RU2742437C2 - Ацидофильные штаммы Fusarium oxysporum, способы их получения и способы их применения - Google Patents
Ацидофильные штаммы Fusarium oxysporum, способы их получения и способы их применения Download PDFInfo
- Publication number
- RU2742437C2 RU2742437C2 RU2017103673A RU2017103673A RU2742437C2 RU 2742437 C2 RU2742437 C2 RU 2742437C2 RU 2017103673 A RU2017103673 A RU 2017103673A RU 2017103673 A RU2017103673 A RU 2017103673A RU 2742437 C2 RU2742437 C2 RU 2742437C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- acid
- strain
- fusarium
- isolated
- fusarium oxysporum
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 178
- 241000223221 Fusarium oxysporum Species 0.000 title abstract description 131
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 187
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims abstract description 162
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 128
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 claims abstract description 74
- UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 5,8-dihydroxy-2-methoxy-6-methyl-7-(2-oxopropyl)naphthalene-1,4-dione Chemical compound CC1=C(CC(C)=O)C(O)=C2C(=O)C(OC)=CC(=O)C2=C1O UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 54
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 claims abstract description 48
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims abstract description 32
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims abstract description 31
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 claims abstract description 7
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims abstract 6
- 239000002551 biofuel Substances 0.000 claims description 106
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 claims description 77
- -1 hydrogen halides Chemical class 0.000 claims description 71
- 239000010902 straw Substances 0.000 claims description 65
- 239000002699 waste material Substances 0.000 claims description 61
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 claims description 53
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 claims description 53
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 50
- 239000000047 product Substances 0.000 claims description 50
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 claims description 48
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 45
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims description 45
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 39
- 230000012010 growth Effects 0.000 claims description 39
- 241000209140 Triticum Species 0.000 claims description 36
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 claims description 36
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 claims description 34
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 claims description 33
- 229920005610 lignin Polymers 0.000 claims description 29
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 28
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 claims description 28
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 claims description 28
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 claims description 28
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 25
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 claims description 25
- 239000008103 glucose Substances 0.000 claims description 25
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 25
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 24
- 239000002609 medium Substances 0.000 claims description 23
- 229920002488 Hemicellulose Polymers 0.000 claims description 21
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 claims description 19
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 claims description 19
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 19
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 19
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 claims description 16
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- UKMSUNONTOPOIO-UHFFFAOYSA-N docosanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O UKMSUNONTOPOIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- VKOBVWXKNCXXDE-UHFFFAOYSA-N icosanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O VKOBVWXKNCXXDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 claims description 11
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 239000002440 industrial waste Substances 0.000 claims description 11
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 claims description 11
- 239000008107 starch Substances 0.000 claims description 11
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 claims description 11
- 239000002535 acidifier Substances 0.000 claims description 10
- DTOSIQBPPRVQHS-PDBXOOCHSA-N alpha-linolenic acid Chemical compound CC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCCCCC(O)=O DTOSIQBPPRVQHS-PDBXOOCHSA-N 0.000 claims description 10
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid group Chemical group C(CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC)(=O)O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 claims description 10
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims description 10
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 claims description 10
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 claims description 9
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 9
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 150000004702 methyl esters Chemical class 0.000 claims description 9
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N palmitic acid group Chemical group C(CCCCCCCCCCCCCCC)(=O)O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 239000001814 pectin Substances 0.000 claims description 8
- 229920001277 pectin Polymers 0.000 claims description 8
- 235000010987 pectin Nutrition 0.000 claims description 8
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 claims description 7
- 235000020661 alpha-linolenic acid Nutrition 0.000 claims description 7
- 229960004488 linolenic acid Drugs 0.000 claims description 7
- XUDJZDNUVZHSKZ-UHFFFAOYSA-N methyl ester of tetracosanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC XUDJZDNUVZHSKZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 235000021357 Behenic acid Nutrition 0.000 claims description 6
- 229940116226 behenic acid Drugs 0.000 claims description 6
- ZAZKJZBWRNNLDS-UHFFFAOYSA-N methyl tetradecanoate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCC(=O)OC ZAZKJZBWRNNLDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-N methyl undecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCC(O)=O POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 235000021314 Palmitic acid Nutrition 0.000 claims description 5
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 claims description 5
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 claims description 5
- 239000002154 agricultural waste Substances 0.000 claims description 5
- 239000011785 micronutrient Substances 0.000 claims description 5
- 235000013369 micronutrients Nutrition 0.000 claims description 5
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 claims description 5
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- IZFGRAGOVZCUFB-CMDGGOBGSA-N Palmitelaidic acid methyl ester Chemical compound CCCCCC\C=C\CCCCCCCC(=O)OC IZFGRAGOVZCUFB-CMDGGOBGSA-N 0.000 claims description 4
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 235000015872 dietary supplement Nutrition 0.000 claims description 4
- KFEVDPWXEVUUMW-UHFFFAOYSA-N docosanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCCC1=CC=C(O)C=C1 KFEVDPWXEVUUMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims description 4
- KQQKGWQCNNTQJW-UHFFFAOYSA-N linolenic acid Natural products CC=CCCC=CCC=CCCCCCCCC(O)=O KQQKGWQCNNTQJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- PVVODBCDJBGMJL-CMDGGOBGSA-N methyl (e)-octadec-11-enoate Chemical compound CCCCCC\C=C\CCCCCCCCCC(=O)OC PVVODBCDJBGMJL-CMDGGOBGSA-N 0.000 claims description 4
- UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N triformin Chemical compound O=COCC(OC=O)COC=O UFTFJSFQGQCHQW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- OYHQOLUKZRVURQ-NTGFUMLPSA-N (9Z,12Z)-9,10,12,13-tetratritiooctadeca-9,12-dienoic acid Chemical compound C(CCCCCCC\C(=C(/C\C(=C(/CCCCC)\[3H])\[3H])\[3H])\[3H])(=O)O OYHQOLUKZRVURQ-NTGFUMLPSA-N 0.000 claims description 3
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 claims description 3
- HPEUJPJOZXNMSJ-UHFFFAOYSA-N Methyl stearate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC HPEUJPJOZXNMSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N benzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 claims description 3
- 229940108924 conjugated linoleic acid Drugs 0.000 claims description 3
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 claims description 3
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 3
- ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-N triflic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C(F)(F)F ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- RILZRCJGXSFXNE-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]ethanol Chemical compound OCCC1=CC=C(OC(F)(F)F)C=C1 RILZRCJGXSFXNE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- AXPAUZGVNGEWJD-UHFFFAOYSA-N 2-methylhexadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCC(C)C(O)=O AXPAUZGVNGEWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N Acrylic acid Chemical class OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 108010009736 Protein Hydrolysates Proteins 0.000 claims description 2
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229940092714 benzenesulfonic acid Drugs 0.000 claims description 2
- 150000001735 carboxylic acids Chemical class 0.000 claims description 2
- KRVSOGSZCMJSLX-UHFFFAOYSA-L chromic acid Substances O[Cr](O)(=O)=O KRVSOGSZCMJSLX-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 2
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M ethanesulfonate Chemical compound CCS([O-])(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 2
- UQSQSQZYBQSBJZ-UHFFFAOYSA-N fluorosulfonic acid Chemical compound OS(F)(=O)=O UQSQSQZYBQSBJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 claims description 2
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 2
- OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N linoleic acid Natural products CCCCC\C=C/C\C=C\CCCCCCCC(O)=O OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N 0.000 claims description 2
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 claims description 2
- WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N n-Pentadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229960002969 oleic acid Drugs 0.000 claims description 2
- PNGLEYLFMHGIQO-UHFFFAOYSA-M sodium;3-(n-ethyl-3-methoxyanilino)-2-hydroxypropane-1-sulfonate;dihydrate Chemical compound O.O.[Na+].[O-]S(=O)(=O)CC(O)CN(CC)C1=CC=CC(OC)=C1 PNGLEYLFMHGIQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 2
- 150000003460 sulfonic acids Chemical class 0.000 claims description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 claims 5
- OYHQOLUKZRVURQ-HZJYTTRNSA-N Linoleic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/CCCCCCCC(O)=O OYHQOLUKZRVURQ-HZJYTTRNSA-N 0.000 claims 1
- 150000001734 carboxylic acid salts Chemical class 0.000 claims 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 claims 1
- AWJWCTOOIBYHON-UHFFFAOYSA-N furo[3,4-b]pyrazine-5,7-dione Chemical compound C1=CN=C2C(=O)OC(=O)C2=N1 AWJWCTOOIBYHON-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 235000020778 linoleic acid Nutrition 0.000 claims 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 claims 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 abstract description 100
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 73
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 44
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 26
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 19
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 92
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 76
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 75
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 72
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 72
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 61
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 59
- 239000000589 Siderophore Substances 0.000 description 58
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 57
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N iron Substances [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 51
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 45
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 42
- 239000011572 manganese Substances 0.000 description 42
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 42
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 42
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 41
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 39
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 39
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 39
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 38
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 38
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 38
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 37
- 239000003225 biodiesel Substances 0.000 description 36
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 36
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 35
- 235000010980 cellulose Nutrition 0.000 description 32
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 32
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 29
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 29
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 29
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 29
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 29
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 28
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 27
- 239000010802 sludge Substances 0.000 description 27
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 27
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 26
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 25
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 25
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 24
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 24
- 239000004014 plasticizer Substances 0.000 description 23
- 230000008569 process Effects 0.000 description 23
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 22
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 22
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 22
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 22
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 20
- 239000002585 base Substances 0.000 description 20
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 20
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 20
- 238000005809 transesterification reaction Methods 0.000 description 19
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 18
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 18
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 18
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 18
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 18
- 150000004804 polysaccharides Chemical class 0.000 description 18
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 17
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 17
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 17
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 17
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 17
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 239000002023 wood Substances 0.000 description 17
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 16
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 16
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 16
- 229910052748 manganese Inorganic materials 0.000 description 16
- RQNVIKXOOKXAJQ-UHFFFAOYSA-N naphthazarin Chemical compound O=C1C=CC(=O)C2=C1C(O)=CC=C2O RQNVIKXOOKXAJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 15
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 15
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 15
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 15
- 239000010815 organic waste Substances 0.000 description 15
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 14
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 14
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 14
- 239000000446 fuel Substances 0.000 description 14
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 14
- 239000000463 material Substances 0.000 description 14
- 150000002739 metals Chemical class 0.000 description 14
- VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N methane Chemical compound C VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 14
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 14
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 14
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 description 13
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 13
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 13
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 12
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 12
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 12
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 12
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 12
- SIXWIUJQBBANGK-UHFFFAOYSA-N 4-(4-fluorophenyl)-1h-pyrazol-5-amine Chemical compound N1N=CC(C=2C=CC(F)=CC=2)=C1N SIXWIUJQBBANGK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- DGMPVYSXXIOGJY-UHFFFAOYSA-N Fusaric acid Chemical compound CCCCC1=CC=C(C(O)=O)N=C1 DGMPVYSXXIOGJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N Manganese Chemical compound [Mn] PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 239000011942 biocatalyst Substances 0.000 description 11
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 11
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 11
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 11
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 11
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 10
- 241000427940 Fusarium solani Species 0.000 description 10
- 244000062793 Sorghum vulgare Species 0.000 description 10
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 10
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 10
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 10
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 10
- 229920001971 elastomer Polymers 0.000 description 10
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 10
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 10
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 10
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 10
- ZXEKIIBDNHEJCQ-UHFFFAOYSA-N isobutanol Chemical compound CC(C)CO ZXEKIIBDNHEJCQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 10
- 235000019713 millet Nutrition 0.000 description 10
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 10
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 10
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 10
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 10
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 10
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 10
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 10
- 150000004671 saturated fatty acids Chemical class 0.000 description 10
- 235000003441 saturated fatty acids Nutrition 0.000 description 10
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 241001208371 Fusarium incarnatum Species 0.000 description 9
- 241000233732 Fusarium verticillioides Species 0.000 description 9
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 9
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 description 9
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 9
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 9
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 9
- LINOMUASTDIRTM-QGRHZQQGSA-N deoxynivalenol Chemical compound C([C@@]12[C@@]3(C[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1C=C(C([C@@H](O)[C@@]13CO)=O)C)C)O2 LINOMUASTDIRTM-QGRHZQQGSA-N 0.000 description 9
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 9
- 235000019387 fatty acid methyl ester Nutrition 0.000 description 9
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 9
- 239000011133 lead Substances 0.000 description 9
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 9
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 9
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 9
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 description 9
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 9
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 9
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 9
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 8
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 241000219823 Medicago Species 0.000 description 8
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 8
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 8
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 8
- 230000035508 accumulation Effects 0.000 description 8
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 8
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 8
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 8
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 8
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 8
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 8
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N nickel Substances [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 8
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 8
- 239000005060 rubber Substances 0.000 description 8
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 8
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 8
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 8
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 8
- 108010059892 Cellulase Proteins 0.000 description 7
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 description 7
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 description 7
- 240000006394 Sorghum bicolor Species 0.000 description 7
- 238000005903 acid hydrolysis reaction Methods 0.000 description 7
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 7
- 229910052793 cadmium Inorganic materials 0.000 description 7
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 7
- 238000004821 distillation Methods 0.000 description 7
- 230000006870 function Effects 0.000 description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 7
- 150000002402 hexoses Chemical class 0.000 description 7
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 7
- 239000010871 livestock manure Substances 0.000 description 7
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 7
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 7
- 235000020777 polyunsaturated fatty acids Nutrition 0.000 description 7
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 7
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 7
- LINOMUASTDIRTM-UHFFFAOYSA-N vomitoxin hydrate Natural products OCC12C(O)C(=O)C(C)=CC1OC1C(O)CC2(C)C11CO1 LINOMUASTDIRTM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000010925 yard waste Substances 0.000 description 7
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 7
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Chemical compound CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N D-gluconic acid Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 6
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108010068370 Glutens Proteins 0.000 description 6
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 6
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 6
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 6
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 6
- 229910052804 chromium Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000011651 chromium Substances 0.000 description 6
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 6
- 235000021312 gluten Nutrition 0.000 description 6
- 239000011121 hardwood Substances 0.000 description 6
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 6
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 6
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 6
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 6
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 6
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 6
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 6
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 6
- 235000021281 monounsaturated fatty acids Nutrition 0.000 description 6
- 235000021313 oleic acid Nutrition 0.000 description 6
- 239000010893 paper waste Substances 0.000 description 6
- 150000002972 pentoses Chemical class 0.000 description 6
- 239000010908 plant waste Substances 0.000 description 6
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 6
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 6
- 239000011122 softwood Substances 0.000 description 6
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 6
- BIQPSTSCCIEMEI-HXZSLLSJSA-N 8-acetylneosolaniol Chemical compound C([C@@]12[C@]3(C)[C@H](OC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1C=C(C)[C@@H](OC(C)=O)C[C@@]13COC(=O)C)O2 BIQPSTSCCIEMEI-HXZSLLSJSA-N 0.000 description 5
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 5
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 5
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 5
- SRBFZHDQGSBBOR-SOOFDHNKSA-N D-ribopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 5
- 101710121765 Endo-1,4-beta-xylanase Proteins 0.000 description 5
- 241000577846 Fusarium dimerum Species 0.000 description 5
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 5
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 5
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 5
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 5
- 108010059820 Polygalacturonase Proteins 0.000 description 5
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 5
- 229920001131 Pulp (paper) Polymers 0.000 description 5
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 description 5
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 5
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 5
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 5
- BJQHLKABXJIVAM-UHFFFAOYSA-N bis(2-ethylhexyl) phthalate Chemical compound CCCCC(CC)COC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCC(CC)CCCC BJQHLKABXJIVAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N catechol Chemical class OC1=CC=CC=C1O YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 5
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 5
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 5
- 229930002954 deoxynivalenol Natural products 0.000 description 5
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 5
- 108010093305 exopolygalacturonase Proteins 0.000 description 5
- 235000021588 free fatty acids Nutrition 0.000 description 5
- XGCUCFKWVIWWNW-UHFFFAOYSA-N fusarenone Chemical compound CC(=O)OC1C(O)C2OC3C=C(C)C(=O)C(O)C3(CO)C1(C)C21CO1 XGCUCFKWVIWWNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- XGCUCFKWVIWWNW-CAYGJDLQSA-N fusarenone x Chemical compound C([C@@]12[C@@]3(C)[C@@]4(CO)[C@H](O)C(=O)C(C)=C[C@H]4O[C@@H]1[C@H](O)[C@H]3OC(=O)C)O2 XGCUCFKWVIWWNW-CAYGJDLQSA-N 0.000 description 5
- 239000004009 herbicide Substances 0.000 description 5
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 5
- 239000002917 insecticide Substances 0.000 description 5
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 5
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 5
- 229910052745 lead Inorganic materials 0.000 description 5
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 5
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 5
- TVZHDVCTOCZDNE-WVJYZQHISA-N neosolaniol Chemical compound C([C@@]12[C@]3(C)[C@H](OC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1C=C(C)[C@@H](O)C[C@@]13COC(=O)C)O2 TVZHDVCTOCZDNE-WVJYZQHISA-N 0.000 description 5
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 5
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 5
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 5
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 description 5
- 239000004800 polyvinyl chloride Substances 0.000 description 5
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 5
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 5
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 5
- 238000012552 review Methods 0.000 description 5
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 5
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 5
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 5
- 150000004670 unsaturated fatty acids Chemical class 0.000 description 5
- 235000021122 unsaturated fatty acids Nutrition 0.000 description 5
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 5
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 5
- WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N (+)-Galactose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N 0.000 description 4
- 108020004463 18S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 4
- ADFIQZBYNGPCGY-HTJQZXIKSA-N 3-acetyldeoxynivalenol Chemical compound C([C@]12[C@]3(C)C[C@H]([C@H]2O[C@H]2[C@@]3([C@H](O)C(=O)C(C)=C2)CO)OC(=O)C)O1 ADFIQZBYNGPCGY-HTJQZXIKSA-N 0.000 description 4
- ALRHLSYJTWAHJZ-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxypropionic acid Chemical compound OCCC(O)=O ALRHLSYJTWAHJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 4
- 235000001674 Agaricus brunnescens Nutrition 0.000 description 4
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000019737 Animal fat Nutrition 0.000 description 4
- IRIAEXORFWYRCZ-UHFFFAOYSA-N Butylbenzyl phthalate Chemical compound CCCCOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCC1=CC=CC=C1 IRIAEXORFWYRCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 4
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 4
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 4
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 4
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 4
- 241000006782 Fusarium chlamydosporum Species 0.000 description 4
- 241000223192 Fusarium sporotrichioides Species 0.000 description 4
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010059896 Manganese peroxidase Proteins 0.000 description 4
- WAEMQWOKJMHJLA-UHFFFAOYSA-N Manganese(2+) Chemical compound [Mn+2] WAEMQWOKJMHJLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 description 4
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 4
- 229910052776 Thorium Inorganic materials 0.000 description 4
- 240000000359 Triticum dicoccon Species 0.000 description 4
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 4
- 230000009471 action Effects 0.000 description 4
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 4
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 4
- 229910052785 arsenic Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000002199 base oil Substances 0.000 description 4
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 description 4
- 229910052790 beryllium Inorganic materials 0.000 description 4
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 4
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 4
- 229940106157 cellulase Drugs 0.000 description 4
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 4
- FLKPEMZONWLCSK-UHFFFAOYSA-N diethyl phthalate Chemical compound CCOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCC FLKPEMZONWLCSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MGWAVDBGNNKXQV-UHFFFAOYSA-N diisobutyl phthalate Chemical compound CC(C)COC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCC(C)C MGWAVDBGNNKXQV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 239000000386 donor Substances 0.000 description 4
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 4
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 4
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 4
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 4
- 239000002029 lignocellulosic biomass Substances 0.000 description 4
- 239000012978 lignocellulosic material Substances 0.000 description 4
- 230000006372 lipid accumulation Effects 0.000 description 4
- 239000010808 liquid waste Substances 0.000 description 4
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 4
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 4
- 229910052750 molybdenum Inorganic materials 0.000 description 4
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical class CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 235000021354 omega 7 monounsaturated fatty acids Nutrition 0.000 description 4
- 239000005416 organic matter Substances 0.000 description 4
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 4
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 description 4
- VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N perchloric acid Chemical compound OCl(=O)(=O)=O VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N phenol group Chemical group C1(=CC=CC=C1)O ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000008659 phytopathology Effects 0.000 description 4
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 4
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 4
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 4
- 239000010944 silver (metal) Substances 0.000 description 4
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 4
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N succinic acid Chemical compound OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 150000003538 tetroses Chemical class 0.000 description 4
- 229910052718 tin Inorganic materials 0.000 description 4
- 229910052719 titanium Inorganic materials 0.000 description 4
- MJHNUUNSCNRGJE-UHFFFAOYSA-N trimethyl benzene-1,2,4-tricarboxylate Chemical compound COC(=O)C1=CC=C(C(=O)OC)C(C(=O)OC)=C1 MJHNUUNSCNRGJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 150000003641 trioses Chemical class 0.000 description 4
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 4
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 4
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 4
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 4
- 239000002351 wastewater Substances 0.000 description 4
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 4
- IGGLYMZTLQKWGT-UHFFFAOYSA-N 1-Ipomeanol Chemical compound CC(=O)CCC(O)C=1C=COC=1 IGGLYMZTLQKWGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FJSKXQVRKZTKSI-UHFFFAOYSA-N 2,3-dimethylfuran Chemical compound CC=1C=COC=1C FJSKXQVRKZTKSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 2-deoxy-D-ribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 3
- QPRQEDXDYOZYLA-UHFFFAOYSA-N 2-methylbutan-1-ol Chemical compound CCC(C)CO QPRQEDXDYOZYLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- RJYQLMILDVERHH-UHFFFAOYSA-N 4-Ipomeanol Chemical compound CC(O)CCC(=O)C=1C=COC=1 RJYQLMILDVERHH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000609240 Ambelania acida Species 0.000 description 3
- WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N Benzyl alcohol Chemical compound OCC1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 244000025254 Cannabis sativa Species 0.000 description 3
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000192700 Cyanobacteria Species 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-WHZQZERISA-N D-aldose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-WHZQZERISA-N 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-IVMDWMLBSA-N D-allopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-IVMDWMLBSA-N 0.000 description 3
- LKDRXBCSQODPBY-JDJSBBGDSA-N D-allulose Chemical compound OCC1(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O LKDRXBCSQODPBY-JDJSBBGDSA-N 0.000 description 3
- RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N D-gluconic acid Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N D-ribulose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N 0.000 description 3
- ZAQJHHRNXZUBTE-UHFFFAOYSA-N D-threo-2-Pentulose Natural products OCC(O)C(O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 3
- 108090000371 Esterases Proteins 0.000 description 3
- 241000833541 Fusarium caeruleum Species 0.000 description 3
- 241000837213 Fusarium fusarioides Species 0.000 description 3
- 241000611205 Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Species 0.000 description 3
- 241000690372 Fusarium proliferatum Species 0.000 description 3
- 108010060309 Glucuronidase Proteins 0.000 description 3
- 102000053187 Glucuronidase Human genes 0.000 description 3
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 3
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 3
- LKDRXBCSQODPBY-AMVSKUEXSA-N L-(-)-Sorbose Chemical compound OCC1(O)OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O LKDRXBCSQODPBY-AMVSKUEXSA-N 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-VSOAQEOCSA-N L-altropyranose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VSOAQEOCSA-N 0.000 description 3
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- 108010029541 Laccase Proteins 0.000 description 3
- 240000003433 Miscanthus floridulus Species 0.000 description 3
- 231100000678 Mycotoxin Toxicity 0.000 description 3
- UBQYURCVBFRUQT-UHFFFAOYSA-N N-benzoyl-Ferrioxamine B Chemical compound CC(=O)N(O)CCCCCNC(=O)CCC(=O)N(O)CCCCCNC(=O)CCC(=O)N(O)CCCCCN UBQYURCVBFRUQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229930192627 Naphthoquinone Natural products 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 3
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 3
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 3
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 3
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 3
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 3
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 3
- 235000011054 acetic acid Nutrition 0.000 description 3
- IAJILQKETJEXLJ-RSJOWCBRSA-N aldehydo-D-galacturonic acid Chemical compound O=C[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-RSJOWCBRSA-N 0.000 description 3
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 3
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 3
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 3
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SRBFZHDQGSBBOR-STGXQOJASA-N alpha-D-lyxopyranose Chemical compound O[C@@H]1CO[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-STGXQOJASA-N 0.000 description 3
- 108010084650 alpha-N-arabinofuranosidase Proteins 0.000 description 3
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 3
- 108010076955 arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase Proteins 0.000 description 3
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 3
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 3
- 239000010905 bagasse Substances 0.000 description 3
- AEMOLEFTQBMNLQ-UHFFFAOYSA-N beta-D-galactopyranuronic acid Natural products OC1OC(C(O)=O)C(O)C(O)C1O AEMOLEFTQBMNLQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BTANRVKWQNVYAZ-UHFFFAOYSA-N butan-2-ol Chemical compound CCC(C)O BTANRVKWQNVYAZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 3
- 230000007073 chemical hydrolysis Effects 0.000 description 3
- 239000004567 concrete Substances 0.000 description 3
- 235000013365 dairy product Nutrition 0.000 description 3
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 3
- 238000003795 desorption Methods 0.000 description 3
- 239000002283 diesel fuel Substances 0.000 description 3
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 3
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 239000003925 fat Substances 0.000 description 3
- 235000019197 fats Nutrition 0.000 description 3
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 3
- 235000013373 food additive Nutrition 0.000 description 3
- 239000002778 food additive Substances 0.000 description 3
- 239000000417 fungicide Substances 0.000 description 3
- 238000002290 gas chromatography-mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N geneticin Natural products O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C(C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N 0.000 description 3
- 239000000174 gluconic acid Substances 0.000 description 3
- 235000012208 gluconic acid Nutrition 0.000 description 3
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 3
- 150000002386 heptoses Chemical class 0.000 description 3
- 150000002454 idoses Chemical class 0.000 description 3
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 3
- 238000002743 insertional mutagenesis Methods 0.000 description 3
- BJHIKXHVCXFQLS-PQLUHFTBSA-N keto-D-tagatose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C(=O)CO BJHIKXHVCXFQLS-PQLUHFTBSA-N 0.000 description 3
- 108010062085 ligninase Proteins 0.000 description 3
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 3
- 230000001050 lubricating effect Effects 0.000 description 3
- 238000005461 lubrication Methods 0.000 description 3
- 235000021073 macronutrients Nutrition 0.000 description 3
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 3
- 239000010705 motor oil Substances 0.000 description 3
- 239000002636 mycotoxin Substances 0.000 description 3
- 150000002791 naphthoquinones Chemical class 0.000 description 3
- BIQPSTSCCIEMEI-UHFFFAOYSA-N neosolaniol 8-monoacetate Natural products CC(=O)OCC12CC(OC(C)=O)C(C)=CC1OC1C(O)C(OC(C)=O)C2(C)C11CO1 BIQPSTSCCIEMEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 3
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 3
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 3
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 3
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 3
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 3
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 239000004460 silage Substances 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- HYHCSLBZRBJJCH-UHFFFAOYSA-M sodium hydrosulfide Chemical compound [Na+].[SH-] HYHCSLBZRBJJCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000004458 spent grain Substances 0.000 description 3
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 3
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 3
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 3
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 3
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 3
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 description 3
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 125000005591 trimellitate group Chemical group 0.000 description 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 3
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 3
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 3
- APIKDIHGTQGHBM-WXJJLRKGSA-N (1S,2R,3S,7S,9R,10R,11S,12R)-6-acetyl-3,10,11-trihydroxy-2-(hydroxymethyl)-1,5-dimethylspiro[8-oxatricyclo[7.2.1.02,7]dodec-5-ene-12,2'-oxirane]-4-one Chemical compound C([C@]12[C@@]3(C)[C@@]4(CO)[C@H](O)C(=O)C(C)=C(C(C)=O)[C@H]4O[C@@]1([C@@H]([C@H]3O)O)[H])O2 APIKDIHGTQGHBM-WXJJLRKGSA-N 0.000 description 2
- JAHNSTQSQJOJLO-UHFFFAOYSA-N 2-(3-fluorophenyl)-1h-imidazole Chemical compound FC1=CC=CC(C=2NC=CN=2)=C1 JAHNSTQSQJOJLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FEBUJFMRSBAMES-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-{[3,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-phosphanyloxan-4-yl]oxy}-3,5-dihydroxy-6-({[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}methyl)oxan-4-yl)oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl phosphinite Chemical compound OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(OC2C(C(OP)C(O)C(CO)O2)O)C(O)C(OC2C(C(CO)OC(P)C2O)O)O1 FEBUJFMRSBAMES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CUEJHYHGUMAGBP-UHFFFAOYSA-N 2-[2-(1h-indol-5-yl)phenyl]acetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC=C1C1=CC=C(NC=C2)C2=C1 CUEJHYHGUMAGBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IDGRYIRJIFKTAN-UHFFFAOYSA-N 3-acetyldeoxynivalenol Natural products CC(=O)OCC12C(O)C(=O)C(C)=CC1OC1C(O)CC2(C)C11CO1 IDGRYIRJIFKTAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MXLMTQWGSQIYOW-UHFFFAOYSA-N 3-methyl-2-butanol Chemical compound CC(C)C(C)O MXLMTQWGSQIYOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SATHPVQTSSUFFW-UHFFFAOYSA-N 4-[6-[(3,5-dihydroxy-4-methoxyoxan-2-yl)oxymethyl]-3,5-dihydroxy-4-methoxyoxan-2-yl]oxy-2-(hydroxymethyl)-6-methyloxane-3,5-diol Chemical compound OC1C(OC)C(O)COC1OCC1C(O)C(OC)C(O)C(OC2C(C(CO)OC(C)C2O)O)O1 SATHPVQTSSUFFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GJCOSYZMQJWQCA-UHFFFAOYSA-N 9H-xanthene Chemical compound C1=CC=C2CC3=CC=CC=C3OC2=C1 GJCOSYZMQJWQCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- ADFIQZBYNGPCGY-UHFFFAOYSA-N Acetyldeoxynivalenol Natural products C1=C(C)C(=O)C(O)C2(CO)C1OC1C(OC(=O)C)CC2(C)C21CO2 ADFIQZBYNGPCGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- 229920000189 Arabinogalactan Polymers 0.000 description 2
- 239000001904 Arabinogalactan Substances 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 2
- 101001065065 Aspergillus awamori Feruloyl esterase A Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010084185 Cellulases Proteins 0.000 description 2
- 102000005575 Cellulases Human genes 0.000 description 2
- 241000207199 Citrus Species 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 2
- AEMOLEFTQBMNLQ-DTEWXJGMSA-N D-Galacturonic acid Natural products O[C@@H]1O[C@H](C(O)=O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-DTEWXJGMSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N D-OH-Asp Natural products OC(=O)C(N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AEMOLEFTQBMNLQ-YMDCURPLSA-N D-galactopyranuronic acid Chemical group OC1O[C@H](C(O)=O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-YMDCURPLSA-N 0.000 description 2
- ZAQJHHRNXZUBTE-WUJLRWPWSA-N D-xylulose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H](O)C(=O)CO ZAQJHHRNXZUBTE-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 2
- 101710089042 Demethyl-4-deoxygadusol synthase Proteins 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- KCXZNSGUUQJJTR-UHFFFAOYSA-N Di-n-hexyl phthalate Chemical compound CCCCCCOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCCCCCC KCXZNSGUUQJJTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000009355 Dianthus caryophyllus Nutrition 0.000 description 2
- 240000006497 Dianthus caryophyllus Species 0.000 description 2
- PYGXAGIECVVIOZ-UHFFFAOYSA-N Dibutyl decanedioate Chemical compound CCCCOC(=O)CCCCCCCCC(=O)OCCCC PYGXAGIECVVIOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical group CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZVFDTKUVRCTHQE-UHFFFAOYSA-N Diisodecyl phthalate Chemical compound CC(C)CCCCCCCOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCCCCCCCC(C)C ZVFDTKUVRCTHQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UDSFAEKRVUSQDD-UHFFFAOYSA-N Dimethyl adipate Chemical compound COC(=O)CCCCC(=O)OC UDSFAEKRVUSQDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229930191623 Fusarenone Natural products 0.000 description 2
- 241000577856 Fusarium arthrosporioides Species 0.000 description 2
- 241001443715 Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans Species 0.000 description 2
- 241000468018 Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum Species 0.000 description 2
- 241000693087 Fusarium oxysporum species complex Species 0.000 description 2
- 241000221779 Fusarium sambucinum Species 0.000 description 2
- 241000577872 Fusarium striatum Species 0.000 description 2
- 241000567180 Fusarium tumidum Species 0.000 description 2
- 241000143589 Fusarium ventricosum Species 0.000 description 2
- 241000001619 Fusicolla aquaeductuum Species 0.000 description 2
- 229920002148 Gellan gum Polymers 0.000 description 2
- 229930191978 Gibberellin Natural products 0.000 description 2
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 2
- 244000299507 Gossypium hirsutum Species 0.000 description 2
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 description 2
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 2
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical group NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 2
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 2
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 2
- 241000221089 Jatropha Species 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N L-Aspartic acid Natural products OC(=O)[C@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- YRSDOJQPYZOCMY-UHFFFAOYSA-N Lycomarasmin Natural products NC(=O)CNC(C(O)=O)CNC(C(O)=O)CC(O)=O YRSDOJQPYZOCMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YRSDOJQPYZOCMY-ROLXFIACSA-N Lycomarasmine B Chemical compound NC(=O)CNC(C(O)=O)CN[C@H](C(O)=O)CC(O)=O YRSDOJQPYZOCMY-ROLXFIACSA-N 0.000 description 2
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- AMQJEAYHLZJPGS-UHFFFAOYSA-N N-Pentanol Chemical compound CCCCCO AMQJEAYHLZJPGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IPRJXAGUEGOFGG-UHFFFAOYSA-N N-butylbenzenesulfonamide Chemical compound CCCCNS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 IPRJXAGUEGOFGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 2
- PIHGROVBUUNPDW-UHFFFAOYSA-N Nivalenol-diacetat Natural products CC(=O)OCC12C(O)C(=O)C(C)=CC1OC1C(O)C(OC(C)=O)C2(C)C11CO1 PIHGROVBUUNPDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019482 Palm oil Nutrition 0.000 description 2
- 229920000331 Polyhydroxybutyrate Polymers 0.000 description 2
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001515802 Pseudofusarium Species 0.000 description 2
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 2
- 229920002305 Schizophyllan Polymers 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 2
- 241000187432 Streptomyces coelicolor Species 0.000 description 2
- 235000019486 Sunflower oil Nutrition 0.000 description 2
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- 241000007071 Ustilago trichophora Species 0.000 description 2
- 241000607626 Vibrio cholerae Species 0.000 description 2
- 229920002000 Xyloglucan Polymers 0.000 description 2
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PIHGROVBUUNPDW-OHQJEHTLSA-N [(1S,2R,3S,7R,9R,10R,11S,12S)-11-acetyloxy-3,10-dihydroxy-1,5-dimethyl-4-oxospiro[8-oxatricyclo[7.2.1.02,7]dodec-5-ene-12,2'-oxirane]-2-yl]methyl acetate Chemical compound C([C@@]12[C@]3(C)[C@H](OC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1C=C(C)C(=O)[C@@H](O)[C@@]13COC(=O)C)O2 PIHGROVBUUNPDW-OHQJEHTLSA-N 0.000 description 2
- 108010048241 acetamidase Proteins 0.000 description 2
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 2
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000980 acid dye Substances 0.000 description 2
- 230000009056 active transport Effects 0.000 description 2
- 230000004103 aerobic respiration Effects 0.000 description 2
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 2
- PNNNRSAQSRJVSB-BXKVDMCESA-N aldehydo-L-rhamnose Chemical compound C[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-BXKVDMCESA-N 0.000 description 2
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 2
- 229930013930 alkaloid Natural products 0.000 description 2
- 125000005233 alkylalcohol group Chemical group 0.000 description 2
- AEMOLEFTQBMNLQ-WAXACMCWSA-N alpha-D-glucuronic acid Chemical compound O[C@H]1O[C@H](C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-WAXACMCWSA-N 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 230000009604 anaerobic growth Effects 0.000 description 2
- 230000004099 anaerobic respiration Effects 0.000 description 2
- 235000019730 animal feed additive Nutrition 0.000 description 2
- 150000004056 anthraquinones Chemical class 0.000 description 2
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 235000019312 arabinogalactan Nutrition 0.000 description 2
- YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N arachidonic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N 0.000 description 2
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000010923 batch production Methods 0.000 description 2
- 108010047754 beta-Glucosidase Proteins 0.000 description 2
- 102000006995 beta-Glucosidase Human genes 0.000 description 2
- 230000003851 biochemical process Effects 0.000 description 2
- SAOKZLXYCUGLFA-UHFFFAOYSA-N bis(2-ethylhexyl) adipate Chemical compound CCCCC(CC)COC(=O)CCCCC(=O)OCC(CC)CCCC SAOKZLXYCUGLFA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZFMQKOWCDKKBIF-UHFFFAOYSA-N bis(3,5-difluorophenyl)phosphane Chemical compound FC1=CC(F)=CC(PC=2C=C(F)C=C(F)C=2)=C1 ZFMQKOWCDKKBIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000008429 bread Nutrition 0.000 description 2
- CDQSJQSWAWPGKG-UHFFFAOYSA-N butane-1,1-diol Chemical compound CCCC(O)O CDQSJQSWAWPGKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 2
- BDOSMKKIYDKNTQ-UHFFFAOYSA-N cadmium atom Chemical compound [Cd] BDOSMKKIYDKNTQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IGDIDZAQDRAJRB-UPGMHYFXSA-N calonectrin Chemical compound C([C@@]12[C@]3(C)C[C@H]([C@H]1O[C@@H]1C=C(C)CC[C@@]13COC(=O)C)OC(C)=O)O2 IGDIDZAQDRAJRB-UPGMHYFXSA-N 0.000 description 2
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 2
- 239000000828 canola oil Substances 0.000 description 2
- 235000019519 canola oil Nutrition 0.000 description 2
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 239000004359 castor oil Substances 0.000 description 2
- 235000019438 castor oil Nutrition 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 108010052085 cellobiose-quinone oxidoreductase Proteins 0.000 description 2
- 230000004098 cellular respiration Effects 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 2
- 239000013522 chelant Substances 0.000 description 2
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 235000020971 citrus fruits Nutrition 0.000 description 2
- JMFRWRFFLBVWSI-NSCUHMNNSA-N coniferol Chemical compound COC1=CC(\C=C\CO)=CC=C1O JMFRWRFFLBVWSI-NSCUHMNNSA-N 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 2
- 229940124447 delivery agent Drugs 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- NHKCCADZVLTPPO-UHFFFAOYSA-N desferrioxamine E Chemical compound ON1CCCCCNC(=O)CCC(=O)N(O)CCCCCNC(=O)CCC(=O)N(O)CCCCCNC(=O)CCC1=O NHKCCADZVLTPPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 2
