SK11282003A3 - Life attenuated European PRRS virus, nucleotide sequence coding said virus, method of generating such virus, cell line, and a pharmaceutical composition comprising said PRRS viruses and the use thereof - Google Patents
Life attenuated European PRRS virus, nucleotide sequence coding said virus, method of generating such virus, cell line, and a pharmaceutical composition comprising said PRRS viruses and the use thereof Download PDFInfo
- Publication number
- SK11282003A3 SK11282003A3 SK1128-2003A SK11282003A SK11282003A3 SK 11282003 A3 SK11282003 A3 SK 11282003A3 SK 11282003 A SK11282003 A SK 11282003A SK 11282003 A3 SK11282003 A3 SK 11282003A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- lelystad
- seq
- amino acid
- vir
- leu
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
- C12N7/04—Inactivation or attenuation; Producing viral sub-units
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/525—Virus
- A61K2039/5254—Virus avirulent or attenuated
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/10011—Arteriviridae
- C12N2770/10021—Viruses as such, e.g. new isolates, mutants or their genomic sequences
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/10011—Arteriviridae
- C12N2770/10022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/10011—Arteriviridae
- C12N2770/10061—Methods of inactivation or attenuation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/10011—Arteriviridae
- C12N2770/10061—Methods of inactivation or attenuation
- C12N2770/10062—Methods of inactivation or attenuation by genetic engineering
Abstract
Description
Oblasť technikyTechnical field
Predložený vynález sa týka živých oslabených európskych PRRS vírusov, ktoré sú oslabené prostredníctvom nukleokyselinových mutácií v špecifických miestach. Vynález sa týka aj nukleotidových sekvencii kódujúcich uvedené vírusy, spôsobov generovania takýchto vírusov a farmaceutického prostriedku obsahujúceho uvedené PRRS vírusy a použitia PRRS vírusu na výrobu vakcíny na profylaxiu a liečenie PRRS infekcií.The present invention relates to live attenuated European PRRS viruses that are attenuated by nucleic acid mutations at specific sites. The invention also relates to nucleotide sequences encoding said viruses, to methods for generating such viruses and to a pharmaceutical composition comprising said PRRS viruses and to the use of the PRRS virus for the production of a vaccine for the prophylaxis and treatment of PRRS infections.
Doterajší stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Reprodukčný a respiračný syndróm ošípaných (PRRS) je spôsobený obaleným RNA vírusom s pozitívnym vláknom z čeľade Arterívirídae (Snijder E.J., Meuleberg J.J.M. 1998. „The molecular biology of arteriviruses“. Journal of Generál Virology 79(5): 961-971). Pred približne 10 až 15 rokmi sa objavili dva rozdielne PRRS vírusové kmene očividne nezávisle v USA a Európe. Ochorenie je teraz endemické v mnohých krajinách produkujúcich ošípané v Severnej Amerike, Európe a Ázii. Stále je hlavnou príčinou reprodukčnej straty a respiračného ochorenia u ošípaných. V USA sa prevalencia infekcie odhaduje na do 70 %.Porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) is caused by enveloped positive-stranded RNA virus of the family Arteriviridae (Snijder E.J., Meuleberg J.J.M. 1998. "The molecular biology of arteriviruses". Journal of General Virology 79 (5): 961-971). Approximately 10 to 15 years ago, two different PRRS virus strains apparently appeared independently in the US and Europe. The disease is now endemic in many pig producing countries in North America, Europe and Asia. It is still a major cause of reproductive loss and respiratory disease in pigs. In the US, the prevalence of infection is estimated to be up to 70%.
Vírus sa prenáša inhalovaním, prehltnutím, koitom, ranami po uhryznutí alebo ihlami. Replikuje sa v slizničných, pľúcnych alebo regionálnych makrofágoch. Subklinicky ochorenie vedie k odozneniu alebo k trvalej infekcii. Trvalo infikované zvieratá vylučujú vírus do orálnych/hltanových tekutín, krvi, výkalov, moču a spermy. Klinické symptómy u prasníc súvisia s potratmi alebo s predčasnými vrhmi so slabými novonarodenými prasiatkami, mŕtvonarodenými prasiatkami a autolyzovanými plodmi. Infikované novonarodené prasiatka majú vysokú úmrtnosť a trpia na pneumóniu. Následné ošetrovanie a chov prasiatok je komplikovanýThe virus is transmitted by inhalation, swallowing, coitus, bite wounds or needles. It replicates in mucosal, pulmonary or regional macrophages. Subclinically, the disease leads to deficiency or persistent infection. Permanently infected animals secrete the virus into oral / pharynx fluids, blood, faeces, urine and semen. Clinical symptoms in sows are related to abortion or premature litters with mild newborn pigs, stillborn pigs and autolysed fetuses. Infected newborn pigs have high mortality and suffer from pneumonia. The subsequent treatment and breeding of piglets is complicated
W-WW-W
-2 pneumóniou, paralelnými bakteriálnymi infekciami a zvýšenou úmrtnosťou. Kance sú náchylné na horúčku a morfologické zmeny v sperme.-2 pneumonia, parallel bacterial infections and increased mortality. Boars are susceptible to fever and morphological changes in semen.
Ako u všetkých arterivírusov je PRRS vírusovým genómom jednovláknová pozitívna RNA molekula s dĺžkou približne 15 kilobáz. ORF's (otvorený čítací rámec) 1a a 1b kódujú replikázy, ORF's 2 až 5 údajné glykoproteíny (gp 1 až 4), ORF 6 kóduje membránový proteín (M) a ORF 7 kóduje nukleokapsidový proteín (N).As with all arteriviruses, the PRRS viral genome is a single stranded positive RNA molecule of approximately 15 kilobases in length. ORF's (open reading frame) 1a and 1b encode replicases, ORF's 2-5 alleged glycoproteins (gp 1-4), ORF 6 encodes membrane protein (M) and ORF 7 encodes nucleocapsid protein (N).
Pôvodné opisy PRRS infekcie v USA (WO 93/03760, izolát ATCC VR-2332, uložený 18. júla 1991 v Američan Type Culture Collection v Rockville, Maryland, USA, NCBI GeneBank prístupové číslo U 87392 U00153) a v Európe (WO 92/21375, izolát Lelystad agent (CDI-NL-2.91), prístupové číslo CNCM 1-1102, uložený 5. júna 1991 v Pasterovom inštitúte v Paríži; NCBI GeneBank prístupové čísla M 96262 [gi:11125727, C 002533 [gi:11138120]) identifikovali vírusy, ktoré majú genomické a serologické rozdiely. Porovnanie demonštrovalo, že oba majú spoločného predka, ktorý sa rozdelil pred tým, ako bolo klinické ochorenie opísané, na konci osemdesiatych rokov. Boli publikované kompletné genomické sekvencie pre množstvo PRRS vírusov a ich kompletné oblasti kódujúce štrukturálne proteíny (Snijder a ďalší, vyššie; Meulenberg J.J.M., Hulst, M.M. a ďalší, 1993. Lelystad virs, the causative agent of porcine epidémie abortion and respirátory syndróme..., Virology 1992, 62-72; Conzelmann K.K., Visser N., Van Woensel P., Thiel H.J., 1993. Molekulová charakterizácia vírusu reprodukčného a respiračného syndrómu ošípaných, člena arterivírusovej skupiny, je uvedená vo Virology 103, 329-339; Murtaugh M.P., Elam M.R., Kakach L.T., 1995. Porovnanie sekvencií kódujúcich štrukturálne proteíny VR-2332 a Lelystad vírusových kmeňov PRRS vírusu je uvedené vArchives of Virology 140, 1451-1460; Kapur V., Elam M.R., Pawtovich T.M. Murtaugh M.P., 1996: Genetic variation in porcine reproductive ad respirátory sydrom vírus isolates in the midwestern United States, Journal of Generál Virology 77, 1271-1276).Original descriptions of PRRS infection in the US (WO 93/03760, isolate ATCC VR-2332, deposited July 18, 1991 at the American Type Culture Collection in Rockville, Maryland, USA, NCBI GeneBank accession number U 87392 U00153) and in Europe (WO 92/21375 , isolate Lelystad agent (CDI-NL-2.91), accession number CNCM 1-1102, deposited on June 5, 1991 at the Paster Institute in Paris; NCBI GeneBank accession numbers M 96262 [gi: 11125727, C 002533 [gi: 11138120]) identified viruses that have genomic and serological differences. The comparison demonstrated that they both share a common ancestor, who split up before the clinical disease was described in the late 1980s. Complete genomic sequences for a number of PRRS viruses and their complete regions encoding structural proteins have been published (Snijder et al., Supra; Meulenberg JJM, Hulst, MM et al., 1993. Lelystad virs, the causative agent of porcine epidemic abortion and respiratory syndrome ... Virology 1992, 62-72, Conzelmann KK, Visser N., Van Woensel P., Thiel HJ, 1993. , Elam MR, Kakach LT, 1995. A comparison of the sequences encoding the structural proteins of VR-2332 and Lelystad virus strains of PRRS virus is given in Archives of Virology 140, 1451-1460, Kapur V., Elam MR, Pawtovich TM Murtaugh MP, 1996 in porcine reproductive ad respiratory syndrome virus isolates in the midwestern United States, Journal of General Virology 77, 1271-1276).
PRRS vírus sa môže replikovať in vitro v prasačích pľúcnych makrofágoch, monocytoch, gliových bunkách a dvoch MA-104 bunkových subpopuláciách (embryonické opičie obličkové bunky) známych ako CL-2621 a MARC-145 (K.D. Rossow, Porcine reproductive ad respirátory syndróme, Vet Pathol 35:1-20, 1998).PRRS virus can replicate in vitro in porcine lung macrophages, monocytes, glial cells and two MA-104 cell subpopulations (embryonic monkey kidney cells) known as CL-2621 and MARC-145 (KD Rossow, Porcine reproductive ad respirators syndrome, Vet Pathol) 35: 1-20 (1998).
-3Rekombinantné prostriedky na generovanie infekčných PRRS klonov sú dostupné (EP 0839912).-3Recombinants for generating infectious PRRS clones are available (EP 0839912).
Na ochranu ošípaných sú komerčne dostupné živé oslabené PRRS vakcíny (RespPRRS/Ingelvac® PRRS MLV, Boehringer Ingelheim). Usmrtené vakcíny (úplne inaktivovaný víru) alebo podjedotkové vakcíny (bežne purifikované a heterológne exprimované purifikované vírusové proteíny) sú často horšej kvality ako živé vakcíny, čo sa týka ich účinnosti pri produkovaní úplnej ochrannej imunitnej reakcie aj v prítomnosti adjuvans. Pre PRRS bolo demonštrované, že v porovnaní s usmrtenými vakcínami, ktoré sú v súčasnosti dostupné, indukujú oslabené vakcíny imunitu voči ochoreniu, ktorá trvá dlhšie a je účinnejšia (Snijder a ďalší, citované vyššie). Súčasné živé PRRS vakcíny sú oslabované zvyčajne sériovým pasážovaním vírusu na vhodných hostiteľských bunkách, až kým sa nestratí patogénnosť (Američan kmeň: EP 0529584; európsky kmeň: EP0676467; EP 0835930).Live attenuated PRRS vaccines (RespPRRS / Ingelvac® PRRS MLV, Boehringer Ingelheim) are commercially available for the protection of pigs. Killed vaccines (completely inactivated virus) or subunit vaccines (commonly purified and heterologously expressed purified viral proteins) are often of lower quality than live vaccines in terms of their efficacy in producing a complete protective immune response even in the presence of an adjuvant. It has been demonstrated for PRRS that, compared to the currently available killed vaccines, attenuated vaccines induce immunity to disease that lasts longer and is more effective (Snijder et al., Cited above). Current live PRRS vaccines are usually attenuated by serial passage of the virus on suitable host cells until the pathogenicity is lost (American strain: EP 0529584; European strain: EP0676467; EP 0835930).
Súčasné živé PRRS vakcíny stále nechávajú priestor na zlepšovanie. Za prvé, nezabraňujú opätovnej infekcii. Za druhé, neumožňujú serologické rozlišovanie medzi očkovanými zvieratami a zvieratami infikovanými prirodzeným vírusom. Okrem toho, živá vakcína zahŕňa teoretické riziko reverzie na neoslabený fenotyp. Najmä RNA vírusy, ako je PRRS vírus, sú považované za vírusy, ktoré majú vysoké podiely mutácie v dôsledku nepresnej replikácie RNA genómu, ktorá je spôsobená chýbaním kontrolného čítania pri RNA replikačnom enzýme. Pri zvyčajnom izolovaní oslabených vírusov získaných bežným viacnásobným pasážovaním ostáva neznámy molekulový pôvod, ako aj genetická stabilita, a znaky revertantov sa nedajú predpokladať.Current live PRRS vaccines still leave room for improvement. First, do not prevent reinfection. Secondly, they do not allow a serological distinction between vaccinated animals and animals infected with natural virus. In addition, the live vaccine entails a theoretical risk of reversion to an undiluted phenotype. In particular, RNA viruses, such as the PRRS virus, are considered to have high rates of mutation due to inaccurate replication of the RNA genome, which is due to a lack of control reading of the RNA replication enzyme. In the normal isolation of attenuated viruses obtained by routine multiple passages, the unknown molecular origin as well as genetic stability remains unknown, and the features of the revertants cannot be assumed.
Takže problémom, ktorý rieši vynález, je poskytnutie zlepšených PRRS vírusových kmeňov, ktoré môžu byť použité na výrobu vakcín, ktoré prekonávajú nevýhody predchádzajúceho stavu techniky.Thus, the problem solved by the invention is to provide improved PRRS virus strains that can be used to produce vaccines that overcome the disadvantages of the prior art.
Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION
Pred opisom uskutočnení predložené vynálezu sa musí poznamenať, že jednotné číslo používané v opise a v pripojených nárokoch zahŕňa aj množné číslo,Before describing the embodiments of the present invention, it should be noted that the singular used in the specification and the appended claims includes the plural,
-4ak z kontextu jasne nevyplýva inak. Takže napríklad výraz „PRRS vírus“ zahŕňa množstvo takýchto PRRS vírusov, výraz „bunka“ zahŕňa jednu alebo viacero buniek a ich ekvivalenty známe priemernému odborníkovi v oblasti a tak ďalej. Ak nie je definované inak, všetky tu používané technické a vedecké pojmy majú rovnaký význam, ako je zvyčajne chápaný priemerným odborníkom v oblasti, do ktorej spadá vynález. Hoci akékoľvek spôsoby a materiály podobné alebo ekvivalentné tu opísaným spôsobom a materiálom sa môžu použiť pri uskutočňovaní alebo testovaní predloženého vynálezu, teraz budú opísané výhodné spôsoby, zariadenia a materiály. Všetky tu uvedené publikácie sú tu začlenené prostredníctvom ich citácii na účely opisovania a ilustrovania bunkových línií, vektorov a metodológií, ktoré sú zverejnené v dokumentoch, ktoré by mohli byť použité v spojitosti s vynálezom. Nič, čo je tu uvedené, nemôže byť považované za pripustenie, že vynález nemá právo byť považovaný za nový vzhľadom na opis v predchádzajúcom stave techniky.-4and the context clearly does not indicate otherwise. Thus, for example, the term "PRRS virus" includes a plurality of such PRRS viruses, the term "cell" includes one or more cells and their equivalents known to one of ordinary skill in the art and so on. Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. Although any methods and materials similar or equivalent to the methods and materials described herein can be used in the practice or testing of the present invention, preferred methods, devices and materials will now be described. All publications mentioned herein are incorporated by reference herein for the purpose of describing and illustrating cell lines, vectors, and methodologies that are disclosed in documents that could be used in connection with the invention. Nothing herein is to be construed as an admission that the invention has no right to be considered novel in view of the prior art description.
Podstatou vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus kódovaný nukleovou kyselinou obsahujúcou ORF1, ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6 a ORF7 a ich subtypy, ako napríklad ORF1a aORFIb alebo ORF2a a ORF2b, ktorý je charakteristický tým, že:The present invention provides an attenuated European PRRS virus encoded by a nucleic acid comprising ORF1, ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6 and ORF7 and their subtypes, such as ORF1a and ORFIb or ORF2a and ORF2b, characterized in that:
a) ORF2 obsahuje v polohách 11915-11935 aspoň jeden z nukleotidov ako sú uvedené v tabuľke 1:(a) ORF2 contains at positions 11915-11935 at least one of the nucleotides as shown in Table 1:
a v polohách 12058-12078 aspoň jeden z nukleotidov ako sú uvedené v tabuľke 3:and at positions 12058-12078 at least one of the nucleotides as set forth in Table 3:
-5b) ORF3 obsahuje v polohách 12660-12680 aspoň jeden z nukleotidov ako sú uvedené v tabuľke 4:-5b) ORF3 contains at positions 12660-12680 at least one of the nucleotides as shown in Table 4:
c) ORF5 obsahuje v polohách 13684-13704 aspoň jeden z nukleotidov uvedených v tabuľke 5:(c) ORF5 contains at positions 13684-13704 at least one of the nucleotides shown in Table 5:
Prekvapujúco sa zistilo, že PRRS vírusy obsahujú špecifické miesta v jednotlivých vírusových proteínoch, ktoré keď sú mutované, vedú k oslabenému fenotypu v porovnaní s pôvodným viruletným prirodzeným terénným kmeňom. Evolučný tlak na tieto miesta, ktoré sa odteraz nazývajú „virulentné špecifické miesta“ alebo sa jednoducho označujú ako „miesta podľa vynálezu“ alebo len „miesta“, je obrovský. Predpokladá sa, že tieto miesta sa vo všeobecnosti podieľali na procese vedúcom k oslabeniu vakcínových kmeňov podobných s európskym PRRSV. Tieto miesta, uvedené v tabuľkách 1 až 5, sú špecifické pre európske kmene (štandardný Lelystad Agens CNCM 1-1102 je braný ako referenčný typový kmeň) a nie sú zdieľané s US kmeňmi PRRS vírusov.Surprisingly, it has been found that PRRS viruses contain specific sites in individual viral proteins which, when mutated, lead to an attenuated phenotype as compared to the original virulet natural field strain. The evolutionary pressure on these sites, now called "virulence specific sites" or simply referred to as "sites of the invention" or "sites" only, is enormous. It is believed that these sites were generally involved in the process leading to the weakening of European PRRSV-like vaccine strains. These sites, listed in Tables 1 to 5, are specific to European strains (the standard Lelystad Agens CNCM 1-1102 is taken as a reference type strain) and are not shared with US PRRS virus strains.
Ďalej sa vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu, v ktorom je aspoň jedna zo sekvenčných častí zodpovedajúcich sekv. č. 25, 26, 27, 28 alebo 29 mutovaná v jednej, dvoch, troch alebo vo viacerých polohách, až maximálne do desať mutácií. Miesta v sekv. č. 25, 26 a 27 sú lokalizované vORF2 (polohy 130150, 252-272, respektíve 273-293 na obrázku 1), miesto v sekv. č. 28 je lokalizované v ORF3 (poloha 267-287 na obrázku 3) a miesto v sekv. č. 29 je lokalizované v ORF5 (poloha 201-221 na obrázku 4). Uvedené sekvenčné časti predstavujú virulentné špecifické miesta podľa vynálezu. Keďže PRRS vírus je RNA vírus s pozitívnym vláknom, bude obsahovať zodpovedajúcu RNA sekvenciu namiesto DNA sekvencií uvedených v zoznamoch sekvencií, tzn. bude obsahovaťFurthermore, the invention relates to an attenuated European PRRS virus, wherein at least one of the sequence portions of the corresponding sequences is SEQ. no. 25, 26, 27, 28 or 29 mutated at one, two, three or more positions, up to a maximum of ten mutations. Places in Seq. no. 25, 26, and 27 are located in vORF2 (positions 130150, 252-272 and 273-293, respectively, in Figure 1), instead of SEQ ID NOs. no. 28 is located in ORF3 (position 267-287 in Figure 3) and the site in SEQ. no. 29 is located in ORF5 (position 201-221 in Figure 4). Said sequence portions represent virulent specific sites of the invention. Since the PRRS virus is a positive strand RNA virus, it will contain the corresponding RNA sequence instead of the DNA sequences listed in the sequence listing, i. will contain
-6uracil (U) v polohách označených ako tymín (T) v zoznamoch sekvencii, a ribózu namiesto deoxyribózy.-6-uracil (U) at positions designated as thymine (T) in the sequence lists, and ribose instead of deoxyribose.
Je zrejmé, že oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu obsahuje genomickú RNA obsahujúcu sekvenčné časti zodpovedajúce DNA sekvenciám so sekv. č. 25, 26, 27, 28 alebo 29, pričom aspoň jedna z uvedených sekvenčných častí sa líši od citovaných sekvencii aspoň jednou mutáciou. V tomto kontexte znamená výraz „zodpovedajúci“ to, že vírus podľa vynálezu obsahuje sekvenčné časti, ktoré môžu byť zosúladené s referenčnými sekvenciami prostredníctvom štandardného zosúlaďovacieho algoritmu, ako napríklad BLAST (Altschul, S.F., Gish, W., Miller, W., Myers, E.V. & Lipman, D.J. (1990) „Basic local alignment search toll.“ J. Mol. Biol. 215:403-41; Gish, W. & States, D.J. (1993) „Identification of protein coding regions by database similarity search.“ Náture Genet. 3:266-272; Madden, T.L., Tatusov, R.L. & Zhang, J. (1996) „Applications of network BLAST server“ Meth. Enzymol. 266:131-141; Zhang, J. & Madden,T.L. (1997) „PowerBLAST: A new network BLAST application for interactive or automated sequence analysis and annotation.“ Genome Res. 7:649-656; Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, a Dávid J. Lipman (1997), „Gapped BLAST and PSI-BLST: a new generation of protein databasesearch programs“, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402). Sekvenčné polohy, ktoré sú prostredníctvom takéhoto algoritmu spárované, sú si navzájom „zodpovedajúce“.It will be appreciated that the attenuated European PRRS virus of the invention comprises genomic RNA comprising the sequence portions corresponding to the DNA sequences of SEQ. no. 25, 26, 27, 28 or 29, wherein at least one of said sequence portions differs from said sequences by at least one mutation. In this context, the term "corresponding" means that the virus of the invention comprises sequence parts that can be aligned with reference sequences by a standard matching algorithm such as BLAST (Altschul, SF, Gish, W., Miller, W., Myers, EV & Lipman, DJ (1990) "Basic local alignment search toll." J. Mol. Biol. 215: 403-41; Gish, W. & States, DJ (1993) "Identification of protein coding regions by database similarity search." "Nature Genet. 3: 266-272; Madden, TL, Tatusov, RL & Zhang, J. (1996)" Applications of the BLAST server network "Meth. Enzymol. 266: 131-141; Zhang, J. & Madden, TL (1997) "PowerBLAST: A New Network of BLAST Applications for Interactive or Automated Sequence Analysis and Annotation." Genome Res. 7: 649-656; Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLST: A New Generation of protein databasesearch programs', Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402). Sequence positions that are paired with such an algorithm are "matching" to each other.
Pri takomto zosúladení by sa príslušné mutované sekvenčné časti vírusu potom mali líšiť od zodpovedajúcej referenčnej sekvencie („miesta“, tzn. buď sekv. č. 25, 26, 27, 28, alebo 29) v jednej, dvoch, troch alebo viacerých polohách, maximálne v desiatich polohách. Výhodne je vírus podľa vynálezu mutovaný vo všetkých piatich citovaných sekvenčných polohách (miestach). Výhodne je (sú) mutácia (mutácie) substitúciou (substitúciami) a/alebo deléciou (deléciami). Vo výhodných uskutočneniach je výsledkom mutácií zmena v a mi no kysel i novej sekvencii (sekvenciách) proteínu (proteínov) kódovaného príslušným ORF(s).In such alignment, the respective mutated sequence parts of the virus should then differ from the corresponding reference sequence ("sites", i.e. either SEQ IDs 25, 26, 27, 28, or 29) at one, two, three or more positions, up to ten positions. Preferably, the virus of the invention is mutated at all five cited sequence positions (sites). Preferably, the mutation (s) is / are a substitution (s) and / or a deletion (s). In preferred embodiments, the mutations result in a change in at least the acid sequence (s) of the protein (s) encoded by the respective ORF (s).
Ďalej predložený vynález sa týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF2, ktorý obsahuje sekvenčnú časť zodpovedajúcu sekv. č. 25, pričom triplet zodpovedajúci polohám 10 až 12 sekv. č. 25 je mutovaný. Výhodne uvedenýFurthermore, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF2 comprising a sequence portion corresponding to SEQ. no. 25, wherein the triplet corresponding to positions 10 to 12 of SEQ. no. 25 is mutated. Preferably said
-7triplet nekóduje fenylalanín. Výhodne uvedený triplet kóduje inú aminokyselinu. Vo výhodnom uskutočnení uvedený triplet kóduje serín. Výhodnejšie, nukleotid zodpovedajúci polohe 11 v sekv. č. 25 je C. Takže vo výhodnom uskutočnení má oslabený európsky PRRS vírus ORF2 kódujúci proteín, ktorý nemá fenylalanín v polohe 47 (alebo v zodpovedajúcej polohe pri BLAST zosúlaďovaní). Uvedený proteín má namiesto toho v tejto polohe výhodne serín.The triplet does not code phenylalanine. Preferably said triplet encodes another amino acid. In a preferred embodiment, said triplet encodes serine. More preferably, the nucleotide corresponding to position 11 in SEQ. no. Thus, in a preferred embodiment, the attenuated European PRRS virus has ORF2 encoding a protein that does not have phenylalanine at position 47 (or the corresponding position in the BLAST alignment). Instead, said protein preferably has serine at this position.
Ďalej predložený vynález sa týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF2, ktorý obsahuje sekvenčnú časť zodpovedajúcu sekv. č. 25, pričom triplet zodpovedajúci polohám 10 až 12 sekv. č. 26 je mutovaný. Výhodne uvedený triplet nekóduje valín. Výhodne uvedený triplet kóduje inú aminokyselinu. Vo výhodnom uskutočnení uvedený triplet kóduje fenylalanín. Výhodnejšie, nukleotid zodpovedajúci polohe 10 v sekv. č. 26 je T (respektíve U v RNA). Takže vo výhodnom uskutočnení má oslabený európsky PRRS vírus ORF2 kódujúci proteín, ktorý nemá valín v polohe 88 (alebo v zodpovedajúcej polohe pri BLAST zosúlaďovaní). Uvedený proteín má namiesto toho v tejto polohe výhodne fenylalanín.Furthermore, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF2 comprising a sequence portion corresponding to SEQ. no. 25, wherein the triplet corresponding to positions 10 to 12 of SEQ. no. 26 is mutated. Preferably said triplet does not encode valine. Preferably said triplet encodes another amino acid. In a preferred embodiment, said triplet encodes phenylalanine. More preferably, the nucleotide corresponding to position 10 in SEQ. no. 26 is T (respectively U in RNA). Thus, in a preferred embodiment, the attenuated European PRRS virus has ORF2 encoding a protein that has no valine at position 88 (or the corresponding position in the BLAST alignment). Instead, said protein preferably has phenylalanine at this position.
