KR102312197B1 - 트립토판 생성능을 가지는 형질전환 메탄자화균 및 이를 이용한 트립토판의 제조방법 - Google Patents

Abstract

본 발명은 메탄자화균을 숙주로 활용하여 메탄으로부터 트립토판을 다량 생산하는 것이다. 우선, 메탄자화균의 shikimic pathway 풀을 향상시키기 위하여 자일로스 (xylose)를 공동 탄소원으로 사용할수 있는 Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z를 숙주로 사용하였으며, 트립토판 feedback inhibition을 극복하기 위하여 대장균 유래의 aroG 및 trpE 유전자를 과발현시킴으로써 메탄 유래 트립토판을 성공적으로 다량 생산할 수 있음을 확인하였다.

Description

트립토판 생성능을 가지는 형질전환 메탄자화균 및 이를 이용한 트립토판의 제조방법 {Production of　tryptophan　from methane by metabolic engineered methanotrophs}

본 발명은 방향족 아미노산인 트립토판 생성능을 가지는 형질전환 메탄자화균 (metabolic engineered methanotrophs) 및 이를 이용한 트립토판 (tryptophan)제조방법에 관한 것이다.

방향족 아미노산인 트립토판 (L-tryptophan)은 모든 생명체의 단백질 합성에 필수적이며, 의약품, 식품첨가제, 사료첨가제 및 화장품 원료 등으로 사용될 수 있는 다양한 이차 대사산물들의 전구체로 사용되기 때문에 산업적으로도 중요한 의미를 가진다.

한편, 박테리아에서의 트립토판 생합성은 자연적으로 shikimic acid 생산 경로로부터 유래되며 중간 기질로써 chorismate를 공유, 이후 chorismat에서 나눠지며 트립토판은 anthranilate를 거쳐 최종적으로 합성된다. 방향족 아미노산을 미생물에서 대량으로 생산하고자 하는 시도는 1980년대부터 시작되어왔으며, 최근, 합성생물학, 생물 정보학, 단백질 공학, 시스템 생물학 등의 발전으로 대장균, 코리네박테리움 등의 대사 경로 조작을 통한 생산량 증가 연구가 꾸준히 진행되고 있다.

미생물에서 트립토판 생합성 대사경로의 첫 단계 효소인 DAHP synthase 및 chorismate에서 각 방향족 아미노산을 생산하는 효소인 TrpE, PheA, TyrA는 각각의 최종 생산물인 트립토판에 의해 feedback inhibition을 받는 것으로 알려져 있다. 이로 인해 생산물의 생산성 역시 감소하기 때문에 이들 방향족 아미노산을 대량으로 생산하기 위하여, 돌연변이 유전자를 도입함으로써 저해를 받지 않고 생산량을 증가시키는 방법이 공통적으로 사용되고 있다.

그러나, 아직 메탄자화균을 이용한 숙주로 보고된 바는 없다. 다른 전통적인 미생물 숙주와 비교하여, 메탄자화균은 메탄을 유일탄소원으로 사용하는 것으로 알려져 있으며, 메탄은 저렴하고 풍부한 차세대 탄소원으로 각광받고 있어 메탄자화균을 이용한 메탄 유래의 트립토판 생산은 유망한 미래 기술이 될 수 있다.

본 발명에서는 메탄자화균 을 숙주로 활용하여 메탄으로부터 트립토판을 생산하고자 하였다. 우선, 메탄자화균의 shikimic pathway 풀을 향상시키기 위하여 xylose를 공동 탄소원으로 사용할수 있는 Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z를 숙주로 사용하였으며, 트립토판 feedback inhibition을 극복하기 위하여 대장균 유래 aroG 및 trpE 유전자를 과발현시킴으로써 메탄 유래의 트립토판을 성공적으로 다량 생산함을 확인하였다.

본 발명의 목적은 메탄자화균을 숙주로 활용하여 메탄으로부터 트립토판을 다량 생산하는 것이다. 우선, 메탄자화균의 shikimic pathway 풀을 향상시키기 위하여 자일로스 (xylose)를 공동 탄소원으로 사용할수 있는 Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z를 숙주로 사용하였으며, 트립토판 feedback inhibition을 극복하기 위하여 대장균 유래의 aroG 및 trpE 유전자를 과발현시킴으로써 트립토판을 다량 생산하는 것에 그 목적이 있다.

상기와 같은 목적을 달성하기 위해, 본 발명은 aroG 및 trpE 유전자를 포함하는, 트립토판 생산용 재조합 벡터를 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, aroG 유전자는 서열번호 1 또는 서열번호 2의 염기서열로 표시된 것을 특징으로 할 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, trpE 유전자는 서열번호 3의 염기서열로 표시된 것을 특징으로 할 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 상기 aroG 및 trpE 유전자는 서열번호 1, 서열번호 2 또는 서열번호 3으로 표시된 염기서열이 차례로 벡터에 도입된 것을 특징으로 할 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

