RU2670278C1 - Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища - Google Patents

Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища Download PDF

Info

Publication number
RU2670278C1
RU2670278C1 RU2017145853A RU2017145853A RU2670278C1 RU 2670278 C1 RU2670278 C1 RU 2670278C1 RU 2017145853 A RU2017145853 A RU 2017145853A RU 2017145853 A RU2017145853 A RU 2017145853A RU 2670278 C1 RU2670278 C1 RU 2670278C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
spp
dna
vagina
enterobacteria
Prior art date
Application number
RU2017145853A
Other languages
English (en)
Inventor
Андрей Сергеевич Коновалов
Леонид Максимович Дьяков
Original Assignee
ООО "НекстБио"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ООО "НекстБио" filed Critical ООО "НекстБио"
Priority to RU2017145853A priority Critical patent/RU2670278C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2670278C1 publication Critical patent/RU2670278C1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/26Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
    • C12P19/28N-glycosides
    • C12P19/30Nucleotides
    • C12P19/34Polynucleotides, e.g. nucleic acids, oligoribonucleotides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804Nucleic acid analysis using immunogens
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56911Bacteria
    • G01N33/56916Enterobacteria, e.g. shigella, salmonella, klebsiella, serratia
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G01N33/582Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области лабораторной диагностики, молекулярной биологии и эпидемиологии. Предложен набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., стафилококков Staphylococcus spp. и стрептококков Streptococcus spp. в слизистой оболочке влагалища методом полимеразной цепной реакции, включающий праймеры и зонды с флуоресцентной меткой. Изобретение обеспечивает расширение арсенала средств количественного определения ДНК возбудителей аэробного вагинита в слизистой оболочке влагалища. 3 пр.

