RU2006119434A - Высокопроизводительный функциональный анализ рецепторов, сопряженных с g-белками, с использованием rap-ras химерного белка - Google Patents
Высокопроизводительный функциональный анализ рецепторов, сопряженных с g-белками, с использованием rap-ras химерного белка Download PDFInfo
- Publication number
- RU2006119434A RU2006119434A RU2006119434/13A RU2006119434A RU2006119434A RU 2006119434 A RU2006119434 A RU 2006119434A RU 2006119434/13 A RU2006119434/13 A RU 2006119434/13A RU 2006119434 A RU2006119434 A RU 2006119434A RU 2006119434 A RU2006119434 A RU 2006119434A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- protein
- specified
- conjugated
- receptor
- helper
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/74—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving hormones or other non-cytokine intercellular protein regulatory factors such as growth factors, including receptors to hormones and growth factors
- G01N33/76—Human chorionic gonadotropin including luteinising hormone, follicle stimulating hormone, thyroid stimulating hormone or their receptors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1086—Preparation or screening of expression libraries, e.g. reporter assays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
- Pathology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Claims (31)
1. Способ определения является ли вещество лигандом рецептора, сопряженного с G-белками (GPCR), предусматривающий
(а) получение культуры клеток, которая содержит клетки, содержащие первую нуклеиновую кислоту, кодирующую GPCR, который увеличивает или уменьшает пролиферацию клеток через GPCR-каскад в ответ на лиганд, вторую рекомбинантную нуклеиновую кислоту, которая кодирует маркер, показывающий степень клеточной пролиферации, и третью рекомбинантную нуклеиновую кислоту, кодирующую эффекторный домен Ras;
(b) контактирование указанной клеточной культуры с тестируемым соединением; и
(с) определение уровня клеточной пролиферации.
2. Способ по п.1, где указанная третья рекомбинантная нуклеиновая кислота, дополнительно содержит получающий сигнал домен Rap, функционально связанный с указанным эффекторным доменом Ras.
3. Способ по п.2, где последовательность Rap не содержит каких-либо мутаций.
4. Способ по п.2, где получающий сигнал домен Rap содержит по крайней мере одну миссенс-мутацию.
5. Способ по п.2, где указанная по крайней мере одна миссенс-мутация в указанном белке Rap предотвращает фосфорилирование указанного получающего сигнал домена Rap.
6. Способ по п.2, где эффекторный домен Ras не является GTPаза-дефицитным.
7. Способ по любому из п.1 или 2, где указанная популяция клеток дополнительно содержит четвертую конструкцию нуклеиновой кислоты, которая функционально кодирует хелперный белок.
8. Способ по п.7, где указанный хелперный белок функционирует в 3'-5' направлении относительно получающего сигнал домена Rap в каскаде сигнальной трансдукции рецептора, сопряженного с G-белком.
9. Способ по п.7, где указанный хелперный белок функционирует в 5'-3' направлении относительно получающего сигнал домена Rap в каскаде сигнальной трансдукции рецептора, сопряженного с G-белком.
10. Способ по п.8, где указанный хелперный белок уменьшает сигнальную трансдукцию через G-сопряженный рецептор, отличающийся от рекомбинантного рецептора сопряженного с G-белком, кодированного первой рекомбинантной нуклеиновой кислотой.
11. Способ по п.8, где указанный хелперный белок усиливает пролиферацию через эффекторный домен Ras.
12. Способ по п.11, где указанный хелперный белок представляет собой "скавенджер" Gβγ.
13. Способ по п.12, где указанный "скавенджер" Gβγ представляет собой трансдуцин.
14. Способ по п.12, где указанный "скавенджер" Gβγ представляет собой BarkCT.
15. Способ по п.10, где указанный хелперный белок представляет собой фрагмент рецептора, сопряженного с G-белком, отличающегося от рецептора, сопряженного с G-белком, кодированного указанной первой рекомбинантной нуклеиновой кислотой.
16. Способ по п.8, где указанный белок, который функционирует в 3'-5' направлении относительно получающего сигнал домена Rap, представляет собой Gα белок.
17. Способ по п.16, где указанный Gα белок выбран из группы, включающей Gαs, Gαq, Gα1 и Gα12/13.
