KR20040035830A - Dna 제공 시스템 - Google Patents

Dna 제공 시스템 Download PDF

Info

Publication number
KR20040035830A
KR20040035830A KR10-2004-7004036A KR20047004036A KR20040035830A KR 20040035830 A KR20040035830 A KR 20040035830A KR 20047004036 A KR20047004036 A KR 20047004036A KR 20040035830 A KR20040035830 A KR 20040035830A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
information
dna
chip
selection
unit
Prior art date
Application number
KR10-2004-7004036A
Other languages
English (en)
Inventor
고지로 다까하시
탄가미치후미
Original Assignee
도요 고한 가부시키가이샤
고지로 다까하시
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 도요 고한 가부시키가이샤, 고지로 다까하시 filed Critical 도요 고한 가부시키가이샤
Publication of KR20040035830A publication Critical patent/KR20040035830A/ko

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06QINFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES; SYSTEMS OR METHODS SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • G06Q30/00Commerce
    • G06Q30/06Buying, selling or leasing transactions
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06QINFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES; SYSTEMS OR METHODS SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • G06Q30/00Commerce
    • G06Q30/02Marketing; Price estimation or determination; Fundraising
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
    • G16B25/30Microarray design
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16HHEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H10/00ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
    • G16H10/40ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Business, Economics & Management (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Finance (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Accounting & Taxation (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Strategic Management (AREA)
  • Development Economics (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Economics (AREA)
  • Marketing (AREA)
  • General Business, Economics & Management (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Game Theory and Decision Science (AREA)
  • Primary Health Care (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Entrepreneurship & Innovation (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)

Abstract

시간이나 장소나 환경 등의 요인에 속박되지 않는 효율적인 DNA정보·DNA칩 제공을 가능하게 하는 것을 목적으로 한다. DNA정보 및/또는 DNA칩 제공정보를 수신하는 제공정보수신부와, 제공정보의 축적과 이러한 제공정보 중에서 유저가 소망하는 제공정보의 선택을 행하는 제공정보축적·선택부와, 유저가 선택하는 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보를 입력하는 선택정보입력부와, 선택정보를 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 선택정보출력·축적부와, 선택정보를 외부로 출력하는 선택정보송신부와, 제공정보·선택정보 등을 표시·제어하는 표시부·제어부를 구비하는 DNA정보·칩 선택구입장치, 및 선택정보를 수신하는 선택정보수신부와, 선택정보, DNA정보, DNA칩을 위한 DNA시료, DNA칩을 보존하는 보존관리부와, 선택정보에 대응하는 제공정보를 외부로 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 제공정보출력·축적부와, 제공정보를 외부로 출력하는 제공정보송신부와, 유저가 소망하는 DNA칩이 남아 있지 않을 때에 상기 DNA칩을 제작하는 DNA칩 제작부와, 제공정보·선택정보 등을 표시·제어하는 표시부·제어부를 구비하는 DNA정보·칩 제공장치를 포함하여 이루어지는 DNA 제공 시스템.

