KR20220088896A - 암을 치료하는 방법 - Google Patents

암을 치료하는 방법 Download PDF

Info

Publication number
KR20220088896A
KR20220088896A KR1020227017271A KR20227017271A KR20220088896A KR 20220088896 A KR20220088896 A KR 20220088896A KR 1020227017271 A KR1020227017271 A KR 1020227017271A KR 20227017271 A KR20227017271 A KR 20227017271A KR 20220088896 A KR20220088896 A KR 20220088896A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
cancer
slfn11
patient
dna
damaging agent
Prior art date
Application number
KR1020227017271A
Other languages
English (en)
Inventor
엘리자베타 레오
클라우디아 윙클러
마크 제임스 오코너
젬마 니콜 존스
앤드류 제임스 피어스
Original Assignee
아스트라제네카 아베
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 아스트라제네카 아베 filed Critical 아스트라제네카 아베
Publication of KR20220088896A publication Critical patent/KR20220088896A/ko

Links

Images

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7068—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/16—Amides, e.g. hydroxamic acids
    • A61K31/17—Amides, e.g. hydroxamic acids having the group >N—C(O)—N< or >N—C(S)—N<, e.g. urea, thiourea, carmustine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
    • A61K31/35—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having six-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K33/00—Medicinal preparations containing inorganic active ingredients
    • A61K33/24—Heavy metals; Compounds thereof
    • A61K33/243—Platinum; Compounds thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
    • A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
    • A61K47/6851—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell
    • A61K47/6855—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell the tumour determinant being from breast cancer cell
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2300/00—Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis

Abstract

SLFN11-결핍(deficient) 암세포를 갖는 환자에서 WEE1 저해제와 DNA-손상제의 조합을 이용하여 암을 치료하는 방법이 본원에 개시된다.

