RU2804775C2

RU2804775C2 - Режимы дозирования для антител против tim-3 и их применения

Info

Publication number: RU2804775C2
Application number: RU2020102863A
Authority: RU
Inventors: Эндрю Марк СТЕЙН; Цзянь СЮЙ; Луиджи МАНЕНТИ; Кэтрин Энн Сабатос-Пейтон
Original assignee: Новартис Аг
Priority date: 2017-06-27
Filing date: 2018-06-27
Publication date: 2023-10-05

Abstract

Группа изобретений относится к биотехнологии. Представлены: применение молекулы антитела против TIM-3 в дозе 400 мг раз в каждые две недели или 800 мг один раз в каждые четыре недели, для лечения злокачественной опухоли у субъекта, способ лечения злокачественной опухоли у субъекта, включающий введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, и применение фармацевтической композиции, содержащей молекулу антитела против TIM-3. Изобретение можно использовать для лечения или предотвращения онкологических или инфекционных состояний. 3 н. и 51 з.п. ф-лы, 12 табл.

Description

ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ

По настоящей заявке испрашивается приоритет на основании предварительной заявки США No. 62/525465, поданной 27 июня 2017 г., и предварительной заявки США No. 62/633899, поданной 22 февраля 2018 г. Полное содержание вышеупомянутых заявок, таким образом, приведено путем ссылки.

СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

Настоящая заявка содержит список последовательностей, который подан в электронной форме в формате ASCII, и полное содержание которого, таким образом, приведено путем ссылки. Указанная копия ASCII, созданная 27 июня 2018 г., названа C2160-7018WO_SL.txt и имеет размер 233933 байт.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ

Активация наивных CD4+ T-клеток-помощников приводит к развитию по меньшей мере двух отдельных эффекторных популяций, Th1-клеток и Th2-клеток. См. US 7470428, Mosmann T R et al. (1986) J Immunol 136:2348-57; Mosmann T R et al. (1996) Immunol Today 17:138-46; Abbas A K et al. (1996) Nature 383:787-793. Th1-клетки продуцируют цитокины (например, интерферон-гамма, интерлейкин-2, фактор некроза опухоли альфа и лимфотоксин), обычно ассоциированные с опосредованными клетками иммунными ответами против внутриклеточных патогенов, реакциями гиперчувствительности замедленного типа (Sher A et al. (1992) Annu Rev Immunol 10:385-409) и индукцией органоспецифических аутоиммунных заболеваний (Liblau R S et al. (1995) Immunol Today 16:34-38). Th2-клетки продуцируют цитокины (например, IL-4, IL-10 и IL-13), являющиеся критическими для контроля внеклеточных гельминтных инфекций и стимулирующие атопические и аллергические заболевания (Sher A et al. (1992) Annu Rev Immunol 10:385-409). В дополнение к их отдельным ролям в заболевании, Th1 и Th2-клетки перекрестно регулируют размножение и функции друг друга. Таким образом, предпочтительная индукция Th2-клеток подавляет аутоиммунные заболевания (Kuchroo V K et al. (1995) Cell 80:707-18; Nicholson L B et al. (1995) Immunity 3:397-405), и предпочтительная индукция Th1-клеток может регулировать индукцию астмы, атопии и аллергии (Lack G et al. (1994) J Immunol 152:2546-54; Hofstra C L et al. (1998) J Immunol 161:5054-60).

TIM-3 представляет собой трансмембранный рецепторный белок, экспрессированный, например, на Th1 (T-клетках-помощниках 1) CD4+ клетках и цитотоксических CD8+ T-клетках, секретирующих IFN-γ. TIM-3, как правило, не экспрессируется на наивных T-клетках, но подвергается достаточно сильной повышающей регуляции на активированных, эффекторных T-клетках. TIM-3 играет роль в регуляции иммунитета и толерантности in vivo (см. Hastings et al., Eur J Immunol. 2009; 39(9):2492-501). Таким образом, существует необходимость в новых терапевтических способах, регулирующих функции TIM-3 и функции экспрессирующих TIM-3 клеток, включая режимы дозирования и составы для молекул антител против TIM-3 для лечения заболеваний, таких как злокачественная опухоль.

СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Настоящее изобретение относится, по меньшей мере, частично, к молекулам антител (например, молекулам гуманизированных антител), связывающих белок 3, содержащий Т-клеточный иммуноглобулиновый домен и домен муцина (TIM-3), с высокой аффинностью и специфичностью. Настоящее изобретение относится также к фармацевтическим композициям и составам для дозирования, содержащим молекулы антител против TIM-3. Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно использовать (отдельно или в комбинации с другими лекарственными средствами, способами или средствами) для лечения или предотвращения нарушений, таких как онкологические нарушения (например, солидные опухоли и гематологические злокачественные опухоли), так же как инфекционные заболевания (например, хронические инфекционные нарушения или сепсис). Таким образом, настоящее изобретение относится к способам, включая режимы дозирования, для лечения различных нарушений с использованием молекул антител против TIM-3. В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в постоянной или фиксированной дозе.

Соответственно, в одном аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения (например, ингибирования, уменьшения, облегчения или предотвращения) нарушения, например, гиперпролиферативного состояния или нарушения (например, злокачественной опухоли) у субъекта. Способ включает введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, например, молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг, от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг, или от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг, один раз в каждые две или каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг один раз в каждые две или один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг один раз в каждые две или четыре недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг один раз в каждые две или каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг один раз в каждые две или четыре недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг один раз в каждые две или каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 5 мг до приблизительно 50 мг, например, от приблизительно 8 мг до приблизительно 40 мг, от приблизительно 10 мг до приблизительно 30 мг, от приблизительно 15 мг до приблизительно 35 мг, от приблизительно 15 мг до приблизительно 25 мг, от приблизительно 5 мг до приблизительно 25 мг, от приблизительно 25 мг до приблизительно 50 мг, например, приблизительно 5 мг, приблизительно 10 мг, приблизительно 15 мг, приблизительно 20 мг, приблизительно 25 мг, приблизительно 30 мг, приблизительно 35 мг, или приблизительно 40 мг, один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 30 мг, например, приблизительно 20 мг, один раз в каждые две недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг, например, от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 70 мг до приблизительно 90 мг, от приблизительно 75 мг до приблизительно 85 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 60 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 50 мг, приблизительно 60 мг, приблизительно 70 мг, приблизительно 80 мг, приблизительно 90 мг или приблизительно 100 мг, один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 80 мг, один раз в каждые две недели.

В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг, например, от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 70 мг до приблизительно 90 мг, от приблизительно 75 мг до приблизительно 85 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 60 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 50 мг, приблизительно 60 мг, приблизительно 70 мг, приблизительно 80 мг, приблизительно 90 мг или приблизительно 100 мг, один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 80 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг, например, от приблизительно 200 мг до приблизительно 280 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 250 мг, от приблизительно 210 мг до приблизительно 270 мг, от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, от приблизительно 230 мг до приблизительно 250 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 220 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 240 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 260 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 280 мг, от приблизительно 280 до приблизительно 300 мг, от приблизительно 260 до приблизительно 300 мг, от приблизительно 240 до приблизительно 300 мг, от приблизительно 220 до приблизительно 300 мг, например, приблизительно 200 мг, приблизительно 240 мг, приблизительно 260 мг, приблизительно 280 мг или приблизительно 300 мг, один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, например, приблизительно 240 мг, один раз в каждые две недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг, например, от приблизительно 200 мг до приблизительно 280 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 250 мг, от приблизительно 210 мг до приблизительно 270 мг, от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, от приблизительно 230 мг до приблизительно 250 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 220 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 240 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 260 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 280 мг, от приблизительно 280 до приблизительно 300 мг, от приблизительно 260 до приблизительно 300 мг, от приблизительно 240 до приблизительно 300 мг, от приблизительно 220 до приблизительно 300 мг, например, приблизительно 200 мг, приблизительно 240 мг, приблизительно 260 мг, приблизительно 280 мг или приблизительно 300 мг, один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, например, приблизительно 240 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг, например, от приблизительно 600 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 700 мг до приблизительно 900 мг, от приблизительно 750 мг до приблизительно 850 мг, от приблизительно 500 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 500 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 800 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 600 мг до приблизительно 1000 мг, например, приблизительно 500 мг, приблизительно 600 мг, приблизительно 700 мг, приблизительно 800 мг, приблизительно 900 мг или приблизительно 1000 мг, один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 600 мг до приблизительно 1000 мг, например, приблизительно 800 мг, один раз в каждые две недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг, например, от приблизительно 600 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 700 мг до приблизительно 900 мг, от приблизительно 750 мг до приблизительно 850 мг, от приблизительно 500 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 500 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 800 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 600 мг до приблизительно 1000 мг, например, приблизительно 500 мг, приблизительно 600 мг, приблизительно 700 мг, приблизительно 800 мг, приблизительно 900 мг или приблизительно 1000 мг, один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 600 мг до приблизительно 1000 мг, например, приблизительно 800 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг, например, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1300 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1300 мг до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1300 мг, от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1500 мг, например, приблизительно 1000 мг, приблизительно 1100 мг, приблизительно 1200 мг, приблизительно 1300 мг, приблизительно 1400 мг или приблизительно 1500 мг, один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1300 мг, например, приблизительно 1200 мг, один раз в каждые две недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг, например, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1300 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1300 мг до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1300 мг, от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1500 мг, например, приблизительно 1000 мг, приблизительно 1100 мг, приблизительно 1200 мг, приблизительно 1300 мг, приблизительно 1400 мг или приблизительно 1500 мг, один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1100 мг до приблизительно 1300 мг, например, приблизительно 1200 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, нарушение представляет собой злокачественную опухоль, например, злокачественную опухоль, описанную в настоящем описании. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак яичника. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак легких, например, мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой мезотелиому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак кожи, например, карциному из клеток Меркеля или меланому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак почки, например, почечноклеточный рак (RCC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак мочевого пузыря. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому мягких тканей, например, гемангиоперицитому (HPC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль кости, например, саркому кости. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой колоректальный рак. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак поджелудочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль носоглотки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак молочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль двенадцатиперстной кишки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак эндометрия. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой аденокарциному, например, аденокарциному неизвестной первичной локализации. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак печени, например, печеночноклеточную карциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой холангиокарциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелодиспластический синдром (MDS) (например, MDS высокого риска).

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой гематологическую злокачественную опухоль. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой лейкоз (например, острый миелоидный лейкоз (AML), например, рецидивирующий или невосприимчивый AML или AML de novo). В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой лимфому. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелому.

В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль с высокой MSI. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой метастазирующую злокачественную опухоль. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль на поздних стадиях. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рецидивирующую или невосприимчивую злокачественную опухоль.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 посредством инъекции (например, внутривенно или подкожно) в дозе (например, постоянной дозе) от приблизительно 10 мг до приблизительно 30 мг (например, приблизительно 20 мг), от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг), от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг), от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) или от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг). Расписание дозирования (например, расписание постоянного дозирования) можно менять, например, от одного раза в каждые две недели до одного раза в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 30 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе от приблизительно 60 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели.

В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе приблизительно 20 мг один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели для лечения злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе приблизительно 80 мг один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели для лечения злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе приблизительно 240 мг один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели для лечения злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе приблизительно 800 мг один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели для лечения злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 внутривенно в дозе приблизительно 1200 мг один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели для лечения злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании.

В одном варианте осуществления, способ дополнительно включает введение субъекту ингибитора PD-1 (например, молекулы антитела против PD-1, описанной в настоящем описании) или ингибитора PD-L1 (например, молекулы антитела против PD-L1, описанной в настоящем описании). В конкретных вариантах осуществления, субъекту вводят молекулу антитела против PD-1 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 500 мг, например, от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг или от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг, один раз в каждые четыре недели или один раз в каждые восемь недель. В некоторых вариантах осуществления, субъекту вводят молекулу антитела против PD-1 в дозе приблизительно 240 мг один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, субъекту вводят молекулу антитела против PD-1 в дозе приблизительно 400 мг один раз в каждые четыре недели. В некоторых вариантах осуществления, субъекту вводят молекулу антитела против PD-1 в дозе приблизительно 400 мг один раз в каждые восемь недель.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, и вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, 20 мг) один раз в каждые две недели, и вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, и вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, и вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, и ингибитор PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели.

В одном варианте осуществления, способ дополнительно включает введение субъекту гипометилирующего средства (например, децитабина). В некоторых вариантах осуществления, субъекту вводят гипометилирующее средство или децитабин в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м², например, от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 50 мг/м² или от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, субъекту вводят гипометилирующее средство или децитабин в дозе от приблизительно 20 мг/м² каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В одном варианте осуществления, способ включает введение субъекту молекулы антитела против TIM-3 (например, молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании) и гипометилирующего средства (например, децитабина). В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые две недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели.

В одном варианте осуществления, способ включает введение субъекту молекулы антитела против TIM-3 (например, молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании), ингибитора PD-1 (например, молекулы антитела против PD-1, описанной в настоящем описании) и гипометилирующего средства (например, децитабина). В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, вводят ингибитор PD-1 в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и вводят гипометилирующее средство (например, децитабин) в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 30 мг/м²(например, приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 или комбинацию, содержащую молекулу антитела против TIM-3, используют для лечения острого миелоидного лейкоза (AML) или миелодиспластического синдрома (MDS), например, в соответствии с расписанием дозирования, описанным в настоящем описании.

В конкретных вариантах осуществления, субъекта не подвергали терапии против PD-1 или PD-L1 до введения молекулы антитела против TIM-3. В других вариантах осуществления, субъекта подвергали терапии против PD-1 или PD-L1 до введения молекулы антитела против TIM-3.

В других вариантах осуществления, субъект имеет или идентифицирован как имеющий экспрессию TIM-3 в инфильтрующих опухоль лимфоцитах (TIL).

В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу уменьшения активности (например, роста, выживаемости или жизнеспособности, или всего этого), гипопролиферативной (например, злокачественной) клетки. Способ включает приведение клетки в контакт с молекулой антитела против TIM-3, например, молекулой антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании. Способ можно осуществлять для субъекта, например, в качестве части терапевтического протокола, например, в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг), от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг), от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг), от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг), или от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, доза составляет от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг) молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, доза составляет от приблизительно 50 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, доза составляет от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, доза составляет от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, доза составляет от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 20 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 80 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 240 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 800 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 1200 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 80 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 240 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 800 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые четыре недели. В других вариантах осуществления, доза составляет приблизительно 1200 мг молекулы антитела против TIM-3 один раз в каждые четыре недели.

Злокачественная клетка может представлять собой, например, клетку из злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании, такой как солидная опухоль или гематологическая злокачественная опухоль, например, рак яичника, рак легких (например, мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC)), мезотелиома, рак кожи (например, карцинома из клеток Меркеля (MCC) или меланома), рак почки (например, почечноклеточный рак), рак мочевого пузыря, саркома мягких тканей (например, гемангиоперицитома (HPC)), злокачественная опухоль кости (например, саркома кости), колоректальный рак, рак поджелудочной железы, злокачественная опухоль носоглотки, рак молочной железы, злокачественная опухоль двенадцатиперстной кишки, рак эндометрия, аденокарцинома (аденокарцинома неизвестной первичной локализации), рак печени (например, печеночноклеточная карцинома), холангиокарцинома, саркома, миелодиспластический синдром (MDS) (например, MDS высокого риска), лейкоз (например, острый миелоидный лейкоз (AML), например, рецидивирующий или невосприимчивый AML или AML de novo), лимфома или миелома.

В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак яичника. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак легких, например, мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой мезотелиому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак кожи, например, карциному из клеток Меркеля или меланому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак почки, например, почечноклеточный рак. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак мочевого пузыря. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому мягких тканей, например, гемангиоперицитому (HPC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль кости, например, саркому кости. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой колоректальный рак. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак поджелудочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль носоглотки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак молочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль двенадцатиперстной кишки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак эндометрия. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой аденокарциному, например, аденокарциному неизвестной первичной локализации. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак печени, например, печеночноклеточную карциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой холангиокарциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелодиспластический синдром (MDS) (например, MDS высокого риска). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой лейкоз (например, острый миелоидный лейкоз (AML), например, рецидивирующий или невосприимчивый AML или AML de novo). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой лимфому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль с высокой MSI. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой метастазирующую злокачественную опухоль. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль на поздних стадиях. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рецидивирующую или невосприимчивую злокачественную опухоль.

В конкретных вариантах осуществления способов, описанных в настоящем описании, способ дополнительно включает определение уровня экспрессии TIM-3 в инфильтрующих опухоль лимфоцитах (TIL) у субъекта. В других вариантах осуществления, уровень экспрессии TIM-3 определяют в образце (например, биоптате опухоли) полученном от субъекта (например, с использованием иммуногистохимии). В конкретных вариантах осуществления, при наличии ответа на поддающийся детекции уровень или увеличенный уровень TIM-3 у субъекта, вводят молекулу антитела против TIM-3. Стадии детекции можно также использовать, например, для мониторирования эффективности лекарственного средства, описанного в настоящем описании. Например, стадию детекции можно использовать для мониторирования эффективности молекулы антитела против TIM-3.

В другом аспекте настоящее изобретение относится к композиции (например, одной или нескольким композициям или лекарственным формам), включающим молекулу антитела против TIM-3 (например, молекулу антитела против TIM-3, как описано в настоящем описании). Составы, например, дозированные составы, и наборы, например, терапевтические наборы, содержащие молекулу антитела против TIM-3 (например, молекулу антитела против TIM-3 как описано в настоящем описании), также описаны в настоящем описании. В конкретных вариантах осуществления, композиция или состав содержит от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг), от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг), от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг), от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг), или от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) молекулы антитела против TIM-3 (например, молекулы антитела против TIM-3, как описано в настоящем описании). В некоторых вариантах осуществления, композицию или состав вводят или используют один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В некоторых вариантах осуществления, композиция или состав содержит приблизительно 20 мг, приблизительно 80 мг, приблизительно 240 мг или приблизительно 1200 мг молекулы антитела против TIM-3 (например, молекулы антитела против TIM-3 как описано в настоящем описании), и их вводят или используют один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, композицию или состав используют для лечения злокачественной опухоли, например, злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании.

Дополнительные признаки или варианты осуществления способов, композиций, дозированных составов и наборов, описанных в настоящем описании, включают одно или несколько из следующего.

Молекулы антитела против TIM-3

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть определяющих комплементарность областей (CDR) (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблице 7 (например, из последовательностей вариабельной области тяжелой и легкой цепи ABTIM3-hum11 или ABTIM3-hum03, описанных в таблице 7), или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 7. В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Kabat (например, как приведено в таблице 7). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Chothia (например, как приведено в таблице 7). В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен (например, консервативных аминокислотных замен) или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблице 7, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 7.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 802 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812, где каждая описана в таблице 7. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 820 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812, где каждая описана в таблице 7.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 806 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 806. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 816 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 816. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 822 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 822. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 826 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 826. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 806, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 816. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 822, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 826.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 807 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 807. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 817 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 817. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 823 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 823. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 827 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 827. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 807, и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 817. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 823, и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 827.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 808 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 808. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 818 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 818. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 824 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 824. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 828 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 828. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 808, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 818. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 824, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 828.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 809 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 809. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 819 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 819. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 825 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 825. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 829 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 829. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 809, и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 819. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 825, и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 829.

Другие иллюстративные ингибиторы TIM-3

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой TSR-022 (AnaptysBio/Tesaro). В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из TSR-022. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из APE5137 или APE5121, например, как описано в таблице 8. APE5137, APE5121, и другие антитела против TIM-3 описаны в WO 2016/161270, полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой клон антитела F38-2E2. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из F38-2E2.

Дополнительные известные антитела против TIM-3 включают антитела, описанные, например, в WO 2016/111947, WO 2016/071448, WO 2016/144803, US 8552156, US 8841418 и US 9163087, полное содержание которых приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, антитело против TIM-3 представляет собой антитело, конкурирующее за связывание с и/или связывающееся с тем же эпитопом на TIM-3, что и одно из антител против TIM-3, описанных в настоящем описании.

Составы

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно составлять в состав (например, дозированный состав или лекарственную форму), пригодный для введения (например, внутривенного введения) субъекту, как описано в настоящем описании. Состав, описанный в настоящем описании, может представлять собой жидкий состав, лиофилизированный состав или разведенный состав.

В конкретных вариантах осуществления, состав представляет собой жидкий состав. В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3 (например, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании) и забуферивающее средство.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 25 мг/мл - 250 мг/мл, например, 50 мг/мл - 200 мг/мл, 60 мг/мл - 180 мг/мл, 70 мг/мл - 150 мг/мл, 80 мг/мл - 120 мг/мл, 90 мг/мл - 110 мг/мл, 50 мг/мл - 150 мг/мл, 50 мг/мл - 100 мг/мл, 150 мг/мл - 200 мг/мл, или 100 мг/мл - 200 мг/мл, например, 50 мг/мл, 60 мг/мл, 70 мг/мл, 80 мг/мл, 90 мг/мл, 100 мг/мл, 110 мг/мл, 120 мг/мл, 130 мг/мл, 140 мг/мл или 150 мг/мл. В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 присутствует в концентрации 80 мг/мл - 120 мг/мл, например, 100 мг/мл.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит забуферивающее средство, содержащее гистидин (например, гистидиновый буфер). В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) присутствует в концентрации 1 мМ - 100 мМ, например, 2 мМ - 50 мМ, 5 мМ - 40 мМ, 10 мМ - 30 мМ, 15 to 25 мМ, 5 мМ - 40 мМ, 5 мМ - 30 мМ, 5 мМ - 20 мМ, 5 мМ - 10 мМ, 40 мМ - 50 мМ, 30 мМ - 50 мМ, 20 мМ - 50 мМ, 10 мМ - 50 мМ, или 5 мМ - 50 мМ, например, 2 мМ, 5 мМ, 10 мМ, 15 мМ, 20 мМ, 25 мМ, 30 мМ, 35 мМ, 40 мМ, 45 мМ или 50 мМ. В некоторых вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) присутствует в концентрации 15 мМ - 25 мМ, например, 20 мМ. В других вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) или состав имеет pH 4-7, например, 5-6, например, 5, 5,5, или 6. В некоторых вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) или состав имеет pH 5-6, например, 5,5. В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5). В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство содержит гистидин и гистидин-HCl.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; и забуферивающее средство, содержащее гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ), при pH 5-6 (например, 5,5).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) дополнительно содержит углевод. В конкретных вариантах осуществления, углевод представляет собой сахарозу. В некоторых вариантах осуществления, углевод (например, сахароза) присутствует в концентрации 50 мМ - 500 мМ, например, 100 мМ - 400 мМ, 150 мМ - 300 мМ, 180 мМ - 250 мМ, 200 мМ - 240 мМ, 210 мМ - 230 мМ, 100 мМ - 300 мМ, 100 мМ - 250 мМ, 100 мМ - 200 мМ, 100 мМ - 150 мМ, 300 мМ - 400 мМ, 200 мМ - 400 мМ, или 100 мМ - 400 мМ, например, 100 мМ, 150 мМ, 180 мМ, 200 мМ, 220 мМ, 250 мМ, 300 мМ, 350 мМ, или 400 мМ. В некоторых вариантах осуществления, состав содержит углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; забуферивающее средство, содержащее гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ); и углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ, при pH 5-6 (например, 5,5).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) дополнительно содержит поверхностно-активное вещество. В конкретных вариантах осуществления, поверхностно-активное вещество представляет собой полисорбат 20. В некоторых вариантах осуществления, поверхностно-активное вещество или полисорбат 20) присутствует в концентрации 0,005% - 0,1% (масс./масс.), например, 0,01% - 0,08%, 0,02% - 0,06%, 0,03% - 0,05%, 0,01% - 0,06%, 0,01% - 0,05%, 0,01% - 0,03%, 0,06% - 0,08%, 0,04% - 0,08%, или 0,02% - 0,08% (масс./масс.), например, 0,01%, 0,02%, 0,03%, 0,04%, 0,05%, 0,06%, 0,07%, 0,08%, 0,09% или 0,1% (масс./масс.). В некоторых вариантах осуществления, состав содержит поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,03% - 0,05%, например, 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; забуферивающее средство, содержащее гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ); углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ; и поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,03% - 0,05%, например, 0,04% (масс./масс.), при pH 5-6 (например, 5,5).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 100 мг/мл; забуферивающее средство, содержащее гистидиновый буфер (например, гистидин/гистидин-HCL) в концентрации 20 мМ); углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 220 мМ; и поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,04% (масс./масс.), при pH 5-6 (например, 5,5).

Состав, описанный в настоящем описании, можно хранить в контейнере. Контейнер, используемый для любого из составов, описанных в настоящем описании, может включать, например, флакон, и необязательно, пробку, крышку или обе. В конкретных вариантах осуществления, флакон представляет собой стеклянный флакон, например, флакон из белого стекла 6R. В других вариантах осуществления, пробка представляет собой резиновую пробку например, пробку из серой резины. В других вариантах осуществления, крышка представляет собой обжимной колпачок, например, алюминиевый обжимной колпачок. В некоторых вариантах осуществления, контейнер содержит флакон из белого стекла 6R, пробку из серой резины и алюминиевый обжимной колпачок. В некоторых вариантах осуществления, контейнер (например, флакон) представляет собой одноразовый контейнер. В конкретных вариантах осуществления, 25 мг/мл - 250 мг/мл, например, 50 мг/мл - 200 мг/мл, 60 мг/мл - 180 мг/мл, 70 мг/мл - 150 мг/мл, 80 мг/мл - 120 мг/мл, 90 мг/мл - 110 мг/мл, 50 мг/мл - 150 мг/мл, 50 мг/мл - 100 мг/мл, 150 мг/мл - 200 мг/мл, или 100 мг/мл - 200 мг/мл, например, 50 мг/мл, 60 мг/мл, 70 мг/мл, 80 мг/мл, 90 мг/мл, 100 мг/мл, 110 мг/мл, 120 мг/мл, 130 мг/мл, 140 мг/мл или 150 мг/мл молекулы антитела против TIM-3, присутствует в контейнере (например, флаконе).

В другом аспекте, настоящее изобретение относится к терапевтическим наборам, включающим молекулы антител против TIM-3, композиции, или составы, описанные в настоящем описании, и инструкции для использования, например, в соответствии с режимами дозирования, описанными в настоящем описании.

Терапевтическое применение

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, могут ингибировать, уменьшать или нейтрализовать один или несколько видов активности TIM-3, приводящих к блокированию или уменьшению действия иммунной контрольной точки. Таким образом, молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно использовать для лечения или предотвращения нарушения (например, злокачественной опухоли), когда усиление иммунного ответа у субъекта является желательным.

Соответственно, в другом аспекте, настоящее изобретение относится к способу модуляции иммунного ответа у субъекта. Способ включает введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании, отдельно или в комбинации с одним или несколькими лекарственными средствами, способами или средствами, таким образом, чтобы модулировать иммунный ответ у субъекта. В одном варианте осуществления, молекула антитела усиливает, стимулирует или увеличивает иммунный ответ у субъекта. Субъект может представлять собой млекопитающее, например, примата, предпочтительно, высшего примата, например, человека (например, пациента, имеющего или подверженного риску иметь нарушение, описанное в настоящем описании). В одном варианте осуществления, субъект нуждается в усилении иммунного ответа. В одном варианте осуществления, субъект имеет или подвержен риску иметь нарушение, описанное в настоящем описании, например, злокачественную опухоль или инфекционное нарушение, как описано в настоящем описании. В конкретных вариантах осуществления, субъект имеет или подвержен риску иметь иммунную недостаточность. Например, субъекта подвергают или подвергали лечению с использованием химиотерапевтического средства и/или радиотерапии. Альтернативно или в комбинации, субъект имеет или подвержен риску иметь иммунную недостаточность в результате инфекции.

В одном аспекте, настоящее изобретение относится к способу лечения (например, одного или нескольких из уменьшения, ингибирования, или замедления прогрессирования) злокачественной опухоли или опухоли у субъекта. Способ включает введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании, отдельно или в комбинации с одним или несколькими лекарственными средствами, способами или средствами.

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль, подвергаемая лечению с использованием молекулы антитела против TIM-3, включает, но без ограничения, солидную опухоль, гематологическую злокачественную опухоль (например, лейкоз, лимфому, миелому, например, множественную миелому) и очаг метастазирования. В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль. Примеры солидных опухолей включают злокачественные новообразования, например, саркомы и карциномы, например, аденокарциномы различных систем органов, такие как поражающие легкое, молочную железу, яичники, лимфоидные органы, желудочно-кишечный тракт (например, ободочную кишку), анус, гениталии и мочеполовой тракт (например, почки, уротелий, клетки мочевого пузыря, предстательную железу), глотку, ЦНС (например, головной мозг, нервные или глиальные клетки), голову и шею, кожу (например, меланому) и поджелудочную железу, так же как аденокарциномы, включающие злокачественные новообразования, такие как виды рака ободочной кишки, рак прямой кишки, рак почки (например, почечноклеточную карциному (светлоклеточный или несветлоклеточный почечноклеточный рак), рак печени, рак легких (например, немелкоклеточный рак легких (плоскоклеточный или неплоскоклеточный немелкоклеточный рак легких)), рак тонкого кишечника и рак пищевода. Злокачественная опухоль может находиться на ранней, промежуточной, поздней стадии или на стадии метастазирующей злокачественной опухоли.

В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль выбрана из рака легких (например, немелкоклеточного рака легких (NSCLC) (например, NSCLC с плоскоклеточной и/или неплоскоклеточной гистологией, или аденокарциномы NSCLC) или мелкоклеточного рака легких (SCLC)), рака кожи (например, карциномы из клеток Меркеля или меланомы (например, меланомы на поздних стадиях)), рака яичника, мезотелиомы, рака мочевого пузыря, саркомы мягких тканей (например, гемангиоперицитомы (HPC)), злокачественной опухоли кости (саркомы кости), рака почки (например, рака почки (например, почечноклеточного рака)), рака печени (например, печеночноклеточной карциномы), холангиокарциномы, саркомы, миелодиспластического синдрома (MDS), рака предстательной железы, рака молочной железы (например, рака молочной железы, не экспрессирующего один, два или все из рецептора эстрогена, рецептора прогестерона, или Her2/neu, например, трижды отрицательного рака молочной железы), колоректального рака, злокачественной опухоли носоглотки, злокачественной опухоли двенадцатиперстной кишки, рака эндометрия, рака поджелудочной железы, рака головы и шеи (например, плоскоклеточной карциномы головы и шеи (HNSCC), рака анального канала, рака желудка и пищевода, рака щитовидной железы (например, анапластической карциномы щитовидной железы), рака шейки матки, нейроэндокринной опухоли (NET) (например, атипичной карциноидной опухоли легких), лимфопролиферативного заболевания (например, посттрансплантационного лимфопролиферативного заболевания), лимфомы (например, T-клеточной лимфомы, B-клеточной лимфомы или неходжкинской лимфомы), миеломы (например, множественной миеломы) или лейкоза (например, миелоидного лейкоза или лимфоидного лейкоза).

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак яичника. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак легких, например, мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой мезотелиому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак кожи, например, карциному из клеток Меркеля или меланому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак почки, например, почечноклеточный рак (RCC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак мочевого пузыря. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому мягких тканей, например, гемангиоперицитому (HPC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль кости, например, саркому кости. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой колоректальный рак. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак поджелудочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль носоглотки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак молочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль двенадцатиперстной кишки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак эндометрия. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой аденокарциному, например, аденокарциному неизвестной первичной локализации. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак печени, например, печеночноклеточную карциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой холангиокарциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелодиспластический синдром (MDS) (например, MDS высокого риска).

В другом варианте осуществления, злокачественная опухоль выбрана из карциномы (например, находящейся на поздних стадиях или метастазирующей карциномы), меланомы или карциномы легких, например, немелкоклеточная карцинома легких. В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак легких, например, немелкоклеточный рак легких или мелкоклеточный рак легких. В некоторых вариантах осуществления, немелкоклеточный рак легких представляет собой немелкоклеточный рак легких стадии I (например, стадии Ia или Ib), стадии II (например, стадии IIa или IIb), стадии III (например, стадии IIIa или IIIb) или стадии IV,. В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой меланому, например, меланому на поздних стадиях. В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой находящуюся на поздних стадиях или неоперабельную меланому, не отвечающую на другие способы терапии. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой меланому с мутацией BRAF (например, с мутацией BRAF V600). В другом варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой гепатокарциному, например, находящуюся на поздних стадиях гепатокарциному, в присутствии или в отсутствие вирусной инфекции, например, хронического вирусного гепатита. В другом варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак предстательной железы, например, находящийся на поздних стадиях рак предстательной железы. В другом варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелому, например, множественную миелома. В другом варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак почки, например, почечноклеточный рак (RCC) (например, метастазирующий RCC, несветлоклеточный почечноклеточный рак (nccRCC) или светлоклеточный почечноклеточный рак (CCRCC)).

В одном варианте осуществления, микроокружение злокачественной опухоли имеет увеличенный уровень экспрессии TIM-3. В одном варианте осуществления, микроокружение злокачественной опухоли имеет увеличенный уровень экспрессии PD-L1. Альтернативно или в комбинации, микроокружение злокачественной опухоли может иметь увеличенную экспрессию IFNγ и/или CD8.

В некоторых вариантах осуществления, субъект имеет или идентифицирован как имеющий опухоль, которая имеет одно или несколько из высокого уровня или экспрессии PD-L1, или как являющийся положительным по инфильтрующим опухоль лимфоцитам (TIL)+ (например, как имеющий увеличенное количество TIL), или и то, и другое. В конкретных вариантах осуществления, субъект имеет или идентифицирован как имеющий опухоль, которая имеет высокие уровень или экспрессию PD-L1 и которая является TIL+. В некоторых вариантах осуществления, способы, описанные в настоящем описании, дополнительно включают идентификацию субъекта на основании наличия опухоли, которая имеет одно или несколько из высокого уровня или экспрессии PD-L1, или как являющегося TIL+, или и то, и другое. В конкретных вариантах осуществления, способы, описанные в настоящем описании, дополнительно включают идентификацию субъекта на основании наличия опухоли, которая имеет высокие уровень или экспрессию PD-L1, и как являющегося TIL+. В некоторых вариантах осуществления, опухоли, являющиеся TIL+, являются положительными по CD8 и IFNγ. В некоторых вариантах осуществления, субъект имеет или идентифицирован как имеющий высокий процент клеток, которые являются положительными по одному, двум или более из PD-L1, CD8, и/или IFNγ. В конкретных вариантах осуществления, субъект имеет или идентифицирован как имеющий высокий процент клеток, которые являются положительными по всем из PD-L1, CD8 и IFNγ.

В некоторых вариантах осуществления, способы, описанные в настоящем описании, дополнительно включают идентификацию субъекта на основании наличия высокого процента клеток, которые являются положительными по одному, двум или более из PD-L1, CD8 и/или IFNγ. В конкретных вариантах осуществления, способы, описанные в настоящем описании, дополнительно включают идентификацию субъекта на основании наличия высокого процента клеток, которые являются положительными по всем из PD-L1, CD8 и IFNγ. В некоторых вариантах осуществления, субъект имеет или идентифицирован как имеющий один, два или более из PD-L1, CD8, и/или IFNγ, и одно или несколько из рака легких, например, плоскоклеточного рака легких или аденокарциномы легких (например, NSCLC); рака головы и шеи; плоскоклеточного рака шейки матки; рака желудка; рака пищевода; рака щитовидной железы (например, анапластической карциномы щитовидной железы); рака кожи (например, карциномы из клеток Меркеля или меланомы), рака молочной железы (например, NTBC) и/или злокачественной опухоли носоглотки (NPC). В конкретных вариантах осуществления, способы, описанные в настоящем описании, дополнительно описывают идентификацию субъекта на основании наличия одного, двух или более из PD-L1, CD8 и/или IFNγ, и одного или нескольких из рака легких, например, плоскоклеточного рака легких или аденокарциномы легких (например, NSCLC); рака головы и шеи; плоскоклеточного рака шейки матки; рака желудка; рака щитовидной железы (например, анапластической карциномы щитовидной железы); рака кожи (например, карциномы из клеток Меркеля или меланомы), нейроэндокринной опухоли, рака молочной железы (например, NTBC), и/или злокачественной опухоли носоглотки.

Способы, композиции, и составы, описанные в настоящем описании, можно использовать для лечения очагов метастазирования, ассоциированных с вышеупомянутыми злокачественными опухолями.

В следующем аспекте, настоящее изобретение относится к способу лечения инфекционного заболевания (например, инфекционного заболевания, описанного в настоящем описании) у субъекта, включающему введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании.

Кроме того, настоящее изобретение относится к способу усиления иммунного ответа на антиген у субъекта, включающему введение субъекту: (i) антигена; и (ii) молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании, таким образом, чтобы усиливать иммунный ответ на антиген у субъекта. Антиген может представлять собой, например, антиген опухоли, вирусный антиген, бактериальный антиген или антиген из патогена.

Молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании можно вводить субъекту системно (например, перорально, парентерально, подкожно, внутривенно, ректально, внутримышечно, внутрибрюшинно, интраназально, чрескожно или посредством ингаляции или внутриполостной инсталляции), местно или посредством нанесения на слизистые оболочки, например, носа, горла и бронхиол. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3, внутривенно, в постоянной дозе, описанной в настоящем описании.

Виды комбинированной терапии

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно использовать в комбинации с другими лекарственными средствами, способами или средствами.

В одном варианте осуществления, способы, описанные в настоящем описании, включают введение субъекту комбинации, содержащей молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, в комбинации с лекарственным средством, способом или средством, в количестве, эффективном для лечения или предотвращения нарушения. В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании. В других вариантах осуществления, молекулу антитела вводят или используют в форме композиции или состава, описанных в настоящем описании.

Молекулу антитела против TIM-3 и лекарственное средство, способ или средство можно вводить или использовать, одновременно или последовательно в любом порядке. Можно использовать любую комбинацию и последовательность молекулы антитела против TIM-3 и лекарственного средства, способа или средства (например, как описано в настоящем описании). Молекулу антитела и/или лекарственное средство, способ или средство можно вводить или использовать во время периодов активного нарушения, или во время периода ремиссии или менее активного заболевания. Молекулу антитела можно вводить до, во время или после лечения с использованием лекарственного средства, способа или средства.

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят в комбинации с одним или несколькими из других молекул антител, химиотерапии, другой противораковой терапии (например, видов направленной противораковой терапии, генотерапии, вирусной терапии, РНК-терапии, трансплантации костного мозга, нанотерапии или онколитических лекарственных средств), цитотоксических средств, видов терапии на иммунной основе (например, видов иммунотерапии на основе цитокинов или клеток), хирургических процедур (например, лампэктомии или мастэктомии) или радиологических процедур, или комбинации любых из вышеуказанных. Дополнительная терапия может присутствовать в форме адъювантной или неоадъювантной терапии. В некоторых вариантах осуществления, дополнительная терапия представляет собой ингибитор фермента (например, низкомолекулярный ингибитор фермента) или ингибитор метастазирования. Иллюстративные цитотоксические средства, которые можно вводить в комбинации, включают средства против микротрубочек, ингибиторы топоизомеразы, антиметаболиты, ингибиторы митоза, алкилирующие средства, антрациклины, алкалоиды барвинка, интеркалирующие средства, средства, способные создавать помехи для пути передачи сигнала, средства, стимулирующие апоптоз, ингибиторы протеасом и радиоактивное облучение (например, локальное или тотальное облучение организма (например, гамма-радиоактивное облучение). В других вариантах осуществления, дополнительная терапия представляет собой хирургию или радиоактивное облучение, или их комбинацию. В других вариантах осуществления, дополнительная терапия представляет собой терапию, нацеленную на один или несколько из пути PI3K/AKT/mTOR, ингибитора HSP90 или ингибитора тубулина.

Альтернативно или в комбинации с вышеуказанными комбинациями, антитело против TIM-3, описанное в настоящем описании, можно вводить или использовать в комбинации с одним или несколькими из: иммуномодулятора (например, активатора костимулирующей молекулы или ингибитора ингибирующей молекулы, например, молекулы иммунной контрольной точки); вакцины, например, терапевтической противораковой вакцины; или других форм клеточной иммунотерапии.

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с модулятором костимулирующей молекулы или ингибирующей молекулы, например, коингибирующим лигандом или рецептором.

В одном варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с модулятором, например, агонистом, костимулирующей молекулы. В одном варианте осуществления, агонист костимулирующей молекулы выбран из агониста (например, агонистического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или растворимого слитого белка) лиганда OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 или CD83.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с агонистом GITR, например, молекулой антитела против GITR.

В одном варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором ингибирующей молекулы (или молекулы иммунной контрольной точки), выбранным из PD-L1, PD-L2, CTLA-4, TIM-3, LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGF-бета. В одном варианте осуществления, ингибитор представляет собой растворимый лиганд (например, CTLA-4-Ig), или антитело или фрагмент антитела, связывающий PD-1, LAG-3, PD-L1, PD-L2 или CTLA-4.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором PD-1, например, молекулой антитела против PD-1. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором LAG-3, например, молекулой антитела против LAG-3. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором PD-L1, например, молекулой антитела против PD-L1.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором PD-1 (например, молекулой антитела против PD-1) и ингибитором LAG-3 (например, молекулой антитела против LAG-3). В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором PD-1 (например, молекулой антитела против PD-1) и ингибитором PD-L1 (например, молекулой антитела против PD-L1). В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором LAG-3 (например, молекулой антитела против LAG-3) и ингибитором PD-L1 (например, молекулой антитела против PD-L1).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором CEACAM (например, ингибитором CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), например, молекулой антитела против CEACAM. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с ингибитором CEACAM-1, например, молекулой антитела против CEACAM-1. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с ингибитором CEACAM-3, например, молекулой антитела против CEACAM-3. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят или используют в комбинации с ингибитором CEACAM-5, например, молекулой антитела против CEACAM-5.

