KR20230046294A - G12v 돌연변이를 갖는 ras에 대한 hla 클래스 ii-제한된 drb t 세포 수용체 - Google Patents

G12v 돌연변이를 갖는 ras에 대한 hla 클래스 ii-제한된 drb t 세포 수용체 Download PDF

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노암 레빈
프랑크 제이 3세 로워리
마리아 알 파커스트
스티븐 에이 로젠버그
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더 유나이티드 스테이츠 오브 어메리카, 애즈 리프리젠티드 바이 더 세크러테리, 디파트먼트 오브 헬쓰 앤드 휴먼 서비씨즈
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Abstract

본 발명은 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖는 단리되거나 정제된 T 세포 수용체(TCR)에 관한 것이다. TCR은 HLA-DR 이종이량체에 의해 제시된 G12V RAS를 인식할 수 있다. 관련된 폴리펩티드 및 단백질, 뿐만 아니라 관련된 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 및 약학 조성물이 또한 제공된다. 또한, 포유동물에서 암의 존재의 검출 방법 및 포유동물에서 암의 치료 또는 예방 방법이 개시된다.

Description

G12V 돌연변이를 갖는 RAS에 대한 HLA 클래스 II-제한된 DRB T 세포 수용체
관련 출원의 상호-참조
본원은 2020년 7월 16일자 출원된 미국 가출원 제63/052,502호(이의 전문은 본원에 참조로 혼입됨)를 우선권 주장한다.
연방 지원된 연구 개발에 관한 진술
본 발명은 국립 보건원, 국립 암 연구소에 의해 ZIABC010984의 프로젝트 번호 하에 정부 지원으로 이루어졌다. 정부는 본 발명에 일정한 권리를 갖는다.
전자 제출된 자료의 참조에 의한 혼입
본원과 동시에 제출되고 하기와 같이 확인된 컴퓨터-판독가능한 뉴클레오티드/아미노산 서열 목록이 전체적으로 본원에 참조로 혼입된다: 2021년 5월 17일자 생성되어 "754396_ST25.txt"로 명명된 1개의 58,420 바이트 ASCII(텍스트) 파일.
몇몇 암들은, 특히 암이 전이성이 되고 절제불가능하게 될 때, 매우 제한된 치료 선택권을 가질 수 있다. 예를 들어, 수술, 화학요법 및 방사선 치료와 같은 치료법의 발전에도 불구하고, 예를 들어, 췌장암, 대장암, 폐암, 자궁내막암, 난소암 및 전립선암과 같은 많은 암들에 대한 예후는 불량할 수 있다. 따라서, 암의 또 다른 치료법에 대한 미충족 요구가 남아있다.
본 발명의 양태는 (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열, (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는 (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열을 포함하는 단리되거나 정제된 T 세포 수용체(TCR)를 제공하고, 이때 TCR은 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖고, 상기 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열은 돌연변이된 인간 키르스텐 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(KRAS), 돌연변이된 인간 하베이 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(HRAS), 또는 돌연변이된 인간 신경아세포종 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(NRAS) 아미노산 서열이고, 위치 12는 각각 야생형 인간 KRAS, 야생형 인간 HRAS 또는 야생형 인간 NRAS 단백질을 기준으로 정의된다.
본 발명의 또 다른 양태는 본 발명의 TCR의 기능성 부분을 포함하는 단리되거나 정제된 폴리펩티드를 제공하고, 이때 상기 기능성 부분은 (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열, (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는 (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 또 다른 양태는 서열번호 1 내지 3의 아미노산 서열을 포함하는 제1 폴리펩티드 쇄 및 서열번호 4 내지 6의 아미노산 서열을 포함하는 제2 폴리펩티드 쇄를 포함하는 단리되거나 정제된 단백질을 제공한다.
본 발명의 한 양태는 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질과 관련된 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 및 약학 조성물을 제공한다.
본 발명의 한 양태는, 5'로부터 3'로, 제1 뉴클레오티드 서열 및 제2 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리되거나 정제된 핵산을 제공하고, 이때 제1 및 제2 뉴클레오티드 서열은 각각 서열번호 7 및 8; 8 및 7; 9 및 10의 아미노산 서열을 암호화한다.
포유동물에서 암의 존재를 검출하는 방법, 포유동물에서 암의 치료 또는 예방 방법, 포유동물에서 암에 대한 면역반응을 유도하는 방법, MTEYKLVVVGA V GVGKSALTIQLI(서열번호 34)의 펩티드에 대한 항원 특이성을 갖는 TCR을 발현하는 숙주 세포, 및 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질의 생산 방법이 또한 본 발명의 한 양태에 의해 제공된다.
도 1a 및 1b는 표적 세포와 효과기 세포의 공동-배양 후, INF-γ 분비량(pg/mL)(도 1a), 또는 4-1BB 발현에 대해 양성인 TCR 뮤린 불변 영역(mTCR) 양성/CD3+ 세포의 백분율(도 1b)을 나타내는 그래프를 도시한다. 효과기 세포는 4304 TCR1로 형질도입된 T 세포였다. 표적 세포는 G12V 24-량체 펩티드(정사각형)(KRAS mut) 또는 상응하는 WT 24-량체 펩티드(원)(KRAS wt)의 지시되는 농도(ng/mL)에 의해 펄스화된 DC였다.
도 2는 효과기 세포와 표적 세포의 공동-배양 후, ELISPOT 분석에 의해 측정된 INF-γ 분비(반점/3e4 세포)를 나타내는 그래프를 도시한다. 효과기 세포는 4304 TCR1에 의해 형질도입된 건강한 공여자 PBL이었다. 표적 세포는 나타낸 HLA 클래스 II 이종이량체 중 하나에 의해 독립적으로 형질감염된 COS7 또는 HEK 293 세포였다. 표적 세포는 G12V 24-량체 펩티드에 의해 로딩되었고 미리 형질감염된 각각의 HLA 클래스 II 분자를 차단하는 항체의 존재 또는 부재 하에 배양되었다. DMSO와 함께 배양된 표적 세포를 음성 대조군으로서 사용하였다. (i) G12V 24-량체 펩티드와 공동-배양된 환자 4304로부터의 자기유래 DC를 양성 대조군으로서 사용하고, (ii) DMSO와 공동-배양된 환자 4304로부터의 자기유래 DC를 음성 대조군으로서 사용하였다.
RAS 패밀리 단백질은 소 GTPase의 큰 패밀리에 속한다. 특정 이론 또는 기전에 구속되지 않고, 돌연변이될 때, RAS 단백질이 많은 인간 암의 발암 초기에 신호전달에 수반될 수 있는 것으로 생각된다. 단일 아미노산 치환은 단백질을 활성화시킬 수 있다. 돌연변이된 RAS 단백질 생성물은 구성적으로 활성화될 수 있다. 돌연변이된 RAS 단백질은 임의의 다양한 인간 암, 예컨대 췌장암(예를 들어, 췌장 암종), 대장암, 폐암(예를 들어, 폐 선암종), 자궁내막암, 난소암(예를 들어, 상피 난소암) 및 전립선암에서 발현될 수 있다. 인간 RAS 패밀리 단백질은 KRAS, HRAS 및 NRAS를 포함한다.
또한, KRAS는 GTPase KRas, V-Ki-Ras2 키르스텐 래트 육종 바이러스 발암유전자 또는 KRAS2로 지칭된다. KRAS의 2개의 전사 변이체가 존재한다: KRAS 변이체 A 및 KRAS 변이체 B. 야생형(WT) KRAS 변이체 A는 서열번호 11의 아미노산 서열을 갖는다. WT KRAS 변이체 B는 서열번호 12의 아미노산 서열을 갖는다. 이후, 달리 명시되지 않는 한, "KRAS"(돌연변이되거나 돌연변이되지 않음(WT))에 대한 언급은 변이체 A 및 변이체 B 둘 다를 지칭한다. 활성화될 때, 돌연변이된 KRAS는 구아노신-5'-트라이포스페이트(GTP)에 결합하고 GTP를 구아노신 5'-다이포스페이트(GDP)로 전환시킨다.
HRAS는 RAS 단백질 패밀리의 또 다른 구성원이다. 또한, HRAS는 하베이 래트 육종 바이러스 종양 단백질, V-Ha-Ras 하베이 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체 또는 Ras 패밀리 소 GTP 결합 단백질 H-Ras로 지칭된다. WT HRAS는 서열번호 13의 아미노산 서열을 갖는다.
NRAS는 RAS 단백질 패밀리의 또 다른 구성원이다. 또한, NRAS는 GTPase NRas, V-Ras 신경아세포종 RAS 바이러스 발암유전자 동족체 또는 NRAS1로 지칭된다. WT NRAS는 서열번호 14의 아미노산 서열을 갖는다.
본 발명의 한 양태는 단리되거나 정제된 TCR을 제공하고, 이때 TCR은 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖고, 상기 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열은 돌연변이된 인간 KRAS, 돌연변이된 인간 HRAS 또는 돌연변이된 인간 NRAS 아미노산 서열이고, 위치 12는 각각 WT 인간 KRAS, WT 인간 HRAS 또는 WT 인간 NRAS 단백질을 기준으로 정의된다. 이어서, "TCR"에 대한 언급은 또한 달리 특정되지 않는 한 TCR의 기능성 부분 및 기능성 변이체를 지칭한다.
돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열은 돌연변이된 인간 KRAS 아미노산 서열, 돌연변이된 인간 HRAS 아미노산 서열 또는 돌연변이된 인간 NRAS 아미노산 서열일 수 있다. WT 인간 KRAS, NRAS 및 HRAS 단백질의 아미노산 서열은 각각 188 또는 189개의 아미노산 잔기의 길이를 가지며 서로에 대한 높은 동일성을 갖는다. 예를 들어, WT 인간 NRAS 단백질의 아미노산 서열은 WT 인간 KRAS 단백질의 것에 86.8% 동일하다. WT 인간 NRAS 단백질 및 WT 인간 KRAS 단백질의 아미노산 잔기 1 내지 86은 100% 동일하다. WT 인간 HRAS 단백질의 아미노산 서열은 WT 인간 KRAS 단백질의 것에 86.3% 동일하다. WT 인간 HRAS 단백질 및 WT 인간 KRAS 단백질의 아미노산 잔기 1 내지 94는 100% 동일하다. 이후, 달리 명시되지 않는 한, "RAS"(돌연변이되거나 돌연변이되지 않음(WT))의 언급은 일괄하여 KRAS, HRAS 및 NRAS를 지칭한다.
본 발명의 한 양태에서, 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열은 발린에 의한 위치 12의 글리신 치환을 갖는 인간 RAS 아미노산 서열을 포함하되, 상기 위치 12는 상응하는 WT RAS 단백질을 기준으로 정의된다. WT RAS 단백질은 WT KRAS 단백질(서열번호 11 또는 12), WT HRAS 단백질(서열번호 13) 또는 WT NRAS 단백질(서열번호 14) 중 임의의 것일 수 있는 데, 이는 상기에 설명된 바와 같이, WT 인간 NRAS 단백질 및 WT 인간 KRAS 단백질의 아미노산 잔기 1 내지 86이 100% 동일하고, WT 인간 HRAS 단백질 및 WT 인간 KRAS 단백질의 아미노산 잔기 1 내지 94가 100% 동일하기 때문이다. 따라서, WT KRAS, WT HRAS 및 WT NRAS 단백질 각각의 위치 12의 아미노산 잔기는 동일하고, 즉, 글리신이다.
돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열은 발린에 의한 위치 12의 글리신 치환을 갖는다. 이와 관련하여, 본 발명의 한 양태는 G12V 돌연변이를 갖는 임의의 인간 RAS 단백질, 폴리펩티드 또는 펩티드 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖는 TCR을 제공한다.
RAS의 돌연변이 및 치환은 WT RAS 단백질의 아미노산 서열과 관련하여 본원에서 한정된다. 따라서, RAS의 돌연변이 및 치환은, WT RAS 단백질의 특정 위치(즉, 위치 12)에 존재하는 아미노산 잔기, 이어서 위치 번호, 이어서 논의 중인 특정 돌연변이 또는 치환에서 잔기를 대체하는 아미노산 잔기와 관련하여 본원에서 기재된다. RAS 아미노산 서열(예를 들어, RAS 펩티드)은 전장 WT RAS 단백질의 모든 아미노산 잔기보다 적은 아미노산 잔기를 포함할 수 있다. 따라서, 위치 12는, RAS 아미노산 서열의 특정 예에서 상응하는 잔기의 실제 위치가 상이할 수 있다는 점을 포함해서, WT 전장 RAS 단백질(즉, 서열번호 11 내지 14 중 어느 하나)과 관련하여 본원에서 한정된다. 위치가 서열번호 11 내지 14 중 어느 하나에 의해 한정되는 경우, 용어 "G12"는 서열번호 11 내지 14 중 어느 하나의 위치 12에 정상적으로 존재하는 글리신을 지칭하고, "G12V"는 서열번호 11 내지 14 중 어느 하나의 위치 12에 정상적으로 존재하는 글리신이 발린으로 대체됨을 나타낸다. 예를 들어, RAS 아미노산 서열의 특정 예는, 예를 들어 TEYKLVVVGA G GVGKSALTIQLI(서열번호 36)(서열번호 11의 연속 아미노산 잔기 2 내지 24에 상응하는 예시적 WT KRAS 펩티드)이고, "G12V"는, 서열번호 36의 밑줄 친 글리신의 실제 위치는 11이더라도, 발린에 의한 서열번호 36의 밑줄 친 글리신의 치환을 지칭한다. G12V 돌연변이를 갖는 인간 RAS 아미노산 서열은 이하 "G12V RAS" 또는 "G12V"로 지칭된다.
G12V 돌연변이를 갖는 전장 RAS 단백질의 예가 하기 표 1에 제공된다.
[표 1]
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본 발명의 한 양태에서, TCR은 상기에 기재된 G12V 돌연변이를 갖는 RAS 펩티드에 대한 항원 특이성을 갖되, 상기 G12V RAS 펩티드는 임의의 길이를 갖는다. 본 발명의 한 양태에서, G12V RAS 펩티드는 본원에 기재된 임의의 HLA 클래스 II 분자에 결합하기에 적합한 임의의 길이를 갖는다. 예를 들어, TCR은 G12V 돌연변이를 갖는 RAS 펩티드에 대한 항원 특이성을 가질 수 있고, 이때 상기 RAS 펩티드는 약 11 내지 약 30개의 아미노산 잔기, 약 12 내지 약 24개의 아미노산 잔기 또는 약 18 내지 약 20개의 아미노산 잔기의 길이를 갖는다. G12V RAS 펩티드는 G12V 돌연변이를 포함하는 돌연변이된 RAS 단백질의 임의의 연속 아미노산 잔기를 포함할 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, TCR은 G12V 돌연변이를 갖는 RAS 펩티드에 대한 항원 특이성을 가질 수 있고, 이때 상기 돌연변이된 RAS 펩티드는 약 30개의 아미노산 잔기, 약 29개의 아미노산 잔기, 약 28개의 아미노산 잔기, 약 27개의 아미노산 잔기, 약 26개의 아미노산 잔기, 약 25개의 아미노산 잔기, 약 24개의 아미노산 잔기, 약 23개의 아미노산 잔기, 약 22개의 아미노산 잔기, 약 21개의 아미노산 잔기, 약 20개의 아미노산 잔기, 약 19개의 아미노산 잔기, 약 18개의 아미노산 잔기, 약 17개의 아미노산 잔기, 약 16개의 아미노산 잔기, 약 15개의 아미노산 잔기, 약 14개의 아미노산 잔기, 약 13개의 아미노산 잔기, 약 12개의 아미노산 잔기, 약 11개의 아미노산 잔기, 전술된 범위 중 임의의 2개 사이의 범위의 길이를 갖는다. 본 발명의 TCR에 인식될 수 있는, G12V 돌연변이를 갖는 펩티드의 예는 MTEYKLVVVGA V GVGKSALTIQLI(서열번호 34)이다. 본 발명의 한 양태에서, TCR은 서열번호 34의 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖는다. 본 발명의 한 양태에서, TCR은 MTEYKLVVVGA G GVGKSALTIQLI(서열번호 35)의 야생형 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖지 않는다.
본 발명의 한 양태에서, 본 발명의 TCR은 HLA 클래스 II 분자에 의해 제시된 G12V RAS를 인식할 수 있다. 이와 관련하여, TCR은 HLA 클래스 II 분자 내에서 G12V RAS에 결합 시 면역 반응을 유도할 수 있다. 본 발명의 TCR은 HLA 클래스 II 분자에 의해 제시된 G12V RAS를 인식할 수 있고, G12V RAS 이외에도 HLA 클래스 II 분자에 결합할 수 있다.
본 발명의 한 양태에서, HLA 클래스 II 분자는 HLA-DR 이종이량체이다. HLA-DR 이종이량체는 α 쇄 및 β 쇄를 포함하는 세포 표면 수용체이다. HLA-DR α 쇄는 HLA-DRA 유전자에 의해 암호화된다. HLA-DR β 쇄는 HLA-DRB1 유전자, HLA-DRB3 유전자, HLA-DRB4 유전자 또는 HLA-DRB5 유전자에 의해 암호화된다. HLA-DRB1 유전자에 의해 암호화되는 분자의 예는, 비제한적으로, HLA-DR1, HLA-DR2, HLA-DR3, HLA-DR4, HLA-DR5, HLA-DR6, HLA-DR7, HLA-DR8, HLA-DR9, HLA-DR10, HLA-DR11, HLA-DR12, HLA-DR13, HLA-DR14, HLA-DR15, HLA-DR16 및 HLA-DR17을 포함할 수 있다. HLA-DRB3 유전자는 HLA-DR52를 암호화한다. HLA-DRB4 유전자는 HLA-DR53을 암호화한다. HLA-DRB5 유전자는 HLA-DR51을 암호화한다. 본 발명의 양태에서, HLA 클래스 II 분자는 HLA-DR α 쇄를, HLA-DRB1 유전자에 의해 암호화된 HLA-DR β 쇄와 조합으로 포함한다. 특히 바람직한 양태에서, HLA 클래스 II 분자는 HLA-DRB1*01:HLA-DRA*01 이종이량체(즉, HLA-DRB1*01:HLA-DRA*01 대립 유전자로 표시됨)이다. 한 양태에서, HLA-DR β 쇄는 HLA-DRB1*01:01 대립 유전자에 의해 암호화된다.
