KR20210044251A

KR20210044251A - 암 치료용 바이오마커

Info

Publication number: KR20210044251A
Application number: KR1020217007013A
Authority: KR
Inventors: 시앙 리; 이요우 첸
Original assignee: 베이징 페르칸스 온콜로지 컴퍼니 리미티드
Priority date: 2018-08-13
Filing date: 2019-08-12
Publication date: 2021-04-22
Also published as: BR112021002622A2; WO2020036852A1; EP3836909A4; SG11202101397TA; US20210180141A1; AU2019321289A1; MX2021001749A; EP3836909A1; JP2021533774A; JP2024023480A; CN113226318A; CA3109605A1

Abstract

암 치료에서 YM155 모노브로마이드와 같은 서바이빈 억제제의 치료 효능을 예측하기 위한 바이오마커로서 MYC 유전자를 사용하는 방법, 및 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 진단하고 치료하기 위한 관련 키트, 조성물, 및 방법이 제공된다.

Description

암 치료용 바이오마커

관련 출원에 대한 상호 참조

본 출원은 2018년 8월 13일에 출원된 PCT/CN2018/100206; 및 2018년 11월 16일에 출원된 PCT/CN2018/115826에 대한 우선권을 주장하며, 이들 각각은 그 전체가 참조로서 본원에 통합된다.

본 개시의 실시예는 암 치료에서 YM155 모노브로마이드와 같은 서바이빈 억제제의 치료 효능을 예측하기 위한 바이오마커로서 MYC 유전자의 용도, 및 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 진단하고 치료하기 위한 관련 키트, 조성물, 및 방법에 관한 것이다.

YM155 모노브로마이드(monobromide)는 서바이빈(survivin)의 하향 조절을 유도하고 강력한 항종양 활성을 나타내는 소분자 서바이빈 억제제이다(예를 들어, Minematsu 등, Drug Metabolism and Disposition, 37:619-628, 2008 참조). YM-155는 전립선암, 췌장암 및 폐암을 비롯한, 다양한 생체 내 암 모델에서 항종양 효과를 발휘한다(예를 들어, Nakahara 등, Cancer Research 67:8014-8021, 2007; 및 Na 등, PLoS One 7(6), 2012 참조).

그러나, YM155 모노브로마이드의 항암 치료 효능을 더욱 잘 예측하여, 이러한 화학요법, 및 기타를 사용한 치료로부터 가장 혜택을 받을 환자를 식별하는 것이 당업계에 필요하다.

본 개시의 실시예들은 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료하기 위한 방법을 포함하며, 상기 방법은:

(a) 상기 대상체로부터의 암 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수(copy number), 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계; 및

(b) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가되는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되는 경우, YM155 모노브로마이드[1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드]([1-(2-Methoxyethyl)-2-methyl-4,9-dioxo-3-(pyrazin-2-ylmethyl)-4,9-dihydro-1H-naphtho[2,3-d] imidazolium bromide]), 또는 이의 유사체 또는 유도체를, 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고,

이에 의해 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료한다.

일부 실시예는, 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, YM155 모노브로마이드를 배제(또는 제외)한 화학요법제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다.

또한, 암을 앓고 있는 대상체에서, YM155 모노브로마이드[1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체에 대한 치료 반응을 예측하기 위한 방법이 포함되며, 상기 방법은

(a) 상기 대상체로부터의 암 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계; 및

(b) (i) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가되는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되는 경우, 상기 대상체를 YM155 모노브로마이드 치료에 반응성인 것으로 특성화하는 단계; 또는

(ii) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, 상기 대상체를 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화하는 단계를 포함하고,

이에 의해 암을 앓고 있는 대상체에서 YM155 모노브로마이드에 대한 치료 반응을 예측한다.

일부 실시예는, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 반응성인 것으로 특성화되는 경우, YM155 모노브로마이드를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시예는, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 경우, YM155 모노브로마이드를 제외한 화학요법제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다.

일부 실시예에서, 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수는 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 약 또는 적어도 약 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10배만큼 증가된다.

일부 실시예는 어레이 비교 게놈 혼성화(array comparative genome hybridization, aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 어레이, 복제 수 변이(copy number variation, CNV) 시퀀싱, 또는 다중 결찰 의존 프로브 증폭(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)에 의해 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수를 결정하는 단계를 포함한다. 일부 실시예는 원위치 혼성화(in situ hybridization, ISH), 형광 원위치 혼성화(fluorescence in situ hybridization, FISH), 차세대 시퀀싱(next generation sequencing, NGS), 또는 비교 게놈 혼성화(comparative genome hybridization, CGH)에 의해 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계를 포함한다. 일부 실시예는 데이터베이스로부터 MYC 유전자 복제 수 기준을 수득하는 단계, 또는 선택적으로 aCGH, SNP 어레이, CNV 서열, 또는 MLPA에 의해, 대조군으로부터 비-암성 조직으로부터 MYC 유전자 복제 수 기준을 결정하는 단계를 포함한다. 일부 실시예는 데이터베이스로부터 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 수득하는 단계, 또는 선택적으로 ISH, FISH, NGS 또는 CGH에 의해, 대조군으로부터 비-암성 조직으로부터 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 결정하는 단계를 포함한다.

일부 실시예는 대상체로부터 암 조직의 시료를 수득하는 단계를 포함한다. 특정 실시예에서, 암 조직의 시료는 대상체로부터 수득된 수술 시료, 생검 시료, 흉수(pleural effusion) 시료, 또는 복수액(ascetic fluid) 시료며, 폐, 혈액, 유방, 위장(위, 결장, 직장), 난소, 췌장, 간, 방광, 경부, 신경, 자궁, 침샘, 신장, 전립선, 갑상선 또는 근육 조직 중 하나 이상으로부터 임의로 선택된다.

특정 실시예에서, 대상체는 인간 대상체이다.

특정 실시예에서, 암은 암종, 육종, 예컨대 횡문근육종(rhabdomyosarcoma), 예를 들어, 폐포 횡문근육종 (뼈, 힘줄, 연골, 근육, 지방(fat), 섬유성, 혈관, 지방(adipose), 및/또는 결합 조직에서 기원하는 육종 포함), 신경아세포종, 수모세포종, 성상세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 골수종, 백혈병, 림프종(호지킨 림프종 및 비호지킨 림프종 포함), 선편평세포 암종, 암육종, 혼합 중배엽성 종양, 기형암종, 폐암(비소세포 폐암, 소세포 폐암, 선암종, 및 폐의 편평세포 암종 포함), 유방암(전이성 유방암 포함), 위장암, 위암, 대장암, 결장암, 직장암, 난소암, 췌장암, 간암, 방광암, 자궁경부암, 교아세포종, 자궁 암종, 침샘 암종, 신장암 또는 신암(예를 들어, 윌름 종양), 전립선암, 갑상선암, 및 두경부암 중 하나 이상으로부터 선택된다.

특정 실시예에서, MYC 유전자는 MYCC 및 MYCN으로부터 선택된다. 구체적인 실시예에서, MYC 유전자는 MYCC이고, 암은 폐암 및 혈액암, 임의로 백혈병 및 림프종으로부터 선택된다. 구체적인 실시예에서, MYC 유전자는 MYCN이고, 암은 신경아세포종, 소세포 폐암, 전립선암, 폐포 횡문근육종, 수모세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종 및 유방암으로부터 선택된다.

또한, 암 조직 및 비-암성 조직을 포함하는, 대상체로부터의 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단을 포함하는, 암을 앓고 있는 대상체에서, YM155 모노브로마이드 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체, 치료에 대한 치료 반응을 결정하기 위한 진단 키트의 용도가 포함된다.

특정 실시예에서, MYC 유전자 복제 수를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 어레이 비교 게놈 혼성화(aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 어레이, 복제 수 변이(CNV) 시퀀싱, 및 다중 결찰 의존 프로브 증폭(MLPA) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함한다.

특정 실시예에서, MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 원위치 혼성화(ISH), 형광 원위치 혼성화(FISH), 차세대 시퀀싱(NGS), 및 비교 게놈 혼성화(CGH) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함한다. 일부 실시예는 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 복제 수 기준 값을 포함한다. 일부 실시예는 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 포함한다.

또한, 다음을 포함하는 환자 관리 키트가 포함된다:

(a) 암 조직 및 비-암성 조직을 포함하는, 대상체로부터의 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단; 및

(b) YM155 모노브로마이드[1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체.

특정 실시예에서, MYC 유전자 복제 수를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 어레이 비교 게놈 혼성화(aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 어레이, 복제 수 변이(CNV) 시퀀싱, 및 다중 결찰 의존 프로브 증폭(MLPA) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함한다. 특정 실시예에서, MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 원위치 혼성화(ISH), 형광 원위치 혼성화(FISH), 차세대 시퀀싱(NGS), 및 비교 게놈 혼성화(CGH) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함한다.

일부 실시예는 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 복제 수 기준 값을 포함한다. 일부 실시예는 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 포함한다.

일부 용도 또는 키트에서, 암은 암종, 육종, 예컨대 횡문근육종(rhabdomyosarcoma), 예를 들어, 폐포 횡문근육종 (뼈, 힘줄, 연골, 근육, 지방(fat), 섬유성, 혈관, 지방(adipose), 및/또는 결합 조직에서 기원하는 육종 포함), 신경아세포종, 수모세포종, 성상세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 골수종, 백혈병, 림프종(호지킨 림프종 및 비호지킨 림프종 포함), 선편평세포 암종, 암육종, 혼합 중배엽성 종양, 기형암종, 폐암(비소세포 폐암, 소세포 폐암, 선암종, 및 폐의 편평세포 암종 포함), 유방암(전이성 유방암 포함), 위장암, 위암, 대장암, 결장암, 직장암, 난소암, 췌장암, 간암, 방광암, 자궁경부암, 교아세포종, 자궁 암종, 침샘 암종, 신장암 또는 신암(예를 들어, 윌름 종양), 전립선암, 갑상선암, 및 두경부암 중 하나 이상으로부터 선택된다.

몇몇 사용 또는 키트에서, MYC 유전자는 MYCC 및 MYCN으로부터 선택된다. 구체적인 예시에서, MYC 유전자는 MYCC이고, 암은 폐암 및 혈액암, 임의로 백혈병 및 림프종으로부터 선택된다. 특정한 예시에서, MYC 유전자는 MYCN이고, 암은 신경아세포종, 소세포 폐암, 전립선암, 폐포 횡문근육종, 수모세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종 및 유방암으로부터 선택된다.

