RU2648773C2 - Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС - Google Patents

Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС Download PDF

Info

Publication number
RU2648773C2
RU2648773C2 RU2016132731A RU2016132731A RU2648773C2 RU 2648773 C2 RU2648773 C2 RU 2648773C2 RU 2016132731 A RU2016132731 A RU 2016132731A RU 2016132731 A RU2016132731 A RU 2016132731A RU 2648773 C2 RU2648773 C2 RU 2648773C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cattle
nodular
virus
nodular dermatitis
infectious disease
Prior art date
Application number
RU2016132731A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016132731A (ru
Inventor
Олег Юрьевич Черных
Василий Александрович Баннов
Алексей Владимирович Мищенко
Владимир Николаевич Шевкопляс
Роман Анатольевич Кривонос
Андрей Георгиевич Кощаев
Георгий Анастасович Джаилиди
Юрий Андреевич Лысенко
Александр Анатолиевич Лысенко
Светлана Георгиевна Дресвянникова
Альберт Николаевич Чернов
Михаил Геннадиевич Коновалов
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" filed Critical Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина"
Priority to RU2016132731A priority Critical patent/RU2648773C2/ru
Publication of RU2016132731A publication Critical patent/RU2016132731A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2648773C2 publication Critical patent/RU2648773C2/ru

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/531Production of immunochemical test materials
    • G01N33/532Production of labelled immunochemicals
    • G01N33/533Production of labelled immunochemicals with fluorescent label

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии, в частности к способу экспресс-диагностики нодулярного дерматита крупного рогатого скота (КРС). Способ экспресс-диагностики вируса нодулярного дерматита КРС включает отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания от всех животных, находящихся в очаге инфекционного заболевания, и проведение экспресс-диагностики полученного патологического материала в течение суток методом ПЦР с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene для выявления животных-носителей вируса нодулярного дерматита на начальной стадии инфицирования, при этом учет результатов ПЦР проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией, если наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают положительным - вирус нодулярного дерматита КРС присутствует, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы, если не наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают отрицательным - вирус нодулярного дерматита крупного рогата скота отсутствует, и значения контрольных образцов также находятся в пределах нормы. 3 табл., 1 ил.

