RU2009149093A - Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении - Google Patents

Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении Download PDF

Info

Publication number
RU2009149093A
RU2009149093A RU2009149093/08A RU2009149093A RU2009149093A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A RU 2009149093/08 A RU2009149093/08 A RU 2009149093/08A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A RU 2009149093 A RU2009149093 A RU 2009149093A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
objects
viral particles
exposure
distribution
radius
Prior art date
Application number
RU2009149093/08A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2461063C2 (ru
Inventor
Мохаммед ХОММАН (SE)
Мохаммед ХОММАН
Original Assignee
Интеллигент Вирус Имагинг Инк. (Us)
Интеллигент Вирус Имагинг Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Интеллигент Вирус Имагинг Инк. (Us), Интеллигент Вирус Имагинг Инк. filed Critical Интеллигент Вирус Имагинг Инк. (Us)
Publication of RU2009149093A publication Critical patent/RU2009149093A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2461063C2 publication Critical patent/RU2461063C2/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06VIMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
    • G06V20/00Scenes; Scene-specific elements
    • G06V20/60Type of objects
    • G06V20/69Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
    • G06V20/695Preprocessing, e.g. image segmentation
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T1/00General purpose image data processing
    • G06T1/20Processor architectures; Processor configuration, e.g. pipelining

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Multimedia (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Analysing Materials By The Use Of Radiation (AREA)

Abstract

1. Способ внутриклеточного подсчета и сегментации вирусных частиц на изображении, содержащий: ! создание изображения, на котором имеется множество объектов; ! идентификацию круглых объектов на изображении; ! сортировку идентифицированных круглых объектов по группам; ! определение распределения профилей плотности по радиусу для идентифицированных круглых объектов; ! идентификацию эллиптических объектов, которые могут сформироваться при установленном распределении профилей плотности по радиусу; ! сортировку идентифицированных эллиптических объектов по группам; и ! идентификацию вирусных частиц среди отсортированных круглых и эллиптических объектов на основе распределения профилей плотности по радиусу объектов в отобранной группе круглых и эллиптических объектов; ! воздействие на вирусные частицы фармацевтическим препаратом; ! сортировку вирусных частиц по группам после воздействия на них фармацевтическим препаратом; ! анализ различий между распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц до воздействия и распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц после воздействия фармацевтическим препаратом. ! 2. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ изменений в распределении размеров объектов на изображении в результате воздействия. ! 3. Способ по п.1, содержащий, кроме того, определение разности количества объектов в группе до и после воздействия химическим веществом. ! 4. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ морфологических структур вирусных частиц.

Claims (4)

1. Способ внутриклеточного подсчета и сегментации вирусных частиц на изображении, содержащий:
создание изображения, на котором имеется множество объектов;
идентификацию круглых объектов на изображении;
сортировку идентифицированных круглых объектов по группам;
определение распределения профилей плотности по радиусу для идентифицированных круглых объектов;
идентификацию эллиптических объектов, которые могут сформироваться при установленном распределении профилей плотности по радиусу;
сортировку идентифицированных эллиптических объектов по группам; и
идентификацию вирусных частиц среди отсортированных круглых и эллиптических объектов на основе распределения профилей плотности по радиусу объектов в отобранной группе круглых и эллиптических объектов;
воздействие на вирусные частицы фармацевтическим препаратом;
сортировку вирусных частиц по группам после воздействия на них фармацевтическим препаратом;
анализ различий между распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц до воздействия и распределением профилей плотности по радиусу у вирусных частиц после воздействия фармацевтическим препаратом.
2. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ изменений в распределении размеров объектов на изображении в результате воздействия.
3. Способ по п.1, содержащий, кроме того, определение разности количества объектов в группе до и после воздействия химическим веществом.
4. Способ по п.1, содержащий, кроме того, анализ морфологических структур вирусных частиц.
RU2009149093/08A 2007-05-30 2008-04-25 Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении RU2461063C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US94087007P 2007-05-30 2007-05-30
US60/940,870 2007-05-30

