KR20220116255A - 비-푸코실화 항체의 제조를 위한 푸코실화 억제제의 용도 - Google Patents

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로드니 로렌스 파슨스
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Abstract

본 발명은 포유동물 세포로부터의 단백질 발현 동안 푸코실화의 억제제를 제공한다. 억제제는 람노스로부터 유래되고, GDP-만노스 4,6-데히드라타제 (GMD)의 억제에 의해 작용한다. 본 발명은 감소된 푸코실화 수준을 갖는 단백질, 예컨대 항체의 제조 방법 및 본 발명의 방법에 의해 제조된 항체를 추가로 제공한다. 이러한 저푸코실화 또는 비푸코실화 항체는, 그의 표면 상에 항체 표적을 발현하는 세포의 항체 의존성 세포성 세포독성 (ADCC) 매개된 사멸을 지시하는 것이 치료상 유익한 인간 질환의 치료에, 예를 들어 저푸코실화 또는 비푸코실화 항-CTLA-4 항체를 사용하여 암 환자에서의 Treg의 고갈에서 사용될 수 있다.

Description

비-푸코실화 항체의 제조를 위한 푸코실화 억제제의 용도
관련 출원에 대한 상호 참조
본 출원은 2019년 12월 20일에 출원된 미국 가출원 번호 62/951,318을 우선권 주장하며, 그의 개시내용은 본원에 참조로 포함된다.
서열 목록
본원과 함께 전자적으로 출원된 서열 목록은 또한 그 전문이 본원에 참조로 포함된다 (파일 명칭: 202001104_SEQL_13347WOPCT_GB.txt; 생성된 날짜: 2020년 11월 4일; 파일 크기: 11 KB).
치료 항체는 인간 질환을 치료하는데 더욱더 일반적으로 사용되고 있다. 관심 치료 표적에 결합하는 항체를 생성하고, 이를 질환 메커니즘에 대해 목적하는 효과를 나타내도록 선택하고 변형시킨다. 자가면역 질환의 치료는 염증 매개자, 예컨대 시토카인 및 그의 수용체에 결합하는 항체의 사용을 통해 혁신되었다. 이러한 항체는 전형적으로 단순히 염증성 신호전달 경로를 차단하도록 의도되고, 그의 리간드 또는 수용체에 대한 결합을 차단하는 에피토프에서 표적 단백질에 결합하는 것보다 더 많은 작용을 필요로 하지는 않는다.
항체는 또한 암의 치료를 위해 개발되었다. 항암 항체의 원래 치료 모델은 독성 약물을 종양 세포에 특이적으로 향하게 하는 "매직 총알"의 아이디어였다. 종양-특이적 세포 표면 항원에 대해 항체를 생성한 후, 종종 통상적인 화학요법제인 세포독성 "페이로드"로 유도체화할 것이다. 암 환자에게 투여되었을 때, 항체는 순환하여 종양 세포에 특이적으로 결합하여, 독성 페이로드를 종양 세포에만 전달하고 건강한 조직은 대부분 보존하고, 따라서 부작용이 감소될 것이다. 약물은 표적 종양 세포 부근에서 세포독소를 방출하여 종양에서 국소적으로 고농도를 생성하는 링커에 의해 부착될 수 있거나, 또는 항체가 세포 표면 수용체에 결합한 후에 내재화될 때까지 항체에 부착된 채로 유지될 수 있다.
세포독성 페이로드에 대한 대안은 종양 세포에 대해 특이적으로 증진된 면역 반응을 지시할 수 있는 항체의 사용이다. 매직 총알 접근법에서는, 항체가 종양 세포에 세포독성을 유도하지만, 이 경우에 이들은 세포독성 면역 반응을 지시한다. 이러한 항체는 종양-특이적 세포 표면 마커에 결합할 뿐만 아니라, 면역 세포, 예컨대 항-종양 CD8+ T 세포를 종양 부근으로 유인하고/유인하거나 활성화시키도록 설계되어야 한다.
항체를 사용한 암의 치료에 대한 훨씬 더 최근의 접근법은 면역-종양학이다. 이러한 접근법에서, 항체는 종양 세포를 직접 사멸시키지 않고, 대신에 효과적인 항-종양 면역 반응을 유도하기 위해 면역계의 활성을 변형시킴으로써 설계된다. 많은 종양이 항-종양 면역 반응을 유발하지만, 이러한 면역 반응은 항-종양 반응을 활성화시키는 신호를 차단하거나 또는 면역억제 메커니즘을 증진시키는 다양한 세포 표면 수용체의 활성에 의해 방해되는 것으로 밝혀졌다. 면역억제 메커니즘은 항상성을 복구하고, 달리 면역 반응이 더 이상 필요하지 않게 된 후에 면역 반응을 제한하는데 필수적이지만, 이러한 메커니즘은 이러한 반응이 유익할 경우인 항-종양 면역 반응을 억제할 수 있다. 한 이러한 면역억제 인자는 조절 T 세포 (Treg)이고, 이는 세포독성 CD8+ T 세포의 활성을 억제하는 기능을 하는 T 세포의 서브세트이다. 생명을 위협하는 종양이 있는 환자에서, 이러한 억제 효과는 달리 제거되거나 제어되어야 하는 종양의 성장을 가능하게 할 수 있다. 실제로, 종양 내의 높은 수준의 Treg의 존재는 불량한 예후에 대한 공지된 마커이다. Tao et al. (2012) Lung Cancer 75:95.
그 결과, 일부 암의 치료에서, 제한받지 않는 항-종양 면역 반응을 가능하게 하도록 Treg의 집단을 고갈시키는 것이 유익하다. 종양 세포에 있어서, 한 접근법은 Treg에 대해 특이적인 항체, 예컨대 항-CTLA-4 또는 항-CCR4를 사용하는 것이다. 이러한 항체는 Treg를 고갈시키도록 설계되고, 예를 들어 CD8+ T 세포에 의해 유발된 항체-의존성 세포성 세포독성 (ADCC)에 의해 이들 세포에 대한 면역 반응을 지시함으로써 그렇게 할 수 있다. 항체는 항-종양 면역 반응을 증가시키기 위해 T 세포 상의 활성화 Fc 수용체에 결합하는 Fc 영역을 갖도록 설계되고, 이러한 항체는 이펙터 기능을 갖는 것으로 언급된다. 이펙터 기능은 면역 세포와 상호작용하는 항체의 Fc 부분의 변형에 의해, 예컨대 Fc 영역의 아미노산 서열을 변형시키거나 또는 글리코실화를 변형시킴으로써 증진될 수 있다.
또한, 인간 이뮤노글로불린 중쇄의 N297에서의 N-연결된 글리칸 쇄로부터 푸코스의 제거는 활성화 Fc 수용체에 대한 증진된 결합을 유발하여, 항-종양 ADCC-매개 독성을 크게 증진시키는 것으로 밝혀졌다. Rothman et al. (1989) Mol. Immunol. 26:1113, at 1122 (종양 형성의 면역요법에 사용되는 항체의 ADCC를 증진시키기 위한 항체의 코어 푸코실화의 감소를 제안함); Harris et al. (1997) Biochemistry 36:1581; Satoh et al. (2003) Expert Opin. Bio. Ther. 6:1161.
저푸코실화 및 비푸코실화 항체를 포함한, 감소된 푸코실화를 갖는 이러한 항체를 생산하는 여러 방법이 공지되어 있다. Le et al. (2016) Biochim. Biophys. Acta 1860:1655. 항체는 푸코실화가 자연적으로 결핍된 세포주 (Lifely et al. (1995) Glycobiology 5:813)에서, 또는 푸코실화 경로의 핵심 효소 성분이 녹아웃된 세포주에서, 예를 들어 푸코실 트랜스퍼라제 8 (FUT8)이 결여된 세포, 예컨대 포텔리겐트(POTELLIGENT)® 차이니즈 햄스터 난소 (CHO) 세포에서 생산될 수 있다. 예를 들어, 문헌 [Rothman et al. (1989) Mol. Immunol. 26:1113; WO 97/27303; WO 99/54342; WO 00/61739; WO 02/31140]을 참조한다. 대안적으로, 효소적 푸코실화 경로의 억제제가 항체의 생산 동안 배양물에 첨가될 수 있다. 예를 들어, 문헌 [Rothman et al. (1989) Mol. Immunol. 26:1113; 미국 특허 번호 8,071,336; WO 09/135181; WO 14/130613; EP 2958905 B1; Allen et al. (2016) ACS Chem. Biol. 11:2734]을 참조한다. 푸코실화의 예시적인 소분자 억제제는 카스타노스퍼민, 2F-퍼아세틸-푸코스, 2-데옥시-2-플루오로-L-푸코스, 6,6,6,-트리플루오로푸코스 (푸코스타틴 I) 및 6,6,6,-트리플루오로푸코스 포스포네이트 유사체 (푸코스타틴 II)를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. Rothman et al. (1989) Mol. Immunol. 26:1113; Okeley et al. (2016) Proc. Nat'l Acad. Sci. (USA) 110:5404; Rillahan et al. (2012) Nat. Chem. Biol. 8:661; U.S. Pat. No. 8,163,551; EP 2958905 B1; Allen et al. (2016) ACS Chem. Biol. 11:2734. 다른 창의적인 접근법은 항체 생산 세포주에서 GDP-푸코스 전구체의 효소적 고갈, 글리맥스(GLYMAXX)® 푸코실화 억제 기술을 포함한다. 예를 들어, 문헌 [미국 특허 US8,642,292; von Horsten et al. (2010) Glycobiology 20:1607; Roy et al. (2018) mAbs 10:416]을 참조한다.
저푸코실화 및 비푸코실화 항체, 및 그의 개선된 제조 방법에 대한 필요성이 존재한다. 푸코실화를 갖는 분자의 백분율에서의 조정가능한 증가 및 감소를 가능하게 하는 방법은 발견 연구에서 특히 가치있을 수 있다. 이상적으로, 이러한 방법은 항체 생산에 사용되는 세포주 내로의 임의의 유전자 구축물의 도입, 또는 새로운 안정한 세포주의 시간 소모적 생산을 필요로 하지 않을 것이고, 푸코실화된 항체의 생산과 비교하여 생성된 항체의 역가를 유의하게 감소시키지 않을 것이다.
