RU2017131044A - Способы и системы для экспериментального планирования и анализа - Google Patents

Способы и системы для экспериментального планирования и анализа Download PDF

Info

Publication number
RU2017131044A
RU2017131044A RU2017131044A RU2017131044A RU2017131044A RU 2017131044 A RU2017131044 A RU 2017131044A RU 2017131044 A RU2017131044 A RU 2017131044A RU 2017131044 A RU2017131044 A RU 2017131044A RU 2017131044 A RU2017131044 A RU 2017131044A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
amplification curves
list
amplification
display screen
curves
Prior art date
Application number
RU2017131044A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2017131044A3 (ru
RU2719346C2 (ru
Inventor
Скотт РАЙКС
Лик Сэн ЛАУ
Кок Сионг ТЕО
Цзэн Вэй ЧУ
Лянь Сэн ЛОХ
Вани ФО
Майкл УЙ
Дэвид ХОРД
Шон ЦИММЕРМАН
Original Assignee
Лайф Текнолоджиз Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Лайф Текнолоджиз Корпорейшн filed Critical Лайф Текнолоджиз Корпорейшн
Publication of RU2017131044A publication Critical patent/RU2017131044A/ru
Publication of RU2017131044A3 publication Critical patent/RU2017131044A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2719346C2 publication Critical patent/RU2719346C2/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B45/00—ICT specially adapted for bioinformatics-related data visualisation, e.g. displaying of maps or networks
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
    • G01N21/6428—Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
    • G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
    • G01N21/6452—Individual samples arranged in a regular 2D-array, e.g. multiwell plates
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
    • G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
    • G01N21/6456—Spatial resolved fluorescence measurements; Imaging
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F3/00—Input arrangements for transferring data to be processed into a form capable of being handled by the computer; Output arrangements for transferring data from processing unit to output unit, e.g. interface arrangements
    • G06F3/01—Input arrangements or combined input and output arrangements for interaction between user and computer
    • G06F3/048—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI]
    • G06F3/0481—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI] based on specific properties of the displayed interaction object or a metaphor-based environment, e.g. interaction with desktop elements like windows or icons, or assisted by a cursor's changing behaviour or appearance
    • G06F3/0482—Interaction with lists of selectable items, e.g. menus
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F3/00—Input arrangements for transferring data to be processed into a form capable of being handled by the computer; Output arrangements for transferring data from processing unit to output unit, e.g. interface arrangements
    • G06F3/01—Input arrangements or combined input and output arrangements for interaction between user and computer
    • G06F3/048—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI]
    • G06F3/0484—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI] for the control of specific functions or operations, e.g. selecting or manipulating an object, an image or a displayed text element, setting a parameter value or selecting a range
    • G06F3/04842—Selection of displayed objects or displayed text elements
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F3/00—Input arrangements for transferring data to be processed into a form capable of being handled by the computer; Output arrangements for transferring data from processing unit to output unit, e.g. interface arrangements
    • G06F3/01—Input arrangements or combined input and output arrangements for interaction between user and computer
    • G06F3/048—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI]
    • G06F3/0484—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI] for the control of specific functions or operations, e.g. selecting or manipulating an object, an image or a displayed text element, setting a parameter value or selecting a range
    • G06F3/0485—Scrolling or panning
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
    • G06F3/00—Input arrangements for transferring data to be processed into a form capable of being handled by the computer; Output arrangements for transferring data from processing unit to output unit, e.g. interface arrangements
    • G06F3/01—Input arrangements or combined input and output arrangements for interaction between user and computer
    • G06F3/048—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI]
    • G06F3/0487—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI] using specific features provided by the input device, e.g. functions controlled by the rotation of a mouse with dual sensing arrangements, or of the nature of the input device, e.g. tap gestures based on pressure sensed by a digitiser
    • G06F3/0488—Interaction techniques based on graphical user interfaces [GUI] using specific features provided by the input device, e.g. functions controlled by the rotation of a mouse with dual sensing arrangements, or of the nature of the input device, e.g. tap gestures based on pressure sensed by a digitiser using a touch-screen or digitiser, e.g. input of commands through traced gestures
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T11/00—2D [Two Dimensional] image generation
    • G06T11/20—Drawing from basic elements, e.g. lines or circles
    • G06T11/206—Drawing of charts or graphs
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T3/00—Geometric image transformations in the plane of the image
    • G06T3/40—Scaling of whole images or parts thereof, e.g. expanding or contracting

