RU2603056C2 - Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections - Google Patents

Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections Download PDF

Info

Publication number
RU2603056C2
RU2603056C2 RU2015102383/10A RU2015102383A RU2603056C2 RU 2603056 C2 RU2603056 C2 RU 2603056C2 RU 2015102383/10 A RU2015102383/10 A RU 2015102383/10A RU 2015102383 A RU2015102383 A RU 2015102383A RU 2603056 C2 RU2603056 C2 RU 2603056C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
protein
asfv
recombinant protein
thioredoxin
recombinant
Prior art date
Application number
RU2015102383/10A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2015102383A (en
Inventor
Алексей Дмитриевич Середа
Ильназ Рамисович Иматдинов
Анна Сергеевна Казакова
Алмаз Рамисович Иматдинов
Ольга Александровна Дубровская
Original Assignee
Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Российской академии сельскохозяйственных наук, RU
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Российской академии сельскохозяйственных наук, RU filed Critical Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Российской академии сельскохозяйственных наук, RU
Priority to RU2015102383/10A priority Critical patent/RU2603056C2/en
Publication of RU2015102383A publication Critical patent/RU2015102383A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2603056C2 publication Critical patent/RU2603056C2/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • C07K14/01DNA viruses

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: invention relates to biotechnology and veterinary virology. Disclosed is an expression plasmid vector, providing production of recombinant protein in E. coli cells, consisting of african swine fever virus (ASFV) protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections.
EFFECT: invention can be used for making virus-specific antigens for analyzing swine serums by immunoblotting.
1 cl, 3 dwg, 1 tbl, 4 ex

Description

Область техникиTechnical field

Изобретение относится к области биотехнологии и ветеринарной вирусологии, и представляет собой экспрессирующий плазмидный вектор, обеспечивающий синтез в клетках Е. coli рекомбинантного белка, состоящего из фрагмента р30 вируса АЧС, тиоредоксина (Trx-Tag) и полигистидиновых участков (6xHis), и может быть использовано для изготовления вирусспецифических антигенов в тест-системы, предназначенные для исследования сывороток свиней методом иммуноблоттинга.The invention relates to the field of biotechnology and veterinary virology, and is an expression plasmid vector that provides for the synthesis in recombinant protein of E. coli cells consisting of a p30 fragment of the ASF virus, thioredoxin (Trx-Tag) and polyhistidine sections (6xHis), and can be used for the production of virus-specific antigens in test systems designed for the study of pig sera by immunoblotting.

Уровень техникиState of the art

АЧС - контагиозная, септическая болезнь свиней, характеризующаяся лихорадкой, признаками токсикоза, геморрагическим диатезом и высокой летальностью. К АЧС восприимчивы домашние свиньи и дикие кабаны независимо от породы и возраста, у которых болезнь может протекать сверхостро, остро, подостро, хронически и бессимптомно. Возбудитель АЧС передается от больных животных и выживших вирусоносителей контактным и алиментарным путем, а также трансплацентарно [1]. Поскольку вакцины против АЧС не разработаны, то для ликвидации и предупреждения распространения болезни применяется тотальный убой свиней в первой угрожаемой зоне радиусом до 20 км от очага инфекции, а также жесткие карантинные мероприятия во второй угрожаемой зоне радиусом до 100 км. С учетом этого лабораторная диагностика имеет решающее значение для принятия решений о ликвидации вспышек и контроля распространения болезни. Современные методы лабораторной диагностики АЧС, основанные на определении вирусных антигенов или ДНК, не всегда обеспечивают выявление хронически или бессимптомно инфицированных животных. В этих случаях наиболее информативными являются серологические методы, основанные на определении антител к вирусным белкам в сыворотках крови животных.ASF is a contagious, septic disease of pigs characterized by fever, signs of toxicosis, hemorrhagic diathesis and high mortality. Domestic pigs and wild boars are susceptible to ASF, regardless of breed and age, in which the disease can occur superstroit, acute, subacute, chronically and asymptomatically. The causative agent of ASF is transmitted from sick animals and surviving virus carriers by contact and alimentary routes, as well as transplacental [1]. Since vaccines against ASF have not been developed, the total slaughter of pigs in the first threatened zone with a radius of up to 20 km from the source of infection is used to eliminate and prevent the spread of the disease, as well as strict quarantine measures in the second threatened zone with a radius of 100 km. With this in mind, laboratory diagnostics are critical to making decisions about eliminating outbreaks and controlling the spread of the disease. Modern laboratory methods for the diagnosis of ASF, based on the determination of viral antigens or DNA, do not always ensure the detection of chronically or asymptomatically infected animals. In these cases, the most informative are serological methods based on the determination of antibodies to viral proteins in the blood serum of animals.

Согласно рекомендациям Международного эпизоотического бюро (МЭБ) для подтверждения сомнительных результатов лабораторной диагностики АЧС непрямыми вариантами иммуноферментного анализа (ИФА) или реакции иммунофлуоресценции следует использовать метод иммуноблоттинга. Также его применяют при нарушении условий хранения проб сывороток крови и для исключения ложноположительных результатов в случаях, когда антитела сывороток крови от привитых животных реагируют с антигенами клеток, использованных при изготовлении вакцин.According to the recommendations of the International Epizootic Bureau (OIE), an immunoblot method should be used to confirm the doubtful results of laboratory diagnosis of ASF by indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) or immunofluorescence reaction. It is also used in violation of the storage conditions of blood serum samples and to eliminate false-positive results in cases when blood serum antibodies from vaccinated animals react with the antigens of the cells used in the manufacture of vaccines.

В рекомендованных МЭБ тест-системах для выявления АЧС методом иммуноблоттинга вирусные антигены происходят из живого вируса, что предполагает манипуляции с инфекционным агентом. Применение вместо них рекомбинантных белков гарантирует биологическую безопасность производства диагностических тест-систем и высокую специфичность входящих в их состав антигенов [2, 3].In the OIE recommended test systems for detecting ASF by immunoblotting, viral antigens come from a live virus, which involves manipulating an infectious agent. The use of recombinant proteins instead of them guarantees the biological safety of the production of diagnostic test systems and the high specificity of their antigens [2, 3].

Установлено, что в ранние сроки после заражения (3-6 суток) низко-, умеренно- и высоковирулентными штаммами вируса АЧС в сыворотках крови свиней преимущественно выявляются антитела к структурному белку вируса р30 [4]. Было показано, что чувствительность и специфичность ИФА при использовании рекомбинантного р30 для обнаружения антител к АЧС в сыворотках экспериментально инфицированных свиней и полевых сывороток от серопозитивных животных с бессимптомным течением болезни, составляют 96% и 99%, соответственно [5].It has been established that in the early stages after infection (3-6 days) with low-, moderate- and highly virulent ASF virus strains, antibodies to the structural protein of the p30 virus are predominantly detected in pig serum [4]. It was shown that the sensitivity and specificity of ELISA using recombinant p30 to detect antibodies to ASF in the sera of experimentally infected pigs and field sera from seropositive animals with an asymptomatic course of the disease are 96% and 99%, respectively [5].

Таким образом, применение рекомбинантного белка р30 в качестве антигена для выявления вирусспецифических антител при АЧС методом иммуноблоттинга является предпочтительным решением.Thus, the use of recombinant p30 protein as an antigen for detecting virus-specific antibodies in ASF by immunoblotting is the preferred solution.

Известен штамм клеток Е. coli M15 (Qiagen) с плазмидой рТТ9р30-9, экспрессирующий гибридный белок р30 вируса АЧС, выход которого при индукции IPTG составлял всего 1 мг с 1 дм3 бактериальной культуры [6], чего недостаточно для получения рекомбинантного р30 в препаративных количествах.A known strain of E. coli M15 cells (Qiagen) with plasmid pTT9p30-9 expressing ASF virus p30 fusion protein, the yield of which upon IPTG induction was only 1 mg with 1 dm 3 of bacterial culture [6], which is insufficient to obtain recombinant p30 in preparative quantities.

