KR20170087429A - 닭의 산란 형질 관련 유전자 마커 및 이를 이용하여 닭의 산란 형질을 분별하는 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자 내에 존재하는 단일염기다형성 마커를 기반으로 하여 닭의 산란 형질을 분별하는 방법에 관한 것으로, 본 발명의 방법을 이용할 경우, 닭의 산란 형질을 효과적으로 평가할 수 있어, 우수한 산란능을 갖는 닭의 선별 등에 광범위하게 사용할 수 있다.
Description
본 발명은 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자 내에 존재하는 단일염기다형성 마커를 기반으로 하여 닭의 산란 형질을 분별하는 방법에 관한 것이다.
한국 재래닭은 맛과 육질면에서 기호성은 좋으나, 생산성이 낮고, 발육이 늦으며, 체중이 가볍고 연간 산란 수 또한 적어 육계나 산란계로 이용하기에 불리한 점이 많다. 또한, 재래닭은 소규모의 농가 양계형태로 사육되었기 때문에 특별한 목적으로 개량되거나 계통을 조성한 바가 없으며, 유전자원으로서의 가치를 충분히 인정받고 있음에도 불구하고, 기본적인 유전정보가 미흡해 개량 및 유전자원 확보에 어려움을 겪고 있다.
그러나, 최근 축산물 안전성에 대한 국민적 관심이 높아지면서 외래종보다 재래종의 선호도가 증가하고 있으며, 전 세계적으로 재래가축 유전자원의 중요성이 부각되고 있다. 따라서, 재래닭의 시장 경쟁력 확보 및 유전자원 보존을 위해 생산 능력 개량이 절대적으로 필요한 실정이다.
기존의 양계 육종 방법은 검정기록을 이용한 전통적인 통계 육종학적인 접근
방법이었지만, 최근 분자 생물학적 기법이 다양하게 발전하면서 가축의 경제형질에 영향을 미치는 주요 유전자(Quantitative trait locus, QTL)의 특성에 관한 연구가 가속화되고 있어, 분자 육종에 의한 가축 개량이 점차 확대되는 추세이다.
여러 가지 DNA 마커 중 하나인 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism, 이하 SNP)은 30억 개의 염기 서열 중 개체 간의 표현형에 차이를 나타나게 하는 한 개 혹은 수십 개의 염기변이를 뜻한다. 전체 집단의 DNA 염기서열 상에서 약 1% 이상의 빈도로 존재하며 약 1,000개의 염기마다 1개 정도의 빈도로 나타나는 것으로 알려져 있다. 또한, SNP는 유전적 근접성을 알려주는 지표역할을 한다.
SNP는 여러 가지 차이로 인한 유전적 원인을 규명하기 위하여 가축의 경제형질에 관한 연관성 연구(association study)에도 사용되고 있다. 즉, SNP는 가축의 경제형질과 연관된 유전적 표지 인자로서, 연구에 적극 활용되고 있는 것이다.
한편, OCX-32(Ovocalyxin-32)은 32 kDa의 크기를 갖는 단백질로, 조류의 난각 형성의 마지막 단계에서 자궁 내에 높은 수준으로 존재하며, 조류의 바깥쪽 난각을 형성하여 배아의 항균작용에 중요한 역할을 한다. 최근 보고에 의하면, OCX-32 유전자는 닭의 산란 특성 및 계란 특성과 연관이 있다고 알려졌는데, White Leghorn × Rhode Island Red F2의 산란율 및 계란의 황색지수와 육반에 연관이 있는 것으로 보고된바 있다 (Polymorphism of the ovocalyxin-32 gene and its association with egg production traits in the chicken. Uemoto et al. Poult Sci. 2009). 또한, Fulton 등 (Variation in the ovocalyxin-32 gene in commercial egg-laying chickens and its relationship with egg production and egg quality traits. Anim Genet. 2012)의 연구에 의하면, OCX-32 유전자는 산란 수, 난중, 시산난중과 같은 닭의 산란 특성과 난각색, 난황무게 등 계란 특성에도 연관되어 있는 것으로 보고되었다.
본 발명은 닭의 산란 특성과 관련된 OCX-32 유전자를 대상으로, 한국 재래닭의 산란율 향상 및 양적 형질에 효과가 있는지 알아보기 위해, 유전자형 분석과 PCR 및 DNA targeted sequencing을 통해, 변이를 확인하여 산란 형질(산란율, 난중, 시산일령)과의 연관성을 통계적으로 분석하였고, 이를 통하여 한국 재래닭의 선발에 있어 DNA marker의 활용 가능성을 검토하고자 하였다.
즉, 본 발명에서는 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자 중 존재하는 SNP를 기반으로 하여 닭의 산란 형질을 쉽게 분별할 수 있는 방법을 개발하고자 한다.