Description

암을 치료하는 방법
본 개시내용은 일반적으로 암을 치료하는 방법에 관한 것이다.
WEE1은 단백질 키나제의 세린/트레오닌 계열에 속하는 핵 키나제이다. WEE1은 2개의 상이한 부위(Tyr15 및 Thr14) 상의 사이클린-의존적 키나제(CDK)를 인산화시킴으로써 CDK를 저해한다. 따라서, WEE1은 DNA 복제의 유사 분열 진입과 개시, 세포 크기, 및 DNA 손상 체크포인트를 조절하는 역할을 한다. WEE1의 저해제는 단독치료법으로서 그리고 다른 암 치료와 조합되어 암의 치료에 대해 시험되어 왔다.
슐라펜 11(SLFN11: Schlafen 11)은 슐라펜 계열의 단백질에 속하고, 인간 및 일부 영장류에서만 발현된다. 암세포에서 SLFN11의 불활성화는, DNA 손상 및 복제 스트레스를 야기하는 항암제에 대한 내성을 초래하는 것으로 나타났다. 그러므로, SLFN11은 상이한 부류의 DNA-손상제 및 PARP 저해제에 대한 민감도의 결정인자이다. 문헌[Zoppoli et al., PNAS 2012; 109: 15030-35; Murai et al., Oncotarget 2016; 7: 76534-50; Murai et al., Mol. Cell 2018; 69: 371-84]를 참조한다.
많은 암 치료가 개발되고 승인되어 왔다. 그러나, 일부 암 치료는 일부 환자에서만 효과적이다. 더욱이, 일부 암 환자는 소정의 암 치료에 대해 내성이 된다. 그러므로, 적절한 환자에게 암 치료가 표적화될 수 있도록 암 치료에 반응성인 환자를 식별하는 방법에 대한 필요성이 존재한다. 이에 더하여, 일부 환자에서 관찰된 암 치료에 대한 내성을 반전시키는 방법에 대한 필요성이 존재한다.
전술한 필요성은 본원에 기재된 방법에 의해 충족된다. 특히, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍(deficient)인지의 여부를 결정하는 단계; 및 c) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은지의 여부를 결정하는 단계; 및 c) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 c) SLFN11의 발현 수준이 10% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 0%이다.
일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인지의 여부를 결정하는 단계; 및 b) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은지의 여부를 결정하는 단계; 및 b) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 b) SLFN11의 발현 수준이 10% 미만인 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 0%이다.
일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학, 질량 분광법, 인-시추 혼성화, NanoString, 역전사 정량적 중합효소 연쇄 반응(RT-qPCR), 마이크로어레이 분석, 아황산수소 염기서열분석, 또는 정량적 메틸화-특이적 중합효소 연쇄 반응(Q-MSP)에 의해 결정된다. 구체적인 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학에 의해 결정된다.
본원에 개시된 방법의 일부 구현예에서, 암은 췌장암, 자궁내막암, 난소암, 흑색종, 폐암, 결장직장암, 결장암, 직장암, 전립선암, 유방암, 뇌암, 뇌경부암(cervicocerebral cancer), 식도암, 갑상선암, 위암, 담낭암, 간암, 융모막암종, 자궁체부암(uterus body cancer), 자궁경부암, 신장암, 방광암, 고환암, 피부암, 신경아세포종, 골육종, 유잉 육종(Ewing's sarcoma), 백혈병, 호지킨 림프종(Hodgkin's lymphoma), 급성 골수성 백혈병, 미만성 거대 B-세포 림프종, 및 두경부암으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
본원에 개시된 방법의 일부 구현예에서, DNA-손상제는 젬시타빈(gemcitabine), 에토포시드(etoposide), 시스플라틴(cisplatin), 카르보플라틴(carboplatin), 옥살리플라틴(oxaliplatin), 피코플라틴(picoplatin), 메토트렉세이트(methotrexate), 독소루비신(doxorubicin), 다우노루비신(daunorubicin), 5-플루오로우라실(5-fluorouracil), 이리노테칸(irinotecan), 미토마이신(mitomycin), 테모졸로마이드(temozolomide), 토포테칸(topotecan), 캄프토테신(camptothecin), 에피루비신(epirubicin), 이다루비신(idarubicin), 트라벡테딘(trabectedin), 카페시타빈(capecitabine), 벤다무스틴(bendamustine), 플루다라빈(fludarabine), 하이드록시우레아(hydroxyurea), 트라스투주맙 데룩스테칸(trastuzumab deruxtecan), 및 이의 약학적으로 허용 가능한 염으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
본원에 개시된 방법의 일부 구현예에서, WEE1 저해제는 아다보세르팁(adavosertib) 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염이다.
도 1a는 SLFN11 면역조직화학(IHC) 검정으로부터 DU145 이종이식편(SLFN11-숙련(proficient)) 및 HT29 이종이식편 조직(SLFN11-결핍) 각각에서의 양성 및 음성 염색을 도시한다.
도 2a는 SLFN11 야생형(WT) 및 넉아웃(KO) DU145 동질유전자형(isogenic) 세포에서 SLFN11 및 GAPDH에 대한 면역블롯을 도시한다. KO 1 및 KO 2는 2개의 상이한 CRISPR-KO 클론이었다.
도 2b는 야생형 SLFN11(WT) 또는 SLFN11 넉아웃 DU145 세포주(KO1 및 KO2)를 젬시타빈(Gem.)과 아다보세르팁의 조합으로 치료함으로써 비롯된 상승작용 점수(로에베(Loewe))를 도시한다.
도 2c는 야생형 SLFN11(WT) 또는 SLFN11 넉아웃 DU145 세포주(KO1 및 KO2)를 에토포시드(ETP) 및 아다보세르팁으로 치료함으로써 비롯된 상승작용 점수(로에베)를 도시한다.
