KR20160048760A - 피부 상재균 분석을 기반으로 하는 맞춤형 스킨 케어 제품 및 개인용 케어 제품 - Google Patents

Abstract

본 발명은 임의의 피부 상태가 공생(commensal) 또는 상리공생(mutualistic) 미생물 또는 그의 관련 대사물질의 불균형 또는 부재의 결과인지를 결정하기 위하여 개체의 피부 및 피하 조직을 먼저 평가하고자 하는, 피부 및 피하 조직 미생물 상재균 및 그의 관련 대사체의 특성화를 허용하는 실험적 및 전산 워크플로우(workflow)의 조합에 관한 것이다. 본원에 제공된 방법 및 관련 전산 플랫폼은 맞춤형(customized) 또는 개인화된(personalized) 시험을 수행하고, 그로부터 피부 및 피하 조직 상재균 및 그의 관련 대사체에 대한 맞춤형 또는 개인화된 정보를 수득하는 것에 관한 것으로, 이 또한 본원에 개시된다.

Description

피부 상재균 분석을 기반으로 하는 맞춤형 스킨 케어 제품 및 개인용 케어 제품{CUSTOMIZED SKIN CARE PRODUCTS AND PERSONAL CARE PRODUCTS BASED ON THE ANALYSIS OF SKIN FLORA}

관련출원(들)에 대한 상호 참조

본 출원은 각각의 전문이 본원에 참조로 포함된, 2014년 3월 3일자로 출원된 미국 시리얼 번호 제61/947,316호 및 2013년 6월 18일자로 출원된 미국 시리얼 번호 제61/836,589호의 35 U.S.C. §　119(e)하의 우선권의 이점을 청구한다.

본 발명은 일반적으로 스킨 케어 제품 및 보다 특히는, 개인화된(personalized) 스킨 케어 제품을 개발 또는 식별하기 위한 피부 및 피하 조직 상재균(flora)과 그의 관련 대사체(metabolome)의 분석 방법을 기반으로 한다.

약 100조 개의 미생물이 몸의 대략 10조 개 인간 세포보다 굉장히 수적으로 우세하게 인체 안 및 위에 살고 있다. 이들 통상적으로 무해한 바이러스, 박테리아 및 진균은 공생(commensal) 또는 상리공생(mutualistic) 유기체로서 지칭된다. 공생 및 상리공생 유기체는 많은 방법으로 우리의 몸이 건강하게 유지되는 것을 돕는다: 그들은 우리가 음식을 소화하여 비타민 B 및 K와 같은 영양소를 얻고, 예를 들면, 면역계가 그들과 경쟁함으로써 질환을 유발하는 박테리아성 병원균의 콜로니화(colonization)를 발전 및 방지하도록 권장하는 것을 돕는다. 몸 안 및 밖에 사는 모든 미생물 - 공생, 상리공생 및 병원성 -을 함께 미생물군집(microbiome)으로서 지칭하고, 그들의 평형과 관련된 대사체는 개체의 건강 상태와 밀접하게 관련되며, 그 반대도 또한 같다.

차세대 시퀀싱(NGS: Next generation sequencing)은 피부 및 피하 조직에 서식하는 미생물군집을 신속히 그리고 정확하게 식별하여 개요를 알려주는 기회를 만들었고, 이어서 건강한 미생물군집을 유지하거나, 특히 건강한 프로파일을 정립하도록 생성된 공생 및/또는 상리공생 유기체의 혼합물을 배합함으로써 건강한 평형 또는 프로파일쪽으로 프로파일을 움직이는 맞춤형(customized) 또는 개인화된(personalized) 스킨 케어 및 개인용 케어 제품의 생성 기회를 만들고 있다. 최적의 상재균은 또한 그의 건강한 이점을 추가로 전파하는 상승적 방식으로 숙주 면역계와 상호작용한다. 관련된 개체의 대사체는 또한 질량 분석법(mass-spectrometry) 기반 시스템에 의해 또는 게놈-기반 대사체 모델링(genomics-based metabolome modeling) 및 대사-흐름 분석(flux-balance analysis)을 사용하여 프로파일링 할 수 있고, 건강한 대사체 프로파일을 만드는데 사용할 수 있다. 유용한 대사물질중 어느 것의 결핍이 마찬가지로 보충될 수 있다.

현재, 피부학적 상태를 치료하는 유일한 방법은 공생 및 상리공생 박테리아를 포함한 미생물군집에 철저하게 영향을 주는 항생제를 통해 또는 몸의 면역 반응을 약화시키고 병원균에 대한 상피 세포의 반응을 완화시키는 항-염증제를 통해서이지만, 그것이 만약 공생 또는 상리공생 미생물의 불균형 또는 부재, 기회성 또는 병원성 박테리아의 과잉, 또는 필수 또는 유용한 대사물질의 결핍으로 인한 경우 피부 상태의 기초 원인을 다룰 수 없다.

발명의 요약

본 발명은 일반적으로 인간 및 동물 사용을 위한 맞춤형 스킨 케어 및 개인용 케어 제품의 개발 및, 보다 특히는, 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 피부 및 피하 조직에 서식하는 상재균의 초기 평가를 기반으로 하는 개인용 케어 제품의 개발에 관한 것이다. 본 기재는 피부 및 피하 조직 상재균, 예를 들면, 미생물군집, 및 그의 관련 대사체를 분석하고, 생성된 피부 및 피하 조직 상재균과 대사체의 프로파일을, 건강한 피부 유형의 세트로부터 결정된 범위 내에 속하는 상재균의 양 및 다양성으로서 표현되는, 건강한 프로파일과 비교한 다음, 시험 대상체의 피부 및 피하 조직에 살고있는 상재균 및 그의 관련 대사체를 증가시키거나, 시험 대상체의 것에 대해 건강한 상재균 프로파일을 복제할 스킨 케어 및 개인용 케어 제품을 맞춤화하는 방법에 관한 것이다.

따라서, 한 측면에 있어서, 본 발명은 대상체의 피부 또는 피하 조직의 미생물군집을 특성화(characterizing)하는 방법을 제공한다. 상기 방법은: a) 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하고; b) 대상체의 미생물군집을 특성화하기 위하여 (a)의 복수 미생물을 분석 및 분류함으로써, 대상체의 미생물군집을 특성화함을 포함한다. 일부 구현예로, 상기 방법은 대상체의 미생물군집을 참조 미생물군집(reference microbiome)에 비교하거나, 대상체의 미생물군집 프로파일을 생성하거나, 또는 대상체가 발병하거나 이러한 위험에 처해 있는 질환 또는 장애를 식별하거나, 또는 대상체에 대한 맞춤형 치료 레지멘(regime)을 제공함을 추가로 포함한다. 다양한 구현예로, 참조 미생물군집은 건강한 프로파일을 갖는 것으로서 분류되고, 대상체의 미생물군집과 참조 미생물군집 사이의 유사성은 대상체의 미생물군집이 건강한 프로파일을 갖는 것으로서 식별한다. 대안적으로, 참조 미생물군집은 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 것으로서 분류되며, 대상체의 미생물군집과 참조 미생물군집 사이에 유사성은 대상체의 미생물군집이 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 것으로서 식별한다.

다른 측면에 있어서, 본 발명은 복수 대상체의 피부 또는 피하 조직의 미생물군집을 특성화하는 방법을 제공한다. 상기 방법은: a) 복수 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 샘플을 수득하며, 각 샘플은 복수의 미생물을 포함하고; b) 복수 샘플 각각의 미생물군집을 식별하기 위하여 (a)의 각 샘플의 복수 미생물을 분석 및 분류함으로써, 복수 대상체의 미생물군집을 특성화함을 포함한다. 구현예로, 상기 방법은 복수 샘플의 개별 코호트(cohort)를 식별하기 위하여 (b)의 결과를 군집화함을 추가로 포함한다. 일부 구현예로, 각각의 개별 코호트는 특별한 표현형 또는 프로파일을 나타낸다. 일부 구현예로, 각각의 개별 코호트는 유사한 미생물군집을 갖는 샘플, 공통의 피부 질환 또는 장애를 갖는 대상체로부터의 샘플, 또는 유사한 대사물질 프로파일을 갖는 대상체로부터의 샘플을 포함한다.

또 다른 측면에 있어서, 본 발명은 대상체에서 질환 또는 장애의 진단 방법을 제공한다. 상기 방법은 a) 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하고; b) 대상체의 미생물군집을 식별하기 위하여 (a)의 복수 미생물을 분석 및 분류하며; c) 대상체의 미생물군집을 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 대상체의 미생물군집을 대표하는 참조 미생물군집에 비교(여기서, 대상체의 미생물군집과 참조 미생물군집 사이의 유사성은 질환 또는 장애의 위험이 있거나 이를 가진 대상체를 나타낸다)함으로써, 대상체에서 질환 또는 장애를 진단함을 포함한다. 구현예로, 상기 방법은 대상체에 맞춤형 치료 레지멘을 제공함을 추가로 포함한다. 일부 구현예로, 상기 방법은 대상체에 맞춤형 치료학적 제형을 제형화하여 투여함을 추가로 포함한다.

다른 측면에 있어서, 본 발명은 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 대상체에 대해 맞춤형 치료학적 제형을 제형화하는 방법을 제공한다. 상기 방법은: a) 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하고; b) 대상체의 미생물군집을 식별하기 위하여 (a)의 복수 미생물을 분석 및 분류하며; c) 대상체의 미생물군집을 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 대상체의 미생물군집을 대표하는 참조 미생물군집에 비교(여기서, 대상체의 미생물군집과 참조 미생물군집 사이의 유사성은 질환 또는 장애의 위험이 있거나 이를 가진 대상체를 나타낸다)하고; d) (c)를 기반으로 하는 맞춤형 치료학적 제형을 제형화함으로써, 맞춤형 치료학적 제형을 제형화함을 포함한다.