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2009149093A true RU2009149093A (ru) 2011-07-10
RU2461063C2 RU2461063C2 (ru) 2012-09-10

Family

ID=40094049

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009149093/08A RU2461063C2 (ru) 2007-05-30 2008-04-25 Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении

Country Status (19)

Country Link
US (1) US8224059B2 (ru)
EP (1) EP2149105B1 (ru)
JP (1) JP5243535B2 (ru)
KR (1) KR101343749B1 (ru)
CN (1) CN101681427B (ru)
AU (1) AU2008260410B2 (ru)
BR (1) BRPI0811951A2 (ru)
CA (1) CA2688153C (ru)
DK (1) DK2149105T3 (ru)
ES (1) ES2835175T3 (ru)
HK (1) HK1137254A1 (ru)
HU (1) HUE052662T2 (ru)
MX (1) MX2009012265A (ru)
MY (1) MY153016A (ru)
PL (1) PL2149105T3 (ru)
PT (1) PT2149105T (ru)
RU (1) RU2461063C2 (ru)
WO (1) WO2008150588A1 (ru)
ZA (1) ZA200907666B (ru)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MX2007012679A (es) * 2005-04-15 2008-04-17 Intelligent Virus Imaging Inc Metodo para analizar estructuras celulares y sus componentes.
US8712140B2 (en) * 2005-04-15 2014-04-29 Intelligent Virus Imaging Inc. Method of analyzing cell structures and their components
US8712141B2 (en) * 2007-05-30 2014-04-29 Intelligent Virus Imagaing Inc. Method for counting and segmenting viral particles in an image
JPWO2012077280A1 (ja) 2010-12-09 2014-05-19 パナソニック株式会社 三次元集積回路の設計支援装置及び設計支援方法
CN103514481A (zh) * 2012-06-20 2014-01-15 天津三星电机有限公司 一种基于图像的制品数量快速测量方法及其装置
PT3389813T (pt) * 2015-12-18 2020-04-08 Intelligent Virus Imaging Inc Quantificação de elevada precisão de partículas sub-visíveis
RU2626145C1 (ru) * 2016-01-27 2017-07-21 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Оренбургский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО ОрГМУ Минздрава России) Способ оценки содержания белков межклеточного матрикса в регенерирующих тканях при анализе цифровых изображений иммуногистохимических микропрепаратов в программе adobe® photoshop®
SG11201805521XA (en) * 2016-09-30 2018-07-30 Intelligent Virus Imaging Inc Method for quantification of purity of sub-visible particle samples
MA44418B1 (fr) * 2017-03-02 2021-11-30 Intelligent Virus Imaging Inc Procédé permettant la mesure quantitative de contenu particulaire à l'aide d'une imagerie à l'état hydraté
RU2750591C1 (ru) * 2020-05-12 2021-06-29 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ижевская государственная медицинская академия" Способ определения степени окраски эндотелиальных клеток
CN111795986A (zh) * 2020-05-20 2020-10-20 万秋花 应用外形搜索的病毒临床检验检测平台
CN112288684B (zh) * 2020-07-15 2021-06-25 华北理工大学 应用密度分析的致病判断系统及方法

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR9813763A (pt) * 1997-12-18 2000-10-03 Infineon Technologies Ag Dispositivo para a captação de imagens
JP4069545B2 (ja) * 1999-05-19 2008-04-02 株式会社日立製作所 電子顕微方法及びそれを用いた電子顕微鏡並び生体試料検査方法及び生体検査装置
RU2168206C1 (ru) * 2000-06-30 2001-05-27 Зайцев Павел Анатольевич Способ сканирования рисунка кожных линий и устройство для его осуществления
JP4012813B2 (ja) * 2002-11-27 2007-11-21 株式会社日立ハイテクノロジーズ 透過型電子顕微鏡及び試料観察方法
JP4154300B2 (ja) * 2003-09-08 2008-09-24 株式会社日立ハイテクノロジーズ 透過電子顕微鏡システムおよびそれを用いた検査方法
US20070099276A1 (en) * 2003-10-25 2007-05-03 David Ott Retrovirus-like particles and retroviral vaccines
EP1934860B1 (en) * 2005-10-12 2014-07-23 Intelligent Virus Imaging Inc. Identification and classification of virus particles in textured electron micrographs