Description

DNA 제공 시스템{DNA PROVIDING SYSTEM}
DNA는 유전자의 본체이며, 생체의 구성성분의 결정에 관한 것임과 아울러 질병에 관여하는 기능부분을 갖고, 유전자진단, 약품의 스크리닝 등에 유용한 것이 판명되어 오고 있다. 인간게놈 해석 등, 생체 전체의 대규모인 DNA해독도 진행되고 있는 상황하에서, DNA의 기능해석의 스피드도 상승하고, 유전자해석, 유전자진단·치료, 창약 등에의 DNA정보의 이용도 활발히 이루어지고 있다.
이러한 DNA정보의 이용을 공통(공평)화하기 위한 국제적인 DNA 정보뱅크가 몇개인가 구축되어 오고 있고, 또 DNA정보의 이용에 있어서의 기업화도 이루어져 오고 있지만, DNA정보와 상기 DNA시료를 통괄적으로 대응시킨 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNP)」는 현존하고 있지 않다.
질병관여 등의 DNA의 기능정보와 상기 DNA의 실제의 염기배열정보(SNP, VNTR다형, 마이크로 세틀라이트 다형, 삽입·결실형 다형 등의 유전자 다형 정보도 포함한다)를 관련시키기 위해서, 대학·연구소의 연구자나 기업의 개발 연구자는 방대한 비용과 시간을 들여서 DNA의 기능과 그 염기배열정보를 차례로 해명해 오고 있다.
그러한 연구 개발에 있어서의 방대한 비용과 시간을 감소시키기 위한 수단으로서의 DNA칩의 개발 이용이 급속히 진전되어 오고 있다. 칩(유리·실리콘 기판 중, 주로 유리 기판)에 고정된 DNA를 사용한 유전자해석, 유전자진단 등의 간편성으로부터, 생화학, 세포생물학, 분자생물학, 분자유전학, 유전자의과학, 실제의 유전자 의료분야, 식료문제·환경문제에 관련된 유전자이용·보존 분야에 있어서의 DNA칩의 실용화도 계속 진전되고 있다.
또, 상기와 같은 해석형 DNA칩에 더해서 암조직 세포 등으로부터 입수되는 미량이며 귀중한 유전자시료에 대하여, 장래, 필요에 따라서 언제든지 재해석가능한 형태로 하는 것을 목적으로 하고, 다이아몬드 기판을 이용한 유전자시료나 그 DNA단편을 반영구적으로 보존할 수 있는 보존형 DNA칩도 개발되어 오고 있다.
특정한 DNA를 고정한 DNA칩의 입수를 희망하는 유저는, 예를 들면, 소정 질병에 관여하는 DNA의 염기배열을 해명한 후, 그 배열을 갖는 DNA를 구축조제하고, 이것을 칩 상에 스스로 또는 외주하여 고정해서 DNA칩을 제작할 수 있다.
그러나, 스스로 제작할 경우에는 고가인 기기가 필요하며, 또한 필요한 DNA가 1종 내지 수종으로 비교적 적은 경우라도 경비, 시간, 손이 많이 간다는 문제가 있다. 한편, 외주하는 경우에도, 소망하는 DNA의 염기배열이 미해명일 때에는 어느 정도의 해명 기간이 필요하며, 신속한 입수는 곤란하다.
또, 많은 DNA단편이 고정화되어 있는 이미 판매되고 있는 DNA칩 상에 있는 일부의 DNA단편만을 이용하고 싶은 유저에 있어서는 비용적으로도 큰 부담이며, 효율도 나쁜 것이 현상태이다.
본 발명은 상기의 문제점을 해결하기 위해서 이뤄진 것으로, 그 목적으로 하는 바는 유저가 희망하는 DNA(정보:SNP, VNTR 다형, 마이크로 세틀라이트 다형, 삽입·결실형 다형 등의 유전자 다형 정보 등도 포함하는 염기배열 정보 등)의 신속한 제공에 더해서 그 DNA정보를 포함하는 상기 유전자 또는 상기 DNA단편시료를 칩에 고정한 DNA칩을 제공하는 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNP)」에 관한 것이다.
본 발명은 유전자해석, 유전자진단·치료, 유전자이용, 유전자보존 등의 기술에 대응한 유저가 희망하는 DNA정보(SNP(Single Nucleotide Polymorphism), VNTR(Variable Number of Tandem Repeat) 다형, 마이크로 세틀라이트 다형, 삽입·결실형 다형 등의 유전자 다형 정보 등도 포함하는 염기배열 정보 등)의 신속한 제공, 및 그 DNA정보를 포함하는 유전자나 DNA(Deoxyribonucleic Acid)단편 등의 DNA시료를 칩에 고정한 DNA칩을 제공하는 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB, Gene Net Bank 의 약자)」에 관한 것이다.
도 1은 청구항 1에 기재된 본 발명의 시스템의 개략을 나타내는 블록도.
도 2는 청구항 1에 기재된 본 발명의 시스템에 의한 DNA 제공 시스템의 개략을 나타내는 블록도.
도 3은 청구항 1에 기재된 본 발명의 시스템의 사용상황을 나타내는 설명 도.
도 4는 청구항 1에 기재된 본 발명의 시스템의 사용상황을 나타내는 설명 도.
도 5는 청구항 1에 기재의 본 발명의 시스템의 사용상황을 나타내는 설명 도.
도 6은 제공정보 검색화면의 일례를 나타내는 설명도.
도 7은 제공정보 일람화면의 일례를 나타내는 설명도.
도 8은 선택화면의 일례를 나타내는 설명도.
본 발명은 상기의 문제점을 해결하기 위해서, 예의검토한 결과, 특정의 DNA정보·칩 선택구입장치 및 DNA정보·칩 제공장치로 이루어지는 시스템을 구축함으로써, 상기의 문제점을 해결하는 것을 발견하고, 본 발명에 이르렀다.
즉, 청구항 1에 기재된 본 발명은 통신회선을 통해서 제공되는 DNA정보 및/또는 DNA칩정보(이하, 제공정보라 한다.)를 수신하는 제공정보수신부와, 제공정보수신부가 수신하는 제공정보의 축적과 그 축적된 제공정보 중에서 유저가 소망하는 제공정보의 선택을 행하는 제공정보축적·선택부와, 제공정보축적·선택부의 제공정보로부터 유저가 선택하는 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보(이하, 선택정보라 한다.)를 입력하는 선택정보입력부와, 선택정보입력부에서 선택된 선택정보를 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 선택정보출력·축적부와, 선택정보출력·축적부로부터의 선택정보를 외부로 출력하는 선택정보송신부와, 제공정보·선택정보 등을 표시·제어하는 표시부·제어부를 구비하는 DNA정보·칩 선택구입장치, 및 선택구입장치의 선택정보송신부로부터의 선택정보를 수신하는 선택정보수신부와, 선택정보, DNA정보, DNA칩을 위한 DNA시료, DNA칩을 보존하는 보존관리부와, 선택정보에 대응하는 제공정보를 보존관리부로부터 외부로 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 제공정보출력·축적부와, 제공정보출력·축적부로부터의 제공정보를 외부로 출력하는 제공정보송신부와, 유저가 소망하는 DNA칩이 보존관리부의 DNA칩 보존부에 남아 있지 않을 때에 상기 DNA칩을 제작하는 DNA칩 제작부와, 제공정보·선택정보 등을 표시·제어하는 표시부·제어부를 구비하는 DNA정보·칩 제공장치를 포함해서 이루어지는 DNA 제공 시스템(진네트뱅크(GNB))을 제공하는 것이다.
여기에서, 청구항 2에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 선택구입장치에 있어서, 선택정보입력부는 또한, 제공정보에 없는 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩(이하, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩이라고 한다.)을 입력하는 기능을 가짐과 아울러, 선택정보출력·축적부는 이러한 정보를 출력가능하게 하여 이것을 축적하는 기능을 가짐과 아울러, 선택정보송신부가 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 외부로 출력하는 기능을 갖는 것이 바람직하다.
또한, 청구항 3에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 제공장치에 있어서, 선택정보수신부는 선택구입장치의 선택정보송신부로부터의 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 수신하는 기능도 갖고, 보존관리부는 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩에 대해서, 제공정보로서는 보존하고 있었지만 DNA정보·칩 선택구입장치에 미송신의 상태였던 경우에는, 이것을 송신하기 위한 지시를 행하는 기능을 추가로 갖고, 제공정보출력·축적부는 이러한 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 제공정보로서 보존관리부로부터 외부로 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 기능을 추가로 갖는 것이 바람직하다.
