RU2009149093A - Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении - Google Patents
Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении Download PDFInfo
- Publication number
- RU2009149093A RU2009149093A RU2009149093/08A RU2009149093A RU2009149093A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A RU 2009149093/08 A RU2009149093/08 A RU 2009149093/08A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- objects
- viral particles
- exposure
- distribution
- radius
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
- G06V20/695—Preprocessing, e.g. image segmentation
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F18/00—Pattern recognition
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T1/00—General purpose image data processing
- G06T1/20—Processor architectures; Processor configuration, e.g. pipelining
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Artificial Intelligence (AREA)
- Evolutionary Computation (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Analysing Materials By The Use Of Radiation (AREA)
Abstract
1. Способ внутриклеточного подсчета и сегментации вирусных частиц на изображении, содержащий: ! создание изображения, на котором имеется множество объектов; ! идентификацию круглых объектов на изображении; ! сортировку идентифицированных круглых объектов по группам; ! определение распределения профилей плотности по радиусу для идентифицированных круглых объектов; ! идентификацию эллиптических объектов, которые могут сформироваться при установленном распределении профилей плотности по радиусу; ! сортировку идентифицированных эллиптических объектов по группам; и ! идентификацию вирусных частиц среди отсортированных круглых и эллиптических объектов на основе распределения профилей плотности по радиусу объектов в отобранной группе круглых и эллиптических объектов; ! воздействие на вирусные частицы фармацевтическим препаратом; ! сортировку вирусных частиц по группам после воздействия на них фармацевтическим препаратом; ! анализ различий между распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц до воздействия и распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц после воздействия фармацевтическим препаратом. ! 2. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ изменений в распределении размеров объектов на изображении в результате воздействия. ! 3. Способ по п.1, содержащий, кроме того, определение разности количества объектов в группе до и после воздействия химическим веществом. ! 4. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ морфологических структур вирусных частиц.
Claims (4)
1. Способ внутриклеточного подсчета и сегментации вирусных частиц на изображении, содержащий:
создание изображения, на котором имеется множество объектов;
идентификацию круглых объектов на изображении;
сортировку идентифицированных круглых объектов по группам;
определение распределения профилей плотности по радиусу для идентифицированных круглых объектов;
идентификацию эллиптических объектов, которые могут сформироваться при установленном распределении профилей плотности по радиусу;
сортировку идентифицированных эллиптических объектов по группам; и
идентификацию вирусных частиц среди отсортированных круглых и эллиптических объектов на основе распределения профилей плотности по радиусу объектов в отобранной группе круглых и эллиптических объектов;
воздействие на вирусные частицы фармацевтическим препаратом;
сортировку вирусных частиц по группам после воздействия на них фармацевтическим препаратом;
анализ различий между распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц до воздействия и распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц после воздействия фармацевтическим препаратом.
2. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ изменений в распределении размеров объектов на изображении в результате воздействия.
3. Способ по п.1, содержащий, кроме того, определение разности количества объектов в группе до и после воздействия химическим веществом.
4. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ морфологических структур вирусных частиц.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US94087007P | 2007-05-30 | 2007-05-30 | |
| US60/940,870 | 2007-05-30 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2009149093A true RU2009149093A (ru) | 2011-07-10 |