Description

Изобретение относится к области лабораторной диагностики, молекулярной биологии и эпидемиологии, и касается синтетических олигонуклеотидов для выявления ДНК энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.). Изобретение предназначено для исследования биологического материала человека, полученного от лиц с подозрением на наличие аэробный вагинит вне зависимости от формы и наличия манифестации заболевания с целью выявления ДНК энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.). Олигонуклеотиды могут быть использованы для создания набора реагентов для выявления ДНК возбудителей анаэробного вагинита методом полимеразной цепной реакции. Изобретение позволяет проводить обнаружение указанных микроорганизмов в биологическом материале с высокой точностью.
Из уровня техники известен способ проведения количественной ПЦР в режиме реального времени. Также описаны наборы специфических праймеров для ПЦР. При описании способа заявитель приводит наиболее оптимальные параметры для ПЦР [Заявка WO 02/070751 А1, (University Of Pittsburg Of The Commonwealth System Of Higher Education, US), опубл. 12.09.2002 г.].
Также из уровня техники известны критерии оценки состояния вагинального микробиоценоза и факторы, способствующие его нарушению. Оценены преимущества и недостатки рутинных методов лабораторной диагностики неспецифических вульвовагинитов [М.Р. Рахматулина и соавт., 2009, Вестник дерматологии и венерологии, 2009; 3: 38-42 «Современные представления о микробиоценозе вагинального биотопа и его нарушениях у женщин репродуктивного возраста»]. Освещены современные проблемы терапии неспецифических вульвовагинитов, в частности, рост резистентности условно-патогенных микроорганизмов к применяемым препаратам.
Также известны данные о нарушения микроценоза влагалища с преобладанием аэробного компонента [Ю.В. Ширева, Е.А. Сандакова, Т.И. Карпунина, 2010, Медицинский альманах, ноябрь 2010; №4(13): 164-168 «Неспецифический аэробный вагинит - «новое» или «старое» заболевание? (обзор)»]. Особое внимание обращается на роль условно-патогенных аэробных бактерий в развитии перинатальных инфекционных осложнений.
Техническим результатом, на достижение которого направлено предлагаемое изобретение, является расширение арсенала средств выявления ДНК возбудителей аэробного вагинита (энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp.; стафилококков Staphylococcus spp. и стрептококков Streptococcus spp.) в биологическом материале (отделяемое слизистой оболочки влагалища).
Указанный результат достигается путем использования при постановке ПЦР набора синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК в слизистой оболочке влагалища возбудителей аэробного вагинита (энтеробактерий (семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp.), стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.)) в области амплификации - gene 16S rRNA, включающие в себя праймеры следующих последовательностей Seq. N1 - Seq. N8, также используются зонды с флуоресцентной меткой, интенсивность флуоресценции которых свидетельствует о количестве образующегося продукта, Seq. N9 - Seq. N12:
CTGGACGAAGACTGACGCTC Seq. N1
GTTTACGGCGTGGACTACCA Seq. N2
GGACAATACAAAGGGCAGCG Seq. N3
CCGGGAACGTATTCACCGTA Seq. N4
CCCCTTATGACCTGGGCTAC Seq. N5
GAGATTTGCTTGCCGTCACC Seq. N6
CGTCTGCGGATGGAGAGTGCAA Seq. N7
GAAGTCCGTCAATAGGCCCACAC Seq. N8
GTGCGAAAGCGTGGGGAGCA Seq. N9
CCGCGAGGTCAAGCAAATCCCA Seq. N10
TGGTTGGTACAACGAGTCGCAAGT Seq. N11
CTAGCTGGGCGTCAGGAATCCCAGG Seq. N12
Существенным отличием работы с данными праймерами является:
1) Высокая специфичность и чувствительность праймеров в области gene 16S рибосомальной РНК позволяет выявить ДНК (энтеробактерий (семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp.), стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.)), в биологическом материале при низкой концентрации возбудителя.
2) Для снижения вероятности образования неспецифических продуктов реакции использовали праймеры с высокой температурой отжига.
3) Использование данных праймеров для ПЦР совместимо с образцами ДНК, выделенных с применением коммерческих наборов, таких как «АмплиПрайм® ДНК-сорб-АМ», «МагноПрайм Юни» и «МагноПрайм Фаст» (ООО «НекстБио» Россия).
Указанный набор синтетических олигонуклеотидов может являться составной частью многосоставных реакционных смесей, реакционных смесей раскапаных под прослойку парафина и лиофильновысушенных реакционных смесей.
Указанный набор синтетических олигонуклеотидов является составной частью набора следующих веществ:
1. ПЦР-смесь, включающая в состав указанные праймеры и зонды, специфические к участку ДНК энтеробактерий (семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp.), стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.), смесь дезоксинуклеозидтрифосфатов (дНТФ).
2. ПЦР-буфер.
3. Набор контрольных образцов (положительный кнтрольный образец и отрицательный контрольный образец):
3.1. Положительный контрольный образец (ПК) - смесь бактериофагов λ и плазмид со вставками специфических последовательностей. Положительный контрольный образец вносится в отдельную пробирку с реакционной смесью. Результат амплификации ПК демонстрирует эталонное положительное прохождение реакции, с которым сравниваются результаты амплификации исследуемых образцов.
3.2. Отрицательный контрольный образец - образец, который вводится в эксперимент для контроля возможного загрязнения реактивов продуктами ранее проведенных реакций. Отрицательный контрольный образец вносится в отдельную пробирку с реакционной смесью. Положительный результат в этом образце свидетельствует о необходимости заменить реагенты и переставить эксперимент.
Пример 1. Определение наличия ДНК энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.) в биологическом образце с помощью набора синтетических олигонуклеотидов в составе многосоставной реакционной смеси.
Биологический материал (отделяемое слизистой оболочки влагалища) перед проведением ПЦР с помощью предлагаемого набора реагентов проводится через процедуру пробоподготовки с использованием набора реагентов для пробоподготовки, который не является предметом данного патента. В ходе этой процедуры из биологического материала выделяется ДНК, которые, в свою очередь, используют для проведения ПЦР. Вместе с образцами биологического материала процедуру экстракции проходят контрольные образцы - отрицательный контроль и положительный контроль.
Предварительно готовиться реакционная смесь путем смешивания ПЦР-смеси, содержащей специфические синтетические олигонуклеотидные праймеры и зонды, и ПЦР-буфера в объемах, необходимых для исследования образцов биологического материала и контрольных образцов (отрицательный и положительный контроли).
В предварительно подготовленные маркированные пробирки вносится приготовленная реакционная смесь.
В пробирки с реакционной смесью, промаркированные для образцов биологического материала, вносятся пробы ДНК, полученные на этапе экстракции.
В специально промаркированную пробирку вносятся пробы ДНК, полученные на этапе экстракции из отрицательного контроля.
В специально промаркированную пробирку вносятся пробы ДНК, полученные на этапе экстракции из положительного контроля.
Установить пробирки в ячейки реакционного модуля прибора, провести амплификацию и выполнить анализ результатов.
Предложенный набор синтетических олигонуклеотидов позволяет определять наличие возбудителей аэробного вагинита с высокой точностью.
Пример 2. Определение наличия ДНК энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.) в биологическом образце с помощью набора синтетических олигонуклеотидов в составе реакционной смеси раскапаной под прослойку парафина.
Биологический материал (отделяемое слизистой оболочки влагалища) перед проведением ПЦР проводится через процедуру пробоподготовки с использованием набора реагентов для пробоподготовки. В ходе этой процедуры из биологического материала выделяется ДНК, которую, в свою очередь, используют для проведения ПЦР. Вместе с образцами биологического материала процедуру экстракции проходят контрольные образцы - отрицательный контроль и положительный контроль.
Отобрать необходимое количество пробирок с ПЦР-смесью для амплификации ДНК исследуемых и контрольных образцов. Убедиться, что парафин полностью покрывает раствор на дне пробирок.
На поверхность парафина внести буферный раствор с полимеразой, при этом он не должен проваливаться под парафин и смешиваться с ПЦР-смесью.
Внести в подготовленные маркированные пробирки пробы ДНК, полученные в результате экстракции из исследуемых образцов. В специально промаркированную пробирку вносится проба ДНК, полученная на этапе экстракции из отрицательного контроля.
В специально промаркированную пробирку вносится проба ДНК, полученная на этапе экстракции из положительного контроля.
Установить пробирки в ячейки реакционного модуля прибора, провести амплификацию и выполнить анализ результатов.
Предложенный набор синтетических олигонуклеотидов позволяет определять наличие возбудителей аэробного вагинита с высокой точностью.
Пример 3. Определение наличия ДНК энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, стафилококков (Staphylococcus spp.) и стрептококков (Streptococcus spp.) в биологическом образце с помощью набора синтетических олигонуклеотидов в составе лиофильновысушенной реакционной смеси.
Биологический материал (отделяемое слизистой оболочки влагалища) перед проведением ПЦР проводится через процедуру пробоподготовки с использованием набора реагентов для пробоподготовки. В ходе этой процедуры из биологического материала выделяется ДНК, которую, в свою очередь, используют для проведения ПЦР. Вместе с образцами биологического материала процедуру экстракции проходят контрольные образцы - отрицательный контроль и положительный контроль.
Отобрать необходимое количество пробирок или достать 96-луночный планшет для амплификации с готовой лиофилизированной реакционной смесью для амплификации ДНК исследуемых и контрольных образцов.
В подготовленные пробирки или лунки планшета внести по пробу ДНК, полученную в результате экстракции из исследуемых образцов.
Поставить контрольные реакции:
а) в пробирку или лунку планшета с реакционной смесью внести контрольный образец.
б) в пробирку или лунку планшета с реакционной смесью внести контрольный образец.
в) отрицательный контроль экстракции (ОК) - в пробирку или лунку планшета с реакционной смесью внести пробы, экстрагированные из ОКО.
Установить пробирки или планшет в ячейки реакционного модуля прибора, провести амплификацию и выполнить анализ результатов.
Предложенный набор синтетических олигонуклеотидов позволяет определять наличие возбудителей аэробного вагинита с высокой точностью.

