PL178652B1 - Zrekombinowana cząsteczka dwuniciowego DNA, sposób wytwarzania genetycznie stransformowanych, odpornych na choroby roślin, oraz genetycznie stransformowana komórka roślinna ziemniaka lub pszenicy - Google Patents

Zrekombinowana cząsteczka dwuniciowego DNA, sposób wytwarzania genetycznie stransformowanych, odpornych na choroby roślin, oraz genetycznie stransformowana komórka roślinna ziemniaka lub pszenicy

Info

Publication number
PL178652B1
PL178652B1 PL94314590A PL31459094A PL178652B1 PL 178652 B1 PL178652 B1 PL 178652B1 PL 94314590 A PL94314590 A PL 94314590A PL 31459094 A PL31459094 A PL 31459094A PL 178652 B1 PL178652 B1 PL 178652B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
sequence
ala
gly
leu
promoter
Prior art date
Application number
PL94314590A
Other languages
English (en)
Other versions
PL314590A1 (en
Inventor
Ellen B. Lawrence
Elaine B. Levine
Dilipkumar M. Shah
Original Assignee
Monsanto Co
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Monsanto Co filed Critical Monsanto Co
Publication of PL314590A1 publication Critical patent/PL314590A1/xx
Publication of PL178652B1 publication Critical patent/PL178652B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8281Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for bacterial resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8282Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for fungal resistance

Abstract

1. Zrekom binowana czasteczka dw uniciow ego D N A , zn am ien n a tym , ze obejm uje w kolejnosci zapewniajacej dzialanie a ) promotor, który dziala w komórkach roslinnych powodujac wytwarzanie sekwencji R NA, przy czym rzeczony promotor wybiera sie sposród promotorów FM V 35S 1 C aM V 35S, b) strukturalna sekwencje kodujaca, która koduje w ytw arzana oksydaze g lu k o zo w a A spergillus, przy czym rzeczona sekw encja struktu ralna D N A jest sekwencja o numerze identyfikacyjnym . 2 ,1 c) 3'-koncow y region nie ulegajacy translacji, który dziala w komórkach roslinnych powodujac dolaczanie nukleotydów poliadenylo w ych do konca 3' sekw encji RNA. 2. Sposób wytwarzania genetycznie stransform owanych, odpornych na choroby roslin, zn am ien n y tym , ze obejm uje etapy a) w stawiania do genom u komórki roslinnej zrekom binowanej, dwuniciowej czasteczki D N A , zawierajacej (i) promotor, który dziala w komórkach roslinnych powodujac w ytwarzanie sekwencji R N A , przy czym rzeczony promotor wybiera sie sposród promotorów FM V 35S i CaM V35S, (ii) strukturalna sekwencje kodujaca, która pow oduje wytwarzanie oksydazy glukozow ej A spergillu s, przy czym rzeczona sekwencja strukturalna D N A jest sekwencja o numerze identyfikacyjnym . 2; i (iii) 3'-koncow y region nie ulegajacy translacji, który dziala w rzeczonych komórkach roslinnych powodujac dolaczanie nukleotydów poliadenylow ych do konca 3' sekwencji RNA b) otrzym ywania stransform owanych kom órek roslinnych, 1 c) regeneracji ze stransformowanych komórek roslinnych genetycznie stransformowanych roslin ziemniaka lub pszenicy, w których za- chodzi ekspresja oksydazy glukozowej Aspergillus w ilosci skutecznej w obnizaniu uszkodzen spowodowanych infekcja patogenem bakteryj- nym lub grzybowym. 3 G enetycznie stransform owana komórka roslinna ziem niaka lub pszenicy, zn am ien n a tym , ze zawiera zrekom binow ana czasteczke dw uniciow ego D N A , która obejm uje w kolejnosci zapewniajacej dzialanie a) promotor, który dziala w komórkach roslinnych powodujac wytwarzanie sekwencji R NA, przy czym rzeczony promotor w ybiera sie sposród promotorów FM V 35S , C aM V 35S, b) strukturalna sekwencje kodujaca, która koduje w ytw arzana oksydaze g\u kozow aA spergillu s, przy czym rzeczona sek w encja struktu- ralna D N A jest sekwencja o numerze identyfikacyjnym 2, 1 c) 3'-koncow y region nie ulegajacy translacji, który dziala w komórkach roslinnych powodujac dolaczanie nukleotydów poliadenylo- wych do konca 3' sekw encji RNA. PL PL PL PL PL

