KR20190092494A - 메티오날로부터의 l-메티오닌의 제조 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 단백질생성 작용성 L-아미노산, 예컨대 L-알라닌, L-발린, L-메티오닌, L-류신, L-이소류신 또는 L-페닐알라닌의 해당 알데히드 및 이산화탄소로부터의, 특히, 3-메틸티오-프로판알 ("메티오날") 및 이산화탄소로부터의 L-메티오닌의 생촉매 합성 방법에 관한 것이다.
Description
본 발명은 단백질생성 작용성 (proteinogenic) L-아미노산, 예컨대 L-알라닌, L-발린, L-메티오닌, L-류신, L-이소류신 또는 L-페닐알라닌의 해당 알데히드 및 이산화탄소, 뿐 아니라 아미노 공여자로부터의, 특히, 3-메틸티오-프로판알 ("메티오날") 및 이산화탄소, 뿐 아니라 아미노 공여자, 예컨대 암모니아로부터의 L-메티오닌의 생촉매 합성 방법에 관한 것이다.
α-아미노산은 통상적으로 스트레커 (Strecker) 아미노산 합성에 의해 합성되고, 이는 중간체로서 α-아미노 니트릴을 유도하는 암모니아 및 포타슘 시아니드와 알데히드의 처리를 수반한다. 니트릴의 산으로의 가수분해는 α-아미노산을 산출한다. 이러한 화학 합성은 D- 및 L-아미노산의 라세미 혼합물을 제공한다. 단백질생성 작용성 α-아미노산은 또한 바람직하게는 L-아미노산을 유도하는 미생물의 발효에 의해 생성될 수 있다.
아미노산 메티오닌은 현재 다량으로 전세계에서 산업적으로 제조되고 있고, 이는 상업적으로 상당히 중요하다. 메티오닌은 다양한 분야, 예컨대 약학, 건강 및 피트니스 제품에서, 특히 다양한 가축용 다수의 사료 중 첨가제로서 이용되고, 여기서 메티오닌의 라세미 및 거울상이성질체적으로 순수한 L-입체이성질체 둘 모두가 사용될 수 있다.
산업적 규모에서, 메티오닌은 부헤러-베르그 (Bucherer-Bergs) 반응을 통해 화학적으로 제조되고, 이는 스트레커 합성의 변형이다. 개시 물질, 3-메틸티오-프로판알 ("메티오날") 은 통상적으로 프로페날 (아크롤레인) 및 메탄티올 (메틸 메르캅탄) 로부터 제조된다. 메티오날, 시안화수소, 암모니아 및 이산화탄소는 반응하여 5-(2-메틸메르캅토에틸) 히단토인을 제공하고, 이는 이후 알칼리에 의해 가수분해되어 알칼리 금속 D,L-메티오네이트를 제공한다. D,L-메티오닌은 이후 산으로의 중화에 의해 유리화된다 (US 5,770,769). 그러나, 시안화수소를 사용하는 것에 대한 요구는 이러한 방법의 단점이다. 시안화수소의 높은 독성으로 인해, 반응의 안전에 대한 경비가 높아야 한다. 또 다른 큰 단점은 황산으로의 시안화수소의 정제에 의해 형성되는 많은 양의 암모늄 술페이트이다 (이의 메티오닌 히단토인 합성에서의 사용 전). 따라서, HCN 이 없는 메티오닌의 제조 방법에 대한 요구가 존재한다.
다양한 다른 방법이 또한 메티오닌을 제조하기 위해 사용될 수 있고, 예를 들어 아미드, 일산화탄소 및 전이 금속 카르보닐 촉매의 존재 하에서 메티오날의 아미도카르보닐화 (WO 2005/121068 A1, WO 2005/121079 A1), 메티오닌을 생성하는 미생물의 발효 또는 단백질의 가수분해가 사용될 수 있다.
상기 언급된 바, 화학적 합성에서, 예컨대 모든 다른 α-아미노산, 메티오닌은 통상적으로 D- 및 L-메티오닌의 라세미 혼합물로서 제조된다. 그러나, 약학 또는 의학 적용은 흔히 키랄 순수 L-아미노산, 특히 L-메티오닌을 요구한다. L-메티오닌은 D,L-라세메이트의 순수 거울상이성질체로의 전환 또는 적합한 미생물의 발효에 의해 생성될 수 있다. 그러나, 미생물에서 L-메티오닌의 완전 발효의 주요한 단점은 특히 메티오닌-생성 미생물에 대한 환원된 황 화합물 (예컨대, 메탄티올) 의 독성 효과로 인해 통상적으로 발효 배지에 술페이트 형태로 첨가되는, 메티오닌 분자로 도입될 황의 환원을 위해 다량의 영양분 및/또는 에너지가 요구된다는 점이다. 반면, 아스파르테이트에서 개시되는 L-메티오닌의 직접 합성은 1 ATP 및 2 NADPH 분자를 요구하고, 무기 술페이트로부터의 황의 도입은 부가적으로 2 ATP, 1 GTP 및 4 NADPH 분자를 소모한다. 따라서, 환원된 황 화합물 (예를 들어, 메탄티올) 이 L-메티오닌 합성을 위해 사용될 수 있는 경우, 에너지 균형이 크게 개선될 수 있다 (Wilke (2014) Appl. Microbiol. Biotechnol. 98, 9893-9914).
이러한 문제를 해결하기 위해, L-메티오닌의 2-단계 생명공학적 제조 방법이 Kim 등 (WO 2008/013432 A1) 에 의해 제안되었다. 제 1 단계에서, L-메티오닌 전구체, O-숙시닐-L-호모세린 또는 O-아세틸-L-호모세린이, 재조합 미생물에 의해 수득되고, 배양 브로쓰에 축적된다. 제 2 단계에서, L-메티오닌 전구체는 O-숙시닐-L-호모세린 술프히드릴라아제 활성 또는 O-아세틸-L-호모세린 술프히드릴라아제 활성을 갖는 단백질의 존재 하에서 메탄티올과 반응하여, L-메티오닌 및 상응하는 카르복실산, 즉 아세테이트 또는 숙시네이트를 제공한다. 그러나, 이러한 효소 반응에서, 등몰량의 아세테이트 또는 숙시네이트가 L-메티오닌에 더불어 형성된다. 예를 들어, L-메티오닌 전구체로서 O-아세틸-L-호모세린을 선택하는 경우, 이는 반응 과정, 특히 산업적 규모의 반응 과정에서 높은 아세테이트 농도를 유도한다. 그러나, 아세테이트는 수용가능한 노력으로 L-메티오닌 생성물로부터 완전히 제거될 수 없다. 따라서, Hong 등 (WO 2012/091479 A2) 은 L-메티오닌 생성물로부터 L-메티오닌 제조 방법의 제 2 단계에서 생성된 비교적 다량의 아세테이트를 재사용하고 제거하기 위한 다수의 방법을 제안하였다.
탄소 사슬 연장을 위한 C1 빌딩 블록으로서 이산화탄소를 사용하는 여러 시도가 착수되어 왔다. Miyazaki 등 (Chem. Commun., 2001, 1800-1801) 은, 피루베이트 데카르복실라아제 및 C1 빌딩 블록으로서 이산화탄소의 존재 하에서 역효소 반응을 사용하여 아세트알데히드로부터 피루브산을 성공적으로 합성하는 것을 보고하였다. 반응은 데카르복실화의 반대 방향으로 평형을 옮기기 위해, 매우 과량의 이산화탄소를 요구한다. 아세트알데히드 및 피루브산을 통한 L-락테이트의 제조를 위해, 이산화탄소 및 에탄올을 사용하는 보조인자 재생 사이클을 비롯한 다중효소 촉매 시스템이 Tong 등 (Biotechnol. Bioeng. (2011) 108, 465-469) 에 의해 제안되었다.
Wichmann 등 (Biotechnol. Bioeng. (1981) 23, 2789-2802) 은 NADH 재생을 위해 포르메이트 및 포르메이트 데히드로게나아제를 사용하는 생촉매 NADH 재생 시스템, L-류신 데히드로게나아제 (LeuDH), NADH-의존성 효소에 의해 촉매화된 L-류신으로의 2-옥소-4-메틸펜탄산 (α-케토이소카프로에이트) 의 환원성 아민화를 제안하였다.
본 발명의 목적은, C1 빌딩 블록으로서 시아니드 대신 이산화탄소를 사용하고, 이에 따라 다량의 암모늄 술페이트의 형성을 회피하고, 거울상이성질체적으로 순수한 L-아미노산을 직접 유도하는, L-아미노산, 예컨대 L-알라닌, L-발린, L-메티오닌, L-류신, L-이소류신 및 L-페닐알라닌의 제조 방법을 제공하는 것이다.
이러한 목적은 알데히드, 이산화탄소, 데카르복실라아제, 이의 상응하는 보조인자를 포함하는 혼합물 및 (a) 하나 이상의 공여자 아미노산 및 아미노트랜스페라아제 및/또는 (b) NADH, 암모니아 및/또는 암모늄 염 및 아미노산 데히드로게나아제를 반응시켜 L-아미노산 또는 이의 염을 형성하는 단계를 포함하는, L-아미노산의 제조 방법에 의해 달성된다.
