KR20130021023A - Primer for the detection of mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of mycoplasma hyorhinis by using the primer, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer - Google Patents

Primer for the detection of mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of mycoplasma hyorhinis by using the primer, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer Download PDF

Info

Publication number
KR20130021023A
KR20130021023A KR1020110083293A KR20110083293A KR20130021023A KR 20130021023 A KR20130021023 A KR 20130021023A KR 1020110083293 A KR1020110083293 A KR 1020110083293A KR 20110083293 A KR20110083293 A KR 20110083293A KR 20130021023 A KR20130021023 A KR 20130021023A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
mycoplasma
primer
kit
rrna
detection
Prior art date
Application number
KR1020110083293A
Other languages
Korean (ko)
Other versions
KR101279395B1 (en
Inventor
김옥진
채찬희
최창순
박상호
김대진
서국헌
조정행
김윤아
홍선화
이현아
Original Assignee
원광대학교산학협력단
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 원광대학교산학협력단 filed Critical 원광대학교산학협력단
Priority to KR1020110083293A priority Critical patent/KR101279395B1/en
Publication of KR20130021023A publication Critical patent/KR20130021023A/en
Application granted granted Critical
Publication of KR101279395B1 publication Critical patent/KR101279395B1/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12RINDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • C12R2001/35Mycoplasma

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

PURPOSE: A primer set for detecting mycoplasma hyorhinis, a mycoplasma hyorhinis detection kit using the same, and a diagnosing kit for porcine pneumonia using the same are provided to quickly and specifically detect mycoplasma hyorhinis. CONSTITUTION: A primer set for detecting mycoplasma hyorhinis contains a mycoplasma hyorhinis detection primer with a pair of primers in sequence numbers 1 and 2. The primer detects the mycoplasma hyorhinis by targeting a region between 16s rRNA and 23s rRNA, which is specific to species.

Description

마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출하기 위한 프라이머, 상기 프라이머를 이용한 마이코플라즈마 하이오라이니스 검출키트, 및 상기 프라이머를 이용한 돼지 유행성 폐렴 진단키트{Primer for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer}Primer for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer}

본 발명은, 다양한 마이코플라즈마(Mycoplasma) 종들 중에서 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis) 만을 특이적으로 검출할 수 있는, 특이도 및 민감도를 보유한 프라이머에 관한 것이다. The present invention relates to a primer having specificity and sensitivity, capable of specifically detecting only Mycoplasma hyorhinis among various Mycoplasma species.

본 발명은, 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체의 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머에 관한 것이다.The present invention relates to primers that target a region between 16s rRNA and 23s rRNA specific for the species of mycoplasma hyorainis pathogen.

본 발명은, 마이코플라즈마 하이오라이니스를 신속하게 검출하는 방법으로PCR 방법을 적용하되, 마이코플라즈마 하이오라이니스 만을 특이적으로 신속하게 검출할 수 있는 검출키트에 관한 것이다. The present invention relates to a detection kit that can apply the PCR method as a method for rapidly detecting mycoplasma hyorainis, and can detect only mycoplasma hyorainis specifically and rapidly.

본 발명은, 돼지의 유행성 폐렴을 진단하기 위해서 병원체인 마이코플라즈마 하이오라이니스를 신속하게 검출하는 방법으로PCR 방법을 적용하되, 돼지 유행성 폐렴을 신속하게 진단할 수 있는 진단키트에 관한 것이다.
The present invention relates to a diagnostic kit capable of rapidly diagnosing swine pandemic pneumonia, while applying the PCR method as a method of rapidly detecting mycoplasma hyoranisis, a pathogen, for diagnosing swine pandemic pneumonia.

마이코플라즈마(Mycoplasma)는 분류학적으로 몰리큐트 강(綱)(Mollicutes class)에 속하는 원핵세균으로서, 인간 또는 동물의 호흡기나 생식기 등의 각종 장기에 상주하며 심각한 질병을 일으키며, 현재까지 수백여 종(species)이 알려져 있다. Mycoplasma is a prokaryotic bacterium belonging to the Molycutes class taxonomically and resides in various organs such as the respiratory or genital organs of humans or animals and causes serious diseases. species are known.

마이코플라즈마는 세포벽이 없어 페니실린이나 스트렙토마이신과 같은 세포벽합성을 저해하는 항생물질에 내성이 있고, 크기가 0.15~0.8 ㎛ 정도이기 때문에 여과멸균에 의하여 제거되지 않으며, 형태학적으로도 다형적(pleomorphic) 특성이 있어 광학현미경을 이용한 관찰이 어려운 미생물이다.
Mycoplasmas are resistant to antibiotics that inhibit cell wall synthesis, such as penicillin or streptomycin because they do not have a cell wall, and because they are 0.15 to 0.8 μm in size, they are not removed by filter sterilization and are morphologically pleomorphic. Because of its characteristics, microorganisms are difficult to observe using optical microscopes.

통상적으로, 마이코플라즈마를 검출하기 위하여는 배지를 이용하여 분리 배양하는 직접배양법이 이용되고 있다. Usually, in order to detect mycoplasma, the direct culture method which isolates and cultures using a medium is used.

그런데 직접배양법은 세포나 조직 배양 시 기질이나 생체재료가 오염이 쉽게 되며, 또한 성장속도가 느린 마이코플라즈마의 증식을 확인하기 위해서는 2주 이상의 긴 시간이 걸리는 문제점이 존재한다.However, in the direct culture method, the substrate or the biomaterial is easily contaminated when culturing cells or tissues, and there is a problem that it takes longer than two weeks to confirm the growth of mycoplasma with slow growth rate.

또한 마이코플라즈마의 까다로운 영양 요구성 때문에 종(species)에 따라 서로 다른 배양 기법을 필요로 하는 문제점도 존재한다.There are also problems that require different culture techniques depending on the species due to the demanding nutritional requirements of mycoplasma.

더욱이 마이코플라즈마에 오염이 되었어도 세포의 형태 변이나 배양용 배지의 색깔 변이를 유도하지 않고, 감염 시 아무런 증상이 나타나지 않을 수 있으므로 직접배양법으로는 마이코플라즈마의 증식을 확인하는 것은 극히 어렵다고 할 수 있다.
Moreover, even if contaminated with mycoplasma, it is very difficult to confirm the proliferation of mycoplasma by direct culture because it does not induce cell morphology or color change of culture medium, and no symptoms may occur during infection.

한편, 돼지 마이코플라즈마 폐렴(Swine Mycoplasma Pneumonia)은 일명 돼지 유행성 폐렴(Swine Epidemic pneumonia, SEP)라고도 하는 전염성 호흡기 질병으로서, 과거에는 주된 원인체로 마이코플라즈마 하이오뉴모니에(Mycoplasma hyophenamoniae)를 고려하였으나, 최근 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis)가 동일한 호흡기 질병을 유발한다고 밝혀지고 있다.
Meanwhile, swine mycoplasma pneumonia (Swine Mycoplasma Pneumonia) is one person pig influenza pneumonia (Swine Epidemic pneumonia, SEP) as a contagious respiratory disease, also known as, in the past, but considering the mycoplasma high ohnyu monitor as the main woninche (Mycoplasma hyophenamoniae), recent Mycoplasma hyorhinis has been shown to cause the same respiratory disease.

이 질병의 기전을 보면, 마이코플라즈마 세균이 돼지의 기관지 섬모세포에 부착하여 집락을 형성하고 세포 독소를 분비하여 섬모 세포를 마비시킴으로써 기관지 섬모의 배출 기능 및 기관지 점액 생성을 억제하는 것은 물론 섬모 세포에 침입하여 상피세포를 손상시키며 증식하게 된다. The mechanism of this disease is that mycoplasma bacteria adhere to the bronchial ciliary cells of the pig to form colonies and secrete cytotoxic to paralyze the ciliated cells, thereby inhibiting bronchial ciliary discharge and bronchial mucus production. They invade and damage epithelial cells and proliferate.