본 발명은 제1형태로, 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자에 대해 OCX-32 유전자의 1078번 염기를 포함하도록 PCR 증폭하여 증폭산물을 회수하는 단계; 상기 증폭산물 중 1078번 염기의 단일염기다형성을 분석하여 개체별 유전자형을 결정하는 단계; 상기 유전자형 결정 후, OCX-32 유전자의 1078번 염기가 대립유전자 중 어느 하나 또는 모두에서, T에서 C로 변형된 닭을 선별하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 닭 산란 형질 분별 방법을 제공한다.
1078T>C SNP는, 오골계의 산란율 및 시산일령, 흑색재계의 난중, 회색재계의 산란율 및 시산일령, 백색재계의 시산일령 및 난중에서 CT 또는 CC유전자형이 TT유전자형 보다 높은 수치를 나타냈으며, 유전자형 간의 높은 유의적인 차이를 보여주었다.
상기 본 발명의 제1형태에 있어서, 상기의 산란 형질은 바람직하게 산란율, 시산일령, 난중 중 선택되는 하나 이상인 것일 수 있다.
상기 본 발명의 제1형태에 있어서, 상기 닭은 일 예로 오골계, 흑색재래계, 회색재래계, 백색재래계 중 선택되는 하나 이상인 것일 수 있다.
한편, 본 발명은 제2형태로, 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자에 대해 OCX-32 유전자의 1125번 염기를 포함하도록 PCR 증폭하여 증폭산물을 회수하는 단계; 상기 증폭산물 중 1125번 염기의 단일염기다형성을 분석하여 개체별 유전자형을 결정하는 단계; 상기 유전자형 결정 후, OCX-32 유전자의 1125번 염기가 대립유전자 중 어느 하나 또는 모두에서, C에서 G로 변형된 닭을 선별하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 닭 산란 형질 분별 방법을 제공한다.
1125C>G는, 오골계의 산란율 및 시산일령, 흑색재래계의 산란율 및 난중에서 GG유전자형이 CC유전자형보다 높은 평균 측정치를 나타냈으며, 유전자형 간의 높은 유의적인 차이를 보여주었다.
상기 본 발명의 제2형태에 있어서, 상기 산란 형질은 바람직하게 산란율, 시산일령, 난중 중 선택되는 하나 이상인 것이 좋다.
상기 본 발명의 제3형태에 있어서, 상기 닭은 바람직하게 오골계 또는 흑색재래계인 것이 좋다.
*
한편, 본 발명은 제3형태로, 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자에 대해 OCX-32 유전자의 1145번 염기를 포함하도록 PCR 증폭하여 증폭산물을 회수하는 단계; 상기 증폭산물 중 1145번 염기의 단일염기다형성을 분석하여 개체별 유전자형을 결정하는 단계; 상기 유전자형 결정 후, OCX-32 유전자의 1145번 염기가 대립유전자 중 어느 하나 또는 모두에서, T에서 C로 변형된 닭을 선별하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 닭 산란 형질 분별 방법을 제공한다.
1145T>C는, 오골계의 난중, 흑색재래계의 산란율, 시산일령 및 난중, 회색재래계의 산란율 및 시산일령, 백색재래계의 시산일령 및 난중에서 TC 또는 CC유전자형이 TT유전자형보다 높은 평균 측정치를 나타냈으며, 유전자형 간의 높은 유의적인 차이를 보여주었다.
상기 본 발명의 제3형태에 있어서, 상기 산란 형질은 바람직하게 산란율, 시산일령, 난중 중 선택되는 하나 이상인 것이 좋다.
상기 본 발명의 제3형태에 있어서, 상기의 닭은 일 예로, 오골계, 흑색재래계, 회색재래계, 백색재래계 중 선택되는 하나 이상인 것일 수 있다.
본 발명의 닭 산란 형질 분별방법을 이용할 경우, 닭의 산란 형질을 효과적으로 평가할 수 있어, 우수한 산란능을 가지는 닭의 선별 등에 광범위하게 사용할 수 있다.
산란계는 식용 가능한 알을 생산할 목적으로 육종하는 닭으로, 산란계의 일반적인 특징은 체구가 작고 성성숙이 빠르다는 점이 있다. 일반적으로 산란율이 높고, 한 계군을 길러 처음으로 산란을 시작한 날인 시산일령이 짧으며, 난중이 클수록 산란계로 이용하기 좋다.
따라서, 본 발명에서는 상기의 조건을 갖춘 닭의 유전자형을 찾고, 이 유전자형과 산란 형질과의 상관관계 분석을 통해, 재래계의 산란 형질을 분별할 수 있는 유전자 마커(SNP)를 발굴하여 제공하는 것이다.
