCCATTCCîTT
GGCCCICAAGCATYCGCCCAA
13615
. %839
01678-P-0005
gß--glukosidaz
gg-glukosidaz
ßvgluikosiAdaz
ß~glukosidaz
S-glukosidaz
gîi--glukosidaz
Ileri GTGCCGGTCGTTACGGîTCA
giieri CTTGCGCITCGCTGACCACG
giieri `I`GGCCCGACCACCAACATGC
gi'ieri CACCTGAACTCTTGCCCGÜ
Geri CGTGTACGCTGGTGGTCATCG
Ileri Acncccm !GALCCCc-sc
Geri TCACGCNxCCGGACTCîCC/X
Geri TGC/&G GGAGAACAGTGTAGCG
Geri ACCCACCAC CCCACCGATCC
Ileri TGACGAGCCATGAGGTCCGC
Geri CGCTTGGACGTCGATGCAGT
Ileri TGCAGGCCCCTTTCATCTGCC
â Ileri GCCCACGCCTGCTCG TTCAAT î
01678-P-0005
gß~glukosida
îß glükosidag
Âlglukosidaz
gßwglukosidaz
ß-glukosidaz
gm-glukosidaz
ga-iglukosidaz
ga--glukosidaz
.sallieri
Ileri csccmßc'rmrcrccccn
Geri CGGTTT'GGCAAGATGGCGGC
Ileri WGCGACGGAGATGCGTGGG
ATCACCGCCAÃAÄCACCACGC
3 Ileri CGGGTTGGAGCCGCAGTGATT
gGeri AMCCGTCAGCGTCCCCTCCA
GACGGCICGTCCACSAYCCTCA
TCCCWGGCCÜCCTCCGAAC
} Geri CCCTGCTTFCGGCTACCG GTC
.2 304
ccccsamixccmcrcacxm
.2380
01678-P-0005
gmglukosidaz
a~glukosidaz
î Ekso-1.3-ß-glukanaz
Ekso-1.3-ß-glukanaz
=Ekso-1.3-ß-glukanaz
Ekso-1 3-ß-glukanaz
Eken-1 3-ß-glukanaz
Ekso-1 3-ß-glukanaz
Ekso-1 3-ß-glukanaz
î Ileri
CGAAACÂCGGANRCACCCGCAG
v v 3138
ACACCîGGC-CYAC C CGTCTC
CATC CCCTGCîCCGG CIICC
. 1401
AITAG Ü'GCACCGTCCCCGC
Mg37?
01678-P-0005
lEkso-1 3-ßglukanaz
»:i- glukan liyaz
....
n-ksilosidaz
a~ksil05idaz
gd-ßgr doymamis
Sti-4,5- doymamis
d-4,5- doymamis
glukuroriil hidrolaz
(1-45 doymamis
glukuronil hidrolaz
d-4,S~ doymamis
gglukuronil hidrolaz
Ekso-1 3-ßglukanaz
0:-- glukan liyaz
CGGGY'CGAAGGAGCTCÂCGC
(JAGCTGIACTICAGCGCACG
CAGACCCCFICGGACCCCGTA
01678-P-0005
2 Ileri GCGCCTICTTCGCACCGTCAT i g
GliugçandM-u- 193 . v r 0› 1853 ?
9” 02' az ;Geri ATCUGCCGCGACGCTCAAAG '
iier'i TTGCAGCCAGCCTCCTTCTCT
Glukan 1.4- 0-
glukozidaz
Geri AGCGAACCCCTCATCGTCICG
g Geri ACGCGTTCCAAAG (SGGTCA
Ileri CATG TCCCG CTTCG CGTACT
0-1.2-mannozidaz 211 › ........ . . . . . . . . . . . . . v y SZOOFJ
Geri TGTACCGCACCCCGCTGTIT `
7# I", 7,7 U,, V 7 MJMWUMI_ A,” é“.Ahm ..
giien CCCGCCGÜCTGGATAGTCG
G Gen CCGCCGITCCAAGCAGAGGG
› â Ileri TCCCCCTCMGAAGCTGCCAGT
01678-P-0005
0-13-glukanaz
u-1_3-glukanaz
0-13-glukanaz
(1-1 .3-glukanaz
0-13-glukanaz
.› ci-1.3-glukanaz
ci-1.3-glukanaz
ci-1.3-glukanaz
0-13-glukanaz
ci-fukozidaz
ci-fukozidaz
2.5.3
Geri
1 Ileri
3 Ileri
ssccccccAcnc-mccrcr
ACCTGGTTGAGCGG !AMAGAGC I `I
MGCACCCAÇCCCACCCCAT '
GCGTGTCCCACGÜGATGCI'
AIXFGGCICGCGAAÂGCGCAG
01678-P-0005
Ksilan ß-174-ksilozidaz
Ksilan [-34 4-ksi`|02idaz
gKsiian ß-1 4-ksilozidaz
iKsilan ß-1.4-ksilozidaz
Ksilan B~1 4~ksilozidaz
SKsIlan ß-1 4-ksilozidaz
iKsIlan B-1.4-ksilozidaz
Ksilan [3-1 aî-ksilozidaz
Ksilan ß-u-ksiiozidaz
gKsiian ß-14-ksilozwdaz
.7.731
.Ileri KiCvKCYTCATGGACLGCGT
Elleri ”ACACCCGEÃCEACMTGCCG
îGeri coscccccmrcmcmcm
Gerimucccacacwcawm
iIleri ATISCTCCCCTAGCCAFGCCG
Gen GGTCACTGCCCACCTCCICT
gGeri GCCCTACCACCCACTTTCGC
illeri CCGTCGCACGACCGGGAAAC
glieri ccccsmtcrrccemccc
M 3642
.42806
Ileri AGCGAAGGCGACCACAGACCA
g Geri TTCTGAGCCACCGCCTÇCTGG
.2896
21350
Geri CGGCCCAGCAGATCCGCATA
01678-P-0005
iarabinozidaz
Geri AAGCACGAYTGCTTGGGCGGT
î Ileri CCÄCGATGCTGTCCTCCCTGG
EEndo-l,5-ü-arabinozidaz 1293 I 4 . H .... ”:120&
E Geri TGCG CGGA/UCMCCCCACAC
î '5 Ileri CTGCCCAACAAAGCCTCCCCA _
Endo-1,5-U-arabinozidaz ?301 i,... .. . ., . . 1157
› ; Geri ATTAAGCCGCCTICG(SCGCAsI
Endo-1.4-beta-ksilanaz 304 W W W W .W W ,1222
giien GGCTGGAGCGGTGACAGCAG .
End0~1.4-beta~ksilanaz 30'
Ileri CCCCCACATTGCGTCCAGGAG
gEndo-u-beta-ksiianaz 310 E . 1220
3 5 ”en ICCAGGTCGIACGGGCAAGC
~ I Geri CGCATGCCAGCGACGCTACG
i "en carcmcmscmmccccc
a-arabin0furanozidaz 316 .....v..w....i. .. .. . . _- .41317
Geri GCGGCCCCGTCTCCTÂÂAGC ›
Ileri TTGTACGACC'TGCTCCGCCG
a-arabinofuranozidaz .31.9 r . .. --1607
Geri AGGTCGGTGCCGCGCTCAAA
Geri `K`CACGCATCCGGCYCCCCAG
01678-P-0005
Jiien AGACATGCGCG'ICGCTCITCC
u-arabinofuranozidaz 325 .. 1206
Ileri GCCTGCATCCATCCÂCCCGIC
u_a(abln0furanozidaz 328 ...... . . n .. \ 33L4
Geri CCAYÂGCCÂCACCACACCÜ ?C C
a.arabinofuranozidaz 33') ............................................................................................ 2496
Geri C ACGCC GTCTTGCTATGCATCC
. Ileri CCTCCACGATGGCGCGGTTG
ßgalaktozidaz `334 v . . ...%31.44
g Geri AGGGGÂACAGACGGCÄÂGCÂC
g Ileri CCÄGACTCCGTGCT'ICGGGÂ
B-galakîozidaz ;337 i » -- 2346
3 ? Geri AGGCAGTCGGTGGACAGCTC
g Ileri GCCCCACCTTTCCCG CTGAG
ßgaiaktozidaz ;3:33 __unu .. v. w .2337
Ileri ?GCTCTCCG CÂC! GCG TTTT
î : Geri CCTCATCACTCGGCTCCCGT
gzIleri CÜTCACCGGCAGCCATGCG
End0-1.4- ß-galaktanaz
01678-P-0005
Gen GGGCCAATACCCCACCTGCG
Ileri GGGCCAGGGCGTCAATTCCC
Linda-Lövßvgalaktanaz 361 .4 . H
EGen CGCGCCTGCATCAGTGTCCA
=` Ileri CAGGCCACACCCACACTCCT
Geri TGGGCACCTCGATCGTGAGQ
Örnek 3 M. phaseoti'na ms69dan elde edilen Selülazlarin ve Hemiselülazlarin
ampliiîkasyonu, klonlanmasi ve dizilenmesi
Toplam RNA, Önceden Chomczynski P and Sacchi N, Single-step method of
RNA isolation by acid guanidiniurn thiocyanate-phenol-chloroform extraction,
üzerinde büyütülmüs üç günlük miselyumdan izole edilmistir. RNA'nin kalitesi
veya bütünlügü standart prosedürler uyarinca agaroz jel elektroforezi ile kontrol
edilmistir ve Thermo Scientific Nano Drop 2000 kullanilarak kantifiye edilmistir,
CDNA birinci sarmali, üreticinin talimatlari izlenerek SuperScript HI Revers
transcriptase (Invitrogen) kullanilarak sentezlenmistir. Gen, gen spesifik primerler
kullanilarak PCR ile cDNA'dan çogaltilmistir. PCR reaksiyonu (50 uL), l uL
CDNA, her bir primerden 20 pmol, 5 al 10X PCR Taponu, 5 ul 2,5 mM dNTP
karisimi ve 1,0 ünite PfuTaq DNA polimerazi, içermistir. PCR asagidaki kosullar
kullanilarak Thermal Cycler (Applied Biosystems) içinde gerçeklestirilmistir:
95°C'de 5 dakika boyunca ilk denatürasyon akabinde 95°C'de 30 saniye boyunca
denatürasyonun, 59-610C'de 30 s boyunca tavlamanin ve 72°C'de hedeflenen
genin uzunlugunda bagli olarak 1 ila 2,0 dk boyunca uzamanin 35 siklusu, son
olarak 72°C'de 7 dk boyunca bir nihai uzama. PCR ürünü, lX TAE tamponu
kullanilarak %1 agaroz jel ile analiz edilmistir ve amplikon üreticinin talimatlari
izlenerek QIAGEN gel extraction kit kullanilarak jelden ayristirilmistir.