또한, 본 발명은 상기 벡터들 중 어느 하나가 도입된, 트립토판 생산용 벡터가 형질전환된 메탄자화균를 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 메탄자화균은 메틸로모나스 속 (Methylomonas), 메틸로박터 속 (Methylobacter), 메틸로코커스 속 (Methylococcus), 메틸로스페라 속 (Methylosphaera), 메틸로칼덤 속 (Methylocaldum), 메틸로글로버스 속 (Methyloglobus), 메틸로사르시나 속 (Methylosarcina), 메틸로프로펀더스 속 (Methyloprofundus), 메틸로썰머스 속 (Methylothermus), 메틸로할로비우스 속 (Methylohalobius), 메틸로게아 속 (Methylogaea), 메틸로마리넘 속 (Methylomarinum), 메틸로벌럼 속 (Methylovulum), 메틸로마리노범 속 (Methylomarinovum), 메틸로러브럼 속 (Methylorubrum), 메틸로파라코커스 속 (Methyloparacoccus), 메틸로시스티스 속 (Methylocystis), 메틸로셀라 속 (Methylocella), 메틸로캡사 속 (Methylocapsa), 메틸로퍼룰라 속 (Methylofurula), 메틸아시디필럼 속 (Methylacidiphilum), 메틸아시디마이크로븀 속 (Methylacidimicrobium), 메틸로마이크로븀 (Methylomicrobium) 속 또는 메틸로시 너스 속 (Methylosinus) 균주일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

마지막으로 본 발명은 트립토판 생산용 벡터가 형질전환된 메탄자화균을 이용한, 트립토판 생성방법을 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 배양시 탄소원으로 메탄을 첨가하여 배양하는 것을 특징으로 할 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 있어서, 배양시 탄소원으로 자일로스를 추가로 첨가하여 배양하는 것을 특징으로 할 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명은 메탄자화균을 숙주로 활용하여 메탄으로부터 트립토판을 다량 생산하는 것이다. 우선, 메탄자화균의 shikimic pathway 풀을 향상시키기 위하여 xylose를 공동 탄소원으로 사용할수 있는 Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z를 숙주로 사용하였으며, 트립토판 feedback inhibition을 극복하기 위하여 대장균 유래의 aroG 및 trpE 유전자를 과발현시킴으로써 메탄 유래 트립토판을 성공적으로 다량 생산할 수 있음을 확인하였다. 본 발명의 균주에 의해 생성된 총 트립토판은 39.6 mg/L에 도달하였으며, 이는 야생형보다 5.2배 더 높음을 확인하여 본 발명을 완성하였다.

도 1은 Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z에서 트립토판의 생합성 경로에서 주요 단계를 나타낸 도이다 (PEP: phosphoenolpyruvate; E4P: erythrose-4-phosphate).
도 2a는 wild-type 및 본 발명 균주의 성장 프로파일을 나타낸 도이다 (메탄을 공급한 정상 배양 조건에서는 20ZX, 20ZX-TRP 균주, 자일로스를 추가로 첨가한 배양 조건은 20ZX-TRP-Xyl로 표시).
도 2b는 144시간 배양 후 야생형 (wild-type) 및 본 발명 균주에서의 트립토판 생산을 나타낸 도이다 (데이터는 3회 반복 ±표준편차의 평균으로 표시).

이하, 첨부된 도면을 참조하여 본 발명의 실시예로 본 발명을 상세히 설명하기로 한다. 다만, 하기 실시예는 본 발명에 대한 예시로 제시되는 것으로, 당업자에게 주지 저명한 기술 또는 구성에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명을 생략할 수 있고, 이에 의해 본 발명이 제한되지는 않는다. 본 발명은 후술하는 특허 청구범위의 기재 및 그로부터 해석되는 균등 범주 내에서 다양한 변형 및 응용이 가능하다.

또한, 본 명세서에서 사용되는 용어 (terminology)들은 본 발명의 바람직한 실시예를 적절히 표현하기 위해 사용된 용어들로서, 이는 사용자, 운용자의 의도 또는 본 발명이 속하는 분야의 관례 등에 따라 달라질 수 있다. 따라서, 본 용어들에 대한 정의는 본 명세서 전반에 걸친 내용을 토대로 내려져야 할 것이다. 명세서 전체에서, 어떤 부분이 어떤 구성요소를 "포함"한다고 할 때, 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성 요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다.

본 명세서 전체에 걸쳐, 특정 물질의 농도를 나타내기 위하여 사용되는 '%'는 별도의 언급이 없는 경우, 고체/고체는 (w/w) %, 고체/액체는 (w/v) %, 그리고 액체/액체는 (v/v) %이다.

본 발명에서 사용되는 모든 기술용어는, 달리 정의되지 않는 이상, 본 발명의 관련 분야에서 통상의 당업자가 일반적으로 이해하는 바와 같은 의미로 사용된다. 또한 본 명세서에는 바람직한 방법이나 시료가 기재되나, 이와 유사하거나 동등한 것들도 본 발명의 범주에 포함된다. 본 명세서에 참고문헌으로 기재되는 모든 간행물의 내용은 본 발명에 도입된다.

이하, 본 발명을 상세하게 설명하도록 한다.

본 발명에서 용어 "대장균 (E.coli)"은 포도당을 주요 탄소원 또는 에너지원으로 사용하는 세균을 의미한다. 상기 대장균은 본 발명에서 형질전환의 대상이 되는 숙주 균주를 의미할 수 있으며, 본 발명의 목적상 포도당을 탄소원으로 사용하여, 아세틸-CoA로부터 3-hydroxybutyryl-CoA, 4-하이드록시부틸릴 CoA 를 거쳐 최종적으로 (3-하이드록시부티레이트 및 4-하이드록시부티레이트) 공중합체을 생산할 수 있는 한 특별히 이에 제한되지 않는다.