다른 측면에 있어서, 본 발명은 본 발명의 방법을 통해 제형화된 치료학적 제형을 제공한다.

도 1은 피부 및 피하 조직 상재균을 프로파일링하기 위한 실험적 및 분석 파이프라인의 고-수준 요약(high-level summary)이다. 피부 또는 피하 조직 샘플로부터 수집된 혼합 개체군으로부터의 미생물 게놈의 정보 영역은 다양한 박테리아 종의 최대 다양성을 포획하도록 디자인된 보편적인 프라이머 서열에 의해 증폭시킨다. 증폭된 영역은 다양한 공급원으로부터의 샘플을 다중 처리(multiplex processing)할 수 있도록 독특하게 인덱스화(indexed)된다 (핵산 하베스팅 및 제조). 상이한 공급원으로부터의 증폭된 영역은 합하여 NGS 플랫폼 상에서 쌍 말단(Paired End: PE) 방식으로 서열화할 수 있거나, 또는 대안적으로 생어-시퀀싱(Sanger-sequencing), 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법(immunofluorescence), 원위치 혼성화(in situ hybridization), 또는 미생물 염색 기반 플랫폼(microbial staining based platform)에 대해 분석할 수 있다. 식별 플랫폼(identification platform)의 로우 아웃풋(Raw output)은 로우 리드아웃(raw read-out)을 상이한 분류학 그룹으로부터의 종으로 할당하는 프로프리어터리 분석(proprietary analysis) 파이프라인을 사용하여 분석한다. 유사한 워크플로우(workflow)는 임의의 제시된 샘플과 관련된 대사물질을 맵핑하기 위해 이용한다.
도 2는 개체의 건강한 코호트로부터의 다중 샘플을 수집하고, 샘플은 본 발명자의 파이프라인을 통해 도 1에 기술된 바와 같이 처리하여, 건강한 개체군에 대한 공통 프로파일(consensus profile)을 형성하여, 구성 우세 종 상재균 또는 그들의 관련 대사체를 포획하는데 사용함을 보여주고 있다. 건강한 프로파일은 임의의 감염 그룹, 개체군 또는 개체를 비교하기 위한 참조로서 처리한다.
도 3은 하나의 독특한 피부 상태를 갖는 개체의 코호트로부터의 다중 샘플을 수집하고, 그들의 피부 상재균 및 그의 관련 대사체를 앞서 기술한 바와 같이 프로파일링함을 보여준다. 종 메타-데이타(species meta-data) 프로파일은 그 피부 상태의 원인이 되거나 그와 관련된 특징 미생물 또는 대사물질을 식별하기 위하여 사용한다. 앞서 식별된 건강한 프로파일과 대조적으로, 새로운 클라이언트(도면에서 물음표로 표시된)의 피부 및 피하 조직 상재균 또는 대사체 조성물의 어떤 변칙이 심지어 초기 단계에서도 검출될 수 있고, 특히 건강한 프로파일을 정립하기 위하여 예상되는 공생 유기체 또는 대사물질의 혼합물을 배합함으로써 생성되는 건강한 평형쪽으로 그 감염된 프로파일을 이동하는 맞춤형 또는 개인화된 스킨 케어 제품에 의해 고치거나 개선할 수 있다.

이제 약 100조 개의 미생물이 대략 10조 개 인간 세포보다 굉장히 수적으로 우세하게 인체 안 및 위에 살고 있다고 잘 정립되어 있다. 이들 통상적으로 무해한 바이러스, 박테리아 및 진균은 공생(그들의 숙주에 대해 유해하지 않음) 또는 상리공생(이점을 제공함)으로서 지칭된다. 공생 및 상리공생 유기체는 많은 방법으로 우리의 몸이 건강하게 유지되는 것을 돕는다: 그들은 우리가 음식을 소화하여 비타민 B 및 K와 같은 영양소를 얻고, 우리의 면역계가, 예를 들면, 그들과 경쟁함으로써 질환을 유발하는 박테리아성 병원균의 콜로니화를 발전 및 방지하도록 권장하는 것을 돕는다. 모든 미생물 - 공생, 상리공생 및 병원성 -을 함께 몸의 미생물군집으로서 지칭하고, 그들의 평형 및 관련된 미생물군집은 개체의 건강 상태와 밀접하게 관련되며, 그 반대도 또한 같다.

현재, 피부학적 상태를 치료하는 주요 방법은 개체의 미생물군집을 철저하게 변화시키는 항생제를 통해 또는 몸의 면역 반응을 약화시키고 병원균에 대한 상피 세포의 반응을 완화시키는 항-염증제를 통해서이지만, 피부 상태의 기초 원인을 다룰 수 없다. 본 발명의 구현예는 그들의 피부 상태가 공생 또는 상리공생 미생물 또는 그의 관련 대사체의 불균형 또는 부재의 결과인지를 결정하기 위하여 개체의 피부를 먼저 평가하고자 하는, 피부 미생물 상재균 및 그의 관련 대사체의 특성 분석을 허용하는 실험적 및 전산 워크플로우의 조합에 관한 것이다.

본 명세서 및 첨부된 특허청구범위에 사용된 바와 같이, 단수 형태 "a", "an" 및 "the"는 내용이 달리 명확히 지시하지 않는 한 복수 기준을 포함한다. 따라서, 예를 들면, "방법(method)"에 대한 기준은 하나 이상의 방법들, 및/또는 본 기재 등을 읽으면 당해 분야의 숙련가에게 명확해질 본원에 기술된 유형의 단계들을 포함한다.

달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어는 본 발명이 속하는 당해 분야의 통상의 숙련가중 누군가가 통상 이해하는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기술된 것과 유사하거나 동등한 어떤 방법 및 물질이 본 발명의 실행 또는 시험에 사용될 수 있음에도 불구하고, 바람직한 방법 및 물질을 이제 기술한다.

본 발명은 일반적으로 인간 및 동물 사용을 위한 맞춤형 스킨 케어 및 개인용 케어 제품의 개발 및, 보다 특히는, 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 피부 및 피하 조직에 서식하는 상재균의 초기 평가를 기반으로 하는 개인용 케어 제품의 개발에 관한 것이다. 본 기재는 피부 및 피하 조직 상재균과 그의 관련 대사체를 분석하고, 생성된 피부 및 피하 조직 상재균과 대사체의 프로파일을 건강한 피부 유형의 세트로부터 결정된 범위 내에 속하는 상재균의 양 및 다양성으로서 표현되는, 건강한 프로파일과 비교한 다음, 시험 대상체의 피부 및 피하 조직에 살고 있는 상재균 및 그의 관련 대사체를 증가시키거나, 시험 대상체의 것에 대해 건강한 상재균 프로파일을 복제할 스킨 케어 및 개인용 케어 제품을 맞춤화하는 방법에 관한 것이다.

개별화된(individualized) 피부 시험 결과는 건강한 피부 미생물군집 및 대사체를 유지하거나, 피부에 공생 및 상리공생 유기체의 성장에 유리한 하나 이상의 공생 및/또는 상리공생 유기체 및/또는 기질을 가함으로써 건강한 평형 또는 프로파일쪽으로 프로파일을 이동하도록 맞춤화된 개별화된 스킨 케어 및 개인용 케어 제품의 개발을 위한 기반이 될 수 있다. 스킨 케어 제품 배합물의 정확한 조성은 어떤 개체의 피부 및 피하 조직 상재균 및 대사체의 생성된 프로파일을 건강한 프로파일에 비교한 다음, 대상체의 피부 및 피하 조직 상재균과 대사체를 건강한 프로파일쪽으로 최상으로 이동하는 스킨 케어 및 개인용 케어 제품을 맞춤화한 후 결정할 수 있다. 최적의 상재균 및 기질과 대사체는 또한 숙주의 면역계와 상승작용하여, 그 관점으로부터 건강한 피부쪽으로 기여한다.

본원에 사용된 바와 같은 용어 "대상체(subject)"은 본 방법이 수행되는 어떤 개체 또는 환자를 지칭한다. 일반적으로, 대상체는 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 대상체가 동물일 수 있음에도 불구하고, 인간이다. 따라서, 설치류(마우스, 래트, 햄스터 및 기니 피그 포함), 고양이, 개, 토끼, 소, 말, 염소, 양, 돼지 등을 포함한 농장 동물, 및 영장류(원숭이, 침팬지, 오랑우탄 및 고릴라를 포함)와 같은 포유류를 포함한, 다른 동물이 본 정의 내에 포함된다.

따라서, 한 측면에 있어서, 본 발명은 대상체의 피부 또는 피하 조직의 미생물군집을 특성화하는 방법을 제공한다. 상기 방법은: a) 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하고; b) 대상체의 미생물군집을 특성화하기 위하여 (a)의 복수 미생물을 분석 및 분류함으로써, 대상체의 미생물군집을 특성화함을 포함한다.

