RU2021105822A - Недеструктивная генная терапия для лечения mma - Google Patents
Недеструктивная генная терапия для лечения mma Download PDFInfo
- Publication number
- RU2021105822A RU2021105822A RU2021105822A RU2021105822A RU2021105822A RU 2021105822 A RU2021105822 A RU 2021105822A RU 2021105822 A RU2021105822 A RU 2021105822A RU 2021105822 A RU2021105822 A RU 2021105822A RU 2021105822 A RU2021105822 A RU 2021105822A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- transgene
- acid sequence
- mut
- viral vector
- Prior art date
Links
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 title 1
- 102100001249 ALB Human genes 0.000 claims 45
- 101710027066 ALB Proteins 0.000 claims 45
- 229940050528 albumin Drugs 0.000 claims 44
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims 44
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims 42
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims 39
- 230000003612 virological Effects 0.000 claims 30
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 claims 28
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 28
- 210000001519 tissues Anatomy 0.000 claims 13
- 108020004684 Internal Ribosome Entry Sites Proteins 0.000 claims 8
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 8
- 230000017730 intein-mediated protein splicing Effects 0.000 claims 8
- 241000702423 Adeno-associated virus - 2 Species 0.000 claims 4
- 102000004040 Capsid Proteins Human genes 0.000 claims 4
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 claims 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims 4
- 102100008005 GPR180 Human genes 0.000 claims 4
- 210000004185 Liver Anatomy 0.000 claims 4
- 229920000978 Start codon Polymers 0.000 claims 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 4
- 101700080605 NUC1 Proteins 0.000 claims 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 3
- 101700006494 nucA Proteins 0.000 claims 3
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 2
- 210000000234 Capsid Anatomy 0.000 claims 1
Claims (101)
1. Способ встраивания трансгена в геном по меньшей мере популяции клеток в ткани индивидуума, причем указанный способ включает введение индивидууму, у которого клетки в ткани не экспрессируют функциональный белок, кодируемый продуктом гена, композиции, которая доставляет трансген, кодирующий функциональный белок, где композиция содержит
полинуклеотидную кассету, содержащую
первую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, где первая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует трансген; и вторая последовательность нуклеиновой кислоты находится с 5’- или 3’-стороны от первой последовательности нуклеиновой кислоты и способствует продуцированию двух независимых продуктов генов при встраивании в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки;
третью последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 5’-стороны от полинуклеотида и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности, находящейся с 5’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью, в геноме клетки; и
четвертую последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 3’-стороны от полинуклеотида и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности, находящейся с 3’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью, в геноме клетки;
где после введения композиции трансген встраивается в геном популяции клеток.
2. Способ по п.1, где встраивание не включает нуклеазную активность.
3. Способ по п.1, где композиция содержит рекомбинантный вирусный вектор.
4. Способ по п.3, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой рекомбинантный вектор на основе AAV.
5. Способ по п.4, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой или содержит капсидный белок, содержащий аминокислотную последовательность, обладающую по меньшей мере 95% идентичностью последовательности с аминокислотной последовательностью LK03, AAV8, AAV-DJ; AAV-LK03 или AAVNP59.
6. Способ по любому из предшествующих пунктов, где трансген представляет собой или содержит трансген MUT.
7. Способ по любому из предшествующих пунктов, где композиция дополнительно содержит последовательности ITR AAV2.
8. Способ по любому из предшествующих пунктов, где полинуклеотидная кассета не содержит промоторную последовательность.
9. Способ по любому из предшествующих пунктов, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки трансген экспрессируется под контролем эндогенного промотора в участке встраивания, являющемся мишенью.
10. Способ по п.9, где участок встраивания, являющийся мишенью, представляет собой локус альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
11. Способ по п.10, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки трансген экспрессируется под контролем эндогенного промотора альбумина без нарушения экспрессии эндогенного гена альбумина.
12. Способ по любому из предшествующих пунктов, где ткань представляет собой печень.
13. Способ по любому из предшествующих пунктов, где вторая последовательность нуклеиновой кислоты содержит
пептид 2A;
участок внутренней посадки рибосомы (IRES);
N-концевой участок сплайсинга интеина и C-концевой участок сплайсинга интеина; или
донор сплайсинга и акцептор сплайсинга.
14. Способ по любому из предшествующих пунктов, где третья и четвертая последовательности нуклеиновых кислот представляют собой плечи гомологии, которые встраивают трансген и вторую последовательность нуклеиновой кислоты в эндогенный локус гена альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
15. Способ по п.14, где плечи гомологии направляют встраивание полинуклеотидной кассеты непосредственно с 3'-стороны от инициирующего кодона эндогенного гена альбумина или непосредственно с 5'-стороны от стоп-кодона эндогенного гена альбумина.