Ďalej sa predložený vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF2, ktorý obsahuje sekvenčnú časť zodpovedajúcu sekv. č. 27, pričom triplet zodpovedajúci polohám 11 až 13 sekv. č. 27 je mutovaný. Výhodne uvedený triplet nekóduje fenylalanín. Výhodne uvedený triplet kóduje inú aminokyselinu. Vo výhodnom uskutočnení uvedený triplet kóduje leucín. Výhodnejšie, nukleotid zodpovedajúci polohe 11 v sekv. č. 27 je C. Takže vo výhodnom uskutočnení má oslabený európsky PRRS vírus ORF2 kódujúci proteín, ktorý nemá fenylalanín v polohe 95 (alebo v zodpovedajúcej polohe pri BLAST zosúlaďovaní). Uvedený proteín má namiesto toho v tejto polohe výhodne leucín.Furthermore, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF2 which comprises a sequence portion corresponding to SEQ. no. 27, wherein the triplet corresponding to positions 11-13 of SEQ. no. 27 is mutated. Preferably said triplet does not encode phenylalanine. Preferably said triplet encodes another amino acid. In a preferred embodiment, said triplet encodes leucine. More preferably, the nucleotide corresponding to position 11 in SEQ. no. Thus, in a preferred embodiment, the attenuated European PRRS virus has ORF2 encoding a protein that does not have phenylalanine at position 95 (or the corresponding position in the BLAST alignment). Instead, said protein preferably has leucine at this position.
Ďalej sa predložený vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF3, ktorý obsahuje sekvenčnú časť zodpovedajúcu sekv. č. 28, pričom triplet zodpovedajúci polohám 11 až 13 sekv. č. 28 je mutovaný. Výhodne uvedený triplet nekóduje serín. Výhodne uvedený triplet kóduje inú aminokyselinu. Vo výhodnom uskutočnení uvedený triplet kóduje prolín. Výhodnejšie, nukleotid zodpovedajúci polohe 11 v sekv. č. 28 je C. Takže vo výhodnom uskutočnení má oslabený európsky PRRS vírus ORF3 kódujúci proteín, ktorý nemá serín v poloheFurthermore, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF3, which comprises a sequence portion corresponding to SEQ. no. 28, wherein the triplet corresponding to positions 11-13 of SEQ. no. 28 is mutated. Preferably said triplet does not encode serine. Preferably said triplet encodes another amino acid. In a preferred embodiment, said triplet encodes a proline. More preferably, the nucleotide corresponding to position 11 in SEQ. no. Thus, in a preferred embodiment, the attenuated European PRRS virus has an ORF3 encoding a protein that does not have a serine in position.
-893 (alebo v zodpovedajúcej polohe pri BLAST zosúlaďovaní). Uvedený proteín má namiesto toho v tejto polohe výhodne prolín.-893 (or the corresponding position for BLAST alignment). Instead, said protein preferably has proline at this position.
Ďalší predmet predloženého vynálezu sa týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF5, ktorý obsahuje sekvenčnú časť zodpovedajúcu sekv. č. 29, pričom triplet zodpovedajúci polohám 11 až 13 sekv. č. 29 je mutovaný. Výhodne uvedený triplet nekóduje leucín. Výhodne uvedený triplet kóduje inú aminokyselinu. Vo výhodnom uskutočnení uvedený triplet kóduje fenylalanín. Výhodnejšie, nukleotid zodpovedajúci polohe 11 v sekv. č. 29 je T (alebo U v RNA). Takže vo výhodnom uskutočnení má oslabený európsky PRRS vírus ORF5 kódujúci proteín, ktorý nemá leucín v polohe 71 (alebo v zodpovedajúcej polohe pri BLAST zosúlaďovaní). Uvedený proteín má namiesto toho v tejto polohe výhodne fenylalanín.Another object of the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF5, which comprises a sequence portion corresponding to SEQ. no. 29, wherein the triplet corresponding to positions 11-13 of SEQ. no. 29 is mutated. Preferably said triplet does not encode leucine. Preferably said triplet encodes another amino acid. In a preferred embodiment, said triplet encodes phenylalanine. More preferably, the nucleotide corresponding to position 11 in SEQ. no. 29 is T (or U in RNA). Thus, in a preferred embodiment, the attenuated European PRRS virus has ORF5 encoding a protein that does not have a leucine at position 71 (or the corresponding position in the BLAST alignment). Instead, said protein preferably has phenylalanine at this position.
Živé PRRS vakcíny založené na európskych kmeňoch oslabených prostredníctvom definovaných mutácií a/alebo delécií umožňujú vyhnúť sa nevýhodám súčasnej generácie oslabených vakcín. Ak oslabený kmeň nesie definované a známe mutácie, môže byť jednoducho analyzovaný z hľadiska kvality a genetickej stability. Možnosť zaviesť definované delécie a/alebo substitúcie, najmä ako dvojité alebo viacnásobné mutácie, znižuje pravdepodobnosť reverzie na neoslabený alebo virulentný fenotyp. Ďalšia výhoda oslabovacích mutácií spočíva v ich známej molekulovej unikátnosti, ktorá umožňuje ich použitie ako rozlišujúcich značiek pre oslabené PRRS vírusy na ich odlíšenie od terénnych PRRS vírusov. S miestami identifikovanými v predloženom vynáleze je možné generovať bezpečné a mieste špecificky oslabené vírusy. Takéto vírusy sú užitočné na prípravu bezpečnej živej vakcíny na použitie na prevenciu a/alebo liečenie PRRS infekcií.Live PRRS vaccines based on European strains attenuated by defined mutations and / or deletions make it possible to avoid the disadvantages of the current generation of attenuated vaccines. If the attenuated strain carries defined and known mutations, it can be easily analyzed for quality and genetic stability. The possibility of introducing defined deletions and / or substitutions, in particular as double or multiple mutations, reduces the likelihood of reversion to an un-attenuated or virulent phenotype. A further advantage of the attenuating mutations lies in their known molecular uniqueness which allows them to be used as distinguishing labels for attenuated PRRS viruses to distinguish them from field PRRS viruses. With the sites identified in the present invention, safe and site-specific attenuated viruses can be generated. Such viruses are useful for preparing a safe live vaccine for use in preventing and / or treating PRRS infections.
Predložený vynález sa týka oslabených európskych PRRS kmeňov a spôsobov ich produkcie. V tomto kontexte výraz „oslabený“ znamená, že virulentný kmeň je alebo bol modifikovaný takým spôsobom, že je menej virulentný alebo patogénny ako bol pred modifikáciou. Konkrétne, „oslabený“ znamená, že vírus má významne zníženú schopnosť spôsobovať klinické ochorenie, hoci je stále schopný replikovať sa v hostiteľovi. Výhodne je virulencia alebo patogénnosť znížená na úroveň, ktorá robí vírus akceptovateľným na podávanie vo forme vakcíny. Vo výhodnom uskutočnení je vírus oslabený vtákom rozsahu, žeThe present invention relates to attenuated European PRRS strains and methods for their production. In this context, the term "attenuated" means that the virulent strain is or has been modified in such a way that it is less virulent or pathogenic than before it was modified. In particular, "attenuated" means that the virus has a significantly reduced ability to cause clinical disease, although it is still able to replicate in the host. Preferably, virulence or pathogenicity is reduced to a level that makes the virus acceptable for administration as a vaccine. In a preferred embodiment, the virus is attenuated in a bird that is
-9nespôsobuje klinické ochorenie, hoci je stále schopný replikovať sa v hostiteľovi. Takto oslabený kmeň je ideálnym agensom na očkovanie, pretože replikácia v hostiteľovi zaručuje stimuláciu rýchlej a vynikajúcej imunologickej reakcie. Vo výhodnom uskutočnení je oslabený európsky PRRS vírus menej virulentný ako Lelystad agens. V inom uskutočnení je oslabený vírus menej virulentný ako rodičovský kmeň, z ktorého je odvodený. Výraz „menej viruletný ako PRRS vírusový Lelystad agens“ (alebo, podobne, ako rodičovský kmeň, z ktorého je odvodený) sa má chápať v kontexte porovnávania klinických symptómov daného vírusu s Lelystad agensom (CDI-NL-2.91/CNCM 1-1102) alebo rodičovským kmeňom. V príklade 1 je opísaný výhodný spôsob determinácie toho, či je PRRS vírus menej virulentný ako Lelystad agens, alebo podobne, na determináciu toho, či je vírus modifikovaný podľa vynálezu menej virulentný ako jeho rodičovský kmeň pred modifikáciou. Môže byť, že nie každá a každá možná nukleokyselinová mutácia vo virulentnom špecifickom mieste sa podieľa na zníženej virulecii. Spôsob podľa príkladu 1 poskytuje presné a priame experimentálne nastavenie na determináciu toho, či živý PRRS vírus podľa návodu podľa vynálezu je menej virulentný ako jeho rodičovský kmeň alebo virulentný terénny izolát, ako Lelystad agens.It does not cause clinical disease, although it is still able to replicate in the host. The attenuated strain is an ideal vaccine agent because replication in the host guarantees the stimulation of a rapid and excellent immunological response. In a preferred embodiment, the attenuated European PRRS virus is less virulent than the Lelystad agent. In another embodiment, the attenuated virus is less virulent than the parent strain from which it is derived. The term "less virulent than PRRS virus Lelystad agent" (or, similarly to the parent strain from which it is derived) is to be understood in the context of comparing the clinical symptoms of a given virus with Lelystad agent (CDI-NL-2.91 / CNCM 1-1102) or parental tribe. Example 1 describes a preferred method for determining whether a PRRS virus is less virulent than Lelystad agents or the like, to determine whether a virus modified according to the invention is less virulent than its parent strain prior to modification. It may be that not every and every possible nucleic acid mutation at a virulent specific site is involved in reduced virulence. The method of Example 1 provides an accurate and direct experimental set-up to determine whether a live PRRS virus according to the instruction of the invention is less virulent than its parent strain or virulent field isolate than Lelystad agents.
Predložený vynález sa týka európskych PRRS kmeňov, ktoré je možné odlíšiť od amerických kmeňov nasledovne. Veľmi skoro po nájdení vírusu Wensvoort a ďalší (J. Vet. Diagn. Invest 4: 134-138 (1992)) objavili rozdiely v antigénových charakteristikách medzi americkými a európskymi izolátmi. Vyvinuli séra proti tak americkému typu, ako aj európskemu typu, v niekoľkých ošípaných a porovnávali krížovú reaktivitu anti-európskeho (LV) a anti-amerického (VR-2332) séra s troma americkými vírusovými izolátmi a 4 európskymi izolátmi. Séra proti PRRS vírusom európskeho serotypu sú významne menej reaktívne s americkými izolátmi ako s európskymi izolátmi. Okrem toho, séra vyvinuté proti vírusom amerického serotypu sú menej reaktívne, alebo aj úplne nereaktívne s európskymi vírusovými izolátmi. Wensvoort a ďalší tiež ukázali reaktivitu séra vyvinutého proti európskym a americkým izolátom s dvoma referenčnými vírusmi CNCM 1-1102 (európsky) a ATCC VR-2332 americký). V tomto experimente séra vyvinuté proti európskym kmeňom neboli vôbec reaktívne s americkým kmeňom. Takže existujúThe present invention relates to European PRRS strains which can be distinguished from American strains as follows. Very soon after the detection of the virus, Wensvoort et al. (J. Vet. Diagn. Invest 4: 134-138 (1992)) discovered differences in antigenic characteristics between American and European isolates. They developed sera against both American and European type in several pigs and compared the cross-reactivity of anti-European (LV) and anti-American (VR-2332) sera with three American virus isolates and 4 European isolates. Sera against PRRS viruses of the European serotype are significantly less reactive with American isolates than with European isolates. In addition, sera developed against American serotype viruses are less reactive or even completely unreactive with European virus isolates. Wensvoort et al. Also showed reactivity of serum developed against European and American isolates with two reference viruses CNCM 1-1102 (European) and ATCC VR-2332 American). In this experiment, the sera developed against European strains were not at all reactive with the American strain. So they exist
- 10dva kompletne odlišné serotypy vírusu: americký a európsky serotyp, ktoré môžu byť rozlíšené na základe ich serologických vlastností.- 10 completely different virus serotypes: American and European serotypes, which can be distinguished by their serological characteristics.
Toto môže byť dokázané aj na molekulovej úrovni. Nelson a ďalší (74th Annual Meeting of the Conference of Research Workers in Animal Diseases, November 8-9, 1993) porovnávaním sekvencií génov kódujúcich polymerázu z rôznych izolátov. Demonštrovali, že polymerázové gény vykazujú 87 až 95% homológiu v rámci americkej skupiny. Avšak medzi európskymi a americkými serotypmi sa našla len 64 až 67% homológia na úrovni nukleových kyselín. Mardassi publikoval porovnateľné výsledky na vyššie uvedenej konferencii, ktoré dokazovali, že 530 3'-koncových nukleových kyselín Quebec PRRS referenčného kmeňa a európskych izolátov vykazuje len 59% homológiu. Z výsledkov vyššie uvedených publikácií vyplýva, že americký a európsky serotyp sa rozdvojil pred dlhým časom, čím by potom bolo možné jednoducho vysvetliť ich genetické rozdiely a ich serologickú nepríbuznosť.This can also be demonstrated at the molecular level. Nelson et al. (74th Annual Meeting of Researchers in Animal Diseases, November 8-9, 1993) comparing the sequences of genes encoding polymerase from various isolates. They have demonstrated that polymerase genes exhibit 87-95% homology within the American group. However, only 64-67% homology at the nucleic acid level was found between European and American serotypes. Mardassi published comparable results at the aforementioned conference, which showed that 530 3'-terminal Quebec PRRS nucleic acids of the reference strain and European isolates showed only 59% homology. The results of the aforementioned publications show that the American and European serotypes have been bifurcated a long time ago, which would then simply explain their genetic differences and their serological unrelatedness.
Americký a európsky serotyp je tak možné jednoducho rozlíšiť. Vírusy európskeho serotypu sa vyznačujú tým, že reagujú s vyšším titrom v imunoperoxidázovom monovrstvovom teste s panelom antisér proti európskemu PRRS vírusu LV (CNCM 1-1102) v porovnaní s reakciou s panelom antisér proti americkému PRRS vírusu (ATCC VR-2332). Ak sa použije panel sér, získaných približne 40 dní po infekcii, a od rozličných zvierat, akýkoľvek vírus je možné jednoducho klasifikovať ako patriaci buď k americkému, alebo k európskemu serotypu. Typicky, reaktivita európskeho kmeňa s panelom antisér proti iným európskym kmeňom je približne 400 krát vyššia ako reaktivita s panelom antisér proti americkým kmeňom. Keď európsky kmeň reaguje s antisérom proti deponovanému európskemu kmeňu 1-1102 a deponovanému americkému kmeňu VR-2332 typicky sa zistí rozdiel v reaktivite, ktorý je približne 55 násobný (Wensvoort a ďalší, citovaný vyššie).Thus, the American and European serotypes can be easily distinguished. European serotype viruses are characterized by reacting with a higher titer in an immunoperoxidase monolayer panel with an antisera panel against the European PRRS virus LV (CNCM 1-1102) compared to a response with an antisera panel against the American PRRS virus (ATCC VR-2332). When a panel of sera, obtained approximately 40 days after infection, and from different animals is used, any virus can easily be classified as belonging to either the American or European serotype. Typically, the reactivity of a European strain with a panel of antisera against other European strains is approximately 400 times higher than the reactivity with a panel of antisera against American strains. When a European strain reacts with an antisera against a deposited European strain 1-1102 and a deposited American strain VR-2332, a difference in reactivity is typically found to be approximately 55-fold (Wensvoort et al., Cited above).
„Mutácia“ znamená substitúciu, deléciu alebo inzerciu nukleotidu alebo aminokyseliny v danej polohe nukleotidovej alebo aminokyselinovej sekvencie. „Substitúcia“ je náhrada nukleotidu alebo aminokyseliny iným nukleotidom alebo aminokyselinou (napr. C za T). „Delécia znamená odstránenie nukleotidu alebo"Mutation" means the substitution, deletion or insertion of a nucleotide or amino acid at a given position in a nucleotide or amino acid sequence. "Substitution" means the replacement of a nucleotide or amino acid by another nucleotide or amino acid (e.g., C for T). "Deletion means nucleotide removal or
-11 aminokyseliny. „Inzercia“ znamená, že nukleotid alebo aminokyselina sa začlenia do danej polohy.-11 amino acids. "Insertion" means that a nucleotide or amino acid is inserted at a given position.
Ďalej predložený vynález zahŕňa spôsob alebo proces oslabenia európskehoFurther, the present invention includes a method or process of weakening the European
PRRS vírusu, v ktorom:PRRS virus in which:
a) nukleotidová sekvencia vírusu je modifikovaná miestne špecifickou mutagenézou aspoň v jednej z polôh ORF2 zodpovedajúcich polohám 130 až 150 a/alebo polohám 252 až 272 a/alebo polohám 273 až 293 sekv. č. 22;(a) the nucleotide sequence of the virus is modified by site-specific mutagenesis in at least one of the ORF2 positions corresponding to positions 130 to 150 and / or positions 252 to 272 and / or positions 273 to 293 of SEQ ID NO: 2; no. 22;
b) je testovaná, či výsledný PRRS vírus je oslabený.b) it is tested whether the resulting PRRS virus is attenuated.
Ďalej predložený vynález zahŕňa spôsob oslabenia európskeho PRRS vírusu, v ktorom:Further, the present invention includes a method of attenuating the European PRRS virus, in which:
a) nukleotidová sekvencia vírusu je modifikovaná miestne špecifickou mutagenézou aspoň v jednej z polôh ORF3 zodpovedajúcich polohám 267 až 287 sekv. č. 23;a) the nucleotide sequence of the virus is modified by site-specific mutagenesis in at least one of the ORF3 positions corresponding to positions 267 to 287 of SEQ ID NO: 2; no. 23;
b) je testovaná, či výsledný PRRS vírus je oslabený.b) it is tested whether the resulting PRRS virus is attenuated.
Ďalej predložený vynález zahŕňa spôsob oslabenia európskeho PRRS vírusu, v ktorom:Further, the present invention includes a method of attenuating the European PRRS virus, in which:
a) nukleotidová sekvencia vírusu je modifikovaná miestne špecifickou mutagenézou aspoň v jednej z polôh zodpovedajúcich polohám 201 až 221 ORF5 podľa sekv. č. 24;a) the nucleotide sequence of the virus is modified by site-specific mutagenesis in at least one of the positions corresponding to positions 201 to 221 of ORF5 according to SEQ ID NO: 2; no. 24;
b) je testovaná, či výsledný PRRS vírus je oslabený.b) it is tested whether the resulting PRRS virus is attenuated.
V tomto kontexte výraz „zodpovedajúci“ má význam uvedený vyššie, tzn., že dve polohy si navzájom zodpovedajú, ak môžu byť zosúladené ako pár pri zosúlaďovaní sekvencií, ako napríklad použitím BLAST. Výhodne je výsledkom modifikácie podľa vynálezu zmena aminokyselinovej sekvencie, ktorá kóduje proteín. Vo výhodných uskutočneniach sú modifikáciami delécie a/alebo substitúcie, výhodne dvojité alebo viacnásobné mutácie. Vo výhodnom uskutočnení sú kombinované dve alebo viaceré z vyššie uvedených modifikácií. V ďalšom výhodnom uskutočnení je sekvencia každého z ORF2, ORF3 a ORF5 modifikovaná. Výhodne je sekvencia ORF2 modifikovaná najmenej v dvoch, výhodne najmenej v troch polohách.In this context, the term "corresponding" has the meaning given above, that is, the two positions correspond to each other if they can be aligned as a pair in sequence alignment, such as by using BLAST. Preferably, the modification of the invention results in a change in the amino acid sequence that encodes the protein. In preferred embodiments, the modifications are deletions and / or substitutions, preferably double or multiple mutations. In a preferred embodiment, two or more of the above modifications are combined. In another preferred embodiment, the sequence of each of ORF2, ORF3 and ORF5 is modified. Preferably, the ORF2 sequence is modified in at least two, preferably at least three, positions.
Výhodne vyššie uvedený spôsob zahŕňa modifikáciu (modifikácie), ktorá vedie k jednému alebo viacerým z nasledujúcich znakov: OFR2 kódujúci proteínPreferably, the above method comprises modification (s) that result in one or more of the following features: OFR2 encoding the protein
- 12 majúci aminokyselinu (aminokyseliny) v jednej alebo viacerých aminokyselinových sekvenčných polohách zodpovedajúcich pozíciám 47, 88 a/alebo 95 v sekv. č. 22, substituované alebo deletované; ORF3 kódujúci proteín majúci aminokyselinu v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 93 sekv. č. 23 substituovanú alebo deletovanú; a/alebo ORF5 kódujúci proteín majúci aminokyselinu v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 71 sekv. č. 24 substituovanú alebo deletovanú. Výhodne sú všetky z vyššie uvedených polôh mutované.Having 12 amino acid (s) at one or more amino acid sequence positions corresponding to positions 47, 88 and / or 95 of SEQ ID NO: 2; no. 22, substituted or deleted; ORF3 encoding a protein having an amino acid at an amino acid sequence position corresponding to position 93 of SEQ. no. 23 substituted or deleted; and / or ORF5 encoding a protein having an amino acid at an amino acid sequence position corresponding to position 71 of SEQ. no. 24 substituted or deleted. Preferably all of the above positions are mutated.
Výhodne vyššie uvedený spôsob podľa vynálezu zahŕňa modifikáciu (modifikácie), ktorá vedie k jednému alebo viacerým, výhodne ku všetkým, z nasledujúcich znakov: OFR2 kódujúci proteín, ktorý nemá fenylalanín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 47 sekv. č. 22, ORF2 kódujúci proteín, ktorý nemá valín v aminokyselinovej sekvenčnej pozícii zodpovedajúcej polohe 88 sekv. č. 22, ORF2, ktorý nemá fenylalanín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 95 sekv. č. 22, ORF3, ktorý nemá serín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 93 sekv. č. 23, a/alebo ORF5, ktorý nemá leucín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 71 sekv. č. 24.Preferably, the above method of the invention comprises a modification (s) that results in one or more, preferably all, of the following features: OFR2 encoding a protein that does not have phenylalanine at an amino acid sequence position corresponding to position 47 of SEQ. no. 22, an ORF2 encoding a protein that has no valine at the amino acid sequence position corresponding to position 88 of SEQ ID NO: 2; no. 22, an ORF2 that does not have phenylalanine at an amino acid sequence position corresponding to position 95 of SEQ ID NO: 2; no. 22, ORF3 which does not have a serine at the amino acid sequence position corresponding to position 93 of SEQ ID NO: 22; no. 23, and / or ORF5 that does not have a leucine at an amino acid sequence position corresponding to position 71 of SEQ ID NO: 23. no. 24th
Výhodne vyššie uvedený spôsob podľa vynálezu zahŕňa modifikáciu (modifikácie), ktorá vedie k jednému alebo viacerým, výhodne ku všetkým, z nasledujúcich znakov: OFR2 kódujúci proteín, ktorý má serín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 47 sekv. č. 22, ORF2 kódujúci proteín, ktorý má fenylalanín v aminokyselinovej sekvenčnej pozícii zodpovedajúcej polohe 88 sekv. č. 22, ORF2, ktorý má leucín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 95 sekv. č. 22, ORF3, ktorý má prolín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 93 sekv. č. 23, a/alebo ORF5, ktorý má fenylalanín v aminokyselinovej sekvenčnej polohe zodpovedajúcej pozícii 71 sekv. č. 24.Preferably, the above method of the invention comprises a modification (s) that results in one or more, preferably all, of the following features: OFR2 encoding a protein having a serine at an amino acid sequence position corresponding to position 47 of SEQ. no. 22, an ORF2 encoding a protein having a phenylalanine at an amino acid sequence position corresponding to position 88 of SEQ. no. 22, ORF2 having a leucine at an amino acid sequence position corresponding to position 95 of SEQ. no. 22, an ORF3 having a proline at an amino acid sequence position corresponding to position 93 of SEQ ID NO: 22; no. 23, and / or ORF5 having a phenylalanine at an amino acid sequence position corresponding to position 71 of SEQ. no. 24th
Výhodne spôsob podľa vynálezu zahŕňa modifikáciu (modifikácie), ktorá vedie k jednému alebo viacerým, výhodne ku všetkým z nasledujúcich znakov: ORF2 majúci C v polohe zodpovedajúcej polohe 140 sekv. č. 22, ORF2 majúci T v polohe zodpovedajúcej polohe 262 sekv. č. 22, ORF2 majúci C v polohePreferably, the method of the invention comprises a modification (s) that results in one or more, preferably all of the following features: ORF2 having C at a position corresponding to position 140 of SEQ. no. 22, an ORF2 having a T at a position corresponding to position 262 of SEQ. no. 22, ORF2 having a C in position
-13zodpovedajúcej polohe 283 sekv. č. 22, ORF3 majúci C v polohe zodpovedajúcej polohe 277 sekv. č. 23 a/alebo ORF5 majúci T v polohe zodpovedajúcej polohe 211 sekv. č. 24.-13 corresponding to position 283 of SEQ. no. 22, an ORF3 having C at a position corresponding to position 277 of SEQ. no. 23 and / or ORF5 having a T at a position corresponding to position 211 of SEQ. no. 24th
Okrem toho sa predložený vynález týka oslabeného európskeho vírusu, ktorý je možné získať ktorýmkoľvek z vyššie uvedených spôsobov.In addition, the present invention relates to an attenuated European virus obtainable by any of the above methods.
Ďalej predložený vynález zahŕňa nukleovú kyselinu, ktorá obsahuje kódujúcu informáciu oslabeného európskeho PRRS vírusu, ako je opísaný vyššie. Ako je uvedené vyššie, môže to byť ribonukleová kyselina (RNA). Takouto nukleovou kyselinou môže byť okrem toho aj deoxyribonukleová kyselina, ktorá je komplementárna s takouto ribonukleovou kyselinou, tzn. cDNA, alebo akýkoľvek iný typ DNA. Vo výhodnom uskutočnení je takáto cDNA infekčná. To znamená, že ak sa takáto cDNA zavedie do vhodnej hostiteľskej bunky, uvedená buka začne generovať vírusové častice. Predložený vynález sa ďalej týka RNA, cDNA alebo inej DNA obsahujúcej akúkoľvek z vyššie uvedených mutácií, alebo viaceré z vyššie uvedených mutácií.Further, the present invention encompasses a nucleic acid that comprises the encoding information of an attenuated European PRRS virus as described above. As mentioned above, it may be a ribonucleic acid (RNA). Such a nucleic acid may furthermore be a deoxyribonucleic acid which is complementary to such a ribonucleic acid, i. cDNA, or any other type of DNA. In a preferred embodiment, such cDNA is infectious. That is, if such cDNA is introduced into a suitable host cell, said cell will begin to generate viral particles. The present invention further relates to RNA, cDNA or other DNA comprising any of the above mutations, or more of the above mutations.