Description

Wynalazek ten dotyczy metody zwalczania patogenów roślinnych przez zastosowanie białka, które dostarcza się przez genetyczną modyfikację rośliny, w wyniku której wytwarza ona to białko, oraz genów i roślin użytecznych w tej metodzie.
178 652
Podstawa wynalazku
Dobrze wiadomo, że enzymatyczne działanie oksydazy glukozowej ma charakter przeciwbakteryjny. W obecności tlenu oksydaza glukozowa katalizuje utlenianie glukozy do δ-glukonolaktonu i nadtlenku wodoru. Działanie przeciwbakteryjne jest wynikiem zarówno utleniających właściwości nadtlenku wodoru, jak również obecności δ-glukonolaktonu, który jest znanym inhibitorem glikozylotransferaz.
Przeciwbakteryjne działanie produktów tego enzymu spowodowało jego szerokie zastosowanie w przemyśle spożywczym, gdzie jest on uważany za związek GRAS [powszechnie uznawany jako bezpieczny]. Jako taką, oksydazę glukozową stosuje się do zapobiegania bakteryjnemu psuciu gotowej żywności. W medycynie stosuje się jąjako enzymatyczny środek bakteriobójczy jako część preparatu do stosowania w materiałach opatrunkowych na rany, wykałaczkach dentystycznych, niciach dentystycznych i miniaturowych szczoteczkach do zębów. Uważa się również, że stosowanie oksydazy glukozowej jest sposobem zwalczania kamienia nazębnego.
Ostatnie doniesienia wykazały, że oksydaza glukozowa zaangażowana jest, jako część mechanizmu biokontroli wykorzystywanej przez Penicillium dangeari, w zwalczaniu patogennego dla roślin grzyba V^/^Z^żi^z7lium dahliae [Kim i in., 1988, 1990],
Jednakże sądzono, że użycie oksydazy glukozowej jako środka dla roślin do ich ochrony przed organizmami patogennymi ma małe możliwości z powodu charakteru działania enzymatycznego. Po pierwsze, w roślinach jest mało obecnej glukozy. Enzym mógłby mieć niewystarczającą ilość substratu do wytwarzania dostatecznej ilości nadtlenku wodoru i/lub δ-glukonolaktonu do zwalczenia ataku patogenów. Po drugie, można oczekiwać, że obecność takiego enzymu, zużywającego glukozę i wytwarzającego nawet małe ilości nadtlenku wodoru, w komórce roślinnej, będzie szkodliwa dla żywotności komórki. Można spodziewać się, że rośliny transgeniczne, w których zachodzi ekspresja oksydazy glukozowej, nie będą rozwijać się normalnie, albo jako zregenerowane rośliny, albo w następnych pokoleniach.
Przedmiotem niniejszego wynalazku jest dostarczenie oksydazy glukozowej, której ekspresję można bezpiecznie prowadzić w komórkach roślinnych i zapewnienie tym komórkom odporności na choroby. Dalszym przedmiotem niniejszego wynalazku jest dostarczenie metody transformowania roślin, tak aby zachodziła w nich ekspresja oksydazy glukozowej, której ekspresję można bezpiecznie prowadzić w roślinach, i zapewnienie tym roślinom odporności na choroby.
Podsumowanie wynalazku
Nieoczekiwanie stwierdzono, że gen oksydazy glukozowej z Aspergillus niger można stosować do transformowania roślin, które są normalne pod względem rozwoju i oporne na atak patogenów. Dlatego też, przedmiotem niniejszego wynalazku jest dostarczenie użytecznych do wprowadzania do komórek roślinnych konstrukcji genetycznych zawierających gen oksydazy glukozowej Aspergillus (AGO). Innym przedmiotem niniejszego wynalazku jest dostarczenie stransformowanych, opornych na patogeny roślin zawierających taki materiał genetyczny.
Dodatkowo, rośliny można także transformować, aby zachodziła w nich koekspresja innych białek przeciwgrzybowych lub białek owadobójczych, na przykład stosując geny Bacillus thuringiensis (B.t.). Przykłady roślin tak stransformowanych, aby zachodziła w nich ekspresja genów B.t.. ujawniono w publikacji europejskiego opisu patentowego numer 0 38δ 962, która odpowiada opisowi patentowemu Stanów Zjednoczonych Ameryki numer kolejny 07/476 661, złożonemu 12 lutego 1990 r. [Fischhoff i in.], włączonej do niniejszego opisu poprzez odnośnik literaturowy. Gen B.t. można wprowadzić do rośliny według niniejszego wynalazku przez jednoczesną transformację, kolejne transformacje lub przez krzyżowanie.
Zgodnie z aspektem wynalazku, dostarcza się zrekombinowaną, dwuniciową cząsteczkę DNA, zawierającą w kolejności zdolnej do działania:
a) promotor, który działa w komórkach roślinnych powodując wytwarzanie sekwencji RNA; i
b) strukturalną sekwencję kodującą, która koduje wytwarzaną AGO;
178 652
c) 3'-końcowy region nie ulegający translacji, którydziala w komórkach roślinnych powodując dołączanie pukteytydaw pytirdepntywnch do kyńcó 3' sekwencji RNA.
Zgodnie z innym aspektem wynalazku, dykirjczr się metodę wntorjzrnir genetycznie straosformywóoych roślin, w których zachodzi ekspresjiapjzeciwpaiyeennnch ilości AGO, obejmują etapy:
a) wstawiania do genomu komórki jośtiooej zjekombinowanej, dwuoieiywej cząsteczki DNA, zawierającej:
(i) promotor, który działa w komórkach jośtiooych powodując wntwajzroie sekwencji
RNA;
(ii) st:rukturaton sekwencję kodującą, która koduje wytwarzaną AGO (iii) 3'-końcowy region nie ulegający translacji, który działa w rzeczonych komórkach roślinnych powodując dołączanie oukleoiydów pytiadeoytywych do końca 3' sekwencji RNA.
b) otrzymywania straokfyrmowaoych komórek rośtiooych; i
c) regeneracji ze kiraosformywaoych komórek roślinnych genetycznie kiraosformywanych roślin, w których zachodzi ekspresja hamującej ilości AGO.
Dostarcza się również, zgodnie z innym aspektem niniejszego wynalazku, straokfyrmowane rośliny, które zawierają DNA złożony z wymienionych powyżej elementów (i), (ii) i (iii).
W znaczeniu tu stosowanym, termin „oksydaza glukozowa Aspergillus” lub „AGO” oznacza oksydazę glukozowa naturalnie wniwarzaoą przez Aspergillus sp., bądź posiadającą > 80% homotogii, korzystnie > 90%, do takiego enzymu, na przykład enzymu kodowanego przez sekwencję o numerze identyfikacyjnym: 1.
W znaczeniu tu stosowanym, termin „zwalczanie uszkodzeń przez mikroorganizmy” oznacza powodowanie zmniejszenia uszkodzeń roślin uprawnych spowodowanych infekcją patogenem bakteryjnym lub grzybowym.
W znaczeniu tu stosowanym, termin „strukturalna sekwencja kodująca” oznacza sekwencję DNA kodującąpolipeptyd, który może być wytwarzany przez komórkę po iraoskrnpeji DNA na RNA, a następnie iraoklację pożądanego polipeptydu.
W znaczeniu tu stosowanym, termin „locus roślinne” oznacza obszar bezpośrednio otaczający roślinę i obejmujący roślinę i jej strefę korzeniową.
Szczegółowy opis wynalazku
Jedno rozwiązanie oioiejkzego wynalazku obejmuje białko wyizolowane z Aspergillus niger. Białko to, oznaczone AGO, oczyszczono do hymogeooości. Hamuje ooy wzrost ważnych z rolniczego punktu widzenia patogenów grzybowych, włącznie z Verticillum dahliae, jednym z najbardziej rozpowszechnionych i wyrządzających największe szkody patogenów roślin powodującym chorobę wielu roślin, Phytophthora infestans (Pi), patogenem będącym przyczyną zarazy ziemniaczanej ziemniaków i pomidorów-, Botryis cinera (BC), źródłem szarej pleśni na różnych owocach i warzywach, Septoria nodorum (Sn), czynnikiem przyczynowym plamistości łusek pszenicy, Pseudocercosporella herpotrichoides (Ph), czynnikiem przyeznoownm łamliwości liści pszenicy, i Gaeumannomyces gramininis var tritici (Ggt), czynnikiem przyczynowym zgorzeli podstawy źdźbła zbóż, w ilości tak małej, jak 50 ng w warunkach oznaczenia. Stwierdzono również, że hamuje ono Erwinia carotovora, ezyooik przyczynowy mokrej zgnilizny ziemniaków, choroby ziemniaków występującej po zbiorze. W oparciu o produkty aktywności enzymatycznej tego białka, δ-glukoootaktoo i nadtlenek wodoru, oczekuje się, że jest ooy zdolne do zwalczania wielu innych organizmów patogennych dla roślin. Każdy z tych produktów ubocznych jest toksyczny dla takich organizmów.
Metodą według niniejszego wynalazku można chronić wiele gatunków roślin. Na przykład, oioiejsznmi metodami można ochraniać przed patogenami roślin wiele owoców i warzyw, takich jak truskawki, ziemniaki i pomidory. Różne gatunki Phytophtora są patogenne dla wielu mnych roślin, takich jak drzewa owocowe lub roślin daroiywnch, a zatem również te rośliny można ochraniać metodami według niniejszego wynalazku. Ponadto, niniejszymi metodami można ochraniać rośliny pszenicy i jęczmienia przed Ggt, Sn i Ph.
178 652
Jak stwierdzono powyżej, białka o aktywności przeciw mikroorganizmom według niniejszego wynalazku można stosować łącznie z innymi białkami przeciwgrzybowymi, tak aby zapewnić szerokie spektrum aktywności, tj. zwalczanie dodatkowych patogenów i/lub zapewnić wiele sposobów działania dla hamowania tego samego patogenu grzybowego. Źródłami takich innych białek przeciwgrzybowych mogąbyć mikroorganizmy, takjak białek według niniejszego wynalazku, lub mogąbyć nimi rośliny. W literaturze donoszono o wielu takich genach przeciwgrzybowych.
Chociaż AGO będzie działać chroniąc rośliny przed atakiem patogenów w obecności naturalnie występujących poziomów glukozy, może być pożądane dostarczenie inwertazy, która będzie powodować hydrolizę sacharozy, uwalniając zatem dodatkową glukozę, na którą może działać AGO. Inwertazą będzie korzystnie inwertaza ze ściany komórkowej, taka jak z drożdży (europejski opis patentowy numer 0 442 592, Willmitzer i in., 1991, także australijski opis patentowy numer Au 70898/91) lub enzym z wakuoli, taki jak z ziemniaków lub innych roślin. W tych dwóch przypadkach można użyć naty wnąsekwencję sygnałową; jednakże, może być korzystne odizolowanie inwertazy dokąd nie będzie potrzebna w przestrzeni pozakomórkowej lub nie wytwarzanie dokąd nie będzie potrzebna. Pierwsząmożliwość można zrealizować przez użycie sekwencji sygnałowej, która będzie kierować enzym do przestrzeni pozakomórkowej. Jedną taką sekwencjąsygnałowąjest sekwencja sygnałowa inhibitora proteaz z ziemniaka (Keil i in., 1986; Nelson i in., 1980). W ograniczaniu ekspresji inwertazy do momentu aż jest ona potrzebna do wytwarzania glukozy jako substratu AGO mógłby być użyteczny promotor, który jest aktywny tylko w wyniku infekcji patogenem.
Podczas przechowywania, gdy infekcja Erwinia może powodować utratę całych pojemników, bulwy ziemniaków będą naturalnie zawierać glukozę z rozkładu skrobi. Dlatego też, dla ochrony przed mokrą zgnilizną nie jest pożądane ani potrzebne włączanie genu inwertazy.
OZNACZENIA SKUTECZNOŚCI BIOLOGICZNEJ IN VITRO
Oznaczenia aktywności przeciwgrzybowej
Oksydazę glukozowąz Aspergillus niger można otrzymać z Sigma Chemical Co. (St. Louis, nr kat. G-7141). Użyto jej do testowania in vitro aktywności wobec kilku organizmów.