본 발명의 TCR은, 입양 세포 전송을 위해 사용되는 세포에 의해 발현될 때를 포함하여, 임의의 하나 이상의 다양한 장점을 제공할 수 있다. 돌연변이된 RAS는 암 세포에 의해 발현되며 정상적인 비-암성 세포에 의해서는 발현되지 않는다. 특정 이론 또는 기전에 구속되지 않고, 본 발명의 TCR이 유리하게는, 정상적인 비-암성 세포의 파괴를 최소화시키거나 제거하여 독성을, 예를 들어 최소화시키거나 제거하여 감소시키면서, 암 세포의 파괴를 표적화하는 것으로 생각된다. 또한, G12V 돌연변이가 종양형성의 조기 단계에서 발생할 수 있으므로, G12V RAS 돌연변이는 실질적으로 환자의 모든 암 세포 상에서 발현될 수 있다. 본 발명의 TCR은, 유리하게는, 예를 들어 화학요법, 수술 또는 방사선과 같은 다른 유형의 치료에 반응하지 않는 G12V RAS-양성 암을 성공적으로 치료하거나 예방할 수 있다. 또한, 본 발명의 TCR은 G12V RAS의 고도로 열망하는 인식을 제공할 수 있고, 조작되지 않은 종양 세포(예컨대, 인터페론(IFN)-γ로 처리되지 않거나, G12V RAS 및 HLA-DRB1*01:HLA-DRA*01 이종이량체 중 하나 또는 둘 다를 암호화하는 벡터로 형질감염되지 않거나, G12V RAS 펩티드로 펄스화되지 않거나, 이들의 조합인 종양 세포)를 인식하는 능력을 제공할 수 있다. KRAS 돌연변이는 췌장암의 약 70%, 대장암의 약 36% 및 폐암의 약 20%에서 발견된다. 가장 통상적으로, 돌연변이는 코돈 12(글리신(G)을 암호화함)에서 발생한다. G12V RAS 돌연변이는 각각 췌장암 및 대장암을 갖는 환자의 약 27% 및 약 8%에서 발견된다. 또한, HLA-DRB1*01 대립 유전자는 통상적으로 백인 민족의 인간에 의해 발현된다. 예컨대, 상기 대립 유전자는 미국 내 백인 민족의 인간의 약 20%에 의해 발현된다. 상기 대립 유전자가 미국 내 백인 민족의 인간의 약 20%에 의해 발현되고, 돌연변이된 RAS가 모든 암 환자의 약 30%에 의해 발현되고, RAS 돌연변이 중 약 25%가 G12V RAS인 경우, TCR은 미국 내 암에 걸린 백인 민족의 모든 인간의 약 1.5%(0.2 x 0.3 x 0.25 = 0.015)를 치료할 잠재력을 갖는다. 따라서, 본 발명의 TCR은, 다른 MHC 분자에 의해 제시된 RAS를 인식하는 TCR을 사용하여 면역요법-적격 암 환자의 수를 증가시켜 HLA-DRB1*01 대립 유전자를 발현하는 환자를 포함하도록 하여야 한다. 또한, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 인간 CDR 및 가변 영역 아미노산 서열을 포함하고, 예컨대, 마우스 CDR 및 가변 영역 아미노산 서열을 포함하는 TCR, 폴리펩티드 및 단백질과 비교하여, 인간 면역 시스템에 의해 거부의 위험을 감소시킬 수 있다.
본원에 사용된 용어 "항원 특이성"은, TCR이 높은 결합 활성에 의해 G12V RAS에 특이적으로 결합하고 면역학적으로 이를 인식할 수 있는 것을 의미한다. 예를 들어, (a) 저 농도의 G12V RAS 펩티드(예를 들어, 약 0.05 내지 약 10 ng/mL, 1 ng/mL, 2 ng/mL, 5 ng/mL, 8 ng/mL, 10 ng/mL 또는 상기 값 중 임의의 2개 값에 의해 한정된 범위)에 의해 펄스화된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포, 또는 (b) 표적 세포가 G12V RAS를 발현하도록, G12V RAS를 암호화하는 뉴클레오티드 서열이 도입되는 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포와 함께 공동-배양 시, TCR을 발현하는 약 1 x 104 내지 약 1 x 105개의 T 세포가 적어도 약 200 pg/mL 이상(예를 들어, 200 pg/mL 이상, 300 pg/mL 이상, 400 pg/mL 이상, 500 pg/mL 이상, 600 pg/mL 이상, 700 pg/mL 이상, 1,000 pg/mL 이상, 5,000 pg/mL 이상, 7,000 pg/mL 이상, 10,000 pg/mL 이상, 20,000 pg/mL 이상 또는 상기 값 중 임의의 2개 값에 의해 한정된 범위)의 IFN-γ를 분비하는 경우, TCR은 G12V RAS에 대해 "항원 특이성"을 갖는 것으로 간주될 수 있다. 또한, 본 발명의 TCR을 발현하는 세포는 고 농도의 G12V RAS 펩티드에 의해 펄스화된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포와 함께 공동-배양 시 IFN-γ를 분비할 수 있다. HLA 클래스 II 분자는 본원에 기술된 임의의 HLA 클래스 II 분자일 수 있다.
다르게는 또는 추가적으로, TCR을 발현하는 T 세포가, (a) 저 농도의 G12V RAS 펩티드에 의해 펄스화된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포, 또는 (b) 표적 세포가 돌연변이된 RAS를 발현하도록 G12V RAS를 암호화하는 뉴클레오티드 서열이 도입되는 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포와 함께 공동-배양 시, 음성 대조군에 의해 발현된 IFN-γ의 양과 비교하여, 2배(예컨대, 5배) 이상 더 많은 IFN-γ를 분비하는 경우, TCR은 G12V RAS에 대해 "항원 특이성"을 갖는 것으로 간주된다. 음성 대조군은, 예를 들어 (i) (a) 동일 농도의 무관한 펩티드(예를 들어, G12V RAS 펩티드와 상이한 서열을 갖는 몇몇 다른 펩티드)에 펄스화된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포, 또는 (b) 표적 세포가 무관한 펩티드를 발현하도록, 무관한 펩티드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열이 도입된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포와 함께 공동-배양된 TCR을 발현하는 T 세포; 또는 (ii) (a) 동일 농도의 G12V RAS 펩티드에 의해 펄스화된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포, 또는 (b) 표적 세포가 G12V RAS를 발현하도록 G12V RAS를 암호화하는 뉴클레오티드 서열이 도입된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포와 공동-배양된 형질도입되지 않은 T 세포(예를 들어, TCR을 발현하지 않는, PBMC로부터 유도된 것)일 수 있다. 음성 대조군의 표적 세포에 의해 발현된 HLA 클래스 II 분자는, 시험할 T 세포와 공동-배양된 표적 세포에 의해 발현된 HLA 클래스 II 분자와 동일할 수 있다. HLA 클래스 II 분자는 본원에 기술된 임의의 HLA 클래스 II 분자일 수 있다. IFN-γ 분비는, 예를 들어 효소-연결된 면역흡착성 검정(ELISA)과 같은 당업계에 공지된 방법에 의해 측정될 수 있다.
다르게는 또는 추가적으로, (a) 저 농도의 G12V RAS 펩티드에 의해 펄스화된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포, 또는 (b) 표적 세포가 G12V RAS를 발현하도록, G12V RAS를 암호화하는 뉴클레오티드 서열이 도입된 항원-음성, HLA 클래스 II 분자 양성 표적 세포와 공동-배양 시, IFN-γ를 분비하는 음성 대조군 T 세포의 수와 비교하여 2배(예컨대, 5배) 이상 많은 수의 TCR을 발현하는 T 세포가 IFN-γ를 분비하는 경우, TCR은 G12V RAS에 대해 "항원 특이성"을 갖는 것으로 간주될 수 있다. HLA 클래스 II 분자, 펩티드의 농도 및 음성 대조군은 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기재된 바와 같을 수 있다. IFN-γ를 분비하는 세포의 수는 당업계에 공지된 방법, 예컨대 ELISPOT에 의해 측정될 수 있다.
다르게는 또는 추가적으로, 예를 들어 G12V RAS를 발현하는 표적 세포에 의한 자극 후 유세포 분석에 의해 측정 시 TCR을 발현하는 T 세포가 하나 이상의 T 세포 활성화 마커의 발현을 상향조절하는 경우, TCR은 G12V RAS에 대해 "항원 특이성"을 갖는 것으로 간주될 수 있다. T 세포 활성화 마커의 예는 4-1BB, OX40, CD107a, CD69 및 시토카인(항원 자극 시 상향조절됨(예를 들어, 종양 괴사 인자(TNF), 인터류킨(IL)-2 등))을 포함한다.
본 발명의 한 양태는 2개의 폴리펩티드(즉, 폴리펩티드 쇄), 예컨대 TCR의 알파(α) 쇄, TCR의 베타(β) 쇄, TCR의 감마(γ) 쇄, TCR의 델타(δ) 쇄 또는 이들의 조합을 포함하는 TCR을 제공한다. 본 발명의 TCR의 폴리펩티드는 임의의 아미노산 서열을 포함할 수 있되, TCR은 G12V RAS에 대한 항원 특이성을 갖는다. 일부 양태에서, TCR은 자연에서 발생하지 않는다.
본 발명의 한 양태에서, TCR은 2개의 폴리펩티드 쇄를 포함하고, 이들 각각은 TCR의 상보성 결정 영역(CDR)1, CDR2 및 CDR3을 포함하는 가변 영역을 포함한다. 본 발명의 한 양태에서, TCR은, 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 CDR1(4304 TCR1의 α 쇄의 CDR1), 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 CDR2(4304 TCR1의 α 쇄의 CDR2), 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 CDR3(4304 TCR1의 α 쇄의 CDR3)을 포함하는 제1 폴리펩티드 쇄, 및 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 CDR1(4304 TCR1의 β 쇄의 CDR1), 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 CDR2(4304 TCR1의 β 쇄의 CDR2), 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 CDR3(4304 TCR1의 β 쇄의 CDR3)을 포함하는 제2 폴리펩티드 쇄를 포함한다. 이에 관하여, 본 발명의 TCR은 서열번호 1 내지 6으로 이루어진 군으로부터 선택되는 임의의 하나 이상의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 본 발명의 양태에서, TCR은 (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열, (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는 (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열을 포함한다. 특히 바람직한 양태에서, TCR은 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 양태에서, TCR은 상기 제시된 CDR을 포함하는 TCR의 가변 영역의 아미노산 서열을 포함한다. 이에 관하여, TCR은 (i) 서열번호 7(N-말단 신호 펩티드가 없는 4304 TCR1의 α 쇄의 가변 영역의 예측 서열); (ii) 서열번호 8(N-말단 신호 펩티드가 없는 4304 TCR1의 β 쇄의 가변 영역의 예측 서열); (iii) 서열번호 9(N-말단 신호 펩티드가 있는 4304 TCR1의 α 쇄의 가변 영역); (iv) 서열번호 10(N-말단 신호 펩티드가 있는 4304 TCR1의 β 쇄의 가변 영역); (v) 서열번호 7 및 8 둘 다; 또는 (vi) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 바람직하게는, TCR은 (i) 서열번호 7 및 8 둘 다, 또는 (ii) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 TCR은 α 쇄 불변 영역 및 β 쇄 불변 영역을 추가로 포함할 수 있다. 불변 영역은 임의의 적합한 종, 예컨대 인간 또는 마우스로부터 유래될 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, TCR은 뮤린 α 및 β 쇄 불변 영역, 또는 인간 α 및 β 쇄 불변 영역을 추가로 포함한다. TCR 또는 본원에 기재된 TCR의 임의의 성분(예를 들어, CDR, 가변 영역, 불변 영역, α 쇄, 및/또는 β 쇄)을 언급할 때, 본원에 사용된 용어 "뮤린" 또는 "인간"은, 각각 마우스 또는 인간으로부터 유래된 TCR(또는 이의 성분), 즉, 각각 마우스 T 세포 또는 인간 T 세포로부터 유래되었거나 이에 의해 동시에 발현되는 TCR(또는 이의 성분)을 의미한다.
본 발명의 한 양태는 인간 가변 영역 및 뮤린 불변 영역을 포함하는 키메라 TCR을 제공하고, 이때 TCR은 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖는다. 뮤린 불변 영역은 임의의 하나 이상의 장점을 제공할 수 있다. 예를 들어, 뮤린 불변 영역은 본 발명의 TCR과 본 발명의 TCR이 도입된 숙주 세포의 내인성 TCR의 미스페어링을 감소시킬 수 있다. 다르게는 또는 추가적으로, 뮤린 불변 영역은 인간 불변 영역을 갖는 동일한 TCR과 비교하여 본 발명의 TCR의 발현을 증가시킬수 있다. 키메라 TCR은 서열번호 23(WT 뮤린 α 쇄 불변 영역), 서열번호 24(WT 뮤린 β 쇄 불변 영역), 또는 서열번호 23 및 24 둘 다의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 바람직하게는, 본 발명의 TCR은 서열번호 23 및 24의 아미노산 서열을 포함한다. 키메라 TCR은 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기재된 바와 같은 임의의 CDR 영역과 조합된 본원에 기재된 임의의 뮤린 불변 영역을 포함할 수 있다. 이에 관하여, TCR은 (a) 서열번호 1 내지 3 및 23 모두의 아미노산 서열, (b) 서열번호 4 내지 6 및 24 모두의 아미노산 서열, 또는 (c) 서열번호 1 내지 6, 23 및 24 모두의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 본 발명의 또 다른 양태에서, 키메라 TCR은 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기재된 임의의 가변 영역과 조합된 본원에 기재된 임의의 뮤린 불변 영역을 포함할 수 있다. 이에 관하여, TCR은 (i) 서열번호 7 및 23 둘 다, (ii) 서열번호 8 및 24 둘 다, (iii) 서열번호 9 및 23 둘 다, (iv) 서열번호 10 및 24 둘 다, (v) 서열번호 7, 8, 23 및 24 모두, 또는 (vi) 서열번호 9, 10, 23 및 24 모두의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 한 양태에서, TCR은 치환된 불변 영역을 포함한다. 이와 관련하여, TCR은 α 및 β 쇄 중 하나 또는 둘 다의 불변 영역에서 1, 2, 3 또는 4개의 아미노산 치환을 갖는 본원에 기재된 임의의 TCR의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 바람직하게는, TCR은 α 및 β 쇄 중 하나 또는 둘 다의 뮤린 불변 영역에서 1, 2, 3 또는 4개의 아미노산 치환을 갖는 뮤린 불변 영역을 포함한다. 특히 바람직한 양태에서, TCR은 α 쇄의 뮤린 불변 영역에서 1, 2, 3 또는 4개의 아미노산 치환 및 β 쇄의 뮤린 불변 영역에서 1개의 아미노산 치환을 갖는 뮤린 불변 영역을 포함한다. 일부 양태에서, 치환된 불변 영역을 포함하는 TCR은 유리하게는, 치환되지 않은 (야생형) 불변 영역을 포함하는 모 TCR과 비교하여, G12V RAS+ 표적의 증가된 인식, 숙주 세포에 의한 증가된 발현, 내인성 TCR과의 감소된 미스페어링 및 증가된 항종양 활성 중 하나 이상을 제공한다. 일반적으로, TCR α 및 β 쇄의 뮤린 불변 영역의 치환된 아미노산 서열(각각 서열번호 19 및 20)은 치환되지 않은 뮤린 불변 영역 아미노산 서열(각각 서열번호 23 및 24)의 전부 또는 일부에 부합하고, 서열번호 19는 서열번호 23과 비교하여 1, 2, 3 또는 4개의 아미노산 치환을 갖고, 서열번호 20은 서열번호 24와 비교하여 1개의 아미노산 치환을 갖는다. 이와 관련하여, 본 발명의 한 양태는 (a) (i) 위치 48의 X가 Thr 또는 Cys이고, (ii) 위치 112의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고, (iii) 위치 114의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고, (iv) 위치 115의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 19(α 쇄의 불변 영역)의 아미노산 서열; (b) 위치 57의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 20(β 쇄의 불변 영역)의 아미노산 서열; 또는 (c) 서열번호 19 및 20 둘 다의 아미노산 서열을 포함하는 TCR을 제공한다. 본 발명의 한 양태에서, 서열번호 19를 포함하는 TCR은 서열번호 23(α 쇄의 치환되지 않은 뮤린 불변 영역)을 포함하지 않는다. 본 발명의 한 양태에서, 서열번호 20을 포함하는 TCR은 서열번호 24(β 쇄의 치환되지 않은 뮤린 불변 영역)를 포함하지 않는다.
본 발명의 양태에서, TCR은 가변 영역 및 불변 영역을 포함하는 α 쇄 및 가변 영역 및 불변 영역을 포함하는 β 쇄를 포함한다. 이에 관하여, TCR은 (a) (i) 서열번호 25의 위치 175가 Thr 또는 Cys이고; (ii) 서열번호 25의 위치 239가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고; (iii) 서열번호 25의 위치 241이 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고; (iv) 서열번호 25의 위치 242가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 25의 아미노산 서열의 α 쇄(N-말단 신호 펩티드가 있는 4304 TCR1의 α 쇄); (b) 서열번호 26의 위치 186이 Ser 또는 Cys인, 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄(N-말단 신호 펩티드가 있는 4304 TCR1의 β 쇄); (c) 서열번호 25 및 26 둘 다; (d) (i) 서열번호 27의 위치 156이 Thr 또는 Cys이고; (ii) 서열번호 27의 위치 220이 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고; (iii) 서열번호 27의 위치 222가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고; (iv) 서열번호 27의 위치 223이 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄(N-말단 신호 펩티드가 없는 4304 TCR1의 α 쇄의 예측 서열); (e) 서열번호 28의 위치 171이 Ser 또는 Cys인, 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄(N-말단 신호 펩티드가 없는 4304 TCR1의 β 쇄의 예측 서열); (f) 서열번호 27 및 28 둘 다; (g) 서열번호 29(시스테인-치환된, LVL-변형된, N-말단 신호 서열이 있는 4304 TCR1의 α 쇄); (h) 서열번호 30(시스테인-치환된, LVL-변형된, N-말단 신호 서열이 있는 4304 TCR1의 β 쇄); (i) 서열번호 31(시스테인-치환된, LVL-변형된, N-말단 신호 서열이 없는 4304 TCR1의 α 쇄의 예측 서열); 또는 (j) 서열번호 32(시스테인-치환된, LVL-변형된, N-말단 신호 서열이 없는 4304 TCR1의 β 쇄의 예측 서열)를 포함할 수 있다.
