RU2020134965A - Генная терапия при дегенерации цнс - Google Patents

Генная терапия при дегенерации цнс Download PDF

Info

Publication number
RU2020134965A
RU2020134965A RU2020134965A RU2020134965A RU2020134965A RU 2020134965 A RU2020134965 A RU 2020134965A RU 2020134965 A RU2020134965 A RU 2020134965A RU 2020134965 A RU2020134965 A RU 2020134965A RU 2020134965 A RU2020134965 A RU 2020134965A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
paragraphs
subject
gene
gene therapy
neuron
Prior art date
Application number
RU2020134965A
Other languages
English (en)
Inventor
Аннахита Керавала
Павен БАТТИПРОЛУ
Радж ПРАБХАКАР
Родерик ВАН
Пиратип ПРАТУМСУВАН
Навин ЯЛАМАНЧИ
Original Assignee
Спейскрафт Севен, Ллк
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Спейскрафт Севен, Ллк filed Critical Спейскрафт Севен, Ллк
Publication of RU2020134965A publication Critical patent/RU2020134965A/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0085—Brain, e.g. brain implants; Spinal cord
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/14—Drugs for disorders of the nervous system for treating abnormal movements, e.g. chorea, dyskinesia
    • A61P25/16—Anti-Parkinson drugs
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/82—Translation products from oncogenes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0012—Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/1025—Acyltransferases (2.3)
    • C12N9/104—Aminoacyltransferases (2.3.2)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/93—Ligases (6)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y203/00—Acyltransferases (2.3)
    • C12Y203/02—Aminoacyltransferases (2.3.2)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/22—Vectors comprising a coding region that has been codon optimised for expression in a respective host
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/80—Vectors containing sites for inducing double-stranded breaks, e.g. meganuclease restriction sites

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Psychology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Claims (210)

1. Рекомбинантный вектор для генной терапии, содержащий экспрессионную кассету, содержащую трансген, кодирующий убиквитинпротеинлигазу E3 (PARK2), PTEN-индуцируемую предположительную киназу 1 (PINK1), протеиндегликазу DJ-1 (DJ-1), киназу 2, содержащую повтор, богатый лейцином (LRRK2), альфа-синуклеин (SCNA), протоонкоген c-Rel (c-Rel), фермент, активирующий убиквитин-подобный модификатор (ATG7), переносчик аминов синаптических пузырьков (VMAT2) или глюкоцереброзидазу (GBA), причем полинуклеотид трансгена функционально связан с последовательностью промотора, активного у эукариот.
2. Вектор по п. 1, характеризующийся тем, что указанный трансген кодирует PARK2, а полинуклеотидная последовательность трансгена характеризуется по меньшей мере 95% идентичностью с одной из SEQ ID NO: 35-38.
3. Вектор по п. 1 или 2, характеризующийся тем, что последовательность промотора выбрана из таблицы 5.
4. Вектор по любому из пп. 1-3, характеризующийся тем, что экспрессионная кассета дополнительно содержит энхансер ЦМВ.
5. Вектор по любому из пп. 1-4, характеризующийся тем, что экспрессионная кассета дополнительно содержит 5'-нетранслируемую область (UTR), выбранную из таблицы 6.
6. Вектор по любому из пп. 1-5, характеризующийся тем, что экспрессионная кассета дополнительно содержит 3'-нетранслируемую область, выбранную из таблицы 7.
7. Вектор по любому из пп. 1-6, характеризующийся тем, что экспрессионная кассета дополнительно содержит последовательность полиаденилирования (полиА), выбранную из таблицы 8.
8. Вектор по любому из пп. 1-7, характеризующийся тем, что трансген является кодон-оптимизированным.
9. Вектор по любому из пп. 1-8, характеризующийся тем, что экспрессионная кассета характеризуется по меньшей мере 95% идентичностью последовательности с любой из SEQ ID NO: 39-58.
10. Вектор по любому из пп. 1-9, характеризующийся тем, что экспрессионная кассета содержит в порядке от 5' до 3':
промотор HuBA, трансген, WPRE(x) и pA глобин-Oc;
промотор ЦМВ, энхансер TPL-eMLP, трансген, WPRE(r) и pA глобин-Oc;
промотор Syn, трансген, WPRE(r), 3'UTR(глобин) и pAGH-Bt;
промотор CBA, трансген и pAGH-Bt;
промотор EF1α, трансген и pA глобин-Oc;
промотор HuBA, трансген, R2V17 и pAGH-Bt;
промотор Syn, трансген, WPRE(х), 3'UTR(глобин) и pAGH- Hs;
промотор CaMKIIa, трансген, WPRE(r) и pAGH- Hs;
промотор ЦМВ, 5'-энхансер TPL-eMLP, трансген, WPRE(r) и pAGH-Hs;
промотор HuBA, трансген и pAGH- Hs;
промотор ЦМВ и TPL, eMPL, трансген, R2V17, 3'UTR(глобин) и pAGH- Bt;
промотор EF1α, трансген, WPRE(r) и pAGH-Bt;
промотор Syn, трансген, R2V17 и pA глобин-Oc;
промотор CaMKIIa, трансген, R2V17 и pA глобин-Oc;
промотор CBA, трансген, WPRE(х), 3'UTR(глобин) и pAGH-Hs;
промотор CBA, трансген, 3’UTR(глобин) и pA глобин-Oc;
промотор CaMKIIa, трансген, R2V17 и pAGH-Bt;
промотор EF1α, трансген, R2V17, 3'UTR (глобин) и pAGH-Hs;
промотор ЦМВ, трансген, R2V17, 3'UTR(глобин) и pAGH-Hs; или
промотор ЦМВ, трансген и pAGH- Hs,
причем трансген необязательно кодирует PARK2.