본원에 사용된 바와 같이, 용어 "샘플" 및 "생물학적 샘플"은 본 발명에 의해 제공되는 방법에 적합한 임의 샘플을 지칭한다. 세포의 샘플은, 예를 들면, 테이프 스트립핑, 스크레이핑(scraping), 소제(swabbing)와 같은 비-외과적(non-invasive) 기술, 또는 대상체의 생검과 같은 보다 외과적인 기술에 의해 수득되는 피부 또는 피하 조직 샘플을 포함한, 임의 샘플일 수 있다. 한 구현예로, 용어 "샘플"은 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 유래된 어떤 제제를 지칭한다. 예를 들면, 본원에 기술된 비-외과적 방법을 사용하여 수득한 세포 샘플은 본 발명의 방법을 위해 핵산 분자 또는 단백질을 분리하는데 사용될 수 있다. 본 발명을 위한 샘플은 질환 또는 병리학적 또는 생리학적 상태의 결과로 의심되는 질환 또는 장애 (예: 건선 또는 피부염)를 나타내는 것으로 보여지는 피부 부위, 또는 주변부(surrounding margin)나 조직으로부터 취할 수 있다. 본원에 사용된 바와 같이, "주변부" 또는 "주변 조직"은 질환 또는 장애를 나타내는 것으로 보여지는 피부에 인접한 대상체의 조직을 지칭하지만, 다른 것은 정상으로 나타난다.

일부 구현예로, 상기 방법은 대상체의 미생물군집을 참조 미생물군집에 비교하거나, 대상체의 미생물군집 프로파일을 생성하거나, 또는 대상체가 발병하거나 이러한 위험에 처해 있는 질환 또는 장애를 식별하거나, 또는 대상체에 대한 맞춤형 치료 레지멘을 제공함을 추가로 포함한다. 다양한 구현예로, 참조 미생물군집은 건강한 프로파일을 갖는 것으로서 분류되고, 대상체의 미생물군집과 참조 미생물군집 사이의 유사성은 대상체의 미생물군집이 건강한 프로파일을 갖는 것으로서 식별한다. 대안적으로, 참조 미생물군집은 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 것으로서 분류되며, 대상체의 미생물군집과 참조 미생물군집 사이에 유사성은 대상체의 미생물군집이 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 것으로서 식별한다.

본원에 사용된 바와 같이, "건강한 프로파일(healthy profile)"은 건강한 미생물군집을 갖는 것으로 결정된, 예를 들면, 질환 또는 장애나, 이의 위험이 없는 대상체로부터인 대상체로부터의 샘플과 관련된 미생물군집을 지칭한다. 또한, 한 구현예로, 참조 미생물군집은 피부 장애 또는 특별한 바람직하지 못한 표현형을 갖지 않는 건강한 개체로부터 수득한 세포 샘플의 것이다.

용어 건강한 프로파일은 건강한 피부 유형의 세트로부터 결정된 범위 내에 속하는 상재균의 양 및 다양성을 지칭한다. 용어 건강한 피부는, 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 염증, 발진, 피부염, 아토피성 피부염, 습진, 건선, 비듬, 여드름, 봉와직염, 주사, 사마귀, 지루성 각화증, 광선 각화증, 어루러기(tinea versicolor), 바이러스성 발진, 대상포진, 백선 및 암, 예를 들면, 기저세포암, 편평세포암, 및 흑색종을 포함한, 피부 상태 질환 또는 장애가 없는 피부를 지칭한다.

또한, 본원에 사용된 바와 같이, "질환(disease)" 또는 "장애(disorder)"는 일반적으로 임의의 피부 관련 질환, 예를 들면, 어떠한 방법으로든 이것으로 제한하지 않지만, 염증, 발진, 피부염, 아토피성 피부염, 습진, 건선, 비듬, 여드름, 봉와직염, 주사, 사마귀, 지루성 각화증, 광선 각화증, 어루러기, 바이러스성 발진, 대상포진, 백선 및 암, 예를 들면, 기저세포암, 편평세포암, 및 흑색종을 지칭하고자 한다.

본원에 사용된 바와 같이, 용어 "암(cancer)"은 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 암종, 흑색종 및 육종을 포함한, 임의의 악성 종양을 포함한다. 암은 세포의 조절되지 않고/않거나 비정상적인 분할로부터 일어난 다음, 주변 조직을 침입하여 파괴한다. 본원에 사용된 바와 같이, "증식하는(proliferating)" 및 "증식(proliferation)"은 유사분열을 수행하는 세포를 지칭한다. 본원에 사용된 바와 같이, "전이(metastasis)"는 그것의 본래 시야로부터 악성 종양의 멀리 퍼짐을 지칭한다. 암세포는 혈류를 통해, 림프계를 통해, 체강을 가로질러, 또는 이들의 임의 조합에 의해 전이될 수 있다. 본원에 제공된 바와 같은 용어 "암에 걸린 세포(cancerous cell)"는 본원에 제공된 암에 걸린 상태중 어느 하나로 고생하는 세포를 포함한다. 용어 "암종(carcinoma)"은 주변 조직을 침윤하기 위해 상피 세포를 채우고 전이를 일으키는 악성의 새로운 성장을 지칭한다. 용어 "흑색종(melanoma)"은 피부에서 주로 그러나 창자 및 눈에서도 또한 발견되는 멜라닌 세포(melanocyte)의 악성 종양을 지칭한다. "멜라닌 세포"는 피부 표피의 기저층, 기저판 및 눈의 중간층에 위치하는 세포를 지칭한다. 따라서, "흑색종 전이"는 흑색종 세포가 국소 임파절 및/또는 원위 기관(예: 간, 뇌, 유방, 전립성 등)으로 퍼짐을 지칭한다.

용어 "피부" 또는 "피하 조직"은 표피(각질층 포함) 및 그 밑의 진피로 이루어진, 몸의 외부 보호 커버링을 지칭하며, 모낭 구조 및 손톱뿐만 아니라, 땀샘 및 피지선을 포함하는 것으로 이해한다. 본 출원을 통해, 형용사 "피부(cutaneous)" 및 "피하(subcutaneous)"가 사용될 수 있고, 일반적으로 그들이 사용된 내용에 적합하다면 피부의 속성을 지칭하는 것으로 이해해야 한다. 인간 피부의 표피는 몇몇 독특한 피부 조직층을 포함한다. 가장 깊은 층은 기저층(stratum basalis layer)이며, 이는 원주 세포(columnar cell)로 이루어진다. 중복되는 층은 다면 세포로 구성된, 유극층(stratum spinosum)이다. 유극층으로부터 밀어올려진 세포는 납작해져 각질유리 과립을 합성하여 과립층(stratum granulosum layer)을 형성한다. 이들 세포가 밖으로 움직이면, 그들은 그들의 핵을 잃어버리고, 각질유리 과립이 장원섬유와 융합되어 섞인다. 이는 투명층(stratum lucidum)이라 불리우는 투명한 층을 형성한다. 투명층의 세포는 밀접하게 팩킹된다. 세포가 투명층으로부터 위로 움직이면, 그들은 많은 불투명한 인설(opaque squamae)층으로 압축된다. 이들 세포는 모두 각질로 완전히 채워져 핵을 포함한, 다른 내부 구조를 모두 잃어버린 세포의 평평한 잔여분이다. 이들 인설은 표피의 외부층, 각질층(stratum corneum)을 구성한다. 각질층의 기저에, 세포는 밀접하게 치밀화되어 있고 서로 강하게 부착되지만, 각질에서 더 높을수록, 그들은 느슨하게 충전되어, 실제로 표면으로부터 떨어져 나가게 된다.

본원에서 추가로 논의된 바와 같이, 세포 또는 유기체의 신속하고 정확한 시퀀싱을 허용하는 강력한 DNA 시퀀싱 기술인, 차세대 시퀀싱, 또는 NGS는 오늘날 이의 좋은 예가 미생물군집인, 복잡한 박테리아성 군집을 평가할 수 있다. 본 발명은 모든 개체가 그러한 차세대 시퀀싱(NGS) 플랫폼 상에서 수행되는 서식자 상재균의 식별을 그리고 있다. 이러한 플랫폼은 누군가가 비교적 짧은 턴-어라운드(turn-around) 시간 및 잴 수 있는 처리량으로 충분히 높은 감수성 및 특이성을 가지면서 피부에 서식하는 미생물군집을 신속하고 정확하게 식별 및 프로파일링할 수 있게 한다. 대안적으로, 생어-시퀀싱, 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법, 원위치 혼성화, 또는 미생물 염색 기반 플랫폼이 개체 프로파일을 특성화하는데 사용될 수 있다. 유사하게, 미생물군집 또는 대사체는 질량분석법 기반 시스템에 의해 또는 게놈-기반 대사체 모델링 및 대사-흐름 분석을 사용하여 프로파일링할 수 있다. 상기 언급한 모든 식별 방법들은 임의의 증식 단계없이 개체로부터 직접 수집한 샘플에 대해 실행할 수 있다. 이 방법은, 최소의 선입견으로 배양 가능 및 배양 불가능한 미생물 또는 그들의 관련 대사체의 혼합물 식별에 대해 도입된다.

질량분석법 또는 생어 시퀀싱과 같은 NGS 또는 다른 미생물 식별 방법의 높은 처리량 능력을 레버리징(leveraging)함으로써, 개체의 피하 조직 위에 수많은 미생물 및 그들의 관련 미생물군집과 대사체가 동시에 식별될 것이고, 생성된 프로파일은 피부 및 피하 조직 프로파일의 데이타베이스로부터 건강한 프로파일과 비교할 수 있다. 그 플랫폼이 프로파일링을 위해 활용됨과 무관하게, 상기 언급한 플랫폼은 임의의 클라이언트에 대한 시험으로서 제공될 수 있고, 아웃풋은 공생, 병원성 또는 상리공생 미생물이나 그들의 관련 대사물질이 건강한 프로파일에 견주어 대상체의 피부 및 피하 조직 위에서 고갈되거나 지나치게 나타나는 지를 식별하기 위하여 사용될 수 있다.

