CN107223249B - 用于实验设计和分析的方法和系统 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种用于从多条扩增曲线(104、204、304、404)中识别某条扩增曲线相关反应位点的方法。所述方法包括从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据。所述方法进一步包括从所述扩增数据生成多条扩增曲线(104、204、304、404)，并在显示屏幕(1212)上显示所述多条扩增曲线(104、204、304、404)的第一部分。所述方法包括在所述显示屏幕(1212)上显示的扩增曲线(104、204、304、404)的所述第一部分的旁边显示扩增曲线(104、204、304、404)所述第一部分相关反应位点(A24‑A29)的指示列表。随后，所述方法包括调整所述视图以显示所述多条扩增曲线(104、204、304、404)的第二部分。所述方法进一步包括动态地调整所述列表，以在所述显示屏幕(1212)上显示的扩增曲线(104、204、304、404)的所述第二部分的旁边显示扩增曲线(104、204、304、404)所述第二部分相关反应位点(A24‑A29)的指示。
Description
背景
一般而言，用户通过收集和比较各种生物数据来进行生物学研究。例如，一位用户可能运行各种基于qPCR的实验来收集研究目标基因的不同类型生物数据，例如基因分型数据或基因表达数据。如果该用户希望比较各种类型的生物数据，通常会以人工方式进行。一个实验所需的样品数量也可能很大，通常很难隔离一位用户的一个特定样品，对其进行详细检查和可视化以便用户可快捷方便地从数据中获得有价值的信息。此外，实验室或设施经常会运行多种生物仪器。跟踪仪器的维护或校准可能较为困难。
发明概要
在一个示例性实施例中，提供了一种用于从多条扩增曲线中识别一条扩增曲线相关反应位点的方法。该方法包括从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据，并从扩增数据生成多条扩增曲线。该方法还包括在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分，并在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点指示列表。该方法包括调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分，并动态地调整该列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点指示。该列表配置为可滚动。
在另一个示例性实施例中，提供了一个用处理器可执行指令编码的计算机可读存储介质，该指令用于从多条扩增曲线中识别一条扩增曲线相关反应位点。该指令包括用于从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据，并从扩增数据生成多条扩增曲线的指令。该指令还包括用于在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分，并在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点指示列表的指令。该指令包括用于调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分，并动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点指示的指令。该列表配置为可滚动。
在另一个示例性实施例中，提供了一种用于从多条扩增曲线中识别某条扩增曲线相关反应位点的系统。该系统包括一个处理器和一个存储器。该存储器用指令编码，由该处理器执行。该指令包括用于从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据，并从扩增数据生成多条扩增曲线的指令。该指令还包括用于在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分，并在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点指示列表的指令。该指令包括用于调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分，并动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点指示的指令。该列表配置为可滚动。
附图说明
图1示出根据本文所述各种实施例，用于显示扩增曲线的一个图形用户界面的一个实例；
图2示出根据本文所述各种实施例，用于查看一组选定扩增曲线的一个图形用户界面的一个实例；
图3示出根据本文所述各种实施例，用于识别扩增曲线的一个图形用户界面的一个实例；