Description

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии, в частности к способу диагностики вируса нодулярного дерматита КРС.
Известен способ обнаружения специфических антител к вирусам оспы овец и коз методом ингибирования твердофазного иммуноферментного анализа, предусматривающий взаимодействие исследуемой сыворотки крови с антигеном вируса оспы овец и последующую детекцию иммобилизированного на твердой фазе комплекса антитело - специфический антиген поликлональным пероксидазным конъюгатом, где на первом этапе реакции происходит взаимодействие исследуемой сыворотки с культуральным антигеном вируса оспы овец, на втором этапе не вступивший в реакцию антиген взаимодействует с иммобилизированными на твердой фазе моноклональными антителами клона 08.3, обладающими специфичностью к антигенной детерминанте полипептида молекулярной массы 36-40 кД вируса оспы овец штамма "НИСХИ", а образовавшийся комплекс моноклональное антитело - антиген выявляют специфическим пероксидазным конъюгатом поликлональных антител, выделенных из гипериммунной сыворотки животных-реконвалесцентов (патент РФ №2202112, кл. A61K 39/275, G12Q 1/68).
Известен метод диагностики оспы коз и овец (Орлова Е.С. Совершенствование методов диагностики оспы овец и оспы коз: автореф. дис.канд. биол. наук / Е.С.Орлова. - Владимир, 2007 г. - 25 с.), включающий проведение ПЦР в реакционной смеси следующего состава: 2,5 мкл 10х буфера для Taq-полимеразы, 3 мМ Mg2+0,2 мМ dNTPs, 1,0 ед. Taq-полимеразы, по 10 пмоль праймеров, 3 мкл раствора вирусной ДНК и вода до конечного объема 25 мкл на ДНК-амплификаторе РТС-100 (MJ Research, США) при следующем температурном режиме: 2 мин предварительной денатурации при 94°С, 35 циклов амплификации (30 с денатурации при 94°С, 30 с отжига праймеров при 55°С, 30 с элонгации при 72°С) и 2 мин заключительной элонгации, с возможным (при необходимости) проведением второго этапа амплификации с внутренними праймерами в смеси аналогичного состава в течение 20-25 циклов, далее продукты реакции анализировали с помощью электорофореза в 2,0% агарозном геле, содержащем 0,001% бромистого этидия, при силе тока 50 мА.
Недостатком данного способа является то, что он дает только качественный результат.
Известно техническое решение (Касьян Ж.А. и др. «Разработка тест-системы для дифференциации видов бруцелл методом ПНР с учетом результатов в режиме реального времени. Проблемы особо опасных инфекций. 2016, вып. 3, с. 47-51. http://ioumal.microbe.ru/iour - прототип) отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией.
Недостатком данного способа является ограниченная применимость только к возбудителю бруцеллеза и отсутствие возможности диагностирования раннего развития заболевания.
Техническим результатом является расширение функциональных возможностей способа, предотвращение массового распространения заболевания и перехода его в тяжелую запущенную форму.
Технический результат достигается тем, что в способе экспресс-диагностики нодулярного дерматита крупного рогатого скота, включающем отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, согласно изобретению в качестве патологического материала используют пробы из очага инфекционного заболевания нодулярного дерматита, при этом отбор проб патологического материала осуществляют от всех животных, находящихся в очаге инфекционного заболевания, и проводят экспресс-диагностику полученного патологического материала в течение суток для выявления животных-носителей вируса нодулярного дерматита на начальной стадии инфицирования, при этом учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией, если наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают положительным - вирус нодулярного дерматита крупного рогата скота присутствует, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы, если не наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают отрицательным - вирус нодулярного дерматита крупного рогата скота отсутствует и значения контрольных образцов также находятся в пределах нормы.
Новизна заявляемого способа экспресс-диагностики нодулярного дерматита крупного рогата скота состоит в идентификации вируса нодулярного дерматита в пробах патологического материала с помощью полимеразной цепной реакции (ПНР) с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени, что в свою очередь позволяет выявить животных-носителей вируса заболевания на начальной стадии инфицирования животных.
Признаки, отличающие заявляемое техническое решение от прототипа, направлены на достижение технического результата и не выявлены при изучении данной и смежной областей науки и техники и, следовательно, соответствуют критерию «изобретательский уровень».
Заявляемый способ экспресс-диагностики вируса нодулярного дерматита крупного рогатого скота рекомендовано использовать в специализированных ветеринарных, санитарно-эпидемиологических, животноводческих, сельскохозяйственных предприятиях, что соответствует критерию «промышленная применимость».
Сущность изобретения поясняется чертежом, где на рисунке 1 представлен график результатов экспресс-диагностики нодулярного дерматита.
Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита крупного рогатого скота осуществляют следующим образом.
В стаде овец или коз осуществляют отбор проб патологического материала от каждого животного из очага инфекционного заболевания нодулярного дерматита. При отборе проб и подготовке проб для исследования соблюдают меры, предупреждающие обсеменение объектов внешней среды. Материал от каждого животного отбирают отдельными инструментами.
Цельная кровь забирается в пробирку с 6% ЭДТА из расчета 50 мкл раствора ЭДГА на 1 мл крови, закрытую пробирку с кровью несколько раз переворачивают. Для получения сыворотки забирают кровь в пробирку без антикоагулянта. Помимо крови, в качестве исследуемого материала также используют фрагменты тканей и органов (нодулы, селезенка, лимфатические узлы), которые отбирают в стерильный контейнер. Для подготовки пробы к проведению полимеразной цепной реакции используют различные методики, с помощью которых осуществляют экстракцию ДНК из полученных образцов сыворотки крови животных и удалении или нейтрализации посторонних примесей для получения препарата ДНК с чистотой, пригодной для проведения полимеразной цепной реакции.
После подготовки исследуемого материала приступают к проведению анализа, состоящего из 3 этапов:
- экстракция ДНК;
- проведение полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени;
- учет результатов анализа.
ПЦР с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени имеет ряд значительных преимуществ:
- объединение этапов амплификации и детекции результатов. Появляется возможность оценить кинетику процесса, которая зависит от начального количества исследуемого материала;
- существенное снижение риска контаминации и ошибок при анализе результатов;
- высокая специфичность реакции за счет использования высокоспецифичных флуоресцентных зондов;
- высокая производительность;
- упрощение требований к организации ПЦР-лаборатории;
- возможность количественной оценки исходной ДНК матрицы;
- регистрация и учет данных в электронном формате.
ПЦР в реальном времени характеризуется возможностью проведения качественного и количественного анализа. Регистрируемое в процессе амплификации нарастание сигнала от отделенного флуорофора прямо пропорционально увеличению концентрации синтезированных специфических продуктов и отражает концентрацию ДНК в исходной матрице.
Экстракция ДНК
Перед выделением ДНК осуществляют подготовку исследуемых проб с помощью набора реагентов «ПЦР-НОДУЛЯРНЫЙ ДЕРМАТИТ КРС-ФАКТОР», состоящий из 2 комплектов (таблица 1 и 2).
Figure 00000001
Figure 00000002
При подготовке образцов в отдельной пробирке смешивают компоненты набора из расчета на каждую реакцию: 10 мкл ПЦР СМЕСЬ LSDV, 5 мкл смеси ПЦР БУФЕР LSDV, 0,5 мкл TAQ POLYMERASE, данную смесь перемешивают и сбрасывают капли кратковременным центрифугированием. Затем отбирают необходимое количество пробирок для амплификации ДНК исследуемых и контрольных проб, вносят по 15 мкл приготовленной реакционной смеси. Используя наконечники с фильтром, в подготовленные пробирки добавляют:
1) отрицательный контроль ПЦР (К-) - вносят в пробирку по 10 мкл отрицательного контрольного образца;
2) по 10 мкл ДНК из исследуемых образцов (включая ОКО) в соответствующие пробирки;
3) положительный контроль ПЦР (К+) - вносят в пробирку 10 мкл положительного контрольного образца LSDV.
При этом не наносят маркировку на крышку пробирок, т.к. это затрудняет процесс считывания амплификатором.
Проведение полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Устанавливают пробирки в реакционный модуль прибора «Rotor-Gene 3000/6000» (Q), в котором осуществляют полимеразную цепную реакцию с флуоресцентным детектором в режиме реального времени. В соответствии с протоколом анализа прибор программируют, устанавливают параметры температурно-временного режима амплификации, детекцию флуоресцентного сигнала назначают после стации отжига праймеров, после чего начинают процесс амплификации с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени. В его основе лежит принцип флуоресцентной детекции продуктов полимеразной цепной реакции непосредственно в ходе амплификации. Детекция продуктов амплификации проводится прямо в реакционной среде через стенки или крышку закрытой пробирки.
Учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией (рисунок 1). Образец считают положительным (вирус нодулярного дерматита крупного рогатого скота присутствует), если наблюдают рост специфического сигнала, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы (таблица 3). Образец считают отрицательным (вирус нодулярного дерматита крупного рогатого скота отсутствует), если не наблюдают рост специфического сигнала, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы.
Figure 00000003
Таким образом, результаты исследований показывают, что заявляемый способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС, состоящий из идентификации вируса нодулярного дерматита в пробах патологического материала с помощью полимеразной цепной реакции с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени позволяет выявить животных-носителей вируса нодулярного дерматита на начальной стадии их инфицирования, что в свою очередь не позволит заболеванию массово распространиться, перейти в более тяжелую и запущенную форму.