Claims (13)

  1. Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК возбудителей аэробного вагинита: энтеробактерий семейства Enterobacteriaceae, включая Е. coli, Klebsiella spp., Proteus spp., стафилококков Staphylococcus spp. и стрептококков Streptococcus spp. в слизистой оболочке влагалища методом полимеразной цепной реакции, включающий в себя праймеры следующих последовательностей Seq. N1 - Seq. N8, также зонды с флуоресцентной меткой, интенсивность флуоресценции которых свидетельствует о количестве образующегося продукта, Seq. N9 - Seq. N12:
  2. CTGGACGAAGACTGACGCTC Seq. N1
  3. GTTTACGGCGTGGACTACCA Seq. N2
  4. GGACAATACAAAGGGCAGCG Seq. N3
  5. CCGGGAACGTATTCACCGTA Seq. N4
  6. CCCCTTATGACCTGGGCTAC Seq. N5
  7. GAGATTTGCTTGCCGTCACC Seq. N6
  8. CGTCTGCGGATGGAGAGTGCAA Seq. N7
  9. GAAGTCCGTCAATAGGCCCACAC Seq. N8
  10. GTGCGAAAGCGTGGGGAGCA Seq. N9
  11. CCGCGAGGTCAAGCAAATCCCA Seq. N10
  12. TGGTTGGTACAACGAGTCGCAAGT Seq. N11
  13. CTAGCTGGGCGTCAGGAATCCCAGG Seq. N12.
RU2017145853A 2017-12-26 2017-12-26 Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища RU2670278C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017145853A RU2670278C1 (ru) 2017-12-26 2017-12-26 Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017145853A RU2670278C1 (ru) 2017-12-26 2017-12-26 Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2670278C1 true RU2670278C1 (ru) 2018-10-22

Family

ID=63923357

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017145853A RU2670278C1 (ru) 2017-12-26 2017-12-26 Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2670278C1 (ru)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2009049007A2 (en) * 2007-10-10 2009-04-16 Magellan Biosciences, Inc. Compositions, methods and systems for rapid identification of pathogenic nucleic acids
RU109139U1 (ru) * 2010-04-06 2011-10-10 Федеральное Государственное Учреждение "Государственный Научный Центр Дерматовенерологии Федерального Агентства По Высокотехнологичной Медицинской Помощи" Днк-чип для комплексной идентификации условно-патогенных возбудителей урогенитальных инфекционных заболеваний