图4示出根据本文所述各种实施例，用于识别扩增曲线的一个图形用户界面的一个实例；
图5示出根据本文所述各种实施例，用于输入标签或备注的一个图形用户界面的一个实例；
图6示出根据本文所述各种实施例，用于显示和编辑一个热循环方案的一个图形用户界面的一个实例；
图7示出根据本文所述各种实施例，用于显示和编辑热循环方案的一个图形用户界面的一个实例；
图8示出根据本文所述各种实施例，用于显示多台仪器状态的一个图形用户界面的一个实例；
图9示出根据本文所述各种实施例，用于显示一台仪器相关信息的一个图形用户界面的一个实例；
图10示出根据本文所述各种实施例，用于显示一台仪器相关统计信息的一个图形用户界面的一个实例；
图11示出根据本文所述各种实施例，用于显示一台仪器相关统计信息的一个图形用户界面的一个实例；
图12示出在其上可实现本文所述各种实施例的一个计算系统；
图13示出根据本文所述各种实施例的一个示例性分布式网络系统；
图14为示出PCR仪器1400的一个框图，在其上可实现本教导内容的实施例；
图15示出可用于根据本文所述实施例成像的一个示例性光学系统1500。
详细说明
为了更全面地理解本发明，以下描述阐述了众多具体细节，如具体配置、参数、实例等。然而，应当认识到，此类描述并非旨在限制本发明的范围，而是旨在更好地描述示例性实施例。
研究人员使用生物仪器进行各种实验以研究目标基因。本教导内容参考实时聚合酶链反应(RT-PCR)仪器进行描述。具体地，本教导内容的一个实施例由采用孔板光学成像的RT-PCR仪器实现。此类仪器能够同时测量来自多个样品、部位或反应位点的信号以供分析。
所测信号包括从多个反应位点获得的荧光数据，以检测经过一段时间，随着反应位点内的该样品扩增，反应位点内核酸的量。对每个反应位点的该荧光数据作图，生成一条扩增曲线。由于在每个反应位点都会测量荧光数据，因此生成的扩增曲线通常有几百条，有时可达数千条。可以想象，很难单独查看一条扩增曲线以及该样品相关信息。根据本文描述的各种实施例，通过方法和系统，一位用户可以很容易地选择一个目标特定扩增曲线并查看该扩增曲线的相关信息，使得该用户能够从该实时扩增曲线快速获得有用信息，或者标记曲线以便日后进一步分析。
参见图1，所示为一个图形用户界面100在扩增曲线图102内显示多条扩增曲线104。对于扩增曲线图102中多条扩增曲线104的可视部分，可以通过激活孔细节按钮106查看与扩增曲线相关联的每个孔的详细信息。此外，通过激活缩放按钮108可放大或缩小扩增曲线图102来观看多条扩增曲线的不同部分。
在图2示出的另一个实施例中，所示为用于查看一组选定扩增曲线204的图形用户界面200的一个实例。在本实例中，扩增曲线图202显示了扩增曲线204的一部分。扩增曲线图202的视图可通过激活箭头206来移动。此外，扩增曲线图202的视图可通过激活放大308放大，或使用缩小按钮210缩小。通过改变扩增曲线图202的视图，可动态地改变显示的扩增曲线部分。孔滚动条216中显示了可视扩增曲线的更多信息。例如，扩增曲线204的孔位置用孔滚动条216中的颜色表示。如果扩增曲线图202中可视扩增曲线的数量超过孔滚动条216中的可用空间数量，则该用户可向下或向上滚动以查看关于其他扩增曲线的信息。如果需要关于一条特定扩增曲线的更多信息，则用户可以在孔滚动条216中选择关联的孔位置信息以查看更多详细信息，例如加载到孔中的样品类型。通过这种方式，可更容易地选择单条扩增曲线，并且可以快捷方便地识别与所选扩增曲线相关联的信息。
另外，根据各种实施例，备注按钮212和标签按钮214可被提供给一位用户，以供该用户选择添加备注或标签至一条特定扩增曲线。例如，一位用户可能注意到一条扩增曲线具有一项不寻常的特征，并想要添加与该条扩增曲线相关联的备注用于存储以备将来参考。该用户可选择备注按钮212和标签按钮214以输入标签和/或备注。
箭头206、放大按钮208、缩小按钮210和孔滚动条216可通过触摸控制激活。在各种实施例中，用户还可能够在扩增曲线图202上作出捏合缩放触摸屏手势，以放大和缩小扩增曲线图202的可视区域。孔滚动条216也可通过触摸屏手势来控制，例如向上滑动以使孔滚动条216向上移动，或向下滑动以使孔滚动条216向下移动。
图3示出根据本文所述各种实施例，用于识别扩增曲线的一个图形用户界面300的另一个实例。在本实例中，扩增曲线图302显示了扩增曲线304的一部分。扩增曲线图302的视图可通过激活箭头306来移动。此外，扩增曲线图302的视图可通过激活放大按钮308放大，或使用缩小按钮310缩小。通过改变扩增曲线图302的视图，可动态地改变显示的扩增曲线部分。孔滚动条316中显示了可视扩增曲线的更多信息。例如，扩增曲线304的孔位置用孔滚动条316中的颜色表示。如果扩增曲线图302中可视扩增曲线的数量超过孔滚动条316中的可用空间数量，则该用户可向下或向上滚动以查看关于其他扩增曲线的信息。如果需要关于一条特定扩增曲线的更多信息，则用户可以在孔滚动条316中选择关联的孔位置信息以查看更多详细信息，例如加载到孔中的样品类型。在本实例中，从孔滚动条316中选择A27。与A27相关联的其他信息显示在孔滚动条316附近。此外，与A27相关联的扩增曲线可在扩增曲线图302中突出显示，使得该用户能够容易地识别到孔A27的所有相关信息。通过这种方式，可更容易地选择单条扩增曲线，并且可以快捷方便地识别与所选扩增曲线相关联的信息。
