RU2012133434A - Способы и наборы для детекции факторов риска развития остеонекроза челюсти и способы его лечения - Google Patents

Способы и наборы для детекции факторов риска развития остеонекроза челюсти и способы его лечения Download PDF

Info

Publication number
RU2012133434A
RU2012133434A RU2012133434/15A RU2012133434A RU2012133434A RU 2012133434 A RU2012133434 A RU 2012133434A RU 2012133434/15 A RU2012133434/15 A RU 2012133434/15A RU 2012133434 A RU2012133434 A RU 2012133434A RU 2012133434 A RU2012133434 A RU 2012133434A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
bonj
snp
gene
biomarker
predisposition
Prior art date
Application number
RU2012133434/15A
Other languages
English (en)
Inventor
Джозеф КАТЦ
Тэймор Й. ЛЭНГАЙ
Original Assignee
Юниверсити Оф Флорида Рисерч Фаундейшн, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Юниверсити Оф Флорида Рисерч Фаундейшн, Инк. filed Critical Юниверсити Оф Флорида Рисерч Фаундейшн, Инк.
Publication of RU2012133434A publication Critical patent/RU2012133434A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/08—Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/172—Haplotypes

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Physical Education & Sports Medicine (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

1. Способ определения индивидуума с предрасположенностью к индуцированному бисфосфонатами остеонекрозу челюсти (BONJ) после введения бисфосфонатов, где способ включает этапы:(a) получения образца у индивидуума;(b) анализа образца на присутствие по меньшей мере одного гена с SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, или по меньшей мере одного SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN; и(c) установления корреляции присутствия по меньшей мере одного гена или SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ в образце с предрасположенностью индивидуума к BONJ.2. Способ по п.1, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.3. Способ по п.1, где по меньшей мере один ген включает множество генов, включающих COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.4. Способ по п.1, где по меньшей мере один SNP включает по меньшей мере один SNP из rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.5. Способ по п.1, где по меньшей мере один SNP включает множество SNP, включающих rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.6. Способ по п.1, где образец включает кровь, сыворотку, плазму или слюну.7. Способ по п.1, где этап (b) анализа образца на присутствие по меньшей мере одного гена с SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, или по меньшей мере одного SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ, включает использование микропанели для детекции присутствия по меньшей мере одного гена или по меньшей мере одного SNP.8. Способ предотвращения BONJ у индивидуума с предрасположенностью к BONJ и подвергаемого лечению бисфосфонатами, где способ включает

Claims (29)