본 발명의 한 양태에서, 치환된 불변 영역은 α 및 β 쇄 중 하나 또는 둘 다의 불변 영역에서 시스테인 치환을 포함하여 시스테인-치환된 TCR을 제공한다. α 및 β 쇄의 대립되는 시스테인은, 치환되지 않은 뮤린 불변 영역을 포함하는 TCR에 존재하지 않는, 치환된 TCR의 α 및 β 쇄의 불변 영역을 서로 연결시키는 다이설파이드 결합을 제공한다. 이와 관련하여, TCR은, 서열번호 23의 위치 48의 천연 Thr(Thr48) 및 서열번호 24의 위치 57의 천연 Ser(Ser57) 중 하나 또는 둘 다가 Cys로 치환될 수 있는 시스테인-치환된 TCR일 수 있다. 바람직하게는, 서열번호 23의 천연 Thr48 및 서열번호 24의 천연 Ser57 둘 다가 Cys로 치환된다. 시스테인-치환된 TCR 불변 영역 서열의 예는 표 2에 제공된다. 본 발명의 한 양태에서, 시스테인-치환된 TCR은 (i) 서열번호 19, (ii) 서열번호 20, 또는 (iii) 서열번호 19 및 20 둘 다를 포함하되, 서열번호 19 및 20 둘 다는 표 2에 정의되어 있다. 본 발명의 시스테인-치환된 TCR은 본원에 기재된 임의의 CDR 또는 가변 영역 외에 치환된 불변 영역을 포함할 수 있다.
본 발명의 한 양태에서, 시스테인-치환된 키메라 TCR은 전장 α 쇄 및 전장 β 쇄를 포함한다. 시스테인-치환된 키메라 TCR α 쇄 및 β 쇄 서열의 예는 표 2에 제공된다. 본 발명의 양태에서, TCR은 (i) 서열번호 25, (ii) 서열번호 26, (iii) 서열번호 27, (iv) 서열번호 28, (v) 서열번호 25 및 26 둘 다, 또는 (vi) 서열번호 27 및 28 둘 다를 포함하고, 이때 서열번호 25 내지 28은 모두 표 2에 정의된 바와 같다.
[표 2]
Figure pct00002
본 발명의 한 양태에서, 치환된 아미노산 서열은 소수성 아미노산에 의한 α 쇄의 불변 영역의 막관통(TM) 도메인의 1, 2 또는 3개의 아미노산의 치환을 포함하여 소수성 아미노산-치환된 TCR(본원에서 "LVL-변형된 TCR"로도 지칭됨)을 제공한다. TCR의 TM 도메인의 소수성 아미노산 치환은, TM 도메인에서 소수성 아미노산 치환이 없는 TCR과 비교하여, TCR의 TM 도메인의 소수성을 증가시킬 수 있다. 이와 관련하여, TCR은 서열번호 23의 천연 Ser112, Met114, 및 Gly115 중 1, 2 또는 3개가, 독립적으로, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp; 바람직하게는 Leu, Ile 또는 Val로 치환될 수 있는, LVL-변형된 TCR이다. 바람직하게는, 서열번호 23의 천연 Ser112, Met114, 및 Gly115 3개 모두가, 독립적으로, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp; 바람직하게는 Leu, Ile 또는 Val로 치환될 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, LVL-변형된 TCR은 (i) 서열번호 19, (ii) 서열번호 20, 또는 (iii) 서열번호 19 및 20 둘 다를 포함하되, 상기 서열번호 19 및 20 둘 다는 표 3에 한정된 바와 같다. 본 발명의 LVL-변형된 TCR은 본원에 기재된 임의의 CDR 또는 가변 영역 외에 치환된 불변 영역을 포함할 수 있다.
본 발명의 한 양태에서, LVL-변형된 TCR은 전장 α 쇄 및 전장 β 쇄를 포함한다. LVL-변형된 TCR α 쇄 및 β 쇄 서열의 예는 표 3에 제공된다. 본 발명의 양태에서, TCR은 (i) 서열번호 25, (ii) 서열번호 26, (iii) 서열번호 27, (iv) 서열번호 28, (v) 서열번호 25 및 26 둘 다, 또는 (vi) 서열번호 27 및 28 둘 다를 포함하고, 이때 서열번호 25 내지 28은 모두 표 3에 정의된 바와 같다.
[표 3]
Figure pct00003
Figure pct00004
본 발명의 한 양태에서, 치환된 아미노산 서열은, α 쇄의 불변 영역의 막관통(TM) 도메인에서 소수성 아미노산에 의한 1, 2 또는 3개의 아미노산의 치환과 조합된 α 및 β 쇄 중 하나 또는 둘 다의 불변 영역에서 시스테인 치환을 포함한다(본원에서 "시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR"로도 지칭됨). 이와 관련하여, TCR은, 서열번호 23의 천연 Thr48이 Cys로 치환되고; 서열번호 23의 천연 Ser112, Met114 및 Gly115 중 1, 2 또는 3개가 독립적으로 Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp, 바람직하게는 Leu, Ile 또는 Val로 치환되고; 서열번호 24의 천연 Ser57이 Cys로 치환된, 시스테인-치환된, LVL-변형된 키메라 TCR이다. 바람직하게는, 서열번호 23의 천연 Ser112, Met114 및 Gly115 셋 모두는 독립적으로 Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp, 바람직하게는 Leu, Ile 또는 Val로 치환될 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, 시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR은 (i) 서열번호 19, (ii) 서열번호 20, 또는 (iii) 서열번호 19 및 20 둘 다를 포함하되, 서열번호 19 및 20 둘 다는 표 4에 한정된 바와 같다. 본 발명의 시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR은 본원에 기재된 임의의 CDR 또는 가변 영역 외에 치환된 불변 영역을 포함할 수 있다.
한 양태에서, 시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR은 전장 α 쇄 및 전장 β 쇄를 포함한다. 시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR α 쇄 및 β 쇄 서열의 예는 표 4 및 8에 제시된다. 본 발명의 양태에서, TCR은 (i) 서열번호 25, (ii) 서열번호 26, (iii) 서열번호 27, (iv) 서열번호 28, (v) 서열번호 29, (vi) 서열번호 30, (vii) 서열번호 31, (viii) 서열번호 32, (ix) 서열번호 25 및 26 둘 다, (x) 서열번호 27 및 28 둘다, (xi) 서열번호 29 및 30 둘 다, 또는 (xii) 서열번호 31 및 32 둘 다를 포함하고, 이때 서열번호 25 내지 28은 모두 표 4에 정의된 바와 같다.
[표 4]
Figure pct00005
Figure pct00006
본 발명의 양태에서, 시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR은 (a) 서열번호 21(시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR의 α 쇄 불변 영역); (b) 서열번호 22(시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR의 β 쇄 불변 영역); 또는 (c) (a) 및 (b) 둘 다를 포함한다.
또한, 본 발명은 본원에 기재된 임의의 TCR의 기능성 부분을 포함하는 폴리펩티드를 포함한다. 본원에 사용된 용어 "폴리펩티드"는 올리고펩티드를 포함하고, 하나 이상의 펩티드 결합에 의해 연결된 아미노산의 단일 쇄를 지칭한다.
본 발명의 폴리펩티드와 관련하여, 기능성 부분은 TCR의 연속 아미노산을 포함하는 임의의 부분으로서, 이중 일부는 기능성 부분이 G12V RAS에 특이적으로 결합한다. TCR과 관련하여 사용될 때 용어 "기능성 부분"은 상기 기능성 부분이 그의 일부인 TCR(모 TCR)의 생물 활성을 유지하는, 본 발명의 TCR의 임의의 부분 또는 단편을 지칭한다. 기능성 부분은, 예를 들어, G12V RAS(예컨대, 본원에 기술된 임의의 HLA 클래스 II 분자의 맥락에서)로 특이적으로 결합하는 능력을 보유하는 TCR의 부분을 포괄하거나, 모 TCR과 유사한 정도, 동일한 정도 또는 더 높은 정도까지 암을 검출하거나 치료하거나 예방한다. 모 TCR과 관련하여, 기능성 부분은, 예를 들어 모 TCR의 약 10%, 약 25%, 약 30%, 약 50%, 약 68%, 약 80%, 약 90%, 약 95% 이상을 포함할 수 있다.
기능성 부분은 상기 부분의 아미노 또는 카복시 말단 또는 둘 다의 말단에서 추가적 아미노산을 포함할 수 있고, 추가적 아미노산은 모 TCR의 아미노산 서열에서 발견되지 않는다. 바람직하게는, 추가적 아미노산은 기능성 부분의 생물학적 기능(예를 들어, G12V RAS에 특이적으로 결합함; 및/또는 암을 검출하거나 치료하거나 예방하는 능력을 가짐)을 저해하지 않는다. 보다 바람직하게는, 추가적 아미노산은 모 TCR의 생물학적 활성과 비교하여 생물학적 활성을 증진시킨다.
폴리펩티드는 본 발명의 TCR의 α 및 β 쇄 중 하나 또는 둘 다의 기능성 부분, 예컨대 본 발명의 TCR의 α 쇄 및/또는 β 쇄의 가변 영역의 CDR1, CDR2 및 CDR3 중 하나 이상을 포함하는 기능성 부분을 포함할 수 있다. 본 발명의 양태에서, 폴리펩티드는 서열번호 1의 아미노산 서열(4304 TCR1의 α 쇄의 CDR1), 서열번호 2의 아미노산 서열(4304 TCR1의 α 쇄의 CDR2), 서열번호 3의 아미노산 서열(4304 TCR1의 α 쇄의 CDR3), 서열번호 4의 아미노산 서열(4304 TCR1의 β 쇄의 CDR1), 서열번호 5의 아미노산 서열(4304 TCR1의 β 쇄의 CDR2), 서열번호 6의 아미노산 서열(4304 TCR1의 β 쇄의 CDR3), 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다. 이에 관하여, 본 발명의 폴리펩티드는 서열번호 1 내지 6으로 이루어진 군으로부터 선택되는 임의의 하나 이상의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 본 발명의 양태에서, 폴리펩티드는 (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열, (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는 (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열을 포함한다. 바람직한 양태에서, 폴리펩티드는 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 한 양태에서, 본 발명의 폴리펩티드는, 예를 들어 상기에 제공된 CDR 영역의 조합을 포함하는 본 발명의 TCR의 가변 영역을 포함할 수 있다. 이에 관하여, 폴리펩티드는 (i) 서열번호 7(N-말단 신호 펩티드가 없는 4304 TCR1의 α 쇄의 가변 영역의 예측 서열); (ii) 서열번호 8(N-말단 신호 펩티드가 없는 4304 TCR1의 β 쇄의 가변 영역의 예측 서열); (iii) 서열번호 9(N-말단 신호 펩티드가 있는 4304 TCR1의 α 쇄의 가변 영역); (iv) 서열번호 10(N-말단 신호 펩티드가 있는 4304 TCR1의 β 쇄의 가변 영역); (v) 서열번호 7 및 8 둘 다; 또는 (vi) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 바람직하게는, 폴리펩티드는 (i) 서열번호 7 및 8 둘 다, 또는 (ii) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 한 양태에서, 본 발명의 폴리펩티드는 상기에 제시된 본 발명의 TCR의 불변 영역을 추가로 포함할 수 있다. 이에 관하여, 폴리펩티드는 서열번호 23(α 쇄의 WT 뮤린 불변 영역), 서열번호 24(β 쇄의 WT 뮤린 불변 영역), 서열번호 19(α 쇄의 치환된 뮤린 불변 영역), 서열번호 20(β 쇄의 치환된 뮤린 불변 영역), 서열번호 21(시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR의 α 쇄 불변 영역); 서열번호 22(시스테인-치환된, LVL-변형된 TCR의 β 쇄 불변 영역); 서열번호 19 및 20 둘 다, 서열번호 21 및 22 둘 다, 또는 서열번호 23 및 24 둘 다의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있다. 바람직하게는, 폴리펩티드는 서열번호 19 및 20 둘 다, 서열번호 21 및 22 둘 다, 또는 서열번호 23 및 24 둘 다의 아미노산 서열을 본 발명의 다른 양상에 관하여 본원에 기술된 임의의 CDR 영역 또는 가변 영역과 조합으로 추가로 포함한다. 본 발명의 한 양태에서, 폴리펩티드의 서열번호 19 및 20 중 하나 또는 둘 다는 표 2 내지 4 중 어느 하나에 정의된 바와 같다.
본 발명의 한 양태에서, 본 발명의 폴리펩티드는 본원에 기재된 TCR의 α 또는 β 쇄의 전체 길이를 포함할 수 있다. 이에 관하여, 본 발명의 폴리펩티드는 서열번호 25, 서열번호 26, 서열번호 27, 서열번호 28, 서열번호 29, 서열번호 30, 서열번호 31, 또는 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 다르게는, 본 발명의 폴리펩티드는 본원에 기술된 TCR의 쇄를 둘 다 포함할 수 있다. 예를 들어, 폴리펩티드는 서열번호 25 및 26 둘 다, 서열번호 27 및 28 둘 다, 서열번호 29 및 30 둘 다, 또는 서열번호 31 및 32 둘 다를 포함할 수 있다.
예를 들어, 본 발명의 폴리펩티드는 (a) (i) 서열번호 25의 위치 175의 X가 Thr 또는 Cys이고; (ii) 서열번호 25의 위치 239의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고; (iii) 서열번호 25의 위치 241의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고; (iv) 서열번호 25의 위치 242의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄; (b) 서열번호 26의 위치 186의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄; (c) 서열번호 25 및 26 둘 다; (d) (i) 서열번호 27의 위치 156의 X가 Thr 또는 Cys이고; (ii) 서열번호 27의 위치 220의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고; (iii) 서열번호 27의 위치 222의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고; (iv) 서열번호 27의 위치 223의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄; (e) 서열번호 28의 위치 171의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄; (f) 서열번호 27 및 28 둘 다; (g) 서열번호 29; (h) 서열번호 30; (i) 서열번호 31; (j) 서열번호 32; (k) 서열번호 29 및 30 둘 다; 또는 (l) 서열번호 31 및 32 둘 다를 포함할 수 있다. 본 발명의 양태에서, 서열번호 25 내지 28의 폴리펩티드 중 임의의 하나 이상은 표 2 내지 4 중 어느 하나에 정의된다.
본 발명은 본원에 기재된 하나 이상의 폴리펩티드를 포함하는 단백질을 추가로 제공한다. "단백질"은 하나 이상의 폴리펩티드 쇄를 포함하는 분자를 의미한다.
한 양태에서, 본 발명의 단백질은 서열번호 1 내지 3의 아미노산 서열을 포함하는 제1 폴리펩티드 쇄 및 서열번호 4 내지 6의 아미노산 서열을 포함하는 제2 폴리펩티드 쇄를 포함할 수 있다.
본 발명의 다른 양태에서, (i) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하고, 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하거나; (ii) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하고, 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 10의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 단백질은 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기술된 임의의 불변 영역을 추가로 포함할 수 있다. 이에 관하여, 본 발명의 양태에서, (i) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 19의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있고, 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 20의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있거나; (ii) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 21의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있고, 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 22의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있거나; (iii) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 23의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있고, 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 24의 아미노산 서열을 추가로 포함할 수 있다. 본 발명의 양태에서, 서열번호 19 및 20의 단백질 중 하나 또는 둘 다는 표 2 내지 4 중 어느 하나에 정의된 바와 같다.
다르게 또는 추가적으로, (a) 제1 폴리펩티드 쇄는 (i) 서열번호 25의 위치 175의 X가 Thr 또는 Cys이고; (ii) 서열번호 25의 위치 239의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고; (iii) 서열번호 25의 위치 241의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고; (iv) 서열번호 25의 위치 242의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하거나; (b) 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 26의 위치 186의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하거나; (c) 상기 (a) 및 (b) 둘 다이거나; (d) 제1 폴리펩티드 쇄는 (i) 서열번호 27의 위치 156의 X가 Thr 또는 Cys이고; (ii) 서열번호 27의 위치 220의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고; (iii) 서열번호 27의 위치 222의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고; (iv) 서열번호 27의 위치 223의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인, 서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하거나; (e) 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 28의 위치 171의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하거나; (f) 상기 (d) 및 (e) 둘 다이거나; (g) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하거나; (h) 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하거나; (i) 제1 폴리펩티드 쇄는 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하거나; (j) 제2 폴리펩티드 쇄는 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하거나; (k) 상기 (g) 및 (h) 둘 다이거나; (l) 상기 (i) 및 (j) 둘 다이다. 본 발명의 양태에서, 서열번호 25 내지 58은 표 2 내지 4 중 어느 하나에 정의된 바와 같다.
본 발명의 단백질은 TCR일 수 있다. 다르게는, 예를 들어, 단백질이 TCR α 및 β 쇄 둘 다의 아미노산 서열을 포함하는 단일 폴리펩티드 쇄를 포함하는 경우, 또는 상기 단백질의 제1 및/또는 제2 폴리펩티드 쇄가 다른 아미노산 서열, 예를 들어, 면역글로불린 또는 그의 일부를 암호화하는 아미노산 서열을 추가로 포함하는 경우, 본 발명의 단백질은 융합 단백질일 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명은 또한 1개 이상의 다른 폴리펩티드와 함께 본원에 기술된 본 발명의 폴리펩티드를 1개 이상 포함하는 융합 단백질을 제공한다. 상기 다른 폴리펩티드는 융합 단백질의 별개의 폴리펩티드로서 존재할 수 있거나, 본원에 기술된 본 발명의 폴리펩티드 중 하나와 인프레임(in frame)으로(나란히) 발현되는 폴리펩티드로서 존재할 수 있다. 다른 폴리펩티드는, 비제한적으로, 면역글로불린, CD3, CD4, CD8, MHC 분자, CD1 분자, 예를 들어, CD1a, CD1b, CD1c, CD1d 등을 포함하는 임의의 펩티드성 또는 단백질성 분자, 또는 그의 일부를 암호화할 수 있다.
융합 단백질은 본 발명의 폴리펩티드의 1개 이상의 카피 및/또는 다른 폴리펩티드의 1개 이상의 카피를 포함할 수 있다. 예를 들어, 융합 단백질은 본 발명의 폴리펩티드 및/또는 다른 폴리펩티드의 1, 2, 3, 4 또는 5개 이상의 카피를 포함할 수 있다. 융합 단백질을 생산하는 적합한 방법은 당업계에 공지되어 있고, 예를 들어, 재조합 방법을 포함한다.
