KR970702366A - 세포-주기 조절 단백질 및 그것의 사용방법(cell-cycle regulatory proteins. and uses related thereto) - Google Patents

세포-주기 조절 단백질 및 그것의 사용방법(cell-cycle regulatory proteins. and uses related thereto)

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KR970702366A
KR970702366A KR1019960705807A KR19960705807A KR970702366A KR 970702366 A KR970702366 A KR 970702366A KR 1019960705807 A KR1019960705807 A KR 1019960705807A KR 19960705807 A KR19960705807 A KR 19960705807A KR 970702366 A KR970702366 A KR 970702366A
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에이치. 비이취 데이비드
제이. 디메트릭 더글라스
세라노 마뉴엘
제이. 해넌 그레고리
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죤 마로니
콜드 스프링 하버 래보레이토리
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Abstract

본 발명은 진핵 세포, 특히 포유동물 세포내의 신종의 세포-주기 조절 단백질 (″CCR-단백질″)의 발견에 관한 것이다. 본 원에 기술된 바와 같이, 상기 종류의 단백질에는 겉보기 분자량이 16kDa인 폴리펩티드 및 겉보기 분자량이 15kDa인 폴리펩티드가 포함되며, 상기 두 폴리펩티드는 각각 세포-주기 진행의 억제물질로 작용하여, 결과적으로 세포 성장을 저해하는 작용을 한다. 상기와 같이, p53 체크 포인트에 대한 p21의 역할과 유사하게, 상기 CCR-단백질은 망막아종 (RB)----. 또한, 본 발명의 CCR-단백질 종류에는 겉보기 분자량이 13.5kDa(이하 ″p13.5″)인 단백질이 포함된다. p16 및 p15와 같이, p13.5는 세포-주기를 조절하는 작용을 하는 것으로 추정된다.

Description

세포-주기 조절 단백질 및 그것의 사용방법(CELL-CYCLE REGULATORY PROTEINS. AND USES RELATED THERETO)
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
제lA-lB도는 엑손 경계 및 PCR 프라이머의 위치가 표시된, p16 cDNA의 개략도이다.
제2A도 및 제2B도는 엑손 1에 대한 게놈성 핵산 서열 및 엑손 1을 직접 플랭킹하는 비-코우딩 서열이다. 상기 서열은 수 개의 프라이머로부터의 복합 서열이다· 제2C도는 엑손 2에 대한 게놈성 서열이다.
제3A-3D도는 엑손 3에 대한 게놈성 핵산 서열 및 엑손 3를 직접 플랭킹하는 비-코우딩 서열이다. 상기 서열은 수 개의 프라이머로부터의 복합 서열이다.
제4도는 정상 사람 대조군 및 다른 사람 종양과 비교하여, p16 서열이 수 개의 사람 종양 세포의 게놈으로부터 손실된 것을 도시한다.
제5도는 마우스 p16 유전자에 대한 제한-부위 지도를 도시한다.

Claims (56)

  1. 안키린-류의 반복단위체로 이루어지는 아미노산 서열을 포함하고, 서열번호 2와 아미노산 서열이 불일치 한다는 조건하에서, 사이클린-의존성 키나아제(CDK)와 결합하는, 단리된 또는 재조합형 세포-주기 조절 폴리펩티드.
  2. 제1항에 있어서, 상기 CDK가 G1기의 CDK인 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  3. 제1항에 있어서, 상기 CDK가 CDK4 또는 CDK6인 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  4. 제1항에 있어서, 상기 폴리펩티드가 SDS-PAGE에 의한 겉보기 분자량이 12kD 내지 20kD인 폴리펩티드 또는 SDS-PAGE에 의한 분자량이 12kD 내지 20kD인 완전한 길이의 단백질의 CDK-결합 단편인 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  5. 제1항에 있어서, 상기 폴리펩티드가 서열번호 2로 지정된 단백질과 경쟁적으로 CDK에 결합하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  6. 세포-주기 조절(CCR) 단백질의 서열이 서열번호 2와 불일치한다는 조건하에서, 완전한 길이의 상기 CCR 단백질의 분자량이 12kD 내지 20kD이고, 사이클린-의존성 키나아제(CDK)와 특이적으로 결합하는, 세포-주기 조절(CCR) 단백질 또는 그것의 단편의 순수 제조물.
  7. 제6항에 있어서, 상기 단백질이 서열번호 2에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 CCR-단백질.
  8. 제6항에 있어서, 상기 단백질이 서열번호 4에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 CCR-단백질.
  9. 제6항에 있어서, 상기 단백질이 서열번호 8에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 CCR-단백질.
  10. 제6항에 있어서, 상기 단백질이 하기식에 나타나는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 CCR-단백질:
  11. 제6항에 있어서, 상기 단백질이 세포-주기 조절의 작용제 또는 길항제 중의 하나로 기능하는 것을 특징으로 하는 CCR-단백질.
  12. 서열번호 2와 서열이 불일치한다는 조건하에서, 서열번호 2에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 아미노산 서열을 포함하는, p16 상동 폴리펩티드 또는 그것의 단편의 순수 제조물.
  13. 제12항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 하기식에 의해 나타나는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드:
  14. 제12항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 세포-주기 조절의 작용제 또는 길항제 중의 하나로 기능하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  15. 서열번호 2와 서열이 불일치한다는 조건하에서, 서열번호 4의 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 아미노산 서열을 포함하는, p15 폴리펩티드 또는 그것의 단면의 순수 제조물.
  16. 제15항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 하기식에 의해 나타난 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드:
  17. 제15항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 세포-주기 조절의 작용제로서 또는 길항제로서 기능하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  18. 세포 주기 조절(CCR) 단백질이 서열번호 2와 서열이 일치하지 않는 조건하에서, 사이클린-의존성 키나아제 4(CDK4)와 특이적으로 상호작용하고, 상기 상호작용은 CDK4의 K22, R24, H95 및 D97 잔기에 의해 영향을 받는, 서열번호 2,4 또는 8 중 1개 이상의 서열에 나타나는 아미노산과 상동인 아미노산 서열을 포함하는 단리된 또는 재조합형 폴리펩티드.
  19. 제18항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 CDK4에 의해 매개되는 인산 전이 반응을 저해하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  20. 제6항의 CCR-단백질의 에피토프와 특이적으로 반응하는 항체 제조물.
  21. 서열번호 4의 폴리펩티드의 에피토프와 특이적으로 반응하는 항체 제조물.
  22. 서열번호 8의 폴리펩티드의 에피토프와 특이적으로 반응하는 항체 제조물.
  23. 상기 CCR 단백질이 서열번호 2와 서열이 불일치한다는 조건하에서, 서열번호 2, 4 또는 8 중 한 서열 이상에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 아미노산을 포함하는 재조합형 폴리펩티드.
  24. 제23항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 세포-주기 조절의 작용제 또는 길항제 중 하나의 기능을 하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  25. 제23항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 사이클린-의존성 키나아제와 결합하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  26. 제25항에 있어서, 상기 사이클린-의존성 키나아제는 CDK4이고, 상기 폴리펩티드 및 CDK4의 결합이 CDK4의 잔기 K22, R24, H95 및 D97에 의해 영향을 받는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  27. 제26항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 CDK4에 의해 매개되는 인산 전이 반응을 저해하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  28. 제23항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 하기식에 의해 나타나는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드:
  29. 제23항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 하기식에 의해 나타나는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드:
  30. 제23항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 하기식에 의해 나타나는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 폴리펩티드;
  31. 제23항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 서열번호 2, 4 또는 8의 단백질과 무관한 단백질의 아미노산 서열을 가지는 제2폴리펩티드 부분을 더 포함하는 융합 단백질인 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  32. 제31항에 있어서, 상기 융합 단백질은 2-혼성체 검정법에서 기능적인 것을 특징으로 하는 폴리펩티드.
  33. 서열번호 2와 아미노산 서열이 불일치한다는 조건하에서, 사이클린-의존성 키나아제(CDK)와 결합하며, 안키린-류의 반복단위체를 가지는 아미노산 서열을 포함하는, 단리된 또는 재조합형 세포-주기 조절 폴리펩티드를 코우드화하는 누클레오티드 서열을 갖는 순수 핵산.
  34. 제33항에 있어서, 상기 CDK가 G1기의 CDK인 것을 특징으로 하는 핵산.
  35. 제33항에 있어서, 상기 CDK가 CDK4 또는 CDK6인 것을 특징으로 하는 핵산.
  36. 제33항에 있어서, 상기 폴리펩티드가 SDS-PAGE에 의한 겉보기 분자량이 12kD 내지 20kD인 폴리펩티드이거나, 또한 SDS-PAGE에 의한 분자량이 12kD 내지 20kD인 완전한 길이의 단백질의 CDK-결합 단편인 것을 특징으로 하는 핵산.
  37. 상기 폴리펩티드가 서열번호 2의 아미노산 서열과 일치하지 않는 조건하에서, 사이클린-의존성 키나아제(CDK)와 특이적으로 결합하고, 완전한 길이 형태의 분자량이 12kD 내지 20kD인 세포-주기 조절(CCR) 단백질 및 그것의 단편을 코우드화하는 누클레오티드 서열을 갖는 순수 핵산.
  38. 제37항에 있어서, 상기 누클레오티드 서열에 의해 코우드화되는 CCR-단백질이 서열번호 2에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 것을 특징으로 하는 핵산.
  39. 제37항에 있어서, 상기 누클레오티드 서열에 의해 코우드화되는 CCR-단백질이 서열번호 4에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 것을 특징으로 하는 핵산.
  40. 제37항에 있어서, 상기 누클레오티드 서열에 의해 코우드화되는 CCR-단백질이 서열번호 8에 나타나는 아미노산 서열과 60% 이상이 상동인 것을 특징으로 하는 핵산.
  41. 제37항에 있어서, 상기 누클레오티드 서열에 의해 코우드화된 CCR-단백질이 하기식에 의해 나타나는 아미노산 서열을 가지는 것을 특징으로 하는 핵산:
  42. 제37항에 있어서, 상기 누클레오티드 서열에 의해 코우드화된 CCR-단백질이 세포-주기 조절의 작용제 또는 길항제 중 하나의 기능을 하는 것을 특징으로 하는 핵산.
  43. 제37항에 있어서, 엄격한 조건하에서, 상기 누클레오티드 서열이 서열번호 1, 3 또는 7중 하나 이상의 서열 중 12개 이상의 연속적 누클레오티드에 상응하는 핵산 프로브와 혼성화되는 것을 특징으로 하는 핵산.
  44. 서열번호 3 또는 7의 센스 또는 앤티센스 서열의 10개 이상의 연속 누클레오티드 또는 그것의 자연-발생적 돌연변이체와 혼성화되는 누클레오티드 서열 영역을 함유하는, 정제된 올리고누클레오티드를 포함하는 프로브-프라이머.
  45. 제44항에 있어서, 상기 프로브/플라이머에 부착되어 검출될 수 있는 표지군을 더 포함하는 것을 특징으로 하는 프로브-프라이머.
  46. 제45항에 있어서, 상기 표지 군이 방사성 동위원소, 형광성 화합물, 효소 및 효소 보조-인자로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 프로브-프라이머. ·
  47. 제44항의 프로브-프라이머를 형질전환된 세포를 확인하고, 환자로부터 단리된 세포 시료내에서 세포-주기 조절 단백질을 코우드화하는 핵산의 수준을 측정하는, 진단용 시험 키트.
  48. 세포-주기 조절 (CCR) 폴리펩티드 및 사이클린-의존성 키나아제 (CDK)의 상호작용의 저해물질에 대한 시험 화합물의 스크리닝 검정법으로서, i. CDK 및, 안키린-류 반복단위체를 특징으로 하는 아미노산 서열을 포함하고, 상기 CDK와 결합하는 CCR 폴리펩티드를, 상기 CDK 및 상기 CCR 폴리펩티드가 상호작용 할 수 있는 조건하에서 결합시키는 단계; ii. 상기 결합물을 시험 화합물과 접촉시키는 단계:및 iii. 상기 CDK 및 상기 CCR 폴리펩티드를 포함하는 복합체의 형성을 검출하는 단계, 를 포함하여, 상기 시험 화합물의 존재하에서 상기 복합체의 형성의 감소가 CDK 및 CCR 폴리펩티드 간의 상호작용의 저해물질이 존재한다는 지표가 되는 검정법.
  49. 진핵세포의 세포 주기를 조절하는 CCR-단백질의 능력을 파괴시키는 제재의 확인 방법으로서, i) (a) 사이클린-의존성 키나아제 (CDK)를 포함하는 제1융합 단액질 및 (b) 안키린-류 반복단위체를 특징으로 하는 아미노산 서열을 포함하고, 2-혼성체 검정이 상기 제1융합 단백질의 CDK 및 상기 제2폴리펩티드의 p16NK4간의 상호작용에 민감하다는 조건하에서, 상기 CDK에 결합하는 CCR 폴리펩티드를 포함하는 제2융합 단백질을 포함하는 2-혼성체 검정 시스템을 제공하는 단계; ii) 상기 2-혼성체 검정 시스템에 후보 제제를 접촉시키는 단계; iii) 상기 후보 제제의 존재하에서, 상기 융합 단백질 간의 상호작용 수준을 측정하는 단계; 및 iv) 상기 후보 제제의 존재하에서의 상기 융합 단백질의 상호작용 수준 및 상기 후보 제제의 부재하에서의 상기 융합 단백질의 상호작용 수준을 비교하는 단계, 를 포함하여, 상기 후보 제제의 존재하에서의 상호작용 수준의 감소가 CCR 단백질 및 사이클린-의존성 키나아제의 상호작용의 저해가 존재한다는 지표가 되는 방법.
  50. 환자가 바람직하지 못한 세포 증식을 특징으로 하는 질환의 위험성 유무를 결정하는 방법으로서, 안키린-류 반복단위체를 특징으로 하는 아미노산 서열을 가지며, 사이클린-의존성 키나아제와 결합하는 CCR 단백질을 코우드화하는 유전자의 돌연변이, 및 상기 유전자의 잘못된 발현 중의 하나를 갖는 것을 특징으로 하는 유전자 병변의 존재 여부를 상기 환자의 조직내에서 검출하는 것을 포함하는 방법.
  51. 제50항에 있어서, 상기 유전자 병변의 검출하는 것이, i. 상기 유전자로부터 하나 이상의 누클레오티드의 결실, ii. 상기 유전자에 하나 이상의 누클레오티드의 부가, iii. 상기 유전자의 하나 이상의 누클레오티드의 치환, iv. 상기 유전자의 총 염색체 재배열, v. 상기 유전자의 mRNA 전사체 수준의 총 변화, vi. 상기 유전자의 mRNA 전사체의 비-야생형 스플라이싱 패턴의 존재, vii. 상기 단백질의 비-야생형 수준, 중에서, 하나 이상이 존재하는 것을 확인하는 것을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  52. 제50항에 있어서, 상기 유전자 병변을 검출하는 것이, i. 서열번호 1 또는 3의 센스 또는 앤티센스 서열과 혼성화되는 누클레오티드 서열, 그것의 자연-발생적 돌연변이체, 또는 본래 상기 유전자와 관련된 5′ 또는 3′ 플랭킹 서열 또는 인트론 서열 영역을 함유하는 올리고누클레오티드를 포함하는 프로브/프라이머를 제공하는 단계; ii. 상기 프로브/프라이머를 상기 조직의 핵산에 노출시키는 단계; 및 iii. 상기 프로브/프라이머를 상기 핵산과 혼성화시켜. 상기 유전자 병변의 유무를 검출하는 단계, 를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  53. 제50항에 있어서, 상기 병변을 검출하는 것이 상기 프로브/프라이머를 사용하여, 상기 유전자의 누클레오티드 서열 및 상기 플랭킹 핵산 서열을 결정하는 것을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  54. 제50항에 있어서, 상기 병변을 검출하는 것이 상기 프로브/프라이머를 중합효소 사슬 반응 (PCR) 또는 연결 사슬 반응 (LCR)에서 사용하는 것을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
  55. 제51항에 있어서, 상기 단백질의 수준이 면역검정법으로 검출되는 것을 특징으로 하는 방법.
  56. 세포내에서, 사이클린-의존성 키나아제(CDK), 및 안키린-류 반복단위체를 특징으로 하는 아미노산 서열을 갖고, 서열번호 2의 서열과 불일치한다는 조건하에서, 상기 CDK와 결합하는 폴리펩티드 간의 단백질 복합체의 존재를 검출하는 것을 포함하는, 세포의 형질전환 위험성을 결정하는 방법.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
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