KR20170124006A - Method for predicting antioxidation - Google Patents
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Abstract
Description
본 명세서는 항산화능의 예측 방법에 관하여 기술한다.This specification describes a method for predicting antioxidant ability.
체내 효소계, 환원대사, 화학약품, 공해물질 및 광화학반응 등의 각종 물리적, 화학적 및 환경적 요인 등에 의하여 생성되는 활성산소는 세포구성 성분들인 지질, 단백질, 당 및 DNA 등에 대하여 비선택적, 비가역적인 파괴작용을 함으로써 세포노화 또는 암을 비롯한 각종 질병을 일으키는 것으로 알려져 있다. 또한 이들 활성산소에 의한 지질과산화의 결과로 생성되는 지질 과산화물을 비롯한 여러 가지 체내 과산화물도 세포에 대한 산화적 파괴를 일으켜 각종 기능장애를 야기함으로써 여러 가지 질병의 원인이 되기도 한다.Active oxygen generated by various physical, chemical and environmental factors such as in vivo enzymes, reductive metabolism, chemicals, pollutants and photochemical reactions can cause non-selective and irreversible destruction of cellular components such as lipids, proteins, It is known to cause various diseases including cancer and senescence. In addition, lipid peroxides and various peroxides such as lipid peroxides produced as a result of lipid peroxidation by these active oxygen also cause oxidative destruction to cells and cause various dysfunctions and cause various diseases.
흔히 유해산소라고 알려진 활성산소는 가장 안정한 형태의 산소인 삼중항산소(3O2)가 산화, 화원 과정에서 환원되어 생성되는 일중항산소인 슈퍼옥사이드 음이온(1O2 -)과 과산화수소(H2O2), 하이드록시라디칼(·OH)과 같은 짝짓지 않은 상태의 자유 라디칼로서, 이들은 단백질, DNA, 효소 또는 T세포와 같은 면역계통의 인자를 손상시켜 질환을 일으킨다.Active oxygen, which is commonly known as harmful oxygen, is a superoxide anion ( 1 O 2 - ) and hydrogen peroxide (H 2 ), which are the most stable forms of oxygen, trioxide oxygen ( 3 O 2 ) O 2 ), and hydroxyl radicals (· OH), which cause damage to the immune system, such as proteins, DNA, enzymes or T cells.
자유 라디칼 및 활성 유해 산소 등이 증가함으로써 생기는 과도한 화학적 자극 및 산화 스트레스 등은 피부의 정상기능 저하 및 피부 노화현상을 촉진하여 피부를 손상시키게 된다.Excessive chemical stimulation and oxidative stress caused by the increase of free radicals and active harmful oxygen, etc., will damage the skin by promoting normal skin function and aging of the skin.
이러한 내적, 외적 요인에 의한 피부노화 및 손상을 방지하여 보다 피부의 고유기능을 유지시키고 피부세포를 활성화시켜 피부 신진대사를 촉진하여 필부 활력 증진을 향상시키는 노력이 요구되고 있다.There is a demand for efforts to improve skin vitality by promoting skin metabolism by activating skin cells and maintaining natural functions of skin by preventing skin aging and damage caused by internal and external factors.
그러나 유전적, 환경적 영향에 따라 개인별 피부 특성이 매우 상이하므로 동일한 방법을 사용하였을 때에 나타나는 효과는 매우 다양하게 나타날 수 있다. 따라서 효과적인 피부 상태 유지 및 개선을 위해서는 개인별 피부 특성을 파악하는 것이 중요하다.However, due to the genetic and environmental influences, the individual skin characteristics are very different, so the effects of using the same method can vary widely. Therefore, it is important to understand individual skin characteristics in order to maintain and improve effective skin condition.
개인이 가진 유전적 특성은 유전자를 통하여 진단할 수 있으며, 예를 들어 특정 질환의 발병 위험도를 확인하기 위하여 유전자 수준의 마커를 이용한 진단 방법들이 이루어지고 있다. 이러한 방법에서는 표적 특성과 관련성을 갖는 마커의 규명이 필요하다.Genetic characteristics of individuals can be diagnosed through genes. For example, diagnostic methods using genetic markers are being conducted to identify the risk of developing a specific disease. In such a method, it is necessary to identify the marker having a relation with the target characteristic.
나아가 피부 특성은 다양한 유전적 특성의 조합에 의하여 나타나는 것으로 특성에 관여하는 요인들을 밝혀 보다 정확한 피부 특성의 판단을 위한 방법에 대한 요구가 존재한다.Furthermore, the skin characteristic is represented by a combination of various genetic characteristics, and there is a demand for a method for determining more accurate skin characteristic by revealing the factors involved in the characteristic.
일 측면에서, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는 개인이 유전적으로 보유한 항산화능에 관한 정보를 제공하는 것이다.In one aspect, the problem to be solved by the present invention is to provide information about the antioxidant ability genetically possessed by an individual.
다른 측면에서, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는 특정 유전자형을 통해 개인의 활성산소 등의 생성 정도, 산화 스트레스에 대한 방어능을 정확하게 예측하는 것이다.In another aspect, the object of the present invention is to accurately predict the degree of production of active oxygen and the like, and the ability to protect against oxidative stress through a specific genotype.
또 다른 측면에서, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는 특정 유전자형의 관련도 및 특정 유전자의 영향도를 반영하여 개인이 타고난 항산화능에 대하여 정확도 높게 예측하는 것이다.In another aspect, an object of the present invention is to accurately predict an individual's antioxidant ability by reflecting the degree of association of a specific genotype and the degree of influence of a specific gene.
또 다른 측면에서, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는 인종별로 나타나는 유전적 특성을 반영하여 특정 유전자형의 관련도 및 특정 유전자의 영향도를 고려하여 개인이 타고난 항산화능에 대하여 정확도 높게 예측하는 것이다.In another aspect, the object of the present invention is to predict the antioxidant ability of an individual with high accuracy in consideration of the genetic characteristic of each race, considering the degree of association of a specific genotype and the influence of a specific gene.
본 발명 일 관점에서, 검체로부터 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상을 측정하고, 상기 유전자의 SNP 위치의 염기에 따라 유전적 항산화능을 분석하는 것을 포함하는 항산화능에 대한 정보 제공 방법을 제공한다.In one aspect of the present invention, rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism SNP of the NQO1 gene, rs6721961 SNP ), Antioxidant activity including one or more of rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of PON1 gene and rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of CYBA gene and analyzing genetic antioxidant ability according to the base of SNP position of the gene It provides a method of providing information about capabilities.
본 발명 다른 관점에서 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상의 SNP 위치의 염기를 검출하는 프라이머 및 프로브 중 하나 이상을 포함하는 항산화능 예측용 조성물을 제공한다.In another aspect of the present invention, rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism SNP of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, A primer and a probe for detecting a base at one or more SNP positions among the rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the gene and the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene.
본 발명 또 다른 관점에서, 상기 항산화능 예측용 조성물을 포함하는 항산화능 예측용 키트를 제공한다.In another aspect of the present invention, there is provided a kit for predicting the antioxidant ability, which comprises the composition for predicting the antioxidant ability.
일 측면에서, 본 발명은 개인이 유전적으로 보유한 항산화능에 관한 정보를 제공할 수 있다.In one aspect, the invention can provide information about the antioxidant potential genetically possessed by an individual.
다른 측면에서, 본 발명은 특정 유전자형을 통해 개인의 활성산소 등의 생성 정도, 산화스트레스에 대한 방어능을 예측할 수 있다.In another aspect, the present invention can predict the degree of production of active oxygen and the like, and the ability to protect against oxidative stress through a specific genotype.
또 다른 측면에서, 본 발명은 특정 유전자형의 관련도 및 특정 유전자의 영향도를 반영하여 개인이 타고난 항산화능에 대하여 정확도 높게 예측할 수 있다.In another aspect, the present invention can accurately predict an individual's antioxidant ability by reflecting the degree of association of a specific genotype and the degree of influence of a specific gene.
또 다른 측면에서, 본 발명은 인종별로 나타나는 유전적 특성을 반영하여 특정 유전자형의 관련도 및 특정 유전자의 영향도를 고려하여 개인이 타고난 항산화능에 대하여 정확도 높게 예측할 수 있다.In another aspect, the present invention can accurately predict the antioxidant ability of an individual in consideration of the genetic characteristic of each race, considering the degree of association of a specific genotype and the influence of a specific gene.
또 다른 측면에서, 본 발명은 활성 산소 생성 경향, 활성산소와 같은 산화 대사물에 대한 중화능과 같은 산화스트레스에 대한 방어능 등의 항산화와 관련된 특성을 정확도 높게 예측하여 이에 따른 적절한 항산화 관리에 관한 기준을 제공할 수 있다.In another aspect, the present invention provides a method for predicting antioxidant-related characteristics such as active oxygen generation tendency, antioxidative ability against oxidative stress such as neutralizing ability to oxidized metabolites such as active oxygen with high accuracy, Standards can be provided.
도 1은 TaqMan 프로브법에 따른 단일염기다형성 검출 방법의 작업 흐름을 도식화한 것이다.
도 2는 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP)을 표시한 염기서열을 나타낸다.
도 3은 GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성을 표시한 염기서열을 나타낸다.
도 4는 NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성을 표시한 염기서열을 나타낸다.
도 5는 NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성을 표시한 염기서열을 나타낸다.
도 6은 PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성을 표시한 염기서열을 나타낸다.
도 7은 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성을 표시한 염기서열을 나타낸다.FIG. 1 is a diagram illustrating a workflow of a single base polymorphism detection method according to the TaqMan probe method.
Figure 2 shows the nucleotide sequence representing the rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene.
Figure 3 shows the nucleotide sequence representing the rs1050450 single nucleotide polymorphism of the GPX1 gene.
Fig. 4 shows the nucleotide sequence representing the rs1800566 single nucleotide polymorphism of the NQO1 gene.
Figure 5 shows the nucleotide sequence representing the rs6721961 single nucleotide polymorphism of the NFE2L2 gene.
6 shows the nucleotide sequence representing the rs662 single nucleotide polymorphism of the PON1 gene.
