RU2762616C1 - Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2 - Google Patents

Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2 Download PDF

Info

Publication number
RU2762616C1
RU2762616C1 RU2021127790A RU2021127790A RU2762616C1 RU 2762616 C1 RU2762616 C1 RU 2762616C1 RU 2021127790 A RU2021127790 A RU 2021127790A RU 2021127790 A RU2021127790 A RU 2021127790A RU 2762616 C1 RU2762616 C1 RU 2762616C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sars
cov
lymphocytes
protein
virus
Prior art date
Application number
RU2021127790A
Other languages
English (en)
Inventor
Анна Павловна Топтыгина
Original Assignee
Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека filed Critical Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Priority to RU2021127790A priority Critical patent/RU2762616C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2762616C1 publication Critical patent/RU2762616C1/ru

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61BDIAGNOSIS; SURGERY; IDENTIFICATION
    • A61B5/00Measuring for diagnostic purposes; Identification of persons
    • A61B5/145Measuring characteristics of blood in vivo, e.g. gas concentration, pH value; Measuring characteristics of body fluids or tissues, e.g. interstitial fluid, cerebral tissue
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/531Production of immunochemical test materials
    • G01N33/532Production of labelled immunochemicals
    • G01N33/533Production of labelled immunochemicals with fluorescent label
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/577Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor involving monoclonal antibodies binding reaction mechanisms characterised by the use of monoclonal antibodies; monoclonal antibodies per se are classified with their corresponding antigens

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Surgery (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области медицинской иммунологии и предназначено для определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2. Выделенные из крови пациента мононуклеары инкубируют в лунках 96-луночного планшета, на дне которых сорбирован полноразмерный S-белок, в качестве опытной пробы. На проточном цитофлюорометре осуществляют регистрацию процента субпопуляции дважды позитивных Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в контрольной и опытной пробе. Из полученного значения процента Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в опытной пробе вычитают значение процента Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в контрольной пробе и полученную разницу процентов сравнивают со значением cut off, равным 0,765%. Если полученная разница превышает 0,765%, судят о наличии у пациента специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2 в количестве, равном полученной разнице. Если полученная разница составляет менее 0,765%, судят об отсутствии у пациента специфического клеточного иммунитета. Изобретение позволяет количественно определить клеточный компонент иммунной защиты против коронавируса SARS-COV-2 как у переболевших COVID-19, так и у привитых людей. 1 ил., 1 табл., 1 пр.