- PIHGROVBUUNPDW-SUWHGTQISA-N diacetylnivalenol Chemical compound CC1([C@H](OC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]2O[C@@H]3C=C(C)C(=O)[C@@H](O)[C@@]31COC(=O)C)C21CO1 PIHGROVBUUNPDW-SUWHGTQISA-N 0.000 description 2
- JBSLOWBPDRZSMB-FPLPWBNLSA-N dibutyl (z)-but-2-enedioate Chemical compound CCCCOC(=O)\C=C/C(=O)OCCCC JBSLOWBPDRZSMB-FPLPWBNLSA-N 0.000 description 2
- HBGGXOJOCNVPFY-UHFFFAOYSA-N diisononyl phthalate Chemical compound CC(C)CCCCCCOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCCCCCCC(C)C HBGGXOJOCNVPFY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 239000000806 elastomer Substances 0.000 description 2
- 229930191716 enniatin Natural products 0.000 description 2
- MIZMDSVSLSIMSC-VYLWARHZSA-N enniatin B Chemical compound CC(C)[C@H]1OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)[C@@H](C(C)C)OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)[C@@H](C(C)C)OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C1=O MIZMDSVSLSIMSC-VYLWARHZSA-N 0.000 description 2
- 108010081513 enniatins Proteins 0.000 description 2
- 230000007071 enzymatic hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006047 enzymatic hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- 125000004494 ethyl ester group Chemical group 0.000 description 2
- 108010041969 feruloyl esterase Proteins 0.000 description 2
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 2
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 2
- 239000002803 fossil fuel Substances 0.000 description 2
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 description 2
- 235000011087 fumaric acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000003008 fumonisin Substances 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 239000003448 gibberellin Substances 0.000 description 2
- IXORZMNAPKEEDV-OBDJNFEBSA-N gibberellin A3 Chemical class C([C@@]1(O)C(=C)C[C@@]2(C1)[C@H]1C(O)=O)C[C@H]2[C@]2(C=C[C@@H]3O)[C@H]1[C@]3(C)C(=O)O2 IXORZMNAPKEEDV-OBDJNFEBSA-N 0.000 description 2
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 2
- ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N glycerol triricinoleate Natural products CCCCCC[C@@H](O)CC=CCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCC=CC[C@@H](O)CCCCCC)OC(=O)CCCCCCCC=CC[C@H](O)CCCCCC ZEMPKEQAKRGZGQ-XOQCFJPHSA-N 0.000 description 2
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910002804 graphite Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010439 graphite Substances 0.000 description 2
- 229940093915 gynecological organic acid Drugs 0.000 description 2
- KEMQGTRYUADPNZ-UHFFFAOYSA-N heptadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O KEMQGTRYUADPNZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002363 herbicidal effect Effects 0.000 description 2
- 235000008216 herbs Nutrition 0.000 description 2
- FUZZWVXGSFPDMH-UHFFFAOYSA-N hexanoic acid Chemical compound CCCCCC(O)=O FUZZWVXGSFPDMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- 210000004276 hyalin Anatomy 0.000 description 2
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 description 2
- 150000002430 hydrocarbons Chemical class 0.000 description 2
- XMBWDFGMSWQBCA-UHFFFAOYSA-N hydrogen iodide Chemical compound I XMBWDFGMSWQBCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940071870 hydroiodic acid Drugs 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 2
- 229960003444 immunosuppressant agent Drugs 0.000 description 2
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 2
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000000749 insecticidal effect Effects 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 2
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000013190 lipid storage Effects 0.000 description 2
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LVHBHZANLOWSRM-UHFFFAOYSA-N methylenebutanedioic acid Natural products OC(=O)CC(=C)C(O)=O LVHBHZANLOWSRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010208 microarray analysis Methods 0.000 description 2
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 2
- 238000005065 mining Methods 0.000 description 2
- CWQXQMHSOZUFJS-UHFFFAOYSA-N molybdenum disulfide Chemical compound S=[Mo]=S CWQXQMHSOZUFJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KGPQKNJSZNXOPV-UHFFFAOYSA-N moniliformin Chemical compound OC1=CC(=O)C1=O KGPQKNJSZNXOPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UOBSVARXACCLLH-UHFFFAOYSA-N monomethyl adipate Chemical compound COC(=O)CCCCC(O)=O UOBSVARXACCLLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 229930027945 nicotinamide-adenine dinucleotide Natural products 0.000 description 2
- BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N nicotinamide-adenine dinucleotide Chemical compound C1=CCC(C(=O)N)=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O2)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)O)O1 BOPGDPNILDQYTO-NNYOXOHSSA-N 0.000 description 2
- VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N nile red Chemical compound C1=CC=C2C3=NC4=CC=C(N(CC)CC)C=C4OC3=CC(=O)C2=C1 VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002823 nitrates Chemical class 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-N octanoic acid Chemical compound CCCCCCCC(O)=O WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PJHOFUXBXJNUAC-UHFFFAOYSA-N omega7-palmitoleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCC(O)=O PJHOFUXBXJNUAC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000399 optical microscopy Methods 0.000 description 2
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 125000000962 organic group Chemical group 0.000 description 2
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 2
- 239000002540 palm oil Substances 0.000 description 2
- 150000002943 palmitic acids Chemical class 0.000 description 2
- IJTNSXPMYKJZPR-UHFFFAOYSA-N parinaric acid Chemical compound CCC=CC=CC=CC=CCCCCCCCC(O)=O IJTNSXPMYKJZPR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- JYVLIDXNZAXMDK-UHFFFAOYSA-N pentan-2-ol Chemical compound CCCC(C)O JYVLIDXNZAXMDK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AQIXEPGDORPWBJ-UHFFFAOYSA-N pentan-3-ol Chemical compound CCC(O)CC AQIXEPGDORPWBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000575 pesticide Substances 0.000 description 2
- 239000013520 petroleum-based product Substances 0.000 description 2
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 2
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 2
- 150000002989 phenols Chemical class 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 125000005498 phthalate group Chemical class 0.000 description 2
- 230000000885 phytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- 230000019612 pigmentation Effects 0.000 description 2
- 239000005015 poly(hydroxybutyrate) Substances 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 2
- 235000013824 polyphenols Nutrition 0.000 description 2
- 229920001343 polytetrafluoroethylene Polymers 0.000 description 2
- 239000004810 polytetrafluoroethylene Substances 0.000 description 2
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 2
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000001965 potato dextrose agar Substances 0.000 description 2
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 2
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 2
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 2
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 2
- 239000000344 soap Substances 0.000 description 2
- IFGCUJZIWBUILZ-UHFFFAOYSA-N sodium 2-[[2-[[hydroxy-(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxyphosphoryl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound [Na+].C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NP(O)(=O)OC1OC(C)C(O)C(O)C1O IFGCUJZIWBUILZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910001415 sodium ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 235000013555 soy sauce Nutrition 0.000 description 2
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 description 2
- WPLOVIFNBMNBPD-ATHMIXSHSA-N subtilin Chemical compound CC1SCC(NC2=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NC(=C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O)CSC(C)C2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C1NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C1NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)CNC(=O)C(NC(=O)C(NC(=O)C2NC(=O)CNC(=O)C3CCCN3C(=O)C(NC(=O)C3NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CCCCN)NC(=O)C(N)CC=4C5=CC=CC=C5NC=4)CSC3)C(C)SC2)C(C)C)C(C)SC1)CC1=CC=CC=C1 WPLOVIFNBMNBPD-ATHMIXSHSA-N 0.000 description 2
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 2
- 239000002600 sunflower oil Substances 0.000 description 2
- 150000003568 thioethers Chemical group 0.000 description 2
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 2
- 231100000033 toxigenic Toxicity 0.000 description 2
- 230000001551 toxigenic effect Effects 0.000 description 2
- MBMQEIFVQACCCH-UHFFFAOYSA-N trans-Zearalenon Natural products O=C1OC(C)CCCC(=O)CCCC=CC2=CC(O)=CC(O)=C21 MBMQEIFVQACCCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LZFOPEXOUVTGJS-ONEGZZNKSA-N trans-sinapyl alcohol Chemical compound COC1=CC(\C=C\CO)=CC(OC)=C1O LZFOPEXOUVTGJS-ONEGZZNKSA-N 0.000 description 2
- STCOOQWBFONSKY-UHFFFAOYSA-N tributyl phosphate Chemical compound CCCCOP(=O)(OCCCC)OCCCC STCOOQWBFONSKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KQTIIICEAUMSDG-UHFFFAOYSA-N tricarballylic acid Chemical compound OC(=O)CC(C(O)=O)CC(O)=O KQTIIICEAUMSDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000003628 tricarboxylic acids Chemical class 0.000 description 2
- SZHOJFHSIKHZHA-UHFFFAOYSA-N tridecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCC(O)=O SZHOJFHSIKHZHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000005691 triesters Chemical class 0.000 description 2
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 2
- ITRNXVSDJBHYNJ-UHFFFAOYSA-N tungsten disulfide Chemical compound S=[W]=S ITRNXVSDJBHYNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 2
- 238000005292 vacuum distillation Methods 0.000 description 2
- 229940118696 vibrio cholerae Drugs 0.000 description 2
- 239000000052 vinegar Substances 0.000 description 2
- 235000021419 vinegar Nutrition 0.000 description 2
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 2
- 235000014101 wine Nutrition 0.000 description 2
- 229920001285 xanthan gum Polymers 0.000 description 2
- 229920001221 xylan Polymers 0.000 description 2
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 2
- MBMQEIFVQACCCH-QBODLPLBSA-N zearalenone Chemical compound O=C1O[C@@H](C)CCCC(=O)CCC\C=C\C2=CC(O)=CC(O)=C21 MBMQEIFVQACCCH-QBODLPLBSA-N 0.000 description 2
- MNULEGDCPYONBU-WMBHJXFZSA-N (1r,4s,5e,5'r,6'r,7e,10s,11r,12s,14r,15s,16s,18r,19s,20r,21e,25s,26r,27s,29s)-4-ethyl-11,12,15,19-tetrahydroxy-6'-[(2s)-2-hydroxypropyl]-5',10,12,14,16,18,20,26,29-nonamethylspiro[24,28-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-5,7,21-triene-27,2'-oxane]-13,17,23-trio Polymers O([C@@H]1CC[C@@H](/C=C/C=C/C[C@H](C)[C@@H](O)[C@](C)(O)C(=O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)/C=C/C(=O)O[C@H]([C@H]2C)[C@H]1C)CC)[C@]12CC[C@@H](C)[C@@H](C[C@H](C)O)O1 MNULEGDCPYONBU-WMBHJXFZSA-N 0.000 description 1
- MNULEGDCPYONBU-DJRUDOHVSA-N (1s,4r,5z,5'r,6'r,7e,10s,11r,12s,14r,15s,18r,19r,20s,21e,26r,27s)-4-ethyl-11,12,15,19-tetrahydroxy-6'-(2-hydroxypropyl)-5',10,12,14,16,18,20,26,29-nonamethylspiro[24,28-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-5,7,21-triene-27,2'-oxane]-13,17,23-trione Polymers O([C@H]1CC[C@H](\C=C/C=C/C[C@H](C)[C@@H](O)[C@](C)(O)C(=O)[C@H](C)[C@@H](O)C(C)C(=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)/C=C/C(=O)OC([C@H]2C)C1C)CC)[C@]12CC[C@@H](C)[C@@H](CC(C)O)O1 MNULEGDCPYONBU-DJRUDOHVSA-N 0.000 description 1
- GEHPRJRWZDWFBJ-FOCLMDBBSA-N (2E)-2-heptadecenoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCC\C=C\C(O)=O GEHPRJRWZDWFBJ-FOCLMDBBSA-N 0.000 description 1
- OMDQUFIYNPYJFM-XKDAHURESA-N (2r,3r,4s,5r,6s)-2-(hydroxymethyl)-6-[[(2r,3s,4r,5s,6r)-4,5,6-trihydroxy-3-[(2s,3s,4s,5s,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]methoxy]oxane-3,4,5-triol Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O[C@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)O1 OMDQUFIYNPYJFM-XKDAHURESA-N 0.000 description 1
- VCUILRLOJMHSMR-JRTVQGFMSA-N (2r,3s,4s,5r)-3,4,5-trihydroxy-2-methoxyhexanal Chemical compound CO[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](C)O VCUILRLOJMHSMR-JRTVQGFMSA-N 0.000 description 1
- LUEWUZLMQUOBSB-FSKGGBMCSA-N (2s,3s,4s,5s,6r)-2-[(2r,3s,4r,5r,6s)-6-[(2r,3s,4r,5s,6s)-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-[(2r,4r,5s,6r)-4,5,6-trihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol Chemical compound O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](OC3[C@H](O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]3O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O LUEWUZLMQUOBSB-FSKGGBMCSA-N 0.000 description 1
- MNULEGDCPYONBU-YNZHUHFTSA-N (4Z,18Z,20Z)-22-ethyl-7,11,14,15-tetrahydroxy-6'-(2-hydroxypropyl)-5',6,8,10,12,14,16,28,29-nonamethylspiro[2,26-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-4,18,20-triene-27,2'-oxane]-3,9,13-trione Polymers CC1C(C2C)OC(=O)\C=C/C(C)C(O)C(C)C(=O)C(C)C(O)C(C)C(=O)C(C)(O)C(O)C(C)C\C=C/C=C\C(CC)CCC2OC21CCC(C)C(CC(C)O)O2 MNULEGDCPYONBU-YNZHUHFTSA-N 0.000 description 1
- MNULEGDCPYONBU-VVXVDZGXSA-N (5e,5'r,7e,10s,11r,12s,14s,15r,16r,18r,19s,20r,21e,26r,29s)-4-ethyl-11,12,15,19-tetrahydroxy-6'-[(2s)-2-hydroxypropyl]-5',10,12,14,16,18,20,26,29-nonamethylspiro[24,28-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-5,7,21-triene-27,2'-oxane]-13,17,23-trione Polymers C([C@H](C)[C@@H](O)[C@](C)(O)C(=O)[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)/C=C/C(=O)OC([C@H]1C)[C@H]2C)\C=C\C=C\C(CC)CCC2OC21CC[C@@H](C)C(C[C@H](C)O)O2 MNULEGDCPYONBU-VVXVDZGXSA-N 0.000 description 1
- SQEBMLCQNJOCBG-HVHJFMEUSA-N (5s)-3-(hydroxymethyl)-5-methoxy-4-methyl-5-[(e)-2-phenylethenyl]furan-2-one Chemical compound C=1C=CC=CC=1/C=C/[C@]1(OC)OC(=O)C(CO)=C1C SQEBMLCQNJOCBG-HVHJFMEUSA-N 0.000 description 1
- CGMACWYGXJQZQW-NGAQKLERSA-N (9Z,21Z,33Z)-3,15,27-triamino-7,19,31-trihydroxy-10,22,34-trimethyl-1,13,25-trioxa-7,19,31-triazacyclohexatriaconta-9,21,33-triene-2,8,14,20,26,32-hexone Chemical compound C/C/1=C/C(=O)N(CCCC(C(=O)OCC/C(=C\C(=O)N(CCCC(C(=O)OCC/C(=C\C(=O)N(CCCC(C(=O)OCC1)N)O)/C)N)O)/C)N)O CGMACWYGXJQZQW-NGAQKLERSA-N 0.000 description 1
- 125000004169 (C1-C6) alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- AORCXYMSPVAQIZ-UHFFFAOYSA-N 1,4-Ipomeadiol Chemical compound CC(O)CCC(O)C=1C=COC=1 AORCXYMSPVAQIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KBYFQSOWBFNZAW-UHFFFAOYSA-N 1,5,10-trihydroxy-7-methoxy-3-methyl-1h-benzo[g]isochromene-6,9-dione Chemical compound OC1OC(C)=CC2=C1C(O)=C1C(=O)C=C(OC)C(=O)C1=C2O KBYFQSOWBFNZAW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VTUSNBRLKKKEAC-UHFFFAOYSA-N 1-(furan-3-yl)pentane-2,4-diol Chemical compound CC(O)CC(O)CC=1C=COC=1 VTUSNBRLKKKEAC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GYSCBCSGKXNZRH-UHFFFAOYSA-N 1-benzothiophene-2-carboxamide Chemical compound C1=CC=C2SC(C(=O)N)=CC2=C1 GYSCBCSGKXNZRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KHWCHTKSEGGWEX-RRKCRQDMSA-N 2'-deoxyadenosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O1 KHWCHTKSEGGWEX-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- NCMVOABPESMRCP-SHYZEUOFSA-N 2'-deoxycytosine 5'-monophosphate Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NCMVOABPESMRCP-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 1
- LTFMZDNNPPEQNG-KVQBGUIXSA-N 2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O1 LTFMZDNNPPEQNG-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 1
- NIOPZPCMRQGZCE-WEVVVXLNSA-N 2,4-dinitro-6-(octan-2-yl)phenyl (E)-but-2-enoate Chemical compound CCCCCCC(C)C1=CC([N+]([O-])=O)=CC([N+]([O-])=O)=C1OC(=O)\C=C\C NIOPZPCMRQGZCE-WEVVVXLNSA-N 0.000 description 1
- PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 2-(3-bromo-2-fluorophenyl)acetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC(Br)=C1F PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UAXFCDNRLADBDZ-UHFFFAOYSA-N 2-O-Me-D-Lyxose Natural products COC1C(O)OCC(O)C1O UAXFCDNRLADBDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ALNDFFUAQIVVPG-SRQIZXRXSA-N 2-O-Methyl-D-xylose Chemical compound CO[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)CO ALNDFFUAQIVVPG-SRQIZXRXSA-N 0.000 description 1
- WPMUZECMAFLDQO-UHFFFAOYSA-N 2-[2-(2-hexanoyloxyethoxy)ethoxy]ethyl hexanoate Chemical compound CCCCCC(=O)OCCOCCOCCOC(=O)CCCCC WPMUZECMAFLDQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UVBUBMSSQKOIBE-UHFFFAOYSA-N 2-[2-({19-amino-6-[(3,4-dicarboxybutanoyl)oxy]-11,16,18-trihydroxy-5,9-dimethylicosan-7-yl}oxy)-2-oxoethyl]butanedioic acid Chemical compound OC(=O)CC(C(O)=O)CC(=O)OC(C(C)CCCC)C(OC(=O)CC(CC(O)=O)C(O)=O)CC(C)CC(O)CCCCC(O)CC(O)C(C)N UVBUBMSSQKOIBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SSKNCQWPZQCABD-UHFFFAOYSA-N 2-[2-[2-(2-heptanoyloxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl heptanoate Chemical compound CCCCCCC(=O)OCCOCCOCCOCCOC(=O)CCCCCC SSKNCQWPZQCABD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QRBLKGHRWFGINE-UGWAGOLRSA-N 2-[2-[2-[[2-[[4-[[2-[[6-amino-2-[3-amino-1-[(2,3-diamino-3-oxopropyl)amino]-3-oxopropyl]-5-methylpyrimidine-4-carbonyl]amino]-3-[(2r,3s,4s,5s,6s)-3-[(2s,3r,4r,5s)-4-carbamoyl-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)- Chemical compound N=1C(C=2SC=C(N=2)C(N)=O)CSC=1CCNC(=O)C(C(C)=O)NC(=O)C(C)C(O)C(C)NC(=O)C(C(O[C@H]1[C@@]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)(C)O[C@H]1[C@@H]([C@](O)([C@@H](O)C(CO)O1)C(N)=O)O)C=1NC=NC=1)NC(=O)C1=NC(C(CC(N)=O)NCC(N)C(N)=O)=NC(N)=C1C QRBLKGHRWFGINE-UGWAGOLRSA-N 0.000 description 1
- ZBMRKNMTMPPMMK-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4-[hydroxy(methyl)phosphoryl]butanoic acid;azane Chemical compound [NH4+].CP(O)(=O)CCC(N)C([O-])=O ZBMRKNMTMPPMMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZNQVEEAIQZEUHB-UHFFFAOYSA-N 2-ethoxyethanol Chemical compound CCOCCO ZNQVEEAIQZEUHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940093475 2-ethoxyethanol Drugs 0.000 description 1
- 108020005065 3' Flanking Region Proteins 0.000 description 1
- YHCCCMIWRBJYHG-UHFFFAOYSA-N 3-(2-ethylhexoxymethyl)heptane Chemical compound CCCCC(CC)COCC(CC)CCCC YHCCCMIWRBJYHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003682 3-furyl group Chemical group O1C([H])=C([*])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- KYQCXUMVJGMDNG-UHFFFAOYSA-N 4,5,6,7,8-pentahydroxy-2-oxooctanoic acid Chemical compound OCC(O)C(O)C(O)C(O)CC(=O)C(O)=O KYQCXUMVJGMDNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PIFPCDRPHCQLSJ-WYIJOVFWSA-N 4,8,12,15,19-Docosapentaenoic acid Chemical compound CC\C=C\CC\C=C\C\C=C\CC\C=C\CC\C=C\CCC(O)=O PIFPCDRPHCQLSJ-WYIJOVFWSA-N 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IXTLVPXCZJJUQB-VYJQSIGYSA-N 4-[[1-[[(2r)-1-[[(2s)-5-(diaminomethylideneamino)-1-[[(2r)-1-[[(2s)-5-[formyl(hydroxy)amino]-1-[[(3s,6s,9s,12s)-9-[3-[formyl(hydroxy)amino]propyl]-3,6-bis[(1r)-1-hydroxyethyl]-2,5,8,11-tetraoxo-1,4,7,10-tetrazacyclohexadec-12-yl]amino]-1-oxopentan-2-yl]am Chemical compound C1CCCNC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCCN(O)C=O)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H](CCCN(O)C=O)NC(=O)[C@@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](CO)NC(=O)C1N(C=2C(=CC(O)=C(O)C=2)C=C2NC(=O)CCC(O)=O)C2NCC1 IXTLVPXCZJJUQB-VYJQSIGYSA-N 0.000 description 1
- MNULEGDCPYONBU-UHFFFAOYSA-N 4-ethyl-11,12,15,19-tetrahydroxy-6'-(2-hydroxypropyl)-5',10,12,14,16,18,20,26,29-nonamethylspiro[24,28-dioxabicyclo[23.3.1]nonacosa-5,7,21-triene-27,2'-oxane]-13,17,23-trione Polymers CC1C(C2C)OC(=O)C=CC(C)C(O)C(C)C(=O)C(C)C(O)C(C)C(=O)C(C)(O)C(O)C(C)CC=CC=CC(CC)CCC2OC21CCC(C)C(CC(C)O)O2 MNULEGDCPYONBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AKIJONGZTGVCPH-UHFFFAOYSA-N 4-phenoxypyridine-2,6-diamine Chemical compound NC1=NC(N)=CC(OC=2C=CC=CC=2)=C1 AKIJONGZTGVCPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005029 5' Flanking Region Proteins 0.000 description 1
- FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 6-{[2-carboxy-4,5-dihydroxy-6-(phosphanyloxy)oxan-3-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-3-phosphanyloxane-2-carboxylic acid Chemical compound O1C(C(O)=O)C(P)C(O)C(O)C1OC1C(C(O)=O)OC(OP)C(O)C1O FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JBYXPOFIGCOSSB-GOJKSUSPSA-N 9-cis,11-trans-octadecadienoic acid Chemical compound CCCCCC\C=C\C=C/CCCCCCCC(O)=O JBYXPOFIGCOSSB-GOJKSUSPSA-N 0.000 description 1
- YWWVWXASSLXJHU-UHFFFAOYSA-N 9E-tetradecenoic acid Natural products CCCCC=CCCCCCCCC(O)=O YWWVWXASSLXJHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000007173 Abies balsamea Nutrition 0.000 description 1
- 108010013043 Acetylesterase Proteins 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 241001439211 Almeida Species 0.000 description 1
- 206010072735 Aluminium overload Diseases 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 101710152845 Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase Proteins 0.000 description 1
- 241000203069 Archaea Species 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 241000589149 Azotobacter vinelandii Species 0.000 description 1
- 241000193738 Bacillus anthracis Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 239000004857 Balsam Substances 0.000 description 1
- 235000006469 Batis maritima Nutrition 0.000 description 1
- 241000486634 Bena Species 0.000 description 1
- 241000219198 Brassica Species 0.000 description 1
- 235000003351 Brassica cretica Nutrition 0.000 description 1
- 235000003343 Brassica rupestris Nutrition 0.000 description 1
- DPUOLQHDNGRHBS-UHFFFAOYSA-N Brassidinsaeure Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCCCCCC(O)=O DPUOLQHDNGRHBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LNAVIIOBBICBIS-NBRVCOCJSA-N CCCCCCCCCCCCCCC\C=C\C=C\C(O)=O Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCC\C=C\C=C\C(O)=O LNAVIIOBBICBIS-NBRVCOCJSA-N 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000012766 Cannabis sativa ssp. sativa var. sativa Nutrition 0.000 description 1
- 235000012765 Cannabis sativa ssp. sativa var. spontanea Nutrition 0.000 description 1
- 239000005635 Caprylic acid (CAS 124-07-2) Substances 0.000 description 1
- KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M Carbamate Chemical group NC([O-])=O KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000004215 Carbon black (E152) Substances 0.000 description 1
- 239000004709 Chlorinated polyethylene Substances 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000007445 Chromatographic isolation Methods 0.000 description 1
- VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N Chromium Chemical compound [Cr] VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000008733 Citrus aurantifolia Nutrition 0.000 description 1
- 229910020366 ClO 4 Inorganic materials 0.000 description 1
- PIFPCDRPHCQLSJ-UHFFFAOYSA-N Clupanodonic acid Natural products CCC=CCCC=CCC=CCCC=CCCC=CCCC(O)=O PIFPCDRPHCQLSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000013162 Cocos nucifera Nutrition 0.000 description 1
- 244000060011 Cocos nucifera Species 0.000 description 1
- 206010010144 Completed suicide Diseases 0.000 description 1
- 241000223935 Cryptosporidium Species 0.000 description 1
- AVGPOAXYRRIZMM-UHFFFAOYSA-N D-Apiose Natural products OCC(O)(CO)C(O)C=O AVGPOAXYRRIZMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- ASNHGEVAWNWCRQ-LJJLCWGRSA-N D-apiofuranose Chemical compound OC[C@@]1(O)COC(O)[C@@H]1O ASNHGEVAWNWCRQ-LJJLCWGRSA-N 0.000 description 1
- ASNHGEVAWNWCRQ-UHFFFAOYSA-N D-apiofuranose Natural products OCC1(O)COC(O)C1O ASNHGEVAWNWCRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-SVZMEOIVSA-N D-fucopyranose Chemical compound C[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-SVZMEOIVSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-N Decanoic acid Natural products CCCCCCCCCC(O)=O GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBMORZZOJSDNRQ-UHFFFAOYSA-N Demethoxy,B,HCl-Adriamycin Natural products C1C2C(=C)CCCC2(C)CC2(O)C1=C(C)C(=O)O2 FBMORZZOJSDNRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 1
- 244000147058 Derris elliptica Species 0.000 description 1
- 239000004803 Di-2ethylhexylphthalate Substances 0.000 description 1
- 229920002943 EPDM rubber Polymers 0.000 description 1
- 235000001950 Elaeis guineensis Nutrition 0.000 description 1
- 240000003133 Elaeis guineensis Species 0.000 description 1
- 101100271445 Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) atp9 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710147028 Endo-beta-1,4-galactanase Proteins 0.000 description 1
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 1
- 108010061075 Enterobactin Proteins 0.000 description 1
- SERBHKJMVBATSJ-UHFFFAOYSA-N Enterobactin Natural products OC1=CC=CC(C(=O)NC2C(OCC(C(=O)OCC(C(=O)OC2)NC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)NC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)=O)=C1O SERBHKJMVBATSJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BRLQWZUYTZBJKN-UHFFFAOYSA-N Epichlorohydrin Chemical compound ClCC1CO1 BRLQWZUYTZBJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000006890 Erythroxylum coca Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 101100437498 Escherichia coli (strain K12) uidA gene Proteins 0.000 description 1
- 229920000181 Ethylene propylene rubber Polymers 0.000 description 1
- 108010014701 Exo-beta-D-glucosaminidase Proteins 0.000 description 1
- VTLYFUHAOXGGBS-UHFFFAOYSA-N Fe3+ Chemical compound [Fe+3] VTLYFUHAOXGGBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010067157 Ferrichrome Proteins 0.000 description 1
- 241000221778 Fusarium fujikuroi Species 0.000 description 1
- 241000899359 Fusarium illudens Species 0.000 description 1
- 241000145494 Fusarium napiforme Species 0.000 description 1
- 241000527566 Fusarium oxysporum 247 Species 0.000 description 1
- 241000527570 Fusarium oxysporum CL57 Species 0.000 description 1
- 241000527538 Fusarium oxysporum FOL 4287 Species 0.000 description 1
- 241000527508 Fusarium oxysporum Fo47 Species 0.000 description 1
- 241000527531 Fusarium oxysporum Fo5176 Species 0.000 description 1
- 241000527507 Fusarium oxysporum Fov24500 Species 0.000 description 1
- 241000527561 Fusarium oxysporum II5 Species 0.000 description 1
- 241000527509 Fusarium oxysporum MN25 Species 0.000 description 1
- 241000527563 Fusarium oxysporum NRRL 25433 Species 0.000 description 1
- 241000527562 Fusarium oxysporum NRRL 26406 Species 0.000 description 1
- 241000527510 Fusarium oxysporum NRRL 32931 Species 0.000 description 1
- 241000527568 Fusarium oxysporum PHW808 Species 0.000 description 1
- 241000527560 Fusarium oxysporum PHW815 Species 0.000 description 1
- 241000879841 Fusarium oxysporum f. cubense Species 0.000 description 1
- 241000223224 Fusarium oxysporum f. cucumerinum Species 0.000 description 1
- 241000879805 Fusarium oxysporum f. perniciosum Species 0.000 description 1
- 241000417969 Fusarium oxysporum f. sp. aechmeae Species 0.000 description 1
- 241001251196 Fusarium oxysporum f. sp. albedinis Species 0.000 description 1
- 241000210515 Fusarium oxysporum f. sp. allii Species 0.000 description 1
- 241000274788 Fusarium oxysporum f. sp. apii Species 0.000 description 1
- 241000210516 Fusarium oxysporum f. sp. arctii Species 0.000 description 1
- 241000509436 Fusarium oxysporum f. sp. asparagi Species 0.000 description 1
- 241000517351 Fusarium oxysporum f. sp. basilici Species 0.000 description 1
- 241000210517 Fusarium oxysporum f. sp. betae Species 0.000 description 1
- 241000210518 Fusarium oxysporum f. sp. bouvardiae Species 0.000 description 1
- 241000309051 Fusarium oxysporum f. sp. bulbigenum Species 0.000 description 1
- 241000912943 Fusarium oxysporum f. sp. callistephi Species 0.000 description 1
- 241000879838 Fusarium oxysporum f. sp. canariensis Species 0.000 description 1
- 241000210509 Fusarium oxysporum f. sp. cannabis Species 0.000 description 1
- 241000464524 Fusarium oxysporum f. sp. carthami Species 0.000 description 1
- 241000210510 Fusarium oxysporum f. sp. cassiae Species 0.000 description 1
- 241000210511 Fusarium oxysporum f. sp. cattleyae Species 0.000 description 1
- 241000912945 Fusarium oxysporum f. sp. cepae Species 0.000 description 1
- 241000778218 Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi Species 0.000 description 1
- 241000895522 Fusarium oxysporum f. sp. ciceris Species 0.000 description 1
- 241000468003 Fusarium oxysporum f. sp. colocasiae Species 0.000 description 1
- 241000210512 Fusarium oxysporum f. sp. cucurbitacearum Species 0.000 description 1
- 241000778220 Fusarium oxysporum f. sp. cyclaminis Species 0.000 description 1
- 241000144767 Fusarium oxysporum f. sp. dianthi Species 0.000 description 1
- 241000210521 Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis Species 0.000 description 1
- 241000879840 Fusarium oxysporum f. sp. erythroxyli Species 0.000 description 1
- 241000912956 Fusarium oxysporum f. sp. fabae Species 0.000 description 1
- 241000230695 Fusarium oxysporum f. sp. foetens Species 0.000 description 1
- 241001443714 Fusarium oxysporum f. sp. fragariae Species 0.000 description 1
- 241000879843 Fusarium oxysporum f. sp. glycines Species 0.000 description 1
- 241000210522 Fusarium oxysporum f. sp. hebes Species 0.000 description 1
- 241000210523 Fusarium oxysporum f. sp. koae Species 0.000 description 1
- 241001222927 Fusarium oxysporum f. sp. lactucae Species 0.000 description 1
- 241000508180 Fusarium oxysporum f. sp. lagenariae Species 0.000 description 1
- 241000464527 Fusarium oxysporum f. sp. lentis Species 0.000 description 1
- 241000509435 Fusarium oxysporum f. sp. lilii Species 0.000 description 1
- 241000509501 Fusarium oxysporum f. sp. lini Species 0.000 description 1
- 241000287539 Fusarium oxysporum f. sp. loti Species 0.000 description 1
- 241001002382 Fusarium oxysporum f. sp. luffae Species 0.000 description 1
- 241000210524 Fusarium oxysporum f. sp. lupini Species 0.000 description 1
- 241000382770 Fusarium oxysporum f. sp. matthiolae Species 0.000 description 1
- 241000912951 Fusarium oxysporum f. sp. medicaginis Species 0.000 description 1
- 241000879842 Fusarium oxysporum f. sp. melonis Species 0.000 description 1
- 241000790909 Fusarium oxysporum f. sp. momordicae Species 0.000 description 1
- 241000761417 Fusarium oxysporum f. sp. narcissi Species 0.000 description 1
- 241000508192 Fusarium oxysporum f. sp. niveum Species 0.000 description 1
- 241000509511 Fusarium oxysporum f. sp. opuntiarum Species 0.000 description 1
- 241000879803 Fusarium oxysporum f. sp. passiflorae Species 0.000 description 1
- 241001334064 Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli Species 0.000 description 1
- 241000210525 Fusarium oxysporum f. sp. pini Species 0.000 description 1
- 241000790913 Fusarium oxysporum f. sp. pisi Species 0.000 description 1
- 241000014900 Fusarium oxysporum f. sp. radicis-cucumerinum Species 0.000 description 1
- 241000879804 Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici Species 0.000 description 1
- 241000241166 Fusarium oxysporum f. sp. rapae Species 0.000 description 1
- 241000382773 Fusarium oxysporum f. sp. raphani Species 0.000 description 1
- 241000210526 Fusarium oxysporum f. sp. rauvolfiae Species 0.000 description 1
- 241000912953 Fusarium oxysporum f. sp. rhois Species 0.000 description 1
- 241000464525 Fusarium oxysporum f. sp. ricini Species 0.000 description 1
- 241000210519 Fusarium oxysporum f. sp. sesami Species 0.000 description 1
- 241000509496 Fusarium oxysporum f. sp. spinaciae Species 0.000 description 1
- 241000643382 Fusarium oxysporum f. sp. strigae Species 0.000 description 1
- 241000509498 Fusarium oxysporum f. sp. tulipae Species 0.000 description 1
- 241001037751 Fusarium oxysporum f. sp. vanillae Species 0.000 description 1
- 241000879806 Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum Species 0.000 description 1
- 241000210520 Fusarium oxysporum f. sp. voandzeiae Species 0.000 description 1
- 241000210903 Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi Species 0.000 description 1
- 241000879807 Fusarium oxysporum f. tuberosi Species 0.000 description 1
- 241000229202 Fusarium oxysporum var. meniscoideum Species 0.000 description 1
- 241000145511 Fusarium sacchari Species 0.000 description 1
- 241000879141 Fusarium tricinctum Species 0.000 description 1
- 229920000926 Galactomannan Polymers 0.000 description 1
- GYHNNYVSQQEPJS-UHFFFAOYSA-N Gallium Chemical compound [Ga] GYHNNYVSQQEPJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000224466 Giardia Species 0.000 description 1
- 229920002581 Glucomannan Polymers 0.000 description 1
- 229920001706 Glucuronoxylan Polymers 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000219146 Gossypium Species 0.000 description 1
- 235000009438 Gossypium Nutrition 0.000 description 1
- 102000004269 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010017080 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 101100295959 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) arcB gene Proteins 0.000 description 1
- 208000036066 Hemophagocytic Lymphohistiocytosis Diseases 0.000 description 1
- 208000032672 Histiocytosis haematophagic Diseases 0.000 description 1
- 108010020056 Hydrogenase Proteins 0.000 description 1
- GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N Hygromycin-B Natural products OC1C(NC)CC(N)C(O)C1OC1C2OC3(C(C(O)C(O)C(C(N)CO)O3)O)OC2C(O)C(CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 244000018716 Impatiens biflora Species 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 108091023242 Internal transcribed spacer Proteins 0.000 description 1
- VUENWDJSJYJARL-UHFFFAOYSA-N Ipomeanine Chemical compound CC(=O)CCC(=O)C=1C=COC=1 VUENWDJSJYJARL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010065973 Iron Overload Diseases 0.000 description 1
- 102000008133 Iron-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010035210 Iron-Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- WHUAIEAFPHHTPO-UHFFFAOYSA-N Javanicin Natural products CC(=O)OC1C(=O)OC2CC(C(C)=O)C(C34)(C)CC(=O)OC4C(OC(C)=O)C4(C(=O)OC)C1C23CO4 WHUAIEAFPHHTPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000007976 Ketosis Diseases 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-PQMKYFCFSA-N L-Fucose Natural products C[C@H]1O[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-PQMKYFCFSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-DHVFOXMCSA-N L-galactose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical group C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 description 1
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M Lactate Chemical compound CC(O)C([O-])=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 244000165082 Lavanda vera Species 0.000 description 1
- 235000010663 Lavandula angustifolia Nutrition 0.000 description 1
- 108010054320 Lignin peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 235000021353 Lignoceric acid Nutrition 0.000 description 1
- CQXMAMUUWHYSIY-UHFFFAOYSA-N Lignoceric acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCCC1=CC=C(O)C=C1 CQXMAMUUWHYSIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 1
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 description 1
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241001344133 Magnaporthe Species 0.000 description 1
- 229920002774 Maltodextrin Polymers 0.000 description 1
- 239000005913 Maltodextrin Substances 0.000 description 1
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 1
- 244000207047 Melilotus alba Species 0.000 description 1
- 235000017385 Melilotus alba Nutrition 0.000 description 1
- 101100513612 Microdochium nivale MnCO gene Proteins 0.000 description 1
- 108091092878 Microsatellite Proteins 0.000 description 1
- UVPSSGJTBLNVRE-UHFFFAOYSA-N Moniliformin Natural products O=C1C(OC)=CC(=O)C=2C1=C1C(=O)C(OC)=CC(=O)C1=CC=2 UVPSSGJTBLNVRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000291473 Musa acuminata Species 0.000 description 1
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 1
- TUNFSRHWOTWDNC-UHFFFAOYSA-N Myristic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCC(O)=O TUNFSRHWOTWDNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010061304 Nail infection Diseases 0.000 description 1
- TVZHDVCTOCZDNE-UHFFFAOYSA-N Neosolaniol Natural products CC(=O)OCC12CC(O)C(C)=CC1OC1C(O)C(OC(C)=O)C2(C)C11CO1 TVZHDVCTOCZDNE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000221960 Neurospora Species 0.000 description 1
- 241000221961 Neurospora crassa Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical compound [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ITCSWEBPTQLQKN-UHFFFAOYSA-N Nivalenol Natural products CC1=CC2OC3C(O)C(O)C(C2(CO)CC1=O)C34CO4 ITCSWEBPTQLQKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UKOTXHQERFPCBU-YQPARWETSA-N Nivalenol Chemical compound C([C@]12[C@@]3([C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1C=C(C([C@@H](O)[C@@]13CO)=O)C)C)O2 UKOTXHQERFPCBU-YQPARWETSA-N 0.000 description 1
- 239000006057 Non-nutritive feed additive Substances 0.000 description 1
- INKQLYSQWHBEGS-UHFFFAOYSA-N Nonadecenoicacid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCC=CC(O)=O INKQLYSQWHBEGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001263478 Norovirus Species 0.000 description 1
- 229940122426 Nuclease inhibitor Drugs 0.000 description 1
- ALNDFFUAQIVVPG-UHFFFAOYSA-N O2-methyl-D-xylose Natural products COC(C=O)C(O)C(O)CO ALNDFFUAQIVVPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- CBENFWSGALASAD-UHFFFAOYSA-N Ozone Chemical compound [O-][O+]=O CBENFWSGALASAD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000845082 Panama Species 0.000 description 1
- 235000019483 Peanut oil Nutrition 0.000 description 1
- 241000209046 Pennisetum Species 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 241000199919 Phaeophyceae Species 0.000 description 1
- 241000222393 Phanerochaete chrysosporium Species 0.000 description 1
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 1
- LTQCLFMNABRKSH-UHFFFAOYSA-N Phleomycin Natural products N=1C(C=2SC=C(N=2)C(N)=O)CSC=1CCNC(=O)C(C(O)C)NC(=O)C(C)C(O)C(C)NC(=O)C(C(OC1C(C(O)C(O)C(CO)O1)OC1C(C(OC(N)=O)C(O)C(CO)O1)O)C=1NC=NC=1)NC(=O)C1=NC(C(CC(N)=O)NCC(N)C(N)=O)=NC(N)=C1C LTQCLFMNABRKSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010035235 Phleomycins Proteins 0.000 description 1
- 244000104275 Phoenix dactylifera Species 0.000 description 1
- 235000010659 Phoenix dactylifera Nutrition 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000007685 Pleurotus columbinus Nutrition 0.000 description 1
- 240000001462 Pleurotus ostreatus Species 0.000 description 1
- 235000001603 Pleurotus ostreatus Nutrition 0.000 description 1
- 244000166541 Plumeria alba Species 0.000 description 1
- 229910052778 Plutonium Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000209504 Poaceae Species 0.000 description 1
- 241000565347 Pongamia Species 0.000 description 1
- 241000219000 Populus Species 0.000 description 1
- 235000015696 Portulacaria afra Nutrition 0.000 description 1
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 229930186551 Pyoverdin Natural products 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 235000019484 Rapeseed oil Nutrition 0.000 description 1
- 244000088415 Raphanus sativus Species 0.000 description 1
- 235000006140 Raphanus sativus var sativus Nutrition 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 235000019774 Rice Bran oil Nutrition 0.000 description 1
- 241000702670 Rotavirus Species 0.000 description 1
- 108010019477 S-adenosyl-L-methionine-dependent N-methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 235000019485 Safflower oil Nutrition 0.000 description 1
- 235000003042 Salicornia europaea Nutrition 0.000 description 1
- 241000124033 Salix Species 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 240000002625 Salsola soda Species 0.000 description 1
- 241000576755 Sclerotia Species 0.000 description 1
- 241001557894 Scytalidium sp. Species 0.000 description 1
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 244000138286 Sorghum saccharatum Species 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 108010073771 Soybean Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101100370749 Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) trpC1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241001137868 Streptomyces pilosus Species 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- BXFOFFBJRFZBQZ-QYWOHJEZSA-N T-2 toxin Chemical compound C([C@@]12[C@]3(C)[C@H](OC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@]3(COC(C)=O)C[C@@H](C(=C1)C)OC(=O)CC(C)C)O2 BXFOFFBJRFZBQZ-QYWOHJEZSA-N 0.000 description 1
- 235000009065 Taxus cuspidata Nutrition 0.000 description 1
- 244000162450 Taxus cuspidata Species 0.000 description 1
- 239000004809 Teflon Substances 0.000 description 1
- 229920006362 Teflon® Polymers 0.000 description 1
- 208000002903 Thalassemia Diseases 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000011941 Tilia x europaea Nutrition 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 241000499912 Trichoderma reesei Species 0.000 description 1
- 102000004243 Tubulin Human genes 0.000 description 1
- 108090000704 Tubulin Proteins 0.000 description 1
- 235000018747 Typha elephantina Nutrition 0.000 description 1
- 244000177175 Typha elephantina Species 0.000 description 1
- 235000021322 Vaccenic acid Nutrition 0.000 description 1
- UWHZIFQPPBDJPM-FPLPWBNLSA-M Vaccenic acid Natural products CCCCCC\C=C/CCCCCCCCCC([O-])=O UWHZIFQPPBDJPM-FPLPWBNLSA-M 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 235000010726 Vigna sinensis Nutrition 0.000 description 1
- 244000042314 Vigna unguiculata Species 0.000 description 1
- 241001464837 Viridiplantae Species 0.000 description 1
- 241000607734 Yersinia <bacteria> Species 0.000 description 1
- 241000607479 Yersinia pestis Species 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UGXQOOQUZRUVSS-ZZXKWVIFSA-N [5-[3,5-dihydroxy-2-(1,3,4-trihydroxy-5-oxopentan-2-yl)oxyoxan-4-yl]oxy-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (e)-3-(4-hydroxyphenyl)prop-2-enoate Chemical compound OC1C(OC(CO)C(O)C(O)C=O)OCC(O)C1OC1C(O)C(O)C(COC(=O)\C=C\C=2C=CC(O)=CC=2)O1 UGXQOOQUZRUVSS-ZZXKWVIFSA-N 0.000 description 1
- 241001231403 [Nectria] haematococca Species 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 108010093941 acetylxylan esterase Proteins 0.000 description 1
- 239000003377 acid catalyst Substances 0.000 description 1
- 238000003914 acid mine drainage Methods 0.000 description 1
- 239000003929 acidic solution Substances 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 208000005652 acute fatty liver of pregnancy Diseases 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 1
- 125000004423 acyloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N adenosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-L adipate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCCCC([O-])=O WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N adipic acid Chemical class OC(=O)CCCCC(O)=O WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- 125000003158 alcohol group Chemical group 0.000 description 1
- GZCGUPFRVQAUEE-SLPGGIOYSA-N aldehydo-D-glucose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C=O GZCGUPFRVQAUEE-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001312 aldohexoses Chemical class 0.000 description 1
- 150000001320 aldopentoses Chemical class 0.000 description 1
- 150000001323 aldoses Chemical class 0.000 description 1
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 1
- 150000001335 aliphatic alkanes Chemical class 0.000 description 1
- 238000005904 alkaline hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012670 alkaline solution Substances 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003282 alkyl amino group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005907 alkyl ester group Chemical group 0.000 description 1
- FPQFYIAXQDXNOR-QDKLYSGJSA-N alpha-Zearalenol Chemical compound O=C1O[C@@H](C)CCC[C@H](O)CCC\C=C\C2=CC(O)=CC(O)=C21 FPQFYIAXQDXNOR-QDKLYSGJSA-N 0.000 description 1
- IJTNSXPMYKJZPR-WVRBZULHSA-N alpha-parinaric acid Natural products CCC=C/C=C/C=C/C=CCCCCCCCC(=O)O IJTNSXPMYKJZPR-WVRBZULHSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003368 amide group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical group 0.000 description 1
- 125000004397 aminosulfonyl group Chemical group NS(=O)(=O)* 0.000 description 1
- 229940025131 amylases Drugs 0.000 description 1
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 1
- 229910052787 antimony Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 229920000617 arabinoxylan Polymers 0.000 description 1
- 235000021342 arachidonic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940114079 arachidonic acid Drugs 0.000 description 1
- 101150008194 argB gene Proteins 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001769 aryl amino group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- GIXWDMTZECRIJT-UHFFFAOYSA-N aurintricarboxylic acid Chemical compound C1=CC(=O)C(C(=O)O)=CC1=C(C=1C=C(C(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C(C(O)=O)=C1 GIXWDMTZECRIJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000680 avirulence Effects 0.000 description 1
- HIIOEEFXLUSDLO-JBCSJTSVSA-N azotobactin Chemical compound O=C1C(O)=CC2=CC(NC3=O)=C4N3CCC(C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(O)C(O)=O)C(O)=O)N4C2=C1 HIIOEEFXLUSDLO-JBCSJTSVSA-N 0.000 description 1
- 108010029968 azotobactin Proteins 0.000 description 1
- 108010026917 bacillibactin Proteins 0.000 description 1
- RCQTVEFBFUNTGM-UHFFFAOYSA-N bacillibactin Natural products CC1OC(=O)C(NC(=O)CNC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)C(C)OC(=O)C(NC(=O)CNC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)C(C)OC(=O)C1NC(=O)CNC(=O)C1=CC=CC(O)=C1O RCQTVEFBFUNTGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940065181 bacillus anthracis Drugs 0.000 description 1
- 210000000270 basal cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- RIOXQFHNBCKOKP-UHFFFAOYSA-N benomyl Chemical compound C1=CC=C2N(C(=O)NCCCC)C(NC(=O)OC)=NC2=C1 RIOXQFHNBCKOKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MFMVRILBADIIJO-UHFFFAOYSA-N benzo[e][1]benzofuran Chemical class C1=CC=C2C(C=CO3)=C3C=CC2=C1 MFMVRILBADIIJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001558 benzoic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- MITFXPHMIHQXPI-UHFFFAOYSA-N benzoxaprofen Natural products N=1C2=CC(C(C(O)=O)C)=CC=C2OC=1C1=CC=C(Cl)C=C1 MITFXPHMIHQXPI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019445 benzyl alcohol Nutrition 0.000 description 1
- 208000036815 beta tubulin Diseases 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000002210 biocatalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006065 biodegradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000035 biogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- QKSKPIVNLNLAAV-UHFFFAOYSA-N bis(2-chloroethyl) sulfide Chemical compound ClCCSCCCl QKSKPIVNLNLAAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010083912 bleomycin N-acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 229910021538 borax Inorganic materials 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000648 calcium alginate Substances 0.000 description 1
- 235000010410 calcium alginate Nutrition 0.000 description 1
- 229960002681 calcium alginate Drugs 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- OKHHGHGGPDJQHR-YMOPUZKJSA-L calcium;(2s,3s,4s,5s,6r)-6-[(2r,3s,4r,5s,6r)-2-carboxy-6-[(2r,3s,4r,5s,6r)-2-carboxylato-4,5,6-trihydroxyoxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylate Chemical compound [Ca+2].O[C@@H]1[C@H](O)[C@H](O)O[C@@H](C([O-])=O)[C@H]1O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O2)C([O-])=O)O)[C@H](C(O)=O)O1 OKHHGHGGPDJQHR-YMOPUZKJSA-L 0.000 description 1
- 235000009120 camo Nutrition 0.000 description 1
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 1
- 150000001722 carbon compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000007942 carboxylates Chemical class 0.000 description 1
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical group 0.000 description 1
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 239000005018 casein Substances 0.000 description 1
- BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N casein, tech. Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CC(C)C)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(C(C)O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(COP(O)(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000004568 cement Substances 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 108010080434 cephalosporin-C deacetylase Proteins 0.000 description 1
- 235000005607 chanvre indien Nutrition 0.000 description 1
- 229920001429 chelating resin Polymers 0.000 description 1
- 230000009920 chelation Effects 0.000 description 1
- 238000002655 chelation therapy Methods 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 1
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 229930002875 chlorophyll Natural products 0.000 description 1
- 235000019804 chlorophyll Nutrition 0.000 description 1
- ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M chlorophyll a Chemical compound C1([C@@H](C(=O)OC)C(=O)C2=C3C)=C2N2C3=CC(C(CC)=C3C)=[N+]4C3=CC3=C(C=C)C(C)=C5N3[Mg-2]42[N+]2=C1[C@@H](CCC(=O)OC\C=C(/C)CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H](C)C2=C5 ATNHDLDRLWWWCB-AENOIHSZSA-M 0.000 description 1
- SECPZKHBENQXJG-UHFFFAOYSA-N cis-palmitoleic acid Natural products CCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O SECPZKHBENQXJG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZFOPEXOUVTGJS-UHFFFAOYSA-N cis-sinapyl alcohol Natural products COC1=CC(C=CCO)=CC(OC)=C1O LZFOPEXOUVTGJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001860 citric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000004927 clay Substances 0.000 description 1
- 239000003245 coal Substances 0.000 description 1
- 235000008957 cocaer Nutrition 0.000 description 1
- ZPUCINDJVBIVPJ-LJISPDSOSA-N cocaine Chemical compound O([C@H]1C[C@@H]2CC[C@@H](N2C)[C@H]1C(=O)OC)C(=O)C1=CC=CC=C1 ZPUCINDJVBIVPJ-LJISPDSOSA-N 0.000 description 1
- 239000003240 coconut oil Substances 0.000 description 1
- 235000019864 coconut oil Nutrition 0.000 description 1
- 238000002485 combustion reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 238000010668 complexation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009264 composting Methods 0.000 description 1
- 238000007906 compression Methods 0.000 description 1
- 230000006835 compression Effects 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 239000008032 concrete plasticizer Substances 0.000 description 1
- 229940119526 coniferyl alcohol Drugs 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 235000005687 corn oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000002285 corn oil Substances 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 230000007797 corrosion Effects 0.000 description 1
- 238000005260 corrosion Methods 0.000 description 1
- RCQTVEFBFUNTGM-BDVHUIKKSA-N corynebactin Chemical compound N([C@@H]1C(=O)O[C@@H]([C@@H](C(=O)O[C@H](C)[C@H](NC(=O)CNC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)C(=O)O[C@@H]1C)NC(=O)CNC(=O)C=1C(=C(O)C=CC=1)O)C)C(=O)CNC(=O)C1=CC=CC(O)=C1O RCQTVEFBFUNTGM-BDVHUIKKSA-N 0.000 description 1
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 1
- 235000012343 cottonseed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000002385 cottonseed oil Substances 0.000 description 1
- 230000037029 cross reaction Effects 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 238000012136 culture method Methods 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- IERHLVCPSMICTF-XVFCMESISA-N cytidine 5'-monophosphate Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O1 IERHLVCPSMICTF-XVFCMESISA-N 0.000 description 1
- 230000002380 cytological effect Effects 0.000 description 1
- GYOZYWVXFNDGLU-XLPZGREQSA-N dTMP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 GYOZYWVXFNDGLU-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008260 defense mechanism Effects 0.000 description 1
- 229960000958 deferoxamine Drugs 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 150000008266 deoxy sugars Chemical class 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000000368 destabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 125000004663 dialkyl amino group Chemical group 0.000 description 1
- DOIRQSBPFJWKBE-UHFFFAOYSA-N dibutyl phthalate Chemical compound CCCCOC(=O)C1=CC=CC=C1C(=O)OCCCC DOIRQSBPFJWKBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006280 diesel fuel additive Substances 0.000 description 1
- 150000005690 diesters Chemical class 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 235000019621 digestibility Nutrition 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 102000038379 digestive enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108091007734 digestive enzymes Proteins 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 150000002009 diols Chemical class 0.000 description 1
- PCHPORCSPXIHLZ-UHFFFAOYSA-N diphenhydramine hydrochloride Chemical compound [Cl-].C=1C=CC=CC=1C(OCC[NH+](C)C)C1=CC=CC=C1 PCHPORCSPXIHLZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L disodium hydrogen phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].OP([O-])([O-])=O BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000397 disodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019800 disodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000002270 dispersing agent Substances 0.000 description 1
- 239000010791 domestic waste Substances 0.000 description 1
- 230000012361 double-strand break repair Effects 0.000 description 1
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- SERBHKJMVBATSJ-BZSNNMDCSA-N enterobactin Chemical compound OC1=CC=CC(C(=O)N[C@@H]2C(OC[C@@H](C(=O)OC[C@@H](C(=O)OC2)NC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)NC(=O)C=2C(=C(O)C=CC=2)O)=O)=C1O SERBHKJMVBATSJ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 230000000369 enteropathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003344 environmental pollutant Substances 0.000 description 1
- 230000007515 enzymatic degradation Effects 0.000 description 1
- 230000032050 esterification Effects 0.000 description 1
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004880 explosion Methods 0.000 description 1
- 238000001400 expression cloning Methods 0.000 description 1
- 229910001447 ferric ion Inorganic materials 0.000 description 1