Патент RU 2463343 С1 раскрывает штамм клеток Е. coli BL21(DE3)pLysS, клон pTT9/ASFVp30 (клон 11), содержащий плазмиду, кодирующую, в том числе, рекомбинантный белок, включающий аминокислоты с 90-й по 190-ю белка р30 с молекулярной массой 14 кДа, в том числе, его конформационный эпитоп, а также целлюлозо-связывающий домен. Выход рекомбинантного белка после очистки на целлюлозном сорбенте достигает 2-4 мг с 1 дм3 бактериальной культуры [7].Patent RU 2463343 C1 discloses an E. coli BL21 (DE3) pLysS cell strain, clone pTT9 / ASFVp30 (clone 11), containing a plasmid encoding, including a recombinant protein, comprising amino acids 90 through 190 of p30 s molecular weight 14 kDa, including its conformational epitope, as well as the cellulose-binding domain. The output of the recombinant protein after purification on a cellulosic sorbent reaches 2-4 mg with 1 DM 3 bacterial culture [7].

В описании изобретения не были представлены электрофореграммы препаратов очищенного рекомбинантного белка, которые бы объективно свидетельствовали об отсутствии в нем примесей белков Е. coli, что принципиально важно для метода иммуноблоттинга. Кроме того, метод иммуноблоттинга предполагает электрофоретическое разделение полипептидов в денатурирующих условиях, в результате чего конформационные эпитопы теряют антигенную активность.In the description of the invention were not presented electrophoregrams of the preparations of purified recombinant protein, which would objectively indicate the absence of impurities of E. coli proteins in it, which is fundamentally important for the method of immunoblotting. In addition, the method of immunoblotting involves electrophoretic separation of polypeptides under denaturing conditions, as a result of which conformational epitopes lose antigenic activity.

Целью настоящего изобретения является усовершенствование генетической конструкции, кодирующей фрагмент белка р30 вируса АЧС и обеспечивающей охват максимального количества его гидрофильных участков и антигенных эпитопов, а также получение максимально растворимой формы рекомбинантного белка за счет лидирующей последовательности тиоредоксина, входящей в его структуру, и последовательностей, кодирующих полигистидиновые участки, обеспечивающие его эффективную очистку методом металлохелатной хроматографии в препаративных количествах.The aim of the present invention is to improve the genetic construct that encodes a fragment of the p30 protein of the ASF virus and provides coverage of the maximum number of its hydrophilic sites and antigenic epitopes, as well as obtaining the most soluble form of the recombinant protein due to the leading sequence of thioredoxin included in its structure, and sequences encoding polyhistidine areas ensuring its effective purification by metal chelate chromatography in preparative quantities x.

Раскрытие изобретенияDisclosure of invention

Технический результат от использования предлагаемого изобретения заключается в возможности поучения пригодного для иммуноблоттинга высокоочищенного модифицированного рекомбинантного р30 вируса АЧС с выходом не менее 15-20 мг с 1 дм3 бактериальной культуры.The technical result from the use of the present invention lies in the possibility of learning suitable for immunoblotting highly purified modified recombinant p30 ASF virus with a yield of at least 15-20 mg with 1 DM 3 bacterial culture.

Для достижения технического результата изобретения существенна совокупность следующих этапов:To achieve the technical result of the invention, the essential set of the following steps:

1) дизайн конструкции гена TrxA-6xHis-p30e2-6xHis, предполагающий подбор олигонуклеотидных праймеров с сайтами рестрикции для фланкирования участков гена CP204L вируса АЧС с сохранением рамок считывания при клонировании;1) the design design of the TrxA-6xHis-p30e2-6xHis gene, which involves the selection of oligonucleotide primers with restriction sites to flank portions of the ASF virus CP204L gene while preserving the reading frames during cloning;

2) выбор штамма Е. coli и реципиентной плазмиды для создания экспрессирующей конструкции;2) the choice of strain E. coli and recipient plasmids to create expressing constructs;

3) оптимизация условий экспрессии и хроматографической очистки рекомбинантного белка;3) optimization of the expression and chromatographic purification conditions of the recombinant protein;

4) оценка специфичности рекомбинантного белка методом иммуноблоттинга.4) assessment of the specificity of the recombinant protein by immunoblotting.

Лидирующая последовательность фрагмента тиоредоксина в составе экспрессирующего вектора в Е. coli обеспечивает сохранение рекомбинантного белка p30e2_TrxA_6xHis (Rec р30е2) в растворимой форме в цитоплазме продуцента, а наличие двух 6xHis участков позволяет достигать высокой степени очистки целевого продукта на металлохелатном сорбенте.The leading sequence of the thioredoxin fragment in the expression vector in E. coli ensures the conservation of the recombinant protein p30e2_TrxA_6xHis (Rec p30e2) in a soluble form in the producer cytoplasm, and the presence of two 6xHis sites allows to achieve a high degree of purification of the target product on a metal chelate sorbent.

Предлагаются:It is offered:

- нуклеотидная последовательность TrxA-6xHis-p30e2-6xHis (SEQ ID №1), представленная открытой рамкой считывания химерного белка Rec р30е2 (SEQ ID №3);- the nucleotide sequence of TrxA-6xHis-p30e2-6xHis (SEQ ID No. 1), represented by the open reading frame of the chimeric protein Rec p30e2 (SEQ ID No. 3);

- рекомбинантная плазмида pET32b(+)ASFV/p30e2 (SEQ ID №2), обеспечивающая высокий уровень экспрессии Rec р30е2 в клетках Escherichia coli и содержащая ген TrxA-6xHis-p30e2-6xHis с последовательностью SEQ ID №1 под контролем промотора гена 10 бактериофага Т7 и терминатора Т7 (фиг. 1).- recombinant plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2 (SEQ ID No. 2), which provides a high level of expression of Rec p30e2 in Escherichia coli cells and contains the TrxA-6xHis-p30e2-6xHis gene with the sequence SEQ ID No. 1 under the control of the promoter of gene 10 of the bacteriophage T7 and T7 terminator (Fig. 1).

- аминокислотная последовательность химерного белка Rec р30е2 (SEQ ID №3).- amino acid sequence of the chimeric protein Rec p30e2 (SEQ ID No. 3).

Дизайн гибридного гена TrxA-6xHis-p30e2-6xHis проводили в BioEdit 7.2.5 (http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit) с учетом сохранения корректных рамок считывания при клонировании в вектор экспрессии. Нуклеотидные последовательности, кодирующие соответствующие участки гена CP204L вируса АЧС, получали методом ПЦР со специфичными праймерами на матрице ДНК вируса АЧС штамма Stavropol2008 (Ставрополь 01/08) [8].The design of the TrxA-6xHis-p30e2-6xHis hybrid gene was carried out in BioEdit 7.2.5 (http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit), taking into account the preservation of the correct reading frames when cloning into the expression vector. The nucleotide sequences encoding the corresponding regions of the ASF virus CP204L gene were obtained by PCR with specific primers on the ASF virus DNA matrix of the Stavropol2008 strain (Stavropol 01/08) [8].

Для получения вектора экспрессии была выбрана плазмида pET32b(+), которая содержала лидирующую последовательность фрагмента тиоредоксина Е. coli под контролем сильного промотора гена «10» фага Т7, обеспечивающего высокий уровень экспрессии в Е. coli, стабильно или индуцибельно экспрессирующую ДНК-зависимую РНК-полимеразу фага Т7 [9].To obtain the expression vector, plasmid pET32b (+) was selected, which contained the leading sequence of the E. coli thioredoxin fragment under the control of the strong promoter of the T7 phage 10 gene, which provides a high level of expression in E. coli that stably or inducibly expresses DNA-dependent RNA- phage T7 polymerase [9].

Экспрессирующая рекомбинантная плазмида pET32b(+)ASFV/p30e2 получена путем субклонирования полученной в ПЦР нуклеотидной последовательностей гена CP204L вируса АЧС с праймерами F-p30e2 и R-р30е2 (таблица 1) в вектор pET32b(+) по сайтам рестрикции EcoRV и XhoI (фиг. 1).The expressing recombinant plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2 was obtained by subcloning the nucleotide sequences of the CP204L gene of the ASF virus with primers F-p30e2 and R-p30e2 (table 1) into the pET32b (+) vector of the EcoRV restriction sites (Fig. X and EcoRV). one).

После трансформации клеток Е. coli штамма KRX (Promega) плазмидой pET32b(+)ASFV/p30e2 и последующего скрининга рекомбинантов с высоким уровнем экспрессии гибридного белка Rec р30е2, отобран штамм-продуцент Е. coli pET32b/ASFV/p30e2/1.After transformation of E. coli cells of strain KRX (Promega) with plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2 and subsequent screening of recombinants with high expression level of Rec p30e2 fusion protein, the producer strain E. coli pET32b / ASFV / p30e2 / 1 was selected.