Комбинацию молекул антител, описанных в настоящем описании, можно вводить отдельно, например, в форме отдельных молекул антител, или связанными, например, в форме биспецифической или триспецифической молекулы антитела. В одном варианте осуществления, вводят биспецифическое антитело, включающее молекулу антитела против TIM-3 и молекулу антитела против PD-1, против CEACAM (например, против CEACAM-1, CEACAM-3 и/или против CEACAM-5), против PD-L1 или против LAG-3. В конкретных вариантах осуществления, комбинацию антител, описанных в настоящем описании, используют для лечения злокачественной опухоли, например, злокачественной опухоли, как описано в настоящем описании (например, солидной опухоли или гематологического злокачественного новообразования).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, например, ниволумаба, необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором VEGF (например, бевацизумабом), интерфероном-гамма, агонистом CD27 (например, варлилумабом), ингибитором IDO (например, эпакадостатом), ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), ингибитором CSF1R (например, кабирализумабом), агонистом OX40 (например, BMS 986178) или ингибитором KIR (например, лирилумабом), или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, например, пембролизумабом, необязательно, дополнительно в комбинации с химиотерапией (например, карбоплатином, паклитакселом, доксорубицином, гемцитабином, цисплатином или азацитидином), ингибитором DNMT (например, гвадецитабином), ингибитором рецепторной тирозинкиназы (например, нинтеданибом), ингибитором CSF1R (например, пексидартинибом или ARRY-382), ингибитором BTK (например, акалабрутинибом), ингибитором PARP (например, нирапарибом), ингибитором IDO (например, эпакадостатом), иммуноконъюгатом, нацеленным на FOLR1 (например, мирветуксимабом соравтанзином), ингибитором B7-H3 (например, эноблитузумабом) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, например, атезолизумабом, необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором ANG2/VEGF (например, вануцизумабом), ингибитором CSF1R (например, эмактузумабом), химиотерапией (например, доксорубицином или химиотерапией на основе платины, необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором VEGF (например, бевацизумабом)) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, например, дурвалумабом, необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором CTLA-4 (например, тремелимумабом), химиотерапией (например, карбоплатином, паклитакселом или азацитидином), ингибитором PARP (например, олапарибом), ингибитором VEGF (например, цедиранибом), противораковой вакциной (например, мультиэпитопной пептидной вакциной против фолатного рецептора TPIV 200), агонистом TLR8 (например, мотолимодом) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, например, авелумабом, необязательно, дополнительно в комбинации с химиотерапией (например, карбоплатином, паклитакселом или доксорубицином), ингибитором HDAC (например, энтиностатом), ингибитором FAK (например, дефактинибом) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с агонистом TLR8 (например, мотолимодом), химиотерапевтическим средством (например, доксорубицином, паклитакселом, карбоплатином, блеомицином, этопозидом, доцетакселом или дазатинибом), агонистом OX40 (например, BMS 986178 или INCAGN-1949), ингибитором CSF1R (например, эмактузумабом или пексидартинибом), ингибитором VEGF (например, бевацизумабом), ингибитором NKG2 (например, монализумабом), ингибитором B7-H3 (например, эноблитузумабом), ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), рекомбинантным интерлейкином-10 (например, пегилированным рекомбинантным человеческим интерлейкином-10 AM0010), агонистом CD40 (например, RG-7876), ингибитором ANG2/VEGF (например, вануцизумабом), молекулой, нацеленной как на B7-H3, так и на CD3 (например, MGD-009), ингибитором PD-L1/VISTA (например, CA-170), ингибитором IDO (например, эпакадостатом), вакциной (например, ANZ-207, DPX-Survivac, CDX1401 или вакциной из экспрессирующих би-кшРНК-фурин/GMCSF аутологичных клеток опухоли (VIGIL®)), ингибитором CEACAM (например, MK-6018), ингибитором PARP (например, олапарибом или BGB-290), гормоном (например, лейпрорелином), ингибитором MIF (например, ингибитором PD-L1/VISTA) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с ингибитором CTLA-4, например, молекулой антитела против CTLA-4 (например, ипилимумаба).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1 (например, авелумаба).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, например, авелумаба, необязательно, дополнительно в комбинации с локализованной радиотерапией, рекомбинантным интерфероном-бета, специфической для MCPyV TAg поликлональной аутологичной CD8-положительной T-клеточной вакциной или их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с полученным способом генной инженерии онколитическим вирусом (например, Talimogene laherparepvec), необязательно, дополнительно в комбинации с радиотерапией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1 (например, ниволумаба) и/или молекулой антитела против CTLA-4 (например, ипилимумаба), необязательно, дополнительно в комбинации с радиотерапией (например, стереотаксической радиотерапией тела (SBRT)).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1 (например, ниволумаба), в комбинации с полученным способом генной инженерии онколитическим вирусом (например, Talimogene laherparepvec).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1 (например, атезолизумаба) и ингибитором VEGF (например, молекулой антитела против VEGF, например, бевацизумаба).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1 (например, дурвалумаба) в комбинации с иммуностимулятором (например, поли-ICLC), необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором CTLA-4, например, молекулой антитела против CTLA-4 (например, тремелимумаба).

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, например, ниволумаба, необязательно, дополнительно в комбинации с химиотерапевтическим средством, интерфероном-гамма, ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), конъюгатом антитело-лекарственное средство (например, ровалпитузумабом тезирином), ингибитором CXCR4 (например, улокуплумабом), агонистом OX40 (например, BMS 986178) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, например, пембролизумаба, необязательно, дополнительно в комбинации с химиотерапевтическим средством (например, химиотерапевтическим средством на основе платины, паклитакселом, этопозидом или иринотеканом), слитым белком (например, слитым белком DEC-205/NY-ESO-1 CDX-1401), радиотерапией или любой их комбинацией.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с гипометилирующим средством (например, децитабином), необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором PD-1 (например, ингибитором PD-1, описанным в настоящем описании), например, молекулой антитела против PD-1 (например, молекулой антитела против PD-1), например, PDR001. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, например, атезолизумаба, необязательно, дополнительно в комбинации с химиотерапевтическим средством (например, карбоплатином или этопозидом), интерфероном-гамма, ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), конъюгатом антитело-лекарственное средство (например, ровалпитузумабом тезирином), ингибитором CXCR4 (например, улокуплумабом), агонистом OX40 (например, BMS 986178) или любой их комбинацией.

В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, например, дурвалумаба, необязательно, в комбинации с ингибитором CTLA-4 (например, тремелимумабом), химиотерапевтическим средством (например, карбоплатином или этопозидом), ингибитором PARP (например, олапарибом), радиотерапией или любой их комбинацией. В другом варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят или используют в комбинации с агонистом OX40 (например, BMS 986178), ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом) или обоими.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с цитокином. Цитокин можно вводить в форме молекулы, слитой с молекулой антитела против TIM-3, или в форме отдельных композиций. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с одним, двумя, тремя или более цитокинами, например, в форме слитой молекулы или в форме отдельных композиций. В одном варианте осуществления, цитокин представляет собой интерлейкин (IL), выбранный из одного, двух, трех или более из IL-1, IL-2, IL-12, IL-15 или IL-21. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела имеет первую специфичность связывания для первой мишени (например, для TIM-3), вторую специфичность связывания для второй мишени (например, PD-1, LAG-3 или PD-L1) и является, необязательно, связанной с доменом интерлейкина (например, IL-12) например, полноразмерным IL-12 или его частью. В конкретных вариантах осуществления, комбинацию молекулы антитела против TIM-3 и цитокина, описанную в настоящем описании, используют для лечения злокачественной опухоли, например, злокачественной опухоли, как описано в настоящем описании (например, солидной опухоли).

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с антителом, специфическим против HLA C, например, антителом, специфическим для иммуноглобулиноподобных рецепторов клеток-киллеров (также обозначенным в настоящем описании как «антитело против KIR»). В конкретных вариантах осуществления, комбинацию молекулы антитела против TIM-3 и антитела против KIR используют для лечения злокачественной опухоли, например, злокачественной опухоли, как описано в настоящем описании (например, солидной опухоли, например, находящейся на поздних стадиях солидной опухоли).

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с клеточной иммунотерапией (например, PROVENGE® (например, Sipuleucel-T)), и необязательно, в комбинации с циклофосфамидом. В конкретных вариантах осуществления, комбинацию молекулы антитела против TIM-3, PROVENGE® и/или циклофосфамида используют для лечения злокачественной опухоли, например, злокачественной опухоли, как описано в настоящем описании (например, рака предстательной железы, например, находящегося на поздних стадиях рака предстательной железы).

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с вакциной, например, противораковой вакциной, (например, вакциной из дендритных клеток карциномы почки (DC-RCC)). В одном варианте осуществления, вакцина представляет собой вакцину на основе пептида, на основе ДНК, на основе РНК или на основе антигена, или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления, вакцина содержит один или несколько пептидов, нуклеиновых кислот (например, ДНК или РНК), антигенов или их комбинаций. В конкретных вариантах осуществления, комбинацию молекулы антитела против TIM-3 и вакцины DC-RCC используют для лечения злокачественной опухоли, например, злокачественной опухоли, как описано в настоящем описании (например, карциномы почки, например, метастазирующего почечноклеточного рака (RCC) или светлоклеточного почечноклеточного рака (CCRCC)).

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с адъювантом.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с химиотерапией и/или иммунотерапией. Например, молекулу антитела против TIM-3 можно использовать для лечения миеломы, отдельно или в комбинации с одним или несколькими из: химиотерапии или других противораковых средств (например, аналогов талидомида, например, леналидомида), молекул антитела против PD-1, сенсибилизированных антигеном опухоли дендритных клеток, слияний (например, электрослияний) клеток опухолей и дендритных клеток или вакцинации с использованием идиотипа иммуноглобулина, продуцируемого злокачественными плазматическими клетками. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с молекулой антитела против PD-1 для лечения миеломы, например, множественной миеломы

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с химиотерапией для лечения рака легких, например, немелкоклеточного рака легких. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют со стандартной химиотерапией легких, например, NSCLC, например, двухкомпонентной химиотерапией препаратами платины, для лечения рака легких. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с ингибитором индолeамин-пиррол-2,3-диоксигеназы (IDO) (например, (4E)-4-[(3-хлор-4-фторанилино)-нитрозометилиден]-1,2,5-оксадиазол-3-амином (также известным как INCB24360), индоксимодом (1-метил-D-триптофаном), α-циклогексил-5H-имидазо[5,1-a]изоиндол-5-этанолом (также известным как NLG919) и т.д.) у субъекта с находящейся на поздних стадиях или метастазирующей злокачественной опухолью (например, у пациента с метастазирующей и рецидивирующей злокачественной опухолью NSCL).

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с одним или несколькими из: средств на основе иммунитета (например, интерлейкина-2 или интерферона-α), нацеливающего средства (например, ингибитора VEGF, такого как моноклональное антитело против VEGF); ингибитора тирозинкиназы VEGF, такого как сунитиниб, сорафениб, акситиниб и пазопаниб; ингибитора РНКи; или ингибитора нижестоящего медиатора передачи сигналов VEGF, например, ингибитора мишени рапамицина млекопитающих (mTOR), например, эверолимуса и темсиролимуса. Любую из таких комбинаций можно использовать для лечения рака почки, например, почечноклеточного рака (RCC) (например, светлоклеточного почечноклеточного рака (CCRCC) или несветлоклеточного почечноклеточного рака (nccRCC) или метастазирующего RCC, или рака печени (например, печеночноклеточной карциномы).

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с ингибитором MEK (например, ингибитором MEK, как описано в настоящем описании). В некоторых вариантах осуществления, комбинацию молекулы антитела против TIM-3 и ингибитора MEK используют для лечения злокачественной опухоли (например, злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании). В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль, подвергаемая лечению с использованием комбинации, выбрана из меланомы, колоректального рака, немелкоклеточного рака легких, рака яичника, рака молочной железы, рака предстательной железы, рака поджелудочной железы, гематологического злокачественного новообразования или почечноклеточного рака. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль содержит мутацию BRAF (например, мутацию BRAF V600E), BRAF дикого типа, KRAS дикого типа или активирующую мутацию KRAS. Злокачественная опухоль может находиться на ранней, промежуточной или поздней стадии.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с одним, двумя или всеми из оксалиплатина, лейковорина или 5-FU (например, совместная терапия FOLFOX). Альтернативно или в комбинации, комбинация дополнительно включает ингибитор VEGF (например, ингибитор VEGF, как описано в настоящем описании). В некоторых вариантах осуществления, комбинацию молекулы антитела против TIM-3, совместной терапии FOLFOX и ингибитора VEGF используют для лечения злокачественной опухоли (например, злокачественной опухоли, описанной в настоящем описании). В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль, подвергаемая лечению с использованием этой комбинации, выбрана из меланомы, колоректального рака, немелкоклеточного рака легких, рака яичника, рака молочной железы, рака предстательной железы, рака поджелудочной железы, гематологического злокачественного новообразования или почечноклеточного рака. Злокачественная опухоль может находиться на ранней, промежуточной или поздней стадии.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют с ингибитором тирозинкиназы (например, акситинибом) для лечения почечноклеточного рака и других солидных опухолей.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют с нацеливающим на рецептор 4-1BB средством (например, антителом, стимулирующим передачу сигналов посредством 4-1BB (CD-137), например, PF-2566). В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют в комбинации с ингибитором тирозинкиназы (например, акситинибом) и нацеливающим на рецептор 4-1BB средством.

Молекула антитела против TIM-3 может являться связанной с веществом, например, цитотоксическим средством или группой (например, терапевтическим лекарственным средством; соединением, испускающим радиоактивное излучение; молекулами, происходящими из растений, грибов или бактерий; или биологическим белком (например, белковым токсином) или частицей (например, рекомбинантной вирусной частицей, например, посредством белка вирусной оболочки). Например, антитело может являться связанным с радиоактивным изотопом, таким как α-, β- или γ-излучатель, или β-и γ-излучатель.

Иммуномодуляторы

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно использовать в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами.

В конкретных вариантах осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор молекулы иммунной контрольной точки. В одном варианте осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA-4, LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGF-бета. В одном варианте осуществления, ингибитор молекулы иммунной контрольной точки ингибирует PD-1, PD-L1, LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), CTLA-4 или любую их комбинацию.

Ингибирование ингибирующей молекулы можно осуществлять на уровне ДНК, РНК или белка. В некоторых вариантах осуществления, ингибирующую нуклеиновую кислоту (например, дцРНК, миРНК или кшРНК), можно использовать для ингибирования экспрессии ингибирующей молекулы. В других вариантах осуществления, ингибитор ингибирующего сигнала представляет собой полипептид, например, растворимый лиганд (например, PD-1-Ig или CTLA-4 Ig), или молекулу антитела, связывающую ингибирующую молекулу; например, молекулу антитела, связывающую PD-1, PD-L1, PD-L2, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), CTLA-4, LAG-3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGF-бета, или их комбинацию.

В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 находится в форме биспецифической или мультиспецифической молекулы антитела. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела имеет первую специфичность связывания с TIM-3 и вторую специфичность связывания, например, вторую специфичность связывания с PD-1, PD-L1, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), LAG-3 или PD-L2. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает (i) PD-1 или PD-L1 (ii) и TIM-3. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает TIM-3 и LAG-3. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает TIM-3 и CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5). В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает TIM-3 и CEACAM-1. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает TIM-3 и CEACAM-3. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает TIM-3 и CEACAM-5.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 используют в комбинации с биспецифической или мультиспецифической молекулой антитела. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает PD-1 или PD-L1. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает PD-1 и PD-L2. В другом варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела связывает CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) и LAG-3.

Любую комбинацию вышеуказанных молекул можно получать в мультиспецифической молекуле антитела, например, триспецифическом антителе, включающем первую специфичность связывания для TIM-3 и вторую и третью специфичности связывания для двух или более из: PD-1, PD-L1, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), LAG-3 или PD-L2.

В конкретных вариантах осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-1, например, PD-1 человека. В другом варианте осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-L1, например, PD-L1 человека. В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 или PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-1 или PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-1 или против PD-L1, как описано в настоящем описании).

Комбинация ингибитора PD-1 или PD-L1 с молекулой антитела против TIM-3 может дополнительно включать один или несколько дополнительных иммуномодуляторов, например, в комбинации с ингибитором LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) или CTLA-4. В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 или PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-1 или PD-L1) вводят в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 и ингибитором LAG-3 (например, молекулой антитела против LAG-3). В другом варианте осуществления, ингибитор PD-1 или PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-1 или PD-L1) вводят в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 и ингибитором CEACAM (например, ингибитором CEACAM-1, -3 и/или -5), например, молекулой антитела против CEACAM. В другом варианте осуществления, ингибитор PD-1 или PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-1 или PD-L1) вводят в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 и ингибитором CEACAM-1 (например, молекулой антитела против CEACAM-1). В другом варианте осуществления, ингибитор PD-1 или PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-1 или PD-L1) вводят в комбинации с молекулой антитела против TIM-3 и ингибитором CEACAM-5 (например, молекулой антитела против CEACAM-5). В других вариантах осуществления, ингибитор PD-1 или PD-L1 (например, молекулу антитела против PD-1 или PD-L1) вводят в комбинации с молекулой антитела против TIM-3, ингибитором LAG-3 (например, молекулой антитела против LAG-3) и ингибитором TIM-3 (например, молекулой антитела против TIM-3). Другие комбинации иммуномодуляторов с молекулой антитела против TIM-3 и ингибитором PD-1 (например, одним или несколькими из PD-L2, CTLA-4, LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGF-бета) также включены в настоящее изобретение. Любые из молекул антител, известных в данной области или описанных в настоящем описании, можно использовать в вышеуказанных комбинациях ингибиторов молекул контрольных точек.

В других вариантах осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), например, CEACAM человека (например, CEACAM-1, -3 и/или -5). В одном варианте осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор CEACAM-1, например, CEACAM-1 человека. В другом варианте осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор CEACAM-3, например, CEACAM-3 человека. В другом варианте осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор CEACAM-5, например, CEACAM-5 человека. В одном варианте осуществления, ингибитор CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) представляет собой молекулу антитела против CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5). Комбинация ингибитора CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) и молекулы антитела против TIM-3 может дополнительно включать один или несколько дополнительных иммуномодуляторов, например, в комбинации с ингибитором LAG-3, PD-1, PD-L1 или CTLA-4.

В других вариантах осуществления, иммуномодулятор представляет собой ингибитор LAG-3, например, LAG-3 человека. В одном варианте осуществления, ингибитор LAG-3 представляет собой молекулу антитела против LAG-3. Комбинация ингибитора LAG-3 и молекулы антитела против TIM-3 может дополнительно включать один или несколько дополнительных иммуномодуляторов, например, в комбинации с ингибитором CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), PD-1, PD-L1 или CTLA-4.

В конкретных вариантах осуществления, иммуномодулятор, используемый в комбинациях, описанных в настоящем описании (например, в комбинации с лекарственным средством, выбранным из из антигенпредставляющей комбинации) представляет собой активатор или агонист костимулирующей молекулы. В одном варианте осуществления, агонист костимулирующей молекулы выбран из агониста (например, агонистического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или растворимого слитого белка) лиганда OX40, CD2, CD27, CD28, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 или CD83.

В других вариантах осуществления, иммуномодулятор представляет собой агонист GITR. В одном варианте осуществления, агонист GITR представляет собой молекулу антитела против GITR. Молекула антитела против GITR и молекула антитела против TIM-3 могут находиться в форме композиции отдельных антител, или в форме молекулы биспецифического антитела. Комбинация агониста GITR с молекулой антитела против TIM-3 может дополнительно включать один или несколько дополнительных иммуномодуляторов, например, в комбинации с ингибитором PD-1, PD-L1, CTLA-4, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) или LAG-3. В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой биспецифическое антитело, связывающее GITR и PD-1, PD-L1, CTLA-4, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5), или LAG-3. В других вариантах осуществления, агонист GITR можно вводить в комбинации с одним или несколькими дополнительными активаторами костимулирующих молекул, например, агонистом лиганда OX40, CD2, CD27, CD28, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 или CD83.

В других вариантах осуществления, иммуномодулятор представляет собой агонист OX40. В одном варианте осуществления, агонист OX40 представляет собой молекулу антитела против OX40. Молекула антитела против OX40 и молекула антитела против TIM-3 могут находиться в форме композиции отдельных антител, или в форме молекулы биспецифического антитела. Комбинация агониста OX40 с молекулой антитела против TIM-3 может дополнительно включать один или несколько дополнительных иммуномодуляторов, например, в комбинации с ингибитором PD-1, PD-L1, CTLA-4, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) или LAG-3. В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела против OX40 представляет собой биспецифическое антитело, связывающее OX40 и PD-1, PD-L1, CTLA-4, CEACAM (например, CEACAM-1, -3 и/или -5) или LAG-3. В других вариантах осуществления, агонист OX40 можно вводить в комбинации с другой костимулирующей молекулой, например, агонистом лиганда GITR, CD2, CD27, CD28, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3 или CD83.

Следует отметить, что только иллюстративные комбинации ингибиторов из ингибиторов контрольных точек или агонистов костимулирующих молекул представлены в настоящем описании. Дополнительные комбинации этих средств включены в объем настоящего изобретения.

Биомаркеры

В конкретных вариантах осуществления, любой из способов, описанных в настоящем описании дополнительно включает, оценку или мониторирование эффективности терапии (например, монотерапии или комбинированной терапии), описанной в настоящем описании, у субъекта (например, у субъекта, имеющего злокачественную опухоль, например, злокачественную опухоль, описанную в настоящем описании). Способ включает получение значения эффективности терапии, где указанное значение является показателем эффективность терапии.

В некоторых вариантах осуществления, значение эффективности терапии содержит показатель одного, двух, трех, четырех, пяти, шести, семи, восьми, девяти или более (например, всех) из следующего:

(i) параметр фенотипа инфильтрующих опухоль лимфоцитов (TIL);

(ii) параметр популяции миелоидных клеток;

(iii) параметр экспрессии поверхностного маркера;

(iv) параметр биомаркера иммунологического ответа;

(v) параметр системной модуляции цитокина;

(vi) параметр свободной циркулирующей ДНК (сцДНК);

(vii) параметр системной иммуномодуляции;

(viii) параметр микробиома;

(ix) параметр маркера активации циркулирующего иммуноцита; или

(x) параметр циркулирующего цитокина.

В некоторых вариантах осуществления, параметр фенотипа TIL включает уровень или активность одного, двух, трех, четырех или более (например, всех) из окрашивания гематоксилином и эозином (H&E) для подсчета TIL, CD8, FOXP3, CD4 или CD3, у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце опухоли).

В некоторых вариантах осуществления, параметр популяции миелоидных клеток включает уровень или активность одного или обоих из CD68 или CD163, у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце опухоли).

В некоторых вариантах осуществления, параметр экспрессии поверхностного маркера включает уровень или активность одного, двух, трех или более (например, всех) из TIM-3, PD-1, PD-L1 или LAG-3, у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце опухоли). В конкретных вариантах осуществления, уровень TIM-3, PD-1, PD-L1 или LAG-3 определяют посредством иммуногистохимии (IHC). В конкретных вариантах осуществления, определяют уровень TIM-3.

В некоторых вариантах осуществления, параметр биомаркера иммунологического ответа включает уровень или последовательность одного или нескольких маркеров на основе нуклеиновой кислоты, у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце опухоли).

В некоторых вариантах осуществления, параметр системной модуляции цитокина включает уровень или активность одного, двух, трех, четырех, пяти, шести, семи, восьми или более (например, всех) из IL-18, IFN-γ, ITAC (CXCL11), IL-6, IL-10, IL-4, IL-17, IL-15 или TGF-бета, у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце крови, например, в образце плазмы).

В некоторых вариантах осуществления, параметр сцДНК включает последовательность или уровень одной или нескольких молекул циркулирующей ДНК опухоли (сцДНК), у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце крови, например, в образце плазмы).

В некоторых вариантах осуществления, параметр системной иммуномодуляции включает фенотипическую характеризацию активированного иммуноцита, например, экспрессирующей CD3 клетки, экспрессирующей CD8 клетки, или обеих, у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце крови, например, в образце PBMC).

В некоторых вариантах осуществления, параметр микробиома включает последовательность или уровень экспрессии одного или нескольких генов в микробиоме у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце фекалий).

В некоторых вариантах осуществления, параметр маркера активации циркулирующего иммуноцита включает уровень или активность одного, двух, трех, четырех, пяти или более (например, всех) из циркулирующих CD8+, HLA-DR+Ki67+, T-клеток, экспрессирующих IFN-γ, IL-18 или CXCL11 (индуцированных IFN-γ CCK) клеток, в образце (например, в образце крови, например, в образце плазмы).

В некоторых вариантах осуществления, параметр циркулирующего цитокина включает уровень или активность IL-6 у субъекта, например, в образце от субъекта (например, в образце крови, например, в образце плазмы).

В некоторых вариантах осуществления любого из способов, описанных в настоящем описании, терапия включает комбинацию молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, и второго ингибитора молекулы иммунной контрольной точки, например, ингибитора PD-1 (например, молекулы антитела против PD-1) или ингибитора PD-L1 (например, молекулы антитела против PD-L1).

В некоторых вариантах осуществления любого из способов, описанных в настоящем описании, показатель одного или нескольких из (i)-(x) получают в образце, полученном от субъекта. В некоторых вариантах осуществления, образец выбран из образца опухоли, образца крови (например, образца плазмы или образца PBMC) или образца фекалий.

В некоторых вариантах осуществления любого из способов, описанных в настоящем описании, субъекта оценивают до подвергания, во время или после подвергания терапии.

В некоторых вариантах осуществления любого из способов, описанных в настоящем описании, показатель одного или нескольких из (i)-(x) оценивает профиль для одной или нескольких из экспрессии гена, проточной цитометрии или экспрессии белка.

В некоторых вариантах осуществления любого из способов, описанных в настоящем описании, присутствие увеличенных уровня или активности одного, двух, трех, четырех, пяти или более (например, всех) из циркулирующих CD8+, HLA-DR+Ki67+, T-клеток, экспрессирующих IFN-γ, IL-18 или CXCL11 (индуцированных IFN-γ CCK) клеток, и/или присутствие уменьшенных уровня или активности IL-6 у субъекта или в образце, является положительным прогностическим фактором эффективности терапии.

Альтернативно или в комбинации со способами, описанными в настоящем описании, в зависимости от указанного значения, проводят одно, два, три, четыре или более (например, все) из:

(i) подвергания субъекта терапии;

(ii) введения измененной дозы терапии;

(iii) изменения расписания или временных рамок терапии;

(iv) введения субъекту дополнительного средства (например, лекарственного средства, описанного в настоящем описании) в комбинации с терапией; или

(v) подвергания субъекта альтернативной терапии.

Дополнительные варианты осуществления

В конкретных вариантах осуществления, любой из способов, описанных в настоящем описании, дополнительно включает идентификацию у субъекта или в образце (например, в образце от субъекта, содержащем клетки злокачественных опухолей и/или иммуноциты, такие как TIL) присутствия TIM-3, таким образом, получение значения для TIM-3. Способ может дополнительно включать сравнение значения для TIM-3 с эталонным значением, например, с контрольным значением. Если значение для TIM-3 превышает эталонное значение, например, контрольное значение, введение терапевтически эффективного количества молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, субъекту, и необязательно, в комбинации с вторым лекарственным средством, способом или средством, описанным в настоящем описании, таким образом, лечение злокачественной опухоли.

В других вариантах осуществления, любой из способов, описанных в настоящем описании, дополнительно включает идентификацию у субъекта или в образце (например, в образце от субъекта, содержащем клетки злокачественных опухолей и/или иммуноциты, такие как TIL) присутствия PD-L1, таким образом, получение значения для PD-L1. Способ может дополнительно включать сравнение значения для PD-L1 с эталонным значением, например, с контрольным значением. Если значение для PD-L1 превышает эталонное значение, например, контрольное значение, введение терапевтически эффективного количества молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, субъекту, и необязательно, в комбинации с вторым лекарственным средством, способом или средством, описанным в настоящем описании, таким образом, лечение злокачественной опухоли.

В других вариантах осуществления, любой из способов, описанных в настоящем описании, дополнительно включает идентификацию у субъекта или в образце (например, в образце от субъекта, содержащем клетки злокачественных опухолей и необязательно, иммуноциты, такие как TIL) присутствия одного, двух или всех из PD-L1, CD8 или IFN-γ, таким образом, получение значения для одного, двух или всех из PD-L1, CD8 и IFN-γ. Способ может дополнительно включать сравнение значений для PD-L1, CD8 и/или IFN-γ с эталонным значением, например, с контрольным значением. Если значения для PD-L1, CD8 и/или IFN-γ превышают эталонное значение, например, контрольные значения, введение терапевтически эффективного количества молекулы антитела против TIM-3, описанного в настоящем описании, субъекту, и необязательно, в комбинации с вторым лекарственным средством, способом или средством, описанным в настоящем описании, таким образом, лечение злокачественной опухоли.

Субъект может иметь злокачественную опухоль, описанную в настоящем описании, такую как солидная опухоль или гематологическая злокачественная опухоль, например, рак яичника, рак легких (например, мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC)), мезотелиома, рак кожи (например, карцинома из клеток Меркеля (MCC) или меланома), рак почки (например, почечноклеточный рак), рак мочевого пузыря, саркома мягких тканей (например, гемангиоперицитома (HPC)), злокачественная опухоль кости (например, саркома кости), колоректальный рак, рак поджелудочной железы, злокачественная опухоль носоглотки, рак молочной железы, злокачественная опухоль двенадцатиперстной кишки, рак эндометрия, аденокарцинома (аденокарцинома неизвестной первичной локализации), рак печени (например, печеночноклеточная карцинома), холангиокарцинома, саркома, миелодиспластический синдром (MDS) (например, MDS высокого риска), лейкоз (например, острый миелоидный лейкоз (AML), например, рецидивирующий или невосприимчивый AML, или AML de novo), лимфома или миелома.

Полное содержание всех публикаций, патентных заявок, патентов и других ссылок, упомянутых в настоящем описании, приведено путем ссылки.

Другие признаки, объекты и преимущества изобретения станут очевидными из описания и чертежей, и из формулы изобретения.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ

TIM-3 конститутивно экспрессируется на множестве врожденных иммуноцитов, например, миелоидных клеток. Экспрессия индуцируется на активированных и регуляторных T-клетках. Лиганды для TIM-3 включают, например, PtdSer, CEACAM1, HMGB1 и галектин-9. Блокирование антителами против TIM-3 может восстанавливать активность эффекторных клеток, уменьшать супресорную активность T-рег, и усиливать противоопухолевую и противовирусную активность антител против PD-1/PD-L1. Без намерения быть связанными теорией, считают, что в конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3, описанная в настоящем описании, может блокировать взаимодействие TIM-3/PtdSer, увеличивать секрецию воспалительных цитокинов из миелоидных клеток, усиливать ответ MLR in vitro, восстанавливать функцию дисфункциональных CD8+ T-клеток и депрограммировать активные внутриопухолевые T-рег, опухолеассоциированные дендритные клетки и супрессорные клетки миелоидного происхождения в комбинации с блокированием PD-1.

Соответственно, настоящее изобретение относится, по меньшей мере частично, к молекулам антител (например, молекулам гуманизированных антител), связывающим TIM-3 с высокой аффинностью и специфичностью. Настоящее изобретение относится также к фармацевтическим композициям и дозированным составам, содержащим молекулы антител против TIM-3. Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно использовать (отдельно или в комбинации с другими лекарственными средствами, способами или средствами) для лечения или предотвращения нарушения, таких как онкологические нарушения (например, солидные опухоли и гематологические злокачественные опухоли), так же как инфекционные заболевания (например, хронические инфекционные нарушения или сепсис). Таким образом, настоящее изобретение относится к способам, включающим режимы дозирования, для лечения различных нарушений с использованием молекул антител против TIM-3, описанных в настоящем описании. В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 вводят или используют при постоянной или фиксированной дозе.

Определения

Дополнительные термины определены ниже и на протяжении заявки.

В рамках изобретения, формы единственного числа относятся к одному или более, чем одному (например, по меньшей мере к одному) грамматическому объекту ссылки.

Термин «или», в рамках изобретения, используют для обозначения, и используют взаимозаменяемо с термином «и/или», если контекст явно не требует иного.

«Около» и «приблизительно» как правило, означают приемлемую степень ошибки для измеренного количества, принимая во внимание характер или точность измерений. Иллюстративные степени ошибки находятся в пределах 20 процентов (%), как правило, в пределах 10%, и более конкретно, в пределах 5% от данного значения или диапазона значений.

«Комбинация» или «в комбинации с», не предназначена, чтобы подразумевать, что терапию или лекарственные средства необходимо вводить в одно и то же время и/или составлять для совместной доставки, хотя эти способы доставки включены в объем изобретения, описанного в настоящем описании. Лекарственные средства в комбинации можно вводить одновременно, до или после одного или нескольких других дополнительных видов терапии или лекарственных средств. Лекарственные средства или терапевтический протокол можно вводить в любом порядке. Как правило, каждое средство можно вводить в дозе и/или во временных рамках, определенных для этого средства. Кроме того, понятно, что дополнительное лекарственное средство, используемое в этой комбинации можно вводить вместе в одной композиции или вводить отдельно в различных композициях. Как правило, ожидают, что дополнительные лекарственные средства, используемые в комбинации, можно использовать на уровнях, не превышающих уровни, на которых их используют индивидуально. В некоторых вариантах осуществления, уровни, используемые в комбинации, могут быть ниже уровней, используемых индивидуально.

В некоторых вариантах осуществления, дополнительное лекарственное средство вводят в терапевтической или более низкой, чем терапевтическая, дозе. В конкретных вариантах осуществления, концентрация второго лекарственного средства, необходимая для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой, когда второе лекарственное средство вводят в комбинации с первым лекарственным средством, например, молекулой антитела против TIM-3, чем когда второе лекарственное средство вводят индивидуально. В конкретных вариантах осуществления, концентрация первого лекарственного средства необходимая для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой, когда первое лекарственное средство вводят в комбинации с вторым лекарственным средством, чем когда первое лекарственное средство вводят индивидуально. В конкретных вариантах осуществления, при комбинированной терапии, концентрация второго лекарственного средства, необходимая для достижения ингибирования, например, ингибирования роста, является более низкой, чем терапевтическая доза второго лекарственного средства в качестве монотерапии, например, на 10-20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80% или 80-90% ниже. В конкретных вариантах осуществления, в комбинированной терапии, концентрация первого лекарственного средства необходимая для достижения ингибирования, например, ингибирование роста, является более низкой, чем терапевтическая доза первого лекарственного средства в качестве монотерапии, например, на 10-20%, 20-30%, 30-40%, 40-50%, 50-60%, 60-70%, 70-80%, или 80-90% ниже.

Термин «ингибирование», «ингибитор» или «антагонист» включает уменьшение конкретного параметра, например, активности, данной молекулы, например, ингибитор иммунной контрольной точки. Например, ингибирование активности, например, активности PD-1 или PD-L1, по меньшей мере на 5%, 10%, 20%, 30%, 40% или более, включено в этот термин. Таким образом, ингибирование не обязательно должно составлять 100%.

Термин «активация», «активатор» или «агонист» включает увеличение конкретного параметра, например, активности, данной молекулы, например, костимулирующей молекулы. Например, увеличение активности, например, костимулирующей активности, по меньшей мере на 5%, 10%, 25%, 50%, 75% или более, включено в этот термин.

Термин «противораковый эффект» относится к биологическому эффекту, который может проявляться различным образом, включая, но без ограничения, например, уменьшение объема опухоли, уменьшение количества клеток злокачественных опухолей, уменьшение количества метастазов, увеличение ожидаемой продолжительности жизни, уменьшение пролиферации злокачественной клетки, уменьшение выживаемости злокачественной клетки или облегчение различных физиологических симптомов, ассоциированных с злокачественным состоянием. «Противораковый эффект» может также проявляться способностью пептидов, полинуклеотидов, клеток и антител к предотвращению возникновения злокачественной опухоли в первом участке.

Термин «противоопухолевый эффект» относится к биологическому эффекту, который может проявляться различным образом, включая, но без ограничения, например, уменьшение объема опухоли, уменьшение количества клеток опухоли, уменьшение пролиферации клеток опухоли или уменьшение выживаемости клеток опухоли.

Термин «злокачественная опухоль» относится к заболеванию, характеризующемуся быстрым и неконтролируемым ростом аберрантных клеток. Клетки злокачественных опухолей могут распространяться локально или через кровоток и лимфатическую систему к другим частям организма. Примеры различных злокачественных опухолей описаны в настоящем описании и включают, но без ограничения, солидные опухоли, например, рак легких, рак молочной железы, рак предстательной железы, рак яичника, рак шейки матки, рак кожи, рак поджелудочной железы, колоректальный рак, рак почки, рак печени и злокачественную опухоль мозга, и гематологические злокачественные новообразования, например, лимфому и лейкоз, и т.п. Термины «опухоль» и «злокачественная опухоль» используют взаимозаменяемо в настоящем описании, например, оба термина включают солидные и жидкие, например, диффузные или циркулирующие, опухоли. В рамках изобретения, термин «злокачественная опухоль» или «опухоль» включает предзлокачественные, так же злокачественные опухоли и опухоли.

Термин «антигенпредставляющая клетка» или «APC» относится к клетке иммунной системы, такой как вспомогательная клетка (например, B-клетка, дендритная клетка и т.п.), представляющая чужеродный антиген в комплексе с главным комплексом гистосовместимости (MHC) на своей поверхности. T-клетки могут узнавать эти комплексы с использованием своих T-клеточных рецепторов (TCR). APC процессируют антигены и представляют их T-клеткам.

Термин «костимулирующая молекула» относится к родственному партнеру по связыванию на T-клетке, который специфически связывается с костимулирующим лигандом, таким образом, опосредуя костимулирующий ответ T-клетки, например, но без ограничения, пролиферацию. Костимулирующие молекулы представляют собой молекулы поверхности клетки, отличные от рецепторов антигенов или их лигандов, необходимых для эффективного иммунного ответа. Костимулирующие молекулы включают, но без ограничения, молекулу MHC класса I, белки-рецепторы TNF, иммуноглобулиноподобные белки, рецепторы цитокинов, интегрины, сигнальные молекулы активации лимфоцитов (белки SLAM), активирующие рецепторы клеток NK, BTLA, рецептор лиганда Toll, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a и лиганд, специфически связывающий CD83.

«Иммуноэффекторная клетка», или «эффекторная клетка», как этот термин используют в настоящем описании, относится к клетке, вовлеченной в иммунный ответ, например, в стимуляцию иммуноэффекторного ответа. Примеры иммуноэффекторных клеток включают T-клетки, например, альфа/бета-T-клетки и гамма/дельта-T-клетки, B-клетки, клетки естественные киллеры (NK), T-клетки естественные киллеры (NKT), тучные клетки и фагоциты миелоидного происхождения.

«Иммуноэффекторная» или «эффекторная» «функция», или «ответ», как этот термин используют в настоящем описании, относится к функции или ответу, например, иммуноэффекторной клетки, которые усиливают или стимулируют иммунную атаку клетки-мишени. Например, иммуноэффекторная функция или ответ относится к свойству T- или NK-клетки, которое стимулирует уничтожение или ингибирование роста или пролиферации, клетки-мишени. В случае T-клетки, первичная стимуляция и костимуляция являются примерами иммуноэффекторной функции или ответа.

Термин «эффекторная функция» относится к специализированной функции клетки. Эффекторная функция T-клетки, например, может представлять собой цитолитическую активность или активность клетки-помощника, включая секрецию цитокинов.

В рамках изобретения, термины «лечить», «лечение» и «обработка» относятся к уменьшению или облегчению прогрессирования, тяжести и/или длительности нарушения, например, пролиферативного нарушения, или облегчению одного или нескольких симптомов (предпочтительно, одного или нескольких различимых симптомов) нарушения в результате подвергания одному или нескольким видам терапии. В конкретных вариантах осуществления, термины «лечить», «лечение» и «обработка» относятся к облегчению по меньшей мере одного поддающегося измерению физического параметра пролиферативного нарушения, такого как рост опухоли, не обязательно различимого пациентом. В других вариантах осуществления, термины «лечить», «лечение» и «обработка» относятся к ингибированию прогрессирования пролиферативного нарушения, либо физически, посредством, например, стабилизации различимого симптома, физиологически, посредством, например, стабилизации физического параметра, или обоими способами. В других вариантах осуществления термины «лечить», «лечение» и «обработка» относятся к уменьшению или стабилизации размера опухоли или количества злокачественных клеток.

Композиции, составы, и способы по настоящему изобретению включают полипептиды и нуклеиновые кислоты, имеющие указанные последовательности, или последовательности, по существу идентичные или сходные с ними, например, последовательности по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или более идентичные указанной последовательности. В контексте аминокислотной последовательности, термин «по существу идентичный» используют в настоящем описании для обозначения первой аминокислотной последовательности, содержащей достаточное или минимальное количество аминокислотных остатков, которые являются i) идентичными или ii) консервативными заменами для выровненных аминокислотных остатков во второй аминокислотной последовательности, таким образом, что первая и вторая аминокислотные последовательности могут иметь общий структурный домен и/или общую функциональную активность. Например, аминокислотные последовательности, содержащие общий структурный, домен, имеющий по меньшей мере приблизительно 85%, 90%. 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичность с контрольной последовательностью, например, последовательностью, представленной в настоящем описании.

В контексте нуклеотидной последовательности, термин «по существу идентичный» используют в настоящем описании для обозначения первой последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей достаточное или минимальное количество нуклеотидов, которые являются идентичными выровненным нуклеотидам во второй последовательности нуклеиновой кислоты, таким образом, что первая и вторая нуклеотидные последовательности кодируют полипептид, имеющий общую функциональную активность, или кодируют общий структурный домен полипептида или общую функциональную активность полипептида. Например, нуклеотидные последовательности, имеющие по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичность с контрольной последовательностью, например, последовательностью, представленной в настоящем описании.

Термин «функциональный вариант» относится к полипептидам, которые имеют по существу идентичную аминокислотную последовательность с природной последовательностью, или которые кодированы по существу идентичной нуклеотидной последовательностью и могут иметь один или несколько видов активности природной последовательности.

Расчет гомологии или идентичности последовательности между последовательностями (термины используют взаимозаменяемо в настоящем описании) проводят следующим образом.

Для определения процента идентичности двух аминокислотных последовательностей или двух последовательностей нуклеиновой кислоты, последовательности выравнивают для целей оптимального выравнивания (например, можно вносить пропуски в одну или обе из первой и второй аминокислотной последовательности или последовательности нуклеиновой кислоты для оптимального выравнивания, и негомологичные последовательности можно не учитывать для целей сравнения). В предпочтительном варианте осуществления, длина контрольной последовательности, выровненной для целей сравнения, составляет по меньшей мере 30%, предпочтительно, по меньшей мере 40%, более предпочтительно, по меньшей мере 50%, 60% и даже более предпочтительно, по меньшей мере 70%, 80%, 90%, 100% от длины контрольной последовательности. Аминокислотные остатки или нуклеотиды в соответствующих положениях аминокислот или положениях нуклеотидов затем сравнивают. Когда положение в первой последовательности занято таким же аминокислотным остатком или нуклеотидом, что и соответствующее положение во второй последовательности, тогда молекулы являются идентичными в этом положении (в рамках изобретения «идентичность» аминокислот или нуклеиновых кислот является эквивалентной «гомологии» аминокислот или нуклеиновых кислот).

Процент идентичности между двумя последовательностями является функцией количества идентичных положений, разделяемых последовательностями, принимая во внимание количество пропусков, и длину каждого пропуска, которые необходимо вносить для оптимального выравнивания двух последовательности.

Сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя последовательностями можно осуществлять с использованием математического алгоритма. В предпочтительном варианте осуществления, процент идентичности между двумя аминокислотными последовательности определяют с использованием алгоритма Нидлмана-Вунша ((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453), встроенного в программу GAP в пакете программного обеспечения GCG (доступного на www.gcg.com), с использованием либо матрицы Blossum 62, либо матрицы PAM250, и штрафа за внесения пропуска 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4, и штрафа за удлинение пропуска 1, 2, 3, 4, 5 или 6. В другом предпочтительном варианте осуществления, процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями определяют с использованием программы GAP в пакете программного обеспечения GCG (доступного на www.gcg.com), с использованием матрицы NWSgapdna.CMP и штрафа за внесения пропуска 40, 50, 60, 70 или 80 и штрафа за удлинение пропуска 1, 2, 3, 4, 5 или 6. Особенно предпочтительный набор параметров (и тот, который следует использовать, если не указано иное) представляет собой матрицу баллов Blossum 62 со штрафом за делецию 12, штрафом за удлинение пропуска 4 и штрафом за делецию со сдвигом рамки считывания 5.

