KR20220032054A - 결핵 백신용 융합 단백질 - Google Patents
결핵 백신용 융합 단백질 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20220032054A KR20220032054A KR1020227001213A KR20227001213A KR20220032054A KR 20220032054 A KR20220032054 A KR 20220032054A KR 1020227001213 A KR1020227001213 A KR 1020227001213A KR 20227001213 A KR20227001213 A KR 20227001213A KR 20220032054 A KR20220032054 A KR 20220032054A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- ala
- gly
- leu
- ser
- pro
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/35—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Mycobacteriaceae (F)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/04—Mycobacterium, e.g. Mycobacterium tuberculosis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
- A61P31/06—Antibacterial agents for tuberculosis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/555—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by a specific combination antigen/adjuvant
- A61K2039/55511—Organic adjuvants
- A61K2039/55555—Liposomes; Vesicles, e.g. nanoparticles; Spheres, e.g. nanospheres; Polymers
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/57—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2
- A61K2039/572—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2 cytotoxic response
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/60—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characteristics by the carrier linked to the antigen
- A61K2039/6018—Lipids, e.g. in lipopeptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/60—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characteristics by the carrier linked to the antigen
- A61K2039/6031—Proteins
- A61K2039/6068—Other bacterial proteins, e.g. OMP
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/20—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
- C07K2319/21—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand containing a His-tag
Abstract
본 발명은 결핵 복합체의 종에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병을 예방, 억제 또는 치료하기 위한 결핵균 유래 항원성 폴리펩티드에 기초한 융합 단백질에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 BCG 및/또는 ESAT-6 반복부에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 항원을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 융합 단백질은 초기 및 후기 항원의 조합을 포함할 수 있다. 또한, 본 발명은 융합 단백질을 포함하는 백신, 면역원성 조성물 및 약제학적 조성물에 관한 것이다.
Description
본 발명은 결핵 복합체 (Tuberculosis complex)의 종에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병을 예방, 억제 또는 치료하기 위한 결핵균 (Mycobacterium tuberculosis) 유래 항원성 폴리펩티드에 기초한 융합 단백질에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 BCG 및/또는 ESAT-6 반복부에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않은 항원을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 융합 단백질은 초기 및 후기 항원의 조합을 포함할 수 있다. 또한, 본 발명은 융합 단백질을 포함하는 백신, 면역원성 조성물 (Immunogenic composition) 및 약제학적 조성물 (Pharmaceutical composition)에 관한 것이다.
WHO에 따르면 결핵균 (M. tuberculosis)으로 인한 인간 결핵은 심각한 전 세계 건강문제로, 매년 수백만명이 사망한다. 1960년대 및 1970년대에는 새로운 결핵 환자의 발생률이 감소했지만, 긍정적인 경향은 부분적인 AIDS의 도래와 M.tuberculosis의 다제내성 균주의 출현으로 인해 깨졌다.
현재 임상에서 사용할 수 있는 유일한 백신은 BCG (Bacille Calmette-Guerin)로, 그 효능은 여전히 논란의 여지가 있다. BCG는 대부분의 결핵 풍토병 지역에서 유아에게 널리 투여되는 약독화 생백신이다. BCG는 일반적으로 결핵 동물 모델에서 높은 수준의 후천적 내성을 유도하고 어린이의 경우 뇌수막염 (Meningitis) 및 속립성 결핵 (Miliary tuberculosis)과 같은 파종성 결핵에 대해 보호한다. 어린 아이들에게 접종할 때, 그것은 몇 년 동안 결핵에 대한 보호 효과가 있지만, 그 후에는 효과가 떨어진다. 다양한 대조 시험을 비교한 결과, 성인에서 BCG의 보호 효능은 비효과적인 보호에서 80 % 보호까지의 효능 범위로 극적으로 변하는 것으로 나타났다. 이것은 WHO에서 매우 높은 우선순위를 부여한 M.tuberculosis에 대한 새롭고 개선된 백신의 개발을 시급한 문제로 만든다.
현재, 임상 시험 중인 몇 가지 새로운 결핵 백신이 있다. 결핵 감염 및 질병에 대한 보호를 위해서는 강력한 세포 면역 반응이 필요하다는데 일반적으로 공감대가 형성되어 있기 때문에, 현재 임상 결핵 후보의 대다수는 CD4+ 또는 CD8+ T세포에서 IFN-γ 또는 TNF-α와 같은 고전적인 TH1 사이토카인을 유도하는 것을 목표로 하며 보호 면역에 중요한 역할을 하는 T 세포 품질 개선에 대한 문제는 다루지 않는다. 현재 결핵 백신 후보에는 비활성화된 전체 세포 또는 전체 세포 추출물, 바이러스 벡터 기반 백신, 살아있는 재조합 BCG 또는 약독화된 BCG 백신, DNA 백신과 같은 다양한 백신 플랫폼이 포함된다. 그러나 위의 백신 플랫폼 중 어느 것도 지금까지 설득력 있는 임상 결과를 얻지 못하였다.
효과적인 결핵 백신을 제공하기 위한 대안 전략은 M.tuberculosis 항원의 융합 단백질을 기반으로 하는 소단위 백신을 중심으로 이루어진다. 소단위 접근법 (The subunit approach)은 증가된 안전성 및 안정성뿐만 아니라 이전 BCG 백신 접종을 증가시키는 능력과 같은 많은 이점을 보유하는 것으로 간주되었다. 강력한 세포 면역 반응을 유도하기 위해 다양한 M.tuberculosis 항원의 융합 단백질을 적절한 아쥬반트와 조합하려는 노력이 있어왔다.
WO2010006607 A2에서는 단 2개의 M.tuberculosis 항원으로 구성된 단순 융합체가 면역증강제 IC31과 함께 투여될 때 결핵 백신으로 기능할 수 있음이 입증되었다. WO2006136162 A2, WO2014063704 A2 및 WO2015161853 A1 모두 결핵 감염 및 질병에 대한 융합 단백질을 개시하고, 상기 다양한 M.tuberculosis 항원이 혼합되어 강한 면역 반응을 유도할 수 있는 서브유닛 백신을 제공한다. 그러나, 상기 융합 단백질에 공통적인 것은 상응하는 서브유닛 백신 중 어느 것도 아직 상업적으로 입수가능한 결핵 백신을 생산하지 않았다는 것이다.
따라서, 임상적으로 허용되는 백신을 생성할 가능성이 있는 개선된 결핵 백신이 유리할 것이다. 특히, 강력한 고품질 면역 반응을 유도할 수 있고 따라서 보호를 강화하는 능력을 유발할 수 있는 융합 단백질이 유리할 것이다.
Seder et al (2008), Nat. Rev. Immunol. 8, 247-258
본 발명에 있어서 결핵 감염 및/또는 질병을 예방, 억제 또는 치료하기 위해 이전에 개발된 융합 단백질과 개념적으로 상이한 융합 단백질을 제공한다. 본 발명에 있어서 기재된 융합 단백질은 BCG (본 발명에 있어서 “BCG-항원”으로 칭함) 및/또는 “ESAT-6 반복부”에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 항원을 기반으로 하며, 상기 ESAT-6 항원의 하나 이상의 카피가 융합 단백질에 존재한다. 융합 단백질은 초기 및 후기 항원의 조합을 포함할 수 있다. 본 발명에서 제공되는 융합 단백질은 기존의 결핵 백신에 비해 개선된 면역 반응을 나타낸다.
따라서, 본 발명의 목적은 강력한 세포 면역 반응을 유도하는 동시에 T 세포의 품질을 개선하는 BCG-항원 및/또는 ESAT-6 반복부를 포함하는 융합 단백질의 제공에 관한 것이다.
본 발명의 다른 목적은 Mtb 감염 후 면역 반응을 가속화하고 감염의 후기 만성 단계에서 박테리아를 특이적으로 인식할 가능성이 있는 T 세포를 유도할 초기 및 후기 결핵 항원의 조합을 포함하는 융합 단백질의 제공에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 단독 백신으로서 또는 BCG와 조합하여, 결핵 감염 및/또는 질병의 예방, 억제 또는 치료를 위한 백신 또는 면역원성 조성물에 효과적으로 사용될 수 있는 융합 단백질을 제공하는 것이다.
따라서, 본 발명의 일 측면은 M. tuberculosis로부터 유래하는 5개 이상의 항원을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다.
본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 초기 및 후기 항원 둘 다를 포함한다.
본 발명의 또 다른 일 양태는 항원이 BCG로부터 결실되거나, 분비되지 않거나, 또는 BCG에서 낮은 발현을 갖는 본 발명에 있어서 기재된 융합 단백질에 관한 것이다.
본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 기재된 바와 같은 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 5번 이상의 반복부를 포함한다.
본 발명의 다른 일 측면은 본 발명에 있어서 융합 단백질을 포함하는 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 일 측면은 독성 마이코박테리움 (Virulent mycobacterium)에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병에 대한 대상체의 백신접종 또는 면역화에 사용하기 위한 본 발명에 있어서 융합 단백질 또는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 일 측면은 다음을 포함하는 키트를 제공하는 것이다:
i) 본 발명에 있어서 융합 단백질 또는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물,
ii) BCG, 및
iii) 선택적으로, 사용 지침.
본 발명의 추가적인 측면은 본 발명에 있어서 융합 단백질을 코딩하는 서열을 포함하는 핵산 서열을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 측면은 적합한 숙주에서 융합 단백질의 생산을 지시하기에 적합한 하나 이상의 제어 서열에 작동 가능하게 연결된 본 발명에 있어서 뉴클레오티드 서열을 포함하는 재조합 발현 벡터를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 측면은 본 발명에 있어서 발현 벡터를 포함하는 재조합 숙주 세포를 제공하는 것이다.
정의
본 발명을 더 상세히 논의하기 전에, 다음 용어 및 관례 (Convention)을 먼저 정의할 것이다:
항원 (Antigen)
본 문맥에서, 용어 “항원”은 면역 반응을 유도할 수 있는 분자, 예를 들어, 면역원성 폴리펩타이드 (Immunogenic polypeptide)를 지칭한다. 항원에 의해 생성된 면역 반응은 B 세포 구동 (항체 매개 면역 반응) 및/또는 T 세포 구동 (세포 면역 반응)일 수 있다.
본 발명에 있어서 기재된 항원은 결핵균 (M. tuberculosis or Mtb)에서 유래한다.
초기 및 후기 항원 (Early and late antigens)
결핵균 감염의 과정은 기본적으로 3단계를 거친다; (i) 급성기, (ii) 잠복기/만성기 및 가능하면 (iii) 재활성화 단계. M. tuberculosis의 유전자 발현 패턴은 이 단계에서 변화한다.
따라서, 본 발명에 있어서, 용어 “초기 항원”은 주로 급성기 동안 발현되는 항원을 지칭하는 반면, “후기 항원”은 잠복기/만성기 동안 주로 발현되는 항원을 지칭한다.
융합 단백질 (Fusion protein)
본 발명에 있어서, 용어 “융합 단백질”은 M. tuberculosis 또는 이의 유사체로부터의 무작위 순서의 2개 이상의 항원을 포함하는 폴리펩타이드를 지칭한다. 항원은 다양한 길이 및 서열의 아미노산 링커와 함께 또는 없이 융합될 수 있다.
융합 단백질은 관심 항원 (antigen of interest)의 아미노산 서열을 코딩하는 2개 이상의 이종 핵산 서열을 작동 가능하게 연결함으로써 생성될 수 있다. 다운스트림 생산에서 단백질 응집을 피하기 위해 융합 단백질의 모든 시스테인을 임의의 아미노산으로 대체할 수 있지만 시스테인 (cysteine)과의 높은 구조적 유사성 때문에 세린 (serine)이 선호되는 대체물이다.
융합 단백질 또는 항원은 미정제 생물학적 공급원 (예를 들어, 재조합 발현 시스템)으로부터 정제를 허용하는 적절한 정제 태그 (또는 친화성 태그)를 포함할 수 있다. 정제 태그에는 His-태그, 키틴 결합 단백질 (Chitin binding protein, CBP), 말토스 결합 단백질 (Maltose binding protein, MBP) 및 글루타티온-S-트랜스페라제 (Glitathione-S-transferase, GST)가 포함되지만, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, “융합 단백질”이라는 용어는 “서브유닛 백신 (subunit vaccine)”이라는 용어와 혼용될 수 있다.
폴리펩티드 (Polypeptide)
본 발명에 있어서, 용어 “폴리펩티드”는 펩티드 결합을 통해 연결된 아미노산 잔기, 관련된 자연 발생 구조적 변이체 및/또는 합성 비-자연 발생 유사체로 구성된 중합체를 지칭한다.
통상적인 표기법은 본 발명에 있어서 폴리펩티드 서열을 묘사하기 위해 사용된다: 폴리펩타이드 서열의 왼쪽 말단은 아미노산 말단 (N 말단)이고; 폴리펩티드 서열의 오른쪽 끝은 카르복실 말단 (C 말단)이다.
폴리펩티드는 글리코실화, 지질화, 보결 그룹에 의해 또는 예를 들어, 정제 태그 (예를 들어, His-태그) 또는 신호 펩티드와 같은 추가 아미노산을 함유함으로써 화학적으로 변형될 수 있다. 정제 태그는 고순도 단백질 제제를 얻는데 사용된다. His-태그는 첫 번째 아미노산으로서 메티오닌 (methionine)을 포함할 수 있고, N-말단이 사용되는 경우 6 내지 8개의 히스티딘 (Histidine)이 뒤따르고, C-말단이 사용되는 경우 STOP-코돈이 뒤따르는 6-8개의 히스티딘을 포함할 수 있다. N-말단이 사용될 때, 폴리펩티드 융합을 코딩하는 유전자의 메티오닌 시작 코돈은 잘못된 번역 시작 부위를 피하기 위해 삭제될 수 있다.
각 폴리펩티드는 특정 핵산 서열에 의해 암호화 된다. 이러한 서열은 그의 유사체 및 변이체를 포함하며, 상기 핵산 서열은 하나 이상의 핵산의 치환, 삽입, 추가 또는 결실에 의해 변형된 것으로 이해될 것이다. 치환 (Substitutions)은 바람직하게는 코돈 사요의 보존적 치환이며, 이는 아미노산 서열에 어떠한 변화도 일으키지 않지만 단백질의 발현을 향상시키기 위해 도입될 수 있다.
폴리펩티드는 예를 들어 자동화된 폴리펩티드 합성기를 사용하여 재조합 또는 합성으로 생산될 수 있다.
결핵균 (M. tuberculosis)
본 발명에 있어서, 용어 “M. tuberculosis”은 결핵 감염 및 질병의 원인이 될 수 있는 Mycobacteriaceae과의 병원성 세균 종인 마이코박테리움 투베르쿨로시스 (Mycobacterium tuberculosis)를 말한다. 마이코박테리움 투베르쿨로시스는 본 명세서에서 Mtb로 약칭될 수 있다.
본 발명에 있어서, M.tuberculosis는 3단계를 거친다. 본 발명에 있어서 “감염 (infection)”이라는 용어는 이러한 3단계 중 어느 하나를 의미하며, 즉, 독성 마이코박테리움에 의한 질병에 대한 예방접종 또는 면역화는 급성기, 잠복기/만성기 및 재활성화기를 포함할 수 있다.
Bacille Calmette-Guerin (BCG)
본 발명에 있어서 용어 “Bacille Calmette-Guerin (BCG)”는 마이코박테리움 보비스 (Mycobacterium bovis)에서 유래한 약독화된 살아있는 결핵 균주를 나타낸다. BCG는 현재 결핵 감염 및 질병에 대해 상업적으로 이용 가능한 유일한 백신이다.
BCG는 거의 100년 전에 파스퇴르 연구소에서 마이코박테리움 보비스의 약독화에 의해 개발되었으며, 이 과정에서 독성 균주는 ESAT-6과 같은 독성 관련 항원을 인코딩하는 주요한 유전자 세그먼트 하나를 잃었다. 이 원래 돌연변이를 RD1이라고 한다. BCG 백신은 이후 30-40년 동안 전 세계의 다양한 실험실과 생산 시설에 배포되었다. 이것은 종종 그것이 생산되는 실험실의 위치 (BCG 덴마크 (Danish), 프라하 (Praque), 도쿄 (Tokyo) 등)의 이름을 따서 명명된 다양한 백신 하위 균주를 발생시켰다. 이러한 균주의 대부분은 처음에 연속 배양에 의해 전파되었기 때문에 원래 게놈의 많은 결실이 관찰되었으며 다른 하위 균주에서 분포가 다르다. 전체적으로, 분석된 BCG 백신 균주 중 적어도 12개의 주요 변경/삭제 (RD1-11 및 SigK 돌연변이)가 보고되었다. 이러한 결실 중 일부는 백신 가능성이 있는 면역학적으로 중요한 항원을 포함하고 일부 결실은 면역학적으로 침묵 (silent)한다.
원래의 RD1 결실은 백신에 매우 중요한 면역 우성 항원 (dominant antigen)을 포함하는 영역의 일 예이다. 본 발명에 있어서 자연 감염 동안 강하게 인식되는 항원이 개시되어 있다; RD1, RD2 및 그 발현이 SigK에 의해 조절되는 항원. 세 지역 모두의 항원을 포함하면 강력한 다단백질 기반 백신을 구성할 수 있을 만큼 충분히 많은 수의 항원과 다양한 감염 단계에서 발현되는 항원이 제공된다.
본 발명에 있어서, BGC 균주는 두 가지 주요 그룹으로 나눌 수 있다; 초기 BCG 균주 및 후기 BCG 균주. 초기 및 후기 BCG 균주를 초기 및 후기 항원과 혼동해서는 안 된다.
초기 BCG 균주에는 RD1 영역이 없다. 초기 BCG 계통은 BCG Russia, BCG Japan, BCG Moreau, BCG Sweden 및 BCG Birkhaug로 구성된다.
후기 BCG 균주는 RD1 및 RD2 영역이 없고, sigK 돌연변이가 있다. 후기 BCG 균주는 BCG Tice, BCG Frappier, BCG Pasteur, BCG Danish, BCG Glaxo, BCG Praque, BCG China 뿐만 아니라 유전자 변형 BCG 균주 VPM1002를 포함한다.
후기 및 초기 BCG 균주는 동일한 유전자형 (genotype)과 표현형 (phenotype)을 소유하지 않는다. 따라서, 후기 BCG 균주에서는 RD2 영역에 의해 암호화된 일부 항원이 결실되고 다른 항원은 제대로 발현되지 않거나 비-분실된다. 결과적으로, 이러한 결손, 저발현 또는 비분비 항원의 경우 후기 BCG 균주로 백신 접종 시 면역 반응이 유도되지 않는다.
BCG
+
항원
본 발명에 있어서, 용어 “BCG+ 항원”은 백신 접종 시 주어진 BCG 균주에 의해 발현되는 항원 및 주어진 BCG 균주로 백신 접종시 면역 반응 (자극된 세포의 배양물에서 IFN-γ 방출 (예를 들어, ELISA)에 의해 측정됨)을 프라이밍한다. 따라서, BCG+ 항원을 포함하는 융합 단백질은 주어진 BCG 균주로 초기 백신 접종 후에 투여될 때 상기 주어진 BCG 균주에 의해 이전에 유도된 면역 반응을 부스트하기 위해 사용될 수 있다.
본 발명에 있어서 BCG+ 항원은 BCG 데니쉬, BCG 파스퇴르 및 BCG 프라하 및/또는 이들 균주의 임의의 유도체 (예를 들어, VPM1002)로 이루어진 군으로부터 선택된 BCG 균주와 관련하여 정의될 수 있다. 따라서, BCG+ 항원에는 Rv1886c (Ag85b), Rv3804c (Ag85a), Rv0288 (TB10.4), Rv0287 (EsxG), Rv3478 (PPE60), Rv0475 (HBHA), Rv3890c (EsxC), Rv3891c (EsxD), Rv1284 (CanA), Rv3019c (EsxR), Rv3020c (EsxS), Rv3017c (EsxQ), Rv2031c (HspX), Rv0983 (PepD), Rv1196 (PPE18), Rv2608 (PPE42), Rv3619 (EsxV) and Rv3620 (EsxW) 및 이의 변이체를 포함할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
BCG
-
antigen
본 발명에 있어서, 용어 “BCG- 항원”은 결실, 비-분비 또는 낮은 발현 수준을 갖기 때문에 주어진 BCG 균주로 백신 접종 시 면역 반응 (IFN-γ 방출에 의해 측정됨)을 프라이밍하지 않는 항원을 지칭한다. 따라서, BCG- 항원을 포함하는 융합 단백질은 주어진 BCG 균주로 초기 백신 접종 후에 투여될 때 상기 주어진 BCG 균주에 의해 이전에 유도된 면역 반응을 부스트하지 않을 것이다. 따라서, BCG- 항원은 기능적으로 음성으로 정의될 수 있다.
본 발명에 있어서 BCG- 항원은 BCG 데니쉬, BCG 파스퇴르 및 BCG 프라하 및/또는 이들 균주의 임의이 유도체 (예를 들어, VPM1002)로 이루어진 군으로부터 선택된 BCG 균주와 관련하여 정의될 수 있다. 따라서, BCG- 항원은 이러한 BCG 균주와 관련하여 기능적으로 음성으로 정의될 수 있다.
따라서, BCG- 항원은 Rv3875 (ESAT-6), Rv3873 (PPE68), Rv3876 (espI), Rv3615c (espC), Rv3616c (espA), Rv1980c (MPT64), Rv2875 (MPT70), Rv2873 (MPT83) 및 이의 변형체를 포함할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
BCG- 항원은 상보적 면역 반응, 즉 초기 BCG 백신 접종의 항원과 다른 Mtb 항원에 대한 면역 반응을 프라이밍하는데 사용될 수 있다.
면역원성 에피토프 (Immunogenic epitope)
폴리펩타이드의 면역원성 에피토프는 폴리펩타이드의 일부이며, 이는 동물 또는 인간, 및/또는 본 발명에 있어서 임의의 생물학적 검정에 의해 결정된 생물학적 샘플에서 면역 반응을 유발한다. 폴리펩타이드의 면역원성 에피토프는 T-세포 에피토프 또는 B-세포 에피토프일 수 있다. 면역원성 에피토프는 폴리펩티드의 하나 또는 몇 개의 비교적 작은 부분과 관련될 수 있으며, 폴리펩티드 서열 전체에 흩어져 있거나 폴리펩티드의 특정 부분에 위치할 수 있다. 일부 폴리펩티드의 경우 에피토프가 전체 서열을 덮는 폴리펩타이드 전체에 흩어져 있는 것으로 나타났다 (Ravn, 1999).
면역 반응 동안 인식되는 관련 T 세포 에피토프를 확인하기 위해 “무차별 대입”방법을 사용할 수 있다: T-세포 에피토프는 선형이기 때문에, 폴리펩티드의 결실 돌여변이체는, 만약 체계적으로 구성된다면, 폴리펩타이드의 어떤 영역이 면역 인식에 필수적인지 밝히고, 예를 들어, 이러한 삭제 돌연변이를 처리하거나, 예를 들어, IFN-γ 분석에 대해 설명한다. 또 다른 방법은 바람직하게는 합성된, 예를 들어 폴리펩타이드에서 유래된 20개의 아미노산 잔기를 갖는 MHC 클래스 II 에피토프를 사용한다. 이들 펩티드는 생물학적 검정 (예를 들어, 본 발명에 있어서 IFN-γ 검정)에서 시험될 수 있으며 이들 중 일부는 펩티드에 T 세포 에피토프의 존재에 대한 증거로서 긍정적인 반응 (따라서 면역원성이 될 것이다)을 나타내게 될 것이다. MHC 클래스 I 에피토프의 검출을 위해 결합할 펩티드를 예측하고 (Stryhn, 1996) 이후 이러한 펩티드 합성을 생성하고 관련 생물학적 분석 예를 들어, 본 발명에 있어서 IFN-γ 분석으로 테스트할 수 있다. 펩티드는 바람직하게는 예를 들어 폴리펩타이드로부터 유래된 8 내지 11개의 아미노산 잔기를 가진다.
T 세포 에피토프의 최소 길이가 6개 이상의 아미노산인 것으로 나타났지만, 이러한 에피토프가 더 긴 아미노산으로 구성되는 것이 정상이다. 따라서, 본 발명의 폴리펩타이드 단편은 7개 이상의 아미노산 잔기, 예를 들어, 8개 이상, 9개 이상, 10개 이상, 12개 이상, 14개 이상, 16개 이상, 18개 이상, 20개 이상, 22개 이상, 24개 이상, 30개 이상의 아미노산 잔기의 길이를 갖는 것이 바람직하다. 따라서, 본 발명의 중요한 일 양태에 있어서, 폴리펩티드 단편은 최대 50개 아미노산 잔기, 예를 들어 최대 40, 35, 30, 25 및 20개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 것이 바람직하다. 10 내지 13개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 펩티드가 MHC 클래스 II 에피토프로서 가장 효율적인 것으로 판명될 것으로 예상되며 따라서 본 발명에 있어서 사용되는 폴리펩티드 단편의 특히 바람직한 길이는 18개, 예를 들어, 15개, 14개, 13개, 12개 및 심지어 11개의 아미노산 잔기이다. 7 내지 12개 아미노산 잔기의 길이를 갖는 펩타이드가 MHC 클래스 I 에피토프로서 가장 효율적인 것으로 판명될 것으로 예상되며 따라서 본 발명의 방법에 사용되는 폴리펩티드 단편의 특히 바람직한 길이는 11개, 예를 들어 10개, 9개, 8개 및 심지어 7개 아미노산 잔기이다.
면역원성 에피토프를 포함하는 폴리펩타이드의 면역원성 부분 (면역원성 에피토프를 포함하는 단편)은 유전적으로 이질적인 인간 집단의 넓은 부분 (높은 빈도) 또는 작은 부분 (낮은 빈도)에 의해 인식 될 수 있다. 또한, 일부 면역원성 부분은 높은 면역학적 반응 (우성)을 유도하는 반면, 다른 부분은 낮지만 여전히 중요한 반응 (하위성)을 유도한다. 높은 빈도><낮은 빈도는 광범위하게 분포된 MHC 분자 (HLA 유형) 또는 여러 MHC 분자에 결합하는 면역원성 부분과 관련될 수 있다 (Sinigaglia, 1988; Kilgus, 1991). 상기 폴리펩타이드로부터의 면역원성 에피토프를 포함하는 단편은 적어도 10개 아미노산 길이의 중첩 펩타이드로서 존재할 수 있고, 이에 의해 여러 에피토프에 걸쳐 있다.
변이체
본 발명에 있어서, 용어 “변이체 (Variant)”는 본 발명에 있어서 항원, 폴리펩타이드 또는 “실질적으로 상동성 (substantially homologous)”이고/또는 적어도 상당한 양의 항원의 면역원성을 보유하고, 그것이 가리키는 폴리펩타이드 또는 융합 단백질인 융합 단백질을 지칭한다.
본 발명에 있어서, 용어 “실질적으로 상동성”이라는 용어는 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어, 90 % 이상, 예를 들어, 95 % 이상, 예를 들어, 96 % 이상, 예를 들어, 97 % 이상, 예를 들어, 98 % 이상, 예를 들어, 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 참조하는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질에 대한 서열 동일성을 의미한다.
본 발명에 있어서, 용어 “면역원성의 실질적인 양”은 언급하는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질과 비교하여 적어도 80 %의 면역원성을 유지하고, 예를 들어, 90 % 이상, 예를 들어, 95 % 이상, 예를 들어, 96 % 이상, 예를 들어, 97 % 이상, 예를 들어, 98 % 이상, 예를 들어, 99 % 이상 면역원성을 유지하는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질을 의미한다.
따라서, 본 발명에 있어서 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질의 변이체는 그것이 언급하는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질과 동일한 면역원성 또는 적어도 동일한 면역원성을 가질 수 있다. 유사하게, 본 발명에 있어서 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질에 대해 정의된 서열 동일성을 갖는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질은 언급되는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질과 동일한 면역원성 또는 적어도 동일한 면역원성을 가질 수 있다.
항원 반복부
본 발명에 있어서, 용어 “항원 반복부 (Antigen repeats)”는 항원의 1개 초과 카피가 융합 단백질에 존재하는 항원을 지칭한다. 항원 반복부의 별개의 항원 카피는 (i) 연속적으로, (ii) 항원 반복부와 상이한 항원과 교대로, 또는 (iii) 융합 단백질에서 항원 반복부와 상이한 항원에 의해 분리될 수 있다. 항원 반복부는 2개 이상의 항원 반복부, 예를 들어, 3개 이상, 예를 들어, 4개 이상, 예를 들어, 5개 이상의 항원 반복부를 포함할 수 있다. 따라서, 예를 들어, 3개 이상의 항원 반복부는 상기 항원의 3개 이상의 카피를 포함한다.
본 발명에 있어서, ESAT-6의 항원 반복체, 즉 ESAT-6 반복체를 포함하는 융합 단백질이 바람직하다.
링커 분자
본 발명에 있어서, “링커 분자 (Linker molecule)” 또는 “링커”라는 용어는 융합 단백질에서 항원 사이에 발생하는 펩타이드 서열을 의미한다. 링커는 종종 글리신 (glycine) 및 세린 (serine)과 같은 유연한 잔기로 구성되어 융합 단백질의 인접 도메인이 분비/제조 동안 독립적으로 적절한 폴딩을 위해 서로에 대해 자유롭게 이동할 수 있다. 만일 필요한 경우, 융합 단백질의 2개의 인접한 도메인이 입체적으로 서로 간섭하지 않도록 하기 위해 더 긴 링커를 사용할 수 있다.
유전적 수준의 링커는 핵산으로 구성된다는 것을 이해해야 한다. 따라서, 본 발명에 있어서 융합 단백질을 코딩하는 핵산은 핵산 서열로 표시되는 링커를 포함할 수 있다.
공동 예방 접종
본 발명에 있어서, 용어 “공동 백신 접종 (Co-vaccination)”은 2개의 별개의 백신 및/또는 면역원성 조성물의 동시 투여, 예를 들어, 본 발명에 있어서 서브유닛 백신 (또는 융합 단백질) 및 BCG 백신의 동시 투여, 또는 BCG가 숙주에서 지속되는 것으로 예상될 수 있는 기간 내에 BCG를 사용한 백신의 동시 투여, 또는 BCG가 숙주에서 지속되는 것으로 예상될 수 있는 기간 내에 BCG를 사용한 백신 접종 후 서브유닛 백신 접종를 지칭한다.
용어 “공동 백신 접종”, “공동 면역화” 및 “공동-투여”는 본 발명에 있어서 상호 교환가능하게 사용된다.
백신 및 면역원성 조성물
본 발명에 있어서, 용어 “백신 (Vaccine)” 및 “면역원성 조성물 (immunogenic composition)”은 결핵 감염 또는 질병에 대한 능동적 획득 면역을 제공할 수 있는 하나 이상의 항원을 포함하는 조성물을 지칭한다. “백신” 또는 “면역원성 조성물”은 바람직하게는 결핵 감염 또는 질병에 대한 능동적 획득 면역을 제공할 수 있는 본 발명에 있어서 융합 단백질을 포함할 수 있다. 따라서, 본 명세서에 기재된 바와 같은 백신 또는 면역원성 조성물은 백신 접종되지 않은 동물과 비교하여, 표적 기관에서 박테리아 부하를 감소시키고, 생존 시간을 연장시키고/시키거나 독성 마이코박테리움으로 공격한 후 동물의 체중 감소를 감소시킬 수 있다.
백신 또는 면역원성 조성물은 면역학적으로 및 약학적으로 허용되는 담체 또는 비히클을 포함할 수 있다. 적합한 담체에는 폴리펩타이드가 소수성 비공유 상호작용에 의해 결합된 폴리머, 예를 들어, 플라스틱 폴리스티렌, 또는 폴리사카라이드오 같은 폴리펩타이드가 공유 결합된 중합체, 또는 폴리펩티드, 예를 들어, 소 혈청 알부민 (Bovine serum albumin), 오브알부민 (ovalbumin) 또는 키홀 림펫 헤모시아닌 (keyhole limpet haemocyanin)이 포함될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 적합한 비히클에는 희석제 및 현탁제가 포함될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
더욱이, 백신 또는 면역원성 조성물은 바람직하게는 하나 이상의 아쥬반트를 포함한다.
아쥬반트
본 발명에 있어서, 용어 “아쥬반트 (Adjuvants)”는 항원에 대한 면역 반응을 항상시키는 화합물 또는 혼합물을 지칭한다. 아쥬반트는 항원을 천천히 방출하는 조직 저장소와 면역 반응을 비특이적으로 향상시키는 림프계 활성화제 역할을 할 수 있다. 종종, 항원 보강제 없이 항원만을 사용한 1차 시험은 체액성 또는 세포성 면역 반응을 이끌어내지 못할 것이다.
아쥬반트는 중성 아쥬반트 제형 (neutral adjuvant formulation), 음이온성 아쥬반트 제형 (anionic adjuvant formulation), 양이온성 아쥬반트 제형 (cationic adjuvant formulation) (예를 들어, “CAF01”“CAF04”“CAF09”및 “CAF10”), 양이온성 리포솜 (cationic liposome) (예를 들어, 디메틸디옥타데실암모니움 브로마이드 (dimethyl-di-octadecylammonium bromide, DDA)), Quil A, QS21, 폴리 I:C, 암모늄하이드록사이드 (aluminium hydroxide), 프로인트 불완전 아쥬반트, IFN-γ, IL-2, IL-12, 모노포스포릴 지질 A (MPL), 트레할로스 디미콜레이트 (Trehalose Dimycolate, TDM), 트레할로스 디베헤네이트 (Trehalose Dibehenate, TDB), 무라밀 디펩티드 (Muramyl Dipeptide, MDP), 모노마이콜릴 글리세롤 (monomycolyl glycerol, MMG), CpG 및 “IC31”또는 이들의 조합이 포함될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
표현 벡터
본 발명에 있어서, 용어 “발현 벡터 (Expression vector)”는 재조합 유전 물질을 숙주 세포로 전달하기 위한 매개체로 사용되는 DNA 분자를 의미한다. 4가지 주요 유형의 발현 벡터는 플라스미드, 박테리오파지 및 기타 바이러스, 코스미드 및 인공 염색체이다. 발현 벡터 자체는 일반적으로 삽입체 (이종 핵산 서열, 이식 유전자) 및 발현 벡터의 “백본”역할을 하는 더 큰 서열로 구성된 DNA 서열이다. 숙주에 유전 정보를 전달하는 발현 백터의 목적은 일반적으로 표적 세포에서 삽입물을 분리, 증식 또는 발현하는 것이다. 발현 벡터는 표적 세포에서 이종 서열의 발현을 위해 특별히 적합화되고 일반적으로 이종 서열의 발현을 유도하는 프로모터 서열을 갖는다.
작동적으로 연결됨
본 발명에 있어서, 용어 “작동적으로 연결됨 (Operatively linked)”은 유전자 또는 오픈 리딩 프레임과 같은 기능적 단위의 일부인 요소의 연결을 의미한다. 따라서, 프로모터를 폴리펩티드를 암호화하는 핵산 서열에 작동적으로 연결함으로써 두 요소는 기능적 단위인 유전자의 일부가 된다. 발현 조절 서열 (프로모터)을 핵산 서열에 연결함으로써 프로모터가 지시하는 핵산 서열의 전사를 가능하게 한다. 폴리펩티드를 암호화하는 두 개의 이종 핵산 서열을 작동 가능하게 연결함으로써 서열은 기능적 단위의 일부가 된다. 두 개의 아미노산 서열을 작동 가능하게 연결함으로써 서열은 동일한 기능 단위의 일부가 된다-폴리펩타이드. 2개의 이종 아미노산 서열을 작동적으로 연결하면 하이브리드(융합) 폴리펩타이드가 생성된다.
포유류
본 발명에 있어서, 용어 “포유류 (Mammal)”는 설치류, 영장류, 유제류 및 육식동물을 포함하지만 이에 한정되지 않는 포유류 클래스에 속하는 모든 동물을 의미한다. 유제류에는 소, 말, 돼지, 양, 염소 및 낙타가 포함될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에 있어서, 포유동물은 바람직하게는 인간 또는 가축이다.
시퀀스 ID
본 발명에 있어서, 용어 “서열 동일성 (Sequence identity)”은 각각 뉴클레오티드, 염기 또는 아미노산 수준에서 유전자 또는 단백질사이의 서열 동일성을 의미한다. 구체적으로, DNA 서열의 전사체가 동일한 RNA 서열로 전사될 수 있다면 DNA 및 RNA 서열은 동일한 것으로 간주된다.
따라서, 본 발명에 있어서, “서열 동일성”은 아미노산 수준에서 단백질 간의 동일성의 척도이고 뉴클레오티드 수준에서 핵산 간의 동일성의 척도이다. 단백질 서열 동일성은 서열이 정렬될 때 각 서열의 주어진 위치에서 아미노산 서열을 비교함으로써 결정될 수 있다. 유사하게, 핵산 서열 동일성은 서열이 정렬될 때 각 서열의 주어진 위치에서 뉴클레오티드 서열을 비교함으로써 결정될 수 있다.
2개의 아미노산 서열 또는 2개의 핵산의 퍼센트 동일성을 결정하기 위해 최적의 비교 목적 (예를 들어, 갭은 제2 아미노 또는 핵산 서열과의 최적 정렬을 위해 제1 아미노산 또는 핵산 서열의 서열에 도입될 수 있다.)을 위해 서열을 정렬한다. 이어서, 상응하는 아미노산 위치 또는 뉴클레오티드 위치에서 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드가 비교된다. 첫 번째 서열의 위치가 두 번째 서열의 상응하는 위치와 동일한 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드에 의해 점유될 때, 분자는 그 위치에서 동일하다. 두 서열 사이의 퍼센트 동일성은 서열이 공유하는 동일한 위치의 수의 함수 (즉, % 동일성 = 동일한 위치의 #/총 위치의 # (예를 들어, 겹치는 위치) x 100)이다. 일 실시예에서, 2개의 서열은 동일한 길이이다.
다른 일 양태에 있어서, 2개의 서열은 상이한 길이를 갖고 갭은 상이한 위치로서 보여진다. 수동으로 서열을 정렬하고 동일한 아미노산의 수를 계산할 수 있다. 대안적으로, 퍼센트 동일성의 결정을 위한 2개의 서열의 정렬은 수학적 알고리즘을 사용하여 달성될 수 있다. 이러한 알고리즘은 (Altschul et al. 1990)의 NBLAST 및 XBLAST 프로그램에 통합됩니다. BLAST 뉴클레오티드 검색은 NBLAST 프로그램, 점수= 100, 단어 길이 = 12로 수행되어 본 발명의 핵산 분자와 상동성인 뉴클레오티드 서열을 얻을 수 있다. BLAST 단백질 검색은 XBLAST 프로그램, 점수 = 50, 단어 길이 = 3으로 수행되어 본 발명의 단백질 분자와 상동성인 아미노산 서열을 얻을 수 있다.
비교 목적으로 갭 정렬을 얻기 위해 Gapped BLAST를 사용할 수 있다. 또는, PSI-Blast를 사용하여 분자 간의 먼 관계를 감지하는 반복 검색을 수행할 수 있다. NBLAST, XBLAST 및 Gapped BLAST 프로그램을 사용할 때 각 프로그램의 기본 매개변수를 사용할 수 있다. http://www.ncbi.nlm.nih.gov를 참조하라. 대안적으로, 서열 동일성은 서열이 정렬 된 후에 예를 들어, EMBL 데이터 베이스 (www.ncbi.nlm.gov/cgi-bin/BLAST)의 BLAST 프로그램으로 계산될 수 있다. 일반적으로, 다음과 같은 기본 설정은 다음과 같다. 정렬을 위해 “스코어링 매트릭스” 및 “갭 페널티”가 사용될 수 있다. 본 발명의 맥락에서, BLASTN 및 PSI BLAST 디폴트 설정이 유리할 수 있다.
2개의 서열 사이의 퍼센트 동일성은 갭을 허용하거나 허용하지 않고 상기 기재된 것과 유사한 기술을 사용하여 결정될 수 있다. 퍼센트 동일성을 계산할 때, 정확히 일치하는 항목만 계산하면 된다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 어느 정도의 서열 변이를 갖는 본 발명의 서열에 관한 것이다.
결핵 백신용 융합 단백질
세계 인구의 약 4분의 1이 결핵에 감염되어 있는 것으로 추산되며, 이 질병으로 인해 매년 백만명 이상이 사망한다. 이것은 결핵을 전 세계적으로 가장 치명적인 전염병으로 만든다. 이러한 사실에도 불구하고, 100년 전에는 개발된 논란의 여지가 있고 신뢰할 수 없는 BCG 백신을 대체하고 강화할 효율적인 백신이 개발되지 않았다. 비활성화된 전체 세포 또는 전체 세포 추출물, 바이러스 벡터 기반 백신, 살아있는 재조합 BCG, 약독화된 BCG 백신 또는 DNA 백신과 같은 다양한 플랫폼을 기반으로 하는 전략은 강화된 결핵 백신의 약속과 함께 고무적인 결과를 제공하는데 대체로 실패했다.
대안적인 접근법은 결핵 서브유닛 백신 생산을 위한 항원 선택을 포함하는 융합 단백질의 설계이다. 이러한 유형의 결핵 백신은 백신의 안정성 및 안정성 향상을 ?l마하여 다른 백신 전략에 비해 일련의 이점을 갖고 있는 것으로 믿어진다. 융합 단백질의 세심한 설계로 고품질 T 세포의 강력한 세포 면역 반응을 유도할 수 있다. 따라서, 본 발명에 있어서 결핵 감염 및/또는 질병의 예방, 억제 또는 치료를 위한 백신 또는 면역원성 조성물에 효과적으로 사용될 수 있는 융합 단백질을 제공한다.
따라서, 본 발명의 일 측면은 M.tuberculosis로부터 유래하는 적어도 2개의 항원을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다.
결핵균 (Mycobacterium tuberculosis)의 게놈에는 약 4000개의 유전자가 포함되어 있으며, 그 중 다수는 충분한 강도나 품질의 면역 반응을 유도하지 않기 때문에 결핵 감염 또는 질병에 대한 서브유닛 백신의 항원으로 적합하지 않은 단백질을 암호화한다. 따라서, 본 발명에 있어서 융합 단백질의 항원은 이의 면역원성에 대해 주의 깊게 선택되며, Rv3875 (ESAT-6), Rv3873 (PPE68), Rv3876 (espI), Rv3615c (espC), Rv3616c (espA), Rv1980c (MPT64), Rv2875 (MPT70), Rv2873 (MPT83), Rv1886c (Ag85b), Rv3804c (Ag85a), Rv0288 (TB10.4), Rv0287 (EsxG), Rv3478 (PPE60), Rv0475 (HBHA), Rv3890c (EsxC), Rv3891c (EsxD), Rv1284 (CanA), Rv3019c (EsxR), Rv3020c (EsxS), Rv3017c (EsxQ), Rv2031c (HspX), Rv0983 (PepD), Rv1196 (PPE18), Rv2608 (PPE42), Rv3619 (EsxV), Rv3620 (EsxW), Rv2660c, Rv3614 (EspD), Rv3865 (EspF), Rv3849 (EspR), Rv3872 (PE35) 및 Rv3881 (EspB)을 포함할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), SEQ ID NO:8 (MPT83), SEQ ID NO:10 (Ag85b), SEQ ID NO:11 (Ag85a), SEQ ID NO:12 (TB10.4), SEQ ID NO:13 (EsxG), SEQ ID NO:14 (PPE60), SEQ ID NO:15 (HBHA), SEQ ID NO:16 (EsxC), SEQ ID NO:17 (EsxD), SEQ ID NO:18 (CanA), SEQ ID NO:19 (EsxR), SEQ ID NO:20 (EsxS), SEQ ID NO:21 (EsxQ), SEQ ID NO:22 (HspX), SEQ ID NO:23 (PepD), SEQ ID NO:24 (PPE18), SEQ ID NO:25 (PPE42), SEQ ID NO:26 (EsxV), SEQ ID NO:27 (EsxW), SEQ ID NO:28 (Rv2660c), SEQ ID NO:29 (Rv3614), SEQ ID NO:30 (Rv3865), SEQ ID NO:31 (Rv3849), SEQ ID NO:32 (Rv3872) 및 SEQ ID NO:33 (Rv3881) 및 이의 변이체로 이루어진 군으로부터 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 3개 이상의 항원, 예를 들어, 4개 이상의 항원, 예를 들어, 5개 이상의 항원, 예를 들어, 6개 이상의 항원, 예를 들어, 7개 이상의 항원, 예를 들어, 8개 이상의 항원을 포함한다.
결핵균 감염 과정은 기본적으로 3단계를 거친다. 급성기 동안 박테리아는 면역 반응이 증가할 때까지 장기에서 증식한다. 특히, 감작된 CD4 T 림프구는 감염 조절을 매개하며 가장 중요한 매개체 분자는 인터페론 감마 (IFN-감마) 인 것으로 보인다. 박테리아 부하가 감소하기 시작하고 박테리아 부하가 낮은 수준에서 안정적으로 유지되는 잠복/만성 단계가 설정된다. 이 단계에서 M.tuberculosis는 활성 증식에서 휴면으로 이동하여 본질적으로 복제되지 않고 육아종 (granuloma) 내부에 남는다. 어떤 경우에는 감염이 재활성화 단계로 진행되어 휴면 박테리아가 다시 복제를 시작한다.
M. tuberculosis의 일차 감염에서 잠복기로의 전환은 유전자 발현의 변화를 동반한다. 또한, 박테리아가 활성 복제에서 휴면으로 전환하는 동안 유전자 발현을 조절하기 때문에 면역 반응의 항원 특이성 변화가 발생할 가능성이 있다. 잠복/만성 감염을 조절하는 면역 반응의 전체 특성과 재활성화를 유발하는 요인은 완전히 밝혀지지 않았다. 그러나 책임 있는 우성 세포 유형의 변화에 대한 몇 가지 증거가 있다. CD4 T 세포는 급성기 동안 감염 조절에 필수적이고 충분하지만 연구에 따르면 CD8 T 세포 반응은 잠복기/만성기에 더 중요하다.
현재 임상 시험에서는 몇 가지 새로운 결핵 백신이 있다. 그러나, 이들은 주로 감염 초기 단계에서 발현되는 제한된 수의 항원에 기초한 고전적인 예방 백신이다. 그러나, 위에서 설명한 역학적인 발현의 직접적인 결과로서, T 세포에 제시되는 에피토프 패턴은 시간이 지남에 따라 근본적으로 변한다. 따라서, 이론에 얽매이지 않고, 각각 감염 초기 및 후기 단계에서 고도로 발현되는 두 항원을 모두 포함하는 융합 단백질이 (i) Mtb 감염 후 면역 반응을 가속화할 수 있는 강력한 백신에 사용될 수 있음 및 (ii) 후기 만성 단계에서 박테리아를 특이적으로 인식할 가능성이 있는 T 세포를 유도할 수 있음이 고려된다. 이러한 융합 단백질 디자인의 이점은 개선된 에피토프 적용 범위와 급성 및 잠복/만성 감염 모두를 표적으로 하는 능력까지 확장된다.
따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 같은 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 초기 및 후기 항원 둘 다를 포함한다.
본 발명의 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 상기 초기 항원은 Rv3875 (ESAT-6), Rv3873 (PPE68), Rv3876 (espI), Rv3615c (espC), Rv3616c (espA), Rv1886c (Ag85b), Rv3804c (Ag85a), Rv0288 (TB10.4), Rv0287 (EsxG), Rv3478 (PPE60), Rv0475 (HBHA), Rv3890c (EsxC), Rv3891c (EsxD), Rv1284 (CanA), Rv3019c (EsxR), Rv3020c (EsxS), Rv3017c (EsxQ), Rv0983 (PepD), Rv1196 (PPE18), Rv2608 (PPE42), Rv3619 (EsxV), Rv3620 (EsxW), Rv3614 (EspD), Rv3865 (EspF), Rv3849 (EspR), Rv3872 (PE35) and Rv3881 (EspB) 및 이의 변이체로 이루어진 군에서 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다.
본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 상기 후기 항원은 Rv2875 (MPT70), Rv2873 (MPT83), Rv2031c (HspX) and Rv2660c 및 이의 변이체로 이루어진 군에서 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다.
결핵 질병으로 고통받는 국가의 인구 대부분은 BCG (Mycobacterium bovis에서 유래한 약독화된 살아있는 결핵균의 한 종류) 백신을 접종받는다. 결핵에 대한 보호를 강화하기 위한 일반적인 전략은 초기 BCG 백신 접종에 대한 반응으로 제기되는 면역 반응을 높이는 것이다. 이것은 BCG에 의해 발현되고 초기 BCG 백신 접종시 이미 면역 반응을 준비시킨 결핵 항원을 투여함으로써 달성될 수 있다. 이러한 항원은 본 발명에 있어서 BCG+ 항원으로 지칭되고, 초기 BCG 백신접종에 의해 유도된 면역 반응을 부스팅할 목적으로 서브유닛 백신의 일부로 투여될 수 있다. 그러나 BCG 백신 접종 및 Mtb 감염을 포함한 마이코박테리아 감염은 열악한 T 세포 품질을 갖는 T 세포를 유도하며, 이는 결과적으로 실망스러운 효능으로 서브유닛 백신으로 추가접종 시 재프로그래밍하기가 극히 어려운 것으로 입증되었다.
본 발명에 있어서 상기 BCG+ 부스트 백신과 개념적으로 상이한 융합 단백질 변이가 개시되어 있다. 놀랍게도, BCG와 관련하여 기능적으로 음성인 결핵 항원, 즉, BCG로 백신 접종시 면역 반응을 자극하지 않는 항원은 M.tuberculosis에 대해 현저하게 강화된 보호를 제공하기 위해 융합 단백질에 사용될 수 있음이 밝혀졌다. 이러한 항원은 본 발명에 있어서 BCG- 항원으로 지칭되며, 단독 백신의 일부로서 융합 단백질에 사용되거나 1차 BCG 백신접종의 항원과 상이한 BCG 항원에 대한 사옵적 면역 반응을 프라이밍하기 위해 BCG와 조합하여 사용할 수 있다.
이론에 얽매이지 않고, 증가된 보호의 적어도 일부는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 의해 유도된 면역 반응의 품질에 기인하는 것으로 고려된다. BCG 백신 접종은 주로 마이코박테리움 (mycobacterium) 감염이며, 만성 항원 자극으로 인해 폐 조직을 핌투하여 감염과 싸울 수 있는 짧은 수명의 T 세포를 유도한다. BCG 백신 접종의 1차 면역 반응에 의해 남겨진 이러한 발자국 또는 면역학적 유산은 이후에 변경하기가 매우 어렵다. 본 발명에 있어서 융합 단백질은 BCG- 항원을 기반으로 하는 변형으로, 이러한 면역학적 유산에 의해 제한되지 않고 다라서 BCG+ 항원을 기반으로 하는 전통적인 서브유닛 백신에 대해 일반적으로 제한되는 T 세포 품질에 대한 장벽을 우회할 수 있다.
따라서, 본 발명에 있어서 융합 단백질의 변이는 BCG, 즉 BCG- 항원에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 항원을 기반으로 한다. 본 발명에 있어서 융합 단백질은 기존의 결핵 백신에 비해 개선된 면역 반응을 나타낸다.
따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 하나 이상의 항원이 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 하나 이상의 항원이 BCG와 관련하여 기능적으로 음성인 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 하나 이상의 항원이 BCG- 항원인 융합 단백질에 관한 것이다.
다양한 BCG 균주가 존재하며, 유전자형과 표현형은 균주마다 다르다. 따라서, 항원이 BCG+ 또는 BCG- 항원인지 여부를 결정하기 위해, 본 발명에 있어서 후기 BCG 균주, 바람직하게는 BCG 데니쉬, BCG 파스퇴르, BCG 프라하 또는 VPM1002를 참조한다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 BCG가 후기 BCG 균주, 바람직하게는 BCG 데니쉬, BCG 파스퇴르 또는 BCG 프라하로부터 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 하나 이상의 항원이 후기 BCG 균주에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 BCG 데니쉬, BCG 파스퇴르 및 BCG 프라하로 이루어진 군으로부터 선택된 BCG 균주에 대해 하나 이상의 항원이 면역 반응을 프라이밍하지 않는 융합 단백질에 관한 것이다.
후기 BCG 균주는 또한 (i) 결실된 RD2 영역에 의해 코딩되는 일부 항원의 부재 및 (ii) 다른 항원의 빈약한 발현 또는 비분비를 특징으로 할 수 있다. 결과적으로, 이러한 결손 (missing), 저발현 (poorly expressed) 또는 비분비 (non-secreted) 항원의 경우 후기 BCG 균주로 백신 접종 시 면역 반응이 유도되지 않는다. 따라서 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 항원이 BCG로부터 결실되거나, 비-분비되거나, 또는 BCG에서 낮은 발현을 갖는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 다른 구체적인 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 항원은 후기 BCG 균주로부터 결실되거나, 비-분비되거나, 저발현되며, 바람직하게는 후기 BCG 균주는 BCG 데니쉬, BCG 파스퇴르 및 BCG 프라하로 이루어진 군으로부터 선택된다.
본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 항원이 RD1 내에 위치한 항원, RD2에 위치한 항원 및 발현이 SigK에 의해 조절되는 항원, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다.
결핵균의 게놈은 약 4000개의 유전자를 포함하고 있지만, BCG의 게놈과 약 98%의 큰 중첩이 있다. 결과적으로, 잠재적인 BCG-항원의 수는 BCG가 T 세포 반응을 프라이밍하지 않는 약 100개의 항원으로 제한된다. 본 발명에 있어서 결핵 감염 및/또는 질병에 대한 백신에 사용하기 위한 융합 단백질에 포함되기에 적합한 확인되 BCG- 항원이 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 항원이 Rv3875 (ESAT-6), Rv3873 (PPE68), Rv3876 (espI), Rv3615c (espC), Rv3616c (espA), Rv1980c (MPT64), Rv2875 (MPT70) and Rv2873 (MPT83) 및 이의 대상체로 이루어진 군으로부터 선택된 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명에 있어서 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질의 변이체는 동일한 면역원성을 가질 수 있으며, 즉 이들은 면역 반응을 유도하는 데 동등하게 효과적이거나, 또는 항원, 폴리펩타이드 또는 그것이 참조된 융합 단백질과 적어도 동일한 면역원성을 갖는 것으로 이해되어야 한다. 본 발명에 있어서 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 항원이 다음으로부터 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70) 및 SEQ ID NO:8 (MPT83) 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로 구성된 그룹으로부터 선택된 아미노산 서열, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
항원의 일부 단편이 유리한 것으로 밝혀졌다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 하기로부터 선택된 아미노산 서열을 포함한다:
a) SEQ ID NO:34 (H107b), SEQ ID NO:35 (H107c) 또는 SEQ ID NO:91 (H107e) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
본 발명의 바람직한 구체적인 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것이고, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), and SEQ ID NO:5 (espA) 및 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 다음으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함한다:
a) SEQ ID NO:36 (H106) or SEQ ID NO:38 (H104) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), and SEQ ID NO:8 (MPT83) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 다음으로부터 선택된 아미노산 서열을 포함한다:
a) SEQ ID NO:37 (H105) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
본 발명의 추가적인 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 b)의 아미노산 서열은 a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 90 % 이상 서열 동일성, 95 % 이상 서열 동일성, 96 % 이상 서열 동일성, 97 % 이상 서열 동일성, 98 % 이상 서열 동일성, 99 % 이상 서열 동일성을 갖는다. 본 발명에 있어서 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질에 대해 정의된 서열 동일성을 갖는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질이 동일한 면역원성을 가질 수 있으며, 즉, 면역 반응을 유도하는 데 동등하게 효과적이거나 적어도 그것이 참조하는 항원, 폴리펩타이드 또는 융합 단백질과 동일한 면역원성을 가질 수 있다.