그리고, 청구항 4에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 제공장치가 유저가 소망하는 DNA칩을 제작하기 위한 DNA시료도 남아 있지 않을 때에, DNA정보 및/또는 DNA시료를 다른 제공기관 또는 유저로부터 구입하는 DNA정보 및/또는 DNA시료 구입부를 추가로 구비하는 것이 바람직하다.
또한, 청구항 5에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 제공장치가 구입한 DNA시료를 고정한 DNA칩의 정보해석을 행하는 DNA칩 정보해석부를 추가로 구비하는 것이 바람직하다.
그리고, 청구항 6에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 선택구입장치의 선택정보송신부와 상기 DNA정보·칩 제공장치의 선택정보수신부 사이의 선택정보의 수수를 비접촉으로 이루도록 한 것이 바람직하다.
청구항 7에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 제공장치의 제공정보송신부와 상기 DNA정보·칩 선택구입장치의 제공정보수신부 사이의 제공정보의 수수를 비접촉으로 이루도록 한 것이 바람직하다.
청구항 8에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 제공장치의 보존관리부가선택정보 보존부, DNA정보 보존부, DNA시료 보존부 및 DNA칩 보존부를 포함해서 이루어지는 것이 바람직하다.
청구항 9에 기재하는 바와 같이, 상기 DNA정보·칩 제공장치의 DNA칩 제작부가 DNA복제수단, 칩 활성화부 및 DNA고정부를 포함해서 이루어지는 것이 바람직하다.
청구항 1에 관한 본 발명의 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB)」에 대해서,도 1 내지 도 3에 기초해서 상세하게 설명한다.
도 1은 청구항 1에 관한 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB)」의 개략을 나타내고 있다. 도 2는 「진네트뱅크(GNB)」에 의한 DNA 제공 시스템의 개략을 나타내는 블록도이다. 도 3 내지 도 5는 「진네트뱅크(GNB)」의 사용상황을 플로우차트로 나타내는 설명도이다.
(1)진네트뱅크(GNB)의 개략
우선, DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB)」의 개략에 대해서 도 1에 따라 설명한다.
DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB)」는 도 1에 나타낸 바와 같이, 통신회로(L1)를 통한 주시스템과, 통신회로(L2)를 통한 부수시스템을 포함해서 구성된다.
주시스템이란, DNA정보 및/또는 DNA시료구입부와 DNA칩 제작부를 구비한 DNA정보·칩 제공장치를 갖는 DNA정보· DNA칩의 제공회사측과, DNA정보·칩 선택구입장치를 갖는 유저측이, 통신회로(L1)를 통한 DNA정보 및/또는 DNA칩의 판매구입 계약 후에, DNA정보 및/또는 DNA칩의 발송과 대금(DNA정보 제공비용, 칩 소재에 따른 DNA칩 제공비용)의 지불을 행하는 시스템이다.
한편, 부수시스템이란, 유저측이 소망하는 DNA정보나, DNA칩의 재료가 제공회사측에 남아 있지 않은 경우에, 제공회사측과 DNA정보 및/또는 DNA 시료의 제공측이, 통신회선(L2)을 통한 DNA정보 및/또는 DNA시료의 구입판매 계약 후에, DNA정보 및/또는 DNA시료의 발송과 대금지불을 행하는 것이다.
DNA정보·칩선택구입장치는, 예를 들면 퍼스널 컴퓨터 등의 통신기기 등이며, 연구소, 연구자 개인 등의 유저의 바로 앞에 설치된다.
한편, DNA정보·칩 제공장치는 DNA정보 및/또는 DNA칩에 관한 정보를 판독하여 유저에게 그 정보를 제공하는 장치이며, DNA정보·칩의 제공원인 제공회사가 소유하고 있다.
또한, DNA정보 및/또는 DNA시료 제공측이란, 다른 제공기관 또는 유저이며, DNA정보나, DNA칩의 재료가 되는 DNA시료를 제공하는 것을 말한다. DNA정보를 제공하는 것으로서는, 예를 들면, 기업화된 DNA뱅크(정보) 등을 들 수 있다. 또, DNA정보뿐만 아니라 DNA시료도 제공하는 것으로서는, 유저도 포함하는 연구자(소)·개발자(소) 등을 들 수 있다.
(2)DNA정보·칩 선택구입장치
이하, DNA정보·칩 선택구입장치에 대해서 설명한다.
DNA정보·칩 선택구입장치는 도 2에 나타내는 바와 같이, 제어부와, (1):제공정보수신부와, (2):제공정보축적·선택부와, (3):선택정보입력부와, (4):선택정보출력·축적부와, (5):선택정보송신부와, 제공정보, 선택정보 등을 나타내는 표시부를 구비하고 있다.
제어부는 마이크로 컴퓨터 또는 마이크로 프로세서를 포함해서 구성되어 있고, DNA정보·칩 선택구입장치 전체를 제어한다.
(2):제공정보축적·선택부는 제공정보수신부가 수신하는 제공정보를 축적하는 기능을 구비함과 아울러, 그 축적된 제공정보 중에서 유저가 소망하는 제공정보의 선택을 행하는 기능도 구비하고 있다.
(3):선택정보입력부는 (2):제공정보축적·선택부의 제공정보로부터 유저가 선택하는 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보(이하, 선택정보라 한다.)를 입력하는 부분이다.
또한, (4):선택정보출력·축적부는 선택정보입력부에서 선택된 선택정보를 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 기능을 구비하고 있다.
(2):제공정보축적·선택부와 (4):선택정보출력·축적부는 수시의 기입과 판독이 가능한 하드 디스크 또는 광자기 디스크 등의 대용량 기억매체로 구성된다.
통신회로(L1)와 접속되는 (1):제공정보수신부는, DNA정보·칩의 제공원인 제공회사로부터 통신회로(L1)를 통해서 배신해 오는 DNA정보 및/또는 DNA칩에 관한 정보(이하, 제공정보라 한다.), 즉 제공회사가 제공가능한 DNA(정보:SNP, VNTR 다형, 마이크로 세틀라이트 다형, 삽입·결실형 다형 등의 유전자 다형 정보 등도 포함하는 염기배열 정보)나, 상기 DNA시료 중, 질병에 관여하는 부분이나 각종 생체성분에 대응하는 DNA정보 등을 수신한다.
통신회로(L1)와 접속되는 (5):선택정보송신부도, 제공정보로부터 유저가 선택하는 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보(이하, 선택정보라 한다.)를 통신회로(L1)를 통해서 제공회사에 송신한다.
또한, DNA시료·칩 선택구입장치에서는, 유저측이, 제공정보에 없는 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩(이하, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩이라 한다.)을 소망하는 경우에도 대응할 수 있게 되어 있다. 즉, 이러한 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 의뢰 정보 등도 접수하는 것이 가능하다.
이 경우는, 유저가 (3):선택정보입력부에서 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 입력하면, (4):선택정보출력·축적부가 이러한 정보를 출력가능하게 하여 이것을 축적한 후에, (5):선택정보송신부가 이러한 정보를 외부로 출력한다. 즉, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 DNA정보·칩 제공장치의 (11):선택정보수신부에 송신하고, DNA정보 및/또는 DNA칩에 관한 제공정보를 구축할 수 있는지의 여부, DNA칩의 경우는 마더칩을 만들기 위한 별주의뢰에 대응가능한지의 여부를 타진할 수 있다.