01678-P-0005
Saflastirilmis PCR ürünü, pCR®8/GW/TOPO® TA cloning kit'e (lnvitrogen)
baglaninistir ve kompetan E. cola' hücrelerine (lnvitrogen) transforme edilmistir.
Plazmidler, üreticinin taliinatlari izlenerek QIAprip Spin Miniprep Kit (QIAGEN)
kullanilarak varsayimsal kolonilerden izole edilmistir. Içeri yerlestirinenin varligi,
gen spesifik primerler kullanilarak kontrol edilmistir ve pozitif plazmidler
dizilemeye tabi tutulmustur.
Örnek 4 Dizinin Analizi
Nükleotid dizisi ve amino asit dizisi sirasiyla, BLASTN ve BLASTP programlari
ile analiz edilmistir. Diger bitkilerden bildirilen diziler ClustaIW ile hizalanmistir.
Filogenetik analiz, Komsu Birlestirme (NJ) kullanilarak yürütülmüstür.
01678-P-0005
UZUNLUK : ;'.5- 'a [150 hp 5 UTRve 150 tip 3 UTR dahil::
ORG-'âr-lemâ
nfr r". TT "ni-A î-s
ORGÄNEMA : M.;Hmse IHH
OZELLWLADUÄNAHTÄR : KDE
LOKÂSYON : :î~"mJ&:3:
1:* .`~l I`~. M [-
î::n?:tqm:i:qtf qqrithüiîiq::tqnîîqttânjitü
01678-P-0005
ORGANiziJii. .
ORGâ.NIZr.-I.A.
UZUNLUK î -
TIF' V : .' I'Çfs
O RGÄN IZf.'1.›'-`± : u
OZELLIK ADIJ'ÄN-'ÄHTÄR "-"4
01678-P-0005
HK LlF›ß9hsü'
UZUNLUK : r :ra-t (150 hp 5 UTRve150 bp 3 UTR dahil]
TIP 1 [I'ÇFL
ORGÄI'JIZMÄ. : N. _va.'..i.-iu.:i ;:..i
55: IL H"l : R
UZUNLUK I 7
ORGAP-JIZL-I.=`-. .
OZELLIK "1.DI."*`~.N›'=.HT›'Ä.R: -
LOKRSYON : ~ . i ......
7_.'.i `:1` '
01678-P-0005
ED.' IZ' NL : 'J
ORGANIZM-"a
UIZUNLUK
ORGâI-JIZLIA.
ORGANIZMA : _
OZELLIK' ADIJ'AIJAHTAR = *î
LOKABYOH : ' _ ...... : .;. .
01678-P-0005
01678-P-0005
ORGâr-JIZIJ-ü. . _
LOKASYON ; ::.m;"î:
1.' 3-_:i:'1'. ..
ORGAN IZLi'i.
MPU'LbT"
ORGÄNIZLH
cirgtaigi'
01678-P-0005
UZUNLUK I'T”
ORGANIer-[Ai : ."a', _rtfissi-:::ILn'x-s
ÖZELLIKADIJ'ANJLHTÂR 2 ' '
LOKP-.SYON =
.'12 I-glil [II I-Jn". :
ORGANaMA
01678-P-0005
ORG ÃNIZLH
UAZUNLUK : 14.51
ORGÄNIZMÂ. : .`i'. 5'›:l.'.":i';`›I :rlv'e
OZELLIKADIJ'ANAHTAR =
LOKÄSYON
01678-P-0005
I'li'A: l I "J"
ORGANIZL-M
ORGANIZM 9-.
01678-P-0005
ORGâNlZMâ.
OZE LLI K &ADIJ'ANAHTAR
LOK-'ÄSYON
M. gndüdpilnn
1 T 5 N I
tâqîqcaîgqgîs:c
01678-P-0005
bu: HJMÇ
ORG '-`*-P-iIZL-1.±.
ORG,›I.NIZM-^«.
33r$yhrL
ORGÄNELÂ
ÖZELUKÄDUANAHTÄR
LOKÂSYON
L :4;: 1150 bpS UTRve 150 hp 3 UTRdahilj:
.P-.FaT'êTT I'I'TTT'TTI'7 '
01678-P-0005
ILîüîýiT':g
ORGÄN IZMÄ
H " ' :- .::kil-.Lan
.1- _'IJli_ -1:-4-0_ _
3 . Nü : -3
01678-P-0005
ÖZE LLI K ›"-.D LIM-JFH TAR
LOKÄSYON : :1 .-.wir-13`*
i_1 7 '
ORG.-^3~.NIZI.'U`~. : ."I. ;.I."i:.|;-'v:.'...;.'.v:.-2
ICIN.' 7 RÄTIÃÄ. ." ` .. ~ ~.-'."}*'|,'1"._4›"-."' ;M T 7-. ::N'I'JWNI F VT-. 1 ..5.9.
UZUNLUK : '. :. [150 Up 5 UTRve150 Up 3 UTR dahil::
ORGÄNIZL'H ; .'i' ;m 1.-'i",î . 'i
01678-P-0005
ORGâNQhA :
OZEUJKADUâNAHTAR : .
LOKASYor : -~i ...... ~p+~
.1 ”Liv 'Ir :14'
ORGANRMA
HEY-J. ..::In
IZMÂ. 1 H. rf :ina
.1ii› '
01678-P-0005
ORGFLI'JIZ'JÄ : 51'. E'!.'.4..'-i'i-"i'!. 1.2.1'
OZELUKÂDUAHAHTAR: Tus
LOKÄSYON : ::um-gw i
UZUNLUK . ..i
ORG ›"~.r-JIZI:1 a.
î '3154;` I I'IÜ'"
-13 :1' :-11 : :--
01678-P-0005
ORGANizn-ii.
ORGÂI'ÄIZMÄ
ÖZELLIK ±.Di.ii±.r-J±.HTAR 4
LOKASYON ; -
444.139* *
11'. 2' H
01678-P-0005
ORGANIZMA.
ORG-"-.P-JIZI:1'-`-.
01678-P-0005
UZUNLUK i ' "2
OZELLIK 4.DI.I'-"-.F-J-"-.HT*`-.R = '3 "-
01678-P-0005
ORGANIZIs-îâ.
MES" FLY
UZUNLUIvâ`
01678-P-0005
UZUNLUK . w
ORGANEMA ;
OZELUKADUANaHTAR:
LOKASYON : :1 mm 118!
01678-P-0005
ORGANizrs-u.
- 3 l'i`~.' }
UTR'u'e150 bp 3 UTR dahii:
. :377. "TT
ommizr: A. :
OZELLIK ±.Di.i'.±.r-4AHT±.R
LOKâSYON
.11 L... '
01678-P-0005
UZUNLUK ; r, .i .›.
ORGIAMZifiAA_ : ;.Ji'lase.;:-.`:r;;1-
9.17" ..
01678-P-0005
ORGÄNÜMÄ : W.5üh5wîHna
ÖZELUKÂDUÄNÄHTÃR: ?75
LOKÂSYON 1
uxüqiqiLgd
.'1.'îtIY'-'jtî.î.'
01678-P-0005
ORGANQMA
ORGâNEMâ
ORGANEM& 1
ÖZELLIK ß.D[.i'="-.P'J-"«.HTI-.R 1
LOKASYON =
. PUÇTTTß-j "r` '
01678-P-0005
0 R G .Ji-.N IZ M -'-.
UZUNLUK : :5,.- I,150 Up 5 UTRve 150 bp 3 UTR dahil':
01678-P-0005
ORGAJ'JIZMA
L '1Lu.LL-
ORGANIZM-"m
OZELLIK &D l.i'î=.f'vJ.A.HT.›'l.R : '-' "-`
LOKÂSYON ' 4
UIZUNLUK ; -
ORGÄNIZMÂ. : ".'. 143..'«mr-'i'vi i'm-i
UZUNLUK î
ORGÄNIZMA :.'.'.1:i.'iasi_=i'=.7i`::5
01678-P-0005
ORGANIZMA .
OZELLIK ADiramiAHTAR : dt:
LOKâSYON '
01678-P-0005
01678-P-0005
1 nin** -«
ORGß-.NIZIs-H ; `-" `
1- "i : `':1.'
-1r..-5'-r`-.'_U:-i
01678-P-0005
. WF?“ ?ö'iw'ri'imrrv
UZUNLUK : :EH
ORGANIZMÄ ; _55' '.III:i.-~'c:.zili'::.-:
OZELLIK .A.Di.i'AriJ.±.HTA.R : î-
LOKâSYOr-J :
7 5.3 I I "1'II'7I`1'7L' `1.'
01678-P-0005
-d-Fjýt:7::ct:a3:31:
-. 1" :1 :Jr "J ..1
ORGÂNIZMÃ. : M. ,'.:i`i.-i:-=r'- iî ;in-.-
k«rwpw. ' JRHT
HHERVIEFF
01678-P-0005
ORGÄNEH`
ORGANIZMA.