발명의 개요
본 발명은 포유동물 GDP-만노스 4,6-데히드라타제 (GMD), 예를 들어 햄스터 GMD를 억제하는 푸코실화 억제제로서 사용하기 위한 화합물을 제공한다. 이러한 화합물은, 예를 들어, 감소된 N-연결된 글리칸 푸코실화를 갖는 단백질, 예컨대 항체의 제조에서 사용될 것이며, 여기서 상기 화합물은 단백질 (예를 들어, 항체)의 생산 동안 세포 배양물에 첨가된다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 화합물은 람노스의 유도체, 예컨대 GDP-D-람노스, Ac-GDP-D-람노스 또는 소듐 람노스 포스페이트이다. 한 실시양태에서, GDP-D-람노스는 본 발명의 화합물이다. 또 다른 실시양태에서, Ac-GDP-D-람노스는 본 발명의 화합물이다. 또 다른 실시양태에서, 소듐 람노스 포스페이트는 본 발명의 화합물이다. 다양한 실시양태에서, 본 발명의 푸코실화 억제제는 배양 배지 중에 6 mM 이상의 농도, 또는 10 mM 이상의 농도로 존재한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 단백질, 예를 들어 항체를 발현하는 세포주로부터의 단백질의 생산 동안 사용되는 배양 배지에 본 발명의 화합물을 포함시킴으로써 감소된 푸코실화를 갖는 단백질, 예컨대 항체를 제조하는 방법을 제공한다. 일부 실시양태에서, 화합물은 생산되는 비푸코실화 단백질 (예를 들어 항체)의 비율을 최대화하기 위해, 단리될 단백질 (예를 들어 항체)이 세포주에 의해 생산되는 모든 또는 실질적으로 모든 시간 동안 배양 배지에 존재하지만, 원칙적으로 화합물은 목적하는 수준의 비푸코실화를 달성하기에 충분한 생산 배양 동안만 존재할 필요가 있다.
추가 측면에서, 본 발명은 본 발명의 방법에 의해 제조된 감소된 푸코실화를 갖는 단백질, 예컨대 감소된 푸코실화를 갖는 단백질 (예를 들어 ≥20% 또는 ≥40% 비-푸코실화 폴리펩티드 쇄), 또는 저푸코실화 또는 비푸코실화 단백질을 제공한다.
관련된 측면에서, 본 발명은 본 발명의 방법에 의해 제조된 감소된 푸코실화를 갖는 항체, 예컨대 푸코실화 억제제의 부재 하에 동일한 세포주에서 생산된 동일한 항체와 비교하여 ADCC의 2배 이상의 증진을 나타내는 항체 (실시예 2에 기재된 방법에 의해 결정됨), 및/또는 감소된 푸코실화를 갖는 항체 (예를 들어 ≥20% 또는 ≥40% 비-푸코실화 항체 쇄), 또는 저푸코실화 또는 비푸코실화 항체를 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 본 발명의 방법에 의해 제조된 감소된 푸코실화를 갖는 항체 또는 다른 단백질을 이를 필요로 하는 환자에게 투여함으로써 인간 질환, 예컨대 암을 치료하는 방법을 제공한다.
다양한 실시양태에서, 본 발명의 화합물은 항체 생산 동안 사용되는 세포 성장 배지에 1 mM, 2 mM, 3 mM, 6 mM, 10 mM 또는 그 초과의 농도로 포함된다.
본 발명의 방법에 의해 저푸코실화 또는 비푸코실화 형태로 제조될 수 있는 예시적인 항체는 인간 CD20, CCR4, EGFR, CD19, Her2, IL-5R, CD40, BCMA, Siglec 8, CD147, CD30, EphA3, 푸코실 GM1, CTLA-4, MICA, 및 ICOS에 결합하는 항체를 포함한다.
도 1은 3종의 화합물, 구체적으로 GDP-D-람노스 (화학식 I), Ac-GDP-D-람노스 (화학식 II), 및 소듐 람노스 포스페이트 (화학식 III)에 대한 구조를 제공한다.
도 2a는 1 mM 내지 6 mM의 농도에서 본 발명의 예시적인 푸코실화 억제제의 존재 또는 부재 하에 성장된 항체에 대한 비푸코실화 항체의 백분율을 나타낸다. GDP-D-람노스 및 Ac-GDP-D-람노스의 구조가 도 1에 제공된다. 도 2b는 도 2a의 동일한 항체 제제에 대한 항체 역가를 보여준다. Ac-GDP-D-람노스는 역가 (수율)에 덜 유해한 영향을 미치면서 비푸코실화 항체의 백분율을 증가시키는데 있어서 GDP-D-람노스만큼 효과적이다.
도 3a, 3b 및 3c는 각각 푸코실화 억제제 없이 또는 6 mM 또는 10 mM Ac-GDP-D-람노스의 존재 하에 배양된 세포를 사용하여 제조된 항체 제제의 전기영동도를 보여준다. 상이한 당형태에 대한 피크가 푸코실화 종에 대해서는 백색 박스로, 비푸코실화 종에 대해서는 어두운 박스로 표시된다. 증가하는 농도의 Ac-GDP-D-람노스는 비푸코실화 종의 비율을 증가시킨다.
도 4a 및 4b는 람노스 포스페이트, GDP-D-람노스 및 Ac-GDP-D-람노스의 생산을 위한 예시적인 합성 반응식을 제공한다. 실시예 1을 참조한다.
도 5a, 5b 및 5c는 GDP-D-람노스 및 Ac-GDP-D-람노스의 생산을 위한 제2의 예시적인 합성 반응식을 제공한다.
발명의 상세한 설명
정의
본 개시내용이 보다 용이하게 이해될 수 있도록, 특정 용어가 먼저 정의된다. 본 출원에서 사용되는 경우, 본 명세서에서 달리 명시적으로 제공되는 것을 제외하면, 다음의 용어 각각은 하기에 제시된 의미를 가질 것이다. 추가적인 정의가 본 출원 전체에 걸쳐 제시된다.
"투여하는"은 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 다양한 방법 및 전달 시스템 중 임의의 것을 사용하여, 치료제를 포함하는 조성물을 대상체에게 물리적으로 도입하는 것을 지칭한다. 본 발명의 항체에 대한 바람직한 투여 경로는 예를 들어 주사 또는 주입에 의한 정맥내, 복강내, 근육내, 피하, 척수 또는 다른 비경구 투여 경로를 포함한다. 본원에 사용된 어구 "비경구 투여"는 경장 및 국소 투여 이외의, 통상적으로 주사에 의한 투여 방식을 의미하고, 비제한적으로 정맥내, 복강내, 근육내, 동맥내, 경막내, 림프내, 병변내, 피막내, 안와내, 심장내, 피내, 경기관, 피하, 각피하, 관절내, 피막하, 지주막하, 척수내, 경막외 및 흉골내 주사 및 주입, 뿐만 아니라 생체내 전기천공을 포함한다. 대안적으로, 본 발명의 항체는 비-비경구 경로, 예컨대 국소, 표피 또는 점막 투여 경로를 통해, 예를 들어, 비강내로, 경구로, 질로, 직장으로, 설하로 또는 국소로 투여될 수 있다. 투여는 또한, 예를 들어 1회, 복수회, 및/또는 1회 이상의 연장된 기간에 걸쳐 수행될 수 있다. 투여는 의사, 간호사, 다른 건강관리 제공자, 또는 환자 자신을 포함하지만 이에 제한되지 않는 1명 이상의 개인에 의해 수행될 수 있다. 청구범위에 기재된 "그를 필요로 하는 환자"는 치료될 질환, 예컨대 암으로 진단된 임의의 인간 대상체를 지칭한다.
"항체" (Ab)는, 비제한적으로, 항원에 특이적으로 결합하고 디술피드 결합에 의해 상호연결된 적어도 2개의 중쇄 (H) 및 2개의 경쇄 (L)를 포함하는 당단백질 이뮤노글로불린을 포함할 것이다. 본 발명의 푸코실화 억제제의 존재 하에 배양된 세포주에서의 항체 생산을 포함하는, 본 발명의 방법에 의해 제조된 항체는 본 발명의 항체로 지칭된다. 통상적인 항체에서, 각각의 H 쇄는 중쇄 가변 영역 (본원에서 VH로 약칭됨) 및 중쇄 불변 영역을 포함한다. 중쇄 불변 영역은 3개의 도메인, CH1, CH2 및 CH3을 포함한다. 각각의 경쇄는 경쇄 가변 영역 (본원에서 VL로 약칭됨) 및 경쇄 불변 영역을 포함한다. 경쇄 불변 영역은 1개의 도메인 CL로 구성된다. VH 및 VL 영역은 프레임워크 영역 (FR)으로 불리는 보다 보존된 영역이 산재된, 상보성 결정 영역 (CDR)으로 불리는 초가변 영역으로 추가로 세분될 수 있다. 각각의 VH 및 VL은 아미노-말단에서 카르복시-말단으로 하기 순서로 배열된 3개의 CDR 및 4개의 FR로 구성된다: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. 중쇄 및 경쇄의 가변 영역은 항원과 상호작용하는 결합 도메인을 함유한다.
본원에 사용된 바와 같이, 통상적인 해석에 따라, 단수 형태로 중쇄 및/또는 경쇄를 포함하는 것으로 기재된 항체는 "적어도 하나"의 언급된 중쇄 및/또는 경쇄 를 포함하는 항체를 지칭하고, 따라서 2개 이상의 중쇄 및/또는 경쇄를 갖는 항체를 포괄할 것이다. 구체적으로, 이와 같이 기재된 항체는 2개의 실질적으로 동일한 중쇄 및 2개의 실질적으로 동일한 경쇄를 갖는 통상의 항체를 포괄할 것이다. 항체 쇄는 실질적으로 동일하지만 번역후 변형, 예컨대 리신 잔기의 C-말단 절단, 대안적 글리코실화 패턴 등으로 인해 상이한 경우에 완전히 동일하지는 않을 수 있다. "항체"는 또한 2개의 별개의 항원 결합 도메인, 예를 들어 이중특이적 항체 또는 동일한 표적 상의 2개의 상이한 에피토프에 결합하는 항체를 포함할 수 있고, 따라서 2개의 비-동일한 중쇄 및/또는 경쇄를 포함할 수 있다.
달리 나타내거나 문맥으로부터 명백하지 않는 한, 그의 표적 특이성에 의해 정의된 항체 (예를 들어 "항-CTLA-4 항체")는 그의 인간 표적 (예를 들어 인간 CTLA-4)에 결합할 수 있는 항체를 지칭한다. 이러한 항체는 다른 종으로부터의 CTLA-4에 결합하거나 결합하지 않을 수 있다.
