RU2648845C2 - Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз - Google Patents

Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз Download PDF

Info

Publication number
RU2648845C2
RU2648845C2 RU2016132747A RU2016132747A RU2648845C2 RU 2648845 C2 RU2648845 C2 RU 2648845C2 RU 2016132747 A RU2016132747 A RU 2016132747A RU 2016132747 A RU2016132747 A RU 2016132747A RU 2648845 C2 RU2648845 C2 RU 2648845C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sheep
smallpox
samples
pathological material
infectious disease
Prior art date
Application number
RU2016132747A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016132747A (ru
Inventor
Олег Юрьевич Черных
Василий Александрович Баннов
Алексей Владимирович Мищенко
Владимир Николаевич Шевкопляс
Роман Анатольевич Кривонос
Андрей Георгиевич Кощаев
Георгий Анастасович Джаилиди
Юрий Андреевич Лысенко
Александр Анатолиевич Лысенко
Светлана Георгиевна Дресвянникова
Альберт Николаевич Чернов
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Кубанский государственный аграрный университет"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Кубанский государственный аграрный университет" filed Critical Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Кубанский государственный аграрный университет"
Priority to RU2016132747A priority Critical patent/RU2648845C2/ru
Publication of RU2016132747A publication Critical patent/RU2016132747A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2648845C2 publication Critical patent/RU2648845C2/ru

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии, в частности к способу диагностики оспы овец и коз. Способ экспресс-диагностики вируса оспы коз и овец включает отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией. В качестве патологического материала используют пробы из очага инфекционного заболевания оспы, при этом отбор проб патологического материала осуществляют от всех животных, находящихся в очаге инфекционного заболевания, и проводят экспресс-диагностику полученного патологического материала в течение суток для выявления животных-носителей вируса оспы на начальной стадии инфицирования. Учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией, если наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают положительным - вирус оспы овец и коз присутствует, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы, если не наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают отрицательным - вирус оспы овец и коз отсутствует и значения контрольных образцов также находятся в пределах нормы. Способ позволяет расширить функциональные возможности способа диагностики оспы овец и коз. 3 табл., 1 ил.