OZELLIK ADIAI'Ar-JAHTAR .
LOKASYON
01678-P-0005
01678-P-0005
ORGâNÜMA
mvsz' ›uykisy
<1I~I I LK.: I.
C`-."F.I-›Z LPG-.W x ;LII`
UAZUNLUK
ORGANEMA
01678-P-0005
UZUNLUK I "I "`
OZELLIK RDIJWNÄHTAR 5
LOKÂSYON I - -'
1'21j-:2-.L-.f _2:_ :'
01678-P-0005
UZUNLUK 7 .+"I` '=
01678-P-0005
ORGAr-JIZI
01678-P-0005
UZUNLUK ; .›_.; .g ._.
ORGâr'lIZL-î-“a _ ...
OZELLIK »"«DIJIAr-JAHTAR : :2-:
dr? vuq. ':a.':;'gs.~ig. :aagîarrirsixg
iLî 'ç ivv>u:q';wwqgqug~iqjçqq `îqç'qai
grianaaarç“gna:g
U V N H H J I I P S H Q 3 H F I E 8 3
01678-P-0005
.1' .:11 ' î _12
UZUNLUK 2 `1 m,
01678-P-0005
ORGâNIZIVlA. ; .\i'. pi?..'i.-1›_-;_-i.` .Ir-.3
ORG-'kNIZh-H ›
01678-P-0005
.%GG 1' 'IP-s" 7. T 7-'
Ti 31-- ; 7:.
ORGANIZL-l'ê ;
OZELLi'KADLMNAHTAR ; " f
LOK'ASYON ' '
01678-P-0005
.îî'GJ'êTJFE
01678-P-0005
..4.El TA". IIFJ'
UZÜNLUK ; :5.11:
ORGMJIZL- ~ .
OZELLIK -^`-:Dl,iîâ.r-J.-'-`-.HT,âR :
LOKASYor-J
01678-P-0005
.' ::ng' ' .'i.'i "HIT-7' '
01678-P-0005
SEHIR: . i .'
ORGANEMA
01678-P-0005
9.›'1` . --v-.i .-
I " n5;;sîn;“h;”"” ” ` l."IISCâAC" m
ORGâr-JIZHA.
OZELLIK ADIJ'ANAHTÄHR = .;
LOKASYON
uuuk.tdul4îwqiiüJiv,
01678-P-0005
ORGANIZIM
.' -4 -_.
01678-P-0005
1.150 Dp 5 UTRV 150 Up 3 UTR dahil::
J- i'I'ÂHÄ
A'IJ 'iiIiu-'x . #ki-.24
ORGÄF'JIZL'I-'K : .'vg. AliniLiw'N' 2:'
OZELUKiDUANâHTâR :-18
LOKASYON
3' 755_
01678-P-0005
01678-P-0005
ORGANlZf: 9-.
01678-P-0005
I'lPJ-.IIIATT'I
ORGÂI-JIZMÄ ; ,'vî. ;'f54155:i11r:4
OZELLIK A.Dl.i'i"-.N.›^-.HT.-^-.R =
01678-P-0005
› 1).'ILL_'{ÇL.1 ` ' `
.El-.j II.: IKI› : F'
01678-P-0005
TIP : .';S'xu
ORGAF'JIZI-.I v'-`~.
ORGANIZI: i. .
OZELLIK ADIi'ANAHTAR :
LOKASYON ; i
01678-P-0005
01678-P-0005
3 "-.i`gîî1
ORGANIZI-Jâ. ; M. _:ii'iei.~'›;-':'.' ina'
01678-P-0005
ORGANQHA :
OZELL“(ÄDUÄNÄHTÄR :
LOKÄSYON
01678-P-0005
p -3 .'-1 r :3. '7 r- .ri 3.:
ORGâîJIZf-Aâ.
UZUNLUK' : ;v -› .-"1 [150 Dp 5 UTR'v'E1SÜ Up 3 UTR dahil.:
TIP ; rir-cri.
ORGANIZL-M
01678-P-0005
ÖZE LLIK #3D l.I'#`~.N i"HT #XR
LOKÄSYON
01678-P-0005
ORGÄNEMA
ORGANEM&
01678-P-0005
U_ZUr-JLUK : 1.1.1.
TIP _ ; ir-m.
ORGANIZMÂ, ._ N. y.':..:'ii_'*i_ii.'1,`i
OZELLIK :Dii'ArJAHrsR : -.
LOKASYON : ".' i . '-. ;i'
.17211 mi- '
01678-P-0005
UZUNLUK : ;hr
ORGANEMA
ORGANEMA
U_ZUNLUK : lo-
01678-P-0005
ORGÄNEMA :
OZELLH
LOKÄSYON : î.' ...... J:IH
i.JLFÇîk]üîL`K”I'
üiîJLiHJ.
i :2 :i i . u
01678-P-0005
ORGANEL. :.v.;±us; U
(-Yu'îrlßfll ;'I" ""L'i."_` :'.vî . A' "E-IT?` 'LI PTT`
.52; ;L 2-1.] 1 _:7
UIZUNLUK :
UZUNLUK r :”w
Tip _ «. :'S-.xiz
ORGANEMA :
ÖZELUKßDUâNAHTAR:
LOKÄSYON
01678-P-0005
14 _l L" E
01678-P-0005
ORGâNQMA ; y,,ç, En;
ORGANEMÄ
.1v iv-
.1:14 .v
UZUNLUK -. in:::
ORGJÃ'NIZHA' ; li!. i_'-.*;La.-ts_;:_:i›' ! r:.i'
ÖZELLIKFÄDli'î-.NÄHTGR : 'ILE
LOK'-`~.SYON : I 1 i..... i.
01678-P-0005
ORGANIZf-;Hs
.7.5 l'rx _ -. '4:' _EL :IHL'I'i' MN' J _-
-_`-'.:'i`III.'I`HqI.Z: "
01678-P-0005
Ç-I-_IÜ IL' HIÇ : 11:;-
ORGAJ'JIZHA
,::: Iîi N." ; 11:
ORGâ,r-JIZI'.'IA. ; ,_,i _.
OZELLIKADLv'AIJâHTAR : ali&-
LOKiisvon
01678-P-0005
ORGANEMA
LIVE-':17 :3 `i i'lf -Th-'tTI ?4772'
w'I-'Mlî "vi i"'J "5
Ili~g"7`v'ît'f~1."".157f I'_l`-.'.7'î`.f'F [CNET i"
ORGmizn ~ ;
ORGÄNBMÄ :
01678-P-0005
OZELLIKADLI'ANAHTAR : 'r-&î
01678-P-0005
ORGANQMR ~ 6
Vhêiîwfîthüî”
.I .AI-:Af- . .-..~. :TF-.Il
ITTCGC_ v. _ . s .' r › `aGTTîîhüTT”
01678-P-0005
313-," _ ,: NF) : . _ ,;
UAZUNLUK :
ORGANIZMÂ. ;
ÖZELLIK &DIJ'ANÄHTAR * ` '54
LOKASYON : 2. ..-_ :::14:
1 '45-031 33!
.TH-Tîîîfîî'îîgzîîqqi't ::L
01678-P-0005
asgiL u; ; .q
UZUNLUK J.
ORGFNIZL-iß.
01678-P-0005
UÄZUNLUK =
ORGmiziJA .
01678-P-0005
ORGANIZL-IA .
OZELLIK .ADIJ'Ar-JAHTAR : --i F›
LOKASYON
01678-P-0005
UZUNLUK .ii'
ORGANEMA
Ivî'_'_.'_ BiLI-L`-i'i`-.t'1.Z-" 'EV
ORGâP'JIZI-JA ;
-v ' 'IS/`d TtI
01678-P-0005
ORGÄNIZMÄ : lu', 1'.`i'1'.-îr'-'"w':'!:.'-.'
OZELLIK' ADLI'AT-JÄHTAR :
LOKASYON : .- _____ 2;_-
ir.:- “i"izr' --rv-qi.
01678-P-0005
. '511-'4'571.'..'L1. S::. .
1 1 1 :r': '1 L l
ORGAjJiZMA. ; ß!. "ILE-.56311 1-3
r«1F"›~i'.-`›..›'v.=',' : _: ' GAP-K-uZ'HFu T :-î-'-.«" TFT F 'JT IT'T T"-'h`Nî-`.T'II.FZL_`- " F'TIiT'.I-_'FTv1`~'”T.'i'iîîfî-""
01678-P-0005
O RG AN IZIJ '-`i.
ÖZELLIK AD |.I'i'-`iN#`«.HTâ.R :
LOKßlSYOrJ 1 : i i' N,... I Ç ;Il-:5;
01678-P-0005
01678-P-0005
UZUNLUK :-wi
ORGANQMA :gt
îLîsirVvââ
Laik; '1; Mi; : 1,:-
W.5mi~m'
01678-P-0005
ORGAr-JIZI-;I-“x ..
OZELLIK A.Di.i'A.N±.HTAR i
LOKASYON
01678-P-0005
01678-P-0005
UIZUNLUK
ORGANEMA
.1 1;`1'}.1:-'
55"; _II N11 : ji.i_.
O R G 9-.er IZM 9',
.'3,_`:'I'I ' "'
01678-P-0005
TIP ; :r-;îi
ORGâNIZMâ ;
OZELLIK 2.Di.iî'-*.N±.HT±.R :
LOKASYON : v '
01678-P-0005
.5 .1 ::1.4 ..i
01678-P-0005
ORGMJIZMâ
*SESLI IÇ Ni," _ . :_
UZUN-UK = ”- i150 mp 5 UTRve150 bp 3 UTR cami::
TIP : Z'I'Çfi.