본 발명에 따른 방법으로 L-아미노산의 개시 알데히드로부터 합성될 수 있는 바람직한 L-아미노산은 에탄알 (아세트알데히드) 로부터의 L-알라닌, 2-메틸 프로판알로부터의 L-발린, 3-(메틸티오) 프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌, 3-메틸 부탄알로부터의 L-류신, 2-메틸 부탄알로부터의 L-이소류신 및 2-페닐 에탄알 (페닐 아세트알데히드) 로부터의 L-페닐알라닌이다.
본 발명의 바람직한 구현예에서, 목적은 3-(메틸티오)-프로판알 (메티오날), 이산화탄소, 데카르복실라아제, 이의 상응하는 보조인자의 혼합물 및 (a) 하나 이상의 공여자 아미노산 및 아미노트랜스페라아제 및/또는 (b) NADH, 암모니아 및/또는 암모늄 염 및 아미노산 데히드로게나아제를 반응시켜 L-메티오닌 또는 이의 염을 형성하는 단계를 포함하는, L-메티오닌 (L-Met) 의 제조 방법에 의해 달성된다.
이론에 의해 구속되지 않으면서, 먼저, 혼합물 중 데카르복실라아제가 이의 역반응, 즉 알데히드, 예를 들어 메티오날의 이산화탄소 (CO2) 와의 카르복실화 (이는 중간체 α-케토산 (2-옥소산), 예를 들어 4-메틸티오-2-옥소부탄산 (MTOB) 를 유도함) 를 촉매화한다고 인식된다. 이후, α-케토산 (예를 들어, 2-MTOB) 의 α-카르보닐 기는, L-아미노산, 예컨대 L-메티오닌을 산출하기 위해, 아미노트랜스페라아제에 의해 촉매화되는 입체특이성 반응에서 아미노 기에 의해 교환된다 (도 1A). 이러한 반응은 공여자 아미노산 (예를 들어, L-글루타민) 의 존재를 요구하고, 이는 그 자체로 해당 α-케토산으로 전환된다. 대안적으로, 상기 L-아미노산의 α-케토산의 전환 (예를 들어, MTOB 에서 L-메티오닌) 은, 아미노 공여자로서 NH3 를 갖는 NADH 의 소모 하에서, α-케토산, 예를 들어 MTOB 의 환원성 아민화를 촉매화하는 아미노산 데히드로게나아제 (예를 들어, LeuDH 또는 페닐알라닌 데히드로게나아제, PheDH) 에 의해 달성될 수 있다 (도 1B).
데카르복실라아제의 보조인자는 티아민 피로포스페이트를 포함한다. CO2 와 메티오날의 카르복실화를 촉매화하는 적합한 데카르복실라아제는, 예를 들어 사카로마이세스 세레비시아에 (Saccharomyces cerevisiae) 유래 피루베이트 데카르복실라아제 PDC1, 사카로마이세스 세레비시아에 유래 페닐피루베이트 데카르복실라아제 ARO10, 및 락토코쿠스 락티스 (Lactococcus lactis) 유래 분지쇄 데카르복실라아제 KdcA, 뿐 아니라 데카르복실라아제 활성을 갖는 이러한 데카르복실라아제의 돌연변이 및 변이체이다 (표 1). 이산화탄소는 바람직하게는 10 내지 7400 kPa (0.1 내지 74 bar), 바람직하게는 100 내지 1000 kPa (1 내지 10 bar), 보다 바람직하게는 200 내지 800 kPa (2 내지 8 bar) 의 압력에서 반응 혼합물에 적용된다.
본 발명에 따른 방법, 예를 들어 공여자 아미노산으로부터의 아미노 기의 MTOB 의 α-카르보닐 기로의 이동의 변이체 (a) 로 특히 적합한 아미노트랜스페라아제는 예를 들어 E. 콜라이 (E. coli) 유래 메티오닌 아미노트랜스페라아제 YbdL, 및 사카로마이세스 세레비시아에 유래 방향족 아미노트랜스페라아제 Aro8, 뿐 아니라 아미노트랜스페라아제 활성을 갖는 이러한 아미노트랜스페라아제의 돌연변이 및 변이체이다 (표 1). 바람직하게는, 공여자 아미노산은 형성될 L-아미노산과 상이하다. 본 발명에 따른 방법의 이러한 변이체로 바람직한 공여자 아미노산은 L-글루타민, L-글루타메이트, L-알라닌, L-페닐알라닌, L-티로신, L-류신, L-이소류신, L-히스티딘 및 L-트립토판으로 이루어지는 군으로부터 선택된 하나 이상의 L-아미노산이다.
본 발명에 따른 방법, 예를 들어 NADH 및 NH3 의 소모 하에서 메티오날로부터 형성된 MTOB 의 환원성 아민화의 변이체 (b) 로 특히 적합한 아미노산 데히드로게나아제는, 예를 들어 바실루스 스파에리쿠스 (Bacillus sphaericus) 유래 류신 데히드로게나아제 LeuDH, 및 테르모액티노마이세스 인테르메디우스 (Thermoactinomyces intermedius) 유래 페닐알라닌 데히드로게나아제 PheDH, 뿐 아니라 아미노산 데히드로게나아제 활성을 갖는 이러한 아미노산 데히드로게나아제의 돌연변이 및 변이체이다 (표 1).
표 1: 메티오날로부터 L-메티오닌의 합성에 적합한 효소.
이론에 구속되지 않으면서, 데카르복실라아제 (예를 들어, ARO10 또는 KdcA) 및 아미노산 데히드로게나아제 (예를 들어, LeuDH 또는 PheDH) 에 의해 촉매화된, 알데히드로부터의 L-아미노산, 예컨대 메티오날로부터의 L-메티오닌의 2-단계 효소 합성 중, 공동기질 NADH 가 α-케토산, 예를 들어, MTOB 의 α-카르보닐 기의 환원을 위해 데히드로게나아제에 의해 소모된다.
제자리에서 NADH 의 산화된 형태 NAD+ 로부터 NADH 를 재순환시키기 위해, 포르메이트 데히드로게나아제 (예를 들어, CboFDH(C23A/F285S)) 가 이용될 수 있다 (도 1C). 이러한 효소는 CO2 를 산출하기 위해 NAD+ 로 포르메이트를 산화시키고, 이는 또한 알데히드, 예를 들어 메티오날의 카르복실화 반응에 대한 기질, 뿐 아니라 공동기질 NADH 로 작용할 수 있다 (Schutte 등. (1976) Eur. J. Biochem. 62, 151-160; Wichmann 등. (1981) Biotechnol. Bioeng. 23, 2789-2802).
따라서, 본 발명에 따른 방법의 특정 구현예에서, 알데히드, 이산화탄소, 데카르복실라아제, 이의 상응하는 보조인자를 포함하는 반응 혼합물 및 NADH, 암모니아 및/또는 암모늄 염 및 아미노산 데히드로게나아제 및, 임의로, 하나 이상의 공여자 아미노산 및 아미노트랜스페라아제는 추가로 포름산 또는 이의 염 및 포르메이트 데히드로게나아제를 포함한다.
NADH 재생은, 포르메이트 소모 및 CO2 방출 하에서, 예를 들어 슈도모나스 종 (Pseudomonas sp.) 101 유래 포르메이트 데히드로게나아제, 예컨대 PseFDH (Egorov 등. (1979) Eur. J. Biochem. 99, 569-576) 또는 칸디다 보이디니 (Candida boidinii) 유래 포르메이트 데히드로게나아제 (CboFDH; O13437; Schutte 등. (1976) Eur. J. Biochem. 62, 151-160) 또는 이의 돌연변이 CboFDH (C23A/F285S) 에 의해 달성될 수 있다.
따라서, 본 발명에 따른 방법의 바람직한 구현예에서, 포르메이트 데히드로게나아제는 슈도모나스 종 또는 칸디다 종에서 유래할 뿐 아니라 포르메이트 데히드로게나아제 활성을 갖는 이러한 포르메이트 데히드로게나아제의 돌연변이 및 변이체로부터 유래한다.
도 1a: 데카르복실라아제 및 아미노트랜스페라아제를 수반하는 3-(메틸티오)프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌의 2-단계 생촉매 합성에 대한 반응식.
도 1b: 데카르복실라아제 및 아미노산 데히드로게나아제를 수반하는 3-(메틸티오)프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌의 2-단계 생촉매 합성에 대한 반응식.
도 1c: 생촉매 NADH 재생 시스템의 존재 하에서 3-(메틸티오)프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌의 2-단계 생촉매 합성에 대한 반응식.
도 2a: HPLC 분석학을 사용한 반응 생성물 L-메티오닌의 검출. L-메티오닌의 생성은, 1 % v/v 인산으로 보충된 4 % (v/v) 수성 아세토니트릴 중 등용매 용리 및 C18 컬럼 (Gemini C18, 4.6×15 ㎜, 3 ㎛, 110 Å) 을 사용하여, HPLC 분석학을 통해 실시예 4 로부터의 5 μL 샘플에서 확인되었다. 메티오날 및 L-메티오닌을 210 ㎚ 에서 이의 흡광에 따라 검출하였다. 5 μM KdcA, 5 μM YbdL, 4 mM 메티오날, 50 mM L-글루타민의 존재 하에서, 105 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 L-메티오닌 합성. 점선 기록은 정의된 농도에 의한 L-메티오닌 표준물에 상응한다. 체류 시간의 약간의 변동은 반복된 크로마토그래피 수행 사이의 전형적인 실험 오류에 상응한다.