Процент идентичности между двумя аминокислотными последовательностями или нуклеотидными последовательностями можно определять с использованием алгоритма E. Meyers and W. Miller ((1989) CABIOS, 4:11-17), встроенного в программу ALIGN (версии 2.0), с использованием таблицы весов замен остатков PAM120, штрафа за удлинение пропуска 12 и штрафа за делецию 4.

Последовательности нуклеиновой кислоты и белка, описанные в настоящем описании, можно использовать в качестве «запрашиваемой последовательности» для проведения поиска в публичных базах данных, например, для идентификации других членов семейства или родственных последовательностей. Такие поиски можно проводить с использованием программ NBLAST и XBLAST (версии 2.0) от Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10. Поиски нуклеотидов BLAST можно проводить с использованием программы NBLAST, количества баллов=100, длины слова=12, для получения нуклеотидных последовательностей, гомологичных молекулам нуклеиновой кислоты (SEQ ID NO: 1) по изобретению. Поиски белков BLAST можно проводить с использованием программы XBLAST, количества баллов=50, длины слова=3, для получения аминокислотных последовательностей, гомологичных молекулам белка по изобретению. Для получения выравниваний с пропусками для целей сравнения, можно использовать Gapped BLAST, как описано в Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. При использовании программ BLAST и Gapped BLAST, можно использовать параметры соответствующих программ по умолчанию (например, XBLAST и NBLAST). См. www.ncbi.nlm.nih.gov.

В рамках изобретения, термин «гибридизуется в условиях низкой строгости, средней строгости, высокой строгости или очень высокой строгости» описывает условия гибридизации и промывки. Руководство для проведения реакций гибридизации можно обнаружить в Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6, полное содержание которого приведено в качестве ссылки. Водные и неводные способы описаны в этой ссылке, и любой можно использовать. Специфические условия гибридизации, на которые ссылаются в настоящем описании, являются следующими: 1) условия гибридизации низкой строгости в 6X хлориде натрия/цитрате натрия (SSC) при приблизительно 45°C, с последующими двумя промывками в 0,2X SSC, 0,1% SDS по меньшей мере при 50°C (температуру промывок можно увеличивать до 55°C для условий низкой строгости); 2) условия гибридизации средней строгости в 6X SSC при приблизительно 45°C, с последующей одной или несколькими промывками в 0,2X SSC, 0,1% SDS при 60°C; 3) условия гибридизации высокой строгости в 6X SSC при приблизительно 45°C, с последующей одной или несколькими промывками в 0,2X SSC, 0,1% SDS при 65°C; и предпочтительно, 4) условия гибридизации очень высокой строгости представляют собой 0,5M фосфат натрия, 7% SDS при 65°C, с последующей одной или несколькими промывками в 0,2X SSC, 1% SDS при 65°C. Условия очень высокой строгости (4) представляют собой предпочтительные условия и те, которые следует использовать, если не указано иное.

Понятно, что молекулы по настоящему изобретению могут иметь дополнительные консервативные или несущественные аминокислотные замены, которые не оказывают значительного эффекта на их функции.

Термин «аминокислота» предназначен для включения всех молекул, природных или синтетических, которые включают как функциональную аминогруппу, так и кислую функциональную группу, и способны к включению в полимер из природных аминокислот. Иллюстративные аминокислоты включают природные аминокислоты; их аналоги, производные и родственные соединения; аналоги аминокислот, имеющих вариант боковых цепей; и все стереоизомеры любого из вышеуказанных. В рамках изобретения, термин «аминокислота» включает D- или L- оптические изомеры и пептидомиметики.

«Консервативная аминокислотная замена» представляет собой замену, при которой аминокислотный остаток заменяют на аминокислотный остаток, имеющий сходную боковую цепь. Семейства аминокислотных остатков, имеющих сходные боковые цепи, определены в данной области. Эти семейства включают аминокислоты с основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин, гистидин), кислыми боковыми цепями (например, аспарагиновую кислоту, глутаминовую кислоту), незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин), неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин, триптофан), бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин).

Термины «полипептид», «пептид» и «белок» (если он одноцепочечный) используют в настоящем описании взаимозаменяемо для обозначения полимеров аминокислот любой длины. Полимер может являться линейным или разветвленным, он может содержать модифицированные аминокислоты, и может прерываться неаминокислотами. Термины включают также аминокислотный полимер, который был модифицирован; например, посредством образования дисульфидных связей, гликозилирования, липидизации, ацетилирования, фосфорилирования или любой другой манипуляции, такой как конъюгация с метящим компонентом. Полипептид можно выделять из природных источников, можно получать рекомбинантными способами из эукариотического или прокариотического хозяина, или он может являться продуктом синтетических способов.

Термины «нуклеиновая кислота», «последовательность нуклеиновой кислоты», «нуклеотидная последовательность» или «полинуклеотидная последовательность» и «полинуклеотид» используют взаимозаменяемо. Они относятся к полимерной форме нуклеотидов любой длины, либо дезоксирибонуклеотидов, либо рибонуклеотидов, либо их аналогов. Полинуклеотид может являться либо одноцепочечным, либо двухцепочечным, и если является одноцепочечным, может представлять собой кодирующую цепь или некодирующую (антисмысловую) цепь. Полинуклеотид может содержит модифицированные нуклеотиды, такие как метилированные нуклеотиды и аналоги нуклеотидов. Последовательность нуклеотидов может прерываться ненуклеотидными компонентами. Полинуклеотид можно дополнительно модифицировать после полимеризации, например, посредством конъюгации с метящим компонентом. Нуклеиновая кислота может представлять собой рекомбинантный полинуклеотид, или полинуклеотид геномного, кДНК, полусинтетического или синтетического происхождения, который либо не встречается в природе, либо является связанным с другим полинуклеотидом в неприродной аранжировке.

Термин «выделенный», в рамках изобретения, относится к материалу, удаленному из его исходного или естественного окружения (например, природного окружения, если он встречается в природе). Например, природные полинуклеотид или полипептид, присутствующие в живом животном, не являются выделенными, но такой же полинуклеотид или полипептид, отделенный посредством вмешательства человека от некоторых или всех из совместно существующих в природной системе материалов, является выделенным. Такие полинуклеотиды могут составлять часть вектора, и/или такие полинуклеотиды или полипептиды могут составлять часть композиции, и все еще являться выделенными в том отношении, что такой вектор или композиция не являются частью окружения, в котором они обнаружены в природе.

Различные аспекты изобретения описаны более подробно ниже. Дополнительные определения приведены на протяжении описания.

Режимы дозирования

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно вводить в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании, для лечения (например, ингибирования, уменьшения, облегчения или предотвращения) нарушения, например, гиперпролиферативного состояния или нарушения (например, злокачественной опухоли) у субъекта. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 субъекту в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 2000 мг или от приблизительно 20 мг до приблизительно 2000 мг, например, один раз в каждые две, три, четыре, шесть или восемь недель.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе, которая связывает, например, насыщает, растворимый TIM-3 у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе, которая приводит к по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% или 98% связыванию, например, насыщению, растворимого TIM-3 у субъекта, например, в пределах 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 недель после введения.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе, которая приводит к по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% или 98% связыванию, например, занятости, TIM-3 в опухоли у субъекта, например, в пределах 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 недель после введения.

В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе, которая приводит к по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% или 98% связыванию, например, насыщению, растворимого TIM-3 у субъекта; и которая приводит к по меньшей мере 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% или 98% связыванию, например, занятости, TIM-3 в опухоли у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, насыщение и/или занятость возникает, например, в пределах 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 недель после введения.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 15 мг до приблизительно 1600 мг, от приблизительно 20 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 25 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 60 мг до приблизительно 1600 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 100 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 120 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 140 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 160 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 180 мг до приблизительно 400 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг, от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 1600 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 1200 мг, от 40 мг до приблизительно 1000 мг, от 40 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 400 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 200 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 1600 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 800 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 600 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 400 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 100 мг до приблизительно 1800 мг или от приблизительно 80 до приблизительно 1800 мг, например, один раз в каждые две, три или четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 15 мг до приблизительно 1600 мг, от приблизительно 20 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 25 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 60 мг до приблизительно 1600 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 100 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 120 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 140 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 160 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 180 мг до приблизительно 400 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг, от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 1600 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 1200 мг, от 40 мг до приблизительно 1000 мг, от 40 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 400 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 200 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 40 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 1600 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 800 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 600 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 400 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 1800 мг, от приблизительно 100 мг до приблизительно 1800 мг или от приблизительно 80 до приблизительно 1800 мг, например, один раз в каждые две недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 100 мг, от 15 мг до приблизительно 95 мг, от приблизительно 20 мг до приблизительно 90 мг, от приблизительно 10 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 15 мг до приблизительно 75 мг, или от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг, например, приблизительно 20 мг, например, один раз в каждые две или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг, например, приблизительно 20 мг, один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг, например, приблизительно 20 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 40 мг до приблизительно 120 мг, от 60 мг до приблизительно 100 мг, от приблизительно 70 мг до приблизительно 90 мг, от приблизительно 60 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 60 мг, приблизительно 70 мг, приблизительно 80 мг, приблизительно 90 мг или приблизительно 100 мг, например, один раз в каждые две или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 80 мг, один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг, например, приблизительно 80 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг, от приблизительно 220 мг до приблизительно 280 мг, от приблизительно 230 мг и 250 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 240 мг, от приблизительно 240 мг до приблизительно 260 мг, например, приблизительно 200 мг, приблизительно 220 мг, приблизительно 240 мг, приблизительно 260 мг, приблизительно 280 мг или приблизительно 300 мг, например, один раз в каждые две или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, например, приблизительно 240 мг, один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 220 мг до приблизительно 260 мг, например, приблизительно 240 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 550 мг до приблизительно 950 мг, от приблизительно 600 мг до приблизительно 900 мг, от приблизительно 650 мг до приблизительно 925, от приблизительно 700 мг до приблизительно 900 мг, например, приблизительно 700 мг, приблизительно 725 мг, приблизительно 750 мг, приблизительно 800 мг, приблизительно 825 мг, приблизительно 850 мг или приблизительно 900 мг, например, один раз в каждые две или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 700 мг до приблизительно 900 мг, например, приблизительно 800 мг, один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 700 мг до приблизительно 900 мг, например, приблизительно 800 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 900 мг до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, от приблизительно 1100 мг до 1300 мг, от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1200, от приблизительно 1200 мг до приблизительно 1400 мг, например, приблизительно 1000 мг, приблизительно 1100 мг, приблизительно 1200 мг, приблизительно 1300 мг, приблизительно 1400 мг или приблизительно 1500 мг, например, один раз в каждые две, три или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, например, приблизительно 1200 мг, один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1400 мг, например, приблизительно 1200 мг, один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 20 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 20 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 20 мг до приблизительно 240 мг, от приблизительно 20 мг до приблизительно 80 мг, от приблизительно 800 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 240 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 80 мг до приблизительно 1200 мг, от приблизительно 80 до приблизительно 240 мг, от приблизительно 240 мг до приблизительно 800 мг, один раз в каждые две или четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе приблизительно 2000 мг или менее, приблизительно 1900 мг или менее, приблизительно 1800 мг или менее, приблизительно 1700 мг или менее, приблизительно 1600 мг или менее, приблизительно 1500 мг или менее, приблизительно 1400 мг или менее, приблизительно 1300 мг или менее, приблизительно 1200 мг или менее, приблизительно 1100 мг или менее, приблизительно 1000 мг или менее, приблизительно 900 мг или менее, приблизительно 800 мг или менее, приблизительно 700 мг или менее, приблизительно 600 мг или менее, приблизительно 500 мг или менее, приблизительно 400 мг или менее, приблизительно 300 мг или менее, приблизительно 250 мг или менее, приблизительно 200 мг или менее, приблизительно 150 мг или менее, приблизительно 100 мг или менее, приблизительно 50 мг или менее, или приблизительно 25 мг или менее, один раз в каждые две или четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, нарушение представляет собой злокачественную опухоль, например, злокачественную опухоль, описанную в настоящем описании. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак яичника. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак легких, например, мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой мезотелиому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак кожи, например, карциному из клеток Меркеля или меланому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак почки, например, почечноклеточный рак. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак мочевого пузыря. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому мягких тканей, например, гемангиоперицитому (HPC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль кости, например, саркому кости. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой колоректальный рак. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак поджелудочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль носоглотки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак молочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль двенадцатиперстной кишки. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак эндометрия. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой аденокарциному, например, аденокарциному неизвестной первичной локализации. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак печени, например, печеночноклеточную карциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой холангиокарциному. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой саркому. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелодиспластический синдром (MDS) (например, MDS высокого риска). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой лейкоз (например, острый миелоидный лейкоз (AML), например, рецидивирующий или невосприимчивый AML или AML de novo). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой лимфому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой миелому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль с высокой MSI. В некоторых вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой метастазирующую злокачественную опухоль. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль на поздних стадиях. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рецидивирующую или невосприимчивую злокачественную опухоль.

В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой карциному из клеток Меркеля. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой меланому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак молочной железы, например, трижды отрицательный рак молочной железы (TNBC) или отрицательный по HER2 рак молочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой почечноклеточный рак (например, светлоклеточный почечноклеточный рак (CCRCC) или несветлоклеточный почечноклеточный рак (nccRCC)). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак щитовидной железы, например, анапластическую карциному щитовидной железы (ATC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой нейроэндокринную опухоль (NET), например, атипичную карциноидную опухоль легких или NET поджелудочной железы, желудочно-кишечного (GI) тракта, или легкого. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой немелкоклеточный рак легких (NSCLC) (например, плоскоклеточный NSCLC или неплоскоклеточный NSCLC). В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль фаллопиевой трубы. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой колоректальный рак с высокой микросателлитной нестабильностью (CRC с высокой MSI) или колоректальный рак с микросателлитной стабильностью (MSS CRC).

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в комбинации с молекулой антитела против PD-1 (например, молекулой антитела против PD-1, описанной в настоящем описании). Молекулу антитела против PD-1 можно вводить в присутствии или в отсутствие гипометилирующего средства (например, децитабина). В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели или от приблизительно 200 мг до приблизительно 400 мг (например, приблизительно 300 мг) один раз в каждые три недели. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 400 мг (например, приблизительно 300 мг) один раз в каждые три недели. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до 30 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые четыре недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые четыре недели, и молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые четыре недели.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в комбинации с гипометилирующим средством. В конкретных вариантах осуществления, гипометилирующее средство представляет собой децитабин. В других вариантах осуществления, гипометилирующее средство представляет собой азацитидин.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в комбинации с децитабином (5-аза-2’-дезоксицитидином). В конкретных вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 5 мг/м² до приблизительно 60 мг/м², например, от 10 мг/м² до приблизительно 50 мг/м², от 15 мг/м² до приблизительно 40 мг/м², от приблизительно 20 мг/м² до приблизительно 30 мг/м², от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м², от приблизительно 15 мг/м² до приблизительно 25 мг/м², от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 20 мг/м², от приблизительно 20 мг/м² до приблизительно 30 мг/м², от приблизительно 30 мг/м² до приблизительно 40 мг/м², от приблизительно 40 мг/м² до приблизительно 50 мг/м² или от приблизительно 50 мг/м² до приблизительно 60 мг/м², например, каждые две недели, каждые четыре недели, каждые шесть недель, или каждые восемь недель. Например, децитабин можно вводить в одни или несколько суток из 28-суточного цикла.

В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели. В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1 и 2. В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-3. В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-4. В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5. В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-6. В некоторых вариантах осуществления, децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-7.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые две недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в комбинации с молекулой антитела против PD-1 (например, молекулой антитела против PD-1, описанной в настоящем описании) и децитабином (5-аза-2’-дезоксицитидином). В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) один раз в каждые четыре недели. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1 и 2. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-3. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-4. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-6. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-7.

В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или от приблизительно 20 мг/м²) один раз в каждые четыре недели. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1 и 2. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-3. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-4. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-6. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м²до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-7.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 30 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые восемь недель, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 30 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 50 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели, молекулу антитела против PD-1 вводят в дозе от приблизительно 300 мг до приблизительно 500 мг (например, приблизительно 400 мг) один раз в каждые четыре недели, и децитабин вводят в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 60 мг/м² (например, от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² или приблизительно 20 мг/м²) каждые четыре недели, например, на сутки 1-5.

В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой ABTIM3-hum11, и молекула антитела против PD-1 представляет собой PDR001. В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой ABTIM3-hum03, и молекула антитела против PD-1 представляет собой PDR001.

В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой ABTIM3-hum11, и гипометилирующее средство представляет собой децитабин. В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой ABTIM3-hum03, и гипометилирующее средство представляет собой децитабин.

В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой ABTIM3-hum11, молекула антитела против PD-1 представляет собой PDR001, и гипометилирующее средство представляет собой децитабин. В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 представляет собой ABTIM3-hum03, молекула антитела против PD-1 представляет собой PDR001, и гипометилирующее средство представляет собой децитабин.

Молекулы антител

Настоящее изобретение относится к способам, композициям и составам, включающим молекулу антитела, связывающую TIM-3 млекопитающего, например, человека. Например, молекула антитела специфически связывает эпитоп, например, линейный или конформационный эпитоп (например, эпитоп, как описано в настоящем описании) на TIM-3.

В рамках изобретения, термин «молекула антитела» относится к белку, например, иммуноглобулиновой цепи или ее фрагменту, содержащим по меньшей мере одну последовательность вариабельного домена иммуноглобулина. Термин «молекула антитела» включает, например, моноклональное антитело (включая полноразмерное антитело, имеющее область Fc иммуноглобулина). В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит полноразмерное антитело или полноразмерную иммуноглобулиновую цепь. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит антигенсвязывающий или функциональный фрагмент полноразмерного антитела, или полноразмерной иммуноглобулиновой цепи. В одном варианте осуществления, молекула антитела представляет собой мультиспецифическую молекулу антитела, например, она содержит множество последовательностей вариабельных доменов иммуноглобулинов, где первая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из множества имеет специфичность связывания для первого эпитопа, и вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из множества имеет специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, мультиспецифическая молекула антитела представляет собой биспецифическую молекулу антитела.

В одном варианте осуществления, молекула антитела представляет собой моноспецифическую молекулу антитела и связывает один эпитоп. Например, моноспецифическая молекула антитела может иметь множество последовательностей вариабельных доменов иммуноглобулинов, каждый из которых связывает тот же эпитоп.

В одном варианте осуществления, молекула антитела представляет собой мультиспецифическую молекулу антитела, например, содержит множество последовательностей вариабельных доменов иммуноглобулинов, где первая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из множества имеет специфичность связывания для первого эпитопа, и вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из множества имеет специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы находятся на одном и том же антигене, например, том же самом белке (или субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы перекрываются. В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы не перекрываются. В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы находятся на различных антигенах, например, на различных белках (или различных субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления, мультиспецифическая молекула антитела содержит третий, четвертый или пятый вариабельный домен иммуноглобулина. В одном варианте осуществления, мультиспецифическая молекула антитела представляет собой биспецифическую молекулу антитела, триспецифическую молекулу антитела или тетраспецифическую молекулу антитела,

В одном варианте осуществления, мультиспецифическая молекула антитела представляет собой биспецифическую молекулу антитела. Биспецифическое антитело имеет специфичность для не более, чем двух антигенов. Биспецифическая молекула антитела характеризуется первой последовательностью вариабельного домена иммуноглобулина, который имеет специфичность связывания для первого эпитопа, и второй последовательностью вариабельного домена иммуноглобулина, который имеет специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы находятся на одном и том же антигене, например, том же самом белке (или субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы перекрываются. В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы не перекрываются. В одном варианте осуществления, первый и второй эпитопы находятся на различных антигенах, например, на различных белках (или различных субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи и последовательность вариабельного домена легкой цепи, которые имеют специфичность связывания для первого эпитопа, и последовательность вариабельного домена тяжелой цепи и последовательность вариабельного домена легкой цепи, которые имеют специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела содержит полуантитело, имеющее специфичность связывания для первого эпитопа, и полуантитело, имеющее специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела содержит полуантитело или его фрагмент, имеющие специфичность связывания для первого эпитопа, и полуантитело, или его фрагмент, имеющие специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела содержит scFv, или его фрагмент, имеющие специфичность связывания для первого эпитопа, и scFv или его фрагмент, имеющие специфичность связывания для второго эпитопа. В одном варианте осуществления, первый эпитоп локализован на TIM-3, и второй эпитоп локализован на PD-1, LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1 и/или CEACAM-5), PD-L1 или PD-L2.

Способы получения мультиспецифических (например, биспецифических или триспецифических) или гетеродимерных молекул антител известны в данной области; включая, но без ограничения, например, способ «выступ во впадину» описанный, например, в US 5731168; спаривание Fc посредством электростатического взаимодействия, как описано, например, в WO 09/089004, WO 06/106905 и WO 2010/129304; формирование гетеродимера с использованием доменов, сконструированных посредством обмена цепей (SEED), как описано, например, в WO 07/110205; обмен плеча Fab, как описано, например, в WO 08/119353, WO 2011/131746 и WO 2013/060867; конъюгирование двойного антитела, например, посредством перекрестного сшивания антитела для получения биспецифической структуры с использованием гетеробифункционального реагента, имеющего амино-реакционноспособную группу и сульфгидрильную реакционноспособную группу, как описано, например, в US 4433059; детерминанты биспецифического антитела, полученные посредством рекомбинации полуантител (пар тяжелых-легких цепей или Fab) из различных антител посредством цикла восстановления и окисления дисульфидных связей между двумя тяжелыми цепями, как описано, например, в US 4444878; трифункциональные антитела, например, три фрагмента Fab' перекрестно сшитые посредством сульфгидрильных реакционноспособных групп, как описано, например, в US 5273743; биосинтетические связывающие белки, например, пара scFv, перекрестно сшитых через С-концевые хвосты предпочтительно посредством перекрестного химического сшивания в реакции с дисульфидом или амином, как описано, например, в US 5534254; бифункциональные антитела, например, фрагменты Fab с различной специфичностью связывания, димеризованные посредством лейциновых молний (например, c-fos и c-jun), которые заменяют константный домен, как описано, например, в US 5582996; биспецифические и олигоспецифические моно-и олиговалентные рецепторы, например, области VH-CH1 двух антител (два фрагмента Fab), связанные через полипептидный спейсер между областью CH1 одного антитела и областью VH другого антитела, как правило, с ассоциированными легкими цепями, как описано, например, в US 5591828; биспецифические конъюгаты ДНК-антитело, например, перекрестное сшивание антител или фрагментов Fab с помощью двухцепочечного участка ДНК, как описано, например, в US 5635602; биспецифические слитые белки, например, экспрессирующая конструкция, содержащая два scFv с гидрофильным спиральным пептидным линкером между ними и полной константной областью, как описано, например, в US 5637481; мультивалентные и мультиспецифические связывающие белки, например, димер из полипептидов, имеющих первый домен со связывающей областью из вариабельной области тяжелой цепи Ig, и второй домен со связывающей областью из вариабельной области легкой цепи Ig, в общем, называемый диателами (также раскрыты структуры высшего порядка, образующие биспецифические, триспецифические или тетраспецифические молекулы, как описано, например, в US 5837242; конструкции миниантитела со связанными цепями VL и VH, дополнительно присоединенные через пептидные спейсеры к шарнирной области антитела и к области CH3, которые могут быть димеризованы для образования биспецифической/мультивалентной молекулы, как описано, например, в US 5837821; домены VH и VL, связанные через короткий пептидный линкер (например, длиной 5 или 10 аминокислот) или вообще без линкера в любой ориентации, которые могут образовывать димеры с образованием биспецифических диател; тримеры и тетрамеры, как описано, например, в US 5844094; цепь доменов VH (или доменов VL в членах семейства), соединенных пептидными связями с поддающимися перекрестному сшиванию группами на С-конце, дополнительно ассоциированных с доменами VL, для образования серий FV (или scFv), как описано, например, в US 5864019; и одноцепочечные связывающие полипептиды с доменом VH и доменом VL, связанные через пептидный линкер, объединяют в мультивалентные структуры посредством нековалентного или химического сшивания с образованием, например, гомобивалентных, гетеробивалентных, трехвалентных и тетравалентных структур, с использованием формата типа scFV или формата типа диатела, как описано, например, в US 5869620. Дополнительные иллюстративные мультиспецифические и биспецифические молекулы и способы их получения обнаружены, например, в US 5910573, US 5932448, US 5959083, US 5989830, US 6005079, US 6239259, US 6294353, US 6333396, US 6476198, US 6511663, US 6670453, US 6743896, US 6809185, US 6833441, US 7129330, US7183076, US7521056, US7527787, US7534866, US7612181, US 2002/004587A1, US 2002/076406A1, US 2002/103345A1, US 2003/207346A1, US 2003/211078A1, US 2004/219643A1, US 2004/220388A1, US 2004/242847A1, US 2005/003403A1, US 2005/004352A1, US 2005/069552A1, US 2005/079170A1, US 2005/100543A1, US 2005/136049A1, US 2005/136051A1, US 2005/163782A1, US 2005/266425A1, US 2006/083747A1, US 2006/120960A1, US 2006/204493A1, US 2006/263367A1, US 2007/004909A1, US 2007/087381A1, US 2007/128150A1, US 2007/141049A1, US 2007/154901A1, US 2007/274985A1, US 2008/050370A1, US 2008/069820A1, US 2008/152645A1, US 2008/171855A1, US 2008/241884A1, US 2008/254512A1, US 2008/260738A1, US 2009/130106A1, US 2009/148905A1, US 2009/155275A1, US 2009/162359A1, US 2009/162360A1, US 2009/175851A1, US 2009/175867A1, US 2009/232811A1, US 2009/234105A1, US 2009/263392A1, US 2009/274649A1, EP 346087A2, WO 00/06605A2, WO 02/072635A2, WO 04/081051A1, WO 06/020258A2, WO 2007/044887A2, WO 2007/095338A2, WO 2007/137760A2, WO 2008/119353A1, WO 2009/021754A2, WO 2009/068630A1, WO 91/03493A1, WO 93/23537A1, WO 94/09131A1, WO 94/12625A2, WO 95/09917A1, WO 96/37621A2, WO 99/64460A1. Полное содержание вышеуказанных заявок приведено в настоящем описании путем ссылки.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 (например, молекулу моноспецифического, биспецифического или мультиспецифического антитела) ковалентно связывают, например, сливают, с другим партнером, например, с белком, например, с одним, двумя или более цитокинами, например, в форме слитой молекулы например, слитого белка. В других вариантах осуществления, слитая молекула содержит один или несколько белков, например, один, два или более цитокинов. В одном варианте осуществления, цитокин представляет собой интерлейкин (IL), выбранный из одного, двух, трех или более из IL-1, IL-2, IL-12, IL-15 или IL-21. В одном варианте осуществления, биспецифическая молекула антитела имеет первую специфичность связывания для первой мишени (например, PD-1), вторую специфичность связывания для второй мишени (например, LAG-3 или TIM-3), и является, необязательно, связанной с доменом интерлейкина (например, IL-12) например, полноразмерным IL-12 или его частью.

«Слитый белок» и «слитый полипептид» относятся к полипептиду, имеющему, по меньшей мере, две ковалентно связанных друг с другом части, причем каждая из частей представляет собой полипептид с разными свойствами. Свойство может представлять собой биологическое свойство, такое как активность in vitro или in vivo. Свойство также может представлять собой простое химическое или физическое свойство, такое как связывание с молекулой-мишенью, катализ реакции и т.д. Эти две части могут быть связаны напрямую посредством единственной пептидной связи или через пептидный линкер, но располагаться в рамке считывания друг с другом.

В одном варианте осуществления, молекула антитела включает диатело и одноцепочечную молекулу, так же как антигенсвязывающий фрагмент антитела (например, Fab, F(ab’)₂ и Fv). Например, молекула антитела может включать последовательность вариабельного домена тяжелой (H) цепи (сокращенно обозначенной в настоящем описании как VH) и последовательность вариабельного домена легкой (L) цепи (сокращенно обозначенной в настоящем описании как VL). В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит или состоит из тяжелой цепи и легкой цепи (обозначено в настоящем описании как полуантитело). В другом примере, молекула антитела содержит две последовательности вариабельного домена тяжелой (H) цепи и две последовательности вариабельного домена легкой (L) цепи, таким образом, образуя два антигенсвязывающих участка, например, Fab, Fab’, F(ab’)₂, Fc, Fd, Fd’, Fv, одноцепочечные антитела (например, scFv), антитела с одиночным вариабельным доменом, диатела (Dab) (бивалентные и биспецифические) и химерные (например, гуманизированные) антитела, которые могут являться полученными посредством модификации полноразмерных антител или которые могут являться синтезированными de novo с использованием способов рекомбинантной ДНК. Эти функциональные фрагменты антитела сохраняют избирательно связываться с их соответствующим антигеном или рецептором. Антитела и фрагменты антител могут принадлежать к любому классу антител, включая, но без ограничения, IgG, IgA, IgM, IgD и IgE, и к любому подклассу (например, IgG1, IgG2, IgG3, и IgG4) антител. Препарат молекул антител может являться моноклональным или поликлональным. Молекула антитела может также представлять собой человеческое, гуманизированное, CDR-привитое или полученное in vitro антитело. Антитело может иметь константную область тяжелой цепи, выбранную, например, из IgG1, IgG2, IgG3, или IgG4. Антитело может также иметь легкую цепь, выбранную, например, из каппа или лямбда. Термин «иммуноглобулин» (Ig) используют взаимозаменяемо с термином «антитело» в настоящем описании.

Примеры антигенсвязывающих фрагментов молекулы антитела включают: (i) фрагмент Fab, одновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, CL и CH1; (ii) фрагмент F(ab')2, бивалентный фрагмент, содержащий два фрагмента Fab, связанные дисульфидным мостиком в шарнирной области; (iii) фрагмент Fd, состоящий из доменов VH и CH1; (iv) фрагмент Fv, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела, (v) фрагмент диатела (dAb), состоящий из домена VH; (vi) вариабельный домен верблюдовых или камелизированный вариабельный домен; (vii) одноцепочечный Fv (scFv), см., например, Bird et al. (1988) Science 242:423-426; и Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883); (viii) однодоменное антитело. Эти фрагменты антител получают с использованием общепринятых способов, известных специалисту в данной области, и проводят скрининг фрагментов по применимости таким же способом, как для интактных антител.

Термин «антитело» включает интактные молекулы, так же как их функциональные фрагменты. Константные области антител можно изменять, например, подвергать мутагенезу, для модификации свойств антитела (например, для увеличения или уменьшения одного или нескольких из: связывания рецептора Fc, гликозилирования антитела, количества остатков цистеина, функции эффекторной клетки или функции комплемента).

Молекулы антител могут также представлять собой однодоменные антитела. Однодоменные антитела могут включать антитела, определяющие комплементарность области которых являются частью однодоменного полипептида. Примеры включают, но без ограничения, антитела из тяжелых цепей, антитела, естественным образом лишенные легких цепей, однодоменные антитела, происходящие из общепринятых 4-цепочечных антител, сконструированные антитела и однодоменные каркасы, отличные от каркасов, происходящих из антител. Однодоменные антитела могут представлять собой любые однодоменные антитела в данной области или любые будущие однодоменные антитела. Однодоменные антитела могут происходить из любых видов, включая, но без ограничения, мышь, человека, верблюда, ламу, рыбу, акулу, козу, кролика и быка. В соответствии с другим аспектом изобретению, однодоменное антитело представляет собой природное однодоменное антитело, известное как антитело из тяжелых цепей, лишенное легких цепей. Такие однодоменные антитела описаны, например, в WO 94/04678. Для ясности, этот вариабельный домен, происходящий из антитела из тяжелых цепей, естественным образом лишенного легких цепей, обозначен в настоящем описании как VHH или нанотело, чтобы отличать его от общепринятого VH из четырехцепочечных иммуноглобулинов. Такая молекула VHH может происходить из антител, полученных в видах Camelidae, например, у верблюда, ламы, дромадера, альпаки и гуанако. Другие виды, помимо Camelidae, могут продуцировать антитела из тяжелых цепей естественным образом лишенные легких цепей; такие VHH включены в объем изобретения.

Области VH и VL можно подразделять на области гипервариабельности, названные «определяющими комплементарность областями» (CDR), перемежающиеся с областями, которые являются более консервативными, названными «каркасными областями» (FR или FW).

Протяженность каркасных областей и CDR точно определена рядом способов (см., Kabat, E. A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242; Chothia, C. et al. (1987) J. Mol. Biol. 196:901-917; и определение AbM, используемое в программном обеспечении для моделирования антител AbM от Oxford Molecular. См., в общем, например, Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains. In: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel, S. и Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg).

Термины «определяющая комплементарность область» и «CDR», в рамках изобретения относятся к последовательностям аминокислот внутри вариабельных областей антитела, которые обеспечивают специфичность и аффинность связывания антигена. Как правило, присутствуют три CDR в каждой вариабельной области тяжелой цепи (HCDR1, HCDR2 и HCDR3) и три CDR в каждой вариабельной области легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3).

Точные границы аминокислотной последовательности данной CDR можно определять с использованием любой из ряда хорошо известных схем, включая схемы, описанные в Kabat et al. (1991), «Sequences of Proteins of Immunological Interest», 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (схема нумерации «Kabat»), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (схема нумерации «Chothia»). В рамках изобретения, CDR, определенные в соответствии со схемой нумерации «Chothia», иногда обозначают как «гипервариабельные петли».

Например, по Kabat, аминокислотные остатки CDR в вариабельном домене тяжелой цепи (VH) пронумерованы 31-35 (HCDR1), 50-65 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3); и аминокислотные остатки CDR в вариабельном домене легкой цепи (VL) пронумерованы 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCDR2) и 89-97 (LCDR3). По Chothia, аминокислоты CDR в VH пронумерованы 26-32 (HCDR1), 52-56 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3); и аминокислотные остатки в VL пронумерованы 26-32 (LCDR1), 50-52 (LCDR2) и 91-96 (LCDR3). По комбинации определений CDR Kabat и Chothia, CDR состоят из аминокислотных остатков 26-35 (HCDR1), 50-65 (HCDR2) и 95-102 (HCDR3) в VH человека, и аминокислотных остатков 24-34 (LCDR1), 50-56 (LCDR2), и 89-97 (LCDR3) в VL человека.

Как правило, если конкретно не указано иное, молекулы антител против PD-1 могут включать любую комбинацию одной или нескольких CDR по Kabat и/или гипервариабельных петель по Chothia, например, описанных в таблице 1. В одном варианте осуществления, следующие определения используют для молекул антител против PD-1, описанных в таблице 1: HCDR1 в соответствии с комбинированными определениями CDR по Kabat и Chothia, и HCCDR 2-3 и LCCDR 1-3 в соответствии с определением CDR по Kabat. По всем определениям, каждая VH и VL, как правило, включает три CDR и четыре FR, расположенных от амино-конца к карбокси-концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.

В рамках изобретения, «последовательность вариабельного домена иммуноглобулина» относится к аминокислотной последовательности, которая может формировать структуру вариабельного домена иммуноглобулина. Например, последовательность может включать всю или часть аминокислотной последовательности природного вариабельного домена. Например, последовательность может включать или может не включать одну, две или более N- или C-концевых аминокислот, или может включать другие изменения, совместимые с формированием структуры белка.

Термин «антигенсвязывающий участок» относится к части молекулы антитела, содержащей детерминанты, которые формируют поверхность контакта, связывающую полипептид PD-1 или его эпитоп. Применительно к белкам (или миметикам белков), антигенсвязывающий участок, как правило, включает одну или несколько петель (из по меньшей мере четырех аминокислот или миметиков аминокислот) которые формируют поверхность контакта, связывающую полипептид PD-1. Как правило, антигенсвязывающий участок молекулы антитела включает по меньшей мере одну или две CDR и/или гипервариабельные петли, или более конкретно по меньшей мере три, четыре, пять или шесть CDR и/или гипервариабельных петель.

Термины «конкурировать» или «перекрестно конкурировать» используют в настоящем описании взаимозаменяемо для обозначения способности молекулы антитела мешать связыванию молекулы антитела против PD-1, например, молекулы антитела против PD-1, представленной в настоящем описании, с мишенью, например, PD-1 человека. Помеха для связывания может быть прямой или опосредованной (например, посредством аллостерической модуляции молекулы антитела или мишени). Степень, в которой молекула антитела способна мешать связыванию другой молекулы антитела против мишени, и таким образом то, можно ли их назвать конкурирующими, можно определять с использованием анализов конкурентного связывания, например, анализа FACS, ELISA или анализа BIACORE. В некоторых вариантах осуществления, анализ конкурентного связывания представляет собой количественный конкурентный анализ. В некоторых вариантах осуществления, первую молекулу антитела против TIM-3 называют конкурирующей за связывание с мишенью с второй молекулой антитела против TIM-3, когда связывание первой молекулы антитела против мишени уменьшено на 10% или более, например, 20% или более, 30% или более, 40% или более, 50% или более, 55% или более, 60% или более, 65% или более, 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 98% или более, 99% или более в анализе конкурентного связывания (например, конкурентном анализе, описанном в настоящем описании).

Термины «моноклональные антитело» или «композиция моноклональных антител», в рамках изобретения, относятся к препарату молекул антител одного молекулярного состава. Композиция моноклональных антител имеет одну специфичность и аффинность связывания для конкретного эпитопа. Моноклональное антитело можно получать способом гибридомы или способами, в которых не используют технологию гибридомы (например, рекомбинантными способами).

«Эффективный у человека» белок представляет собой белок, не вызывающий ответа нейтрализующего антитела, например, ответа антитела человека против антитела мыши (HAMA). HAMA может являться проблематичным в ряде условий, например, если молекулу антитела вводят повторно, например, при лечении хронического или рецидивирующего состояния заболевания. Ответ HAMA может сделать повторяющееся введение антитела потенциально неэффективным из-за увеличенного выведения антитела из сыворотки (см., например, Saleh et al., Cancer Immunol. Immunother. 32:180-190 (1990)), а также из-за потенциальных аллергических реакций (см., например, LoBuglio et al., Hybridoma, 5:5117-5123 (1986)).

Молекула антитела может представлять собой поликлональное или моноклональное антитело. В других вариантах осуществления, антитело можно получать рекомбинантным способом, например, получать посредством фагового дисплея или комбинаторных способов.

Фаговый дисплей и комбинаторные способы для получения антител известны в данной области (как описано, например, в Ladner et al. Патент США No. 5223409; Kang et al. Международная публикация No. WO 92/18619; Dower et al. Международная публикация No. WO 91/17271; Winter et al. Международная публикация WO 92/20791; Markland et al. Международная публикация No. WO 92/15679; Breitling et al. Международная публикация WO 93/01288; McCafferty et al. Международная публикация No. WO 92/01047; Garrard et al. Международная публикация No. WO 92/09690; Ladner et al. Международная публикация No. WO 90/02809; Fuchs et al. (1991) Bio/Technology 9:1370-1372; Hay et al. (1992) Hum Antibody Hybridomas 3:81-85; Huse et al. (1989) Science 246:1275-1281; Griffths et al. (1993) EMBO J 12:725-734; Hawkins et al. (1992) J Mol Biol 226:889-896; Clackson et al. (1991) Nature 352:624-628; Gram et al. (1992) PNAS 89:3576-3580; Garrad et al. (1991) Bio/Technology 9:1373-1377; Hoogenboom et al. (1991) Nuc Acid Res 19:4133-4137; и Barbas et al. (1991) PNAS 88:7978-7982, содержание всех из которых приведено в настоящем описании путем ссылки).

В одном варианте осуществления, антитело представляет собой полностью человеческое антитело (например, антитело, полученное у мыши, подвергнутой генной инженерии для продукции антитела по последовательности человеческого иммуноглобулина), или не относящееся к человеку антитело, например, антитело грызуна (мыши или крысы), козы, примата (например, обезьяны), верблюда. Предпочтительно, не относящееся к человеку антитело представляет собой антитело грызуна (антитело мыши или крысы). Способы получения антител грызунов известны в данной области.

Человеческие моноклональные антитела можно получать с использованием трансгенных мышей, несущих гены человеческих иммуноглобулинов вместо мышиной системы. Спленоциты из этих трансгенных мышей, иммунизированных представляющим интерес антигеном, используют для получения гибридом, секретирующих mAb человека со специфической аффинностью для эпитопов из белка человека (см., например, Wood et al. Международная заявка WO 91/00906, Kucherlapati et al. PCT publication WO 91/10741; Lonberg et al. Международная заявка WO 92/03918; Kay et al. Международная заявка 92/03917; Lonberg, N. et al. 1994 Nature 368:856-859; Green, L.L. et al. 1994 Nature Genet. 7:13-21; Morrison, S.L. et al. 1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855; Bruggeman et al. 1993 Year Immunol 7:33-40; Tuaillon et al. 1993 PNAS 90:3720-3724; Bruggeman et al. 1991 Eur J Immunol 21:1323-1326).

Антитело может представлять собой антитело, в котором вариабельная область, или ее часть, например, CDR, получены в не относящемся к человеку организме, например, крысе или мыши. Химерные, CDR-привитые и гуманизированные антитела включены в объем изобретения. Антитела, полученные в не относящемся к человеку организме, например, крысе или мыши, и затем модифицированные, например, в вариабельной каркасной или константной области, для уменьшения антигенности у человека, включены в объем изобретения.

Химерные антитела можно получать способами рекомбинантной ДНК, известными в данной области (см. Robinson et al., Международная публикация патента PCT/US86/02269; Akira, et al., Европейская Патентная заявка 184187; Taniguchi, M., Европейская Патентная заявка 171,496; Morrison et al., Европейская Патентная заявка 173,494; Neuberger et al., Международная заявка WO 86/01533; Cabilly et al. Патент США No. 4816567; Cabilly et al., Европейская Патентная заявка 125,023; Better et al. (1988 Science 240:1041-1043); Liu et al. (1987) PNAS 84:3439-3443; Liu et al., 1987, J. Immunol. 139:3521-3526; Sun et al. (1987) PNAS 84:214-218; Nishimura et al., 1987, Canc. Res. 47:999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314:446-449; и Shaw et al., 1988, J. Natl Cancer Inst. 80:1553-1559).

Гуманизированное или CDR-привитое антитело может иметь по меньшей мере одну или две, но обычно все три реципиентные CDR (из тяжелой и/или легкой цепей иммуноглобулина), замененные на донорную CDR. В антителе можно проводить замены с использованием по меньшей мере части не относящейся к человеку CDR, или только некоторые из CDR можно заменять с использованием не относящихся к человеку CDR. Является необходимым только замена ряда CDR, необходимых для связывания гуманизированного антитела с PD-1. Предпочтительно, донор может представлять собой антитело грызуна, например, антитело мыши или крысы, и реципиент может представлять собой человеческую каркасную область или человеческую консенсусную каркасную область. Как правило, иммуноглобулин, предоставляющий CDR, называют «донором», и иммуноглобулин, предоставляющий каркасную область, называют «акцептором». В одном варианте осуществления, донорный иммуноглобулин представляет собой не относящийся к человеку иммуноглобулин (например, грызуна). Акцепторная каркасная область представляет собой природную (например, человеческую) каркасную область или консенсусную каркасную область, или последовательность, приблизительно на 85% или выше, предпочтительно на 90%, 95%, 99% или выше, идентичную ей.