Экспрессия целевого белка в полученном штамме-продуценте осуществляется при культивировании на селективных средах с добавлением индуктора L-рамнозы, последующего сбора биомассы клеток, их разрушения, отделения нерастворимых белков и дебриса и очисткой белка Rec р30е2 методом металлохелатной хроматографии в нативных или денатурирующих условиях. Конечный выход целевого белка составляет не менее 15-20 мг с 1 дм3 бактериальной культуры.Expression of the target protein in the obtained producer strain is carried out by cultivation on selective media with the addition of an L-ramnose inducer, subsequent collection of cell biomass, their destruction, separation of insoluble proteins and debris, and purification of Rec p30e2 protein by metal chelate chromatography under native or denaturing conditions. The final yield of the target protein is at least 15-20 mg with 1 dm 3 of the bacterial culture.

Осуществление изобретенияThe implementation of the invention

При осуществлении изобретения, помимо методов, описанных в нижеследующих примерах, использовали ряд общепринятых методик, описанных в руководствах по молекулярной биологии [10].When carrying out the invention, in addition to the methods described in the following examples, a number of generally accepted methods were used, which are described in molecular biology manuals [10].

Изобретение иллюстрируют нуклеотидные и аминокислотные последовательности:The invention is illustrated by nucleotide and amino acid sequences:

Seq ID №1 Нуклеотидная последовательность TrxA-6xHis-p30e2-6xHis, кодирующая химерный белок Rec р30е2 (1…327 - лидирующая последовательность тиоредоксина (TrxA-Tag); 349…366, 916…933 -полигистидиновые участки (6xHis); 376…393 - нуклеотидная последовательность, кодирующая сайт расщепления тромбина (thrombin site); 460…474 - нуклеотидная последовательность, кодирующая сайт расщепления энтерокиназы (enterokinase site); 490…894 - нуклеотидная последовательность, кодирующая рекомбинантный р30е2).Seq ID No. 1 The nucleotide sequence of TrxA-6xHis-p30e2-6xHis encoding the chimeric protein Rec p30e2 (1 ... 327 is the leading sequence of thioredoxin (TrxA-Tag); 349 ... 366, 916 ... 933-polyhistidine sites (6xHis); 376 ... 393 - the nucleotide sequence encoding the thrombin cleavage site (thrombin site); 460 ... 474 is the nucleotide sequence encoding the enterokinase cleavage site (enterokinase site); 490 ... 894 is the nucleotide sequence encoding the recombinant p30e2).

Seq ID №2 Нуклеотидная последовательность рекомбинантной плазмиды pET32b(+)ASFV/p30e2 (746…1072 - лидирующая последовательность тиоредоксина (TrxA-Tag); 140…157, 707…724 - полигистидиновые участки (6xHis); 680…697 - нуклеотидная последовательность, кодирующая сайт расщепления тромбина (thrombin site); 599…613 - нуклеотидная последовательность, кодирующая сайт расщепления энтерокиназы (enterokinase site); 179…583 - нуклеотидная последовательность, кодирующая рекомбинантный р30е2).Seq ID No. 2 The nucleotide sequence of the recombinant plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2 (746 ... 1072 - the leading sequence of thioredoxin (TrxA-Tag); 140 ... 157, 707 ... 724 - polyhistidine regions (6xHis); 680 ... 697 - nucleotide sequence, coding thrombin cleavage site (thrombin site); 599 ... 613 - nucleotide sequence encoding the enterokinase site (enterokinase site); 179 ... 583 - nucleotide sequence encoding the recombinant p30e2).

Seq ID №3 Аминокислотная последовательность химерного белка Rec р30е2 (1…109 - лидирующая последовательность тиоредоксина (TrxA-Tag); 117…122, 306…311 - полигистидиновые участки (6xHis); 126…131 - сайт расщепления тромбина (thrombin site); 154…158 - сайт расщепления энтерокиназы (enterokinase site); 164…298 - последовательность рекомбинантного р30е2).Seq ID No. 3 Amino acid sequence of the chimeric protein Rec p30e2 (1 ... 109 - leading sequence of thioredoxin (TrxA-Tag); 117 ... 122, 306 ... 311 - polyhistidine sites (6xHis); 126 ... 131 - thrombin cleavage site (thrombin site); 154 ... 158 is the enterokinase cleavage site (enterokinase site); 164 ... 298 is the sequence of recombinant p30e2).

Изобретение иллюстрируют графические материалы.The invention is illustrated by graphic materials.

Фиг. 1 - Схема рекомбинантной плазмиды pET32b(+)ASFV/p30e2. Примечания: обозначено положение нуклеотидной вставки «р30е2»; стрелками указаны открытые рамки считывания гена TrxA-6xHis-p30e2-6xHis; сайты энтерокиназы и тромбина «ЕК and Trb»; сайтов рестрикции; «T7_promoter» - промотер фага Т7; «T7_terminator» - последовательность терминального участка фага Т7; «AmpR» - bla (β-lactamase) ген, кодирующий резистентность к ампициллину, карбенициллину и другим производным антибиотикам; «pBR 322_origin» - инициация репликации ColE1/pMB1/pBR322/pUC.FIG. 1 - Scheme of the recombinant plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2. Notes: the position of the nucleotide insert "p30e2" is indicated; arrows indicate open reading frames of the TrxA-6xHis-p30e2-6xHis gene; sites of enterokinase and thrombin "EC and Trb"; restriction sites; "T7_promoter" - promoter of phage T7; "T7_terminator" is the sequence of the terminal portion of the T7 phage; "AmpR" - bla (β-lactamase) gene encoding resistance to ampicillin, carbenicillin and other derivative antibiotics; "PBR 322_origin" - initiation of ColE1 / pMB1 / pBR322 / pUC replication.

Фиг. 2 - Электрофореграммы исходного лизата клеток Е. coli (штамм-продуцент KRX pET32b/ASFV/p30e2/1) (1), фракций в процессе отмывки сорбента (2-4) и фракции очищенного рекомбинантного белка (5). М - окрашенные маркеры молекулярной массы белков Spectra™ Multicolor 10 - 260 кДа.FIG. 2 - Electrophoregrams of the original E. coli cell lysate (producer strain KRX pET32b / ASFV / p30e2 / 1) (1), fractions during washing of the sorbent (2-4) and fractions of the purified recombinant protein (5). M - stained molecular weight markers of Spectra ™ Multicolor 10 - 260 kDa proteins.

Фиг. 3 - Специфическое окрашивание иммунострипа (указано стрелкой) в результате взаимодействия рекомбинантного белка р30 вируса АЧС со специфическими антителами положительной контрольной сыворотки крови свиньи, иммунной к вирусу АЧС (К+), и отсутствие окрашивания иммунострипа после инкубирования его с сывороткой крови от интактной свиньи (К-). Примечание: К+ - положительная инактивированная контрольная сыворотка, К- - отрицательная контрольная сывороток.FIG. 3 - Specific staining of the immunostrip (indicated by the arrow) as a result of the interaction of the recombinant p30 protein of the ASF virus with specific antibodies of the positive control serum of the pig immune to the ASF virus (K + ), and the absence of staining of the immunostrip after incubation with the blood serum of the intact pig (K - ). Note: K + is a positive inactivated control serum, K - is a negative control serum.

Изобретение иллюстрируют следующие примеры.The invention is illustrated by the following examples.

Пример 1. Получение специфической нуклеотидной вставки, кодирующей участок гена CP204L (р30) вируса АЧСExample 1. Obtaining a specific nucleotide insert that encodes a portion of the gene CP204L (p30) ASF virus

Аминокислотная последовательность структурного белка р30 вируса АЧС составляет 201 аминокислоту (ген CP204L). На первом этапе был проведен биоинформатический анализ с целью поиска трансмембранных регионов и/или гидрофобных участков, которые могут негативно повлиять на экспрессию белка или последующую очистку. Используя алгоритм по поиску протяженных гидрофобных участков «Ноор and Woods» (BioEdit 2.7.5), а также сервер «ТМНММ Server 2.0» (http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/) локализованы 2 перекрывающихся участка для клонирования.The amino acid sequence of the p30 structural protein of ASF virus is 201 amino acids (CP204L gene). At the first stage, bioinformatics analysis was carried out to search for transmembrane regions and / or hydrophobic regions that could adversely affect protein expression or subsequent purification. Using the algorithm for the search for extended hydrophobic sites “Noor and Woods” (BioEdit 2.7.5), as well as the TMNMM Server 2.0 server (http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/), 2 overlapping sites are localized cloning.