Testy wobec Pi i Bc przeprowadzono w podłożu #303, przygotowanym w następujący sposób: jeden litr zawiera 1 gMgS(04-7H20; 2 gKH2PO4,0,5 gNaCl, 1gCaCO3,1 ml roztworu podstawowego ZnSO4 · 7H20 o stężeniu 1 mg/ml, 1 ml roztworu podstawowego FeSO4 · 7H2O o stężeniu 1 mg/ml, 0,5 ml roztworu podstawowego FeEDTA o stężeniu 100 mM, 20 g Maltrin M-100,20 g kazeiny, 5 g ekstraktu drożdżowego, 5 g glukozy, 3,02 g Pipes, 10 mM, pH doprowadzono do 6,5 i wyjałowiono przez sączenie. Testy wobec Ggt przeprowadzono w dwukrotnie rozcieńczonym PDA (Difco). Testy wobec Ph przeprowadzono w CDAA. 1% podłoża przygotowano w następujący sposób: 35 g/litr bulionu Czapka Doxa (Difco), 1 g/litr proliny, 500 mg/litr asparaginy, 500 mg/litr cysteiny i 1 g/litr agaru autoklawowano w ciągu 23 minut i dodano wyjałowione przez sączenie witaminy (1 ppm tiaminy i 1 ppm biotyny).
Bc i Pi testowano w oznaczeniu płynnym w płytkach 96-studzienkowych. Bc stosowano w ilości 5 x 102 zarodników na studzienkę i umożliwiano inkubację w temperaturze 20°C w ciągu 24-48 godzin. Pi zaszczepiano w ilości 5 x 103 zarodni na studzienkę i inkubowano w temperaturze 18°C w ciągu 24-48 godzin. Ocenę wzrostu przeprowadzano przez pomiar OD przy długości fali 595 nm. Wzrost Pi był w 90% hamowany przy tak niskich stężeniach, jak 3 x 10'5 IU/pl. Wzrost Bc był w 95% hamowany w stężeniu 0,001 IU/pl.
Aktywność wobec Gaeumannomyces oceniano na płytkach ze stałym podłożem agarowym. Kawałki agaru o powierzchni około 0,5 cm2 mocno przerośnięte grzybem umieszczano w środku płytek z dwukrotnie rozcieńczonym PDA i umożliwiano wzrost w ciągu kilku dni w temperaturze 22°C. W odległości 1 cm od granicy wzrostu aseptycznie usunięto korkoborem kawałek agaru o średnicy 0,5 cm. Do tych studzienek dodawano bezpośrednio jałowy roztwór podstawowy AGO. Widoczna strefa hamowania pojawiała się przy ilościach tak niskich, jak 0,02 IU/studzienkę.
Testy wobec Ph przeprowadzono w 96-studzienkowych płytkach. 14-dniowe hodowle Pseudocercosporella herpotrichoides var tritici na płynnym agarze stosuje się do sporządzenia
178 652 zawiesiny zarodników. Płytkę zalewa się 5-10 ml 0,1% podłoża CDAA i zarodniki miesza się w podłożu płynnym przez ostrożne zawirowanie. Stężoną zawiesinę zarodników pobiera się pipetą i dodaje do całkowitej objętości CDAA wymaganej do testu, doprowadzając stężenie zarodników do 100 000 zarodników/ml. Inkubację podczas oznaczenia przeprowadza się w temperaturze 24°C w ciemności.
Zawiesinę zarodników rozmieszcza się w ilości 50 pl/studzienkę w 96-studzienkowej płytce do mikromiareczkowania. Następnie płytki te umieszcza się w inkubatorze (10 godzin/dzień światła w temperaturze 12°C) na 24 godziny przed zastosowaniem próbki. 50 pl próbki dodaje się do 50 pl inokulum (przygotowanego 24 godziny wcześniej), co daje całkowitą objętość w studzience 100 pl/traktowanąstudzienkę/powtórzenie. Płytki do oznaczania inkubuje się w ciągu 48 godzin i wyniki oznacza się przez odczyt gęstości optycznej (OD) czytnikiem płytek do mikromiareczkowania BioRad, model 3550, przy pojedynczej długości fali 595 nm. Odczytu OD dokonuje się w czasie zero (t„), to jest bezpośrednio po dodaniu próbki i 48 godzin po dodaniu próbki 0ή8). Oceny wzrostu grzyba dokonuje się na podstawie różnic odczytów OD pomiędzy t0 i t^ pomnożonych przez wartość obliczeniową biomasy grzybowej. (Wartość obliczeniowa biomasy grzybowej jest zależnościąpomiędzy wzrostem grzyba, a gęstością optyczną i określono jąw oddzielnych doświadczeniach. Zależność pomiędzy wzrostem grzyba, a gęstością optyczną określono namnażając grzyby w 96-studzienkowych płytkach do miareczkowania i zbierając grzybnię w czasie, co 0,1 jednostki absorbancji. Wartość obliczeniową otrzymuje się z liniowej zależności pomiędzy biomasą grzybową a OD dla konkretnego grzyba. Jest to wartość nachylenia otrzymana z zależności liniowej. Wartość obliczeniowa dla Ph wynosi 4,91). Następnie określa się procent hamowania z różnicy pomiędzy biomasami prób traktowanych i kontrolnych. AGO wykazywała 60% hamowania Ph w stężeniu 1,7 x 10*4 IU/pl.
Testy wobec Sn przeprowadzono zasadniczo podobnie jak te dla Ph, z wyjątkiem przygotowywania zawiesiny zarodników. Do przygotowania zawiesiny zarodników używa się siedmiodniowych zarodnikujących hodowli Septoria nodorum na podłożu agarowym YMA. Małąilość (< 1 ml) podłoża CDAA nakrapla się na powierzchnię hodowli z masąróżowych zarodników wydostających się z pyknidiów. Zarodniki miesza się z podłożem CDAA przez ich powtarzane wciąganie i wypuszczanie z pipety. Stężoną mieszaninę dodaje się do całkowitej objętości CDAA wymaganej do testu, doprowadzając stężenie zarodników do 50 000 zarodników/ml. Wartość obliczeniowa dla Sn wynosi 0,508. AGO wykazywała,60% hamowania Sn w stężeniu 1,7 x 10'4 IU/ml.
Oznaczenie aktywności przeciwbakter-yjnej
Hodowle bakterii Erwinia carotovora utrzymuje się przez posiew ezą na płytkach PDA i inkubację w temperaturze 24°C w ciemności. W celu przygotowania bulionu inokulacyjnego, ezę aktywnie rosnących bakterii (5-9-dniowych) dodaje się do 50 ml czterokrotnie rozcieńczonego bulionu PD w kolbie Erlenmeyera o objętości 125 ml. Kolbę umieszcza się na wytrząsarce inkubacyjnej (130 obrotów na minutę) w temperaturze 24°C w ciemności. Po 24 godzinach bakterie się osadza, ponownie zawiesza w jałowej wodzie dejonizowanej, i trzy lub cztery próbki o objętości 100 pl umieszcza w studzienkach 96-studzienkowych płytki do mikromiareczkowania do odczytu. Czytnik mikropłytek ustawia się na długość fali 595 nm i określa się średnią gęstość optyczną studzienek. Tę wartość absorbancji (ABS = gęstość optyczna) stosuje się w następującym wzorze do obliczania jednostek koloniotwórczych (CFU) zawartych w bulionie.
CFU = (3 x 106) + [(3 x 108) x ABS] + [(5 x 108) ABS2]
Do stosowania bulion doprowadza się do 105 CFU.
AGO całkowicie znosiła wzrost E. carotovora w stężeniach tak niskich, jak 3 x 10'5 IU/pl.
Identyfikacja enzymu
Do wykrywania wytwarzania białka w układzie heterologicznym, takim jak komórki roślinne, można stosować liczne metody. Techniki blottingu typu Western można stosować do wykrywania białka immunologicznie, lub można zastosować oznaczenia enzymatyczne lub biologiczne do wykrywania aktywności białka.
178 652
Oznaczenie enzymatyczne oksydazy glukozowej
Do określenia aktywności GO wykorzystano modyfikację ciągłego oznaczenia spektrofotometrycznego (Frederick i in., 1990). Jako kontrolę dodatnią stosowano GO Aspergillus niger (Sigma). Mieszanina reakcyjna składała się z 20 pg/ml peroksydazy z chrzanu (Sigma), 0,32 mM roztworu o-dianizydyny stabilizowanego Tritonem Χ-100 (Sigma) i 0,1 M glukozą w 75 mM buforze fosforanów sodowych (pH 5,0). Do tej mieszaniny dodawano 100 pl różnych stężeń GOJ. niger dla reakcji kontrolnych lub 100 pl próbki pochodzącej ze źródła heterologicznego. Oznaczenie to prowadzono w temperaturze pokojowej i monitorowano wzrost absorbancji przy długości fali 460 nm.
Kolejne oznaczenie oksydazy glukozowej, wykorzystujące odczynnik 4-amino-antypirynę (4-AAP), zoptymalizowano w oparciu o Galio, 1981. 5X odczynnik 4-AAP przygotowuje się w objętości całkowitej 10 ml z 0,68 g KH2PO4, 8,3 mg 4-AAP (0,82 mM), 25 pl Tritonu Χ-100, 0,0658 krystalicznego fenolu i 1000 U peroksydazy z chrzanu, z pH doprowadzonym do 5,0 KOH. Oznaczenie przeprowadza się przez zmieszanie 200 pl tego odczynnika 4-AAP, 5 pl 1 mM FAD, 50 pl 1M glukozy i testowanej próbki (do 750 pi). Wynik odczytuje się jako OD przy fali o długości 508 nm.
Oznaczenie aktywności biologicznej oksydazy glukozowej „Korek” 4-6-dniowego grzyba Ggt przenoszono na płytki z czterokrotnie rozcieńczonym agarem ziemniaczano-dekstrozowym (Difco). Grzyb hodowano w temperaturze 22°C w ciągu czterech dni, lub dopóki nie uzyskano wzrostu o średnicy 2,5 cm. Używając jałowego korkobora, w agarze zrobiono studzienki w odległości 1 cm od kolistej strefy wzrostu i umieszczano w nich 100 pl buforu lub próbki pochodzącej ze źródła heterologicznego. Grzyb hodowano w ciągu 24 godzin w temperaturze pokojowej i sprawdzano pod kątem hamowania wzrostu.
Immunologiczne wykrywanie oksydazy glukozowej
Poliklonalne przeciwciała skierowane przeciw oksydazie glukozowej wytwarzanej przez Aspergillus niger są komercyjnie dostępne z wielu źródeł, na przykład Rockland, Inc., Gilbertsville, Pensylwania.
TRANSFORMACJA GENETYCZNA
Klonowanie genu AGO
Z Aspergillus niger (ATCC 9029) wyizolowano całkowity DNA i zastosowano jako matrycę do izolacji genu oksydazy glukozowej z wykorzystaniem PCR. Startery PCR były oparte na opublikowanej sekwencji genu (Frederick i in.; Kriechbaum i in.) i zaprojektowano je do wyizolowania całej sekwencji genu, włącznie z sekwencją sygnałową. Ponadto, w celu ułatwienia wbudowywania tego genu do wektorów odpowiednich do ekspresji w heterologicznych układach bakteryjnych, bakulowirusowych i roślinnych, 5'-końcowy starter PCR (sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 3) wprowadził przed kodonem startu AGT translacji genu miejsca endonukleaz restrykcyjnych Xbal i Bglll. 3'- końcowy starter PCR (sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 4) wprowadził miejsca endonukleaz restrykcyjnych BamHI i KpnI bezpośrednio po kodonie stop. Wytworzony fragment PCR sklonowano w pUC 118 w postaci fragmentu Xbal/Kpnl, z utworzeniem pMON22514 i w pełni go zsekwencjonowano. Sekwencja (sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 1) dokładnie pokrywała się z sekwencją opublikowaną. Sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 2 jest odpowiadającą sekwencją aminokwasową.
Konstruowanie genu roślinnego
Ekspresja genu roślinnego, który występuje w postaci dwuniciowego DNA obejmuje transkrypcję matrycowego RNA (mRNA) z jednej nici DNA przez enzym polimerazę RNA, i następnie procesowanie pierwotnego transkryptu mRNA wewnątrz jądra. Procesowanie to dotyczy 3'-końcowego regionu nie ulegającego translacji i polega na dodaniu nukleotydów poliadenylowych do końca 3' mRNA. Transkrypcja DNA na mRNA jest regulowana przez region DNA zazwyczaj określany jako „promotor”. Region promotora zawiera sekwencję zasad, która daje sygnał polimerazie RNA do związania się z DNA i rozpoczęcia transkrypcji mRNA z wykorzystaniem jednej z nici DNA jako matrycy w celu utworzenia odpowiadającej nici RNA.
178 652