또한, (1):제공정보수신부는, 이러한 문의에 대하여, DNA정보·칩 제공장치로부터의 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 의뢰에 대한 회답, 대응을 수신할 수 있다. 그리고, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 제공 또는 별주의뢰에 필요로 하는 비용 등의 과금제어 정보 등의 부수적 정보도 수신한다.
DNA정보·칩 선택구입장치의 제어부는, (1):제공정보수신부가 수신한 제공정보 등의 (2):제공정보축적·선택부에의 기입 ·축적을 제어하거나, (3):선택정보입력부에서 입력한 선택정보 등의 (4):선택정보출력·축적부에 있어서의 출력·축적을 제어한다.
통신회로(L1)로서는, 전화회선 등의 공중회선, 위성통신회선 등, DNA정보·칩 선택구입장치의 설치상황에 따라서 적절한 것을 이용할 수 있다.
제공정보는, 제공회사가 소유하는 DNA정보·칩 제공장치로부터 배신되는 것이며, 데이터 압축된 것이 바람직하다. 데이터 압축된 것이면, 통신회선 사용시간을 단축해서 통신 가격을 절약할 수 있음과 아울러, (2):제공정보축적·선택부의용량도 절약할 수 있다.
DNA정보·칩 선택구입장치의 (2):제공정보축적·선택부는, 제공정보수신부가 수신하는 제공정보의 축적과 그 축적된 제공정보 중에서 유저가 원하는 제공정보의 선택을 행한다.
예를 들면, 도 6에 나타내는 바와 같이, 표시부의 적당한 디스플레이에 제공정보의 검색화면이 표시되고, 생물명, 효소명, 질병명 등으로부터 선택할 수 있도록 되어 있고, 소망의 DNA에 관한 정보를 유저가 입력하면, 도 7의 제공정보일람이 표시되어, DNA의 종류, 가격, 재고정보 등이 표시된다. 이 제공정보는 통신회로(L1)를 통해서, 제공회사의 DNA정보·칩 제공장치로부터 배신되어 온다.
그리고, 유저가 어느 하나의 제공정보를 클릭하면, 다음에 도 8의 선택화면으로 이동한다. 이 화면에서는, DNA정보 및/또는 DNA칩 제공정보 중에서 선택된, 유저가 소망하는 DNA의 종류, 개수, DNA정보나 DNA칩 중 어느 것을 희망하는지(양쪽을 희망하는 경우도 포함한다)를 선택표시할 수 있도록 되어 있다. 또한, 유저의 이름, 주소, 메일 어드레스 등 연락처를 입력하는 선택부위도 설치되어 있다. 또, 제공정보일람에는 없는, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 구입하고 싶은 경우에는, 그 정보 등을 기입하는 선택부위가 설치되어 있다.
이들 선택부위는 제어부의 신호 입력부에 접속하고 있어, 이후의 처리로 진행할 수 있다.
DNA정보·칩 선택구입장치의 (5):선택정보송신부는, 유저가 (3):선택정보입력부에서 선택정보를 입력하면, (4):선택정보출력·축적부가 이러한 선택정보를 출력가능하게 하여 이것을 축적한 후에, 이러한 선택정보를 외부로 출력한다. 즉, 선택정보를 DNA정보·칩 제공장치의 (11):선택정보수신부에 송신할 수 있다.
한편, (5):선택정보송신부가 송신하는 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보의 데이터에 대해서도, 압축된 것이 바람직하다. 데이터 압축된 것이면, 통신회선의 사용시간을 단축하여 통신비용을 절약할 수 있음과 아울러, 용량도 절약할 수 있다.
또, DNA정보·칩 선택구입장치의 표시부는, (1):제공정보수신부를 경유하여 (2):제공정보축적·선택부가 수신한 DNA정보 및/또는 DNA칩 제공정보나, (2):제공정보축적·선택부의 제공정보 중 (3):선택정보입력부에서 선택입력된 선택정보 등을 표시하는 부위이다. 소망에 의해 프린터 등과 접속시켜, 프린트 가능하게 할 수도 있다.
(3)DNA정보·칩 제공장치
이하, DNA정보·칩 제공장치에 대해서 설명한다.
DNA정보·칩 제공장치는, 도 2에 나타내는 바와 같이, 제어부와, (11):선택정보수신부와, 선택정보 보존부, DNA정보 보존부, DNA시료 보존부 및 DNA칩 보존부로 이루어지는 (12):보존관리부와, (13):제공정보출력·축적부와, (14):제공정보송신부와, DNA복제수단·칩 활성화부·DNA고정부로 이루어지는 (15):DNA칩 제작부와, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료구입부와, (17):DNA칩 정보해석부와, 선택정보, 제공정보, 보존관리 정보 등을 표시하는 표시부를 구비하고 있다.
제어부는, 마이크로 컴퓨터 또는 마이크로 프로세서를 포함해서 구성되어 있고, DNA정보·칩 제공장치 전체를 제어한다.
또한, (12):보존관리부와 (13):제공정보출력·축적부는 수시로 기입과 판독이 가능한 RAM 또는 플레시 메모리 등, 대용량의 기억매체로 구성된다.
DNA정보·칩 제공장치의 (11):선택정보수신부는, DNA정보·칩 선택구입장치의 (4):선택정보출력부가 출력하고, (5):선택정보송신부가 송신하는, 유저가 DNA정보·칩 제공장치에 있어서 선택한 선택정보를 수신한다. 또한, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 의뢰정보도 수신한다.
이 (11):선택정보수신부에서 수신된 선택정보 등은 제어부에 의해 (12):보존관리부의 선택정보 보존부에 축적된다.
또한, DNA정보·칩 선택구입장치의 (5):선택정보송신부와 DNA정보·칩 제공장치의 (11):선택정보수신부 사이의 통신회선(L1)은, 기계적 또한 전기적으로 접촉함으로써 데이터의 수수를 행해도 좋지만, 기계적인 접촉이 없는 적외선통신, 광통신 또는 전자유도통신 등을 이용하는 것이 바람직하고, 그렇게 함으로써 기밀성, 신뢰성이 높은 DNA 제공 시스템으로 할 수 있다.
DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부는, DNA정보·칩 선택구입장치로부터의 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보를 보존하는 선택정보 보존부와, 제공가능한 DNA정보에 대한 DNA정보 보존부와, DNA칩 제작용 DNA시료 자체와 DNA시료의 관리상황을 보존하는 DNA시료 보존부와, 제작된 DNA칩 자체와 DNA칩의 관리상황의 보존 및 유저에의 DNA칩 발송업무를 행하는 DNA칩 보존부를 포함해서 구성되는 것이다.
또, (12):보존관리부는, 유저가 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 의뢰해 온 경우, 제공정보로서는 보존하고 있었지만, DNA정보·칩 선택구입장치에 미송신의 상태였던 경우에는, 이것을 송신하기 위한 지시를 행하는 기능을 갖는다.
또한, (12):보존관리부는, DNA정보나 DNA시료가 존재하지 않는 경우에는, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료 구입부에 그러한 내용을 전하는 기능도 갖는다. 그리고, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료 구입부가 구입한 정보 및 시료를, DNA칩 제작부에 보내고, DNA칩의 작성을 지시하는 기능도 갖는다.
제공대상이 되는 DNA정보· DNA칩은 특별히 한정되지 않고, 올리고뉴클레오티드 외, RNAs(mRNA·tRNA·rRNA 등), cDNA(상보적 DNA) 또는 gDNA(염색체 DNA)의 라이브러리, 이들 라이브러리로부터 PCR 증폭·플러스미드 증폭 등을 행한 유전자·DNA단편 등의 DNA정보와 DNA칩을 들 수 있다.
DNA정보·칩 제공장치의 (13):제공정보출력·축적부는, 선택정보에 대응하는 제공정보를, 보존관리부에서 외부로 출력가능하게 함과 아울러 축적한다. (14):제공정보송신부는, 이 제공정보를 통신회선(L1)을 이용하여, 외부로 출력한다.
또한, (13):제공정보출력·축적부가 출력하는 선택정보의 데이터에 대해서도, 압축된 것이 바람직하다. 데이터 압축된 것이면, 통신회선의 사용시간을 단축해서 통신비용을 절약할 수 있음과 아울러, 용량도 절약할 수 있다.
DNA정보·칩 제공장치의 표시부는, (11):선택정보수신부를 경유해서 (12):보존관리부가 수신한 선택정보나 (13):제공정보출력·축적부에서 출력되는 제공정보 등을 표시하는 부위이다. 소망에 의해 프린터 등과의 접속으로 프린트 가능하게 할 수도 있다.