ORGANIZLvIâ
01678-P-0005
Ç WIHI :
ORGANQHA
OZELLIK ADIi'âJ'lâHTAR :
LOKASYON
01678-P-0005
ORGANIK-.M
01678-P-0005
..F v3.` Pî'."l.`cAI FA:
ORGÄNEMÄ
UZUNLUK : ini&
OZELLIK ±_Di.i'±.N±.HT.±.R ; '."_'i.':
LOKASYON : :î:mu:î?aü
01678-P-0005
UZUNLUK = "1" A
ORGÃNIZL'IHL. : .'›.'. '.:."1 1374;:: :i: i
L__ _ .. . l _ SI'H'Ç _.
(150 Up 5 UTR'v'e150 Dp 3 UTR dahil::
01678-P-0005
ORGANIZMA ;
ÖZELLIK ADIJ'ûI-JâHTAR : v:
LOKASYON ;
01678-P-0005
ORGMJIZMA ; -i ..... .
55: 1D NL
OR RNEMÂ
01678-P-0005
UVZUNLUK : 11.::
ORGANIZMA. ; IJ_ .::gt-u ,4; n 1 1' ifa-i'
OZELLIK ADLi'â-.r-JAHTAR 1 '13&
LOKASYON : Iîumni.w
”LÃSÜIIIÄÜFÃI`îILÜQ$q1KÜQWî7I115= ›-=-'V» . . .
JÇJSÇLLLUJJRKJLüJI
01678-P-0005
.55- _LI I~'_I : 14;
UZUNLUK : <4é
ORGÂNQMÄ
ORGANIZIJA : !4. ,'::ai'isuiîduici
p. ..T-wwrr..mnu
:: Il: :-ç-î.
ORGANEMA _
OZELUKADVâNAHTAR:
LOKASYON : i:- fm::
.4 .J 'IJ _ ' L.
01678-P-0005
ORGANEMâ
TIP : Izr-m,
OR GIRN IZMA
01678-P-0005
ÄA.ÜIâ;uLiai
Tip _ t :Irk-'S
ORGÄNIZLM ; .'-:'. ;3.2.1 »'aizji.' _:11 ;4
ÖZELLIK ADIi'âNAHTâR 2
LOKASYON :
mrglmîllL[.LALLilÜJ.ÃJVLLHJIIHUJITuI. .4% ›;:V i ,i.i|
.t.: '1 L.:: :.;1 FluLi-_ tt ::x4i.:r V
. 54::
ORGAr-JIZLH
'i› 'i' [ \.
DUSMrîûerLh"s
UZUNLUK . - '›' (150 Up 5 UTRve1SO Up 3 UTR dahil.:
01678-P-0005
OZELLIIK` -"-'.D|J'=`
LOKÄSYON
01678-P-0005
UZUNLUK : 3 'I'
ORGMJIZMA '
ORG 'RN IZMA. : "'.
r~iî|'_î ' `i : IH-e
ORG-"i~NIZ'=1"I*- : !4. g-::asezli'za
OZELLIK â.DI.i'.A.r~Jâ.HT.'-\R ; “rs"
LOKASYON
01678-P-0005
+2:: ;1: r~;i'.
ORG &HIZMÄ
ORGÄNIZMÄ
1" vwliii
01678-P-0005
ORGRNIZL-IA .
LOKASYON
.. i xi ›' ›.'.,. '-i Ii ..;.i : :ww-:111.1 21-. vd-v'qnL-.v'-:vrvwiu : f-.ivçiv i i :. -vi
01678-P-0005
1.1`Jî.'i.117-'1'37I `II î
4-: _ .:03: :it ;4'-
T 7 r'-
01678-P-0005
ORGANIZMA
ORGÄNIZMA.
.-. aI-rivrwii y,
01678-P-0005
~. 1.. i..
.'IÂIIIÃPis `
ORG›9~.NIZM+`«`
ÖZELLIKADI.I'.›"~.r-J#`~.HT±.R 1
01678-P-0005
UZUNLUK ; `i H“.i [150 CD 5 UTRve1SÜ Dp 3 UTR dahil.:
ORGANIZM-'Ä : M. DIJHSHFI.' Ei'iî
01678-P-0005
.'77'. ' 1'.' I
ORGANEMA .
OZEUJKADUANAHTAR= t
LOKâSYON ;
01678-P-0005
7 1' F"
01678-P-0005
ORGANQMA
i-1-'_' 1-'
JLICKAYEFF
ÄUYHFhHT;;L
3 &u : Im&
UZUNLUK : H [150 hp S UTRve15Ü bp 3 UTR cami;
ORGANIZMÄ. : M. '-1 .in '
01678-P-0005
*, 17:::: : 111*
ORGÄNIZW.
01678-P-0005
1:' F .:5
01678-P-0005
q77îFfî*”î--*îr:77~
3:L;a;5a;:3_9}
7. 'c` F. . I '.-` i'
ORGâNEMA
."'I'l' Ekim.' _'!i-'LJLJF-J
.IÇ-TTB' ;MrFI'
01678-P-0005
ORGÄNEMH
001377
1 .- F..Ä.~"-.r'-.A.-..^`e
.îTF^î“mn“nangTq
01678-P-0005
ORGANIZL'Ä : i'u'. .l..-.1:.i-`-e"›:Ifr..:-
ÖZEUJKADUANÄHTÄR : ”PF
LOKASYON ›
CNN-15”; :iggd'ii "v
1" '7 T' 'i-`; 'K' M
01678-P-0005
01678-P-0005
ORGÄNEMA _
ÇKTHTTETF'QTRFV
»1. i mi
.I'i:.)"1 a..- 'IK-V 1 v
ORGâNEMâ
01678-P-0005
ÃGI. - '- IÃ :'Li". u
7741'”.
UIZUNLUK 1 1:;
TIP : Litaf',
ORGÄI'JIZL'IÄ : M. ;.-.'...~_<'e_':.v.'i.v'.v.i
OZELLIK 'ütDlJl'ûtN '-`-.HT.'-"R `
LOKg-.SYON
.1r^_1*.*.::r 2›
01678-P-0005
1;: :-:i: : ;
ORGÄNIZMA : ;mi _in ,
. H '_" I 2 v .`
ORGâ.rJi`zi.-i.â.
.. 1 :T-
01678-P-0005
SEI' îri 3:" : .T
O RGP-.P-l IZHA
ÖZE LLI K AD IJ'AN :RH TÂR
LO KI-SYO H :
01678-P-0005
=?”19î”'7_113`FHÄF'r'Ü?“IJ1`ü”1YT”`FQ'”7
ORG AN IZL-IA
- LSLELAIÄ`1'A(;E:1"LLI"I `
01678-P-0005
ORGF-.N IZM 2,
ORGAN IZMA. - .
OZEUJKADUANAHTâR : :hb
LOKP-.SYON : 1 i.... :
01678-P-0005
..1.;--~..›.-.- --.-.
ORG-'ANIZL- A.
ORGANlZL'IA : .'-.'. ;li mr ., :ya:
01678-P-0005
OZELLIK -"-.DI.I':`-.N.:`-.HT.-"-R ; :-i
LOK-'HSYON ; ;~_
- 'i › Ni“- : .6 :.
ORGÄNIZMÄ `
TJTGHÜQIV..›-
ORGÄNIZI: "32
01678-P-0005
ORGÄNQMÂ
ÖZELUKÂDHÂNÄHTÄR 2
LOK-'ÄSYON ;
01678-P-0005
UZUNLUK '. â-:-
ORGÂI'JIZHÄ : pr_ : ;..; . .' _ .ii
L" 5“ _ _-_ _i._
ORG'J-.NIZM-'î's
ORGANIZMÂ. .- M. ;.I.:'_'i,'-7i'_1;îv.' 1. rrji
OZELLIK.±.Di.ii±.N±.HT.±.R ; :-:
LOKASYON ; . i s.
.113.54 ::i :1 1?
31 I". '_ 51 .'.I
01678-P-0005
1 _' II' KIZ" : :99
ORGÄNEMÄ
ORGÄNEMÂ
01678-P-0005
ORGANIZMÂ_ ; .'2'. ; !Lise-2.2.' HH
ÖZELLIK %DI."F`-.NF`1HT.›"-.R : ':I' s"
LOK-'ÄSYON
Z - 9' 1-: '
01678-P-0005
UZUNLUK ; ;vu
ORGANEMA
Ijbî'Hi'tlI-.I- FF.
ORGM-JIZMA . _ .m . ::d .- :1
ORGÄF'JIZI'JÄ
ÖZELLWIÂDU'
LOKÄSYON
arar" :'T'.`-3"'." "v“tî'rr.Tfj-:“:i':=z`.1”:fr-Q'rirq'zv*îq=i*x:'“'r-"›3' '
.ar-%--zwrgrr-tig›
01678-P-0005
1:.' E
.3 :1:31 qqi :i ' 2:31:: :. '::izq 't 1'qu t =. ;I .aci i:vt:."1.r.'.aiq›:ii':
.“2- I :L ['Ç'îg : ;':Ii-
UZU JLUK 1 .-.+ i-
01678-P-0005
ORGANIZMA
EF.? Irii WT:
ORGAr-UZMA ;
ÖZELLIK A.D|I'ÄT'JÄHT"~`~R :
LOKASYON
01678-P-0005
01678-P-0005
ORGANRMA
'I _ î I'C-I
ORGÄNIZMA
01678-P-0005
UZU NLUK : 7 i:.'- 7 I'
ORGÃT'ÄIZMÄ : .\:'. :Ars-.::i-L. i` :ne
ÖZELLIK :3.DII'ÂI'J-ÄHT4ÄR : .'1'i:-i
LOKASYON ' _
01678-P-0005
UIZUNLUK :
01678-P-0005
ORGâr'JIZh-lû. : :4. - ;m
ORGAF-JIZL-Iâ ; .,
OZELLIK '-`i.DI.i'.d-.NAHT2-R ;
LOKASYON ; z:
01678-P-0005
01678-P-0005
SE., lL› I'CIÇÄ
ORGANIZMA
OZELLIK A.Dl.i':`~.N›`~.HT'›“«.R
LOKâSYor-i : :i i '--
. _i`l_'4i_ I_ [141.3: *TI-'V
01678-P-0005
1144w14isjnpv4iýgiLr
QZUNLUK
ORGÄNEMÄ
L5...iéLH
01678-P-0005
.j'I'T'L'iIII'L' tc!. .