В качестве объекта для расчета праймеров была выбрана нуклеотидная последовательность генома вируса АЧС штамма Georgia/2007 (GeneBank FR682468.1). При подборе праймеров соблюдали минимальное содержание димерных структур и самокомплементарных регионов, которые могут приводить к образованию шпилек с высокой температурой плавления. В праймеры F-p30e2 и R-p30e2 включены сайты рестрикции EcoRV и XhoI. Данные сайты рестрикции позволяют переклонировать нуклеотидную вставку в необходимый прокариотический и эукариотический экспрессирующий вектор. Последовательности рассчитанных олигонуклеотидных праймеров указаны в таблице 1.The nucleotide sequence of the ASF virus genome of Georgia / 2007 strain (GeneBank FR682468.1) was chosen as an object for primer calculation. When selecting primers, the minimum content of dimeric structures and self-complementary regions was observed, which can lead to the formation of hairpins with a high melting point. EcoRV and XhoI restriction sites are included in the primers F-p30e2 and R-p30e2. These restriction sites allow the nucleotide insertion to be cloned into the desired prokaryotic and eukaryotic expression vector. The sequence of the calculated oligonucleotide primers are shown in table 1.

Figure 00000001
Figure 00000001

ПЦР проводили на приборе Терцик МС2 («ДНК-технология», Россия). В качестве матрицы использовали геномную ДНК вируса АЧС штамма Ставрополь 01/08 (Stavropol2008), циркулирующего на территории РФ [8]. Препаративные реакции проводили в объеме 25 мкл. Реакционная смесь состояла из: 1х буфер для термостабильной pfu ДНК-полимеразы; 10 пмоль каждого праймера; 2,5 мМ смеси дезоксирибонуклеотидтрифосфатов; 2,5 ед. pfu-полимеразы. Поверх этой смеси наслаивали 20 мкл минерального масла.PCR was performed on a Tertsik MS2 instrument (DNA Technology, Russia). The genomic DNA of the ASF virus of the Stavropol strain 01/08 (Stavropol2008) circulating in the Russian Federation was used as a matrix [8]. Preparative reactions were carried out in a volume of 25 μl. The reaction mixture consisted of: 1x buffer for thermostable pfu DNA polymerase; 10 pmol of each primer; 2.5 mM mixture of deoxyribonucleotide triphosphates; 2.5 units pfu polymerase. On top of this mixture was layered 20 μl of mineral oil.

Режим амплификации участка гена CP204L (р30): горячий старт: 95°С - 3 мин × 1 цикл; 24 цикла: денатурация 95°С - 30 сек, отжиг 54°С - 30 сек, элонгация 72°С - 30 сек; заключительная элонгация: 72°С - 3 мин × 1 цикл.Amplification mode of the CP204L gene region (p30): hot start: 95 ° C - 3 min × 1 cycle; 24 cycles: denaturation 95 ° С - 30 sec, annealing 54 ° С - 30 sec, elongation 72 ° С - 30 sec; final elongation: 72 ° C - 3 min × 1 cycle.

ПЦР-продукты (амплификаты) выделяли из 1% агарозного геля набором GeneJET Plasmid Miniprep Kit (Thermo Scietific, США) по протоколу производителя.PCR products (amplifications) were isolated from 1% agarose gel using the GeneJET Plasmid Miniprep Kit (Thermo Scietific, USA) according to the manufacturer's protocol.

Очищенные ПЦР-продукты рестрицировали соответствующими эндонуклеазами 1 час при 37°С: EcoRV+XhoI в буфере Red (Thermo Scietific, США) по рекомендованному протоколу производителя. Продукты рестрикции подвергали фракционированию в 1% агарозном геле с последующим выделением набором GeneJET Gel Extraction Kit (Thermo Scietific, США).Purified PCR products were digested with the corresponding endonucleases for 1 hour at 37 ° C: EcoRV + XhoI in Red buffer (Thermo Scietific, USA) according to the recommended manufacturer's protocol. The restriction products were subjected to fractionation in a 1% agarose gel, followed by isolation with the GeneJET Gel Extraction Kit (Thermo Scietific, USA).

Пример 2. Конструирование экспрессирующего плазмидного вектора pET32b(+)ASFV/p30e2Example 2. Construction of expressing plasmid vector pET32b (+) ASFV / p30e2

Акцепторную плазмиду pET32b(+) (Novagen) рестрицировали эндонуклеазами EcoRV и XhoI в буфере Red в течение 4 часов при 37°С. По завершению рестрикции эндонуклеазы инактивировали прогреванием 80°С 20 минут. Весь объем вносили в лунки 1% агарозного геля для последующего электрофореза. Линеаризованную плазмиду размером ~5900 п. н. выделяли из геля набором GeneJET Gel Extraction Kit.The acceptor plasmid pET32b (+) (Novagen) was digested with EcoRV and XhoI endonucleases in Red buffer for 4 hours at 37 ° C. Upon completion of the restriction, the endonucleases were inactivated by heating at 80 ° C for 20 minutes. The entire volume was added to the wells of a 1% agarose gel for subsequent electrophoresis. Linearized plasmid ~ 5900 bp in size isolated from the gel using the GeneJET Gel Extraction Kit.

Для получения плазмиды pET32b(+)ASFV/p30e2 очищенный рестрицированный ПЦР-продукт, полученный с использованием праймеров F-p30e2 и R-p30e2, лигировали с линеаризованной плазмидой pET32b(+), рестрицированной EcoRV/XhoI. Лигирование проводили с использованием Т4 ДНК-лигазы в рекомендованном буфере («α фермент», Россия) при комнатной температуре (25±2)°С в течение часа, соотношение вставки к вектору составляло 2:1.To obtain the plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2, the purified restricted PCR product obtained using the primers F-p30e2 and R-p30e2 was ligated with the linearized plasmid pET32b (+) restricted by EcoRV / XhoI. Ligation was carried out using T4 DNA ligase in the recommended buffer (“α enzyme”, Russia) at room temperature (25 ± 2) ° С for an hour, the ratio of insert to vector was 2: 1.

Полученной лигазной смесью трансформировали клетки Е. coli штамма KRX с генотипом [F′, traD36, ΔompP, proA+В+, lacIq, Δ(lacZ)M15] ΔompT, endA1, recA1, gyrA96 (Nalr), thi-1, hsdR17 (rk-, mk+), e14-(McrA), relA1, supE44, Δ(lac-proAB), Δ(rhaBAD): T7 RNA polymerase.The E. coli strain KRX cells with the genotype [F ′, traD36, ΔompP, proA + B + , lacI q , Δ (lacZ) M15] ΔompT, endA1, recA1, gyrA96 (Nal r ), thi-1, were transformed with the obtained ligase mixture. hsdR17 (r k -, m k +), e14 - (McrA), relA1, supE44, Δ (lac-proAB), Δ (rhaBAD): T7 RNA polymerase.

