RU2021135111A - PRODUCTION OF HUMAN DAIRY OLIGOSACCHARIDES IN MICROBIAL PRODUCERS WITH ARTIFICIAL IMPORT/EXPORT - Google Patents

PRODUCTION OF HUMAN DAIRY OLIGOSACCHARIDES IN MICROBIAL PRODUCERS WITH ARTIFICIAL IMPORT/EXPORT Download PDF

Info

Publication number
RU2021135111A
RU2021135111A RU2021135111A RU2021135111A RU2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A RU 2021135111 A RU2021135111 A RU 2021135111A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
genetically modified
host microorganism
modified host
cell
udp
Prior art date
Application number
RU2021135111A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2798786C2 (en
Inventor
Штефан ЙЕННЕВАЙН
Дирк ВАРТЕНБЕРГ
Original Assignee
Йенневайн Биотехнологи Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Йенневайн Биотехнологи Гмбх filed Critical Йенневайн Биотехнологи Гмбх
Publication of RU2021135111A publication Critical patent/RU2021135111A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2798786C2 publication Critical patent/RU2798786C2/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/24Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/24Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • C07K14/245Escherichia (G)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/285Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Pasteurellaceae (F), e.g. Haemophilus influenza
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/67General methods for enhancing the expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/04Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/18Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a glycosyl transferase, e.g. alpha-, beta- or gamma-cyclodextrins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y204/00Glycosyltransferases (2.4)
    • C12Y204/01Hexosyltransferases (2.4.1)
    • C12Y204/01146Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase (2.4.1.146)

Claims (19)