이뮤노글로불린은 IgA, 분비성 IgA, IgG 및 IgM을 포함하나 이에 제한되지는 않는 임의의 통상적으로 공지된 이소형으로부터 유래될 수 있다. IgG 이소형은 특정 종에서 하위부류로 분류될 수 있다: 인간에서는 IgG1, IgG2, IgG3 및 IgG4, 및 마우스에서는 IgG1, IgG2a, IgG2b 및 IgG3. IgG 항체는 본원에서 기호 감마 (γ) 또는 간단히 "G"로 지칭될 수 있고, 예를 들어 IgG1은 문맥으로부터 명백한 바와 같이 "γ1" 또는 "G1"로 표현될 수 있다. "이소형"은 중쇄 불변 영역 유전자에 의해 코딩되는 항체 클래스 (예를 들어, IgM 또는 IgG1)를 지칭한다. "항체"는, 예로서, 자연 발생 및 비-자연 발생 항체 둘 다; 모노클로날 및 폴리클로날 항체; 키메라 및 인간화 항체; 인간 또는 비인간 항체; 완전 합성 항체; 및 단일쇄 항체를 포함한다. 달리 지시되거나 문맥으로부터 명백하지 않는 한, 본원에 개시된 항체는 인간 IgG1 항체이다.
"단리된 항체"는 상이한 항원 특이성을 갖는 다른 항체가 실질적으로 없는 항체를 지칭한다 (예를 들어, CTLA-4에 특이적으로 결합하는 단리된 항체에는 CTLA-4 이외의 항원에 특이적으로 결합하는 항체가 실질적으로 없음). 그러나, CTLA-4에 특이적으로 결합하는 단리된 항체는 다른 항원, 예컨대 상이한 종으로부터의 CTLA-4 분자와 교차-반응할 수 있다. 또한, 단리된 항체에는 다른 세포 물질 및/또는 화학물질이 실질적으로 없을 수 있다. 비교하자면, "단리된" 핵산은 자연에 존재하는 핵산과 현저하게 상이한, 즉, 특유의 화학적 동일성, 성질 및 유용성을 갖는 물질의 핵산 조성물을 지칭한다. 예를 들어, 단리된 DNA는, 천연 DNA와 달리, 천연 DNA의 독립형 부분이고, 자연에서 발견되는 보다 큰 구조적 복합체, 염색체의 필수 부분이 아니다. 또한, 단리된 DNA는, 천연 DNA와는 달리, 특히, 질병을 진단하거나 치료제의 효능을 예측하기 위해 유전자 발현을 측정하고 바이오마커 유전자 또는 돌연변이를 검출하기 위한 PCR 프라이머 또는 혼성화 프로브로서 사용될 수 있다. 단리된 핵산은 또한 관련 기술분야에 널리 공지된 표준 기술을 사용하여 다른 세포 성분 또는 다른 오염물, 예를 들어, 다른 세포 핵산 또는 단백질이 실질적으로 없도록 정제될 수 있다.
용어 "모노클로날 항체" ("mAb")는 단일 분자 조성의 항체 분자, 즉, 그의 1차 서열이 본질적으로 동일하고, 특정 에피토프에 대해 단일 결합 특이성 및 친화도를 나타내는 항체 분자의 제제를 지칭한다. 모노클로날 항체는 하이브리도마, 재조합, 트랜스제닉 또는 관련 기술분야의 통상의 기술자에게 공지된 다른 기술에 의해 생산될 수 있다.
"인간" 항체 (HuMAb)는 프레임워크 및 CDR 영역 둘 다가 인간 배선 이뮤노글로불린 서열로부터 유래된 가변 영역을 갖는 항체를 지칭한다. 또한, 항체가 불변 영역을 함유하는 경우, 불변 영역은 또한 인간 배선 이뮤노글로불린 서열로부터 유래된다. 본 발명의 인간 항체는 인간 배선 이뮤노글로불린 서열에 의해 코딩되지 않는 아미노산 잔기 (예를 들어, 시험관내 무작위 또는 부위-특이적 돌연변이유발에 의해 또는 생체내 체세포 돌연변이에 의해 도입된 돌연변이)를 포함할 수 있다. 그러나, 본원에 사용된 용어 "인간 항체"는 또 다른 포유동물 종, 예컨대 마우스의 배선으로부터 유래된 CDR 서열이 인간 프레임워크 서열 상에 그라프팅된 항체를 포함하는 것으로 의도되지 않는다. 용어 "인간" 항체 및 "완전 인간" 항체는 동의어로 사용된다.
"항체 단편"은 일반적으로 무손상 항체에 의해 결합된 항원에 특이적으로 결합하는 능력을 보유하는 무손상 항체의 "항원-결합 부분" ("항원-결합 단편"), 또는 FcR 결합 능력을 보유하는 항체의 Fc 영역을 포함하는 전체 항체의 일부를 지칭한다. 예시적인 항체 단편은 Fab 단편 및 단일 쇄 가변 도메인 (scFv) 단편을 포함한다.
"항체-의존성 세포-매개된 세포독성" ("ADCC")은 FcR을 발현하는 비특이적 세포독성 세포 (예를 들어, 자연 킬러 (NK) 세포, 대식 세포, 호중구 및 호산구)가 표적 세포 상의 표면 항원에 결합된 항체를 인식하고, 후속적으로 표적 세포의 용해를 유발하는 시험관내 또는 생체내 세포-매개된 반응을 지칭한다. 원칙적으로, 활성화 FcR을 갖는 임의의 이펙터 세포는 ADCC를 매개하도록 촉발될 수 있다.
"암"은 신체에서의 비정상적인 세포의 제어되지 않는 성장을 특징으로 하는 다양한 질병의 광범위한 군을 지칭한다. 조절되지 않은 세포 분열 및 성장은 분열 하고 성장하여 이웃 조직을 침습하고 또한 림프계 또는 혈류를 통해 신체의 먼 부분으로 전이될 수 있는 악성 종양 또는 세포를 형성한다.
"세포 표면 수용체"는 신호를 수신하고 이러한 신호를 세포의 원형질막을 가로질러 전송할 수 있는 분자 및 분자의 복합체를 지칭한다.
"이펙터 세포"는 1개 이상의 FcR을 발현하고 1개 이상의 이펙터 기능을 매개하는 면역계의 세포를 지칭한다. 바람직하게는, 세포는 적어도 1개의 유형의 활성화 Fc 수용체, 예컨대, 예를 들어, 인간 FcγRIII을 발현하고, ADCC 이펙터 기능을 수행한다. ADCC를 매개하는 인간 백혈구의 예는 말초 혈액 단핵 세포 (PBMC), NK 세포, 단핵구, 대식 세포, 호중구 및 호산구를 포함한다.
"이펙터 기능"은 항체 Fc 영역과 Fc 수용체 또는 리간드의 상호작용, 또는 그로부터 발생하는 생화학적 사건을 지칭한다. 예시적인 "이펙터 기능"은 Clq 결합, 보체 의존성 세포독성 (CDC), Fc 수용체 결합, FcγR-매개된 이펙터 기능, 예컨대 ADCC 및 항체 의존성 세포-매개된 식세포작용 (ADCP), 및 세포 표면 수용체 (예를 들어, B 세포 수용체; BCR)의 하향-조절을 포함한다. 이러한 이펙터 기능은 일반적으로 Fc 영역이 결합 도메인 (예를 들어, 항체 가변 도메인)과 조합될 것을 요구한다.
"Fc 수용체" 또는 "FcR"은 이뮤노글로불린의 Fc 영역에 결합하는 수용체이다. IgG 항체에 결합하는 FcR은 이러한 수용체의 대립유전자 변이체 및 대안적으로 스플라이싱된 형태를 포함하는 FcγR 패밀리의 수용체를 포함한다. FcγR 패밀리는 3개의 활성화 (마우스에서 FcγRI, FcγRIII, 및 FcγRIV; 인간에서 FcγRIA, FcγRIIA, 및 FcγRIIIA) 수용체 및 1개의 억제 (FcγRIIB) 수용체로 이루어진다. 인간 FcγR의 다양한 특성이 표 1에 요약되어 있다. 대다수의 선천성 이펙터 세포 유형은 1개 이상의 활성화 FcγR 및 억제 FcγRIIB를 공동발현하는 반면, 자연 킬러 (NK) 세포는 1개의 활성화 Fc 수용체 (마우스에서 FcγRIII 및 인간에서 FcγRIIIA)를 선택적으로 발현하지만, 마우스 및 인간에서 억제 FcγRIIB는 발현하지 않는다.
"Fc 영역" (단편 결정화가능한 영역) 또는 "Fc 도메인" 또는 "Fc"는 면역계의 다양한 세포 (예를 들어, 이펙터 세포) 상에 위치하는 Fc 수용체 또는 고전적 보체계의 제1 성분 (C1q)에 대한 결합을 포함하는, 숙주 조직 또는 인자에 대한 이뮤노글로불린의 결합을 매개하는 항체의 중쇄의 C-말단 영역을 지칭한다. 따라서, Fc 영역은 제1 불변 영역 이뮤노글로불린 도메인을 제외한 항체의 불변 영역을 포함하는 폴리펩티드이다. IgG, IgA 및 IgD 항체 이소형에서, Fc 영역은 항체의 2개의 중쇄의 제2 (CH2) 및 제3 (CH2) 불변 도메인으로부터 유래된 2개의 동일한 단백질 단편으로 구성된다; IgM 및 IgE Fc 영역은 각각의 폴리펩티드 사슬 내에 3개의 중쇄 불변 도메인 (CH 도메인 2-4)을 함유한다. IgG의 경우, Fc 영역은 이뮤노글로불린 도메인 Cγ2 및 Cγ3, 및 Cγ1과 Cγ2 사이의 힌지를 포함한다. 이뮤노글로불린 중쇄의 Fc 영역의 경계는 달라질 수 있지만, 인간 IgG 중쇄 Fc 영역은 통상적으로 위치 C226 또는 P230에서의 아미노산 잔기로부터 중쇄의 카르복시-말단까지 이르는 것으로 정의되고, 여기서 넘버링은 카바트(Kabat)에서와 같은 EU 인덱스에 따른다. 인간 IgG Fc 영역의 CH2 도메인은 대략 아미노산 231로부터 대략 아미노산 340까지 연장되는 반면, CH3 도메인은 Fc 영역에서 CH2 도메인의 C-말단 측에 위치하고, 즉, 이는 IgG의 대략 아미노산 341로부터 대략 아미노산 447까지 연장된다. 본원에 사용된 바와 같이, Fc 영역은 천연 서열 Fc 또는 변이체 Fc일 수 있다. Fc는 또한 단리되거나 Fc-포함 단백질 폴리펩티드, 예컨대 "Fc 융합 단백질" (예를 들어, 항체 또는 이뮤노어드헤신)로도 지칭되는 "Fc 영역을 포함하는 결합 단백질"의 맥락에서 이 영역을 지칭할 수 있다.