另外，根据各种实施例，备注按钮312和标签按钮314可被提供给一位用户，以供该用户选择添加备注或标签至一条特定扩增曲线。例如，一位用户可能注意到一条扩增曲线具有一项不寻常的特征，并想要添加与该条扩增曲线相关联的备注用于存储以备将来参考。该用户可选择备注按钮312和标签按钮314以输入标签和/或备注。
箭头306、放大按钮308、缩小按钮310和孔滚动条316可通过触摸控制激活。在各种实施例中，用户还可能够在扩增曲线图302上作出捏合缩放触摸屏手势，以放大和缩小扩增曲线图302的可视区域。孔滚动条316也可通过触摸屏手势来控制，例如向上滑动以使孔滚动条316向上移动，或向下滑动以使孔滚动条316向下移动。
图4示出根据本文所述各种实施例，用于识别扩增曲线的一个图形用户界面400的另一个实例。在本实例中，一条选定扩增曲线被突出显示在扩增图402中。孔滚动条418显示多条扩增曲线404的一部分的孔位置。一位用户可以选择一个特定孔，在例中为A27，并查看与A27相关联的样品名称、目标名称、孔ID和染料。与A27相关的该扩增曲线显示为绿色。除了标识该相关扩增曲线的该颜色之外，该系统还以突出方式显示与A27 406相关联的该扩增曲线，得以淡化其他曲线以突出显示扩增曲线406。
图5示出根据本文所述各种实施例，用于输入标签或备注的一个图形用户界面500的一个实例。再次参考图4，备注按钮414和标签按钮416允许一位用户选择输入一项备注或标签至一条选定扩增曲线。一旦一位用户选择备注按钮414或标签按钮416后，一个键盘会显示给该用户。该用户可使用该键盘在该输入字段框502中输入一条备注或标签。该键盘也可显示在一个触摸屏上，以便该用户可直接与所显示的图像进行交互。
图6示出根据本文所述各种实施例，用于显示和编辑一个热循环方案的一个图形用户界面的一个实例。一位用户可使用图形用户界面600设置该热循环方案。该用户可在仪器开始运行之前调整该方案。用户还可在运行已开始后调整该方案。如果该用户想要修改/调整该热循环方案，该用户可选择他们希望编辑的该热循环方案602的该图示部分，然后选择该编辑按钮610。然后，用户可调整例如该循环特定部分的温度或长度。此功能允许一位用户立即进行更改，无需终止整个实验运行。
此外，该用户能够查看开始时间606、结束时间608和该实验剩余时间604。GUI 600也可显示在一个触摸屏上，能够通过一位用户直接与GUI 600交互而激活。
图7示出根据本文所述各种实施例，用于显示和编辑一个热循环方案的一个图形用户界面的另一个实例。在本实例中，该用户可以从该热循环方案702的该图示中添加或删除，通过激活该添加按钮704或删除按钮706。
在一个实验室环境中，使用该实验室的研究人员通常会使用多种仪器。监测该仪器的状态以及日常维护和校准计划通常较为困难。根据本文所述各种实施例，GUI800可显示给一位用户，以指示例如一间实验室使用的该仪器网络中每台仪器的状态。参考图8，所示为根据本文所述各种实施例，用于显示多台仪器状态802的一个图形用户界面800。一位用户查看GUI 800时，可以查看相同网络内的仪器，并且可以方便地查看仪器状态(如空闲或正在使用)以及其他信息(如校准状态)。还可查看有关单个仪器的更多详细信息。
图9示出根据本文所述各种实施例，用于显示一台仪器相关信息的一个图形用户界面900的一个实例。GUI 900示出用于单个仪器的一个摘要页面902。各种校准状态和到期日期可在校准状态表904中查看。一位用户还可选择查看事件历史选项卡906、校准历史选项卡908和统计信息选项卡910。在汇总页面902中，一位用户可以查看该仪器的校准状态。
图10示出根据本文所述各种实施例，用于显示一台仪器相关统计信息的一个图形用户界面1000的一个实例。该统计页面1010显示了使用此特定仪器的运行类型。统计页面1010还显示了该实验的使用小时数。
图11示出根据本文所述各种实施例，用于显示一台仪器相关统计信息的一个图形用户界面1100的另一个实例。在本实例中，饼图1104以图形方式显示用户使用该仪器的数量。饼图1104显示此设备最经常被用户1使用。
计算机实现的系统
本领域的技术人员将认识到，可以适当地使用硬件、软件、固件或它们的组合来实现各种实施例的操作。例如，一些过程可由使用处理器或软件、固件或硬连线逻辑部件控制下的其它数字电路执行。(术语“逻辑部件”在本文中是指如本领域的技术人员所认识到的能够执行上述功能的固定硬件、可编程逻辑部件和/或它们的适当组合。)软件和固件可存储在非暂态计算机可读介质上。一些其他过程可使用模拟电路来实现，正如本领域的普通技术人员所熟知。另外，存储器或其它存储设备以及通信部件也可以用于本发明的实施例中。