본 발명의 일부 양태에서, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 α 쇄 및 β 쇄를 결합시키는 링커 펩티드를 포함하는 단일 단백질로서 발현될 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 추가로 링커 펩티드를 포함할 수 있다. 링커 펩티드는 유리하게 숙주 세포에서 재조합 TCR, 폴리펩티드 및/또는 단백질의 발현을 촉진할 수 있다. 링커 펩티드는 임의의 적합한 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 링커 펩티드는 절단가능한 링커 펩티드일 수 있다. 예를 들어, 링커 펩티드는 RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP(서열번호 33)의 아미노산 서열을 포함하는 퓨린-SGSG-P2A 링커 펩티드일 수 있다. 숙주 세포에 의한 링커 펩티드를 포함하는 구축물의 발현시, 링커 펩티드는 절단되어 분리된 α 및 β 쇄를 생성할 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질은 전장 α 쇄, 전장 β 쇄, 및 상기 α 쇄와 β 쇄 사이에 위치한 링커 펩티드를 포함하는 아미노산 서열을 포함할 수 있다.
본 발명의 단백질은 본원에 기술된 본 발명의 폴리펩티드를 1개 이상 포함하는 재조합 항체 또는 그의 항원 결합부일 수 있다. 본원에서 사용된 "재조합 항체"는 본 발명의 폴리펩티드 1개 이상 및 항체 또는 그의 항원 결합부의 폴리펩티드 쇄를 포함하는 재조합(예를 들어, 유전자 조작된) 단백질을 지칭한다. 항체 또는 그의 항원 결합부의 폴리펩티드는 중쇄, 경쇄, 중쇄 또는 경쇄의 가변 영역 또는 불변 영역, 단일쇄 가변 단편(scFv), 또는 항체의 Fc, Fab 또는 F(ab)2' 단편 등일 수 있다. 항체 또는 그의 항원 결합부의 폴리펩티드 쇄는 재조합 항체의 별개의 폴리펩티드로 존재할 수 있다. 다르게는, 항체 또는 그의 항원 결합부의 폴리펩티드 쇄는 본 발명의 폴리펩티드와 인프레임으로(나란히) 발현되는 폴리펩티드로서 존재할 수 있다. 항체 또는 그의 항원 결합부의 폴리펩티드는, 본원에 기술된 임의의 항체 및 항체 단편들을 포함하여 임의의 항체 또는 임의의 항체 단편의 폴리펩티드일 수 있다.
본원에 기재된 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 기능성 변이체가 본원의 범위에 포함된다. 본원에 사용된 용어 "기능성 변이체"는 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질과 실질적이거나 유의미한 서열 동일성 또는 유사성을 갖는 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 지칭하고, 상기 기능성 변이체는 일부가 변이체인 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 생물학적 활성을 보유한다. 기능성 변이체는, 예를 들어 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질과 비교하여 비슷한 정도, 동일한 정도 또는 높은 정도로, G12V RAS(이에 대해 모 TCR이 항원 특이성을 갖거나 이에 모 폴리펩티드 또는 단백질이 결합함)에 특이적으로 결합하는 능력을 보유하는, 본원에 기재된 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질(모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질)의 변이체를 포함한다. 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질과 관련하여, 기능성 변이체는, 예를 들어 각각 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 아미노산 서열에 적어도 약 30%, 약 50%, 약 75%, 약 80%, 약 90%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98% 또는 약 99% 이상 동일할 수 있다.
기능성 변이체는, 예를 들어 하나 이상의 보존적 아미노산 치환을 갖는 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 보존적 아미노산 치환은 당업계에 공지되어 있고, 물리적 및/또는 화학적 특성을 갖는 하나의 아미노산이 동일한 화학적 또는 물리적 특성을 갖는 또 다른 아미노산으로 교환되는 아미노산 치환을 포함한다. 예를 들어, 보존적 아미노산 치환은 또 다른 산성 아미노산에 의해 치환된 산성 아미노산(예를 들어, Asp 또는 Glu), 비극성 측쇄를 갖는 또 다른 아미노산에 의해 치환된 비극성 측쇄를 갖는 아미노산(예를 들어, Ala, Gly, Val, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Trp, Val 등), 또 다른 염기성 아미노산에 의해 치환된 염기성 아미노산(Lys, Arg 등), 극성 측쇄를 갖는 또 다른 아미노산에 의해 치환된 극성 측쇄를 갖는 아미노산(Asn, Cys, Gln, Ser, Thr, Tyr 등) 등일 수 있다.
다르게는 또는 추가적으로, 기능성 변이체는 하나 이상의 비-보존적 아미노산 치환을 갖는 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 이러한 경우에, 비-보존적 아미노산 치환이 기능성 변이체의 생물학적 활성을 저해하거나 억제하지 않는 것이 바람직하다. 바람직하게는, 비-보존적 아미노산 치환은, 기능성 변이체의 생물학적 활성이 모 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질과 비교하여 증가되도록, 기능성 변이체의 생물학적 활성을 증진시킨다.
TCR, 폴리펩티드 또는 단백질은, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 다른 성분, 예를 들어 다른 아미노산이 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 생물학적 활성을 실질적으로 변화시키지 않도록, 본원에 기재된 명시된 아미노산 서열로 본질적으로 이루어질 수 있다. 이에 관하여, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 또는 단백질은, 예를 들어, 서열번호 25, 서열번호 26, 서열번호 27, 서열번호 28, 서열번호 29, 서열번호 30, 서열번호 31, 서열번호 32, 서열번호 25 및 26 둘 다, 서열번호 27 및 28 둘 다, 서열번호 29 및 30 둘 다, 또는 서열번호 31 및 32 둘 다의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어질 수 있다. 또한, 예를 들어, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 또는 단백질은 (i) 서열번호 7, (ii) 서열번호 8, (iii) 서열번호 9, (iv) 서열번호 10, (v) 서열번호 7 및 8 둘 다, 또는 (vi) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어질 수 있다. 또한, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 또는 단백질은 (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열, (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는 (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어질 수 있다.
본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 임의의 길이의 것일 수 있고, 즉, 임의의 수의 아미노산을 포함할 수 있되, 상기 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질이 생물학적 활성, 예를 들어 G12V RAS에 특이적으로 결합하는 능력; 포유동물에서 암을 검출하는 능력; 또는 포유동물에서 암을 치료하거나 예방하는 능력 등을 보유해야 한다. 예를 들어, 폴리펩티드는 약 50 내지 약 5,000개의 아미노산 길이 범위, 예컨대 약 50, 약 70, 약 75, 약 100, 약 125, 약 150, 약 175, 약 200, 약 300, 약 400, 약 500, 약 600, 약 700, 약 800, 약 900, 또는 약 1,000개 이상의 아미노산 길이를 가질 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명의 폴리펩티드는 또한 올리고펩티드를 포함한다.
본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 1개 이상의 천연 아미노산 대신 합성 아미노산을 포함할 수 있다. 상기 합성 아미노산은 당업계에 공지되어 있고, 예를 들어, 아미노사이클로헥산 카복실산, 노르류신, α-아미노 n-데카노산, 호모세린, S-아세틸아미노메틸-시스테인, 트랜스-3- 및 트랜스-4-하이드록시프롤린, 4-아미노페닐알라닌, 4-니트로페닐알라닌, 4-클로로페닐알라닌, 4-카복시페닐알라닌, β-페닐세린 β-하이드록시페닐알라닌, 페닐글리신, α-나프틸알라닌, 사이클로헥실알라닌, 사이클로헥실글리신, 인돌린-2-카복실산, 1,2,3,4-테트라하이드로이소퀴놀린-3-카복실산, 아미노말론산, 아미노말론산 모노아미드, N'-벤질-N'-메틸-리신, N',N'-다이벤질-리신, 6-하이드록시리신, 오르니틴, α-아미노사이클로펜탄 카복실산, α-아미노사이클로헥산 카복실산, α-아미노사이클로헵탄 카복실산, α-(2-아미노-2-노르보난)-카복실산, α,γ-다이아미노부티르산, α,β-다이아미노프로피온산, 호모페닐알라닌 및 α-tert-부틸글리신을 포함한다.
본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 글리코실화되거나, 아미드화되거나, 카복실화되거나, 포스포릴화되거나, 에스터화되거나, N-아실화되거나, 예를 들어, 다이설파이드 가교를 통해 환화되거나, 산 부가 염으로 전환되고/되거나 임의적으로 이량체화되거나 중합되거나, 접합될 수 있다.
본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및/또는 단백질은, 예를 들어, 신생 합성과 같은 당업계에 공지된 방법에 의해 수득될 수 있다. 또한, 폴리펩티드 및 단백질은 표준 재조합 방법을 이용하여 본원에 기술된 핵산을 사용하여 재조합적으로 생산될 수 있다(예를 들어, 문헌[Green and Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 4th ed., Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2012)] 참조). 또는, 본원에 기재된 TCR, 폴리펩티드 및/또는 단백질은, 예컨대 펩티드 테크놀로지스 코포레이션(Peptide Technologies Corp.)(미국 메릴랜드주 게이터스버그) 진스크립트(GenScript)(미국 뉴저지주 피스캐터웨이), 및 레이바이오테크 라이프(RayBiotech Life)(미국 조지아주 피치트리 코너스)와 같은 회사에 의해 상업적으로 합성될 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 및 단백질은 합성, 재조합, 단리 및/또는 정제될 수 있다. 본 발명의 한 양태는 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기술된 임의의 핵산 또는 벡터에 의해 암호화된, 단리되거나 정제된 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 제공한다. 본 발명의 다른 양태는 세포에서, 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기술된 임의의 핵산 또는 벡터의 발현으로부터 생성된 단리되거나 정제된 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 제공한다. 본 발명의 또 다른 양태는 본원에 기술된 임의의 숙주 세포 또는 숙주 세포 집단을 배양하여 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 생산하는 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질의 생산 방법을 제공한다.
임의의 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질(이의 임의의 기능성 부분 또는 변이체를 포함함), 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 숙주 세포 집단, 항체 또는 이의 항원 결합부를 포함하는 접합체, 예를 들어 바이오접합체가 본 발명의 범위에 포함된다. 접합체, 뿐만 아니라 접합체의 합성 방법이 일반적으로 당업계에 공지되어 있다.
본 발명의 한 양태는 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산을 제공한다. 본원에서 사용된 바와 같이, "핵산"은 "폴리뉴클레오티드", "올리고뉴클레오티드" 및 "핵산 분자"를 포함하고, 일반적으로 DNA 또는 RNA의 중합체를 의미하고, 상기 DNA 또는 RNA는 단일-가닥 또는 이중-가닥일 수 있고, 천연, 비-천연 또는 변경된 뉴클레오티드를 함유할 수 있고, 변형되지 않은 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드들 사이에서 발견되는 포스포다이에스터 대신에 천연, 비-천연 또는 변경된 뉴클레오티드간 결합, 예를 들어, 포스포로아미데이트 결합 또는 포스포로티오에이트 결합을 함유할 수 있다. 한 양태에서, 핵산은 상보적 DNA(cDNA)를 포함한다. 일반적으로, 핵산은 임의의 삽입, 결실, 전환 및/또는 치환을 포함하지 않는 것이 바람직하다. 그러나, 일부 경우에서, 본원에서 논의된 바와 같이, 핵산이 1개 이상의 삽입, 결실, 전환 및/또는 치환을 포함하는 것이 적합할 수 있다.
바람직하게는, 본 발명의 핵산은 재조합체이다. 본원에 사용된 용어 "재조합체"는 (i) 천연 또는 합성 핵산 분절을 살아있는 세포에서 복제될 수 있는 핵산 분자에 연결시킴으로써 살아있는 세포 밖에서 구축되는 분자, 또는 (ii) 상기 (i)에서 기술된 분자의 복제로부터 생산되는 분자를 지칭한다. 본 발명의 목적에 있어서, 복제는 시험관내 복제 또는 생체내 복제일 수 있다.
본 발명의 양태에서, 핵산은 서열번호 38(4304 TCR1 절단가능한 링커 펩티드에 의해 분리된 4304 TCR1의 α 및 β 쇄 둘 다를 암호화함), 서열번호 39(4304 TCR1의 α 쇄 가변 영역을 암호화함), 서열번호 40(4304 TCR1의 β 쇄 가변 영역을 암호화함), 또는 서열번호 39 및 40 둘 다의 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
핵산은 당업계에 공지된 절차를 이용하여 화학 합성 및/또는 효소적 접합 반응에 기반하여 구축될 수 있다. 예를 들어, 그린 및 샘브룩 등(Green and Sambrook, et al.)의 상기 문헌을 참조한다. 예를 들어, 핵산은, 천연 뉴클레오티드, 또는 분자의 생물학적 안정성을 증가시키거나 하이브리드화 시 생산된 이중체의 물리적 안정성을 증가시키도록 설계된 다양하게 변형된 뉴클레오티드(예를 들어, 포스포로티오에이트 유도체 및 아크리딘 치환된 뉴클레오티드)를 사용하여 화학적으로 합성될 수 있다. 상기 핵산을 생산하기 위해 사용될 수 있는 변형된 뉴클레오티드의 예는 비제한적으로 5-플루오로우라실, 5-브로모우라실, 5-클로로우라실, 5-요오도우라실, 하이포잔틴, 잔틴, 4-아세틸시토신, 5-(카복시하이드록시메틸)우라실, 5-카복시메틸아미노메틸-2-티오우리딘, 5-카복시메틸아미노메틸우라실, 다이하이드로우라실, β-D-갈락토실쿠에오신, 이노신, N6-이소펜텐일아데닌, 1-메틸구아닌, 1-메틸이노신, 2,2-다이메틸구아닌, 2-메틸아데닌, 2-메틸구아닌, 3-메틸시토신, 5-메틸시토신, N6-치환된 아데닌, 7-메틸구아닌, 5-메틸아미노메틸우라실, 5-메톡시아미노메틸-2-티오우라실, β-D-만노실쿠에오신, 5'-메톡시카복시메틸우라실, 5-메톡시우라실, 2-메틸티오-N6-이소펜텐일아데닌, 우라실-5-옥시아세트산(v), 와이부톡소신, 슈도우라실, 쿠에오신, 2-티오시토신, 5-메틸-2-티오우라실, 2-티오우라실, 4-티오우라실, 5-메틸우라실, 우라실-5-옥시아세트산 메틸에스터, 3-(3-아미노-3-N-2-카복시프로필)우라실 및 2,6-다이아미노퓨린을 포함한다. 다르게는, 본 발명의 1개 이상의 핵산은 임의의 다양한 상업 단체로부터 구입할 수 있다.
핵산은 본원에 기재된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 임의의 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, 핵산은 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 코돈-최적화된 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 임의의 특정 이론 또는 기전에 결부되지 않고, 뉴클레오티드 서열의 코돈 최적화는 mRNA 전사체의 번역 효율을 증가시키는 것으로 생각된다. 뉴클레오티드 서열의 코돈 최적화는 천연 코돈을, 동일 아미노산을 암호화하지만 세포 내에서 더 용이하게 이용가능한 tRNA에 의해 번역되어 번역 효율을 증가시킬 수 있는 또 다른 코돈으로 치환시키는 것을 포함할 수 있다. 뉴클레오티드 서열의 최적화는 또한 번역을 저해하는 2차 mRNA 구조물을 감소시켜 번역 효율을 증가시킬 수 있다.
본 발명은 또한 본원에 기술된 임의의 핵산의 뉴클레오티드 서열에 상보적인 뉴클레오티드 서열, 또는 엄격한 조건 하에 본원에 기술된 임의의 핵산의 뉴클레오티드 서열에 하이브리드화되는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산을 제공한다.
엄격한 조건 하에 하이브리드화되는 뉴클레오티드 서열은 바람직하게는 고 엄격성 조건 하에 하이브리드화된다. "고 엄격성 조건"은, 뉴클레오티드 서열이 비-특이적 하이브리드화보다 검출가능하게 더 강한 양으로 표적 서열(본원에 기술된 임의의 핵산의 뉴클레오티드 서열)에 특이적으로 하이브리드화되는 것을 의미한다. 고 엄격성 조건은, 정확한 상보적 서열을 갖는 폴리뉴클레오티드, 또는 뉴클레오티드 서열과 매칭된 몇 개의 소영역(예를 들어, 3 내지 10개의 염기)을 갖게 된 랜덤 서열로부터의 단지 몇 개의 산재된 미스매치 만을 함유하는 폴리뉴클레오티드를 식별하는 조건을 포함한다. 상기 상보성을 갖는 소영역은 14 내지 17개 이상의 염기의 전장 보체보다 더 용이하게 용융되며, 고 엄격성 하이브리드화로 인해 상기 소영역을 용이하게 식별할 수 있게 된다. 비교적 높은 엄격성 조건은, 예를 들어, 약 50 내지 70℃의 온도에서 약 0.02 내지 0.1 M의 NaCl 또는 등가물에 의해 제공되는 바와 같은 저염 및/또는 고온 조건을 포함한다. 상기 고 엄격성 조건은, 존재하는 경우, 뉴클레오티드 서열과 주형 또는 표적 가닥 사이의 미스매치를 거의 허용하지 않으며, 임의의 본 발명의 TCR의 발현을 검출하는 데 특히 적합하다. 일반적으로, 조건은 증가하는 양의 포름아미드를 첨가함으로써 더 엄격하게 될 수 있는 것으로 인지된다.
본 발명의 한 양태는 또한 본원에 기술된 임의의 핵산과 적어도 약 70% 이상, 예를 들어, 약 80%, 약 90%, 약 91%, 약 92%, 약 93%, 약 94%, 약 95%, 약 96%, 약 97%, 약 98% 또는 약 99% 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산을 제공한다. 이와 관련하여, 핵산은 본원에 기술된 임의의 뉴클레오티드 서열로 본질적으로 이루어질 수 있다.
본 발명의 양태는 5'로부터 3'로, 제1 핵산 서열 및 제2 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리되거나 정제된 핵산을 제공하고, 이때 제1 및 제2 뉴클레오티드 서열은 각각 서열번호 7 및 8; 8 및 7; 9 및 10; 10 및 9; 25 및 26; 26 및 25; 27 및 28; 28 및 27; 29 및 30; 30 및 29; 31 및 32; 또는 32 및 31의 아미노산 서열을 암호화시킨다.