더욱이, 대상체의 상재균 및 대사체의 조성은 그 또는 그녀가 미래에 그들 피부 상태중 어떤 것이 발생되기 쉬운 지를 알기 위하여 앞서 이행한 상이한 피부 상태의 데이타베이스에 비교할 수 있다. 맞춤형 또는 개인화된 시험 결과를 근거로 하여, 공생 및 상리공생 유기체의 증식에 유리한 필요한 기질 및 영양소의 존재 또는 부재하에 개체의 상재균 또는 대사체가 고갈된 공생 및 상리공생 미생물 또는 그들의 관련 대사물질의 혼합물을 배합함으로써 맞춤형 또는 개인화된 스킨 케어 또는 개인용 케어 배합물이 그 개체에 대해 제형화될 수 있다. 이러한 맞춤형 또는 개인화된 스킨 케어 및 개인용 케어 제품은 특히 건강한 미생물군집을 유지하거나, 차선의 프로파일을 건강한 평형쪽으로 이동시킴으로써 최적의 프로파일을 정립하는 방법으로 생성된다. 또한, 최적의 미생물 상재균 및 그의 관련 대사체와 숙주의 면역계 사이에 상승작용이 피부 건강 및 웰니스(wellness)에 또한 기여할 것이다.

또한, 본원에 기술된 방법 및 플랫폼이 핵산 분자의 시퀀싱과 같은, 핵산 분자의 분석을 이용할 수 있다. 시퀀싱 방법은 전체 게놈 시퀀싱(whole genome sequencing), 차세대 시퀀싱, 생어-시퀀싱, 16S rDNA 시퀀싱 및 16S rRNA 시퀀싱을 포함할 수 있다. 또한, 본원에 기술된 상기 방법 및 플랫폼은 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법, 원위치 혼성화, 미생물 염색 기반 플랫폼 또는 이들의 조합을 이용할 수 있다.

구현예로, 식별 플랫폼에 대한 입력은 DNA, RNA, cDNA, miRNA, mtDNA, 단일 또는 이중-가닥을 포함한, 임의의 핵산일 수 있다. 이 핵산은 임의의 길이, 약 5 bp의 올리고만큼 짧음 내지 메가염기쌍(megabase) 또는 심지어 더 긴 길이일 수 있다. 본원에 사용된 바와 같이, 용어 "핵산 분자"는 DNA, RNA, 단일-가닥, 이중-가닥 또는 삼중 가닥 및 이들의 임의의 화학적 변형체를 의미한다. 실제로, 핵산의 임의 변형이 시도된다. "핵산 분자"는 거의 임의의 길이, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 75, 100, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000, 1500, 2000, 2500, 3000, 3500, 4000, 4500, 5000, 6000, 7000, 8000, 9000, 10,000, 15,000, 20,000, 30,000, 40,000, 50,000, 75,000, 100,000, 150,000, 200,000, 500,000, 1,000,000, 1,500,000, 2,000,000, 5,000,000 또는 심지어 그 이상의 염기로부터 전장 염색체 DNA 분자까지 일 수 있다. 유전자 발현을 분석하는 방법의 경우, 샘플로부터 분리된 핵산은 통상 RNA이다.

마이크로-RNA (miRNA)는 인간을 포함한 다양한 종에서 mRNA 발현을 조절하는데 관여하는 길이가 평균 22 뉴클레오티드인 작은 단일 가닥 RNA 분자이다 (Bartel 2004에서 검토). miRNA의 처음 리포트는 벌레 예쁜꼬마선충(C. elegans)에서 발견된 lin-4 유전자의 것이었다 (참조: Lee, Feinbaum et al. 1993). 그 이래로 수백 개의 miRNA가 파리, 식물 및 포유동물에서 발견되었다. miRNA는 mRNA의 3'-비해독 영역에 결합됨으로써 유전자 발현을 조절하고, i) mRNA의 절단; 또는 2) 해독의 억제를 촉매화한다. miRNA에 의한 유전자 발현의 조절은 세포 발생, 분화, 상호작용 및 세포사멸(apoptosis)와 같은 많은 생물학적 과정에 대해 중요하다 (참조: Reinhart, Slack et al. 2000; Baehrecke 2003; Brennecke, Hipfner et al. 2003; Chen, Li et al. 2004). 최근, miRNA가 마우스 상피의 배아발생 도중 활성이 되어 피부 형태발생(morphogenesis)에서 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀졌다 (참조: (Yi, O'Carroll et al. 2006).

유전자 발현에서 miRNA의 역할이 제시되어, miRNA는 특별한 세포 유형에서 상대적인 양의 mRNA를 완전히 명시하지 못하면, 영향을 줄 것이고, 이에 따라 상이한 세포 유형에서 특별한 유전자 발현 프로파일 (즉, 특정 mRNA의 개체군)을 결정할 것이 확실하다. 또한, 세포에서 특정 miRNA의 특별한 분포가 또한 상이한 세포 유형에서 구별될 것 같다. 따라서, 조직의 miRNA 프로파일의 결정은 그 조직에서 실제 mRNA 개체군의 발현 프로파일링을 위한 도구로서 사용될 수 있다. 따라서, miRNA 수준 및/또는 miRNA 돌연변이의 검출이 질환 검출, 진단, 예후, 또는 치료-관련 결정 (즉, 치료 레지멘이 수행되기 전 또는 후에 반응을 나타냄) 또는 대상체에서 특별한 질환의 특성화를 위해 유용하다

본원에 사용된 바와 같이, 용어 "단백질"은 적어도 2개의 공유결합된 아미노산을 지칭하며, 이는 단백질, 폴리펩티드, 올리고펩티드 및 펩티드를 포함한다. 단백질은 천연으로 존재하는 아미노산 및 펩티드 결합, 또는 합성 펩티도미메틱(peptidomimetic) 구조로 구성될 수 있다. 따라서, 본원에 사용된 바와 같이, "아미노산" 또는 "펩티드 잔기"는 천연으로 존재하는 아미노산 및 합성 아미노산 모두를 의미한다. 예를 -들면, 호모페닐알라닌, 시트룰린 및 노레루신(noreleucine)이 본 발명의 목적을 위한 아미노산으로 고려된다. "아미노산"은 또한 프로파일 및 하이드록시프롤린과 같은 이미노산 잔기를 포함한다. 측쇄는 (R) 또는 (S) 배위로 존재할 수 있다.

"프로브(probe)" 또는 "프로브 핵산 분자"는 적어도 부분적으로 단일-가닥이며, 관심있는 서열에 대해 적어도 부분적으로 상보성, 또는 적어도 부분적으로 실질적으로 상보성인 핵산 분자이다. 프로브는 RNA, DNA, 또는 RNA와 DNA 모두의 조합일 수 있다. 골격 당이 리보스 또는 데옥시리보스가 아닌 핵산을 포함하는 프로브 핵산 분자를 갖는 것이 또한 본 발명의 범위 내에 속한다. 프로브 핵산은 또한 펩티드 핵산일 수 있다. 프로브는 핵산분해-활성 내성 결합 또는 검출가능한 라벨을 포함할 수 있고, 다른 모이어티(moieties), 예를 들면, 펩티드에 작동가능하게 결합될 수 있다.

단일-가닥 핵산 분자는 시토신(C)과의 염기쌍에 대한 구아닌(G) 및 티민(T) 또는 우리딘(U)과의 염기쌍에 대한 아데닌(A)의 능력을 근거로 하여, 그것이 다른 핵산 분자의 모두 또는 일부와 염기-쌍(혼성화)을 이루어 이중 나선(이중-가닥 핵산 분자)을 형성하는 경우 다른 단일-가닥 핵산 분자에 대해 "상보성"이다. 예를 들면, 뉴클레오티드 서열 5'-TATAC-3'는 뉴클레오티드 서열 5'-GTATA-3'에 대해 상보성이다.

본원에 사용된 바와 같이, "혼성화"는 핵산 가닥이 염기 쌍(base pairing)을 통해 상보성 가닥과 연결되는 과정을 지칭한다. 혼성화 반응은 민감하고 선택적이어서, 관심있는 특별한 서열이 심지어 그것이 저농도로 존재하는 샘플에서 조차도 식별될 수 있다. 시험관내 상황에서, 적절히 엄격한 조건은, 예를 들면, 예비혼성화 및 혼성화 용액중 염 또는 포름아미드의 농도에 의해, 또는 혼성화 온도에 의해 정의될 수 있으며, 당해 분야에 잘 공지되어 있다. 특히, 엄격함은 염의 농도를 감소시키거나, 포름아미드의 농도를 증가시키거나, 또는 혼성화 온도를 상승시킴으로써 증가시킬 수 있다. 예를 들면, 엄격함이 높은 조건하에 혼성화는 약 37 내지 약 42℃에서 약 50% 포름아미드에서 일어날 수 있다. 혼성화는 약 30 내지 약 35℃에서 약 35 내지 25% 포름아미드에서 엄격함이 감소된 조건하에 일어날 수 있다. 특히, 혼성화는 50% 포름아미드, 5X SSPE, 0.3% SDS, 및 200 mg/ml 전단 및 변성된 연어 정자 DNA에서 42℃에서 엄격함이 높은 조건하에 일어날 수 있다. 혼성화는 상기 기술한 바와 같은 엄격함이 감소된 조건하에, 그러나 35℃의 감소된 온도에서 35% 포름아미드에서 일어날 수 있다. 특별한 엄격함 수준에 상응하는 온도 범위는 관심있는 핵산의 피리미딘에 대한 푸린의 비를 계산하고, 이에 따라 온도를 조절함으로써 추가로 좁힐 수 있다. 상기 범위 및 조건에 대한 변환이 당해 분야에 잘 공지되어 있다.