图12为示出根据各种实施例可用于执行处理功能的计算机系统1200的框图。执行实验的仪器可以连接至示例性计算系统1200。计算系统1200可包括一个或多个处理器，诸如处理器1204。例如，处理器1204可使用通用或专用处理引擎，诸如微处理器、控制器或其它控制逻辑部件来实现。在本实例中，处理器1204连接至一条总线1202或其他通信媒介。
此外，应当理解图12的计算系统1200可以实现为多种形式中的任一种，诸如机架式计算机、大型机、超级计算机、服务器、客户端、台式计算机、笔记本电脑、平板电脑、手持式计算设备(例如，PDA、蜂窝电话、智能电话、掌上电脑等)、集群网格、上网本、嵌入式系统或给定应用或环境可能期望的或适当的任何其他类型的专用或通用计算设备。另外，计算系统1200可包括传统网络系统或与LIS/LIMS基础设施的集成，其中传统网络系统包括客户端/服务器环境和一个或多个数据库服务器。多种传统网络系统在本领域中是已知的，其中包括局域网(LAN)或广域网(WAN)，并且包括无线和/或有线部件。另外，客户端/服务器环境、数据库服务器和网络在本领域中已有充分记载。根据本文所述的各种实施例，计算系统1200可能被配置为连接至分布式网络中的一个或多个服务器。计算系统1200可接收来自分布式网络的信息或更新。计算系统1200还可以传输待存储于分布式网络内的信息，该信息可以由连接至分布式网络的其他客户端来访问。
计算系统1200可包括用于传输信息的总线1202或其他通信装置，以及与总线1202耦合以用于处理信息的处理器1204。
计算系统1200还包括一个存储器1206，可以是一个随机存取存储器(RAM)或其他动态存储器，耦合至总线1202用于存储指令，以供处理器1204执行。存储器1206还可用于在执行将由处理器1204执行的指令的过程中存储临时变量或其它中间信息。计算系统1200还包括一个只读存储器(ROM)1208或其他静态存储设备，耦合至总线1203用于存储静态信息和指令给处理器1204。
计算系统1200还可包括一个存储设备1210，诸如一个磁盘、光盘或固态驱动器(SSD)被提供，并耦合至总线1202用于存储信息和指令。存储设备1210可包括介质驱动器和可移动存储接口。介质驱动器可包括支持固定或可移动存储介质的驱动器或其他机构，如硬盘驱动器、软盘驱动器、磁带驱动器、光盘驱动器、CD或DVD驱动器(R或RW)、闪盘驱动器或其他移动或固定介质驱动器。如这些实例所示，该存储介质可包括一个计算机可读存储介质，其中存储有特定的计算机软件、指令或数据。
在另选的实施例中，存储设备1210可包括其他类似的工具以允许计算机程序或其他指令或数据加载到计算系统1200中。此类工具可包括诸如可移动存储单元和接口，例如程序盒式存储器和盒式存储器接口、移动存储器(例如，闪速存储器或其他可移动存储模块)和存储器插槽，以及用于允许将软件和数据从存储设备1210传送至计算系统1200的其他移动存储单元和接口。
计算系统1200还可包括一个通信接口1218。通信接口1218可用于允许软件和数据在计算系统1200和外部设备之间传输。通信接口1218的实例可包括调制解调器、网络接口(诸如以太网或其他NIC卡)、通信端口(诸如USB端口、RS-232C串行端口)、PCMCIA插槽和PCMCIA卡、蓝牙等。通过通信接口1218传送的软件和数据形式可以是能够由通信接口1218接收的电子、电磁、光学及其他信号的形式。这些信号可以由通信接口1218通过诸如无线介质、线材或线缆、光纤、或其他通信介质的信道来发送和接收。信道的一些实例包括电话线、蜂窝电话链路、RF链路、网络接口、局域网或广域网及其他通信信道。
计算系统1200可通过总线1202耦合到显示器1212，诸如阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD)，该显示器1212用于向计算机用户显示信息。例如，包括字母数字键及其他键的输入设备1214耦合到总线1202，该设备用于将信息和命令选择传输至处理器1204。输入设备还可以是具有触摸屏输入功能的显示器，例如LCD显示器。另一种类型的用户输入设备为光标控制装置1216，例如用于将方向信息和命令选择传递至处理器1204并且用于控制光标在显示器1212上移动的鼠标、轨迹球或光标方向键。该输入设备通常具有两个轴上的两种自由度以使设备指定在平面上的位置，所述两个轴为第一轴(例如，x轴)和第二轴(例如，y轴)。计算系统1200提供数据处理并且提供此类数据的置信水平。与本教导内容实施例的某些具体实现一致的是，数据处理和置信水平值由计算系统1200提供以响应处理器1204执行包含在存储器1206中的一个或多个指令的一个或多个序列。此类指令可以由另一个如存储设备1210的计算机可读介质读入存储器1206中。执行包含在存储器1206中的指令序列引起处理器1204执行本文所述的过程。或者，硬连线电路可用于代替软件指令或与软件指令结合以实现本教导内容的实施例。因此，本教导内容实施例的具体实现不限于硬件电路和软件的任何特定组合。