11. Вектор по любому из пп. 1-10, характеризующийся тем, что указанный вектор представляет собой вектор на основе аденоассоциированного вируса (AAV).
12. Вектор по п. 11, характеризующийся тем, что указанный вектор содержит два инвертированных концевых повтора (ИКП) AAV, фланкирующих экспрессионную кассету.
13. Вектор по п. 11 или 12, характеризующийся тем, что AAV характеризуется серотипом AAV1, AAV2, AAV5, AAV8, AAV9, AAVrh10 или AAVrh74.
14. Вектор по любому из пп. 11-13, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии включает самокомплементарный AAV или одноцепочечный AAV.
15. Вектор по любому из пп. 11-14, характеризующийся тем, что AAV представляет собой AAV дикого типа или модифицированный AAV.
16. Вектор по любому из пп. 11-15, характеризующийся тем, что AAV включает белок капсида, характеризующийся по меньшей мере 95% идентичностью с белком капсида VP1, VP2 или VP3 дикого типа.
17. Клетка-хозяин, содержащая вектор по любому из пп. 1-16.
18. Способ подавления дегенерации или гибели дофаминергического нейрона, несущего мутацию в гене, ассоциированном с болезнью Паркинсона (БП), включающий:
приведение нейрона в контакт с рекомбинантным вектором для генной терапии по любому из пп. 1-16;
причем после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии нейрон экспрессирует PARK2, PINK1, DJ-1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA,
причем нейрон необязательно несет мутацию в гене PARK2, а экспрессионная кассета кодирует PARK2.
19. Способ по п. 18, характеризующийся тем, что указанный нейрон экспрессирует пониженное количество альфа-синуклеина и/или содержит уменьшенное количество телец Леви после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
20. Способ по п. 18 или 19, характеризующийся тем, что указанный нейрон экспрессирует пониженное количество моноаминоксидаз после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
21. Способ по любому из пп. 18-20, характеризующийся тем, что указанный нейрон продуцирует и/или высвобождает повышенное количество дофамина после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
22. Способ по любому из пп. 18-21, характеризующийся тем, что указанный нейрон подвергается усиленной митофагии после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
23. Способ по любому из пп. 18-22, характеризующийся тем, что указанный нейрон экспрессирует пониженное количество моноаминоксидаз по сравнению с нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, причем указанное пониженное количество необязательно ниже по меньшей мере на 5%, по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70% или по меньшей мере на 80% по сравнению с количеством, экспрессируемым нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии.
24. Способ по любому из пп. 18-23, характеризующийся тем, что указанный нейрон продуцирует и/или высвобождает повышенное количество дофамина по сравнению количеством дофамина, продуцируемым и/или высвобождаемым нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, причем указанное повышенное количество необязательно выше по меньшей мере на 5%, по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере в два раза, по меньшей мере в три раза, по меньшей мере в четыре раза, по меньшей мере в пять раз или по меньшей мере в 10 раз, чем количество, продуцируемое и/или высвобождаемое нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии.
25. Способ по любому из пп. 18-24, характеризующийся тем, что указанный нейрон подвергается количественно повышенной аутофагии по сравнению с нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, причем повышенный количественный показатель необязательно выше по меньшей мере на 5%, по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере в два раза, по меньшей мере в три раза, по меньшей мере в четыре раза, по меньшей мере в пять раз или по меньшей мере в 10 раз, чем количественный показатель аутофагии, которому подвергается нейрон, не контактировавший с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии.
26. Способ по любому из пп. 18-25, характеризующийся тем, что указанный нейрон является первичным нейроном, положительным по тирозингидроксилазе.
27. Способ по любому из пп. 18-26, характеризующийся тем, что указанный нейрон получен из индуцированной плюрипотентной стволовой клетки, полученной из клеток субъекта с диагнозом болезни Паркинсона.
28. Способ лечения или подавления начала болезни Паркинсона (БП) у субъекта, страдающего болезнью Паркинсона или подверженного риску БП, включающий:
введение субъекту вектора по любому из пп. 1-16;
причем введение рекомбинантного вектора для генной терапии приводит к лечению или подавлению начала болезни Паркинсона у субъекта.
29. Способ по п. 28, характеризующийся тем, что БП представляет собой БП с ранним началом, необязательно аутосомно-рецессивную БП с ранним началом.
30. Способ по п. 28 или 29, характеризующийся тем, что субъект несет мутацию в гене PARK2.
31. Способ по любому из пп. 28-30, характеризующийся тем, что PARK2 содержит аминокислотную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 1.
32. Способ по любому из пп. 28-31, характеризующийся тем, что этап введения включает системное, парентеральное, внутривенное, церебральное, цереброспинальное, интратекальное, интрацистернальное, интрапутаминальное, интрагиппокампальное, интрастриарное или интрацеребровентрикулярное введение.