Description

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии, в частности к способу диагностики вируса оспы коз и овец.
Известен способ обнаружения специфических антител к вирусам оспы овец и коз методом ингибирования твердофазного иммуноферментного анализа, предусматривающий взаимодействие исследуемой сыворотки крови с антигеном вируса оспы овец и последующую детекцию иммобилизированного на твердой фазе комплекса антитело - специфический антиген поликлональным пероксидазным конъюгатом, где на первом этапе реакции происходит взаимодействие исследуемой сыворотки с культуральным антигеном вируса оспы овец, на втором этапе не вступивший в реакцию антиген взаимодействует с иммобилизированными на твердой фазе моноклональными антителами клона 08.3, обладающими специфичностью к антигенной детерминанте полипептида молекулярной массы 36-40 кД вируса оспы овец штамма "НИСХИ", а образовавшийся комплекс моноклональное антитело - антиген выявляют специфическим пероксидазным конъюгатом поликлональных антител, выделенных из гипериммунной сыворотки животных-реконвалесцентов (патент РФ №2202112, кл. А61К 39/275, G12Q 1/68).
Известен метод диагностики оспы коз и овец (Орлова Е.С. Совершенствование методов диагностики оспы овец и оспы коз: автореф. дис. канд. биол. наук / Е.С. Орлова. - Владимир, 2007 г. - 25 с.), включающий проведение ПЦР в реакционной смеси следующего состава: 2,5 мкл 10× буфера для Taq-полимеразы, 3 мМ Mg2+ 0,2 мМ dNTPs, 1,0 ед. Taq-полимеразы, по 10 пмоль праймеров, 3 мкл раствора вирусной ДНК и вода до конечного объема 25 мкл на ДНК-амплификаторе РТС-100 (MJ Research, США) при следующем температурном режиме: 2 мин предварительной денатурации при 94°C, 35 циклов амплификации (30 с денатурации при 94°C, 30 с отжига праймеров при 55°C, 30 с элонгации при 72°C) и 2 мин заключительной элонгации, с возможным (при необходимости) проведением второго этапа амплификации с внутренними праймерами в смеси аналогичного состава в течение 20-25 циклов, далее продукты реакции анализировали с помощью электорофореза в 2,0% агарозном геле, содержащем 0,001% бромистого этидия, при силе тока 50 мА.
Недостаток данного способа - он дает только качественный результат.
Известно техническое решение (Касьян Ж.А. и др. «Разработка тест-системы для дифференциации видов бруцелл методом ПЦР с учетом результатов в режиме реального времени. Проблемы особо опасных инфекций. 2016, вып. 3, с. 47-51. http://journal.microbe.ru/jour - прототип) отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией.
Недостатком данного метода является ограниченная применимость только к возбудителю бруцеллеза и отсутствие возможности диагностирования раннего развития заболевания с целью предотвращения массового распространения заболевания и перехода его в тяжелую запущенную форму.
Техническим результатом является расширение функциональных возможностей способа, предотвращение массового распространения заболевания и перехода его в тяжелую запущенную форму.
Технический результат достигается тем, что в способе экспресс-диагностики вируса оспы коз и овец, включающем отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, согласно изобретению в качестве патологического материала используют пробы из очага инфекционного заболевания оспы, при этом отбор проб патологического материала осуществляют от всех животных, находящихся в очаге инфекционного заболевания, и проводят экспресс-диагностику полученного патологического материала в течение суток для выявления животных-носителей вируса оспы на начальной стадии инфицирования, при этом учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией, если наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают положительным - вирус оспы овец и коз присутствует, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы, если не наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают отрицательным - вирус оспы овец и коз отсутствует и значения контрольных образцов также находятся в пределах нормы.
Новизна заявляемого способа экспресс-диагностики вируса оспы коз и овец состоит в идентификации вируса оспы в пробах патологического материала с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени, что в свою очередь позволяет выявить животных-носителей вируса оспы на начальной стадии инфицирования животных.
Признаки, отличающие заявляемое техническое решение от прототипа, направлены на достижение технического результата и не выявлены при изучении данной и смежной областей науки и техники и, следовательно, соответствуют критерию «изобретательский уровень».
Заявляемый способ экспресс-диагностики вируса оспы коз и овец рекомендовано использовать в специализированных ветеринарных, санитарно-эпидемиологических, животноводческих, сельскохозяйственных предприятиях, что соответствует критерию «промышленная применимость».
Способ экспресс-диагностики вируса оспы коз и овец осуществляют следующим образом.
В стаде овец или коз осуществляют отбор проб патологического материала от каждого животного из очага инфекционного заболевания оспы.
При отборе проб и их подготовке для исследования соблюдают меры, предупреждающие обсеменение объектов внешней среды. Материал от каждого животного отбирают отдельными инструментами.
Для исследования используют содержимое везикул, пустул, после предварительной очистки их поверхности спиртом; папулы, соскобленные скальпелем, и оспенные корки, собранные пинцетом; фрагменты измененных органов (лимфатические узлы, селезенка, легкие); для получения сыворотки собирают кровь в пробирку без антикоагулянта.
Взятие клинического материала производят в пробирку с транспортной средой.
Перед проведением анализа исследуемый материал подготавливают:
- исследуемые пробы тканей, органов гомогенизируют с использованием стерильных фарфоровых ступок и пестиков, затем готовят 10% суспензию на стерильном физиологическом растворе. Суспензию переносят а пробирку объемом 1,5 мл и отстаивают в течение 5-7 минут. Аликвоту надосадочной жидкости используют для экстракции ДНК;
- для получения сыворотки пробирки с кровью отстаивают при комнатной температуре в течение 30 мин до полного образования сгустка. Затем центрифугируют при 800-1000 g в течение 10 минут при комнатной температуре. Сыворотку переносят одноразовыми наконечниками с фильтром в одноразовые пробирки объемом 1,5 мл.
После подготовки исследуемого материала приступают к проведению анализа, состоящего из 3 этапов:
- экстракция ДНК;
- проведение полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени;
- учет результатов анализа.
ПЦР с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени имеет ряд значительных преимуществ:
- объединение этапов амплификации и детекции результатов. Появляется возможность оценить кинетику процесса, которая зависит от начального количества исследуемого материала;
- существенное снижение риска контаминации и ошибок при анализе результатов;
- высокая специфичность реакции за счет использования высокоспецифичных флуоресцентных зондов;
- высокая производительность;
- упрощение требований к организации ПЦР-лаборатории;
- возможность количественной оценки исходной ДНК матрицы;
- регистрация и учет данных в электронном формате.
ПЦР в реальном времени характеризуется возможностью проведения качественного и количественного анализа. Регистрируемое в процессе амплификации нарастание сигнала от отделенного флуорофора прямо пропорционально увеличению концентрации синтезированных специфических продуктов и отражает концентрацию ДНК в исходной матрице.
Экстракция ДНК.
Перед выделением ДНК осуществляют подготовку исследуемых проб с помощью набора реагентов «ПЦР-ОСПА-ФАКТОР», состоящего из 2 комплектов (таблица 1 и 2).
Figure 00000001
Figure 00000002
В отдельной пробирке смешивают компоненты набора из расчета на каждую реакцию 10 мкл ПЦР СМЕСЬ РОХ, 5 мкл смеси ПЦР БУФЕР РОХ, 0,5 мкл TAQ POLYMERASE. Перемешивают смесь на вортексе и сбрасываю капли кратковременным центрифугированием. Затем отбирают необходимое количество пробирок для амплификации ДНК исследуемых и контрольных проб, вносят по 15 мкл приготовленной реакционной смеси. Используя наконечники с фильтром в подготовленные пробирки добавляют:
1) отрицательный контроль ПЦР (К-) - вносят в пробирку по 10 мкл ОКО;
2) по 10 мкл ДНК из исследуемых образцов в соответствующие пробирки;
3) положительный контроль ПЦР (К+) - вносят в пробирку 10 мкл ПКО.
При этом не наносят маркировку на крышку пробирок, т.к. это затрудняет процесс считывания амплификатором.
Проведение полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Устанавливают пробирки в реакционный модуль прибора «Rotor-Gene 3000/6000» (Q), в котором осуществляют полимеразную цепную реакцию с флуоресцентным детектором в режиме реального времени. В соответствии с протоколом анализа прибор программируют, устанавливают параметры температурно-временного режима амплификации, детекцию флуоресцентного сигнала назначают после стации отжига праймеров, после чего начинают процесс амплификации с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени. В его основе лежит принцип флуоресцентной детекции продуктов полимеразной цепной реакции непосредственно в ходе амплификации. Детекция продуктов амплификации проводится прямо в реакционной среде через стенки или крышку закрытой пробирки.
Учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией (см. чертеж). Образец считают положительным (вирус оспы овец и коз присутствует), если наблюдают рост специфического сигнала, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы (таблица 3). Образец считают отрицательным (вирус оспы овец и коз отсутствует), если не наблюдают рост специфического сигнала, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы.
Figure 00000003

