RU2021135111A - Производство молочных олигосахаридов человека в микробных продуцентах с искусственным импортом/экспортом - Google Patents

Производство молочных олигосахаридов человека в микробных продуцентах с искусственным импортом/экспортом Download PDF

Info

Publication number
RU2021135111A
RU2021135111A RU2021135111A RU2021135111A RU2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
genetically modified
host microorganism
modified host
cell
udp
Prior art date
Application number
RU2021135111A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2798786C2 (ru
Inventor
Штефан ЙЕННЕВАЙН
Дирк ВАРТЕНБЕРГ
Original Assignee
Йенневайн Биотехнологи Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Йенневайн Биотехнологи Гмбх filed Critical Йенневайн Биотехнологи Гмбх
Publication of RU2021135111A publication Critical patent/RU2021135111A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2798786C2 publication Critical patent/RU2798786C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/24Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/24Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • C07K14/245Escherichia (G)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/285Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Pasteurellaceae (F), e.g. Haemophilus influenza
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/67General methods for enhancing the expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/04Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/18Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a glycosyl transferase, e.g. alpha-, beta- or gamma-cyclodextrins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y204/00Glycosyltransferases (2.4)
    • C12Y204/01Hexosyltransferases (2.4.1)
    • C12Y204/01146Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase (2.4.1.146)

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (19)

1. Способ производства лакто-N-триозы II генетически модифицированной клеткой микроорганизма-хозяина, включающий стадии, на которых
- получают генетически модифицированную клетку микроорганизма-хозяина, которая включает:
- по меньшей мере одну рекомбинантную β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансферазу,
- повышенную экспрессию или активность по меньшей мере одного белка, осуществляющего экспорт сахара, способного осуществлять экспорт лакто-N-триозы II;
- культивируют клетку микроорганизма-хозяина в среде в условиях, обеспечивающих производство лакто-N-триозы II, в результате чего осуществляется повышенный уровень экспорта лакто-N-триозы II в среду по сравнению с немодифицированной клеткой микроорганизма-хозяина, и
- получают лакто-N-триозу II из среды.
2. Способ по п. 1, где указанная β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза относится к классу lgtA из Neisseria meningitides или PmnagT из Pasteurella multocida, или их вариантам.
3. Способ по п. 1, где указанный по меньшей мере один белок, осуществляющий экспорт сахара, выбран из группы, состоящей из yjhB из Escherichia coli, proP из Mannheimia succiniciproducens, setA из Cedecea neteri и их функциональных фрагментов.
4. Способ по п. 1, в котором в генетически модифицированной клетке микроорганизма-хозяина осуществлена инактивация эндогенных генов β-галактозидазы и глюкозамин-6-фосфат-дезаминазы, и при этом указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина содержит нуклеиновокислотную последовательность, кодирующую функциональный белок лактозопермеазы.
5. Способ по п. 1, где указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина включает повышенную способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу или ГДФ-фукозу или ЦМФ-N-ацетилнейраминовую кислоту по сравнению с генетически не модифицированной клеткой-хозяином, при этом, возможно, указанная повышенная способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу присутствует за счет сверхэкспрессии одного или более чем одного гена, кодирующего белок, выбранный из группы, состоящей из L-глутамин:D-фруктозо-6-фосфат-аминотрансферазы, N-ацетилглюкозамин-1-фосфатуридилтрансферазы/глюкозамин-1-фосфатацетилтрансферазы, фосфоглюкозаминмутазы, УДФ-галактозо-4-эпимеразы, фосфоглюкомутазы, глюкозо-1-фосфатуридилилтрансферазы.
6. Способ по п. 4, где указанную генетически модифицированную клетку микроорганизма-хозяина культивируют в присутствии глюкозы, сахарозы, глицерина или их комбинации.
7. Способ по п. 6, где указанную генетически модифицированную клетку микроорганизма-хозяина культивируют не в присутствии N-ацетилглюкозамина или галактозы.
8. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина для производства лакто-N-триозы II, где указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина включает:
- по меньшей мере одну рекомбинантную β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансферазу, и
- повышенную экспрессию или активность по меньшей мере одного белка, осуществляющего экспорт сахара, способного осуществлять экспорт лакто-N-триозы II.
9. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где указанная β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза относится к классу lgtA из Neisseria meningitides или PmnagT из Pasteurella multocida, или их вариантам.
10. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где указанный по меньшей мере один белок, осуществляющий экспорт сахара, выбран из группы, состоящей из yjhB из Escherichia coli, proP из Mannheimia succiniciproducens, setA из Cedecea neteri и их функциональных фрагментов.
11. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где в указанной генетически модифицированной клетке микроорганизма-хозяина осуществлена инактивация эндогенных генов β-галактозидазы и глюкозамин-6-фосфат-дезаминазы, и при этом указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина содержит нуклеиновокислотную последовательность, кодирующую функциональный белок лактозопермеазы.
12. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина включает повышенную способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу или ГДФ-фукозу или ЦМФ-N-ацетилнейраминовую кислоту по сравнению с генетически не модифицированной клеткой-хозяином, при этом, возможно, указанная повышенная способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу присутствует за счет сверхэкспрессии одного или более чем одного гена, кодирующего белок, выбранный из группы, состоящей из L-глутамин:D-фруктозо-6-фосфат-аминотрансферазы, N-ацетилглюкозамин-1-фосфатуридилтрансферазы/глюкозамин-1-фосфатацетилтрансферазы, фосфоглюкозаминмутазы, УДФ-галактозо-4-эпимеразы, фосфоглюкомутазы, глюкозо-1-фосфатуридилилтрансферазы.
RU2021135111A 2015-09-12 2016-09-12 Производство молочных олигосахаридов человека в микробных продуцентах с искусственным импортом/экспортом RU2798786C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP15184968.4A EP3141610A1 (en) 2015-09-12 2015-09-12 Production of human milk oligosaccharides in microbial hosts with engineered import / export
EP15184968.4 2015-09-12