도 2b: (a) 와 동일하지만, 각각 KdcA, YbdL 또는 메티오날을 생략한 조건 하에서의 대조 반응.
도 2c: 하기의 상승하는 KdcA 농도를 사용하여, 반응 조건의 최적화 후, (a) 에 나타난 바와 같은, 3 % 로부터 12.5 % 까지의 L-메티오닌 수율의 증가: 5 또는 10 또는 20 μM KdcA, 5 μM YbdL, 4 mM 메티오날, 50 mM L-글루타민; 105 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 반응.
도 3a: HPLC 분석학을 사용한 반응 생성물 L-메티오닌의 검출. L-메티오닌의 생성은 1 % v/v 인산으로 보충된 4 % (v/v) 수성 아세토니트릴 중 등용매 용리 및 C18 컬럼 (Gemini C18, 4.6×15 mm, 3 ㎛, 110 Å) 을 사용하여, HPLC 분석학을 통해 실시예 5 로부터의 5 μL 샘플에서 확인되었다. 메티오날 및 L-메티오닌을 210 ㎚ 에서 이의 흡광에 따라 검출하였다. 10 μM KdcA, 5 μM LeuDH, 4 mM 메티오날, 4 mM NADH 의 존재 하에서, 45 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 L-메티오닌 합성.
도 3b: (a) 와 동일하지만, 각각 KdcA, LeuDH, 메티오날 또는 NADH 를 생략한 조건 하에서의 대조 반응.
도 3c: 2 배 LeuDH 농도를 사용하여, (a) 에 나타난 바와 같은, 1.5 % 로부터 3 % 까지의 L-메티오닌 수율의 증가: 45 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 반응.
도 1b: 데카르복실라아제 및 아미노산 데히드로게나아제를 수반하는 3-(메틸티오)프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌의 2-단계 생촉매 합성에 대한 반응식.
도 1c: 생촉매 NADH 재생 시스템의 존재 하에서 3-(메틸티오)프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌의 2-단계 생촉매 합성에 대한 반응식.
도 2a: HPLC 분석학을 사용한 반응 생성물 L-메티오닌의 검출. L-메티오닌의 생성은, 1 % v/v 인산으로 보충된 4 % (v/v) 수성 아세토니트릴 중 등용매 용리 및 C18 컬럼 (Gemini C18, 4.6×15 ㎜, 3 ㎛, 110 Å) 을 사용하여, HPLC 분석학을 통해 실시예 4 로부터의 5 μL 샘플에서 확인되었다. 메티오날 및 L-메티오닌을 210 ㎚ 에서 이의 흡광에 따라 검출하였다. 5 μM KdcA, 5 μM YbdL, 4 mM 메티오날, 50 mM L-글루타민의 존재 하에서, 105 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 L-메티오닌 합성. 점선 기록은 정의된 농도에 의한 L-메티오닌 표준물에 상응한다. 체류 시간의 약간의 변동은 반복된 크로마토그래피 수행 사이의 전형적인 실험 오류에 상응한다.
도 2b: (a) 와 동일하지만, 각각 KdcA, YbdL 또는 메티오날을 생략한 조건 하에서의 대조 반응.
도 2c: 하기의 상승하는 KdcA 농도를 사용하여, 반응 조건의 최적화 후, (a) 에 나타난 바와 같은, 3 % 로부터 12.5 % 까지의 L-메티오닌 수율의 증가: 5 또는 10 또는 20 μM KdcA, 5 μM YbdL, 4 mM 메티오날, 50 mM L-글루타민; 105 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 반응.
도 3a: HPLC 분석학을 사용한 반응 생성물 L-메티오닌의 검출. L-메티오닌의 생성은 1 % v/v 인산으로 보충된 4 % (v/v) 수성 아세토니트릴 중 등용매 용리 및 C18 컬럼 (Gemini C18, 4.6×15 mm, 3 ㎛, 110 Å) 을 사용하여, HPLC 분석학을 통해 실시예 5 로부터의 5 μL 샘플에서 확인되었다. 메티오날 및 L-메티오닌을 210 ㎚ 에서 이의 흡광에 따라 검출하였다. 10 μM KdcA, 5 μM LeuDH, 4 mM 메티오날, 4 mM NADH 의 존재 하에서, 45 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 L-메티오닌 합성.
도 3b: (a) 와 동일하지만, 각각 KdcA, LeuDH, 메티오날 또는 NADH 를 생략한 조건 하에서의 대조 반응.
도 3c: 2 배 LeuDH 농도를 사용하여, (a) 에 나타난 바와 같은, 1.5 % 로부터 3 % 까지의 L-메티오닌 수율의 증가: 45 min 동안 2 bar (200 kPa) CO2 하에서 반응.
실시예
실시예 1:
E.
콜라이에서 데카르복실라아제의 생성
사카로마이세스 세레비시아에 유래 피루베이트 데카르복실라아제 (Pdc1; SEQ ID NO: 1; P06169; Killenberg-Jabs 등. (1997) Biochemistry 36, 1900-1905) 및 페닐피루베이트 데카르복실라아제 (Aro10; SEQ ID NO: 3; Q06408; Kneen 등. (2011) FEBS J. 278, 1842-1853) 에 대한 유전자, 뿐 아니라 락토코쿠스 락티스 유래 분지쇄 데카르복실라아제 (KdcA) (SEQ ID NO: 5; Q6QBS4; Yep 등. (2006) Bioorg. Chem. 34, 325-336) 에 대한 유전자를, E. 콜라이에서 발현을 위한 최적의 코돈을 사용하여 합성한 후, 제한 효소 NdeI 및 XhoI 를 사용하여 발현 벡터 pET21 (Novagen, Madison, WI) 상에서 클로닝하였다. 또한, 각 효소에 대한 카르복시-말단 His6-태그를 인코딩하는, 3 개의 수득된 발현 플라스미드 pET21-Pdc1, pET21-Aro10 및 pET21-KdcA 각각을 클로닝된 구조 유전자의 DNA 시퀀싱에 의해 확인하였다 (Eurofins Genomics, Ebersberg, Germany).
이러한 발현 플라스미드로의, CaCl2-방법에 따른 (Sambrook 등. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press) E. 콜라이 BL21 세포의 화학적 형질전환 후 (Studier and Moffatt (1986) J. Mol. Biol. 189, 113-130), T7 프로모터의 제어 하에서 효소 Pdc1, Aro10 및 KdcA 를 개별 제조하였다 (Studier and Moffatt, ibid.). 이를 위해, 0.3-0.4 의 OD550 이 달성될 때까지 셰이킹하면서 30℃ 에서, 100 ㎍/㎖ 암피실린으로 보충된 LB 배지 중 2 리터 배양물에서 형질전환된 박테리아를 성장시켰다. 22℃ 로 45-60 min 동안 온도를 낮춘 후, 0.01 mM 이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노시드 (IPTG) 의 첨가에 의해 OD550 = 0.6-0.8 에서 5 h 동안 22℃ 에서 재조합 유전자 발현을 유도하였다. 마지막으로, 원심분리 (10 min, 6000 rpm, 4℃) 에 의해 박테리아를 채취하고, 세포 페이스트를 -20℃ 에서 동결시켰다.
부동화된 금속 이온 친화성 크로마토그래피 (IMAC, immobilized metal ion affinity chromatography) 이후 크기 배제 크로마토그래피 (SEC) 를 포함하는 2-단계 전략을 사용하여 모든 데카르복실라아제를 정제하였다. 따라서, 3 ㎖ 300 mM NaCl, 1 mM MgSO4, 0.1 mM 티아민 피로포스페이트 (ThDP), 20 mM PIPES/NaOH pH 7.0/1 g 웨트 (wet) 중량에서 세포를 재현탁시킨 후, 프렌치 압력 셀 (French pressure cell) (SLM Aminco, Rochester, NY) 을 사용하여 기계 분쇄하였다. 균질 현탁액을 원심분리 (30 min, 18000 rpm, 4℃) 하고, 러닝 완충액으로서 300 mM NaCl, 1 mM MgSO4, 0.1 mM ThDP, 20 mM PIPES/NaOH pH 7.0 을 사용하여, Ni(II) 이온이 채워진 5 ㎖ 베드 용적 HisTrap HP 컬럼 (GE Healthcare, Munich, Germany) 에 완전 상청액을 가하였다. 결합된 데카르복실라아제를 러닝 완충액 중 0 내지 500 mM 이미다졸/HCl 의 선형 농도 구배에 의해 용리하였다. 데카르복실라아제 함유 메인 분획을 쿠마시-염색된 SDS-PAGE 로 확인하고, 30 kDa 의 공칭 분자량 한계 (nominal molecular weight limit, NMWL) 를 갖는 원심분리 필터 유닛 (Merck, Darmstadt, Germany) 을 사용하여 2-2.5 ㎖ 의 최종 용적으로 농축시켰다. 500 mM NaCl, 1 mM MgSO4, 0.5 mM ThDP, 20 mM PIPES/NaOH pH 7.0 의 존재 하에서, 120 ㎖ 베드 용적 HiLoad Superdex 200 16/60 컬럼 (GE Healthcare) 을 사용하여 SEC 를 통해 농축된 샘플을 추가 정제하였다.