Ďalej predložený vynález zahŕňa vakcínu, ktorá obsahuje oslabený európsky PRRS vírus, ako je opísaný, v kombinácii s farmaceutický prijateľným nosičom.Further, the present invention encompasses a vaccine comprising an attenuated European PRRS virus as described in combination with a pharmaceutically acceptable carrier.
Ďalej predložený vynález zahŕňa spôsob očkovania ošípaných proti PRRS, ktorý sa vyznačuje tým, že sa ošípanej podáva účinné množstvo vyššie uvedenej vakcíny.Further, the present invention comprises a method of inoculating pigs against PRRS, characterized in that an effective amount of the above vaccine is administered to the pig.
Ďalej predložený vynález sa týka použitia oslabeného európskeho PRRS vírusu, ako je opísaný, na výrobu vakcíny proti PRRS.Further, the present invention relates to the use of an attenuated European PRRS virus as described for the production of a PRRS vaccine.
V súlade s predloženým vynálezom sa nukleotidy a aminokyseliny číslujú podľa verejne dostupného Lelystad agensu, ako je opísaný vyššie. Avšak, ako je uvedené na obrázkoch 1 až 4, ORFs („otvorené čítacie rámce = ORF“) sa číslujú oddelene, keďže niektoré z nich sa prekrývajú.In accordance with the present invention, the nucleotides and amino acids are numbered according to a publicly available Lelystad agent as described above. However, as shown in Figures 1 to 4, ORFs ("open reading frames = ORFs") are numbered separately as some of them overlap.
Nukleotidy špecifických miest, v ktorých sa oslabený európsky vírus líši od virulentného štandardného typu, sú v ORF2 nukleotidy 11915-11935 (tabuľka 1 zodpovedajúce číslam 130 až 150 na obrázku 1), 12037-12057 (tabuľka 2, čísla 252-272 na obrázku 1), 12058-12078 (tabuľka 3, čísla 273-293 na obrázku 1); v ORF3 12660-12680 (tabuľka 4; čísla 267-287 na obrázku 3) a/alebo v ORF5 1368413704 (tabuľka 5; čísla 201-221 na obrázku 4). Prostredníctvom mutovania LelystadThe nucleotides of the specific sites where the attenuated European virus differs from the virulent wild type are in the ORF2 nucleotides 11915-11935 (Table 1 corresponding to numbers 130 to 150 in Figure 1), 12037-12057 (Table 2, numbers 252-272 in Figure 1) ), 12058-12078 (Table 3, Nos. 273-293 in Figure 1); in ORF3 12660-12680 (Table 4; numbers 267-287 in Figure 3) and / or in ORF5 1368413704 (Table 5; numbers 201-221 in Figure 4). Through mutation Lelystad
- 14agensu v jednej alebo viacerých z vyššie uvedených polôh na akýkoľvek z nukleotidov uvedených v tabuľkách a/alebo prostredníctvom deletovania uvedených nukleotidov v týchto polohách, odborník získa živé oslabené európske očkovacie kmene PRRS vírusu. Mutácie, ako napríklad substitúcia alebo delécia, v uvedených lokalitách, sú limitované len podmienkou, že vírus sa musí byť schopný ešte replikovať, tzn. musí to byť ešte živý vírus. To je možné určiť bez nadmerného experimentovania. Priemerný odborník v oblasti môže na základe verejne dostupného Lelystad agensu a návodov podľa vynálezu zaviesť napr. jednu single mutáciu do každého opísaného miesta na základe poskytnutých tabuliek, napr. do polohy 11915 môže zaviesť A, C alebo G alebo môže deletovať nukleotid v tejto polohe (ktorým je T). Neobmedzujúci príklad je uvedený na obrázkoch 1 až 3 (ORF2, ORF3 a ORF5 Lelystad B a oslabeného vírusu A) a v príklade 1.- 14agens at one or more of the above positions at any of the nucleotides listed in the tables and / or by deleting said nucleotides at these positions, the skilled artisan will obtain live attenuated European PRRS virus vaccine strains. Mutations, such as substitution or deletion, at these sites are limited only by the condition that the virus must still be able to replicate, i. it must still be a living virus. This can be determined without undue experimentation. A person of ordinary skill in the art can, for example, introduce e.g. one single mutation to each site described based on the provided tables, e.g. at position 11915, it may introduce A, C or G, or may delete a nucleotide at that position (which is T). A non-limiting example is shown in Figures 1-3 (ORF2, ORF3 and ORF5 of Lelystad B and attenuated virus A) and in Example 1.
Vynález zahŕňa také vírusy, v ktorých je mutovaný len jeden nukleotid, ale aj niekoľko nukleotidov, alebo aj všetky nukleotidy, napr. jeden alebo niekoľko tripletov kódujúcich jednu alebo niekoľko aminokyselín v uvedených polohách. Avšak sekvencia nesmie byť mutovaná do takého rozsahu, v ktorom sa už vírus nie je schopný viac replikovať, tzn., že podľa vynálezu je kódovaný živý vírus.The invention encompasses such viruses in which only one nucleotide, but also several nucleotides, or even all nucleotides, e.g. one or more triplets encoding one or more amino acids at said positions. However, the sequence must not be mutated to such an extent that the virus is no longer capable of replicating, i.e. the live virus is encoded according to the invention.
Aj ďalšie nukleové kyseliny mimo uvedených oblastí môžu byť mutované, avšak to nie je nevyhnutné pre vynález (pozri obrázok 1, napr. poloha 426 v ORF2 Lelystad-B, v ktorej je C namiesto T).Other nucleic acids outside these regions may also be mutated, but this is not essential to the invention (see Figure 1, e.g., position 426 in Lelystad-B ORF2 in which C is instead of T).
Uvedené mutácie sa môžu uskutočňovať štandardnými metódami genetického inžinierstva známymi v oblasti, najmä miestne špecifickou mutagenézou. V kontexte tohto vynálezu výraz „miestne špecifická mutagenéza“ znamená techniku genetického inžinierstva, ktorá umožňuje riadené mutovanie vo vopred vybraných miestach nukleovej kyseliny. Vo všeobecnosti takáto technika vyžaduje aspoň čiastočnú znalosť sekvencie takejto nukleovej kyseliny. Klasický oslabovací spôsob prostredníctvom sériového pasážovania dávky neumožňuje mutovanie vo vopred vybraných miestach. Takéto metódy genetického inžinierstva sú dobre známe v oblasti (pozri napr. Sambrook a ďalší (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. vydanie, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York; kapitola 15; Wu (vyd.) (1993), Methods in Enzymology zv. 217, str. 173-285).Said mutations may be carried out by standard genetic engineering methods known in the art, in particular by site-specific mutagenesis. In the context of the present invention, the term "site-specific mutagenesis" means a genetic engineering technique that allows for controlled mutation at preselected nucleic acid sites. Generally, such a technique requires at least partial knowledge of the sequence of such a nucleic acid. The classical attenuation method through serial passage of the batch does not allow mutation at preselected sites. Such genetic engineering methods are well known in the art (see, e.g., Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York; Chapter 15; Wu (Ed. (1993), Methods in Enzymology vol. 217, pp. 173-285).
- 15Ako východiskový materiál na zavádzanie mutácií sa môže cDNA kloň virulentného PRSSV kmeňa, napr. Lelystad agens (CNCM 1-1102), generovať spôsobmi známymi v oblasti (Boyer a Haenni. Infectious transcripts and cDNA dones of RNA viruses. Virology (1994) 198: 415-426). Napríklad, infekčná PRRSV kópia sa môže pripraviť ako je opísané vo WO 00/53787; Meulenberg a ďalší, Adv. Exp. Biol (1998) 440: 199-206; Meulenberg a ďalší, J. Virol. (1998) 72(1): 380-387, ktorá sa potom môže mutovať v súlade s vynálezom. Citované referencie poskytujú podrobné postupy ako získať infekčné cDNA klony PRRSV a ako vytvoriť ich mutanty. Mutovaný kloň alebo jeho infekčné transkripty generované in vitro sa potom môžu transfekovať do vhodných hostiteľských buniek, ktoré potom budú generovať oslabený vírus.As a starting material for introducing mutations, a cDNA clone of a virulent PRSSV strain, e.g. Lelystad agents (CNCM 1-1102), generated by methods known in the art (Boyer and Haenni. Infectious transcripts and cDNAs of RNA viruses. Virology (1994) 198: 415-426). For example, an infectious PRRSV copy may be prepared as described in WO 00/53787; Meulenberg et al., Adv. Exp. Biol. (1998) 440: 199-206; Meulenberg et al., J. Virol. (1998) 72 (1): 380-387, which can then be mutated in accordance with the invention. The cited references provide detailed procedures on how to obtain infectious PRRSV cDNA clones and how to create mutants thereof. The mutated clone or its infectious transcripts generated in vitro can then be transfected into suitable host cells, which will then generate attenuated virus.
Najmä sa prekvapujúco zistilo, že miesta 11925, 12047 a 12068 ORF2 (pozri obrázok 1); 12670 ORF3 (pozri obrázok 2) a/alebo 13694 ORF5 (pozri obrázok 4) sú stále zmenené v porovnaní s virulentným terénnym kmeňom Lelystad agensu. Preto iné výhodné uskutočnenie predloženého vynálezu predstavuje oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu, v ktorom:In particular, it was surprisingly found that the 11925, 12047 and 12068 ORF2 sites (see Figure 1); The 12670 ORF3 (see Figure 2) and / or 13694 ORF5 (see Figure 4) are still altered compared to the virulent field strain of Lelystad agent. Therefore, another preferred embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus according to the invention, in which:
a) ORF2 obsahuje C, A alebo G v polohe 11925 a/alebo C, T alebo A v polohe 12047 a/alebo A, C alebo G v polohe 12068 alebo deléciu v uvedenej polohe (polohách) a/alebo(a) ORF2 comprises C, A or G at position 11925 and / or C, T or A at position 12047 and / or A, C or G at position 12068 or a deletion at said position (s) and / or
b) ORF3 obsahuje A, C alebo G v polohe 12670 alebo deléciu v uvedenej polohe a/alebo(b) ORF3 comprises A, C or G at position 12670 or a deletion at said position and / or
c) ORF5 obsahuje G, A alebo T v polohe 13694 alebo deléciu v uvedenej polohe.(c) ORF5 comprises G, A, or T at position 13694 or a deletion at said position.
Konkrétnejšie sa zistilo, že miesto 11925 v ORF2 je stále zmenené na C, miesto 12047 v ORF2 je stále zmenené na T a miesto 12068 v ORF2 je stále zmenené na C (pozri obrázok 1); miesto 12670 v ORF3 je stále zmenené na C (pozri obrázok 2) a/alebo 13694 ORF5 je stále zmenené na T (pozri obrázok 4) v porovnaní s virulentným terénnym kmeňom Lelystad agensu. Preto iné, výhodnejšie, uskutočnenie predloženého vynálezu predstavuje oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu, v ktorom sa nukleová kyselina ďalej vyznačuje tým, žeMore specifically, it was found that the 11925 site in ORF2 is still changed to C, the 12047 site in ORF2 is still changed to T, and the 12068 site in ORF2 is still changed to C (see Figure 1); site 12670 in ORF3 is still changed to C (see Figure 2) and / or 13694 ORF5 is still changed to T (see Figure 4) compared to the virulent field strain of Lelystad agent. Therefore, another, more preferred embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus according to the invention, wherein the nucleic acid is further characterized in that:
a) ORF2 obsahuje C v polohe 11925 a/alebo T v polohe 12047 a/alebo C v polohe 12068 alebo deléciu v uvedenej polohe (polohách) a/alebo(a) ORF2 comprises a C at position 11925 and / or a T at position 12047 and / or a C at position 12068 or a deletion at said position (s), and / or
b) ORF3 obsahuje C v polohe 12670 alebo deléciu v uvedenej polohe a/alebo(b) ORF3 comprises a C at position 12670 or a deletion at said position and / or
c) ORF5 obsahuje T v polohe 13694 alebo deléciu v uvedenej polohe.c) ORF5 comprises a T at position 13694 or a deletion at said position.
Iným, výhodnejším, uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu, ktorý je označený ako oslabený vírus A na obrázkoch, ktorého nukleová kyselina sa ďalej vyznačuje tým, žeAnother, more preferred embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus according to the invention, which is designated as attenuated virus A in the figures, the nucleic acid of which is further characterized in that:
a) ORF2 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 1 a/aleboa) ORF2 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 1 and / or
b) ORF3 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 2 a/alebob) ORF3 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 2 and / or
c) ORF4 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 3 a/aleboc) ORF4 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 3 and / or
d) ORF5 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 4, alebo ich fragment, alelický variant, funkčný variant, variant založený na degenerovanosti nukleokyselinového kódu, fúznu molekulu alebo chemický derivát.d) ORF5 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 4, or a fragment, allelic variant, functional variant, variant based on degeneracy of the nucleic acid code, a fusion molecule or a chemical derivative thereof.
„Fragmentom“ podľa vynálezu je akákoľvek imunogénna podjednotka PRRS vírusu alebo ORF podľa vynálezu, tzn. akákoľvek polypeptidová podsada, ktorá sa vyznačuje tým, že je kódované kratšou nukleokyselinovou molekulou ako je opísaná vyššie, avšak ešte stále si zachováva aktivitu.A "fragment" of the invention is any immunogenic subunit of the PRRS virus or ORF of the invention, i. any polypeptide subset that is encoded by a shorter nucleic acid molecule as described above, but still retains activity.
„Funkčný variant“ PRRS vírusu alebo ORF podľa vynálezu je PRRS vírus alebo ORF, ktorý má biologickú aktivitu (buď funkčnú, alebo štrukturálnu), ktorá je v podstate podobná s aktivitou PRRS vírusu alebo ORF podľa vynálezu. Výraz „funkčný variant“ zahŕňa aj „fragment“, „alelický variant“, „funkčný variant“, „variant založený na degenerovanosti nukleokyselinového kódu“ alebo „chemické deriváty“. Takýto „funkčný variant“ môže napr. niesť jednu alebo niekoľko bodových mutácií, jednu alebo niekoľko nukleokyselinových zámien, delécií alebo inzercií alebo jednu alebo niekoľko aminokyselinových zámien, delécií alebo inzercií. Uvedený funkčný variant si ešte zachováva svoju biologickú aktivitu, napr. funkciu ako očkovací kmeň, aspoň sčasti, alebo má aj zlepšenú uvedenú biologickú aktivitu.A "functional variant" of the PRRS virus or ORF of the invention is a PRRS virus or ORF that has a biological activity (either functional or structural) that is substantially similar to that of the PRRS virus or ORF of the invention. The term "functional variant" also includes "fragment", "allelic variant", "functional variant", "variant based on nucleic acid degeneracy" or "chemical derivatives". Such a "functional variant" can e.g. carrying one or more point mutations, one or more nucleic acid substitutions, deletions or insertions, or one or more amino acid substitutions, deletions or insertions. Said functional variant still retains its biological activity, e.g. function as a vaccine strain, at least in part, or also have an improved biological activity.
„Variant založený na degenerovanosti genetického kódu“ je variant vďaka skutočnosti, že určitá aminokyselina môže byť kódovaná niekoľkými rozličnými nukleotidovými tripletmi. Uvedený variant si stále zachováva svoju biologickú aktivitu, aspoň čiastočne, alebo má aj zlepšenú uvedenú biologickú aktivitu.A "genetic code degenerate variant" is a variant due to the fact that a particular amino acid can be encoded by several different nucleotide triplets. Said variant still retains its biological activity, at least in part, or has an improved said biological activity.
„Fúzovanou molekulou“ môže byť PRRS vírus alebo ORF podľa vynálezu fúzovaný napr. s reportérom, ako napríklad rádioaktívnou značkou, chemickouA "fusion molecule" can be a PRRS virus or ORF of the invention fused e.g. with a reporter, such as a radiolabel, chemical
- 17 molekulou, ako napríklad fluorescenčnou značkou alebo akoukoľvek inou molekulou známou v oblasti.A molecule such as a fluorescent label or any other molecule known in the art.
Tak ako sa používa tu, „chemický derivát“ podľa vynálezu je PRRS vírus alebo ORF podľa vynálezu chemicky modifikované alebo obsahujúce ďalšie chemické skupiny, ktoré normálne nie sú súčasťou molekuly. Takéto skupiny môžu zlepšovať rozpustnosť, absorpciu, biologický polčas rozpadu molekuly, atď.As used herein, a "chemical derivative" of the invention is a PRRS virus or ORF of the invention chemically modified or containing other chemical groups that are not normally part of the molecule. Such groups can improve solubility, absorption, biological half-life of the molecule, etc.
Molekula je „v podstate podobná“ s inou molekulou, ak obe molekuly majú v podstate podobné štruktúry alebo biologickú aktivitu. Takže za predpokladu, že dve molekuly majú podobnú aktivitu, sú považované za varianty, keďže tento výraz sa tu používa aj vtedy, ak sa štruktúra jednej z molekúl nenachádza v inej, alebo aj vtedy, ak nie je zhodná sekvencia aminokyselinových zvyškov.A molecule is "substantially similar" to another molecule if both molecules have substantially similar structures or biological activity. Thus, assuming that two molecules have similar activity, they are considered variants, as this term is used herein even if the structure of one of the molecules is not in the other, or even if the sequence of the amino acid residues is not identical.
Iným, najvýhodnejším, uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu (označený ako oslabený vírus A na obrázkoch), v ktorom sa nukleová kyselina vyznačuje tým, žeAnother, most preferred embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus of the invention (referred to as attenuated virus A in the figures), wherein the nucleic acid is characterized in that:
a) ORF2 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 1 a/aleboa) ORF2 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 1 and / or
b) ORF3 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 2 a/alebob) ORF3 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 2 and / or
c) ORF4 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 3 a/aleboc) ORF4 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 3 and / or
d) ORF5 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 4.d) ORF5 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 4th
Iným výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu (označený ako oslabený vírus A na obrázkoch), v ktorom sa nukleová kyselina vyznačuje tým, že obsahuje nukleovú kyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 5, alebo jej fragment, alelický variant, funkčný variant, variant založený a degenerovanosti nukleokyselinového kódu, fúzovanú molekulu alebo chemický derivát.Another preferred embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus according to the invention (referred to as attenuated virus A in the figures), wherein the nucleic acid is characterized in that it comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 5, or a fragment, allelic variant, functional variant, variant based and degeneracy of the nucleic acid code, fusion molecule or chemical derivative thereof.
Iným, výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu (LELYSTAD-B na obrázkoch), v ktorom sa uvedená nukleová kyselina ďalej vyznačuje tým, žeAnother preferred embodiment of the present invention is the attenuated European PRRS virus of the invention (LELYSTAD-B in the figures), wherein said nucleic acid is further characterized in that:
a) ORF2 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 6 a/aleboa) ORF2 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 6 and / or
b) ORF3 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 7 a/alebob) ORF3 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 7 and / or
c) ORF4 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 8 a/aleboc) ORF4 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 8 and / or
d) ORF5 obsahuje nukleovú kyselinu ako je definovaná v sekv. č. 9 a/alebo jej fragment, alelický variant, funkčný variant, variant založený a degenerovanosti nukleokyselinového kódu, fúzovanú molekulu alebo chemický derivát.d) ORF5 comprises a nucleic acid as defined in SEQ. no. 9 and / or a fragment, allelic variant, functional variant, variant based and degeneracy of the nucleic acid code, fusion molecule or chemical derivative.
Iným, výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus podľa vynálezu (LELYSTAD-B na obrázkoch), v ktorom sa uvedená nukleová kyselina ďalej vyznačuje tým, žeAnother preferred embodiment of the present invention is the attenuated European PRRS virus of the invention (LELYSTAD-B in the figures), wherein said nucleic acid is further characterized in that:
a) ORF2 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 6 a/aleboa) ORF2 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 6 and / or
b) ORF3 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 7 a/alebob) ORF3 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 7 and / or
c) ORF4 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 8 a/aleboc) ORF4 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 8 and / or
d) ORF5 pozostáva z nukleovej kyseliny ako je definovaná v sekv. č. 9.d) ORF5 consists of a nucleic acid as defined in SEQ. no. 9th
Iným dôležitým uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus (oslabený vírus A na obrázkoch), pričom PRRS vírus sa vyznačuje tým, že:Another important embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus (attenuated virus A in the figures), wherein the PRRS virus is characterized in that:
a) ORF1a obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 10 a/aleboa) ORF1a comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 10 and / or
b) ORF1 b obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 11 a/alebob) ORF1b comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 11 and / or
c) ORF2 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 12 a/aleboc) ORF2 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 12 and / or
d) ORF3 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 13 a/alebod) ORF3 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 13 and / or
e) ORF4 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 14 a/aleboe) ORF4 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 14 and / or
f) ORF5 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 15 a/alebof) ORF5 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 15 and / or
g) ORF6 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 16 a/alebog) ORF6 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 16 and / or
h) ORF7 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 17 alebo jej fragment, alelický variant, funkčný variant, variant založený a degenerovanosti nukleokyselinového kódu, fúzovanú molekulu alebo chemický derivát.h) ORF7 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. Or a fragment thereof, allelic variant, functional variant, variant based and degeneracy of a nucleic acid code, a fusion molecule or a chemical derivative.
Iným, výhodnejším, uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus (oslabený vírus A na obrázkoch), pričom PRRS vírus sa vyznačuje tým, že:Another, more preferred embodiment of the present invention is an attenuated European PRRS virus (attenuated virus A in the figures), wherein the PRRS virus is characterized in that:
a) ORF1a pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 10 a/aleboa) ORF1a consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 10 and / or
b) ORF1b pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 11 a/alebob) ORF1b consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 11 and / or
c) ORF2 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 12 a/aleboc) ORF2 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 12 and / or
d) ORF3 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 13 a/alebod) ORF3 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 13 and / or
e) ORF4 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 14 a/aleboe) ORF4 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 14 and / or
f) ORF5 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 15 a/alebof) ORF5 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 15 and / or
g) ORF6 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 16 a/alebog) ORF6 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 16 and / or
h) ORF7 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 17.h) ORF7 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 17th
Iným veľmi dôležitým uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus (LELYSTAD-B na obrázkoch), ktorý sa vyznačuje tým, žeAnother very important embodiment of the present invention is the attenuated European PRRS virus (LELYSTAD-B in the figures), characterized in that
a) ORF2 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 18 a/aleboa) ORF2 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 18 and / or
b) ORF3 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 19 a/alebob) ORF3 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 19 and / or
c) ORF4 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 20 a/aleboc) ORF4 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 20 and / or
d) ORF5 obsahuje aminokyselinu, ako je definovaná v sekv. č. 21 alebo jej fragment, alelický variant, funkčný variant, variant založený a degenerovanosti nukleokyselinového kódu, fúzovanú molekulu alebo chemický derivát.d) ORF5 comprises an amino acid as defined in SEQ. no. 21 or a fragment thereof, allelic variant, functional variant, variant based and degeneracy of the nucleic acid code, fusion molecule or chemical derivative.
Iným veľmi dôležitým uskutočnením predloženého vynálezu je oslabený európsky PRRS vírus (LELYSTAD-B na obrázkoch), ktorý sa vyznačuje tým, žeAnother very important embodiment of the present invention is the attenuated European PRRS virus (LELYSTAD-B in the figures), characterized in that
a) ORF2 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 18 a/aleboa) ORF2 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 18 and / or
b) ORF3 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 19 a/alebob) ORF3 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 19 and / or
c) ORF4 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 20 a/aleboc) ORF4 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 20 and / or
d) ORF5 pozostáva z aminokyseliny, ako je definovaná v sekv. č. 21.d) ORF5 consists of an amino acid as defined in SEQ. no. 21st
Ešte iným dôležitým uskutočnením predloženého vynálezu je nukleotidová sekvencia kódujúca vírus podľa vynálezu, ako je opísaný vyššie. Takéto nukleotidové sekvencie obsahujú sekvencie opísané v zozname sekvencii (napr. s identifikačnými číslami 1 až 9 (pod <400> je uvádzaná sekv. č.). Vynález sa ďalej týka proteínov uvedených ako sekv. č. 10 až 21.Yet another important embodiment of the present invention is a nucleotide sequence encoding a virus of the invention as described above. Such nucleotide sequences comprise the sequences described in the Sequence Listing (e.g., with SEQ ID NOS: 1 to 9 (SEQ ID NO: <400)) The invention further relates to the proteins shown in SEQ ID NOs 10 to 21.
Ešte iným výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je nukleotidová sekvencia podľa vynálezu, ktorá bola modifikovaná tak, aby kódovala virulentný marker a/alebo serologický marker. Ako je uvedené na úvodných stranách, je pre zvládnutie zdravia ošípaných dôležitá možnosť rozlišovať medzi menej virulentným živým očkovacím kmeňom farmaceutického prostriedku a virulentným štandardným typom vírusovej infekcie. To je často ťažké, najmä ak klinické symptómy terénnej infekcie nie sú špecifické alebo sú prekryté inými infekciami alebo ak je čas pozorovania a hodnotenia krátky. Rekombinantné generovanie vírusov, o ktoré je záujem, umožňuje zavedenie modifikácií do genetického kódu, ktoré zavádzajú serologický marker a/alebo virulentný marker. Serologický marker označujeYet another preferred embodiment of the present invention is a nucleotide sequence of the invention that has been modified to encode a virulent marker and / or a serological marker. As stated on the introductory pages, the ability to differentiate between a less virulent live vaccine strain of a pharmaceutical composition and a virulent wild-type viral infection is important to manage pig health. This is often difficult, especially if the clinical symptoms of the field infection are not specific or are obscured by other infections or if the time of observation and assessment is short. Recombinant generation of the viruses of interest allows for the introduction of modifications into the genetic code that introduce a serological marker and / or a virulent marker. Serological marker indicates
-20antigénne detegovateľnú molekulu, ako napríklad peptid, proteín, glykoproteín, ktorá môže byť izolovaná z infikovaných buniek alebo telesných tekutín, ako napríklad, ale bez obmedzenia na faryngeálnu alebo nosnú tekutinu alebo moč. Virulentný marker musí byť chápaný ako marker v genetickom kóde, ktorý môže byť identifikovaný rekombinantnými analytickými metódami, ako napríklad, ale bez obmedzenia na PCR a bežné sekvenovanie. Preto, vo výhodnom uskutočnení, sa predložený vynález týka nukleotidovej sekvencie podľa vynálezu, ktorá bola modifikovaná tak, aby kódovala virulentný marker a/alebo serologický marker. Konkrétne, mutácie alebo delécie zavádzané za účelom oslabenia vírusu sú užitočné ako virulentné a serologické markery. Monitorovaním týchto mutácií v nárokovaných virulentných špecifických miestach je možné predpovedať objavenie sa možných virulentných revertantov v skorom štádiu.An antigen-detectable molecule, such as a peptide, protein, glycoprotein, which can be isolated from infected cells or body fluids such as, but not limited to, pharyngeal or nasal fluid or urine. A virulent marker must be understood as a marker in the genetic code that can be identified by recombinant analytical methods such as, but not limited to, PCR and routine sequencing. Therefore, in a preferred embodiment, the present invention relates to a nucleotide sequence of the invention that has been modified to encode a virulent marker and / or a serological marker. In particular, mutations or deletions introduced to attenuate the virus are useful as virulent and serological markers. By monitoring these mutations at the claimed virulent specific sites, it is possible to predict the appearance of possible virulent revertants at an early stage.
