RU2022124050A - Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование - Google Patents

Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование Download PDF

Info

Publication number
RU2022124050A
RU2022124050A RU2022124050A RU2022124050A RU2022124050A RU 2022124050 A RU2022124050 A RU 2022124050A RU 2022124050 A RU2022124050 A RU 2022124050A RU 2022124050 A RU2022124050 A RU 2022124050A RU 2022124050 A RU2022124050 A RU 2022124050A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
gaa
nucleic acid
paragraphs
fragment
Prior art date
Application number
RU2022124050A
Other languages
English (en)
Inventor
Федерико МИНГОЦЦИ
Джузеппе РОНЦИТТИ
Паскуалина Колелла
Франческо ПУЦЦО
Original Assignee
Женетон
Сорбонн Юниверсите
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Женетон, Сорбонн Юниверсите filed Critical Женетон
Publication of RU2022124050A publication Critical patent/RU2022124050A/ru

Links

Claims (18)

1. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая функциональный химерный белок GAA, который содержит фрагмент сигнального пептида и фрагмент функциональной GAA, в частности фрагмент GAA, соответствующий усеченной форме родительской GAA, где фрагмент сигнального пептида имеет аминокислотную последовательность, выбранную в группе, состоящей из SEQ ID NO: 2-4, предпочтительно SEQ ID NO: 2.
2. Молекула нуклеиновой кислоты по п. 1, в которой указанный фрагмент GAA имеет от 1 до 75 последовательных аминокислот, усеченных на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA, где указанный фрагмент GAA имеет в частности 6, 7, 8, 9, 10, 40, 41, 42, 43, 44, 45 или 46 последовательных аминокислот, усеченных на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA, в частности 8, 42 или 43 последовательных аминокислот, усеченных на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA.
3. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1, 2, в которой указанный фрагмент GAA имеет 8 последовательных аминокислот, усеченных на его N-конце, по сравнению с родительской GAA.
4. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-3, в которой указанная родительская GAA представляет собой полипептид GAA человека, приведенный в SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 36, в частности в SEQ ID NO: 5.
5. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-4, которая представляет собой нуклеотидную последовательность, оптимизированную для того, чтобы усовершенствовать экспрессию и/или усовершенствовать иммунологическую толерантность для химерной GAA in vivo, в частности нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 13 или 14.
6. Молекула нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-5, которая содержит нуклеотидную последовательность, являющуюся результатом комбинации следующих последовательностей:
Кодирующая фрагмент сигнального пептида последовательность Кодирующая фрагмент GAA последовательность SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 31
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 13
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 14
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 32
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 33
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 34
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 35
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 44
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 45
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 46
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 47
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 48
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 49
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 50
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 51
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 52
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 53
SEQ ID NO: 26
SEQ ID NO: 27
SEQ ID NO: 28
SEQ ID NO: 54
7. Конструкция нуклеиновой кислоты, которая содержит молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, которая представляет собой экспрессирующую кассету, содержащую указанную молекулу нуклеиновой кислоты, функционально связанную с промотором, таким как специфический промотор печени, предпочтительно выбранный в группе, состоящей из промотора α-1-антитрипсина (hAAT), промотора транстиретина, промотора альбумина и промотора тироксинсвязывающего глобулина (TBG), где указанная конструкция нуклеиновой кислоты необязательно дополнительно содержит интрон, в частности интрон, выбранный в группе, состоящей из интрона β-глобина b2 человека (или HBB2), интрона FIX, интрона β-глобина курицы и интрона SV40, где указанный интрон необязательно представляет собой модифицированный интрон, такой как модифицированный интрон HBB2 из SEQ ID NO: 7, модифицированный интрон FIX из SEQ ID NO: 9 или модифицированный интрон β-глобина курицы из SEQ ID NO: 11.