Description

Изобретение относится к медицинской иммунологии, а именно к способам определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета.
Изобретение может быть использовано в медицине для определения специфического клеточного иммунного ответа к S-белку вируса SARS-COV-2 и его количественной оценки у переболевших COVID-19 и привитых от этой инфекции людей.
Специфический противовирусный иммунный ответ осуществляется за счет двух основных механизмов: гуморального, представленного вируснейтрализующими антителами, и клеточного, осуществляемого специфическими CD8+ цитотоксическими Т-лимфоцитами. При этом антитела играют вспомогательную роль, поскольку они могут связывать вирус только во внеклеточном пространстве - кровь, лимфа, тканевая жидкость и т.д., тогда как жизненный цикл вируса происходит внутриклеточно. Именно специфические CD8+ цитотоксические Т-лимфоциты способны распознать клетки, зараженные вирусом и уничтожить их вместе с размножающимся в них вирусом. Другая часть Т-лимфоцитов - специфические CD4+ хелперы помогают и организовывают гармоничность работы разных звеньев иммунного ответа. Для измерения уровня антител используется общепризнанный стандартный метод иммуноферментного анализа, существующий в нескольких модификациях. В то же время, для оценки специфического клеточного иммунитета нет такого стандартного метода.
Суть имеющихся подходов к определению специфического клеточного иммунитета сводится к выделению мононуклеаров периферической крови исследуемого донора, в состав которых входят лимфоциты и моноциты, и добавление в культуру этих клеток антигенов изучаемого вируса. После инкубации необходимо определить количество ответивших на антиген вируса клеток. Для этого определения используют разные способы. Так, например, используют метод тетрамеров - специальных конструкций, несущих HLA в комплексе с антигенным пептидом вируса, меченных флюорохромом [1]. Недостатком метода является то, что система HLA очень гетерогенна, при этом разработаны всего несколько вариантов тетрамеров, поэтому невозможно использовать этот подход для широкого, тем более популяционного исследования клеточного иммунитета. Метод тетрамеров подходит только для научных исследований небольших групп, специально отобранных доноров, идентичных по 3-5 вариантам HLA. Кроме того, создание тетрамеров весьма трудоемкое и дорогое дело.
Другим методом оценки специфического распознавания Т-лимфоцитами антигена является продукция интерферона-γ (IFN-γ). Этот цитокин участвует в организации противовирусного иммунного ответа. Используют методы оценки продукции IFN-γ Т-лимфоцитами в культуре в присутствии вирусного антигена (оценка качественная: да/нет, т.к. количественно продукция IFN-γ зависит от индивидуальных особенностей каждою человека), метод внутриклеточного окрашивания IFN-γ с последующим подсчетом процента ответивших клеток на проточном цитометре [2]. Этот метод позволяет количественно измерить клеточный ответ и выделить ответ именно CD8+ лимфоцитов. Однако данный метод требует процедуры пермеабелизации клеток и серии отмывок, в результате чего изрядная часть клеток теряется, что может приводить к неточным результатам. Достаточно распространен метод оценки продукции IFN-γ ELISpot, позволяющий подсчитать количество лимфоцитов, продуцирующих IFN-γ в ответ на распознавание вирусного антигена [3,4]. Все эти методы имеют ограничение, связанное с тем, что IFN-γ продуцируют и натуральные киллеры, и CD4+, и CD8+ лимфоциты.
Существуют методы выделения, например, только CD8+ лимфоцитов, но для этого требуется большой объем крови (порядка 20 мл на каждый антиген) и дополнительные достаточно дорогие импортные реактивы. Кроме того, метод ELISpot требует дорогостоящих импортных тест-систем (отечественных аналогов нет) и специализированного дорогостоящего оборудования, которое имеется в наличии только в нескольких лабораториях нашей страны. Важно, что сам IFN-γ лишь участвует в организации противовирусного клеточного иммунитета, но не является цитотоксическим веществом, поэтому может лишь косвенно свидетельствовать о наличии специфического клеточного цитотоксического иммунитета.