本文中使用的术语“计算机可读介质”和“计算机程序产品”通常是指涉及向处理器1204提供用于执行的一个或多个序列或一个或多个指令的任何介质。在执行时，通常被称为“计算机程序代码”的此类指令(其可以以计算机程序的形式或其它分组的形式分组)使计算系统1200能够执行本发明的实施例的特征或功能。这些及其他形式的非暂态计算机可读介质可采取多种形式，包括但不限于非易失性介质、易失性介质和传输介质。非易失性介质包括例如固态光盘或磁盘，诸如存储设备1210。易失性介质包括动态存储器，例如存储器1206。传输介质包括同轴线缆、铜线和光纤，该光纤包括线材，该线材包括总线1202。
计算机可读介质的常见形式包括例如软盘(floppy disk)、软磁盘(flexibledisk)、硬盘、磁带或任何其他磁介质、CD-ROM、任何其他光学介质、穿孔卡、纸带、任何其他具有孔图案的物理介质、RAM、PROM以及EPROM、FLASH-EPROM、任何其他存储器芯片或盒式存储器、如下文所述的载波或计算机可读取的任何其他介质。
各种形式的计算机可读介质可涉及将一个或多个指令的一个或多个序列携带至用于执行的处理器1204。例如，指令最初可携带在远程计算机的磁盘上。远程计算机可将指令加载到其动态存储器中并且使用调制解调器通过电话线路发送指令。计算系统1200的本地调制解调器可接收电话线的数据并且使用红外发射器将数据转换为红外信号。耦合到总线1202的红外检测器可接收红外信号中携带的数据并且将该数据置于总线1202上。总线1202将该数据携带至存储器1206，处理器1204从存储器1206中检索并且执行指令。由存储器1206接收的指令可可选地在处理器1204执行之前或执行之后存储于存储设备1210上。
应当理解，为清楚起见，上述说明参考不同的功能单元和处理器描述本发明的实施例。然而，显而易见的是，在不脱离本发明的情况下可使用不同的功能单元、处理器或域之间任何合适的功能分布。例如，示出的由独立的处理器或控制器执行的功能可以由相同的处理器或控制器来执行。因此，对特定功能单元的引用仅应视为对提供所述功能的合适装置的引用，而非指示严格的逻辑或物理结构或组织。
分布式系统
典型的互联网网络配置1300的一些元素如图13所示，其中可能处于远程本地办公室中的多个客户端机器1302被示出为连接至网关/集线器/隧道服务器等1310，网关/集线器/隧道服务器等1310本身通过一些互联网服务提供商(ISP)连接1310连接到互联网1308。还示出了类似地通过ISP连接1314连接到互联网1308的其他可能的客户端1312，其中这些单元与可能的中心实验室或办公室进行通信，例如，通过ISP连接1316连接到网关/隧道服务器1318，网关/隧道服务器1318已连接1320至各种企业应用服务器1322，其可通过另一个集线器/路由器1326连接到各种本地客户端1330。这些服务器1322中的任一种可用作分析本发明中所述的潜在内容管理和传输设计解决方案的开发服务器，下文提供了更为全面的描述。
PCR仪器
如上所述，根据各个实施例可利用但不限于此的一台仪器是一台聚合酶链反应(PCR)仪器。图14为示出PCR仪器1400的框图，在其上可实现本教导内容的实施例。PCR仪器1400可包括一个加热盖1410，其置于基板所盛装的多个样品1412上方(未示出)。在各种实施例中，一个基板可能是一块玻璃或塑料载玻片，具有多个样品区域，此类样品区域有一块盖玻片在样品区域和加热盖1410之间。一块基板的一些实例可能包括但不限于一块多孔板诸如一标准微量滴定96孔、一384孔板或一微卡，或一基本平面载体诸如一玻璃或塑料载玻片。在一基板的各种实施例中，所述反应位点可能包括凹陷、凹痕、脊以及它们的组合，在所述基板的表面上形成规则或不规则阵列。PCR仪器的多种实施例包括一个样品块1414、用于加热和冷却的元件1416、一个热交换器1418、控制系统1420和用户界面1422。。根据本教导内容的热块组件的各种实施例包括部件1414-1418，PCR仪器1400，如图。14。
实时PCR仪器1400具有一个光学系统1424。在图14中，一个光学系统1424可具有发射电磁能量的照明源(未示出)、用于接收来自基板上样品1412的电磁能量的光学传感器、检测器或成像器(未示出)、用于将电磁能量从每个DNA样品引导至成像器的光学器件1440。对于图14所示PCR仪器1400与图14所示实时PCR仪器1400的实施例，控制系统1420可用于控制该检测系统、加热盖和热块组件的功能。控制系统1420可由一位最终用户访问，通过用户界面1422，PCR仪器1400，如图14所示，以及实时PCR仪器1400，如图14。此外，计算系统1400，如图14所示，可用于提供对图14中PCR仪器1400以及用户界面功能的控制。另外，图4的计算机系统400可提供数据处理、显示和报告准备功能。所有此类仪器控制功能可局部专用于PCR仪器，或图4的计算系统400可提供对控制、分析和报告功能中的一部分或全部的远程控制，如随后所详述。
成像光学系统