8. Конструкция нуклеиновой кислоты по п. 7, которая содержит, предпочтительно в этом порядке: энхансер; интрон; промотор, в частности специфический промотор печени; последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую химерный полипептид GAA; и сигнал полиаденилирования, конструкция содержит, предпочтительно в этом порядке: управляющую область ApoE; интрон HBB2, в частности, модифицированный интрон HBB2; промотор hAAT; последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую химерный полипептид GAA; и сигнал полиаденилирования бычьего гормона роста, указанная конструкция нуклеиновой кислоты более конкретно содержит нуклеотидную последовательность из SEQ ID NO: 20, 21 или 22 или нуклеотидную последовательность, являющуюся результатом любой одно из комбинаций, представленных в п. 6.
9. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты или конструкцию нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-8, который представляет собой вирусный вектор, предпочтительно ретровирусный вектор, такой как лентивирусный вектор, или AAV вектор, такой как одноцепочечный или двухцепочечный самокомплементарный AAV вектор, предпочтительно AAV вектор с происходящим из AAV капсидом, таким как капсид AAV1, AAV2, варианта AAV2, AAV3, варианта AAV3, AAV3B, варианта AAV3B, AAV4, AAV5, AAV6, варианта AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, например, AAVcy10 и AAVrh10, AAVrh74, AAVdj, AAV-Anc80, AAV-LK03, AAV2i8 и AAV свиньи, например, AAVpo4 и AAVpo6, или с химерным капсидом, где AAV вектор более конкретно имеет капсид AAV8, AAV9, AAVrh74 или AAV2i8, в частности капсид AAV8, AAV9 или AAVrh74, более конкретно капсид AAV8.
10. Клетка, трансформированная молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, конструкцией нуклеиновой кислоты по любому одному из пп. 7, 8 или вектором по п. 9, где клетка, в частности представляет собой клетку печени или клетку мышцы.
11. Химерный полипептид GAA, который содержит фрагмент сигнального пептида и фрагмент функциональной GAA, где фрагмент сигнального пептида выбирают в группе, состоящей из SEQ ID NO: 2-4, где в частности фрагмент GAA представляет собой усеченную форму родительского полипептида GAA, такую как фрагмент GAA, имеющий от 1 до 75 последовательных аминокислот, удаленных на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA, в частности 6, 7, 8, 9, 10, 20, 27, 28, 29, 30, 31, 41, 42, 43, 44, 45 или 45, более конкретно 6, 7, 8, 9, 10, 20, 41, 42, 43 или 44 последовательные аминокислоты, удаленные на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA, где фрагмент GAA в частности представляет собой усеченную форму белка GAA человека из SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 36, в частности из SEQ ID NO: 5.
12. Химерный полипептид GAA по п. 11, в котором фрагмент GAA имеет 8, 29, 42 или 43 последовательные аминокислоты, усеченные на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA, более конкретно 8 или 42, в частности 8 последовательных аминокислот, усеченных на его N-конце, по сравнению с родительским полипептидом GAA, в частности по сравнению с белком GAA человека из SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 36, в частности из SEQ ID NO: 5.
13. Химерный полипептид GAA по п. 11 или 12, который содержит аминокислотную последовательность, являющуюся результатом комбинации следующих последовательностей:
Фрагмент сигнального пептида фрагмент GAA SEQ ID NO: 2
SEQ ID NO: 3
SEQ ID NO: 4
hGAA дикого типа, свободная от ее природного сигнального пептида; например, SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 36, в частности SEQ ID NO: 5
SEQ ID NO: 2
SEQ ID NO: 3
SEQ ID NO: 4
Усеченная hGAA с делецией 8 последовательных N-концевых аминокислот; например, SEQ ID NO: 29
SEQ ID NO: 2
SEQ ID NO: 3
SEQ ID NO: 4
Усеченная hGAA с делецией 29 последовательных N-концевых аминокислот; например, SEQ ID NO: 41
SEQ ID NO: 2
SEQ ID NO: 3
SEQ ID NO: 4
Усеченная hGAA с делецией 42 последовательных N-концевых аминокислот; например, SEQ ID NO: 30
SEQ ID NO: 2
SEQ ID NO: 3
SEQ ID NO: 4
Усеченная hGAA с делецией 43 последовательных N-концевых аминокислот; например, SEQ ID NO: 42
SEQ ID NO: 2
SEQ ID NO: 3
SEQ ID NO: 4
Усеченная hGAA с делецией 47 последовательных N-концевых аминокислот; например, SEQ ID NO: 43
14. Фармацевтическая композиция, содержащая в фармацевтически приемлемом носителе последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, конструкцию нуклеиновой кислоты по любому из пп. 7, 8, вектор по п. 9, клетку по п. 10 или химерный полипептид по любому из пп. 11-13.
15. Последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, конструкция нуклеиновой кислоты по любому из пп. 7, 8, вектор по п. 9, клетка по п. 10 или химерный полипептид по любому из пп. 11-13 для применения в качестве лекарственного средства.
16. Последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп. 1-6, конструкция нуклеиновой кислоты по любому из пп. 7, 8, вектор по п. 9, клетка по п. 10 или химерный полипептид по любому из пп. 11-13 для применения в способе лечения болезни накопления гликогена, такой как GSDI (болезнь Гирке), GSDII (болезнь Помпе), GSDIII (болезнь Кори), GSDIV, GSDV, GSDVI, GSDVII, GSDVIII и летальная врожденная болезнь накопления гликогена в сердце, более конкретно GSDI, GSDII или GSDIII, даже более конкретно GSDII и GSDIII и наиболее конкретно GSDII.
RU2022124050A 2016-09-12 2017-09-12 Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование RU2022124050A (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP16306149.2 2016-09-12