Для этого к 50 мкл суспензии клеток Е. coli вносили 3 мкл лигазной смеси, инкубировали на льду в течение 10 минут, подвергали «термошоку» (42°С - 20 сек), охлаждали, а затем переносили суспензию в чашку Петри с твердой агаризованной питательной средой, содержащей ампициллин в концентрации 100 мкг/см3, с последующим инкубированием в термостате при 37°С в течение 18 часов. Единичные колонии анализировали методом ПЦР с использованием матрицы ДНК клонов и праймеров, использованных при получении ПЦР-продукта. Положительные в ПЦР клоны наращивали в 3 см3 питательного бульона SOB (ампициллин 100 мкг/см3) и проводили выделение плазмидной ДНК набором реактивов GeneJET Plasmid Miniprep Kit по протоколу производителя (ThermoScientific). Секвенирование для верифицирования конструкций проводили по методу Сэнгера. В результате секвенирования установили, что в области вставки плазмиды pET32b(+)ASFV/p30e2 штамма-продуцента pET32b/ASFV/p30e2/1, не содержатся мутации, то есть кодируется корректная последовательность гена TrxA-6xHis-p30e2-6xHis. Карта экспрессирующей плазмидной конструкции приведена на фиг. 1, ее нуклеотидная последовательность - SEQ ID №2. Аминокислотная последовательность продукта экспрессии приведена в SEQ ID №3.For this, 3 μl of the ligase mixture was added to 50 μl of a suspension of E. coli cells, incubated on ice for 10 minutes, subjected to thermal shock (42 ° C for 20 sec), cooled, and then the suspension was transferred to a Petri dish with a solid agarized nutrient medium containing ampicillin at a concentration of 100 μg / cm 3 , followed by incubation in an incubator at 37 ° C for 18 hours. Single colonies were analyzed by PCR using a DNA template of clones and primers used to obtain the PCR product. Clones positive for PCR were expanded in 3 cm 3 of SOB nutrient broth (ampicillin 100 μg / cm 3 ) and plasmid DNA was isolated using the GeneJET Plasmid Miniprep Kit reagent kit according to the manufacturer's protocol (ThermoScientific). Sequencing for verification of structures was performed according to the Sanger method. As a result of sequencing, it was found that in the insertion region of the plasmid pET32b (+) ASFV / p30e2 of the producer strain pET32b / ASFV / p30e2 / 1, the mutation was not contained, i.e., the correct TrxA-6xHis-p30e2-6xHis gene sequence is encoded. A map of the expression plasmid construct is shown in FIG. 1, its nucleotide sequence is SEQ ID No. 2. The amino acid sequence of the expression product is shown in SEQ ID No. 3.

Полученный рекомбинантный белок р30 штамма Ставрополь 01/08 (Stavropol2008) Rec р30е2 кодирует последовательность с 56 по 190 аминокислоту и соответствуют таковому других изолятов вируса АЧС, циркулирующего на территории РФ.The resulting recombinant protein p30 of the Stavropol strain 01/08 (Stavropol2008) Rec p30e2 encodes a sequence from 56 to 190 amino acids and corresponds to that of other ASF virus isolates circulating in the Russian Federation.

Пример 3. Индукция экспрессии и хроматографическая очистка белка Rec р30е2Example 3. Induction of expression and chromatographic purification of protein Rec p30e2

Штамм продуцент pET32b/ASFV/p30e2/1 высевали из аликвот в 20 см3 жидкой питательной среды SOB, содержащей 100 мкг/см3 ампициллина, культивировали на термошейкере 14 часов при 37°С («ночная культура») M.R. Green & J. Sambrook (2012) [10].The producer strain pET32b / ASFV / p30e2 / 1 was seeded from aliquots in 20 cm 3 of liquid SOB medium containing 100 μg / cm 3 ampicillin, cultured on a thermo shaker for 14 hours at 37 ° C ("night culture") MR Green & J. Sambrook (2012) [10].

На следующий день проводили пересев «ночной культуры» на питательную среду в соотношении среды к расплодке 25:1, соответственно, и культивирование по методу F.W. Studier и соавт.(2005) [11] в среде SOB-5052 с 50 мкг/см3 ампициллина и с использованием шейкера в течение 2-3 часов при температуре (37,0±0,5)°С и умеренном встряхивании (110-120 об/мин) до концентрации (6-7)×107 жизнеспособных клеток в см3, при этом оптическая плотность бактериальной культуры при длине волны 600 нм (OD600) составляла 0,4-0,5 (процедура подращивания пересеянной на свежеприготовленную среду «ночной» бактериальной культуры). Далее инкубировали бактериальную культуру в течение 1-2 часов до концентрации (7-9)×107 жизнеспособных клеток в см3 (OD600 0,5-0,6) при температуре (28,0±0,5)°С и также при постоянном встряхивании, затем, вносили индуктор экспрессии рекомбинантного белка - 20% раствор L-рамнозы, в отношении 1:200 (5 см3 индуктора / 1000 см3 бактериальной культуры) [9, 11, 12], и продолжали инкубировать при тех же параметрах еще 16-18 часов («автоиндукция» экспрессии рекомбинантного белка Rec р30е2).The next day, “night culture” was reseeded on a nutrient medium in a medium to seed ratio of 25: 1, respectively, and cultured according to the method of FW Studier et al. (2005) [11] in SOB-5052 medium with 50 μg / cm 3 of ampicillin and using a shaker for 2-3 hours at a temperature of (37,0 ± 0,5) ° C and moderate shaking (110-120 rev / min) to a concentration of (6-7) × 10 July viable cells in cm 3, the optical density of the bacterial culture at a wavelength of 600 nm (OD 600 ) was 0.4–0.5 (the procedure for growing the “night” seeded onto freshly prepared medium bacterial culture). Then the bacterial culture was incubated for 1-2 hours to a concentration of (7-9) × 10 7 viable cells in cm 3 (OD 600 0.5-0.6) at a temperature of (28.0 ± 0.5) ° C and also with constant shaking, then, the inducer of expression of the recombinant protein — 20% L-rhamnose solution — was introduced in a ratio of 1: 200 (5 cm 3 of the inductor / 1000 cm 3 of the bacterial culture) [9, 11, 12], and continued to incubate with the same parameters for another 16-18 hours (“auto-induction” of expression of the recombinant protein Rec p30e2).

Для работы использовали хелатообразующий сорбент из гидрофильной матрицы - Ni2+-сефароза (HIS-Select Nickel Affinity Gel, Sigma), pH буферных растворов в хроматографической системе 7,8±0,2.For work, we used a chelating sorbent from a hydrophilic matrix - Ni 2+ -sepharose (HIS-Select Nickel Affinity Gel, Sigma), pH of buffer solutions in the chromatographic system 7.8 ± 0.2.

Для приготовления лизата клеток бактериальную культуру рекомбинантного клона переносили в предварительно взвешенные полипропиленовые пробирки объемом 50 см3, охлаждали бактериальную культуру в течение 1 часа в бытовом холодильнике при 4±0,5°С, осаждали клетки бактериальной культуры центрифугированием при 3400 g в течение 30 мин и температуре 4±0,5°С. Супернатант удаляли, а осадок замораживали. После замораживания готовили лизат, для чего клетки ресуспендировали из расчета на 1 г осадка 10 см3 лизирующего буферного раствора и переносили в стеклянные флаконы по 4 см3. Биомассу разрушали тремя сериями ультразвуковой обработки с постоянным охлаждением смеси при частоте 18 кГц, каждая серия - три раза по 40 сек с перерывом в 1 мин, с перерывом между сериями - 15 минут. Процесс озвучивания контролировали микроскопически, окрашивая аликвоты лизата фуксином Пфейфера. Обломки клеток удаляли центрифугированием на настольной центрифуге при 13000 g в течение 5 мин. Супернатант отбирали и смешивали с двукратным буферным раствором для нанесения в соотношении 1:1, подводя рН пробы до значения 7,8±0,2. Содержание общего белка в лизате определяли по О.Н. Lowry et al. (1972) [13]. Пробу фильтровали через мембранные фильтры Millipore 0,45 мкм в стеклянные флаконы, объемом 10 см3.To prepare the cell lysate, the bacterial culture of the recombinant clone was transferred to 50 cm 3 pre-weighed polypropylene tubes, the bacterial culture was cooled for 1 hour in a domestic refrigerator at 4 ± 0.5 ° С, the bacterial culture cells were besieged by centrifugation at 3400 g for 30 minutes and a temperature of 4 ± 0.5 ° C. The supernatant was removed and the pellet was frozen. After freezing, a lysate was prepared, for which the cells were resuspended based on 1 g of a precipitate of 10 cm 3 of lysis buffer solution and transferred to 4 cm 3 glass vials. Biomass was destroyed by three series of ultrasonic treatment with constant cooling of the mixture at a frequency of 18 kHz, each series - three times for 40 seconds with a break of 1 minute, with a break between series of 15 minutes. The scoring process was microscopically monitored by staining aliquots of the lysate with fuchsin Pfeifer. Cell debris was removed by centrifugation on a benchtop centrifuge at 13,000 g for 5 minutes. The supernatant was collected and mixed with a double buffer solution for application in a ratio of 1: 1, adjusting the pH of the sample to a value of 7.8 ± 0.2. The total protein content in the lysate was determined by O.N. Lowry et al. (1972) [13]. The sample was filtered through membrane filters Millipore 0,45 microns in glass vials of 10 cm 3.