1. Способ определения индивидуума с предрасположенностью к индуцированному бисфосфонатами остеонекрозу челюсти (BONJ) после введения бисфосфонатов, где способ включает этапы:
(a) получения образца у индивидуума;
(b) анализа образца на присутствие по меньшей мере одного гена с SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, или по меньшей мере одного SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN; и
(c) установления корреляции присутствия по меньшей мере одного гена или SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ в образце с предрасположенностью индивидуума к BONJ.
2. Способ по п.1, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
3. Способ по п.1, где по меньшей мере один ген включает множество генов, включающих COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
4. Способ по п.1, где по меньшей мере один SNP включает по меньшей мере один SNP из rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
5. Способ по п.1, где по меньшей мере один SNP включает множество SNP, включающих rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
6. Способ по п.1, где образец включает кровь, сыворотку, плазму или слюну.
7. Способ по п.1, где этап (b) анализа образца на присутствие по меньшей мере одного гена с SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, или по меньшей мере одного SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ, включает использование микропанели для детекции присутствия по меньшей мере одного гена или по меньшей мере одного SNP.
8. Способ предотвращения BONJ у индивидуума с предрасположенностью к BONJ и подвергаемого лечению бисфосфонатами, где способ включает этапы:
(a) получения образца у индивидуума;
(b) анализа образца на присутствие по меньшей мере одного гена с SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, или по меньшей мере одного SNP, являющегося биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN;
(c) установления корреляции присутствия по меньшей мере одного гена, белка или по меньшей мере одного SNP, являющегося биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ в образце с предрасположенностью индивидуума к BONJ; и
(d) введения индивидууму бисфосфоната, который не ассоциирован с BONJ или который с меньшей вероятностью вызывает BONJ, чем другие бисфосфонаты, введения индивидууму бисфосфоната с меньшей дозой или меньшей частотой, чем это предписывают обычно.
9. Способ по п.8, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
10. Способ по п.8, где по меньшей мере один ген включает множество генов, включающих COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
11. Способ по п.8, где по меньшей мере один SNP включает по меньшей мере один SNP из rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
12. Способ по п.8, где по меньшей мере один SNP включает множество SNP, включающих rs18002, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
13. Способ по любому из пп.8-12, где образец включает кровь, сыворотку, плазму или слюну.
14. Способ по пп.8-12, где этап (b) анализа образца на присутствие по меньшей мере одного гена с SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, или по меньшей мере одного SNP, являющегося маркером BONJ или предрасположенности к BONJ, включает использование микропанели для детекции присутствия по меньшей мере одного гена или по меньшей мере одного SNP.
15. Набор для определения пациентов с предрасположенностью к BONJ после введения бисфосфонатов, где набор содержит:
(а) твердую подложку со множеством связанных с ней нуклеиновых кислот, где по меньшей мере одна из нуклеиновых кислот специфически гибридизуется с геном, содержащим SNP, являющимся биомаркером BONJ или предрасположенности к BONJ, где по меньшей мере один ген представляет собой ген, приведенный в таблице 11;
(b) реагент для детекции; и
(c) инструкции по применению.
16. Набор по п.15, где по меньшей мере один SNP представляет собой по меньшей мере один SNP, приведенный в таблице 11.
17. Набор по п.15, где по меньшей мере один ген включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
18. Набор по п.15, где по меньшей мере один ген включает множество генов, включающих COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
19. Набор по п.15, где по меньшей мере один SNP включает по меньшей мере один SNP из rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
20. Набор по п.15, где по меньшей мере один SNP включает множество SNP, включающих rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
21. Способ оценки риска развития BONJ у индивидуума после лечения бисфосфонатами, включающий: а) получение биологического образца у индивидуума; b) детекцию в указанном образце одного или нескольких ассоциированных с BONJ биомаркеров, где биомаркеры относятся к одному или нескольким генам, приведенным в таблице 11, или указанные биомаркеры относятся к одному или нескольким полипептидам, кодируемым указанными генами, получая набор данных о биомаркерах; с) сравнение набора данных о биомаркерах с данными о биомаркерах у здоровых людей и людей с BONJ и d) определение риска развития BONJ у индивидуума.
22. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер представляет собой SNP, присутствующий в генах, приведенных в таблице 11.
23. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер представляет собой ассоциированный с BONJ полиморфный участок, ассоциированный с одним или несколькими из SNP-маркеров, приведенных в таблице 11.
24. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер представляет собой SNP, находящийся в полном неравновесном сцеплении с одним или несколькими из SNP-маркеров, приведенных в таблице 11.
25. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер представляет собой продукт экспрессии гена, приведенного в таблице 11.
26. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер включает по меньшей мере один ген из COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
27. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер включает множество генов, включающих COL1A1, RANK, MMP2, OPG и OPN.
28. Способ по п.21, где по меньшей мере один биомаркер включает по меньшей мере один SNP из rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
29. Способ по п.15, где по меньшей мере один биомаркер включает множество SNP, включающих rs1800012, rs12458117, rs243865, rs2073618 и rs11730582.
RU2012133434/15A 2010-01-06 2010-12-13 Способы и наборы для детекции факторов риска развития остеонекроза челюсти и способы его лечения RU2012133434A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US29273010P 2010-01-06 2010-01-06
US61/292,730 2010-01-06
PCT/US2010/060139 WO2011084387A2 (en) 2010-01-06 2010-12-13 Methods and kits for detecting risk factors for development of jaw osteonecrosis and methods of treatment thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2012133434A true RU2012133434A (ru) 2014-02-27

Family

ID=44306025

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012133434/15A RU2012133434A (ru) 2010-01-06 2010-12-13 Способы и наборы для детекции факторов риска развития остеонекроза челюсти и способы его лечения

Country Status (9)