В рамках изобретения, термин «консенсусная последовательность» относится к последовательности, сформированную из наиболее часто встречающихся аминокислот (или нуклеотидов) в семействе родственных последовательностей (см., например, Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987). В семействе белков, каждое положение в консенсусной последовательности занято аминокислотой, встречающейся наиболее часто в этом положении в семействе. Если две аминокислоты встречаются одинаково часто, любую можно включать в консенсусную последовательность. «Консенсусная каркасная область» относится к каркасной области в консенсусной иммуноглобулиновой последовательности.

Антитело можно гуманизировать способами, известными в данной области (см., например, Morrison, S. L., 1985, Science 229:1202-1207, от Oi et al., 1986, BioTechniques 4:214, и от Queen et al. US 5585089, US 5693761 и US 5693762, содержание всех из которых, таким образом, приведено путем ссылки).

Гуманизированные или CDR-привитые антитела можно получать посредством CDR-прививки или замены CDR, где одну, две или все CDR цепи иммуноглобулина можно заменять. См., например, Патент США 5225539; Jones et al. 1986 Nature 321:552-525; Verhoeyan et al. 1988 Science 239:1534; Beidler et al. 1988 J. Immunol. 141:4053-4060; Winter US 5225539, содержание всех из которых, таким образом, явно приведено путем ссылки. В Winter описан способ CDR-прививки, который можно использовать для получения гуманизированных антител по настоящему изобретению (Патентная заявка UK GB 2188638A, поданная 26 марта 1987 г.; Winter US 5225539), содержание которых явно приведено путем ссылки.

В объем изобретения включены также гуманизированные антитела, в которых специфические аминокислоты заменены, делетированы или добавлены. Критерии выбора аминокислот из донора описаны в US 5585089, например, столбцы 12-16 из US 5585089, например, столбцы 12-16 из US 5585089, содержание которого, таким образом, приведено путем ссылки. Другие способы гуманизации антитела описаны в Padlan et al. EP 519596 A1, опубликованной 23 декабря 1992 г.

Молекула антитела может представлять собой одноцепочечное антитело. Одноцепочечное антитело (scFV) можно конструировать (см., например, Colcher, D. et al. (1999) Ann N Y Acad Sci 880:263-80; и Reiter, Y. (1996) Clin Cancer Res 2:245-52). Одноцепочечное антитело можно подвергать димеризации или мультимеризации для получения мультивалентных антител, имеющих специфичность для различных эпитопов одного и того же белка-мишени.

В других вариантах осуществления, молекула антитела имеет константную область тяжелой цепи, выбранную, например, из константных областей тяжелых цепей из IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD и IgE; в частности, выбранную, например, из константных областей тяжелых цепей (например, человека) из IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4. В другом варианте осуществления, молекула антитела имеет константную область легкой цепи, выбранную, например, из константных областей легких цепей (например, человека) из каппа или лямбда. Константную область можно изменять, например, подвергать мутагенезу, для модификации свойств антитела (например, для увеличения или уменьшения одного или нескольких из: связывания рецептора Fc, гликозилирования антитела, количества остатков цистеина, функции эффекторной клетки, и/или функции комплемента). В одном варианте осуществления антитело имеет: эффекторную функцию; и может фиксировать комплемент. В других вариантах осуществления, антитело не может: привлекать эффекторные клетки; или фиксировать комплемент. В другом варианте осуществления, антитело имеет уменьшенную способность или не имеет способности связывать рецептор Fc. Например, оно представляет собой изотип или подтип, фрагмент или другой мутант, который не поддерживает связывание с рецептором Fc, например, оно имеет подвергнутую мутагенезу или делетированную область связывания рецептора Fc.

Способы изменения константной области антитела известны в данной области. Антитела с измененной функцией, например, измененной аффинностью для эффекторного лиганда, такого как FcR, на клетке, или компонента комплемента C1, можно получать посредством замены по меньшей мере одного аминокислотного остатка в константной части антитела на другой остаток (см., например, EP 388,151 A1, Патент США No. 5624821 и Патент США No. 5648260, содержание всех из которых, таким образом, приведено путем ссылки). Можно описать сходный тип изменений, который, при использовании для иммуноглобулина мыши или других видов, может уменьшать или прекращать эти функции.

Молекулу антитела можно дериватизировать или присоединять к другой функциональной молекуле (например, другому пептиду или белку). В рамках изобретения, «дериватизированная» молекула антитела представляет собой молекулу антитела, которая была модифицирована. Способы дериватизации включают, но без ограничения, добавление флуоресцентной группы, радионуклеотида, токсина, фермента или аффинного лиганда, такого как биотин. Соответственно, молекулы антител по изобретению предназначены для включения дериватизированных и иным образом модифицированных форм антител, описанных в настоящем описании, включая молекулы иммуноадгезии. Например, молекулу антитела можно функционально связывать (посредством химического присоединения, генетического слияния, нековалентной ассоциации или другим способом) с одной или несколькими другими молекулами, такими как другое антитело (например, биспецифическое антитело или диатело), поддающееся детекции средство, цитотоксическое средство, лекарственное средство, и/или белок или пептид, которые могут опосредовать ассоциацию антитела или части антитела с другой молекулой (такой как коровая область стрептавидина или полигистидиновая метка).

Один тип дериватизированной молекулы антитела получают посредством перекрестного сшивания двух или более антител (одного и того же типа или различных типов, например, для получения биспецифических антител). Пригодные перекрестно сшивающие средства включают средства, которые являются гетеробифункциональными, имея две отдельные реакционноспособные группы, разделенные подходящим спейсером (например, сложный эфир м-малеимидобензоил-N-гидроксисукцинимида) или гомобифункциональными (например, дисукцинимидилсуберат). Такие линкеры доступны из Pierce Chemical Company, Rockford, Ill.

Пригодные поддающиеся детекции средства, с использованием которых можно дериватизировать (или метить) молекулу антитела по изобретению, могут быть предназначены для включения флуоресцентных соединений, различных ферментов, простетических групп, люминесцентных материалов, биолюминесцентных материалов, испускающих флуоресценцию атомов металлов, например, европия (Eu) и других лантанидов, и радиоактивных материалов (описанных ниже). Иллюстративные флуоресцентные поддающееся детекции средства включают флуоресцеин, изотиоцианат флуоресцеина, родамин, 5-диметиламин-1-нафталенсульфонилхлорид, фикоэритрин и т.п. Антитело можно также дериватизировать с использованием поддающихся детекции ферментов, таких как щелочная фосфатаза, пероксидаза хрена, β-галактозидаза, ацетилхолинэстераза, оксидаза глюкозы и т.п. Когда антитело дериватизируют с использованием поддающегося детекции фермента, его детектируют посредством добавления дополнительных реагентов, используемых ферментом для получения поддающегося детекции продукта реакции. Например, когда присутствует поддающееся детекции средство пероксидаза хрена, добавление пероксида водорода и диаминобензидина приводит к окрашенному продукту реакции, который поддается детекции. Молекулу антитела можно также дериватизировать с использованием простетической группы (например, стрептавидина/биотина и авидина/биотина). Например, антитело можно дериватизировать с использованием биотина и детектировать посредством непрямого измерения связывания авидина или стрептавидина. Примеры пригодных флуоресцентных материалов включают умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеин изотиоцианат, родамин, дихлортриазиниламин флуоресцеин, дансилхлорид или фикоэритрин; пример люминесцентного материала включает люминол; и примеры биолюминесцентных материалов включают люциферазу, люциферин и экворин.

Меченную молекулу антитела можно использовать, например, диагностически и/или экспериментально в ряде контекстов, включая (i) для выделения предопределенного антигена стандартными способами, такими как аффинная хроматография или иммунопреципитация; (ii) для детекции предопределенного антигена (например, в клеточном лизате или супернатанте клеток) для оценки распространенности и паттерна экспрессии белка; (iii) для мониторирования уровней белка в ткани в качестве части способа клинического тестирования, например, для определения эффективности данного режима лечения.

Молекулы антител можно конъюгировать с другой молекулой, как правило, меткой или терапевтическими (например, цитотоксическими или цитостатическими) средством или группой. Радиоактивные изотопы можно использовать в диагностических или терапевтических применениях.

Настоящее изобретение относится к меченным радиоактивной меткой молекулам антител и способам их мечения. В одном варианте осуществления, настоящее изобретение относится к способу мечения молекулы антитела. Способ включает приведение молекулы антитела в контакт с хелатирующим агентом, для получения таким образом конъюгированного антитела.

Как обсуждали выше, молекулу антитела можно конъюгировать с лекарственным средством. Терапевтически активные радиоактивные изотопы уже были упомянуты. Примеры других лекарственных средств включают таксол, цитохалазин B, грамицидин D, бромид этидия, эметин, митомицин, этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, колхицин, доксорубицин, даунорубицин, дигидроксиантрациндион, митоксантрон, митрамицин, актиномицин D, 1-дегидротестостерон, глюкокортикоиды, прокаин, татракаин, лидокаин, пропранолол, пуромицин, майтанзиноиды, например, майтанзинол (см., например, Патент США No. 5208020), CC-1065 (см., например, Патенты США No. 5475092, 5585499, 5846545) и их аналоги или гомологи. Лекарственные средства включают, но без ограничения, антиметаболиты (например, метотрексат, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин, цитарабин, 5-фторурацилдекарбазин), алкилирующие средства (например, мехлорэтамин, тиотепа, хлорамбуцил, CC-1065, мелфалан, кармустин (BSNU) и ломустин (CCNU), циклофосфамид, бусульфан, дибромманнит, стрептозотоцин, митомицин C и цис-дихлордиаминплатину (II) (DDP) цисплатин), антрациклины (например, даунорубицин (ранее дауномицин) и доксорубицин), антибиотики (например, дактиномицин (ранее актиномицин), блеомицин, митрамицин и антрамицин (AMC)) и антимитотические средства (например, винкристин, винбластин, таксол и майтанзиноиды).

В одном аспекте настоящее изобретение относится к способу получения связывающей мишень молекулы, которая специфически связывает мишень, описанную в настоящем описании, например, TIM-3. Например, связывающая мишень молекула представляет собой молекулу антитела. Способ включает: получение белка-мишени, содержащего по меньшей мере часть не относящегося к человеку белка, где часть является гомологичной (по меньшей мере на 70, 75, 80, 85, 87, 90, 92, 94, 95, 96, 97, 98% идентичной) соответствующей части человеческого белка-мишени, но отличается по меньшей мере на одну аминокислоту (например, по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь или девять аминокислот); получение молекулы антитела, которая специфически связывает антиген; и оценку эффективности связывающего средства для модуляции активности белка-мишени. Способ может дополнительно включать введение связывающего средства (например, молекулы антитела) или производного (например, гуманизированной молекулы антитела) субъекту-человеку.

Настоящее изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей вышеуказанную молекулу антитела, векторам и их клеткам-хозяевам. Молекула нуклеиновой кислоты включает, но без ограничения, РНК, геномную ДНК и кДНК.

Иллюстративные молекулы антител против TIM-3

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 описана в US 2015/0218274, опубликованной 6 августа 2015 г., озаглавленной «Antibody Molecules to TIM-3 and Uses Thereof», полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 802 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812, где каждая описана в таблице 7. В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 820, и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812, где каждая описана в таблице 7.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 807 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 807. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 817 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 817. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 823 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 823. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 827 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 827. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 807 и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 817. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 823 и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 827.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 809 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 809. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 819 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 819. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 825 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 825. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 829 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 829. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 809 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 819. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 825 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 829.

Молекулы антител, описанные в настоящем описании, можно получать посредством векторов, клеток-хозяев и способов, описанных в US 2015/0218274, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 7. Аминокислотные и нуклеотидные последовательности иллюстративных молекул антител против TIM-3

ABTIM3-hum11
SEQ ID NO: 801 (Kabat)	HCDR1	SYNMH
SEQ ID NO: 802 (Kabat)	HCDR2	DIYPGNGDTSYNQKFKG
SEQ ID NO: 803 (Kabat)	HCDR3	VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 804 (Chothia)	HCDR1	GYTFTSY
SEQ ID NO: 805 (Chothia)	HCDR2	YPGNGD
SEQ ID NO: 803 (Chothia)	HCDR3	VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 806	VH	QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWMGDIYPGNGDTSYNQKFKGRVTITADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 807	ДНК VH	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCTCTAGCGTGAAAGTTTCTTGTAAAGCTAGTGGCTACACCTTCACTAGCTATAATATGCACTGGGTTCGCCAGGCCCCAGGGCAAGGCCTCGAGTGGATGGGCGATATCTACCCCGGGAACGGCGACACTAGTTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGTCACTATCACCGCCGATAAGTCTACTAGCACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTAGC
SEQ ID NO: 808	Тяжелая цепь	QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWMGDIYPGNGDTSYNQKFKGRVTITADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 809	ДНК тяжелой цепи	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCTCTAGCGTGAAAGTTTCTTGTAAAGCTAGTGGCTACACCTTCACTAGCTATAATATGCACTGGGTTCGCCAGGCCCCAGGGCAAGGCCTCGAGTGGATGGGCGATATCTACCCCGGGAACGGCGACACTAGTTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGTCACTATCACCGCCGATAAGTCTACTAGCACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTAGCGCTAGCACTAAGGGCCCGTCCGTGTTCCCCCTGGCACCTTGTAGCCGGAGCACTAGCGAATCCACCGCTGCCCTCGGCTGCCTGGTCAAGGATTACTTCCCGGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCTCCGGAGTGCACACCTTCCCCGCTGTGCTGCAGAGCTCCGGGCTGTACTCGCTGTCGTCGGTGGTCACGGTGCCTTCATCTAGCCTGGGTACCAAGACCTACACTTGCAACGTGGACCACAAGCCTTCCAACACTAAGGTGGACAAGCGCGTCGAATCGAAGTACGGCCCACCGTGCCCGCCTTGTCCCGCGCCGGAGTTCCTCGGCGGTCCCTCGGTCTTTCTGTTCCCACCGAAGCCCAAGGACACTTTGATGATTTCCCGCACCCCTGAAGTGACATGCGTGGTCGTGGACGTGTCACAGGAAGATCCGGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCACAACGCCAAAACCAAGCCGAGGGAGGAGCAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTGCTGACGGTGCTGCATCAGGACTGGCTGAACGGGAAGGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGGACTTCCTAGCTCAATCGAAAAGACCATCTCGAAAGCCAAGGGACAGCCCCGGGAACCCCAAGTGTATACCCTGCCACCGAGCCAGGAAGAAATGACTAAGAACCAAGTCTCATTGACTTGCCTTGTGAAGGGCTTCTACCCATCGGATATCGCCGTGGAATGGGAGTCCAACGGCCAGCCGGAAAACAACTACAAGACCACCCCTCCGGTGCTGGACTCAGACGGATCCTTCTTCCTCTACTCGCGGCTGACCGTGGATAAGAGCAGATGGCAGGAGGGAAATGTGTTCAGCTGTTCTGTGATGCATGAAGCCCTGCACAACCACTACACTCAGAAGTCCCTGTCCCTCTCCCTGGGA
SEQ ID NO: 810 (Kabat)	LCDR1	RASESVEYYGTSLMQ
SEQ ID NO: 811 (Kabat)	LCDR2	AASNVES
SEQ ID NO: 812 (Kabat)	LCDR3	QQSRKDPST
SEQ ID NO: 813 (Chothia)	LCDR1	SESVEYYGTSL
SEQ ID NO: 814 (Chothia)	LCDR2	AAS
SEQ ID NO: 815 (Chothia)	LCDR3	SRKDPS
SEQ ID NO: 816	VL	AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGKAPKLLIYAASNVESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQSRKDPSTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO: 817	ДНК VL	GCTATTCAGCTGACTCAGTCACCTAGTAGCCTGAGCGCTAGTGTGGGCGATAGAGTGACTATCACCTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGGAAAGCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATCTCTAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGCTACCTACTTCTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAG
SEQ ID NO: 818	Легкая цепь	AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGKAPKLLIYAASNVESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQSRKDPSTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 819	ДНК легкой цепи	GCTATTCAGCTGACTCAGTCACCTAGTAGCCTGAGCGCTAGTGTGGGCGATAGAGTGACTATCACCTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGGAAAGCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATCTCTAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGCTACCTACTTCTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
ABTIM3-hum03
SEQ ID NO: 801 (Kabat)	HCDR1	SYNMH
SEQ ID NO: 820 (Kabat)	HCDR2	DIYPGQGDTSYNQKFKG
SEQ ID NO: 803 (Kabat)	HCDR3	VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 804 (Chothia)	HCDR1	GYTFTSY
SEQ ID NO: 821 (Chothia)	HCDR2	YPGQGD
SEQ ID NO: 803 (Chothia)	HCDR3	VGGAFPMDY
SEQ ID NO: 822	VH	QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWIGDIYPGQGDTSYNQKFKGRATMTADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 823	ДНК VH	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTAGTGTGAAAGTTAGCTGTAAAGCTAGTGGCTATACTTTCACTTCTTATAATATGCACTGGGTCCGCCAGGCCCCAGGTCAAGGCCTCGAGTGGATCGGCGATATCTACCCCGGTCAAGGCGACACTTCCTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGCTACTATGACCGCCGATAAGTCTACTTCTACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCAATGGACTACTGGGGTCAAGGCACCCTGGTCACCGTGTCTAGC
SEQ ID NO: 824	Тяжелая цепь	QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYNMHWVRQAPGQGLEWIGDIYPGQGDTSYNQKFKGRATMTADKSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARVGGAFPMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 825	ДНК тяжелой цепи	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTAGTGTGAAAGTTAGCTGTAAAGCTAGTGGCTATACTTTCACTTCTTATAATATGCACTGGGTCCGCCAGGCCCCAGGTCAAGGCCTCGAGTGGATCGGCGATATCTACCCCGGTCAAGGCGACACTTCCTATAATCAGAAGTTTAAGGGTAGAGCTACTATGACCGCCGATAAGTCTACTTCTACCGTCTATATGGAACTGAGTTCCCTGAGGTCTGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGTGGGCGGAGCCTTCCCAATGGACTACTGGGGTCAAGGCACCCTGGTCACCGTGTCTAGCGCTAGCACTAAGGGCCCGTCCGTGTTCCCCCTGGCACCTTGTAGCCGGAGCACTAGCGAATCCACCGCTGCCCTCGGCTGCCTGGTCAAGGATTACTTCCCGGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCTCCGGAGTGCACACCTTCCCCGCTGTGCTGCAGAGCTCCGGGCTGTACTCGCTGTCGTCGGTGGTCACGGTGCCTTCATCTAGCCTGGGTACCAAGACCTACACTTGCAACGTGGACCACAAGCCTTCCAACACTAAGGTGGACAAGCGCGTCGAATCGAAGTACGGCCCACCGTGCCCGCCTTGTCCCGCGCCGGAGTTCCTCGGCGGTCCCTCGGTCTTTCTGTTCCCACCGAAGCCCAAGGACACTTTGATGATTTCCCGCACCCCTGAAGTGACATGCGTGGTCGTGGACGTGTCACAGGAAGATCCGGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCACAACGCCAAAACCAAGCCGAGGGAGGAGCAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTGCTGACGGTGCTGCATCAGGACTGGCTGAACGGGAAGGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGGACTTCCTAGCTCAATCGAAAAGACCATCTCGAAAGCCAAGGGACAGCCCCGGGAACCCCAAGTGTATACCCTGCCACCGAGCCAGGAAGAAATGACTAAGAACCAAGTCTCATTGACTTGCCTTGTGAAGGGCTTCTACCCATCGGATATCGCCGTGGAATGGGAGTCCAACGGCCAGCCGGAAAACAACTACAAGACCACCCCTCCGGTGCTGGACTCAGACGGATCCTTCTTCCTCTACTCGCGGCTGACCGTGGATAAGAGCAGATGGCAGGAGGGAAATGTGTTCAGCTGTTCTGTGATGCATGAAGCCCTGCACAACCACTACACTCAGAAGTCCCTGTCCCTCTCCCTGGGA
SEQ ID NO: 810 (Kabat)	LCDR1	RASESVEYYGTSLMQ
SEQ ID NO: 811 (Kabat)	LCDR2	AASNVES
SEQ ID NO: 812 (Kabat)	LCDR3	QQSRKDPST
SEQ ID NO: 813 (Chothia)	LCDR1	SESVEYYGTSL
SEQ ID NO: 814 (Chothia)	LCDR2	AAS
SEQ ID NO: 815 (Chothia)	LCDR3	SRKDPS
SEQ ID NO: 826	VL	DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGQPPKLLIYAASNVESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSRKDPSTFGGGTKVEIK
SEQ ID NO: 827	ДНК VL	GATATCGTCCTGACTCAGTCACCCGATAGCCTGGCCGTCAGCCTGGGCGAGCGGGCTACTATTAACTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGTCAACCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCGATAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATTAGTAGCCTGCAGGCCGAGGACGTGGCCGTCTACTACTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAG
SEQ ID NO: 828	Легкая цепь	DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVEYYGTSLMQWYQQKPGQPPKLLIYAASNVESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSRKDPSTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 829	ДНК легкой цепи	GATATCGTCCTGACTCAGTCACCCGATAGCCTGGCCGTCAGCCTGGGCGAGCGGGCTACTATTAACTGTAGAGCTAGTGAATCAGTCGAGTACTACGGCACTAGCCTGATGCAGTGGTATCAGCAGAAGCCCGGTCAACCCCCTAAGCTGCTGATCTACGCCGCCTCTAACGTGGAATCAGGCGTGCCCGATAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCCTGACTATTAGTAGCCTGCAGGCCGAGGACGTGGCCGTCTACTACTGTCAGCAGTCTAGGAAGGACCCTAGCACCTTCGGCGGAGGCACTAAGGTCGAGATTAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC

В одном варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 включает по меньшей мере один или два вариабельных домена тяжелой цепи (необязательно, включающие константную область), по меньшей мере один или два вариабельных домена легкой цепи (необязательно, включающие константную область), или и те, и другие, в которых содержится аминокислотная последовательность ABTIM3, ABTIM3-hum01, ABTIM3-hum02, ABTIM3-hum03, ABTIM3-hum04, ABTIM3-hum05, ABTIM3-hum06, ABTIM3-hum07, ABTIM3-hum08, ABTIM3-hum09, ABTIM3-hum10, ABTIM3-hum11, ABTIM3-hum12, ABTIM3-hum13, ABTIM3-hum14, ABTIM3-hum15, ABTIM3-hum16, ABTIM3-hum17, ABTIM3-hum18, ABTIM3-hum19, ABTIM3-hum20, ABTIM3-hum21, ABTIM3-hum22, ABTIM3-hum23; или как описано в таблицах 1-4 из US 2015/0218274; или которые кодирует нуклеотидная последовательность в таблицах 1-4; или последовательность, по существу идентичная (например, идентичная по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% или выше) любой из вышеуказанных последовательностей. Молекула антитела против TIM-3, необязательно, содержит лидерную последовательность из тяжелой цепи, легкой цепи или обеих, как показано в US 2015/0218274; или последовательность, по существу идентичную ей.

В другом варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит по меньшей мере одну, две, или три определяющих комплементарность области (CDR) из вариабельной области тяжелой цепи и/или вариабельной области легкой цепи антитела, описанного в настоящем описании, например, антитела, выбранного из любого из ABTIM3, ABTIM3-hum01, ABTIM3-hum02, ABTIM3-hum03, ABTIM3-hum04, ABTIM3-hum05, ABTIM3-hum06, ABTIM3-hum07, ABTIM3-hum08, ABTIM3-hum09, ABTIM3-hum10, ABTIM3-hum11, ABTIM3-hum12, ABTIM3-hum13, ABTIM3-hum14, ABTIM3-hum15, ABTIM3-hum16, ABTIM3-hum17, ABTIM3-hum18, ABTIM3-hum19, ABTIM3-hum20, ABTIM3-hum21, ABTIM3-hum22, ABTIM3-hum23; или как описано в таблицах 1-4 из US 2015/0218274; или ее кодирует нуклеотидная последовательность в таблицах 1-4; или последовательность, по существу идентичная (например, идентичная по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 97%, 98%, 99% или выше) любой из вышеуказанных последовательностей.

В другом варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит по меньшей мере одну, две или три CDR (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблицах 1-4 из US 2015/0218274, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблицах 1-4. В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблицах 1-4, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 1-4.

В другом варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит по меньшей мере одну, две, или три CDR (или совместно все CDR) из вариабельной области легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблицах 1-4 из US 2015/0218274, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблицах 1-4. В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблицах 1-4, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблицах 1-4. В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит замену в CDR легкой цепи, например, одну или несколько замен в CDR1, CDR2 и/или CDR3 легкой цепи.

В другом варианте осуществления, молекула антитела против TIM-3 содержит по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть CDR (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, содержащие аминокислотную последовательность, показанную в таблицах 1-4 из US 2015/0218274, или кодированную нуклеотидной последовательностью, показанной в таблицах 1-4. В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблицах 1-4, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблицах 1-4.

Другие иллюстративные молекулы антител против TIM-3

В одном варианте осуществления, антитело против TIM-3 представляет собой антитело, конкурирующее за связывание с и/или связывающееся с тем же эпитопом на TIM-3, что и одно из антител против TIM-3, описанные в настоящем описании.

Таблица 8. Аминокислотные последовательности других иллюстративных молекул антител против TIM-3

APE5137
SEQ ID NO: 830	VH	EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAAASGFTFSSYDMSWVRQAPGKGLDWVSTISGGGTYTYYQDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCASMDYWGQGTTVTVSSA
SEQ ID NO: 831	VL	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSIRRYLNWYHQKPGKAPKLLIYGASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQSHSAPLTFGGGTKVEIKR
APE5121
SEQ ID NO: 832	VH	EVQVLESGGGLVQPGGSLRLYCVASGFTFSGSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKKYYVGPADYWGQGTLVTVSSG
SEQ ID NO: 833	VL	DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQSVLYSSNNKNYLAWYQHKPGQPPKLLIYWASTRESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQYYSSPLTFGGGTKIEVK

Ингибиторы PD-1

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят в комбинации с ингибитором PD-1. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-1 выбран из PDR001 (Novartis), ниволумаба (Bristol-Myers Squibb), пембролизумаба (Merck & Co), пидилизумаба (CureTech), MEDI0680 (Medimmune), REGN2810 (Regeneron), TSR-042 (Tesaro), PF-06801591 (Pfizer), BGB-A317 (Beigene), BGB-108 (Beigene), INCSHR1210 (Incyte) или AMP-224 (Amplimmune).

Иллюстративные ингибиторы PD-1

В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой молекулу антитела против PD-1. В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой молекулу антитела против PD-1, как описано в US 2015/0210769, опубликованной 30 июля 2015 г., озаглавленной «Antibody Molecules to PD-1 and Uses Thereof», полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть определяющих комплементарность областей (CDR) (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблице 1 (например, из последовательностей вариабельной области тяжелой и легкой цепи из BAP049-клон-E или BAP049-клон-B, описанной в таблице 1), или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 1. В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Kabat (например, как приведено в таблице 1). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Chothia (например, как приведено в таблице 1). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют комбинированным определениям CDR по Kabat и Chothia (например, как приведено в таблице 1). В одном варианте осуществления, комбинация CDR по Kabat и Chothia из CDR1 VH содержит аминокислотную последовательность GYTFTTYWMH (SEQ ID NO: 541). В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен (например, консервативных аминокислотных замен) или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблице 1, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 1.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 501, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 502 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 503; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 510, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 511, и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 512, где каждая описана в таблице 1.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, содержащую VHCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 524, VHCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 525, и VHCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 526; и VL, содержащую VLCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 529, VLCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 530, и VLCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 531, где каждая описана в таблице 1.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 506 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 506. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 520 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 520. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 516 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 516. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 506, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 520. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 506, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 516.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 507 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 507. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 521 или 517 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 521 или 517. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 507, и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 521 или 517.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 508 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 508. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 522 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 522. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 518 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 518. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 508, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 522. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 508, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 518.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 509 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 509. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 523 или 519 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 523 или 519. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 509 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 523 или 519.

Молекулы антител, описанные в настоящем описании, можно получать посредством векторов, клеток-хозяев и способов, описанных в US 2015/0210769, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 1. Аминокислотные и нуклеотидные последовательности иллюстративных молекул антител против PD-1

BAP049-клон-B, HC
SEQ ID NO: 501 (Kabat)	HCDR1	TYWMH
SEQ ID NO: 502 (Kabat)	HCDR2	NIYPGTGGSNFDEKFKN
SEQ ID NO: 503 (Kabat)	HCDR3	WTTGTGAY
SEQ ID NO: 504 (Chothia)	HCDR1	GYTFTTY
SEQ ID NO: 505 (Chothia)	HCDR2	YPGTGG
SEQ ID NO: 503 (Chothia)	HCDR3	WTTGTGAY
SEQ ID NO: 506	VH	EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWVRQATGQGLEWMGNIYPGTGGSNFDEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 507	ДНК VH	Gaggtgcagctggtgcagtcaggcgccgaagtgaagaagcccggcgagtcactgagaattagctgtaaaggttcaggctacaccttcactacctactggatgcactgggtccgccaggctaccggtcaaggcctcgagtggatgggtaatatctaccccggcaccggcggctctaacttcgacgagaagtttaagaatagagtgactatcaccgccgataagtctactagcaccgcctatatggaactgtctagcctgagatcagaggacaccgccgtctactactgcactaggtggactaccggcacaggcgcctactggggtcaaggcactaccgtgaccgtgtctagc
SEQ ID NO: 508	Тяжелая цепь	EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWVRQATGQGLEWMGNIYPGTGGSNFDEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 509	ДНК тяжелой цепи	gaggtgcagctggtgcagtcaggcgccgaagtgaagaagcccggcgagtcactgagaattagctgtaaaggttcaggctacaccttcactacctactggatgcactgggtccgccaggctaccggtcaaggcctcgagtggatgggtaatatctaccccggcaccggcggctctaacttcgacgagaagtttaagaatagagtgactatcaccgccgataagtctactagcaccgcctatatggaactgtctagcctgagatcagaggacaccgccgtctactactgcactaggtggactaccggcacaggcgcctactggggtcaaggcactaccgtgaccgtgtctagcgctagcactaagggcccgtccgtgttccccctggcaccttgtagccggagcactagcgaatccaccgctgccctcggctgcctggtcaaggattacttcccggagcccgtgaccgtgtcctggaacagcggagccctgacctccggagtgcacaccttccccgctgtgctgcagagctccgggctgtactcgctgtcgtcggtggtcacggtgccttcatctagcctgggtaccaagacctacacttgcaacgtggaccacaagccttccaacactaaggtggacaagcgcgtcgaatcgaagtacggcccaccgtgcccgccttgtcccgcgccggagttcctcggcggtccctcggtctttctgttcccaccgaagcccaaggacactttgatgatttcccgcacccctgaagtgacatgcgtggtcgtggacgtgtcacaggaagatccggaggtgcagttcaattggtacgtggatggcgtcgaggtgcacaacgccaaaaccaagccgagggaggagcagttcaactccacttaccgcgtcgtgtccgtgctgacggtgctgcatcaggactggctgaacgggaaggagtacaagtgcaaagtgtccaacaagggacttcctagctcaatcgaaaagaccatctcgaaagccaagggacagccccgggaaccccaagtgtataccctgccaccgagccaggaagaaatgactaagaaccaagtctcattgacttgccttgtgaagggcttctacccatcggatatcgccgtggaatgggagtccaacggccagccggaaaacaactacaagaccacccctccggtgctggactcagacggatccttcttcctctactcgcggctgaccgtggataagagcagatggcaggagggaaatgtgttcagctgttctgtgatgcatgaagccctgcacaaccactacactcagaagtccctgtccctctccctggga
BAP049-клон-B, LC
SEQ ID NO: 510 (Kabat)	LCDR1	KSSQSLLDSGNQKNFLT
SEQ ID NO: 511 (Kabat)	LCDR2	WASTRES
SEQ ID NO: 512 (Kabat)	LCDR3	QNDYSYPYT
SEQ ID NO: 513 (Chothia)	LCDR1	SQSLLDSGNQKNF
SEQ ID NO: 514 (Chothia)	LCDR2	WAS
SEQ ID NO: 515 (Chothia)	LCDR3	DYSYPY
SEQ ID NO: 516	VL	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 517	ДНК VL	Gagatcgtcctgactcagtcacccgctaccctgagcctgagccctggcgagcgggctacactgagctgtaaatctagtcagtcactgctggatagcggtaatcagaagaacttcctgacctggtatcagcagaagcccggtaaagcccctaagctgctgatctactgggcctctactagagaatcaggcgtgccctctaggtttagcggtagcggtagtggcaccgacttcaccttcactatctctagcctgcagcccgaggatatcgctacctactactgtcagaacgactatagctacccctacaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaag
SEQ ID NO: 518	Легкая цепь	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGKAPKLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 519	ДНК легкой цепи	Gagatcgtcctgactcagtcacccgctaccctgagcctgagccctggcgagcgggctacactgagctgtaaatctagtcagtcactgctggatagcggtaatcagaagaacttcctgacctggtatcagcagaagcccggtaaagcccctaagctgctgatctactgggcctctactagagaatcaggcgtgccctctaggtttagcggtagcggtagtggcaccgacttcaccttcactatctctagcctgcagcccgaggatatcgctacctactactgtcagaacgactatagctacccctacaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaagcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagcggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc
BAP049-клон-E, HC
SEQ ID NO: 501 (Kabat)	HCDR1	TYWMH
SEQ ID NO: 502 (Kabat)	HCDR2	NIYPGTGGSNFDEKFKN
SEQ ID NO: 503 (Kabat)	HCDR3	WTTGTGAY
SEQ ID NO: 504 (Chothia)	HCDR1	GYTFTTY
SEQ ID NO: 505 (Chothia)	HCDR2	YPGTGG
SEQ ID NO: 503 (Chothia)	HCDR3	WTTGTGAY
SEQ ID NO: 506	VH	EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWVRQATGQGLEWMGNIYPGTGGSNFDEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 507	ДНК VH	Gaggtgcagctggtgcagtcaggcgccgaagtgaagaagcccggcgagtcactgagaattagctgtaaaggttcaggctacaccttcactacctactggatgcactgggtccgccaggctaccggtcaaggcctcgagtggatgggtaatatctaccccggcaccggcggctctaacttcgacgagaagtttaagaatagagtgactatcaccgccgataagtctactagcaccgcctatatggaactgtctagcctgagatcagaggacaccgccgtctactactgcactaggtggactaccggcacaggcgcctactggggtcaaggcactaccgtgaccgtgtctagc
SEQ ID NO: 508	Тяжелая цепь	EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWVRQATGQGLEWMGNIYPGTGGSNFDEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 509	ДНК тяжелой цепи	gaggtgcagctggtgcagtcaggcgccgaagtgaagaagcccggcgagtcactgagaattagctgtaaaggttcaggctacaccttcactacctactggatgcactgggtccgccaggctaccggtcaaggcctcgagtggatgggtaatatctaccccggcaccggcggctctaacttcgacgagaagtttaagaatagagtgactatcaccgccgataagtctactagcaccgcctatatggaactgtctagcctgagatcagaggacaccgccgtctactactgcactaggtggactaccggcacaggcgcctactggggtcaaggcactaccgtgaccgtgtctagcgctagcactaagggcccgtccgtgttccccctggcaccttgtagccggagcactagcgaatccaccgctgccctcggctgcctggtcaaggattacttcccggagcccgtgaccgtgtcctggaacagcggagccctgacctccggagtgcacaccttccccgctgtgctgcagagctccgggctgtactcgctgtcgtcggtggtcacggtgccttcatctagcctgggtaccaagacctacacttgcaacgtggaccacaagccttccaacactaaggtggacaagcgcgtcgaatcgaagtacggcccaccgtgcccgccttgtcccgcgccggagttcctcggcggtccctcggtctttctgttcccaccgaagcccaaggacactttgatgatttcccgcacccctgaagtgacatgcgtggtcgtggacgtgtcacaggaagatccggaggtgcagttcaattggtacgtggatggcgtcgaggtgcacaacgccaaaaccaagccgagggaggagcagttcaactccacttaccgcgtcgtgtccgtgctgacggtgctgcatcaggactggctgaacgggaaggagtacaagtgcaaagtgtccaacaagggacttcctagctcaatcgaaaagaccatctcgaaagccaagggacagccccgggaaccccaagtgtataccctgccaccgagccaggaagaaatgactaagaaccaagtctcattgacttgccttgtgaagggcttctacccatcggatatcgccgtggaatgggagtccaacggccagccggaaaacaactacaagaccacccctccggtgctggactcagacggatccttcttcctctactcgcggctgaccgtggataagagcagatggcaggagggaaatgtgttcagctgttctgtgatgcatgaagccctgcacaaccactacactcagaagtccctgtccctctccctggga
BAP049-клон-E, LC
SEQ ID NO: 510 (Kabat)	LCDR1	KSSQSLLDSGNQKNFLT
SEQ ID NO: 511 (Kabat)	LCDR2	WASTRES
SEQ ID NO: 512 (Kabat)	LCDR3	QNDYSYPYT
SEQ ID NO: 513 (Chothia)	LCDR1	SQSLLDSGNQKNF
SEQ ID NO: 514 (Chothia)	LCDR2	WAS
SEQ ID NO: 515 (Chothia)	LCDR3	DYSYPY
SEQ ID NO: 520	VL	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 521	ДНК VL	Gagatcgtcctgactcagtcacccgctaccctgagcctgagccctggcgagcgggctacactgagctgtaaatctagtcagtcactgctggatagcggtaatcagaagaacttcctgacctggtatcagcagaagcccggtcaagcccctagactgctgatctactgggcctctactagagaatcaggcgtgccctctaggtttagcggtagcggtagtggcaccgacttcaccttcactatctctagcctggaagccgaggacgccgctacctactactgtcagaacgactatagctacccctacaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaag
SEQ ID NO: 522	Легкая цепь	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTRESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 523	ДНК легкой цепи	Gagatcgtcctgactcagtcacccgctaccctgagcctgagccctggcgagcgggctacactgagctgtaaatctagtcagtcactgctggatagcggtaatcagaagaacttcctgacctggtatcagcagaagcccggtcaagcccctagactgctgatctactgggcctctactagagaatcaggcgtgccctctaggtttagcggtagcggtagtggcaccgacttcaccttcactatctctagcctggaagccgaggacgccgctacctactactgtcagaacgactatagctacccctacaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaagcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagcggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc
BAP049-клон-B, HC
SEQ ID NO: 524 (Kabat)	HCDR1	ACCTACTGGATGCAC
SEQ ID NO: 525 (Kabat)	HCDR2	AATATCTACCCCGGCACCGGCGGCTCTAACTTCGACGAGAAGTTTAAGAAT
SEQ ID NO: 526 (Kabat)	HCDR3	TGGACTACCGGCACAGGCGCCTAC
SEQ ID NO: 527 (Chothia)	HCDR1	GGCTACACCTTCACTACCTAC
SEQ ID NO: 528 (Chothia)	HCDR2	TACCCCGGCACCGGCGGC
SEQ ID NO: 526 (Chothia)	HCDR3	TGGACTACCGGCACAGGCGCCTAC
BAP049-клон-B, LC
SEQ ID NO: 529 (Kabat)	LCDR1	AAATCTAGTCAGTCACTGCTGGATAGCGGTAATCAGAAGAACTTCCTGACC
SEQ ID NO: 530 (Kabat)	LCDR2	TGGGCCTCTACTAGAGAATCA
SEQ ID NO: 531 (Kabat)	LCDR3	CAGAACGACTATAGCTACCCCTACACC
SEQ ID NO: 532 (Chothia)	LCDR1	AGTCAGTCACTGCTGGATAGCGGTAATCAGAAGAACTTC
SEQ ID NO: 533 (Chothia)	LCDR2	TGGGCCTCT
SEQ ID NO: 534 (Chothia)	LCDR3	GACTATAGCTACCCCTAC
BAP049-клон-E, HC
SEQ ID NO: 524 (Kabat)	HCDR1	ACCTACTGGATGCAC
SEQ ID NO: 525 (Kabat)	HCDR2	AATATCTACCCCGGCACCGGCGGCTCTAACTTCGACGAGAAGTTTAAGAAT
SEQ ID NO: 526 (Kabat)	HCDR3	TGGACTACCGGCACAGGCGCCTAC
SEQ ID NO: 527 (Chothia)	HCDR1	GGCTACACCTTCACTACCTAC
SEQ ID NO: 528 (Chothia)	HCDR2	TACCCCGGCACCGGCGGC
SEQ ID NO: 526 (Chothia)	HCDR3	TGGACTACCGGCACAGGCGCCTAC
BAP049-клон-E, LC
SEQ ID NO: 529 (Kabat)	LCDR1	AAATCTAGTCAGTCACTGCTGGATAGCGGTAATCAGAAGAACTTCCTGACC
SEQ ID NO: 530 (Kabat)	LCDR2	TGGGCCTCTACTAGAGAATCA
SEQ ID NO: 531 (Kabat)	LCDR3	CAGAACGACTATAGCTACCCCTACACC
SEQ ID NO: 532 (Chothia)	LCDR1	AGTCAGTCACTGCTGGATAGCGGTAATCAGAAGAACTTC
SEQ ID NO: 533 (Chothia)	LCDR2	TGGGCCTCT
SEQ ID NO: 534 (Chothia)	LCDR3	GACTATAGCTACCCCTAC

Другие иллюстративные ингибиторы PD-1

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой ниволумаб (Bristol-Myers Squibb), также известный как MDX-1106, MDX-1106-04, ONO-4538, BMS-936558 или OPDIVO®. Ниволумаб (клон 5C4) и другие антитела против PD-1 описаны в US 8008449 и WO 2006/121168, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из ниволумаба, например, как описано в таблице 2.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой пембролизумаб (Merck & Co), также известный как ламбролизумаб, MK-3475, MK03475, SCH-900475, или KEYTRUDA®. Пембролизумаб и другие антитела против PD-1 описаны в Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44, US 8354509 и WO 2009/114335, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из пембролизумаба, например, как описано в таблице 2.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой пидилизумаб (CureTech), также известный как CT-011. Пидилизумаб и другие антитела против PD-1 описаны в Rosenblatt, J. et al. (2011) J Immunotherapy 34(5): 409-18, US 7695715, US 7332582 и US 8686119, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из пидилизумаба, например, как описано в таблице 2.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой MEDI0680 (Medimmune), также известный как AMP-514. MEDI0680 и другие антитела против PD-1 описаны в US 9205148 и WO 2012/145493, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из MEDI0680.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой REGN2810 (Regeneron). В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из REGN2810.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой PF-06801591 (Pfizer). В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из PF-06801591.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой BGB-A317 или BGB-108 (Beigene). В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из BGB-A317 или BGB-108.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой INCSHR1210 (Incyte), также известный как INCSHR01210 или SHR-1210. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из INCSHR1210.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 представляет собой TSR-042 (Tesaro), также известный как ANB011. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из TSR-042.