본 발명에 있어서, 초기 및 후기 항원 둘 모두를 사용한 백신 접종은 개선된 면역 반응을 초래하는 것으로 고려된다. 본 발명에 있어서 제한된 수의 BCG- 항원 중에서 초기 및 후기 항원을 모두 식별한다. 따라서, 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질 BCG (즉, BCG- 항원)에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 초기 및 후기 항원 둘 다를 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 후기 항원이 Rv2875(MPT70) 및/또는 Rv2873(MPT83), 및 이의 변이체인 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 추가적인 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것이고, 상기 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 초기 항원은 Rv3875(ESAT-6), Rv3873(PPE68), Rv3876(espI), Rv3615c(espC) 및 Rv3616c(espA), 및 이들의 변이체로 구성된 그룹에서 선택된다.
본 발명에 있어서 융합 단백질의 일부 변형은 BCG- 항원만을 함유하는 것으로 한정된다. 따라서, 본 발명의 구체적인 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍 하지 않는 항원 (즉, BCG-항원)만을 포함한다.
본 발명에 있어서 융합 단백질은 또한 6 kDa 조기 분비 항원 표적 (ESAT-6)의 함량을 변경함으로써 개선될 수 있다. ESAT-6은 결핵균의 중요한 분비 단백질이자 강력한 T 세포 항원이다. 박테리아에 의해 다량으로 구성적으로 발현되고 분비되는 ESAT-6 단백질은 감염 후 인간과 동물 모두에서 인식된다. 따라서, ESAT-6은 결핵 감염 및 질병에 대한 서브유닛 백신에 유리하게 포함될 수 있는 중요한 항원으로 인정된다. 그러나 천연 ESAT-6 분자는 95개 아미노산의 작은 단백질이기 때문에 인간과 동물에서 ESAT-6에 대한 면역 반응의 크기는 상대적으로 낮다.
본 발명에 있어서 ESAT-6이 융합 단백질의 더 큰 부분을 상대적으로 나타내도록 ESAT-6의 여러 카피를 포함하는 융합 단백질의 변형이 개시되어 있다. 이론에 얽매이지 않고, 융합 단백질에서 ESAT-6 항원의 상대적 함량을 증가시키는 것은 낮은 면역원성을 갖는 천연 ESAT-6에 대한 도전을 완화시키는 것으로 본 발명에 있어서 고려된다. 하나 이상의 ESAT-6 카피를 포함하는 융합 단백질의 경우 항원의 각 발생은 ESAT-6 반복이라고 한다. 4개의 ESAT-6 항원 카피를 포함하는 융합 단백질은 4개의 ESAT-6 반복을 포함한다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 5개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함한다. 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질이 4개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질이 4개의 ESAT-6 반복부를 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 각각의 ESAT-6 반복은 SEQ ID NO:1 또는 SEQ ID NO:1에 80 % 이상 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열로 표시된다.
ESAT-6의 반복부는 원칙적으로 융합 단백질에서 임의의 순서로, 예를 들어 C-말단, N-말단에서, 연속적으로, 교대로, 또는 분리되어 분포될 수 있다. 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 ESAT-6 반복부가 ESAT-6과 상이한 하나 이상의 항원에 의해 분리되는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 ESAT-6 반복부가 ESAT-6과 상이한 항원과 교대로 위치하는 융합 단백질에 관한 것이다.
ESAT-6 반복이 있는 융합 단백질에 사용하기에 적합한 항원은 바람직하게는 높은 면역원성이며 결핵 감염 후 인간과 동물 모두에서 인식된다. 따라서, ESAT-6 반복부와 함께 융합 단백질에 사용하기에 적합한 항원은 Rv3873 (PPE68), Rv3876 (espI), Rv3615c (espC), Rv3616c (espA), Rv1980c (MPT64), Rv2875 (MPT70), Rv2873 (MPT83), Rv1886c (Ag85b), Rv3804c (Ag85a), Rv0288 (TB10.4), Rv0287 (EsxG), Rv3478 (PPE60), Rv0475 (HBHA), Rv3890c (EsxC), Rv3891c (EsxD), Rv1284 (CanA), Rv3019c (EsxR), Rv3020c (EsxS), Rv3017c (EsxQ), Rv2031c (HspX), Rv0983 (PepD), Rv1196 (PPE18), Rv2608 (PPE42), Rv3619 (EsxV), Rv3620 (EsxW), Rv2660c, Rv3614 (EspD), Rv3865 (EspF), Rv3849 (EspR), Rv3872 (PE35) 및 Rv3881 (EspB)을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.
따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것이고, 상기 항원은 SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), SEQ ID NO:8 (MPT83), SEQ ID NO:10 (Ag85b), SEQ ID NO:11 (Ag85a), SEQ ID NO:12 (TB10.4), SEQ ID NO:13 (EsxG), SEQ ID NO:14 (PPE60), SEQ ID NO:15 (HBHA), SEQ ID NO:16 (EsxC), SEQ ID NO:17 (EsxD), SEQ ID NO:18 (CanA), SEQ ID NO:19 (EsxR), SEQ ID NO:20 (EsxS), SEQ ID NO:21 (EsxQ), SEQ ID NO:22 (HspX), SEQ ID NO:23 (PepD), SEQ ID NO:24 (PPE18), SEQ ID NO:25 (PPE42), SEQ ID NO:26 (EsxV), SEQ ID NO:27 (EsxW), SEQ ID NO:28 (Rv2660c), SEQ ID NO:29 (Rv3614), SEQ ID NO:30 (Rv3865), SEQ ID NO:31 (Rv3849), SEQ ID NO:32 (Rv3872) and SEQ ID NO:33 (Rv3881) 및 이의 변이체로 이루어진 군에서 선택되고, 및 상기 융합 단백질은 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 5개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함한다.
본 발명에 있어서 융합 단백질은 또한 ESAT-6 반복부와 조합된 초기 및 후기 항원 또는 BCG-항원을 모두 포함하는 융합 단백질을 포함한다. 따라서, 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 초기 항원 및 후기 항원 둘 모두, 및 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 5개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함한다. 본 발명의 또 다른 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 하나 이상의 항원은 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않으며, 및 상기 융합 단백질은 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 5개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함한다.
본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), 서열번호:7 (MPT70) 및 서열번호:8 (MPT83) 및 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로 구성된 그룹으로부터 선택된 아미노산 서열, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열, 및
상기 융합 단백질은 ESAT-6과 다른 항원과 교대로 위치하는 4개의 ESAT-6 반복을 포함한다.
본 발명의 또 다른 특히 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 ESAT-6 반복부와 조합된 초기 및 후기 BCG- 항원 둘 다를 포함한다. 이러한 융합 단백질의 변이체는 H107 (SEQ ID NO:9)로 명명된다. 따라서, 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 SEQ ID NO:9로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:9 (H107) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열, 및
상기 b)의 아미노산 서열은 SEQ ID NO:9와 동일한 면역원성 또는 적어도 동일한 면역원성을 갖는다.
H107 융합 단백질의 변이체는 H107e (SEQ ID NO:91)로 명명된다. 따라서, 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 SEQ ID NO:91로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다. 본 발명의 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:91 (H107e) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열, 및
상기 b) 아미노산 서열은 SEQ ID NO:91과 동일한 면역원성 또는 적어도 동일한 면역원성을 갖는다.
본 발명에 있어서 융합 단백질의 항원은 펩티드 링커와 같은 링커를 통해 연결될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질의 항원이 링커 분자와 연결된 융합 단백질에 관한 것이다.
융합 단백질 또는 항원의 생산을 가능하게 하기 위해, 정제를 허용하는 예를 들어 재조합 발현 시스템으로부터의 정제 태그를 포함할 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 정제 태그를 포함한다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것이고, 상기 정제 태그는 His-태그, 키틴 결합 단백질 (Chitin binding protein, CBP), 말토스 결합 단백질 (Maltose binding protien, MBP) 및 글루타티온-S-트랜스퍼라제 (Glutathione-S-transterase, GST)로 이루어진 군에서 선택된다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 정제 태그가 His-태그인 융합 단백질에 관한 것이다.
융합 단백질의 변이체에는 BCG+ 항원이 포함될 수 있다. 따라서, 본 발명의 구체예는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 융합 단백질은 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원을 포함한다. 본 발명의 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 BCG+ 항원을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 본 발명에 있어서 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질에 관한 것으로, 상기 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원은 Rv1886c (Ag85b), Rv3804c (Ag85a), Rv0288 (TB10.4), Rv0287 (EsxG), Rv3478 (PPE60), Rv0475 (HBHA), Rv3890c (EsxC), Rv3891c (EsxD), Rv1284 (CanA), Rv3019c (EsxR), Rv3020c (EsxS), Rv3017c (EsxQ), Rv2031c (HspX), Rv0983 (PepD), Rv1196 (PPE18), Rv2608 (PPE42), Rv3619 (EsxV) and Rv3620 (EsxW) 및 이의 변이체로부터 선택된다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 다음으로부터 선택되는 융합 단백질에 관한 것이다:
a) SEQ ID NO:10 (Ag85b), SEQ ID NO:11 (Ag85a), SEQ ID NO:12 (TB10.4), SEQ ID NO:13 (EsxG), SEQ ID NO:14 (PPE60), SEQ ID NO:15 (HBHA), SEQ ID NO:16 (EsxC), SEQ ID NO:17 (EsxD), SEQ ID NO:18 (CanA), SEQ ID NO:19 (EsxR), SEQ ID NO:20 (EsxS), SEQ ID NO:21 (EsxQ), SEQ ID NO:22 (HspX), SEQ ID NO:23 (PepD), SEQ ID NO:24 (PPE18), SEQ ID NO:25 (PPE42), SEQ ID NO:26 (EsxV) and SEQ ID NO:27 (EsxW) 및 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로 이루어진 군에서 선택된 아미노산, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
본 발명에 있어서 융합 단백질은 면역원성이며, 결핵 감염/또는 질병의 예방, 억제 또는 치료를 위한 백신 또는 면역원성 조성물에 효과적으로 사용될 수 있다. 이러한 백신 또는 면역원성 조성물은 예방적으로 또는 치료적으로 사용될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 측면은 본 발명에 있어서 융합 단백질을 포함하는 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이다.
백신 또는 면역원성 조성물의 최적의 성능을 보장하기 위해, 면역학적으로 및 약학적으로 허용되는 담체, 비히클 또는 아쥬반트를 포함하는 것이 바람직하다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 백신 또는 면역원성 조성물은 면역학적으로 약학적으로 허용되는 담체, 비히클 또는 아쥬반트를 추가로 포함한다. 본 발명의 또 다른 일 양태는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 백신 또는 면역원성 조성물은 하나 이상의 아쥬반트를 추가로 포함한다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 아쥬반트는 중성 아쥬반트 제형 (neutral adjuvant formulation), 음이온성 아쥬반트 제형 (anionic adjuvant formulation), 양이온성 아쥬반트 제형 (cationic adjuvant formulation), 양이온성 리포솜 (cationic liposome)(예를 들어, 디메틸-디-옥타데실암모늄 브로마이드 (dimethyl-di-octadecylammonium bromide, DDA), Quil A, QS21, poly I:C, 암모늄하이드록사이드 (aluminium hydroxide), 프로인트 불완전 아쥬반트, IFN-γ, IL-2, IL-12, 모노포스포릴 지질 A (MPL), 트레할로스 디미콜레이트 (Trehalose Dimycolate, TDM), 트레할로스 디베헤네이트 (Trehalose Dibehenate, TDB), 무라밀 디펩티드 (Muramyl Dipeptide, MDP), 모노마이콜릴 글리세롤 (monomycolyl glycerol, MMG), CpG 및 “IC31”또는 이들의 조합으로 이루어진 그룹에서 선택된다. 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 아쥬반트가 양이온성 아쥬반트 제제 1 (CAF01)인 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이다. 또 다른 바람직한 일 양태에서, 아쥬반트는 DDA, MMG 및 CpG를 포함하는 양이온성 아쥬반트 제제 10 (CAF10)이다. 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물에서 아쥬반트로서 사용될 수 있는 추가의 양이온성 아쥬반트 제형은 하기 표 1에 나타내었다:
CAF 아쥬반트 명명법.
Delivery system | Immunostimulators | ||||
Type | Surfactant(s) | Oil | CLR-ligand | TLR-ligand | Other |
CAF01 Liposome | DDA | - | TDB | - | - |
CAF04 Liposome | DDA | - | MMG | - | - |
CAF05 Liposome | DDA | - | TDB | Poly-IC | - |
CAF06 Liposome | DDA | - | TDB | MPL | - |
CAF09 Liposome | DDA | - | MMG | Poly-IC | - |
CAF10 Liposome | DDA | - | MMG | CpG | |
CAF11 Liposome | DDA | - | MMG | Flagellin | |
CAF19 Emulsion | DDA | Squalane | MMG | - | |
CAF24 Emulsion | DDA | Squalane | MMG | pIC |
약어: DDA; N,N-디메틸-N,N-디옥타데실암모늄 (N,N-dimethyl-N,N-dioctadecylammonium) (브롬화물 염). DSPC; 1,2-디스테아로일-sn-글리세로-3-포스포콜린 (1,2-Distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine). DSPE-PEG; 1,2-디스테아로일-sn-글리세로-3포스포에탄올아민-N-[카르복시(폴리에틸렌글리콜)-2000] 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N- [carboxy(polyethyleneglycol)-2000] (소듐 솔트). TDB; a,a-트레할로스 6,6'-디베헤네이트 (a,a-trehalose 6,6'-dibehenate). MMG; 합성 모노-마이콜릴 글리세롤 (Synthetic mono-mycolyl glycerol). 폴리-IC; 폴리이노신-폴리시티딜산 (Polyinosinic-polycytidylic acid )(소듐 솔트). CpG; 5'-C-포스페이트-G-3' 올리고뉴클레오티드 (5'-C-phosphate-G-3' oligonucleotide). MPL; 모노포스포릴 지질 A (Monophosphoryl lipid A).
본 발명에 있어서 융합 단백질은 독립형 백신으로 또는 BCG 백신과 조합하여 사용될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 BCG를 추가로 포함하는 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 측면은 본 발명에 있어서 독성 마이코박테리움에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병에 대한 대상체의 백신 접종 또는 면역화에 사용하기 위한 융합 단백질 또는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이다.
독성 마이코박테리아는 다양한 동물을 감염시킬 수 있으며 일부 설정에서는 예를 들어 농장 동물을 감염시킬 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이고, 상기 대상은 포유동물이다. 하지만, 본 발명에 있어서 융합 단백질 제공의 주요 목적은 인간의 결핵 감염 및/또는 질병에 대한 세계적인 도전과제를 퇴치하기 위한 현재 가능성을 개선하는 것이다. 따라서, 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이고, 상기 포유동물은 인간이다.
결핵은 다양한 독성 마이코박테리아에 의해 발생할 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이고, 상기 독성 마이코박테리움은 M.tuberculosis, M.bovis, M.africanum, M.canetti 및 M.microti, 바람직하게는 M.tuberculosis로 이루어진 군에서 선택된다. 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 독성 마이크로박테리움은 M.tuberculosis이다.
적용 방식은 다양할 수 있다. 백신의 임의의 통상적인 투여 방법이 적용가능하고 경구 제형, 좌약, 비경구 및 주사, 예를 들어 피하 또는 근육내를 포함하지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물은 경구, 비경구, 피하 및 근육내로 이루어진 군으로부터 선택된 경로에 의해 투여된다. 백신 투여량은 투여 경로에 따라 달라지며 예방 접종을 받는 사람의 나이와 예방 접종을 받는 사람의 크기에 따라 다르다.
융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물은 본 발명에 있어서 BCG 백신과 조합하여 투여될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이고, 상기 BCG는 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물의 투여 전, 동시 또는 후에 투여된다. 본 발명에 있어서 놀랍게도 BCG가 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물과 동시에 투여될 때, 높은 품질의 강력한 면역 반응을 일으키는 강력한 아쥬반트 효과를 제공할 수 있다. 따라서, 본 발명의 바람직한 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것이고, 상기 BCG는 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물의 투여와 동시에 투여된다. 본 발명의 추가 일 양태는 본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 관한 것으로, 상기 대상체는 이전에 BCG로 백신접종을 받은 적이 있다.
본 발명에 있어서 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물로서 BCG 백신과 함께 시너지 효과를 낼 수 있으며 쉽게 적용할 수 있도록 함께 공급될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 측면은 다음을 포함하는 키트에 관한 것이다:
i) 본 발명에 있어서 융합 단백질 또는 본 발명에 있어서 백신 또는 면역 조성물,
ii) BCG, 및
iii) 선택적으로 사용 지침.
본 발명의 일 양태는 본 발명에 있어서 i) 및 ii)가 동시, 개별 또는 순차 투여를 위한 것인 키트에 관한 것이다.
본 발명에 있어서 융합 단백질은 융합 단백질을 코딩하는 발현 벡터 작제물을 설계하고 적절한 재조합 발현 시스템에 발현 벡터를 도입함으로써 재조합적으로 생산될 수 있다. 따라서, 본 발명의 일 측면은 본 발명에 있어서 융합 단백질을 코딩하는 서열을 포함하는 핵산 서열에 관한 것이다.
본 발명의 다른 일 측면은 본 발명에 있어서 적합한 숙주에서 융합 단백질의 생산을 지시하는데 적합한 하나 이상의 제어 서열에 작동 가능하게 연결된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 재조합 발현 벡터에 관한 것이다.
본 발명의 추가적인 일 측면은 본 발명에 있어서 발현 벡터를 포함하는 재조합 숙주 세포에 관한 것이다.
본 발명에 있어서 융합 단백질의 생산에 적합한 발현 벡터는 SEQ ID NO:46 (ESAT-6), SEQ ID NO:47 (PPE68), SEQ ID NO:48 (espI), SEQ ID NO:49 (espC), SEQ ID NO:50 (espA), SEQ ID NO:51 (MPT64), SEQ ID NO:52 (MPT70), SEQ ID NO:53 (MPT83), SEQ ID NO:55 (Ag85b), SEQ ID NO:56 (Ag85a), SEQ ID NO:57 (TB10.4), SEQ ID NO:58 (EsxG), SEQ ID NO:59 (PPE60), SEQ ID NO:60 (HBHA), SEQ ID NO:61 (EsxC), SEQ ID NO:62 (EsxD), SEQ ID NO:63 (CanA), SEQ ID NO:64 (EsxR), SEQ ID NO:65 (EsxS), SEQ ID NO:66 (EsxQ), SEQ ID NO:67 (HspX), SEQ ID NO:68 (PepD), SEQ ID NO:69 (PPE18), SEQ ID NO:70 (PPE42), SEQ ID NO:71 (EsxV), SEQ ID NO:72 (EsxW), SEQ ID NO:73 (Rv2660c), SEQ ID NO:74 (Rv3614), SEQ ID NO:75 (Rv3865), SEQ ID NO:76 (Rv3849), SEQ ID NO:77 (Rv3872) 및 SEQ ID NO:78 (Rv3881), 및 이의 변이체로 이루어진 군으로부터 선택된 핵산을 포함할 수 있다.
또한, 선택된 융합 단백질은 SEQ ID NO:54 (H107), SEQ ID NO:79 (H107b), SEQ ID NO:80 (H107c), SEQ D NO: 92 (H107e), SEQ ID NO:81 (H106), SEQ ID NO:82 (H105) and SEQ ID NO:83 (H104) 및 이의 변이체로 이루어진 군으로부터 선택된 핵산에 의해 코딩될 수 있다.
표 2는 서열 번호 및 발현 패턴과 함께 항원 및 융합 단백질의 개요를 보여준다:
Antigen (or fusion protein) | Amino acid sequence | Nucleic acid sequence | Expression | BCG |
ESAT-6, Rv3875 | SEQ ID NO:1 | SEQ ID NO:46 | Early | - |
PPE68, Rv3873 | SEQ ID NO:2 | SEQ ID NO:47 | Early | - |
espI, Rv3876 | SEQ ID NO:3 | SEQ ID NO:48 | Early | - |
espC, Rv3615c | SEQ ID NO:4 | SEQ ID NO:49 | Early | - |
espA, Rv3616c | SEQ ID NO:5 | SEQ ID NO:50 | Early | - |
MPT64, Rv1980c | SEQ ID NO:6 | SEQ ID NO:51 | Unknown | - |
MPT70, Rv2875 | SEQ ID NO:7 | SEQ ID NO:52 | Late | - |
MPT83, Rv2873 | SEQ ID NO:8 | SEQ ID NO:53 | Late | - |
H107 | SEQ ID NO:9 | SEQ ID NO:54 | N/A | |
Ag85b, Rv1886c | SEQ ID NO:10 | SEQ ID NO:55 | Early | + |
Ag85a, Rv3804c | SEQ ID NO:11 | SEQ ID NO:56 | Early | + |
TB10.4, Rv0288 | SEQ ID NO:12 | SEQ ID NO:57 | Early | + |
EsxG, Rv0287 | SEQ ID NO:13 | SEQ ID NO:58 | Early | + |
PPE60, Rv3478 | SEQ ID NO:14 | SEQ ID NO:59 | Early | + |
HBHA, Rv0475 | SEQ ID NO:15 | SEQ ID NO:60 | Early | + |
EsxC, Rv3890c | SEQ ID NO:16 | SEQ ID NO:61 | Early | + |
EsxD, Rv3891c | SEQ ID NO:17 | SEQ ID NO:62 | Early | + |
CanA, Rv1284 | SEQ ID NO:18 | SEQ ID NO:63 | Early | + |
EsxR, Rv3019c | SEQ ID NO:19 | SEQ ID NO:64 | Early | + |
EsxS, Rv3020c | SEQ ID NO:20 | SEQ ID NO:65 | Early | + |
EsxQ, Rv3017c | SEQ ID NO:21 | SEQ ID NO:66 | Early | + |
HspX, Rv2031c | SEQ ID NO:22 | SEQ ID NO:67 | Late | + |
PepD, Rv0983 | SEQ ID NO:23 | SEQ ID NO:68 | Early | + |
PPE18, Rv1196 | SEQ ID NO:24 | SEQ ID NO:69 | Early | + |
PPE42, Rv2608 | SEQ ID NO:25 | SEQ ID NO:70 | Early | + |
EsxV, Rv3619 | SEQ ID NO:26 | SEQ ID NO:71 | Early | + |
EsxW, Rv3620 | SEQ ID NO:27 | SEQ ID NO:72 | Early | + |
Rv2660c | SEQ ID NO:28 | SEQ ID NO:73 | Late | + |
EspD, Rv3614 | SEQ ID NO:29 | SEQ ID NO:74 | Early | Unknown |
EspF, Rv3865 | SEQ ID NO:30 | SEQ ID NO:75 | Early | - |
EspR, Rv3849 | SEQ ID NO:31 | SEQ ID NO:76 | Early | Unknown |
PE35, Rv3872 | SEQ ID NO:32 | SEQ ID NO:77 | Early | - |
EspB, Rv3881 | SEQ ID NO:33 | SEQ ID NO:78 | Early | - |
H107b | SEQ ID NO:34 | SEQ ID NO:79 | N/A | |
H107c | SEQ ID NO:35 | SEQ ID NO:80 | N/A | |
H106 | SEQ ID NO:36 | SEQ ID NO:81 | N/A | |
H105 | SEQ ID NO:37 | SEQ ID NO:82 | N/A | |
H104 | SEQ ID NO:38 | SEQ ID NO:83 | N/A | |
H84 | SEQ ID NO:39 | SEQ ID NO:84 | N/A | |
H83 | SEQ ID NO:40 | SEQ ID NO:85 | N/A | |
H76 | SEQ ID NO:41 | SEQ ID NO:86 | N/A | |
H74 | SEQ ID NO:42 | SEQ ID NO:87 | N/A | |
H65 | SEQ ID NO:43 | SEQ ID NO:88 | N/A | |
H64 | SEQ ID NO:44 | SEQ ID NO:89 | N/A | |
H56 | SEQ ID NO:45 | SEQ ID NO:90 | N/A | |
H107e | SEQ ID NO:91 | SEQ ID NO:92 | N/A |
본 출원에 인용된 모든 특허 및 비특허 참고 문헌은 그 전체가 참고로 본 명세서에 포함된다.
본 발명의 일 측면 중 하나와 관련하여 설명된 실시예 및 특징은 본 발명의 다른 측면에도 적용된다는 점에 유의해야 한다. 본 발명의 실시예 및 특징은 또한 다음 항목에 요약되어 있다.
아이템 (Items)
1. 결핵균 (M. tuberculosis)에서 유래하는 2개 이상의 항원을 포함하는 융합 단백질.
2. 아이템 1에 있어서, 융합 단백질은 3개 이상의 항원, 4개 이상의 항원, 5개 이상의 항원, 6개 이상의 항원, 7개 이상의 항원, 8개 이상의 항원을 포함한다.
3. 아이템 1 또는 아이템 2에 있어서, 융합 단백질이 초기 및 후기 항원 둘 다를 포함하는 융합 단백질.
4. 선행 아이템 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 항원이 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 융합 단백질.
5. 선행 아이템 중 어느 하나에 있어서, 항원이 BCG에서 결실되거나, 비-분비되거나, 또는 BCG에서 저발현을 갖는 것인 융합 단백질.
6. 전 아이템 중 어느 한 아이템에 기재된 융합 단백질, 상기 항원은 Rv3875 (ESAT-6), Rv3873 (PPE68), Rv3876 (espI), Rv3615c (espC), Rv3616c (espA), Rv1980c (MPT64), Rv2875 (MPT70) and Rv2873 (MPT83) 및 이의 변이체로 이루어진 군으로부터 선택된다.
7. 전 아이템 중 어느 한 아이템에 기재된 융합 단백질, 상기 항원은 다음으로부터 선택된다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70) and SEQ ID NO:8 (MPT83) 및 이의 변이체 또는 면역원성 조성물, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
8. 전 아이템 중 어느 한 아이템에 기재된 융합 단백질, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), and SEQ ID NO:5 (espA) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 조성물, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
9. 전 아이템 중 어느 한 아이템에 기재된 융합 단백질, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), and SEQ ID NO:8 (MPT83) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 조성물, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
10. 아이템 7 내지 아이템 9 중 어느 하나에 따른 융합 단백질, 상기 b)의 아미노산 서열은 a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대하여 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 %이 이상의 서열 동일성을 갖는다.
11. 선행 아이템 중 어느 하나에 있어서, 융합 단백질은 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어 5개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함한다.
12. 선행 아이템 중 어느 하나에 있어서, 상기 융합 단백질은 4개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함한다.
13. 아이템 11 또는 아이템 12에 따른 어느 하나의 융합 단백질에 있어서, 상기 ESAT-6 반복부는 ESAT-6과 상이한 하나 이상의 항원에 의해 분리된다.
14. 아이템 11 내지 13에 따른 어느 하나의 융합 단백질에 있어서, 상기 ESAT-6 반복부는 ESAT-6과 상이한 항원과 교대로 위치한다.
15. 선행 아이템 중 어느 한 아이템에 따른 융합 단백질에 있어서, 상기 융합 단백질은 다음을 포함한다:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), and SEQ ID NO:8 (MPT83) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열; 및
상기 융합 단백질은 ESAT-6과 상이한 항원과 교대로 위치하는 4개의 ESAT-6 반복부를 포함한다.
19. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 다음의 그룹으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 아미노산 서열을 포함하는 것인 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38 또는 SEQ ID NO:91 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프; 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 SEQ ID NO:9 or SEQ ID NO:91를 포함하는 것인, 융합 단백질.
21. 제1항 내지 20항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된 핵산 서열에 의해 코딩되는 것인, 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:54 (H107), SEQ ID NO:79 (H107b), SEQ ID NO:80 (H107c), SEQ ID NO:92 (H107e) SEQ ID NO:81 (H106), SEQ ID NO:82 (H105) and SEQ ID NO:83 (H104) 및 이의 변이체 또는 이의 단편; 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
22. 선행 아이템 중 어느 하나에 있어서, 상기 융합 단백질의 항원은 링커 분자와 연결된다.
23. 선행 아이템 중 어느 하나에 있어서, 상기 융합 단백질은 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원을 포함한다.
24. 아이템 23에 따른 융합 단백질에 있어서, 상기 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원은 Rv1886c (Ag85b), Rv3804c (Ag85a), Rv0288 (TB10.4), Rv0287 (EsxG), Rv3478 (PPE60), Rv0475 (HBHA), Rv3890c (EsxC), Rv3891c (EsxD), Rv1284 (CanA), Rv3019c (EsxR), Rv3020c (EsxS), Rv3017c (EsxQ), Rv2031c (HspX), Rv0983 (PepD), Rv1196 (PPE18), Rv2608 (PPE42), Rv3619 (EsxV) 및 Rv3620 (EsxW), 및 이의 변이체로 이루어진 군에서 선택된다.
25. 아이템 23 또는 아이템 24에 따른 융합 단백질에 있어서, 상기 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원은 다음으로부터 선택된다:
SEQ ID NO:10 (Ag85b), SEQ ID NO:11 (Ag85a), SEQ ID NO:12 (TB10.4), SEQ ID NO:13 (EsxG), SEQ ID NO:14 (PPE60), SEQ ID NO:15 (HBHA), SEQ ID NO:16 (EsxC), SEQ ID NO:17 (EsxD), SEQ ID NO:18 (CanA), SEQ ID NO:19 (EsxR), SEQ ID NO:20 (EsxS), SEQ ID NO:21 (EsxQ), SEQ ID NO:22 (HspX), SEQ ID NO:23 (PepD), SEQ ID NO:24 (PPE18), SEQ ID NO:25 (PPE42), SEQ ID NO:26 (EsxV) 및 SEQ ID NO:27 (EsxW) 및 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로 이루어진 그룹에서 선택된 아미노산, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열.
26. 선행 아이템 중 어느 하나에 따른 융합 단백질을 포함하는 백신 또는 면역원성 조성물.
27. 아이템 26에 따른 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 백신 또는면역원성 조성물은 하나 이상의 아쥬반트를 추가로 포함한다.
28. 아이템 27에 따른 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 아쥬반트는 중성 아쥬반트 제형, 음이온성 아쥬반트 제형, 양이온성 아쥬반트 제형, 양이온성 리포솜 (예를 들어, 디메틸디옥타데실암모늄 브로마이드(DDA)), Quil A, QS21, poly I:C, 알루미늄 하이드록사이드, 프로인트 불완전 아주반트, IFN-γ, IL-2, IL-12, 모노포스포릴 지질 A (MPL), 트레할로스 디미콜레이트 (TDM), 트레할로스 디베헤네이트(TDB), 무라밀 디펩티드 (MDP), 모노마이콜릴 글리세롤(MMG), CpG 및 "IC31", 또는 이들의 조합으로 이루어진 군에서 선택된 것이다.
29. 아이템 26 중 어느 하나에 따른 백신 또는 면역원성 조성물.
28. 상기 백신 또는 면역원성 조성물은 BCG를 추가로 포함한다.
30. 독성 마이크로박테리움에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병에 대한 대상체의 백신 접종 또는 면역화에 사용하기 위한 아이템 1 내지 25 중 어느 하나에 따른 융합 단백질 또는 아이템 26 내지 29 중 어느 하나테 따른 백신 또는 면역원성 조성물.
31. 아이템 30에 있어서, 대상체가 포유동물인 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
32. 아이템 31에 따라 사용하기 위한 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 포유동물은 인간이다.
33. 아이템 30 내지 32 중 어느 하나에 따라 사용하기 위한 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 독성 마이코박테리움은 M. tuberculosis, M. bovis, M. africanum, M. canetti, 및 M. microti, 바람직하게는 M. tuberculosis로 이루어진 군으로부터 선택된다.
34. 아이템 30 내지 33중 어느 하나에 따라 사용하기 위한 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 BCG는 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물의 투여 전, 동시 또는 후에 투여된다.
35. 아이템 34에 따라 사용하기 위한 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 BCG는 융합 단백질, 백신 또는 면여권성 조성물의 투여와 동시에 투여된다.
36. 아이템 30 내지 35 중 어느 하나에 따라 사용하기 위한 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물에 있어서, 상기 대상체는 이전에 BCG로 예방접종을 받은 적이 있다.
37. 다음을 포함하는 키트:
i) 아이템 1 내지 25 중 어느 하나에 따른 융합 단백질 또는 아이템 26 내지 29 중 어느 하나에 따른 백신 또는 면역원성 조성물,
ii) BCG, 및
iii) 선택적으로 사용 지침.
38. 아이템 37에 있어서, i) 및 ii)는 동시, 개별 또는 순차 투여를 위한 것인 키트.
39. 아이템 1 내지 25 중 어느 하나에 따른 융합 단백질을 코딩하는 서열을 포함하는 핵산 서열.
40. 적합한 숙주에서 융합 단백질의 생산을 지시하기에 적합한 하나 이상의 제어 서열에 작동가능하게 연결된 아이템 39에 따른 뉴클레오티드 서열을 포함하는 재조합 발현 벡터.
41. 아이템 40에 따른 발현 벡터를 포함하는 재조합 숙주 세포.
본 발명은 결핵 복합체의 종에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병을 예방, 억제 또는 치료하기 위한 결핵균 유래 항원성 폴리펩티드에 기초한 융합 단백질에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 BCG 및/또는 ESAT-6 반복부에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는 항원을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다. 융합 단백질은 초기 및 후기 항원의 조합을 포함할 수 있다. 또한, 본 발명은 융합 단백질을 포함하는 백신, 면역원성 조성물 및 약제학적 조성물에 관한 것이다.
도 1은 M.bovis BCG 데니쉬 (BCG-항원)에 대한 T 세포 반응을 유도하지 않는 선택된 항원의 면역 인식을 보여준다. (A) M.bovis BCG 데니쉬 예방접종 (Immunization), (B) M.tuberculosis Erdman 감염, 또는 (C) 개별 항원을 사용한 예방접종 후의 면역 반응.
도 2는 BCG-항원을 포함하는 선택된 융합 단백질의 개략도를 보여준다.
도 3은 본 발명에 있어서 추가의 선택된 융합 단백질의 개략적인 개요를 보여준다.
도 4는 Mtb 감염 동안 ESAT-6 및 MPT70의 면역 동역학 인식을 보여준다. (A) 항원 특이적 인터페론-γ 방출 또는 (B) 항원 특이적 CD4 T 세포의 빈도의 배수 증가는 Mtb Erdman 감염 후 3, 12 및 20주에 폐에서 측정되었다.
도 5는 후기 발현 항원을 함유하는 백신이 장기간 보호를 유도함을 보여준다. H104 또는 H105로 면역되거나 식염수가 주사된 Mtb 감염 동물의 폐 CFU (A) 4주 및 (B) 에어로졸 Mtb 감염 후 18주 (C) H105에는 MPT64, MPT70 및 MPT83 항원이 포함된다.
도 6은 BCG와 H107/CAF01의 동시 투여가 두 가지 백신 접종 모델에서 특정 H107 면역 반응을 증가시켰음을 보여준다. H107 특이적 CD4 T 세포의 빈도는 (A) 표준 예방 모델 및 (B) BCG 재접종 모델은 M.bovis BCG 데니쉬를 H107 백신을 투여하기 12개월 전에 투여하였다.
도 7은 융합 단백질이 BCG-항원 (H107) 또는 BCG+항원 (H65)을 포함하는지 여부에 따라 BCG 공동 투여가 융합 단백질 특이적 CD4 T 세포의 분화에 영향을 미친다는 것을 보여준다. (A) Seder et al(2008)에서 채택한 단일 세포에 의한 사이토카인 발현을 기반으로 한 T 세포 분화를 보여주는 개요 (B) 사이토카인 IFN-γ, TNF-α 및/또는 IL-2의 단일 세포 발현을 기반으로 한 비장에 위치한 CD4 세포의 사이토카인 발현 프로필 (C) KLRG1을 발현하는 융합 단백질 특이적 CD4 T 세포의 빈도.
도 8은 BCG-항원 (H107)을 함유하는 융합 단백질이 BCG와 함께 투여될 때 Mtb 감염에 대한 보호가 증가되었음을 나타낸다. Mtb Erdman 감염 후 폐 CFU의 4주(A) 및 18주(B).
도 9는 M.bovis BCG 및 CAF01에서 제형화된 H104-H107 융합 단백질을 사용한 공동 백신 접종이 Mtb 감염에 대한 상당한 보호를 유도함을 보여준다. Mtb Erdman 감염 4주 후의 폐 CFU를 보여준다.
도 10은 백신 제형에 유리 ESAT-6 단백질의 첨가가 백신 프라이밍 된 면역 반응을 증가시키지 않았고 Mtb 감염 후 마이코박테리아 수를 감소 시키지 않았음을 보여준다. ESAT-6 특이적 CD4 T 세포의 수는 (A) 면역화 3주 후 및 (B) Mtb 감염 3주 후 백신 접종 그룹에서 결정되었다. (C) 6주 감염 후 폐에서 마이코박테리아의 수가 결정되었다.
도 11은 융합 단백질에서 ESAT-6을 반복하면 ESAT-6에 대한 면역 반응이 증가하고 예방 백신 접종 모델에서 더 나은 보호를 제공한다는 것을 보여준다. (A) 항원 특이적 반응은 면역화 3주 후 비장에서 H64 (1개의 ESAT-6 카피) 및 H76 (5개의 ESAT-6 카피) 면역화 후에 측정되었다.(B) Mtb 감염 6주 후 폐에서 마이코박테리아 수를 측정했다.
도 12는 융합 분자에서 ESAT-6를 반복하는 것이 감염 부위에 대한 ESAT-6 특이적 T 세포의 리크루먼트 (recruitment)를 개선하고 노출 후 백신 접종 모델에서 배신의 보호 효능을 개선함을 보여준다. Mtb Erdman에 감염된 동물은 항생제로 치료하였다. 치료 종료 2주 전에 H83/CAF01 (1개의 ESAT-6 카피) 및 H84/CAF01 (4개의 ESAT-6 카피)을 사용한 면역화가 시작되었다. (A) 면역화 2주 후 폐에서 ESAT-6 특이적 CD4 T 세포의 수. (B) 감염 22주 및 35주 후(마지막 면역 접종 후 6주 및 19주) 폐의 마이코박테리아 수.
도 13은 융합 단백질에서 반복되는 ESAT-6이 면역 반응을 증가시키고 백신의 보호 효능을 개선함을 보여준다. (A) 백신 접종된 129sc 마우스 및 (B) CB6F1 마우스로부터 분리된 비장에서의 특정 ESAT-6 반응. (C) BCG 및 소단위 공동 면역화된 마우스의 비장에서의 ESAT-6 특이적 면역 반응 및 4주 감염 후 폐에서의 보호 효능.
도 14는 CAF01 아주반트에서 제형화된 H107 융합 단백질이 CAF01에서 제형화된 H56보다 우수한 백신임을 보여준다. 보호 효능 (Δlog10CFUsaline-log10CFUimmunized) 은 Mtb 감염 4주에서 12주 후에 폐에서 결정되었다. 결과는 5개의 독립적인 실험에서 수집된 데이터이다.
도 15는 첫 번째 예방 접종 후 이미 3주 (두번째 H107 후 1주) TB10.4 반응의 증가는 BCG 단독과 비교하여 BCG+H107 그룹에서 관찰되었으며, 이는 H107+BCG 동시 투여가 BCG 특이적 면역 반응을 증가시키고 따라서 H107이 BCG에 대한 아쥬반트로 작용함을 의미한다.
도 16은 H107 및 H107e 융합 단백질의 조성의 개략도를 나타낸다. 도 16A는 E.coli로부터의 H107 및 H107e 융합 단백질 발현의 SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯을 나타낸다. H107e는 H107에 비해 단백질 발현이 증가하였다.
도 17은 BCG로 공동 백신접종한 후 사이토카인을 발현하는 CD4 T 세포 (도 17A, 왼쪽) 및 ELISA에 의한 IFNγ 방출 (도 17A, 오른쪽) 둘 모두에 의해 측정된 면역원성. H107과 H107e는 유사한 정도의 면역 반응을 유도한다. 도 17B는 H107e가 H107과 동일한 개별 항원에 대한 면역 반응을 유도함을 보여준다. 도 17C는 감염 후 H107e가 BCG와 유사하거나 더 나은 보호를 제공하고 BCG+H107e 공동 백신접종이 BCG 및 H107e 단독과 비교하여 보호에서 상당한 증가를 유도한다는 것을 보여준다. 도 17D는 BCG-메모리 마우스에서 H107e(BCG-) 백신접종이 H65 (BCG+)에 비해 덜 분화된 CD4 T 세포 (더 나은 품질)를 유도 한다는 것을 보여주고, 기능적 분화 점수, FDS 및 CD4 T 세포를 생산하는 IL-17의 비율에 의해 측정된다.
본 발명은 이제 하기에서 더 상세히 설명될 것이다.
도 2는 BCG-항원을 포함하는 선택된 융합 단백질의 개략도를 보여준다.
도 3은 본 발명에 있어서 추가의 선택된 융합 단백질의 개략적인 개요를 보여준다.
도 4는 Mtb 감염 동안 ESAT-6 및 MPT70의 면역 동역학 인식을 보여준다. (A) 항원 특이적 인터페론-γ 방출 또는 (B) 항원 특이적 CD4 T 세포의 빈도의 배수 증가는 Mtb Erdman 감염 후 3, 12 및 20주에 폐에서 측정되었다.
도 5는 후기 발현 항원을 함유하는 백신이 장기간 보호를 유도함을 보여준다. H104 또는 H105로 면역되거나 식염수가 주사된 Mtb 감염 동물의 폐 CFU (A) 4주 및 (B) 에어로졸 Mtb 감염 후 18주 (C) H105에는 MPT64, MPT70 및 MPT83 항원이 포함된다.
도 6은 BCG와 H107/CAF01의 동시 투여가 두 가지 백신 접종 모델에서 특정 H107 면역 반응을 증가시켰음을 보여준다. H107 특이적 CD4 T 세포의 빈도는 (A) 표준 예방 모델 및 (B) BCG 재접종 모델은 M.bovis BCG 데니쉬를 H107 백신을 투여하기 12개월 전에 투여하였다.
도 7은 융합 단백질이 BCG-항원 (H107) 또는 BCG+항원 (H65)을 포함하는지 여부에 따라 BCG 공동 투여가 융합 단백질 특이적 CD4 T 세포의 분화에 영향을 미친다는 것을 보여준다. (A) Seder et al(2008)에서 채택한 단일 세포에 의한 사이토카인 발현을 기반으로 한 T 세포 분화를 보여주는 개요 (B) 사이토카인 IFN-γ, TNF-α 및/또는 IL-2의 단일 세포 발현을 기반으로 한 비장에 위치한 CD4 세포의 사이토카인 발현 프로필 (C) KLRG1을 발현하는 융합 단백질 특이적 CD4 T 세포의 빈도.
도 8은 BCG-항원 (H107)을 함유하는 융합 단백질이 BCG와 함께 투여될 때 Mtb 감염에 대한 보호가 증가되었음을 나타낸다. Mtb Erdman 감염 후 폐 CFU의 4주(A) 및 18주(B).
도 9는 M.bovis BCG 및 CAF01에서 제형화된 H104-H107 융합 단백질을 사용한 공동 백신 접종이 Mtb 감염에 대한 상당한 보호를 유도함을 보여준다. Mtb Erdman 감염 4주 후의 폐 CFU를 보여준다.
도 10은 백신 제형에 유리 ESAT-6 단백질의 첨가가 백신 프라이밍 된 면역 반응을 증가시키지 않았고 Mtb 감염 후 마이코박테리아 수를 감소 시키지 않았음을 보여준다. ESAT-6 특이적 CD4 T 세포의 수는 (A) 면역화 3주 후 및 (B) Mtb 감염 3주 후 백신 접종 그룹에서 결정되었다. (C) 6주 감염 후 폐에서 마이코박테리아의 수가 결정되었다.
도 11은 융합 단백질에서 ESAT-6을 반복하면 ESAT-6에 대한 면역 반응이 증가하고 예방 백신 접종 모델에서 더 나은 보호를 제공한다는 것을 보여준다. (A) 항원 특이적 반응은 면역화 3주 후 비장에서 H64 (1개의 ESAT-6 카피) 및 H76 (5개의 ESAT-6 카피) 면역화 후에 측정되었다.(B) Mtb 감염 6주 후 폐에서 마이코박테리아 수를 측정했다.
도 12는 융합 분자에서 ESAT-6를 반복하는 것이 감염 부위에 대한 ESAT-6 특이적 T 세포의 리크루먼트 (recruitment)를 개선하고 노출 후 백신 접종 모델에서 배신의 보호 효능을 개선함을 보여준다. Mtb Erdman에 감염된 동물은 항생제로 치료하였다. 치료 종료 2주 전에 H83/CAF01 (1개의 ESAT-6 카피) 및 H84/CAF01 (4개의 ESAT-6 카피)을 사용한 면역화가 시작되었다. (A) 면역화 2주 후 폐에서 ESAT-6 특이적 CD4 T 세포의 수. (B) 감염 22주 및 35주 후(마지막 면역 접종 후 6주 및 19주) 폐의 마이코박테리아 수.
도 13은 융합 단백질에서 반복되는 ESAT-6이 면역 반응을 증가시키고 백신의 보호 효능을 개선함을 보여준다. (A) 백신 접종된 129sc 마우스 및 (B) CB6F1 마우스로부터 분리된 비장에서의 특정 ESAT-6 반응. (C) BCG 및 소단위 공동 면역화된 마우스의 비장에서의 ESAT-6 특이적 면역 반응 및 4주 감염 후 폐에서의 보호 효능.
도 14는 CAF01 아주반트에서 제형화된 H107 융합 단백질이 CAF01에서 제형화된 H56보다 우수한 백신임을 보여준다. 보호 효능 (Δlog10CFUsaline-log10CFUimmunized) 은 Mtb 감염 4주에서 12주 후에 폐에서 결정되었다. 결과는 5개의 독립적인 실험에서 수집된 데이터이다.
도 15는 첫 번째 예방 접종 후 이미 3주 (두번째 H107 후 1주) TB10.4 반응의 증가는 BCG 단독과 비교하여 BCG+H107 그룹에서 관찰되었으며, 이는 H107+BCG 동시 투여가 BCG 특이적 면역 반응을 증가시키고 따라서 H107이 BCG에 대한 아쥬반트로 작용함을 의미한다.
도 16은 H107 및 H107e 융합 단백질의 조성의 개략도를 나타낸다. 도 16A는 E.coli로부터의 H107 및 H107e 융합 단백질 발현의 SDS-PAGE 및 웨스턴 블롯을 나타낸다. H107e는 H107에 비해 단백질 발현이 증가하였다.
도 17은 BCG로 공동 백신접종한 후 사이토카인을 발현하는 CD4 T 세포 (도 17A, 왼쪽) 및 ELISA에 의한 IFNγ 방출 (도 17A, 오른쪽) 둘 모두에 의해 측정된 면역원성. H107과 H107e는 유사한 정도의 면역 반응을 유도한다. 도 17B는 H107e가 H107과 동일한 개별 항원에 대한 면역 반응을 유도함을 보여준다. 도 17C는 감염 후 H107e가 BCG와 유사하거나 더 나은 보호를 제공하고 BCG+H107e 공동 백신접종이 BCG 및 H107e 단독과 비교하여 보호에서 상당한 증가를 유도한다는 것을 보여준다. 도 17D는 BCG-메모리 마우스에서 H107e(BCG-) 백신접종이 H65 (BCG+)에 비해 덜 분화된 CD4 T 세포 (더 나은 품질)를 유도 한다는 것을 보여주고, 기능적 분화 점수, FDS 및 CD4 T 세포를 생산하는 IL-17의 비율에 의해 측정된다.
본 발명은 이제 하기에서 더 상세히 설명될 것이다.
본 발명은 이제 다음의 비제한적인 실시예에서 더욱 상세하게 설명될 것이다.
실시예
실시예 1: BCG 백신은 H104-H107 융합 단백질의 결핵균 항원에 대한 면역 반응을 프라이밍하지 않는다
재료 및 방법
6 내지 10 주령 암컷 CB6F1 마우스를 M.bovis BCG 데니쉬로 면역화 시키거나 에어로졸 경로를 통해 25 내지 50 CFU의 독성 Mtb Erdman으로 감염시키거나 총 부피 200 uL의 양이온성 아쥬반트 제형 1 (CAF01)로 제형화된 단일 단백질 2 ug으로 3회 면역시켰다. 각 단백질 백신은 2주 간격으로 투여되었다. BCG 면역화 후 10 주 또는 Mtb 감염 후 18 주 또는 마지막 단일 단백질 면역화 후 2주에, 비장을 100 um 세포 여과기에 통과시켜 개별 동물로부터 비장 세포의 단일 세포 현??액을 얻었다. 세포를 RPMI로 2회 세척한 후 각 비장에서 얻은 세포 수를 측정하고 2 x 106 cells/ml로 조정하였다. 세포를 자극하기 위해 100 uL (2 x 105 세포)을 96-웰 플레이트의 개별 웰에 분취하고 정제된 재조합 단일 Mtb 항원 (2 ug/ml)을 추가하였다. RPMI 배지를 사용하여 웰당 총 부피를 200 uL로 조정하고, 세포를 CO2 인큐베이터에서 37 ℃, 3 내지 5일 동안 개별 항원과 함께 인큐베이션을 하였다. 이때 사이토카인 IFN-γ의 농도를 세포 상층액에서 샌드위치 ELISA로 측정하였다.
결과
비-BCG (BCG-) 항원을 사용하는 소단위 백신을 설계하기 위해 잠재적인 항원 후보의 하위 집합을 선택하고 BCG 백신 접종 후 면역 반응을 일으켰는지 여부를 조사하였다. 마우스로부터 단리된 비장세포는 재조합 단백질로서 정제된 표시된 단일 항원 (2 ug/ml)으로 자극되었다 (실시예 2 참조). 자극 후, 배지로의 사이토카인 IFN-γ의 세포 방출을 측정하였다. 항원 없이 배양된 세포의 배지에서 측정된 사이토카인 IFN-γ농도 (“없음”)는 자극되지 않은 세포에 대한 기준선을 설정하였다. BCG 면역 동물에서 항원 후보 중 어느 것도 면역 반응을 일으키지 않았다 (도 1A). 대조적으로, BCG에 의해 발현되는 TB10.4 항원은 상당한 면역 반응을 일으켰다 (도 1A). Mtb에 감염된 동물에서 모든 항원은 면역 반응을 일으켜 이러한 항원이 Mtb 감염 동안 면역 원성과 발현 됨을 확인하였다 (도 1B). 유사하게, 개별 단백질로 백신을 접종한 동물에서 모든 항원은 면역 반응을 일으켜 이러한 항원이 CB6F1 마우스 균주에서 면역원성임을 입증하였다 (도 1C).
결론
M.bovis BCG 데니쉬 예방접종은 8가지 백신 항원 후보 중 어느 것에 대해서도 세포 면역 반응을 유도하지 않았다. 대조적으로, 모든 항원 후보는 Mtb 감염 또는 단일 단백질 면역화 후에 면역 반응을 일으켰다. 따라서, H104-107의 항원은 M.bovis BCG 데니쉬와 항원을 공유하지 않으며, Mtb에 특이적이다. 본 발명에 있어서 이러한 항원은 BCG- 항원으로 지칭된다. 대조적으로, BCG 면역화가 T 세포 반응을 일으키는 항원은 본 발명에 있어서 BCG+ 항원, 예를 들어, TB10.4로 지칭된다.
실시예 2: 융합 단백질의 구성
재료 및 방법
단일 및 융합 단백질을 인코딩하는 유전자는 Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv의 공개된 게놈 서열에서 번역된 단백질 서열을 기반으로 합성적으로 만들어 졌다. 합성 DNA 서열은 대장균 (E.coli)에서의 발현을 위해 최적화된 코돈이었고, 유도성 프로모터 T7 프로모터의 제어하에 pJ411 발현 벡터에 클로닝되었고, 대장균으로 형질전환 되었다. pJ411 벡터는 삽입된 재조합 단백질에 대한 코딩 서열과 프레임 내 N-말단 His-tag를 코딩한다. 각 단백질에 대해, 시험관 내 배양이 ~0.5 OD600의 밀도에 도달할 때 His 태그에 붙은 재조합 단백질의 발현이 유도되었다. 다음날 박테리아를 수거하여 용해하고 3단계 정제 공정을 사용하여 재조합 단백질을 정제했다. 여기에는 침전된 재조합 단백질 (봉입체)에서 가용성 대장균 단백질 제거, 고정된 금속 친화성 크로마토그래피 및 단백질 전하에 따라 음이온 또는 양이온 교환이 포함된다. 정제 후, 정제된 단백질의 정체는 질량 분광법으로 확인하였고 순도는 Coomassie 염색 SDS-gel을 스캔하여 확인하였다. 마지막으로, 단백질 농도를 측정하였다.
결과
실시예 1의 결과를 바탕으로 BCG- 항원과의 융합 단백질을 설계하였다. 재조합 융합 단백질의 선택든 (도 2 및 3)에 개략적으로 설명되어 있다. 6 L 시작 배양에서 정제된 융합 단백질의 수율은 0.6 mg에서 20 mg까지 다양하였다. 정제된 단백질의 농도는 0.2 mg/ml에서 0.7 mg/ml까지 다양하였다. 순도는 95 % 이상이었다.
결론
모든 단일 및 융합 단백질은 백신에 적합한 항원이 되고 하기 실시예에 기재된 모든 필요한 면역화 및 세포 자극을 수행하기에 충분한 양 및 품질로 생산되었다.
실시예 3: MTP70은 말기 Mtb 감염 동안 발현이 상향 조절되는 항원, 즉 “후기 항원”이다
재료 및 방법
암컷 CB6F1 마우스를 20 내지 50 CFU 악성 Mtb Erdman으로 에어로졸 감염시켰다. 3주, 12주 및 20주 후 마우스를 면역학적 분석을 위해 희생시켰다. T-튜브 GentleMACS(Miltenyi Biotec)를 사용하여 폐를 약간 균질화하고 콜라게나제 IV (Sigma-Aldrich)를 사용하여 37 ℃에서 30 내지 60분동안 소화시켰다. 조직을 100 um 세포 여과기에 통과시켜 단일 세포 현탁액을 얻었다. 세포는 세포내 사이토카인 염색 (ICS) 및 ELISA를 위한 항원 자극 전에 RPMI로 2회 세척하였다.
ICS: 총 1 내지 2 x 106 세포는 인큐베이션 후 세포를 4 ℃로 냉각시키는 자동화 히터에서 37 ℃의 10 ug/ml brefeldin A (Sigma-Aldrich) 존재하에 5시간 동안 RPMI + 5 μg의 ESAT-6 또는 MPT70 퍼프믹스를 포함 또는 포함하지 않는 항-CD49d 및 1 ug/ml 항-CD28 및 항-CD49d를 포함하는 10 % FCS에서 1시간 동안 시험관 내에서 자극되었다. 다음날, 세포를 FACS 완충액 (1 % FCS를 포함하는 1 x PBS)에서 세척하고 항-CD3, 항-CD4 및 항-CD44를 사용하여 표면 마커에 대해 4 ℃에서 염색하였다. 15 내지 30분 정도 표면을 염색 후, 세포를 FACS 완충액으로 세척하고, 제조업체의 지침에 따라 Cytofix/Cytoperm 키트 (BD)를 사용하여 투과성으로 만들고, 항-IFN-γ, 항-TNF-α, 항-IL-2, 항-IL-17A로 세포내를 염색하였다. 이후에 세포를 세척하고 FACS 완충액에 재현탁하고 LSR FACS Fortessa (BD)로 분석하였다. 모든 유세포 분석 데이터는 Flow Jo 소프트웨어 v.10 (Tree Star, Ashland, OR, USA)으로 분석되었다.