본 발명의 한 양태에서, 단리되거나 정제된 핵산은 제1 핵산 서열과 제2 핵산 서열 사이에 삽입된 제3 뉴클레오티드 서열을 추가로 포함하고, 이때 상기 제3 뉴클레오티드 서열은 절단가능한 링커 펩티드를 암호화한다. 본 발명의 한 양태에서, 상기 절단가능한 링커 펩티드는 RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP(서열번호 33)의 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 핵산은 재조합 발현 벡터 내에 혼입될 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명은 본 발명의 임의의 핵산을 포함하는 재조합 발현 벡터를 제공한다. 본 발명의 한 양태에서, 재조합 발현 벡터는 α 쇄, β 쇄 및 링커 펩티드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
본 발명의 목적에 있어서, 용어 "재조합 발현 벡터"는, 구축물이 mRNA, 단백질, 폴리펩티드 또는 펩티드를 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 벡터가 세포 내에서 발현된 mRNA, 단백질, 폴리펩티드 또는 펩티드를 갖기에 충분한 조건 하에 세포에 접촉하는 경우, 숙주 세포에 의한 mRNA, 단백질, 폴리펩티드 또는 펩티드의 발현을 허용하는 유전자-변형된 올리고뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드 구축물을 의미한다. 본 발명의 벡터는 전체로서는 천연이 아니다. 그러나, 상기 벡터의 일부는 천연일 수 있다. 본 발명의 재조합 발현 벡터는, 단일-가닥 또는 이중-가닥이고, 합성되거나 부분적으로 천연 공급원으로부터 수득될 수 있고, 천연, 비-천연 또는 변경된 뉴클레오티드를 함유할 수 있는, DNA 및 RNA를 포함하지만 이로 한정되지는 않는 임의의 유형의 뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 재조합 발현 벡터는 천연 뉴클레오티드간 결합, 비-천연 뉴클레오티드간 결합, 또는 두 유형 모두의 결합을 포함할 수 있다. 바람직하게는, 비-천연 또는 변경된 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드간 결합은 벡터의 전사 또는 복제를 방해하지 않는다.
본 발명의 재조합 발현 벡터는 임의의 적합한 재조합 발현 벡터일 수 있고, 임의의 적합한 숙주 세포를 형질전환시키거나 형질감염시키는 데 사용될 수 있다. 적합한 벡터로는 플라스미드 및 바이러스와 같은, 증식 및 팽창 성장을 위해 또는 발현을 위해 또는 둘 다를 위해 설계된 벡터가 포함된다. 벡터는 pUC 시리즈(퍼멘타스 라이프 사이언시즈(Fermentas Life Sciences)), pBluescript 시리즈(스트라타진(Stratagene), 미국 캘리포니아주 라졸라 소재), pET 시리즈(노바겐(Novagen), 미국 위스콘신주 매디슨 소재), pGEX 시리즈(파마시아 바이오테크(Pharmacia Biotech), 스웨덴 웁살라 소재), 및 pEX 시리즈(클론테크(Clontech), 미국 캘리포니아주 팔로 알토 소재)로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다. 박테리오파지 벡터, 예컨대 λGT10, λGT11, λZapII(스트라타진), λEMBL4 및 λNM1149도 또한 사용될 수 있다. 식물 발현 벡터의 예로는 pBI01, pBI101.2, pBI101.3, pBI121 및 pBIN19(클론테크)가 포함된다. 동물 발현 벡터의 예로는 pEUK-Cl, pMAM 및 pMAMneo(클론테크)가 포함된다. 바람직하게는, 재조합 발현 벡터는 바이러스 벡터, 예를 들어, 레트로바이러스 벡터이다. 특히 바람직한 양태에서, 재조합 발현 벡터는 MSGV1 벡터이다. 본 발명의 한 양태에서, 재조합 발현 벡터는 트랜스포손 또는 렌티바이러스 벡터이다.
본 발명의 재조합 발현 벡터는, 예를 들어, 그린 및 샘브룩 등의 상기 문헌에 기술된 표준 재조합 DNA 기술을 이용하여 생산할 수 있다. 원형 또는 선형인 발현 벡터 구축물은 원핵 또는 진핵 숙주 세포에서 기능성인 복제 시스템을 함유하도록 생산될 수 있다. 복제 시스템은, 예를 들어, ColEl, 2μ 플라스미드, λ, SV40, 소 유두종 바이러스 등으로부터 유도될 수 있다.
바람직하게는, 재조합 발현 벡터는, 적절한 대로, 벡터가 DNA- 또는 RNA-기반인지를 고려하여, 벡터가 그 안에 도입될 숙주 세포의 유형(예를 들어, 세균, 진균, 식물 또는 동물)에 특이적인 조절 서열, 예를 들어, 전사 및 번역 개시 및 종료 코돈을 포함한다.
재조합 발현 벡터는 형질전환되거나 형질감염된 숙주 세포의 선별을 가능하게 하는 1개 이상의 마커 유전자를 포함할 수 있다. 마커 유전자는 살생물제 내성, 예를 들어, 항생물질, 중금속 등에 대한 내성, 원영양성을 제공하는 영양요구성 숙주 세포에서의 상보성 등을 포함한다. 본 발명의 발현 벡터에 적합한 마커 유전자는, 예를 들어, 네오마이신/G418 내성 유전자, 하이그로신 내성 유전자, 히스티디놀 내성 유전자, 테트라사이클린 내성 유전자 및 암피실린 내성 유전자를 포함한다.
재조합 발현 벡터는, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열에, 또는 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열에 상보적이거나 상기 서열과 하이브리드화되는 뉴클레오티드 서열에 작동가능하게 연결된 천연 또는 비-천연 프로모터를 포함할 수 있다. 프로모터의 선별, 예를 들어, 강한 프로모터, 약한 프로모터, 유도성 프로모터, 조직-특이적 프로모터 및 발달-특이적 프로모터의 선별은 전문가의 통상의 기술에 속한다. 유사하게, 뉴클레오티드 서열과 프로모터의 결합도 또한 전문가의 기술에 속한다. 프로모터는 비-바이러스성 프로모터 또는 바이러스 프로모터, 예를 들어, 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터, SV40 프로모터, RSV 프로모터, 및 뮤린 줄기 세포 바이러스의 긴-말단 반복서열에서 발견되는 프로모터일 수 있다.
본 발명의 재조합 발현 벡터는 일시적 발현을 위해, 안정한 발현을 위해, 또는 둘 다를 위해 설계될 수 있다. 또한, 재조합 발현 벡터는 구성적 발현을 위해 또는 유도성 발현을 위해 생산될 수 있다.
또한, 재조합 발현 벡터는 자살 유전자를 포함하도록 생산될 수 있다. 본원에 사용된 용어 "자살 유전자"는 자살 유전자를 발현하는 세포가 사멸되게 하는 유전자를 지칭한다. 자살 유전자는, 유전자가 발현되는 세포에 약제, 예를 들어, 약물에 대한 민감성을 제공하고 세포가 약제와 접촉하거나 약제에 노출될 때 세포가 사멸되게 하는 유전자일 수 있다. 자살 유전자는 당업계에 공지되어 있고, 예를 들어, 단순 헤르페스 바이러스(HSV) 티미딘 키나제(TK) 유전자, 시토신 데아미나제, 퓨린 뉴클레오시드 포스포릴라제, 니트로리덕타제 및 유도성 카스파제 9 유전자 시스템을 포함한다.
본 발명의 또 다른 양태는 또한 본원에 기술된 임의의 핵산 또는 재조합 발현 벡터를 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 본원에 사용된 용어 "숙주 세포"는 본 발명의 재조합 발현 벡터를 함유할 수 있는 임의의 유형의 세포를 지칭한다. 숙주 세포는 진핵 세포, 예를 들어, 식물, 동물, 진균 또는 조류(algae)일 수 있거나, 원핵 세포, 예를 들어, 세균 또는 원생동물일 수 있다. 숙주 세포는 배양된 세포이거나 1차 세포일 수 있고, 즉 유기체, 예를 들어, 인간으로부터 직접 단리될 수 있다. 숙주 세포는 부착 세포 또는 현탁된 세포, 즉, 현탁액 중에서 성장하는 세포일 수 있다. 적합한 숙주 세포는 당업계에 공지되어 있고, 예를 들어, DH5α 에스케리치아 콜라이(Escherichia coli) 세포, 차이니즈 햄스터 난소 세포, 원숭이 VERO 세포, COS 세포, HEK293 세포 등을 포함한다. 재조합 발현 벡터를 증식시키거나 복제할 목적을 위해, 숙주 세포는 바람직하게는 원핵 세포, 예를 들어, DH5α 세포이다. 재조합 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 생산할 목적을 위해, 숙주 세포는 바람직하게는 포유동물 세포이다. 가장 바람직하게는, 숙주 세포는 인간 세포이다. 숙주 세포는 임의의 세포 유형일 수 있고, 임의의 유형의 조직으로부터 기원할 수 있고, 임의의 발달 단계의 세포일 수 있지만, 숙주 세포는 바람직하게는 말초혈 림프구(PBL) 또는 말초혈 단핵 세포(PBMC)이다. 보다 바람직하게는, 숙주 세포는 T 세포이다. 본 발명의 한 양태에서, 숙주 세포는 인간 림프구이다. 본 발명의 다른 양태에서, 숙주 세포는 T 세포, 천연 킬러 T(NKT) 세포, 불변 천연 킬러 T(iNKT) 세포 및 천연 킬러(NK) 세포로 이루어진 군으로부터 선택된다. 본 발명의 또 다른 양태는 세포를, 상기 세포로 본원에 기술된 벡터를 도입하는 조건 하에 상기 임의의 벡터와 접촉시키는 단계를 포함하는, MTEYKLVVVGA V GVGKSALTIQLI(서열번호 34)의 펩티드에 대한 항원 특이성을 갖는 TCR을 발현하는 숙주 세포의 생산 방법을 제공한다.
본 발명의 목적에 있어서, T 세포는, 배양된 T 세포, 예를 들어, 1차 T 세포, 또는 배양된 T 세포주, 예를 들어, Jurkat, SupT1 등으로부터의 T 세포, 또는 포유동물로부터 수득된 T 세포와 같은 임의의 T 세포일 수 있다. 포유동물로부터 수득되는 경우, T 세포는 혈액, 골수, 림프절, 흉선 또는 다른 조직 또는 체액을 포함하지만 이로 한정되지는 않는 많은 공급원으로부터 수득될 수 있다. T 세포는 또한 농축되거나 정제될 수 있다. 바람직하게는, T 세포는 인간 T 세포이다. T 세포는 임의의 유형의 T 세포일 수 있고, CD4+/CD8+ 이중 양성 T 세포, CD4+ 헬퍼 T 세포, 예를 들어, Th1 및 Th2 세포, CD4+ T 세포, CD8+ T 세포(예를 들어, 세포독성 T 세포), 종양 침윤 림프구(TIL), 기억 T 세포(예를 들어, 중추 기억 T 세포 및 작동인자 기억 T 세포), 나이브(naive) T 세포 등을 포함하지만 이로 한정되지는 않는, 임의의 발달 단계의 세포일 수 있다.
본원에 기재된 숙주 세포를 1개 이상 포함하는 세포 집단도 또한 본 발명에 의해 제공된다. 세포 집단은, 임의의 재조합 발현 벡터를 포함하지 않는 1개 이상의 다른 세포, 예를 들어, 숙주 세포(예를 들어, T 세포), 또는 T 세포 이외의 다른 세포, 예를 들어, B 세포, 대식세포, 호중구, 적혈구, 간 세포, 내피 세포, 상피 세포, 근육 세포, 뇌 세포 등에 더하여, 기술된 임의의 재조합 발현 벡터를 포함하는 숙주 세포를 포함하는 이종 집단일 수 있다. 다르게는, 세포 집단은 실질적으로, 재조합 발현 벡터를 포함하는 숙주 세포로 주로 이루어진(예를 들어, 본질적으로 이루어진) 동종 집단일 수 있다. 상기 집단은 또한, 집단의 모든 세포가 재조합 발현 벡터를 포함하는 단일 숙주 세포의 클론이어서 집단의 모든 세포가 재조합 발현 벡터를 포함하는, 세포의 클론성 집단일 수 있다. 본 발명의 한 양태에서, 상기 세포 집단은 본원에 기재된 바와 같은 재조합 발현 벡터를 포함하는 숙주 세포를 포함하는 클론성 집단이다.
본 발명의 한 양태에서, 집단내 세포의 수는 급속하게 증식될 수 있다. T 세포의 수의 증식은, 예를 들어, 미국 특허공보 제8,034,334호; 미국 특허공보 제8,383,099호; 미국 특허출원공개공보 제2012/0244133호; 문헌[Dudley et al., J. Immunother., 26:332-342 (2003)]; 및 [Riddell et al., J. Immunol. Methods, 128:189-201 (1990)]에 기재된 바와 같이 당업계에 공지되어 있는 바와 같은 많은 방법 중 임의의 방법에 의해 달성될 수 있다. 한 양태에서, T 세포의 수의 증식은 OKT3 항체, IL-2, 및 피더(feeder) PBMC(예를 들어, 방사선 조사된 동종이계 PBMC)와 함께 T 세포를 배양함으로써 수행된다.
본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 및 숙주 세포(그의 집단 포함)는 단리되고/되거나 정제될 수 있다. 본원에 사용된 용어 "단리된"은 그의 천연 환경으로부터 제거된 것을 의미한다. 본원에 사용된 용어 "정제된"은 순도가 증가된 것을 의미하고, 이때 "순도"는 상대적 용어이며 반드시 절대 순도로 이해되는 것은 아니다. 예를 들어, 순도는 적어도 약 50%일 수 있거나, 약 60%, 약 70%, 약 80%, 약 90%, 약 95%보다 클 수 있거나, 약 100%일 수 있다.
본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터 및 숙주 세포(그의 집단 포함)(이하에서, 이들 모두는 총괄하여 "본 발명의 TCR 물질"로 지칭됨)는 약학 조성물과 같은 조성물로 제형화될 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명은 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 발현 벡터 및 숙주 세포(그의 집단 포함), 및 약학적으로 허용되는 담체를 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 임의의 본 발명의 TCR 물질을 함유하는 본 발명의 약학 조성물은 1개 초과의 본 발명의 TCR 물질, 예를 들어, 폴리펩티드 및 핵산, 또는 2개 이상의 상이한 TCR을 포함할 수 있다. 다르게는, 약학 조성물은 또 다른 약학적으로 활성인 약제 또는 약물, 예를 들어, 화학요법제, 예를 들어, 아스파라기나제, 부설판, 카보플라틴, 시스플라틴, 다우노루비신, 독소루비신, 플루오로우라실, 겜시타빈, 하이드록시우레아, 메토트렉세이트, 파클리탁셀, 리툭시맙, 빈블라스틴, 빈크리스틴 등과 함께 본 발명의 TCR 물질을 포함할 수 있다.
바람직하게는, 담체는 약학적으로 허용되는 담체이다. 약학 조성물과 관련하여, 담체는 고려 중인 특정한 본 발명의 TCR 물질에 통상적으로 사용되는 임의의 담체일 수 있다. 투여가능한 조성물을 제조하는 방법은 당업계에 숙련된 자에게 공지되어 있거나 명백하고, 예를 들어, 문헌[Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 22nd Ed., Pharmaceutical Press (2012)]에 보다 상세히 기재되어 있다. 약학적으로 허용되는 담체는 사용 조건 하에 해로운 부작용 또는 독성을 갖지 않는 물질인 것이 바람직하다.
담체의 선택은 부분적으로, 특정한 본 발명의 TCR 물질에 의해서 뿐만 아니라 본 발명의 TCR 물질을 투여하기 위해 사용되는 특정 방법에 의해서 결정될 것이다. 따라서, 본 발명의 약학 조성물의 다양한 적합한 제형이 존재한다. 적합한 제형은 비경구, 피하, 정맥내, 근육내, 동맥내, 척추강내, 종양내 또는 복강내 투여를 위한 임의의 제형을 포함할 수 있다. 본 발명의 TCR 물질을 투여하기 위해 1개 초과의 경로가 이용될 수 있고, 특정한 경우에, 특정한 경로가 또 다른 경로보다 더 즉각적이고 더 효과적인 반응을 제공할 수 있다.
바람직하게는, 본 발명의 TCR 물질은 주사에 의해, 예를 들어, 정맥내로 투여된다. 본 발명의 TCR 물질이 본 발명의 TCR을 발현하는 숙주 세포(또는 그의 집단)인 경우, 주사용 세포를 위한 약학적으로 허용되는 담체는, 예를 들어, 생리 식염수(물 중 약 0.90%(w/v)의 NaCl, 물 중 약 300 mOsm/L NaCl, 또는 물 1 L 당 약 9.0 g NaCl), 노르모솔(NORMOSOL) R 전해질 용액(애보트(Abbott), 미국 일리노이주 시카고 소재), 플라스마-라이트 A(PLASMA-LYTE A)(박스터(Baxter), 미국 일리노이주 디어필드 소재), 물 중 약 5% 덱스트로스, 또는 링거(Ringer's) 락테이트와 같은 임의의 등장성 담체를 포함할 수 있다. 한 양태에서, 약학적으로 허용되는 담체는 인간 혈청 알부민으로 보충된다.
본 발명의 목적에 있어서, 투여되는 본 발명의 TCR 물질의 양 또는 용량(예를 들어, 본 발명의 TCR 물질이 1개 이상의 세포인 경우 세포의 수)은, 개체 또는 동물에서 타당한 시간대에 걸쳐, 예를 들어, 치료적 또는 예방적 반응을 수행하기에 충분해야 한다. 예를 들어, 본 발명의 TCR 물질의 용량은, 투여 시간으로부터 약 2시간 이상, 예를 들어, 12 내지 24시간 이상의 기간 동안 암 항원(예를 들어, G12V RAS)에 결합하거나, 암을 검출, 치료 또는 예방하기에 충분해야 한다. 특정 양태에서, 상기 기간은 훨씬 더 길 수 있다. 용량은, 본 발명의 특정 TCR 물질의 효능 및 동물(예를 들어, 인간)의 병태뿐만 아니라, 치료받을 동물(예를 들어, 인간)의 체중에 의해 결정될 것이다.
투여할 용량을 결정하기 위한 많은 분석법이 당업계에 공지되어 있다. 본 발명의 목적에 있어서, 각각에 상이한 용량의 T 세포가 제공되는 일군의 포유동물들 중에서 한 포유동물에게 상기 T 세포의 제공 용량을 투여 시 표적 세포가 용해되거나 본 발명의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 발현하는 T 세포에 의해 IFN-γ가 분비되는 정도를 비교하는 것을 포함하는 분석법을 이용하여 포유동물에게 투여할 출발 용량을 결정할 수 있다. 특정 용량의 투여 시 표적 세포가 용해되거나 IFN-γ가 분비되는 정도는 당업계에 공지된 방법에 의해 분석될 수 있다.
