RU2007453C1 - Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of endonuclease restriction bsh 451 - Google Patents
Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of endonuclease restriction bsh 451 Download PDFInfo
- Publication number
- RU2007453C1 RU2007453C1 SU4907993A RU2007453C1 RU 2007453 C1 RU2007453 C1 RU 2007453C1 SU 4907993 A SU4907993 A SU 4907993A RU 2007453 C1 RU2007453 C1 RU 2007453C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- strain
- bsh
- enzyme
- bacillus sphaericus
- producer
- Prior art date
Links
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к биотехнологии и генной инженерии, в частности к получению штамма, используемого для выделения эндонуклеазы рестрикции (рестриктазы), узнающей и расщепляющей последовательность нуклеотидов 5'-G(A/T)GC(A/T)C-3'.The invention relates to biotechnology and genetic engineering, in particular to the production of a strain used to isolate a restriction endonuclease (restrictase) that recognizes and cleaves the nucleotide sequence 5 ' -G (A / T) GC (A / T) C-3'.
Рестриктаза данной специфичности может быть использована для работ по клонированию, физическому картированию субстратных ДНК. Данная рестриктаза является удобной моделью для изучения специфичности белок-нуклеиновых взаимодействий. A restriction enzyme of this specificity can be used for cloning and physical mapping of substrate DNA. This restriction enzyme is a convenient model for studying the specificity of protein-nucleic acid interactions.
Наиболее близким к заявляемому штамму-прототипом является штамм Bacillus brevis (ВКПМ В-4906) - продуцент сайт-специфической эндонуклеазы рестрикции Bbv 12 I, узнающей и расщепляющей последовательность 5'-G(A/T)GC(A/T)C-3'. Штамм хорошо растет на агаризованной среде отечественного производства, приготовленной на основе 3,7% гидролизата кильки. Биомасса лизируется лизоцимом. Основным недостатком данного штамма является недостаточно высокий выход фермента - 6000 ед/г сырой биомассы.Closest to the claimed strain of the prototype is a strain of Bacillus brevis (VKPM B-4906) - the producer of site-specific restriction endonuclease Bbv 12 I, recognizing and cleaving the sequence 5 ' -G (A / T) GC (A / T) C-3 ' . The strain grows well on a domestic agar medium prepared on the basis of a 3.7% sprat hydrolyzate. Biomass is lysed by lysozyme. The main disadvantage of this strain is the insufficiently high yield of the enzyme - 6000 u / g of raw biomass.
Целью изобретения является выявление штамма-продуцента, синтезирующего рестриктазу, способную узнавать и расщеплять последовательность неклеотидов 5'-G(A/T)GC(A/T)C-3', с повышенным выходом целевого фермента.The aim of the invention is to identify the producer strain synthesizing restriction enzyme capable of recognizing and cleaving a sequence nekleotidov 5 '-G (A / T) GC (A / T) C- 3', with an increased yield of the desired enzyme.
Цель достигается получением штамма Bacillus sphaericus 45 - продуцента сайт-специфической рестриктазы Bsh 45 I. The goal is achieved by obtaining a strain of Bacillus sphaericus 45 - producer of site-specific restriction enzyme Bsh 45 I.
Новый штамм выделен из природного материала (почвы) в результате систематического поиска штаммов-продуцентов эндонуклеаз рестрикции в роде Bacillus. The new strain was isolated from natural material (soil) as a result of a systematic search for strains producing restriction endonucleases in the genus Bacillus.
Рестриктаза из Bacillus sphaericus 45 названа Bsh 45 I согласно общепринятой номенклатуре. The restriction enzyme from Bacillus sphaericus 45 is named Bsh 45 I according to generally accepted nomenclature.