그 후 마이코플라즈마 세균은 림파구를 손상시키면서 돼지의 면역기능 장애까지 유발시킨다. Mycoplasma bacteria then damage lymphocytes and cause immune dysfunction in pigs.

또한 돼지의 폐포 대식세포(Pulmonary Alveolar Macropharge; PAM) 의 기능을 심각하게 저하시켜 흉막 폐렴군 및 파스튜렐라 균 등 2차 세균감염이 쉽게 나타나서 복합적인 폐렴이 발생하며 점진적으로 소모성질병으로 악화되는 발병기전을 일으키는 것으로 알려져 있다.
In addition, the function of Pulmonary Alveolar Macropharge (PAM) in pigs is severely impaired, resulting in secondary bacterial infections such as pleural pneumonia and Pasteurella. It is known to cause mechanisms.

따라서 마이코플라즈마 하이오라이니스가 마이코플라즈마 하이오뉴모니에 만큼이나 돼지 유행성 폐렴에 중요한 병원체라는 것이 밝혀지고 있으므로, 마이코플라즈마 하이오라이니스의 정확한 진단 필요성이 크게 대두되고 있는 실정이다.
Therefore, it has been found that mycoplasma hyolainis is an important pathogen for swine epidemic pneumonia as much as mycoplasma hyo pneumoniae, so the need for accurate diagnosis of mycoplasma hyolainis is emerging.

종래에는, 이러한 돼지의 유행성 폐렴을 진단하는 방법으로는 신선한 가검물을 채취하여 원인 병원체를 분리 및 동정하는 균분리 동정방법, 혈청학적 방법 또는 조직을 이용한 방법이 이용되어 왔다.Conventionally, as a method for diagnosing a pandemic pneumonia in pigs, a bacterium identification method, a serological method, or a tissue method has been used in which a fresh specimen is collected to isolate and identify a causative pathogen.

그러나 균분리 동정방법은 병원체의 특성상 배양조건이 까다로울 뿐만 아니라, 성장속도가 매우 느리기 때문에 균 분리 배양에 10일 내지 30일 이상이 걸려 병원체의 진단에 장기간이 소요되고, 따라서 이들의 감염에 대하여 즉시적으로 대처할 수 없는 문제점이 있었다.
However, the bacterium identification method is difficult to culture due to the characteristics of the pathogen, and because the growth rate is very slow, it takes 10 to 30 days or more to isolate the bacterium, and therefore it takes a long time to diagnose the pathogen. There was a problem that can not cope with the enemy.

최근에, 마이코플라즈마 하이오라이니스 검출방법 중에서 가장 선호되는 방법은 유전물질인 핵산을 증폭하는 중합효소연쇄반응(PCR; polymerase chain reaction)을 이용한 방법이다.Recently, the most preferred method of detecting mycoplasma hyoliinis is a method using a polymerase chain reaction (PCR) that amplifies a nucleic acid, a genetic material.

여기에서, PCR은 생체 내에 존재하는 적은 양의 DNA를 분리하여 주형으로 사용하고 표적 DNA 서열의 양 말단에 상보적인 올리고뉴클레오타이드 (oligonucleotide)를 프라이머로 이용하여 표적 DNA 단편만을 짧은 시간 안에 수십만 배 이상 증폭시키는 기법이다.
Here, PCR uses a small amount of DNA present in vivo as a template and amplifies only a target DNA fragment hundreds of thousands times in a short time by using oligonucleotides complementary to both ends of the target DNA sequence as primers. Is a technique.

한편 종래에 돼지의 유행성 폐렴 및 마이코플라즈마 검출과 관련되어 출원된 특허문헌을 살펴보면, 먼저, 한국공개특허공보 10-1999-0073181호(특허문헌 1)에는 조직내 교잡법을 이용한 돼지 유행성 폐렴 진단방법이 기재되어 있다.On the other hand, when looking at the patent documents conventionally related to the detection of epidemic pneumonia and mycoplasma in pigs, first, Korean Patent Publication No. 10-1999-0073181 (Patent Document 1) a method for diagnosing swine pandemic pneumonia using an intracellular tissue hybridization method This is described.

이는 마이코플라즈마 하이오뉴모니에의 특이적 DNA 탐침자(probe)를 돼지의 조직절편상에 적용시키는 조직내 교잡법을 이용하여 세균분리 없이 병원체의 감염 여부를 진단하는 것에 대한 것을 특징으로 하고 있다.
This is characterized by diagnosing the infection of a pathogen without bacterial separation using an intracellular hybridization method in which a specific DNA probe of Mycoplasma hyopneumoniae is applied to a tissue section of a pig.

두 번째로, 한국공개특허공보 10-2001-0032493호(특허문헌2)에는 재조합 DNA 또는 합성수단에 의해 만들어진 마이코플라즈마 하이오뉴모니에 단백질, 단백질을 코딩한 DNA 서열, 단백질에 기초한 백신, DNA 서열에 기초한 백신 등을 이용하여 돼지 유행성 폐렴을 예방하는 방법 및 마이코플라즈마 하이오뉴모니에 감염의 존재를 검출하기 위하여 이에 대항하여 생성된 단백질 또는 항체에 기초한 진단 방법이 기재되어 있다.
Second, Korean Patent Laid-Open Publication No. 10-2001-0032493 (Patent Document 2) discloses a protein, a DNA sequence encoding a protein, a protein-based vaccine, a DNA sequence, and a mycoplasma hyonneumoniae produced by recombinant DNA or synthetic means. A method for preventing swine pandemic pneumonia using a vaccine and the like, and a diagnostic method based on a protein or antibody generated therein for detecting the presence of an infection in Mycoplasma hyon pneumoniae.

세 번째로, 한국공개특허공보 10-2010-0043619호(특허문헌 3)에는 돼지의 흉막 폐렴 예방을 위한 재조합 항원 단백질로서 사용되는 ApxIIA를 수용성 형태로 생산하기 위한 재조합 발현 벡터 및 이를 이용하여 ApxIIA 단백질을 수용성 형태로 생산하는 방법에 대한 것이 기재되어 있다.
Third, Korean Patent Laid-Open Publication No. 10-2010-0043619 (Patent Document 3) discloses a recombinant expression vector for producing ApxIIA, which is used as a recombinant antigen protein for preventing pleural pneumonia in swine, and an ApxIIA protein using the same. It is described how to produce the in water-soluble form.

네 번째로, 한국등록특허공보 10-0615424호(특허문헌4)에는 마이코플라즈마 및 유사 균종의 유전자형 감별을 위한 올리고뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이와 이를 이용한 균종 검출방법이 개시되어 있다.Fourth, Korean Patent Publication No. 10-0615424 (Patent Document 4) discloses an oligonucleotide for genotype discrimination of mycoplasma and similar strains, a microarray including the same and a method for detecting the species using the same.

개략적으로 살펴보면, 청구항 1에는 서열번호 1 ~ 6을 갖는 표적 DNA를 청구하고 있으며, 청구항 2 및 3에는 서열번호 7 ~ 21 및 28 ~ 127을 갖는 마이코플라즈마 균주 감별을 위한 올리고뉴클레오티드를 청구하고 있다. In brief, claim 1 claims a target DNA having SEQ ID NOS: 1 to 6, and claims 2 and 3 claim an oligonucleotide for differentiating mycoplasma strains having SEQ ID NOs: 7 to 21 and 28 to 127.