Claims (1)

  1. Способ экспресс-диагностики вируса нодулярного дерматита крупного рогатого скота, включающий отбор проб патологического материала из очага инфекционного заболевания, экстракцию ДНК бактерий инфекционного заболевания из полученных проб, идентификацию видовой принадлежности возбудителя болезни методом полимеразной цепной реакции с флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени с применением термоциклера типа RotorGene на основании наличия/отсутствия пересечения кривой флуоресценции с пороговой линией, отличающийся тем, что в качестве патологического материала используют пробы из очага инфекционного заболевания нодулярного дерматита крупного рогата скота, при этом отбор проб патологического материала осуществляют от всех животных, находящихся в очаге инфекционного заболевания, и проводят экспресс-диагностику полученного патологического материала в течение суток для выявления животных-носителей вируса нодулярного дерматита на начальной стадии инфицирования, при этом учет результатов полимеразной цепной реакции проводят по наличию или отсутствию пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией, если наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают положительным - вирус нодулярного дерматита крупного рогата скота присутствует, при этом значения контрольных образцов находятся в пределах нормы, если не наблюдают рост специфического сигнала, то образец считают отрицательным - вирус нодулярного дерматита крупного рогата скота отсутствует, и значения контрольных образцов также находятся в пределах нормы.
RU2016132731A 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС RU2648773C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016132731A RU2648773C2 (ru) 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016132731A RU2648773C2 (ru) 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016132731A RU2016132731A (ru) 2018-02-13
RU2648773C2 true RU2648773C2 (ru) 2018-03-28