Для оценки активации Т-лимфоцитов используют также экспрессию маркера CD69 на поверхности распознавших антиген клеток [5]. Этот маркер появляется па поверхности только активированных клеток. С помощью проточной цитометрии можно подсчитать процент таких клеток и именно CD8+ лимфоцитов. Недостатком этого метода оценки является то, что молекула CD69 появляется при распознавании антигена как на Т-клетках памяти, так и на наивных лимфоцитах, способных, в принципе, ответить на данный антиген, что затрудняет оценку количества именно клеток памяти. Кроме того, в пределах популяции CD8+ есть центральные клетки памяти, помнящие образ врага, для активации которых типична экспрессия CD69, и клетки - эффекторы, которые, собственно, и осуществляют цитотоксические реакции для защиты от вируса и не экспрессируют CD69. Данный метод не позволяет определить их количество.
Известно, что цитотоксические CD8+ лимфоциты имеют гранулы, нагруженные цитотоксическими веществами. На внутренней поверхности мембран этих гранул экспрессирована молекула CD107a. В покое эта молекула отсутствует на внешней мембране клетки. При специфическом распознавании комплекса HLA-антигенный пептид, цитотоксические CD8+ лимфоциты активируются и атакуют, выбрасывая содержимое цитотоксических гранул. При этом мембрана цитотоксической гранулы сливается с внешней мембраной цитотоксического CD8+ лимфоцита и на его поверхности па некоторое время появляются молекулы CD107a. Этот эффект легко зафиксировать с помощью флюоресцентно меченых моноклональных антител с последующим подсчетом CD107a+ цитотоксических CD8+ лимфоцитов на проточном цитометре. Поэтому экспрессия CD107a на поверхности цитотоксических CD8+ лимфоцитов после инкубации с антигеном может быть использована в качестве способа оценки и количественного подсчета специфического клеточного иммунитета.
В качестве аналога предлагаемого метода можно рассматривать статью O.-W.Ng et al. [6], в которой изучали клеточный иммунитет к вирусу SARS, эпидемия которого случилась в 2003 г. Авторами было показано, что клеточный иммунитет к вирусу SARS сохранялся более 10 лет после инфекции, тогда как антитела к этому вирусу не определялись уже после 3 лет. В отличие от нашего метода, стимуляцию цитотоксических лимфоцитов проводили синтетическими пептидами, аналогичными по своей структуре пептидам различных белков вируса SARS. Такой способ стимуляции интересен с научной точки зрения, но имеет тот недостаток, что все люди различаются по молекулам HLA, которые презентируют антигенные пептиды для распознавания цитотоксическими CD8+ лимфоцитами. Один и тот же пептид может успешно встраиваться в молекулу HLA одного варианта и не укладываться в молекулу другого варианта. Кроме того, в обсуждаемой работе использовали пептиды разных белков вируса SARS, что обосновано в случае научного исследования клеточного иммунитета после заболевания, но не подходит для оценки поствакцинального иммунитета.
В качестве прототипа выбран патент РФ №2464571 [7].
Способ предусматривает инкубацию суспензии выделенных из крови мононуклеаров, 10 мкМ моненсина, меченных флюорохромом моноклональных антител к CD107a и индукторов дегрануляции цитотоксических Т-лимфоцитов - вирусов кори или краснухи в полной культуральной среде RPMI-1640 с добавлением 2 мМ L-глутамина, гентамицина и 10% эмбриональной телячьей сыворотки в течение 15 часов при 37°С в атмосфере 5% CO2 и 100% влажности. После инкубации осуществляют окрашивание Т-лимфоцитов меченными флюорохромом антителами к CD8 и регистрацию на проточном цитофлюорометре субпопуляции Т-лимфоцитов, экспрессирующих CD8hiqh и CD107a. Различия состоят в том, что в указанном патенте стимуляцию проводили белками вирусов кори и краснухи, а в заявленном способе использован S-белок вируса SARS-COV-2. Кроме того, в прототипе антигенные белки вирусов добавлялись в культуру клеток в растворе, тогда как в нашей разработке S-белок был сорбирован на дно лунок 96-луночного планшета.
Технической проблемой, решаемой изобретением, является разработка простого и удобного способа определения и оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка коронавируса SARS-COV-2, позволяющего количественно определять специфический клеточный компонент иммунного ответа как у переболевших COVID-19, так и у привитых.
Поставленная задача достигается путем разработки способа определения и оценки специфического клеточного иммунного ответа на S-белок коронавируса SARS-COV-2 на основании экспрессии молекул CD107a на поверхности распознавших антигены S-белка коронавируса SARS-COV-2 CD8+ цитотоксических Т-лимфоцитов, определяемой методом проточной цитометрии.