- GGUNGDGGXMHBMJ-UHFFFAOYSA-N ferrichrome Chemical compound [Fe+3].CC(=O)N([O-])CCCC1NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)CNC(=O)C(CCCN([O-])C(C)=O)NC(=O)C(CCCN([O-])C(C)=O)NC1=O GGUNGDGGXMHBMJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003337 fertilizer Substances 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000000295 fuel oil Substances 0.000 description 1
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004362 fungal culture Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 229910052733 gallium Inorganic materials 0.000 description 1
- VZCCETWTMQHEPK-UHFFFAOYSA-N gamma-Linolensaeure Natural products CCCCCC=CCC=CCC=CCCCCC(O)=O VZCCETWTMQHEPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VZCCETWTMQHEPK-QNEBEIHSSA-N gamma-linolenic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC(O)=O VZCCETWTMQHEPK-QNEBEIHSSA-N 0.000 description 1
- 235000020664 gamma-linolenic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960002733 gamolenic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000004817 gas chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000012215 gene cloning Methods 0.000 description 1
- 238000003209 gene knockout Methods 0.000 description 1
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000009477 glass transition Effects 0.000 description 1
- 229940046240 glucomannan Drugs 0.000 description 1
- JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N glutaric acid Chemical class OC(=O)CCCC(O)=O JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002334 glycols Chemical class 0.000 description 1
- 230000034659 glycolysis Effects 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 1
- 239000004519 grease Substances 0.000 description 1
- 239000005431 greenhouse gas Substances 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- RQFCJASXJCIDSX-UUOKFMHZSA-N guanosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O RQFCJASXJCIDSX-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- 108010021519 haematoporphyrin-bovine serum albumin conjugate Proteins 0.000 description 1
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical group 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 108010002430 hemicellulase Proteins 0.000 description 1
- 229940059442 hemicellulase Drugs 0.000 description 1
- 208000014752 hemophagocytic syndrome Diseases 0.000 description 1
- 239000011487 hemp Substances 0.000 description 1
- 125000003187 heptyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 229920000140 heteropolymer Polymers 0.000 description 1
- OOJGMLFHAQOYIL-UHFFFAOYSA-N hexadeca-2,4-dienoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCC=CC=CC(O)=O OOJGMLFHAQOYIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 231100000086 high toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N hygromycin B Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC)C[C@@H](N)[C@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@H]2O[C@@]3([C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](C(N)CO)O3)O)O[C@H]2[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N 0.000 description 1
- 229940097277 hygromycin b Drugs 0.000 description 1
- QWPPOHNGKGFGJK-UHFFFAOYSA-N hypochlorous acid Chemical compound ClO QWPPOHNGKGFGJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 150000002466 imines Chemical group 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 229910052738 indium Inorganic materials 0.000 description 1
- APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N indium atom Chemical compound [In] APFVFJFRJDLVQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003262 industrial enzyme Substances 0.000 description 1
- 238000009655 industrial fermentation Methods 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 244000000074 intestinal pathogen Species 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000005061 intracellular organelle Anatomy 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 150000002497 iodine compounds Chemical class 0.000 description 1
- 150000002506 iron compounds Chemical class 0.000 description 1
- YAQXGBBDJYBXKL-UHFFFAOYSA-N iron(2+);1,10-phenanthroline;dicyanide Chemical compound [Fe+2].N#[C-].N#[C-].C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1.C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 YAQXGBBDJYBXKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JEIPFZHSYJVQDO-UHFFFAOYSA-N iron(III) oxide Inorganic materials O=[Fe]O[Fe]=O JEIPFZHSYJVQDO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 229940119170 jojoba wax Drugs 0.000 description 1
- JUTMAMXOAOYKHT-UHFFFAOYSA-N karrikinolide Natural products C1=COC=C2OC(=O)C(C)=C21 JUTMAMXOAOYKHT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002574 ketohexoses Chemical class 0.000 description 1
- 125000000468 ketone group Chemical group 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 150000002581 ketopentoses Chemical class 0.000 description 1
- 150000002584 ketoses Chemical class 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000001102 lavandula vera Substances 0.000 description 1
- 235000018219 lavender Nutrition 0.000 description 1
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 239000004571 lime Substances 0.000 description 1
- 230000003859 lipid peroxidation Effects 0.000 description 1
- 210000005228 liver tissue Anatomy 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 150000004668 long chain fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 231100000053 low toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000010687 lubricating oil Substances 0.000 description 1
- 101150039489 lysZ gene Proteins 0.000 description 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 1
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 description 1
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 1
- 229940035034 maltodextrin Drugs 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 229910001437 manganese ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940099596 manganese sulfate Drugs 0.000 description 1
- 239000011702 manganese sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000007079 manganese sulphate Nutrition 0.000 description 1
- MMIPFLVOWGHZQD-UHFFFAOYSA-N manganese(3+) Chemical compound [Mn+3] MMIPFLVOWGHZQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L manganese(II) sulfate Chemical compound [Mn+2].[O-]S([O-])(=O)=O SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000010297 mechanical methods and process Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- GXHFUVWIGNLZSC-UHFFFAOYSA-N meldrum's acid Chemical compound CC1(C)OC(=O)CC(=O)O1 GXHFUVWIGNLZSC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 1
- QGBRLVONZXHAKJ-UHFFFAOYSA-N methyl arachidate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC QGBRLVONZXHAKJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004170 methylsulfonyl group Chemical group [H]C([H])([H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 230000007269 microbial metabolism Effects 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 238000009629 microbiological culture Methods 0.000 description 1
- 230000033607 mismatch repair Effects 0.000 description 1
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 1
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 1
- 229910000403 monosodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019799 monosodium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 235000021084 monounsaturated fats Nutrition 0.000 description 1
- 235000010460 mustard Nutrition 0.000 description 1
- PNKLMTPXERFKEN-ZIOSACBISA-N mycotoxin ht 2 Chemical compound C([C@]12[C@]3(C)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@]3(COC(C)=O)C[C@@H](C(=C1)C)OC(=O)CC(C)C)O2 PNKLMTPXERFKEN-ZIOSACBISA-N 0.000 description 1
- DHRXPBUFQGUINE-UHFFFAOYSA-N n-(2-hydroxypropyl)benzenesulfonamide Chemical compound CC(O)CNS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 DHRXPBUFQGUINE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021290 n-3 DPA Nutrition 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 208000004235 neutropenia Diseases 0.000 description 1
- 101150095344 niaD gene Proteins 0.000 description 1
- 150000002825 nitriles Chemical class 0.000 description 1
- LBQAJLBSGOBDQF-UHFFFAOYSA-N nitro azanylidynemethanesulfonate Chemical group [O-][N+](=O)OS(=O)(=O)C#N LBQAJLBSGOBDQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910000510 noble metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010000785 non-ribosomal peptide synthase Proteins 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 125000001400 nonyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- CSYVMZMEBKUDRQ-BNWDXEGFSA-N nt-2 toxin Chemical compound C([C@@]12[C@@]3(C)[C@@]4(CO)C[C@H](O)C(C)=C[C@H]4O[C@@H]1[C@H](O)[C@H]3OC(=O)C)O2 CSYVMZMEBKUDRQ-BNWDXEGFSA-N 0.000 description 1
- 235000019488 nut oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000010466 nut oil Substances 0.000 description 1
- 239000002417 nutraceutical Substances 0.000 description 1
- 235000021436 nutraceutical agent Nutrition 0.000 description 1
- 229960002446 octanoic acid Drugs 0.000 description 1
- 229930191479 oligomycin Natural products 0.000 description 1
- MNULEGDCPYONBU-AWJDAWNUSA-N oligomycin A Polymers O([C@H]1CC[C@H](/C=C/C=C/C[C@@H](C)[C@H](O)[C@@](C)(O)C(=O)[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)/C=C/C(=O)O[C@@H]([C@@H]2C)[C@@H]1C)CC)[C@@]12CC[C@H](C)[C@H](C[C@@H](C)O)O1 MNULEGDCPYONBU-AWJDAWNUSA-N 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 229920000620 organic polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000002923 oximes Chemical group 0.000 description 1
- 230000020477 pH reduction Effects 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000007110 pathogen host interaction Effects 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000000312 peanut oil Substances 0.000 description 1
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 150000004707 phenolate Chemical class 0.000 description 1
- 235000009048 phenolic acids Nutrition 0.000 description 1
- 150000007965 phenolic acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000005328 phosphinyl group Chemical group [PH2](=O)* 0.000 description 1
- 125000005499 phosphonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- LFGREXWGYUGZLY-UHFFFAOYSA-N phosphoryl Chemical group [P]=O LFGREXWGYUGZLY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 230000029553 photosynthesis Effects 0.000 description 1
- 238000010672 photosynthesis Methods 0.000 description 1
- 230000000243 photosynthetic effect Effects 0.000 description 1
- XNGIFLGASWRNHJ-UHFFFAOYSA-L phthalate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)C1=CC=CC=C1C([O-])=O XNGIFLGASWRNHJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 238000000053 physical method Methods 0.000 description 1
- 230000005080 plant death Effects 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- OYEHPCDNVJXUIW-UHFFFAOYSA-N plutonium atom Chemical compound [Pu] OYEHPCDNVJXUIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 231100000572 poisoning Toxicity 0.000 description 1
- 230000000607 poisoning effect Effects 0.000 description 1
- 231100000719 pollutant Toxicity 0.000 description 1
- 229920001084 poly(chloroprene) Polymers 0.000 description 1
- 229920002492 poly(sulfone) Polymers 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229920006122 polyamide resin Polymers 0.000 description 1
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 description 1
- 229920001083 polybutene Polymers 0.000 description 1
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 1
- 229930001118 polyketide hybrid Natural products 0.000 description 1
- 125000003308 polyketide hybrid group Chemical group 0.000 description 1
- 229920000098 polyolefin Polymers 0.000 description 1
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 description 1
- 229920005990 polystyrene resin Polymers 0.000 description 1
- 239000004814 polyurethane Substances 0.000 description 1
- 229920002635 polyurethane Polymers 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M potassium hydroxide Substances [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 239000010970 precious metal Substances 0.000 description 1
- 238000003825 pressing Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 239000010909 process residue Substances 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000013587 protein N-linked glycosylation Effects 0.000 description 1
- 230000018570 protein O-linked glycosylation Effects 0.000 description 1
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 1
- 230000009822 protein phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 108010025281 pyoverdin Proteins 0.000 description 1
- 101150054232 pyrG gene Proteins 0.000 description 1
- 150000003214 pyranose derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 239000010494 ramtil oil Substances 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 238000004064 recycling Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 238000005067 remediation Methods 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 230000029058 respiratory gaseous exchange Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000008165 rice bran oil Substances 0.000 description 1
- 230000000630 rising effect Effects 0.000 description 1
- 238000010058 rubber compounding Methods 0.000 description 1
- 238000010092 rubber production Methods 0.000 description 1
- 235000005713 safflower oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000003813 safflower oil Substances 0.000 description 1
- NNNVXFKZMRGJPM-KHPPLWFESA-N sapienic acid Chemical compound CCCCCCCCC\C=C/CCCCC(O)=O NNNVXFKZMRGJPM-KHPPLWFESA-N 0.000 description 1
- 235000021003 saturated fats Nutrition 0.000 description 1
- CXMXRPHRNRROMY-UHFFFAOYSA-N sebacic acid Chemical class OC(=O)CCCCCCCCC(O)=O CXMXRPHRNRROMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930000044 secondary metabolite Natural products 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 239000010801 sewage sludge Substances 0.000 description 1
- 230000001568 sexual effect Effects 0.000 description 1
- 101150091813 shfl gene Proteins 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 206010040872 skin infection Diseases 0.000 description 1
- 239000010822 slaughterhouse waste Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- WBHQBSYUUJJSRZ-UHFFFAOYSA-M sodium bisulfate Chemical compound [Na+].OS([O-])(=O)=O WBHQBSYUUJJSRZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910000342 sodium bisulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M sodium dihydrogen phosphate Chemical compound [Na+].OP(O)([O-])=O AJPJDKMHJJGVTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000004328 sodium tetraborate Substances 0.000 description 1
- 235000010339 sodium tetraborate Nutrition 0.000 description 1
- SSJVITCQKXKAAS-UHFFFAOYSA-N solaniol Natural products CC1=C(CC(C)O)C(O)=C2C(=O)C(OC)=CC(=O)C2=C1O SSJVITCQKXKAAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010563 solid-state fermentation Methods 0.000 description 1
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 229940001941 soy protein Drugs 0.000 description 1
- 235000012424 soybean oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000003549 soybean oil Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 235000015096 spirit Nutrition 0.000 description 1
- 230000028070 sporulation Effects 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000010025 steaming Methods 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000001384 succinic acid Substances 0.000 description 1
- 125000000475 sulfinyl group Chemical group [*:2]S([*:1])=O 0.000 description 1
- 229940124530 sulfonamide Drugs 0.000 description 1
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 238000000194 supercritical-fluid extraction Methods 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000031068 symbiosis, encompassing mutualism through parasitism Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- NOTOVTQRFFVBSB-VZPCOZJFSA-N t-2 acetate Chemical compound C([C@@]12[C@]3(C)[C@H](OC(C)=O)[C@@H](OC(C)=O)[C@H]1O[C@H]1[C@]3(COC(C)=O)C[C@@H](C(=C1)C)OC(=O)CC(C)C)O2 NOTOVTQRFFVBSB-VZPCOZJFSA-N 0.000 description 1
- 239000003784 tall oil Substances 0.000 description 1
- 229920001864 tannin Polymers 0.000 description 1
- 239000001648 tannin Substances 0.000 description 1
- 235000018553 tannin Nutrition 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 150000003505 terpenes Chemical class 0.000 description 1
- 235000007586 terpenes Nutrition 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- QZZGJDVWLFXDLK-UHFFFAOYSA-N tetracosanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QZZGJDVWLFXDLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IBYFOBGPNPINBU-UHFFFAOYSA-N tetradecenoic acid Natural products CCCCCCCCCCCC=CC(O)=O IBYFOBGPNPINBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005979 thermal decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009283 thermal hydrolysis Methods 0.000 description 1
- 230000008719 thickening Effects 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 1
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 1
- 235000021404 traditional food Nutrition 0.000 description 1
- HOGWBMWOBRRKCD-BUHFOSPRSA-N trans-2-pentadecenoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCC\C=C\C(O)=O HOGWBMWOBRRKCD-BUHFOSPRSA-N 0.000 description 1
- IBYFOBGPNPINBU-OUKQBFOZSA-N trans-2-tetradecenoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCC\C=C\C(O)=O IBYFOBGPNPINBU-OUKQBFOZSA-N 0.000 description 1
- DPUOLQHDNGRHBS-MDZDMXLPSA-N trans-Brassidic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C\CCCCCCCCCCCC(O)=O DPUOLQHDNGRHBS-MDZDMXLPSA-N 0.000 description 1
- LKOVPWSSZFDYPG-WUKNDPDISA-N trans-octadec-2-enoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCC\C=C\C(O)=O LKOVPWSSZFDYPG-WUKNDPDISA-N 0.000 description 1
- UWHZIFQPPBDJPM-BQYQJAHWSA-N trans-vaccenic acid Chemical compound CCCCCC\C=C\CCCCCCCCCC(O)=O UWHZIFQPPBDJPM-BQYQJAHWSA-N 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 229930013292 trichothecene Natural products 0.000 description 1
- 150000003327 trichothecene derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 101150016309 trpC gene Proteins 0.000 description 1
- 239000012137 tryptone Substances 0.000 description 1
- 239000002383 tung oil Substances 0.000 description 1
- 230000007306 turnover Effects 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DNYWZCXLKNTFFI-UHFFFAOYSA-N uranium Chemical compound [U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U][U] DNYWZCXLKNTFFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- DJJCXFVJDGTHFX-XVFCMESISA-N uridine 5'-monophosphate Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DJJCXFVJDGTHFX-XVFCMESISA-N 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 229910052720 vanadium Inorganic materials 0.000 description 1
- GPPXJZIENCGNKB-UHFFFAOYSA-N vanadium Chemical compound [V]#[V] GPPXJZIENCGNKB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- LLMKLMMXMOTPRU-YOAXHERRSA-N vibriobactin Chemical compound O=C([C@@H]1N=C(O[C@H]1C)C=1C(=C(O)C=CC=1)O)NCCCN(C(=O)[C@@H]1[C@H](OC(=N1)C=1C(=C(O)C=CC=1)O)C)CCCNC(=O)C1=CC=CC(O)=C1O LLMKLMMXMOTPRU-YOAXHERRSA-N 0.000 description 1
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 238000004065 wastewater treatment Methods 0.000 description 1
- 238000009279 wet oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000004823 xylans Chemical class 0.000 description 1
- 108010083879 xyloglucan endo(1-4)-beta-D-glucanase Proteins 0.000 description 1
- 238000004383 yellowing Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
- C12N1/145—Fungal isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/22—Processes using, or culture media containing, cellulose or hydrolysates thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P3/00—Preparation of elements or inorganic compounds except carbon dioxide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
- C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
- C12P7/06—Ethanol, i.e. non-beverage
- C12P7/065—Ethanol, i.e. non-beverage with microorganisms other than yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
- C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
- C12P7/06—Ethanol, i.e. non-beverage
- C12P7/08—Ethanol, i.e. non-beverage produced as by-product or from waste or cellulosic material substrate
- C12P7/10—Ethanol, i.e. non-beverage produced as by-product or from waste or cellulosic material substrate substrate containing cellulosic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/64—Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
- C12P7/6436—Fatty acid esters
- C12P7/6445—Glycerides
- C12P7/6458—Glycerides by transesterification, e.g. interesterification, ester interchange, alcoholysis or acidolysis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/64—Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
- C12P7/6436—Fatty acid esters
- C12P7/6445—Glycerides
- C12P7/6463—Glycerides obtained from glyceride producing microorganisms, e.g. single cell oil
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/64—Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
- C12P7/6436—Fatty acid esters
- C12P7/649—Biodiesel, i.e. fatty acid alkyl esters
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P2203/00—Fermentation products obtained from optionally pretreated or hydrolyzed cellulosic or lignocellulosic material as the carbon source
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/645—Fungi ; Processes using fungi
- C12R2001/77—Fusarium
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02E—REDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
- Y02E50/00—Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
- Y02E50/10—Biofuels, e.g. bio-diesel
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Botany (AREA)
- Mycology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
Изобретения относятся к выделенному штамму грибов ацидофильного Fusarium oxysporum, продуцирования высокоэнергетического метаболита, представляющего собой липид, этанол и/или водород, способам применения указанного штамма и композиции, содержащей указанный штамм. Предложен выделенный штамм Fusarium МК7, депонированный как ATCC под номером PTA-10698 и продуцирующий высокоэнергетический метаболит, представляющий собой липид, этанол и/или водород. Предложены также способы получения высокоэнергетического метаболита с использованием указанного штамма, а также композиция для продуцирования высокоэнергетического метаболита, представляющего собой липид, этанол и/или водород. Предложен способ культивирования указанного штамма. Изобретения обеспечивают эффективную продукцию высокоэнергетического метаболита, представляющего собой липид, этанол и/или водород. 6 н. и 34 з.п. ф-лы, 7 ил., 1 табл., 7 пр.
Description
ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ
В данной заявке заявлен приоритет предварительной заявки США 62/020,607, поданной 3 июля 2014 года, и предварительной заявки США 62/061,076, поданной 7 октября 2014, каждая из которых включена в данную заявку посредством ссылки во всей полноте для всех целей.
ОПИСАНИЕ ТЕКСТОВОГО ФАЙЛА, ПРЕДСТАВЛЕННОГО В ЭЛЕКТРОННОМ ВИДЕ
Содержание текстового файла, представленного в электронном виде, включено в данное описание посредством ссылки во всей его полноте. Копия перечня последовательностей в машиночитаемом формате (имя файла: MONT_151_03US_ST25.txt, дата записи: 1 июля, 2015, размер файла 2 килобайта).
ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Эта заявка относится к новым выделенным штаммам грибов ацидофильного Fusarium oxysporum (например МК7), к их потомству, к способам получения таких выделенных штаммов грибов и их потомства, и к способам применения таких выделенных штаммов грибов и их потомства для создания полезных процессов и продуктов. Например, выделенные штаммы грибов и их потомство могут быть использованы для превращения лигноцеллюлозного сырья, биомассы водорослей и глицерина в высокоэнергетические метаболиты для производства биоэнергии, для получения ферментов, антибиотиков, более конкретно жирных кислот и липидов (например восков) для промышленного применения, для депарафинизации соломы и для нейтрализации кислоты и связывания тяжелых металлов.
ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Fusarium (синонимы: Fusisporium, Pseudofusarium, Sporotrichella) представляет собой большой род нитчатых грибов, широко распространенных в почве и совместно с растениями. Большинство видов являются безвредными сапрофитами и относительно распространенными членами микробного сообщества почвы. Некоторые виды производят микотоксины в зерновых культурах, которые могут влиять на здоровье человека и животных, если они входят в пищевую цепь. Основные токсины, вырабатываемые этими видами Fusarium, представляют собой фумонизины и трихотецины.
Штаммы Fusarium, выделенные из природы, оказались полезными для людей в самых разнообразных технологиях, включая применение в качестве продуктов питания и для производства антибиотиков. Все еще существует необходимость в новых изолятах Fusarium для использования в новых и существующих применениях. В настоящем изобретении предложен уникальный выделенный штамм Fusarium и его потомство, которые пригодны для множества разных целей, включая, но без ограничения ими, производство биоэнергии, в качестве биологические смазок, для биоизвлечения драгоценных металлов посредством биосорбции, для ремедиации шахтных отходов, для депарафинизации пшеничной соломы, для расщепления биомассы водорослей, и глицерин-содержащих отходов и для получения антибиотиков, сидерофоров, и пластификаторов.
КРАТКОЕ ИЗЛОЖЕНИЕ СУЩНОСТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
В настоящем изобретении предложены выделенные штаммы грибов ацидофильного Fusarium oxysporum, такие как выделенный штамм, обозначенный МК7, который был депонирован как АТСС депозит номер РТА-10698, и/или его потомство. "Потомство", при использовании здесь, относится к любому или ко всем потомкам линии, которая происходит от выделенного штамма, независимо от того, как и где они получены. В определение "потомства", используемого в данном описании, включены любые или все мутанты выделенного/депонированного штамма и его потомства, если эти мутанты имеют все физиологические и морфологические характеристики выделенного/депонированного штамма и его потомства.
В одном воплощении настоящего изобретения предложен выделенный ацидофильный штамм гриба Fusarium oxysporum, расщепляющий лигноцеллюлозу, или его потомство, где выделенный штамм гриба Fusarium oxysporum обладает по меньшей мере следующими идентифицирующими характеристиками:
а) выделенный штамм является ацидофильным и может расти при pH в диапазоне от примерно 0,7 до примерно 7,5; и
б) способен продуцировать липиды из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов или их комбинации в аэробных или по существу аэробных условиях;
В одном воплощении выделенный штамм по настоящему изобретению дополнительно имеет одну или более следующих дополнительных идентифицирующих характеристик:
в) способен продуцировать этанол и/или водород из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов или их комбинации в анаэробных или по существу анаэробных условиях;
г) способен выдерживать концентрации Mn вплоть до 25 мМ, концентрации As вплоть до 250 мМ или 300 мМ, и концентрации Hg вплоть до 100 мМ;
д) способен депарафинизировать пшеничную солому и другой растительный материал;
е) способен продуцировать липиды из водорослевого сырья и из отходов, образующихся при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) в аэробных или по существу аэробных условиях;
ж) способен продуцировать этанол и/или водород из водорослевого сырья и из отходов, образующихся при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) в анаэробных или анаэробных условиях;
з) способен продуцировать диизооктилфталат (DIOP);
и) способен продуцировать гександионовой кислоты моно(2-этилгексил)овый сложный эфир; и
к) содержит 18S рРНК и ДНК последовательность ITS (внутреннего транскрибируемого участка), которая обладает по меньшей мере 98% идентичностью с SEQ ID NO: 1.
В некоторых воплощениях лигноцеллюлозное сырье, используемое выделенным штаммом и его потомством, выбрано из группы, состоящей из остатков сельскохозяйственных культур (например пшеничной соломы, ячменной соломы, рисовой соломы, соломы мелкозерных злаков, стеблей кукурузы, кукурузных волокон (например камеди кукурузных волокон (CFG), сушеной барды (DDG), кукурузной глютеновой муки (CGM)), проса, сена люцерны, жома сахарного тростника), несельскохозяйственной биомассы (например тины, остатков городских деревьев), лесных продуктов и промышленных отходов (например остатков первичного/вторичного измельчения деревьев с мягкой древесиной, остатков первичного/вторичного измельчения деревьев с твердой древесиной, шлама бумажной массы вторичной бумаги), лигноцеллюлоза-содержащих отходов (например газетной бумаги, бумажных отходов, зерна от пивоварения, использованной резиновой шины (UTR), городских органических отходов, дворовых отходов, клинических органических отходов и отходов, образующихся при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) и их комбинации. В некоторых воплощениях углеводы выбраны из группы, состоящей из моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов и их смеси.
В некоторых воплощениях указанный выделенный штамм гриба и его потомство могут расти и/или размножаться при pH в диапазоне от примерно 0,7 до примерно 7,0. Например, штаммы и потомство по настоящему изобретению способны расти и/или размножаться при pH, составляющим по меньшей мере примерно 7,0, по меньшей мере примерно 6,5, по меньшей мере примерно 6,0, по меньшей мере примерно 5,5, по меньшей мере примерно 5,0, по меньшей мере примерно 4,5, по меньшей мере примерно 4,0, по меньшей мере примерно 3,5, по меньшей мере примерно 3,0, по меньшей мере примерно 2,5, по меньшей мере примерно 2,0, по меньшей мере примерно 1,9, по меньшей мере примерно 1,8, по меньшей мере примерно 1,6, по меньшей мере примерно 1,4, по меньшей мере примерно 1,2, по меньшей мере примерно 1,0, по меньшей мере примерно 0,9, по меньшей мере примерно 0,8, по меньшей мере примерно 0,75, по меньшей мере примерно 0,7, по меньшей мере примерно 0,65, по меньшей мере примерно 0,6 или по меньшей мере примерно 0,55.
В некоторых воплощениях выделенный штамм гриба и его потомство устойчивы к высоким концентрациям других металлов, выбранных из группы, состоящей из Ag, Zn, Fe, A3., Be, Pb, Cu, Cr, Ni, Cd, Co, Ni, Pd, Pt, U, Th, Mo, Sn, Ti, As, Au, Se, Sb и Hg.
Выделенный штамм Fusarium oxysporum и его потомство по настоящему изобретению можно культивировать без антибиотиков с небольшим загрязнением или без загрязнения другими организмами, где указанные другие организмы могут быть выбраны из группы, состоящей из других бактериальных штаммов, родов или видов, других грибов (например дрожжей, плесени), морских водорослей, вирусов, растений, насекомых и любой их комбинации.
В настоящем изобретении также предлагается биологически чистая культура, имеющая одну или более идентифицирующих характеристик выделенного штамма гриба Fusarium oxysporum или его потомства, как описано в данном документе. В одном воплощении биологически чистая культура содержит выделенный штамм гриба Fusarium oxysporum, обозначенный как МК7, который был депонирован как АТСС депозит номер РТА-10698, и/или его потомство. В одном воплощении указанный выделенный штамм гриба и/или его потомство находится в форме конидии, пикниды, хламидоспор, фрагментов гиф или любой и всех их комбинаций.
В настоящем изобретении кроме того предлагается композиция, содержащая выделенный штамм гриба Fusarium oxysporum и/или его потомство, обладающий по меньшей мере одной или более идентифицирующими характеристиками, как описано в данном описании изобретения. В одном воплощении выделенный штамм гриба представляет собой МК7 и/или его потомство. В одном воплощении указанные композиции содержат выделенный штамм гриба и/или его потомство в форме конидии, пикниды, хламидоспор, фрагментов гиф или любой и всех их комбинаций. В некоторых воплощениях композиция дополнительно содержит один или более компонентов, выбранных из группы, состоящей из среды, которая поддерживает рост штамма гриба, подкисляющего вещества, донора марганца, пищевой добавки и любой или всех смесей этих компонентов. В одном воплощении среда является твердой. В другом воплощении среда является жидкой.
В настоящем изобретении также предлагаются способы получения полезных продуктов с использованием указанного выделенного штамма грибов и/или его потомства, включающие:
а) получение смеси одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или его потомства с исходным сырьем, выбранным из группы, состоящей из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих сельскохозяйственных и бытовых отходов, углеводов, мономеров сахара, дрожжевого экстракта, казаминовых кислот и их комбинации в контейнере, в котором указанное вещество может поддерживать рост указанного выделенного штамма гриба; и
б) выращивание указанного выделенного штамма гриба в указанной смеси с получением одного или более полезных продуктов.
В одном воплощении смесь находится в аэробных условиях или по существу в аэробных условиях. В другом воплощении, смесь находится в анаэробных условиях или по существу в анаэробных условиях.
В одном воплощении указанные полезные продукты представляют собой один или более высокоэнергетических метаболитов. Например, полезные продукты, продуцируемые с использованием грибов и способов по настоящему изобретению, включают, без ограничения ими, биотопливо и/или предшественников биотоплива. В одном воплощении смесь находится в аэробных условиях или по существу в аэробных условиях и указанные высокоэнергетические метаболиты представляют собой, главным образом, липиды, где липиды могут быть экстрагированы из биомассы выделенных штаммов грибов и/или его потомства. В одном воплощении указанные липиды представляют собой по существу жирные кислоты. В одном воплощении указанные жирные кислоты представляют собой, главным образом, ненасыщенные жирные кислоты и/или насыщенные жирные кислоты. В одном воплощении указанные ненасыщенные жирные кислоты выбраны из группы, состоящей из олеиновой кислоты (18:1), α-линоленовой кислоты (18:3), эйкозеновой кислоты (20:1) и их комбинации. В одном воплощении указанные насыщенные жирные кислоты выбраны из группы, состоящей из пальмитиновых кислот (16:0), стеариновых кислот (18:0), арахиновой кислоты (20:0), бегеновой кислоты (22:0), и любой или всех их комбинаций. В одном воплощении липиды экстрагируют и используют для получения биологических смазок. В одном воплощении смесь находится в анаэробных условиях или по существу анаэробных условиях и указанные высокоэнергетические метаболиты представляют собой, главным образом, спирты и/или водород. В некоторых воплощениях указанный спирт является этиловым спиртом, бутанолом и/или изобутанолом.
В одном воплощении указанные полезные продукты представляют собой нафтазариновые пигменты. В другом воплощении указанные нафтазариновые пигменты собирают и используют для получения пестицидов, выбранных из группы, состоящей из антибиотиков, фунгицидов, гербицидов, дрожжецидов и инсектицидов.
В одном воплощении указанные полезные продукты представляют собой сидерофоры.
В одном воплощении указанные полезные продукты представляют собой пластификаторы, например диизооктилфталат (DIOP, CAS 117-81-7) и/или гександионовую кислоту, моно(2-этилгексил)овый эфир (или 2-этилгексил-гидроадипат, CAS 4337-65-9).
По сравнению с методами, ранее известными в данной области техники, настоящее изобретение является уникальным по меньшей мере в том, что процесс производства, описанный в данном описании изобретения, является очень простым в исполнении, в результате чего исходное сырье превращается непосредственно в липиды с высоким выходом в кислых условиях. В одном воплощении лигноцеллюлозное сырье выбрано из группы, состоящей из остатков сельскохозяйственных культур (например пшеничной соломы, ячменной соломы, рисовой соломы, соломы мелкозерных злаков, стеблей кукурузы, кукурузных волокон (например камеди кукурузных волокон (CFG), сушеной барды (DDG), кукурузной глютеновой муки (CGM)), проса, сена люцерны, жома сахарного тростника), несельскохозяйственной биомассы (например тины, остатков городских деревьев), лесных продуктов и промышленных отходов (например остатков первичного/вторичного измельчения дерева с мягкой древесиной, остатков первичного/вторичного измельчения дерева с твердой древесиной, шлама бумажной массы вторичной бумаги), лигноцеллюлоза-содержащих отходов (например газетной бумаги, бумажных отходов, зерна от пивоварения, использованной резиновой шины (UTR), городских органических отходов, дворовых отходов, клинических органических отходов и отходов, полученных при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) и любой или всех их комбинаций. В одном воплощении указанные углеводы выбраны из группы, состоящей из моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов и их комбинации.
В одном воплощении указанные мономеры сахара выбраны из группы, состоящей из триоз, тетроз, пентоз, гексоз, гептоз и др. и любой и всех их комбинаций. В одном воплощении указанные пентозы выбраны из группы, состоящей из рибулозы, ксилулозы, рибозы, арабинозы, ксилозы, ликсозы, дезоксирибозы и любой и всех их комбинаций. В одном воплощении указанные гексозы выбраны из группы, состоящей из аллозы, альтрозы, глюкозы, маннозы, глюкозы, идозы, галактозы, талозы, псикозы, фруктозы, сорбозы, тагатозы и любой и всех их комбинаций.
В одном воплощении указанная смесь дополнительно содержит по меньшей мере один компонент, выбранный из группы, состоящей из подкисляющих веществ, донора марганца, пищевых добавок, pH-буферных веществ и любой и всех их комбинаций.
В некоторых воплощениях указанная смесь имеет исходное значение pH от примерно 0,5 до примерно 3,0. В других воплощениях указанная смесь имеет исходное значение pH от примерно 3,0 до примерно 7,0. pH определяют на основе продуктов. Например, продуцирование высокого уровня липидов происходит в дипазоне pH 2,0-7,0, производство этанола происходит при pH 3-4,5 и производство H2 происходит в диапазоне 2,0-7,0.
В настоящем изобретении также предложены способы производства биотоплива или предшественника биотоплива с использованием одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства, где указанные способы включают:
а) получение смеси одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства с исходным сырьем, выбранным из группы, состоящей из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов, мономеров сахара и любых и всех их комбинаций в контейнере, в котором указанное сырье может поддерживать рост указанных выделенных штаммов грибов; и
б) выращивание указанного выделенного штамма гриба в указанной смеси с получения одного или более типов высокоэнергетических метаболитов в качестве биотоплива и/или предшественников биотоплива;
в) сбор указанных высокоэнергетических метаболитов; и
г) при необходимости получение биотоплива из указанных предшественников биотоплива.
В одном воплощении указанное биотопливо представляет собой биодизель. В другом воплощении указанное биотопливо представляет собой биоспирты. В еще одном воплощении указанное биотопливо представляет собой биогаз.
В настоящем изобретении также предложены способы предварительной обработки целлюлозных отходов и одновременного превращения в высокоэнергетические метаболиты с использованием одного или более выделенных грибных штаммов и/или их потомства, где указанные способы включают:
а) получение смеси одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства с целлюлозными отходами в контейнере; и
б) выращивание указанного выделенного штамма гриба и/или его потомства в указанной смеси, где целлюлозные отходы разрушаются и одновременно образуются высокоэнергетические метаболиты.
В одном воплощении целлюлозные отходы могут поддерживать рост указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства. В другом воплощении в смесь также добавляют дополнительные соединения, которые необходимы для роста указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства, где дополнительные соединения не обеспечиваются целлюлозными отходами. Такие соединения включают, без ограничения ими, макронутриенты, микронутриенты и их комбинацию. В еще одном воплощении в смесь также могут быть добавлены соединения, которые могут облегчать предварительную обработку. Такие соединения включают, без ограничения ими, подкисляющие вещества, источники марганца, питательные вещества, pH-буферные вещества.
В настоящем изобретении также предложены способы детоксикации жидких отходов, содержащих металлы и/или извлечения металлов из указанных жидких отходов посредством биосорбции с использованием одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства, включающие получение смеси одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства с отходами, содержащими один или более типов благородных металлов, где жидкие отходы детоксифицируют и/или металлы извлекают посредством биосорбции.
В одном воплощении жидкие отходы могут поддерживать рост указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства. В другом воплощении также добавляют в смесь дополнительные соединения, необходимые для роста указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства, где дополнительные соединения не обеспечиваются жидкими отходами. Такие соединения включают, без ограничения ими, макронутриенты, микронутриенты и их комбинации. В одном воплощении биосорбция осуществляется посредством сидерофоров, продуцируемых в выделенном штамме гриба. В одном воплощении отходы представляют собой стоки от добычи полезных ископаемых и промышленности. В одном воплощении металл выбран из группы, состоящей из Mn, Ag, Zn, Fe, Al, Be, Pb, Cu, Cr, Ni, Cd, Co, Ni, Pd, Pt, U, Th, Mo, Sn, Ti, As, Au, Hg и любой и всех их комбинаций. Общая концентрация иона(ов) металла или концентрация определенного иона металла в жидкости составляет по меньшей мере 0,1 млн-1, 1 млн-1, или 10 млн-1, или 100 млн-1, или 1000 млн-1, или 10000 млн-1, или 10000 млн-1, или 100000 млн-1 по массе. Например, концентрация определенного иона металла в жидкости выше, чем требования в Federal Hazard Waste Codes EPA D004 - EPAD013.
В настоящем изобретении также предложены способы нейтрализации pH кислых жидкостей с использованием одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства, включающие получение смеси одного или более указанных выделенных штаммов грибов с кислой жидкостью, где pH кислых жидкостей нейтрализуется. В одном воплощении кислая жидкость представляет собой кислый шахтный дренаж. В одном воплощении кислые жидкости могут поддерживать рост указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства. В другом воплощении в смесь также добавляют дополнительные соединения, необходимые для роста указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства, когда кислые жидкости не обеспечивают эти дополнительные соединения. Такие соединения включают, без ограничения ими, углеродсодержащее сырье, макронутриенты, микронутриенты и любую и все их комбинации.
В настоящем изобретении также предлагаются устойчивые к кислоте ферменты или части устойчивых к кислоте ферментов, и нуклеиновые кислоты, кодирующие такие ферменты, части устойчивых к кислоте ферментов или их варианты, где такие ферменты продуцируются выделенным штаммом и/или его потомством.
В настоящем изобретение также предлагаются мутантные или рекомбинантные грибные штаммы, происходящие от штамма грибов и/или его потомства по настоящему изобретению.
В настоящем изобретении также предложены способы использования выделенных штаммов грибов ацидофильного Fusarium oxysporum, такого как выделенный штамм, обозначенный как МК7, для прямого превращения широкого спектра сырья, такого как пшеничная солома, стебли кукурузы и промышленные побочные продукты (например мелассы, глицерин) в полезные липидные продукты, такие как омега-7 жирные кислоты и/или воски с высокой температурой плавления.
В настоящем изобретении также предлагаются простые, новые и рентабельные способы превращения лигноцеллюлозных и других отходов в ценные липиды с использованием выделенных штаммов грибов ацидофильного Fusarium oxysporum, таких как выделенный штамм, обозначенный как МК7, который способен выдерживать экстремальные кислотные условия и продуцировать эффективные ферменты для разложения целлюлозы, лигнина и гемицеллюлозы. Организм накапливает высокие концентрации ценных липидов в рентабельном "одностадийном" способе.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения раскрыт способ получения высокоэнергетического субстрата, включающий приведение источника углерода в контакт с выделенным штаммом Fusarium oxysporum с образованием смеси, инкубирование указанной смеси в течение некоторого периода времени и получение высокоэнергетического субстрата в результате такого контакта.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения раскрыт штамм МК7 Fusarium oxysporum, репрезентативный образец которого был депонирован как АТСС депозит номер РТА-10698.
В некоторых воплощениях в способах получения высокоэнергетических субстратов по настоящему изобретению используют штамм Fusarium oxysporum с последовательностью рРНК, раскрытой в SEQ ID NO: 1.
В некоторых воплощениях в данном описании изобретения раскрыто, что источник углерода, используемый в способах по настоящему изобретению, представляет собой биомассу.
В некоторых воплощениях в данном описании изобретения раскрыто, что источник углерода, используемый в способах по настоящему изобретению, представляет собой целлюлозную биомассу.
В некоторых воплощениях в данном описании изобретения раскрыто, что источник углерода, используемый в способах по настоящему изобретению, представляет собой лигноцеллюлозное сырье или лигноцеллюлозные отходы.
В некоторых воплощениях в данном описании изобретения раскрыто, что источник углерода, используемый в способах по настоящему изобретению, представляет собой углевод.
В некоторых воплощениях в данном описании изобретения раскрыты, способы, в которых штамм Fusarium oxysporum и источник углерода инкубируют в анаэробных или микроаэробных условиях.
В некоторых воплощениях посредством способов по настоящему изобретению продуцируют высокоэнергетический субстрат, где указанный высокоэнергетический субстрат выбран из группы, состоящей из этанола и газообразного водорода.
В некоторых воплощениях в настоящем изобретении раскрыта стадия предварительной обработки, выбранная из группы, выбранной из: снижения pH смеси источника углерода и Fusarium oxysporum, добавления марганца к смеси источника углерода и Fusarium oxysporum, и добавления питательного вещества к смеси источника углерода и Fusarium oxysporum перед стадией инкубации.
В некоторых воплощениях высокоэнергетический субстрат, полученный способами по настоящему изобретению, представляет собой липид, этанол и/или водород.
В некоторых воплощениях высокоэнергетический субстрат, получаемый посредством способов по настоящему изобретению, представляет собой липид.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения раскрыт способ получения одного или более высокоэнергетических метаболитов с использованием штамма Fusarium oxysporum, включающий стадии: а) получения смеси штамма МК7 Fusarium oxysporum и/или его потомства с исходным сырьем, выбранным из группы, состоящей из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов и их комбинации, в контейнере, где сырье может поддерживать рост указанного штамма МК7 и/или его потомства; б) выращивание указанного штамма МК7 в указанной смеси с получением одного или более высокоэнергетических метаболитов; и в) возможно, выделение указанных одного или более высокоэнергетических метаболитов из смеси; где репрезентативный образец указанного штамма МК7 депонирован как АТСС депозит номер РТА-10698.
В некоторых воплощениях настоящего изобретения раскрыты способы получения высокоэнергетических субстратов из сырья пшеничной соломы.
В некоторых воплощениях высокоэнергетический субстрат, полученный способами по настоящему изобретению, представляет собой этанол.
В некоторых воплощениях высокоэнергетический субстрат, полученный способами по настоящему изобретению, представляет собой газообразный водород.
В некоторых воплощениях, высокоэнергетический субстрат, полученный способами по настоящему изобретению, представляет собой метиловый эфир жирной кислоты (FAME).
В некоторых воплощениях настоящего изобретения раскрыты FAME, выбранные из группы, состоящей из метилтетрадеканоата, метилгексадец-9-еноата, метилового эфира гексадекановой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, конъюгированной линолевой кислоты, линоленовой кислоты, метил-11-октадеценоата, метилового эфира октадекановой кислоты, метилового эфира эйкозановой кислоты, метилового эфира докозановой кислоты и метилового эфира тетракозановой кислоты.
В некоторых воплощениях в настоящем описании изобретения раскрыто, что FAME, полученный способами по настоящему изобретению, представляет собой омега-7 вакценовую кислоту.
В некоторых воплощениях в настоящем описании изобретения раскрыто, что смесь Fusarium и источника энергии (например источника углерода или сырья) инкубируют в анаэробных или микроаэробных условиях.
В некоторых воплощениях способы по настоящему изобретению включают стадию предварительной обработки, выбранную из группы, состоящей из: снижения рН смеси, добавления марганца к смеси и добавления питательного вещества к смеси.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ
На Фиг. 1 показан способ по изобретению, в котором используется штамм МК7 Fusarium oxysporum, новый ацидофильный гриб, и/или его потомство для непосредственного превращения лигноцеллюлозного сырья, 5- и 6-углеродных сахаров и биомассы водорослей в высокоэнергетические субстраты, включающие липиды, этанол и водород. Кроме того, гриб можно использовать для производства ферментов и антибиотиков для промышленного применения. Кроме того, гриб способен нейтрализовать кислоту и связывать тяжелые металлы для ремедиации кислого шахтного дренажа.
На Фиг. 2 показана грибная биомасса через 7 суток роста на пшеничной соломе при pH 2,5 в аэробных условиях. Этот грибной мат готов к экстракции липидов.
На Фиг. 3 показана общая продукция липидов штаммом Fusarium МК7 и/или его потомством в виде доли от исходной глюкозы или пшеничной соломы. Процентное содержание пшеничной соломы (4% или 8%) указывает исходную массу пшеничной соломы к объему воды. Величины ошибки показывают стандартные отклонения в трех экспериментах.
На Фиг. 4 показана оптическая микроскопия (слева) штамма Fusarium МК7 и/или его потомства, культивируемого на пшеничной соломе при pH 2,5 через 10 суток. Идентичное изображение, полученное с использованием флуоресцентной микроскопии клеток, окрашенных Nile Red (справа), ясно указывает на значительное продуцирование липидов (Nile Red specifically stains lipids, Cooksey et al., 1987).
На Фиг. 5 показан профиль жирных кислот штамма Fusarium МК7 и/или его потомства, культивированного на пшеничной соломе при pH 2,5 через 10 суток.
На Фиг. 6 показаны выходы этанола в граммах этанола, полученного на грамм сухого сырья пшеничной соломы или глюкозы.
На Фиг. 7 показаны профили липидов, продуцируемых штаммом МК7.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Определение
При использовании в данном описании и в формуле изобретения глагол "содержать" и его спряжения используются в их неограничивающем смысле, означающем, что элементы, следующие за этим словом, включены, но элементы, не указанные конкретно, не исключены. Кроме того, ссылка на элемент посредством неопределенного артикля "a" или "an" не исключает возможности того, что присутствует более чем один элемент, если контекст явно не требует того, чтобы это был один и только один из элементов. Неопределенный артикль "a или "an" таким образом обычно означает "по меньшей мере один".
При использовании здесь, термин "происходящий из (от)" относится к происхождению или источнику и может включать природные, рекомбинантные, неочищенные или очищенные молекулы. Белки и молекулы по настоящему изобретению могут происходить из гриппозных или негриппозных молекул.
При использовании здесь, термин "микроаэробный" относится к среде, в которой концентрация кислорода меньше, чем концентрация кислорода в воздухе.
При использовании здесь, термин "химерный белок" относится к конструкции, которая связывает по меньшей мере два гетерологичных белка в одной макромолекуле (слитого белка).
При использовании здесь, термин "нуклеиновая кислота" относится к полимерной форме нуклеотидов любой длины, либо рибонуклеотидов, либо дезоксирибонуклеотидов, или к их аналогам. Этот термин относится к первичной структуре молекулы и таким образом включает двух- и одноцепочечную ДНК, а также двух- и одноцепочечную РНК. Он также включает модифицированные нуклеиновые кислоты, такие как метилированные и/или кэппированные нуклеиновые кислоты, нуклеиновые кислоты, содержащие модифицированные основания, модификации каркаса и тому подобное. Термины "нуклеиновая кислота" и "нуклеотидная последовательность" используются взаимозаменяемо.
При использовании здесь, термин "ген" относится к нуклеиновой кислоте или части нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность, которая кодирует белок. В данной области техники очевидно, что ген также содержит некодирующие последовательности, такие как 5'- и 3'-фланкирующие последовательности (такие как промоторы, энхансеры, репрессоры и другие регуляторные последовательности), а также интроны.
Используемые здесь термины "полинуклеотид", "полинуклеотидная последовательность", "нуклеиновокислотная последовательность", "фрагмент нуклеиновой кислоты" и "выделенный фрагмент нуклеиновой кислоты" используются взаимозаменяемо в данном описании изобретения. Эти термины охватывают нуклеотидные последовательности и тому подобное. Полинуклеотид может представлять собой полимер РНК или ДНК, который является одноцепочечным или двухцепочечным, который возможно содержит синтетические, неприродные или измененные нуклеотидные основания. Полинуклеотид в форме полимера ДНК может состоять из одного или более сегментов кДНК, геномной ДНК, синтетической ДНК или их смесей. Нуклеотиды (обычно находящиеся в форме 5'-монофосфата) указаны посредством однобуквенного обозначения следующим образом: "A" для аденилата или дезоксиаденилата (для РНК или ДНК соответственно), "C" для цитидилата или дезоксицитидилата, "G" для гуанилата или дезоксигуанилата, "U" для уридилата, "T" для дезокситимидилата, "R" для пуринов (A или G), "Y" для пиримидинов (C или T), "K" для G или T, "H" для A или C или T, "I" для инозина, и "N" для любого нуклеотида.
При использовании здесь, термины "полипептид", "пептид" и "белок" используются взаимозаменяем и относятся к полимерам аминокислот любой длины. Эти термины также включают белки, которые являются посттрансляционно модифицрованными посредством реакций, включающих гликозилирование, ацетилирование и фосфорилирование.