Country Link
US (1) US20130035314A1 (ru)
EP (1) EP2521793A4 (ru)
CN (1) CN102812132A (ru)
AU (1) AU2010340161A1 (ru)
BR (1) BR112012016744A2 (ru)
CA (1) CA2786545A1 (ru)
IN (1) IN2012DN06571A (ru)
RU (1) RU2012133434A (ru)
WO (1) WO2011084387A2 (ru)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010005939A1 (en) * 2008-07-07 2010-01-14 University Of Florida Research Foundation, Inc. Methods and kits for detecting risk factors for development of jaw osteonecrosis and methods of treatment thereof
US20160298192A1 (en) * 2013-12-04 2016-10-13 Micromedic Technologies Ltd. Methods and kits for identifying susceptibility to antiresorptive-agent-induced osteonecrosis of the jaw
CN111518882B (zh) * 2019-02-03 2022-06-28 陈卫衡 通过分子标志物辨识激素性股骨头坏死的中医证型的系统
CN112410413A (zh) * 2020-09-24 2021-02-26 吉林大学 Onfh易感相关vdr、mmp2、mmp3、mmp9基因snp的检测物质及应用

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003062465A1 (es) * 2002-01-25 2003-07-31 Universidad De Barcelona Compuestos para el diagnóstico de la predisposición a la osteoporosis
WO2010005939A1 (en) * 2008-07-07 2010-01-14 University Of Florida Research Foundation, Inc. Methods and kits for detecting risk factors for development of jaw osteonecrosis and methods of treatment thereof

Also Published As

Publication number Publication date
US20130035314A1 (en) 2013-02-07
WO2011084387A3 (en) 2011-10-27
EP2521793A2 (en) 2012-11-14
IN2012DN06571A (ru) 2015-10-23
WO2011084387A2 (en) 2011-07-14
EP2521793A4 (en) 2013-07-03
AU2010340161A1 (en) 2012-07-26
BR112012016744A2 (pt) 2017-06-13
CA2786545A1 (en) 2011-07-14
CN102812132A (zh) 2012-12-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Belote et al. Human melanocyte development and melanoma dedifferentiation at single-cell resolution
Guo et al. Gene expression profile based classification models of psoriasis
JP6067686B2 (ja) 癌の分子的診断検査
Glocker et al. Rheumatoid arthritis, a complex multifactorial disease: on the way toward individualized medicine
US11312999B2 (en) Set of genes for molecular classifying of medulloblastoma and use thereof
US20150184248A1 (en) Method for detecting pancreatic cancer and detection kit
CN106156543B (zh) 一种肿瘤ctDNA信息统计方法
Kopylov et al. Targeted quantitative screening of chromosome 18 encoded proteome in plasma samples of astronaut candidates
RU2013141965A (ru) Диагностика и лечение рака
RU2012133318A (ru) Идентификация, оценка и лечение раковых заболеваний с генетической или приобретенной устойчивостью к ингибиторам alk
JP2022505295A (ja) ヒト腫瘍のがん細胞における分子活性を定量化するための方法
TW201741915A (zh) 基因表現圖譜以及將其應用於乳癌醫療之方法
Roberts et al. Unique associations of DNA methylation regions with 24-hour blood pressure phenotypes in black participants
Verity et al. Plasmodium falciparum genetic variation of var2csa in the Democratic Republic of the Congo
CN113462773A (zh) 一种预测胃癌患者生存风险、免疫治疗响应和细胞焦亡诱导剂适用性的标志物及其应用
CN114875149A (zh) 检测生物标志物的试剂在制备预测胃癌预后产品中的应用
RU2012133434A (ru) Способы и наборы для детекции факторов риска развития остеонекроза челюсти и способы его лечения
CN113168885A (zh) 用于体细胞突变的方法和系统及其用途
Sombekke et al. Analysis of multiple candidate genes in association with phenotypes of multiple sclerosis
Muthukaruppan et al. Multimodal assessment of estrogen receptor mRNA profiles to quantify estrogen pathway activity in breast tumors
Jungwirth et al. Meta‐analysis and Consolidation of Farnesoid X Receptor Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Data Across Different Species and Conditions
WO2020021028A1 (en) Biomarkers for the diagnosis and/or prognosis of frailty
CN107937515B (zh) 一种阿尔茨海默的诊疗基因靶点及其应用
CN108034707B (zh) Spag7基因在制备老年痴呆诊断制剂中的应用
CN113234817B (zh) 利用CpG位点甲基化水平检测早期肝癌的标志物

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20150817