18. Способ по п.8, где указанный хелперный белок представляет собой фактор обмена гуанин-нуклеотида (GEF).
19. Способ по п.18, где указанный хелперный белок представляет собой ЕРАС.
20. Способ по п.18, где указанный хелперный белок представляет собой C3G.
21. Способ по п.8, где указанный хелперный белок представляет собой циклазу.
22. Способ по п.21, где указанная циклаза представляет собой аденилилциклазу.
23. Способ по п.22, где указанный хелперный белок представляет собой аденилилциклазу II (ACII).
24. Способ по п.8, где указанный хелперный белок представляет собой GTPазу.
25. Способ по п.24, где указанная GTPаза представляет собой Rac.
26. Способ по п.1, где указанный рецептор, сопряженный с G-белком, представляет собой Gs-связанный рецептор, сопряженный с G-белком.
27. Способ по п.1, где указанный рецептор, сопряженный с G-белком, представляет собой Gi-связанный рецептор, сопряженный с G-белком.
28. Способ по п.1, где указанный сопряженный с G-белком рецептор представляет собой Gq-связанный рецептор, сопряженный с G-белком.
29. Способ по п.1, где указанный сопряженный с G-белком рецептор представляет собой G12/G13-связанный рецептор, сопряженный с G-белком.
30. Способ по п.1, где указанная стадия определения указанного уровня клеточной пролиферации включает трансфекцию указанной клеточной культуры четвертой нуклеиновой кислотой, которая кодирует β-галактозидазу, и измерение количества активности β-галактозидазы указанной клеточной культуры.
31. Способ по п.1, где стадия определения указанного уровня клеточной пролиферации включает проведение анализа R-SATTM.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US51714303P | 2003-11-03 | 2003-11-03 | |
| US60/517,143 | 2003-11-03 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2006119434A true RU2006119434A (ru) | 2007-12-20 |
Family
ID=34549593
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2006119434/13A RU2006119434A (ru) | 2003-11-03 | 2004-11-02 | Высокопроизводительный функциональный анализ рецепторов, сопряженных с g-белками, с использованием rap-ras химерного белка |
Country Status (15)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US20050123964A1 (ru) |
| EP (1) | EP1692165B1 (ru) |
| JP (1) | JP2007536904A (ru) |
| KR (1) | KR20060135644A (ru) |
| CN (1) | CN1875033A (ru) |
| AT (1) | ATE420107T1 (ru) |
| AU (1) | AU2004285964A1 (ru) |
| BR (1) | BRPI0415787A (ru) |
| CA (1) | CA2543451A1 (ru) |
| DE (1) | DE602004018976D1 (ru) |
| IL (1) | IL175332A0 (ru) |
| NZ (1) | NZ546580A (ru) |
| RU (1) | RU2006119434A (ru) |
| WO (1) | WO2005042574A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA200603366B (ru) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR101104088B1 (ko) * | 2003-05-14 | 2012-01-12 | 에보닉 데구사 게엠베하 | 표면 개질된 침강 실리카 |
| US20060134670A1 (en) * | 2004-11-19 | 2006-06-22 | Fabrice Piu | Enabling tools to identify ligands for hormone nuclear receptors |
| TWI443337B (zh) * | 2008-10-10 | 2014-07-01 | Ct Hospitalier Universitaire Sainte Justine | 用於脊柱側彎之分類及診斷的方法 |
| WO2013096859A1 (en) * | 2011-12-22 | 2013-06-27 | Linda Buck | Methods and g proteins for screening and identifying ligands of g protein-coupled receptors |
Family Cites Families (19)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5196524A (en) * | 1989-01-06 | 1993-03-23 | Eli Lilly And Company | Fusion reporter gene for bacterial luciferase |
| US5661024A (en) * | 1989-10-31 | 1997-08-26 | Synaptic Pharmaceutical Corporation | DNA encoding a human serotonic (5-HT2) receptor and uses thereof |
