KR20090015034A - 가용성 바이러스-특이적 t-세포 수용체의 조성물 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 바이러스 감염을 진단하는 방법 및 조성물 및 이러한 감염을 억제하는 방법을 기술한다. 상기 방법들은 HIV-1 또는 HCV에 특이적인 세포독성 T 세포 클론 유래의 T 세포 수용체 유전자 서열의 동정을 기초로 한다. HIV 및 HCV 병원체 제한적 HLA 클래스 I에 결합하는 가용성 T 세포 수용체 조성물을 동정 및 제작하였다.
Description
본 발명은 가용성 바이러스-특이적 T 세포 수용체 조성물에 관한 것이다.
바이러스 감염 예컨대 인간 면역결핍 바이러스(HIV) 예를 들어 HIV-I 감염 및 C형 간염 바이러스(HCV) 감염은 심각한 공중 보건 문제이다. 이러한 바이러스 감염으로 감염된 개체를 치료하기 위하여 현재 다수의 약물들이 사용되고 있는데, 예를 들어, 항레트로바이러스 약물로 역전사효소(RT) 억제제 및 프로테아제 억제제(PI)가 포함된다. 이러한 제제들이 HIV 감염을 치료하는데 유효하였지만, 약물 내성주의 발생 및 바이러스의 약물 독성 누적이 문제가 되고 있다.
-본 발명의 요약-
본 발명은 바이러스 감염의 진단 및 치료를 위한 방법 및 조성물을 특징으로 한다. 상기 방법은 HIV-1 또는 HCV에 특이적인 세포독성 T 세포 클론 유래의 T 세포 수용체 유전자 서열의 동정을 기초로 한다. 따라서, 본 발명은 단리된 T 세포 수용체 유전자 및 HIV-1 또는 HCV의 세포독성 T 세포 에피토프에 특이적으로 결합하는 가용성 T 세포 수용성 폴리펩티드 또는 단백질을 코딩하는, 유전자에 의해 코딩되는 폴리펩티드를 포함한다.
상기 에피토프는 세포 표면 상의 HLA 분자 등과 같은 클래스 I MHC(major histocompatibility complex) 항원과 연관된 짧은, 8 내지 11-mer 펩티드로 구성되거나 이를 포함한다. 이 에피토프는 천연적으로 발생하는 HIV 또는 HCV 단백질에 상응하거나 또는 그로부터 유래하는 폴리펩티드 서열을 함유한다.
상기 T 세포 수용체 유전자는 T 세포 수용체의 알파 사슬 및 T 세포 수용체의 베타 사슬 둘 다를 코딩한다. TCR 알파 사슬 및 TCR 베타 사슬 양자는 불변 영역(C 영역), 가변 영역(V 영역) 및 상보성 결정 3 영역(CDR 3) 영역을 포함하거나 이로 구성된다. CDR3 영역은 항원성 펩티드/MHC 클래스 I 복합체와의 상호작용을 매개하고 체세포 재조합을 통해 생성된 1 내지 90 뉴클레오티드의 무작위 서열로 이루어진다. 이들 유전자 서열은 시험관 내 진단 용도 및 생체 내 치료 용도로 사용되는 재조합 HIV-1 또는 HCV-특이적 가용성 TCR 수용체 분자를 제작하는데 사용된다. 예를 들어, 이들 가용성 TCR은 시험관 내 분석에서 환자 유래 조직 또는 체액 샘플 중 HIV-1 또는 HCV 세포독성 T 세포 에피토프 존재를 검출하기 위한 염색 시약으로서 사용할 수 있다. 선택적으로, 가용성 T 세포 수용체 폴리펩티드는 검출가능한 마커 예컨대 형광 분자와 연합될 수 있다. 검출가능한 마커는 진단 방법을 용이하게 하도록 수용체 폴리펩티드에 연결되거나 접합된다. 또한, 가용성 단일 사슬 HLA 클래스 I-제한적 T 세포 수용체 폴리펩티드 다수를 고상 지지체 예컨대 칩 또는 플레이트 상에 고정화시킨다. 예를 들어, 프로세싱된 바이러스 에피토프를 검출 및 동정하기 위해서 마이크로어레이 판형에 TCR을 배열시킨다. 치료 목적을 위해서, 세포독성 분자 또는 사이토카인을 TCR에 연결시키거나 또는 연합시킨다.
바람직한 가용성 TCR 구성체는 TCR α, β 사슬쌍에 상응하는 하기의 서열을 포함한다: Vb 서열 CASSQGVTLLN(서열 번호 4) 및 Va5 서열 CAETY(서열 번호 6). 이 가용성 TCR은 HLA 클래스 I 분자 A2에 있어서 서열 번호 5(HIV-1 vpr)의 에피토프 특이성을 갖는다. TCR 서열의 유도체가 또한 본 발명의 범주에 속한다. 유도체 TCR은 하기 표 1에 도시한 HLA 클래스 I 제한적 에피토프에 대한 고도의 결합 친화성으로 특징된다. 예를 들어, 기준 서열 서열 번호 4 및 서열 번호 6에 대한 유도체 가용성 TCR 구성체는 1, 2, 3, 4 또는 그 이상의 보존성 또는 비보존성 아미노산 치환을 포함할 수 있고 원래 기준 서열을 함유하는 구성체와 비교하여 증가된 에피토프에 대한 결합 친화성을 특징으로 한다. HCV에 대한 에피토프 결합 특이성을 갖는 바람직한 가용성 TCR 구성체는 TCR α,β 사슬쌍에 상응하는 서열을 포함한다: Va 서열CAVNEYGQNFV(서열 번호 27) 및 Vb 서열 CAWSGGLNTEAF(서열 번호 29). 이 가용성 TCR 구성체는 HLA 클래스 I 분자 A2에 대해서도 존재하는 HCV 펩티드인, 서열 번호 28의 에피토프 결합 특이성을 갖는다. 이들 및 다른 TCR 서열을 비롯하여 이들의 결합 특이성 및 HLA 제한성을 하기 표 1에 도시하였다.
"실질적으로 순수한"은 천연적으로 수반되는 성분들과 분리된 핵산, 폴리펩티드 또는 다른 분자를 의미한다. 대체로, 폴리펩티드는 천연적으로 연합된 단백질 및 천연 발생 유기 분자없이 60 중량%, 70 중량%, 80 중량%, 90 중량%, 95 중량%, 또는 99 중량%일 때 실질적으로 순수하다. 예를 들어, 실질적으로 순수한 펩티드는 화학 합성을 통해서 또는, 정상적으로 그 단백질을 발현하지 않는 세포 내 재조합 핵산의 발현을 통해서, 또는 천연 공급원으로부터 추출을 통해서 얻을 수 있다. 단백질의 단리 단편은 전체 서열보다는 작고, 천연 발생된 측접 영역을 함유하지 않는 기준 단백질 서열의 일부를 갖는 펩티드를 의미한다. 단리 폴리펩티드는 천연 발생 분자의 기준 단편에 바로 가까이 측접한 하나 이상의 아미노산이 결여되어 있다.
특정 폴리펩티드 또는 핵산 분자가 정해진 길이의 기준 폴리펩티드 또는 핵산 분자에 대해 특정한 비율의 동일성을 갖는다고 하는 경우, 동일성 비율은 기준 폴리펩티드 또는 핵산 분자에 대한 것이다. 따라서, 100 아미노산 길이인 기준 폴리펩티드에 대한 동일성이 50%인 펩티드는 기준 폴리펩티드의 50 아미노산 길이 부분에 대해 완전하게 동일한 50 아미노산 폴리펩티드일 수 있다. 또한 그 전체 길이에 걸쳐서 기준 폴리펩티드에 대한 동일성이 50%인 100 아미노산 길이 폴리펩티드일 수도 있다. 핵산 분자에 대해서도 동일한 법칙이 적용된다.
폴리펩티드에 있어서, 기준 폴리펩티드 서열의 길이는 일반적으로 5 아미노산 이상의 길이이다. 예를 들어, 펩티드는 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 아미노산 길이이다. 일부 경우에서, 펩티드는 예를 들어, 15, 20, 25 아미노산 이상의 길이로 보다 클 수 있다. 예를 들어, 특정 서열, 예컨대 에피토프 서열의 펩티드는 천연 발생 단백질에서 그 서열에 측접하는 아미노산과는 상이한 다른 아미노산이 측접한다. 핵산의 경우에서, 기준 핵산 서열의 길이는 일반적으로 15, 20, 또는 25 뉴클레오티드 이상의 길이이다. 그러나, 보다 큰 구성체, 예를 들어, 50 뉴클레오티드 이상, 바람직하게는 60 뉴클레오티드 이상, 보다 바람직하게는 75 뉴클레오티드 이상, 가장 바람직하게는 100 뉴클레오티드 또는 300 뉴클레오티드인 것일 수 있다.