ELISA: 폐 세포는 37 ℃ 및 5 % CO2에서 ESAT-6 또는 MPT70 pepmix로 자극되었다. 3일 후, 배양 상청액의 샌드위치 ELISA로 분비된 IFN-γ를 측정하였다.
결과
Mib 감염 3주 후 IFN-γ ELISA (도 4A) 및 사이토카인 분비 CD4 T 세포 (도 4B) 모두에 의해 측정된 실질적인 ESAT-6 반응이 있었다. 그러나 이 시점에서 MPT70에 대한 면역 반응은 없었다. 감염 12 주 후 MPT70에 대한 작지만 감지 가능한 면역 반응이 20주차에 증가하였다. 이는 ESAT-6을 “초기 항원”으로, MPT70을 “후기 항원”으로 지원하며, 이는 감염의 후기/만성 단계에서 면역 인식을 특징으로 한다.
결론
ESAT-6 및 MPT70에 대한 면역 반응의 동역학은 BCG-항원 내에서 ESAT-6이 “초기 항원”인 반면 MPT70은 말기 감염 동안 발현이 상향 조절되는 “말기 항원”임을 뒷받침한다.
실시예 4: 후기 항원은 장기간 보호를 향상 시킨다
재료 및 방법
마우스 그룹을 총 부피 200 L의 양이온성 아쥬반트 1 (CAF01)로 제형화된 2 ug의 융합 단백질로 3회 면역화시켰다. 각 백신 접종 라운드는 2주로 구분되었다. 3차 면역화 6주 후, 모든 동물에 결핵균 균주 Erdman으로 에어로졸 챌린지 (20 내지 50 CFU)를 가하였다. 4주 또는 18주 후에 폐 균질액의 연속 희석액을 플레이팅하여 개별 폐에서 마이코박테리아의 수를 측정하였다.
결과
장기간 보호를 위한 “후기 항원”의 중요성을 테스트하기 위해, 초기 및 후기 단계 항원 (H105)(SEQ ID NO:37)을 모두 포함하는 융합 단백질로 면역화된 감염된 동물의 박테리아성 로드 (load)를 초기 발현 항원 (H104)(SEQ ID NO:38)만을 함유하는 융합 단백질로 면역화된 감염된 동물과 비교하였다 (도 5A). 감염의 만성 단계 (18주)에서 H105가 후기 항원이 없는 H104보다 더 나은 보호를 제공하였기 때문에 후기 항원을 추가하면 차이가 생겼다 (p=0.044)(도 5B).
결론
백신에 후기 항원을 포함하면 장기적인 보호/억제를 향상 시킬 수 있다 (도 5).
실시예 5: BCG
-
항원은 매우 효과적이며, BCG
+
항원과 달리 BCG와 “상승적으로”작용한다
재료 및 방법
CB6F1 마우스 그룹 (n=4)은 먼저 BCG s.c.를 투여함으로써 H107 및 BCG (BCG+H107)로 공동 면역화되었다. 꼬리 기저부의 왼쪽에 다음 날 동일한 주사 부위에 CAF01 중 1㎍ H107 (SEQ ID NO: 9) 을 투여하였다. 동물은 2주 (오른쪽) 및 4주 (왼쪽) 후에 H107로 다시 백신 접종을 받았다. 마지막 면역화 2주 후 동물을 안락사 시키고 비장을 100 um 세포 여과기에 통과시켜 단일 세포 현탁액을 얻었다. 이번에는 항-KMRG1이 표면 염색에 포함되었다는 점을 제외하고는 실시예 3에 기재된 바와 같이 ICS에 대한 항원 자극 전에 세포를 RPMI로 2회 세척하였다. 두 번째 실험에서 작은 식염수 대조군 (n=4)을 제외한 모든 동물은 M.bovis BCG 데니쉬 면역화를 하고, 12개월 동안 휴식을 취했다. 이 시점에서 BCG 면역화된 동물을 4개의 그룹 (그룹당 n=4)으로 나누고 M.bovis BCG로 1회 또는 H107/CAF01 또는 식염수로 3회 재면역 시켰다. 세번째 면역화 3주 후, 동물을 안락사 시키고 비장으로부터 단일 세포 현탁액을 수득하고 항원으로서 H107을 사용하여 ICS (실시예 3에 기재된 바와 같음)에 대해 자극하였다.
별도의 실험에서, 마우스 그룹은 BCG 및 H104-H107 (BCG- 항원), H74 (BCG- 항원, SEQ ID NO:42) 또는 H65 (BCG+ antigens, SEQ ID NO:43)으로 공동 면역화시켰다 (상기 기재된 바와 같음). 대조군은 H107/CAF01 또는 BCG로 면역화하거나 식염수를 주사하였다. 박테리아 로드는 Mtb 균주 Erdman 감염 4주 및 18주 후 개별 폐에서 측정되었다.
결과
식염수 및 BCG 면역 동물에서 H107은 BCG와 항원을 공유하지 않기 때문에 예상대로 H107에 대한 면역 반응이 없었다. H107을 사용한 면역화는 강력한 CD4 T 세포 반응의 형성으로 이어졌고, 중요하게는 이것이 BCG의 공동 투여에 의해 상당히 향상되었다 (BCG+ H107, 도 6A). 이것은 항원이 두 백신간에 공유되지 않더라도 BCG 공동 투여가 H107 (BCG- 항원)의 면역 반응을 강화할 수 있음을 보여준다.
전 세계 인구의 대다수가 신생아와 함께 BCG에 의해 예방 접종을 받고 있으며 최근 임상 시험의 유망한 결과로 인해 BCG 재접종에 대한 관심이 높아지고 있다. BCG의 공동 보조 효과가 이미 BCG 백신을 접종한 동물에서도 나타났는지 조사하기 위해 2회의 BCG 예방접종이 1년 간격으로 이루어진 BCG 재접종 모델이 적용되었다 (도 6B). 예상대로 식염수, BCG 또는 BCG 재접종 그룹에서 H107에 대한 반응이 없었다. 대조적으로, 1차 BCG 백신 접종된 동물에서 H107을 사용한 백신 접종은 H107이 2차 BCG 백신 접종과 공동 투여될 때 유의하게 증가된 고체 CD4 T 세포 반응을 초래하였다. 이것은 BCG가 이미 BCG 백신을 접종한 동물에서도 보조 아쥬반트로 작용한다는 것을 보여준다.
살아있는 BCG 백신 접종은 보호 능력이 약한 것으로 알려진 고도로 분화된 표현형을 갖는 CD4 T 세포를 유도한다. 대조적으로, 소단위 백신은 덜 분화된 CD4 T 세포를 유도한다. 고도로 분화된 CD4 T 세포 (효과기 기억 및 효과기 세포)는 IFN-γ를 발현하지만 덜 분화된 T 세포 (예를 들어, 중앙 기억 세포)와 대조적으로 TNF-α 및 IL-2의 공동 발현을 점차 느슨하게 한다 (도 7A). T 세포 분화를 특징 짓기 위해, 기능적 분화점수 (FDS)는 IFN-γ+ 세포를 IFN-γ-세포로 나눈 것으로 정의될 수 있다. BCG 백신 접종은 주로 IFN-γ 생산 이펙터- 및 이펙터 메모리 CD4 T 세포 (그리고 매우 소수의 IFN-γ 세포)를 생성하여 13.3의 분화지수를 산출하는 것 (도 7B, 상단)으로 이어졌다. BCG와 BCG+ 백신 (H65)의 공동 면역화는 더 많은 IFN-γ 세포를 사용하여 사이토카인 발현 프로필의 일부 개선을 유도하여 1.9의 FDS를 산출하였다 (도 7B, 중간). 하지만, H107 (BCG-항원)과 BCG의 공동 백신 접종은 0.5의 FDS를 산출하는 우세한 IFN-γ 중추 기억 CD4 T 세포를 사용하여 사이토카인 발현 프로파일의 훨씬 더 큰 개선을 초래하였다. 이는 백신을 BCG와 함께 투여할 때 BCG+ 항원에 비해 BCG- 항원을 사용할 때 개선된 T 세포 품질을 얻을 수 있음을 보여준다. 고도로 분화된 T 세포는 또한 KLRG1의 발현을 특징으로 하며 BCG+ H107이 BCG 및 BCG+H65 둘 다에 비해 KLRG1 발현 CD4 T 세포이 가장 낮은 빈도를 초래하는 것으로 확인되었다 (도 7C).
BCG-항원 (H107) 또는 BCG+항원 (H65)과 BCG 동시 면역화의 보호 효능을 비교하기 위해, 면역화된 마우스를 Mtb Erdman으로 에어로졸 감염시켰다. H74는 이전에 기술된 융합 단백질에 대한 참조로 포함되었다 (WO2015161853 A1). 4주 감염 후, H107 및 H74를 사용한 공동 면역화는 M.bovis BCG 백신의 보호 효능에 추가된 반면 H65는 그렇지 않았다. 이러한 증가는 H107 또는 BCG 단독 (p<0.0001)과 비교할 때 뿐만 아니라 H74 (p=0.0489) 및 H65 (p<0.0001)를 사용한 BCG 공동 면역화에 비해 H107에 대해 유의적이였다 (도 8A). 특히, 단독 백신으로 투여된 H107은 BCG 및 BCG+H65 보다 더 효과적이었고 BCG+H74와 동등하였다. 후기 시점 (도 8B)에서 BCG 단독 및 BCG+H65 동시 예방접종의 보호 효능이 상실되었고, 그러나 H107/CAF01은 여전히 Mtb에 대해 유의하게 보호되었고 (p<0.0001), BCG 및 H107 융합 단백질과이 공동 백신 접종은 최상의 보호 그룹으로 남아 있었다. 다른 BCG 융합 H104-H106은 4주차에 이 백신을 BCG와 함께 투여했을 때 유사한 수준의 보호를 유도하였다 (도 9).
결론
M.bovis BCG와 BCG-항원으로 구성된 서브유닛 백신의 동시 투여는 크기 (도 6) 및 품질 (도 7)면에서 모두 서브유닛 백신에 대한 면역 반응을 향상시키고 에어로졸 Mtb 감염 후 보호를 개선하였다 (도 8 및 도 9). 독립형 백신으로서 H107은 BCG 및 BCG+H65보다 더 효과적이었고 BCG+H74와 동등하였으며, 이는 본 발명에 있어서 BCG-항원 조합이 독립형 백신 뿐만 아니라 BCG와 함께 공동 투여될 때 강력하다는 것을 입증하였다.
실시예 6: 융합 단백질의 ESAT-6 반복부는 면역원성을 증가시킨다
재료 및 방법
첫 번째 실험에서, 암컷 CB6F1 마우스 그룹을 CAF01에서 5 ug의 H56 (SEQ ID NO:45) 또는 CAF01에서 5 ug H56+5 ug ESAT-6으로 3회 면역화 시켰다. 3차 면역화 3주 후, 그룹당 2마리의 동물로부터 비장세포를 분리하고, 37 ℃에서 6시간 동안 ESAT-6 단백질로 2 x 105 세포/웰을 시험관 내에서 자극하였다. 자극에 반응하여 사이토카인 IFN-γ, TNF-α 또는 IL-2를 생성하는 CD4 T 세포의 수를 ICS에 의해 결정하였다. 면역화 6주 후 마우스를 Mtb 균주 Erdman으로 감염시키고 3 주 후 폐 세포를 그룹당 4마리의 동물로부터 분리하고 상기 비장 세포로 처리하여 사이토카인 생성 CD4 T 세포의 수를 결정하였다. 감염 6주후, 7H11 한천 (그룹당 n=8)에 개별 마우스의 폐 균질액을 플레이팅하여 박테리아 수를 결정하였다 (도 10).
두 번째 실험 (도 11)에서, 마우스 그룹은 각각 ESAT-6 분자 사본 1개 (H64, SEQ ID NO:44) 또는 5개 (H76, SEQ ID NO:41)를 함유하는 H64/CAF01 또는 H76/CAF01로 면역화 시켰다. 3차 면역화 3주 후, H64 및 H76 융합 단백질 둘다에 존재하는 단일 항원으로 비장 세포를 자극하고 CD4 T세포를 생성하는 IFN-γ, TNF-α 또는 IL-2의 빈도를 ICS에 의해 결정하였다. Rv0287 단백질을 사용한 자극은 음성 대조군으로 포함되었다. Mtb 균주 Erdman 감염 6주 후 폐에서 박테리아 수를 측정하였다.
세 번째 실험 (도 12)에서 Mtb 재발 모델을 사용하여 다른 분자 골격에서 ESAT-6 반복의 영향을 조사하였다. Mtb Erdman 에어로졸 감염 6주 후, 생쥐에게 6주 동안 자유롭게 식수에 자유롭게 이소니아지드 (0.1 g/L)와 리파부틴 (0.1 g/L)을 주었다. 0.5 ug의 H83 (1개의 ESAT-6 카피, SEQ ID NO:40) 및 H84 (4개의 ESAT-6 카피, SEQ ID NO:39) 또는 식염수(대조군)로 면역화 감염 후 10주차에 시작하여 3주 간격으로 3회 투여하였다. 마지막 면역화 2주 후 (감염 18 주차) ICS에 의한 면역 분석을 위해 폐를 채취하고 감염 22주차 및 33주차에 7H11 한천에 균질액을 플레이팅 하여 폐 박테리아 부하를 평가하였다.
결과
EAST-6는 단백질 백신 접종 후 낮은 면역원성 항원이므로 ESAT-6 특이적 면역원성을 증가시키는 것이 바람직하다. 융합 단백질 (H65)을 포함하는 ESAT-6과 함께 더 많은 유리 ESAT-6을 추가하면 면역 반응이 증가하는지 여부가 먼저 조사되었다. 백신 접종 3주 후, ESAT-6 특이적 면역 반응은 H56+ESAT-6을 받은 마우스에 비해 H56만 받은 마우스에서 더 높았다 (도 10A). 이 차이는 에어로졸 감염 3주 후 폐에서 더욱 두드러졌다. 이 시점에서 사이토카인을 생산하는 CD4 T 세포 수의 차이는 상당했다 (p=0.0060)(도 10B). 두 백신 접종 요법은 감염 6 주후 폐에서 유사하게 유의한 보호를 제공하였다 (백신 접종하지 않은 동물에 비해 p=0.0016 및 0.0121). 이것은 백신에 더 많은 ESAT-6 단백질을 추가해도 면역원성이나 보호가 증가하지 않다는 것을 보여준다.
ESAT-6이 낮은 면역원성인 것에 대한 해결책으로 ESAT-6 서열이 분자 구조 전체에 반복되는 융합 단백질이 설계되었다. ESAT-6 분자의 한 카피를 포함하는 H64에 의해 유도된 면역 반응을 H76 융합 단백질과 비교하면, ESAT-6 분자의 5개 사본을 함유하는 ESAT-6 분자는 백신-프라이밍된 ESAT-6 특이적 CD4 T 세포의 수가 H76 면역화된 동물에서 3 내지 5배 더 높다는 것을 보여주었다 (도 11A). ESAT-6에 특이적인 증가된 면역 반응은 에어로졸 Mtb Erdman 감염 6주 후에 H64 및 H76 면역 동물의 박테리아 부하를 비교할 때 보호 기능이 향상되었다 (도 11B).
유사하게, 다른 분자 구조를 사용하여 ESAT-6 사본의 수를 1개(H83)에서 4개(H84)로 증가시키면 부분 항생제 요법을 사용한 Mtb 재발 모델에서 면역원성과 보호가 증가하였다. 마지막 면역화 2 주 후, ESAT-6 특이적 CD4 T 세포 반응은 H83 그룹에 비해 H84 그룹에서 유의하게 증가하였다 (도 12A). 부분 항생제 치료 종료 후, 대조군 및 H83 백신 접종 동물의 박테리아 부하는 22주에서 35주 (재발)로 증가하였다 (도 12B). 대조적으로, 박테리아 부하는 H84 백신 접종 동물에서 22주에서 35주로 감소하여 (도 12B), ESAT-6 반복 패턴이 Mtb 재발 모델에서 보호 능력뿐만 아니라 ESAT-6 특이적 면역 반응을 증가시켰음을 입증한다.
결론
융합 단백질을 함유한 ESAT-6과 함께 백신 제제에 유리 ESAT-6 단백질 (“유리 ESAT-6”은 융합 단백질의 일부가 아닌 ESAT-6 단백질)을 추가하여 백신 프라이밍 된 ESAT-6 반응을 증가시키는 것은 불가능하다 (도 10). 대신에, 융합 단백질에 더 많은 ESAT-6 사본을 통합하면 백신에 의해 프라이밍된 ESAT-6 특이적 CD4 T 세포의 수가 증가하고 다양한 동물 모델에서 보호가 개선되었다 (도 11 및 12).
실시예 7: 융합 단백질은 단독으로 또는 BCG와 함께 작동한다
재료 및 방법
첫 번째 (도 13A) 및 두 번째 (도 13B)에서, 각각 암컷 129/Sv 및 CB6F1 마우스를 CAF01에서 H74 (SEQ ID NO:37), H105 (서열 번호 37) 또는 H107(SEQ ID NO:9) 중 하나로 1 ug으로 3회 면역화 시켰다. 3차 면역화 2주 후, 그룹당 4마리의 동물로부터 비장세포를 분리하고, ICS에 의해 CD4 T 세포를 생산하는 사이토카인이 수를 측정하기 전에 1 내지 2 x 106 세포/웰을 37 ℃에서 6시간 동안 ESAT-6 펩티드로 시험관내 자극하였다. IFN-γ 분비 수준은 이전에 기술된 바와 같이 ELISA에 의해 3일 배양 상청액에서 측정되었다.
세 번째 실험 (도 13C)에서 암컷 CB6F1 마우스는 BCG s.c. 꼬리 기저부의 왼쪽에 다음 날 동일한 주사 부위에 CAF01에 H105 또는 H107을 투여하였다. 동물은 후속적으로 2주 (오른쪽) 및 4주 (왼쪽) 후에 다시 서브유닛 백신으로 면역화 되었다. 3차 면역화 2주 후, 그룹당 4마리의 동물로부터 비장세포를 분리하고 ICS에 의해 CD4 T 세포를 생산하는 사이토카인의 수를 측정하기 전에 1-2 x 106 세포/웰을 37 ℃에서 6시간 동안 ESAT-6 펩티드로 시험관내 자극하였다. IFN-γ 분비 수준은 본 명세서에서 기재된 바와 같이 ELISA에 의해 3일 배양 상청액에서 측정하였다. 마지막 면역화 6주 후, 모든 동물은 Mtb 균주 Erdman으로 에어로졸 감염되었고, 4주 감염 후 기관 균질액을 플레이팅하여 폐 박테리아 부하를 측정하였다.
결과
129/Sv 마우스에서 ESAT-6 사본의 수를 1개 (H74 및 H105)에서 4개 (H107)로 증가시키면 ESAT-6 반응이 향상되었다 (도 13A). 이것은 ICS 및 ELISA 둘 다에 의해 측정된 CB6F1 마우스에서도 마찬가지였다 (도 13B). 마지막으로, 백신이 BCG와 함께 투여되었을 때 이것이 사실인지 여부를 테스트 하였다. 이 요법에서 다시 H107은 H105에 비해 ESAT-6 특이적 면역 반응을 유의하게 증가시켰으며, 이는 또한 Mtb 에어로졸 감염에 대한 보호를 증가시켰다 (도 13C).
결론
3개의 독립적인 실험 (두 개의 다른 마우스 계통 사용)에서 ESAT-6 사본 수를 1개 (H74 및 H75)에서 4개 (H107)로 증가시키면 ESAT-6 특이적 면역 반응이 증가하는 것으로 나타났다. 이것은 백신이 BCG와 함께 투여되었을 ??도 마찬가지였다. 이것은 또한 박테리아 부하를 감소시켜 백신 백본에서 ESAT-6을 반복하는 것이 면역원성과 백신 매개 보호를 모두 개선하는 강력한 방법임을 보여준다. 또한, 데이터는 융합이 독립형 백신으로 그리고 BCG와 함께 효과적이라는 것을 뒷받침한다.
실시예 8: H107은 최첨단 서브유닛 백신 H56 보다 더 나은 독립형 백신이다
재료 및 방법
마우스 그룹을 총 부피 200 uL에서 양이온성 아쥬반트 제형 1 (CAF01)로 제형화된 2 ug의 융합 단백질로 3회 면역화 시켰다. 각 백신 접종 라운드는 2주로 구분되었다. 3차 면역화 6주 후, 모든 동물에 결핵균 균주 Erdman으로 에어로졸 챌린지 (20 내지 50 CFU)를 가하였다. 4주에서 12주 후 폐 균질액의 연속 희석액을 플레이팅하여 개별 폐에서 마이코박테리아의 수를 측정하였다.
결과
H107 (SEQ ID NO:9)의 보호 효능을 현재의 최첨단 서브유닛 백신 (H56; SEQ ID NO:45)과 비교하기 위해, 2번(H107) 및 5번(H56) 독립적인 실험에서 마우스 그룹을 CAF01 아쥬반트의 융합 단백질로 면역화시켰다. 동물을 Mtb 균주 Erdman으로 챌린지하고 개별 동물의 폐에서 박테리아의 수를 계산하였다 (도 14). 실험에 따라 보호 효능은 Mtb 균주 Erdman 챌린지 4주에서 12주 후에 결정되었다. 평균적으로 H107 백신은 100배의 박테리아 부하 감소에 해당하는 2.0 log10 보호를 제공하였다. 이에 비해 H56 백신은 평균적으로 ~7 배 (0.82 log10)의 세균 부하를 감소시켰다.
결론
H107/CAF01 백신은 최첨단 서브유닛 TB 백신 (H56/CAF01)과 비교할 때 독성 Mtb를 사용한 에어로졸 공격에 대해 우수한 보호 기능을 제공한다 (도 14).
실시예 9: BCG+H107 동시 투여는 BCG 특이적 면역 반응을 증가시킨다
재료 및 방법
나이브 CB6F1 마우스 (시점당 n=4) 그룹을 이전 실시예에 기재된 바와 같이 BCG 및 1 ug의 H107 (SEQ ID NO:9)로 3회 공동 면역화 시켰다. 동물을 면역화 후 다른 시점에서 안락사 시키고 비장을 100 um 세포 여과기에 통과시켜 단일 세포 현탁액을 얻었다. 본 발명에 있어서 세포는 ICS에 대한 항원 자극 전에 RPMI에서 2회 세척되었다. TB10.4는 이 항원이 BCG에 포함되어 있지만 H107에는 포함되어 있지 않기 때문에 BCG 특이적 면역 반응을 평가하기 위한 자극에 사용되었다.
결과
첫 번째 면역화 3주 후 (두 번째 H107 1주후) BCG 단독에 비해 BCG+107 그룹에서 증가된 TB10.4 반응이 관찰되었다 (도 15). 이 차이는 실험이 종료된 9주차까지 유지되었다. 이것은 H107과 BCG의 동시 투여가 항원을 공유하지 않더라도 BCG 특이적 면역 반응을 증가시킨다는 것을 보여준다.
결론:
이전 예에서는 BCG+H107 공동 투여가 H107반응을 증가시키는 것으로 나타났다 (BCG는 H107에 대한 아쥬반트로 작용함). 이 예는 H107+BCG 동시 투여가 BCG 특이적 면역 반응을 증가시킨다는 것을 보여준다. 즉, H107이 BCG에 대한 아쥬반트 역할을 한다는 것을 의미한다 (도 15). 이러한 방식으로 두 백신 간에 진정한 시너지 효과가 있다.
실시예 10: H107e는 H107에 비해 대장균에서 단백질 발현이 증가하였다.
재조합 단백질 발현의 수율은 무엇보다도 단백질의 아미노산 서열에 의존하며 대규모 백신 제조는 가장 최적의 발현 과정을 필요로 한다. 이를 해결하기 위해 H107, H107e의 표현력이 높은 버전이 개발되었다.
재료 및 방법
발현을 최적화 하기위해 H107 (SEQ ID NO:9)의 Rv3876-부분, AA298-AA517에 있는 프롤린이 풍부한 서열을 결실시켜 H107e (SEQ ID NO:91)를 만들었다. H107(SEQ ID NO:54) 및 H107e(SEQ ID NO:92)에 상응하는 DNA 서열은 pJ 411 발현 벡터(ATUM, Menlo Park, CA, US)에 삽입된 화학적 합성에 의해 제조되었고 Luria-Bertani(LB) 배지에서 성장한 E. coli BL21(DE3) 균주(Agilent, DK)로 형질 전환되었다. 재조합 단백질 발현 수준은 1 mM 이소프로필 β D1 티오갈락토피라노사이드 (IPTG)로 배양 유도 후 0, 1 및 3시간에 SDS-PAGE 또는 western-blot(H107/H107e의 MPT70-part를 인식하는 1차 항체 사용)으로 평가하였다. 동일한 양의 세포 (동일한 OD600)를 겔의 레인에 로드하였다. 발현 후 재조합 항원을 봉입체로부터 정제하고 5 ml HisTrap HP 컬럼(GE Healthcare)을 사용하여 금속 이온 친화성 크로마토그래피를 수행한 후 HiTrap Q HP 컬럼(GE Healthcare)을 사용하여 음이온 교환을 수행하였다. 최종 단백질 수율은 비신코닌 애씨드 (bicinchoninic acid) 분석에 의해 추정되었다.
결과
배양 유도 실험에서, H107e가 E. coli에서 유의하게 증가된 발현을 가짐이 분명하였다. 유도 후 1시간 및 3시간 후, H107e에 해당하는 밴드는 SDS-PAGE 겔 및 웨스턴 블롯 모두에서 H107에 대한 밴드에 비해 훨씬 더 강했습니다(도 16A). 비교를 위해 6 L 발효에서 정제된 단백질의 수율은 H107의 경우 2.4 내지 7.2mg에서 H107e의 경우 15.2 mg으로 증가하였다.
결론:
H107e의 서열을 변경하면 H107에 비해 단백질 발현 및 수율이 크게 증가하였다.
실시예 11: H107e는 H107만큼 면역원성이며 또한 BCG와 상승적으로 작용한다
재료 및 방법
나이브 CB6F1 마우스(n=8) 그룹을 이전 실시예에 기재된 바와 같이 BCG 및 1㎍의 H107(SEQ ID NO:9) 또는 H107e(SEQ ID NO:91)로 공동 면역화시켰다. 마지막 면역화 2주 후 동물을 안락사시키고 비장을 100 μm 세포 여과기에 통과시켜 단일 세포 현탁액을 얻었다. 세포는 이전 실시예에 기술된 바와 같이 ICS 및 IFN-g ELISA에 대한 항원 자극 전에 RPMI에서 2회 세척하였다. 두 번째 실험에서, 나이브 CB6F1 마우스 그룹(n=6)은 위와 같이 BCG 및 H107e로 공동 면역화되었고 대조군은 H107e/CAF01 또는 BCG로 면역화되거나 식염수가 주사 되었다. 박테리아 로드는 Mtb 균주 Erdman 감염 8주 후 개별 폐에서 측정하였다.
세 번째 실험에서 BCG 메모리 CB6F1 마우스 그룹 (n=6)은 꼬리 바닥 (base of the tail)에 2 ug의 H107 또는 H65와 함께 s.c.를 3차례 면역화 하였다. 마지막 면역화 2주 후, 동물을 안락사시키고 100 μm 세포 여과기를 통해 사타구니 림프절을 통과시켜 단일 세포 현탁액을 얻었다. ICS에 대한 항원 자극 전에 세포를 RPMI로 2회 세척하였다.
결과
BCG로 동시 백신 접종한 후, H107e 및 H107이 CD4 T 세포를 발현하는 사이토카인 (도 17A, 왼쪽) 및 ELISA에 의해 IFN-γ 방출 (도 17A, 오른쪽) 둘 모두에 의해 측정된 동일한 면역원성을 가짐을 확인하였다. 또한 H107e가 H107과 동일한 개별 항원에 대한 면역 반응을 유도함을 확인하였다 (도 17B). H107e의 Rv3876-part의 결실이 Rv3876-특이적 면역 반응의 경미한 감소를 초래했지만, MPT70 및 MPT83에 대한 면역 반응의 증가를 유도하는 것이 눈에 띈다 (도 17B). 감염 후, H107e는 BCG 및 BCG+H107e 공동 백신접종과 유사하거나 더 나은 보호를 제공했으며, 이는 실시예 9에서 이전에 H107에서 관찰된 바와 같이 BCG 및 H107e 단독 (도 17C)에 비해 보호에서 상당한 증가를 가져왔다. BCG-기억 마우스에서, H107e (BCG-) 백신접종은 기능적 분화 점수, FDS에 의해 측정된 H65(BCG+)에 비해 덜 분화된 CD4 T 세포(더 나은 품질)로 이어졌다(도 17D). 또한, Th17 세포는 지난 10년 동안 관심이 증가함에 따라, 및 Th17 세포는 Mtb 감염 동안 보호 특성을 갖는 것으로 제안되었으며, CD4 T 세포를 발현하는 IL-17을 유세포 분석에 의해 측정하였다. H107e는 H65와 비교하여 훨씬 더 높은 비율의 Th17 세포를 유도하여 BCG-프라이밍된 개체에서 BCG-백신이 전통적인 BCG+ 백신보다 전반적으로 더 광범위한 면역 반응을 생성함을 입증한다(도 17D).
결론
H107e는 H107과 유사한 면역원성을 가지며 Mtb 챌린지 후 상당한 보호를 유도한다. H107과 마찬가지로 H107e는 H107e 및 BCG 단독보다 훨씬 높은 BCG+H107e 보호 수준과 함께 BCG 및 공동 예방 접종과 상승 작용을 한다. BCG 프라이밍된 동물에서 H107e(BCG-) 백신 접종은 H65(BCG+)와 비교하여 CD4 T 세포를 발현하는 IL-17에 의해 측정된 덜 분화된 T 세포(예: H107)를 유도하고 Th17 세포의 비율을 증가시킨다.
<110> Statens Serum Institut
<120> Fusion proteins for tuberculosis vaccines
<130> PI210048EP
<150> EP19180280
<151> 2019-06-14
<160> 92
<170> BiSSAP 1.3.6
<210> 1
<211> 95
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 1
Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
20 25 30
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
35 40 45
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
50 55 60
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
65 70 75 80
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala
85 90 95
<210> 2
<211> 368
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 2
Met Leu Trp His Ala Met Pro Pro Glu Leu Asn Thr Ala Arg Leu Met
1 5 10 15
Ala Gly Ala Gly Pro Ala Pro Met Leu Ala Ala Ala Ala Gly Trp Gln
20 25 30
Thr Leu Ser Ala Ala Leu Asp Ala Gln Ala Val Glu Leu Thr Ala Arg
35 40 45
Leu Asn Ser Leu Gly Glu Ala Trp Thr Gly Gly Gly Ser Asp Lys Ala
50 55 60
Leu Ala Ala Ala Thr Pro Met Val Val Trp Leu Gln Thr Ala Ser Thr
65 70 75 80
Gln Ala Lys Thr Arg Ala Met Gln Ala Thr Ala Gln Ala Ala Ala Tyr
85 90 95
Thr Gln Ala Met Ala Thr Thr Pro Ser Leu Pro Glu Ile Ala Ala Asn
100 105 110
His Ile Thr Gln Ala Val Leu Thr Ala Thr Asn Phe Phe Gly Ile Asn
115 120 125
Thr Ile Pro Ile Ala Leu Thr Glu Met Asp Tyr Phe Ile Arg Met Trp
130 135 140
Asn Gln Ala Ala Leu Ala Met Glu Val Tyr Gln Ala Glu Thr Ala Val
145 150 155 160
Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro
165 170 175
Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro
180 185 190
Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr
195 200 205
Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly Pro Met Gln Gln Leu Thr Gln
210 215 220
Pro Leu Gln Gln Val Thr Ser Leu Phe Ser Gln Val Gly Gly Thr Gly
225 230 235 240
Gly Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met Gly Leu Leu Gly
245 250 255
Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly Ser Gly Pro Ser
260 265 270
Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro Gly Ala Gly Gly
275 280 285
Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile Glu Lys Pro Val
290 295 300
Ala Pro Ser Val Met Pro Ala Ala Ala Ala Gly Ser Ser Ala Thr Gly
305 310 315 320
Gly Ala Ala Pro Val Gly Ala Gly Ala Met Gly Gln Gly Ala Gln Ser
325 330 335
Gly Gly Ser Thr Arg Pro Gly Leu Val Ala Pro Ala Pro Leu Ala Gln
340 345 350
Glu Arg Glu Glu Asp Asp Glu Asp Asp Trp Asp Glu Glu Asp Asp Trp
355 360 365
<210> 3
<211> 666
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 3
Met Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly Met Glu
1 5 10 15
Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser Ala Ser
20 25 30
Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn Gly Gln
35 40 45
Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val Ser Ala
50 55 60
Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Thr Pro Met
65 70 75 80
Pro Ile Ala Ala Gly Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala Ser Lys
85 90 95
Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala Pro Pro
100 105 110
Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala Pro
115 120 125
Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Ala Pro Thr
130 135 140
Pro Thr Glu Ser Gln Leu Ala Pro Pro Arg Pro Pro Thr Pro Gln Thr
145 150 155 160
Pro Thr Gly Ala Pro Gln Gln Pro Glu Ser Pro Ala Pro His Val Pro
165 170 175
Ser His Gly Pro His Gln Pro Arg Arg Thr Ala Pro Ala Pro Pro Trp
180 185 190
Ala Lys Met Pro Ile Gly Glu Pro Pro Pro Ala Pro Ser Arg Pro Ser
195 200 205
Ala Ser Pro Ala Glu Pro Pro Thr Arg Pro Ala Pro Gln His Ser Arg
210 215 220
Arg Ala Arg Arg Gly His Arg Tyr Arg Thr Asp Thr Glu Arg Asn Val
225 230 235 240
Gly Lys Val Ala Thr Gly Pro Ser Ile Gln Ala Arg Leu Arg Ala Glu
245 250 255
Glu Ala Ser Gly Ala Gln Leu Ala Pro Gly Thr Glu Pro Ser Pro Ala
260 265 270
Pro Leu Gly Gln Pro Arg Ser Tyr Leu Ala Pro Pro Thr Arg Pro Ala
275 280 285
Pro Thr Glu Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro Gln Arg Asn Ser Gly Arg
290 295 300
Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu Ala Ala Gln His Ala Ala
305 310 315 320
Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr Thr Gly Gly Arg Arg Arg
325 330 335
Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr Gln Lys Ser Leu Arg Pro
340 345 350
Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val Lys Pro Gln Lys Pro Lys
355 360 365
Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln Arg Gly Trp Arg His Trp
370 375 380
Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser Pro Asp Glu Lys
385 390 395 400
Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn Pro Arg Gly Ser
405 410 415
Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Lys Gly Gly Ala Gly Lys Thr Thr
420 425 430
Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val Arg Ala Asp Arg
435 440 445
Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn Leu Ala Asp Arg
450 455 460
Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val Leu Ala Glu Lys
465 470 475 480
Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr Ser Val Asn Ala
485 490 495
Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser Ser Ala Gln Arg
500 505 510
Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp Pro Ala Ser Arg
515 520 525
Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Cys Gly Ala Gly Phe Phe Asp Pro
530 535 540
Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val Val Val Val Ala
545 550 555 560
Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val Ala Leu Asp Trp
565 570 575
Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg Ala Cys Val Val
580 585 590
Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala Val Lys Asp Leu
595 600 605
Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg Val Val Val Met
610 615 620
Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile Ser Leu Asp Leu
625 630 635 640
Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu Ala Ala Ala Leu
645 650 655
Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg
660 665
<210> 4
<211> 103
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 4
Met Thr Glu Asn Leu Thr Val Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala
1 5 10 15
Ser His His Asp Asn Ala Ala Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala
20 25 30
Ala Ala Gly Leu Gly Glu Ser Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Cys
35 40 45
Ser Gln Phe Asn Asp Thr Leu Asn Val Tyr Leu Thr Ala His Asn Ala
50 55 60
Leu Gly Ser Ser Leu His Thr Ala Gly Val Asp Leu Ala Lys Ser Leu
65 70 75 80
Arg Ile Ala Ala Lys Ile Tyr Ser Glu Ala Asp Glu Ala Trp Arg Lys
85 90 95
Ala Ile Asp Gly Leu Phe Thr
100
<210> 5
<211> 392
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 5
Met Ser Arg Ala Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly
1 5 10 15
Leu Tyr Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu
20 25 30
Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala
35 40 45
Ala Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala
50 55 60
Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu
65 70 75 80
Asp Arg Gln Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln
85 90 95
Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val
100 105 110
Arg Pro Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala
115 120 125
Leu Ser Ala Ala Phe Gln Ala Pro Phe Cys Ala Gly Ala Met Ala Val
130 135 140
Val Gly Gly Ala Leu Ala Tyr Leu Val Val Lys Thr Leu Ile Asn Ala
145 150 155 160
Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ala Lys Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala
165 170 175
Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser Asp Val Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr
180 185 190
Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys
195 200 205
Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg
210 215 220
Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Ala Gly Val Pro Gly Leu Thr
225 230 235 240
Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gln Val Thr Gly Leu Phe Gly Ala Ala
245 250 255
Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala His Ala Asp Ser Leu Ala Ser
260 265 270
Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe
275 280 285
Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gln Val His Ala Ala Ser Thr Arg Gln
290 295 300
Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro Val Gly Ala Ala Ala Glu Gln
305 310 315 320
Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu Val Ser Ala Gln Gly Ser Gln Gly Met
325 330 335
Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met His Pro Ser Ser Gly Ala Ser
340 345 350
Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser Glu Gly Ala Ala Ala Gly Thr
355 360 365
Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu Ala Asp Ala Gly Gly Gly Gln
370 375 380
Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val
385 390
<210> 6
<211> 228
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 6
Val Arg Ile Lys Ile Phe Met Leu Val Thr Ala Val Val Leu Leu Cys
1 5 10 15
Cys Ser Gly Val Ala Thr Ala Ala Pro Lys Thr Tyr Cys Glu Glu Leu
20 25 30
Lys Gly Thr Asp Thr Gly Gln Ala Cys Gln Ile Gln Met Ser Asp Pro
35 40 45
Ala Tyr Asn Ile Asn Ile Ser Leu Pro Ser Tyr Tyr Pro Asp Gln Lys
50 55 60
Ser Leu Glu Asn Tyr Ile Ala Gln Thr Arg Asp Lys Phe Leu Ser Ala
65 70 75 80
Ala Thr Ser Ser Thr Pro Arg Glu Ala Pro Tyr Glu Leu Asn Ile Thr
85 90 95
Ser Ala Thr Tyr Gln Ser Ala Ile Pro Pro Arg Gly Thr Gln Ala Val
100 105 110
Val Leu Lys Val Tyr Gln Asn Ala Gly Gly Thr His Pro Thr Thr Thr
115 120 125
Tyr Lys Ala Phe Asp Trp Asp Gln Ala Tyr Arg Lys Pro Ile Thr Tyr
130 135 140
Asp Thr Leu Trp Gln Ala Asp Thr Asp Pro Leu Pro Val Val Phe Pro
145 150 155 160
Ile Val Gln Gly Glu Leu Ser Lys Gln Thr Gly Gln Gln Val Ser Ile
165 170 175
Ala Pro Asn Ala Gly Leu Asp Pro Val Asn Tyr Gln Asn Phe Ala Val
180 185 190
Thr Asn Asp Gly Val Ile Phe Phe Phe Asn Pro Gly Glu Leu Leu Pro
195 200 205
Glu Ala Ala Gly Pro Thr Gln Val Leu Val Pro Arg Ser Ala Ile Asp
210 215 220
Ser Met Leu Ala
225
<210> 7
<211> 193
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 7
Met Lys Val Lys Asn Thr Ile Ala Ala Thr Ser Phe Ala Ala Ala Gly
1 5 10 15
Leu Ala Ala Leu Ala Val Ala Val Ser Pro Pro Ala Ala Ala Gly Asp
20 25 30
Leu Val Gly Pro Gly Cys Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly
35 40 45
Pro Ala Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala
50 55 60
Ser Asn Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln
65 70 75 80
Leu Asn Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr
85 90 95
Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser
100 105 110
Thr Ile Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu
115 120 125
Thr Tyr His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly
130 135 140
Thr Arg Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly
145 150 155 160
Asn Ser Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val Cys Gly Gly Val Ser
165 170 175
Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro
180 185 190
Ala
<210> 8
<211> 220
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 8
Met Ile Asn Val Gln Ala Lys Pro Ala Ala Ala Ala Ser Leu Ala Ala
1 5 10 15
Ile Ala Ile Ala Phe Leu Ala Gly Cys Ser Ser Thr Lys Pro Val Ser
20 25 30
Gln Asp Thr Ser Pro Lys Pro Ala Thr Ser Pro Ala Ala Pro Val Thr
35 40 45
Thr Ala Ala Met Ala Asp Pro Ala Ala Asp Leu Ile Gly Arg Gly Cys
50 55 60
Ala Gln Tyr Ala Ala Gln Asn Pro Thr Gly Pro Gly Ser Val Ala Gly
65 70 75 80
Met Ala Gln Asp Pro Val Ala Thr Ala Ala Ser Asn Asn Pro Met Leu
85 90 95
Ser Thr Leu Thr Ser Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asn Pro Asp Val Asn
100 105 110
Leu Val Asp Thr Leu Asn Gly Gly Glu Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr
115 120 125
Asn Ala Ala Phe Asp Lys Leu Pro Ala Ala Thr Ile Asp Gln Leu Lys
130 135 140
Thr Asp Ala Lys Leu Leu Ser Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Ile Ala
145 150 155 160
Gly Gln Ala Ser Pro Ser Arg Ile Asp Gly Thr His Gln Thr Leu Gln
165 170 175
Gly Ala Asp Leu Thr Val Ile Gly Ala Arg Asp Asp Leu Met Val Asn
180 185 190
Asn Ala Gly Leu Val Cys Gly Gly Val His Thr Ala Asn Ala Thr Val
195 200 205
Tyr Met Ile Asp Thr Val Leu Met Pro Pro Ala Gln
210 215 220
<210> 9
<211> 2153
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 9
Met Gln Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro
1 5 10 15
Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro
20 25 30
Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu
35 40 45
Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly
50 55 60
Pro Met Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met
65 70 75 80
Gly Leu Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly
85 90 95
Ser Gly Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro
100 105 110
Gly Ala Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile
115 120 125
Glu Lys Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu
130 135 140
Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu
145 150 155 160
Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly
165 170 175
Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala
180 185 190
Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile
195 200 205
Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly
210 215 220
Met Phe Ala Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly
225 230 235 240
Met Glu Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser
245 250 255
Ala Ser Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn
260 265 270
Gly Gln Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val
275 280 285
Ser Ala Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Thr
290 295 300
Pro Met Pro Ile Ala Ala Gly Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala
305 310 315 320
Ser Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala
325 330 335
Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro
340 345 350
Ala Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Ala
355 360 365
Pro Thr Pro Thr Glu Ser Gln Leu Ala Pro Pro Arg Pro Pro Thr Pro
370 375 380
Gln Thr Pro Thr Gly Ala Pro Gln Gln Pro Glu Ser Pro Ala Pro His
385 390 395 400
Val Pro Ser His Gly Pro His Gln Pro Arg Arg Thr Ala Pro Ala Pro
405 410 415
Pro Trp Ala Lys Met Pro Ile Gly Glu Pro Pro Pro Ala Pro Ser Arg
420 425 430
Pro Ser Ala Ser Pro Ala Glu Pro Pro Thr Arg Pro Ala Pro Gln His
435 440 445
Ser Arg Arg Ala Arg Arg Gly His Arg Tyr Arg Thr Asp Thr Glu Arg
450 455 460
Asn Val Gly Lys Val Ala Thr Gly Pro Ser Ile Gln Ala Arg Leu Arg
465 470 475 480
Ala Glu Glu Ala Ser Gly Ala Gln Leu Ala Pro Gly Thr Glu Pro Ser
485 490 495
Pro Ala Pro Leu Gly Gln Pro Arg Ser Tyr Leu Ala Pro Pro Thr Arg
500 505 510
Pro Ala Pro Thr Glu Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro Gln Arg Asn Ser
515 520 525
Gly Arg Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu Ala Ala Gln His
530 535 540
Ala Ala Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr Thr Gly Gly Arg
545 550 555 560
Arg Arg Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr Gln Lys Ser Leu
565 570 575
Arg Pro Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val Lys Pro Gln Lys
580 585 590
Pro Lys Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln Arg Gly Trp Arg
595 600 605
His Trp Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser Pro Asp
610 615 620
Glu Lys Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn Pro Arg
625 630 635 640
Gly Ser Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly Gly Ala Gly Lys
645 650 655
Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val Arg Ala
660 665 670
Asp Arg Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn Leu Ala
675 680 685
Asp Arg Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val Leu Ala
690 695 700
Glu Lys Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr Ser Val
705 710 715 720
Asn Ala Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser Ser Ala
725 730 735
Gln Arg Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp Pro Ala
740 745 750
Ser Arg Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly Ala Gly Phe Phe
755 760 765
Asp Pro Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val Val Val
770 775 780
Val Ala Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val Ala Leu
785 790 795 800
Asp Trp Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg Ala Ser
805 810 815
Val Val Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala Val Lys
820 825 830
Asp Leu Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg Val Val
835 840 845
Val Met Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile Ser Leu
850 855 860
Asp Leu Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu Ala Ala
865 870 875 880
Ala Leu Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg Thr Glu Gln Gln
885 890 895
Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn
900 905 910
Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr
915 920 925
Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly
930 935 940
Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu
945 950 955 960
Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser
965 970 975
Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Thr Glu Asn Leu Thr Val
980 985 990
Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn Ala Ala
995 1000 1005
Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly Glu Ser
1010 1015 1020
Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp Thr Thr
1025 1030 1035 1040
Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile
1045 1050 1055
Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln
1060 1065 1070
Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala
1075 1080 1085
Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn
1090 1095 1100
Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala
1105 1110 1115 1120
Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser Arg Ala
1125 1130 1135
Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly Leu Tyr Asp Leu
1140 1145 1150
Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu Tyr Ser Ser Leu
1155 1160 1165
Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala Ala Phe Pro Gly
1170 1175 1180
Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala Gly Lys Asn Arg
1185 1190 1195 1200
Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu Asp Arg Gln Leu
1205 1210 1215
Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln Thr Thr Arg Asp
1220 1225 1230
Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val Arg Pro Val Ala
1235 1240 1245
Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala Leu Ser Ala Lys
1250 1255 1260
Thr Leu Ile Asn Ala Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ala Lys Leu Ala
1265 1270 1275 1280
Glu Leu Val Ala Ala Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser Asp Val Ala Asp
1285 1290 1295
Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn Ala
1300 1305 1310
Leu Asn Gly Leu Lys Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val Thr
1315 1320 1325
Gly Leu Phe Ser Arg Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Ala Gly
1330 1335 1340
Val Pro Gly Leu Thr Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gln Val Thr Gly
1345 1350 1355 1360
Leu Phe Gly Ala Ala Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala His Ala
1365 1370 1375
Asp Ser Leu Ala Ser Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly Ile Gly
1380 1385 1390
Gly Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gln Val His Ala
1395 1400 1405
Ala Ser Thr Arg Gln Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro Val Gly
1410 1415 1420
Ala Ala Ala Glu Gln Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu Val Ser Ala Gln
1425 1430 1435 1440
Gly Ser Gln Gly Met Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met His Pro
1445 1450 1455
Ser Ser Gly Ala Ser Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser Glu Gly
1460 1465 1470
Ala Ala Ala Gly Thr Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu Ala Asp
1475 1480 1485
Ala Gly Gly Gly Gln Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val Thr Glu Gln
1490 1495 1500
Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly
1505 1510 1515 1520
Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu
1525 1530 1535
Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln
1540 1545 1550
Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala
1555 1560 1565
Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala
1570 1575 1580
Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ala Pro Lys Thr Tyr
1585 1590 1595 1600
Ser Glu Glu Leu Lys Gly Thr Asp Thr Gly Gln Ala Ser Gln Ile Gln
1605 1610 1615
Met Ser Asp Pro Ala Tyr Asn Ile Asn Ile Ser Leu Pro Ser Tyr Tyr
1620 1625 1630
Pro Asp Gln Lys Ser Leu Glu Asn Tyr Ile Ala Gln Thr Arg Asp Lys
1635 1640 1645
Phe Leu Ser Ala Ala Thr Ser Ser Thr Pro Arg Glu Ala Pro Tyr Glu
1650 1655 1660
Leu Asn Ile Thr Ser Ala Thr Tyr Gln Ser Ala Ile Pro Pro Arg Gly
1665 1670 1675 1680
Thr Gln Ala Val Val Leu Lys Val Tyr Gln Asn Ala Gly Gly Thr His
1685 1690 1695
Pro Thr Thr Thr Tyr Lys Ala Phe Asp Trp Asp Gln Ala Tyr Arg Lys
1700 1705 1710
Pro Ile Thr Tyr Asp Thr Leu Trp Gln Ala Asp Thr Asp Pro Leu Pro
1715 1720 1725
Val Val Phe Pro Ile Val Gln Gly Glu Leu Ser Lys Gln Thr Gly Gln
1730 1735 1740
Gln Val Ser Ile Ala Pro Asn Ala Gly Leu Asp Pro Val Asn Tyr Gln
1745 1750 1755 1760
Asn Phe Ala Val Thr Asn Asp Gly Val Ile Phe Phe Phe Asn Pro Gly
1765 1770 1775
Glu Leu Leu Pro Glu Ala Ala Gly Pro Thr Gln Val Leu Val Pro Arg
1780 1785 1790
Ser Ala Ile Asp Ser Met Leu Ala Gly Asp Leu Val Gly Pro Gly Ser
1795 1800 1805
Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly Pro Ala Ser Val Gln Gly
1810 1815 1820
Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala Ser Asn Asn Pro Glu Leu
1825 1830 1835 1840
Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln Leu Asn Pro Gln Val Asn
1845 1850 1855
Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr
1860 1865 1870
Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser Thr Ile Asp Glu Leu Lys
1875 1880 1885
Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Val Ala
1890 1895 1900
Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly Thr Arg Gln Thr Leu Gln
1905 1910 1915 1920
Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly Asn Ser Leu Lys Val Gly
1925 1930 1935
Asn Ala Asp Val Val Ser Gly Gly Val Ser Thr Ala Asn Ala Thr Val
1940 1945 1950
Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro Ala Val Ser Gln Asp Thr
1955 1960 1965
Ser Pro Lys Pro Ala Thr Ser Pro Ala Ala Pro Val Thr Thr Ala Ala
1970 1975 1980
Met Ala Asp Pro Ala Ala Asp Leu Ile Gly Arg Gly Ser Ala Gln Tyr
1985 1990 1995 2000
Ala Ala Gln Asn Pro Thr Gly Pro Gly Ser Val Ala Gly Met Ala Gln
2005 2010 2015
Asp Pro Val Ala Thr Ala Ala Ser Asn Asn Pro Met Leu Ser Thr Leu
2020 2025 2030
Thr Ser Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asn Pro Asp Val Asn Leu Val Asp
2035 2040 2045
Thr Leu Asn Gly Gly Glu Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala
2050 2055 2060
Phe Asp Lys Leu Pro Ala Ala Thr Ile Asp Gln Leu Lys Thr Asp Ala
2065 2070 2075 2080
Lys Leu Leu Ser Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Ile Ala Gly Gln Ala
2085 2090 2095
Ser Pro Ser Arg Ile Asp Gly Thr His Gln Thr Leu Gln Gly Ala Asp
2100 2105 2110
Leu Thr Val Ile Gly Ala Arg Asp Asp Leu Met Val Asn Asn Ala Gly
2115 2120 2125
Leu Val Ser Gly Gly Val His Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile
2130 2135 2140
Asp Thr Val Leu Met Pro Pro Ala Gln
2145 2150
<210> 10
<211> 325
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 10
Met Thr Asp Val Ser Arg Lys Ile Arg Ala Trp Gly Arg Arg Leu Met
1 5 10 15
Ile Gly Thr Ala Ala Ala Val Val Leu Pro Gly Leu Val Gly Leu Ala
20 25 30
Gly Gly Ala Ala Thr Ala Gly Ala Phe Ser Arg Pro Gly Leu Pro Val
35 40 45
Glu Tyr Leu Gln Val Pro Ser Pro Ser Met Gly Arg Asp Ile Lys Val
50 55 60
Gln Phe Gln Ser Gly Gly Asn Asn Ser Pro Ala Val Tyr Leu Leu Asp
65 70 75 80
Gly Leu Arg Ala Gln Asp Asp Tyr Asn Gly Trp Asp Ile Asn Thr Pro
85 90 95
Ala Phe Glu Trp Tyr Tyr Gln Ser Gly Leu Ser Ile Val Met Pro Val
100 105 110
Gly Gly Gln Ser Ser Phe Tyr Ser Asp Trp Tyr Ser Pro Ala Cys Gly
115 120 125
Lys Ala Gly Cys Gln Thr Tyr Lys Trp Glu Thr Phe Leu Thr Ser Glu
130 135 140
Leu Pro Gln Trp Leu Ser Ala Asn Arg Ala Val Lys Pro Thr Gly Ser
145 150 155 160
Ala Ala Ile Gly Leu Ser Met Ala Gly Ser Ser Ala Met Ile Leu Ala
165 170 175
Ala Tyr His Pro Gln Gln Phe Ile Tyr Ala Gly Ser Leu Ser Ala Leu
180 185 190
Leu Asp Pro Ser Gln Gly Met Gly Pro Ser Leu Ile Gly Leu Ala Met
195 200 205
Gly Asp Ala Gly Gly Tyr Lys Ala Ala Asp Met Trp Gly Pro Ser Ser
210 215 220
Asp Pro Ala Trp Glu Arg Asn Asp Pro Thr Gln Gln Ile Pro Lys Leu
225 230 235 240
Val Ala Asn Asn Thr Arg Leu Trp Val Tyr Cys Gly Asn Gly Thr Pro
245 250 255
Asn Glu Leu Gly Gly Ala Asn Ile Pro Ala Glu Phe Leu Glu Asn Phe
260 265 270
Val Arg Ser Ser Asn Leu Lys Phe Gln Asp Ala Tyr Asn Ala Ala Gly
275 280 285
Gly His Asn Ala Val Phe Asn Phe Pro Pro Asn Gly Thr His Ser Trp
290 295 300
Glu Tyr Trp Gly Ala Gln Leu Asn Ala Met Lys Gly Asp Leu Gln Ser
305 310 315 320
Ser Leu Gly Ala Gly
325
<210> 11
<211> 338
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 11
Met Gln Leu Val Asp Arg Val Arg Gly Ala Val Thr Gly Met Ser Arg
1 5 10 15
Arg Leu Val Val Gly Ala Val Gly Ala Ala Leu Val Ser Gly Leu Val
20 25 30
Gly Ala Val Gly Gly Thr Ala Thr Ala Gly Ala Phe Ser Arg Pro Gly
35 40 45
Leu Pro Val Glu Tyr Leu Gln Val Pro Ser Pro Ser Met Gly Arg Asp
50 55 60
Ile Lys Val Gln Phe Gln Ser Gly Gly Ala Asn Ser Pro Ala Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Leu Asp Gly Leu Arg Ala Gln Asp Asp Phe Ser Gly Trp Asp Ile
85 90 95
Asn Thr Pro Ala Phe Glu Trp Tyr Asp Gln Ser Gly Leu Ser Val Val
100 105 110
Met Pro Val Gly Gly Gln Ser Ser Phe Tyr Ser Asp Trp Tyr Gln Pro
115 120 125
Ala Cys Gly Lys Ala Gly Cys Gln Thr Tyr Lys Trp Glu Thr Phe Leu
130 135 140
Thr Ser Glu Leu Pro Gly Trp Leu Gln Ala Asn Arg His Val Lys Pro
145 150 155 160
Thr Gly Ser Ala Val Val Gly Leu Ser Met Ala Ala Ser Ser Ala Leu
165 170 175
Thr Leu Ala Ile Tyr His Pro Gln Gln Phe Val Tyr Ala Gly Ala Met
180 185 190
Ser Gly Leu Leu Asp Pro Ser Gln Ala Met Gly Pro Thr Leu Ile Gly
195 200 205
Leu Ala Met Gly Asp Ala Gly Gly Tyr Lys Ala Ser Asp Met Trp Gly
210 215 220
Pro Lys Glu Asp Pro Ala Trp Gln Arg Asn Asp Pro Leu Leu Asn Val
225 230 235 240
Gly Lys Leu Ile Ala Asn Asn Thr Arg Val Trp Val Tyr Cys Gly Asn
245 250 255
Gly Lys Pro Ser Asp Leu Gly Gly Asn Asn Leu Pro Ala Lys Phe Leu
260 265 270
Glu Gly Phe Val Arg Thr Ser Asn Ile Lys Phe Gln Asp Ala Tyr Asn
275 280 285
Ala Gly Gly Gly His Asn Gly Val Phe Asp Phe Pro Asp Ser Gly Thr
290 295 300
His Ser Trp Glu Tyr Trp Gly Ala Gln Leu Asn Ala Met Lys Pro Asp
305 310 315 320
Leu Gln Arg Ala Leu Gly Ala Thr Pro Asn Thr Gly Pro Ala Pro Gln
325 330 335
Gly Ala
<210> 12
<211> 96
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 12
Met Ser Gln Ile Met Tyr Asn Tyr Pro Ala Met Leu Gly His Ala Gly
1 5 10 15
Asp Met Ala Gly Tyr Ala Gly Thr Leu Gln Ser Leu Gly Ala Glu Ile
20 25 30
Ala Val Glu Gln Ala Ala Leu Gln Ser Ala Trp Gln Gly Asp Thr Gly
35 40 45
Ile Thr Tyr Gln Ala Trp Gln Ala Gln Trp Asn Gln Ala Met Glu Asp
50 55 60
Leu Val Arg Ala Tyr His Ala Met Ser Ser Thr His Glu Ala Asn Thr
65 70 75 80
Met Ala Met Met Ala Arg Asp Thr Ala Glu Ala Ala Lys Trp Gly Gly
85 90 95
<210> 13
<211> 97
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 13
Met Ser Leu Leu Asp Ala His Ile Pro Gln Leu Val Ala Ser Gln Ser
1 5 10 15
Ala Phe Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gln Ala
20 25 30
Glu Gln Ala Ala Met Ser Ala Gln Ala Phe His Gln Gly Glu Ser Ser
35 40 45
Ala Ala Phe Gln Ala Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys
50 55 60
Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Ala Gln Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala
65 70 75 80
Gly Thr Tyr Val Ala Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ser Thr Tyr Thr Gly
85 90 95
Phe
<210> 14
<211> 393
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 14
Val Val Asp Phe Gly Ala Leu Pro Pro Glu Ile Asn Ser Ala Arg Met
1 5 10 15
Tyr Ala Gly Pro Gly Ser Ala Ser Leu Val Ala Ala Ala Lys Met Trp
20 25 30
Asp Ser Val Ala Ser Asp Leu Phe Ser Ala Ala Ser Ala Phe Gln Ser
35 40 45
Val Val Trp Gly Leu Thr Val Gly Ser Trp Ile Gly Ser Ser Ala Gly
50 55 60
Leu Met Ala Ala Ala Ala Ser Pro Tyr Val Ala Trp Met Ser Val Thr
65 70 75 80
Ala Gly Gln Ala Gln Leu Thr Ala Ala Gln Val Arg Val Ala Ala Ala
85 90 95