| US5219737A (en) * | 1990-03-27 | 1993-06-15 | Kikkoman Corporation | Mutant luciferase of a firefly, mutant luciferase genes, recombinant dnas containing the genes and a method of producing mutant luciferase |
| US5401629A (en) * | 1990-08-07 | 1995-03-28 | The Salk Institute Biotechnology/Industrial Associates, Inc. | Assay methods and compositions useful for measuring the transduction of an intracellular signal |
| US5229285A (en) * | 1991-06-27 | 1993-07-20 | Kikkoman Corporation | Thermostable luciferase of firefly, thermostable luciferase gene of firefly, novel recombinant dna, and process for the preparation of thermostable luciferase of firefly |
| IL110298A (en) * | 1993-07-13 | 1999-04-11 | Brann Mark Robert | Identification of ligands by selective amplification of cells transfected with receptors |
| JP3466765B2 (ja) * | 1994-07-27 | 2003-11-17 | キッコーマン株式会社 | ビオチン化ホタルルシフェラーゼ、ビオチン化ホタルルシフェラーゼ遺伝子、新規な組み換え体ｄｎａ、ビオチン化ホタルルシフェラーゼの製造法及び生物発光分析法 |
| US5670356A (en) * | 1994-12-12 | 1997-09-23 | Promega Corporation | Modified luciferase |
| US8669074B2 (en) * | 1996-01-31 | 2014-03-11 | The Regents Of The University Of California | Chimeric phosphorylation indicator |
| US6004808A (en) * | 1996-06-21 | 1999-12-21 | Aurora Biosciences Corporation | Promiscuous G-protein compositions and their use |
| JP2003514763A (ja) * | 1998-04-14 | 2003-04-22 | アリーナ・フアーマシユーチカルズ・インコーポレーテツド | 非内在性の構成的に活性化されるヒトセロトニンレセプターおよびその小分子調節物質 |
| US6358698B1 (en) * | 1998-10-07 | 2002-03-19 | Acadia Pharmacueticals Inc. | Methods of identifying inverse agonists of the serotonin 2A receptor |
| DE19860834C1 (de) * | 1998-12-30 | 2000-08-24 | Albrecht E Sippel | Methode zur zellulären High-Throughput-Detektion von nukleären Rezeptor-Liganden-Interaktionen |
| US6462178B1 (en) * | 1999-11-17 | 2002-10-08 | Yong Hou Wong | G protein |
| WO2001046694A2 (en) * | 1999-12-22 | 2001-06-28 | Biosignal Packard Inc. | A bioluminescence resonance energy transfer (bret) fusion molecule and method of use |
| EP1315821A2 (en) * | 2000-09-07 | 2003-06-04 | Christer S. D. Owman | Reporter system for cell surface receptor-ligand binding |
| DE10226674B4 (de) * | 2002-06-12 | 2006-01-05 | Schering Ag | Verfahren zur Testung des hormonellen Effekts von Substanzen |
| ES2276179T3 (es) * | 2003-03-04 | 2007-06-16 | Bayer Schering Pharma Aktiengesellschaft | Procedimiento para la determinacion del efecto hormonal de sustancias mediante la interacion entre el receptor de androgenos y la proteina del sarcoma de ewing. |
| JP2005000132A (ja) * | 2003-06-13 | 2005-01-06 | Hitachi Ltd | Ｇα蛋白質共発現によるＧＰＣＲ計測方法 |
-
2004
- 2004-11-02 RU RU2006119434/13A patent/RU2006119434A/ru not_active Application Discontinuation
- 2004-11-02 EP EP04810260A patent/EP1692165B1/en not_active Not-in-force
- 2004-11-02 NZ NZ546580A patent/NZ546580A/en not_active IP Right Cessation
- 2004-11-02 AU AU2004285964A patent/AU2004285964A1/en not_active Abandoned
- 2004-11-02 CN CNA2004800323337A patent/CN1875033A/zh active Pending
- 2004-11-02 US US10/980,885 patent/US20050123964A1/en not_active Abandoned
- 2004-11-02 WO PCT/US2004/036595 patent/WO2005042574A1/en active Application Filing
- 2004-11-02 CA CA002543451A patent/CA2543451A1/en not_active Abandoned
- 2004-11-02 KR KR1020067010951A patent/KR20060135644A/ko not_active Application Discontinuation
- 2004-11-02 JP JP2006538452A patent/JP2007536904A/ja active Pending
- 2004-11-02 BR BRPI0415787-7A patent/BRPI0415787A/pt not_active Application Discontinuation
- 2004-11-02 AT AT04810260T patent/ATE420107T1/de not_active IP Right Cessation
- 2004-11-02 DE DE602004018976T patent/DE602004018976D1/de not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-04-30 IL IL175332A patent/IL175332A0/en unknown