Хроматографическую очистку рекомбинантного белка проводили при постоянной скорости подачи растворов перистальтическим насосом 0,5 см3/мин. Для элюции рекомбинантного белка использовали буферный раствор (рН 7,8±0,2): ФБР с 300 мМ NaCl; 500 мМ Imidazol; 0,25 мг/см3 Pefablock SC (Roche). Фракцию с очищенным рекомбинантным белком диализовали в ФБР с 300 мМ NaCl и 0,25 мг/см3 Pefablock SC (Roche) (рН 7,8±0,2) в течение 16-18 часов при температуре (4,0±2,0)°С.Chromatographic purification of the recombinant protein was carried out at a constant flow rate of solutions with a 0.5 cm 3 / min peristaltic pump. To elute the recombinant protein, a buffer solution (pH 7.8 ± 0.2) was used: PBS with 300 mM NaCl; 500 mM Imidazol; 0.25 mg / cm 3 Pefablock SC (Roche). The purified recombinant protein fraction was dialyzed in PBS with 300 mM NaCl and 0.25 mg / cm 3 Pefablock SC (Roche) (pH 7.8 ± 0.2) for 16-18 hours at a temperature of (4.0 ± 2, 0) ° C.

Раствор рекомбинантного белка делили на аликвоты и хранили в замороженном виде в бытовом или низкотемпературном холодильнике.The recombinant protein solution was aliquoted and stored frozen in a domestic or low temperature refrigerator.

Эффективность очистки рекомбинантного белка оценивали в 10% ДСН-ПААГ (SDS-PAAG) электрофорезе по U.K. Laemmle (1970) [14] (фиг. 2). Выход очищенного рекомбинантного Rec р30е2 составил не менее 15,0-20,0 мг с 1 дм3 бактериальной культуры, что в пять раз выше, чем при использовании прототипа.The purification efficiency of the recombinant protein was evaluated in 10% SDS-PAGE (SDS-PAAG) electrophoresis according to UK Laemmle (1970) [14] (Fig. 2). The yield of purified recombinant Rec p30e2 was at least 15.0-20.0 mg with 1 dm 3 of the bacterial culture, which is five times higher than when using the prototype.

Пример 4. Оценка специфичности рекомбинантного белка Rec р30е2 методом иммуноблоттингаExample 4. The assessment of the specificity of the recombinant protein Rec p30e2 by immunoblotting

Разведения хроматографически очищенного белка Rec р30е2 подвергали фракцированию в 10% ДСН-ПААГ (SDS-PAAG) электрофорезе по U.K. Laemmle (1970) [14] с последующим электропереносом полипептидов из полиакриламидного геля на нитроцеллюлозную мембрану в полусухой буферной системе по методам J. Kyhse-Andersen (1984) [15]. Мембрану после электропереноса блокировали 2,0%-ным раствором обезжиренного сухого молока на фосфатном буферном растворе с 0,1% твина-20 (ФБР-т) (рН 7,8±0,2) при 4±0,5°С в течение 16-18 часов, после чего мембрану нарезали на единичные треки.Dilutions of chromatographically purified Rec p30e2 protein were subjected to fractionation in 10% SDS-PAG (SDS-PAAG) electrophoresis according to U.K. Laemmle (1970) [14] followed by the electric transfer of polypeptides from a polyacrylamide gel to a nitrocellulose membrane in a semi-dry buffer system according to the methods of J. Kyhse-Andersen (1984) [15]. The membrane after electrotransfer was blocked with a 2.0% solution of skimmed milk powder in a phosphate buffer solution with 0.1% Tween-20 (FBI-t) (pH 7.8 ± 0.2) at 4 ± 0.5 ° C in for 16-18 hours, after which the membrane was cut into single tracks.

Постановку реакции иммуноблоттинга осуществляли, основываясь на методиках МЭБ [2, 3].The immunoblotting reaction was carried out based on the methods of the OIE [2, 3].

Параметры постановки иммуноблоттинга подобраны следующие:The parameters of the immunoblotting are selected as follows:

- инкубирование иммунострипов в течение 1,5 ч при (25,0±2,5)°С с исследуемыми сыворотками в разведениях 1:20 или с исследуемыми 20% суспензиями проб органов на ФБР-т;- incubation of immunostripses for 1.5 hours at (25.0 ± 2.5) ° С with the studied sera at 1:20 dilutions or with the studied 20% suspensions of organ samples on FBI-t;

- трехкратная отмывка тест-полосок в ФБР-т по 5 мин при (25,0±2,5)°С (общее время отмывки составляет 15 мин);- three-time washing of test strips in the FBI-t for 5 minutes at (25.0 ± 2.5) ° С (total washing time is 15 minutes);

- инкубирование иммунострипов в течение 45 мин при (25,0±2,5)°С в рабочем разведении пероксидазного конъюгата с протеином А (рабочее разведение конъюгата 1:2000);- incubation of immunostripses for 45 min at (25.0 ± 2.5) ° С in the working dilution of the peroxidase conjugate with protein A (working dilution of the conjugate 1: 2000);

- четырехкратная отмывка тест-полосок в ФБР-т по 5 мин при (25,0±2,5)°С (общее время отмывки составляет 20 мин);- four-time washing of test strips in the FBI-t for 5 minutes at (25.0 ± 2.5) ° C (total washing time is 20 minutes);

- окрашивание иммунострипов в растворе хромогенного субстрата в течение 10-15 с при (25,0±2,5)°С;- staining of immunostrips in a solution of a chromogenic substrate for 10-15 s at (25.0 ± 2.5) ° С;

- остановка реакции погружением иммунострипов в дистиллированную воду;- stopping the reaction by immersion of the immunostrips in distilled water;

- визуальный учет результатов реакции.- visual recording of reaction results.

При учете результатов проводят сравнение каждого иммунострипа с отрицательным (К-) и положительным (К+) контрольными образцами. Реакцию считают положительной, если выявляют окрашенную полосу различной интенсивности и ширины на уровне положительного контроля по центру иммунострипа, отрицательной - при отсутствии специфического окрашивания (фиг. 3).When taking into account the results of each comparison performed immunostripa negative (K -) and positive (K +) controls. The reaction is considered positive if a colored band of varying intensity and width is detected at the level of a positive control in the center of the immunostrip, negative - in the absence of specific staining (Fig. 3).

Данные результаты показали, что наличие последовательности тиоредоксина в рекомбинантном белке Rec р30е2, не влияет на специфичность серологических реакций при использовании указанного белка в качестве антигена, также это позволило упростить процедуру выделения и хроматографической очистки.These results showed that the presence of the thioredoxin sequence in the recombinant Rec p30e2 protein does not affect the specificity of serological reactions when using the indicated protein as an antigen, and this also simplified the procedure of isolation and chromatographic purification.

Источники информацииInformation sources

1. Sanchez-Vizcaino, J.M. (2006). African swine fever. In Diseases of Swine, 9 Edition, pp 93-102. Ed A.D. Leman, B.E. Straw, W.L. Mengeling, S Dallaire and D.J. Taylor. Iowa State Univesity Press, 2000. - P. 159-165.1. Sanchez-Vizcaino, J.M. (2006). African swine fever. In Diseases of Swine, 9 Edition, pp 93-102. Ed A.D. Leman, B.E. Straw, W.L. Mengeling, S Dallaire and D.J. Taylor Iowa State Univesity Press, 2000 .-- P. 159-165.

2. Immunoblotting OIE for Serological Diagnosis of African Swine Fever (SOP/CISA/ASF/IB/1/2008) [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://asf-referencelab.info/asf/images/files/SOPs/SOP-AFSIB12008.pdf. - Загл. с экрана.2. Immunoblotting OIE for Serological Diagnosis of African Swine Fever (SOP / CISA / ASF / IB / 1/2008) [Electronic resource]. - Access mode: http://asf-referencelab.info/asf/images/files/SOPs/SOP-AFSIB12008.pdf. - Zagl. from the screen.

3. Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals (mammals, birds and bees). Capter 2.8.1. African swine fever/ Office International des Epizooties [Электронный ресурс]. - Paris, France, 2008. - 6th ed. - Режим доступа: http://www.oie.int/fileadmin/Home/fr/Health_standards/tahm/2.08.01_ASF.pdf. - Загл. с экрана.3. Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals (mammals, birds and bees). Capter 2.8.1. African swine fever / Office International des Epizooties [Electronic resource]. - Paris, France, 2008 .-- 6th ed. - Access mode: http://www.oie.int/fileadmin/Home/fr/Health_standards/tahm/2.08.01_ASF.pdf. - Zagl. from the screen.