Изначально не было ясно, можно ли использовать для стимуляции лимфоцитов S-антиген, сорбированный на дне лунки 96-луночного планшета. Расчет был сделан на то, что моноциты при культивировании прикрепляются к дну лунки и перемещаются по нему, собирая и поглощая все, что находят. Также не было понятно, какой срок инкубации будет достаточным для того, чтобы моноциты поглотили сорбированный антигенный S-белок, спроцессировали его, презентировали полученные пептиды в комплексе HLA, a CD8+ цитотоксические лимфоциты распознали этот комплекс, активировались и выбросили цитотоксические гранулы. Проведенные предварительные исследования показали, что можно использовать полноразмерный S-белок вируса SARS-COV-2, сорбированный на дне лунок в качестве антигена для стимуляции лимфоцитов. Присутствующие в выделенной фракции мононуклеаров периферической крови моноциты способны поглощать S-белок, сорбированный на дне лунок, процессировать его и презентировать полученные пептиды в комплексе HLA. При этом у каждого человека будут презентированы пептиды, оптимально подходящие именно для его комплекса HLA. Было отработано оптимальное время инкубации (20 часов) для проявления реакции распознавания CD8+ лимфоцитами антигенов S-белка коронавируса. Преимуществом заявленного способа оценки специфического клеточного иммунитета к вирусу SARS-COV-2 является то, что нет необходимости закупать антигенный S-белок, тем более, что его не продают, а можно использовать лунки 96-луночного планшета от набора для определения антител к S-белку вируса SARS-COV-2 методом ИФА, в которых на дно лунок сорбирован полноразмерный S-белок, согласно инструкции производителя. Использован набор «SARS-CoV-2-IgG-ИФА-БЕСТ» (АО Вектор-Бест, Новосибирск РФ).
Технический результат заключается в том, что заявленный способ определения и оценки специфического клеточного иммунного ответа на S-белок коронавируса SARS-COV-2, осуществляемый на основании выявления экспрессии CD107a на поверхности распознающих антигены S-белка коронавируса SARS-COV-2 CD8+ Т-лимфоцитов, позволяет количественно определить клеточный компонент иммунной защиты против коронавируса SARS-COV-2 как у переболевших COVID-19, так и у привитых людей. Разработанный способ оценки специфического клеточного иммунного ответа на S-белок коронавируса SARS-COV-2 позволяет не только подтвердить наличие клеточного компонента иммунной защиты от вируса SARS-COV-2 в дополнение к специфическим антителам, которые рутинно определяются методом ИФА, но и в случае отсутствия таких антител решить вопрос, болел ли данный человек COVID-19, имеется ли у него клеточный иммунитет к коронавирусу SARS-COV-2. При этом предложенный метод позволяет оценить процент именно цитотоксических Т-лимфоцитов, специфически распознающих антигены S-белка коронавируса SARS-COV-2 и уничтожающих клетки, зараженные вирусом SARS-COV-2, а не вообще клетки, способные распознать антигены S-белка, как это происходит при других методах оценки.
Данный способ позволяет с чувствительностью 93,75% и специфичностью 100% выявить специфический клеточный иммунный ответ на антигены S-белка коронавируса SARS-CoV-2.
Сущность изобретения заключается в следующем:
Для определения специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка коронавируса SARS-COV-2 были сформированы 3 группы обследованных. В группу 1 вошли 15 человек, переболевших COVID-19 с подтвержденным диагнозом методом ПЦР. Давность заболевания составила от 2 до 6 месяцев. В группу 2 вошли 16 человек, прошедших двукратную вакцинацию вакциной Спутник V и предоставившие стандартный сертификат о вакцинации. От второй прививки до момента исследования прошло 2-3 месяца. Группу 3 составили 12 человек, не болевших COVID-19, не имевших антител к антигенам вируса SARS-COV-2 и не прививавшихся от коронавируса (контрольная группа). Кровь для анализа получали из локтевой вены в вакуумные пробирки с напылением гепарина. Фракцию мононуклеаров периферической крови выделяли методом градиентного центрифугирования в стерильных условиях и отмывали от тромбоцитов центрифугированием при 600g 10 мин в 8 мл среды RPMI-1640. Отмытые клетки ресуспендировали в 1 мл среды RPMI-1640 с добавлением 2 мМ L-глютамина, гентамицина и 10% эмбриональной телячьей сыворотки. В лунку плоскодонного стерильного 96-луночного планшета вносили суспензию мононуклеаров (3x105 на лунку), раствор моненсина в конечной концентрации К) мкМ и моноклональные антитела к антигену CD107a-PE-Су5 в конечном разведении 1:100 (контрольная проба). Для опытной пробы использовали лунки 96-луночного