Ešte iným výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je nukleotidová sekvencia podľa vynálezu, pričom nukleová kyselina kódujúca uvedený marker je umiestnená medzi ktorékoľvek z otvorených čítacích rámcov kódujúcich štrukturálne vírusové proteíny.Yet another preferred embodiment of the present invention is a nucleotide sequence of the invention wherein the nucleic acid encoding said marker is located between any of the open reading frames encoding structural viral proteins.
Ďalej sa vynález týka spôsobu generovania infekčného živého oslabeného PRRS vírusu, ktorý zahŕňa produkciu rekombinantnej nukleovej kyseliny obsahujúcej aspoň jednu kompletnú DNA kópiu alebo in vitro transkribovanú RNA kópiu alebo derivát buď DNA, alebo RNA, pričom uvedenou nukleotidovou sekvenciou je nukleotidová sekvencia podľa vynálezu. Takže v súlade s vynálezom spôsob vedie k PRRS vírusu, ako je opísaný vyššie. Odborník môže využiť miestne špecifickú mutagenézu (Sambrook a ďalší (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. vyd., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York; kapitola 15; Wu (vyd.) (1993), Methods in Enzymology zv. 217, str. 173-285) alebo akýkoľvek iný spôsob na zavedenie mutácie (mutácií) na špecifické zavedenie mutácie (mutácií) na získanie PRRS vírusu, ako je opísaný vyššie.Further, the invention relates to a method of generating an infectious live attenuated PRRS virus, comprising producing a recombinant nucleic acid comprising at least one complete DNA copy or an in vitro transcribed RNA copy or derivative of either DNA or RNA, wherein said nucleotide sequence is a nucleotide sequence of the invention. Thus, in accordance with the invention, the method results in a PRRS virus as described above. One of skill in the art may utilize site-specific mutagenesis (Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York; Chapter 15; Wu (Ed.) (1993), Methods in Enzymology vol. 217, pp. 173-285) or any other method for introducing a mutation (s) to specifically introduce a mutation (s) to obtain a PRRS virus as described above.
Spôsob opísaný v nasledujúcom výhodnom uskutočnení bude viesť (na genomickej úrovni) k PRRS vírusu podľa vynálezu, ako je opísaný vyššie. Takže v inom výhodnom uskutočnení sa vynález týka spôsobu, ako je opísaný na generovanie infekčného oslabeného PRRS vírusu, ktorý sa vyznačuje nasledujúcimi krokmi:The method described in the following preferred embodiment will lead (at the genomic level) to the PRRS virus of the invention as described above. Thus, in another preferred embodiment, the invention relates to a method as described for generating an infectious attenuated PRRS virus, characterized by the following steps:
a) PRRS vírus podľa vynálezu sa použije na infikovanie vhodnej bunkovej línie,a) The PRRS virus of the invention is used to infect a suitable cell line,
b) uvedený PRRS vírus sa ďalej oslabuje pasážovaním na bunkových kultúrach.b) said PRRS virus is further attenuated by passage on cell cultures.
Iné výhodné uskutočnenie sa týka spôsobu, ako je opísaný, pri ktorom je uvedenou bunkovou líniou línia embryonických opičích obličkových buniek alebo výhodne Mare bunky alebo ich derivát (pozri nižšie).Another preferred embodiment relates to a method as described wherein said cell line is an embryonic monkey kidney cell line or preferably a Mare cell or a derivative thereof (see below).
Iné výhodné uskutočnenie vynálezu sa týka spôsobu, ako je opísaný, pri ktorom je PRRS vírusom vírus (vírusy) podľa vynálezu, ako sú opísané vyššie.Another preferred embodiment of the invention relates to a method as described in which the PRRS virus is the virus (s) of the invention as described above.
Ďalej sa predložený vynález týka bunkovej línie obsahujúcej PRRS vírus podľa vynálezu. Príklady takých bunkových línií zahŕňajú permanentné bunkové línie známe odborníkovi, výhodne bravčové, opičie alebo ľudské bunkové línie, ako napríklad ľudské embryonické obličkové (HEK) 293, BHK, GH3, H4, U373, NT2, PC12, COS, CHO, Ltk-, fibroblasty, myelómy, neuroblatómy, hybridómy, oocyty, embryonické kmeňové bunky), hmyzie bunkové línie (napr. použitím bakulovírusových vektorov, ako napríklad pPbac alebo pMbac (Stratagene, La Jolla, USA)), kvasinky (napr. Pichia pastoris alebo použitím kvasinkových expresných vektorov, ako napríklad pYESHIS (Invitrogen, San Diego, USA)), a plesne.Furthermore, the present invention relates to a cell line comprising the PRRS virus of the invention. Examples of such cell lines include permanent cell lines known to the skilled person, preferably porcine, monkey or human cell lines, such as human embryonic kidney (HEK) 293, BHK, GH3, H4, U373, NT2, PC12, COS, CHO, Ltk-, fibroblasts. , myelomas, neuroblatomas, hybridomas, oocytes, embryonic stem cells), insect cell lines (e.g., using baculovirus vectors such as pPbac or pMbac (Stratagene, La Jolla, USA)), yeasts (e.g., Pichia pastoris, or using yeast expression vectors) , such as pYESHIS (Invitrogen, San Diego, USA), and fungi.
Ďalej vo výhodnom uskutočnení sa vynález týka bunkovej línie podľa vynálezu, ktorou je embryonické opičia obličková bunka alebo, výhodne, Mare bunka, alebo ich derivát.Further, in a preferred embodiment, the invention relates to a cell line according to the invention which is an embryonic monkey kidney cell or, preferably, a Mare cell, or a derivative thereof.
Ďalej predložený vynález zahŕňa spôsob alebo proces oslabovania európskeho PRRS vírusu, ktorý sa vyznačuje tým, žeFurther, the present invention includes a method or process of attenuating the European PRRS virus, characterized in that:
a) nukleotidová sekvencia vírusu sa modifikuje miestne špecifickou mutagenézou aspoň v jednej z polôh ORF2 zodpovedajúcich polohám 130 až 150 a/alebo polohám 252 až 272 a/alebo polohám 273 až 293 v sekv. č. 22;a) the nucleotide sequence of the virus is modified by site-specific mutagenesis in at least one of the ORF2 positions corresponding to positions 130 to 150 and / or positions 252 to 272 and / or positions 273 to 293 of SEQ ID NO: 2; no. 22;
b) testuje sa, či je výsledný PRRS vírus oslabený.(b) it is tested whether the resulting PRRS virus is attenuated.
V tomto kontexte poloha v nukleovej kyseline alebo v aminokyselinovej sekvencii „zodpovedajúca“ polohe v inej sekvencii znamená, že ak majú tieto dve sekvencie dostatočnú štrukturálnu podobnosť, môžu byť zosúladené prostredníctvom štandardného zosúlaďovacieho algoritmu, ako napríklad BLAST (Altschul, S.F., Gish, W., Miller, W., Myers, E.V. & Lipman, D.J. (1990) „Basic localIn this context, a position in a nucleic acid or amino acid sequence "corresponding" to a position in another sequence means that if the two sequences have sufficient structural similarity, they can be aligned through a standard matching algorithm such as BLAST (Altschul, SF, Gish, W. Miller, W., Myers, EV & Lipman, DJ (1990) " Basic local
-22alignment search toll.“ J. Mol. Biol. 215:403-41; Gish, W. & States, D.J. (1993) „Identification of protein coding regions by database similarity search.“ Náture Genet. 3:266-272; Madden, T.L., Tatusov, R.L. & Zhang, J. (1996) „Applications of network BLAST server“ Meth. Enzymol. 266:131-141; Zhang, J. & Madden,T.L. (1997) „PowerBLAST: A new network BLAST application for interactive or automated sequence analysis and annotation.“ Genome Res. 7:649-656; Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, a Dávid J. Lipman (1997), „Gapped BLAST and PSI-BLST: a new generation of protein databasesearch programs“, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402), a pri uskutočnení takéhoto zosúladenia by boli tieto dve polohy zoradené ako pár.-22 alignment search toll. 'J. Mol. Biol. 215: 403-41; Gish, W. & States, D.J. (1993) "Identification of protein coding regions by database similarity search." Nature Genet. 3: 266-272; Madden, T.L., Tatusov, R.L. & Zhang, J. (1996) "Applications of Network BLAST Server" Meth. Enzymol. 266: 131-141; Zhang, J. & Madden, T.L. (1997) "PowerBLAST: A New Network BLAST Application for Interactive or Automated Sequence Analysis and Annotation." Genome Res. 7: 649-656; Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLST: a new generation of protein databasesearch programs Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402), and in performing such alignment, the two positions would be aligned as a pair.
Ďalšie uskutočnenie predloženého vynálezu sa týka spôsobu oslabenia európskeho PRRS vírusu, ktorý spočíva v tom, žeA further embodiment of the present invention relates to a method of attenuating the European PRRS virus, comprising:
a) nukleotidová sekvencia vírusu sa modifikuje miestne špecifickou mutagenézou aspoň v jednej z polôh ORF3 zodpovedajúcich polohám 267 až 287 v sekv. č. 23;a) the nucleotide sequence of the virus is modified by site-specific mutagenesis in at least one of the ORF3 positions corresponding to positions 267 to 287 of SEQ ID NO: 2; no. 23;
b) testuje sa, či je výsledný PRRS vírus oslabený.(b) it is tested whether the resulting PRRS virus is attenuated.
Ďalšie uskutočnenie predloženého vynálezu sa týka spôsobu oslabenia európskeho PRRS vírusu, ktorý spočíva v tom, žeA further embodiment of the present invention relates to a method of attenuating the European PRRS virus, comprising:
a) nukleotidová sekvencia vírusu sa modifikuje miestne špecifickou mutagenézou aspoň v jednej z polôh zodpovedajúcich polohám 201 až 221 ORF5 v sekv. č. 24;a) the nucleotide sequence of the virus is modified by site-specific mutagenesis in at least one of the positions corresponding to positions 201 to 221 of ORF5 in SEQ ID NO: 2; no. 24;
b) testuje sa, či je výsledný PRRS vírus oslabený.(b) it is tested whether the resulting PRRS virus is attenuated.
Výhodne, modifikácia, ako je opísaná vyššie, vedie k zmene aminokyselinovej sekvencie kódovaného proteínu. Výhode je modifikáciou delécia alebo substitúcia. Vo výhodnom uskutočnení je sekvencia každého z ORF2, ORF3 a ORF5 modifikovaná. V inom výhodnom uskutočnení je sekvencia ORF2 modifikovaná aspoň v dvoch, výhodne aspoň v troch polohách. Výhodne modifikácia vedie k jednému alebo viacerým z nasledujúcich znakov; OFR2 kódujúci proteín majúci aminokyselinu v jednej alebo viacerých aminokyselinových sekvenčných polohách zodpovedajúcich pozíciám 47, 88 a/alebo 95 aminokyselinovej sekvencie kódovanej sekv. č. 22, substituované alebo deletované;Preferably, the modification as described above results in a change in the amino acid sequence of the encoded protein. Preferably, the modification is a deletion or substitution. In a preferred embodiment, the sequence of each of ORF2, ORF3 and ORF5 is modified. In another preferred embodiment, the ORF2 sequence is modified in at least two, preferably at least three, positions. Preferably, the modification results in one or more of the following features; OFR2 encoding a protein having an amino acid at one or more amino acid sequence positions corresponding to positions 47, 88 and / or 95 of the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 22, substituted or deleted;
-23ORF3 kódujúci proteín majúci aminokyselinu zodpovedajúcu polohe 93 v aminokyselinovej sekvencií kódovanej sekv. č. 23 substituovanú alebo deletovanú;-23ORF3 encoding a protein having an amino acid corresponding to position 93 in the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 23 substituted or deleted;
a/alebo ORF5 kódujúci proteín majúci aminokyselinu zodpovedajúcu polohe 71 aminokyselinovej sekvencie kódovanej sekv. č. 24 substituovanú alebo deletovanú.and / or ORF5 encoding a protein having an amino acid corresponding to position 71 of the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 24 substituted or deleted.
Výhodnejšie modifikácia urobená takýmto spôsobom vedie k jednému alebo viacerým, výhodne ku všetkým nasledujúcim znakom: OFR2 kódujúci proteín, ktorý má serín v polohe zodpovedajúcej polohe 47 aminokyselinovej sekvencie kódovanej sekv. č. 22, ORF2 kódujúci proteín, ktorý má fenylalanín v polohe zodpovedajúcej polohe 88 aminokyselinovej sekvencie kódovanej sekv. č. 22, ORF2, ktorý má leucín v v polohe zodpovedajúcej polohe 95 aminokyselinovej sekvencie kódovanej sekv. č. 22, ORF3, ktorý má prolín v polohe zodpovedajúcej polohe 93 aminokyselinovej sekvencie kódovanej sekv. č. 23, a/alebo ORF5, ktorý má fenylalanín v polohe zodpovedajúcej polohe 71 v aminokyselinovej sekvencií kódovanej sekv. č.More preferably, a modification made in this way results in one or more, preferably all of the following features: OFR2 encoding a protein having a serine at a position corresponding to position 47 of the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 22, an ORF2 encoding a protein having phenylalanine at a position corresponding to position 88 of the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 22, ORF2 having a leucine at a position corresponding to position 95 of the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 22, an ORF3 having a proline at a position corresponding to position 93 of the amino acid sequence of the encoded sequence. no. 23, and / or ORF5 having a phenylalanine at a position corresponding to position 71 in the amino acid sequence of the encoded sequence. no.
24.24th
Vo výhodných uskutočneniach modifikácia vedie k jednému alebo viacerým, výhodne ku všetkým z nasledujúcich znakov: ORF2 majúci C v polohe zodpovedajúcej polohe 140 v sekv. č. 22, ORF2 majúci T v polohe zodpovedajúcej polohe 262 v sekv. č. 22, ORF2 majúci C v polohe zodpovedajúcej polohe 283 v sekv. č. 22, ORF3 majúci C v polohe zodpovedajúcej polohe 277 v sekv. č. 23 a/alebo ORF5 majúci T v polohe zodpovedajúcej polohe 211 v sekv. č. 24.In preferred embodiments, the modification results in one or more, preferably all of the following features: ORF2 having a C at a position corresponding to position 140 in SEQ. no. 22, an ORF2 having a T at a position corresponding to position 262 in SEQ. no. 22, an ORF2 having a C at a position corresponding to position 283 in SEQ. no. 22, an ORF3 having a C at a position corresponding to position 277 in SEQ. no. 23 and / or ORF5 having a T at a position corresponding to position 211 in SEQ. no. 24th
V ďalšom uskutočnení sa predložený vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu získateľného spôsobom opísaným vyššie.In another embodiment, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus obtainable by the method described above.
V ďalšom uskutočnení sa predložený vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF2, ktorý sa líši od sekv. č. 22 v jednej alebo vo viacerých polohách 130 až 150 a/alebo jednej alebo vo viacerých polohách 252 až 272 a/alebo jednej alebo vo viacerých polohách 273 až 293.In another embodiment, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF2 that differs from SEQ. no. 22 in one or more positions 130 to 150 and / or one or more positions 252 to 272 and / or one or more positions 273 to 293.
V ďalšom uskutočnení sa predložený vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF3, ktorý sa líši od sekv. č. 23 v jednej alebo vo viacerých polohách 267 až 287.In another embodiment, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF3 that differs from SEQ. no. 23 in one or more positions 267 to 287.
V ďalšom uskutočnení sa predložený vynález týka oslabeného európskeho PRRS vírusu majúceho ORF5, ktorý sa líši od sekv. č. 24 v jednej alebo vo viacerých polohách 201 až 221.In another embodiment, the present invention relates to an attenuated European PRRS virus having ORF5 that differs from SEQ. no. 24 at one or more of positions 201 to 221.
V ďalšom uskutočnení sa predložený vynález týka vakcíny, ktorá obsahuje oslabený európsky PRRS vírus, ako je opísaný vyššie, v kombinácii s farmaceutický prijateľným nosičom. V ďalšom uskutočnení sa predložený vynález týka spôsobu očkovania ošípaných proti PRRS, ktorý spočíva vtom, že sa účinné množstvo takejto vakcíny podáva ošípanej. Alternatívne sa predložený vynález týka použitia oslabeného európskeho PRRS vírusu, ako je opísaný, na výrobu vakcíny proti PRRS.In another embodiment, the present invention relates to a vaccine comprising an attenuated European PRRS virus as described above in combination with a pharmaceutically acceptable carrier. In another embodiment, the present invention relates to a method for vaccination of pigs against PRRS, comprising administering an effective amount of such a vaccine to a pig. Alternatively, the present invention relates to the use of an attenuated European PRRS virus as described for the production of a PRRS vaccine.
Výhodne môže byť živý oslabený PRRS vírus použitý na liečenie, profylaxiu alebo diagnostiku ochorení spôsobených štandardným PRRS vírusom. Príklady takýchto ochorení a použití sú uvedené v príklade 1. Ďalej sa vynález týka použitia vírusov podľa vynálezu. Ich definovaný molekulový základ oslabenia ich robí vynikajúcimi oproti vírusom známym v oblasti. Najmä použitie vírusov podľa vynálezu, ktoré obsahujú delécie vo virulentných špecifických miestach, je výhodné, keďže delécie sú menej náchylné na reverziu.Advantageously, the live attenuated PRRS virus may be used for the treatment, prophylaxis or diagnosis of diseases caused by wild-type PRRS virus. Examples of such diseases and uses are given in Example 1. The invention further relates to the use of the viruses according to the invention. Their defined molecular basis of attenuation makes them superior to viruses known in the art. In particular, the use of viruses according to the invention which contain deletions at virulent specific sites is advantageous since the deletions are less susceptible to reversion.
Iným výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je farmaceutický prostriedok obsahujúci jeden alebo niekoľko PRRS vírusov podľa vynálezu a farmaceutický prijateľný nosič. Výhodným predmetom je farmaceutický prostriedok obsahujúci nie len uvedený európsky PRRS vírus podľa vynálezu, ale aj oslabený US PRRS vírus, ako napríklad vírus, ktorý sa predáva vo farmaceutickom prostriedku pod obchodným označením RespPRRS/Ingelvac® PRRS MLV, Boehringer Ingelheim. Farmaceutický prijateľný nosič môže obsahovať fyziologicky prijateľné zlúčeniny, ktoré slúžia napríklad na stabilizáciu alebo a zvýšenie absorpcie alebo tvoria časť PRRS formulácie s pomalým uvoľňovaním podľa vynálezu. Takéto fyziologicky prijateľné zlúčeniny zahŕňajú napríklad sacharidy, ako napríklad glukózu, sacharózu alebo dextrány, antioxidanty, ako napríklad kyselinu askorbovú alebo glutatión, chelatačné činidlá, proteíny s nízkou molekulovou hmotnosťou alebo iné stabilizátory alebo excipienty (pozri aj napr. Remington's Pharmaceutical Sciences (1990), 18. vyd. Mack Publ., Easton). Priemerný odborník v oblasti by vedel, že voľba farmaceutický prijateľného nosiča, vrátane fyziologicky prijateľnej zlúčeniny, závisí napríklad na spôsobe podávania prostriedku. Najvýhodnejšie je prostriedok formulovaný prostredníctvom získania supernatantu obsahujúceho vírus (tekutina z tkanivovej kultúry) z infikovanej bunkovej kultúryAnother preferred embodiment of the present invention is a pharmaceutical composition comprising one or more PRRS viruses of the invention and a pharmaceutically acceptable carrier. A preferred object is a pharmaceutical composition comprising not only said European PRRS virus of the invention, but also a attenuated US PRRS virus, such as a virus sold in a pharmaceutical formulation under the trade name RespPRRS / Ingelvac® PRRS MLV, Boehringer Ingelheim. The pharmaceutically acceptable carrier may contain physiologically acceptable compounds which serve, for example, to stabilize or to enhance absorption or form part of a PRRS slow release formulation of the invention. Such physiologically acceptable compounds include, for example, carbohydrates such as glucose, sucrose or dextrans, antioxidants such as ascorbic acid or glutathione, chelating agents, low molecular weight proteins, or other stabilizers or excipients (see also e.g. Remington's Pharmaceutical Sciences (1990), 18th ed. Mack Publ., Easton). One of ordinary skill in the art would know that the choice of a pharmaceutically acceptable carrier, including a physiologically acceptable compound, depends, for example, on the mode of administration of the composition. Most preferably, the composition is formulated by obtaining a virus-containing supernatant (tissue culture fluid) from the infected cell culture
-25a mrazovým vysušením uvedeného supernatantu, voliteľne po pridaní stabilizátora. Mrazom vysušený prostriedok môže byť rekonštruovaný s vodou pred podávaním. V inom príklade by bol vhodným nosičom roztok fyziologickej soli. Výhode sa farmaceutický prostriedok injektuje intramuskuláre alebo intradermálne. Vakcína podľa vynálezu sa môže podávať prasiatkam, v závislosti na spôsobe vakcinácie prasníc, vo veku 1, 3, 6 alebo 10 týždňov, prasniciam pred páraním a/alebo 6 týždňov pred vrhaním (booster očkovanie) alebo kancom každého pol roka (boostery).Freeze-drying said supernatant, optionally after addition of a stabilizer. The freeze-dried composition may be reconstituted with water prior to administration. In another example, a suitable carrier would be a physiological salt solution. Preferably, the pharmaceutical composition is injected intramuscularly or intradermally. The vaccine of the invention may be administered to piglets, depending on the method of vaccinating the sows, at 1, 3, 6 or 10 weeks of age, sows prior to mating and / or 6 weeks prior to shedding (booster vaccination) or boars every six months (boosters).
Iným výhodným uskutočnením predloženého vynálezu je použitie PRRS vírusu podľa vynálezu na výrobu vakcíny na profylaxiu a liečenie PRRS infekcií.Another preferred embodiment of the present invention is the use of the PRRS virus of the invention for the manufacture of a vaccine for the prophylaxis and treatment of PRRS infections.
Nasledujúci príklad slúži na podrobnejšie ilustrovanie predloženého vynálezu, ale nemôže byť považovaný za obmedzujúci rozsah tu opísaného vynálezu.The following example serves to illustrate the present invention in more detail, but should not be construed as limiting the scope of the invention described herein.
Prehľad obrázkov na výkreseOverview of the figures in the drawing
Obrázok 1: Porovnanie sekvencií štandardného Lelystad vírusu, zverejneného v GenBank, oslabeného vírusu A (skratka Vir.A) a oslabeného Lelystad vírusu BFigure 1: Sequence comparison of wild-type Lelystad virus published in GenBank, attenuated virus A (abbreviated Vir.A) and attenuated Lelystad virus B
Genomická oblasť: ORF 2Genomic region: ORF 2
Počet nukleotidov: 750Number of nucleotides: 750
Hrubým písmom a v rámčekoch sú označené mutácie (nesynonymné nukleotidové zmeny) podľa vynálezu (pozri nároky 2 a 3).Mutations (non-synonymous nucleotide changes) of the invention are indicated in bold and in boxes (see claims 2 and 3).
Obrázok 2: Porovnanie sekvencií štandardného Lelystad vírusu, zverejneného v GenBank, oslabeného vírusu A (skratka Vir.A) a oslabeného Lelystad vírusu BFigure 2: Sequence comparison of wild-type Lelystad virus published in GenBank, attenuated virus A (abbreviated Vir.A) and attenuated Lelystad virus B
Genomická oblasť: ORF 3Genomic region: ORF 3
Počet nukleotidov: 798Number of nucleotides: 798
Hrubým písmom a v rámčekoch sú označené mutácie (nesynonymné nukleotidové zmeny) podľa vynálezu (pozri nároky 2 a 3).Mutations (non-synonymous nucleotide changes) of the invention are indicated in bold and in boxes (see claims 2 and 3).
Obrázok 3: Porovnanie sekvencií štandardného Lelystad vírusu, zverejneného v GenBank, oslabeného vírusu A (skratka Vir.A) a oslabeného Lelystad vírusu BFigure 3: Sequence comparison of wild-type Lelystad virus, published in GenBank, attenuated virus A (abbreviated Vir.A) and attenuated Lelystad virus B
-26Genomická oblasť: ORF 4-26Genomic region: ORF 4
Počet nukleotidov: 552Number of nucleotides: 552
Obrázok 4: Porovnanie sekvencií štandardného Lelystad vírusu, zverejneného v GenBank, oslabeného vírusu A (skratka Vir.A) a oslabeného Lelystad vírusu BFigure 4: Sequence comparison of wild-type Lelystad virus published in GenBank, attenuated virus A (abbreviated Vir.A) and attenuated Lelystad virus B
Genomická oblasť: ORF 5Genomic region: ORF 5
Počet nukleotidov: 606Number of nucleotides: 606
Hrubým písmom a v rámčekoch sú označené mutácie (nesynonymné nukleotidové zmeny) podľa vynálezu (pozri nároky 2 a 3).Mutations (non-synonymous nucleotide changes) of the invention are indicated in bold and in boxes (see claims 2 and 3).
Príklad uskutočnenia vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Príklad 1Example 1
Zavedenie oslabeniaIntroduction of weakness
Tento príklad poskytuje jasný návod na porovnanie virulentného charakteru dvoch odlišných kmeňov PRRS vírusov. Ako referenčný kmeň pre typický virulentný európsky kmeň môže slúžiť Lelystad agens (CDI-NL-2.91) s nízkym počtom pasáží (nie viac ako piatimi) na bunkovej kultúre.This example provides a clear guide to comparing the virulent nature of two different strains of PRRS viruses. Lelystad agents (CDI-NL-2.91) with a low number of passages (no more than five) in cell culture can serve as a reference strain for a typical virulent European strain.