본 발명은 또한 TCR 서열 또는 에피토프 서열에 상응하는 유도체 펩티드를 포함한다. 기준 서열에 대한 동일성이 100%보다 낮은 폴리펩티드 서열의 경우에서, 비동일 위치는, 필수적인 것은 아니며, 바람직하게는 기준 서열에 대한 보존 치환이다. 보존 치환은 대체로 하기 군내에서의 치환을 포함한다: 글리신 및 알라닌; 발린, 이소류신 및 류신; 아스파르트산 및 글루탐산; 아스파라긴 및 글루타민; 세린 및 트레오닌; 리신 및 아르기닌; 및 페닐알라닌 및 티로신. 기준 서열에 대해서 아미노산 치환이 이루어진 펩티드에서, HLA-제한적 에피토프에 대한 T 세포 수용체의 결합 친화성이 증가한다. 대안적으로, 유도체 서열을 포함하는 구성체는 높은 안정성, 예를 들어 생리적 허용 용액 예컨대 배양 배지 또는 체액 예컨대 혈액, 혈장 또는 혈청 등에서의 높은 반감기를 갖는다. 예를 들어, 이러한 유도체 펩티드의 결합 친화성 및/또는 안정성은 기준 펩티드 서열에 대하여 적어도 5%, 10%, 25%, 50%, 75%, 90%, 100%, 2배, 5배, 10배, 20배, 또는 그 이상이다. 선택적으로 유도체 펩티드 서열은 서열의 아미노 말단부 및/또는 카르복시 말단부 상에서 기준 서열에 측접하는 추가 아미노산을 포함한다. 상기 기술한 바와 같이, 비천연 발생 측접 서열을 함유하는 이러한 구성체는 증가된 에피토프 결합 친화성 및/또는 증가된 안정성을 갖는 것을 특징으로 한다. 이러한 유도체 펩티드 서열을 코딩하는 핵산 서열은 본 발명에 포함된다.
단리 또는 정제된 핵산 분자는 유기체의 천연 발생 게놈에서 바로 가까이 인접하는 5' 및 3' 코딩 서열 또는 비코딩 서열로부터 분리된 것이다. 단리 핵산 분자는 천연 발생된 것이 아닌 핵산 분자, 예를 들어, 재조합 DNA 방법으로 생성한 핵산 분자를 포함한다. 본 발명에서 동정한 핵산은 기준 서열에 대한 동일성이 85%, 90%, 95%, 98%, 99% 이상이고 기준 핵산 서열의 축퇴성 변이체인 서열을 포함한다.
본 발명의 다른 특징 및 장점은 하기의 본 발명의 바람직한 구체예의 상세한 설명 및 청구항을 통해서 자명해질 것이다. 본 발명에서 인용한 참조 문헌의 전체 내용을 참조하여 포함시킨다.
-본 발명의 상세한 설명-
한정된 MHC 클래스 I 제한적 세포독성 T 세포 에피토프를 인식하는 HIV-I-특이적 또는 HCV-특이적 세포를 제한 희석 클로닝을 통해 단리하였다. 클로닝된 세포를 개별 에피토프성 펩티드로 재폴딩된 MHC 클래스 I 사량체로 염색하고, 사량체 결합 세포를 FACS ARIA 장치를 이용하여 분류하였다. 분류된 세포의 mRNA를 추출하고, 역전사하였으며 TCR 유전자의 cDNA를 네스티드 PCR을 통해 증폭시켰다. PCR 생성물은 E.coli를 형질전환시키는데 사용되는 클로닝 벡터에 결찰시켰다. 박테리아 증폭 후, 표준 과정에 따라서 벡터 삽입물을 정제 및 서열분석하였다. 하기 TCR의 서열이 동정되었다.
[표 1] TCR 서열
[표 2] TCR을 코딩하는 뉴클레오티드 서열
병원체 특이적 가용성 TCR 구성체
HIV-1 감염된 세포 표면 상의 MHC 클래스 I 분자에 결합된 HIV-1 세포독성 T 세포 에피토프를 특이적으로 인식하는 분자 화합물은 생체내 면역 치료적 접근법에서 감염 세포의 직접 표적화를 위한 강력한 도구이다. 또한, 이들 화합물은 자연 감염 동안 전문적인 항원 제시 세포 또는 림프구 상에 제시된 HIV-1 항원의 생체 외 진단 평가법에서 사용된다. 동종 MHC 복합체에 특이적으로 결합하는 가용성, 단일 사슬 α/β T 세포 수용체 구성체는 HIV-1 감염된 세포의 생체외 또는 생체 내 직접 표적화를 위해 가장 유망한 분자일 수 있다. 특정 병원체를 인식하는 가용성 TCR의 아미노산 서열은 천연 발생 TCR의 서열을 기초로 한다. 이러한 개시 전에, HIV-1 또는 HCV에 특이적인 천연 발생 TCR의 TCR 서열에 대해서는 매우 제한된 정보만이 이용가능하였다. 본 발명에서 개시한 데이타는 진단 및 치료 용도로 사용하기 위한 가용성 TCR의 제작에 사용되는 HIV-1 또는 HCV 특이적 TCR 유전자의 서열을 밝혔다.
현재, HIV-1 감염된 세포의 직접 표적화에 대해 재조합 HIV-1 특이적 항체를 이용할 수 있다. 항체 접근법의 단점 하나는 HIV-1 바이러스의 외피(envelope) 만이 HIV-1 항체에 대해 접근가능한 반면, 기능적으로 가장 중요한 HIV 단백질은 외피 내부에 숨어있고 세포 내 프로세싱 및 MHC 클래스 I 또는 II 분자에 의해 제시된 이후 면역계에 대해서만 접근가능하다. MHC 분자에 의해 제시되면, 이들 HIV 유전자 생성물은 TCR에 의해 인식되지만, 항체에 의해서는 인식되지 않는다. 따라서, HIV-1 항체는 HIV-1 감염된 세포의 매우 제한된 표적화만이 가능하다. 본 발명에서 기술한 조성물은 이러한 문제에 대한 해결책을 제공한다.
HIV-1 또는 HCV에 특이적인 가용성 TCR은 현행 접근법에 비해 상당한 장점을 갖는다.
천연 발생 HIV-1 특이적 CD8+ T 세포 클론의 TCR 알파 사슬 및 베타 사슬의 완전한 서열을 동정하였다. HIV-1 또는 HCV 특이적 CD8+ T 세포의 이들 TCR 서열이 현재 동정되었다.
TCR 서열은 HIV-1 감염된 세포를 특이적으로 인식할 수 있는 재조합 단일 사슬 TCR의 생산에 유용하다. 이들 재조합 TCR은 실제로 (i) 면역치료적 접근법에서 HIV-1 감염된 세포의 생체 내 표적화, (ii) 림프구 또는 전문적 항원 제시 세포 상의 HIV-1 항원 발현의 생체 외 평가를 위해 사용된다. HIV-1 항원 발현의 정량 분석은 HIV-1 면역발병 연구에서 중요하고 면역치료적 치료법의 생체 외 모니터링에 유용하다.
현재, HIV-1 감염된 환자의 치료는 항레트로바이러스 약물 사용을 기반으로 한다. 이들 약물은 매유 효과적이지만, 누적 독성을 가지고 있고, 알약 부담이 높고 바이러스 내성을 일으킬 수 있다. 따라서, 이들 환자에 대한 다른 치료 선택법이 계속적으로 요구되고 있다. 가용성 TCR을 이용한 면역 치료적 치료법은 HIV-1 또는 HCV 감염된 환자 집단에 대한 대안적인 치료 선택권을 제시한다. 또한, TCR은 HIV-1 항원 발현의 생체 외 평가법에 사용된다.