그 결과, 모든 3 개의 데카르복실라아제는 쿠마시-염색된 SDS-PAGE 분석에 의해 확인된 바와 같이 >90% 순도로 수득되었다. 수율은 각각 Pdc1, Aro10 및 KdcA 에 대한 배양액 용적 1 리터 당 대략 50 mg, 10 mg 및 30 mg 이었다.
실시예 2:
E.
콜라이에서 아미노트랜스페라아제의 생성
E. 콜라이 유래 메티오닌 아미노트랜스페라아제 (YbdL) (SEQ ID NO: 7; P77806; Dolzan 등. (2004) FEBS Lett. 571, 141-146) 에 대한 유전자를 적합한 프라이머를 사용하여 E. 콜라이 K12 MG1655 로부터 증폭시키고, 제한 효소 KasI 및 HindIII 를 사용하여 발현 벡터 pASK-IBA35(+) (IBA, Gottingen, Germany) 상에서 클로닝하였다. 또한, YbdL 에 대한 아미노-말단 His6-태그를 인코딩하는, 수득된 발현 플라스미드 pASK-IBA35(+)-YbdL 을 클로닝된 구조 유전자의 DNA 시퀀싱에 의해 확인하였다 (Eurofins Genomics).
사카로마이세스 세레비시아에 유래 방향족 아미노트랜스페라아제 (Aro8) (SEQ ID NO: 9; P53090; Bulfer 등. (2013) Protein Sci. 22, 1417-1424) 에 대한 유전자를 E. 콜라이 (Geneart) 에서 발현을 위한 최적의 코돈을 사용하여 합성하고, 제한 효소 KasI 및 HindIII 를 사용하여 발현 벡터 pASK-IBA35(+) 상에서 클로닝하였다. 또한, Aro8 에 대한 아미노-말단 His6-태그를 인코딩하는, 수득된 발현 플라스미드 pASK-IBA35(+)-Aro8 을 클로닝된 구조 유전자의 DNA 시퀀싱에 의해 확인하였다 (Eurofins Genomics).
tet 프로모터의 제어 하 E. 콜라이 BL21 에서 두 효소, YbdL 및 Aro8 을 생성하였다 (Skerra (1994) Gene 151, 131-135). 따라서, E. 콜라이 BL21 세포를 상응하는 발현 플라스미드로 CaCl2-방법 (Sambrook 등, ibid.) 에 따라 형질전환시킨 후, OD550 = 0.3-0.4 이 도달될 때까지 셰이킹하면서 30℃ 에서 100 ㎍/㎖ 암피실린을 보충한 2 리터 LB 배지에서 성장시켰다. 이후, 온도를 22℃ 로 45-60 min 동안 감소시키고, 재조합 유전자 발현을 0.2 mg/l 안히드로테트라시클린 (aTc; Acros, Geel, Belgium) 으로 유도하였다. 22℃ 에서 5 h 후, 박테리아를 원심분리 (10 min, 6000 rpm, 4℃) 에 의해 채취하고, -20℃ 에서 동결시켰다.
아미노트랜스페라아제를 정제하기 위해, 3 ㎖ 500 mM NaCl, 40 mM Tris/HCl pH 7.4/1 g 웨트 중량에서 각각의 재조합 단백질을 함유하는 세포를 재현탁시켰다. 이후, 박테리아를 프렌치 압력 셀에서 기계 분쇄하였다. 균질 현탁액을 원심분리 (30 min, 18000 rpm, 4℃) 하고, 러닝 완충액으로서 500 mM NaCl, 40 mM Tris/HCl pH 7.4 을 사용하여, Ni(II) 이온이 채워진 5 ㎖ 베드 용적 HisTrap HP 컬럼 (GE Healthcare) 에 전체 상청액을 가하였다. 결합된 아미노트랜스페라아제를 러닝 완충액 중 0 내지 500 mM 이미다졸/HCl 의 선형 농도 구배에 의해 용리하였다. 아미노트랜스페라아제 함유 메인 분획을 쿠마시-염색된 SDS-PAGE 로 확인하고, 30 kDa 의 NMWL 을 갖는 원심분리 필터 유닛을 사용하여 4-5 ㎖ 의 최종 용적으로 농축시켰다. 제 2 단계에서, 500 mM NaCl, 20 mM Tris/HCl pH 7.4 의 존재 하에서, 320 ㎖ 베드 용적 HiLoad Superdex 200 26/60 컬럼을 사용하여 SEC 를 통해 농축된 샘플을 정제하였다.
두 아미노트랜스페라아제는 YbdL 에 대해 18 mg/l 및 Aro8 에 대해 47 mg/l 의 수율로, SDS-PAGE 분석에 의해 확인된 바와 같이 >90% 순도로 수득되었다.
실시예 3:
E.
콜라이에서 아미노산 데히드로게나아제의 생성
바실루스 스파에리쿠스 유래 류신 데히드로게나아제 (LeuDH; SEQ ID NO: 11; Li 등. (2009) Appl. Biochem. Biotechnol. 158, 343-351) 에 대한 유전자 및 테르모액티노마이세스 인테르메디우스 유래 페닐알라닌 데히드로게나아제 (PheDH; SEQ ID NO: 13; P22823; Takada 등. (1991) J. Biochem. 109, 371-376) 에 대한 유전자를, E. 콜라이 (Geneart) 에서 발현을 위한 최적의 코돈을 사용하여 합성하고, 제한 효소 KasI 및 HindIII 를 사용하여 발현 벡터 pASK-IBA35(+) 상에서 클로닝하였다. 또한, 아미노-말단 His6-태그를 인코딩하는, 수득된 발현 플라스미드 pASK-IBA35(+)-LeuDH 및 pASK-IBA35(+)-PheDH 각각을 클로닝된 구조 유전자의 DNA 시퀀싱에 의해 확인하였다 (Eurofins Genomics).
aTc 로의 유도 후, 5 h 동안 30℃ 에서 (22℃ 대신) 배양물을 인큐베이팅한 것을 제외하고, 본원에서 실시예 2 에 전술된 아미노트랜스페라아제와 동일한 조건 하에서, LeuDH 뿐 아니라 PheDH 를 E. 콜라이 BL21 에서 생성하였다.
두 아미노산 데히드로게나아제의 정제를 위해, 3 ㎖ 100 mM NaCl, 50 mM Tris/HCl pH 8.0/1 g 웨트 세포 매스에서 박테리아 페이스트를 재현탁시키고, 프렌치 압력 셀을 사용하여 기계 분쇄하였다. 원심분리 (30 min, 18000 rpm, 4℃) 후, 러닝 완충액으로서 100 mM NaCl, 50 mM Tris/HCl pH 8.0 을 사용하는, Ni(II) 이온이 채워진 5 ㎖ 베드 용적 HisTrap HP 컬럼 (GE Healthcare) 에 상청액을 가하였다. 결합된 아미노산 데히드로게나아제를 러닝 완충액 중 0 내지 500 mM 이미다졸/HCl 의 선형 농도 구배에 의해 용리하였다. 아미노산 데히드로게나아제 함유 메인 분획을 쿠마시-염색된 SDS-PAGE 로 확인하고, 30 kDa 의 NMWL 을 갖는 원심분리 필터 유닛 (Merck) 을 사용하여 4-5 ㎖ 의 최종 용적으로 농축시켰다. 제 2 단계에서, 300 mM NaCl, 20 mM Tris/HCl pH 8.0 의 존재 하에서, 320 ㎖ 베드 용적 HiLoad Superdex 200 26/60 컬럼을 사용하여 SEC 를 통해 농축된 샘플을 정제하였다.
LeuDH 및 PheDH 는 각각 7.5 mg/l 및 19 mg/l 의 수율로 수득되었다. >95 % 의 높은 순도가 쿠마시-염색된 SDS-PAGE 분석에 의해 확인되었다.
실시예 4: 데카르복실라아제 및 아미노트랜스페라아제를 수반하는 2-단계 생촉매 반응에 의한 3-(메틸티오)프로판알 (메티오날) 로부터의 L-메티오닌의 합성.
2-단계 생촉매 반응에서 L-메티오닌을 합성하기 위해 (도. 1A), 정제된 데카르복실라아제 KdcA 및 아미노트랜스페라아제 YbdL 을 최종 용적 1 ㎖ 로 10 ㎖ 압력 반응기 (타이니클레이브 스틸 (Tinyclave steel); Buchi, Uster, Switzerland) 에서 하기 시약과 혼합하였다:
기질 메티오날의 첨가 및 2 bar (200 kPa) CO2 의 적용에 의해 반응을 개시하였다. 혼합물의 초기 pH 는 8 이었고, CO2 적용시 이는 약 6.5 로 변경되었다 (불변색 pH 지시 스틱; Carl Roth, Karlsruhe, Germany 로 측정됨). 인큐베이션 1 h 후, 혼합물을 반응기로부터 수집하고, 벤치 탑 원심분리기에서 5 min 동안 13400 rpm 에서 원심분리하여 침전된 단백질을 제거하였다. 투명 상청액을 사용하여, 1% (v/v) 인산으로 보충된 4 % (v/v) 수성 아세토니트릴 중 등용매 용리와, C18 컬럼 (Gemini C18, 4.6×15 ㎜, 3 ㎛, 110 Å; Phenomenex, Aschaffenburg, Germany) 을 사용하는 HPLC 에 의해 생성물 형성을 분석하였다.