표 1
인간 FcγR의 특성
Figure pct00001
본원에 사용된 "푸코실화"는 달리 나타내지 않는 한, 단백질 상의 N-연결된 글리칸 쇄의 가장 안쪽 GlcNac 잔기에 분지형 푸코스 잔기의 존재를 지칭한다. 푸코실화는 단백질 분자 집단의 벌크 특성이지만, 이 용어는 또한 집단 내의 개별 단백질과 관련하여 사용될 수 있다. 임의의 개별 항체는, 예를 들어, 두 중쇄 모두에서 "푸코실화"될 수 있거나 (푸코실화), 어느 중쇄에서도 "푸코실화"되지 않을 수 있거나 (비-푸코실화), 또는 2개의 중쇄 중 단지 1개에서만 "푸코실화"될 수 있다 (헤미-푸코실화). 항체 집단, 예를 들어 생산 실행으로부터의 제조는 개별 푸코실화, 비푸코실화 및 헤미-푸코실화 항체의 혼합물을 포함할 것이고, 따라서 0% 내지 100%의 임의의 푸코실화도를 나타낼 수 있다. 본원에 사용된 푸코실화 퍼센트는 푸코스가 존재하는 모든 잠재적 푸코실화 부위의 퍼센트를 지칭한다. 예를 들어, 순수한 헤미-푸코실화 항체의 제제는 50% 푸코실화될 것이다. 항체의 제조에서의 푸코실화 퍼센트를 결정하는 예시적인 방법이 실시예 2에 제공된다.
GMD는 포유동물, 예컨대 햄스터 또는 인간으로부터의 "GDP-만노스 4,6-데히드라타제"를 지칭한다. GMD는 효소 위원회 (EC) 번호 4.2.1.47에 의해 지칭된다. 인간 GMD는 또한 GMDS 및 SDR3E1로 지칭된다. GMD는 보조인자로서 NADP+를 사용하여 GDP-만노스로부터 GDP-푸코스를 합성하는 제1 단계인 GDP-만노스의 GDP-4-케토-6-데옥시만노스로의 전환을 촉매한다. 달리 나타내지 않는 한, 또는 문맥으로부터 명백하지 않는 한, 본원에서 GMD에 대한 언급은 햄스터 GMD를 지칭하지만, 대부분의 문맥에서는 햄스터 및 인간 단백질 둘 다가 포함될 것이다. 햄스터 (크리세툴루스 그리세우스(Cricetulus griseus)) GMD는 유전자식별번호(GENE ID NO): 100689436에 추가로 기재되어 있다. 23개의 아미노산 신호 서열을 포함하는 햄스터 GMD의 서열 (NP_001233625.1)은 서열식별번호: 1에 제공되고, 코딩 DNA 서열 NM_001246696.1은 서열식별번호: 2에 제공된다. 인간 (호모 사피엔스(Homo sapiens)) GMD는 유전자식별번호: 2762 및 MIM (인간 멘델 유전(Mendelian Inheritance in Man)): 602884에 추가로 기재되어 있다. 23개의 아미노산 신호 서열을 포함하는 인간 GMD 이소형 1 (NP_001491.1)의 서열은 서열식별번호: 3에 제공되고, 코딩 DNA 서열 NM_001500.4는 서열식별번호: 4에 제공된다. 햄스터 및 인간 GMD 폴리펩티드는 347aa 성숙 단백질에 비해 98% 서열 유사성 및 >99% 서열 동일성을 공유한다.
"면역 반응"은 외래 작용제에 대한 척추동물 내에서의 생물학적 반응을 지칭하고, 이 반응은 이들 작용제 및 그에 의해 유발된 질환에 대해 유기체를 보호한다. 면역 반응은 면역계의 세포 (예를 들어, T 림프구, B 림프구, 자연 킬러 (NK) 세포, 대식세포, 호산구, 비만 세포, 수지상 세포 또는 호중구) 및 임의의 이들 세포 또는 간에 의해 생산된 가용성 거대분자 (항체, 시토카인 및 보체 포함)의 작용에 의해 매개되며, 이는 침입 병원체, 병원체로 감염된 세포 또는 조직, 암성 또는 다른 비정상적 세포, 또는 자가면역 또는 병리학적 염증의 경우에 정상 인간 세포 또는 조직의 선택적 표적화, 그에 대한 결합, 그에 대한 손상, 그의 파괴 및/또는 그의 척추동물의 신체로부터의 제거를 유발한다.
"면역조정제" 또는 "면역조절제"는 면역 반응의 조정, 조절 또는 변형에 수반될 수 있는 신호전달 경로의 성분을 지칭한다. 면역 반응을 "조정하는", "조절하는", 또는 "변형하는"은 면역계의 세포 또는 이러한 세포의 활성에서의 임의의 변경을 지칭한다. 이러한 조정은 다양한 세포 유형의 수의 증가 또는 감소, 이들 세포의 활성의 증가 또는 감소, 또는 면역계 내에서 발생할 수 있는 임의의 다른 변화에 의해 나타날 수 있는 면역계의 자극 또는 억제를 포함한다. 억제 및 자극 면역조절제 둘 다가 확인되었고, 이들 중 일부는 종양 미세환경에서 증진된 기능을 가질 수 있다. 개시된 발명의 바람직한 실시양태에서, 면역조정제는 T 세포의 표면 상에 위치한다. "면역조정 표적" 또는 "면역조절 표적"은 물질, 작용제, 모이어티, 화합물 또는 분자에 의한 결합을 위해 표적화되고, 그의 활성이 그의 결합에 의해 변경되는 면역조정제이다. 면역조정 표적은 예를 들어 세포의 표면 상의 수용체 ("면역조정 수용체") 및 수용체 리간드 ("면역조정 리간드")를 포함한다.
"면역요법"은 면역 반응을 유도하거나, 증진시키거나, 억제하거나 또는 달리 변형시키는 것을 포함하는 방법에 의한, 질환을 앓고 있거나 또는 질환에 걸릴 위험이 있거나 또는 질환이 재발할 위험이 있는 대상체의 치료를 지칭한다.
"내인성 면역 반응을 강화시키는 것"은 대상체에서 기존 면역 반응의 유효성 또는 효력을 증가시키는 것을 의미한다. 유효성 및 효력의 이러한 증가는, 예를 들어 내인성 숙주 면역 반응을 억제하는 메커니즘을 극복함으로써 또는 내인성 숙주 면역 반응을 증진시키는 메커니즘을 자극함으로써 달성될 수 있다.
"단백질"은 적어도 2개의 연속적으로 연결된 아미노산 잔기를 포함하는 쇄를 지칭하고, 쇄의 길이에 대한 상한은 없다. 단백질 내의 1개 이상의 아미노산 잔기는 글리코실화, 인산화 또는 디술피드 결합 형성과 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 변형을 함유할 수 있다. 용어 "단백질"은 본원에서 "폴리펩티드"와 상호교환가능하게 사용된다. "단백질"은 상이한 폴리펩티드 서열, 예컨대 항체의 중쇄 및 경쇄를 포함할 수 있는 2개 이상의 폴리펩티드 쇄를 포함할 수 있다. 통상적인 전장 항체는 2개의 중쇄 및 2개의 경쇄를 포함할 것이고, "단백질"이다. 상이한 서열을 갖는 2개 이상의 폴리펩티드를 포함하는 "단백질"을 발현하는 세포 또는 세포주는 단백질의 모든 쇄, 예를 들어 항체의 중쇄 및 경쇄 둘 다를 발현한다.
본원에 사용된 "단백질"은, 달리 나타내지 않는 한, 감소된 푸코실화를 갖는 단백질을 제조하기 위한 본 발명의 화합물 및 방법과 관련하여, N-연결된 글리칸을 포함한다. N-연결된 글리코실화를 갖는 단백질, 예컨대 항체 내의 Fc 영역 (N297) 글리코실화가 본 발명의 화합물 및 방법과 함께 사용되어, 글리칸 사슬의 가장 안쪽 GlcNac 잔기에 달리 통상적으로 부가되는 푸코스 잔기의 부가를 제한 또는 방지할 수 있다.
통상적인 바와 같이, 용어 "단백질", 예컨대 "항체"는 문맥에 따라 제제 내의 단백질 분자의 집단, 또는 그 집단 내의 개별 단백질 분자를 지칭할 수 있다. 명확성을 위해, 용어 "비-푸코실화"는 본원에서 N-연결된 푸코스가 결여된 개별 단백질 (예를 들어 항체 쇄)을 지칭하기 위해 사용되고, "비푸코실화"는 단백질 분자의 집단 또는 제제를 지칭하기 위해 사용된다. 그 결과, 임의의 개별 폴리펩티드 쇄는 푸코실화 또는 비푸코실화될 수 있는 반면, 단백질의 집단은 임의의 주어진 비푸코실화 퍼센트로 비푸코실화될 수 있다. 따라서, 푸코실화의 수준과 관련된 단백질 또는 단백질들에 대한 임의의 언급, 예를 들어 "감소된 푸코실화를 갖는 항체"는 명백하게 언급되지 않은 경우에도 단백질 분자의 이종 집단을 반드시 지칭한다.
달리 나타내지 않는 한, 또는 문맥으로부터 명백하지 않는 한, 항체의 Fc 영역에서의 아미노산 잔기 넘버링은 서열 목록 내의 서열 내의 잔기를 구체적으로 언급할 때 (이 경우 넘버링은 반드시 연속적일 필요가 있음)를 제외하고는 EU 넘버링 규약에 따른다 (문헌 [Kabat et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, National Institutes of Health, Bethesda, MD]에서와 같은 EU 인덱스; 또한 미국 특허 출원 공개 번호 2008/0248028의 도 3c-3f 참조). 예를 들어, Fc 영역 내의 아미노산 치환의 효과에 관한 참조는 전형적으로 EU 넘버링을 사용할 것이고, 이는 항체의 Fc 영역 내의 임의의 주어진 잔기에 대해 그것이 부착되어 있는 가변 도메인의 길이에 관계없이 동일한 번호로 참조하는 것을 허용한다. 드문 경우에, 언급되는 정확한 Fc 잔기를 확인하기 위해 참조되는 문헌을 언급하는 것이 필요할 수 있다.
"람노스"는, 달리 나타내지 않는 한, D-람노스를 지칭한다.