33. Способ по любому из пп. 28-31, характеризующийся тем, что этап введения включает внутривенную, церебральную, цереброспинальную, интратекальную, интрацистернальную, интрапутаминальную, интрагиппокампальную, интрастриарную или интрацеребровентрикулярную инъекцию.
34. Способ по п. 32, характеризующийся тем, что этап введения включает интратекальную инъекцию с наклоном по Тределенбургу.
35. Способ по п. 32, характеризующийся тем, что этап введения включает прямую инъекцию в pars compacta черной субстанции головного мозга.
36. Способ по любому из пп. 28-35, характеризующийся тем, что этап введения включает внедрение рекомбинантного вектора для генной терапии в головной мозг или цереброспинальную жидкость (ЦСЖ) субъекта.
37. Способ по любому из пп. 28-36, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x109 - 1x1014 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
38. Способ по любому из пп. 28-36, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x109 - 1x1014 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
39. Способ по любому из пп. 28-36, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x109 - 1x1014 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
40. Способ по любому из пп. 28-36, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x107 - 1x109 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
41. Способ по любому из пп. 28-40, характеризующийся тем, что субъект является взрослым.
42. Способ по любому из пп. 28-40, характеризующийся тем, что субъект является ребёнком.
43. Способ по любому из пп. 28-42, характеризующийся тем, что количество дофаминергических нейронов у субъекта после этапа введения превышает количество дофаминергических нейронов у субъекта до этапа введения.
44. Способ по любому из пп. 28-43, характеризующийся тем, что уровень дофамина у субъекта после этапа введения превышает уровень дофамина у субъекта до этапа введения.
45. Способ по любому из пп. 28-44, характеризующийся тем, что количество дофаминергических нейронов у субъекта, получившего лечение указанным способом, повышено по сравнению с количеством дофаминергических нейронов у субъекта, не получившего такого лечения.
46. Способ по любому из пп. 28-45, характеризующийся тем, что уровень дофамина у субъекта, получившего лечение указанным способом, повышен по сравнению с уровнем дофамина у субъекта, не получившего такого лечения.
47. Способ по любому из пп. 28-46, характеризующийся тем, что уровень дофамина в черной субстанции у субъекта, получившего лечение указанным способом, повышен по сравнению с уровнем дофамина в черной субстанции у субъекта, не получившего такого лечения.
48. Способ по любому из пп. 28-47, характеризующийся тем, что уровень PRKN в ЦСЖ субъекта после этапа введения превышает уровень PRKN в ЦСЖ субъекта до этапа введения.
49. Способ по любому из пп. 28-48, характеризующийся тем, что балльный показатель по унифицированной шкале оценки болезни Паркинсона (UPDRS) у субъекта до этапа введения улучшается по сравнению с балльным показателем UPDRS у субъекта до этапа введения.
50. Способ по любому из пп. 28-49, характеризующийся тем, что уровень PRKN в ЦСЖ субъекта, получившего лечение указанным способом, повышен по сравнению с уровнем PRKN в ЦСЖ субъекта, не получившего такого лечения.
51. Способ по любому из пп. 28-50, характеризующийся тем, что балльный показатель UPDRS у субъекта, получившего лечение указанным способом, улучшен по сравнению с балльным показателем UPDRS у субъекта, не получившего такого лечения.
52. Способ по любому из пп. 28-51, характеризующийся тем, что нейроны субъекта экспрессируют пониженное количество альфа-синуклеина и/или содержат уменьшенное количество телец Леви после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
53. Способ подавления дегенерации или гибели дофаминергического нейрона, несущего мутацию в гене, ассоциированном с болезнью Паркинсона (БП), причем мутированный ген представляет собой: ген белка Паркинсона 2, убиквитинпротеинлигазы E3 (PARK2), ген PTEN-индуцируемой предположительной киназы 1 (PINK1), ген протеиндегликазы DJ-1 (DJ-1), ген киназы 2, содержащей повтор, богатый лейцином (LRRK2), ген альфа-синуклеина (SCNA), ген протоонкогена c-Rel (c-Rel), ген фермента, активирующего убиквитин-подобный модификатор (ATG7), ген переносчика аминов синаптических пузырьков (VMAT2) или ген глюкоцереброзидазы (GBA), включающий:
приведение нейрона в контакт с рекомбинантным вектором для генной терапии, содержащим полинуклеотид, кодирующий белок дикого типа, экспрессируемый версией мутированного гена дикого типа, или его функциональный вариант или фрагмент;
причем после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии нейрон экспрессирует белок дикого типа или его функциональный вариант или фрагмент.
54. Способ по п. 53, характеризующийся тем, что белок PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA дикого типа содержит аминокислотную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 1-9, соответственно.
55. Способ по п. 53, характеризующийся тем, что указанный ген представляет собой ген PARK2, а белок PARK2 дикого типа содержит аминокислотную последовательность, приведенную в любой из SEQ ID NO: 10-17.
56. Способ по п. 53, характеризующийся тем, что указанный полинуклеотид содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 95% или 99% идентичностью с полинуклеотидной последовательностью PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA, приведенной в SEQ ID NO: 18-26, соответственно.
57. Способ по п. 53, характеризующийся тем, что указанный ген представляет собой ген PARK2, а полинуклеотид содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 95% или 99% идентичностью с полинуклеотидной последовательностью изоформы PARK2, приведенной в любой из SEQ ID NO: 27-34.