본 발명에서 용어 "메탄자화균 (methanotroph)"은 메탄을 주요 탄소원 또는 에너지원으로 사용하는 세균을 의미한다. 상기 메탄자화균은 본 발명에서 형질전환의 대상이 되는 숙주 균주를 의미할 수 있으며, 본 발명의 목적상 메탄을 탄소원으로 사용하여, 아세틸-CoA로부터 3-hydroxybutyryl-CoA, 4-하이드록시부틸릴 CoA 를 거쳐 최종적으로 (3-하이드록시부티레이트 및 4-하이드록시부티레이트) 공중합체을 생산할 수 있는 한 특별히 이에 제한되지 않는다.

상기 메탄자화균은 메탄 등 C1화합물을 에너지원으로 사용할 수 있는 것인한 특별히 이에 제한되지 않으나, 메틸로모나스 속 (Methylomonas), 메틸로박터속 (Methylobacter), 메틸로코커스 속 (Methylococcus), 메틸로스페라 속 (Methylosphaera), 메틸로칼덤 속 (Methylocaldum), 메틸로글로버스 속 (Methyloglobus), 메틸로사르시나 속 (Methylosarcina), 메틸로프로펀더스 속 (Methyloprofundus), 메틸로썰머스 속 (Methylothermus), 메틸로할로비우스 속 (Methylohalobius), 메틸로게아 속 (Methylogaea), 메틸로마리넘 속 (Methylomarinum), 메틸로벌럼 속 (Methylovulum), 메틸로마리노범 속 (Methylomarinovum), 메틸로러브럼 속 (Methylorubrum), 메틸로파라코커스 속 (Methyloparacoccus), 메틸로시스티스 속 (Methylocystis), 메틸로셀라 속 (Methylocella), 메틸로캡사 속 (Methylocapsa), 메틸로퍼룰라 속 (Methylofurula), 메틸아시디필럼 속 (Methylacidiphilum), 메틸아시디마이크로븀 속 (Methylacidimicrobium), 메틸로마이크로븀 (Methylomicrobium) 속 또는 메틸로시 너스 속 (Methylosinus) 균주 일 수 있으며, 구체적으로 메틸아시디마이크로븀 알칼리필리엄 (Methylomicrobium alcaliphilum) 20Z 또는 메틸로시너스 트리코스포륨 (Methylosinus trichosporium) OB3b 일 수 있다.

이러한 메탄자화균을 이용한 바이오전환 공정의 경우, 비교적 저렴한 탄소원으로 사용할 수 있어 경제적으로 유리하며, 배양과정에서 온실가스의 방출을 저감하는 등 환경적인 면에서도 장점이 있다.

본 발명에서 용어 "형질전환 미생물"은 상기 미생물의 유전자를 도입하거나 또는 제거하여 형질을 전환시킨 균주를 의미한다.

이하, 본 발명은 실시예에 의해 상세히 설명한다. 그러나 이들 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기의 실시 예에 한정되는 것은 아니다.

실시예 1. 본 발명에 사용된 균주 및 성장조건 확립

본 발명에 사용된 균주는 하기의 표 1에 나타나 있다.

균주	특징
Escherichia coli DH5α	-
Escherichia coli K12-MG1655	-
Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z	숙주 균주로 사용
20ZX	자일로스를 이용한 Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z 균주
20ZX-TRP	pAWP89-Trp 벡터를 보유하는 20ZX

M. alcaliphilum 20Z를 5 μM의 텅스텐, 50 μM의 카나마이신 및 10 μM의 겐타 마이신을 포함하는 항생제가 보충된 50 ml의 질산 미네랄염 배지 (nitrate mineral salts medium; NMS)에서 배양 하였다. 공기 중 50 % 메탄 조건에서 스크류캡으로 밀봉된 500 ml 플라스크에서 배양 조건을 30 ℃ 및 230 rpm으로 설정 하였다. 또한, 배양 플라스크의 공기를 매일 새로 교체해 주었다.

실시예 2. 본 발명의 플라스미드 구축

본 발명에 사용된 벡터는 하기의 표 2에 나타나 있다.

플라스미드	특징
pAWP89	pTac:: dTomato; oriV oriT trfA; KanR
pET28	T7lac; ori lacI; KanR
pET-Trp	pET28:: aroG(20Z)-aroGfbr(Ec)-trpEfbr(Ec)
pAWP89-Trp	pAWP89:: aroG(20Z)-aroGfbr(Ec)-trpEfbr(Ec)

또한, 본 발명의 플라스미드 구축에 사용된 프라이머 서열은 하기의 표 3에 나타내었다.