"대상체"는 임의의 인간 또는 비-인간 동물을 포함한다. 용어 "비-인간 동물"은 척추동물, 예컨대 비인간 영장류, 양, 개, 토끼, 설치류, 예컨대 마우스, 래트 및 기니 피그, 조류 종, 예컨대 닭, 양서류 및 파충류를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다. 바람직한 실시양태에서, 대상체는 포유동물, 예컨대 비인간 영장류, 양, 개, 고양이, 토끼, 페렛 또는 설치류이다. 개시된 발명의 임의의 측면의 보다 바람직한 실시양태에서, 대상체는 인간이다. 용어 "대상체" 및 "환자"는 본원에서 상호교환가능하게 사용된다.
대상체의 "치료" 또는 "요법"은 질환과 연관된 증상, 합병증, 상태 또는 생화학적 징후의 발병, 진행, 발달, 중증도 또는 재발을 역전시키거나, 완화시키거나, 개선시키거나, 억제하거나, 늦추거나 또는 예방할 목적으로 대상체에 대해 수행되는 임의의 유형의 개입 또는 방법, 또는 대상체에게 활성제를 투여하는 것을 지칭한다.
항체의 푸코실화를 감소시키는 전통적인 방법
항체와 FcγR의 상호작용은 각각의 Fc 단편에 N297 잔기에서 부착된 글리칸 모이어티를 변형시킴으로써 증진될 수 있다. 특히, 코어 푸코스 잔기의 부재는 항원 결합 또는 CDC를 변경시키지 않으면서 활성화 FcγRIIIA에 대한 IgG의 개선된 결합을 통해 ADCC를 강하게 증진시킨다. Natsume et al. (2009) Drug Des. Devel. Ther. 3:7. 비-푸코실화 종양-특이적 항체가 생체내 마우스 모델에서 증진된 치료 활성으로 번역된다는 확신적인 증거가 존재한다. Nimmerjahn & Ravetch (2005) Science 310:1510; Mossner et al. (2010) Blood 115:4393.
항체 글리코실화의 변형은 전통적으로, 예를 들어 변경된 글리코실화 기구를 갖는 숙주 세포 내에서 항체를 발현시킴으로써 달성되었다. 변경된 글리코실화 기구를 갖는 세포는 관련 기술분야에 기재되어 있다. 예를 들어, 세포주 Ms704, Ms705, 및 Ms709에는 푸코실트랜스퍼라제 유전자인 FUT8 (α-(1,6) 푸코실트랜스퍼라제가 결여되어 있고 (미국 특허 출원 공개 번호 20040110704; Yamane-Ohnuki et al. (2004) Biotechnol. Bioeng. 87: 614 참조), 따라서 이들 세포주에서 발현된 항체에는 그의 탄수화물 상에 푸코스가 결여된다. EP 1176195는 또한 기능적으로 파괴된 FUT8 유전자를 갖는 세포주 뿐만 아니라 항체의 Fc 영역에 결합하는 N-아세틸글루코사민에 푸코스를 부가하기 위한 활성이 거의 또는 전혀 없는 세포주, 예를 들어, 래트 골수종 세포주 YB2/0 (ATCC CRL 1662)을 기재한다. PCT 공개 WO 03/035835는 Asn(297)-연결된 탄수화물에 푸코스를 부착시키는 능력이 감소되고, 또한 그 숙주 세포에서 발현된 항체의 저푸코실화를 유발하는 변이체 CHO 세포주, Lec13을 기재한다. 또한, 문헌 [Shields et al. (2002) J. Biol. Chem. 277:26733]을 참조한다. 변형된 글리코실화 프로파일을 갖는 항체는 또한 PCT 공개 번호 WO 2006/089231에 기재된 바와 같이 닭 알에서 생산될 수 있다. 대안적으로, 변형된 글리코실화 프로파일을 갖는 항체는 식물 세포, 예컨대 렘나(Lemna)에서 생산될 수 있다. 예를 들어, 미국 공개 번호 2012/0276086을 참조한다. PCT 공개 번호 WO 99/54342는 조작된 세포주에서 발현된 항체가 증가된 이등분 GlcNac 구조를 나타내어 항체의 ADCC 활성을 증가시키도록 당단백질-변형 글리코실 트랜스퍼라제 (예를 들어, 베타(1,4)-N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라제 III (GnTIII))를 발현하도록 조작된 세포주를 기재한다. 또한, 문헌 [Umana et al. (1999) Nat. Biotech. 17:176]을 참조한다. 대안적으로, 항체의 푸코스 잔기는 푸코시다제 효소를 사용하여 절단될 수 있다. 예를 들어, 효소 알파-L-푸코시다제는 항체로부터 푸코실 잔기를 제거한다. Tarentino et al. (1975) Biochem. 14:5516. 감소된 푸코실화를 갖는 항체는 또한 미국 특허 번호 8,642,292에 기재된 바와 같이, GDP-6-데옥시-D-릭소-4-헥실로스를 기질로서 사용하는 효소, 예컨대 GDP-6-데옥시-D-릭소-4-헥실로스 리덕타제 (RMD)를 코딩하는 재조합 유전자를 보유하는 세포에서 생산될 수 있다. 대안적으로, 세포는 배지에서 성장된 세포에 의해 생산된 N-연결된 글리칸 또는 당단백질, 예컨대 항체로의 푸코스 잔기의 부가를 차단하는 푸코스 유사체를 함유하는 배지에서 성장될 수 있다. 미국 특허 번호 8,163,551; WO 09/135181. 이러한 화합물은 퍼아세틸-푸코스, 6,6,6-트리플루오로푸코스 퍼-O-아세테이트, 6,6,6-트리플루오로푸코스 (푸코스타틴 I) 및 푸코스-1-포스페이트 유사체 (푸코스타틴 II)를 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
푸코실화 억제제로서의 람노스 유도체
한 측면에서, 본 발명은 포유동물 세포 배양물에서 생산된 단백질의 푸코실화를 억제하는 람노스-유래 화합물, 예컨대 GDP-D-람노스 및 그의 유도체를 제공한다. 이론에 의해 제한되는 것을 의도하지는 않지만, 이러한 화합물은 GDP-만노스-4,6-데히드라타제 (GMD)의 억제제로서 작용할 수 있다. 본 발명의 예시적인 화합물은 GDP-D-람노스 (화학식 I), Ac-GDP-D-람노스 (화학식 II), 및 소듐 람노스 포스페이트 (화학식 III)를 포함하고, 그의 구조는 도 1에 제공된다. 본 발명의 화합물의 합성의 예시적인 방법이 도 4a 및 4b (Ac-GDP-D-람노스에 대해) 및 도 4a, 4b 및 4c (GDP-D-람노스)에 제공되고 실시예 1에서 보다 상세히 논의된다. 본 발명의 화합물의 합성의 제2 예시적 방법이 도 5a 및 5b (Ac-GDP-D-람노스에 대해) 및 도 5a, 5b 및 5c (GDP-D-람노스)에 제공된다.
본 발명은 또한 본 발명의 푸코실화 억제제, 예컨대 GDP-D-람노스, Ac-GDP-D-람노스, 및 소듐 람노스 포스페이트를 예를 들어 6 mM 이상, 또는 10 mM 이상의 농도로 포함하는 배양 배지에서, 단백질-생산 세포를 성장시킴으로써, 감소된 푸코실화를 갖는 단백질, 및 저푸코실화 및 비푸코실화 단백질, 예컨대 항체를 생산하는 방법을 제공한다.
본 발명은 또한 본 발명의 방법에 의해 제조된 단백질, 예컨대 항체, 및 이들 단백질 (예를 들어, 항체)을 사용한 질환, 예를 들어 암의 치료 방법을 제공한다.
비푸코실화 항체는 푸코실화 항체에 비해 크게 증진된 ADCC를 나타내기 때문에, 항체 제제는 푸코실화 항체보다 치료상 우수하도록 푸코실화 중쇄가 완전히 없을 필요는 없다. 푸코실화 중쇄의 잔류 수준은 실질적으로 비푸코실화 중쇄의 제제의 ADCC 활성을 유의하게 방해하지 않을 것이다. 그럼에도 불구하고, 코어 푸코스를 N-글리칸에 부가하는 데 완전히 적격인, 통상적인 CHO 세포에서 생산된 항체는 수 퍼센트 내지 15% 이하의 비푸코실화 항체를 포함할 수 있다. 비푸코실화된 항체는 CD16에 대해 10배 더 높은 친화도, 및 ADCC 활성의 최대 30- 내지 100-배 증진을 나타낼 수 있고, 따라서 심지어 비푸코실화 항체의 비율의 작은 증가도 제제의 ADCC 활성을 극적으로 증가시킬 수 있다. 배양물 중 정상 CHO 세포에서 생산될 것보다 더 많은 비푸코실화 항체를 포함하는 임의의 제제는 어느 정도의 증진된 ADCC를 나타낼 수 있다. 이러한 항체 제제는 본원에서 "감소된 푸코실화"를 갖는 제제로 지칭된다. 정상 CHO 세포로부터 수득된 비푸코실화의 원래 수준에 따라, 감소된 푸코실화를 갖는 제제는 40%, 30%, 20%, 10% 및 심지어 5% 정도만큼 적은 비푸코실화 항체를 포함할 수 있다. 감소된 푸코실화는, 임의의 고정된 퍼센트의 비푸코실화 종에 대한 언급이 아니라, 정상 CHO 세포에서 제조된 항체에 비해 ADCC의 2배 이상의 증진을 나타내는 제제로서 기능적으로 정의된다.
다른 실시양태에서, 비푸코실화의 수준은 구조적으로 정의된다. 본원에 사용된 비푸코실화 항체 제제는 100%를 포함한, 95% 초과의 비푸코실화 항체 중쇄를 포함하는 항체 제제이다. 저푸코실화 항체 제제는 95% 이하의 푸코스가 결여된 중쇄를 포함하는 항체 제제, 예를 들어 중쇄의 50 내지 95%, 예컨대 75 내지 95%, 및 85 내지 95%가 푸코스가 결여된 항체 제제이다. 달리 나타내지 않는 한, 저푸코실화는 50 내지 95%의 중쇄에 푸코스가 결여된 항체 제제를 지칭하고, 비푸코실화는 95% 초과의 중쇄에 푸코스가 결여된 항체 제제를 지칭하고, "저푸코실화 또는 비푸코실화"는 50% 이상의 중쇄에 푸코스가 결여된 항체 제제를 지칭한다.
