CN101490078A - 可溶性病毒特异性t细胞受体组合物 - Google Patents

可溶性病毒特异性t细胞受体组合物 Download PDF

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Abstract

本发明描述了用于诊断病毒感染的组合物以及方法,以及抑制这类感染的方法。上述方法是以对来自于细胞毒性T细胞克隆的T细胞受体基因序列的识别为基础的,其中所述的T细胞受体基因序列对HIV-I或者HCV具有特异性。已经识别并且构建成与I类HLA限制的HIV病原体以及HCV病原体相结合的可溶性T细胞受体组合物。

Description

可溶性病毒特异性T细胞受体组合物
发明的背景技术
病毒感染,例如人类免疫缺陷病毒(HIV)诸如HIV-I的感染以及丙型肝炎病毒(HCV)的感染,是一项重大的公共健康问题。有许多种药物目前被用来治疗感染了这类病毒感染的个体,例如,包括逆转录酶(RT)抑制剂以及蛋白酶(PI)抑制剂在内的抗逆转录病毒药物。尽管这些试剂对于HIV(人类免疫缺陷病毒)感染的治疗是有效的,对药物抗性品系以及病毒的蓄积药物毒性的研究发展仍然是一个受关注的问题。
发明内容
本发明描述了用于诊断以及治疗病毒感染的方法以及组合物。所述的方法是以对来自于细胞毒性T细胞克隆的T细胞受体基因序列的识别为基础的,其中所述的T细胞受体基因序列对HIV-I(人类免疫缺陷病毒-I)或者HCV(丙型肝炎病毒)具有特异性。因此,本发明包括分离的T细胞受体基因以及由该基因编码的多肽,其编码可溶性T细胞受体多肽或者蛋白,其中所述的受体多肽或者蛋白能够与HIV-I或者HCV以及由该基因编码的多肽之上的细胞毒性T细胞表位发生特异性的结合。
上述表位包括一种短的、8至11个肽,或者由一种短的8至11个肽组成,其中所述的肽依靠一种细胞表面与I类主要组织相容性复合体(MHC)抗原相连接,其中所述的I类主要组织相容性复合体是例如HLA(人类白细胞抗原)分子。所述的表位包括与天然产生的HIV蛋白或者HCV蛋白相一致的多肽序列,或者包括来自于天然产生的HIV蛋白或者HCV蛋白的多肽序列。
所述的T细胞受体基因既编码T细胞受体的α链,也编码T细胞受体的β链。所述的T细胞受体α链以及T细胞受体的β链均包括一种恒定区(C区),一种可变区(V区)以及一种互补决定区3(CDR3)区域,或者由上述三个区域构成。所述的CDR3区域介导抗原肽/主要组织相容性复合体I类复合体间的相互反应,由一种1至90个核苷的随机序列组成,其中所述的随机序列是由体细胞重组而产生的。这些基因序列被用来构建重组HIV-I或者HCV-特异性可溶性T细胞受体分子,所述的T细胞受体分子被用来进行体外诊断以及体内治疗。例如,这些可溶性T细胞受体可以作为着色剂,用来在体外试验中对患者来源的组织样本或者体液样本呈现出的HIV-I或者HCV细胞毒性T细胞表位进行检测。可以任选的,所述的可溶性T细胞受体多肽可以与一种可检测的标记物相连接,所述的可检测的标记物是例如荧光分子。所述的可检测的标记物与所述的受体多肽相连接或者相共轭,从而促进了诊断。而且,大量的可溶性单链I类HLA(人类白细胞抗原)限制的T细胞受体多肽被固定于固体载体之上,所述的固体载体是例如木片或者平板。例如,将所述的T细胞受体以一种微阵列的形式进行构建,用于对过程中的病毒表位进行识别以及检测。对于治疗目的而言,将细胞毒性分子或者细胞因子连接或者结合至所述的T细胞受体(TCR)上。
优选的可溶性T细胞受体构建包括下列与T细胞受体α、β链对相一致的序列:Vb序列CASSQGVTLLN(序列4)以及Va5序列CAETY(序列6)。在I类人类白细胞抗原(HLA)分子A2中这种可溶性T细胞受体具有序列5(HIV-I vpr:人类免疫缺陷病毒-I病毒蛋白)的表位特异性。上述T细胞受体序列的衍生物同样被包含在本发明的范围之内。衍生的T细胞受体的特征是对I类人类白细胞抗原限制性表位具有更高的结合亲和性,在下文的表1中所示。例如,一种衍生的可溶性T细胞受体构建体相对于参考序列4以及参考序列6而言,可能包括1、2、3、4或者更多个保守的或者非保守的氨基酸取代基,并且与含有上述初始参考序列的构建体相比,其具有增加了的表位结合亲和性的特征。一种优选的具有丙型肝炎病毒(HCV)表位结合特异性的可溶性T细胞受体构建体包括下列与T细胞受体α、β链对相一致的序列:Va序列CAVNEYGQNFV(序列27)以及Vb序列CAWSGGLNTEAF(序列29)。这种可溶性T细胞受体构建体具有序列28的表位结合特异性,其为一种HCV肽,同样存在于I类HLA分子A2中。上述T细胞受体序列以及其他T细胞受体序列以及它们的结合特异性和HLA限制性在表1中所示。
“基本上是纯的”指的是已经从天然伴随其存在的组分中分离出来的核酸、多肽或者其他分子。典型的,当多肽具有的至少60%、70%、80%、90%、95%、或者甚至99%重量的部分是不含蛋白质以及与其天然相结合的天然产生的有机分子时,则所述的多肽在基本上是纯的。例如,可以通过下述方法来获得一种本质上纯的多肽:从天然来源中进行分离,在细胞中进行重组核酸的表达,其中所述的细胞在正常情况下不对所述蛋白进行表达,或者通过化学合成的方法。一种蛋白分离片段指的是具有所述参考蛋白的序列的一部分的肽,其中所述的序列比全部序列短,并且不含有天然产生的侧翼区。一种分离的多肽缺少一个或者多个氨基酸,其中所述的氨基酸是所述天然产生的分子中的参考片段的侧翼。
当一个具体的多肽分子或者核酸分子被认为与一种被定义了长度的参考多肽分子或者参考核酸分子具有特定的同一性百分数时,则所述的同一性百分数是相对于所述的参考多肽分子或者参考核酸分子而言的。因此,当一种肽与具有100个氨基酸长度的参考多肽具有50%的同一性时,则所述的肽可以是一种具有50个氨基酸的多肽,所述的50个氨基酸与所述参考多肽的50个氨基酸长度的部分是完全相同的。它也可能是一种具有100个氨基酸长度的多肽,其中有50%的氨基酸在其完整的长度内与所述参考多肽是相同的。同样的规则也适用于核酸分子。
对于多肽而言,所述参考多肽序列的长度将通常为至少5个氨基酸的长度。例如,所述的肽具有5、6、7、8、9、10、11、12个氨基酸的长度。在某些情况中,所述的肽更大一些,例如,15、20、25个氨基酸或者更长的长度。例如,一个特定序列例如表位序列的肽的侧翼是其他氨基酸,其中所述的氨基酸与天然产生的蛋白中的序列的侧翼上的氨基酸不同。对于核酸而言,所述参考核酸序列的长度将通常为至少15、20或者25个核酸的长度。然而,具有更大的构建体,例如那些具有至少50个核苷、优选具有至少60个核苷、更优选具有至少75个核苷、以及最优选具有100个核苷或者300个核苷的构建体。
本发明还包括根据T细胞受体序列或者表位序列而产生的衍生肽。在与参考序列具有小于100%同一性的多肽序列的情况中,在不相同的位置处优选但不是必须的存在针对所述参考序列的保守性取代基。保守性取代基通常包括具有下述基团的取代基:甘氨酸以及丙氨酸;缬氨酸,异亮氨酸,以及亮氨酸;天冬氨酸以及谷氨酸;天冬酰胺以及谷酰胺;丝氨酸以及苏氨酸;赖氨酸以及精氨酸;以及苯丙氨酸以及酪氨酸。在相对于所述参考序列而言具有氨基酸取代基的肽中,所述T细胞受体对其HLA限制性表位的结合亲和性增加了。或者,含有衍生序列的构建体具有优秀的稳定性,例如,在生理可接受性溶液中具有更长的半衰期,其中所述的生理可接受性溶液是例如培养基或者体液,并且其中所述的体液是例如血液,血浆或者血清。例如,相对于所述参考肽序列而言,这类衍生肽的结合亲和性和/或稳定性为至少5%、10%、25%、50%、75%、90%、100%、2倍、5倍、10倍、20倍或者更高。可以任选的,衍生的肽序列包括其他的氨基酸,其中所述的氨基酸在所述参考序列的侧翼上,位于所述序列的氨基末端和/或羧基末端。如上所述,这类含有非天然产生的侧翼序列的构建体的特征是具有增加了的表位结合亲和性和/或增加了的稳定性。编码所述衍生肽序列的核酸序列也被包含在本发明之内。
一种分离的或者纯化的核酸分子是从5’编码序列以及3’编码序列或者非编码序列中分离出来的,在有机体天然产生的基因组中,它们之间是直接相邻的(immediately contiguous)。分离的核酸分子包括那些不是天然产生的核酸分子,例如,由重组DNA技术生成的核酸分子。这里所识别的核酸包括那些与参考序列具有至少85%、90%、95%、98%、99%的同一性的序列,以及参考核酸序列的退化变体(degenerate variants)。
通过下文对于优选实施方式的描述以及权利要求,本领域技术人员可以明显看出本发明的其他特征以及优点。这里所引用的参考文献的全部内容在此引入作为参考。
具体实施方式
HIV-I或者HCV特异性细胞精确的识别I类MHC(主要组织相容性复合体)限制的细胞毒性T细胞表位,并通过有限稀释克隆的方法对其进行分离。使用MHC(主要组织相容性复合体)I类四聚体对克隆细胞进行染色,其中所述的MHC I类四聚体与各自的表位肽发生了折叠,并且使用一种FACS ARIA(流式细胞分选仪)仪器对四聚体结合细胞进行分选。分离储存细胞的mRNA,利用巢式PCR(聚合酶链式反应)对所述T细胞受体基因的逆转录体以及cDNA进行扩增。使PCR产物与克隆载体发生结合,用来转化E.coli(大肠杆菌)。在细菌扩增之后,利用标准操作对插入的载体进行纯化和测序。下述T细胞受体的序列被识别出来。
表1:T细胞受体序列
 
T细胞受体(α(a),β(b)链对) 表位特异性 限制的I类HLA(人类白细胞抗原)的类型       
Vb27-CASSLGQGLANYGYT-J1.2序列1Va3-CAVRDLTGNQFY-J49序列3                     FL8(FLKEKGGL)序列2HIV-I(nef)    B8
Vb14-CASSQGVTLLN-J2.1序列4Va5-CAETY-J36序列6                 AL9(AIIRILQQL)序列5HIV-I(vpr)     A2