도 2d는 DU145 동질유전자형 세포에서 0.36 μM 아다보세르팁의 부재 또는 존재 하에서의, 명시된 DNA 손상제(젬시타빈, 에토포시드, 캄프토테신, 시스플라틴, 및 하이드록시우레아)의 생존 곡선을 도시한다.
도 3a는 SLFN11-결핍 또는 SLFN11-숙련인 췌장 세포주의 패널에서 젬시타빈 단독치료법의 log IC50 값을 도시한다.
도 3b는 SLFN11-결핍 또는 SLFN11-숙련인 췌장 세포주의 패널에서 아다보세르팁 단독치료법의 log IC50 값을 도시한다.
도 3c는 SLFN11-결핍 또는 SLFN11-숙련인 췌장 세포주의 패널에서 젬시타빈과 아다보세르팁의 조합에 대한 상승작용 점수를 도시한다.
본 발명의 구현예가 본원에 제시되고 기재되어 있으나, 이러한 구현예는 단지 예로서 제공된다는 것이 당업자에게 분명할 것이다. 당업자는 본 발명으로부터 벗어나지 않으면서 수많은 변형, 변화 및 치환을 수행할 수 있을 것이다. 본원에 기재된 구현예에 대한 다양한 대안이 이용될 수 있다는 것이 이해되어야 한다. 본원에 사용되는 표제 부문은 단지 구조적 목적을 위한 것이며, 기재된 주제를 제한하는 것으로 해석되어서는 안 된다.
정의
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "치료하다", "치료하는" 또는 "치료" 및 기타 문법적 등가물은 질병 또는 질환 또는 이의 하나 이상의 증상을 완화시키거나, 약화시키거나 개선하거나, 증상의 기저 대사 원인을 개선하거나, 질병 또는 질환을 저해하거나, 질병 또는 질환을 경감시키거나, 질병 또는 질환의 퇴행을 야기하거나, 질병 또는 질환에 의해 야기되는 질환을 경감시키거나, 질병 또는 질환의 증상을 중단시키는 것을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "투여하다", "투여하는", "투여" 및 이들의 문법적 등가물은 본원에 개시된 약학적 조성물을 생물학적 작용이 요망되는 부위에 전달하는 데 사용되는 방법을 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "공동-투여하다", "공동-투여", "와 조합하여 투여되는" 및 이들의 문법적 등가물은 단일 개체에 대한 활성제의 투여를 포괄하는 것으로 하고자 하며, 달리 명시되지 않는 한, 제제가 동일한 또는 상이한 투여 경로에 의해 또는 동일한 또는 상이한 시간에 시행되는 치료 계획을 포함한다. 이들은 별개의 조성물로 동시 투여하는 것, 상이한 시간에 별개의 조성물로 투여하는 것, 또는 하나 이상의 활성제가 존재하는 조성물로 투여하는 것을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "약학적으로 허용 가능한"은 활성제의 생물학적 활성 또는 특성을 무력화시키지 않고, 상대적으로 무독성인 재료, 즉, 바람직하지 않은 생물학적 효과를 야기하거나 이것이 함유된 조성물의 임의의 성분과 유해한 방식으로 상호작용하지 않으면서 개체에게 투여될 수 있는 재료, 예컨대 담체 또는 희석제를 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "약학적으로 허용 가능한 염"은 활성제의 유리 산 및 유리 염기의 생물학적 효능을 보유하고, 생물학적으로 또는 달리 바람직하지 않은 것이 아닌 염을 지칭한다. 활성제는 무기 또는 유기 염기, 또는 무기 또는 유기 산과 반응하여, 약학적으로 허용 가능한 염을 형성할 수 있다. 이들 염은 최종 단리 및 정제 동안에 인 시추로 제조되거나, 정제된 화합물을 적합한 무기 또는 유기 염기, 또는 무기 또는 유기 산과 별개로 반응시키고, 그리하여 형성된 염을 단리함으로써 제조될 수 있다.
용어 "환자", "대상체" 또는 "개체"는 본원에서 상호 교환적으로 사용된다. 본원에 사용된 바와 같이, 이들은 암을 앓고 있는 인간을 지칭한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "SLFN11의 발현 수준이 어느 정도의 양, 예를 들어, 0%라는 것"은, 환자의 암 조직 중 언급된 양의 암세포가 SLFN11을 발현함을 의미한다. 유사하게, 본원에 사용된 바와 같이, 용어 "SLFN11의 발현 수준이 어느 정도의 양, 예를 들어, 10% 미만이라는 것"은, 환자의 암 조직 중 언급된 양 미만의 암세포가 SLFN11을 발현함을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "SLFN11-결핍"은, 관련 환자, 동물, 조직, 세포 등에서 유전자와 관련된 정상적인 표현형을 나타내거나 단백질의 경우 이의 생리학적 기능을 나타내기에 부적절한 SLFN11의 발현 수준을 지칭한다. 전임상 모델의 맥락에서, SLFN11 유전자가 넉아웃(KO)된 세포 또는 동물은 "SLFN11-결핍"의 예이다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "SLFN-11 숙련"은, 관련 환자, 동물, 조직, 세포 등에서 유전자와 관련된 정상적인 표현형을 나타내거나 단백질의 경우 이의 생리학적 기능을 나타내기에 적절한 SLFN11의 발현 수준을 지칭한다. 전임상 모델의 맥락에서, SLFN11 유전자가 정상적인 수준으로 발현되는 세포 또는 동물, 즉, 야생형(WT) 세포 또는 동물은 "SLFN11-숙련"의 예이다.
치료 방법
일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인지의 여부를 결정하는 단계; 및 c) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은지의 여부를 결정하는 단계; 및 c) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 c) SLFN11의 발현 수준이 25% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 c) SLFN11의 발현 수준이 20% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 c) SLFN11의 발현 수준이 15% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계; b) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 c) SLFN11의 발현 수준이 10% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 9% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 8% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 7% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 6% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 5% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 4% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 3% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 2% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 1% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 0%인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다.
일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인지의 여부를 결정하는 단계; 및 b) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은지의 여부를 결정하는 단계; 및 b) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성이다.
일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 b) SLFN11의 발현 수준이 25% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 b) SLFN11의 발현 수준이 20% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 b) SLFN11의 발현 수준이 15% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법이 본원에 개시되며, 상기 방법은 a) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및 b) SLFN11의 발현 수준이 10% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 9% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 8% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 7% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 6% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 5% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 4% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 3% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 2% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 1% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준이 0%인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제가 공동-투여된다.
본원에 개시된 방법에서, SLFN11의 발현 수준은 당업자에게 알려진 임의의 적합한 방법에 의해 결정될 수 있다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 mRNA 전사물 수준 또는 DNA 프로모터 과메틸화에 의해 결정된다. 일부 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학, 질량 분광법, 인-시추 혼성화, NanoString, 역전사 정량적 중합효소 연쇄 반응(RT-qPCR), 마이크로어레이 분석, 아황산수소 염기서열분석, 또는 정량적 메틸화-특이적 중합효소 연쇄 반응(Q-MSP)에 의해 결정된다. 구체적인 구현예에서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학(IHC)에 의해 결정된다.
질병
본원에 기재된 방법은 다양한 암의 치료에 적용 가능하다. 일부 구현예에서, 암은 췌장암, 자궁내막암, 난소암, 흑색종, 폐암, 결장직장암, 결장암, 직장암, 전립선암, 유방암, 뇌암, 뇌경부암, 식도암, 갑상선암, 위암, 담낭암, 간암, 융모막암종, 자궁체부암, 자궁경부암, 신장암, 방광암, 고환암, 피부암, 신경아세포종, 골육종, 유잉 육종, 백혈병, 호지킨 림프종, 급성 골수성 백혈병, 미만성 거대 B-세포 림프종, 및 두경부암으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 암은 췌장암이다. 일부 구현예에서, 암은 난소암이다. 일부 구현예에서, 암은 백금 내성 난소암이다. 일부 구현예에서, 암은 자궁내막암이다. 일부 구현예에서, 암은 유방암이다.
WEE1 저해제
아다보세르팁은 화학명 2-알릴-(1-[6-(1-하이드록시-1-메틸에틸)피린딘-2-일]-6-{[4-(4-메틸피페라진-1-일)페닐]아미노}-1,2-디하이드로-3H-피라졸로[3,4-d]피리미딘-3-온 및 하기 화학 구조를 갖는다:
Figure pct00001
WEE1의 저해제로서의 아다보세르팁의 활성, 다양한 암을 치료하는 데 있어서의 유용성, 및 합성은 미국 특허 제7,834,019호에 기재되어 있다. 아다보세르팁의 다양한 결정질 형태는 미국 특허 제8,703,779호 및 제8,198,281호에 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 본원에 기재된 방법에서 투여되는 WEE1 저해제는 아다보세르팁 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염이다. 일부 구현예에서, 본원에 기재된 방법에서 투여되는 WEE1 저해제는 아다보세르팁이다.
3-(2,6-디클로로페닐)-4-이미노-7-[(2'-메틸-2',3'-디하이드로-1'H-스피로[사이클로프로판-1,4'-이소퀴놀린]-7'-일)아미노]-3,4-디하이드로피리미도[4,5-d]피리미딘-2(1H)-온은 하기 화학 구조를 갖는 WEE1 저해제이다:
Figure pct00002
WEE1의 저해제로서의 3-(2,6-디클로로페닐)-4-이미노-7-[(2'-메틸-2',3'-디하이드로-1'H-스피로[사이클로프로판-1,4'-이소퀴놀린]-7'-일)아미노]-3,4-디하이드로피리미도[4,5-d]피리미딘-2(1H)-온의 활성, 다양한 암을 치료하는 데 있어서의 유용성, 및 합성은 미국 특허 제8,436,004호에 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 본원에 기재된 방법에서 투여되는 WEE1 저해제는 3-(2,6-디클로로페닐)-4-이미노-7-[(2'-메틸-2',3'-디하이드로-1'H-스피로[사이클로프로판-1,4'-이소퀴놀린]-7'-일)아미노]-3,4-디하이드로피리미도[4,5-d]피리미딘-2(1H)-온이다.
DNA-손상제
본원에 사용된 바와 같이, "DNA-손상제" 또는 "DDA"는 암세포의 DNA에 손상을 야기함으로써 기능하는 암 치료이다. DDA는 DNA 가교, DNA 복제의 간섭, 및 DNA 합성의 저해를 포함하는 다양한 기전을 통해 작용한다. 본원에 기재된 방법에 사용될 수 있는 DDA의 비제한적인 예는 젬시타빈, 에토포시드, 시스플라틴, 카르보플라틴, 옥살리플라틴, 피코플라틴, 메토트렉세이트, 독소루비신, 다우노루비신, 5-플루오로우라실, 이리노테칸, 미토마이신, 테모졸로마이드, 토포테칸, 캄프토테신, 에피루비신, 이다루비신, 트라벡테딘, 카페시타빈, 벤다무스틴, 플루다라빈, 하이드록시우레아, 트라스투주맙 데룩스테칸, 및 이의 약학적으로 허용 가능한 염을 포함한다.
조합 치료법
일부 구현예에서, 본원에 개시된 방법에서 공동-투여되는 WEE1 저해제와 DDA는 하나 이상의 추가 암 치료법과 공동-투여된다. 의사는 치료를 받는 중인 환자 및 암의 특정한 특징에 따라 환자에게 공동-시행할 하나 이상의 암 치료법을 결정할 수 있다. 하나 이상의 추가 암 치료법은 본원에 기재된 방법에 따라 WEE1 저해제 및 DDA의 투여와 동시에, 그 전에, 또는 그 후에 투여될 수 있다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 추가 암 치료법은 이온화 방사선, 튜불린 상호작용제, 키네신 스핀들(kinesin spindle) 단백질 저해제, 스핀들 체크포인트 저해제, 폴리(ADP-리보스) 중합효소 저해제, 매트릭스 메탈로프로테이나제(matrix metalloproteinase) 저해제, 프로테아제 저해제, 프로테아좀 저해제, Bcl-2 저해제, 열 충격 단백질 조절제, 히스톤 데아세틸라제 저해제, 항에스트로겐, 선택적 에스트로겐 수용체 조절제, 항안드로겐, LHRH 작용제, 5α-리덕타제 저해제, 시토크롬 P450 C17 리아제 저해제, 아로마타제(aromatase) 저해제, EGFR 키나제 저해제, 이중 erbB1 및 erbB2 저해제, ABL 키나제 저해제, VEGFR-1 저해제, VEGFR-2 저해제, 폴로-유사(polo-like) 키나제 저해제, 오로라(aurora) 키나제 저해제, JAK 저해제, c-MET 키나제 저해제, 사이클린-의존적 키나제 저해제, PI3K 저해제, 및 mTOR 저해제로부터 선택된다.
실시예
이하에 제공되는 실시예는 본 개시내용을 추가로 설명하고 예시하며, 청구항의 범위를 임의의 방식으로 제한하지 않는다.
실시예 1: SLFN11에 특이적인 FFPE IHC 검정 및 DU145 SLFN11 KO 세포주의 특징화의 개발.
방법
DU145 전립선 암세포에서의 SLFN11의 넉아웃을 CRISPR/Cas9에 의해 수행하였다. 엑손 4 내 SLFN11을 표적화하는 sgRNAS(GCGTTCCATGGACTCAAGAGAGG, 프로토스페이서 인접 모티프는 볼드체로 표시되어 있음)를 인-하우스 CRISPR3 소프트웨어를 이용하여 설계하고, 통합 DNA 기술(IDT: Integrated DNA Technology)에 의해 합성하고, CAS9 및 GFP 카세트(azPGE02-Cas9-T2A-GFP)를 함유하는 벡터 내로 클로닝하였다. 후속하여, 리포펙타민 3000(Thermofisher Scientific)을 사용하여 벡터를 DU145 전립선 암세포 내로 형질주입하였다. 48시간 후, 최고 녹색 형광 단백질(GFP) 발현을 갖는 세포 풀(pool)을 96-웰 플레이트 내로 단일 세포 분류하였다. 이의 야생형 대립유전자를 상실한 클론을 증식시켜(expand), 단일 클론으로부터 세포주를 수득하였다. 2개의 SLFN11-결핍 클론(클론 KO1 및 클론 KO2)을 프로파일링하고, 약리학적 연구를 위해 선택하였다. SLFN11-숙련(wt) 및 SLFN11-결핍(KO1 및 KO2) 클론으로부터의 세포 용해물을 제조하고, 표준 SDS-PAGE 면역블롯팅에 의해 분석하였다. 면역블롯팅 검출에 사용된 항체는 다음과 같았다: 항-SLFN11 항체(ab121731, 1:1000, Abcam), 및 로딩 대조군으로서 항-GAPDH 항체(14C10, 1:2000, CST).
DU145(SLFN11-숙련) 및 HT29(SLFN11-결핍) 이종이식편을 아스트라제네카 글로벌 바이오에틱스 정책(AstraZeneca Global Bioethics policy), 영국 내무부 법안(UK Home Office legislation) 및 동물실험 과학적 절차법(Animal Scientific Procedures Act) 1986(ASPA)에 따라 성장시켰다. SLFN11 면역조직화학을 포르말린 고정되고 파라핀 포매된 조직의 4 μM 두께의 종양 섹션 상에서 수행하고, Bond RX(Leica Microsystems) 상에서 ER1 항원 복구를 사용하여 실시하였다. 슬라이드를 이종이식편 조직으로부터의 섹션에 대해 0.5 μg/ml로, 그리고 인간 조직으로부터의 섹션에 대해 2.5 μg/ml로 일차 토끼 다중클론 항-SLFN11 항체(Abcam, ab121731)로 염색하였다. 20x 대물렌즈를 사용하는 Aperio AT2 스캐너(Leica)로 디지털 슬라이드를 획득하였다.
결과
SLFN11-양성 DU145 및 SLFN11-음성 HT29 조직의 SLFN11 면역조직화학은 이들 2개의 모델에서 SLFN11의 존재 및 부재 각각을 확인시켜 주었다(도 1a).
실시예 2: DU145 SLFN11 KO 세포에서 DDA에 대한 내성은 WEE1 저해제를 이용한 조합 치료에 의해 반전될 수 있다.
방법