Штамм Bacillus sphaericus 45 характеризуется следующими признаками:
Культурально-морфологические признаки: на среде МПА и РА образует слегка выпуклые колонии с ровными краями. Клетки палочковидные, размеры 1,6-2,5 мкм длины и 0,6-0,8 мкм ширины. Образуют эндоспоры сферической формы, в раздутом спорангии в основном терминального или субтерминального расположения. Аэробы.The strain of Bacillus sphaericus 45 is characterized by the following features:
Cultural and morphological characteristics: on the medium of MPA and RA forms slightly convex colonies with smooth edges. The cells are rod-shaped, sizes 1.6-2.5 microns in length and 0.6-0.8 microns in width. They form endospores of a spherical shape, in a bloated sporangium of a mainly terminal or subterminal location. Aerobes.
Физиолого-биохимические свойства: Каталазоположительные. Не гидролизуют тирозин и крахмал, не образуют индол и H2S, реакция Фогес-Проскауэра отрицательная, не дает роста в анаэробных условиях и при 50оС. Углеводы и спирты (глюкозу, арабинозу, ксилозу, маннит и др. ) не ферментирует.Physiological and biochemical properties: Catalase-positive. Tyrosine not hydrolyze starch and do not form indole and H 2 S, Voges-Proskauer negative reaction, gives growth in anaerobic conditions at 50 ° C and alcohols Carbohydrates (glucose, arabinose, xylose, mannitol, etc.) Are not fermented.
Хранение штамма осуществляют под вазелиновым маслом в фильно высушенном состоянии или в 30% глицерине при -70оС.Strain deposited under the mineral oil is carried out in philous dried state or in 30% glycerol at -70 ° C.
Для глубинного культивирования биомассы применяют среду следующего состава: (г/л) Рыбный гидролизат 37 Вода Остальное. For the deep cultivation of biomass, an environment of the following composition is used: (g / l) Fish hydrolyzate 37 Water Else.
Культивирование проводят при 30оС с хорошей аэрацией до достижения стационарной фазы роста. Выход рестриктазы Bsh 45 I - 30.000 ед/г сырой биомассы.Cultivation was conducted at 30 ° C with good aeration until the stationary growth phase. The restriction enzyme yield of Bsh 45 I is 30,000 units / g of crude biomass.
Полученная рестриктаза Bsh 45 I характеризуется следующими свойствами:
- узнает и расщепляет последовательность нуклеотидов 5'-G(A/T) GC(A/T)C-3';
- оптимальное значение рН для действия рестриктазы 7,9-9,0;
- оптимальная температура действия 37оС;
- для активации рестриктазы требуются ионы Mg2+, оптимальная концентрация 5-15 мМ.The obtained restriction enzyme Bsh 45 I is characterized by the following properties:
- recognizes and cleaves the sequence of nucleotides 5 ' -G (A / T) GC (A / T) C-3 ' ;
- the optimal pH for the action of restriction enzyme 7.9-9.0;
- optimum temperature action of 37 ° C;
- to activate restriction enzyme requires Mg 2+ ions , the optimal concentration of 5-15 mm.
Определяющими отличиями предложенного штамма Bacillus sphaericus 45 являются:
- штамм содержит одну сайт-специфическую рестриктазу Bsh 45 I, способную узнавать и расщеплять нуклеотидную последовательность 5'-G(A/T)GC(A/T)С-3';
- продуктивность штамма в 5 раз превосходит по целевому ферменту штамм-прототип.The defining differences of the proposed strain of Bacillus sphaericus 45 are:
- the strain contains one site-specific restriction enzyme Bsh 45 I, capable of recognizing and cleaving the nucleotide sequence of 5'-G (A / T) GC (A / T) C-3 ';
- the strain productivity is 5 times higher than the prototype strain in the target enzyme.