16. Способ по п.6, где трансген MUT представляет собой MUT wt человека; кодон-оптимизированный MUT; синтетический MUT; вариант MUT; мутант MUT или фрагмент MUT.
17. Способ повышения уровня экспрессии трансгена в ткани в течение периода времени, причем указанный способ включает
введение индивидууму, нуждающемуся в этом, композиции, которая доставляет трансген, который встраивается в геном по меньшей мере популяции клеток в ткани индивидуума, где композиция содержит:
полинуклеотид, содержащий первую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, где первая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует трансген; и вторая последовательность нуклеиновой кислоты находится с 5’- или 3’-стороны от первой последовательности нуклеиновой кислоты и способствует продуцированию двух независимых продуктов генов при встраивании в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки;
третью последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 5’-стороны от полинуклеотида и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности, находящейся с 5’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью, в геноме клетки; и
четвертую последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 3’-стороны от полинуклеотида и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности, находящейся с 3’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью, в геноме клетки;
где после введения композиции трансген встраивается в геном популяции клеток и уровень экспрессии трансгена в ткани возрастает на протяжении некоторого периода времени.
18. Способ по п.17, где встраивание трансгена не включает нуклеазную активность.
19. Способ по п.17 или 18, где увеличенный уровень экспрессии включает увеличенный процент клеток в ткани, экспрессирующих трансген.
20. Способ по любому из пп.17-19, где композиция содержит рекомбинантный вирусный вектор.
21. Способ по п.20, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой рекомбинантный вектор на основе AAV.
22. Способ по п.21, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой или содержит капсидный белок, содержащий аминокислотную последовательность, обладающую по меньшей мере 95% идентичностью последовательности с аминокислотной последовательностью LK03, AAV8, AAV-DJ; AAV-LK03 или AAVNP59.
23. Способ по любому из пп.17-22, где трансген представляет собой или включает трансген MUT.
24. Способ по любому из пп.17-23, где композиция дополнительно содержит последовательности ITR AAV2.
25. Способ по любому из пп.17-24, где полинуклеотидная кассета не содержит промоторную последовательность.
26. Способ по любому из пп.17-25, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геном клетки трансген экспрессируется под контролем эндогенного промотора в участке встраивания, являющемся мишенью.
27. Способ по п.26, где участок встраивания, являющийся мишенью, представляет собой локус альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
28. Способ по п.27, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки трансген экспрессируется под контролем эндогенного промотора альбумина без нарушения экспрессии эндогенного гена альбумина.
29. Способ по любому из пп.17-28, где ткань представляет собой печень.
30. Способ по любому из пп.17-29, где вторая последовательность нуклеиновой кислоты включает
пептид 2A;
участок внутренней посадки рибосомы (IRES);
N-концевой участок сплайсинга интеина и C-концевой участок сплайсинга интеина; или
донор сплайсинга и акцептор сплайсинга.
31. Способ по любому из пп.17-30, где третья и четвертая последовательности нуклеиновых кислот представляют собой плечи гомологии, которые встраивают трансген и вторую последовательность нуклеиновой кислоты в эндогенный локус гена альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
32. Способ по п.31, где плечи гомологии направляют встраивание полинуклеотидной кассеты непосредственно с 3'-стороны от инициирующего кодона эндогенного гена альбумина или непосредственно с 5'-стороны от стоп-кодона эндогенного гена альбумина.
33. Способ по п.23, где трансген MUT представляет собой MUT wt человека; кодон-оптимизированный MUT; синтетический MUT; вариант MUT; мутант MUT или фрагмент MUT.
34. Рекомбинантный вирусный вектор для встраивания в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки, содержащий
полинуклеотидную кассету, содержащую первую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, где первая последовательность нуклеиновой кислоты содержит трансген MUT; и вторая последовательность нуклеиновой кислоты находится с 5’- или 3’-стороны от первой последовательности нуклеиновой кислоты и способствует продуцированию двух независимых продуктов генов при встраивании в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки;
третью последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 5’-стороны от полинуклеотидной кассеты вектора и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности с 5’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью, в геноме клетки-хозяина; и
четвертую последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 3’-стороны от полинуклеотидной кассеты вирусного вектора и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности с 3’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью, в геноме клетки-хозяина;
где вирусный вектор содержит капсид LK03 AAV.
35. Рекомбинантный вирусный вектор по п.34, где третья нуклеиновая кислота имеет 800-1200 нуклеотидов.
36. Рекомбинантный вирусный вектор по п.34 или 35, где четвертая нуклеиновая кислота имеет 800-1200 нуклеотидов.
37. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-36, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой рекомбинантный вектор на основе AAV.