Ala Tyr Glu Thr Ala Tyr Arg Leu Thr Val Pro Pro Pro Val Ile Ala
100 105 110
Glu Asn Arg Thr Glu Leu Met Thr Leu Thr Ala Thr Asn Leu Leu Gly
115 120 125
Gln Asn Thr Pro Ala Ile Glu Ala Asn Gln Ala Ala Tyr Ser Gln Met
130 135 140
Trp Gly Gln Asp Ala Glu Ala Met Tyr Gly Tyr Ala Ala Thr Ala Ala
145 150 155 160
Thr Ala Thr Glu Ala Leu Leu Pro Phe Glu Asp Ala Pro Leu Ile Thr
165 170 175
Asn Pro Gly Gly Leu Leu Glu Gln Ala Val Ala Val Glu Glu Ala Ile
180 185 190
Asp Thr Ala Ala Ala Asn Gln Leu Met Asn Asn Val Pro Gln Ala Leu
195 200 205
Gln Gln Leu Ala Gln Pro Ala Gln Gly Val Val Pro Ser Ser Lys Leu
210 215 220
Gly Gly Leu Trp Thr Ala Val Ser Pro His Leu Ser Pro Leu Ser Asn
225 230 235 240
Val Ser Ser Ile Ala Asn Asn His Met Ser Met Met Gly Thr Gly Val
245 250 255
Ser Met Thr Asn Thr Leu His Ser Met Leu Lys Gly Leu Ala Pro Ala
260 265 270
Ala Ala Gln Ala Val Glu Thr Ala Ala Glu Asn Gly Val Trp Ala Met
275 280 285
Ser Ser Leu Gly Ser Gln Leu Gly Ser Ser Leu Gly Ser Ser Gly Leu
290 295 300
Gly Ala Gly Val Ala Ala Asn Leu Gly Arg Ala Ala Ser Val Gly Ser
305 310 315 320
Leu Ser Val Pro Pro Ala Trp Ala Ala Ala Asn Gln Ala Val Thr Pro
325 330 335
Ala Ala Arg Ala Leu Pro Leu Thr Ser Leu Thr Ser Ala Ala Gln Thr
340 345 350
Ala Pro Gly His Met Leu Gly Gly Leu Pro Leu Gly His Ser Val Asn
355 360 365
Ala Gly Ser Gly Ile Asn Asn Ala Leu Arg Val Pro Ala Arg Ala Tyr
370 375 380
Ala Ile Pro Arg Thr Pro Ala Ala Gly
385 390
<210> 15
<211> 199
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 15
Met Ala Glu Asn Ser Asn Ile Asp Asp Ile Lys Ala Pro Leu Leu Ala
1 5 10 15
Ala Leu Gly Ala Ala Asp Leu Ala Leu Ala Thr Val Asn Glu Leu Ile
20 25 30
Thr Asn Leu Arg Glu Arg Ala Glu Glu Thr Arg Thr Asp Thr Arg Ser
35 40 45
Arg Val Glu Glu Ser Arg Ala Arg Leu Thr Lys Leu Gln Glu Asp Leu
50 55 60
Pro Glu Gln Leu Thr Glu Leu Arg Glu Lys Phe Thr Ala Glu Glu Leu
65 70 75 80
Arg Lys Ala Ala Glu Gly Tyr Leu Glu Ala Ala Thr Ser Arg Tyr Asn
85 90 95
Glu Leu Val Glu Arg Gly Glu Ala Ala Leu Glu Arg Leu Arg Ser Gln
100 105 110
Gln Ser Phe Glu Glu Val Ser Ala Arg Ala Glu Gly Tyr Val Asp Gln
115 120 125
Ala Val Glu Leu Thr Gln Glu Ala Leu Gly Thr Val Ala Ser Gln Thr
130 135 140
Arg Ala Val Gly Glu Arg Ala Ala Lys Leu Val Gly Ile Glu Leu Pro
145 150 155 160
Lys Lys Ala Ala Pro Ala Lys Lys Ala Ala Pro Ala Lys Lys Ala Ala
165 170 175
Pro Ala Lys Lys Ala Ala Ala Lys Lys Ala Pro Ala Lys Lys Ala Ala
180 185 190
Ala Lys Lys Val Thr Gln Lys
195
<210> 16
<211> 95
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 16
Met Ser Asp Gln Ile Thr Tyr Asn Pro Gly Ala Val Ser Asp Phe Ala
1 5 10 15
Ser Asp Val Gly Ser Arg Ala Gly Gln Leu His Met Ile Tyr Glu Asp
20 25 30
Thr Ala Ser Lys Thr Asn Ala Leu Gln Glu Phe Phe Ala Gly His Gly
35 40 45
Ala Gln Gly Phe Phe Asp Ala Gln Ala Gln Met Leu Ser Gly Leu Gln
50 55 60
Gly Leu Ile Glu Thr Val Gly Gln His Gly Thr Thr Thr Gly His Val
65 70 75 80
Leu Asp Asn Ala Ile Gly Thr Asp Gln Ala Ile Ala Gly Leu Phe
85 90 95
<210> 17
<211> 107
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 17
Val Ala Asp Thr Ile Gln Val Thr Pro Gln Met Leu Arg Ser Thr Ala
1 5 10 15
Asn Asp Ile Gln Ala Asn Met Glu Gln Ala Met Gly Ile Ala Lys Gly
20 25 30
Tyr Leu Ala Asn Gln Glu Asn Val Met Asn Pro Ala Thr Trp Ser Gly
35 40 45
Thr Gly Val Val Ala Ser His Met Thr Ala Thr Glu Ile Thr Asn Glu
50 55 60
Leu Asn Lys Val Leu Thr Gly Gly Thr Arg Leu Ala Glu Gly Leu Val
65 70 75 80
Gln Ala Ala Ala Leu Met Glu Gly His Glu Ala Asp Ser Gln Thr Ala
85 90 95
Phe Gln Ala Leu Phe Gly Ala Ser His Gly Ser
100 105
<210> 18
<211> 163
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 18
Val Thr Val Thr Asp Asp Tyr Leu Ala Asn Asn Val Asp Tyr Ala Ser
1 5 10 15
Gly Phe Lys Gly Pro Leu Pro Met Pro Pro Ser Lys His Ile Ala Ile
20 25 30
Val Ala Cys Met Asp Ala Arg Leu Asp Val Tyr Arg Met Leu Gly Ile
35 40 45
Lys Glu Gly Glu Ala His Val Ile Arg Asn Ala Gly Cys Val Val Thr
50 55 60
Asp Asp Val Ile Arg Ser Leu Ala Ile Ser Gln Arg Leu Leu Gly Thr
65 70 75 80
Arg Glu Ile Ile Leu Leu His His Thr Asp Cys Gly Met Leu Thr Phe
85 90 95
Thr Asp Asp Asp Phe Lys Arg Ala Ile Gln Asp Glu Thr Gly Ile Arg
100 105 110
Pro Thr Trp Ser Pro Glu Ser Tyr Pro Asp Ala Val Glu Asp Val Arg
115 120 125
Gln Ser Leu Arg Arg Ile Glu Val Asn Pro Phe Val Thr Lys His Thr
130 135 140
Ser Leu Arg Gly Phe Val Phe Asp Val Ala Thr Gly Lys Leu Asn Glu
145 150 155 160
Val Thr Pro
<210> 19
<211> 96
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 19
Met Ser Gln Ile Met Tyr Asn Tyr Pro Ala Met Met Ala His Ala Gly
1 5 10 15
Asp Met Ala Gly Tyr Ala Gly Thr Leu Gln Ser Leu Gly Ala Asp Ile
20 25 30
Ala Ser Glu Gln Ala Val Leu Ser Ser Ala Trp Gln Gly Asp Thr Gly
35 40 45
Ile Thr Tyr Gln Gly Trp Gln Thr Gln Trp Asn Gln Ala Leu Glu Asp
50 55 60
Leu Val Arg Ala Tyr Gln Ser Met Ser Gly Thr His Glu Ser Asn Thr
65 70 75 80
Met Ala Met Leu Ala Arg Asp Gly Ala Glu Ala Ala Lys Trp Gly Gly
85 90 95
<210> 20
<211> 97
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 20
Met Ser Leu Leu Asp Ala His Ile Pro Gln Leu Ile Ala Ser His Thr
1 5 10 15
Ala Phe Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gln Ala
20 25 30
Glu Gln Gln Ala Met Ser Ala Gln Ala Phe His Gln Gly Glu Ser Ala
35 40 45
Ala Ala Phe Gln Gly Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys
50 55 60
Val Asn Thr Leu Leu Asp Ile Ala Gln Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala
65 70 75 80
Gly Thr Tyr Val Ala Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ser Ser Tyr Thr Gly
85 90 95
Phe
<210> 21
<211> 120
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 21
Val Ser Gln Ser Met Tyr Ser Tyr Pro Ala Met Thr Ala Asn Val Gly
1 5 10 15
Asp Met Ala Gly Tyr Thr Gly Thr Thr Gln Ser Leu Gly Ala Asp Ile
20 25 30
Ala Ser Glu Arg Thr Ala Pro Ser Arg Ala Cys Gln Gly Asp Leu Gly
35 40 45
Met Ser His Gln Asp Trp Gln Ala Gln Trp Asn Gln Ala Met Glu Ala
50 55 60
Leu Ala Arg Ala Tyr Arg Arg Cys Arg Arg Ala Leu Arg Gln Ile Gly
65 70 75 80
Val Leu Glu Arg Pro Val Gly Asp Ser Ser Asp Cys Gly Thr Ile Arg
85 90 95
Val Gly Ser Phe Arg Gly Arg Trp Leu Asp Pro Arg His Ala Gly Pro
100 105 110
Ala Thr Ala Ala Asp Ala Gly Asp
115 120
<210> 22
<211> 144
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 22
Met Ala Thr Thr Leu Pro Val Gln Arg His Pro Arg Ser Leu Phe Pro
1 5 10 15
Glu Phe Ser Glu Leu Phe Ala Ala Phe Pro Ser Phe Ala Gly Leu Arg
20 25 30
Pro Thr Phe Asp Thr Arg Leu Met Arg Leu Glu Asp Glu Met Lys Glu
35 40 45
Gly Arg Tyr Glu Val Arg Ala Glu Leu Pro Gly Val Asp Pro Asp Lys
50 55 60
Asp Val Asp Ile Met Val Arg Asp Gly Gln Leu Thr Ile Lys Ala Glu
65 70 75 80
Arg Thr Glu Gln Lys Asp Phe Asp Gly Arg Ser Glu Phe Ala Tyr Gly
85 90 95
Ser Phe Val Arg Thr Val Ser Leu Pro Val Gly Ala Asp Glu Asp Asp
100 105 110
Ile Lys Ala Thr Tyr Asp Lys Gly Ile Leu Thr Val Ser Val Ala Val
115 120 125
Ser Glu Gly Lys Pro Thr Glu Lys His Ile Gln Ile Arg Ser Thr Asn
130 135 140
<210> 23
<211> 464
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 23
Met Ala Lys Leu Ala Arg Val Val Gly Leu Val Gln Glu Glu Gln Pro
1 5 10 15
Ser Asp Met Thr Asn His Pro Arg Tyr Ser Pro Pro Pro Gln Gln Pro
20 25 30
Gly Thr Pro Gly Tyr Ala Gln Gly Gln Gln Gln Thr Tyr Ser Gln Gln
35 40 45
Phe Asp Trp Arg Tyr Pro Pro Ser Pro Pro Pro Gln Pro Thr Gln Tyr
50 55 60
Arg Gln Pro Tyr Glu Ala Leu Gly Gly Thr Arg Pro Gly Leu Ile Pro
65 70 75 80
Gly Val Ile Pro Thr Met Thr Pro Pro Pro Gly Met Val Arg Gln Arg
85 90 95
Pro Arg Ala Gly Met Leu Ala Ile Gly Ala Val Thr Ile Ala Val Val
100 105 110
Ser Ala Gly Ile Gly Gly Ala Ala Ala Ser Leu Val Gly Phe Asn Arg
115 120 125
Ala Pro Ala Gly Pro Ser Gly Gly Pro Val Ala Ala Ser Ala Ala Pro
130 135 140
Ser Ile Pro Ala Ala Asn Met Pro Pro Gly Ser Val Glu Gln Val Ala
145 150 155 160
Ala Lys Val Val Pro Ser Val Val Met Leu Glu Thr Asp Leu Gly Arg
165 170 175
Gln Ser Glu Glu Gly Ser Gly Ile Ile Leu Ser Ala Glu Gly Leu Ile
180 185 190
Leu Thr Asn Asn His Val Ile Ala Ala Ala Ala Lys Pro Pro Leu Gly
195 200 205
Ser Pro Pro Pro Lys Thr Thr Val Thr Phe Ser Asp Gly Arg Thr Ala
210 215 220
Pro Phe Thr Val Val Gly Ala Asp Pro Thr Ser Asp Ile Ala Val Val
225 230 235 240
Arg Val Gln Gly Val Ser Gly Leu Thr Pro Ile Ser Leu Gly Ser Ser
245 250 255
Ser Asp Leu Arg Val Gly Gln Pro Val Leu Ala Ile Gly Ser Pro Leu
260 265 270
Gly Leu Glu Gly Thr Val Thr Thr Gly Ile Val Ser Ala Leu Asn Arg
275 280 285
Pro Val Ser Thr Thr Gly Glu Ala Gly Asn Gln Asn Thr Val Leu Asp
290 295 300
Ala Ile Gln Thr Asp Ala Ala Ile Asn Pro Gly Asn Ser Gly Gly Ala
305 310 315 320
Leu Val Asn Met Asn Ala Gln Leu Val Gly Val Asn Ser Ala Ile Ala
325 330 335
Thr Leu Gly Ala Asp Ser Ala Asp Ala Gln Ser Gly Ser Ile Gly Leu
340 345 350
Gly Phe Ala Ile Pro Val Asp Gln Ala Lys Arg Ile Ala Asp Glu Leu
355 360 365
Ile Ser Thr Gly Lys Ala Ser His Ala Ser Leu Gly Val Gln Val Thr
370 375 380
Asn Asp Lys Asp Thr Leu Gly Ala Lys Ile Val Glu Val Val Ala Gly
385 390 395 400
Gly Ala Ala Ala Asn Ala Gly Val Pro Lys Gly Val Val Val Thr Lys
405 410 415
Val Asp Asp Arg Pro Ile Asn Ser Ala Asp Ala Leu Val Ala Ala Val
420 425 430
Arg Ser Lys Ala Pro Gly Ala Thr Val Ala Leu Thr Phe Gln Asp Pro
435 440 445
Ser Gly Gly Ser Arg Thr Val Gln Val Thr Leu Gly Lys Ala Glu Gln
450 455 460
<210> 24
<211> 391
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 24
Met Val Asp Phe Gly Ala Leu Pro Pro Glu Ile Asn Ser Ala Arg Met
1 5 10 15
Tyr Ala Gly Pro Gly Ser Ala Ser Leu Val Ala Ala Ala Gln Met Trp
20 25 30
Asp Ser Val Ala Ser Asp Leu Phe Ser Ala Ala Ser Ala Phe Gln Ser
35 40 45
Val Val Trp Gly Leu Thr Val Gly Ser Trp Ile Gly Ser Ser Ala Gly
50 55 60
Leu Met Val Ala Ala Ala Ser Pro Tyr Val Ala Trp Met Ser Val Thr
65 70 75 80
Ala Gly Gln Ala Glu Leu Thr Ala Ala Gln Val Arg Val Ala Ala Ala
85 90 95
Ala Tyr Glu Thr Ala Tyr Gly Leu Thr Val Pro Pro Pro Val Ile Ala
100 105 110
Glu Asn Arg Ala Glu Leu Met Ile Leu Ile Ala Thr Asn Leu Leu Gly
115 120 125
Gln Asn Thr Pro Ala Ile Ala Val Asn Glu Ala Glu Tyr Gly Glu Met
130 135 140
Trp Ala Gln Asp Ala Ala Ala Met Phe Gly Tyr Ala Ala Ala Thr Ala
145 150 155 160
Thr Ala Thr Ala Thr Leu Leu Pro Phe Glu Glu Ala Pro Glu Met Thr
165 170 175
Ser Ala Gly Gly Leu Leu Glu Gln Ala Ala Ala Val Glu Glu Ala Ser
180 185 190
Asp Thr Ala Ala Ala Asn Gln Leu Met Asn Asn Val Pro Gln Ala Leu
195 200 205
Gln Gln Leu Ala Gln Pro Thr Gln Gly Thr Thr Pro Ser Ser Lys Leu
210 215 220
Gly Gly Leu Trp Lys Thr Val Ser Pro His Arg Ser Pro Ile Ser Asn
225 230 235 240
Met Val Ser Met Ala Asn Asn His Met Ser Met Thr Asn Ser Gly Val
245 250 255
Ser Met Thr Asn Thr Leu Ser Ser Met Leu Lys Gly Phe Ala Pro Ala
260 265 270
Ala Ala Ala Gln Ala Val Gln Thr Ala Ala Gln Asn Gly Val Arg Ala
275 280 285
Met Ser Ser Leu Gly Ser Ser Leu Gly Ser Ser Gly Leu Gly Gly Gly
290 295 300
Val Ala Ala Asn Leu Gly Arg Ala Ala Ser Val Gly Ser Leu Ser Val
305 310 315 320
Pro Gln Ala Trp Ala Ala Ala Asn Gln Ala Val Thr Pro Ala Ala Arg
325 330 335
Ala Leu Pro Leu Thr Ser Leu Thr Ser Ala Ala Glu Arg Gly Pro Gly
340 345 350
Gln Met Leu Gly Gly Leu Pro Val Gly Gln Met Gly Ala Arg Ala Gly
355 360 365
Gly Gly Leu Ser Gly Val Leu Arg Val Pro Pro Arg Pro Tyr Val Met
370 375 380
Pro His Ser Pro Ala Ala Gly
385 390
<210> 25
<211> 580
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 25
Met Asn Phe Ala Val Leu Pro Pro Glu Val Asn Ser Ala Arg Ile Phe
1 5 10 15
Ala Gly Ala Gly Leu Gly Pro Met Leu Ala Ala Ala Ser Ala Trp Asp
20 25 30
Gly Leu Ala Glu Glu Leu His Ala Ala Ala Gly Ser Phe Ala Ser Val
35 40 45
Thr Thr Gly Leu Ala Gly Asp Ala Trp His Gly Pro Ala Ser Leu Ala
50 55 60
Met Thr Arg Ala Ala Ser Pro Tyr Val Gly Trp Leu Asn Thr Ala Ala
65 70 75 80
Gly Gln Ala Ala Gln Ala Ala Gly Gln Ala Arg Leu Ala Ala Ser Ala
85 90 95
Phe Glu Ala Thr Leu Ala Ala Thr Val Ser Pro Ala Met Val Ala Ala
100 105 110
Asn Arg Thr Arg Leu Ala Ser Leu Val Ala Ala Asn Leu Leu Gly Gln
115 120 125
Asn Ala Pro Ala Ile Ala Ala Ala Glu Ala Glu Tyr Glu Gln Ile Trp
130 135 140
Ala Gln Asp Val Ala Ala Met Phe Gly Tyr His Ser Ala Ala Ser Ala
145 150 155 160
Val Ala Thr Gln Leu Ala Pro Ile Gln Glu Gly Leu Gln Gln Gln Leu
165 170 175
Gln Asn Val Leu Ala Gln Leu Ala Ser Gly Asn Leu Gly Ser Gly Asn
180 185 190
Val Gly Val Gly Asn Ile Gly Asn Asp Asn Ile Gly Asn Ala Asn Ile
195 200 205
Gly Phe Gly Asn Arg Gly Asp Ala Asn Ile Gly Ile Gly Asn Ile Gly
210 215 220
Asp Arg Asn Leu Gly Ile Gly Asn Thr Gly Asn Trp Asn Ile Gly Ile
225 230 235 240
Gly Ile Thr Gly Asn Gly Gln Ile Gly Phe Gly Lys Pro Ala Asn Pro
245 250 255
Asp Val Leu Val Val Gly Asn Gly Gly Pro Gly Val Thr Ala Leu Val
260 265 270
Met Gly Gly Thr Asp Ser Leu Leu Pro Leu Pro Asn Ile Pro Leu Leu
275 280 285
Glu Tyr Ala Ala Arg Phe Ile Thr Pro Val His Pro Gly Tyr Thr Ala
290 295 300
Thr Phe Leu Glu Thr Pro Ser Gln Phe Phe Pro Phe Thr Gly Leu Asn
305 310 315 320
Ser Leu Thr Tyr Asp Val Ser Val Ala Gln Gly Val Thr Asn Leu His
325 330 335
Thr Ala Ile Met Ala Gln Leu Ala Ala Gly Asn Glu Val Val Val Phe
340 345 350
Gly Thr Ser Gln Ser Ala Thr Ile Ala Thr Phe Glu Met Arg Tyr Leu
355 360 365
Gln Ser Leu Pro Ala His Leu Arg Pro Gly Leu Asp Glu Leu Ser Phe
370 375 380
Thr Leu Thr Gly Asn Pro Asn Arg Pro Asp Gly Gly Ile Leu Thr Arg
385 390 395 400
Phe Gly Phe Ser Ile Pro Gln Leu Gly Phe Thr Leu Ser Gly Ala Thr
405 410 415
Pro Ala Asp Ala Tyr Pro Thr Val Asp Tyr Ala Phe Gln Tyr Asp Gly
420 425 430
Val Asn Asp Phe Pro Lys Tyr Pro Leu Asn Val Phe Ala Thr Ala Asn
435 440 445
Ala Ile Ala Gly Ile Leu Phe Leu His Ser Gly Leu Ile Ala Leu Pro
450 455 460
Pro Asp Leu Ala Ser Gly Val Val Gln Pro Val Ser Ser Pro Asp Val
465 470 475 480
Leu Thr Thr Tyr Ile Leu Leu Pro Ser Gln Asp Leu Pro Leu Leu Val
485 490 495
Pro Leu Arg Ala Ile Pro Leu Leu Gly Asn Pro Leu Ala Asp Leu Ile
500 505 510
Gln Pro Asp Leu Arg Val Leu Val Glu Leu Gly Tyr Asp Arg Thr Ala
515 520 525
His Gln Asp Val Pro Ser Pro Phe Gly Leu Phe Pro Asp Val Asp Trp
530 535 540
Ala Glu Val Ala Ala Asp Leu Gln Gln Gly Ala Val Gln Gly Val Asn
545 550 555 560
Asp Ala Leu Ser Gly Leu Gly Leu Pro Pro Pro Trp Gln Pro Ala Leu
565 570 575
Pro Arg Leu Phe
580
<210> 26
<211> 94
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 26
Met Thr Ile Asn Tyr Gln Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
1 5 10 15
Ile Arg Ala Gln Ala Gly Ser Leu Glu Ala Glu His Gln Ala Ile Ile
20 25 30
Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
35 40 45
Ala Cys Gln Gly Phe Ile Thr Gln Leu Gly Arg Asn Phe Gln Val Ile
50 55 60
Tyr Glu Gln Ala Asn Ala His Gly Gln Lys Val Gln Ala Ala Gly Asn
65 70 75 80
Asn Met Ala Gln Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
85 90
<210> 27
<211> 98
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 27
Met Thr Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Ala Met Arg Asp Met Ala
1 5 10 15
Gly Arg Phe Glu Val His Ala Gln Thr Val Glu Asp Glu Ala Arg Arg
20 25 30
Met Trp Ala Ser Ala Gln Asn Ile Ser Gly Ala Gly Trp Ser Gly Met
35 40 45
Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr Gln Met Asn Gln Ala Phe
50 55 60
Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg Asp Gly Leu Val Arg
65 70 75 80
Asp Ala Asn Asn Tyr Glu Gln Gln Glu Gln Ala Ser Gln Gln Ile Leu
85 90 95
Ser Ser
<210> 28
<211> 75
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 28
Val Ile Ala Gly Val Asp Gln Ala Leu Ala Ala Thr Gly Gln Ala Ser
1 5 10 15
Gln Arg Ala Ala Gly Ala Ser Gly Gly Val Thr Val Gly Val Gly Val
20 25 30
Gly Thr Glu Gln Arg Asn Leu Ser Val Val Ala Pro Ser Gln Phe Thr
35 40 45
Phe Ser Ser Arg Ser Pro Asp Phe Val Asp Glu Thr Ala Gly Gln Ser
50 55 60
Trp Cys Ala Ile Leu Gly Leu Asn Gln Phe His
65 70 75
<210> 29
<211> 184
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 29
Val Asp Leu Pro Gly Asn Asp Phe Asp Ser Asn Asp Phe Asp Ala Val
1 5 10 15
Asp Leu Trp Gly Ala Asp Gly Ala Glu Gly Trp Thr Ala Asp Pro Ile
20 25 30
Ile Gly Val Gly Ser Ala Ala Thr Pro Asp Thr Gly Pro Asp Leu Asp
35 40 45
Asn Ala His Gly Gln Ala Glu Thr Asp Thr Glu Gln Glu Ile Ala Leu
50 55 60
Phe Thr Val Thr Asn Pro Pro Arg Thr Val Ser Val Ser Thr Leu Met
65 70 75 80
Asp Gly Arg Ile Asp His Val Glu Leu Ser Ala Arg Val Ala Trp Met
85 90 95
Ser Glu Ser Gln Leu Ala Ser Glu Ile Leu Val Ile Ala Asp Leu Ala
100 105 110
Arg Gln Lys Ala Gln Ser Ala Gln Tyr Ala Phe Ile Leu Asp Arg Met
115 120 125
Ser Gln Gln Val Asp Ala Asp Glu His Arg Val Ala Leu Leu Arg Lys
130 135 140
Thr Val Gly Glu Thr Trp Gly Leu Pro Ser Pro Glu Glu Ala Ala Ala
145 150 155 160
Ala Glu Ala Glu Val Phe Ala Thr Arg Tyr Ser Asp Asp Cys Pro Ala
165 170 175
Pro Asp Asp Glu Ser Asp Pro Trp
180
<210> 30
<211> 103
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 30
Met Thr Gly Phe Leu Gly Val Val Pro Ser Phe Leu Lys Val Leu Ala
1 5 10 15
Gly Met His Asn Glu Ile Val Gly Asp Ile Lys Arg Ala Thr Asp Thr
20 25 30
Val Ala Gly Ile Ser Gly Arg Val Gln Leu Thr His Gly Ser Phe Thr
35 40 45
Ser Lys Phe Asn Asp Thr Leu Gln Glu Phe Glu Thr Thr Arg Ser Ser
50 55 60
Thr Gly Thr Gly Leu Gln Gly Val Thr Ser Gly Leu Ala Asn Asn Leu
65 70 75 80
Leu Ala Ala Ala Gly Ala Tyr Leu Lys Ala Asp Asp Gly Leu Ala Gly
85 90 95
Val Ile Asp Lys Ile Phe Gly
100
<210> 31
<211> 132
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 31
Met Ser Thr Thr Phe Ala Ala Arg Leu Asn Arg Leu Phe Asp Thr Val
1 5 10 15
Tyr Pro Pro Gly Arg Gly Pro His Thr Ser Ala Glu Val Ile Ala Ala
20 25 30
Leu Lys Ala Glu Gly Ile Thr Met Ser Ala Pro Tyr Leu Ser Gln Leu
35 40 45
Arg Ser Gly Asn Arg Thr Asn Pro Ser Gly Ala Thr Met Ala Ala Leu
50 55 60
Ala Asn Phe Phe Arg Ile Lys Ala Ala Tyr Phe Thr Asp Asp Glu Tyr
65 70 75 80
Tyr Glu Lys Leu Asp Lys Glu Leu Gln Trp Leu Cys Thr Met Arg Asp
85 90 95
Asp Gly Val Arg Arg Ile Ala Gln Arg Ala His Gly Leu Pro Ser Ala
100 105 110
Ala Gln Gln Lys Val Leu Asp Arg Ile Asp Glu Leu Arg Arg Ala Glu
115 120 125
Gly Ile Asp Ala
130
<210> 32
<211> 99
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 32
Met Glu Lys Met Ser His Asp Pro Ile Ala Ala Asp Ile Gly Thr Gln
1 5 10 15
Val Ser Asp Asn Ala Leu His Gly Val Thr Ala Gly Ser Thr Ala Leu
20 25 30
Thr Ser Val Thr Gly Leu Val Pro Ala Gly Ala Asp Glu Val Ser Ala
35 40 45
Gln Ala Ala Thr Ala Phe Thr Ser Glu Gly Ile Gln Leu Leu Ala Ser
50 55 60
Asn Ala Ser Ala Gln Asp Gln Leu His Arg Ala Gly Glu Ala Val Gln
65 70 75 80
Asp Val Ala Arg Thr Tyr Ser Gln Ile Asp Asp Gly Ala Ala Gly Val
85 90 95
Phe Ala Glu
<210> 33
<211> 460
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 33
Met Thr Gln Ser Gln Thr Val Thr Val Asp Gln Gln Glu Ile Leu Asn
1 5 10 15
Arg Ala Asn Glu Val Glu Ala Pro Met Ala Asp Pro Pro Thr Asp Val
20 25 30
Pro Ile Thr Pro Cys Glu Leu Thr Ala Ala Lys Asn Ala Ala Gln Gln
35 40 45
Leu Val Leu Ser Ala Asp Asn Met Arg Glu Tyr Leu Ala Ala Gly Ala
50 55 60
Lys Glu Arg Gln Arg Leu Ala Thr Ser Leu Arg Asn Ala Ala Lys Ala
65 70 75 80
Tyr Gly Glu Val Asp Glu Glu Ala Ala Thr Ala Leu Asp Asn Asp Gly
85 90 95
Glu Gly Thr Val Gln Ala Glu Ser Ala Gly Ala Val Gly Gly Asp Ser
100 105 110
Ser Ala Glu Leu Thr Asp Thr Pro Arg Val Ala Thr Ala Gly Glu Pro
115 120 125
Asn Phe Met Asp Leu Lys Glu Ala Ala Arg Lys Leu Glu Thr Gly Asp
130 135 140
Gln Gly Ala Ser Leu Ala His Phe Ala Asp Gly Trp Asn Thr Phe Asn
145 150 155 160
Leu Thr Leu Gln Gly Asp Val Lys Arg Phe Arg Gly Phe Asp Asn Trp
165 170 175
Glu Gly Asp Ala Ala Thr Ala Cys Glu Ala Ser Leu Asp Gln Gln Arg
180 185 190
Gln Trp Ile Leu His Met Ala Lys Leu Ser Ala Ala Met Ala Lys Gln
195 200 205
Ala Gln Tyr Val Ala Gln Leu His Val Trp Ala Arg Arg Glu His Pro
210 215 220
Thr Tyr Glu Asp Ile Val Gly Leu Glu Arg Leu Tyr Ala Glu Asn Pro
225 230 235 240
Ser Ala Arg Asp Gln Ile Leu Pro Val Tyr Ala Glu Tyr Gln Gln Arg
245 250 255
Ser Glu Lys Val Leu Thr Glu Tyr Asn Asn Lys Ala Ala Leu Glu Pro
260 265 270
Val Asn Pro Pro Lys Pro Pro Pro Ala Ile Lys Ile Asp Pro Pro Pro
275 280 285
Pro Pro Gln Glu Gln Gly Leu Ile Pro Gly Phe Leu Met Pro Pro Ser
290 295 300
Asp Gly Ser Gly Val Thr Pro Gly Thr Gly Met Pro Ala Ala Pro Met
305 310 315 320
Val Pro Pro Thr Gly Ser Pro Gly Gly Gly Leu Pro Ala Asp Thr Ala
325 330 335
Ala Gln Leu Thr Ser Ala Gly Arg Glu Ala Ala Ala Leu Ser Gly Asp
340 345 350
Val Ala Val Lys Ala Ala Ser Leu Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Val
355 360 365
Pro Ser Ala Pro Leu Gly Ser Ala Ile Gly Gly Ala Glu Ser Val Arg
370 375 380
Pro Ala Gly Ala Gly Asp Ile Ala Gly Leu Gly Gln Gly Arg Ala Gly
385 390 395 400
Gly Gly Ala Ala Leu Gly Gly Gly Gly Met Gly Met Pro Met Gly Ala
405 410 415
Ala His Gln Gly Gln Gly Gly Ala Lys Ser Lys Gly Ser Gln Gln Glu
420 425 430
Asp Glu Ala Leu Tyr Thr Glu Asp Arg Ala Trp Thr Glu Ala Val Ile
435 440 445
Gly Asn Arg Arg Arg Gln Asp Ser Lys Glu Ser Lys
450 455 460
<210> 34
<211> 2100
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 34
Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
20 25 30
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
35 40 45
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
50 55 60
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
65 70 75 80
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Gln
85 90 95
Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro Met Ala
100 105 110
Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro Ile Phe
115 120 125
Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu Pro Pro
130 135 140
Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly Pro Met
145 150 155 160
Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met Gly Leu
165 170 175
Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly Ser Gly
180 185 190
Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro Gly Ala
195 200 205
Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile Glu Lys
210 215 220
Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala
225 230 235 240
Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp
245 250 255
Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser
260 265 270
Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala
275 280 285
Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu
290 295 300
Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe
305 310 315 320
Ala Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly Met Glu
325 330 335
Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser Ala Ser
340 345 350
Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn Gly Gln
355 360 365
Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val Ser Ala
370 375 380
Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Thr Pro Met
385 390 395 400
Pro Ile Ala Ala Gly Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala Ser Lys
405 410 415
Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala Pro Pro
420 425 430
Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala Pro
435 440 445
Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Ala Pro Thr
450 455 460
Pro Thr Glu Ser Gln Leu Ala Pro Pro Arg Pro Pro Thr Pro Gln Thr
465 470 475 480
Pro Thr Gly Ala Pro Gln Gln Pro Glu Ser Pro Ala Pro His Val Pro
485 490 495
Ser His Gly Pro His Gln Pro Arg Arg Thr Ala Pro Ala Pro Pro Trp
500 505 510
Ala Lys Met Pro Ile Gly Glu Pro Pro Pro Ala Pro Ser Arg Pro Ser
515 520 525
Ala Ser Pro Ala Glu Pro Pro Thr Arg Pro Ala Pro Gln His Ser Arg
530 535 540
Arg Ala Arg Arg Gly His Arg Tyr Arg Thr Asp Thr Glu Arg Asn Val
545 550 555 560
Gly Lys Val Ala Thr Gly Pro Ser Ile Gln Ala Arg Leu Arg Ala Glu
565 570 575
Glu Ala Ser Gly Ala Gln Leu Ala Pro Gly Thr Glu Pro Ser Pro Ala
580 585 590
Pro Leu Gly Gln Pro Arg Ser Tyr Leu Ala Pro Pro Thr Arg Pro Ala
595 600 605
Pro Thr Glu Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro Gln Arg Asn Ser Gly Arg
610 615 620
Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu Ala Ala Gln His Ala Ala
625 630 635 640
Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr Thr Gly Gly Arg Arg Arg
645 650 655
Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr Gln Lys Ser Leu Arg Pro
660 665 670
Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val Lys Pro Gln Lys Pro Lys
675 680 685
Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln Arg Gly Trp Arg His Trp
690 695 700
Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser Pro Asp Glu Lys
705 710 715 720
Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn Pro Arg Gly Ser
725 730 735
Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly Gly Ala Gly Lys Thr Thr
740 745 750
Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val Arg Ala Asp Arg
755 760 765
Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn Leu Ala Asp Arg
770 775 780
Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val Leu Ala Glu Lys
785 790 795 800
Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr Ser Val Asn Ala
805 810 815
Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser Ser Ala Gln Arg
820 825 830
Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp Pro Ala Ser Arg
835 840 845
Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly Ala Gly Phe Phe Asp Pro
850 855 860
Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val Val Val Val Ala
865 870 875 880
Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val Ala Leu Asp Trp
885 890 895
Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg Ala Ser Val Val
900 905 910
Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala Val Lys Asp Leu
915 920 925
Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg Val Val Val Met
930 935 940
Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile Ser Leu Asp Leu
945 950 955 960
Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu Ala Ala Ala Leu
965 970 975
Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg Thr Glu Gln Gln Trp Asn
980 985 990
Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr
995 1000 1005
Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu
1010 1015 1020
Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln
1025 1030 1035 1040
Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn
1045 1050 1055
Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu
1060 1065 1070
Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser Arg Ala Phe Ile Ile Asp Pro
1075 1080 1085
Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly Leu Tyr Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile
1090 1095 1100
Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys
1105 1110 1115 1120
Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala Ala Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly
1125 1130 1135
Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe
1140 1145 1150
Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu Asp Arg Gln Leu Ile Ser Leu Ile His
1155 1160 1165
Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala
1170 1175 1180
Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val Arg Pro Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr
1185 1190 1195 1200
Ile Pro Val Val Gly His Ala Leu Ser Ala Lys Thr Leu Ile Asn Ala
1205 1210 1215
Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ala Lys Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala
1220 1225 1230
Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser Asp Val Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr
1235 1240 1245
Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys
1250 1255 1260
Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg
1265 1270 1275 1280
Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Ala Gly Val Pro Gly Leu Thr
1285 1290 1295
Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gln Val Thr Gly Leu Phe Gly Ala Ala
1300 1305 1310
Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala His Ala Asp Ser Leu Ala Ser
1315 1320 1325
Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe
1330 1335 1340
Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gln Val His Ala Ala Ser Thr Arg Gln
1345 1350 1355 1360
Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro Val Gly Ala Ala Ala Glu Gln
1365 1370 1375
Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu Val Ser Ala Gln Gly Ser Gln Gly Met
1380 1385 1390
Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met His Pro Ser Ser Gly Ala Ser
1395 1400 1405
Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser Glu Gly Ala Ala Ala Gly Thr
1410 1415 1420
Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu Ala Asp Ala Gly Gly Gly Gln
1425 1430 1435 1440
Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala
1445 1450 1455
Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile
1460 1465 1470
His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala
1475 1480 1485
Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys
1490 1495 1500
Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala
1505 1510 1515 1520
Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn
1525 1530 1535
Val Thr Gly Met Phe Ala Ala Pro Lys Thr Tyr Ser Glu Glu Leu Lys
1540 1545 1550
Gly Thr Asp Thr Gly Gln Ala Ser Gln Ile Gln Met Ser Asp Pro Ala
1555 1560 1565
Tyr Asn Ile Asn Ile Ser Leu Pro Ser Tyr Tyr Pro Asp Gln Lys Ser
1570 1575 1580
Leu Glu Asn Tyr Ile Ala Gln Thr Arg Asp Lys Phe Leu Ser Ala Ala
1585 1590 1595 1600
Thr Ser Ser Thr Pro Arg Glu Ala Pro Tyr Glu Leu Asn Ile Thr Ser
1605 1610 1615
Ala Thr Tyr Gln Ser Ala Ile Pro Pro Arg Gly Thr Gln Ala Val Val
1620 1625 1630
Leu Lys Val Tyr Gln Asn Ala Gly Gly Thr His Pro Thr Thr Thr Tyr
1635 1640 1645
Lys Ala Phe Asp Trp Asp Gln Ala Tyr Arg Lys Pro Ile Thr Tyr Asp
1650 1655 1660
Thr Leu Trp Gln Ala Asp Thr Asp Pro Leu Pro Val Val Phe Pro Ile
1665 1670 1675 1680
Val Gln Gly Glu Leu Ser Lys Gln Thr Gly Gln Gln Val Ser Ile Ala
1685 1690 1695
Pro Asn Ala Gly Leu Asp Pro Val Asn Tyr Gln Asn Phe Ala Val Thr
1700 1705 1710
Asn Asp Gly Val Ile Phe Phe Phe Asn Pro Gly Glu Leu Leu Pro Glu
1715 1720 1725
Ala Ala Gly Pro Thr Gln Val Leu Val Pro Arg Ser Ala Ile Asp Ser
1730 1735 1740
Met Leu Ala Gly Asp Leu Val Gly Pro Gly Ser Ala Glu Tyr Ala Ala
1745 1750 1755 1760
Ala Asn Pro Thr Gly Pro Ala Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro
1765 1770 1775
Val Ala Val Ala Ala Ser Asn Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala
1780 1785 1790
Ala Leu Ser Gly Gln Leu Asn Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu
1795 1800 1805
Asn Ser Gly Gln Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser
1810 1815 1820
Lys Leu Pro Ala Ser Thr Ile Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu
1825 1830 1835 1840
Leu Thr Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro
1845 1850 1855
Ala Asn Val Val Gly Thr Arg Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr
1860 1865 1870
Val Thr Gly Gln Gly Asn Ser Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val
1875 1880 1885
Ser Gly Gly Val Ser Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser
1890 1895 1900
Val Leu Met Pro Pro Ala Val Ser Gln Asp Thr Ser Pro Lys Pro Ala
1905 1910 1915 1920
Thr Ser Pro Ala Ala Pro Val Thr Thr Ala Ala Met Ala Asp Pro Ala
1925 1930 1935
Ala Asp Leu Ile Gly Arg Gly Ser Ala Gln Tyr Ala Ala Gln Asn Pro
1940 1945 1950
Thr Gly Pro Gly Ser Val Ala Gly Met Ala Gln Asp Pro Val Ala Thr
1955 1960 1965
Ala Ala Ser Asn Asn Pro Met Leu Ser Thr Leu Thr Ser Ala Leu Ser
1970 1975 1980
Gly Lys Leu Asn Pro Asp Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Gly Gly
1985 1990 1995 2000
Glu Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Asp Lys Leu Pro
2005 2010 2015
Ala Ala Thr Ile Asp Gln Leu Lys Thr Asp Ala Lys Leu Leu Ser Ser
2020 2025 2030
Ile Leu Thr Tyr His Val Ile Ala Gly Gln Ala Ser Pro Ser Arg Ile
2035 2040 2045
Asp Gly Thr His Gln Thr Leu Gln Gly Ala Asp Leu Thr Val Ile Gly
2050 2055 2060
Ala Arg Asp Asp Leu Met Val Asn Asn Ala Gly Leu Val Ser Gly Gly
2065 2070 2075 2080
Val His Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Thr Val Leu Met
2085 2090 2095
Pro Pro Ala Gln
2100
<210> 35
<211> 1771
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 35
Met Gln Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro
1 5 10 15
Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro
20 25 30
Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu
35 40 45
Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly
50 55 60
Pro Met Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met
65 70 75 80
Gly Leu Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly
85 90 95
Ser Gly Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro
100 105 110
Gly Ala Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile
115 120 125
Glu Lys Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu
130 135 140
Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu
145 150 155 160
Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly
165 170 175
Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala
180 185 190
Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile
195 200 205
Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly
210 215 220
Met Phe Ala Trp Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser
225 230 235 240
Pro Asp Glu Lys Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn
245 250 255
Pro Arg Gly Ser Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly Gly Ala
260 265 270
Gly Lys Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val
275 280 285
Arg Ala Asp Arg Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn
290 295 300
Leu Ala Asp Arg Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val
305 310 315 320
Leu Ala Glu Lys Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr
325 330 335
Ser Val Asn Ala Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser
340 345 350
Ser Ala Gln Arg Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp
355 360 365
Pro Ala Ser Arg Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly Ala Gly
370 375 380
Phe Phe Asp Pro Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val
385 390 395 400
Val Val Val Ala Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val
405 410 415
Ala Leu Asp Trp Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg
420 425 430
Ala Ser Val Val Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala
435 440 445
Val Lys Asp Leu Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg
450 455 460
Val Val Val Met Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile
465 470 475 480
Ser Leu Asp Leu Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu
485 490 495
Ala Ala Ala Leu Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg Thr Glu
500 505 510
Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln
515 520 525
Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser
530 535 540
Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr
545 550 555 560
Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn
565 570 575
Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met
580 585 590
Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Thr Glu Asn Leu
595 600 605
Thr Val Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn
610 615 620
Ala Ala Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly
625 630 635 640
Glu Ser Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp
645 650 655
Thr Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
660 665 670
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
675 680 685
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
690 695 700
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
705 710 715 720
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
725 730 735
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser
740 745 750
Arg Ala Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly Leu Tyr
755 760 765
Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu Tyr Ser
770 775 780
Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala Ala Phe
785 790 795 800
Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala Gly Lys
805 810 815
Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu Asp Arg
820 825 830
Gln Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln Thr Thr
835 840 845
Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val Arg Pro
850 855 860
Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala Leu Ser
865 870 875 880
Ala Lys Thr Leu Ile Asn Ala Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ala Lys
885 890 895
Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser Asp Val
900 905 910
Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr
915 920 925
Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp
930 935 940
Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe
945 950 955 960
Ala Gly Val Pro Gly Leu Thr Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gln Val
965 970 975
Thr Gly Leu Phe Gly Ala Ala Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala
980 985 990
His Ala Asp Ser Leu Ala Ser Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly
995 1000 1005
Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gln Val
1010 1015 1020
His Ala Ala Ser Thr Arg Gln Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro
1025 1030 1035 1040
Val Gly Ala Ala Ala Glu Gln Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu Val Ser
1045 1050 1055
Ala Gln Gly Ser Gln Gly Met Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met
1060 1065 1070
His Pro Ser Ser Gly Ala Ser Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser
1075 1080 1085
Glu Gly Ala Ala Ala Gly Thr Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu
1090 1095 1100
Ala Asp Ala Gly Gly Gly Gln Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val Thr
1105 1110 1115 1120
Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile
1125 1130 1135
Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln
1140 1145 1150
Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala
1155 1160 1165
Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn
1170 1175 1180
Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala
1185 1190 1195 1200
Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ala Pro Lys
1205 1210 1215
Thr Tyr Ser Glu Glu Leu Lys Gly Thr Asp Thr Gly Gln Ala Ser Gln
1220 1225 1230
Ile Gln Met Ser Asp Pro Ala Tyr Asn Ile Asn Ile Ser Leu Pro Ser
1235 1240 1245
Tyr Tyr Pro Asp Gln Lys Ser Leu Glu Asn Tyr Ile Ala Gln Thr Arg
1250 1255 1260
Asp Lys Phe Leu Ser Ala Ala Thr Ser Ser Thr Pro Arg Glu Ala Pro
1265 1270 1275 1280
Tyr Glu Leu Asn Ile Thr Ser Ala Thr Tyr Gln Ser Ala Ile Pro Pro
1285 1290 1295
Arg Gly Thr Gln Ala Val Val Leu Lys Val Tyr Gln Asn Ala Gly Gly
1300 1305 1310
Thr His Pro Thr Thr Thr Tyr Lys Ala Phe Asp Trp Asp Gln Ala Tyr
1315 1320 1325
Arg Lys Pro Ile Thr Tyr Asp Thr Leu Trp Gln Ala Asp Thr Asp Pro
1330 1335 1340
Leu Pro Val Val Phe Pro Ile Val Gln Gly Glu Leu Ser Lys Gln Thr
1345 1350 1355 1360
Gly Gln Gln Val Ser Ile Ala Pro Asn Ala Gly Leu Asp Pro Val Asn
1365 1370 1375
Tyr Gln Asn Phe Ala Val Thr Asn Asp Gly Val Ile Phe Phe Phe Asn
1380 1385 1390
Pro Gly Glu Leu Leu Pro Glu Ala Ala Gly Pro Thr Gln Val Leu Val
1395 1400 1405
Pro Arg Ser Ala Ile Asp Ser Met Leu Ala Gly Asp Leu Val Gly Pro
1410 1415 1420
Gly Ser Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly Pro Ala Ser Val
1425 1430 1435 1440
Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala Ser Asn Asn Pro
1445 1450 1455
Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln Leu Asn Pro Gln
1460 1465 1470
Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr Thr Val Phe Ala
1475 1480 1485
Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser Thr Ile Asp Glu
1490 1495 1500
Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu Thr Tyr His Val
1505 1510 1515 1520
Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly Thr Arg Gln Thr
1525 1530 1535
Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly Asn Ser Leu Lys
1540 1545 1550
Val Gly Asn Ala Asp Val Val Ser Gly Gly Val Ser Thr Ala Asn Ala
1555 1560 1565
Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro Ala Val Ser Gln
1570 1575 1580
Asp Thr Ser Pro Lys Pro Ala Thr Ser Pro Ala Ala Pro Val Thr Thr
1585 1590 1595 1600
Ala Ala Met Ala Asp Pro Ala Ala Asp Leu Ile Gly Arg Gly Ser Ala
1605 1610 1615
Gln Tyr Ala Ala Gln Asn Pro Thr Gly Pro Gly Ser Val Ala Gly Met
1620 1625 1630
Ala Gln Asp Pro Val Ala Thr Ala Ala Ser Asn Asn Pro Met Leu Ser
1635 1640 1645
Thr Leu Thr Ser Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asn Pro Asp Val Asn Leu
1650 1655 1660
Val Asp Thr Leu Asn Gly Gly Glu Tyr Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn
1665 1670 1675 1680
Ala Ala Phe Asp Lys Leu Pro Ala Ala Thr Ile Asp Gln Leu Lys Thr
1685 1690 1695
Asp Ala Lys Leu Leu Ser Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Ile Ala Gly
1700 1705 1710
Gln Ala Ser Pro Ser Arg Ile Asp Gly Thr His Gln Thr Leu Gln Gly
1715 1720 1725
Ala Asp Leu Thr Val Ile Gly Ala Arg Asp Asp Leu Met Val Asn Asn
1730 1735 1740
Ala Gly Leu Val Ser Gly Gly Val His Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr
1745 1750 1755 1760
Met Ile Asp Thr Val Leu Met Pro Pro Ala Gln
1765 1770
<210> 36
<211> 1595
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 36
Met Gln Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro
1 5 10 15
Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro
20 25 30
Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu
35 40 45
Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly
50 55 60
Pro Met Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met
65 70 75 80
Gly Leu Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly
85 90 95
Ser Gly Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro
100 105 110