V skupine je pre každý pokus zahrnutých aspoň 10 prasničiek prvôstok, ktoré sú získané z farmy bez PRRS. Zvieratá sa testujú, či neobsahujú PRRS vírusové špecifické sérové protilátky a či sú negatíve na PRRSV. Všetky zvieratá zahrnuté v jednom teste sú z rovnakého zdroja a plemena a sú z farmy, v ktorej sa v predchádzajúcej histórii nevyskytla žiadna PRRSV infekcia. Rozdelenie zvierat do skupín je náhodné. Očkovanie sa uskutočňuje na 85. až 90. deň ťarchavosti intranazálnou aplikáciou 1 ml PRRSV s 105 TDCID50 (tretia pasáž) do nozdier. Sú najmenej tri skupiny pre každú testovaciu zostavu:At least 10 gilts of first gilts that are obtained from a farm without PRRS are included in the group for each experiment. Animals are tested for PRRS virus specific serum antibodies and negative for PRRSV. All animals included in one test are from the same source and breed and are from a farm where no PRRSV infection has occurred in previous history. The grouping of animals is random. Vaccination is performed on day 85-90 of pregnancy by intranasal administration of 1 ml PRRSV with 10 5 TDCID 50 (third passage) into the nostrils. There are at least three groups for each test kit:
Jedna skupina na infikovanie s Lelystad agensom (CDI-NL-2.91); jedna testovacia skupina na infikovanie s pravdepodobným oslabeným vírusom; a jedna striktná kontrolná skupina.One group for infection with Lelystad agent (CDI-NL-2.91); one test group for infection with a probable attenuated virus; and one strict control group.
-27Hodnota štúdie je potvrdená, keď striktné kontroly ostávajú PRRS negatívne v priebehu štúdie a v skupine infikovanej s Lelystad agensom sa narodí aspoň 25 % menej zdravých prasiatok v porovnaní so striktnými kontrolami.The study value is confirmed when strict controls remain PRRS negative throughout the study and at least 25% fewer healthy pigs are born in the Lelystad-infected group compared to strict controls.
Oslabenie, inými slovami nižšia virulencia, je definované ako štatisticky významná zmena jedného alebo viacerých parametrov determinujúcich reprodukčnú výkonnosť.Attenuation, in other words, lower virulence, is defined as a statistically significant change in one or more parameters determining reproductive performance.
Výhodná je významná redukcia aspoň v jednom z nasledujúcich parametrov pre testovanú skupinu:A significant reduction in at least one of the following parameters for the test group is preferred:
- frekvencia mŕtvonarodených- frequency of stillbirths
- potrat v 112. alebo pred 112. dňom ťarchavosti- abortion at or before 112 days of pregnancy
- počet mumifikovaných prasiatok- number of mummified piglets
- počet živých a slabých prasiatok- number of live and weak piglets
- úmrtnosť pred odstavením alebo je okrem toho výhodný významný nárast v jednom z nasledujúcich parametrov pre testovanú skupinu:- mortality before weaning or, in addition, a significant increase in one of the following parameters for the test group is beneficial:
- počet odstavených prasiatok na prasnicu- number of weaned piglets per sow
- počet narodených živých zdravých prasiatok na prasnicu- number of live healthy piglets born per sow
- v porovnaní so skupinou infikovanou s Lelystad agensom.- compared to the group infected with Lelystad.
Ako príklad môžu byť v klinickom teste podľa uvedeného opisu získané nasledujúce výsledky s Lelystad agensom 147 krát pasážovaným na bunkovej kultúre:By way of example, the following results may be obtained in a clinical assay as described with Lelystad agent 147 times passaged on cell culture:
Uvedené sú údaje o reprodukčnej výkonnosti prasníc od prasníc, ktoré boli inokulované, ako je opísané vyššie, s Lelystad agensom pasážovaným na bunkovej kultúre 5 krát (skupina 1) a s Lelystad agensom pasážovaným na bunkovej kultúreData are shown on the reproductive performance of sows from sows that have been inoculated as described above with Lelystad agent passaged on cell culture 5 times (group 1) and with Lelystad agent passaged on cell culture
-28147 krát (skupina 2). V ďalšej skupine 3 zvieratá slúžili ako striktná kontrola a inokuloval sa im len supernatant z bunkovej kultúry bez PRRSV:-28147 times (group 2). In another group of 3, the animals served as a strict control and were inoculated only with cell culture supernatant without PRRSV:
-30Zoznam sekvencii <110> Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH <120> Živý oslabený PRRS vírus <130> 1-1176 <160> 29 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 750 <212> DNA <213> PRRS vírus <400> 1 atgcaatggg tccttgttag caggatggtt ctgccatt'ca ccggatgtcc tcccaatťaa caagcggcc.t atagttactc tcacgactcg acgttggacc ttcagacaat accttgttca tggcccacgg <210> 2 <211> 798 gttactgtgg tgtggttgat actggtcttc ctctcccgaa cacaatttgc ttgatgagat ggaagcaggc atttccaaaa tgatgctaaa gcgttgagct ggctcatcag tagtgctttg caacacatca agtaaaatca attgttattt cttctcagag ctatcgaagg attcaagcac ggtctctcgt ggttggtgag cctggccgca aaatcttgcc catcttcccc tgtgcacgct gcttcgaatt ttcgagctga gccagctgtt tccttgccat tggtttgctc tccťatgaag ccattgggta cgcatttacc gccactctca gtagaggcgg gttggcaatg acgacaggta tccatttttt ccagctctac cgtggacgcc actgtttggg cgcgcttctc gcttgttgcc tgctttggca agaccatgga cgaagctgtc attcttgccg tgagcctaca cgaggcccaa cctctgtggc gctatgtttt ttcactgagt ttcaccgtcg cgttcgcgct caactgdaga catgcgagtt acattcaggt aaggctcgat ctttctcagc gtacaäcacc gttgaccgac ttcatctgtt tggtttccat-30List of sequences <110> Boehringer Ingelheim Vetmedica GmbH <120> Live attenuated PRRS virus <130> 1-1176 <160> 29 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 750 <212> DNA <213> PRRS virus <400> 1 atgcaatggg tccttgttag caggatggtt ctgccatt'ca ccggatgtcc tcccaattaa caagcggcc.t atagttactc tcacgactcg acgttggacc tttcagacaat ctctcccgaa cacaatttgc ttgatgagat ggaagcaggc atttccaaaa tgatgctaaa gcgttgagct ggctcatcag tagtgctttg caacacatca agtaaaatca attgttattt cttctcagag ctatcgaagg attcaagcac ggtctctcgt ggttggtgag cctggccgca aaatcttgcc catcttcccc tgtgcacgct gcttcgaatt ttcgagctga gccagctgtt tccttgccat tggtttgctc tccťatgaag ccattgggta cgcatttacc gccactctca gtagaggcgg gttggcaatg acgacaggta tccatttttt ccagctctac cgtggacgcc actgtttggg cgcgcttctc gcttgttgcc tgctttggca agaccatgga cgaagctgtc attcttgccg tgagcctaca cgaggcccaa cctctgtggc gctatgtttt ttcactgagt ttcaccgtcg cgttcgcgct caactgdaga catgcgagtt acattcaggt aaggctcgat ctttctcagc gtacaäcacc gttgaccgac ttcatctgtt tggtttccat
120120
180180
240 300.240 300.
360360
420420
480480
540540
600600
660660
720720
750· <212> DNA <213> PRRS vírus <40Q> 2 atggctcatc catagtgctt ggcaacacat caagcggctc aggtgtgagg ctcaaacttg ttccatccgg cagttcattt tccgcattat gaatggctgc cgttcgcctg cggctgccgg cagcgcaaga cccagtacat <210> 3 <211> 552 <212> DNA agtgtgcacg tggcttcgaa cattcgagct gccaaaggct agcgtgacca agggttatta agttgttcgg gtgccgagca atgcggcata ggccactctt taagccctgt tttcatggtc ggaaattccc cacgataa cttccatttt ttccagctct gaccatcaac cgagcccggt tgatgagttg tgcttggctg gatagggaat tgatggacag ttaccaccac ttcctcctgg ttctcgacgc cttcaggaca ttcggaaagt ttcctctgtg acgctatgtt tacaccatat cgtaacatgt ttaatgccca gcttttttgt gtgtcgcgcg aattcaaccg caaatagacg ctggtgctca atctatcaga tcaattgtct cgtcccaatg gcttcatctg tttggtttcc gcatgccctg ggtgcaaaat tcccgtccgg ccttttccta tcttcgtgga tatctaccgg ggggcaattg atatatcatg tattgagacc ccgacctcac tcgtgaagcc ttaccttgtt attggcccac ttctaccagt agggtatgac gtacgacaac cgcggcccaa caagcgacac acacaacatc gttccatttg gtttctgagg aacacgaccg ggggtctcag gtcggtactc750 · <212> DNA <213> PRRS virus <40Q> 2 atggctcatc catagtgctt ggcaacacat caagcggctc aggtgtgagg ctcaaacttg ttccatccgg cagttcattt tccgcattat gaatggctgc cgttcgcctg cggctgccgg cagcgcaaga cccagtacat <210> 3 <211> 552 <212> DNA agtgtgcacg tggcttcgaa cattcgagct gccaaaggct agcgtgacca agggttatta agttgttcgg gtgccgagca atgcggcata ggccactctt taagccctgt tttcatggtc ggaaattccc cacgataa cttccatttt ttccagctct gaccatcaac cgagcccggt tgatgagttg tgcttggctg gatagggaat tgatggacag ttaccaccac ttcctcctgg ttctcgacgc cttcaggaca ttcggaaagt ttcctctgtg acgctatgtt tacaccatat cgtaacatgt ttaatgccca gcttttttgt gtgtcgcgcg aattcaaccg caaatagacg ctggtgctca atctatcaga tcaattgtct cgtcccaatg gcttcatctg tttggtttcc gcatgccctg ggtgcaaaat tcccgtccgg ccttttccta tcttcgtgga tatctaccgg ggggcaattg atatatcatg tattgagacc ccgacctcac tcgtgaagcc ttaccttgtt attggcccac ttctaccagt agggtatgac gtacgacaac cgcggcccaa caagcgacac acacaacatc gttccatttg gtttctgagg aacacgaccg ggggtctcag gtcggtactc
120120
180180
240240
300300
360360
420420
480480
540540
600600
660660
720720
780780
798798
-31 <213> PRRS vírus <400 3 atggctgcgg ccactctttt cctcctggct ggtgctcaat atatcatggt ttctgaggcg 60 ttcgcctgta agccctgttt ctcgacgcat ctatcagata ttgagaccaa cacgaccgcg 120 gctgccggtt tcatggtcct tcaggacatc aattgtctcc gacctcacgg ggtctcagca 180 gcgcaagagg aaattccctt cggaaagtcg tcccaatgtc gtgaagccgt cggtactccc 240 cagtacatca cgataacggc taacgtgacc gacgaatcat acttgtacaa cgcggacttg 300 ctgatgcttt ctgcgtgcct tttccacgcc tcagaaatga gcgagaaagg cttcaaagtt 360 atctttggga atgtctctgg cgttgtttcc gcttgtgtca atttcacaga ttatgtggcc 420 catgtgaccc aacataccca gcagcatcat ttggtaattg atcacattcg gttgctgcat 480 ttcctgacac catctgcaat gaggtgggct acaaccattg cttgtttgtt cgccattctc 540. ttggcgatat ga 552.-31 <213> PRRS virus <400 3 atggctgcgg ccactctttt cctcctggct ggtgctcaat atatcatggt ttctgaggcg 60 ttcgcctgta agccctgttt ctcgacgcat ctatcagata ttgagaccaa cacgaccgcg 120 gctgccggtt tcatggtcct tcaggacatc aattgtctcc gacctcacgg ggtctcagca 180 gcgcaagagg aaattccctt cggaaagtcg tcccaatgtc gtgaagccgt cggtactccc 240 cagtacatca cgataacggc taacgtgacc gacgaatcat acttgtacaa cgcggacttg 300 ctgatgcttt ctgcgtgcct tttccacgcc tcagaaatga gcgagaaagg cttcaaagtt 360 atctttggga atgtctctgg cgttgtttcc gcttgtgtca atttcacaga ttatgtggcc 420 catgtgaccc aacataccca gcagcatcat ttggtaattg atcacattcg gttgctgcat 480 ttcctgacac catctgcaat gaggtgggct acaaccattg cttgtttgtt cgccattctc ttggcgatat 540 g 552nd
<210> 4 <211> 606 <212> DNA <213> PRRS vírus <400> 4 .atgagatgtt ctcacaaatt ggggcgtttc ttgactccgc actcttgctt ctggtggttt 60tttttgctgt gtaccggctt gtcctggtcc tttgccgatg gcaacggcaa cagctčgaca 120 taccaataca tatataactt gacgatatgc gagctgaatg.ggaccgactg gttgtccagc 180 cattttggtt gggcagtcga gacctttgtg ttttacccgg ttgccactca tatcctctca -240 ctgggttttc tcacaacaag ccattttttt gacgcgctcg. gtctcggcgc· tgtatccact. 3 00' .gcaggatttg ttggcgggcg gtatgtaatc tgcagdgtct.acggcgcttg tgctttcgca 360 gcgttcgtat gttttgtcat ccgtgctgct aaaaattgca·tggcctgccg ctatgcccgt 4.20 acccggttta ccaacttcat tgtagacaac cgggggagag ttcatcgatg gaagtctcca 480 atagtggtag aaaaattggg caaagccgaa gtcgacggca acctcgtcac catcaaacat 540 gtcgtcctcg aaggggttaa agctcaaccc ttgačgagga cttcggctga gcaatgggag 600 gcctag 606 <210> 5 <211> 14815 <212> DNA <213> PRRS vírus <400> 5 gganacatac acgacacttc tagtgtttgt gtaccttgga ggcgtgggta cagccccgcc 60 ccaccccttg gcccctgttc tagcccaaca ggtatccttc tctctcgggg cgagtgcgcc 120 gcctgctgct cccttgcagc gggaaggacc tcccgagtat ttccggagag cacctgcttt 180 acgggatctc caccctttaa ccatgtctgg gacgttctcc cggtgcatgt gcaccccggc 240 tgcccgggta ttttggaacg ccggccaagt cttttgcaca cggtgtctca gtgcgcggtc 300 tcttctctct ccagagcttc aggacactga cctcggtgca gttggcttgt tttacaagcc 360 tagggacaag cttcactgga aagtccctat cggcatccct caggtggaat gtactccatc 420 cgggtgctgt tggctctcag ctgttttccc tttggcgcgt atgacctccg gcaatcacaa 480cttcctccaa cgacttgtga aggttgctga tgttttgtac cgtgacggtt gcttggcacc 540 tcgacacctt cgtgaactcc aagtttacga gcgcggctgc aactggtacc cgatcacggg 600 gcccgtgccc gggatgggtt tgtttgcgaa ctccatgcac gtatccgacc agccgttccc 660 tggtgccacc catgtgttga ctaactcgcc tttgcctcaa caggcttgtc ggcagccgtt 720 ctgtccattt gaggaggctc attctagcgt gtacaggtgg aagaaatttg tggttttcac 780 ggactcctcc ctcaacggtc gatctcgcat gatgtggacg ccggaatccg atgattcagc 840 cgccctggag gtactaccgc ctgagttaga acgtcaggtt gaaatcctca ttcggagttt 900 tcctgctcat caccctgtcg acctggccga ctgggagctc actgagtccc ctgagaacgg 960<210> 4 <211> 606 <212> DNA <213> PRRS virus <400> 4 .atgagatgtt ctcacaaatt ggggcgtttc ttgactccgc actcttgctt ctggtggttt 60tttttgctgt gtaccggctt gtcctggtcc tttgccgatg gcaacggcaa cagctčgaca 120 taccaataca tatataactt gacgatatgc gagctgaatg.ggaccgactg gttgtccagc 180 cattttggtt gggcagtcga gacctttgtg ttttacccgg ttgccactca tatcctctca - 240 ctgggttttc tcacaacaag ccattttttt gacgcgctcg. gtctcggcgc · tgtatccact. 3 00 '.gcaggatttg ttggcgggcg gtatgtaatc tgcagdgtct.acggcgcttg tgctttcgca 360 gcgttcgtat gttttgtcat ccgtgctgct aaaaattgca · tggcctgccg ctatgcccgt 4.20 acccggttta ccaacttcat tgtagacaac cgggggagag ttcatcgatg gaagtctcca 480 atagtggtag aaaaattggg caaagccgaa gtcgacggca acctcgtcac catcaaacat 540 gtcgtcctcg aaggggttaa agctcaaccc ttgačgagga cttcggctga gcaatgggag 600 gcctag 606 <210> 5 <211> 14815 <212> DNA <213> PRRS virus <400> 5 gganacatac acgacacttc tagtgtttgt gtaccttgga ggcgtgggta cagccccgcc 60 ccaccccttg gcccctgttc tagcccaaca ggtatccttc tctctcgggg cgagtgcgcc 120 gcctgctgct cccttgcagc gggaaggacc tcccgagtat ttccggagag cacctgcttt 180 acgggatctc caccctttaa ccatgtctgg gacgttctcc cggtgcatgt gcaccccggc 240 tgcccgggta ttttggaacg ccggccaagt cttttgcaca cggtgtctca gtgcgcggtc 300 tcttctctct ccagagcttc aggacactga cctcggtgca gttggcttgt tttacaagcc 360 tagggacaag cttcactgga aagtccctat cggcatccct caggtggaat gtactccatc 420 cgggtgctgt tggctctcag ctgttttccc ttgtga aggttgctga tgttttgtac cgtgacggtt gcttggcacc 540 tcgacacctt cgtgaactcc aagtttacga gcgcggctgc aactggtacc cgatcacggg 600 gcccgtgccc gggatgggtt tgtttgcgaa ctccatgcac gtatccgacc agccgttccc 660 tggtgccacc catgtgttga ctaactcgcc tttgcctcaa caggcttgtc ggcagccgtt 720 ctgtccattt gaggaggctc attctagcgt gtacaggtgg aagaaatttg tggttttcac 780 ggactcctcc ctcaacggtc gatctcgcat gatgtggacg ccggaatccg atgattcagc 840 cgccctggag gtactaccgc ctgagttaga acgtcaggtt gaaatcctca ttcggagttt 900 tcctgctcat caccctgtcg acctggccga ctgggagctc actgagtccc ctgagaacgg 960
-32tttttccttc aacacgtctc attcttgcgg tcaccttgtc caaaaccccg acgtgtttga 1020 tggcaagtgc tggctctcct gctttttggg ccagtcggcc gaagtgcgct gccatgagga 1080 acatctagct gacgccttcg gttaccaaac caagtggggc gtgcatggta agtacctcca 1140 gcgcaggctt caagttcacg gcattcgtgc tgtagtcgat cctgacggtc. ccattcacgt 1200 tgaagcgctg tcttgccccc agtcttggat caggcacctg actctgaatg atgatgtcac 1260 cccaggattc gttcgcctga catcccttcg cattgtgccg aacacagagc ctaccacttc 1320 ccggatcttt cggtttggag cgcataagtg gtatggcgct gccggcaaac gggctcgtgc 1380 taagcgtgcc gctaaaagtg agaaggattc ggctcccacc cccaaggttg ccctgcctgt 14'40 ccccacctgt ggaattacca cctactctcc accgacagac gggtcttgtg gttggcatgt 1500 ccttgccgcc ataatgaacc ggatgataaa tggtgacttc acgtcccctc tgactcagta 1560 caacagacca gaggatgatt gggcttctga ttatgatctt gttcaggcga- ttcaatgtct 1620 acaactgcct gctaccgtgg ttcggaatcg cgcctgtcct aacgccaagt accttataaa 1680 acttaacgga gttcactggg aggtagaggt gaggtctgga atggctcctc gctcccttcc 1740 tcgtgaatgt gtggttggcg tttgctctga aggctgtgtc gcaccgcctt atccagcaga 1800 cgggctacct aaacgtgcac tcgaggcctt ggcgtctgct tacagactac cctccgattg 1860 tgttagctct ggtattgctg actttcttgc taatccacct cctcaggaat tctggaccct 1920 cgacaaaatg ttgacctccc cgtcaccaga gcggtccggc ttctctagtt tgtataaatt 1980 actattagag gttgttccgc aaaaatgcgg tgccacggaa ggggctttca tctatgctgt 2040 •tgagaggatg ttgaaggatt ’gtccgagctc caaacaggcc atggcccttc tggcaäaaat 2100 taaagttcca tcctcaaagg ccccgtctgt gtccctggac gggtgtttcc ctacggatgt 2160 tccagccgac ttcgagccag catctccgga aaggccagct ggtctaatta acctggtagg 2220 cgggaatttg tccccctcag actccatgaa agaaaacatg cbcaatagac gggaagacga 2280 accactggat ttgtcccaac cagcaccagc tgccacaacg acccttgtga gagagcaaac 2340 acccgacaac ccaggttctg atgccggtgc cctccccgtc accgttcgag. aatttgtccc 2400 gacggggcct atactccgtc atgttgagca ctgcggcacg gagtcgggcg acagcagttc 2460 gcctttggac cagtctgatg cgcaaaccct •ggaccagcct ttaaatctat ccctggccgc -2520'. ttggccag.tg agggccaccg · cgtctgaccc tggctgggtc cacggtaggc gcgagččtgt 258 0: ttttgtaaag cctcgaaatg ctttctctga tggcgattca gcccttcágt tcggggägct 2640· ttctgaatcc agccctgtca tcgagtttga ccggacaaaa gatgctccgg tggttgacgc. 