KdcA, YbdL 또는 메티오날 각각을 생략한 대조 반응에 비해 (도. 2B), 데카르복실라아제 (예를 들어, KdcA) 및 아미노트랜스페라아제 (예를 들어, YbdL) 뿐 아니라 공여자 아미노산 (예를 들어, L-글루타민) 의 존재 하의 2-단계 생촉매 합성의 크로마토그램은, L-메티오닌이 메티오날로부터 생성되었다는 것을 명백히 입증하였다 (도. 2A). 데카르복실라아제의 농도를 20 μM 로 증가시킴으로써, L-메티오닌 수율은 3 % 에서 12.5 % 로 개선되었다 (도. 2C).
실시예 5: 데카르복실라아제 및 아미노산 데히드로게나아제를 수반하는 2-단계 생촉매 반응에 의한 메티오날로부터의 L-메티오닌의 합성.
아미노 공여자 공동기질에 대한 필요 없이 2-단계 생촉매 반응에서 L-메티오닌을 합성하기 위해 (도. 1B), 정제된 데카르복실라아제 KdcA 및 아미노산 데히드로게나아제 LeuDH 를 최종 용적 1 ㎖ 로 10 ㎖ 압력 반응기 (타이니클레이브 스틸) 에서 하기 시약과 혼합하였다:
실시예 4 에서와 같이, 메티오날의 첨가 및 2 bar (200 kPa) CO2 의 적용에 의해 반응을 개시하였다. 혼합물의 초기 pH 는 8 이었고, CO2 적용시 이는 약 7 로 변경되었다 (불변색 pH 지시 스틱으로 측정됨). 인큐베이션 45 min 후, 혼합물을 반응기로부터 회수하고, 실시예 4 에 기재된 바와 같이 HPLC 를 사용하여 분석하였다.
데카르복실라아제 (예를 들어, KdcA), 아미노산 데히드로게나아제 (예를 들어, LeuDH) 또는 NADH 각각을 생략한 대조 반응에 비해 (도. 3B), 데카르복실라아제 (예를 들어, KdcA) 및 아미노산 데히드로게나아제 (예를 들어, LeuDH) 뿐 아니라 NADH 및 암모늄 염의 존재 하의 2-단계 생촉매 합성의 크로마토그램은, L-메티오닌이 메티오날로부터 생성되었다는 것을 명백히 입증하였다 (도. 3A). 아미노산 데히드로게나아제의 농도를 10 μM 로 2 배함으로써, L-메티오닌 수율이 1.5 % 에서 3 % 로 개선되었다 (도. 3C).
SEQUENCE LISTING
<110> Evonik Degussa GmbH
<120> Method for producing L-amino acids
<130> 201600130
<160> 14
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1719
<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(6)
<223> NdeI restriction site
<220>
<221> CDS
<222> (4)..(1719)
<223> sequence of PDC1 of Sacharomyces cerevisiae optimized for the
codon usage of Escherichia coli with a carboxy-terminal His6-tag
<220>
<221> misc_feature
<222> (1693)..(1698)
<223> XhoI restriction site
<400> 1
cat atg agc gaa att acc ctg ggc aaa tac ctg ttt gaa cgc ctg aaa 48
Met Ser Glu Ile Thr Leu Gly Lys Tyr Leu Phe Glu Arg Leu Lys
1 5 10 15
cag gtt aat gtg aat acc gtt ttt ggt ctg cct ggc gat ttt aat ctg 96
Gln Val Asn Val Asn Thr Val Phe Gly Leu Pro Gly Asp Phe Asn Leu
20 25 30
agc ctg ctg gat aaa atc tat gaa gtt gaa ggt atg cgt tgg gca ggt 144
Ser Leu Leu Asp Lys Ile Tyr Glu Val Glu Gly Met Arg Trp Ala Gly
35 40 45
aat gca aat gaa ctg aat gca gcc tat gca gca gat ggt tat gca cgt 192
Asn Ala Asn Glu Leu Asn Ala Ala Tyr Ala Ala Asp Gly Tyr Ala Arg
50 55 60
att aaa ggt atg agc tgc att att acc acc ttt ggt gtt ggt gaa ctg 240
Ile Lys Gly Met Ser Cys Ile Ile Thr Thr Phe Gly Val Gly Glu Leu
65 70 75
agc gca ctg aat ggt att gca ggt agc tat gca gaa cat gtt ggt gtg 288
Ser Ala Leu Asn Gly Ile Ala Gly Ser Tyr Ala Glu His Val Gly Val
80 85 90 95
ctg cat gtt gtt ggt gtt ccg agc att agc gca cag gca aaa cag ctg 336
Leu His Val Val Gly Val Pro Ser Ile Ser Ala Gln Ala Lys Gln Leu
100 105 110
ctg ctg cat cat acc ctg ggt aat ggt gat ttt acc gtg ttt cat cgt 384
Leu Leu His His Thr Leu Gly Asn Gly Asp Phe Thr Val Phe His Arg
115 120 125
atg agc gca aat att agc gaa acc acc gca atg att acc gat att gca 432
Met Ser Ala Asn Ile Ser Glu Thr Thr Ala Met Ile Thr Asp Ile Ala
130 135 140
acc gca ccg gca gaa att gat cgt tgt att cgt acc acc tat gtt acc 480
Thr Ala Pro Ala Glu Ile Asp Arg Cys Ile Arg Thr Thr Tyr Val Thr
145 150 155
cag cgt ccg gtt tat ctg ggt ctg cca gca aat ctg gtt gat ctg aat 528
Gln Arg Pro Val Tyr Leu Gly Leu Pro Ala Asn Leu Val Asp Leu Asn
160 165 170 175
gtt ccg gct aaa ctg ctg caa acc ccg att gat atg agc ctg aaa ccg 576
Val Pro Ala Lys Leu Leu Gln Thr Pro Ile Asp Met Ser Leu Lys Pro
180 185 190
aat gat gca gaa agc gaa aaa gaa gtg att gat acc att ctg gcc ctg 624
Asn Asp Ala Glu Ser Glu Lys Glu Val Ile Asp Thr Ile Leu Ala Leu
195 200 205
gtt aaa gat gca aaa aat ccg gtt att ctg gca gat gcc tgt tgt agc 672
Val Lys Asp Ala Lys Asn Pro Val Ile Leu Ala Asp Ala Cys Cys Ser
210 215 220
cgt cat gat gtt aaa gca gaa acc aaa aaa ctg atc gac ctg acc cag 720
Arg His Asp Val Lys Ala Glu Thr Lys Lys Leu Ile Asp Leu Thr Gln
225 230 235
ttt ccg gca ttt gtt acc ccg atg ggt aaa ggt agc att gat gaa cag 768
Phe Pro Ala Phe Val Thr Pro Met Gly Lys Gly Ser Ile Asp Glu Gln
240 245 250 255
cat ccg cgt tat ggt ggt gtt tat gtt ggc acc ctg agc aaa ccg gaa 816
His Pro Arg Tyr Gly Gly Val Tyr Val Gly Thr Leu Ser Lys Pro Glu
260 265 270
gtt aaa gaa gca gtt gaa agc gca gat ctg att ctg agc gtt ggt gca 864
Val Lys Glu Ala Val Glu Ser Ala Asp Leu Ile Leu Ser Val Gly Ala
275 280 285
ctg ctg agt gat ttt aac acc ggt agc ttt tcg tat agc tac aaa acg 912
Leu Leu Ser Asp Phe Asn Thr Gly Ser Phe Ser Tyr Ser Tyr Lys Thr
290 295 300
aaa aac atc gtc gag ttt cat agc gat cac atg aaa att cgt aat gca 960
Lys Asn Ile Val Glu Phe His Ser Asp His Met Lys Ile Arg Asn Ala
305 310 315
acc ttt ccg ggt gtg cag atg aaa ttt gtt ctg caa aaa ctg ctg acc 1008
Thr Phe Pro Gly Val Gln Met Lys Phe Val Leu Gln Lys Leu Leu Thr
320 325 330 335
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<222> (4)..(1671)
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usage of Escherichia coli with a carboxy-terminal His6-tag
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ctg tgg ggt agc att ggt tat acc ttt ccg gca gca ctg ggt agc cag 1248
Leu Trp Gly Ser Ile Gly Tyr Thr Phe Pro Ala Ala Leu Gly Ser Gln
400 405 410 415
att gca gat aaa gaa agc cgt cat ctg ctg ttt att ggt gat ggt agc 1296
Ile Ala Asp Lys Glu Ser Arg His Leu Leu Phe Ile Gly Asp Gly Ser
420 425 430
ctg caa ctg acc gtt caa gaa ctg ggt ctg agc att cgt gaa aaa ctg 1344
Leu Gln Leu Thr Val Gln Glu Leu Gly Leu Ser Ile Arg Glu Lys Leu
435 440 445
aat ccg att tgc ttc atc att aac aac gat ggc tat acc gtg gaa cgt 1392
Asn Pro Ile Cys Phe Ile Ile Asn Asn Asp Gly Tyr Thr Val Glu Arg
450 455 460
gaa att cat ggt ccg acc cag agt tat aat gat att ccg atg tgg aac 1440
Glu Ile His Gly Pro Thr Gln Ser Tyr Asn Asp Ile Pro Met Trp Asn
465 470 475
tac tcg aaa ctg cct gaa acc ttt ggc gca acc gaa gat cgt gtg gtt 1488
Tyr Ser Lys Leu Pro Glu Thr Phe Gly Ala Thr Glu Asp Arg Val Val
480 485 490 495
agc aaa att gtt cgt acc gaa aat gaa ttt gtg agc gtg atg aaa gaa 1536
Ser Lys Ile Val Arg Thr Glu Asn Glu Phe Val Ser Val Met Lys Glu
500 505 510
gca cag gca gac gtt aat cgt atg tat tgg att gaa ctg gtg ctg gaa 1584
Ala Gln Ala Asp Val Asn Arg Met Tyr Trp Ile Glu Leu Val Leu Glu
515 520 525
aaa gag gat gca ccg aaa ctg ctg aaa aaa atg ggt aaa ctg ttt gcc 1632
Lys Glu Asp Ala Pro Lys Leu Leu Lys Lys Met Gly Lys Leu Phe Ala
530 535 540
gag cag aat aaa ctc gag cac cac cac cac cac cac tga 1671
Glu Gln Asn Lys Leu Glu His His His His His His
545 550 555
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<211> 555
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
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1 5 10 15
Ile Glu Glu Ile Phe Gly Val Pro Gly Asp Tyr Asn Leu Gln Phe Leu
20 25 30