Другие известные антитела против PD-1 включают антитела, описанные, например, в WO 2015/112800, WO 2016/092419, WO 2015/085847, WO 2014/179664, WO 2014/194302, WO 2014/209804, WO 2015/200119, US 8735553, US 7488802, US 8927697, US 8993731 и US 9102727, полное содержание которых приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, антитело против PD-1 представляет собой антитело, конкурирующее за связывание с и/или связывающееся с тем же эпитопом на PD-1, как одно из антител против PD-1, описанных в настоящем описании.

В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой пептид, ингибирующий путь передачи сигнала PD-1, например, как описано в US 8907053, полное содержание которой приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой иммуноадгезин (например, иммуноадгезин, содержащий внеклеточную или связывающую PD-1 часть PD-L1 или PD-L2, слитую с константной областью (например, областью Fc из последовательности иммуноглобулина). В одном варианте осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой AMP-224 (B7-DCIg (Amplimmune), например, описанный в WO 2010/027827 и WO 2011/066342, полное содержание которых приведено путем ссылки).

Таблица 2. Аминокислотные последовательности других иллюстративных молекул антител против PD-1

Ниволумаб
SEQ ID NO: 535	Тяжелая цепь	QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
SEQ ID NO: 536	Легкая цепь	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSSNWPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
Пембролизумаб
SEQ ID NO: 537	Тяжелая цепь	QVQLVQSGVEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYMYWVRQAPGQGLEWMGGINPSNGGTNFNEKFKNRVTLTTDSSTTTAYMELKSLQFDDTAVYYCARRDYRFDMGFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
SEQ ID NO: 538	Легкая цепь	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASKGVSTSGYSYLHWYQQKPGQAPRLLIYLASYLESGVPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQHSRDLPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
Пидилизумаб
SEQ ID NO: 539	Тяжелая цепь	QVQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGYTFTNYGMNWVRQAPGQGLQWMGWINTDSGESTYAEEFKGRFVFSLDTSVNTAYLQITSLTAEDTGMYFCVRVGYDALDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 540	Легкая цепь	EIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCSARSSVSYMHWFQQKPGKAPKLWIYRTSNLASGVPSRFSGSGSGTSYCLTINSLQPEDFATYYCQQRSSFPLTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

Ингибиторы PD-L1

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят в комбинации с ингибитором PD-L1. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-L1 выбран из FAZ053 (Novartis), атезолизумаба (Genentech/Roche), авелумаба (Merck Serono и Pfizer), дурвалумаба (MedImmune/AstraZeneca) или BMS-936559 (Bristol-Myers Squibb).

Иллюстративные ингибиторы PD-L1

В одном варианте осуществления, ингибитор PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-L1. В одном варианте осуществления, ингибитор PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-L1, как описано в US 2016/0108123, опубликованной 21 апреля 2016 г., озаглавленной «Antibody Molecules to PD-L1 and Uses Thereof», полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть определяющих комплементарность областей (CDR) (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблице 3 (например, из последовательностей вариабельной области тяжелой и легкой цепи BAP058-клон O или BAP058-клон N, описанной в таблице 3), или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 3. В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Kabat (например, как приведено в таблице 3). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Chothia (например, как приведено в таблице 3). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют комбинированным определениям CDR по Kabat и Chothia (например, как приведено в таблице 3). В одном варианте осуществления, комбинация CDR по Kabat и Chothia из CDR1 VH содержит аминокислотную последовательность GYTFTSYWMY (SEQ ID NO: 647). В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен (например, консервативных аминокислотных замен) или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблице 3, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 3.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 601, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 602 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 603; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 609, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 610 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 611, где каждая описана в таблице 3.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VH, содержащую VHCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 628, VHCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 629, и VHCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 630; и VL, содержащую VLCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 633, VLCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 634, и VLCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 635, где каждая описана в таблице 3.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 606 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 606. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 616 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 616. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 620 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 620. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 624 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 624. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 606, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 616. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 620, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 624.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 607 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 607. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 617 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 617. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 621 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 621. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 625 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 625. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 607 и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 617. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 621 и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 625.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 608 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 608. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 618 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 618. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 622 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 622. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 626 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 626. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 608, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 618. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 622, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 626.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 615 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 615. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 619 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 619. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 623 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 623. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 627 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 627. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 615 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 619. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 623 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 627.

Молекулы антител, описанные в настоящем описании, можно получать посредством векторов, клеток-хозяев и способов, описанных в US 2016/0108123, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 3. Аминокислотные и нуклеотидные последовательности иллюстративных молекул антител против PD-L1

BAP058-клон O, HC
SEQ ID NO: 601 (Kabat)	HCDR1	SYWMY
SEQ ID NO: 602 (Kabat)	HCDR2	RIDPNSGSTKYNEKFKN
SEQ ID NO: 603 (Kabat)	HCDR3	DYRKGLYAMDY
SEQ ID NO: 604 (Chothia)	HCDR1	GYTFTSY
SEQ ID NO: 605 (Chothia)	HCDR2	DPNSGS
SEQ ID NO: 603 (Chothia)	HCDR3	DYRKGLYAMDY
SEQ ID NO: 606	VH	EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWVRQARGQRLEWIGRIDPNSGSTKYNEKFKNRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 607	ДНК VH	GAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTACCGTGAAGATTAGCTGTAAAGTCTCAGGCTACACCTTCACTAGCTACTGGATGTACTGGGTCCGACAGGCTAGAGGGCAAAGACTGGAGTGGATCGGTAGAATCGACCCTAATAGCGGCTCTACTAAGTATAACGAGAAGTTTAAGAATAGGTTCACTATTAGTAGGGATAACTCTAAGAACACCCTGTACCTGCAGATGAATAGCCTGAGAGCCGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTTCA
SEQ ID NO: 608	Тяжелая цепь	EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWVRQARGQRLEWIGRIDPNSGSTKYNEKFKNRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 615	ДНК тяжелой цепи	GAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTACCGTGAAGATTAGCTGTAAAGTCTCAGGCTACACCTTCACTAGCTACTGGATGTACTGGGTCCGACAGGCTAGAGGGCAAAGACTGGAGTGGATCGGTAGAATCGACCCTAATAGCGGCTCTACTAAGTATAACGAGAAGTTTAAGAATAGGTTCACTATTAGTAGGGATAACTCTAAGAACACCCTGTACCTGCAGATGAATAGCCTGAGAGCCGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTTCAGCTAGCACTAAGGGCCCGTCCGTGTTCCCCCTGGCACCTTGTAGCCGGAGCACTAGCGAATCCACCGCTGCCCTCGGCTGCCTGGTCAAGGATTACTTCCCGGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCTCCGGAGTGCACACCTTCCCCGCTGTGCTGCAGAGCTCCGGGCTGTACTCGCTGTCGTCGGTGGTCACGGTGCCTTCATCTAGCCTGGGTACCAAGACCTACACTTGCAACGTGGACCACAAGCCTTCCAACACTAAGGTGGACAAGCGCGTCGAATCGAAGTACGGCCCACCGTGCCCGCCTTGTCCCGCGCCGGAGTTCCTCGGCGGTCCCTCGGTCTTTCTGTTCCCACCGAAGCCCAAGGACACTTTGATGATTTCCCGCACCCCTGAAGTGACATGCGTGGTCGTGGACGTGTCACAGGAAGATCCGGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCACAACGCCAAAACCAAGCCGAGGGAGGAGCAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTGCTGACGGTGCTGCATCAGGACTGGCTGAACGGGAAGGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGGACTTCCTAGCTCAATCGAAAAGACCATCTCGAAAGCCAAGGGACAGCCCCGGGAACCCCAAGTGTATACCCTGCCACCGAGCCAGGAAGAAATGACTAAGAACCAAGTCTCATTGACTTGCCTTGTGAAGGGCTTCTACCCATCGGATATCGCCGTGGAATGGGAGTCCAACGGCCAGCCGGAAAACAACTACAAGACCACCCCTCCGGTGCTGGACTCAGACGGATCCTTCTTCCTCTACTCGCGGCTGACCGTGGATAAGAGCAGATGGCAGGAGGGAAATGTGTTCAGCTGTTCTGTGATGCATGAAGCCCTGCACAACCACTACACTCAGAAGTCCCTGTCCCTCTCCCTGGGA
BAP058-клон O, LC
SEQ ID NO: 609 (Kabat)	LCDR1	KASQDVGTAVA
SEQ ID NO: 610 (Kabat)	LCDR2	WASTRHT
SEQ ID NO: 611(Kabat)	LCDR3	QQYNSYPLT
SEQ ID NO: 612 (Chothia)	LCDR1	SQDVGTA
SEQ ID NO: 613 (Chothia)	LCDR2	WAS
SEQ ID NO: 614 (Chothia)	LCDR3	YNSYPL
SEQ ID NO: 616	VL	AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 617	ДНК VL	GCTATTCAGCTGACTCAGTCACCTAGTAGCCTGAGCGCTAGTGTGGGCGATAGAGTGACTATCACCTGTAAAGCCTCTCAGGACGTGGGCACCGCCGTGGCCTGGTATCTGCAGAAGCCTGGTCAATCACCTCAGCTGCTGATCTACTGGGCCTCTACTAGACACACCGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCTTCACTATCTCTTCACTGGAAGCCGAGGACGCCGCTACCTACTACTGTCAGCAGTATAATAGCTACCCCCTGACCTTCGGTCAAGGCACTAAGGTCGAGATTAAG
SEQ ID NO: 618	Легкая цепь	AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 619	ДНК легкой цепи	GCTATTCAGCTGACTCAGTCACCTAGTAGCCTGAGCGCTAGTGTGGGCGATAGAGTGACTATCACCTGTAAAGCCTCTCAGGACGTGGGCACCGCCGTGGCCTGGTATCTGCAGAAGCCTGGTCAATCACCTCAGCTGCTGATCTACTGGGCCTCTACTAGACACACCGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGACTTCACCTTCACTATCTCTTCACTGGAAGCCGAGGACGCCGCTACCTACTACTGTCAGCAGTATAATAGCTACCCCCTGACCTTCGGTCAAGGCACTAAGGTCGAGATTAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
BAP058-клон N, HC
SEQ ID NO: 601 (Kabat)	HCDR1	SYWMY
SEQ ID NO: 602 (Kabat)	HCDR2	RIDPNSGSTKYNEKFKN
SEQ ID NO: 603 (Kabat)	HCDR3	DYRKGLYAMDY
SEQ ID NO: 604 (Chothia)	HCDR1	GYTFTSY
SEQ ID NO: 605 (Chothia)	HCDR2	DPNSGS
SEQ ID NO: 603 (Chothia)	HCDR3	DYRKGLYAMDY
SEQ ID NO: 620	VH	EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWVRQATGQGLEWMGRIDPNSGSTKYNEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 621	ДНК VH	GAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTACCGTGAAGATTAGCTGTAAAGTCTCAGGCTACACCTTCACTAGCTACTGGATGTACTGGGTCCGACAGGCTACCGGTCAAGGCCTGGAGTGGATGGGTAGAATCGACCCTAATAGCGGCTCTACTAAGTATAACGAGAAGTTTAAGAATAGAGTGACTATCACCGCCGATAAGTCTACTAGCACCGCCTATATGGAACTGTCTAGCCTGAGATCAGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTTCA
SEQ ID NO: 622	Тяжелая цепь	EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWVRQATGQGLEWMGRIDPNSGSTKYNEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 623	ДНК тяжелой цепи	GAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGCGCCGAAGTGAAGAAACCCGGCGCTACCGTGAAGATTAGCTGTAAAGTCTCAGGCTACACCTTCACTAGCTACTGGATGTACTGGGTCCGACAGGCTACCGGTCAAGGCCTGGAGTGGATGGGTAGAATCGACCCTAATAGCGGCTCTACTAAGTATAACGAGAAGTTTAAGAATAGAGTGACTATCACCGCCGATAAGTCTACTAGCACCGCCTATATGGAACTGTCTAGCCTGAGATCAGAGGACACCGCCGTCTACTACTGCGCTAGAGACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGCACTACCGTGACCGTGTCTTCAGCTAGCACTAAGGGCCCGTCCGTGTTCCCCCTGGCACCTTGTAGCCGGAGCACTAGCGAATCCACCGCTGCCCTCGGCTGCCTGGTCAAGGATTACTTCCCGGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCTCCGGAGTGCACACCTTCCCCGCTGTGCTGCAGAGCTCCGGGCTGTACTCGCTGTCGTCGGTGGTCACGGTGCCTTCATCTAGCCTGGGTACCAAGACCTACACTTGCAACGTGGACCACAAGCCTTCCAACACTAAGGTGGACAAGCGCGTCGAATCGAAGTACGGCCCACCGTGCCCGCCTTGTCCCGCGCCGGAGTTCCTCGGCGGTCCCTCGGTCTTTCTGTTCCCACCGAAGCCCAAGGACACTTTGATGATTTCCCGCACCCCTGAAGTGACATGCGTGGTCGTGGACGTGTCACAGGAAGATCCGGAGGTGCAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCACAACGCCAAAACCAAGCCGAGGGAGGAGCAGTTCAACTCCACTTACCGCGTCGTGTCCGTGCTGACGGTGCTGCATCAGGACTGGCTGAACGGGAAGGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGGACTTCCTAGCTCAATCGAAAAGACCATCTCGAAAGCCAAGGGACAGCCCCGGGAACCCCAAGTGTATACCCTGCCACCGAGCCAGGAAGAAATGACTAAGAACCAAGTCTCATTGACTTGCCTTGTGAAGGGCTTCTACCCATCGGATATCGCCGTGGAATGGGAGTCCAACGGCCAGCCGGAAAACAACTACAAGACCACCCCTCCGGTGCTGGACTCAGACGGATCCTTCTTCCTCTACTCGCGGCTGACCGTGGATAAGAGCAGATGGCAGGAGGGAAATGTGTTCAGCTGTTCTGTGATGCATGAAGCCCTGCACAACCACTACACTCAGAAGTCCCTGTCCCTCTCCCTGGGA
BAP058-клон N, LC
SEQ ID NO: 609 (Kabat)	LCDR1	KASQDVGTAVA
SEQ ID NO: 610 (Kabat)	LCDR2	WASTRHT
SEQ ID NO: 611(Kabat)	LCDR3	QQYNSYPLT
SEQ ID NO: 612 (Chothia)	LCDR1	SQDVGTA
SEQ ID NO: 613 (Chothia)	LCDR2	WAS
SEQ ID NO: 614 (Chothia)	LCDR3	YNSYPL
SEQ ID NO: 624	VL	DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCKASQDVGTAVAWYQQKPGQAPRLLIYWASTRHTGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 625	ДНК VL	GACGTCGTGATGACTCAGTCACCCCTGAGCCTGCCCGTGACCCTGGGGCAGCCCGCCTCTATTAGCTGTAAAGCCTCTCAGGACGTGGGCACCGCCGTGGCCTGGTATCAGCAGAAGCCAGGGCAAGCCCCTAGACTGCTGATCTACTGGGCCTCTACTAGACACACCGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGAGTTCACCCTGACTATCTCTTCACTGCAGCCCGACGACTTCGCTACCTACTACTGTCAGCAGTATAATAGCTACCCCCTGACCTTCGGTCAAGGCACTAAGGTCGAGATTAAG
SEQ ID NO: 626	Легкая цепь	DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCKASQDVGTAVAWYQQKPGQAPRLLIYWASTRHTGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 627	ДНК легкой цепи	GACGTCGTGATGACTCAGTCACCCCTGAGCCTGCCCGTGACCCTGGGGCAGCCCGCCTCTATTAGCTGTAAAGCCTCTCAGGACGTGGGCACCGCCGTGGCCTGGTATCAGCAGAAGCCAGGGCAAGCCCCTAGACTGCTGATCTACTGGGCCTCTACTAGACACACCGGCGTGCCCTCTAGGTTTAGCGGTAGCGGTAGTGGCACCGAGTTCACCCTGACTATCTCTTCACTGCAGCCCGACGACTTCGCTACCTACTACTGTCAGCAGTATAATAGCTACCCCCTGACCTTCGGTCAAGGCACTAAGGTCGAGATTAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
BAP058-клон O, HC
SEQ ID NO: 628 (Kabat)	HCDR1	AGCTACTGGATGTAC
SEQ ID NO: 629 (Kabat)	HCDR2	AGAATCGACCCTAATAGCGGCTCTACTAAGTATAACGAGAAGTTTAAGAAT
SEQ ID NO: 630 (Kabat)	HCDR3	GACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTAC
SEQ ID NO: 631 (Chothia)	HCDR1	GGCTACACCTTCACTAGCTAC
SEQ ID NO: 632 (Chothia)	HCDR2	GACCCTAATAGCGGCTCT
SEQ ID NO: 630 (Chothia)	HCDR3	GACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTAC
BAP058-клон O, LC
SEQ ID NO: 633 (Kabat)	LCDR1	AAAGCCTCTCAGGACGTGGGCACCGCCGTGGCC
SEQ ID NO: 634 (Kabat)	LCDR2	TGGGCCTCTACTAGACACACC
SEQ ID NO: 635 (Kabat)	LCDR3	CAGCAGTATAATAGCTACCCCCTGACC
SEQ ID NO: 636 (Chothia)	LCDR1	TCTCAGGACGTGGGCACCGCC
SEQ ID NO: 637 (Chothia)	LCDR2	TGGGCCTCT
SEQ ID NO: 638 (Chothia)	LCDR3	TATAATAGCTACCCCCTG
BAP058-клон N, HC
SEQ ID NO: 628 (Kabat)	HCDR1	AGCTACTGGATGTAC
SEQ ID NO: 629 (Kabat)	HCDR2	AGAATCGACCCTAATAGCGGCTCTACTAAGTATAACGAGAAGTTTAAGAAT
SEQ ID NO: 630 (Kabat)	HCDR3	GACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTAC
SEQ ID NO: 631 (Chothia)	HCDR1	GGCTACACCTTCACTAGCTAC
SEQ ID NO: 632 (Chothia)	HCDR2	GACCCTAATAGCGGCTCT
SEQ ID NO: 630 (Chothia)	HCDR3	GACTATAGAAAGGGCCTGTACGCTATGGACTAC
BAP058-клон N, LC
SEQ ID NO: 633 (Kabat)	LCDR1	AAAGCCTCTCAGGACGTGGGCACCGCCGTGGCC
SEQ ID NO: 634 (Kabat)	LCDR2	TGGGCCTCTACTAGACACACC
SEQ ID NO: 635 (Kabat)	LCDR3	CAGCAGTATAATAGCTACCCCCTGACC
SEQ ID NO: 636 (Chothia)	LCDR1	TCTCAGGACGTGGGCACCGCC
SEQ ID NO: 637 (Chothia)	LCDR2	TGGGCCTCT
SEQ ID NO: 638 (Chothia)	LCDR3	TATAATAGCTACCCCCTG

Другие иллюстративные ингибиторы PD-L1

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 представляет собой атезолизумаб (Genentech/Roche), также известный как MPDL3280A, RG7446, RO5541267, YW243.55.S70, или TECENTRIQ™. Атезолизумаб и другие антитела против PD-L1 описаны в US 8217149, полное содержание которой приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из атезолизумаба, например, как описано в таблице 4.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 представляет собой авелумаб (Merck Serono и Pfizer), также известный как MSB0010718C. Авелумаб и другие антитела против PD-L1 описаны в WO 2013/079174, полное содержание которой приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из авелумаба, например, как описано в таблице 4.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 представляет собой дурвалумаб (MedImmune/AstraZeneca), также известный как MEDI4736. Дурвалумаб и другие антитела против PD-L1 описаны в US 8779108, полное содержание которой приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из дурвалумаба, например, как описано в таблице 4.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 представляет собой BMS-936559 (Bristol-Myers Squibb), также известный как MDX-1105 или 12A4. BMS-936559 и другие антитела против PD-L1 описаны в US 7943743 и WO 2015/081158, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против PD-L1 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из BMS-936559, например, как описано в таблице 4.

Дополнительные известные антитела против PD-L1 включают антитела, описанные, например, в WO 2015/181342, WO 2014/100079, WO 2016/000619, WO 2014/022758, WO 2014/055897, WO 2015/061668, WO 2013/079174, WO 2012/145493, WO 2015/112805, WO 2015/109124, WO 2015/195163, US 8168179, US 8552154, US 8460927 и US 9175082, полное содержание которых приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, антитело против PD-L1 представляет собой антитело, конкурирующее за связывание с и/или связывающееся с тем же эпитопом на PD-L1, что и одно из антител против PD-L1, описанных в настоящем описании.

Таблица 4. Аминокислотные последовательности других иллюстративных молекул антител против PD-L1

Атезолизумаб
SEQ ID NO: 639	Тяжелая цепь	EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 640	Легкая цепь	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
Авелумаб
SEQ ID NO: 641	Тяжелая цепь	EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYIMMWVRQAPGKGLEWVSSIYPSGGITFYADTVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARIKLGTVTTVDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 642	Легкая цепь	QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTRVFGTGTKVTVLGQPKANPTVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADGSPVKAGVETTKPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS
Дурвалумаб
SEQ ID NO: 643	Тяжелая цепь	EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSEKYYVDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREGGWFGELAFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPASIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 644	Легкая цепь	EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQRVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSLPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
BMS-936559
SEQ ID NO: 645	VH	QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKTSGDTFSTYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGKAHYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYFCARKFHFVSGSPFGMDVWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 646	VL	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPTFGQGTKVEIK

Ингибиторы LAG-3

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят в комбинации с ингибитором LAG-3. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор LAG-3 выбран из LAG525 (Novartis), BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb), или TSR-033 (Tesaro).

Иллюстративные ингибиторы LAG-3

В одном варианте осуществления, ингибитор LAG-3 представляет собой молекулу антитела против LAG-3. В одном варианте осуществления, ингибитор LAG-3 представляет собой молекулу антитела против LAG-3, как описано в US 2015/0259420, опубликованной 17 сентября 2015 г., озаглавленной «Antibody Molecules to LAG-3 and Uses Thereof», полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть определяющих комплементарность областей (CDR) (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблице 5 (например, из последовательностей вариабельной области тяжелой и легкой цепи BAP050-клон I или BAP050-клон J, описанной в таблице 5), или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 5. В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Kabat (например, как приведено в таблице 5). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Chothia (например, как приведено в таблице 5). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют комбинированным определениям CDR по Kabat и Chothia (например, как приведено в таблице 5). В одном варианте осуществления, комбинация CDR по Kabat и Chothia из CDR1 VH содержит аминокислотную последовательность GFTLTNYGMN (SEQ ID NO: 766). В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен (например, консервативных аминокислотных замен) или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблице 5, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 5.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 701, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 702, и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 703; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 710, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 711 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 712, где каждая описана в таблице 5.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VH, содержащую VHCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 736 или 737, VHCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 738 или 739, и VHCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 740 или 741; и VL, содержащую VLCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 746 или 747, VLCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 748 или 749, и VLCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 750 или 751, где каждая описана в таблице 5. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VH, содержащую VHCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 758 или 737, VHCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 759 или 739, и VHCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 760 или 741; и VL, содержащую VLCDR1, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 746 или 747, VLCDR2, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 748 или 749, и VLCDR3, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 750 или 751, где каждая описана в таблице 5.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 706 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 706. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 718 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 718. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 724 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 724. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 730 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 730. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 706, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 718. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 724, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 730.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 707 или 708, или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 707 или 708. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 719 или 720, или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 719 или 720. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 725 или 726, или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 725 или 726. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 731 или 732, или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 731 или 732. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 707 или 708, и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 719 или 720. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 725 или 726, и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 731 или 732.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 709 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 709. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 721 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 721. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 727 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 727. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 733 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 733. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 709, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 721. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 727, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 733.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 716 или 717 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 716 или 717. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 722 или 723 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 722 или 723. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 728 или 729 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 728 или 729. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 734 или 735 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 734 или 735. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 716 или 717 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 722 или 723. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 728 или 729 и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 734 или 735.

Молекулы антител, описанные в настоящем описании, можно получать посредством векторов, клеток-хозяев и способов, описанных в US 2015/0259420, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 5. Аминокислотные и нуклеотидные последовательности иллюстративных молекул антител против LAG-3

BAP050-клон I, HC
SEQ ID NO: 701 (Kabat)	HCDR1	NYGMN
SEQ ID NO: 702 (Kabat)	HCDR2	WINTDTGEPTYADDFKG
SEQ ID NO: 703 (Kabat)	HCDR3	NPPYYYGTNNAEAMDY
SEQ ID NO: 704 (Chothia)	HCDR1	GFTLTNY
SEQ ID NO: 705 (Chothia)	HCDR2	NTDTGE
SEQ ID NO: 703 (Chothia)	HCDR3	NPPYYYGTNNAEAMDY
SEQ ID NO:706	VH	QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFTLTNYGMNWVRQARGQRLEWIGWINTDTGEPTYADDFKGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCARNPPYYYGTNNAEAMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 707	ДНК VH	Caagtgcagctggtgcagtcgggagccgaagtgaagaagcctggagcctcggtgaaggtgtcgtgcaaggcatccggattcaccctcaccaattacgggatgaactgggtcagacaggcccggggtcaacggctggagtggatcggatggattaacaccgacaccggggagcctacctacgcggacgatttcaagggacggttcgtgttctccctcgacacctccgtgtccaccgcctacctccaaatctcctcactgaaagcggaggacaccgccgtgtactattgcgcgaggaacccgccctactactacggaaccaacaacgccgaagccatggactactggggccagggcaccactgtgactgtgtccagc
SEQ ID NO: 708	ДНК VH	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGTGAAGAAACCTGGCGCCTCCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTTCACCCTGACCAACTACGGCATGAACTGGGTGCGACAGGCCAGGGGCCAGCGGCTGGAATGGATCGGCTGGATCAACACCGACACCGGCGAGCCTACCTACGCCGACGACTTCAAGGGCAGATTCGTGTTCTCCCTGGACACCTCCGTGTCCACCGCCTACCTGCAGATCTCCAGCCTGAAGGCCGAGGATACCGCCGTGTACTACTGCGCCCGGAACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACCGTGTCCTCT
SEQ ID NO: 709	Тяжелая цепь	QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFTLTNYGMNWVRQARGQRLEWIGWINTDTGEPTYADDFKGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCARNPPYYYGTNNAEAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 716	ДНК тяжелой цепи	caagtgcagctggtgcagtcgggagccgaagtgaagaagcctggagcctcggtgaaggtgtcgtgcaaggcatccggattcaccctcaccaattacgggatgaactgggtcagacaggcccggggtcaacggctggagtggatcggatggattaacaccgacaccggggagcctacctacgcggacgatttcaagggacggttcgtgttctccctcgacacctccgtgtccaccgcctacctccaaatctcctcactgaaagcggaggacaccgccgtgtactattgcgcgaggaacccgccctactactacggaaccaacaacgccgaagccatggactactggggccagggcaccactgtgactgtgtccagcgcgtccactaagggcccgtccgtgttccccctggcaccttgtagccggagcactagcgaatccaccgctgccctcggctgcctggtcaaggattacttcccggagcccgtgaccgtgtcctggaacagcggagccctgacctccggagtgcacaccttccccgctgtgctgcagagctccgggctgtactcgctgtcgtcggtggtcacggtgccttcatctagcctgggtaccaagacctacacttgcaacgtggaccacaagccttccaacactaaggtggacaagcgcgtcgaatcgaagtacggcccaccgtgcccgccttgtcccgcgccggagttcctcggcggtccctcggtctttctgttcccaccgaagcccaaggacactttgatgatttcccgcacccctgaagtgacatgcgtggtcgtggacgtgtcacaggaagatccggaggtgcagttcaattggtacgtggatggcgtcgaggtgcacaacgccaaaaccaagccgagggaggagcagttcaactccacttaccgcgtcgtgtccgtgctgacggtgctgcatcaggactggctgaacgggaaggagtacaagtgcaaagtgtccaacaagggacttcctagctcaatcgaaaagaccatctcgaaagccaagggacagccccgggaaccccaagtgtataccctgccaccgagccaggaagaaatgactaagaaccaagtctcattgacttgccttgtgaagggcttctacccatcggatatcgccgtggaatgggagtccaacggccagccggaaaacaactacaagaccacccctccggtgctggactcagacggatccttcttcctctactcgcggctgaccgtggataagagcagatggcaggagggaaatgtgttcagctgttctgtgatgcatgaagccctgcacaaccactacactcagaagtccctgtccctctccctggga
SEQ ID NO: 717	ДНК тяжелой цепи	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGTGAAGAAACCTGGCGCCTCCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTTCACCCTGACCAACTACGGCATGAACTGGGTGCGACAGGCCAGGGGCCAGCGGCTGGAATGGATCGGCTGGATCAACACCGACACCGGCGAGCCTACCTACGCCGACGACTTCAAGGGCAGATTCGTGTTCTCCCTGGACACCTCCGTGTCCACCGCCTACCTGCAGATCTCCAGCCTGAAGGCCGAGGATACCGCCGTGTACTACTGCGCCCGGAACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACCGTGTCCTCTGCTTCTACCAAGGGGCCCAGCGTGTTCCCCCTGGCCCCCTGCTCCAGAAGCACCAGCGAGAGCACAGCCGCCCTGGGCTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCAGCAGCAGCCTGGGCACCAAGACCTACACCTGTAACGTGGACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGGGTGGAGAGCAAGTACGGCCCACCCTGCCCCCCCTGCCCAGCCCCCGAGTTCCTGGGCGGACCCAGCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGAACCCCCGAGGTGACCTGTGTGGTGGTGGACGTGTCCCAGGAGGACCCCGAGGTCCAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTTTAACAGCACCTACCGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGTAAGGTCTCCAACAAGGGCCTGCCAAGCAGCATCGAAAAGACCATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCTAGAGAGCCCCAGGTCTACACCCTGCCACCCAGCCAAGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCAAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAGGCTGACCGTGGACAAGTCCAGATGGCAGGAGGGCAACGTCTTTAGCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGAGCCTGAGCCTGTCCCTGGGC
BAP050-клон I, LC
SEQ ID NO: 710 (Kabat)	LCDR1	SSSQDISNYLN
SEQ ID NO: 711 (Kabat)	LCDR2	YTSTLHL
SEQ ID NO: 712 (Kabat)	LCDR3	QQYYNLPWT
SEQ ID NO: 713 (Chothia)	LCDR1	SQDISNY
SEQ ID NO: 714 (Chothia)	LCDR2	YTS
SEQ ID NO: 715 (Chothia)	LCDR3	YYNLPW
SEQ ID NO: 718	VL	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSSSQDISNYLNWYLQKPGQSPQLLIYYTSTLHLGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQYYNLPWTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 719	ДНК VL	Gatattcagatgactcagtcacctagtagcctgagcgctagtgtgggcgatagagtgactatcacctgtagctctagtcaggatatctctaactacctgaactggtatctgcagaagcccggtcaatcacctcagctgctgatctactacactagcaccctgcacctgggcgtgccctctaggtttagcggtagcggtagtggcaccgagttcaccctgactatctctagcctgcagcccgacgacttcgctacctactactgtcagcagtactataacctgccctggaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaag
SEQ ID NO: 720	ДНК VL	GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCTGCTTCCGTGGGCGACAGAGTGACCATCACCTGTTCCTCCAGCCAGGACATCTCCAACTACCTGAACTGGTATCTGCAGAAGCCCGGCCAGTCCCCTCAGCTGCTGATCTACTACACCTCCACCCTGCACCTGGGCGTGCCCTCCAGATTTTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCAGCTCCCTGCAGCCCGACGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGTACTACAACCTGCCCTGGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAAATCAAG
SEQ ID NO: 721	Легкая цепь	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSSSQDISNYLNWYLQKPGQSPQLLIYYTSTLHLGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQYYNLPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 722	ДНК легкой цепи	Gatattcagatgactcagtcacctagtagcctgagcgctagtgtgggcgatagagtgactatcacctgtagctctagtcaggatatctctaactacctgaactggtatctgcagaagcccggtcaatcacctcagctgctgatctactacactagcaccctgcacctgggcgtgccctctaggtttagcggtagcggtagtggcaccgagttcaccctgactatctctagcctgcagcccgacgacttcgctacctactactgtcagcagtactataacctgccctggaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaagcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagcggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc
SEQ ID NO: 723	ДНК легкой цепи	GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCTGCTTCCGTGGGCGACAGAGTGACCATCACCTGTTCCTCCAGCCAGGACATCTCCAACTACCTGAACTGGTATCTGCAGAAGCCCGGCCAGTCCCCTCAGCTGCTGATCTACTACACCTCCACCCTGCACCTGGGCGTGCCCTCCAGATTTTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCAGCTCCCTGCAGCCCGACGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGTACTACAACCTGCCCTGGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCAAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGTCTGCTGAACAACTTCTACCCCAGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGTGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
BAP050-клон J, HC
SEQ ID NO: 701 (Kabat)	HCDR1	NYGMN
SEQ ID NO: 702 (Kabat)	HCDR2	WINTDTGEPTYADDFKG
SEQ ID NO: 703 (Kabat)	HCDR3	NPPYYYGTNNAEAMDY
SEQ ID NO: 704 (Chothia)	HCDR1	GFTLTNY
SEQ ID NO: 705 (Chothia)	HCDR2	NTDTGE
SEQ ID NO: 703 (Chothia)	HCDR3	NPPYYYGTNNAEAMDY
SEQ ID NO: 724	VH	QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFTLTNYGMNWVRQAPGQGLEWMGWINTDTGEPTYADDFKGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCARNPPYYYGTNNAEAMDYWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 725	ДНК VH	Caggtgcagctggtgcagtcaggcgccgaagtgaagaaacccggcgctagtgtgaaagtcagctgtaaagctagtggcttcaccctgactaactacgggatgaactgggtccgccaggccccaggtcaaggcctcgagtggatgggctggattaacaccgacaccggcgagcctacctacgccgacgactttaagggcagattcgtgtttagcctggacactagtgtgtctaccgcctacctgcagatctctagcctgaaggccgaggacaccgccgtctactactgcgctagaaaccccccctactactacggcactaacaacgccgaggctatggactactggggtcaaggcactaccgtgaccgtgtctagc
SEQ ID NO: 726	ДНК VH	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGTGAAGAAACCTGGCGCCTCCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTTCACCCTGACCAACTACGGCATGAACTGGGTGCGACAGGCCCCTGGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCTGGATCAACACCGACACCGGCGAGCCTACCTACGCCGACGACTTCAAGGGCAGATTCGTGTTCTCCCTGGACACCTCCGTGTCCACCGCCTACCTGCAGATCTCCAGCCTGAAGGCCGAGGATACCGCCGTGTACTACTGCGCCCGGAACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACCGTGTCCTCT
SEQ ID NO: 727	Тяжелая цепь	QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFTLTNYGMNWVRQAPGQGLEWMGWINTDTGEPTYADDFKGRFVFSLDTSVSTAYLQISSLKAEDTAVYYCARNPPYYYGTNNAEAMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLG
SEQ ID NO: 728	ДНК тяжелой цепи	caggtgcagctggtgcagtcaggcgccgaagtgaagaaacccggcgctagtgtgaaagtcagctgtaaagctagtggcttcaccctgactaactacgggatgaactgggtccgccaggccccaggtcaaggcctcgagtggatgggctggattaacaccgacaccggcgagcctacctacgccgacgactttaagggcagattcgtgtttagcctggacactagtgtgtctaccgcctacctgcagatctctagcctgaaggccgaggacaccgccgtctactactgcgctagaaaccccccctactactacggcactaacaacgccgaggctatggactactggggtcaaggcactaccgtgaccgtgtctagcgctagcactaagggcccgtccgtgttccccctggcaccttgtagccggagcactagcgaatccaccgctgccctcggctgcctggtcaaggattacttcccggagcccgtgaccgtgtcctggaacagcggagccctgacctccggagtgcacaccttccccgctgtgctgcagagctccgggctgtactcgctgtcgtcggtggtcacggtgccttcatctagcctgggtaccaagacctacacttgcaacgtggaccacaagccttccaacactaaggtggacaagcgcgtcgaatcgaagtacggcccaccgtgcccgccttgtcccgcgccggagttcctcggcggtccctcggtctttctgttcccaccgaagcccaaggacactttgatgatttcccgcacccctgaagtgacatgcgtggtcgtggacgtgtcacaggaagatccggaggtgcagttcaattggtacgtggatggcgtcgaggtgcacaacgccaaaaccaagccgagggaggagcagttcaactccacttaccgcgtcgtgtccgtgctgacggtgctgcatcaggactggctgaacgggaaggagtacaagtgcaaagtgtccaacaagggacttcctagctcaatcgaaaagaccatctcgaaagccaagggacagccccgggaaccccaagtgtataccctgccaccgagccaggaagaaatgactaagaaccaagtctcattgacttgccttgtgaagggcttctacccatcggatatcgccgtggaatgggagtccaacggccagccggaaaacaactacaagaccacccctccggtgctggactcagacggatccttcttcctctactcgcggctgaccgtggataagagcagatggcaggagggaaatgtgttcagctgttctgtgatgcatgaagccctgcacaaccactacactcagaagtccctgtccctctccctggga
SEQ ID NO: 729	ДНК тяжелой цепи	CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCCGAAGTGAAGAAACCTGGCGCCTCCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTTCACCCTGACCAACTACGGCATGAACTGGGTGCGACAGGCCCCTGGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCTGGATCAACACCGACACCGGCGAGCCTACCTACGCCGACGACTTCAAGGGCAGATTCGTGTTCTCCCTGGACACCTCCGTGTCCACCGCCTACCTGCAGATCTCCAGCCTGAAGGCCGAGGATACCGCCGTGTACTACTGCGCCCGGAACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACCGTGTCCTCTGCTTCTACCAAGGGGCCCAGCGTGTTCCCCCTGGCCCCCTGCTCCAGAAGCACCAGCGAGAGCACAGCCGCCCTGGGCTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACCGTGTCCTGGAACAGCGGAGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCAGCAGCAGCCTGGGCACCAAGACCTACACCTGTAACGTGGACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGGGTGGAGAGCAAGTACGGCCCACCCTGCCCCCCCTGCCCAGCCCCCGAGTTCCTGGGCGGACCCAGCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGAACCCCCGAGGTGACCTGTGTGGTGGTGGACGTGTCCCAGGAGGACCCCGAGGTCCAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTTTAACAGCACCTACCGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGTAAGGTCTCCAACAAGGGCCTGCCAAGCAGCATCGAAAAGACCATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCTAGAGAGCCCCAGGTCTACACCCTGCCACCCAGCCAAGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCAAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAGGCTGACCGTGGACAAGTCCAGATGGCAGGAGGGCAACGTCTTTAGCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGAGCCTGAGCCTGTCCCTGGGC
BAP050-клон J, LC
SEQ ID NO: 710 (Kabat)	LCDR1	SSSQDISNYLN
SEQ ID NO: 711 (Kabat)	LCDR2	YTSTLHL
SEQ ID NO: 712 (Kabat)	LCDR3	QQYYNLPWT
SEQ ID NO: 713 (Chothia)	LCDR1	SQDISNY
SEQ ID NO: 714 (Chothia)	LCDR2	YTS
SEQ ID NO: 715 (Chothia)	LCDR3	YYNLPW
SEQ ID NO: 730	VL	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSSSQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSTLHLGIPPRFSGSGYGTDFTLTINNIESEDAAYYFCQQYYNLPWTFGQGTKVEIK
SEQ ID NO: 731	ДНК VL	Gatattcagatgactcagtcacctagtagcctgagcgctagtgtgggcgatagagtgactatcacctgtagctctagtcaggatatctctaactacctgaactggtatcagcagaagcccggtaaagcccctaagctgctgatctactacactagcaccctgcacctgggaatcccccctaggtttagcggtagcggctacggcaccgacttcaccctgactattaacaatatcgagtcagaggacgccgcctactacttctgtcagcagtactataacctgccctggaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaag
SEQ ID NO: 732	ДНК VL	GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCTGCTTCCGTGGGCGACAGAGTGACCATCACCTGTTCCTCCAGCCAGGACATCTCCAACTACCTGAACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCCCCAAGCTGCTGATCTACTACACCTCCACCCTGCACCTGGGCATCCCCCCTAGATTCTCCGGCTCTGGCTACGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAACAACATCGAGTCCGAGGACGCCGCCTACTACTTCTGCCAGCAGTACTACAACCTGCCCTGGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAAATCAAG
SEQ ID NO: 733	Легкая цепь	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSSSQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSTLHLGIPPRFSGSGYGTDFTLTINNIESEDAAYYFCQQYYNLPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 734	ДНК легкой цепи	Gatattcagatgactcagtcacctagtagcctgagcgctagtgtgggcgatagagtgactatcacctgtagctctagtcaggatatctctaactacctgaactggtatcagcagaagcccggtaaagcccctaagctgctgatctactacactagcaccctgcacctgggaatcccccctaggtttagcggtagcggctacggcaccgacttcaccctgactattaacaatatcgagtcagaggacgccgcctactacttctgtcagcagtactataacctgccctggaccttcggtcaaggcactaaggtcgagattaagcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagcggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc
SEQ ID NO: 735	ДНК легкой цепи	GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCTGCTTCCGTGGGCGACAGAGTGACCATCACCTGTTCCTCCAGCCAGGACATCTCCAACTACCTGAACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCCCCAAGCTGCTGATCTACTACACCTCCACCCTGCACCTGGGCATCCCCCCTAGATTCTCCGGCTCTGGCTACGGCACCGACTTCACCCTGACCATCAACAACATCGAGTCCGAGGACGCCGCCTACTACTTCTGCCAGCAGTACTACAACCTGCCCTGGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGGTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCAAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGTCTGCTGAACAACTTCTACCCCAGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGTGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
BAP050-клон I, HC
SEQ ID NO: 736 (Kabat)	HCDR1	aattacgggatgaac
SEQ ID NO: 737 (Kabat)	HCDR1	AACTACGGCATGAAC
SEQ ID NO: 738 (Kabat)	HCDR2	tggattaacaccgacaccggggagcctacctacgcggacgatttcaaggga
SEQ ID NO: 739 (Kabat)	HCDR2	TGGATCAACACCGACACCGGCGAGCCTACCTACGCCGACGACTTCAAGGGC
SEQ ID NO: 740 (Kabat)	HCDR3	aacccgccctactactacggaaccaacaacgccgaagccatggactac
SEQ ID NO: 741 (Kabat)	HCDR3	AACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTAT
SEQ ID NO: 742 (Chothia)	HCDR1	ggattcaccctcaccaattac
SEQ ID NO: 743 (Chothia)	HCDR1	GGCTTCACCCTGACCAACTAC
SEQ ID NO: 744 (Chothia)	HCDR2	aacaccgacaccggggag
SEQ ID NO: 745 (Chothia)	HCDR2	AACACCGACACCGGCGAG
SEQ ID NO: 740 (Chothia)	HCDR3	aacccgccctactactacggaaccaacaacgccgaagccatggactac
SEQ ID NO: 741 (Chothia)	HCDR3	AACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTAT
BAP050-клон I, LC
SEQ ID NO: 746 (Kabat)	LCDR1	agctctagtcaggatatctctaactacctgaac
SEQ ID NO: 747 (Kabat)	LCDR1	TCCTCCAGCCAGGACATCTCCAACTACCTGAAC
SEQ ID NO: 748 (Kabat)	LCDR2	tacactagcaccctgcacctg
SEQ ID NO: 749 (Kabat)	LCDR2	TACACCTCCACCCTGCACCTG
SEQ ID NO: 750 (Kabat)	LCDR3	cagcagtactataacctgccctggacc
SEQ ID NO: 751 (Kabat)	LCDR3	CAGCAGTACTACAACCTGCCCTGGACC
SEQ ID NO: 752 (Chothia)	LCDR1	agtcaggatatctctaactac
SEQ ID NO: 753 (Chothia)	LCDR1	AGCCAGGACATCTCCAACTAC
SEQ ID NO: 754 (Chothia)	LCDR2	tacactagc
SEQ ID NO: 755 (Chothia)	LCDR2	TACACCTCC
SEQ ID NO: 756 (Chothia)	LCDR3	tactataacctgccctgg
SEQ ID NO: 757 (Chothia)	LCDR3	TACTACAACCTGCCCTGG
BAP050-клон J, HC
SEQ ID NO: 758 (Kabat)	HCDR1	aactacgggatgaac
SEQ ID NO: 737 (Kabat)	HCDR1	AACTACGGCATGAAC
SEQ ID NO: 759 (Kabat)	HCDR2	tggattaacaccgacaccggcgagcctacctacgccgacgactttaagggc
SEQ ID NO: 739 (Kabat)	HCDR2	TGGATCAACACCGACACCGGCGAGCCTACCTACGCCGACGACTTCAAGGGC
SEQ ID NO: 760 (Kabat)	HCDR3	aaccccccctactactacggcactaacaacgccgaggctatggactac
SEQ ID NO: 741 (Kabat)	HCDR3	AACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTAT
SEQ ID NO: 761 (Chothia)	HCDR1	ggcttcaccctgactaactac
SEQ ID NO: 743 (Chothia)	HCDR1	GGCTTCACCCTGACCAACTAC
SEQ ID NO: 744 (Chothia)	HCDR2	aacaccgacaccggggag
SEQ ID NO: 745 (Chothia)	HCDR2	AACACCGACACCGGCGAG
SEQ ID NO: 760 (Chothia)	HCDR3	aaccccccctactactacggcactaacaacgccgaggctatggactac
SEQ ID NO: 741 (Chothia)	HCDR3	AACCCCCCTTACTACTACGGCACCAACAACGCCGAGGCCATGGACTAT
BAP050-клон J, LC
SEQ ID NO: 746 (Kabat)	LCDR1	agctctagtcaggatatctctaactacctgaac
SEQ ID NO: 747 (Kabat)	LCDR1	TCCTCCAGCCAGGACATCTCCAACTACCTGAAC
SEQ ID NO: 748 (Kabat)	LCDR2	TACACTAGCACCCTGCACCTG
SEQ ID NO: 749 (Kabat)	LCDR2	TACACCTCCACCCTGCACCTG
SEQ ID NO: 750 (Kabat)	LCDR3	cagcagtactataacctgccctggacc
SEQ ID NO: 751 (Kabat)	LCDR3	CAGCAGTACTACAACCTGCCCTGGACC
SEQ ID NO: 752 (Chothia)	LCDR1	agtcaggatatctctaactac
SEQ ID NO: 753 (Chothia)	LCDR1	AGCCAGGACATCTCCAACTAC
SEQ ID NO: 754 (Chothia)	LCDR2	TACACTAGC
SEQ ID NO: 755 (Chothia)	LCDR2	TACACCTCC
SEQ ID NO: 756 (Chothia)	LCDR3	tactataacctgccctgg
SEQ ID NO: 757 (Chothia)	LCDR3	TACTACAACCTGCCCTGG

Другие иллюстративные ингибиторы LAG-3

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 представляет собой BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb), также известный как BMS986016. BMS-986016 и другие антитела против LAG-3 описаны в WO 2015/116539 и US 9505839, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из BMS-986016, например, как описано в таблице 6.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 представляет собой TSR-033 (Tesaro). В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из TSR-033.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 представляет собой IMP731 или GSK2831781 (GSK и Prima BioMed). IMP731 и другие антитела против LAG-3, описанные в WO 2008/132601 и US 9244059, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из IMP731, например, как описано в таблице 6. В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из GSK2831781.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 представляет собой IMP761 (Prima BioMed). В одном варианте осуществления, молекула антитела против LAG-3 содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из IMP761.