38. Рекомбинантный вирусный вектор по п.37, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой или содержит капсидный белок, содержащий аминокислотную последовательность, обладающую по меньшей мере 95% идентичностью последовательности с аминокислотной последовательностью AAV8, AAV-DJ; AAV-LK03 или AAV-NP59.
39. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-38, дополнительно содержащий последовательности ITR AAV2.
40. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-39, где полинуклеотидная кассета не содержит промоторную последовательность.
41. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-40, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки трансген MUT экспрессируется под контролем эндогенного промотора в участке встраивания, являющемся мишенью.
42. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.41, где участок встраивания, являющийся мишенью, представляет собой локус альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
43. Рекомбинантный вирусный вектор по п.41, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки трансген MUT экспрессируется под контролем эндогенного промотора альбумина без нарушения экспрессии эндогенного гена альбумина.
44. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-43, где два независимых продукта генов представляют собой белок MUT, экспрессируемый с трансгена MUT, и эндогенный белок альбумин, экспрессируемый с эндогенного гена альбумина.
45. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-44, где клетка представляет собой клетку печени.
46. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-45, где вторая последовательность нуклеиновой кислоты включает
пептид 2A;
участок внутренней посадки рибосомы (IRES);
N-концевой участок сплайсинга интеина и C-концевой участок сплайсинга интеина; или
донор сплайсинга и акцептор сплайсинга.
47. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-46, где третья и четвертая последовательности нуклеиновых кислот представляют собой плечи гомологии, которые встраивают трансген MUT и вторую последовательность нуклеиновой кислоты в эндогенный локус гена альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
48. Рекомбинантный вирусный вектор по п.47, где третья и четвертая последовательности нуклеиновых кислот представляют собой плечи гомологии, которые встраивают трансген MUT и вторую последовательность нуклеиновой кислоты в эндогенный локус гена альбумина в рамке считывания с эндогенным промотором альбумина и эндогенным геном альбумина.
49. Рекомбинантный вирусный вектор по п.47 или 48, где плечи гомологии направляют встраивание полинуклеотидной кассеты непосредственно с 3'-стороны от инициирующего кодона эндогенного гена альбумина или непосредственно с 5'-стороны от стоп-кодона эндогенного гена альбумина.
50. Рекомбинантный вирусный вектор по любому из пп.34-49, где трансген MUT представляет собой MUT wt человека; кодон-оптимизированный MUT; синтетический MUT; вариант MUT; мутант MUT или фрагмент MUT.
51. Способ, включающий стадию
введение индивидууму дозы композиции, которая доставляет в клетки в ткани индивидуума трансген, кодирующий представляющий интерес продукт, который не экспрессируется функционально клетками до введения, где трансген (i) кодирует представляющий интерес продукт; (ii) встраивается в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме множества клеток; (iii) функционально экспрессирует представляющий интерес продукт после встраивания; и (iv) обеспечивает селективное преимущество множеству клеток относительно других клеток в ткани, так что с течением времени ткань достигает уровня функциональной экспрессии представляющего интерес продукта, который, как определено, является более высоким, чем уровень, достигаемый посредством в остальном сравнимого введения, где клетки, в которые встроен трансген, функционально экспрессируют представляющий интерес продукт до введения, где композиция содержит
полинуклеотид, содержащий первую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, где первая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует трансген; и вторая последовательность нуклеиновой кислоты находится с 5’- или 3’-стороны от первой последовательности нуклеиновой кислоты и способствует продуцированию двух независимых продуктов генов, когда трансген встраивается в участке встраивания, являющемся мишенью;
третью последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 5’-стороны от полинуклеотида и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности с 5’-стороны от участка встраивания, являющегося мишенью; и
четвертую последовательность нуклеиновой кислоты, находящуюся с 3’-стороны от полинуклеотида и содержащую последовательность, которая по существу гомологична геномной последовательности с 3’-стороны от участка встраивания мишени.
52. Способ по п.51, где встраивание трансгена не включает нуклеазную активность.
53. Способ по п.51 или 52, где селективное преимущество включает увеличенный процент клеток в ткани, экспрессирующей трансген.
54. Способ по любому из пп.51-53, где композиция содержит рекомбинантный вирусный вектор.
55. Способ по п.54, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой рекомбинантный вектор на основе AAV.
56. Способ по п.55, где рекомбинантный вирусный вектор представляет собой или содержит капсидный белок, содержащий аминокислотную последовательность, обладающую по меньшей мере 95% идентичностью последовательности с аминокислотной последовательностью LK03, AAV8, AAV-DJ; AAV-LK03 или AAVNP59.
57. Способ по любому из пп.51-56, где трансген представляет собой или содержит трансген MUT.
58. Способ по любому из пп.51-57, где композиция дополнительно содержит последовательности ITR AAV2.
59. Способ по любому из пп.51-58, где полинуклеотидная кассета не содержит промоторную последовательность.