항체 제제에서의 푸코실화의 수준은 겔 전기영동, 액체 크로마토그래피 및 질량 분광측정법을 포함하나 이에 제한되지는 않는 관련 기술분야에 공지된 임의의 방법에 의해 결정될 수 있다. 달리 나타내지 않는 한, 본 발명의 목적을 위해, 항체 제제에서의 푸코실화 수준은 본질적으로 실시예 2에 기재된 바와 같이 친수성 상호작용 크로마토그래피 (또는 친수성 상호작용 액체 크로마토그래피, HILIC)에 의해 결정된다. 항체 제제의 푸코실화 수준을 결정하기 위해, 샘플을 PNGase F로 변성 처리하여 N-연결된 글리칸을 절단하고, 이어서 이를 푸코스 함량에 대해 분석한다. 전장 항체 쇄의 LC/MS는 항체 제제의 푸코실화 수준을 검출하는 대안적 방법이지만, 질량 분광법은 본질적으로 덜 정량적이다.
본 발명의 치료 용도 및 방법
일부 실시양태, 예컨대 암 또는 감염의 치료에서, 보다 강건한 항-종양 또는 항-감염 면역 반응을 가능하게 하기 위해, 또는 종양 감염된 세포 자체를 고갈시키기 위해, 면역억제 세포, 예컨대 조절 T 세포 (Treg)를 고갈시키는 것이 바람직할 수 있다. 이러한 경우에, 면역억제 세포 상에서 우선적으로 또는 독점적으로 발현되는 세포 표면 단백질에 대해, 또는 종양 세포 (예를 들어 종양 항원) 상에서 우선적으로 또는 독점적으로 발현되는 세포 표면 단백질 또는 감염된 세포 자체에 대해 생성된 항체 (또는 그의 항원 결합 단편)는 본 발명의 람노스-관련 푸코실화 억제제의 존재 하에 성장시킨 포유동물 세포주에서 생산되어, 증진된 ADCC 활성을 갖는 저푸코실화 또는 비푸코실화 항체의 집단을 생산한다. 병리학적 염증이 질환, 예컨대 자가면역 장애를 유발하는 다른 경우에, 본 발명의 람노스-관련 푸코실화 억제제의 존재 하에 성장시킨 포유동물 세포주에서 생산된 저푸코실화 또는 비푸코실화 항체는 염증성 세포 자체 상에서 우선적으로 또는 독점적으로 발현되는 세포 표면 단백질에 대해 특이적이다.
본 치료 방법의 바람직한 실시양태에서, 대상체는 인간이다.
본 발명의 방법에 의해 생산된 저푸코실화 또는 비푸코실화 항체를 사용하여 치료될 수 있는 암의 예는 골암, 췌장암, 피부암, 두경부암, 유방암, 폐암, 피부 또는 안내 악성 흑색종, 신암, 자궁암, 난소암, 결장직장암, 결장암, 직장암, 항문부암, 위암, 고환암, 자궁암, 난관의 암종, 자궁내막의 암종, 자궁경부의 암종, 질의 암종, 외음부의 암종, 식도암, 소장암, 내분비계암, 갑상선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직의 육종, 요도암, 음경암, 혈액 악성종양, 소아기의 고형 종양, 림프구성 림프종, 방광암, 신장암 또는 요관암, 신우의 암종, 중추 신경계 (CNS)의 신생물, 원발성 CNS 림프종, 종양 혈관형성, 척수축 종양, 뇌간 신경교종, 뇌하수체 선종, 카포시 육종, 표피양암, 편평 세포암, 석면에 의해 유발된 것을 포함한 환경적으로 유발된 암, 전이성 암, 및 상기 암의 임의의 조합을 포함한다. 바람직한 실시양태에서, 암은 MEL, RCC, 편평 NSCLC, 비-편평 NSCLC, CRC, CRPC, 두경부의 편평 세포 암종, 및 식도, 난소, 위장관 및 유방의 암종으로부터 선택된다. 본 방법은 또한 전이성 암의 치료에 적용가능하다.
다른 암은, 예를 들어 다발성 골수종, B-세포 림프종, 호지킨 림프종/원발성 종격 B-세포 림프종, 비-호지킨 림프종, 급성 골수성 림프종, 만성 골수성 백혈병, 만성 림프성 백혈병, 여포성 림프종, 미만성 거대 B-세포 림프종, 버킷 림프종, 면역모구성 대세포 림프종, 전구체 B-림프모구성 림프종, 외투 세포 림프종, 급성 림프모구성 백혈병, 균상 식육종, 역형성 대세포 림프종, T-세포 림프종, 및 전구체 T-림프모구성 림프종, 및 상기 암의 임의의 조합을 포함한 혈액 악성종양을 포함한다.
본 발명은 하기 실시예에 의해 추가로 예시되며, 이는 제한적인 것으로 해석되어서는 안된다. 본 출원 전체에 걸쳐 인용된 모든 도면 및 모든 참고문헌, 특허 및 공개된 특허 출원의 내용은 명백하게 본원에 참조로 포함된다.
실시예 1
푸코실화 억제제의 예시적인 합성
도 4a 및 4b에 제공된 본 발명의 푸코실화 억제제를 제조하기 위한 예시적인 합성 방법이 여기서 보다 상세히 논의된다.
단계 1.
Figure pct00002
아세톤 (750 mL) 중 화합물 1 (150 g, 772 mmol, 1 당량), 2,2-디메톡시프로판 (402 g, 3.86 mol, 473 mL, 5 당량) 및 PTSA (6.65 g, 38.6 mmol, 0.05 당량)의 용액을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC (에틸 아세테이트, SM (Rf) = 0.01, 생성물 (Rf) = 0.38)는 반응이 완결되었음을 나타내었다. 혼합물에 물 (150 mL)을 첨가하였다. 30분 후, PTSA를 5% 수성 NaHCO3으로 중화시켰다. 아세톤을 진공 하에 제거하고, 수성 상을 석유 에테르로 세척하여 디이소프로필리덴을 분리한 다음, DCM (3*200 mL)으로 세척하였다. 유기 층을 건조 (Na2SO4)시키고, 진공 하에 농축시켜 화합물 2 (100 g, 55%)를 회백색 고체로서 수득하였고, 이를 후속 단계에 추가 정제 없이 사용하였다.
단계 2.
Figure pct00003
DCM (700 mL) 중 화합물 2 (100 g, 426 mmol, 1 당량)의 용액에 TEA (56.1 g, 554 mmol, 77.25 mL, 1.3 당량) 및 TosCl (105 g, 554 mmol, 1.3 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 16시간 동안 교반하였다.
TLC (석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 1:1, 생성물 (Rf) = 0.43)는 화합물 2가 완전히 소모되었음을 나타내었다. CH2Cl2 (200 mL)를 첨가하고, 용액을 포화 NaHCO3 (5 x 300 mL) 및 H2O (3 x 300 mL)로 연속적으로 세척하고, 건조시키고 (MgSO4), 시럽으로 증발시켰다. 잔류물을 칼럼 크로마토그래피 (SiO2, 석유 에테르/ 에틸 아세테이트 = 5/1에서 2/1)에 의해 정제하여 화합물 3 (100 g, 60% 수율)을 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 3.
Figure pct00004
2개의 반응을 동시에 수행한다.
N2 하에 DMSO (450 mL) 중 화합물 3 (45.0 g, 115 mmol, 1 당량)의 용액을 20℃로 냉각시키고, NaBH4 (21.9 g, 579 mmol, 5 당량)를 교반하면서 천천히 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. TLC (석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 2:1, 생성물 (Rf) = 0.43)는 화합물 3이 완전히 소모되었음을 나타내었다. 여기서 2개의 반응을 합하였다. 혼합물을 얼음 H2O(1400 mL)로 켄칭하고, 혼합물을 15분 동안 교반한 다음, EtOAc (1000 mL)로 세척하고, 건조 (Na2SO4)시키고, 증발시켰다. 잔류물을 칼럼 크로마토그래피 (SiO2, 석유 에테르/에틸 아세테이트 = 5/1에서 2/1)에 의해 정제하여 화합물 4 (40 g, 79% 수율)를 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 4.
Figure pct00005
H2O (2000 mL) 중 화합물 4 (40 g, 183 mmol, 1 당량)의 용액에 다우엑스(Dowex) 50 H+ 수지 (300 g)를 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 24시간 동안 교반하였다. TLC (디클로로메탄: 메탄올 = 3:1, 생성물 (Rf) = 0.15)는 화합물 4가 완전히 소모되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 여과하고, 감압 하에 농축시켜 화합물 5 (30 g, 조 물질)를 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 5.
Figure pct00006
Py (300 mL) 중 화합물 5 (30.0 g, 182 mmol, 1 당량)의 용액에 DMAP (4.47 g, 36.5 mmol, 0.2 당량) 및 Ac2O (149 g, 1.46 mol, 136 mL, 8 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. TLC (석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 3:1, 생성물 (Rf) = 0.43)는 화합물 5가 완전히 소모되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 H2O (300 mL)를 첨가하여 켄칭한 다음, EtOAC (500 mL)로 희석하였다. 유기 층을 1N HCl (300 mL x 2)로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 칼럼 크로마토그래피 (SiO2, 석유 에테르/에틸 아세테이트=10/1에서 5:1)에 의해 정제하여 화합물 6 (30 g, 49% 수율)을 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 6.
Figure pct00007
화합물 6 (20.0 g, 60.1 mmol, 1 당량)을 DMF (110 mL)에 용해시켰다. 아세트산;히드라진 (8.31 g, 90.2 mmol, 1.5 당량)을 첨가하고, 혼합물을 N2 하에 25℃에서 3시간 동안 교반하였다. TLC (석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:1, 생성물 (Rf) = 0.24)는 화합물 6이 완전히 소모되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 0℃에서 H2O 300 mL를 첨가하여 켄칭한 다음, EtOAc (200 mL x 2)로 추출하였다. 합한 유기 층을 염수 (100 mL x 3)로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 화합물 7 (12.0 g, 조 물질)을 담황색 오일로서 수득하였고, 이를 후속 단계에 추가 정제 없이 사용하였다.
단계 7.
Figure pct00008
화합물 7 (12.0 g, 41.3 mmol, 1 당량)을 ~30mL ACN과 2회 공증발시킨 다음, 50mL의 ACN을 첨가하였다. ACN 40 mL 중 7a (15.7 g, 45.4 mmol, 15 mL, 1.1 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 0℃로 냉각시켰다. TFA.Py (1 M, 74 mL, 1.8 당량)를 0~5℃에서 적가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. 0℃로 냉각시키고, ACN 40 mL 중 m-CPBA (15.1 g, 74.4 mmol, 85% 순도, 1.8 당량)를 0℃에서 적가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. TLC (석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 2:1, 생성물 (Rf) = 0.24)는 화합물 7이 완전히 소모되었음을 나타내었다. 포화 Na2SO3(400 mL) 및 EtOAc(600 mL)를 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 20분 동안 교반하였다. 유기 상을 분리하고, 포화 Na2SO3 (300 mL*2) 및 염수 (300 mL)로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하였다. 잔류물을 칼럼 크로마토그래피 (SiO2, 석유 에테르/에틸 아세테이트=2/1)에 의해 정제하여 화합물 8 (10.0 g, 43% 수율)을 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 8.