프라이머	염기서열 (5’-3’)
pAWP89_fw	TAGTTGTCGGGAAGATGCG
pAWP89_rv	AGCTGTTTCCTGTGTGAATA
aroG_Ma_fw	GACAGCAAATGGGTCGCGATGTTAAGCAAATATAACACCG
aroG_Ma_rv	CGACGGAGCTCGAATTCGTCAATTTTCAGTCTTTCTGCG
aroG_Ec_fw	AAAGACTGAAAATTGACGTTCACACAGGAAACAGCT ATGAATTATCAGAACGACGATTTACGC
aroG_Ec_rv	GCTTGTCGACGGAGCTCGTTACCCGCGACGCGCTTTTA
aroG_D146N_fw	GAGTTTCTCAATATGATCAC
aroG_D146N_rv	GTGATCATATTGAGAAACTC
trpE_Ec_fw	CGTCGCGGGTAACGAGCTGGTATTCACACAGGAAACAGCTATGCAAACACAAAAACCGACTCT
trpE_Ec_rv	AAGCTTGTCGACGGAGCTTCAGAAAGTCTCCTGTGCATGA
trpE_S40F_fw	CTGCTGGAATTCGCAGATATC
trpE_S40F_rv	GATATCTGCGAATTCCAGCAG
aroG_89_fw	TTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAGCAAATATAACACCG
T7ter_89_rv	GCATCTTCCCGACAACTACAAAAAACCCCTCAAGACCC
Gibson Assembly에 사용되는 상동성 서열은 밑줄이 그어져 있음

플라스미드 pET28a 및 pAWP89는 Addgene에 의해 제공되었다. 또한, 모든 벡터는 Gibson Assembly를 사용하여 구성되었다.

먼저, M. alcaliphilum 20Z, aroGfbr 및 trpEfbr를 각각 BamHI, EcoRI 및 SacI의 절단 부위에서 pET28로 번갈아 클로닝하여 pET-Trp 플라스미드를 생성하였다. 이어서 pET-Trp 플라스미드로부터 3개의 상기 유전자를 함유하는 선형 DNA를 pAWP89-Trp 플라스미드를 생성하는 Nguyen at al에서 기재된 방법을 이용하여 선형 pAWP89와 조립하였다.

실시예 3. M. alcaliphilum 20Z에서의 Electroporation기반 유전자 조작

M. alcaliphilum 20Z는 OD가 0.4 내지 0.6에 도달 할 때까지 1 % 메탄올이 보충된 50 ml의 NMS 배지에서 배양되었다. 세포를 10 분 동안 5,000x g 및 4 ℃에서 원심분리하여 수확하였다. 세포 펠렛을 50 ml 멸균 증류수로 2 회 세척한 후, 세척된 펠렛을 100 ㎕ 멸균 증류수에 재현탁한 다음 1000 ng DNA 플라스미드와 혼합하고 얼음 위에 보관 하였다. 혼합물을 ice-cold 큐벳 (Bio-rad)으로 옮기고 1.3 kV, 25 μF 및 200 Ω에서 Gene Pulser XcellTM 전기천공 시스템 (Bio-rad)에 의해 전기천공을 수행 하였다. 방전 펄스 후, 실온에서 1 ml의 NMS 배지를 세포에 즉시 첨가 한 후, 10 ml의 NMS 및 0.1 % 메탄올을 함유하는 180 ml serum bottles로 옮겼다. 그 후 세포를 30 ℃ 및 250 rpm의 배양기에서 밤새 배양하였다. 배양 후, 세포를 탄소원으로서 1 % 메탄올 및 50 ㎍/ml의 항생제 카나마이신이 보충된 NMS 배지에 spread 하여 본 발명의 플라스미드가 도입된 균주를 선발하였다.

실시예 4. 세포 내 대사 산물 추출

10 ml 배양 배지의 원심 분리 후 세포 펠렛을 수확 하였다. 1 ml의 물을 사용하여 세포 펠렛을 재현탁시켰다. 다음으로, 3 ml의 클로로포름을 세포 현탁액에 첨가 하였다. 이어서, 혼합물을 3 분 동안 볼텍싱 (vortexing)하여 세포를 파괴시켰다. 층 분리 후 상층 (수층)을 사용하여 세포 내 트립토판을 분석 하였다.

실시예 5. 분석방법

600 nm의 파장에서 Implen (독일) 나노 광도계를 이용하여 24 시간마다 광학 밀도를 기록하였다. 트립토판은 Nagaraja et al.에 기재된 방법에서 조금 수정된 분광 광도법을 사용하여 분석되었다. 300 ml의 p-페닐렌디아민 (p-phenylenediamine) 0.2 %를 유리 튜브에 충전한 후 600 ml의 황산 (sulfuric acid)용액 을 1:1로 첨가 하였다. 혼합물을 냉각시켜 온도를 약 0 내지 4 ℃로 유지하여 반응시켰다. 이어서, 200 ml의 아질산 나트륨 (sodium nitrite) 0.5 % 및 100 ml의 설팜산 (sulfamic acid) 3 %를 차례로 첨가 하였다. 반응물이 포함된 유리 튜브를 차가운 상태로 유지하고 때때로 5 분 동안 흔들었다. 그 후, 600 ml의 샘플이 첨가되었다. 마지막으로, 혼합물을 황산 (sulfuric acid) 1:1 용액으로 2.5 ml까지 채우고 완전히 혼합 하였다. 생성된 생성물을 520 nm에서 측정 하였다. 분석에 사용된 모든 화학물질은 미국 Sigma-Aldrich Chemical Co. 또는 Daejung Chemicals and Metals Co. (한국)에서 구입하였다.