본 발명의 TCR 물질의 용량은 특정한 본 발명의 TCR 물질의 투여에 수반될 수 있는 임의의 불리한 부작용의 존재, 성질 및 정도에 의해 또한 결정될 것이다. 전형적으로, 주치의가, 연령, 체중, 일반 건강 상태, 식단, 성별, 투여할 본 발명의 TCR 물질, 투여 경로, 및 치료되는 암의 중증도와 같은 다양한 요인들을 고려하여, 각각의 개별 환자를 치료하는 본 발명의 TCR 물질의 용량을 결정할 것이다. 본 발명의 TCR 물질이 세포 집단인 양태에서, 주입 당 투여되는 세포의 수는, 예를 들어, 약 1 x 106 내지 약 1 x 1012개 세포 이상으로 달라질 수 있다. 특정 양태에서, 1 x 106개 미만의 수의 세포가 투여될 수 있다.
당업계에 통상의 기술을 가진 자라면, 본 발명의 TCR 물질의 치료 또는 예방 효능이 변형을 통해 증가되도록, 본 발명의 TCR 물질이 많은 방법으로 변형될 수 있음을 쉽게 인지할 것이다. 예를 들어, 본 발명의 TCR 물질은 직접적으로 또는 가교를 통해 간접적으로 화학요법제에 접합될 수 있다. 화합물을 화학요법제에 접합시키는 실행은 당업계에 공지되어 있다. 당업계에 통상의 기술을 가진 자라면, 본 발명의 TCR 물질의 기능에 필수적이지 않은, 본 발명의 TCR 물질 상의 부위가 가교 및/또는 화학요법제를 부착시키기에 적합한 부위이지만, 상기 가교 및/또는 화학요법제는 본 발명의 TCR 물질에 일단 부착되면 본 발명의 TCR 물질의 기능, 즉, G12V RAS에 결합하거나 암을 검출, 치료 또는 예방하는 능력을 저해하지 않아야 함을 인지할 것이다.
본 발명의 약학 조성물, TCR, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포 또는 세포 집단은 암을 치료하거나 예방하는 방법에 사용될 수 있는 것으로 생각된다. 특정 이론에 결부되지 않고, 본 발명의 TCR은 G12V RAS에 특이적으로 결합하여, TCR(또는 관련된 본 발명의 폴리펩티드 또는 단백질)이 세포에 의해 발현될 때 G12V RAS를 발현하는 표적 세포에 대한 면역 반응을 매개할 수 있는 것으로 생각된다. 이와 관련하여, 본 발명은, 본원에 기재된 임의의 약학 조성물, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질, 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드, 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 임의의 핵산 또는 재조합 발현 벡터, 또는 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 재조합 벡터를 포함하는 임의의 숙주 세포 또는 세포 집단을, 포유동물에서 암을 치료하거나 예방하기에 효과적인 양으로 포유동물에게 투여하는 것을 포함하는, 포유동물에서 암을 치료하거나 예방하는 방법을 제공한다.
본 발명의 한 양태는 본원에 기술된 임의의 약학 조성물, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질, 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 임의의 핵산 또는 재조합 발현 벡터, 또는 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 재조합 벡터를 포함하는 임의의 숙주 세포 또는 숙주 세포 집단을 포유동물에서 암에 대한 면역 반응을 유도하는 데 효과적인 양으로 포유동물에게 투여함을 포함하는, 포유동물에서 암에 대한 면역 반응을 유도하는 방법을 제공한다.
본 발명의 한 양태는, 포유동물에서 암의 치료 또는 예방에 사용하기 위한, 본원에 기술된 임의의 약학 조성물, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질, 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드, 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 임의의 핵산 또는 재조합 발현 벡터, 또는 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 재조합 벡터를 포함하는 임의의 숙주 세포 또는 세포 집단을 제공한다.
본 발명의 한 양태는 포유동물에서 암에 대한 면역 반응의 유도에 사용하기 위한, 본원에 기술된 임의의 약학 조성물, TCR, 폴리펩티드 또는 단백질, 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 임의의 핵산 또는 재조합 발현 벡터, 또는 본원에 기술된 임의의 TCR, 폴리펩티드 또는 단백질을 암호화하는 재조합 벡터를 포함하는 임의의 숙주 세포 또는 숙주 세포 집단을 제공한다.
용어 "치료하다" 및 "예방하다"뿐만 아니라 그로부터 파생된 단어들은, 본원에서 사용되는 바와 같이, 반드시 100% 또는 완전한 치료 또는 예방을 의미하지는 않는다. 더 정확히 말하면, 당업계에 통상의 기술의 가진 자가 잠재적인 이점 또는 치료 효과를 갖는 것으로 인지하는 다양한 정도의 치료 또는 예방이 존재한다. 이와 관련하여, 본 발명의 방법은 포유동물에서 암의 다양한 임의 수준의 치료 또는 예방을 제공할 수 있다. 또한, 본 발명의 방법에 의해 제공되는 치료 또는 예방은 치료하거나 예방할 암의 하나 이상의 병태 또는 증상의 치료 또는 예방을 포함할 수 있다. 예를 들어, 치료 또는 예방은 종양의 관해를 촉진하는 것을 포함할 수 있다. 또한, 본 발명의 목적에 있어서, "예방"은 암, 또는 그의 증상 또는 병태의 개시를 지연시키는 것을 포함할 수 있다. 다르게는 또는 추가적으로, "예방"은 암, 또는 그의 증상 또는 병태의 재발을 예방하거나 지연시키는 것을 포함할 수 있다.
포유동물에서 암의 존재를 검출하는 방법도 또한 제공된다. 상기 방법은 (i) 포유동물로부터의 1개 이상의 세포를 포함하는 샘플을 본원에 기술된 임의의 본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단, 또는 약학 조성물에 접촉시킴으로써 복합체를 생산하는 단계, 및 (ii) 상기 복합체를 검출하는 단계를 포함하고, 이때 상기 복합체의 검출은 포유동물에서 암의 존재를 나타낸다.
포유동물에서 암을 검출하는 본 발명의 방법과 관련하여, 세포의 샘플은 전세포(whole cell), 그의 용해물, 또는 전세포 용해물의 분획, 예를 들어, 핵 또는 세포질 분획, 전체 단백질 분획 또는 핵산 분획을 포함하는 샘플일 수 있다.
본 발명의 검출 방법에 있어서, 접촉은 포유동물과 관련하여 시험관 내에서 또는 생체 내에서 일어날 수 있다. 바람직하게는, 접촉은 시험관내 접촉이다.
또한, 상기 복합체의 검출은 당업계에 공지되어 있는 다양한 방법을 통해 일어날 수 있다. 예를 들어, 본원에 기술된 본 발명의 TCR, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 또는 세포 집단은, 예를 들어, 방사성 동위원소, 형광단(예를 들어, 플루오레세인 이소티오시아네이트(FITC), 피코에리트린(PE)), 효소(예를 들어, 알칼리성 포스파타제, 양고추냉이 퍼옥시다제) 및 원소 입자(예를 들어, 금 입자)와 같은 검출가능한 표지로 표지될 수 있다.
본 발명의 방법에 있어서, 숙주 세포 또는 세포 집단이 투여되는 경우, 상기 세포는 포유동물에 동종이계 또는 자가유래성인 세포일 수 있다. 바람직하게는, 상기 세포는 포유동물에 자가유래성이다.
본 발명의 방법과 관련하여, 암은, 급성 림프구성 암, 급성 골수성 백혈병, 포상횡문근육종, 뼈암, 뇌암, 유방암, 항문, 항문관 또는 항문직장의 암, 눈의 암, 간내 담관의 암, 관절의 암, 목, 담낭 또는 흉막의 암, 코, 비강 또는 중이의 암, 구강암, 질암, 외음부암, 만성 림프구성 백혈병, 만성 골수성 암, 결장암, 대장암, 자궁내막암, 식도암, 자궁경부암, 위장 유암종, 신경교종, 호지킨(Hodgkin) 림프종, 하인두암, 콩팥암, 후두암, 간암, 폐암, 악성 중피종, 흑색종, 다발성 골수종, 비인두암, 비-호지킨 림프종, 구강인두암, 난소암, 음경암, 췌장암, 복막, 대망 및 장간막 암, 인두암, 전립선암, 직장암, 신장암, 피부암, 소장암, 연조직암, 위암, 고환암, 갑상선암, 자궁암, 요관암 및 방광암 중 임의의 암을 포함한 임의의 암일 수 있다. 바람직한 암은 췌장암, 대장암, 폐암, 자궁내막암, 난소암 또는 전립선암이다. 바람직하게는, 폐암은 폐 선암종이고, 난소암은 상피 난소암이고, 췌장암은 췌장 선암종이다. 본 발명의 한 양태에서, 암은 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열을 발현하고, 이때 상기 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열은 돌연변이된 인간 KRAS, 돌연변이된 인간 HRAS 또는 돌연변이된 인간 NRAS 아미노산 서열이고, 위치 12는 각각 WT 인간 KRAS, WT 인간 HRAS 또는 WT 인간 NRAS 단백질을 기준으로 정의된다. 암에 의해 발현된 상기 돌연변이된 인간 KRAS, 돌연변이된 인간 HRAS, 및 돌연변이된 인간 NRAS는 본 발명의 다른 양상과 관련하여 본원에 기술될 수 있다.
본 발명의 방법에서 언급된 포유동물은 임의의 포유동물일 수 있다. 본원에 사용된 용어 "포유동물"은 마우스 및 햄스터와 같은 설치목의 포유동물 및 토끼와 같은 중치목의 포유동물을 포함하지만 이로 한정되지는 않는 임의의 포유동물을 지칭한다. 포유동물은 고양이과(고양이) 및 개과(개)를 포함한 식육목의 포유동물인 것이 바람직하다. 포유동물은 소과(소) 및 돼지과(돼지)를 포함한 우제목 또는 말과(말)를 포함한 기제목의 포유동물인 것이 보다 바람직하다. 포유동물은 영장목, 세보이드(Ceboid) 또는 시모이드(Simoid)(원숭이), 또는 진원류목(인간 및 유인원)의 포유동물인 것이 가장 바람직하다. 특히 바람직한 포유동물은 인간이다.
하기 실시예는 본 발명을 추가로 예시하지만, 어떤 식으로도 본 발명의 범위를 제한하는 것으로 이해해서는 안됨은 물론이다.
실시예 1
본 실시예는 대장암 환자 4304의 TIL로부터의 항-G12V RAS TCR의 단리를 나타낸다.
대장암 환자 4304로부터의 TIL을 상기 환자에 의해 발현되는 다수의 상이한 신생항원(neoantigen)에 대한 반응성에 대해 독립적으로 선별하였다. 후술한 바와 같이, 반응성을 G12V에 대해 관찰하였다. 환자 4304로부터의 종양 단편(F2, F4, F5, F23 및 F24로 넘버링됨)으로부터의 TIL을 수지상 세포(DC)와 공동-배양하였다. 상기 DC는 (i) 독립적으로 24-량체 펩티드의 8개의 상이한 풀(pool)(펩티드 풀 번호 1 내지 8(PP1 내지 PP8)) 중 하나에 의해 펄스화되거나, (ii) 독립적으로 5개의 상이한 나란한 미니유전자(tandem minigene, TMG) 구축물 중 하나에 의해 형질도입되었다. 각각의 펩티드의 풀은 환자에 의해 발현되는 상이한 신생항원을 포함하였다. 하나의 TMG 구축물은 상이한 무관한 펩티드를 나란히 암호화하였다. 각각의 다른 4개의 TMG 구축물은 환자에 의해 발현되는 신생항원을 포함하는 다수의 상이한 24-량체 펩티드를 나란히 암호화하였다. TIL을 음성 대조군으로서 다이메틸 설폭사이드(DMSO)로 처리된 DC와 공동-배양하였다. TIL을 양성 대조군으로서 포볼 미리스테이트 아세테이트(PMA)로 처리하였다.
반응성을, 효소-연결된 면역반점(enzyme-linked immunospot, ELISPOT) 분석을 사용하여 IFN-γ-분비에 의해 시험하였다. 단편 F4에 대한 결과는 표 5에 제시된다. 반응성이 있는 세포를 PP3에 의해 펄스화된 DC와 공동-배양된 TIL에 의해 관찰하였다. PP3의 어떤 펩티드가 반응성을 보였는지 측정하기 위해, TIL을 독립적으로, PP3으로부터의 각각의 펩티드에 의해 별도로 펄스화된 DC와 공동-배양하였다. 결과는 하기 표 6에 제시된다. 반응성이 있는 세포를 G12V 24-량체 펩티드에 의해 펄스화된 DC와 TIL의 공동-배양에 의해 관찰하였다.
[표 5]
Figure pct00007
[표 6]
Figure pct00008
양성 세포를 재-자극하고, 단일-세포 T 세포 수용체(TCR) 서열분석을 위한 96 웰 플레이트로의 4-1BB 상향조절에 의해 분류하였다. TCR, 즉 4304 TCR1(TRBV29-1*01/TRBJ1-2*01/TRBD2*01/TRAV16*01)이 발견되었다.
TCR 알파 및 베타 쇄 가변 영역의 서열을 단일-세포 TCR 서열분석에 의해 동정하였다. 알파 및 베타 쇄 가변 영역의 아미노산 서열은 표 7에 도시된다. CDR은 밑줄이 쳐졌다. N-말단 신호 펩티드는 굵은 글씨이다.
[표 7]
Figure pct00009
실시예 2
본 실시예는 실시예 1의 TCR을 암호화하는 레트로바이러스 벡터의 구축을 나타낸다.
표 7의 4304 TCR1의 α 및 β 쇄의 가변 영역을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 수득하고, 코돈-최적화시켰다. TCRb VDJ 영역을 마우스 TCRb 불변 쇄에 융합하였다. TCRa VJ 영역을 마우스 TCRa 불변 쇄에 융합하였다. 특정 이론 또는 기전에 얽매이려는 것은 아니지만, 인간 TCRa 및 TCRb 쇄의 불변 영역을 상응하는 뮤린 불변 영역으로 대체하는 것이 TCR 발현 및 기능성을 개선하는 것으로 여겨진다(문헌[Cohen et al., Cancer Res., 66(17): 8878-86 (2006)]).
또한, 뮤린 TCRa 및 TCRb 불변 쇄를 시스테인-변형시켰다. 막관통 소수성 돌연변이를 뮤린 TCRa 불변 쇄에 도입하였다. 특정 이론 또는 기전에 얽매이려는 것은 아니지만, 이러한 변형이 도입된 TCR 쇄 및 향상된 TCR 표면 발현 및 기능성의 바람직한 페어링(pairing)을 야기하는 것으로 여겨진다(문헌[Cohen et al., Cancer Res., 67(8): 3898-903 (2007)]; [Haga-Friedman et al., J. Immu., 188: 5538-5546 (2012)]). 불변 영역에 대한 상기 변형을 비롯한 4개의 TCR의 각각의 전장 α 및 β 쇄는 표 8에 제시된다. 표 8에서, CDR은 밑줄이 쳐졌고, 불변 영역의 변형된 아미노산 잔기는 밑줄이 쳐졌고 굵은 글씨이다.
[표 8]
Figure pct00010
표 8의 4304 TCR1의 α 및 β 쇄의 가변 영역을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 하기 발현 카세트 구성에 의해 MSGV1-기반 레트로바이러스 벡터로 클로닝하였다: 5'NcoI-VDJβ-mCβ-퓨린/SerGly/P2A-VJα-mCα-EcoRI3'. MSGV1 벡터 5'NcoI 부위로의 TCR 발현 카세트의 클로닝을 용이하게 하기 위해, TCRVb 쇄의 N-말단 신호 펩티드의 제2 아미노산을 류신(L)에서 알라닌(A)으로 변경하였다. TCR α 쇄를 암호화하는 뉴클레오티드 서열은 서열번호 39를 포함하였다. TCR β 쇄를 암호화하는 뉴클레오티드 서열은 서열번호 40을 포함하였다.
TCRb 및 TCRa 쇄를 퓨린 Ser/Gly P2A 링커 펩티드(서열번호 33)에 의해 분리하였다. 특정 이론 또는 기전에 얽매이려는 것은 아니지만, 링커 펩티드가 2개의 쇄의 상당한 발현 효율을 제공하는 것으로 여겨진다(문헌[Szymczak et al., Nat. Biotechnol., 22(5):589-94 (2004)]).
레트로바이러스 벡터의 TCR 발현 카세트는, 5'로부터 3'로, 링커 펩티드에 의해 분리된 TCRb 및 TCRa 쇄를 암호화하였다. TCR 발현 카세트는 서열번호 38의 뉴클레오티드 서열을 포함하였다. TCR 발현 카세트에 의해 코딩된 아미노산 서열은 표 9에 제시된다. 표 9에서, CDR은 밑줄이 쳐졌고, 불변 영역은 이탤릭체이고, 링커 펩티드는 굵은 글씨로 나타낸다.
[표 9]
Figure pct00011
실시예 3
본 실시예는 실시예 2의 레트로바이러스 벡터에 의해 발현된 TCR의 항원항체결합력(avidity)을 나타낸다.
건강한 공여자의 PBL은 실시예 2의 레트로바이러스 벡터에 의해 형질도입되었다. 자가유래 DC를 도 1a 및 1b에 도시된 다양한 농도로, G12V 24-량체 펩티드 MTEYKLVVVGA V GVGKSALTIQLI(서열번호 34) 또는 상응하는 WT 24-량체 펩티드 MTEYKLVVVGAG G VGKSALTIQLI(서열번호 35)에 의해 2시간 동안 펄스화하였다. 세포를 2회 세척하고, 형질도입된 T 세포와 1:1의 비로 밤새 공동-배양하였다. INF-γ 분비를 ELISA에 의해 측정하였다(도 1a). 4-1BB 상향조절을 형광 활성화된 세포 분류(FACS)에 의해 평가하였다(도 1b). 도 1a 및 1b에 도시된 바와 같이, TCR-형질도입된 세포는 G12V 24-량체 펩티드에 의해 펄스화된 DC의 특이적 및 결합적(avid) 인식을 나타냈다.
실시예 4
본 실시예는 실시예 2의 레트로바이러스 벡터에 의해 발현된 TCR이 HLA-DRB1*01/HLA-DRA*01 이종이량체에 의해 제시된 G12V RAS를 인식함을 나타낸다.
환자 4304에 의해 발현된 MHC 클래스 II 분자는 엑솜 및 mRNA 서열분석을 사용하여 결정되었다. 발현된 MHC 클래스 II 분자는 도 2에 제시된다.