3._ r_1_:_._;._. -_ J _r_
5172:' I.- I'ÇIII. : "37
ORGANIZL-!A
H 19'" "'Ii.-".-'1"-.`u\'I`-J i"HÄ[I'_`-' S `J'.- 'HF' ."'il-l'lî
01678-P-0005
ORGANIZMJI. ,
OZELLIK AD|.i'9-.N›'=.HT*`~R ; : ›-.
01678-P-0005
LOK-'ÄSYON
01678-P-0005
.LI-E.' IL* Nu : l-
ORGANIzr-AA
ORGLKNIZI-;H
01678-P-0005
ORG ±.Nizi.-i.n. :
OZELLH
LOKASYON :
(1.4"
01678-P-0005
n i:n üi:r.i:' i Iii.TW.HHqqqnqâquII.L`ÜJUHTTLHV Hßrr;;ri: i
01678-P-0005
UZUNLUK : ?VZ
ORGÄNEMR
ORGÄNEMA
01678-P-0005
ORGANIZI. A. i _.
ÖZELLIK ADlJ'ß-.N-"mHT-'ÄR : i-L “--
LOKASYON : i: __;;.;,.;4.
.AL _-_-_HT _.1I_I'_I.$'_ _î'_..i _' : 't :' - _;._-'-›i_;._ .i ›i_]._ ;i' `j .`_..Ä«-_ :15:41: 4 . .;. _
01678-P-0005
UZUNLUK : i-.;i-'
O RGÄN IZM 9-.
FPTQAHTh.
.$FSLIUÜYHHT”
.T5F'N3TU”}
01678-P-0005
EE..? ;L' I'i'Ü : g'_~4
ORGÂI'JIZL'IÂ, t .'W 13'i.`
ÖZELLIK -"-.DI.I'F`-.N.'-`~.HTI`-R 3 ' î
LOKÂSYON : i '
01678-P-0005
ORGANQM± 2 “is”m;%f*"*
3.'L."'
ORGANIZIJA.
01678-P-0005
UZUNLUK : 1F.'-.'-.
TIP ; H-IA
ORGANIZMA ; 1.5_
OZELLIK ADLI'ANÄHTAR : :_ l . :_-
ii_:| IÇ'SIJ'i 11.“.
01678-P-0005
U'ZUNLUK r g'-
qîîhýrüNHP
LuîJD.:ÄLHÂI ' `“ '”' w. ”,' .LiI”' ` '“"E `5 . .J'E-JAA HUSEâcwhbw'
:: l;
01678-P-0005
ORG '›`«.NIZL'1.^`± ,
OZELLIK âDlJ'âP-JI-.HTÄR :
LOKASYON
01678-P-0005
IîâpÇFhHFPH&
UIZUNLUK : ' -,
ORGAr-JIZL-in,
ÖZELLI K A.Di.i'.i.N'-".HT±.R
Low-.avon
11-91-43› ›- uiw
01678-P-0005
ORG.*`~.NIZh A. : .'-.', pi: =.~T›= 1.` :ve
ORGANIer-H
..1" H:
3' 17. aa.'
01678-P-0005
› ; 1:' 312' : ;H
ORGANQMA
OZELLH
LOKASYON
UZUNLUK î 35';
ORGÄNIZMà : .'n'. ;'ii`1.=..›îi=i' i ?:75
ORGANQMA
01678-P-0005
ORGâNQMâ
OZELUKADUANâHTAR
01678-P-0005
ORGRNIZMA
ORGANIZh-lel.
Il 11": ..I 9( `L1"I
01678-P-0005
ORGANIZMA :
ÖZELLIK âDli'ê-.Ni'kHTAR -.
LOKASYoi--i
01678-P-0005
l 'V.1*..'.;lv{t I ' I " I* 1 n.” 'J .uyißi'v { i i
51".' _'L- K". -, '__'.`-'
UZUNLUK :int
ORGANQMA
ORGÂNIZHÄ : .'J. AII'i'aSHi” .' i:..-,
ORGANQMA .
OZELUKADUÄNAHTÄR?
LOKâSYON -
01678-P-0005
O RGMJ IZMIR
UIZUNLUK
ORGÄNIZMA
.4555: 1; MM : -éLi
ORGANIZIJA -.
OZELLIK A.Di.i'±.NAHT±R :
01678-P-0005
gr.: 1 r. MC:: : .'-2 ` Is
UAZUNLUK' = -'
ORGANIZf-;H
- 'II
UIZUNLUK
JIZMA ; JJ. g .- ::i-a". .' .in-ayi
01678-P-0005
ORG'A'NIZL'I-A* : .'f. “513 55.:- _I ::13
ÖZELLIK Â.DI.I'=`-.N+`~.HT-"~R : -.L'b
LOKABYON : .
E 3: T." T'ÇII: ; 1 Ah;-
ORGANIZLvIâ.
-rin-rzpm-:T'
01678-P-0005
UZUNLUK : L' :,,i
ORGÄNIZMÄ
li” i` I-ipv .-i-ir- '1.
TIP _ ; ivxri.
ORGâNQHâ ; M.;Lw
ÖZELLIK ADli'âr-Jß-.HTAR :
LOKv'J-.SYON : i;j _w_ ; ' -
01678-P-0005
. “KGB-EFE& 4 F'I'i'î
n) H'u'IJ N I"
(4...:
uzUNLUK
01678-P-0005
ORGANEMA .
OZELUKADUANAHTAR:
LOKASYON : a
01678-P-0005
SEÇ' '[1" MIT : :SEI:
ORGANIZMA
.%213 H'
ORGANQMA
01678-P-0005
-ivn i ›'\ -i-ii-u-ix lal-i).
F. 1; ...I 51'".-
ORGANIZLlâ :
OZELLIK ADii'.'-*.r-JAHTAR :
LOKASYOP-J
01678-P-0005
UZUNLUK ; via-,-
”'P. . ?LI-SI› › I`î_|'
01678-P-0005
-i1'ii--ir~"\-
ORG.^`-.NIZf-.-U`~. :
ÖZELLIK ~"-.DI.I'L`-.N:`-.HT-"-.R : .' 5:'
LOKÄSYON
01678-P-0005
H i ›' J`, › I 1 If I M '.'i' 'Ç I ' I 'I ` .' I 3` .V '4' ' r'.
UZUNLUK : J. =;.
ORGÄNIZMA` : i\'i'. '.".=..-'.-:i'-.: i' .' ." -
FI" S SEHRI.: .›^-.'4.
.`2'J`i31 S'I L
01678-P-0005
01678-P-0005
ISE-:i 'Ti Niîf.' : :ii-'j
UZUNLUK r "'-i'1
ORGANIZMA : f::. ;':.';.is'i.'.i'..';.':z-'i
ÖZELLIK .;`-.DI.i'=`~.r'J.==.HTß`<.R ; , '1'i-
LOKÄSYON ; ;- -431.
it Zîîtgg.`rtütîîîîît7q"`f`î"IQCJJHZCu
LI. ::alt :3. ”kurasi . H.
01678-P-0005
ORGANizmi.
FHAÃÜM
ORGANIZM&
ÜAFUTLI`”
OZELLIK -"-'.Dl.i'.A.N›`-.HTJ=.R : -'I:›~:
LOKûSYON : î- ...... i i i"
i'qmi44241Hquf'J ünü-G“.tqwdq
01678-P-0005
UIZUNLUK
ORGANIZMA
. PCI'IF-.I IPS` î r.`
."iF-Iî-.FTl'INTÄWIZTF`Iv ›
01678-P-0005
ORGi'î-.NIZM`
UIZUNLUK : ;..~;::
ORGANizw.
OZELLIK '~`«.DI:'±.N.I`~.HTAR : - :i.i.
LOKASYON r "-=~~~~›3`-
01678-P-0005
UZUNLUK i 1
ORG.-"-.NIZI-.v1.=*-. ; .
ORGANEMA
Ihfi. î.:'i`..`i.'T iî'.
- üvi hâl-n.
01678-P-0005
ECE:: I: l-Jîlîi ;
ORGANIZTvI.'-*-. ; . .
OZELLIK »iDii'ArmHTAR
LOKASYor-J :
01678-P-0005
muLU.hr
01678-P-0005
ORGANIZLH. : '. vîi'fr.?
ORGv'lIJIZhH
01678-P-0005
ORGANIZLIA : rw,
OZELLIK &DI/APMHTÄR : u`
LOKâSYOT-J
01678-P-0005
E-î E !3 :'1 H ':1 H 1 '.' .'.i LA L' Ka' 1-; "Q :-Ç L' L ii` L.:
01678-P-0005
ORGAI-Jizi-.M
yâîLPLîIAL;
ORGr'ÄNIZI-;IA
Z " 2.', da_ I-Üirzîi'îî. 1 .vr iyi_
757?...
TIP . ; .TF-li"
ORGmizmA. : ;5:11
OZELLIK .±.Di.i'±.r-J.±.HT.±.R ; . a- s:
LOKASYO'* : ;'mm'asç-
01678-P-0005
FECI II' I'IJI' : I`d'
ORGâr-Jizrsîâ
" 1' lik '
ORGÄNIZM
01678-P-0005
TIP j SAH.