Дополнительные известные антитела против LAG-3 включают антитела, описанные, например, в WO 2008/132601, WO 2010/019570, WO 2014/140180, WO 2015/116539, WO 2015/200119, WO 2016/028672, US 9244059, US 9505839, полное содержание которых приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, антитело против LAG-3 представляет собой антитело, конкурирующее за связывание с и/или связывающееся с тем же эпитопом на LAG-3, что и одно из антител против LAG-3, описанных в настоящем описании.

В одном варианте осуществления, ингибитор против LAG-3 представляет собой растворимый белок LAG-3, например, IMP321 (Prima BioMed), например, как описано в WO 2009/044273, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 6. Аминокислотные последовательности других иллюстративных молекул антител против LAG-3

BMS-986016
SEQ ID NO: 762	Тяжелая цепь	QVQLQQWGAGLLKPSETLSLTCAVYGGSFSDYYWNWIRQPPGKGLEWIGEINHRGSTNSNPSLKSRVTLSLDTSKNQFSLKLRSVTAADTAVYYCAFGYSDYEYNWFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
SEQ ID NO: 763	Легкая цепь	EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSISSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPLTFGQGTNLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
IMP731
SEQ ID NO: 764	Тяжелая цепь	QVQLKESGPGLVAPSQSLSITCTVSGFSLTAYGVNWVRQPPGKGLEWLGMIWDDGSTDYNSALKSRLSISKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTARYYCAREGDVAFDYWGQGTTLTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 765	Легкая цепь	DIVMTQSPSSLAVSVGQKVTMSCKSSQSLLNGSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLVYFASTRDSGVPDRFIGSGSGTDFTLTISSVQAEDLADYFCLQHFGTPPTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

Агонисты GITR

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят в комбинации с агонистом GITR. В некоторых вариантах осуществления, агонист GITR представляет собой GWN323 (NVS), BMS-986156, MK-4166 или MK-1248 (Merck), TRX518 (Leap Therapeutics), INCAGN1876 (Incyte/Agenus), AMG 228 (Amgen) или INBRX-110 (Inhibrx).

Иллюстративные агонисты GITR

В одном варианте осуществления, агонист GITR представляет собой молекулу антитела против GITR. В одном варианте осуществления, агонист GITR представляет собой молекулу антитела против GITR, как описано в WO 2016/057846, опубликованной 14 апреля 2016 г., озаглавленной «Compositions and Methods of Use for Augmented Immune Response and Cancer Therapy», полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть определяющих комплементарность областей (CDR) (или совместно все CDR) из вариабельной области тяжелой и легкой цепи, содержащей аминокислотную последовательность, показанную в таблице 9 (например, из последовательностей вариабельной области тяжелой и легкой цепи MAB7, описанной в таблице 9), или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 9. В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Kabat (например, как приведено в таблице 9). В некоторых вариантах осуществления, CDR соответствуют определению Chothia (например, как приведено в таблице 9). В одном варианте осуществления, одна или несколько из CDR (или совместно все CDR) имеют одно, два, три, четыре, пять, шесть или более изменений, например, аминокислотных замен (например, консервативных аминокислотных замен) или делеций, по сравнению с аминокислотной последовательностью, показанной в таблице 9, или кодированной нуклеотидной последовательностью, показанной в таблице 9.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 909, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 911, и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 913; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 914, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 916, и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 918, где каждая описана в таблице 9.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 901 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 901. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 902 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 902. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 901, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 902.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 905 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 905. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 906 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 906. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит VH, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 905, и VL, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 906.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 903 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 903. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 904 или аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичную SEQ ID NO: 904. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 903, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 904.

В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 907 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 907. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 908 или нуклеотидной последовательностью, по меньшей мере на 85%, 90%, 95% или 99%, или выше, идентичной SEQ ID NO: 908. В одном варианте осуществления, молекула антитела содержит тяжелую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 907, и легкую цепь, кодируемую нуклеотидной последовательностью из SEQ ID NO: 908.

Молекулы антител, описанные в настоящем описании, можно получать посредством векторов, клеток-хозяев и способов, описанных в WO 2016/057846, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 9: Аминокислотные и нуклеотидные последовательности иллюстративных молекула антитела против GITR

MAB7
SEQ ID NO: 901	VH	EVQLVESGGGLVQSGGSLRLSCAASGFSLSSYGVDWVRQAPGKGLEWVGVIWGGGGTYYASSLMGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHAYGHDGGFAMDYWGQGTLVTVSS
SEQ ID NO: 902	VL	EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASESVSSNVAWYQQRPGQAPRLLIYGASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCGQSYSYPFTFGQGTKLEIK
SEQ ID NO: 903	Тяжелая цепь	EVQLVESGGGLVQSGGSLRLSCAASGFSLSSYGVDWVRQAPGKGLEWVGVIWGGGGTYYASSLMGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHAYGHDGGFAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
SEQ ID NO: 904	Легкая цепь	EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASESVSSNVAWYQQRPGQAPRLLIYGASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCGQSYSYPFTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SEQ ID NO: 905	ДНК VH	GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGCGGACTGGTGCAGTCCGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGCGCTGCCTCCGGCTTCTCCCTGTCCTCTTACGGCGTGGACTGGGTGCGACAGGCCCCTGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGGAGTGATCTGGGGCGGAGGCGGCACCTACTACGCCTCTTCCCTGATGGGCCGGTTCACCATCTCCCGGGACAACTCCAAGAACACCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGACACGCCTACGGCCACGACGGCGGCTTCGCCATGGATTATTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCTCC
SEQ ID NO: 906	ДНК VL	GAGATCGTGATGACCCAGTCCCCCGCCACCCTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCCTGAGCTGCAGAGCCTCCGAGTCCGTGTCCTCCAACGTGGCCTGGTATCAGCAGAGACCTGGTCAGGCCCCTCGGCTGCTGATCTACGGCGCCTCTAACCGGGCCACCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCCGGCTGGAACCCGAGGACTTCGCCGTGTACTACTGCGGCCAGTCCTACTCATACCCCTTCACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG
SEQ ID NO: 907	ДНК тяжелой цепи	GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGCGGACTGGTGCAGTCCGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGCGCTGCCTCCGGCTTCTCCCTGTCCTCTTACGGCGTGGACTGGGTGCGACAGGCCCCTGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGGAGTGATCTGGGGCGGAGGCGGCACCTACTACGCCTCTTCCCTGATGGGCCGGTTCACCATCTCCCGGGACAACTCCAAGAACACCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGACACGCCTACGGCCACGACGGCGGCTTCGCCATGGATTATTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGACGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGCCAGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG
SEQ ID NO: 908	ДНК легкой цепи	GAGATCGTGATGACCCAGTCCCCCGCCACCCTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCCTGAGCTGCAGAGCCTCCGAGTCCGTGTCCTCCAACGTGGCCTGGTATCAGCAGAGACCTGGTCAGGCCCCTCGGCTGCTGATCTACGGCGCCTCTAACCGGGCCACCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCCGGCTGGAACCCGAGGACTTCGCCGTGTACTACTGCGGCCAGTCCTACTCATACCCCTTCACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC
SEQ ID NO: 909 (KABAT)	HCDR1	SYGVD
SEQ ID NO: 910 (CHOTHIA)	HCDR1	GFSLSSY
SEQ ID NO: 911 (KABAT)	HCDR2	VIWGGGGTYYASSLMG
SEQ ID NO: 912 (CHOTHIA)	HCDR2	WGGGG
SEQ ID NO: 913 (KABAT)	HCDR3	HAYGHDGGFAMDY
SEQ ID NO: 913 (CHOTHIA)	HCDR3	HAYGHDGGFAMDY
SEQ ID NO: 914 (KABAT)	LCDR1	RASESVSSNVA
SEQ ID NO: 915 (CHOTHIA)	LCDR1	SESVSSN
SEQ ID NO: 916 (KABAT)	LCDR2	GASNRAT
SEQ ID NO: 917 (CHOTHIA)	LCDR2	GAS
SEQ ID NO: 918 (KABAT)	LCDR3	GQSYSYPFT
SEQ ID NO: 919 (CHOTHIA)	LCDR3	SYSYPF

Другие иллюстративные агонисты GITR

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой BMS-986156 (Bristol-Myers Squibb), также известный как BMS 986156 или BMS986156. BMS-986156 и другие антитела против GITR описаны, например, в US 9228016 и WO 2016/196792, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из BMS-986156, например, как описано в таблице 10.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой MK-4166 или MK-1248 (Merck). MK-4166, MK-1248 и другие антитела против GITR описаны, например, в US 8709424, WO 2011/028683, WO 2015/026684, и Mahne et al. Cancer Res. 2017; 77(5):1108-1118, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из MK-4166 или MK-1248.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой TRX518 (Leap Therapeutics). TRX518 и другие антитела против GITR описаны, например, в US 7812135, US 8388967, US 9028823, WO 2006/105021 и Ponte J et al. (2010) Clinical Immunology; 135:S96, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из TRX518.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой INCAGN1876 (Incyte/Agenus). INCAGN1876 и другие антитела против GITR описаны, например, в US 2015/0368349 и WO 2015/184099, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из INCAGN1876.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой AMG 228 (Amgen). AMG 228 и другие антитела против GITR описаны, например, в US 9464139 и WO 2015/031667, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из AMG 228.

В одном варианте осуществления, молекула антитела против GITR представляет собой INBRX-110 (Inhibrx). INBRX-110 и другие антитела против GITR описаны, например, в US 2017/0022284 и WO 2017/015623, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, агонист GITR содержит одну или несколько из последовательностей CDR (или совместно все последовательности CDR), последовательность вариабельной области тяжелой цепи или легкой цепи, или последовательность тяжелой цепи или легкой цепи из INBRX-110.

В одном варианте осуществления, агонист GITR (например, слитый белок) представляет собой MEDI 1873 (MedImmune), также известный как MEDI1873. MEDI 1873 и другие агонисты GITR описаны, например, в US 2017/0073386, WO 2017/025610 и Ross et al. Cancer Res 2016; 76(14 Suppl): Abstract nr 561, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, агонист GITR содержит один или несколько из домена Fc IgG, функционального домена для мультимеризации и связывающего рецептор домена лиганда индуцированного глюкокортикоидом рецептора TNF (GITRL) из MEDI 1873.

Дополнительные известные агонисты GITR (например, антитела против GITR) включают агонисты, описанные, например, в WO 2016/054638, полное содержание которой приведено путем ссылки.

В одном варианте осуществления, антитело против GITR представляет собой антитело, конкурирующее за связывание с и/или связывающееся с тем же эпитопом на GITR, что и одно из антител против GITR, описанных в настоящем описании.

В одном варианте осуществления, агонист GITR представляет собой пептид, активирующий путь передачи сигнала GITR. В одном варианте осуществления, агонист GITR представляет собой связывающий иммуноадгезин фрагмент (например, связывающий иммуноадгезин фрагмент, содержащий внеклеточную или связывающую GITR часть GITRL), слитую с константной областью (например, областью Fc из последовательности иммуноглобулина).

Таблица 10: Аминокислотная последовательность других иллюстративных молекул антител против GITR

BMS-986156
SEQ ID NO: 920	VH	QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYEGSNKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGGSMVRGDYYYGMDVWGQGTTVTVSS
SEQ ID NO: 921	VL	AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSALAWYQQKPGKAPKLLIYDASSLESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQFNSYPYTFGQGTKLEIK

Комплексы IL15/IL-15Ra

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, вводят в комбинации с комплексом IL-15/IL-15Ra. В некоторых вариантах осуществления, комплекс IL-15/IL-15Ra выбран из NIZ985 (Novartis), ATL-803 (Altor) или CYP0150 (Cytune).

Иллюстративные комплексы IL-15/IL-15Ra

В одном варианте осуществления, комплекс IL-15/IL-15Ra содержит IL-15 человека в комплексе с растворимой формой IL-15Ra человека. Комплекс может содержать IL-15, ковалентно или нековалентно связанный с растворимой формой IL-15Ra. В конкретном варианте осуществления, IL-15 человека является нековалентно связанным с растворимой формой IL-15Ra. В конкретном варианте осуществления, IL-15 человека из композиции содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 1001 в таблице 11, и растворимая форма IL-15Ra человека содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO:1002 в таблице 11, как описано в WO 2014/066527, полное содержание которой приведено путем ссылки. Молекулы, описанные в настоящем описании, можно получать посредством векторов, клеток-хозяев и способов, описанных в WO 2007/084342, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Таблица 11. Аминокислотные и нуклеотидные последовательности иллюстративных комплексов IL-15/IL-15Ra

NIZ985
SEQ ID NO: 1001	IL-15 человека	NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SEQ ID NO: 1002	Растворимый IL-15Ra человека	ITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSTVTTAGVTPQPESLSPSGKEPAASSPSSNNTAATTAAIVPGSQLMPSKSPSTGTTEISSHESSHGTPSQTTAKNWELTASASHQPPGVYPQG

Другие иллюстративные комплексы IL-15/IL-15Ra

В одном варианте осуществления, комплекс IL-15/IL-15Ra представляет собой ALT-803, слитый белок IL-15/IL-15Ra Fc (растворимый комплекс IL-15N72D:IL-15RaSu/Fc). ALT-803 описан в WO 2008/143794, полное содержание которой приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, IL-15/IL-15Ra Fc слитый белок содержит последовательности, как описано в таблице 12.

В одном варианте осуществления, комплекс IL-15/IL-15Ra содержит IL-15, слитый с доменом суши IL-15Ra (CYP0150, Cytune). Домен суши IL-15Ra относится к домену, начинающемуся на первом остатке цистеина после сигнального пептида IL-15Ra и заканчивающемуся на четвертом остатке цистеина после указанного сигнального пептида. Комплекс IL-15, слитый с доменом суши IL-15Ra, описан в WO 2007/04606 и WO 2012/175222, полное содержание которых приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, слитый белок IL-15/домен суши IL-15Ra содержит последовательности, как описано в таблице 12.

Таблица 12. Аминокислотные последовательности других иллюстративных комплексов IL-15/IL-15Ra

ALT-803 (Altor)
SEQ ID NO: 1003	IL-15N72D	NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANDSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS
SEQ ID NO: 1004	IL-15RaSu/Fc	ITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIREPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
Слитый белок IL-15/домен суши IL-15Ra (Cytune)
SEQ ID NO:1005	IL-15 человека	NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEXKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS Где X представляет собой E или K
SEQ ID NO:1006	Суши и шарнирный домены IL-15Ra человека	ITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPP

Фармацевтические композиции, составы и наборы

В другом аспекте настоящее изобретение относится к композициям, например, к фармацевтически приемлемым композициям, которые включают молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, составленную вместе с фармацевтически приемлемым носителем. В рамках изобретения, «фармацевтически приемлемый носитель» включает все без исключения растворители, дисперсионные среды, изотонические и замедляющие абсорбцию средства, и т.п., которые являются физиологически совместимыми. Носитель может являться пригодным для внутривенного, внутримышечного, подкожного, парентерального, ректального, спинального или эпидермального введения (например, посредством инъекции или инфузии).

Композиции, описанные в настоящем описании могут находиться во множестве форм. Они включают, например, жидкие, полутвердые и твердые лекарственные формы, такие как жидкие растворы (например, пригодные для инъекции и инфузии растворы), дисперсии или суспензии, липосомы и суппозитории. Предпочтительная форма зависит от намеченного способа введения и терапевтического применения. Типичные предпочтительные композиции находятся в форме пригодных для инъекции или инфузии растворов. Предпочтительным способом введения является парентеральный (например, внутривенный, подкожный, внутрибрюшинный, внутримышечный). В предпочтительном варианте осуществления, антитело вводят посредством внутривенной инфузии или инъекции. В другом предпочтительном варианте осуществления, антитело вводят посредством внутримышечной или подкожной инъекции.

Фразы «парентеральное введение» и «вводимый парентерально», в рамках изобретения обозначают способы введения, отличные от энтерального и местного введения, обычно, посредством инъекции, и включают, без ограничения, внутривенную, внутримышечную, внутриартериальную, интратекальную, интракапсулярную, интраорбитальную, внутрисердечную, внутрикожную, внутрибрюшинную, транстрахеальную, подкожную, субкутикулярную, внутрисуставную, субкапсулярную, субарахноидальную, интраспинальную, эпидуральную и интрастернальную инъекцию и инфузию.

Терапевтические композиции, как правило, должны быть стерильными и стабильными в условиях изготовления и хранения. Композицию можно составлять в форме раствора, микроэмульсии, дисперсии, липосомы или другой упорядоченной структуры, подходящей для высокой концентрации антител. Стерильные пригодные для инъекции растворы можно получать посредством введения активного соединения (например, антитела или части антитела) в требуемом количестве в подходящий растворитель с одним или с комбинацией ингредиентов, перечисленных выше, по необходимости, с последующей стерилизацией фильтрованием. Как правило, дисперсии получают посредством введения активного соединения в стерильный носитель, который содержит основную дисперсионную среду и другие необходимые ингредиенты из перечисленных выше. В случае стерильных порошков для получения стерильных пригодных для инъекции растворов, предпочтительными способами получения являются вакуумная сушка и сушка сублимацией, в результате чего получают порошок активного ингредиента плюс любого дополнительного желательного ингредиента из его раствора, предварительно стерилизованного фильтрацией. Надлежащую текучесть раствора можно поддерживать, например, посредством использования покрытия, такого как лецитин, посредством поддержания требуемого размера частиц в случае дисперсии и посредством использования поверхностно-активных веществ. Длительную абсорбцию пригодных для инъекции композиций можно получать посредством включения в композицию средства, которое замедляет абсорбцию, например солей моностеарата и желатина.

Молекулу антитела против TIM-3 или композицию, описанную в настоящем описании, можно составлять в состав (например, дозированный состав или лекарственную форму), пригодную для введения (например, внутривенного введения) субъекту как описано в настоящем описании. Состав, описанный в настоящем описании, может представлять собой жидкий состав, лиофилизированный состав или разведенный состав.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит забуферивающее средство, содержащее гистидин (например, гистидиновый буфер). В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) присутствует в концентрации 1 мМ - 100 мМ, например, 2 мМ - 50 мМ, 5 мМ - 40 мМ, 10 мМ - 30 мМ, 15-25 мМ, 5 мМ - 40 мМ, 5 мМ - 30 мМ, 5 мМ - 20 мМ, 5 мМ - 10 мМ, 40 мМ - 50 мМ, 30 мМ - 50 мМ, 20 мМ - 50 мМ, 10 мМ - 50 мМ, или 5 мМ - 50 мМ, например, 2 мМ, 5 мМ, 10 мМ, 15 мМ, 20 мМ, 25 мМ, 30 мМ, 35 мМ, 40 мМ, 45 мМ или 50 мМ. В некоторых вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) присутствует в концентрации 15 мМ - 25 мМ, например, 20 мМ. В других вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) имеет pH 4-7, например, 5-6, например, 5, 5,5, или 6. В некоторых вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) имеет pH 5-6, например, 5,5. В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5). В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство содержит гистидин и гистидин-HCl.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; и забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) дополнительно содержит углевод. В конкретных вариантах осуществления, углевод представляет собой сахарозу. В некоторых вариантах осуществления, углевод (например, сахароза) присутствует в концентрации 50 мМ - 500 мМ, например, 100 мМ - 400 мМ, 150 мМ - 300 мМ, 180 мМ - 250 мМ, 200 мМ - 240 мМ, 210 мМ - 230 мМ, 100 мМ - 300 мМ, 100 мМ - 250 мМ, 100 мМ - 200 мМ, 100 мМ - 150 мМ, 300 мМ - 400 мМ, 200 мМ - 400 мМ, или 100 мМ - 400 мМ, например, 100 мМ, 150 мМ, 180 мМ, 200 мМ, 220 мМ, 250 мМ, 300 мМ, 350 мМ или 400 мМ. В некоторых вариантах осуществления, состав содержит углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5); и углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ.

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) дополнительно содержит поверхностно-активное вещество. В конкретных вариантах осуществления, поверхностно-активное вещество представляет собой полисорбат 20. В некоторых вариантах осуществления, поверхностно-активное вещество или полисорбат 20) присутствует в концентрации 0,005% - 0,1% (масс./масс.), например, 0,01% - 0,08%, 0,02% - 0,06%, 0,03% - 0,05%, 0,01% - 0,06%, 0,01% - 0,05%, 0,01% - 0,03%, 0,06% - 0,08%, 0,04% - 0,08%, или 0,02% - 0,08% (масс./масс.), например, 0,01%, 0,02%, 0,03%, 0,04%, 0,05%, 0,06%, 0,07%, 0,08%, 0,09%, или 0,1% (масс./масс.). В некоторых вариантах осуществления, состав содержит поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,03% - 0,05%, например, 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ), и имеет pH 5-6 (например, 5,5); углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ; и поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,03% - 0,05%, например, 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 100 мг/мл; забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер (например, гистидин/гистидин-HCL) в концентрации 20 мМ) и имеет pH 5,5; углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 220 мМ; и поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, жидкий состав получают посредством разведения состава, содержащего молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании. Например, состав лекарственного средства можно разводить с использованием раствора, содержащего один или несколько наполнителей (например, концентрированных наполнителей). В некоторых вариантах осуществления, раствор содержит одно, два или все из гистидина, сахарозы или полисорбата 20. В конкретных вариантах осуществления, раствор содержит такой же наполнитель(наполнители), что и состав лекарственного средства. Иллюстративные наполнители включают, но без ограничения, аминокислоту (например, гистидин), углевод (например, сахарозу), или поверхностно-активное вещество (например, полисорбат 20). В конкретных вариантах осуществления, жидкий состав не представляет собой разведенный лиофилизированный состав. В других вариантах осуществления, жидкий состав представляет собой разведенный лиофилизированный состав. В некоторых вариантах осуществления, состав хранят в форме жидкости. В других вариантах осуществления, состав получают в форме жидкости и затем высушивают, например, посредством лиофилизации или сушки распылением, перед хранением.

В конкретных вариантах осуществления, 0,5 мл - 10 мл (например, 0,5 мл - 8 мл, 1 мл - 6 мл, или 2 мл - 5 мл, например, 1 мл, 1,2 мл, 1,5 мл, 2 мл, 3 мл, 4 мл, 4,5 мл, или 5 мл) жидкого состава заполняют контейнер (например, флакон). В других вариантах осуществления, жидким составом заполняют контейнер (например, флакон), таким образом, что извлекаемый объем по меньшей мере 1 мл (например, по меньшей мере 1,2 мл, по меньшей мере 1,5 мл, по меньшей мере 2 мл, по меньшей мере 3 мл, по меньшей мере 4 мл или по меньшей мере 5 мл) жидкого состава можно извлекать из контейнера (например, флакона). В конкретных вариантах осуществления, жидкий состав извлекают из контейнера (например, флакона) без разведения в клиническом центре. В конкретных вариантах осуществления, жидкий состав разводят из состава лекарственного средства и извлекают из контейнера (например, флакона) в клиническом центре. В конкретных вариантах осуществления, состав (например, жидкий состав) инъецируют в пакет для инфузии, например, в пределах 1 часа (например, в пределах 45 минут, 30 минут или 15 минут) до начала инфузии пациенту.

Состав, описанный в настоящем описании, можно хранить в контейнере. Контейнер, используемый для любого из составов, описанных в настоящем описании, может включать, например, флакон, и необязательно, пробку, крышку или и то, и другое. В конкретных вариантах осуществления, флакон представляет собой стеклянный флакон, например, флакон из белого стекла 6R. В других вариантах осуществления, пробка представляет собой резиновую пробку, например, пробку из серой резины. В других вариантах осуществления, крышка представляет собой обжимной колпачок, например, алюминиевый обжимной колпачок. В некоторых вариантах осуществления, контейнер содержит флакон из белого стекла 6R, пробку из серой резины и алюминиевый обжимной колпачок. В некоторых вариантах осуществления, контейнер (например, флакон) представляет собой одноразовый контейнер. В конкретных вариантах осуществления, 25 мг/мл - 250 мг/мл, например, 50 мг/мл - 200 мг/мл, 60 мг/мл - 180 мг/мл, 70 мг/мл - 150 мг/мл, 80 мг/мл - 120 мг/мл, 90 мг/мл - 110 мг/мл, 50 мг/мл - 150 мг/мл, 50 мг/мл - 100 мг/мл, 150 мг/мл - 200 мг/мл, или 100 мг/мл - 200 мг/мл, например, 50 мг/мл, 60 мг/мл, 70 мг/мл, 80 мг/мл, 90 мг/мл, 100 мг/мл, 110 мг/мл, 120 мг/мл, 130 мг/мл, 140 мг/мл или 150 мг/мл, молекулы антитела против TIM-3 присутствует в контейнере (например, флаконе).

В некоторых вариантах осуществления, состав представляет собой лиофилизированный состав. В конкретных вариантах осуществления, лиофилизированный состав является лиофилизированным или высушенным из жидкого состава, содержащего молекулу антитела против TIM-3, описанного в настоящем описании. Например, 1-5 мл, например, 1-2 мл, жидкого состава можно заполнять контейнер (например, флакон) и лиофилизировать.

В некоторых вариантах осуществления, состав представляет собой разведенный состав. В конкретных вариантах осуществления, разведенный состав разводят из лиофилизированного состава, содержащего молекулу антитела против TIM-3, описанного в настоящем описании. Например, разведенный состав можно получать посредством растворения лиофилизированного состава в разбавителе, таким образом, чтобы диспергировать белок в разведенном составе. В некоторых вариантах осуществления, лиофилизированный состав разводят с использованием 1 мл - 5 мл, например, 1 мл - 2 мл, например, 1,2 мл, воды или буфера для инъекции. В конкретных вариантах осуществления, лиофилизированный состав разводят с использованием 1 мл - 2 мл воды для инъекции, например, в клиническом центре.

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит молекулу антитела против TIM-3 (например, молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании) и забуферивающее средство.

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 25 мг/мл - 250 мг/мл, например, 50 мг/мл - 200 мг/мл, 60 мг/мл - 180 мг/мл, 70 мг/мл - 150 мг/мл, 80 мг/мл - 120 мг/мл, 90 мг/мл - 110 мг/мл, 50 мг/мл - 150 мг/мл, 50 мг/мл - 100 мг/мл, 150 мг/мл - 200 мг/мл, или 100 мг/мл - 200 мг/мл, например, 50 мг/мл, 60 мг/мл, 70 мг/мл, 80 мг/мл, 90 мг/мл, 100 мг/мл, 110 мг/мл, 120 мг/мл, 130 мг/мл, 140 мг/мл, или 150 мг/мл. В конкретных вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 присутствует в концентрации 80 мг/мл - 120 мг/мл, например, 100 мг/мл.

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит забуферивающее средство, содержащее гистидин (например, гистидиновый буфер). В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) присутствует в концентрации 1 мМ - 100 мМ, например, 2 мМ - 50 мМ, 5 мМ - 40 мМ, 10 мМ - 30 мМ, 15 to 25 мМ, 5 мМ - 40 мМ, 5 мМ - 30 мМ, 5 мМ - 20 мМ, 5 мМ - 10 мМ, 40 мМ - 50 мМ, 30 мМ - 50 мМ, 20 мМ - 50 мМ, 10 мМ - 50 мМ, или 5 мМ - 50 мМ, например, 2 мМ, 5 мМ, 10 мМ, 15 мМ, 20 мМ, 25 мМ, 30 мМ, 35 мМ, 40 мМ, 45 мМ, или 50 мМ. В некоторых вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) присутствует в концентрации 15 мМ - 25 мМ, например, 20 мМ. В других вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) имеет pH 4-7, например, 5-6, например, 5, 5,5, или 6. В некоторых вариантах осуществления, забуферивающее средство (например, гистидиновый буфер) имеет pH 5-6, например, 5,5. В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5). В конкретных вариантах осуществления, забуферивающее средство содержит гистидин и гистидин-HCl.

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; и забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5).

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав дополнительно содержит углевод. В конкретных вариантах осуществления, углевод представляет собой сахарозу. В некоторых вариантах осуществления, углевод (например, сахароза) присутствует в концентрации 50 мМ - 500 мМ, например, 100 мМ - 400 мМ, 150 мМ - 300 мМ, 180 мМ - 250 мМ, 200 мМ - 240 мМ, 210 мМ - 230 мМ, 100 мМ - 300 мМ, 100 мМ - 250 мМ, 100 мМ - 200 мМ, 100 мМ - 150 мМ, 300 мМ - 400 мМ, 200 мМ - 400 мМ, или 100 мМ - 400 мМ, например, 100 мМ, 150 мМ, 180 мМ, 200 мМ, 220 мМ, 250 мМ, 300 мМ, 350 мМ или 400 мМ. В некоторых вариантах осуществления, состав содержит углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ.

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5); и углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ.

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав дополнительно содержит поверхностно-активное вещество. В конкретных вариантах осуществления, поверхностно-активное вещество представляет собой полисорбат 20. В некоторых вариантах осуществления, поверхностно-активное вещество или полисорбат 20) присутствует в концентрации 0,005% - 0,1% (масс./масс.), например, 0,01% - 0,08%, 0,02% - 0,06%, 0,03% - 0,05%, 0,01% - 0,06%, 0,01% - 0,05%, 0,01% - 0,03%, 0,06% - 0,08%, 0,04% - 0,08%, или 0,02% - 0,08% (масс./масс.), например, 0,01%, 0,02%, 0,03%, 0,04%, 0,05%, 0,06%, 0,07%, 0,08%, 0,09% или 0,1% (масс./масс.). В некоторых вариантах осуществления, состав содержит поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,03% - 0,05%, например, 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 80-120 мг/мл, например, 100 мг/мл; забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер в концентрации 15 мМ - 25 мМ (например, 20 мМ) и имеет pH 5-6 (например, 5,5); углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 200 мМ - 250 мМ, например, 220 мМ; и поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,03% - 0,05%, например, 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, разведенный состав содержит молекулу антитела против TIM-3, присутствующую в концентрации 100 мг/мл; забуферивающее средство, которое содержит гистидиновый буфер (например, гистидин/гистидин-HCL) в концентрации 20 мМ) и имеет pH 5,5; углевод или сахарозу, присутствующие в концентрации 220 мМ; и поверхностно-активное вещество или полисорбат 20, присутствующие в концентрации 0,04% (масс./масс.).

В некоторых вариантах осуществления, состав разводят таким образом, что извлекаемый объем по меньшей мере 1 мл (например, по меньшей мере 1,2 мл, 1,5 мл, 2 мл, 2,5 мл, или 3 мл) разведенного состава можно извлекать из контейнера (например, флакон), содержащего разведенный состав. В конкретных вариантах осуществления, состав разводят и/или извлекают из контейнера (например, флакона) в клиническом центре. В конкретных вариантах осуществления, состав (например, разведенный состав) инъецируют в пакет для инфузии, например, в пределах 1 часа (например, в пределах 45 минут, 30 минут или 15 минут) до начала инфузии пациенту.

Другие иллюстративные забуферивающие средства, которые можно использовать в составе, описанном в настоящем описании, включают, но без ограничения, аргининовый буфер, цитратный буфер или фосфатный буфер. Другие иллюстративные углеводы, которые можно использовать в составе, описанном в настоящем описании, включают, но без ограничения, трегалозу, маннит, сорбит или их комбинацию. Состав, описанный в настоящем описании, может также содержать средство для придания тоничности, например, хлорид натрия, и/или стабилизатор, например, аминокислоту (например, глицин, аргинин, метионин или их комбинацию).

Молекулы антител можно вводить множеством способов, известных в данной области, хотя для многих терапевтических применений, предпочтительным путем/способом введения является внутривенная инъекция или инфузия. Например, молекулы антител можно вводить посредством внутривенной инфузии со скоростью, большей, чем 20 мг/мин, например, 20-40 мг/мин, и как правило, большей или равной 40 мг/мин, для достижения дозы от приблизительно 35 до 440 мг/м², как правило, от приблизительно 70 до 310 мг/м², и более конкретно, от приблизительно 110 до 130 мг/м². В некоторых вариантах осуществления, молекулы антител можно вводить посредством внутривенной инфузии со скоростью, меньшей, чем 10 мг/мин; предпочтительно, меньшей или равной 5 мг/мин, для достижения дозы от приблизительно 1 до 100 мг/м², предпочтительно от приблизительно 5 до 50 мг/м², от приблизительно 7 до 25 мг/м²и более предпочтительно, приблизительно 10 мг/м². Как будет понятно специалисту в данной области, путь и/или способ введения можно менять, в зависимости от желательных результатов. В конкретных вариантах осуществления, активное соединение можно получать с использованием носителя, который может защищать соединение против быстрого высвобождения, такого как состав с контролируемым высвобождением, включая имплантаты, чрескожные пластыри и микроинкапсулированные системы доставки. Можно использовать биоразлагаемые, биосовместимые полимеры, такие как этиленвинилацетат, полиангидриды, полигликолевая кислота, коллаген, полиортоэфиры и полимолочная кислота. Многие способы получения таких составов запатентованы или в общем известны специалисту в данной области. См., например, Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J. R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978.

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела можно вводить перорально, например, с использованием инертного разбавителя или усваиваемого съедобного носителя. Соединение (и другие ингредиенты, если желательно) также можно заключать в твердые или мягкие желатиновые капсулы, прессовать в таблетки или вводить непосредственно в питание индивидуума. Для перорального терапевтического введения, соединения можно вводить с использованием наполнителей и использовать в форме таблеток для приема внутрь, буккальных таблеток, лепешек, капсул, эликсиров, суспензий, сиропов, облаток и т.п.. Для введения соединения по изобретению способом, отличным от парентерального введения, может являться необходимым покрывать соединение материалом или вводить соединение совместно с материалом для предотвращения его инактивации. Терапевтические композиции можно также вводить с использованием медицинских устройств, известных в данной области.

Режимы дозирования корректируют для обеспечения оптимального желательного ответа (например, терапевтического ответа). Например, можно вводить однократный болюс, можно вводить несколько дробных доз в течение периода времени, или дозу можно пропорционально уменьшать или увеличивать, в соответствии с требованиями клинической ситуации. Является особенно преимущественным составлять парентеральные композиции в единичной дозированной форме для простоты введения и единообразия дозирования. Единичная дозированная форма, в рамках изобретения, относится к физически дискретным единицам, подходящим в качестве единичных доз для субъектов, подлежащих лечению; каждая единица содержит предварительно определенное количество активного соединения, рассчитанное на достижение желательного терапевтического эффекта, в комбинации с необходимым фармацевтическим носителем. Спецификация единичных дозированных форм по изобретению продиктована и напрямую зависит от (a) уникальных характеристик активного соединения и конкретного терапевтического эффекта, подлежащего достижению, и (b) ограничений, присущих в области получения соединений, таких как активное соединение для лечения чувствительности у индивидуумов.

Иллюстративный, неограничивающий диапазон терапевтически эффективного или профилактически эффективного количества молекулы антитела составляет 50 мг - 1500 мг, как правило, 80 мг - 1200 мг. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 посредством инъекции (например, подкожно или внутривенно) в дозе (например, постоянной дозе) от приблизительно 60 мг до приблизительно 100 мг (например, приблизительно 80 мг), от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг), или от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг). Расписание дозирования (например, расписание постоянного дозирования) можно менять, например, от одного раза в неделю до одного раза в каждые 2, 3, 4, 5 или 6 недель. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 80 мг один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе приблизительно 240 мг один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1200 мг один раз в каждые четыре недели. Без намерения быть связанными теорией, в некоторых вариантах осуществления, постоянное или фиксированное дозирование может обеспечивать преимущества для пациентов, например, для сохранения источника лекарственного средства и для уменьшения фармацевтических ошибок.

Молекулу антитела можно вводить посредством внутривенной инфузии со скоростью более, чем 20 мг/мин, например, 20-40 мг/мин, и как правило, большей или равной 40 мг/мин, для достижения дозы от приблизительно 35 до 440 мг/м², как правило, от приблизительно 70 до 310 мг/м², и более конкретно, от приблизительно 110 до 130 мг/м². В некоторых вариантах осуществления, скорость инфузии от приблизительно 110 до 130 мг/м²обеспечивает уровень от приблизительно 3 мг/кг. В других вариантах осуществления, молекула антитела можно вводить посредством внутривенной инфузии со скоростью, меньшей, чем 10 мг/мин, например, меньшей или равной 5 мг/мин для достижения дозы от приблизительно 1 до 100 мг/м², например, от приблизительно 5 до 50 мг/м², от приблизительно 7 до 25 мг/м², или приблизительно 10 мг/м². В некоторых вариантах осуществления, антитело вводят посредством инфузии в течение периода от приблизительно 30 мин. Следует отметить, что уровни дозирования можно менять в зависимости от типа и тяжести состояния, подлежащего облегчению. Кроме того понятно, что для любого конкретного субъекта, конкретные режимы дозирования следует корректировать с течением времени, в соответствии с нуждами индивидуума и профессионального суждения индивидуума, осуществляющего введение или руководство введением композиций, и что диапазоны дозирования, указанные в настоящем описании, являются только иллюстративными и не предназначены для ограничения объема или практического осуществления заявленной композиции.

Фармацевтические композиции по изобретению могут включать «терапевтически эффективное количество» или «профилактически эффективное количество» антитела или части антитела по изобретению. «Терапевтически эффективное количество» относится к количеству, эффективному, при необходимых дозах и в течение необходимых периодов времени, для достижения желательного терапевтического результата. Терапевтически эффективное количество модифицированного антитела или фрагмента антитела может меняться в соответствии с такими факторами, как стадия заболевания, возраст, пол и масса индивидуума, и способность антитела или части антитела к вызову желательного ответа у индивидуума. Терапевтически эффективное количество также представляет собой количество, при котором терапевтически благоприятные эффекты превосходят любые токсичные или неблагоприятные эффекты модифицрованного антитела или фрагмента антитела. «Терапевтически эффективная доза», предпочтительно, ингибирует поддающийся измерению параметр, например, скорость роста опухоли, по меньшей мере приблизительно на 20%, более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно на 40%, даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно на 60% и даже более предпочтительно, по меньшей мере приблизительно на 80%, по сравнению с не подвергнутыми лечению субъектами. Способность соединения ингибировать поддающийся измерению параметр, например, злокачественной опухоли, можно оценивать в системе модели на животных, прогностической для эффективности человека. Альтернативно, это свойство композиции можно оценивать посредством проверки способности соединения ингибировать, проверки такого ингибирования in vitro посредством анализов, известных специалисту в данной области.

«Профилактически эффективное количество» относится к количеству, эффективному, при необходимых дозах и в течение необходимых периодов времени, для достижения желательного профилактического результата. Как правило, поскольку профилактическую дозу используют у субъектов до или на более ранней стадии заболевания, профилактически эффективное количество меньше, чем терапевтически эффективное количество.

Настоящее изобретение относится также к набору, содержащему молекулу антитела против TIM-3, композицию или состав, описанные в настоящем описании. Набор может включать один или несколько других элементов, включая: инструкции для использования (например, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании); другие реагенты, например, метку, лекарственное средство, или средство, которое можно использовать для хелатирования, или присоединения иным образом, антитела к метке или лекарственнму средству, или радиопротективной композиции; устройства или другие материалы для получения антитела для введения; фармацевтически приемлемые носители; и устройства или другие материалы для введения субъекту.