실시예 6. 실험결과

6.1 M. alcaliphilum 20Z의 트립토판 과잉 생산을 위한 엔지니어링 전략

전술 한 바와 같이, 미생물은 방향족 아미노산을 합성하기위한 일반적인 shikimate 경로를 공유한다. 그러나, shikimate 경로의 조절 메커니즘은 몇몇 종, 특히 대장균 (E. coli)에서만 알려져있다. 대장균 기반의 피드백-억제 저항성 효소를 사용하면 많은 미생물에서 방향족 아미노산의 역가가 유의하게 향상된다는 것이 입증되었다. 본 출원인은 M. alcaliphilum 20Z에서 트립토판의 생산을 향상시키기 위해 3- 데옥시-D-아라비노-헵틸로소네이트-7-포스페이트 신타제 (3-deoxy-D-arabino-heptilosonate-7-phosphate synthase)에 대해 암호화된 aroGfbr (D146N) 및 대장균으로부터 안트라닐레이트 신타제 (anthranilate synthase)에 대해 암호화 된 trpEfbr (S40F)는 M. alcaliphilum 20Z에서 pTac 프로모터의 구동하에 발현되었다 (도 1 참조).

본 발명에 사용된 유전자 aroG (20Z), aroGfbr (D146N) 및 trpEfbr (S40F)의 유전자 서열은 하기 표 4에 나타내었다.

유전자	염기서열
서열번호 1 : aroG (20Z)	ATGTTAAGCAAATATAACACCGATGACTTAAGAATCAGTGAAACGAAAGAAGTCATCGCGCCTGTTGCAGTACACGAAGAACTGCCGATGAATGAACTCGCGGCGACTACGGTGCTGCAAACGCGCGCCGAAATTCATGACATATTAACCGGAGATGACGACCGCTTGTTAGTCGTGATCGGCCCGTGTTCGATTCATAATCCGGAAGCGGCGATCGAGTATGGAAAAAGACTCAAAACGATCAAAGACGAATTGAACAAAGATCTTCTGATCGTAATGCGGGTTTATTTCGAAAAGCCCAGAACGACGGTCGGCTGGAAAGGTCTGATCAACGATCCCGATCTGGATTCCAGCTTCGATATCAACAAAGGCCTGCGTATTGCCCGGCGCCTATTGCTGGATCTAAACACACTGGGCATGCCGGCCGCAACCGAATATCTCGATTTAATCACACCGCAGTATGTTTCCGACTTGATTTCGTGGGGGGCCATCGGCGCAAGAACTACCGAGAGTCAGGTGCATCGCGAATTGGCTTCCGGCCTATCCTGCGCGGTCGGTTTCAAAAACGCGACCGATGGCTCGATCAAAATCGCAATCGACGCAATCGGCGCGGCAATGAGCCCCCATCACTTCCTTTCGTTAACGAAGGAAGGCCGTTCAGCGATATTTTCGACGCGCGGCAATGAAGATGCTCACATTATTTTGCGCGGCGGCAACGGCCAGCCCAACTACGATGCAGTAAACGTTGAAAAAGTCGCGGAAGGGCTGGAAAATTCAGGGCTAAGACCGCGCATTATGATCGATTTCAGCCATGCGAACAGTTTGAAACAATATCAACGTCAGTTGATCGTCGGCGAGGATGTCGGCGGACAAATTGCCGGTGGCGACAAACGCATCATCGGCGTCATGATCGAAAGCCATTTAAAAGCCGGACGCCAGGACGTAATTCCCGGCAAACCATTGACTTTTGGACAAAGTATTACCGATGCCTGCCTGGGCTGGGAAGACTCGGCACAGTTGTTGAAAGATCTTGCCGCGGCAGTCGTTGCACGCAGAAAGACTGAAAATTGA
서열번호 2 :aroGfbr (D146N)	ATGAATTATCAGAACGACGATTTACGCATCAAAGAAATCAAAGAGTTACTTCCTCCTGTCGCATTGCTGGAAAAATTCCCCGCTACTGAAAATGCCGCGAATACGGTTGCCCATGCCCGAAAAGCGATCCATAAGATCCTGAAAGGTAATGATGATCGCCTGTTGGTTGTGATTGGCCCATGCTCAATTCATGATCCTGTCGCGGCAAAAGAGTATGCCACTCGCTTGCTGGCGCTGCGTGAAGAGCTGAAAGATGAGCTGGAAATCGTAATGCGCGTCTATTTTGAAAAGCCGCGTACCACGGTGGGCTGGAAAGGGCTGATTAACGATCCGCATATGGATAATAGCTTCCAGATCAACGACGGTCTGCGTATAGCCCGTAAATTGCTGCTTGATATTAACGACAGCGGTCTGCCAGCGGCAGGTGAGTTTCTCAATATGATCACCCCACAATATCTCGCTGACCTGATGAGCTGGGGCGCAATTGGCGCACGTACCACCGAATCGCAGGTGCACCGCGAACTGGCATCAGGGCTTTCTTGTCCGGTCGGCTTCAAAAATGGCACCGACGGTACGATTAAAGTGGCTATCGATGCCATTAATGCCGCCGGTGCGCCGCACTGCTTCCTGTCCGTAACGAAATGGGGGCATTCGGCGATTGTGAATACCAGCGGTAACGGCGATTGCCATATCATTCTGCGCGGCGGTAAAGAGCCTAACTACAGCGCGAAGCACGTTGCTGAAGTGAAAGAAGGGCTGAACAAAGCAGGCCTGCCAGCACAGGTGATGATCGATTTCAGCCATGCTAACTCGTCCAAACAATTCAAAAAGCAGATGGATGTTTGTGCTGACGTTTGCCAGCAGATTGCCGGTGGCGAAAAGGCCATTATTGGCGTGATGGTGGAAAGCCATCTGGTGGAAGGCAATCAGAGCCTCGAGAGCGGGGAGCCGCTGGCCTACGGTAAGAGCATCACCGATGCCTGCATCGGCTGGGAAGATACCGATGCTCTGTTACGTCAACTGGCGAATGCAGTAAAAGCGCGTCGCGGGTAA
서열번호 3 : trpEfbr (S40F)	ATGCAAACACAAAAACCGACTCTCGAACTGCTAACCTGCGAAGGCGCTTATCGCGACAATCCCACCGCGCTTTTTCACCAGTTGTGTGGGGATCGTCCGGCAACGCTGCTGCTGGAATTCGCAGATATCGACAGCAAAGATGATTTAAAAAGCCTGCTGCTGGTAGACAGTGCGCTGCGCATTACAGCTTTAGGTGACACTGTCACAATCCAGGCACTTTCCGGCAACGGCGAAGCCCTCCTGGCACTACTGGATAACGCCCTGCCTGCGGGTGTGGAAAGTGAACAATCACCAAACTGCCGTGTGCTGCGCTTCCCCCCTGTCAGTCCACTGCTGGATGAAGACGCCCGCTTATGCTCCCTTTCGGTTTTTGACGCTTTCCGTTTATTGCAGAATCTGTTGAATGTACCGAAGGAAGAACGAGAAGCCATGTTCTTCGGCGGCCTGTTCTCTTATGACCTTGTGGCGGGATTTGAAGATTTACCGCAACTGTCAGCGGAAAATAACTGCCCTGATTTCTGTTTTTATCTCGCTGAAACGCTGATGGTGATTGACCATCAGAAAAAAAGCACCCGTATTCAGGCCAGCCTGTTTGCTCCGAATGAAGAAGAAAAACAACGTCTCACTGCTCGCCTGAACGAACTACGTCAGCAACTGACCGAAGCCGCGCCGCCGCTGCCAGTGGTTTCCGTGCCGCATATGCGTTGTGAATGTAATCAGAGCGATGAAGAGTTCGGTGGCGTAGTGCGTTTGTTGCAAAAAGCGATTCGCGCTGGAGAAATTTTCCAGGTGGTGCCATCTCGCCGTTTCTCTCTGCCCTGCCCGTCACCGCTGGCGGCCTATTACGTGCTGAAAAAGAGTAATCCCAGCCCGTACATGTTTTTTATGCAGGATAATGATTTCACCCTATTTGGCGCGTCGCCGGAAAGCTCGCTCAAGTATGATGCCACCAGCCGCCAGATTGAGATCTACCCGATTGCCGGAACACGCCCACGCGGTCGTCGCGCCGATGGTTCACTGGACAGAGATCTCGACAGCCGTATTGAACTGGAAATGCGTACCGATCATAAAGAGCTGTCTGAACATCTGATGCTGGTTGATCTCGCCCGTAATGATCTGGCACGCATTTGCACCCCCGGCAGCCGCTACGTCGCCGATCTCACCAAAGTTGACCGTTATTCCTATGTGATGCACCTCGTCTCTCGCGTAGTCGGCGAACTGCGTCACGATCTTGACGCCCTGCACGCTTATCGCGCCTGTATGAATATGGGGACGTTAAGCGGTGCGCCGAAAGTACGCGCTATGCAGTTAATTGCCGAGGCGGAAGGTCGTCGCCGCGGCAGCTACGGCGGCGCGGTAGGTTATTTCACCGCGCATGGCGATCTCGACACCTGCATTGTGATCCGCTCGGCGCTGGTGGAAAACGGTATCGCCACCGTGCAAGCGGGTGCTGGTGTAGTCCTTGATTCTGTTCCGCAGTCGGAAGCCGACGAAACCCGTAACAAAGCCCGCGCTGTACTGCGCGCTATTGCCACCGCGCATCATGCACAGGAGACTTTCTGA