Fig. 7 shows the nucleotide sequence representing the rs4673 single base polymorphism of the CYBA gene.
이하, 본 발명의 실시예들을 보다 상세하게 설명하고자 한다. 그러나 본 출원에 개시된 기술은 여기서 설명되는 실시예들에 한정되지 않고 다른 형태로 구체화될 수도 있다. 단지, 여기서 소개되는 실시예들은 개시된 내용이 철저하고 완전해질 수 있도록 그리고 당업자에게 본 출원의 사상이 충분히 전달될 수 있도록 하기 위해 제공되는 것이다. 또한, 해당 분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 본 출원의 기술적 사상을 벗어나지 않는 범위 내에서 본 출원의 사상을 다양한 다른 형태로 구현할 수 있을 것이다.Hereinafter, embodiments of the present invention will be described in more detail. However, the techniques disclosed in the present application are not limited to the embodiments described herein but may be embodied in other forms. It should be understood, however, that the embodiments disclosed herein are provided so that this disclosure will be thorough and complete, and will fully convey the scope of the invention to those skilled in the art. It will be apparent to those skilled in the art that various modifications and variations can be made in the present invention without departing from the spirit and scope of the invention.
본 명세서에서, “단일염기다형성(SNP, Single nucleotide polymorphism”이란 DNA에서 단일염기가 상이하게 나타나는 염기 변이를 의미하며, 개인에 따라 편차를 나타낸다. 이러한 단일염기다형성이 나타나는 유전자 상의 위치에 따라 발현되는 단백질 구조, 발현 수준, 또는 발현 형태 등에 영향을 미칠 수 있다.In the present specification, " single nucleotide polymorphism " (SNP) refers to a base mutation in which a single nucleotide appears differently in DNA, and shows a deviation depending on an individual. Such single nucleotide polymorphism Protein structure, expression level, or expression pattern, and the like.
본 명세서에서 SNP를 특정하는 rs 번호는 NCBI(National center for Biotechnology Information)의 기준번호이다.In the present specification, the rs number specifying the SNP is a reference number of NCBI (National Center for Biotechnology Information).
본 명세서에서 “프로브(probe)”란 유전자의 표적 부위와 상보적으로 결합할 수 있는 서열의 염기를 갖는 폴리뉴클레오타이드, 그 변이체, 또는 폴리뉴클레오타이드와 이에 결합된 표지 물질을 포함하는 것을 의미한다.As used herein, the term " probe " refers to a polynucleotide, a variant thereof, or a polynucleotide having a base sequence complementary to a target site of a gene and a marker substance bound thereto.
본 명세서에서 “프라이머(primer)”란 유전자의 표적 부위에 해당하는 특정 영역을 PCR을 이용하여 증폭하기 위하여 사용하는 유전자 특정 영역의 말단에 상보적으로 결합할 수 있는 서열의 염기를 갖는 폴리뉴클레오타이드 또는 그 변이체를 의미한다. 상기 프라미어는 특정 영역 말단과 완전히 상보적일 것을 요구하지 않으며, 상기 말단에 혼성화되어 이중사슬 구조를 형성할 정도로 상보적이라면 사용될 수 있다.As used herein, the term " primer " refers to a polynucleotide having a base sequence complementary to the end of a specific region of a gene used for amplifying a specific region corresponding to a target region of the gene using PCR Means a variant thereof. The primer does not need to be completely complementary to the end of a specific region and can be used if it is complementary enough to hybridize to the terminal to form a double-stranded structure.
본 명세서에서 “혼성화(hybridization)”란 2개의 단일 가닥 핵산이 상보적인 염기 서열들의 페어링(pairing)에 의하여 이합체 구조(duplex structure)를 형성하는 것을 의미한다. 혼성화는 단일 가닥 핵산 서열 간의 상보성이 완전할 경우(perfect match) 뿐 아니라 일부 미스매치(mismatch) 염기가 존재하여도 일어날 수 있다.As used herein, " hybridization " means that two single-stranded nucleic acids form a duplex structure by pairing complementary base sequences. Hybridization can occur not only in perfect complementarity between single-stranded nucleic acid sequences, but also in the presence of some mismatching nucleotides.
본 명세서에서 “유전자형의 빈도”는 유전자 풀(genetic pool)에서 당해 유전자형이 나타나는 빈도를 백분율로 나타낸 것을 의미한다. 상기 유전자 풀은 전체 인류의 유전자 풀 또는 특정 인종이나 공통적인 유전적 연관성을 갖는 집단의 유전자 풀일 수 있다. 예를 들어, 아시아인의 유전자 풀에서의 유전자형의 빈도는 http://asia.ensembl.org 에서 정보를 얻을 수 있다.As used herein, the term " frequency of genotypes " refers to the frequency of occurrence of the genotype in the genetic pool as a percentage. The gene pool may be a pool of whole human species or a gene pool of a particular race or group with a common genetic association. For example, the frequency of genotypes in Asian gene pools can be found at http://asia.ensembl.org.
일 실시예에서, 본 발명은 항산화능에 대한 정보 제공 방법을 제공한다.In one embodiment, the invention provides a method of providing information on antioxidant ability.
본 실시예에서, 항산화능에 대한 정보 제공 방법은 검체의 DNA로부터 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상을 측정하고, 상기 유전자의 SNP 위치의 염기에 따라 유전적 항산화능을 분석하는 것을 포함할 수 있다.In this example, the method of providing information on the antioxidant ability includes rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, NFE2L2 One or more of the rs6721961 single nucleotide polymorphism (SNP) of the gene, the rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene and the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene were measured and genetic antioxidant And analyzing performance.
상기 검체로부터 유전자의 단일염기다형성을 측정하는 것은 검체의 DNA로부터 상기 각 유전자의 SNP 위치의 염기를 확인하는 것을 포함할 수 있다. 염기의 확인 방법은 통상적으로 단일염기다형(SNP)의 검출에 이용되는 방법이라면 특별히 제한되지 않으며, 예를 들어 상기 부위의 서열을 시퀀싱(sequencing)에 의하여 분석하거나, 상기 단일염기다형성(SNP) 부위의 서열을 포함하는 프로브 또는 상기 서열에 상보적인 프로브를 사용하여 검체 DNA와 혼성화시켜 혼성화 정도를 측정하는 방법 등을 이용할 수 있다. 예를 들어 대립형질 특이적 혼성화(Allele-specific hybridization)를 이용한 TaqManTM 프로브법, 중합반응을 통한 대립형질 특이적 혼성화(Allele-specific hybridization)를 이용한 프로브법, 제한효소를 이용한 제한 단편화 길이 다형성(RFLP, Restriction Fragment Length Polymorphism)법, 용융온도(Tm, melting temperature)을 이용한 역동적 대립형질 특이적 혼성화(DASH, Dynamic Allele-Specific Hybridization)법, 중합반응을 이용한 파이로시퀀싱(pyrosequencing), 대립형질 특이적 신장(Allele-Specific Extension)을 이용한 마이크로어레이 방법 등을 사용할 수 있으나 이에 제한되지 않는다.The measurement of the single base polymorphism of the gene from the sample may include identifying a base at the SNP position of each gene from the DNA of the sample. The method for identifying a base is not particularly limited as long as it is a method used for detecting a single nucleotide polymorphism (SNP). For example, the nucleotide sequence may be analyzed by sequencing, , Or a method of hybridizing with sample DNA using a probe complementary to the above sequence to measure the degree of hybridization. For example, TaqMan TM using allele-specific hybridization Probe method using allele-specific hybridization through polymerisation, restriction fragment length polymorphism (RFLP) method using restriction enzymes, melting temperature (Tm) A dynamic allele-specific hybridization (DASH) method, a pyrosequencing method using a polymerization reaction, a microarray method using an allele-specific extension, or the like can be used But is not limited thereto.
일 구체예에서, 상기 검체로부터 유전자의 단일염기다형성을 측정하는 것은, (a) 검체로부터 DNA를 얻는 단계; (b) 상기 DNA에서 상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상의 SNP 부위의 증폭 반응을 수행하는 단계; 및 (c) 상기 증폭된 DNA에서 SNP 위치의 염기를 확인하는 단계;를 포함할 수 있다.In one embodiment, measuring a single base polymorphism of a gene from the sample comprises: (a) obtaining DNA from the sample; (b) rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 SNP of the NFE2L2 gene, , An rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene, and an rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene; And (c) identifying a base at the SNP position in the amplified DNA.
상기 검체는 인간으로부터 분리된 상피세포, 각질형성세포, 섬유아세포 또는 멜라닌형성세포일 수 있으나 이에 제한되지 않는다.The specimen can be, but is not limited to, human epithelial cells, keratinocytes, fibroblasts or melanin-forming cells.
인간 SOD2 (superoxide dismutase 2)유전자는 자유라디칼 중화 효소를 코딩하는 유전자로서 상기 SOD2의 rs4880 SNP는 SOD2로부터 코딩되는 효소에 영향을 미치므로 대사 과정에서 생성되는 슈퍼옥사이드 등의 자유라디칼의 중화 즉, 산화스트레스에 대한 방어능에 영향을 미친다.Since the human superoxide dismutase 2 (SOD2) gene is a gene encoding a free radical neutralizing enzyme, the rs4880 SNP of SOD2 affects the enzyme encoded by SOD2, and thus neutralization of free radicals such as superoxide It affects the ability to defend against stress.
상기 SOD2 유전자의 단일염기다형성(SNP)인 rs4880 에 해당하는 폴리뉴클레오타이드는, SNP 위치에서 염기가 T 또는 C 인 단일염기다형성을 갖는다. 상기 단일염기다형성 위치의 유전자형은 TT, TC 또는 CC일 수 있다.The polynucleotide corresponding to rs4880, the single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, has a single base polymorphism in which the base is T or C at the SNP position. The genotype of the single nucleotide polymorphic position may be TT, TC or CC.
상기 SOD2 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 TT, TC 또는 CC인 경우, TT > TC > CC의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것으로 판정할 수 있다.In the SOD2 gene, when the genotype of the SNP locus is TT, TC or CC, it can be judged that the genetic antioxidant ability is superior in order of TT> TC> CC.