2700ccctgtcgac ttgacgactt cgaacgaggc cctctctgta gtcgaccctt tcgaatttgc 2760 cgaactcaag cgcccgcgtt tctccgcaca agccttaatt. gaccgaggcg gtccacttgc 2820 cgatgtccat gcgaaaataa agaaccgggt atatgaacag tgcctccaag cttgtgagcc 2880 cggtagtcgt gcaaccccag ccaccaggga gtggctcgac aaaatgtggg atagggtgga 2940 catgaaaact tggcgctgca cctcgcagtt ccaagctggt cgcattcttg cgtccctcaa 3000 attcctccct gacatgattc aagacacacc gcctcctgtt cccaggaaga accgagctag 3060 tgacaatgcc ggcctgaagc aaccggtggc acagtgggat aggaaattga gtgtgacccc 3120 ccccccaaaa ccggttgggc cagtgcttga ccagaccgtc cctccgccta cggatatcca 3180 gcaagaagat gtcaccccct ccgatgggcc accccatgcg ccggattttc ctagtcgagt 3240 gagcacgggc gggagttgga aaggccttat gctttccggc acccgtctcg cggggtctat 3300 cagtcagcgc ctcatgacat gggtttttga agttttctcc cacctcccag cttttatgct 3360 cacacttttc tcgccacggg gctctatggc tccaggtgat tggttgtttg caggtgtcgt 3420 •tttactcgct ctcttgctct gtcgttctta cccgatactc ggatgccttc ccctattggg 3480 tgtcttttct ggttctttgc ggcgtgttcg tctgggtgtt tttggttctt ggatggcttt 3540 tgctgtattt ttattctcga ctccatccaa cccagtcggt tcttcttgtg accacgattc 3600 gccggagtgt catgctgagc ttttggctct tgagcagcgc caactttggg aacctgtgcg 3660 cggccttgtg gtcggcccct‘cgggcctctt atgtgtcatt cttggcaagt tactcggtgg 3720 gtcacgttat ctctggcatg ttttcctacg tttatgcatg cttgcggatt tggccctttc 3780 tcttgtttat gtggtgtccc aggggcgttg tcacaagtgt tggggaaagt gtataaggac 3840 agctcctgcg gaggtggctc ttaatgtatt tcctttcttg cgcgccaccc gtgcctctct 3900 tgtatccttg tgtgatcgat tccaaacgcc aaaaggggtt gatcctgtgc acttggcaac 3960 gggttggcgc gggtgctggc gtggtgagag tcccattcat caaccacacc aaaagcccat 4020 agcttatgcc aatttggatg aaaagaaaat atctgctcaa acggtggttg ctgtcccata 4080 cgatcccagt caggctgtca aatgcctgaa agttctgcag gcgggagggg ctatcgtggá 4140 ccagcctaca cctgaggtcg ttcgcgtgtc cgagatcccc ttctcagccc catttttccc 4200 aaaagttcca gtcaacccag attgcagggt tgtggtagat tcggacactt· ttgtggctgc 4260 ggtccgctgc ggttactcga cagcacaact ggtcctgggc cggggcaact ttgccaagtt 4320-32tttttccttc aacacgtctc attcttgcgg tcaccttgtc caaaaccccg acgtgtttga 1020 tggcaagtgc tggctctcct gctttttggg ccagtcggcc gaagtgcgct gccatgagga 1080 acatctagct gacgccttcg gttaccaaac caagtggggc gtgcatggta agtacctcca 1140 gcgcaggctt caagttcacg gcattcgtgc tgtagtcgat cctgacggtc. ccattcacgt 1200 tgaagcgctg tcttgccccc agtcttggat caggcacctg actctgaatg atgatgtcac 1260 cccaggattc gttcgcctga catcccttcg cattgtgccg aacacagagc ctaccacttc 1320 ccggatcttt cggtttggag cgcataagtg gtatggcgct gccggcaaac gggctcgtgc 1380 taagcgtgcc gctaaaagtg agaaggattc ggctcccacc cccaaggttg ccctgcctgt 14'40 ccccacctgt ggaattacca cctactctcc accgacagac gggtcttgtg gttggcatgt 1500 ccttgccgcc ataatgaacc ggatgataaa tggtgacttc acgtcccctc tgactcagta 1560 caacagacca gaggatgatt gggcttctga ttatgatctt gttcaggcga- ttcaatgtct 1620 acaactgcct gctaccgtgg ttcggaatcg cgcctgtcct aacgccaagt accttataaa 1680 acttaacgga gttcactggg aggtagaggt gaggtctgga atggctcctc gctcccttcc 1740 tcgtgaatgt gtggttggcg tttgctctga aggctgtgtc gcaccgcctt atccagcaga 1800 cgggctacct aaacgtgcac tcgaggcctt ggcgtctgct tacagactac cctccgattg 1860 tgttagctct ggtattgctg actttcttgc taatccacct cctcaggaat tctggaccct 1920 cgacaaaatg ttgacctccc cgtcaccaga gcggtccggc ttctctagtt tgtataaatt 1980 actattagag gttgttccgc aaaaatgcgg tgccacggaa ggggctttca tcta tgctgt 2040 • tgagaggatg ttgaaggatt 'gtccgagctc caaacaggcc atggcccttc tggcaäaaat 2100 taaagttcca tcctcaaagg ccccgtctgt gtccctggac gggtgtttcc ctacggatgt 2160 tccagccgac ttcgagccag catctccgga aaggccagct ggtctaatta acctggtagg 2220 cgggaatttg tccccctcag actccatgaa agaaaacatg cbcaatagac gggaagacga 2280 accactggat ttgtcccaac cagcaccagc tgccacaacg acccttgtga gagagcaaac 2340 acccgacaac ccaggttctg atgccggtgc cctccccgtc accgttcgag. aatttgtccc 2400 gacggggcct atactccgtc atgttgagca ctgcggcacg gagtcgggcg acagcagttc 2460 gcctttggac cagtctgatg cgcaaaccct • ggaccagcct ttaaatctat ccctggccgc -2520 '. ttggccag.tg agggccaccg · cgtctgaccc tggctgggtc cacggtaggc gcgagcctgt 258 0: ttttgtaaag cctcgaaatg ctttctctga tggcgattca gcccttgcgta tcgggggggca 2700ccctgtcgac ttgacgactt cgaacgaggc cctctctgta gtcgaccctt tcgaatttgc 2760 cgaactcaag cgcccgcgtt tctccgcaca agccttaatt. gaccgaggcg gtccacttgc 2820 cgatgtccat gcgaaaataa agaaccgggt atatgaacag tgcctccaag cttgtgagcc 2880 cggtagtcgt gcaaccccag ccaccaggga gtggctcgac aaaatgtggg atagggtgga 2940 catgaaaact tggcgctgca cctcgcagtt ccaagctggt cgcattcttg cgtccctcaa 3000 attcctccct gacatgattc aagacacacc gcctcctgtt cccaggaaga accgagctag 3060 tgacaatgcc ggcctgaagc aaccggtggc acagtgggat aggaaattga gtgtgacccc 3120 ccccccaaaa ccggttgggc cagtgcttga ccagaccgtc cctccgccta cggatatcca 3180 gcaagaagat gtcaccccct ccgatgggcc accccatgcg ccggattttc ctagtcgagt 3240 gagcacgggc gggagttgga aaggccttat gctttccggc acccgtctcg cggggtctat 3300 cagtcagcgc ctcatgacat gggtttttga agttttctcc cacctcccag cttttatgct 3360 cacacttttc tcgccacggg gctctatggc tccaggtgat tggttgtttg caggtgtcgt 3420 • tttactcgct ctcttgctct gtcgttctta cccgatactc ggatgccttc ccctattggg 3480 tgtcttttct ggttctttgc ggcgtgttcg tctgggtgtt tttggttctt ggatggcttt 3540 tgctgtattt ttattctcga ctccatccaa cccagtcggt tcttcttgtg accacgattc 3600 gccggagtgt catgctgagc ttttggctct tgagcagcgc CAA ctttggg aacctgtgcg 3660 cggccttgtg gtcggcccct'cgggcctctt atgtgtcatt cttggcaagt tactcggtgg 3720 gtcacgttat ctctggcatg ttttcctacg tttatgcatg cttgcggatt tggccctttc 3780 tcttgtttat gtggtgtccc aggggcgttg tcacaagtgt tggggaaagt gtataaggac 3840 agctcctgcg gaggtggctc ttaatgtatt tcctttcttg cgcgccaccc gtgcctctct 3900 tgtatccttg tgtgatcgat tccaaacgcc aaaaggggtt gatcctgtgc acttggcaac 3960 gggttggcgc gggtgctggc gtggtgagag tcccattcat caaccacacc aaaagcccat 4020 agcttatgcc aatttggatg aaaagaaaat atctgctcaa acggtggttg ctgtcccata 4080 cgatcccagt caggctgtca aatgcctgaa agttctgcag gcgggagggg ctatcgtggá 4140 ccagcctaca cctgaggtcg ttcgcgtgtc cgagatcccc ttctcagccc catttttccc 4200 aaaagttcca gtcaacccag attgcagggt tgtggtagat tcggacactt · ttgtggctgc 4260 ggtccgctgc ggttactcga cagcacaact ggtcctgggc cggggcaact ttgccaagtt 4320
-33aaatcagacc ccccccagga actctatctc caccaaaacg actggtgggg cctcttacac 4380 ccttgctgtg gctcaagtgt ctgcgtggac tcttgttcat ttcatcctcg gtctttggtt 4440 cacatcacct caagtgtgtg gccgaggaac cgctgaccca tggtgttcaa atcctttttc 4500 atatcctacc tatggccccg gagttgtgtg ctcctctcga ctttgtgtgt ctgccgäcgg 4560 ggtcaccctg ccattgttct ’cagccgtggc acaactctcc ggtagagagg tggggatttt 4620 tattttggtg ctcgtctcct tgactgcttt ggcccaccgc atggctctta aggcagacat 4680 gttagtgatc ttttcggctt tctgtgctta cgcctggccc atgagctcct ggttaat-ctg 4740 cttctttcct atactcttga agtgggttac ccttcaccct ctcactatgc tttgggtgca 4800 ctcattcttg gtgttttgtc tgccagcagc cggcatcctc tcactaggga taactggcct 4860 tctctgggca attggccgct ttacccaggt tgccggaatt attacacctt atgacatcca 4920 ccagtacacc tctgggccac gtggtgcagc tgctgtggcc acagccccag aaggcactta 4980 .tatggacgcc gtccggagag ctgctttaac tgggcgaact ttaatcttca ccccgtictgc 5040 .agttggatcc cttctcgaag gtgctttcag gactcataaa ccctgcctta acaccgtgaa 5100 tgttgtaggc tcttcccttg gttccggagg ggttttcacc attgatggca gaagaactgt 5160 cgtcaatgct gcccatgtgt tgaacggcga cacagctaga gtcaccggcg actcctacaa 5220 ccgcatgcac actttcaaga ccaatggtga ttatgcctgg tcccatgctg atgactggca 5280 •gggcgttgcc cctgtggtca aggttgcgaa ggggtaccgc ggtcgtgcct actggcaaac 5340 atcaaatggt gtcgaacccg gtatcattgg ggaagggttc gccttctgtt ttactaáctg 5400 tggcgattcg gggtcacccg tcatctcaga atctggtgat cttattggaa tccacaccgg 5460 •ttcaaacaaa cttggttctg gtcttgtgac aacccctgaa ggggagacct gcaccatícaa 5520 •agaaaccaag ctctčtgacc.tttccagaca ttttgcaggc ccaagcgttc ctcttgggga 5580: „cattaaat.tg agtccggcca tcatccctga tgtaacatcc attccgagtg acttggcatc .5640 gctcctagcc tccgtccctg · tagtggaagg cggcctctcg accgttcaac ttttgťgtgt 5700 .ctttttcctt ctctggcgca tgatgggcca tgcctggaca cccattgttg ccgtgggctt 5760 ctttttgctg aatgaaattc· ttccagcag't · tttggtccga gccgtgtttt cttttgcact 5820. ctttgtgctt gcatgggcca ccccctggtc tgcacaggtg ttgatgatta gactcctcac 5880'· .ggcatctctc aaccgcaaca agctttctct ggcgttctac -gcactcgggg gtgtcg.tcgg ‘5940 •.tttggccgct gaaatcggga cttttgctgg cagattgtct gaattgtctc aagctdbttc. 6 0001 gacatactgc ttcttaccta gggtccttgc tatgaccagt tgtgttccca ccatcatcat 6060.cggtggactc cataccctcg gtgtgattct gtggttattc aaataccggt gcctccacaa 6120catgctggtt · ggtgatggga gtttctcaag cgccttcttc ctacggtatt ttgcagaggg 6180. taatctcaga aaaggtgttt cacagtcctg tggcatgaat aacgagtccc taacggctgc 6240 tttagcttgc aagttgtcac aggctgacct tgattttttg tccagcttaa cgaacttcaa 6300 gtgctttgta tctgcttcaa acatgaaaaa tgctgccggc cagtacattg aagcagcgta 6360 tgccaaggcc ctgcgccaag agttggcctc tctagttcag attgacaaaa tgaaaggagt 6420 tttgtccaag ctcgaggcct ttgctgaaac agccaccccg tcccttgaca taggtgacgt '6480 gattgttctg cttgggcaac atcctcacgg atccatcctc gatattaatg tggggactga 6540 aaggaaaact gtgtccgtgc aagagacccg gagcctaggc ggctccaaat tcagtgtttg 6600 tactgtcgtg tccaacacac cc'gtggacgc cttaaccggc atcccactcc agacaccaac 6660 ccctcttttt gagaatggtc cgcgtcatcg cagcgaggaa gacgatctta aagtcgagag 6720 gatgaagaaa cactgtgtat ccctcggctt ccacaacatc aatggcaaag tttactgcaa 6780 aatttgggac aagtctaccg gtgacacctt ttacacggat gattcccggt acacccaaga 6840 ccatgctttt caggacaggt cagccgacta cagagacagg gactatgagg gtgtgcaaac 6900 cgccccccaa cagggatttg atccaaagtc tgaaaccccg gttggcaccg ttgtgatcgg 6960 cggtattacg tataacaggt atctgatcaa aggtaaagag gttctggtťc ccaagcctga 7020 caactgcctt gaagctgcca agctgtccct tgagcaagct ctcgctggga tgggccaaac 7080 ttgcgacctt acagctgccg aggtggaaaa gctaaagcgc atcattagtc aactccaagg 7140 cttgaccact gaacaggctt taaactgtta gccgccagcg gcttgacccg ctgtggccgc 7200 ggcggcctag ttgtaactga aacggcggta aaaattataa aataccacag cagaactttc 7260 accttaggcc ctttagacct aaaagtcact tccgaggtgg aggtaaagaa atcaactgag 7320 cagggccacg ctgttgtggc aaacttatgt tccggtgtca tcttgatgag acctcaccca 7380 ccgtcccttg ttgacgttct tctgaaaccc ggacttgata caacacccgg cattcaacca 7440 gggcatgggg ccgggaatat gggcgtggac ggttctattt gggattttga aaccgcacc’c 7500 acaaaggcag aactcgagtt atccaagcaa ataatccaag catgtgáagt taggcgcggg 7560 gacgccccga acctccaact cccttacaag ctctatcctg ttagggggga tcctgagcgg 7620 cataaaggcc gccttatcaa caccaggttt ggagatttac cttacaaaac tcctcaagac 7680-33aaatcagacc ccccccagga actctatctc caccaaaacg actggtgggg cctcttacac 4380 ccttgctgtg gctcaagtgt ctgcgtggac tcttgttcat ttcatcctcg gtctttggtt 4440 cacatcacct caagtgtgtg gccgaggaac cgctgaccca tggtgttcaa atcctttttc 4500 atatcctacc tatggccccg gagttgtgtg ctcctctcga ctttgtgtgt ctgccgäcgg 4560 ggtcaccctg ccattgttct 'cagccgtggc acaactctcc ggtagagagg tggggatttt 4620 tattttggtg ctcgtctcct tgactgcttt ggcccaccgc atggctctta aggcagacat 4680 gttagtgatc ttttcggctt tctgtgctta cgcctggccc atgagctcct ggttaat -ctg 4740 cttctttcct atactcttga agtgggttac ccttcaccct ctcactatgc tttgggtgca 4800 ctcattcttg gtgttttgtc tgccagcagc cggcatcctc tcactaggga taactggcct 4860 tctctgggca attggccgct ttacccaggt tgccggaatt attacacctt atgacatcca 4920 ccagtacacc tctgggccac gtggtgcagc tgctgtggcc acagccccag aaggcactta 4980 .tatggacgcc gtccggagag ctgctttaac tgggcgaact ttaatcttca ccccgtictgc 5040 .agttggatcc cttctcgaag gtgctttcag gactcataaa ccctgcctta acaccgtgaa 5100 tgttgtaggc tcttcccttg gttccggagg ggttttcacc attgatggca gaagaactgt 5160 cgtcaatgct gcccatgtgt tgaacggcga cacagctaga gtcaccggcg actcctacaa 5220 ccgcatgcac actttcaaga ccaatggtga ttatgcctgg tcccatgctg atgactggca 5280 • gggcgttgcc cctgtggtca aggttgcgaa ggggtaccgc ggtcgtgcct actggcaaac 5340 atcaaatggt gtcgaacccg gtatcattgg ggaagggttc gccttctgtt ttactaáctg 5400 tggcgattcg gggtcacccg tcatctcaga atctggtgat cttattggaa tccacaccgg 5460 • ttcaaacaaa cttggttctg gtcttgtgac aacccctgaa ggggagacct gcaccatícaa 5520 • agaaaccaag ctctčtgacc.tttccagaca ttttgcaggc ccaagcgttc ctcttgggga 5580 "cattaaat.tg agtccggcca tcatccctga tgtaacatcc attccgagtg acttggcatc .5640 gctcctagcc tccgtccctg · tagtggaagg cggcctctcg accgttcaac ttttgťgtgt 5700 .ctttttcctt ctctggcgca tgatgggcca tgcctggaca cccattgttg ccgtgggctt 5760 ctttttgctg aatgaaattc ttccagcag't · · tttggtccga gccgtgtttt cttttgcact 5820. ctttgtgctt gcatgggcca ccccctggtc tgcacaggtg ttgatgatta gactcctcac 5880 '· .ggcatctctc aaccgcaaca agctttctct ggcgttctac -gcactcgggg gtgtcg.tcgg' 5940 • .tttggccgct gaaatcggga cttttg ctgg cagattgtct gaattgtctc aagctdbttc. 6 0001 gacatactgc ttcttaccta gggtccttgc tatgaccagt tgtgttccca ccatcatcat 6060.cggtggactc cataccctcg gtgtgattct gtggttattc aaataccggt gcctccacaa 6120catgctggtt · ggtgatggga gtttctcaag cgccttcttc ctacggtatt ttgcagaggg 6180. taatctcaga aaaggtgttt cacagtcctg tggcatgaat aacgagtccc taacggctgc 6240 tttagcttgc aagttgtcac aggctgacct tgattttttg tccagcttaa cgaacttcaa 6300 gtgctttgta tctgcttcaa acatgaaaaa tgctgccggc cagtacattg aagcagcgta 6360 tgccaaggcc ctgcgccaag agttggcctc tctagttcag attgacaaaa tgaaaggagt 6420 tttgtccaag ctcgaggcct ttgctgaaac agccaccccg tcccttgaca taggtgacgt '6480 gattgttctg cttgggcaac atcctcacgg atccatcctc gatattaatg tggggactga 6540 aaggaaaact gtgtccgtgc aagagacccg gagcctaggc ggctccaaat tcagtgtttg 6600 tactgtcgtg tccaacacac cc'gtggacgc cttaaccggc atcccactcc agacaccaac 6660 ccctcttttt gagaatggtc cgcgtcatcg cagcgaggaa gacgatctta aagtcgagag 6720 gatgaagaaa cactgtgtat ccctcggctt ccacaacatc aatggcaaag tttactgcaa 6780 aatttgggac aagtctaccg gtgacacctt ttacacggat gattcccggt acacccaaga 6840 ccatgctttt caggacaggt cagccgacta cagagacagg gactatgagg gtgtgcaaac 6900 cgccccccaa cagggatttg atccaaagtc tgaaaccccg gttggcaccg ttgtgatcgg 6960 cggtattacg tataacaggt atctgatcaa aggtaaagag gttctggtťc ccaagcctga 7020 caactgcctt gaagctgcca agctgtccct tgagcaagct ctcgctggga tgggccaaac 7080 ttgcgacctt acagctgccg aggtggaaaa gctaaagcgc atcattagtc aactccaagg 7140 cttgaccact gaacaggctt taaactgtta gccgccagcg gcttgacccg ctgtggccgc 7200 ggcggcctag ttgtaactga aacggcggta aaaattataa aataccacag cagaactttc 7260 accttaggcc ctttagacct aaaagtcact tccgaggtgg aggtaaagaa atcaactgag 7320 cagggccacg ctgttgtggc aaacttatgt tccggtgtca tcttgatgag acctcaccca 7380 ccgtcccttg ttgacgttct tctgaaaccc ggacttgata caacacccgg cattcaacca 7440 gggcatgggg ccgggaatat gggcgtggac ggttctattt gggattttga aaccgcacc'c 7500 acaaaggcag aactcgagtt atccaagcaa ataatccaag catgtgáagt taggcgcggg 7560 gacgccccga acctccaact cccttacaag ctctatcctg ttagggggga tcctgagcgg 7620 cataaaggcc gccttatcaa caccaggttt ggagatttac cttacaaaac tcctcaagac7680
-34accaagtccg caatccacgc ggcttgttgc ctgcacccca acggggcccc agtgtctgat 7740 ggtaaatcca cactaggtac cactcttcaa catggtttcg agctttatgt ccctactgtg 7800 ccctatagtg tcatggagta ccttgattca cgccctgaca ccccttttat gtgtactaaa 7860 catggcactt ccaaggctgc tgcagaggac ctccaaaaat acgacctatc cacccaagga 7920 tttgtcctgc ctggggtcct acgcctagta cgcagattca tctttggcca tattggtaag 7980 gcgccgccat tgttcctccc atcaacttat cccgccaaga actctatggc agggatcaat 8040 ggccagaggt tcccaacaaa ggacgttcag agcatacctg aaattgatga aatgtgtgcc 8100 cgcgccgtca aggagaattg gcaaactgtg acaccttgta ccctcaagaa acagtactgt 81'60 tccaagccca aaaccaggac catcctgggc accaacaact ttattgcctt ggctcacaga 8220 tcggcgctca gtggtgtcac ccaggcattc atgaagaagg cttggaagtc cccaattgcc 8280 ttggggaaaa acaaattcaa ggagctgcat tgcactgtcg ccggcagatg tcttgaggcc 8340' gacttggcct cctgtgaccg cagcaccccc gccattgtaa gatggtttgt tgccaacctc 8400 ctgtatgaac ttgcaggatg tgaagagtac ttgcctagct atgtgcttaa ttgctgccat 8460 gacctcgtgg caacacagga tggtgccttc acaaaacgcg gtggcctgtc gtccggggac 8520 cccgtcacca gtgtgtccaa caccgtatat tcactggtaa tttatgccca gcacatggta 8580 ttgtcggcct tgaaaatggg tcatgaaatt ggtcttaagt tcctcgagga acagctcaaa 8640 ttcgaggacc tccttgaaat tcagcctatg ttggtatact ctgatgacct tgtcttgtac 8700 gctgaaagac ccacct-ttcc caattaccac tggtgggtcg agcaccttga cctgatgctg 87.60 ggtttcagaa·cggacccaaa gaaaaccgtc ataactgata aacccagctt cctcggctgc 8820 .agaattgagg cagggcgaca gctagtcccc -aatcgcgacc gcatcctggc tgctcttgca 8880tatcacatga aggcgcagaa cgcctcagag tattatgcgt ctgctgccgc aatcctgatg·894Ό' -gattcatgtg-cttgcattga ccatgaccct gagtggtatg aggacctcat ctgcggtatt -9000> gcccggtgcg cccgccagga tggttatagc ttcccaggtc cggcattttt catgtccatg '9060 •.tgggagaagc tgagaagtca taatgaaggg aagaagttcc gccactgcgg catctgcgac 9120.-34accaagtccg caatccacgc ggcttgttgc ctgcacccca acggggcccc agtgtctgat 7740 ggtaaatcca cactaggtac cactcttcaa catggtttcg agctttatgt ccctactgtg 7800 ccctatagtg tcatggagta ccttgattca cgccctgaca ccccttttat gtgtactaaa 7860 catggcactt ccaaggctgc tgcagaggac ctccaaaaat acgacctatc cacccaagga 7920 tttgtcctgc ctggggtcct acgcctagta cgcagattca tctttggcca tattggtaag 7980 gcgccgccat tgttcctccc atcaacttat cccgccaaga actctatggc agggatcaat 8040 ggccagaggt tcccaacaaa ggacgttcag agcatacctg aaattgatga aatgtgtgcc 8100 cgcgccgtca aggagaattg gcaaactgtg acaccttgta ccctcaagaa acagtactgt 81'60 tccaagccca aaaccaggac catcctgggc accaacaact ttattgcctt ggctcacaga 8220 tcggcgctca gtggtgtcac ccaggcattc atgaagaagg cttggaagtc cccaattgcc 8280 ttggggaaaa acaaattcaa ggagctgcat tgcactgtcg ccggcagatg tcttgaggcc 8340 'gacttggcct cctgtgaccg cagcaccccc gccattgtaa gatggtttgt tgccaacctc 8400 ctgtatgaac ttgcaggatg tgaagagtac ttgcctagct atgtgcttaa ttgctgccat 8460 gacctcgtgg caacacagga tggtgccttc acaaaacgcg gtggcctgtc gtccggggac 8520 c ccgtcacca gtgtgtccaa caccgtatat tcactggtaa tttatgccca gcacatggta 8580 ttgtcggcct tgaaaatggg tcatgaaatt ggtcttaagt tcctcgagga acagctcaaa 8640 ttcgaggacc tccttgaaat tcagcctatg ttggtatact ctgatgacct tgtcttgtac 8700 gctgaaagac CCACC-TCCA caattaccac tggtgggtcg agcaccttga cctgatgctg 87.60 ggtttcagaa · cggacccaaa gaaaaccgtc ataactgata aacccagctt cctcggctgc 8820 .agaattgagg cagggcgaca gctagtcccc -aatcgcgacc gcatcctggc tgctcttgca 8880tatcacatga aggcgcagaa cgcctcagag tattatgcgt ctgctgccgc aatcctgatg · 894Ό '-gattcatgtg -cttgcattga ccatgaccct gagtggtatg aggacctcat ctgcggtatt -9000> gcccggtgcg
gccaaagc.cg actatgcgtc cgcctgtggg cttgatttgt gtttgttcca ttcgcacttt 9180' • catcaacact-gccctgtcac tctgagctgc -ggtcaccatg ccggttcaaa ggaatgttcg 9240· •cagtgtcagt c.acctgttgg ggctggcaga tcacctcttg atgccgtgct aaaacaaatt 9300;gccaaagc.cg actatgcgtc cgcctgtggg cttgatttgt gtttgttcca ttcgcacttt 9180 '• catcaacact-gccctgtcac tctgagctgc -ggtcaccatg ccggttcaaa ggaatgttcg 9240 · • cagtgtctccc;
ccatacaaac ctcctcgcac tgtcatcatg aaggtgggta ataaaacaac- ggccctcgat· .9360 · ccggggaggt •accagtcccg tcgaggtctc gttgcagtca agaggggtat tgcaggcaat -94-2-0’ gaagttgatc tttctgatgg agactaccaa gtggtgcctc ttttgccgac ttgcaaagac 9480.· .ataaaaatgg tgaaggtggc ttgcaatgta ctactcagca agttcatagt agggccacca 9540;ccatacaaac ctcctcgcac tgtcatcatg aaggtgggta ataaaacaac- ggccctcgat .9360 · · ccggggaggt • accagtcccg tcgaggtctc gttgcagtca agaggggtat tgcaggcaat -94-2-0 'gaagttgatc tttctgatgg agactaccaa gtggtgcctc ttttgccgac ttgcaaagac 9480. · .ataaaaatgg tgaaggtggc ttgcaatgta ctactcagca agttcatagt agggccacca 9540;
ggttcaggaa agaccacctg gctactgagt caagtccagg acgatgatgt catttacaca 9600cccacccatc. -agactatgtt tgatatagtc agtgctctca aagtttgcag gtattccgtt 9660 ccaggagcct caggactccc tttcccacca cctgccaggt ccgggccgtg ggttaggctt 9720 attgccagcg ggcacgtccc tggccgagta tcatacctcg atgaggctgg atattgtaat 9780 catctggaca -ttcttagact gctttccaaa acaccccttg tgtgtttggg tgaccttcag 984Ó caacttcacc ctgtcggctt tgattcctrc tgttatgtgt tcgatcagat gcctcagaag 9900 cagctgacca ctatttacag atttggccct aacatttgcg cagccatcca gccttgttac 9960 agggaaaaac ttgaatctaa ggctaggaac accagggtgg tttttaccac ccggcctgtg 10020 gcctttggtc aggtgctgac accataccat aaagatcgca tcggctctgc gataaccata 10080 gattcatccc agggggccac ctttgatatt gtgacattgc atctaccatc gccaaagtcc 10140 ctaaataaat cccgagcact tgtagccatc actcgggcaa gacacgggtt gttcatttat 10200 gaccctcata accagctcca ggagtttttc aatctaaccc ctgagcgcac tgattgtaac 10260 cttgtgttca gctgtgggga tgagctggta gttctgaatg cggataatgc agtcacaact 10320 gtagcgaagg ccctagagac aggtccatct cgatttcgag tatcagaccc gaggtgcaag 10380 tctctcttag ccgcttgttc ggccagtctg gaagggagct gtatgccact accgcaagtg 10440 gcacataacc tggggtttta cttttccccg gacagtccag tatttgcacc tctgccaaaa 10500 gagttggcgc cacattggcc agtggttacc caccagaaca atcgggcgtg gcctgatcga 10560 cttgtcgcta gtatgcgccc aattgatgcc cgctacagca agccaatggt cggtgcaggg 10620 •tatgtggtcg ggccgtccac ctttcttggt actcctggcg tggtgtcata ctatctcaca 10680 ctatacatca ggggtgaacc tcaggccttg ccagaaacac tcgtttcaac aggacgtata 10740 gccacagatt gtcgggagta tctcgacgcg gctgaggaag aggcagcaaa agaactcccc 10800 cacgcattca ttggcgatgt caaaggtacc acggtggggg ggtgtcatca cattacatca 10860 aaatacctac ctaggtccct gcctaaggac tctgttgccg tagttggagt aagttcgccc 10920 ggcagggctg ctaaagccgt gtgcactctc accgatgtgt acctccccga actccggcca 10980 tatctgcaac ctgagacggc atcaaaatgc tggaaactca aattagactt cagggacgtc 11040ggttcaggaa agaccacctg gctactgagt caagtccagg acgatgatgt catttacaca 9600cccacccatc. -agactatgtt tgatatagtc agtgctctca aagtttgcag gtattccgtt 9660 ccaggagcct caggactccc tttcccacca cctgccaggt ccgggccgtg ggttaggctt 9720 attgccagcg ggcacgtccc tggccgagta tcatacctcg atgaggctgg atattgtaat 9780 catctggaca -ttcttagact gctttccaaa acaccccttg tgtgtttggg tgaccttcag 984Ó caacttcacc ctgtcggctt tgattcctrc tgttatgtgt tcgatcagat gcctcagaag 9900 cagctgacca ctatttacag atttggccct aacatttgcg cagccatcca gccttgttac 9960 agggaaaaac ttgaatctaa ggctaggaac accagggtgg tttttaccac ccggcctgtg 10020 gcctttggtc aggtgctgac accataccat aaagatcgca tcggctctgc gataaccata 10080 gattcatccc agggggccac ctttgatatt gtgacattgc atctaccatc gccaaagtcc 10140 ctaaataaat cccgagcact tgtagccatc actcgggcaa gacacgggtt gttcatttat 10200 gaccctcata accagctcca ggagtttttc aatctaaccc ctgagcgcac tgattgtaac 10260 cttgtgttca gctgtgggga tgagctggta gttctgaatg cggataatgc agtcacaact 10320 gtagcgaagg ccctagagac aggtccatct cgatttcgag tatcagaccc gaggtgcaag 10380 tctctcttag ccgcttgttc ggccagtctg gaagggagct gtatgccact accgcaagtg 10440 GCAC AACC tggggtttta cttttccccg gacagtccag tatttgcacc tctgccaaaa 10500 gagttggcgc cacattggcc agtggttacc caccagaaca atcgggcgtg gcctgatcga 10560 cttgtcgcta gtatgcgccc aattgatgcc cgctacagca agccaatggt cggtgcaggg 10620 • tatgtggtcg ggccgtccac ctttcttggt actcctggcg tggtgtcata ctatctcaca 10680 ctatacatca ggggtgaacc tcaggccttg ccagaaacac tcgtttcaac aggacgtata 10740 gccacagatt gtcgggagta tctcgacgcg gctgaggaag aggcagcaaa agaactcccc 10800 cacgcattca ttggcgatgt caaaggtacc acggtggggg ggtgtcatca cattacatca 10860 aaatacctac ctaggtccct gcctaaggac tctgttgccg tagttggagt aagttcgccc 10920 ggcagggctg ctaaagccgt gtgcactctc accgatgtgt acctccccga actccggcca 10980 tatctgcaac ctgagacggc atcaaatactc