여기에서, 서열번호 7 ~ 21 및 28 ~ 127의 올리고뉴클레오티드는 주로 개별 마이코플라즈마 탐색을 위한 프로브(probe)로서의 기능을 하게 되는데, 특히 서열번호 41 ~ 48 에는 마이코플라즈마 하이오라이니스 검출을 위한 프로브 염기서열이 기재되어 있다.Here, the oligonucleotides of SEQ ID NOs: 7 to 21 and 28 to 127 mainly function as probes for the search for individual mycoplasma, and in particular, SEQ ID NOs: 41 to 48 are probe bases for the detection of mycoplasma hyorainis. The sequence is described.

그러나 이하에서 서술하는 본 발명의 실시예에 따른 프라이머의 염기서열과는 일치되지 않는다.
However, the base sequence of the primer according to the embodiment of the present invention described below does not match.

다섯 번째로, 한국등록특허공보 10-0502765호(특허문헌5)에는 PCR을 이용하여 마이코플라즈마의 동정 및 탐지를 하기 위한 프라이머가 개시되어 있는데, 청구항 4에는 서열번호 28 ~ 31을 갖는 동정 프라이머가, 청구항 5에는 서열번호 32 ~ 37을 갖는 탐지 프라이머가 기재되어 있다.Fifthly, Korean Patent Publication No. 10-0502765 (Patent Document 5) discloses a primer for identifying and detecting mycoplasma using PCR, and claim 4 has an identification primer having SEQ ID NOs: 28 to 31. , Claim 5 describes detection primers having SEQ ID NOs: 32-37.

여기에서, 서열번호 28 ~ 29 및 32 ~ 33은 뉴모니에(Pneumoniae) 그룹, 서열번호 30 ~ 31 및 34 ~ 37은 호미니스(Hominis) 그룹을 위한 프라이머이다.
Here, SEQ ID NOs: 28 to 29 and 32 to 33 are Pneumoniae groups, and SEQ ID NOs: 30 to 31 and 34 to 37 are primers for the Hominis group.

여섯 번째로, 한국등록특허공보 10-0974861호(특허문헌 6)에는 생물학적 의약품으로부터 마이코플라즈마를 검출하는 PCR 프라이머 세트가 개시되어 있다.Sixth, Korean Patent Publication No. 10-0974861 (Patent Document 6) discloses a PCR primer set for detecting mycoplasma from a biological drug.

개략적으로 살펴보면, 1, 2차 중합효소연쇄반응을 실시하되, 1차에는 1, 2 및 10 서열의 전방향 프라이머 및 3, 4, 5, 6 및 11서열의 역방향 프라이머를 사용하며, 2차에는 7 및 12 서열의 전방향 프라이머 및 8, 9 및 13 서열의 역방향 프라이머를 이용하게 된다.Schematically, the first and second polymerase chain reactions are carried out, but the first and second forward primers of the 1, 2 and 10 sequences and the reverse primers of the 3, 4, 5, 6 and 11 sequences are used. Forward primers of 7 and 12 sequences and reverse primers of 8, 9 and 13 sequences will be used.

그러나 상기 1 ~ 13 서열의 프라이머들은 이하에서 서술하는 본 발명의 실시예에 따른 프라이머와는 일치되지 않는다.
However, the primers of the 1 to 13 sequences are not consistent with the primers according to the embodiments of the present invention described below.

총괄적으로 정리하여 보면, 돼지의 유행성 폐렴을 진단하기 위해서 병원체인 마이코플라즈마 하이오라이니스를 신속하게 검출하는 것이 요구되나, 병원체의 특성상 균분리 동정방법 등은 진단을 위해서 장기간이 소요되는 문제점이 존재해왔다.Collectively, it is required to quickly detect mycoplasma hyorainis, a pathogen, in order to diagnose swine pandemic pneumonia. However, due to the nature of pathogens, the identification method of bacteria has been required for a long time for diagnosis. .

또한 종래의 특허기술 중에서는, 돼지의 유행성 폐렴을 진단하기 위한 방법으로 DNA 프로브 방법을 사용하거나, 단백질 또는 항체에 기초하고 있는 것이 공지되어 있을 뿐으로서, 그 외의 경우는 유행성 폐렴을 예방 및 치료하는 것에 초점이 맞추어져 왔다.In addition, in the conventional patent technology, it is only known that the DNA probe method is used as a method for diagnosing swine pandemic pneumonia or based on a protein or an antibody. It has been focused on.

또한 종래의 특허기술 중에서는, 개별 마이코플라즈마 탐색을 위한 프로브(probe), 뉴모니에(Pneumoniae) 또는 호미니스(Hominis) 그룹을 위한 프라이머, 13종의 전방향 및 역방향 프라이머를 이용하여 두 번의 중합효소연쇄반응을 실시하는 방법 등이 있었으나, 마이코플라즈마 하이오라이니스를 특이적이고 민감하게 검출하는 방법은 개발되지 않았다.
In addition, in the conventional patent technology, two polymerizations using a probe for probing individual mycoplasmas, a Pneumoniae or Hominis group, and 13 kinds of forward and reverse primers There have been methods for carrying out an enzyme chain reaction, but a method for detecting mycoplasma hyorainis specifically and sensitively has not been developed.

따라서 본 발명자들은 돼지의 유행성 폐렴을 진단하기 위해서 병원체인 마이코플라즈마 하이오라이니스를 신속하게 검출하는 방법으로PCR 방법을 적용하되, 프라이머가 특이도 및 민감도를 보유하게 함으로써, 다양한 마이코플라즈마 종들 중에서 마이코플라즈마 하이오라이니스 만을 특이적으로 검출할 수 있는 기술을 안출하였다. Therefore, the present inventors apply the PCR method as a method for rapidly detecting mycoplasma hyorainis, a pathogen for diagnosing the epidemic pneumonia in pigs, but by allowing the primer to retain specificity and sensitivity, mycoplasma among various mycoplasma species A technique capable of specifically detecting only hyorinis was devised.

KRKR 10-1999-007318110-1999-0073181 AA KRKR 10-2001-003249310-2001-0032493 AA KRKR 10-2010-004361910-2010-0043619 AA KRKR 10-061542410-0615424 B1B1 KRKR 10-050276510-0502765 B1B1 KRKR 10-097486110-0974861 B1B1

본 발명의 목적은, 다양한 마이코플라즈마 종들 중에서 마이코플라즈마 하이오뉴모니에 만을 특이적으로 검출할 수 있는, 특이도 및 민감도를 보유한 프라이머를 제공함에 있다. It is an object of the present invention to provide a primer having specificity and sensitivity capable of specifically detecting mycoplasma hyopneumoniae among various mycoplasma species.

본 발명의 목적은, 마이코플라즈마 하이오뉴모니에 병원체의 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머를 제공함에 있다.It is an object of the present invention to provide a primer that targets a region between 16s rRNA and 23s rRNA that is specific for mycoplasma hyon pneumoniae species.

본 발명의 목적은, 마이코플라즈마 하이오라이니스를 신속하게 검출하는 방법으로PCR 방법을 적용하되, 마이코플라즈마 하이오라이니스 만을 특이적으로 신속하게 검출할 수 있는 검출키트를 제공함에 있다. SUMMARY OF THE INVENTION An object of the present invention is to provide a detection kit that can apply a PCR method as a method for rapidly detecting mycoplasma hyorainis, and can detect only mycoplasma hyorainis specifically and rapidly.

본 발명의 목적은, 돼지의 유행성 폐렴을 진단하기 위해서 병원체인 마이코플라즈마 하이오라이니스를 신속하게 검출하는 방법으로PCR 방법을 적용하되, 돼지 유행성 폐렴을 신속하게 진단할 수 있는 진단키트를 제공함에 있다. An object of the present invention is to provide a diagnostic kit for rapidly detecting swine epidemic pneumonia, while applying the PCR method as a method of rapidly detecting mycoplasma hyorainis, a pathogen, for diagnosing swine pandemic pneumonia. .