하기 실시예에서는 닭의 산란 형질과 관련된 OCX-32 유전자를 대상으로, 닭의 양적 형질에 있어서 효과가 있는지 알아보기 위해, DNA Sequencing을 통한 유전자형 분석으로 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)를 발굴하고, 육종가와의 연관성을 통계적으로 분석하였다.
본 발명의 방법을 구현하기 위해, 하기 실험에서는 총 80수의 재래계를 이용하였다. 실험에서 사용된 프라이머는 NCBI의 SNP 데이터베이스 정보를 토대로 OCX-32 유전자 중 SNP 밀도가 비교적 높은 1번과 2번 exon 사이 intron 구역의 733 bp부분이 증폭되도록 제작하여 PCR을 수행하였다.
산란 형질과 관련된 측정값에 대한 OCX-32 유전자 내 SNP의 유전자형 분석에서, 대립유전자의 빈도는 Cervus Ver. 2.0 program(Marshall T. C., Slate J., Kruuk L. E. B. & Pemberton J. M. 1998. Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations. MolEcol. 7:639-655)을 이용하였고, 통계분석은 SAS 9.2 Package(SAS Institute, Inc. Cary, NC, USA)를 이용하여 PROC GLM 방법으로 분석하였다.
SNP 유전자형 효과의 유의성이 나타난 형질에 대해서는 Duncan's multiple range test에 의한 유전자형별 유의성 검정을 실시하였다. 통계분석에 이용한 모형은 다음의 수학식 1과 같았다.
[수학식 1]
Yij= μ + Gi + eij
여기서, Yij는 육종가 추정치, μ는 각 육종가의 평균, Gi은 I 번째 SNP 유전자형의 효과, eij는 임의오차를 나타낸다.
이하, 본 발명의 내용을 하기 실시예를 통해 더욱 상세히 설명하고자 한다. 다만, 본 발명의 권리범위가 하기 실시예에만 한정되는 것은 아니고, 그와 등가의 기술적 사상의 변형까지를 포함한다.
[실시예 1: 닭 OCX-32 유전자 내 SNP의 유전자형 분석]
본 실험에 이용된 혈액 샘플은 농촌진흥청 국립축산과학원에서 사육 중인 검정 자료를 보유한 한국 재래닭 암컷 집단을 공시축으로 선정하여 채취한 것으로, 채취한 혈액으로부터 유전체 DNA를 정제하여 공시 재료로 이용하였다. DNA 시퀀싱 과정은 산란 형질 중 산란율을 기준으로 상·하위로 나누어 오골계와 흑계를 각각 30수, 재계와 백계를 각각 10수씩 총 80수를 선발하여 공시 재료로 이용하였다.
닭 OCX-32 유전자의 SNP 실험을 위해, NCBI의 SNP 데이터베이스 정보를 이용하여 닭의 OCX-32 유전자 (full sequence, 서열목록 1) 중 SNP 밀도가 비교적 높은 1번과 2번 엑손(exon) 사이 인트론(intron) 구역의 733 bp를 타겟으로 지정하여 PCR로 유전자를 증폭한 후 시퀀싱을 통해 분석하였다.
NCBI의 SNP 데이터베이스를 토대로 OCX-32 유전자의 프라이머를 확인한 후, PCR을 실시하였다. 실험에 이용된 닭 OCX-32 유전자의 프라이머 염기서열 정보는 하기 표 1에 제시한 바와 같았다. 표 1은 OCX-32 유전자 영역의 증폭을 위해 사용된 정방향(F) 및 역방향(R) 프라이머를 나타낸다.
[표 1]
PCR 증폭 실험을 수행하기 위해 DNA Engine Tetrad 2 Peltier Thermal Cycler (BIO-RAD, USA)를 이용하여 다음 조건으로 실험하였다. PCR 반응을 위해, genomic DNA 100 ng과 DNA polymerase (Doctor Protein, Korea)를 첨가하였다. 증폭을 위한 PCR 반응 조건은 최초 94℃에서 3분간 최초변성을 한 후, 94℃에서 30초, 63℃에서 30초, 72℃에서 1분씩 총 35 cycle을 반복하였고, 마지막으로 최종 72℃에서 7분간 확장을 하여 DNA를 증폭시켰다.
이후, PCR 산물은 Millipore plate MSNU030 (Millipore SAS, Molsheim, France)을 사용해 정제하였다. 정제된 PCR 산물의 PCR-direct 시퀀싱을 수행하기 위해, BigDye(R) Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, CA)를 이용하였으며, Sequencer 기기는 ABI PRISM 3730XL Analyzer (Applied Biosystems, CA)을 사용하여 분석하였다.