DNA정보·칩 제공장치의 (15):DNA칩 제작부는, 유저가 소망하는 DNA칩이 보존관리부의 DNA칩 보존부에 남아 있지 않을 때에 상기 DNA칩을 제작하는 기능을 갖고, DNA복제수단과, 칩 활성화부와, DNA고정부를 구비하고 있다. 이 (15):DNA칩 제작부는 DNA정보·칩 제공원인 제공회사가 통상은 소유하고 있지만, 다른 기관이 소유하고 제공회사가 외주하는 형태이어도 좋다.
또, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료구입부는, (12):보존관리부로부터의 지시에 따라서, 유저가 소망하는 DNA칩을 제작하기 위한 DNA시료도 남아 있지 않을 때나, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 별주의뢰에 대응해서 DNA정보 및/또는 DNA시료를 다른 제공기관 또는 유저로부터 구입한다.
(15):DNA칩 제작부의 DNA복제수단에서는, 유저의 선택정보에 기초하여, 제공회사가 제공가능한 DNA시료 및/또는 DNA칩을 복제하기 위해, 특정한 염기배열영역의 선택 및 복제처리를 행한다. 실제의 복제수단은, DNA시료를 플러스미드 등의 벡터계에 조립한 형태로의 복제방법도 가능하지만, 후술하는 바와 같이, 복제 조작의 극단적인 간소화 및 복제시간의 대폭적인 단축화가 가능한 형태인 DNA라이브러리를 고정한 마더칩을 이용한 무벡터계로 행한다.
다음에, (15):DNA칩 제작부의 칩 활성화부에서는, 복제처리된 DNA시료를 고정할 수 있도록 칩 표면의 화학적처리를 행한다. 칩(고정화용 기판)으로서는, 예를 들면, 다이아몬드, 실리콘, 유리 등의 기판을 들 수 있지만, 특히 DNA고정화 능력이나 안정성이 뛰어난 점에서 다이아몬드칩이 바람직하다.
다이아몬드칩 표면을 세정후, 자외선조사 하에서 표면탄소원자의 염소화를 행하고, 또한 암모니아가스 존재하의 자외선조사로 염소치환하여 표면탄소원자의화학수식적 아미노화를 행한 다이아몬드칩 제품을 사용하고, 그 칩 표면의 아미노기에 2가 카르복실산의 1개의 카르복실기를 아미드결합시켜서 카르복실화 다이아몬드칩을 제작한다.
다음에, 카르복실화 다이아몬드칩의 미수식 카르복실기를 활성화한 상태로 올리고뉴클레오티드용액에 침지시킴으로써, 2가 카르복실산을 링커로서 소망하는 유전자·DNA단편의 고정에 대응한 올리고뉴클레오티드를 화학수식하고, 그 전에 소망하는 유전자·DNA단편 등의 DNA시료를 고정할 수 있도록 한 활성화칩을 제작한다.
그리고, (15):DNA칩 제작부의 DNA고정부에서는, 올리고뉴클레오티드를 화학수식하여 DNA시료를 고정할 수 있도록 한 활성화칩에, 복제처리된 DNA시료를 실제로 고정한다. 이 때의 고정화 올리고뉴클레오티드에 복제처리된 DNA시료를 공유결합적으로 결합시키는 반응은, 통상의 분자생물학적 키트시약과 관련 효소를 이용해서 행한다.
여기에서, 제공하는 DNA칩을 제작하기 위한 유전자· DNA단편 등의 DNA시료는, (12):보존관리부의 DNA시료부이며, 신규구입 직후의 DNA시료로 칩에 고정되어 있지 않는 형태나, 또는 마더칩의 형태(이쪽이 주)로 보존되어 있다.
한편, 유저로부터의 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 별주의뢰의 경우는, 마더칩이 아직 존재하지 않게 된다. 그래서, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료구입부를 통해서 신규 구입된 DNA시료는 유전자·DNA단편의 단독의 형태나, 또는 라이브러리상태의 형태로 구입 직후에 상기와 마찬가지로 고정화 올리고뉴클레오티드에 통상의분자생물학적 키트 시약과 관련 효소를 이용해서 마더칩으로서 고정한다.
통상, 마더칩은 마이크로파 기상합성법에 의한 고열전도성 박막(예를 들면 두께 0.1∼0.2㎜)으로 이루어지는 다이아몬드 단편(예를 들면 3㎜×3㎜)의 한쪽 면 상에, 상기의 고정화 전처리를 행한 후에 그 칩 1장당 몇 백억∼몇 천억개의 DNA분자를 고정한 상태에서의 cDNA라이브러리 또는 gDNA라이브러리이다.
DNA정보·칩 제공장치의 (16):DNA정보 및/또는 DNA시료 구입부가 DNA시료를 토탈 RNA시료로서 구입하여 cDNA라이브러리(일본쇄)를 구축한 경우나, 토탈 RNA시료로부터의 cDNA라이브러리(일본쇄)로서 처음부터 구입한 경우, 이들에 대한 마더칩은 5'말단에 1∼3개의 아데노신이나 시티딘을 갖는 올리고(dT)n를 활성화 다이아몬드칩에 그 5'측에서 고정한 올리고(dT)n칩을 조제된 토탈 RNA용액에 침지시키고, 역전사효소의 첨가로 제작한다. (토탈 RNA시료의 일부는, 상시, (12):보존관리부의 DNA시료보존부에서 보존관리된다). 그 마더칩 제작시의 mRNA의 리사이클하는 방법에서와 같은 고정화 방법이 가능한 레플리카 자동제작장치에 의해, 20장 이상의 마더칩에 대한 레플리카칩도 하루 채 안 걸리게 제작할 수 있다. cDNA라이브러리(일본쇄)의 이본쇄화는 필요에 따라서 마더칩 또는 레플리카칩 상에서 비교적 간단히 행할 수 있다.
한편, DNA정보·칩 제공장치의 (16):DNA정보 및/또는 DNA시료구입부가, DNA시료를 gDNA시료(이본쇄)로서 구입한 경우는, 적당한 제한효소로 처리한 후에 동일한 제한 효소부위를 소유하는 올리고뉴클레오티드를 고정한 이본쇄 DNA고정용칩에 라이게이스를 작용시켜서 마더칩으로서 제작할 수 있다. (gDNA시료의 일부는 상시(12):보존관리부의 DNA시료보존부에서 보존관리된다). 이 마더칩을 사용한 레플리카칩 제작도 레플리카 자동제작장치를 사용해서 할 수 있다.
이들 마더칩 및 레플리카칩은, 각각의 칩의 배면에 각인된 식별용 넘버(마더칩 ID번호)에 기초하여, DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부의 DNA시료 보존부에 보관관리되어 있다.
보존관리되어 있는 cDNA라이브러리 및 gDNA라이브러리의 각각의 마더칩 또는 레플리카칩을 이용하여, 그들 라이브러리 중에 포함되는 각각의 유전자 또는 DNA단편을 PCR(Polymerase Chain Reaction) 증폭한 후, 그 증폭산물을 상기와 마찬가지로 각각의 활성화 다이아몬드칩에 고정한 도우터칩를 제작한다. 그들 도우터칩에 대해서도, 각각의 배면에 각인된 식별용 넘버(도우터칩 ID번호)에 기초해서 DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부의 DNA칩 보존부에 보관되어 있다.
통신회선(L2)을 통해서 구입된 DNA정보 단독 또는 DNA시료 구입에 따르는 상기 DNA정보의 보존 및 마더칩, 레플리카칩, 도우터칩의 관리정보의 보존은, DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부의 DNA정보 보존부에서 행해진다.
(17):DNA칩 정보해석부는 구입한 DNA시료를 고정한 DNA칩의 정보해석을 행한다. 정보해석은 항상 행하는 것으로 해도 좋지만, 유저가 희망하는 경우에 행해지는 것으로 해도 좋다.
(4)「진네트뱅크(GNB)」에 의한 DNA제공 프로세스
다음에, 상술의 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB)」의 DNA정보·칩 선택구입장치와 DNA정보·칩 제공장치의 취급방법을 도 2의 DNA 제공 시스템과 도 3 내지도 5의 플로우차트로 설명한다.
〔주시스템〕
도 3은 DNA정보 및/또는 DNA칩의 송신·발송까지 〔주시스템〕의 일련의 플로우를 나타내는 것이다.
우선, DNA정보·칩 선택구입장치의 (3):선택정보입력부로부터 제어부에 신호를 보내고, (2):제공정보축적·선택부로부터 제공정보를 연다.
이 조작은 유저가 행하게 된다. 유저의 바로 앞에 DNA정보·칩 선택구입장치가 없는 경우는, 상기 장치의 설치 장소를 향해서 행하게 된다.
유저는 (2):제공정보축적·선택부로부터 소망하는 제공정보를 선택하고, 예를 들면 누름버튼 스위치를 누르면, 제어부는 선택한 DNA정보 및/또는 DNA칩(선택정보)이 제공정보의 범위 내인지의 여부를 확인한다.
예를 들면, 유저가 어떤 질병 등에 관여하는 DNA정보 및/또는 DNA칩을 선택한 경우, 이것을 반문해서 유저가 소망하는 제공정보를 확인하고, 인식한다.