| RU2461063C2 RU2461063C2 (ru) | 2012-09-10 |
Family
ID=40094049
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2009149093/08A RU2461063C2 (ru) | 2007-05-30 | 2008-04-25 | Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении |
Country Status (19)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8224059B2 (ru) |
| EP (1) | EP2149105B1 (ru) |
| JP (1) | JP5243535B2 (ru) |
| KR (1) | KR101343749B1 (ru) |
| CN (1) | CN101681427B (ru) |
| AU (1) | AU2008260410B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0811951A2 (ru) |
| CA (1) | CA2688153C (ru) |
| DK (1) | DK2149105T3 (ru) |
| ES (1) | ES2835175T3 (ru) |
| HK (1) | HK1137254A1 (ru) |
| HU (1) | HUE052662T2 (ru) |
| MX (1) | MX2009012265A (ru) |
| MY (1) | MY153016A (ru) |
| PL (1) | PL2149105T3 (ru) |
| PT (1) | PT2149105T (ru) |
| RU (1) | RU2461063C2 (ru) |
| WO (1) | WO2008150588A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA200907666B (ru) |
Families Citing this family (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| SG161215A1 (en) * | 2005-04-15 | 2010-05-27 | Intelligent Virus Imaging Inc | Method of analyzing cell structures and their components |
| US8712140B2 (en) * | 2005-04-15 | 2014-04-29 | Intelligent Virus Imaging Inc. | Method of analyzing cell structures and their components |
| US8712141B2 (en) * | 2007-05-30 | 2014-04-29 | Intelligent Virus Imagaing Inc. | Method for counting and segmenting viral particles in an image |
| CN102754102B (zh) | 2010-12-09 | 2016-02-03 | 松下电器产业株式会社 | 三维集成电路的设计支持装置及设计支持方法 |
| CN103514481A (zh) * | 2012-06-20 | 2014-01-15 | 天津三星电机有限公司 | 一种基于图像的制品数量快速测量方法及其装置 |
| JP6621825B2 (ja) | 2015-12-18 | 2019-12-18 | インテリジェント ヴァイルス イメージング インコーポレイテッド | サブビジブル粒子の高精度定量化 |
| RU2626145C1 (ru) * | 2016-01-27 | 2017-07-21 | Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Оренбургский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО ОрГМУ Минздрава России) | Способ оценки содержания белков межклеточного матрикса в регенерирующих тканях при анализе цифровых изображений иммуногистохимических микропрепаратов в программе adobe® photoshop® |
| PT3349872T (pt) * | 2016-09-30 | 2020-03-13 | Intelligent Virus Imaging Inc | Método para quantificação da pureza das amostras de partículas subvisíveis |
| MA44418B1 (fr) * | 2017-03-02 | 2021-11-30 | Intelligent Virus Imaging Inc | Procédé permettant la mesure quantitative de contenu particulaire à l'aide d'une imagerie à l'état hydraté |
| RU2750591C1 (ru) * | 2020-05-12 | 2021-06-29 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ижевская государственная медицинская академия" | Способ определения степени окраски эндотелиальных клеток |
| CN111795986A (zh) * | 2020-05-20 | 2020-10-20 | 万秋花 | 应用外形搜索的病毒临床检验检测平台 |
| CN112288684B (zh) * | 2020-07-15 | 2021-06-25 | 华北理工大学 | 应用密度分析的致病判断系统及方法 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ATE237165T1 (de) * | 1997-12-18 | 2003-04-15 | Infineon Technologies Ag | Vorrichtung zur bilderfassung |
| JP4069545B2 (ja) * | 1999-05-19 | 2008-04-02 | 株式会社日立製作所 | 電子顕微方法及びそれを用いた電子顕微鏡並び生体試料検査方法及び生体検査装置 |
| RU2168206C1 (ru) * | 2000-06-30 | 2001-05-27 | Зайцев Павел Анатольевич | Способ сканирования рисунка кожных линий и устройство для его осуществления |
| JP4012813B2 (ja) * | 2002-11-27 | 2007-11-21 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 透過型電子顕微鏡及び試料観察方法 |
| JP4154300B2 (ja) * | 2003-09-08 | 2008-09-24 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 透過電子顕微鏡システムおよびそれを用いた検査方法 |
| US20070099276A1 (en) * | 2003-10-25 | 2007-05-03 | David Ott | Retrovirus-like particles and retroviral vaccines |
| AU2006302938B2 (en) * | 2005-10-12 | 2011-12-15 | Intelligent Virus Imaging Inc. | Identification and classification of virus particles in textured electron micrographs |
-
2008
- 2008-04-25 KR KR1020097027393A patent/KR101343749B1/ko active IP Right Grant
- 2008-04-25 MX MX2009012265A patent/MX2009012265A/es unknown
- 2008-04-25 PL PL08746847T patent/PL2149105T3/pl unknown
- 2008-04-25 CA CA2688153A patent/CA2688153C/en active Active
- 2008-04-25 ES ES08746847T patent/ES2835175T3/es active Active
- 2008-04-25 PT PT87468476T patent/PT2149105T/pt unknown
- 2008-04-25 WO PCT/US2008/061499 patent/WO2008150588A1/en active Search and Examination