분석 결과, 재래닭 80수로부터 3개의 SNP를 발굴하였으며, 이를 서열목록 2를 기초로 1078T>C, 1125C>G 및 1145T>C로 명명하였다. 또한, 이를 대상으로 Cervus Ver. 2.0 program (Marshall et al.,1998)을 이용하여 유전자형의 빈도를 분석하였다
유전자형의 빈도를 분석한 결과를 하기 표 2에 나타내었다. 표 2는 재래닭 4종(오골계, 흑색재래계, 회색재래계, 백색재래계)의 OCX-32 유전자 내 SNP인 1078T>C, 1125C>G, 1145T>C의 유전자형 빈도 분석결과이다.
본 실험에서 1078T>C, 1125C>G, 1145T>C는 각각 SNP로서, 유전체(genomic DNA) 상 OCX-32 유전자의 1078번째 염기가 T에서 C로, 1125번째 염기가 C에서 G로, 1145번째 염기가 T에서 C로 바뀌는 것을 의미한다. (KOC는 오골계, KBC는 흑색재래계, KGC는 회색재래계, KWC는 백색재래계이다.)
[표 2]
분석 결과, 오골계와 흑색재래계는 유전자형의 빈도가 3가지 SNP 1078T>C, 1125C>G, 1145T>C에서 모두 유사한 패턴을 가지는 것으로 확인되었다. 회색재래계와 백색재래계의 경우, 1125C>G SNP가 호모형으로 동일한 것을 확인할 수 있었다.
[ 실시예 2: 닭 OCX -32 유전자 내 SNP의 유전자형 빈도수 및 산란 형질과의 상관관계 분석]
OCX-32 유전자 내 SNP인 1078T>C, 1125C>G, 1145T>C가 닭의 주요 산란 형질에 미치는 영향을 확인하기 위하여, 상기에 확인된 SNP 유전자형과 산란 형질과의 연관성 분석을 실시하였다. 실시 방법으로, SAS 9.2 Package (SAS institute, Cary, NC, USA)를 이용하여 PROC GLM 방식으로 통계 분석하였으며, SNP 유전자형 효과의 유의성이 나타난 형질에 대해서는 Duncan’s multiple range test에 의한 유전자형 별 유의성 검정을 실시하였다.
본 실시예 2에서 측정한 산란 형질은, 시산일령(age of first egg), 시산난중(weight of first egg), 270일령 산란수를 비율로 계산한 산란율(egg production ratio at 270 days) 총 4가지 항목으로, 각각의 연관성을 분석하였다.
닭 OCX-32 유전자 내 1078T>C, 1125C>G, 1145T>C SNP 유전자형과 산란 형질 간의 연관성 분석 결과를 하기 표 3에 나타내었다. 표 3은 닭 OCX-32 유전자 내 1078T>C, 1125C>G, 1145T>C SNP 유전자형과, 재래닭 4종(오골계, 흑색재래계, 회색재래계, 백색재래계) 산란 형질 간의 연관성 분석 결과이다.
[표 3]
분석 결과, 1078T>C SNP는, 오골계의 산란율 및 시산일령, 흑색재계의 난중, 회색재계의 산란율 및 시산일령, 백색재계의 시산일령 및 난중에서 CT 또는 CC 유전자형이 TT 유전자형 보다 높은 평균 측정치를 나타냈으며, 유전자형 간의 높은 유의적인 차이를 보여주었다.
1125C>G SNP는, 오골계의 산란율 및 시산일령, 흑색재래계의 산란율 및 난중에서 GG 유전자형이 CC 유전자형보다 높은 평균 측정치를 나타냈으며, 유전자형 간의 높은 유의적인 차이를 보여주었다.
1145T>C SNP는, 오골계의 난중, 흑색재래계의 산란율, 시산일령 및 난중, 회색재래계의 산란율 및 시산일령, 백색재래계의 시산일령 및 난중에서 TC 또는 CC 유전자형이 TT 유전자형보다 높은 평균 측정치를 나타냈으며, 유전자형 간의 높은 유의적인 차이를 보여주었다.