인간 GPX1 유전자는 과산화수소 중화효소를 코딩하는 유전자로서, 상기 효소는 슈퍼옥사이드의 1차 중화에 의해 생성되는 과산화수소를 중화시킨다. 상기 GPX1 의 rs1050450 SNP에 따라 산화스트레스에 대한 방어능에 영향을 미칠 수 있다.The human GPX1 gene is a gene encoding a hydrogen peroxide neutralizing enzyme, which neutralizes the hydrogen peroxide produced by the primary neutralization of the superoxide. It may affect the ability to protect against oxidative stress according to rs1050450 SNP of GPX1.
상기 GPX1 유전자의 단일염기다형성(SNP)인 rs1050450 에 해당하는 폴리뉴클레오타이드는, SNP 위치에서 염기가 T 또는 C 인 단일염기다형성을 갖는다. 상기 단일염기다형성 위치의 유전자형은 TT, CT 또는 CC 일 수 있다.The polynucleotide corresponding to rs1050450, which is the single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, has a single base polymorphism in which the base is T or C at the SNP position. The genotype of the single nucleotide polymorphic position may be TT, CT or CC.
상기 GPX1 유전자에 있어서, 상기 SNP 위치 염기의 유전자형(genotype)이 TT, CT 또는 CC 인 경우, TT > CT > CC 의 순서로 유전적으로 항산화능이 우수한 것으로 판정할 수 있다.In the GPX1 gene, when the genotype of the SNP locus is TT, CT or CC, it can be judged that the antioxidant ability is genetically superior in order of TT> CT> CC.
인간 NQO1 유전자는 퀴논 환원 효소를 코딩하는 유전자로서, 활성산소의 일종인 퀴논을 중화시키는 역할을 한다. 상기 NQO1 의 rs1800566 SNP는 퀴논 중화에 따른 산화스트레스에 대한 방어능에 영향을 미칠 수 있다.The human NQO1 gene is a gene encoding a quinone reductase and serves to neutralize quinone, a kind of active oxygen. The SNP of rs1800566 of NQO1 may affect the ability to protect against oxidation stress due to quinone neutralization.
상기 NQO1 유전자의 단일염기다형성(SNP)인 rs1800566에 해당하는 폴리뉴클레오타이드는, SNP 위치에서 염기가 T 또는 C 인 단일염기다형성을 갖는다. 상기 단일염기다형성 위치의 유전자형은 TT, CT 또는 CC 일 수 있다.The polynucleotide corresponding to rs1800566, which is the single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, has a single base polymorphism in which the base is T or C at the SNP position. The genotype of the single nucleotide polymorphic position may be TT, CT or CC.
상기 NQO1 유전자에 있어서, 상기 SNP 위치 염기의 유전자형(genotype)이 TT, CT 또는 CC 인 경우, TT > CT > CC 의 순서로 유전적으로 항산화능이 우수한 것으로 판정할 수 있다.In the NQO1 gene, when the genotype of the SNP locating base is TT, CT or CC, it can be judged that the antioxidant ability is genetically superior in order of TT> CT> CC.
인간 NFE2L2 유전자는 항산화 유전자의 발현을 조절하며, 산화스트레스가 있는 상황에서 상기 유전자가 핵으로 이동하여 항산화 유전자 발현을 유도하는 역할을 한다. 상기 NFE2L2의 rs6721961 SNP는 항산화능에 영향을 미칠 수 있다.The human NFE2L2 gene regulates the expression of the antioxidant gene, and in the presence of oxidative stress, the gene migrates to the nucleus and induces antioxidant gene expression. The rs6721961 SNP of NFE2L2 may affect the antioxidant ability.
상기 NFE2L2 유전자의 단일염기다형성(SNP)인 rs6721961에 해당하는 폴리뉴클레오타이드는, SNP 위치에서 염기가 G 또는 T 인 단일염기다형성을 갖는다. 상기 단일염기다형성 위치의 유전자형은 GG, TG 또는 TT일 수 있다.The polynucleotide corresponding to rs6721961, the single nucleotide polymorphism (SNP) of the NFE2L2 gene, has a single base polymorphism in which the base is G or T at the SNP position. The genotype of the single nucleotide polymorphic position may be GG, TG or TT.
상기 NFE2L2 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 GG, TG 또는 TT인 경우, GG > TG > TT의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것으로 판정할 수 있다.In the NFE2L2 gene, when the genotype of the SNP locus is GG, TG or TT, it can be judged that the genetic antioxidant ability is superior in order of GG> TG> TT.
인간 PON1 유전자는 혈청의 파라옥소네이즈(paraoxonase)를 코딩하는 유전자로서, 상기 유전자 활성은 염증과 산화스트레스 손상에 대한 지표이다. 상기 PON1의 rs662 SNP는 산화스트레스 손상에 영향을 미칠 수 있다.The human PON1 gene is a gene encoding serum paraoxonase, and the gene activity is an index of inflammation and oxidative stress damage. The rs662 SNP of PON1 may affect oxidative stress damage.
상기 PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP)인 rs662에 해당하는 폴리뉴클레오타이드는, SNP 위치에서 염기가 인 단일염기다형성을 갖는다. The polynucleotide corresponding to the rs662 single base polymorphism (SNP) rs662 of the PON1 gene has a base single polymorphism at the SNP position.
상기 PON1 유전자에 있어서, SNP 위치에서 염기가 G 또는 A 인 단일염기다형성을 갖는다. 상기 단일염기다형성 위치의 유전자형은 GG, AG 또는 AA일 수 있다.In the PON1 gene, it has a single base polymorphism in which the base is G or A at the SNP position. The genotype of the single nucleotide polymorphic position may be GG, AG or AA.
상기 PON1 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 GG, AG 또는 AA인 경우, GG > AG > AA의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것으로 판정할 수 있다.In the PON1 gene, when the genotype of the SNP locus is GG, AG or AA, it can be judged that the genetic antioxidant ability is superior in order of GG> AG> AA.
인간 CYBA 유전자는 사이토크롬b 구성 분자를 코딩하는 유전자로서, 슈퍼옥사이드 생산과 대신세포 작용에 관여한다. 상기 CYBA의 rs4673 SNP는 활성산소 생성 정도에 영향을 미칠 수 있다.The human CYBA gene is a gene encoding a cytochrome b constituent molecule, and is involved in superoxide production and cell action instead. The rs4673 SNP of CYBA may affect the degree of active oxygen production.
상기 CYBA의 단일염기다형성(SNP)인 rs4673에 해당하는 폴리뉴클레오타이드는, SNP 위치에서 염기가 T 또는 C 인 단일염기다형성을 갖는다. 상기 단일염기다형성 위치의 유전자형은 TT, CT 또는 CC 일 수 있다.The polynucleotide corresponding to rs4673, which is the single base polymorphism (SNP) of CYBA, has a single base polymorphism in which the base is T or C at the SNP position. The genotype of the single nucleotide polymorphic position may be TT, CT or CC.
상기 CYBA 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 상기 SNP 위치 염기의 유전자형(genotype)이 TT, CT 또는 CC 인 경우, TT > CT > CC 의 순서로 유전적으로 항산화능이 우수한 것으로 판정할 수 있다.In the CYBA gene, when the genotype of the SNP locus base is TT, CT or CC, the genotype of the SNP locus is TT> CT> CC, it can be judged genetically to be superior in antioxidant ability.
일 구체예에서, 상기 검체로부터 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2 이상에 대한 분석을 조합하여 유전적 항산화능을 판정할 수 있다. 기능이 상이한 각 유전자의 SNP의 항산화능에 대한 관련도에 따라 각 유전자의 기여도를 조정하여 보다 정확한 항산화능에 관한 정보 제공이 가능하다.In one embodiment, rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene ), The rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene and the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene can be combined to determine genetic antioxidant capacity. It is possible to provide more accurate information on the antioxidant ability by regulating the contribution of each gene according to the degree of association of the SNPs of the different genes with different functions.
다른 실시예에서, 상기 정보 제공 방법은 검체로부터 상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상을 측정하여 상기 각각의 유전자로부터 유전자형 점수 SG 를 산출하여 이를 분석하는 것을 포함할 수 있다.In another embodiment, the method of providing information comprises obtaining rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 One or more of the single nucleotide polymorphism (SNP), the rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene and the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene were measured and the genotype score S G And analyzing it.
상기 유전자의 SNP 위치의 염기에 따라 피부의 유전적 항산화능을 판별할 수 있다. 상기 유전자의 SNP 서열을 확인하여 개인이 유전적으로 타고난 활성산소 생성 정도, 산화에 의해 생성되는 슈퍼옥사이드, 자유라디칼 등의 중화능, 산화스트레스에 의한 손상 정도 등의 산화스트레스에 대한 방어능 등의 기능을 확인할 수 있다. 상기 유전자의 SNP 서열을 확인하여 개인이 유전적으로 타고난 항산화능을 판정할 수 있다.The genetic antioxidant ability of the skin can be determined according to the base at the SNP position of the gene. The SNP sequence of the gene can be confirmed to show the ability of the individual to protect against oxidative stress such as the degree of genetically innate active oxygen production, the neutralization ability such as superoxide generated by oxidation, the free radical, and the degree of damage due to oxidative stress can confirm. The SNP sequence of the gene can be confirmed to determine the genetically innate antioxidant ability of an individual.
상기 유전자의 SNP 위치 염기의 유전자형(genotype)을 E0, E1 및 E2라 할 때, E0 > E1 > E2의 순서로 항산화능이 우수하고, 상기 유전자형에 따라 점수를 부여할 수 있다.When the genotype of the SNP locus of the gene is E0, E1 and E2, the antioxidative ability is excellent in order of E0 > E1 > E2, and scores can be given according to the genotype.