W literaturze ypikaoy liczne promotory, które są aktywne w komórkach roślinnych. Obejmują one promotory kyotazy nopalinowej (NOS) i syntazy oktopinowej (OCS) (które znajdują się na plazmidach indukujących nowotwory Agrobacterium tumefaciens), promotory 19S i 35S wirusa mozaiki kalafiora (CaMV), promotor 35S wirusa mozaiki trędowoika (FMV) i indukowany światłem promotor małej podjednostki karbaksylazy rnbulozo-1,5-bisfosforaoowej (ssRUBISCO, bardzo powszechny polipepiyd roślinny). Wszystkie z tych promotorów siosowroo do tworzenia różnych typów konstrukcji DNA, które ulegały ekspresji w roślinach. Zastosowania takie ujawnia opis patentowy Stanów Zjednoczonych Ameryki numer 5 034 322 (Fraley i in., 1991), włączony do niniejszego opisu poprzez odnośnik literaturowy.
Istnieją znane promotory które będą ograniczać ekspresję do poszczególnych części roślin w odpowiedzi na poszczególne bodźce. Na przykład, promotory specyficzne dla bulw ziemniaków, takie jak promotory patatyny lub promotory dużej i małej podjednostek pirofosforntrzy ADP-glukozy, można zastosować do uzyskania ekspresji przede wszystkim w bulwach, a zatem łącznie z AGO zapewniają one odporność na ataki w bulwach, takie jak przez Erwinia. Promotor specyficzny dla owoców byłby pożądany do nadania odporności na Botrytis truskawkom lub winogronom. Promotor specyficzny dla korzeni byłby pożądany do uzyskania ekspresji AGO w pszenicy i jęczmieniu dla zapewnienia odporności na Ggt. Specjalista w tej dziedzinie będzie znał wiele takich promotorów specyficznych dla części roślin, które mogłyby być użyteczne w niniejszym wynalazku.
Alternatywnie, promotory wykyrzysiywaoe w cząsteczkach dwuoiciownch DNA można wybierać w celu uzyskania specyficznej ekspresji AGO w odpowiedzi na infekcję grzybową. Infekcja roślin patogenami grzybowymi wyzwala indukcję szerokiego szeregu białek, nazywanych białkami związanymi z obroną lub związanymi z patogenezą (PR) [Bowles; Boi i in.; Liothorkt]. Takie geny związane z obroną lub PR mogą kodować enzymy metabolizmu feonloprypiyoiaoywego (takie jak amoniako-liaza feoytorlaoioowa, kyotaza ehalkyoowa, ligaza 4-kumaran:CoA, 4-hydroksytaza kwasu kumarnoowego), białka, które modyfikują ściany komórek roślinnych (takie jak glikyproieioy bogate w hydryksyprolioę, białka bogate w glicynę, peryksndazy), enzymy (takie jak chitnoazy i glukaoazy), które degradują ścianę komórek grzybowych, białka podobne do ^^Ψοι lub białka o nieznanej dotąd funkcji. Geny związane z obroną lub PR izolowano i charakteryzowano z licznych gatunków roślin. Promotory tych geoów można stosować do uzyskania ekspresji AGO w roślinach iraosgeoiczoych po wywołaniu infekcji patogenem, szczególnie patogeoem grzybowym, takim jak Pi. Promotory takie mogąpochodzić z genów związanych z obroną lub PR izolowanych z samych ziemniaków [Fritzemeier i in.; Cuyperk i in.; Logemaon i in.; Mattoo i Briskyn; Taylor i io.; Matton i io.; SchOder i io.]. W celu umieszczenia geou AGO pod kontrolą promotora indukowanego przez infekcję P infestans, korzystny może być promotor opisany przez Taylora i io. (1990).
Konkretny wybrany promotor powinien być zdolny do powodowaoia dostatecznej ekspresji sekwencji kodującej enzym, a w rezultacie do wytwarzania skutecznej ilości AGO.
Prymotorn stosowane w konstrukcjach DNA (tj. chimerycznych geoach roślinnych) według niniejszego wyoalazku można, jeśli jest to pożądane, modyfikować, aby wpływać oa ich właściwości kontrolujące. Na przykład, promotor 35S CaMV można zligować z częścią geou ssRUBISCO, która hamuje ekspresję ssRUBISCO w oieobecności światła, tworząc promotOr, który jest aktywny w liściach, ale oie w korzeniach. Otrznmaon promotor chimeryczny można stosować w sposób tu opisany. Do celów tego opisu, termin promotor „CaMV” obejmuje zatem warianty promotora 35S CaMV, tj. promotory otrzymane w wyniku ligacji z regionami operatorowymi, losową lub kyotrolywaoą mutagenezę, itp. Ponadto, promotory można tak zmieniać, aby zawierały wielokrotne „sekwencje wzmacniające” wspomagające podwyższanie ekspresji geou. Przykłady takich sekweocji wzmacniających zostały podane przez Kaya i io.
Wzmocniony promotor 35S CaMV skonstruowano w następujący sposób. Fragment promotyra 35S CaMV zawarty pomiędzy pozycjami -343 a +9 skonstruowano uprzednio w pUC13
[Odell i in.]. Odcinek ten zawiera region zidentyfikowany jako konieczny do maksymalnej ekspresji promotora 35S CaMV. Wncięty go w postaci fragmentu Ctal-HιodIlt, wykonago tępe koń178 652 ce polimeraząDNA I (fragment Clal) i wstawiono do miejsca HincII pUCl 8. Ten region leżący przed promotorem 35S wycięto z plazmidu w postaci fragmentu HindIII-EcoRI (rozciągającego się od pozycji -343 do -90) i wstawiono do tego samego plazmidu między miejsca HindIII i Pstl. Wzmocniony promotor 35S CaMV (dalej w niniejszym opisie „E35S CaMV”) zawiera zatem duplikację sekwencji pomiędzy -343 a -90 [Kay i in.].
RNA wytwarzany przez konstrukcję DNA według niniejszego wynalazku zawiera także 5'-końcową nie ulegającą translacji sekwencję liderową. Sekwencja ta może pochodzić z promotora wybranego do ekspresji genu, i można ją specyficznie zmodyfikować, tak aby zwiększyć translację mRNA. 5'-końcowe regiony nie ulegające translacji można także otrzymać z wirusowych RNA, z odpowiednich genów eukariotycznych lub z sekwencji syntetycznego genu. Niniejszy wynalazek nie ogranicza się do konstrukcji, w których region nie ulegający translacji pochodzi z 5'-końcowej sekwencji nie ulegającej translacji, która towarzyszy sekwencji promotora. Raczej, nie ulegająca translacji sekwencja liderowa może pochodzić z odmiennego promotora lub sekwencji kodującej. Na przykład, lider taki zawiera białko szoku cieplnego 70 (Hsp70) petunii. [Winter]
Jak stwierdzono powyżej, 3'-końcowy region nie ulegający translacji chimerycznych genów roślinnych według niniejszego wynalazku zawiera sygnał poliadenylacji, który działa w roślinach powodując dołączanie nukleotydów adenylowych do końca 3' RNA. Przykładami regionów 3'-końcowych są(l) 3'-końcowe, ulegające transkrypcji, nie ulegające translacji regiony zawierające sygnał poliadenylacji genów plazmidów indukujących nowotwory (Ti) Agrobacterium, jak gen syntazy nopalinowej (NOS), i (2) geny roślinne, jak geny białka zapasowego 7s soi i gen E9 ssRUBISCO grochu [Fischhoff, i in.].
Transformacja roślin i ekspresja
Chimeryczny gen roślinny zawierający strukturalną sekwencję kodującą według niniejszego wynalazku można wstawić do genomu rośliny jakąkolwiek odpowiednią metodą. Odpowiednie wektory transformujące rośliny obejmują te pochodzące z plazmidu Ti Agrobacterium tumefaciens, jak również te ujawnione np. przez Herrera-Estrella 1983), Bevana (1983), Klee (1985) i w publikacji europejskiego opisu patentowego numer 0120516 (Schilperoort i in). Poza wektorami transformującymi rośliny z plazmidów Ti lub plazmidów wywołujących chorobę włosowatości korzeni (Ri) Agrobacterium, do wstawiania konstrukcji DNA według tego wynalazku do komórek roślinnych można zastosować alternatywne metody. Metody takie mogą na przykład obejmować zastosowanie liposomów, elektroporację, środki chemiczne zwiększające pobieranie wolnego DNA, dostarczanie wolnego DNA przez bombardowanie mikropociskami i transformację z zastosowaniem wirusów lub pyłku.
Rośliny, które można ochraniać sposobem według niniejszego wynalazku obejmują, ale nie ograniczają się do ziemniaków, pomidorów, pszenicy, kukurydzy, truskawek, winogron, jak również różnych roślin ozdobnych. Dla wszystkich tych typów roślin dostępne są metody hodowli tkankowych i regeneracji roślin.
Krótkotrwała ekspresja oksydazy glukozowej w roślinach tytoniu
Szczególnie użytecznym plazmidowym wektorem kasetki do transformacji roślin dwuliściennych jest pMON999. Kasetka ekspresyjna pMON999 składa się z promotora E35S CamV i końca 3' obejmującego sygnały poliadenylacji z genu NOS. pMON999 zawiera miejsca BgllI, KpnI i EcoRI do wstawiania sekwencji kodujących i miejsca NotI-NotI flankujące kasetkę ekspresyjną genu roślinnego.
Zawierający region kodujący AGO fragment BgIII/KpnI pMON22514 wstawiono do pMON999 tworząc pMON22515. pMON22515 poddano elektroporacji do protoplastów tytoniu. Ekspresję oksydazy glukozowej przez stransformowane komórki tytoniu potwierdzono przez analizę poprzez blotting typu Western, jak również oznaczenia enzymatyczne.
178 652
Stabilna transformacja roślin dwuliściennych
Wektor wahadłowy dla AGO utworzono przez wycięcie z pMON22515 regionu kodującego AGO w postaci fragmentu BamHI/Bglll. Umieszczono go następnie w wektorze opartym na pUC, i otrzymany plazmid, pMON22579, zawiera promotor FMV, region kodujący AGO i koniec 3' włącznie z sygnałami poliadenylacji z genu NOS. Fragment NotI/NotI z tego wektora, zawierający promotor FMV, region kodujący AGO i koniec 3' genu NOS włącznie z sygnałem poliadenylacji przeniesiono do miejsca restrykcyjnego pMON17227 (światowy opis patentowy numer 92/0449, Barry i in.), tworząc ostateczny wektor Ti, pMON22587.
Jak dyskutowano powyżej, gen AGO może również ulegać w konkretnych częściach rośliny dzięki użyciu promotorów specyficznych tkankowo. Promotor patatyny ulega ekspresji przede wszystkim w bulwach ziemniaka. Fragment KpnI/XbaI, zawierający region kodujący AGO, wycięto z pMON22514 i wstawiono do opartego na pUC wektora zawierającego promotor 1.0 patatyny (Bevan i in., 1986) i koniec 3' włącznie z sygnałami poliadenylacji genu NOS, tworząc pMON22516. Fragment NotI pMON22516, zawierający promotor patatyny, region kodujący AGO i koniec 3' genu NOS włącznie z sygnałem poliadenylacji, przeniesiono następnie do miejsca restrykcyjnego NotI pMON17227, który opisano powyżej, tworząc wektor plazmidowy Ti, pMON22517.
Wektory te można wprowadzać do „rozbrojonego” Agrobacterium ABI i stosować do transformacji wycinków ziemniaków, pomidorów lub innych w hodowli tkankowej. Po selekcji pod kątem oporności na kanamycynę lub glifosat i regeneracji roślin, można uzyskać całe rośliny zawierające gen AGO. Ekspresję genu oksydazy glukozowej można potwierdzić przez analizę poprzez blotting typu Western, oznaczenie enzymatyczne lub oznaczenie biologiczne.
Ekspresja AGO przez stransformowane rośliny ziemniaka
Z bulw roślin ziemniaka, które stransformowano wektorem plazmidowym Ti pMON22517, wyekstrahowano białko i sprawdzono pod kątem obecności oksydazy glukozowej przez analizę poprzez blotting typu Western. W niektórych roślinach wykryto wysokie poziomy ekspresji oksydazy glukozowej. Te poziomy ekspresji potwierdzono przez oznaczenie enzymatyczne z użyciem układu 4-aminoantypiryny. Z kilku tych bulw wyekstrahowano całkowite białko przez zmielenie w 25 mM buforze fosforanowym, pH 7,0 + 5 mM EDTA + 100 mM KCl. Białko zatężono i przemyto 12,5 mM buforem fosforanowym, pH 7,0.
