RU2018122664A - Разработанные бактериальные композиции - Google Patents

Разработанные бактериальные композиции Download PDF

Info

Publication number
RU2018122664A
RU2018122664A RU2018122664A RU2018122664A RU2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
dbc
composition according
composition
paragraphs
population
Prior art date
Application number
RU2018122664A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018122664A3 (ru
RU2773327C2 (ru
Inventor
Джули БАТТОН
Дэвид КУК
Мэттью ХЕНН
Мэри-Джейн Ломбардо МАККЕНЗИ
Кевин ЛИТКОФСКИ
Асунсьон МАРТИНЕС
Грегори МАККЕНЗИ
Мадхумитха НАНДАКУМАР
Марин ВУЛИЧ
Дженнифер УОРТМАН
Original Assignee
Серес Терапеутикс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Серес Терапеутикс, Инк. filed Critical Серес Терапеутикс, Инк.
Publication of RU2018122664A publication Critical patent/RU2018122664A/ru
Publication of RU2018122664A3 publication Critical patent/RU2018122664A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2773327C2 publication Critical patent/RU2773327C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/66Microorganisms or materials therefrom
    • A61K35/74Bacteria
    • A61K35/741Probiotics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/66Microorganisms or materials therefrom
    • A61K35/74Bacteria
    • A61K35/741Probiotics
    • A61K35/742Spore-forming bacteria, e.g. Bacillus coagulans, Bacillus subtilis, clostridium or Lactobacillus sporogenes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)

Claims (20)

1. Композиция, содержащая жизнеспособную популяцию бактерий, включающую бактериальные виды DBC 1, DBC 2, DBC 3, DBC 4, DBC 5, DBC 6, DBC 7, DBC 8, или DBC 9 из Таблицы 3, или DBC S1, DBC S2, DBC S4, DBC S5, DBC S6, DBC S7, DBC S8, DBC S9, DBC S10, DBC S11, DBC S12, DBC S13, DBC S14, DBC S15, DBC S16, DBC S17, DBC S18, DBC S19, DBC S20, DBC S21, DBC S22, DBC S23 или DBC S24 из Таблицы 4.
2. Композиция по п. 1, отличающаяся тем, что 16S рДНК каждого из бактериальных видов в DBC имеет по меньшей мере 97% идентичности с по меньшей мере одной последовательностью 16S рДНК на Фигуре 1.
3. Композиция по п. 1, отличающаяся тем, что композиция состоит из жизнеспособной популяции бактериальных видов DBC 1, DBC 2, DBC 3, DBC 4, DBC 5, DBC 6, DBC 7, DBC 8, DBC 9, DBC S1, DBC S2, DBC S4, DBC S5, DBC S6, DBC S7, DBC S8, DBC S9, DBC S10, DBC S11, DBC S12, DBC S13, DBC S14, DBC S15, DBC S16, DBC S17, DBC S18, DBC S19, DBC S20, DBC S21, DBC S22, DBC S23 или DBC S24.
4. Композиция по п. 3, отличающаяся тем, что 16S рДНК каждого из бактериальных видов в DBC имеет по меньшей мере 97% идентичности с по меньшей мере одной последовательностью 16S рДНК на Фигуре 1.
5. Композиция по любому из пп. 1-4, отличающаяся тем, что популяция бактериальных видов способна утилизировать по меньшей мере 90% источников углерода, перечисленных на Фигуре 4.
6. Композиция, содержащая популяцию по меньшей мере пяти видов жизнеспособных бактерий, отличающаяся тем, что по меньшей мере один из видов популяции имеет один или несколько признаков, выбранных из группы, состоящей из: (i) утилизации одного или нескольких источников углерода, утилизируемых патогенным микроорганизмом, (ii) продуцирования ингибитора гистондеацетилазы (HDAC), (iii) продуцирования индола или других метаболитов триптофана, и (iv) продуцирования фермента, участвующего в регуляции желчных кислот.
7. Композиция по п. 6, отличающаяся тем, что патогенный микроорганизм представляет собой C. difficile, и популяция включает один или несколько видов жизнеспособных бактерий, которые могут утилизировать по меньшей мере пять разных источников углерода C. difficile.
8. Композиция по п. 7, отличающаяся тем, что источники углерода C. difficile выбирают из группы, состоящей из: таурохолата, гликохолата, гликохенодезоксихолата, таурохенодезоксихолата, холата, хенодезоксихолата и дезоксихолата.
9. Композиция по п. 6, отличающаяся тем, что популяция включает один или несколько видов жизнеспособных бактерий, которые продуцируют ингибитор HDAC, выбранный из группы, состоящей из: бутирата, изовалерата, изобутирата, пропионата и 2-метилбутирата.
10. Композиция по п. 6, отличающаяся тем, что популяция включает один или несколько видов, которые продуцируют один или несколько ферментов, выбранных из группы, состоящей из гидролазы желчных солей (BSH), 3-α-гидроксистероиддегидрогеназы (3-α-HSDH), 7-α-гидроксистероиддегидрогеназы (7-α-HSDH) и 12-α-гидроксистероиддегидрогеназы (12-α-HSDH).
11. Композиция, содержащая по меньшей мере один вид из каждого из кладов 86, 90, 101, 139, 195, 197, 206, 233, 238, 241, 244 и 290, и необязательно вид из клада 202.
12. Композиция по любому из пп. 6-11, отличающаяся тем, что композиция включает 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 видов бактерий.
13. Композиция по любому из пп. 1-12, отличающаяся тем, что по меньшей мере 75% бактерий являются спорами.
14. Состав, содержащий композицию по любому из пп. 1-13 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
15. Состав по п. 14, отличающийся тем, что фармацевтически приемлемый эксципиент содержит глицерин, полиэтиленгликоль или масло какао.
16. Состав по п. 14 или 15, отличающийся тем, что состав находится в капсуле или таблетке.
17. Использование фармацевтически эффективного количества композиции по любому из пп. 1-13 для предотвращения или лечения дисбиоза у субъекта с риском, или с диагнозом, дисбиоза.
18. Использование по п. 17, отличающееся тем, что общая концентрация бактерий в композиции составляет от 10e1 до 10e9.
19. Использование по п. 17 или 18, отличающееся тем, что бактерии композиции содержатся в 1, 2, 3, 4 или 5 капсулах.
20. Использование терапевтически эффективного количества композиции по любому из пп. 1-13 для лечения инфекции C. difficile, или предотвращения инфекции C. difficile, или предотвращения рецидива инфекции C. difficile.
RU2018122664A 2015-11-24 2016-11-23 Разработанные бактериальные композиции RU2773327C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562259523P 2015-11-24 2015-11-24
US62/259,523 2015-11-24
US201662351696P 2016-06-17 2016-06-17
US62/351,696 2016-06-17
US201662401011P 2016-09-28 2016-09-28
US62/401,011 2016-09-28
PCT/US2016/063697 WO2017091783A2 (en) 2015-11-24 2016-11-23 Designed bacterial compositions