-35cgactaatgg tctggaaagg agccaccgcc tatttccagt tggaagggct tacatggtcg 11100 gcgctgcccg actatgccag gtttattcag ctgcccaagg atgccgttgt atacatetgat 11160 ccgtgtatag gaccggaaac agccaaccgt aaggtcgtgc gaaccacaga ctggcgggcc 112-2 0 gacctagcag tgacaccgta tgattacggc gcccagaaca ttttgacaac agcctggttc 11280 gaggacctcg ggccgcagtg gaagattttg gggttacagc cctttaggcg agcatttggc 11340 tttgaaaaca ctgaggattg ggcaatcctt gcacgccgta tgaatgacgg caaggactac 11400 actgactata actggaactg tgttcgagaa cgcccacacg ccatctacgg gcgtgctcgt 11460 gaccatacgt atcattttgc ccctggcaca gaattgcagg tagagctagg taaaccccgg 11520 ctgccgcctg ggcaagtgcc _gtgaa.ttcgg agtgatgcaa tggggttact gtggagtaaa 11580 atcagccagc tgttcgtgga cgccttcact gagttccttg ttagtgtggt tgatattgtt 11640 attttccttg ccateactgtt tgggttcacc gtcgcaggat ggttactggt cttccttctc 11700 agagtggttt- gctccgcgct tctccgttcg cgctctgcca ttcactctcc cgaactatcg 11760 aaggtcctat gaaggcttgt tgcccaactg cagaccggat gtcccacaat ttgcattcaa 11820 gcacccattg ggtatgcttt ggcacatgcg agtttccaaa ttaattgatg agatggtctc 11880 tcgtcgcatt taccagacca tggaacattc aggtcaagcg gcctggaagc aggcggttgg 11940 .tgaggccact ctcacgaagc tgtcaaggct cgatatagtt actcatttcc aacacdtggc 12000 cgcagtagag gcggattctt 'gccgctttct cagctcacga ctcgtgatgc taaaaaatct 12060 .tgccgttggc aatgtgagcc tacagtacaa caccacgttg gaccgcgttg agctcatctt 12120 ccccacgcca ggtacgaggc ccaagttgac cgacttcaga caatggctca tcagtgtgca 12180 -.cgcttccatt ttttcctctg tggcttcatc tgttaccttg ttcatagtgc tttggcttcg 12240 taattccagct ctacgctatg tttttggttt ccattggccc .acggcaacac atcattcgag 12300 ctgaccatpa-actacaccat atgcatgccc tgttctacca gt.caagcggc tcgccaaagg 12360 ctcgagcccg gtcgtaacat gtggtgcaaa atagggtatg -acaggtgtga ggagcgtgac 12420 •catgatgagt .tgttaatgcc. catcccgtcc gggtacgaca. acctcaaact· tgagggttat. 12480. •tatgcttggc tggctttttt gtccttttcc tacgcggccc -aattccatcc ggagttgttc -12540 gggataggga- -atgtgtcgcg cgtcttcgtg gacaagcgac. accagttcat ttgtgccgag 12600 •catgatggac. agaattcaac cgtatctacc ggacacaaca’.tctccgcatt atatgcggca 12660 :.tattaccacc-:accaaataga cgggggcaat tggttccatt' bggaatggct gcggccactc- 12720 •ttttcctcct ggctggtgct · caatatatca tggtttctga-.ggcgttcgcc tgtaagccct 12780 -.gtttctcgac igcatc.tatca gatattgaga ccaacacgac cg.cggctgcc ggtt.tcatgg 1284 0 .tccttcagga catcaattgt -ctccgacctc acggggtctc agcagcgcaa gaggaaattc 12900 ,-ccttcggaaa gtcgtcccaa .tgtcgtgaag ccgtcggtac tccccagtac atcacgataa 12960 ícggctaacgt gaccgacgaa tcatacttgt acaacgcgga cttgctgatg ctttctgcgt 13020 gcctttt.cca cgcctcagaa atgagcgaga aaggcttcaa agttatcttt gggaatgtct 13 0-80 zctggcgttgt ttccgcttgt gtcaatttca cagattatgt ggcccatgtg acccaacata 13140 -.cccagcagca tcatttggta -attgatcaca ttcggttgct gcatttcctg acaccatctg 13200 caatgaggtg ggctacaacc·attgcttgtt tgttcgccat tctcttggcg atatgagatg 13260 ttctcacaaa ttggggcgtt tcttgactcc gcactcttgc ttctggtggt tttttttgct 13320 gtgtaccggc ttgtcctggt cctttgccga tggcaacggc aacagctcga cataccaata 13380 .catatataac ttgacgatat gcgagctgaa tgggaccgac tggttgtcca gccattttgg 13440 ttgggcagtc gagacctttg tgttttaccc ggttgccact catatcctct cactgggttt 13500 tctcacaaca agccattttt ttgacgcgct cggtctcggc gctgtatcca ctgcaggatt 13560 tSttSSCSgS cggtatgtac tctgcagcgt ctacggcgct tgtgctttcg cagcgttcgt 13620 atgttttgtc atccgtgctg ctaaaaattg catggcctgc cgctatgccc gtacccggtt 13680 taccaacttc attgtagaca accgggggag agttcatcga tggaagtctc caatagtggt 13740 agaaaaattg ggcaaagccg aagtcgacgg caacctcgtc accatcaaac atgtcgtcct 13800 cgaaggggtt aaagctcaac ccttgacgag gacttcggct gagcaatggg aggcctagac 13860 gatttttgca acgat-cctat cgccgcacaa aagctcgtgc tagcctttag catcacatac 13920 acacctataa tgatatacgc ccttaaggtg tcacgcggcc gactcctggg gctgttgcac 13980 atcctaatat ttctgaactg ttcctttaca ttcggataca tgacatatgt gcattttcaa 14040 •tccaccaacc gtgtcgcact taccctgggg gctgttgtcg cccttctgtg gggtgtttac 14100 agcttcacag aatcatggaa gtttatcact tccagatgca gattgtgttg ccttggccgg 14160 cgatacattc tggcccctgc ccatcacgta gaaagtgctg caggtctcca ttcaatctča 14220 gcgtctggta accgagcata cgctgtgaga aagcccggac taacatcagt gaacggcact 14280 ctagtaccag gacttcggag cctcgtgctg ggcggcaaac gagctgttaa acgaggagtg 14340 gttaacctcg tcaagtatgg ccggtaaaaa ccagagccag aagaaaaaga aaagtacagc 14400-35cgactaatgg tctggaaagg agccaccgcc tatttccagt tggaagggct tacatggtcg 11100 gcgctgcccg actatgccag gtttattcag ctgcccaagg atgccgttgt atacatetgat 11160 ccgtgtatag gaccggaaac agccaaccgt aaggtcgtgc gaaccacaga ctggcgggcc 112-2 0 gacctagcag tgacaccgta tgattacggc gcccagaaca ttttgacaac agcctggttc 11280 gaggacctcg ggccgcagtg gaagattttg gggttacagc cctttaggcg agcatttggc 11340 tttgaaaaca ctgaggattg ggcaatcctt gcacgccgta tgaatgacgg caaggactac 11400 actgactata actggaactg tgttcgagaa cgcccacacg ccatctacgg gcgtgctcgt 11460 gaccatacgt atcattttgc ccctggcaca gaattgcagg tagagctagg taaaccccgg 11520 ctgccgcctg ggcaagtgcc _gtgaa.ttcgg agtgatgcaa tggggttact gtggagtaaa 11580 atcagccagc tgttcgtgga cgccttcact gagttccttg ttagtgtggt tgatattgtt 11640 attttccttg ccateactgtt tgggttcacc gtcgcaggat ggttactggt cttccttctc 11700 agagtggttt- gctccgcgct tctccgttcg cgctctgcca ttcactctcc cgaactatcg 11760 aaggtcctat gaaggcttgt tgcccaactg cagaccggat gtcccacaat ttgcattcaa 11820 gcacccattg ggtatgcttt ggcacatgcg agtttccaaa ttaattgatg agatggtctc 11880 tcgtcgcatt taccagacca tggaacattc aggtcaagcg gcctggaagc aggcggttgg 11940 .tgaggccact ctcacgaagc tgtcaaggct cgatatagtt actcatttcc aacacdtggc 12000 cgcagtagag gcggattctt 'gccgctttct cagctcacga ctcgtgatgc taaaaaatct 12060 .tgccgttggc aatgtgagcc tacagtacaa caccacgttg gaccgcgttg agctcatctt 12120 ccccacgcca ggtacgaggc ccaagttgac cgacttcaga caatggctca tcagtgtgca 12180 -.cgcttccatt ttttcctctg tggcttcatc tgttaccttg ttcatagtgc tttggcttcg 12240 taattccagct ctacgctatg tttttggttt ccattggccc .acggcaacac atcattcgag 12300 ctgaccatpa-actacaccat atgcatgccc tgttctacca gt.caagcggc tcgccaaagg 12360 ctcgagcccg gtcgtaacat catcccgtcc gggtacgaca. acctcaaact · tgagggttat. 12480. • tatgcttggc tggctttttt gtccttttcc tacgcggccc -aattccatcc ggagttgttc -12540 gggataggga- -atgtgtcgcg cgtcttcgtg gacaagcgac. accagttcat ttgtgccgag 12600 • catgatggac. agaattcaac cgtatctacc ggacacaaca'.tctccgcatt atatgcggca 12660: .tattaccacc-: accaaataga cgggggcaat tggttccatt 'bggaatggct gcggccactc- 12720 • ttttcctcct ggctggtgct · caatatatca tggtttctga-.ggcgttcgcc tgtaagccct 12780 -.gtttctcgac igcatc.tatca gatattgaga ccaacacgac cg.cggctgcc ggtt.tcatgg 1284 0 .tccttcagga catcaattgt -ctccgacctc acggggtctc agcagcgcaa gaggaaattc 12900, -ccttcggaaa gtcgtcccaa .tgtcgtgaag ccgtcggtac tccccagtac atcacgataa 12960 ícggctaacgt gaccgacgaa tcatacttgt acaacgcgga cttgctgatg ctttctgcgt 13020 gcctttt.cca cgcctcagaa atgagcgaga aaggcttcaa agttatcttt gggaatgtct 13 0-80 zctggcgttgt ttccgcttgt gtcaatttca cagattatgt ggcccatgtg acccaacata 13140 -.cccagcagca tcatttggta -attgatcaca ttcggttgct gcatttcctg acaccatctg 13200 caatgaggtg ggctacaacc · attgcttgtt tgttcgccat tctcttggcg atatgagatg 13260 ttctcacaaa ttggggcgtt tcttgactcc gcactcttgc ttctggtggt tttttttgct 13320 gtgtaccggc ttgtcctggt cctttgccga tggcaacggc aacagctcga cataccaata 13380 .catatataac ttgacgatat gcgagctgaa tggg accgac tggttgtcca gccattttgg 13440 ttgggcagtc gagacctttg tgttttaccc ggttgccact catatcctct cactgggttt 13500 tctcacaaca agccattttt ttgacgcgct cggtctcggc gctgtatcca ctgcaggatt 13560 tSttSSCSgS cggtatgtac tctgcagcgt ctacggcgct tgtgctttcg cagcgttcgt 13620 atgttttgtc atccgtgctg ctaaaaattg catggcctgc cgctatgccc gtacccggtt 13680 taccaacttc attgtagaca accgggggag agttcatcga tggaagtctc caatagtggt 13740 agaaaaattg ggcaaagccg aagtcgacgg caacctcgtc accatcaaac atgtcgtcct 13800 cgaaggggtt aaagctcaac ccttgacgag gacttcggct gagcaatggg aggcctagac 13860 gatttttgca acgat-CCTA cgccgcacaa aagctcgtgc tagcctttag catcacatac 13920 acacctataa tgatatacgc ccttaaggtg tcacgcggcc gactcctggg gctgttgcac 13980 atcctaatat ttctgaactg ttcctttaca ttcggataca tgacatatgt gcattttcaa 14040 • tccaccaacc gtgtcgcact taccctgggg gctgttgtcg cccttctgtg gggtgtttac 14100 agcttcacag aatcatggaa gtttatcact tccagatgca gattgtgttg ccttggccgg 14160 cgatacattc tggcccctgc ccatcacgta gaaagtgctg caggtctcca ttcaatctča 14220 gcgtctggta accgagcata cg ctgtgaga aagcccggac taacatcagt gaacggcact 14280 ctagtaccag gacttcggag cctcgtgctg ggcggcaaac gagctgttaa acgaggagtg 14340 gttaacctcg tcaagtatgg ccggtaaaaa ccagagagag aagaa
-36tccgatgggg aatggccagc cagtcaatca actgtgccag ttgctgggtg caatgataaa 14460 .gtcccagcgc cagcaaccta ggggaggaca ggccaaaaag aaaaagcctg agaagccaca 14520 .ttttcccctg gctgctgaag atgacatccg gcaccacctc acccagactg aacgctccct 14580 ctgcttgcaa tcgatccaga cggctttcaa tcaaggcgca ggaactgcgt cgctttcatc 14640 cagcgggaag gtcagttttc aggttgagtt tatgctgccg gttgctcata cagtgcgcct 14700 gattcgcgtg acttctacat ccgccagtca gggtgcaagt taatttgaca gtcaggtgaa 14760 •tggccgcgat tggcgtgtgg cctctgagtc acctattcaa ttagggcggt catag 14815 <210>6 <211> 750 <212> DNA <213> PRRS vírus <400> 6-36tccgatgggg aatggccagc cagtcaatca actgtgccag ttgctgggtg caatgataaa 14460 .gtcccagcgc cagcaaccta ggggaggaca ggccaaaaag aaaaagcctg agaagccaca 14520 .ttttcccctg gctgctgaag atgacatccg gcaccacctc acccagactg aacgctccct 14580 ctgcttgcaa tcgatccaga cggctttcaa tcaaggcgca ggaactgcgt cgctttcatc 14640 cagcgggaag gtcagttttc aggttgagtt tatgctgccg gttgctcata cagtgcgcct 14700 gattcgcgtg acttctacat ccgccagtca gggtgcaagt taatttgaca gtcaggtgaa 14760 • tggccgcgat tggcgtgtgg cctctgagtc acctattcaa ttagggcggt catag 14815 <210> 6 <211> 750 <212> DNA <213> PRRS virus <400> 6
•.atgcaatggg gtcactgtgg agtaaaatca gccagctgtt cgtggacgcc ttcactgagt · 60. ’tccttgttag tgtggttgat. attgccattt· tccttgccat actgtttggg ttcaccgtcg 12.0. caggatggtt actggtcttt cttctcagag tggtttgctc cgcgcttctc cgttcgcgct -180' ctgccatt.ca ctcteccgaa ctatcgaagg tcatatgaag gc.ttgttgcc 'caactgcaga 240 ccggatgtcc cacaätttgc agtcaagcac ccattgggya ’tgttttggca catgcgagtt 3 00· •tcccacttga ttgatgagat ggtctctcgt cgcatttacc agaccatgga acattcaggt· 360 .caagcggcct ggaagcaggt ggttggtgag gccactctca cgaagctgtc agggctcgat 42.0 atagttactc- atttecaaca catggccgca gtggaggcgg attcttgccg ctttctcagc ·480 tcacgactcg tgatgctaaa aaatcttgcc gttggcaatg tgagcctaca-gtacaacacc 540 .acgttggacc · gcgttgagct catcttcccc acgccaggta cgaggcccaa gttgaccgat .600. ..ttcagacaat. ggctcatcag tgtgcacgct tccatttttt cctctgtggc ttcatctgtt 660accttgttca tagfcgctttg gcttcgaatt ccagctctac gctatgtttt· tggtttccat 720 tggcccacgg caaca.catca-'btcgagctga 750· <210> 7 <211> 798 <212> DNA <213> PRRS vírus <400> 7 atggctcatc agtgtgcacg cttccatttt ttcctctgtg gcttcatctg ttaccttgtt 60 catagtgctt tggcttcgaa ttccagctct acgctatgtt tttggtttcc attggcccac 120 ggcaacacat cattcgagct gaccatcaac tacaccatat gcatgccctg ttctaccagt 180 caagcggctc gccaaaggct cgagcccggt catagcatgt ggtgcaaaat agggcatgac 240 aggtgtgagg agcgtgacca tgatgagttg ttaatgccca tcccgtccgg gtacgacaac 300 ctcaaacttg agggttatta tgcttggctg gcttttttgt ccttttccta’ cgcggcccaa 360 ttccatccgg agttgttcgg gatagggaat gtgtcgcgcg tcttcgtgga caagcgacac 420 cagttcattt gtgccgagca tgatggacac aattcaaccg tgtctaccgg acacaacatc 480 tccgcattat atgcggcata ttaccaccac caaatagacg ggggcaattg gttccatttg 540 gaatggctgc ggccactctt ttcttcctgg ctggtgctca acatatcatg gtttctgagg 600 cgttcgcctg taagccctgt ttctcgacgc atctatcaga tattaagacc aacacgaccg 660 cggctgccgg tttcatggtc cttcaggaca tcaattgttt ccgacctcac ggggtctcag 720 cagcgcaaga gaaaatttcc ttcggaaagt cgtcccaatg tcgtgaagcc gtcggtactc 780 cccagtacat cacgataa 798 <210> 8 <211 >552 <212> DNA <213> PRRS vírus• .atgcaatggg gtcactgtgg agtaaaatca gccagctgtt cgtggacgcc ttcactgagt · 60's tccttgttag tgtggttgat. attgccattt · tccttgccat actgtttggg ttcaccgtcg 12.0. caggatggtt actggtcttt cttctcagag tggtttgctc cgcgcttctc cgttcgcgct -180 'ctgccatt.ca ctcteccgaa ctatcgaagg tcatatgaag gc.ttgttgcc' caactgcaga 240 ccggatgtcc cacaätttgc agtcaagcac ccattgggya 'tgttttggca catgcgagtt 3 00 • • tcccacttga ttgatgagat ggtctctcgt cgcatttacc agaccatgga acattcaggt · 360 .caagcggcct ggaagcaggt ggttggtgag gccactctca cgaagctgtc agggctcgat 42.0 atagttactc- atttecaaca catggccgca gtggaggcgg attcttgccg ctttctcagc · 480 tcacgactcg tgatgctaaa aaatcttgcc gttggcaatg tgagcctaca-gtacaacacc 540 .acgttggacc · gcgttgagct catcttcccc acgggcccc. ..ttcagacaat. ggctcatcag tgtgcacgct tccatttttt cctctgtggc ttcatctgtt 660accttgttca tagfcgctttg gcttcgaatt ccagctctac gctatgtttt · tggtttccat 720 tggcccacgg caaca.catca-'btcgagctga · 750 <210> 7 <211> 798 <212> DNA <213> PRRS virus <400> 7 atggctcatc agtgtgcacg cttccatttt ttcctctgtg gcttcatctg ttaccttgtt 60 catagtgctt tggcttcgaa ttccagctct acgctatgtt tttggtttcc attggcccac 120 ggcaacacat cattcgagct gaccatcaac tacaccatat gcatgccctg ttctaccagt 180 caagcggctc gccaaaggct cgagcccggt catagcatgt ggtgcaaaat agggcatgac 240 aggtgtgagg agcgtgacca tgatgagttg ttaatgccca tcccgtccgg gtacgacaac 300 ctcaaacttg agggttatta tgcttggctg gcttttttgt ccttttccta 'cgcggcccaa 360 ttccatccgg agttgttcgg gatagggaat gtgtcgcgcg tcttcgtgga caagcgacac 420 cagttcattt gtgccgagca tgatggacac aattcaaccg tgtctaccgg acacaacatc 480 tccgcattat atgcggcata ttaccaccac caaatagacg ggggcaattg gttccatttg 540 gaatggctgc ggccactctt ttcttcctgg ctggtgctca acatatcatg gtttctgagg 600 cgttcgcctg taagccctgt ttctgcagac gctgccgg tttcatggtc cttcaggaca tcaattgttt ccgacctcac ggggtctcag 720 cagcgcaaga gaaaatttcc ttcggaaagt cgtcccaatg tcgtgaagcc gtcggtactc 780 cccagtacat cacgataa 798 <210>
-37<400> 8 atggctgcgg ccactctttt cttcctggct ggtgctcaac atatcatggt ttctgaggcg 60 ttcgcctgta agccctgttt ctcgacgcat ctatcagata ttaagaccaa- cacgaccgcg 120 gctgccggtt tcatggtcct tcaggacatc aattgtttcc gacctcacgg ggtctcagca 1.80 gcgcaagaga aaatttcctt cggaaagtcg tcccaatgtc gtgaagccgt cggtactccc 240 cagtacatca cgataacggc taacgtgacc gacgaatcat acttgtacaa cgcggacctg 300 ctgatgcttt ctgcgtgcct tttctacgcc tcagaaatga gcgagaaagg cttcaaagtc 360 atctttggga atgtctctgg cgttgtttct gcttgtgtca atttcacaga ttatgtggcc 420 catgtgaccc aacataccca gcagcatcat ctggtagttg atcacattcg gttgctgcat 480 ttcctgacac catctgcaat gaggtgggct acaaccattg cttgtttgct cgccaťtctc 540 ttggcnatat ga 552 <210> 9 <211>606 <212> DNA <213> PRRS vírus <400> 9 atgagatgtt ctcacaaatt ggggcgttccttgactccgc actcttgctt- ctggtggctt 60 tttttgctgt· gtaccggctt gtcctggtcc .tttgccgatg gcaacggcga·cagctogaca 120taccaataca tatatgactt gacgatatgc gagctgaatg ggaccgactg gttgtccagc 180 cattttggtt·gggcagtcga gacctttgtg·ttttacccgg ttgccactca tatcctctca 240. ictgggttttc ..tcacaacaag ccattttttt gacgcgctcg gtctcggcgc tgtatccact 300 gcaggatttg· ttggcgggcg gtacgtactc tgcagcgtct acggcgcttg tgctttcgca 360 gcgttcgtat gttttgtcat ccgtgctgct aaaaattgca tggcctgccg ctatgcccgt 420 acccggttta ccaacttcat tgtggacgaocgggggagag ttcatcgatg gaagtctcca 480 atagtggtag aaaaattggg caaagccgaa gtcgatggca acctcgtcac catcaaacat 540 gtcgtcctcg aaggggttaa agctcaaccc ttgacgagga cttcggctga gcaatgggag 600 gcctag 606 <210> 10 <211> 2396 <212> PRT <213> PRRS vírus-37 <400> 8 atggctgcgg ccactctttt cttcctggct ggtgctcaac atatcatggt ttctgaggcg 60 ttcgcctgta agccctgttt ctcgacgcat ctatcagata ttaagaccaa- cacgaccgcg 120 gctgccggtt tcatggtcct tcaggacatc aattgtttcc gacctcacgg ggtctcagca 1.80 gcgcaagaga aaatttcctt cggaaagtcg tcccaatgtc gtgaagccgt cggtactccc 240 cagtacatca cgataacggc taacgtgacc gacgaatcat acttgtacaa cgcggacctg 300 ctgatgcttt ctgcgtgcct tttctacgcc tcagaaatga gcgagaaagg cttcaaagtc 360 atctttggga atgtctctgg cgttgtttct gcttgtgtca atttcacaga ttatgtggcc 420 catgtgaccc aacataccca gcagcatcat ctggtagttg atcacattcg gttgctgcat 480 ttcctgacac catctgcaat gaggtgggct acaaccattg cttgtttgct cgccaťtctc ttggcnatat 540 g, 552 <210> 9 <211> 606 <212> DNA <213> PRRS virus <400> 9 atgagatgtt ctcacaaatt ggggcgttccttgactccgc actcttgctt- ctggtggctt 60 tttttgctgt · gtaccggctt gtcctggtcc ctgggttttc ..tcacaacaag ccattttttt gacgcgctcg gtctcggcgc tgtatccact 300 gcaggatttg · ttggcgggcg gtacgtactc tgcagcgtct acggcgcttg tgctttcgca 360 gcgttcgtat gttttgtcat ccgtgctgct aaaaattgca tggcctgccg ctatgcccgt 420 acccggttta ccaacttcat tgtggacgaocgggggagag ttcatcgatg gaagtctcca 480 atagtggtag aaaaattggg caaagccgaa gtcgatggca acctcgtcac catcaaacat 540 gtcgtcctcg aaggggttaa agctcaaccc ttgacgagga cttcggctga gcaatgggag gcctag 600 606 <210> 10 <211> 2396 <212> PRT <213> PRRS virus
370 375 380370 375 380
Gly Ala Ala Gly Lys Arg Ala Arg Ala Lys Arg Ala Ala Lys Ser GluGly Ala Ala Gly Lys Arg
675 680 685675 680 685
965 970 975965 970 975
Glu Trp Leu Asp Lys Met Trp Asp Arg Val Asp Met Lys Thr Trp ArgGlu Trp Leu Lp Met Lp Met Val Lp Met Lp Thr Trp Arg
980 985 990980 985 990
1235 1240 12451235 1240 1245
Arg Tyr Leu Trp His Val Phe Leu Arg Leu Cys Met Leu Ala Asp Leu 1250 1255 1260Arg Thr Leu Trp His Val Phe Leu Arg Leu Cys Met Leu Ala Asp Leu 1250 1255 1260
Ala Leu Ser Leu Val Tyr Val Val Ser Gin Gly Arg Cys His Lys Cys 1265 1270 1275 1280Ala Leu Ser Leu Val Gin Gly Arg Cys His Lys Cys 1265 1270 1275 1280
Trp Gly Lys Cys íle Arg Thr Ala Pro Ala Glu Val Ala Leu Asn ValTrp Gly Lys Cys White Arg Thr Ala Pro Ala Glu Val Ala Leu Asn Val
1555 1560 15651555 1560 1565
Val íle Phe Ser Ala Phe Cys Ala Tyr Ala Trp Pro Met Ser Ser Trp 1570 1575 1580Val White Phe Ser Ala Phe Cys Ala Tyr Ala Trp Pro Ser Ser Trp 1570 1575 1580
1860 1865 18701860 1865 1870
Ala íle íle Pro Asp Val Thr Ser íle Pro Ser Asp Leu Ala Ser Leu 1875 1880 1B85Ala White Pro Asp Val Thr Ser Pro White Asp Leu Ala Ser Leu 1875 1880 1B85
2115 2120 21252115 2120
Lys Ala Leu Arg Gin Glu Leu Ala Ser Leu Val Gin íle Asp Lys Met 2130 21352140Lys Ala Leu Arg Gin Glu Leu Ala Ser Leu Val Gin White Asp Lys Met 2130 21352140
Lys Gly Val Leu Ser Lys Leu Glu Ala Phe Ala Glu Thr Ala Thr Pro 2145 2150 21552160Lys Gly Val Leu Ser Lys Leu Glu Ala Phe Ala Glu Thr
Ser Leu Asp íle Gly Asp Val íle Val Leu Leu Gly Gin His Pro HisSer Leu Asp Goals Gly Asp Val Goals Val Leu Leu Gly Gin His Pro His
2165 217021752165 21702175
Gly Ser íle Leu Asp íle Asn Val Gly Thr Glu Arg Lys Thr Val SerGly Ser Leu Asp Asn Val Gly Thr Glu Arg Lys Thr Val Ser
-452180 2185 2190-452180 2185 2190
2385 2390 2395 <210 11 <211> 1463 <212> PRT <213> PRRS vírus <400 112385 2390 2395 <210 11 <211> 1463 <212> PRT <213> PRRS virus <400 11