планшета от набора для определения антител к S-белку вируса SARS-COV-2 методом ИФА, в которых на дно лунок сорбирован полноразмерный S-белок, согласно инструкции производителя. Использован набор «SARS-CoV-2-IgG-HOA-BECT» (АО Вектор-Бест, Новосибирск РФ). Поскольку лунки набора для ИФА не стерильны, перед постановкой эксперимента они были простерилизованы с помощью ультрафиолетового облучения в стерильных условиях в течение 30 минут После стерилизации в лунку вносили так же суспензию мононуклеаров (3x103 на лунку), раствор моненсина в конечной концентрации 10 мкМ и моноклональные антитела к антигену CD107a-PE-Су5 в конечном разведении 1:100, как и в контроле. Далее контрольные и опытные пробы инкубировали 20 часов при 37°С во влажной атмосфере и 5% CO2. По окончании инкубации клетки ресуспендировали, переносили в пробирки типа эппендорф и отмывали центрифугированием (300g 3 мин) в забуференном фосфатами физиологическом растворе с добавлением 0,02% азида натрия и 0,02% Na2-ЭДТА. Супернатант аккуратно отбирали пипеткой, а клетки окрашивали антителами к антигену CD8-FITC 20 минут в темноте при 4°С, затем повторно отмывали центрифугированием при тех же условиях, добавляли CellWash раствор для цитометрии и ресуспендировали. Полученную суспензию клеток анализировали на проточном цитометре. Для такого анализа подходит любой проточный цитометр, мы использовали BD FACS Canto II (технологии и программное обеспечение Becton Dickinson, США). Подсчитывали в каждой пробе 50 тысяч клеток, поскольку количество специфических цитотоксических лимфоцитов к каждой инфекции невелико. Для анализа выделяли лимфоидный гейт, в нем в режиме FITC-SSS выделяли гейт лимфоцитов, высоко экспрессирующих антиген CD8 (CD8high) - это субпопуляция цитотоксических Т-лимфоцитов. Далее на графике CD107a-PE-Су5 против CD8-FITC регистрировали облако дважды положительных клеток. Полученное число отражает процент цитотоксических лимфоцитов, распознавших антигены S-белка коронавируса и ответивших атакой (цитотоксической реакцией, заключающейся в выделении содержимого цитотоксических гранул) относительно общего количества CD8+ цитотоксических Т-лимфоцитов. Поскольку пребывание клеток в условиях культивирования может вызывать небольшую спонтанную активацию лимфоцитов, для нивелирования этого эффекта из результата, полученного в опытной лунке, вычитали соответствующий результат в контроле.
Для выяснения информативности предложенного метода оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам коронавируса SARS-CoV-2, был проведен ROC-анализ полученных данных - метод построения операционных характеристических кривых (Receiver Operating Characteristic curve, сокращенно ROC-кривых), позволяющих оценить диагностическую эффективность метода. Была продемонстрирована высокая вероятность правильного разделения группы переболевших CoVID-19 и привитых против этой инфекции от здоровых людей контрольной группы. Площадь под ROC-кривой (AUC) составила 0,992 (0,975-1,009), (р<0,05) (Фиг. 1).
Далее был произведен расчет уровня порогового значения (cut off) для критерия экспрессии антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах в ответ на индукцию антигенами S-белка вируса SARS-CoV-2 за вычетом показателя спонтанной экспрессии этого антигена. В результате был получен уровень cut-off=0,765%, который с чувствительностью 93,75% и специфичностью 100% позволяет выявить специфический клеточный иммунитет на антигены S-белка вируса SARS-CoV-2.
Таким образом, если у обследуемого человека рассчитанный критерий (процент экспрессии антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах в ответ на индукцию антигенами S-белка вируса SARS-CoV-2 за вычетом спонтанной экспрессии этого антигена) превышает уровень cut off (0,765%), то данный человек имеет специфический клеточный иммунитет на антигены S-белка вируса SARS-CoV-2. Чем больше полученное число, тем выше клеточный иммунитет к коронавирусу. Дополнительным критерием правильности выполненного теста является то, что уровень спонтанной экспрессии антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах не превышает 1%.
Осуществление способа изобретения поясняется на следующем примере.
Пример. В качестве примера в Таблице 1 приведены результаты измерения уровней экспрессии антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах (спонтанный и индуцированный антигенами S-белка вируса SARS-CoV-2) у 10-и человек с неизвестным анамнезом относительно вируса SARS-CoV-2.