ORGÄNIZMÄ : fif, ;:i!:.i:=H5›J !rz'a
ÖZELLIK v±.Dl.i'v'›`«.P-J.±.HT.›"~.R ; _ ;
01678-P-0005
UZUNLUK ; C7!
ORGANIZL '-x
V I' Lîßâélîgénff'
ORGÄT'JIZMA
01678-P-0005
TIP : uca.
ORGANIZL 9-. ; .\f. ::-2
OZELLIKADLIâNâHTßuR ; :.':'
LOKÂSYON -
01678-P-0005
ORGâ .HEM-
ORG“HQM»
ORGANEMA
01678-P-0005
OZELLIK iDli'ANAHTâ-.R : :';`i,'›.:
LOKASYON 3 .1 .i-vi-
.riirt :ja 'giîjt r_ ;rc-i 1 'JC-5.1 .. v.-
ttjnquctgSiznt'
01678-P-0005
S: .i -L Z-J'II'
ORG.~"«.NIZI~.1~"«
ORGAN IZMA
UÄZUNLUK : î i'iS :1
OR GÄN IZMÄ.
OZELLIK .".'.Dl»'- .--N'-`.'HT.R : :":
01678-P-0005
*'gudqwdfwn'üqußqü
01678-P-0005
gii', › ri'AI-"I' I F E" ..
II IÇI "" .'.TF-ÜI'H
ORGÄNEMA
UZUNLUK . vu:
ORGANIZMA : .'-':'. _:-linia'm i. _i :H
OZELUKÄDUANÄHTAR: vis
LOKASYON
01678-P-0005
JLquiîu:
H,;{n.+ry;iqigk
ORG 'AN IZMA
01678-P-0005
ORGÄNIZMÄ
ORGANizr-JA, : M, 1._v._._._;_-.v,_-.._-.;i,.m
ÖZELLIK âDli'ilI-JßaHTß-R : i.;
LOKASYON ; u
01678-P-0005
ORGÂF-JIZIJ'Ä
ÜÇiÜ.JIÄkhü'
FÇILHPItFÇJiI:
AW F#"hr9FlHJ
TIP ; Tir-m.
ORGâNQMA ...
UZUNLUK : :Hun
ORGÄHIZIs-iâ. ; .'~.', ;I'.'2:`i$z?i'|î 1:25.
ÖZELLIK ileJÄF-JâHT-'IR : 'ILE'
LOKê-.SYON ; : i i.___i ;:H !;.›.- gi
01678-P-0005
ORGÂNIZMÄ : .'a'. _ i ›.-i;-i'c`i'!1 Ã..”
M› ':,w ;Fin `ß."`.›'i.lil."-: l »15" .I I I 5- F1z"f`.".\l'î”~ `c' î :-'~`~.`i-`l']:ê`.*--I l?
."*IfrFItIJhll . › ..
13".! .,
f-III :i TT .`vI-' : LI :Ml
.4. _.
01678-P-0005
UZUNLUK : '3: J
ORGÄNIZMÂ.
LOKÄSYOF'J
*lf'îîiTH%'.3>lâîî}.1,4j:
LI Egri-J I F.?
01678-P-0005
U_ZUNLUK : H* 'i (150 Up 5 UTRve 150 hp 3 UTR dahil:
TIP _ ; firça.
ORGÂIJIZMA.
ORGANizn-IA : _ .v
OZELLIK âDli'ANAHTAR ; ›-r..-:.
LOKÄSYON ; .1 _, ._
01678-P-0005
ORGE-.NIZI 11 - `
UZUNLUK '. _iî'g_
ORG!`«NIZL-Ir'k : i'n'. pixesecgime
OZELLIK v'-`-.Dl.r'i'-`i.I“J.-'-`~.HT.'_`-.R 5 1 :-'F
LOK'ÄSYON › '
01678-P-0005
ORGÄNEHA
2.1111
01678-P-0005
UIZUNLUK
ORGANizn-ii. ;
OZELLIK' ADLRAPMHTAR ;
LOKASYor-J : : :....:.ii-.›i
UZUNLUK 2 i“
ORGâNIZh-iâ.
u"-Jf=."- PAI 1'"
01678-P-0005
ORGANQMA
ORGÄNEHA :FL5,M50_HVJ
OZELLH
LOKASYON
.11 l.:
01678-P-0005
- :iqîquüiütî'
UIZUNLUK = " J
QZUNLUK
ORGANEMA
PT" HA.Mn
.51-nfîün"
01678-P-0005
ORGMJIZIçlâ : .'52 ;hi-Tr.: -. I 2 '1 =.
OZELLIK.RDUFÄNAHTAR : "V"
LOKASYON : : 1:' .mi 1 51'e?
.ar-q “EF" 35",“ _izr -_Ti:1"::î' ' ::r-'f'î'îîq *r 21":::1' 'F .
i"".'.I-'î~..;'."'2.IHSSg-"ivtî'îîiiý : t›|-:i›'."i~.i.ç'i':""
01678-P-0005
3:::: m: :3::
ORGANEMA
.`-1FIiI 'J` MSR:
ORGANEMA
ORGMIIZH'-`~` ; ,\.'_ 5.55559,” ?ini-_S
ÖZELLIKA.D|.i'›'l.NP<.HT›`«.R : ::is
LOKÄSYON : :i'm_iîL1n
01678-P-0005
ORGANEMA
HE&;;F_L1;;AH”"'T›””`
K '"rwii'r m T *- ..
SlîYHSNkX}LI5HAAEI:FÄQKFLFÄG
ORGANQMA
1_-\as -snr-
01678-P-0005
ORGANEMA
OZELLH
LOKASYON ;
01678-P-0005
H' 1 « . ' ç ' a r '. -
ORGAT-JIZMA
O R (3 AN IZM '-`-
TI p : i .Ir-S
ORGÄNIZMA. : M. ;insani-li:::
OZELLIK' '-`-.Dl.i'â.r'Jâ.HTâR : ' is.-
LOKASYON ' '
01678-P-0005
ST. .::7 JPG::: ::î î.:-_;
ORGÄT'JIZRH _ F', 51'i.] __:2
ORGANI
01678-P-0005
..g 'AL` hap; Ahir. :, ; L'A-î 11 i 1 .h Ii L;""i"":«,: ci.
EF:: fî: rçî: ; ait'
ORGâr-JIZL-lik : ma ;:i'mw.' .~.'.-.i›.
OZELLIK âDli'Ar'iâHTâR = '“3
LOKf-.SYON " `
ORGANQHA
7-EJEYASn;
41' Hg'l
ORG“.NIZLH : 51'. 1'_i.*i;
01678-P-0005
ORGANIZMA. :
OZELLIKADIJ'ANJRHTÂR :
LOKASYON :
01678-P-0005
;_ -; Il_ -
ORGAFJIZI'JIÄ
UZUI'JLUK : ;::.'.H (150 hp 5 UTR ve “ISO bp 3 UTR dahil]
ORGÄNIZfs-I* 1
01678-P-0005
v 7. \ -i
TIP : I~r›;.u.
ORGANIZHA ; M.
ÖZELLIK .A.Di.i'.â.r-J.±.HT.±.R :
LOKASYor-i ; ::im
01678-P-0005
52'; L-' Hi: L
UZUNLUK : i
ORGÄNIZMÂ
01678-P-0005
TEPITÇTL
. lig, :L IK' '1
ORGANIZL-U".
"- ;"L' IÇA'; .
ORGANIZL-m.
01678-P-0005
OZELLIK ADIJ'ANAHTß-.R : x:::
LOKâSYON
31:3"nrsgz
01678-P-0005
ORGANIZJA : .\-.-'. ;'.:i`Ji:-i::-.:.-l-n'i
01678-P-0005
ORGANEMA
UZUNLUK :::%i
ORGANBMA :
OZEUJKâDUANAHTAR ;
LOKASYON : ::1 ._... '
01678-P-0005
UZUNLUK : v. -1 .1,
01678-P-0005
O R G #RN IZ!-
v. GWÖJIQ .._ .L
..P;;\UEF . “ _;;GYKLL
.fEAirÜlL
01678-P-0005
ORG-'lI-JIZMA .'
ÖZELLIK â.DIAi'-'l.r-J-'=.HT.5«.R
H 2= '5 H ›'
01678-P-0005
01678-P-0005
ORG-`i .NIZLH
LHYTKLÜHJ
PV'FNTFM .
~wiF~iFFT"`F'îH 1-îi'- '-
HLSLYHLTÜFEGIQN
21:'1. 21:.
ORGANQHA
.7. :"I ?3 :KITI-4 -
SIT; JU-EC
7. ~~1~s -ivi-n
.iÜTRF`CT_TTTii
- âII-j ,P'irT `-i -;.Ti-i- 1
01678-P-0005
U_ZUNLUK : :::4: .'I'
ORG?`«I'JIZMÄ ; M, ri,';.'.›';eü".".:`;1.;'i
OZELLIK '-`~.Dl.".-'i.I"J.-'i.HT.3-R
LOKJÄSYON
01678-P-0005
I. S .31. i“. PI Ir: 'l 'J 1 H `c` li
ORGÄNQMÄ
7-' .ra'r'Lic-mir';
21-..
ORGÄNQMA
01678-P-0005
UZUNLUK î
ORGANIZL-Iiû. : ;=.'i.;i.-..
OZELLIK ADLI'î-.NP-.HTûR : ' '354
LOK›'-`i.SYON
01678-P-0005
01678-P-0005
4.:- 4 .l ::44.14.24
UZUNLUK i E
IL..'.1.'.i.'11 i.i. lxu.
4151; '112' -i›:. ;
2 --M7 -v-y,~i-ii,r-i-\-
01678-P-0005
ORGANIZMR ;
OZELLIK ADIJ'ANAHTAR :
01678-P-0005
01678-P-0005
5371-2: '7.' ."C ':1 ; _”37
ORGâNIZMA
MHûlTâLL LLHAYWUIJU
.D-J'V [. .."l^ wxh'i'llb-
3;.1Ltgl'E'IÇS-.l3 l .'"Z'IJ
01678-P-0005
54;› .LI [x'i: : _;-__.