<110> KNU-Industry Cooperation Foundation
<120> Single nucleotide polymorphism marker associated with egg
production traits in chicken and method for the determination of
egg production traits in chicken using same marker
<130> YP-17-052
<160> 2
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 7560
<212> DNA
<213> Ovocalyxin-32 (full sequence)
<400> 1
tattagtacc gtcccgcccg gagtccgcct tacagcgctc cgccagcagc atgccggggc 60
tccgcgccgc gctgcccgcc gccctcctcc tcctcagctc cttcccgccc gccgcggcgg 120
agcggctccc gtggccgcag gttcagggcg tgatgcgccc gctgaacccc agccaccgcg 180
aggccgtctg ggcggcgtgg acagcgctgc actacatcaa ctcccacgag gcgtccccca 240
gccggccgct ggcgctgcat aaggtggtga aggccgcctc caaggtagga ggggcggtgg 300
ggcgggcggg gggctgccct cagggctgag aagcgctgag cggagcgctt cccgccttcc 360
ccacaggaac tgagggcacc cacacagcag cgccgcaccg ctctgaagcg cggtttcggt 420
cctcacgcct tagcctttca cagggatccc agcggcttca gattgggatc tctatgaaag 480
attggcgccg atttgcacgc atttcacaga tcaggaaaat aatttccaat caaatttgac 540
aaagctactg cataacgttc ggattttgtg cacgacctcg ttcgttcttc ctctggaact 600
ctggcagaaa tcaatgacaa aaattaacat ttgatacttc tcttgaagcg tgcaggtgcc 660
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aagtgagtat cttccaggaa acagcagcat gcatctcatg ggattgttga cagttgcact 1800
ttaaaacata tatctgagaa gtgaagcatt agtgcgtgcc agctgaagag cctggaattc 1860
caaagagaaa atgtcagagc acagactgac tccccagagc agtctcccat acccctgagc 1920
agctaggcag tggatcagca gggaagcaca aaggtaaagc tagttaatct cttgactgaa 1980
ctgcaacagt ttctaaaatt ggggtaccag gtactatttt atggctggag atctctctac 2040
aaaagctcat cttgacacag aactgtcatg tcaggactac ggtacggata ttaaaataag 2100
gcaattaaaa gttatctatg aatttccaac agtcaggcac gcaagtcaga gtgggaaggt 2160
aagatcagtc gcagggtagc tttattatct agggcacaga aagcaaccaa ctttgctggc 2220
ttttccctcc ccagcagcag gggtaaagct acctgagctg gctgggaggg atggtggcag 2280
ggctttgagg tgtggatccc caggcaagcc ccccgacaca tctcacactc ctccctcagt 2340
gatccggttg tccctctgtc ccagtgaatg agatccacgg aaagaactgg cagggaaatg 2400
cgcagaggag acggggactt gcagcaaagg gtgaaggagg gatcatccct ttcagcagag 2460
ttagggcagt gtcagcaagt tgtgaaacta cctcttttgg gacccggaat gaaactgctc 2520
ttaaaaagct attctggcct ttacagctct aaaaatttgt cattaaactt gcattaattt 2580
tgagactggt attaaaacaa tcctgcaacc cagatattca gtggggggaa aaatatatta 2640
cttacttttc tttttggatg ctatctgact actttcatga agtcagccat cattgttcga 2700
tgtcaaatat gcctcagctg ttatttaatt cacagtgtgt gatggtttac aggaatgcat 2760
tgtggggtaa tagtgaaaat aacagtggga atgaaagcag tttctttctt aggaccaaga 2820
ccctgatact gtaaccagca gtgtgcaggc atgctgctat gctgggccac tggaggaaga 2880
ggttcagcag gaaaccccac cattaccttc agttacatca gatagccaag ttgctcctgc 2940
tccagcagtg ctgtagtcca cccaactgtt ccagtgtctc atctgtagta ctgatgacaa 3000
gacaaggaat aagcctaggt tgctgtgctt caaatagcaa tacttcatca aatgaagaat 3060
gctagacata gtagctctaa taataacatc actttacagt aattagaaac ttgggcttaa 3120
ctgcagcaat tgtgaacaat tagaacctcc tttcagtgcc ccgaattact gattttttca 3180
taaacctgca cttcagaaac ctagttttta ccagtttgct acagtaagag tagaatgtaa 3240
tgcagtaaca cggaataacc tgtcattttg acttaagact aagtagaaaa gaaggacaac 3300
actttggcta gtgcacaaaa tgggcgcagg agagaatggc agagaaaaga ttataaaggt 3360
ctgaactcat cctctcttcc tacattccct tcttggtatg acgtgggcca acttcagact 3420
tggctatttt taaagactgc atgaaggtaa aaatgaaaag tgactaaacc aatatgtcat 3480
cagcagtgcc caactgcata cgtaccaaag gcaggagctg agctcatggc cttgcctagt 3540
caatgaaact ttgctaacat gatgctgttg atggctttat gaaggtatgg tgggaacaca 3600