아다보세르팁을 AstraZeneca에서 합성하였다. 젬시타빈, 시스플라틴, 하이드록시우레아(HU), 및 에토포시드는 Tocris로부터 입수하였고, 캄프토테신은 Sigma로부터 입수하였다. 젬시타빈(50 mM), 시스플라틴(1.67 mM) 및 HU(1 M)의 스톡 용액을 수용액에서 제조하였고; 다른 약물 모두를 디메틸설폭시드(DMSO)(10 mM)에서 10 mM 농도로 용해시켰다.
DU145 동질유전자형 세포(WT 및 SLFN11 KO)를 384-웰 플레이트에 시딩하고, 밤새 침강되게 하였다. 도 2a는 실험에 사용된 SLFN11 WT 및 KO DU145 동질유전자형 세포에 대한 면역블롯을 도시한다. KO 1 및 KO 2는 2개의 상이한 CRISPR-KO 클론이었다. 고용량(top dose)의 3 μM 아다보세르팁, 0.1 μM 젬시타빈, 및 1 μM 에토포시드와 함께, 6x6 농도 매트릭스 중 화합물 용액을 Echo 555(LabCyte)를 사용하여 세포에 투여하였다. 연속 치료 후 5일째에, 세포 생존력을 생존-사멸 SyTox 녹색 검정(live-dead SyTox green assay)(Life Technologies, Carlsbad, CA, USA)에 의해 결정하였다. 총 판독물로부터 사멸 판독물을 차감함으로써 생존 세포의 수를 계산하였다. 이 방법을 사용하여, 웰당 세포 수도 치료 시점(제0일)에 결정하였다. Ti≥Tz에 대한 값에 대해 방정식 [1-(Ti-Tz)/(C-Tz)] x100, 및 Ti<Tz, x 100에 대한 농도에 대해 [1-(Ti-Tz)/Tz] x100을 사용하여 데이터를 나타내고, 여기서 Ti는 화합물-처리된 세포이고; Tz는 0시간 시점에서의 세포이고 C는 대조군 세포이다. 이는 생존 세포 수의 0% 내지 200% 스케일을 제공하며, 여기서 0% 내지 100%는 성장 저해를 나타내고, 100% 내지 200%는 세포 사멸화를 나타낸다.
Genedata Screener(Genedata, Basel, Switzerland) 소프트웨어에서 로에베 용량-상가성 모델을 사용하여 조합 활성(상승작용)을 계산하였다. 이 모델은, 2개의 화합물의 효과가 2개의 단독치료법을 기준으로 상가적인 경우 예상되는 결과를 계산한다. 잉여 점수는, 예측된 상가 효과를 실험 결과가 얼마나 상회하는지를 반영한다. 프로그램은 조합에 대한 상승작용 점수를 제공하며, 이는 잉여 점수의 강도, 및 용량 의존도 둘 모두를 반영한다. 5 초과의 점수는 상승작용적인 것으로 여겨진다.
96-웰 플레이트에서의 세포 생존 실험을 위해, 세포를 96-웰 플레이트에 시딩한 후, HP 분배기를 사용하여 화합물을 투여하였다. 72시간 후, 종점 CellTiter-Glo 발광 검정(Promega)을 이용하여 세포 생존력을 결정하였다. 방정식 (T-T0)/(C-T0) x 100을 사용하여 성장 백분율을 계산하였고, 여기서 T는 화합물-처리된 세포이며; T0은 0시간 시점에서의 세포이고, C는 대조군 세포이다. 용량 반응 곡선을 GraphPad 프리즘에서 플롯팅하였다.
결과
아다보세르팁과 젬시타빈 또는 에토포시드를 이용한 조합 치료는 야생형, SLFN11-숙련 세포와 비교할 때 SLFN11 KO 세포에서 더 높은 상승작용 점수를 일관되게 생성하였다(각각 도 2b 및 도 2c). 더 높은 상승작용 점수는, WEE1 저해제와 DDA를 이용한 조합 치료가, 어느 한 제제를 이용한 단독치료법의 효과와 비교할 시, 야생형 세포에 비해 SLFN11 KO 세포에서 더 효과적임을 나타낸다. 조합 상승작용 실험을 더 낮은 처리량 검정 포맷에 의해 확증하였다. 결과는 상이한 명시된 DDA(젬시타빈, 에토포시드, 캄프토테신, 시스플라틴, 및 하이드록시우레아)와 아다보세르팁의 조합에 대해 도 2d에 도시한다. 모든 경우에, SLFN11 KO 세포(회색 점선)는 야생형 세포(회색 실선)와 비교할 때 DDA 각각에 대해 내성인 것으로 발견되었다. DDA와 아다보세르팁의 조합은 SLFN11-숙련 세포(검정색 실선)에서 유의한 항증식성 효과를 부가하지 않았다. 그러나, SLFN11 KO 세포에서, 동일한 조합은 SLFN11 결핍 세포에서 DDA 단독치료법과 비교하여 유의한 곡선-이동을 이끌어냈으며(검정색 점선으로 나타냄), 이는 아다보세르팁을 공동-투여함으로써 이들 세포가 DDA 치료에 대해 완전히 재민감화될 수 있음을 확인시켜 준다.
실시예 3: SLFN11-결핍 세포주에서 젬시타빈에 대한 내성은 WEE1 저해제를 이용한 조합 치료에 의해 반전될 수 있다.
방법
SLFN11 RNA 서열 데이터(log2 RPKM 값)를 암세포주 백과사전(CCLE)(문헌[Barretina J. et al., Nature, 2012; 483: 603-607])으로부터 다운로드하고, 약물 반응 데이터(log(IC50) 및 용량-반응 곡선 아래 면적(AUC))를 암 데이터베이스에서의 약물 민감도로부터 다운로드하였다(문헌[Yang W et al., Nucleic Acids Res, 2013; 41: D955-61]). 1 미만의 CCLE RNA 서열 log2 RPKM 값을 갖는 세포주를 SLFN11-결핍으로 정의하고, 1 초과의 log2 RPKM 값을 갖는 세포주를 SLFN11-숙련으로 정의하였다. 6x6 농도 매트릭스 중 증가하는 농도의 아다보세르팁 및 젬시타빈을 Echo 555(LabCyte)를 사용하여 384-웰 플레이트 내 19개의 췌장 세포주에 투여하였다. 용량 범위는 아다보세르팁에 대해 0 내지 3 μM였고, 젬시타빈에 대해 0 내지 0.3 μM였으며; 두 경우 모두에서, 고용량으로부터 1:3 희석을 수행하였다. 연속 치료 후 5일째에, 세포 생존력을 생존-사멸 SyTox 녹색 검정(Life Technologies, Carlsbad, CA, USA)에 의해 결정하였다. 상기 기재된 바와 같이 Genedata Screener 소프트웨어에서 로에베 용량-상가성 모델을 사용하여 상승작용을 분석하였다.
결과
실시예 2에 제시된 결과를 췌장암 세포주의 패널에서 확증하였다. 이 패널에서, 젬시타빈 단독치료법을 이용한 용량 반응 치료 시, SLFN11-결핍 세포주는 SLFN11-숙련 세포보다 평균적으로 100배 덜 민감한 것으로 발견되었다(도 3a). SLFN11-결핍 및 SLFN11-숙련 췌장암 세포주는 아다보세르팁 단독치료법 치료에 대해 동일한 반응을 보여주었다(도 3b). 그러나, 젬시타빈과 아다보세르팁을 이용한 조합 치료는 SLFN11-숙련 췌장암 세포보다 SLFN11-결핍 췌장암 세포에서 유의하게 더 상승작용적이었다(도 3c). 결과는, WEE1 저해제와 DDA를 이용한 조합 치료법이 WEE1 저해제 또는 DDA를 이용한 단독치료법과 비교하여 SLFN11-결핍 암세포를 갖는 환자에서 더 효과적일 것으로 예상됨을 나타낸다.