Vb19-CASSIDGASNQPQH-J1.5序列7Va13.2-CAENSDAGGTSYGKLT-J52序列9                       SL9(SLYNTVATL)序列8HIV-I(gag)     A2
Vb15-CATSRGAGSNTGELF-J2.2序列10Va12.2-CAVRGSGTYKYI-J40序列11                    FL8(FLKEKGGL)序列2HIV-I(nef)    B8
Va19-CALSGNHSGGATNKLI-J32序列12Vb4.3-CASSPWTGGGQPQH-J1.5序列14                    TW10(TSTLQEQIGW)序列13HIV-I(gag)       B57
Va5-CAASGGYQKVTFGTGTKLQVIP序列15Vb19-CASTGTYGYT-J1.2序列16                     KF11(KAFSPEVIPMF)序列17HIV-I(gag)        B57
Va12.3-CAMSAQQAGTALI-J15序列18Vb11.2-CASSLVIMSEQY-J2.7序列20                   SL9(SEGATPQDL)序列19HIV-I(gag)     B60
 
Va13.1-CAATSGYALN-J41序列21Vb9-CASSVQGEFREKLF-J1.4序列23                  E18(EIYKRWII)序列22HIV-I(gag)    B8
Va27-CAGRDYKLS-J20序列24Vb20.1-CSARGDNPNTEAF-J1.1序列26                    KL9(KEKGGLEGL)序列25HIV-I(nef)     B60
Va8.1-CAVNEYGQNFV-J26序列27Vb30-CAWSGGLNTEAF-J1.1序列29                 AL9(ALYDVVTKL)序列28(HCV)          A2
Vb27-CASSVRTGELF-J2.2序列30Va29-CAASFTQNGLT-J45序列32                QK10(QVPLRPMTYK)序列31HIV-I(nef)       A3以及A11
Vb9-CASSERDSQYQETQY-J2.5序列33Va29-CAASFTQNGLT-J45序列34                   QK10(QVPLRPMTYK)序列31HIV-I(nef)       A3以及A11
Vb14-CASSPVLYEQY-J2.7序列35Va39-CAVVAQGGSEKLV-J57序列36                 QK10(QVPLRPMTYK)序列31HIV-I(nef)       A3以及A11
Vb9-CASSARAFPEGNQPQH-J1.5序列37Va39-CAVVAQGGSEKLV-J57序列38                    QK10(QVPLRPMTYK)序列31HIV-I(nef)       A3以及A11
Vb10.2-CASSETNRVMEAF-J1.1序列39Va8.6-CAVSDPGFKTI-J9序列40                    QK10(QVPLRPMTYK)序列31HIV-I(nef)       A3
Vb24-CATSAGRQRDTGELF-J2.2序列41Va8.6-CAVSDPGFKTI-J9序列42                    QK10(QVPLRPMTYK)序列31HIV-I(nef)       A3
Vb25.1-CASSNGYEQY-J2.7序列43Va38.2-CAYRSDNDMR-J43序列44                 KV10(KLVALGINAV)序列45(HCV)            A2
Vb24.1-CATSSQDGQVYEQY-J2.7序列46Va24-CASYKAAGNKLT-J17序列47                     GT9(GPRLGVRAT)序列48(HCV)          B7
Vb7.9-CASSSPKDPSNQPQH-J1.5序列82Va5-CAEDPTSSSGYALN-J4序列84                     KK10(KRWIILGLNK)序列83(HIV-I gag)       B27
表2:编码T细胞受体的核苷酸序列
HCV-A2-KV10(KLVALGINAV)
Vb25.1-CASSNGYEQY-J2.7(序列43)
NNNNNNNNGNNNNNNNTCGCCCTTNNCAGTGGTTCAACGC
AGAGTACGCGGGGGGGAGACATCCTCTCTAGCCCCAACTGT
GCCATGACTATCAGGCTCCTCTGCTACATGGGCTTTTATTTTC
TGGGGGCAGGCCTCATGGAAGCTGACATCTACCAGACCCCA
AGATACCTTGTTATAGGGACAGGAAAGAAGATCACTCTGGA
ATGTTCTCAAACCATGGGCCATGACAAAATGTACTGGTATCA
ACAAGATCCAGGAATGGAACTACACCTCATCCACTATTCCTA
TGGAGTTAATTCCACAGAGAAGGGAGATCTTTCCTCTGAGT
CAACAGTCTCCAGAATAAGGACGGAGCATTTTCCCCTGACC
CTGGAGTCTGCCAGGCCCTCACATACCTCTCAGTACCTCTGT
GCCAGCAGTAATGGATACGAGCAGTACTTCGGGCCGGGCAC
CAGGCTCACGGTCACAGAGGACCTGAAAAACGTGTTCCCA
CCCGAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTC
CCACACCAAGGGCGAATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTC
CCTTTAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGGCGTAATCATGGTC
ATAGNNNNTTTCCTNN(序列49)
Va38.2-CAYRSDNDMR-J43(序列44)
NNNNNNNGGNNNNNNNANTCGCCCTTNNNAGTGGTATCAA
CGCAGAGTACGCGGGGAGAAGAGGAGGCTTCTCACCCTGC
AGCAGGGACCTGTGAGCATGGCATGCCCTGGCTTCCTGTGG
GCACTTGTGATCTCCACCTGTCTTGAATTTAGCATGGCTCAG
ACAGTCACTCAGTCTCAACCAGAGATGTCTGTGCAGGGGGC
AGAGACCGTGACCCTGAGCTGCACATATGACACCAGTGAGA
GTGATTATTATTTATTCTGGTACAAGCAGCCTCCCAGCAGGC
AGATGATTCTCGTTATTCGCCAAGAAGCTTATAAGCAACAGA
ATGCAACAGAGAATCGTTTCTCTGTGAACTTCCAGAAAGCA
GCCAAATCCTTCAGTCTCAAGATCTCAGACTCACAGCTGGG
GGATGCCGCGATGTATTTCTGTGCTTATAGGAGCGACAATGA
CATGCGCTTTGGAGCAGGGACCAGACTGACAGTAAAACCA
AATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGA
CTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTT
TGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGT
GTATAAGGGCGAATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTT
TAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGGCGTANTCATGGTCATAG
NNNNNTTTCNNNN(序列50)
HCV-B7-GT9(GPRLGVRAT)(序列48)
Vb24.1-CATSSQDGQVYEQY-J2.7(序列46)
NNNNNNNNNNNNNNCNNNTCGCCCTTAAGCAGTGGTATCA
ACGCAGAGTACGCGGGGAGAGCTGGAAACACCTCCATCCT
GCCTCTTCATGCCATGGCCTCCCTGCTCTTCTTCTGTGGGGC
CTTTTATCTCCTGGGAACAGGGTCCATGGATGCTGATGTTAC
CCAGACCCCAAGGAATAGGATCACAAAGACAGGAAAGAGG
ATTATGCTGGAATGTTCTCAGACTAAGGGTCATGATAGAATG
TACTGGTATCGACAAGACCCAGGACTGGGCCTACGGTTGAT
CTATTACTCCTTTGATGTCAAAGATATAAACAAAGGAGAGAT
CTCTGATGGATACAGTGTCTCTCGACAGGCACAGGCTAAATT
CTCCCTGTCCCTAGAGTCTGCCATCCCCAACCAGACAGCTC
TTTACTTCTGTGCCACCAGTTCCCAGGACGGGCAAGTCTAC
GAGCAGTACTTCGGGCCGGGCACCAGGCTCACGGTCACAG
AGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTT
GAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCAAGGGCGAATT
CGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTTAATT
CTGAGC TTGGCGTAATCATGGTCATAGCTNNNTTNNNNGNN
(序列51)
Va24-CASYKAAGNKLT-J17(序列47)
NNNNNNNNNNNNNCNNCNAATTCGCCCTTANGCAGTGGTAT
CAACGCAGAGTACGCGGGGGTTTTTCTGCTGTGGGTACGTG
AGCAGGAAACATGGAGAAGAATCCTTTGGCAGCCCCATTAC
TAATCCTCTGGTTTCATCTTGACTGCGTGAGCAGCATACTGA
ACGTGGAACAAAGTCCTCAGTCACTGCATGTTCAGGAGGG
AGACAGCACCAATTTCACCTGCAGCTTCCCTTCCAGCAATnT
TATGCCTTACACTGGTACAGATGGGAAACTGCAAAAAGCCC
CGAGGCCTTGTTTGTAATGACTTTAAATGGGGATGAAAAGA
AGAAAGGACGAATAAGTGCCACTCTTAATACCAAGGAGGGT
TACAGCTATTTGTACATCAAAGGATCCCAGCCTGAAGACTCA
GCCACATACCTCTGTGCCTCCTACAAAGCTGCAGGCAACAA
GCTAACTTTTGGAGGAGGAACCAGGGTGCTAGTTAAACCAA
ATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGAC
TCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTT
GATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGT
GTATAAGGGCGAATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTT
TAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGGCGTAATCATGGTCNTAN
NNTNNTNNNNNN(序列52)
HCV A2-AL9
Va8.1-CAVNEYGQNFV-J26(序列27)
NNNNNNNNNNGNNNNCNNNTCNCCCTTATACNCATCAGAAT
CCTTACTTTGTGACACATTTGTTTGAGAATCAAAATCGGTGA
CTAGGCAGACAGACTTGTCACTGGATTTAGAGTCTCTCAGC
TGGTACACGGCAGGGTCAGGGTTCTGGATATAGGGCAGCAC
GGACAATCTGGTTCCGGGACCAAAGACAAAATTCTGACCAT
ACTCATTCACGGCACAGAAGTACTCAGCTGTGTCACTCCAC
TGCACAGAGGGTTTCCTCAGATTAAAGGAGAATTTACTCTTT
ATAAATTCAGCCTCAAAGCCCTTGATGCCTTTAACCAGTGGA
TCCCCTGAAAAGTACTTGAGGAGAAGCTGAAGGTGTTGACC
AGGGTACTGGACATACCAGAAGAGATTAACAGTTCCACCGT
AGGAATAGTTGCATCCCAACTCCAGTGAGGCTGCTTCAGAG
AGAATTACGTGGTGGTTATGCTGGCTCACAGACTGGGCTCT
GGCATCTCTCAGGGCAAAAATCATCCCCAGCACTGGTATGA
GCAACAGGAGCATGGCTGAGCTGTGGAAACACTGCAAGCG
TCTCTTTGGAAATTCTCCTCGGGGCCAGTAGGAAAGTGGCT
GGAACCCAGGTCTTGAGAATAGCGAGCGTGAGGAAGGTTG
GGCTAGGCAAGTCTCTTGTTTTGGTAAGAATCCCCGCGTACT
CTGCGTTGATACCACTGCTTAANGGCGAATTCGTTTAAACCT
GCNNNACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGG
NGTAATCATGG TCNNNNNNTGTTTTCCNGN(序列53)
HCV A2-AL9
Vb30-CAWSGGLNTEAF-J1.1(序列29)
NNNNNNNNNNNNNNNTCGCCCTTGGTGTGGGANNNCTCTG
CTTCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACC
TTGTTCAGGTCCTCTACAACTGTGAGTCTGGTGCCTTGTCCA
AAGAAAGCTTCAGTGTTCAGGCCTCCCGACCAGGCACAGA
GATAGAAGCCAGAGTCACTGAGAAGGAGCTTCTTAGAACTC
AGGATGAACTGCCGGTCCTGGGGTCTGGAGGCTGAGAGATT
CTGGGGCACCTCAGAGCTGATCTGGCCAATACCAACGGAGT
AGAAGAGCAGCTGGAGGCCCCTGCCTGCAGCCTGTCGGTA
CCAGTATAGGTTGGGGTTTGATGTTCCCTCCACAGTGCACTC
CAGAGAGAGCGGGCTGCCCACAGGCTGCACCAGGGTCGCT
GGCCATTGATGAATAGTCTGAGATCTGACCCCAAAGAAAGT
GCCCAGGAGAAGGGCAAGGAGAGAGCAGAGCATCATCCAA
GCCAGCCTTTCCTTCAGCTAGTCTGGGGGACAGACGCCTCC
TCTTCTGGGCCAGTGATGTGGCCAGGCACACCAGTGTGGCC
CGCGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAAGGGCGAATTCGC
GGCCGCTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAA
TTCACTGGCNNNNCNNTTTTAN(序列54)
B8-EI8
Va13.1-CAATSGYALN-J41(序列21)
NNNNNNNNNNNNNCGCCCTTATACACATCAGAATCCTTACT
TTGTGACACATTTGTTTGAGAATCAAAATCGGTGAATAGGCA
GACAGACTTGTCACTGGATTTAGAGTCTCTCAGCTGGTACA
CGGCAGGGTCAGGGTTCTGGATATGGGGTGTGACCAACAGC
GAGGTGCCTTTGCCGAAGTTGAGTGCATACCCGGACGTTGC
TGCACAGAAGTAGACAGCCGAGTCTTCAGGTTGGGTCTCTG
TGATGTGCAGGGAGAAATGTTTGGCTGTCTTGTTCAATGTAA
CAGCAATTCGTTGGTCTTTCTTTTCGCCCACATTTGAACGAA
TGTCTATAATAAGCTGAGGTCTTTTTCCAAGTTCTTGCTTATA
CCAAGGGAAGTAGTTTGAGGCACTGTCTGAATAAGTACACT
TGATAACAGCGCTGTCTCCCTCCTGGACACTCAGGGTTGAA
GGATGCTGCTCCACATTCTCTCCATTCACCAAGTCCAGCTGC
AGCCACAGGAATATAAATACAGCTCGAATGGATGTCATCCTT
GTTCTTCCCAATTAAGATCAGTCATTGACCTGCAACCTCCAG
TTATCCCCGCGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAAGGGCG
AATTCGCGGCCGCTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGT
ATTACAATTCACTGGCN TNCCNTTTTTAN(序列55)
B8-EI8
Vb9-CASSVQGEFREKLF-J1.4(序列23)
NNNNNNNNNNNNNNNNCGCCCTTGGTGTGGGANANCTCTG
CTTCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACC
TTGTTCAGGTCCTCCAAGACAGAGAGCTGGGTTCCACTGCC
AAAAAACAGTTTTTCTCTAAACTCCCCCTGTACGCTGCTGG
CACAGAAATACAAAGCTGAGTCCCCCAGCTCCAGAGAGCTC
AGGTTTAGTTCAGAGTGCAAGTCAGGGAACTGTTGTGCGGA
GAATCGTTCAAGAATGTTTCCTTTTGCTCTCTCTTCTCCATTA
TAATACTGAATGAGGAACTGGAGGCCCTGGTCCAGGCTCTG
TTGGTACCAGTACACAGAGAGGTCTCCAGACCTAGGGGAGC
ATCTCAGCGTCACTCGCTGTCCAGTTGCTGTGATCAGGTGCT
TTGGGGTTTGTGTGACTCCAGAATCCACTGGGCCTGCTCCC
AGGAGACAAAAGGCCACACAGCAGAGGAGCCTGAAGCCCA
TGGCAGGATCTCTAGCTTGGGGCTGGTGTCTCTGTAGTAAG
CATTCTCCCCGCGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAAGGG
CGAATTCGCGGCCGCTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTC
GTATTACAATTCACTGGCCNNNNNTTTTTACANNNN(序列
56)
B60-KL9
Va27-CAGRDYKLS-J20(序列24)
NNNNNNNNNNNNNCGCCCTTATACACATCAGAATCCTTACT