본 발명은, 서열번호 1 및 서열번호 2 의 프라이머 쌍을 포함하는, 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis)를 검출하기 위한 프라이머를 제공함으로써, 기술적 과제를 해결하고자 한다. The present invention aims to solve the technical problem by providing a primer for detecting Mycoplasma hyorhinis , comprising a primer pair of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2.

본 발명은, 상기 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출하되, 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하여 검출하는 것을 특징으로 하는 프라이머를 제공함으로써, 기술적 과제를 해결하고자 한다.The present invention is to solve the technical problem by detecting the mycoplasma hyorainis, by providing a primer characterized by detecting a region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species (species).

본 발명은, 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출하는 키트로서, 상기 프라이머를 포함하는, 마이코플라즈마 하이오라이니스 검출키트를 제공함으로써, 기술적 과제를 해결하고자 한다.The present invention aims to solve the technical problem by providing a mycoplasma hyalurine detection kit comprising the primer as a kit for detecting mycoplasma hyalurine using a polymerase chain reaction (PCR).

본 발명은, 중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 돼지 유행성 폐렴(SEP)를 진단하는 키트로서, 상기 프라이머를 포함하는, 돼지 유행성 폐렴 진단키트를 제공함으로써, 기술적 과제를 해결하고자 한다.The present invention, as a kit for diagnosing swine pandemic pneumonia (SEP) using a polymerase chain reaction (PCR), comprising the primer, to provide a swine pandemic pneumonia diagnostic kit, to solve the technical problem.

본 발명에 따른 프라이머는, 6개 종류의 마이코플라즈마 균주들의 102 pg의 DNA 샘플들에서, 마이코플라즈마 하이오라이니스만 특이적으로 반응하는 현저한 효과를 보유하고 있다.The primer according to the present invention has a remarkable effect of specifically reacting only mycoplasma hyorinis in 10 2 pg of DNA samples of six kinds of mycoplasma strains.

본 발명에 따른 프라이머는, 마이코플라즈마 하이오라이니스의 1 pg 이상 DNA 샘플들에서 유의미할 정도로 민감하게 반응하는 현저한 효과를 보유하고 있다.The primers according to the present invention have a remarkable effect of reacting significantly sensitively in more than 1 pg DNA samples of Mycoplasma hyorinis.

본 발명에 따른 프라이머는, 임상적으로 마이코플라즈마 하이오라이니스 감염에 의한 돼지의 폐장으로부터, 마이코플라즈마 하이오라이니스를 효과적으로 검출하는 현저한 효과를 보유하고 있다.The primer according to the present invention has a remarkable effect of effectively detecting mycoplasma hyorainis from the lungs of pigs clinically due to mycoplasma hyalurinitis infection.

본 발명에 따른 프라이머는, 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체의 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 함으로써, 특이도 및 민감도를 보유함은 물론 임상적으로 신속하고도 현저하게 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출할 수 있는 현저한 효과를 보유하고 있다.The primer according to the present invention targets a region between 16s rRNA and 23s rRNA specific for the species of mycoplasma hyorainis pathogen, thereby retaining specificity and sensitivity, as well as clinically rapid and remarkable. It has a remarkable effect that can detect mycoplasma hyorainis.

본 발명은, 농업 축산 분야에서 막대한 피해를 끼치고 있는 돼지 유행성 폐렴의 병원체인 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체를 신속 정확하게 검출하여 조기에 치료 및 전염 예방을 할 수 있는 방법을 제시할 수 있어 양돈 산업에 매우 유익한 효과를 보유하고 있다.The present invention can provide a method that can quickly and accurately detect the mycoplasma hyorainis pathogen, a pathogen of swine pandemic pneumonia, which causes enormous damage in the field of agriculture and livestock raising, and thus can provide a method for early treatment and prevention of infection. It has a beneficial effect.

본 발명은 농업 축산 분야뿐만 아니라 의약학 분야에서 수행되는 세포 배양이나 생물의약품의 제조, 보관, 투여, 배양에서 빈번하게 오염되는 마이코플라즈마 병원체를 직접 배양 방법에 의하지 않고 신속하고 정확하게 고민감도로 검출할 수 있어 의약학 및 바이오 생물 산업 분야에도 적용할 수 있는 현저한 효과를 보유하고 있다.
The present invention can detect mycoplasma pathogens that are frequently contaminated in cell culture or biopharmaceutical manufacture, storage, administration, and culture performed in the field of agriculture, animal husbandry, as well as in the field of agriculture and livestock with rapid and accurate sensitivity and sensitivity. It has significant effects that can be applied to the pharmaceutical and bio-biological industries.

도 1은 본 발명에 따른 프라이머의 특이도(specificity) 실험 결과를 나타낸 도면이다.
도 2는 본 발명에 따른 프라이머의 민감도(sensitivity) 실험 결과를 나타낸 도면이다.
도 3은 유행성 폐렴에 감염된 돼지 및 음성이 확인된 돼지의 폐장으로부터 획득한 임상샘플을 이용하여 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체를 검출한 결과를 나타낸 도면이다.
1 is a view showing the results of specificity (specificity) experiment of the primer according to the present invention.
2 is a view showing the results of the sensitivity (sensitivity) experiment of the primer according to the present invention.
Figure 3 is a diagram showing the results of detecting mycoplasma hyalurine pathogens using clinical samples obtained from the lungs of pigs infected with pandemic pneumonia and pigs confirmed negative.

본 명세서 및 청구범위에 사용된 용어나 단어는 통상적이거나 사전적인 의미로 한정해서 해석되어서는 안 되며, 발명자는 그 자신의 발명을 가장 최선의 방법으로 설명하기 위해 용어의 개념을 적절하게 정의할 수 있다는 원칙에 입각하여 본 발명의 기술적 사상에 부합하는 의미와 개념으로 해석되어야만 한다.
The terms and words used in the present specification and claims should not be construed as limited to ordinary or dictionary terms and the inventor may properly define the concept of the term in order to best describe its invention It should be construed as meaning and concept consistent with the technical idea of the present invention.

따라서 본 명세서에 기재된 실시예, 참고예, 실험예 및 도면에 도시된 사항은 본 발명의 가장 바람직한 일 예에 불과할 뿐이고 본 발명의 기술적 사상을 모두 대변하는 것은 아니므로, 본 출원시점에 있어서 이들을 대체할 수 있는 다양한 균등물과 변형예들이 있을 수 있음을 이해하여야 한다.
Therefore, the matters shown in the embodiments, reference examples, experimental examples, and drawings described herein are only the most preferred examples of the present invention, and do not represent all of the technical ideas of the present invention, and thus, these are replaced at the time of the present application. It should be understood that there may be various equivalents and variations that can be made.

먼저, 여기에서 "프라이머(primer)"는 중합효소연쇄반응에서 이용되는 타깃 핵산에 인접해 있는 5'말단 서열 및 3'말단 서열에 상보적인 올리고뉴클레오타이드(oligonucleotide)를 의미한다. First, "primer" herein means an oligonucleotide complementary to the 5 'terminal sequence and the 3' terminal sequence adjacent to the target nucleic acid used in the polymerase chain reaction.

또한 "전방향(forward) 프라이머" 및 "역방향(reverse) 프라이머"는 중합효소연쇄반응에 의해 증폭되는 유전자의 일정 부위의 3'말단 및 5'말단에 각각 결합하는 프라이머를 의미한다.
In addition, "forward (prior) primer" and "reverse (reverse) primer" means a primer that binds to the 3 'end and 5' end of each region of the gene amplified by the polymerase chain reaction, respectively.

이하 첨부된 도면을 참조하여 본 발명의 바람직한 실시예를 상세히 설명하기로 한다.
Hereinafter, exemplary embodiments of the present invention will be described in detail with reference to the accompanying drawings.