- 2006-05-02 ZA ZA200603366A patent/ZA200603366B/en unknown
-
2008
- 2008-05-12 US US12/119,119 patent/US20080280303A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2004285964A1 (en) | 2005-05-12 |
| KR20060135644A (ko) | 2006-12-29 |
| EP1692165A1 (en) | 2006-08-23 |
| CN1875033A (zh) | 2006-12-06 |
| ZA200603366B (en) | 2008-03-26 |
| DE602004018976D1 (de) | 2009-02-26 |
| EP1692165B1 (en) | 2009-01-07 |
| JP2007536904A (ja) | 2007-12-20 |
| IL175332A0 (en) | 2006-09-05 |
| CA2543451A1 (en) | 2005-05-12 |
| US20050123964A1 (en) | 2005-06-09 |
| WO2005042574A1 (en) | 2005-05-12 |
| BRPI0415787A (pt) | 2006-12-26 |
| ATE420107T1 (de) | 2009-01-15 |
| US20080280303A1 (en) | 2008-11-13 |
| NZ546580A (en) | 2009-06-26 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Pontiggia et al. | Sex‐reversing mutations affect the architecture of SRY‐DNA complexes. | |
| Masternak et al. | A gene encoding a novel RFX-associated transactivator is mutated in the majority of MHC class II deficiency patients | |
| EP2080812A1 (en) | Compositions and methods of detecting post-stop peptides | |
| US20030143668A1 (en) | Guanosine triphosphate-binding protein coupled receptors | |
| ES2577535T3 (es) | Mutaciones del oncogén de C-kit en melanomas | |
| Heyl et al. | Evolutionary proteomics identifies amino acids essential for ligand-binding of the cytokinin receptor CHASE domain | |
| Jin et al. | Two novel members of the interleukin-1 receptor gene family, one deleted in Xp22. 1–Xp21. 3 mental retardation | |
| WO2002090979A1 (en) | Biochips and method of screening using drug induced gene and protein expression profiling | |
| Favre et al. | DOK4 and DOK5: new Dok-related genes expressed in human T cells | |
| AU2003293124A1 (en) | Heart failure gene determination and therapeutic screening | |
| Dlakić et al. | DNA sequence-dependent folding determines the divergence in binding specificities between Maf and other bZIP proteins | |
| CN110241183A (zh) | 一种fgfr融合基因的检测方法、试剂盒以及探针库 | |
| Rohila et al. | Protein-protein interactions of tandem affinity purified protein kinases from rice | |
| Sodeland et al. | Molecular characterization of a long range haplotype affecting protein yield and mastitis susceptibility in Norwegian Red cattle | |
| RU2006119434A (ru) | Высокопроизводительный функциональный анализ рецепторов, сопряженных с g-белками, с использованием rap-ras химерного белка | |
| Lewis et al. | Hyper IgE in New Zealand black mice due to a dominant-negative CD23 mutation | |
| Zhang et al. | The porcine Gpr3 gene: molecular cloning, characterization and expression level in tissues and cumulus–oocyte complexes during in vitro maturation | |
| Rimini et al. | Interaction of normal and mutant SRY proteins with DNA | |
| Kim et al. | Chromatin immunoprecipitation (ChIP) analysis of protein–DNA interactions | |
| Kralova et al. | Differential regulation of the inhibitor of apoptosis ch-IAP1 by v-rel and the proto-oncogene c-rel | |
| JP2005506056A (ja) | カチオン伝導ｇａｂａａレセプターおよびその使用 | |
| WO2003031655A1 (en) | Method for diagnosis of multiple sclerosis by genetic analysis of the lag3 gene | |
| WO2002097061A2 (en) | Iterative promoter affinity chromatography to identify trans-regulatory networks of gene expression | |
| Gibson et al. | Non-muscle and smooth muscle myosin light chain kinases: no end in sight | |
| MXPA06004862A (en) | High troughput functional assay for g-protein coupled receptors using a rap-ras chimeric protein |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20081126 |