효과기 세포는 4304 TCR1을 암호화하는 실시예 2의 레트로바이러스 벡터로 형질도입된 건강한 공여자 PBL이었다. 표적 세포는 도 2에 나타낸 HLA 클래스 II 이종이량체 중 하나에 의해 독립적으로 형질감염된 COS7 또는 HEK 293 세포였다. 표적 세포를 G12V 24-량체 펩티드에 의해 로딩하고 미리 형질감염된 각각의 HLA 클래스 II 분자를 차단하는 항체의 존재 또는 부재 하에 배양하였다. DMSO와 함께 배양된 표적 세포를 음성 대조군으로서 사용하였다. 환자 4304로부터 자기유래 DC를 (i) HLA 차단 항체의 부재 하에 G12V 24-량체 펩티드로 처리하여 양성 대조군으로서 사용하고, (ii) DMSO로 처리하여 음성 대조군으로서 사용하였다.
반응성은 ELISPOT 분석을 사용하여 INF-γ-분비에 의해 시험되었다. 결과는 도 2에 도시되어 있다. 도 2에 도시된 바와 같이, 반응성이, DRA*01:01/DRB1*01:01 이종이량체를 암호화하는 뉴클레오티드 서열로 형질도입된 G12V 24-량체-로딩된 표적 세포와 4304 TCR1-형질도입된 세포의 공동-배양시 관찰되었다. 이러한 반응성은 DRA*01:01/DRB1*01:01 이종이량체를 인식하는 항체에 의해 차단되었다.
본원에 인용된 공개공보, 특허출원 및 특허를 포함하여 모든 참조문헌은, 각각의 참조문헌이 참조로 혼입된 것으로 개별적으로 및 구체적으로 지적되고 본원에 전체적으로 나타낸 바와 동일한 정도로 본원에 참조로 혼입된다.
본 발명에 있어서(특히 하기 청구범위에 있어서) 단수형 용어, "적어도 하나" 및 유사한 지시대상들의 사용은, 본원에서 달리 나타내지 않거나 문맥상 명백하게 모순되지 않는 한, 단수형 및 복수형 둘 다를 포함하는 것으로 이해해야 한다. 하나 이상의 대상들의 목록이 뒤따르는 용어 "적어도 하나"의 사용(예를 들어, "적어도 하나의 A 및 B")은, 본원에서 달리 나타내지 않거나 문맥상 명백하게 모순되지 않는 한, 열거된 대상들로부터 선택되는 하나의 대상(A 또는 B) 또는 열거된 대상 중 2개 이상의 임의의 조합(A 및 B)을 의미하는 것으로 이해해야 한다. 용어 "포함하는", "갖는", "포괄하는" 및 "함유하는"은, 달리 언급되지 않는 한, 제약을 두지 않는(open-ended) 용어(즉, "포함하지만, 그로 한정되지는 않는"의 의미)로서 이해해야 한다. 본원에서 값들의 범위의 인용은, 본원에서 달리 나타내지 않는 한, 단지 그 범위내에 속하는 각각의 별개의 값을 개별적으로 언급하는 약칭 방법으로서 이용되는 것뿐이며, 각각의 별개의 값은 본원에서 개별적으로 인용되는 것처럼 명세서에 도입된다. 본원에 기술된 모든 방법들은 본원에서 달리 나타내지 않거나 문맥상 명백하게 모순되지 않는 한 임의의 적합한 순서로 수행될 수 있다. 본원에 제공된 모든 예, 또는 예시적 용어(예를 들어, "예컨대")의 사용은 단지 본 발명을 더 잘 예시하기 위한 것이며 달리 주장되지 않는 한 본 발명의 범위에 제한을 두는 것이 아니다. 명세서의 어떤 용어도 임의의 비-청구된 요소를 본 발명의 실시에 필수적인 것으로 지시하는 것으로 이해해서는 안된다.
본 발명을 실시하기 위해 본 발명자들에게 공지된 가장 우수한 방식을 포함하여 본 발명의 바람직한 양태들이 본원에 기술되어 있다. 상기 바람직한 양태의 변화가 상기 설명을 읽을 때 당업계의 통상의 기술을 가진 자들에게 명백해질 수 있다. 본 발명자들은 숙련된 전문가들이 상기 변화를 적절하게 이용할 것으로 예상하고, 본 발명자들은 본 발명이 본원에 구체적으로 기술된 바와 달리 실시될 것을 바란다. 따라서, 본 발명은 준거법에 의해 허용될 때 본원에 첨부된 청구범위에 인용된 대상의 모든 변형 및 등가물을 포함한다. 또한, 본원에서 달리 나타내지 않거나 문맥상 명백하게 모순되지 않는 한, 모든 가능한 변화 안에서 전술한 요소들의 임의의 조합이 본 발명에 포함된다.
SEQUENCE LISTING <110> THE UNITED STATES OF AMERICA, AS REPRESENTED BY THE SECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES <120> HLA CLASS II-RESTRICTED DRB T CELL RECEPTORS AGAINST RAS WITH G12V MUTATION <130> 754396 <140> PCT/US2021/041737 <141> 2021-07-15 <150> US 63/052,502 <151> 2020-07-16 <160> 40 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 6 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Tyr Ser Gly Ser Pro Glu 1 5 <210> 2 <211> 4 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 His Ile Ser Arg 1 <210> 3 <211> 12 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Cys Ala Leu Leu Gln Gly Ala Gln Lys Leu Val Phe 1 5 10 <210> 4 <211> 5 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Ser Gln Val Thr Met 1 5 <210> 5 <211> 7 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Ala Asn Gln Gly Ser Glu Ala 1 5 <210> 6 <211> 13 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 6 Cys Ser Val Glu Ser Gly Gln Asp Tyr Gly Tyr Thr Phe 1 5 10 <210> 7 <211> 108 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 7 Ala Gln Arg Val Thr Gln Pro Glu Lys Leu Leu Ser Val Phe Lys Gly 1 5 10 15 Ala Pro Val Glu Leu Lys Cys Asn Tyr Ser Tyr Ser Gly Ser Pro Glu 20 25 30 Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Ser Arg Gln Arg Leu Gln Leu Leu Leu 35 40 45 Arg His Ile Ser Arg Glu Ser Ile Lys Gly Phe Thr Ala Asp Leu Asn 50 55 60 Lys Gly Glu Thr Ser Phe His Leu Lys Lys Pro Phe Ala Gln Glu Glu 65 70 75 80 Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys Ala Leu Leu Gln Gly Ala Gln Lys Leu 85 90 95 Val Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Thr Ile Asn Pro 100 105 <210> 8 <211> 114 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 8 Ser Ala Val Ile Ser Gln Lys Pro Ser Arg Asp Ile Cys Gln Arg Gly 1 5 10 15 Thr Ser Leu Thr Ile Gln Cys Gln Val Asp Ser Gln Val Thr Met Met 20 25 30 Phe Trp Tyr Arg Gln Gln Pro Gly Gln Ser Leu Thr Leu Ile Ala Thr 35 40 45 Ala Asn Gln Gly Ser Glu Ala Thr Tyr Glu Ser Gly Phe Val Ile Asp 50 55 60 Lys Phe Pro Ile Ser Arg Pro Asn Leu Thr Phe Ser Thr Leu Thr Val 65 70 75 80 Ser Asn Met Ser Pro Glu Asp Ser Ser Ile Tyr Leu Cys Ser Val Glu 85 90 95 Ser Gly Gln Asp Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr 100 105 110 Val Val <210> 9 <211> 127 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 9 Met Lys Pro Thr Leu Ile Ser Val Leu Val Ile Ile Phe Ile Leu Arg 1 5 10 15 Gly Thr Arg Ala Gln Arg Val Thr Gln Pro Glu Lys Leu Leu Ser Val 20 25 30 Phe Lys Gly Ala Pro Val Glu Leu Lys Cys Asn Tyr Ser Tyr Ser Gly 35 40 45 Ser Pro Glu Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Ser Arg Gln Arg Leu Gln 50 55 60 Leu Leu Leu Arg His Ile Ser Arg Glu Ser Ile Lys Gly Phe Thr Ala 65 70 75 80 Asp Leu Asn Lys Gly Glu Thr Ser Phe His Leu Lys Lys Pro Phe Ala 85 90 95 Gln Glu Glu Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys Ala Leu Leu Gln Gly Ala 100 105 110 Gln Lys Leu Val Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Thr Ile Asn Pro 115 120 125 <210> 10 <211> 129 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 10 Met Ala Ser Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gly Leu Gly Ser Val Phe Ser 1 5 10 15 Ala Val Ile Ser Gln Lys Pro Ser Arg Asp Ile Cys Gln Arg Gly Thr 20 25 30 Ser Leu Thr Ile Gln Cys Gln Val Asp Ser Gln Val Thr Met Met Phe 35 40 45 Trp Tyr Arg Gln Gln Pro Gly Gln Ser Leu Thr Leu Ile Ala Thr Ala 50 55 60 Asn Gln Gly Ser Glu Ala Thr Tyr Glu Ser Gly Phe Val Ile Asp Lys 65 70 75 80 Phe Pro Ile Ser Arg Pro Asn Leu Thr Phe Ser Thr Leu Thr Val Ser 85 90 95 Asn Met Ser Pro Glu Asp Ser Ser Ile Tyr Leu Cys Ser Val Glu Ser 100 105 110 Gly Gln Asp Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val 115 120 125 Val <210> 11 <211> 189 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 11 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr 20 25 30 Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly 35 40 45 Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr 50 55 60 Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys 65 70 75 80 Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr 85 90 95 Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val 100 105 110 Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys 115 120 125 Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr 130 135 140 Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val 145 150 155 160 Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys 165 170 175 Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys Ile Ile Met 180 185 <210> 12 <211> 188 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 12 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr 20 25 30 Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly 35 40 45 Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr 50 55 60 Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys 65 70 75 80 Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr 85 90 95 Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val 100 105 110 Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys 115 120 125 Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr 130 135 140 Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Asp Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val 145 150 155 160 Arg Glu Ile Arg Lys His Lys Glu Lys Met Ser Lys Asp Gly Lys Lys 165 170 175 Lys Lys Lys Lys Ser Lys Thr Lys Cys Val Ile Met 180 185 <210> 13 <211> 189 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 13 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr 20 25 30 Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly 35 40 45 Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr 50 55 60 Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys 65 70 75 80 Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His Gln Tyr 85 90 95 Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val 100 105 110 Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Ala Ala Arg Thr Val Glu Ser Arg 115 120 125 Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Tyr Ile Glu Thr 130 135 140 Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val 145 150 155 160 Arg Glu Ile Arg Gln His Lys Leu Arg Lys Leu Asn Pro Pro Asp Glu 165 170 175 Ser Gly Pro Gly Cys Met Ser Cys Lys Cys Val Leu Ser 180 185 <210> 14 <211> 189 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 14 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr 20 25 30 Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly 35 40 45 Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr 50 55 60 Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys 65 70 75 80 Val Phe Ala Ile Asn Asn Ser Lys Ser Phe Ala Asp Ile Asn Leu Tyr 85 90 95 Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val 100 105 110 Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Thr Arg Thr Val Asp Thr Lys 115 120 125 Gln Ala His Glu Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr 130 135 140 Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val 145 150 155 160 Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Met Lys Lys Leu Asn Ser Ser Asp Asp 165 170 175 Gly Thr Gln Gly Cys Met Gly Leu Pro Cys Val Val Met 180 185 <210> 15 <211> 189 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 15 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr 20 25 30 Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly 35 40 45 Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr 50 55 60 Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys 65 70 75 80 Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr 85 90 95 Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val 100 105 110 Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys 115 120 125 Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr 130 135 140 Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val 145 150 155 160 Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys 165 170 175 Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys 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Pro Ser Arg Asp Ile Cys Gln Arg Gly Thr 20 25 30 Ser Leu Thr Ile Gln Cys Gln Val Asp Ser Gln Val Thr Met Met Phe 35 40 45 Trp Tyr Arg Gln Gln Pro Gly Gln Ser Leu Thr Leu Ile Ala Thr Ala 50 55 60 Asn Gln Gly Ser Glu Ala Thr Tyr Glu Ser Gly Phe Val Ile Asp Lys 65 70 75 80 Phe Pro Ile Ser Arg Pro Asn Leu Thr Phe Ser Thr Leu Thr Val Ser 85 90 95 Asn Met Ser Pro Glu Asp Ser Ser Ile Tyr Leu Cys Ser Val Glu Ser 100 105 110 Gly Gln Asp Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val 115 120 125 Val Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu 130 135 140 Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys 145 150 155 160 Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val 165 170 175 Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr 180 185 190 Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser 195 200 205 Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln 210 215 220 Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys 225 230 235 240 Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys 245 250 255 Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile 260 265 270 Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val 275 280 285 Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser 290 295 300 <210> 31 <211> 245 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic <400> 31 Ala Gln Arg Val Thr Gln Pro Glu Lys Leu Leu Ser Val Phe Lys Gly 1 5 10 15 Ala Pro Val Glu Leu Lys Cys Asn Tyr Ser Tyr Ser Gly Ser Pro Glu 20 25 30 Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Ser Arg Gln Arg Leu Gln Leu Leu Leu 35 40 45 Arg His Ile Ser Arg Glu Ser Ile Lys Gly Phe Thr Ala Asp Leu Asn 50 55 60 Lys Gly Glu Thr Ser Phe His Leu Lys Lys Pro Phe Ala Gln Glu Glu 65 70 75 80 Asp Ser Ala Met Tyr Tyr Cys Ala Leu Leu Gln Gly Ala Gln Lys Leu 85 90 95 Val Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Thr Ile Asn Pro Asn Ile Gln Asn 100 105 110 Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser 115 120 125 Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys 130 135 140 Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Val Leu Asp Met 145 150 155 160 Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln 165 170 175 Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr 180 185 190 Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe 195 200 205 Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Val Ile Val Leu 210 215 220 Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu 225 230 235 240 Arg Leu Trp Ser Ser 245 <210> 32 <211> 287 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic <400> 32 Ser Ala Val Ile Ser Gln Lys Pro Ser Arg Asp Ile Cys Gln Arg Gly 1 5 10 15 Thr Ser Leu Thr Ile Gln Cys Gln Val Asp Ser Gln Val Thr Met Met 20 25 30 Phe Trp Tyr Arg Gln Gln Pro Gly Gln Ser Leu Thr Leu Ile Ala Thr 35 40 45 Ala Asn Gln Gly Ser Glu Ala Thr Tyr Glu Ser Gly Phe Val Ile Asp 50 55 60 Lys Phe Pro Ile Ser Arg Pro Asn Leu Thr Phe Ser Thr Leu Thr Val 65 70 75 80 Ser Asn Met Ser Pro Glu Asp Ser Ser Ile Tyr Leu Cys Ser Val Glu 85 90 95 Ser Gly Gln Asp Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr 100 105 110 Val Val Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe 115 120 125 Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val 130 135 140 Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp 145 150 155 160 Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala 165 170 175 Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val 180 185 190 Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val 195 200 205 Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro 210 215 220 Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp 225 230 235 240 Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr 245 250 255 Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu 260 265 270 Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser 275 280 285 <210> 33 <211> 27 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic <400> 33 Arg Ala Lys Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys 1 5 10 15 Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro 20 25 <210> 34 <211> 24 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 34 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile 20 <210> 35 <211> 24 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 35 Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys 1 5 10 15 Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile 20 <210> 36 <211> 23 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 36 Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Ser 1 5 10 15 Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile 20 <210> 37 <211> 593 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic <400> 37 Met Ala Ser Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gly Leu Gly Ser Val Phe Ser 1 5 10 15 Ala Val Ile Ser Gln Lys Pro Ser Arg Asp Ile Cys Gln Arg Gly Thr 20 25 30 Ser Leu Thr Ile Gln Cys Gln Val Asp Ser Gln Val Thr Met Met Phe 35 40 45 Trp Tyr Arg Gln Gln Pro Gly Gln Ser Leu Thr Leu Ile Ala Thr Ala 50 55 60 Asn Gln Gly Ser Glu Ala Thr Tyr Glu Ser Gly Phe Val Ile Asp Lys 65 70 75 80 Phe Pro Ile Ser Arg Pro Asn Leu Thr Phe Ser Thr Leu Thr Val Ser 85 90 95 Asn Met Ser Pro Glu Asp Ser Ser Ile Tyr Leu Cys Ser Val Glu Ser 100 105 110 Gly Gln Asp Tyr Gly Tyr Thr Phe Gly Ser Gly Thr Arg Leu Thr Val 115 120 125 Val Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu 130 135 140 Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys 145 150 155 160 Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val 165 170 175 Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr 180 185 190 Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser 195 200 205 Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln 210 215 220 Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys 225 230 235 240 Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys 245 250 255 Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile 260 265 270 Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val 275 280 285 Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Arg Ala 290 295 300 Lys Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala 305 310 315 320 Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Lys Pro Thr Leu Ile Ser 325 330 335 Val Leu Val Ile Ile Phe Ile Leu Arg Gly Thr Arg Ala Gln Arg Val 340 345 350 Thr Gln Pro Glu Lys Leu Leu Ser Val Phe Lys Gly Ala Pro Val Glu 355 360 365 Leu Lys Cys Asn Tyr Ser Tyr Ser Gly Ser Pro Glu Leu Phe Trp Tyr 370 375 380 Val Gln Tyr Ser Arg Gln Arg Leu Gln Leu Leu Leu Arg His Ile Ser 385 390 395 400 Arg Glu Ser Ile Lys Gly Phe Thr Ala Asp Leu Asn Lys Gly Glu Thr 405 410 415 Ser Phe His Leu Lys Lys Pro Phe Ala Gln Glu Glu Asp Ser Ala Met 420 425 430 Tyr Tyr Cys Ala Leu Leu Gln Gly Ala Gln Lys Leu Val Phe Gly Gln 435 440 445 Gly Thr Arg Leu Thr Ile Asn Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala 450 455 460 Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu 465 470 475 480 Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser 485 490 495 Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp 500 505 510 Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr 515 520 525 Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp 530 535 540 Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met 545 550 555 560 Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu 565 570 575 Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser 580 585 590 Ser <210> 38 <211> 1782 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic <400> 38 atggcctccc tgctgctgct gctgctgggc ctgggaagcg tgttcagcgc cgtgatctct 60 cagaagccca gcagagatat ctgccagagg ggcaccagcc tgacaatcca gtgtcaggtg 120 gactcccagg tgaccatgat gttctggtac agacagcagc ctggccagag cctgaccctg 180 atcgccacag ccaaccaggg ctctgaggcc acctatgaga gcggcttcgt gatcgataag 240 tttccaatct ccaggcccaa cctgacattc tctaccctga cagtgtccaa tatgtctccc 300 gaggatagct ccatctacct gtgcagcgtg gagtccggcc aggactacgg ctataccttt 360 ggcagcggaa ccaggctgac agtggtggag gacctgcgga acgtgacacc ccctaaggtg 420 agcctgttcg agccctccaa ggccgagatc gccaataagc agaaggccac cctggtgtgc 480 ctggccagag gcttctttcc tgatcacgtg gagctgtctt ggtgggtgaa cggcaaggag 540 gtgcacagcg gcgtgtgcac cgacccacag gcctacaagg agtctaatta cagctattgt 600 ctgtctagcc ggctgagagt gtccgccaca ttttggcaca accctagaaa tcacttcagg 660 tgccaggtgc agtttcacgg cctgtctgag gaggataagt ggccagaggg cagcccaaag 720 ccagtgaccc agaacatctc cgccgaggca tggggaaggg cagactgtgg aatcacctct 780 gccagctatc agcagggcgt gctgagcgcc acaatcctgt acgagatcct gctgggcaag 840 gccaccctgt atgccgtgct ggtgagcaca ctggtggtca tggctatggt gaagcggaag 900 aactcccggg ccaagagatc cggatctgga gccaccaatt tctctctgct gaagcaggcc 960 ggcgatgtgg aggagaatcc tggcccaatg aagcctacac tgatcagcgt gctggtcatc 1020 atcttcatcc tgaggggaac ccgcgcccag agggtgacac agcccgagaa gctgctgagc 1080 gtgtttaagg gcgcccctgt ggagctgaag tgcaactaca gctattccgg ctctccagag 1140 ctgttctggt acgtgcagta ttccaggcag cgcctgcagc tgctgctgag gcacatctcc 1200 cgggagtcta tcaagggctt taccgccgat ctgaataagg gcgagacaag cttccacctg 1260 aagaagccct ttgcccagga ggaggactcc gccatgtact attgtgcact gctgcaggga 1320 gcacagaagc tggtgttcgg acagggaacc aggctgacaa tcaacccaaa tatccagaac 1380 cccgagcctg ccgtgtacca gctgaaggac ccccggagcc aggattccac cctgtgcctg 1440 ttcacagact ttgattccca gatcaatgtg cccaagacaa tggagtctgg cacctttatc 1500 acagacaagt gcgtgctgga catgaaggct atggacagca agtccaacgg cgccatcgcc 1560 tggtccaatc agacctcttt cacatgccag gatatcttta aggagacaaa cgccacatat 1620 ccttcctctg acgtgccatg tgatgccacc ctgacagaga agagcttcga gacagacatg 1680 aacctgaatt ttcagaacct gctggtcatc gtgctgagaa tcctgctgct gaaggtggcc 1740 ggcttcaatc tgctgatgac actgaggctg tggagctcct ga 1782 <210> 39 <211> 381 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 39 atgaagccta cactgatcag cgtgctggtc atcatcttca tcctgagggg aacccgcgcc 60 cagagggtga cacagcccga gaagctgctg agcgtgttta agggcgcccc tgtggagctg 120 aagtgcaact acagctattc cggctctcca gagctgttct ggtacgtgca gtattccagg 180 cagcgcctgc agctgctgct gaggcacatc tcccgggagt ctatcaaggg ctttaccgcc 240 gatctgaata agggcgagac aagcttccac ctgaagaagc cctttgccca ggaggaggac 300 tccgccatgt actattgtgc actgctgcag ggagcacaga agctggtgtt cggacaggga 360 accaggctga caatcaaccc a 381 <210> 40 <211> 387 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 40 atggcctccc tgctgctgct gctgctgggc ctgggaagcg tgttcagcgc cgtgatctct 60 cagaagccca gcagagatat ctgccagagg ggcaccagcc tgacaatcca gtgtcaggtg 120 gactcccagg tgaccatgat gttctggtac agacagcagc ctggccagag cctgaccctg 180 atcgccacag ccaaccaggg ctctgaggcc acctatgaga gcggcttcgt gatcgataag 240 tttccaatct ccaggcccaa cctgacattc tctaccctga cagtgtccaa tatgtctccc 300 gaggatagct ccatctacct gtgcagcgtg gagtccggcc aggactacgg ctataccttt 360 ggcagcggaa ccaggctgac agtggtg 387

Claims (41)

  1. (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열,
    (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는
    (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열
    을 포함하는 단리되거나 정제된 T 세포 수용체로서,
    상기 T 세포 수용체가 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖고,
    상기 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 돌연변이된 인간 키르스텐 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(KRAS), 돌연변이된 인간 하베이 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(HRAS) 또는 돌연변이된 인간 신경아세포종 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(NRAS) 아미노산 서열이고,
    상기 위치 12가 각각 야생형 인간 KRAS, 야생형 인간 HRAS 또는 야생형 인간 NRAS 단백질을 기준으로 한정되는,
    T 세포 수용체.