실시예 1. 마이코플라즈마 하이오라이니스를 특이적으로 검출하는 프라이머의 제조 Example 1 Preparation of a Primer Specific for Detecting Mycoplasma Hyorinis

마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 함으로써, 마이코플라즈마 하이오라이니스 만을 특이적으로 검출할 수 있는 프라이머를 아래와 같이 서열번호 1 및 2의 염기서열로 이루어진 프라이머 쌍을 포함하도록 제조한다.
By targeting the region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the mycoplasma hyorainis genome sequence, primers that can specifically detect mycoplasma hyorainis are shown below in SEQ ID NOs: 1 and 2 Prepare to include a primer pair consisting of a nucleotide sequence.

서열번호 1. SEQ ID NO: 1. 전방향 프라이머(Forward primer)Forward primer

5'-ACT TCG GAG ACC ATT GCC TAA G-3'5'-ACT TCG GAG ACC ATT GCC TAA G-3 '

(22 mer, 뉴클레오타이드 19731 ~ 19750)
(22 mer, nucleotides 19731-19750)

서열번호 2. SEQ ID NO: 2. 역방향 프라이머(Reverse primer)Reverse primer

5'-AAA GCT CTC AAA ACT AGA CAC GAA-3'5'-AAA GCT CTC AAA ACT AGA CAC GAA-3 '

(24 mer, 뉴클레오타이드 19889 ~ 19866)
(24 mer, nucleotides 19889-19866)

상기 프라이머는 ㈜ 바이오니아(대한민국)에 의뢰하여 합성 후 OPC 방법으로 정제하여 사용한다.
The primer is used by Bioneer Co., Ltd. (Republic of Korea) and then purified by OPC method.

실시예 2. 마이코플라즈마 하이오라이니스를 특이적으로 검출하는 방법 Example 2 Method for Specific Detection of Mycoplasma Hyorinis

(1) 시료(sample)로부터 DNA를 추출하는 단계(1) extracting DNA from a sample

배양된 세포(cultured cell), 또는 돼지 폐렴 조직 등을 시료로 사용하며, 이로부터 DNA를 분리 추출한다.
Cultured cells or porcine pneumonia tissues are used as samples, and DNA is separated and extracted therefrom.

(2) 실시예 1에서 제조된 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체에 특이적인 프라이머를 준비하는 단계(2) preparing a primer specific for the mycoplasma hyorinis pathogen prepared in Example 1

마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머를 준비한다.
Primers targeting the region between 16s rRNA and 23s rRNA that are specific for the species in the Mycoplasma hyorinis genome sequence are prepared.

(3) 추출된 시료 DNA 및 프라이머를 가지고 중합효소연쇄반응(PCR)을 실시하는 단계(3) performing polymerase chain reaction (PCR) with the extracted sample DNA and primer

PCR을 위한 반응시약의 조성은, 1㎕ 전방향, 역방향 프라이머 (10 pmol/㎕), 2.5㎕ 10× 반응버퍼, 500 μM 디옥시뉴클레오타이드, 1.5 U Taq 중합효소를 각각 넣고, 25 ㎕의 반응량이 되도록 멸균된 증류수를 첨가하여 섞어 제조한다.The composition of the reaction reagent for PCR was 1 μl forward, reverse primer (10 pmol / μl), 2.5 μl 10 × reaction buffer, 500 μM deoxynucleotide, 1.5 U Taq polymerase, and 25 μl of reaction volume. Prepare by mixing sterilized distilled water as much as possible.

중합효소연쇄반응은 써모사이클러(Thermocycler; ABI, USA)를 이용하여 반응을 실시한다.The polymerase chain reaction is carried out using a thermocycler (ABI, USA).

반응조건은 95℃에서 5 분(min)간 프리디내츄레이션(pre-denaturation)을 실시 한 후 95℃에서 1 분(min), 62℃에서 1분(min), 72℃에서 1분(min)을 30 주기로 시행하고 마지막으로 72℃에서 3분(min)간 포스트폴리머라이제이션(post-polymerization)을 실시한다.The reaction conditions were pre-denaturation for 5 minutes at 95 ° C, followed by 1 minute at 95 ° C, 1 minute at 62 ° C, and 1 minute at 72 ° C. 30 cycles and finally post-polymerization (min) at 72 ℃ for 3 minutes (min).

중합효소 연쇄반응의 산물은 2% 아가로즈겔에 전기영동하여 140 bp의 밴드를 확인한다.
The product of the polymerase chain reaction was electrophoresed on 2% agarose gel to confirm the band of 140 bp.

참고예 1. 실험 준비Reference Example 1. Experiment Preparation

본 발명의 실시예에 따라 개발된, 마이코플라즈마 하이모라이니스에 특이적인 프라이머의 특이도 및 민감도를 확인하기 위하여 아래와 같이 실험을 준비하였다.
Developed according to the embodiment of the present invention, the following experiments were prepared to confirm the specificity and sensitivity of the primers specific for mycoplasma hymorinis.

1-1. 마이코플라즈마 균주 준비와 배양1-1. Mycoplasma Strain Preparation and Culture

본 발명에 따른 프라이머의 특이도 및 민감도 등을 확인하기 위한 비교 실험을 수행하기 위하여 아래와 같이 총 6 개 종류의 마이코플라즈마 종 별 균주들을 구입하여 배양하였다. In order to perform comparative experiments to confirm the specificity and sensitivity of the primer according to the present invention, a total of six kinds of mycoplasma strains were purchased and cultured as follows.

Mycoplasma speciesMycoplasma species 1One Mycoplasma hyorhinis (ATCC strain 27717) Mycoplasma hyorhinis (ATCC strain 27717) 22 Mycoplasma hyopneumoniae (ATCC strain 25934) Mycoplasma hyopneumoniae (ATCC strain 25934) 33 Mycoplasma pneumoniae (ATCC 15531) Mycoplasma pneumoniae (ATCC 15531) 44 Mycoplasma pulmonis (ATCC 19612) Mycoplasma pulmonis (ATCC 19612) 55 Mycoplasma hominis (ATCC 23114) Mycoplasma hominis (ATCC 23114) 66 Mycoplasma arthritiditis (ATCC 19611) Mycoplasma arthritiditis (ATCC 19611)

상기 마이코플라즈마 균주의 배양은 modified Friis 배지를 이용하여 37 ℃에서 58 rpm으로 10일간 배양하여 13,000 g에서 30분 동안 원심 분리하여 Friss 배지성분을 제거하였다.
The mycoplasma strain was cultured for 10 days at 37 rpm at 58 rpm using modified Friis medium to remove Friss medium components by centrifugation at 13,000 g for 30 minutes.

1-2. 마이코플라즈마 균주 별 DNA 추출 시료 준비1-2. DNA Extraction Sample Preparation for Mycoplasma Strains

배양한 각각의 마이코플라즈마 균주들의 DNA 추출은 비드 비터-페놀 추출 방법(bead beater-phenol extraction method)를 사용하였다.DNA extraction of each mycoplasma strain cultured using the bead beater-phenol extraction method (bead beater-phenol extraction method).

배양된 균주들을 13,000 g에서 30분 동안 원심분리하여 얻은 펠렛 검체를 1 ml 멸균 증류수가 들어있는 Mini-Bead Beater(Biospec product) 전용 2 ml 튜브에 무균 채취하여 세절한 후 멸균 3차 증류수에 부유시킨 glass bead(0.1 mm size, Biospec product) 200 μl와 phenol-chlorform-isoamyl alcohol 용액(50:49:1(v/v/v)) 200μl를 넣어 Mini-Bead Beater(Biospec product)로 30초간 5,000rpm으로 진탕하였다.Pellet samples obtained by centrifuging the cultured strains at 13,000 g for 30 minutes were sterilely collected in a 2 ml tube dedicated to Mini-Bead Beater (Biospec product) containing 1 ml sterile distilled water, sliced and suspended in sterile tertiary distilled water. Add 200 μl of glass bead (0.1 mm size, Biospec product) and 200 μl of phenol-chlorform-isoamyl alcohol solution (50: 49: 1 (v / v / v)) with 5,000 rpm for 30 seconds using Mini-Bead Beater (Biospec product). Shaken.

