RU2009149093A - Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении - Google Patents
Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении Download PDFInfo
- Publication number
- RU2009149093A RU2009149093A RU2009149093/08A RU2009149093A RU2009149093A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A RU 2009149093/08 A RU2009149093/08 A RU 2009149093/08A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- objects
- viral particles
- exposure
- distribution
- radius
- Prior art date
Links
- 239000002245 particle Substances 0.000 title claims abstract 15
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 9
- 241000700605 Viruses Species 0.000 title 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims abstract 14
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 claims abstract 6
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 claims abstract 2
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 claims abstract 2
- 230000011218 segmentation Effects 0.000 claims abstract 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims abstract 2
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06V—IMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
- G06V20/00—Scenes; Scene-specific elements
- G06V20/60—Type of objects
- G06V20/69—Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
- G06V20/695—Preprocessing, e.g. image segmentation
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T1/00—General purpose image data processing
- G06T1/20—Processor architectures; Processor configuration, e.g. pipelining
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Multimedia (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Analysing Materials By The Use Of Radiation (AREA)
Abstract
1. Способ внутриклеточного подсчета и сегментации вирусных частиц на изображении, содержащий: ! создание изображения, на котором имеется множество объектов; ! идентификацию круглых объектов на изображении; ! сортировку идентифицированных круглых объектов по группам; ! определение распределения профилей плотности по радиусу для идентифицированных круглых объектов; ! идентификацию эллиптических объектов, которые могут сформироваться при установленном распределении профилей плотности по радиусу; ! сортировку идентифицированных эллиптических объектов по группам; и ! идентификацию вирусных частиц среди отсортированных круглых и эллиптических объектов на основе распределения профилей плотности по радиусу объектов в отобранной группе круглых и эллиптических объектов; ! воздействие на вирусные частицы фармацевтическим препаратом; ! сортировку вирусных частиц по группам после воздействия на них фармацевтическим препаратом; ! анализ различий между распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц до воздействия и распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц после воздействия фармацевтическим препаратом. ! 2. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ изменений в распределении размеров объектов на изображении в результате воздействия. ! 3. Способ по п.1, содержащий, кроме того, определение разности количества объектов в группе до и после воздействия химическим веществом. ! 4. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ морфологических структур вирусных частиц.
Claims (4)
1. Способ внутриклеточного подсчета и сегментации вирусных частиц на изображении, содержащий:
создание изображения, на котором имеется множество объектов;
идентификацию круглых объектов на изображении;
сортировку идентифицированных круглых объектов по группам;
определение распределения профилей плотности по радиусу для идентифицированных круглых объектов;
идентификацию эллиптических объектов, которые могут сформироваться при установленном распределении профилей плотности по радиусу;
сортировку идентифицированных эллиптических объектов по группам; и
идентификацию вирусных частиц среди отсортированных круглых и эллиптических объектов на основе распределения профилей плотности по радиусу объектов в отобранной группе круглых и эллиптических объектов;
воздействие на вирусные частицы фармацевтическим препаратом;
сортировку вирусных частиц по группам после воздействия на них фармацевтическим препаратом;
анализ различий между распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц до воздействия и распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц после воздействия фармацевтическим препаратом.
2. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ изменений в распределении размеров объектов на изображении в результате воздействия.
3. Способ по п.1, содержащий, кроме того, определение разности количества объектов в группе до и после воздействия химическим веществом.
4. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ морфологических структур вирусных частиц.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US94087007P | 2007-05-30 | 2007-05-30 | |
| US60/940,870 | 2007-05-30 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2009149093A true RU2009149093A (ru) | 2011-07-10 |
| RU2461063C2 RU2461063C2 (ru) | 2012-09-10 |
Family
ID=40094049
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2009149093/08A RU2461063C2 (ru) | 2007-05-30 | 2008-04-25 | Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении |
Country Status (19)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8224059B2 (ru) |
| EP (1) | EP2149105B1 (ru) |
| JP (1) | JP5243535B2 (ru) |
| KR (1) | KR101343749B1 (ru) |
| CN (1) | CN101681427B (ru) |
| AU (1) | AU2008260410B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0811951A2 (ru) |
| CA (1) | CA2688153C (ru) |
| DK (1) | DK2149105T3 (ru) |
| ES (1) | ES2835175T3 (ru) |
| HK (1) | HK1137254A1 (ru) |
| HU (1) | HUE052662T2 (ru) |
| MX (1) | MX2009012265A (ru) |
| MY (1) | MY153016A (ru) |
| PL (1) | PL2149105T3 (ru) |
| PT (1) | PT2149105T (ru) |
| RU (1) | RU2461063C2 (ru) |
| WO (1) | WO2008150588A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA200907666B (ru) |
Families Citing this family (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| MX2007012679A (es) * | 2005-04-15 | 2008-04-17 | Intelligent Virus Imaging Inc | Metodo para analizar estructuras celulares y sus componentes. |
| US8712140B2 (en) * | 2005-04-15 | 2014-04-29 | Intelligent Virus Imaging Inc. | Method of analyzing cell structures and their components |
| US8712141B2 (en) * | 2007-05-30 | 2014-04-29 | Intelligent Virus Imagaing Inc. | Method for counting and segmenting viral particles in an image |
| JPWO2012077280A1 (ja) | 2010-12-09 | 2014-05-19 | パナソニック株式会社 | 三次元集積回路の設計支援装置及び設計支援方法 |
| CN103514481A (zh) * | 2012-06-20 | 2014-01-15 | 天津三星电机有限公司 | 一种基于图像的制品数量快速测量方法及其装置 |
| PT3389813T (pt) * | 2015-12-18 | 2020-04-08 | Intelligent Virus Imaging Inc | Quantificação de elevada precisão de partículas sub-visíveis |
| RU2626145C1 (ru) * | 2016-01-27 | 2017-07-21 | Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Оренбургский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО ОрГМУ Минздрава России) | Способ оценки содержания белков межклеточного матрикса в регенерирующих тканях при анализе цифровых изображений иммуногистохимических микропрепаратов в программе adobe® photoshop® |
| SG11201805521XA (en) * | 2016-09-30 | 2018-07-30 | Intelligent Virus Imaging Inc | Method for quantification of purity of sub-visible particle samples |
| MA44418B1 (fr) * | 2017-03-02 | 2021-11-30 | Intelligent Virus Imaging Inc | Procédé permettant la mesure quantitative de contenu particulaire à l'aide d'une imagerie à l'état hydraté |
| RU2750591C1 (ru) * | 2020-05-12 | 2021-06-29 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ижевская государственная медицинская академия" | Способ определения степени окраски эндотелиальных клеток |
| CN111795986A (zh) * | 2020-05-20 | 2020-10-20 | 万秋花 | 应用外形搜索的病毒临床检验检测平台 |
| CN112288684B (zh) * | 2020-07-15 | 2021-06-25 | 华北理工大学 | 应用密度分析的致病判断系统及方法 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| BR9813763A (pt) * | 1997-12-18 | 2000-10-03 | Infineon Technologies Ag | Dispositivo para a captação de imagens |
| JP4069545B2 (ja) * | 1999-05-19 | 2008-04-02 | 株式会社日立製作所 | 電子顕微方法及びそれを用いた電子顕微鏡並び生体試料検査方法及び生体検査装置 |
| RU2168206C1 (ru) * | 2000-06-30 | 2001-05-27 | Зайцев Павел Анатольевич | Способ сканирования рисунка кожных линий и устройство для его осуществления |
| JP4012813B2 (ja) * | 2002-11-27 | 2007-11-21 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 透過型電子顕微鏡及び試料観察方法 |
| JP4154300B2 (ja) * | 2003-09-08 | 2008-09-24 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 透過電子顕微鏡システムおよびそれを用いた検査方法 |
| US20070099276A1 (en) * | 2003-10-25 | 2007-05-03 | David Ott | Retrovirus-like particles and retroviral vaccines |
| EP1934860B1 (en) * | 2005-10-12 | 2014-07-23 | Intelligent Virus Imaging Inc. | Identification and classification of virus particles in textured electron micrographs |
-
2008
- 2008-04-25 DK DK08746847.6T patent/DK2149105T3/da active
- 2008-04-25 AU AU2008260410A patent/AU2008260410B2/en not_active Ceased