6.2 본 발명의 균주에서 트립토판 생성 향상 확인

성장을 지지하기 위해 텅스텐 (tungsten)이 보충된 NMS 배지에서 야생형 및 본 발명의 균주를 성장시키고 메탄을 공급 하였다. 본 발명의 균주의 경우, 본 발명자들은 메탄 또는 메탄 및 자일로스 (10 g/L) 탄소원의 상이한 조건에서 트립토판 생산을 확인하였다. 두 균주의 성장 프로파일 (도 2a)과 트립토판 생산 (도 2b)은 도 2에 나타내었다.

본 발명의 균주는 야생형과 유사한 성장 패턴을 수행하는 한편, 자일로스를 첨가하면 OD600가 10.2에 도달하여 메탄에서만 배양했을 경우보다 1.8 배 더 높아진다. 144 시간의 배양 후 모든 균주의 세포 추출물 및 배양 배지 둘 다에서 트립토판의 농도를 측정하였다. 모든 조건에서 20ZX 및 20ZX-Trp의 세포 추출물에서 트립토판의 생산량은 크게 다르지 않았다. 그러나 배양 배지에서는 트립토판이 현저하게 많이 생산된 것을 확인할 수 있었다 (도 2b). 본 발명의 균주에 의해 생성 된 총 트립토판은 39.6 mg/L에 도달하였으며, 이는 야생형보다 5.2 배 더 높은 수치이다. 또한, 10 g/L의 자일로스가 추가로 배지에 첨가될 때 트립토판의 농도는 자일로스를 첨가하지 않을 때 보다 1.6 배 높은 수치인, 63.3 mg/L로 증가함을 확인하였다.

