KR20230044816A - 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물 - Google Patents
넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20230044816A KR20230044816A KR1020210127390A KR20210127390A KR20230044816A KR 20230044816 A KR20230044816 A KR 20230044816A KR 1020210127390 A KR1020210127390 A KR 1020210127390A KR 20210127390 A KR20210127390 A KR 20210127390A KR 20230044816 A KR20230044816 A KR 20230044816A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- infection
- mir
- kif5a
- streptococcus parauberis
- expression
- Prior art date
Links
- 241000194055 Streptococcus parauberis Species 0.000 title claims abstract description 55
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title claims abstract description 31
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title claims abstract description 31
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 title claims abstract description 31
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 29
- 241000269979 Paralichthys olivaceus Species 0.000 title abstract description 6
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 45
- 108091060382 miR-140 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 108091030617 miR-140-1 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 108091023370 miR-140-2 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 101001139062 Homo sapiens Kinesin heavy chain isoform 5A Proteins 0.000 claims abstract description 31
- 102100020685 Kinesin heavy chain isoform 5A Human genes 0.000 claims abstract description 31
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 28
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 24
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims abstract description 16
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 6
- 241000269980 Pleuronectidae Species 0.000 claims description 28
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 14
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 13
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 13
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 9
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 8
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 6
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 5
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 4
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 claims description 4
- 206010061372 Streptococcal infection Diseases 0.000 claims description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 4
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 claims description 3
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 claims description 3
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 claims description 3
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 claims description 3
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000000951 immunodiffusion Effects 0.000 claims description 3
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 3
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 3
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 2
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 claims description 2
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 claims description 2
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 claims description 2
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 claims description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 2
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 claims description 2
- 238000000760 immunoelectrophoresis Methods 0.000 claims description 2
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 claims description 2
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 claims description 2
- 239000002523 lectin Substances 0.000 claims description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 claims description 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 claims 3
- 230000005855 radiation Effects 0.000 claims 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims 1
- 238000002331 protein detection Methods 0.000 claims 1
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 abstract description 3
- 238000009313 farming Methods 0.000 abstract 1
- 241000269908 Platichthys flesus Species 0.000 description 10
- 241000269978 Pleuronectiformes Species 0.000 description 9
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 8
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 8
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 7
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 7
- 238000009360 aquaculture Methods 0.000 description 6
- 244000144974 aquaculture Species 0.000 description 6
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 description 6
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 6
- 101150111430 KIF5A gene Proteins 0.000 description 5
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 4
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 4
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 4
- -1 nucleoside triphosphates Chemical class 0.000 description 4
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 3
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 3
- 241000193985 Streptococcus agalactiae Species 0.000 description 3
- 241000194056 Streptococcus iniae Species 0.000 description 3
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 2
- 208000010824 fish disease Diseases 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 108020005345 3' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 1
- 206010060954 Abdominal Hernia Diseases 0.000 description 1
- 206010000060 Abdominal distension Diseases 0.000 description 1
- NLHHRLWOUZZQLW-UHFFFAOYSA-N Acrylonitrile Chemical compound C=CC#N NLHHRLWOUZZQLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 1
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- QCMYYKRYFNMIEC-UHFFFAOYSA-N COP(O)=O Chemical class COP(O)=O QCMYYKRYFNMIEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010006895 Cachexia Diseases 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 101001139158 Dictyostelium discoideum Kinesin-related protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001006792 Dictyostelium discoideum Kinesin-related protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 101001006786 Dictyostelium discoideum Kinesin-related protein 7 Proteins 0.000 description 1
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 description 1
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 208000032843 Hemorrhage Diseases 0.000 description 1
- 206010020565 Hyperaemia Diseases 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 241000194040 Lactococcus garvieae Species 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 238000001190 Q-PCR Methods 0.000 description 1
- 108020004518 RNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 239000003391 RNA probe Substances 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical class OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091036066 Three prime untranslated region Proteins 0.000 description 1
- 108020004417 Untranslated RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000039634 Untranslated RNA Human genes 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 230000008094 contradictory effect Effects 0.000 description 1
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 1
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- NAGJZTKCGNOGPW-UHFFFAOYSA-N dithiophosphoric acid Chemical class OP(O)(S)=S NAGJZTKCGNOGPW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003203 everyday effect Effects 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 238000012215 gene cloning Methods 0.000 description 1
- 210000002816 gill Anatomy 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 238000003670 luciferase enzyme activity assay Methods 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 239000000123 paper Substances 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N phosphoramidic acid Chemical class NP(O)(O)=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 229920000728 polyester Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 208000026438 poor feeding Diseases 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000009182 swimming Effects 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/195—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria
- G01N2333/315—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Streptococcus (G), e.g. Enterococci
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/26—Infectious diseases, e.g. generalised sepsis
Abstract
본 발명은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염에 의한 질병 진단용 바이오마커 조성물, 진단용 조성물, 진단 키트 또는 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것으로, 본 발명에 따르면 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치의 경우, 정상 대조군보다 miR-140-3p의 발현 수준이 저하되며, 상기 miR-140-3P의 표적유전자인 KIF5A의 발현 수준이 높아지는 것을 확인하였으므로 이를 이용해 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 여부를 정확하게 진단할 수 있어, 넙치 양식 산업에 크게 기여할 수 있다.
Description
본 발명은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염 여부를 진단할 수 있는 조성물에 관한 것이다.
넙치(olive flounder)는 우리나라 수산업 및 양식업 시장에서 큰 부분을 차지하는 고부가가치 양식 생물이다. 하지만 매년 다양한 어류질병이 발생하는 바, 막대한 피해가 야기되고 있다.
수산 양식에 있어, 어류질병의 발생은 양식 어류의 누적되는 폐사로 인한 직접적인 경제적 피해 초래와 더불어 수산용 약제의 사용 증가와 관리 비용 증가 등 제반 양식경비를 증가시켜 결과적으로 생산성을 저하시킬 뿐 아니라, 민감한 사회적 문제인 항생제 잔류 문제로부터 자유롭지 못하게 하여 고품질의 안전한 수산물 생산을 어렵게 한다. 이러한 양식 어류의 질병에 대한 예방 및 처치 대책 마련은 비단 우리나라뿐만 아니라 세계 여러 나라에서 주요한 관심사가 되고 있다.
스트렙토코커스 파라우베리스는 양식 어류에서 연쇄구균증(Streptococcosis)을 야기하는 대표적인 원인균으로 잘 알려져 있고, 스트렙토코커스 파라우베리스 외에도 스트렙토코커스 이니에(Streptococcus iniae, S. iniae), 스트렙토코커스 디피실리스(Streptococcus difficilis, S. difficilis), 스트렙토코커스 실로이(Streptococcus shiloi, S. shiloi), 및 락토코커스 가르비에(Lactococcus garvieae) 등의 다양한 세균들이 연쇄구균증의 원인균으로 보고되고 있다. 그러나, 이중 스트렙토코커스 파라우베리스가 가장 빈번하게 발견되는 연쇄구균증의 원인균으로 알려져 있다.
연쇄구균증에 걸린 넙치의 외부소견으로는 채색흑화, 안구 돌출 및 충혈, 복부 팽만, 탈장 등을 보이며, 내부적으로는 복수가 고이거나 복벽의 출혈, 심장내 농양 등의 소견을 보이게 된다. 또한 특이적으로 어떤 경우는 별다른 소견 없이 아가미만 부식되는 경우도 가끔 관찰되기도 한다. 연쇄구균증은 주로 치어보다는 성어에서 발병률이 높아 경제적인 피해가 다른 세균성 질병에 비해 상대적으로 높게 나타난다.
따라서 스트렙토코커스 파라우베리스에 의한 질병은 넙치 양식 산업에 막대한 피해를 야기하는 바, 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 여부를 정확하게 파악할 수 있는 기술이 요구되고 있다.
한편 바이러스와 박테리아를 비롯한 여러 병원균에 감염되었을 때 생체 내에서 마이크로RNA(MicroRNA, miRNA)의 발현 패턴에 변화가 일어나게 되는데, 이렇게 감염 전후에 그 발현 패턴에 차이가 있는 miRNA를 DEmiRNA(differentialy expressed miRNA)라고 한다.
현재 넙치의 miRNA에 대하여 많은 연구가 행해졌으나, 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 시 넙치의 miRNA 발현 변화에 대해서는 명확하게 보고된 바 없다.
본 발명자들은 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치를 정확하게 진단할 수 있는 방법에 대하여 연구하던 중, 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치의 특정 유전자의 발현 변화를 확인하여 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염에 의한 질병 진단용 바이오마커 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염에 의한 질병 진단용 바이오마커 조성물을 제공한다.
또한 상기 또 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 제제를 포함하는, 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물을 제공한다.
또한 상기 또 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 본 발명에 따른 바이오마커 조성물 또는 진단용 조성물을 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 키트를 제공한다.
또한 상기 또 다른 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 시료로부터 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 단계를 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공한다.
본 발명은 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis)에 감염된 넙치와 정상 개체의 특정 유전자의 발현 변화를 확인한 것으로, 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치의 경우, 정상 대조군보다 miR-140-3p의 발현 수준이 저하되며, KIF5A의 발현 수준이 높아지는 것을 확인하였으므로 이를 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염 여부를 진단하기 위한 바이오마커 조성물, 진단용 조성물, 진단용 키트 또는 정보 제공 방법 등에 유용하게 활용할 수 있어 넙치 양식 산업에 크게 기여할 수 있다.
도 1은 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치와 정상 넙치의 특정 유전자 발현 수준을 비교한 결과로, 도 1 중 A는 miR-140-3p의 발현 수준을 비교한 결과이고, 도 1 중 B는 KIF5A 발현 수준을 비교한 결과이다.
도 2는 뇌조직 유래 세포주에서 miR-140-3p와 KIF5A 유전자의 발현 상관관계를 확인한 결과이다.
도 2는 뇌조직 유래 세포주에서 miR-140-3p와 KIF5A 유전자의 발현 상관관계를 확인한 결과이다.
이하, 본 발명에 대해 상세히 설명한다.
본 발명은 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염에 의한 질병 진단용 바이오마커 조성물을 제공한다.
본 발명에 있어서, 상기 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis, S. parauberis)는 국내 넙치 양식장에서 높은 분리율을 보이며 연쇄상구균 감염증의 주요 원인체로 떠오르고 있다. S. parauberis에 감염된 넙치는 체색흑화, 무안측출혈, 비정상적인 유영과 섭식이 불량해지며 만성소모성(cachexia)으로 폐사가 발생한다. 특히 S. parauberis 감염 질병은 감염성을 지닌 바, 이를 정확하게 진단할 수 있는 기술 개발이 반드시 필요하다.
본 발명에 있어서, "miRNA(microRNA)"는, mRNA의 3' 비번역 영역(UTR) 부위와의 염기결합을 통해 전사 후 억제자 역할을 하는 대략 22 nt의 비번역 RNA를 의미한다.
본 발명의 일실시예에 다르면, 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치의 경우 miRNA인 miR-140-3p의 발현이 정상 개체 대비 현저히 감소하였으며, 이의 표적유전자인 KIF5A의 발현은 정상 개체 대비 증가한 것을 확인하였다.
따라서 본 발명은 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병인 연쇄상구균감염증 감염 여부를 진단하는데 사용할 수 있다.
본 발명에 있어서, "진단"은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 상기 진단은 발병 여부뿐만 아니라 예후, 경과, 병기 등의 모니터링에 필요한 객관적인 기초정보를 제공할 수 있으며, 의사의 임상학적 판단 또는 소견은 제외된다. 본 발명의 목적상, 진단은 스트렙토코커스 파라우베리스에 의한 질병, 즉 연쇄상구균감염증의 발병, 경과, 병기 상태 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다.
본 발명에 있어서, "바이오마커"는 진단용 마커로도 쓰일 수 있으며, 생물학적 시료에서 스트렙토코커스 파라우베리스에 의한 질병의 발생 여부를 구분하여 진단할 수 있는 물질로, 정상 시료에 비하여 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 개체에서 채취한 시료에서 발현 증가 또는 감소를 보이는 특정 인자를 의미한다.
또한 본 발명은 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 제제를 포함하는, 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물을 제공한다.
상기 제제는 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 특이적으로 결합하는 올리고펩타이드, 모노클로날 항체, 폴리클로날 항체, 키메릭(chimeric) 항체, 리간드, PNA(Peptide nucleic acid), 앱타머(aptamer), 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 또는 프로브일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 상기 "항체"는 당해 분야에서 공지된 용어로서 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 의미한다. 본 발명의 목적상, 항체는 본 발명의 바이오마커인 KIF5A에 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, 이러한 항체는, 각 유전자를 통상적인 방법에 따라 발현벡터에 클로닝하여 상기 마커 유전자에 의해 코딩되는 단백질을 얻고, 얻어진 단백질로부터 통상적인 방법에 의해 제조될 수 있다. 여기에는 상기 단백질에서 만들어질 수 있는 부분 펩티드도 포함된다. 본 발명의 항체의 형태는 특별히 제한되지 않으며 폴리클로날 항체, 모노클로날 항체 또는 항원 결합성을 갖는 것이면 그것의 일부도 본 발명의 항체에 포함되고 모든 면역 글로불린 항체가 포함된다.
본 발명의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 바이오마커의 검출에 사용되는 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 뜻하며 Fab, F(ab'), F(ab') 2 및 Fv 등이 있다.
본 발명에 있어서, "프라이머"는 짧은 자유 3말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 핵산 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 템플레이트 가닥 복사를 위한 시작지점으로 기능을 하는 짧은 핵산 서열을 의미한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 폴리머레이즈 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성이 개시할 수 있다. 구체적으로, miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 폴리뉴클레오티드의 센스 및 안티센스 프라이머를 이용한 PCR 증폭을 실시하여 원하는 생성물의 생성 여부를 통해 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 여부를 진단할 수 있다. PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 것을 기초로 변형할 수 있다.
본 발명에 있어서, "프로브"는 mRNA와 특이적 결합을 이룰 수 있는 짧게는 수 염기 내지 길게는 수백 염기에 해당하는 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미하며 라벨링 되어 있어서 특정 mRNA의 존재 유무를 확인할 수 있다.
프로브는 올리고뉴클로타이드(oligonucleotide) 프로브, 단일가닥 DNA(single stranded DNA) 프로브, 이중가닥 DNA(double stranded DNA) 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다. 적당한 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당업계에 공지된 것을 기초로 변형할 수 있다.
본 발명의 프라이머 또는 프로브는 포스포르아미다이트 고체 지지체 방법, 또는 기타 널리 공지된 방법을 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 분야에 공지된 많은 수단을 이용하여 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 비-제한적인 예로는 메틸화, "캡화", 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면, 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있다.
더불어 본 발명은 본 발명에 따른 바이오마커 조성물 또는 진단용 조성물을 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 구체예에서, 상기 키트는 RT-PCR 키트, DNA 칩 키트 또는 단백질 칩 키트일 수 있으며, 이에 제한되지 않는다.
상기 키트에는 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 바이오마커 조성물, 또는 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 제제뿐만 아니라, 면역학적 분석에 사용되는 당 분야에서 일반적으로 사용되는 도구, 시약 등이 포함될 수 있다.
상기 도구 또는 시약의 일 예로, 적합한 담체, 검출 가능한 신호를 생성할 수 있는 표지 물질, 발색단(chromophores), 용해제, 세정제, 완충제, 안정화제 등이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 표지물질이 효소인 경우에는 효소 활성을 측정할 수 있는 기질 및 반응 정지제를 포함할 수 있다. 담체는 가용성 담체, 불용성 담체가 있고, 가용성 담체의 일 예로 당 분야에서 공지된 생리학적으로 허용되는 완충액, 예를 들어 PBS가 있고, 불용성 담체의 일 예로 폴리스틸렌, 폴리에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리아크릴로니트릴, 불소 수지, 가교 덱스트란, 폴리사카라이드, 라텍스에 금속을 도금한 자성 미립자와 같은 고분자, 기타 종이, 유리, 금속, 아가로오스 및 이들의 조합일 수 있다.
본 발명의 키트는 상술한 바이오마커 조성물 또는 진단용 조성물을 구성으로 포함하므로, 중복된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
또한 본 발명은 시료로부터 넙치의 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 단계를 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공한다.
본 발명의 정보 제공 방법에 있어서, 상기 miR-140-3p의 발현 또는 활성이 정상 대조군 대비 낮은 경우 질병이 발생한 것으로 진단하며, 상기 KIF5A의 발현 또는 활성이 정상 대조군 대비 높은 경우 질병이 발생한 것으로 진단할 수 있다.
본 발명에 있어서, "시료"란 본 발명의 유전자 또는 단백질의 발현이 검출될 수 있는 대상 개체로부터 얻어지는 모든 시료를 의미한다.
바람직하게는, 상기 시료는 생검(biopsy), 혈액, 혈청, 혈장, 림프액, 뇌척수액, 복수, 피부 조직, 액체 배양물, 분변 및 소변으로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상일 수 있으며, 특별히 이에 제한되지 않고, 본 발명의 기술분야에서 통상적으로 사용되는 방법으로 처리하여 준비될 수 있다.
본 발명에 있어서 "miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정"이란, 예컨대, 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 여부를 진단하기 위하여 생물학적 시료에서의 본 발명에 따른 바이오마커 유전자에서 발현된 단백질 또는 이를 코딩하는 mRNA의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정일 수 있으며, 상기 단백질 또는 이를 코딩하는 mRNA에 대하여 특이적으로 결합하는 분자를 이용하여 단백질 또는 이를 코딩하는 mRNA의 양을 확인하는 것이다.
상기 측정은 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 코딩하는 mRNA 양을 확인할 수 있는 공지의 어느 방법이든 사용하여 수행할 수 있다. 이를 위하여 역전사효소 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합효소반응(competitive RT-PCR), 실시간 중합효소반응(real time RT-PCR), 실시간 역전사효소 중합효소반응(real time quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RNase protection method), 노던 블랏팅(Northern blotting) 및 DNA칩으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상으로 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또는 상기 측정은 KIF5A 유전자에서 발현된 단백질을 측정하는 것을 의미하는 것일 수 있으며, 공지의 어느 방법이든 사용하여 수행할 수 있다. 이를 위하여 웨스턴 블랏팅, ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), ELLA (enzyme-linked lectin assay), 방사선면역분석(Radioimmunoassay,RIA), 방사 면역확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 면역조직화학염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체고정분석(Complement Fixation Assay), FACS 및 단백질 칩(protein chip)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상으로 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상술한 본 발명의 내용은 상호 모순되지 않는 한, 서로 동일하게 적용되며, 당해 기술분야의 통상의 기술자가 적절한 변경을 가해 실시하는 것 또한 본 발명의 범주에 포함된다.
이하 본 발명을 실시예를 통해 상세하게 설명하나 본 발명의 범위가 하기 실시예로만 한정되는 것은 아니다.
실시예 1. 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치 준비
일주일간의 순치 과정이 끝난 넙치들을 각 실험군과 대조군으로 나눈 후 스트렙토코커스 파라우베리스 균 감염이 잘 일어나게 되는 고온의 환경에 적응시킬 수 있도록 수조의 온도가 26℃가 될 때까지 매일 1℃씩 올려주었다. 그 후 실험군의 넙치에 스트렙토코커스 파라우베리스 균이 9x103 CFU가 되도록 배양한 배양액 100μl을 피하주사를 통해 주입하고 대조군의 넙치에는 같은 양의 PBS(phosphate buffer saline)를 주입하였다. 균 감염 후 1일 그리고 3일이 지났을 때 대조군과 실험군에서 무작위로 세 마리의 넙치를 선택하여 뇌 조직을 적출하였다. 적출한 뇌 조직은 트리졸(trizol)에 담가 -80℃에서 RNA를 추출하기 전까지 보관하였다.
실시예 2. 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 넙치와 정상 넙치의 유전자 발현 차이 확인
상기 실시예 1의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 넙치와 정상 넙치의 뇌 조직을 채취하고 이로부터 RNA를 추출하였다. 그 후 특정 유전자인 miR-140-3p의 발현 차이를 확인하기 위하여 하임바이오텍사의 HB_I RT Reaction kit를 이용하여 추출한 RNA를 상보적 DNA(complementary DNA, cDNA)로 합성한 후 이를 이용해 실시간 중합효소 연쇄반응(real-time polymerase chain reaction)을 수행하였다. 이 때 실시간 중합효소 연쇄반응은 하임바이오텍사의 HB_I Real-Time PCR Master Mix kit를 사용하여 제조사의 지시에 따라 수행하였고, miR-140-3p의 발현의 정도를 비교하기 위한 참조유전자(reference gene)으로는 RN_U6를 사용하였다. 그 결과 도 1 중 A에 나타낸 바와 같이, 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 후 1일 및 3일이 지난 개체의 뇌 조직에서(day post-infection, DPI) miR-140-3p의 발현이 정상 넙치 대비 현저히 감소한 것을 확인하였다.
한편, 수지상세포가 항원제시세포로서의 기능을 하는데 기여하는 단백질인 키네신-1(Kinesin-1)의 구성 인자 중 하나인 KIF5A를 miR-140-3p의 표적 유전자 후보로 선정하고, 이의 발현 변화도 확인하였다. 이때 SmartGene사의 SYBR Green Q-PCR Master Mix with High Rox kit를 이용하여 실시간 중합효소 연쇄반응을 수행하였으며, 하기 표 1의 프라이머를 사용하였다.
| 프라이머 | 서열(5'-3') | 온도(℃) |
| KIF5A_3’UTR | TGACCCAGTGTCTGTTGCTC | 60 |
| TATCTCCCGAATGTGCTTGG | ||
| GAPDH | CAACGGCGACACTCACTCCTC | 60 |
| TCGCAGACACGGTTGCTGTAG |
그 결과 도 1 중 B에 나타낸 바와 같이, 스트렙토코커스 파라우베리스 감염시 KIF5A의 발현이 증가되는 것을 확인한 바, KIF5A가 miR-140-3p의 유의미한 표적유전자이며 스트렙토코커스 파라우베리스 감염 여부를 판별할 수 있는 진단 마커가 될 수 있음을 확인하였다.
실시예 3. miR-140-3p와 KIF5A 유전자의 발현 상관관계 확인
뇌 조직 유래 세포주인 U373에서 발광효소분석(Luciferase assay)을 통해 miR-140-3p와 KIF5A 유전자의 발현 상관관계를 확인하였다. 유전자 클로닝 (gene cloning) 과정을 통해 KIF5A 유전자의 3’UTR 부분을 포함하는 증폭 부위가 삽입된 psi-CHECK2 벡터 플라스미드(psi-CHECK2 + KIF5A)와 음성대조군을 위한 negative control, miR-140-3p의 시퀀스를 가지는 미믹(mimic), 그리고 미믹에 상보적으로 결합하여 그 기능을 억제하는 억제제(inhibitor)를 발광효소 분석에 이용하였다. 이들을 U373 세포주에 공동-형질주입(co-transfection)하여 결과를 확인하였을 때 도 2와 같이, miR-140-3p 미믹(mimic)을 처리했을 때 KIF5A의 발현이 감소하고, miR-140-3p의 억제제(inhibitor)를 처리했을 때 KIF5A의 발현이 증가하는 것을 확인하였다. 또한 미믹과 억제제를 함께 처리한 경우, 플라스미드만 처리한 컨트롤과 비교시 발현값이 차이가 없을만큼 회복된 것을 확인하였다. 따라서 KIF5A가 miR-140-3p에 의하여 발현이 조절되는 유의미한 표적 유전자임을 확인하였다.
종합적으로 본 발명은 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis)에 감염된 넙치와 정상 개체의 특정 마커의 발현 변화를 확인한 것으로, 스트렙토코커스 파라우베리스에 감염된 넙치의 경우, 정상 대조군보다 miR-140-3p의 발현 수준이 저하되며, 상기 miR-140-3P의 표적유전자인 KIF5A의 발현 수준이 높아지는 것을 확인하였으므로 이를 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염 여부를 진단하기 위한 바이오마커 조성물, 진단용 조성물, 진단용 키트 또는 정보 제공 방법 등에 유용하게 활용할 수 있다.
Claims (10)
- miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스(Streptococcus parauberis) 감염에 의한 질병 진단용 바이오마커 조성물.
- 제 1항에 있어서,
상기 질병은 연쇄상구균감염증인 것을 특징으로 하는, 바이오마커 조성물.
- miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 제제를 포함하는, 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물.
- 제 3항에 있어서,
상기 제제는 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 특이적으로 결합하는 올리고펩타이드, 모노클로날 항체, 폴리클로날 항체, 키메릭(chimeric) 항체, 리간드, PNA(Peptide nucleic acid), 앱타머(aptamer), 안티센스(anti-sense) 뉴클레오티드, 프라이머 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 진단용 조성물.
- 제 1항의 바이오마커 조성물 또는 제 3항의 진단용 조성물을 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 키트.
- 시료로부터 miR-140-3p 및 KIF5A로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 또는 활성을 측정하는 단계를 포함하는 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단을 위한 정보 제공 방법.
- 제 6항에 있어서,
상기 miR-140-3p의 발현 또는 활성이 정상 대조군 대비 낮은 경우 질병이 발생한 것으로 진단하는 것을 특징으로 하는, 정보 제공 방법.
- 제 6항에 있어서,
상기 KIF5A의 발현 또는 활성이 정상 대조군 대비 높은 경우 질병이 발생한 것으로 진단하는 것을 특징으로 하는, 정보 제공 방법.
- 제 6항에 있어서,
상기 측정은 역전사 중합효소반응, 경쟁적 역전사 중합효소반응, 실시간 역전사 중합효소반응, RNase 보호 분석법(RPA), 노던 블랏팅 및 DNA 칩으로 구성된 군으로부터 선택된 1 종 이상의 mRNA 검출 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보 제공 방법.
- 제 6항에 있어서,
상기 측정은 웨스턴 블랏팅, ELISA (Enzymelinked immunosorbent assay), ELLA (enzyme-linked lectin assay), 방사선 면역분석법, 방사선 면역확산법, 오우크테로니(Ouchterlony) 면역확산법, 로케트 면역전기영동, 면역조직화학염색, 면역침전분석, 보체고정분석, FACS 및 단백질 칩으로 구성된 군으로부터 선택된 1 종 이상의 단백질 검출 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는, 정보 제공 방법.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020210127390A KR102609984B1 (ko) | 2021-09-27 | 2021-09-27 | 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020210127390A KR102609984B1 (ko) | 2021-09-27 | 2021-09-27 | 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20230044816A true KR20230044816A (ko) | 2023-04-04 |
| KR102609984B1 KR102609984B1 (ko) | 2023-12-05 |
Family
ID=85928667
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR1020210127390A KR102609984B1 (ko) | 2021-09-27 | 2021-09-27 | 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| KR (1) | KR102609984B1 (ko) |
-
2021
- 2021-09-27 KR KR1020210127390A patent/KR102609984B1/ko active IP Right Grant
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| "Discovery of differentially expressed miRNAs in response to Streptococcus parauberis infection in zebrafish(Danio rerio)" Thiloma Dhilrukshi Liyanage, 충남대학교 대학원 수의학과 석사학위논문 (2020. 08.) 1부.* * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR102609984B1 (ko) | 2023-12-05 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2654587C2 (ru) | Способ предсказания рецидива рака молочной железы при эндокринном лечении | |
| EP1781814B3 (en) | Methods and kit for the prognosis of breast cancer | |
| US20110091377A1 (en) | Biomarkers for melanoma | |
| KR101966493B1 (ko) | 삼중음성유방암 예후 예측용 바이오마커 | |
| CN109735623B (zh) | 一种结直肠癌生物标志物 | |
| KR20140123437A (ko) | 피부 자극 물질 스크리닝용 조성물 및 이를 이용한 피부 자극 물질의 스크리닝 방법 | |
| KR20190114298A (ko) | 위암 예후 또는 약물 반응성 예측용 바이오마커 | |
| KR101416147B1 (ko) | 위암 진단 및 치료를 위한 ａｄｃｙ3의 용도 | |
| KR101929009B1 (ko) | 뇌졸중 진단용 조성물 및 이를 진단하는 방법 | |
| KR101847815B1 (ko) | 삼중음성유방암의 아형 분류 방법 | |
| KR20120004286A (ko) | 림프종 진단 또는 예후 마커로서 Ｐｅｌｌｉｎｏ 1 | |
| JP6711968B2 (ja) | 子宮体がんのリンパ節転移能の評価方法 | |
| KR102609984B1 (ko) | 넙치의 스트렙토코커스 파라우베리스 감염에 의한 질병 진단용 조성물 | |
| KR102505618B1 (ko) | 신장이식 후 항체 매개성 거부반응의 진단을 위한 소변 엑소좀 유래 miRNA 유전자 바이오마커 및 이의 용도 | |
| CN112029864B (zh) | 一种乳腺癌miRNA检测试剂盒及其应用 | |
| KR102505617B1 (ko) | 신장이식 후 T 세포 매개성 거부반응의 진단을 위한 소변 엑소좀 유래 miRNA 유전자 바이오마커 및 이의 용도 | |
| CN108753790B (zh) | 与bavm相关的基因标志物及其突变 | |
| KR101871847B1 (ko) | Igbp1을 포함하는 루프스 신염 진단용 바이오 마커 조성물 | |
| CN107385081B (zh) | 一种与肾癌相关的基因及其应用 | |
| US20180030535A1 (en) | Biomarker for diagnosis of moyamoya disease | |
| US20120156681A1 (en) | Composition for diagnosis of liver metastasis of colorectal cancer and the use thereof | |
| KR102545543B1 (ko) | BK 바이러스 신병증의 진단을 위한 소변 엑소좀 유래 miRNA 유전자 바이오마커 및 이의 용도 | |
| KR102341302B1 (ko) | TMEM57 또는 NudC 유전자를 이용한 백혈병 진단용 조성물 | |
| EP3321683A1 (en) | Method for evaluating lymph node metastatic potential of endometrial cancer | |
| KR101802473B1 (ko) | TMEM57 또는 NudC 유전자를 이용한 백혈병 진단용 조성물 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| E902 | Notification of reason for refusal | ||
| E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
| GRNT | Written decision to grant |