상기 유전자형 점수 SG 는 E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 미만인 경우, 검체의 유전자형이 E0이면 SG=1, E1이면 0.4 ≤ SG ≤ 0.98, E2이면 0.1 ≤ SG ≤ 0.85일 수 있으며, 예를 들어, E0이면 SG=1, E1이면 0.5 ≤ SG ≤ 0.95, E2이면 0.2 ≤ SG ≤ 0.75일 수 있다. 단 상기 E0, E1, E2의 유전자형 점수는 E0 > E1 > E2이다. 일예에서, 상기 유전자형 점수는 E0 유전자형의 빈도, SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 에 대한 유전자형 점수 간의 반영 비율에 따라 적절하게 조정될 수 있다. 일예에서, 상기 유전자형 점수는 검체 풀에서의 나타나는 유전자형 비율을 고려하여 적절하게 조정될 수 있다.The genotype score S G If the frequency F E0 of E0 genotype is less than 45%, and the genotype of the subject is E0 is be S G = 1, E1 is 0.4 ≤ if S G ≤ 0.98, E2 0.1 ≤ S G ≤ 0.85, for example, If E0, S G = 1, if E1, 0.5? S G ? 0.95, and if E2, 0.2? S G ? 0.75. However, the genotype scores of E0, E1 and E2 are E0>E1> E2. In one embodiment, the genotypic score includes the frequency of the E0 genotype, rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism SNP of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism (SNP), the rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene, and the genotype score for the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene. In one example, the genotypic score may be appropriately adjusted in consideration of the genotype ratio appearing in the sample pool.
상기 유전자형 점수 SG 는 E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 이상인 경우, 하기 식 1로 나타낼 수 있다.The genotype score S G can be represented by the following formula 1 when the frequency F of the E0 E0 genotype is not less than 45%.
<식 1><Formula 1>
유전자형 점수(SG) = Fs / FE0 Genotype score (S G ) = F s / F E0
상기 Fs는 검체의 유전자형의 빈도이고, FE0는 E0 유전자형의 빈도이다.F s is the frequency of the genotype of the specimen, and F E0 is the frequency of the E0 genotype.
상기와 같이 특정 유전자형의 빈도에 따라 유전자형 점수를 산출하여 실제 유전자 풀에서의 빈도를 반영하기 때문에, 보다 검체에 적합하게 매칭된 정보를 제공할 수 있다. 특히, 유전자 풀을 검체가 속하는 특정 인종 또는 유전적 관련성을 갖는 집단으로 한정하여, 보다 정확한 정보의 제공이 가능하다.Since the genotype score is calculated according to the frequency of the specific genotype as described above and the frequency in the actual gene pool is reflected, more matching information can be provided for the specimen. In particular, it is possible to provide more accurate information by limiting the gene pool to a specific racial or genetic association group to which the specimen belongs.
상기 E0, E1 및 E2의 유전자형은 상술한 각각의 유전자의 SNP 염기 유전자형에 따른 항산화능 순서에 관하여 설명한 바에 따르며, 구체적으로 하기 표 1에 나타내는 바와 같다.The genotypes E0, E1 and E2 described above are described in the order of the antioxidant ability according to the SNP base genotype of each of the genes described above, and specifically shown in Table 1 below.
상기 정보 제공에 있어서 유전자의 SNP 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수를 반영하는 경우, 해당 검체가 속하는 유전적 관련성을 갖는 집단에서 각 유전자가 항산화능에 따라 피부에 대하여 갖는 관련성의 정도에 따라 각 유전자에 대한 유전자형 점수의 반영 비율을 조절할 수 있다.In the case of reflecting the genotypic score for two or more SNPs of the gene in the provision of the above information, it is preferable that the genotypic score of each gene in the genetically related group to which the test sample belongs depends on the degree of relevance of each gene to the skin according to the antioxidant ability The proportion of genotypic scores can be adjusted.
일예에서, 상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 10 내지 50%, 20 내지 40%, 또는 25 내지 35%의 비율로 반영할 수 있다.In one embodiment, the genotype score for the rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene may be reflected at a rate of 10-50%, 20-40%, or 25-35%.
일예에서, 상기 GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 10 내지 50%, 20 내지 40%, 또는 25 내지 35%의 비율로 반영할 수 있다.In one example, the genotype score for the rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene may be reflected at a rate of 10-50%, 20-40%, or 25-35%.
일예에서, 상기 NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%, 1 내지 20%, 또는 5 내지 15%의 비율로 반영할 수 있다.In one example, the genotypic score for the rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene may be reflected at a rate of 0.5-30%, 1-20%, or 5-15%.
일예에서, 상기 NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%, 1 내지 20%, 또는 5 내지 15%의 비율로 반영할 수 있다.In one embodiment, the genotype score for the rs6721961 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NFE2L2 gene may be reflected at a rate of 0.5-30%, 1-20%, or 5-15%.
일예에서, 상기 PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%, 1 내지 20%, 또는 5 내지 15%의 비율로 반영할 수 있다.In one example, the genotype score for the rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene may be reflected at a rate of 0.5-30%, 1-20%, or 5-15%.
일예에서, 상기 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%, 1 내지 20%, 또는 5 내지 15%의 비율로 반영할 수 있다.In one embodiment, the genotype score for the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene may be reflected at a rate of 0.5-30%, 1-20%, or 5-15%.
일예에서, 상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수 SG 를 1-5 : 1-5 : 0.1-3 : 0.1-3 : 0.1-3 : 0.1-3의 비율로 반영할 수 있으며, 예를 들어 2-4 : 2-4 : 0.1-2 : 0.1-2 : 0.1-2 : 0.1-2의 비율로 반영할 수 있다. 상기 비율로 반영하였을 때, 유전적 항산화능에 관하여 보다 정확한 정보 제공이 가능하다.For example, rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism SNP of the NQO1 gene, rs6721961 SNP of the NFE2L2 gene, Genotype scores for rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) and rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of CYBA gene S G Can be reflected at a ratio of 1-5: 1-5: 0.1-3: 0.1-3: 0.1-3: 0.1-3. For example, 2-4: 2-4: 0.1-2: 0.1-2 : 0.1-2: 0.1-2. When this ratio is reflected, it is possible to provide more accurate information about the genetic antioxidant ability.
본 발명 실시예들에 따른 정보 제공 방법은 상기 6종의 유전자에 관한 단일염기다형성을 단순 판단하는 것 뿐 아니라, 이들의 유전자형 빈도가 반영된 유전자형 점수를 산출하여 보다 정확한 정보의 제공이 가능하다. 또한, 이들 유전자에 관한 판정을 단순 조합하는 것이 아니라 각 유전자를 특정 비율로 반영하여 보다 정확한 정보의 제공이 가능하다.The information providing method according to the embodiments of the present invention can provide more accurate information by not only determining single nucleotide polymorphisms related to the six genes but also calculating the genotype score reflecting the genotype frequencies of the genes. In addition, it is possible to provide more accurate information by reflecting each gene at a specific rate, rather than simply combining the judgments about these genes.
일 구체예에서, 상기 6종의 유전자에 관한 유전자형 점수를 반영하여 항산화능 점수를 산출할 수 있다. 상기 유전자형 점수의 반영 비율은 상술한 바와 같을 수 있다. 상기 점수에 따라 항산화능에 관한 등급을 분류하여 항산화능에 관한 정보를 제공할 수 있다. 일예에서, 상기 등급은 항산화능이 우수한 순서로 양호, 관심, 주의로 나눌 수 있으나 이에 제한되지 않는다.In one embodiment, the antioxidant ability score can be calculated by reflecting the genotype score of the six genes. The rate of reflection of the genotypic score may be as described above. According to the score, the class of the antioxidant ability can be classified to provide information about the antioxidant ability. In one example, the grade may be divided into good, interest, and attention, but not limited thereto, in order of superior antioxidant ability.
하기 도 2-7에 각각 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP)의 염기서열을 나타낸다. SOD2 유전자의 SNP 염기서열은 서열번호 1, GPX1 유전자의 SNP 염기서열은 서열번호 2, NQO1 유전자의 SNP 염기서열은 서열번호 3, NFE2L2 유전자의 SNP 염기서열은 서열번호 4, PON1 유전자의 SNP 염기서열은 서열번호 5, CYBA 유전자의 SNP 염기서열은 서열번호 6으로 표시한다. 도 2-7에서 대괄호로 나타낸 염기는 SNP 위치의 염기를 나타낸다.Rs488080 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 SNP of the NFE2L2 gene are shown in FIGS. , The rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene, and the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene. SNP base sequence of SOD2 gene is SEQ ID NO: 1, SNP base sequence of GPX1 gene is SEQ ID NO: 2, SNP base sequence of NQO1 gene is SEQ ID NO: 3, SNP base sequence of NFE2L2 gene is SNP base sequence of PON1 gene And the nucleotide sequence of the SNP of the CYBA gene is represented by SEQ ID NO: 6. The bases in brackets in Figs. 2-7 represent bases at the SNP position.
일 구체예에서, 상기 유전자의 SNP 위치의 염기를 검출하기 위하여 프라이머 및 프로브 중 하나 이상을 사용할 수 있다. In one embodiment, one or more of a primer and a probe may be used to detect a base at the SNP position of the gene.
상기 프로브는 상기 염기서열의 SNP 위치의 염기를 포함하는 20 내지 60개, 예를 들어, 40 내지 52개, 예를 들어 45 내지 50 개의 연속하는 염기서열, 또는 상기 염기서열에 상보적인 서열을 가질 수 있다. 상기 프로브는 상기 SNP 위치의 염기를 검출하기 위하여 상기 SNP 서열에 혼성화될 수 있을 정도의 서열을 가질 수 있다. 상기 프로브는 이러한 서열을 갖는 폴리뉴클레오타이드와 검출을 위해 이에 결합된 표지 물질을 포함할 수 있다.The probe may comprise 20 to 60, for example 40 to 52, for example 45 to 50 consecutive nucleotide sequences comprising a base at the SNP position of the nucleotide sequence, or a sequence complementary to the nucleotide sequence . The probe may have a sequence that is capable of hybridizing to the SNP sequence to detect a base at the SNP position. The probe may comprise a polynucleotide having such a sequence and a labeling substance bound thereto for detection.