- 2008-04-25 JP JP2010510391A patent/JP5243535B2/ja active Active
- 2008-04-25 RU RU2009149093/08A patent/RU2461063C2/ru active
- 2008-04-25 CN CN2008800179936A patent/CN101681427B/zh active Active
- 2008-04-25 US US12/600,623 patent/US8224059B2/en active Active
- 2008-04-25 BR BRPI0811951A patent/BRPI0811951A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2008-04-25 DK DK08746847.6T patent/DK2149105T3/da active
- 2008-04-25 EP EP08746847.6A patent/EP2149105B1/en active Active
- 2008-04-25 HU HUE08746847A patent/HUE052662T2/hu unknown
- 2008-04-25 MY MYPI20094764 patent/MY153016A/en unknown
- 2008-04-25 AU AU2008260410A patent/AU2008260410B2/en not_active Ceased
-
2009
- 2009-11-02 ZA ZA200907666A patent/ZA200907666B/xx unknown
-
2010
- 2010-05-14 HK HK10104767.1A patent/HK1137254A1/xx unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2149105B1 (en) | 2020-11-18 |
| WO2008150588A1 (en) | 2008-12-11 |
| BRPI0811951A2 (pt) | 2016-10-04 |
| US20100151446A1 (en) | 2010-06-17 |
| MY153016A (en) | 2014-12-31 |
| ES2835175T3 (es) | 2021-06-22 |
| HK1137254A1 (en) | 2010-07-23 |
| PL2149105T3 (pl) | 2021-05-17 |
| RU2461063C2 (ru) | 2012-09-10 |
| US8224059B2 (en) | 2012-07-17 |
| CN101681427A (zh) | 2010-03-24 |
| KR20100025545A (ko) | 2010-03-09 |
| JP5243535B2 (ja) | 2013-07-24 |
| EP2149105A4 (en) | 2013-09-25 |
| PT2149105T (pt) | 2020-12-15 |
| MX2009012265A (es) | 2009-12-01 |
| ZA200907666B (en) | 2010-07-28 |
| CA2688153C (en) | 2015-03-31 |
| AU2008260410B2 (en) | 2012-05-03 |
| CN101681427B (zh) | 2012-12-05 |
| JP2010529428A (ja) | 2010-08-26 |
| HUE052662T2 (hu) | 2021-05-28 |
| AU2008260410A1 (en) | 2008-12-11 |
| DK2149105T3 (da) | 2021-02-01 |
| EP2149105A1 (en) | 2010-02-03 |
| CA2688153A1 (en) | 2008-12-11 |
| KR101343749B1 (ko) | 2013-12-19 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2009149093A (ru) | Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении | |
| Tibbe et al. | Statistical considerations for enumeration of circulating tumor cells | |
| BR112019003144A2 (pt) | sistema e método de classificação de partículas biológicas | |
| Schmeja | Identifying star clusters in a field: A comparison of different algorithms | |
| Inglis et al. | Highly accurate deterministic lateral displacement device and its application to purification of fungal spores | |
| JP2023081880A (ja) | 磁気浮上を用いた生物学的および非生物学的な部分の選別 | |
| ES2554993T3 (es) | Sistema de análisis para el análisis de muestras biológicas, métodos y producto de programa informático | |
| US8693762B2 (en) | Inertial particle focusing flow cytometer | |
| Kim et al. | Deterministic migration‐based separation of white blood cells | |
| Jones et al. | Clinical, histopathologic, and immunohistochemical characterization of experimental Marburg virus infection in a natural reservoir host, the Egyptian rousette bat (Rousettus aegyptiacus) | |
| WO2011028818A3 (en) | High throughput multichannel reader and uses thereof | |
| SE0800117L (sv) | Metod och apparat för analys av partiklar i ett vätskeformigt prov | |
| EP2790020A3 (en) | Methods for segregating particles using an apparatus with a size-discriminating separation element having an elongate leading edge | |
| Lv et al. | Spatially gradated segregation and recovery of circulating tumor cells from peripheral blood of cancer patients | |
| Feldherr et al. | Electron microscopy of the nuclear envelope | |
| CN104182759A (zh) | 基于扫描电镜的颗粒物形态识别方法 | |
| Oberemm et al. | Proteomic responses of human intestinal Caco‐2 cells exposed to silver nanoparticles and ionic silver | |
| EP2902769A3 (en) | Blood cell analyzer | |
| CL2015002091A1 (es) | Sistema y método para contar zooplancton. | |
| JP2018525644A5 (ru) | ||
| Kutter et al. | Comparison of three air samplers for the collection of four nebulized respiratory viruses‐Collection of respiratory viruses from air– | |
| Olson | The effect of fibre length on passage through narrow apertures | |
| Yang et al. | A novel rare cell sorting microfluidic chip based on magnetic nanoparticle labels | |
| RU2015108746A (ru) | Способы сортировки материалов | |
| EP4212853A1 (en) | Method and system for detecting cell killing efficacy and/or immune activity, and application thereof |