진단 방법
가용성 TCR은 전문적인 항원 제시 세포 상에서 세포독성 T 세포 에피토프 제시의 HLA 클래스 I-매개성 제시를 분석하는데 사용된다. 예를 들어, 체액, 예컨대 혈액 또는 체조직, 예컨대 림프절 등의 샘플을 개체로부터 얻는다. 샘플 유래의 백혈구를 본 발명에서 기술한 단일 사슬 TCR과 접촉시킨다. 감응성을 증가시키기 위해서, 4개의 단일 사슬 TCR 구성체를 예를 들어 중심 스트렙타비딘과 함께 연결하여서 사량체 복합체를 형성시킨다. 이 구성체는 검출가능한 마커에 연결시킬 수 있으며, 예를 들어, 형광물질 형광단으로 표지화한다. 검출가능한 마커는 형광색소 예컨대 파이코에리트린(PE), 플루오레세인 이소티오시아네이트(FITC) 및 알로파이코시아닌(APC) 등을 포함한다. 검출은 유세포 측정법 및/또는 조직 염색법(면역조직화학법)을 통해 수행한다. 다른 예에서, 다수의 TCR 구성체를 마이크로어레이, 예컨대 칩 또는 플레이트에 고정화시키고, 환자 유래 샘플을 이 어레이와 접촉시키고, 어레이를 세정하여 결합된 세포를 검출한다. 이러한 방식으로, 환자의 항원 제시 세포 상에 발현되거나 제시된 펩티드를 확인한다. 따라서, 가용성 TCR은 또한 HIV-1 또는 HCV CTL 에피토프 제시의 생체 외 평가 및 정량을 위한 연구 도구로서 유용하다. 이들은 특이적 HIV-1 또는 HCV CTL 에피토프를 발현하는 환자를 확인하기 위해 유용한 도구이고, 따라서 본 발명에서 기술한 면역치료적 매개법을 위해 유망한 후보물이다.
치료 방법
HCV 또는 HIV로 감염된 환자를 치료하기 위해서, 가용성 단일 사슬 TCR 구성체 하나 또는 그 혼합물을 투여한다. TCR은 제2 조성 예컨대 사이토카인, 예를 들어 인터루킨-2, 인터페론-감마, 인터페론-알파 또는 세포독성 시약 예를 들어 퍼포린, 그랜자임 또는 특수약물에 접합된다. HCV 치료를 위해서, 가용성 단일 사슬의 HCV 특이적 TCR은 선택적으로 인터페론 예를 들어, 인터페론 알파에 접합되거나 연결된다. 이러한 구성체의 장점 중 하나는 반감기가 증가하고 이들 시약을 감염된 세포로 직접 항원-특이적 전달한다는 것이다. 이러한 치료 전략은 총 약물 용량, 투약 빈도 및 치료와 관련된 부작용을 줄인다.
TCR 구성체는 표적 집단의 유전적 특징(예를 들어, 특정 HLA 형의 우세)을 기초로 선택된다. 예를 들어, 특정 집단에서 가장 빈번하게 발생하는 HLA 클래스 I 분자에 의해 제한되는 세포독성 T 세포 에피토프의 레파토리를 인식하는 가용성 TCR의 풀을 사용한다. 다르게는, 특정 환자의 HLA형을 결정하고 환자의 HLA를 기초로 투여를 위한 하나 이상의 HLA 특이적 TCR을 선택한다.
비경구 투여, 예컨대 정맥 내, 피하, 근육내 및 복막 내 전달 경로를 이용하여 가용성 TCR 구성체를 전달할 수 있다. 예를 들어, 가용성 TCR은 동물 당 32 ㎍의 용량으로 마우스에게 정맥 내 투여하였다. 환자 용량의 결정은 당분야의 공지 방법을 이용하여 수행한다.
조성물은 바이러스 병원체를 억제하기 위해 투여된다. 특정한 상황에 대해 적당한 용량 및 투여 방침을 결정하는 것은 당분야의 당업자에게 공지이다. 치료 화합물의 유효량은 바람직하게 약 0.1 mg/kg∼약 150 mg/kg이다. 당분야의 당업자가 인지하는 유효 용량은 투여 경로, 부형제 사용 및 다른 제제 또는 치료제의 사용을 비롯한 다른 치료 요법과의 공동 투여 등에 따라 다양하다. 치료 방침은 표준 방법을 이용하여 바이러스 병원체에 의한 감염을 앓고 있는(또는 진행할 위험이 있는) 포유류 예를 들어, 인간 환자를 확인하여 수행한다. 약학 화합물은 당분야의 공지 방법을 이용하여 이러한 개체에게 투여한다. 바람직하게, 화합물은, 경구, 직장, 비강, 국소 또는 비경구, 예를 들어 피하, 복막 내, 수막강 내, 근육 내 및 정맥 내 투여된다.
다른 구체예
본 발명을 상기 상세한 설명과 함께 기술하였지만, 상기 설명은 예를 들고자 하는 것이고, 첨부된 청구항의 범위로 정해지는 본 발명의 범주를 한정하려는 것이 아니다. 다른 측면, 장점 및 별법은 하기 청구항의 범주 내에 속한다.
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<211> 11
<212> PRT
<213> Human Immunodeficiency Virus
<400> 17
Lys Ala Phe Ser Pro Glu Val Ile Pro Met Phe
1 5 10
<210> 18
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 18
Cys Ala Met Ser Ala Gln Gln Ala Gly Thr Ala Leu Ile
1 5 10
<210> 19
<211> 9
<212> PRT
<213> Human Immunodeficiency Virus
<400> 19
Ser Glu Gly Ala Thr Pro Gln Asp Leu
1 5
<210> 20
<211> 12
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 20
Cys Ala Ser Ser Leu Val Ile Met Ser Glu Gln Tyr
1 5 10
<210> 21
<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 21
Cys Ala Ala Thr Ser Gly Tyr Ala Leu Asn
1 5 10
<210> 22
<211> 8
<212> PRT
<213> Human Immunodeficiency Virus
<400> 22
Glu Ile Tyr Lys Arg Trp Ile Ile
1 5
<210> 23
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 23
Cys Ala Ser Ser Val Gln Gly Glu Phe Arg Glu Lys Leu Phe
1 5 10
<210> 24
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 24
Cys Ala Gly Arg Asp Tyr Lys Leu Ser
1 5
<210> 25
<211> 9
<212> PRT
<213> Human Immunodeficiency Virus
<400> 25
Lys Glu Lys Gly Gly Leu Glu Gly Leu
1 5
<210> 26
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 26
Cys Ser Ala Arg Gly Asp Asn Pro Asn Thr Glu Ala Phe
1 5 10
<210> 27
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 27
Cys Ala Val Asn Glu Tyr Gly Gln Asn Phe Val
1 5 10
<210> 28
<211> 9
<212> PRT
<213> Hepatitis C Virus
<400> 28
Ala Leu Tyr Asp Val Val Thr Lys Leu
1 5
<210> 29
<211> 12
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 29
Cys Ala Trp Ser Gly Gly Leu Asn Thr Glu Ala Phe
1 5 10
<210> 30
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 30
Cys Ala Ser Ser Val Arg Thr Gly Glu Leu Phe
1 5 10
<210> 31
<211> 10
<212> PRT
<213> Human Immunodeficiency Virus
<400> 31
Gln Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys
1 5 10
<210> 32
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 32
Cys Ala Ala Ser Phe Thr Gln Asn Gly Leu Thr
1 5 10
<210> 33
<211> 15
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 33
Cys Ala Ser Ser Glu Arg Asp Ser Gln Tyr Gln Glu Thr Gln Tyr
1 5 10 15
<210> 34
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 34
Cys Ala Ala Ser Phe Thr Gln Asn Gly Leu Thr
1 5 10
<210> 35
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 35
Cys Ala Ser Ser Pro Val Leu Tyr Glu Gln Tyr
1 5 10
<210> 36
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 36
Cys Ala Val Val Ala Gln Gly Gly Ser Glu Lys Leu Val
1 5 10
<210> 37
<211> 16
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 37
Cys Ala Ser Ser Ala Arg Ala Phe Pro Glu Gly Asn Gln Pro Gln His
1 5 10 15
<210> 38
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 38
Cys Ala Val Val Ala Gln Gly Gly Ser Glu Lys Leu Val
1 5 10
<210> 39
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 39
Cys Ala Ser Ser Glu Thr Asn Arg Val Met Glu Ala Phe
1 5 10
<210> 40
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 40
Cys Ala Val Ser Asp Pro Gly Phe Lys Thr Ile
1 5 10
<210> 41
<211> 15
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 41
Cys Ala Thr Ser Ala Gly Arg Gln Arg Asp Thr Gly Glu Leu Phe
1 5 10 15
<210> 42
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 42
Cys Ala Val Ser Asp Pro Gly Phe Lys Thr Ile
1 5 10
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<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 43
Cys Ala Ser Ser Asn Gly Tyr Glu Gln Tyr
1 5 10
<210> 44
<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 44
Cys Ala Tyr Arg Ser Asp Asn Asp Met Arg
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<211> 10
<212> PRT
<213> Hepatitis C Virus
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Lys Leu Val Ala Leu Gly Ile Asn Ala Val
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<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 46
Cys Ala Thr Ser Ser Gln Asp Gly Gln Val Tyr Glu Gln Tyr
1 5 10
<210> 47
<211> 12
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 47
Cys Ala Ser Tyr Lys Ala Ala Gly Asn Lys Leu Thr
1 5 10
<210> 48
<211> 9
<212> PRT
<213> Hepatitis C Virus
<400> 48
Gly Pro Arg Leu Gly Val Arg Ala Thr
1 5
<210> 49
<211> 635
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(8)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (25)..(26)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (624)..(627)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (634)..(635)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 49
nnnnnnnngn nnnnnntcgc ccttnncagt ggttcaacgc agagtacgcg ggggggagac 60
atcctctcta gccccaactg tgccatgact atcaggctcc tctgctacat gggcttttat 120
tttctggggg caggcctcat ggaagctgac atctaccaga ccccaagata ccttgttata 180
gggacaggaa agaagatcac tctggaatgt tctcaaacca tgggccatga caaaatgtac 240
tggtatcaac aagatccagg aatggaacta cacctcatcc actattccta tggagttaat 300
tccacagaga agggagatct ttcctctgag tcaacagtct ccagaataag gacggagcat 360
tttcccctga ccctggagtc tgccaggccc tcacatacct ctcagtacct ctgtgccagc 420
agtaatggat acgagcagta cttcgggccg ggcaccaggc tcacggtcac agaggacctg 480
aaaaacgtgt tcccacccga ggtcgctgtg tttgagccat cagaagcaga gatctcccac 540
accaagggcg aattcgttta aacctgcagg actagtccct ttagtgaggg ttaattctga 600
gcttggcgta atcatggtca tagnnnnttt cctnn 635
<210> 50
<211> 715