TTGTGACACATTTGTTTGAGAATCAAAATCGGTGAATAGGCA
GACAGACTTGTCACTGGATTTAGAGTCTCTCAGCTGGTACA
CGGCAGGGTCAGGGTTCTGGATATTTGCTCTTACAGTTACTG
TGGTTCCGGCTCCAAAGCTGAGCTTGTAGTCGCGTCCTGCA
CAGAGGTAGAGGCCTGTATCACCAGGCTGGGCCGCAGTGAT
GTGGAGAGAACTGTCCTTTCTTGCATCACCAAACTGAAAGG
TTAGTCTCTTCAGCTTCTTCACTTCTCCACCCGTAACTACTG
TCACCAGGAGGACAGGACCTTCCCCAGGCTCCTGTCTGTAC
CATTGTAAGCTGGAAAAAACACTTGAGGAGTTGCAGTACAC
AGTGAGATTTTCTCCCTCTTGGATGCTTAGAAACTGAGGGCT
CTGCTCCAGCAGCTGGGTGCTCACCCATGCCAACTGAATCC
AAAGAATGGACACGGAGAATTTCAGGACCATCTTGTCTTTC
TATCACATGGTGGACATGGCCCCTGACTTTAGCTGCTCCTGA
AAGAGCCCGTCCTGGAACANACTTCTCTGNNCTANAANANT
GCTTGCTGCCACCCACTTTGAGTTCCATANAAAGCCCCCCG
CGACTCTGCGTTGATACCACTGCTTNAGGGCGANNTCNCGN
NCNNTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTANTACAATT
CACTGGCNNNNNNNTTTTANN(序列57)
B60-KL9
Vb20.1-CSARGDNPNTEAF-J1.1(序列26)
NNNNNNNGGNNNCNNANTCGCCCTTANGCAGTGGTATCAA
CGCAGAGTACGCGGTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACG
CGGGAGAGAAGGTGGTGTGAGGCCATCACGGAAGATGCTG
CTGCTTCTGCTGCTTCTGGGGCCAGGCTCCGGGCTTGGTGG
TGTCGTCTCTCAACATCCGAGCTGGGTTATCTGTAAGAGTGG
AACCTCTGTGAAGATCGAGTGCCGTTCCCTGGACTTTCAGG
CCACAACTATGTTTTGGTATCGTCAGTTCCCGAAACAGAGTC
TCATGCTGATGGCAACTTCCAATGAGGGCTCCAAGGCCACA
TACGAGCAAGGCGTCGAGAAGGACAAGTTTCTCATCAACCA
TGCAAGCCTGACCTTGTCCACTCTGACAGTGACCAGTGCCC
ATCCTGAAGACAGCAGCTTCTACATCTGCAGTGCTAGAGGG
GACAACCCGAACACTGAAGCTTTCTTTGGACAAGGCACCA
GACTCACAGTTGTAAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCG
AGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCAC
ACCAAGGGCGAAT[Gamma]CGTTTAAACCTGCAGGACTAGT
CCCTTTAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGGCGTAATCATGGT
CATANNNNNNTTTCCTNN(序列58)
A2-AL9 α链:
Va5-CAETY-J36(序列6)
NNNNNNNNNNNNCGCCCTTATACACATCAGAATCCTTACTT
TGTGACACATTTGTTTGAGAATCAAAATCGGTGAATAGGCA
GACAGACTTGTCACTGGATTTAGAGTCTCTCAGCTGGTACA
CGGCAGGGTCAGGCTTCTGGATATAGGGAATAACGGTGAGT
CTCGTTCCAGTCCCAAAGAAGAGGTTGTTTGCCCCAGTTTG
ATAAGTCTCTGCACAGAAGTAGATAGCTGAGTCCCCAGTCT
GGGTGTCTGCAATGCGCAGAGACAGATGTTTATCCTTTTATT
CAATAGAACAGTGAGTCTTTGGTCTTGTTTCATGTCCATATTT
GAGAAAATATACGTCAGCAACTGGAGACCTGCTCCAGATTC
TTGCTTATACCAGTATAAGTAGGTGGAGGAGCTGTCTGTGTA
AGTGCAGTTTATAACGGAGCTGTCTCCCTCTCGGACACTCA
GGAAAAGACTCTGCTCCACATCCTCTCCTCTACTCATACAGT
CCAGCTGCAGCCACAAAAACAGGAACGAAAATCCAGCAAA
TGTCTTCATTGTTCTCCCCACTGGGACCTGCCCCGCGTACTC
TGCGTTGATACCACTGCTTAAGGGCGAATTCGCGGCCGCTA
AATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCACTGN
NNNNNNNTTTNNNNN(序列59)
A2-AL9β链:Vb14-CASSQGVTLLN-J2.1(序列4)
NNNNNNNNNNNNNNNCGCCCTTGGTGTGGGAGANCTCTGC
TTCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACGT
TTTTCAGGTCCTCTAGCACGGTGAGCCGTGTCCCTGGCCCG
AAGAACTGCTCATTCAACAAAGTCACCCCTTGGCTGCTGGC
ACAGAAATAAACTCCAGAATCCTCCAGTTCTGCAGGCTGCA
CCTTCAGAGTAGAATACGTCCCTCCAGTCCTTTCAGCTAAGA
ATCGATTGTTGGGCATACCGGACTCATCCTGTTTAGACTCTT
TCACAAAATGTAACAGAAATTTTATTTCTTTTCCCATAACAC
GTCGATACCAATAAAGATTATCATGTCCAGAAATTGGGTCAC
ATCTCAGAGTCACAGTCTGGCCCTTCTCTATTACGCTGTGGC
TGGGGAACTGAGTAACTCCAGCTTCTATGTGCTAAGCATGA
GAAAAAGGAAAGCAAATCTGTCTCTTGGCCCTGTAAGATGT
GGCCTCCAGTGACATCAGTATATTAGCCAATGTCCACAGTCT
CAGGAGCTCCCTCTACCCCGCGTACTCTGCGTTGATACCACT
GCTTAAGGGCGAATTCGCGGCCGCTAAATTCAATTCGCCCTA
TAGT GAGTCGTATTACAATTCACTGGCN(序列60)
B8-FL8 α链:Va12.2-CAVRGSGTYKYI-J40(序列11)
NNNNGNNCNNANTCGCCCTTNAGCAGTGGTATCAACGCAG
AGTACGCGGGGAAGAATGATGAAATCCTTGAGAGTTTTACT
AGTGATCCTGTGGCTTCAGTTGAGCTGGGTTTGGAGCCAAC
AGAAGGAGGTGGAGCAGAATTCTGGACCCCTCAGTGTTCC
AGAGGGAGCCATTGCCTCTCTCAACTGCACTTACAGTGACC
GAGTTTCCCAGTCCTTCTTCTGGTACAGACAATATTCTGGGA
AAAGCCCTGAGTTGATAATGTCCATATACTCCAATGGTGACA
AAGAAGATGGAAGGTTTACAGCACAGCTCAATAAAGCCAG
CCAGTATGTTTCTCTGCTCATCAGAGACTCCCAGCCCAGTGA
TTCAGCCACCTACCTCTGTGCCGTGCGAGGCTCAGGAACCT
ACAAATACATCTTTGGAACAGGCACCAGGCTGAAGGTTTTA
GCAAATATCCNGAACCCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAG
AGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGA
TTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGA
TGTGTATAANGGCGAATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCC
CTTTAGTGAGGGTTAATTCTGANCTTGGCGTANTCATGGNNN
NNNNNNNNNTTNNNNNNN(序列61)
B8-FL8 β链:Vb15-CATSRGAGSNTGELF-J2.2(序列10)
NNNNNNNNCNNNNTCGCCCTTANGCAGTGGTATCACGCAG
AGTCGCGGGGGAGACAGACAGATGCTTCATTCCTGCATGGG
GTGGTATTCCTGCCATGGGTCCTGGGCTTCTCCACTGGATGG
CCCTTTGTCTCCTTGGAACAGGTCACGGGGATGCCATGGTC
ATCCAGAACCCAAGATACCAGGTTACCCAGTTTGGAAAGCC
AGTGACCCTGAGTTGTTCTCAGACTTTGAACCATAACGTCAT
GTACTGGTACCAGCAGAAGTCAAGTCAGGCCCCAAAGCTG
CTGTTCCACTACTATGACAAAGATTTTAACAATGAAGCAGAC