Gly Ala Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile
115 120 125
Glu Lys Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu
130 135 140
Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu
145 150 155 160
Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly
165 170 175
Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala
180 185 190
Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile
195 200 205
Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly
210 215 220
Met Phe Ala Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly
225 230 235 240
Met Glu Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser
245 250 255
Ala Ser Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn
260 265 270
Gly Gln Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val
275 280 285
Ser Ala Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Thr
290 295 300
Pro Met Pro Ile Ala Ala Gly Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala
305 310 315 320
Ser Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala
325 330 335
Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro
340 345 350
Ala Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Ala
355 360 365
Pro Thr Pro Thr Glu Ser Gln Leu Ala Pro Pro Arg Pro Pro Thr Pro
370 375 380
Gln Thr Pro Thr Gly Ala Pro Gln Gln Pro Glu Ser Pro Ala Pro His
385 390 395 400
Val Pro Ser His Gly Pro His Gln Pro Arg Arg Thr Ala Pro Ala Pro
405 410 415
Pro Trp Ala Lys Met Pro Ile Gly Glu Pro Pro Pro Ala Pro Ser Arg
420 425 430
Pro Ser Ala Ser Pro Ala Glu Pro Pro Thr Arg Pro Ala Pro Gln His
435 440 445
Ser Arg Arg Ala Arg Arg Gly His Arg Tyr Arg Thr Asp Thr Glu Arg
450 455 460
Asn Val Gly Lys Val Ala Thr Gly Pro Ser Ile Gln Ala Arg Leu Arg
465 470 475 480
Ala Glu Glu Ala Ser Gly Ala Gln Leu Ala Pro Gly Thr Glu Pro Ser
485 490 495
Pro Ala Pro Leu Gly Gln Pro Arg Ser Tyr Leu Ala Pro Pro Thr Arg
500 505 510
Pro Ala Pro Thr Glu Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro Gln Arg Asn Ser
515 520 525
Gly Arg Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu Ala Ala Gln His
530 535 540
Ala Ala Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr Thr Gly Gly Arg
545 550 555 560
Arg Arg Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr Gln Lys Ser Leu
565 570 575
Arg Pro Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val Lys Pro Gln Lys
580 585 590
Pro Lys Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln Arg Gly Trp Arg
595 600 605
His Trp Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser Pro Asp
610 615 620
Glu Lys Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn Pro Arg
625 630 635 640
Gly Ser Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly Gly Ala Gly Lys
645 650 655
Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val Arg Ala
660 665 670
Asp Arg Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn Leu Ala
675 680 685
Asp Arg Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val Leu Ala
690 695 700
Glu Lys Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr Ser Val
705 710 715 720
Asn Ala Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser Ser Ala
725 730 735
Gln Arg Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp Pro Ala
740 745 750
Ser Arg Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly Ala Gly Phe Phe
755 760 765
Asp Pro Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val Val Val
770 775 780
Val Ala Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val Ala Leu
785 790 795 800
Asp Trp Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg Ala Ser
805 810 815
Val Val Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala Val Lys
820 825 830
Asp Leu Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg Val Val
835 840 845
Val Met Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile Ser Leu
850 855 860
Asp Leu Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu Ala Ala
865 870 875 880
Ala Leu Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg Thr Glu Gln Gln
885 890 895
Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn
900 905 910
Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr
915 920 925
Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly
930 935 940
Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu
945 950 955 960
Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser
965 970 975
Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Thr Glu Asn Leu Thr Val
980 985 990
Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn Ala Ala
995 1000 1005
Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly Glu Ser
1010 1015 1020
Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp Thr Thr
1025 1030 1035 1040
Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile
1045 1050 1055
Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln
1060 1065 1070
Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala
1075 1080 1085
Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn
1090 1095 1100
Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala
1105 1110 1115 1120
Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser Arg Ala
1125 1130 1135
Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly Leu Tyr Asp Leu
1140 1145 1150
Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu Tyr Ser Ser Leu
1155 1160 1165
Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala Ala Phe Pro Gly
1170 1175 1180
Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala Gly Lys Asn Arg
1185 1190 1195 1200
Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu Asp Arg Gln Leu
1205 1210 1215
Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln Thr Thr Arg Asp
1220 1225 1230
Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val Arg Pro Val Ala
1235 1240 1245
Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala Leu Ser Ala Lys
1250 1255 1260
Thr Leu Ile Asn Ala Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ala Lys Leu Ala
1265 1270 1275 1280
Glu Leu Val Ala Ala Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser Asp Val Ala Asp
1285 1290 1295
Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn Ala
1300 1305 1310
Leu Asn Gly Leu Lys Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val Thr
1315 1320 1325
Gly Leu Phe Ser Arg Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Ala Gly
1330 1335 1340
Val Pro Gly Leu Thr Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gln Val Thr Gly
1345 1350 1355 1360
Leu Phe Gly Ala Ala Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala His Ala
1365 1370 1375
Asp Ser Leu Ala Ser Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly Ile Gly
1380 1385 1390
Gly Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gln Val His Ala
1395 1400 1405
Ala Ser Thr Arg Gln Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro Val Gly
1410 1415 1420
Ala Ala Ala Glu Gln Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu Val Ser Ala Gln
1425 1430 1435 1440
Gly Ser Gln Gly Met Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met His Pro
1445 1450 1455
Ser Ser Gly Ala Ser Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser Glu Gly
1460 1465 1470
Ala Ala Ala Gly Thr Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu Ala Asp
1475 1480 1485
Ala Gly Gly Gly Gln Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val Thr Glu Gln
1490 1495 1500
Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly
1505 1510 1515 1520
Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu
1525 1530 1535
Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln
1540 1545 1550
Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala
1555 1560 1565
Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala
1570 1575 1580
Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala
1585 1590 1595
<210> 37
<211> 1871
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 37
Met Gln Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro
1 5 10 15
Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro
20 25 30
Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu
35 40 45
Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly
50 55 60
Pro Met Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met
65 70 75 80
Gly Leu Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly
85 90 95
Ser Gly Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro
100 105 110
Gly Ala Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile
115 120 125
Glu Lys Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu
130 135 140
Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu
145 150 155 160
Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly
165 170 175
Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala
180 185 190
Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile
195 200 205
Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly
210 215 220
Met Phe Ala Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly
225 230 235 240
Met Glu Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser
245 250 255
Ala Ser Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn
260 265 270
Gly Gln Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val
275 280 285
Ser Ala Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Thr
290 295 300
Pro Met Pro Ile Ala Ala Gly Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala
305 310 315 320
Ser Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala
325 330 335
Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro
340 345 350
Ala Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Ala
355 360 365
Pro Thr Pro Thr Glu Ser Gln Leu Ala Pro Pro Arg Pro Pro Thr Pro
370 375 380
Gln Thr Pro Thr Gly Ala Pro Gln Gln Pro Glu Ser Pro Ala Pro His
385 390 395 400
Val Pro Ser His Gly Pro His Gln Pro Arg Arg Thr Ala Pro Ala Pro
405 410 415
Pro Trp Ala Lys Met Pro Ile Gly Glu Pro Pro Pro Ala Pro Ser Arg
420 425 430
Pro Ser Ala Ser Pro Ala Glu Pro Pro Thr Arg Pro Ala Pro Gln His
435 440 445
Ser Arg Arg Ala Arg Arg Gly His Arg Tyr Arg Thr Asp Thr Glu Arg
450 455 460
Asn Val Gly Lys Val Ala Thr Gly Pro Ser Ile Gln Ala Arg Leu Arg
465 470 475 480
Ala Glu Glu Ala Ser Gly Ala Gln Leu Ala Pro Gly Thr Glu Pro Ser
485 490 495
Pro Ala Pro Leu Gly Gln Pro Arg Ser Tyr Leu Ala Pro Pro Thr Arg
500 505 510
Pro Ala Pro Thr Glu Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro Gln Arg Asn Ser
515 520 525
Gly Arg Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu Ala Ala Gln His
530 535 540
Ala Ala Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr Thr Gly Gly Arg
545 550 555 560
Arg Arg Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr Gln Lys Ser Leu
565 570 575
Arg Pro Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val Lys Pro Gln Lys
580 585 590
Pro Lys Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln Arg Gly Trp Arg
595 600 605
His Trp Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser Pro Asp
610 615 620
Glu Lys Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn Pro Arg
625 630 635 640
Gly Ser Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly Gly Ala Gly Lys
645 650 655
Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val Arg Ala
660 665 670
Asp Arg Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn Leu Ala
675 680 685
Asp Arg Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val Leu Ala
690 695 700
Glu Lys Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr Ser Val
705 710 715 720
Asn Ala Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser Ser Ala
725 730 735
Gln Arg Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp Pro Ala
740 745 750
Ser Arg Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly Ala Gly Phe Phe
755 760 765
Asp Pro Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val Val Val
770 775 780
Val Ala Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val Ala Leu
785 790 795 800
Asp Trp Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg Ala Ser
805 810 815
Val Val Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala Val Lys
820 825 830
Asp Leu Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg Val Val
835 840 845
Val Met Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile Ser Leu
850 855 860
Asp Leu Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu Ala Ala
865 870 875 880
Ala Leu Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg Thr Glu Asn Leu
885 890 895
Thr Val Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn
900 905 910
Ala Ala Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly
915 920 925
Glu Ser Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp
930 935 940
Thr Ser Arg Ala Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly
945 950 955 960
Leu Tyr Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu
965 970 975
Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala
980 985 990
Ala Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala
995 1000 1005
Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu
1010 1015 1020
Asp Arg Gln Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln
1025 1030 1035 1040
Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val
1045 1050 1055
Arg Pro Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala
1060 1065 1070
Leu Ser Ala Lys Thr Leu Ile Asn Ala Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu
1075 1080 1085
Ala Lys Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser
1090 1095 1100
Asp Val Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe
1105 1110 1115 1120
Ile Thr Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr
1125 1130 1135
Gly Trp Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser
1140 1145 1150
Phe Phe Ala Gly Val Pro Gly Leu Thr Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser
1155 1160 1165
Gln Val Thr Gly Leu Phe Gly Ala Ala Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly
1170 1175 1180
Leu Ala His Ala Asp Ser Leu Ala Ser Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu
1185 1190 1195 1200
Ala Gly Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala
1205 1210 1215
Gln Val His Ala Ala Ser Thr Arg Gln Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp
1220 1225 1230
Gly Pro Val Gly Ala Ala Ala Glu Gln Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu
1235 1240 1245
Val Ser Ala Gln Gly Ser Gln Gly Met Gly Gly Pro Val Gly Met Gly
1250 1255 1260
Gly Met His Pro Ser Ser Gly Ala Ser Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys
1265 1270 1275 1280
Tyr Ser Glu Gly Ala Ala Ala Gly Thr Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro
1285 1290 1295
Val Glu Ala Asp Ala Gly Gly Gly Gln Lys Val Leu Val Arg Asn Val
1300 1305 1310
Val Ala Pro Lys Thr Tyr Ser Glu Glu Leu Lys Gly Thr Asp Thr Gly
1315 1320 1325
Gln Ala Ser Gln Ile Gln Met Ser Asp Pro Ala Tyr Asn Ile Asn Ile
1330 1335 1340
Ser Leu Pro Ser Tyr Tyr Pro Asp Gln Lys Ser Leu Glu Asn Tyr Ile
1345 1350 1355 1360
Ala Gln Thr Arg Asp Lys Phe Leu Ser Ala Ala Thr Ser Ser Thr Pro
1365 1370 1375
Arg Glu Ala Pro Tyr Glu Leu Asn Ile Thr Ser Ala Thr Tyr Gln Ser
1380 1385 1390
Ala Ile Pro Pro Arg Gly Thr Gln Ala Val Val Leu Lys Val Tyr Gln
1395 1400 1405
Asn Ala Gly Gly Thr His Pro Thr Thr Thr Tyr Lys Ala Phe Asp Trp
1410 1415 1420
Asp Gln Ala Tyr Arg Lys Pro Ile Thr Tyr Asp Thr Leu Trp Gln Ala
1425 1430 1435 1440
Asp Thr Asp Pro Leu Pro Val Val Phe Pro Ile Val Gln Gly Glu Leu
1445 1450 1455
Ser Lys Gln Thr Gly Gln Gln Val Ser Ile Ala Pro Asn Ala Gly Leu
1460 1465 1470
Asp Pro Val Asn Tyr Gln Asn Phe Ala Val Thr Asn Asp Gly Val Ile
1475 1480 1485
Phe Phe Phe Asn Pro Gly Glu Leu Leu Pro Glu Ala Ala Gly Pro Thr
1490 1495 1500
Gln Val Leu Val Pro Arg Ser Ala Ile Asp Ser Met Leu Ala Gly Asp
1505 1510 1515 1520
Leu Val Gly Pro Gly Ser Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly
1525 1530 1535
Pro Ala Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala
1540 1545 1550
Ser Asn Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln
1555 1560 1565
Leu Asn Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr
1570 1575 1580
Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser
1585 1590 1595 1600
Thr Ile Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu
1605 1610 1615
Thr Tyr His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly
1620 1625 1630
Thr Arg Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly
1635 1640 1645
Asn Ser Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val Ser Gly Gly Val Ser
1650 1655 1660
Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro
1665 1670 1675 1680
Ala Val Ser Gln Asp Thr Ser Pro Lys Pro Ala Thr Ser Pro Ala Ala
1685 1690 1695
Pro Val Thr Thr Ala Ala Met Ala Asp Pro Ala Ala Asp Leu Ile Gly
1700 1705 1710
Arg Gly Ser Ala Gln Tyr Ala Ala Gln Asn Pro Thr Gly Pro Gly Ser
1715 1720 1725
Val Ala Gly Met Ala Gln Asp Pro Val Ala Thr Ala Ala Ser Asn Asn
1730 1735 1740
Pro Met Leu Ser Thr Leu Thr Ser Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asn Pro
1745 1750 1755 1760
Asp Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Gly Gly Glu Tyr Thr Val Phe
1765 1770 1775
Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Asp Lys Leu Pro Ala Ala Thr Ile Asp
1780 1785 1790
Gln Leu Lys Thr Asp Ala Lys Leu Leu Ser Ser Ile Leu Thr Tyr His
1795 1800 1805
Val Ile Ala Gly Gln Ala Ser Pro Ser Arg Ile Asp Gly Thr His Gln
1810 1815 1820
Thr Leu Gln Gly Ala Asp Leu Thr Val Ile Gly Ala Arg Asp Asp Leu
1825 1830 1835 1840
Met Val Asn Asn Ala Gly Leu Val Ser Gly Gly Val His Thr Ala Asn
1845 1850 1855
Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Thr Val Leu Met Pro Pro Ala Gln
1860 1865 1870
<210> 38
<211> 1130
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 38
Met Gln Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro
1 5 10 15
Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro
20 25 30
Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu
35 40 45
Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly
50 55 60
Pro Met Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met
65 70 75 80
Gly Leu Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly
85 90 95
Ser Gly Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro
100 105 110
Gly Ala Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile
115 120 125
Glu Lys Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu
130 135 140
Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu
145 150 155 160
Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly
165 170 175
Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala
180 185 190
Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile
195 200 205
Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly
210 215 220
Met Phe Ala Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly
225 230 235 240
Met Glu Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser
245 250 255
Ala Ser Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn
260 265 270
Gly Gln Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val
275 280 285
Ser Ala Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Thr
290 295 300
Pro Met Pro Ile Ala Ala Gly Glu Pro Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala
305 310 315 320
Ser Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro Ala
325 330 335
Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Glu Pro
340 345 350
Ala Pro Pro Lys Pro Pro Thr Pro Pro Met Pro Ile Ala Gly Pro Ala
355 360 365
Pro Thr Pro Thr Glu Ser Gln Leu Ala Pro Pro Arg Pro Pro Thr Pro
370 375 380
Gln Thr Pro Thr Gly Ala Pro Gln Gln Pro Glu Ser Pro Ala Pro His
385 390 395 400
Val Pro Ser His Gly Pro His Gln Pro Arg Arg Thr Ala Pro Ala Pro
405 410 415
Pro Trp Ala Lys Met Pro Ile Gly Glu Pro Pro Pro Ala Pro Ser Arg
420 425 430
Pro Ser Ala Ser Pro Ala Glu Pro Pro Thr Arg Pro Ala Pro Gln His
435 440 445
Ser Arg Arg Ala Arg Arg Gly His Arg Tyr Arg Thr Asp Thr Glu Arg
450 455 460
Asn Val Gly Lys Val Ala Thr Gly Pro Ser Ile Gln Ala Arg Leu Arg
465 470 475 480
Ala Glu Glu Ala Ser Gly Ala Gln Leu Ala Pro Gly Thr Glu Pro Ser
485 490 495
Pro Ala Pro Leu Gly Gln Pro Arg Ser Tyr Leu Ala Pro Pro Thr Arg
500 505 510
Pro Ala Pro Thr Glu Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro Gln Arg Asn Ser
515 520 525
Gly Arg Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu Ala Ala Gln His
530 535 540
Ala Ala Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr Thr Gly Gly Arg
545 550 555 560
Arg Arg Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr Gln Lys Ser Leu
565 570 575
Arg Pro Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val Lys Pro Gln Lys
580 585 590
Pro Lys Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln Arg Gly Trp Arg
595 600 605
His Trp Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly Leu Ser Pro Asp
610 615 620
Glu Lys Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg Arg Asn Pro Arg
625 630 635 640
Gly Ser Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly Gly Ala Gly Lys
645 650 655
Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala Gln Val Arg Ala
660 665 670
Asp Arg Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala Gly Asn Leu Ala
675 680 685
Asp Arg Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala Asp Val Leu Ala
690 695 700
Glu Lys Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala His Thr Ser Val
705 710 715 720
Asn Ala Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu Tyr Ser Ser Ala
725 730 735
Gln Arg Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile Ala Asp Pro Ala
740 745 750
Ser Arg Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly Ala Gly Phe Phe
755 760 765
Asp Pro Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser Gly Val Val Val
770 775 780
Val Ala Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala Ser Val Ala Leu
785 790 795 800
Asp Trp Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala Ser Arg Ala Ser
805 810 815
Val Val Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn Val Ala Val Lys
820 825 830
Asp Leu Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro Gly Arg Val Val
835 840 845
Val Met Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr Glu Ile Ser Leu
850 855 860
Asp Leu Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu Glu Leu Ala Ala
865 870 875 880
Ala Leu Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg Thr Glu Asn Leu
885 890 895
Thr Val Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn
900 905 910
Ala Ala Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly
915 920 925
Glu Ser Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp
930 935 940
Thr Ser Arg Ala Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly
945 950 955 960
Leu Tyr Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu
965 970 975
Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala
980 985 990
Ala Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala
995 1000 1005
Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu
1010 1015 1020
Asp Arg Gln Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln
1025 1030 1035 1040
Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val
1045 1050 1055
Arg Pro Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala
1060 1065 1070
Leu Ser Ala Lys Thr Leu Ile Asn Ala Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu
1075 1080 1085
Ala Lys Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser
1090 1095 1100
Asp Val Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe
1105 1110 1115 1120
Ile Thr Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys Glu
1125 1130
<210> 39
<211> 760
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 39
Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
20 25 30
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
35 40 45
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
50 55 60
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
65 70 75 80
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Lys
85 90 95
Val Lys Asn Thr Ile Ala Ala Thr Ser Phe Ala Ala Ala Gly Leu Ala
100 105 110
Ala Leu Ala Val Ala Val Ser Pro Pro Ala Ala Ala Gly Asp Leu Val
115 120 125
Gly Pro Gly Cys Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly Pro Ala
130 135 140
Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala Ser Asn
145 150 155 160
Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln Leu Asn
165 170 175
Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr Thr Val
180 185 190
Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser Thr Ile
195 200 205
Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu Thr Tyr
210 215 220
His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly Thr Arg
225 230 235 240
Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly Asn Ser
245 250 255
Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val Cys Gly Gly Val Ser Thr Ala
260 265 270
Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro Ala Thr
275 280 285
Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile
290 295 300
Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln
305 310 315 320
Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala
325 330 335
Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn
340 345 350
Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala
355 360 365
Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser Leu Leu
370 375 380
Asp Ala His Ile Pro Gln Leu Ile Ala Ser His Thr Ala Phe Ala Ala
385 390 395 400
Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gln Ala Glu Gln Gln Ala
405 410 415
Met Ser Ala Gln Ala Phe His Gln Gly Glu Ser Ala Ala Ala Phe Gln
420 425 430
Gly Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys Val Asn Thr Leu
435 440 445
Leu Asp Ile Ala Gln Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala Gly Thr Tyr Val
450 455 460
Ala Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ser Ser Tyr Thr Gly Phe Thr Glu Gln
465 470 475 480
Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly
485 490 495
Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu
500 505 510
Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln
515 520 525
Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala
530 535 540
Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala
545 550 555 560
Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser Gln Ile Met Tyr
565 570 575
Asn Tyr Pro Ala Met Met Ala His Ala Gly Asp Met Ala Gly Tyr Ala
580 585 590
Gly Thr Leu Gln Ser Leu Gly Ala Asp Ile Ala Ser Glu Gln Ala Val
595 600 605
Leu Ser Ser Ala Trp Gln Gly Asp Thr Gly Ile Thr Tyr Gln Gly Trp
610 615 620
Gln Thr Gln Trp Asn Gln Ala Leu Glu Asp Leu Val Arg Ala Tyr Gln
625 630 635 640
Ser Met Ser Gly Thr His Glu Ser Asn Thr Met Ala Met Leu Ala Arg
645 650 655
Asp Gly Ala Glu Ala Ala Lys Trp Gly Gly Thr Glu Gln Gln Trp Asn
660 665 670
Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr
675 680 685
Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu
690 695 700
Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln
705 710 715 720
Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn
725 730 735
Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu
740 745 750
Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala
755 760
<210> 40
<211> 478
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 40
Met Lys Val Lys Asn Thr Ile Ala Ala Thr Ser Phe Ala Ala Ala Gly
1 5 10 15
Leu Ala Ala Leu Ala Val Ala Val Ser Pro Pro Ala Ala Ala Gly Asp
20 25 30
Leu Val Gly Pro Gly Cys Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly
35 40 45
Pro Ala Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala
50 55 60
Ser Asn Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln
65 70 75 80
Leu Asn Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr
85 90 95
Thr Val Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser
100 105 110
Thr Ile Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu
115 120 125
Thr Tyr His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly
130 135 140
Thr Arg Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly
145 150 155 160
Asn Ser Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val Cys Gly Gly Val Ser
165 170 175
Thr Ala Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro
180 185 190
Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
195 200 205
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
210 215 220
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
225 230 235 240
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
245 250 255
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
260 265 270
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ser
275 280 285
Leu Leu Asp Ala His Ile Pro Gln Leu Ile Ala Ser His Thr Ala Phe
290 295 300
Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met Arg His Thr Ile Gly Gln Ala Glu Gln
305 310 315 320
Gln Ala Met Ser Ala Gln Ala Phe His Gln Gly Glu Ser Ala Ala Ala
325 330 335
Phe Gln Gly Ala His Ala Arg Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys Val Asn
340 345 350
Thr Leu Leu Asp Ile Ala Gln Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala Gly Thr
355 360 365
Tyr Val Ala Ala Asp Ala Ala Ala Ala Ser Ser Tyr Thr Gly Phe Ser
370 375 380
Gln Ile Met Tyr Asn Tyr Pro Ala Met Met Ala His Ala Gly Asp Met
385 390 395 400
Ala Gly Tyr Ala Gly Thr Leu Gln Ser Leu Gly Ala Asp Ile Ala Ser
405 410 415
Glu Gln Ala Val Leu Ser Ser Ala Trp Gln Gly Asp Thr Gly Ile Thr
420 425 430
Tyr Gln Gly Trp Gln Thr Gln Trp Asn Gln Ala Leu Glu Asp Leu Val
435 440 445
Arg Ala Tyr Gln Ser Met Ser Gly Thr His Glu Ser Asn Thr Met Ala
450 455 460
Met Leu Ala Arg Asp Gly Ala Glu Ala Ala Lys Trp Gly Gly
465 470 475
<210> 41
<211> 1096
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 41
Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
20 25 30
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
35 40 45
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
50 55 60
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
65 70 75 80
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Met
85 90 95
Asp Leu Pro Gly Asn Asp Phe Asp Ser Asn Asp Phe Asp Ala Val Asp
100 105 110
Leu Trp Gly Ala Asp Gly Ala Glu Gly Trp Thr Ala Asp Pro Ile Ile
115 120 125
Gly Val Gly Ser Ala Ala Thr Pro Asp Thr Gly Pro Asp Leu Asp Asn
130 135 140
Ala His Gly Gln Ala Glu Thr Asp Thr Glu Gln Glu Ile Ala Leu Phe
145 150 155 160
Thr Val Thr Asn Pro Pro Arg Thr Val Ser Val Ser Thr Leu Met Asp
165 170 175
Gly Arg Ile Asp His Val Glu Leu Ser Ala Arg Val Ala Trp Met Ser
180 185 190
Glu Ser Gln Leu Ala Ser Glu Ile Leu Val Ile Ala Asp Leu Ala Arg
195 200 205
Gln Lys Ala Gln Ser Ala Gln Tyr Ala Phe Ile Leu Asp Arg Met Ser
210 215 220
Gln Gln Val Asp Ala Asp Glu His Arg Val Ala Leu Leu Arg Lys Thr
225 230 235 240
Val Gly Glu Thr Trp Gly Leu Pro Ser Pro Glu Glu Ala Ala Ala Ala
245 250 255
Glu Ala Glu Val Phe Ala Thr Arg Tyr Ser Asp Asp Ser Pro Ala Pro
260 265 270
Asp Asp Glu Ser Asp Pro Trp Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala
275 280 285
Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile
290 295 300
His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala
305 310 315 320
Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys
325 330 335
Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala
340 345 350
Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn
355 360 365
Val Thr Gly Met Phe Ala Met Thr Glu Asn Leu Thr Val Gln Pro Glu
370 375 380
Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn Ala Ala Val Asp Ala
385 390 395 400
Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly Glu Ser Val Ala Ile
405 410 415
Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp Thr Leu Asn Val Tyr
420 425 430
Leu Thr Ala His Asn Ala Leu Gly Ser Ser Leu His Thr Ala Gly Val
435 440 445
Asp Leu Ala Lys Ser Leu Arg Ile Ala Ala Lys Ile Tyr Ser Glu Ala
450 455 460
Asp Glu Ala Trp Arg Lys Ala Ile Asp Gly Leu Phe Thr Met Thr Glu
465 470 475 480
Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln
485 490 495
Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser
500 505 510
Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr
515 520 525
Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn
530 535 540
Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met
545 550 555 560
Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Met Thr Gly Phe
565 570 575
Leu Gly Val Val Pro Ser Phe Leu Lys Val Leu Ala Gly Met His Asn
580 585 590
Glu Ile Val Gly Asp Ile Lys Arg Ala Thr Asp Thr Val Ala Gly Ile
595 600 605
Ser Gly Arg Val Gln Leu Thr His Gly Ser Phe Thr Ser Lys Phe Asn
610 615 620
Asp Thr Leu Gln Glu Phe Glu Thr Thr Arg Ser Ser Thr Gly Thr Gly
625 630 635 640
Leu Gln Gly Val Thr Ser Gly Leu Ala Asn Asn Leu Leu Ala Ala Ala
645 650 655
Gly Ala Tyr Leu Lys Ala Asp Asp Gly Leu Ala Gly Val Ile Asp Lys
660 665 670
Ile Phe Gly Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala
675 680 685
Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu
690 695 700
Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly
705 710 715 720
Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr
725 730 735
Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser
740 745 750
Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met
755 760 765
Phe Ala Met Ser Thr Thr Phe Ala Ala Arg Leu Asn Arg Leu Phe Asp
770 775 780
Thr Val Tyr Pro Pro Gly Arg Gly Pro His Thr Ser Ala Glu Val Ile
785 790 795 800
Ala Ala Leu Lys Ala Glu Gly Ile Thr Met Ser Ala Pro Tyr Leu Ser
805 810 815
Gln Leu Arg Ser Gly Asn Arg Thr Asn Pro Ser Gly Ala Thr Met Ala
820 825 830
Ala Leu Ala Asn Phe Phe Arg Ile Lys Ala Ala Tyr Phe Thr Asp Asp
835 840 845
Glu Tyr Tyr Glu Lys Leu Asp Lys Glu Leu Gln Trp Leu Ser Thr Met
850 855 860
Arg Asp Asp Gly Val Arg Arg Ile Ala Gln Arg Ala His Gly Leu Pro
865 870 875 880
Ser Ala Ala Gln Gln Lys Val Leu Asp Arg Ile Asp Glu Leu Arg Arg
885 890 895
Ala Glu Gly Ile Asp Ala Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly
900 905 910
Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His
915 920 925
Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala
930 935 940
Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp
945 950 955 960
Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg
965 970 975
Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val
980 985 990
Thr Gly Met Phe Ala Met Glu Lys Met Ser His Asp Pro Ile Ala Ala
995 1000 1005
Asp Ile Gly Thr Gln Val Ser Asp Asn Ala Leu His Gly Val Thr Ala
1010 1015 1020
Gly Ser Thr Ala Leu Thr Ser Val Thr Gly Leu Val Pro Ala Gly Ala
1025 1030 1035 1040
Asp Glu Val Ser Ala Gln Ala Ala Thr Ala Phe Thr Ser Glu Gly Ile
1045 1050 1055
Gln Leu Leu Ala Ser Asn Ala Ser Ala Gln Asp Gln Leu His Arg Ala
1060 1065 1070
Gly Glu Ala Val Gln Asp Val Ala Arg Thr Tyr Ser Gln Ile Asp Asp
1075 1080 1085
Gly Ala Ala Gly Val Phe Ala Glu
1090 1095
<210> 42
<211> 1313
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 42
Met Gly Ser Thr Gln Ser Gln Thr Val Thr Val Asp Gln Gln Glu Ile
1 5 10 15
Leu Asn Arg Ala Asn Glu Val Glu Ala Pro Met Ala Asp Pro Pro Thr
20 25 30
Asp Val Pro Ile Thr Pro Ser Glu Leu Thr Ala Ala Lys Asn Ala Ala
35 40 45
Gln Gln Leu Val Leu Ser Ala Asp Asn Met Arg Glu Tyr Leu Ala Ala
50 55 60
Gly Ala Lys Glu Arg Gln Arg Leu Ala Thr Ser Leu Arg Asn Ala Ala
65 70 75 80
Lys Ala Tyr Gly Glu Val Asp Glu Glu Ala Ala Thr Ala Leu Asp Asn
85 90 95
Asp Gly Glu Gly Thr Val Gln Ala Glu Ser Ala Gly Ala Val Gly Gly
100 105 110
Asp Ser Ser Ala Glu Leu Thr Asp Thr Pro Arg Val Ala Thr Ala Gly
115 120 125
Glu Pro Asn Phe Met Asp Leu Lys Glu Ala Ala Arg Lys Leu Glu Thr
130 135 140
Gly Asp Gln Gly Ala Ser Leu Ala His Phe Ala Asp Gly Trp Asn Thr
145 150 155 160
Phe Asn Leu Thr Leu Gln Gly Asp Val Lys Arg Phe Arg Gly Phe Asp
165 170 175
Asn Trp Glu Gly Asp Ala Ala Thr Ala Ser Glu Ala Ser Leu Asp Gln
180 185 190
Gln Arg Gln Trp Ile Leu His Met Ala Lys Leu Ser Ala Ala Met Ala
195 200 205
Lys Gln Ala Gln Tyr Val Ala Gln Leu His Val Trp Ala Arg Arg Glu
210 215 220
His Pro Thr Tyr Glu Asp Ile Val Gly Leu Glu Arg Leu Tyr Ala Glu
225 230 235 240
Asn Pro Ser Ala Arg Asp Gln Ile Leu Pro Val Tyr Ala Glu Tyr Gln
245 250 255
Gln Arg Ser Glu Lys Val Leu Thr Glu Tyr Asn Asn Lys Ala Ala Leu
260 265 270
Glu Pro Val Asn Pro Pro Lys Pro Pro Pro Ala Ile Lys Ile Asp Pro
275 280 285
Pro Pro Pro Pro Gln Glu Gln Gly Leu Ile Pro Gly Phe Leu Met Pro
290 295 300
Pro Ser Asp Gly Ser Gly Val Thr Pro Gly Thr Gly Met Pro Ala Ala
305 310 315 320
Pro Met Val Pro Pro Thr Gly Ser Pro Gly Gly Gly Leu Pro Ala Asp
325 330 335
Thr Ala Ala Gln Leu Thr Ser Ala Gly Arg Glu Ala Ala Ala Leu Ser
340 345 350
Gly Asp Val Ala Val Lys Ala Ala Ser Leu Gly Gly Gly Gly Gly Gly
355 360 365
Gly Val Pro Ser Ala Pro Leu Gly Ser Ala Ile Gly Gly Ala Glu Ser
370 375 380
Val Arg Pro Ala Gly Ala Gly Asp Ile Ala Gly Leu Gly Gln Gly Arg
385 390 395 400
Ala Gly Gly Gly Ala Ala Leu Gly Gly Gly Gly Met Gly Met Pro Met
405 410 415
Gly Ala Ala His Gln Gly Gln Gly Gly Ala Lys Ser Lys Gly Ser Gln
420 425 430
Gln Glu Asp Glu Ala Leu Tyr Thr Glu Asp Arg Ala Trp Thr Glu Ala
435 440 445
Val Ile Gly Asn Arg Arg Arg Gln Asp Ser Lys Glu Ser Lys Gly Ser
450 455 460
Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala
465 470 475 480
Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys
485 490 495
Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu
500 505 510
Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu
515 520 525
Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln
530 535 540
Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Glu Phe
545 550 555 560
Asp Leu Pro Gly Asn Asp Phe Asp Ser Asn Asp Phe Asp Ala Val Asp
565 570 575
Leu Trp Gly Ala Asp Gly Ala Glu Gly Trp Thr Ala Asp Pro Ile Ile
580 585 590
Gly Val Gly Ser Ala Ala Thr Pro Asp Thr Gly Pro Asp Leu Asp Asn
595 600 605
Ala His Gly Gln Ala Glu Thr Asp Thr Glu Gln Glu Ile Ala Leu Phe
610 615 620
Thr Val Thr Asn Pro Pro Arg Thr Val Ser Val Ser Thr Leu Met Asp
625 630 635 640
Gly Arg Ile Asp His Val Glu Leu Ser Ala Arg Val Ala Trp Met Ser
645 650 655
Glu Ser Gln Leu Ala Ser Glu Ile Leu Val Ile Ala Asp Leu Ala Arg
660 665 670
Gln Lys Ala Gln Ser Ala Gln Tyr Ala Phe Ile Leu Asp Arg Met Ser
675 680 685
Gln Gln Val Asp Ala Asp Glu His Arg Val Ala Leu Leu Arg Lys Thr
690 695 700
Val Gly Glu Thr Trp Gly Leu Pro Ser Pro Glu Glu Ala Ala Ala Ala
705 710 715 720
Glu Ala Glu Val Phe Ala Thr Arg Tyr Ser Asp Asp Ser Pro Ala Pro
725 730 735
Asp Asp Glu Ser Asp Pro Trp Thr Glu Asn Leu Thr Val Gln Pro Glu
740 745 750
Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn Ala Ala Val Asp Ala
755 760 765
Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly Glu Ser Val Ala Ile
770 775 780
Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp Thr Leu Asn Val Tyr
785 790 795 800
Leu Thr Ala His Asn Ala Leu Gly Ser Ser Leu His Thr Ala Gly Val
805 810 815
Asp Leu Ala Lys Ser Leu Arg Ile Ala Ala Lys Ile Tyr Ser Glu Ala
820 825 830
Asp Glu Ala Trp Arg Lys Ala Ile Asp Gly Leu Phe Thr Ser Arg Ala
835 840 845
Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly Leu Tyr Asp Leu
850 855 860
Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu Tyr Ser Ser Leu
865 870 875 880
Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala Ala Phe Pro Gly
885 890 895
Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala Gly Lys Asn Arg
900 905 910
Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu Asp Arg Gln Leu
915 920 925
Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln Thr Thr Arg Asp
930 935 940
Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val Arg Pro Val Ala
945 950 955 960
Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala Leu Asp Val Ala
965 970 975
Asp Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe Ile Thr Asn
980 985 990
Ala Leu Asn Gly Leu Lys Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr Gly Trp Val
995 1000 1005
Thr Gly Leu Phe Ser Arg Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser Phe Phe Ala
1010 1015 1020
Gly Val Pro Gly Leu Thr Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser Gln Val Thr
1025 1030 1035 1040
Gly Leu Phe Gly Ala Ala Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly Leu Ala His
1045 1050 1055
Ala Asp Ser Leu Ala Ser Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Ala Gly Ile
1060 1065 1070
Gly Gly Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala Gln Val His
1075 1080 1085
Ala Ala Ser Thr Arg Gln Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp Gly Pro Val
1090 1095 1100
Gly Ala Ala Ala Glu Gln Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu Val Ser Ala
1105 1110 1115 1120
Gln Gly Ser Gln Gly Met Gly Gly Pro Val Gly Met Gly Gly Met His
1125 1130 1135
Pro Ser Ser Gly Ala Ser Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys Tyr Ser Glu
1140 1145 1150
Gly Ala Ala Ala Gly Thr Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro Val Glu Ala
1155 1160 1165
Asp Ala Gly Gly Gly Gln Lys Val Leu Val Arg Asn Val Val Ser Thr
1170 1175 1180
Thr Phe Ala Ala Arg Leu Asn Arg Leu Phe Asp Thr Val Tyr Pro Pro
1185 1190 1195 1200
Gly Arg Gly Pro His Thr Ser Ala Glu Val Ile Ala Ala Leu Lys Ala
1205 1210 1215
Glu Gly Ile Thr Met Ser Ala Pro Tyr Leu Ser Gln Leu Arg Ser Gly
1220 1225 1230
Asn Arg Thr Asn Pro Ser Gly Ala Thr Met Ala Ala Leu Ala Asn Phe
1235 1240 1245
Phe Arg Ile Lys Ala Ala Tyr Phe Thr Asp Asp Glu Tyr Tyr Glu Lys
1250 1255 1260
Leu Asp Lys Glu Leu Gln Trp Leu Ser Thr Met Arg Asp Asp Gly Val
1265 1270 1275 1280
Arg Arg Ile Ala Gln Arg Ala His Gly Leu Pro Ser Ala Ala Gln Gln
1285 1290 1295