П р и м е р. Культуру хранят в косяках под вазелиновым маслом. Перед началом работы клетки пересевают бактериологической петлей на твердую агаризованную среду (3,7% СПА). Чашки Петри помещают в термостат на 30оС. После 24-часовой инкубации подросшие клетки пересевают в колбы со свежей питательной средой, состоящей из 3,7% гидролизата кильки, и помещают в термостат на ночь. Ночную культуру штамма Bacillus sphaericus 45 засевают в жидкую питательную среду, состоящую из 3,7% гидролизата кильки, остальное вода. Культивируют в термостатированных качалках при температуре 30оС, при 200 об/мин до достижения стационарной фазы роста. Клетки осаждают центрифугированием при 4оС. Выход биомассы составляет 6 г/л культуральной жидкости. Выделение осуществляют по методике Bickle, Pirota, Imber. Выход фермента составляет 30.000 ед/г сырой биомассы. Удельная активность рестриктазы Bsh 45 I составляет 10.000 ед/мл. Фермент хранится при -20оС в глицерине.PRI me R. The culture is stored in jambs under liquid paraffin. Before starting work, the cells are subcultured with a bacteriological loop on a solid agar medium (3.7% SPA). Petri dishes are placed in a thermostat at 30 ° C. After a 24-hour incubation, the grown cells are transplanted into flasks with a fresh nutrient medium consisting of 3.7% sprat hydrolyzate and placed in the thermostat overnight. The overnight culture of the strain of Bacillus sphaericus 45 is seeded in a liquid nutrient medium consisting of 3.7% sprat hydrolyzate, the rest is water. Cultured in incubator shaker at 30 ° C at 200 rev / min until the stationary growth phase. Cells were pelleted by centrifugation at 4 C. The yield of biomass was 6 g / l culture medium. Isolation is carried out according to the method of Bickle, Pirota, Imber. The enzyme yield is 30,000 units / g of raw biomass. The specific activity of the restriction enzyme Bsh 45 I is 10,000 units / ml. The enzyme was stored at -20 ° C in glycerol.
Полученный штамм по сравнению с прототипом характеризуется значительно более высоким выходом фермента (30.000 ед/г вместо 6.000 ед/г), т. е. в 5 раз и продуцирует только одну рестриктазу. The obtained strain in comparison with the prototype is characterized by a significantly higher enzyme yield (30,000 units / g instead of 6,000 units / g), i.e. 5 times and produces only one restrictase.
Поскольку рестриктаза Bsh 45 I имеет сайт узнавания, идентичный сайту узнавания рестриктазы Bbv 12 I (прототип), а выход фермента при культивировании на одинаковых средах выше в 5 раз, то Bsh 45 I может заменить прототип во всех генноинженерных исследованиях. (56) Brown N. L. Mc. Clealland M. , Whitehead P. R. Hgi AI: a restriction endonuclease from Herpetosiphon giganteus HP 1023. Gene. 1980, v. 9, p. 49-68. Since the restriction enzyme Bsh 45 I has a recognition site that is identical to the recognition site for the restriction enzyme Bbv 12 I (prototype), and the enzyme yield upon cultivation on identical media is 5 times higher, Bsh 45 I can replace the prototype in all genetic engineering studies. (56) Brown N. L. Mc. Clealland M., Whitehead P. R. Hgi AI: a restriction endonuclease from Herpetosiphon giganteus HP 1023. Gene. 1980, v. 9, p. 49-68.
Авторское свидетельство СССР N 1694647, кл. С 12 N 9/14, 1990. USSR author's certificate N 1694647, cl. C 12 N 9/14, 1990.