진탕 후 4 ℃에서 12,000 rpm으로 15분간 원심 분리한 후 상층액을 멸균 2ml 튜브에 옮겼다.After shaking, the mixture was centrifuged at 12,000 rpm for 15 minutes at 4 ° C, and the supernatant was transferred to a sterile 2 ml tube.

3 M 초산나트륨(sodium acetate) 10 μl와 ice-cold 에탄올 250μl를 넣어 -20℃에서 10분간 정체시킨 후, 15,000rpm으로 15분간 원심분리 하였다.10 μl of 3 M sodium acetate and 250 μl of ice-cold ethanol were added to the mixture, and the mixture was suspended for 10 minutes at −20 ° C., followed by centrifugation at 15,000 rpm for 15 minutes.

침전물은 70% 알코올로 세척하여 실온에서 건조시키고 Tris EDTA(pH 8.0) 60μl에 용해시켜 실험에 사용하였다.
The precipitate was washed with 70% alcohol, dried at room temperature and dissolved in 60 μl of Tris EDTA (pH 8.0) and used for the experiment.

1-3. 중합효소연쇄반응 조건1-3. Polymerase Chain Reaction Conditions

실시예 1에서 제조된 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체에 특이적인 프라이머를 이용하되, 이는 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하고 있다.
Primers specific for the mycoplasma hyorainis pathogen prepared in Example 1 are used, which targets a region between the 16s rRNA and the 23s rRNA that is specific for the species in the mycoplasma hyorainis genome sequence.

중합효소연쇄반응을 위한 반응시약 조성, 반응을 위한 써모사이클러, 반응조건 및 반응산물의 확인은, 실시예 2와 동일하게 진행한다.
The composition of the reaction reagent for the polymerase chain reaction, the thermocycler for the reaction, the reaction conditions, and the confirmation of the reaction product proceed in the same manner as in Example 2.

실험예 1. 본 발명에 따른 프라이머의 마이코플라즈마 하이오라이니스에 대한 특이도(specificity) 확인 Experimental Example 1. Confirmation of specificity of mycoplasma hyorinis of the primer according to the present invention

참고예 1의 실험준비에 따라서, 6개 종류의 마이코플라즈마 균주들인 마이코플라즈마 하이오라이니스(M. hyorhinis), 마이코플라즈마 하이오뉴모니에(M. hyopneumoniae), 마이코플라즈마 뉴모니에(M. pneumoniae), 마이코플라즈마 펄모니스(M. pulmonis), 마이코플라즈마 호미니스(M. hominis), 마이코플라즈마 아쓰라이티디티스(M. arthritiditis) 의 102 pg의 DNA 샘플들을 준비하였다.
According to the experimental preparation of Reference Example 1, six kinds of mycoplasma strains, Mycoplasma hyorhinis , M. hyopneumoniae and Mycoplasma pneumoniae , mycoplasma pulse monitor's (M. pulmonis), mycoplasma hoe to prepare the DNA samples of 10 pg of the varnish 2 (M. hominis), mycoplasma O Write ET di tooth (M. arthritiditis).

샘플들 각각에 대하여, 실시예 1에서 제조된 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis) 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머를 가지고 중합효소연쇄반응을 수행하였다.
For each of the samples, a polymerase chain reaction was carried out with primers targeting the region between 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the Mycoplasma hyorhinis genome sequence prepared in Example 1. Was performed.

중합효소연쇄반응의 조건은 실시예 2와 동일하게 진행하였다.
The conditions of the polymerase chain reaction were performed in the same manner as in Example 2.

도 1은 본 발명에 따른 프라이머의 특이도(specificity) 실험 결과를 나타낸 도면이고, 이를 표로서 나타낸 것이 다음의 표 2이다.1 is a view showing the results of a specificity (specificity) experiment of the primer according to the present invention, which is shown in Table 2 below.

Mycoplasma speciesMycoplasma species PCR resultPCR result 1One M. hyorhinis M. hyorhinis ++++++ 22 M. hyopneumoniaeM. hyopneumoniae -- 33 M. pneumoniaeM. pneumoniae -- 44 M. pulmonisM. pulmonis -- 55 M. hominisM. hominis -- 66 M. arthritiditisM. arthritiditis --

+++: Strong reaction, -: No reaction
+++: Strong reaction,-: No reaction

도 1 및 표 2에 나타난 것과 같이, 본 발명에서 개발한 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머는, 1번 균주인 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis) DNA에만 특이적으로 반응하였음을 알 수 있다.As shown in FIG. 1 and Table 2, the primers targeting the region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the mycoplasma hyorinis genome sequence developed in the present invention are Mycoplasma, which is strain # 1. It can be seen that it specifically reacted only to the hycoplasma hyorhinis DNA.

반면에 2번 내지 6번 균주들에 대해서는 반응이 일어나지 않았음을 알 수 있다.
On the other hand, it can be seen that the reaction did not occur with strains 2-6.

따라서 실험예 1의 결과는, 본 발명에서 개발된 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머가 마이코플라즈마 하이오라이니스에만 특이적으로 반응하는 것이 확인되었다.
Therefore, the result of Experiment 1 shows that the primers targeting the region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the mycoplasma hyorainis genome sequence developed in the present invention are specific to mycoplasma hyorainis only. It was confirmed to react.

실험예 2. 본 발명에 따른 프라이머의 마이코플라즈마 하이오라이니스에 대한 민감도(sensitivity) 확인Experimental Example 2. Confirmation of the sensitivity of the primer according to the present invention for mycoplasma hyorininess

참고예 1의 실험준비에 따라, 마이코플라즈마 하이오라이니스 균주의 배양 및 DNA 추출 시료를 준비하였다.
According to the experimental preparation of Reference Example 1, the culture and DNA extraction samples of mycoplasma hyorinis strains were prepared.

추출된 마이코플라즈마 하이오라이니스는 분광광도계(Spectrophotometer)를 이용하여 DNA 정량을 한 후 단계 희석하여 준비한 정제(purified) 마이코플라즈마 하이오라이니스 DNA 샘플들(102, 10, 1, 0.1 pg) 각각에 대하여 중합효소연쇄반응을 수행하였다.
The extracted Mycoplasma hyorinis Purified Mycoplasma Hyorinis DNA Samples Prepared by Quantitative DNA Quantification Using a Spectrophotometer (10)2, 10, 1, 0.1 pg) for each polymerase chain reaction.

실시예 1에서 제조된 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머를 가지고 중합효소연쇄반응을 수행하였다.
The polymerase chain reaction was carried out with primers targeting the region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the Mycoplasma hyorainis genome sequence prepared in Example 1.

중합효소연쇄반응의 조건은 실시예 2와 동일하게 진행하였다.
The conditions of the polymerase chain reaction were performed in the same manner as in Example 2.

도 2는 본 발명에 따른 프라이머의 민감도(sensitivity) 실험 결과를 나타낸 도면이고, 이를 표로서 나타낸 것이 다음의 표 3이다.2 is a view showing the results of the sensitivity (sensitivity) experiment of the primer according to the present invention, which is shown as a table Table 3 below.