상기 프라이머는 표적 부위의 유전자 단편의 5' 말단 및 3' 말단의 연속하는 10 내지 40개의 염기서열 각각에 대하여 상보적인 서열을 갖는 두 개의 폴리뉴클레오타이드로 이루어진 프라이머 세트를 포함할 수 있다. 상기 프라이머 세트는 표적 부위의 증폭을 위하여 사용되며, 상기 표적 부위는 상기 유전자의 SNP 위치의 염기를 포함하는 연속하는 염기서열이고, 예를 들어 상기 SNP 위치의 염기를 포함하는 50 내지 400개의 연속하는 염기서열일 수 있다. 상기 표적부위는 예를 들어 상기 SNP 위치의 염기를 포함하는 100 내지 300개의 연속하는 염기서열, 예를 들어 200개의 연속하는 염기서열일 수 있다.The primer may comprise a set of primers consisting of two polynucleotides having a sequence complementary to each of 10 to 40 consecutive nucleotide sequences at the 5 'and 3' ends of the gene fragment of the target site. The primer set is used for amplification of a target site, and the target site is a contiguous base sequence comprising a base at the SNP position of the gene, for example, 50 to 400 consecutive bases containing a base at the SNP position Base sequence. The target site may be, for example, 100 to 300 consecutive nucleotide sequences, including, for example, 200 consecutive nucleotide sequences containing a nucleotide at the SNP position.
본 발명 일 실시예에서, SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상의 SNP 위치의 염기를 검출하는 프라이머 및 프로브 중 하나 이상을 포함하는 항산화능 예측용 조성물을 제공할 수 있다. 상기 프라이머, 프로브는 상술한 유전자의 SNP 위치의 염기를 검출하기 위한 프라이머 및 프로브에 관하여 설명한 바와 동일하므로 설명을 생략한다.In one embodiment, rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 SNP of the NFE2L2 gene, , A primer and a probe for detecting a base at one or more SNP positions among the rs662 single base polymorphism (SNP) of the PON1 gene and the rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene can be provided have. The primer and the probe are the same as those described for the primer and the probe for detecting the base at the SNP position of the above-mentioned gene, and the description is omitted.
본 발명 일 실시예에서, 상기 항산화능 예측용 조성물을 포함하는 항산화능 예측용 키트를 제공할 수 있다.In one embodiment of the present invention, a kit for predicting an antioxidant ability including the composition for predicting the antioxidative ability can be provided.
본 발명 실시예들에 따르면, 개인이 유전적으로 보유한 항산화능에 관한 정보를 제공할 수 있다. 구체적으로 유전적 항산화능 관련된 특정 유전자의 단일염기다형성을 규명하여 이를 통해 개인이 타고난 피부 특성에 관한 정보를 제공할 수 있어, 피부에 관하여 개인의 특성에 특화된 관리, 치료, 유지 등에 적절한 정보를 제공할 수 있다.According to embodiments of the present invention, information about the antioxidant capacity genetically possessed by an individual can be provided. Specifically, it is possible to identify single nucleotide polymorphisms of a specific gene related to genetic antioxidant ability, thereby providing information on an individual's natural skin characteristics, thereby providing appropriate information on management, treatment, maintenance, etc. can do.
이하, 실시예, 비교예 및 시험예를 참조하여 본 발명을 상세히 설명한다. 이들은 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위해 예시적으로 제시한 것일 뿐, 본 발명의 범위가 이 실시예, 비교예 및 시험예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가지는 자에 있어서 자명할 것이다.Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to Examples, Comparative Examples and Test Examples. It is to be understood that both the foregoing general description and the following detailed description are exemplary and explanatory only and are not to be construed as limiting the scope of the present invention. It will be self-evident.
[시험예 1] 검체로부터 DNA 추출 및 증폭[Test Example 1] DNA extraction and amplification from a specimen
108명의 한국인을 대상으로 blood DNA(QIAamp DNA Blood Mini Kit, QIAGEN)를 이용하여 대상자 혈액으로부터 유전체(genomic) DNA를 추출하였다. 추출된 DNA를 정제하여 이하 실험에 사용하였다.Genomic DNA was extracted from blood of subjects using blood DNA (QIAamp DNA Blood Mini Kit, QIAGEN) in 108 Koreans. The extracted DNA was purified and used in the following experiments.
[시험예 2] 유전자 SNP 검출[Test Example 2] Detection of gene SNP
상기 시험예 1에서 증폭 및 정제된 대상자의 DNA를 주형으로 하고, 도 1에서 나타나는 바와 같은 TaqMan 프로브법을 통하여 각 유전자의 SNP를 검출하였다.Using the DNA of the subject amplified and purified in Test Example 1 as a template, the SNP of each gene was detected by the TaqMan probe method as shown in Fig.
구체적으로, 상기 시험예 1에서 얻어진 대상자의 유전체 DNA 20ng에, 2X TaqMan Universal PCR Master mix 12.5㎕, 하기 표 2에 따른 각 유전자 SNP에 특이적인 TaqMan SNP Genotyping Assay의 20X Primer and TaqMan Probe dye mix 1.25㎕, DNase가 없는 증류수 (DNase free sterile water) 11.25㎕를 사용하여 최종 반응 용액을 25㎕로 맞추어 Vortex mix하였다. 반응 용액을 96-웰 플레이트에 분주하여 PCR 반응을 수행하였다. PCR 조건은 95℃ 10분간 가온한 후(denaturation), 95℃ 15초(denaturation) 후 60℃ 1분(annealing and extension)의 반응을 40 cycle 반복하였다. 이 후, real-time PCR system(TaqMan Mastermix, ABI 사)을 이용하여 유전자 SNP를 검출하였다.Specifically, 12.5 .mu.l of 2X TaqMan Universal PCR Master mix, 20 .mu.l Primer and TaqMan Probe dye mix of TaqMan SNP Genotyping Assay specific to each gene SNP according to the following Table 2 was added to 20ng of the subject DNA obtained in Test Example 1 , And 11.25 μl of DNase-free sterile water. The final reaction solution was adjusted to 25 μl by vortexing. The reaction solution was dispensed into a 96-well plate to perform PCR reaction. The PCR conditions were 95 ℃ for 10 min, followed by denaturation at 95 ℃ for 15 sec and annealing and extension at 60 ℃ for 40 cycles. After that, gene SNP was detected using a real-time PCR system (TaqMan Mastermix, ABI).
[시험예 3] 유전자형 분석 및 유전자형 점수 산출 [Test Example 3] Genotype analysis and genotype score calculation
상기 시험예 2에서 확인한 SNP 유전자형을 이용하여 하기와 같이 검체의 유전자형 점수 SG 를 산출하였다.Using the SNP genotype identified in Test Example 2, the genotype score S G Respectively.
http://asia.ensembl.org 로부터 상기 표 3의 SNP 유전자형 각각에 대한 빈도(FE0, FE1, FE2)를 얻고, E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 미만인 경우, 하기 표 4에 나타내는 바와 같이 유전자형 점수를 산출하였고, E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 이상인 경우, 하기 식 1에 의해 구하였다.The frequency (F E0 , F E1 , F E2 ) for each of the SNP genotypes in Table 3 is obtained from http://asia.ensembl.org and when the frequency F E0 of the genotype of E0 is less than 45% And the frequency of the genotype of E0 was 45% or more, it was determined by the following equation (1).
<식 1><Formula 1>
유전자형 점수(SG) = Fs / FE0 Genotype score (S G ) = F s / F E0
상기 각 유전자의 유전자형 점수를 표 3의 순서대로 3:3:1:1:1:1의 비율로 반영하여 하기 표와 같이 항산화능에 관한 점수를 나타내었다.The genotypic scores of each of the above genes were reflected in the ratio of 3: 3: 1: 1: 1: 1 according to the order of Table 3, and the scores on the antioxidant ability were shown in the following table.
[시험예 4] 항산화능의 평가 [Test Example 4] Evaluation of antioxidant ability
상기 대상자의 항산화능을 하기와 같은 방법으로 평가하였다.The antioxidative capacity of the subject was evaluated by the following method.
[시험예 5] 항산화능 점수와 항산화능과의 상관 관계 확인[Test Example 5] Correlation between antioxidant ability score and antioxidant ability
상기 시험예 3에서 산출된 항산화능과 시험예 4에서 측정된 항산화능과의 상관 관계를 해석하였다.The correlation between the antioxidant capacity calculated in Test Example 3 and the antioxidant capacity measured in Test Example 4 was analyzed.
상기 결과로부터, 본원의 특정 유전자 SNP를 유전자형 빈도를 고려한 유전자형 점수를 통해 항산화능을 판별함으로써, 개인에 대하여 보다 정확한 항산화능에 대한 정보를 제공할 수 있음을 알 수 있다.From the above results, it can be seen that information on the antioxidant ability can be more accurately provided to the individual by discriminating the antioxidant ability of the specific gene SNP of the present invention through the genotype score in consideration of the genotype frequency.