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2022114519A Division RU2022114519A (ru) 2015-11-24 2016-11-23 Разработанные бактериальные композиции

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018122664A true RU2018122664A (ru) 2019-12-25
RU2018122664A3 RU2018122664A3 (ru) 2020-04-15
RU2773327C2 RU2773327C2 (ru) 2022-06-02

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
EP3380108A2 (en) 2018-10-03
CA3006187A1 (en) 2017-06-01
RU2018122664A3 (ru) 2020-04-15
PL3380108T3 (pl) 2023-03-27
EP3380108B1 (en) 2022-11-16
BR112018010430A2 (pt) 2018-11-27
JP2022033885A (ja) 2022-03-02
WO2017091783A3 (en) 2017-07-13
ES2938361T3 (es) 2023-04-10
PT3380108T (pt) 2023-02-17
KR20180083894A (ko) 2018-07-23
AU2024200663A1 (en) 2024-02-22
FI3380108T3 (fi) 2023-03-03
EP4233884A2 (en) 2023-08-30
JP7523884B2 (ja) 2024-07-29
AU2016359178A1 (en) 2018-06-14
EP4233884A3 (en) 2023-10-04
WO2017091783A2 (en) 2017-06-01
US20240216444A1 (en) 2024-07-04
US20190247447A1 (en) 2019-08-15
CN109661236A (zh) 2019-04-19
DK3380108T3 (da) 2023-02-06
JP2019501136A (ja) 2019-01-17
MX2018006283A (es) 2019-09-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2019501136A5 (ru)
Dubois et al. Control of Clostridium difficile physiopathology in response to cysteine availability
JP2018039833A5 (ru)
CY1123676T1 (el) Συνθεσεις και μεθοδοι για την εσωτερικοποιηση ενζυμων
Azriel et al. The stringent response regulator DksA is required for Salmonella enterica serovar Typhimurium growth in minimal medium, motility, biofilm formation, and intestinal colonization
MX2021009285A (es) Anticuerpos novedosos de unión a la proteína de antígenos de diferenciación 40 (cd40).
Nilsen et al. Novel selective inhibition of Lactobacillus iners by Lactobacillus-derived bacteriocins
Kim et al. Passage of Campylobacter jejuni through the chicken reservoir or mice promotes phase variation in contingency genes Cj0045 and Cj0170 that strongly associates with colonization and disease in a mouse model
EA202092490A1 (ru) Модуляторы метилмодифицирующих ферментов, композиции и их применения
Shang et al. Comparative fitness and determinants for the characteristic drug resistance of ST239-MRSA-III-t030 and ST239-MRSA-III-t037 strains isolated in China
BR112014031730A2 (pt) entidades químicas, composições farmacêuticas, compostos ou sais farmaceuticamente aceitáveis dos mesmos, usos de entidades químicas ou composições e métodos para tratar doenças, distúrbios ou condições médicas mediadas pela atividade enzimática de pde1 e para modular a atividade da enzima pde1
BR112018068565A2 (pt) combinações de inibidores de lsd1 para uso no tratamento de tumores sólidos
Sun et al. Gut microbiota‐mediated NLRP12 expression drives the attenuation of dextran sulphate sodium‐induced ulcerative colitis by Qingchang Wenzhong decoction
AU2017268795A1 (en) Methods of treating behavioral syndromes using pipradrol
MX2023001287A (es) Bancos universales de células t específicas de antígeno y métodos de fabricación y uso terapéutico de los mismos.
Latif et al. Antimicrobial susceptibility in Neisseria gonorrhoeae isolates from five sentinel surveillance sites in Zimbabwe, 2015–2016
EA202192925A1 (ru) Твердые формы ингибитора glyt1
RU2014150498A (ru) Стерильная композиция
RU2010135252A (ru) Применение маслиновой кислоты для лечения заболеваний и их симптомов посредством ингибирования сох-2
Ganguly et al. Antioxidant and anticancer roles of a novel strain of Bacillus anthracis isolated from vermicompost prepared from paper mill sludge
RU2018122664A (ru) Разработанные бактериальные композиции
Sood et al. Fecal microbiota transplantation for ulcerative colitis: an evolving therapy
MX2020000009A (es) Nuevas formulaciones en capsulas de gelatina blandas de secnidazol y sus usos.
Lee et al. Lack of modulatory effect of simvastatin on indoxyl sulfate-induced activation of cultured endothelial cells
WO2019079618A3 (en) Formulations for treatment of skin conditions