4. Середа, А.Д. Белки вируса африканской чумы свиней / А.Д. Середа, Д.В. Колбасов // Научный журнал КубГАУ. - 2012. - №77(03). - С. 21-37. - 0421200012\0181. http://ej.kubagro.ru/2012/03/pdf/48.pdf.4. Sereda, A.D. Proteins of the African swine fever virus / A.D. Sereda, D.V. Kolbasov // Scientific journal KubSAU. - 2012. - No. 77 (03). - S. 21-37. - 0421200012 \ 0181. http://ej.kubagro.ru/2012/03/pdf/48.pdf.

5. Serodiagnosis of African swine fever using the recombinant protein p30 expressed in insect larvae / M.G. Barderas, A. Wigdorovit, F. Merelo, F. Beitia, C. Alonso, M.V. Borca, J.M. Escribano // Journal of Virological Methods. - 2000. - Vol. 89, N 1-2. - P. 129-136.5. Serodiagnosis of African swine fever using the recombinant protein p30 expressed in insect larvae / M.G. Barderas, A. Wigdorovit, F. Merelo, F. Beitia, C. Alonso, M.V. Borca, J.M. Escribano // Journal of Virological Methods. - 2000. - Vol. 89, N 1-2. - P. 129-136.

6. Копытов, B.O. Клонирование и экспрессия генов структурных белков р30 и р72 вируса африканской чумы свиней: дис.... канд. биол. наук: 03.00.06: защищена 23.12.04 / Копытов Валерий Олегович. - Покров, 2004. - 140 с. 6. Kopytov, B.O. Cloning and expression of genes for structural proteins p30 and p72 of the virus of African swine fever: dis .... Cand. biol. Sciences: 03.00.06: protected 12.23.04 / Kopytov Valeriy Olegovich. - Pokrov, 2004 .-- 140 s.

7. Пат. RU 2463343 С1. Штамм клеток E.coli BL21(DE3)pLysS, клон pTT9/ASFVp30, содержащий рекомбинантную плазмиду со встройкой участка гена CP204L вируса африканской чумы свиней, кодирующего конформационный эпитоп белка р30, для изготовления диагностических препаратов / В.О. Копытов, С.Ж. Цыбанов, А.С. Казакова, Т.Э. Южук, С.А. Белянин, А.Г. Гузалова, Н.Н. Власова, Д.В. Колбасов (RU). - №2011141517/10; заявл. 13.10.2011; опубл. 10.10.2012, Бюл. №28. - 8 с. Режим доступа http:www.freepatent.ru/images/patents/54/2463343/patent-2463343.pdf.7. Pat. RU 2463343 C1. The strain of E. coli cells BL21 (DE3) pLysS, clone pTT9 / ASFVp30 containing a recombinant plasmid with the insertion of a portion of the gene for African swine fever virus CP204L encoding the p30 protein conformational epitope for the manufacture of diagnostic preparations / B.O. Kopytov, S.Zh. Tsybanov, A.S. Kazakova, T.E. Yuzhuk, S.A. Belyanin, A.G. Guzalova, N.N. Vlasova, D.V. Sausages (RU). - No. 2011141517/10; declared 10/13/2011; publ. 10/10/2012, Bull. No. 28. - 8 p. Access mode http: www.freepatent.ru/images/patents/54/2463343/patent-2463343.pdf.

8. Пат. RU 2439152 С1. Штамм «Ставрополь 01/08» вируса АЧС для вирусологических, молекулярно-генетических и мониторинговых исследований / В.М. Балышев, Д.В. Колбасов, В.В. Куриннов, Ю.Ф. Калантаенко, С.Ж. Цыбанов, А.Н. Жуков, А.П. Васильев (RU). - №2010126641/10; заявл. 30.06.2010; опубл. 10.01.2012, Бюл. №1. - 6 с. Режим доступа: http://www.freepatent.ru/images/patents/19/2439152/patent-2439152.pdf.8. Pat. RU 2439152 C1. The strain "Stavropol 01/08" ASF virus for virological, molecular genetic and monitoring studies / V.M. Balyshev, D.V. Kolbasov, V.V. Kurinnov, Yu.F. Kalantaenko, S.Zh. Tsybanov, A.N. Zhukov, A.P. Vasiliev (RU). - No. 2010126641/10; declared 06/30/2010; publ. 01/10/2012, Bull. No. 1. - 6 p. Access mode: http://www.freepatent.ru/images/patents/19/2439152/patent-2439152.pdf.

9. Novagen рЕТ System Manual. - 11th Edition. User Protocol TB055 Rev. С 0611 JN 1-63Х[Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.emdmillipore.com/chemdat/en_CA/Merck-US-Site/USD/ViewProductDocuments-File?ProductSKU=EMD_BIO-71867&DocumentType=USP&DocumentId=/emd/biosciences/userprotocols/en-US/TB055.pdf&DocumentSource=GDS. - Загл. с экрана.9. Novagen PET System Manual. - 11th Edition. User Protocol TB055 Rev. C 0611 JN 1-63X [Electronic resource]. - Access mode: http://www.emdmillipore.com/chemdat/en_CA/Merck-US-Site/USD/ViewProductDocuments-File?ProductSKU=EMD_BIO-71867&DocumentType=USP&DocumentId=/emd/biosciences/userprotocols/en-US/Tervices .pdf & DocumentSource = GDS. - Zagl. from the screen.

10. Green, M.R. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. - 4th ed. / M.R. Green and J. Sambrook. - New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012. - 2096 p.10. Green, MR Molecular Cloning: A Laboratory Manual. - 4 th ed. / MR Green and J. Sambrook. - New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012 .-- 2096 p.

11. Studier, F.W. Protein production by auto-induction in high density shaking cultures/ F.W. Studier // Protein Expr Purif. - 2005. - Vol. 41, №1. - P. 207-34. - Режим доступа http://www.biology.bnl.gov/cellbio/studier.html. - Загл. с экрана.11. Studier, F.W. Protein production by auto-induction in high density shaking cultures / F.W. Studier // Protein Expr Purif. - 2005. - Vol. 41, No. 1. - P. 207-34. - Access mode http://www.biology.bnl.gov/cellbio/studier.html. - Zagl. from the screen.

12. Single Step (KRX) Competent Cells. Technical Bulletin. - Promega, 2009. - Part TB352. - 11 p.12. Single Step (KRX) Competent Cells. Technical Bulletin. - Promega, 2009 .-- Part TB352. - 11 p.

13. Protein masurement with the folin phenol reagents/ O.H. Lowry, M.G. Rosebrough, A.L. Farr [et al.] // J. Gen. Virol. - 1972. - Vol.14. - №1. - P. 111-114.13. Protein masurement with the folin phenol reagents / O.H. Lowry, M.G. Rosebrough, A.L. Farr [et al.] // J. Gen. Virol. - 1972. - Vol.14. - No. 1. - P. 111-114.

14. Laemmle, U.K. Clevage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage Т4 / U.K. Laemmli // Nature. - 1970. - Vol. 227. - P. 680-685.14. Laemmle, U.K. Clevage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 / U.K. Laemmli // Nature. - 1970. - Vol. 227. - P. 680-685.

15. Kyhse-Andersen, J. Electroblotting of multiple gels:a simple apparatus without buffer tank for rapid transfer of proteins from polyacrylamide to nitrocellulose / J. Kyhse-Andersen // J. of Biochem. and Biophys. Methods. - 1984. - Vol. 10. - №3/4. - P. 203-209.15. Kyhse-Andersen, J. Electroblotting of multiple gels: a simple apparatus without buffer tank for rapid transfer of proteins from polyacrylamide to nitrocellulose / J. Kyhse-Andersen // J. of Biochem. and Biophys. Methods - 1984. - Vol. 10. - No. 3/4. - P. 203-209.