Also Published As

Publication number Publication date
KR20100025545A (ko) 2010-03-09
EP2149105A1 (en) 2010-02-03
US20100151446A1 (en) 2010-06-17
KR101343749B1 (ko) 2013-12-19
JP2010529428A (ja) 2010-08-26
EP2149105B1 (en) 2020-11-18
WO2008150588A1 (en) 2008-12-11
MY153016A (en) 2014-12-31
CN101681427A (zh) 2010-03-24
BRPI0811951A2 (pt) 2016-10-04
CN101681427B (zh) 2012-12-05
RU2461063C2 (ru) 2012-09-10
PL2149105T3 (pl) 2021-05-17
DK2149105T3 (da) 2021-02-01
PT2149105T (pt) 2020-12-15
EP2149105A4 (en) 2013-09-25
HUE052662T2 (hu) 2021-05-28
ES2835175T3 (es) 2021-06-22
CA2688153C (en) 2015-03-31
HK1137254A1 (en) 2010-07-23
US8224059B2 (en) 2012-07-17
JP5243535B2 (ja) 2013-07-24
MX2009012265A (es) 2009-12-01
AU2008260410A1 (en) 2008-12-11
AU2008260410B2 (en) 2012-05-03
CA2688153A1 (en) 2008-12-11
ZA200907666B (en) 2010-07-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2009149093A (ru) Способ подсчета и сегментации частиц вирусов на изображении
Tibbe et al. Statistical considerations for enumeration of circulating tumor cells
Mohamadi et al. Nanoparticle‐mediated binning and profiling of heterogeneous circulating tumor cell subpopulations
ES2554993T3 (es) Sistema de análisis para el análisis de muestras biológicas, métodos y producto de programa informático
CN107250343A (zh) 分离细胞的方法及用于该方法的器件
US8693762B2 (en) Inertial particle focusing flow cytometer
Shankar et al. Automatic detection of acute lymphoblasitc leukemia using image processing
JP2012530246A5 (ru)
JP2013015357A5 (ru)
EP2853895A3 (en) Methods, apparatus and systems for detection of total protein using capillary electrophoresis
Schmeja Identifying star clusters in a field: A comparison of different algorithms
CN104732524B (zh) 血液白细胞显微图像的随机权网络分割方法
CN104282026A (zh) 基于分水岭算法和最小生成树的分布均匀性评估方法
BR112013011946A2 (pt) método para identificação de um código de barras bidimensional em dados de imagem digital do código de barras, aparato configurado para identificar um código de barras bidimensional em dados de imagem digital do código de barras, programa de computador e meio legível por computador
MX355628B (es) Sistema y metodo para cuantificar zooplancton.
Oberemm et al. Proteomic responses of human intestinal Caco‐2 cells exposed to silver nanoparticles and ionic silver
EP2902769A3 (en) Blood cell analyzer
EP2706345A3 (en) Method and Apparatus for Creating Nondestructive Inspection Porosity Standards
Englund et al. The role of tumour‐infiltrating eosinophils, mast cells and macrophages in Classical and Nodular Lymphocyte Predominant Hodgkin Lymphoma in children
CN105608694A (zh) 视网膜细胞显微图像分割与计数方法
Olson The effect of fibre length on passage through narrow apertures
CN104966109B (zh) 医疗化验单图像分类方法及装置
CN106845535B (zh) 基于点云的典型零部件识别方法
DE60325934D1 (de) Segmentierung eines Bildes mittels kürzester Zyklen
CN105469099A (zh) 基于稀疏表示分类的路面裂缝检测和识别方法