도 1은 YM155 모노브로마이드(CAS 781661-94-7)의 화학 구조를 도시한다.
도 2는 YM155가 인간 폐암 세포주의 세포 증식을 억제함을 보여준다. NCI-H1975, HCC827, NCI-H226 및 HCC4006 세포를 96-웰 플레이트에서 배양하고 표시된 투여량(nM)으로 YM155로 처리하였다. 세포 증식은 EdU 증식 분석에 의해 검출하였다. 제시된 데이터는 평균±SEM이다.
도 3은 YM155가 인간 급성 골수성 백혈병(AML) 세포주의 세포 증식을 억제함을 보여준다. U937 및 HL-60 세포를 96-웰 플레이트에서 배양하고 표시된 투여량(nM)으로 YM155로 처리하였다. 세포 증식은 XTT 세포 생존력 분석에 의해 검출하였다. 제시된 데이터는 평균±SEM이다.
도 4는 YM155가 U937 및 RAMOS 세포주의 세포 증식을 억제함을 보여준다. U937 및 RAMOS 세포를 96-웰 플레이트에서 배양하고 표시된 투여량(nM)으로 YM155로 처리하였다. 세포 증식은 XTT 세포 생존력 분석에 의해 검출하였다. 제시된 데이터는 평균±SEM이다.
도 5 및 도 6은 인간 MYC 유전자에 대한 게놈 정보를 제공한다 (http://uswest.ensembl.org/Homo_sapiens/Location/View?db=core;g=ENSG00000136997;r=8:127735434-127742951 참조).
도 7은 YM155가 인간 신경아세포종 세포주, 특히 N-MYC의 복제 수 증가를 특징으로 하는 세포주의 세포 증식을 억제함을 보여준다(또한 표 E3 참조). 세포 증식은 EdU 분석에 의해 검출하였다. 제시된 데이터는 평균±SD이다.
도 8은 위치 24.3에서 염색체 2의 단완(short arm)(p arm) 상의 MYCN 유전자의 위치를 보여준다.
도 9a 내지 도 9b는 마우스의 HCC827 이종이식편에서 YM155의 항종양 효과를 보여준다. 도 9a는 종양 성장 곡선을 나타내고, 도 9b는 종양 부피의 평균 ±SD로서 데이터를 나타낸다 (n=5).** p<0.01 비히클 군 대비.
도 10a 내지 도 10b는 마우스의 HCC4006 이종이식편에서 YM155의 항종양 효과를 보여준다. 도 10a는 종양 성장 곡선을 나타내고, 도 10b는 종양 부피의 평균 ±SD로서 데이터를 나타낸다 (n=8).
도 11a 내지 도 11b는 마우스의 RAMOS 이종이식편에서YM155의 항종양 효과를 보여준다. 도 11a는 종양 성장 곡선을 나타내고, 도 11b는 종양 부피의 평균 ±SD로서 데이터를 나타낸다 (n=3).** p<0.01 비히클 군 대비.
도 12a 내지 도 12b는 마우스의 U937 이종이식편에서YM155의 항종양 효과를 보여준다. 도 12a는 종양 성장 곡선을 나타내고, 도 12b는 종양 부피의 평균 ±SD로서 데이터를 나타낸다 (n=3).
도 13a 내지 도 13b는 마우스의 IMR-32 이종이식편에서YM155의 항종양 효과를 보여준다. 도 13a는 종양 성장 곡선을 나타내고, 도 13b는 종양 부피의 평균 ±SD로서 데이터를 나타낸다 (n=3).
도 14a 내지 도 14b는 마우스의 SH-SY5Y 이종이식편에서YM155의 항종양 효과를 보여준다. 도 14a는 종양 성장 곡선을 나타내고, 도 14b는 종양 부피의 평균 ±SD로서 데이터를 제시한다(비히클 내 n=2; YM155로 치료한 경우 n=3).

본 개시의 실시예들은, 인간 악성 종양에서 MYC 유전자의 증폭 및/또는 전위가 YM155 모노브로마이드와 같은 서바이빈 억제제의 항암 효능 증가와 관련이 있고, 따라서 이 제제 및 다른 것들에 의한 암 치료를 최적화하기 위한 바이오마커(들)로서 사용될 수 있다는 놀라운 발견에 관한 것이다. 임의의 하나의 이론에 구속되고자 함이 없이, MYC-증폭된 또는 MYC-전위된 암세포에서의 MYC 종양유전자(oncogene) 발현은, 그 세포사멸-증진(pro-apoptotic) 신호전달이 카스파제를 억제하고 세포사를 차단하는 세포사멸 억제제(IAP) 단백질 계열의 구성원인 서바이빈에 의해 음성-조절된다는 것을 제외하고는, 이와 달리 세포사멸-증진성인 것으로 여겨진다. 따라서, YM155 모노브로마이드와 같은 서바이빈 억제제는 MYC 증폭 및/또는 전위의 맥락에서 서바이빈의 세포사멸-억제 활성을 차단하는 데 사용될 수 있고, 암세포 사멸을 증가시키기 위해 MYC의 세포사멸-증진 신호전달에 유리하여, 이러한 맥락에서 최적의 치료 효능을 제공할 수 있을 것으로 예상된다.

달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술적 용어 및 과학적 용어는 본 개시가 속하는 기술 분야의 숙련자가 일반적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기술된 것들과 유사하거나 동등한 임의의 방법, 재료, 조성물, 시약, 세포가 본 개시의 주제를 실시하거나 시험하는 데 사용될 수 있지만, 바람직한 방법 및 재료가 기술된다. 본 명세서에 인용된 특허 및 특허 출원을 포함하지만 이에 한정되지 않는, 모든 간행물 및 참조 문헌은, 각각의 개별 간행물 또는 참조 문헌이 마치 완전히 기재된 것으로서 참조로서 본원에 통합되도록 구체적으로 그리고 개별적으로 표시된 것처럼 그 전체가 본원에 통합된다. 본 출원이 우선권을 주장하는 임의의 특허 출원은 또한 간행물 및 참조 문헌을 위해 전술한 방식으로 그 전체가 참조로서 본원에 통합된다.

본 개시의 목적을 위해, 다음의 용어들이 아래에 정의된다.

관사 "a" 및 "an"은 그 관사의 문법적 객체 중 하나 또는 둘 이상(즉, 적어도 하나)을 지칭하기 위해 본원에서 사용된다. 예로서, "요소(an element)"는 하나의 요소 또는 둘 이상의 요소를 의미한다.

"길항제(antagonist)" 또는 "억제제(inhibitor)"는 단백질(예: 서바이빈)과 같은 다른 분자의 생리학적 작용을 방해하거나 그렇지 않으면 감소시키는 생물학적 구조 또는 화학 제제를 지칭한다. 일부 경우에, 길항제 또는 억제제는 다른 분자 및/또는 다른 분자의 기능적 리간드에 특이적으로 결합한다. 일부 경우에, 길항제 또는 억제제는 다른 분자(예: 서바이빈)의 발현을 하향 조절한다. 전체 및 부분 길항제가 포함된다.

"작용제(agonist)" 또는 "활성제(activator)"는 다른 제제 또는 분자의 생리학적 작용을 증가시키거나 증강시키는 생물학적 구조 또는 화학 제제를 지칭한다. 일부 경우에, 작용제는 다른 제제 또는 분자에 특이적으로 결합한다. 전체 및 부분 작용제가 포함된다.

"약(about)"이란 기준 수량, 수준, 값, 수, 빈도, 백분율, 치수, 크기, 양, 중량 또는 길이에 대해 30, 25, 20, 15, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 또는 1%만큼 가변되는 수량, 수준, 값, 수, 빈도, 백분율, 치수, 크기, 양, 중량 또는 길이를 의미한다.

본 개시 전체에 걸쳐, 문맥이 달리 요구하지 않는 한, 용어 "포함하다(comprise, comprises)", 및 "포함하는(comprising)"은 언급된 단계 또는 요소 또는 단계들 또는 요소들의 군을 포함하지만 임의의 다른 단계 또는 요소 또는 단계들 또는 요소들의 군을 배제하지 않는 것을 암시하는 것으로 이해될 것이다.

"~으로 이루어지는(consisting of)"이란 "~으로 이루어지는"이라는 문구 뒤에 오는 모든 것을 포함하고, 이에 한정되는 것을 의미한다. 따라서, 문구 "~으로 이루어지는"은 열거된 요소들이 요구되거나 의무사항이며, 다른 요소가 존재할 수 없음을 나타낸다. "필수적으로 ~으로 이루어지는"은 그 문구 다음에 열거된 임의의 요소들을 포함하는 것을 의미하며, 열거된 요소들에 대해 본 개시에서 명시된 활성 또는 작용을 방해하거나 이에 기여하지 않는 다른 요소들로 제한된다. 따라서, 문구 "필수적으로 ~으로 이루어지는"은 열거된 요소들이 요구되거나 의무사항이지만, 다른 요소들이 선택사항이고 이들이 열거된 요소들의 활성 또는 작용에 실질적으로 영향을 미치는지 여부에 따라 존재할 수도 있고 존재하지 않을 수도 있음을 나타낸다.

"절반 최대 억제 농도(half maximal inhibitory concentration)"(또는 "IC₅₀")는 특이적 생물학적 또는 생화학적 기능을 억제하는 데 있어서 제제의 효능의 척도이다. 이러한 정량적 척도는 주어진 생물학적 공정(또는 공정의 구성요소, 즉 효소, 세포, 세포 수용체 또는 미생물)을 절반만큼 억제하는 데 필요한 특정 제제(억제제)의 양을 나타낸다. 값은 일반적으로 몰 농도로 표현된다. 농도는 약리학적 연구에서 길항제 약물 효능의 척도로서 흔히 사용된다. 일부 경우에, IC₅₀은 시험관 내 50% 억제에 요구되는 제제의 농도를 나타낸다. 제제의 IC₅₀은 투여량-반응 곡선을 구성하고, 원하는 활성, 예를 들어, 종양 세포 증식의 억제, 종양 세포 사멸에 대한, 상이한 농도의 제제의 효과를 검사함으로써 결정될 수 있다.

"증가된" 또는 "향상된" 양은 통상적으로 "통계적으로 유의한" 양이며, 기준 또는 대조군에 비해 약 또는 적어도 약 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 또는 1000배, 또는 약 또는 적어도 약 5%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18% , 19%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100%, 200%, 300%, 400%, 500%, 600%, 700%, 800%, 900%, 1000%인 증가를 포함할 수 있다 (모든 정수 및 그 사이의 범위 포함). "감소된" 또는 "감소된" 양은 통상적으로 "통계적으로 유의한" 양이며, 기준 또는 대조군에 비해 약 또는 적어도 약 1.2, 1.4, 1.6, 1.8, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 1000배, 또는 약 또는 적어도 약 5%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18% , 19%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 100%, 200%, 300%, 400%, 500%, 600%, 700%, 800%, 900%, 1000%인 감소를 포함할 수 있다 (모든 정수 및 그 사이의 범위 포함).

용어 "폴리뉴클레오티드" 및 "핵산"은 mRNA, RNA, cRNA, cDNA, 및 게놈 DNA를 포함하는 DNA를 포함한다. 이 용어는 일반적으로 리보뉴클레오티드 또는 데옥시뉴클레오티드인, 적어도 10 염기 길이인 뉴클레오티드의 고분자 형태, 또는 뉴클레오티드의 어느 한 유형의 변형된 형태를 지칭한다. 상기 용어는 DNA의 단일 및 이중 가닥 형태를 포함한다.

"유전자"는 염색체 상의 특정 위치를 차지하고 기능성 분자 또는 단백질을 암호화하는 DNA의 서열로 이루어진 유전 단위를 지칭한다. 유전자의 구조는 실제 단백질 코딩 서열이 종종 작은 부분인 많은 요소로 이루어진다. 이들 요소는 RNA의 미번역 영역뿐만 아니라 전사되지 않은 DNA 영역을 포함한다. 또한, 유전자는 코딩 서열의 많은 킬로염기 상류 또는 하류에 놓여 있는 발현-변경 조절 영역을 가질 수 있다. 유전자 내의 정보는 또한 RNA 또는 암호화된 단백질의 서열에 의해 표현될 수 있다(또는 그 안에서 발견될 수 있다).

"대상체(subject)" 또는 "이를 필요로 하는 대상체"는 인간 대상체와 같은 포유류 대상체를 포함한다.

"통계적으로 유의미하다(statistically significant)"는 것은 결과가 우연히 발생했을 가능성이 낮음을 의미한다. 통계적 유의성은 당업계에 공지된 임의의 방법에 의해 결정될 수 있다. 일반적으로 사용되는 유의성 척도는 p-값을 포함하며, 이는 영 가설(null hypothesis)이 참인 경우, 관찰된 이벤트가 발생할 빈도 또는 확률이다. 수득된 p-값이 유의 수준보다 작은 경우, 영 가설이 기각된다. 간단한 경우에, 유의 수준은 0.05 이하의 p-값으로 정의된다.