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019110772A Division RU2780329C2 (ru) 2016-09-12 2017-09-12 Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2022124050A true RU2022124050A (ru) 2022-10-06

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102604510B1 (ko) 신규 아데노-관련 바이러스 캡시드 단백질
US11821008B2 (en) Liver targeting adeno-associated viral vectors
US10046016B2 (en) Mutant adeno-associated virus virions and methods of use thereof
RU2018116076A (ru) Модифицированные гены атаксии фридрейха и векторы для генной терапии
RU2015144234A (ru) Композиции и способы лечения mps1
AU2017322374B2 (en) Acid-alpha glucosidase variants and uses thereof
RU2017115477A (ru) Полинуклеотиды aadc для лечения болезни паркинсона
RU2017125234A (ru) Конструкции нуклеиновой кислоты и векторы для генотерапии для применения для лечения болезни вильсона и других состояний
JP2003505033A5 (ru)
US20210292724A1 (en) Mini-gde for the treatment of glycogen storage disease iii
JPWO2020106916A5 (ru)
RU2022124050A (ru) Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование
RU2019110772A (ru) Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование
US20180163229A1 (en) Novel recombinant adeno-associated virus capsids containing a designed ankyrin repeat protein (darpin) or fragment thereof
RU2022124093A (ru) Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование
RU2019110773A (ru) Варианты кислой альфа-глюкозидазы и их использование
US11795207B2 (en) Modified plasma clotting factor VIII and method of use thereof
US20240181082A1 (en) Methods and means for the prevention and/or treatment of hemophilic arthropathy in hemophilia
JPWO2021076911A5 (ru)
RU2022111734A (ru) Кодон-оптимизированная нуклеиновая кислота, которая кодирует белок фактора свёртывания крови VIII c делетированным B доменом, и ее применение
RU2779318C2 (ru) Новые капсидные белки адено-ассоциированного вируса
RU2022111695A (ru) Выделенная нуклеиновая кислота, которая кодирует слитый белок на основе FVIII-BDD и гетерологичного сигнального пептида, и ее применение
JPWO2019200286A5 (ru)
EP4314041A1 (en) Modified plasma clotting factor viii and method of use thereof
WO2021078834A1 (en) Chimeric acid-alpha glucosidase polypeptides and uses thereof