aaagaacaca tttaggtaaa taagatatac atgtgctttg gattctaatc ttcaacactg 3660
tgcaaacatt cagaatgccc ctcctgttta cttgaaatgt actgctcaga aaacagatag 3720
attaccaaac agtgctgctg ctgaactaca gtaatttgcc ttctgtggac actttatagc 3780
ttgcattctc cagtaaaatg tatttcctac acactgcatc acacgcctca cagaggaaaa 3840
ccttgttaac aacacggtcc tacactagta gtgaataaaa gctagaggtt ttcaacaagg 3900
gagaacgcct cttgccaaaa caattaatct atgcaaaaca aaccaccttt cagatacaga 3960
aataacacag cttatgtatg agaaagttga tctagtaaat catacaaaaa tacatacatt 4020
cttcactgtt gactaatttc atcaaagaaa ggcttagaaa tataccaatc agctaaacaa 4080
cacaaagtgg tgttttacaa gcaaatagtt taataaagtt ttcctcgctg tttgccactc 4140
taactgccca ctggtcagaa aagaacaggt agaataatga agtaaagagt atttggtata 4200
aaggcagcct caccttccct ccacagtgct agtggaacca agccataagg cttcactgtg 4260
ggctgaatcc tcctctcttt cagatgattc caagacttgg ttggaagtat tacgtgcact 4320
gtactactga aggctacata catggggtaa gtttaccatc caacatgtct tcttagagtg 4380
tctgttaaat aaactctaac atcttcaaaa cagtatattt aagtgctttt gcaaatcggc 4440
ctttcacagt gtatggactt actttcatgc ttttacctgt ccagcatggg gcacagtttg 4500
ctcttagtaa cacctgagta tctcatcaat cagctctttt cctctgcagg ggtccaactg 4560
cagtttcctg ccttgcttgc tgtcttacta agtcgtgtca ggcaacaaag cttctgagtc 4620
agactttgca gtggtccaaa ctcagtgata cactgtggtc ctcatccagc tgtagctcct 4680
gctgtgcccg cacaccaaaa tgagagcaga tattgacagc tgattttttt tttttaaata 4740
caaccacatc tccattcatt atcacaactg tcactagcaa ttttaccaca agcacctgtc 4800
cttctattac acacttgtta taatattcaa attactttca gaatttatta aagcattatt 4860
tttctttcaa ggcagaaata tcatataatg aaagtcccat tatcagtatt atttcttgag 4920
aacttgcaga cacgttttta agatgactcg gtacatttct gttccacctt gatttaagag 4980
gtttgttaaa tcactttcat cttgtggttt aaacctcctt aactttctgg tggaaaaaac 5040
agtagcatgt acatccttta aaggttttct ctgatctttg tacagcttca gacaaagcat 5100
ctcatgtact ttctccaaac gtatgcttca cttatcacca caaagaatgt gttgctggta 5160
aataaagtgt tgactaaagg taacagtctg taattctacc tttacaggaa aatgctggga 5220
gctgctttgc tacagtcttg tacctaaaga agtctccgcc tgtagtccat gggaagtgtg 5280
tgcatgctca aaataagaaa caaatccaag aagaggacca cagattttac gaatatcttc 5340
agcatcaaaa gaaaccaata actgcaaatt atattccagg tacactcctc caaataatca 5400
actgcacttc attttatatc agtttgcaca cttaagaaca caagccaatg aacatgcaat 5460
tcaaaaagta taaatgcaaa gtagcaccct aaaactatag ggctaactag tacaagaatt 5520
cacctcacca gaaattcctg gggagaaaaa aacaaccaaa catgtttagc agcacagtgg 5580
tagtcaacac aatgttgtga acacgttctg gatttaaaaa caagactatg cagttttaca 5640
ctcaagtaaa tgcaaaatat tctgaagtaa taccaattgc ctgaagccac aaaccttcca 5700
cagctgtgga taggaattca caagggatgg aagcaacaga acatttccat cctggaaacg 5760
gagcacctgg gcaccttctt ttcctcctgg ttaagtaatg acctccacta tggtggatat 5820
tgagtttctc acctcattga ggggaacctg tgagtaacat ctcttggtaa tttcacttcc 5880
aacatgctca catacttctg tggtcacagt aaatttagca tcagttcatt ctcctccctg 5940
ttcacaactg taacgtgcct gaggaaagag ctagctccca ggcatagtgc tatgccaggc 6000
agaaatgctc tgcggtttat catgtttctg atgaagagcc agaattcatc atttttatat 6060
gactctctct cagacagcaa tggaaatatt gcccatgacc atcttcaact gtggggcttg 6120
gccattgttg gcagcagtta catcatgtgg aagcagtcaa cagagcacac gggttactta 6180
ttggcacaag tcagttctgt gaagcagcag gtaagcaaag cggaaattac atgtcttcct 6240
tacaaaaggt gacagcctac agagtggcaa agaataaaac agctgccagt atctcatact 6300
ctctgtaatg gcggtggttc ttccagaagt ggatctgttg gcttctgcag gtttaatcag 6360
aagatttgaa catacgatcc cgcagttcat cagccccata ctatgtcacc ttttgtgctc 6420