Lys Val Leu Asp Arg Ile Asp Glu Leu Arg Arg Ala Glu Gly Ile Asp
1300 1305 1310
Ala
<210> 43
<211> 654
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 43
Met Ala Asp Thr Ile Gln Val Thr Pro Gln Met Leu Arg Ser Thr Ala
1 5 10 15
Asn Asp Ile Gln Ala Asn Met Glu Gln Ala Met Gly Ile Ala Lys Gly
20 25 30
Tyr Leu Ala Asn Gln Glu Asn Val Met Asn Pro Ala Thr Trp Ser Gly
35 40 45
Thr Gly Val Val Ala Ser His Met Thr Ala Thr Glu Ile Thr Asn Glu
50 55 60
Leu Asn Lys Val Leu Thr Gly Gly Thr Arg Leu Ala Glu Gly Leu Val
65 70 75 80
Gln Ala Ala Ala Leu Met Glu Gly His Glu Ala Asp Ser Gln Thr Ala
85 90 95
Phe Gln Ala Leu Phe Gly Ala Ser His Gly Ser Gly Leu Val Pro Arg
100 105 110
Gly Ser Thr Gly Met Ser Asp Gln Ile Thr Tyr Asn Pro Gly Ala Val
115 120 125
Ser Asp Phe Ala Ser Asp Val Gly Ser Arg Ala Gly Gln Leu His Met
130 135 140
Ile Tyr Glu Asp Thr Ala Ser Lys Thr Asn Ala Leu Gln Glu Phe Phe
145 150 155 160
Ala Gly His Gly Ala Gln Gly Phe Phe Asp Ala Gln Ala Gln Met Leu
165 170 175
Ser Gly Leu Gln Gly Leu Ile Glu Thr Val Gly Gln His Gly Thr Thr
180 185 190
Thr Gly His Val Leu Asp Asn Ala Ile Gly Thr Asp Gln Ala Ile Ala
195 200 205
Gly Leu Phe Leu Ile Gly Ala His Pro Arg Ala Leu Asn Val Val Lys
210 215 220
Phe Gly Gly Ala Ala Phe Leu Met Ser Leu Leu Asp Ala His Ile Pro
225 230 235 240
Gln Leu Val Ala Ser Gln Ser Ala Phe Ala Ala Lys Ala Gly Leu Met
245 250 255
Arg His Thr Ile Gly Gln Ala Glu Gln Ala Ala Met Ser Ala Gln Ala
260 265 270
Phe His Gln Gly Glu Ser Ser Ala Ala Phe Gln Ala Ala His Ala Arg
275 280 285
Phe Val Ala Ala Ala Ala Lys Val Asn Thr Leu Leu Asp Val Ala Gln
290 295 300
Ala Asn Leu Gly Glu Ala Ala Gly Thr Tyr Val Ala Ala Asp Ala Ala
305 310 315 320
Ala Ala Ser Thr Tyr Thr Gly Phe Gly Leu Val Pro Arg Gly Ser Thr
325 330 335
Gly Met Ser Gln Ile Met Tyr Asn Tyr Pro Ala Met Leu Gly His Ala
340 345 350
Gly Asp Met Ala Gly Tyr Ala Gly Thr Leu Gln Ser Leu Gly Ala Glu
355 360 365
Ile Ala Val Glu Gln Ala Ala Leu Gln Ser Ala Trp Gln Gly Asp Thr
370 375 380
Gly Ile Thr Tyr Gln Ala Trp Gln Ala Gln Trp Asn Gln Ala Met Glu
385 390 395 400
Asp Leu Val Arg Ala Tyr His Ala Met Ser Ser Thr His Glu Ala Asn
405 410 415
Thr Met Ala Met Met Ala Arg Asp Thr Ala Glu Ala Ala Lys Trp Gly
420 425 430
Gly Leu Gly Phe Gly Ala Gly Arg Leu Arg Gly Leu Phe Thr Asn Pro
435 440 445
Gly Ser Trp Arg Ile Met Thr Ser Arg Phe Met Thr Asp Pro His Ala
450 455 460
Met Arg Asp Met Ala Gly Arg Phe Glu Val His Ala Gln Thr Val Glu
465 470 475 480
Asp Glu Ala Arg Arg Met Trp Ala Ser Ala Gln Asn Ile Ser Gly Ala
485 490 495
Gly Trp Ser Gly Met Ala Glu Ala Thr Ser Leu Asp Thr Met Thr Gln
500 505 510
Met Asn Gln Ala Phe Arg Asn Ile Val Asn Met Leu His Gly Val Arg
515 520 525
Asp Gly Leu Val Arg Asp Ala Asn Asn Tyr Glu Gln Gln Glu Gln Ala
530 535 540
Ser Gln Gln Ile Leu Ser Ser Gly Leu Val Pro Arg Gly Ser Thr Gly
545 550 555 560
Met Thr Ile Asn Tyr Gln Phe Gly Asp Val Asp Ala His Gly Ala Met
565 570 575
Ile Arg Ala Gln Ala Gly Ser Leu Glu Ala Glu His Gln Ala Ile Ile
580 585 590
Ser Asp Val Leu Thr Ala Ser Asp Phe Trp Gly Gly Ala Gly Ser Ala
595 600 605
Ala Ser Gln Gly Phe Ile Thr Gln Leu Gly Arg Asn Phe Gln Val Ile
610 615 620
Tyr Glu Gln Ala Asn Ala His Gly Gln Lys Val Gln Ala Ala Gly Asn
625 630 635 640
Asn Met Ala Gln Thr Asp Ser Ala Val Gly Ser Ser Trp Ala
645 650
<210> 44
<211> 716
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 44
Met Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
1 5 10 15
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
20 25 30
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
35 40 45
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
50 55 60
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
65 70 75 80
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Met
85 90 95
Asp Leu Pro Gly Asn Asp Phe Asp Ser Asn Asp Phe Asp Ala Val Asp
100 105 110
Leu Trp Gly Ala Asp Gly Ala Glu Gly Trp Thr Ala Asp Pro Ile Ile
115 120 125
Gly Val Gly Ser Ala Ala Thr Pro Asp Thr Gly Pro Asp Leu Asp Asn
130 135 140
Ala His Gly Gln Ala Glu Thr Asp Thr Glu Gln Glu Ile Ala Leu Phe
145 150 155 160
Thr Val Thr Asn Pro Pro Arg Thr Val Ser Val Ser Thr Leu Met Asp
165 170 175
Gly Arg Ile Asp His Val Glu Leu Ser Ala Arg Val Ala Trp Met Ser
180 185 190
Glu Ser Gln Leu Ala Ser Glu Ile Leu Val Ile Ala Asp Leu Ala Arg
195 200 205
Gln Lys Ala Gln Ser Ala Gln Tyr Ala Phe Ile Leu Asp Arg Met Ser
210 215 220
Gln Gln Val Asp Ala Asp Glu His Arg Val Ala Leu Leu Arg Lys Thr
225 230 235 240
Val Gly Glu Thr Trp Gly Leu Pro Ser Pro Glu Glu Ala Ala Ala Ala
245 250 255
Glu Ala Glu Val Phe Ala Thr Arg Tyr Ser Asp Asp Ser Pro Ala Pro
260 265 270
Asp Asp Glu Ser Asp Pro Trp Met Thr Glu Asn Leu Thr Val Gln Pro
275 280 285
Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His Asp Asn Ala Ala Val Asp
290 295 300
Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly Leu Gly Glu Ser Val Ala
305 310 315 320
Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe Asn Asp Thr Leu Asn Val
325 330 335
Tyr Leu Thr Ala His Asn Ala Leu Gly Ser Ser Leu His Thr Ala Gly
340 345 350
Val Asp Leu Ala Lys Ser Leu Arg Ile Ala Ala Lys Ile Tyr Ser Glu
355 360 365
Ala Asp Glu Ala Trp Arg Lys Ala Ile Asp Gly Leu Phe Thr Met Thr
370 375 380
Gly Phe Leu Gly Val Val Pro Ser Phe Leu Lys Val Leu Ala Gly Met
385 390 395 400
His Asn Glu Ile Val Gly Asp Ile Lys Arg Ala Thr Asp Thr Val Ala
405 410 415
Gly Ile Ser Gly Arg Val Gln Leu Thr His Gly Ser Phe Thr Ser Lys
420 425 430
Phe Asn Asp Thr Leu Gln Glu Phe Glu Thr Thr Arg Ser Ser Thr Gly
435 440 445
Thr Gly Leu Gln Gly Val Thr Ser Gly Leu Ala Asn Asn Leu Leu Ala
450 455 460
Ala Ala Gly Ala Tyr Leu Lys Ala Asp Asp Gly Leu Ala Gly Val Ile
465 470 475 480
Asp Lys Ile Phe Gly Met Ser Thr Thr Phe Ala Ala Arg Leu Asn Arg
485 490 495
Leu Phe Asp Thr Val Tyr Pro Pro Gly Arg Gly Pro His Thr Ser Ala
500 505 510
Glu Val Ile Ala Ala Leu Lys Ala Glu Gly Ile Thr Met Ser Ala Pro
515 520 525
Tyr Leu Ser Gln Leu Arg Ser Gly Asn Arg Thr Asn Pro Ser Gly Ala
530 535 540
Thr Met Ala Ala Leu Ala Asn Phe Phe Arg Ile Lys Ala Ala Tyr Phe
545 550 555 560
Thr Asp Asp Glu Tyr Tyr Glu Lys Leu Asp Lys Glu Leu Gln Trp Leu
565 570 575
Ser Thr Met Arg Asp Asp Gly Val Arg Arg Ile Ala Gln Arg Ala His
580 585 590
Gly Leu Pro Ser Ala Ala Gln Gln Lys Val Leu Asp Arg Ile Asp Glu
595 600 605
Leu Arg Arg Ala Glu Gly Ile Asp Ala Met Glu Lys Met Ser His Asp
610 615 620
Pro Ile Ala Ala Asp Ile Gly Thr Gln Val Ser Asp Asn Ala Leu His
625 630 635 640
Gly Val Thr Ala Gly Ser Thr Ala Leu Thr Ser Val Thr Gly Leu Val
645 650 655
Pro Ala Gly Ala Asp Glu Val Ser Ala Gln Ala Ala Thr Ala Phe Thr
660 665 670
Ser Glu Gly Ile Gln Leu Leu Ala Ser Asn Ala Ser Ala Gln Asp Gln
675 680 685
Leu His Arg Ala Gly Glu Ala Val Gln Asp Val Ala Arg Thr Tyr Ser
690 695 700
Gln Ile Asp Asp Gly Ala Ala Gly Val Phe Ala Glu
705 710 715
<210> 45
<211> 454
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 45
Met Ser Arg Pro Gly Leu Pro Val Glu Tyr Leu Gln Val Pro Ser Pro
1 5 10 15
Ser Met Gly Arg Asp Ile Lys Val Gln Phe Gln Ser Gly Gly Asn Asn
20 25 30
Ser Pro Ala Val Tyr Leu Leu Asp Gly Leu Arg Ala Gln Asp Asp Tyr
35 40 45
Asn Gly Trp Asp Ile Asn Thr Pro Ala Phe Glu Trp Tyr Tyr Gln Ser
50 55 60
Gly Leu Ser Ile Val Met Pro Val Gly Gly Gln Ser Ser Phe Tyr Ser
65 70 75 80
Asp Trp Tyr Ser Pro Ala Cys Gly Lys Ala Gly Cys Gln Thr Tyr Lys
85 90 95
Trp Glu Thr Phe Leu Thr Ser Glu Leu Pro Gln Trp Leu Ser Ala Asn
100 105 110
Arg Ala Val Lys Pro Thr Gly Ser Ala Ala Ile Gly Leu Ser Met Ala
115 120 125
Gly Ser Ser Ala Met Ile Leu Ala Ala Tyr His Pro Gln Gln Phe Ile
130 135 140
Tyr Ala Gly Ser Leu Ser Ala Leu Leu Asp Pro Ser Gln Gly Met Gly
145 150 155 160
Pro Ser Leu Ile Gly Leu Ala Met Gly Asp Ala Gly Gly Tyr Lys Ala
165 170 175
Ala Asp Met Trp Gly Pro Ser Ser Asp Pro Ala Trp Glu Arg Asn Asp
180 185 190
Pro Thr Gln Gln Ile Pro Lys Leu Val Ala Asn Asn Thr Arg Leu Trp
195 200 205
Val Tyr Cys Gly Asn Gly Thr Pro Asn Glu Leu Gly Gly Ala Asn Ile
210 215 220
Pro Ala Glu Phe Leu Glu Asn Phe Val Arg Ser Ser Asn Leu Lys Phe
225 230 235 240
Gln Asp Ala Tyr Asn Ala Ala Gly Gly His Asn Ala Val Phe Asn Phe
245 250 255
Pro Pro Asn Gly Thr His Ser Trp Glu Tyr Trp Gly Ala Gln Leu Asn
260 265 270
Ala Met Lys Gly Asp Leu Gln Ser Ser Leu Gly Ala Gly Thr Glu Gln
275 280 285
Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly
290 295 300
Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu
305 310 315 320
Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln
325 330 335
Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala
340 345 350
Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala
355 360 365
Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Val Ile Ala Gly Val
370 375 380
Asp Gln Ala Leu Ala Ala Thr Gly Gln Ala Ser Gln Arg Ala Ala Gly
385 390 395 400
Ala Ser Gly Gly Val Thr Val Gly Val Gly Val Gly Thr Glu Gln Arg
405 410 415
Asn Leu Ser Val Val Ala Pro Ser Gln Phe Thr Phe Ser Ser Arg Ser
420 425 430
Pro Asp Phe Val Asp Glu Thr Ala Gly Gln Ser Trp Cys Ala Ile Leu
435 440 445
Gly Leu Asn Gln Phe His
450
<210> 46
<211> 288
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 46
atgacagagc agcagtggaa tttcgcgggt atcgaggccg cggcaagcgc aatccaggga 60
aatgtcacgt ccattcattc cctccttgac gaggggaagc agtccctgac caagctcgca 120
gcggcctggg gcggtagcgg ttcggaggcg taccagggtg tccagcaaaa atgggacgcc 180
acggctaccg agctgaacaa cgcgctgcag aacctggcgc ggacgatcag cgaagccggt 240
caggcaatgg cttcgaccga aggcaacgtc actgggatgt tcgcatag 288
<210> 47
<211> 1107
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 47
atgctgtggc acgcaatgcc accggagcta aataccgcac ggctgatggc cggcgcgggt 60
ccggctccaa tgcttgcggc ggccgcggga tggcagacgc tttcggcggc tctggacgct 120
caggccgtcg agttgaccgc gcgcctgaac tctctgggag aagcctggac tggaggtggc 180
agcgacaagg cgcttgcggc tgcaacgccg atggtggtct ggctacaaac cgcgtcaaca 240
caggccaaga cccgtgcgat gcaggcgacg gcgcaagccg cggcatacac ccaggccatg 300
gccacgacgc cgtcgctgcc ggagatcgcc gccaaccaca tcacccaggc cgtccttacg 360
gccaccaact tcttcggtat caacacgatc ccgatcgcgt tgaccgagat ggattatttc 420
atccgtatgt ggaaccaggc agccctggca atggaggtct accaggccga gaccgcggtt 480
aacacgcttt tcgagaagct cgagccgatg gcgtcgatcc ttgatcccgg cgcgagccag 540
agcacgacga acccgatctt cggaatgccc tcccctggca gctcaacacc ggttggccag 600
ttgccgccgg cggctaccca gaccctcggc caactgggtg agatgagcgg cccgatgcag 660
cagctgaccc agccgctgca gcaggtgacg tcgttgttca gccaggtggg cggcaccggc 720
ggcggcaacc cagccgacga ggaagccgcg cagatgggcc tgctcggcac cagtccgctg 780
tcgaaccatc cgctggctgg tggatcaggc cccagcgcgg gcgcgggcct gctgcgcgcg 840
gagtcgctac ctggcgcagg tgggtcgttg acccgcacgc cgctgatgtc tcagctgatc 900
gaaaagccgg ttgccccctc ggtgatgccg gcggctgctg ccggatcgtc ggcgacgggt 960
ggcgccgctc cggtgggtgc gggagcgatg ggccagggtg cgcaatccgg cggctccacc 1020
aggccgggtc tggtcgcgcc ggcaccgctc gcgcaggagc gtgaagaaga cgacgaggac 1080
gactgggacg aagaggacga ctggtga 1107
<210> 48
<211> 2001
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 48
atggcggccg actacgacaa gctcttccgg ccgcacgaag gtatggaagc tccggacgat 60
atggcagcgc agccgttctt cgaccccagt gcttcgtttc cgccggcgcc cgcatcggca 120
aacctaccga agcccaacgg ccagactccg cccccgacgt ccgacgacct gtcggagcgg 180
ttcgtgtcgg ccccgccgcc gccaccccca cccccacctc cgcctccgcc aactccgatg 240
ccgatcgccg caggagagcc gccctcgccg gaaccggccg catctaaacc acccacaccc 300
cccatgccca tcgccggacc cgaaccggcc ccacccaaac cacccacacc ccccatgccc 360
atcgccggac ccgaaccggc cccacccaaa ccacccacac ctccgatgcc catcgccgga 420
cctgcaccca ccccaaccga atcccagttg gcgcccccca gaccaccgac accacaaacg 480
ccaaccggag cgccgcagca accggaatca ccggcgcccc acgtaccctc gcacgggcca 540
catcaacccc ggcgcaccgc accagcaccg ccctgggcaa agatgccaat cggcgaaccc 600
ccgcccgctc cgtccagacc gtctgcgtcc ccggccgaac caccgacccg gcctgccccc 660
caacactccc gacgtgcgcg ccggggtcac cgctatcgca cagacaccga acgaaacgtc 720
gggaaggtag caactggtcc atccatccag gcgcggctgc gggcagagga agcatccggc 780
gcgcagctcg cccccggaac ggagccctcg ccagcgccgt tgggccaacc gagatcgtat 840
ctggctccgc ccacccgccc cgcgccgaca gaacctcccc ccagcccctc gccgcagcgc 900
aactccggtc ggcgtgccga gcgacgcgtc caccccgatt tagccgccca acatgccgcg 960
gcgcaacctg attcaattac ggccgcaacc actggcggtc gtcgccgcaa gcgtgcagcg 1020
ccggatctcg acgcgacaca gaaatcctta aggccggcgg ccaaggggcc gaaggtgaag 1080
aaggtgaagc cccagaaacc gaaggccacg aagccgccca aagtggtgtc gcagcgcggc 1140
tggcgacatt gggtgcatgc gttgacgcga atcaacctgg gcctgtcacc cgacgagaag 1200
tacgagctgg acctgcacgc tcgagtccgc cgcaatcccc gcgggtcgta tcagatcgcc 1260
gtcgtcggtc tcaaaggtgg ggctggcaaa accacgctga cagcagcgtt ggggtcgacg 1320
ttggctcagg tgcgggccga ccggatcctg gctctagacg cggatccagg cgccggaaac 1380
ctcgccgatc gggtagggcg acaatcgggc gcgaccatcg ctgatgtgct tgcagaaaaa 1440
gagctgtcgc actacaacga catccgcgca cacactagcg tcaatgcggt caatctggaa 1500
gtgctgccgg caccggaata cagctcggcg cagcgcgcgc tcagcgacgc cgactggcat 1560
ttcatcgccg atcctgcgtc gaggttttac aacctcgtct tggctgattg tggggccggc 1620
ttcttcgacc cgctgacccg cggcgtgctg tccacggtgt ccggtgtcgt ggtcgtggca 1680
agtgtctcaa tcgacggcgc acaacaggcg tcggtcgcgt tggactggtt gcgcaacaac 1740
ggttaccaag atttggcgag ccgcgcatgc gtggtcatca atcacatcat gccgggagaa 1800
cccaatgtcg cagttaaaga cctggtgcgg catttcgaac agcaagttca acccggccgg 1860
gtcgtggtca tgccgtggga caggcacatt gcggccggaa ccgagatttc actcgacttg 1920
ctcgacccta tctacaagcg caaggtcctc gaattggccg cagcgctatc cgacgatttc 1980
gagagggctg gacgtcgttg a 2001
<210> 49
<211> 312
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 49
atgacggaaa acttgaccgt ccagcccgag cgtctcggtg tactggcgtc gcaccatgac 60
aacgcggcgg tcgatgcctc ctcgggcgtc gaagctgccg ctggcctagg cgaatctgtg 120
gcgatcactc acggtccgta ctgctcacag ttcaacgaca cgttaaatgt gtacttgact 180
gcccacaatg ccctgggctc gtccttgcat acggccggtg tcgatctcgc caaaagtctt 240
cgaattgcgg cgaagatata tagcgaggcc gacgaagcgt ggcgcaaggc tatcgacggg 300
ttgtttacct ga 312
<210> 50
<211> 1179
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 50
atgagcagag cgttcatcat cgatccaacg atcagtgcca ttgacggctt gtacgacctt 60
ctggggattg gaatacccaa ccaagggggt atcctttact cctcactaga gtacttcgaa 120
aaagccctgg aggagctggc agcagcgttt ccgggtgatg gctggttagg ttcggccgcg 180
gacaaatacg ccggcaaaaa ccgcaaccac gtgaattttt tccaggaact ggcagacctc 240
gatcgtcagc tcatcagcct gatccacgac caggccaacg cggtccagac gacccgcgac 300
atcctggagg gcgccaagaa aggtctcgag ttcgtgcgcc cggtggctgt ggacctgacc 360
tacatcccgg tcgtcgggca cgccctatcg gccgccttcc aggcgccgtt ttgcgcgggc 420
gcgatggccg tagtgggcgg cgcgcttgcc tacttggtcg tgaaaacgct gatcaacgcg 480
actcaactcc tcaaattgct tgccaaattg gcggagttgg tcgcggccgc cattgcggac 540
atcatttcgg atgtggcgga catcatcaag ggcaccctcg gagaagtgtg ggagttcatc 600
acaaacgcgc tcaacggcct gaaagagctt tgggacaagc tcacggggtg ggtgaccgga 660
ctgttctctc gagggtggtc gaacctggag tccttctttg cgggcgtccc cggcttgacc 720
ggcgcgacca gcggcttgtc gcaagtgact ggcttgttcg gtgcggccgg tctgtccgca 780
tcgtcgggct tggctcacgc ggatagcctg gcgagctcag ccagcttgcc cgccctggcc 840
ggcattgggg gcgggtccgg ttttgggggc ttgccgagcc tggctcaggt ccatgccgcc 900
tcaactcggc aggcgctacg gccccgagct gatggcccgg tcggcgccgc tgccgagcag 960
gtcggcgggc agtcgcagct ggtctccgcg cagggttccc aaggtatggg cggacccgta 1020
ggcatgggcg gcatgcaccc ctcttcgggg gcgtcgaaag ggacgacgac gaagaagtac 1080
tcggaaggcg cggcggcggg cactgaagac gccgagcgcg cgccagtcga agctgacgcg 1140
ggcggtgggc aaaaggtgct ggtacgaaac gtcgtctaa 1179
<210> 51
<211> 687
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 51
atgcgcatca agatcttcat gctggtcacg gctgtcgttt tgctctgttg ttcgggtgtg 60
gccacggccg cgcccaagac ctactgcgag gagttgaaag gcaccgatac cggccaggcg 120
tgccagattc aaatgtccga cccggcctac aacatcaaca tcagcctgcc cagttactac 180
cccgaccaga agtcgctgga aaattacatc gcccagacgc gcgacaagtt cctcagcgcg 240
gccacatcgt ccactccacg cgaagccccc tacgaattga atatcacctc ggccacatac 300
cagtccgcga taccgccgcg tggtacgcag gccgtggtgc tcaaggtcta ccagaacgcc 360
ggcggcacgc acccaacgac cacgtacaag gccttcgatt gggaccaggc ctatcgcaag 420
ccaatcacct atgacacgct gtggcaggct gacaccgatc cgctgccagt cgtcttcccc 480
attgtgcaag gtgaactgag caagcagacc ggacaacagg tatcgatagc gccgaatgcc 540
ggcttggacc cggtgaatta tcagaacttc gcagtcacga acgacggggt gattttcttc 600
ttcaacccgg gggagttgct gcccgaagca gccggcccaa cccaggtatt ggtcccacgt 660
tccgcgatcg actcgatgct ggcctag 687
<210> 52
<211> 582
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 52
atgaaggtaa agaacacaat tgcggcaacc agtttcgcgg cggccggcct ggcggctctg 60
gcggtggctg tctcaccgcc ggcggccgca ggcgatctgg tgggcccggg ctgcgcggaa 120
tacgcggcag ccaatcccac tgggccggcc tcggtgcagg gaatgtcgca ggacccggtc 180
gcggtggcgg cctcgaacaa tccggagttg acaacgctga cggctgcact gtcgggccag 240
ctcaatccgc aagtaaacct ggtggacacc ctcaacagcg gtcagtacac ggtgttcgca 300
ccgaccaacg cggcatttag caagctgccg gcatccacga tcgacgagct caagaccaat 360
tcgtcactgc tgaccagcat cctgacctac cacgtagtgg ccggccaaac cagcccggcc 420
aacgtcgtcg gcacccgtca gaccctccag ggcgccagcg tgacggtgac cggtcagggt 480
aacagcctca aggtcggtaa cgccgacgtc gtctgtggtg gggtgtctac cgccaacgcg 540
acggtgtaca tgattgacag cgtgctaatg cctccggcgt aa 582
<210> 53
<211> 663
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 53
atgatcaacg ttcaggccaa accggccgca gcagcgagcc tcgcagccat cgcgattgcg 60
ttcttagcgg gttgttcgag caccaaaccc gtgtcgcaag acaccagccc gaaaccggcg 120
accagcccgg cggcgcccgt taccacggcg gcaatggctg accccgcagc ggacctgatt 180
ggtcgtgggt gcgcgcaata cgcggcgcaa aatcccaccg gtcccggatc ggtggccgga 240
atggcgcaag acccggtcgc taccgcggct tccaacaacc cgatgctcag taccctgacc 300
tcggctctgt cgggcaagct gaacccggat gtgaatctgg tcgacaccct caacggcggc 360
gagtacaccg ttttcgcccc caccaacgcc gcattcgaca agctgccggc ggccactatc 420
gatcaactca agactgacgc caagctgctc agcagcatcc tgacctacca cgtgatagcc 480
ggccaggcga gtccgagcag gatcgacggc acccatcaga ccctgcaagg tgccgacctg 540
acggtgatag gcgcccgcga cgacctcatg gtcaacaacg ccggtttggt atgtggcgga 600
gttcacaccg ccaacgcgac ggtgtacatg atcgatacgg tgctgatgcc cccggcacag 660
taa 663
<210> 54
<211> 6469
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 54
atgcaagccg aaaccgccgt caataccctg ttcgagaaac tggagccgat ggcatctatt 60
cttgatccgg gtgcgagcca gagcactacc aatccaatct ttggcatgcc gtccccgggc 120
agctcgacgc cggtgggcca gctgccgccg gcggctaccc aaaccttagg tcagctgggt 180
gagatgagcg gcccgatggg cggctccggt aaccctgcag atgaagaggc agcacaaatg 240
ggtctgctgg gtaccagccc gctgagcaat cacccactgg ccggcggcag cggcccaagc 300
gctggtgcgg gtctgctgcg cgcggagtcc ctgccgggtg cgggtggctc cctgacgcgt 360
accccactca tgagccaact gattgagaaa ccggttgcga ccgaacaaca gtggaatttt 420
gccggtattg aagctgcggc cagcgccatc cagggcaatg ttacgagcat ccacagcctg 480
ctggatgaag gcaaacagtc gctgaccaag ctggcggcgg cgtggggtgg ctccggtagc 540
gaagcctatc agggtgttca gcagaaatgg gacgcgaccg cgactgagct gaacaatgcg 600
ctgcagaatc tggcccgcac tatttccgag gccggtcaag cgatggcaag caccgagggc 660
aacgtgaccg gtatgttcgc tgctgccgat tacgacaaac tgtttcgccc acatgaaggc 720
atggaggcac cggatgatat ggcggcgcag ccgtttttcg acccgtccgc gagctttccg 780
ccggccccag caagcgcgaa tctgcctaaa ccgaacggtc agaccccgcc gcctacgagc 840
gacgatttga gcgaacgttt tgtgagcgcg ccgccgccgc cgccaccgcc gccgcctccg 900
ccgccaccta ccccgatgcc gattgccgcg ggtgagccac cgagcccgga gccagcggcc 960
tcgaagccgc cgacgccgcc gatgccgatc gcgggccctg aaccggcgcc gccgaaacct 1020
ccgaccccgc cgatgcctat tgctggtccg gaaccggcac cgcctaaacc gccgacgccg 1080
ccgatgccaa tcgcgggtcc ggctcctacc ccgacggaaa gccagctggc tccaccgcgt 1140
ccgcctaccc cgcagacccc gaccggtgcg ccgcaacaac cggaaagccc ggcgccgcat 1200
gtcccttcgc acggccctca ccaaccgcgt cgcacggctc cggcgccgcc ttgggctaag 1260
atgccgattg gtgagccgcc gccggctccg agccgtccga gcgctagccc ggcggaaccg 1320
ccgacccgtc cggcgccaca gcattctcgt cgtgcacgcc gcggtcaccg ctaccgtacg 1380
gataccgaac gtaacgtcgg taaagtcgca accggtccgt caatccaggc acgtttgcgt 1440
gcggaagaag ccagcggtgc gcagctggcg ccgggcacgg agccgtcgcc ggcaccgctg 1500
ggtcaaccga gatcttactt ggccccgccg acccgcccgg cgccgacgga accgccgccg 1560
agcccgtccc cgcaacgcaa cagcggccgc cgtgcggagc gtcgtgttca cccggatctg 1620
gcggcgcaac acgccgcagc ccagccggac agcattaccg cggcaaccac cggcggtcgc 1680
cgccgcaagc gtgcggcgcc ggacctggac gccacccaga aaagcctgcg tccagctgca 1740
aagggcccga aagtcaaaaa ggtcaagccg caaaagccga aagcaactaa accgccgaaa 1800
gtcgttagcc agcgcggttg gcgtcactgg gtgcacgcgc tgacgcgcat taacctgggt 1860
ttgagcccgg acgaaaaata tgaactggac ttgcacgcac gtgtccgccg taacccgcgt 1920
ggttcatacc agattgccgt tgtcggtctg cagggtggcg ccggcaaaac cacgctgact 1980
gcggcactgg gttccacgct ggcgcaagtg cgtgcggatc gtattctggc actggatgct 2040
gacccgggcg cgggtaatct ggcagatcgt gtgggtcgtc agtctggtgc gaccatcgca 2100
gatgttctgg ctgagaaaga actgagccat tacaacgaca ttcgtgcgca cacgtctgtt 2160
aatgccgtta atctggaagt gctgccggca ccggagtaca gcagcgcaca gcgcgccctg 2220
agcgacgcgg actggcactt catcgcagac ccggcatctc gcttctataa cctggttttg 2280
gcggattccg gtgcgggctt tttcgatcca ctgacccgcg gtgtgctcag caccgttagc 2340
ggtgtggttg tggttgcctc cgtgagcatc gacggtgcgc aacaagcatc ggtggcgctg 2400
gactggctgc gtaataacgg ttatcaagac ttggcgagcc gcgcgagcgt tgtgattaac 2460
catatcatgc cgggcgagcc gaatgttgcg gttaaagatt tggtgcgcca ttttgagcaa 2520
caggtccaac cgggccgcgt cgttgtgatg ccttgggatc gtcatattgc agcgggcacc 2580
gaaattagcc tggacttact ggacccgatt tataagcgta aggtactgga actggccgca 2640
gcgctgagcg acgatttcga gcgtgcaggc cgtcgtaccg agcaacagtg gaatttcgct 2700
ggcattgaag ccgcagcctc tgcaattcag ggtaatgtta cctcgattca cagcctgctg 2760
gacgagggca aacaaagcct gaccaagctg gcggctgctt ggggtggttc tggtagcgaa 2820
gcgtaccagg gcgtccagca aaaatgggac gcaaccgcaa ccgagctgaa taatgctctg 2880
caaaacctgg cccgtaccat tagcgaagcg ggccaggcca tggcgagcac cgaaggcaac 2940
gtgaccggta tgtttgccac cgaaaacttg accgttcagc cggaacgtct gggtgtgctg 3000
gcgagccatc atgacaacgc agcagttgat gcgagcagcg gtgtcgaggc agccgcgggt 3060
ttgggcgaga gcgttgccat cacccatggt ccgtattcat ctcagttcaa cgacaccacg 3120
gaacagcagt ggaacttcgc aggcatcgaa gccgcggcgt ccgcgatcca gggtaacgtg 3180
actagcattc attcgttgct ggacgaaggc aagcaaagcc tgaccaaact ggcagctgca 3240
tggggtggct cgggctctga ggcgtaccaa ggcgtccaac agaagtggga cgcgactgcg 3300
accgagttaa acaatgcttt acagaacctg gctcgtacta tcagcgaggc tggtcaggcc 3360
atggcgagca ccgaaggtaa tgttaccggc atgttcgcga gccgcgcttt tattatcgac 3420
ccgacgatca gcgccatcga tggtctgtac gatctgttgg gtattggcat tccgaaccaa 3480
ggcggcatcc tgtatagctc cctggaatac ttcgagaaag ccttggaaga actggcggcc 3540
gcgttcccgg gcgatggctg gctgggtagc gcggctgaca aatatgcggg caaaaaccgt 3600
aaccatgtca actttttcca agagttggcg gatttggatc gtcaattgat tagcctgatc 3660
cacgatcagg cgaatgcagt gcaaaccact cgcgatatcc tcgaaggtgc caaaaagggt 3720
ctggagtttg tacgtccagt cgcagtcgac ctgacctaca ttccagttgt cggtcatgcg 3780
ttgtcggcaa agactctgat taatgcgacg caactgttaa aactgttggc gaaattggca 3840
gagctggtcg cggcagcgat cgccgacatc atcagcgatg tggcagatat cattaagggt 3900
acgctgggcg aagtgtggga atttattact aatgcgctca acggtctgaa ggaactgtgg 3960
gataaattga cgggttgggt taccggcttg tttagccgtg gttggtccaa tttggagagc 4020
tttttcgccg gtgttccggg cctgaccggc gcaacgagcg gtttgtccca ggtcacgggc 4080
ttgtttggtg ctgcgggtct gagcgcatcc agcggtctgg cgcacgcaga ttccttggcg 4140
tctagcgcaa gcctgccggc gctggcaggc atcggcggcg gctctggctt cggtggcttg 4200
ccaagcctgg cccaagtcca tgctgcttcc acgcgccagg ctctgcgccc acgtgcagat 4260
ggtccggttg gtgccgcagc cgagcaagtt ggtggccaga gccaactggt cagcgctcag 4320
ggctctcagg gcatgggcgg tccggttggt atgggtggta tgcacccgag ctccggcgca 4380
tccaagggta ctaccacgaa aaagtatagc gagggtgcag cggcgggtac tgaagatgcc 4440
gaacgtgcac cggttgaggc tgatgcgggt ggcggccaaa aagttttggt ccgtaatgtc 4500
gtgactgagc agcagtggaa ttttgccggc atcgaagcgg cggcgagcgc gatccaaggc 4560
aacgtcactt cgattcactc tctgctggat gagggcaaac agtccctgac gaaactggca 4620
gccgcgtggg gtggtagcgg ttccgaggca taccaaggtg ttcagcagaa gtgggacgcg 4680
acggccacgg aactgaacaa cgcgctgcag aacctggcgc gtaccatctc ggaagcaggc 4740
caggcaatgg ctagcactga aggcaacgtg acgggtatgt tcgcagcacc taagacctat 4800
agcgaagagt tgaagggtac tgatactggt caagcgagcc agattcagat gagcgacccg 4860
gcgtacaata tcaacatctc cctgccaagc tactatccag accaaaaaag cctggagaac 4920
tacatcgcgc agactcgcga taagttcctg tccgcagcga cgagcagcac cccacgcgaa 4980
gcaccgtatg agctgaacat tactagcgcg acgtaccaaa gcgcgattcc gccgcgtggt 5040
acccaagccg ttgtcctgaa agtttatcag aacgccggtg gcactcatcc gacgacgacc 5100
tataaggcct ttgactggga ccaggcatat cgtaagccaa tcacgtacga caccctgtgg 5160
caggccgaca cggatccact gccagttgtg tttccgatcg tgcaaggtga actgtcaaaa 5220
caaactggtc aacaggtgag cattgcccca aacgccggtc tggatccggt gaattatcaa 5280
aattttgctg ttacgaacga cggcgttatc tttttcttca acccgggtga actgctgccg 5340
gaagcggcgg gtccgaccca agtgctggtt ccgcgtagcg cgattgacag catgctggcg 5400
ggcgatctgg ttggcccggg tagcgcagaa tacgccgcgg ccaacccgac cggtccggca 5460
tccgtccaag gtatgagcca ggatccggtg gctgttgcag cctctaacaa tccggaactg 5520
accaccttga cggcagcgct gagcggtcag ctgaatcctc aagtgaatct ggttgatacg 5580
ctgaatagcg gccaatatac cgtctttgca ccgaccaacg ctgcgttcag caaactgccg 5640
gccagcacca ttgacgaatt gaaaaccaat tccagcctgt tgacgagcat tctgacgtat 5700
cacgttgtgg cgggccagac gtccccagcg aacgtcgtcg gtacccgtca gacgctgcag 5760
ggtgcgtctg taaccgttac gggccaaggc aactctttga aagtcggtaa tgccgacgtc 5820
gtcagcggtg gcgttagcac ggctaatgca accgtctaca tgattgacag cgttttgatg 5880
ccgcctgccg tcagccagga tacgtccccg aaaccggcta cgagcccggc agccccggtt 5940
accactgcag caatggcgga ccctgcggct gatttgatcg gtcgcggctc tgcacagtat 6000
gctgcccaaa acccgacggg tccgggctct gttgccggca tggcgcagga cccggtcgca 6060
accgcggcta gcaataatcc aatgctgtcg acgctgactt ccgctctgtc cggtaaactg 6120
aatccggacg tcaacctggt ggataccctg aacggtggcg agtataccgt ctttgccccg 6180
accaacgctg cgttcgacaa gctgccggca gccaccatcg accaactgaa aaccgacgcc 6240
aagctgctga gcagcatcct gacctatcac gtgattgcgg gtcaagctag cccgagccgc 6300
atcgacggca cccaccagac cttgcagggc gctgacctga cggttattgg tgctcgcgat 6360
gatctgatgg tgaataacgc cggtctggtt tccggcggcg ttcatacggc taatgcaacg 6420
gtgtacatga ttgatacggt ccttatgcct ccggcgcagt gataagctt 6469
<210> 55
<211> 978
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 55
atgacagacg tgagccgaaa gattcgagct tggggacgcc gattgatgat cggcacggca 60
gcggctgtag tccttccggg cctggtgggg cttgccggcg gagcggcaac cgcgggcgcg 120
ttctcccggc cggggctgcc ggtcgagtac ctgcaggtgc cgtcgccgtc gatgggccgc 180
gacatcaagg ttcagttcca gagcggtggg aacaactcac ctgcggttta tctgctcgac 240
ggcctgcgcg cccaagacga ctacaacggc tgggatatca acaccccggc gttcgagtgg 300
tactaccagt cgggactgtc gatagtcatg ccggtcggcg ggcagtccag cttctacagc 360
gactggtaca gcccggcctg cggtaaggct ggctgccaga cttacaagtg ggaaaccttc 420
ctgaccagcg agctgccgca atggttgtcc gccaacaggg ccgtgaagcc caccggcagc 480
gctgcaatcg gcttgtcgat ggccggctcg tcggcaatga tcttggccgc ctaccacccc 540
cagcagttca tctacgccgg ctcgctgtcg gccctgctgg acccctctca ggggatgggg 600
cctagcctga tcggcctcgc gatgggtgac gccggcggtt acaaggccgc agacatgtgg 660
ggtccctcga gtgacccggc atgggagcgc aacgacccta cgcagcagat ccccaagctg 720
gtcgcaaaca acacccggct atgggtttat tgcgggaacg gcaccccgaa cgagttgggc 780
ggtgccaaca tacccgccga gttcttggag aacttcgttc gtagcagcaa cctgaagttc 840
caggatgcgt acaacgccgc gggcgggcac aacgccgtgt tcaacttccc gcccaacggc 900
acgcacagct gggagtactg gggcgctcag ctcaacgcca tgaagggtga cctgcagagt 960
tcgttaggcg ccggctga 978
<210> 56
<211> 1017
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 56
atgcagcttg ttgacagggt tcgtggcgcc gtcacgggta tgtcgcgtcg actcgtggtc 60
ggggccgtcg gcgcggccct agtgtcgggt ctggtcggcg ccgtcggtgg cacggcgacc 120
gcgggggcat tttcccggcc gggcttgccg gtggagtacc tgcaggtgcc gtcgccgtcg 180
atgggccgtg acatcaaggt ccaattccaa agtggtggtg ccaactcgcc cgccctgtac 240
ctgctcgacg gcctgcgcgc gcaggacgac ttcagcggct gggacatcaa caccccggcg 300
ttcgagtggt acgaccagtc gggcctgtcg gtggtcatgc cggtgggtgg ccagtcaagc 360
ttctactccg actggtacca gcccgcctgc ggcaaggccg gttgccagac ttacaagtgg 420
gagaccttcc tgaccagcga gctgccgggg tggctgcagg ccaacaggca cgtcaagccc 480
accggaagcg ccgtcgtcgg tctttcgatg gctgcttctt cggcgctgac gctggcgatc 540
tatcaccccc agcagttcgt ctacgcggga gcgatgtcgg gcctgttgga cccctcccag 600
gcgatgggtc ccaccctgat cggcctggcg atgggtgacg ctggcggcta caaggcctcc 660
gacatgtggg gcccgaagga ggacccggcg tggcagcgca acgacccgct gttgaacgtc 720
gggaagctga tcgccaacaa cacccgcgtc tgggtgtact gcggcaacgg caagccgtcg 780
gatctgggtg gcaacaacct gccggccaag ttcctcgagg gcttcgtgcg gaccagcaac 840
atcaagttcc aagacgccta caacgccggt ggcggccaca acggcgtgtt cgacttcccg 900
gacagcggta cgcacagctg ggagtactgg ggcgcgcagc tcaacgctat gaagcccgac 960
ctgcaacggg cactgggtgc cacgcccaac accgggcccg cgccccaggg cgcctag 1017
<210> 57
<211> 291
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 57
atgtcgcaaa tcatgtacaa ctaccccgcg atgttgggtc acgccgggga tatggccgga 60
tatgccggca cgctgcagag cttgggtgcc gagatcgccg tggagcaggc cgcgttgcag 120
agtgcgtggc agggcgatac cgggatcacg tatcaggcgt ggcaggcaca gtggaaccag 180
gccatggaag atttggtgcg ggcctatcat gcgatgtcca gcacccatga agccaacacc 240
atggcgatga tggcccgcga cacggccgaa gccgccaaat ggggcggcta g 291
<210> 58
<211> 294
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 58
atgagccttt tggatgctca tatcccacag ttggtggcct cccagtcggc gtttgccgcc 60
aaggcggggc tgatgcggca cacgatcggt caggccgagc aggcggcgat gtcggctcag 120
gcgtttcacc agggggagtc gtcggcggcg tttcaggccg cccatgcccg gtttgtggcg 180
gcggccgcca aagtcaacac cttgttggat gtcgcgcagg cgaatctggg tgaggccgcc 240
ggtacctatg tggccgccga tgctgcggcc gcgtcgacct ataccgggtt ctga 294
<210> 59
<211> 1182
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 59
gtggtggatt tcggggcgtt accaccggag atcaactccg cgaggatgta cgccggcccg 60
ggttcggcct cgctggtggc cgccgcgaag atgtgggaca gcgtggcgag tgacctgttt 120
tcggccgcgt cggcgtttca gtcggtggtc tggggtctga cggtggggtc gtggataggt 180
tcgtcggcgg gtctgatggc ggcggcggcc tcgccgtatg tggcgtggat gagcgtcacc 240
gcggggcagg cccagctgac cgccgcccag gtccgggttg ctgcggcggc ctacgagaca 300
gcgtataggc tgacggtgcc cccgccggtg atcgccgaga accgtaccga actgatgacg 360
ctgaccgcga ccaacctctt ggggcaaaac acgccggcga tcgaggccaa tcaggccgca 420
tacagccaga tgtggggcca agacgcggag gcgatgtatg gctacgccgc cacggcggcg 480
acggcgaccg aggcgttgct gccgttcgag gacgccccac tgatcaccaa ccccggcggg 540
ctccttgagc aggccgtcgc ggtcgaggag gccatcgaca ccgccgcggc gaaccagttg 600
atgaacaatg tgccccaagc gctgcaacag ctggcccagc cagcgcaggg cgtcgtacct 660
tcttccaagc tgggtgggct gtggacggcg gtctcgccgc atctgtcgcc gctcagcaac 720
gtcagttcga tagccaacaa ccacatgtcg atgatgggca cgggtgtgtc gatgaccaac 780
accttgcact cgatgttgaa gggcttagct ccggcggcgg ctcaggccgt ggaaaccgcg 840
gcggaaaacg gggtctgggc gatgagctcg ctgggcagcc agctgggttc gtcgctgggt 900
tcttcgggtc tgggcgctgg ggtggccgcc aacttgggtc gggcggcctc ggtcggttcg 960
ttgtcggtgc cgccagcatg ggccgcggcc aaccaggcgg tcaccccggc ggcgcgggcg 1020
ctgccgctga ccagcctgac cagcgccgcc caaaccgccc ccggacacat gctgggcggg 1080
ctaccgctgg ggcactcggt caacgccggc agcggtatca acaatgcgct gcgggtgccg 1140
gcacgggcct acgcgatacc ccgcacaccg gccgccggat ag 1182
<210> 60
<211> 600
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 60
atggctgaaa actcgaacat tgatgacatc aaggctccgt tgcttgccgc gcttggagcg 60
gccgacctgg ccttggccac tgtcaacgag ttgatcacga acctgcgtga gcgtgcggag 120
gagactcgta cggacacccg cagccgggtc gaggagagcc gtgctcgcct gaccaagctg 180
caggaagatc tgcccgagca gctcaccgag ctgcgtgaga agttcaccgc cgaggagctg 240
cgtaaggccg ccgagggcta cctcgaggcc gcgactagcc ggtacaacga gctggtcgag 300
cgcggtgagg ccgctctaga gcggctgcgc agccagcaga gcttcgagga agtgtcggcg 360
cgcgccgaag gctacgtgga ccaggcggtg gagttgaccc aggaggcgtt gggtacggtc 420
gcatcgcaga cccgcgcggt cggtgagcgt gccgccaagc tggtcggcat cgagctgcct 480
aagaaggctg ctccggccaa gaaggccgct ccggccaaga aggccgctcc ggccaagaag 540
gcggcggcca agaaggcgcc cgcgaagaag gcggcggcca agaaggtcac ccagaagtag 600
600
<210> 61
<211> 288
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 61
atgtcagatc aaatcacgta taacccggga gccgtatccg acttcgcttc cgacgtgggc 60
tcgcgcgccg gccagctcca catgatttac gaagacaccg ccagcaaaac aaatgcgctg 120
caagagtttt tcgcgggcca cggcgcgcaa gggtttttcg acgcccaggc gcagatgctg 180
tcggggctgc aggggctcat tgagacggtg ggtcagcatg ggactaccac cggccacgtg 240
ctggacaacg cgatcggaac cgaccaggcc atcgcgggct tgttctaa 288
<210> 62
<211> 324
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 62
gtggcagaca caattcaggt aacaccgcag atgctgcgca gcaccgccaa cgatatccag 60
gcgaatatgg agcaagccat gggaatcgcc aagggctacc tagccaacca ggaaaacgtc 120
atgaaccccg ccacctggtc tggtaccggc gtcgttgctt cgcatatgac agccaccgag 180
atcaccaatg aattgaacaa ggtccttacc gggggcacgc gcctggccga gggcctcgtg 240
caggccgcag ccctgatgga gggacacgag gcggactcgc agacagcgtt tcaggcgctg 300
ttcggcgcta gccacggatc ctga 324
<210> 63
<211> 492
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 63
gtgacggtta ccgacgacta cctggccaac aacgtggact acgcgagcgg tttcaagggc 60
ccgctaccga tgccgccgag caaacacatc gcaatcgtgg cgtgcatgga cgcccggctg 120
gacgtctacc gcatgctggg catcaaggag ggcgaggcac acgtcatccg caacgccgga 180
tgcgtggtca ccgacgatgt gatccgttca ctggccatca gccagcggct gctgggaacc 240
cgcgaaatca tcctgctgca ccacaccgac tgtgggatgc tgactttcac cgacgacgac 300
ttcaagcgcg ccatccagga cgagaccggc atcagaccca cgtggtcgcc cgagtcgtac 360
cccgacgccg tcgaggacgt ccgtcagtcg ctgcgccgca tcgaggtcaa cccgttcgtc 420
accaagcaca cgtcgctgcg cggcttcgtc ttcgatgtcg ccaccggcaa actcaacgag 480
gtcacgccct ag 492
<210> 64
<211> 291
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 64
atgtcgcaga ttatgtacaa ctatccggcg atgatggctc atgccgggga catggccggt 60
tatgcgggca cgctgcagag cttgggggcc gatatcgcca gtgagcaggc cgtgctgtcc 120
agtgcttggc agggtgatac cgggatcacg tatcagggct ggcagaccca gtggaaccag 180
gccctagagg atctggtgcg ggcctatcag tcgatgtctg gcacccatga gtccaacacc 240
atggcgatgt tggctcgaga tggggccgaa gccgccaagt ggggcggcta g 291
<210> 65
<211> 294
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 65
atgagtttgt tggatgccca tattccgcag ttgatcgctt cgcatacggc gtttgccgct 60
aaggcggggt tgatgcggca tacgatcggt caggccgagc agcaggcgat gtcggcgcag 120
gcgtttcatc agggagagtc cgcggcggcg tttcagggtg cgcatgcccg gtttgtggcc 180
gcggccgcca aggtcaatac cttgctggat atcgcgcaag ccaatttggg tgaggccgcg 240
ggcacgtatg tggccgccga tgccgccgcc gcgtccagct acaccgggtt ttaa 294
<210> 66
<211> 363
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 66
gtgtcgcaga gtatgtacag ctacccggcg atgacggcca atgtcggaga catggccggt 60
tatacgggca cgacgcagag cttgggggcc gatatcgcca gtgagcgcac cgcgccgtcg 120
cgtgcttgcc aaggtgatct cgggatgagt catcaggact ggcaggccca gtggaatcag 180
gccatggagg ctctcgcgcg ggcctaccgt cggtgccggc gagcactacg ccagatcggg 240
gtgctggaaa ggccggtagg cgattcgtca gactgcggaa cgattagggt ggggtcgttc 300
cggggtcggt ggctggaccc gcgccatgcg ggtccagcca cggccgccga cgccggagac 360
taa 363
<210> 67
<211> 435
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 67
atggccacca cccttcccgt tcagcgccac ccgcggtccc tcttccccga gttttctgag 60
ctgttcgcgg ccttcccgtc attcgccgga ctccggccca ccttcgacac ccggttgatg 120
cggctggaag acgagatgaa agaggggcgc tacgaggtac gcgcggagct tcccggggtc 180
gaccccgaca aggacgtcga cattatggtc cgcgatggtc agctgaccat caaggccgag 240
cgcaccgagc agaaggactt cgacggtcgc tcggaattcg cgtacggttc cttcgttcgc 300
acggtgtcgc tgccggtagg tgctgacgag gacgacatta aggccaccta cgacaagggc 360
attcttactg tgtcggtggc ggtttcggaa gggaagccaa ccgaaaagca cattcagatc 420
cggtccacca actga 435
<210> 68
<211> 1395
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 68
atggccaagt tggcccgagt agtgggccta gtacaggaag agcaacctag cgacatgacg 60
aatcacccac ggtattcgcc accgccgcag cagccgggaa ccccaggtta tgctcagggg 120
cagcagcaaa cgtacagcca gcagttcgac tggcgttacc caccgtcccc gcccccgcag 180
ccaacccagt accgtcaacc ctacgaggcg ttgggtggta cccggccggg tctgatacct 240
ggcgtgattc cgaccatgac gccccctcct gggatggttc gccaacgccc tcgtgcaggc 300
atgttggcca tcggcgcggt gacgatagcg gtggtgtccg ccggcatcgg cggcgcggcc 360
gcatccctgg tcgggttcaa ccgggcaccc gccggcccca gcggcggccc agtggctgcc 420
agcgcggcgc caagcatccc cgcagcaaac atgccgccgg ggtcggtcga acaggtggcg 480
gccaaggtgg tgcccagtgt cgtcatgttg gaaaccgatc tgggccgcca gtcggaggag 540
ggctccggca tcattctgtc tgccgagggg ctgatcttga ccaacaacca cgtgatcgcg 600
gcggccgcca agcctcccct gggcagtccg ccgccgaaaa cgacggtaac cttctctgac 660
gggcggaccg cacccttcac ggtggtgggg gctgacccca ccagtgatat cgccgtcgtc 720
cgtgttcagg gcgtctccgg gctcaccccg atctccctgg gttcctcctc ggacctgagg 780
gtcggtcagc cggtgctggc gatcgggtcg ccgctcggtt tggagggcac cgtgaccacg 840
gggatcgtca gcgctctcaa ccgtccagtg tcgacgaccg gcgaggccgg caaccagaac 900
accgtgctgg acgccattca gaccgacgcc gcgatcaacc ccggtaactc cgggggcgcg 960
ctggtgaaca tgaacgctca actcgtcgga gtcaactcgg ccattgccac gctgggcgcg 1020
gactcagccg atgcgcagag cggctcgatc ggtctcggtt ttgcgattcc agtcgaccag 1080
gccaagcgca tcgccgacga gttgatcagc accggcaagg cgtcacatgc ctccctgggt 1140
gtgcaggtga ccaatgacaa agacaccctg ggcgccaaga tcgtcgaagt agtggccggt 1200
ggtgctgccg cgaacgctgg agtgccgaag ggcgtcgttg tcaccaaggt cgacgaccgc 1260
ccgatcaaca gcgcggacgc gttggttgcc gccgtgcggt ccaaagcgcc gggcgccacg 1320
gtggcgctaa cctttcagga tccctcgggc ggtagccgca cagtgcaagt caccctcggc 1380
aaggcggagc agtga 1395
<210> 69
<211> 1176
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 69
atggtggatt tcggggcgtt accaccggag atcaactccg cgaggatgta cgccggcccg 60
ggttcggcct cgctggtggc cgcggctcag atgtgggaca gcgtggcgag tgacctgttt 120
tcggccgcgt cggcgtttca gtcggtggtc tggggtctga cggtggggtc gtggataggt 180
tcgtcggcgg gtctgatggt ggcggcggcc tcgccgtatg tggcgtggat gagcgtcacc 240
gcggggcagg ccgagctgac cgccgcccag gtccgggttg ctgcggcggc ctacgagacg 300
gcgtatgggc tgacggtgcc cccgccggtg atcgccgaga accgtgctga actgatgatt 360
ctgatagcga ccaacctctt ggggcaaaac accccggcga tcgcggtcaa cgaggccgaa 420
tacggcgaga tgtgggccca agacgccgcc gcgatgtttg gctacgccgc ggcgacggcg 480
acggcgacgg cgacgttgct gccgttcgag gaggcgccgg agatgaccag cgcgggtggg 540
ctcctcgagc aggccgccgc ggtcgaggag gcctccgaca ccgccgcggc gaaccagttg 600
atgaacaatg tgccccaggc gctgcaacag ctggcccagc ccacgcaggg caccacgcct 660
tcttccaagc tgggtggcct gtggaagacg gtctcgccgc atcggtcgcc gatcagcaac 720
atggtgtcga tggccaacaa ccacatgtcg atgaccaact cgggtgtgtc gatgaccaac 780
accttgagct cgatgttgaa gggctttgct ccggcggcgg ccgcccaggc cgtgcaaacc 840
gcggcgcaaa acggggtccg ggcgatgagc tcgctgggca gctcgctggg ttcttcgggt 900
ctgggcggtg gggtggccgc caacttgggt cgggcggcct cggtcggttc gttgtcggtg 960
ccgcaggcct gggccgcggc caaccaggca gtcaccccgg cggcgcgggc gctgccgctg 1020
accagcctga ccagcgccgc ggaaagaggg cccgggcaga tgctgggcgg gctgccggtg 1080
gggcagatgg gcgccagggc cggtggtggg ctcagtggtg tgctgcgtgt tccgccgcga 1140
ccctatgtga tgccgcattc tccggcggcc ggctag 1176
<210> 70
<211> 1743
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 70
atgaatttcg ccgttttgcc gccggaggtg aattcggcgc gcatattcgc cggtgcgggc 60
ctgggcccaa tgctggcggc ggcgtcggcc tgggacgggt tggccgagga gttgcatgcc 120
gcggcgggct cgttcgcgtc ggtgaccacc gggttggcgg gcgacgcgtg gcatggtccg 180
gcgtcgctgg cgatgacccg cgcggccagc ccgtatgtgg ggtggttgaa cacggcggcg 240
ggtcaggccg cgcaggcggc cggccaggcg cggctagcgg cgagcgcgtt cgaggcgacg 300
ctggcggcca ccgtgtctcc agcgatggtc gcggccaacc ggacacggct ggcgtcgctg 360
gtggcagcca acttgctggg ccagaacgcc ccggcgatcg cggccgcgga ggctgaatac 420
gagcagatat gggcccagga cgtggccgcg atgttcggct atcactccgc cgcgtcggcg 480
gtggccacgc agctggcgcc tattcaagag ggtttgcagc agcagctgca aaacgtgctg 540
gcccagttgg ctagcgggaa cctgggcagc ggaaatgtgg gcgtcggcaa catcggcaac 600
gacaacattg gcaacgcaaa catcggcttc ggaaatcgag gcgacgccaa catcggcatc 660
gggaatatcg gcgacagaaa cctcggcatt gggaacaccg gcaattggaa tatcggcatc 720
ggcatcaccg gcaacggaca aatcggcttc ggcaagcctg ccaaccccga cgtcttggtg 780
gtgggcaacg gcggcccggg agtaaccgcg ttggtcatgg gcggcaccga cagcctactg 840
ccgctgccca acatcccctt actcgagtac gctgcgcggt tcatcacccc cgtgcatccc 900
ggatacaccg ctacgttcct ggaaacgcca tcgcagtttt tcccattcac cgggctgaat 960
agcctgacct atgacgtctc cgtggcccag ggcgtaacga atctgcacac cgcgatcatg 1020
gcgcaactcg cggcgggaaa cgaagtcgtc gtcttcggca cctcccaaag cgccacgata 1080
gccaccttcg aaatgcgcta tctgcaatcc ctgccagcac acctgcgtcc gggtctcgac 1140
gaattgtcct ttacgttgac cggcaatccc aaccggcccg acggtggcat tcttacgcgt 1200
tttggcttct ccataccgca gttgggtttc acattgtccg gcgcgacgcc cgccgacgcc 1260
taccccaccg tcgattacgc gttccagtac gacggcgtca acgacttccc caaatacccg 1320
ctgaatgtct tcgcgaccgc caacgcgatc gcgggcatcc ttttcctgca ctccgggttg 1380
attgcgttgc cgcccgatct tgcctcgggc gtggttcaac cggtgtcctc accggacgtc 1440
ctgaccacct acatcctgct gcccagccaa gatctgccgc tgctggtccc gctgcgtgct 1500
atccccctgc tgggaaaccc gcttgccgac ctcatccagc cggacttgcg ggtgctcgtc 1560
gagttgggtt atgaccgcac cgcccaccag gacgtgccca gcccgttcgg actgtttccg 1620
gacgtcgatt gggccgaggt ggccgcggac ctgcagcaag gcgccgtgca aggcgtcaac 1680
gacgccctgt ccggactggg gctgccgccg ccgtggcagc cggcgctacc ccgacttttc 1740
taa 1743
<210> 71
<211> 285
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 71
atgaccatca actatcaatt cggggacgtc gacgctcacg gcgccatgat ccgcgctcag 60
gccgggtcgc tggaggccga gcatcaggcc atcatttctg atgtgttgac cgcgagtgac 120
ttttggggcg gcgccggttc ggcggcctgc caggggttca ttacccagct gggccgtaac 180
ttccaggtga tctacgagca ggccaacgcc cacgggcaga aggtgcaggc tgccggcaac 240
aacatggcac aaaccgacag cgccgtcggc tccagctggg cctaa 285
<210> 72
<211> 297
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 72
atgacctcgc gttttatgac ggatccgcac gcgatgcggg acatggcggg ccgttttgag 60
gtgcacgccc agacggtgga ggacgaggct cgccggatgt gggcgtccgc gcaaaacatt 120
tccggcgcgg gctggagtgg catggccgag gcgacctcgc tagacaccat gacccagatg 180
aatcaggcgt ttcgcaacat cgtgaacatg ctgcacgggg tgcgtgacgg gctggttcgc 240
gacgccaaca actacgaaca gcaagagcag gcctcccagc agatcctcag cagctga 297
<210> 73
<211> 228
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 73
gtgatagcgg gcgtcgacca ggcgcttgca gcaacaggcc aggctagcca gcgggcggca 60
ggcgcatctg gtggggtcac cgtcggtgtc ggcgtgggca cggaacagag gaacctttcg 120
gtggttgcac cgagtcagtt cacatttagt tcacgcagcc cagattttgt ggatgaaacc 180
gcaggtcaat cgtggtgcgc gatactggga ttgaaccagt ttcactag 228
<210> 74
<211> 555
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 74
gtggacttgc ccggaaatga ctttgacagc aacgatttcg acgccgtgga tctctggggt 60
gccgacggcg cggagggctg gactgcggat ccgattattg gcgtcgggtc ggcggcgacc 120
ccggacaccg gacccgacct ggacaatgcc cacggtcagg cggagacgga caccgaacaa 180