58. Способ по любому из пп. 53-57, характеризующийся тем, что указанный полинуклеотид является кодон-оптимизированным.
59. Способ по любому из пп. 53-58, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии представляет собой рекомбинантный аденоассоциированный вирус (AAV).
60. Способ по п. 59, характеризующийся тем, что AAV характеризуется серотипом AAV1, AAV2, AAV5, AAV8, AAV9, AAVrh10 или AAVrh74.
61. Способ по п. 59 или 60, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии включает самокомплементарный AAV.
62. Способ по любому из пп. 59-61, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии представляет собой одноцепочечный AAV.
63. Способ по любому из пп. 59-62, характеризующийся тем, что AAV представляет собой AAV дикого типа или модифицированный AAV.
64. Способ по любому из пп. 59-63, характеризующийся тем, что AAV содержит белок капсида, характеризующийся по меньшей мере 95% идентичностью с белком капсида VP1, VP2 или VP3 дикого типа.
65. Способ по любому из пп. 53-64, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии содержит полинуклеотид, содержащий в порядке от 5’ до 3’:
a. последовательность промотора, активного у эукариот; и
b. последовательность, кодирующую белок дикого типа или его функциональный фрагмент или вариант;
причем последовательность, кодирующая белок дикого типа или его функциональный фрагмент или вариант, функционально связана с последовательностью промотора, активного у эукариот.
66. Способ по любому из пп. 53-65, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии дополнительно содержит один или более из следующего:
нейрон-специфичный промотор, необязательно выбранный из группы, состоящей из промоторов hSYN1 (синапсина человека), INA (альфа-интернексина), NES (нестина), TH (тирозингидроксилазы), FOXA2 (Forkhead-бокса A2), CaMKII (кальмодулин-зависимой протеинкиназы II) и NSE (нейрон-специфичной энолазы);
широко распространенный промотор, выбранный из группы, состоящей из промоторов ЦМВ, CAG, UBC, PGK, EF1-альфа, GAPDH, SV40, ВГВ, а также бета-актина курицы и бета-актина человека;
энхансер;
интрон;
сигнал поли-A;
последовательность, кодирующую пептид 2A; и
WPRE (посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурков).
67. Способ по любому из пп. 53-64, характеризующийся тем, что указанный нейрон экспрессирует пониженное количество альфа-синуклеина и/или содержат уменьшенное количество телец Леви после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
68. Способ по любому из пп. 53-67, характеризующийся тем, что указанный нейрон экспрессирует пониженное количество моноаминоксидаз после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
69. Способ по любому из пп. 53-68, характеризующийся тем, что указанный нейрон продуцирует и/или высвобождает повышенное количество дофамина после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
70. Способ по любому из пп. 53-69, характеризующийся тем, что указанный нейрон подвергается усиленной митофагии после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
71. Способ по любому из пп. 53-70, характеризующийся тем, что указанный нейрон экспрессирует пониженное количество моноаминоксидаз по сравнению с нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, причем указанное пониженное количество необязательно ниже по меньшей мере на 5%, по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70% или по меньшей мере на 80%, чем количество, экспрессируемое нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии.
72. Способ по любому из пп. 53-71, характеризующийся тем, что указанный нейрон продуцирует и/или высвобождает повышенное количество дофамина по сравнению количеством дофамина, продуцируемым и/или высвобождаемым нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, причем указанное повышенное количество необязательно выше по меньшей мере на 5%, по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере в два раза, по меньшей мере в три раза, по меньшей мере в четыре раза, по меньшей мере в пять раз или по меньшей мере в 10 раз, чем количество, продуцируемое и/или высвобождаемое нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии.
73. Способ по любому из пп. 53-72, характеризующийся тем, что указанный нейрон подвергается количественно повышенной аутофагии по сравнению с нейроном, не контактировавшим с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, причем повышенный количественный показатель необязательно выше по меньшей мере на 5%, по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 40%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере в два раза, по меньшей мере в три раза, по меньшей мере в четыре раза, по меньшей мере в пять раз или по меньшей мере в 10 раз по сравнению с количественным показателем аутофагии, которому подвергается нейрон, не контактировавший с указанным рекомбинантным вектором для генной терапии.
74. Способ по любому из пп. 53-73, характеризующийся тем, что указанный нейрон является первичным нейроном, положительным по тирозингидроксилазе.
75. Способ по любому из пп. 53-74, характеризующийся тем, что указанный нейрон получен из индуцированной плюрипотентной стволовой клетки, полученной из клеток субъекта с диагнозом болезни Паркинсона.
76. Рекомбинантный вектор для генной терапии, содержащий полинуклеотид, кодирующий ген белка Паркинсона 2, убиквитинпротеинлигазы E3 (PARK2) дикого типа, ген PTEN-индуцируемой предположительной киназы 1 (PINK1), ген протеиндегликазы DJ-1 (DJ-1), ген киназы 2, содержащей повтор, богатый лейцином (LRRK2), ген альфа-синуклеина (SCNA), ген протоонкогена c-Rel (c-Rel), ген фермента, активирующего убиквитин-подобный модификатор (ATG7), ген переносчика аминов синаптических пузырьков (VMAT2) или ген глюкоцереброзидазы или их функциональный вариант или фрагмент; причем полинуклеотид функционально связан с промотором, активным у эукариот; а нейрон трансдуцируют указанным рекомбинантным вектором для генной терапии, экспрессирующим белок дикого типа или его функциональный вариант или фрагмент.
