RU2014137125A

RU2014137125A - Способы формирования изображения биологического образца

Info

Publication number: RU2014137125A
Application number: RU2014137125A
Authority: RU
Inventors: Антти Е. СЕППО; Фиона ДЖИНТИ; Кевин Б. КЕННИ; Дэвид ЛаВан ХЕНДЕРСОН; Майкл Дж. ГЕРДЕС; МОРЕНО Адриана И. ЛАРРИЕРА; Сяофэн Лю; Алекс Д. КОРВИН; Стивен И. ЗИНГЕЛЕВИЧ; Томас ХА; Натали Р. ДЖУН; Аинура КИШТООБЕЙИВ; Дениз А. ХОЛЛМАН-ХЬЮГЛИ; Ин ЛИ
Original assignee: Клариент Дайагностик Сервисез, Инк.
Priority date: 2012-03-30
Filing date: 2013-03-21
Publication date: 2016-05-27
Also published as: SG11201406104QA; US11573235B2; EP2831559A1; IN2014DN07533A; WO2013148458A1; AU2013240137A1; CN104520689A; CA2867359A1; JP6348481B2; KR20140145141A; US20150050650A1; JP2015514213A; AU2013240137B2

Abstract

1. Способ формирования изображения представляющей интерес области биологического образца, включающий стадии:1) формирования первого изображения, включающего указанную представляющую интерес область указанного биологического образца, после осуществления первого протокола, но до осуществления второго протокола; и2) формирования второго изображения, включающего указанную представляющую интерес область указанного биологического образца, после осуществления второго протокола;где указанная представляющая интерес область меньше указанного образца и где второй протокол включает иммунофлуоресцентное выявление белка-мишени или флуоресцентное выявление по меньшей мере одной нуклеиновокислотной последовательности-мишени посредством гибридизации зонда с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью.2. Способ по п. 1, где представляющую интерес область выбирают путем сравнения первого изображения биологического образца с предопределенным критерием.3. Способ по п. 1, где первый протокол включает иммунофлуоресцентное выявление белка-мишени.4. Способ по п. 3, где иммунофлуоресцентное выявление включает физическое связывание антитела с белком-мишенью.5. Способ по п. 4, где указанное антитело мечено флуорофором.6. Способ по п. 3, где первый протокол дополнительно включает иммунофлуоресцентное выявление по меньшей мере одного дополнительного белка, обеспечивающего морфологическую информацию.7. Способ по п. 1, где указанная реакция гибридизации выбрана из группы, состоящей из FISH (флуоресцентная гибридизация in situ), IQ-FISH (интерфазная количественная FISH), PCR (полимеразная цепная реакция) in situ, амплификации по типу катящегося кольца и примированного

Claims

1. Способ формирования изображения представляющей интерес области биологического образца, включающий стадии:

1) формирования первого изображения, включающего указанную представляющую интерес область указанного биологического образца, после осуществления первого протокола, но до осуществления второго протокола; и

2) формирования второго изображения, включающего указанную представляющую интерес область указанного биологического образца, после осуществления второго протокола;

где указанная представляющая интерес область меньше указанного образца и где второй протокол включает иммунофлуоресцентное выявление белка-мишени или флуоресцентное выявление по меньшей мере одной нуклеиновокислотной последовательности-мишени посредством гибридизации зонда с нуклеиновокислотной последовательностью-мишенью.

2. Способ по п. 1, где представляющую интерес область выбирают путем сравнения первого изображения биологического образца с предопределенным критерием.

3. Способ по п. 1, где первый протокол включает иммунофлуоресцентное выявление белка-мишени.

4. Способ по п. 3, где иммунофлуоресцентное выявление включает физическое связывание антитела с белком-мишенью.

5. Способ по п. 4, где указанное антитело мечено флуорофором.

6. Способ по п. 3, где первый протокол дополнительно включает иммунофлуоресцентное выявление по меньшей мере одного дополнительного белка, обеспечивающего морфологическую информацию.

7. Способ по п. 1, где указанная реакция гибридизации выбрана из группы, состоящей из FISH (флуоресцентная гибридизация in situ), IQ-FISH (интерфазная количественная FISH), PCR (полимеразная цепная реакция) in situ, амплификации по типу катящегося кольца и примированного мечения in situ.

8. Способ по п. 1, где первый или второй протокол включает окрашивание образца флуоресцентным маркером, обеспечивающим морфологическую информацию.

9. Способ по п. 8, где указанный флуоресцентный маркер окрашивает ядро клетки.

10. Способ по п. 1, где первый или второй протокол включает выявление аутофлуоресценции биологического образца.

11. Способ по п. 1, где первое и второе изображения представляют собой флуоресцентные изображения.

12. Способ по п. 11, где формирование первого изображения и/или формирование второго изображения включает формирование изображения светлопольного типа, сходного со светлопольным окрашиванием, где указанные изображения светлопольного типа сходны с имитированным Н&Е(гематоксилин и эозин)-изображением или имитированным DAB(3,3'-диаминобензидин)-изображением.

13. Способ по п. 1, дополнительно включающий формирование составного изображения, включающего по меньшей мере представляющие интерес области из первого и второго изображений.

14. Способ по п. 13, где формирование составного изображения включает соотнесение расположения выбранных сигналов, полученных при формировании первого изображения, с расположением выбранных сигналов, полученных при формировании второго изображения.

15. Способ по п. 13 или 14, где выбранные сигналы исходят из представляющей интерес области.

16. Способ анализа биологического образца, включающий получение изображения биологического образца по п. 1 и анализ биологического образца по изображению.

17. Способ формирования изображения биологического образца, включающий стадии:

1) формирования первого изображения указанного биологического образца после осуществления первого протокола и до осуществления второго протокола на указанном биологическом образце; и

2) получения изображения представляющей интерес области указанного образца после осуществления второго протокола на представляющей интерес области указанного биологического образца, где указанная представляющая интерес область меньше указанного образца.

18. Способ получения изображения биологического образца, включающий стадии:

1) формирования первого изображения указанного биологического образца после осуществления на нем первого протокола, но до применения второго протокола; и

2) формирования второго изображения представляющей интерес области указанного образца после осуществления указанного второго протокола на указанной представляющей интерес области, где указанная представляющая интерес область меньше указанного образца.

19. Способ по п. 1, где указанное второе изображение охватывает меньшую область указанного биологического образца по сравнению с областью, охватываемой указанным первым изображением.