ACCCCTGATAACTTCCAATCCAGGAGGCCGAACACTTCTTT
CTGCTTTCTTGACATCCGCTCACCAGGCCTGGGGGACGCAG
CCATGTACCTGTGTGCCACCAGCAGAGGGGCAGGATCGAAC
ACCGGGGAGCTGTTTTTTGGAGAAGGCTCTAGGCTGACCGT
ACTGGAGGACCTGAAAACGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGT
GTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCAAGGGCG
AATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTT
AATTCTGAGCTTGGCGTANTCATGGNNNNNNNNNTNTTTNC
NNGN(序列62)
A2-SL9:Va13.2-CAENSDAGGTSYGKLT-J52(序列9)
NNNNNNNGNNNCNNANTCGCCCTNNAGCAGTGGTATCAAC
GCAGAGTACGCGGGGATGGCTGGAGATTGCAGGTTTATGAC
TGATCCTATTTGGGAAGAACAATGATGGCAGGCATTCGAGCT
TTATTTATGTACTTGTGGCTGCAGCTGGACTGGGTGAGCAGA
GGAGAGAGTGTGGGGCTGCATCTTCCTACCCTGAGTGTCCA
GGAGGGTGACAACTCTATTATCAACTGTGCTTATTCAAACAG
CGCCTCANACTACTTCATTTGGTACAAGCAAGAATCTGGAA
AAGATCCTCAATTCATTATAGACATTCGTTCAAATATGGACA
AAAGGCAAGGCCAAAGAGTCACCGTTTTATTGAATAAGACA
GTGAAACATCTCTCTCTGCAAATTGCAGCTACTCAACCTGG
AGACTCAGCTGTCTACTTTTGTGCAGAGAATTCTGATGCTGG
TGGTACTAGCTATGGAAAGCTGACATTTGGACAAGGGACCA
TCTTGACTGTCCATCCNAATATCCAGAAGCCTGACCCTGCCG
TGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTC
TGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAA
AGTAAGGATTCTGATGTGTATAAGGGCGAATTCGTTTAAACC
TGCAGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGG
CGTATCATGTNNNNNN(序列63)
A2-SL9:Vb19-CASSIDGASNQPQH-J1.5(序列7)
NNNNNNNNGNNNNCNANTTCGCCCTTCCCTTTGCACTATGA
GCAACATTTGTTTCCTGGGAGCAAACACCGTGGATGGTGGA
ATCACTCAGTCCCCGAAGTACCTGTTCAGAAAGGAAGGACA
GAATGTGACCCTGAGTTGTGAACAGAATTTGAACCACGATG
CCATGTACTGGTACCGACAGGACCCAGGGCAAGGGCTGAGA
TTGATCTACTACTCACAGATAGTAAATGACTTTCAGAAAGGA
GGTATAGCTGAAGGGTACAGCGTCTCTCGGGAGAAGAAGG
AATCCTTTCCTCTCACTGTGACATCGGCCCAAAAGAACCCG
ACAGCTTTCTATCTCTGTGCCAGTAGTATAGATGGCGCTAGC
AATCAGCCCCAGCATTTTGGTGATGGGACTCGACTCTCCATC
CTAGAGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGT
GTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCAAGGGCG
AATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTT
AATTCTGAGCTTGGCGTAATCATGTCATA NNNNNTTNNNNN
(序列64)
B8-FL8:Vb27-CASSLGQGLANYGYT-J1.2(序列1)
NNNNNNNNNNNNTNNNNNNGTCCTCTACNACGGTTAACCT
GGTCCCCGAACCGAAGGTGTAGCCATAGTTAGCTAAGCCCT
GCCCTAAACTGCTGGCACAGAAGTACGGAGAGGTCTGGTTG
GGGCTGGGCGACTCCAGGATCAGGGGGAAATTCCTCTTCTC
TTTTCGAGAGACTTTGTACCCTTCAGGAACACCTCCCTTATC
AGTCACCTCAACATTCATTGAATAGTAGATCTGCCTTAAGCC
CAGCCCTGGGTCTTGTCGATACCAGGACATATACTCATGGTT
CATATTCTGAGAACAAGTCACTGTTAACTTCTTTCCAGTCAC
TGTGATGAGGTATCTTGGGTTCTGGGTCACTTGGGCTTCCAG
GGGGCCTGCTCCTAGAAGGCAAAGGACCACATAGCCAAGG
AGCTGGGGGCCCATGGCAGCATCAGGCAGGTGTCTGCCAGT
TCTGGGGGCTCCAGGTGGTTTCTGTAACGTCTCCACCTCTTC
CCCCGCGTACTCTGCGTTGATACCACTGCNNNCNCTGCGTT
GANACNNCTGNNN(序列65)
B8-FL8:Va3-CAVRDLTGNQFY-J49(序列3)
GACCCCCCNNNNNNCGCCCGCCGNGAGCTTANNTGGAGCC
ATGGCCTCTGCACCCATCTCGATGCTTGCGATGCTCTTCACA
TTGAGTGGGCTGAGAGCTCAGTCAGTGGCTCAGCCGGAAG
ATCAGGTCAACGTTGCTGAAGGGAATCCTCTGACTGTGAAA
TGCACCTATTCAGTCTCTGGAAACCCTTATCTTTTTTGGTATG
TTCAATACCCCAACCGAGGCCTCCAGTTCCTTCTGAAATACA
TCACAGGGGATAACCTGGTTAAAGGCAGCTATGGCTTTGAA
GCTGAATTTAACAAGAGCCAAACCTCCTTCCACCTGAANAA
ACCATCTGCCCTTGTGAGCGACTCCGCTTTGTACTTCTGTGC
TGTGAGAGACCTCACCGGTAACCAGTTCTATTTTGGGACAG
GGACAAGTTTGACGGTCATTCCAAATATCCAGAACCCTGAC
CCTGCCGTGTACCAGCTGANAGACTCTAAATCCAGTGACAA
GTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGT
GTCACAAANNNNN(序列66)
B57-TW10
Va19-CALSGNHSGGATNKLI-J32(序列12)
NNNGGNCGCNNATTCGCCCTTAAGCAGTGGTATCAACGCAG
AGTACGCGGGGCAGTAACTTTGCTAGTACCTCTTGAGTGCA
AGGTGGAGAATTAAGATCTGGATTTGAGACGGAGCACGGAA
CATTTCACTCAGGGGAAGAGCTATGAACATGCTGACTGCCA
GCCTGTTGAGGGCAGTCATAGCCTCCATCTGTGTTGTATCCA
GCATGGCTCAGAAGGTAACTCAAGCGCAGACTGAAATTTCT
GTGGTGGAGAAGGAGGATGTGACCTTGGACTGTGTGTATGA
AACCCGTGATACTACTTATTACTTATTCTGGTACAAGCAACC
ACCAAGTGGAGAATTGGTTTTCCTTATTCGTCGGAACTCTTT
TGATGAGCAAAATGAAATAAGTGGTCGGTATTCTTGGAACTT
CCAGAAATCCACCAGTTCCTTCAACTTCACCATCACAGCCT
CACAAGTCGTGGACTCAGCAGTATACTTCTGTGCTCTGAGT
GGAAATCACTCAGGTGGTGCTACAAACAAGCTCATCTTTGG
AACTGGCACTCTGCTTGCTGTCCGGCCAAATATCCAGAACC
CTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGT
GACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACA
AATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATAANGGCGAA
TTCGTTTAAACCTGCANGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGNT
AATTCTGANCTNGNCGNNATCNNNNNNN^fNNNNNNNN^^^^I
NNNNNNN(序列67)
B57-TW10
Vb4.3-CASSPWTGGGQPQH-J1.5(序列14)
NNNNNNNGNNNNCNNNTTCGCCCTTANGCAGTGTATCAAC
GCAGAGTACGCGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACG
CGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGGAAGCAG
TGGTATCAACGCAGAGTACGCGGGAAGCAGTGGTATCAACG
CAGAGTACGCGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGC
GGGGGTCATAACGCTATGTATTGGTACAAGCAAAGTGCTAA
GAAGCCACTGGAGCTCATGTTTGTCTACAGTCTTGAAGAAC
GGGTTGAAAACAACAGTGTGCCAAGTCGCTTCTCACCTGAA
TGCCCCAACAGCTCTCACTTATTCCTTCACCTACACACCCTG
CAGCCAGAAGACTCGGCCCTGTATCTCTGCGCCAGCAGCCC
GTGGACAGGGGGCGGCCAGCCCCAGCATTTTGGTGATGGG
ACTCGACTCTCCATCCTAGAGGACCTGAACAAGGTGTTCCC
ACCCGAGGTCGCTGTGGTTGAGCCATCAGAAGCGAGATCTC
CCACACCAAGGGCGAATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTC
CCTTTAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGGCGTAACATGGTCN
TAGNNNNGT TTCCNGA(序列68)
B56-KF11
Va5-CAASGGYQKVTFGTGTKLQVIP(序列15)
NNNNNNNNNNNNNNTCNCCCTTNNNCNGNGGTNNCNNCGC
NNAGNANNCGGGGGAAGANATACTTGNNNNTATNGCTCTCT
TGGCTGGAGATTGCAGGTCCCAGTGGGGAGAACAATGAAG
ACATITGCTGGATITTCGTTCCTGTTTTTGTGGCTGCAGCTGG
ACTGTATGAGTAGAGGAGAGGATGTGGAGCAGAGTCTTTTC
CTGAGTGTCCGAGAGGGAGACAGCTCCGTTATAAACTGCAC
TTACACAGACAGCTCCTCCACCTACTTATACTGGTATAAGCA
AGAACCTGGAGCAGGTCTCCAGTTGCTGACGTATATTTTTTC
AAATATGGACATGAAACAAGACCAAAGACTCACTGTTCTAT
TGAATAAAAAGGATAAACATCTGTCTCTGCGCATTGCAGAC
ACCCAGACTGGGGACTCAGCTATCTACTTCTGTGCAGCTTCT
GGGGGTTACCAGAAAGTTACCTTTGGAACTGGAACAAAGCT
CCAAGTCATCCCAAATATCCAGAAGCCTGACCCTGCCGTGT
ACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAGTGACAAGTCTGTCTGC
CTATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGT
AAGGATTCTGATGTGTATATCACAGACAAAACTGTCCATAGA
CCTCATGTCTAGCACAGTTTTGTCTGTGATCCCGCGTACTCT
GCGTTGATACCACTGCTTANNNGNCGAATTCGTTTAAACCTG
CNNNACTAGTCCCTTTANTGAGGGTTAATTCTGANCTTGNN
GTAATCNTGGNNNNNNCNNNNNNTTTNCCNGNNNNN(序列
69)
B57-KF11
Vb19-CASTGTYGYT-J1.2(序列16)
NNNNNNNNNCNCNNANTCGCCCTTAAGCAGTGGTATCAAC
GCAGAGTACGCGGGGACATTAGGCCAGGAGAAGCCCCCGA
GCCAAGTCTCTTTTCTCATTCTCTTCCAACAAGTGCTTGGAG
CTCCAAGAAGGCCCCCTTTGCACTATGAGCAACCAGGTGCT
CTGCTGTGTGGTCCTTTGTCTCCTGGGAGCAAACACCGTGG
ATGGTGGAATCACTCAGTCCCCAAAGTACCTGTTCAGAAAG
GAAGGACAGAATGTGACCCTGAGTTGTGAACAGAATTTGAA
CCACGATGCCATGTACTGGTACCGACAGGACCCAGGGCAAG
GGCTGAGATCGATCTACTACTCACAGATAGTAAATGACTTTC
AGAAAGGAGATATAGCTGAAGGGTACAGCGTCTCTCGGGAG
AAGAAGGAATCCTTTCCTCTCACTGTGACATCGGCCCAAAA
GAACCCGACAGCTTTCTATCTCTGTGCCAGTACCGGGACTTA
TGGCTACACCTTCGGTTCGGGGACCAGGTTAACCGTTGTAG
AGGACCTGAACAAGGTGTTCCCACCCGAGGTCGCTGTGTTT
GAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCAAGGGCGAATT
CGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTTAATT
CTGAGCTTGGCGTANTCATGGTCNNNNNNTNNNTTNCCNGN
N(序列70)
B60-SL9
Va12.3-CAMSAQQAGTALI-J15(序列18)
NNNNNNNGNNNNCNNNTCGCCCTTNAGCAGTGGTATCAAC
GCAGAGTACGCGGGGAGGACAGATTTCTTTTATGATTCCTAC
AGCAGAAAAATGAGAAACGTTTGTTATTATTTTTTTTTCGTG
TTTAAAGTTTGAATCCTCAGTGAACCAGGGCAGAAAAGAAT
GATGAAATCCTTGAGAGTTTTACTGGTGATCCTGTGGCTTCA
GTTAAGCTGGGTTTGGAGCCAACAGAAGGAGGTGGAGCAG
GATCCTGGACCACTCAGTGTTCCAGAGGGAGCCATTGTTTC
TCTCAACTGCACTTACAGCAACAGTGCTTTTCAATACTTCAT
GTGGTACAGACAGTATTCCAGAAAAGGCCCTGAGTTGCTGA
TGTACACATACTCCAGTGGTAACAAAGAAGATGGAAGGTTT
ACAGCACAGGTCGATAAATCCAGCAAGTATATCTCCTTGTTC
ATCAGAGACTCACAGCCCAGTGATTCAGCCACCTACCTCTG
TGCAATGAGCGCGCAACAGGCAGGAACTGCTCTGATCTTTG
GGAAGGGAACCACCTTATCAGTGAGTTCCAATATCCAGAAC
CCTGACCCTGCCGTGTACCAGCTGAGAGACTCTAAATCCAG
TGACAAGTCTGTCTGCCTATTCACCGATTTTGANTCTCAAAC
AAATGTGTCACAAAGTAAGGATTCTGATGTGTATAANGGCG
AATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCCCTTTAGTGAGGGTT
AATTCTGAGCTTGGCGNNATCNNNNNNAANNNTNTTTTNNN
NNNNNN(序列71)
B60-SL9Vb11.2
Vb11.2-CASSLVIMSEQY-J2.7(序列20)
NNNNNNNNGNNNCNNNTCGCCCTTGGTGTGGGAGANCTCT
GCTTCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACAC
GTTTTTCAGGTCCTCTGTGACCGTGAGCCTGGTGCCCGGCC
CGAAGTACTGCTCGCTCATGGTGACTAAGCTGCTGGCACAG
AGATACACGGCCGAGTCCTCAAGCTTTGCAGGCTGGATCTT
GAGAGTGGAGTCTACTCCTTTGAGCCTCTCTGCAGAAAATC
GATCCTTAGGCAACTGTGAATCATCCACTACACCGTTATTCT
GAAACTGAATCAGAAGCTTTGGGCCCTGTCCCAGGATCTGC
TGGTACCAGTAAAGGGTAGCATGGCCAGATATAGGATTGCA
CCAAAAAGCCACACTCTGCCTTTTCTCTATAATCTTATATCTG
GGAGACTGGGCAACTCCAGCTTCTGTGAGTTCTGCTCCCAG
GAGACAGAGGGCCGCCCAGCAGAGGAGCCTGGTGCCCATG
GCAGGGTCAGGGAAGGATGGGAGCTTTGCCCAATCAAGGT
CACTGTGAGCAACAGCCCCCGCGTACTCTGCGTTGATACCA
CTGCTTAAGGGCGAATTCGTTTAAACCTGCAGGACTAGTCC
CTTTAGTGAGGGTTAATTCTGAGCTTGGCGTNNTCATGGTNN
NNNNNNNTTTNCCNNNN(序列72)
A3/A11 QK10
Vb27-CASSVRTGELF-J2.2(序列30)
NNNNNNNNNNNANTCGCCCTTGGTGTGGGAGANCTCTGCT
TCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACGnT
TTCAGGTCCTCCAGTACGGTCAGCCTAGAGCCTTCTCCAAA
AAACAGCTCCCCGGTCCGTACGCTGCTGGCACAGAAGTACA
GAGAGGTCTGGTTGGGGCTCGGCGACTCCAGGATCAGGGG