Template DNA(pg)Template DNA (pg) 102 10 2 1010 1One 0.10.1 Positive reactionPositive reaction ++++ ++ ++ --

+++: Strong band, ++: moderate band, +: mild band, -: No reaction
+++: Strong band, ++: moderate band, +: mild band,-: No reaction

도 2및 표 3에 나타난 것과 같이, 본 발명에서 개발한 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머는 1 pg 이상의 마이코플라즈마 하이오라이니스 DNA 샘플에서 유의미한 반응이 일어났음을 알 수 있다.
As shown in FIG. 2 and Table 3, the primers targeting the region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the mycoplasma hyorinis genome sequence developed in the present invention are 1 pg or more of mycoplasma hyora It can be seen that a significant reaction occurred in the innis DNA sample.

따라서 실험예 2의 결과는, 본 발명에서 개발된 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머는 마이코플라즈마 하이오라이니스에 유의미할 정도로 민감하게 반응하는 것이 확인되었다.
Therefore, the result of Experiment 2 shows that the primers targeting the region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species among the mycoplasma hyorainis genome sequences developed in the present invention are significant to mycoplasma hyolineis. It was confirmed to react sensitively.

실험예 3. 임상 샘플을 이용한 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체 검출Experimental Example 3. Detection of Mycoplasma Hyorinis Pathogens Using Clinical Samples

임상적으로 마이코플라즈마 하이오라이니스 감염에 의한 유행성 폐렴에 감염된 돼지의 폐장으로부터 본 발명으로 개발한 프라이머의 효용성을 확인하고자, 임상샘플을 이용한 마이코플라즈마 병원체 검출 실험을 수행하였다.To confirm the efficacy of the primers developed according to the present invention from the lungs of pigs clinically infected with pancreatic pneumonia due to mycoplasma hyorainis infection, a mycoplasma pathogen detection experiment using clinical samples was performed.

전북 익산에 소재하고 있는 도축장에서 도축전 혈액 검사를 통하여 마이코플라즈마 하이오라이니스 감염이 확인된 돼지로부터 육안적으로 폐렴이 확인된 폐장의 일부를 무균 채취하였다.A slaughtered sample of pneumonia confirmed asymptomatically was collected from pigs confirmed with mycoplasma hyorainis infection at a slaughterhouse in Iksan, Jeonbuk.

또한 도축전 혈액 검사를 통하여 음성인 돼지로부터 폐장의 일부를 무균 채취하였다.
In addition, a portion of the lungs was aseptically collected from a pig that was negative through pre-slaughter blood tests.

참고예 1의 DNA 추출 시료 준비와 동일한 과정을 수행하여, DNA 샘플을 준비하되, 유행성 폐렴에 감염된 돼지의 DNA 샘플을 3개, 음성인 돼지의 DNA 샘플을 3개 준비하였다.DNA samples were prepared by following the same procedure as preparing the DNA extraction sample of Reference Example 1, but three DNA samples of pigs infected with pandemic pneumonia and three DNA samples of negative pigs were prepared.

DNA 샘플 각각에 대하여, 실시예 1에서 제조된 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis) 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머를 가지고 중합효소연쇄반응을 수행하였다.
For each DNA sample, polymerase chain reaction was carried out with primers targeting the region between 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species in the Mycoplasma hyorhinis genome sequence prepared in Example 1. Was performed.

중합효소연쇄반응의 조건은 실시예 2와 동일하게 진행하였다.
The conditions of the polymerase chain reaction were performed in the same manner as in Example 2.

도 3은 유행성 폐렴에 감염된 돼지 및 음성이 확인인 돼지의 폐장으로부터 획득한 임상샘플을 이용하여 마이코플라즈마 하이오라이니스 병원체를 검출한 결과를 나타낸 도면이고, 이를 표로 나타낸 것이 표 4이다.FIG. 3 is a diagram showing the results of detecting mycoplasma hyalurine pathogens using clinical samples obtained from pigs infected with pandemic pneumonia and lungs of negative pigs, and shown in Table 4 as a table.

Clinical samples (Lung)Clinical samples (Lung) PCR resultPCR result No. 1(sero-positive)No. 1 (sero-positive) ++ No. 2(sero-positive)No. 2 (sero-positive) ++++ No. 3(sero-positive)No. 3 (sero-positive) ++++++ No. 4(sero-negative)No. 4 (sero-negative) -- No. 5(sero-negative)No. 5 (sero-negative) -- No. 6(sero-negative)No. 6 (sero-negative) --

++: Strong reaction, -: No reaction
++: Strong reaction,-: No reaction

도 3 및 표 4에 나타난 것과 같이, 본 발명에서 개발한 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머는 임상적으로 마이코플라즈마 하이오라이니스 감염에 의한 돼지 유행성 폐렴에 감염된 돼지의 폐장으로부터 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출할 수 있었다.As shown in FIG. 3 and Table 4, the primers targeting the region between the 16s rRNA and the 23s rRNA specific to the species in the mycoplasma hyorainis genome sequence developed in the present invention are clinically known as mycoplasma hyora. Mycoplasma hyorainis could be detected from the lungs of pigs infected with swine pandemic pneumonia caused by innis infection.

반면에 도축 전 혈청 검사에서 음성인 개체인 No. 4, 5, 6의 돼지 폐장 조직에서는 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출할 수 없었다.
On the other hand, no. 4, 5, 6 pig lung tissue was unable to detect mycoplasma hyorainis.

따라서 본 발명에서 개발한 마이코플라즈마 하이오라이니스 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하는 프라이머는 임상적으로 마이코플라즈마 하이오라이니스 감염에 의한 돼지 유행성 폐렴에 감염된 돼지의 폐장으로부터 마이코플라즈마 하이오라이니스를 효과적으로 검출할 수 있음을 확인할 수 있었다.
Therefore, primers targeting the region between 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species among the mycoplasma hyorainis genome sequences developed in the present invention are clinically infected with swine epidemic pneumonia caused by mycoplasma hyouranis infection. It was confirmed that mycoplasma hyorainis can be effectively detected from the lungs of pigs.

실험예 1 내지 실험예 3을 총괄하여 정리하여 보면, 6개 종류의 마이코플라즈마 균주들의 102 pg의 DNA 샘플들에서, 본 발명의 실시예 1에 따른 프라이머는 마이코플라즈마 하이오라이니스에만 특이적으로 반응하였음이 확인되었다.In summary, Experimental Examples 1 to 3, in 10 2 pg of DNA samples of six kinds of mycoplasma strains, the primer according to Example 1 of the present invention was specifically specific to Mycoplasma hyorainis. It was confirmed that the reaction.

또한 마이코플라즈마 하이오라이니스의 1 pg 이상 DNA 샘플들에서, 본 발명의 실시예 1에 따른 프라이머가 유의미할 정도로 민감하게 반응하였음이 확인되었다.In addition, it was confirmed that the primers according to Example 1 of the present invention responded significantly sensitively to DNA samples of 1 pg or more of Mycoplasma hyorainis.

또한 임상적으로 마이코플라즈마 하이오라이니스 감염에 의한 돼지의 폐장으로부터, 본 발명의 실시예 1에 따른 프라이머는 마이코플라즈마 하이오라이니스를 효과적으로 검출하였음이 확인되었다.
In addition, it was confirmed that the primers according to Example 1 of the present invention effectively detected mycoplasma hyorainis from the lung of a pig due to mycoplasma hyalurinitis infection.

따라서 본 발명의 실시예 1에 따른 프라이머는 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis) 게놈서열 중에서 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 함으로써, 특이도 및 민감도가 매우 향상됨은 물론 임상적으로 신속하고도 현저하게 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출할 수 있다고 할 수 있겠다.Therefore, the primer according to Example 1 of the present invention targets a region between a 16s rRNA and a 23s rRNA specific to a species in the Mycoplasma hyorhinis genome sequence, thereby significantly improving specificity and sensitivity. Of course, it can be said that clinically rapid and remarkably detectable mycoplasma hyorainis can be detected.