본원에 사용된 바와 같이, 용어 "피부 상재균(skin flora)" 또는 "미생물군집(microbiome)"은 대상체의 피부 또는 피하 조직에 서식하는 박테리아, 바이러스 및, 진균을 포함한, 미생물을 지칭한다.

본원에 사용된 바와 같이, 용어 미생물(microbial, microbe, 또는 microorganism)은 원핵세포 또는 진핵세포, 박테리아, 고박테리아(archaebacterium), 진균, 바이러스, 또는 원생동물, 단세포 또는 다세포를 포함하는 임의의 미시적 유기체를 지칭한다.

본원에 사용된 바와 같이, 용어 "개선(ameliorating)" 또는 "치료(treating)"는 암 또는 흑색종과 관련된 임상 징후 및/또는 증상이 수행된 작용의 결과로서 경감됨을 의미한다. 모니터되는 징후 또는 증상은 특별한 암 또는 흑색종의 특성일 것이고, 징후 또는 상태를 모니터하는 방법에 따라, 숙련가에게 잘 알려져 있을 것이다. 따라서, "치료 레지멘(treatment regimen)"은 대상체에서 질환 또는 암의 치료를 위한 임의의 체계적인 계획 또는 과정을 지칭한다.

구현예로, 핵산 분자는 또한 당해 분야의 숙련가에게 잘 알려진 임의의 수많은 방법에 의해 피부 샘플로부터 수집된 세포 및 세포성 물질을 용해시켜 분리할 수 있다. 예를 들면, 이것으로 제한되는 것은 아니지만, RNeasy™ (Qiagen, Valencia, CA) 및 TriReagent™ (Molecular Research Center, Inc, Cincinnati, OH)를 포함하는, 폴리뉴클레오티드를 분리하는데 유용한 수많은 시판용 제품이 사용될 수 있다. 분리된 폴리뉴클레오티드는 이어서 사이토킨을 암호화하는 폴리뉴클레오티드를 포함한, 특별한 핵산 서열에 대해 시험 또는 검정할 수 있다. 핵산 샘플 내에 표적 핵산 분자를 회수하는 방법이 당해 분야에 잘 알려져 있고, 마이크로어레이 분석(microarray analysis)을 포함할 수 있다.

본원에 추가로 논의된 바와 같이, 핵산 분자는 개체의 피부와 관련된 미생물군집 및/또는 대사체를 결정하는데 도울 수 있는 당해 분야에 공지된 임의 수의 방법으로 분석할 수 있다. 예를 들면, 핵산 분자의 존재는 특정한 핵산 분자의 프로브 또는 단편을 사용하여 DNA-DNA 또는 DNA-RNA 혼성화 또는 증폭에 의해 검출할 수 있다. 핵산 증폭 기반 검정은 특정한 DNA 또는 RNA를 함유하는 형질전체를 검출하기 위하여 핵산 서열을 기반으로 하는 올리고뉴클레오티드 또는 올리고머의 사용을 포함한다.

다른 구현예로, 본 발명의 핵산 분자의 발현 생성물에 특이적으로 결합되는 항체가 대상체의 피부 병변을 특성화하기 위하여 사용될 수 있다. 항체는 변형하에 또는 변형없이 사용될 수 있고, 리포터(reporter) 분자와 공유 또는 비공유적으로 그들을 결합시켜 표지화할 수 있다.

광범위한 라벨 및 접합 기술이 당해 분야의 숙련가에 의해 공지되어 있으며, 다양한 핵산 및 아미노산 검정에 사용될 수 있다. 표 1 내지 6의 핵산 분자에 관련된 서열을 검출하기 위한 표지화된 혼성화 또는 PCR 프로브의 제조 방법은 올리고표지화(oligolabeling), 틈해독(nick translation), 말단-표지화(end-labeling), 또는 표지된 뉴클레오티드를 사용한 PCR 증폭을 포함한다. 대안적으로, 핵산 분자 또는 그의 단편은 mRNA 프로브의 제조를 위해 벡터로 클로닝시킬 수 있다. 상기 벡터는 당해 분야에 공지되어 있고, 시판되고 있으며, 적절한 RNA 폴리머라제(예: T7, T3, 또는 SP6) 및 표지된 뉴클레오티드의 부가에 의해 RNA 프로브를 시험관내 합성하는데 사용될 수 있다. 이들 과정은 다양한 시판용 키트 (Pharmacia & Upjohn, (Kalamazoo, Mich.); 프로메가(Promega) (Madison Wis.); 및 미국 바이오케이칼 코포레이션(U.S. Biochemical Corp., Cleveland, Ohio)를 사용하여 수행할 수 있다. 검출의 용이성을 위해 사용될 수 있는, 적절한 리포터 분자 또는 라벨은 기질, 보조인자, 억제제, 자기 입자 등뿐만 아니라, 방사성 핵종, 효소, 형광, 화학발광, 또는 발색제를 포함한다.

PCR 시스템은 대개 2개의 증폭 프라이머 및 증폭제(amplicon) 내의 부위에 특이적으로 결합되는 부가의 증폭제-특이적, 형광원 혼성화 프로브를 사용한다. 프로브는 하나 이상의 형광 표지 모이어티를 포함할 수 있다. 예를 들면, 프로브는 2개의 형광 염료로 표지할 수 있다: 1) 리포터로서 작용하는, 5'-말단에 위치한, 6-카르복시-플루오레신(FAM), 및 2) 소광제(quencher)로서 작용하는, 3'-말단에 위치한, 6-카르복시-테트라메틸-로다민(TAMRA). 증폭이 일어나는 경우에, Taq DNA 폴리머라제의 5'-3' 엑소뉴클레아제 활성은 확장 단계 도중 프로브로부터 리포터를 절단함으로써, 소광제로부터 그것을 방출시킨다. 생성된 리포터 염료의 형광 방출의 증가는 PCR 과정 도중 모니터하며, 생성된 DNA 단편의 수를 나타낸다. 원위치 PCR은 표적 핵산 분자의 직접 국부화 및 가시화를 위해 이용할 수 있고, 조직병리학적 결과와 함께 상관관계 표시에 추가로 유용할 수 있다.

본 발명의 핵산 분자를 위한 특이적 혼성화 프로브의 제조 방법은 mRNA 프로브의 제조를 위해 벡터로 핵산 서열의 클로닝을 포함한다. 상기 벡터는 당해 분야에 공지되어 있고, 시판되고 있으며, 적절한 RNA 폴리머라제 및 적절한 표지된 뉴클레오티드의 부가에 의해 RNA 프로브를 시험관내 합성하는데 사용될 수 있다. 혼성화 프로브는 다양한 리포터 그룹, 예를 들면, 방사성 핵종(예: 32P 또는 35S), 또는 효소적 라벨(예: 아비딘/비오틴 커플링 시스템을 통해 프로브에 결합된 알칼리성 포스파타제) 등에 의해 표지화할 수 있다.

용어 "스킨 케어 제품(skin care product)" 또는 "개인용 케어 제품(personal care product)"은 스킨 케어 제품을 지칭하지만, 국부화 (예: 눈 아래) 겔뿐만 아니라, 세정 제품, 샴푸, 컨디셔너, 토너 또는 크림, 국소용 연고 및 겔을 포함하되, 이것으로 제한되지 않으며, 이들 모두는 특히 활성 또는 휴지 상태에서 공생 또는 상리공생 유기체 또는 공생 또는 상리공생 유기체 혼합물의 존재 또는 부재하에 미생물 개체군을 건강한 프로파일로 이동시키도록 디자인된 성분을 함유하도록 제형화될 수 있다. 상기 스킨 케어 제품은 치료학적 제제, 비타민, 항산화제, 미네랄, 스킨 토너제, 중합체, 부형제, 계면활성제, 프로바이오틱스(probiotics) 또는 그의 분획, 미생물 또는 그의 배양으로부터의 생성물(예: 살아있거나, 휴지 또는 비활성인 박테리아 및 진균 등)을 추가로 포함할 수 있다.

"피부 공생 미생물(Skin commensal microorganisms)"은 시험관내, 생체외 및/또는 생체내에서 콜로니화 (즉, 인간 피부 위에 살며 증식함)되거나, 인간 피부에 일시적으로 서식할 수 있는 원핵생물 및 진핵생물을 모두 의미한다. 예시적인 피부 공생 미생물은, 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 알파프로테오박테리아(Alphaproteobacteria), 베타프로테오박테리아(Betaproteobacteria), 감마프로테오박테리아(Gammaproteobacteria), 프로피오니박테리아(Propionibacteria), 코리네박테리아(Corynebacteria), 악티노박테리아(Actinobacteria), 클로스트리듐(Clostridiales), 락토바킬루스(Lactobacillales), 스타필로코쿠스(Staphylococcus), 바실루스(Bacillus), 마이크로코쿠스(Micrococcus), 스트렙토코쿠스(Streptococcus), 박테로이데스(Bacteroidales), 플라보박테리아(Flavobacteriales), 엔테로코쿠스(Eenterococcus), 슈도모나스(Pseudomonas), 말라세지아(Malassezia), 마이디다(Maydida), 데바로요마이세스(Debaroyomyces), 및 크립토코쿠스(Cryptococcus)를 포함한다.