Asp Gln Ile Ile Ser Arg Glu Asp Met Lys Trp Ile Gly Asn Ala Asn
35 40 45
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50 55 60
Ala Ala Ala Phe Leu Thr Thr Phe Gly Val Gly Glu Leu Ser Ala Ile
65 70 75 80
Asn Gly Leu Ala Gly Ser Tyr Ala Glu Asn Leu Pro Val Val Glu Ile
85 90 95
Val Gly Ser Pro Thr Ser Lys Val Gln Asn Asp Gly Lys Phe Val His
100 105 110
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Pro Val Thr Ala Ala Arg Thr Leu Leu Thr Ala Glu Asn Ala Thr Tyr
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180 185 190
Val Ile Leu Ser Lys Ile Glu Glu Ser Leu Lys Asn Ala Gln Lys Pro
195 200 205
Val Val Ile Ala Gly His Glu Val Ile Ser Phe Gly Leu Glu Lys Thr
210 215 220
Val Thr Gln Phe Val Ser Glu Thr Lys Leu Pro Ile Thr Thr Leu Asn
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260 265 270
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515 520 525
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115 120 125
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tca caa cag ggc cat gcc agt gtg ctg gcg cat ccg cag ctg cgt gag 720
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Arg Ala Val Ala Val Ser Ser Phe Gly Lys Thr Tyr His Met Thr Gly
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Arg Lys Val His Gln Tyr Leu Thr Phe Ser Val Asn Thr Pro Ala Gln
275 280 285
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tta ccg gac ttt tat cgc cag aag cgc gat att ctg gtg aat gct tta 960
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305 310 315 320
aat gaa agc cgg ctg gag att tta ccg tgt gaa ggt aca tac ttt ttg 1008
Asn Glu Ser Arg Leu Glu Ile Leu Pro Cys Glu Gly Thr Tyr Phe Leu
325 330 335
ctg gtg gat tac agc gcg gtt tct acc ctg gat gat gtt gag ttt tgc 1056
Leu Val Asp Tyr Ser Ala Val Ser Thr Leu Asp Asp Val Glu Phe Cys
340 345 350
cag tgg ctg acg cag gag cac ggc gta gcg gcg att ccg ctg tcg gtg 1104
Gln Trp Leu Thr Gln Glu His Gly Val Ala Ala Ile Pro Leu Ser Val
355 360 365
ttt tgc gcc gat ccc ttc cca cat aaa ctg att cgt ctc tgt ttt gcc 1152
Phe Cys Ala Asp Pro Phe Pro His Lys Leu Ile Arg Leu Cys Phe Ala
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aag aag gaa tcg acg ttg ctg gca gca gct gaa cgc ctg cgc cag ctt 1200
Lys Lys Glu Ser Thr Leu Leu Ala Ala Ala Glu Arg Leu Arg Gln Leu
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taa gctt 1207
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Thr Gly Val Gln Ala Leu Arg Glu Ala Ile Ala Gln Lys Thr Glu Arg
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<220>
<221> CDS
<222> (1)..(1545)
<223> sequence of ARO8 of Saccharomyces cerevisiae optimized for the
codon usage of Escherichia coli with an amino-terminal His6-tag
<220>
<221> misc_feature
<222> (37)..(42)
<223> KasI restriction site
<220>
<221> misc_feature
<222> (1544)..(1549)
<223> HindIII restriction site
<400> 9
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Met Ala Ser Arg Gly Ser His His His His His His Gly Ala Met Thr
1 5 10 15
ctg ccg gaa agc aaa gat ttt agc tac ctg ttt tcc gat gaa acc aat 96
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35 40 45
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Pro Asn Ile Ile Phe Leu Gly Gly Gly Leu Pro Leu Lys Asp Tyr Phe
50 55 60
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Pro Trp Asp Asn Leu Ser Val Asp Ser Pro Lys Pro Pro Phe Pro Gln
65 70 75 80
ggt att ggt gca ccg att gat gaa cag aat tgc atc aaa tac acc gtg 288
Gly Ile Gly Ala Pro Ile Asp Glu Gln Asn Cys Ile Lys Tyr Thr Val
85 90 95
aac aaa gat tac gca gat aaa agc gca aat ccg agc aat gat att ccg 336
Asn Lys Asp Tyr Ala Asp Lys Ser Ala Asn Pro Ser Asn Asp Ile Pro
100 105 110
ctg agc cgt gca ctg cag tat ggt ttt agc gca ggt cag ccg gaa ctg 384
Leu Ser Arg Ala Leu Gln Tyr Gly Phe Ser Ala Gly Gln Pro Glu Leu
115 120 125
ctg aac ttt att cgt gat cat acc aaa atc atc cac gat ctg aaa tac 432
Leu Asn Phe Ile Arg Asp His Thr Lys Ile Ile His Asp Leu Lys Tyr
130 135 140
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Lys Asp Trp Asp Val Leu Ala Thr Ala Gly Asn Thr Asn Ala Trp Glu
145 150 155 160
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Leu Leu Tyr Thr Ile Pro Thr Gly Gln Asn Pro Thr Gly Thr Ser Ile
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Ala Asp His Arg Lys Glu Ala Ile Tyr Lys Ile Ala Gln Lys Tyr Asp
245 250 255
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Phe Leu Ile Val Glu Asp Glu Pro Tyr Tyr Phe Leu Gln Met Asn Pro
260 265 270
tat atc aaa gat ctg aaa gaa cgt gaa aaa gca cag agc agt ccg aaa 864
Tyr Ile Lys Asp Leu Lys Glu Arg Glu Lys Ala Gln Ser Ser Pro Lys
275 280 285
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Gln Asp His Asp Glu Phe Leu Lys Ser Leu Ala Asn Thr Phe Leu Ser
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Leu Asp Thr Glu Gly Arg Val Ile Arg Met Asp Ser Phe Ser Lys Val
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ctg gca ccg ggt aca cgt ctg ggt tgg att acc ggt agc agc aaa att 1008
Leu Ala Pro Gly Thr Arg Leu Gly Trp Ile Thr Gly Ser Ser Lys Ile
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ctg aaa ccg tat ctg agt ctg cat gaa atg acc att cag gca ccg gca 1056
Leu Lys Pro Tyr Leu Ser Leu His Glu Met Thr Ile Gln Ala Pro Ala
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Gly Phe Thr Gln Val Leu Val Asn Ala Thr Leu Ser Arg Trp Gly Gln
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Lys Arg Asp Cys Ala Ile Asp Ala Leu Tyr Lys Tyr Leu Pro Gln Ser
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Gly Val Leu Val Val Pro Gly Ser Trp Phe Lys Ser Glu Gly Glu Thr
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275 280 285
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355 360 365
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485 490 495
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500 505 510
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<212> DNA
<213> Bacillus sphaericus
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(1137)
<223> sequence of leudh of Bacillus sphaericus optimized for the codon
usage of Escherichia coli with an amino-terminal His6-tag
<220>
<221> misc_feature
<222> (37)..(42)
<223> KasI restriction site
<220>
<221> misc_feature
<222> (1136)..(1141)
<223> HindIII restriction site
<400> 11
atg gct agc aga gga tcg cat cac cat cac cat cac ggc gcc atg gaa 48
Met Ala Ser Arg Gly Ser His His His His His His Gly Ala Met Glu
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att ttc aaa tat atg gaa aaa tat gat tat gaa cag ctg gtg ttc tgt 96