Figure pct00009
MeOH (200 mL) 중 화합물 8 (4.00 g, 7.27 mmol, 1 당량)의 용액에 N2 분위기 하에 Pd/C (10%, 4.0 g), 3.63 mL TEA를 첨가하였다. 현탁액을 탈기하고, H2로 3회 퍼징하였다. 혼합물을 H2 (30 Psi) 하에 25℃에서 3시간 동안 교반하였다. TLC (석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 1:1, 생성물 (Rf) = 0.05)는 화합물 8이 완전히 소모되었음을 나타내었다. 혼합물을 셀라이트를 통해 여과하고, 필터 케이크를 MeOH (30 mL)로 세척하고, 감압 하에 농축시켜 화합물 9 (1.5 g, 55.7% 수율)를 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 9.
Figure pct00010
화합물 8의 용액 (1.5 g, 4.05 mmol, 1 당량)에 NH3/MeOH (7 M, 70 mL, 120 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. LCMS(et14769-65-p1a, Rt = 0.235분)는 목적 MS가 검출되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 여과하고, 필터 케이크를 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물을 동결건조시켰다. 화합물 D-Rha-포스페이트 (0.6 g, 61% 수율)를 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 10.
Figure pct00011
화합물 9 (0.1 g, 270 umol, 1 당량)를 Py (1 mL × 2)와 공증발시켰다. 화합물 9_A (98.0 mg, 135 umol, 0.5 당량)를 첨가하고, 혼합물을 Py (1 mL × 2)와 공증발시켰다. 테트라졸 (0.45 M, 1.20 mL, 2 당량)을 첨가하고, 혼합물을 Py (1 mL × 2)와 함께 공증발시켰다. Py (2 mL)를 첨가하고, N2로 탈기시켰다. 혼합물을 25℃에서 40시간 동안 교반하였다. LCMS(et14769-78-p1D, Rt = 1.157분)은 반응물 1이 남아있음을 나타내었다. 여러 새로운 피크가 LC-MS 상에서 나타났고, 목적 화합물이 검출되었다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 정제용 HPLC (중성 조건)에 의해 정제하였다. 동결건조하여 혼합물 화합물 10 및 화합물 9 (20 mg, 61% 수율)를 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 11.
Figure pct00012
화합물 10 및 화합물 9의 혼합물 (20 mg)을 H2O (0.5 mL)에 용해시켰다. MeOH/H2O/TEA의 용액 (0.5 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 20분 동안 교반하였다. LCMS(et14769-83-p1a)는 목적 ms가 검출되었음을 나타내었다. 생성된 혼합물에 H2O (6 mL)를 첨가하고, 3회 동결건조시켰다. 화합물 11 및 화합물 11_A의 혼합물 (20 mg)을 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 12.
Figure pct00013
화합물 11 및 화합물 11_A의 혼합물 (20 mg)을 비-이온 H2O (300 mL)로 다우엑스 5WX8-100 (Na+ 형태)을 통해 용리시켰다. 용리액을 동결건조시켰다. 화합물 GDP-D-람노스 및 화합물 11_B (15 mg)의 혼합물을 담황색 고체로서 수득하였다.
실시예 2
샘플 중 비푸코실화된 항체의 퍼센트를 결정하기 위한 검정
비푸코실화 항체 제제를 분석하여 본질적으로 하기와 같이 비푸코실화 중쇄의 백분율을 결정할 수 있다.
항체를 먼저 우레아를 사용하여 변성시킨 후, DTT (디티오트레이톨)를 사용하여 환원시킨다. 이어서, 샘플을 밤새 37℃에서 PNGase F로 소화시켜 N-연결된 글리칸을 제거한다. 방출된 글리칸을 수집하고, 여과하고, 건조시키고, 2-아미노벤조산 (2-AA) 또는 2-아미노벤즈아미드 (2-AB)로 유도체화한다. 이어서, 생성된 표지된 글리칸을 HILIC 칼럼 상에서 분해하고, 용리된 분획을 형광에 의해 정량화하고, 건조시킨다. 이어서, 분획을 엑소글리코시다제, 예컨대 α(1-2,3,4,6) 푸코시다제 (BKF)로 처리하고, 이는 코어 α(1,6)-연결된 푸코스 잔기를 방출한다. 이어서, 비처리된 샘플 및 BKF-처리된 샘플을 액체 크로마토그래피에 의해 분석한다. α(1,6)-연결된 푸코스 잔기를 포함하는 글리칸은 BKF 처리 후에 변경된 용리를 나타내는 반면, 비푸코실화 글리칸은 변하지 않는다. 올리고당 조성을 또한 질량 분석법에 의해 확인한다. 예를 들어, 문헌 [Zhu et al. (2014) MAbs 6:1474]을 참조한다.
비푸코실화 퍼센트는 (항체 중쇄의 N297에서의 N-연결된 글리칸에서 제1 GlcNac 잔기에 α1,6-연결된 푸코스가 결여된 글리칸)의 (푸코스가 결여된 글리칸 및 α1,6-연결된 푸코스를 갖는 글리칸 둘 다를 포함한, 그 위치에서의 모든 글리칸의 총합)에 대한 몰비 곱하기 100으로 계산된다.
표 7
서열 목록의 요약
Figure pct00014
등가물:
관련 기술분야의 통상의 기술자는 단지 일상적인 실험을 사용하여 본원에 개시된 구체적 실시양태의 많은 등가물을 인식하거나 확인할 수 있을 것이다. 이러한 등가물은 하기의 청구항에 포괄되는 것으로 의도된다.
SEQUENCE LISTING <110> Bristol-Myers Squibb Company <120> USE OF FUCOSYLATION INHIBITOR FOR PRODUCING AFUCOSYLATED ANTIBODY <130> 13347-WO-PCT <150> US 62/951,318 <151> 2019-12-20 <160> 4 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 372 <212> PRT <213> Cricetulus griseus <400> 1 Met Ala His Ala Pro Ala Ser Cys Pro Ser Ser Arg Asn Ser Gly Asp 1 5 10 15 Gly Asp Lys Gly Lys Pro Arg Lys Val Ala Leu Ile Thr Gly Ile Thr 20 25 30 Gly Gln Asp Gly Ser Tyr Leu Ala Glu Phe Leu Leu Glu Lys Gly Tyr 35 40 45 Glu Val His Gly Ile Val Arg Arg Ser Ser Ser Phe Asn Thr Gly Arg 50 55 60 Ile Glu His Leu Tyr Lys Asn Pro Gln Ala His Ile Glu Gly Asn Met 65 70 75 80 Lys Leu His Tyr Gly Asp Leu Thr Asp Ser Thr Cys Leu Val Lys Ile 85 90 95 Ile Asn Glu Val Lys Pro Thr Glu Ile Tyr Asn Leu Gly Ala Gln Ser 100 105 110 His Val Lys Ile Ser Phe Asp Leu Ala Glu Tyr Thr Ala Asp Val Asp 115 120 125 Gly Val Gly Thr Leu Arg Leu Leu Asp Ala Ile Lys Thr Cys Gly Leu 130 135 140 Ile Asn Ser Val Lys Phe Tyr Gln Ala Ser Thr Ser Glu Leu Tyr Gly 145 150 155 160 Lys Val Gln Glu Ile Pro Gln Lys Glu Thr Thr Pro Phe Tyr Pro Arg 165 170 175 Ser Pro Tyr Gly Ala Ala Lys Leu Tyr Ala Tyr Trp Ile Val Val Asn 180 185 190 Phe Arg Glu Ala Tyr Asn Leu Phe Ala Val Asn Gly Ile Leu Phe Asn 195 200 205 His Glu Ser Pro Arg Arg Gly Ala Asn Phe Val Thr Arg Lys Ile Ser 210 215 220 Arg Ser Val Ala Lys Ile Tyr Leu Gly Gln Leu Glu Cys Phe Ser Leu 225 230 235 240 Gly Asn Leu Asp Ala Lys Arg Asp Trp Gly His Ala Lys Asp Tyr Val 245 250 255 Glu Ala Met Trp Leu Met Leu Gln Asn Asp Glu Pro Glu Asp Phe Val 260 265 270 Ile Ala Thr Gly Glu Val His Ser Val Arg Glu Phe Val Glu Lys Ser 275 280 285 Phe Met His Ile Gly Lys Thr Ile Val Trp Glu Gly Lys Asn Glu Asn 290 295 300 Glu Val Gly Arg Cys Lys Glu Thr Gly Lys Ile His Val Thr Val Asp 305 310 315 320 Leu Lys Tyr Tyr Arg Pro Thr Glu Val Asp Phe Leu Gln Gly Asp Cys 325 330 335 Ser Lys Ala Gln Gln Lys Leu Asn Trp Lys Pro Arg Val Ala Phe Asp 340 345 350 Glu Leu Val Arg Glu Met Val Gln Ala Asp Val Glu Leu Met Arg Thr 355 360 365 Asn Pro Asn Ala 370 <210> 2 <211> 1606 <212> DNA <213> Cricetulus griseus <400> 2 agactgtggc ggccgctgca gctccgtgag gcgactggcg cgcgcaccca cgtctctgtc 60 ggcccgctgc cggttccacg gttccactcc tccttccact cggctgcacg ctcacccgcc 120 cgcggcgaca tggctcacgc tcccgctagc tgcccgagct ccaggaactc tggggacggc 180 gataagggca agcccaggaa ggtggcgctc atcacgggca tcaccggcca ggatggctca 240 tacttggcag aattcctgct ggagaaagga tacgaggttc atggaattgt acggcgatcc 300 agttcattta atacaggtcg aattgaacat ttatataaga atccacaggc tcatattgaa 360 ggaaacatga agttgcacta tggtgacctc accgacagca cctgcctagt aaaaatcatc 420 aatgaagtca aacctacaga gatctacaat cttggtgccc agagccatgt caagatttcc 480 tttgacttag cagagtacac tgcagatgtt gatggagttg gcaccttgcg gcttctggat 540 gcaattaaga cttgtggcct tataaattct gtgaagttct accaggcctc aactagtgaa 600 ctgtatggaa aagtgcaaga aataccccag aaagagacca cccctttcta tccaaggtcg 660 ccctatggag cagccaaact ttatgcctat tggattgtag tgaactttcg agaggcttat 720 aatctctttg cggtgaacgg cattctcttc aatcatgaga gtcctagaag aggagctaat 780 tttgttactc gaaaaattag ccggtcagta gctaagattt accttggaca actggaatgt 840 ttcagtttgg gaaatctgga cgccaaacga gactggggcc atgccaagga ctatgtcgag 900 gctatgtggc tgatgttaca aaatgatgaa ccagaggact ttgtcatagc