"실질적으로" 또는 "필수적으로"는 거의 전체적으로 또는 완전히, 예를 들어, 일부 주어진 양의 95% 이상을 의미한다.

"치료적 반응(therapeutic response)"은 치료 반응의 투여에 기초한 (지속 여부와 상관없이) 증상의 개선을 지칭한다.

본원에서 사용되는 바와 같이, 용어 "치료적 유효량(therapeutically effective amount)", "치료적 투여량(therapeutic dose)", "예방적 유효량(prophylactically effective amount)", 또는 "진단적 유효량(diagnostically effective amount)"은 투여 후 원하는 생물학적 반응을 유도하는 데 필요한 제제의 양이다.

본원에서 사용되는 바와 같이, 대상체(예를 들어, 인간과 같은 포유동물) 또는 세포의 "치료"는 대상체 또는 세포의 자연적인 과정(natural course)을 변경하려는 시도에 사용되는 임의의 유형의 개입이다. 치료는 약제학적 조성물의 투여를 포함하지만 이에 한정되지 않으며, 예방적으로 또는 병리학적 이벤트의 개시 또는 병인제(etiologic agent)와의 접촉 후에 수행될 수 있다. 또한, 치료 중인 질환 또는 병태의 진행 속도를 감소시키거나, 해당 질환 또는 병태의 발병을 지연시키거나, 발병의 중증도를 감소시키는 것에 대한 것일 수 있는 "예방적(prophylactic)" 치료가 포함된다. "치료" 또는 "예방"이 반드시 질환 또는 병태, 또는 이와 관련된 증상의 완전한 근절, 치유 또는 예방을 나타내는 것은 아니다.

용어 "야생형(wild-type)"은 집단에서 가장 빈번하게 관찰되고 따라서 유전자의 "정상" 또는 "야생형" 형태로 임의로 설계된 유전자 또는 유전자 산물(예: 폴리펩티드)을 지칭한다.

본 명세서의 각각의 실시예는 달리 명시적으로 언급되지 않는 한 다른 모든 실시예에 적용되어야 한다.

본 개시는, 부분적으로, 인간 악성 종양에서 MYC 유전자의 증폭 및/또는 전위가 화학요법제 YM155 모노브로마이드의 항암 효능 증가와 관련이 있고, 따라서 이 제제 및 다른 것들에 의한 암 치료를 최적화하기 위한 바이오마커로서 사용될 수 있다는 놀라운 발견에 관한 것이다.

따라서, 본 개시의 실시예들은 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료하기 위한 방법을 포함하며, 상기 방법은 (a) 상기 대상체로부터의 암 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수(copy number), 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계; 및 (b) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가되는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되는 경우, YM155 모노브로마이드[1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드]를, 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고, 이에 의해 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료한다. 특정 실시예는, 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우(예를 들어, 약 1.1배 증가와 같거나 적음), 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, YM155 모노브로마이드를 배제(또는 제외)한 화학요법제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다.

또한, 암을 앓고 있는 대상체에서, YM155 모노브로마이드[1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드]에 대한 치료 반응을 예측하기 위한 방법이 포함되며, 상기 방법은 (a) 상기 대상체로부터의 암 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계; 및 (b) (i) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가되는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되는 경우, 상기 대상체를 YM155 모노브로마이드 치료에 반응성인 것으로 특성화하는 단계; 또는 (ii) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우(예를 들어, 약 1.1배 증가와 같거나 적음), 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, 상기 대상체를 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화하는 단계를 포함하고, 이에 의해 암을 앓고 있는 대상체에서 YM155 모노브로마이드에 대한 치료 반응을 예측한다. 특정 실시예는, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 반응성인 것으로 특성화되는 경우, YM155 모노브로마이드를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. 일부 실시예는, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 경우, YM155 모노브로마이드를 배제(또는 제외)한 화학요법제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다.

"MYC 유전자" 또는 "MYC 종양유전자"는 전사 인자를 암호화하는 원-종양유전자(proto-oncogene) 계열을 지칭하며, 그 예는 c-Myc(MYCC) 및 N-myc(MYCN)를 포함한다.

MYCC 유전자는 세포 주기 진행, 세포사멸 및 세포 형질전환을 담당하는 핵 인단백질을 암호화한다. 암호화된 단백질은 관련 전사 인자 MAX와 이종이량체를 형성한다. 이 복합체는 E 박스 DNA 컨센서스 서열에 결합하여 특이적 표적 유전자의 전사를 조절한다. 번역이 상류, 프레임 내 비-AUG(CUG) 및 하류 AUG 시작 자리 모두에서 개시되어, 독특한 N-말단을 가진 2개의 이소형(isoform)의 생산을 초래한다는 것을 보여주는 증거가 있다. 인간 게놈에서, MYCC 유전자는 염색체 8:127, 735, 434-127, 741, 434, 정방향 가닥에 위치한다(예를 들어, 도 5 및 도 6; 및 Gene: MYC ENSG00000136997 참조).

MYCN 유전자는 염기성 나선-루프-나선(basic helix-loop-helix, bHLH) 도메인이 있는 단백질을 암호화한다. 이는 세포 핵 속에 위치하고, 또 다른 bHLH 단백질과 이량체화하여 DNA를 결합한다. MYCN은, 예를 들어, 신경아세포종, 횡문근육종, 수모세포종, 성상세포종, 교아세포종, 망막아세포종, 전립선암, 유방암, 윌름 종양, 및 소세포 폐암을 비롯한, 다수의 상이한 유형의 암에서 과발현된다(예를 들어, Beltran, Mol Cancer Res. 12:815-822, 2014 참조). 실제로, MYCN 증식은 신경아세포종에서 유해한 예후 인자이다. 앰플리콘(amplicon)(MYCN과 공동-증식된 물질)은 대상체 간에 다양하며, 특정 경우에, 예를 들어 DDX1 유전자를 포함한다. 일부 경우에, MYCN 증식은 1p36 결실 및 염색체 17q의 획득과 상관된다. 인간 게놈에서, MYCN 유전자는 24.3 위치에서 염색체 2의 단완(short arm)(p arm) 상에 위치한다 (2p24.3에서의 세포유전학적 위치; 염색체 2 위의 염기쌍 15,940,438 내지 15,947,007에서의 분자 위치; 또한 도 8 참조).

따라서, 특정 실시예에서, MYC 유전자는 MYCC 및 MYCN으로부터 선택된다.

"YM155 모노브로마이드(YM155 monobromide)"는 분자식 C₂₀H₁₉N₄O₃·Br, 및 CAS 번호 781661-94-7을 갖는, 소분자 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드]를 지칭하며, 이의 약제학적으로 허용 가능한 염 및 산을 포함한다. YM155 모노브로마이드의 생물학적으로 활성이거나 균등한 유사체 및/또는 유도체가 또한 포함된다.

위에서 언급한 바와 같이, 일부 경우에, 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수는 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가된다. 특정 실시예에서, 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수는 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 통계적으로 유의한 양만큼 증가된다. 일부 실시예에서, 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수는 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 약 또는 적어도 약 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10배 (또는 그 이상)만큼 증가된다.

암 조직 내 MYC 유전자 복제 수는 임의의 다양한 방법에 의해 결정될 수 있다. 예를 들어, 일부 실시예에서, MYC 유전자 복제 수는 어레이 비교 게놈 혼성화(aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 어레이, 복제 수 변이(CNV) 시퀀싱, 또는 다중 결찰 의존 프로브 증폭(MLPA)에 의해 결정된다. 따라서, 특정 실시예는 이를 필요로 하는 대상체의 암 조직의 시료에서 MYC 유전자의 복제 수를 결정하거나 검출하는 단계를 포함한다. 또한, 암 조직 시료 내의 MYC 유전자의 복제 수를 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수 대비 비교하는 단계가 포함된다.

암 조직 내의 MYC 유전자 염색체 위치 자리는 임의의 다양한 방법에 의해 결정될 수 있다. 예를 들어, 일부 실시예에서, 암 조직 내의 MYC 유전자 염색체 위치 자리는 원위치 혼성화(ISH), 형광 원위치 혼성화(FISH), 차세대 시퀀싱(NGS), 또는 비교 게놈 혼성화(CGH)에 의해 결정된다. 따라서, 특정 실시예는 이를 필요로 하는 대상체의 암 조직 시료에서 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하거나 검출하는 단계를 포함한다. 또한, 암 조직 내의 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 MYC 유전자 염색체 자리 기준의 위치 자리 대비 비교하는 단계가 포함된다.

CGH는, 세포를 배양할 필요 없이, 기준 시료와 비교하여 시험 시료의 DNA에서의 배수성(ploidy) 수준 대비 복제 수 변이(CNV)를 분석하기 위한 분자 세포유전학적 방법을 지칭한다. 이 기술은 가장 자주 밀접하게 관련된, 2개의 소스로부터 발생하는 2개의 게놈 DNA 시료 간의 신속하고 효율적인 비교를 가능하게 하는데, 이는 이들이 전체 염색체 또는 하위 염색체 영역(전체 염색체의 일부분)의 획득 또는 손실의 측면에서 차이를 포함하는 것으로 의심되기 때문이다. 이 기술은 원래 고형 종양과 정상 조직의 염색체 보체 간의 차이를 평가하기 위해 개발되었다(예를 들어, Kallioniemi 등, 258 (5083): 818-821, 1992 참조). CGH 기법과 함께 DNA 마이크로어레이를 사용함으로써, 보다 특이적인 형태의 어레이 CGH(aCGH)가 개발되었으며, 100 킬로염기만큼 낮은 해상도 증가로 CNV의 유전자좌별 측정을 가능하게 하였다(예를 들어, Pinkel, Annu Rev Genom Hum Genet. 6:331-354, 2005 참조). CNV는 세포에서 큰 게놈 영역의 비정상적인 복제 수로 이어지는 중요한 유전적 변이의 흔한 형태이며, 고해상도 서열 데이터는 차세대 시퀀싱(NGS)에 의해 분석되어 이를 식별할 수 있다(예를 들어, Zhao 등, BMC Bioinformatics. 14 Suppl 11:S1, 2013 참조). MLPA는 단일 프라이머 쌍으로만 다수의 표적의 증폭을 허용하는 다중 중합효소 연쇄 반응의 변이를 지칭한다(예를 들어, Schouten 등, Nucleic Acids Res. 30 (12): e57, 2002 참조). 원위치 혼성화(ISH) 및 형광 원위치 혼성화(FISH)는, 표지된 상보적 DNA, RNA 또는 변형된 핵산 가닥(즉, 프로브)을 사용하여 특정 DNA 또는 RNA 서열을 조직의 일부 또는 부분(원위치)에 국소화하는 혼성화 유형을 지칭한다(예를 들어, Parra & Windle, Nature Genetics. 5:17-21, 1993; 및 Gall & Pardue, PNAS USA. 63: 378-383, 1969 참조). 따라서, 일부 경우에, 본원에 기술된 방법 및 키트는 전술한 기술 중 임의의 하나 이상을 채택하고/하거나 이를 수행하기 위한 시약을 포함한다.