선택정보가 제공정보의 범위 내인 경우에는(도 3의 Yes), 이하의 스텝으로 진행된다. 한편, 선택정보가 제공정보의 범위 내가 아닌 경우에는(도 3의 No (*)), 그 상태에서는 선택정보로서 그대로 접수할 수 없으므로, 도 5에서 설명하는 〔부수시스템〕의 스텝으로 진행하게 된다.
다음에, (2):제공정보축적·선택부로부터 소망하는 제공정보를 판독하고, (4):선택정보출력·축적부를 경유해서 (5):선택정보송신부로부터 선택정보를 출력한다.
즉, (2):제공정보축적·선택부로부터 소망하는 제공정보 중에서, (3):선택정보입력부에서 유저가 소망하는 제공정보를 선택정보를 입력하면, (4):선택정보출력·축적부가 이러한 정보를 출력가능하게 하여 이것을 축적한 후에, (5):선택정보송신부가 이러한 정보를 외부로 출력한다.
그리고, DNA정보·칩 선택구입장치와 DNA정보·칩 제공장치에서 송수신가능한 경우에는(Yes), 이하의 스텝으로 진행된다.
다음에, DNA정보·칩 선택구입장치로부터의 선택정보의 신호를, DNA정보·칩 제공장치의 (11):선택정보수신부를 경유해서 제어부에 보내고, (12):보존관리부로부터의 소망하는 DNA칩 보존정보 및/또는 DNA정보를 판독하고, (13)제공정보출력·축적부, (15):제공정보송신부를 경유해서, DNA정보·칩 선택구입장치의 (1)제공정보수신부에 보낸다.
DNA칩 보존정보란, DNA칩이 남아 있다는 정보나, DNA칩에 대한 마더칩, 레플리카칩 또는 DNA시료는 존재하지만, DNA칩 보존부에는 상기 DNA칩이 남아 있지 않다는 정보이다.
유저가 DNA정보를 소망하는 경우, DNA정보·칩 선택구입장치와 DNA정보·칩 제공장치에서 송수신가능한 것을 조건으로(Yes), DNA정보·칩 제공장치로부터 판독한 대응 DNA정보가 송신된다.
유저는 소망하는 DNA정보를 DNA정보·칩 선택구입장치의 수신부를 통해서 받을 수 있다.
한편, 유저가 DNA칩을 소망하는 경우, 소망하는 DNA칩이 보존되어 있는(재고가 있는) 경우는(Yes), 그 DNA칩이 유저에 대하여 발송된다.
소망하는 DNA칩이 보존되어 있지 않는(재고가 없는) 경우에는, 〔부수시스템〕의 도 4의 플로우로 진행된다.
또한, 유저가 DNA정보와 DNA칩의 모두를 소망하는 경우에는, 이상 설명한 프로세스에서, 상기 DNA정보를 부수된 DNA칩을 (12):보존관리부의 DNA칩 보존부로부터 유저에게 발송한다. 발송시에는 청구서를 첨부하는 등하여 대금지불을 청구한다.
〔부수시스템〕
〔1〕유저가 선택한 DNA칩에 대한 마더칩, 레플리카칩 또는 DNA시료는 존재하지만, DNA칩 보존부에는 상기 DNA칩이 남아 있지 않는 경우(도 4).
도 4는 유저가 선택한 DNA칩의 재고가 없는 경우의, DNA칩 제작, 발송의 프로세스의 일련의 플로우를 나타내는 것이다.
소망하는 DNA칩이 보존되어 있지 않는(재고가 없는) 경우에는, DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부가 DNA시료 등의 부족한 재료를 조달한다. 구체적으로는, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료구입부에 구입을 의뢰하고, 다른 제공기관이나 유저에게 DNA시료에 한정되지 않고, 칩 재료 외의 DNA칩을 제작하는 데에 필요한 재료를 의뢰함으로써 조달한다.
칩에 대응하는 DNA시료를 고정할 수 있는 경우는(Yes), (15):DNA칩 제작부에서 DNA시료를 고정하고, 도우터칩으로서 제작한다. 즉, (16):DNA정보 및/또는 DNA시료구입부가 DNA시료 등을 구입하면, (12):보존관리부가 지시를 받고, (15):DNA칩제작부에 대하여 DNA시료를 보냄과 아울러, DNA칩 제작을 지시한다.
제작한 DNA칩의 정보해석이 필요하지 않은 경우에는(No), 제작한 DNA칩을 유저에게 발송한다. 발송시에는 청구서를 첨부하는 등 하여 대금지불을 청구한다.
한편, DNA칩의 정보해석이 필요한 경우에는(Yes), (17):DNA칩 정보해석부에서 염기배열을 해석하고, (12): 보존관리부의 DNA정보 보존부에 해석정보를 보존함과 아울러, DNA칩이 발송된다.
〔2〕제공정보에 없는 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 의뢰가 있던 경우(도 5)
한편, 도 5는 제공정보 중에, 유저가 소망하는 DNA정보 및/또는 DNA칩이 존재하지 않고 있는 경우의 처리 플로우를 나타내는 것이다.
DNA정보·칩 선택구입장치의 (2):제공정보축적·선택부의 제공정보 중에, 유저가 소망하는 DNA정보 및/또는 DNA칩이 존재하지 않고 있는 경우에는(No(*)), 선택구입장치와 제공장치에서 송수신가능한 것을 조건으로(Yes), 선택정보의 신호를 DNA정보·칩 선택구입장치의 (5):선택정보송신부로부터 DNA정보·칩 제공장치의 (11):선택정보수신부에 접속하고, 신규의 제공의뢰정보로서 DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부에 전송한다.
또한, 선택정보의 신호는, 통상의 경우와 마찬가지로 유저가 (3):선택정보입력부에 입력된 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을, (4):선택정보출력·축적부가, 이러한 정보를 출력가능하게 하여 이것을 축적한 후에, (5):선택정보송신부가 이러한 정보를 신호로서 외부로 출력한 것이다.
그리고, (12):보존관리부의 DNA정보 보존부, DNA시료보존부, DNA칩 보존부에, 선택정보에 대응한 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩이 존재하는 지의 여부를 문의한다.
대응한 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩이 (12):보존관리부에 더해지고 있는 경우는, DNA정보·칩 제공장치의 제어부는 그러한 내용을, (13)제공정보출력·축적부 및 (14)제공정보송신부를 통해서, DNA정보·칩 선택구입장치의 (2):제공정보축적·선택부에 반송해서 제공정보 중에 추가 삽입함과 아울러, 유저가 소망한 DNA정보 및/또는 DNA칩을 선택정보로서 접수한다(도 3의 (*)에 되돌아오고, 상술한 프로세스를 반복한다). 또한, 대응한 신규 제공정보가 존재하지 않을 때에는(No), 유저는 구입을 포기하고 통신 전반을 멈추거나(Stop), 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 별주의뢰를 행한다(도 4의 (**)).
신규 DNA정보 및/또는 DNA칩의 별주의뢰를 받은 DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부는, 구입부를 통해서 DNA정보 및/또는 DNA 시료의 제공측으로부터 유저가 소망하는 신규 DNA정보 또는 신규 DNA정보 및/또는 DNA시료를 찾아내서 구입한다.
그리고, 마더칩으로서 신규 DNA칩을 제작하고, 그 도우터칩를 제작하여 상기 DNA정보를 부수하여 유저에게 발송함과 아울러 (12):보존관리부의 DNA칩 보존부에도 몇 장인가의 스페어를 보존한다.
청구항 1에 기재된 본 발명의 DNA 제공 시스템 「진네트뱅크(GNB)」에 있어서의 DNA칩 제작조작은, DNA정보·칩 제공장치의 (12):보존관리부에 축적되어 있는 데이터에 기초하여 행하고 있는 것이며, 유저는 시간이나 장소나 환경 등의 요인에 속박되는 일없이 DNA정보·DNA칩을 얻을 수 있어, 효율적인 연구, 진단을 행할 수 있다.
또한, 청구항 1에 기재된 본 발명에 의하면, 유저는 DNA의 기능을 선택하는 것만으로 그 기능을 갖는 DNA의 염기배열정보나 상기 DNA칩 등을 즉석에서 입수할 수도 있으므로, 연구나 질병진단에 유용하다.
또한, 청구항 1에 기재된 본 발명에 의하면, DNA정보·DNA칩 제공회사도 유저의 희망을 재빠르게 수신할 수 있으므로, 재빠른 서비스제공이 가능함과 아울러 고객의 증가에 의한 수입의 증가를 많이 기대할 수 있다.
그리고, 청구항 1에 기재된 본 발명의 시스템을 이용하여, 특히 DNA의 염기배열해석이나 기능구명에 다액의 투자를 행해 온 대학·연구소·기업 등도 그들의 투자를 충분히 회수할 수 있게 된다.