При использовании здесь, термин "гомологичный" или "гомолог" или "ортолог" известен в данной области техники и относится к родственным последовательностям, которые имеют общего родоначальника или члена семейства и определяются, исходя из степени идентичности последовательности. Эти термины описывают взаимосвязь между геном, обнаруженным в одном виде, подвиде, разновидности, культиваре или штамме, и соответствующим или эквивалентным геном в другом виде, подвиде, разновидности, культиваре или штамме. В контексте настоящего изобретения гомологичные последовательности сравнивают. "Гомологичные последовательности", или "гомологи", или "ортологи", как полагают, считают или знают, являются функционально родственными. Функциональное родство может быть указано любым из ряда способов, включая, без ограничения ими: (а) степень идентичности последовательности, и/или (б) такая же или подобная биологическая функция. Предпочтительно, когда указаны оба (а) и (б). Степень идентичности последовательности может варьироваться, но в одном воплощении составляет по меньшей мере 50% (при использовании стандартных программ выравнивания последовательности, известных в данной области техники), по меньшей мере 60%, по меньшей мере 65%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере примерно 91%, по меньшей мере примерно 92%, по меньшей мере примерно 93%, по меньшей мере примерно 94%, по меньшей мере примерно 95%, по меньшей мере примерно 96%, по меньшей мере примерно 97%, по меньшей мере примерно 98%, или по меньшей мере 98,5%, или по меньшей мере примерно 99%, или по меньшей мере 99,5%, или по меньшей мере 99,8%, или по меньшей мере 99,9%. Гомология может быть определена с использованием компьютерных программ, доступных в данной области техники, таких как программы, обсуждаемые в Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel et al, eds., 1987) Supplement 30, section 7.718, Table 7.71. Некоторые программы выравнивания представляют собой Mac Vector (Oxford Molecular Ltd, Oxford, U.K.) и ALIGN Plus (Scientific and Educational Software, Pennsylvania). Другая программа выравнивания представляет собой Sequencher (Gene Codes, Ann Arbor, Michigan) с использованием базовых параметров.
При использовании здесь, термин "изменение нуклеотида" относится, например, к замене, делеции и/или вставке нуклеотида, хорошо известным в данной области техники. Например, мутации могут представлять собой мутации, которые содержат изменения, вызывающие молчащие замены, добавления или делеции, но не изменяют свойства или активности кодируемого белка или то, каким образом получают эти белки.
При использовании здесь, термин "модификация белка" относится, например, к аминокислотным заменам, аминокислотным модификациям, делециям и/или вставкам, хорошо известным в данной области техники.
При использовании здесь, термин "происходящий из (от)" относится к происхождению или источнику и может включать природные, рекомбинантные, неочищенные или очищенные молекулы. Нуклеиновая кислота или аминокислота, имеющая какое-либо происхождение или происходящая из какого-либо источника, может иметь все виды нуклеотидных изменений или модификаций белка, определенные выше. Грибы, происходящие от конкретного выделенного штамма гриба и/или его потомства, могут содержать некоторые мутации, но по-прежнему сохраняют один, два или более, или все из характерных морфологических и физиологических характеристик выделенного гриба или его потомства, от которого они были получены.
При использовании здесь, термин "ацидофильный" относится к организму, чей оптимальный рост происходит в кислых условиях.
При использовании здесь, термин "агент", означает биологическое или химическое соединение, такое как простая или сложная органическая или неорганическая молекула, пептид, белок или олигонуклеотид, которые модулируют функцию нуклеиновой кислоты или полипептида. Широкий спектр соединений может быть синтезирован, например олигомеры, такие как олигопептиды и олигонуклеотиды, и синтетические органические и неорганические соединения на основе различных коровых структур, и все они также включены в термин "агент". Кроме того, различные природные источники, такие как растительные или животные экстракты и тому подобное, могут обеспечивать соединения для скрининга. Соединения могут быть протестированы отдельно или в комбинации друг с другом.
При использовании здесь, термин "по меньшей мере часть" в отношении нуклеиновой кислоты или полипептида означает часть, имеющую минимальные характеристики размера таких последовательностей или любой более крупный фрагмент полноразмерной молекулы, вплоть до и включая полноразмерную молекулу. Например, часть нуклеиновой кислоты может иметь 12 нуклеотидов, 13 нуклеотидов, 14 нуклеотидов, 15 нуклеотидов, 16 нуклеотидов, 17 нуклеотидов, 18 нуклеотидов, 19 нуклеотидов, 20 нуклеотидов, 22 нуклеотида, 24 нуклеотида, 26 нуклеотидов, 28 нуклеотидов, 30 нуклеотидов, 32 нуклеотида, 34 нуклеотида, 36 нуклеотидов, 38 нуклеотидов, 40 нуклеотидов, 45 нуклеотидов, 50 нуклеотидов, 55 нуклеотидов и так далее, вплоть до полноразмерной нуклеиновой кислоты. Аналогично, часть полипептида может иметь 4 аминокислоты, 5 аминокислот, 6 аминокислот, 7 аминокислот и так далее, вплоть до полноразмерного полипептида. Длина используемого участка будет зависеть от конкретного применения. Часть нуклеиновой кислоты, полезной в качестве гибридизационного зонда, может быть такой короткой, как 12 нуклеотидов; в одном воплощении она составляет 20 нуклеотидов. Часть полипептида, пригодная в качестве эпитопа, может быть такой короткой, как 4 аминокислоты. Часть полипептида, который выполняет функцию полноразмерного полипептида, обычно длиннее чем 4 аминокислоты.
При использовании в данном описании изобретения "идентичность последовательности" или "идентичность" в контексте двух нуклеиновокислотных или полипептидных последовательностей включает в себя указание на остатки в этих двух последовательностях, которые являются одинаковыми при выравнивании с максимальным соответствием в заданном окне сравнения. Когда процент идентичности последовательности используется в отношении белков, считается, что положения остатков, которые не идентичны, часто отличаются консервативными аминокислотными заменами, когда аминокислотные остатки заменены другими аминокислотными остатками с аналогичными химическими свойствами (например зарядом или гидрофобностью) и, следовательно, не меняют функциональных свойств молекулы. Если последовательности отличаются консервативными заменами, то процент идентичности последовательностей может быть скорректирован в сторону повышения для коррекции консервативного характера замещения. Про последовательности, которые отличаются такими консервативными заменами, говорят, что они имеют "подобие последовательности" или "подобие". Средства для такой коррекции хорошо известны специалистам в данной области техники. Как правило, они включают оценку консервативной замены как частичного, а не полного несоответствия, посредством чего процент идентичности последовательности увеличивается. Так, например, когда идентичной аминокислоте присваивают 1 балл, а неконсервативной замене присваивают 0 баллов, то консервативной замене присваивают балл между 0 и 1. Балл консервативных замен рассчитывают, например, в соответствии с алгоритмом Meyers и Miller, Computer Applic, Bioi, Sei,, 4: 11-17 (1988).
При использовании здесь, термин "по существу комплементарные" означает, что две нуклеиновокислотные последовательности имеют друг с другом по меньшей мере примерно 65%, предпочтительно примерно 70%, более предпочтительно примерно 80%, еще более предпочтительно 90% и еще более предпочтительно примерно 98%, примерно 98,5%, примерно 99%, примерно 99,1%, примерно 99,2%, примерно 99,3%, примерно 99,4%, примерно 99,5%, примерно 99,6%, примерно 99,7%, примерно 99,8% или примерно 99,9% комплементарность последовательности. Это означает, что праймеры и зонды должны обладать достаточной комплементарностью с их матрицей и целевой нуклеиновой кислотой соответственно, чтобы гибридизироваться в жестких условиях. Следовательно, последовательности праймера и зонда не должны отражать точную комплементарную последовательность области связывания на матрице и можно использовать вырожденные праймеры. Например, некомплементарный нуклеотидный фрагмент может быть присоединен к 5'-концу праймера, при этом остальная часть последовательности праймера комплементарна нити. Альтернативно, некомплементарные основания или более длинные последовательности могут быть рассеяны в праймере, при условии что праймер имеет достаточную комплементарность с последовательностью одной из нитей, подлежащей амплификации, чтобы гибридизоваться с ней и тем самым образовать дуплексную структуру, которая может быть удлинена посредством полимеризации. Некомплементарные нуклеотидные последовательности праймеров могут включать сайты ферментной рестрикции. Присоединение сайта ферментной рестрикции к концу(ам) целевой последовательности было бы особенно полезным для клонирования целевой последовательности. По существу комплементарной последовательностью праймера является такая последовательность, которая имеет достаточную комплементарность последовательности с матрицей для амплификации, чтобы привести к связыванию праймера и синтезу второй нити. Специалисту известно, что праймеры должны обладать достаточной комплементарностью последовательности с матрицей для амплификации.
Термины "по существу чистый" и "выделенный" используются взаимозаменяемо и описывают что-то, что по существу отделено от других. Например, он может быть использован для указания гриба, части или формы гриба (например конидии, пикниды, хламидоспоры и гиф), белка, пептида или нуклеиновой кислоты, которые по существу отделены от других клеточных и/или (суб)клеточных компонентов или загрязняющих веществ, которые сопровождают его в природе. Этот термин охватывает грибы, форму гриба или его часть, нуклеиновую кислоту или белок, которые были выделены из его природной среды. Обычно этот термин относится к очищенным объектам, имеющим чистоту по меньшей мере примерно 75%, по меньшей мере примерно 80%, по меньшей мере примерно 85%, по меньшей мере примерно 90%, по меньшей мере примерно 85%, по меньшей мере примерно 90%, по меньшей мере примерно 95%, по меньшей мере примерно 98%, или по меньшей мере примерно 99% по массе. Минорные варианты или химические модификации обычно имеют такую же общую полипептидную или нуклеотидную последовательность. По существу чистый белок или нуклеиновая кислота, обычно составляют примерно 85-100% (масс/масс.) образца белка или нуклеиновой кислоты, чаще примерно 95%, и более предпочтительно имеют более чем примерно 99%-ную чистоту. Чистота или гомогенность белка или нуклеиновой кислоты может быть определена рядом способов, хорошо известных в данной области техники, таких как электрофорез белкового образца в полиакриламидном геле с последующей визуализацией единичного полипептидного бэнда на полиакриламидном геле при окрашивании, или электорфорез образца нуклеиновой кислоты в агарозном геле с последующей визуализацией единичного полинуклеотидного бэнда на агарозном геле при окрашивании. "Окрашивание" может либо относиться к использованию специфических пептидных или нуклеиновокислотных красителей, таких как серебро и краситель Кумасси или бромистый этидий и красители SYBR®, либо может относиться к применению специфических пептидных или нуклеиновокислотных красителей, таких как приведение пептида в контакт с антителами и визуализация антитела с.использованием меченого вторичного антитела (например конъюгированного с щелочной фосфатазой) в случае белков или пептидов, или приведение нуклеиновой кислоты в контакт с комплементарным зондом, меченным для визуализации наличия гибридизации между нуклеиновой кислотой и зондом. Для некоторых целей более высокое разрешение может быть обеспечено путем использования высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ) или аналогичного средства очистки. Такие методы являются общеизвестными (см., например, Katz, et al., 1998).
Термины "жесткость" или "жесткие условия гибридизации" относятся к условиям гибридизации, которые влияют на стабильность гибридов, например к температуре, концентрации соли, рН, концентрации формамида и тому подобному. Эти условия эмпирически оптимизируют для максимального увеличения специфического связывания и минимизации неспецифического связывания праймера или зонда с его целевой нуклеиновокислотной последовательностью. Эти термины, при использовании здесь, включают указание условий, при которых зонд или праймер будет гибридизоваться со своей целевой последовательностью в обнаружимо большей степени, чем с другими последовательностями (например по меньшей мере в 2 раза по сравнению с фоном). Жесткие условия зависят от последовательности и будут разными в разных условиях. Более длинные последовательности гибридизуются специфически при более высоких температурах. Как правило, жесткие условия выбирают таким образом, чтобы они были примерно на 5°C ниже, чем точка термического плавления (Tm) для конкретной последовательности при определенной ионной силе и pH. Tm представляет собой температуру (при определенной ионной силе и pH), при которой 50% комплементарной целевой последовательности гибридизуется с идеально совпадающим зондом или праймером. Обычно жесткими условиями являются такие, при которых концентрация соли составляет менее чем примерно 1,0 М Na+ иона, обычно концентрация примерно от 0,01 до 1,0 М Na+ иона (или других солей) при pH 7,0-8,3, и температура составляет по меньшей мере примерно 30°C для коротких зондов или праймеров (например от 10 до 50 нуклеотидов) и по меньшей мере примерно 60°C для длинных зондов или праймеров (например более 50 нуклеотидов). Жесткие условия также могут быть достигнуты путем добавления дестабилизирующих агентов, таких как формамид. Типичные условия с низкой жесткостью или "условия пониженной жесткости" включают гибридизацию с буферным раствором, состоящим из 30% формамида, 1 М NaCl, 1% SDS (додецилсульфат натрия), при 37°C и промывание в 2xSSC (раствор хлорида и цитрата натрия) при 40°C. Типичные условия с высокой жесткостью включают гибридизацию в 50% формамиде, 1 М NaCl, 1% SDS при 37°C и промывание в 0,1xSSC при 60°C Процедура гибридизации хорошо известна в данной области техники и описана, например, в Ausubel et al., 1998 и Sambrook et ai., 2001.
При использовании в данном описании изобретения, "кодирующая последовательность" относится к последовательности ДНК, которая кодирует определенную аминокислотную последовательность. "Регуляторные последовательности" относятся к нуклеотидным последовательностям, расположенным выше (5'-некодирующие последовательности), внутри или ниже (3'-некодирующие последовательности) кодирующей последовательности, и влияющим на транскрипцию, РНК-процессинг или стабильность, или на трансляцию ассоциированной кодирующей последовательности.
При использовании в данном описании изобретения "регуляторные последовательности" могут включать, без ограничения ими, промоторы, трансляционные лидерные последовательности, интроны и последовательности распознавания полиаденилирования.
При использовании в данном описании изобретения "промотор" относится к последовательности ДНК, способной контролировать экспрессию кодирующей последовательности или функциональной РНК. Последовательность промотора состоит из проксимально и более дистально расположенных выше элементов, где последние элементы часто называют энхансерами. Соответственно, "энхансер" представляет собой последовательность ДНК, которая может стимулировать активность промотора и может быть природным элементом промотора или гетерологичным элементом, встроенным для повышения уровня или тканевой специфичности промотора. Промоторы могут происходить в полном объеме из нативного гена или состоять из разных элементов, происходящих из разных промоторов, обнаруженных в природе, или даже могут содержать синтетические сегменты ДНК.. Специалистам в данной области техники понятно, что разные промоторы могут направлять экспрессию гена в разных тканях или типах клеток, или на разных стадиях развития, или в ответ на разные условия окружающей среды. Кроме того, считается, что поскольку в большинстве случаев точные границы регуляторных последовательностей не полностью определены, ДНК фрагменты с некоторыми вариациями могут иметь одинаковую промоторную активность. Промоторы, которые вызывают экспрессию гена в большинстве клеточных типов в большинстве случаев обычно называются "конститутивными промоторами".
При использовании здесь, "3'-некодирующие последовательности" относятся к последовательностям ДНК, расположенным ниже кодирующей последовательности, и включают последовательности распознавания полиаденилирования и другие последовательности, кодирующие регуляторные сигналы, способные влиять на процессинг мРНК или экспрессию гена. Сигнал полиаденилирования обычно характеризуется воздействием добавления участков полиадениловой кислоты к 3'-концу предшественника мРНК. Использование разных 3'-некодирующих последовательностей представлено в Ingelbrecht, I. L, et al. (1989) Plant Ceil 1: 671-680.
При использовании здесь, термин "функционально связанный" относится к ассоциации нуклеиновокислотных последовательностей на единичном фрагменте нуклеиновой кислоты, так что функция одного регулируется другим. Например, промотор функционально связан с кодирующей последовательностью, когда он способен регулировать экспрессию этой кодирующей последовательности (то есть кодирующая последовательность находится под транскрипционным контролем промотора). Кодирующие последовательности могут быть функционально связаны с регуляторными последовательностями в смысловой или антисмысловой ориентации. В другом примере комплементарные области РНК по изобретению могут быть функционально связаны, или прямо или опосредованно, 5' с целевой мРНК или 3' с целевой мРНК, или внутри целевой мРНК, или первая комплементарная область находится 5', а его комплементарная область находится 3' по отношению к целевой мРНК.
При использовании здесь, термин "рекомбинантный" относится к искусственной комбинации двух, в иных случаях разделенных, сегментов последовательности, например посредством химического синтеза или путем манипуляций с выделенными сегментами нуклеиновых кислот с помощью методов генной инженерии.
При использовании здесь, выражения "рекомбинантная конструкция", "экспрессирующая конструкция", "химерная конструкция", "конструкция" и "рекомбинантная ДНК-конструкция" используются взаимозаменяемо. Рекомбинантная конструкция содержит искусственную комбинацию фрагментов нуклеиновых кислот, например регуляторные и кодирующие последовательности, которые не встречаются вместе в природе. Например, химерная конструкция может содержать регуляторные последовательности и кодирующие последовательности, которые происходят из разных источников, или регуляторные последовательности и кодирующие последовательности, происходящие из того же самого источника, но расположенные иначе, чем в природе. Такая конструкция может быть использована сама по себе или может быть использована в сочетании с вектором. Если используется вектор, то выбор вектора зависит от способа, используемого для трансформации клеток-хозяев, что хорошо известно специалистам в данной области техники. Например, можно использовать плазмидный вектор. Специалисту хорошо известны генетические элементы, которые должны присутствовать на векторе для того, чтобы успешно трансформировать, выбирать или размножать клетки-хозяева, содержащие любой из выделенных фрагментов нуклеиновой кислоты по изобретению. Специалисту также понятно, что разные независимые события трансформации приведут к разным уровням и паттернам экспрессии (Jones et al, (1985) EMBO J. 4: 2411-2418; De Almeida et al, (1989) Mol. Gen. Genetics 218: 78-86) и, таким образом, множество событий должны быть подвергнуты скринингу для получения линий, демонстрирующих нужный уровень и паттерн экспрессии. Такой скрининг, в числе прочих, может быть выполнен с помощью Саузерн-анализа ДНК, Нозерн-анализ экспрессии мРНК, иммуноблотинг-анализа экспрессии белка или фенотипического анализа. Термин "экспрессия", при использовании в данном описании изобретения, относится к продуцированию функционального конечного продукта, например мРНК или белка (предшественника или зрелого).
При использовании здесь, термин "трансформация" относится к передаче нуклеиновой кислоты (то есть нуклеотидного полимера) в клетку. При использовании здесь, термин "генетическая трансформация" относится к передаче и включению ДНК, особенно рекомбинантной ДНК, в клетку.
При использовании здесь, термин "трансформант" относится к клетке, ткани или организму, которые претерпели трансформацию. Исходный трансформант обозначают как "Т0" или "Т0." Самовоспроизводство Т0 производит первое трансформированное поколение, обозначаемое как "Т1" или "T1"
При использовании здесь, термин "трансген" относится к нуклеиновой кислоте, которая включена в организм, клетку-хозяина или вектор способом, обеспечивающим его функционирование.
При использовании здесь, термин "трансгенный" относится к клеткам, культурам клеток, организмам (например растениям) и потомству, которые получили чужеродный или модифицированный ген с помощью одного из различных способов трансформации, где чужеродный или модифицированный ген происходит из того же самого или другого вида, чем вид организма, получившего этот чужеродный или модифицированный ген.
При использовании здесь, "антисмысловое ингибирование" или "антисмысловой сайленсинг" относится к продуцированию антисмысловых транскриптов РНК, способных подавлять экспрессию целевого белка. "Косупрессия" относится к продуцированию смысловых транскриптов РНК, способных подавлять экспрессию идентичных или по существу аналогичных чужеродных или эндогенных генов (патент US 5231020).
При использовании здесь, термин "вектор", "плазмида" или "конструкция" относится в широком смысле к любой плазмиде или вирусу, кодирующему экзогенную нуклеиновую кислоту. Этот термин также следует рассматривать, как включающий неплазмидные и невирусные соединения, которые облегчают перенос нуклеиновой кислоты в вирионы или клетки, такие как, например, полилизиновые соединения и тому подобные. Вектор может быть вирусным вектором, который пригоден в качестве средства доставки нуклеиновой кислоты или ее мутанта в клетку, или вектор может быть невирусным вектором, который подходит для той же цели. Примеры вирусных и невирусных векторов для доставки ДНК в клетки и ткани хорошо известны в данной области техники и описаны, например, в Ma et al. (1997, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 12744-12746). Примеры вирусных векторов включают, без ограничения ими, рекомбинантный вирус осповакцины, рекомбинантный аденовирус, рекомбинантный ретровирус, рекомбинантный аденоассоциированный вирус, рекомбинантный птичий поксвирус и тому подобное (Cranage et ah, 1986, EMBO J. 5: 3057-3063; международная патентная заявка WO 94/17810, опубликована 18 августа 1994 г; международная патентная заявка W0 94/23744, опубликована 27 октября 1994 г). Примеры невирусных векторов включают, без ограничения ими, липосомы, полиаминные производные ДНК и тому подобное.
При использовании здесь, выражение "лигноцеллюлозное сырье" относится к сырью, содержащему лигноцеллюлозу. Неограничивающие примеры лигноцеллюлозного сырья включают остатки сельскохозяйственных культур (например пшеничной соломы, ячменной соломы, рисовой соломы, соломы мелкозерных злаков, стеблей кукурузы, кукурузных волокон (например камеди кукурузных волокон (CFG), сушеной барды (DDG), кукурузной глютеновой муки (CGM)), проса, сена люцерны, жома сахарного тростника), несельскохозяйственной биомассы (например тины, остатков городских деревьев), лесных продуктов и промышленных отходов (например остатков первичного/вторичного измельчения дерева с мягкой древесиной, остатков первичного/вторичного измельчения дерева с твердой древесиной, шлама бумажной массы вторичной бумаги), лигноцеллюлозо-содержащих отходов (например газетной бумаги, бумажных отходов, зерна пивоварения, использованной резиновой шины (UTR), городских органических отходов, дворовых отходов, клинических органических отходов и отходов, полученных при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) и их комбинации.
При использовании здесь,, если не указано иное, термин "углевод" относится к соединению углерода, водорода и кислорода, которое содержит альдегидную или кетогруппу в комбинации по меньшей мере с двумя гидроксильными группами. Углеводы по настоящему изобретению также возможно могут быть замещены или дезоксигенированы по одному или более положениям. Углеводы, таким образом, включают замещенные и незамещенные моносахариды, дисахариды, олигосахариды и полисахариды. Сахарид может представлять собой альдозу или кетозу и может содержать 3, 4, 5, 6 или 7 атомов углерода. В одном воплощении они представляют собой моносахариды. В другом воплощении они могут быть пиранозными и фуранозными сахарами. Они возможно могут быть дезоксигенированы в любом соответствующем С-положении и/или замещены одной или более группировками, такими как водород, галоген, галогеналкил, карбоксил, ацил, ацилокси, амино, амидо, карбоксильные производные, алкиламино, диалкиламино, ариламино, алкокси, арилокси, нитро, циано, сульфоновая кислота, тиол, имин, сульфонил, сульфанил, сульфинил, сульфамоил, эфир, карбоновая кислота, амид, фосфонил, фосфинил, фосфорил, тиоэфир, простой тиоэфир, оксим, гидразин, карбамат. Эти сахаридные звенья могут быть расположены в любом порядке, и связь между двумя сахаридными звеньями может быть осуществлена любым из примерно десяти разных способов. В результате, число различных возможных стереоизомерных олигосахаридных цепей огромно. В одном воплощении указанные углеводы выбраны из группы, состоящей из моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов и их комбинации.
При использовании здесь, термин "моносахарид" относится к сахарным мономерам, выбранным из группы, состоящей из трехуглеродных Сахаров (триозы), четырехуглеродных Сахаров (тетрозы) пятиуглеродных Сахаров (пентозы), шестиуглеродных Сахаров (гексозы) и др. и их комбинации. В одном воплощении пятиуглеродные сахара выбраны из группы, состоящей из кетопентозы (например рибулозы, ксилозы), альдопентозы (рибозы, арабинозы, ксилозы, ликсозы), дезоксисахара (дезоксирибозы) и их комбинации. В одном воплощении шестиуглеродные сахара выбраны из группы, состоящей из альдогексоз (например аллозы, альтрозы, глюкозы, маннозы, глюкозы, идозы, галактозы, талозы), циклических полуацеталей, кетогексоз (например псикозы, фруктозы, сорбозы, тагатозы). В одном воплощении указанные моносахариды выбраны из группы, состоящей из триоз, тетроз, пентоз, гексоз, гептоз и др. и их комбинации. В одном воплощении моносахариды находятся в линейной форме; в другом воплощении моносахариды находятся в циклической форме.
При использовании здесь, выражение "сбраживаемые сахара" относится к сахарным соединениям, которые могут быть превращены в полезные, ценные продукты ферментации, неограничивающие примеры которых включают аминокислоты, витамины, фармацевтические средства, добавки к корму для животных, специальные химические агенты, химическое сырье, пластмассы, растворители, топливо или другие органические полимеры, молочную кислоту и этанол, включая топливный этанол. Конкретные ценные продукты, которые могут быть получены способами по изобретению, включают, без ограничения ими, биотопливо (в том числе этанол, бутанол и изобутанол); молочную кислоту; пластмассы; специальные химические агенты; органические кислоты, в том числе лимонную кислоту, янтарную кислоту и малеиновую кислоту; растворители; добавки к корму для животных; фармацевтические средства; витамины; аминокислоты, такие как лизин, метионин, триптофан, треонин и аспарагиновая кислота; промышленные ферменты, такие как протеазы, целлюлазы, амилазы, глюканазы, лактазы, липазы, лиазы, оксидоредуктазы, трансферазы и ксиланазы; и химическое сырье.
При использовании здесь, термин "гриб" или "грибы" относится к отдельной группе эукариотических, спорообразующих организмов с абсорбтивным питанием и не имеющим хлорофилл.
При использовании здесь, термин "подкисляющее вещество" относится к любым веществам, химическим соединениям, композициям, при добавлении которых в растворитель (например воду) получается раствор с ионной активностью водорода большей, чем в чистом растворителе (например воде). Вещество может находиться в газовой, жидкой или твердой форме. Вещество может быть органическим и/или неорганическим. Неограничивающие примеры подкисляющих веществ включают любое вещество, включая галогеноводороды и их растворы (например хлористоводородную кислоту (HO), бромистоводородную кислоту (HBr), иодистоводородную кислоту (HI)), галоидные оксокислоты (например хлорноватистую кислоту, хлорную кислоту, перхлорную кислоту, йодную кислоту и соответствующие соединения брома и йода), серную кислоту (H2SO4), фторсульфоновую кислоту, азотную кислоту (HNO3), фосфорную кислоту (H3PO4), фторсурьмяную кислоту, фторборную кислоту, гексафторфосфорную кислоту, хромовую кислоту (H2CrO4), сульфоновые кислоты, метансульфоновую кислоту (синоним мезиловая кислота, MeSCO3H), этансульфоновую кислоту (синоним эзиловая кислота, EtSO3H), бензолсульфокислоту (синоним безиловая кислота, PhSO3H), лара-толуолсульфокислоту (синоним тозиловая кислота) (CH3C6H4SO3H), трифторметансульфокислоту (синоним трифликовая кислота, CF3SO3H), карбоновые кислоты (например уксусную кислоту, лимонную кислоту, муравьиную кислоту, глюконовую кислоту, молочную кислоту, щавелевую кислоту, винную кислоту), винилогические карбоновые кислоты (например аскорбиновую кислоту, кислоту Мелдрума), кислые соли (например бикарбонат натрия (NaHCO3), гидросульфид натрия (NaHS), бисульфат натрия (NaHSO4), мононатрийфосфат (NaH2PO4) и динатрийфосфата (Na2HPO4)).
При использовании здесь, термин "высокоэнергетические метаболиты" относится к метаболитам, продуцируемым организмом (например грибом), где метаболит можно использовать непосредственно в качестве биотоплива (например спирт) или в качестве предшественника для получения биотоплива (например липиды для биодизеля).
При использовании здесь, термин "нейтрализовать", "нейтрализующий" и "нейтрализация" относится к химической реакции в водных растворах, где кислота и основание взаимодействуют с образованием воды и соли и, где pH раствора доведен до значения, близкого к 7.
При использовании здесь, термин "донор марганца" относится к композиции или соединению, которые могут обеспечить ион марганца (например марганец(I), марганец(II) и марганец(III)) в водном растворе. Неограничивающие примеры доноров марганца включают Mn2(СО)10, K5[Mn(CN)6NO, MnCl2, MnF2, MnBr2, MnO, MnO2, MnCl3, MnF3, MnBr3, MnCO3, Mn(CH3COO)2, C6H9MnO6, MnTiO3, [СН3СОСН=С(O)СН3]2Mn, [C6H11(CH2)3CO2]2Mn, (HCO2)2Mn, Mn(C5HF6O2)2, Mn(PH2O2)2, Mnl2, (C3H5O3)2Mn, MnMoO4, Mn(NO3)2, Mn(ClO4)2, C32H16MnN8, MnSO4, (CH3COO)3Mn, C32H16ClMnN8, C48H28ClMnN4O8, С5Н4СН3Мn(СО)3, Mn(C5H4C2H5)2 и C16H22Mn.
При использовании здесь, выражение "pH-буферные вещества" относится к композициям, которые при добавлении в жидкую смесь могут поддерживать pH указанной жидкой смеси, где pH поддерживается около примерно 0,5, примерно 0,6, примерно 0,7, примерно 0,8, примерно 0,9, примерно 1,0, примерно 1,1, примерно 1,2, примерно 1,3, примерно 1,4, примерно 1,5, примерно 1,6, примерно 1,7, примерно 1,8, примерно 1,9, примерно 2,0, примерно 2,1, примерно 2,2, примерно 2,3, примерно 2,4, примерно 2,5, примерно 2,6, примерно 2,7, примерно 2,8, примерно 2,9, примерно 3,0, примерно 3,1, примерно 3,2, примерно 3,3, примерно 3,4, примерно 3,5, примерно 3,6, примерно 3,7, примерно 3,8, примерно 3,9, примерно 4,0, примерно 4,1, примерно 4,2, примерно 4,3, примерно 4,4, примерно 4,5, примерно 4,6, примерно 4,7, примерно 4,8, примерно 4,9, примерно 5,0, примерно 5,1, примерно 5,2, примерно 5,3, примерно 5,4, примерно 5,5, примерно 5,6, примерно 5,7, примерно 5,8, примерно 5,9, примерно 6,0, примерно 6,1, примерно 6,2, примерно 6,3, примерно 6,4, примерно 6,5 примерно 6,6, примерно 6,7, примерно 6,8, примерно 6,9 или примерно 7,0. Например, pH жидкой смеси находится в диапазоне от примерно 0,5 до примерно 3,0. Такая композиция может содержать такие соединения, как кислота, соли кислот, основания и соли оснований, например HCl, H2NQ3, H2SO4, NaHCO3, NaHS, NaHSO4, NaH2PO4, Na2HPO4, NaHSO3, KHCO3, KHS, KHSO4, KH2PO4, K2HPO4, KHSO3, NaOH, KOH, Mg(OH)2, Na2CO3, K2CO3, KHCO3, CaCO3, MgCO3, Na2S, K2S и др.
При использовании здесь, термин "аэробные условия" относится к условиям, которые обеспечивают достаточное количество кислорода, и анаэробное дыхание у микроорганизмов, растущих в таких условиях, становится невозможным.
При использовании здесь, термин "по существу аэробные условия" относится к условиям, когда подача кислорода ограничена, но клеточное дыхание в организме представляет собой преимущественно аэробное дыхание.
При использовании здесь, термин "биотопливо" (также называемый биоэнергия) определяется как твердое, жидкое или газообразное топливо, полученное из относительно недавно умершего или умирающего биологического материала и отличается от ископаемого топлива, которое получено из давно умершего биологического материала. Теоретически оно может быть получено из любого биологического источника углерода.
Биотопливо может подразделяться на биотопливо первого поколения (которое получают из сахара, крахмала, растительного масла и животных жиров, включая, но без ограничения ими, растительное масло, биодизель, биоспирты, биоэфиры, биогаз, синтетический газ и твердое биотопливо), биотопливо второго поколения (которое получают из биомассы непищевых культур, также называемое целлюлозное биотопливо, включая, но без ограничения ими, биоводород, биометанол, DMF (диметилфуран), Bio-DME (био-диметиловый эфир), дизель Фишера-Тропша, биоводородный дизель, смешанные спирты и древесный дизель) и биотопливо третьего поколения (также называемое водорослевое топливо, которое получают из водорослей).
Термин "предшественник биотоплива" относится к органической молекуле, в которой весь содержащийся углерод получен из биомассы и биохимически преобразован. Он может быть дополнительно превращен, либо химически, либо биохимически, в биотопливо. Например, предшественник биотоплива включает, без ограничения ими, например, изобутанол, изопропанол, пропанол, 2-бутанол, бутанол, пентанол, 2-пентанол, 3-пентанол, 3-метил-1-бутанол, 2-метил-1-бутанол, 3-метил-2-бутанол и липид.
При использовании здесь, термин "биодизель" относится к растительному маслу или дизельному топливу на основе животного жира, состоящему из длинноцепочечных алкиловых (например метиловых, пропиловых или этиловых) сложных эфиров. Он может быть получен посредством химической реакции липидов с одним или более типами спирта в реакции переэтерификации. Химически он содержит смесь моноалкиловых эфиров длинноцепочечных жирных кислот. Спирты, которые можно использовать для получения биодизеля, включают, без ограничения ими, метанол, этанол, пропанол, изопропанол, бутанол, изобутанол и 2-этоксиэтанол. Для облегчения эстерификации жирных кислот можно использовать кислый или щелочной катализатор. Глицерин образуется как побочный продукт таких реакций.
При использовании в данном описании изобретения, выражение "жирные кислоты" относится к длинноцепочечным молекулам, имеющим метильную группу на одном конце и группу карбоновой кислоты на другом конце.
При использовании в данном описании изобретения, выражение "выделенный гриб" относится к любой композиции, содержащей популяцию грибов, полученную из природного источника.
При использовании здесь, термин "биоспирты" относится к спиртам, синтезируемым биологически, включая, но без ограничения ими, биоэтанол, биометанол, биобутанол и другие биоспирты.
При использовании здесь, термин "спирт" относится к любому органическому соединению, в котором гидроксильная группа (-OH) связана с атомом углерода алкильной или замещенной алкильной группы. Важная группа спиртов образована простыми ациклическими спиртами, общей формулой которых является CnH2n+1OH.
При использовании здесь, термин "биогаз" относится к газу, полученному посредством биологического разложения органического вещества в отсутствие кислорода. Биогаз происходит из биогенного вещества и является одним из типов биотоплива.
При использовании здесь, термин "сидерофоры" относится к малым, высокоаффинным хелатным соединениям, включающим ион металла, секретируемым микроорганизмами, такими как бактерии, грибы, и травами.
При использовании здесь, термин "сырье" относится к необработанному материалу или смеси необработанных материалов, поставляемых в процесс биокатализа или ферментации, из которых могут быть получены другие продукты. Например, источник углерода, такой как биомасса или углеродные соединения, полученные из биомассы, является сырьем для биокатализатора, который производит биотопливо и/или предшественник биотоплива в процессе ферментации. Кроме того, сырье может содержать питательные вещества, отличные от источника углерода. Сырьем также могут являться муниципальные, промышленные и сельскохозяйственные сточные отходы.
При использовании здесь, термин "биокатализатор" относится к живой системе или клетке любого типа, которые ускоряют химические реакции путем снижения энергии активации реакции и не разрушаются и не изменяются в процессе реакции. Биокатализаторы могут включать, без ограничения ими, микроорганизмы, такие как дрожжи, грибы, бактерии и археи. Например, выделенный штамм гриба по настоящему изобретению можно использовать в качестве биокатализатора при получении биотоплива.
При использовании здесь, термин "ферментация" или "процесс ферментации" относится к процессу, в котором биокатализатор культивируют в культуральной среде, содержащей исходные вещества, такие как сырье и питательные вещества, где биокатализатор превращает исходные вещества, такие как сырье, в продукты.
При использовании здесь, термин "источник углерода", как правило, относится к веществу, подходящему для использования в качестве источника углерода для роста прокариотических или эукариотических клеток. Источники углерода включают, без ограничения ими, гидролизаты биомассы, углеводы (например крахмал, сахарозу, полисахариды и моносахариды), целлюлозу, гемицеллюлозу, ксилозу и лигнин, а также мономерные компоненты этих субстратов. Источники углерода могут содержать различные органические соединения в различных формах, включая, но без ограничения ими, полимеры, углеводы, кислоты, спирты, альдегиды, кетоны, аминокислоты, пептиды и т.д. Они включают, например, различные моносахариды, такие как глюкоза, декстроза (D-глюкоза), мальтоза, олигосахариды, полисахариды, насыщенные или ненасыщенные жирные кислоты, сукцинат, лактат, ацетат, этанол и т.д., или их смеси. Фотосинтезирующие организмы могут дополнительно производить источник углерода, в качестве продукта фотосинтеза.
При использовании здесь, термин "биомасса" относится к биологическому веществу, полученному из живых или недавно живых организмов, например стеблей, листьев и крахмалсодержащих частей зеленых растений, или древесины, отходов, порубочных остатков (мертвых деревьев, веток и пней деревьев), дворовой щепы, деревянных стружек, или веществ, полученных из водорослей или животных, и состоит главным образом из крахмала, лигнина, пектина, целлюлозы, гемицеллюлозы и/или пектина. Биомасса может также включать в себя биоразлагаемые отходы, которые могут быть сожжены в качестве топлива. Она не включает органическое вещество, такое как ископаемое топливо, которое трансформировалось в результате геологических процессов в такие вещества, как уголь или нефть. Биомасса может быть разложена посредством химической или ферментативной обработки до мономерных Сахаров и фенолов, из которых она состоит (Wyman, С.Е. 2003 Biotechnological Progress 19: 254-62). Это полученное вещество, называемое гидролизатом биомассы, нейтрализуют и обрабатывают для удаления следовых количеств органического вещества, которые могут негативно воздействовать на биокатализатор, и затем используют в качестве сырья для ферментации с использованием биокатализатора.
При использовании здесь, термин "целлюлозная биомасса" относится к биомассе, состоящей, главным образом, из растительных волокон, которые являются несъедобными или почти несъедобными для людей, и важным компонентом которых является целлюлоза. Эти волокна могут быть гидролизованы с получением различных Сахаров, которые можно ферментировать микроорганизмами. Примеры целлюлозной биомассы включают траву, дерево и богатые целлюлозой остатки, полученные от сельского хозяйства или лесной промышленности.
При использовании здесь, термин "крахмал" относится к полимеру глюкозы, легко гидролизуемому пищеварительными ферментами. Крахмал обычно концентрируется в специализированных участках растений, таких как картофель, зерна кукурузы, рисовые зерна, зерна пшеницы и стебли сахарного тростника.
При использовании здесь, термин "лигнин" относится к полимерному веществу, состоящему главным образом из соединенных фенольных мономерных соединений, таких как лара-кумариловый спирт, конифериловый спирт и синапиловый спирт, которые являются основой структурной жесткости в растениях и часто называются древесной частью растений. Лигнин также считается неуглеводной частью клеточной стенки растений.
При использовании здесь, термин "целлюлоза" относится к длинноцепочечному полимерному полисахаридному углеводу бета-глюкозы формулы (C6H10O5)n, обычно встречающемуся в стенках растительных клеток в комбинации с лигнином и какой-либо гемицеллюлозой.
При использовании здесь, термин "гемицеллюлоза" относится к классу полисахаридов клеточной стенки растений, который может представлять собой любой из нескольких гетерополимеров. Они включают ксилан, ксилоглюкан, арабиноксилан, арабиногалактан, глюкуроноксилан, глюкоманнан и галактоманнан. Мономерные компоненты гемицеллюлозы включают, без ограничения ими: D-галактозу, L-галактозу, D-маннозу, L-рамнозу, L-фукозу, D-ксилозу, L-арабинозу и D-глюкуроновую кислоту. Этот класс полисахаридов встречается практически во всех клеточных стенках наряду с целлюлозой. Гемицеллюлоза имеет меньшую массу, чем целлюлоза, и не может быть экстрагирована с помощью горячей воды или хелатирующих агентов, но может быть экстрагирована с помощью водного раствора щелочи. Полимерные цепи гемицеллюлозы связывают пектин и целлюлозу в сеть сшитых волокон, образующих клеточные стенки большинства растительных клеток.
Термин "пектин", при использовании здесь, относится к классу гетерогенных полисахаридов клеточной стенки растений, которые могут быть экстрагированы посредством обработки кислотами и хелатирующими агентами. Как правило, 70-80% пектина обнаруживается в виде линейной цепи мономеров α-(1-4)-связанной D-галактуроновой кислоты. Меньшая RG-I фракция пектина состоит из чередующихся (1-4)-связанной галактуроновой кислоты и (1-2)-связанной L-рамнозы, с существенным арабиногалактановым разветвлением, происходящим от остатка рамнозы. Другие моносахариды, такие как D-фукоза, D-ксилоза, апиоза, ацеровая кислота, Kdo (2-кето-3-дезокси-D-манно-октоновая кислота), Dha (3-дезокси-D-ликсо-гептулозаровая кислота), 2-O-метил-D-фукоза и 2-O-метил-D-ксилоза, встречаются либо во фракции пектина RG-II (<2%), либо в качестве минорных компонентов во фракции RG-I. Доли каждого из моносахаридов относительно D-галактуроновой кислоты варьируются в зависимости от конкретного растения и его микроокружения, вида и времени в цикле роста. По тем же самым причинам фракции моногалактуронана и RG-I могут значительно отличаться по содержанию в них метиловых эфиров на остатках GalA и по содержанию эфиров ацетильных остатков в положениях С-2 и С-3 GalA и нейтральных Сахаров.
При использовании в данном описании изобретения, выражение "факультативный анаэробный организм" или "факультативный анаэробный микроорганизм" или "факультативный анаэробный биокатализатор" определено как организм, который может расти в присутствии или в отсутствие кислорода, такой как штаммы грибов по настоящему изобретению.
При использовании здесь, термин "побочный продукт" означает нежелательный продукт, связанный с производством биотоплива и/или предшественника биотоплива. Побочные продукты, как правило, рассматриваются как отходы и увеличивают стоимость способа.
При использовании здесь, термин "сопутствующий продукт" означает второстепенный или побочный продукт, связанный с производством биотоплива и/или предшественника биотоплива. Сопутствующие продукты имеют потенциальную коммерческую стоимость, которая увеличивает полную стоимость получения предшественника биотоплива, и может быть решающим фактором в отношении рентабельности конкретного способа получения предшественника биотоплива.
При использовании здесь, термин "сушеная барда", сокращенно DDG, относится к твердым веществам, остающимся после ферментации, обычно состоящим из неизрасходованных твердых сырьевых веществ, оставшихся питательных веществ, белка, волокна и масла, а также биокаталитического клеточного дебриса. Этот термин также может включать растворимое остаточное вещество после ферментации и тогда упоминается как " сушеная барда и растворимые компоненты" (DDGS). DDG или DDGS являются примером сопутствующего продукта в процессе получения предшественника биотоплива.
При использовании здесь, термин "питательное вещество" определен, как химическое соединение, которое используется биокатализатором для роста и выживания. Питательные вещества могут быть органическими соединениями, такими как углеводы и аминокислоты, или неорганическими соединениями, такими как соли металлов.
При использовании здесь, термин "комплексное питательное вещество" определен как источник питательных веществ, содержащий в основном мономерные органические соединения, используемые биокатализатором для продуцирования белков, ДНК, липидов и углеводов. Термин "богатое питательное вещество" по всему описанию изобретения используются взаимозаменяемо с термином комплексное питательное вещество. Как правило, комплексные питательные вещества или богатые питательные вещества получают из биологических веществ, таких как отходы скотобоен, молочные отходы или сельскохозяйственные остатки. Комплексные питательные вещества или богатые питательные вещества включают, без ограничения ими: дрожжевой экстракт, триптон, пептон, соевый экстракт, кукурузный экстракт, соевый белок и казеин.
При использовании в данном описании изобретения, выражение "аэробный метаболизм" относится к биохимическому процессу, в котором кислород используется для получения энергии из углеводов, обычно в форме АТФ. Типичный аэробный метаболизм осуществляется посредством гликолиза и цикла ТСА (трикарбоновых кислот), когда одна молекула глюкозы в присутствии кислорода полностью метаболизируется в двуокись углерода.
При использовании в данном описании изобретения, выражение "анаэробный метаболизм" относится к биохимическому процессу, в котором кислород не является конечным акцептором электронов, содержащихся в NADH. Анаэробный метаболизм можно разделить на анаэробное дыхание, при котором соединения, отличные от кислорода, служат в качестве конечного акцептора электронов, и ферментации, при которой электроны от NADH, используются для создания восстановленного продукта "ферментативным путем".
При использовании здесь, термин "рекомбинантный микроорганизм" и "рекомбинантная клетка хозяина" используются взаимозаменяемо и относятся к микроорганизмам, которые были генетически модифицированы, чтобы экспрессировать и сверхэкспрессировать эндогенные полинуклеотиды, или экспрессировать гетерологичные полинуклеотиды, такие, как включенные в вектор, или такие, которые имеют уменьшенную экспрессию эндогенного гена. Полинуклеотид, как правило, кодирует целевой фермент, вовлеченный в метаболический путь, для получения нужного метаболита. Следует понимать, что термины "рекомбинантный микроорганизм" и "рекомбинантная клетка-хозяин" относятся не только к конкретному рекомбинантному микроорганизму, но и к потомству или к возможному потомству такого микроорганизма. Поскольку некоторые модификации могут происходить в последующих поколениях вследствие либо мутации, либо влияния окружающей среды, такое потомство может на самом деле не быть идентичным родительской клетке, но все же включено в объем данного термина при использовании в данном описании.
При использовании здесь, термин "ферментация" относится к способу получения биотоплива и других продуктов, где биомассу (предварительно обработанную или предварительно необработанную) ферментируют с помощью микроорганизмов (например бактерий, цианобактерий, дрожжей, грибов или водорослей).
Используемые здесь термин "микробиологическая ферментация" относится к процессу, в котором органические вещества разлагаются и вновь собираются в продукты при помощи микроорганизмов. Эти вещества могут включать, без ограничения ими, глюкозу, сахарозу, глицерин, крахмал, мальтодекстрин, лактозу, жиры, углеводороды, белок, аммиак, нитраты, источники фосфора. Продукты могут включать, без ограничения ими, традиционные продукты (включающие, без ограничения ими, хлеб, пиво, вино, спиртные напитки, сыр, молочные продукты, ферментированные мясные продукты и овощи, грибы, соевый соус и уксус), сельскохозяйственные продукты (включающие, без ограничения ими, гиббереллины, фунгициды, инсектициды, силос, аминокислоты, такие как L-глутамин, L-лизин, L-триптофан, L-треонин, L-аспарагиновая кислота (+), L-арилглицины), ферменты (включающие, без ограничения ими, углеводы, целлюлозы, липазы, пектиназы, протеазы), топливо и химическое сырье (включающее, без ограничения ими, ацетон, бутанол, бутандиол, изопропиловый спирт, этанол, глицерин, метан, глицерин, масляную кислоту, метан, лимонную кислоту, фумаровую кислоту, молочную кислоту, пропионовую кислоту, янтарную кислоту, итаконовую кислоту, уксусную кислоту, 3-гидроксипропионовую кислоту, глюконовую кислоту, винную кислоту и L-глутаровую кислоту, или соли любой из этих кислот), нуклеотиды, органические кислоты, фармацевтические средства и родственные соединения (включающие, без ограничения ими, алкалоиды, антибиотики, гормоны, иммунодепрессант, интерферон, стероиды, вакцины, витамины) и полимеры (включающие, без ограничения ими, альгинаты, декстран, геллан, полигидроксибутират, склероглюкан и ксантан). Микроорганизмы, используемые для ферментации, могут включать как прокариотические микроорганизмы (в том числе бактерии, цианобактерий), так и эукариотические микроорганизмы (в том числе дрожжи, грибы и водоросли).