<110> AMOREPACIFIC CORPORATION <120> Method for predicting antioxidation <130> 16P195/IND <160> 6 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 gggggggggg ggcggggcgg cggtgccctt gcggcgcagc tggggtcgcg gccctgctcc 60 ccgcgctttc ttaaggcccg cgggcggcgc aggagcggca ctcgtggctg tggtggcttc 120 ggcagcggct tcagcagatc ggcggcatca gcggtagcac cagcactagc agcatgttga 180 gccgggcagt gtgcgggtga gaagaaaggg gacccggtca cggccccaag ggcgaagggg 240 ctcgcggcgg gcagggcctc cgcggcaatg gcgacagtgg ccgcaccggg cctggcggga 300 ccggggcacc tgcaggcggt tctcccggga gtgcccggcg cggcggctgg agcggggatc 360 cgcagggagg ggacgcgggg actcggggga cgccgcgcgc tgccgttcct cggcagccca 420 gcctgcgtag acggtcccgc ggcgctgact gaccgggctg tgctttctcg tcttcagcac 480 cagcaggcag ctggctccgg ytttggggta tctgggctcc aggcagaagc acagcctccc 540 cgacctgccc tacgactacg gcgccctgga acctcacatc aacgcgcaga tcatgcagct 600 gcaccacagc aagcaccacg cggcctacgt gaacaacctg aacgtcaccg aggagaagta 660 ccaggaggcg ttggccaagg gtaggttcca ggctgagcgg cgggaggcag tccccggcag 720 aggcgacccc agggagccag gccccatacg gacgggcctc tccgtggagg agaactcgct 780 tcgtatttgt accggttccg agttttccag gcacgatagt ctctctttta aacacatggt 840 ctacctcatt gtagaaggag tgcctcgatg ggtttgaaca cacttctgtc atctcaggga 900 acttggggtc ctgcgaagga gcttgcctta ctgttgtgag ccacattccg ttacacatat 960 tgccagcact ggtgaattgt agggcctgaa aagaaagctc t 1001 <210> 2 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 2 ctgttgctcg tagctgctga aattcctctc cgcccttggg attgcgcatg gagggcaaaa 60 tcccggtgac tcatagaaaa tctcccttgt ttgtggttag aacgtttctc tcctcctctt 120 gaccccgggt tctagctgcc cttctctcct gtaggagaac gccaagaacg aagagattct 180 gaattccctc aagtacgtcc ggcctggtgg tgggttcgag cccaacttca tgctcttcga 240 gaagtgcgag gtgaacggtg cgggggcgca ccctctcttc gccttcctgc gggaggccct 300 gccagctccc agcgacgacg ccaccgcgct tatgaccgac cccaagctca tcacctggtc 360 tccggtgtgt cgcaacgatg ttgcctggaa ctttgagaag ttcctggtgg gccctgacgg 420 tgtgccccta cgcaggtaca gccgccgctt ccagaccatt gacatcgagc ctgacatcga 480 agccctgctg tctcaagggc ycagctgtgc ctagggcgcc cctcctaccc cggctgcttg 540 gcagttgcag tgctgctgtc tcgggggggt tttcatctat gagggtgttt cctctaaacc 600 tacgagggag gaacacctga tcttacagaa aataccacct cgagatgggt gctggtcctg 660 ttgatcccag tctctgccag accaaggcga gtttccccac taataaagtg ccgggtgtca 720 gcagaactgt gtgtatgtcc tgtgtcattg tcatttggga attctttttc ttttcttttt 780 tttttttttt ttttgagacg gagttttttg ctctattgcc caggctggag tgcagtggcg 840 caatctaggc tcactgcaag ctccgcctcc cgggttcacg ccattctcct gcctcaacct 900 cctgagtagc tgggactaca ggtgcctgcc accacgcccg gctaattttt tgtattttta 960 gtagagacag ggtttcaccg tgttagccag gatggtatcg a 1001 <210> 3 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 agtggaagcc gcaatgagcc gagatcgtgc catggcactc cagcctggac gaccgagcga 60 gactctgcct caaaaaaaaa aaaaaaaaga aaaagaaaaa aaggactcat ctagttatat 120 ggagaggcag agaaatgcac ccacgcaggt cttggtgagt cacctgccaa gaaactgaga 180 ctccctaaag taacagaact tccagccttc ttggcaaagg atccaggttg gcacagtttc 240 aaggtttatg catttaaaga agaacacacc tgagaaggct aaaattggta acggctaggt 300 agagggtaag 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120 agaggaggtc tccgttagct ccccggtgcc ggcgttcagt ttgccctccc ccgcaaataa 180 gggcagcgct ctcgcccgcg agataaagag ttgtttgcga aggtcgctgg agttcggacg 240 ctttgaaaca gtttaaacag ttggaacaaa cacacccgga gccccggaaa ggcgttggtg 300 taggagctgc gcctccctga tttggagttg cagaaccttg ccctgctttt atctcacttt 360 accgcccgag aatggcgcca gccggggtgg ggggggctaa agatttggac ccagaccgtg 420 ccactgccaa ctgccctccc gcccttgctc ccttcccggg ctggggccag tgggccctgc 480 ctaggggaga tgtggacagc kccggcagct cgtgttcgca gtcaccctga acgccctcct 540 ctgaactccc acgtgtctcc attctcctaa gctcaggtcg tcaaaggcaa acggagaagc 600 ccctttaggt cggagagtgg tcagtattgc ccacccagag ctgggagaaa aacgggaacc 660 ccaagagaac ctcttcccac caaagcgcag ccaccacgcc acagatggcg cccttcaaca 720 gtgtgtaata ccacaacatg ctgtaatcgt ttactcttta caaatttctt tttcacgtac 780 tcacaaaata gtacaaatta aaaaaagtta caaaaacgtt tgtatagtat tggctcattt 840 tataaaaacg tgcctagaaa aaaattgaag gttaccaata tattaaatgc tgtggaatca 900 acgattttta tgtttctcct tgttacttcc aagtatgctt taaatctgca gtgcgtatgt 960 tttatgtctt acattaaaaa caattattta aaaattaatc a 1001 <210> 5 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 ttcttatggg agttagttct atgtgagccc agatatgtga gcacattttt gccctgacaa 60 tgatttctgg cttaatttaa tttctactga atttagtgta tttacacaca gacacacaca 120 gatacacaca cacacacaca cacacacaca cacacacacg acgtaacact attttaagat 180 acatataata ggatttttat gttacagtgc tataatcacc tcctcagatt tcttagacca 240 atgattgtct aaggattgta tcggcaggac taatttcata ttaattgtgt tccattatag 300 ctagcacgaa ggctccatcc cacatcttga ttttaggaat agacagtgag gaatgccagt 360 taataatcct gtaatgttca ataccttcac cttatatatt atgtgtgtat gttttaattg 420 cagtttgaat gatattgttg ctgtgggacc tgagcacttt tatggcacaa atgatcacta 480 ttttcttgac ccctacttac ratcctggga gatgtatttg ggtttagcgt ggtcgtatgt 540 tgtctactat agtccaagtg aagttcgagt ggtggcagaa ggatttgatt ttgctaatgg 600 aatcaacatt tcacccgatg gcaagtatgt gaactctctg aaatgtagtg gatttactca 660 gattctcagg agatatcttg gaatatattc tttttttaag taatatgata cattttaaca 720 tgttacccta gtgagataaa attaggaaaa atgtaaaatg tcttaatttt tcagggggtg 780 aaatttatca aatcaaaaat ttcattgtga aggcatactg gttttatttc ctttttggaa 840 agaaagtaca ttttaagagg gggaactgtg atgaagattt gatatgtctg aatagctttg 900 ttttgagtaa agatgtgagt gtataatgag ttgaatagta tgcaggtata gatacgtcag 960 tagtgcaggt ttatgacaag atgaggaatt tgtaccaaaa t 1001 <210> 6 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 ctccagtgat cctcccgcct cagcctccca aaatgctggg attccaggca tgagccaccg 60 tgctcgggcc cctctctgtg ttgtcttcag taaagggagt tccctgtggc ccctcaggct 120 gagctgggct gttccttaac cacatggctt cagtgtggcg ggcgtgtttg tgtgcctgct 180 ggagtacccc cgggggaaga ggaagaaggg ctccaccatg gagcgctggt gagtctcctc 240 ctgctctggg gtctctccgg gggctgcggg gcccaggcag ggctcacagg gttgggtgga 300 gcttggtttc tcacttggag gctccggaac caaccctttg gtgcttgtgg gtaaaccaag 360 gccggtgcct gcccggtgtg ttttgtggga ggaaagaggc ctgggtgccc tggggtggtc 420 agcagggcag caaaggagtc ccgagtggga gaggcccagc cgcgccgtct cgccttcctc 480 cctcccccag gggacagaag yacatgaccg ccgtggtgaa gctgttcggg ccctttacca 540 ggaattacta tgttcgggcc gtcctgcatc tcctgtgagt ccccgtcccg caccccctct 600 agggctcagg agggcttgga gccgaccctc cccactgtcc caccggccgg gctgcctgga 660 caggagccac ccccacttac ctcagtgttt ttccaaacaa aaattcgggt ccctggctct 720 ggcagggcct gtgtctgctg tctagtgtgc aggatttgta aggatccact ccaaatccga 780 ggagctccga tccgtcgcca gggtctgggg tcagcatgca ctgctggggg gtcttgcctg 840 ggcttcctgg tagggtggag ggttccgtgc tgtgtgtctg ctggttactg ccggctgagg 900 ccaggacacc cacacgtggc tgcttcctcc gagcaagtgc accagagccg ctagtgtcca 960 catcaaggct gagaacaccc aggaccgaaa caagccccgg t 1001 <110> AMOREPACIFIC CORPORATION <120> Method for predicting antioxidation <130> 16P195 / IND <160> 6 <170> KoPatentin 3.0 <210> 1 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 gggggggggg ggcggggcgg cggtgccctt gcggcgcagc tggggtcgcg gccctgctcc 60 ccgcgctttc ttaaggcccg cgggcggcgc aggagcggca ctcgtggctg tggtggcttc 120 ggcagcggct tcagcagatc ggcggcatca gcggtagcac cagcactagc agcatgttga 180 gccgggcagt gtgcgggtga gaagaaaggg gacccggtca cggccccaag ggcgaagggg 240 ctcgcggcgg gcagggcctc cgcggcaatg gcgacagtgg ccgcaccggg cctggcggga 300 ccggggcacc tgcaggcggt tctcccggga gtgcccggcg cggcggctgg agcggggatc 360 cgcagggagg ggacgcgggg actcggggga cgccgcgcgc tgccgttcct cggcagccca 420 gcctgcgtag acggtcccgc ggcgctgact gaccgggctg tgctttctcg tcttcagcac 480 cagcaggcag ctggctccgg ytttggggta tctgggctcc aggcagaagc acagcctccc 540 cgacctgccc tacgactacg gcgccctgga acctcacatc aacgcgcaga tcatgcagct 600 gcaccacagc aagcaccacg cggcctacgt gaacaacctg aacgtcaccg aggagaagta 660 ccaggaggcg ttggccaagg gtaggttcca ggctgagcgg cgggaggcag tccccggcag 720 aggcgacccc agggagccag gccccatacg gacgggcctc tccgtggagg agaactcgct 780 tcgtatttgt accggttccg agttttccag gcacgatagt ctctctttta aacacatggt 840 ctacctcatt gtagaaggag tgcctcgatg ggtttgaaca cacttctgtc atctcaggga 900 acttggggtc ctgcgaagga gcttgcctta ctgttgtgag ccacattccg ttacacatat 960 tgccagcact ggtgaattgt agggcctgaa aagaaagctc t 1001 <210> 2 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 2 ctgttgctcg tagctgctga aattcctctc