1. Способ производства лакто-N-триозы II генетически модифицированной клеткой микроорганизма-хозяина, включающий стадии, на которых1. A method for the production of lacto-N-triose II by a genetically modified cell of a host microorganism, including the steps in which - получают генетически модифицированную клетку микроорганизма-хозяина, которая включает:- receive a genetically modified host microorganism cell, which includes: - по меньшей мере одну рекомбинантную β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансферазу,- at least one recombinant β-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, - повышенную экспрессию или активность по меньшей мере одного белка, осуществляющего экспорт сахара, способного осуществлять экспорт лакто-N-триозы II;- increased expression or activity of at least one sugar export protein capable of exporting lacto-N-triose II; - культивируют клетку микроорганизма-хозяина в среде в условиях, обеспечивающих производство лакто-N-триозы II, в результате чего осуществляется повышенный уровень экспорта лакто-N-триозы II в среду по сравнению с немодифицированной клеткой микроорганизма-хозяина, и- culturing the cell of the host microorganism in the environment under conditions that ensure the production of lacto-N-triose II, resulting in an increased level of export of lacto-N-triose II to the environment compared to the unmodified cell of the host microorganism, and - получают лакто-N-триозу II из среды.- get lacto-N-triose II from the environment. 2. Способ по п. 1, где указанная β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза относится к классу lgtA из Neisseria meningitides или PmnagT из Pasteurella multocida, или их вариантам.2. The method of claim 1, wherein said β-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase is of the class IgtA from Neisseria meningitides or PmnagT from Pasteurella multocida, or variants thereof. 3. Способ по п. 1, где указанный по меньшей мере один белок, осуществляющий экспорт сахара, выбран из группы, состоящей из yjhB из Escherichia coli, proP из Mannheimia succiniciproducens, setA из Cedecea neteri и их функциональных фрагментов.3. The method of claim 1, wherein said at least one sugar export protein is selected from the group consisting of yjhB from Escherichia coli, proP from Mannheimia succiniciproducens, setA from Cedecea neteri, and functional fragments thereof. 4. Способ по п. 1, в котором в генетически модифицированной клетке микроорганизма-хозяина осуществлена инактивация эндогенных генов β-галактозидазы и глюкозамин-6-фосфат-дезаминазы, и при этом указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина содержит нуклеиновокислотную последовательность, кодирующую функциональный белок лактозопермеазы.4. The method according to claim 1, in which inactivation of endogenous β-galactosidase and glucosamine-6-phosphate deaminase genes is carried out in the genetically modified host microorganism cell, and at the same time, said genetically modified host microorganism cell contains a nucleic acid sequence encoding a functional protein lactose permease. 5. Способ по п. 1, где указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина включает повышенную способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу или ГДФ-фукозу или ЦМФ-N-ацетилнейраминовую кислоту по сравнению с генетически не модифицированной клеткой-хозяином, при этом, возможно, указанная повышенная способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу присутствует за счет сверхэкспрессии одного или более чем одного гена, кодирующего белок, выбранный из группы, состоящей из L-глутамин:D-фруктозо-6-фосфат-аминотрансферазы, N-ацетилглюкозамин-1-фосфатуридилтрансферазы/глюкозамин-1-фосфатацетилтрансферазы, фосфоглюкозаминмутазы, УДФ-галактозо-4-эпимеразы, фосфоглюкомутазы, глюкозо-1-фосфатуридилилтрансферазы.5. The method according to claim 1, wherein said genetically modified host microorganism cell includes an increased ability to produce UDP-N-acetylglucosamine and UDP-galactose or GDP-fucose or CMP-N-acetylneuraminic acid compared to a non-genetically modified host cell, it is possible that said increased ability to produce UDP-N-acetylglucosamine and UDP-galactose is due to overexpression of one or more genes encoding a protein selected from the group consisting of L-glutamine:D-fructose-6-phosphate- aminotransferases, N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase, phosphoglucosamine mutase, UDP-galactose-4-epimerase, phosphoglucomutase, glucose-1-phosphate uridylyltransferase. 6. Способ по п. 4, где указанную генетически модифицированную клетку микроорганизма-хозяина культивируют в присутствии глюкозы, сахарозы, глицерина или их комбинации.6. The method of claim 4, wherein said genetically modified host microorganism cell is cultured in the presence of glucose, sucrose, glycerol, or a combination thereof. 7. Способ по п. 6, где указанную генетически модифицированную клетку микроорганизма-хозяина культивируют не в присутствии N-ацетилглюкозамина или галактозы.7. The method of claim 6, wherein said genetically modified host microorganism cell is not cultured in the presence of N-acetylglucosamine or galactose. 8. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина для производства лакто-N-триозы II, где указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина включает:8. A genetically modified host microorganism cell for the production of lacto-N-triose II, wherein said genetically modified host microorganism cell comprises: - по меньшей мере одну рекомбинантную β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансферазу, и- at least one recombinant β-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, and - повышенную экспрессию или активность по меньшей мере одного белка, осуществляющего экспорт сахара, способного осуществлять экспорт лакто-N-триозы II.- increased expression or activity of at least one sugar export protein capable of exporting lacto-N-triose II. 9. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где указанная β-1,3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза относится к классу lgtA из Neisseria meningitides или PmnagT из Pasteurella multocida, или их вариантам.9. The genetically modified host microorganism cell of claim 8, wherein said β-1,3-N-acetylglucosaminyl transferase is of the IgtA class from Neisseria meningitides or PmnagT from Pasteurella multocida, or variants thereof. 10. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где указанный по меньшей мере один белок, осуществляющий экспорт сахара, выбран из группы, состоящей из yjhB из Escherichia coli, proP из Mannheimia succiniciproducens, setA из Cedecea neteri и их функциональных фрагментов.10. The genetically modified host microorganism cell of claim 8, wherein said at least one sugar export protein is selected from the group consisting of yjhB from Escherichia coli, proP from Mannheimia succiniciproducens, setA from Cedecea neteri, and functional fragments thereof. 11. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где в указанной генетически модифицированной клетке микроорганизма-хозяина осуществлена инактивация эндогенных генов β-галактозидазы и глюкозамин-6-фосфат-дезаминазы, и при этом указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина содержит нуклеиновокислотную последовательность, кодирующую функциональный белок лактозопермеазы.11. A genetically modified host microorganism cell according to claim 8, wherein in said genetically modified host microorganism cell, endogenous β-galactosidase and glucosamine-6-phosphate deaminase genes have been inactivated, and said genetically modified host microorganism cell contains a nucleic acid a sequence encoding a functional lactose permease protein. 12. Генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина по п. 8, где указанная генетически модифицированная клетка микроорганизма-хозяина включает повышенную способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу или ГДФ-фукозу или ЦМФ-N-ацетилнейраминовую кислоту по сравнению с генетически не модифицированной клеткой-хозяином, при этом, возможно, указанная повышенная способность продуцировать УДФ-N-ацетилглюкозамин и УДФ-галактозу присутствует за счет сверхэкспрессии одного или более чем одного гена, кодирующего белок, выбранный из группы, состоящей из L-глутамин:D-фруктозо-6-фосфат-аминотрансферазы, N-ацетилглюкозамин-1-фосфатуридилтрансферазы/глюкозамин-1-фосфатацетилтрансферазы, фосфоглюкозаминмутазы, УДФ-галактозо-4-эпимеразы, фосфоглюкомутазы, глюкозо-1-фосфатуридилилтрансферазы.12. The genetically modified host microorganism cell of claim 8, wherein said genetically modified host microorganism cell comprises an increased ability to produce UDP-N-acetylglucosamine and UDP-galactose or GDP-fucose or CMP-N-acetylneuraminic acid compared to a genetically non-genetically modified host cell. modified by the host cell, it is possible that this increased ability to produce UDP-N-acetylglucosamine and UDP-galactose is due to the overexpression of one or more genes encoding a protein selected from the group consisting of L-glutamine: D-fructose -6-phosphate aminotransferase, N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase / glucosamine-1-phosphate acetyltransferase, phosphoglucosamine mutase, UDP-galactose-4-epimerase, phosphoglucomutase, glucose-1-phosphate uridylyltransferase.
RU2021135111A 2015-09-12 2016-09-12 Production of human dairy oligosaccharides in microbial producers with artificial import/export RU2798786C2 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP15184968.4 2015-09-12
EP15184968.4A EP3141610A1 (en) 2015-09-12 2015-09-12 Production of human milk oligosaccharides in microbial hosts with engineered import / export