gagatcgcgc tttttaccgt gacgaatccc ccacgcacgg tgtcggtatc gacgctgatg 240
gacggccgga ttgaccatgt cgagctgtcg gccagggtgg cctggatgag tgagtcgcag 300
ctcgcttctg agatcctggt gattgccgac ctggcgcggc agaaggcgca gtcggcccag 360
tacgccttca tccttgacag gatgagtcaa caggtcgatg cagatgaaca ccgcgtcgca 420
ctgctacgta agaccgtggg cgaaacctgg gggttaccat cgccggaaga agccgcggca 480
gcagaagctg aggtgttcgc gacgcgctac agcgacgatt gtccagcacc agacgacgag 540
agcgatccat ggtga 555
<210> 75
<211> 312
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 75
atgaccggat ttctcggtgt cgtgccttcg ttcctgaagg tgctggcggg catgcacaac 60
gagatcgtgg gtgatatcaa aagggcgacc gatacggtcg ccgggattag cggacgagtt 120
cagcttaccc atggttcgtt cacgtcgaaa ttcaatgaca cgctgcaaga gtttgagacc 180
acccgtagca gcacgggcac gggtttgcag ggagtcacca gcggactggc caataatctg 240
ctcgcagccg ccggcgccta cctcaaggcc gacgatggcc tagccggtgt tatcgacaag 300
attttcggtt ga 312
<210> 76
<211> 399
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 76
atgagcacga cgttcgctgc ccgcctgaac cgcctgttcg acacggttta tccgcccgga 60
cgcgggccac atacctccgc ggaggtgatc gcggcgctca aggcagaggg catcacgatg 120
tcggctccct acctatcaca gctacgctca ggaaaccgta cgaacccatc gggggcgacc 180
atggccgccc tggccaactt cttccgcatc aaggcggcct acttcaccga cgacgagtac 240
tacgaaaagc tcgacaagga attgcagtgg ctgtgcacga tgcgcgacga cggcgtgcgc 300
cggatcgcgc agcgggccca cgggttgccc tccgcggcgc agcagaaggt gttggaccgg 360
atcgacgagc tgcggcgtgc cgaagggatc gacgcttag 399
<210> 77
<211> 300
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 77
atggaaaaaa tgtcacatga tccgatcgct gccgacattg gcacgcaagt gagcgacaac 60
gctctgcacg gcgtgacggc cggctcgacg gcgctgacgt cggtgaccgg gctggttccc 120
gcgggggccg atgaggtctc cgcccaagcg gcgacggcgt tcacatcgga gggcatccaa 180
ttgctggctt ccaatgcatc ggcccaagac cagctccacc gtgcgggcga agcggtccag 240
gacgtcgccc gcacctattc gcaaatcgac gacggcgccg ccggcgtctt cgccgaatag 300
300
<210> 78
<211> 1383
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 78
atgacgcagt cgcagaccgt gacggtggat cagcaagaga ttttgaacag ggccaacgag 60
gtggaggccc cgatggcgga cccaccgact gatgtcccca tcacaccgtg cgaactcacg 120
gcggctaaaa acgccgccca acagctggta ttgtccgccg acaacatgcg ggaatacctg 180
gcggccggtg ccaaagagcg gcagcgtctg gcgacctcgc tgcgcaacgc ggccaaggcg 240
tatggcgagg ttgatgagga ggctgcgacc gcgctggaca acgacggcga aggaactgtg 300
caggcagaat cggccggggc cgtcggaggg gacagttcgg ccgaactaac cgatacgccg 360
agggtggcca cggccggtga acccaacttc atggatctca aagaagcggc aaggaagctc 420
gaaacgggcg accaaggcgc atcgctcgcg cactttgcgg atgggtggaa cactttcaac 480
ctgacgctgc aaggcgacgt caagcggttc cgggggtttg acaactggga aggcgatgcg 540
gctaccgctt gcgaggcttc gctcgatcaa caacggcaat ggatactcca catggccaaa 600
ttgagcgctg cgatggccaa gcaggctcaa tatgtcgcgc agctgcacgt gtgggctagg 660
cgggaacatc cgacttatga agacatagtc gggctcgaac ggctttacgc ggaaaaccct 720
tcggcccgcg accaaattct cccggtgtac gcggagtatc agcagaggtc ggagaaggtg 780
ctgaccgaat acaacaacaa ggcagccctg gaaccggtaa acccgccgaa gcctcccccc 840
gccatcaaga tcgacccgcc cccgcctccg caagagcagg gattgatccc tggcttcctg 900
atgccgccgt ctgacggctc cggtgtgact cccggtaccg ggatgccagc cgcaccgatg 960
gttccgccta ccggatcgcc gggtggtggc ctcccggctg acacggcggc gcagctgacg 1020
tcggctgggc gggaagccgc agcgctgtcg ggcgacgtgg cggtcaaagc ggcatcgctc 1080
ggtggcggtg gaggcggcgg ggtgccgtcg gcgccgttgg gatccgcgat cgggggcgcc 1140
gaatcggtgc ggcccgctgg cgctggtgac attgccggct taggccaggg aagggccggc 1200
ggcggcgccg cgctgggcgg cggtggcatg ggaatgccga tgggtgccgc gcatcaggga 1260
caagggggcg ccaagtccaa gggttctcag caggaagacg aggcgctcta caccgaggat 1320
cgggcatgga ccgaggccgt cattggtaac cgtcggcgcc aggacagtaa ggagtcgaag 1380
tga 1383
<210> 79
<211> 6303
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 79
atgaccgagc agcaatggaa cttcgcgggc attgaagcgg cagcgagcgc aatccagggt 60
aatgtgacca gcatccatag cctgcttgac gagggtaagc aaagcctgac caaacttgcg 120
gcggcctggg gtggcagcgg ttcggaagcg taccagggtg tgcagcaaaa atgggatgcg 180
accgcaaccg agctgaataa cgcgttacaa aacctcgcgc gcaccatctc tgaggccggt 240
caagcgatgg cgagcaccga aggcaatgta accggtatgt tcgcgcaagc cgaaaccgcc 300
gtcaataccc tgttcgagaa actggagccg atggcatcta ttcttgatcc gggtgcgagc 360
cagagcacta ccaatccaat ctttggcatg ccgtccccgg gcagctcgac gccggtgggc 420
cagctgccgc cggcggctac ccaaacctta ggtcagctgg gtgagatgag cggcccgatg 480
ggcggctccg gtaaccctgc agatgaagag gcagcacaaa tgggtctgct gggtaccagc 540
ccgctgagca atcacccact ggccggcggc agcggcccaa gcgctggtgc gggtctgctg 600
cgcgcggagt ccctgccggg tgcgggtggc tccctgacgc gtaccccact catgagccaa 660
ctgattgaga aaccggttgc gaccgaacaa cagtggaatt ttgccggtat tgaagctgcg 720
gccagcgcca tccagggcaa tgttacgagc atccacagcc tgctggatga aggcaaacag 780
tcgctgacca agctggcggc ggcgtggggt ggctccggta gcgaagccta tcagggtgtt 840
cagcagaaat gggacgcgac cgcgactgag ctgaacaatg cgctgcagaa tctggcccgc 900
actatttccg aggccggtca agcgatggca agcaccgagg gcaacgtgac cggtatgttc 960
gctgctgccg attacgacaa actgtttcgc ccacatgaag gcatggaggc accggatgat 1020
atggcggcgc agccgttttt cgacccgtcc gcgagctttc cgccggcccc agcaagcgcg 1080
aatctgccta aaccgaacgg tcagaccccg ccgcctacga gcgacgattt gagcgaacgt 1140
tttgtgagcg cacctccacc accgccgccg ccaccaccgc ctccgcctcc tacgccgatg 1200
ccaattgccg ccggtgaacc gcctagcccg gaaccggctg caagcaaacc gccaactcct 1260
ccgatgccga ttgccggtcc agaaccggca ccgccgaaac caccgacgcc tccgatgcct 1320
atcgcgggtc ctgaaccggc gccaccgaaa ccgccgaccc caccgatgcc gattgctggt 1380
ccggcgccaa ccccaacgga gtctcaattg gcaccacctc gtccaccgac cccacaaacg 1440
cctaccggtg cgccgcaaca gccagaatca ccggccccgc atgttcctag ccacggtccg 1500
caccaaccgc gtcgtaccgc gcctgcaccg ccgtgggcga aaatgccgat tggtgaaccg 1560
cctccggctc cttctcgtcc gtcggcttca ccggcggaac cgcctactcg tccagcgccg 1620
caacactccc gtcgtgcgcg tcgtggtcac cgctaccgta cggacacgga acgtaacgtc 1680
ggtaaagtcg ctaccggccc gagcatccag gctcgtctgc gcgcagaaga agcatcaggt 1740
gcgcaactgg cccctggtac cgagccttct ccggctccgc tgggtcaacc gagatcttac 1800
ctggcaccgc ctacccgtcc ggcgcctacc gaaccaccgc ctagccctag cccgcagcgt 1860
aactccggtc gccgtgcaga gcgtcgtgtc cacccggatc tggcggcgca acacgctgcg 1920
gctcagccag attctattac tgccgccact accggtggca gacgccgcaa acgtgctgca 1980
ccggacttgg acgccaccca gaaaagcctg cgtccagctg caaagggccc gaaagtcaaa 2040
aaggtcaagc cgcaaaagcc gaaagcaact aaaccgccga aagtcgttag ccagcgcggt 2100
tggcgtcact gggtgcacgc gctgacgcgc attaacctgg gtttgagccc ggacgaaaaa 2160
tatgaactgg acttgcacgc acgtgtccgc cgtaacccgc gtggttcata ccagattgcc 2220
gttgtcggtc tgcagggtgg cgccggcaaa accacgctga ctgcggcact gggttccacg 2280
ctggcgcaag tgcgtgcgga tcgtattctg gcactggatg ctgacccggg cgcgggtaat 2340
ctggcagatc gtgtgggtcg tcagtctggt gcgaccatcg cagatgttct ggctgagaaa 2400
gaactgagcc attacaacga cattcgtgcg cacacgtctg ttaatgccgt taatctggaa 2460
gtgctgccgg caccggagta cagcagcgca cagcgcgccc tgagcgacgc ggactggcac 2520
ttcatcgcag acccggcatc tcgcttctat aacctggttt tggcggattc cggtgcgggc 2580
tttttcgatc cactgacccg cggtgtgctc agcaccgtta gcggtgtggt tgtggttgcc 2640
tccgtgagca tcgacggtgc gcaacaagca tcggtggcgc tggactggct gcgtaataac 2700
ggttatcaag acttggcgag ccgcgcgagc gttgtgatta accatatcat gccgggcgag 2760
ccgaatgttg cggttaaaga tttggtgcgc cattttgagc aacaggtcca accgggccgc 2820
gtcgttgtga tgccatggga tcgtcatatt gcagcgggca ccgaaattag cctggactta 2880
ctggacccga tttataagcg taaggtactg gaactggccg cagcgctgag cgacgatttc 2940
gagcgtgcag gccgtcgtac cgagcaacag tggaatttcg ctggcattga agccgcagcc 3000
tctgcaattc agggtaacgt gactagcatt cattcgttgc tggacgaagg caagcaaagc 3060
ctgaccaaac tggcagctgc atggggtggc tcgggctctg aggcgtacca aggcgtccaa 3120
cagaagtggg acgcgactgc gaccgagtta aacaatgctt tacagaacct ggctcgtact 3180
atcagcgagg ctggtcaggc aatggcgagc accgaaggta atgttaccgg catgttcgcg 3240
agccgcgctt ttattatcga cccgacgatc agcgccatcg atggtctgta cgatctgttg 3300
ggtattggca ttccgaacca aggcggcatc ctgtatagct ccctggaata cttcgagaaa 3360
gccttggaag aactggcggc cgcgttcccg ggcgatggct ggctgggtag cgcggctgac 3420
aaatatgcgg gcaaaaaccg taaccatgtc aactttttcc aagagttggc ggatttggat 3480
cgtcaattga ttagcctgat ccacgatcag gcgaatgcag tgcaaaccac tcgcgatatc 3540
ctcgaaggtg ccaaaaaggg tctggagttt gtacgtccag tcgcagtcga cctgacctac 3600
attccagttg tcggtcatgc gttgtcggca aagactctga ttaatgcgac gcaactgtta 3660
aaactgttgg cgaaattggc agagctggtc gcggcagcga tcgccgacat catcagcgat 3720
gtggcagata tcattaaggg tacgctgggc gaagtgtggg aatttattac taatgcgctc 3780
aacggtctga aggaactgtg ggataaattg acgggttggg ttaccggctt gtttagccgt 3840
ggttggtcca atttggagag ctttttcgcc ggtgttccgg gcctgaccgg cgcaacgagc 3900
ggtttgtccc aggtcacggg cttgtttggt gctgcgggtc tgagcgcatc cagcggtctg 3960
gcgcacgcag attccttggc gtctagcgca agcctgccgg cgctggcagg catcggcggc 4020
ggctctggct tcggtggctt gccaagcctg gcccaagtcc atgctgcttc cacgcgccag 4080
gctctgcgcc cacgtgcaga tggtccggtt ggtgccgcag ccgagcaagt tggtggccag 4140
agccaactgg tcagcgctca gggctctcag ggcatgggcg gtccggttgg tatgggtggt 4200
atgcacccga gctccggcgc atccaagggt actaccacga aaaagtatag cgagggtgca 4260
gcggcgggta ctgaagatgc cgaacgtgca ccggttgagg ctgatgcggg tggcggccaa 4320
aaagttttgg tccgtaatgt cgtgactgag cagcagtgga attttgccgg catcgaagcg 4380
gcggcgagcg cgatccaagg caacgtcact tcgattcact ctctgctgga tgagggcaaa 4440
cagtccctga cgaaactggc agccgcgtgg ggtggtagcg gttccgaggc ataccaaggt 4500
gttcagcaga agtgggacgc gacggccacg gaactgaaca acgcgctgca gaacctggcg 4560
cgtaccatct cggaagcagg ccaggcaatg gctagcactg aaggcaacgt gacgggtatg 4620
ttcgcagcac ctaagaccta tagcgaagag ttgaagggta ctgatactgg tcaagcgagc 4680
cagattcaga tgagcgaccc ggcgtacaat atcaacatct ccctgccaag ctactatcca 4740
gaccaaaaaa gcctggagaa ctacatcgcg cagactcgcg ataagttcct gtccgcagcg 4800
acgagcagca ccccacgcga agcaccgtat gagctgaaca ttactagcgc gacgtaccaa 4860
agcgcgattc cgccgcgtgg tacccaagcc gttgtcctga aagtttatca gaacgccggt 4920
ggcactcatc cgacgacgac ctataaggcc tttgactggg accaggcata tcgtaagcca 4980
atcacgtacg acaccctgtg gcaggccgac acggatccac tgccagttgt gtttccgatc 5040
gtgcaaggtg aactgtcaaa acaaactggt caacaggtga gcattgcccc aaacgccggt 5100
ctggatccgg tgaattatca aaattttgct gttacgaacg acggcgttat ctttttcttc 5160
aacccgggtg aactgctgcc ggaagcggcg ggtccgaccc aagtgctggt tccgcgtagc 5220
gcgattgaca gcatgctggc gggcgatctg gttggcccgg gtagcgcaga atacgccgcg 5280
gccaacccga ccggtccggc atccgtccaa ggtatgagcc aggatccggt ggctgttgca 5340
gcctctaaca atccggaact gaccaccttg acggcagcgc tgagcggtca gctgaatcct 5400
caagtgaatc tggttgatac gctgaatagc ggccaatata ccgtctttgc accgaccaac 5460
gctgcgttca gcaaactgcc ggccagcacc attgacgaat tgaaaaccaa ttccagcctg 5520
ttgacgagca ttctgacgta tcacgttgtg gcgggccaga cgtccccagc gaacgtcgtc 5580
ggtacccgtc agacgctgca gggtgcgtct gtaaccgtta cgggccaagg caactctttg 5640
aaagtcggta atgccgacgt cgtcagcggt ggcgttagca cggctaatgc aaccgtctac 5700
atgattgaca gcgttttgat gccgcctgcc gtcagccagg atacgtcccc gaaaccggct 5760
acgagcccgg cagccccggt taccactgca gcaatggcgg accctgcggc tgatttgatc 5820
ggtcgcggct ctgcacagta tgctgcccaa aacccgacgg gtccgggctc tgttgccggc 5880
atggcgcagg acccggtcgc aaccgcggct agcaataatc caatgctgtc tacgctgact 5940
tccgctctgt ccggtaaact gaatccggac gtcaacctgg tggataccct gaacggtggc 6000
gagtataccg tctttgcccc gaccaacgct gcgttcgaca agctgccggc agccaccatc 6060
gaccaactga aaaccgacgc caagctgctg agcagcatcc tgacctatca cgtgattgcg 6120
ggtcaagcta gcccgagccg catcgacggc acccaccaga ccttgcaggg cgctgacctg 6180
acggttattg gtgctcgcga tgatctgatg gtgaataacg ccggtctggt ttccggcggc 6240
gttcatacgg ctaatgcaac ggtgtacatg attgatacgg tccttatgcc tccggcgcag 6300
tga 6303
<210> 80
<211> 5313
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 80
atgcaggcgg aaaccgcggt gaacaccctg tttgaaaaac tggaaccgat ggcgagcatt 60
ctggatccgg gcgcgagcca gagcaccacc aacccgattt ttggcatgcc gagcccgggc 120
agcagcaccc cggtgggcca gctgccgccg gcggcgaccc agaccctggg ccagctgggc 180
gaaatgagcg gcccgatggg cggcagcggc aacccggcgg atgaagaagc ggcgcagatg 240
ggcctgctgg gcaccagccc gctgagcaac catccgctgg cgggcggcag cggcccgagc 300
gcgggcgcgg gcctgctgcg cgcggaaagc ctgccgggcg cgggcggcag cctgacccgc 360
accccgctga tgagccagct gattgaaaaa ccggtggcga ccgaacagca gtggaacttt 420
gcgggcattg aagcggcggc gagcgcgatt cagggcaacg tgaccagcat tcatagcctg 480
ctggatgaag gcaaacagag cctgaccaaa ctggcggcgg cgtggggcgg cagcggcagc 540
gaagcgtatc agggcgtgca gcagaaatgg gatgcgaccg cgaccgaact gaacaacgcg 600
ctgcagaacc tggcgcgcac cattagcgaa gcgggccagg cgatggcgag caccgaaggc 660
aacgtgaccg gcatgtttgc gtgggtgcat gcgctgaccc gcattaacct gggcctgagc 720
ccggatgaaa aatatgaact ggatctgcat gcgcgcgtgc gccgcaaccc gcgcggcagc 780
tatcagattg cggtggtggg cctgcagggc ggcgcgggca aaaccaccct gaccgcggcg 840
ctgggcagca ccctggcgca ggtgcgcgcg gatcgcattc tggcgctgga tgcggatccg 900
ggcgcgggca acctggcgga tcgcgtgggc cgccagagcg gcgcgaccat tgcggatgtg 960
ctggcggaaa aagaactgag ccattataac gatattcgcg cgcataccag cgtgaacgcg 1020
gtgaacctgg aagtgctgcc ggcgccggaa tatagcagcg cgcagcgcgc gctgagcgat 1080
gcggattggc attttattgc ggatccggcg agccgctttt ataacctggt gctggcggat 1140
agcggcgcgg gcttttttga tccgctgacc cgcggcgtgc tgagcaccgt gagcggcgtg 1200
gtggtggtgg cgagcgtgag cattgatggc gcgcagcagg cgagcgtggc gctggattgg 1260
ctgcgcaaca acggctatca ggatctggcg agccgcgcga gcgtggtgat taaccatatt 1320
atgccgggcg aaccgaacgt ggcggtgaaa gatctggtgc gccattttga acagcaggtg 1380
cagccgggcc gcgtggtggt gatgccgtgg gatcgccata ttgcggcggg caccgaaatt 1440
agcctggatc tgctggatcc gatttataaa cgcaaagtgc tggaactggc ggcggcgctg 1500
agcgatgatt ttgaacgcgc gggccgccgc accgaacagc agtggaactt tgcgggcatt 1560
gaagcggcgg cgagcgcgat tcagggcaac gtgaccagca ttcatagcct gctggatgaa 1620
ggcaaacaga gcctgaccaa actggcggcg gcgtggggcg gcagcggcag cgaagcgtat 1680
cagggcgtgc agcagaaatg ggatgcgacc gcgaccgaac tgaacaacgc gctgcagaac 1740
ctggcgcgca ccattagcga agcgggccag gcgatggcga gcaccgaagg caacgtgacc 1800
ggcatgtttg cgaccgaaaa cctgaccgtg cagccggaac gcctgggcgt gctggcgagc 1860
catcatgata acgcggcggt ggatgcgagc agcggcgtgg aagcggcggc gggcctgggc 1920
gaaagcgtgg cgattaccca tggcccgtat agcagccagt ttaacgatac caccgaacag 1980
cagtggaact ttgcgggcat tgaagcggcg gcgagcgcga ttcagggcaa cgtgaccagc 2040
attcatagcc tgctggatga aggcaaacag agcctgacca aactggcggc ggcgtggggc 2100
ggcagcggca gcgaagcgta tcagggcgtg cagcagaaat gggatgcgac cgcgaccgaa 2160
ctgaacaacg cgctgcagaa cctggcgcgc accattagcg aagcgggcca ggcgatggcg 2220
agcaccgaag gcaacgtgac cggcatgttt gcgagccgcg cgtttattat tgatccgacc 2280
attagcgcga ttgatggcct gtatgatctg ctgggcattg gcattccgaa ccagggcggc 2340
attctgtata gcagcctgga atattttgaa aaagcgctgg aagaactggc ggcggcgttt 2400
ccgggcgatg gctggctggg cagcgcggcg gataaatatg cgggcaaaaa ccgcaaccat 2460
gtgaactttt ttcaggaact ggcggatctg gatcgccagc tgattagcct gattcatgat 2520
caggcgaacg cggtgcagac cacccgcgat attctggaag gcgcgaaaaa aggcctggaa 2580
tttgtgcgcc cggtggcggt ggatctgacc tatattccgg tggtgggcca tgcgctgagc 2640
gcgaaaaccc tgattaacgc gacccagctg ctgaaactgc tggcgaaact ggcggaactg 2700
gtggcggcgg cgattgcgga tattattagc gatgtggcgg atattattaa aggcaccctg 2760
ggcgaagtgt gggaatttat taccaacgcg ctgaacggcc tgaaagaact gtgggataaa 2820
ctgaccggct gggtgaccgg cctgtttagc cgcggctgga gcaacctgga aagctttttt 2880
gcgggcgtgc cgggcctgac cggcgcgacc agcggcctga gccaggtgac cggcctgttt 2940
ggcgcggcgg gcctgagcgc gagcagcggc ctggcgcatg cggatagcct ggcgagcagc 3000
gcgagcctgc cggcgctggc gggcattggc ggcggcagcg gctttggcgg cctgccgagc 3060
ctggcgcagg tgcatgcggc gagcacccgc caggcgctgc gcccgcgcgc ggatggcccg 3120
gtgggcgcgg cggcggaaca ggtgggcggc cagagccagc tggtgagcgc gcagggcagc 3180
cagggcatgg gcggcccggt gggcatgggc ggcatgcatc cgagcagcgg cgcgagcaaa 3240
ggcaccacca ccaaaaaata tagcgaaggc gcggcggcgg gcaccgaaga tgcggaacgc 3300
gcgccggtgg aagcggatgc gggcggcggc cagaaagtgc tggtgcgcaa cgtggtgacc 3360
gaacagcagt ggaactttgc gggcattgaa gcggcggcga gcgcgattca gggcaacgtg 3420
accagcattc atagcctgct ggatgaaggc aaacagagcc tgaccaaact ggcggcggcg 3480
tggggcggca gcggcagcga agcgtatcag ggcgtgcagc agaaatggga tgcgaccgcg 3540
accgaactga acaacgcgct gcagaacctg gcgcgcacca ttagcgaagc gggccaggcg 3600
atggcgagca ccgaaggcaa cgtgaccggc atgtttgcgg cgccgaaaac ctatagcgaa 3660
gaactgaaag gcaccgatac cggccaggcg agccagattc agatgagcga tccggcgtat 3720
aacattaaca ttagcctgcc gagctattat ccggatcaga aaagcctgga aaactatatt 3780
gcgcagaccc gcgataaatt tctgagcgcg gcgaccagca gcaccccgcg cgaagcgccg 3840
tatgaactga acattaccag cgcgacctat cagagcgcga ttccgccgcg cggcacccag 3900
gcggtggtgc tgaaagtgta tcagaacgcg ggcggcaccc atccgaccac cacctataaa 3960
gcgtttgatt gggatcaggc gtatcgcaaa ccgattacct atgataccct gtggcaggcg 4020
gataccgatc cgctgccggt ggtgtttccg attgtgcagg gcgaactgag caaacagacc 4080
ggccagcagg tgagcattgc gccgaacgcg ggcctggatc cggtgaacta tcagaacttt 4140
gcggtgacca acgatggcgt gatttttttt tttaacccgg gcgaactgct gccggaagcg 4200
gcgggcccga cccaggtgct ggtgccgcgc agcgcgattg atagcatgct ggcgggcgat 4260
ctggtgggcc cgggcagcgc ggaatatgcg gcggcgaacc cgaccggccc ggcgagcgtg 4320
cagggcatga gccaggatcc ggtggcggtg gcggcgagca acaacccgga actgaccacc 4380
ctgaccgcgg cgctgagcgg ccagctgaac ccgcaggtga acctggtgga taccctgaac 4440
agcggccagt ataccgtgtt tgcgccgacc aacgcggcgt ttagcaaact gccggcgagc 4500
accattgatg aactgaaaac caacagcagc ctgctgacca gcattctgac ctatcatgtg 4560
gtggcgggcc agaccagccc ggcgaacgtg gtgggcaccc gccagaccct gcagggcgcg 4620
agcgtgaccg tgaccggcca gggcaacagc ctgaaagtgg gcaacgcgga tgtggtgagc 4680
ggcggcgtga gcaccgcgaa cgcgaccgtg tatatgattg atagcgtgct gatgccgccg 4740
gcggtgagcc aggataccag cccgaaaccg gcgaccagcc cggcggcgcc ggtgaccacc 4800
gcggcgatgg cggatccggc ggcggatctg attggccgcg gcagcgcgca gtatgcggcg 4860
cagaacccga ccggcccggg cagcgtggcg ggcatggcgc aggatccggt ggcgaccgcg 4920
gcgagcaaca acccgatgct gagcaccctg accagcgcgc tgagcggcaa actgaacccg 4980
gatgtgaacc tggtggatac cctgaacggc ggcgaatata ccgtgtttgc gccgaccaac 5040
gcggcgtttg ataaactgcc ggcggcgacc attgatcagc tgaaaaccga tgcgaaactg 5100
ctgagcagca ttctgaccta tcatgtgatt gcgggccagg cgagcccgag ccgcattgat 5160
ggcacccatc agaccctgca gggcgcggat ctgaccgtga ttggcgcgcg cgatgatctg 5220
atggtgaaca acgcgggcct ggtgagcggc ggcgtgcata ccgcgaacgc gaccgtgtat 5280
atgattgata ccgtgctgat gccgccggcg cag 5313
<210> 81
<211> 4795
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 81
atgcaagccg aaaccgccgt caataccctg ttcgagaaac tggagccgat ggcatctatt 60
cttgatccgg gtgcgagcca gagcactacc aatccaatct ttggcatgcc gtccccgggc 120
agctcgacgc cggtgggcca gctgccgccg gcggctaccc aaaccttagg tcagctgggt 180
gagatgagcg gcccgatggg cggctccggt aaccctgcag atgaagaggc agcacaaatg 240
ggtctgctgg gtaccagccc gctgagcaat cacccactgg ccggcggcag cggcccaagc 300
gctggtgcgg gtctgctgcg cgcggagtcc ctgccgggtg cgggtggctc cctgacgcgt 360
accccactca tgagccaact gattgagaaa ccggttgcga ccgaacaaca gtggaatttt 420
gccggtattg aagctgcggc cagcgccatc cagggcaatg ttacgagcat ccacagcctg 480
ctggatgaag gcaaacagtc gctgaccaag ctggcggcgg cgtggggtgg ctccggtagc 540
gaagcctatc agggtgttca gcagaaatgg gacgcgaccg cgactgagct gaacaatgcg 600
ctgcagaatc tggcccgcac tatttccgag gccggtcaag cgatggcaag caccgagggc 660
aacgtgaccg gtatgttcgc tgctgccgat tacgacaaac tgtttcgccc acatgaaggc 720
atggaggcac cggatgatat ggcggcgcag ccgtttttcg acccgtccgc gagctttccg 780
ccggccccag caagcgcgaa tctgcctaaa ccgaacggtc agaccccgcc gcctacgagc 840
gacgatttga gcgaacgttt tgtgagcgcg ccgccgccgc cgccaccgcc gccgcctccg 900
ccgccaccta ccccgatgcc gattgccgcg ggtgagccac cgagcccgga gccagcggcc 960
tcgaagccgc cgacgccgcc gatgccgatc gcgggccctg aaccggcgcc gccgaaacct 1020
ccgaccccgc cgatgcctat tgctggtccg gaaccggcac cgcctaaacc gccgacgccg 1080
ccgatgccaa tcgcgggtcc ggctcctacc ccgacggaaa gccagctggc tccaccgcgt 1140
ccgcctaccc cgcagacccc gaccggtgcg ccgcaacaac cggaaagccc ggcgccgcat 1200
gtcccttcgc acggccctca ccaaccgcgt cgcacggctc cggcgccgcc ttgggctaag 1260
atgccgattg gtgagccgcc gccggctccg agccgtccga gcgctagccc ggcggaaccg 1320
ccgacccgtc cggcgccaca gcattctcgt cgtgcacgcc gcggtcaccg ctaccgtacg 1380
gataccgaac gtaacgtcgg taaagtcgca accggtccgt caatccaggc acgtttgcgt 1440
gcggaagaag ccagcggtgc gcagctggcg ccgggcacgg agccgtcgcc ggcaccgctg 1500
ggtcaaccga gatcttactt ggccccgccg acccgcccgg cgccgacgga accgccgccg 1560
agcccgtccc cgcaacgcaa cagcggccgc cgtgcggagc gtcgtgttca cccggatctg 1620
gcggcgcaac acgccgcagc ccagccggac agcattaccg cggcaaccac cggcggtcgc 1680
cgccgcaagc gtgcggcgcc ggacctggac gccacccaga aaagcctgcg tccagctgca 1740
aagggcccga aagtcaaaaa ggtcaagccg caaaagccga aagcaactaa accgccgaaa 1800
gtcgttagcc agcgcggttg gcgtcactgg gtgcacgcgc tgacgcgcat taacctgggt 1860
ttgagcccgg acgaaaaata tgaactggac ttgcacgcac gtgtccgccg taacccgcgt 1920
ggttcatacc agattgccgt tgtcggtctg cagggtggcg ccggcaaaac cacgctgact 1980
gcggcactgg gttccacgct ggcgcaagtg cgtgcggatc gtattctggc actggatgct 2040
gacccgggcg cgggtaatct ggcagatcgt gtgggtcgtc agtctggtgc gaccatcgca 2100
gatgttctgg ctgagaaaga actgagccat tacaacgaca ttcgtgcgca cacgtctgtt 2160
aatgccgtta atctggaagt gctgccggca ccggagtaca gcagcgcaca gcgcgccctg 2220
agcgacgcgg actggcactt catcgcagac ccggcatctc gcttctataa cctggttttg 2280
gcggattccg gtgcgggctt tttcgatcca ctgacccgcg gtgtgctcag caccgttagc 2340
ggtgtggttg tggttgcctc cgtgagcatc gacggtgcgc aacaagcatc ggtggcgctg 2400
gactggctgc gtaataacgg ttatcaagac ttggcgagcc gcgcgagcgt tgtgattaac 2460
catatcatgc cgggcgagcc gaatgttgcg gttaaagatt tggtgcgcca ttttgagcaa 2520
caggtccaac cgggccgcgt cgttgtgatg ccttgggatc gtcatattgc agcgggcacc 2580
gaaattagcc tggacttact ggacccgatt tataagcgta aggtactgga actggccgca 2640
gcgctgagcg acgatttcga gcgtgcaggc cgtcgtaccg agcaacagtg gaatttcgct 2700
ggcattgaag ccgcagcctc tgcaattcag ggtaatgtta cctcgattca cagcctgctg 2760
gacgagggca aacaaagcct gaccaagctg gcggctgctt ggggtggttc tggtagcgaa 2820
gcgtaccagg gcgtccagca aaaatgggac gcaaccgcaa ccgagctgaa taatgctctg 2880
caaaacctgg cccgtaccat tagcgaagcg ggccaggcca tggcgagcac cgaaggcaac 2940
gtgaccggta tgtttgccac cgaaaacttg accgttcagc cggaacgtct gggtgtgctg 3000
gcgagccatc atgacaacgc agcagttgat gcgagcagcg gtgtcgaggc agccgcgggt 3060
ttgggcgaga gcgttgccat cacccatggt ccgtattcat ctcagttcaa cgacaccacg 3120
gaacagcagt ggaacttcgc aggcatcgaa gccgcggcgt ccgcgatcca gggtaacgtg 3180
actagcattc attcgttgct ggacgaaggc aagcaaagcc tgaccaaact ggcagctgca 3240
tggggtggct cgggctctga ggcgtaccaa ggcgtccaac agaagtggga cgcgactgcg 3300
accgagttaa acaatgcttt acagaacctg gctcgtacta tcagcgaggc tggtcaggcc 3360
atggcgagca ccgaaggtaa tgttaccggc atgttcgcga gccgcgcttt tattatcgac 3420
ccgacgatca gcgccatcga tggtctgtac gatctgttgg gtattggcat tccgaaccaa 3480
ggcggcatcc tgtatagctc cctggaatac ttcgagaaag ccttggaaga actggcggcc 3540
gcgttcccgg gcgatggctg gctgggtagc gcggctgaca aatatgcggg caaaaaccgt 3600
aaccatgtca actttttcca agagttggcg gatttggatc gtcaattgat tagcctgatc 3660
cacgatcagg cgaatgcagt gcaaaccact cgcgatatcc tcgaaggtgc caaaaagggt 3720
ctggagtttg tacgtccagt cgcagtcgac ctgacctaca ttccagttgt cggtcatgcg 3780
ttgtcggcaa agactctgat taatgcgacg caactgttaa aactgttggc gaaattggca 3840
gagctggtcg cggcagcgat cgccgacatc atcagcgatg tggcagatat cattaagggt 3900
acgctgggcg aagtgtggga atttattact aatgcgctca acggtctgaa ggaactgtgg 3960
gataaattga cgggttgggt taccggcttg tttagccgtg gttggtccaa tttggagagc 4020
tttttcgccg gtgttccggg cctgaccggc gcaacgagcg gtttgtccca ggtcacgggc 4080
ttgtttggtg ctgcgggtct gagcgcatcc agcggtctgg cgcacgcaga ttccttggcg 4140
tctagcgcaa gcctgccggc gctggcaggc atcggcggcg gctctggctt cggtggcttg 4200
ccaagcctgg cccaagtcca tgctgcttcc acgcgccagg ctctgcgccc acgtgcagat 4260
ggtccggttg gtgccgcagc cgagcaagtt ggtggccaga gccaactggt cagcgctcag 4320
ggctctcagg gcatgggcgg tccggttggt atgggtggta tgcacccgag ctccggcgca 4380
tccaagggta ctaccacgaa aaagtatagc gagggtgcag cggcgggtac tgaagatgcc 4440
gaacgtgcac cggttgaggc tgatgcgggt ggcggccaaa aagttttggt ccgtaatgtc 4500
gtgactgagc agcagtggaa ttttgccggc atcgaagcgg cggcgagcgc gatccaaggc 4560
aacgtcactt cgattcactc tctgctggat gagggcaaac agtccctgac gaaactggca 4620
gccgcgtggg gtggtagcgg ttccgaggca taccaaggtg ttcagcagaa gtgggacgcg 4680
acggccacgg aactgaacaa cgcgctgcag aacctggcac gtacgatcag cgaagcgggt 4740
caagcaatgg ccagcaccga aggcaatgtt acgggcatgt tcgcgtgata agctt 4795
<210> 82
<211> 5616
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 82
atgcaagccg aaaccgccgt caataccctg ttcgagaaac tggagccgat ggcatctatt 60
cttgatccgg gtgcgagcca gagcactacc aatccaatct ttggcatgcc gtccccgggc 120
agctcgacgc cggtgggcca gctgccgccg gcggctaccc aaaccttagg tcagctgggt 180
gagatgagcg gcccgatggg cggctccggt aaccctgcag atgaagaggc agcacaaatg 240
ggtctgctgg gtaccagccc gctgagcaat cacccactgg ccggcggcag cggcccaagc 300
gctggtgcgg gtctgctgcg cgcggagtcc ctgccgggtg cgggtggctc cctgacgcgt 360
accccactca tgagccaact gattgagaaa ccggttgcga ccgaacaaca gtggaatttt 420
gccggtattg aagctgcggc cagcgccatc cagggcaatg ttacgagcat ccacagcctg 480
ctggatgaag gcaaacagtc gctgaccaag ctggcggcgg cgtggggtgg ctccggtagc 540
gaagcctatc agggtgttca gcagaaatgg gacgcgaccg cgactgagct gaacaatgcg 600
ctgcagaatc tggcccgcac tatttccgag gccggtcaag cgatggcaag caccgagggc 660
aacgtgaccg gtatgttcgc tgctgccgat tacgacaaac tgtttcgccc acatgaaggc 720
atggaggcac cggatgatat ggcggcgcag ccgtttttcg acccgtccgc gagctttccg 780
ccggccccag caagcgcgaa tctgcctaaa ccgaacggtc agaccccgcc gcctacgagc 840
gacgatttga gcgaacgttt tgtgagcgcg ccgccgccgc cgccaccgcc gccgcctccg 900
ccgccaccta ccccgatgcc gattgccgcg ggtgagccac cgagcccgga gccagcggcc 960
tcgaagccgc cgacgccgcc gatgccgatc gcgggccctg aaccggcgcc gccgaaacct 1020
ccgaccccgc cgatgcctat tgctggtccg gaaccggcac cgcctaaacc gccgacgccg 1080
ccgatgccaa tcgcgggtcc ggctcctacc ccgacggaaa gccagctggc tccaccgcgt 1140
ccgcctaccc cgcagacccc gaccggtgcg ccgcaacaac cggaaagccc ggcgccgcat 1200
gtcccttcgc acggccctca ccaaccgcgt cgcacggctc cggcgccgcc ttgggctaag 1260
atgccgattg gtgagccgcc gccggctccg agccgtccga gcgctagccc ggcggaaccg 1320
ccgacccgtc cggcgccaca gcattctcgt cgtgcacgcc gcggtcaccg ctaccgtacg 1380
gataccgaac gtaacgtcgg taaagtcgca accggtccgt caatccaggc acgtttgcgt 1440
gcggaagaag ccagcggtgc gcagctggcg ccgggcacgg agccgtcgcc ggcaccgctg 1500
ggtcaaccga gatcttactt ggccccgccg acccgcccgg cgccgacgga accgccgccg 1560
agcccgtccc cgcaacgcaa cagcggccgc cgtgcggagc gtcgtgttca cccggatctg 1620
gcggcgcaac acgccgcagc ccagccggac agcattaccg cggcaaccac cggcggtcgc 1680
cgccgcaagc gtgcggcgcc ggacctggac gccacccaga aaagcctgcg tccagctgca 1740
aagggcccga aagtcaaaaa ggtcaagccg caaaagccga aagcaactaa accgccgaaa 1800
gtcgttagcc agcgcggttg gcgtcactgg gtgcacgcgc tgacgcgcat taacctgggt 1860
ttgagcccgg acgaaaaata tgaactggac ttgcacgcac gtgtccgccg taacccgcgt 1920
ggttcatacc agattgccgt tgtcggtctg cagggtggcg ccggcaaaac cacgctgact 1980
gcggcactgg gttccacgct ggcgcaagtg cgtgcggatc gtattctggc actggatgct 2040
gacccgggcg cgggtaatct ggcagatcgt gtgggtcgtc agtctggtgc gaccatcgca 2100
gatgttctgg ctgagaaaga actgagccat tacaacgaca ttcgtgcgca cacgtctgtt 2160
aatgccgtta atctggaagt gctgccggca ccggagtaca gcagcgcaca gcgcgccctg 2220
agcgacgcgg actggcactt catcgcagac ccggcatctc gcttctataa cctggttttg 2280
gcggattccg gtgcgggctt tttcgatcca ctgacccgcg gtgtgctcag caccgttagc 2340
ggtgtggttg tggttgcctc cgtgagcatc gacggtgcgc aacaagcatc ggtggcgctg 2400
gactggctgc gtaataacgg ttatcaagac ttggcgagcc gcgcgagcgt tgtgattaac 2460
catatcatgc cgggcgagcc gaatgttgcg gttaaagatt tggtgcgcca ttttgagcaa 2520
caggtccaac cgggccgcgt cgttgtgatg ccttgggatc gtcatattgc agcgggcacc 2580
gaaattagcc tggacttact ggacccgatt tataagcgta aggtactgga actggccgca 2640
gcgctgagcg acgatttcga gcgtgcaggc cgtcgtaccg aaaacttgac cgttcagccg 2700
gaacgtctgg gtgtgctggc gagccatcat gacaacgcag cagttgatgc gagcagcggt 2760
gtcgaggcag ccgcgggttt gggcgagagc gttgccatca cccatggtcc gtattcatct 2820
cagttcaacg acaccagccg cgcttttatt atcgacccga cgatcagcgc catcgatggt 2880
ctgtacgatc tgttgggtat tggcattccg aaccaaggcg gcatcctgta tagctccctg 2940
gaatacttcg agaaagcctt ggaagaactg gcggccgcgt tcccgggcga tggctggctg 3000
ggtagcgcgg ctgacaaata tgcgggcaaa aaccgtaacc atgtcaactt tttccaagag 3060
ttggcggatt tggatcgtca attgattagc ctgatccacg atcaggcgaa tgcagtgcaa 3120
accactcgcg atatcctcga aggtgccaaa aagggtctgg agtttgtacg tccagtcgca 3180
gtcgacctga cctacattcc agttgtcggt catgcgttgt cggcaaagac tctgattaat 3240
gcgacgcaac tgttaaaact gttggcgaaa ttggcagagc tggtcgcggc agcgatcgcc 3300
gacatcatca gcgatgtggc agatatcatt aagggtacgc tgggcgaagt gtgggaattt 3360
attactaatg cgctcaacgg tctgaaggaa ctgtgggata aattgacggg ttgggttacc 3420
ggcttgttta gccgtggttg gtccaatttg gagagctttt tcgccggtgt tccgggcctg 3480
accggcgcaa cgagcggttt gtcccaggtc acgggcttgt ttggtgctgc gggtctgagc 3540
gcatccagcg gtctggcgca cgcagattcc ttggcgtcta gcgcaagcct gccggcgctg 3600
gcaggcatcg gcggcggctc tggcttcggt ggcttgccaa gcctggccca agtccatgct 3660
gcttccacgc gccaggctct gcgcccacgt gcagatggtc cggttggtgc cgcagccgag 3720
caagttggtg gccagagcca actggtcagc gctcagggct ctcagggcat gggcggtccg 3780
gttggtatgg gtggtatgca cccgagctcc ggcgcatcca agggtactac cacgaaaaag 3840
tatagcgagg gtgcagcggc gggtactgaa gatgccgaac gtgcaccggt tgaggctgat 3900
gcgggtggcg gccaaaaagt tttggtccgt aacgttgtgg cacctaagac ctatagcgaa 3960
gagttgaagg gtactgatac tggtcaagcg agccagattc agatgagcga cccggcgtac 4020
aatatcaaca tctccctgcc aagctactat ccagaccaaa aaagcctgga gaactacatc 4080
gcgcagactc gcgataagtt cctgtccgca gcgacgagca gcaccccacg cgaagcaccg 4140
tatgagctga acattactag cgcgacgtac caaagcgcga ttccgccgcg tggtacccaa 4200
gccgttgtcc tgaaagttta tcagaacgcc ggtggcactc atccgacgac gacctataag 4260
gcctttgact gggaccaggc atatcgtaag ccaatcacgt acgacaccct gtggcaggcc 4320
gacacggatc cactgccagt tgtgtttccg atcgtgcaag gtgaactgtc aaaacaaact 4380
ggtcaacagg tgagcattgc cccaaacgcc ggtctggatc cggtgaatta tcaaaatttt 4440
gctgttacga acgacggcgt tatctttttc ttcaacccgg gtgaactgct gccggaagcg 4500
gcgggtccga cccaagtgct ggttccgcgt agcgcgattg acagcatgct ggcgggcgat 4560
ctggttggcc cgggtagcgc agaatacgcc gcggccaacc cgaccggtcc ggcatccgtc 4620
caaggtatga gccaggatcc ggtggctgtt gcagcctcta acaatccgga actgaccacc 4680
ttgacggcag cgctgagcgg tcagctgaat cctcaagtga atctggttga tacgctgaat 4740
agcggccaat ataccgtctt tgcaccgacc aacgctgcgt tcagcaaact gccggccagc 4800
accattgacg aattgaaaac caattccagc ctgttgacga gcattctgac gtatcacgtt 4860
gtggcgggcc agacgtcccc agcgaacgtc gtcggtaccc gtcagacgct gcagggtgcg 4920
tctgtaaccg ttacgggcca aggcaactct ttgaaagtcg gtaatgccga cgtcgtcagc 4980
ggtggcgtta gcacggctaa tgcaaccgtc tacatgattg acagcgtttt gatgccgcct 5040
gccgtcagcc aggatacgtc cccgaaaccg gctacgagcc cggcagcccc ggttaccact 5100
gcagcaatgg cggaccctgc ggctgatttg atcggtcgcg gctctgcaca gtatgctgcc 5160
caaaacccga cgggtccggg ctctgttgcc ggcatggcgc aggacccggt cgcaaccgcg 5220
gctagcaata atccaatgct gtcgacgctg acttccgctc tgtccggtaa actgaatccg 5280
gacgtcaacc tggtggatac cctgaacggt ggcgagtata ccgtctttgc cccgaccaac 5340
gctgcgttcg acaagctgcc ggcagccacc atcgaccaac tgaaaaccga cgccaagctg 5400
ctgagcagca tcctgaccta tcacgtgatt gcgggtcaag ctagcccgag ccgcatcgac 5460
ggcacccacc agaccttgca gggcgctgac ctgacggtta ttggtgctcg cgatgatctg 5520
atggtgaata acgccggtct ggtttccggc ggcgttcata cggctaatgc aacggtgtac 5580
atgattgata cggtccttat gcctccggcg cagtga 5616
<210> 83
<211> 3942
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 83
atgcaagccg aaaccgccgt caataccctg ttcgagaaac tggagccgat ggcatctatt 60
cttgatccgg gtgcgagcca gagcactacc aatccaatct ttggcatgcc gtccccgggc 120
agctcgacgc cggtgggcca gctgccgccg gcggctaccc aaaccttagg tcagctgggt 180
gagatgagcg gcccgatggg cggctccggt aaccctgcag atgaagaggc agcacaaatg 240
ggtctgctgg gtaccagccc gctgagcaat cacccactgg ccggcggcag cggcccaagc 300
gctggtgcgg gtctgctgcg cgcggagtcc ctgccgggtg cgggtggctc cctgacgcgt 360
accccactca tgagccaact gattgagaaa ccggttgcga ccgaacaaca gtggaatttt 420
gccggtattg aagctgcggc cagcgccatc cagggcaatg ttacgagcat ccacagcctg 480
ctggatgaag gcaaacagtc gctgaccaag ctggcggcgg cgtggggtgg ctccggtagc 540
gaagcctatc agggtgttca gcagaaatgg gacgcgaccg cgactgagct gaacaatgcg 600
ctgcagaatc tggcccgcac tatttccgag gccggtcaag cgatggcaag caccgagggc 660
aacgtgaccg gtatgttcgc tgctgccgat tacgacaaac tgtttcgccc acatgaaggc 720
atggaggcac cggatgatat ggcggcgcag ccgtttttcg acccgtccgc gagctttccg 780
ccggccccag caagcgcgaa tctgcctaaa ccgaacggtc agaccccgcc gcctacgagc 840
gacgatttga gcgaacgttt tgtgagcgcg ccgccgccgc cgccaccgcc gccgcctccg 900
ccgccaccta ccccgatgcc gattgccgcg ggtgagccac cgagcccgga gccagcggcc 960
tcgaagccgc cgacgccgcc gatgccgatc gcgggccctg aaccggcgcc gccgaaacct 1020
ccgaccccgc cgatgcctat tgctggtccg gaaccggcac cgcctaaacc gccgacgccg 1080
ccgatgccaa tcgcgggtcc ggctcctacc ccgacggaaa gccagctggc tccaccgcgt 1140
ccgcctaccc cgcagacccc gaccggtgcg ccgcaacaac cggaaagccc ggcgccgcat 1200
gtcccttcgc acggccctca ccaaccgcgt cgcacggctc cggcgccgcc ttgggctaag 1260
atgccgattg gtgagccgcc gccggctccg agccgtccga gcgctagccc ggcggaaccg 1320
ccgacccgtc cggcgccaca gcattctcgt cgtgcacgcc gcggtcaccg ctaccgtacg 1380
gataccgaac gtaacgtcgg taaagtcgca accggtccgt caatccaggc acgtttgcgt 1440
gcggaagaag ccagcggtgc gcagctggcg ccgggcacgg agccgtcgcc ggcaccgctg 1500
ggtcaaccga gatcttactt ggccccgccg acccgcccgg cgccgacgga accgccgccg 1560
agcccgtccc cgcaacgcaa cagcggccgc cgtgcggagc gtcgtgttca cccggatctg 1620
gcggcgcaac acgccgcagc ccagccggac agcattaccg cggcaaccac cggcggtcgc 1680
cgccgcaagc gtgcggcgcc ggacctggac gccacccaga aaagcctgcg tccagctgca 1740
aagggcccga aagtcaaaaa ggtcaagccg caaaagccga aagcaactaa accgccgaaa 1800
gtcgttagcc agcgcggttg gcgtcactgg gtgcacgcgc tgacgcgcat taacctgggt 1860
ttgagcccgg acgaaaaata tgaactggac ttgcacgcac gtgtccgccg taacccgcgt 1920
ggttcatacc agattgccgt tgtcggtctg cagggtggcg ccggcaaaac cacgctgact 1980
gcggcactgg gttccacgct ggcgcaagtg cgtgcggatc gtattctggc actggatgct 2040
gacccgggcg cgggtaatct ggcagatcgt gtgggtcgtc agtctggtgc gaccatcgca 2100
gatgttctgg ctgagaaaga actgagccat tacaacgaca ttcgtgcgca cacgtctgtt 2160
aatgccgtta atctggaagt gctgccggca ccggagtaca gcagcgcaca gcgcgccctg 2220
agcgacgcgg actggcactt catcgcagac ccggcatctc gcttctataa cctggttttg 2280
gcggattccg gtgcgggctt tttcgatcca ctgacccgcg gtgtgctcag caccgttagc 2340
ggtgtggttg tggttgcctc cgtgagcatc gacggtgcgc aacaagcatc ggtggcgctg 2400
gactggctgc gtaataacgg ttatcaagac ttggcgagcc gcgcgagcgt tgtgattaac 2460
catatcatgc cgggcgagcc gaatgttgcg gttaaagatt tggtgcgcca ttttgagcaa 2520
caggtccaac cgggccgcgt cgttgtgatg ccttgggatc gtcatattgc agcgggcacc 2580
gaaattagcc tggacttact ggacccgatt tataagcgta aggtactgga actggccgca 2640
gcgctgagcg acgatttcga gcgtgcaggc cgtcgtaccg aaaacttgac cgttcagccg 2700
gaacgtctgg gtgtgctggc gagccatcat gacaacgcag cagttgatgc gagcagcggt 2760
gtcgaggcag ccgcgggttt gggcgagagc gttgccatca cccatggtcc gtattcatct 2820
cagttcaacg acaccagccg cgcttttatt atcgacccga cgatcagcgc catcgatggt 2880
ctgtacgatc tgttgggtat tggcattccg aaccaaggcg gcatcctgta tagctccctg 2940
gaatacttcg agaaagcctt ggaagaactg gcggccgcgt tcccgggcga tggctggctg 3000
ggtagcgcgg ctgacaaata tgcgggcaaa aaccgtaacc atgtcaactt tttccaagag 3060
ttggcggatt tggatcgtca attgattagc ctgatccacg atcaggcgaa tgcagtgcaa 3120
accactcgcg atatcctcga aggtgccaaa aagggtctgg agtttgtacg tccagtcgca 3180
gtcgacctga cctacattcc agttgtcggt catgcgttgt cggcaaagac tctgattaat 3240
gcgacgcaac tgttaaaact gttggcgaaa ttggcagagc tggtcgcggc agcgatcgcc 3300
gacatcatca gcgatgtggc agatatcatt aagggtacgc tgggcgaagt gtgggaattt 3360
attactaatg cgctcaacgg tctgaaggaa ctgtgggata aattgacggg ttgggttacc 3420
ggcttgttta gccgtggttg gtccaatttg gagagctttt tcgccggtgt tccgggcctg 3480
accggcgcaa cgagcggttt gtcccaggtc acgggcttgt ttggtgctgc gggtctgagc 3540
gcatccagcg gtctggcgca cgcagattcc ttggcgtcta gcgcaagcct gccggcgctg 3600
gcaggcatcg gcggcggctc tggcttcggt ggcttgccaa gcctggccca agtccatgct 3660
gcttccacgc gccaggctct gcgcccacgt gcagatggtc cggttggtgc cgcagccgag 3720
caagttggtg gccagagcca actggtcagc gctcagggct ctcagggcat gggcggtccg 3780
gttggtatgg gtggtatgca cccgagctcc ggcgcatcca agggcactac tacgaagaag 3840
tatagcgagg gtgcggccgc cggcacggaa gatgctgaac gtgcgcctgt cgaagcggac 3900
gctggcggtg gccaaaaggt gctggttcgc aatgtggtct ga 3942
<210> 84
<211> 2283
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 84
atgaccgagc aacagtggaa ctttgcgggc atcgaagcgg ctgcgagcgc aattcagggt 60
aacgtgacgt ccatccacag cctgttggac gagggcaagc aaagcttgac gaaactggct 120
gcggcgtggg gcggtagcgg ttcggaagcc tatcagggcg tccaacagaa atgggatgct 180
acggcaactg agctgaataa tgcgttgcag aatctggcgc gtaccatttc cgaggccggt 240
caagcgatgg cgtccaccga aggcaacgtg accggtatgt tcgccaaagt caagaatacc 300
atcgcagcca cctcgttcgc ggcagctggc ctggcagcgt tggccgtcgc ggtgagcccg 360
cctgcagcgg cgggtgacct ggttggtccg ggctgtgcgg aatacgcagc ggccaacccg 420
accggtccgg ccagcgtgca gggtatgagc caagatccgg tagcggtcgc ggctagcaac 480
aacccagaac tgacgacgct gacggcagca ctgtccggcc aactgaatcc gcaagttaac 540
ctggttgaca cgctgaatag cggtcagtat accgtgttcg cgccgaccaa cgccgcattt 600
agcaagctgc cggctagcac gattgatgaa ctgaaaacca acagcagcct cctgacttct 660
atcttgacgt accacgttgt ggcgggtcaa accagcccgg caaatgtcgt tggtacccgt 720
cagaccctgc agggcgcgag cgtcactgtt accggtcaag gtaattctct gaaagtcggc 780
aacgctgacg tcgtgtgcgg cggcgtttcc acggcaaacg cgaccgtgta tatgatcgac 840
agcgttctga tgccgccagc gaccgagcaa cagtggaatt tcgcgggcat cgaggcagcc 900
gcaagcgcga ttcaaggcaa tgtgacctcc atccacagcc tgctggacga aggcaagcaa 960
agcctgacca aactggcggc ggcgtggggt ggcagcggta gcgaagccta ccagggcgtg 1020
cagcagaaat gggatgcaac ggctaccgag ttgaataacg cgctgcaaaa tctggcgcgc 1080
accatttctg aggccggtca agcgatggct agcaccgaag gcaacgttac gggtatgttt 1140
gcgtccttgt tagatgctca cattccgcag ctgattgcga gccacaccgc atttgcggca 1200
aaggctggtc tgatgcgtca caccatcggt caggccgagc aacaagccat gtctgcgcag 1260
gcatttcatc agggtgagag cgcggcagcg ttccagggtg cgcacgcgcg tttcgttgcg 1320
gcggcggcta aggttaatac cttgctggac attgcacaag ctaacctggg tgaggccgca 1380
ggcacctatg tggccgcaga tgcggcggca gccagctctt atacgggttt caccgaacaa 1440
caatggaatt tcgcaggcat cgaagcggca gcaagcgcga ttcagggcaa tgtcactagc 1500
atccactccc tgctggatga aggtaaacag agcctgacga aactggctgc ggcctggggt 1560
ggttccggca gcgaagcata ccaaggtgtc caacaaaaat gggacgcgac ggccaccgag 1620
ctgaacaacg cattgcagaa tctggctcgt acgatttctg aggccggtca ggccatggca 1680
agcaccgagg gtaacgttac gggcatgttc gcgagccaga tcatgtacaa ctatccggct 1740
atgatggccc atgcgggtga catggcaggc tacgcgggta ctctgcagag cctgggtgcc 1800
gatattgcct ccgagcaagc cgtcctgtcg agcgcgtggc agggtgacac cggtatcacc 1860
tatcagggtt ggcaaaccca gtggaaccaa gccttggaag atctggttcg cgcttaccag 1920
agcatgagcg gtactcacga gtcaaatacg atggccatgc tggcacgcga cggtgcagaa 1980
gcggcgaaat ggggtggcac ggaacagcag tggaattttg ccggtattga agccgctgcg 2040
tcggcgattc agggtaatgt gacgagcatt cactctctgc tggacgaagg caaacagtcc 2100
ctgaccaaac tggcagccgc gtggggtggc agcggtagcg aagcgtacca gggtgtgcaa 2160
cagaagtggg atgcgaccgc gacggagctg aacaacgcgc tccaaaacct ggcacgtacc 2220
attagcgaag cgggccaggc aatggcctcg accgagggca atgttaccgg catgtttgcg 2280
tga 2283
<210> 85
<211> 1437
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 85
atgaaagtca agaataccat cgcagccacc tcgttcgcgg cagctggcct ggcagcgttg 60
gccgtcgcgg tgagcccgcc tgcagcggcg ggtgacctgg ttggtccggg ctgtgcggaa 120
tacgcagcgg ccaacccgac cggtccggcc agcgtgcagg gtatgagcca agatccggta 180
gcggtcgcgg ctagcaacaa cccagaactg acgacgctga cggcagcact gtccggccaa 240
ctgaatccgc aagttaacct ggttgacacg ctgaatagcg gtcagtatac cgtgttcgcg 300
ccgaccaacg ccgcatttag caagctgccg gctagcacga ttgatgaact gaaaaccaac 360
agcagcctcc tgacttctat cttgacgtac cacgttgtgg cgggtcaaac cagcccggca 420
aatgtcgttg gtacccgtca gaccctgcag ggcgcgagcg tcactgttac cggtcaaggt 480
aattctctga aagtcggcaa cgctgacgtc gtgtgcggcg gcgtttccac ggcaaacgcg 540
accgtgtata tgatcgacag cgttctgatg ccgccagcga ccgagcaaca gtggaatttc 600
gcgggcatcg aggcagccgc aagcgcgatt caaggcaatg tgacctccat ccacagcctg 660
ctggacgaag gcaagcaaag cctgaccaaa ctggcggcgg cgtggggtgg cagcggtagc 720
gaagcctacc agggcgtgca gcagaaatgg gatgcaacgg ctaccgagtt gaataacgcg 780
ctgcaaaatc tggcgcgcac catttctgag gccggtcaag cgatggctag caccgaaggc 840
aacgttacgg gtatgtttgc gtccttgtta gatgctcaca ttccgcagct gattgcgagc 900
cacaccgcat ttgcggcaaa ggctggtctg atgcgtcaca ccatcggtca ggccgagcaa 960
caagccatgt ctgcgcaggc atttcatcag ggtgagagcg cggcagcgtt ccagggtgcg 1020
cacgcgcgtt tcgttgcggc ggcggctaag gttaatacct tgctggacat tgcacaagct 1080
aacctgggtg aggccgcagg cacctatgtg gccgcagatg cggctgcggc ctccagctac 1140
acgggcttca gccagatcat gtacaactat ccggctatga tggcccatgc gggtgacatg 1200
gcaggctacg cgggtactct gcagagcctg ggtgccgata ttgcctccga gcaagccgtc 1260
ctgtcgagcg cgtggcaggg tgacaccggt atcacctatc agggttggca aacccagtgg 1320
aaccaagcct tggaagatct ggttcgcgct taccagagca tgagcggtac tcacgagtca 1380
aatacgatgg ccatgctggc acgcgacggt gcggaagcgg cgaagtgggg cggctga 1437
<210> 86
<211> 3291
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 86
atgaccgagc agcaatggaa cttcgcgggt attgaagcgg cagcaagcgc gattcaaggc 60
aatgtgacgt cgatccactc attgctggac gagggcaagc aatcgctgac gaaattggct 120
gctgcctggg gtggttctgg cagcgaagct taccagggtg ttcagcagaa atgggacgca 180
actgcgaccg agttgaacaa tgcgcttcag aatctggcgc gtaccatcag cgaggccggt 240
caggcgatgg cctctaccga aggtaacgtc accggtatgt tcgctatgga tctgccgggt 300
aacgatttcg atagcaatga cttcgatgcg gtggacctgt ggggtgccga cggtgcagag 360
ggctggaccg cagacccgat tatcggcgtt ggcagcgcgg caaccccgga cacgggtccg 420
gatctggata acgctcatgg tcaggcagaa accgacacgg agcaagagat cgccctgttt 480
accgtcacga atccgccacg caccgttagc gttagcacgc tgatggatgg ccgtatcgat 540
catgtcgagc tgtccgcgcg tgtggcctgg atgagcgagt cccagctggc gagcgaaatc 600
ttggttattg cggacctggc acgtcaaaaa gcgcaaagcg cgcaatatgc gttcatcttg 660
gatcgtatga gccaacaagt cgacgcggac gagcatcgtg tcgccctgct gcgcaagacc 720
gtgggtgaaa cctggggcct gccgagcccg gaagaagcag cagcagccga ggctgaggtg 780
ttcgccacgc gttacagcga cgatagcccg gccccggacg atgaaagcga tccgtggatg 840
accgaacaac agtggaattt cgcaggcatt gaggccgcag cgtctgccat ccagggcaac 900
gtgaccagca tccactcgct gctggatgaa ggcaaacagt ccctgaccaa gcttgcggca 960
gcatggggtg gtagcggctc tgaggcgtac cagggcgttc aacaaaagtg ggacgcgacc 1020
gcgactgagc tgaataacgc actgcagaat ctcgcgcgta cgatctccga ggctggtcaa 1080
gcgatggcta gcaccgaagg caatgtcacc ggcatgtttg ctatgaccga gaatctgacc 1140
gtgcagccgg agcgcctggg tgtcctggcg agccaccatg ataatgcggc agttgatgcg 1200
agcagcggcg ttgaagccgc agccggcctg ggtgaaagcg ttgcgatcac gcatggtccg 1260
tattcctctc agtttaatga cacgctgaat gtttacctga ccgcgcataa cgcgttgggt 1320
agcagcctgc acaccgccgg tgttgacctg gccaaaagcc tgcgcatcgc ggcgaagatt 1380
tacagcgaag cagacgaagc ctggcgtaag gcaattgatg gtctgttcac catgaccgag 1440
caacaatgga actttgcggg cattgaagcc gctgctagcg caatccaggg caatgttacg 1500
agcattcact ccctgcttga tgaaggcaaa caaagcctga ccaaactggc cgctgcatgg 1560
ggcggtagcg gttcggaggc ctaccaaggc gtgcagcaaa aatgggatgc gaccgccacc 1620