cgcccttggg attgcgcatg gagggcaaaa 60 tcccggtgac tcatagaaaa 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accacgcccg gctaattttt tgtattttta 960 gtagagacag ggtttcaccg tgttagccag gatggtatcg a 1001 <210> 3 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 agtggaagcc gcaatgagcc gagatcgtgc catggcactc cagcctggac gaccgagcga 60 gactctgcct caaaaaaaaa aaaaaaaaga aaaagaaaaa aaggactcat ctagttatat 120 ggagaggcag agaaatgcac ccacgcaggt cttggtgagt cacctgccaa gaaactgaga 180 ctccctaaag taacagaact tccagccttc ttggcaaagg atccaggttg gcacagtttc 240 aaggtttatg catttaaaga agaacacacc tgagaaggct aaaattggta acggctaggt 300 agagggtaag agagagacgc tagctctgaa ctgattctct agtgtgcctg aggcctcctt 360 atcagagtgt cttactgaga agcccagacc aacttctgtt gtttatagta caactgcatg 420 gaattggttg acttacctct ctgtgctttc tgtatcctca gagtggcatt ctgcatttct 480 gtggcttcca agtcttagaa yctcaactga catatagcat tgggcacact ccagcagacg 540 cccgaattca aatcctggaa ggatggaaga aacgcctgga gaatatttgg gatgagacac 600 cactgtattt tgctccaagc agcctctttg acctaaactt ccaggcagga ttcttaatga 660 aaaaagaggt acaggatgag gagaaaaaca agaaatttgg cctttctgtg ggccatcact 720 tgggcaagtc catcccaact gacaaccaga tcaaagctag aaaatgagat tccttagcct 780 ggatttcctt ctaacatgtt atcaaatctg ggtatctttc caggcttccc tgacttgctt 840 tagtttttaa gatttgtgtt tttctttttc cacaaggaat aaatgagagg gaatcgactg 900 tattcgtgca tttttggatc atttttaact gattcttatg attactatca tggcatataa 960 ccaaaatccg actgggctca agaggccact tagggaaaga t 1001 <210> 4 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 cgccggccgc gcgggctgag cttccgaaaa tcccccaccc gcgccggggc tgacgcaaga 60 agctcgcggt ccgggggcgg gaagggactg ccagctgggg tcccagcagg cgggggacct 120 agaggaggtc tccgttagct ccccggtgcc ggcgttcagt ttgccctccc ccgcaaataa 180 gggcagcgct ctcgcccgcg agataaagag ttgtttgcga aggtcgctgg agttcggacg 240 ctttgaaaca gtttaaacag ttggaacaaa cacacccgga gccccggaaa ggcgttggtg 300 taggagctgc gcctccctga tttggagttg cagaaccttg ccctgctttt atctcacttt 360 accgcccgag aatggcgcca gccggggtgg ggggggctaa agatttggac ccagaccgtg 420 ccactgccaa ctgccctccc gcccttgctc ccttcccggg ctggggccag tgggccctgc 480 ctaggggaga tgtggacagc kccggcagct cgtgttcgca gtcaccctga acgccctcct 540 ctgaactccc acgtgtctcc attctcctaa gctcaggtcg tcaaaggcaa acggagaagc 600 ccctttaggt cggagagtgg tcagtattgc ccacccagag ctgggagaaa aacgggaacc 660 ccaagagaac ctcttcccac caaagcgcag ccaccacgcc acagatggcg cccttcaaca 720 gtgtgtaata ccacaacatg ctgtaatcgt ttactcttta caaatttctt tttcacgtac 780 tcacaaaata gtacaaatta aaaaaagtta caaaaacgtt tgtatagtat tggctcattt 840 tataaaaacg tgcctagaaa aaaattgaag gttaccaata tattaaatgc tgtggaatca 900 acgattttta tgtttctcct tgttacttcc aagtatgctt taaatctgca gtgcgtatgt 960 tttatgtctt acattaaaaa caattattta aaaattaatc a 1001 <210> 5 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 ttcttatggg agttagttct atgtgagccc agatatgtga gcacattttt gccctgacaa 60 tgatttctgg cttaatttaa tttctactga atttagtgta tttacacaca gacacacaca 120 gatacacaca cacacacaca cacacacaca cacacacacg acgtaacact attttaagat 180 acatataata ggatttttat gttacagtgc tataatcacc tcctcagatt tcttagacca 240 atgattgtct aaggattgta tcggcaggac taatttcata ttaattgtgt tccattatag 300 ctagcacgaa ggctccatcc cacatcttga ttttaggaat agacagtgag gaatgccagt 360 taataatcct gtaatgttca ataccttcac cttatatatt atgtgtgtat gttttaattg 420 cagtttgaat gatattgttg ctgtgggacc tgagcacttt tatggcacaa atgatcacta 480 ttttcttgac ccctacttac ratcctggga gatgtatttg ggtttagcgt ggtcgtatgt 540 tgtctactat agtccaagtg aagttcgagt ggtggcagaa ggatttgatt ttgctaatgg 600 aatcaacatt tcacccgatg gcaagtatgt gaactctctg aaatgtagtg gatttactca 660 gattctcagg agatatcttg gaatatattc tttttttaag taatatgata cattttaaca 720 tgttacccta gtgagataaa attaggaaaa atgtaaaatg tcttaatttt tcagggggtg 780 aaatttatca aatcaaaaat ttcattgtga aggcatactg gttttatttc ctttttggaa 840 agaaagtaca ttttaagagg gggaactgtg atgaagattt gatatgtctg aatagctttg 900 ttttgagtaa agatgtgagt gtataatgag ttgaatagta tgcaggtata gatacgtcag 960 tagtgcaggt ttatgacaag atgaggaatt tgtaccaaaa t 1001 <210> 6 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 ctccagtgat cctcccgcct cagcctccca aaatgctggg attccaggca tgagccaccg 60 tgctcgggcc cctctctgtg ttgtcttcag taaagggagt tccctgtggc ccctcaggct 120 gagctgggct gttccttaac cacatggctt cagtgtggcg ggcgtgtttg tgtgcctgct 180 ggagtacccc cgggggaaga ggaagaaggg ctccaccatg gagcgctggt gagtctcctc 240 ctgctctggg gtctctccgg gggctgcggg gcccaggcag ggctcacagg gttgggtgga 300 gcttggtttc tcacttggag gctccggaac caaccctttg gtgcttgtgg gtaaaccaag 360 gccggtgcct gcccggtgtg ttttgtggga ggaaagaggc ctgggtgccc tggggtggtc 420 agcagggcag caaaggagtc ccgagtggga gaggcccagc cgcgccgtct cgccttcctc 480 cctcccccag gggacagaag yacatgaccg ccgtggtgaa gctgttcggg ccctttacca 540 ggaattacta tgttcgggcc gtcctgcatc tcctgtgagt ccccgtcccg caccccctct 600 agggctcagg agggcttgga gccgaccctc cccactgtcc caccggccgg gctgcctgga 660 caggagccac ccccacttac ctcagtgttt ttccaaacaa aaattcgggt ccctggctct 720 ggcagggcct gtgtctgctg tctagtgtgc aggatttgta aggatccact ccaaatccga 780 ggagctccga tccgtcgcca gggtctgggg tcagcatgca ctgctggggg gtcttgcctg 840 ggcttcctgg tagggtggag ggttccgtgc tgtgtgtctg ctggttactg ccggctgagg 900 ccaggacacc cacacgtggc tgcttcctcc gagcaagtgc accagagccg ctagtgtcca 960 catcaaggct gagaacaccc aggaccgaaa caagccccgg t 1001
Claims (29)
검체로부터 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상을 측정하고, 상기 유전자의 SNP 위치의 염기에 따라 유전적 항산화능을 분석하는 것을 포함하는 항산화능에 대한 정보 제공 방법.As a method for providing information on the antioxidant ability,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, the rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, the rs1800566 single nucleotide polymorphism SNP of the NQO1 gene, the rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, Measuring one or more of the single nucleotide polymorphism (SNP) and the rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene, and analyzing the genetic antioxidant ability according to the nucleotide at the SNP position of the gene.
(a) 검체로부터 DNA를 얻는 단계;
(b) 상기 DNA에서 상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상의 SNP 부위의 증폭 반응을 수행하는 단계; 및
(c) 상기 증폭된 DNA에서 SNP 위치의 염기를 확인하여 SNP 위치의 염기에 따라 항산화능을 분석하는 단계;를 포함하는 정보 제공 방법.The information providing method according to claim 1,
(a) obtaining DNA from a specimen;
(b) rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 SNP of the NFE2L2 gene, , An rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene, and an rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene; And
(c) analyzing the antioxidant ability of the amplified DNA by detecting the base at the SNP position according to the base at the SNP position.
상기 SOD2 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 TT, TC 또는 CC인 경우, TT > TC > CC의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것으로 판정하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.The method according to claim 1,
Wherein said SOD2 gene is judged to be superior in genetic antioxidant ability in the order of TT>TC> CC when the genotype of the SNP locus is TT, TC or CC.
상기 GPX1 유전자에 있어서, 상기 SNP 위치 염기의 유전자형이 TT, CT 또는 CC 인 경우, TT > CT > CC 의 순서로 유전적으로 항산화능이 우수한 것으로 판정하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.The method according to claim 1,
And determining that the GPX1 gene is genetically superior in antioxidant ability in the order of TT>CT> CC when the genotype of the SNP locating base is TT, CT or CC.
상기 NQO1 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 TT, CT 또는 CC 인 경우, TT > CT > CC 의 순서로 유전적으로 항산화능이 우수한 것으로 판정하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.The method according to claim 1,
And determining that the NQO1 gene is genetically superior in antioxidant ability in the order of TT>CT> CC when the genotype of the SNP locating base is TT, CT or CC.
상기 NFE2L2 유전자에 있어서, 상기 SNP 위치 염기의 유전자형이 GG, TG 또는 TT인 경우, GG > TG > TT의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것으로 판정하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.The method according to claim 1,
Wherein the NFE2L2 gene is judged to be excellent in genetic antioxidant ability in the order of GG>TG> TT when the genotype of the SNP locus is GG, TG or TT.
상기 PON1 유전자에 있어서, 상기 SNP 위치 염기의 유전자형이 GG, AG 또는 AA인 경우, GG > AG > AA의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것으로 판정하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.The method according to claim 1,
Wherein said PON1 gene is judged to be superior in genetic antioxidant ability in the order of GG>AG> AA when the genotype of said SNP locus is GG, AG or AA.
상기 CYBA 유전자에 있어서, SNP 위치 염기의 유전자형이 TT, CT 또는 CC 인 경우, TT > CT > CC 의 순서로 유전적으로 항산화능이 우수한 것으로 판정하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.The method according to claim 1,
And determining that the CYBA gene is genetically superior in antioxidant ability in the order of TT>CT> CC when the genotype of the SNP locating base is TT, CT or CC.
검체로부터 상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 하나 이상을 측정하고,
상기 유전자의 SNP 위치 염기의 유전자형(genotype)을 E0, E1 및 E2라 할 때, E0 > E1 > E2의 순서로 유전적 항산화능이 우수하고,
상기 각각의 유전자로부터 유전자형 점수 SG 를 산출하여 이를 분석하는 것을 포함하고,
상기 유전자형 점수 SG 는 E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 미만인 경우, 검체의 유전자형이 E0이면 SG=1, E1이면 0.5 ≤ SG ≤ 0.8, E2이면 0.2 ≤ SG ≤ 0.5이고, E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 이상인 경우, 하기 식 1로 나타내는 것인,
정보 제공 방법:
<식 1>
유전자형 점수(SG) = Fs / FE0
상기 Fs는 검체의 유전자형의 빈도이고, FE0는 E0 유전자형의 빈도이고, 상기 Fs 및 FE0 는 검체가 속하는 인종의 유전자형 데이터베이스로부터 얻는다.The method according to claim 1,
Rs488080 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism SNP of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, One or more of rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) and rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of CYBA gene were measured,
When genotypes of SNP loci of the genes are E0, E1 and E2, the genetic antioxidant ability is excellent in order of E0 > E1 > E2,
From each of the genes, the genotype score S G And analyzing it,
The genotype score S G The frequency of the genotype of E0 is less than 45%. If the genotype of the specimen is E0, S G = 1, if E0 is 0.5 ≤ S G ≤ 0.8, and if E2 is 0.2 ≤ S G ≤ 0.5, And E0 is 45% or more,
How to provide information:
<Formula 1>
Genotype score (S G ) = F s / F E0
F s is the frequency of the genotype of the specimen, F E0 is the frequency of the E0 genotype, and F s and F E0 are obtained from the genotype database of the race to which the specimen belongs.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수 SG 를 반영하고,
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 10 내지 50%의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Reflecting the genotype score S G for two or more of the base polymorphism (SNP) and rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene,
And reflecting the genotypic score of rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene at a ratio of 10 to 50%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수 SG 를 반영하고,
상기 GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 10 내지 50%의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Reflecting the genotype score S G for two or more of the base polymorphism (SNP) and rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene,
And reflecting the genotypic score of rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene at a ratio of 10 to 50%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수 SG 를 반영하고,
상기 NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Reflecting the genotype score S G for two or more of the base polymorphism (SNP) and rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene,
And reflecting the genotypic score of rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene at a rate of 0.5 to 30%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수 SG 를 반영하고,
상기 NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Reflecting the genotype score S G for two or more of the base polymorphism (SNP) and rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene,
And reflecting the genotypic score of the NFE2L2 gene to rs6721961 single nucleotide polymorphism (SNP) at a rate of 0.5 to 30%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수 SG 를 반영하고,
상기 PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Reflecting the genotype score S G for two or more of the base polymorphism (SNP) and rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene,
And reflecting the genotypic score for the rs662 single nucleotide polymorphism (SNP) of the PON1 gene at a rate of 0.5 to 30%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP) 중 2종 이상에 대한 유전자형 점수 SG 를 반영하고,
상기 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수를 0.5 내지 30%의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Reflecting the genotype score S G for two or more of the base polymorphism (SNP) and rs4673 single base polymorphism (SNP) of the CYBA gene,
And reflecting the genotype score of rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of the CYBA gene at a rate of 0.5 to 30%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수 SG 를 1-5 : 1-5 : 0.1-3 : 0.1-3 : 0.1-3 : 0.1-3의 비율로 반영하는 것을 포함하는 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Genotype scores for basal polymorphism (SNP) and rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of CYBA gene S G In a ratio of 1-5: 1-5: 0.1-3: 0.1-3: 0.1-3: 0.1-3.
상기 SOD2 유전자의 상기 SNP 위치 염기의 유전자형은 TT, TC 또는 CC이고, TT > TC > CC의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
Wherein the genotype of the SNP locus of the SOD2 gene is TT, TC or CC, and TT>TC> CC.
상기 GPX1 유전자의 상기 SNP 위치 염기의 유전자형은 TT, CT 또는 CC 이고, TT > CT > CC 의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
Wherein the genotype of the SNP locus of the GPX1 gene is TT, CT or CC and has excellent genetic antioxidant ability in the order of TT>CT> CC.
상기 NQO1 유전자의 상기 SNP 위치 염기의 유전자형은 TT, CT 또는 CC 이고, TT > CT > CC 의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
Wherein the genotype of the SNP locus of the NQO1 gene is TT, CT or CC and has excellent genetic antioxidant ability in the order of TT>CT> CC.
상기 NFE2L2 유전자의 상기 SNP 위치 염기의 유전자형은 GG, TG 또는 TT이고, GG > TG > TT의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
Wherein the genotype of the SNP locating base of the NFE2L2 gene is GG, TG or TT, and GG > TG > TT.
PON1 유전자의 상기 SNP 위치 염기의 유전자형은 GG, AG 또는 AA이고, GG > AG > AA의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
Wherein the genotype of the SNP locus of the PON1 gene is GG, AG or AA and has an excellent genetic antioxidant ability in the order of GG>AG> AA.
상기 CYBA 유전자의 상기 SNP 위치 염기의 유전자형이 TT, CT 또는 CC 이고, TT > CT > CC 의 순서로 유전적 항산화능이 우수한 것인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
Wherein the genotype of the SNP locus of the CYBA gene is TT, CT or CC and the genetic antioxidant ability is superior in order of TT>CT> CC.
상기 유전자형 점수 SG 는 E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 미만인 경우, 검체의 유전자형이 E0이면 SG=1, E1이면 0.4 ≤ SG ≤ 0.98, E2이면 0.1 ≤ SG ≤ 0.85인, 정보 제공 방법.10. The method of claim 9,
The genotype score S G Wherein S G = 1 if the genotype of the specimen is E0, 0.4? S G ? 0.98 if E1, and 0.1? S G ? 0.85 when the frequency F E0 of the genotype of E0 is less than 45%.
상기 SOD2 유전자의 rs4880 단일염기다형성(SNP), GPX1 유전자의 rs1050450 단일염기다형성(SNP), NQO1 유전자의 rs1800566 단일염기다형성(SNP), NFE2L2 유전자의 rs6721961 단일염기다형성(SNP), PON1 유전자의 rs662 단일염기다형성(SNP) 및 CYBA 유전자의 rs4673 단일염기다형성(SNP)에 대한 유전자형 점수 SG 를 2-4 : 2-4 : 0.1-2 : 0.1-2 : 0.1-2 : 0.1-2 의 비율로 반영하고,
상기 유전자형 점수 SG 는 E0의 유전자형의 빈도 FE0 가 45% 미만인 경우, 검체의 유전자형이 E0이면 SG=1, E1이면 0.5 ≤ SG ≤ 0.95, E2이면 0.2 ≤ SG ≤ 0.75인, 정보 제공 방법.17. The method of claim 16,
The rs4880 single nucleotide polymorphism (SNP) of the SOD2 gene, rs1050450 single nucleotide polymorphism (SNP) of the GPX1 gene, rs1800566 single nucleotide polymorphism (SNP) of the NQO1 gene, rs6721961 single nucleotide polymorphism SNP of the NFE2L2 gene, rs662 single Genotype scores for basal polymorphism (SNP) and rs4673 single nucleotide polymorphism (SNP) of CYBA gene S G At a ratio of 2-4: 2-4: 0.1-2: 0.1-2: 0.1-2: 0.1-2,
The genotype score S G S G = 1 if the genotype of the specimen is E0, 0.5? S G ? 0.95 if E1, 0.2? S G ? 0.75 when the frequency F E0 of the genotype of E0 is less than 45%.
상기 검체는 인간으로부터 분리된 상피세포, 각질형성세포, 섬유아세포 또는 멜라닌형성세포인, 정보 제공 방법.25. The method according to any one of claims 1 to 24,
Wherein the sample is an epithelial cell, a keratinocyte, a fibroblast, or a melanin-forming cell isolated from a human.
상기 프로브는 상기 유전자의 염기서열에서 상기 SNP 위치의 염기를 포함하는 20 내지 60개의 연속하는 염기서열에 상보적인 서열을 갖는 폴리뉴클레오타이드인, 조성물.27. The method of claim 26,
Wherein the probe is a polynucleotide having a sequence complementary to 20 to 60 consecutive nucleotide sequences comprising a base at the SNP position in the nucleotide sequence of the gene.
상기 프라이머는 표적 부위의 유전자 단편에 대하여, 상기 유전자 단편의 5' 말단 및 3' 말단의 연속하는 10 내지 40개의 염기서열 각각에 대하여 상보적인 서열을 갖는 두개의 폴리뉴클레오타이드로 이루어진 프라이머 세트를 포함하고, 상기 표적 부위는 상기 유전자의 염기서열에서 상기 SNP 위치의 염기를 포함하는 연속하는 50 내지 400개의 염기서열인, 조성물.28. The method of claim 27,
Wherein the primer comprises a set of primers consisting of two polynucleotides having a sequence complementary to each of the consecutive 10 to 40 nucleotide sequences at the 5 ' end and the 3 ' end of the gene fragment, , Wherein said target site is a consecutive 50 to 400 nucleotide sequences comprising a base at said SNP position in the nucleotide sequence of said gene.
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