Figure 00000001
Во всех приведенных случаях спонтанный уровень экспрессии антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах не превышает 1%, что свидетельствует о правильности проведенной оценки.
Используя значение порогового критерия 0,765% для оценки полученной разницы между индуцированной и спонтанной экспрессией антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах (правая колонка таблицы), находим, что пациенты под номером 1-6 и 8 имеют значения этого показателя выше значения cut off, что свидетельствует о наличии специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-CoV-2. При этом, чем выше полученное значение рассчитанного показателя (правая колонка таблицы), тем более выражен специфический клеточный иммунитет к антигенам S-белка вируса SARS-CoV-2. Так у людей под номером 2, 4, 5 и 6 выявлен высокий уровень специфического клеточного иммунитета к коронавирусу, у людей под номером 1 и 3 - средний уровень, у человека под номером 8 -невысокий, но положительный уровень специфического клеточного иммунного ответа на коронавирус. В то же время, у людей №7,9 и 10 рассчитанный показатель оказался ниже значения cut off=0,765%), что говорит об отсутствии у данных людей специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-CoV-2.
Таким образом, используя предложенный нами способ, по уровню индуцированной антигенами S-белка вируса SARS-CoV-2 экспрессии антигена CD107a на CD8high Т-лимфоцитах за вычетом спонтанного уровня экспрессии антигена CD107a, можно выявлять наличие и количественно оценивать специфический клеточный иммунитет к антигенам S-белка вируса SARS-CoV-2. Рассчитанный пороговый критерий (cut off=0,765%) позволяет с чувствительностью 93,75% и специфичностью 100% разделять людей имеющих и не имеющих специфический клеточный иммунитет к антигенам S-белка вируса SARS-CoV-2. Метод прост в исполнении и позволяет получать количественные результаты на следующий день после взятия крови на анализ.
ЛИТЕРАТУРА
1. Kared Н., Redd А.D., Bloch E.M., Bonny T.S., Sumatoh H., Kairi F., Carbajo D., Abel В., Newell E.W., Bettinotti M.P., Benner S.E., Patel E.U., Littlefield K.,
Laeyendecker O., Shoham S., Sullivan D., Casadevall A., Pekosz A., Nardin A., Fehlings M, Tobian A.A.R., Quinn Т.C. SARS-CoV-2-specific CD8+ T cell responses in convalescent COVID-19 individuals J Clin Invest. 2021; 131(5):e 145476. https://doi.org/10.1172/JCI145476.
2. Wang F., Hou H, Luo Y., Tang G., Wu S., Huang M, Liu W., Zhu Y, Lin Q., Mao L., Fang M., Zhang H., Sun Z. The laboratory tests and host immunity of COVID-19 patients with different severity of illness. JCI Insight. 2020;5(10):e137799. https://doi.org/l 0.1172/jci.insight.137799.
3. Ni L., Ye F, Cheng M.-L, Feng Y, Deng Y.-Q., Zhao H., Wei P., Ge J., Gou M., Li X., Sun L., Cao T, Wang P., Zhou C., Zhang R., Liang P., Guo H., Wang X., Qin C.-F, Chen F., Dong C. Detection of SARS-CoV-2-Specific Humoral and Cellular Immunity in COVID-19 Convalescent Individuals. Immunity 52, 971-977, https://doi.org/10.1016/j.immuni. 2020.04.023.
4. Cassaniti I., Percivalle E., Bergami F., Piralla A., Comolli G., Bruno R., Vecchia M., Sambo M., Colaneri M., Zuccaro V, Benazzo M., Robotti C, Calastri A., Maiorano E., Ferrari A., Cambi G., Baldanti F. SARS-CoV-2 specific T-cell immunity in COVID-19 convalescent patients and unexposed controls measured by ex vivo ELISpot assay, Clinical Microbiology and Infection, https://doi.org/10.1016/j.cmi.2021.03.010.
5. Бочкарева С.С., Караулов А.В., Алешкин А.В., Новикова Л.И., Федорова И.М., Бляхер М.С., Котелева С.И., Капустин И.В.//Методические подходы к оценке некоторых параметров гуморального и клеточного иммунного ответа на бактериофаги/ Клиническая лабораторная диагностика. - 2019. - т.64. -№4. - С.237 - 242. DOI: 10.18821 /0869-2084-2019-64-4-237-242.
6. Ng O.-W., Chia A., Tan A.T., Jadi R.S., Leong H.N., Bertoletti A., Tan Y.-J. Memory T cell responses targeting the SARS coronavirus persist up to 11 years post-infection Vaccine 34 (2016) 2008-2014 http://dx.doi.org/10.1016/j.vaccine.2016.02.063.
7. Патент 2464571 Российская Федерация МПК G01N 33/533. Способ определения специфического клеточного иммунного ответа к антигенам вируса кори и краснухи. /Топтыгина А.П., Алешкин В.А., заявитель и патентообладатель ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора (RU)/ - №2011124362/10; заявл 17.06.11 опубл. 20.10.2012. Бюл. 29 - 7 с.: с ил.