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(7)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)..(18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (27)..(29)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (690)..(690)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (703)..(707)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (712)..(715)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 50
nnnnnnnggn nnnnnnantc gcccttnnna gtggtatcaa cgcagagtac gcggggagaa 60
gaggaggctt ctcaccctgc agcagggacc tgtgagcatg gcatgccctg gcttcctgtg 120
ggcacttgtg atctccacct gtcttgaatt tagcatggct cagacagtca ctcagtctca 180
accagagatg tctgtgcagg gggcagagac cgtgaccctg agctgcacat atgacaccag 240
tgagagtgat tattatttat tctggtacaa gcagcctccc agcaggcaga tgattctcgt 300
tattcgccaa gaagcttata agcaacagaa tgcaacagag aatcgtttct ctgtgaactt 360
ccagaaagca gccaaatcct tcagtctcaa gatctcagac tcacagctgg gggatgccgc 420
gatgtatttc tgtgcttata ggagcgacaa tgacatgcgc tttggagcag ggaccagact 480
gacagtaaaa ccaaatatcc agaaccctga ccctgccgtg taccagctga gagactctaa 540
atccagtgac aagtctgtct gcctattcac cgattttgat tctcaaacaa atgtgtcaca 600
aagtaaggat tctgatgtgt ataagggcga attcgtttaa acctgcagga ctagtccctt 660
tagtgagggt taattctgag cttggcgtan tcatggtcat agnnnnnttt cnnnn 715
<210> 51
<211> 658
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(14)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (16)..(18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (647)..(649)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (652)..(655)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (657)..(658)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 51
nnnnnnnnnn nnnncnnntc gcccttaagc agtggtatca acgcagagta cgcggggaga 60
gctggaaaca cctccatcct gcctcttcat gccatggcct ccctgctctt cttctgtggg 120
gccttttatc tcctgggaac agggtccatg gatgctgatg ttacccagac cccaaggaat 180
aggatcacaa agacaggaaa gaggattatg ctggaatgtt ctcagactaa gggtcatgat 240
agaatgtact ggtatcgaca agacccagga ctgggcctac ggttgatcta ttactccttt 300
gatgtcaaag atataaacaa aggagagatc tctgatggat acagtgtctc tcgacaggca 360
caggctaaat tctccctgtc cctagagtct gccatcccca accagacagc tctttacttc 420
tgtgccacca gttcccagga cgggcaagtc tacgagcagt acttcgggcc gggcaccagg 480
ctcacggtca cagaggacct gaaaaacgtg ttcccacccg aggtcgctgt gtttgagcca 540
tcagaagcag agatctccca caccaagggc gaattcgttt aaacctgcag gactagtccc 600
tttagtgagg gttaattctg agcttggcgt aatcatggtc atagctnnnt tnnnngnn 658
<210> 52
<211> 715
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)..(18)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (31)..(31)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (700)..(700)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (703)..(705)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (707)..(708)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (710)..(715)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 52
nnnnnnnnnn nnncnncnaa ttcgccctta ngcagtggta tcaacgcaga gtacgcgggg 60
gtttttctgc tgtgggtacg tgagcaggaa acatggagaa gaatcctttg gcagccccat 120
tactaatcct ctggtttcat cttgactgcg tgagcagcat actgaacgtg gaacaaagtc 180
ctcagtcact gcatgttcag gagggagaca gcaccaattt cacctgcagc ttcccttcca 240
gcaattttta tgccttacac tggtacagat gggaaactgc aaaaagcccc gaggccttgt 300
ttgtaatgac tttaaatggg gatgaaaaga agaaaggacg aataagtgcc actcttaata 360
ccaaggaggg ttacagctat ttgtacatca aaggatccca gcctgaagac tcagccacat 420
acctctgtgc ctcctacaaa gctgcaggca acaagctaac ttttggagga ggaaccaggg 480
tgctagttaa accaaatatc cagaaccctg accctgccgt gtaccagctg agagactcta 540
aatccagtga caagtctgtc tgcctattca ccgattttga ttctcaaaca aatgtgtcac 600
aaagtaagga ttctgatgtg tataagggcg aattcgttta aacctgcagg actagtccct 660
ttagtgaggg ttaattctga gcttggcgta atcatggtcn tannntnntn nnnnn 715
<210> 53
<211> 812
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(10)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (12)..(15)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (17)..(19)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (22)..(22)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (32)..(32)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (722)..(722)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (744)..(746)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (783)..(783)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (796)..(801)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (810)..(810)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (812)..(812)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 53
nnnnnnnnnn gnnnncnnnt cncccttata cncatcagaa tccttacttt gtgacacatt 60
tgtttgagaa tcaaaatcgg tgactaggca gacagacttg tcactggatt tagagtctct 120
cagctggtac acggcagggt cagggttctg gatatagggc agcacggaca atctggttcc 180
gggaccaaag acaaaattct gaccatactc attcacggca cagaagtact cagctgtgtc 240
actccactgc acagagggtt tcctcagatt aaaggagaat ttactcttta taaattcagc 300
ctcaaagccc ttgatgcctt taaccagtgg atcccctgaa aagtacttga ggagaagctg 360
aaggtgttga ccagggtact ggacatacca gaagagatta acagttccac cgtaggaata 420
gttgcatccc aactccagtg aggctgcttc agagagaatt acgtggtggt tatgctggct 480
cacagactgg gctctggcat ctctcagggc aaaaatcatc cccagcactg gtatgagcaa 540
caggagcatg gctgagctgt ggaaacactg caagcgtctc tttggaaatt ctcctcgggg 600
ccagtaggaa agtggctgga acccaggtct tgagaatagc gagcgtgagg aaggttgggc 660
taggcaagtc tcttgttttg gtaagaatcc ccgcgtactc tgcgttgata ccactgctta 720
anggcgaatt cgtttaaacc tgcnnnacta gtccctttag tgagggttaa ttctgagctt 780
ggngtaatca tggtcnnnnn ntgttttccn gn 812
<210> 54
<211> 677
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(15)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(35)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (665)..(668)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (670)..(671)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (677)..(677)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 54
nnnnnnnnnn nnnnntcgcc cttggtgtgg gannnctctg cttctgatgg ctcaaacaca 60
gcgacctcgg gtgggaacac cttgttcagg tcctctacaa ctgtgagtct ggtgccttgt 120
ccaaagaaag cttcagtgtt caggcctccc gaccaggcac agagatagaa gccagagtca 180
ctgagaagga gcttcttaga actcaggatg aactgccggt cctggggtct ggaggctgag 240
agattctggg gcacctcaga gctgatctgg ccaataccaa cggagtagaa gagcagctgg 300
aggcccctgc ctgcagcctg tcggtaccag tataggttgg ggtttgatgt tccctccaca 360
gtgcactcca gagagagcgg gctgcccaca ggctgcacca gggtcgctgg ccattgatga 420
atagtctgag atctgacccc aaagaaagtg cccaggagaa gggcaaggag agagcagagc 480
atcatccaag ccagcctttc cttcagctag tctgggggac agacgcctcc tcttctgggc 540
cagtgatgtg gccaggcaca ccagtgtggc ccgcgtactc tgcgttgata ccactgctta 600
agggcgaatt cgcggccgct aaattcaatt cgccctatag tgagtcgtat tacaattcac 660
tggcnnnncn nttttan 677
<210> 55
<211> 695
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (683)..(683)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (685)..(685)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (688)..(688)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (695)..(695)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 55
nnnnnnnnnn nnncgccctt atacacatca gaatccttac tttgtgacac atttgtttga 60
gaatcaaaat cggtgaatag gcagacagac ttgtcactgg atttagagtc tctcagctgg 120
tacacggcag ggtcagggtt ctggatatgg ggtgtgacca acagcgaggt gcctttgccg 180
aagttgagtg catacccgga cgttgctgca cagaagtaga cagccgagtc ttcaggttgg 240
gtctctgtga tgtgcaggga gaaatgtttg gctgtcttgt tcaatgtaac agcaattcgt 300
tggtctttct tttcgcccac atttgaacga atgtctataa taagctgagg tctttttcca 360