이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시 예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허청구 범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.

<110> University-Industry Cooperation Group of Kyung Hee University <120> Production of tryptophan from methane by metabolic engineered methanotrophs <130> PN2005-206 <160> 3 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 1071 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> aroG (20Z) <400> 1 atgttaagca aatataacac cgatgactta agaatcagtg aaacgaaaga agtcatcgcg 60 cctgttgcag tacacgaaga actgccgatg aatgaactcg cggcgactac ggtgctgcaa 120 acgcgcgccg aaattcatga catattaacc ggagatgacg accgcttgtt agtcgtgatc 180 ggcccgtgtt cgattcataa tccggaagcg gcgatcgagt atggaaaaag actcaaaacg 240 atcaaagacg aattgaacaa agatcttctg atcgtaatgc gggtttattt cgaaaagccc 300 agaacgacgg tcggctggaa aggtctgatc aacgatcccg atctggattc cagcttcgat 360 atcaacaaag gcctgcgtat tgcccggcgc ctattgctgg atctaaacac actgggcatg 420 ccggccgcaa ccgaatatct cgatttaatc acaccgcagt atgtttccga cttgatttcg 480 tggggggcca tcggcgcaag aactaccgag agtcaggtgc atcgcgaatt ggcttccggc 540 ctatcctgcg cggtcggttt caaaaacgcg accgatggct cgatcaaaat cgcaatcgac 600 gcaatcggcg cggcaatgag cccccatcac ttcctttcgt taacgaagga aggccgttca 660 gcgatatttt cgacgcgcgg caatgaagat gctcacatta ttttgcgcgg cggcaacggc 720 cagcccaact acgatgcagt aaacgttgaa aaagtcgcgg aagggctgga aaattcaggg 780 ctaagaccgc gcattatgat cgatttcagc catgcgaaca gtttgaaaca atatcaacgt 840 cagttgatcg tcggcgagga tgtcggcgga caaattgccg gtggcgacaa acgcatcatc 900 ggcgtcatga tcgaaagcca tttaaaagcc ggacgccagg acgtaattcc cggcaaacca 960 ttgacttttg gacaaagtat taccgatgcc tgcctgggct gggaagactc ggcacagttg 1020 ttgaaagatc ttgccgcggc agtcgttgca cgcagaaaga ctgaaaattg a 1071 <210> 2 <211> 1053 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> aroGfbr (D146N) <400> 2 atgaattatc agaacgacga tttacgcatc aaagaaatca aagagttact tcctcctgtc 60 gcattgctgg aaaaattccc cgctactgaa aatgccgcga atacggttgc ccatgcccga 120 aaagcgatcc ataagatcct gaaaggtaat gatgatcgcc tgttggttgt gattggccca 180 tgctcaattc atgatcctgt cgcggcaaaa gagtatgcca ctcgcttgct ggcgctgcgt 240 gaagagctga aagatgagct ggaaatcgta atgcgcgtct attttgaaaa gccgcgtacc 300 acggtgggct ggaaagggct gattaacgat ccgcatatgg ataatagctt ccagatcaac 360 gacggtctgc gtatagcccg taaattgctg cttgatatta acgacagcgg tctgccagcg 420 gcaggtgagt ttctcaatat gatcacccca caatatctcg ctgacctgat gagctggggc 480 gcaattggcg cacgtaccac cgaatcgcag gtgcaccgcg aactggcatc agggctttct 540 tgtccggtcg gcttcaaaaa tggcaccgac ggtacgatta aagtggctat cgatgccatt 600 aatgccgccg gtgcgccgca ctgcttcctg tccgtaacga aatgggggca ttcggcgatt 660 gtgaatacca gcggtaacgg cgattgccat atcattctgc gcggcggtaa agagcctaac 720 tacagcgcga agcacgttgc tgaagtgaaa gaagggctga acaaagcagg cctgccagca 780 caggtgatga tcgatttcag ccatgctaac tcgtccaaac aattcaaaaa gcagatggat 840 gtttgtgctg acgtttgcca gcagattgcc ggtggcgaaa aggccattat tggcgtgatg 900 gtggaaagcc atctggtgga aggcaatcag agcctcgaga gcggggagcc gctggcctac 960 ggtaagagca tcaccgatgc ctgcatcggc tgggaagata ccgatgctct gttacgtcaa 1020 ctggcgaatg cagtaaaagc gcgtcgcggg taa 1053 <210> 3 <211> 1563 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> trpEfbr (S40F) <400> 3 atgcaaacac aaaaaccgac tctcgaactg ctaacctgcg aaggcgctta tcgcgacaat 60 cccaccgcgc tttttcacca gttgtgtggg gatcgtccgg caacgctgct gctggaattc 120 gcagatatcg acagcaaaga tgatttaaaa agcctgctgc tggtagacag tgcgctgcgc 180 attacagctt taggtgacac tgtcacaatc caggcacttt ccggcaacgg cgaagccctc 240 ctggcactac tggataacgc cctgcctgcg ggtgtggaaa gtgaacaatc accaaactgc 300 cgtgtgctgc gcttcccccc tgtcagtcca ctgctggatg aagacgcccg cttatgctcc 360 ctttcggttt ttgacgcttt ccgtttattg cagaatctgt tgaatgtacc gaaggaagaa 420 cgagaagcca tgttcttcgg cggcctgttc tcttatgacc ttgtggcggg atttgaagat 480 ttaccgcaac tgtcagcgga aaataactgc cctgatttct gtttttatct cgctgaaacg 540 ctgatggtga ttgaccatca gaaaaaaagc acccgtattc aggccagcct gtttgctccg 600 aatgaagaag aaaaacaacg tctcactgct cgcctgaacg aactacgtca gcaactgacc 660 gaagccgcgc cgccgctgcc agtggtttcc gtgccgcata tgcgttgtga atgtaatcag 720 agcgatgaag agttcggtgg cgtagtgcgt ttgttgcaaa aagcgattcg cgctggagaa 780 attttccagg tggtgccatc tcgccgtttc tctctgccct gcccgtcacc gctggcggcc 840 tattacgtgc tgaaaaagag taatcccagc ccgtacatgt tttttatgca ggataatgat 900 ttcaccctat ttggcgcgtc gccggaaagc tcgctcaagt atgatgccac cagccgccag 960 attgagatct acccgattgc cggaacacgc ccacgcggtc gtcgcgccga tggttcactg 1020 gacagagatc tcgacagccg tattgaactg gaaatgcgta ccgatcataa agagctgtct 1080 gaacatctga tgctggttga tctcgcccgt aatgatctgg cacgcatttg cacccccggc 1140 agccgctacg tcgccgatct caccaaagtt gaccgttatt cctatgtgat gcacctcgtc 1200 tctcgcgtag tcggcgaact gcgtcacgat cttgacgccc tgcacgctta tcgcgcctgt 1260 atgaatatgg ggacgttaag cggtgcgccg aaagtacgcg ctatgcagtt aattgccgag 1320 gcggaaggtc gtcgccgcgg cagctacggc ggcgcggtag gttatttcac cgcgcatggc 1380 gatctcgaca cctgcattgt gatccgctcg gcgctggtgg aaaacggtat cgccaccgtg 1440 caagcgggtg ctggtgtagt ccttgattct gttccgcagt cggaagccga cgaaacccgt 1500 aacaaagccc gcgctgtact gcgcgctatt gccaccgcgc atcatgcaca ggagactttc 1560 tga 1563