GAAATTCCTCTTCTCTTTTCGAGAGACTTTGTACCCTTCAGG
AACATCTCCCTTATCAGTCACCTCAACATTCATTGAATAGTA
GATCTGCCTTAAGCCCAGCCCTGGGTCTTGNTGNNACCAGA
ACAGAATTCGAGAAGGGCGAATTCGCGGCCGCTAAATTCAA
TTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCACTGGCCGNNNT
TTTANNN(序列73)
Vb9-CASSERDSQYQETQY-J2.5(序列33)
NNNNNNNNNNNNNTCGCCCTTGGTGTGGGAGANCTCTGCT
TCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACGTT
TTTCAGGTCCTCGAGCACCAGGAGCCGCGTGCCTGGCCCGA
AGTACTGGGTCTCTTGGTACTGACTGTCCCTCTCGCTGCTGG
CACAGAAATACAAAGCTGAGTCCCCCAGCTCCAGAGAGCTC
AGGTTTAGTTCAGAGTGCAAGTCAGGGAACTGTTGTGCGGA
GAATCGTTCAAGAATGTTTCCTTTTGCTCTCTCTTCTCCATTA
TAATACTGAATGAGGAACTGGAGGCCCTGGTCCAGGCTCTG
ATGGTACCANNACAGAATTCGAGAAGGGCGAATTCGCGGCC
GCTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCAC
TGGCCGNNCGTTTTANAN(序列74)
Va29-CAASFTQNGLT-J45(序列34)
NNNNNNNNNNNNANTCGCCCTTANCAGTGGTATCAACGCA
GAGTACGCGGGGGGACATGAATAAAGCACAGGAGGTTGAA
GTCAGATTTGCAGCTTTCTAGGCGGGAGACAAGACAATCTG
CATCTTCACAGGGGGGATGGCCATGCTCCTGGGGGCATCAG
TGCTGATTCTGTGGCTTCAGCCAGACTGGGTAAACAGTCAA
CAGAAGAATGATGACCAGCAAGTTAAGCAAAATTCACCATC
CCTGAGCGTCCAGGAAGGAAGAATTTCTATTCTGAACTGTG
ACTATACTAACAGCATGTTTGATTATTTCCTATGGTACAAAAA
ATACCCTGCTGAAGGTCCTACATTCCTGATATCTATAAGTTCC
ATTGAGGATAAAAATGAAGATGGAAGATTCACTGTCTTCTTA
AACAAAAGTGCCAAGCACCTCTCTCTGCACATTGTGCCCTC
CCAGCCTGGAGACTCTGCAGTGTACTTCTGTGCAGCAAGCT
TCACGCAGAACGGACTCACCTTTGGCAAAGGGACTCATCTA
ATCATCCAGCCCTATATCCAGAACCCTGACCCTGCCGTGTAC
CAGCTGAGAGACTCTAACTCCAGTGACAAGTCTGTCTGCCT
ATTCACCGATTTTGATTCTCAAACAAATGTGTCACAAAGTAA
GGATTCTGATGTGTATAANGNCGAATTCGCGGCCGCTAAATT
CAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCAC
TGNNNNNCNNNNTTTNN(序列75)
A3/A11 QK10
Vb14-CASSPVLYEQY-J2.7(序列35)
NNNNNNNNNNNNNCGCCCTTGGTGTGGGANANCTCTGCTT
CTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACGTTT
TTCAGGTCCTCTGTGACCGTGAGCCTGGTGCCCGGCCCGAA
GTACTGCTCGTATAGAACGGGGCTGCTGGCACAGAAATAAA
CTCCAGAATCCTCCAGTTCTGCAGGCTGCACCTTCAGAGTA
GAATACGTCCCTCCAGTCCTTTCAGCTAAGAATCGATTGTTG
GGCATACCGGACTCATCCTGTTTAGACTCTTTCACAAAATGT
AACAGAAATTTTATTTCTTTTCCCATAACATGTCGATACCAGT
ACAGAATTCGAGAAGGGCGAATTCGCGGCCGCTAAATTCAA
TTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCACTGGCCGNCGT
TTTNNNN(序列76)
Vb9-CASSARAFPEGNQPQH-J1.5(序列37)
NNNNNTNNNNNNNATTCGCCCTTGGTGTGGGANANCTCTGC
TTCTGANGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACC
TTGTTCAGGTCCTCTAGGATGGAGAGTCGAGTCCCATCACC
AAAATGCTGGGGCTGATTGCCCTCTGGGAAGGCCCGGGCGC
TGCTGGCACAGAAATACAAAGCTGAGTCCCCCAGCTCCAGA
GAGCTCAGGTTTAGTTCAGAGTGCAAGTCAGGGAACTGTTG
TGCGGAGAATCGTTCAAGAATGTTTCCTTTTGCTCTCTCTTC
TCCATTATAATAGTGAATGAGGAACTGGAGGCCCTGGTCCA
GGCTCTGACGGTACCAGTACAGAATTCGAGAAGGGCGAATT
CGCGGCCGCTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTA
CAATTCACTGGCCGTCGTTTTANAN(序列77)
Va39-CAVVAQGGSEKLV-J57(序列38)
NNNNNTNNNNNNNATTCGCCCTTGGTGTGGGANANCTCTGC
TTCTGANGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACC
TTGTTCAGGTCCTCTAGGATGGAGAGTCGAGTCCCATCACC
AAAATGCTGGGGCTGATTGCCCTCTGGGAAGGCCCGGGCGC
TGCTGGCACAGAAATACAAAGCTGAGTCCCCCAGCTCCAGA
GAGCTCAGGTTTAGTTCAGAGTGCAAGTCAGGGAACTGTTG
TGCGGAGAATCGTTCAAGAATGTTTCCTTTTGCTCTCTCTTC
TCCATTATAATAGTGAATGAGGAACTGGAGGCCCTGGTCCA
GGCTCTGACGGTACCAGTACAGAATTCGAGAAGGGCGAATT
CGCGGCCGCTAAATTCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTA
CAATTCACTGGCCGTCGTTTTANAN(序列78)
A3 QK10
Vb10.2-CASSETNRVMEAF-J1.1(序列39)
NNNNNNNNANNNNTTCGCCCTTGGTGTGGGAGNNCTCTGC
TTCTGATGGCTCAAACACAGCGACCTCGGGTGGGAACACCT
TGTTCAGGTCCTCTACAACTGTGAGTCTGGTGCCTTGTCCAA
AGAAAGCTTCCATTACCCTGTTTGTTTCACTGCTGGCGCAGA
AATACACAGATGTCTGGGAGCGGGTAGCTGACTCCAGAGTG
AGGGGGAAATTCTCTGTCTTGGATCTGGAGACAACATAGCC
ATCGGGGACTTCTCCTTTATCTGTAATATCAGCAGCTGCTGA
GTAATAGATCAGCCTCAGCCCATGTCCCAGGTCTTGACGGTA
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病原体特异性可溶性T细胞受体构建体
对于体内免疫治疗途径而言,能够特异性的识别在感染HIV-I的细胞的表面上结合有MHC(主要组织相容性复合体)I类分子的HIV-I细胞毒性T细胞表位的分子化合物是一种有力的工具,它可以直接命中感染细胞。而且,这些化合物被用来在自然感染的过程中对淋巴细胞或者专职抗原呈递细胞上呈现出的HIV-I抗原进行诊断性的体外评估。能够特异性的与同源MHC复合体发生结合的可溶性单链α/βT细胞受体构建体代表的是能够对HIV-I感染细胞进行直接体外命中或者体内命中的最有希望的分子。可溶性T细胞受体的氨基酸序列对特异性病原体的识别是以天然产生的T细胞受体的序列为基础的。在本发明公开之前,对于具有HIV-I表位或者HCV表位特异性的天然产生的T细胞受体的T细胞受体序列而言,仅有非常有限的信息可以利用。本发明描述的数据阐明了HIV-I或者HCV特异性T细胞受体基因的序列,所述的序列可以用于进行可溶性T细胞受体的构建,用于诊断和治疗的用途。
目前,可以利用重组HIV-I特异性抗体进行HIV-I感染细胞的直接命中。所述的抗体途径的一个缺点在于,HIV-I抗体仅仅能接触到HIV-I病毒的包膜,而官能上最重要的HIV蛋白隐藏在包膜之内,并且只能在由MHC I类分子或者II类分子进行胞内加工和呈递之后与免疫系统相接触。一旦被MHC分子所呈递,这些HIV基因产物会被T细胞受体所识别,而不是被抗体所识别。因此,HIV-I抗体仅仅能够用于进行非常有限的HIV-I感染细胞的命中。本发明描述的组合物提供了一种解决上述问题的方法。
对于HIV I或者HCV具有特异性的可溶性T细胞受体与现 有方法相比具有显著的优点