275 280 285275 280 285
325 330 335(+420) 325 330 335
Ser Lys Pro Lys Thr Arg Thr íle Leu Gly Thr Asn Asn Phe íle AlaSer Lys Pro Lys Thr Arg Thr White Leu Gly Thr Asn Asn Phe White Ala
625 630 635 640(+420) 625 630 635 640
915 920 925915 920 925
Cys Ala Ala íle Gin Pro Cys Tyr Arg Glu Lys Leu Glu Ser Lys Ala 930 935 940Cys Ala Ala Gin Pro Cys Tyr Arg Glu Lys Leu Glu Ser Lys Ala 930 935 940
1425 1430 1435 14401425 1430 1435 1440
His Phe Ala Pro Gly Thr Glu Leu Gin Val Glu Leu Gly Lys Pro Arg 1445 1450 1455His Phe Ala Gly Thr Glu Leu Gin Val Glu Leu Gly Lys Pro Arg 1445 1450 1455
Leu Pro Pro Gly Gin Val ProGly Gin Val Pro Pro
1460 <210> 12 <211 >249 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 121460 <210> 12 <211> 249 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 12
Met Gin Trp Gly Tyr Cys Gly Val Lys Ser Ala Ser Cys Ser Trp Thr 15 10 15Met Gin Trp Gly Tyr Cys
Pro Ser Leu Ser Ser Leu Leu Val Trp Leu íle Leu Leu Phe Ser LeuFor Ser Leu Ser Ser Leu Leu Val Trp Leu Clay Leu Leu Phe Ser Leu
25 3025 30
<210> 13 <211> 265 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 13<210> 13 <211> 265 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 13
Met Ala HisMet Ala His
Gin Cys Ala Arg Phe His 5Gin Cys Ala Arg Phe His 4
Phe Phe Leu CysPhe Phe Leu Cys
Gly Phe íleGly Phe White
Cys Tyr Leu Val His Ser Ala Leu Ala Ser Asn Ser Ser Ser Thr LeuCys Tyr Leu Val His Ser Ala Leu Ala Ser Asn Ser Ser Ser Thr Leu
25 3025 30
260 265 <210> 14 <211> 183 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 14260 265 <210> 14 <211> 183 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 14
Met Ala AlaMet Ala Ala
AlaAla
ThrThr
LeuLeu
PhePhe
LeuLeu
LeuLeu
AlaAla
GlyGly
AlaAla
Gingin
Tyr íleTyr ile
MetMet
HisHis
LeuLeu
SerSer
Val Ser GluVal Glu
AlaAla
PhePhe
AlaAla
CysCys
LysLys
Profor
CysCys
PhePhe
SerSer
ThrThr
180 <210> 15 <211 >201 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 15180 <210> 15 <211> 201 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 15
Leu Gly Phe Leu Thr Thr Ser His Phe Phe Asp Ala Leu Gly Leu GlyLeu Gly Phu Leu Thr Thr Ser Phu Phe Asp Ala Leu Gly Leu Gly
90 9590 95
<210> 16 <211> 173 <212> PRT <213> PRRS vírus <400 16<210> 16 <211> 173 <212> PRT <213> PRRS virus <400 16
-55Thr Leu Val Pro Gly Leu Arg Ser Leu Val 145 150-55Thr Leu Val Pro Gly Leu Arg
Leu Gly Gly Lys Arg AlaLys Arg Ala
155 160155 160
Val Lys Arg Gly Val Val Asn Leu Val 165Val Lys Arg Gly Val Val Asn Leu Val 165
Lys Tyr Gly ArgLys Tyr Gly Arg
170 <210> 17 <211> 128 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 17170 <210> 17 <211> 128 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 17
<210> 18 <211> 249 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 18<210> 18 <211> 249 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 18
245 <210> 19 <211 >265 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 19245 <210> 19 <211> 265 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 19
260 265 <210> 20 <211> 183 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 20260 265 <210> 20 <211> 183 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 20
180 <210>21 <211> 201 <212> PRT <213> PRRS vírus <400> 21180 <210> 21 <211> 201 <212> PRT <213> PRRS virus <400> 21
Val Tyr Gly Ala Cys Ala Phe Ala Ala Phe Val Cys Phe Val íle ArgVal Tyr Gly Ala Ala Phe Ala Ala Phe Val Cys Phe Val ile Arg
115 120 125115 120 125
195 200 <210> 22 <211> 750 <212> DNA <213> PRRS Lelystad agens ORF2 <400> 22195 200 <210> 22 <211> 750 <212> DNA <213> PRRS Lelystad Agents ORF2 <400> 22
ATGCAATGGG GTCACTGTGG AGTAAAATCA GCCAGCTGTT CGTGGACGCC TTCACTGAGT 60 TCCTTGTTAG TGTGGTTGAT ATTGCCATTT TCCTTGCCAT ACTGTTTGGG TTCACCGTCG 120. CAGGATGGTT ACTGGTCTTT CTTCTCAGAG TGGTTTGCTC CGCGCTTCTC CGTTCGCGCT 180' CTGCCATTCA CTCTCCCGAA CTATCGAAGG TCCTATGAAG GCTTGTTGCC CAACTGCAGA 240 CCGGATGTCC CACAATTTGC AGTCAAGCAC CCATTGGGyA TGTTTTGGCA CATGCGAGTT 300 TCCCACTTGA TTGATGAGAT GGTCTCTCGT CGCATTTACC AGACCATGGA ACATTCAGGT 360 CAAGCGGCCT GGAAGCAGGT GGTTGGTGAG GCCACTCTCA CGAAGCTGTC AGGGCTCGAT 420 ATAGTTACTC ATTTCCAA.CA CCTGGCCGCA GTGGAGGCGG ATTCTTGCCG CTTTCTCAGC 480' TCACGACTCG TGATGCTAAA AAATCTTGCC GTTGGCAATG TGAGCCTACA GTACAAGACC 540 ACGTTGGACC GCGTTGAGCT CATCTTCCCC ACGCCAGGTA CGAGGCCCAA GTTGACCGAT 600 TTCAGACAAT GGCTCATCAG TGTGCACGCT TCCATTTTTT CCTCTGTGGC TTCATCTGTT 660 ACCTTGTTCA TAGTGCTTTG GCTTCGAATT CCAGCTCTAC GCTATGTTTT TGGTTTCCAT 720 TGGCCCACGG CAACACATCA TTCGAGCTGA 750 <210> 23 <211> 798 <212> DNA <213> PRRS Lelystad agens ORF3 <400> 23ATGCAATGGG GTCACTGTGG AGTAAAATCA GCCAGCTGTT CGTGGACGCC TTCACTGAGT 60 TCCTTGTTAG TGTGGTTGAT ATTGCCATTT TCCTTGCCAT ACTGTTTGGG TTCACCGTCG 120 CAGGATGGTT ACTGGTCTTT CTTCTCAGAG TGGTTTGCTC CGCGCTTCTC CGTTCGCGCT 180 'CTGCCATTCA CTCTCCCGAA CTATCGAAGG TCCTATGAAG GCTTGTTGCC CAACTGCAGA 240 CCGGATGTCC CACAATTTGC AGTCAAGCAC CCATTGGGyA TGTTTTGGCA CATGCGAGTT 300 TCCCACTTGA TTGATGAGAT GGTCTCTCGT CGCATTTACC AGACCATGGA ACATTCAGGT 360 CAAGCGGCCT GGAAGCAGGT GGTTGGTGAG GCCACTCTCA CGAAGCTGTC AGGGCTCGAT 420 ATAGTTACTC ATTTCCAA.CA CCTGGCCGCA GTGGAGGCGG ATTCTTGCCG CTTTCTCAGC 480 'TCACGACTCG TGATGCTAAA AAATCTTGCC GTTGGCAATG TGAGCCTACA GTACAAGACC 540 ACGTTGGACC GCGTTGAGCT CATCTTCCCC ACGCCAGGTA CGAGGCCCAA GTTGACCGAT 600 TTCAGACAAT GGCTCATCAG TGTGCACGCT TCCATTTTTT CCTCTGTGGC TTCATCTGTT 660 ACCTTGTTCA TAGTGCTTTG GCTTCGAATT CCAGCTCTAC GCTATGTTTT TGGTTTCCAT 720 TGGCCCACGG CAACACATCA TTCGAGCTGA 750 <210> 23 <211> 798 <212> DNA <213> PRRS Lelystad agent ORF3 <400> 23
ATGGCTCATC AGTGTGCACG CTTCCATTTT TTCCTCTGTG GCTTCATCTG TTACCTTGTT 60 CATAGTGCTT TGGCTTCGAA TTCCAGCTCT ACGCTATGTT TTTGGTTTCC ATTGGCCCAC 120 GGCAACACAT CATTCGAGCT GACCATCAAC TACACCATAT GCATGCCCTG TTCTACCAGT 180 CAAGCGGCTC GCCAAAGGCT CGAGCCCGGT CGTAACATGT GGTGCAAAAT AGGGCATGAC 240 AGGTGTGAGG AGCGTGACCA TGATGAGTTG TTAATGTCCA TCCCGTCCGG GTACGGACAA 300 CTCAAACTTG AGGGTTATTA TGCTTGGCTG GCTTTTTTGT CCTTTTCCTA CGCGGCCCAA 360 TTCCATCCGG AGTTGTTCGG GATAGGGAAT GTGTCGCGCG TCTTCGTGGA CAAGCGACAC 420 CAGTTCATTT GTGCCGAGCA TGATGGACAC AATTCAACCG TATCTACCGG ACACAACATC 480 TCCGCATTAT ATGCGGCATA TTACCACCAC CAAATAGACG GGGGCAATTG GTTCCATTTG 540 GAATGGCTGC GGCCACTCTT TTCTTCCTGG CTGGTGCTCA ACATATCATG GTTTCTGAGG 600 CGTTCGCCTG TAAGCCCTGT TTCTCGACGC ATCTATCAGA TATTGAGACC AACACGACCG 660ATGGCTCATC AGTGTGCACG CTTCCATTTT TTCCTCTGTG GCTTCATCTG TTACCTTGTT 60 CATAGTGCTT TGGCTTCGAA TTCCAGCTCT ACGCTATGTT TTTGGTTTCC ATTGGCCCAC 120 GGCAACACAT CATTCGAGCT GACCATCAAC TACACCATAT GCATGCCCTG TTCTACCAGT 180 CAAGCGGCTC GCCAAAGGCT CGAGCCCGGT CGTAACATGT GGTGCAAAAT AGGGCATGAC 240 AGGTGTGAGG AGCGTGACCA TGATGAGTTG TTAATGTCCA TCCCGTCCGG GTACGGACAA 300 CTCAAACTTG AGGGTTATTA TGCTTGGCTG GCTTTTTTGT CCTTTTCCTA CGCGGCCCAA 360 TTCCATCCGG AGTTGTTCGG GATAGGGAAT GTGTCGCGCG TCTTCGTGGA CAAGCGACAC 420 CAGTTCATTT GTGCCGAGCA TGATGGACAC AATTCAACCG TATCTACCGG ACACAACATC 480 TCCGCATTAT ATGCGGCATA TTACCACCAC CAAATAGACG GGGGCAATTG GTTCCATTTG 540 GAATGGCTGC GGCCACTCTT TTCTTCCTGG CTGGTGCTCA ACATATCATG GTTTCTGAGG 600 CGTTCGCCTG TAAGCCCTGT TTCTCGACGC ATCTATCAGA TATTGAGACC AACACGACCG 660
-60CGGCTGCCGG TTTCATGGTC CTTCÄGGACA TCAATTGTTT CCGACCTCAC GGGGTCTCAG CAGCGCAAGA GAAAATTTCC TTCGGAAAGT CGTCCCAATG TCGTGAAGCC GTCGGTACTC CCCAGTACAT CACGATAA-60CGGCTGCCGG TTTCATGGTC CTTCÄGGACA TCAATTGTTT CCGACCTCAC GGGGTCTCAG CAGCGCAAGA GAAAATTTCC TTCGGAAAGT CGTCCCAATG TCGTGAAGCC GTCGGTACTC CCCAGTACAT CACGATAA
720720
780780
798 <210> 24 <211> 606 <212> DNA <213> PRRS Lelystad agens ORF5 <400> 24798 <210> 24 <211> 606 <212> DNA <213> PRRS Lelystad Agents ORF5 <400> 24
ATGAGATGTT CTCACAAATT TTTTTGCTGT GTACCGGCTT TACCAATACA TATATAACTT CATTTTGGTT GGGCAGTCGA CTGGGTTTTC TCACAACAAG GCAGGATTTG TTGGCGGGCG GCGTTCGTAT GTTTTGTCAT ACCCGGTTTA CCAACTTCAT ATAGTGGTAG AAAAATTGGG GTCGTCCTCG AAGGGGTTAA GCCTAGATGAGATGTT CTCACAAATT TTTTTGCTGT GTACCGGCTT TACCAATACA TATATAACTT CATTTTGGTT GGGCAGTCGA CTGGGTTTTC TCACAACAAG GCAGGATTTG
GGGGCGTTTC TTGACTCCGC GTCCTGGTCC TTTGCCGATG GACGATATGC GAGCTGAATG GACCTTTGTG CTTTACCCGG CCATTTTTTT GACGCGCTCG GTACGTACTC TGCAGCGTCT CCGTGCTGCT AAAAATTGCA TGTGGACGAC CGGGGGAGAG CAAAGCCGAA GTCGATGGCA AGCTCAACCC TTGACGAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
ACTCTTGCTT CTGGTGGCTT 60 GCAACGGCGA CAGCTCGACA 120 GGACCGACTG GTTGTCCAGC 80ACTCTTGCTT CTGGTGGCTT 60 GCAACGGCGA CAGCTCGACA 120 GGACCGACTG GTTGTCCAGC 80
TTGCCACTCA TATCCTCTCA 240 GTCTCGGCGC TGTATCCACT 300ACGGCGCTTG TGCTTTCGCA 3.60 TGGCCTGCCG CTATGGCCGT 42.0 TTCATCGATG GAAGTCTCCA 480 ACCTCGTCAC CATCAAACAT 540 CTTCGGCTGA GCAATGGGAG 600TTGCCACTCA TATCCTCTCA 240 GTCTCGGCGC TGTATCCACT 300ACGGCGCTTG TGCTTTCGCA 3.60 TGGCCTGCCG CTATGGCCGT 42.0 TTCATCGATG GAAGTCTCCA 480 ACCTCGTCAC CATCAAACAT 540 CTTCGGCTGA 600 GCAATGGGG
606 <210> 25 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS zoslabovacie miesto I ORF2 <400> 25606 <210> 25 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS attenuation site I ORF2 <400> 25
TACTGGTCTT TCTTCTCAGA G 21 <210> 26 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS zoslabovacie miesto II ORF2 <400> 26TACTGGTCTT TCTTCTCAGA G 21 <210> 26 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS attenuation site II ORF2 <400> 26
ACAATTTGCA GTCAAGCACC C 21 <210> 27 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS zoslabovacie miesto III ORF2 <400> 27ACAATTTGCA GTCAAGCACC C 21 <210> 27 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS attenuation site III ORF2 <400> 27
ATTGGyATG TTTTGGCACA TATTGGyATG TTTTGGCACA T
-61 <210> 28 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS zoslabovacie miesto ORF3 <400> 28-61 <210> 28 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS ORF3 attenuation site <400> 28
GTTGTTAAT GTCCATCCCGT C 21 <210> 29 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS zoslabovacie miesto ORF5 <400> 29GTTGTTAAT GTCCATCCCGT C 21 <210> 29 <211> 21 <212> DNA <213> PRRS attenuation site ORF5 <400> 29
GACCTTTGTG CTTTACCCGG TGACCTTTGTG CTTTACCCGG T
Claims (42)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US27460301P | 2001-03-09 | 2001-03-09 | |
PCT/EP2002/002486 WO2002072802A2 (en) | 2001-03-09 | 2002-03-07 | Live attenuated strains of prrs virus |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK11282003A3 true SK11282003A3 (en) | 2004-02-03 |
Family
ID=23048885
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK1128-2003A SK11282003A3 (en) | 2001-03-09 | 2002-03-07 | Life attenuated European PRRS virus, nucleotide sequence coding said virus, method of generating such virus, cell line, and a pharmaceutical composition comprising said PRRS viruses and the use thereof |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP1421184A2 (en) |
JP (1) | JP2004534522A (en) |
KR (1) | KR20030082960A (en) |
BR (1) | BR0207988A (en) |
CA (1) | CA2439254A1 (en) |
CZ (1) | CZ20032743A3 (en) |
HU (1) | HUP0303431A2 (en) |
MX (1) | MXPA03007751A (en) |
PL (1) | PL370541A1 (en) |
RU (1) | RU2003129068A (en) |
SK (1) | SK11282003A3 (en) |
WO (1) | WO2002072802A2 (en) |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1438969A1 (en) * | 2003-01-14 | 2004-07-21 | Universiteit Utrecht | Arterivirus marker vaccine |
KR20050040172A (en) * | 2003-10-27 | 2005-05-03 | 주식회사 중앙백신연구소 | Method of porcine reproductive and respiratory syndrome inactivated oil vaccine |
CN101084011B (en) * | 2004-11-19 | 2010-06-16 | 英特威国际有限公司 | Porcine reproductive and respiratory syndrome virus strains and compositions |
CA2599322C (en) * | 2005-02-25 | 2013-09-03 | Pfizer Products Inc. | N protein mutants of porcine reproductive and respiratory syndrome virus |
WO2009008924A2 (en) | 2007-04-05 | 2009-01-15 | Mount Sinai School Of Medicine Of New York University | Methods of preventing and treating viral infections by inhibiting the deisgylation activity of otu domain-containing viral proteins |
WO2008153572A1 (en) * | 2007-06-15 | 2008-12-18 | Protatek International, Inc. | Construction of chimera prrsv, compositions and vaccine preparations |
US7666585B2 (en) | 2007-06-15 | 2010-02-23 | Protatek International, Inc. | Construction of chimera PRRSV, compositions and vaccine preparations |
WO2012110489A2 (en) * | 2011-02-17 | 2012-08-23 | Boehringer Ingelheim Vetmedica Gmbh | Novel european prrsv strain |
KR101420850B1 (en) * | 2011-05-30 | 2014-08-13 | 건국대학교 산학협력단 | A novel virus like particle of Porcine reproductive and respiratory syndrome virus and vaccine thereof |
KR101281361B1 (en) * | 2011-07-18 | 2013-07-02 | 서울대학교산학협력단 | Vaccine composition for North American Porcine reproductive and respiratory syndrome virus and mixed vaccine comprising thereof |
KR101245029B1 (en) * | 2012-01-18 | 2013-03-18 | 서울대학교산학협력단 | Vaccine composition for Korean Porcine reproductive and respiratory syndrome virus |
JP6386999B2 (en) * | 2012-05-17 | 2018-09-05 | ゾエティス・エルエルシー | Effective vaccination before weaning for porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus |
CN103290142B (en) * | 2013-03-29 | 2015-03-11 | 云南农业大学 | A fluorescent quantitative RT-PCR method for detection of a porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) attenuated vaccine virus content |
KR101624485B1 (en) | 2014-08-13 | 2016-05-26 | 전북대학교산학협력단 | Porcine reproductive and respiratory syndrome virus mutant strain and vaccine composition for preventing or treating porcine reproductive and respiratory syndrome comprising the same |
CN104694561B (en) * | 2015-02-10 | 2018-02-23 | 中国农业科学院上海兽医研究所 | Express construction method and the application of the PRRSV recombinant plasmids of sea pansy or firefly luciferase gene |
CN114502240A (en) * | 2019-08-29 | 2022-05-13 | 礼蓝美国公司 | Porcine reproductive and respiratory syndrome vaccine virus |
KR102276341B1 (en) * | 2020-01-29 | 2021-07-12 | 주식회사 바이오포아 | Method for producing European porcine reproductive and respiratory syndrome virus and use thereof |
WO2021154055A1 (en) * | 2020-01-29 | 2021-08-05 | 주식회사 바이오포아 | Mutant strain of european porcine reproductive and respiratory syndrome virus and vaccine composition comprising same |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK0587780T4 (en) * | 1991-06-06 | 2008-10-13 | Boehringer Ingelheim Vetmed | Infectious agent that causes Mystery Swine Disease, vaccine preparations and diagnostic kits |
US6592873B1 (en) * | 1992-10-30 | 2003-07-15 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | Polynucleic acids isolated from a porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) and proteins encoded by the polynucleic acids |
WO2000053787A1 (en) * | 1999-03-08 | 2000-09-14 | Id-Lelystad, Instituut Voor Dierhouderij En Dierg Ezondheid B.V. | Prrsv vaccines |
KR100388257B1 (en) * | 1997-05-06 | 2003-06-19 | 스티칭 디엔스트 랜드보위쿤디그 온데조에크 | Prrsv antigenic sites identifying peptide sequences of prrs virus for use in vaccines or diagnostic assays |
AU7960598A (en) * | 1997-06-05 | 1998-12-21 | Origen, Inc. | Recombinant porcine reproductive and respiratory syndrome virus (prrsv) for use as a vaccine |
HUP0204176A3 (en) * | 2000-01-26 | 2003-12-29 | Boehringer Ingelheim Vetmed | Recombinant attenuation of prrsv |
EP1156111A1 (en) * | 2000-05-19 | 2001-11-21 | Stichting Dienst Landbouwkundig Onderzoek | Chimeric arterivirus-like particles |
WO2001089559A2 (en) * | 2000-05-24 | 2001-11-29 | Merial | Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (prrsv) recombinant avipoxvirus vaccine |
EP1397498A1 (en) * | 2001-05-21 | 2004-03-17 | ID-Lelystad, Instituut voor Dierhouderij en Diergezondheid B.V. | Delections in arterivirus replicons |
-
2002
- 2002-03-07 JP JP2002571858A patent/JP2004534522A/en active Pending
- 2002-03-07 CA CA002439254A patent/CA2439254A1/en not_active Abandoned
- 2002-03-07 BR BR0207988-7A patent/BR0207988A/en active Pending
- 2002-03-07 HU HU0303431A patent/HUP0303431A2/en unknown
- 2002-03-07 PL PL02370541A patent/PL370541A1/en not_active Application Discontinuation
- 2002-03-07 MX MXPA03007751A patent/MXPA03007751A/en unknown
- 2002-03-07 KR KR10-2003-7011656A patent/KR20030082960A/en not_active Application Discontinuation
- 2002-03-07 RU RU2003129068/13A patent/RU2003129068A/en not_active Application Discontinuation
- 2002-03-07 EP EP02726146A patent/EP1421184A2/en not_active Withdrawn
- 2002-03-07 SK SK1128-2003A patent/SK11282003A3/en unknown
- 2002-03-07 WO PCT/EP2002/002486 patent/WO2002072802A2/en not_active Application Discontinuation
- 2002-03-07 CZ CZ20032743A patent/CZ20032743A3/en unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2004534522A (en) | 2004-11-18 |
WO2002072802A2 (en) | 2002-09-19 |
BR0207988A (en) | 2004-10-26 |
PL370541A1 (en) | 2005-05-30 |
RU2003129068A (en) | 2005-04-10 |
HUP0303431A2 (en) | 2004-01-28 |
MXPA03007751A (en) | 2004-11-12 |
EP1421184A2 (en) | 2004-05-26 |
KR20030082960A (en) | 2003-10-23 |
CZ20032743A3 (en) | 2004-02-18 |
WO2002072802A3 (en) | 2004-03-11 |
CA2439254A1 (en) | 2002-09-19 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2021201224B2 (en) | PRRS virus variant, European PRRS virus cDNA clone, and uses thereof | |
EP0776209B1 (en) | Polynucleic acids and proteins from a porcine reproductive and respiratory syndrome virus and uses thereof | |
US7517976B2 (en) | Polynucleic acids isolated from a porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) | |
US6773908B1 (en) | Proteins encoded by polynucleic acids of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) | |
KR101321153B1 (en) | Prrs viruses, infectious clones, mutants thereof, and methods of use | |
SK11282003A3 (en) | Life attenuated European PRRS virus, nucleotide sequence coding said virus, method of generating such virus, cell line, and a pharmaceutical composition comprising said PRRS viruses and the use thereof | |
WO1996006619A9 (en) | Polynucleic acids and proteins from a porcine reproductive and respiratory syndrome virus and uses thereof | |
US20020012670A1 (en) | Recombinant attenuation of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRSV) | |
US20140314808A1 (en) | Infectious cdna clone of european prrs virus and uses thereof | |
JP7053552B2 (en) | Pig breeding / respiratory disorder syndrome vaccine virus | |
WO2015056850A1 (en) | Chimeric mutant strain of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses | |
MXPA02007198A (en) | Recombinant attenuation of prrsv. | |
WO2024029707A1 (en) | Chimeric strain of north american and european porcine reproductive and respiratory syndrome virus, and method for producing same | |
AU2002256653A1 (en) | Life attenuated strains of PRRS virus |