tttgtccccc cagccaaact tcaggttagc atcagtataa tgtgcattct ggtgaacgta 6480
ccttacacct acagagcagg agttcccaaa ctttctctta ctcatctgtg catccatttt 6540
tcactcccaa gttacataga atagcatttc tctgaaggag agtttaatgg acaagattac 6600
cacatttatt tgagggttaa ctgaatgaat tattacctgt gtacgcctag tttcatgcca 6660
ggctacagac acacactgta gttactgtct ttgaagtttt atgcagtaag tgcccctaat 6720
ttctcctctg ttcatatgca aaaacctgta ttactccagc caggtatcac agccatctta 6780
agtcctattc atctcacttt ctatgcaagc taaatgcagt caagtaaatc agggtagatt 6840
ctaaacttca tcagtataac ttgtgttctt atttgtcttc ctttgatgca tgacagataa 6900
ggaaggacaa tgctgttgcg tttaaattca ttgtcttgct ccacgaaatt ccaacacagg 6960
taagaaagca tattcataca atacctacct tcatcaatgg agaaatggta taaagatcat 7020
aaaagacaat tattgtgaaa tctgttctcc agcaaatgaa cgtctgtcac atgtacctcg 7080
tgtggacatt aggtcaccct attagagtga aatacagctg tgctccagat aaccatgggc 7140
tcgaagatgg atcgggacag gactctggct cggctgctgg aacgtctcat gaaacgaaag 7200
ggaattttta gaagcaactg tcagctttat gcacacatta aatgggaaac ctttgtgtaa 7260
caggcctgaa gttgtgatca tttttctatc caagtctcat tacagtaaat ttgaatgttt 7320
tcactggtct atttgttcca gaatgaacct ctatagtttc tctaaattaa tgttctaggg 7380
acctactgaa aaactttgct agcatacaca cacaggtgag catacacagg tgattacgtc 7440
attcactttc tgttacttac agtaactaag tttctgaaca aaattaatat atcagataaa 7500
aatctcaata aatattaatc tgtcactaag agatatttgc tttttttttt ttttgagata 7560
7560
<210> 2
<211> 2509
<212> DNA
<213> Ovocalyxin-32
<400> 2
gagggcaccc acacagcagc gccgcaccgc tctgaagcgc ggtttcggtc ctcacgcctt 60
agcctttcac agggatccca gcggcttcag attgggatct ctatgaaaga ttggcgccga 120
tttgcacgca tttcacagat caggaaaata atttccaatc aaatttgaca aagctactgc 180
ataacgttcg gattttgtgc acgacctcgt tcgttcttcc tctggaactc tggcagaaat 240
caatgacaaa aattaacatt tgatacttct cttgaagcgt gcaggtgccc cttttacact 300
tactgggcag cgtgcacttg tagtacgttg gaatatagag attgttaagc ctggccaaga 360
aggctggtgg caccctggct tgtagcagta gtgcagccag caggagctgg gggggggata 420
gcccatccct ccacgtcctc ctcacaaaca acagtcagac ttgctccctg ggcagtggtg 480
gctcggggtc accatccctg ggggtgttca gatccataag ctgtggcatt gagggctgtg 540
ctcagtgggt atggtgggtt ggatctgggg acctcagatt ctgggtcttt tccagcctta 600
aggattgtat ggcacaaccc ctggagcagc atgtgtgatg gaagcagtgc agttgtaacc 660
ctacagcttt ggggaggggt tggtgcagat ctttccaacc tgagtgtaac tgactatctg 720
caaggtggag tgaggaaaag ggattttctc cacccagcac tgcccacttg ccttttaaaa 780
caggaaagaa gaaactggct catggagaaa tgaaatgcct cattacttcc tcatggtact 840
tgatgctgtg cagcactctg taaccactgt ctgcaggtta tttccctttt ttctttgcat 900
gctctgtaaa aaacaagagg agaagcacag cagacatggt cacttcctcc tttcctgtcc 960
tctgtaaaaa atgaaaagaa tttcctggaa ggaatgcact atctaatgtg aatataagag 1020
ttataggttt tttgtttgtt tttaagaagg cggttttcct atttattagt ctattattgg 1080
atcaagcaaa aatagaatag ctttatcacg gaatttaatc atgaccattg tatttaaaaa 1140
ctgatattat cagcccactt aacatttaaa tggtgccatt taaaaacagg actggaaaag 1200
gtctccagta cagtaactgg tagatgagga ggatttttca agctcaggta aaatgagcct 1260
tcaagtgact ccttcttcca gtaaccagta gtcggcagat accaaacact ggctgcagtt 1320
ctctgttttc tcatcaattt tagtttagtt ttgttttttt gattttaata agtgagtatc 1380
ttccaggaaa cagcagcatg catctcatgg gattgttgac agttgcactt taaaacatat 1440
atctgagaag tgaagcatta gtgcgtgcca gctgaagagc ctggaattcc aaagagaaaa 1500
tgtcagagca cagactgact ccccagagca gtctcccata cccctgagca gctaggcagt 1560
ggatcagcag ggaagcacaa aggtaaagct agttaatctc ttgactgaac tgcaacagtt 1620