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018109987A Division RU2763170C2 (en) 2015-09-12 2016-09-12 Production of human milk oligosaccharides in host microorganisms with modified import/export

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2021135111A true RU2021135111A (en) 2021-12-30
RU2798786C2 RU2798786C2 (en) 2023-06-27

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
RU2018109987A3 (en) 2020-01-27
US20210277435A1 (en) 2021-09-09
JP7362831B2 (en) 2023-10-17
JP2022105119A (en) 2022-07-12
US11046985B2 (en) 2021-06-29
PH12018550020A1 (en) 2018-08-13
CN108026556B (en) 2023-01-20
WO2017042382A1 (en) 2017-03-16
EP3347483A1 (en) 2018-07-18
AU2016319304B2 (en) 2021-04-29
MX2018003037A (en) 2019-01-10
JP7069007B2 (en) 2022-05-17
AU2016319304A1 (en) 2018-03-08
JP2022105118A (en) 2022-07-12
US20210277436A1 (en) 2021-09-09
CN108026556A (en) 2018-05-11
KR20180043297A (en) 2018-04-27
BR112018004725A2 (en) 2018-09-25
US20180305724A1 (en) 2018-10-25
RU2763170C2 (en) 2021-12-28
JP2018526019A (en) 2018-09-13
RU2018109987A (en) 2019-10-16
MX2022003994A (en) 2022-04-26
EP3141610A1 (en) 2017-03-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018109987A (en) MANUFACTURE OF HUMAN MILK OLIGOSACCHARIDES IN HUMAN MICRO-ORGANISMS WITH MODIFIED IMPORT / EXPORT
RU2020105821A (en) SIALYLTRANSFERASE AND THEIR APPLICATION IN THE OBTAINING OF SIALYATED OLIGOSACCHARIDES
Schmid et al. Bacterial exopolysaccharides: biosynthesis pathways and engineering strategies
ES2856749T3 (en) Process for the production of fucosylated oligosaccharides
ES2715010T3 (en) Total oligosaccharide fermentation
Jin et al. Production of specific-molecular-weight hyaluronan by metabolically engineered Bacillus subtilis 168
Boels et al. Sugar catabolism and its impact on the biosynthesis and engineering of exopolysaccharide production in lactic acid bacteria
RU2021109889A (en) MUTANT MICROORGANISMS RESISTANT TO DEATH UNDER THE ACTION OF LACTOSE
RU2020102747A (en) FUCOZYL TRANSFERASE AND THEIR APPLICATION FOR OBTAINING FUCOZYLATED OLIGOSACCHARIDES
DK2970872T1 (en) Microorganisms and Methods for Preparation of Sialylated and N-Acetylglucosamine-Containing Oligosaccharides
Cui et al. New advances in exopolysaccharides production of Streptococcus thermophilus
Muthana et al. Improved one-pot multienzyme (OPME) systems for synthesizing UDP-uronic acids and glucuronides
JP2017529857A5 (en)
JP2013535962A5 (en)
US20220145342A1 (en) Fermentative production of carbohydrates by microbial cells utilizing a mixed feedstock
Nehru et al. Production and characterization of low molecular weight heparosan in Bacillus megaterium using Escherichia coli K5 glycosyltransferases
CN104498420B (en) It is a kind of produce heparosan recombined bacillus subtilis and its application
MX2021005948A (en) Biosynthesis of compounds in yeast.
RU2021100512A (en) AN ENZYMATIVE METHOD FOR PRODUCING MONOSACCHARIDES IN A FREE FORM FROM SUGARS ACTIVATED WITH NUCLEOTIDES
TW202221130A (en) Cellular production of sialylated di- and/or oligosaccharides
WO2023122270A3 (en) Compositions and methods for improved production of human milk oligosaccharides
US9157105B2 (en) Biosynthesis of CMP-legionaminic acid from fructose-6-P, and respective pathway intermediates, using novel GDP-linked precursors
Cui et al. New progress in the identifying regulatory factors of exopolysaccharide synthesis in lactic acid bacteria
Boels Metabolic engineering of exopolysaccharide production in Lactococcus lactis
WO2023182528A1 (en) PROTEIN HAVING α1,2-FUCOSYLTRANSFERASE ACTIVITY AND METHOD FOR PRODUCING LACTO-N-FUCOPENTAOSE I (LNFPI)