gagctgaaca acgcgctgca gaacttggct cgcaccattt ccgaggcagg ccaggccatg 1680
gcgagcacgg agggtaacgt gaccggtatg ttcgccatga ccggttttct gggtgtggtg 1740
ccgagcttcc tgaaagttct ggccggtatg cataatgaaa tcgttggtga tatcaagcgt 1800
gcgaccgaca ctgtggcggg tattagcggc cgcgttcagc tgacccacgg tagctttacc 1860
tccaagttta acgacaccct gcaggaattt gagactacca gatctagcac gggtaccggc 1920
ttgcaaggcg tcaccagcgg cctggcgaat aacttgctgg cagcagcggg tgcgtatctg 1980
aaggcagacg atggtctggc gggtgtcatc gacaagattt ttggtatgac ggagcagcag 2040
tggaacttcg ctggtattga ggctgccgcg agcgcaattc agggtaacgt gacgtccatc 2100
cacagcctcc tggacgaagg caagcagtca ttgactaaac tggcggcagc ttggggtggc 2160
tctggttccg aggcctatca aggtgtgcag caaaaatggg acgctaccgc gacggaactt 2220
aacaacgccc tgcaaaacct ggcgcgcacg attagcgagg cgggccaggc aatggcgtct 2280
accgagggca acgtcactgg tatgtttgcg atgagcacca cctttgccgc gcgtctgaac 2340
cgtctgtttg atacggtgta cccgcctggt cgtggtccgc acaccagcgc ggaagtcatc 2400
gccgcactga aagcagaggg tatcacgatg agcgcgccgt acctgagcca gctgcgtagc 2460
ggtaatcgta ctaacccgag cggcgctacg atggcggcac tggccaattt cttccgtatt 2520
aaggcagcat acttcacgga tgacgagtat tatgagaagc tggacaaaga actgcaatgg 2580
ctgagcacca tgcgcgacga cggtgtgcgt cgtatcgccc aacgcgcgca cggtctgccg 2640
agcgccgcac agcaaaaagt gctggatcgc attgacgagt tgcgccgtgc ggaaggtatc 2700
gatgcgatga cggagcaaca gtggaatttt gcgggtattg aagctgcagc gagcgcgatc 2760
caaggtaatg ttacgtccat tcacagcttg ttggatgagg gtaaacagag cctgacgaaa 2820
ctggctgcgg cgtggggtgg cagcggtagc gaggcgtatc agggtgtcca gcagaagtgg 2880
gacgcgaccg caaccgaact gaacaatgcg ctgcaaaact tggcacgtac cattagcgaa 2940
gcgggccaag ctatggcgtc gacggaaggc aacgttacgg gcatgttcgc aatggagaag 3000
atgtcgcatg acccgattgc agcggatatc ggtactcagg tgagcgacaa tgcactgcat 3060
ggcgtaaccg cgggtagcac cgccctgacg tcggtcaccg gcctggtccc tgcgggtgcg 3120
gacgaagtta gcgcgcaagc ggcaactgca ttcacgagcg aaggtattca gttactggct 3180
agcaatgcga gcgcgcagga tcagctgcac cgtgccggtg aggccgtgca agatgtagcg 3240
cgtacgtact cccaaatcga cgatggtgca gcgggcgtct ttgcagagta a 3291
<210> 87
<211> 3942
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 87
atgggatcca ctcagagcca gaccgtaacc gttgatcaac aagaaattct gaaccgtgcg 60
aatgaggtgg aagcgccaat ggcagacccg ccaactgacg tcccgattac gccgagcgaa 120
ttgactgcag cgaaaaatgc cgcccagcag ctggttctga gcgcggacaa catgcgcgag 180
tatctggcag cgggtgcgaa agagcgtcag cgtctggcca ccagcttgcg caacgcggcg 240
aaagcctacg gtgaggtcga tgaagaagca gcgaccgcgc tggacaacga tggcgagggt 300
accgtccagg ctgaaagcgc gggtgcggtt ggtggtgact ccagcgccga actgactgac 360
acccctcgtg tggccacggc aggcgagccg aatttcatgg acctgaaaga ggccgcacgt 420
aagctggaaa cgggtgacca aggtgcgagc ttggcccact ttgcggacgg ctggaacact 480
ttcaatctga cgctgcaggg cgatgtcaaa cgtttccgtg gtttcgacaa ctgggaaggt 540
gacgcggcga ctgcgagcga ggcaagcctg gaccagcaac gtcaatggat tctgcacatg 600
gcaaagctga gcgcagcgat ggcaaagcag gcacaatacg ttgcgcagct gcatgtctgg 660
gctcgccgcg agcaccctac ctacgaggat attgtcggcc tggagcgcct gtacgcggag 720
aatccgtctg cccgcgatca aatcctgcct gtatacgcgg aatatcagca acgtagcgaa 780
aaggttctga ccgagtacaa caacaaagca gcgctggaac cggtcaaccc gccgaagccg 840
ccaccggcca tcaagattga cccgccgccg ccgcctcagg agcagggcct gattccgggt 900
ttcctgatgc caccgagcga cggtagcggc gtgactccgg gcaccggtat gccagcagcg 960
ccgatggtcc cgccgacggg tagcccaggt ggcggtctgc ctgcggatac ggctgcgcag 1020
ctgaccagcg cgggtcgtga ggctgcggcg ctgtctggtg acgttgcggt taaggcggcg 1080
tccctgggcg gtggcggtgg tggtggcgtt ccgagcgcac cgctgggttc cgctattggt 1140
ggtgcagaaa gcgtccgtcc ggcaggcgct ggcgatatcg ctggcctggg tcagggtcgt 1200
gcgggtggtg gtgccgcgtt gggtggcggt ggtatgggta tgccaatggg tgcggcccac 1260
cagggccagg gtggtgctaa aagcaaaggt agccaacaag aagatgaggc actgtatacc 1320
gaggaccgcg cttggacgga agcagttatt ggcaaccgtc gtcgtcagga tagcaaagaa 1380
agcaaaggat ccacggagca acaatggaat tttgcgggca tcgaggcagc cgcgtcggcg 1440
attcaaggta atgttaccag cattcactcc ctgctggatg agggtaagca aagcctgacc 1500
aaactggccg cagcttgggg tggcagcggt agcgaggcct atcagggtgt gcaacaaaag 1560
tgggatgcga ctgcaaccga gctgaacaac gcactgcaga atctggctcg tacgattagc 1620
gaagcgggcc aggcgatggc cagcaccgag ggcaacgtga ccggcatgtt cgcggaattc 1680
gatctgccgg gcaatgactt tgatagcaac gattttgatg cggtggatct gtggggtgcc 1740
gatggcgcag agggttggac cgccgacccg attatcggtg ttggttccgc ggcaacgccg 1800
gacacgggtc cggatttgga caatgcgcac ggtcaggcgg aaacggacac ggaacaagag 1860
atcgccctgt tcaccgtcac caacccgcct cgtaccgtta gcgtcagcac cctgatggac 1920
ggtcgcatcg accacgttga actgagcgcg cgtgtggcgt ggatgagcga atctcaactg 1980
gcgagcgaga tcctggtgat cgcggatctg gcgcgtcaga aagctcaatc tgcccaatat 2040
gcgtttatcc tggaccgcat gagccaacag gtggatgctg acgaacatcg cgtggccctg 2100
ctgcgtaaga ccgttggcga aacgtggggc ctgccgagcc cggaagaggc ggcagcggca 2160
gaggccgaag tgtttgccac gcgttacagc gacgattctc cggcaccgga tgacgagagc 2220
gacccgtgga ctgaaaatct gacggtgcag ccggaacgcc tgggtgtttt ggcgtcccac 2280
catgataacg cggcagtaga tgcatccagc ggcgtcgaag ccgcagccgg cctgggcgaa 2340
agcgtcgcaa ttacccacgg cccgtatagc tctcaattca atgacaccct gaatgtatac 2400
ttgactgcac ataatgcact gggtagcagc ctgcacaccg caggcgtcga tctggcaaag 2460
agcctgcgta ttgccgccaa gatctattcc gaagctgatg aagcgtggcg taaggcaatt 2520
gacggcctgt tcacgagccg tgcgttcatc attgatccga cgatctcggc gattgacggt 2580
ctgtacgact tgctgggtat tggcatccct aatcagggtg gtattctgta ttcgagcctg 2640
gagtacttcg aaaaagcctt ggaagagttg gcggcagcat tcccgggtga tggctggctg 2700
ggcagcgcgg cagataagta tgcgggcaaa aatcgcaatc acgttaactt cttccaggag 2760
ctggcagacc tggaccgtca actgatcagc ctgattcatg atcaggctaa tgccgttcag 2820
accacccgtg atatcctgga aggtgcgaaa aagggcttgg agtttgtgcg tccagtggcg 2880
gttgatctga cttatatccc ggtggttggt catgctctgg acgtcgcgga tatcatcaag 2940
ggcaccctgg gtgaagtgtg ggagttcatc acgaacgccc tgaacggtct gaaagaactg 3000
tgggacaaac tgaccggttg ggtcaccggc ttgtttagcc gtggttggag caatttggag 3060
tccttctttg cgggtgttcc gggcctgacc ggtgcgacca gcggtctgag ccaggttacc 3120
ggcctgtttg gtgctgcggg tctgtcggcg agcagcggcc tggcgcatgc tgatagcctg 3180
gcaagcagcg cgagcctgcc ggcactggct ggcattggtg gcggtagcgg ttttggtggt 3240
ctgccgtccc tggcgcaagt tcatgctgct agcacgcgcc aagcgctgcg tccgcgtgcg 3300
gacggtccgg tgggcgcagc ggcggaacag gtcggtggtc aaagccaact ggttagcgcc 3360
caaggttccc agggtatggg tggtccggtt ggcatgggtg gcatgcaccc gtctagcggt 3420
gcgtccaaag gtaccaccac caagaagtat agcgaaggcg cagcagcggg tacggaagat 3480
gcagagcgtg cgccggtcga ggcagatgca ggcggtggtc agaaagtgct ggtgcgcaac 3540
gttgtgagca ctaccttcgc ggcacgcctg aaccgtctgt ttgacacggt ctacccgcct 3600
ggccgtggtc cgcacaccag cgcagaggtt attgcagccc tgaaggccga gggcatcacg 3660
atgtccgcac cgtacttgtc tcagttgcgc tcgggtaacc gcaccaatcc gagcggtgct 3720
accatggccg ccttggcgaa cttctttcgt atcaaagcgg catactttac ggacgacgag 3780
tactacgaga aactggacaa agagctgcag tggctgagca ccatgcgcga tgacggcgtc 3840
cgtcgtatcg ctcagcgcgc acacggtctg ccgagcgcag cccagcaaaa ggtgctggat 3900
cgcattgacg agctgcgccg tgcagagggt atcgacgcgt aa 3942
<210> 88
<211> 1965
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 88
atggcagaca cgatccaggt aaccccgcag atgctgcgta gcaccgccaa tgacatccag 60
gcaaatatgg agcaagccat gggtattgcg aagggttact tggctaatca agagaatgtg 120
atgaatccgg caacttggtc cggtacgggt gttgtggcat cccacatgac ggcaaccgag 180
attacgaatg agttgaacaa agtcctgacc ggtggcacgc gcctggcgga aggcctggta 240
caagctgcgg cgctgatgga gggtcacgaa gcagatagcc aaaccgcatt ccaagcgttg 300
tttggcgcca gccacggcag cggtctggtt ccgcgtggca gcaccggcat gagcgaccag 360
atcacgtaca atcctggcgc ggtgagcgac ttcgcgagcg acgtgggtag ccgtgcaggc 420
caactgcaca tgatttacga ggataccgcg agcaagacga atgcgctgca ggagttcttt 480
gccggtcatg gtgcacaggg cttcttcgac gcccaagccc aaatgttgag cggtttgcaa 540
ggcctgattg agactgtggg tcagcatggt actaccacgg gccatgtgct ggataacgcc 600
attggtaccg atcaagcgat cgcgggtctg ttcctgatcg gtgcgcatcc gcgtgctctg 660
aacgtggtca aatttggtgg cgctgcattt ctgatgagcc tgttggacgc gcatatcccg 720
caactggtgg cctcccaatc tgcttttgca gccaaggcgg gtctgatgcg tcatacgatc 780
ggtcaggcgg agcaggcagc gatgagcgcg caggcttttc accagggtga aagcagcgcg 840
gcattccagg cagcacacgc gcgcttcgtt gccgcagctg ccaaagttaa taccctgctg 900
gacgttgccc aagcgaatct gggcgaagcg gcaggcacct acgtcgcagc ggatgctgcg 960
gcagctagca cctacaccgg cttcggtctg gtcccgcgtg gtagcaccgg tatgtcgcaa 1020
atcatgtata actatccggc catgctgggc cacgccggtg atatggcggg ctatgcgggc 1080
accctgcaga gcctgggtgc agaaattgcc gtcgagcagg ccgccttgca gagcgcatgg 1140
cagggtgaca cgggtatcac ctatcaggcg tggcaagcgc aatggaatca ggcgatggag 1200
gacctggttc gtgcgtacca tgcgatgagc tctacccacg aggcgaatac catggcgatg 1260
atggcacgtg acaccgcgga agctgctaag tggggtggtc tgggttttgg cgctggtcgc 1320
ctgcgtggcc tgtttaccaa cccgggtagc tggcgcatta tgactagccg cttcatgacc 1380
gatccacacg ccatgcgcga tatggctggt cgttttgaag tgcacgcgca aaccgtcgag 1440
gatgaggcac gccgcatgtg ggcgtcggcc cagaacatct ccggcgcagg ttggtcgggc 1500
atggcggaag caacgagcct ggacacgatg acccagatga atcaagcgtt ccgcaacatt 1560
gtcaacatgc tgcatggtgt ccgtgatggc ctggtccgtg acgccaacaa ctatgaacaa 1620
caggaacagg cgagccaaca gattctgagc tccggcctgg tgccgcgtgg ttcgacgggt 1680
atgaccatta actaccagtt tggtgacgtt gatgcccatg gcgcgatgat tcgtgcgcag 1740
gcaggtagcc tggaagcaga acaccaggcg attatcagcg atgttctgac cgcgagcgat 1800
ttctggggcg gtgcgggttc tgcagccagc caaggtttta tcacgcaact gggccgtaac 1860
ttccaagtta tctacgagca ggctaatgcg cacggccaga aagtgcaggc tgcgggtaac 1920
aacatggcac aaactgactc tgcggttggt agcagctggg cgtaa 1965
<210> 89
<211> 2151
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 89
atgacggaac agcaatggaa cttcgcgggt attgaggcag cggcatccgc tatccaaggc 60
aacgtcacca gcattcattc tctgctggat gagggtaagc aaagcctgac caagctggct 120
gcggcgtggg gcggtagcgg ctctgaagcg taccagggcg ttcagcagaa atgggacgcg 180
acggcgacgg aactgaacaa tgcgctgcag aacctggctc gtaccatcag cgaggcgggt 240
caggcgatgg catctaccga gggcaatgtc accggtatgt tcgcaatgga cttgccgggt 300
aatgactttg actctaatga cttcgacgcg gtggatttgt ggggtgcaga tggcgctgaa 360
ggttggaccg ccgacccgat catcggtgtc ggtagcgccg caacgccgga taccggtccg 420
gatctggata atgcgcacgg tcaagccgaa accgataccg aacaagagat tgcgttgttt 480
acggttacca acccaccgcg taccgtgagc gtgagcacgc tgatggacgg ccgcattgac 540
catgtggaac tgagcgcgcg tgttgcatgg atgagcgaga gccagttggc aagcgagatt 600
ctggtcattg ctgacttggc gcgtcaaaaa gcgcaaagcg cgcagtacgc ctttatcctg 660
gatcgcatga gccagcaggt tgatgcggac gaacaccgtg tggccctgct gcgtaagacg 720
gtgggtgaaa cgtggggttt gccgagcccg gaagaggccg cagcagctga ggcagaggtg 780
tttgcgaccc gttattcgga cgacagccct gcgccggatg acgagtcgga cccgtggatg 840
actgaaaacc tgacggttca accggaacgc ctgggtgtcc tggcaagcca tcacgacaat 900
gcggcagtcg atgcgagctc tggtgttgaa gccgcagcgg gtctgggtga aagcgtggcg 960
atcacccatg gtccgtattc cagccagttt aacgacacgc tgaacgttta tctgacggcc 1020
cacaacgcgc tgggcagctc tctgcatacg gcgggtgtcg atctggcgaa atccctgcgc 1080
atcgcggcga agatctacag cgaagccgat gaggcctggc gcaaggcaat tgacggtctg 1140
ttcactatga ccggtttcct gggtgttgtc ccatccttcc tgaaagtttt ggccggcatg 1200
cacaatgaga tcgttggcga tatcaagcgc gccacggata ccgtggctgg tattagcggc 1260
cgtgttcagc tgacccatgg tagcttcact tccaagttca atgataccct gcaggagttt 1320
gagactacgc gcagcagcac gggcaccggc ctgcaaggcg tgaccagcgg cctggcgaat 1380
aacttgctgg ccgcagccgg tgcatacctg aaggcagatg acggtttggc gggtgttatt 1440
gacaaaatct tcggtatgtc cacgaccttc gcagcacgtc tgaaccgtct gtttgacacc 1500
gtgtacccac cgggtcgtgg cccgcacact agcgcggaag ttatcgctgc cctgaaggcg 1560
gagggtatca cgatgtctgc accgtacctg agccagctgc gtagcggtaa tcgcaccaat 1620
ccgtcgggtg caacgatggc ggctctggct aatttctttc gcatcaaagc agcatacttt 1680
accgatgatg agtattacga gaaactggac aaagagctgc agtggttgtc caccatgcgc 1740
gatgacggtg tgcgtcgtat tgcgcaacgc gcacatggcc tgccgagcgc ggctcagcaa 1800
aaagtgctgg accgtattga cgagctgcgt cgtgccgaag gtattgatgc catggaaaag 1860
atgagccatg atccgattgc ggccgatatt ggcacccaag tctccgataa cgcgctgcac 1920
ggcgtcacgg cgggtagcac ggcgctgacc agcgtgaccg gcctggtccc ggctggcgcg 1980
gatgaggtta gcgcgcaggc agcgaccgcg ttcaccagcg agggcatcca gctgttggct 2040
agcaacgcaa gcgctcagga tcaactgcac cgtgcaggcg aggctgtcca agacgtggca 2100
cgtacctata gccaaatcga cgacggtgcg gctggcgttt ttgccgagta a 2151
<210> 90
<211> 1368
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 90
atgttctccc ggccggggct gccggtcgag tacctgcagg tgccgtcgcc gtcgatgggc 60
cgcgacatca aggttcagtt ccagagcggt gggaacaact cacctgcggt ttatctgctc 120
gacggcctgc gcgcccaaga cgactacaac ggctgggata tcaacacccc ggcgttcgag 180
tggtactacc agtcgggact gtcgatagtc atgccggtcg gcgggcagtc cagcttctac 240
agcgactggt acagcccggc ctgcggtaag gctggctgcc agacttacaa gtgggaaacc 300
ttcctgacca gcgagctgcc gcaatggttg tccgccaaca gggccgtgaa gcccaccggc 360
agcgctgcaa tcggcttgtc gatggccggc tcgtcggcaa tgatcttggc cgcctaccac 420
ccccagcagt tcatctacgc cggctcgctg tcggccctgc tggacccctc tcaggggatg 480
gggcctagcc tgatcggcct cgcgatgggt gacgccggcg gttacaaggc cgcagacatg 540
tggggtccct cgagtgaccc ggcatgggag cgcaacgacc ctacgcagca gatccccaag 600
ctggtcgcaa acaacacccg gctatgggtt tattgcggga acggcacccc gaacgagttg 660
ggcggtgcca acatacccgc cgagttcttg gagaacttcg ttcgtagcag caacctgaag 720
ttccaggatg cgtacaacgc cgcgggcggg cacaacgccg tgttcaactt cccgcccaac 780
ggcacgcaca gctgggagta ctggggcgct cagctcaacg ccatgaaggg tgacctgcag 840
agttcgttag gcgccggcac agagcagcag tggaatttcg cgggtatcga ggccgcggca 900
agcgcaatcc agggaaatgt cacgtccatt cattccctcc ttgacgaggg gaagcagtcc 960
ctgaccaagc tcgcagcggc ctggggcggt agcggttcgg aggcgtacca gggtgtccag 1020
caaaaatggg acgccacggc taccgagctg aacaacgcgc tgcagaacct ggcgcggacg 1080
atcagcgaag ccggtcaggc aatggcttcg accgaaggca acgtcactgg gatgttcgca 1140
gtgatagcgg gcgtcgacca ggcgcttgca gcaacaggcc aggctagcca gcgggcggca 1200
ggcgcatctg gtggggtcac cgtcggtgtc ggcgtgggca cggaacagag gaacctttcg 1260
gtggttgcac cgagtcagtt cacatttagt tcacgcagcc cagattttgt ggatgaaacc 1320
gcaggtcaat cgtggtgcgc gatactggga ttgaaccagt ttcactag 1368
<210> 91
<211> 1933
<212> PRT
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 91
Met Gln Ala Glu Thr Ala Val Asn Thr Leu Phe Glu Lys Leu Glu Pro
1 5 10 15
Met Ala Ser Ile Leu Asp Pro Gly Ala Ser Gln Ser Thr Thr Asn Pro
20 25 30
Ile Phe Gly Met Pro Ser Pro Gly Ser Ser Thr Pro Val Gly Gln Leu
35 40 45
Pro Pro Ala Ala Thr Gln Thr Leu Gly Gln Leu Gly Glu Met Ser Gly
50 55 60
Pro Met Gly Gly Ser Gly Asn Pro Ala Asp Glu Glu Ala Ala Gln Met
65 70 75 80
Gly Leu Leu Gly Thr Ser Pro Leu Ser Asn His Pro Leu Ala Gly Gly
85 90 95
Ser Gly Pro Ser Ala Gly Ala Gly Leu Leu Arg Ala Glu Ser Leu Pro
100 105 110
Gly Ala Gly Gly Ser Leu Thr Arg Thr Pro Leu Met Ser Gln Leu Ile
115 120 125
Glu Lys Pro Val Ala Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu
130 135 140
Ala Ala Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu
145 150 155 160
Leu Asp Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly
165 170 175
Gly Ser Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala
180 185 190
Thr Ala Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile
195 200 205
Ser Glu Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly
210 215 220
Met Phe Ala Ala Ala Asp Tyr Asp Lys Leu Phe Arg Pro His Glu Gly
225 230 235 240
Met Glu Ala Pro Asp Asp Met Ala Ala Gln Pro Phe Phe Asp Pro Ser
245 250 255
Ala Ser Phe Pro Pro Ala Pro Ala Ser Ala Asn Leu Pro Lys Pro Asn
260 265 270
Gly Gln Thr Pro Pro Pro Thr Ser Asp Asp Leu Ser Glu Arg Phe Val
275 280 285
Ser Ala Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Ser Pro Ser Pro
290 295 300
Gln Arg Asn Ser Gly Arg Arg Ala Glu Arg Arg Val His Pro Asp Leu
305 310 315 320
Ala Ala Gln His Ala Ala Ala Gln Pro Asp Ser Ile Thr Ala Ala Thr
325 330 335
Thr Gly Gly Arg Arg Arg Lys Arg Ala Ala Pro Asp Leu Asp Ala Thr
340 345 350
Gln Lys Ser Leu Arg Pro Ala Ala Lys Gly Pro Lys Val Lys Lys Val
355 360 365
Lys Pro Gln Lys Pro Lys Ala Thr Lys Pro Pro Lys Val Val Ser Gln
370 375 380
Arg Gly Trp Arg His Trp Val His Ala Leu Thr Arg Ile Asn Leu Gly
385 390 395 400
Leu Ser Pro Asp Glu Lys Tyr Glu Leu Asp Leu His Ala Arg Val Arg
405 410 415
Arg Asn Pro Arg Gly Ser Tyr Gln Ile Ala Val Val Gly Leu Gln Gly
420 425 430
Gly Ala Gly Lys Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Gly Ser Thr Leu Ala
435 440 445
Gln Val Arg Ala Asp Arg Ile Leu Ala Leu Asp Ala Asp Pro Gly Ala
450 455 460
Gly Asn Leu Ala Asp Arg Val Gly Arg Gln Ser Gly Ala Thr Ile Ala
465 470 475 480
Asp Val Leu Ala Glu Lys Glu Leu Ser His Tyr Asn Asp Ile Arg Ala
485 490 495
His Thr Ser Val Asn Ala Val Asn Leu Glu Val Leu Pro Ala Pro Glu
500 505 510
Tyr Ser Ser Ala Gln Arg Ala Leu Ser Asp Ala Asp Trp His Phe Ile
515 520 525
Ala Asp Pro Ala Ser Arg Phe Tyr Asn Leu Val Leu Ala Asp Ser Gly
530 535 540
Ala Gly Phe Phe Asp Pro Leu Thr Arg Gly Val Leu Ser Thr Val Ser
545 550 555 560
Gly Val Val Val Val Ala Ser Val Ser Ile Asp Gly Ala Gln Gln Ala
565 570 575
Ser Val Ala Leu Asp Trp Leu Arg Asn Asn Gly Tyr Gln Asp Leu Ala
580 585 590
Ser Arg Ala Ser Val Val Ile Asn His Ile Met Pro Gly Glu Pro Asn
595 600 605
Val Ala Val Lys Asp Leu Val Arg His Phe Glu Gln Gln Val Gln Pro
610 615 620
Gly Arg Val Val Val Met Pro Trp Asp Arg His Ile Ala Ala Gly Thr
625 630 635 640
Glu Ile Ser Leu Asp Leu Leu Asp Pro Ile Tyr Lys Arg Lys Val Leu
645 650 655
Glu Leu Ala Ala Ala Leu Ser Asp Asp Phe Glu Arg Ala Gly Arg Arg
660 665 670
Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser Ala
675 680 685
Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly Lys
690 695 700
Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser Glu
705 710 715 720
Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu Leu
725 730 735
Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly Gln
740 745 750
Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Thr Glu
755 760 765
Asn Leu Thr Val Gln Pro Glu Arg Leu Gly Val Leu Ala Ser His His
770 775 780
Asp Asn Ala Ala Val Asp Ala Ser Ser Gly Val Glu Ala Ala Ala Gly
785 790 795 800
Leu Gly Glu Ser Val Ala Ile Thr His Gly Pro Tyr Ser Ser Gln Phe
805 810 815
Asn Asp Thr Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala
820 825 830
Ala Ser Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp
835 840 845
Glu Gly Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser
850 855 860
Gly Ser Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala
865 870 875 880
Thr Glu Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu
885 890 895
Ala Gly Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe
900 905 910
Ala Ser Arg Ala Phe Ile Ile Asp Pro Thr Ile Ser Ala Ile Asp Gly
915 920 925
Leu Tyr Asp Leu Leu Gly Ile Gly Ile Pro Asn Gln Gly Gly Ile Leu
930 935 940
Tyr Ser Ser Leu Glu Tyr Phe Glu Lys Ala Leu Glu Glu Leu Ala Ala
945 950 955 960
Ala Phe Pro Gly Asp Gly Trp Leu Gly Ser Ala Ala Asp Lys Tyr Ala
965 970 975
Gly Lys Asn Arg Asn His Val Asn Phe Phe Gln Glu Leu Ala Asp Leu
980 985 990
Asp Arg Gln Leu Ile Ser Leu Ile His Asp Gln Ala Asn Ala Val Gln
995 1000 1005
Thr Thr Arg Asp Ile Leu Glu Gly Ala Lys Lys Gly Leu Glu Phe Val
1010 1015 1020
Arg Pro Val Ala Val Asp Leu Thr Tyr Ile Pro Val Val Gly His Ala
1025 1030 1035 1040
Leu Ser Ala Lys Thr Leu Ile Asn Ala Thr Gln Leu Leu Lys Leu Leu
1045 1050 1055
Ala Lys Leu Ala Glu Leu Val Ala Ala Ala Ile Ala Asp Ile Ile Ser
1060 1065 1070
Asp Val Ala Asp Ile Ile Lys Gly Thr Leu Gly Glu Val Trp Glu Phe
1075 1080 1085
Ile Thr Asn Ala Leu Asn Gly Leu Lys Glu Leu Trp Asp Lys Leu Thr
1090 1095 1100
Gly Trp Val Thr Gly Leu Phe Ser Arg Gly Trp Ser Asn Leu Glu Ser
1105 1110 1115 1120
Phe Phe Ala Gly Val Pro Gly Leu Thr Gly Ala Thr Ser Gly Leu Ser
1125 1130 1135
Gln Val Thr Gly Leu Phe Gly Ala Ala Gly Leu Ser Ala Ser Ser Gly
1140 1145 1150
Leu Ala His Ala Asp Ser Leu Ala Ser Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu
1155 1160 1165
Ala Gly Ile Gly Gly Gly Ser Gly Phe Gly Gly Leu Pro Ser Leu Ala
1170 1175 1180
Gln Val His Ala Ala Ser Thr Arg Gln Ala Leu Arg Pro Arg Ala Asp
1185 1190 1195 1200
Gly Pro Val Gly Ala Ala Ala Glu Gln Val Gly Gly Gln Ser Gln Leu
1205 1210 1215
Val Ser Ala Gln Gly Ser Gln Gly Met Gly Gly Pro Val Gly Met Gly
1220 1225 1230
Gly Met His Pro Ser Ser Gly Ala Ser Lys Gly Thr Thr Thr Lys Lys
1235 1240 1245
Tyr Ser Glu Gly Ala Ala Ala Gly Thr Glu Asp Ala Glu Arg Ala Pro
1250 1255 1260
Val Glu Ala Asp Ala Gly Gly Gly Gln Lys Val Leu Val Arg Asn Val
1265 1270 1275 1280
Val Thr Glu Gln Gln Trp Asn Phe Ala Gly Ile Glu Ala Ala Ala Ser
1285 1290 1295
Ala Ile Gln Gly Asn Val Thr Ser Ile His Ser Leu Leu Asp Glu Gly
1300 1305 1310
Lys Gln Ser Leu Thr Lys Leu Ala Ala Ala Trp Gly Gly Ser Gly Ser
1315 1320 1325
Glu Ala Tyr Gln Gly Val Gln Gln Lys Trp Asp Ala Thr Ala Thr Glu
1330 1335 1340
Leu Asn Asn Ala Leu Gln Asn Leu Ala Arg Thr Ile Ser Glu Ala Gly
1345 1350 1355 1360
Gln Ala Met Ala Ser Thr Glu Gly Asn Val Thr Gly Met Phe Ala Ala
1365 1370 1375
Pro Lys Thr Tyr Ser Glu Glu Leu Lys Gly Thr Asp Thr Gly Gln Ala
1380 1385 1390
Ser Gln Ile Gln Met Ser Asp Pro Ala Tyr Asn Ile Asn Ile Ser Leu
1395 1400 1405
Pro Ser Tyr Tyr Pro Asp Gln Lys Ser Leu Glu Asn Tyr Ile Ala Gln
1410 1415 1420
Thr Arg Asp Lys Phe Leu Ser Ala Ala Thr Ser Ser Thr Pro Arg Glu
1425 1430 1435 1440
Ala Pro Tyr Glu Leu Asn Ile Thr Ser Ala Thr Tyr Gln Ser Ala Ile
1445 1450 1455
Pro Pro Arg Gly Thr Gln Ala Val Val Leu Lys Val Tyr Gln Asn Ala
1460 1465 1470
Gly Gly Thr His Pro Thr Thr Thr Tyr Lys Ala Phe Asp Trp Asp Gln
1475 1480 1485
Ala Tyr Arg Lys Pro Ile Thr Tyr Asp Thr Leu Trp Gln Ala Asp Thr
1490 1495 1500
Asp Pro Leu Pro Val Val Phe Pro Ile Val Gln Gly Glu Leu Ser Lys
1505 1510 1515 1520
Gln Thr Gly Gln Gln Val Ser Ile Ala Pro Asn Ala Gly Leu Asp Pro
1525 1530 1535
Val Asn Tyr Gln Asn Phe Ala Val Thr Asn Asp Gly Val Ile Phe Phe
1540 1545 1550
Phe Asn Pro Gly Glu Leu Leu Pro Glu Ala Ala Gly Pro Thr Gln Val
1555 1560 1565
Leu Val Pro Arg Ser Ala Ile Asp Ser Met Leu Ala Gly Asp Leu Val
1570 1575 1580
Gly Pro Gly Ser Ala Glu Tyr Ala Ala Ala Asn Pro Thr Gly Pro Ala
1585 1590 1595 1600
Ser Val Gln Gly Met Ser Gln Asp Pro Val Ala Val Ala Ala Ser Asn
1605 1610 1615
Asn Pro Glu Leu Thr Thr Leu Thr Ala Ala Leu Ser Gly Gln Leu Asn
1620 1625 1630
Pro Gln Val Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Ser Gly Gln Tyr Thr Val
1635 1640 1645
Phe Ala Pro Thr Asn Ala Ala Phe Ser Lys Leu Pro Ala Ser Thr Ile
1650 1655 1660
Asp Glu Leu Lys Thr Asn Ser Ser Leu Leu Thr Ser Ile Leu Thr Tyr
1665 1670 1675 1680
His Val Val Ala Gly Gln Thr Ser Pro Ala Asn Val Val Gly Thr Arg
1685 1690 1695
Gln Thr Leu Gln Gly Ala Ser Val Thr Val Thr Gly Gln Gly Asn Ser
1700 1705 1710
Leu Lys Val Gly Asn Ala Asp Val Val Ser Gly Gly Val Ser Thr Ala
1715 1720 1725
Asn Ala Thr Val Tyr Met Ile Asp Ser Val Leu Met Pro Pro Ala Val
1730 1735 1740
Ser Gln Asp Thr Ser Pro Lys Pro Ala Thr Ser Pro Ala Ala Pro Val
1745 1750 1755 1760
Thr Thr Ala Ala Met Ala Asp Pro Ala Ala Asp Leu Ile Gly Arg Gly
1765 1770 1775
Ser Ala Gln Tyr Ala Ala Gln Asn Pro Thr Gly Pro Gly Ser Val Ala
1780 1785 1790
Gly Met Ala Gln Asp Pro Val Ala Thr Ala Ala Ser Asn Asn Pro Met
1795 1800 1805
Leu Ser Thr Leu Thr Ser Ala Leu Ser Gly Lys Leu Asn Pro Asp Val
1810 1815 1820
Asn Leu Val Asp Thr Leu Asn Gly Gly Glu Tyr Thr Val Phe Ala Pro
1825 1830 1835 1840
Thr Asn Ala Ala Phe Asp Lys Leu Pro Ala Ala Thr Ile Asp Gln Leu
1845 1850 1855
Lys Thr Asp Ala Lys Leu Leu Ser Ser Ile Leu Thr Tyr His Val Ile
1860 1865 1870
Ala Gly Gln Ala Ser Pro Ser Arg Ile Asp Gly Thr His Gln Thr Leu
1875 1880 1885
Gln Gly Ala Asp Leu Thr Val Ile Gly Ala Arg Asp Asp Leu Met Val
1890 1895 1900
Asn Asn Ala Gly Leu Val Ser Gly Gly Val His Thr Ala Asn Ala Thr
1905 1910 1915 1920
Val Tyr Met Ile Asp Thr Val Leu Met Pro Pro Ala Gln
1925 1930
<210> 92
<211> 5809
<212> DNA
<213> Mycobacterium tuberculosis
<400> 92
atgcaagccg aaaccgccgt caataccctg ttcgagaaac tggagccgat ggcatctatt 60
cttgatccgg gtgcgagcca gagcactacc aatccaatct ttggcatgcc gtccccgggc 120
agctcgacgc cggtgggcca gctgccgccg gcggctaccc aaaccttagg tcagctgggt 180
gagatgagcg gcccgatggg cggctccggt aaccctgcag atgaagaggc agcacaaatg 240
ggtctgctgg gtaccagccc gctgagcaat cacccactgg ccggcggcag cggcccaagc 300
gctggtgcgg gtctgctgcg cgcggagtcc ctgccgggtg cgggtggctc cctgacgcgt 360
accccactca tgagccaact gattgagaaa ccggttgcga ccgaacaaca gtggaatttt 420
gccggtattg aagctgcggc cagcgccatc cagggcaatg ttacgagcat ccacagcctg 480
ctggatgaag gcaaacagtc gctgaccaag ctggcggcgg cgtggggtgg ctccggtagc 540
gaagcctatc agggtgttca gcagaaatgg gacgcgaccg cgactgagct gaacaatgcg 600
ctgcagaatc tggcccgcac tatttccgag gccggtcaag cgatggcaag caccgagggc 660
aacgtgaccg gtatgttcgc tgctgccgat tacgacaaac tgtttcgccc acatgaaggc 720
atggaggcac cggatgatat ggcggcgcag ccgtttttcg acccgtccgc gagctttccg 780
ccggccccag caagcgcgaa tctgcctaaa ccgaacggtc agaccccgcc gcctacgagc 840
gacgatttga gcgaacgttt tgtgagcgca cctccaccac cgccgccgcc accaccgcct 900
agccctagcc cgcagcgtaa ctccggtcgc cgtgcagagc gtcgtgtcca cccggatctg 960
gcggcgcaac acgctgcggc tcagccagat tctattactg ccgccactac cggtggcaga 1020
cgccgcaaac gtgctgcacc ggacttggac gccacccaga aaagcctgcg tccagctgca 1080
aagggcccga aagtcaaaaa ggtcaagccg caaaagccga aagcaactaa accgccgaaa 1140
gtcgttagcc agcgcggttg gcgtcactgg gtgcacgcgc tgacgcgcat taacctgggt 1200
ttgagcccgg acgaaaaata tgaactggac ttgcacgcac gtgtccgccg taacccgcgt 1260
ggttcatacc agattgccgt tgtcggtctg cagggtggcg ccggcaaaac cacgctgact 1320
gcggcactgg gttccacgct ggcgcaagtg cgtgcggatc gtattctggc actggatgct 1380
gacccgggcg cgggtaatct ggcagatcgt gtgggtcgtc agtctggtgc gaccatcgca 1440
gatgttctgg ctgagaaaga actgagccat tacaacgaca ttcgtgcgca cacgtctgtt 1500
aatgccgtta atctggaagt gctgccggca ccggagtaca gcagcgcaca gcgcgccctg 1560
agcgacgcgg actggcactt catcgcagac ccggcatctc gcttctataa cctggttttg 1620
gcggattccg gtgcgggctt tttcgatcca ctgacccgcg gtgtgctcag caccgttagc 1680
ggtgtggttg tggttgcctc cgtgagcatc gacggtgcgc aacaagcatc ggtggcgctg 1740
gactggctgc gtaataacgg ttatcaagac ttggcgagcc gcgcgagcgt tgtgattaac 1800
catatcatgc cgggcgagcc gaatgttgcg gttaaagatt tggtgcgcca ttttgagcaa 1860
caggtccaac cgggccgcgt cgttgtgatg ccatgggatc gtcatattgc agcgggcacc 1920
gaaattagcc tggacttact ggacccgatt tataagcgta aggtactgga actggccgca 1980
gcgctgagcg acgatttcga gcgtgcaggc cgtcgtaccg agcaacagtg gaatttcgct 2040
ggcattgaag ccgcagcctc tgcaattcag ggtaatgtta cctcgattca cagcctgctg 2100
gacgagggca aacaaagcct gaccaagctg gcggctgctt ggggtggttc tggtagcgaa 2160
gcgtaccagg gcgtccagca aaaatgggac gcaaccgcaa ccgagctgaa taatgctctg 2220
caaaacctgg cccgtaccat tagcgaagcg ggccaggcaa tggcgagcac cgaaggcaac 2280
gtgaccggta tgtttgccac cgaaaacttg accgttcagc cggaacgtct gggtgtgctg 2340
gcgagccatc atgacaacgc agcagttgat gcgagcagcg gtgtcgaggc agccgcgggt 2400
ttgggcgaga gcgttgccat cacacatggt ccgtattcat ctcagttcaa cgacaccacg 2460
gaacagcagt ggaacttcgc aggcatcgaa gccgcggcgt ccgcgatcca gggtaacgtg 2520
actagcattc attcgttgct ggacgaaggc aagcaaagcc tgaccaaact ggcagctgca 2580
tggggtggct cgggctctga ggcgtaccaa ggcgtccaac agaagtggga cgcgactgcg 2640
accgagttaa acaatgcttt acagaacctg gctcgtacta tcagcgaggc tggtcaggca 2700
atggcgagca ccgaaggtaa tgttaccggc atgttcgcga gccgcgcttt tattatcgac 2760
ccgacgatca gcgccatcga tggtctgtac gatctgttgg gtattggcat tccgaaccaa 2820
ggcggcatcc tgtatagctc cctggaatac ttcgagaaag ccttggaaga actggcggcc 2880
gcgttcccgg gcgatggctg gctgggtagc gcggctgaca aatatgcggg caaaaaccgt 2940
aaccatgtca actttttcca agagttggcg gatttggatc gtcaattgat tagcctgatc 3000
cacgatcagg cgaatgcagt gcaaaccact cgcgatatcc tcgaaggtgc caaaaagggt 3060
ctggagtttg tacgtccagt cgcagtcgac ctgacctaca ttccagttgt cggtcatgcg 3120
ttgtcggcaa agactctgat taatgcgacg caactgttaa aactgttggc gaaattggca 3180
gagctggtcg cggcagcgat cgccgacatc atcagcgatg tggcagatat cattaagggt 3240
acgctgggcg aagtgtggga atttattact aatgcgctca acggtctgaa ggaactgtgg 3300
gataaattga cgggttgggt taccggcttg tttagccgtg gttggtccaa tttggagagc 3360
tttttcgccg gtgttccggg cctgaccggc gcaacgagcg gtttgtccca ggtcacgggc 3420
ttgtttggtg ctgcgggtct gagcgcatcc agcggtctgg cgcacgcaga ttccttggcg 3480
tctagcgcaa gcctgccggc gctggcaggc atcggcggcg gctctggctt cggtggcttg 3540
ccaagcctgg cccaagtcca tgctgcttcc acgcgccagg ctctgcgccc acgtgcagat 3600
ggtccggttg gtgccgcagc cgagcaagtt ggtggccaga gccaactggt cagcgctcag 3660
ggctctcagg gcatgggcgg tccggttggt atgggtggta tgcacccgag ctccggcgca 3720
tccaagggta ctaccacgaa aaagtatagc gagggtgcag cggcgggtac tgaagatgcc 3780
gaacgtgcac cggttgaggc tgatgcgggt ggcggccaaa aagttttggt ccgtaatgtc 3840
gtgactgagc agcagtggaa ttttgccggc atcgaagcgg cggcgagcgc gatccaaggc 3900
aacgtcactt cgattcactc tctgctggat gagggcaaac agtccctgac gaaactggca 3960
gccgcgtggg gtggtagcgg ttccgaggca taccaaggtg ttcagcagaa gtgggacgcg 4020
acggccacgg aactgaacaa cgcgctgcag aacctggcgc gtaccatctc ggaagcaggc 4080
caggcaatgg ctagcactga aggcaacgtg acgggtatgt tcgcagcacc taagacctat 4140
agcgaagagt tgaagggtac tgatactggt caagcgagcc agattcagat gagcgacccg 4200
gcgtacaata tcaacatctc cctgccaagc tactatccag accaaaaaag cctggagaac 4260
tacatcgcgc agactcgcga taagttcctg tccgcagcga cgagcagcac cccacgcgaa 4320
gcaccgtatg agctgaacat tactagcgcg acgtaccaaa gcgcgattcc gccgcgtggt 4380
acccaagccg ttgtcctgaa agtttatcag aacgccggtg gcactcatcc gacgacgacc 4440
tataaggcct ttgactggga ccaggcatat cgtaagccaa tcacgtacga caccctgtgg 4500
caggccgaca cggatccact gccagttgtg tttccgatcg tgcaaggtga actgtcaaaa 4560
caaactggtc aacaggtgag cattgcccca aacgccggtc tggatccggt gaattatcaa 4620
aattttgctg ttacgaacga cggcgttatc tttttcttca acccgggtga actgctgccg 4680
gaagcggcgg gtccgaccca agtgctggtt ccgcgtagcg cgattgacag catgctggcg 4740
ggcgatctgg ttggcccggg tagcgcagaa tacgccgcgg ccaacccgac cggtccggca 4800
tccgtccaag gtatgagcca ggatccggtg gctgttgcag cctctaacaa tccggaactg 4860
accaccttga cggcagcgct gagcggtcag ctgaatcctc aagtgaatct ggttgatacg 4920
ctgaatagcg gccaatatac cgtctttgca ccgaccaacg ctgcgttcag caaactgccg 4980
gccagcacca ttgacgaatt gaaaaccaat tccagcctgt tgacgagcat tctgacgtat 5040
cacgttgtgg cgggccagac gtccccagcg aacgtcgtcg gtacccgtca gacgctgcag 5100
ggtgcgtctg taaccgttac gggccaaggc aactctttga aagtcggtaa tgccgacgtc 5160
gtcagcggtg gcgttagcac ggctaatgca accgtctaca tgattgacag cgttttgatg 5220
ccgcctgccg tcagccagga tacgtccccg aaaccggcta cgagcccggc agccccggtt 5280
accactgcag caatggcgga ccctgcggct gatttgatcg gtcgcggctc tgcacagtat 5340
gctgcccaaa acccgacggg tccgggctct gttgccggca tggcgcagga cccggtcgca 5400
accgcggcta gcaataatcc aatgctgtcg acgctgactt ccgctctgtc cggtaaactg 5460
aatccggacg tcaacctggt ggataccctg aacggtggcg agtataccgt ctttgccccg 5520
accaacgctg cgttcgacaa gctgccggca gccaccatcg accaactgaa aaccgacgcc 5580
aagctgctga gcagcatcct gacctatcac gtgattgcgg gtcaagctag cccgagccgc 5640
atcgacggca cccaccagac cttgcagggc gctgacctga cggttattgg tgctcgcgat 5700
gatctgatgg tgaataacgc cggtctggtt tccggcggcg ttcatacggc taatgcaacg 5760
gtgtacatga ttgatacggt ccttatgcct ccggcgcagt gataagctt 5809
Claims (36)
- 결핵균 (M. tuberculosis)에서 유래하는 5개 이상의 항원을 포함하는 융합 단백질.
- 제1항에 있어서, 상기 융합 단백질은 6개 이상의 항원, 예를 들어, 7개 이상의 항원, 예를 들어, 8개 이상의 항원을 포함하는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 융합 단백질은 초기 항원 (early antigen)및 후기 항원 (late antigen)을 모두 포함하는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 하나 이상의 항원은 BCG 에 대한 면역 반응을 프라이밍 (Prime)하지 않는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항원은 BCG에서 결실되거나, 분비되지 않거나, 저발현 되는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항원은 다음으로부터 선택되는 것인, 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), 서열번호:7 (MPT70) 및 서열번호:8 (MPT83) 및 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로 구성된 그룹으로부터 선택된 아미노산 서열, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열. - 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 다음을 포함하는 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), 및 SEQ ID NO:5 (espA) 또는 변이체 또는 이의 면역원성 에피토프,
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열. - 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 다음을 포함하는 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), 및 SEQ ID NO:8 (MPT83) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열. - 제5항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 b)의 아미노산 서열은 a)의 아미노산 서열 중 어느 하나와 90 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 99 % 이상 서열 동일성을 갖는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 2개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 3개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 4개 이상의 ESAT-6 반복부, 예를 들어, 5개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함하는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 10항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 4개 이상의 ESAT-6 반복부를 포함하는 것인, 융합 단백질.
- 제10항 또는 11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ESAT-6 반복부는 ESAT-6과 상이한 하나 이상의 항원에 의해 분리되는 것인, 융합 단백질.
- 제10항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ESAT-6 반복부는 ESAT-6과 상이한 항원과 교대로 위치하는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 다음을 포함하는 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:1 (ESAT-6), SEQ ID NO:2 (PPE68), SEQ ID NO:3 (espI), SEQ ID NO:4 (espC), SEQ ID NO:5 (espA), SEQ ID NO:6 (MPT64), SEQ ID NO:7 (MPT70), 및 SEQ ID NO:8 (MPT83) 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열, 및
상기 융합 단백질은 ESAT-6과 상이한 항원과 교대로 위치하는 4개의 ESAT-6 반복부를 포함. - 제1항 내지 14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 다음의 그룹으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 아미노산 서열을 포함하는 것인 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38 또는 SEQ ID NO:91 또는 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프; 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열. - 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 SEQ ID NO: 9 또는 SEQ ID NO:91로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 다음으로부터 이루어진 군으로부터 선택 된 핵산 서열에 의해 코딩되는 것인, 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:54(H107), SEQ ID NO:79(H107b), SEQ ID NO:80(H107c), SEQ ID NO:92(H107e) SEQ ID NO:81(H106), SEQ ID NO:82( H105) 및 SEQ ID NO:83(H104), 또는 이의 변이체 또는 단편; 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열. - 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질의 항원은 링커 분자 (Linker molecule)와 연결되는 것인, 융합 단백질.
- 제1항 내지 18항에 중 어느 한 항에 있어서, 상기 융합 단백질은 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원을 포함하는 것인, 융합 단백질.
- 제19항에 있어서, 상기 BCG에 대한 면역 반응을 프라이밍하는 하나 이상의 항원은 다음으로부터 선택되는 것인 융합 단백질:
a) SEQ ID NO:10 (Ag85b), SEQ ID NO:11 (Ag85a), SEQ ID NO:12 (TB10.4), SEQ ID NO:13 (EsxG), SEQ ID NO: 14 (PPE60), SEQ ID NO:15 (HBHA), SEQ ID NO:16 (EsxC), SEQ ID NO:17 (EsxD), SEQ ID NO:18 (CanA), SEQ ID NO:19 (EsxR), SEQ ID NO:20 (EsxS), SEQ ID NO:21 (EsxQ), SEQ ID NO:22 (HspX), SEQ ID NO:23 (PepD), SEQ ID NO:24 (PPE18), SEQ ID NO:25 (PPE42), SEQ ID NO:26 (EsxV) 및 SEQ ID NO:27 (EsxW) 및 이의 변이체 또는 면역원성 에피토프로 이루어진 그룹에서 선택된 아미노산, 또는
b) a)의 아미노산 서열 중 어느 하나에 대한 80 % 이상의 서열 동일성, 예를 들어 90 % 이상, 예를 들어 95 % 이상, 예를 들어 96 % 이상, 예를 들어 97 % 이상, 예를 들어 98 % 이상, 예를 들어 99 % 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열. - 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 따른 융합 단백질을 포함하는 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제21항에 있어서, 상기 백신 또는 면역원성 조성물은 하나 이상의 아쥬반트 (adjuvant)를 추가로 포함하는 것인, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제22항에 있어서, 상기 아쥬반트는 중성 아쥬반트 제형, 음이온성 아쥬반트 제형, 양이온성 아쥬반트 제형, 양이온성 리포솜 (예를 들어, 디메틸디옥타데실암모늄 브로마이드(Dimethyl-di-octadecylammonium bromide, DDA)), Quil A, QS21, 폴리 I:C, 암모니움 하이드록사이드 (Aluminium hydroxide), 프로인트 불완전 아쥬반트 (Freund's incomplete adjuvant), IFN-γ, IL-2, IL-12, 모노포스포릴 지질 A (Monophosphoryl lipid A, MPL), 트레할로스 디미콜레이트(Trehalose Dimycolate, TDM), 트레할로스 디베헤네이트 (Trehalose Dibehenate, TDB), 무라밀 디펩티드(Muramyl Dipeptide, MDP), 모노마이콜릴 글리세롤(Monomycolyl glycerol, MMG), CpG 및 "IC31", 또는 이들의 조합인 것인, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제21 내지 23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 백신 또는 면역원성 조성물은 BCG를 추가로 포함하는 것인, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 독성 마이코박테리움 (Virulent mycobacterium)에 의해 유발되는 감염 및/또는 질병에 대한 대상체의 백신접종 또는 면역화에 사용하기 위한 제1항 내지 20항 중 어느 한 항에 따른 융합 단백질 또는 제21항 내지 제24항 중 어느 한 항에 따른 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제25항에 있어서, 상기 대상체가 포유동물 (Mammal)인 것인, 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제26항에 있어서, 상기 포유동물은 사람인 것인, 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제25항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 독성 마이코박테리움은 M.튜버큘로시스 (M. tuberculosis), M.보비스 (M. bovis), M.아프리카넘 (M. africanum), M.카네티 (M. canetti), 및 M.마이크로티 (M. microti), 바람직하게는, M.튜버큘로시스 (M. tuberculosis)로 이루어진 군으로부터 선택된 것인, 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제25항 내지 제28항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 BCG는 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물의 투여전, 동시 또는 후에 투여되는 것인, 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제29항에 있어서, 상기 BCG는 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물의 투여와 동시에 투여되는 것인, 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 제25항 내지 30항에 있어서, 상기 대상체는 이전에 BCG로 예방접종을 받은 적인 있는 것인, 융합 단백질, 백신 또는 면역원성 조성물.
- 다음을 포함하는 키트:
i) 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 따른 융합 단백질 또는 제21항 내지 제24항 중 어느 한 항에 따른 백신 또는 면역원성 조성물,
ii) BCG, 및
iii) 선택적으로, 사용 지침. - 제32항에 있어서, 상기 i) 및 ii)는 동시, 개별 또는 순차 투여용인 것인, 키트.
- 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 따른 융합 단백질을 코딩하는 서열을 포함하는 핵산 서열.
- 적합한 숙주에서 융합 단백질의 생산을 지시하기에 적합한 하나 이상의 제어 서열에 작동 가능하게 연결된 제34항에 따른 뉴클레오티드 서열을 포함하는 재조합 발현 벡터.
- 제35항에 따른 발현 벡터를 포함하는 재조합 숙주 세포.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP19180280.0 | 2019-06-14 | ||
EP19180280 | 2019-06-14 | ||
PCT/EP2020/066343 WO2020249756A1 (en) | 2019-06-14 | 2020-06-12 | Fusion proteins for tuberculosis vaccines |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20220032054A true KR20220032054A (ko) | 2022-03-15 |
Family
ID=66999556
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020227001213A KR20220032054A (ko) | 2019-06-14 | 2020-06-12 | 결핵 백신용 융합 단백질 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP3983011A1 (ko) |
KR (1) | KR20220032054A (ko) |
CN (1) | CN114222762A (ko) |
BR (1) | BR112021025172A2 (ko) |
WO (1) | WO2020249756A1 (ko) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN112852848B (zh) * | 2021-03-17 | 2022-04-29 | 中国农业大学 | 一种含密码子优化的结核分枝杆菌融合蛋白ah疫苗 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006136162A2 (en) | 2005-06-23 | 2006-12-28 | Statens Serum Institut | Tuberculosis vaccines comprising antigens expressed during the latent infection phase |
WO2010006607A1 (en) | 2008-07-15 | 2010-01-21 | Satens Serum Institut | Vaccines comprising tb10.4 |
WO2014063704A2 (en) | 2012-10-23 | 2014-05-01 | Statens Serum Institut | M. tuberculosis vaccines |
WO2015161853A1 (en) | 2014-04-24 | 2015-10-29 | Statens Serum Institut | New m.tuberculosis vaccines |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101248084B (zh) * | 2005-06-23 | 2013-11-06 | 国家血清研究中心 | 包含潜伏感染阶段期间所表达的抗原的结核疫苗 |
AU2009273132B2 (en) * | 2008-07-25 | 2015-09-03 | Glaxo Group Limited | The tuberculosis Rv2386c protein, compositions and uses thereof |
EP2872172B1 (en) * | 2012-07-10 | 2018-11-14 | Transgene SA | Mycobacterial antigen vaccine |
-
2020
- 2020-06-12 BR BR112021025172A patent/BR112021025172A2/pt unknown
- 2020-06-12 CN CN202080056859.8A patent/CN114222762A/zh active Pending
- 2020-06-12 WO PCT/EP2020/066343 patent/WO2020249756A1/en unknown
- 2020-06-12 EP EP20731142.4A patent/EP3983011A1/en active Pending
- 2020-06-12 KR KR1020227001213A patent/KR20220032054A/ko unknown
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006136162A2 (en) | 2005-06-23 | 2006-12-28 | Statens Serum Institut | Tuberculosis vaccines comprising antigens expressed during the latent infection phase |
WO2010006607A1 (en) | 2008-07-15 | 2010-01-21 | Satens Serum Institut | Vaccines comprising tb10.4 |
WO2014063704A2 (en) | 2012-10-23 | 2014-05-01 | Statens Serum Institut | M. tuberculosis vaccines |
WO2015161853A1 (en) | 2014-04-24 | 2015-10-29 | Statens Serum Institut | New m.tuberculosis vaccines |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Seder et al (2008), Nat. Rev. Immunol. 8, 247-258 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN114222762A (zh) | 2022-03-22 |
WO2020249756A1 (en) | 2020-12-17 |
EP3983011A1 (en) | 2022-04-20 |
BR112021025172A2 (pt) | 2022-01-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR101035053B1 (ko) | 감염 잠복기 동안 발현되는 항원을 포함하는 결핵 백신 | |
RU2235128C2 (ru) | Гены рецептора трансферрина moraxela | |
JP4276670B2 (ja) | 微生物蛋白質と、この蛋白質を産生する微生物と、該蛋白質のワクチンおよび結核検出での利用 | |
JP4053085B2 (ja) | マイコバクテリアの膜−関連免疫原 | |
US5786189A (en) | Vaccine | |
ES2229220T3 (es) | Vacuna contra la tuberculosis. | |
US20040057963A1 (en) | Therapeutic TB vaccine | |
JP2001204482A (ja) | 肺炎球菌タンパクの構造遺伝子 | |
EP1000144B1 (en) | Lactoferrin receptor gene of moraxella | |
JPH07507688A (ja) | ジフテリア毒素ワクチン | |
JP5010079B2 (ja) | マイコバクテリウム・ツベルクローシスesat−6遺伝子ファミリーベースの結核ワクチン及び診断法 | |
JP2001515359A (ja) | 結核菌由来の核酸フラグメント及びポリペプチドフラグメント | |
JPH11506320A (ja) | 豊富な細胞外産物、ならびにそれらを産生および使用するための方法 | |
US7935354B2 (en) | Generation of new BCG vaccine strains protecting against the establishment of latent Mycobacterium tuberculosis infection and reactivation from the latent or persistent state | |
KR20220032054A (ko) | 결핵 백신용 융합 단백질 | |
US20040013685A1 (en) | Nucleic acid fragments and polypeptide fragments derived from M. tuberculosis | |
KR20200046059A (ko) | 그룹 a 스트렙토코쿠스에 대한 면역원성 펩티드 | |
US8299232B2 (en) | Constructing a DNA chimera for vaccine development against leishmaniasis and tuberculosis | |
US6436898B1 (en) | Compounds for treatment of infectious and immune system disorders and methods for their use | |
US20030054013A1 (en) | Compounds for treatment of infectious and immune system disorders and methods for their use | |
AU2002339236B2 (en) | Groel chimeric protein and vaccine | |
US20050063984A1 (en) | Antigenic peptide fragments of vapa protein, and uses thereof | |
JP3140776B2 (ja) | 無細胞ワクチン | |
US20040072224A1 (en) | Compounds for treatment of infectious and immune system disorders and methods for their use | |
WO2003060105A1 (en) | Defective entities and uses therefor |