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Human Computer Interaction (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Data Mining & Analysis (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
  • User Interface Of Digital Computer (AREA)

Claims (43)

1. Способ идентификации области реакции, связанной с кривой амплификации из множества кривых амплификации, причем способ включает:
прием данных амплификации из множества областей реакции, при этом каждая область реакции содержит пробу;
генерирование множества кривых амплификации из данных амплификации;
отображение первой части множества кривых амплификации на экране дисплея;
отображение перечня индикаций областей реакции, связанных с первой частью кривых амплификации, наряду с первой частью кривых амплификации на экране дисплея;
регулировку вида для отображения второй части множества кривых амплификации;
динамическую регулировку перечня для отображения индикаций областей реакции, связанных со второй частью кривых амплификации, наряду со второй частью кривых амплификации на экране дисплея, причем перечень выполнен с возможностью прокрутки.
2. Способ по п. 1, в котором регулировка вида представляет собой увеличение масштаба множества кривых амплификации.
3. Способ по п. 1, в котором регулировка вида представляет собой уменьшение масштаба множества кривых амплификации.
4. Способ по п. 1, в котором первая часть перечня может быть просмотрена на экране дисплея.
5. Способ по п. 4, в котором вторая часть перечня может быть просмотрена после прокрутки перечня вниз.
6. Способ по п. 1, который дополнительно включает:
предоставление информации о пробе в области реакции после того, как пользователь выбрал индикацию области реакции из перечня.
7. Способ по п. 1, в котором экран дисплея представляет собой сенсорный экран.
8. Машиночитаемый носитель информации, кодированный исполняемыми процессором инструкциями, причем инструкция служит для идентификации области реакции, связанной с кривой амплификации из множества кривых амплификации, при этом инструкции содержат инструкции для:
приема данных амплификации из множества областей реакции, при этом каждая область реакции содержит пробу;
генерирования множества кривых амплификации из данных амплификации;
отображения первой части множества кривых амплификации на экране дисплея;
отображения перечня индикаций областей реакции, связанных с первой частью кривых амплификации, наряду с первой частью кривых амплификации на экране дисплея;
регулировки вида для отображения второй части множества кривых амплификации;
динамической регулировки перечня для отображения индикаций областей реакции, связанных со второй частью кривых амплификации, наряду со второй частью кривых амплификации на экране дисплея, причем перечень выполнен с возможностью прокрутки.
9. Машиночитаемый носитель информации по п. 8, в котором регулировка вида представляет собой увеличение масштаба множества кривых амплификации.
10. Машиночитаемый носитель информации по п. 8, в котором регулировка вида представляет собой уменьшение масштаба множества кривых амплификации.
11. Машиночитаемый носитель информации по п. 8, в котором первая часть перечня может быть просмотрена на экране дисплея.
12. Машиночитаемый носитель информации по п. 11, в котором вторая часть перечня может быть просмотрена после прокрутки перечня вниз.
13. Машиночитаемый носитель информации по п. 8, который дополнительно содержит инструкции для:
предоставления информации о пробе в области реакции после того, как пользователь выбрал индикацию области реакции из перечня.
14. Машиночитаемый носитель информации по п. 8, в котором экран дисплея представляет собой сенсорный экран.
15. Система для идентификации области реакции, связанной с кривой амплификации из множества кривых амплификации, причем система содержит:
процессор; и
память, кодированную инструкциями, исполняемыми процессором, при этом инструкции содержат инструкции для:
приема данных амплификации из множества областей реакции, при этом каждая область реакции содержит пробу;
генерирования множества кривых амплификации из данных амплификации;
отображения первой части множества кривых амплификации на экране дисплея;
отображения перечня индикаций областей реакции, связанных с первой частью кривых амплификации, наряду с первой частью кривых амплификации на экране дисплея;
регулировки вида для отображения второй части множества кривых амплификации;
динамической регулировки перечня для отображения индикаций областей реакции, связанных со второй частью кривых амплификации, наряду со второй частью кривых амплификации на экране дисплея, при этом перечень выполнен с возможностью прокрутки.
16. Система по п. 15, в которой регулировка вида представляет собой увеличение масштаба множества кривых амплификации.
17. Система по п. 15, в которой регулировка вида представляет собой уменьшение масштаба множества кривых амплификации.
18. Система по п. 15, в которой первая часть перечня может быть просмотрена на экране дисплея.
19. Система по п. 18, в которой вторая часть перечня может быть просмотрена после прокрутки перечня вниз.
20. Система по п. 15, которая дополнительно содержит инструкции для:
предоставления информации о пробе в области реакции после того, как пользователь выбрал индикацию области реакции из перечня.
RU2017131044A 2015-02-06 2016-02-05 Способы и системы для экспериментального планирования и анализа RU2719346C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562113006P 2015-02-06 2015-02-06
US62/113,006 2015-02-06
PCT/US2016/016827 WO2016127086A1 (en) 2015-02-06 2016-02-05 Methods and systems for experiment design and analysis