agttcttgct tataccaagg gaagtagttt gaggcactgt ctgaataagt acacttgata 420
acagcgctgt ctccctcctg gacactcagg gttgaaggat gctgctccac attctctcca 480
ttcaccaagt ccagctgcag ccacaggaat ataaatacag ctcgaatgga tgtcatcctt 540
gttcttccca attaagatca gtcattgacc tgcaacctcc agttatcccc gcgtactctg 600
cgttgatacc actgcttaag ggcgaattcg cggccgctaa attcaattcg ccctatagtg 660
agtcgtatta caattcactg gcntnccntt tttan 695
<210> 56
<211> 655
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(33)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (35)..(35)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (639)..(643)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (652)..(655)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 56
nnnnnnnnnn nnnnnncgcc cttggtgtgg gananctctg cttctgatgg ctcaaacaca 60
gcgacctcgg gtgggaacac cttgttcagg tcctccaaga cagagagctg ggttccactg 120
ccaaaaaaca gtttttctct aaactccccc tgtacgctgc tggcacagaa atacaaagct 180
gagtccccca gctccagaga gctcaggttt agttcagagt gcaagtcagg gaactgttgt 240
gcggagaatc gttcaagaat gtttcctttt gctctctctt ctccattata atactgaatg 300
aggaactgga ggccctggtc caggctctgt tggtaccagt acacagagag gtctccagac 360
ctaggggagc atctcagcgt cactcgctgt ccagttgctg tgatcaggtg ctttggggtt 420
tgtgtgactc cagaatccac tgggcctgct cccaggagac aaaaggccac acagcagagg 480
agcctgaagc ccatggcagg atctcctagc ttggggctgg tgtctctgta gtaagcattc 540
tccccgcgta ctctgcgttg ataccactgc ttaagggcga attcgcggcc gctaaattca 600
attcgcccta tagtgagtcg tattacaatt cactggccnn nnntttttac annnn 655
<210> 57
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
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<222> (1)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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nnnnnnnnnn nnncgccctt atacacatca gaatccttac tttgtgacac atttgtttga 60
gaatcaaaat cggtgaatag gcagacagac ttgtcactgg atttagagtc tctcagctgg 120
tacacggcag ggtcagggtt ctggatattt gctcttacag ttactgtggt tccggctcca 180
aagctgagct tgtagtcgcg tcctgcacag aggtagaggc ctgtatcacc aggctgggcc 240
gcagtgatgt ggagagaact gtcctttctt gcatcaccaa actgaaaggt tagtctcttc 300
agcttcttca cttctccacc cgtaactact gtcaccagga ggacaggacc ttccccaggc 360
tcctgtctgt accattgtaa gctggaaaaa acacttgagg agttgcagta cacagtgaga 420
ttttctccct cttggatgct tagaaactga gggctctgct ccagcagctg ggtgctcacc 480
catgccaact gaatccaaag aatggacacg gagaatttca ggaccatctt gtctttctat 540
cacatggtgg acatggcccc tgactttagc tgctcctgaa agagcccgtc ctggaacana 600
cttctctgnn ctanaanant gcttgctgcc acccactttg agttccatan aaagcccccc 660
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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<220>
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<220>
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<222> (14)..(15)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<222> (17)..(17)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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nnnnnnnggn nncnnantcg cccttangca gtggtatcaa cgcagagtac gcggtaagca 60
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tcaggccaca actatgtttt ggtatcgtca gttcccgaaa cagagtctca tgctgatggc 300
aacttccaat gagggctcca aggccacata cgagcaaggc gtcgagaagg acaagtttct 360
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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<220>
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<222> (674)..(678)
<223> n is a, c, g, or t
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nnnnnnnnnn nncgccctta tacacatcag aatccttact ttgtgacaca tttgtttgag 60
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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nnnnnnnnnn nnnnncgccc ttggtgtggg aganctctgc ttctgatggc tcaaacacag 60
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<211> 678
<212> DNA
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<223> n is a, c, g, or t
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nnnngnncnn antcgccctt nagcagtggt atcaacgcag agtacgcggg gaagaatgat 60
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gtttacagca cagctcaata aagccagcca gtatgtttct ctgctcatca gagactccca 360
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gctttattta tgtacttgtg gctgcagctg gactgggtga gcagaggaga gagtgtgggg 180
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<222> (10)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
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ctgagcttgg cgtaatcatg gtcatannnn nttnnnnn 578
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (14)..(19)
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<222> (540)..(540)
<223> n is a, c, g, or t
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<222> (543)..(544)
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<221> misc_feature
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nnnnnnnnnn nntnnnnnng tcctctacna cggttaacct ggtccccgaa ccgaaggtgt 60
agccatagtt agctaagccc tgccctaaac tgctggcaca gaagtacgga gaggtctggt 120
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aacaagtcac tgttaacttc tttccagtca ctgtgatgag gtatcttggg ttctgggtca 360
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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<222> (9)..(14)
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<220>
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<212> DNA
<213> Homo sapiens
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<221> misc_feature
<222> (10)..(11)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (697)..(697)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (720)..(720)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (743)..(743)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (753)..(753)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (756)..(756)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (758)..(758)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (761)..(762)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (766)..(782)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (784)..(791)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 67
nnnggncgcn nattcgccct taagcagtgg tatcaacgca gagtacgcgg ggcagtaact 60
ttgctagtac ctcttgagtg caaggtggag aattaagatc tggatttgag acggagcacg 120
gaacatttca ctcaggggaa gagctatgaa catgctgact gccagcctgt tgagggcagt 180
catagcctcc atctgtgttg tatccagcat ggctcagaag gtaactcaag cgcagactga 240
aatttctgtg gtggagaagg aggatgtgac cttggactgt gtgtatgaaa cccgtgatac 300
tacttattac ttattctggt acaagcaacc accaagtgga gaattggttt tccttattcg 360
tcggaactct tttgatgagc aaaatgaaat aagtggtcgg tattcttgga acttccagaa 420
atccaccagt tccttcaact tcaccatcac agcctcacaa gtcgtggact cagcagtata 480
cttctgtgct ctgagtggaa atcactcagg tggtgctaca aacaagctca tctttggaac 540
tggcactctg cttgctgtcc ggccaaatat ccagaaccct gaccctgccg tgtaccagct 600
gagagactct aaatccagtg acaagtctgt ctgcctattc accgattttg attctcaaac 660
aaatgtgtca caaagtaagg attctgatgt gtataanggc gaattcgttt aaacctgcan 720
ggactagtcc ctttagtgag ggntaattct ganctngncg nnatcnnnnn nnnnnnnnnn 780
nntnnnnnnn n 791
<210> 68
<211> 629
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(7)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (9)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (14)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (27)..(27)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (613)..(613)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (617)..(620)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (627)..(627)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 68