При использовании в данном описании изобретения, выражение "энергетическая культура" относится к растениям, выращиваемым в качестве низкозатратного и не требующего особого ухода урожая, используемого для получения биотоплива, или непосредственного используемых из-за содержания в них энергии. Коммерческие энергетические культуры, как правило, представляют собой плотно посаженные, высокоурожайные виды культур, где энергетические культуры сжигают для выработки энергии. Широко используются древесные культуры, такие как ива или тополь, а также тропические травы, такие как мискантус и пеннисетум красный (оба известны как слоновая трава). Если содержание углевода необходимо для получения биогаза, урожай растительной массы, такой как кукуруза, суданская трава, просо, донник белый и многие другие могут быть превращены в силос, а затем превращены в биогаз.
При использовании здесь, термин микроаэробные относится к среде, в которой концентрация кислорода меньше, чем в воздухе, но клеточное дыхание в организме в основном является аэробным дыханием.
Fusarium
Виды Fusarium могут продуцировать три типа спор, называемых макроконидии, микроконидии и хламидоспоры. Макроконидии продуцируются в специализированной структуре, называемой спородохий, где масса спор поддерживается поверхностной подушковидной массой коротких монофиалид, несущих макроконидии, или продуцируются на монофиалидах и полифиалидах в воздушном мицелии. Монофиалида представляет собой конидиофор только с одним отверстием или порой, через которое эндоконидии выдавливаются, в то время как полифиалида имеет два или более таких отверстий или пор. Некоторые конидии являются промежуточными по размеру и форме и их называют и макроконидии, и мезоконидии. Микроконидии продуцируются в воздушном мицелии, но не в спородохиях. Они могут продуцироваться только в фальшивых головках или фальшивых головках и цепочках на монофиалидах или полифиалидах. Фальшивые головки возникают, когда капля влаги образуется на кончике конидиеносца и содержит эндоконидии, как они продуцируются. Микроконидии бывают разных форм и размеров, а микроконидии, продуцируемые в цепочках, имеют усеченное основание. Третьим типом спор, образуемых видами Fusarium, является хламидоспора, которая представляет собой толстостенную спору, заполненную липидоподобным веществом, которое служит для поддержания грибов в течение зимы в почве, когда подходящий хозяин не доступен. Хламидоспоры могут находиться поодиночке, в парах, в комках или в цепочках, и внешняя стенка может быть гладкой или шероховатой. Морфологию этих спор можно использовать для разделения видов Fusarium.
Способы переноса и культивирования видов Fusarium хорошо известны в данной области техники. Например, односпоровый метод и или метод с использованием верхушки гифы являются основными средствами, используемыми для инициирования и переноса культур видов Fusarium. Метод верхушки гифы используют для переноса культур видов Fusarium, которые быстро мутируют после переноса единичными конидиями. Перенос выполняют под препаровальной лупой, во многом таким же образом, как и перенос одного прорастающего конидия. Четыре среды, используемой для выращивания видов Fusarium для идентификации, представляют собой агар с листом садовой гвоздики (Fisher et al., 1982, Carnation leaves as a substrate and for preserving Fusarium species. Phytopathology 72: 151-153), картофельный агар с декстрозой (Nelson et al., 1983. Fusarium species: an illustrated manual for identification. Pennsylvania State University Press, University Park), KCl среду (Fisher et al., 1983. Taxonomic importance of microconidial chains in Fusarium section Liseola and effects of water potential on their formation. Mycologia 75: 693-698) и почвенный агар (Klotz et al., 1988. A medium for enhancement of chlamydospore formation in Fusarium species. Mycologia 80: 108-109), каждый из которых включен посредством ссылки во всей своей полноте.
Большинство видов Fusarium, выделенных из природы, продуцирует свои макроконидии на спородохиях. Тип спородохий часто мутирует в культуре, особенно в среде, богатой углеводами. Мутации могут также происходить в природе, но являются редкими. Эти мутанты могут дать начало другим, так что образуется последовательность мутаций. В патогенных изолятах эти мутанты часто демонстрируют потерю вирулентности и способность продуцировать токсины может быть уменьшена или потеряна. Двумя основными типами мутантов, продуцируемых спородохиальным типом, являются пионнотальный тип (например продуцирующий незначительное количество воздушного мицелия или не продуцирующий его; продуцирующий многочисленные макроконидии на поверхности колоний, в результате чего поверхность выглядит блестящей и влажной; с более интенсивной пигментацией колоний, чем спородохиальные колонии; с продуцированием более длинных и более тонких макроконидий, чем макроконидии, продуцируемые спородохиальным типом; менее вирулентный, чем спородохиальный тип, а также может терять способность продуцировать токсины) и мицеллиальный тип (например продуцирующий обильный воздушный мицелий; продуцирующий очень незначительное количестве макроконидии или не продуцирующий их; с частым отсутствием спородохий, склероции и пигментации в культуре; мутанты, которые могут быть менее вирулентными, чем спородохиальный тип, а также могут терять способность продуцировать токсины).
Процедуры, которые уменьшают мутантные популяции, включают, без ограничения ими, инициацию культур из единичной конидии; инициацию культур из единичных верхушек гиф; не использование сред, богатых углеводами; и сокращение пересевов до минимума, как описано в Nelson et al. (1983, Fusarium species: an illustrated manual for identification, Pennsylvania State University Press, University Park).
Неограничивающие примеры видов Fusarium включает Fusarium angustum (синоним F. oxysporum), Fusarium aquaeductuum (например Fusarium aquaeductuum var. dimerum, синоним F. dimerum), Fusarium aquaeductuum var. media (например Fusarium bostrycoides, синоним F. oxysporum, Fusarium chlamydosporum (синоним Dactylium fusarioides, F. fusarioides, F. sporotrichioides var. chlamydosporum, F. tricinctum), Fusarium coeruleum (синоним F. solani var. coeruleum), Fusarium conglutinans (синоним F. oxysporum), Fusarium dianthi (синоним F oxysporum), Fusarium dimerum (синонимы F. aquaeductuum var. dimerum, F. episphaeha), Fusarium episphaeha (синоним F. dimerum), Fusarium eumartii (синоним F. solani), Fusarium fujikuroi (синоним F. moniliforme), Fusarium fusarioides (синоним F. chlamydosporum), Fusarium illudens (синоним F. solani), Fusarium incarnatum (синоним F. semitectum), Fusarium javanicum (синоним F. solani), Fusarium lini (синоним F. oxysporum), Fusarium moniliforme (синоним F. proliferatum, F. verticillioides, F. fujikuroi, F. verticillioides), Fusarium moniliforme var. intermedium (синоним F. proliferatum), Fusarium napiforme, Fusarium orthoceras (синоним F. oxysporum), Fusarium oxysporum (синоним F. angustum, F. bostrycoides, F. bulbigenum, F. conglutinans, F. dianthi, F. lini, F. orthoceras, F. tracheiphilum, F. vasinfectum), Fusarium pallidoroseum (синоним F. semitectum), Fusarium proliferatum (синоним F. moniliforme, F. moniliforme var. intermedium), Fusarium roseum (синоним F. semitectum), Fusarium roseum var. arthrosporioide (синоним F. semitectum), Fusarium sacchari, Fusarium semitectum (синоним F. incarnatum, F. pallidoroseum, F. roseum, F. roseum var. arthrosporioide, Pseudofusarium semitectum), Fusarium solani (синоним F. eumartii, F. illudens, F. javanicum, F. tumidum, F. ventricosum, Fusispohum solani, Nectria haematococca), Fusarium solani var. coeruleum (синоним F. coeruleum), Fusarium sporotrichiella var. sporotrichioides (синоним F. sporotrichoides), Fusarium sporotrichioides var. chlamydosporum (синоним F. chlamydosporum.), Fusarium sporotrichoides (синоним F. sporotrichiella var. sporotrichioides, F. tricinctum, Sporotrichella rosea), Fusarium sub glutinans, Fusarium tabacinum (телеоморф Plectosphaerella cucumerina), Fusarium tracheiphilum (синоним F. oxysporum), Fusarium tricinctum (синоним F. chlamydosporum, F. sporotrichoides), Fusarium tumidum (синоним F. solani), Fusarium vasinfectum (синоним F. oxysporum), Fusarium ventricosum (синоним F. solani) и Fusarium verticillioides (синоним F. moniliforme).
Более подробная информация о видах Fusarium, их способах выделения и культивирования описана в Nelson et al., (Taxonomy, Biology, and Clinical Aspects of Fusarium Species, 1994, Clinical Microbiology Reviews, 7 (4): 479-504), Toussoun and Nelson (1976, Fusarium), Booth (Fusarium; laboratory guide to the identification of the major species, 1977, Commonwealth Mycological Institute, ISBN 0851983839, 9780851983837) и Leslie et al. (The Fusarium laboratory manual, 2006, Wiley-Blackwell, ISBN 0813819199, 9780813819198), каждый из которых включен в данное описание посредством ссылки во всей полноте.
Fusarium oxysporum
Fusarium oxysporum, также известный, как патоген панамской болезни или Agent Green, представляет собой гриб, вызывающий фузариозное увядание более чем ста видов растений. Он действует путем колонизации водопроводящих сосудов (ксилемы) растения. В результате такой закупорки и выхода из строя ксилемы у растений появляются такие симптомы, как увядание, пожелтение листьев и в конечном счете гибель растений. Интерес к Fusarium oxysporum как к гербициду впервые возник после обнаружения в 1960-ых, что он являлся причиной уничтожения популяции гавайской коки.
Представители комплекса видов Fusarium oxysporum (FOSC) представляют собой наиболее распространенные патогенные Fusaria. Они вызывают фузариозное увядание более 100 культурных видов растений, включая помидоры, картофель, сахарный тростник, бобы, вигну, финиковую и масличную пальму, а также кулинарные и десертные сорта бананов (Beckman, 1987. The Nature of Wilt Diseases of Plants. The American Phytopathological Society Press, St. Paul). Поскольку он является долгоживущим почвенным патогеном, зараженная почва остается загрязненной неопределенно долго, так что на этом месте можно выращивать только устойчивые разновидности.
Штамм 4287 Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (штамм 2, VCG 0030) был полностью секвенирован. Размер генома оценивается в 59,9 Мб. Эта характеристика позволяет осуществить широкое исследование взаимодействий хозяин-патоген, патогенной инфекции и механизмов защиты растений с использованием модельной системы растений A. thaliana. В результате интенсивных исследований в течение последних 10 лет этот штамм продемонстрировал замечательную фенотипическую стабильность, включая рост мицелия на разных питательных средах, спорообразование и высокую вирулентность. Этот штамм также в высокой степени поддается трансформации, как с помощью протопластов, так и с помощью Agrobacterium tumefaciens, и опосредованному трансформацией разрушению гена. Карта митотического сцепления была создана на основании слияния протопластов двух штаммов F. oxysporum f, sp. lycopersici, VCG 0030 (Teunissen et al. 2003, A Near-Isogenic Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Strain with a Novel Combination of Avirulence Characteristics, Phytopathology, 93 (11): 1360-1367). Также были разработаны новая высокоэффективная техника нокаута гена и молекулярные цитологические способы (Khang et al, 2005, A dual selection based, targeted gene replacement tool for Magnaporthe ghsea and Fusarium oxysporum. Fungal Genet. Biol. 42: 483-492). Также имеется микроматричный анализ Fusarium oxysporum (Mcfadden et al, 2006, Fusarium wilt {Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum) genes expressed during infection of cotton (Gossypium hirsulum), Molecular Plant Pathology 7 (2): 87-101).
Макроскопическая морфология Fusarium oxysporum может существенно варьироваться на разных средах. Приведенное ниже описание основано на росте на агаре из картофельных хлопьев при 25°C и циклами включения/выключения люминесцентного света длительностью примерно 12 часов каждый. Гифы являются септатными и гиалиновыми. Конидиеносцы являются короткими (по сравнению с конидиеносцами F. solani) и простыми (обычно неразветвленными). Макроконидии обычно продуцируются обильно, являются слегка серповидными, тонкостенными, с вытянутой апикальной клеткой и имеющей форму ступни базальной клеткой. Они имеют от трех до пяти перегородок, составляющих 23-54×3-4.5 мкм. Микроконидии представлены изобильно, обычно не имеют перегородок, имеют форму от эллипсоидной до цилиндрической, слегка изогнуты или прямые, составляют 5-12×2,3-3,5 мкм, встречаются в фальшивых головках (скопление конидий на кончике фиалиды) из коротких монофиалид. Хламидоконидии присутствуют и часто в изобилии, при этом встречаются в одиночку или парами. В то время как F. solani является наиболее распространенным клиническим изолятом, Fusarium oxysporum является вторым по распространения выявленным видом. Сообщалось, что он присутствует при кожных и ногтевых инфекциях, подкожном заболевании, у ребенка с нейтропенией, контролируемой гранулоцитарным колониестимулирующим фактором, в диссеминированной инфекции в гемофагоцитарном лимфогистиоцитозе, и в безнадежном случае включает перекрестную реакцию с зондом рода пан-Candida. Этот вид обычно легко определить по его лавандовому цвету на картофельном агаре с декстрозой, его коротким монофиалидам и микроконидиям, образующимся только в фальшивых головках.
Неограничивающие примеры ранее выделенных форм Fusarium oxysporum включают Fusarium oxysporum 247, Fusarium oxysporum CL57, Fusarium oxysporum f. cubense, Fusarium oxysporum f. perniciosum, Fusarium oxysporum f. sp. aechmeae, Fusarium oxysporum f. sp. albedinis, Fusarium oxysporum f. sp. allii, Fusarium oxysporum f. sp. apii, Fusarium oxysporum f. sp. arctii, Fusarium oxysporum f. sp. asparagi, Fusarium oxysporum f. sp. basilici, Fusarium oxysporum f, sp. batatas, Fusarium oxysporum f. sp. betae, Fusarium oxysporum f. sp. bouvardiae, Fusarium oxysporum f. sp. bulbigenum, Fusarium oxysporum f. sp. callistephi, Fusarium oxysporum f. sp. canariensis, Fusarium oxysporum f. sp. cannabis, Fusarium oxysporum f. sp. carthami, Fusarium oxysporum f. sp. cassiae, Fusarium oxysporum f. sp. cattleyae, Fusarium oxysporum f. sp. cepae, Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi, Fusarium oxysporum f. sp. ciceris, Fusarium oxysporum f. sp. colocasiae, Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans, Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum, Fusarium oxysporum f. sp. cucurbitacearum, Fusarium oxysporum f. sp. cyclaminis, Fusarium oxysporum f. sp. dianthi, Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis, Fusarium oxysporum f. sp. erythroxyli, Fusarium oxysporum f. sp. fabae, Fusarium oxysporum f. sp. foetens, Fusarium oxysporum f. sp. fragariae, Fusarium oxysporum f. sp. gladioli, Fusarium oxysporum f. sp. glycines, Fusarium oxysporum f. sp. hebes, Fusarium oxysporum f. sp. helioiropii, Fusarium oxysporum f. sp. koae, Fusarium oxysporum f. sp. lactucae, Fusarium oxysporum f. sp. lagenariae, Fusarium oxysporum f. sp. lentis, Fusarium oxysporum f. sp. lilii, Fusarium oxysporum f. sp. lini, Fusarium oxysporum f. sp. loti, Fusarium oxysporum f. sp. luffae, Fusarium oxysporum f. sp. lupini, Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, Fusarium oxysporum f. sp. matthiolae, Fusarium oxysporum f. sp. medicaginis, Fusarium oxysporum f. sp. melongenae, Fusarium oxysporum f. sp. melonis, Fusarium oxysporum f. sp. momordicae, Fusarium oxysporum f. sp. narcissi, Fusarium. oxysporum f. sp. nelumbicola, Fusarium oxysporum f. sp. niveum, Fusarium oxysporum f. sp. opuntiarum, Fusarium oxysporum f. sp. passiflorae, Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, Fusarium oxysporum f. sp. pini, Fusarium oxysporum f. sp. pisi, Fusarium oxysporum f. sp. radicis-cucumerinum, Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, Fusarium oxysporum f. sp. rapae, Fusarium oxysporum f. sp. raphani, Fusarium oxysporum f. sp. rauvolfiae, Fusarium oxysporum f. sp. rhois, Fusarium oxysporum f. sp. ricini, Fusarium oxysporum f. sp. sesami, Fusarium oxysporum f. sp. spinaciae, Fusarium oxysporum f. sp. strigae, Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum, Fusarium oxysporum f. sp. tulipae, Fusarium oxysporum f. sp. vanillae, Fusarium oxysporum f. sp. vasinfecium, Fusarium oxysporum f. sp. voandzeiae, Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi, Fusarium oxysporum f. tuberosi, Fusarium oxysporum Fo47, Fusarium oxysporum Fo5176, Fusarium oxysporum FOL 4287, Fusarium oxysporum Fov24500, Fusarium oxysporum II5, Fusarium oxysporum MN25, Fusarium oxysporum NRRL 25433, Fusarium oxysporum NRRL 26406, Fusarium oxysporum NRRL 32931, Fusarium oxysporum PHW808, Fusarium oxysporum PHW815 и Fusarium oxysporum var. meniscoideum.
Выделенный штамм гриба
В настоящем изобретении предложен выделенный, расщепляющий лигноцеллюлозу, ацидофильный штамм гриба Fusarium oxysporum и его потомство, где выделенный штамм гриба и его потомство имеют по меньшей мере следующие идентифицирующие характеристики:
а) выделенный штамм является ацидофильным и может расти при pH в диапазоне от примерно 0,7 до примерно 7,5; и
б) продуцирует липиды из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов или их комбинации в аэробных или по существу аэробных условиях.
В одном воплощении выделенный штамм по настоящему изобретению, кроме того, имеет одну или более следующих дополнительных идентифицирующих характеристик:
в) продуцирует этанол и/или водород из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов, или их комбинации в анаэробных или анаэробных условиях;
г) устойчив к концентрациям Mn вплоть до 25 мМ, концентрациям As вплоть до 250 мМ или 300 мМ, и к концентрациям Hg вплоть до 100 мМ;
д) способен депарафинизировать пшеничную солому и другие растительные материалы;
е) способен продуцировать липиды из водорослевого сырья и из отходов, образующихся при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) в аэробных или по существу аэробных условиях;
ж) способен продуцировать этанол и/или водород из водорослевого сырья и из отходов, образующихся при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) в анаэробных или анаэробных условиях;
з) способен продуцировать диизооктилфталат (DIOP);
и) способен продуцировать гександионовой кислоты моно(2-этилгексил)овый сложный эфир; и
к) содержит 18S рРНК и последовательность ДНК области ITS, которая обладает по меньшей мере 98% идентичностью с SEQ ID NO: 1.
В одном воплощении указанный выделенный штамм гриба Fusarium oxysporum представляет собой штамм, обозначенный как МК7, который был депонирован как АТСС номер РТА-10698, или его потомство.
В некоторых воплощениях указанное лигноцеллюлозное сырье выбрано из группы, состоящей из остатков сельскохозяйственных культур (например пшеничной соломы, ячменной соломы, рисовой соломы, соломы мелкозерных злаков, стеблей кукурузы, кукурузных волокон (например камеди кукурузных волокон (CFG), сушеной барды (DDG), кукурузной глютеновой муки (CGM)), проса, сена люцерны, жома сахарного тростника), несельскохозяйственной биомассы (например тины, остатков городских деревьев), лесных продуктов и промышленных отходов (например остатков первичного/вторичного измельчения дерева с мягкой древесиной, остатков первичного/вторичного измельчения дерева с твердой древесиной, шлама бумажной массы вторичной бумаги), лигноцеллюлозо-содержащих отходов (например газетной бумаги, бумажных отходов, зерна пивоварения, использованной резиновой шины (UTR), городских органических отходов, дворовых отходов, клинических органических отходов и отходов, полученных при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) и их комбинации. В некоторых воплощениях углеводы выбраны из группы, состоящей из моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов и их смеси.
В некоторых воплощениях указанный выделенный штамм гриба и/или его потомство может расти при низком pH, равном не более чем примерно 7,0, примерно 6,5, примерно 6,0, примерно 5,5, примерно 5,0, примерно 4,5, примерно 4,0, примерно 3,5, примерно 2,0, примерно 1,8, примерно 1,6, примерно 1,4, примерно 1,2, примерно 1,0, примерно 0,9, примерно 0,8 или примерно 0,7, или примерно 0,6, или примерно 0,5. Например, указанный штамм гриба может расти при низком рН в диапазоне от примерно 0,7 до примерно 2,0.
Выделенный штамм по настоящему изобретению может продуцировать большое количество липидов в диапазонах низких значений pH, как описано выше. В одном воплощении выделенный штамм может превращать сырье с более высокой скоростью в пределах низкого значения pH, как описано выше, чем любой другой штамм Fusarium oxysporum, выделенный ранее в данной области техники. Ранее были описаны выделенные штаммы Fusarium oxysporum (см. Nairn et al, 1985, Bhatia et a!., 2006 и Naqvi et al, 1997). В одном воплощении выделенный штамм может превращать сырье в липиды со скоростью по меньшей мере 0,04 г липида/г сырья, 0,05 г липида/ г сырья, 0,06 г липида/г сырья, 0,07 г липида/г сырья, 0,08 г липида/г сырья, 0,1 г липида/г сырья, 0,12 г липида/г сырья, 0,14 г липида/г сырья, 0,16 г липида/г сырья, 0,18 г липида/г сырья, 0,2 г липида/г сырья, 0,25 г липида/ г сырья, 0,3 г липида/г сырья, 0,35 г липида/г сырья или 0,4 г липида/г сырья через 10 суток инкубации при pH 2,5 в аэробных условиях.
В одном воплощении выделенный штамм гриба по настоящему изобретению продуцирует более подходящий профиль липидов по сравнению с ранее выделенными грибами или микроводорослями. Например, выделенный штамм продуцирует больше насыщенных жирных кислот (например пальмитиновую (16:0) и стеариновую кислоты (18:0)) и мононенасыщенных жирных кислот (например олеиновую кислоту (18:1)), но меньше полиненасыщенных жирных кислот, которые более подвержены окислению.
В некоторых воплощениях указанный выделенный штамм гриба и/или его потомство могут расти при более высокой концентрации металла, где металл выбран из группы, состоящей из Mn, Ag, Zn, Fe, Al, Be, Pb, Cu, Cr, Ni, Cd, Co, Ni, Pd, Pt, U, Th, Mo, Sn, Ti, As, An, Se, Sb и Hg. В одном воплощении выделенный штамм гриба может хорошо расти при высокой концентрации Mn, составляющей вплоть до 25 мМ. В одном воплощении два или более таких тяжелых металла(ов) (или тяжелых металлов, взятых вместе) могут присутствовать в количестве более чем 0,1 млн-1, или 1 млн-1, или 10 млн-1, или 50 млн-1, или 100 млн-1, или 200 млн-1, или 400 млн-1, или 500 млн-1, или 1000 млн-1, или 5000 млн-1, или 10000 млн-1, или 50000 млн-1, или 100000 млн-1 по массе.
Выделенный штамм Fusarium oxysporum и/или его потомство по настоящему изобретению можно культивировать без антибиотиков с небольшими загрязнениями или без них, где указанные загрязнения другими организмами выбраны из группы, состоящей из контаминации бактериями, другими грибами (например дрожжами, плесенью), водорослями, растениями, насекомыми и их смесью.
Выделенный штамм Fusarium oxysporum и/или его потомство могут быть дополнительно модифицированы, например посредством мутагенеза и/или рекомбинантных способов (например трансформации). Способы мутагенеза грибов и рекомбинантные способы хорошо известны в данной области техники. Могут быть применены классические методы мутагенеза, которые включают, без ограничения ими, химический мутагенез, инсерционный мутагенез и радиационный мутагенез (например УФ- или гамма-облучение). В некоторых случаях можно выполнить генетические скрещивания, чтобы скомбинировать улучшения разных мутантов.
В одном воплощении настоящего изобретения выделенный штамм гриба и/или его потомство способны расти при высокой плотности клеток. В некоторых воплощениях настоящего изобретения микроорганизмы способны достигать плотности клеток по меньшей мере примерно 10 г/л, по меньшей мере примерно 15 г/л, по меньшей мере примерно 20 г/л, по меньшей мере примерно 25 г/л, по меньшей мере примерно 30 г/л, по меньшей мере примерно 50 г/л, по меньшей мере примерно 75 г/л, по меньшей мере примерно 100 г/л, по меньшей мере примерно 125 г/л, по меньшей мере примерно 135 г/л, по меньшей мере примерно 140 г/л, по меньшей мере примерно 145 г/л или по меньшей мере примерно 150 г/л. Например, выделенный штамм гриба способен достигать плотности клеток от примерно 10 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 15 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 20 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 25 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 30 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 50 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 75 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 100 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 125 г/л до примерно 300 г/л, от примерно 130 г/л до примерно 290 г/л, от примерно 135 г/л до примерно 280 г/л, от примерно 140 г/л до примерно 270 г/л, от примерно 145 г/л до примерно 260 г/л, от примерно 150 г/л до примерно 250 г/л, или от примерно 100 г/л до примерно 280 г/л. Высокая плотность роста выделенного штамма гриба по настоящему изобретению может быть увеличена путем регулирования условий ферментации (таких как температура, pH, концентрация ионов и концентрации газов).
Гены и белки выделенного штамма гриба
Могут быть очищены белки (например определенные ферменты) дикого типа выделенного штамма МК7 Fusarium oxysporum и/или его потомства. Специалисту в данной области техники известны способы очистки белков. Подробное описание способов очистки представлено в Janson and Ryden (Protein purification: principles, high-resolution methods, and applications; Wiley-VCH, 1998, ISBN 0471186260, 9780471186267), Deutscher (Guide to protein purification, Volume 182 of Methods in enzymology, Gulf Professional Publishing, 1990, ISBN 0121820831, 9780121820831) и Cutler (Protein purification protocols, Volume 244 of Methods in molecular biology, Humana Press, 2004 ISBN 1588290670, 9781588290670), которые включены посредством ссылки во всей своей полноте для всех целей.
Нуклеотидные последовательности выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению могут быть клонированы, секвенированы, охарактеризованы и модифицированы с помощью биотехнологии. Клонированные последовательности могут быть перенесены в другой организм.
Неограничивающие примеры способов выделения ДНК из Fusarium oxysporum и способов анализа последовательности ДНК (например ПЦР (полимеразная цепная реакция), ПДАФ (полиморфизм длины амплифицированных фрагментов), SSR (микросателлитный анализ) и анализы последовательности ДНК, Саузерн-блот, ОТ-ПЦР и др.) показаны в Lee et al. (1990, Isolation of DNA from fungal mycelia and single spores, Academic Press, New York, pp. 282-287), Gale et al. (2003, Phytopathology 93: 1014-1022), Bogale et al. (2006, Characterization of Fusarium oxysporum isolates from Ethiopia using AFLP, SSR and DNA sequence analyses, Fungal Diversity, 25: 51-65). Кроме того, биологические материалы, экспериментальные процедуры, которые можно использовать для выращивания Fusarium oxysporum, выделение РНК, создание библиотеки кДНК, методы получения микропанели и микроматричного анализа данных были описаны в Dowd et al (2004, Gene expression profile changes in cotton root and hypocotyl tissues in response to infection with Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum. MoL Plant-Microbe Interact. 17: 654-667).
Основные руководства, описывающие молекулярно-биологические методы, применимые к настоящему изобретению, такие как клонирование, мутации и тому подобное, включают Berger and Kimmel, Guide to Molecular Cloning Techniques, Methods in Enzymology, Vol. 152 Academic Press, Inc., San Diego, Calif. ("Berger"); Sambrook et al., Molecular Cloning-A Laboratory Manual (3rd Ed.), Vol. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 2000 ("Sambrook") и Current Protocols in Molecular Biology, F. M. Ausubel et al., eds., Current Protocols, совместное предприятие Greene Publishing Associates, Inc. and John Wiley & Sons, Inc., ("Ausubel"). Эти руководства описывают мутагенез, использование векторов, промоторы и многие другие релевантные темы, относящиеся, например, к клонированию и мутациям присутствующих генов, и т.д. Таким образом, данное изобретение также включает использование известных методов белковой инженерии и технологии рекомбинантной ДНК для улучшения или изменения характеристик белков, экспрессируемых штаммами Fusarium (например штаммом МК7). Различные типы мутагенеза можно использовать для получения и/или выделения различных нуклеиновых кислот, которые кодируют белковые молекулы, и/или для модификации/мутации белков по настоящему изобретению. Они включают, без ограничения ими, сайт-направленный, случайный мутагенез, гомологичную рекомбинацию (ДНК-шаффлинг), мутагенез с помощью урацилсодержащих матриц, олигонуклеотид-направленный мутагенез, фосфоротиоат-модифицированный мутагенез ДНК, мутагенез с использованием дуплекса ДНК с разрывами или т.п. Дополнительные подходящие способы включают репарацию ошибочно спаренных оснований, мутагенез с использованием штаммов-хозяев с недостатком репарации, рестрикцию-селекцию и рестрикцию-очистку, делеционный мутагенез, мутагенез посредством общего генетического синтеза, репарацию двунитевых разрывов и тому подобное. Мутагенез, например, включающий химерные конструкции, также включен в настоящее изобретение. В одном воплощении мутагенез определяется известной информацией о природной молекуле или измененной или мутированной природной молекуле, например последовательности, сравнении последовательностей, физических свойствах, кристаллической структуре или тому подобное.
Методы клонирования генов известны в данной области. Ген может быть клонирован в виде вставки ДНК в вектор. Термин "вектор" относится к средству, посредством которого нуклеиновая кислота может быть размножены и/или перемещена между организмами, клетками или клеточными компонентами. Векторы включают плазмиды, вирусы, бактериофаги, провирусы, фагемиды, транспозоны, искусственные хромосомы и тому подобное, которые реплицируются автономно или могут интегрироваться в хромосому клетки-хозяина. Вектором также может быть голый РНК-полинуклеотид, голый ДНК-полинуклеотид, полинуклеотид, состоящий и из ДНК, и из РНК в пределах одной нити, полилизин-конъюгированная ДНК или РНК, пептид-конъюгированная ДНК или РНК, липосома-конъюгированная ДНК или тому подобное, то есть не реплицирующиеся автономно. Во многих, но не во всех, общих воплощениях векторы по настоящему изобретению представляют собой плазмиды или бакмиды.
В одном воплощении гены, кодирующие определенные ферменты, клонировали посредством экспрессионного клонирования (синоним клонирование активности). Например, выделенный штамм МК7 Fusarium oxysporum размножают и получают библиотеки кДНК с использованием полиаденилированной мРНК, выделенной из штамма МК7. Затем экспрессионные векторы в библиотеках кДНК трансформируют в подходящие клетки-хозяева (например клетки грибов, бактериальные клетки, клетки дрожжей, клетки растений, клетки насекомых и клетки животных) и указанные клетки-хозяева подвергают скринингу на предпочтительную ферментативную активность. В одном воплощении указанная ферментативная активность выбрана из группы, состоящей из ферментативных активностей целлюлазы, ксиланазы, лигниназы, глюкуронидазы, арабинофуранозидазы, арабиногалактаназы, эстеразы фуруловой кислоты, липазы, пектиназы, глюкоманназы, амилазы, ламинариназы, ксилоглюканазы, галактаназы, глюкоамилазы, пектатлиазы, хитиназы, экзо-β-D-глюкозаминидазы, целлобиозо-дегидрогеназы и ацетил ксилан-эстеразы, ксилозидазы, α-L-арабинофуранозидазы, ферулоил-эстеразы, эндоглюканазы, β-глюкозидазы, Mn-пероксидазы и лакказы.
В другом воплощении, благодаря доступности геномной последовательности Fusarium oxysporum, можно использовать метод геномики/биоинформатики для клонирования генов, кодирующих интересующие ферменты. Например, анализ данных о геномной последовательности Fusarium oxysporum для гомологов интересующих генов может выявить гены-кандидаты, кодирующие белок с определенными предпочтительными ферментативными активностями. Затем такие гены могут быть клонированы и их активность протестирована.
В еще одном воплощении гены, кодирующие белок с определенной предпочтительной ферментативной активностью, могут быть выделены с помощью традиционных методов молекулярного клонирования. Например, могут быть определены активности некоторых белков из банка культур и указанные белки могут быть очищены. Затем очищенные ферменты подвергают анализу и могут быть определены пептидные последовательности. Затем конструируют вырожденные праймеры и используют их в ПЦР или в ОТ-ПЦР для клонирования интересующих генов. Для конструирования вырожденных праймеров известные гомологичные аминокислотные последовательности могут быть выровнены с интересующим белком, чтобы идентифицировать консервативные области.
Выделенный ген, кодирующий фермент, устойчивый к кислому рН, можно клонировать в экспрессиойный вектор и трансформировать клетку-хозяина, выбранную из группы, состоящей из клетки гриба (например видов Fusarium, видов Aspergillus), бактериальной клетки (например видов бациллы), дрожжевой клетки, растительной клетки, клетки насекомых и животной клетки. Для выбора подходящей клетки-хозяина, необходимо учитывать несколько факторов: скорость роста клеток, стоимость ростовой среды, уровни экспрессии, способность к секреции и посттрансляционные модификации (например сворачивание белка, N-связанное гликозилирование, О-связанное гликозилирование, фосфорилирование, ацетилирование и ацилирование).
В одном воплощении указанный ген, кодирующий фермент, устойчивый к кислому рН, трансформируют в клетку гриба. Как правило, штамм гриба, имеющий (1) низкие уровни секретируемых протеаз, (2) низкий общий спектр секретируемых белков, (3) способность к высокому уровню гетерологичной экспрессии, (4) подходящую ферментационную морфологию, (5) "обычно рассматривается как безопасный" и (6) трансформируемость, является предпочтительным для экспрессии. Способы трансформации нитчатых грибов хорошо известны в данной области техники. В одном воплощении трансформацию осуществляют посредством бомбардировок (см. Aboul-Soud et al., Transformation of Fusarium oxysporum by particle bombardment and characterization of the resulting transformants expressing a GFP transgene, January 2005, Mycopathologia, 158 (4): 475-482). В другом воплощении трансформация опосредована агробактериями (см. Mullins et al., Agrobacterium-mediated transformation of Fusarium oxyspomm: an efficient tool for insertional mutagenesis and gene transfer, 2001, Phytopathology, 91 (2): 173-180). В еще одном воплощении указанная трансформация является химически опосредованной (например полиэтиленгликоль(ПЭГ)-опосредованная трансформация протопластов, см. Powell et al, Journal of Bacteriology, June 1990, 172 (6): 3163-3171). Например, конидии (споры) хозяина-гриба проращивают для получения сначала молодого зародышевого мицелия. Затем удаляют клеточную стенку мицелия с помощью смеси литических ферментов с образованием протопластов грибов, которые являются осмотически хрупкими. Указанные протопласты грибов смешивают с ДНК (кодирующей селективный маркер), CaCl2 и ПЭГ и, возможно, с ингибитором нуклеазы (например ауринтрикарбоновой кислотой). Разведения протопластов затем наносят на осмотически стабилизированную среду (например минимальную среду, содержащую сахарозу), чтобы обеспечить регенерацию и отбор трансформантов. Типичный экспрессионный вектор, используемый в клетке-хозяине гриба, содержит грибковый промотор (который обеспечивает инициацию транскрипции в грибе-хозяине), интересующий ген, грибковый терминатор (который обеспечивает прекращение транскрипции в грибе-хозяине) и селективный маркер. Также могут быть включены сигналы инициации трансляции и ДНК, кодирующая сигнальный пептид для секреции. Селективный маркер может быть выбран из группы, состоящей из пищевых маркеров (например argB (аргининовая прототрофность) и trpC (триптофановая прототрофность)), пищевых маркеров с прямой и обратной селекцией (например amdS (ацетамидаза), pyrG (уридиновая прототрофность), niaD (использование нитратов) и sC (использование сульфатов)), и доминантных селективных маркеров (например benA (беномил-резистентный β-тубулин), oliC (олигомицин-резистентная АТФ-синтаза), hygB (резистентность к гигромицину В), G418 (резистентность к генетицину), резистентность к флеомицину/блеомицину, bar (придает резистентность к BASTA (гербициду)). Неограничивающими примерами грибковых экспрессионных векторов являются pBARKS, pBARGEM, pBARMTE, pBARGP, pAn52-7Not uidA, pPFE2, p777, pAN, pTL, pUC19 и вектора, описанные в Cullen et al. (Molecular Cloning Vectors for Aspergillus ami Neurospora в A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses, Butterworth Publishers, Stoneham, MA 1986). Трансформация грибов-хозяев является интегративной и обычно митотически стабильной.
Грибковые экспрессионные системы могут быть оптимизированы. Например, основные секретируемые белки хозяина могут быть удалены, так чтобы гетерологичный фермент составлял высокий процент от общего белка. Гены, кодирующие протеазы и микотоксины, также могут быть удалены, чтобы стабилизировать экспрессируемый белок и нежелательную побочную активность. Кроме того, могут быть использованы конститутивный/индуцируемый промотор, горячие точки, включенные в экспрессионные векторы, ectors, оптимизация последовательности Козак, манипуляция с различными сайтами связывания в промоторе.
Выделенный штамм гриба и/или его потомство по настоящему изобретению могут быть дополнительно подвергнуты мутагенезу и скринингу в отношении улучшенной экспрессии или удаления одной или более нежелательных побочных активностей. Могут быть применены методы классического мутагенеза, которые включают, без ограничения ими, химический мутагенез, инсерционный мутагенез и радиационный мутагенез (например УФ- или гамма-облучение). В некоторых случаях могут быть выполнены генетические скрещивания, чтобы объединить улучшения разных мутантов.
Получение биотоплива и/или предшественников биотоплива
Биотопливо, полученное из сахара, крахмала, растительного масла или животных жиров с использованием традиционной технологии, называют биотопливом первого поколения. Основным сырьем для этого биотоплива часто являются семена/зерна, содержащие крахмал (например пшеница, кукуруза) или растительное масло (например подсолнечное), которые представляют лишь небольшие части целых растений. В связи с ростом населения Земли, сырье для получения биотоплива критикуют за выведение пищи из пищевой цепи человека и животных, что приводит к нехватке продовольствия и росту цен.
Биотопливо второго поколения (например целлюлозное биотопливо, биоводород, биометанол, DMF, Bio-DME, дизель Фишера-Тропша, биоводородный дизель, смешанные спирты и древесный дизель), которое может быть получено из непродовольственных культур или несъедобных частей культур, включающих, без ограничения ими, биомассу отходов, стебли пшеницы, кукурузы, дерево и биомассу специальных культур (например мискантус), является публично и политически более популярным. Среди них целлюлозный этанол представляет собой тип биотоплива, получаемого из лигноцеллюлозы, конструкционного материала, который составляет большую часть биомассы растений. Он состоит главным образом из целлюлозы (31-49%), гемицеллюлозы (16-26%) и лигнина (19-26%). Лигнин делает растение жестким и устойчивым к сжатию и должен быть удален перед ферментацией. Солома культур (например листья и стебли кукурузы, сорго, сои и др.), просо прутьевидное, мискантус, щепа и побочные продукты ухода за газонами и деревьями являются одними из наиболее популярных целлюлозных материалов для получения этанола. Для производства целлюлозного этанола требуются дополнительные стадии переработки исходных материалов для высвобождения мономеров сахара для микробиологической ферментации из лигнина. По сравнению с биотопливом первого поколения, биотопливо на основе лигноцеллюлозы имеет ряд преимуществ. Во-первых, источники биотоплива на основе лигноцеллюлозы географически распределены более равномерно, чем для биотоплива на основе сахаров/крахмала. Во-вторых, лигноцеллюлозные исходные материалы минимизируют возможный конфликт между использованием земель для производства продуктов питания (и корма) и производством энергетического сырья. Исходный материал является более дешевым, чем обычное сельскохозяйственное сырье и может быть получен с более низкими затратами удобрений, пестицидов и энергии. В-третьих, биотопливо из лигноцеллюлозы образует низкой уровень выбросов парниковых газов, уменьшая воздействия на окружающую среду, в частности на изменение климата.
Как правило, сырье содержит органические и неорганические питательные вещества для поддержания роста и метаболизма выделенного штамма гриба. Однако, когда необходимые неогранические или органические питательные вещества отсутствуют или присутствуют в недостаточных количествах, сырье может быть дополнено водной фазой, содержащей указанные необходимые неорганические или органические питательные вещества для поддержания роста и метаболизма гриба.
Биоспирты
В одном воплощении в настоящем изобретении предлагаются способы получения биоспиртов и/или предшественников биоспиртов из сырья с использованием выделенного штамма гриба по настоящему изобретению. Неограничивающими примерами получаемых биоспиртов являются биоэтанол, биометанол, биобутанол, изобутанол и др. В одном воплощении биоспирт представляет собой биоэтанол.
В одном воплощении указанные биоспирты получают при ферментации в анаэробных условиях. В другом воплощении указанные биоспирты получают при ферментации по существу в анаэробных условиях.
Неограничивающие примеры сырья включают лигноцеллюлозное сырье, углеродсодержащие отходы, углеводы или их комбинации. Например, лигноцеллюлозное сырье выбрано из группы, состоящей из остатков сельскохозяйственных культур (например пшеничной соломы, ячменной соломы, рисовой соломы, соломы мелкозерных злаков, стеблей кукурузы, кукурузных волокон (например камеди кукурузных волокон (CFG), сушеной барды (DDG), кукурузной глютеновой муки (CGM)), проса, сена люцерны, жома сахарного тростника), несельскохозяйственной биомассы (например тины, остатков городских деревьев), лесных продуктов и промышленных отходов (например остатков первичного/вторичного измельчения дерева с мягкой древесиной, остатков первичного/вторичного измельчения дерева с твердой древесиной, шлама бумажной массы вторичной бумаги), лигноцеллюлозо-содержащих отходов (например газетной бумаги, бумажных отходов, зерна пивоварения, использованной резиновой шины (UTR), городских органических отходов, дворовых отходов, клинических органических отходов и отходов, получаемых при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) и их комбинации. В некоторых воплощениях углеводы выбраны из группы, состоящей из моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов и их смеси. Например, углеводы представляют собой пяти- и шести-углеродные сахара.
Способы и стратегии производства товарного биотоплива и/или предшественников биотоплива и химических веществ из сырья известны в данной области техники. Основные стадии получения целлюлозных спиртов включают предварительную обработку (получение лигноцеллюлозного материала, такого как древесина или солома, подходящего для гидролиза), гидролиз целлюлозы (расщепление молекул на сахара), разделение (главным образом отделение раствора сахара от лигнина), ферментация и дистилляция. Методы предварительной обработки включают кислотный гидролиз, обработку паром, аммиачный взрыв волокна, щелочное влажное окисление и предварительную обработку озоном (Klinke et ah, 2004, Inhibition of ethanol-producing yeast and bacteria by degradation products produced during pre-treatment of biomass. Appl Microbiol Biotechnol 66: 10-26).
Ферментер (также называемый биореактор) может быть использован в качестве контейнера для получения биотоплива. Первая стадия ферментации заключается в стерилизации ферментера. Стерилизация может быть выполнена с помощью пара, химических агентов, моющих средств или их комбинации. Были зарегистрированы многочисленные конструкции реакторов, такие как реакторы периодического действия, последовательно-периодические реакторы, баковые реакторы с постоянным перемешиванием, анаэробные контактные реакторы, анаэробные реакторы с перегородками, реакторы с псевдоожиженным слоем, газлифтные реакторы, анаэробные реакторы с придонным слоем организмов и восходящим потоком жидкости и анаэробные реакторы с комбинированной структурой потока. Типичные ферментеры описаны в патентах US 3615253; 5205936; 5728577; 4530762; 4649117; 7446156 и 5228995. В соответствии с разными ферментерами имеются три основных способа проведения ферментации: периодическая ферментация, периодическая ферментация с добавлением субстрата (или непрерывная ферментация) и каскадная ферментация. Для периодической ферментации реактор заполняют стерильным субстратом и засевают ферментирующим организмом. Культуру оставляют расти до насыщения. Для периодической ферментации с добавлением субстрата (или непрерывной ферментации), субстрат подается непрерывно, а культуральную среду непрерывно удаляют. Для каскадной ферментации ферментационная "жидкость" проходит через ряд ферментов для создания все большего количества продуктов (например в пивоварении, пиво ферментируют за несколько стадий, чтобы увеличить содержание алкоголя).
Ферментация начинается с введения небольшого, активно растущего образца микроорганизма в ферментеры (биореакторы), содержащие стерильный субстрат. И прокариотические микроорганизмы (включая бактерии, цианобактерии), и эукариотические микроорганизмы (включая дрожжи, грибы и водоросли) используются в промышленной ферментации. В некоторых других биореакторах альтернативные организмы (включая клетки растений, клетки млекопитающих) используются для получения продуктов, таких как белки, особенно для фармацевтических целей. Например, клеточные культуры нескольких разных видов растений, в том числе Arahidopsis thaliana, Taxus cuspidata, Catharathus roseus и важные культурные растения, такие как табак, люцерна, рис, помидоры и соя, используются для получения рекомбинантного белка.
Микроорганизмы широко используются для получения большого круга продуктов и услуг: таких как традиционные продукты (включающие, без ограничения ими, хлеб, пиво, вино, продукты перегонки, сыр, молочные продукты, ферментированное мясо и овощи, грибы, соевый соус и уксус), сельскохозяйственные продукты (включающие, без ограничения ими, гиббереллины, фунгициды, инсектициды, силос, аминокислоты, такие как L-глутамин, L-лизин, L-триптофан, L-треонин, L-аспарагиновая кислота (+), L-арилглицины), ферменты (включающие, без ограничения ими, углеводы, целлюлозы, липазы, пектиназы, протеазы), топливо и химическое сырье (включающее, без ограничения ими, ацетон, бутанол, бутандиол, изопропанол, этанол, глицерин, метан, глицерин, масляную кислоту, метан, лимонную кислоту, фумаровую кислоту, молочную кислоту, пропионовую кислоту, янтарную кислоту, итаконовую кислоту, уксусную кислоту, 3-гидроксипропионовую кислоту, глюконовую кислоту, винную кислоту и L-глутаровую кислоту, или соли любой из этих кислот), нуклеотиды, органические кислоты, фармацевтические средства и родственные соединения (включающие, без ограничения ими, алкалоиды, антибиотики, гормоны, иммунодепрессант, интерферон, стероиды, вакцины, витамины) и полимеры (включающие, без ограничения ими, альгинаты, декстран, геллан, полигидрооксибутират, склероглюкан и ксантан).
Гидролиз целлюлозы в настоящее время выполняют путем выбора из химического гидролиза (например, патенты US 4427453; 4556430; 6022419), ферментативного гидролиза (например, патент US 5637502) и термического гидролиза (например, патент US 6692578). В химическом гидролизе используют разбавленную кислоту при высокой температуре и высоком давлении (или концентрированную кислоту при низкой температуре и давлении) для расщепления полисахаридных цепей. Целлюлазу, ксиланазу и гемицеллюлазу, которые могут быть получены из грибов (Trichoderma reesei) в большом количестве (например, патент US 6555335) используют для превращения биомассы, такой как стебли кукурузы, барда, пшеничная солома и жом сахарного тростника, или энергетических культур (например проса прутьевидного) в сбраживаемые сахара. На стадии ферментации пекарские дрожжи (Saccharomyces cerevisiae) используют в промышленном производстве этанола из гексоз (6-углеродный сахар). Известны способы непрерывной ферментации Сахаров с получением спирта и способы этанольной ферментации с участием рециркуляции дрожжей (а именно, патенты US 1201062; 2054736; 2063223; 2122939; 2146326; 2169244; 2230318; 2272982; 2285130; 2155134; 2371208; 2657174; 2676137; 2967107; 3015612; 3078166; 3093548; 3177005; 3201328; 3207605; 3207606; 3219319; 3234026; 3413124; 3528889; 3575813; 3591454; 3658647; 3676640; 3705841; 3737323; 3940492; и 3984286).