ÖZELLIK F`4.DI.I'-'-`~.Ni'-`~.HTI`
LOKÄSYON
34;› -`.I ['CÇI
F'T 'ri`l`iri
9:; :: mr : =aî
UZUNLUK : -9 - [150 tip 5 UTR'v'e 150 hp 3 UTR dahil::
ORG-'ÄNIZMÄ -. '4. ;'i'53.-7e':;i.':':..a.
01678-P-0005
ORGAT-JIZMÂ. : H. _rkPiii-aanf ina
OZELLIK Ä.D|i.›"~.î"Jß`~.HT›"~.R I 1-*
LOK-'ÄSYON : '. ~I '_ Ir: Fii
01678-P-0005
.5. 'a` Z :2] K I? .-`-. L
.ST-":2 `T` KI- : ?EFT
UZUNLUK = i* 4
ORGANEMA
s :Jr-.'-k . r'iT-J .'i
ILLETIFPMI”
170.1'-
ORG›`~.NIZI.-1ßc`
77777& '- "TTTII : .'..
451 i.
ORGâr-JIZMA
OZELLIK ADIJ'AN AHTAR
LOKASYON :
01678-P-0005
ORGANEMA ; M.;ýmsaüinj
ORGâ.NEMâ
AHTTI Tw;****;"inTu
- 5;“-
01678-P-0005
.1 '_~I"_i'T'.'T`_"._
.5.5“. -'_ NI.` .
ÖZELLIK -"~.D|.".J`~.r-l.›"-.HT-^`«R :
LOK-'ÄSYON
01678-P-0005
ORGANEHA
-I`."»F.l rîI1`-i'."`1.'7F'_'
-'.-.`.i'x1'L\' - ' 2 . . I"~'î*l `J I' ~4 -i' F v'uh'Hv: i-
O R Gr"~.NIZf-.1P-.
.1A T` 1' `H
TIP .' SIM?..
ORGaNBMA : H.;W»wvr~ni
OZELLWLADHANAHTAR = GLS
LOKASYON
01678-P-0005
lD'l'ALDRLKliSGIKLLRIWG
l-'NDVN'1`VP'1DGIÂVWYOSFVA
ggccaggacccggtcatcaacaccggtgccaatggcttgcagcgtctggactatgtcgtc
GQDPVINTGANGLQRLDYVV
aagtcggclgagtctcgcggcalcaagclguttataaacittgicaacaactggaccgal
KSAESRGIKI.IINFVN\'\VTD
tacggaggcatggccgcctacatgaagaggtttggcggctcggccaacccggactggtac
YUGMAAYMKRFGGSANPDWY
gccaatgccgacancaggctcagtacaagaagtacatcaaggccgttgtcicacgctac
ANADIQAQYKKYIKAVVSRY
aicgaclctccggccaicticgcclgggagciggcgauigagccccgclgcaaiggcigi
gacacctctgtgatctacgactgggccaaggaaaccagcgcatacatcaagagccttgac
DTSVIYDWAKETSAYIKSLD
gccaaccacciggliacccicggcgatgaaggatIcggaglagcgggiggtgalggcagc
ANIII.VTI.GDEGFGVAGGDGS
tatccctaccagaagagîgagggtgtcgamczigcaagaacctcgagatcgatactctc
YPYQKSEGVDFSKNLEID'I'L
gaclacggcacauccalctctacccggallcctgggglcaacccaacgaaccgillggc
DYGTFHLYPDSWGQPNEPFG
SEWVTAHGAACATAGKPCIF
gaggaglatgglgtgaagacggacaaglgcaacalagaaggcaaaiggcaglcgacggcl
EEYGVKTDKCXIEGKWQSTA
cnaacaccaclggcalcgccgccgaicagltcLgggaiitcggaaccacgclcagcigg
gglcaaaccaacaacgalggcaacaccalctLcacgggcacgiccgaclgggagtgcclg
GO'I NNDG.\"l`ll"'I'G'I'SDWL~'CL
gtgaccaagcacgttgccaacattggttga
VTKIIVANIG-
SI'IQ [D NO 3 366
UZUNLUK î 369
ORGÄNIZM» : M. phascnlina
M KYSTI LGLTAAVTLAAASPVKRQSSFAKVDG LKF N I DGVTKYYAGTNAYWLG FTTG DADI DTALDRLKE
SG I KLLRIWGFNDVNTVPTDGWWYQSFVAGQDPVINTGANGLQRLDYVVKSAESRGIKLII NFVN NW
TDYGG MAAYM KRFGGSAN P DWYANADIQAQYK KYIKAWS RYI DSPAIFAWELAN EPRCNGCDTSVIY
DWAKETSAYIKSLDAN H LVTLG DEGFGVAGG DGSYPYQKSEGVDFS KN LEIDTLDYGTFH LYPDSWGQP
NEPFGSEWV IAHGAACAIAG KPCI FEEYGVK l DKCNIEG KWQS IALN I I GIAADQFWD FG I ILSWGO.
01678-P-0005
Endoglukanaz: kristal selüloz yapisini bozmak için iç
baglan kirar
Sellobihidrosilaz
Kn'stal selüloz ßoglukosidaz
Sellobiyoz
01678-P-0005
01678-P-0005
857 hp
1048 bp
01678-P-0005
1491 bp
1084 bp
01678-P-0005
1661bp
864 hp
01678-P-0005
1150bp
677 hp
01678-P-0005
916 hp
1224 bp
01678-P-0005
1891 bp
1580 bp
01678-P-0005
1165 bp
839 hp _›
01678-P-0005
693bp
2603bp
SekHZO
01678-P-0005
2897 bp
2050 bp
01678-P-0005
2843bp
2652bp
01678-P-0005
3245 bp _›
2165 bp
01678-P-0005
2126 bp
2435 bp
01678-P-0005
2630 bp
2024 bp
01678-P-0005
2104 bp
2057 bp
01678-P-0005
684 hp
2096 bp
01678-P-0005
2080 bp
753 hp
Seküßö
01678-P-0005
2246 bp
2794 bp
01678-P-0005
3145 bp
2380 bp
01678-P-0005
2430 bp
3227 bp
01678-P-0005
1490 bp
01678-P-0005
1977bp
04 hp
01678-P-0005
1401bp
01678-P-0005
1232 bp
1569 bp
01678-P-0005
2377bp
2771bp
01678-P-0005
3194 bp
2406 bp
01678-P-0005
1155 bp
1358 bp
01678-P-0005
1331 bp
1450 bp
01678-P-0005
1258 bp
1284 bp
SekHGO
01678-P-0005
1851 bp
2502 bp
01678-P-0005
3175 bp
2021 bp
01678-P-0005
3016 bp
2009 bp
01678-P-0005
2741 bp
1786 bp
01678-P-0005
1464bp
Seküög
1531bp
01678-P-0005
853bp
1226bp
01678-P-0005
908 hp
01678-P-0005
934bp
1753bp
01678-P-0005
1693bp
2688bp
01678-P-0005
2392bp
1518bp
01678-P-0005
4_ 1642 bp
01678-P-0005
3489bp
960bp
01678-P-0005
1960bp
1954bp
01678-P-0005
1366 bp
01678-P-0005
1384 bp
1206 bp
01678-P-0005
1222bp
1395 bp
01678-P-0005
1220 bp
01678-P-0005
1317bp
1667bp
01678-P-0005
1520 bp
1206 bp
01678-P-0005
2324 bp
2406 bp
01678-P-0005
2346bp
3568bp
01678-P-0005
2337 bp
3424 bp
01678-P-0005
1339bp
1111bp
01678-P-0005
1360 bp
1941bp
01678-P-0005
1459bp
Claims (1)
- ISTEMLER . SEQ ID No. 2°de verilen bir nükleotid dizisi ile en az %90 özdes olan bir konusu nükleik asit molekülü, [3- l ,4-end0glukanazi kodlar. . Istem 1'in nükleik asit molekülüdür, burada söz konusu molekül, SEQ ID No. 2'de verilen nükleotid dizisi ile en az %95 dizi özdesligine sahiptir. . Istem l°in nükleik asit molekülüdür, burada söz konusu molekül, SEQ ID No. 2°de verilen nükleotid dizisi ile en az %98 dizi özdesligine sahiptir. . Tek iplikli olan istemler 1 ila 3lten herhangi birinin izole nükleik asit molekülüdür. . Heterolog bir proteini veya peptidi kodlayan bir kodlama dizisi içindeki bir durdurma kodonu ile kesilen istemler 1 ila 3lten herhangi birinin izole nükleik asit molekülünü içeren bir nükleik asit molekülüdür. . Istemler 1 ila ?ten herhangi birinin izole nükleik asit molekülünü içeren rekombinant bir yapidir. . Istemler 1 ila 3`ten herhangi birinin izole nükleik asit molekülünü içeren bir ekspresyon yapisidir, burada nükleotid dizisi, konak hücrede nükleotid dizisinin ekspresyonunu kontrol eden transkripsiyonel veya translasyonel regülatör sinyalleri veya her ikisini içeren regülatör bir nükleotid dizisi ile operatif olarak iliskilidir. . Istemler 1 ila 3`ten herhangi birinin izole nükleik asit molekülünü içeren genetik olarak gelistirilmis konak hücredir. . Asagidaki adimlari içeren bir polipeptit yapim yöntemidir: i. istem 7”nin ekspresyon yapisi ile transforme edilmis bir hücrenin, polipeptit üretmek üzere uygun kosullar altinda kültürlenmesi; ve ii. polipeptidin izole edilmesi. te verilen amino asit dizisi ile en az %95 özdes olan ve [3- 1,4-endoglukanazin katalitik aktivitesini sergileyen bir amino asit dizisini içeren izole polipeptittir. Istem 10anun polipeptididir, burada söz konusu polipeptit, SEQ lD No. 3 ,te verilen nükleotid dizisi ile en az %98 dizi özdesligine sahiptir. Kovalent bir bag araciligiyla ikinci polipeptidin amino asit dizisine kaynastirilmis istem 10 veya istem llsin izole polipeptidini içeren kimerik bir proteindir. Istem 7°nin ekspresyon yapisi ile transforme edilmis konak hücredir, burada söz konusu konak hücre, selülolitik parçalanmayi hizlandiran bir enzimi üretir. Istem 7”nin ekspresyon yapisini içeren, artmis selülolitik parçalanmaya sahip transgenik M. phaseoli'na mantaridir.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201261683908P | 2012-08-16 | 2012-08-16 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
TR201815368T4 true TR201815368T4 (tr) | 2018-11-21 |
Family
ID=50101611
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