nnnnnnngnn nncnnnttcg cccttangca gtgtatcaac gcagagtacg cgggaagcag 60
tggtatcaac gcagagtacg cgggaagcag tggtatcaac gcagagtacg cgggaagcag 120
tggtatcaac gcagagtacg cgggaagcag tggtatcaac gcagagtacg cgggaagcag 180
tggtatcaac gcagagtacg cgggggtcat aacgctatgt attggtacaa gcaaagtgct 240
aagaagccac tggagctcat gtttgtctac agtcttgaag aacgggttga aaacaacagt 300
gtgccaagtc gcttctcacc tgaatgcccc aacagctctc acttattcct tcacctacac 360
accctgcagc cagaagactc ggccctgtat ctctgcgcca gcagcccgtg gacagggggc 420
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gtgttcccac ccgaggtcgc tgtggttgag ccatcagaag cgagatctcc cacaccaagg 540
gcgaattcgt ttaaacctgc aggactagtc cctttagtga gggttaattc tgagcttggc 600
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<210> 69
<211> 822
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(14)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (17)..(17)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (23)..(25)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (27)..(27)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<220>
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (723)..(725)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (727)..(727)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (747)..(749)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (763)..(763)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (780)..(780)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (785)..(786)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (793)..(793)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (797)..(802)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (804)..(809)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (813)..(813)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (816)..(816)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (818)..(822)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 69
nnnnnnnnnn nnnntcnccc ttnnncngng gtnncnncgc nnagnanncg ggggaagana 60
tacttgnnnn tatngctctc ttggctggag attgcaggtc ccagtgggga gaacaatgaa 120
gacatttgct ggattttcgt tcctgttttt gtggctgcag ctggactgta tgagtagagg 180
agaggatgtg gagcagagtc ttttcctgag tgtccgagag ggagacagct ccgttataaa 240
ctgcacttac acagacagct cctccaccta cttatactgg tataagcaag aacctggagc 300
aggtctccag ttgctgacgt atattttttc aaatatggac atgaaacaag accaaagact 360
cactgttcta ttgaataaaa aggataaaca tctgtctctg cgcattgcag acacccagac 420
tggggactca gctatctact tctgtgcagc ttctgggggt taccagaaag ttacctttgg 480
aactggaaca aagctccaag tcatcccaaa tatccagaag cctgaccctg ccgtgtacca 540
gctgagagac tctaaatcca gtgacaagtc tgtctgccta ttcaccgatt ttgattctca 600
aacaaatgtg tcacaaagta aggattctga tgtgtatatc acagacaaaa ctgtccatag 660
acctcatgtc tagcacagtt ttgtctgtga tcccgcgtac tctgcgttga taccactgct 720
tannngncga attcgtttaa acctgcnnna ctagtccctt tantgagggt taattctgan 780
cttgnngtaa tcntggnnnn nncnnnnnnt ttnccngnnn nn 822
<210> 70
<211> 700
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(9)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (13)..(14)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (16)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
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<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (694)..(694)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (697)..(697)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (699)..(700)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 70
nnnnnnnnnc ncnnantcgc ccttaagcag tggtatcaac gcagagtacg cggggacatt 60
aggccaggag aagcccccga gccaagtctc ttttctcatt ctcttccaac aagtgcttgg 120
agctccaaga aggccccctt tgcactatga gcaaccaggt gctctgctgt gtggtccttt 180
gtctcctggg agcaaacacc gtggatggtg gaatcactca gtccccaaag tacctgttca 240
gaaaggaagg acagaatgtg accctgagtt gtgaacagaa tttgaaccac gatgccatgt 300
actggtaccg acaggaccca gggcaagggc tgagatcgat ctactactca cagatagtaa 360
atgactttca gaaaggagat atagctgaag ggtacagcgt ctctcgggag aagaaggaat 420
cctttcctct cactgtgaca tcggcccaaa agaacccgac agctttctat ctctgtgcca 480
gtaccgggac ttatggctac accttcggtt cggggaccag gttaaccgtt gtagaggacc 540
tgaacaaggt gttcccaccc gaggtcgctg tgtttgagcc atcagaagca gagatctccc 600
acaccaaggg cgaattcgtt taaacctgca ggactagtcc ctttagtgag ggttaattct 660
gagcttggcg tantcatggt cnnnnnntnn nttnccngnn 700
<210> 71
<211> 790
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(7)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (9)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (14)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (25)..(25)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (652)..(652)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (697)..(697)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (760)..(761)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (765)..(770)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
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<222> (773)..(775)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (777)..(777)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (782)..(790)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 71
nnnnnnngnn nncnnntcgc ccttnagcag tggtatcaac gcagagtacg cggggaggac 60
agatttcttt tatgattcct acagcagaaa aatgagaaac gtttgttatt attttttttt 120
cgtgtttaaa gtttgaatcc tcagtgaacc agggcagaaa agaatgatga aatccttgag 180
agttttactg gtgatcctgt ggcttcagtt aagctgggtt tggagccaac agaaggaggt 240
ggagcaggat cctggaccac tcagtgttcc agagggagcc attgtttctc tcaactgcac 300
ttacagcaac agtgcttttc aatacttcat gtggtacaga cagtattcca gaaaaggccc 360
tgagttgctg atgtacacat actccagtgg taacaaagaa gatggaaggt ttacagcaca 420
ggtcgataaa tccagcaagt atatctcctt gttcatcaga gactcacagc ccagtgattc 480
agccacctac ctctgtgcaa tgagcgcgca acaggcagga actgctctga tctttgggaa 540
gggaaccacc ttatcagtga gttccaatat ccagaaccct gaccctgccg tgtaccagct 600
gagagactct aaatccagtg acaagtctgt ctgcctattc accgattttg antctcaaac 660
aaatgtgtca caaagtaagg attctgatgt gtataanggc gaattcgttt aaacctgcag 720
gactagtccc tttagtgagg gttaattctg agcttggcgn natcnnnnnn aannntnttt 780
tnnnnnnnnn 790
<210> 72
<211> 674
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(8)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (14)..(16)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (36)..(36)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (647)..(648)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (656)..(664)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (668)..(668)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (671)..(674)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 72
nnnnnnnngn nncnnntcgc ccttggtgtg ggaganctct gcttctgatg gctcaaacac 60
agcgacctcg ggtgggaaca cgtttttcag gtcctctgtg accgtgagcc tggtgcccgg 120
cccgaagtac tgctcgctca tggtgactaa gctgctggca cagagataca cggccgagtc 180
ctcaagcttt gcaggctgga tcttgagagt ggagtctact cctttgagcc tctctgcaga 240
aaatcgatcc ttaggcaact gtgaatcatc cactacaccg ttattctgaa actgaatcag 300
aagctttggg ccctgtccca ggatctgctg gtaccagtaa agggtagcat ggccagatat 360
aggattgcac caaaaagcca cactctgcct tttctctata atcttatatc tgggagactg 420
ggcaactcca gcttctgtga gttctgctcc caggagacag agggccgccc agcagaggag 480
cctggtgccc atggcagggt cagggaagga tgggagcttt gcccaatcaa ggtcactgtg 540