"기준(reference)"의 예(예를 들어, MYC 유전자 복제 수 "기준", MYC 유전자 염색체 자리 "기준")는 데이터베이스로부터 수득된 값 또는 양 또는 위치, 예를 들어, "야생형" MYC 유전자 복제 수 또는 "야생형" MYC 유전자 염색체 위치 자리의 값 또는 양, (예를 들어, 인간 MYCC 유전자 염색체 자리 기준의 경우 도 5 및 도 6; 및 인간 MYCN 유전자 염색체 자리 기준의 경우 도 8 참조)를 포함한다. "기준"은 또한 하나 이상의 대조군으로부터의 비-암성 조직, 예를 들어, 하나 이상의 건강한 또는 비-암성 대조군 대상체(예를 들어, 건강한 또는 비-암성 대조군 대상체의 모집단), 또는 시험 중인 대상체로부터의 하나 이상의 상응하는 비-암성 대조군 조직으로부터 수득된 값 또는 양 또는 위치를 포함한다. 일반적으로, "상응하는" 비-암성 대조군 조직은 시험 중인 암 조직과 동일한 유형의 조직으로부터 수득된다. 암 조직과 마찬가지로, 비-암성 대조군으로부터의 MYC 유전자 복제 수 기준은, 예를 들어, aCGH, SNP 어레이, CNV 서열, 및/또는 MLPA(전술함)를 포함하는 임의의 다양한 방법에 의해 결정될 수 있다. 유사하게, 비-암성 대조군으로부터의 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준은, 예를 들어, ISH, FISH, NGS, 및/또는 CGH(전술함)를 포함하는 임의의 다양한 방법에 의해 결정될 수 있다.

일부 실시예에서, 암 조직(또는 비-암성 대조군 조직)의 시료는 대상체로부터의 수술 시료, 생검 시료, 흉수 시료, 또는 복수액 시료다. 암 조직(또는 비-암성 대조군 조직)의 시료의 특정 예는 폐, 혈액, 유방, 위장(위, 결장, 직장), 난소, 췌장, 간, 방광, 경부, 신경, 자궁, 침샘, 신장, 전립선, 갑상선, 또는 근육 조직을 포함한다. 특정 실시예는, 예를 들어 MYC 유전자 복제 수준 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하기 전에, 대상체로부터 암 조직(또는 비-암성 대조군 조직)의 시료를 수득하는 단계를 포함한다.

일부 실시예에서, 대상체는 인간 대상체이다.

전술한 바와 같이, 특정 실시예는, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 경우, 예를 들어, 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우, 또는 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, YM155 모노브로마이드를 배제(또는 제외)한 항암제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함한다. YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 대상체에게 투여하기 위한 (YM155 모노브로마이드 이외의) 예시적인 항암제는, 예를 들어, 다양한 암의 치료에 유용한 것으로 간주된 것들과 같은, 세포독성, 화학요법 및 항혈관형성제와 같은 소분자를 포함한다. 항암제의 일반 부류는, 제한 없이, 알킬화제, 대사길항제(anti-metabolite), 안트라사이클린, 항종양 항생제, 백금, I형 국소이성화효소 억제제, II형 국소이성화효소 억제제, 빈카 알칼로이드(vinca alkaloid), 및 탁산을 포함한다.

YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 대상체에게 투여하기 위한 항암제의 특정 예는 클로람부실, 시클로포스파미드, 실렌지타이드, 로무스틴 (CCNU), 멜팔란, 프로카르바진, 티오테파, 카르무스틴 (BCNU), 엔자스타우린, 부설판, 다우노루비신, 독소루비신, 게피티닙, 엘로티닙 이다루비신, 테모졸로마이드, 에피루비신, 미톡산트론, 블레오마이신, 시스플라틴, 카보플라틴, 옥살리플라틴, 캠프토테신, 이리노테칸, 토포테칸, 암사크린, 에토포시드, 에토포시드 포스페이트, 테니포시드, 템시롤리무스, 에베롤리무스, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 비노렐빈, 빈데신, CT52923, 및 파클리탁셀, 및 상기 중 어느 하나의 약제학적으로 허용 가능한 염, 산 또는 유도체를 포함한다. 항암제의 추가 예는 이마티닙, 크리조티닙, 다사티닙, 소라페닙, 파조파닙, 수니티닙, 바탈라닙, 게프티닙, 엘로티닙, AEE-788, 디코로아세테이트, 타목시펜, 파수딜, SB-681323, 및 세막사닙(SU5416)을 포함한다(Chico 등, Nat Rev Drug Discov. 8:829-909, 2009 참조).

YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 대상체에게 투여하기 위한 항암제의 추가의 예는 알킬화제, 예컨대 티오테파, 시클로포스파미드 (CYTOXAN™); 알킬 술포네이트, 예컨대 부설판, 임프로설판 및 피포설판; 아지리딘, 예컨대 벤조도파, 카르보쿠온, 메투레도파, 및 우레도파; 에틸렌이민 및 메틸아멜아민, 예를 들면 알트레타민, 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포라미드, 트리에틸렌티오포스파오르아미드 및 트리메틸올로멜라민; 질소 머스타드, 예컨대 클로람부실, 클로르나파진, 콜로포스파미드, 에스트라무스틴, 이포스파미드, 메클로레타민, 메클로레타민 옥사이드 하이드로클로라이드, 멜팔란, 노벰비친, 펜에스테린, 프레드니무스틴, 트로포스파미드, 우라실 머스타드; 니트로우레아, 예컨대 카르무스틴, 클로로조토신, 포테무스틴, 로무스틴, 니무스틴, 라니무스틴; 항생제, 예컨대 아클라시노마이신, 악티노마이신, 오트라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 칼리키아마이신, 카라비신, 카르미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이신, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르류신, 독소루비신, 에피루비신, 에소루비신, 이다루비신, 마르셀로마이신, 미토마이신, 마이코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 페플로마이신, 포트피로마이신, 퓨로마이신, 쿠엘라마이신, 로도루비신, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 투베르시딘, 우베니멕스, 지노스타틴, 조루비신; 대사길항제, 예컨대 메토트렉세이트 및 5-플루오로우라실(5-FU); 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린, 메토트렉세이트, 프테로프테린, 트리메트렉세이트; 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈, 6-메르캅토푸린, 티아미프린, 티오구아닌; 피리미딘 유사체, 예컨대 아시타빈, 아자시티딘, 6-아자우리딘, 카르모퍼, 시타라빈, 디데옥시우리딘, 독시플루리딘, 에노시타빈, 플록수리딘, 5-FU; 안드로겐, 예컨대 칼루스테론, 드로모스타놀론 프로피오네이트, 에피티오스탄올, 메피티오스탄, 테스토락톤; 항부신제, 예컨대 아미노글루테티미드, 미토탄, 트리로스탄; 엽산 보충제, 예컨대 프롤린산; 아세글라톤; 알도포스파미드 글리코시드; 아미노레불린산; 암사크린; 베스트라부실; 비산트렌; 에다트랙세이트; 데포파민; 데메콜신; 다이아지쿠온; 엘포르미틴; 엘립티늄 아세테이트; 에토글루시드; 질산갈륨; 하이드록시우레아; 렌티난; 로니다민; 미토구아존; 미톡산트론; 모피다몰; 니트라크린; 펜토스타틴; 페나메트; 피라루비신; 포도필린산; 2-에틸하이드라지드; 프로카르바진; PSK; 라족산; 시조피란; 스피로게르마늄; 테누아존산; 트리아지쿠온; 2,2',2"-트리클로로트리에틸아민; 우레탄; 빈데신; 다카르바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미토락톨; 피포브로만 가시토신; 아라비노시드 ("Ara-C"); 시클로포스파미드; 티오테파; 탁소이드, 예: 파클리탁셀 (TAXOL®, Bristol-Myers Squibb Oncology, 뉴저지 프린스턴) 및 도세탁셀 (TAXOTERE®, Rhne-Poulenc Rorer, 프랑스 안토니); 클로람부실; 젬시타빈; 6-티오구아닌; 메르캅토푸린; 메토트랙세이트; 백금 유사체, 예컨대 시스플라틴 및 카보플라틴; 빈블라스틴; 백금; 에토포시드 (VP-16); 이포스파미드; 미토마이신 C; 미톡산트론; 빈크리스틴; 비노렐빈; 나벨빈; 노반트론; 테니포시드; 다우노마이신; 아미노프테린; 셀로다; 이반드로네이트; CPT-11; 국소이성화효소 억제제 RFS 2000; 디플루오로메틸오미틴 (DMFO); 레티노산 유도체, 예컨대 Targretin™ (벡사로텐), Panretin™ (알리트레티노인); ONTAK™ (데닐루킨 디프티톡스); 에스페라마이신; 카페시타빈; 및 상기 중 어느 하나의 약제학적으로 허용 가능한 염, 산 또는 유도체를 포함한다.

YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 대상체에게 투여하기 위한 항암제의 추가 예는, 예를 들어, 타목시펜, 랄로시펜, 아로마타아제 억제 4(5)-이미다졸, 4-하이드록시타목시펜, 트리옥시펜, 케옥시펜, LY117018, 오나프리스톤, 및 토레미펜 (Fareston)을 포함하는 항-에스트로겐; 및 플루타미드, 닐루타미드, 비칼루타미드, 루프롤리드, 및 고세렐린과 같은 항-안드로겐과 같은 종양에 대한 호르몬 작용을 조절하거나 억제하는 작용을 하는 항호르몬제; 및 상기 중 어느 하나의 약제학적으로 허용 가능한 염, 산 또는 유도체를 포함한다.

YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 대상체에게 투여하기 위한 항암제의 추가의 예는 항암 항체, 예컨대 3F8, 8H9, 아바고보맙, 아데카투무맙, 아푸투주맙, 알렘투주맙, 알라시주맙 (페골), 아마툭시맙, 아폴리주맙, 바비툭시맙, 벡투모맙, 벨리무맙, 베바시주맙, 비바투주맙 (메르탄신), 브렌툭시맙 베도틴, 칸투주맙 (메르탄신), 칸투주맙 (라브탄신), 카프로맙 (펜데티드), 카투막소맙, 세툭시맙, 시타투주맙 (보가톡스), 식수투무맙, 클리바투주맙 (테트라크세탄), 코나투무맙, 다세투주맙, 달로투주맙, 데투모맙, 드로지투맙, 에크로멕시맙, 에드레콜로맙, 엘로투주맙, 에나바투주맙, 엔시툭시맙, 에프라투주맙, 에르투막소맙, 에타라시주맙, 파렐투주맙, FBTA05, 피기투무맙, 플란보투맙, 갈릭시맙, 겜투주맙, 가니투맙, 겜투주맙 (오조가마이신), 기렌툭시맙, 글렘바투무맙 (베도틴), 이브리투모맙 티우크세탄, 이크루쿠맙, 이고보맙, 인다툭시맙 라브탄신, 인테투무맙, 이노투주맙 오조가마이신, 이필리무맙 (MDX-101), 이라투무맙, 라베투주맙, 렉사투무맙, 린투주맙, 로보투주맙 (메르탄신), 루카투무맙, 루밀릭시맙, 마파투무맙, 마투주맙, 밀라투주맙, 미투모맙, 모가물리주맙, 목세투모맙 (파스우도톡스), 나콜로맙 (타페나톡스), 나프투모맙 (에스타페나톡스), 나르나투맙, 네시투무맙, 니모투주맙, 니볼루맙, Neuradiab® (방사성 요오드가 있거나 없음), NR-LU-10, 오파투무맙, 올라투맙, 오나르투주맙, 오포르투주맙 (모나톡스), 오레고보맙, 파니투무맙, 파트리투맙, 펨투모맙, 페르투주맙, 프리투무맙, 라코투모맙, 라드레투맙, 라무시루맙, 릴로투무맙, 리툭시맙, 로바투무맙, 사말리주맙, 시브로투주맙, 실툭시맙, 타발루맙, 타플리투모맙 (파프톡스), 테나토모맙, 테프로투무맙, TGN1412, 티시리무맙, 트레멜리무맙, 티가투주맙, TNX-650, 토시투모맙, TRBS07, 트라스투주맙, 투코투주맙 (셀모루킨), 우블리툭시맙, 우렐루맙, 벨투주맙, 볼로식시맙, 보투무맙, 및 잘루투무맙을 포함한다. 이들 항체의 단편, 변이체 및 유도체가 또한 포함된다.