Применение молекул антител против TIM-3

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно использовать для модификации иммунного ответа у субъекта. В некоторых вариантах осуществления, иммунный ответ усиливают, стимулируют или подвергают повышающей регуляции. В конкретных вариантах осуществления, иммунный ответ ингибируют, уменьшают или подвергают понижающей регуляции. Например, эти молекулы антител можно вводить в клетки в культуре, например, in vitro или ex vivo, или субъекту, например, in vivo, для лечения, предотвращения и/или диагностики множества нарушений, таких как злокачественные опухоли, иммунные нарушения и инфекционные заболевания.

В рамках изобретения, термин «субъект» предназначен для включения человека и не относящихся к человеку животных. В некоторых вариантах осуществления, субъект представляет собой субъекта-человека, например, пациента-человека, имеющего нарушение или состояние, характеризуемое аномальным функционированием TIM-3. Как правило, субъект имеет по меньшей мере некоторое количество белка TIM-3, включая эпитоп TIM-3, связываемый молекулой антитела, например, достаточно высокий уровень белка и эпитопа для поддержания связывания антитела с TIM-3. Термин «не относящиеся к человеку животные» включает млекопитающих и не млекопитающих, например, нечеловекообразных приматов. В некоторых вариантах осуществления, субъект представляет собой человека. В некоторых вариантах осуществления, субъект представляет собой пациента-человека, нуждающегося в усилении иммунного ответа. Способы и композиции, описанные в настоящем описании, являются подходящими для лечения пациентов-людей, имеющих нарушение, которое можно лечить посредством модуляции (например, усиления или ингибирования) иммунного ответа. В конкретных вариантах осуществления, пациент имеет или подвержен риску наличия нарушения, описанного в настоящем описании, например, острого миелоидного лейкоза (AML) или миелодиспластического синдрома (MDS). В конкретных вариантах осуществления, пациент не является подходящим для стандартного терапевтического режима с установленным преимуществом для пациентов с AML или MDS.

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 используют в комбинации с ингибитором PD-1. AML/MDS как правило, имеют совместную сверхэкспрессию PD-1 и TIM-3, которые кооперируются для ингибирования иммунного узнавания цитотоксическими T-клетками (Kikushige et al. (2010) Cell Stem Cell; 7(6): 708-717, полное содержание которого приведено путем ссылки). Без намерения быть связанными теорией, считают, что в конкретных вариантах осуществления, параллельное блокирование TIM-3 и PD-1 может стимулировать более сильную активацию T-клеток, чем каждая терапия отдельно, и синергически ингибировать рост опухоли в экспериментальных моделях злокачественных опухолей (Sakuishi et al. (2010) J Exp Med; 207(10): 2187-94; Ngiow et al. (2011) Cancer Res; 71(10): 3540-51; Anderson (2014) Cancer Immunol Res.; 2(5):393-8; полное содержание всех из которых приведено в настоящем описании путем ссылки).

Альтернативно или в комбинации, в других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 используют в комбинации с гипометилирующим средством (например, децитабином). Гипометилирующие средства могут индцуцировать увеличенную экспрессию PD-1, PD-L1, PD-L2 и/или CTLA-4, что поддерживает использование ингибиторов контрольных точек для уменьшения иммуносупрессивного микроокружения опухоли (Yang et al. (2014) Leukemia; 28(6):1280-8; Orskov et al. (2015) Oncotarger: 6(11):9612-26; полное содержание всех из которых приведено в настоящем описании путем ссылки). Без намерения быть связанными теорией, считают, что в некоторых вариантах осуществления децитабин играет роль в противоопухолевом иммунитете посредством увеличения активности клеток NK (Sohlberg et al. (2015) Oncotarget; 6(33):34178-90, полное содержание которой приведено путем ссылки).

В конкретных вариантах осуществления, субъекта не подвергали лечению с использованием терапии PD-1/PD-L1 до введения молекулы антитела против TIM-3. В других вариантах осуществления, субъекта подвергали лечению с использованием терапии PD-1/PD-L1 до введения молекулы антитела против TIM-3. В конкретных вариантах осуществления, субъект идентифицирован как имеющий экспрессию TIM-3 в инфильтрующих опухоль лимфоцитах. В других вариантах осуществления, субъект не имеет поддающегося детекции уровня экспрессии TIM-3 в инфильтрующих опухоль лимфоцитах.

Способы лечения злокачественной опухоли

В одном аспекте настоящее изобретение относится к лечению субъекта in vivo с использованием молекулы антитела против TIM-3 (например, молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании), или композиции или состава, содержащих молекулу антитела против TIM-3 (например, композиции или состава, описанных в настоящем описании), таким образом, что рост злокачественной опухоли ингибируют или уменьшают.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в количестве, эффективном для лечения злокачественной опухоли или очага ее метастазирования. В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 2000 мг или от приблизительно 20 мг до приблизительно 2000 мг один раз в каждые две, три или четыре недели. Например, молекулу антитела против TIM-3 можно вводить в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 200 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 500 мг, от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг, или от приблизительно 500 мг до приблизительно 1500 мг, один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до 30 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 500 мг до приблизительно 1000 мг (например, приблизительно 800 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 один раз в каждые четыре недели.

Антитело против TIM-3, или композицию или состав, содержащие молекулу антитела против TIM-3, можно использовать отдельно для ингибирования роста злокачественных опухолей. Альтернативно антитело против LAG-3, или композицию или состав, содержащие молекулу антитела против TIM-3, можно использовать в комбинации с одним или несколькими из: стандартного лечения (например, против злокачественных опухолей или инфекционных нарушений), другого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, иммуномодулятора (например, активатора костимулирующей молекулы или ингибитора ингибирующей молекулы); вакцины, например, терапевтической противораковой вакцины; или других форм клеточной иммунотерапии, как описано в настоящем описании.

Соответственно, в одном варианте осуществления, настоящее изобретение относится к способу ингибирования роста клеток опухолей у субъекта, включающему введение субъекту терапевтически эффективного количества молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании, например, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в форме композиции или состава, описанных в настоящем описании.

В одном варианте осуществления, способ является пригодным для лечения злокачественной опухоли in vivo. Для достижения антигенспецифического усиления иммунитета, молекулу антитела против TIM-3 можно вводить совместно с представляющим интерес антигеном. Когда антитело против TIM-3 вводят в комбинации с один или несколько средствами, комбинацию можно вводить в любом порядке или одновременно.

В другом аспекте, настоящее изобретение относится к способу лечения субъекта, например, уменьшения или облегчения гиперпролиферативного состояния или нарушения (например, злокачественной опухоли), например, солидной опухоли, гематологической злокачественной опухоли, опухоли мягких тканей, или очага метастазирования, у субъекта. Способ включает введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, или композиции или состава, содержащих молекулу антитела против TIM-3, как описано в настоящем описании, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании.

В рамках изобретения, термин «злокачественная опухоль» понимают как включающий все типы злокачественного роста или онкогенных процессов, метастазирующих тканей или злокачественно трансформированных клеток, тканей или органов, независимо от гистопатологического типа или стадии инвазивности. Примеры онкологических нарушений включают, но без ограничения, солидные опухоли, гематологические злокачественные опухоли, опухоли мягких тканей и очаги метастазирования. Примеры солидных опухолей включают злокачественные новообразования, например, саркомы, и карциномы (включая аденокарциномы и плоскоклеточный рак), различных систем органов, такие как поражающие печень, легкое, молочную железу, лимфоидные органы, желудочно-кишечный тракт (например, ободочную кишку), мочеполовой тракт (например, почки, уротелий, клетки мочевого пузыря), предстательную железу, ЦНС (например, головной мозг, нервные или глиальные клетки), кожу, поджелудочную железу и глотку. Аденокарциномы включают злокачественные новообразования, такие как большинство видов рака ободочной кишки, рак прямой кишки, почечноклеточную карциному, рак печени, немелкоклеточную карциному легких, рак тонкого кишечника и рак пищевода. Плоскоклеточный рак включает злокачественные новообразования, например, в легком, пищеводе, коже, области головы и шеи, полости рта, анусе и шейке матки. В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой меланому, например, находящуюся на поздних стадиях меланому. Очаги метастазирования вышеупомянутых злокачественных опухолей также можно лечить или предотвращать с использованием способов и композиций по изобретению.

Иллюстративные злокачественные опухоли, рост которых можно ингибировать с использованием молекул антител, композиций или составов, как описано в настоящем описании, включают злокачественные опухоли, как правило, способные отвечать на иммунотерапию. Неограничивающие примеры типичных злокачественных опухолей для лечения включают меланому (например, метастазирующую злокачественную меланому), рак почки (например, светлоклеточную карциному), рак предстательной железы (например, невосприимчивую к гормонам аденокарциному предстательной железы), рак молочной железы, рак ободочной кишки и рак легких (например, немелкоклеточный рак легких). Кроме того, невосприимчивые или рецидивирующие злокачественные новообразования можно лечить с использованием молекул антител, описанных в настоящем описании.

Примеры других злокачественных опухолей, которые можно лечить, включают, но без ограничения, базально-клеточную карциному, рак желчных протоков; рак мочевого пузыря; злокачественную опухоль кости; злокачественную опухоль головного мозга и ЦНС; первичную лимфому ЦНС; неоплазию центральной нервной системы (ЦНС); рак молочной железы; рак шейки матки; хориокарциному; злокачественную опухоль ободочной кишки и прямой кишки; злокачественную опухоль соединительной ткани; злокачественную опухоль пищеварительной системы; рак эндометрия; рак пищевода; злокачественную опухоль глаза; злокачественную опухоль головы и шеи; рак желудка; интраэпителиальную неоплазию; рак почки; злокачественную опухоль гортани; лейкоз (включая острый миелоидный лейкоз, хронический миелоидный лейкоз, острый лимфобластный лейкоз, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический или острый лейкоз); рак печени; рак легких (например, мелкоклеточный и немелкоклеточный); лимфому, включая лимфому Ходжкина и неходжскинскую лимфому; лимфоцитарную лимфому; меланому, например, кожную или внутриглазную злокачественную меланому; миелому; нейробластому; злокачественную опухоль полости рта (например, губ, языка, рта и глотки); рак яичника; рак поджелудочной железы; рак предстательной железы; ретинобластому; рабдомиосаркому; рак прямой кишки; злокачественную опухоль дыхательной системы; саркому; рак кожи; рак желудка; рак яичка; рак щитовидной железы; рак тела матки; злокачественную опухоль мочевыделительной системы, гепатокарциному, злокачественную опухоль области ануса, карциному фаллопиевых труб, карциному вагины, карциному вульвы, рак тонкого кишечника, злокачественную опухоль эндокринной системы, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль надпочечника, саркому мягких тканей, злокачественную опухоль уретры, злокачественную опухоль пениса, солидные опухоли пациентов детского возраста, опухоль оси позвоночника, глиому ствола мозга, аденому гипофиза, саркому Капоши, эпидермоидную злокачественную опухоль, плоскоклеточный рак, Т-клеточную лимфому, индуцированные условиями окружающей среды злокачественные опухоли, включая злокачественные опухоли, индуцированные асбестом, так же как другие карциномы и саркомы, и комбинации указанных злокачественных опухолей.

В одном варианте осуществления, злокачественная опухоль представляет собой карциному из клеток Меркеля. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой меланому. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак молочной железы, например, трижды отрицательный рак молочной железы (TNBC) или отрицательный по HER2 рак молочной железы. В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой почечноклеточный рак (например, светлоклеточный почечноклеточный рак (CCRCC) или несветлоклеточный почечноклеточный рак (nccRCC)). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак щитовидной железы, например, анапластическую карциному щитовидной железы (ATC). В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой нейроэндокринную опухоль (NET), например, атипичную карциноидную опухоль легких или NET поджелудочной железы, желудочно-кишечного (GI) тракта или легких. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой немелкоклеточный рак легких (NSCLC) (например, плоскоклеточный NSCLC или неплоскоклеточный NSCLC). В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль фаллопиевой трубы. В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой колоректальный рак с высокой микросателлитной нестабильностью (CRC с высокой MSI) или колоректальный рак с микросателлитной стабильностью (MSS CRC).

В других вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой гематологическое злокачественное новообразование или злокачественную опухоль, включая но без ограничения, лейкоз или лимфому. Например, молекулу антитела против TIM-3 можно использовать для лечения злокачественных опухолей и злокачественных новообразований, включая, но без ограничения, например, острый лейкоз, например, B-клеточный острый лимфоидный лейкоз («BALL»), T-клеточный острый лимфоидный лейкоз («TALL»), острый лимфоидный лейкоз (ALL); хронический лейкоз, например, хронический миелогенный лейкоз (CML), хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL); дополнительную гематологическую злокачественную опухоль или гематологическое состояние, например, B-клеточный пролимфоцитарный лейкоз, неоплазию бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфому Беркитта, диффузную крупноклеточную B-клеточную лимфому, фолликулярную лимфому, волосатоклеточный лейкоз, мелкоклеточную или крупноклеточную фолликулярную лимфому, злокачественные лимфопролиферативные состояния, MALT-лимфому, лимфому из клеток мантийной зоны, лимфому из клеток маргинальной зоны, множественную миелому, миелодисплазию и миелодиспластический синдром, неходжскинскую лимфому, плазмобластную лимфому, неоплазию плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемию Вальденстрема и «предлейкоз», которые представляют собой разнообразный набор гематологических состояний, объединяемых неэффективной продукцией (или дисплазией) миелоидных клеток крови, и т.п.

В рамках изобретения, термин «субъект» предназначен для включения человека и не относящихся к человеку животных. В некоторых вариантах осуществления, субъект представляет собой субъекта-человека, например, пациента-человека, имеющего нарушение или состояние, характеризуемое аномальным функционированием TIM-3. Как правило, субъект имеет по меньшей мере некоторое количество белка TIM-3, включая эпитоп TIM-3, связываемый молекулой антитела, например, достаточно высокий уровень белка и эпитопа для поддержания связывания антитела с TIM-3. Термин «не относящиеся к человеку животные» включает млекопитающих и не млекопитающих, например, нечеловекообразных приматов. В некоторых вариантах осуществления, субъект представляет собой человека. В некоторых вариантах осуществления, субъект представляет собой пациента-человека, нуждающегося в усилении иммунного ответа. Способы и композиции, описанные в настоящем описании, являются подходящими для лечения пациентов-людей, имеющих нарушение, которое можно лечить посредством модуляции (например, усиления или ингибирования) иммунного ответа.

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой рак яичника. Без намерения быть связанными теорией, считают, что в некоторых вариантах осуществления, инфильтрующие опухоль яичников регуляторные T-клетки (T-рег) являются более иммуносупрессивными, чем выделенные из периферической крови зависимым от TIM-3 образом (Bu et al. Tumour Biol. 2016; 37(3):3949-56). TIM-3 подвергается повышающей регуляции на FoxP3+ T-рег в инфильтрующих опухоль лимфоцитах (TIL) от пациентов с карциномой яичников (Yan et al. PLoS One. 2013; 8(3):e58006).

В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в качестве единственного средства для лечения рака яичника. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в комбинации с вторым лекарственным средством или средством, например, ингибитором PD-1 или ингибитором PD-L1, для лечения рака яичника. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой молекулу антитела против PD-1, например, антитела против PD-1, описанного в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-L1, например, молекулу антитела против PD-L1, описанную в настоящем описании.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-1, например, ниволумаб, необязательно, в комбинации с ингибитором VEGF (например, бевацизумабом), интерфероном-гамма, агонистом CD27 (например, варлилумабом), ингибиторомом IDO (например, эпакадостатом), ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), ингибитором CSF1R (например, кабирализумабом), агонистом OX40 (например, BMS 986178) или ингибитором KIR (например, лирилумабом) или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-1, например, пембролизумаб, необязательно, в комбинации с химиотерапией (например, карбоплатином, паклитакселом, доксорубицином, гемцитабином, цисплатином или азацитидином), ингибитором DNMT (например, гвадецитабином), ингибитором рецепторной тирозинкиназы (например, нинтеданибом), ингибитором CSF1R (например, пексидартинибом или ARRY-382), ингибитором BTK (например, акалабрутинибом), ингибитором PARP (например, нирапарибом), ингибитором IDO (например, эпакадостатом), иммуноконъюгатом, нацеленным на FOLR1 (например, мирветуксимабом соравтанзином), ингибитором B7-H3 (например, эноблитузумабом), гипометилирующим средством (например, децитабином или азацитидином) или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает гипометилирующее средство. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает децитабин. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает азацитидин.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1, например, атезолизумаб, необязательно, в комбинации с ингибитором ANG2/VEGF (например, вануцизумабом), ингибитором CSF1R (например, эмактузумабом), химиотерапией (например, доксорубицином или химиотерапией на основе платины, необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором VEGF (например, бевацизумабом)), или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1, например, дурвалумаб, необязательно, в комбинации с ингибитором CTLA-4 (например, тремелимумаб), химиотерапию (например, карбоплатином, паклитакселом или азацитидином), ингибитором PARP (например, олапарибом), ингибитором VEGF (например, цедиранибом), противораковой вакциной (например, мультиэпитопной пептидной вакциной против фолатного рецептора TPIV 200), агонистом TLR8 (например, мотолимодом) или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1, например, авелумаба, необязательно, в комбинации с химиотерапией (например, карбоплатином, паклитакселом или доксорубицином), ингибитором HDAC (например, энтиностатом), ингибитором FAK (например, дефактинибом) или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает агонист TLR8 (например, мотолимод), химиотерапевтическое средство (например, доксорубицин, паклитаксел, карбоплатин, блеомицин, этопозид, доцетаксел или дазатиниб), агонист OX40 (например, BMS 986178 или INCAGN-1949), ингибитор CSF1R (например, эмактузумаб или пексидартиниб), ингибитор VEGF (например, бевацизумаб), ингибитор NKG2 (например, монализумаб), ингибитор B7-H3 (например, эноблитузумаб), ингибитор CTLA-4 (например, ипилимумаб), рекомбинантный интерлейкин-10 (например, пегилированный рекомбинантный интерлейкин-10 человека AM0010), агонист CD40 (например, RG-7876), ингибитор ANG2/VEGF (например, вануцизумаб), молекулу, нацеленную как на B7-H3, так и на CD3 (например, MGD-009), ингибитор PD-L1/VISTA (например, CA-170), ингибитор IDO (например, эпакадостат), вакцину (например, ANZ-207, DPX-Survivac, CDX1401 или вакцину из экспрессирующих би-кшРНК-фурин/GMCSF аутологичных клеток опухоли (VIGIL®)), ингибитор CEACAM (например, MK-6018), ингибитор PARP (например, олапариб или BGB-290), гормон (например, лейпрорелин), ингибитор MIF (например, ингибитор PD-L1/VISTA) или любую их комбинациею.

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой карциному из клеток Меркеля (MCC). Без намерения быть связанными теорией, считают, что в некоторых вариантах осуществления, количество T-клеток, специфических для полиомавируса клеток Меркеля, меняется в зависимости от нагрузки карциномы из клеток Меркеля, и они экспрессируют поддающиеся терапевтическому нацеливанию маркеры истощения PD-1 и TIM-3 (Afanasiev et al, Clin Cancer Res. 2013; 19(19):5351-60). TIM-3 совместно экспрессируется с PD-1 в инфильтрующих опухоль лимфоцитах при карциноме из клеток Меркеля (Paul Nghiem, Clin Can Res. 2017). Доклиническое данные для мононуклеарных клеток периферической крови (PBMC) от одного пациента с карциномой из клеток Меркеля показали, что блокирование TIM-3 в анализе антигенспецифической стимуляции ex vivo усиливает секрецию IFN-γ более значительно, чем блокирование PD-1 или совместное блокирование PD-1/TIM-3 (Afanasiev et al, Clin Cancer Res. 2013; 19(19):5351-60).

В некоторых вариантах осуществления, карцинома из клеток Меркеля представляет собой метастазирующую карциному из клеток Меркеля (mMCC). В других вариантах осуществления, mMCC представляет собой mMCC с повышающей регуляцией MHC класса 1. В других вариантах осуществления, карцинома из клеток Меркеля представляет собой местнораспространенную карциному из клеток Меркеля.

В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в качестве единственного средства для лечения карциномы из клеток Меркеля. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в комбинации с вторым лекарственным средством или средством, например, ингибитором PD-1 или ингибитором PD-L1, для лечения карциномы из клеток Меркеля. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой молекулу антитела против PD-1, например, антитела против PD-1, описанного в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-L1, например, молекулу антитела против PD-L1, описанного в настоящем описании.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает ингибитор CTLA-4, например, молекулу антитела против CTLA-4 (например, ипилимумаб), например, для лечения карциномы из клеток Меркеля после резекции. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1 (например, авелумаб), например, для лечения метастазирующей карциномы из клеток Меркеля (mMCC). В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1, например, авелумаб, необязательно, в комбинации с локализованной радиотерапией, рекомбинантным интерфероном-бета, специфической для MCPyV TAg поликлональной аутологичной CD8-положительной T-клеточной вакциной, или их комбинацией, например, для лечения mMCC с повышающей регуляцией MHC класса 1. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает полученный способом генной инженерии онколитический вирус (например, Talimogene laherparepvec), необязательно, в комбинации с радиотерапией, например, для лечения mMCC. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-1 (например, ниволумаба) и/или молекулу антитела против CTLA-4 (например, ипилимумаба), необязательно, в комбинации с радиотерапией (например, стереотаксической радиотерапией тела (SBRT)), например, для лечения mMCC. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-1 (например, ниволумаб) в комбинации с полученным способом генной инженерии онколитическим вирусом (например, Talimogene laherparepvec), например, для лечения mMCC. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1 (например, атезолизумаб) и ингибитор VEGF (например, молекулу антитела против VEGF, например, бевацизумаба), например, для лечения местнораспространенной MCC или mMCC. В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1 (например, дурвалумаб) в комбинации с иммуностимулятором (например, поли-ICLC), необязательно, дополнительно в комбинации с ингибитором CTLA-4, например, молекулой антитела против CTLA-4 (например, тремелимумаба), например, для лечения mMCC.

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой мелкоклеточный рак легких (SCLC). Без намерения быть связанными теорией, считают, что в некоторых вариантах осуществления, TIM-3 экспрессируется при мелкоклеточном раке легких. Иммуногистохимия (IHC) для 105 FFPE биоптатов SCLC показала экспрессию TIM-3 в 57/96 (59%) образцах (Rivalland et al, Small cell lung cancer: the immune microenvironment and prognostic impact of checkpoint expression, ASCO 2017).

В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в качестве единственного средства для лечения мелкоклеточного рака легких. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в комбинации с вторым лекарственным средством или средством, например, ингибитором PD-1 или ингибитором PD-L1, для лечения мелкоклеточного рака легких. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой молекулу антитела против PD-1, например, антитела против PD-1, описанного в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-L1, например, молекулу антитела против PD-L1, описанного в настоящем описании.

В некоторых вариантах осуществления, мелкоклеточный рак легких представляет собой мелкоклеточный рак легких на запущенной стадии (ES-SCLC). В некоторых вариантах осуществления, мелкоклеточный рак легких представляет собой мелкоклеточный рак легких на локализованной стадии (LS-SCLC)

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-1, например, ниволумаб, необязательно, в комбинации с химиотерапевтическим средством, интерфероном-гамма, ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), конъюгатом антитело-лекарственное средство (например, ровалпитузумабом тезирином), ингибитором CXCR4 (например, улокуплумабом), агонистом OX40 (например, BMS 986178) или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-1, например, пембролизумаб, необязательно, в комбинации с химиотерапевтическим средством (например, химиотерапевтическим средством на основе платины, паклитакселом, этопозидом или иринотекан), слитым белком (например, слитым белком DEC-205/NY-ESO-1 CDX-1401), радиотерапией или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1, например, атезолизумаб, необязательно, в комбинации с химиотерапевтическим средством (например, карбоплатином или этопозидом), интерфероном-гамма, ингибитором CTLA-4 (например, ипилимумабом), конъюгатом антитело-лекарственное средство (например, ровалпитузумабом тезирином), ингибитором CXCR4 (например, улокуплумабом), агонистом OX40 (например, BMS 986178), или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает молекулу антитела против PD-L1, например, дурвалумаб, необязательно, в комбинации с ингибитором CTLA-4 (например, тремелимумабом), химиотерапевтическим средством (например, карбоплатином или этопозидом), ингибитором PARP (например, олапарибом), радиотерапией или любой их комбинацией.

В некоторых вариантах осуществления, второе лекарственное средство или средство включает агонист OX40 (например, BMS 986178), ингибитор CTLA-4 (например, ипилимумаб), или оба.

В конкретных вариантах осуществления, злокачественная опухоль представляет собой мезотелиому. В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в качестве единственного средства для лечения мезотелиомы. В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, или композицию или состав, содержащие антитело против TIM-3, вводят в комбинации с вторым лекарственным средством или средством, например, ингибитором PD-1 или ингибитором PD-L1, для лечения мезотелиомы. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-1 представляет собой молекулу антитела против PD-1, например, антитела против PD-1, описанного в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор PD-L1 представляет собой молекулу антитела против PD-L1, например, молекулу антитела против PD-L1, описанного в настоящем описании.

Способы и композиции, описанные в настоящем описании, можно использовать для лечения очагов метастазирования, ассоциированных с вышеупомянутыми злокачественными опухолями.

В некоторых вариантах осуществления, способ дополнительно включает определение того, является ли образец опухоли положительным по одному или нескольким из PD-L1, CD8, и IFN-γ, и если образец опухоли является положительным по одному или нескольким, например, двум, или всем трем, из маркеров, тогда введение пациенту терапевтически эффективного количества молекулы антитела против TIM-3, необязательно в комбинации с одним или несколькими другими иммуномодуляторами или противораковыми средствами, как описано в настоящем описании.

В некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 используют для лечения злокачественной опухоли, экспрессирующей TIM-3. Экспрессирующие TIM-3 злокачественные опухоли включают, например, рак шейки матки (Cao et al., PLoS One. 2013;8(1):e53834), рак легких (Zhuang et al., Am J Clin Pathol. 2012;137(6):978-985) (например, немелкоклеточный рак легких), острый миелоидный лейкоз (Kikushige et al., Cell Stem Cell. 2010 Dec 3;7(6):708-17), диффузную крупноклеточную B-клеточную лимфому, меланому (Fourcade et al., JEM, 2010; 207 (10): 2175), рак почки (например, почечноклеточный рак (RCC), например, светлоклеточную карциному почки, папиллярную почечноклеточную карциному или метастазирующий почечноклеточный рак), плоскоклеточную карциному, плоскоклеточную карциному пищевода, карциному носоглотки, колоректальный рак, рак молочной железы (например, рак молочной железы, не экспрессирующий один, два или все из рецептора эстрогена, рецептора прогестерона или Her2/neu, например, трижды отрицательный рак молочной железы), мезотелиому, печеночноклеточную карциному и рак яичника. Экспрессирующая TIM-3 злокачественная опухоль может представлять собой метастазирующую злокачественную опухоль.

В других вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3 используют для лечения злокачественной опухоли, характеризующейся активностью макрофагов или высокой экспрессией клеточных маркеров макрофагов. В одном варианте осуществления, молекулу антитела против TIM-3 используют для лечения злокачественной опухоли, характеризующейся высокой экспрессией одного или нескольких из следующих клеточных маркеров макрофагов: LILRB4 (ингибирующего рецептора макрофагов), CD14, CD16, CD68, MSR1, SIGLEC1, TREM2, CD163, ITGAX, ITGAM, CD11b или CD11c. Примеры таких злокачественных опухолей включают, но без ограничения, диффузную крупноклеточную B-клеточную лимфому, мультиформную глиобластому, светлоклеточную почечноклеточную карциному, аденокарциному поджелудочной железы, саркому, печеночноклеточную карциному, аденокарциному легких, папиллярную почечноклеточную карциному, кожную меланому, высокодифференцированную глиому головного мозга, плоскоклеточную карциному легких, тяжелую цистаденокарциному яичников, плоскоклеточную карциному головы и шеи, инвазивную карциному молочной железы, острый миелоидный лейкоз, плоскоклеточную карциному шейки матки, эндоцервикальную аденокарциному, карциному матки, колоректальный рак, эндометиральную карциному тела матки, карциному щитовидной железы, уротелиальную карциному мочевого пузыря, адренокортикальную карциному, хромофобный почечноклеточный рак и аденокарциному предстательной железы.

Виды комбинированной терапии, описанные в настоящем описании, могут включать композицию по настоящему изобретению, включенную в совместный состав с и/или вводимую совместно с одним или несколькими дополнительными лекарственными средствами, например, одним или несколькими противораковыми средствами, цитотоксическими или цитостатическими средствами, гормонотерапией, вакцинами и/или другими иммунотерапевтическими средствами. В других вариантах осуществления, молекулы антител вводят в комбинации с другими терапевтическими средствами, включая хирургию, радиоактивное облучение, криохирургию и/или термотерапию. В таких видах комбинированной терапии можно преимущественным образом использовать более низкие дозы вводимых лекарственных средств, таким образом, исключая возможную токсичность или осложнения, ассоциированные с различными видами монотерапии.

Способы, композиции и комбинации, описанные в настоящем описании (например, антитела против TIM-3 и способы их применения) можно использовать в комбинации с другими средствами или терапевтическими средствами, например, вторым лекарственным средством, выбранным из одного или нескольких средств, перечисленных в таблице 6 из WO 2017/019897, полное содержание которой приведено путем ссылки. В одном варианте осуществления, способы, описанные в настоящем описании, включают введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, как описано в WO2017/019897 (необязательно в комбинации с одним или несколькими ингибиторами PD-1, PD-L1, LAG-3, CEACAM (например, CEACAM-1 и/или CEACAM-5) или CTLA-4)), дополнительно включают введение второго лекарственного средства, выбранного из одного или нескольких средств, перечисленных в таблице 6 из WO 2017/019897, в количестве, эффективном для лечения или предотвращения нарушения, например, нарушения, как описано в настоящем описании, например, злокачественной опухоли. При введении в комбинации, молекулу антитела против TIM-3, дополнительное средство (например, второе или третье средство), или все, можно вводить в количестве или дозе, которые являются более высокими, более низкими или такими же, что и количество или доза каждого средства, используемого индивидуально, например, в качестве монотерапии. В конкретных вариантах осуществления, вводимые количество или доза антитела против TIM-3, дополнительного средства (например, второго или третьего средства), или всех, ниже (например, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, или по меньшей мере на 50%), чем количество или доза каждого средства, используемого индивидуально, например, в качестве монотерапии. В других вариантах осуществления, количество или доза антитела против TIM-3, дополнительного средства (например, второго или третьего средства), или всех, которая приводит к желательному эффекту (например, лечению злокачественной опухоли), ниже (например, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40% или по меньшей мере на 50% ниже).

В других вариантах осуществления, дополнительное лекарственное средство выбрано из одного или нескольких из средств, перечисленных в таблице 6 из WO 2017/019897. В некоторых вариантах осуществления, дополнительное лекарственное средство выбрано из одного или нескольких из: 1) ингибитора протеинкиназы C (PKC); 2) ингибитора белка теплового шока 90 (HSP90); 3) ингибитора фосфоинозитид-3-киназы (PI3K) и/или мишени рапамицина (mTOR); 4) ингибитора цитохрома P450 (например, ингибитора CYP17 или ингибитора 17-альфа-гидроксилазы/c17-20 лиазы); 5) хелатирующего железо агента; 6) ингибитора ароматазы; 7) ингибитора p53, например, ингибитора взаимодействия p53/Mdm2; 8) индуктора апоптоза; 9) ингибитора ангиогенеза; 10) ингибитора альдостеронсинтазы; 11) ингибитора рецептора smoothened (SMO); 12) ингибитора рецептора пролактина (PRLR); 13) ингибитора передачи сигналов Wnt; 14) ингибитора CDK4/6; 15) ингибитора рецептора 2 фактора роста фибробластов (FGFR2)/ ингибитора рецептора 4 фактора роста фибробластов (FGFR4); 16) ингибитора колониестимулирующего фактора макрофагов (M-CSF); 17) ингибитора одного или нескольких из c-KIT, высвобождения гистамина, Flt3 (например, FLK2/STK1) или PKC; 18) ингибитора одного или нескольких из VEGFR-2 (например, FLK-1/KDR), PDGFR-бета, c-KIT или Raf-киназы C; 19) агониста соматостатина и/или ингибитора высвобождения гормона роста; 20) ингибитора киназы анапластической лимфомы (ALK); 21) ингибитора рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF-1R); 22) ингибитора P-гликопротеина 1; 23) ингибитора рецептора фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR); 24) ингибитора киназы BCR-ABL; 25) ингибитора FGFR; 26) ингибитора CYP11B2; 27) ингибитора HDM2, например, ингибитора взаимодействия HDM2-p53; 28) ингибитора тирозинкиназы; 29) ингибитора c-MET; 30) ингибитора JAK; 31) ингибитора DAC; 32) ингибитора 11β-гидроксилазы; 33) ингибитора IAP; 34) ингибитора киназы PIM; 35) ингибитора белка porcupine; 36) ингибитора BRAF, например, BRAF V600E или BRAF дикого типа; 37) ингибитора HER3; 38) ингибитора MEK; или 39) ингибитора киназы липидов, например, как описано в таблице 6 из WO 2017/019897.

Дополнительные варианты осуществления видов комбинированной терапии, включающих молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании, описаны в WO2017/019897, полное содержание которой приведено путем ссылки.

Способы лечения инфекционных заболеваний

Настоящее изобретение относится к способам лечения инфекционных заболеваний с использованием молекулы антитела против TIM-3 (например, молекулы антитела против TIM-3, описанной в настоящем описании), или композиции или состава, содержащих молекулу антитела против TIM-3 (например, композиции или состава, описанных в настоящем описании). В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела, композицию или состав вводят субъекту в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании.

В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в количестве, эффективном для лечения инфекционного заболевания или его симптома. В некоторых вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 2000 мг или от приблизительно 20 мг до приблизительно 2000 мг один раз в каждые две, три или четыре недели. Например, молекулу антитела против TIM-3 можно вводить в дозе от приблизительно 10 мг до приблизительно 50 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 200 мг, от приблизительно 200 мг до приблизительно 500 мг, или от приблизительно 500 мг до приблизительно 1500 мг, один раз в каждые две недели или один раз в каждые четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 10 мг до 30 мг (например, приблизительно 20 мг) один раз в каждые две недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 60 мг до 100 мг (например, приблизительно 80 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 200 мг до приблизительно 300 мг (например, приблизительно 240 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В одном варианте осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 в дозе от приблизительно 1000 мг до приблизительно 1500 мг (например, приблизительно 1200 мг) один раз в каждые две недели или четыре недели. В конкретных вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 один раз в каждые две недели. В других вариантах осуществления, вводят молекулу антитела против TIM-3 один раз в каждые четыре недели.

Конкретные способы, описанные в настоящем описании, используют для лечения субъектов, подвергавшихся воздействию конкретных токсинов или патогенов. Без намерения быть связанными теорией, считают, что в некоторых вариантах осуществления, антитела против TIM-3 могут стимулировать опосредованное клетками NK уничтожение клеток-мишеней и могут усиливать секрецию IFN-гамма и пролиферацию CD4+ T-клеток. Соответственно, в конкретных вариантах осуществления, молекулы антител против TIM-3, композиции и составы, описанные в настоящем описании, являются пригодными для использования для стимуляции иммунного ответа против инфекционного агента. Соответственно, в другом аспекте, настоящее изобретение относится к способу лечения инфекционного заболевания у субъекта, включающему введение субъекту молекулы антитела против TIM-3, или композиции или состава, содержащих молекулу антитела против TIM-3, например, в соответствии с режимом дозирования, описанным в настоящем описании, таким образом, что у субъекта лечат инфекционное заболевание. При лечении инфекции (например, острой и/или хронической), введение молекул антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми способами лечения, в дополнение к или вместо стимуляции видов естественной иммунной защиты хозяина против инфекции. Виды естественной иммунной защиты хозяина против инфекции включают, но без ограничения, воспаление, лихорадку, опосредованную антителами защиту хозяина, виды опосредованной T-лимфоцитами защиты хозяина, включая секрецию лимфокинов и цитотоксические T-клетки (особенно во время вирусной инфекции), опосредованные комплементов лизис и опсонизацию (облегченный фагоцитоз), и фагоцитоз. Способность молекул антител против TIM-3 повторно активировать дисфункицональные T-клетки можно использовать для лечения хронических инфекций, в частности, инфекций, при которых опосредованный клетками иммунитет необходим для полного выздоровления.

Подобно их применениям для опухолей, как обсуждали в предшествующем разделе, молекулы антител против TIM-3, композиции и составы, описанные в настоящем описании, можно использовать отдельно или в комбинации с вторым лекарственным средством или средством, или в качестве адъюванта, в комбинации с вакциной, для стимуляции иммунного ответа на патоген или токсин. Примеры патогенов, против которых этот терапевтический способ является особенно полезным, включают патогены, для которых в настоящее время не существует эффективной вакцины, или патогены, для которых общепринятые вакцины менее, чем полностью эффективны. Они включают, но без ограничения, HIV, вирусы гепатита (A, B, и C), гриппа, герпеса, жиардию, возбудитель малярии, Leishmania, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa. Терапию с использованием молекулы антитела против TIM-3 также можно использовать против развившихся инфекций агентами, такими как HIV, представляющими измененные антигены в ходе инфекции.

Соответственно, в некоторых вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, композицию или состав, описанные в настоящем описании, используют для лечения субъекта, имеющего инфекцию или подверженного риску наличия инфекции. Инфекция, например, относится к заболеванию или состоянию, которое можно отнести к присутствию у хозяина чужеродного организма или агента, воспроизводящегося внутри хозяина. Инфекции, как правило, включают нарушения барьера нормальной слизистой оболочки или другой ткани инфекционным организмом или агентом. Субъект, имеющий инфекцию. представляет собой субъекта, имеющего поддающиеся объективному измерению инфекционные организмы или агенты, присутствующие в организме субъекта. Субъект, подверженный риску наличия инфекции, представляет собой субъекта, имеющего предрасположенность к развитию инфекции. Такой субъект может включать, например, субъекта после известного или подозреваемого воздействия инфекционного организма или агента. Субъект, подверженный риску наличия инфекции, может также включать субъекта с состоянием, ассоциированным с нарушенной способностью развивать иммунный ответ на инфекционный организм или агента, например, субъекта с врожденным или приобретенным иммунодефицитом, субъекта, подвергнутого радиотерапии или химиотерапии, субъекта с ожоговым поражением, субъекта с травматическим поражением, субъекта, подвергнутого хирургической или другой инвазивной медицинской или стоматологической процедуре.

Инфекции в широком смысле классифицируют как бактериальные, вирусные, грибковые или паразитарные, на основании категории вовлеченного инфекционного организма или агента. Другие менее распространенные типы инфекций включают, например, инфекции, включающие риккетсии, микоплазму и агенты, вызывающие почесуху, губчатую энцефалопатию крупного рогатого скота (BSE) и прионные заболевания (например, куру и болезнь Крейтцфельда-Якоба). Примеры бактерий, вирусов, грибов и паразитов, вызывающих инфекцию, хорошо известны в данной области. Инфекция может являться острой, подострой, хронической или латентной, и она может являться локализованной или системной. Кроме того, инфекция может являться преимущественно внутриклеточной или внеклеточной во время по меньшей мере одной фазы жизненного цикла инфекционного организма или агента у хозяина.

Вирусы

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, композицию или состав, описанные в настоящем описании, используют для лечения вирусной инфекции или заболевания, ассоциированного с вирусом.

Примеры вирусов, как обнаружено, вызывающих инфекции у человека, включают, но без ограничения: Retroviridae (например, вирусы иммунодефицита человека, такие как HIV-1 (также обозначенный как HTLV-III), HIV-2, LAV или HTLV-III/LAV, или HIV-III, и другие изоляты, такие как HIV-LP; Picornaviridae (например, вирусы полиомиелита, вирус гепатита A; энтеровирусы, вирусы Коксаки человека, риновирусы, эховирусы); Calciviridae (например, штаммы, вызывающие гастроэнтерит); Togaviridae (например, вирусы энцефалита лошадей, вирусы краснухи); Flaviviridae (например, вирусы денге, вирусы энцефалита, вирусы желтой лихорадки); Coronaviridae (например, коронавирусы); Rhabdoviridae (например, вирусы везикулярного стоматита, вирусы бешенства); Filoviridae (например, вирусы Эбола); Paramyxoviridae (например, вирусы парагриппа, вирус свинки, вирус кори, респираторно-синцитиальный вирус); Orthomyxoviridae (например, вирусы гриппа); Bungaviridae (например, вирусы Хантаан, вирусы бунга, флебовирусы и вирусы Найро); Arenaviridae (вирусы геморрагической лихорадки); Reoviridae (например, реовирусы, орбивирусы и ротавирусы); Birnaviridae; Hepadnaviridae (вирус гепатита B); Parvoviridae (парвовирусы); Papovaviridae (вирусы папилломы, вирусы полиомы); Adenoviridae (большинство аденовирусов); Herpesviridae (вирус простого герпеса (HSV) 1 и 2, вирус ветряной оспы, цитомегаловирус (CMV), вирус герпеса; Poxyiridae (вирусы натуральной оспы, вирусы осповакцины, поксвирусы); и Iridoviridae (например, вирус африканской лихорадки свиней); и неклассифицированные вирусы (например, этиологические агенты губчатых энцефалопатий, агент гепатита дельта (который, как считают, является дефектным сателлитом вируса гепатита В), агенты гепатита не-A, не-B гепатит (класс 1= энтерально переносимый; класс 2=парентерально переносимый (т.е., гепатит C); вирусы Норвалка и родственные вирусы, и астровирусы). Некоторые примеры патогенных вирусов, вызывающих инфекции, поддающиеся лечению способами по настоящему изобретению, включают HIV, вирус гепатита (A, B или C), вирус герпеса (например, VZV, HSV-1, HAV-6, HSV-II и CMV, вирус Эпштейна-Барр), аденовирус, вирус гриппа, флавивирусы, эховирус, риновирус, вирус Коксаки, коронавирус, респираторно-синцитиальный вирус, вирус свинки, ротавирус, вирус кори, вирус краснухи, парвовирус, вирус осповакцины, вирус HTLV, вирус денге, папилломавирус, вирус моллюска, вирус полиомиелита, вирус бешенства, вирус JC и вирус арбовирусного энцефалита.

В случае инфекций, возникающих из-за вирусов, молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать посредством введения во время, до или после использования стандартных видов терапии для лечения вирусных инфекций. Такие стандартные виды терапии меняются в зависимости от типа вируса, хотя почти во всех случаях, введение сыворотки человека, содержащей антитела (например, IgA, IgG), специфические для вируса, может являться эффективным.

Некоторые примеры патогенных вирусов, вызывающих инфекции, поддающиеся лечению этими способами, включают HIV, гепатит (A, B, или C), вирус герпеса (например, VZV, HSV-1, HAV-6, HSV-II и CMV, вирус Эпштейна-Барр), аденовирус, вирус гриппа, флавивирусы, эховирус, риновирус, вирус Коксаки, коронавирус, респираторно-синцитиальный вирус, вирус свинки, ротавирус, вирус кори, вирус краснухи, парвовирус, вирус осповакцины, вирус HTLV, вирус денге, папилломавирус, вирус моллюска, вирус полиомиелита, вирус бешенства, вирус JC, вирус арбовирусного энцефалита и вирусы Эбола (например, BDBV, EBOV, RESTV, SUDV и TAFV).