77. Рекомбинантный вектор для генной терапии по п. 76, характеризующийся тем, что белок PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA дикого типа содержит аминокислотную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 1-9, соответственно.
78. Рекомбинантный вектор для генной терапии по п. 76, характеризующийся тем, что указанный ген представляет собой ген PARK2, а белок PARK2 дикого типа содержит аминокислотную последовательность, приведенную в любой из SEQ ID NO: 10-17.
79. Рекомбинантный вектор для генной терапии по п. 76, характеризующийся тем, что указанный полинуклеотид содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 95% или 99% идентичностью с полинуклеотидной последовательностью PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA, приведенной в SEQ ID NO: 18-26, соответственно.
80. Рекомбинантный вектор для генной терапии по п. 76, характеризующийся тем, что указанный ген представляет собой ген PARK2, а полинуклеотид содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 95% или 99% идентичностью с полинуклеотидной последовательностью изоформы PARK2, приведенной в любой из SEQ ID NO: 27-34.
81. Рекомбинантный вектор для генной терапии по п. 76, характеризующийся тем, что указанный полинуклеотид является кодон-оптимизированным.
82. Рекомбинантный вектор для генной терапии по любому из пп. 76-81, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии представляет собой рекомбинантный аденоассоциированный вирус (rAAV).
83. Рекомбинантный вектор для генной терапии по п. 82, характеризующийся тем, что rAAV характеризуется серотипом AAV1, AAV2, AAV5, AAV8, AAV9, AAVrh10 или AAVrh74.
84. Рекомбинантный вектор для генной терапии по любому пп. 76-83, характеризующийся тем, что указанный рекомбинантный вектор для генной терапии включает самокомплементарный AAV или одноцепочечный AAV.
85. Рекомбинантный вектор для генной терапии по любому из пп. 76-83, характеризующийся тем, что указанный AAV представляет собой AAV дикого типа или модифицированный AAV.
86. Рекомбинантный вектор для генной терапии по любому из пп. 76-85, характеризующийся тем, что AAV содержит белок капсида, характеризующийся по меньшей мере 95% идентичностью с белком капсида VP1, VP2 или VP3 дикого типа.
87. Способ лечения или подавления начала болезни Паркинсона (БП) у субъекта, страдающего болезнью Паркинсона или подверженного риску БП, включающий:
введение субъекту рекомбинантного вектора для генной терапии, содержащего полинуклеотидную последовательность, кодирующую белок Паркинсона 2, убиквитинпротеинлигазу E3 (PARK2), белок PTEN-индуцируемой предположительной киназы 1 (PINK1), протеиндегликазы DJ-1 (DJ-1), киназы 2, содержащей повтор, богатый лейцином (LRRK2), альфа-синуклеина (SCNA), протоонкогена c-Rel (c-Rel), фермента, активирующего убиквитин-подобный модификатор (ATG7), переносчика аминов синаптических пузырьков (VMAT2) или глюкоцереброзидазы (GBA) дикого типа или его функциональный вариант или фрагмент,
причем введение рекомбинантного вектора для генной терапии приводит к лечению или подавлению начала болезни Паркинсона у субъекта.
88. Способ по п. 87, характеризующийся тем, что БП представляет собой БП с ранним началом, необязательно аутосомно-рецессивную БП с ранним началом.
89. Способ по п. 87 или 88, характеризующийся тем, что у субъекта есть мутация в гене PARK2, гене PINK1, гене LRRK2, гене SCNA, гене c-Rel, гене ATG7, гене VMAT2 или гене GBA.
90. Способ по любому из пп. 87-89, характеризующийся тем, что белок PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA содержит аминокислотную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 1-9, соответственно.
91. Способ по любому из пп. 87-89, характеризующийся тем, что указанная последовательность кодирует ген PARK2, а белок PARK2 дикого типа содержит аминокислотную последовательность, приведенную в любой из SEQ ID NO: 10-17.
92. Способ по любому из пп. 87-89, характеризующийся тем, что указанный полинуклеотид содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 95% или 99% идентичностью с полинуклеотидной последовательностью PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA, приведенной в SEQ ID NO: 18-26, соответственно.
93. Способ по любому из пп. 87-89, характеризующийся тем, что указанная последовательность кодирует ген PARK2, а полинуклеотид содержит последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 70%, 75%, 80%, 85%, 95% или 99% идентичностью с полинуклеотидной последовательностью изоформы PARK2, приведенной в любой из SEQ ID NO: 27-34.
94. Способ по любому из пп. 87-93, характеризующийся тем, что последовательность, кодирующая белок PARK2, PINK1, LRRK2, SCNA, c-Rel, ATG7, VMAT2 или GBA или его функциональный вариант или фрагмент, является кодон-оптимизированной, причем указанная последовательность необязательно содержит любую из SEQ ID NO: 35-38.
95. Способ по любому из пп. 87-94, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии представляет собой рекомбинантный аденоассоциированный вирус (AAV).
96. Способ по п. 95, характеризующийся тем, что AAV характеризуется серотипом AAV1, AAV2, AAV5, AAV8, AAV9, AAVrh10 или AAVrh74.
97. Способ по п. 95 или 96, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии включает самокомплементарный AAV или одноцепочечный AAV.