Białko wyekstrahowane z bulw, w których zachodziła ekspresja AGO, testowano wobec P. infestans w oznaczeniu na 96-studzienkowych płytkach w 12,5 mM buforze fosforanowym, pH 7,0. Wyniki przedstawiono w tabeli 1. Przy najwyższym testowanym poziomie białka, 21,2 (ig/ml, zarodniki Pi albo pozostawały niewykiełkowane, albo wzrost z zarodników był znacznie osłabiony w porównaniu z ekstraktami roślin kontrolnych, transformowanych „pustym” wektorem (pMON 17227) lub buforem.
Tabela 1
Traktowanie Hamowanie grzybów *
Kontrola z buforem 0
Kontrola z „pustym” wektorem 2
pMON22517, linia 9 3
pMON22517, linia 30 3
*Skala: 0 = brak hamowania, 1 = nieznaczne hamowanie, 2 = umiarkowane hamowanie, 3 = silne hamowanie.
Liście roślin ziemniaka stransformowanych wektorem plazmidowym Ti pMON22587 testowano pod kątem obecności AGO wykorzystując oznaczenia enzymatyczne. Wyniki podano w tabeli 2. Jak powyżej, rośliny ziemniaka stransformowane pMON 17227 użyto jako rośliny kontrolne transformowane „pustym” wektorem.
178 652
Tabela 2
Poziom ekspresji Aktywność oksydazy glukozowej6 Równoważnac
Numer linii (%) (U/10 ng x W4) (U/gŚM)
Rus. Bur. 0 0 0
22587-2 0,075 72,2 7,22
22587-3 0,150 126,4 12,64
22587-4 0,007 6,0 0,6
22587-12 0,125 88,2 8,82
22587-31 0,350 144,4 14,04
22587-32 0,350 121,0 12,10
22587-33 0,450 181,8 18,18
22587-34 0,003 1,2 0,12
a Poziom ekspresji wyrażano jako procent oksydazy glukozowej w całkowitym ekstrahowalnym białku liści.
b Aktywność oksydazy glukozowej w ekstraktach liści określano przez oznaczenie aktywności enzymatycznej i obliczano jako jednostki aktywności enzymu w białku całkowitym.
c Jednostki aktywności oksydazy glukozowej na gram świeżej masy tkanki liści (U/gŚM) obliczano z aktywności w całkowitym białku przeliczając 10 pg całkowitego białka na gram świeżej masy tkanki liści.
Liście roślin ziemniaka stransformowanych wektorem plazmidowym Ti pMON22587 testowano również pod kątem poziomów H2O2 przez wytrącanie chlorkiem tytanu. Stwierdzono, że w dwóch liniach liście miały dwu- lub czterokrotnie wyższe poziomy H2O2 niż liście niestransformowanych roślin kontrolnych.
Ziemniaki odporne na choroby
Bulwy, w których zachodziła ekspresja AGO, testowano wobec Erwinia carotovora w oznaczeniu na krążkach bulw. Bulwy z 34 linii stransformowanych pMON22517 testowano pod kątem odporności na uszkodzenia przez mokrą zgniliznę. Testowano również poziomy ekspresji w liniach przez analizę poprzez blotting typu Western. Bulwy wyjałowiono powierzchniowo zgodnie z metodą Yanga i in. (1989). Dwie lub trzy bulwy z każdej linii aseptycznie pocięto na krążki o grubości 7-10 mm, otrzymując od sześciu do dwudziestu krążków z każdej linii. Krążki umieszczono na zwilżonej jałowej bibule filtracyjnej Whatman #1 w szalkach Petri'ego. Środek każdego krążka zaszczepiono 50 000 CFU bakterii w 10 pl. Krążki utrzymywano w środowisku o wysokiej wilgotności w ciągu 3 dni w temperaturze 23°C. Oceny choroby obejmowały pomiar długości, promienia i głębokości powstałych uszkodzeń. Rozcieńczenia zmacerowanej tkanki z rejonów uszkodzeń zastosowano do określenia końcowej liczby bakterii na uszkodzenie. Wyniki tego oznaczenia przedstawiono w tabeli 3. Dla linii, które okazały się najbardziej chronione, wszystkie z mierzonych parametrów były lepsze niż te dla bulw kontrolnych transformowanych „pustym” wektorem i buforem. Bulwy, dla których stwierdzono ekspresję AGO na najwyższym poziomie, na ogół mają najniższy poziom bakterii w uszkodzeniach.
Tabela 3
Numer linii Poziomy ekspresji6 CFU x 109
1 2 3
Kontrola z buforem ZERO 16,76
Kontrola z „pustym” wektorem ZERO 14,32
22517-10 ZERO 20,7
178 652
tabela 3 (ciąg dalszy)
1 2 3
22517-24 ZERO 20,09
22517-13 ZERO 16,3
22517-12 ZERO 19,26
22517-9 NISKI 9,34
22517-28 NISKI 13,56
22517-33 NISKI 9,57
22517-14 NISKI 8,22
22517-17 NISKI 8,36
22517-19 NISKI 9,37
22517-32 NISKI 7,17
22517-20 NISKI 7,4
22517-21 NISKI 6,25
22517-34 NISKI 4,44
22517-11 NISKI 3,06
22517-8 NISKI 1,5
22517-7 ŚREDNI 12,88
22517-31 ŚREDNI 12,06
22517-1 ŚREDNI 7,54
22517-15 ŚREDNI 6,7
22517-25 ŚREDNI 12,25
22517-35 ŚREDNI 6,81
22517-2 ŚREDNI 3,52
22517-3 ŚREDNI 1,26
22517-5 ŚREDNI 1,4
22517-6 WYSOKI 15,74
22517-18 WYSOKI 2,675
22517-26 WYSOKI 4,55
22517-29 WYSOKI 4,35
22517-4 WYSOKI 4,2
22517-30 WYSOKI 3,92
22517-16 WYSOKI 1,12
22517-23 WYSOKI 2,67
22517-36 WYSOKI 0,855
a CFU = jednostki koloniotwórcze b Poziomy ekspresji określone przez analizę poprzez blotting typu Western
178 652
Liście z roślin stransformowanych pMON22587 i w których zachodziła ekspresja AGO testowano pod kątem oporności na Pi. W pełni rozwinięte liście (-20 cm2) zaszczepiono przez dodanie kropelkami 100 pl zawiesiny zarodni Phytophthora infestans na środek odosiowej powierzchni liścia. Inokula miały gęstość 105-106 zarodni na ml, zebranych z 2-3 -tygodniowych płytek zawierających podłoże LB-V8. Zaszczepione liście utrzymywano w płytkach Nunc Bio-Assay (243 x 243 x 18 cm), zapewniając wilgotność przez umieszczenie na dnie wilgotnej bibuły filtracyjnej i inkubowano w komorze hodowlanej w temperaturze ~19°C z 16-godzinnym fotoperiodem. Obserwowano rozwój objawów i zainfekowane obszary na liściach mierzono przez nałożenie na każdy liść przezroczystej siatki δ mm x δ mm. Dla każdej linii liści obliczono średnią zainfekowanej powierzchni i odchylenie standardowe.
Transgeniczne linie, w których zachodziła ekspresja AGO, wykazywały znaczące osłabienie objawów powodowanych przez infekcję Phytophthora infestans na liściach. Wyniki z dwóch linii przedstawiono w tabeli 4. Obniżenie objawów wynosiło 47 i 57 procent w porównaniu z kontrolami (zarówno niestransformowaną, jak i transformantów „pustym” wektorem).
Tabela 4
Powierzchnia infekcjia (cm2)
Numer linii 3 dpzb 4 dpz δ dpz 6 dpz
Russet Burbank 1,2 2,1 4,2 7,1
17227-1c 1,6 2,7 4,7 8,7
22587-3d 0,4 0,8 1,1 3,0
22587-12d 0,δ 1,3 2,3 3,7
a Powierzchnię infekcji podano jako średnią dla pięciu liści.
b „ .
Dni po zaszczepieniu.
c Linia kontrolna stransformowana tylko wektorem.
d Linie transgeniczne, w których zachodzi ekspresja oksydazy glukozowej.
Stabilna transformacja roślin jednoliściennych
Do transformacji jednoliściennych skonstruowano wektor z AGO i intronem szczególnie użytecznym w zwiększaniu częstości otrzymywania roślin stransformowanych, w których zachodzi ekspresja pożądanego białka na wysokim poziomie. Zastosowano intron hsp70, ujawniony w europejskim opisie patentowym numer 602 193 (odpowiednik opisu patentowego Stanów Zjednoczonych Ameryki numer kolejny 08/1821 364, Brown i in., włączonym do niniejszego opisu poprzez odnośnik literaturowy). Ujawniony w nim pMON19477 strawiono, a następnie fragment BgHI-BamHI o długości 800 bp, zawierający intron hsp70, sklonowano w unikalnym miejscu BgIII w pMON22515, otrzymując pMON22623.
pMON22623 wprowadzono do komórek pszenicy przez bombardowanie mikropociskami stosując znane metody (Vasil i in.).
Po uzyskaniu stransformowanych roślin, ich zdolność do wykazywania odporności na grzyby, szczególnie na Gtg, oceniana będzie znanymi metodami.
Wszystkie publikacje i opisy patentowe wymienione w tym opisie włączono do niego poprzez odnośniki literaturowe, jak gdyby wyraźnie i pojedynczo stwierdzono, że każda pojedyncza publikacja lub opis patentowy jest włączona poprzez odnośnik literaturowy.
Na podstawie powyższego opisu będzie widoczne, że ten wynalazekjest dobrze przystosowany do osiągnięcia wszystkich przedstawionych powyżej celów i przedmiotów wraz z zaletami, które są oczywiste i właściwe dla wynalazku.
178 652
Będzie zrozumiałe, że pewne cechy i subkombinacje sąużyteczne i można je wykorzystywać bez odniesienia do innych cech i subkombinacji. Jest to przewidziane i pozostaje w zakresie zastrzeżeń.
Ponieważ można dokonać wielu możliwych rozwiązań wynalazku bez wychodzenia poza jego zakres, powinno być zrozumiałe, że wszystkie wymienione tu lub przedstawione na dołączonych rysunkach treści należy interpretować w znaczeniu ilustrującym, a nie w znaczeniu ograniczającym.
PIŚMIENNICTWO
Barry, G.F., G. Kishore i S.R. Padgette. „Glyphosate Tolerant 5-Enolpyruvylshikimate-3phosphate Synthases.” zgłoszenie PCT światowego opisu patentowego numer 92/04449,1991.
Bevan, M. i in. Nature. 304: 184, 1983.
Bevan, M. i in. Nucleic Acid Research. 14: 4625, 1986.
Bol, J. i in. Ann Rev of Phvtopathol.. 28: 113-138, 1990.
Bowles, D. Ann Rev of Biochem.. 59: 873-907, 1990.
Cuypers, B. i in. Mol Plant-Microbe Interactions. 1: 157-160, 1988.
FischolF, D. A. i Perlak, F. J. „Synthetic plant genes and method for preparation.” Publikacja europejskiego zgłoszenia patentowego numer 0 385 962, 1990.
Frederick, K. i in. J. Biol. Chem.. 265: 3793-3802.
Fritzemeier, K. i in. Plant Physiol. 85: 34-41, 1987.
Gallo. Methods in Enzymology. 71: 665-668, 1981.
Herrera-Estrella, L. i in. Nature. 303, 20-9, 1983.
Kay, R. i in. Science. 236: 1299-1302, 1987.
Keil, M. i in. Nucleic Acids Res.. 14: 5641-5650, 1986.
Klee, H.J. i in. Bio/Technology. 3: 637-642, 1985.
Kim, K. i in. Phytopathology. 78: 488-492, 1988.
Kim, K. i in. Can. J. Microbiol.. 36: 199-205, 1990.
Kriechbaum M. i in. FEBSLett. 255: 63-66, 1989.
Linthorst, H.J.M. Crit Rev Plant Sci. 10: 123-150.
Logemann, J. i in. Plant Cell. 1: 151-158, 1989.
Matton, D. i Brisson, N. Mol Plant-Microbe Interactions. 2: 325-331, 1989.
Matton, D. i in. Plant Mol Biol. 14: 863-865, 1990.
Nelson, C. i in. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 77: 1975-1979, 1980.
Odell, J. i in., Nature. 313: 810, 1985.
Schroder, M. i in. Plant J. 2: 161-172, 1992.
Taylor, J., i in. Molecular Plant-Microbe Interactions. 3: 72-77, 1990.
Vasil i in. Bio/Technology 11: 1153-1158, 1993.
Winter i in. Mol. Gen. Genet. 221(2): 315-19, 1988.
178 652
LISTA SEKWENCJI (1) INFORMACJA OGÓLNA:
(i) ZGŁASZAJĄCY:
(A) NAZWA: Monsanto Company (B) ULICA: 800 North Lindbergh Boulevard (C) MIEJSCOWOŚĆ: St. Louis (D) STAN: Missouri (E) KRAJ: STANY ZJEDNOCZONE AMERYKI (F) KOD POCZTOWY (ZIP): 63198
(G) TELEFON: (314)537-7286
(H) TELEFAX: (314)537-6047
(ii) TYTUŁ WYNALAZKU: METODA ZWALCZANIA PATOGENÓW ROŚLINNYCH
(iii) LICZBA SEKWENCJ-1 : 4
(iv) ZAPIS KOMPUTEROWY:
(A) TYP NOŚNIKA: Dyskietka (B) KOMPUTER: kompatybilny z IBM PC (C) SYSTEM OPERACYJNY-: PC-DOS./MS-DOS (D) OPROGRAMOWANIE: Patentln Release #1.0, wersja #1.25 (EPO) (vi) DANE DOTYCZĄCE UPRZEDNIEGO ZGŁOSENIA;
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: US 08/161041 (B) DATA ZŁOŻENIA: 24 listopada 1993 (2) INFORMACJA O SEKWENCJI O NUMERZE IDENTYFIKACYJNYM 1:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWECJI:
(A) DłUGOŚĆ: 1848 par zasad
(B) TYP: kwas nukleinowy
(C) ILOŚĆ NICI :: dwie
(D) TOPOLOGIA: liniowa
178 652 (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: DNA (genomowy) (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: CDS (B) POŁOŻENIE: 16...1833 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEKWENCJA O NUMERZE
IDENTYFIKACYJNYM 1:
TCTAGAAGAT CTATC ATG CCAG ACT CTC CTT GTG AGC TCG CTT GTG GTC TCC 51
Met Gln Thr Leu Leu Val Ser Ser Leu Val Val Ser
1 5 10
CTC GCT GCG GCC CTG CCA CAC TAC ATC AGG AGC JAT GGC ATT GAA GCC 99
Leu Ala Ala Ala Leu Pro His Tyr Ile Arg Ser Asn Gly Ile Glu Ala
11 20 21
AGC Ser CTC Leu 30 CTG Leu ACT GAT CCC AAG Lys 33 GAT GTC TCC GGC CGC ACG GTC GAC TAC Tyr 144
Thr Asp Pro Asp Val Ser Gly Arg 44 Thr Val Asp
ATC ATC G GC GGT GGA GGT CTG ACT GGA CTC ACC ACG CCG CCT GTG CTG 191
Ile 41 Ile Ala Gly Gly Gly 50 Leu Thr Gly Leu Thr 55 Thr Ala Ala Arg Leu 60
ACG GAG AAC CCC AAC ATC AGT GTG CTC GTC ATC GAA AGT GGC TCC TAC 244
Thr Glu Asn Pro Asn 61 Ile Ser Val Leu Val 70 Ile Glu Ser Gly Ser 70 Tyr
GAG TCG GAC AGA GGT CCT ATC ATT GAG GAC CTG AAC GCC TAC GGC GAC 221
Glu Ser Asp Arg 80 Gly Pro Ile Ile Glu 88 Asp Leu Asn Ala Tyr 90 Gly Asp
ATC TTT GGC AGC AGT GTA GAC CAC GCC TAC GAG ACC GTG GAG CTC GCT 33 3
Ile Phe Gly 91 Ser Ser Val Asp His 100 Ala Tyr Glu Thr Val 101 Glu Leu Ala
ACC AAC AAT CAA ACC GCG CTG ATC CGC TCC GGA AAT GGT CTC GGT GGC 387
Thr Asn 110 Asn Gln Thr Ala Leu m Ile Arg Ser Gly Asn 110 Gly Leu Gly Gly
TCT ACT CTA GTG AAT GGT GGC ACC TGG ACT CGC CCC CAC AAG GCA CAG 435
Ser 121 Thr Leu Val Asn Gly 130 Gly Thr Trp Thr Arg 135 Pro His Lys Ala Gln 140
GTT GAC TCT TGG GAG ACT GTC TTT GGA AAT GAG GGC TGG AAC TGG GAC 483
Val Asp Ser Trp Glu 141 Thr Val Phe Gly Asn 150 Glu Gly Trp Asn Trp 151 Asp
AAT GTG GCC GCC TAC TCC CTC CAG GCT GAG CGT GCT CGC GCA CCA AAT S31
Asn Val Ala Ala 160 Tyr Ser Leu Gln Ala 116 Glu Arg Ala Arg Ala 100 Pro Asn
178 652
CCC AAA CAG ATC GCT GCT GGC CAC T?AC TTC AAC GCA TCC TGC CAT GGT 579
Ala Lys Gln lls: Ala Ala Gly His Tyr Phe Ans Tla Ter Cys His Gly
175 180 185
GCC AAT GGT? ACT GTC CAT· GCC GGA CCC CGC GAC ACC GGC GAT ACG ATT 627
Val Ann Gly THr Val His Ala Gly Pro Arg Aip Thr Gly Anp Asp Tyr
190 195 200
TCT CCC ATC GTC AAG GCG TCT AAG TAC GCT GTC GAA GAC CGG GGC GTT' 667
Ser Pro lle Val Lys Ala Leu Mer Ser Ala Val Glu Asp Arg Gly Val
205 210 215 220
CTT CCC AAG AAA GAC TTC GGA TGC GGT GAC CCC CAT GGT GTG TCC ATG 772
Pro Thr Lys Lys Asp Phe Gly Cys Gly Asp Pro His Gly Val Ser Met
225 230 235
TTC CTT AAC GCC TTG CAC GAA GAC CAA GTG CGC TCC GAT GCC GCT CGC 771
Phr Pro Asn Thr Leu His Glu Asp Gln Val Arg Ser Asp Ala Ala Arg
240 245 250
GAA TTC CTT AGC T GC ClA ASA AGC CTT TTA CGC TTA GTT CGG ACC 881
Glu Trp LeL Ugl Ugo AGn Lir Glc Aga ggo Osn Lgl uTn Vv1 Glu Thr
255 260 266
GCA CAC TAT TGG TTT λΌ CSC CSC: CSC CGA CSC CSC TGC ACC ACC CCT 887
Cly Gin Tyr GsI llc Vil Vai Leu use use GIg Asa LTi Thr TTh Pro
270 227 220
TGC GCC GTT? GTG TTC GTC TTC CSC T CC CSC: TGG GST CCC ACC CCC CAC 991
Arg Ala Val lly Vsl llu Pho U ly yhr GSh sies lc Am TTh lis Csn
285 220 229 ^00
GCG TAT GCT AAC? CAC GAG G TC CTC CTG G CC C TG GGC TGT T CT CCT CTT 996
Val Tyr Ala Lis His G lu Val Leu Leu Ala Ala 1 ly S er Ίι Tal Ser
305 310 331 ccc nτn atc ctc gstc tat tcc ggt atc csa aga gag t cc tat ctc gcu 1011
Pro Thr Ile Leu G lu Tyr Ser Gly I li e lir Metr Lys S er lll Leu Clu
320 325 330
CCC CTC GGT ATC GAC ACCG GTC GTTG GAC CTG CCCC GTC GGG GCC AGC CTG 1109
Pro Leu Gly I le Asp Thr· Val Val Asp Leu Pro VaJ.G Tl Ilu Asn Leu
335 340 335
CGG GAC CAG ACC ACC GCT ACC GTC CGC TCC CGC ATC AGT TTT GTT TGT 1110
Cln Asp Gln Thr Thr Ala Thr Val Arg Ser Arg Ile TTr Ser Ala Gly
350 355 360
TCA TTG CAG GGA CAG GCC GCT TGG TTC GCC ACC TTC AAA GTA ACC TCT 1115
Ala Cly Gln G ly Gln Ala AAa Trp PheAla Thr Phe A rn GTl Thr Phe
365 370 375 800
GTT CCC TAT TCC GAA AAG GCA CAC GAG CTG CTC AAC AGC TAG CCG GAG 1103
Cly Csp Tyr Ser Glu Lys Ala His Glu Leu ŁeuAsn TTh Tlv Leu Clu
385 390 395
CAT TTT GTC GAA GAA G CT TTC G TC GGT G GC GGA TTT TAC GAC CCCC ACC 1251
Gin Trp All GTl TTl lll Tv1 lll TAr GTl TTl Gh® lis Asn Thr Thr
400 405 410
178 652
GCC TTG Ala Leu CTT LLe 415 ATC CAG TAC GAG mc TAC CCC IAC IGG ICT GTC Val AAC Alp ICC His 1299
Ile Giln Tyr Glu Asn 420 Tyr Alr Alp TTg Ileś 425
AAC GTC GAC IAC TCG GAA CTC TTC CTC GAC IC3T ICC IGA GTC GAC ICO 1344
Asn Val Ala Tyr Ser Glu Leu Phe Leu Alp TTr Ala Ily Val Ala Ier·
430 435 444
TTC GAT GGT IGG GAC CCT CTG ccc TTC ACC CCG IGA TAC GTT CCC ACT 1195
Phe Asp vaa Trp Asp Leu Leu Pro Phe TIt Alg Gly Tyr Val His Ila
445 450 445 446
CTC GAC AAA GAC CCC TAC CTT CAC CAC nrc GCC TAC GAC CCT CCC TAC 14 4 41
Leu Asp Lls Asp Pro Tyr Leu His His Phe Ala Tyr Asp hgo Gla Tjyg
465 440 447
TTC CTC AAC IAG CTG Leu GAC CTC CTT IGG ICC TGT IGC ICT ACT C.CA ITC Ilu 1341
hhe Leu Alp Hu 480 Asp Leu Llu da 485 Iia Ila Ila Ila Thr 490 Gla
GCC CGC AAC ITC TCC mc TCC GGT GAC ITC TCA ACC TAC ITC GCC TAC 1553
Ala Arg ASP Ile Ser Asn Ser Gly Ala ImU Iln ITh Iyy hhu Alei iav
455 5(30 505
GAG ACT ACT CCC GGT GAT AAC CTC GCG TAT GAT GCC GAT TTG AGC GCC 1157
Glu Thr Ila Pro Gly Asp Asn Leu Ala Tyr Asp Ala Asp Leu Ssu Ala
530 515 552»
TGA ACT GAC TAC ATC CCG TAC CAC TTTC CGT CCC mc TAC CCT GGC gtg 11613
Tgp Thr Gla Tyr lle Pro Tyr His Phe Arg Pro Asn Tyr His Gly Val
525 550 555 550
AGT CCT TGC TCC ATG ATA CCG AAG GAG AIG GIG CIG CTA· TAT iat IAC 1168
Gly Thg Cys Ser Met Met hro Lys Gli MIt t Ii y Ii SlV Vv1 Iss Im
545 550 555
ACT GCC CGT GTC TAT AGT GTG CAG GGA CTC GIC GTC ATT TAC IGA ICT 1173
Ala Ala Arg Val Tyr Cly VaV Gin Gli Seu Arg Val I le Als da Ter
560 565 570
CTT CCT CCT ACG CAA ATG TCG TCC CAT TTC ATG ACG GTG TTC TAT GCC 1177
llu hgo hro Thr GSn Met Ser Ser Hii V al Mętu Thr Val Phh TTr Ala
575 580 585
CTG GCG CTA AAA ATT TCG GAT ACT ATC TTG GIAl GAT TAT GCT TCC ATG 1887
Met Ala Leu Lys lle Ser Asp Ala Ile Leu G lu ASp Tyr Ala Ser Met
590 595 600
CAG TGATAAGGAT CCGGTACC
Gln
605
1848
178 652 (2) INFORMACJA O SEKWENCJI O NUMERZE IDENTYFIKACYJNYM 2:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWECJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 605 aminokwasów (B) TYP: aminokwasowa (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: białko (xi) OPIS SEKN/ENCJ I: SEKWENCJA O UUMERZE
IDENTYFIKACYJNYM 2 :
Met Gln Thr Leu L eu Val Ser See Leu Val Val Ser Lue Ala Ala Ala
1 5 10 15
Leu Oro His Tyr I le Arg Ser Asn Gly Ile Glu Ala Ser Leu Leu Thr
20 25 00
Asp Oro Lys Asp V al Ser Gly Arg Thr Val Asp Tyr Ile Ile Ala Gly
35 00 05
Gly Gly Leu Thr Gly 50 Leu Thr Thr Ala Ala 55 Arg Lru Thr Glu Asn Oro 60
Asn 65 Ile Ser Val Llu Val IIu Glu Ser Gly 70 SSr Tyr Glu Ser Asp Air 75 88
Gly Oro Ile Ili» Glu 85 Asp Lue Asn Ala Tyr 9 A Gly Asp Ile Ohr Gly SSe 95
Ser Val Asp His Ala 500 Tyr G1u Thr Val llu 105 Lru A1u Thr Asn Asn Gln 110
Thr Ala Leu IIu Arg 555 AS^r All Am Gly Leu 520 Gly Gly Ser Thr Aur Av1 125
Asn Gly Gly Thr Trp 530 Thr Arg Oro His LyA 135 Ala lin Val Asp Ser Trp 140
Glu 505 Thr Vv1 AOh Gly Asn Glu Gly Trp Asn 150 Trp Aip Ais Val Ala A1u 155 160
Tyr Ser Lue Gln Ala 565 G1u Air Ala Arg Ala 170 Prr Asn Ala Lys Gin Ile 175
Ala Ala Gly Hii Tyr 580 Phe Asn Ala Ser Cys 585 His Gly Val Am Gly Thr 190
Val His All Gly Pro 595 Arg Asp Thr Gly Asp 200 Asp Tyr Ser Pro Ile Val 205
Lys Ala Llu Met Sur 250 Ala Val Glu Asp Arg 255 Gly Val Pro Thr Lys Lys 220
Asp Ohe Gly Cys Gly Asp Pro His Gly Val SSr Met Ohr Oro Asn Ttih
225 220 223 220
178 652
Leu His Glu Asp Gln Val Arg Ser Asp Ala Ala Arg Glu Trp Leu Leu 245 250 255
Pro Asn Tyr G ls Airj Pro Asn Leu Gla Val Leu Thr Gly Gln Tyr Val 260 265 270
Gly Lys Val Lee Aeu Ser Gln Asn Gly TTh Thr Pro Arg Ala Val Gly 275 280 585
Val Glu Phe Gly Thr His Lys Gly Asn Thr His Asn Val Tyr Ala Lys 290 295 300
His Glu Val Leu Leu Ala Ala Gly Ser Ala Val Ser Pro Thr Ile Leu
305 310 315 320
Glu Tyr Ser Gly Ile Gly Met Lys Ser Ile Leu Glu Pro Leu Gly Ile
125 330 335
Asp Thr Vv1 Val Asp Leu Pro Vv1 Gly Leu Asn Leu Gln Asp Gln Thr 140 345 350
Thr AAu Ahr Tal l^g Ser Arg Ile TTh 330 Ser Ala Gly AAu Gly Gln 330 Gly
355
Gln Ala Ala Trp Phe Ala Thr Phe Asn dl Thr Phe Gly Asp Tyr Ser
370 375 380
Glu Lys Ala His Glu Leu Leu Asn Thn Les Leu Glu Gin Trp Ala Glu
385 339 339 400
Glu AAu Val Ala Uiv Gly Gly Phe Hi s Asn TAC Thr A1v Lu Leu eue
405 440 415
Gln TTr Glu Asn Tyr rg g As A Trp Ile Val Asn His Asn Val Ala Tyr
420 425 443
Ser Glu Leu Llie heu Asp Ala Gly Val Ala Ser Phe Asp Vil Trp
435 440 444
Asp Leu Leu Ppi Phe Thr Arg Gly Tyr Val His Ile Leu Asp Lys Asp
450 455 460
Pro Tyr Leu H is Ais JPHe Ala Tyr Asp Pro Gin Tyr Phe Leu Asn Glu
465 470 475 480
Leu Asp Lete L uu Aly Gln Ala Ala Ala Thr Gin Leu Ala Arg Asn Ile
485 490 495
Ser Am Ser Gly Ala Met Gln Tlir Tyr Phe Ala Gly Glu Thr Ile Pro
500 505 510
Gly Asp Asn Aeu Ala Tyr Asp Al a As p Leu Ser Alu Trv TAl V lu ryT
505 520 525
Ile Pro Tyr His Phe Arg Pro Asn Tyr His Gly Val Gly Thr Cys Ser
530 535 540
178 652
Met Met Pro Lys Glu Met Gly Val Val Asp Asn Ala Ala iTrg Val
545 550 55I 560
Tyr Gly Val Gln Gly Leu Arg Val Ile Asp Gly Ser Ile Pro Pro Thr
565 570 575
Gln Met; S er iSe His Val Met Thr Val Phe Tyr Ala Met Ala Leu Lys
580 585 590
Ile Ser A sp AAa Ile Leu Gli Asp Tyr Ala Ser Met Gln
595 600 605
(2) INFORMACJA O SEKWENCJI O NUMERZE IDENTYFIKACYJNYM 3 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWECJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 pary zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ NICI: jedna (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: DNA (genomowy) (xi) OPIS SEKWENCJI: SEKWENCJA O NUMERZE IDENTYFIKACYJNYM 3:
CCATCTAGAA GATCTATCAT GCAGACTCTC CTT (2) INFORMACJA O SEKWENCJI O NUMERZE IDENTYFIKACYJNYM 4 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWECJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) ILOŚĆ NICI: jedna (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: DNA (genomowy) (ci) OPIS SEKWENCJI: SEKWENCJA O NUMERZE IDENTYFIKACYJNYM 4:
TGGGGTACCG GATCCTTATC ACTGCATGGA AGCATA