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2009049007A2 (en) * 2007-10-10 2009-04-16 Magellan Biosciences, Inc. Compositions, methods and systems for rapid identification of pathogenic nucleic acids
RU109139U1 (ru) * 2010-04-06 2011-10-10 Федеральное Государственное Учреждение "Государственный Научный Центр Дерматовенерологии Федерального Агентства По Высокотехнологичной Медицинской Помощи" Днк-чип для комплексной идентификации условно-патогенных возбудителей урогенитальных инфекционных заболеваний

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
HRUSKOVA V. Foodborne Staphylococcus aureus: Identification and enterotoxin production in milk and cheese. Brno: Vysoke uceni technicke v Brne, Fakulta chemicka, 2012; 85 s. *
HRUSKOVA V. Foodborne Staphylococcus aureus: Identification and enterotoxin production in milk and cheese. Brno: Vysoke uceni technicke v Brne, Fakulta chemicka, 2012; 85 s. VIOLANT D. et al. Microbiological, periodontal and blood biochemistry profile of periodontal patients with atherosclerosis. Journal of Oral Health Research. 2015 July; 6(3): 1-15. WIJANARKO A. et al. Isolation and Properties Characterization of Biosurfactant Synthesized by Prene Degrading Bacillus Subtilis. J. Chem. Eng. 2012; 6(10): 889-896. *
VIOLANT D. et al. Microbiological, periodontal and blood biochemistry profile of periodontal patients with atherosclerosis. Journal of Oral Health Research. 2015 July; 6(3): 1-15. *
WIJANARKO A. et al. Isolation and Properties Characterization of Biosurfactant Synthesized by Prene Degrading Bacillus Subtilis. J. Chem. Eng. 2012; 6(10): 889-896. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Fan et al. Multiplex real-time SYBR Green I PCR assay for detection of tetracycline efflux genes of Gram-negative bacteria
US20180135108A1 (en) Method for detecting bacterial and fungal pathogens
Chang et al. Rapid detection and typing of live bacteria from human joint fluid samples by utilizing an integrated microfluidic system
BRPI0710889A2 (pt) método para a detecção e quantificação múltipla e simultánea de patogênicos mediante a reação em cadeia da polimerasa em tempo real
US8080378B2 (en) Method of detecting colon cancer marker
WO2006080501A1 (ja) rRNAを標的とした微生物の定量的解析方法
RU2625006C1 (ru) Способ таргетной амплификации геномов возбудителей инфекций органов репродукции человека с целью одновременной идентификации возбудителей с набором праймеров
RU2645263C1 (ru) Тест-система для обнаружения ДНК вируса африканской чумы свиней с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
Lin et al. Quantitative and specific detection of viable pathogens on a portable microfluidic chip system by combining improved propidium monoazide (PMAxx) and loop-mediated isothermal amplification (LAMP)
US20220136046A1 (en) Detection and antibiotic resistance profiling of microorganisms
WO2012110822A1 (en) Method for identifying neonates at risk for necrotizing enterocolitis
RU2670278C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК энтеробактерий, стафилококков и стрептококков в слизистой оболочке влагалища
CN105368825B (zh) 幽门螺杆菌抗生素耐药性分析试剂盒及耐药性检测方法
RU2608651C1 (ru) Способ идентификации генов клинически значимых семейств β-лактамаз у грамотрицательных микроорганизмов
WO2018212288A1 (ja) パーキンソン病の判定マーカーおよび判定方法
RU2670280C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления ДНК Lactobacillus spp. в слизистой оболочке влагалища
JP5205609B2 (ja) ウイルス検出用オリゴヌクレオチドセット、ebv、cmv及びhhv−6の分析方法及び検出キット
WO2021039777A1 (ja) 関節リウマチを検査する方法
RU2663454C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК возбудителей вульвовагинального кандидоза в слизистой оболочке влагалища
RU2663453C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealyticum и Mycoplasma hominis в слизистой оболочке влагалища
Rustamova et al. Determination of quantitation of the HER2/NEU gene in tumors by art-PCR method
RU2636458C1 (ru) Способ повышения чувствительности полимеразной цепной реакции в реальном времени при обнаружении ДНК патогенных бактерий
Jin et al. Rapid detection of antibiotic resistance genes in lactic acid bacteria using PMMA-based microreactor arrays
CN105400908A (zh) 一种利用焦磷酸测序技术检测斑点叉尾鮰病毒的引物、试剂盒和检测方法
RU2670207C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления ДНК Gardnerella vaginalis в слизистой оболочке влагалища

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191227