본원에 기술된 방법은 임의의 다양한 암 또는 종양의 치료 및/또는 진단에 사용될 수 있다. 일부 실시예에서, 암은 원발성 암, 즉 종양 진행이 시작되어 암성 종괴를 생성한 해부학적 부위에서 성장하는 암이다. 일부 실시예에서, 암은 이차 또는 전이성 암, 즉 원발 부위 또는 기원 조직에서 하나 이상의 상이한 부위 또는 조직으로 퍼진 암이다. 일부 경우에, 암은 암종, 육종, 예컨대 횡문근육종(rhabdomyosarcoma), 예를 들어, 폐포 횡문근육종 (뼈, 힘줄, 연골, 근육, 지방(fat), 섬유성, 혈관, 지방(adipose), 및/또는 결합 조직에서 기원하는 육종 포함), 신경아세포종, 수모세포종, 성상세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 골수종, 백혈병, 림프종(호지킨 림프종 및 비호지킨 림프종 포함), 선편평세포 암종, 암육종, 혼합 중배엽성 종양, 기형암종, 폐암(비소세포 폐암, 소세포 폐암, 선암종, 및 폐의 편평세포 암종 포함), 유방암(전이성 유방암 포함), 위장암, 위암, 대장암, 결장암, 직장암, 난소암, 췌장암, 간암, 방광암, 자궁경부암, 교아세포종, 자궁 암종, 침샘 암종, 신장암 또는 신암(예를 들어, 윌름 종양), 전립선암, 갑상선암, 및 두경부암 중 하나 이상으로부터 선택된다.

구체적인 실시예에서, MYC 유전자는 MYCC이고, 암은 폐암 및 혈액암, 임의로 백혈병 및 림프종으로부터 선택된다. 구체적인 실시예에서, MYC 유전자는 MYCN이고, 암은 신경아세포종, 소세포 폐암, 전립선암, 폐포 횡문근육종, 수모세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종 및 유방암으로부터 선택된다.

일부 실시예에서, 전술한 바와 같이, 암 또는 종양은 전이성 암이다. 상기 암에 더하여, 예시적인 전이성 암은 다음을 포함하지만, 이들에 제한되지 않는다: 특히, 뼈, 간, 및/또는 폐로 전이된 방광암; 뼈, 간, 및/또는 폐로 전이된 유방암; 간, 폐 및/또는 복막으로 전이된 결장암; 부신, 뼈, 뇌, 간, 및/또는 폐로 전이된 신장암; 부신, 뼈, 뇌, 간, 및/또는 기타 폐 부위로 전이된 폐암; 뼈, 뇌, 간, 폐, 및/또는 피부/근육으로 전이된 흑색종; 간, 폐, 및/또는 복막으로 전이된 난소암; 간, 폐, 및/또는 복막으로 전이된 췌장암; 부신, 뼈, 간, 및/또는 폐로 전이된 전립선암; 간, 폐, 및/또는 복막으로 전이된 위암; 뼈, 간, 및/또는 폐로 전이된 갑상선암; 및 뼈, 간, 폐, 복막, 및/또는 질로 전이된 자궁암을 포함한다.

특정 실시예에서, 본원에 기술된 방법은 생존 가능한 종양의 양의 통계적으로 유의한 감소, 예를 들어, 종양 질량의 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50% 또는 그 이상의 감소, 또는 변경된(예를 들어, 통계적 유의성에 따라 감소된) 스캔 치수로 표시되는 바와 같이, 종양 퇴화를 초래하기에 충분하다. 특정 실시예에서, 기술된 방법은 안정 질환(stable disease)을 초래하기에 충분하다. 특정 실시예에서, 본원에 기술된 방법은 숙련된 임상의에게 알려진 특정 질환 표시의 증상에 있어서 임상적으로 관련 있는 감소를 초래하기에 충분하다.

암을 치료하기 위한 방법은 다른 치료 방법과 병용될 수 있다. 예를 들어, 본원에 기술된 병용 요법은 대증 치료, 방사선요법, 수술, 이식, 호르몬 요법, 광역학적 요법(photodynamic therapy), 항생제 요법, 또는 이들의 임의의 조합을 포함하는, 다른 치료적 개입의 이전, 도중, 또는 이후에 대상체에게 투여될 수 있다. 대증 치료에는 뇌 부종, 두통, 인지 기능이상 및 구토를 감소시키기 위한 코르티코스테로이드 투여, 및 발작을 감소시키기 위한 항경련제 투여가 포함된다. 방사선요법은 전뇌 방사선 조사, 분할 방사선요법, 및 방사선 수술, 예컨대 정위 방사선수술을 포함하며, 이는 전통적인 수술과 추가로 병용될 수 있다.

본원에 기술된 질환 또는 병태 중 하나 이상을 갖는 대상체를 식별하기 위한 방법은 당업계에 공지되어 있다.

생체 내 용도의 경우, 예를 들어, 인간 질환 치료 또는 시험을 위해, 본원에 기술된 제제는 일반적으로 투여 전에 하나 이상의 치료적 또는 약제학적 조성물에 통합된다.

치료적 또는 약제학적 조성물을 제조하기 위해, 하나 이상의 제제의 유효량 또는 원하는 양은 일반적으로 특정 제제 및/또는 투여 방식에 적합한 것으로 당업자에게 알려진 임의의 약제학적 담체(들) 또는 부형제와 혼합된다. 약제학적 담체는 액체, 반-액체 또는 고체일 수 있다. 비경구, 피내, 피하 또는 국소 적용에 사용되는 용액 또는 현탁액은 다음을 포함할 수 있다: 예를 들어, 멸균 희석제(예컨대, 물), 식염수 용액(예를 들어, 인산염 완충 식염수; PBS), 고정 오일, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 다른 합성 용매; 항균제(예컨대, 벤질 알코올 및 메틸 파라벤); 항산화제(예컨대, 아스코르브산 및 중아황산나트륨) 및 킬레이트제(예컨대, 에틸렌디아민테트라아세트산(EDTA)); 완충제(예컨대, 아세트산염, 시트르산염 및 인산염). 정맥 내(예를 들어, IV 주입에 의해) 투여되는 경우, 적절한 담체는 생리식염수 또는 인산염 완충 식염수(PBS) 및 증점제 및 용해화제, 예컨대 포도당, 폴리에틸렌 글리콜, 폴리프로필렌 글리콜 및 이들의 혼합물을 함유하는 용액을 포함한다.

순수한 형태 또는 적절한 치료적 또는 약제학적 조성물로, 본원에 기술된 제제의 투여는 유사한 유틸리티를 제공하기 위한 허용되는 제제의 투여 모드 중 어느 하나를 통해 수행될 수 있다. 치료적 또는 약제학적 조성물은 제제-함유 조성물을 적절한 생리학적으로 허용 가능한 담체, 희석제 또는 부형제와 조합함으로써 제조될 수 있고, 정제, 캡슐, 분말, 과립, 연고, 용액, 좌제, 주사제, 흡입제, 겔, 미소구체 및 에어로졸과 같은, 고체, 반고체, 액체 또는 기체 형태의 조제물로 제형화될 수 있다. 또한, 다른 약제학적 활성 성분(본원의 다른 곳에서 기술된 바와 같은 다른 소분자를 포함함) 및/또는 염, 완충제 및 안정화제 같은 적절한 부형제가 조성물 내에 존재할 수 있지만, 반드시 그럴 필요는 없다.

투여는 경구, 비경구, 비강, 정맥 내, 피내, 근육 내, 피하 또는 국소를 포함하는, 다양한 상이한 경로에 의해 달성될 수 있다. 바람직한 투여 모드는 치료 또는 예방될 병태의 성질에 따라 달라진다. 특정 실시예는 IV 주입에 의한 투여를 포함한다.

담체는, 예를 들어, 사용된 용량 및 농도에서 노출되는 세포 또는 포유동물에 비독성인 약제학적으로 또는 생리학적으로 허용 가능한 담체, 부형제, 또는 안정화제를 포함할 수 있다. 종종 생리학적으로 허용 가능한 담체는 pH 완충 수용액이다. 생리학적으로 허용 가능한 담체의 예는 완충제, 예컨대 인산염, 시트르산염, 및 기타 유기산; 항산화제, 예컨대 아스코르브산; 저 분자량(약 10개 미만의 잔기) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 고분자, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 아르기닌 또는 라이신; 단당류, 이당류, 및 기타 탄수화물, 예를 들어 포도당, 만노오스, 또는 덱스트린; 킬레이트제, 예컨대 EDTA; 당 알코올, 예컨대 만니톨 또는 소르비톨; 염 형성 반대이온, 예컨대 나트륨; 및/또는 비이온성 계면활성제, 예컨대 폴리소르베이트 20 (TWEEN™) 폴리에틸렌 글리콜 (PEG), 및 폴록사머 (PLURONICS™), 및 기타 등등을 포함한다.

일부 실시예에서, 하나 이상의 제제는, 예를 들어, 코아세르베이션 기법(coacervation technique)에 의해 또는 계면 중합화(예를 들어, 하이드록시메틸셀룰로오스 또는 젤라틴-마이크로캡슐 및 폴리-(메틸메타실레이트)마이크로캡슐 각각)에 의해 제조된 마이크로캡슐에, 콜로이드 약물 전달 시스템(예를 들어, 리포좀, 알부민 미소구체, 마이크로에멀전, 나노-입자 및 나노캡슐)에, 또는 매크로에멀전에 포획될 수 있다. 이러한 기법들은 Remington's Pharmaceutical Sciences, 제16 판, Oslo, A., Ed., (1980)에 개시되어 있다. 입자(들) 또는 리포좀은 다른 치료제 또는 진단제를 추가로 포함할 수 있다.

정확한 용량 및 치료 기간은 치료 대상 질환의 함수이며, 공지된 시험 프로토콜을 사용하거나 당업계에 공지된 모델 시스템에서 조성물을 시험하고 이로부터 외삽함으로써 경험적으로 결정될 수 있다. 제어된 임상 시험도 수행될 수 있다. 용량은 완화될 병태의 중증도에 따라 달라질 수도 있다. 약제학적 조성물은 바람직하지 않은 부작용을 최소화하면서 치료적으로 유용한 효과를 발휘하도록 일반적으로 제형화되고 투여된다. 조성물은 1회 투여되거나, 일정 시간 간격으로 투여될 보다 적은 투여량 수로 나누어질 수 있다. 임의의 특정 대상체의 경우, 특정 용량 요법은 개별적인 필요에 따라 시간에 걸쳐 조정될 수 있다.

따라서, 이들 및 관련 치료적 또는 약제학적 조성물을 투여하는 일반적인 경로는, 제한 없이, 경구, 국소, 경피, 흡입, 비경구, 설하, 구강, 직장, 질 및 비강내를 포함한다. 본원에서 사용되는 바와 같이 비경구라는 용어는 피하 주사, 정맥내, 근육내, 흉골내 주사 또는 주입 기법을 포함한다. 본 개시의 특정 실시예에 따른 치료적 또는 약제학적 조성물은, 대상체 또는 환자에게 조성물을 투여할 때, 그 안에 함유된 활성 성분이 생체 이용 가능하게 되도록 제형화된다. 대상체 또는 환자에게 투여될 조성물은 하나 이상의 용량 단위의 형태를 취할 수 있으며, 여기서, 예를 들어, 정제는 단일 용량 단위일 수 있고, 에어로졸 형태의 본원에 기술된 제제의 용기는 복수의 용량 단위를 보유할 수 있다. 이러한 용량 형태를 제조하는 실제 방법은 본 기술 분야의 숙련자에게 공지되어 있거나 명백할 것이며, 예를 들어, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 제20판 (Philadelphia College of Pharmacy and Science, 2000)를 참조한다. 투여될 조성물은 일반적으로 관심 질환 또는 병태의 치료를 위해, 본원에 기술된 제제의 치료적 유효량을 함유할 것이다.