tctaaaattg gggtaccagg tactatttta tggctggaga tctctctaca aaagctcatc 1680
ttgacacaga actgtcatgt caggactacg gtacggatat taaaataagg caattaaaag 1740
ttatctatga atttccaaca gtcaggcacg caagtcagag tgggaaggta agatcagtcg 1800
cagggtagct ttattatcta gggcacagaa agcaaccaac tttgctggct tttccctccc 1860
cagcagcagg ggtaaagcta cctgagctgg ctgggaggga tggtggcagg gctttgaggt 1920
gtggatcccc aggcaagccc cccgacacat ctcacactcc tccctcagtg atccggttgt 1980
ccctctgtcc cagtgaatga gatccacgga aagaactggc agggaaatgc gcagaggaga 2040
cggggacttg cagcaaaggg tgaaggaggg atcatccctt tcagcagagt tagggcagtg 2100
tcagcaagtt gtgaaactac ctcttttggg acccggaatg aaactgctct taaaaagcta 2160
ttctggcctt tacagctcta aaaatttgtc attaaacttg cattaatttt gagactggta 2220
ttaaaacaat cctgcaaccc agatattcag tggggggaaa aatatattac ttacttttct 2280
ttttggatgc tatctgacta ctttcatgaa gtcagccatc attgttcgat gtcaaatatg 2340
cctcagctgt tatttaattc acagtgtgtg atggtttaca ggaatgcatt gtggggtaat 2400
agtgaaaata acagtgggaa tgaaagcagt ttctttctta ggaccaagac cctgatactg 2460
taaccagcag tgtgcaggca tgctgctatg ctgggccact ggaggaaga 2509
Claims (3)
- 닭의 OCX-32(Ovocalyxin-32) 유전자에 대해 OCX-32 서열목록 2에 기재된 유전자의 1145번 염기를 포함하도록 PCR 증폭하여 증폭산물을 회수하는 단계;
상기 증폭산물 중 1145번 염기의 단일염기다형성을 분석하여 개체별 유전자형을 결정하는 단계;
상기 유전자형 결정 후, OCX-32 유전자의 1145번 염기가 대립유전자 중 어느 하나 또는 모두에서, T에서 C로 변형된 닭을 선별하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 닭 산란 형질 분별 방법.
- 제1항에 있어서,
상기의 산란 형질은,
산란율, 시산일령, 난중 중 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는 닭의 산란 형질 분별 방법.
- 제1항에 있어서,
상기의 닭은,
오골계, 흑색재래계, 회색재래계, 백색재래계 중 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는 닭의 산란 형질 분별 방법.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170050493A KR20170087429A (ko) | 2017-04-19 | 2017-04-19 | 닭의 산란 형질 관련 유전자 마커 및 이를 이용하여 닭의 산란 형질을 분별하는 방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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KR1020170050493A KR20170087429A (ko) | 2017-04-19 | 2017-04-19 | 닭의 산란 형질 관련 유전자 마커 및 이를 이용하여 닭의 산란 형질을 분별하는 방법 |
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KR1020160006569A Division KR20170087115A (ko) | 2016-01-19 | 2016-01-19 | 닭의 산란 형질 관련 유전자 마커 및 이를 이용하여 닭의 산란 형질을 분별하는 방법 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20170087429A true KR20170087429A (ko) | 2017-07-28 |
Family
ID=59422533
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Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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KR (1) | KR20170087429A (ko) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111418548A (zh) * | 2020-04-24 | 2020-07-17 | 广东天农食品有限公司 | 一种致因纯合突变的矮脚黄鸡品系的培育方法 |
CN115820872A (zh) * | 2022-08-10 | 2023-03-21 | 华南农业大学 | 一种与麻黄鸡繁殖性状相关的分子标记及其应用 |
-
2017
- 2017-04-19 KR KR1020170050493A patent/KR20170087429A/ko not_active Application Discontinuation
Cited By (3)
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CN111418548A (zh) * | 2020-04-24 | 2020-07-17 | 广东天农食品有限公司 | 一种致因纯合突变的矮脚黄鸡品系的培育方法 |
CN115820872A (zh) * | 2022-08-10 | 2023-03-21 | 华南农业大学 | 一种与麻黄鸡繁殖性状相关的分子标记及其应用 |
CN115820872B (zh) * | 2022-08-10 | 2023-10-20 | 华南农业大学 | 一种与麻黄鸡繁殖性状相关的分子标记及其应用 |
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Date | Code | Title | Description |
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A107 | Divisional application of patent | ||
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E601 | Decision to refuse application |