Ile Phe Lys Tyr Met Glu Lys Tyr Asp Tyr Glu Gln Leu Val Phe Cys
20 25 30
cag gat gaa gca agc ggt ctg aaa gca gtt att gca att cat gat acc 144
Gln Asp Glu Ala Ser Gly Leu Lys Ala Val Ile Ala Ile His Asp Thr
35 40 45
acc ctg ggt ccg gca ctg ggt ggt gca cgt atg tgg acc tat gca agc 192
Thr Leu Gly Pro Ala Leu Gly Gly Ala Arg Met Trp Thr Tyr Ala Ser
50 55 60
gaa gaa aat gca att gaa gat gca ctg cgt ctg gca cgt ggt atg acc 240
Glu Glu Asn Ala Ile Glu Asp Ala Leu Arg Leu Ala Arg Gly Met Thr
65 70 75 80
tat aaa aac gca gca gca ggt ctg aat ctg ggt ggc ggt aaa acc gtt 288
Tyr Lys Asn Ala Ala Ala Gly Leu Asn Leu Gly Gly Gly Lys Thr Val
85 90 95
att att ggt gat ccg ttc aaa gat aaa aac gaa gaa atg ttt cgt gcc 336
Ile Ile Gly Asp Pro Phe Lys Asp Lys Asn Glu Glu Met Phe Arg Ala
100 105 110
ctg ggt cgt ttt att cag ggt ctg aat ggt cgt tat att acc gca gaa 384
Leu Gly Arg Phe Ile Gln Gly Leu Asn Gly Arg Tyr Ile Thr Ala Glu
115 120 125
gat gtt ggc acc acc gtt ctg gat atg gat ctg att cat gaa gaa acc 432
Asp Val Gly Thr Thr Val Leu Asp Met Asp Leu Ile His Glu Glu Thr
130 135 140
acc tat gtg acc ggt att agt ccg gca ttt ggt agc agc ggt aat ccg 480
Thr Tyr Val Thr Gly Ile Ser Pro Ala Phe Gly Ser Ser Gly Asn Pro
145 150 155 160
agt ccg gtt acc gcc tat ggt gtt tat cgt ggc atg aaa gca gca gca 528
Ser Pro Val Thr Ala Tyr Gly Val Tyr Arg Gly Met Lys Ala Ala Ala
165 170 175
aaa gaa gcc ttt ggt agc gat agc ctg gaa ggc ctg aaa gtt agc gtg 576
Lys Glu Ala Phe Gly Ser Asp Ser Leu Glu Gly Leu Lys Val Ser Val
180 185 190
cag ggt ctg ggt aat gtt gca tat aaa ctg tgt gaa tat ctg cac aac 624
Gln Gly Leu Gly Asn Val Ala Tyr Lys Leu Cys Glu Tyr Leu His Asn
195 200 205
gaa ggt gca aaa ctg gtt gtt acc gat att aat cag gca gcc att gat 672
Glu Gly Ala Lys Leu Val Val Thr Asp Ile Asn Gln Ala Ala Ile Asp
210 215 220
cgt gtg gtg aat gat ttt gat gca att gcc gtt gca ccg gat gaa att 720
Arg Val Val Asn Asp Phe Asp Ala Ile Ala Val Ala Pro Asp Glu Ile
225 230 235 240
tat gca caa gaa gtg gat atc ttt agc ccg tgt gcg ctg ggt gca att 768
Tyr Ala Gln Glu Val Asp Ile Phe Ser Pro Cys Ala Leu Gly Ala Ile
245 250 255
ctg aat gat gaa acc att ccg cag ctg aaa gca aaa gtt att gcc ggt 816
Leu Asn Asp Glu Thr Ile Pro Gln Leu Lys Ala Lys Val Ile Ala Gly
260 265 270
agc gca aat aac caa ctg aaa gat agc cgt cat ggt gat tat ctg cat 864
Ser Ala Asn Asn Gln Leu Lys Asp Ser Arg His Gly Asp Tyr Leu His
275 280 285
gag ctg ggt att gtt tat gct ccg gat tat gtt att aat gcc ggt ggt 912
Glu Leu Gly Ile Val Tyr Ala Pro Asp Tyr Val Ile Asn Ala Gly Gly
290 295 300
gtg att aat gtt gcc gat gaa ctg tat ggt tat aat cgt gaa cgt gcc 960
Val Ile Asn Val Ala Asp Glu Leu Tyr Gly Tyr Asn Arg Glu Arg Ala
305 310 315 320
atg aaa cgt gtg gat ggt att tat gat agc atc gag aaa atc ttt gcc 1008
Met Lys Arg Val Asp Gly Ile Tyr Asp Ser Ile Glu Lys Ile Phe Ala
325 330 335
atc agc aaa cgt gat ggt att ccg acc tat gtt gca gca aat cgt ctg 1056
Ile Ser Lys Arg Asp Gly Ile Pro Thr Tyr Val Ala Ala Asn Arg Leu
340 345 350
gcc gaa gaa cgt att gca cgt gtt gca aaa agc cgt agc cag ttt ctg 1104
Ala Glu Glu Arg Ile Ala Arg Val Ala Lys Ser Arg Ser Gln Phe Leu
355 360 365
aaa aac gaa aaa aac att ctg aac ggt cgt taa gctt 1141
Lys Asn Glu Lys Asn Ile Leu Asn Gly Arg
370 375
<210> 12
<211> 378
<212> PRT
<213> Bacillus sphaericus
<400> 12
Met Ala Ser Arg Gly Ser His His His His His His Gly Ala Met Glu
1 5 10 15
Ile Phe Lys Tyr Met Glu Lys Tyr Asp Tyr Glu Gln Leu Val Phe Cys
20 25 30
Gln Asp Glu Ala Ser Gly Leu Lys Ala Val Ile Ala Ile His Asp Thr
35 40 45
Thr Leu Gly Pro Ala Leu Gly Gly Ala Arg Met Trp Thr Tyr Ala Ser
50 55 60
Glu Glu Asn Ala Ile Glu Asp Ala Leu Arg Leu Ala Arg Gly Met Thr
65 70 75 80
Tyr Lys Asn Ala Ala Ala Gly Leu Asn Leu Gly Gly Gly Lys Thr Val
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Ile Ile Gly Asp Pro Phe Lys Asp Lys Asn Glu Glu Met Phe Arg Ala
100 105 110
Leu Gly Arg Phe Ile Gln Gly Leu Asn Gly Arg Tyr Ile Thr Ala Glu
115 120 125
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130 135 140
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Lys Glu Ala Phe Gly Ser Asp Ser Leu Glu Gly Leu Lys Val Ser Val
180 185 190
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195 200 205
Glu Gly Ala Lys Leu Val Val Thr Asp Ile Asn Gln Ala Ala Ile Asp
210 215 220
Arg Val Val Asn Asp Phe Asp Ala Ile Ala Val Ala Pro Asp Glu Ile
225 230 235 240
Tyr Ala Gln Glu Val Asp Ile Phe Ser Pro Cys Ala Leu Gly Ala Ile
245 250 255
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260 265 270
Ser Ala Asn Asn Gln Leu Lys Asp Ser Arg His Gly Asp Tyr Leu His
275 280 285
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290 295 300
Val Ile Asn Val Ala Asp Glu Leu Tyr Gly Tyr Asn Arg Glu Arg Ala
305 310 315 320
Met Lys Arg Val Asp Gly Ile Tyr Asp Ser Ile Glu Lys Ile Phe Ala
325 330 335
Ile Ser Lys Arg Asp Gly Ile Pro Thr Tyr Val Ala Ala Asn Arg Leu
340 345 350
Ala Glu Glu Arg Ile Ala Arg Val Ala Lys Ser Arg Ser Gln Phe Leu
355 360 365
Lys Asn Glu Lys Asn Ile Leu Asn Gly Arg
370 375
<210> 13
<211> 1147
<212> DNA
<213> Thermoactinomyces intermedius
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(1143)
<223> sequence of phedh of Thermoactinomyces intermedius optimized for
the codon usage of Escherichia coli with an amino-terminal
His6-tag
<220>
<221> misc_feature
<222> (37)..(42)
<223> KasI restriction site
<220>
<221> misc_feature
<222> (1142)..(1147)
<223> HindIII restriction site
<400> 13
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1 5 10 15
gat gtt ttt gaa atg atg gat cgt tat ggt cac gaa cag gtg att ttt 96
Asp Val Phe Glu Met Met Asp Arg Tyr Gly His Glu Gln Val Ile Phe
20 25 30
tgt cgt cat ccg cag aca ggt ctg aaa gca att att gca ctg cat aat 144
Cys Arg His Pro Gln Thr Gly Leu Lys Ala Ile Ile Ala Leu His Asn
35 40 45
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Thr Thr Ala Gly Pro Ala Leu Gly Gly Cys Arg Met Ile Pro Tyr Ala
50 55 60
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Ser Thr Asp Glu Ala Leu Glu Asp Val Leu Arg Leu Ser Lys Gly Met
65 70 75 80
acc tat aaa tgt agc ctg gcc gat gtt gat ttt ggt ggt ggt aaa atg 288
Thr Tyr Lys Cys Ser Leu Ala Asp Val Asp Phe Gly Gly Gly Lys Met
85 90 95
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Val Ile Ile Gly Asp Pro Lys Lys Asp Lys Ser Pro Glu Leu Phe Arg
100 105 110
gtg att ggt cgt ttt gtt ggt ggt ctg aat ggt cgc ttt tat acc ggc 384
Val Ile Gly Arg Phe Val Gly Gly Leu Asn Gly Arg Phe Tyr Thr Gly
115 120 125
acc gat atg ggc acc aat ccg gaa gat ttt gtt cat gca gca cgt gaa 432
Thr Asp Met Gly Thr Asn Pro Glu Asp Phe Val His Ala Ala Arg Glu