치료적 또는 약제학적 조성물은 고체 또는 액체의 형태일 수 있다. 일 실시예에서, 담체(들)는 미립자이므로, 조성물은, 예를 들어, 정제 또는 분말 형태이다. 담체(들)는 액체일 수 있으며, 이때 조성물은 예를 들어, 흡입성 투여에서 유용한, 구강용 오일, 주사형 액체 또는 에어로졸이다. 경구 투여용으로 의도되는 경우, 약제학적 조성물은 바람직하게는 고체 또는 액체 형태이며, 여기서 반-고체, 반-액체, 현탁액 및 겔 형태가 본원에서 고체 또는 액체 중 어느 하나로 간주되는 형태 내에 포함된다. 특정 실시예는 멸균, 주사 가능한 용액을 포함한다.

경구 투여용 고체 조성물로서, 약제학적 조성물은 분말, 과립, 압축된 정제, 알약, 캡슐, 츄잉 검, 웨이퍼 등으로 제형화될 수 있다. 이러한 고체 조성물은 일반적으로 하나 이상의 불활성 희석제 또는 식용 담체를 함유할 것이다. 추가적으로, 다음 중 하나 이상이 존재할 수 있다: 카르복시메틸셀룰로오스, 에틸 셀룰로오스, 미세결정 셀룰로오스, 검 트라가칸트 또는 젤라틴과 같은 결합제(binder); 전분, 유당, 덱스트린과 같은 부형제, 알긴산, 알긴산 나트륨과 같은 붕해제, 프리모겔(Primogel), 옥수수 전분 등등; 마그네슘 스테아레이트 또는 스테로텍스(Sterotex)와 같은 윤활제(lubricant); 콜로이드성 이산화 규소와 같은 유동화제(glidant); 수크로오스 또는 사카린과 같은 감미제(sweetening agent); 페퍼민트, 살리실산 메틸, 또는 오렌지향과 같은 향미제; 및 착색제. 약제학적 조성물이 캡슐, 예를 들어 젤라틴 캡슐의 형태인 경우, 상기 유형의 재료 이외에, 폴리에틸렌 글리콜 또는 오일과 같은 액체 담체를 함유할 수 있다.

치료적 또는 약제학적 조성물은 액체, 예를 들어, 엘릭시르, 시럽, 용액, 유화액 또는 현탁액의 형태일 수 있다. 액체는 두가지 예로서, 경구 투여용 또는 주사 전달용일 수 있다. 경구 투여용으로 의도되는 경우, 바람직한 조성물은 본 화합물들에 더하여, 감미제, 보존제, 염료/색소 및 향미제 중 하나 이상을 함유한다. 주사에 의해 투여되도록 의도된 조성물에는, 계면활성제, 보존제, 습윤제, 분산제, 현탁제, 완충제, 안정화제 및 등장제 중 하나 이상이 포함될 수 있다.

액체 치료적 또는 약제학적 조성물은, 이들이 용액, 현탁액 또는 기타 유사한 형태이든지 간에, 다음의 보강제(adjuvant) 중 하나 이상을 포함할 수 있다: 주사용수와 같은 멸균 희석제, 식염수, 바람직하게는 생리식염수, 링거 액, 등장성 염화나트륨, 용매 또는 현탁 매질로서 작용할 수 있는 합성 모노 또는 디글리세리드와 같은 고정 오일, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 다른 용매; 항균제, 예컨대 벤질 알코올 또는 메틸 파라벤; 항산화제, 예컨대 아스코르브산 또는 중아황산나트륨; 킬레이트제, 예컨대 에틸렌디아민테트라아세트산; 완충제, 예컨대 아세트산염, 시트르산염 또는 인산염 및 염화나트륨 또는 덱스트로스와 같은 등장성 조절을 위한 제제. 비경구 제제는 유리 또는 플라스틱으로 만들어진 앰플, 일회용 주사기 또는 다회 투여량 바이알에 봉입될 수 있다. 생리식염수는 바람직한 보강제이다. 주사 가능한 약제학적 조성물은 바람직하게는 멸균 상태다.

비경구 또는 경구 투여용으로 의도된 액체 치료적 또는 약제학적 조성물은 적절한 용량이 수득될 수 있도록 하는 제제의 양을 함유해야 한다. 통상적으로, 이 양은 조성물 내의 관심 제제의 적어도 0.01%이다. 경구 투여용으로 의도되는 경우, 이 양은 조성물의 중량의 0.1 내지 약 70%가 되도록 변화될 수 있다. 소정의 경구 치료적 또는 약제학적 조성물은 약 4% 내지 약 75%의 관심 제제를 함유한다. 소정의 실시예에서, 본 발명에 따른 치료적 또는 약제학적 조성물 및 조제물은 희석 전에 비경구 용량 단위가 0.01 내지 10 중량%의 관심 약제를 함유하도록 제조된다.

치료적 또는 약제학적 조성물은 고체 또는 액체 용량 단위의 물리적 형태를 변형시키는, 다양한 물질을 포함할 수 있다. 예를 들어, 조성물은 활성 성분 주위에 코팅 껍질을 형성하는 물질을 포함할 수 있다. 코팅 껍질을 형성하는 물질은 전형적으로 불활성이며, 예를 들어, 설탕, 셸락, 및 다른 장내 코팅제로부터 선택될 수 있다. 대안적으로, 활성 성분은 젤라틴 캡슐에 싸일 수 있다. 고체 또는 액체 형태의 치료적 또는 약제학적 조성물은 제제에 결합하여 화합물의 전달을 돕는 성분을 포함할 수 있다. 이러한 용량으로 작용할 수 있는 적합한 성분은 단클론 또는 다클론 항체, 하나 이상의 단백질 또는 리포좀을 포함한다.

본원에 기술된 조성물은, 시간 방출 제형 또는 코팅과 같은, 체내에서 급속한 제거되지 못하게 제제를 보호하는 담체와 함께 제조될 수 있다. 이러한 담체는 이식재 및 마이크로캡슐화된 전달 시스템, 및 생분해성, 생체적합성 고분자, 예컨대 에틸렌 비닐 아세테이트, 폴리무수물, 폴리글리콜산, 폴리오르토에스테르, 폴리락트산 및 당업자에게 공지된 기타와 같지만, 이에 한정되지 않는 방출 제어형 제형을 포함한다.

치료적 또는 약제학적 조성물은 약제학 분야에 주지된 방법론에 의해 제조될 수 있다. 예를 들어, 주사에 의해 투여되도록 의도된 치료적 또는 약제학적 조성물은 용액을 형성하도록 멸균 증류수가 포함된, 염, 완충액 및/또는 안정화제 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 계면활성제를 첨가해서 균질 용액 또는 현탁액의 형성을 용이하게 할 수도 있다. 계면활성제는 수성 전달 시스템에서 제제의 용해 또는 균질한 현탁을 용이하게 하도록 제제와 비공유적으로 상호작용하는 화합물이다.

특정 실시예는, 암 조직 및 비-암성 조직을 포함하는, 대상체로부터의 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단을 포함하는, 암을 앓고 있는 대상체에서, YM155 모노브로마이드 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드] 치료에 대한 치료 반응(또는 반응성)을 결정하거나 예측하기 위한 진단 키트의 용도를 포함한다. 또한, 다음을 포함하는 환자 관리 키트가 포함된다: (a) 암 조직 및 비-암성 조직을 포함하는, 대상체로부터의 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단; 및 (b) YM155 모노브로마이드[1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드].

일부 실시예에서, MYC 유전자 복제 수를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 어레이 비교 게놈 혼성화(aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 어레이, 복제 수 변이(CNV) 시퀀싱, 및 다중 결찰 의존 프로브 증폭(MLPA) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함한다. 일부 실시예에서, MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 원위치 혼성화(ISH), 형광 원위치 혼성화(FISH), 차세대 시퀀싱(NGS), 및 비교 게놈 혼성화(CGH) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함한다.

특정 진단용 또는 환자 관리 키트는 데이터베이스로부터 수득되거나, 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 복제 수 기준 값을 포함한다. 일부 진단용 또는 환자 관리 키트는, 데이터베이스로부터 수득되거나, 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 포함한다. 키트는 또한, 예를 들어, 대상체로부터의 암 조직 시료, 및/또는 비-암성 대조군으로부터의 MYC 유전자 복제 수 및/또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 방법에 대한 서면 지침을 포함할 수 있다.

일부 실시예에서, 진단용 또는 환자 관리 키트는 조성물(들) 및 정보 자료(들)를 위한 별도의 용기, 칸막이, 또는 구획을 포함한다. 예를 들어, 조성물(들) 또는 시약은 병, 바이알 또는 주사기에 담길 수 있고, 정보 자료(들)는 용기와 연계하여 담길 수 있다. 일부 실시예에서, 키트의 별도의 요소는 단일의 분할되지 않은 용기 내에 포함된다. 예를 들어, 조성물(들) 또는 시약은 라벨의 형태로 정보 자료를 내부에 부착한 병, 바이알 또는 주사기에 함유된다. 일부 실시예에서, 키트는 각각 YM155 모노브로마이드의 하나 이상의 조성물, 시약, 및/또는 단위 용량 형태를 각각 함유하는, 복수의(예: 팩) 개별 용기를 포함한다. 예를 들어, 키트는 YM155 모노브로마이드의 시약 또는 단일 단위 투여량을 각각 함유하는, 복수의 주사기, 앰플, 호일 패킷 또는 블리스터 팩을 포함한다. 키트의 용기는 기밀, 방수 (예를 들어, 수분 변화 또는 증발에 대해 불투과성임), 및/또는 빛-차단성일 수 있다.

환자 관리 키트는 제제(들)의 투여에 적합한 장치, 예를 들어, 주사기, 흡입기, 점적기(예를 들어, 점안액), 면봉(예를 들어, 면봉 또는 나무 면봉), 또는 임의의 이러한 전달 장치를 선택적으로 포함한다. 일부 실시예에서, 장치는 제제(들)의 계량된 투여량을 분배하는 이식형 장치이다. 예를 들어, 본원에 기술된 구성요소를 조합함으로써, 키트를 제공하는 방법이 또한 포함된다.

특정 측면들에서, 본원에 기술된 진단 또는 치료 반응 시험 또는 방법은 진단 실험실에서 수행되며, 그런 다음 결과가 대상체에게 제공되거나, 대상체의 건강관리 및 암 치료를 담당하는 의사 또는 다른 의료 제공자에게 제공된다. 따라서, 특정 실시예는 반응성 시험의 결과를 이를 필요로 하는 대상체에게, 또는 의사 또는 다른 의료 제공자에게 제공하기 위한 방법을 포함한다. 이들 결과 또는 데이터는 하드 카피 또는 종이 카피 형태, 또는 컴퓨터 판독가능 매체와 같은 전자 형태일 수 있다.

본 명세서에 인용된 모든 간행물, 특허 출원, 및 등록 특허는 마치 각각의 개별 간행물, 특허 출원, 또는 등록 특허가 구체적으로 그리고 개별적으로 참조로서 원용되는 것으로 표시되는 것처럼 본원에 참조로서 포함된다.

비록 전술한 발명이 이해를 밝힐 목적으로 설명 및 예로서 일부 상세히 설명되었지만, 본 설명 또는 첨부된 청구범위의 사상 또는 범위를 벗어나지 않고 소정의 변경 및 변형이 이루어질 수 있다는 것이 당업자에게 자명할 것이다. 하기 예들은 단지 예시로서 제공되며, 제한적이지 않다. 당업자라면 본질적으로 유사한 결과를 얻기 위해 변경되거나 변형될 수 있는 다양한 비-주요 변수(noncritical parameter)를 쉽게 인식할 것이다.