В одном варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом гриппа. Инфекция вирусом гриппа может приводить к лихорадке, кашлю, миалгии, головной боли и недомоганию, которые часто возникают при сезонных эпидемиях. Грипп также ассоциирован с рядом постинфекционных нарушений, таких как энцефалит, миоперикардит, синдром Гудпасчера и синдром Рея. Инфекция вирусом гриппа также подавляет виды нормальной легочной антибактериальной защиты, так что пациенты, при выздоровлении от гриппа, имеют повышенный риск развития бактериальной пневмонии. Поверхностные белки вируса гриппа имеют заметную антигенную изменчивость, в результате мутации и рекомбинации. Таким образом, цитолитические T-лимфоциты являются основным средством хозяина для уничтожения вируса после инфекции. Вирус гриппа классифицируют на три основных типа: A, B и C. Вирус гриппа A является уникальным в том смысле, что он инфицирует как человека, так и многих других животных (например, свиней, лошадей, птиц и тюленей) и является главной причиной пандемического гриппа. Также, когда клетка инфицирована двумя разными штаммами вируса гриппа A, сегментированные РНК-геномы двух исходных типов вируса смешиваются во время репликации, создавая гибридную реплику, что приводит к новым эпидемическим штаммам. Вирус гриппа B не реплицируется у животных и, следовательно, имеет меньшую генетическую изменчивость, и вирус гриппа C имеет только один серотип.

Большинство общепринятых видов терапии являются паллиативными для симптомов, возникающих в результате инфекции, в то время как как иммунный ответ хозяина фактически устраняет заболевание. Однако, определенные штаммы (например, вируса гриппа A) могут вызывать более серьезное заболевание и смерть. Грипп типа A можно лечить как клинически, так и профилактически, посредством введения ингибиторов циклических аминов амантадина и римантадина, которые ингибируют репликацию вирусов. Однако клиническая применимость таких лекарственных средств ограничена вследствие относительно высокой встречаемости неблагоприятных реакций, их узкого противовирусного спектра (только против вируса гриппа A), и склонности вируса к приобретению устойчивости. Введение сывороточного антитела IgG против главных поверхностных белков вируса гриппа, гемагглютинина и нейраминидазы может предотвращать легочную инфекцию, в то время как IgA слизистой оболочки необходим для предотвращения инфекции верхних дыхательных путей и трахеи. Наиболее эффективным современным средством лечения гриппа является вакцинация посредством введения вируса, инактивированного формалином или β-пропиолактоном.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом гепатита, например, инфекцию вирусом гепатита B или C.

Вирус гепатита B (HB-V) является наиболее инфекционным из известных передающихся с кровью патогенов. Он является основной причиной острого и хронического гепатита и карциномы печени, а также продолжающейся в течение всей жизни хронической инфекции. После инфицирования вирус реплицируется в гепатоцитах, которые затем также сбрасывают поверхностный антиген HBsAg. Детекцию избыточных уровней HBsAg в сыворотке используют в качестве стандартного способа диагностики инфекции вирусом гепатита B. Острая инфекция может разрешаться или она может развиваться в хроническую персистирующую инфекцию. Современные средства для лечения хронической инфекции HBV включают α-интерферон, который увеличивает экспрессию человеческого лейкоцитарного антигена (HLA) класса I на поверхности гепатоцитов, таким образом облегчая их узнавание цитотоксическими T-лимфоцитами. Кроме того, для аналогов нуклеозидов ганцикловира, фамицикловира и ламивудина также показана некоторая эффективность при лечении инфекции HBV в клинических исследованиях. Дополнительные виды лечения против HBV включают пегилированный a-интерферон, аденфовир, энтекавир и телбувидин. В то время как пассивный иммунитет можно придавать посредством парентерального введения сывороточных антител против HBsAg, вакцинация с использованием инактивированного или рекомбинантного HBsAg также придает устойчивость к инфекции. Молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения инфекций вирусом гепатита B для получения терапевтического преимущества.

Инфекция вирусом гепатита C (HC-V) может приводить к хронической форме гепатита, приводящей к циррозу. В то время как симптомы являются сходными с симптомами в результате инфекций вирусом гепатита B, четко выраженным отличием от HB-V является то, что инфицированные хозяева могут не иметь симптомов на протяжении 10-20 лет. Молекулу антитела против TIM-3 можно вводить в качестве монотерапии, или в комбинации со стандартным лечением инфекции вирусом гепатита C. Например, молекулу антитела против TIM-3 можно вводить с одним или несколькими из SOVALDI® (софосбувира), OLYSIO™ (симепревира), плюс рибавирин или пегилированный интерферон. Хотя режимы, включающие INCIVEK™ (телапревир) или VICTRELIS™ (боцепревир) плюс рибавирин и пегилированный интерферон, также одобрены, они ассоциированы с увеличенными побочными эффектами и большей длительностью лечения, и, таким образом, их не считают предпочтительными режимами.

Общепринятое лечение инфекции HC-V включает введение комбинации α-интерферона и рибавирина. Многообещающим потенциальным терапевтическим средством против инфекции HC-V является ингибитор протеазы телапревир (VX-960). Дополнительные виды лечения включают: антитело против PD-1 (MDX-1106, Medarex), бавитуксимаб (антитело, которое связывает анионный фосфолипид фосфатидилсерин зависимым от B2-гликопротеина I образом, Peregrine Pharmaceuticals), антитело (антитела) против белка оболочки E2 вируса HPV (например, ATL 6865−Ab68+Ab65, XTL Pharmaceuticals) и CIVACIR® (поликлональный человеческий иммуноглобулин против HCV). Антитела против PD-L1 по изобретению можно комбинировать с одним или несколькими из этих видов лечения инфекций вирусом гепатита C для получения терапевтического преимущества. Ингибиторы протеазы, полимеразы и NS5A, которые можно использовать в комбинации с молекулами антител против TIM-3 для специфичного лечения инфекции вирусом гепатита C, включают ингибиторы, описанные в US 2013/0045202, содержание которой приведено в настоящем описании путем ссылки.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом кори. После инкубационного периода 9-11 суток, у хозяев, инфицированных вирусом кори, развивается лихорадка, кашель, насморк и конъюнктивит. В течение 1-2 суток, развивается эритематозная, макулопапулезная сыпь, которая быстро распространяется по всему телу. Поскольку инфекция также супрессирует клеточный иммунитет, хозяин подвержен более высокому риску развития бактериальных суперинфекций, включая средний отит, пневмонию и постинфекционный энцефаломиелит. Острая инфекция ассоциирована со значительным уровнем заболеваемости и смертности, особенно у подростков при недостаточном питании.

Лечение кори включает пассивное введение пулированного IgG человека, который может предотвращать инфекцию у неиммунизированных субъектов, даже если вводить его вплоть до одной недели после воздействия. Однако предварительная иммунизация живым ослабленным вирусом представляет собой наиболее эффективный способ лечения и предотвращает заболевание более чем у 95% иммунизированных индивидуумов. Поскольку существует один серотип этого вируса, однократная иммунизация или инфекция, как правило, приводит к защите от последующей инфекции на протяжении всей жизни.

У небольшой части инфицированных хозяев корь может развиваться в SSPE, который является хроническим прогрессирующим неврологическим нарушением, возникающим в результате персистирующей инфекции центральной нервной системы. SSPE вызывают клональные варианты вируса кори с дефектами, которые влияют на сборку и отпочковывание вирионов. Для этих пациентов, может являться желательной реактивация T-клеток с использованием молекул антител против TIM-3, таким образом, чтобы облегчать выведения вирусов.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию HIV. HIV атакует CD4⁺-клетки, включая T-лимфоциты, моноциты-макрофаги, фолликулярные дендритные клетки и клетки Лангерганса, и происходит истощение CD4⁺-клеток-помощников/индукторов. результате хозяин приобретает тяжелую недостаточность опосредованного клетками иммунитета. Инфекция HIV приводит к СПИД по меньшей мере, у 50% индивидуумов, и передается посредством полового контакта, введения инфицированной крови или продуктов крови, искусственного оплодотворения инфицированной спермой, контакта с содержащими кровь иглами или шприцами и передачи от инфицированной матери ребенку во время родов.

У хозяина, инфицированного HIV, симптомы могут не проявляться, или может развиваться острое заболевание, напоминающее мононуклеоз ‒ лихорадка, головная боль, боль в горле, недомогание и сыпь. Симптомы могут прогрессировать до прогрессирующей дисфункции иммунной системы, включая персистирующую лихорадку, ночную потливость, потерю массы, необъяснимую диарею, экзему, псориаз, себорейный дерматит, опоясывающий герпес, кандидоз ротовой полости и волосистую лейкоплакию ротовой полости. Оппортунистические инфекции хозяина паразитами являются общераспространенными у пациентов, у которых инфекции развиваются в СПИД.

Виды лечения HIV включают противовирусную терапию, включающую аналоги нуклеозидов, зидовудин (AST), либо отдельно, либо в комбинации с диданозином или зальцитабином, дидезоксиинозином, дидезоксицитидином, ламивудином, ставудином; ингибиторы обратной транскриптазы, такие как делавирдин, невирапин, ловирид, и ингибиторы протеаз, такие как саквинавир, ритонавир, индинавир и нельфинавир. Молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения инфекций HIV, для получения терапевтического преимущества.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию цитомегаловирусом (CMV). Инфекция CMV часто ассоциирована с персистирующей, латентной и рецидивирующей инфекцией. CMV инфицирует и остается латентным в моноцитах и клетках-предшественниках гранулоцитов-моноцитов. Клинические симптомы CMV включают подобные мононуклеозу симптомы (т.е., лихорадку, увеличенные железы, недомогание), и тенденцию к развитию аллергической кожной сыпи на антибиотики. Вирус распространяется при прямом контакте. Вирус выделяется в мочу, слюну, сперму и в меньшей степени в другие жидкости организма. Передача также может происходить от инфицированной матери плоду или новорожденному и посредством переливания крови и трансплантации органов. Инфекция CMV приводит к общему нарушению клеточного иммунитета, характеризующемуся нарушенными реакциями бласттрансформации с неспецифическими митогенами и специфическими антигенами CMV, уменьшенной цитотоксической способностью и увеличением количества CD8 лимфоцитов из CD4⁺ лимфоцитов.

Виды лечения инфекции CMV включают противовирусные средства ганцикловир, фоскарнет и цидовир, но эти лекарственное средства, как правило, назначают только пациентам с иммунной недостаточностью. Молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения цитомегаловирусных инфекций для получения терапевтического преимущества.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом Эпштейна-Барр (EBV). EBV может приводить к персистирующей и латентной инфекциям, и в первую очередь атакует B-клетки. Инфекция EBV приводит к клиническому состоянию инфекционного мононуклеоза, которое включает лихорадку, боль в горле, часто с экссудатом, генерализованную лимфоаденопатию и спленомегалию. Присутствует также гепатит, который может развиваться в желтуху.

В то время как типичные виды лечения инфекций EBV являются паллиативными для симптомов, EBV ассоциирован с развитием определенных злокачественных опухолей, таких как лимфома Беркитта и злокачественная опухоль носоглотки. Таким образом, удаление вирусной инфекции до появления этих осложнений может обеспечивать большое преимущество. Молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения инфекций вирусом Эпштейна-Барр для получения терапевтического преимущества.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом простого герпеса (HSV). HSV передается при прямом контакте с инфицированным хозяином. Прямая инфекция может быть бессимптомной, но обычно приводит к появлению волдырей, содержащих инфекционные частицы. Заболевание проявляется в виде циклов активных периодов заболевания, при которых очаги появляются и исчезают, так как вирусы латентно инфицируют нервный ганглий с последующими вспышками заболевания. Очаги могут находиться на лице, гениталиях, глазах и/или руках. В некоторых случаях, инфекция также может вызывать энцефалит.

Виды лечения герпетических инфекций направлены, в первую очередь, на разрешение вспышек симптомов, и включают противовирусные лекарственные средства системного действия, такие как: ацикловир (например, Zovirax®), валацикловир, фамицикловир, пенцикловир и местные лекарственные средства, такие как докозанол (ABREVA®), тромантадин и зилактин. Клиренс латентных герпетических инфекций может иметь важное клиническое значение. Молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения инфекций вирусом герпеса инфекции для получения терапевтического преимущества.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию T-лимфотропным вирусом человека (HTLV-1, HTLV-2). HTLV передается при половом контакте, грудном вскармливании или через зараженную кровь. Вирус активирует подгруппу T_H-клеток, называемых Th1-клетками, что приводит к их сверхпролиферации и сверхпродукции связанных с Th1 цитокинов (например, IFN-γ и TNF-α). Это, в свою очередь, приводит к супрессии Th2-лимфоцитов и уменьшению продукции Th2-цитокинов (например, IL-4, IL-5, IL-10 и IL-13), вызывающей уменьшение способности инфицированного хозяина формировать адекватный иммунный ответ на проникающие микроорганизмы, требующий зависимого от Th2 ответа для выведения (например, паразитарные инфекции, продукция антител слизистой оболочки и гуморальных антител).

Инфекции HTLV вызывают оппортунистические инфекции, приводящие к бронхоэктазу, дерматиту и суперинфекциям Staphylococcus spp. и Strongyloides spp., приводящим к смерти от полимикробного сепсиса. Инфекция HTLV также может непосредственно приводить к T-клеточному лейкозу/лимфоме взрослых и заболеванию с прогрессирующей демиелинизацией верхних двигательных нейронов, известному как HAM/TSP. Выведение латентных инфекций HTLV может обеспечивать большое клиническое преимущество. Молекулы антител против TIM-3 можно комбинировать с общепринятыми видами лечения инфекций HTLV для получения терапевтического преимущества.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом папилломы человека (HPV). HPV в первую очередь поражает кератиноциты и встречается в двух формах: кожной и генитальной. Считают, что передача осуществляется при прямом контакте и/или половым путем. Как кожная, так и генитальная инфекция HPV, может приводить к бородавкам и латентным инфекциям и иногда к рекуррентным инфекциям, которые находятся под контролем иммунитета хозяина, который контролирует симптомы и блокирует появление бородавок, но оставляет хозяина способным передавать инфекцию другим.

Инфекция HPV также может приводить к определенным злокачественным опухолям, таким как злокачественная опухоль шейки матки, ануса, вульвы, пениса и ротоглотки. Не существует известных способов излечения инфекции HPV, но современное лечение заключается в местном применении имиквимода, который стимулирует иммунную систему для атаки пораженной области. Выведение латентных инфекций HPV может обеспечивать большое клиническое преимущество. Антитела против TIM-3 по изобретению можно комбинировать с общепринятыми видами лечения инфекций HPV для получения терапевтического преимущества.

В другом варианте осуществления, инфекция представляет собой инфекцию вирусом Эбола (EBOV). EBOV является одним из пяти известных вирусов внутри рода Ebolavirus. EBOV вызывает тяжелую и часто летальную геморрагическую лихорадку у человека и млекопитающих, известную как геморрагическая лихорадка Эбола (EVD). Передача происходит посредством контакта с кровью, секретами, органами или другими физиологическими жидкостями инфицированных пациентов. В настоящее время, не существует доказанного лечения или вакцины.

Бактерии

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, композицию или состав, описанные в настоящем описании, используют для лечения бактериальной инфекции или заболевания, ассоциированного с бактерией.

Бактерии включают как грамотрицательные, так и грамположительные бактерии. Примеры грамположительных бактерий включают, но без ограничения, виды Pasteurella, виды Staphylococci и виды Streptococcus. Примеры грамотрицательных бактерий включают, но без ограничения, Escherichia coli, виды Pseudomonas и виды Salmonella. Конкретные примеры инфекционных бактерий включают, но без ограничения: Helicobacter pyloris, Borrelia burgdorferi, Legionella pneumophilia, виды микобактерий (например, M. tuberculosis, M. avium, M. intracellulare, M. kansasii, M. gordonae), Staphylococcus aureus, Neisseria gonorrhoeae, Neisseria meningitidis, Listeria monocytogenes, Streptococcus pyogenes (Streptococcus группы A), Streptococcus agalactiae (Streptococcus группы B), Streptococcus (группы viridans), Streptococcus faecalis, Streptococcus bovis, Streptococcus (анаэробные виды), Streptococcus pneumoniae, патогенные виды Campylobacter, виды Enterococcus, Haemophilus influenzae, Bacillus anthracis, Corynebacterium diphtheriae, виды Corynebacterium, Erysipelothrix rhusiopathiae, Clostridium perfringens, Clostridium tetani, Enterobacter aerogenes, Klebsiella pneumoniae, Pasturella multocida, виды Bacteroides, Fusobacterium nucleatum, Streptobacillus moniliformis, Treponema pallidum, Treponema pertenue, Leptospira, Mycobacterium leprae, Rickettsia и Actinomyces israelii. Некоторые примеры патогенных бактерий, вызывающих инфекции, которые можно лечить способами по настоящему изобретению, включают хламидии, риккетсиальные бактерии, микобактерии, стафилококки, стрептококки, пневмококки, менингококки и гонококки, клебсиеллы, протей, серратии, псевдомонады, легионеллы, вызывающие дифтерию бактерии, сальмонеллы, бациллы, бактерии, вызывающие холеру, столбняк, ботулизм, сибирскую язву, чуму, лептоспироз и болезнь Лайма.

Некоторые примеры патогенных бактерий, вызывающих инфекции, которые поддаются лечению способами по изобретению, включают бактерии, вызывающие сифилис, хламидии, риккетсиальные бактерии, микобактерии, стафилококки, стрептококки, пневмококки, менингококки и гонококки, клебсиеллы, протей, серратии, псевдомонады, легионеллы, вызывающие дифтерию бактерии, сальмонеллы, бациллы, бактерии, вызывающие холеру, столбняк, ботулизм, сибирскую язву, чуму, лептоспироз и болезнь Лайма. Молекулы антител против TIM-3 можно использовать в комбинации с существующими средствами для лечения вышеуказанных инфекций. Например, виды лечения сифилиса включают пенициллин (например, пенициллин G), тетрациклин, доксицилин, цефтриаксон и азитромицин.

Болезнь Лайма, вызываемая Borrelia burgdorferi, передается человеку через укусы клещей. Заболевание сначала проявляется в форме локализованной сыпи с последующими подобными гриппу симптомами, включая недомогание, лихорадкой, головная боль, скованность мышц шеи и артралгии. Более поздние проявления могут включать блуждающий артрит и полиартрит, неврологические и сердечные составляющие с парезом черепно-мозгового нерва и радикулопатией, миокардитом и аритмиями. Некоторые случаи болезни Лайма становятся персистирующими, приводя к необратимому повреждению, аналогичному повреждению при третичном сифилисе. Современная терапия болезни Лайма включает, в первую очередь, введение антибиотиков. Устойчивые к антибиотикам штаммы можно лечить гидроксихлороквином или метотрексатом. Невосприимчивых к антибиотикам пациентов с невропатической болью можно лечить габапентином. Миноциклин может быть полезным при поздней/хронической болезни Лайма с неврологическими или другими воспалительными проявлениями.

Другие формы боррелиоза, такие как формы, возникающие в результате инфекции B. recurentis, B. hermsii, B. turicatae, B. parikeri, B. hispanica, B. duttonii и B. persica, так же как лептоспироз (например, вызванный L. interrogans), как правило, разрешаются спонтанно, если титры в крови не достигают концентраций, вызывающих внутрипеченочную обструкцию.

Грибы и паразиты

В конкретных вариантах осуществления, молекулу антитела против TIM-3, композицию или состав, описанные в настоящем описании, используют для лечения грибковой или паразитарной инфекции или заболевания, ассоциированного с грибом или паразитом.

Примеры грибов включают: виды Aspergillus, Blastomyces dermatitidis, Candida albicans, другие виды Candida, Coccidioides immitis, Cryptococcus neoformans, Histoplasma capsulatum, Chlamydia trachomatis виды Nocardia, Pneumocystis carinii. Некоторые примеры патогенных грибов, вызывающих инфекции, которые можно лечить способами по настоящему изобретению, включают Candida (albicans, krusei, glabrata, tropicalis и т.д.), Cryptococcus neoformans, Aspergillus (fumigatus, niger и т.д.), род Mucorales (mucor, absidia, rhizophus), Sporothrix schenkii, Blastomyces dermatitidis, Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides immitis и Histoplasma capsulatum.

Паразиты включают, но без ограничения, переносимых с кровью и/или тканями паразитов, таких как Babesia microti, Babesia divergens, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia, Leishmania tropica, виды Leishmania, Leishmania braziliensis, Leishmania donovani, Plasmodium falciparum, Plasmodium malariae, Plasmodium ovale, Plasmodium vivax и Toxoplasma gondii, Trypanosoma gambiense и Trypanosoma rhodesiense (африканская сонная болезнь), Trypanosoma cruzi (болезнь Чагаса), и Toxoplasma gondii, плоские черви, круглые черви. Некоторые примеры патогенных паразитов, вызывающих инфекции, которые можно лечить способами по настощему изобретению, включают Entamoeba histolytica, Balantidium coli, Naegleriafowleri, виды Acanthamoeba, Giardia lambia, виды Cryptosporidium, Pneumocystis carinii, Plasmodium vivax, Babesia microti, Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, Leishmania donovani, Toxoplasma gondi и Nippostrongylus brasiliensis.

Некоторые примеры патогенных грибов, вызывающие инфекции, которые можно лечить способами по изобретению, включают Candida (albicans, krusei, glabrata, tropicalis и т.д.), Cryptococcus neoformans, Aspergillus (fumigatus, niger и т.д.), род Mucorales (mucor, absidia, rhizophus), Sporothrix schenkii, Blastomyces dermatitidis, Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides immitis и Histoplasma capsulatum.

Некоторые примеры патогенных паразитов, вызывающих инфекции, которые можно лечить способами, описанными в настоящем описании, включают Entamoeba histolytica, Balantidium coli, Naegleriafowleri, виды Acanthamoeba, Giardia lambia, виды Cryptosporidium, Pneumocystis carinii, Plasmodium vivax, Babesia microti, Trypanosoma brucei, Trypanosoma cruzi, Leishmania donovani, Toxoplasma gondi и Nippostrongylus brasiliensis.

Нуклеиновые кислоты

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, могут быть кодированы нуклеиновыми кислотами, описанными в настоящем описании. нуклеиновые кислоты можно использовать для получения молекул антител против TIM-3, описанных в настоящем описании.

В конкретных вариантах осуществления, нуклеиновая кислота содержит нуклеотидные последовательности, кодирующие вариабельные области и CDR тяжелой и легкой цепи молекул антител против TIM-3, как описано в настоящем описании. Например, настоящее изобретение относится к первой и второй нуклеиновым кислотам, кодирующим вариабельные области тяжелой и легкой цепи, соответственно, молекулы антитела против TIM-3, выбранной из одной или нескольких из молекул антител, описанных в настоящем описании, например, антитела из таблиц 1-4 из US 2015/0218274. Нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую любую из аминокислотных последовательностей в таблицах в настоящем описании, или последовательность, по существу идентичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей или отличающуюся не более, чем на 3, 6, 15, 30 или 45 нуклеотидов от последовательностей, представленных в таблицах 1-4. Например, настоящее изобретение относится к первой и второй нуклеиновым кислотам, кодирующим вариабельные области тяжелой и легкой цепи, соответственно, молекулы антитела против TIM-3, выбранной из одной или нескольких из, например, любой из ABTIM3, ABTIM3-hum01, ABTIM3-hum02, ABTIM3-hum03, ABTIM3-hum04, ABTIM3-hum05, ABTIM3-hum06, ABTIM3-hum07, ABTIM3-hum08, ABTIM3-hum09, ABTIM3-hum10, ABTIM3-hum11, ABTIM3-hum12, ABTIM3-hum13, ABTIM3-hum14, ABTIM3-hum15, ABTIM3-hum16, ABTIM3-hum17, ABTIM3-hum18, ABTIM3-hum19, ABTIM3-hum20, ABTIM3-hum21, ABTIM3-hum22, ABTIM3-hum23, как обобщено в таблицах 1-4, или последовательности, по существу идентичной ей.

В конкретных вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR из вариабельной области тяжелой цепи, имеющей аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или имеющую одну или несколько замен, например, консервативных замен). В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR из вариабельной области легкой цепи, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или имеющую одну или несколько замен, например, консервативных замен). В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть CDR из вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или имеющую одну или несколько замен, например, консервативных замен).

В конкретных вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR из вариабельной области тяжелой цепи, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или способную гибридизоваться в строгих условиях, описанных в настоящем описании). В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR из вариабельной области легкой цепи, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или способную гибридизоваться в строгих условиях, описанных в настоящем описании). В конкретных вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть CDR из вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или способную гибридизоваться в строгих условиях, описанных в настоящем описании). Нуклеиновые кислоты, описанные в настоящем описании, включают дезоксирибонуклеотиды или рибонуклеотиды, или их аналоги. Полинуклеотид может являться либо одноцепочечным, либо двухцепочечным, и если является одноцепочечным, может представлять собой кодирующую цепь или некодирующую (антисмысловую) цепь. Полинуклеотид может содержит модифицированные нуклеотиды, такие как метилированные нуклеотиды и аналоги нуклеотидов. Последовательность нуклеотидов может прерываться ненуклеотидными компонентами. Полинуклеотид можно дополнительно модифицировать после полимеризации, например, посредством конъюгации с метящим компонентом. Нуклеиновая кислота может представлять собой рекомбинантный полинуклеотид, или полинуклеотид геномного, кДНК, полусинтетического или синтетического происхождения, который либо не встречается в природе, либо является связанным с другим полинуклеотидом в неприродной аранжировке.

В конкретных вариантах осуществления, нуклеотидная последовательность, кодирующая молекулу антитела против TIM-3, является оптимизированной по кодонному составу.

В некоторых вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к нуклеиновым кислотам, содержащим нуклеотидные последовательности, кодирующие вариабельные области и CDR тяжелой и легкой цепей молекул антител против TIM-3, как описано в настоящем описании. Например, настоящее изобретение относится к первой и второй нуклеиновым кислотам, кодирующим вариабельные области тяжелой и легкой цепи, соответственно, молекулы антитела против TIM-3, в соответствии с таблицами 1-4, или последовательность, по существу идентичную ей. Например, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую молекулу антитела против TIM-3 в соответствии с таблицами 1-4, или последовательность, по существу идентичную этой нуклеотидной последовательности (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей или отличающуюся не более, чем на 3, 6, 15, 30 или 45 нуклеотидов от вышеупомянутой нуклеотидной последовательности.

В конкретных вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR, или гипервариабельные петли, из вариабельной области тяжелой цепи, имеющей аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или имеющую одну, две, три или более замен, вставок или делеций, например, консервативных замен).

В конкретных вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две или три CDR, или гипервариабельные петли, из вариабельной области легкой цепи, имеющей аминокислотную последовательность, как указано в таблицах 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или имеющую одну, две, три или более замен, вставок или делеций, например, консервативных замен).

В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота может содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере одну, две, три, четыре, пять или шесть CDR, или гипервариабельные петли, из вариабельных областей тяжелой и легкой цепей, имеющие аминокислотную последовательность, как указано в таблице 1-4, или последовательность, по существу гомологичную ей (например, последовательность, по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 99% или более идентичную ей, и/или имеющую одну, две, три или более замен, вставок или делеций, например, консервативных замен).

В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела против TIM-3 является выделенной или рекомбинантной.

В некоторых аспектах, настоящее изобретение относится к клеткам-хозяевам и векторам, содержащим нуклеиновые кислоты, описанные в настоящем описании. Нуклеиновые кислоты могут присутствовать в одном векторе или в отдельных векторах, присутствующих в одной и той же клетке-хозяине или в отдельных клетках-хозяевах, как более подробно описано в настоящем описании.

Векторы и клетки-хозяева

Молекулы антител против TIM-3, описанные в настоящем описании, можно получать с использованием клеток-хозяев и векторов, содержащих нуклеиновые кислоты, описанные в настоящем описании. Нуклеиновые кислоты могут присутствовать в одном векторе или в отдельных векторах, присутствующих в одной и той же клетке-хозяине или в отдельных клетках-хозяевах.

В одном варианте осуществления, векторы содержат нуклеотиды, кодирующие молекулу антитела, описанную в настоящем описании. В одном варианте осуществления, векторы содержат нуклеотидные последовательности, описанные в настоящем описании. Векторы включают, но без ограничения, вирус, плазмиду, космиду, фаг лямбда или искусственную хромосому дрожжей (YAC). Можно использовать различные векторные системы. Например, в одном классе векторов используют элементы ДНК, происходящие из вирусов животных, например, таких как вирус папилломы крупного рогатого скота, вирус полиомы, аденовирус, вирус осповакцины, бакуловирус, ретровирусы (вирус саркомы Рауса, MMTV или MOMLV), или вирус SV40. В другом классе векторов используют элементы РНК, происходящие из РНК-вирусов, таких как вирус леса Семлики, вирус восточного энцефалита лошадей и флавивирусы. Кроме того, клетки, имеющие стабильно интегрированную в их хромосомы ДНК, можно отбирать посредством введения одного или нескольких маркеров, которые позволяют проводить отбор трансфицированных клеток-хозяев. Маркер может придавать, например, прототрофность ауксотрофному хозяину, биоцидную устойчивость (например, к антибиотикам), или устойчивость к тяжелым металлам, таким как медь, или т.п. Ген селективного маркера можно либо напрямую связывать с последовательностями ДНК, подлежащими экспрессии, либо вводить в ту же самую клетку посредством котрансформации. Для оптимального синтеза мРНК также могут являться необходимыми дополнительные элементы. Эти элементы могут включать сигналы сплайсинга, так же как транскрипционные промоторы, энхансеры и сигналы терминации. После получения для экспрессии экспрессирующего вектора или последовательности ДНК, содержащих эти конструкции, экспрессирующие векторы можно трансфицировать или вводить в подходящую клетку-хозяина. Для достижения этого можно использовать различные способы, например, такие как слияние протопластов, преципитация фосфатом кальция, электропорация, ретровирусная трансдукция, вирусная трансфекция, способы генной пушки, трансфекция на основе липидов или другие общепринятые способы. В случае слияния протопластов, клетки выращивают в средах и подвергают скринингу по соответствующей активности. Способы и условия культивирования полученных трансфицированных клеток и выделения продуцируемой молекулы антитела известны специалисту в данной области, и их можно менять или оптимизировать, в зависимости от конкретного экспрессирующего вектора и используемой клетки-хозяина млекопитающего, на основании настоящего описания.

В конкретных вариантах осуществления, клетка-хозяин содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую молекулу антитела против TIM-3, описанную в настоящем описании. В других вариантах осуществления, клетка-хозяин получена способом генной инженерии, чтобы содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую молекулу антитела против TIM-3. В одном варианте осуществления, клетка-хозяин получена способом генной инженерии с использованием экспрессирующей кассеты. Фраза «экспрессирующая кассета» относится к нуклеотидным последовательностям, способным влиять на экспрессию гена у хозяев, совместимых с такими последовательностями. Такие кассеты могут включать промотор, открытую рамку считывания с интронами или без интронов и сигнал терминации. Можно использовать также дополнительные факторы, необходимые или полезные для осуществления экспрессии, например, такие как индуцируемый промотор. В конкретных вариантах осуществления, клетка-хозяин содержит вектор, описанный в настоящем описании.

Клетка может представлять собой, но без ограничения, эукариотическую клетку, бактериальную клетку, клетку насекомого или клетку человека. Пригодные эукариотические клетки включают, но без ограничения, клетки Vero, клетки HeLa, клетки COS, клетки CHO, клетки HEK293, клетки BHK и клетки MDCKII. Пригодные клетки насекомых включают, но без ограничения, клетки Sf9.

В некоторых вариантах осуществления, клетка-хозяин представляет собой эукариотическую клетку, например, клетку млекопитающего, клетку насекомого, клетку дрожжей или прокариотическую клетку, например, E. coli. Например, клетка млекопитающего может представлять собой культивируемую клетку или линию клеток. Иллюстративные клетки млекопитающих включают лимфоцитарные линии клеток (например, NSO), клетки яичника китайского хомяка (CHO), клетки COS, клетки ооциты и клетки от трансгенного животного, например, эпителиальные клетки молочной железы.

ВКЛЮЧЕНИЕ ПУТЕМ ССЫЛКИ

Полное содержание всех публикаций, патентов и номеров доступа, упомянутых в настоящем описании, таким образом, приведено путем ссылки, как если бы было конкретно и индивидуально указано, что содержание каждой индивидуальной публикации или патента приведено путем ссылки.

ЭКВИВАЛЕНТЫ

В то время как приведено обсуждение конкретных вариантов осуществления рассматриваемого изобретения, приведенное выше описание является иллюстративным, а не ограничивающим. Множество вариантов изобретения станут очевидными для специалистов в данной области после просмотра этого описания и формулы изобретения ниже. Полный объем изобретения следует определять со ссылкой на пункты формулы изобретения, вместе с полным объемом эквивалентов, и на описание, вместе с такими вариантами.

Claims

1. Применение молекулы антитела против TIM-3 в дозе приблизительно 400 мг раз в каждые две недели или приблизительно 800 мг один раз в каждые четыре недели, для лечения злокачественной опухоли у субъекта,

где молекула антитела против TIM-3 содержит: вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 802 или 820 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812.

2. Способ лечения злокачественной опухоли у субъекта, включающий введение субъекту молекулы антитела против TIM-3 в дозе приблизительно 400 мг один раз в каждые две недели или приблизительно 800 мг один раз в каждые четыре недели,

где молекула антитела против TIM-3 содержит: вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 802 или 820, и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812.

3. Применение по п. 1 или способ по п. 2, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 802 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и VL, содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812.

4. Применение по п. 1 или 3 или способ по п. 2 или 3, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 806, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 816.

5. Применение по любому из пп. 1, 3 или 4 или способ по любому из пп. 2-4, где молекула антитела содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 808, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 818.

6. Применение по п. 1 или способ по п. 2, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 820 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и VL, содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811, и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812.

7. Применение по п. 1 или 6 или способ по любому из п. 2 или 6, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 822, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 826.

8. Применение по любому из пп. 1, 6 или 7 или способ по пп. 2, 6 или 7, где молекула антитела содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 824, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 828.

9. Применение по любому из пп. 1 или 3-8 или способ по любому из пп. 2-8, где злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль или гематологическую злокачественную опухоль.

10. Применение по любому из пп. 1 или 3-9 или способ по любому из пп. 2-9, где злокачественная опухоль выбрана из рака яичника, рака легких, мезотелиомы, рака кожи, рака почки, рака мочевого пузыря, саркомы мягких тканей, злокачественной опухоли кости, колоректального рака, рака поджелудочной железы, злокачественной опухоли носоглотки, рака молочной железы, злокачественной опухоли двенадцатиперстной кишки, рака эндометрия, аденокарциномы, рака печени, холангиокарциномы, миелодиспластического синдрома (MDS), саркомы, лейкоза, лимфомы, миеломы или очага метастазирования злокачественной опухоли.

11. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где рак легких представляет собой мелкоклеточный рак легких (SCLC) или немелкоклеточный рак легких (NSCLC).

12. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где рак кожи представляет собой карциному из клеток Меркеля (MCC) или меланому.

13. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где рак почки представляет собой почечноклеточный рак.

14. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где саркома мягких тканей представляет собой гемангиоперицитому (HPC).

15. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где злокачественная опухоль кости представляет собой карциному кости.

16. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где рак печени представляет собой печеночноклеточную карциному.

17. Применение по п. 10 или способ по п. 10, где лейкоз представляет собой острый миелоидный лейкоз (AML).

18. Применение по любому из пп. 1 или 3-17 или способ по любому из пп. 2-17, где злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль с высокой MSI.

19. Применение по любому из пп. 1 или 3-18 или способ по любому из пп. 2-18, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с вторым лекарственным средством или средством.

20. Применение по любому из пп. 1 или 3-19 или способ по любому из пп. 2-19, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с ингибитором PD-1.

21. Применение по п. 20 или способ по п. 20, где ингибитор PD-1 выбран из PDR001, ниволумаба, пембролизумаба, MEDI0680, REGN2810, PF-06801591, BGB-A317, INCHR1210, TSR-042 или AMP-224.

22. Применение по п. 20 или 21 или способ по п. 20 или 21, где ингибитор PD-1 применяют в дозе приблизительно 300 мг один раз в каждые три недели, приблизительно 400 мг один раз в каждые четыре недели или приблизительно 400 мг один раз в каждые восемь недель.

23. Применение по любому из пп. 1 или 3-22 или способ по любому из пп. 2-22, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с гипометилирующим средством.

24. Применение по п. 23 или способ по п. 23, где гипометилирующее средство представляет собой децитабин.

25. Применение по п. 23 или 24 или способ по п. 23 или 24, где гипометилирующее средство применяют в дозе от приблизительно 10 мг/м² до приблизительно 30 мг/м² каждые четыре недели.

26. Применение по любому из пп. 1 или 3-25 или способ по любому из пп. 2-25, где молекулу антитела против TIM-3 применяют для лечения острого миелоидного лейкоза (AML) или миелодиспластического синдрома (MDS).

27. Применение по любому из пп. 1 или 3-26 или способ по любому из пп. 2-26, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с ингибитором PD-L1.

28. Применение по п. 27 или способ по п. 27, где ингибитор PD-L1 выбран из FAZ053, атезолизумаба, авелумаба, дурвалумаба или BMS-936559.

29. Применение по любому из пп. 1 или 3-28 или способ по любому из пп. 2-28, где молекулу антитела против TIM-3 применяют для лечения рака яичника.

30. Применение по п. 29 или способ по п. 29, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, и необязательно, дополнительно в комбинации с одним или несколькими из: ингибитора VEGF, интерферона-гамма, агониста CD27, ингибитора IDO, ингибитора CTLA-4, ингибитора CSF1R, агониста OX40 или ингибитора KIR, химиотерапии, ингибитора DNMT, ингибитора рецепторной тирозинкиназы, ингибитора BTK, ингибитора PARP, иммуноконъюгата, нацеленного на FOLR1, или ингибитора B7-H3.

31. Применение по п. 29 или 30 или способ по п. 29 или 30, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1 и необязательно, дополнительно в комбинации с одним или несколькими из: ингибитора ANG2/VEGF, ингибитора CSF1R, химиотерапии, ингибитора CTLA-4, ингибитора PARP, ингибитора VEGF, противораковой вакцины, агониста TLR8, ингибитора HDAC или ингибитора FAK.

32. Применение по любому из пп. 29-31 или способ по любому из пп. 29-31, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с одним или несколькими из: агониста TLR8, химиотерапевтического средства, агониста OX40, ингибитора CSF1R, ингибитора VEGF, ингибитора NKG2, ингибитора B7-H3, ингибитора CTLA-4, рекомбинантного интерлейкина-10, агониста CD40, ингибитора ANG2/VEGF, молекулы, нацеленной как на B7-H3, так и на CD3, ингибитора PD-L1/VISTA, ингибитора IDO, вакцины, ингибитора CEACAM, ингибитора PARP, гормона или ингибитора MIF.

33. Применение по любому из пп. 1 или 3-28 или способ по любому из пп. 2-28, где молекулу антитела против TIM-3 применяют для лечения карциномы из клеток Меркеля.

34. Применение по п. 33 или способ по п. 33, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-1.

35. Применение по п. 33 или 34 или способ по п. 33 или 34, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против CTLA-4.

36. Применение по любому из пп. 33-35 или способ по любому из пп. 33-35, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, необязательно, дополнительно в комбинации с одним или несколькими из: локализованной радиотерапии, рекомбинантного интерферона-бета, специфической для MCPyV TAg поликлональной аутологичной CD8-положительной T-клеточной вакцины, ингибитора VEGF или иммуностимулятора.

37. Применение по любому из пп. 33-36 или способ по любому из пп. 33-36, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с полученным способом генной инженерии онколитическим вирусом или радиотерапией.

38. Применение по любому из пп. 1 или 3-28 или способ по любому из пп. 2-28, где молекулу антитела против TIM-3 применяют для лечения мелкоклеточного рака легких (SCLC).

39. Применение по п. 38 или способ по п. 38, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, необязательно, в комбинации с одним или несколькими из: химиотерапевтического средства, интерферона-гамма, ингибитора CTLA-4, конъюгата антитело-лекарственное средство, ингибитора CXCR4, агониста OX40, слитого белка или радиотерапии.

40. Применение по п. 38 или 39 или способ по п. 38 или 39, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-L1, необязательно, в комбинации с одним или несколькими из: химиотерапевтического средства, интерферона-гамма, ингибитора CTLA-4, конъюгата антитело-лекарственное средство, ингибитора CXCR4, агониста OX40, ингибитора PARP или радиотерапии.

41. Применение по любому из пп. 38-40 или способ по любому из пп. 38-40, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с агонистом OX40, ингибитором CTLA-4 или обоими.

42. Применение по любому из пп. 1 или 3-28 или способ по любому из пп. 2-28, где молекулу антитела против TIM-3 применяют для лечения мезотелиомы.

43. Применение по п. 42 или способ по п. 42, где молекулу антитела против TIM-3 применяют в комбинации с молекулой антитела против PD-1, молекулой антитела против PD-L1 или обеими.

44. Применение по любому из пп. 1 или 3-43 или способ по любому из пп. 2-43, где субъект имеет или идентифицирован как имеющий экспрессию TIM-3 в инфильтрующих опухоль лимфоцитах (TIL).

45. Применение по любому из пп. 1 или 3-44 или способ по любому из пп. 2-44, где субъект имеет или идентифицирован как имеющий злокачественную опухоль, экспрессирующую PD-L1.

46. Применение фармацевтической композиции, содержащей молекулу антитела против TIM-3 в дозе приблизительно 400 мг один раз в каждые две недели или приблизительно 800 мг один раз в каждые четыре недели для лечения злокачественной опухоли,

47. Применение по п. 46, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 802 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и VL, содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812.

48. Применение по п. 46 или 47, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 806, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 816.

49. Применение по любому из пп. 46-48, где молекула антитела содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 808, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 818.

50. Применение по п. 46, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность VHCDR1 из SEQ ID NO: 801, аминокислотную последовательность VHCDR2 из SEQ ID NO: 820 и аминокислотную последовательность VHCDR3 из SEQ ID NO: 803; и VL, содержащую аминокислотную последовательность VLCDR1 из SEQ ID NO: 810, аминокислотную последовательность VLCDR2 из SEQ ID NO: 811 и аминокислотную последовательность VLCDR3 из SEQ ID NO: 812.

51. Применение по п. 46 или 50, где молекула антитела содержит VH, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 822, и VL, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 826.

52. Применение по любому из пп. 46, 50 или 51, где молекула антитела содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 824, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 828.

53. Применение по любому из пп. 46-52, где злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль или гематологическую злокачественную опухоль.

54. Применение по любому из пп. 46-53, где злокачественная опухоль выбрана из рака яичника, рака легких, мезотелиомы, рака кожи, рака почки, рака мочевого пузыря, саркомы мягких тканей, злокачественной опухоли кости, колоректального рака, рака поджелудочной железы, злокачественной опухоли носоглотки, рака молочной железы, злокачественной опухоли двенадцатиперстной кишки, рака эндометрия, аденокарциномы, рака печени, холангиокарциномы, миелодиспластического синдрома (MDS), саркомы, лейкоза или очага метастазирования злокачественной опухоли.