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU4907993 RU2007453C1 (en) | 1990-10-24 | 1990-10-24 | Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of endonuclease restriction bsh 451 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU4907993 RU2007453C1 (en) | 1990-10-24 | 1990-10-24 | Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of endonuclease restriction bsh 451 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2007453C1 true RU2007453C1 (en) | 1994-02-15 |
Family
ID=21558699
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SU4907993 RU2007453C1 (en) | 1990-10-24 | 1990-10-24 | Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of endonuclease restriction bsh 451 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2007453C1 (en) |
-
1990
- 1990-10-24 RU SU4907993 patent/RU2007453C1/en active
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Pant et al. | Production, optimization and partial purification of protease from Bacillus subtilis | |
Kristjansson | Thermophilic organisms as sources of thermostable enzymes | |
RU2288263C2 (en) | Strain bacillus coagulants sim-7 dsm 14043 for preparing l-(+)-lactate and method for preparing l-(+)-lactate | |
Liu et al. | Isolation and identification of a novel Rhodococcus sp. ML-0004 producing epoxide hydrolase and optimization of enzyme production | |
RU2007453C1 (en) | Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of endonuclease restriction bsh 451 | |
JP5103597B2 (en) | Thermostable L-ribose isomerase, production method and use thereof | |
CN101137743B (en) | Escherichia strain capable of converting xmp to gmp and maintaining the inactivated state of gene(s) associated with gmp degradation and methods of using the same | |
RU2500811C1 (en) | Recombinant bacillus subtilis bacteria strain-producer of specific phospholipase | |
SU1694647A1 (en) | Strain of bacteria bacillus brevis - a producer of restrictase bbvi 21 | |
RU2021373C1 (en) | Strain of bacterium bacillus pumilis producing restriction endonuclease recognizing and cleaving nucleotide sequence 5′- cctnagc- 3′ | |
RU2057806C1 (en) | Strain of bacterium bacillus coagulans - a producer of restriction endonuclease recognizing and splitting the nucleotide sequence 5′-gatnnnn-atc-3′ | |
RU2110573C1 (en) | Strain of bacterium photobacterium phosphoreum - a producer of restriction endonuclease recognizing and splitting nucleotide sequence 5'-gg(t/c)(ag)cc-3' | |
RU1784642C (en) | Strain of bacterium bacillus sphaericus - a producer of restrictase bsi-i | |
Nashima et al. | Production and optimization of lipase from wild and mutant strains of Bacillus sp. and Pseudomonas sp | |
RU2046142C1 (en) | Strain of bacterium bacillus pumilus - a producer of restriction endonuclease bpu 19-1 | |
Iizuka et al. | Synthesis of Fructan and Oligosaccharides by Microbial and Plant Fructosyltransf erasest | |
RU2266323C2 (en) | Bacterium strain sphingobacterium mizutae-32 as producer of spml restriction endonuclease, recognizing and cleaving 5'-at'cgat-3' nucleotide sequence | |
RU2038380C1 (en) | Strain of bacterium bacillus stearothermophilus - a producer of restriction endonuclease recognizing and cleaving nucleotide sequence 5′-cc(a/t)-gg-3′ | |
RU2073717C1 (en) | Strain of bacterium bacillus schlegelii - a producer of restriction endonuclease recognizing and splitting the nucleotide sequence 5'-ccnnnnnnngg-3' | |
RU2115728C1 (en) | Strain of bacterium bacillus stearothermophilus - a producer of restriction endonuclease recognizing and splitting nucleotide sequence 5'-ggtnacc-3' | |
RU2270859C1 (en) | STRAIN OF BACTERIUM BACILLUS SUBTILIS AS PRODUCER OF RESTRICTION ENDONUCLEASE Bisi | |
RU2105811C1 (en) | Strain of bacterium deleya aquamarina - a producer of restriction endonuclease recognizing and cleaving nucleotide sequence 5'-gtgcac-3' | |
RU2135581C1 (en) | Strain of bacterium streptomyces species sj-12 - producer of restriction endonuclease recognizing and splitting nucleotide sequence 5'-ctgcag-3' | |
RU2040540C1 (en) | Strain of bacteria bacillus coagulants being producer of side specific endonuclease which is enable to identify and to cleave series of 5′-ct(a/g)(t/c)ag-3′ nucleotides | |
RU2077577C1 (en) | Strain of bacterium deleya marina - a producer of alkaline phosphatase and a method of alkaline phosphatase preparing |