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018109987A Division RU2763170C2 (ru) 2015-09-12 2016-09-12 Производство олигосахаридов человеческого молока в микроорганизмах-хозяевах с модифицированным импортом/экспортом

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2021135111A true RU2021135111A (ru) 2021-12-30
RU2798786C2 RU2798786C2 (ru) 2023-06-27

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
WO2017042382A1 (en) 2017-03-16
PH12018550020A1 (en) 2018-08-13
RU2018109987A (ru) 2019-10-16
EP3347483A1 (en) 2018-07-18
CN108026556A (zh) 2018-05-11
JP7362831B2 (ja) 2023-10-17
AU2016319304B2 (en) 2021-04-29
AU2016319304A1 (en) 2018-03-08
RU2018109987A3 (ru) 2020-01-27
US20180305724A1 (en) 2018-10-25
BR112018004725A2 (pt) 2018-09-25
JP7069007B2 (ja) 2022-05-17
EP3141610A1 (en) 2017-03-15
KR20180043297A (ko) 2018-04-27
JP2018526019A (ja) 2018-09-13
US20210277435A1 (en) 2021-09-09
MX2018003037A (es) 2019-01-10
CN108026556B (zh) 2023-01-20
RU2763170C2 (ru) 2021-12-28
JP2022105118A (ja) 2022-07-12
US11046985B2 (en) 2021-06-29
US20210277436A1 (en) 2021-09-09
MX2022003994A (es) 2022-04-26
JP2022105119A (ja) 2022-07-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018109987A (ru) Производство олигосахаридов человеческого молока в микроорганизмах-хозяевах с модифицированным импортом/экспортом
RU2020105821A (ru) Сиалилтрансферазы и их применение в получении сиалированных олигосахаридов
Schmid et al. Bacterial exopolysaccharides: biosynthesis pathways and engineering strategies
ES2715010T3 (es) Fermentación total de oligosacáridos
Jin et al. Production of specific-molecular-weight hyaluronan by metabolically engineered Bacillus subtilis 168
Boels et al. Sugar catabolism and its impact on the biosynthesis and engineering of exopolysaccharide production in lactic acid bacteria
RU2021109889A (ru) Мутантные микроорганизмы, устойчивые к гибели под действием лактозы
Cui et al. New advances in exopolysaccharides production of Streptococcus thermophilus
DK2970872T1 (da) Mikroorganismer og fremgangsmåder til fremstilling af sialylerede og N-acetylglucosamin-holdige oligosaccharider
Muthana et al. Improved one-pot multienzyme (OPME) systems for synthesizing UDP-uronic acids and glucuronides
JP2017529857A5 (ru)
JP2013535962A5 (ru)
US20220145342A1 (en) Fermentative production of carbohydrates by microbial cells utilizing a mixed feedstock
Nehru et al. Production and characterization of low molecular weight heparosan in Bacillus megaterium using Escherichia coli K5 glycosyltransferases
CN104498420B (zh) 一种产肝素前体的重组枯草芽孢杆菌及其应用
MX2021005948A (es) Biosintesis de compuestos en levadura.
RU2021100512A (ru) Ферментативный способ производства моносахаридов в свободной форме из сахаров, активированных нуклеотидами
TW202221130A (zh) 唾液酸化雙醣及/或寡醣的細胞生產
WO2023122270A3 (en) Compositions and methods for improved production of human milk oligosaccharides
Cui et al. New progress in the identifying regulatory factors of exopolysaccharide synthesis in lactic acid bacteria
CA2747214A1 (en) Biosynthesis of cmp-legionaminic acid from fructose-6-p, and respective pathway intermediates, using novel gdp-linked precursors
AU2022258874A9 (en) Cellular production of sialylated di- and/or oligosaccharides
Boels Metabolic engineering of exopolysaccharide production in Lactococcus lactis
WO2023182528A1 (ja) α1,2-フコシルトランスフェラーゼ活性を有する蛋白質及びラクト-N-フコペンタオースI(LNFPI)の製造方法
AU2022256796A1 (en) Cellular production of bioproducts