130 135 140
agc aaa agt ttt gca ggt ctg ccg aaa agc tat ggt ggc aaa ggt gat 480
Ser Lys Ser Phe Ala Gly Leu Pro Lys Ser Tyr Gly Gly Lys Gly Asp
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Thr Ser Ile Pro Thr Ala Leu Gly Val Phe His Gly Met Arg Ala Thr
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Ala Arg Phe Leu Trp Gly Thr Asp Gln Leu Lys Gly Arg Val Val Ala
180 185 190
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Glu Val Gly Ala Tyr Cys Lys Ile Ala Asp Ile Asp Ser Val Arg Cys
210 215 220
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Glu Gln Leu Lys Glu Lys Tyr Gly Asp Lys Val Gln Leu Val Asp Val
225 230 235 240
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Asn Arg Ile His Lys Glu Ser Cys Asp Ile Phe Ser Pro Cys Ala Lys
245 250 255
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Gly Gly Val Val Asn Asp Asp Thr Ile Asp Glu Phe Arg Cys Leu Ala
260 265 270
att gtt ggt agc gca aat aat cag ctg gta gaa gat cgt cat ggt gca 864
Ile Val Gly Ser Ala Asn Asn Gln Leu Val Glu Asp Arg His Gly Ala
275 280 285
ctg ctg cag aaa cgt agc att tgt tat gca ccg gat tat ctg gtt aat 912
Leu Leu Gln Lys Arg Ser Ile Cys Tyr Ala Pro Asp Tyr Leu Val Asn
290 295 300
gca ggc ggt ctg att cag gtt gca gat gaa ctg gaa ggt ttt cat gaa 960
Ala Gly Gly Leu Ile Gln Val Ala Asp Glu Leu Glu Gly Phe His Glu
305 310 315 320
gaa cgt gtt ctg gca aaa acc gaa gcc att tat gat atg gtg ctg gat 1008
Glu Arg Val Leu Ala Lys Thr Glu Ala Ile Tyr Asp Met Val Leu Asp
325 330 335
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Ile Phe His Arg Ala Lys Asn Glu Asn Ile Thr Thr Cys Glu Ala Ala
340 345 350
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Ile Leu Leu Glu Asp Pro Arg Asn Ser Ala Arg Arg
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<210> 14
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<212> PRT
<213> Thermoactinomyces intermedius
<400> 14
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1 5 10 15
Asp Val Phe Glu Met Met Asp Arg Tyr Gly His Glu Gln Val Ile Phe
20 25 30
Cys Arg His Pro Gln Thr Gly Leu Lys Ala Ile Ile Ala Leu His Asn
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165 170 175
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195 200 205
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210 215 220
Glu Gln Leu Lys Glu Lys Tyr Gly Asp Lys Val Gln Leu Val Asp Val
225 230 235 240
Asn Arg Ile His Lys Glu Ser Cys Asp Ile Phe Ser Pro Cys Ala Lys
245 250 255
Gly Gly Val Val Asn Asp Asp Thr Ile Asp Glu Phe Arg Cys Leu Ala
260 265 270
Ile Val Gly Ser Ala Asn Asn Gln Leu Val Glu Asp Arg His Gly Ala
275 280 285
Leu Leu Gln Lys Arg Ser Ile Cys Tyr Ala Pro Asp Tyr Leu Val Asn
290 295 300
Ala Gly Gly Leu Ile Gln Val Ala Asp Glu Leu Glu Gly Phe His Glu
305 310 315 320
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355 360 365
Ile Leu Leu Glu Asp Pro Arg Asn Ser Ala Arg Arg
370 375 380
201600130
2
Claims (11)
- 알데히드, 이산화탄소, 데카르복실라아제, 이의 상응하는 보조인자를 포함하는 혼합물, 및
(a) 하나 이상의 공여자 아미노산 및 아미노트랜스페라아제 및/또는
(b) NADH, 암모니아 및/또는 암모늄 염 및 아미노산 데히드로게나아제
를 반응시켜, L-아미노산 또는 이의 염을 형성하는 단계를 포함하는, L-아미노산의 제조 방법. - 제 1 항에 있어서, 형성될 L-아미노산이 L-알라닌, L-발린, L-메티오닌, L-류신, L-이소류신 및 L-페닐알라닌으로 이루어지는 군으로부터 선택되는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 또는 제 2 항에 있어서, 형성될 L-아미노산이 L-메티오닌이고, 알데히드가 3-(메틸티오)-프로판알 (메티오날) 인, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 3 항 중 어느 한 항에 있어서, 보조인자가 티아민 피로포스페이트를 포함하는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 있어서, 데카르복실라아제가 사카로마이세스 세레비시아에 (Saccharomyces cerevisiae) 유래 피루베이트 데카르복실라아제 PDC1, 사카로마이세스 세레비시아에 유래 페닐피루베이트 데카르복실라아제 ARO10, 및 락토코쿠스 락티스 (Lactococcus lactis) 유래 분지쇄 데카르복실라아제 KdcA, 뿐 아니라 데카르복실라아제 활성을 갖는 이러한 데카르복실라아제의 돌연변이 및 변이체로 이루어지는 군으로부터 선택되는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항에 있어서, 아미노트랜스페라아제가 E. 콜라이 (E. coli) 유래 메티오닌 아미노트랜스페라아제 YbdL, 및 사카로마이세스 세레비시아에 유래 방향족 아미노트랜스페라아제 Aro8, 뿐 아니라 아미노트랜스페라아제 활성을 갖는 이러한 아미노트랜스페라아제의 돌연변이 및 변이체로 이루어지는 군으로부터 선택되는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서, 아미노산 데히드로게나아제가 바실루스 스파에리쿠스 (Bacillus sphaericus) 유래 류신 데히드로게나아제 LeuDH, 및 테르모액티노마이세스 인테르메디우스 (Thermoactinomyces intermedius) 유래 페닐알라닌 데히드로게나아제 PheDH, 뿐 아니라 아미노산 데히드로게나아제 활성을 갖는 이러한 아미노산 데히드로게나아제의 돌연변이 및 변이체로 이루어지는 군으로부터 선택되는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 있어서, 공여자 아미노산이 형성될 L-아미노산과 상이하고, 하나 이상의 L-아미노산이 L-글루타민, L-글루타메이트, L-알라닌, L-페닐알라닌, L-티로신, L-류신, L-이소류신, L-히스티딘 및 L-트립토판으로 이루어지는 군으로부터 선택되는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 있어서, 이산화탄소가 10 내지 7400 kPa 의 압력에서 혼합물에 적용되는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 1 항 내지 제 9 항 중 어느 한 항에 있어서, 혼합물이 추가로 포름산 또는 이의 염 및 포르메이트 데히드로게나아제를 포함하는, L-아미노산의 제조 방법.
- 제 9 항에 있어서, 포르메이트 데히드로게나아제가 슈도모나스 종 (Pseudomonas sp.) 유래 포르메이트 데히드로게나아제 및 칸디다 종 (Candida sp.) 유래 포르메이트 데히드로게나아제, 뿐 아니라 포르메이트 데히드로게나아제 활성을 갖는 이러한 포르메이트 데히드로게나아제의 돌연변이 및 변이체로 이루어지는 군으로부터 선택되는, L-아미노산의 제조 방법.
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DE19547236A1 (de) | 1995-12-18 | 1997-07-03 | Degussa | Verfahren zur Herstellung von D,L-Methionin oder dessen Salz |
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US7572607B2 (en) * | 2002-04-23 | 2009-08-11 | Cargill, Incorporated | Polypeptides and biosynthetic pathways for the production of monatin and its precursors |
GB0413090D0 (en) | 2004-06-11 | 2004-07-14 | Degussa | Process for preparing amino acids using the amidocarbonylation reaction (2) |
GB0413092D0 (en) | 2004-06-11 | 2004-07-14 | Degussa | Process for preparing amino acids using the amidocarbonylation reaction (1) |
US8043837B2 (en) * | 2006-03-07 | 2011-10-25 | Cargill, Incorporated | Aldolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
MX2008011442A (es) * | 2006-03-07 | 2008-11-18 | Verenium Corp | Aldolasas, acidos nucleicos que las codifican, y metodos para hacer y usar las mismas. |
KR100905381B1 (ko) | 2006-07-28 | 2009-06-30 | 씨제이제일제당 (주) | L-메치오닌 전구체 생산 균주 및 상기 l-메치오닌전구체로부터의 l-메치오닌 및 유기산의 생산방법 |
CN102317464B (zh) * | 2008-12-12 | 2014-10-29 | 塞莱西翁有限公司 | 从α-酮酸生物合成双官能烷烃 |
US8372601B2 (en) * | 2010-01-21 | 2013-02-12 | University Of Illinois At Urbana-Champaign | Compositions and methods for the synthesis of APPA-containing peptides |
WO2011100265A2 (en) * | 2010-02-10 | 2011-08-18 | Codexis, Inc. | Processes using amino acid dehydrogenases and ketoreductase-based cofactor regenerating system |
JP2013535203A (ja) * | 2010-07-26 | 2013-09-12 | ジェノマティカ・インコーポレイテッド | 芳香族、2,4−ペンタジエノエートおよび1,3−ブタジエンを生合成するための微生物および方法 |
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