agcaacagcc cccgcgtact ctgcgttgat accactgctt aagggcgaat tcgtttaaac 600
ctgcaggact agtcccttta gtgagggtta attctgagct tggcgtnntc atggtnnnnn 660
nnnntttncc nnnn 674
<210> 73
<211> 419
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(11)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (13)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(33)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (319)..(319)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (322)..(323)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (409)..(411)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (417)..(419)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 73
nnnnnnnnnn nantcgccct tggtgtggga ganctctgct tctgatggct caaacacagc 60
gacctcgggt gggaacacgt ttttcaggtc ctccagtacg gtcagcctag agccttctcc 120
aaaaaacagc tccccggtcc gtacgctgct ggcacagaag tacagagagg tctggttggg 180
gctcggcgac tccaggatca gggggaaatt cctcttctct tttcgagaga ctttgtaccc 240
ttcaggaaca tctcccttat cagtcacctc aacattcatt gaatagtaga tctgccttaa 300
gcccagccct gggtcttgnt gnnaccagaa cagaattcga gaagggcgaa ttcgcggccg 360
ctaaattcaa ttcgccctat agtgagtcgt attacaattc actggccgnn nttttannn 419
<210> 74
<211> 432
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(33)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (340)..(341)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (421)..(422)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (430)..(430)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (432)..(432)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 74
nnnnnnnnnn nnntcgccct tggtgtggga ganctctgct tctgatggct caaacacagc 60
gacctcgggt gggaacacgt ttttcaggtc ctcgagcacc aggagccgcg tgcctggccc 120
gaagtactgg gtctcttggt actgactgtc cctctcgctg ctggcacaga aatacaaagc 180
tgagtccccc agctccagag agctcaggtt tagttcagag tgcaagtcag ggaactgttg 240
tgcggagaat cgttcaagaa tgtttccttt tgctctctct tctccattat aatactgaat 300
gaggaactgg aggccctggt ccaggctctg atggtaccan nacagaattc gagaagggcg 360
aattcgcggc cgctaaattc aattcgccct atagtgagtc gtattacaat tcactggccg 420
nncgttttan an 432
<210> 75
<211> 755
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (14)..(14)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (24)..(24)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (680)..(680)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (682)..(682)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (741)..(745)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (747)..(750)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (754)..(755)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 75
nnnnnnnnnn nnantcgccc ttancagtgg tatcaacgca gagtacgcgg ggggacatga 60
ataaagcaca ggaggttgaa gtcagatttg cagctttcta ggcgggagac aagacaatct 120
gcatcttcac aggggggatg gccatgctcc tgggggcatc agtgctgatt ctgtggcttc 180
agccagactg ggtaaacagt caacagaaga atgatgacca gcaagttaag caaaattcac 240
catccctgag cgtccaggaa ggaagaattt ctattctgaa ctgtgactat actaacagca 300
tgtttgatta tttcctatgg tacaaaaaat accctgctga aggtcctaca ttcctgatat 360
ctataagttc cattgaggat aaaaatgaag atggaagatt cactgtcttc ttaaacaaaa 420
gtgccaagca cctctctctg cacattgtgc cctcccagcc tggagactct gcagtgtact 480
tctgtgcagc aagcttcacg cagaacggac tcacctttgg caaagggact catctaatca 540
tccagcccta tatccagaac cctgaccctg ccgtgtacca gctgagagac tctaactcca 600
gtgacaagtc tgtctgccta ttcaccgatt ttgattctca aacaaatgtg tcacaaagta 660
aggattctga tgtgtataan gncgaattcg cggccgctaa attcaattcg ccctatagtg 720
agtcgtatta caattcactg nnnnncnnnn tttnn 755
<210> 76
<211> 421
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (30)..(30)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (32)..(32)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (411)..(411)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (418)..(421)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 76
nnnnnnnnnn nnncgccctt ggtgtgggan anctctgctt ctgatggctc aaacacagcg 60
acctcgggtg ggaacacgtt tttcaggtcc tctgtgaccg tgagcctggt gcccggcccg 120
aagtactgct cgtatagaac ggggctgctg gcacagaaat aaactccaga atcctccagt 180
tctgcaggct gcaccttcag agtagaatac gtccctccag tcctttcagc taagaatcga 240
ttgttgggca taccggactc atcctgttta gactctttca caaaatgtaa cagaaatttt 300
atttcttttc ccataacatg tcgataccag tacagaattc gagaagggcg aattcgcggc 360
cgctaaattc aattcgccct atagtgagtc gtattacaat tcactggccg ncgttttnnn 420
n 421
<210> 77
<211> 436
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(5)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (7)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(33)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (35)..(35)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (48)..(48)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (434)..(434)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (436)..(436)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 77
nnnnntnnnn nnnattcgcc cttggtgtgg gananctctg cttctgangg ctcaaacaca 60
gcgacctcgg gtgggaacac cttgttcagg tcctctagga tggagagtcg agtcccatca 120
ccaaaatgct ggggctgatt gccctctggg aaggcccggg cgctgctggc acagaaatac 180
aaagctgagt cccccagctc cagagagctc aggtttagtt cagagtgcaa gtcagggaac 240
tgttgtgcgg agaatcgttc aagaatgttt ccttttgctc tctcttctcc attataatag 300
tgaatgagga actggaggcc ctggtccagg ctctgacggt accagtacag aattcgagaa 360
gggcgaattc gcggccgcta aattcaattc gccctatagt gagtcgtatt acaattcact 420
ggccgtcgtt ttanan 436
<210> 78
<211> 436
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(5)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (7)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(33)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (35)..(35)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (48)..(48)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (434)..(434)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (436)..(436)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 78
nnnnntnnnn nnnattcgcc cttggtgtgg gananctctg cttctgangg ctcaaacaca 60
gcgacctcgg gtgggaacac cttgttcagg tcctctagga tggagagtcg agtcccatca 120
ccaaaatgct ggggctgatt gccctctggg aaggcccggg cgctgctggc acagaaatac 180
aaagctgagt cccccagctc cagagagctc aggtttagtt cagagtgcaa gtcagggaac 240
tgttgtgcgg agaatcgttc aagaatgttt ccttttgctc tctcttctcc attataatag 300
tgaatgagga actggaggcc ctggtccagg ctctgacggt accagtacag aattcgagaa 360
gggcgaattc gcggccgcta aattcaattc gccctatagt gagtcgtatt acaattcact 420
ggccgtcgtt ttanan 436
<210> 79
<211> 425
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(8)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (33)..(34)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (425)..(425)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 79
nnnnnnnnan nnnttcgccc ttggtgtggg agnnctctgc ttctgatggc tcaaacacag 60
cgacctcggg tgggaacacc ttgttcaggt cctctacaac tgtgagtctg gtgccttgtc 120
caaagaaagc ttccattacc ctgtttgttt cactgctggc gcagaaatac acagatgtct 180
gggagcgggt agctgactcc agagtgaggg ggaaattctc tgtcttggat ctggagacaa 240
catagccatc ggggacttct cctttatctg taatatcagc agctgctgag taatagatca 300
gcctcagccc atgtcccagg tcttgacggt accagaacag aattcgagaa gggcgaattc 360
gcggccgcta aattcaattc gccctatagt gagtcgtatt acaattcact ggccgtcgtt 420
ttacn 425
<210> 80
<211> 430
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (30)..(32)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (428)..(430)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 80