- 2008-04-25 JP JP2010510391A patent/JP5243535B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2008-04-25 US US12/600,623 patent/US8224059B2/en active Active
- 2008-04-25 CN CN2008800179936A patent/CN101681427B/zh active Active
- 2008-04-25 BR BRPI0811951A patent/BRPI0811951A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2008-04-25 PT PT87468476T patent/PT2149105T/pt unknown
- 2008-04-25 ES ES08746847T patent/ES2835175T3/es active Active
- 2008-04-25 MY MYPI20094764 patent/MY153016A/en unknown
- 2008-04-25 KR KR1020097027393A patent/KR101343749B1/ko active IP Right Grant
- 2008-04-25 PL PL08746847T patent/PL2149105T3/pl unknown
- 2008-04-25 EP EP08746847.6A patent/EP2149105B1/en active Active
- 2008-04-25 MX MX2009012265A patent/MX2009012265A/es unknown
- 2008-04-25 RU RU2009149093/08A patent/RU2461063C2/ru active
- 2008-04-25 WO PCT/US2008/061499 patent/WO2008150588A1/en active Search and Examination
- 2008-04-25 CA CA2688153A patent/CA2688153C/en active Active
- 2008-04-25 HU HUE08746847A patent/HUE052662T2/hu unknown
-
2009
- 2009-11-02 ZA ZA200907666A patent/ZA200907666B/xx unknown
-
2010
- 2010-05-14 HK HK10104767.1A patent/HK1137254A1/xx not_active IP Right Cessation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR20100025545A (ko) | 2010-03-09 |
| EP2149105A1 (en) | 2010-02-03 |
| US20100151446A1 (en) | 2010-06-17 |
| KR101343749B1 (ko) | 2013-12-19 |
| JP2010529428A (ja) | 2010-08-26 |
| EP2149105B1 (en) | 2020-11-18 |
| WO2008150588A1 (en) | 2008-12-11 |
| MY153016A (en) | 2014-12-31 |
| CN101681427A (zh) | 2010-03-24 |
| BRPI0811951A2 (pt) | 2016-10-04 |
| CN101681427B (zh) | 2012-12-05 |
| RU2461063C2 (ru) | 2012-09-10 |
| PL2149105T3 (pl) | 2021-05-17 |
| DK2149105T3 (da) | 2021-02-01 |
| PT2149105T (pt) | 2020-12-15 |
| EP2149105A4 (en) | 2013-09-25 |
| HUE052662T2 (hu) | 2021-05-28 |
| ES2835175T3 (es) | 2021-06-22 |
| CA2688153C (en) | 2015-03-31 |
| HK1137254A1 (en) | 2010-07-23 |
| US8224059B2 (en) | 2012-07-17 |
| JP5243535B2 (ja) | 2013-07-24 |
| MX2009012265A (es) | 2009-12-01 |
| AU2008260410A1 (en) | 2008-12-11 |
| AU2008260410B2 (en) | 2012-05-03 |
| CA2688153A1 (en) | 2008-12-11 |
| ZA200907666B (en) | 2010-07-28 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2009149093A (ru) | Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении | |
| Tibbe et al. | Statistical considerations for enumeration of circulating tumor cells | |
| Mohamadi et al. | Nanoparticle‐mediated binning and profiling of heterogeneous circulating tumor cell subpopulations | |
| ES2554993T3 (es) | Sistema de análisis para el análisis de muestras biológicas, métodos y producto de programa informático | |
| CN107250343A (zh) | 分离细胞的方法及用于该方法的器件 | |
| US8693762B2 (en) | Inertial particle focusing flow cytometer | |
| Shankar et al. | Automatic detection of acute lymphoblasitc leukemia using image processing | |
| JP2012530246A5 (ru) | ||
| JP2013015357A5 (ru) | ||
| EP2853895A3 (en) | Methods, apparatus and systems for detection of total protein using capillary electrophoresis | |
| Schmeja | Identifying star clusters in a field: A comparison of different algorithms | |
| CN104732524B (zh) | 血液白细胞显微图像的随机权网络分割方法 | |
| CN104282026A (zh) | 基于分水岭算法和最小生成树的分布均匀性评估方法 | |
| BR112013011946A2 (pt) | método para identificação de um código de barras bidimensional em dados de imagem digital do código de barras, aparato configurado para identificar um código de barras bidimensional em dados de imagem digital do código de barras, programa de computador e meio legível por computador | |
| MX355628B (es) | Sistema y metodo para cuantificar zooplancton. | |
| Oberemm et al. | Proteomic responses of human intestinal Caco‐2 cells exposed to silver nanoparticles and ionic silver | |
| EP2902769A3 (en) | Blood cell analyzer | |
| EP2706345A3 (en) | Method and Apparatus for Creating Nondestructive Inspection Porosity Standards | |
| Englund et al. | The role of tumour‐infiltrating eosinophils, mast cells and macrophages in Classical and Nodular Lymphocyte Predominant Hodgkin Lymphoma in children | |
| CN105608694A (zh) | 视网膜细胞显微图像分割与计数方法 | |
| Olson | The effect of fibre length on passage through narrow apertures | |
| CN104966109B (zh) | 医疗化验单图像分类方法及装置 | |
| CN106845535B (zh) | 基于点云的典型零部件识别方法 | |
| DE60325934D1 (de) | Segmentierung eines Bildes mittels kürzester Zyklen | |
| CN105469099A (zh) | 基于稀疏表示分类的路面裂缝检测和识别方法 |