Claims (1)

  1. Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2, отличающийся тем, что выделенные из крови пациента мононуклеары инкубируют в присутствии 10 мкМ моненсина, меченных флюорохромом моноклональных антител к антигену CD107a в полной культуральной среде RPMI-1640 с добавлением 2 мМ L-глутамина, гентамицина и 10% эмбриональной телячьей сыворотки в течение 20 часов при 37°С в атмосфере 5% СО2 и 100% влажности в лунках 96-луночного планшета в качестве контрольной пробы и в лунках 96-луночного планшета от набора для определения антител к S-белку вируса SARS-COV-2 методом ИФА, в которых на дно лунок сорбирован полноразмерный S-белок, в качестве опытной пробы; затем осуществляют последующее окрашивание лимфоцитов меченными флюорохромом антителами к CD8 и регистрацию на проточном цитофлюорометре процента субпопуляции дважды позитивных Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в контрольной и опытной пробе; после чего из полученного значения процента Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в опытной пробе вычитают значение процента Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в контрольной пробе и полученную разницу процентов Т-лимфоцитов CD8hiqhCD107a+ в опытной и контрольной пробе сравнивают со значением cut off, равным 0,765%; при этом, если полученная разница превышает 0,765%, это свидетельствует о наличии у пациента специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2 в количестве, равном полученной разнице, а если полученная разница составляет менее 0,765%, это свидетельствует об отсутствии у пациента специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2.
RU2021127790A 2021-09-22 2021-09-22 Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2 RU2762616C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2021127790A RU2762616C1 (ru) 2021-09-22 2021-09-22 Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2021127790A RU2762616C1 (ru) 2021-09-22 2021-09-22 Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2762616C1 true RU2762616C1 (ru) 2021-12-21