여드름 균(P. acnes )은 피부, 입, 요로 및 대장 부위를 포함한 신체 상의 다양한 위치에서 발견되는 공생의, 비-포자형성(non-sporulating) 간균형(막대-형태), 그램-양성 박테리움이다. 여드름 균은 피부 오일을 소비하고, 건강한 피부 장벽의 유지를 돕는 것으로 알려진, 부산물(예: 단쇄 지방산 및 프로피온산)을 생성할 수 있다. 여드름 균과 같은 프로피오니박테리아는 또한 박테리오신 및 박테리오신-유사 화합물(예; 프로피오니신 P1G-1, 젠세닌(jenseniin) G, 프로피오니신 SM1, SM2 T1, 및 아크네신)을 생성하며, 이는 원치않는 락트산-생성 박테리아, 그램-음성 박테리아, 효모 및 곰팡이에 대해 억제한다. 구현예로, 여드름 균을 갖는 것으로 식별된 피부를 갖는 대상체는 여드름 균의 성장 및 증식을 억제하도록 디자인된 개인용 케어 제품으로 치료할 수 있다.

구현예로, 개별 피부 프로파일은 개인용 케어 제품의 제형화를 돕는 피부 상재균의 다양성 및 그의 탁월함(eminence)을 포착함으로써, 피부 건강의 전반적인 스냅샷인, 개인화된 SkinIQ™ 지수로 해독한다. 탁월함에 기여하는 주요 요인은 프로바이오틱 밸런스, (기회성) 병원균에 대한 상리공생 및 공생 미생물의 비이다. 그러나, 탁월함은 또한 피부 건강에 긍정적으로 영향을 줄 수 있는 다른 요인을 포함한다. 이들 요인은 건강한 숙주 피부의 촉진 또는 유지에 책임이 있는 주요 생합성 미생물 유전자, 유전자 생성물 또는 단백질의 존재를 포함할 수 있다. 이들 모든 요인은, 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 염증의 감소, 병원균의 상대적인 양의 감소, 및 프로-비타민, 항균성 펩티드, 비타민 및 지방산의 생합성에 의해 피부의 총괄적인 건강에 기여할 것이다. SkinIQ™ 지수로 표시되는, 다양성 및 탁월함의 조합은 또한 피부 건강의 예측 척도일 수 있다. 예를 들면, 프로피오니박테리움 아크네스( Propionibacterium acnes )의 특정 아종의 우세함은 여드름 발생의 위험과 강하게 연관될 수 있다. 유사하게, SkinIQ™은 이것으로 제한되는 것은 아니지만, 습진, 건선, 아토피성 피부염 및 주사를 포함한, 다른 피부 상태의 재발을 예측할 수 있다.

SkinIQ™ 지수는 피부 프로파일(미생물군집 및/또는 대사체)의 데이타베이스로부터 "공통 건강 프로파일(consensus healthy profile)"에 대한 임의의 개별 프로파일을 대조하고, 건강한 개체군 내용에 모든 프로파일을 두는 피부 건강 측정 시스템하에 정의된다. 공통 건강 프로파일은 각각의 박테리아 종에 대해 별도로 정의된다. 건강한 개체군으로부터의 데이타는 임의의 제시된 박테리아 종이 건강한 개체 내에서 발견되리라 예상되는 범위를 한정하기 위하여 사용된다. 모든 이들 범위는 미래의 비교를 위한 참조를 정의한다. 피부 건강 측정 시스템은, 이것으로 제한되지는 않지만, 아토피성 피부염, 건선 및 습진을 포함한 상이한 피부 상태에 긍정적으로 영향을 주는 스킨 케어 제형에 이용될 수 있는 신규 미생물에 대한 풍부한 데이타 세트를 개발하기 위해 사용될 수 있는 강력한 발견 도구로서 추가로 작용한다. 또한, 잠재적인 치료학적 영향과 함께, 상이한 박테리아 종 사이에 더 큰 수준의 상호작용을 개발하기 위해 사용될 수 있다.

또한, 본 발명은 다양한 피부 질환 상태뿐만 아니라, 정상 또는 건강한 피부와 같이, 공지된 상태를 갖는 대상체의 피부 샘플로부터 생성된 복수의 참조 예상 프로파일을 함유하는 참조 데이타베이스의 생성을 시도하고 있다. 개별적 프로파일은 참조 프로파일을 함유하는 참조 데이타베이스와 비교할 수 있다. 대상체의 프로파일이 데이타베이스에서 특별한 질환 상태의 프로파일과 최고로 매치된다면, 대상체는 상기 질환 상태를 갖는 것으로 진단된다. 다양한 전산 시스템 및 소프트웨어가 본 발명의 분석적 방법을 실행하는데 이용될 수 있고, 당해 분야의 숙련가중 누군가에게 명확하다. 예시적 소프트웨어 프로그램은, 이것으로 제한되지는 않지만, Cluster & TreeView (Stanford, URLs: rana.lbl.gov or microarray.org), GeneCluster (MIT/Whitehead Institute, URL: MPR/GeneCluster/GeneCluster.html), Array Explorer (SpotFire Inc, URL: spotfire.com/products/scicomp.asp#SAE) 및 GeneSpring (Silicon Genetics Inc, URL: sigenetics.com/Products/GeneSpring/index.html) (전산 시스템 및 소프트웨어의 경우, 본원에 참조로 인용된 미국 특허 제6,203,987호를 또한 참조한다)을 포함한다.

구현예로, 본 발명은 피부 또는 피하 조직 상재균을 함유하는 대상체로부터 샘플을 수집함을 포함하는 피부 및/또는 피하 조직의 특성화 방법을 제공한다. 건강한 개체의 피부 및 피하 조직 상재균은 스와이핑, 스크레이핑, 소제 이용, 테이프 스트립 이용 또는 임의의 다른 효과적인 미생물 수집 방법으로 수집할 수 있다. 수확된 샘플은 NGS, 생어-시퀀싱, 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법, 원위치 혼성화, 또는 미생물 염색 기반 플랫폼에 대해 프로파일링할 수 있다. 시퀀싱-기반 플랫폼의 경우, 이는 전체-게놈 시퀀싱 접근법을 사용하거나, 이의 두드러진 예가 16S rDNA 시퀀싱인, 표적화된 적용을 통해 수행할 수 있다. 상기-언급한 식별 방법은 모두 임의의 증식 단계없이 개체로부터 직접 수집된 샘플 상에서 실행할 수 있다. 이 방법은 최소한의 편견으로 배양 가능 및 배양 불가능한 미생물의 혼합물 식별에 대해 도입된다. 프로프리어터리 분석 알고리즘이 각 개체의 종 조성을 식별하기 위해 사용될 수 있다. 공통 건강 프로파일은 건강한 코호트로부터 작제할 수 있다. 건강한 프로파일은 더 많은 샘플이 시간 경과에 따라 수집됨에 따라 실시간 업데이트될 수 있다. 건강한 프로파일은 모든 개체 샘플을 비교하기 위한 참조, 즉 프로파일로서 작용할 것이다. 식별된 박테리아의 예는 악티노박테리아, 퍼미쿠테스(Firmicutes), 프로테오박테리아, 박테로이디트를 포함한, 임의의 문에 속한다. 그것은 통상적으로 공통의 종, 예를 들면, 프로피오니박테리아 ( Propionibacteria ), 스타필로코키(Staphylococci), 코리네박테리아 ( Corynebacteria ), 또는 아세니토박테리아 (Acenitobacteria) 종을 포함할 것이다.

구현예로, 본 발명은 피부 상태를 갖는 개체의 피부 및 피하 조직 미생물 상재균을 특성화하기 위한 플랫폼 또는 방법을 제공한다. 차선으로 여겨지는 피부 상태를 갖는 개체의 피부 및 피하 조직 상재균은 스와이핑, 소제, 테이프 스트립 또는 임의의 다른 효과적인 미생물 수집 방법을 사용하여 수집할 수 있다. 수집된 미생물 샘플은 NGS, 생어-시퀀싱, 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법, 원위치 혼성화, 또는 미생물 염색 기반 플랫폼에 대해 프로파일링할 수 있다. 시퀀싱-기반 플랫폼의 경우, 이는 전체-게놈 시퀀싱 접근법을 사용하거나, 이의 두드러진 예가 16S rDNA 시퀀싱인, 표적화된 적용을 통해 수행할 수 있다. 식별 방법은 모두 임의의 증식 단계없이 개체로부터 직접 수집된 샘플 상에서 실행할 수 있다. 이 방법은 최소한의 편견으로 배양 가능 및 배양 불가능한 미생물의 혼합물 식별에 대해 도입된다. 개인용 피부 및 피하 조직 상재균 프로파일이 각 개체에 대해 생성될 수 있다. 그들의 표현형 특성을 기반으로 하는, 개체는 마찬가지로 특정 피부 상태 범주하에 놓을 수 있다. 이러한 군집화 노력은 각 코호트의 특성이 되는 생물학적 중요 패턴을 식별하는 것을 도울 것이다. 감염된 코호트의 미생물 조성은 건강한 프로파일과 구별된다. 임의의 제시된 피부 상태와 관련이 있는 미생물 종은 가시적인 피부 상태를 발병하지는 않았지만 그러기 쉬울 수 있는 개체에 대한 초기 진단 마커로서 사용될 수 있다. 식별된 박테리아의 예는 악티노박테리아, 퍼미쿠테스, 프로테오박테리아, 박테로이디트를 포함한, 임의의 문에 속한다. 그것은 통상적으로 공통의 종, 예를 들면, 프로피오니박테리아, 스타필로코키, 코리네박테리아, 및 아세니토박테리아 종을 포함할 것이다. 손상된 피부는 박테리아성 상재균의 조성에 영향을 줄 수 있거나, 비병원성 박테리아가 병원성이 되도록 유발할 수 있다.