Claims (1)

Экспрессирующий плазмидный вектор pET32b(+)ASFV/p30e2 (SEQ ID №2), конструктивное выполнение которого раскрыто на фиг. 1, состоящий из плазмиды pET32b, фрагмента гена CP204L белка вируса африканской чумы свиней р30 и двух полигистидиновых последовательностей, обеспечивающий синтез в клетках Escherichia coli кодируемого геном TrxA-6xHis-p30e2-6xHis (SEQ ID №1) рекомбинантного белка Rec р30е2 (SEQ ID №3), используемого в качестве вирусспецифического антигена для диагностического исследования сывороток свиней методом иммуноблоттинга. The expression plasmid vector pET32b (+) ASFV / p30e2 (SEQ ID NO: 2), the structural embodiment of which is disclosed in FIG. 1, consisting of plasmid pET32b, a fragment of the gene for African pig plague virus p30 protein CP204L and two polyhistidine sequences, which provides for the synthesis of recombinant protein Rec ID p30e2 (SEQ ID No. 1) SE ID No. 1 SEX ID No. 1 SEX ID NO. 3) used as a virus-specific antigen for the diagnostic study of pig sera by immunoblotting.
RU2015102383/10A 2015-01-26 2015-01-26 Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections RU2603056C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2015102383/10A RU2603056C2 (en) 2015-01-26 2015-01-26 Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2015102383/10A RU2603056C2 (en) 2015-01-26 2015-01-26 Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2015102383A RU2015102383A (en) 2016-08-10
RU2603056C2 true RU2603056C2 (en) 2016-11-20

Family

ID=56612560

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015102383/10A RU2603056C2 (en) 2015-01-26 2015-01-26 Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2603056C2 (en)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2647573C1 (en) * 2017-03-14 2018-03-16 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии" (ФГБНУ ФИЦВиМ) BACTERIAL STRAIN OF ESCHERICHIA COLI KRX pET32b/ASFV/p30-PRODUCER OF CHIMERICAL RECOMBINANT PROTEIN p30 OF AFRICAN SWINE FEVER VIRUS
CN109254155B (en) * 2018-09-25 2020-08-28 扬州大学 Colloidal gold immunochromatographic test paper for detecting African swine fever virus antigen, and preparation method and application thereof
CN111607000B (en) * 2019-02-26 2023-10-31 浙江海隆生物科技有限公司 Recombinant African swine fever virus p30 subunit soluble fusion protein and preparation method and application thereof
CN116444653B (en) * 2023-03-09 2024-03-15 中国农业科学院上海兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心上海分中心) Preparation and application of blocking African swine fever virus monoclonal antibody hybridoma cell strain

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2360971C1 (en) * 2007-11-23 2009-07-10 ГНУ ВНИИ ветеринарной вирусологии и микробиологии Method and test system to detect dna of african swine fever virus by means of specific oligonucleotide primers in polymerase chain reaction
EP2154146A1 (en) * 2007-04-17 2010-02-17 Centre De Recerca En Sanitat Animal (CRESA) Use of african swine pest haemoglutinin as an adjuvant
RU2463343C1 (en) * 2011-10-13 2012-10-10 Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Российской академии сельскохозяйственных наук Ecoli BL21 (DE3)pLysS CELL STRAIN, pTT9/ASFVp30 CLONE CONTAINING RECOMBINANT PLASMID WITH INTEGRATION OF PART OF CP204L GENE OF AFRICAN SWINE FEVER VIRUS, ENCODING CONFORMATIONAL EPITOPE OF PROTEIN p30, FOR PRODUCING DIAGNOSTIC PREPARATIONS
EP2674438A2 (en) * 2012-06-12 2013-12-18 Alternative Gene Expression, S.L. System Overexpressing baculovirus transactivators for the production of Recombinant Proteins
RU2534343C1 (en) * 2013-09-02 2014-11-27 Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Россельхозакадемии Method of production of monoclonal antibodies to protein p30 of african swine fever virus using recombinant constructions

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2154146A1 (en) * 2007-04-17 2010-02-17 Centre De Recerca En Sanitat Animal (CRESA) Use of african swine pest haemoglutinin as an adjuvant
RU2360971C1 (en) * 2007-11-23 2009-07-10 ГНУ ВНИИ ветеринарной вирусологии и микробиологии Method and test system to detect dna of african swine fever virus by means of specific oligonucleotide primers in polymerase chain reaction
RU2463343C1 (en) * 2011-10-13 2012-10-10 Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Российской академии сельскохозяйственных наук Ecoli BL21 (DE3)pLysS CELL STRAIN, pTT9/ASFVp30 CLONE CONTAINING RECOMBINANT PLASMID WITH INTEGRATION OF PART OF CP204L GENE OF AFRICAN SWINE FEVER VIRUS, ENCODING CONFORMATIONAL EPITOPE OF PROTEIN p30, FOR PRODUCING DIAGNOSTIC PREPARATIONS
EP2674438A2 (en) * 2012-06-12 2013-12-18 Alternative Gene Expression, S.L. System Overexpressing baculovirus transactivators for the production of Recombinant Proteins
RU2534343C1 (en) * 2013-09-02 2014-11-27 Государственное научное учреждение Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии Россельхозакадемии Method of production of monoclonal antibodies to protein p30 of african swine fever virus using recombinant constructions

Also Published As

Publication number Publication date
RU2015102383A (en) 2016-08-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Hudu et al. Cell culture, technology: enhancing the culture of diagnosing human diseases
Kazakova et al. Recombinant protein p30 for serological diagnosis of African swine fever by immunoblotting assay
RU2603056C2 (en) Expression plasmid vector pet32b(+)/asfv/p30e2 for production of recombinant protein, consisting of african swine fever virus protein p30, thioredoxin and polyhistidine sections
CN108680744B (en) Indirect ELISA detection kit for detecting novel duck reovirus antibody and application thereof
Wood et al. Persistence, immune response, and antigenic variation of Mycoplasma genitalium in an experimentally infected pig-tailed macaque (Macaca nemestrina)
Mobberley et al. The temperate marine phage ΦHAP-1 of Halomonas aquamarina possesses a linear plasmid-like prophage genome
CN112724208A (en) SADS-CoV recombinant S protein extracellular segment and preparation method and application thereof
Johne et al. Recombinant expression of a truncated capsid protein of beak and feather disease virus and its application in serological tests
Venkatesan et al. Expression and evaluation of recombinant P32 protein based ELISA for sero-diagnostic potential of capripox in sheep and goats
Zheng et al. Serological detection of bovine ephemeral fever virus using an indirect ELISA based on antigenic site G1 expressed in Pichia pastoris
Liu et al. Deep-sea thermophilic Geobacillus bacteriophage GVE2 transcriptional profile and proteomic characterization of virions
Drecktrah et al. Characterization of 6S RNA in the Lyme disease spirochete
Duan et al. Enhanced therapeutic efficacy of Listeria-based cancer vaccine with codon-optimized HPV16 E7
RU2647573C1 (en) BACTERIAL STRAIN OF ESCHERICHIA COLI KRX pET32b/ASFV/p30-PRODUCER OF CHIMERICAL RECOMBINANT PROTEIN p30 OF AFRICAN SWINE FEVER VIRUS
CN108982847B (en) Indirect ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) detection method for duck reovirus causing duck spleen necrosis
CN104862331B (en) A kind of method of solubility expression Rhodococcus equi Disease-causing gene VapA albumen
RU2742511C1 (en) RECOMBITANT PLASMID DNA pET21-VP40VE CONTAINING THE GENE FOR THE MATRIX PROTEIN VP40 OF EBOLA VIRUS AND THE RECOMBITANT PROTEIN VP40-VE OBTAINED AS A RESULT OF THE GENE EXPRESSION FOR THE PROTEIN VP40 OF EBOLA VIRUS USING THE RECOMBITANT PLASMID DNA pET21-VP40VE AND EXHIBITING IMMUNOGENIC AND ANTIGENIC PROPERTIES
Rana et al. Expression of recombinant Apple chlorotic leaf spot virus coat protein in heterologous system: production and use in immunodiagnosis
CN107664694A (en) A kind of ELISA kit based on E2 Protein Detection pig atypia pestivirus antibody
Sung et al. Improved sero-monitoring assay for classical swine fever (CSF) using the recombinant E2 protein of a recent Korean isolate
Naveen Kumar et al. Genomic and antibody-based assays for the detection of Indian strains of Macrobrachium rosenbergii nodavirus and extra small virus associated with white tail disease of Macrobrachium rosenbergii
CN113307852A (en) Induced expression and purification method for 47kDa protein of orientia tsutsutsugamushi
CN113583113A (en) Single-chain antibody for resisting porcine epidemic diarrhea virus and preparation method thereof
Mirnurollahi et al. Expression and purification of HCV core and core-E1E2 proteins in different bacterial strains
Ibrahim et al. Determination of the optimal conditions of cloning Aerolysin gene from the common carp pathogen Aeromonas hydrophila in Escherichia coli BL21

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20170127