图15示出可用于根据本文所述实施例成像的一个示例性光学系统1500。应当认识到，光学系统1500为示例性的光学系统，并且本领域技术人员将认识到可以使用其他光学系统来捕获目标物体的图像。根据各种实施例，目标物体可是样品固持器，例如本文所述的校准板。例如，相机1504中包括的光学传感器1502可对目标物体1510进行成像。光学传感器1502可是一个CCD传感器，相机1504可是一个CCD相机。此外，光学传感器包括相机镜头1506。
根据目标物体，根据各种实施例，可选择发射滤光器1508以对目标物体1510成像。在其他实施例中，可将发射滤光器1508更改为对目标物体1501发射的荧光成像。
光学系统1500可使用反射光源1512对目标物体1510成像。来自光源1512的光可通过非球面1514、聚焦器/发散器1516和激发滤光器1518进行过滤，再由分光器1520反射到目标物体1510。光学系统1500还可包括场透镜1522。根据目标物体，根据各种实施例，可选择或改变激发滤光器1518以对目标物体1510成像。
在实例1中，提供了一种用于从多条扩增曲线中识别某条扩增曲线相关反应位点的方法。该方法包括：从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据；从扩增数据生成多条扩增曲线；在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分；在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点的指示列表；调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分；动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点的指示，其中列表配置为可滚动。
在实例2中，提供了一个用处理器可执行指令编码的计算机可读存储介质，该指令用于从多条扩增曲线中识别某条扩增曲线相关反应位点。所述指令包括以下用途的指令：从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据；从扩增数据生成多条扩增曲线；在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分；在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点的指示列表；调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分；动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点的指示，其中列表配置为可滚动。
在实例3中，一个系统用于从多条扩增曲线中识别一条扩增曲线相关反应位点的系统。该系统包括：一个处理器；以及一个用可由处理器执行的指令编码的存储器，所述指令包括以下用途的指令：从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据；从扩增数据生成多条扩增曲线；在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分；在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点的指示列表；调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分；动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点的指示，其中列表配置为可滚动。
在实例4中，提供了实例1、2、3或任何前述实例，其中调整视图是放大多条扩增曲线。
在实例5中，提供了实例1、2、3或任何前述实例，其中调整视图缩小是多条扩增曲线。
在实例6中，提供了实例1、2、3或任何前述实例，其中列表的第一部分在显示屏幕上可见。
在实例7中，提供了实例1、2、3或任何前述实例，其中列表的第二部分在向下滚动列表后可见。
在实例8中，提供了实例1、2、3或任何前述实例，还包括在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供一个反应位点中所述样品的相关信息。
在实例4中，提供了实例1、2、3或任何前述实例，其中显示屏幕为触摸屏。
在实例5中，提供了用于从多条扩增曲线中识别某条扩增曲线相关反应位点的方法，包括：从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据；从扩增数据生成多条扩增曲线；在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分；在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点的指示列表；调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分；动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点的指示，其中列表配置为可滚动。