<110> Wonkwang University Center for Industry-Academy Cooperation <120> Primer for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer <130> 2011-03 <160> 2 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Mhyorhinis Forward primer <400> 1 acttcggaga ccattgccta ag 22 <210> 2 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Mhyorhinis Reverse primer <400> 2 aaagctctca aaactagaca cgaa 24 <110> Wonkwang University Center for Industry-Academy Cooperation <120> Primer for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the          detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer, and kit          for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer <130> 2011-03 <160> 2 <170> Kopatentin 1.71 <210> 1 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Mhyorhinis Forward primer <400> 1 acttcggaga ccattgccta ag 22 <210> 2 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Mhyorhinis Reverse primer <400> 2 aaagctctca aaactagaca cgaa 24

Claims (4)

서열번호 1 및 서열번호 2 의 프라이머 쌍을 포함하는, 마이코플라즈마 하이오라이니스(Mycoplasma hyorhinis)를 검출하기 위한 프라이머. A primer for detecting Mycoplasma hyorhinis , comprising primer pairs of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2. 제 1 항에 있어서,
상기 마이코플라즈마 하이오라이니스를 검출하되, 종(species)에 특이적인 16s rRNA와 23s rRNA 사이 영역을 표적으로 하여 검출하는 것을 특징으로 하는 프라이머.
The method of claim 1,
Detecting the mycoplasma hyorainis, characterized in that by detecting the target region between the 16s rRNA and 23s rRNA specific to the species (species).
중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 마이코플라즈마 하이오라이니스 (Mycoplasma hyorhinis)를 검출하는 키트로서,
청구항 1 내지 2 중 한 항에 있는 프라이머를 포함하는, 마이코플라즈마 하이오라이니스 검출키트.
A kit for detecting Mycoplasma hyorhinis using polymerase chain reaction (PCR),
A mycoplasma hyorinis detection kit comprising the primers of claim 1.
중합효소연쇄반응(PCR)을 이용하여 돼지 유행성 폐렴(SEP)를 진단하는 키트로서,
청구항 1 내지 2 중 한 항에 있는 프라이머를 포함하는, 돼지 유행성 폐렴 진단키트.
A kit for diagnosing swine pandemic pneumonia (SEP) using polymerase chain reaction (PCR),
Porcine epidemic pneumonia diagnostic kit comprising the primer of any one of claims 1 to 2.
KR1020110083293A 2011-08-22 2011-08-22 Primer set for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer set, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer set KR101279395B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020110083293A KR101279395B1 (en) 2011-08-22 2011-08-22 Primer set for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer set, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer set

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020110083293A KR101279395B1 (en) 2011-08-22 2011-08-22 Primer set for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer set, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer set

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20130021023A true KR20130021023A (en) 2013-03-05
KR101279395B1 KR101279395B1 (en) 2013-06-27

Family

ID=48174064

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020110083293A KR101279395B1 (en) 2011-08-22 2011-08-22 Primer set for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer set, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer set

Country Status (1)

Country Link
KR (1) KR101279395B1 (en)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102766699A (en) * 2012-08-20 2012-11-07 江苏省农业科学院 Primers and probe for real-time fluorescent quantitative detection of mycoplasma hyorhinis
CN110904251A (en) * 2019-11-28 2020-03-24 温氏食品集团股份有限公司 Primer group and kit for detecting duck mycoplasma
KR102096025B1 (en) * 2018-11-19 2020-04-01 충북대학교 산학협력단 Primer set for loop-mediated isothemal amplification for toxin detecting of actinobacilus pleuropneumoniae and toxin detecting method of actinobacilus pleuropneumoniae using the same

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102766699A (en) * 2012-08-20 2012-11-07 江苏省农业科学院 Primers and probe for real-time fluorescent quantitative detection of mycoplasma hyorhinis
KR102096025B1 (en) * 2018-11-19 2020-04-01 충북대학교 산학협력단 Primer set for loop-mediated isothemal amplification for toxin detecting of actinobacilus pleuropneumoniae and toxin detecting method of actinobacilus pleuropneumoniae using the same
CN110904251A (en) * 2019-11-28 2020-03-24 温氏食品集团股份有限公司 Primer group and kit for detecting duck mycoplasma

Also Published As

Publication number Publication date
KR101279395B1 (en) 2013-06-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Jamal et al. Rapid identification of pathogens directly from blood culture bottles by Bruker matrix-assisted laser desorption laser ionization-time of flight mass spectrometry versus routine methods
KR20100044736A (en) A novel method for simultaneous detection and discrimination of bacterial, fungal, parasitic and viral infections of eye and central nervous system
KR101329114B1 (en) Primer for the detection of Mycoplasma hyopneumoniae, and kit and method for the detection of Mycoplasma hyopneumoniae by using the primer, and kit and method for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer
US20110287965A1 (en) Methods and compositions to detect clostridium difficile
KR101279395B1 (en) Primer set for the detection of Mycoplasma hyorhinis, kit for the detection of Mycoplasma hyorhinis by using the primer set, and kit for the diagnosis of porcine pneumonia by using the primer set
Greco et al. A multiplex-PCR for the diagnosis of contagious agalactia of sheep and goats
Ksiczyk et al. Application of routine diagnostic procedure, VITEK 2 compact, MALDI-TOF MS, and PCR assays in identification procedure of bacterial strain with ambiguous phenotype
KR20150092834A (en) Primer set for the multidetection of mycoplasma genus, method for the multidetection of mycoplasma genus by using the primer, and kit for the multidetection of mycoplasma genus
Liu et al. A rapid and sensitive loop-mediated isothermal amplification procedure (LAMP) for Mycoplasma hyopneumoniae detection based on the p36 gene
KR20070099208A (en) Std kit
Zendulkova et al. Detection of Mycoplasma agalactiae by Polymerase Chain Reaction in Jordanian sheep and goat herds
CN106544432A (en) A kind of drug resistance of Staphylococcus aureus and virulence method for quick and test kit
KR101279396B1 (en) Primer set for the detection of Mycoplasma, and method and kit for the detection of Mycoplasma by using the primer set
Benga et al. Specific detection and identification of [Actinobacillus] muris by PCR using primers targeting the 16S–23S rRNA internal transcribed spacer regions
KR20200123246A (en) Mycoplasma detection method using mitochondrial DNA as an internal reference sample
Asran et al. Identification and Molecular Analysis of Pasteurella Multocida Isolated from Rabbits.
KR20230137097A (en) Primer set for detecting Mycoplasma gallicepticum and detection method using the same
Shayegh et al. POTENTIAL OF PASTEURELLA MULTOCIDA ISOLATED FROM HEALTHY AND DISEASED CATTLE
KR101498176B1 (en) Primer set for the detection of mycoplasma pulmonis, and method and kit for the detection of mycoplasma pulmonis by using the primer set
Othman et al. Conventional and molecular detection of Pasteurella multocida in outbreak of respiratory tract infection of sheep and goats in Basrah Province
KR101395938B1 (en) Pcr diagnosis using specific primer for bacteria that cause diseases of allomyrina dichotoma
Ongor et al. Detection of mycoplasma species in turkeys by culture and polymerase chain reaction
JP2006061134A (en) Primer for detection of mycobacterium tuberculosis and method for detecting and identifying the same bacterium
KR100853263B1 (en) Oligonucleotide primer for detection of salmonella and campylobacter, diagnostic kits for rapid detection comprising them, and method for detecting foodborn intoxicative microbial using them
KR20160075943A (en) Primer for diagnosis of virus that cause diseases of allomyrina dichotoma and method for diagnosis using the same

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant
FPAY Annual fee payment

Payment date: 20160519

Year of fee payment: 4

FPAY Annual fee payment

Payment date: 20170518

Year of fee payment: 5

FPAY Annual fee payment

Payment date: 20180509

Year of fee payment: 6