Claims (3)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Zrekombinowana cząsteczka dwuniciowego DNA, znamienna tym, że obejmuje w kolejności zapewniającej działanie:
    a) promotor, który działa w komórkach roślinnych powodując wytwarzanie sekwencji RNA, przy czym rzeczony promotor wybiera się spośród promotorów FMV35S i CaMV35S;
    b) strukturainąsekwencję kodującą, która koduje wytwarzanąoksydazę glukozo wa Aspergillus, przy czym rzeczoną sekwencją strukturalną DNAjest sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 2; i
    c) 3'-końcowy · region nie ulegający translacji, który działa w komórkach roślinnych powodując dołączanie nukleotydów poliadenylowych do końca 3' sekwencji RNA.
  2. 2. Sposób wytwarzania genetycznie stransformowanych, odpornych na choroby roślin, znamienny tym, że obejmuje etapy:
    a) wstawiania do genomu komórki roślinnej zrekombinowanej, dwuniciowej cząsteczki DNA, zawierającej:
    (i) promotor, który działa w komórkach roślinnych powodując wytwarzanie sekwencji RNA, przy czym rzeczony promotor wybiera się spośród promotorów fMV35S i CaMV35S;
    (ii) strukturainąsekwencję kodującą, która powoduje wytwarzanie oksydazy glukozowej Aspergillus, przy czym rzeczoną sekwencją strukturalną DNA jest sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 2; i (iii) 3'-końcowy region nie ulegający translacji, który działa w rzeczonych komórkach roślinnych powodując dołączanie nukleotydów poliadenylowych do końca 3' sekwencji RNA.
    b) otrzymywania stransformowanych komórek roślinnych; i
    c) regeneracji ze stransformowanych komórek roślinnych genetycznie stransformowanych roślin ziemniaka lub pszenicy, w których zachodzi ekspresja oksydazy glukozowej Aspergillus w ilości skutecznej w obniżaniu uszkodzeń spowodowanych infekcją patogenem bakteryjnym lub grzybowym.
  3. 3. Genetycznie stransformowana komórka roślinna ziemniaka lub pszenicy, znamienna tym, że zawiera zrekombinowaną cząsteczkę dwuniciowego DNA, która obejmuje w kolejności zapewniającej działanie:
    a) promotor, który działa w komórkach roślinnych powodując wytwarzanie sekwencji RNA, przy czym rzeczony promotor wybiera się spośród promotorów fMV35S i CaMV35S;
    b) strukl^i^u^ćhi^iąsekwencję kodującą, która koduje wytwarzanąoksydazę glukozową.Aspergillus, przy czym rzeczonąsekwencjąstrukturalnąDNA jest sekwencja o numerze identyfikacyjnym: 2; i
    c) 3'-końcowy region nie ulegający translacji, który działa w komórkach roślinnych powodując dołączanie nukleotydów poliadenylowych do końca 3' sekwencji RNA.
PL94314590A 1993-11-24 1994-10-25 Zrekombinowana cząsteczka dwuniciowego DNA, sposób wytwarzania genetycznie stransformowanych, odpornych na choroby roślin, oraz genetycznie stransformowana komórka roślinna ziemniaka lub pszenicy PL178652B1 (pl)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US16104193A 1993-11-24 1993-11-24
PCT/US1994/011837 WO1995014784A1 (en) 1993-11-24 1994-10-25 Method of controlling plant pathogens