在实例6中，提供了实例5，其中调整视图是放大多条扩增曲线。
在实例7中，提供了实例5，其中调整视图是缩小多条扩增曲线。
在实例8中，提供了实例5，其中列表的第一部分在显示屏幕上可见。
在实例9中，提供了实例5和8，其中列表的第二部分在向下滚动列表后可见。
在实例10中，提供了实例5，还包括：在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供一个反应位点中所述样品的相关信息。
在实例11中，提供了实例5，其中显示屏幕为触摸屏。
在实例12中，提供了一个用处理器可执行指令编码的计算机可读存储介质，该指令用于从多条扩增曲线中识别某条扩增曲线相关反应位点。所述指令包括以下用途的指令：从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据；从扩增数据生成多条扩增曲线；在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分；在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点的指示列表；调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分；动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点的指示，其中列表配置为可滚动。
在实例13中，提供了实例12，其中调整视图是放大多条扩增曲线。
在实例14中，提供了实例12，其中调整视图是缩小多条扩增曲线。
在实例15中，提供了实例12，其中列表的第一部分在显示屏幕上可见。
在实例16中，提供了实例15，其中列表的第二部分在向下滚动列表后可见。
在实例17中，提供了实例12，还包括以下用途的指令：在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供一个反应位点中所述样品的相关信息。
在实例18中，提供了实例12，其中显示屏幕为触摸屏。
在实例19中，提供了用于从多条扩增曲线中识别某条扩增曲线相关反应位点的系统，包括：一个处理器；以及一个用可由处理器执行的指令编码的存储器，所述指令包括以下用途的指令：从多个反应位点(其中每个反应位点均含有一个样品)接收扩增数据；从扩增数据生成多条扩增曲线；在显示屏幕上显示多条扩增曲线的第一部分；在显示屏幕上显示的扩增曲线的第一部分的旁边显示扩增曲线第一部分相关反应位点的指示列表；调整视图以显示多条扩增曲线的第二部分；动态地调整列表，以在显示屏幕上显示的扩增曲线的第二部分的旁边显示扩增曲线第二部分相关反应位点的指示，其中列表配置为可滚动。
在实例20中，提供了实例19，其中调整视图是放大多条扩增曲线。
在实例21中，提供了实例19，其中调整视图是缩小多条扩增曲线。
在实例22中，提供了实例19，其中列表的第一部分在显示屏幕上可见。
在实例23中，提供了实例22，其中列表的第二部分在向下滚动列表后可见。
在实例24中，提供了实例19，还包括以下用途的指令：在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供一个反应位点中所述样品的相关信息。
以下关于本教导内容各种实施例的描述旨在供说明和描述之用。其并非详尽无遗，也不将本教导内容限制为所公开的确切形式。修改和变化可以根据上述教导内容，或者可从本教导内容的实践中习得。此外，所描述的实现包括软件，但本教导内容可以实现为硬件和软件的组合或仅硬件。本教导内容可以通过面向对象和非面向对象的编程系统实现。
虽然本文已相对于某些示例性实施例、实例和应用描述了多种实施例，然而对于本领域技术人员显而易见的是，在不脱离本教导内容的情况下可以进行各种修改和变化。
Claims (20)
1.一种用于从多条扩增曲线中识别与聚合酶链反应扩增曲线相关的反应位点的方法，所述方法包括：
从多个反应位点接收扩增数据，其中每个反应位点均含有一个样品；
从所述扩增数据生成多条扩增曲线；
在显示屏幕上显示所述多条扩增曲线的第一部分；
在所述显示屏幕上显示的所述多条扩增曲线的所述第一部分的旁边显示与所述多条扩增曲线的所述第一部分相关的反应位点的指示列表；
从所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图移动以显示包括所述多条扩增曲线的第二部分的视图，其中，所述多条扩增曲线的第二部分的至少一部分未被包括在所述多条扩增曲线的所述第一部分内；以及
动态地调整所述列表，以在所述显示屏幕上的所述多条扩增曲线的所述第二部分的旁边显示与所述多条扩增曲线的所述第二部分中包括的可视扩增曲线相关的反应位点的指示，其中所述列表配置为可滚动。