已经识别出天然产生的HIV-I特异性CD8+T细胞克隆的T细胞受体α链以及β链的完整序列。迄今为止(to date)已经识别出这些HIV-I或者HCV特异性CD8+T细胞的T细胞受体序列。
所述的T细胞受体序列能够有效的用于重组单链T细胞受体的生产当中,其中所述的重组单链T细胞受体能够特异性的识别HIV-I感染细胞。这些重组T细胞受体在实践中被用来(i)在免疫治疗方法中进行HIV-I感染细胞的体内命中;(ii)对淋巴细胞或者专职抗原呈递细胞中表达的HIV-I抗原进行体外评估。对HIV-I抗原表达的定量分析对于HIV-I免疫发病机理的研究而言是重要的,其对于免疫治疗方法的体外监测而言也是有效的。
当前,对于HIV-I感染患者的治疗是以抗逆转录病毒类药物的使用为基础的。这些药物是非常有效的,但是具有蓄积毒性,同时伴随着高度的服药负担(pill burden)且能够产生病毒抗性。因此,对于这些患者而言,其他的治疗选择仍然是一种持续的需要。利用可溶性T细胞受体的免疫治疗方法代表的是对于HIV-I或者HCV感染患者人群的一种可供选择的治疗选择。除此之外,所述的T细胞受体可以被用来进行HIV-I抗原表达的体外评估。
诊断方法
可溶性T细胞受体被用来对呈递于专职抗原呈递细胞之上的细胞毒性T细胞表位的I类HLA介导的呈递进行分析。例如,从宿主处获得一种体液样本,例如,血液,或者身体组织,例如淋巴结。将来自于所述样本中的白细胞与本发明所述的单链T细胞受体进行接触。为了增加灵敏性,将四个单链T细胞受体构建体连接在一起,例如与一种中心链亲和素进行连接,从而形成一种四聚物复合体。将所述的构建体与一种可检测的标记物进行连接,例如使用荧光基团对其进行标记。可检测的标记物包括荧光染料,例如藻红蛋白(PE),异硫氰酸荧光素(FITC),以及别藻蓝蛋白(APC)。检测是通过流式细胞术和/或组织染色(免疫组织化学)来进行的。在另外一种实施例中,将大量的T细胞受体构建体固定于一种微阵列之上,例如木片或者平板之上,并且允许来自于患者的样本与所述的阵列发生接触,对所述的阵列进行洗涤,并且对结合的细胞进行检测。通过这种方式,测定出患者的抗原呈递细胞所表达或者呈递出的肽。因此,可溶性T细胞受体同样可以作为一种有效的研究工具,用来对HIV-I或者HCVCTL(细胞毒性T淋巴细胞)表位呈递进行体外评估以及量化分析。它们是有用的工具,用来对表达特异性HIV-I或者HCV CTL表位的患者进行识别,并且因此成为本发明描述的免疫治疗干涉法的最有前途的候选物。
治疗方法
为治疗感染HCV或者HIV的患者,给他们施用可溶性单链T细胞受体的一种或者多种的混合物。所述的T细胞受体共轭于另外一种组合物,例如细胞因子,例如白细胞介素-2,γ干扰素,α干扰素或者细胞毒素试剂,例如穿孔素,粒酶或者特异性药物。对于HCV的治疗而言,将所述的可溶性单链HCV特异性T细胞受体任选的共轭或者连接至干扰素之上,例如α干扰素。这种构建体的一种优点是延长了半衰期,并且增加了这些试剂对于感染细胞所进行的直接的抗原特异性传递。这种治疗策略降低了总体的药物剂量,给药频率,以及与治疗相关的副作用。
根据目标群体的遗传特性(例如,特定的HLA类型的发生率)对T细胞受体构建体进行选择。例如,使用可溶性T细胞受体的集合(pool),识别全部的(a repertoire of)细胞毒性T细胞表位,其中所述的细胞毒性T细胞表位受到一种特殊的群体中最频繁产生的HLA I类分子的限制。或者,测定一种特定患者的HLA类型,根据所述患者的HLA类型选择一种或者多种HLA特异性T细胞受体进行施用。
肠胃外施用,例如静脉内,皮下,肌肉内,以及腹腔内给药途径,可以用来传递可溶性T细胞受体构建体。例如,将可溶性T细胞受体以每个动物32微克的剂量静脉注射给小鼠。使用本领域熟知的方法进行患者剂量的确定。
施用本发明所述的组合物来抑制病毒病原体。对于一种特定的情形而言,确定合适的剂量以及给药方案在本领域的技术范围之内。治疗性化合物的有效剂量优选在大约0.1毫克/千克至大约150毫克/千克的范围之内。本领域技术人员知晓,有效剂量的改变取决于给药途径,赋形剂的使用,以及与其他治疗方案的共同施用,其中所述的其他治疗方案包括其他试剂或者治疗剂的使用。通过使用标准方法对遭受病毒病原体感染的(或者存在感染危险的)哺乳动物患者例如人类患者进行识别,来实施治疗方案。使用本领域已知的方法将所述的药物化合物施用给这样的个体。优选的,所述的化合物通过口服,直肠内,鼻腔内,局部或者肠胃外的形式施用,其中所述的肠胃外的形式是例如皮下,腹腔内,鞘内,肌肉内,以及静脉内的形式。
其他实施方式
尽管已经对本发明进行了详细的描述,前述的描述意在进行阐述而不是限制本发明的范围,本发明的范围是又后附的权利要求进行定义的。其他的特征,优点以及修改在随后的权利要求的范围之内。

Claims (32)

1.一种组合物,包括编码可溶性I类HLA限定的T细胞受体(TCR)多肽的分离的核酸,其中所述的多肽特异性的与HIV或者HCV表位发生结合。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸编码一种包括序列4的分离的T细胞受体多肽。
3.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸编码一种包括序列6的分离的T细胞受体多肽。
4.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸编码一种包括序列4以及序列6的分离的T细胞受体多肽。
5.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸编码一种包括序列27的分离的T细胞受体多肽。
6.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸编码一种包括序列29的分离的T细胞受体多肽。
7.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸编码一种包括序列27以及序列29的分离的T细胞受体多肽。
8.一种组合物,包括一种分离的T细胞受体多肽,其中所述的多肽与HIV或者HCV表位发生了特异性的结合。
9.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的分离的T细胞受体多肽包括序列4。
10.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的分离的T细胞受体多肽包括序列6。
11.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的分离的T细胞受体多肽包括序列4以及序列6。
12.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的分离的T细胞受体多肽包括序列27。
13.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的分离的T细胞受体多肽包括序列29。
14.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的分离的T细胞受体多肽包括序列27以及序列29。
15.根据权利要求1或者8所述的组合物,其中所述的T细胞受体多肽与HIV-I表位发生了结合。
16.根据权利要求1或者8所述的组合物,其中所述的T细胞受体多肽与HCV表位发生了结合。
17.根据权利要求1所述的核酸,其中所述的核酸包括一种α链T细胞受体序列以及一种β链受体序列。
18.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的T细胞受体多肽进一步包括一种可检测的标记物。
19.根据权利要求18所述的T细胞受体多肽,其中所述的可检测标记物是荧光染料。
20.根据权利要求8所述的T细胞受体多肽,其中所述的T细胞受体多肽进一步包括一种细胞毒性组合物。
21.根据权利要求8所述的T细胞受体多肽,其中所述的T细胞受体多肽进一步包括一种细胞因子。
22.一种组合物,包括大量权利要求8所述的可溶性单链I类HLA限制性T细胞受体多肽,其中所述的多肽是固定于一种固体支持物之上的,其中所述的大量的T细胞受体多肽中的每一种都结合了不同的病毒表位。
23.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的T细胞受体多肽包括一种α链序列以及一种β链序列,所述的α链序列以及β链序列均具有至少8个残基的长度。
24.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的α链序列以及β链序列均具有8至20个残基的长度。
25.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的多肽包括一种如表1中所示的α链序列以及β链序列对。
26.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的多肽包括一种来自于表1中所列出的α链序列。
27.根据权利要求8所述的组合物,其中所述的多肽包括一种来自于表1中所列出的β链序列。
28.根据权利要求1所述的组合物,其中所述的核酸包括一种来自于表2中所列出的α链编码序列。
29.根据权利要求2所述的组合物,其中所述的核酸包括一种来自于表2中所列出的β链编码序列。
30.一种诊断病毒感染的方法,包括使一种分离的病毒特异性可溶性T细胞受体构建体与来自于受试宿主的体液或者组织样本发生接触,以及检测结合的T细胞受体构建物,其中所述的结合意味着病毒感染。
31.一种抑制病毒感染的方法,包括给宿主施用一种分离的单链可溶性病毒特异性T细胞受体,所述受体包括一种细胞毒性试剂。
32.根据权利要求31所述的方法,其中所述的受体与HIV或者HCV表位发生了特异性的结合。
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