구현예로, 본 발명은 공통의 건강한 피부 및 피하 조직 대사물질 프로파일을 특성화하기 위한 플랫폼 또는 방법을 제공한다. 피부 및 피하 조직 상재균과 관련된 대사체는 또한 질량분석법 기반 시스템에 의해 또는 게놈-기반 대사체 모델링 및 대사-흐름 분석을 사용하여 프로파일링할 수 있다. 추출은 스와이핑, 소제, 테이프 스트립 또는 임의의 다른 효과적인 미생물 수집 방법을 사용하여 수집된 샘플에 대해 수행할 수 있다. 대안적으로, 이들 대사물질 및 생화학적, 특히 세포외 것들은 임의의 세포 하베스팅을 통하지 않고 임의의 개체로부터 직접 분리할 수 있다. 특성화은 전체 대사체에 대해 수행하거나 단지 대사물질의 서브세트에만 집중될 수 있고, 이는 공지되어 있거나, 특별한 질환 병리학에 유의성이 있는 것으로 보여질 수 있다. 상기-언급한 식별 방법은 모두 임의의 증식 단계없이 개체로부터 직접 수집된 샘플에 대해 실행할 수 있다. 이 방법은, 최소한의 편견으로, 개체군 조성에 도입된다. 프로프리어터리 분석 알고리즘이 각 개체의 피부 상재균의 대사물질 조성을 식별하기 위하여 사용될 수 있다. 공통 건강 프로파일은 건강한 코호트로부터 작제할 수 있다. 건강한 프로파일은 더 많은 샘플이 시간 경과에 따라 수집됨에 따라 실시간 업데이트될 수 있다. 건강한 프로파일은 모든 개체 샘플을 비교하기 위한 참조, 즉 프로파일로서 작용할 것이다.

구현예로, 본 발명은 피부 상태를 갖는 개체의 피부 및 피하 조직 미생물 상재균을 특성화하기 위한 플랫폼 또는 방법을 제공한다. 차선으로 여겨지는 피부 상태를 갖는 개체의 피부 및 피하 조직 상재균의 대사물질 조성은 질량분석법 기반 시스템에 의해 또는 게놈-기반 대사체 모델링 및 대사-흐름 분석을 사용하여 프로파일링할 수 있다. 추출은 스와이핑, 소제, 테이프 스트립 또는 임의의 다른 효과적인 미생물 수집 방법을 사용하여 수집된 샘플에 대해 수행할 수 있다. 대안적으로, 이들 대사물질 및 생화학적, 특히 세포외 것들은 임의의 세포 하베스팅을 통하지 않고 임의의 개체로부터 직접 분리할 수 있다. 특성화은 전체 대사체에 대해 수행하거나 단지 대사물질의 서브세트에만 집중될 수 있고, 이는 공지되어 있거나, 유의성이 있는 것으로 보여질 수 있다. 상기-언급한 식별 방법은 모두 임의의 증식 단계없이 개체로부터 직접 수집된 샘플에 대해 실행할 수 있다. 이 방법은, 최소한의 편견으로, 개체군 조성에 도입된다. 개인용 프로파일은 피부 및 피하 조직 상재균의 대사물질 조성을 반영하는 각 개체에 대해 생성될 수 있다. 그들의 표현형 특성을 기반으로 하는, 개체는 마찬가지로 특정 피부 상태 범주하에 놓을 수 있다. 이러한 군집화 노력은 각 코호트의 특성이 되는 생물학적 중요 패턴을 식별하는 것을 도울 것이다. 감염된 코호트의 대사물질 조성은 건강한 프로파일과 구별된다. 임의의 제시된 피부 상태와 관련이 있는 대사물질은 가시적인 피부 상태를 발병하지는 않았지만 그러기 쉬울 수 있는 개체에 대한 초기 진단 마커로서 사용될 수 있다.

구현예로, 본원에 기술된 플랫폼 또는 방법은 건강하거나, 피부 상태 및 또한 그들의 관련 대사체를 갖는, 어떤 개체의 피부 상재균을 프로파일링하기 위한 시험으로서 제공될 수 있다. 이러한 시험은 어떤 개체의 우세한 피부 상재균 및 대사물질을 특성화하기 위하여 민감하다. 어떤 개체의 상재균의 맞춤형 또는 개인화 평가를 수행하여, 피부 및 피하 조직 상재균을 식별할 수 있고, 대사물질은 건강한 프로파일 및 또한 감염된 피부 프로파일과 비교할 수 있다. 개체의 피부 및 피하 조직 상재균 및 또한 그의 관련 대사물질의 종 조성을 명시할 맞춤형 또는 개인화된 리포트가 생성될 수 있다. 상기 리포트는 각 개체에서 고갈되거나 과하게-나타나는 유용하고 공생인 종을 얻게 될 것이다. 그것은 또한 각 개체에서 고갈되거나 과하게-나타나는 유용하거나 바람직하지 못한 대사물질의 리스트를 포함할 것이다. 이는 맞춤형 또는 개인화된 스킨 케어 또는 개인용 케어 제품, 치료법의 제형을 위해 사용될 수 있다. 대안적으로, 시험은 다른 스킨 케어 및 개인용 케어 제품의 성능을 평가하거나, 정상적인 피부 상재균 또는 대사물질의 임의 파괴를 평가하기 위하여 투여될 수 있다. 시험은 피부 상재균 또는 그의 관련 대사물질에 대한 치료 레지멘의 효능을 모니터하기 위하여 임의의 피부 치료 전, 도중 및 후에 수행할 수 있다. 시험은 또한 특징 미생물 프로파일 또는 그들의 동반되는 대사물질과 관련된 피부 상태의 초기 진단을 위해 사용될 수 있다. 시험의 감수성은 그들의 표현형 발생 전에 상기 피부 상태의 초기 진단을 허용한다. 한 측면에 있어서, 본 발명은 특별한 개체를 위해 제형화된 맞춤형 또는 개인화된 스킨 케어 또는 개인용 케어 제품의 생성 방법을 제공한다. 맞춤형 또는 개인화된 제품은 하나 이상의 유용하거나 공생 미생물 또는 임의의 제시된 개체에서 고갈될 수 있는 화학약품 및 대사물질의 세트를 함유한다. 상기 스킨 케어 제품 및 개인용 케어 제품의 규칙적인 투여는 차선의 프로파일을 건강한 평형쪽으로 이동시켜야 한다. 스킨 케어 제품은 스킨 케어 제품 미생물 또는 그의 구성 대사물질의 콜로니화 효능을 개선할 등록상표가 붙은 로션으로 존재하는 상재균을 세정한 후 적용시킬 수 있다. 임의의 맞춤형 또는 개인화된 스킨 케어 또는 개인용 케어 제품은 하나 이상의 배양가능하거나 배양가능하지 않 미생물을 함유할 수 있다. 맞춤형 또는 개인화된 제품은 대안적으로 상리공생 또는 공생 유기체의 정립 또는 증식 및/또는 병원성 유기체의 억제에 유리한 기질 및 영양소일 수 있다. 이들 화학약품 및 대사물질은 시험관내 합성하거나, 미생물로부터 정제한다.

본 발명이 상기 예를 참조로 기술되었음에도 불구하고, 변형 및 변환이 본 발명의 취지 및 범위 내에 포함됨을 이해할 것이다. 따라서, 본 발명은 하기 특허청구범위에 의해서만 제한된다.

Claims (47)