Лигноцеллюлозные материалы содержат целлюлозу, гемицеллюлозу и лигнин. Целлюлоза представляет собой полисахарид, содержащий глюкопиранозные субъединицы, соединенные β-1→4 глюкозидными связями. Мономерной субъединицей является глюкоза. Гемицеллюлоза представляет собой группы полисахаридов, включающих четыре основных типа: D-ксилоглюканы, D-ксиланы, D-маннаны и D- галактаны. В каждом типе от двух до шести мономеров связаны посредством β-1→4 и β-1→3 связей в главной цепи и посредством α-1→2, 3 и 6 связей в ответвлениях. Мономерные субъединицы могут представлять собой D-ксилозу, L-арабинозу, D-маннозу, D-глюкозу, D-галактозу и D-глюкуроновую кислоту. Основные лигнины представляют собой высококонденсированные полимеры, образованные посредством дегидрирующей полимеризации гидроксикоричных спиртов, пара-кумариловых спиртов, конифериловых спиртов и синапиловых спиртов. Неосновной лигнин включает эстерифицированные или этерифицированные фенольные кислоты, связанные с основным лигнином или нецеллюлозными полисахаридами. В предпочтительных воплощениях вещество биомассы, содержащее целлюлозу, гемицеллюлозу и лигнин (то есть лигноцеллюлозную биомассу), обрабатывают с получением глюкозы, фруктозы, сахарозы, маннозы, мальтозы, сорбита, галактозы, ксилозы, а также их комбинаций.
В некоторых воплощениях вещества лигноцеллюлозной биомассы гидролизуют перед ферментацией. Настоящее изобретение не ограничено использованием какого-либо конкретного способа гидролиз. Действительно, рассматривается применение различных методов гидролиза, включая, но без ограничения ими, ферментативный гидролиз и химический гидролиз (такой как гидролиз разбавленной кислотой или гидролиз концентрированной кислотой) и их комбинации.
Некоторые примеры способов предварительной обработки сырья описаны в публикациях патентных заявок US 2007/0161095, WO 05/053812, WO 06/086757, US 2006/0182857, US 2006/177551, US 2007/0110862, WO 06/096834, WO 07/055735, US 2007/0099278, WO 06/119318, US 2006/0172405 и US 2005/0026262.
Примеры ферментов, подходящих для гидролиза целлюлозы, описаны в патенте или публикациях патентных заявок US 2003/0096342, WO 03/012109, US 7059993, WO 03/012095, WO 03/012090, US 2003/0108988, US 2004/0038334, US 2003/0104522, EP 1612267 и WO 06/003175.
Выделенный штамм гриба и/или его потомство по настоящему изобретению может прямо превращать лигноцеллюлозное сырье в высокоэнергетические метаболиты с несколькими стадиями предварительной обработки и без добавлений ферментов. Следовательно, использование этого нового способа является относительно простым и недорогим по сравнению с существующими методами. Однако, следует понимать, что стадии предварительной обработки и добавления ферментов можно использовать в качестве возможных стадий для повышения скоростей гидролиза и уменьшения времени получения высокоэнергетических метаболитов. Биодизель и биологическая смазка
Биодизель относится к дизельному топливу на основе липидов, состоящему из длинноцепочечных алкиловых (метиловых, пропиловых или этиловых) сложных эфиров, где липид происходит из живых или недавно живых организмов (например растительного масла, животного жира, масла микроорганизмов). Липиды могут быть использованы в качестве предшественников в производстве биодизелей, например посредством переэтерификации. При использовании здесь, термин переэтерификация относится к процессу замены органической группы R" сложного эфира на органическую группу R' спирта:
Эти реакции часто катализируются добавлением кислоты или основания. Биодизель обычно получают посредством взаимодействия химически взаимодействующих липидов (например растительного масла, животного жира) со спиртом. Неограничивающие примеры спиртов включают метиловый спирт, этанол, бутанол, изопропанол. Использование спиртов с более высокой молекулярной массой улучшает свойства холодной текучести полученного сложного эфира за счет менее эффективной реакции переэтерификации. Любые свободные жирные кислоты (FFA) в масляной основе либо превращаются в мыло и удаляются из процесса или их этерифицируют (с получением дополнительного биодизеля), используя кислотный катализатор. Побочным продуктом процесса переэтерификации является получение глицерина.
Липиды, как предшественники биодизеля, могут поступать из многих сырьевых источников. Неограничивающие примеры сырья включают рапсовое масло, соевое масло, ярутку полевую, ятрофу, горчицу, лен, подсолнечник, пальмовое масло, кокосовый орех, коноплю, касторовое масло, кокосовое масло, кукурузное масло, хлопковое масло, арахисовое масло, масло редиса, масло рамтила, масло из рисовых отрубей, сафлоровое масло, масло солероса, подсолнечное масло, тунговое масло, водорослевое масло, копайский бальзам, масло понгамии, масло ятрофы, масло жожоба, молочное дерево, масло орехов нефтяного дерева и животный жир.
Биодизель предназначен для использования в стандартных дизельных двигателях и, таким образом, отличается от растительных и отработанных масел, используемых для подачи топлива в переделанные дизельные двигатели. Биодизель можно использовать сам по себе или в смеси с нефтяным дизельным топливом. Смеси биодизеля и традиционного дизеля на углеводородной основе являются наиболее широко распространенными продуктами для использования на рынке розничной продажи дизельного топлива. Смеси 20 процентов биодизеля с 80 процентами нефтяного дизельного топлива (В20) можно, как правило, использовать в немодифицированных дизельных двигателях. Биодизель также можно использовать в чистом виде (В100), но могут потребоваться определенные модификации двигателя для того, чтобы избежать проблем технического обслуживания и работоспособности.
Биодизель также можно использовать в качестве отопительного топлива в бытовых и промышленных котлах, смесь мазута и биотоплива, стандартизованного и облагаемого несколько другим налогом, чем дизельное топливо, используемое для транспорта. Его иногда называют "биотеплом". Отопительный биодизель доступен в различных смесях; вплоть до 20% биотоплива считается приемлемым для использования в существующих печах без модификации.
Неограничивающие примеры способов получения биодизеля включают: периодический процесс, бесферментный сверхкритический процесс, способ с ультра- и большим сдвиговым усилием в поточной линии и с периодическим реактором, метод ультразвукового реактора и микроволновый способ. Другие системы и устройства для получения биодизеля описаны в патентах US 7452515, 7524982, 7420072, 6824682, 7169821, 6979426, 7514247, 7449313, 7605281 и в патентных заявках US 20080282606, 20070260079, 20070010681, 20090054701, 20030111410, 20080202021, 20050113467, 20050255013, 20030175182, 20080299633, 20080102503, 20090178330, 20080313955, 20080282687, 20070167642 и 20070122667, каждый из которых включен в данное описание посредством ссылки во всей своей полноте.
Таким образом, в настоящем изобретении предложены способы получения высокоэнергетических метаболитов с использованием выделенного штамма гриба по настоящему изобретению, где высокоэнергетические метаболиты представляют собой главным образом липиды в качестве предшественников биодизеля. Липиды могут быть экстрагированы из выделенных штаммов грибов для получения биодизеля. Выделенный штамм гриба по настоящему изобретению имеет более подходящий липидный профиль по сравнению с водорослями и другими липидо-продуцирующими организмами. В одном воплощении указанные липиды по существу представляют собой жирные кислоты. В одном воплощении указанные жирные кислоты по существу представляют собой ненасыщенные жирные кислоты и/или насыщенные жирные кислоты. В одном воплощении указанные ненасыщенные жирные кислоты выбраны из группы, состоящей из олеиновой кислоты (18:1), α-линоленовой кислоты (18:3), эйкозеновой кислоты (20:1) и их комбинации. В одном воплощении указанные насыщенные жирные кислоты выбраны из группы, состоящей из пальмитиновых кислот (16:0), стеариновых кислот (18:0), арахидиновой кислоты (20:0), бегеновой кислоты (22:0) и их комбинации. Другие типы липидов, которые могут быть получены, включают, без ограничения ими, насыщенные жиры (например масляную кислоту, капроновую кислоту, каприловую кислоту, декановую кислоту, додекановую кислоту, тридекановую кислоту, тетрадекановую кислоту, пентадекановую кислоту, гексадекановую кислоту, гептадекановую кислоту, октадекановую кислоту, нонадекановую кислоту, эйкозановую кислота, докозановую кислоту, тетракозановую кислоту), мононенасыщенные жиры (например тетрадеценовую кислоту, пентадеценовую кислоту, гексадеценовую кислоту, гептадеценовую кислоту, октадеценовую кислоту, эйкозеновую кислоту, докозеновую кислоту, цис-тетракозеновую кислоту) и полиненасыщенные жиры (например гексадекадиеновую кислоту, линолевую кислоту, линоленовую кислоту, альфа-линоленовую кислоту, гамма-линоленовую кислоту, паринаровую кислоту, эйкозадиеновую кислоту, арахидоновую кислоту, тимнодоновую кислоту, брассидиновую кислоту, клупанодоновую кислоту и докозагексаеновую кислоту), омега-7 вакценовую кислоту (метил-11-октадеценоат), омега-7 пальмитолеиновую кислоту (метил-гексадец-9-еноат; торговое название Provinal1M) и тетракозановой кислоты метиловый эфир, и другие жирные кислоты, перечисленные в Таблице 1.
В одном воплощении указанные липиды в качестве предшественников биодизеля получают при ферментации в аэробных условиях. В другом воплощении указанные биоспирты получают при ферментации в по существу аэробных условиях.
В одном воплощении выделенный штамм гриба и/или его потомство способны эффективно продуцировать липиды. В некоторых воплощениях настоящего изобретения количество продуцируемых липидов составляет по меньшей мере примерно 1 г/л/сутки, 5 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 10 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 20 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 30 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 40 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 50 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 60 г/л/сутки, по меньшей мере примерно 70 г/л/сутки или более. Например, количество продуцируемого биологического масла составляет от примерно 1 г/л/сутки до примерно 5 г/л/сутки, от примерно 5 г/л/сутки до примерно 70 г/л/сутки, от примерно 10 г/л/сутки до примерно 70 г/л/сутки, от примерно 20 г/л/сутки до примерно 70 г/л/сутки, или от примерно 30 г/л/сутки до примерно 70 г/л/сутки.
Липиды в образце могут быть экстрагированы с использованием разных методов. Неограничивающие примеры экстракции липидов описаны в King et al. (Supercritical Fluid Extraction: Present Status and Prospects, 2002, Grasa Asceites, 53, 8-21), Folch et al. (A simple method for the isolation and purification of total lipids from animal tissues, 1957, J. Biol. Chem,, 226, 497-509), Bligh and Dyer (A rapid method of total lipid extraction and purification. 1959, Can. J. Biochem. Physiol., 37, 911-917), Cabrini et al. (Extraction of lipids and lipophilic antioxidants from fish tissues - a comparison among different methods. 1992, Comp. Biochem. Physiol., 101B, 383-386), Hara et al. (Lipid extraction of tissues with a low toxicity solvent. 1978, Anal. Biochem., 90, 420-426), Lin et al. (Ethyl acetate/ethyl alcohol mixtures as an alternative to Folch reagent for extracting animal lipids. 2004, J. Agric. Food Chem., 52, 4984-4986), Whiteley et al. (Lipid peroxidation in liver tissue specimens stored at subzero temperatures. 1992, Cryo-Letters, 13, 83-86), Kramer et al. (A comparison of procedures to determine free fatty acids in rat heart. 1978, J. Lipid Res., 19, 103-106) и Somashekar et al. (Efficacy of extraction methods for lipid and fatty acid composition from fungal cultures, 2001, World Journal of Microbiology and Biotechnology, 17 (3): 317-320). В другом примере липид может быть выделен с помощью методов, аналогичных FRIOLEX® (Westfalia Separator Industry GmbH, Germany) процессу, используемому для экстракции биологических масел, продуцируемых микроорганизмами. FRIOLEX© представляет собой способ физической экстракции на водной основе, посредством которого исходный материал, содержащий масло, можно использовать непосредственно для экстракции масла, не используя никаких обычных методов экстракции растворителем. В этом способе водорастворимый органический растворитель можно использовать в качестве технологической добавки, и масло отделяют от сырьевого бульона посредством сепарации по плотности с использованием силы тяжести или центробежных сил.
После выделения липидов, эти липиды могут быть извлечены или отделены от нелипидных компонентов любыми подходящими способами, известными в данной области техники. Например, недорогие физические и/или механические методы используются для отделения липидсодержащих композиций от нелипидных композиций. Если в метода экстракции, используемом для извлечения липидов, образуются несколько фаз или фракций, где одна или более фаз или фракций содержат липиды, способ извлечения липидсодержащих фаз или фракций может включать физическое отделение липидсодержащих фаз или фракций от нелипидных фаз или фракций или наоборот.В некоторых воплощениях настоящего изобретения используют метод FRIOLEX® для экстракции липидов, продуцируемых микроорганизмами, и богатую липидами легкую фазу затем физически отделяют от богатой белком тяжелой фазы (например, снимая слой богатой липидами фазы, которая находится сверху богатой белком тяжелой фазы после разделения по плотности).
В некоторых воплощениях настоящего изобретения лигноцеллюлозное сырье, которое используется для выращивания выделенного штамма гриба, содержит целлюлозу в количестве от примерно 5% до примерно 100%, от примерно 10% до примерно 95%, от примерно 20% до примерно 90%, от примерно 30% до примерно 85%, от примерно 40% до примерно 80%, от примерно 50% до примерно 75%, или от примерно 60% до примерно 70% сухой массы углеродного сырья. В некоторых воплощениях настоящего изобретения целлюлозное сырье содержит целлюлозу в количестве по меньшей мере примерно 5%, по меньшей мере примерно 10%, по меньшей мере примерно 20%, по меньшей мере примерно 30%, по меньшей мере примерно 40%, по меньшей мере примерно 50%, по меньшей мере примерно 60%, или по меньшей мере примерно 70% сухой массы углеродного сырья. В некоторых воплощениях настоящего изобретения целлюлозное сырье, используемое для роста выделенного штамма гриба, содержит от примерно 1% до примерно 50%, от примерно 5% до примерно 40%, или от примерно 10% до примерно 30% по массе компонента, выбранного из лигнина, гемицеллюлозы или их комбинации. В некоторых воплощениях настоящего изобретения целлюлозное сырье, используемое для роста микроорганизма, содержит по меньшей мере примерно 1%, по меньшей мере примерно 5%, по меньшей мере примерно 10%, по меньшей мере примерно 20%, или по меньшей мере примерно 30% по массе компонента, выбранного из лигнина, гемицеллюлозы или их комбинации.
Получение липидов с использованием выделенного штамма гриба имеет по меньшей мере две стадии: стадию накопления биомассы и стадию получения липидов. В некоторых воплощениях настоящего изобретения на стадии накопления биомассы получают биомассу штамма гриба, составляющую от примерно 10% до примерно 95%, от примерно 20% до примерно 95%, от примерно 30% до примерно 95%, от примерно 40% до примерно 95%, или от примерно 50% до примерно 95% общей биомассы штамма гриба, полученной на стадии накопления биомассы. В других воплощениях настоящего изобретения на стадии накопления биомассы получают от примерно 60% до примерно 95%, от примерно 70% до примерно 95%, или от примерно 80% до примерно 95% от общей полученной биомассы микроорганизмов. В некоторых воплощениях настоящего изобретения на стадии накопления биомассы получают биомассу микроорганизмов, так что по меньшей мере примерно 10%, по меньшей мере примерно 20%, по меньшей мере примерно 30%, по меньшей мере примерно 40%, по меньшей мере примерно 50%, по меньшей мере примерно 60%, по меньшей мере примерно 70%, по меньшей мере примерно 80%, по меньшей мере примерно 90% или по меньшей мере примерно 95% от общей полученной биомассы микроорганизмов получают на стадии накопления биомассы. Например, от примерно 50% до примерно 95% от общей полученной биомассы микроорганизмов получают на стадии накопления биомассы. В некоторых воплощениях настоящего изобретения на стадии накопления липидов получают липиды, так что от примерно 1,0% до примерно 95%, от примерно 20% до примерно 95%, от примерно 30% до примерно 95%, от примерно 40% до примерно 95% или от примерно 50% до примерно 95% от общего количества полученных липидов микроорганизмов получают на стадии накопления липидов. В других воплощениях настоящего изобретения от примерно 60% до примерно 95%, от примерно 70% до примерно 95% или от примерно 80% до примерно 95% от общего количества полученных липидов микроорганизмов получают на стадии накопления липидов. В некоторых воплощениях настоящего изобретения на стадии накопления липидов получают липиды, так что по меньшей мере примерно 10%, по меньшей мере примерно 20%, по меньшей мере примерно 30%, по меньшей мере примерно 40%, по меньшей мере примерно 50%, по меньшей мере примерно 60%, по меньшей мере примерно 70%, по меньшей мере примерно 80%, по меньшей мере примерно 90% или по меньшей мере примерно 95% от общего количества полученных липидов микроорганизмов получают на стадии накопления липидов. Предпочтительно от примерно 50% до примерно 95% от общего количества полученных липидов микроорганизмов получают на стадии накопления липидов.
Когда липиды получены в соответствии с настоящим изобретением, различные способы, известные в данной области техники, могут быть использованы для превращения биологических масел в сложные эфиры жирных кислот для использования в качестве биодизеля, реактивного биотоплива или в качестве ингредиентов для пищевых или фармацевтических продуктов. В некоторых воплощениях настоящего изобретения получение сложных эфиров жирных кислот включает переэтерификацию биологических масел, продуцируемых микроорганизмами. В некоторых воплощениях настоящего изобретения, экстракция липидов из микроорганизмов и переэтерификация липидов могут быть выполнены одновременно, в одностадийном способе. Например, на культуру, содержащую выделенный штамм гриба, можно воздействовать условиями или воздействиями (или комбинацией условий или воздействий), которые способствуют как экстракции липидов, так и переэтерификации липидов. Такие условия или воздействия могут включать, но без ограничения ими, pH, температуру, давление, присутствие растворителей, присутствие воды, присутствие катализаторов или ферментов, присутствие моющих средств и физические/механические силы. Две совокупности условий или воздействий могут быть объединены с получением одностадийного способа экстракции и переэтерификации липидов, где одна совокупность условий или воздействий положительно способствует экстракции липидов, а другая совокупность условий или воздействий положительно способствует переэтерификации липидов, при условии что эти две совокупности условий и воздействий могут быть объединены, не вызывая значительного снижения эффективности либо экстракции, либо переэтерификации липидов. В некоторых воплощениях настоящего изобретения можно выполнять гидролиз и переэтерификацию непосредственно цельноклеточной биомассы. В других воплощениях настоящего изобретения экстракцию липидов выполняют, как стадию, отдельную от стадии переэтерификации липидов. В одном воплощении такие реакции переэтерификации выполняют с использованием кислотных или основных катализаторов. В некоторых воплощениях настоящего изобретения способы переэтерификации биологических липидов в сложные эфиры жирных кислот для использования в качестве биодизеля или ингредиентов пищевых или фармацевтических продуктов включает взаимодействие биологических масел, содержащих триглицериды, в присутствии спирта и основания с получением сложных эфиров остатков жирных кислот из триглицеридов.
Спирты, подходящие для использования в переэтерификации, включают любой низший алкиловый спирт, содержащий от 1 до 6 атомов углерода (то есть С1-6алкиловый спирт, такой как метиловый, этиловый, изопропиловый, бутиловый, пентиловый, гексиловый спирты и их изомеры). Не будучи связанными теорией, полагают, что в некоторых воплощениях настоящего изобретения при использовании низших алкиловых спиртов в способах по настоящему изобретению получают низших алкиловые эфиры остатков жирных кислот. Например, при использовании этанола получают этиловые эфиры. В некоторых воплощениях спирт представляет собой метанол или этанол. В этих воплощениях получаемые сложные эфиры жирных кислот представляют собой метиловый эфир и этиловый эфир остатка жирной кислоты соответственно. В способах по настоящему изобретению спирт обычно составляет от примерно 5 масс. % до примерно 70 масс. %, от примерно 5 масс. % до примерно 60 масс. %, от примерно 5% до примерно 50 масс. %, от примерно 7 масс. % до примерно 40 масс. %, от примерно 9 масс. % до примерно 30 масс. %, или от примерно 10 масс. % до примерно 25 масс. % от смеси липидной композиции, спирта и основания. В некоторых воплощениях композиция и основание могут быть добавлены либо к чистому этанолу, либо к чистому метанолу. Как правило, количество используемого спирта может варьироваться в зависимости от растворимости липидов или композиции, содержащей триглицериды в спирте.
В композиции, содержащей триглицериды, спирт и основание взаимодействуют вместе при температуре и в течение времени, которые позволяют получить сложный эфир из остатков жирных кислот и спирта. Подходящее время и температуры реакции для получения сложного эфира могут быть определены специалистом в данной области техники. Не будучи связанными с теорией, полагают, что остатки жирных кислот отщепляются от глицеринового каркаса триглицерида и на стадии взаимодействия образуются сложные эфиры каждого остатка жирных кислот. В некоторых воплощениях стадию взаимодействия композиции в присутствии спирта и основания выполняют при температуре от примерно 20°C до примерно 140°C, от примерно 20°C до примерно 120°C, от примерно 20°C до примерно 110°C, от примерно 20°C до примерно 100°C, или от примерно 20°C до примерно 90°C. В других воплощениях стадию взаимодействия композиции в присутствии спирта и основания выполняют при температуре по меньшей мере примерно 20°C, 75°C, 80°C, 85°C, 90°C 95°C, 105°C или 120°C В некоторых воплощениях настоящего изобретения стадию взаимодействия композиции в присутствии спирта и основания выполняют при температуре примерно 20°C, 75°C, 80°C, 85°C, 90°C, 95°C, 105°C или 120°C. В некоторых воплощениях стадию взаимодействия композиции в присутствии спирта и основания выполняют в течение времени, равного от примерно 2 часов до примерно 36 часов, от примерно 3 часов до примерно 36 часов, от примерно 4 часов до примерно 36 часов, от примерно 5 часов до примерно 36 часов, или от примерно 6 часов до примерно 36 часов. В некоторых воплощениях стадию взаимодействия композиции в присутствии спирта и основания выполняют в течение примерно 0,25, 0,5, 1,0, 2,0, 4,0, 5,0, 5,5, 6, 6,5, 7, 7,5, 8, 8,5, 10, 12, 16, 20, 24, 28, 32 или 36 часов.
В одном воплощении стадия взаимодействия липидной композиции, спирта и основания может быть выполнена посредством дефлегмации компонентов с получением сложных эфиров жирных кислот, таких как сложные эфиры PUFA (полиненасыщенная жирная кислота). В других воплощениях стадию взаимодействия липидной композиции можно выполнять при температуре, которая не приводит к дефлегмации компонентов реакции. Например, выполнение стадии взаимодействия липидной композиции при давлении, превышающем атмосферное давление, может повысить температуру кипения растворителей, присутствующих в реакционной смеси. В таких условиях взаимодействие может протекать при температуре, при которой растворители будут кипеть при атмосферном давлении, но не будет происходить дефлегмации компонентов реакционной смеси. В некоторых воплощениях взаимодействие выполняют при давлении от примерно 5 до примерно 20 фунтов на квадратный дюйм (34,5-138 кПа); от примерно 7 до примерно 15 фунтов на квадратный дюйм (48,3-103 кПа); или от примерно 9 до примерно 12 фунтов на квадратный дюйм (62-82,7 кПа). В некоторых воплощениях реакцию выполняют при давлении 7, 8, 9, 10, 11 или 12 фунтов на квадратный дюйм (48,3; 55,1; 62; 69; 75,8 или 82,7 кПа). Реакции, проводимые под давлением, могут быть осуществлены при температурах реакции, представленных выше. В некоторых воплощениях реакции, проводимые под давлением, могут быть осуществлены при температуре по меньшей мере примерно 70°C, 75°C, 80°C, 85°C или 90°C В некоторых воплощениях реакции, проводимые под давлением, могут быть осуществлены при 70°C, 75°C, 80°C, 85°C или 90°C.
В одном воплощении настоящего изобретения сложные эфиры жирных кислот отделяют от реакционной смеси посредством перегонки композиции для извлечения фракции, содержащей эфиры жирных кислот. Целевая фракция реакционной смеси, включающая представляющие интерес сложные эфиры жирных кислот, может быть отделена от реакционной смеси и извлечена. В некоторых воплощениях дистилляцию выполняют под вакуумом. Не будучи связаны теорией, дистилляция под вакуумом позволяет выполнять дистилляцию при более низкой температуре, чем в отсутствие вакуума и, таким образом, может предотвращать разрушение сложных эфиров. Типичный диапазон температуры дистилляции составляет от примерно 120°C до примерно 170°C. В некоторых воплощениях стадию дистилляции выполняют при температуре менее чем примерно 180°C, менее чем примерно 175°C, менее чем примерно 170°C, менее чем примерно 165°C, менее чем примерно 160°C, менее чем примерно 155°C, менее чем примерно 150°C, менее чем примерно 145°C, менее чем примерно 140°C, менее чем примерно 135°C или менее чем примерно 130°C. Типичное давление для дистилляции под вакуумом варьируется от примерно 0,1 мм рт.ст. до примерно 10 мм рт.ст (13,33 Па - 1333 Па). В некоторых воплощениях давление для дистилляции под вакуумом составляет по меньшей мере примерно 0,1, 0,5, 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5 или 4 мм рт.ст.(13,33; 66,6; 133,3; 200; 266,6; 333; 400; 466; или 533 Па). В некоторых воплощениях настоящего изобретения давление для дистилляции под вакуумом составляет примерно 0,1, 0,5, 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5 или 4 мм рт.ст.
Возобновляемые масла, воски и жирные кислоты имеют значительный спрос в широком ряде отраслей промышленности (например нутрицевтики, биологические смазки, косметические средства, свечи и мыло) и продаются по более высокой цене по сравнению с продуктами на нефтяной основе. Высокие прибыли, как правило, ожидаются для липидных продуктов, которые можно продать за более чем $ 2,00/фунт, что эквивалентно прибыли $ 600 на тонну сырья (пшеничная солома стоит $ 60/т). Очевидно, что потребители выиграют от этой технологии из-за снижения их зависимости от продуктов на нефтяной основе, при создании рынка сельскохозяйственных отходов и побочных продуктов. Так как несколько компаний и исследовательских групп исследуют продуцирование липидов грибами непосредственно из лигноцеллюлозной биомассы для получения более ценных продуктов, и промышленность, и научное сообщество выиграют от знаний, полученных с помощью данного изобретения.
Возобновляемые липиды являются идеальными для все большего числа потребителей, требующих углеродно-нейтральные, природные биопродукты, которые в настоящее время производятся, главным образом, из ограниченных растительных и животных источников. Способ по изобретению предлагает альтернативу этим возобновляемым источникам липидов и создает рынок отходов сельскохозяйственного сырья. Способ по настоящему изобретению дополнительно разработан для промышленного производства липидных продуктов из отходов органического сырья. Способ по настоящему изобретению оптимизирован с помощью настольной полупромышленной системы, с осуществлением технологической схемы и технико-экономического анализа промышленных производственных систем, детальным анализом липидных продуктов и нацеливанием соответствующих рынков/клиентов на эти продукты. Полупромышленная демонстрационная система предназначена для получения экономически перспективных выходов высококачественных липидов из различных субстратов для определенных целевых рынков и покупателей.
В другом воплощении использовали липиды, экстрагированные из выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению для получения биологических смазок. При использовании здесь, термин "биологические смазки" относится к смазкам, получаемым путем использования вещества, происходящего из живых или недавно живых организмов. При использовании здесь, термин "смазки" относится к веществам (как правило, жидкости в условиях эксплуатации), вводимым между двумя перемещающимися поверхностями для уменьшения их трения и износа. Базовые масла, используемые как моторные масла, обычно классифицируются Американским институтом нефти как минеральные масла (Группа I, II и III) или синтетические масла (Группа IV и V). См публикацию American Petroleum Institute Publication Number 1509. Одним из важнейших применений смазочных агентов в виде моторного масла является защита двигателей внутреннего сгорания в автомобилях и автоматическом оборудовании. Как правило, смазывающие агенты содержат 90% базового масла (наиболее часто нефтяные фракции, называемые минеральными маслами) и менее 10% добавок. Растительные масла или синтетические жидкости, такие как гидрогенизованные полиолефины, сложные эфиры, силиконы, фторуглероды и многие другие иногда используют в качестве базовых масел. Они представляют собой, прежде всего, триглицеридные эфиры, происходящие из растений и животных. Для смазочного базового масла предпочтительным является использование веществ, полученных из овощей. Обычные вещества включают масло канолы с высоким содержанием олеинового масла, касторовое масло, пальмовое масло, подсолнечное масло и рапсовое масло из овощей, а также талловое масло из животных источников. Многие растительные масла часто гидролизуют с получением кислот, которые затем избирательно объединяют с образованием специализированных синтетических сложных эфиров.
Добавки обеспечивают пониженное трение и износ, повышенную вязкость, улучшенный индекс вязкости, устойчивость к коррозии и окислению, старению или загрязнению, и т.д. Смазывающие агенты, такие как масло для двухтактных двигателей, также добавляют к некоторым видам топлива. Примеси серы в топливе также обеспечивают некоторые смазывающие свойства, которые следует принимать во внимание при переходе на дизель с низким содержанием серы; биодизель представляет собой популярную добавку к дизельному топливу, обеспечивающую дополнительную скользкость. Нежидкие смазывающие агенты включают густую смазку, порошки (сухой графит, PTFE (политетрафторэтилен), дисульфид молибдена, дисульфид вольфрама и т.д.), тефлоновую ленту, используемую в прокладке труб, воздушной подушке, и другие. Сухие смазывающие агенты, такие как графит, дисульфид молибдена и дисульфид вольфрама также обеспечивают смазку при температурах (вплоть до 350°C), более высоких, чем те, при которых могут работать жидкие и основанные на масле смазывающие агенты. Ограниченный интерес проявляется к низкофрикционным свойствам уплотненных слоев оксидной глазури, образованных при температуре в несколько сотен градусов Цельсия в металлических скользящих системах, однако, до их практического применения еще очень далеко из-за их физически нестабильного характера. Другим подходом к снижению трения и износа является использование подшипников, таких как шарикоподшипники, роликовые подшипники или воздушные подшипники, которые в свою очередь, сами требуют внутренней смазки, или использование звука в случае акустической смазки. В дополнение к промышленному применению смазывающие агенты используются для многих других целей. Другие применения включают биомедицинские применения (например смазки для искусственных суставов) и использование индивидуальной смазки для сексуальных целей.
Таким образом, липиды, экстрагированные из культуры выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению, можно использовать для изготовления композиций биологических смазок на основе сложных эфиров путем добавления подходящих добавок. Способы получения смазочных композиций на основе сложных эфиров известны специалисту в данной области техники. В качестве неограничивающего примера, некоторое количество масла биологического происхождения, содержащего триглицериды, берут и обрабатывают таким образом, чтобы гидролизовались по меньшей мере некоторые из триглицеридов и образовались свободные жирные кислоты, где жирные кислоты имеют тип, выбранный из группы, состоящей из насыщенных жирных кислот, мононенасыщенных жирных кислот и полиненасыщенных жирных кислот, и их комбинации. Жирные кислоты разделяют по их типу, так что по меньшей мере мононенасыщенные жирные кислоты по существу отделены от насыщенных жирных кислот и полиненасыщенных жирных кислот. Затем, по меньшей мере некоторые из мононенасыщенных жирных кислот модифицируют с образованием сложноэфирного продукта (например содержащего триэфиры) и по меньшей мере некоторые из насыщенных жирных кислот и/или полиненасыщенных жирных кислот гидрируют с получением алканов (парафинов). Следует отметить также, что в некоторых воплощениях такие сложноэфирные продукты могут включать один или более следующего: моно-, ди- и триэфиры и их гидроксилированные аналоги.
Биоводород
Термин биоводород в данном описании изобретения относится к водороду, полученному посредством биологических процессов, например посредством ферментации с использованием выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению. В настоящем изобретении предложены способы получения высокоэнергетических метаболитов с использованием выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению, где высокоэнергетические метаболиты представляют собой биогаз, например водород или метан. В одном воплощении водород получают в анаэробных условиях. В другом воплощении водород получают в по существу анаэробных условиях.
В одном воплощении сырье смешивают с выделенным грибковым штаммом и/или его потомством по настоящему изобретению в биореакторе с получением водорода. Для ускорения разрушения сырья можно использовать вакуум, например примерно 0,1 атм (9,8 кПа), примерно 0,2 атм (19,5 кПа), примерно 0,3 атм (29,4 кПа), примерно 0,4 атм (39,2 кПа), примерно 0,5 атм (49 кПа), для удаления газов, включая водород, из биореактора. В одном воплощении производство другого биогаза, такого как метан, ингибируют для увеличения производства водорода. Неограничивающие примеры систем и биореакторов для получения водорода описаны в патентах US 7473552 и 7083956, которые включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.
Биотопливо из шламового вещества
Выделенный штамм и/или его потомство по настоящему изобретению устойчивы к высокой концентрации металлов и экстремальным условиям рН. Таким образом, в настоящем изобретении предложены способы получения биотоплива и/или предшественников биотоплива с использованием исходного сырья, городских, промышленных и/или фермерских отходов или шлама сточных вод в качестве углеродсодержащего сырья. Шлам может представлять собой обработанный коммунальный или промышленный сырой осадок или первичные твердые вещества или обработанный сельскохозяйственный шлам. То есть шлам в некоторых воплощениях претерпевает один или несколько процессов обработки, таких как анаэробное и/или аэробное расщепление, компостирование и/или по меньшей мере одну химическую или физическую обработку, такую как сушка, обезвоживание, сгущение, прессование, фильтрация, центрифугирование, ультрафиолетовая или химическая дезинфекция (например дезинфекция хлором), стабилизация известью и/или термическая обработка.
В некоторых воплощениях шлам представляет собой трудноразлагаемый шлам с высоким содержанием тяжелых металлов, таких как один или более из Mn, Zn, Pb, Cu, Cr, Ni, Cd и Hg. По меньшей мере один, два или три таких тяжелых металлов (или тяжелых металлов, взятых вместе), могут присутствовать в количестве более чем 10 млн-1, или 50 млн-1, или 100 млн-1, или 200 млн-1, или 400 млн-1, или 500 млн-1 по массе в трудноразлагаемом шламе. По меньшей мере один такой тяжелой металл (или тяжелые металлы, взятые вместе) могут присутствовать в количестве от примерно 400 до примерно 1000 млн-1. Например, трудноразлагаемый шлам может быть загрязнен таким количеством свинца (Pb) и/или кадмия (Cd). В одном воплощении указанный шлам или отходы являются кислыми. В одном воплощении рН шлама или отходов варьируется от примерно 0 до примерно 8, например от примерно 0,7 до примерно 7,5.
В другом воплощении указанные тяжелые металлы в шламе или отходах извлекают посредством биосорбции при помощи выделенного штамма гриба по настоящему изобретению и указанный кислотный шлам или отходы нейтрализуют.
Выделенный штамм гриба и/или его потомство также устойчивы к загрязнениям благодаря антибиотикам, продуцируемым внутри (например нафтазариновым пигментам). Таким образом, в этих или других воплощениях шлам имеет высокое содержание по меньшей мере одного бактериального, вирусного и/или паразитического патогена, включая, среди прочих, различные кишечные патогены, например энтеропатогенные Е. coli, сальмонеллу, шигеллу, иерсинию, холерный вибрион, криптоспоридию, гиардию, энтамебу, норовирус и ротавирус.
В некоторых воплощениях шлам образуется в результате промышленного производства. То есть шлам является конечным продуктом станции обработки сточных вод производственного объекта, такого как химический, фармацевтический или бумагоизготовительный производственный объект или объект пищевого производства.
Шлам может быть образован фармацевтическим производственным объектом. В соответствии с настоящим изобретением, если соединения, производимые фармацевтическим производственным объектом являются подходящим сырьем для выделенного штамма гриба, их можно расщеплять посредством микробного метаболизма и превращать в биотопливо.
Шлам может быть образован бумагоизготовительным производственным объектом. Целлюлозно-бумажная промышленность несет ответственность за большие сбросы сильно загрязненных сточных вод. Эти загрязнители, основными характеристиками которых являются их высокая токсичность и низкая биоразлогаемость, включают различные таннины, лигнины, смолы, терпены и хлорфенольные соединения. Состав этих сточных вод, который оказывает большое влияние на их обрабатываемость, может значительно варьироваться в зависимости от сырья и технологического процесса. В настоящем изобретении, однако, предложены способы и системы, которые являются универсальными в отношении синтеза компонентов биотоплива из этих токсичных стоков.
В некоторых воплощениях шлам образован объектом пищевого производства.
В некоторых воплощениях шлам представляет собой сельскохозяйственный шлам, содержащий животный навоз. Большая часть животного навоза представляет собой фекалии. Обычные формы животного навоза включают FYM (стойловый навоз) или навозную жижу (жидкий навоз). Стойловый навоз также может включать растительный материал (часто солому), который используется в качестве подстилки для животных и который впитал кал и мочу. Сельскохозяйственный навоз в жидкой форме известен как навозная жижа и продуцируется в более интенсивных животноводческих системах, где вместо соломенной подстилки используется бетонный или планчатый пол.
Таким образом, в настоящем изобретении предложены способы получения одного или более высокоэнергетических метаболитов в качестве биотоплива или предшественников биотоплива с использованием одного или более выделенных штаммов грибов, как описано выше, включающие:
а) получение смеси одного или более указанных выделенных штаммов грибов и/или их потомства с сырьем, выбранным из группы, состоящей из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов и их комбинации, в контейнере, где указанное сырье может поддерживать рост указанного выделенного штамма гриба и/или его потомства;
б) рост указанного выделенного штамма гриба в указанной смеси с получением одного или более типов биотоплива и/или предшественников биотоплива; и
в) возможно, выделение указанных типов биотоплива и/или предшественников биотоплива из смеси.
В одном воплощении дополнительные соединения, необходимые для роста выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению, добавляют в смесь, где сырье не содержит или содержит недостаточное количество указанных соединений, необходимых для роста штамма гриба. Выделенный штамм гриба и/или его потомство по настоящему изобретению может быть использован для получения биотоплива и/или предшественников биотоплива из различных источников, таких как лигноцеллюлозное сырье, углеродсодержащие отходы, углеводы, мономеры сахара или их комбинации. В одном воплощении указанное биотопливо представляет собой биоспирт, биоводород и/или биодизель. В одном воплощении указанные предшественники биотоплива представляют собой липиды или сахара. В одном воплощении указанное сырье выбрано из группы, состоящей из лигноцеллюлозы (например тины, пшеничной соломы, ячменной соломы, стеблей кукурузы, проса, использованных зерен пивоварения, лесных продуктов, материала энергетических культур), углеводов (например моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов), отходов (например шлама коммунальных, промышленных и сельскохозяйственных сточных вод) и их комбинации.
Лигноцеллюлозное сырье может быть выбрано из группы, состоящей из остатков сельскохозяйственных культур (например пшеничной соломы, ячменной соломы, рисовой соломы, соломы мелкозерных злаков, стеблей кукурузы, кукурузных волокон (например камеди кукурузных волокон (CFG), сушеной барды (DDG), кукурузной глютеновой муки (CGM)), проса, сена люцерны, жома сахарного тростника), несельскохозяйственной биомассы (например тины, остатков городских деревьев), лесных продуктов и промышленных отходов (например остатков первичного/вторичного измельчения дерева с мягкой древесиной, остатков первичного/вторичного измельчения дерева с твердой древесиной, шлама бумажной массы вторичной бумаги), лигноцеллюлозо-содержащих отходов (например газетной бумаги, бумажных отходов, зерна пивоварения, использованной резиновой шины (UTR), городских органических отходов, дворовых отходов, клинических органических отходов и отходов, полученных при производстве биотоплива (например обработанной биомассы водорослей, глицерина) и их комбинации.
Углеродсодержащие отходы могут быть выбраны из группы, состоящей из коммунальных органических отходов, дворовых отходов, промышленных отходов, таких как отходы химического, фармацевтического или бумагоизготовительного промышленного объекта или пищевого предприятия и их комбинации.
Углеводное сырье может быть выбрано из группы, состоящей из моносахаридов, дисахаридов, олигосахаридов, полисахаридов и их комбинации. В одном воплощении указанные мономеры сахара выбраны из группы, состоящей из триоз, тетроз, пентоз, гексоз, гептоз и тому подобного и их комбинации. В одном воплощении указанные пентозы выбраны из группы, состоящей из рибулозы, ксилулозы, рибозы, арабинозы, ксилозы, ликсозы, дезоксирибозы и их комбинации. В одном воплощении указанные гексозы выбраны из группы, состоящей из аллозы, альтрозы, глюкозы, маннозы, глюкозы, идозы, галактозы, талозы, псикозы, фруктозы, сорбозы, тагатозы и их комбинации.
В одном воплощении указанная смесь дополнительно содержит по меньшей мере один компонент, выбранный из группы, состоящей из подкисляющих веществ, источников марганца и пищевых добавок, pH-буферных веществ.
В одном воплощении указанная смесь имеет исходное значение pH от 0,5 до 7,5, которое увеличивается в процессе ферментации, кроме ферментации в буферной среде или в культуральном сосуде с контролируемым pH, от примерно 0 до примерно 8,0, например от примерно 0,5 до примерно 7,5, от примерно 0,5 до примерно 3,0, или от примерно 3,0 до примерно 7,0.
Способы получения высокоэнергетических метаболитов с использованием выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению обладают и другими преимуществами. Например, в настоящем изобретении предложены новые способы получения высокоэнергетических метаболитов в качестве биотоплива или предшественников биотоплива из сырья, такого как лигноцеллюлозные материалы (например дерево или солома). Существующие на сегодняшний день способы получения биотоплива из лигноцеллюлозных веществ требуют различных дорогостоящих предварительных обработок и ферментных добавок. Одним преимуществом настоящего изобретения является то, что оно не требует стадий предварительной обработки сырья, таких как получение лигноцеллюлозного материала (например дерева или соломы), пригодного для гидролиза или целлюлолиза, и добавления ферментов, поскольку выделенный штамм гриба по настоящему изобретению сам может выполнять эти стадии. Таким образом, в способе, описанном в данном описании изобретения, лигноцеллюлозное сырье непосредственно преобразуется в высокоэнергетические метаболиты с немногими стадиями предварительной обработки и без добавлений ферментов. Следовательно, применение этого нового способа является относительно простым и недорогим по сравнению с существующими методами. В качестве другого примера выделенный гриб по настоящему изобретению можно использовать для получения высокоэнергетических метаболитов, таких как биотопливо или предшественники биотоплива, в широком диапазоне pH, таким образом устраняя необходимость в дорогостоящих стадиях нейтрализации pH. В качестве другого примера при получении липидов в качестве предшественников биодизеля, выделенный штамм гриба по настоящему изобретению имеет более подходящий липидный профиль по сравнению с водорослями и другими организмами, производящими липиды. В качестве еще одного примера выделенный штамм гриба и/или его потомство по настоящему изобретению обладает высокой устойчивостью к загрязнению другими организмами, так как известно, что представители рода Fusarium образуют нафтазариноидые пигменты, которые обладают мощными антибиотическими, инсектицидными и фитотоксическими свойствами (Brimble et ai., 1999). Таким образом, способы получения высокоэнергетических метаболитов по настоящему изобретению не требуют применения дорогостоящих и времязатратных способов для предотвращения загрязнения по сравнению с другими существующими в настоящее время способами микробного получения биотоплива. В качестве еще одного примера, выделенный штамм гриба и/или его потомство по настоящему изобретению устойчивы к высокой концентрации металлов, таких как Mn, который может быть использован для увеличения скорости разрушения лигнина.
Культуры и композиции, содержащие выделенный штамм гриба
Штамм МК7 Fusarium oxysporum представляет собой новый штамм ацидофильного гриба, который может непосредственно превращать лигноцеллюлозное сырье, углеводы (например 5- и 6-углеродные сахара) и биомассу (например биомассу водорослей) в высокоэнергетические субстраты, включающие липиды, этанол и водород.
В настоящем изобретении предлагается биологически чистая культура, обладающая одной, двумя, более или всеми идентифицирующими характеристиками выделенного штамма гриба Fusarium oxysporum и/или его потомства, как описано в данном описании изобретения. В одном воплощении биологически чистая культура содержит выделенный штамм гриба Fusarium oxysporum, обозначенный как МК7, который был депонирован как АТСС номер РТА-10698, или его активные мутанты. В одном воплощении указанный выделенный штамм гриба и/или его потомство находятся в форме конидии, пикниды, хламидоспор, фрагментов гиф или их комбинации.
Заявитель создал депозит от имени Службы Национальных Парков, Национального Парка Йеллоустоун, США, 2 марта 2010, USA, состоящий из 25 флаконов штамма МК7 Fusarium oxysporum (как описано в данном описании изобретения) в рамках Будапештского договора в Американской коллекции типовых культур (АТСС), P.O. Box 1549, Manassas, VA 20108 USA, АТСС номер РТА-10698. Штамм был депонирован до даты подачи настоящей заявки. Для того чтобы удовлетворить требования 35 U.S.С. 112 и подтвердить, что депозит выделенного штамма по настоящему изобретению удовлетворяет критериям, изложенным в 37 CFR 1.801-1.809, заявители настоящим документом делают следующие заявления, касающиеся депонированного штамма МК7 Fusarium oxysporum (депонированного как АТСС номер РТА-10698):
1. Во время рассмотрения этой заявки доступ к данному изобретению будет предоставлен Уполномоченному по запросу;
2. При выдаче патента штамм будет доступен для общественности при условиях, указанных в 37 CFR 1.808;
3. Депозит будет поддерживаться в общедоступном хранилище в течение 30 лет, или 5 лет после последнего запроса, или в течение возможного срока действия патента, который из них окажется дольше.
4. Будет определена жизнеспособность биологического материала на момент депонирования; и,
5. Депозит будет заменен, если он в каком-либо случае станет недоступным.
Настоящее изобретение также относится к композиции, содержащей выделенный штамм гриба Fusarium oxysporum, имеющий по меньшей мере один, два, более или все идентифицирующие характеристики, описанные в данном описании изобретения. В одном воплощении указанный выделенный штамм гриба и/или его потомство находятся в форме конидий, пикнид, хламидоспор, фрагментов гиф, или их комбинации. В некоторых воплощениях композиция дополнительно содержит один или более компонентов, выбранных из группы, состоящей из среды, которая поддерживает рост штамма гриба, подкисляющего вещества, источника марганца, питательной добавки и их смеси. В одном воплощении среда является твердой. В другом воплощении среда является жидкой.