Claims (9)

  1. 통신회선을 통해서 제공되는 DNA정보 및/또는 DNA칩 정보(이하, 제공정보라 한다.)를 수신하는 제공정보수신부와, 제공정보수신부가 수신하는 제공정보의 축적과 그 축적된 제공정보 중에서 유저가 소망하는 제공정보의 선택을 행하는 제공정보축적·선택부와, 제공정보축적·선택부의 제공정보로부터 유저가 선택하는 DNA정보 및/또는 DNA칩 선택정보(이하, 선택정보라 한다.)를 입력하는 선택정보입력부와, 선택정보입력부에서 선택된 선택정보를 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 선택정보출력·축적부와, 선택정보출력·축적부로부터의 선택정보를 외부로 출력하는 선택정보송신부와, 제공정보·선택정보 등을 표시·제어하는 표시부·제어부를 구비하는 DNA정보·칩 선택구입장치; 및
    선택구입장치의 선택정보송신부로부터의 선택정보를 수신하는 선택정보수신부와, 선택정보, DNA정보, DNA칩을 위한 DNA시료, DNA칩을 보존하는 보존관리부와, 선택정보에 대응하는 제공정보를 보존관리부로부터 외부로 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 제공정보출력·축적부와, 제공정보출력·축적부로부터의 제공정보를 외부로 출력하는 제공정보송신부와, 유저가 소망하는 DNA칩이 보존관리부의 DNA칩 보존부에 남아 있지 않을 때에 상기 DNA칩을 제작하는 DNA칩 제작부와, 제공정보·선택정보 등을 표시·제어하는 표시부·제어부를 구비하는 DNA정보·칩 제공장치를 포함해서 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  2. 제 1항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 선택구입장치에 있어서, 선택정보입력부는 또한, 제공정보에 없는 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩(이하, 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩이라 한다.)을 입력하는 기능을 가짐과 아울러,
    선택정보출력·축적부는 이러한 정보를 출력가능하게 하여 이것을 축적하는 기능을 가짐과 아울러,
    선택정보송신부가 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 외부로 출력하는 기능을 갖는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  3. 제 2항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 제공장치에 있어서, 선택정보수신부는 선택구입장치의 선택정보송신부로부터의 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 수신하는 기능도 갖고,
    보존관리부는 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩에 대해서, 제공정보로서는 보존하고 있었지만 DNA정보·칩 선택구입장치에 미송신의 상태였던 경우에는, 이것을 송신하기 위한 지시를 행하는 기능을 추가로 갖고,
    제공정보출력·축적부는 이러한 신규 DNA정보 및/또는 DNA칩을 제공정보로서 보존관리부로부터 외부로 출력가능하게 함과 아울러 축적하는 기능을 추가로 갖는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  4. 제 1항 내지 제 3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 제공장치가, 유저가 소망하는 DNA칩을 제작하기 위한 DNA시료도 남아 있지 않을 때에, DNA정보및/또는 DNA시료를 다른 제공기관 또는 유저로부터 구입하는 DNA정보 및/또는 DNA시료구입부를 추가로 구비하는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  5. 제 1항 내지 제 4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 제공장치가, 구입한 DNA시료를 고정한 DNA칩의 정보해석을 행하는 DNA칩 정보해석부를 추가로 구비하는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  6. 제 1항 내지 제 5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 선택구입장치의 선택정보송신부와 상기 DNA정보칩 제공장치의 선택정보수신부 사이의 선택정보의 수수가 비접촉으로 되도록 한 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  7. 제 1항 내지 제 6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 제공장치의 제공정보송신부와 상기 DNA정보·칩 선택구입장치의 제공정보수신부 사이의 제공정보의 수수가 비접촉으로 되도록 한 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  8. 제 1항 내지 제 7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 제공장치의 보존관리부가 선택정보 보존부, DNA정보 보존부, DNA시료 보존부 및 DNA칩 보존부를 포함해서 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
  9. 제 1항 내지 제 8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 DNA정보·칩 제공장치의DNA칩 제작부가 DNA복제수단, 칩활성화부 및 DNA고정부를 포함해서 이루어지는 것을 특징으로 하는 DNA 제공 시스템.
KR10-2004-7004036A 2001-09-25 2002-09-25 Dna 제공 시스템 KR20040035830A (ko)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JPJP-P-2001-00290889 2001-09-25
JP2001290889A JP2003099624A (ja) 2001-09-25 2001-09-25 Dna提供システム
PCT/JP2002/009870 WO2003027927A1 (fr) 2001-09-25 2002-09-25 Systeme de fourniture d'adn