Claims (1)

  1. Способ экспресс-диагностики вируса оспы коз и овец, включающий отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, отличающийся тем, что в качестве патологического материала используют пробы из очага инфекционного заболевания оспы, при этом отбор проб патологического материала осуществляют от всех животных, находящихся в очаге инфекционного заболевания, и проводят экспресс-диагностику полученного патологического материала в течение суток для выявления животных-носителей вируса оспы на начальной стадии инфицирования, при этом учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией, если наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают положительным - вирус оспы овец и коз присутствует, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы, если не наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают отрицательным - вирус оспы овец и коз отсутствует и значения контрольных образцов также находятся в пределах нормы.
RU2016132747A 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз RU2648845C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016132747A RU2648845C2 (ru) 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016132747A RU2648845C2 (ru) 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016132747A RU2016132747A (ru) 2018-02-16
RU2648845C2 true RU2648845C2 (ru) 2018-03-28

Family

ID=61227542

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016132747A RU2648845C2 (ru) 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2648845C2 (ru)

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2238565C1 (ru) * 2003-03-13 2004-10-20 ВНИИ ветеринарной вирусологии и микробиологии Способ диагностики оспы овец и оспы коз гистохимическим иммуноферментным анализом на основе моноклональных антител

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2238565C1 (ru) * 2003-03-13 2004-10-20 ВНИИ ветеринарной вирусологии и микробиологии Способ диагностики оспы овец и оспы коз гистохимическим иммуноферментным анализом на основе моноклональных антител