98. Способ по любому из пп. 95-97, характеризующийся тем, что AAV представляет собой AAV дикого типа или модифицированный AAV.
99. Способ по любому из пп. 95-98, характеризующийся тем, что AAV содержит белок капсида, характеризующийся по меньшей мере 95% идентичностью с белком капсида VP1, VP2 или VP3 дикого типа.
100. Способ по любому из пп. 95-99, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии содержит полинуклеотид, содержащий в порядке от 5’ до 3’:
a. последовательность промотора, активного у эукариот; и
b. последовательность, кодирующую белок дикого типа или его функциональный фрагмент или вариант;
причем последовательность, кодирующая белок дикого типа или его функциональный фрагмент или вариант, функционально связана с последовательностью промотора, активного у эукариот.
101. Способ по п. 100, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии дополнительно содержит один или более из следующего:
нейрон-специфичный промотор, необязательно выбранный из группы, состоящей из промоторов hSYN1 (синапсина человека), INA (альфа-интернексина), NES (нестина), TH (тирозингидроксилазы), FOXA2 (Forkhead-бокса A2), CaMKII (кальмодулин-зависимой протеинкиназы II) и NSE (нейрон-специфичной энолазы);
широко распространенный промотор, выбранный из группы, состоящей из промоторов ЦМВ, CAG, UBC, PGK, EF1-альфа, GAPDH, SV40, ВГВ, а также бета-актина курицы и бета-актина человека;
энхансер;
интрон;
сигнал поли-A;
последовательность, кодирующую пептид 2A; и
WPRE (посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурков).
102. Способ по п. 101, характеризующийся тем, что рекомбинантный вектор для генной терапии содержит в порядке от 5’ до 3’:
промотор HuBA, трансген, WPRE(x) и pA глобин-Oc;
промотор ЦМВ, энхансер TPL-eMLP, трансген, WPRE(r) и pA глобин-Oc;
промотор Syn, трансген, WPRE(r), 3'UTR(глобин) и pAGH-Bt;
промотор CBA, трансген и pAGH-Bt;
промотор EF1α, трансген и pA глобин-Oc;
промотор HuBA, трансген, R2V17 и pAGH-Bt;
промотор Syn, трансген, WPRE(х), 3'UTR(глобин) и pAGH- Hs;
промотор CaMKIIa, трансген, WPRE(r) и pAGH- Hs;
промотор ЦМВ, энхансер TPL-eMLP, трансген, WPRE(r) и pAGH-Hs;
промотор HuBA, трансген и pAGH- Hs;
промотор ЦМВ и TPL, eMPL, трансген, R2V17, 3'UTR(глобин) и pAGH- Bt;
промотор EF1α, трансген, WPRE(r) и pAGH-Bt;
промотор Syn, трансген, R2V17 и pA глобин-Oc;
промотор CaMKIIa, трансген, R2V17 и pA глобин-Oc;
промотор CBA, трансген, WPRE(х), 3'UTR(глобин) и pAGH-Hs;
промотор CBA, трансген, 3’UTR(глобин) и pA глобин-Oc;
промотор CaMKIIa, трансген, R2V17 и pAGH-Bt;
промотор EF1α, трансген, R2V17, 3’ UTR (глобин) и pAGH-Hs;
промотор ЦМВ, трансген, R2V17, 3’UTR(глобин) и pAGH-Hs; или
промотор ЦМВ, трансген и pAGH- Hs,
причем трансген необязательно кодирует PARK2.
103. Способ по любому из пп. 87-102, характеризующийся тем, что этап введения включает системное, парентеральное, внутривенное, церебральное, цереброспинальное, интратекальное, интрацистернальное, интрапутаминальное, интрагиппокампальное, интрастриарное или интрацеребровентрикулярное введение.
104. Способ по п. 103, характеризующийся тем, что этап введения включает внутривенную, церебральную, цереброспинальную, интратекальную, интрацистернальную, интрапутаминальную, интрагиппокампальную, интрастриарную или интрацеребровентрикулярную инъекцию.
105. Способ по п. 103, характеризующийся тем, что этап введения включает интратекальную инъекцию с наклоном по Тределенбургу.
106. Способ по п. 103, характеризующийся тем, что этап введения включает прямую инъекцию в pars compacta черной субстанции головного мозга.
107. Способ по любому из пп. 87-106, характеризующийся тем, что этап введения включает внедрение рекомбинантного вектора для генной терапии в головной мозг или цереброспинальную жидкость (ЦСЖ) субъекта.
108. Способ по любому из пп. 87-107, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x109 - 1x1014 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
109. Способ по любому из пп. 87-108, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x109 - 1x1014 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
110. Способ по любому из пп. 87-108, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x109 - 1x1014 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
111. Способ по любому из пп. 87-110, характеризующийся тем, что субъекту вводят 1x107 - 1x109 геномов вектора для генной терапии на килограмм массы тела субъекта (гв/кг).
112. Способ по любому из пп. 87-111, характеризующийся тем, что субъект является взрослым.
113. Способ по любому из пп. 87-112, характеризующийся тем, что субъект является ребёнком.
114. Способ по любому из пп. 87-113, характеризующийся тем, что количество дофаминергических нейронов у субъекта после этапа введения превышает количество дофаминергических нейронов у субъекта до этапа введения.