  2. 제1항에 있어서,
    돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 MTEYKLVVVGA V GVGKSALTIQLI(서열번호 34)인, T 세포 수용체.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서,
    MTEYKLVVVGAG G VGKSALTIQLI(서열번호 35)의 야생형 인간 RAS 아미노산 서열에 대한 항원 특이성을 갖지 않는 T 세포 수용체.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서,
    돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 인간 백혈구 항원(HLA) 클래스 II 분자에 의해 제시되는, T 세포 수용체.
  5. 제4항에 있어서,
    HLA 클래스 II 분자가 HLA-DR 이종이량체인, T 세포 수용체.
  6. 제4항에 있어서,
    HLA 클래스 II 분자가, HLA-DRB1 유전자에 의해 암호화된 HLA-DR β 쇄와 조합된 HLA-DR α 쇄를 포함하는, T 세포 수용체.
  7. 제4항에 있어서,
    HLA 클래스 II 분자가 HLA-DRB1*01:HLA-DRA*01 이종이량체인, T 세포 수용체.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서,
    (i) 서열번호 7의 아미노산 서열,
    (ii) 서열번호 8의 아미노산 서열,
    (iii) 서열번호 9의 아미노산 서열,
    (iv) 서열번호 10의 아미노산 서열,
    (v) 서열번호 7 및 8 둘 다의 아미노산 서열, 또는
    (vi) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열
    을 포함하는 T 세포 수용체.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
    (a) (i) 서열번호 19의 위치 48의 X가 Thr 또는 Cys이고;
    (ii) 서열번호 19의 위치 112의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고;
    (iii) 서열번호 19의 위치 114의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고;
    (iv) 서열번호 19의 위치 115의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인,
    서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄 불변 영역;
    (b) 서열번호 20의 위치 57의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄 불변 영역; 또는
    (c) (a) 및 (b) 둘 다
    를 추가로 포함하는 T 세포 수용체.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서,
    (a) (i) 서열번호 25의 위치 175의 X가 Thr 또는 Cys이고;
    (ii) 서열번호 25의 위치 239의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고;
    (iii) 서열번호 25의 위치 241의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고;
    (iv) 서열번호 25의 위치 242의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인,
    서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄;
    (b) 서열번호 26의 위치 186의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄;
    (c) (a) 및 (b) 둘 다;
    (d) (i) 서열번호 27의 위치 156의 X가 Thr 또는 Cys이고;
    (ii) 서열번호 27의 위치 220의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고;
    (iii) 서열번호 27의 위치 222의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고;
    (iv) 서열번호 27의 위치 223의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인,
    서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄;
    (e) 서열번호 28의 위치 171의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄;
    (f) (d) 및 (e) 둘 다;
    (g) 서열번호 29;
    (h) 서열번호 30;
    (i) 서열번호 31;
    (j) 서열번호 32;
    (k) (g) 및 (h) 둘 다; 또는
    (l)　(i) 및 (j) 둘 다
    를 포함하는 T 세포 수용체.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체의 기능성 부분을 포함하는 단리되거나 정제된 폴리펩티드로서,
    상기 기능성 부분이
    (a) 서열번호 1 내지 3 모두의 아미노산 서열,
    (b) 서열번호 4 내지 6 모두의 아미노산 서열, 또는
    (c) 서열번호 1 내지 6 모두의 아미노산 서열
    을 포함하는, 단리되거나 정제된 폴리펩티드.
  12. 제11항에 있어서,
    기능성 부분이
    (i) 서열번호 7의 아미노산 서열,
    (ii) 서열번호 8의 아미노산 서열,
    (iii) 서열번호 9의 아미노산 서열,
    (iv) 서열번호 10의 아미노산 서열,
    (v) 서열번호 7 및 8 둘 다의 아미노산 서열, 또는
    (vi) 서열번호 9 및 10 둘 다의 아미노산 서열
    을 포함하는, 단리되거나 정제된 폴리펩티드.
  13. 제11항 또는 제12항에 있어서,
    (a) (i) 서열번호 19의 위치 48의 X가 Thr 또는 Cys이고;
    (ii) 서열번호 19의 위치 112의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고;
    (iii) 서열번호 19의 위치 114의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고;
    (iv) 서열번호 19의 위치 115의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인,
    서열번호 19의 아미노산 서열;
    (b) 서열번호 20의 위치 57의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 20의 아미노산 서열; 또는
    (c) (a) 및 (b) 둘 다
    를 추가로 포함하는 단리되거나 정제된 폴리펩티드.
  14. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서,
    (a) (i) 서열번호 25의 위치 175의 X가 Thr 또는 Cys이고;
    (ii) 서열번호 25의 위치 239의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고;
    (iii) 서열번호 25의 위치 241의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고;
    (iv) 서열번호 25의 위치 242의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인,
    서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄;
    (b) 서열번호 26의 위치 186의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄;
    (c) (a) 및 (b) 둘 다;
    (d) (i) 서열번호 27의 위치 156의 X가 Thr 또는 Cys이고;
    (ii) 서열번호 27의 위치 220의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고;
    (iii) 서열번호 27의 위치 222의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고;
    (iv) 서열번호 27의 위치 223의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp인,
    서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하는 α 쇄;
    (e) 서열번호 28의 위치 171의 X가 Ser 또는 Cys인, 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 β 쇄;
    (f) (d) 및 (e) 둘 다;
    (g) 서열번호 29;
    (h) 서열번호 30;
    (i) 서열번호 31;
    (j) 서열번호 32;
    (k) (g) 및 (h) 둘 다; 또는
    (l) (i) 및 (j) 둘 다
    를 포함하는 단리되거나 정제된 폴리펩티드.
  15. 서열번호 1 내지 3의 아미노산 서열을 포함하는 제1 폴리펩티드 쇄 및 서열번호 4 내지 6의 아미노산 서열을 포함하는 제2 폴리펩티드 쇄를 포함하는 단리되거나 정제된 단백질.
  16. 제15항에 있어서,
    (i) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하고, 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하거나;
    (ii) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하고, 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 10의 아미노산 서열을 포함하는,
    단리되거나 정제된 단백질.
  17. 제15항 또는 제16항에 있어서,
    (a) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 19의 아미노산 서열을 추가로 포함하고, 이때
    (i) 서열번호 19의 위치 48의 X가 Thr 또는 Cys이고,
    (ii) 서열번호 19의 위치 112의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고,
    (iii) 서열번호 19의 위치 114의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고,
    (iv) 서열번호 19의 위치 115의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이거나;
    (b) 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 20의 아미노산 서열을 추가로 포함하고, 이때 서열번호 20의 위치 57의 X가 Ser 또는 Cys이거나;
    (c) (a) 및 (b) 둘 다인,
    단리되거나 정제된 단백질.
  18. 제15항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서,
    (a) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하고, 이때
    (i) 서열번호 25의 위치 175의 X가 Thr 또는 Cys이고,
    (ii) 서열번호 25의 위치 239의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고,
    (iii) 서열번호 25의 위치 241의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고,
    (iv) 서열번호 25의 위치 242의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이거나;
    (b) 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하고, 이때 서열번호 26의 위치 186의 X가 Ser 또는 Cys이거나;
    (c) (a) 및 (b) 둘 다이거나;
    (d) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하고, 이때
    (i) 서열번호 27의 위치 156의 X가 Thr 또는 Cys이고,
    (ii) 서열번호 27의 위치 220의 X가 Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이고,
    (iii) 서열번호 27의 위치 222의 X가 Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe 또는 Trp이고,
    (iv) 서열번호 27의 위치 232의 X가 Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met 또는 Trp이거나;
    (e) 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하고, 이때 서열번호 28의 위치 171의 X가 Ser 또는 Cys이거나;
    (f) (d) 및 (e) 둘 다이거나;
    (g) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하거나;
    (h) 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하거나;
    (i) 제1 폴리펩티드 쇄가 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하거나;
    (j) 제2 폴리펩티드 쇄가 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하거나;
    (k) (g) 및 (h) 둘 다이거나;
    (l) (i) 및 (j) 둘 다인,
    단리되거나 정제된 단백질.
  19. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체, 제11항 내지 제14항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드, 또는 제15항 내지 제18항 중 어느 한 항에 따른 단백질을 암호화하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리되거나 정제된 핵산.
  20. 5'로부터 3'로, 제1 뉴클레오티드 서열 및 제2 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리되거나 정제된 핵산으로서,
    상기 제1 및 제2 뉴클레오티드 서열이 각각 서열번호 7 및 8; 8 및 7; 9 및 10; 10 및 9; 25 및 26; 26 및 25; 27 및 28; 28 및 27; 29 및 30; 30 및 29; 31 및 32; 또는 32 및 31의 아미노산 서열을 암호화하는, 단리되거나 정제된 핵산.
  21. 제20항에 있어서,
    제1 뉴클레오티드 서열과 제2 뉴클레오티드 서열 사이에 삽입된 제3 뉴클레오티드 서열을 추가로 포함하되, 상기 제3 뉴클레오티드 서열이 절단가능한 링커 펩티드를 암호화하는, 단리되거나 정제된 핵산.
  22. 제21항에 있어서,
    절단가능한 링커 펩티드가 RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP(서열번호 33)의 아미노산 서열을 포함하는, 단리되거나 정제된 핵산.
  23. 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산을 포함하는 재조합 발현 벡터.
  24. 제23항에 있어서,
    트랜스포손 또는 렌티바이러스 벡터인 재조합 발현 벡터.
  25. 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산 또는 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터에 의해 암호화되는 단리되거나 정제된 T 세포 수용체, 폴리펩티드 또는 단백질.
  26. 세포에서 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산 또는 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터의 발현으로부터 생성된 단리되거나 정제된 T 세포 수용체, 폴리펩티드 또는 단백질.
  27. 세포를, 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터를 상기 세포로 도입하는 조건 하에 상기 재조합 발현 벡터와 접촉시키는 단계를 포함하는, MTEYKLVVVGA V GVGKSALTIQLI(서열번호 34)의 펩티드에 대한 항원 특이성을 갖는 T 세포 수용체를 발현하는 숙주 세포의 생산 방법.
  28. 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산 또는 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터를 포함하는 단리되거나 정제된 숙주 세포.
  29. 제28항에 있어서,
    인간 림프구인 숙주 세포.
  30. 제28항 또는 제29항에 있어서,
    T 세포, 천연 킬러 T(NKT) 세포, 불변 천연 킬러 T(iNKT) 세포 및 천연 킬러(NK) 세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 숙주 세포.
  31. 제28항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 숙주 세포를 포함하는 단리되거나 정제된 세포 집단.
  32. 제28항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 숙주 세포 또는 제31항에 따른 세포 집단을 배양하여 T 세포 수용체, 폴리펩티드 또는 단백질을 생산하는 단계를 포함하는, 제1항 내지 제10항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체, 제11항 내지 제14항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드, 또는 제15항 내지 제18항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 단백질의 생산 방법.
  33. (a) 제1항 내지 제10항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체, 제11항 내지 제14항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드, 제15항 내지 제18항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 단백질, 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산, 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터, 제28항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 숙주 세포, 또는 제31항에 따른 세포 집단; 및
    (b) 약학적으로 허용되는 담체
    를 포함하는 약학 조성물.
  34. 포유동물에서 암의 존재를 검출하는 방법으로서,
    (a) 암 세포를 포함하는 샘플을, 제1항 내지 제10항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체, 제11항 내지 제14항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드, 제15항 내지 제18항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 단백질, 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산, 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터, 제28항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 숙주 세포, 제31항에 따른 세포 집단, 또는 제33항에 따른 약학 조성물과 접촉시켜 복합체를 형성하는 단계; 및
    (b) 상기 복합체를 검출하는 단계
    를 포함하고, 이때 상기 복합체의 검출이 포유동물에서 암의 존재를 지시하는, 방법.
  35. 포유동물에서 암에 대한 면역 반응의 유도에 사용하기 위한, 제1항 내지 제10항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체, 제11항 내지 제14항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드, 제15항 내지 제18항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 단백질, 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산, 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터, 제28항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 숙주 세포, 제31항에 따른 세포 집단, 또는 제33항에 따른 약학 조성물.
  36. 포유동물에서 암의 치료 또는 예방에 사용하기 위한, 제1항 내지 제10항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 T 세포 수용체, 제11항 내지 제14항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 폴리펩티드, 제15항 내지 제18항, 제25항 및 제26항 중 어느 한 항에 따른 단백질, 제19항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 핵산, 제23항 또는 제24항에 따른 재조합 발현 벡터, 제28항 내지 제30항 중 어느 한 항에 따른 숙주 세포, 제31항에 따른 세포 집단, 또는 제33항에 따른 약학 조성물.
  37. 제34항 내지 제36항 중 어느 한 항에 있어서,
    암이, 발린에 의한 위치 12의 글리신의 치환을 갖는 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열을 발현하고,
    상기 돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 돌연변이된 인간 키르스텐 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(KRAS), 돌연변이된 인간 하베이 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(HRAS) 또는 돌연변이된 인간 신경아세포종 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(NRAS) 아미노산 서열이고,
    상기 위치 12가 각각 야생형 인간 KRAS, 야생형 인간 HRAS 또는 야생형 인간 NRAS 단백질을 기준으로 한정되는,
    방법, T 세포 수용체, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 또는 약학 조성물.
  38. 제37항에 있어서,
    돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 돌연변이된 인간 키르스텐 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(KRAS) 아미노산 서열인, 방법, T 세포 수용체, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 또는 약학 조성물.
  39. 제37항에 있어서,
    돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 돌연변이된 인간 신경아세포종 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(NRAS) 아미노산 서열인, 방법, T 세포 수용체, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 또는 약학 조성물.
  40. 제37항에 있어서,
    돌연변이된 인간 RAS 아미노산 서열이 돌연변이된 인간 하베이 래트 육종 바이러스 발암유전자 동족체(HRAS) 아미노산 서열인, 방법, T 세포 수용체, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 또는 약학 조성물.
  41. 제34항 내지 제40항 중 어느 한 항에 있어서,
    암이 췌장암, 대장암, 폐암, 자궁내막암, 난소암 또는 전립선암인, 방법, T 세포 수용체, 폴리펩티드, 단백질, 핵산, 재조합 발현 벡터, 숙주 세포, 세포 집단 또는 약학 조성물.
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