nnnnnnnnnn nntcgccctt ggtgtgggan nnctctgctt ctgatggctc aaacacagcg 60
acctcgggtg ggaacacgtt tttcaggtcc tccagtacgg tcagcctaga gccttctcca 120
aaaaacagct ccccggtgtc tcgctgcctc ccggcactgg tggcacagaa gtaaagagct 180
gtctggttgg ggatggcaga ctctagggac agggagaatt tagcctgtgc ctgtcgagag 240
acactgtatc catcagagat ctctcctttg tttatatctt tgacatcaaa ggagtaatag 300
atcaactgta ggcccagtcc tgggtcttga tggtaccaat acagaattcg agaagggcga 360
attcgcggcc gctaaattca attcgcccta tagtgagtcg tattacaatt cactggccgt 420
cgttttannn 430
<210> 81
<211> 788
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(17)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (30)..(30)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (769)..(770)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (787)..(788)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 81
nnnnnnnnnn nnnannntcg cccttatacn catcagaatc cttactttgt gacacatttg 60
tttgagaatc aaaatcggtg aataggcaga cagacttgtc actggattta gagtctctca 120
gctggtacac ggcagggtca gggttctgga tatttgcttt aacaaatagt cttgttcctg 180
ctccaaagat agttttgaag cctggatcac tcacagcaca gaagtactca gccgtgtcgc 240
ttatatggac tgagggtttc ctcaagtgga aggaagtttg actcttgtta aattcagcct 300
caaaaccgtt gatgccttta accagggtgg atcctgataa atacttcagg agaagctgga 360
gtccttggtt ggggtattgc acataccaga agagatacac tgaaacagac gatgagtagt 420
tgcacctcag caccacaggg gcttcttcaa agacagggac ttggctgtca agctgggtca 480
caggctgggc tctggttcct ccccgggtaa aaatcacctg gaacgctggg acgagcagca 540
ggagcatggc tgagcagtgg caatgctgca ggaccttgag ctgggcggac agaagccaag 600
ggcgctgagc ctcaggagct aggaactgtg aggaggttgg attggacaag tccctggctt 660
tgaaaagttt cagaaacagc cccgcgtact ccccgcgtac tctgcgttga taccactgct 720
taagggcgaa ttcgcggccg ctaaattcaa ttcgccctat agtgagtcnn attacaattc 780
actggcnn 788
<210> 82
<211> 15
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 82
Cys Ala Ser Ser Ser Pro Lys Asp Pro Ser Asn Gln Pro Gln His
1 5 10 15
<210> 83
<211> 10
<212> PRT
<213> Human Immunodeficiency Virus
<400> 83
Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn Lys
1 5 10
<210> 84
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 84
Cys Ala Glu Asp Pro Thr Ser Ser Ser Gly Tyr Ala Leu Asn
1 5 10
<210> 85
<211> 702
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(8)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (11)..(13)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(17)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (679)..(679)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (681)..(691)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (696)..(702)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 85
nnnnnnnngg nnncnnntcg cccttaagca gtggtatcaa cgcagagtac gcggggcagg 60
tcccagtggg gagaacaatg aagacatttg ctggattttc gttcctgttt ttgtggctgc 120
agctggactg tatgagtaga ggagaggatg tggagcagag tcttttcctg agtgtccgag 180
agggagacag ctccgttata aactgcactt acacagacag ctcctccacc tacttatact 240
ggtataagca agaacctgga gcaggtctcc agttgctgac gtatattttt tcaaatatgg 300
acatggaaca agaccaaaga ctcactgttc tattgaataa aaaggataaa catctgtctc 360
tgcgcattgc agacacccag actggggact cagctatcta cttctgtgca gaggatccca 420
cctcaagttc cgggtatgca cccaacttcg gcaaaggcac ctcgctgttg gtcacacccc 480
atatccagaa ccctgaccct gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt 540
ctgtctgcct attcaccgat tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg 600
atgtgtataa gggcgaattc gtttaaacct gcaggactag tccctttagt gagggttaat 660
tctgagcttg gcgtaatcnt nnnnnnnnnn nttttnnnnn nn 702
<210> 86
<211> 664
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(12)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (15)..(17)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (26)..(26)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (640)..(651)
<223> n is a, c, g, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (657)..(664)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 86
nnnnnnnnnn nngcnnntcg cccttnagca gtggtatcaa cgcagagtac gcgggggatc 60
tggtaaagct cccatcctgc cctgaccctg ccatgggcac cagcctcctc tgctggatgg 120
ccctgtgtct cctgggggca gatcacgcag atactggagt ctcccagaac cccagacaca 180
agatcacaaa gaggggacag aatgtaactt tcaggtgtga tccaatttct gaacacaacc 240
gcctttattg gtaccgacag accctggggc agggcccaga gtttctgact tacttccaga 300
atgaagctca actagaaaaa tcaaggctgc tcagtgatcg gttctctgca gagaggccta 360
agggatcttt ctccaccttg gagatccagc gcacagagca gggggactcg gccatgtatc 420
tctgtgccag cagcagtccc aaagatccta gcaatcagcc ccagcatttt ggtgatggga 480
ctcgactctc catcctagag gacctgaaca aggtgttccc acccgaggtc gctgtgtttg 540
agccatcaga agcagagatc tcccacacca agggcgaatt cgtttaaacc tgcaggacta 600
gtccctttag tgagggttaa ttctgagctt ggcgtaatcn nnnnnnnnnn ntttttnnnn 660
nnnn 664
Claims (32)
- 가용성 HLA 클래스 I-제한적 T 세포 수용체(TCR) 폴리펩티드를 코딩하는 단리 핵산을 포함하는 조성물로서, 여기서 폴리펩티드는 HIV 또는 HCV 에피토프에 특이적으로 결합하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 서열 번호 4를 포함하는 단리 TCR 폴리펩티드를 코딩하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 서열 번호 6을 포함하는 단리 TCR 폴리펩티드를 코딩하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 서열 번호 4 및 서열 번호 6을 포함하는 단리 TCR 폴리펩티드를 코딩하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 서열 번호 27을 포함하는 단리 TCR 폴리펩티드를 코딩하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 서열 번호 29를 포함하는 단리 TCR 폴리펩티드를 코딩하는 것인 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 서열 번호 27 및 서열 번호 29를 포함하는 단리 TCR 폴리펩티드를 코딩하는 것인 조성물.
- HIV 또는 HCV 에피토프에 특이적으로 결합하는 단리 TCR 폴리펩티드를 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 단리 TCR 폴리펩티드는 서열 번호 4를 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 단리 TCR 폴리펩티드는 서열 번호 6을 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 단리 TCR 폴리펩티드는 서열 번호 4 및 서열 번호 6을 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 단리 TCR 폴리펩티드는 서열 번호 27을 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 단리 TCR 폴리펩티드는 서열 번호 29를 포함하는 조성 물.
- 제8항에 있어서, 상기 단리 TCR 폴리펩티드는 서열 번호 27 및 서열 번호 29를 포함하는 조성물.
- 제1항 또는 제8항에 있어서, 상기 TCR 폴리펩티드는 HIV-1 에피토프에 결합하는 조성물.
- 제1항 또는 제8항에 있어서, 상기 TCR 폴리펩티드는 HCV 에피토프에 결합하는 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 알파 사슬 T 세포 수용체 서열 및 베타 사슬 수용체 서열을 포함하는 핵산.
- 제8항에 있어서, 상기 TCR 폴리펩티드는 검출가능한 마커를 추가로 포함하는 조성물.
- 제18항에 있어서, 상기 검출가능한 마커는 형광색소인 TCR 폴리펩티드.
- 제8항에 있어서, 상기 TCR 폴리펩티드는 세포독성 조성물을 추가로 포함하는 TCR 폴리펩티드.
- 제8항에 있어서, 상기 TCR 폴리펩티드는 사이토카인을 추가로 포함하는 TCR 폴리펩티드.
- 고상 지지체 상에 고정된 제8항의 다수의 가용성 단일 사슬 HLA 클래스 I-제한적 T 세포 수용체 폴리펩티드를 포함하는 조성물로서, 상기 다수의 폴리펩티드 각각은 상이한 바이러스 에피토프에 결합하는 것인 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 TCR 폴리펩티드는 알파 사슬 서열 및 베타 사슬 서열을 포함하고, 상기 알파 및 베타 사슬 서열의 각각은 길이가 8잔기 이상인 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 알파 및 베타 사슬 서열의 각각은 길이가 8 내지 20 잔기인 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 표 1의 α 사슬 서열 및 β 사슬 서열 쌍을 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 표 1에 열거한 것들로부터 선택된 알파 사슬 서열을 포함하는 조성물.
- 제8항에 있어서, 상기 폴리펩티드는 표 1에 열거한 것들로부터 선택된 베타 사슬 서열을 포함하는 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 핵산은 표 2에 열거한 것들로부터 선택된 알파 사슬 코딩 서열을 포함하는 조성물.
- 제2항에 있어서, 상기 핵산은 표 2에 열거한 것들로부터 선택된 베타 사슬 코딩 서열을 포함하는 조성물.
- 단리된 바이러스-특이적 가용성 T 세포 수용체 구성체를 시험 개체 유래의 체액 또는 조직 샘플과 접촉시키는 단계 및 T 세포 수용체 구성체와의 결합을 검출하는 단계를 포함하고, 여기서 상기 결합은 바이러스 감염을 의미하는 것인 바이러스 감염의 진단 방법.
- 단리된 단일 사슬 가용성 바이러스 특이적 T 세포 수용체를 개체에게 투여하는 단계를 포함하고, 상기 수용체는 세포독성제를 포함하는 것인 바이러스 감염의 억제 방법.
- 제31항에 있어서, 상기 수용체는 HIV 또는 HCV 에피토프에 특이적으로 결합 하는 것인 방법.
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