60. Способ по любому из пп.51-59, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки-хозяина, трансген экспрессируется под контролем эндогенного промотора в участке встраивания, являющемся мишенью.
61. Способ по п.60, где участок встраивания, являющийся мишенью, представляет собой локус альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
62. Способ по п.61, где при встраивании полинуклеотидной кассеты в участок встраивания, являющийся мишенью, в геноме клетки трансген экспрессируется под контролем эндогенного промотора альбумина без нарушения экспрессии эндогенного гена альбумина.
63. Способ по любому из пп.51-62, где ткань представляет собой печень.
64. Способ по любому из пп.51-63, где вторая последовательность нуклеиновой кислоты включает
пептид 2A;
участок внутренней посадки рибосомы (IRES);
N-концевой участок сплайсинга интеина и C-концевой участок сплайсинга интеина; или
донор сплайсинга и акцептор сплайсинга.
65. Способ по любому из пп.51-64, где третья и четвертая последовательности нуклеиновых кислот представляют собой плечи гомологии, которые встраивают трансген и вторую последовательность нуклеиновой кислоты в эндогенный локус гена альбумина, содержащий эндогенный промотор альбумина и эндогенный ген альбумина.
66. Способ по п.65, где плечи гомологии направляют встраивание полинуклеотидной кассеты непосредственно с 3'-стороны от инициирующего кодона эндогенного гена альбумина или непосредственно с 5'-стороны от стоп-кодона эндогенного гена альбумина.
67. Способ по п.57, где трансген MUT представляет собой MUT wt человека; кодон-оптимизированный MUT; синтетический MUT; вариант MUT; мутант MUT или фрагмент MUT.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US62/717,771 | 2018-08-10 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2021105822A true RU2021105822A (ru) | 2022-09-12 |
| RU2820602C2 RU2820602C2 (ru) | 2024-06-06 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN105579465B (zh) | 用于基因转移到细胞、器官和组织中的变异aav和组合物、方法及用途 | |
| EP3071592B1 (en) | Artificial dna-binding proteins and uses thereof | |
| CN104520428B (zh) | 将基因转移到细胞、器官和组织的aav载体组合物和方法 | |
| ATE386131T1 (de) | Aav-vermittelte überbringung von dna in zellen des nervensystems | |
| JPH10507626A (ja) | 細胞サイクルによって変化する細胞に特異的な活性化合物を用いる血管系の疾病の遺伝子療法 | |
| WO2012172277A4 (en) | Simian adenovirus and hybrid adenoviral vectors | |
| Stieger et al. | Gene therapy for vision loss—recent developments | |
| MX2021013365A (es) | Composiciones utiles para el tratamiento de la enfermedad de pompe. | |
| Yan et al. | Conserved enhancer elements in human and mouse renin genes have different transcriptional effects in As4. 1 cells | |
| JP2014509197A (ja) | 標的性治療人腫瘍治療の腫瘍溶解性アデノウイルス及びその応用 | |
| Zhou et al. | HuR-mediated SCN5A messenger RNA stability reduces arrhythmic risk in heart failure | |
| US20240002462A1 (en) | Treatment of neuropathy with igf-1-encoding dna constructs and hgf-encoding dna constructs | |
| Welsh et al. | Coexpression of the platelet-derived growth factor (PDGF) B chain and the PDGF beta receptor in isolated pancreatic islet cells stimulates DNA synthesis. | |
| Breton et al. | Structure and regulation of the mouse melanin-concentrating hormone mRNA and gene | |
| Botta et al. | Targeting and silencing of rhodopsin by ectopic expression of the transcription factor KLF15 | |
| RU2021105822A (ru) | Недеструктивная генная терапия для лечения mma | |
| US11510999B2 (en) | Treatment of neuropathy with DNA constructs expressing IGF-1 isoforms | |
| Sunyer et al. | Cell type‐and differentiation‐dependent expression from the mouse acetylcholine receptor ϵ‐subunit promoter | |
| Famà et al. | Deciphering the Ets-1/2-mediated transcriptional regulation of F8 gene identifies a minimal F8 promoter for hemophilia A gene therapy | |
| JP6871547B2 (ja) | ピエリシン１ａのａｄｐリボシル化ドメイン遺伝子及びセリシン繭 | |
| CN107073078B (zh) | 利用肝细胞生长因子和基质细胞衍生因子1α的用于预防或治疗外周动脉疾病的组合物 | |
| Lin et al. | Cloning of the 5′-flanking region of mouse sodium/iodide symporter and identification of a thyroid-specific and TSH-responsive enhancer | |
| JP7397532B2 (ja) | 眼遺伝子送達のためのｏｎ双極細胞に特異的なプロモーター | |
| JP2005531302A5 (ru) | ||
| TW202221119A (zh) | Dna結合域轉活化子及其用途 |