Claims (33)

  1. 환자에서 암을 치료하는 방법으로서,
    a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계;
    b) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍(deficient)인지의 여부를 결정하는 단계; 및
    c) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  2. 환자에서 암을 치료하는 방법으로서,
    a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계;
    b) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은지의 여부를 결정하는 단계; 및
    c) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성인, 방법.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학, 질량 분광법, 인-시추 혼성화, NanoString, 역전사 정량적 중합효소 연쇄 반응(RT-qPCR), 마이크로어레이 분석, 아황산수소 염기서열분석, 또는 정량적 메틸화-특이적 중합효소 연쇄 반응(Q-MSP)에 의해 결정되는, 방법.
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학에 의해 결정되는, 방법.
  6. 환자에서 암을 치료하는 방법으로서,
    a) 암으로 진단된 환자를 선택하는 단계;
    b) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및
    c) SLFN11의 발현 수준이 10% 미만인 경우, WEE1 저해제 및 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  7. 제6항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 0%인, 방법.
  8. 제6항 또는 제7항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학, 질량 분광법, 인-시추 혼성화, NanoString, 역전사 정량적 중합효소 연쇄 반응(RT-qPCR), 마이크로어레이 분석, 아황산수소 염기서열분석, 또는 정량적 메틸화-특이적 중합효소 연쇄 반응(Q-MSP)에 의해 결정되는, 방법.
  9. 제6항 또는 제7항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학에 의해 결정되는, 방법.
  10. DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법으로서,
    a) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인지의 여부를 결정하는 단계; 및
    b) 환자의 암세포가 SLFN11-결핍인 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  11. DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법으로서,
    a) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은지의 여부를 결정하는 단계; 및
    b) SLFN11 발현이 환자의 SLFN11-발현 비-암세포에 비해 환자의 암세포에서 더 낮은 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  12. 제10항 또는 제11항에 있어서, 환자의 암세포는 SLFN11 발현에 대해 음성인, 방법.
  13. 제10항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학, 질량 분광법, 인-시추 혼성화, NanoString, 역전사 정량적 중합효소 연쇄 반응(RT-qPCR), 마이크로어레이 분석, 아황산수소 염기서열분석, 또는 정량적 메틸화-특이적 중합효소 연쇄 반응(Q-MSP)에 의해 결정되는, 방법.
  14. 제10항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학에 의해 결정되는, 방법.
  15. DNA-손상제를 이용한 치료에 대해 내성인 환자에서 암을 치료하는 방법으로서,
    a) 환자의 암세포에서 SLFN11의 발현 수준을 결정하는 단계; 및
    b) SLFN11의 발현 수준이 10% 미만인 경우, WEE1 저해제와 DNA-손상제를 환자에게 공동-투여하는 단계를 포함하는, 방법.
  16. 제15항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 0%인, 방법.
  17. 제15항 또는 제16항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학, 질량 분광법, 인-시추 혼성화, NanoString, 역전사 정량적 중합효소 연쇄 반응(RT-qPCR), 마이크로어레이 분석, 아황산수소 염기서열분석, 또는 정량적 메틸화-특이적 중합효소 연쇄 반응(Q-MSP)에 의해 결정되는, 방법.
  18. 제15항 또는 제16항에 있어서, SLFN11의 발현 수준은 면역조직화학에 의해 결정되는, 방법.
  19. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 암은 췌장암, 자궁내막암, 난소암, 흑색종, 폐암, 결장직장암, 결장암, 직장암, 전립선암, 유방암, 뇌암, 뇌경부암(cervicocerebral cancer), 식도암, 갑상선암, 위암, 담낭암, 간암, 융모막암종, 자궁체부암(uterus body cancer), 자궁경부암, 신장암, 방광암, 고환암, 피부암, 신경아세포종, 골육종, 유잉 육종(Ewing's sarcoma), 백혈병, 호지킨 림프종(Hodgkin's lymphoma), 급성 골수성 백혈병, 미만성 거대 B-세포 림프종, 및 두경부암으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 방법.
  20. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 암은 난소암인, 방법.
  21. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 암은 백금 내성 난소암인, 방법.
  22. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 암은 자궁내막암인, 방법.
  23. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 암은 췌장암인, 방법.
  24. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 암은 유방암인, 방법.
  25. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, DNA-손상제는 젬시타빈(gemcitabine), 에토포시드(etoposide), 시스플라틴(cisplatin), 카르보플라틴(carboplatin), 옥살리플라틴(oxaliplatin), 피코플라틴(picoplatin), 메토트렉세이트(methotrexate), 독소루비신(doxorubicin), 다우노루비신(daunorubicin), 5-플루오로우라실(5-fluorouracil), 이리노테칸(irinotecan), 미토마이신(mitomycin), 테모졸로마이드(temozolomide), 토포테칸(topotecan), 캄프토테신(camptothecin), 에피루비신(epirubicin), 이다루비신(idarubicin), 트라벡테딘(trabectedin), 카페시타빈(capecitabine), 벤다무스틴(bendamustine), 플루다라빈(fludarabine), 하이드록시우레아(hydroxyurea), 트라스투주맙 데룩스테칸(trastuzumab deruxtecan), 및 이의 약학적으로 허용 가능한 염으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 방법.
  26. 제1항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, DNA-손상제는 젬시타빈, 에토포시드, 캄프토테신, 시스플라틴, 하이드록시우레아, 및 이의 약학적으로 허용 가능한 염으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 방법.
  27. 제1항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, DNA-손상제는 젬시타빈 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염인, 방법.
  28. 제1항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, DNA-손상제는 트라스투주맙 데룩스테칸인, 방법.
  29. 제1항 내지 제28항 중 어느 한 항에 있어서, WEE1 저해제는 아다보세르팁(adavosertib) 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염인, 방법.
  30. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, DNA-손상제는 젬시타빈 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염이고, WEE1 저해제는 아다보세르팁 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염인, 방법.
  31. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, DNA-손상제는 트라스투주맙 데룩스테칸이고, WEE1 저해제는 아다보세르팁 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염인, 방법.
  32. 제30항에 있어서, 28일 사이클에서 175 mg 아다보세르팁은 제1일, 제2일, 제8일, 제9일, 제15일, 및 제16일에 환자에게 투여되고, 800 mg/m2 젬시타빈 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염은 제1일, 제8일, 및 제15일에 환자에게 투여되는, 방법.
  33. 제30항에 있어서, 28일 사이클에서 175 mg 아다보세르팁은 제1일, 제2일, 제8일, 제9일, 제15일, 및 제16일에 환자에게 투여되고, 1,000 mg/m2 젬시타빈 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염은 제1일, 제8일, 및 제15일에 환자에게 투여되는, 방법.
KR1020227017271A 2019-10-25 2020-10-23 암을 치료하는 방법 KR20220088896A (ko)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201962926055P 2019-10-25 2019-10-25
US62/926,055 2019-10-25
PCT/EP2020/079856 WO2021078925A1 (en) 2019-10-25 2020-10-23 Methods of treating cancer