TR2018/15368T TR201815368T4 (tr) | 2012-08-16 | 2013-08-15 | Macrophomina Phaseolina'dan elde edilen selüloz ve hemiselüloz parçalama enzimleri ve bunların kullanımları. |
Country Status (15)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9765315B2 (tr) |
EP (1) | EP2885406B1 (tr) |
JP (1) | JP6616687B2 (tr) |
KR (1) | KR102114010B1 (tr) |
CN (1) | CN104870640A (tr) |
AU (1) | AU2013302537B2 (tr) |
DK (1) | DK2885406T3 (tr) |
ES (1) | ES2693461T3 (tr) |
HK (1) | HK1214296A1 (tr) |
MY (1) | MY175956A (tr) |
PL (1) | PL2885406T3 (tr) |
PT (1) | PT2885406T (tr) |
TR (1) | TR201815368T4 (tr) |
WO (1) | WO2014028774A2 (tr) |
ZA (1) | ZA201501632B (tr) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CL2018003617A1 (es) | 2018-12-14 | 2019-03-22 | Univ Santiago Chile | Polipéptido con actividad xilanasa, secuencia nucleotídica que lo codifica, ingrediente y proceso que comprende dicho ingrediente para la preparación de un producto alimenticio |
Family Cites Families (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK122686D0 (da) | 1986-03-17 | 1986-03-17 | Novo Industri As | Fremstilling af proteiner |
US6117679A (en) | 1994-02-17 | 2000-09-12 | Maxygen, Inc. | Methods for generating polynucleotides having desired characteristics by iterative selection and recombination |
US5605793A (en) | 1994-02-17 | 1997-02-25 | Affymax Technologies N.V. | Methods for in vitro recombination |
CN1151762A (zh) | 1994-06-30 | 1997-06-11 | 诺沃诺尔迪斯克生物技术有限公司 | 非毒性、非产毒性、非致病性镰孢属表达系统及所用启动子和终止子 |
US5939250A (en) | 1995-12-07 | 1999-08-17 | Diversa Corporation | Production of enzymes having desired activities by mutagenesis |
US6171820B1 (en) | 1995-12-07 | 2001-01-09 | Diversa Corporation | Saturation mutagenesis in directed evolution |
US5965408A (en) | 1996-07-09 | 1999-10-12 | Diversa Corporation | Method of DNA reassembly by interrupting synthesis |
WO2001025406A1 (en) * | 1999-10-01 | 2001-04-12 | University Of Victoria Innovation & Development Corporation | Mannosidases and methods for using same |
EP1421224B1 (en) * | 2001-06-26 | 2012-10-17 | Novozymes A/S | Polypeptides having cellobiohydrolase i activity and polynucleotides encoding same |
US7572950B2 (en) | 2002-07-04 | 2009-08-11 | Sungene Gmbh & Co. Kgaa | Methods for obtaining pathogen resistance in plants |
WO2005007869A2 (en) | 2003-07-10 | 2005-01-27 | Third Wave Technologies, Inc. | Assays for the direct measurement of gene dosage |
AU2005269084B2 (en) * | 2004-08-06 | 2010-05-27 | Novozymes A/S | Polypeptides of Botryosphaeria rhodina |
FI122029B (fi) | 2008-12-30 | 2011-07-29 | Ab Enzymes Oy | Sieniperäiset endoglukanaasit, niiden tuotto ja käyttö |
-
2013
- 2013-08-15 KR KR1020157006679A patent/KR102114010B1/ko active IP Right Grant
- 2013-08-15 WO PCT/US2013/055200 patent/WO2014028774A2/en active Application Filing
- 2013-08-15 DK DK13829732.0T patent/DK2885406T3/en active
- 2013-08-15 MY MYPI2015000388A patent/MY175956A/en unknown
- 2013-08-15 AU AU2013302537A patent/AU2013302537B2/en active Active
- 2013-08-15 US US14/421,774 patent/US9765315B2/en active Active
- 2013-08-15 TR TR2018/15368T patent/TR201815368T4/tr unknown
- 2013-08-15 PL PL13829732T patent/PL2885406T3/pl unknown
- 2013-08-15 PT PT13829732T patent/PT2885406T/pt unknown
- 2013-08-15 JP JP2015527644A patent/JP6616687B2/ja active Active
- 2013-08-15 CN CN201380054100.6A patent/CN104870640A/zh active Pending
- 2013-08-15 EP EP13829732.0A patent/EP2885406B1/en active Active
- 2013-08-15 ES ES13829732.0T patent/ES2693461T3/es active Active
-
2015
- 2015-03-10 ZA ZA2015/01632A patent/ZA201501632B/en unknown
-
2016
- 2016-02-25 HK HK16102135.4A patent/HK1214296A1/zh unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR102114010B1 (ko) | 2020-05-25 |
PL2885406T3 (pl) | 2019-02-28 |
AU2013302537B2 (en) | 2018-10-18 |
MY175956A (en) | 2020-07-16 |
WO2014028774A3 (en) | 2014-05-08 |
KR20150042850A (ko) | 2015-04-21 |
DK2885406T3 (en) | 2018-11-26 |
AU2013302537A1 (en) | 2015-03-26 |
ZA201501632B (en) | 2015-12-23 |
EP2885406A2 (en) | 2015-06-24 |
US9765315B2 (en) | 2017-09-19 |
US20150291945A1 (en) | 2015-10-15 |
HK1214296A1 (zh) | 2016-07-22 |
JP6616687B2 (ja) | 2019-12-04 |
EP2885406A4 (en) | 2016-04-27 |
WO2014028774A2 (en) | 2014-02-20 |
BR112015003085A2 (pt) | 2018-06-26 |
ES2693461T3 (es) | 2018-12-11 |
CN104870640A (zh) | 2015-08-26 |
EP2885406B1 (en) | 2018-10-03 |
PT2885406T (pt) | 2018-11-16 |
JP2015529072A (ja) | 2015-10-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CA2112028C (fr) | Pullulanase, microorganismes la produisant, procedes de preparation de cette pullulanase et utilisations de celle-ci | |
KR20110119386A (ko) | 바실러스 벨렌첸시스 a-68 유래 섬유소 분해효소 유전자 및 이를 도입하여 형질전환된 에셰리키아 콜리 a-68 균주 및 이를 이용한 섬유소 분해효소의 생산 방법 | |
Chandra et al. | Isolation, purification and characterization of a thermostable β-mannanase from Paenibacillus sp. DZ3 | |
MX2013008766A (es) | Celobiohidrolasa mutante. | |
US20130337541A1 (en) | Thermostable chitosanase | |
KR101060469B1 (ko) | 바실러스 리케니포미스 b1 균주, 호알칼리성 효소액 및 이것의 제조방법 | |
Xu et al. | An updated comprehensive review of advances on structural features, catalytic mechanisms, modification methods and applications of chitosanases | |
US20150118718A1 (en) | Strain of bacillus subtilis and applications thereof | |
TR201815368T4 (tr) | Macrophomina Phaseolina'dan elde edilen selüloz ve hemiselüloz parçalama enzimleri ve bunların kullanımları. | |
CN110093326A (zh) | 一种胞外AA9家族多糖单加氧酶EpLPMOa及其应用 | |
EP2859095B1 (en) | Novel proteins for the treatment of cellulosic material | |
Rattanasuk et al. | Chryseobacterium indologenes, novel mannanase-producing bacteria | |
US20120040410A1 (en) | Thermohemicellulases for lignocellulosic degradation | |
KR100560375B1 (ko) | 만난아제를 코딩하는 유전자와 그 형질전환체를 이용하여생산된 재조합 만난아제 | |
KR20110115905A (ko) | 신규한 베타-아가라제 및 그 용도 | |
JP2005210977A (ja) | 細胞壁溶解酵素生産菌 | |
KR100732250B1 (ko) | 신규 엔도키티나제 및 그 생성능을 가지는 상귀박터 속미생물 | |
Yang et al. | Penicillium expansum YT01: a lignocellulose-degrading fungal strain isolated from China gaoligong mountain humus soil | |
Fliegerova et al. | Gut fungi: classification, evolution, life style and application | |
KR20170004271A (ko) | 신규 베타-1,3-1,4-글루카나아제 및 이를 페니바실러스 속 x4로부터 분리하는 방법 | |
US20140120586A1 (en) | Esterases Useful in the Treatment of Cellulosic and Lignocellulosic Material | |
Digvijay et al. | 7 ChitinasesStructure | |
JP2006087401A (ja) | アルカリ性マンナナーゼ | |
EP2885407B1 (en) | Pectin degrading enzymes from macrophomina phaseolina and uses thereof | |
BR112015003085B1 (pt) | Molécula de ácido nucleico recombinante, constructo recombinante de expressão e célula hospedeira procariótica engenheirada geneticamente |