Family

ID=61227459

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016132731A RU2648773C2 (ru) 2016-08-08 2016-08-08 Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2648773C2 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2719719C1 (ru) * 2019-10-16 2020-04-22 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ выявления ДНК вируса нодулярного дерматита (LSDV) в биологическом материале животных с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN117987601A (zh) * 2024-04-07 2024-05-07 山东农业大学 一种牛结节性皮肤病病毒的检测试剂盒及应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2202112C1 (ru) * 2001-07-26 2003-04-10 ВНИИ ветеринарной вирусологии и микробиологии Способ обнаружения специфических антител к вирусам оспы овец и оспы коз методом двухфазного ингибирования твердофазного иммуноферментного анализа на основе моноклональных антител

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2202112C1 (ru) * 2001-07-26 2003-04-10 ВНИИ ветеринарной вирусологии и микробиологии Способ обнаружения специфических антител к вирусам оспы овец и оспы коз методом двухфазного ингибирования твердофазного иммуноферментного анализа на основе моноклональных антител

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Mohammed Body et al. Clinico-Histopathological Findings and PCR Based Diagnosis of Lumpy Skin Disease in the Sultanate of Oman. Pakistan Veterinary Journal, 2012, vol. 32(2), pages 206-210. *
Е.С.Орлова. Совершенствование методов диагностики оспы овец и оспы коз. Авто дис. на соиск. уч. степ. к.б.н, Владимир, 2007. *
Е.С.Орлова. Совершенствование методов диагностики оспы овец и оспы коз. Автореферат дис. на соиск. уч. степ. к.б.н, Владимир, 2007. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2719719C1 (ru) * 2019-10-16 2020-04-22 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ выявления ДНК вируса нодулярного дерматита (LSDV) в биологическом материале животных с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Also Published As

Publication number Publication date
RU2016132731A (ru) 2018-02-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Sarasquete et al. Minimal residual disease monitoring in multiple myeloma: a comparison between allelic-specific oligonucleotide real-time quantitative polymerase chain reaction and flow cytometry
Gwida et al. Comparison of diagnostic tests for the detection of Brucella spp. in camel sera
Elfaki1ABCDEF et al. Evaluation of culture, tube agglutination, and PCR methods for the diagnosis of brucellosis in humans
JP2011508892A (ja) 複合試料マトリクスからの細胞の単離および計数の方法
Çiftci et al. Evaluation of PCR methods for detection of Brucella strains from culture and tissues
JP2009507243A (ja) 感染症を診断する方法
Carli et al. Real-time polymerase chain reaction for detection of Mycoplasma gallisepticum in chicken trachea
RU2648773C2 (ru) Способ экспресс-диагностики нодулярного дерматита КРС
CN110564880A (zh) 检测布鲁氏菌减毒活疫苗株和野毒株的方法及应用
Chen et al. Ultra-sensitive and point-of-care detection of Capripoxvirus (CaPV) based on loop-mediated amplification (LAMP) and trans-cleavage activity of CRISPR/Cpf1
CN104263839A (zh) 布鲁氏杆菌 lamp-lfd检测试剂盒及其检测方法
CN112501323A (zh) 基于raa-lf技术的金黄色葡萄球菌扩增引物及应用
WO2005106476A2 (en) Method for diagnosing infectious diseases
RU2648845C2 (ru) Способ экспресс-диагностики оспы овец и коз
Sabry et al. A polymerase chain reaction and enzyme linked immunosorbent assay based approach for diagnosis and differentiation between vaccinated and infected cattle with Mycobacterium bovis
Inzana et al. Commercial methods in clinical veterinary microbiology
CN111647690B (zh) 用于检测covid-19病毒的rt-raa引物对和诊断试剂盒
Singh et al. Current diagnostic techniques of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in domestic ruminants
Kaya et al. Comparison of tuberculin skin test, IFN-γ assay, Real Time PCR and Lateral Flow Rapid Test in diagnosis of field outbreaks of bovine tuberculosis
Carmina et al. Indirect Immunoperoxidase Test (IPT) for Detection of Antibodies Against African Swine Fever Virus (ASFV) on African Green Monkey Cell Lines (Vero, MS)
Gupte et al. Diagnostic approach to brucellosis
Saushkin et al. Strip-dried biofluids for the detection of specific antibodies in small, infected ruminants
Singh et al. Development and Standardization of Visual Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assay for Specific Diagnosis of Johne's Disease
Fenollar et al. Diagnostic strategy of rickettsioses and ehrlichioses
RU2728660C1 (ru) Способ определения ДНК вируса нодулярного дерматита (LSDV) в биологическом материале животных методом ПЦР с электрофоретической детекцией продуктов амплификации в агарозном геле

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20180809