В одном воплощении композиция содержит среду, поддерживающую рост выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению. Подходящая среда для выделения, роста и поддержания Fusarium oxysporum хорошо известна специалистам в данной области техники. Неограничивающие примеры такой среды для Fusarium oxysporum описаны в Gunner et al (1964, Anaerobic Growth of Fusarium oxysporum, J. Bacterial. 87: 1309-1316), Joshi et al (1987, The influence of various carbon and nitrogen sources on oil production by Fusarium oxysporum, 32 (2): 124-129), De La Broise et al (1989, Osmotic, biomass, and oxygen effects on the growth rate of Fusarium oxysporum using a dissolved-oxygen-controlled turbidostat, Biotechol. Bioeng. 33 (6): 699-705) и Norio et al (2007, Selected media for Fusarium oxysporum, Journal of General Plant Pathology, 73 (5): 342-348; 2002, Selective medium for Fusarium oxysporum and nitrate metabolic capacity defective strain, Kyushu Okinawa Nogyo Kenkyu Seika Joho, 17: 491.-492), каждая из которых включена в данный документ посредством ссылки во всей полноте.
Добавки питательных веществ могут быть выбраны из группы, состоящей из углеводов (например моносахаридов, полисахаридов), источника аминокислот (например аминокислоты, полипептидов), микронутриентов (например кальция, аммония, меди, калия, натрия, буры, железа, цинка и т.д.) и их комбинации.
Ферменты, устойчивые к кислому рН, из штамма МК7 F. oxysporum
Современная технология получения этанола из лигноцеллюлозо-содержащих веществ требует нескольких стадий перед ферментацией дрожжами. Эти стадии могут включать термическое разложение, гидролиз разбавленной или концентрированной кислотой, щелочной гидролиз или окисление химическими веществами, такими как перекись водород (Hendricks and Zeeman, 2009, Pretreatments to enhance the digestibility of lignocellulosic biomass. Bioresource Technology, 100: 10-18.). Целью предварительной обработки является солюбилизация гемицеллюлозы и лигнина и декристаллизация целлюлозы. Однако перед ферментацией дрожжами рН смеси должна быть нейтрализован, и смесь должна быть обработана ферментами для деполимеризации целлюлозы в глюкозу.
Недавно был секвенирован геном штамма 4287 Fusarium oxysporum f. sp. liycopersici и было показано, что он несет различные гены, участвующие в разрушении лигнина, гемицеллюлозы и целлюлозы. Кроме того, ферменты, участвующие в разрушении этих веществ (например целлюлаза, ксиланаза, лигниназа, глюциронидаза, арабинофуранозидаза, арабиногалактаназа, эстераза феруловой кислоты, липаза, пектиназа, глюкоманназа, амилаза, ламинариназа, ксилоглюканаза, галактаназа, глюкоамилаза, пектатлиаза, хитиназа, экзо-β-D-глюкозаминидаза, целлобиоза-дегидрогеназа и ацетилксилан-эстераза, ксилозидаза, α-L-арабинофуранозидаза, ферулоил-эстераза, эндоглюканаза, β-глюкозидаза, Mn-пероксидаза и лакказа) были широко изучены в штамме F3 F. oxysporum (Xiros et al. 2009, Enhanced ethanol production from brewer's spent grain by a Fusarium oxysporum consolidated system. Biotechnol Biofuels, 10: 4). Соответственно, штаммы F. oxysporum, в том числе штамм МК7, как ожидается, полностью оснащены для гидролиза сложных лигноцеллюлозных веществ, таких как пшеничная солома. Также ожидается, что, поскольку штамм МК7 способен расти при более низком значении pH (0,7-7,5), по сравнению с другими штаммами Fusarium (pH>2; Starkey, 1973), ферменты для разрушения лигнина, гемицеллюлозы и целлюлозы в штамме МК7 будут иметь более высокие активности при низком значении pH. Ферменты с высокой активностью в кислых условиях будут особенно подходящими для получения биотоплива, когда в качестве предварительной обработки лигноцеллюлозных веществ используют кислотный гидролиз.
Методы клонирования указанных ферментов известны в данной области техники. Например, ген, кодирующий конкретный фермент, может быть выделен посредством ОТ-ПЦР из полиаденилированной мРНК, экстрагированной из гриба, или посредством ПЦР из ДНК, экстрагированной из гриба. Полученный в результате продукт - ген может быть клонирован в качестве ДНК-вставки в вектор. Термин "вектор" относится к средству, посредством которого нуклеиновая кислота может быть размножены и/или перемещены между организмами, клетками или клеточными компонентами. Векторы включают плазмиды, вирусы, бактериофаги, провирусы, фагемиды, транспозоны, искусственные хромосомы и тому подобное, которые автономно реплицируются и могут встраиваться в хромосому клетки-хозяина. Вектором также может быть оголенный РНК-полинуклеотид, оголенный ДНК-полинуклеотид, полинуклеотид, состоящий из ДНК и РНК в пределах одной нити, полилизин-конъюгированная ДНК или РНК, пептид-конъюгированная ДНК или РНК, липосома-конъюгированная ДНК и т.п., которые автономно не реплицируются. Во многих, но не во всех распространенных воплощениях векторы по настоящему изобретению представляют собой плазмиды или бакмиды.
Таким образом, изобретение включает нуклеотиды, которые кодируют ферменты, устойчивые к кислому pH, включая химерные молекулы, клонированные в экспрессионный вектор, который может экспрессироваться в клетке-хозяине, отличной от Fusarium oxysporum (например в клетке другого штамма гриба, дрожжевой клетке, бактериальной клетке, растительной клетке и др.). "Экспрессионный вектор" представляет собой вектор, такой как плазмида, который способен стимулировать экспрессию, а также репликацию, нуклеиновой кислоты, включенной в него. Как правило, нуклеиновая кислота, предназначенная для экспрессии, "функционально связана" с промотором и/или энхансером и подвергается транскрипционному регулирующему контролю со стороны промотора и/или энхансера. Промотором может быть промотор конститутивной экспрессии, промотор индуцибельной экспрессии, промотор тканеспецифической экспрессии или промотор экспрессии, специфичной для внутриклеточный органеллы. В одном воплощении нуклеотиды, кодирующие один или более ферментов, устойчивых к кислому pH, экспрессируются в одном экспрессионном векторе, трансформированном в клетку-хозяина, или в более чем одном экспрессионных векторах, совместно трансформированных в клетку-хозяина.
В одном воплощении ферменты, устойчивые к кислому рН, очищенные из выделенного штамма гриба и/или его потомства по настоящему изобретению или полученные в рекомбинантной клетке-хозяине, при тестировании in vitro, по сравнению с гомологичными ферментами из неустойчивых к кислому pH штаммов Fusarium oxysporum (например штаммов Fusarium, которые могут расти только при pH, равном по меньшей мере 3,0, см. Starkley et al., Effect of pH on toxcicity of copper to Scytalidium sp., a copper-tolerant fungus, and some other fungi. J, gen. Microbiol. 78: 217-225), обладают на примерно 5%, примерно. 10%, примерно 15%, примерно 20%, примерно 25%, примерно 30%, примерно 35%, примерно 40%, примерно 45%, примерно 50%, примерно 55%, примерно 60%, примерно 65%, примерно 70%, примерно 75%, примерно 80%, примерно 85%, примерно 90%, примерно 95%, примерно 100%, примерно 150%, примерно 200%, примерно 250%, примерно 300%, примерно 400%, примерно 500%, примерно 550%, примерно 600%, примерно 650%, примерно 700%, примерно 800%, примерно 850%, примерно 900% или примерно 1000% большей активностью при pH менее 3,0, менее 2,9, менее 2,8, менее 2,7, менее 2,6, менее 2,5, менее 2,4, менее 2,3, менее 2,2, менее 2,1, менее 2,0, менее 1,9, менее 1,8, менее 1,7, менее 1,6, менее 1,5, менее 1,4, менее 1,3, менее 1,2, менее 1,1, менее 1,0, менее 0,9, менее 0,8, менее 0,7, менее 0,6 или менее 0,5.
Таким образом, ферменты, устойчивые к кислому pH, из штамма F. oxysporum и/или его потомства по настоящему изобретению и нуклеотиды, кодирующие такие ферменты, могут быть выделены и использованы для многих целей. В одном воплощении такие ферменты можно использовать в предварительной обработке лигноцеллюлозного сырья при получении этанола перед ферментацией другими организмами (бактериями, грибами, дрожжами и др.) для разрушения лигнина, целлюлозы и гемицеллюлозы. Например, эти ферменты используют непосредственно после гидролиза лигноцеллюлозного сырья (особенно кислотного гидролиза), где лигнин, целлюлоза и гемицеллюлоза разлагаются под действием ферментов. В отличие от традиционных методов, стадия нейтрализации не требуется, благодаря свойству устойчивости к кислому pH ферментов, полученных из выделенного штамма гриба по настоящему изобретению. В одном воплощении ферменты, устойчивые к кислоте, продуцируемые выделенным штаммом гриба по настоящему изобретению, могут быть использованы в современных способах получения биотоплива, которые включают предварительную кислотную обработку и ферментативное разрушение.
Токсины, продуцируемые F. oxysporum
В настоящее время для микробного получения биотоплива требуется использование дорогостоящих и времязатратных методов для предотвращения загрязнения. Штамм МК7 является высокорезистентным к загрязнению другими организмами, так как представители рода Fusarium, как известно, образуют токсины (например нафтазариновые пигменты), которые обладают мощными антибиотическими, инсектицидными и фитотоксическими свойствами. Таким образом, штамм МК7 требует незначительного или совсем не требует добавления внешних антибиотиков при использовании в получении биотоплива и/или предшественников биотоплива. Fusarium oxysporum в общем случае продуцирует девять разных токсинов, при этом продуцирование зависит от их взаимоотношения с разными растениями-хозяевами (Marasas et al., 1984, Toxigenic Fusarium species, identity and mycotoxicology, ISBN 0271003480). Производство токсинов также меняется в зависимости от среды, используемой при ферментации in vitro. Токсины, продуцируемые и секретируемые видами Fusarium, включают, без ограничения ими, бикаверин, энниатины, фузаровую кислоту, ликомаразмин, монилиформин, оксиспорон, трихотецены, зеарелоны, различные нафтохиноны и антрахиноны (например нонакетидные нафтазариновые хиноны, бикаверин и норбикаверин, гептакетиды, нектриафурон, 5-O-метиляваницин и ангидрофусарубин-лактол). Например, токсины из видов Fusarium могут включать 4-ацетоксискирпендиол (4-3-ацетокси-3,15-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен. Аналогичное соединение, монодеацетилангвидин, то есть 4- или 15-ацетилскирпентриол), 3-ацетилдезоксиниваленол (дезоксиниваленола моноацетат, 3''-ацетокси-7'',15-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен-8-он), 8-ацетилнеозоланиол (неозоланиола моноацетат, 4'',8'', 15-триацетокси-3''-гидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), 4- или 15-ацетилскирпентриол (4-ацетоксискирпендиол), ацетил-Т-2 токсин (3'',4'', 15-триацетокси-8''-(3-метилбутирил(окси)-12,13-эпокситрихотец-9-ен), ангвидин (диацетоксискирпенол), авенацеин, боверицин, бутенолид (4-ацетамидо-4-гидрокси-2-бутеновая кислота-лактон), калонектрин (3'', 15-диацетокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), 15-деацетилкалонектрин (15-де-О-ацетилкалонектрин, 3''-ацетокси-15-гидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), дезоксиниваленол (Rd токсин, вомитоксин, 3'',7'',15-тригидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен-8-он), дезоксиниваленола диацетат (диацетилдезоксиниваленол), дезоксиниваленола моноацетат (3-ацетилдезоксиниваленол), диацетоксискирпендиол (7''-гидроксидиацетоксискирпенол), диацетоксискирпенол (ангвидин, 4,15-диацетокси-3'-гидрокси12,13-эпокситрихотец-9-ен), диацетоксискерпентриол (7',8''-дигидроксидиацетоксискирпенол), диацетилдезоксиниваленол (дезоксиниваленола диацетат, 3'',15-диацетокси-7-гидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен-8-он), диацетилниваленол (ниваленола диацетат, 4,15-диацетокси-3',7'-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен-8-он), 7'',8''-дигидроксидиацетоксискирпенол (диацетоксискирпентриол, 4,15-диацетокси-3'',7'',8''-тригидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), энниатины, фруктигенин, фумонизин B1 (1,2,3-пропантрикарбоновой кислоты 1,-1-[1-(12-амино-4,9,11-тригидрокси-2-метилтридецил)-2-(1-метилпентил)-1,2-этандиил]овый эфир; макрофузин), фузаренон (фузаренон-Х, фузаренон, моноацетилниваленол, ниваленола моноацетат, 4-ацетокси-3'',7'',15-тригидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен-8-он) фузаровая кислота (фузариновая кислота, 5-бутилпиколиновая кислота), фузариновая кислота (фузаровая кислота), F-2 (зеараленон), НТ-2 токсин, то есть 15-ацетокси-3'',4-дигидрокси-8''-(3-метилбутирилокси)-12-эпокситрихотец-9-ен. 7''-гидрокси-диацетоксискирпенол (диацетоксискирпендиол, 4,15-диацетокси-3'',7''-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), 8''-гидроксидиацетоксискирпенол (неозоланиол), 1,4-ипомеадиол (1-(3-фурил)-1,4-пентандиол), ипомеанин (1-(3-фурил)-1,4-пентантион), 1-ипомеанол (1-(3-фурил)-1-гидрокси-4-пентанон), 4-ипомеанол (1-(3-фурил)-4-гидрокси-4-пентанон), латеритин, ликомаразмин, монилиформин (калиевая или натриевая соль 1-гидроксициклобут-1-ен-3,4-диона), моноацетоксискирпенол (15-ацетокси-3'',4''-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), моноацетилниваленол (фузаренон-Х), монодеацетилангвидин (4-ацетоксискирпендиол), неозоланиол (8''-гидроксидиацетоксискирпенол, 4,15-диацетокси-3'',8''-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), неозоланиолацетат (8-ацетилнеозоланиол), неозоланиола моноацетат (8-ацетилнеозоланиол), ниваленол (3'',4'',7'',15''-тетрагидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен-8-он), ниваленола диацетат (диацетилниваленол), ниваленола моноацетат (фузаренон-Х), NT-1 токсин (Т-1 токсин, 4'',8''-диацетокси-3'',15-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), NT-2 токсин (4''-ацетокси- 3'',8'',15-тригидрокси-12, 13-эпокситрихотец-9-ен), Rd токсин (дезоксиниваленол), самбуцинин, скирпентриол (3'',4'',15''-тригидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), соланиол (неозоланиол), Т-1 токсин (NT-1 токсин), Т-2 токсин (4'',15''-диацетокси-3''-гидрокси-8''-(3-метилбутирилокси)-12,13-эпокситрихотец-9-ен), триацетокси-скирпендиол (4'',8'',15''-триацетокси-3'',7''-дигидрокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), триацетокси-скирпенол (3'',4'',15''-триацетокси-12,13-эпокситрихотец-9-ен), вомитоксин (дезоксиниваленол), яваницин, зеараленол (2,4-дигидрокси-6-(6,10-дигидрокси-транс-1-ундеценил)-бензойной кислоты лактон), зеараленон (6-(10-гидрокси-6-оксо-транс-1-ундеценил)-резорциловой кислоты лактон). Более подробно токсины, продуцируемые F. oxysporum, описаны в Tatum et al. (Naphthoquinones produced by Fusarium oxysporum isolated from citrus. 1985, Phytochemistry 24: 457-459), Tatum et al. (Naphthofurans produced by Fusarium oxysporum isolated from citrus. 1987, Phytochemistry, 26: 2499-2500), Baker et al. (Novel anthraquinones from stationary cultures of Fusarium oxysporum. 1998, J Ferment Bioeng 85: 359-361); Thrane (Fusarium species on their specific profiles of secondary metabolites, in Fusarium. Mycotoxins, taxonomy and pathogenicity, 1989, ed by Chelkowski J, Elsevier, NY, USA, pp 199-225); Baker et al., Antimicrobial activity of naphthoquinones from Fusaria, Mycopathologia 111: 9-15, 1990; Marasas et al. (Toxigenic Fusarium species, identity and mycotoxicology, 1984, Pennsylvania State University Press, University Park, PA, USA), каждая из которых включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте для всех целей.
В другом воплощении токсины (например нафтазариновые пигменты), продуцируемые штаммом МК7 также могут иметь другое промышленное применение. Например, токсины (например нафтазариновые пигменты), продуцируемые штаммом МК7, могут быть использованы как антибиотики, инсектициды и/или гербициды. В одном воплощении нафтазариновые пигменты, продуцируемые штаммом МК7, используют вместе со вторым химическим веществом, которое выбрано из других антибиотиков, инсектицидов и/или гербицидов.
Сидерофоры, продуцируемые F. oxysporum
Известно, что штаммы Fusarium oxysporum продуцируют сидерофоры, которые можно использовать для комплексообразования с металлами для промышленного применения. Ожидается, что сидерофоры, продуцируемые выделенным штаммом гриба по настоящему изобретению, будут функциональными при низком рН.
Сидерофоры (от греческого: "переносчик железа") представляют собой низкомолекулярные высокоаффинные железохелатирующие соединения, секретируемые микроорганизмами, такими как бактерии, грибы, и травами (Neilands et al., A Crystalline Organo-iron Pigment from a Rust Fungus (Ustilago sphaerogena), 1952. J. Am. Chem. Soc 74: 4846-4847, Neilands et al, Siderophores: Structure and Function of Microbial Iron Transport Compounds. 1995, J. Biol. Chem. 270: 26723-26726). Сидерофоры являются одними из самых сильных известных связывающих агентов растворимого Fe3+. Железо является необходимым почти для всех жизненных процессов, имеет наиважнейшее значение для таких процессов как дыхание и синтез ДНК. Несмотря на то, что железо является одним из самых распространенных элементов в земной коре, биодоступность железа во многих окружающих средах, таких как почва или море, ограничена очень низкой растворимостью иона Fe3+. Микроогранизмы высвобождают сидерофоры, чтобы захватить железо из этих минеральных фаз путем образования растворимых комплексов Fe3+, которые могут быть захвачены активными транспортными механизмами. Многие сидерофоры представляют собой нерибосомные пептиды (Miethke et al, 2007, Siderophore-Based Iron Acquisition and Pathogen Control. Microbiol, Mol. Bio. Reviews, 71: 413-451), хотя биосинтез некоторых из них осуществляется независимо (Challis et al., 2005, А widely distributed bacterial pathway for siderophore biosynthesis independent of nonribosomal peptide synthetases. ChemBioChem, 6: 601-611). Сидерофоры входят в число самых сильных веществ, связывающихся с Fe3+, при этом энтеробактин является одним из самых сильных среди них. Благодаря этому свойству они привлекли интерес медицинской науки для хелаторной терапии, при этом сидерофор десфероксамин В получил широкое применение в лечении отравления железом и талассемии. Сидерофоры также могут хелатировать другие металлы, которые включают, без ограничения ими, алюминий, галлий, хром, медь, цинк, свинец, марганец, кадмий, ванадий, индий, плутоний и уран.
Сидерофоры обычно образуют гексадентатный, окстаэдрический комплекс с Fe3+ предпочтительно по сравнению с другими природными, широко распространенными ионами металлов, хотя при наличии менее чем шести донорных атомов, вода также может координироваться. Наиболее эффективными сидерофорами являются те, которые имеют три бидентатных лиганда на молекулу, образуя гексадентатный комплекс и вызывая меньшее изменение энтропии, чем вызывает хелатирование одного трехвалентного иона железа отдельными лигандами. Типичную коллекцию сидерофоров см. в Miller et al. (Studies and Syntheses of Siderophores, Microbial Iron Chelators, and Analogs as Potential Drag Delivery-Agents. 2000, Current Medicinal Chemistry 7: 159-197). Сидерофоры обычно классифицируют по лигандам, используемым для хелатирования трехвалентного иона железа. Основные группы сидерофоров включают катехоляты (феноляты), гидроксаматы и карбоксилаты (например производные лимонной кислоты). Лимонная кислота также может действовать в качестве сидерофора. Широкое разнообразие сидерофоров может быть связано с эволюционным давлением, действующим на микроорганизмы, с получением структурно различающихся сидерофоров, которые не могут быть транспортированы активными транспортными системами других микроорганизмов, или в случае патогенов, дезактивированы организмом хозяина. Неограничивающие примеры сидерофоров включают гидроксаматные сидерофоры (например феррихром в Ustilago sphaerogena, десферриоксамин В (дефероксамин) в Streptomyces pilosus или Streptomyces coelicolor, десферриоксамин Е в Streptomyces coelicolor, фузаринин С в Fusarium roseum, орнибактин в Burkholderia cepacia), катехолатные сидерофоры (например энтеробактин в Escherichia coli и энтеробактериях, бацилибактин в Bacillus subtilis и Bacillus anthracis, вибриобактин в Vibrio cholerae), и сидерофоры со смешанными лигандами (например азотобактин в Azotobacter vinelandii, пиовердин в Pseudomonas aeruginosa, иерсиниабактин в Yersinia pestis). Большее количество грибковых сидерофоров описано в Renshaw et al, (Fungal siderophores: structures, functions and applications, 2002, Mycol. Res. 106 (10): 1123-1142).
Сидерофоры применяют в медицине для терапии перенасыщения железом и алюминием и лучшей адресности антибиотиков. Понимание механизма действия сидерофоров привело к возможности разработки ингибиторов с малыми молекулами, которые блокируют биосинтез сидерофоров и, следовательно, бактериальный рост и вирулентность в условиях недостатка железа (Ferreras et al,, 2005, Small-molecule inhibition of siderophore biosynthesis in Mycobacterium tuberculosis and Yersinia pestis. Nature Chemical Biology 1: 29-32). Сидерофоры полезны в качестве лекарственных средств в облегчении мобилизации железа у людей, особенно при лечении заболеваний, связанных с железом, благодаря их высокой аффинности к железу. Одно потенциально мощное применение заключается в использовании способностей сидерофоров транспортировать железо для переноса лекарственных средств в клетки путем получении конъюгатов сидерофоров с противомикробными агентами. Поскольку микроорганизмы идентифицируют и используют только определенные сидерофоры, ожидают, что такие конъюгаты будут обладать селективной противомикробной активностью.
Доставка лекарственного средства, опосредованная микробным транспортом железа (сидерофором), позволяет использовать идентификацию сидерофоров в качестве агентов доставки железа, чтобы иметь конъюгаты микробного сидерофора, ассимилированного с прикрепленными лекарственными средствами. Эти лекарственные средства являются летальными для микроорганизмов и заставляют микроорганизм совершить самоубийство, когда он поглотит конъюгат сидерофора. Благодаря включению железосвязывающих функциональных групп сидерофоров в антибиотики, их эффективность значительно возрастает. Это происходит благодаря системе сидерофор-опосредованного захвата железа бактерий.
Таким образом, в одном воплощении сидерофоры могут быть извлечены из выделенного штамма МК7 F. oxysporum. Например, штамм МК7 можно культивировать с использованием подходящей среды, как описано в настоящем изобретении, или лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углеводов или их комбинации в анаэробных или аэробных условиях. Способы выделения сидерофоров известны специалисту в данной области техники. Экстракцию сидерофоров органическим растворителем, этилацетатом в случае катехольного типа, и либо бензиловым спиртом или смесью хлороформ : фенол (1:1) для гидроксаматного типа, используют в качестве эффективных стадий очистки для многих типов сидерофоров, так как соли и макромолекулы эффективно удаляются (Neilands et al, Microbial iron compounds. 1981, Ann. Rev. Biochem. 50, 715-731). Широко используют полистирольную смолу Amberlite XAD для очистки нейтрального, феррихромного типа сидерофоров (Horowitz et ai, Isolation and identification of the conidial growth factor of Neurospora crassa. 1976, J. Bacterial. 127, 135-140) и полиамидную смолу для хроматографического выделения катехольного типа.
Кроме того, в настоящем изобретении предлагаются способы детоксификации жидкостей, содержащих ионы металлов, и/или извлечения ионов металлов из растворов посредством биосорбции. В одном воплощении композицию, содержащую выделенный штамм МК7 F. oxysporum, или композицию, содержащую сидерофоры, экстрагированные из выделенного штамма МК7 F. oxysporum, можно использовать для детоксификации жидкостей, содержащих металлы, как описано выше, и/или для извлечения таких металлов. В одном воплощении композицию, содержащую достаточное количество выделенного штамма МК7 F. oxysporum или сидерофоров, экстрагированных из выделенного штамма МК7 F. oxysporum, смешивали с образцом, содержащим металлы в течение некоторого времени, что позволяло большинству ионов металла в жидкостях связаться с сидерофорами. В одном воплощении такой образец может представлять собой сточную жидкость, содержащую один или более типов ионов металла (например жидкости горнорудных отходов, жидкости промышленных отходов и др.). В одном примере жидкости содержат по меньшей мере один ион металла, выбранный из группы, состоящей из Ag, Zn, Fe, Al, Be, Pb, Cu, Cr, Ni, Cd, Co, Ni, Ma, Pd, Pt, U, Th, Mo, Sn, Ti, As, Au и Hg. В одном воплощении общая исходная концентрация ионов металлов варьируется от примерно 1 млн-1 до примерно 100000 млн-1 по массе. Например, общая концентрация ионов металлов варьируется от примерно 0,5 млн-1 (например Cd) до примерно 250 млн-1 (например Zn) в зависимости от металлического компонента. В одном воплощении жидкие отходы смешивают с выделенным штаммом МК.7 F. oxysporum в биореакторе, куда добавляют среду и питательные вещества для роста грибов для обеспечения пролиферации штамма МК7. Одним из наиболее важных требований к технологическому применению биосорбции является фиксация биомассы на среде для прикрепления, позволяющая биосорбенту удерживаться в реакторе, так что его можно использовать повторно. Это часто осуществляют путем иммобилизации микроорганизмов на матрице. Таким образом, в одном воплощении штамм МК7 или сидерофор иммобилизован на матрице. Есть много примеров применения этих методов, наиболее типичные можно найти в следующих научных исследованиях: Brierley, Production and application of a Bacillus-based product for use in metals biosorption. In: B. Volesky, Editor, Biosorption of Heavy Metals, CRC Press, Boca Raton, Fla. (1990), pp. 305-312; Brierley, Immobilization of biomass for industrial application of biosorption. In: A.E. Torma, M.L. Apel and C.L. Brierley, Editors, Biohydrometallurgical Technologies, Proceedings of the International Biohydrometallurgy Symposium, The Minerals, Metals and Materials Society, Warrendale, Pa. (1993), pp. 35-44; Tsezos у Deutschmann (1990). An Investigation of Engineering Parameters for the use of Immobilized Biomass Particles in Biosorption. J. Chem. Technol. Biotechnol, 48, 29-39; Gilson у Thomas (1995), Calcium alginate bead manufacture: with and without immobilized yeast. Drop formation at a two-fluid nozzle. J. Chem. Technol. Biotechnol, 62 pp. 227-232; Bedell у Damall, (1990), Immobilization of nonviable, biosorbent, algal biomass for the recovery of metal ions. In: B. Volesky, Editor, Biosorption of Heavy Metals, CRC Press, Boca Raton, Fia., pp. 313-326; Figueira et al. (2000), Biosorption of metals in brown seaweed biomass. Water Res. 34 pp. 196-204; Kratochvil et al. (1997) Optimizing Cu removal/recovery in a biosorption column. Water Res. 31 pp. 2327-2339; Kratochvil у Volesky, (2000), Multicomponent biosorption in fixed beds. Water Res. 34 pp. 3186-3196; Trujillo et al, (1991), Mathematically modeling the removal of heavy metals from wastewater using immobilized biomass. Environ. Sci. Technol. 25 pp. 1559-1565. Иммобилизующими агентами или наиболее часто используемыми матрицами являются альгинат, полиакриламид, полисульфон, силикагель, целлюлоза и глутаральдегид.
Ионы металлов, которые связывались с биосорбентом (штаммом МК7 или сидерофорами, экстрагированными из штамма МК7) посредством стадии биосорбции, как описано выше, подвергают стадии десорбции, которая позволяет элюировать ионы металла из сидерофоров и регенерировать связывающую способность с металлами штамма гриба или экстрагированных сидерофоров. Это осуществляли путем обработки смеси штамма гриба и сточных жидкостей или смеси экстрагированных сидерофоров и сточных жидкостей кислым раствором и затем щелочным раствором для нейтрализации кислоты в смеси. Раствор кислоты (например концентрированную 95-97% H2SO4) добавляют в смесь для десорбции, при этом ионы металла высвобождаются из иммобилизованного биосорбента (штамма МК7 или сидерофоров, экстрагированных из штамма МК7). После стадии десорбции смесь нейтрализовали, используя раствор основания (например концентрированный раствора гидроксида натрия (например 50% NaOH).
Пластификатор
Авторы настоящего изобретения также обнаружили, что выделенный штамм F. oxysporum по настоящему изобретению может продуцировать пластификаторы, например диизооктилфталат (DIOP) и гександионовой кислоты моно(2-этилгексил)овый эфир (синоним 2-этилгексилгидроадипат).
Пластификаторы (диспергаторы) представляют собой добавки, которые повышают пластичность или текучесть вещества, к которому они добавлены; к ним относятся пластмассы, цемент, бетон, древесноволокнистая плита и глина. Хотя одни и те же соединения часто используются как для пластмасс, так и для бетона, желаемый эффект немного различается. Мировой рынок пластификаторов в 2004 имел общий объем примерно 5,5 млн тонн, что привело к обороту чуть более 6 млрд. фунтов.
Пластификаторы для бетона смягчают смесь до того, как она затвердеет, увеличивая ее пригодность или уменьшая количество воды и, как правило, не предназначены для влияния на свойства конечного продукта после того, как он затвердеет. Пластификаторы для древесноволокнистой плиты повышают текучесть смеси, что позволяет снизить использование воды и тем самым уменьшает количество энергии для высушивания досок. Пластификаторы для пластмасс смягчают конечный продукт, увеличивая его гибкость.
Пластификаторами для пластмасс являются добавки, наиболее часто фталаты, которые придают твердым пластмассам, таким как ПВХ (поливинилхлорид), необходимую гибкость и долговечность. Они часто основаны на сложных эфирах поликарбоновых кислот с линейными или разветвленными алифатическими спиртами со средней длиной цепи. Пластификаторы работают, встраиваясь между цепями полимеров, создавая пространство между ними (увеличивая "свободный объем"), и тем самым значительно снижая температуру стеклования для пластика и делая его мягче. Для пластмасс, таких как ПВХ, чем больше пластификатора добавлено, тем ниже температура гибкости при низкой температуре. Это означает, что он будет более гибким, хотя его прочность и твердость будет в результате уменьшаться.
Сложноэфирные пластификаторы служат в качестве пластификаторов, смягчителей, наполнителей и смазочных агентов, сложные эфиры играют значительную роль в производстве каучука. Основная функция сложноэфирного пластификатора состоит в модификации полимера или смолы, повышающей его полезность. Сложноэфирные пластификаторы позволяют достичь улучшенных характеристик при обработке соединения и в то же время обеспечивают гибкость конечного продукта. Выбор сложноэфирных пластификаторов основан на оценке эффективности затрат. Составитель каучуковой смеси должен оценить сложноэфирные пластификаторы с точки зрения совместимости, пригодности к обработке, долговечности и других эксплуатационных свойств. Широкий спектр производимых сложноэфирных химических соединений включает себацинаты, адипаты, глутараты, фталаты, азелаты и другие специальные смеси. Эта широкая линейка продуктов предоставляет широкий спектр преимуществ в показателях, необходимых для многих эластомерных изделий, таких как трубы и шланги, уплотнения и прокладки, ремни, провода и кабели, и печатные валы. Сложные эфиры от низкой до высокой полярности обеспечивают применение в широком диапазоне эластомеров, включая нитрил, полихлоропрен, EPDM (этилен-пропиленовый каучук), хлорированный полиэтилен, и эпихлоргидрин. Взаимодействие пластификатор-эластомер определяется многими факторами, такими как параметр растворимости, молекулярная масса и химическое строение. Атрибуты совместимости и производительности являются ключевыми факторами при разработке состава каучука для конкретного применения.
Неограничивающие примеры пластификаторов включают пластификаторы на основе фталата (например бис(2-этилгексил)фталат (DEHP), диизононилфталат (DINP), бис(н-бутил)фталат (DnBP, DBF), бутилбензилфталат (BBzP), диизодецилфталат (DIDP), ди-н-октилфталат (DOP или DnOP), диизооктилфталат (DIOP), диэтилфталат (DEP), диизобутилфталат (DIBP) и ди-н-гексилфталат), тримеллитаты (например триметилтримеллитат (TMTM), три-(2-этилгексил)тримеллитат (TEHTM-MG), три-(н-октил,н-децил)тримеллитат (ATM), три-(гептил,нонил)тримеллитат (LTM), н-октилтримеллитат (ОТМ)), пластификаторы на основе адипата (бис(2-этилгексил)адипат (DEHA), диметиладипат (DMAD), монометиладипат (MMAD), диоктиладипат (DOA)), дибутилсебацинат (DBS), дибутилмалеат (DBM), диизобутилмалеат (DIBM), бензоаты, эпоксидированные растительные масла, сульфаниламиды, N-этил-толуол-сульфонамид (ETSA), орто- и лара-изомеры, N-(2-гидроксипропил)бензолсульфонамид (HP BSA), N-(н-бутил)бензол-сульфонамид (BBSA-NBBS), органофосфаты (например трикрезилфосфат (TCP), трибутилфосфат (ТВР), гликоли/полиэфиры, триэтиленгликоль дигексаноат (3G6, 3GH), тетраэтиленгликоль дигептаноат (4G7)), полимерные пластификаторы и полибутен.
В качестве пластификатора DIOP представляет собой универсальный пластификатор для поливинилхлорида, поливинилацетата, каучуков, пластиков, целлюлозы и полиуретана.
Настоящее изобретение дополнительно проиллюстрировано следующими ниже примерами, которые не следует рассматривать как ограничивающие. Содержание всех ссылок, патентов и опубликованных патентных документов, указанных в данной заявке, а также графические материалы включены в данное описание в качестве ссылки во всей их полноте для всех целей.
ПРИМЕР
Пример 1
Выделение и рост штамма МК7 Fusarium oxysporum
Выделенный штамм гриба МК7 Fusarium oxysporum по настоящему изобретению был выделен в Йеллоустонском национальном парке в рамках NPS-разрешенного проекта исследования номер YELL-2007-SCI-1976.
Способы выделения штамма МК7 Fusarium oxysporum были ранее описаны. Например, 0,5 г смеси водорослей-биомассы грибов вводили в 200 мл природной фильтрованной родниковой воды из Йеллостоунского национального парка при pH 2,5 и культивировали под солнечным светом в течение 10 суток, после чего водоросли были израсходованы. 50 мкл оставшейся розоватой биомассы сеяли штрихом на 1,2% агар с синтетической средой (Kozubal et ah, 2008) при pH 3,0.
Выделенный гриб изучили и подтвердили, что штамм относится к Fusarium oxysporum по морфологическим характеристикам, которые включают гифы, являющиеся перегородчатыми и гиалиновыми, короткие и неразветвленные конидиефоры; многочисленные и типичные Fusarium oxysporu/п-подобные серповидные макроконидии с 5-перегородками размером примерно 25-50×3-4,5 мкм; и многочисленные, слегка изогнутые не имеющие перегородок микроконидии размером примерно 5-10×2,0-3,5 мкм. Кроме того, результаты BLAST ДНК последовательностей 18S рРНК и ITS (внутреннего транскрибируемого участка-спейсера) (SEQ ID NO. 1) указывают на то, что организм представляет собой штамм Fusarium oxysporum.
В процессе роста штамма МК7 были произведены ферменты, которые разрушают лигнин, целлюлозу и гемицеллюлозы. Гриб использует полученные в результате продукты разложения для получения липидов или производства этанола и водорода, в зависимости от условий.
SEQ ID NO: 1 18S рРНК и ДНК последовательность ITS участка штамма МК7 Fusarium oxysporum
Пример 2
Продуцирование липидов штаммом МК7 Fusarium oxysporum
Инокулят штамма МК7 Fusarium oxysporum и жидкую среду (содержащую 3,5 г/л нитрата аммония, 0,4 г/л 2-водного хлорида кальция, 0,30 г/л 7-водного сульфата магния, 2 г/л однозамещенного фосфата калия, 0,5 г/л сульфата марганца и микроэлементы до конечных концентраций, описанных в Kozubal et al., 2008, включенный в данный документ посредством ссылки во всей его полноте) можно смешать с лигноцеллобиозным сырьем, лигноцеллюлозным сырьем, углеродсодержащими отходами или мономерами сахара в аэробной системе. Через определенное количество суток организм можно собрать и использовать для экстракции липида. Запатентованный процесс может также быть проведен в анаэробной системе, в которой производится этанол и газообразный водород. На Фиг. 2 показана биомасса гриба штамма МК7 Fusarium oxysporum через 7 суток роста на пшеничной соломе при pH 2,5 в аэробных условиях. Грибковый коврик готов для экстракции липида.
В исследовании разные типы сырья смешивали с инокулятом штамма МК7 Fusarium oxysporum и жидкой средой, включающей глюкозу, ксилозу, люцерну, авицел, белую бумагу и пшеничную солому. Через 10 суток собирали биомассу грибов для экстракции липидов. Липиды из биомассы грибов экстрагировали, используя метод экстракции общих липидов с помощью смеси 2:1 хлороформ/метиловый спирт, описанный ранее (Bligh and Dyer, A rapid method of total lipid extraction and purification, 1959, Can. J. Biochem. Physiol, 37, 911-917).
Общий выход извлеченных липидов из штамма МК7, растущего в разных типах сырья, определяли с использованием гравиметрической аналитической процедуры. Выходы грибов, растущих на глюкозе (pH 2,5), 8% пшеничной соломе (pH 2,5), 4% пшеничной соломе (pH 2,5) и 8% пшеничной соломе (pH 2,5; 25 мМ Mn) представлены на Фиг. 3. Как показано, штамм МК7 может продуцировать липиды из глюкозы или пшеничной соломы и почти 8% исходной массы пшеничной соломы превращалось в липиды через 10 суток при pH 2,5. Оптическая и флуоресцентная микроскопия показала накопление больших липидных глобул в клетках штамма МК7 (Фиг. 4).
Жирнокислотный состав липидов, экстрагированных из культур, выращенных на пшеничной соломе при pH 2,5, определяли с использованием газовой хроматографии. Результаты показали, что примерно 44% от общего содержания липидов составляли кислая олеиновая кислота (18:1), мононенасыщенная жирная кислота, и примерно 46% пальмитиновая (16:0) и стеариновая кислоты (18:0), которые являются насыщенными жирными кислотами (Фиг. 5). Высокая концентрация мононенасыщенных жирных кислот, таких как олеиновая кислота, является желательным для получения биодизеля благодаря их подходящей вязкости и уменьшенных проблем с окислением (Pinzi et al., 2009. The Ideal Vegetable Oil-based Biodiesel Composition: A Review of Social, Economical and Technical Implications. Energy Fuels, 23 (5): 2325-2341). В связи с этим, профиль липидов, полученный с помощью штамма МК7 Fusarium, является более подходящим по сравнению с профилем других описанных грибов (Ya et al. 2008, Lipids of Filamentous Fungi as a Material for Producing Biodiesel Fuel. Applied Biochemistry and Microbiology. 44: 523-527; Meng et al., 2009, Biodiesel production from oleaginous microorganisms. Renewable Energy. 34: 1-5) и микроводорослями, которые производят намного больше полиненасыщенных жирных кислот, которые склонны к окислению (Christi, Biodiesel from microalgae, 2007, Biotechnology Advances. 25: 294-306).
Пример 3
Производство этанола штаммом МК7 Fusarium oxysporum Штамм MK7 Fusarium способен производить значительное количество этанола в анаэробных и микроаэробных условиях, используя пяти- и шести-углеродные сахара. Кроме того, он способен непосредственно превращать обработанную кислотами пшеничную солому в этанол.
На Фиг. 6 обобщены выходы этанола для 4% глюкозы (масс/об.) при pH 4,5 и 4% пшеничной соломы (масс/об.) при pH 3 и 4,5, при выращивании в анаэробных условиях в герметично закрытых сывороточных флаконах. Выходы этанола на глюкозе были аналогичны полученным для других видов Fusarium, выросших на глюкозе (Ruiz et al., 2007. Sugar fermentation by Fusarium oxysporum to produce ethanol. World J Microbiol Biotechnol. 23: 259-267), и pH-нейтрализованных сахарах, полученных из пшеничной соломы, стеблей сахарного сорго и гидролизатов отработанных пивных зерен после предварительной обработки щелочью (Christakopoulos et al., 1991, Direct ethanol Conversion of Pretreated Straw by Fusarium oxysporum, Bioresource Technology. 35: 297-300; Christakopoulos et al., 1993, Direct conversion of sorghum carbohydrates to ethanol by a mixed microbial culture. Bioresource Technology, 45: 89-92; Lezinou et al., 1994, Simultaneous saccharification and fermentation of sweet sorghum carbohydrates to ethanol in a fed-batch process. Biotechnology Letters. 16: 983-988; и Xiros et al., 2009, Enhanced ethanol production from brewer's spent grain by a Fusarium oxysporum consolidated system. Biotechnol Biofuels. 10: 4). Выходы этанола при pH 2,5 и использовании пшеничной соломы в качестве исходного сырья были низкими для штамма МК7, что соответствовало результатам для других видов грибов и дрожжей, выросших при pH 4,5-5,5 (Christakopoulos et al., 1989, Direct fermentation of cellulose to ethanol by Fusarium oxysporum. Enzyme Microb Tech. 11: 236-239; Christakopoulos et al., 1991, Direct Ethanol Conversion of Pretreated Straw by Fusarium oxysporum. Bioresource Technology. 35: 297-300). Это, вероятно, связано с ингибированием этанольной ферментации фенольными соединениями, фурфуролами и другими соединениями, которые образуются при кислотном гидролизе (Palmqvist and Harm-Hagerdal, 2000).
Пример 4
Получение водорода штаммом МК7 Fusarium oxysporum Кроме получения этанола во время ферментации, штамм МК7 продуцирует газообразный водород при анаэробном росте в герметично закрытых сывороточных флаконах с использованием лигноцеллюлозного сырья. Хотя водород не продуцируется при ферментации глюкозы, но при использовании пшеничной соломы в качестве ростового субстрата концентрация газа Н2 достигала 4% в газовом свободном пространстве над продуктом. Наличие последовательности hyd3-подобного гена гидрогеназы, по-видимому, важное для получения H2, было подтверждено в штамме МК7 путем использования полимеразной цепной реакции.
Пример 5
Продуцирование биотоплива или предшественников биотоплива штаммом МК7 Fusarium oxysporum с предварительными обработками
Различные виды предварительной обработки могут быть использованы для увеличения степени превращения штаммами МК7 в получении биотоплива или предшественников биотоплива. Предварительные обработки могут включать подкисление до pH менее 3,0, добавление Mn и добавление питательных веществ (например аммония и фосфата).
Предыдущая работа показала, что Mn(III) вероятно увеличивает разрушение лигнина через окисление фенольных групп лигнина в сочетании с восстановлением Mn(III) до Mn(II) (Kerem and Hadar, 1995, Effect of manganese on preferential degradation of lignin by Pleurotus ostreatus during solid-state fermentation. Appi Environ Microbiol. 61 (8): 3057-3062; Boominathan et al., 1992, cAMP-mediated differential regulation of lignin peroxidase and manganese-dependent peroxidase production in the white-rot basidiomycete Phanerochaete chrysosporium. Proc. Natl. Acad. Sci. 89: 5586-5590; Tebo et al., 1997, Bacterially-mediated mineral formation: Insights into manganese (II) oxidation from molecular genetic and biochemical studies. In: J.F. Banfield and K.H. Nealson (Eds.) Geomicrobiology: Interactions Between Microbes and Minerals. Reviews in Mineralogy. 35: 225-266). Окисление Mn(II) в Mn(III) различными ферментами может регенерировать Mn(III).
Эксперименты со штаммом МК7 показывают, что гриб может переносить очень высокие уровни Mn и что концентрации Mn 5, 10 и 25 мМ увеличивали расщепление пшеничной соломы и рост грибов. Точное количественное определение биомассы до сих пор не была выполнено, но визуальные оценки указывали на увеличение биомассы грибов примерно на 10-25%. оказалось, что продуцирование липида также было усиленным.
Штамм МК7 также переносит очень кислые значения pH. Для увеличения скоростей конверсии штаммом МК7 в производстве биотоплива или предшественников биотоплива с использованием лигноцеллюлозного сырья, в смесь инокулята штамма МК7 и лигноцеллюлозного сырья добавляют подкисляющее вещество, где pH смеси составляет менее 3,0, менее 2,9, менее 2,8, менее 2,7, менее 2,6, менее 2,5, менее 2,4, менее 2,3, менее 2,2, менее 2,1, менее 2,0, менее 19, менее 1,8, менее 1,7, менее 1,6, менее 1,5, менее 1,4, менее 1,3, менее 1,2, менее 1,1, менее 1,0, менее 0,9, менее 0,8, менее 0,7, менее 0,6 или менее 0,5. Смесь инокулята штамма МК7 и лигноцеллюлозного сырья с pH 7,0 включена в качестве контроля. После инкубации в течение необходимого времени выделяют биотопливо или предшественники биотоплива из биомассы грибов и/или смеси биомассы грибов и сырья. По сравнению с контрольной смесью, подкисленная смесь инокулята штамма МК7 и лигноцеллюлозного сырья продуцирует примерно на 5%, примерно 10%, примерно 15%, примерно 20%, примерно 25%, примерно 30%, примерно 35%,, примерно 40%», примерно 45%, примерно 50%, примерно 55%, примерно 60%, примерно 65%, примерно 70%, примерно 75%, примерно 80%, примерно 85%,, примерно 90%, примерно 95%, примерно 100%, примерно 150%, примерно 200%, примерно 250%, примерно 300%, примерно 400%, примерно 500%, примерно 550%, примерно 600%, примерно 650%, примерно 700%, примерно 800%, примерно 850%, примерно 900% или примерно 1000% больше биотоплива или предшественников биотоплива.
Пример 6
Производство ферментов и антибиотиков штаммом МК7 Fusarium oxysporum
Ферменты (например целлюлаза, ксиланаза, лигниназа, глюкуронидаза, арабинофуранозидаза, арабиногалактаназа, эстераза феруловой кислоты, липаза, пектиназа, глюкоманназа, амилаза, ламинариназа, ксилоглюканаза, галактаназа, глюкоамилаза, пектатлиаза, хитиназа, экзо-β-D-глюкозаминидаза, целлобиоза-дегидрогеназа, и ацетилксилан-эстераза, ксилозидаза, α-L-арабинофуранозидаза, феруоилэстераза, эндоглюканаза, В-глюкозидаза, Mn-пероксидаза и лакказа) в штамме МК7 Fusarium oxysporum потенциально резистентны к кислому pH. Ферменты и нуклеотиды, кодирующие эти ферменты, очень полезны в биотехнологии и, таким образом, могут быть выделены.
Для выделения устойчивых к кислоте ферментов из штамма МК7 F. oxysporum можно применять традиционные методы молекулярного клонирования. Например, ген, кодирующий конкретный фермент, можно выделить посредством ОТ-ПЦР из полиаденилированной мРНК, экстагированной из гриба, или посредством ПЦР из ДНК, экстрагированной из гриба. Праймеры, специфичные для гена, кодирующего интересующий фермент, сконструированы на основании информации о геноме Fusarium oxysporum, или пептидной последовательности очищенного фермента из штамма МК7 Fusarium oxysporum, или пептидной последовательности гомологичных ферментов из видов Fusarium. Полученный в результате продукт гена может быть клонирован в качестве ДНК-вставки в вектор. Вектор может представлять собой экспрессионный вектор, подходящий для клетки-хозяина (например грибковой клетки, бактериальной клетки, дрожжевой клетки, растительной клетки, клетки насекомых или животной клетки).