tactggggaa 960 gttcatagtg tccgtgaatt tgttgagaaa tcattcatgc acattggaaa gaccattgtg 1020 tgggaaggaa agaatgaaaa tgaagtgggc agatgtaaag agaccggcaa aattcatgtg 1080 actgtggatc tgaaatacta ccgaccaact gaagtggact tcctgcaggg agactgctcc 1140 aaggcgcagc agaaactgaa ctggaagccc cgcgttgcct ttgacgagct ggtgagggag 1200 atggtgcaag ccgatgtgga gctcatgaga accaacccca acgcctgagc acctctacaa 1260 aaaattcgcg agacatggac tatggtgcag agccagccaa ccagagtcca gccactcctg 1320 agaccatcga ccataaaccc tcgactgcct gtgtcgtccc cacagctaag agctgggcca 1380 caggtttgtg ggcaccagga cggggacact ccagagctaa ggccacttcg cttttgtcaa 1440 aggctcctct gaatgatttt gggaaatcaa gaagtttaaa atcacatact cattttactt 1500 gaaattatgt cactagacaa cttaaatttt tgagtcttga gattgttttt ctcttttctt 1560 attaaatgat ctttctatga accagcaaaa aaaaaaaaaa aaaaaa 1606 <210> 3 <211> 372 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Ala His Ala Pro Ala Arg Cys Pro Ser Ala Arg Gly Ser Gly Asp 1 5 10 15 Gly Glu Met Gly Lys Pro Arg Asn Val Ala Leu Ile Thr Gly Ile Thr 20 25 30 Gly Gln Asp Gly Ser Tyr Leu Ala Glu Phe Leu Leu Glu Lys Gly Tyr 35 40 45 Glu Val His Gly Ile Val Arg Arg Ser Ser Ser Phe Asn Thr Gly Arg 50 55 60 Ile Glu His Leu Tyr Lys Asn Pro Gln Ala His Ile Glu Gly Asn Met 65 70 75 80 Lys Leu His Tyr Gly Asp Leu Thr Asp Ser Thr Cys Leu Val Lys Ile 85 90 95 Ile Asn Glu Val Lys Pro Thr Glu Ile Tyr Asn Leu Gly Ala Gln Ser 100 105 110 His Val Lys Ile Ser Phe Asp Leu Ala Glu Tyr Thr Ala Asp Val Asp 115 120 125 Gly Val Gly Thr Leu Arg Leu Leu Asp Ala Val Lys Thr Cys Gly Leu 130 135 140 Ile Asn Ser Val Lys Phe Tyr Gln Ala Ser Thr Ser Glu Leu Tyr Gly 145 150 155 160 Lys Val Gln Glu Ile Pro Gln Lys Glu Thr Thr Pro Phe Tyr Pro Arg 165 170 175 Ser Pro Tyr Gly Ala Ala Lys Leu Tyr Ala Tyr Trp Ile Val Val Asn 180 185 190 Phe Arg Glu Ala Tyr Asn Leu Phe Ala Val Asn Gly Ile Leu Phe Asn 195 200 205 His Glu Ser Pro Arg Arg Gly Ala Asn Phe Val Thr Arg Lys Ile Ser 210 215 220 Arg Ser Val Ala Lys Ile Tyr Leu Gly Gln Leu Glu Cys Phe Ser Leu 225 230 235 240 Gly Asn Leu Asp Ala Lys Arg Asp Trp Gly His Ala Lys Asp Tyr Val 245 250 255 Glu Ala Met Trp Leu Met Leu Gln Asn Asp Glu Pro Glu Asp Phe Val 260 265 270 Ile Ala Thr Gly Glu Val His Ser Val Arg Glu Phe Val Glu Lys Ser 275 280 285 Phe Leu His Ile Gly Lys Thr Ile Val Trp Glu Gly Lys Asn Glu Asn 290 295 300 Glu Val Gly Arg Cys Lys Glu Thr Gly Lys Val His Val Thr Val Asp 305 310 315 320 Leu Lys Tyr Tyr Arg Pro Thr Glu Val Asp Phe Leu Gln Gly Asp Cys 325 330 335 Thr Lys Ala Lys Gln Lys Leu Asn Trp Lys Pro Arg Val Ala Phe Asp 340 345 350 Glu Leu Val Arg Glu Met Val His Ala Asp Val Glu Leu Met Arg Thr 355 360 365 Asn Pro Asn Ala 370 <210> 4 <211> 1665 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 ctccctgcac ggcctcccgt gcgcccctgt cagactgtgg cggccggtcg cgcggtgcgc 60 tctccctccc tgcccgcagc ctggagaggc gcttcgtgct gcacaccccc gcgttcctgc 120 cggcaccgcg cctgccctct gccgcgctcc gccctgccgc cgaccgcacg cccgccgcgg 180 gacatggcac acgcaccggc acgctgcccc agcgcccggg gctccgggga cggcgagatg 240 ggcaagccca ggaacgtggc gctcatcacc ggtatcacag gccaggatgg ttcctacctg 300 gctgagttcc tgctggagaa aggctatgag gtccatggaa ttgtacggcg gtccagttca 360 tttaatacgg gtcgaattga gcatctgtat aagaatcccc aggctcacat tgaaggaaac 420 atgaagttgc actatggcga tctcactgac agtacctgcc ttgtgaagat cattaatgaa 480 gtaaagccca cagagatcta caaccttgga gcccagagcc acgtcaaaat ttcctttgac 540 ctcgctgagt acactgcgga cgttgacgga gttggcactc tacgacttct agatgcagtt 600 aagacttgtg gccttatcaa ctctgtgaag ttctaccaag cctcaacaag tgaactttat 660 gggaaagtgc aggaaatacc ccagaaggag accacccctt tctatccccg gtcaccctat 720 ggggcagcaa aactctatgc ctattggatt gtggtgaact tccgtgaggc gtataatctc 780 tttgcagtga acggcattct cttcaatcat gagagtccca gaagaggagc taatttcgtt 840 actcgaaaaa ttagccggtc agtagctaag atttaccttg gacaactgga atgtttcagt 900 ttgggaaatc tggatgccaa acgagattgg ggccatgcca aggactatgt ggaggctatg 960 tggttgatgt tgcagaatga tgagccggag gacttcgtta tagctactgg ggaggtccat 1020 agtgtccggg aatttgtcga gaaatcattc ttgcacattg gaaaaaccat tgtgtgggaa 1080 ggaaagaatg aaaatgaagt gggcagatgt aaagagaccg gcaaagttca cgtgactgtg 1140 gatctcaagt actaccggcc aactgaagtg gactttctgc agggcgactg caccaaagcg 1200 aaacagaagc tgaactggaa gccccgggtc gctttcgatg agctggtgag ggagatggtg 1260 cacgccgacg tggagctcat gaggacaaac cccaatgcct gagcagcgcc tcggagcccg 1320 gcccgccctc cggctacaat ccccgcagag tctccggtgc agacgcgctg cggggatggg 1380 gagcggcgtg ccaatctgcg ggtcccctgc ggcccctgct gccgctgcgc tgtcccggcc 1440 gcaagagcgg ggccgccccg ccgaggtttg tagcagccgg gatgtgaccc tccagggttt 1500 gggtcgcttt gcgtttgtcg aagcctcctc tgaatggctt tgtgaaatca agatgtttta 1560 atcacattca ctttacttga aattatgttg ttacacaaca aattgtgggg ccttcaaatt 1620 gtttttctct tttcatatta aaaatggtct ttctgtgaac tagca 1665

Claims (18)

  1. a. 람노스를 포함하는 화합물을 포함하는 배양 배지에서 포유동물 세포주를 배양하는 것; 및
    b. 감소된 푸코실화를 갖는 단백질을 단리하는 것
    을 포함하는, 단백질을 발현하는 포유류 세포주로부터 감소된 푸코실화를 갖는 단백질을 생산하는 방법.
  2. 제1항에 있어서, 감소된 푸코실화를 갖는 단리된 단백질이 적어도 20%의 비푸코실화 단백질을 포함하는 것인 방법.
  3. 제2항에 있어서, 감소된 푸코실화를 갖는 단리된 단백질이 적어도 40%의 비푸코실화 단백질을 포함하는 것인 방법.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 감소된 푸코실화를 갖는 단리된 단백질이 저푸코실화 또는 비푸코실화된 것인 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 화합물이 GDP-D-람노스, Ac-GDP-D-람노스 또는 소듐 람노스 포스페이트인 방법.
  6. 제5항에 있어서, 화합물이 Ac-GDP-D-람노스인 방법.
  7. 제5항에 있어서, 화합물이 GDP-D-람노스인 방법.
  8. 제5항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 화합물이 6 mM 이상으로 배양 배지에 존재하는 것인 방법.
  9. 제8항에 있어서, 화합물이 10 mM 이상으로 배양 배지에 존재하는 것인 방법.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 포유류 세포주가 감소된 푸코실화를 갖는 단백질을 생산하는 실질적으로 모든 시간 동안 화합물이 배양 배지에 존재하는 것인 방법.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 단백질이 항체인 방법.
  12. 제11항에 있어서, 감소된 푸코실화를 갖는 단리된 항체가, 실시예 2에 기재된 방법에 의해 결정 시에, 푸코실화 억제제의 부재 하에 동일한 세포주에서 생산된 동일한 항체와 비교하여 ADCC의 2배 이상의 증진을 나타내는 것인 방법.
  13. 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항의 방법에 의해 제조된 감소된 푸코실화를 갖는 단백질.
  14. 제11항의 방법에 의해 제조된 감소된 푸코실화를 갖는 항체.
  15. 암 치료를 필요로 하는 환자에게 제13항의 단백질을 투여하는 것을 포함하는, 암 치료 방법.
  16. 암 치료를 필요로 하는 환자에게 제14항의 항체를 투여하는 것을 포함하는, 암 치료 방법.
  17. Ac-GDP-D-람노스.
  18. D-람노스 포스페이트.
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