1. 대상체의 피부 또는 피하 조직의 미생물군집(microbiome)을 특성화(characterizing)하는 방법으로서,
   a) 상기 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하는 단계; 및
   b) 상기 대상체의 미생물군집을 특성화하기 위하여 (a)의 상기 복수의 미생물을 분석 및 분류하여, 이로써 상기 대상체의 미생물군집을 특성화하는 단계를 포함하는, 방법.
2. 청구항 1에 있어서, 상기 대상체의 미생물군집을 참조 미생물군집(reference microbiome)에 비교하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
3. 청구항 1에 있어서, 상기 대상체의 미생물군집 프로파일을 생성하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
4. 청구항 2에 있어서, 상기 대상체가 발병했거나 발병의 위험이 있는 질환 또는 장애를 식별하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
5. 청구항 4에 있어서, 개인화된(personalized) 치료 레지멘(regime)을 상기 대상체에 제공하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
6. 청구항 5에 있어서, 상기 대상체에 대한 맞춤형(customized) 치료학적 제형을 제형화하고 투여하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
7. 청구항 2에 있어서, 상기 참조 미생물군집은 건강한 프로파일을 갖는 것으로서 분류되며, 상기 대상체의 미생물군집과 상기 참조 미생물군집 사이에 유사성으로 상기 대상체의 미생물군집이 건강한 프로파일을 갖는 것을 식별하는, 방법.
8. 청구항 2에 있어서, 상기 참조 미생물군집은 질환 또는 장애를 갖거나 이를 가질 위험이 있는 것으로 분류되며, 상기 대상체의 미생물군집과 상기 참조 미생물군집 사이에 유사성으로 상기 대상체의 미생물군집이 상기 질환 또는 장애를 갖거나 이를 가질 위험이 있을 것을 식별하는, 방법.
9. 청구항 1에 있어서, 상기 샘플이 스와이프(swipe), 스크레이프(scrape), 소제(swab), 생검(biopsy) 또는 테이프를 통해 피부 또는 피하 조직으로부터 수득되는, 방법.
10. 청구항 9에 있어서, 상기 테이프가 접착성 테이프인, 방법.
11. 청구항 1에 있어서, 상기 복수의 미생물이 박테리아, 진균 또는 이의 조합을 포함하는, 방법.
12. 청구항 11에 있어서, 상기 미생물이 알파프로테오박테리아(Alphaproteobacteria), 베타프로테오박테리아(Betaproteobacteria), 감마프로테오박테리아(Gammaproteobacteria), 프로피오니박테리아(Propionibacteria), 프로테오박테리아, 박테로이데테스(Bacteroidetes), 코리네박테리아(Corynebacteria), 악티노박테리아(Actinobacteria), 클로스트리듐(Clostridiales), 락토바킬루스(Lactobacillales), 스타필로코쿠스(Staphylococcus), 바실루스(Bacillus), 마이크로코쿠스(Micrococcus), 스트렙토코쿠스(Streptococcus), 박테로이데스(Bacteroidales), 플라보박테리아(Flavobacteriales), 퍼미쿠테스(Firmicutes), 엔테로코쿠스(Eenterococcus), 슈도모나스(Pseudomonas), 말라세지아(Malassezia), 마이디다(Maydida), 데바로요마이세스(Debaroyomyces), 및 크립토코쿠스(Cryptococcus)로부터 선택되는 박테리아인, 방법.
13. 청구항 11에 있어서, 상기 미생물이 프로피오니박테리아 ( Propionibacteria ), 스타필로코키(Staphylococci), 코리네박테리아 ( Corynebacteria ), 또는 아세니토박테리아 (Acenitobacteria) 속(genus)의 박테리아인, 방법.
14. 청구항 13에 있어서, 상기 박테리아가 프로피오니박테리움 아크네스(Propionibacterium acnes )인, 방법.
15. 청구항 1에 있어서, 상기 분석 및 분류가 핵산의 시퀀싱(sequencing)을 포함하는, 방법.
16. 청구항 15에 있어서, 시퀀싱이 전체 게놈 시퀀싱(whole genome sequencing), 차세대 시퀀싱, 생어-시퀀싱(Sanger-sequencing), 16S rDNA 시퀀싱 및 16S rRNA 시퀀싱으로부터 선택되는, 방법.
17. 청구항 1에 있어서, 상기 분석 및 분류가 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법(immunofluorescence), 원위치 혼성화(in situ hybridization), 미생물 염색 기반 플랫폼(microbial staining based platform), 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
18. 복수 대상체의 피부 또는 피하 조직의 미생물군집을 특성화하는 방법으로서,
    a) 상기 복수 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 샘플을 수득하는 단계 (여기서 각 샘플은 복수의 미생물을 포함한다); 및
    b) 상기 복수의 샘플 각각의 미생물군집을 식별하기 위하여 (a)의 각 샘플의 상기 복수의 미생물을 분석 및 분류하여, 이로써 상기 복수 대상체의 미생물군집을 특성화하는 단계를 포함하는, 방법.
19. 청구항 18에 있어서, 상기 복수의 샘플의 개별 코호트(cohort)를 식별하기 위하여 (b)의 결과를 군집화함(clustering)을 추가로 포함하는, 방법.
20. 청구항 19에 있어서, 각각의 개별 코호트가 특별한 표현형 또는 프로파일을 나타내는, 방법.
21. 청구항 20에 있어서, 각각의 개별 코호트가 유사한 미생물군집을 갖는 샘플을 포함하는, 방법.
22. 청구항 20에 있어서, 개별 코호트가 공통의 피부 질환 또는 장애를 갖는 대상체로부터의 샘플을 포함하는, 방법.
23. 청구항 20에 있어서, 개별 코호트가 유사한 대사물질 프로파일을 갖는 대상체로부터의 샘플을 포함하는, 방법.
24. 청구항 19에 있어서, 각각의 샘플이 스와이프, 스크레이프, 소제, 생검 또는 테이프를 통해 상기 피부 또는 피하 조직으로부터 수득되는, 방법.
25. 청구항 24에 있어서, 상기 테이프가 접착성 테이프인, 방법.
26. 청구항 19에 있어서, 상기 복수의 미생물이 박테리아, 진균 또는 이의 조합을 포함하는, 방법.
27. 청구항 26에 있어서, 상기 미생물이 알파프로테오박테리아, 베타프로테오박테리아, 감마프로테오박테리아, 프로피오니박테리아, 프로테오박테리아, 박테로이데테스, 코리네박테리아, 악티노박테리아, 클로스트리듐, 락토바킬루스, 스타필로코쿠스, 바실루스, 마이크로코쿠스, 스트렙토코쿠스, 박테로이데스, 플라보박테리아, 퍼미쿠테스, 엔테로코쿠스, 슈도모나스, 말라세지아, 마이디다, 데바로요마이세스, 및 크립토코쿠스로부터 선택되는 박테리아인, 방법.
28. 청구항 26에 있어서, 상기 미생물이 프로피오니박테리아, 스타필로코키, 코리네박테리아, 또는 아세니토박테리아 속의 박테리아인, 방법.
29. 청구항 28에 있어서, 상기 박테리아가 프로피오니박테리움 아크네스인, 방법.
30. 청구항 19에 있어서, 상기 분석 및 분류가 핵산의 시퀀싱을 포함하는, 방법.
31. 청구항 30에 있어서, 시퀀싱이 전체 게놈 시퀀싱, 차세대 시퀀싱, 생어-시퀀싱, 16S rDNA 시퀀싱 및 16S rRNA 시퀀싱으로부터 선택되는, 방법.
32. 청구항 19에 있어서, 상기 분석 및 분류가 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법, 원위치 혼성화, 미생물 염색 기반 플랫폼, 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
33. 대상체에서 질환 또는 장애의 진단 방법으로서,
    a) 상기 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하는 단계;
    b) (a)의 상기 복수의 미생물을 분석 및 분류하여 상기 대상체의 미생물군집을 식별하는 단계; 및
    c) 상기 대상체의 미생물군집을 상기 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 대상체의 미생물군집을 대표하는 참조 미생물군집에 비교하여, 상기 대상체에서 질환 또는 장애를 진단하는 단계 (여기서, 상기 대상체의 미생물군집과 상기 참조 미생물군집 사이의 유사성은 상기 질환 또는 장애의 위험이 있거나 이를 가진 대상체를 나타낸다)를 포함하는, 방법.
34. 청구항 33에 있어서, 상기 대상체의 미생물군집 프로파일을 생성하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
35. 청구항 33에 있어서, 상기 대상체에 개인화된 치료 레지멘을 제공하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
36. 청구항 36에 있어서, 상기 대상체에 대한 맞춤형 치료학적 제형을 제형화하고 투여하는 단계를 추가로 포함하는, 방법.
37. 청구항 33에 있어서, 상기 샘플이 스와이프, 스크레이프, 소제, 생검 또는 테이프를 통해 피부 또는 피하 조직으로부터 수득되는, 방법.
38. 청구항 38에 있어서, 상기 테이프가 접착성 테이프인, 방법.
39. 청구항 33에 있어서, 상기 복수의 미생물이 박테리아, 진균 또는 이의 조합을 포함하는, 방법.
40. 청구항 40에 있어서, 상기 미생물이 알파프로테오박테리아, 베타프로테오박테리아, 감마프로테오박테리아, 프로피오니박테리아, 프로테오박테리아, 박테로이데테스, 코리네박테리아, 악티노박테리아, 클로스트리듐, 락토바킬루스, 스타필로코쿠스, 바실루스, 마이크로코쿠스, 스트렙토코쿠스, 박테로이데스, 플라보박테리아, 퍼미쿠테스, 엔테로코쿠스, 슈도모나스, 말라세지아, 마이디다, 데바로요마이세스, 및 크립토코쿠스로부터 선택되는 박테리아인, 방법.
41. 청구항 40에 있어서, 상기 미생물이 프로피오니박테리아, 스타필로코키, 코 리네박테리아, 또는 아세니토박테리아 속(genus)의 박테리아인, 방법.
42. 청구항 42에 있어서, 상기 박테리아가 프로피오니박테리움 아크네스인, 방법.
43. 청구항 33에 있어서, 상기 분석 및 분류가 핵산의 시퀀싱을 포함하는, 방법.
44. 청구항 44에 있어서, 시퀀싱이 전체 게놈 시퀀싱, 차세대 시퀀싱, 생어-시퀀싱, 16S rDNA 시퀀싱 및 16S rRNA 시퀀싱으로부터 선택되는, 방법.
45. 청구항 33에 있어서, 상기 분석 및 분류가 질량분석법, 정량적 PCR, 면역형광법, 원위치 혼성화, 미생물 염색 기반 플랫폼, 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
46. 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 대상체에 대해 맞춤형 치료학적 제형을 제형화하는 방법으로서,
    a) 상기 대상체의 피부 또는 피하 조직으로부터 복수의 미생물을 포함하는 샘플을 수득하는 단계;
    b) (a)의 상기 복수의 미생물을 분석 및 분류하여 상기 대상체의 미생물군집을 식별하는 단계;
    c) 상기 대상체의 미생물군집을 질환 또는 장애를 갖거나 가질 위험에 처해 있는 대상체의 미생물군집을 대표하는 참조 미생물군집에 비교하는 단계 (여기서 상기 대상체의 미생물군집과 상기 참조 미생물군집 사이의 유사성은 상기 질환 또는 장애의 위험이 있거나 이를 가진 대상체를 나타낸다); 및
    d) (c)를 기반으로 하는 맞춤형 치료학적 제형을 제형화하여, 맞춤형 치료학적 제형을 제형화하는 단계를 포함하는, 방법.
47. 청구항 47의 방법을 통해 제형화된 치료학적 제형.
    
    
    
    
    
    
    
    
    
    

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