Ферменты, устойчивые к кислому pH, очищенные из Fusarium oxysporum МК7 или продуцируемые в рекомбинантной клетке-хозяина, при анализе in vitro по сравнению с гомологичным ферментом из вида Fusarium oxysporum, неустойчивым к кислому pH, имели на примерно 5%, примерно 10%, примерно 15%, примерно 20%, примерно 25%, примерно 30%, примерно 35%, примерно 40%, примерно 45%, примерно 50%, примерно 55%, примерно 60%, примерно 65%, примерно 70%, примерно 75%, примерно 80%, примерно 85%, примерно 90%, примерно 95%, примерно 100%, примерно 150%, примерно 200%, примерно 250%, примерно 300%, примерно 400%, примерно 500%, примерно 550%, примерно 600%, примерно 650%, примерно 700%, примерно 800%, примерно 850%, примерно 900% или примерно 1000% большую активность при pH менее 3,0, менее 2,9, менее 2,8, менее 2,7, менее 2,6, менее 2,5, менее 2,4, менее 2,3, менее 2,2, менее 2,1, менее 2,0, менее 19, менее 1,8, менее 1,7, менее 1,6, менее 1,5, менее 1,4, менее 1,3, менее 1,2, менее 1,1, менее 1,0, менее 0,9, менее 0,8, менее 0,7, менее 0,6 или менее 0,5.
Пример 7
Липидные профили, продуцируемые штаммом МК7
Производство всех внутриклеточных липидов определяли с использованием прямой переэтерификации в сочетании с анализом GC-MS (газовая хроматография-масс-спектрометрия), как описано в Lohman et al. (2013). Липидные профили штамма МК7 в высшей степени соответствовали воздействия (т.е. pH, температуре, субстрату для роста, продолжительности культивирования, содержанию влаги) и были преимущественно представлены С16:0 и С18:0, С18:1 и С18:2 триацилглицеридами (>95% общих липидов, Фиг.7 В). Общий топливный потенциал и извлекаемые липидные фракции показывают профили, идеальные для биодизеля (Фиг. 7А). Профили жирных кислот также показывают ряд высокоценных продуктов, включающих омега-7 вакценовую кислоту (метил-11-октадеценоат), омега-7 пальмитолеиновую кислоту (метил-гексадец-9-еноат; торговое наименование ProvinalTM) и метиловый эфир тетракозановой кислоты (Таблица 1). Они являются редкими жирными кислотами, как правило не содержащимися в растительных маслах, и могут обеспечивать значительно больший доход на тонну сырья, чем один биодизель.
На Фиг. 7A показано среднее количество общего содержания метиловых эфиров жирных кислот (FAME) в случае прямой переэтерификации (общий топливный потенциал) и экстрагируемые фракции липида в зависимости от соотношение C:N в среде (n=3). Полосы внутри диаграммы экстрагируемой липидной фракции представляют три-, ди- и моно-ацильные глицериды (TAG, DAG, MAG) и компоненты в виде свободных жирных кислот (FFA). На вставке показана хроматограмма GC-FID (газовый хроматограф с пламенно-ионизационным детектором) липидной фракции с доминирующими молекулами TAG. На Фиг. 7B показан профиль липидов FAME, полученный при прямой переэтерификации всех жирных кислот (Прямые) в FAME, и FAME, полученные только из извлекаемых липидных предшественников (Экстрагируемые). На вставка показана хроматограмма GC-MS прямых и экстрагируемых фракций.
Если не определено иное, все технические и научные термины в настоящем документе имеют такое же значение, которое обычно подразумевается специалистом обычной квалификации в области техники, к которой относится данное изобретение. Хотя любые способы и вещества, аналогичные или эквивалентные описанным в настоящем документе, могут быть использованы на практике или при тестировании настоящего изобретения, предпочтительные способы и вещества описаны в настоящем документе. Все указанные публикации, патенты и патентные публикации включены в данное описание изобретения посредством ссылки во всей своей полноте для всех целей.
Публикации, рассмотренные в настоящем документе, приведены исключительно в отношении их раскрытия до даты подачи настоящей заявки. Ничего в описании изобретения не следует расценивать как допущение того, что настоящее изобретение не дает право предвосхищать такую публикацию посредством предшествующего изобретения.
В то время как изобретение описано в связи с конкретными его воплощениями, следует понимать, что возможны дополнительные модификации и данная заявка охватывает все варианты, применения или адаптации изобретения, в целом соответствующие принципам изобретения и включающие такие отклонения от настоящего описания, которые находятся в пределах известной или обычной практики в данной области техники, к которой относится изобретение, и которые могут быть применены к вышеприведенным существенным признакам и включены в объем прилагаемой формулы изобретения.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Abe Т., Hoshino Т., Nakamura A., and N. Takaya. 2007. Anaerobic elemental sulfur reduction by fungus Fusarium oxysporum. Biosci Biotechnol Biochem. 71: 2402-7.
Bligh, E.G and Dyer, WJ. 1959. A rapid method for total lipid extraction and purification. Can. J. Biochem. Physiol 37: 911-917.
Bhatia, T.S., Arneja J.S. Lipid metabolism in Fusarium oxysporum, Journal of the Science of Food and Agriculture, 2006, 29 (7): 619-626.
Boominathan, K., Reddy, C.A. 1992. cAMP-mediated di-erential regulation of lignin peroxidase and manganese-dependent peroxi-dase production in the white-rot basidiomycete Phanerochaete chrysosporium. Proc. Natl. Acad. Sci. 89: 5586-5590.
Briggs, Michael. UNH Biodiesel Group. 2004. "Wide scale Biodiesel Production from Algae". http://www.unh.edu/'p2/biodiesel/article_alge.html.
Brimble M.A., Letecia J. Duncalfband Michael R. Nairn. 1999. Pyranonaphthoquinone antibiotics - isolation, structure and biological activity. Nat. Prod. Rep. 16: 267-281
Chisti, Y. 2007. Biodiesel from microalgae. Biotechnology Advances. 25: 294-306.
Christakopoulos P, Maoris BJ, Kekos D. 1989. Direct fermentation of cellulose to ethanol by Fusarium oxysporum. Enzyme Microb Tech. 11: 236-239.
Christakopoulos P., D.P. Koullas, D, Kekos, E. G. Koukios and BJ. Maoris. 1991. Direct Ethanol Conversion of Pretreated Straw by Fusarium oxysporum. Bioresource Technology. 35: 297-300.
Christakopoulos P., Lian-Wu L., Kekos D., Macris BJ. 1993. Direct conversion of sorghum carbohydrates to ethanol by a mixed microbial culture. Bioresource Technology, 45: 89-92.
Cooksey, K.E., J.B. Guckert, S.A. Williams, and P.R. Calli. 1987. Fluorometric determination of the neutral lipid content of microalgal cells using Nile Red". Journal of Microbiological Methods, 6: 333-345.
Daviere J.M., Langin Т., and MJ. Daboussi. 2001. Potential role of transposable elements in the rapid reorganization of the Fusarium oxysporum genome. Fungal Genet Biol. 34: 177-92.
Gross S., and E.I. Robbins. 2000, Chemistry and Ecology of Highly Acidic Environments. Acidophilic and acid-tolerant fungi and yeasts Hydrobiologia 433: 91-109.
Hua-Van A., Daviere J.M., Kaper F., Langin Т., and M.J. Daboussi. 2.000. Genome organization in Fusarium oxysporum: clusters of class II transposons. Curr Genet. 37: 339-47.
Inskeep W.P., G.G. Ackerman, W.P. Taylor, M. Kozubal, S. Korf, and R.E. Macur. 2005. On the energetics of chemolithotrophy in nonequilibrium systems: case studies of geothermal springs in Yellowstone National Park. Geobiology. 3: 297-320.
Kerstetter J.D. and J.K. Lyons. 2001. Wheat straw for ethanol production in Washington: a resource, technical and economic assessment, Washington State University, Cooperative Extension Energy Program.
Kozubal M., Macur R.E., Korf S., Taylor W.P., Ackerman G.G., Nagy A., and W.P. Inskeep. 2008. Isolation and Distribution of a Novel Iron-Oxidizing Crenarchaeon from Acidic Geothermal Springs in Yellowstone National Park. Appl. Environ. Microbiol, 74: 942-949.
Lezinou V., Christakopoulos P., Kekos D., Maoris B.J. 1994. Simultaneous saccharification and fermentation of sweet sorghum carbohydrates to ethanol in a fed-batch process. Biotechnology Letters. 16: 983-988.
Li Q., Du W, Liu D. 2008. Perspectives of microbial oils for biodiesel production. Appl Microbiol Biotechnol. 80: 749-56.
Kerem Z. and Y, Hadar. 1995. Effect of manganese on preferential degradation of lignin by Pleurotus ostreatus during solid-state fermentation. Appl Environ Microbiol. 61 (8): 3057-3062.
Meng X., Yang J., Xu X., Zhang L, Nie Q., and M. Xian. 2009. Biodiesel production from oleaginous microorganisms. Renewable Energy. 34: 1-5.
Nairn N. Saad R.R., Nairn M., 1985, Production of lipids and sterols by Fusarium oxysporum (Schlecht). Utilization of some agro-industrial by-products as additives and basal medium, Agricultural Wastes 14 (3): 207-220.
Naqvi B.S., Hashmi K., Farooq A.K., Dilnawaz S., and A.M. Zafar. 1997. Production of Lipids by fermentation Preliminary Report, Journal of Islamic Academy of Sciences. 10: 13-18.
Palmqvist E., and Barbel Hahn-Hagerdal. 2000. Fermentation of lignocellulosic hydrolysates. II: inhibitors and mechanisms of inhibition. Bioresource Technology 74: 25-33.
Panagiotoua G., P. Christakopoulosb, L. Olssona. 2005. Simultaneous saccharification and fermentation of cellulose by Fusarium oxysporum F3 - growth characteristics and metabolite profiling. Enzyme and Microbial Technology 36: 693-699.
Patrick, C, Hallenbeck and Dipankar Ghosh. 2009. Advances in fermentative biohydrogen production: the way forward? Trends in Biotechnology. In Press.
Pinzi S., I.L. Garcia, F.J. Lopez-Gimenez, M.D. Luque de Castro, G. Dorado and M.P. Dorado. 2009. The Ideal Vegetable Oil-based Biodiesel Composition: A Review of Social, Economical and Technical Implications. Energy Fuels
Ruiz E., I. Romero M. Moya S. Sanchez V. Bravo E. Castro. 2007. Sugar fermentation by Fusarium oxysporum to produce ethanol. World J Microbiol Biotechnol. 23: 259-267.
Seo H., Kim H., Lee O., Fia J., Lee H, and K. Jung. 2009. Measurement of ethanol concentration using solvent extraction and dichromate oxidation and its application to bioethanol production process. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 36: 285-292.
Seraphim P., Michael K., A. George, 2004. Single cell oil (SCO) production by Mortierella isabellina grown on high-sugar content media. Bioresour Technol. 95: 287-91.
Smith S.N, 2007. An Overview of Ecological and Habitat Aspects in the Genus Fusarium with Special Emphasis on the Soil-Borne Pathogenic Forms Plant Pathology Bulletin. 16: 97-120,
Starkey, R, L. 1973. Effect of pH on tocicity of copper to Scytalidium sp., a copper-tolerant fungus, and some other fungi. J. gen. Microbiol. 78: 217-225.
Tebo, B.M., W.C. Ghiorse, L.G. van Waasbergen, P.L. Siering, and R. Caspi, 1997. Bacterially-mediated mineral formation: Insights into manganese(II) oxidation from molecular genetic and biochemical studies. In: J.F. Banfield and K.H. Nealson (Eds.) Geomicrobiology: interactions Between Microbes and Minerals. Reviews in Mineralogy. 35: 225-266.
White J.S., Yohannan B.K., Walker G.M. 2008. Bioconversion of brewer's spent grains to bioethanol. FEMS Yeast Res. 8 (7): 1175-84. Epub 2008 Jun 10.
Xiros, C, and P. Christakopoulos. 2009. Enhanced ethanol production from brewer's spent grain by a Fusarium oxysporum consolidated system. Biotechnol Biofuels. 10: 4.
Xiros C, Topakas E, Katapodis P, Christakopoulos P. 2008. Evaluation of Fusarium oxysporum as an enzyme factory for the hydrolysis of brewer's spent grain with improved biodegradability for ethanol production. Ind Crops Prod, 28: 213-224.
Ya. E. Sergeeva, L.A. Galanina, D.A. Andrianova, and E.P. Feofilova. 2008. Lipids of Filamentous Fungi as a Material for Producing Biodiesel Fuel. Applied Biochemistry and Microbiology. 44: 523-527.
--->
Перечень последовательностей
<110> Montana State University
<120> АЦИДОФИЛЬНЫЕ ШТАММЫ FUSARIUM OXYSPORUM, СПОСОБЫ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ И
СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ
<130> MONT-151/02WO
<150> 62/020,607
<151> 2014-07-03
<150> 62/061,076
<151> 2014-10-07
<160> 1
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 962
<212> ДНК
<213> штамм MK7 Fusarium oxysporum
<400> 1
ccgcggggaa tactacctga tccgaggtca cattcagagt tgggggttta cggcttggcc 60
gcgccgcgta ccagttgcga gggttttact actacgcaat ggaagctgca gcgagaccgc 120
cactagattt cggggccggc ttgccgcaag ggctcgccga tccccaacac caaacccggg 180
ggcttgaggg ttgaaatgac gctcgaacag gcatgcccgc cagaatactg gcgggcgcaa 240
tgtgcgttca aagattcgat gattcactga attctgcaat tcacattact tatcgcattt 300
tgctgcgttc ttcatcgatg ccagaaccaa gagatccgtt gttgaaagtt ttgatttatt 360
tatggtttta ctcagaagtt acatatagaa acagagttta ggggtcctct ggcgggccgt 420
cccgttttac cgggagcggg ctgatccgcc gaggcaacaa ttggtatgtt cacaggggtt 480
tgggagttgt aaactcggta atgatccctc cgcagttctc acctacggat aggatcatta 540
ccgagtttac aactcccaaa cccctgtgaa catacccatt gttgcctcgg ccggatcagc 600
ccgctcccgg ttaaaacggg acggcccgcc agagtacccc taaactctgt ttctatatgt 660
aacttctgag taaaaccata aataaatcaa aactttcaac acgcatctct tgcttctgtc 720
atcgatgaag aacgcagcaa aatgcgatag tcatgtgatt gcacattcag tgaatcatcg 780
atcttgacgc acattgcgcc tgcagtattc tggcggtcat gcctgttcga gcgtcattca 840
gccctcagcc ctcggttgtg ttcgggatcg gcgagtcctg cgccagcgac cggatcagtg 900
gcgtctgcct gcgcctccat tgcggttaga gttaagccct cgcccacttg ttttacgcta 960
ac 962
<---
Claims (51)
1. Способ получения высокоэнергетического метаболита, включающий приведение источника углерода в контакт с выделенным штаммом Fusarium MK7 (ATCC номер депонирования PTA-10698) с образованием смеси, инкубирование указанной смеси при pH около 2,5 в течение необходимого периода времени в аэробных условиях и получение высокоэнергетического метаболита в результате такого контакта, где высокоэнергетический метаболит представляет собой общую липидную фракцию, содержащую по меньшей мере 95% C16:0, C18:0, C18:1 и C18:1-3 триацилглицеридов.
2. Способ по п. 1, где источник углерода представляет собой продукт, происходящий из целлюлозной биомассы.
3. Способ по п. 1, где источник углерода представляет собой лигноцеллюлозное сырье или лигноцеллюлозные отходы.
4. Способ по п. 1, где источник углерода представляет собой углевод.
5. Способ по п. 4, где углевод выбран из группы, состоящей из глюкозы, декстрозы, мальтозы, сахарозы, моносахаридов, полисахаридов, олигосахаридов и крахмала.
6. Способ по п. 1, где штамм Fusarium и источник углерода инкубируют в микроаэробных условиях.
7. Способ по п. 1, где примерно 44% от общего содержания липидов составляет олеиновая кислота (18:1).
8. Способ по п. 1, где дополнительно примерно 46% от общего содержания липидов высокоэнергетического метаболита составляют пальмитиновая (16:0) и стеариновая (18:0) кислоты.
9. Способ по п. 1, где C16:0 триглицерид содержит по меньшей мере метиловый эфир гексадекановой кислоты.
10. Способ по п. 1, где C16:0 триглицерид содержит примерно 29% пальмитиновой кислоты.
11. Способ по п. 1, где общая липидная фракция дополнительно содержит примерно 50% C18:1-3 триглицеридов.
12. Способ по п. 11, где C18:1-3 триглицериды содержат комбинацию олеиновой кислоты, линолевой кислоты, конъюгированных линолевых кислот и линоленовой кислоты.
13. Способ по п. 1, где высокоэнергетический метаболит дополнительно содержит по меньшей мере один метиловый эфир жирной кислоты, выбранный из группы, состоящей из метилтетрадеканоата; метилгексадец-9-еноата; метилового эфира гексадекановой кислоты; олеиновой кислоты; линолевой кислоты; конъюгированных линолевых кислот; линоленовой кислоты; метил-11-октадеценоата; метилового эфира октадекановой кислоты; метилового эфира эйкозановой кислоты; метилового эфира докозановой кислоты и метилового эфира тетракозановой кислоты.
14. Способ по п. 13, где высокоэнергетический метаболит дополнительно содержит по меньшей мере одну жирную кислоту, выбранную из группы, состоящей из метилтетрадеканоата; метилового эфира эйкозановой кислоты; метилового эфира докозановой кислоты и метилового эфира тетракозановой кислоты.
15. Способ по п. 1, дополнительно включающий экстрагирование липидов из высокоэнергетического метаболита.
16. Способ по п. 1, где время инкубирования составляет примерно 10 суток, и общий выход экстрагированных липидов в граммах составляет примерно 12% от исходной массы источника углерода в граммах.
17. Способ по п. 1, где общий выход экстрагированных липидов в граммах составляет примерно 5% от исходной массы источника углерода в граммах.
18. Способ по п. 1, где полученная общая липидная фракция составляет примерно 0,05 г/г сырья.
19. Способ получения одного или более высокоэнергетических метаболитов, представляющих собой спирты, включающий стадии:
а) получения смеси путем приведения в контакт выделенного штамма Fusarium MK7 (ATCC номер депонирования PTA-10698) с исходным сырьем, выбранным из группы, состоящей из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углевода и их комбинации, причем указанное исходное сырье может поддерживать рост указанного штамма Fusarium MK7;
б) инкубирование указанной смеси при pH от 2,5 до 4,5 в течение необходимого периода времени в анаэробных условиях;
в) получение из указанной смеси одного или более высокоэнергетических метаболитов после указанного приведения в контакт; и
г) возможно, выделение указанных одного или более высокоэнергетических метаболитов из смеси.
20. Способ получения высокоэнергетического метаболита, представляющего собой газообразный водород, включающий стадии:
а) получения смеси путем приведения в контакт выделенного штамма Fusarium MK7 (ATCC номер депонирования PTA-10698) с исходным сырьем, выбранным из группы, состоящей из лигноцеллюлозного сырья, углеродсодержащих отходов, углевода, отличного от глюкозы, и их комбинации, причем указанное исходное сырье может поддерживать рост указанного штамма Fusarium MK7;
б) инкубирование указанной смеси при pH от 3 до 4,5 в течение необходимого периода времени в анаэробных условиях;
в) получение из указанной смеси указанного высокоэнергетического метаболита после указанного приведения в контакт; и
г) возможно, выделение указанного высокоэнергетического метаболита из смеси.
21. Способ по п. 19 или 20, где лигноцеллюлозное сырье представляет собой пшеничную солому.
22. Способ по п. 19, где рН составляет от 3 до 4,5.
23. Способ по п. 19, где высокоэнергетический метаболит представляет собой биотопливо.
24. Способ по п. 19 или 20, где углеродсодержащие отходы представляют собой муниципальные, промышленные и/или сельскохозяйственные сточные отходы.
25. Способ по п. 19, где углевод представляет собой глюкозу.
26. Выделенный штамм Fusarium МК7, продуцирующий высокоэнергетический метаболит, представляющий собой липид, этанол и/или водород, который был депонирован как ATCC депозит номер PTA-10698.
27. Способ культивирования штамма Fusarium, включающий:
а) культивирование биологически чистой культуры штамма Fusarium MK7, который был депонирован как ATCC депозит номер PTA-10698, в жидкой культуральной среде, содержащей источник углерода и имеющей рН от 2,0 до 5,5, с получением штамма Fusarium MK7 в форме, содержащей гифы штамма Fusarium MK7,
и
б) сбор штамма Fusarium MK7.
28. Способ по п. 27, где жидкая культуральная среда дополнительно содержит источник аминокислот.
29. Способ по п. 27, где стадия культивирования включает культивирование выделенной культуры штамма Fusarium MK7, который был депонирован как ATCC депозит номер PTA-10698, в жидкой культуральной среде, имеющей рН от примерно 2,0 до 4,0.
30. Способ по п. 27, где стадия культивирования включает культивирование выделенной культуры штамма Fusarium MK7, который был депонирован как ATCC депозит номер PTA-10698, в жидкой культуральной среде, имеющей рН от примерно 2,0 до 3,0.
31. Способ по п. 27, где источник углерода выбран из группы, состоящей из гидролизатов биомассы, углеводов, целлюлозы, гемицеллюлозы, ксилозы, лигнина, пектина, мономерных компонентов этих субстратов и их смесей.
32. Способ по п. 27, где источник углерода выбран из группы, состоящей из гидролизата целлюлозной биомассы.
33. Способ по п. 27, где стадия культивирования включает процесс периодической ферментации.
34. Способ по п. 33, где процесс периодической ферментации включает засевание реактора, содержащего субстрат, штаммом Fusarium MK7, который был депонирован как ATCC депозит номер PTA-10698.
35. Способ по п. 34, где жидкая культуральная среда в процессе периодического культивирования находится в микроаэробных условиях.
36. Способ по п. 27, где стадия культивирования включает непрерывный ферментационный процесс.
37. Композиция для продуцирования высокоэнергетического метаболита, представляющего собой липид, этанол и/или водород, содержащая выделенный штамм Fusarium по п. 26 и компонент, выбранный из группы, состоящей из среды, которая поддерживает рост выделенного штамма Fusarium, подкисляющего вещества, источника марганца, питательной добавки и их комбинации.
38. Композиция по п. 37, где подкисляющее вещество выбрано из группы, состоящей из галогеноводородов и их растворов, галоидных оксокислот, серной кислоты, фторсульфоновой кислоты, азотной кислоты, фосфорной кислоты, фторсурьмяной кислоты, фторборной кислоты, гексафторфосфорной кислоты, хромовой кислоты, сульфоновых кислот, метансульфоновой кислоты, этансульфоновой кислоты, бензолсульфокислоты, пара-толуолсульфокислоты, трифторметансульфокислоты, карбоновых кислот, винилогических карбоновых кислот и кислых солей.
39. Композиция по п. 37, где питательная добавка выбрана из группы, состоящей из углеводов, источника аминокислот, микронутриентов и их комбинации.
40. Композиция по любому из пп. 37-39, где выделенный штамм Fusarium находится в форме конидий, пикнид, хламидоспор, гиф или их комбинации.
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201462020607P | 2014-07-03 | 2014-07-03 | |
US62/020,607 | 2014-07-03 | ||
US201462061076P | 2014-10-07 | 2014-10-07 | |
US62/061,076 | 2014-10-07 | ||
PCT/US2015/039100 WO2016004380A2 (en) | 2014-07-03 | 2015-07-02 | Acidophilic fusarium oxysporum strains, methods of their production and methods of their use |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2017103673A RU2017103673A (ru) | 2018-08-06 |
RU2742437C2 true RU2742437C2 (ru) | 2021-02-05 |
Family
ID=55016596
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2017103673A RU2742437C2 (ru) | 2014-07-03 | 2015-07-02 | Ацидофильные штаммы Fusarium oxysporum, способы их получения и способы их применения |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US9796989B2 (ru) |
EP (3) | EP3712248A1 (ru) |
CN (2) | CN110835606B (ru) |
AP (1) | AP2017009715A0 (ru) |
AU (2) | AU2015283922B2 (ru) |
RU (1) | RU2742437C2 (ru) |
WO (1) | WO2016004380A2 (ru) |
ZA (1) | ZA201700888B (ru) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2788705C1 (ru) * | 2022-02-28 | 2023-01-24 | Андрей Аркадьевич Варич | Способ получения гербицида из продуктов жизнедеятельности fusarium oxysporum, streptomyces hygroscopicus и молочнокислых бактерий |
Families Citing this family (27)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9485917B2 (en) | 2006-12-15 | 2016-11-08 | Ecovative Design, LLC | Method for producing grown materials and products made thereby |
US11277979B2 (en) | 2013-07-31 | 2022-03-22 | Ecovative Design Llc | Mycological biopolymers grown in void space tooling |
US20150101509A1 (en) | 2013-10-14 | 2015-04-16 | Gavin R. McIntyre | Method of Manufacturing a Stiff Engineered Composite |
EP3712248A1 (en) | 2014-07-03 | 2020-09-23 | The Fynder Group, Inc. | Acidophilic fusarium oxysporum strain, methods of its growth and methods of its use |
AU2017227612C1 (en) * | 2016-03-01 | 2023-02-16 | The Fynder Group, Inc. | Filamentous fungal biomats, methods of their production and methods of their use |
WO2018183735A1 (en) | 2017-03-31 | 2018-10-04 | Ecovative Design, Llc. | Solution based post-processing methods for mycological biopolymer material and mycological product made thereby |
CA3071422C (en) | 2017-07-28 | 2022-05-10 | Coors Brewing Company | Protein extraction from spent grains |
US11464251B2 (en) | 2017-08-30 | 2022-10-11 | The Fynder Group, Inc. | Edible foodstuffs and bio reactor design |
US11266085B2 (en) | 2017-11-14 | 2022-03-08 | Ecovative Design Llc | Increased homogeneity of mycological biopolymer grown into void space |
US11920126B2 (en) | 2018-03-28 | 2024-03-05 | Ecovative Design Llc | Bio-manufacturing process |
EP3781697A1 (en) * | 2018-04-20 | 2021-02-24 | Renescience A/S | Method for determining chemical compounds in waste |
US11293005B2 (en) | 2018-05-07 | 2022-04-05 | Ecovative Design Llc | Process for making mineralized mycelium scaffolding and product made thereby |
US20190359931A1 (en) | 2018-05-24 | 2019-11-28 | Ecovative Design Llc | Process and Apparatus for Producing Mycelium Biomaterial |
CN110029067A (zh) * | 2018-08-30 | 2019-07-19 | 长沙环境保护职业技术学院 | 一种尖孢镰刀菌及其在修复邻苯二甲酸酯类化合物污染土壤中的应用 |
US11359174B2 (en) | 2018-10-02 | 2022-06-14 | Ecovative Design Llc | Bioreactor paradigm for the production of secondary extra-particle hyphal matrices |
CN109402152B (zh) * | 2018-11-09 | 2021-08-13 | 沈阳农业大学 | 一种表达制备udp-葡萄糖-4-差向异构酶的方法 |
JP7132101B2 (ja) * | 2018-11-21 | 2022-09-06 | 花王株式会社 | 脂質の製造方法 |
JP2022521993A (ja) | 2019-02-27 | 2022-04-13 | ザ・フィンダー・グループ・インコーポレイテッド | 糸状菌粒子を含む食材および膜バイオリアクター設計 |
CN110229776A (zh) * | 2019-04-08 | 2019-09-13 | 济南微生慧生物技术有限公司 | 一种高产热噬地芽胞杆菌芽胞的培养方法 |
KR20220024666A (ko) | 2019-06-18 | 2022-03-03 | 더 파인더 그룹, 인크. | 진균 직물 재료 및 가죽 유사체 |
US11149247B2 (en) * | 2019-12-10 | 2021-10-19 | The Fynder Group, Inc. | Methods for culturing filamentous fungi in fermentation media |
CN111334435A (zh) * | 2020-01-22 | 2020-06-26 | 华南师范大学 | 一种具有生物诱导成矿作用的嗜酸真菌的分离与鉴定方法 |
WO2021226094A1 (en) * | 2020-05-06 | 2021-11-11 | Ramot At Tel-Aviv University Ltd. | Process for conversion of cellulose recycling or waste material to ethanol, nanocellulose and biosorbent material |
CN112359049B (zh) * | 2020-12-10 | 2022-01-28 | 昆明理工大学 | 一种岷江百合几丁质酶基因LrCHI2及其应用 |
CN114276938B (zh) * | 2022-01-10 | 2023-09-05 | 广西壮族自治区药用植物园 | 拟青霉属ejks菌株、镰刀菌属e-9菌株及其应用 |
CN114410485B (zh) * | 2022-02-18 | 2023-06-23 | 中国科学院昆明植物研究所 | 一种降解土壤中聚氨酯的真菌菌株及其应用 |
GB202208600D0 (en) * | 2022-05-31 | 2022-07-27 | Cemvita Factory Inc | Compositions |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SU1613492A1 (ru) * | 1988-06-27 | 1990-12-15 | Сектор Микробиологии Ан Азсср | Способ получени липидов |
US5258293A (en) * | 1991-05-03 | 1993-11-02 | Trustees Of Dartmouth College | Continuous process for ethanol production from lignocellulosic materials without mechanical agitation |
Family Cites Families (93)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA751389A (en) | 1967-01-24 | Loeffler Wolfgang | Antibiotics and their production | |
US1034430A (en) | 1912-02-24 | 1912-08-06 | Thomas Augustus Dring | Flying-machine. |
US2450055A (en) | 1945-01-06 | 1948-09-28 | Friedrich F Nord | Food composition containing fusaria |
US2822319A (en) | 1954-08-17 | 1958-02-04 | Monod Jacques | Methods for the cultivation of micro-organisms |
US3149051A (en) | 1961-08-30 | 1964-09-15 | Noda Inst For Scientific Res | Method of producing a proteolytic enzyme by use of black aspergillus type molds |
US3151038A (en) | 1962-08-24 | 1964-09-29 | Univ Ohio State Res Found | Process for the production of fungal protein |
US3937654A (en) | 1970-05-14 | 1976-02-10 | Ranks Hovis Mcdougall Limited | Production of edible protein substances |
US4466988A (en) | 1973-02-13 | 1984-08-21 | Ranks Hovis Mcdougall Limited | Edible protein containing substances |
GB1440642A (en) | 1973-09-24 | 1976-06-23 | Ranks Hovis Mcdougall Ltd | Production of edible protein containing substances |
GB1408845A (en) | 1973-02-13 | 1975-10-08 | Ranks Hovis Mcdougall Ltd | Production of edible protein containing substances |
EP0006671B1 (de) | 1978-07-03 | 1982-09-15 | Firma Dr.Ing. Hans Müller | Verfahren zur Erhaltung lebender Mikroorganismen |
US4530834A (en) | 1982-09-17 | 1985-07-23 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Preparation of an entomopathogenic fungal insect control agent |
AT381927B (de) | 1983-02-24 | 1986-12-10 | Biochemie Gmbh | Verfahren zur rekultivierung von mit pflanzen unbewachsenen boeden durch kombinierte anwendung eines duengers aus pilzbiomasse und eines polybutadienoel-erosionsschutzmittels |
GB8308162D0 (en) | 1983-03-24 | 1983-05-05 | Ranks Hovis Mcdougall Plc | Edible protein containing substances |
US4800093A (en) | 1986-02-18 | 1989-01-24 | Ralston Purina Company | High moisture animal food product containing a filamentous fungal biomass |
CN1059662A (zh) | 1990-09-10 | 1992-03-25 | 黄山秀 | 保健营养品的制备方法 |
GB9403930D0 (en) | 1994-03-01 | 1994-04-20 | Zeneca Ltd | Production of food |
GB9500579D0 (en) | 1995-01-12 | 1995-03-01 | Zeneca Ltd | Texturised foodstuffs |
WO1998051786A1 (en) | 1997-05-13 | 1998-11-19 | Advanced Biological Services, Inc. | Reaction sites for microorganisms used to biodegrade contaminants and methods of use |
US5854056A (en) | 1997-11-28 | 1998-12-29 | Dschida; William J. A. | Fungal cell wall production and utilization as a raw resource for textiles |
WO1999024555A2 (en) | 1997-11-10 | 1999-05-20 | Dschida William J A | Fungal cell wall production and utilization as a raw resource for textiles |
EP0986960A1 (en) | 1998-09-15 | 2000-03-22 | Dsm N.V. | Mucorales fungi for use in preparation of textured products for foodstuffs |
CA2396691C (en) * | 2000-01-28 | 2012-09-18 | Omegatech, Inc. | Enhanced production of lipids containing polyenoic fatty acids by high density cultures of eukaryotic microbes in fermentors |
EP1133926A1 (en) | 2000-03-17 | 2001-09-19 | Dsm N.V. | Foodstuffs containing mucorales fungi |
GB0110954D0 (en) | 2001-05-04 | 2001-06-27 | Marlow Foods Ltd | Edible fungi |
GB0110953D0 (en) | 2001-05-04 | 2001-06-27 | Marlow Foods Ltd | Edible fungi |
GB0110955D0 (en) | 2001-05-04 | 2001-06-27 | Marlow Foods Ltd | Dough |
WO2003012095A1 (en) | 2001-07-28 | 2003-02-13 | Midwest Research Institute | Thermal tolerant exoglucanase from acidothermus cellulolyticus |
US7364890B2 (en) | 2001-07-28 | 2008-04-29 | Midwest Research Institute | Thermal tolerant avicelase from Acidothermus cellulolyticus |
US7059993B2 (en) | 2001-07-28 | 2006-06-13 | Midwest Research Institute | Thermal tolerant cellulase from Acidothermus cellulolyticus |
US7393673B2 (en) | 2001-07-28 | 2008-07-01 | Midwest Research Institute | Thermal tolerant exoglucanase from Acidothermus cellulolyticus |
AU2001277220A1 (en) | 2001-07-28 | 2003-02-17 | Midwest Research Institute | Thermal tolerant avicelase from acidothermus cellulolyticus |
WO2003012109A1 (en) | 2001-07-28 | 2003-02-13 | Midwest Research Institute | Thermal tolerant cellulase from acidothermus cellulolyticus |
MXPA04005987A (es) | 2001-12-18 | 2005-03-31 | Jerrel Darel Branson | Sistema y metodo para extraer energia de desechos agricolas. |
US6979426B2 (en) | 2002-03-15 | 2005-12-27 | Biodiesel Industries | Biodiesel production unit |
AU2003276691A1 (en) | 2002-12-12 | 2004-06-30 | Department Of Biotechnology | The process of preparing a biopesticide formulation for use against coffee berry borer (cbb) |
US20050026262A1 (en) | 2003-07-30 | 2005-02-03 | Sonoenergy, Llc | Sonication-enhanced digestion process |
US7605281B2 (en) | 2003-08-29 | 2009-10-20 | Nippon Shokubai Co., Ltd. | Method of production of fatty acid alkyl esters and/or glycerine and fatty acid alkyl ester-containing composition |
US20070110862A9 (en) | 2003-09-24 | 2007-05-17 | Thorre Doug V | System and method for extracting materials from biomass |
US7043874B2 (en) | 2003-11-12 | 2006-05-16 | Carmel-Haifa University Economic Corp. Ltd. | Substrate and method for growing shiitake mushrooms [Lentinus edodes (Berk.) singer] and new shiitake strain |
US20070219141A1 (en) | 2003-12-08 | 2007-09-20 | David Jones | Plant Materials Extraction Method |
EP1612267A1 (en) | 2004-07-02 | 2006-01-04 | GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH | Cellulases from rumen |
US20060177551A1 (en) | 2005-01-06 | 2006-08-10 | Doug Van Thorre | System and method for extracting materials from biomass |
US20070161095A1 (en) | 2005-01-18 | 2007-07-12 | Gurin Michael H | Biomass Fuel Synthesis Methods for Increased Energy Efficiency |
EP1869173A4 (en) | 2005-03-08 | 2010-04-07 | Verenium Corp | HYDROLASES, NUCLEIC ACIDS FOR THEIR CODING AND METHOD FOR INCREASING THE THICKNESS OF PAPER |
AU2006242193A1 (en) | 2005-05-02 | 2006-11-09 | Purdue Research Foundation | Methods for increasing the yield of fermentable sugars from plant stover |
CA2611071A1 (en) | 2005-05-31 | 2007-05-18 | Verenium Corporation | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
BRPI0502891B1 (pt) | 2005-07-06 | 2015-11-24 | Fundação Regional Integrada | processo de produção de biodiesel sem catalisador em meio contínuo |
JP4638543B2 (ja) | 2005-09-30 | 2011-02-23 | コリア・インスティチュート・オブ・エネルギー・リサーチ | 内燃機関の排気ガス加熱装置 |
US20070099278A1 (en) | 2005-11-01 | 2007-05-03 | Aare Palaniswamy R | Production of biodiesel from combination of corn (maize) and other feed stocks |
US20070122667A1 (en) | 2005-11-28 | 2007-05-31 | Kelley Richard H | Fuel cell system with integrated fuel processor |
ES2278533B1 (es) | 2006-01-20 | 2008-07-01 | Biodiesel De Andalucia 2004, S.A. | Procedimiento para la obtencion de un biodiesel a partir de aceites vegetales de grado de acidez variable en sistema continuo y combustible biodiesel obtenido. |
US7420072B2 (en) | 2006-05-05 | 2008-09-02 | Orbitek, Inc. | Apparatus and method for producing biodiesel fuel |
KR100762848B1 (ko) | 2006-05-25 | 2007-10-04 | 씨제이 주식회사 | 균류 단백질의 제조방법, 이에 의해 제조된 균류 단백질,이 균류 단백질을 포함하는 저칼로리의 인조육 및 천연육고기향 향미제 |
EP1865048A1 (en) * | 2006-06-09 | 2007-12-12 | Cognis IP Management GmbH | Process for the production of fatty acid alkyl esters by integrating fermentation and esterification |
US7897154B2 (en) | 2006-08-10 | 2011-03-01 | Abr, Llc | Dermal drops |
NZ578233A (en) | 2007-01-08 | 2012-03-30 | Ouro Fino Participacooes E Empreendimentos S A | Process to produce biomass and proteins by microalgae by providing a medium including vinasse and additional carbon dioxide |
US7998225B2 (en) | 2007-02-22 | 2011-08-16 | Powell Scott W | Methods of purifying biodiesel fuels |
CN101636500B (zh) | 2007-03-08 | 2013-08-28 | 阿德库端木营养控股有限责任公司 | 柠檬酸生产 |
US20080282606A1 (en) | 2007-04-16 | 2008-11-20 | Plaza John P | System and process for producing biodiesel |
NZ578234A (en) | 2007-05-02 | 2012-12-21 | Ouro Fino Participacoes E Empreendimentos S A | Process to produce biodiesel and/or fuel oil |
US7923227B2 (en) | 2007-06-08 | 2011-04-12 | Coskata, Inc. | Method of conversion of syngas using microorganism on hydrophilic membrane |
BRPI0702541A2 (pt) | 2007-06-21 | 2009-02-10 | Petroleo Brasileiro Sa | processo de craqueamento catalÍtico para produÇço de diesel a partir de sementes de oleaginosas |
US8058484B2 (en) | 2007-08-24 | 2011-11-15 | Syntroleum Corporation | Flexible glycerol conversion process |
US7514247B2 (en) | 2007-11-03 | 2009-04-07 | Wise Landfill Recycling Mining, Inc. | Systems and processes for cellulosic ethanol production |
US7449313B2 (en) | 2007-11-03 | 2008-11-11 | Rush Stephen L | Systems and processes for cellulosic ethanol production |
US7452515B1 (en) | 2007-11-06 | 2008-11-18 | Biofuels Allied, Inc. | System for creating a biofuel |
WO2009064910A2 (en) * | 2007-11-13 | 2009-05-22 | Synthetic Genomics, Inc. | Dimethyloctane as an advanced biofuel |
WO2010042842A2 (en) | 2008-10-09 | 2010-04-15 | Eudes De Crecy | A method of producing fatty acids for biofuel, biodiesel, and other valuable chemicals |
US9057080B1 (en) | 2008-11-05 | 2015-06-16 | The United States Of America, As Represented By The Secretary Of Agriculture | Biosynthesis of styrene and 7-methyl-1,3,5-cyclooctatriene |
CN101942392A (zh) * | 2009-03-06 | 2011-01-12 | 青海大学 | 一种新的镰孢菌及其在降解植物细胞壁中的应用 |
JP5892725B2 (ja) | 2009-11-26 | 2016-03-23 | 株式会社ロム | アラキドン酸リン脂質含有量の高い菌糸体の製造方法 |
BR112012016635B1 (pt) * | 2010-01-20 | 2019-04-02 | Xyleco, Inc. | Método e sistema para sacarificação e fermentação de uma matéria-prima de biomassa aplicando mistura a jato |
WO2011140520A2 (en) | 2010-05-07 | 2011-11-10 | Menon & Associates | Bioreactors comprising fungal strains |
US8227233B2 (en) | 2010-06-09 | 2012-07-24 | Ford Global Technologies, Llc | Method of making foamed mycelium structure |
US8227225B2 (en) | 2010-06-09 | 2012-07-24 | Ford Global Technologies, Llc | Plasticized mycelium composite and method |
US8298809B2 (en) | 2010-06-09 | 2012-10-30 | Ford Global Technologies, Llc | Method of making a hardened elongate structure from mycelium |
US20110306107A1 (en) | 2010-06-09 | 2011-12-15 | Raymond Edward Kalisz | Hardened mycelium structure and method |
US20110266831A1 (en) | 2010-06-09 | 2011-11-03 | Raymond Edward Kalisz | Cut sheet stock mycelium and method |
US8697404B2 (en) * | 2010-06-18 | 2014-04-15 | Butamax Advanced Biofuels Llc | Enzymatic production of alcohol esters for recovery of diols produced by fermentation |
NZ604846A (en) * | 2010-07-19 | 2014-11-28 | Xyleco Inc | Processing biomass |
IT1401776B1 (it) | 2010-08-05 | 2013-08-02 | Mr Bio Food S R L | Prodotto alimentare comprendente un ingrediente di base comprendente semi di cereali |
CN102154126B (zh) * | 2010-11-19 | 2012-12-05 | 广西大学 | 一种菌株与利用该菌株生产甘露醇的方法 |
CN107821795B (zh) | 2011-12-02 | 2021-12-21 | 普莱瑞阿夸泰克公司 | 用于高质量蛋白质浓缩物的基于微生物的方法 |
BR112016002818A2 (pt) | 2013-08-06 | 2017-08-01 | Prairie Aquatech | métodos de produção de concentrado de proteína não baseado em animais; concentrados de proteína; composições; e método de produção de um ácido graxo poli-insaturado |
KR101569282B1 (ko) | 2014-06-23 | 2015-11-13 | 안동대학교 산학협력단 | 송이버섯 균사체 배양 방법 및 이에 의한 송이버섯 균사체 매트 |
EP3712248A1 (en) | 2014-07-03 | 2020-09-23 | The Fynder Group, Inc. | Acidophilic fusarium oxysporum strain, methods of its growth and methods of its use |
WO2016049198A1 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | Abbott Laboratories | Nutritional compositions containing dairy proteins in combination with alternative protein sources |
GB201418739D0 (en) | 2014-10-22 | 2014-12-03 | Univ Strathclyde | Bioprocess for corproduction of products |
CN104480026B (zh) | 2014-12-25 | 2017-11-03 | 赵晶晶 | 一种用于提取木耳多糖的木耳菌丝体的生产方法 |
AU2017227612C1 (en) | 2016-03-01 | 2023-02-16 | The Fynder Group, Inc. | Filamentous fungal biomats, methods of their production and methods of their use |
GB2551738B (en) | 2016-06-28 | 2018-11-14 | Marlow Foods Ltd | Foodstuff comprising filamentous fungus and agar |
US11464251B2 (en) | 2017-08-30 | 2022-10-11 | The Fynder Group, Inc. | Edible foodstuffs and bio reactor design |
-
2015
- 2015-07-02 EP EP20170818.7A patent/EP3712248A1/en not_active Ceased
- 2015-07-02 US US14/790,948 patent/US9796989B2/en active Active
- 2015-07-02 CN CN201911029514.9A patent/CN110835606B/zh active Active
- 2015-07-02 CN CN201580047655.7A patent/CN107075532B/zh active Active
- 2015-07-02 WO PCT/US2015/039100 patent/WO2016004380A2/en active Application Filing
- 2015-07-02 EP EP23214615.9A patent/EP4361281A2/en active Pending
- 2015-07-02 AP AP2017009715A patent/AP2017009715A0/en unknown
- 2015-07-02 EP EP15814238.0A patent/EP3164498A4/en not_active Withdrawn
- 2015-07-02 RU RU2017103673A patent/RU2742437C2/ru active
- 2015-07-02 AU AU2015283922A patent/AU2015283922B2/en active Active
-
2017
- 2017-02-03 ZA ZA2017/00888A patent/ZA201700888B/en unknown
- 2017-10-23 US US15/791,089 patent/US10344306B2/en active Active
-
2019
- 2019-03-06 AU AU2019201553A patent/AU2019201553B2/en active Active
- 2019-05-22 US US16/419,986 patent/US20190330667A1/en not_active Abandoned
- 2019-06-14 US US16/442,174 patent/US10851396B2/en active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SU1613492A1 (ru) * | 1988-06-27 | 1990-12-15 | Сектор Микробиологии Ан Азсср | Способ получени липидов |
US5258293A (en) * | 1991-05-03 | 1993-11-02 | Trustees Of Dartmouth College | Continuous process for ethanol production from lignocellulosic materials without mechanical agitation |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
MORAN M. ET AL: "Biofuel Production Using an Acidophilic Fungus", MSU STUDENT RESEARCH CELEBRATION 2012, 05 March 2013 (2013-03-05), Abstract Only. Найдено онлайн: http://scholarworks.montana.edu/xmlui/handle/1/500 (дата обращения 15.02.2019). * |
NAIM N. ET AL. Production of Lipids and Sterols by Fusarium oxysporum (Schlecht). Utilization of Some Agro-Industrial By-products as Additives and Basal Medium. Agricultural Wastes, 14(1985), pp. 207-220. * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2788705C1 (ru) * | 2022-02-28 | 2023-01-24 | Андрей Аркадьевич Варич | Способ получения гербицида из продуктов жизнедеятельности fusarium oxysporum, streptomyces hygroscopicus и молочнокислых бактерий |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
ZA201700888B (en) | 2022-07-27 |
AU2015283922A1 (en) | 2017-03-02 |
US20180100171A1 (en) | 2018-04-12 |
US10851396B2 (en) | 2020-12-01 |
EP4361281A2 (en) | 2024-05-01 |
CN107075532A (zh) | 2017-08-18 |
WO2016004380A3 (en) | 2016-03-17 |
AU2019201553B2 (en) | 2020-10-15 |
US10344306B2 (en) | 2019-07-09 |
CN110835606A (zh) | 2020-02-25 |
US9796989B2 (en) | 2017-10-24 |
AP2017009715A0 (en) | 2017-02-28 |
AU2019201553A1 (en) | 2019-03-28 |
US20190330668A1 (en) | 2019-10-31 |
CN110835606B (zh) | 2020-12-22 |
EP3164498A2 (en) | 2017-05-10 |
EP3164498A4 (en) | 2018-02-14 |
RU2017103673A (ru) | 2018-08-06 |
WO2016004380A2 (en) | 2016-01-07 |
AU2015283922B2 (en) | 2018-12-13 |
CN107075532B (zh) | 2021-07-13 |
EP3712248A1 (en) | 2020-09-23 |
US20160002680A1 (en) | 2016-01-07 |
US20190330667A1 (en) | 2019-10-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US10851396B2 (en) | Acidophilic fusarium oxysporum strains, methods of their production and methods of their use | |
US11261420B2 (en) | Filamentous fungal biomats, methods of their production and methods of their use |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant |