KR20220126661A - 췌장암의 진단용 조성물 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 췌장암을 진단할 수 있고, 기타 다른 췌장 질환이나 타 암종과 구별하여 진단할 수 있는 조성물, 키트 및 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.

Description

췌장암의 진단용 조성물{Composition for diagnosing pancreatic cancer}
본 발명은 췌장암을 진단하기 위한 조성물, 키트 및 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.
현대인의 주요 질환 중에서, 암의 치료 방법과 진단 방법에 관한 연구는 발병빈도가 높은 폐암, 간암, 위암 등을 중심으로 비교적 활발히 진행되고 있다. 그러나, 발병빈도가 낮은 식도암, 대장암, 췌장암 등에 대한 연구는 상대적으로 저조한 실정이다.
특히, 췌장암은 초기에는 별로 증세를 느끼지 않으며, 이미 전신전이가 일어난 후에 통증과 체중감소 등의 증세가 나타나는 것이 보통이어서, 더욱 치유율이 낮은 편이므로 정기적인 진단이 매우 중요하다. 임상증세는 대부분이 서서히 발병하고, 허약해지기 쉬우며, 식욕감퇴, 체중감소는 가장 흔한 증세이다. 췌장암은 5년 생존율이 1-4%, 중앙생존기간 5개월에 이르는 치명적인 암으로 인체의 암 중에서 가장 불량한 예후를 보이고 있다. 또한, 80-90% 환자에서 진단시 완치를 기대하는 근치적 절제가 불가능한 상태에서 발견되기 때문에 예후가 불량하고 치료는 주로 항암요법에 의존하고 있으므로, 그 어떤 인체 암보다도 조기 진단법 개발이 절실히 요망되고 있다.
현재까지 췌장암에 효과가 있다고 알려진 5-플루오로유라실, 젬시타빈(gemcitabine), 타르세바(tarceva)를 포함한 몇 가지 항암제의 치료 효과는 지극히 저조하며, 항암치료에 대한 반응율은 15% 내외에 불과하고 이러한 사실은 췌장암 환자의 예후를 향상시키기 위해서는 보다 효과적인 조기 진단법 및 치료법의 개발이 절실히 요구되고 있음을 시사한다. 치명적인 췌장암으로 진행되기 전단계인 췌장암의 전구병변에 대한 적절한 진단과 치료가 췌장암 치료 성적 향상에 매우 중요하다.
췌장암 또는 췌장암 전구병변의 진단은 혈액검사(CA19-9), 위, 십이지장의 X선 조영검사, 피부 및 간을 통한 담도촬영과 역행성 내시경 담도촬영술 사용되고 있다. 이들 방법에 의해 질병의 병변을 발견하였으나, 최근에 초음파촬영 및 전산화 단층촬영이 가장 많이 사용된다. 보다 정밀한 조직검사를 수행하여 비교적 정확한 검사결과를 얻을 수도 있다. 그러나, 상기 진단방법은 정확도가 떨어지거나, 환자에게 고통이 따르는 등 그 수행방법이 매우 불편하여 피검자들이 이를 꺼려하는 실정이다. 따라서, 간편하고 신속하게 췌장암 또는 췌장암 전구병변을 진단할 수 있는 검사방법의 개발이 요구되어 왔다.
대한민국 특허 제 10-0819122호 및 대한민국 공개특허 제 2012-0082372호에는, 마트릴린(matrilin), 트랜스티레틴(transthyretin), 스트라티핀(stratifin) 등을 포함하는 다양한 췌장암 마커를 이용한 기술을 개시하고 있지만, 마커마다 그 진단 효율 및 정확성에서 큰 차이를 나타내므로, 효과가 더 우수한 마커를 발굴하고 이를 이용한 진단 방법을 개발할 필요성이 있다.
본 발명의 일 목적은 췌장암 진단용 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 다른 목적은 췌장암 진단용 키트를 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 췌장암을 진단하기 위한 정보 제공 방법을 제공하고자 한다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
본 발명의 일 구현 예에 따르면, PLD4(Phospholipase D Family Member 4), NR4A1(nuclear receptor subfamily 4 group A member 1), KLRF1(Killer Cell Lectin Like Receptor F1) 및 ID3(Inhibitor of DNA binding 3, HLH protein)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자를 포함하는 암의 진단용 바이오마커에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 "PLD4(Phospholipase D Family Member 4)"는 '5'-3' 엑소뉴클레아제(exonuclease) PLD4'로서, 단일 가닥 DNA(ssDNA)를 분해한다. 상기 PLD4는 핵산의 분해를 통해 TLR9을 자극하는 ssDNA의 농도를 감소시킴으로써 염증성 사이토카인 반응을 조절하는 역할을 하며, 활성화된 미세아교세포의 식세포 작용에 관련이 있는 것으로 알려져 있다. 상기 PLD4 단백질은 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "NR4A1(nuclear receptor subfamily 4 group A member 1)"는 NGFIB(nerve growth factor IB) 또는 Nur77로도 알려져 있으며 세포 내 전사 인자에 속하며, 세포 주기 조절, 염증 또는 세포 자멸 등에 관련이 있는 것으로 알려져 있다. 상기 NR4A1은 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "KLRF1(Killer Cell Lectin Like Receptor F1)"는 자연살해세포에서 발현되는 것으로, 세포 독성 및 사이토카인 분비능과 관련된 것으로 알려져 있다. 상기 KLRF1은 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "ID3(Inhibitor of DNA binding 3, HLH protein)"는 헬릭스-루프-헬릭스(helix-loop-helix; HLH) 단백질로 다른 HLH 단백질과 함께 헤테로다이머(heterodimer)를 형성한다. ID3 단백질은 DNA 결합 도메인이 결여되어 있어 상호 작용하는 HLH 단백질의 DNA 결합을 억제한다. 상기 ID3는 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 바이오마커는 IL7R(Interleukin 7 receptor) 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자를 더 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "IL7R(Interleukin 7 receptor)"은 세포 표면에서 발견되는 단백질로 두개의 다른 종류의 단백질 사슬이 헤테로다이머를 형성하고 있으며, CD127과 CD132의 두 서브유닛으로 이루어져 있다. IL7R은 다양한 나이브 및 기억 T 세포를 포함하여 다양한 세포에서 관찰되며, 면역 세포의 발달에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 상기 IL7R은 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 일 예시에서, 상기 바이오마커는 PLD4 및 ID3을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 일 예시에서, 상기 바이오마커는 PLD4, ID3 및 IL7R을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 일 예시에서, 상기 바이오마커는 PLD4, ID3, NR4A1 및 KLRF1을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 일 예시에서, 상기 바이오마커는 PLD4, ID3, NR4A1, KLRF1 및 IL7R을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 바이오마커는 목적하는 개체에서 분리된 생물학적 시료로, 바람직하게는 액체 생검(liquid biopsy)으로, 예를 들면 혈액, 혈청 또는 혈장으로부터 분리된 세포 또는 엑소좀에서 발현되어 이로부터 발현 수준 등이 측정될 수 있다.
본 발명에서 상기 "목적하는 개체"란 암이 발병하였거나 발병 가능성이 높은 개체로, 인간을 포함하는 포유 동물일 수 있고, 예를 들면, 인간, 래트, 마우스, 모르모트, 햄스터, 토끼, 원숭이, 개, 고양이, 소, 말, 돼지, 양 및 염소로 구성된 군으로부터 선택될 수 있고, 바람직하게는 인간일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 목적하는 개체로부터 분리된 액체 생검, 또는 상기 액체 생검에서 분리된 세포 또는 엑소좀에서 본 발명에 따른 마커의 발현 수준을 측정하는 경우, 환자를 개복하여 조직(예를 들면, 췌장 조직)으로부터 조직 세포를 분리하는 등의 침습 과정이 필요 없고, 상기한 생검을 획득하기까지는 대략 5분 이내로 소요되며, 상기 생검으로부터 본 발명에 따른 다양한 질환 바이오마커의 발현 수준을 측정하는 데에도 대략 2시간 이내로 소요되어 매우 신속하고 간편하게 질환의 발병 여부 또는 발병 가능성을 확인할 수 있다.
본 발명에서 상기 "암"은 포유류에서 전형적으로 조절되지 않는 세포 성장으로 특징 지어진 생리적 상태를 나타내거나 가리킨다. 상기 암은 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종일 수 있고, 바람직하게는 췌장암일 수 있으나, 종양의 분화 및/또는 증식 등 암의 진행이 본 발명에서 기술하는 암 세포 및/또는 암 줄기세포에 의존적인 암의 종류라면 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 상기 "췌장암(pancreatic cancer)"이란 췌장 세포에서 기원하는 암을 의미한다. 췌장암에는 여러 가지 종류가 있는데 췌관 세포에서 발생한 췌관 선암종이 90% 정도를 차지하고 있어 일반적으로 췌장암이라고 하면 췌관 선암종을 의미한다. 그 외에 낭종성암(낭선암), 내분비종양 등이 있다. 췌장암 환자 중 약 5~10%는 유전 소인을 가지고 있는데, 췌장암 환자에서 췌장암의 가족력이 있는 경우는 약 7.8% 정도로 일반인에서의 췌장암 발생률 0.6%에 비해 빈도가 높다. 췌장암은 5년 생존율이 5% 이하로 예후가 매우 나쁜 암이다. 그 이유는 대부분 암이 진행된 후에 발견되기 때문에 발견 당시 수술 절제가 가능한 경우가 20% 이내이고, 육안으로 보기에 완전히 절제되었다 하더라도 미세 전이에 의해 생존율 향상이 적으며, 항암제 및 방사선 치료에 대한 반응이 낮기 때문이다. 따라서, 생존율을 향상시킬 수 있는 가장 중요한 방법은 증상이 없거나 비특이적일 때 조기 발견하여 수술하는 것이다.
본 발명에서 상기 "진단"은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상, 상기 진단은 암의 발병, 성장, 진행 또는 전이 등의 가능성을 예측하는 것일 수 있고, 혹은 암을 다른 질환, 예를 들어 췌장 질환으로 특히는 췌장염(급성 또는 만성 모두 포함), 췌장 양성 종양(지방종(lipoma) 또는 췌관내 유두 점액 종양(IPMN) 등)과 구별하는 것일 수 있으며, 혹은 암종을 구별하여 특히는 췌장암을 다른 암종과 구별하는 것일 수 있다.
본 발명에서 상기 "췌장염(pancreatitis)"이란 췌장(pancreas)에 염증이 발생하여 생기는 질병으로 급성 췌장염(acute pancreatitis) 및 만성 췌장염(chronic pancreatitis)이 있다. 이자액(pancreatic juice)은 아밀라아제(amylase, 탄수화물을 가수분해함), 트립신(trypsin, 단백질 가수분해에 작용), 리파아제(lipase, 지방 가수분해에 작용)와 같은 소화 효소를 포함한다. 췌장염은 과음(alcohol abuse), 담석(gallstones) 등에 의해서 이자액이 원활하게 흐르지 않아 상기 효소들이 췌장의 자가분해를 유발하여 발생할 뿐만 아니라, 대사 장애, 약물, 복부 손상 등의 다양한 원인 등에 의해서도 발생한다. 췌장염은 췌장선세포의 손상, 광범위한 간질성 부종, 출혈 및 손상 부위로의 호중구성 과립구의 이동을 유발하는 췌장의 염증성 질환이다. 췌장염은 크게 두 가지 유형으로 나누어 볼 수 있는데, 간질성 부종(interstitial edema)과 췌장주변의 지방성 괴사(peripancreatic fat necrosis)가 발견되는 경증(mild type)의 췌장염, 췌장주변(peripancreatic) 및 췌장 내부(intrapancreatic)의 광범위한 지방성 괴사, 췌장의 유조직 궤사(pancreatic parenchymal necrosis), 출혈을 동반하는 중증(severe type)의 췌장염이 있다.
본 발명의 다른 구현 예에 따르면, PLD4, NR4A1, KLRF1 및 ID3로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 유효 성분으로 포함하는 암의 진단용 조성물에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 진단용 조성물은 IL7R 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 추가로 더 포함할 수 있다.
본 발명의 일 예시에서, 상기 진단용 조성물은 PLD4 및 ID3의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 유효 성분으로 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 일 예시에서, 상기 진단용 조성물은 PLD4, ID3 및 IL7R의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 유효 성분으로 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 일 예시에서, 상기 진단용 조성물은 PLD4, ID3, NR4A1 및 KLRF1의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 유효 성분으로 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 일 예시에서, 상기 진단용 조성물은 PLD4, ID3, NR4A1, KLRF1 및 IL7R의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 유효 성분으로 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "항체"는 항원과 특이적으로 결합하여 항원-항체 반응을 일으키는 물질을 가리킨다. 본 발명의 목적상, 항체는 상기 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미한다. 본 발명의 항체는 다클론 항체, 단클론 항체 및 재조합 항체를 모두 포함한다. 상기 항체는 당 업계에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 다클론 항체는 상기 단백질의 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 과정을 포함하는 당 업계에 널리 공지된 방법에 의해 생산될 수 있다. 이러한 다클론 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 소, 개 등의 임의의 동물로부터 제조될 수 있다. 또한, 단클론 항체는 당 업계에 널리 공지된 하이브리도마 방법(hybridoma method; Kohler 및 Milstein (1976) European Journal of Immunology 6:511-519 참조), 또는 파지 항체 라이브러리 기술(Clackson et al, Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991 참조)을 이용하여 제조될 수 있다. 상기 방법으로 제조된 항체는 겔 전기영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등의 방법을 이용하여 분리, 정제될 수 있다. 또한, 본 발명의 항체는 2개의 전장의 경쇄 및 2개의 전장의 중쇄를 갖는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란, 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등이 있다.
본 발명에서 상기 "올리고펩타이드"는 펩타이드로 2 내지 20 개의 아미노산으로 구성되며 디 펩티드, 트리 펩티드, 테트라 펩티드 및 펜타 펩티드를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 상기 "PNA(Peptide Nucleic Acid)"는 인공적으로 합성된, DNA 또는 RNA와 비슷한 중합체를 가리키며, 1991년 덴마크 코펜하겐 대학교의 Nielsen, Egholm, Berg와 Buchardt 교수에 의해 처음으로 소개되었다. DNA는 인산-리보스당 골격을 갖는데 반해, PNA는 펩타이드 결합에 의해 연결된 반복된 N-(2-아미노에틸)-글리신 골격을 가지며, 이로 인해 DNA 또는 RNA에 대한 결합력과 안정성이 크게 증가되어 분자 생물학, 진단 분석 및 안티센스 치료법에 사용되고 있다. PNA는 문헌[Nielsen PE, Egholm M, Berg RH, Buchardt O (December 1991). "Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide". Science 254 (5037): 1497-1500]에 상세하게 개시되어 있다.
본 발명에서 상기 "앱타머"는 올리고핵산 또는 펩타이드 분자이며, 앱타머의 일반적인 내용은 문헌[Bock LC et al., Nature 355(6360):5646(1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine". J Mol Med. 78(8):42630(2000); Cohen BA, Colas P, Brent R. "An artificial cell-cycle inhibitor isolated from a combinatorial library". Proc Natl Acad Sci USA. 95(24): 142727(1998)]에 상세하게 개시되어 있다.
본 발명에서 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "프라이머"는 표적 유전자 서열을 인지하는 단편으로서, 정방향 및 역방향의 프라이머 쌍을 포함하나, 바람직하게는, 특이성 및 민감성을 가지는 분석 결과를 제공하는 프라이머 쌍이다. 프라이머의 핵산 서열이 시료 내 존재하는 비-표적 서열과 불일치하는 서열이어서, 상보적인 프라이머 결합 부위를 함유하는 표적 유전자 서열만 증폭하고 비특이적 증폭을 유발하지 않는 프라이머일 때, 높은 특이성이 부여될 수 있다.
본 발명에서 상기 "프로브"란 시료 내의 검출하고자 하는 표적 물질과 특이적으로 결합할 수 있는 물질을 의미하며, 상기 결합을 통하여 특이적으로 시료 내의 표적 물질의 존재를 확인할 수 있는 물질을 의미한다. 프로브의 종류는 당 업계에서 통상적으로 사용되는 물질로서 제한은 없으나, 바람직하게는 PNA(peptide nucleic acid), LNA(locked nucleic acid), 펩타이드, 폴리펩타이드, 단백질, RNA 또는 DNA일 수 있으며, 가장 바람직하게는 PNA이다. 보다 구체적으로, 상기 프로브는 바이오 물질로서 생물에서 유래되거나 이와 유사한 것 또는 생체 외에서 제조된 것을 포함하는 것으로, 예를 들어, 효소, 단백질, 항체, 미생물, 동식물 세포 및 기관, 신경세포, DNA, 및 RNA일 수 있으며, DNA는 cDNA, 게놈 DNA, 올리고뉴클레오타이드를 포함하며, RNA는 게놈 RNA, mRNA, 올리고뉴클레오타이드를 포함하며, 단백질의 예로는 항체, 항원, 효소, 펩타이드 등을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "LNA(Locked nucleic acids)"란, 2'-O, 4'-C 메틸렌 브릿지를 포함하는 핵산 아날로그를 의미한다 [J Weiler, J Hunziker and J Hall Gene Therapy (2006) 13, 496.502]. LNA 뉴클레오사이드는 DNA와 RNA의 일반적 핵산 염기를 포함하며, Watson-Crick 염기 쌍 규칙에 따라 염기 쌍을 형성할 수 있다. 하지만, 메틸렌 브릿지로 인한 분자의 'locking'으로 인해, LNA는 Watson-Crick 결합에서 이상적 형상을 형성하지 못하게 된다. LNA가 DNA 또는 RNA 올리고뉴클레오티드에 포함되면, LNA는 보다 빠르게 상보적 뉴클레오티드 사슬과 쌍을 이루어 이중 나선의 안정성을 높일 수 있다.
본 발명에서 상기 "안티센스"는 안티센스 올리고머가 왓슨-크릭 염기쌍 형성에 의해 RNA 내의 표적 서열과 혼성화되어, 표적서열 내에서 전형적으로 mRNA와 RNA: 올리고머 헤테로이중체의 형성을 허용하는, 뉴클레오티드 염기의 서열 및 서브유닛간 백본을 갖는 올리고머를 의미한다. 올리고머는 표적 서열에 대한 정확한 서열 상보성 또는 근사 상보성을 가질 수 있다.
본 발명에 따른 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 단백질이나, 이들을 코딩하는 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당 업자라면 이를 바탕으로 상기 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 또는 안티센스 뉴클레오티드를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.
본 발명에서 상기 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자는 목적하는 개체에서 분리된 생물학적 시료로, 바람직하게는 액체 생검(liquid biopsy)으로, 예를 들면 혈액, 혈청 또는 혈장으로부터 분리된 세포 또는 엑소좀으로부터 측정될 수 있다.
본 발명에서 상기 암은 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종일 수 있고, 바람직하게는 췌장암일 수 있으나, 종양의 분화 및/또는 증식 등 암의 진행이 본 발명에서 기술하는 암 세포 및/또는 암 줄기세포에 의존적인 암의 종류라면 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 상기 진단용 조성물은 암의 발병, 성장, 진행 또는 전이 등의 가능성을 예측하는 데에 사용될 수 있고, 혹은 암을 다른 질환, 예를 들어 췌장 질환으로 특히는 췌장염(급성 또는 만성 모두 포함), 췌장 양성 종양(지방종(lipoma) 또는 췌관내 유두 점액 종양(IPMN) 등)과 구별하는 데에 사용될 수 있으며, 혹은 암종을 구별하여 특히는 췌장암을 다른 암종과 구별하여 진단하는 데에도 사용될 수 있다.
본 발명의 다른 구현 예에 따르면, 본 발명의 상기 진단용 조성물을 포함하는 암의 진단용 키트에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 "키트"는 바이오 마커 성분에 특이적으로 결합하는 프로브 또는 항체를 검출 가능한 표지로 표지하여 바이오 마커의 발현 수준을 평가할 수 있는 도구를 말한다. 프로브 또는 항체 관련하여 검출 가능한 물질을 기질과의 반응에 의해서 직접적으로 표지하는 것뿐만 아니라, 직접적으로 표지된 다른 시약과의 반응성에 의한 발색하는 표지체가 접합된 간접적 표지도 포함한다. 상기 표지체와 발색 반응할 발색 기질 용액, 세척액 및 기타 다른 용액 등을 포함할 수 있으며, 사용되는 시약 성분을 포함하여 제작될 수 있다. 본 발명에서 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있으며, 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-중합효소, 역전사효소, DNase, RNase 억제제, 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 암 진단을 위한 유전자를 검출하기 위한 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판을 포함하고 기판은 정량 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다. 본 발명의 키트는 당 업계에 공지되어 있는 것이라면, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 상기 키트는 RT-PCR 키트, DNA 칩 키트, ELISA 키트, 단백질 칩 키트, 래피드(rapid) 키트 또는 MRM(Multiple reaction monitoring) 키트일 수 있다.
본 발명의 상기 키트는 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성 성분 조성물, 용액 또는 장치를 더 포함할 수 있다. 예를 들면, 본 발명에서 상기 키트는 역전사 중합효소반응을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 더 포함할 수 있다. 역전사 중합효소반응 키트는 마커 단백질을 코딩하는 유전자에 대해 특이적인 프라이머 쌍을 포함한다. 프라이머는 상기 유전자의 핵산 서열에 특이적인 서열을 가지는 뉴클레오티드로써, 약 7 bp 내지 50 bp의 길이, 보다 바람직하게는 약 10 bp 내지 30 bp의 길이를 가질 수 있다. 또한 대조군 유전자의 핵산 서열에 특이적인 프라이머를 포함할 수 있다. 그 외 역전사 중합효소반응 키트는 테스트 튜브 또는 다른 적절한 용기, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제 DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 암의 진단용 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함할 수 있다. DNA 칩 키트는 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA 또는 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide)가 부착되어 있는 기판, 및 형광표지 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한 기판은 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA 또는 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 암의 진단용 키트는 ELISA를 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함할 수 있다. ELISA 키트는 상기 단백질에 대해 특이적인 항체를 포함한다. 항체는 마커 단백질에 대한 특이성 및 친화성이 높고 다른 단백질에 대한 교차 반응성이 거의 없는 항체로, 단클론 항체, 다클론 항체 또는 재조합 항체이다. 또한 ELISA 키트는 대조군 단백질에 특이적인 항체를 포함할 수 있다. 그 외 ELISA 키트는 결합된 항체를 검출할 수 있는 시약, 예를 들면, 표지된 2차 항체, 발색단(chromophores), 효소(예: 항체와 컨주게이트됨) 및 그의 기질 또는 항체와 결합할 수 있는 다른 물질 등을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 항원-항체 결합반응을 위한 고정체로는 니트로셀룰로오즈 막, PVDF 막, 폴리비닐(polyvinyl) 수지 또는 폴리스티렌(polystyrene) 수지로 합성된 웰 플레이트(Well plate), 유리로 된 슬라이드 글래스 등이 사용될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명에서 상기 2차 항체의 표지체는 발색 반응을 하는 통상의 발색제가 바람직하며, HRP(horseradish peroxidase), 염기성 탈인산화효소(alkaline phosphatase), 콜로이드 골드(coloid gold), FITC(폴리 L-라이신-플루오르세인 아이소티오시아네이트), RITC(로다민-B-아이소티오시아네이트) 등의 형광물질(fluorescein) 및 색소(dye) 등의 표지체가 사용될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명에서 발색을 유도하기 위한 발색 기질은 발색 반응을 하는 표지체에 따라 사용하는 것이 바람직하며, TMB(3,3',5,5'-테트라메틸 베지딘), ABTS[2,2'-아지노-비스(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)], OPD(o-페닐렌다이아민) 등을 사용할 수 있다. 이때, 발색 기질은 완충 용액(0.1 M NaAc, pH 5.5)에 용해된 상태로 제공되는 것이 더욱 바람직하다. TMB와 같은 발색기질은 이차 항체 접합체의 표지체로 사용된 HRP에 의해 분해되어 발색 침적체를 생성하고, 이 발색 침적체의 침적 정도를 육안으로 확인함으로써 상기 마커 단백질들의 존재 유무를 검출한다.
본 발명에서 상기 세척액은 인산염 완충 용액, NaCl 및 트윈 20(Tween 20)을 포함하는 것이 바람직하며, 0.02 M 인산염 완충용액, 0.13 M NaCl, 및 0.05% 트윈 20으로 구성된 완충 용액(PBST)이 더욱 바람직하다. 세척액은 항원-항체 결합 반응 후 항원-항체 결합체에 2차 항체를 반응시킨 다음 적당량을 고정체에 첨가하여 3 내지 6회 세척한다. 반응 정지 용액은 황산 용액(H2SO4)이 바람직하게 사용될 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 PLD4, NR4A1, KLRF1 및 ID3로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 암의 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 목적하는 개체는 암이 발병하였거나 발병 가능성이 높은 개체로, 인간을 포함하는 포유 동물일 수 있고, 예를 들면, 인간, 래트, 마우스, 모르모트, 햄스터, 토끼, 원숭이, 개, 고양이, 소, 말, 돼지, 양 및 염소로 구성된 군으로부터 선택될 수 있고, 바람직하게는 인간일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 생물학적 시료는 개체로부터 얻어지거나 개체로부터 유래된 임의의 물질, 생물학적 체액, 조직 또는 세포를 의미하는 것으로, 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 바람직하게는 액체 생검(liquid biopsy)으로, 예를 들면 혈액, 혈청 또는 혈장으로부터 분리된 세포 또는 엑소좀일 수 있다.
본 발명에서 상기 정보 제공 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 IL7R 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 추가로 더 포함할 수 있다.
본 발명의 일 예시에서, 상기 정보 제공 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 PLD4 및 ID3의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 일 예시에서, 상기 정보 제공 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 PLD4, ID3 및 IL7R의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 일 예시에서, 상기 정보 제공 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 PLD4, ID3, NR4A1 및 KLRF1의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 일 예시에서, 상기 정보 제공 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 PLD4, ID3, NR4A1, KLRF1 및 IL7R의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 단백질의 발현 수준의 측정은 단백질 칩 분석, 면역 측정법, 리간드 바인딩 어세이, MALDI-TOF(Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, SELDI-TOF(Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, 방사선 면역 분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 보체 고정 분석법, 2차원 전기영동 분석, 액상 크로마토그래피-질량분석(liquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS), LC-MS/MS(liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), 웨스턴 블랏팅 또는 ELISA(enzyme linked immunosorbentassay)에 의해 수행될 수 있다.
또한, 본 발명에서 상기 단백질의 발현 수준의 측정은 다중 반응 모니터링 (multiple reaction monitoring; MRM) 방법에 의할 수 있다.
본 발명에서 상기 다중 반응 모니터링 방법 시 내부 표준 물질은 타깃 펩타이드를 구성하는 특정 아미노산을 동위원소로 치환한 합성 펩타이드 또는 대장균 베타 갈락토시다아제를 사용할 수 있다.
본 발명에서 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준의 측정은 역전사 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting) 또는 DNA 칩에 의할 수 있다.
본 발명의 정보 제공 방법에서 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid), 앱타머(aptamer) 등에 관한 기재와 프라이머, 프로브 등에 관한 기재는 앞서 기재된 바와 중복되어 명세서의 과도한 복잡을 피하기 위하여 이하 그 자세한 기재를 생략한다.
본 발명에서는 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 PLD4, NR4A1 및 KLRF1으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 목적하는 개체에 암이 발병하였거나 발병할 가능성이 높은 것으로 예측할 수 있다.
본 발명에서는 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 ID3 및 IL7R 중 적어도 하나의 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이 대조군에 비하여 높은 경우, 상기 목적하는 개체에 암이 발병하였거나 발병할 가능성이 높은 것으로 예측할 수 있다.
본 발명에서 "대조군"이란 건강한 정상 대조군에서의 해당 바이오마커 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이거나, 췌장 질환 환자 유래의 생물학적 시료에서 해당 마커 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준의 평균 값 또는 중앙 값이거나, 암 환자로 바람직하게는 췌장암 외의 타 암종 환자 유래의 생물학적 시료에서 해당 마커 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준의 평균 값 또는 중앙 값일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 정보 제공 방법은, 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준을 하기 식 1에 대입하는 단계를 추가로 더 포함할 수 있다:
[식 1]
A= a1 - b1 X (PLD4) - c1 X (NR4A1) - d1 X (KLRF1) + e1 X (IL7R) + f1 X (ID3)
상기 식 1에서,
a1은 1.5 내지 2.0의 유리수이고, 바람직하게는 1.75 내지 2.0의 유리수이며;
b1은 0.1 내지 0.3의 유리수이고, 바람직하게는 0.15 내지 0.25의 유리수이며;
c1은 0.01 내지 0.03의 유리수이고, 바람직하게는 0.02 내지 0.03의 유리수이며;
d1은 0.005 내지 0.02의 유리수이고, 바람직하게는 0.01 내지 0.02의 유리수이며;
e1은 0.0007 내지 0.0015의 유리수이고, 바람직하게는 0.0009 내지 0.0015의 유리수이며;
f1은 0.05 내지 0.15의 유리수이고, 바람직하게는 0.05 내지 0.10의 유리수이며;
PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R는 각각 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 또는 IL7R 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이다.
본 발명에서 상기 정보 제공 방법은, 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 PLD4, ID3 및 IL7R 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준을 하기 식 2에 대입하는 단계를 추가로 더 포함할 수 있다:
[식 2]
A= - a2 - b2 X (PLD4) + c2 X (IL7R) + d2 X (ID3)
상기 식 2에서,
a2는 0.5 내지 0.9의 유리수이고, 바람직하게는 0.70 내지 0.85의 유리수이며;
b2는 0.1 내지 0.3의 유리수이고, 바람직하게는 0.15 내지 0.25의 유리수이며;
c2는 0.0005 내지 0.0025의 유리수이고, 바람직하게는 0.001 내지 0.002의 유리수이며;
d2는 0.05 내지 0.2의 유리수이고, 바람직하게는 0.10 내지 0.15의 유리수이며;
PLD4, ID3 및 IL7R는 각각 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 PLD4, ID3 또는 IL7R 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이다.
본 발명에서 상기 식 1 또는 2에 대입되는 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R의 값으로, 즉 해당 단백질 또는 유전자의 발현 수준은 하우스키핑(housekeeping) 유전자에 의해 암호화되는 단백질 또는 상기 유전자의 발현 수준의 값으로 정규화된 것일 수 있다. 여기서, 상기 하우스키핑 유전자로는 글리세랄데하이드-3-포스페이트 데시으로제네이즈(glyceraldehyde-3-phosphate desidrogenase; GAPDH), β-액틴(β-actin), 리보솜 단백질(ribosomal proteins; RPL), 유비퀴틴(ubiquitin; UBQ), β-튜뷸린(β-tubulin), 18S 리보솜 단백질(18S ribosomal protein; 18S rRNA) 및 포스포글리세레이트 키네이즈(phosphoglycerate kinase; PGK) 등일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 정보 제공 방법은, 상기 식 1 또는 2로부터 얻어진 값(A)을 하기 식 3에 대입하여 암의 발병 여부 또는 발병 가능성(Pr)을 예측하는 단계를 추가로 더 포함할 수 있다:
[식 3]
Pr = 1/(1+exp(-A))
본 발명에서 상기 식 3으로부터 얻어진 값(Pr)이 0.1 내지 0.4의 유리수 초과인 경우, 바람직하게는 0.2 내지 0.3의 유리수 초과인 경우, 암이 발병하였거나 발병 가능성이 높은 것으로 예측할 수 있다.
본 발명의 정보 제공 방법에서 상기 암이 발병하였거나 발병 가능성이 높은 것으로 예측하는 것은 암의 발병, 성장, 진행 또는 전이 등의 가능성을 예측하는 것을 모두 포함할 뿐만 아니라, 상기 목적하는 개체에서 발병하였거나 발병한 것으로 의심되는 질환을 타 질환으로 특히는, 췌장 질환(예컨대, 췌장염(급성 또는 만성 모두 포함), 췌장 양성 종양(지방종(lipoma) 또는 췌관내 유두 점액 종양(IPMN) 등))과 구별하여 암인 것으로 예측하는 것을 포함하며, 그 외에도 상기 목적하는 개체에서 발병하였거나 발병한 것으로 의심되는 암을 타 암종과 구별하여 췌장암인 것으로 예측하는 것을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 암은 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종일 수 있고, 바람직하게는 췌장암일 수 있으나, 종양의 분화 및/또는 증식 등 암의 진행이 본 발명에서 기술하는 암 세포 및/또는 암 줄기세포에 의존적인 암의 종류라면 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 바이오마커 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정함으로써 암, 특히는 췌장암의 발병 여부나 발병 가능성을 정확하게 예측 또는 진단할 수 있도록 한다. 또한, 본 발명에서는 개체로부터 액체 생검으로부터 상기 바이오마커의 발현 수준을 측정하여 질환의 발병 여부 등을 예측 또는 진단할 수 있으므로, 종래에 비하여 비침습적인 방법으로 간단하고 신속하지만 매우 정확하게 암을 진단할 수 있다.
도 1은 실험예 2에서 건강한 대조군과 췌장암 환자 유래 말초혈액단핵세포에서 PLD4의 발현 수준을 분석한 결과와 이를 바탕으로 췌장암을 진단하기 위한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 2는 실험예 2에서 건강한 대조군과 췌장암 환자군 유래 말초혈액단핵세포에서 NR4A1의 발현 수준을 분석한 결과와 이를 바탕으로 췌장암을 진단하기 위한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 3은 실험예 2에서 건강한 대조군과 췌장암 환자군 유래 말초혈액단핵세포에서 KLRF1의 발현 수준을 분석한 결과와 이를 바탕으로 췌장암을 진단하기 위한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 4는 실험예 2에서 건강한 대조군과 췌장암 환자군 유래 말초혈액단핵세포에서 IL7R의 발현 수준을 분석한 결과와 이를 바탕으로 췌장암을 진단하기 위한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 5는 실험예 3에서 담도암 환자군과 췌장암 환자 유래 말초혈액단핵세포에서 ID3의 발현 수준을 분석한 결과와 이를 바탕으로 췌장암을 진단하기 위한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 6은 실험예 4에서 건강한 대조군과 췌장암 환자군에 대하여 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 췌장암 진단 효율 스코어(score)를 분석한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 7은 실험예 5에서 양성 췌장 질환군과 췌장암 환자군에 대하여 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 췌장암 진단 효율 스코어(score)를 분석한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
도 8은 실험예 5에서 췌장 질환 고위험군과 췌장암 환자군에 대하여 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 췌장암 진단 효율 스코어(score)를 분석한 ROC 곡선을 나타낸 결과이다.
이하, 본 발명을 하기의 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
실시예
[실험예 1]
건강한 대조군 (n=8), 췌장암(PDAC) 환자군 (n=15)의 총 23명의 개체로부터 수득한 말초혈액단핵세포 (PBMC, peripheral blood mononuclear cell)에 대하여 유의하게 발현 수준이 증가 또는 감소한 유전자를 확인하기 위하여 이하의 mRNA-seq 분석(transcriptome sequencing, 전사체 서열분석)을 수행하였고, 대조군 대비 췌장암 환자군의 PBMC에서 유의적으로 발현되는 350 여개의 유전자 중 하기 표 1에 나타낸 최종 4개의 바이오마커를 발굴 및 검증하였다. 실험 방법으로는 상기 시료로부터 총 RNA를 분리한 후 DNase를 이용하여 DNA 오염을 제거한 후 TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep kit를 이용하여 RNA를 정제한 뒤 쇼트 리드(short read)로 시퀀싱하기 위하여 임의로 조각화(fragmentation)하였다. 잘게 쪼개진 RNA 단편에 대하여 역전사 과정을 통해 cDNA를 합성한 후 양 말단에 서로 다른 어댑터(adapter)를 붙이고 이를 연결하였다. cDNA 단편의 양쪽 말단으로부터 리드의 길이만큼 시퀀싱하였다. 이러한 시퀀싱을 통해 얻어진 로우 리드(raw reads)로부터 편차를 줄이기 위한 전처리 과정을 거친 뒤 스플라이스(splice)를 고려한 HISAT2 프로그램을 이용하여 레퍼런스 게놈(reference genome)에 맵핑(mapping)한 후 얼라인 리드(aligned reads)를 생성하였다. 레퍼런스 기반한 얼라인 리드의 정보를 이용하여 StringTie 프로그램을 통해 전사 어셈블리를 진행하였다. 각 샘플의 전사 정량을 통해 얻은 발현량을 리드 카운트(rear count)와 전사 길이 및 커버리지 깊이(depth of coverage)를 고려한 정규화 값인 FPKM(Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads) 값 또는 RPKM(Reads Per Kilobase of transcript per Million mapped reads)으로 발현 프로파일을 추출하였다. 조건이 다른 두 그룹 이상의 발현 값을 통계적인 가설 검증을 통해 차별 발현하는 유전자 또는 전사체를 선별하였다. 알려져 있는 유전 정보가 있는 경우 차별 발현 유전자를 대상으로 GO 및 KEGG 데이터베이스를 기반한 기능적 역할에 대한 주석 및 유전자-세트 풍부 분석(functional annotation and gene-set enrichment analysis)을 진행하였다.
유전자_ID 전사체_ID 명칭 배수
122618 NM_001308174,NM_138790 PLD4 phospholipase D family member 4 -2.007829
3164 NM_001202233,NM_001202234,NM_002135,NM_173157 NR4A1 nuclear receptor subfamily 4 group A member 1 -2.859995
51348 NM_001291822,NM_001291823,NM_001366534,NM_016523 KLRF1 killer cell lectin like receptor F1 -2.460315
3399 NM_002167 ID3 inhibitor of DNA binding 3, HLH protein 2.522447
상기 표 1에서 보는 바와 같이, 건강한 대조군 대비 췌장암 환자에서는 PLD4, NR4A1 및 KLRF1 mRNA의 발현 수준은 감소한 반면, ID3 mRNA 발현 수준은 증가한 것을 확인할 수 있었다.
[실험예 2]
건강한 대조군과 췌장암(PDAC) 환자군의 혈액에서 말초혈액단핵세포 (PBMC, peripheral blood mononuclear cell)를 수득한 뒤 이로부터 RNA를 분리한 후(Qiagen, USA), PrimeScript RT Master MIX(Perfect Real Time, Takara #RR036A)를 이용하여 cDNA를 제조하고, StepOnePlus(AB사) PCR 기기를 사용하여 PCR을 수행하여 각 군에서의 PLD4, NR4A1, KLRF1 및 IL7R mRNA의 발현 수준을 측정해 그 결과를 도 1 내지 4에 나타내었다. 이때 사용한 프라이머 서열은 하기 표 2에 나타낸 바와 같다. 단, 하기 분석에서 민감도 (Sensitivity)는 질병을 가지고 있는 사람이 진단에서 양성의 결과를 얻을 확률을 나타내며, 특이도 (Specificity)는 질병을 가지고 있지 않은 사람이 진단에서 음성의 결과를 얻을 확률을 나타내며 AUC (Area Under the roc Curve)는 ROC 곡선의 아래 면적으로, 예측 인자의 퍼포먼스(performance)를 평가하는 척도이다.
유전자 형태 서열 (5' -> 3')
PLD4 (Ref. NM_138790) 정방향 프라이머 CAA ATT CTG GGT TGT GGA TGG
역방향 프라이머 AGG TGG CTG CAG TTA TAG ATG
NR4A1 (Ref. NM_002135.5) 정방향 프라이머 GACAACGCTTCATGCCAG
역방향 프라이머 TTGTTAGCCAGGCAGATGTAC
KLRF1 (Ref. NM_016523) 정방향 프라이머 GAA AAG GAG TTC TGC CCA AAC
역방향 프라이머 AGA AAC CAA CAG GAT CAA GGA G
IL7R (Ref. NM_002185.5) 정방향 프라이머 GTA GTC ATC ACT CCA GAA AGC
역방향 프라이머 ACC TGG AAG AGG AGA GAA TAG
도 1 내지 4에서 보는 바와 같이, 건강한 대조군에 비하여 췌장암 환자군 유래의 말초혈액단핵세포 (PBMC)에서 PLD4, NR4A1 및 KLRF1의 mRNA 발현 수준은 유의적으로 감소하고(△Ct의 증가), IL7R mRNA 발현 수준은 유의적으로 증가한 것을 확인할 수 있었으며(△Ct의 감소), ROC 커브를 통해 이들 바이오마커를 사용하는 경우 췌장암 진단의 정확도가 뛰어난 것을 알 수 있었다.
[실험예 3]
담도암(CBD) 환자군과 췌장암(PDAC) 환자군의 혈액에서 말초혈액단핵세포 (PBMC, peripheral blood mononuclear cell)를 수득한 뒤 이로부터 RNA를 분리한 후(Qiagen, USA), PrimeScript RT Master MIX(Perfect Real Time, Takara #RR036A)를 이용하여 cDNA를 제조하고, StepOnePlus(AB사) PCR 기기를 사용하여 PCR을 수행하여 각 군에서의 ID3 mRNA의 발현 수준을 측정해 그 결과를 도 5에 나타내었다. 이때 사용한 프라이머 서열은 하기 표 3에 나타낸 바와 같다.
유전자 형태 서열 (5' -> 3')
ID3 (Ref. NM_002167) 정방향 프라이머 GAC TAC ATT CTC GAC CTG CAG
역방향 프라이머 TCG TTG GAG ATG ACA AGT TCC
도 5에서 보는 바와 같이, 담도암 환자군에 비하여 췌장암 환자군 유래의 말초혈액단핵세포 (PBMC)에서 ID3 mRNA 발현 수준이 유의적으로 증가한 것을 확인할 수 있었다(△Ct의 감소).
[실험예 4]
상기 실험예 2 및 3의 결과를 바탕으로 건강한 대조군 및 췌장암 환자군의 예측을 위해 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 진단 효율 스코어(score)를 분석하였다. 분석 소프트웨어는 SASSAS (version 9.3, SAS Inc., Cary, NC, USA)를 사용하였고, 예측 가능성(predicted probability; Pr) 분석하여 하기 식 3 및 4를 도출하였으며, 분석하여 얻어진 ROC 커브는 도 6에 나타내었다.
[식 3]
Pr = 1/(1+exp(-A))
[식 4]
A=1.95710-0.21170X(PLD4)-0.024072X(NR4A1)-0.012005X(KLRF1)+0.00097174X(IL7R)+0.086073X(ID3)
(상기 식 4에서, PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R는 각각 각 군의 말초혈액단핵세포에 대하여 측정된 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 또는 IL7R mRNA의 발현 수준(ΔCt 값)이다.)
그 결과, 도 6에 나타낸 바와 같이, 건강한 대조군과 췌장암 환자군의 예측을 위해 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 예측 가능성(Pr)을 분석한 결과, 진단 정확도(AUC)가 0.910이고, 민감도(sensitivity)가 92.50%, 특이도(specificity)가 97.56%로 모두 매우 높은 값을 가지는 바, 상기 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합을 이용하여 췌장암의 발병 여부 또는 발병 가능성을 뛰어난 정확도로 예측할 수 있음을 알 수 있었다.
[실험예 5]
상기 실험예 2 및 3의 결과를 바탕으로 양성 췌장 질환군(급성 췌장염 및 췌장 지방종) 또는 췌장 질환 고위험군(만성 췌장염 및 IPMN)과 췌장암 환자군의 구별 진단을 위해 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 진단 효율 스코어(score)를 분석하였다. 분석 소프트 웨어는 SASSAS (version 9.3, SAS Inc., Cary, NC, USA)를 사용하였고, 분석하여 얻어진 ROC 커브는 도 7 및 8에 나타내었다.
도 7 및 8에 나타낸 바와 같이, PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합으로 양성 췌장 질환군(급성 췌장염 및 췌장 지방종)과 췌장암 환자군의 진단의 정확도(AUC)가 0.776이었고, 췌장 질환 고위험군(만성 췌장염 및 IPMN)과 췌장암 환자군의 진단의 정확도(AUC)는 0.789로 확인되었는 바, 상기 PLD4, NR4A1, KLRF1, ID3 및 IL7R 5가지 마커 조합은 췌장암을 그 외의 다른 췌장 질환과 구별하여 진단하는 바이오마커로서 의미를 가짐을 알 수 있었다.
[실험예 6]
하기 표 4에 나타낸 췌장암(PDAC) 환자군 (n=50)과, 비-췌장암 환자군 (n=222)의 총 272명의 개체로부터 말초혈액단핵세포(PBMC)를 수득한 뒤, 상기 표 2 및 3에 나타낸 PLD4, ID3 및 IL7R의 프라이머와, 하기 표 5에 나타낸 프로브를 사용하여 PLD4, ID3 및 IL7R의 발현 수준을 측정한 뒤 실험예 4 및 5와 동일한 방법으로, 췌장암 환자군과 비-췌장암 환자군을 구별하기 위한 예측 모형으로 PLD4, ID3 및 IL7R 마커 단독 또는 마커 조합에 대한 로지스틱 회귀 모형을 구축하였다. 이때 예측 가능성(predicted probability; Pr) 분석으로 식 3 및 5를 도출하였다. 상기 분석의 결과는 하기 표 6 및 7에 나타내었다. 단, 하기 표 7에서 각 모형의 예측력(AUC, area under the curve) 과 진단력(sensitivity, specificity, accuracy, PPV, NPV)을 확인하기 위해서 컷-오프 값은 Youden's index(=sensitivity+specificity-1)가 최대가 되는 지점으로 설정하였다.
환자군
췌장암 환자군 (n=50) 비췌장암 환자군 (n=222)
- 정상인 (n=61)
- 고위험군(만성췌장염, 췌장물혹, 췌관 확장 등) (n=56)
- 양성 췌장 질환군 (n=48)
- 기타 소화기계 암종군(담도암, 위암, 대장암, 간암 등) (n=54)
- 기타 (n=3)
[식 3]
Pr = 1/(1+exp(-A))
[식 5]
A= -0.789445 - 0.229438 X (PLD4) + 0.001251 X (IL7R) + 0.134571 X (ID3)
(상기 식 5에서, PLD4, ID3 및 IL7R 각각은 각 군의 말초혈액단핵세포에 대하여 측정된 GAPDH 복제 수 대비 PLD4, ID3 또는 IL7R 마커의 복제 수의 비율(마커 복제 수/GAPDH 복제 수)이다.)
Name Sequence (5'-3') Reporter 5' Quencher 3'
1 PLD4-FAM TCT GAC GCA GGT GAA GGA GCT TG FAM ZEN/IBFQ
2 IL7R-FAM CAG TTG GAA GTG AAT GGA TCG CAG C FAM ZEN/IBFQ
3 ID3-FAM CTC GGC TGT CTG GAT GGG AAG G FAM ZEN/IBFQ
변수 단일 마커 모형 PLD4+ID3+IL7R 조합 마커 모형
Intercept p-value Beta(SE) OR(95% CI) p-value Beta(SE) OR(95% CI) p-value VIF
Intercept -0.034331(0.3140) 0.9129 -0.096451(0.0208) 0.908(0.872-0.946) <.0001 -0.229438(0.0395) 0.795(0.736-0.859) <.0001 1.1554
PLD4 -2.165325(0.3397) <.0001 0.000603(0.0003) 1.001(1.000-1.001) 0.0179 0.001251(0.0004) 1.001(1.000-1.002) 0.0025 1.6804
IL7R -2.116365(0.2716) <.0001 0.072584(0.0237) 1.075(1.026-1.126) 0.0022 0.134571(0.0392) 1.144(1.059-1.235) 0.0006 1.6835
ID3 -0.034331(0.3140) 0.9129 -0.096451(0.0208) 0.908(0.872-0.946) <.0001 -0.229438(0.0395) 0.795(0.736-0.859) <.0001 1.1554
모델 Optimal cut-off point AUC (95% CI) Sensitivity(95% CI) Specificity(95% CI) Accuracy (95% CI) PPV (95% CI) NPV (95% CI)
PLD4 <18.8693 0.727(0.662-0.793) 0.900(0.817-0.983) 0.523(0.457-0.588) 0.592(0.534-0.650) 0.298(0.225-0.371) 0.959(0.923-0.994)
IL7R >1025.40733 0.621(0.533-0.709) 0.660(0.529-0.791) 0.568(0.502-0.633) 0.585(0.526-0.643) 0.256(0.181-0.331) 0.881(0.828-0.934)
ID3 >8.7021 0.640(0.543-0.737) 0.620(0.485-0.755) 0.716(0.657-0.776) 0.699(0.644-0.753) 0.330(0.235-0.425) 0.893(0.848-0.939)
PLD4+ID3+IL7R >0.22016 0.860(0.814-0.907) 0.840(0.738-0.942) 0.788(0.735-0.842) 0.798(0.750-0.846) 0.472(0.368-0.576) 0.956(0.927-0.986)
그 결과, 표 6 및 7에 나타낸 바와 같이, 췌장암과 비-췌장암을 구분함에 있어서 PLD4, IL7R 및 ID3 단일 마커 모형에서 모든 마커의 회귀계수의 p-값이 0.05 미만으로 통계적으로 유의한 것으로 확인되었고, 이에 따라 구축한 PLD4, IL7R 및 ID3의 다항 로지스틱 회귀 모형에 있어서도 3가지 마커의 회귀계수의 p-값이 0.05 미만으로 통계적으로 유의한 것으로 확인되었다. 또한, 진단 정확도(AUC), 민감도 및 특이도가 모두 높은 값을 나타내었고, 3가지 마커의 조합 시 이들 값이 더욱 높아지는 것을 확인할 수 있었다.
이를 통해, PLD4, IL7R 및 ID3의 단일 마커 및 이들의 조합을 이용하여 췌장암을 다른 질환과 구분하여 진단할 수 있음을 알 수 있었다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는 바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> ACURASYSBIO Co.,Ltd <120> Composition for diagnosing pancreatic cancer <130> DP21-062 <150> KR 10-2021-0029877 <151> 2021-03-08 <160> 18 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 506 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Met Leu Lys Pro Leu Trp Lys Ala Ala Val Ala Pro Thr Trp Pro Cys 1 5 10 15 Ser Met Pro Pro Arg Arg Pro Trp Asp Arg Glu Ala Gly Thr Leu Gln 20 25 30 Val Leu Gly Ala Leu Ala Val Leu Trp Leu Gly Ser Val Ala Leu Ile 35 40 45 Cys Leu Leu Trp Gln Val Pro Arg Pro Pro Thr Trp Gly Gln Val Gln 50 55 60 Pro Lys Asp Val Pro Arg Ser Trp Glu His Gly Ser Ser Pro Ala Trp 65 70 75 80 Glu Pro Leu Glu Ala Glu Ala Arg Gln Gln Arg Asp Ser Cys Gln Leu 85 90 95 Val Leu Val Glu Ser Ile Pro Gln Asp Leu Pro Ser Ala Ala Gly Ser 100 105 110 Pro Ser Ala Gln Pro Leu Gly Gln Ala Trp Leu Gln Leu Leu Asp Thr 115 120 125 Ala Gln Glu Ser Val His Val Ala Ser Tyr Tyr Trp Ser Leu Thr Gly 130 135 140 Pro Asp Ile Gly Val Asn Asp Ser Ser Ser Gln Leu Gly Glu Ala Leu 145 150 155 160 Leu Gln Lys Leu Gln Gln Leu Leu Gly Arg Asn Ile Ser Leu Ala Val 165 170 175 Ala Thr Ser Ser Pro Thr Leu Ala Arg Thr Ser Thr Asp Leu Gln Val 180 185 190 Leu Ala Ala Arg Gly Ala His Val Arg Gln Val Pro Met Gly Arg Leu 195 200 205 Thr Arg Gly Val Leu His Ser Lys Phe Trp Val Val Asp Gly Arg His 210 215 220 Ile Tyr Met Gly Ser Ala Asn Met Asp Trp Arg Ser Leu Thr Gln Val 225 230 235 240 Lys Glu Leu Gly Ala Val Ile Tyr Asn Cys Ser His Leu Ala Gln Asp 245 250 255 Leu Glu Lys Thr Phe Gln Thr Tyr Trp Val Leu Gly Val Pro Lys Ala 260 265 270 Val Leu Pro Lys Thr Trp Pro Gln Asn Phe Ser Ser His Phe Asn Arg 275 280 285 Phe Gln Pro Phe His Gly Leu Phe Asp Gly Val Pro Thr Thr Ala Tyr 290 295 300 Phe Ser Ala Ser Pro Pro Ala Leu Cys Pro Gln Gly Arg Thr Arg Asp 305 310 315 320 Leu Glu Ala Leu Leu Ala Val Met Gly Ser Ala Gln Glu Phe Ile Tyr 325 330 335 Ala Ser Val Met Glu Tyr Phe Pro Thr Thr Arg Phe Ser His Pro Pro 340 345 350 Arg Tyr Trp Pro Val Leu Asp Asn Ala Leu Arg Ala Ala Ala Phe Gly 355 360 365 Lys Gly Val Arg Val Arg Leu Leu Val Gly Cys Gly Leu Asn Thr Asp 370 375 380 Pro Thr Met Phe Pro Tyr Leu Arg Ser Leu Gln Ala Leu Ser Asn Pro 385 390 395 400 Ala Ala Asn Val Ser Val Asp Val Lys Val Phe Ile Val Pro Val Gly 405 410 415 Asn His Ser Asn Ile Pro Phe Ser Arg Val Asn His Ser Lys Phe Met 420 425 430 Val Thr Glu Lys Ala Ala Tyr Ile Gly Thr Ser Asn Trp Ser Glu Asp 435 440 445 Tyr Phe Ser Ser Thr Ala Gly Val Gly Leu Val Val Thr Gln Ser Pro 450 455 460 Gly Ala Gln Pro Ala Gly Ala Thr Val Gln Glu Gln Leu Arg Gln Leu 465 470 475 480 Phe Glu Arg Asp Trp Ser Ser Arg Tyr Ala Val Gly Leu Asp Gly Gln 485 490 495 Ala Pro Gly Gln Asp Cys Val Trp Gln Gly 500 505 <210> 2 <211> 598 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Pro Cys Ile Gln Ala Gln Tyr Gly Thr Pro Ala Pro Ser Pro Gly 1 5 10 15 Pro Arg Asp His Leu Ala Ser Asp Pro Leu Thr Pro Glu Phe Ile Lys 20 25 30 Pro Thr Met Asp Leu Ala Ser Pro Glu Ala Ala Pro Ala Ala Pro Thr 35 40 45 Ala Leu Pro Ser Phe Ser Thr Phe Met Asp Gly Tyr Thr Gly Glu Phe 50 55 60 Asp Thr Phe Leu Tyr Gln Leu Pro Gly Thr Val Gln Pro Cys Ser Ser 65 70 75 80 Ala Ser Ser Ser Ala Ser Ser Thr Ser Ser Ser Ser Ala Thr Ser Pro 85 90 95 Ala Ser Ala Ser Phe Lys Phe Glu Asp Phe Gln Val Tyr Gly Cys Tyr 100 105 110 Pro Gly Pro Leu Ser Gly Pro Val Asp Glu Ala Leu Ser Ser Ser Gly 115 120 125 Ser Asp Tyr Tyr Gly Ser Pro Cys Ser Ala Pro Ser Pro Ser Thr Pro 130 135 140 Ser Phe Gln Pro Pro Gln Leu Ser Pro Trp Asp Gly Ser Phe Gly His 145 150 155 160 Phe Ser Pro Ser Gln Thr Tyr Glu Gly Leu Arg Ala Trp Thr Glu Gln 165 170 175 Leu Pro Lys Ala Ser Gly Pro Pro Gln Pro Pro Ala Phe Phe Ser Phe 180 185 190 Ser Pro Pro Thr Gly Pro Ser Pro Ser Leu Ala Gln Ser Pro Leu Lys 195 200 205 Leu Phe Pro Ser Gln Ala Thr His Gln Leu Gly Glu Gly Glu Ser Tyr 210 215 220 Ser Met Pro Thr Ala Phe Pro Gly Leu Ala Pro Thr Ser Pro His Leu 225 230 235 240 Glu Gly Ser Gly Ile Leu Asp Thr Pro Val Thr Ser Thr Lys Ala Arg 245 250 255 Ser Gly Ala Pro Gly Gly Ser Glu Gly Arg Cys Ala Val Cys Gly Asp 260 265 270 Asn Ala Ser Cys Gln His Tyr Gly Val Arg Thr Cys Glu Gly Cys Lys 275 280 285 Gly Phe Phe Lys Arg Thr Val Gln Lys Asn Ala Lys Tyr Ile Cys Leu 290 295 300 Ala Asn Lys Asp Cys Pro Val Asp Lys Arg Arg Arg Asn Arg Cys Gln 305 310 315 320 Phe Cys Arg Phe Gln Lys Cys Leu Ala Val Gly Met Val Lys Glu Val 325 330 335 Val Arg Thr Asp Ser Leu Lys Gly Arg Arg Gly Arg Leu Pro Ser Lys 340 345 350 Pro Lys Gln Pro Pro Asp Ala Phe Pro Ala Asn Leu Leu Thr Ser Leu 355 360 365 Val Arg Ala His Leu Asp Ser Gly Pro Ser Thr Ala Lys Leu Asp Tyr 370 375 380 Ser Lys Phe Gln Glu Leu Val Leu Pro His Phe Gly Lys Glu Asp Ala 385 390 395 400 Gly Asp Val Gln Gln Phe Tyr Asp Leu Leu Ser Gly Ser Leu Glu Val 405 410 415 Ile Arg Lys Trp Ala Glu Lys Ile Pro Gly Phe Ala Glu Leu Ser Pro 420 425 430 Ala Asp Gln Asp Leu Leu Leu Glu Ser Ala Phe Leu Glu Leu Phe Ile 435 440 445 Leu Arg Leu Ala Tyr Arg Ser Lys Pro Gly Glu Gly Lys Leu Ile Phe 450 455 460 Cys Ser Gly Leu Val Leu His Arg Leu Gln Cys Ala Arg Gly Phe Gly 465 470 475 480 Asp Trp Ile Asp Ser Ile Leu Ala Phe Ser Arg Ser Leu His Ser Leu 485 490 495 Leu Val Asp Val Pro Ala Phe Ala Cys Leu Ser Ala Leu Val Leu Ile 500 505 510 Thr Asp Arg His Gly Leu Gln Glu Pro Arg Arg Val Glu Glu Leu Gln 515 520 525 Asn Arg Ile Ala Ser Cys Leu Lys Glu His Val Ala Ala Val Ala Gly 530 535 540 Glu Pro Gln Pro Ala Ser Cys Leu Ser Arg Leu Leu Gly Lys Leu Pro 545 550 555 560 Glu Leu Arg Thr Leu Cys Thr Gln Gly Leu Gln Arg Ile Phe Tyr Leu 565 570 575 Lys Leu Glu Asp Leu Val Pro Pro Pro Pro Ile Ile Asp Lys Ile Phe 580 585 590 Met Asp Thr Leu Pro Phe 595 <210> 3 <211> 231 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Gln Asp Glu Glu Arg Tyr Met Thr Leu Asn Val Gln Ser Lys Lys 1 5 10 15 Arg Ser Ser Ala Gln Thr Ser Gln Leu Thr Phe Lys Asp Tyr Ser Val 20 25 30 Thr Leu His Trp Tyr Lys Ile Leu Leu Gly Ile Ser Gly Thr Val Asn 35 40 45 Gly Ile Leu Thr Leu Thr Leu Ile Ser Leu Ile Leu Leu Val Ser Gln 50 55 60 Gly Val Leu Leu Lys Cys Gln Lys Gly Ser Cys Ser Asn Ala Thr Gln 65 70 75 80 Tyr Glu Asp Thr Gly Asp Leu Lys Val Asn Asn Gly Thr Arg Arg Asn 85 90 95 Ile Ser Asn Lys Asp Leu Cys Ala Ser Arg Ser Ala Asp Gln Thr Val 100 105 110 Leu Cys Gln Ser Glu Trp Leu Lys Tyr Gln Gly Lys Cys Tyr Trp Phe 115 120 125 Ser Asn Glu Met Lys Ser Trp Ser Asp Ser Tyr Val Tyr Cys Leu Glu 130 135 140 Arg Lys Ser His Leu Leu Ile Ile His Asp Gln Leu Glu Met Ala Phe 145 150 155 160 Ile Gln Lys Asn Leu Arg Gln Leu Asn Tyr Val Trp Ile Gly Leu Asn 165 170 175 Phe Thr Ser Leu Lys Met Thr Trp Thr Trp Val Asp Gly Ser Pro Ile 180 185 190 Asp Ser Lys Ile Phe Phe Ile Lys Gly Pro Ala Lys Glu Asn Ser Cys 195 200 205 Ala Ala Ile Lys Glu Ser Lys Ile Phe Ser Glu Thr Cys Ser Ser Val 210 215 220 Phe Lys Trp Ile Cys Gln Tyr 225 230 <210> 4 <211> 119 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Met Lys Ala Leu Ser Pro Val Arg Gly Cys Tyr Glu Ala Val Cys Cys 1 5 10 15 Leu Ser Glu Arg Ser Leu Ala Ile Ala Arg Gly Arg Gly Lys Gly Pro 20 25 30 Ala Ala Glu Glu Pro Leu Ser Leu Leu Asp Asp Met Asn His Cys Tyr 35 40 45 Ser Arg Leu Arg Glu Leu Val Pro Gly Val Pro Arg Gly Thr Gln Leu 50 55 60 Ser Gln Val Glu Ile Leu Gln Arg Val Ile Asp Tyr Ile Leu Asp Leu 65 70 75 80 Gln Val Val Leu Ala Glu Pro Ala Pro Gly Pro Pro Asp Gly Pro His 85 90 95 Leu Pro Ile Gln Thr Ala Glu Leu Ala Pro Glu Leu Val Ile Ser Asn 100 105 110 Asp Lys Arg Ser Phe Cys His 115 <210> 5 <211> 459 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Met Thr Ile Leu Gly Thr Thr Phe Gly Met Val Phe Ser Leu Leu Gln 1 5 10 15 Val Val Ser Gly Glu Ser Gly Tyr Ala Gln Asn Gly Asp Leu Glu Asp 20 25 30 Ala Glu Leu Asp Asp Tyr Ser Phe Ser Cys Tyr Ser Gln Leu Glu Val 35 40 45 Asn Gly Ser Gln His Ser Leu Thr Cys Ala Phe Glu Asp Pro Asp Val 50 55 60 Asn Ile Thr Asn Leu Glu Phe Glu Ile Cys Gly Ala Leu Val Glu Val 65 70 75 80 Lys Cys Leu Asn Phe Arg Lys Leu Gln Glu Ile Tyr Phe Ile Glu Thr 85 90 95 Lys Lys Phe Leu Leu Ile Gly Lys Ser Asn Ile Cys Val Lys Val Gly 100 105 110 Glu Lys Ser Leu Thr Cys Lys Lys Ile Asp Leu Thr Thr Ile Val Lys 115 120 125 Pro Glu Ala Pro Phe Asp Leu Ser Val Ile Tyr Arg Glu Gly Ala Asn 130 135 140 Asp Phe Val Val Thr Phe Asn Thr Ser His Leu Gln Lys Lys Tyr Val 145 150 155 160 Lys Val Leu Met His Asp Val Ala Tyr Arg Gln Glu Lys Asp Glu Asn 165 170 175 Lys Trp Thr His Val Asn Leu Ser Ser Thr Lys Leu Thr Leu Leu Gln 180 185 190 Arg Lys Leu Gln Pro Ala Ala Met Tyr Glu Ile Lys Val Arg Ser Ile 195 200 205 Pro Asp His Tyr Phe Lys Gly Phe Trp Ser Glu Trp Ser Pro Ser Tyr 210 215 220 Tyr Phe Arg Thr Pro Glu Ile Asn Asn Ser Ser Gly Glu Met Asp Pro 225 230 235 240 Ile Leu Leu Thr Ile Ser Ile Leu Ser Phe Phe Ser Val Ala Leu Leu 245 250 255 Val Ile Leu Ala Cys Val Leu Trp Lys Lys Arg Ile Lys Pro Ile Val 260 265 270 Trp Pro Ser Leu Pro Asp His Lys Lys Thr Leu Glu His Leu Cys Lys 275 280 285 Lys Pro Arg Lys Asn Leu Asn Val Ser Phe Asn Pro Glu Ser Phe Leu 290 295 300 Asp Cys Gln Ile His Arg Val Asp Asp Ile Gln Ala Arg Asp Glu Val 305 310 315 320 Glu Gly Phe Leu Gln Asp Thr Phe Pro Gln Gln Leu Glu Glu Ser Glu 325 330 335 Lys Gln Arg Leu Gly Gly Asp Val Gln Ser Pro Asn Cys Pro Ser Glu 340 345 350 Asp Val Val Ile Thr Pro Glu Ser Phe Gly Arg Asp Ser Ser Leu Thr 355 360 365 Cys Leu Ala Gly Asn Val Ser Ala Cys Asp Ala Pro Ile Leu Ser Ser 370 375 380 Ser Arg Ser Leu Asp Cys Arg Glu Ser Gly Lys Asn Gly Pro His Val 385 390 395 400 Tyr Gln Asp Leu Leu Leu Ser Leu Gly Thr Thr Asn Ser Thr Leu Pro 405 410 415 Pro Pro Phe Ser Leu Gln Ser Gly Ile Leu Thr Leu Asn Pro Val Ala 420 425 430 Gln Gly Gln Pro Ile Leu Thr Ser Leu Gly Ser Asn Gln Glu Glu Ala 435 440 445 Tyr Val Thr Met Ser Ser Phe Tyr Gln Asn Gln 450 455 <210> 6 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PLD4 forward primer <400> 6 caaattctgg gttgtggatg g 21 <210> 7 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PLD4 reverse primer <400> 7 aggtggctgc agttatagat g 21 <210> 8 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NR4A1 forward primer <400> 8 gacaacgctt catgccag 18 <210> 9 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> NR4A1 reverse primer <400> 9 ttgttagcca ggcagatgta c 21 <210> 10 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLRF1 forward primer <400> 10 gaaaaggagt tctgcccaaa c 21 <210> 11 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> KLRF1 reverse primer <400> 11 agaaaccaac aggatcaagg ag 22 <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> IL7R forward primer <400> 12 gtagtcatca ctccagaaag c 21 <210> 13 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> IL7R reverse primer <400> 13 acctggaaga ggagagaata g 21 <210> 14 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ID3 forward primer <400> 14 gactacattc tcgacctgca g 21 <210> 15 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ID3 reverse primer <400> 15 tcgttggaga tgacaagttc c 21 <210> 16 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PLD4-FAM probe <400> 16 tctgacgcag gtgaaggagc ttg 23 <210> 17 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> IL7R-FAM probe <400> 17 cagttggaag tgaatggatc gcagc 25 <210> 18 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ID3-FAM probe <400> 18 ctcggctgtc tggatgggaa gg 22

Claims (21)

  1. PLD4(Phospholipase D Family Member 4), NR4A1(nuclear receptor subfamily 4 group A member 1), KLRF1(Killer Cell Lectin Like Receptor F1) 및 ID3(Inhibitor of DNA binding 3, HLH protein)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 유효 성분으로 포함하는 췌장암의 진단용 조성물.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 진단용 조성물은 IL7R(Interleukin 7 receptor) 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 추가로 더 포함하는, 진단용 조성물.
  3. 제1항에 있어서,
    상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 진단용 조성물.
  4. 제1항에 있어서,
    상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 진단용 조성물.
  5. 제1항에 있어서,
    상기 진단용 조성물은 목적하는 개체에서 분리된 액체 생검(liquid biopsy)에 대한 것인, 진단용 조성물.
  6. 제1항에 있어서,
    상기 진단용 조성물은 암의 발병, 성장, 진행 또는 전이 가능성을 예측; 암과 췌장 질환을 구별; 또는 암종을 구별;하기 위한 것인, 진단용 조성물.
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항의 진단용 조성물을 포함하는 췌장암의 진단용 키트.
  8. 제7항에 있어서,
    상기 키트는 RT-PCR 키트, DNA 칩 키트, ELISA 키트, 단백질 칩 키트, 래피드(rapid) 키트 또는 MRM(Multiple reaction monitoring) 키트인, 진단용 키트.
  9. 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 PLD4(Phospholipase D Family Member 4), NR4A1(nuclear receptor subfamily 4 group A member 1), KLRF1(Killer Cell Lectin Like Receptor F1) 및 ID3(Inhibitor of DNA binding 3, HLH protein)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 췌장암의 진단을 위한 정보 제공 방법.
  10. 제9항에 있어서,
    상기 생물학적 시료는 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상인, 정보 제공 방법.
  11. 제9항에 있어서,
    상기 생물학적 시료는 액체 생검(liquid biopsy)인, 정보 제공 방법.
  12. 제9항에 있어서,
    상기 정보 제공 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 IL7R(Interleukin 7 receptor) 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 추가로 더 포함하는, 정보 제공 방법.
  13. 제9항에 있어서,
    상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 정보 제공 방법.
  14. 제9항에 있어서,
    상기 단백질의 발현 수준의 측정은 단백질 칩 분석, 면역 측정법, 리간드 바인딩 어세이, MALDI-TOF(Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, SELDI-TOF(Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, 방사선 면역 분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 보체 고정 분석법, 2차원 전기영동 분석, 액상 크로마토그래피-질량분석(liquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS), LC-MS/MS(liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), 웨스턴 블랏팅, ELISA(enzyme linked immunosorbentassay) 또는 다중 반응 모니터링 (multiple reaction monitoring; MRM) 방법에 의하는, 정보 제공 방법.
  15. 제9항에 있어서,
    상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 정보 제공 방법.
  16. 제9항에 있어서,
    상기 유전자의 발현 수준의 측정은 역전사 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting) 또는 DNA 칩에 의하는, 정보 제공 방법.
  17. 제9항에 있어서,
    상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 PLD4, NR4A1 및 KLRF1으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 목적하는 개체에 췌장암이 발병하였거나 발병할 가능성이 높은 것으로 예측하는, 정보 제공 방법.
  18. 제12항에 있어서,
    상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 ID3 및 IL7R 중 적어도 하나의 단백질 또는 상기 단백질을 암호화하는 유전자의 발현 수준이 대조군에 비하여 높은 경우, 상기 목적하는 개체에 췌장암이 발병하였거나 발병할 가능성이 높은 것으로 예측하는, 정보 제공 방법.
  19. 제17항 또는 제18항에 있어서,
    상기 췌장암이 발병하였거나 발병 가능성이 높은 것으로 예측하는 것은 췌장암의 발병, 성장, 진행 또는 전이 가능성을 예측; 췌장암을 췌장 질환과 구별; 또는 다른 암종과 구별;하는 것을 포함하는, 정보 제공 방법.
  20. PLD4(Phospholipase D Family Member 4), NR4A1(nuclear receptor subfamily 4 group A member 1), KLRF1(Killer Cell Lectin Like Receptor F1) 및 ID3(Inhibitor of DNA binding 3, HLH protein)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자를 포함하는 췌장암의 진단용 바이오마커.
  21. 제20항에 있어서,
    상기 바이오마커는 IL7R(Interleukin 7 receptor) 단백질 또는 이를 암호화하는 유전자를 더 포함하는, 바이오마커.
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EP3336547A1 (en) * 2016-12-13 2018-06-20 Lionex GmbH Novel human bladder cancer biomarkers and their diagnostic use
US11078542B2 (en) * 2017-05-12 2021-08-03 Decipher Biosciences, Inc. Genetic signatures to predict prostate cancer metastasis and identify tumor aggressiveness
KR20200134071A (ko) * 2019-05-21 2020-12-01 (주)아큐레시스바이오 암의 진단용 조성물

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