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2017131044A true RU2017131044A (ru) 2019-03-06
RU2017131044A3 RU2017131044A3 (ru) 2019-07-17
RU2719346C2 RU2719346C2 (ru) 2020-04-17

Family

ID=55411750

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017131044A RU2719346C2 (ru) 2015-02-06 2016-02-05 Способы и системы для экспериментального планирования и анализа

Country Status (9)

Country Link
US (1) US10102653B2 (ru)
EP (1) EP3254086B1 (ru)
JP (1) JP6496417B2 (ru)
KR (1) KR102541746B1 (ru)
CN (1) CN107223249B (ru)
BR (1) BR112017016932B1 (ru)
RU (1) RU2719346C2 (ru)
SG (2) SG11201706356XA (ru)
WO (1) WO2016127086A1 (ru)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019148169A1 (en) * 2018-01-29 2019-08-01 Gen-Probe Incorporated Analytical systems and methods
USD872109S1 (en) 2018-08-07 2020-01-07 Caterpillar Inc. Display screen or portion thereof with graphical user interface

Family Cites Families (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2329061C (en) * 1999-03-27 2006-11-14 The Perkin-Elmer Corporation Methods for exogenous, internal controls during nucleic acid amplification
AU6227900A (en) * 1999-07-21 2001-02-13 Tropix, Inc. Luminescence detection workstation
EP1404878A4 (en) * 2001-07-11 2006-12-06 Applera Corp INTERNAL CALIBRATION STANDARDS FOR ELECTROPHORETIC ANALYZES
US7363168B2 (en) * 2001-10-02 2008-04-22 Stratagene California Adaptive baseline algorithm for quantitative PCR
US7315376B2 (en) * 2005-01-07 2008-01-01 Advanced Molecular Systems, Llc Fluorescence detection system
US7630849B2 (en) * 2005-09-01 2009-12-08 Applied Biosystems, Llc Method of automated calibration and diagnosis of laboratory instruments
US8473216B2 (en) * 2006-11-30 2013-06-25 Fluidigm Corporation Method and program for performing baseline correction of amplification curves in a PCR experiment
JP5810078B2 (ja) * 2009-04-16 2015-11-11 コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェＫｏｎｉｎｋｌｉｊｋｅ Ｐｈｉｌｉｐｓ Ｎ．Ｖ． 核酸定量方法
US8754890B2 (en) * 2009-07-31 2014-06-17 Oracle International Corporation Graphical interface with data presence indicators
CN103038773B (zh) * 2010-04-08 2016-06-08 生命技术公司 通过角度配置搜索的用于基因分型的系统和方法
CN103069427B (zh) * 2010-04-09 2016-11-23 生命技术公司 qPCR基因分型数据的可视化工具
EP2558971B1 (en) * 2010-04-11 2021-02-17 Life Technologies Corporation SYSTEMS AND METHODS FOR MODEL-BASED qPCR
JP5959516B2 (ja) * 2010-08-18 2016-08-02 ライフ テクノロジーズ コーポレーション 電気化学的検出装置のためのマイクロウェルの化学コーティング法
CA2819553C (en) * 2010-12-15 2018-09-04 Akzo Nobel Chemicals International B.V. Aqueous starch containing polymer dispersion for paper applications
JP2014507031A (ja) * 2011-02-01 2014-03-20 ライフ テクノロジーズ コーポレーション タンパク質融解曲線データの分析のためのシステムおよび方法
KR20120103496A (ko) 2011-03-09 2012-09-19 삼성테크윈 주식회사 실시간 중합효소 연쇄 반응에 있어서 표준 곡선 및 임계값을 획득하는 방법
SG10201604446PA (en) * 2011-09-30 2016-07-28 Life Technologies Corp Methods and systems for visualizing and evaluating data
WO2013049702A2 (en) * 2011-09-30 2013-04-04 Life Technologies Corporation Systems and methods for biological analysis