Publications (1)

Publication Number Publication Date
KR20040035830A true KR20040035830A (ko) 2004-04-29

Family

ID=19113122

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR10-2004-7004036A KR20040035830A (ko) 2001-09-25 2002-09-25 Dna 제공 시스템

Country Status (7)

Country Link
US (1) US20040209271A1 (ko)
EP (1) EP1443438A4 (ko)
JP (1) JP2003099624A (ko)
KR (1) KR20040035830A (ko)
CN (1) CN1559047A (ko)
CA (1) CA2461410A1 (ko)
WO (1) WO2003027927A1 (ko)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006337153A (ja) * 2005-06-01 2006-12-14 Toppan Printing Co Ltd Dna合成判定装置、核酸タンク装置、dnaチップ装置及びdna判定システム
US8077974B2 (en) 2006-07-28 2011-12-13 Hewlett-Packard Development Company, L.P. Compact stylus-based input technique for indic scripts

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0512574A (ja) * 1991-07-08 1993-01-22 Oki Electric Ind Co Ltd 商品情報の検索及び予約方法
JPH08272824A (ja) * 1995-03-31 1996-10-18 Hitachi Software Eng Co Ltd 遺伝子配列データ自動検索方法
WO1999005324A1 (en) * 1997-07-25 1999-02-04 Affymetrix, Inc. System for providing a polymorphism database
US6167383A (en) * 1998-09-22 2000-12-26 Dell Usa, Lp Method and apparatus for providing customer configured machines at an internet site
EP2899660A1 (en) * 1999-08-27 2015-07-29 Iris Biotechnologies Inc. Artificial intelligence system for genetic analysis
WO2001031333A1 (en) * 1999-10-26 2001-05-03 Genometrix Genomics Incorporated Process for requesting biological experiments and for the delivery of experimental information
JP3324594B2 (ja) * 1999-12-20 2002-09-17 株式会社日立製作所 バイオ製品の品質保証方法及びバイオ情報の配信方法
CA2398382A1 (en) * 2000-01-25 2001-08-02 Affymetrix, Inc. Method, system and computer software for providing a genomic web portal
JP2001256381A (ja) * 2000-03-08 2001-09-21 Ooguramu Design:Kk ネットワークを用いたオーダーメイドシステム
AU2001240991A1 (en) * 2000-03-15 2001-09-24 Genset Methods, software, and apparati for designing, ordering, pricing, tracking and directing production of custom biologicals

Also Published As

Publication number Publication date
US20040209271A1 (en) 2004-10-21
CN1559047A (zh) 2004-12-29
WO2003027927A1 (fr) 2003-04-03
JP2003099624A (ja) 2003-04-04
CA2461410A1 (en) 2003-04-03
EP1443438A1 (en) 2004-08-04
EP1443438A4 (en) 2007-01-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Lieberman-Aiden et al. Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome
Ren et al. Genome-wide location and function of DNA binding proteins
Somerville et al. Plant functional genomics
CN100350406C (zh) 用于提供基因网入口的方法和系统
Weixlbaumer et al. Insights into translational termination from the structure of RF2 bound to the ribosome
Xiang et al. A new strategy to amplify degraded RNA from small tissue samples for microarray studies
US6955883B2 (en) Life sciences business systems and methods
US8380441B2 (en) Systems for producing chemical array layouts
EP2510127B1 (en) Peptide display arrays
US8012688B2 (en) Gene expression profiling from FFPE samples
CN101133166A (zh) 平行制备核酸及应用
Czarnik Encoding strategies in combinatorial chemistry
US20060116827A1 (en) Systems and methods for producing chemical array layouts
Latham-Timmons et al. Novel method for the covalent immobilization of oligonucleotides via Diels-Alder bioconjugation
KR20040035830A (ko) Dna 제공 시스템
Zeng et al. Probing nucleation, reverse annealing, and chaperone function along the reaction path of HIV-1 single-strand transfer
Saxena et al. Are the reversibly glycosylated polypeptides implicated in plant cell wall biosynthesis non-processive β-glycosyltransferases?
US20040096840A1 (en) Validated design for microarrays
US20090094042A1 (en) Method and System for Providing a Customer Biopolymer to a Customer
Udvardi et al. GRAS genes and the symbiotic green revolution
Conrad et al. Natural and unnatural answers to evolutionary questions
Labant NGS Sample Prep: Enduring Basics and Evolving Enzyme Kits: Protocols for NGS sample prep are much the same as always, but now they are incorporating new enzyme kits that simplify work with challenging sample types and use cases
Carlson Molecular Diagnostics: Potential and Reality: Despite Posting Healthy Growth, Sector Falls Short of Ambitious Predictions Made in Past
DeLisa 1. REPORT DATE (DD-MM-YYYY)
Grasso et al. Identification of Novel FBN1 Mutations in Patients with Marfan Syndrome using DHPLC Analysis.

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E601 Decision to refuse application