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GULBAHARA M.Y. et al. Immunohistochemical detection of antigen in lamb tissues naturally infected with sheep-pox virus // J. Vet. Med. B. 2000. V. 47. N3. P.173-181. *
ОРЛОВА Е. С. Совершенствование методов диагностики оспы овец и оспы коз. Автореф. дисс. к.б.н. Владимир, 2007. Application of fluorescent antibody test in the diagnosis of sheep pox, and study of sheep pox virus multiplication in cell-culture / P. Sarkar, S.P. Singh, A.K. Pandey et al. J // Indian J.Anim.Sci. 1980. V.50. *
ОРЛОВА Е. С. Совершенствование методов диагностики оспы овец и оспы коз. Автореф. дисс. к.б.н. Владимир, 2007. Application of fluorescent antibody test in the diagnosis of sheep pox, and study of sheep pox virus multiplication in cell-culture / P. Sarkar, S.P. Singh, A.K. Pandey et al. J // Indian J.Anim.Sci. 1980. V.50. GULBAHARA M.Y. et al. Immunohistochemical detection of antigen in lamb tissues naturally infected with sheep-pox virus // J. Vet. Med. B. 2000. V. 47. N3. P.173-181. *

Also Published As

Publication number Publication date
RU2016132747A (ru) 2018-02-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Sarasquete et al. Minimal residual disease monitoring in multiple myeloma: a comparison between allelic-specific oligonucleotide real-time quantitative polymerase chain reaction and flow cytometry
Thapa et al. Direct detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples by a dry methyl green loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method
Çiftci et al. Evaluation of PCR methods for detection of Brucella strains from culture and tissues
Moeini-Zanjani et al. Comparison of loop-mediated isothermal amplification and conventional PCR tests for diagnosis of common Brucella species
CN110564880A (zh) 检测布鲁氏菌减毒活疫苗株和野毒株的方法及应用
RU2648773C2 (ru) Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС
Sabour et al. Evaluating the efficiency of TaqMan real-time PCR and serological methods in the detection of Brucella spp. in clinical specimens collected from suspected patients in Ardabil, Iran
RU2648845C2 (ru) Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз
CN111647690B (zh) 用于检测covid-19病毒的rt-raa引物对和诊断试剂盒
El Sanousi et al. Comparison of real-time PCR versus ELISA in the diagnosis of cytomegalovirus infection in pregnant women
RU2586527C1 (ru) Олигонуклеотидные праймеры, флюоресцентный зонд и способ для выявления генома вируса эпизоотической диареи свиней методом обратной транскрипции - полимеразной цепной реакции
Carmina et al. Indirect Immunoperoxidase Test (IPT) for Detection of Antibodies Against African Swine Fever Virus (ASFV) on African Green Monkey Cell Lines (Vero, MS)
CN113755614A (zh) 布鲁氏菌病疫苗株与野毒株快速高灵敏鉴别诊断试剂盒及其使用方法
Patel et al. Polymerase chain reaction in the diagnosis of spontaneous leptospirosis in bovines
CN113624977A (zh) SARS-CoV-2感染诊断方法
de Araújo Teixeira et al. Risk factors and detection of brucella ovis in naturally infected rams and ewes
Peeridogaheh et al. Evaluation of three DNA extraction methods for detection of brucella DNA in human serum samples
RU2728660C1 (ru) Способ определения ДНК вируса нодулярного дерматита (LSDV) в биологическом материале животных методом ПЦР с электрофоретической детекцией продуктов амплификации в агарозном геле
RU2533238C1 (ru) Способ выявления днк mycoplasma hominis из образцов крови
RU2702011C1 (ru) Способ диагностики инфекционных, аллергических, аутоиммунных и онкологических заболеваний
RU2820832C1 (ru) Способ выявления ДНК возбудителя пастереллеза (Pasteurella multocida) в биологическом материале животных и кормах с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
CN109406776B (zh) 用于特异性检测结核分枝杆菌感染的蛋白Rv2818c
Nematollahi et al. Survey on ovine toxoplasmosis by IFAT and double-tube nested-PCR in Tabriz, Iran
RU2372098C1 (ru) Способ получения анаплазменного антигена для серологической диагностики у животных
Romanova et al. LABORATORY METHODS FOR DETERMINING NEW COVID-19 INFECTION

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20180809

NF4A Reinstatement of patent

Effective date: 20191108