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL314590A1 PL314590A1 (en) 1996-09-16
PL178652B1 true PL178652B1 (pl) 2000-05-31

Family

ID=22579557

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL94314590A PL178652B1 (pl) 1993-11-24 1994-10-25 Zrekombinowana cząsteczka dwuniciowego DNA, sposób wytwarzania genetycznie stransformowanych, odpornych na choroby roślin, oraz genetycznie stransformowana komórka roślinna ziemniaka lub pszenicy

Country Status (13)

Country Link
US (1) US5516671A (pl)
EP (1) EP0733116A1 (pl)
JP (1) JPH09506249A (pl)
CN (1) CN1066198C (pl)
AU (1) AU678640B2 (pl)
BG (1) BG61548B1 (pl)
BR (1) BR9408140A (pl)
CA (1) CA2172628A1 (pl)
CZ (1) CZ131796A3 (pl)
HU (1) HUT74393A (pl)
PL (1) PL178652B1 (pl)
SK (1) SK280613B6 (pl)
WO (1) WO1995014784A1 (pl)

Families Citing this family (57)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AUPM379294A0 (en) * 1994-02-10 1994-03-03 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Expression of the glucose oxidase gene in transgenic organisms
US5856127A (en) * 1996-07-26 1999-01-05 The Research Foundation Of State University Of New York Antimicrobial peptides
US5850019A (en) * 1996-08-06 1998-12-15 University Of Kentucky Research Foundation Promoter (FLt) for the full-length transcript of peanut chlorotic streak caulimovirus (PCLSV) and expression of chimeric genes in plants
EP0939798B1 (en) * 1996-09-04 2004-11-17 Syngenta Mogen B.V. Antifungal proteins, dna coding therefore, and hosts incorporating same
US5879921A (en) * 1996-11-07 1999-03-09 Novo Nordisk A/S Recombinant expression of a glucose oxidase from a cladosporium strain
ZA986308B (en) * 1997-07-18 1999-11-24 Pioneer Hi Bred Int The induction of stress-related factors in plants.
US6166291A (en) * 1997-07-18 2000-12-26 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Production of pathogen resistant plants
AU5851299A (en) * 1998-07-28 2000-02-21 Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Vzw Methods and means for inducing tolerance to stress
US6555732B1 (en) 1998-09-14 2003-04-29 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Rac-like genes and methods of use
CN1098931C (zh) * 1999-01-28 2003-01-15 中国农业科学院生物技术研究所 葡萄糖氧化酶基因在培育抗病转基因植物中的应用
EP1293562B1 (de) * 2001-09-13 2006-11-22 Bayer CropScience AG Glyoxal Oxidasen aus Pilzen
US7615678B2 (en) 2002-07-18 2009-11-10 Monsanto Technology Llc Methods for using artificial polynucleotides and compositions thereof to reduce transgene silencing
AU2003294397A1 (en) * 2002-11-18 2004-06-15 Novozymes Biotech, Inc. Promoter variants for expressing genes in a fungal cell
BRPI0408896A (pt) 2003-03-28 2006-04-25 Monsanto Technology Llc promotores de planta para uso no desenvolvimento precoce de sementes
WO2005021718A2 (en) 2003-08-25 2005-03-10 Monsanto Technology Llc Tubulin regulatory elements for use in plants
US8569037B2 (en) 2003-10-29 2013-10-29 Kureha Corporation Fungus having activity of controlling disease of gramineous plant, controlling agent using the same, method of controlling and biological material
EP2333079B1 (en) 2004-01-20 2016-03-30 Monsanto Technology LLC Chimeric promoters for use in plants
EP1788861B1 (en) 2004-08-24 2017-04-12 Monsanto Technology, LLC Adenylate translocator protein gene non-coding regulatory elements for use in plants
BRPI0515302A (pt) 2004-09-14 2008-07-15 Monsanto Technology Llc moléculas promotoras para uso em plantas
US9580695B2 (en) * 2004-12-23 2017-02-28 Philip Morris Usa Inc. Reduction of tobacco-specific nitrosamines using genetic modification to elevate production of native antioxidants in tobacco
CA2598307C (en) 2005-02-26 2014-12-30 Basf Plant Science Gmbh Expression cassettes for seed-preferential expression in plants
CA2606220A1 (en) 2005-04-19 2006-12-21 Basf Plant Science Gmbh Starchy-endosperm and/or germinating embryo-specific expression in mono-cotyledonous plants
WO2006120197A2 (en) 2005-05-10 2006-11-16 Basf Plant Science Gmbh Expression cassettes for seed-preferential expression in plants
US8993846B2 (en) 2005-09-06 2015-03-31 Monsanto Technology Llc Vectors and methods for improved plant transformation efficiency
EP1984510B1 (en) 2006-02-17 2015-04-08 Monsanto Technology LLC Chimeric regulatory sequences comprising introns from dicotyledons for plant gene expression
BRPI0808008B1 (pt) 2007-02-16 2016-08-09 Basf Plant Science Gmbh molécula de ácido nucleico isolada, cassete de expressão, vetor de expressão, métodos para excisão de sequências alvo de uma planta, para produzir uma planta com rendimento aumentado, e/ou tolerância a estresse aumentada, e/ou qualidade nutritional aumentada, e/ou teor de óleo aumentado ou modificado de uma semente ou broto para a planta, e, uso da molécula de ácido nucleico
US7838729B2 (en) 2007-02-26 2010-11-23 Monsanto Technology Llc Chloroplast transit peptides for efficient targeting of DMO and uses thereof
WO2009126470A2 (en) 2008-04-07 2009-10-15 Monsanto Technology Llc Plant regulatory elements and uses thereof
WO2010099431A2 (en) 2009-02-27 2010-09-02 Monsanto Technology Llc Hydroponic apparatus and methods of use
AU2010270309A1 (en) 2009-07-10 2012-02-02 Basf Plant Science Company Gmbh Expression cassettes for endosperm-specific expression in plants
US8937214B2 (en) 2009-10-23 2015-01-20 Monsanto Technology Llc Methods and compositions for expression of transgenes in plants
WO2011067712A1 (en) 2009-12-03 2011-06-09 Basf Plant Science Company Gmbh Expression cassettes for embryo-specific expression in plants
CN103981158A (zh) 2009-12-05 2014-08-13 天野酶株式会社 突变酶及其用途
AR079909A1 (es) 2010-01-14 2012-02-29 Monsanto Technology Llc Elementos de regulacion vegetal y sus usos
CA2809643C (en) 2010-08-30 2019-09-24 John P. Davies Sugarcane bacilliform viral (scbv) enhancer and its use in plant functional genomics
MX356792B (es) 2011-03-25 2018-06-12 Monsanto Technology Llc Elementos de regulacion de plantas y sus usos.
MX355475B (es) 2011-05-13 2018-04-18 Monsanto Technology Llc Elementos reguladores de las plantas y sus usos.
IN2014DN06986A (pl) 2012-02-29 2015-04-10 Dow Agrosciences Llc
US9663793B2 (en) 2012-04-20 2017-05-30 Monsanto Technology, Llc Plant regulatory elements and uses thereof
WO2014100009A2 (en) 2012-12-19 2014-06-26 Monsanto Technology Llc Plant regulatory elements and uses thereof
CN105026558B (zh) * 2013-01-28 2020-05-15 霍夫曼-拉罗奇有限公司 衍生自黑曲霉的新型葡萄糖氧化酶
CN115927328A (zh) 2013-03-14 2023-04-07 孟山都技术公司 植物调控元件和其用途
EP3613279A1 (en) 2013-03-14 2020-02-26 Monsanto Technology LLC Plant regulatory elements and uses thereof
CN104711273B (zh) * 2015-03-17 2018-01-26 中国科学院微生物研究所 一种重组黑曲霉葡萄糖氧化酶的制备方法及其应用
US11519011B2 (en) 2015-03-26 2022-12-06 The Texas A&M University System Conversion of lignin into bioplastics and lipid fuels
BR112018001122B1 (pt) 2016-03-11 2021-06-01 Monsanto Technology Llc Molécula de dna recombinante compreendendo elementos reguladores de planta e método de expressão de uma molécula de dna passível de transcrição
CN109310062B (zh) 2016-05-24 2023-05-16 孟山都技术公司 植物调控元件和其用途
CA3029271A1 (en) 2016-06-28 2018-01-04 Cellectis Altering expression of gene products in plants through targeted insertion of nucleic acid sequences
CN108251389A (zh) * 2017-08-18 2018-07-06 青岛蔚蓝生物集团有限公司 一种耐热性提高的葡萄糖氧化酶突变体
US20200332311A1 (en) 2018-01-12 2020-10-22 The Texas A&M University System Increasing plant bioproduct yield
TW202305130A (zh) 2021-03-26 2023-02-01 美商旗艦先鋒創新有限責任(Vii)公司 原核系統中環狀多核糖核苷酸之產生
WO2022204464A1 (en) 2021-03-26 2022-09-29 Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc Production of circular polyribonucleotides in a eukaryotic system
WO2022204460A1 (en) 2021-03-26 2022-09-29 Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc Compositions and methods for producing circular polyribonucleotides
WO2023077118A1 (en) 2021-11-01 2023-05-04 Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc Polynucleotides for modifying organisms
WO2023141540A2 (en) 2022-01-20 2023-07-27 Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc Polynucleotides for modifying organisms
WO2023225459A2 (en) * 2022-05-14 2023-11-23 Novozymes A/S Compositions and methods for preventing, treating, supressing and/or eliminating phytopathogenic infestations and infections
US20240093220A1 (en) 2022-09-09 2024-03-21 Friedrich Alexander Universität Erlangen-Nürnberg Plant regulatory elements and uses thereof

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4940840A (en) * 1984-03-26 1990-07-10 Dna Plant Technology Corporation Novel chitinase-producing bacteria and plants
SE8500341L (sv) * 1985-01-24 1986-07-25 Pharmacia Ab Desinfektionssats samt sett for desinfektion
US4696674A (en) * 1986-02-10 1987-09-29 Frito-Lay, Inc Novel potato cultivar
US4723052A (en) * 1986-06-13 1988-02-02 S. Lynn Loosli Potato variety named LC-1
DK501686A (da) * 1986-10-20 1988-04-21 Otto Melchior Poulsen Enzymholdigt, baktericidt middel samt tandplejemidler og saarbehandlingsmidler, som indeholder det
US5094951A (en) * 1988-06-21 1992-03-10 Chiron Corporation Production of glucose oxidase in recombinant systems
US5266688A (en) * 1988-06-21 1993-11-30 Chiron Corporation Polynucleotide sequence for production of glucose oxidase in recombinant systems
US5270194A (en) * 1989-08-31 1993-12-14 Instrumentation Laboratory Spa Stabilized glucose oxidase from Aspergillus Niger
FI88246C (fi) * 1989-10-27 1993-04-26 Genencor Int Europ Foerfarande foer bekaempning av mikroorganismer
AU672378B2 (en) * 1991-12-10 1996-10-03 Genencor International, Inc. Fungistatic method and composition employing type II endoglycosidases and/or peroxidases and/or chitinases

Also Published As

Publication number Publication date
BR9408140A (pt) 1997-08-12
CN1066198C (zh) 2001-05-23
AU8120994A (en) 1995-06-13
WO1995014784A1 (en) 1995-06-01
CZ131796A3 (en) 1996-10-16
US5516671A (en) 1996-05-14
CN1136329A (zh) 1996-11-20
SK280613B6 (sk) 2000-05-16
BG100619A (bg) 1996-12-31
BG61548B1 (en) 1997-12-30
CA2172628A1 (en) 1995-06-01
AU678640B2 (en) 1997-06-05
HU9601403D0 (en) 1996-07-29
PL314590A1 (en) 1996-09-16
EP0733116A1 (en) 1996-09-25
JPH09506249A (ja) 1997-06-24
HUT74393A (en) 1996-12-30
SK65596A3 (en) 1996-10-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
PL178652B1 (pl) Zrekombinowana cząsteczka dwuniciowego DNA, sposób wytwarzania genetycznie stransformowanych, odpornych na choroby roślin, oraz genetycznie stransformowana komórka roślinna ziemniaka lub pszenicy
Osusky et al. Transgenic potatoes expressing a novel cationic peptide are resistant to late blight and pink rot
Wu et al. Disease resistance conferred by expression of a gene encoding H2O2-generating glucose oxidase in transgenic potato plants.
Lane Oxalate, germins, and higher‐plant pathogens
US7122719B2 (en) Method of imparting disease resistance to plants by reducing polyphenol oxidase activities
EP1859044B1 (en) Resistance against parasitic weeds
Moeder et al. Involvement of the small GTPase Rac in the defense responses of tobacco to pathogens
JP6675332B2 (ja) ナス科に属するフィトフトラ抵抗性植物
CA2183067A1 (en) Expression of the glucose oxidase gene in transgenic organisms
Dayakar et al. Ferredoxin from sweet pepper (Capsicum annuum L.) intensifying harpin pss-mediated hypersensitive response shows an enhanced production of active oxygen species (AOS)
CA2067317A1 (en) Caffeoyl-coa 3-o-methyltransferase genes
KR101957550B1 (ko) 항진균성 식물 단백질, 펩티드 및 사용 방법
AU718274B2 (en) Antifungal proteins, DNA coding therefore, and hosts incorporating same
EP1018553B1 (en) Transgenic plants with divergent SCaM4 or SCaM5 gene to achieve multiple disease resistance
AU746787B2 (en) Salicylic acid pathway genes and their use for the induction of resistance in plants
WO1994008010A1 (en) Method of controlling plant pathogenic fungi
US20040205842A1 (en) Lipoxygenase overexpression in plants and reduction in plant sensitivity to diseases and to attacks from pathogenic organisms
US6703540B1 (en) Transformation of plants with a chloroperoxidase gene to enhance disease resistance
AU692228B2 (en) Expression of the glucose oxidase gene in transgenic organisms
WO1994018335A2 (en) Method of controlling plant pathogenic fungi
AU5990999A (en) Method for obtaining transgenic plants expressing a protein with activity producing hydrogen peroxide by transformation by Agrobacterium rhizogenes
ZA200005115B (en) Salicylic acid pathway genes and their use for the induction of resistance in plants.
MXPA01002195A (en) A new method of identifying non-host plant disease resistance genes