Family

ID=80039351

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2021127790A RU2762616C1 (ru) 2021-09-22 2021-09-22 Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2762616C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2818080C1 (ru) * 2023-09-22 2024-04-24 Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам N-белка вируса SARS-COV-2

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2464571C1 (ru) * 2011-06-17 2012-10-20 Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека Способ определения специфического клеточного иммунного ответа к антигенам вируса кори и краснухи
WO2021163398A1 (en) * 2020-02-14 2021-08-19 Epivax, Inc. T cell epitope clusters and related compositions useful in the prevention, diagnosis, and treatment of covid-19

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2464571C1 (ru) * 2011-06-17 2012-10-20 Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека Способ определения специфического клеточного иммунного ответа к антигенам вируса кори и краснухи
WO2021163398A1 (en) * 2020-02-14 2021-08-19 Epivax, Inc. T cell epitope clusters and related compositions useful in the prevention, diagnosis, and treatment of covid-19

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
PELUSO M.J. et al. Long-term SARS-CoV-2-specific immune and inflammatory responses in individuals recovering from COVID-19 with and without post-acute symptoms. Cell Rep. 2021 Aug 10; 36(6): 109518. *
БУРБЕЛЛО А.Т. и др. Современные лекарственные средства: Клинико-фармакологический справочник практического врача (2-е издание, переработанное и дополненное) - СПб.: Издательский дом "Нева"; М.: Издательство "ОЛМА-ПРЕСС Звездный мир", 2003. - 864 с.. *
БУРБЕЛЛО А.Т. и др. Современные лекарственные средства: Клинико-фармакологический справочник практического врача (2-е издание, переработанное и дополненное) - СПб.: Издательский дом "Нева"; М.: Издательство "ОЛМА-ПРЕСС Звездный мир", 2003. - 864 с.. Современная фармацевтика: теория, практика, эксперименты: сборник материалов международной научной конференции. Россия, г. Москва, 26-28 ноября 2014 г./ под. ред. проф. Д.Ф. Нохрина. - Киров: МЦНИП, 2014. - 54 с.. Современная медицина: традиции и инновации. Сборник научных статей Петрозаводского государственного университета/ под. ред. проф. А.Н. Полторака, проф. А.Т. Балашова, проф. Т.О. Волковой. - Киров: МЦНИП, 2013. - 274 с.. PELUSO M.J. et al. Long-term SARS-CoV-2-specific immune and inflammatory responses in individuals recovering from COVID-19 with and without post-acute symptoms. Cell Rep. 2021 Aug 10; 36(6): 109518. *
Современная медицина: традиции и инновации. Сборник научных статей Петрозаводского государственного университета/ под. ред. проф. А.Н. Полторака, проф. А.Т. Балашова, проф. Т.О. Волковой. - Киров: МЦНИП, 2013. - 274 с.. *
Современная фармацевтика: теория, практика, эксперименты: сборник материалов международной научной конференции. Россия, г. Москва, 26-28 ноября 2014 г./ под. ред. проф. Д.Ф. Нохрина. - Киров: МЦНИП, 2014. - 54 с.. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2818080C1 (ru) * 2023-09-22 2024-04-24 Федеральное бюджетное учреждение науки "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам N-белка вируса SARS-COV-2

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2261658T3 (en) IP-10-time based infection diagnosis
LaVergne et al. Ebola-Specific CD8+ and CD4+ T-Cell responses in sierra leonean ebola virus survivors with or without post-ebola sequelae
US20150204885A1 (en) Method for the direct detection of mycobacterium tuberculosis
Kijlstra The value of laboratory testing in uveitis
CN109991417B (zh) 一种结核病的免疫标志物及应用
Adamo et al. Memory profiles distinguish cross-reactive and virus-specific T cell immunity to mpox
RU2762616C1 (ru) Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам S-белка вируса SARS-COV-2
JP6272820B2 (ja) Hiv特異的t細胞応答のモニタリング方法
CN111443208B (zh) 鉴别活动性结核病和潜伏性结核病的组合物
Mysore et al. Protective heterologous T cell immunity in COVID-19 induced by MMR and Tdap vaccine antigens
ES2715526T3 (es) Método para la detección de células inmunitarias específicas de antígeno en líquidos extrasanguíneos
RU2818080C1 (ru) Способ определения и количественной оценки специфического клеточного иммунитета к антигенам N-белка вируса SARS-COV-2
CN114121162A (zh) 一种关于免疫力评估的方法
US9678071B2 (en) Detecting latent tuberculosis infections
Shokouhi et al. Diagnostic value of the leukocyte esterase test for early detection of pleocytosis in cerebrospinal fluid of patients with suspected acute bacterial meningitis
US7169571B2 (en) Methods for measurement of lymphocyte function
RU2754340C1 (ru) Тест-система и способ дифференцированного выявления антител к SARS-CoV-2
Rivas et al. Prospective evaluation of latent tuberculosis with interferon-γ release assays in drug and alcohol abusers
RU2431675C1 (ru) Способ получения антигенного препарата из mycobacterium tuberculosis с расширенным спектром серопозитивных фракций в реакции иммуноблотинга
US20180120330A1 (en) Pre-symptomatic diagnosis of a viral illness
RU2251701C1 (ru) Способ диагностики стадий вич-инфекции
RU2695359C1 (ru) Способ дифференциальной диагностики менингитов у детей
Ikeda et al. Quantitative leukoviremia and immune complex-dissociated antigenemia as predictors of infection status in children born to mothers infected with human immunodeficiency virus type 1
Abdou et al. Seroprevalence and Serological Status of Cytomegalovirus Infection in Patients Received at the Medical Biology Laboratory of Pasteur Institute in Dakar from January 2018 to June 2020
KR20140127864A (ko) 림프조직 친화성 바이러스의 생존능 평가 방법