115. Способ по любому из пп. 87-114, характеризующийся тем, что уровень дофамина у субъекта после этапа введения превышает уровень дофамина у субъекта до этапа введения.
116. Способ по любому из пп. 87-115, характеризующийся тем, что количество дофаминергических нейронов у субъекта, получившего лечение указанным способом, повышено по сравнению с количеством дофаминергических нейронов у субъекта, не получившего такого лечения.
117. Способ по любому из пп. 87-116, характеризующийся тем, что уровень дофамина у субъекта, получившего лечение указанным способом, повышен по сравнению с уровнем дофамина у субъекта, не получившего такого лечения.
118. Способ по п. 87 или 117, характеризующийся тем, что уровень дофамина в черной субстанции у субъекта, получившего лечение указанным способом, повышен по сравнению с уровнем дофамина в черной субстанции у субъекта, не получившего такого лечения.
119. Способ по любому из пп. 87-118, характеризующийся тем, что уровень PRKN в ЦСЖ субъекта после этапа введения превышает уровень PRKN в ЦСЖ субъекта до этапа введения.
120. Способ по любому из пп. 87-119, характеризующийся тем, что балльный показатель по унифицированной шкале оценки болезни Паркинсона (UPDRS) у субъекта до этапа введения улучшается по сравнению с балльным показателем UPDRS у субъекта до этапа введения.
121. Способ по любому из пп. 87-120, характеризующийся тем, что уровень PRKN в ЦСЖ субъекта, получившего лечение указанным способом, повышен по сравнению с уровнем PRKN в ЦСЖ субъекта, не получившего такого лечения.
122. Способ по любому из пп. 87-121, характеризующийся тем, что балльный показатель UPDRS у субъекта, получившего лечение указанным способом, улучшается по сравнению с балльным показателем UPDRS у субъекта, не получившего такого лечения.
123. Способ по любому из пп. 87-112, характеризующийся тем, что нейроны субъекта экспрессируют пониженное количество альфа-синуклеина и/или содержат уменьшенное количество телец Леви после контакта с рекомбинантным вектором для генной терапии.
124. Способ подавления дегенерации или гибели дофаминергического нейрона, содержащего мутацию гена паркина (PRKN), включающий приведение нейрона в контакт с системой редактирования генов, включающей:
a. белок Cas или полинуклеотид, кодирующий белок Cas;
b. направляющую РНК (нРНК); и
c. матрицу для репарации, содержащую ген функционального белка Паркинсона 2, убиквитинпротеинлигазы E3 (PARK2), ген PTEN-индуцируемой предположительной киназы 1 (PINK1), ген протеиндегликазы DJ-1 (DJ-1), ген киназы 2, содержащей повтор, богатый лейцином (LRRK2), ген альфа-синуклеина (SCNA), ген протоонкогена c-Rel (c-Rel), ген фермента, активирующего убиквитин-подобный модификатор (ATG7), ген переносчика аминов синаптических пузырьков (VMAT2) или ген глюкоцереброзидазы (GBA) или их функционального варианта или фрагмента;
причем указанная система редактирования генов способна осуществлять репарацию эндогенного гена в нейроне или инсерцию функционального гена в геном нейрона.
125. Способ по п. 124, характеризующийся тем, что доставку по меньшей мере одного компонента системы редактирования генов осуществляют посредством рекомбинантного AAV.
126. Способ по п. 124, характеризующийся тем, что доставку системы редактирования генов осуществляют посредством рекомбинантного AAV.
127. Система редактирования генов клетки, включающая:
a. белок Cas или полинуклеотид, кодирующий белок Cas;
b. направляющую РНК (нРНК); и
c. матрицу для репарации, содержащую ген функционального белка Паркинсона 2, убиквитинпротеинлигазы E3 (PARK2), ген PTEN-индуцируемой предположительной киназы 1 (PINK1), ген протеиндегликазы DJ-1 (DJ-1), ген киназы 2, содержащей повтор, богатый лейцином (LRRK2), ген альфа-синуклеина (SCNA), ген протоонкогена c-Rel (c-Rel), ген фермента, активирующего убиквитин-подобный модификатор (ATG7), ген переносчика аминов синаптических пузырьков (VMAT2) или ген глюкоцереброзидазы (GBA) или их функционального варианта или фрагмента;
причем указанная система редактирования генов способна осуществлять репарацию эндогенного гена в клетке или инсерцию функционального гена в геном клетки.
128. Система редактирования генов по п. 127, характеризующаяся тем, что доставку по меньшей мере одного компонента указанной системы редактирования генов осуществляют посредством рекомбинантного AAV.
129. Система редактирования генов по п. 127, характеризующаяся тем, что доставку указанной системы редактирования генов осуществляют посредством рекомбинантного AAV.
130. Система редактирования генов по любому из пп. 127-129, характеризующаяся тем, что указанная клетка представляет собой нейрон ex vivo.
131. Система редактирования генов по любому из пп. 127-130, характеризующаяся тем, что указанная клетка представляет собой клетку субъекта.