예

예 1

암 세포주에서 YM155 모노브로마이드의 효능

다양한 암 세포주에서 YM155 모노브로마이드의 효능을 평가하고, YM155 모노브로마이드의 효능을 MYC 유전자 복제 수와 상관시키기 위해 연구를 수행하였다.

폐 세포 배양. 인간 폐암 세포주 NCI-H1975, HCC827, NCI-H226 및 HCC4006 세포를 10% 우태 혈청(GEMINI, 900-108)이 보충된 RPMI 1640(Hyclone^TM, SH30809.01B)에서 배양하였다. 배양을 5% CO₂에서 37℃에서 인큐베이션하였다. NCI-H1975, HCC827 및 NCI-H226은 중국 과학 아카데미, 상하이 생물과학 연구소(Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences)의 Cell Bank로부터 구입하였다. HCC4006은 CoBioer Biosciences Corporation(중국 난징)에서 구입하였다.

세포 처리 및 증식 분석. NCI-H1975, HCC827, NCI-H226 및 HCC4006 세포를 각각 24시간 동안 200μl 배양 배지에서 2000 세포/웰로 96-웰 플레이트(Corning-Costar, 3603)에 시딩하였다. 그런 다음, 세포들을 YM155 (50, 30, 20, 10, 2, 0.4, 0.08, 0.016 및 0.0032 nM; APExBIO, A4221) 또는 DMSO (0.1%; Amresco, 67-68-5)로 처리하였다. 72시간 인큐베이션 후, 동일한 배양 조건 하에 추가로 4시간 동안 5-에티닐-2'-데옥시우리딘(EdU, 1uM의 최종 농도; Sigma, 900584)으로 세포들을 표지하였다.

EdU로 인큐베이션한 후, 실온에서 30분 동안 포름알데히드(4%의 최종 농도; Thermo, 28908)로 세포들을 고정시켰다. 세포들을 PBS(Hyclone^TM, SH30256.01)로 2회 세척한 다음, PBS 중에서 0.5% Triton X-100 (T8787-250ML)으로 4℃에서 밤새 투과시켰다. 상청액을 폐기한 후, 세포들을 Hoechst 33342 (Invitrogen, H1399)로 실온에서 1시간 동안 인큐베이션한 다음 PBS로 2회 다시 세척하였다.

세포들을 염색 믹스 (Beijing Percans Oncology Medical Research Co., Ltd., RUO-00401#150T)로 실온에서 30분 동안 인큐베이션한 다음 PBS로 3회 세척하였다. 세포들을 PBS에 유지시키고, 실험 전체에 걸쳐 광을 차단하였다.

고함량 이미징 분석. 처리된 세포들을, Hoechst 33342 (Ex: 386nm) 및 EdU(Ex: 560nm)용 필터가 장착된 CellInsight™ CX5 고함량 스크리닝 (High-Content Screening, HSC) 플랫폼(Thermo Fisher)을 이용한 이미지 획득을 위해 스캔하였다. 총 세포 수 및 EdU-양성 세포 수를 핵 영역에서 신호 강도를 측정하여 분석하였다.

도 2에 도시된 바와 같이, YM155는 인간 폐암 세포주의 세포 증식을 억제한다. NCI-H1975, HCC827, NCI-H226 및 HCC4006을 다양한 농도의 YM155에 72시간 동안 노출시켰다. 그러나, YM155의 증식 억제 효과는 이들 세포주에서 상이하였는데, 산출된 IC₅₀은 아래 표 E1에 나타나 있다. MYC 유전자 증폭을 갖는(기준에 비해 MYC 유전자 복제 수가 증가함) NCI-H1975 및 HCC827은 MYC 유전자 증폭을 동반하지 않은 NCI-H226 및 HCC4006보다 YM155에 유의하게 더 민감하였다.

혈액 세포 배양. 인간 급성 골수성 백혈병 세포(U937 및 HL-60) 및 인간 버킷 림프종 세포(Human Burkitt's lymphoma cells)(Ramos)를 10% 우태 혈청이 보충된 RPMI 1640에서 배양하였다. 배양을 5% CO₂에서 37℃에서 인큐베이션하였다. U937 및 HL-60 세포는 중국 과학 아카데미, 상하이 생물과학 연구소의 Cell Bank로부터 구입하였다. Ramos 세포는 CoBioer Biosciences Corporation(중국 난징)으로부터 구입하였다. Ramos 세포는 IgH-c-MYC 전위 돌연변이를 보유한다.

세포 처리 및 증식 분석. U937, HL-60, 및 Ramos 세포를 YM155(200, 100, 50, 25, 12.5, 2.5, 1, 0.5nM; APExBIO, A4221) 또는 DMSO(0.1%; Amresco, 67-68-5)로 처리된 200μl 배양 배지에서 40000 세포/웰로 96-웰 플레이트(Corning-Costar, 3599)에 시딩하였다. 72시간 인큐베이션 후, 제조사의 프로토콜에 따라 XTT 검정(세포 증식 키트 II XTT, Sigma, 11465015001)에 의해 세포 증식을 측정하였다. 간략하게, YM155 처리 후, 50 μl의 XTT 표지 혼합물을 각각의 웰에 첨가한 다음, 가습된 대기에서 4시간 동안 마이크로플레이트를 인큐베이션하였다. 490nm (OD₄₉₀) 및 650nm (OD₆₅₀)에서의 파장 흡광도를 SpectraMax 190로 각각 결정하였다. IC₅₀은 OD_490- OD₆₅₀의 값으로 계산하였다.

도 3 및 도 4에 도시된 바와 같이, YM155는 인간 급성 골수성 백혈병 세포 및 인간 버킷 림프종 세포의 세포 증식을 억제한다. U937, HL-60, 및 Ramos를 다양한 농도의 YM155에 72시간 동안 노출시켰다. 그러나, YM155의 증식 억제 효과는 이들 세포주에서 상이하였는데, 산출된 IC₅₀은 표 E2에서 5 미만으로 나타났다. MYC 유전자 증폭을 갖는(기준에 비해 MYC 유전자 복제 수가 증가함) HL-60 세포 및 MYC 유전자 전위를 갖는 Ramos 세포는 MYC 유전자 증폭 또는 전위를 동반하지 않은 U937 세포보다 YM155에 더 민감하였다.

신경아세포종 세포 배양. 신경아세포종 세포주 IMR-32, NB-1, KP-N-YN, SK-N-BE, SK-N-SH, 및 SH-SY5Y 세포를 96-웰 플레이트에서 배양하고 표시된 투여량(nM)으로 YM155로 처리하였다. 인간 신경아세포종 세포주 IMR-32를 10% 우태 혈청(GEMINI, 900-108)이 보충된 MEM(Hyclone™, SH30024.01)에서 배양하고; 신경아세포종 세포주 NB-1 및 KP-N-YN을 10% 우태 혈청이 보충된 RPMI 1640(HycloneTM, SH30809.01B)에서 배양하고; 신경아세포종 세포주 SK-N-BE를 10% 우태 혈청이 보충된 F12(Gibco, 11765-054)/MEM(1:1) (HycloneTM, SH30024.01)에서 배양하고; 신경아세포종 세포주 SH-SY5Y를 10% 우태 혈청이 보충된 MEM/F12(1:1)에서 배양하고; 신경아세포종 세포주 SK-N-SH를 10% 우태 혈청이 보충된 MEM에서 배양하였다. 배양을 5% CO2에서, 37℃에서 인큐베이션하였다.

IMR-32, SH-SY5Y, 및 SK-N-SH는 중국 과학 아카데미, 상하이 생물과학 연구소의 Cell Bank로부터 구입하였다. NB-1, KP-N-YN 및 SK-N-BE 세포는 CoBioer Biosciences Corporation(중국 난징)으로부터 구매하였다.

세포 처리 및 증식 분석. IMR-32, SH-SY5Y, SK-N-SH, NB-1, KP-N-YN, 및 SK-N-BE 세포를 24시간 동안 200 μl 배양 배지에서 2000 세포/웰로 96-웰 플레이트(Corning-Costar, 3603)에 시딩하였다. 그런 다음, 세포들을 YM155(200, 100, 50, 25, 12.5, 6.25, 3.125, 1.5625 및 0.78125 nM; APExBIO, A4221) 또는 DMSO(0.1%; Amresco, 67-68-5)로 처리하였다. 72시간 인큐베이션 후, 동일한 배양 조건 하에 추가로 4시간 동안 5-에티닐-2'-데옥시우리딘(EdU, 1uM의 최종 농도; Sigma, 900584)으로 세포들을 표지하였다.

EdU로 인큐베이션한 후, 실온에서 30분 동안 포름알데히드(4%의 최종 농도; Thermo, 28908)로 세포들을 고정시켰다. 세포들을 PBS(HycloneTM, SH30256.01)로 2회 세척한 다음, PBS 중에서 0.5% Triton X-100 (T8787-250ML)으로 4℃에서 밤새 투과시켰다. 상청액을 폐기한 후, 세포들을 Hoechst 33342 (Invitrogen, H1399)로 실온에서 1시간 동안 인큐베이션한 다음 PBS로 2회 다시 세척하였다. 세포들을 염색 믹스 (Beijing Percans Oncology Medical Research Co., Ltd., RUO-00401#150T)로 실온에서 30분 동안 인큐베이션한 다음 세포들을 PBS로 3회 세척하였다. 세포들을 PBS에 유지시키고, 실험 전체에 걸쳐 광을 차단하였다.

고함량 이미징 분석. 처리된 세포들을, Hoechst33342 (Ex: 386nm) 및 EdU(Ex: 560nm)용 필터가 장착된 CellInsight™ CX5 고함량 스크리닝 (High-Content Screening, HSC) 플랫폼(Thermo Fisher)을 이용한 이미지 획득을 위해 스캔하였다. 총 세포 수 및 EdU-양성 세포 수를 핵 영역에서 신호 강도를 측정하여 분석하였다.

아래 도 7 및 표 E3에 나타낸 바와 같이, YM155는 신경아세포종 세포주의 세포 증식을 억제한다. 이는 NMYC의 복제 수 증가를 특징으로 하는, IMR-32, NB-1, KP-N-YN, 및 SK-N-BE 신경아세포종 세포주의 세포 증식을 억제하는 데 특히 효과적이다.

이들 데이터는 폐암, 혈액 세포암, 신경아세포종 등을 포함하는, 암에서 YM155 모노브로마이드 치료에 대한 반응성을 예측하는 데에 MYC 유전자 증폭(즉, 기준 대비 MYC 유전자 복제 수 증가) 및 MYC 유전자 전위가 사용될 수 있음을 예시한다.

예 2

HCC827/HCC 4006 이종이식 실험

4 내지 6주령 암컷 마우스(Balb/C-nu)를 BEIJING HFK BIOSCIENCE Co., Ltd.로부터 구입하였다. 세포 배양 배지의 세포 현탁액(HCC827 (상피 폐 선암종): 마우스당 5x10⁶/0.1ml; HCC4006: 마우스당 5x10⁶/0.1ml)을 마우스의 우측 옆구리에 피하 접종하였다. 종양 크기가 약 100mm³-150mm³에 달했을 때, 마우스를 치료군 및 대조군으로 무작위 배정하였다. 5mg/kg 또는 비히클(식염수, Shijiazhuang No.4 Pharmaceutical)에서 YM155(Biochem partner, BCP01864)을 3주에 걸쳐 5일/주 동안 1일 1회 피하 투여하였다. 마우스의 체중을 주 2회 평가하고, 표준 캘리퍼를 사용하여 종양 직경(긴 직경 및 짧은 직경)을 측정하였다. 종양 부피 = 1/2* 긴 직경* (짧은 직경)². 2주 또는 3주 관찰 후, 분석을 위해 마우스를 희생시켰다. 데이터는 도 9a 내지 도 9b 및 도 10a 내지 도 10b에 제시되어 있다.