Claims (9)

1. aroG 유전자, aroG^fbr 유전자 및 trpE^fbr 유전자를 포함하는 트립토판 생산용 재조합 벡터가 도입된 트립토판 생산용 메탄자화균에서,
   상기 aroG 유전자는 서열번호 1의 염기서열로 표시되는 것을 특징으로 하고,
   상기 메탄자화균은 메탄 및 자일로스를 탄소원으로 사용하는 것을 특징으로 하는, 트립토판 생산용 메탄자화균.
   
2. 제 1항에 있어서,
   상기 aroG^fbr 유전자는 서열번호 2의 염기서열로 표시된 것을 특징으로 하는, 트립토판 생산용 메탄자화균.
   
3. 제 1항에 있어서,
   상기 trpE^fbr 유전자는 서열번호 3의 염기서열로 표시된 것을 특징으로 하는, 트립토판 생산용 메탄자화균.
   
4. 제 1항에 있어서,
   상기 재조합 벡터는 aroG 유전자, aroG^fbr 유전자 및 trpE^fbr 유전자가 차례로 도입된 것을 특징으로 하는, 트립토판 생산용 메탄자화균.
   
5. 삭제
6. 제 1항에 있어서,
   상기 메탄자화균은 메틸로모나스 속 (Methylomonas), 메틸로박터 속 (Methylobacter), 메틸로코커스 속 (Methylococcus), 메틸로스페라 속 (Methylosphaera), 메틸로칼덤 속 (Methylocaldum), 메틸로글로버스 속 (Methyloglobus), 메틸로사르시나 속 (Methylosarcina), 메틸로프로펀더스 속 (Methyloprofundus), 메틸로썰머스 속 (Methylothermus), 메틸로할로비우스 속 (Methylohalobius), 메틸로게아 속 (Methylogaea), 메틸로마리넘 속 (Methylomarinum), 메틸로벌럼 속 (Methylovulum), 메틸로마리노범 속 (Methylomarinovum), 메틸로러브럼 속 (Methylorubrum), 메틸로파라코커스 속 (Methyloparacoccus), 메틸로시스티스 속 (Methylocystis), 메틸로셀라 속 (Methylocella), 메틸로캡사 속 (Methylocapsa), 메틸로퍼룰라 속 (Methylofurula), 메틸아시디필럼 속 (Methylacidiphilum), 메틸아시디마이크로븀 속 (Methylacidimicrobium), 메틸로마이크로븀 (Methylomicrobium) 속 또는 메틸로시 너스 속 (Methylosinus) 균주인, 트립토판 생산용 메탄자화균.
   
7. 제 1항의 트립토판 생산용 메탄자화균을 배양하는 단계를 포함하는, 트립토판 생성방법.
   
8. 제 7항에 있어서,
   상기 방법은 배양시 탄소원으로 메탄 및 자일로스를 첨가하여 배양하는 것을 특징으로 하는, 트립토판 생성방법.
   
   
9. 삭제

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