RU2020134965A 2018-04-27 2019-04-29 Генная терапия при дегенерации цнс RU2020134965A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201862664006P 2018-04-27 2018-04-27
US62/664,006 2018-04-27
PCT/US2019/029744 WO2019210325A1 (en) 2018-04-27 2019-04-29 Gene therapy for cns degeneration

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2020134965A true RU2020134965A (ru) 2022-04-27

Family

ID=68295821

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020134965A RU2020134965A (ru) 2018-04-27 2019-04-29 Генная терапия при дегенерации цнс

Country Status (13)

Country Link
US (1) US20210230631A1 (ru)
EP (1) EP3810781A4 (ru)
JP (2) JP2021522273A (ru)
KR (1) KR20210005889A (ru)
CN (1) CN112368390A (ru)
AU (1) AU2019261646A1 (ru)
BR (1) BR112020021903A2 (ru)
CA (1) CA3096293A1 (ru)
IL (1) IL278213A (ru)
MX (1) MX2020011386A (ru)
RU (1) RU2020134965A (ru)
SG (1) SG11202010061PA (ru)
WO (1) WO2019210325A1 (ru)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019111258A1 (en) * 2017-12-07 2019-06-13 Ramot At Tel-Aviv University Ltd. Treatment for parkinsonian patients with mutations in the lrrk2 gene
JP2023526449A (ja) * 2020-05-21 2023-06-21 ニスノバイオ ジーティー，エルエルシー パーキンソン病を治療するための、増加した活性を有するパーキン変異体の遺伝子治療送達
CA3190720A1 (en) * 2020-08-03 2022-02-10 Prevail Therapeutics, Inc. Aav vectors encoding parkin and uses thereof
MX2023001615A (es) 2020-08-07 2023-03-08 Spacecraft Seven Llc Genoterapia con placofilina-2 (pkp2) mediante el uso de vector de aav.
WO2022040530A2 (en) * 2020-08-21 2022-02-24 Capsida, Inc. Virus compositions for treating mucopolysaccharidosis ii
CN113846122B (zh) * 2021-08-16 2023-08-25 中国医学科学院医学生物学研究所 一种过表达snca的腺相关病毒载体aav-snca、制备方法及其应用
CN115029360A (zh) * 2022-05-30 2022-09-09 上海勉亦生物科技有限公司 用于治疗粘多糖贮积症iiia型的转基因表达盒

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2003234337B2 (en) * 2002-05-02 2008-08-07 University Of Rochester Vectors having both isoforms of beta-hexosaminidase
US20060171935A1 (en) * 2005-01-31 2006-08-03 Asa Abeliovich Protecting cell therapy for neurological disorders including Parkinson's disease
WO2012067970A2 (en) * 2010-11-11 2012-05-24 Ted M Dawson Transcriptional repression leading to parkinson's disease
EP2834259A4 (en) * 2012-04-02 2016-08-24 Moderna Therapeutics Inc MODIFIED POLYNUCLEOTIDES
EP2669381A1 (en) * 2012-05-30 2013-12-04 AmVac AG Method for expression of heterologous proteins using a recombinant negative-strand RNA virus vector comprising a mutated P protein
JP6873699B2 (ja) * 2013-10-24 2021-05-19 ユニキュアー アイピー ビー．ブイ． Ａａｖ５カプシドタンパク質を含むアデノ随伴ウイルス（ａａｖ）を用いた神経学的疾患の処置
AU2017289886A1 (en) * 2016-06-29 2019-01-24 Ramot At Tel-Aviv University Ltd. Engineered parasites for delivering protein to the central nervous system (CNS)

Also Published As

Publication number Publication date
WO2019210325A1 (en) 2019-10-31
CA3096293A1 (en) 2019-10-31
SG11202010061PA (en) 2020-11-27
BR112020021903A2 (pt) 2021-03-02
EP3810781A1 (en) 2021-04-28
EP3810781A4 (en) 2022-08-17
JP2024059727A (ja) 2024-05-01
KR20210005889A (ko) 2021-01-15
JP2021522273A (ja) 2021-08-30
MX2020011386A (es) 2021-01-29
US20210230631A1 (en) 2021-07-29
AU2019261646A1 (en) 2020-11-12
IL278213A (en) 2020-11-30
CN112368390A (zh) 2021-02-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2020134965A (ru) Генная терапия при дегенерации цнс
US11325956B2 (en) Dual-AAV vector-based systems and methods for delivering oversized genes to mammalian cells
CA3182970A1 (en) Redirection of tropism of aav capsids
CA3083761A1 (en) Gene therapy for mucopolysaccharidosis iiib
EP4055174A1 (en) Transgene cassettes, aav vectors and aav viral vectors for the expression of human codon-optimized slc6a1
US20240102050A1 (en) Compositions and methods for treatment of neurological disorders
US11946065B2 (en) Transgene cassettes, AAV vectors, and AAV viral vectors for expression of human codon-optimized CSTB
WO2021222232A1 (en) Compositions and uses thereof for treatment of angelman syndrome
US20230414785A1 (en) Compositions and uses thereof for treatment of angelman syndrome
US20230149565A1 (en) Dual aav-myo7a vectors with improved safety for the treatment of ush1b
JP2024517957A (ja) ベクター系
CN116670159A (zh) 组合物及其用于治疗安格尔曼综合征的用途
AU2022358523A1 (en) Slc13a5 gene therapy vectors and uses thereof
AU2022290521A1 (en) Recombinant adeno-associated viruses for lesch-nyhan disorders and uses thereof
WO2023147476A1 (en) Transgene casette designed to express the human codon-optimized gene fmr1
WO2021231491A1 (en) Disease correction by delivery of aav8 vectors expressing codon optimized naglu