예 3

RAMOS/U937 이종이식 실험

4 내지 6주령 암컷 마우스(RAMOS: SCID; U937: NOD/SCID)를 BEIJING HFK BIOSCIENCE Co., Ltd.로부터 구입하였다. 세포 배양 배지의 세포 현탁액(RAMOS: 마우스당 1x10⁷/0.1ml; U937: 마우스당 2x10⁶/0.1ml + 0.1ml 매트리겔)을 마우스의 우측 옆구리에 피하 접종하였다. 종양 크기가 약 100mm³-150mm³에 달했을 때, 마우스를 치료군 및 대조군으로 무작위 배정하였다. 5mg/kg 또는 비히클(식염수, Shijiazhuang No.4 Pharmaceutical)에서 YM155(Biochem partner, BCP01864)을 9일 동안 1일 1회 피하 투여하였다. 마우스의 체중을 주 2회 평가하고, 표준 캘리퍼를 사용하여 종양 직경(긴 직경 및 짧은 직경)을 측정하였다. 종양 부피=1/2* 긴 직경* (짧은 직경)². 2주 또는 3주 관찰 후, 분석을 위해 마우스를 희생시켰다. 데이터는 도 11a 내지 도 11b 및 도 12a 내지 도 12b에 제시되어 있다.

예 6

IMR-3/SH-SY5Y 이종이식 실험

4 내지 6주령 암컷 마우스(IMR-32: NOD/SCID; SH-SY5Y: Balb/C-nu)를 BEIJING HFK BIOSCIENCE Co., Ltd.로부터 구입하였다. 세포 배양 배지의 세포 현탁액(IMR-32: 마우스당 5x10⁶/0.1ml + 0.1ml 매트리겔; SH-SY5Y: 마우스당 2x10⁶/0.1ml + 0.1ml 매트리겔)을 마우스의 우측 옆구리에 피하 접종하였다. 종양 크기가 약 100mm³-150mm³에 달했을 때, 마우스를 치료군 및 대조군으로 무작위 배정하였다. 5mg/kg 또는 비히클(식염수, Shijiazhuang No.4 Pharmaceutical)에서 YM155(Biochem partner, BCP01864)을 3주에 걸쳐 5일/주 동안 1일 1회 피하 투여하였다. 마우스의 체중을 주 2회 평가하고, 표준 캘리퍼를 사용하여 종양 직경(긴 직경 및 짧은 직경)을 측정하였다. 종양 부피=1/2* 긴 직경* (짧은 직경)². 2주 또는 3주 관찰 후, 분석을 위해 마우스를 희생시켰다. 데이터는 도 13a 내지 도 13b 및 도 14a 내지 도 14b에 제시되어 있다.

Claims

이를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료하기 위한 방법으로서,
(a) 상기 대상체로부터의 암 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수(copy number), 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계; 및
(b) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가되는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되는 경우, YM155 모노브로마이드 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체를, 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하고,
이에 의해 이를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료하는, 방법.
제1항에 있어서, 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, YM155 모노브로마이드를 배제(또는 제외)한 화학요법제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는, 방법.
암을 앓고 있는 대상체에서, YM155 모노브로마이드 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체에 대한 치료 반응을 예측하기 위한 방법으로서,
(a) 상기 대상체로부터의 암 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계; 및
(b) (i) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 증가되는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되는 경우, 상기 대상체를 YM155 모노브로마이드 치료에 반응성인 것으로 특성화하는 단계; 또는
(ii) 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수가 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 실질적으로 증가되지 않는 경우, 또는 상기 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리가 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준의 위치 자리에 비해 전위되지 않는 경우, 상기 대상체를 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화하는 단계를 포함하고,
이에 의해 암을 앓고 있는 대상체에서 YM155 모노브로마이드에 대한 치료 반응을 예측하는, 방법.
제3항에 있어서, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 반응성인 것으로 특성화되는 경우, YM155 모노브로마이드를 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는, 방법.
제3항에 있어서, 대상체가 YM155 모노브로마이드 치료에 비반응성인 것으로 특성화되는 경우, YM155 모노브로마이드를 제외한 화학요법제를 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는, 방법.
제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수는 MYC 유전자 복제 수 기준의 복제 수에 비해 약 또는 적어도 약 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10배만큼 증가하는, 방법.
제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 어레이 비교 게놈 혼성화(array comparative genome hybridization, aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(single nucleotide polymorphism, SNP) 어레이, 복제 수 변이(copy number variation, CNV) 시퀀싱, 또는 다중 결찰 의존 프로브 증폭(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)에 의해 암 조직 내 MYC 유전자 복제 수를 결정하는 단계를 포함하는, 방법.
제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 원위치 혼성화(in situ hybridization, ISH), 형광 원위치 혼성화(fluorescence in situ hybridization, FISH), 차세대 시퀀싱(next generation sequencing, NGS), 또는 비교 게놈 혼성화(comparative genome hybridization, CGH)에 의해 암 조직 내 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 결정하는 단계를 포함하는, 방법.
제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 데이터베이스로부터 MYC 유전자 복제 수 기준을 수득하는 단계, 또는 선택적으로 aCGH, SNP 어레이, CNV 서열, 또는 MLPA에 의해, 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 MYC 유전자 복제 수 기준을 결정하는 단계를 포함하는, 방법.
제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 데이터베이스로부터 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 수득하는 단계, 또는 선택적으로 ISH, FISH, NGS 또는 CGH에 의해, 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 결정하는 단계를 포함하는, 방법.
제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체로부터 암 조직의 시료를 수득하는 단계를 포함하는, 방법.
제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 암 조직의 시료는 대상체로부터 수득되며, 폐, 혈액, 유방, 위장(위, 결장, 직장), 난소, 췌장, 간, 방광, 경부, 신경, 자궁, 침샘, 신장, 전립선, 갑상선 또는 근육 조직 중 하나 이상으로부터 임의로 선택되는, 수술 시료, 생검 시료, 흉수(pleural effusion) 시료, 또는 복수액(ascetic fluid) 시료인, 방법.
제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체는 인간 대상체인, 방법.
제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 암은 암종, 육종, 예컨대 횡문근육종(rhabdomyosarcoma), 예를 들어, 폐포 횡문근육종 (뼈, 힘줄, 연골, 근육, 지방(fat), 섬유성, 혈관, 지방(adipose), 및/또는 결합 조직에서 기원하는 육종 포함), 신경아세포종, 수모세포종, 성상세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 골수종, 백혈병, 림프종(호지킨 림프종 및 비호지킨 림프종 포함), 선편평세포 암종, 암육종, 혼합 중배엽성 종양, 기형암종, 폐암(비소세포 폐암, 소세포 폐암, 선암종, 및 폐의 편평세포 암종 포함), 유방암(전이성 유방암 포함), 위장암, 위암, 대장암, 결장암, 직장암, 난소암, 췌장암, 간암, 방광암, 자궁경부암, 교아세포종, 자궁 암종, 침샘 암종, 신장암 또는 신암(예를 들어, 윌름 종양), 전립선암, 갑상선암, 및 두경부암 중 하나 이상으로부터 선택되는, 방법.
제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCC 및 MYCN으로부터 선택되는, 방법.
제15항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCC이고, 상기 암은 폐암 및 혈액암, 임의로 백혈병 및 림프종으로부터 선택되는, 방법.
제15항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCN이고, 상기 암은 신경아세포종, 소세포 폐암, 전립선암, 폐포 횡문근육종, 수모세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 및 유방암으로부터 선택되는, 방법.
암 조직 및 비-암성 조직을 포함하는, 대상체로부터의 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단을 포함하는, 암을 앓고 있는 대상체에서, YM155 모노브로마이드 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체, 치료에 대한 치료 반응을 결정하기 위한 진단 키트의 용도.
제18항에 있어서, 상기 MYC 유전자 복제 수를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 어레이 비교 게놈 혼성화(aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 어레이, 복제 수 변이(CNV) 시퀀싱, 및 다중 결찰 의존 프로브 증폭(MLPA) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 용도.
제18항 또는 제19항에 있어서, 상기 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 원위치 혼성화(ISH), 형광 원위치 혼성화(FISH), 차세대 시퀀싱(NGS), 및 비교 게놈 혼성화(CGH) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 용도.
제18항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 복제 수 기준 값을 포함하는, 용도.
제18항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 포함하는, 용도.
제18항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 암은 암종, 육종, 예컨대 횡문근육종(rhabdomyosarcoma), 예를 들어, 폐포 횡문근육종 (뼈, 힘줄, 연골, 근육, 지방(fat), 섬유성, 혈관, 지방(adipose), 및/또는 결합 조직에서 기원하는 육종 포함), 신경아세포종, 수모세포종, 성상세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 골수종, 백혈병, 림프종(호지킨 림프종 및 비호지킨 림프종 포함), 선편평세포 암종, 암육종, 혼합 중배엽성 종양, 기형암종, 폐암(비소세포 폐암, 소세포 폐암, 선암종, 및 폐의 편평세포 암종 포함), 유방암(전이성 유방암 포함), 위장암, 위암, 대장암, 결장암, 직장암, 난소암, 췌장암, 간암, 방광암, 자궁경부암, 교아세포종, 자궁 암종, 침샘 암종, 신장암 또는 신암(예를 들어, 윌름 종양), 전립선암, 갑상선암, 및 두경부암 중 하나 이상으로부터 선택되는, 용도.
제18항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCC 및 MYCN으로부터 선택되는, 용도.
제24항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCC이고, 상기 암은 폐암 및 혈액암, 임의로 백혈병 및 림프종으로부터 선택되는, 용도.
제24항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCN이고, 상기 암은 신경아세포종, 소세포 폐암, 전립선암, 폐포 횡문근육종, 수모세포종, 다형성 교아세포종, 망막아세포종, 및 유방암으로부터 선택되는, 용도.
환자 관리 키트로서,
(a) 암 조직 및 비-암성 조직을 포함하는, 대상체로부터의 조직 시료 내의, MYC 유전자 복제 수, 또는 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단; 및
(b) YM155 모노브로마이드 [1-(2-메톡시에틸)-2-메틸-4,9-디옥소-3-(피라진-2-일메틸)-4,9-디하이드로-1H-나프토[2,3-d] 이미다졸륨 브로마이드], 또는 이의 유사체 또는 유도체를 포함하는, 환자 관리 키트.
제27항에 있어서, 상기 MYC 유전자 복제 수를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 어레이 비교 게놈 혼성화(aCGH), 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP) 어레이, 복제 수 변이(CNV) 시퀀싱, 및 다중 결찰 의존 프로브 증폭(MLPA) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 환자 관리 키트.
제27항 또는 제28항에 있어서, 상기 MYC 유전자 염색체 위치 자리를 측정하기 위한 수단은 인간 MYC 유전자에 대한 원위치 혼성화(ISH), 형광 원위치 혼성화(FISH), 차세대 시퀀싱(NGS), 및 비교 게놈 혼성화(CGH) 중 하나 이상으로부터 선택된 진단 분석을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 환자 관리 키트.
제27항 내지 제29항 중 어느 한 항에 있어서, 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 복제 수 기준 값을 포함하는, 환자 관리 키트.
제27항 내지 제30항 중 어느 한 항에 있어서, 데이터베이스로부터 수득되거나 대조군으로부터의 비-암성 조직으로부터 결정된 MYC 유전자 염색체 위치 자리 기준을 포함하는, 환자 관리 키트.
제27항 내지 제31항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 MYC 유전자는 MYCC 및 MYCN으로부터 선택되는, 환자 관리 키트.