Also Published As

Publication number Publication date
SG10202006588UA (en) 2020-08-28
BR112017016932A2 (pt) 2018-04-03
RU2017131044A3 (ru) 2019-07-17
KR20170135832A (ko) 2017-12-08
RU2719346C2 (ru) 2020-04-17
US20160239990A1 (en) 2016-08-18
JP2018506974A (ja) 2018-03-15
BR112017016932B1 (pt) 2021-04-20
EP3254086A1 (en) 2017-12-13
CN107223249A (zh) 2017-09-29
WO2016127086A1 (en) 2016-08-11
JP6496417B2 (ja) 2019-04-03
KR102541746B1 (ko) 2023-06-09
CN107223249B (zh) 2021-06-18
SG11201706356XA (en) 2017-09-28
EP3254086B1 (en) 2020-08-05
US10102653B2 (en) 2018-10-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
MX2015016047A (es) Metodo y sistema para mantener o mejorar el bienestar.
EP2857983A3 (en) Analyzing font similarity for presentation
EP2662700A3 (en) Method and apparatus for obtaining location of user
MY187254A (en) Systems and methods for ranking potential attended delivery/pickup locations
BR112018003372A2 (pt) método para fornecer recomendações de barbeamento em estágios, programa de computador executável em uma unidade de processamento, sistema de cuidados pessoais, e aparelho de barbeamento
WO2014151467A3 (en) Method and apparatus for providing suggestions driven by nearby favorites
JP2016024789A5 (ru)
WO2012030793A3 (en) Providing results to parameterless search queries
RU2014129554A (ru) Системы и способы для идентификации и предложения значков настроения
RU2012146096A (ru) Временное форматирование и построение диаграммы выбранных данных
WO2012162278A3 (en) Social data recording
MX357642B (es) Metodo y dispositivo para seleccionar informacion.
PH12015502104A1 (en) System for non-deterministic disambiguation and qualitative entity matching of geographical locale data for business entities
MX2017005872A (es) Multi-busquedas y multi-tareas en las busquedas.
BR112012021103A2 (pt) dispositivo, método, sistema e programa de processamento de informação, e, meio de armazenamento legível por computador
RU2014153979A (ru) Способ создания надписи, устройство и терминал
GB2547755A (en) System and method for providing contextual analytics data
EA201490595A1 (ru) Способ и система идентификации геологических горизонтов
WO2014140848A3 (en) Systems and methods for providing retail process analytics information based on physiological indicator data
EP2755155A3 (en) Computer implemented method of collecting data relating to an adverse event relating to use of a substance
BR112013003988A2 (pt) "dispositivo de provisão de informação, método de provisão de informação executado por um dispositivo de provisão de informação, e, meio de gravação de informação legível por computador não transitório".
RU2017131044A (ru) Способы и системы для экспериментального планирования и анализа
EP2797001A3 (en) System and method for creating variants in a test database during various test stages
RU2018117732A (ru) Системы и способы генерирования корректных радиологических рекомендаций
Kostrikov et al. Three key EOS LiDAR tool functionalities for urban studies