2.根据权利要求1所述的方法，还包括通过放大来调整所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图或者所述多条扩增曲线的所述第二部分的视图。
3.根据权利要求1所述的方法，还包括通过缩小来调整所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图或者所述多条扩增曲线的所述第二部分的视图。
4.根据权利要求1所述的方法，其中所述列表的第一部分在所述显示屏幕上可见。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述列表的第二部分在向下滚动所述列表后可见。
6.根据权利要求1所述的方法，进一步包括：
在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供所述反应位点中所述样品的相关信息。
7.根据权利要求1所述的方法，其中所述显示屏幕为一个触摸屏。
8.一个用处理器可执行指令编码的非暂态计算机可读存储介质，所述指令用于从多条扩增曲线中识别与聚合酶链反应扩增曲线相关的反应位点，所述指令包括：
从多个反应位点接收扩增数据，其中每个反应位点均含有一个样品；
从所述扩增数据生成多条扩增曲线；
在显示屏幕上显示所述多条扩增曲线的第一部分；
在所述显示屏幕上显示的所述多条扩增曲线的所述第一部分的旁边显示与所述多条扩增曲线的所述第一部分相关的反应位点的指示列表；
从所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图移动以显示包括所述多条扩增曲线的第二部分的视图，其中，所述多条扩增曲线的第二部分的至少一部分未被包括在所述多条扩增曲线的所述第一部分内；以及
动态地调整所述列表，以在所述显示屏幕上的所述多条扩增曲线的所述第二部分的旁边显示与所述多条扩增曲线的所述第二部分中包括的可视扩增曲线相关的反应位点的指示，其中所述列表配置为可滚动。
9.根据权利要求8所述的计算机可读存储介质，还包括用于通过放大来调整所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图或者所述多条扩增曲线的所述第二部分的视图的指令。
10.根据权利要求8所述的计算机可读存储介质，还包括用于通过缩小来调整所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图或者所述多条扩增曲线的所述第二部分的视图的指令。
11.根据权利要求8所述的计算机可读存储介质，其中所述列表的第一部分在所述显示屏幕上可见。
12.根据权利要求11所述的计算机可读存储介质，其中所述列表的第二部分在向下滚动所述列表后可见。
13.根据权利要求8所述的计算机可读存储介质，进一步包括以下用途的指令：
在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供所述反应位点中所述样品的相关信息。
14.根据权利要求8所述的计算机可读存储介质，其中所述显示屏幕为触摸屏。
15.一种用于从多条扩增曲线中识别与聚合酶链反应扩增曲线相关的反应位点的系统，所述系统包括：
一个处理器；以及
一个存储有用可由所述处理器执行的指令编码的存储器，所述指令包括：
从多个反应位点接收扩增数据，其中每个反应位点均含有一个样品；
从所述扩增数据生成多条扩增曲线；
在显示屏幕上显示所述多条扩增曲线的第一部分；
在所述显示屏幕上显示的所述多条扩增曲线的所述第一部分的旁边显示与所述多条扩增曲线的所述第一部分相关的反应位点的指示列表；
从所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图移动以显示包括所述多条扩增曲线的第二部分的视图，其中，所述多条扩增曲线的第二部分的至少一部分未被包括在所述多条扩增曲线的所述第一部分内；
动态地调整所述列表，以在所述显示屏幕上的所述多条扩增曲线的所述第二部分的旁边显示与所述多条扩增曲线的所述第二部分中包括的可视扩增曲线相关的反应位点的指示，其中所述列表配置为可滚动。
16.根据权利要求15所述的系统，还包括用于通过放大来调整所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图或者所述多条扩增曲线的所述第二部分的视图的指令。
17.根据权利要求15所述的系统，还包括用于通过缩小来调整所述多条扩增曲线的所述第一部分的视图或者所述多条扩增曲线的所述第二部分的视图的指令。
18.根据权利要求15所述的系统，其中所述列表的第一部分在所述显示屏幕上可见。
19.根据权利要求18所述的系统，其中所述列表的第一部分在向下滚动所述列表后可见。
20.根据权利要求15所述的系统，进一步包括以下用途的指令：
在一位用户从所述列表中选择一个反应位点的指示之后提供所述反应位点中所述样品的相关信息。
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