Publications (1)

Publication Number Publication Date
KR20220088896A true KR20220088896A (ko) 2022-06-28

Family

ID=73030090

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020227017271A KR20220088896A (ko) 2019-10-25 2020-10-23 암을 치료하는 방법

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20220387468A1 (ko)
EP (1) EP4048277A1 (ko)
JP (1) JP2022554157A (ko)
KR (1) KR20220088896A (ko)
CN (1) CN114599399A (ko)
AU (1) AU2020369996A1 (ko)
BR (1) BR112022007609A2 (ko)
CA (1) CA3158274A1 (ko)
IL (1) IL292348A (ko)
MX (1) MX2022004934A (ko)
TW (1) TW202131925A (ko)
WO (1) WO2021078925A1 (ko)

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AR060635A1 (es) 2006-04-27 2008-07-02 Banyu Pharma Co Ltd Derivados de 1,2-dihidro-3h-pirazolo[3,4-d]pirimidin-3-ona, composiciones farmaceuticas que los comprenden y su uso en el tratamiento del cancer
WO2008133866A1 (en) 2007-04-25 2008-11-06 Merck & Co., Inc. Polymorph of dihydropyrazolopyrimidinone derivative as weel kinase.inhibitor
CN101784551A (zh) 2007-06-15 2010-07-21 万有制药株式会社 二环苯胺衍生物
SI2477628T1 (sl) 2009-09-15 2014-11-28 Merck Sharp & Dohme Corp. Priprava oblik kristalinskega hemihidrata dihidropirazolopirimidinona
KR20190130621A (ko) * 2017-03-31 2019-11-22 시애틀 지네틱스, 인크. Chk1 저해제와 wee1 저해제의 조합물
AU2018289512A1 (en) * 2017-06-20 2020-02-06 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Quantifying SLFN11 protein for optimal cancer therapy

Also Published As

Publication number Publication date
BR112022007609A2 (pt) 2022-07-19
CN114599399A (zh) 2022-06-07
JP2022554157A (ja) 2022-12-28
EP4048277A1 (en) 2022-08-31
US20220387468A1 (en) 2022-12-08
CA3158274A1 (en) 2021-04-29
AU2020369996A1 (en) 2022-06-02
IL292348A (en) 2022-06-01
TW202131925A (zh) 2021-09-01
WO2021078925A1 (en) 2021-04-29
MX2022004934A (es) 2022-05-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6678585B2 (ja) Ｅｒｋ阻害剤およびｒａｆ阻害剤の組み合わせを使用するがん処置
US8877764B2 (en) Method for treating cancer harboring EGFR mutations
US20130012465A1 (en) Bibw 2992 for use in the treatment of triple negative breast cancer
AU2015278765B2 (en) Intermittent dosing of MDM2 inhibitor
JP2022520079A (ja) Ｔｎｏ１５５及びｋｒａｓｇ１２ｃ阻害剤を含む医薬組合せ
CN111789956B (zh) 用于抑制化疗引起副作用的药物治疗、筛选技术和试剂盒
JP6678583B2 (ja) ２型ｍｅｋ阻害剤およびｅｒｋ阻害剤の組み合わせを用いるがん処置
TW200934784A (en) Therapeutic cancer treatments
BR112019021032A2 (pt) terapia combinada anticâncer
JP2008505862A (ja) 予後分子マーカー
CN115551513A (zh) 使用包含gdc-9545和cdk4/6抑制剂的组合疗法治疗乳腺癌
WO2018092064A1 (en) Combinations of mdm2 inhibitors and bcl-xl inhibitors
KR20220088896A (ko) 암을 치료하는 방법
JP2021529177A (ja) ポジオチニブと細胞毒性剤および／またはその他の分子標的化薬剤との組合せならびにその使用
US20220323443A1 (en) Combination therapy for cancer treatment
WO2024086533A2 (en) Methods for treating or preventing neuroendocrine tumor formation using cdc7 inhibitors
WO2023063432A1 (en) Treatment methods for subjects having cancer with a dysregulated mapk and/or pi3k pathway
CN117794523A (zh) 使用parp抑制剂和plk1抑制剂的癌症治疗
Roselló et al. Principles of systemic therapy for surgeons