KR102305034B1 - Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same - Google Patents

Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same Download PDF

Info

Publication number
KR102305034B1
KR102305034B1 KR1020190164070A KR20190164070A KR102305034B1 KR 102305034 B1 KR102305034 B1 KR 102305034B1 KR 1020190164070 A KR1020190164070 A KR 1020190164070A KR 20190164070 A KR20190164070 A KR 20190164070A KR 102305034 B1 KR102305034 B1 KR 102305034B1
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
thickness
back fat
woori
base
seq
Prior art date
Application number
KR1020190164070A
Other languages
Korean (ko)
Other versions
KR20210073339A (en
Inventor
김영신
홍준기
조규호
조은석
문홍길
정학재
사수진
백선영
정현정
김영화
김두완
김조은
민예진
김용곤
안홍원
이상운
엄주철
박치영
이형준
김학수
안홍순
Original Assignee
대한민국
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 대한민국 filed Critical 대한민국
Priority to KR1020190164070A priority Critical patent/KR102305034B1/en
Publication of KR20210073339A publication Critical patent/KR20210073339A/en
Application granted granted Critical
Publication of KR102305034B1 publication Critical patent/KR102305034B1/en

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/124—Animal traits, i.e. production traits, including athletic performance or the like
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Abstract

본 발명은 서열번호 1 내지 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드 또는 그에 상보적인 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에 관한 것이다.The present invention relates to a SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs comprising any one of the polynucleotides represented by SEQ ID NOs: 1 to 18 or polynucleotides complementary thereto.

Description

우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 및 이를 이용한 등 지방 두께 식별 방법{SNP MAKERS OF IDENTIFICATION OF DORSAL FAT THICKNESS IN WOORI BLACK PORCINE AND METHOD FOR IDENTIFYING DORSAL FAT THICKNESS USING THE SAME}SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Korean pigs and the method of identifying the thickness of the back using the same

본 발명은 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 및 이를 이용한 등 지방 두께 식별 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Korean heuk pigs and a method for identifying the thickness of the back fat using the same.

최근에는 돼지육의 품질을 제고하기 위하여, 돼지를 일정한 규격에서 사육하고 과학적으로 관리하고, 이로부터 얻어진 돼지육을 브랜드화하고 있으며, 이미 다양한 브랜드의 돼지육이 상업적으로 판매되고 있다. 이렇게, 브랜드화된 돼지와 브랜드화되지 않은 돼지육을 구별하는 것은 전문가의 수준에서도 매우 어려운 일이기 때문에, 정품 브랜드의 돼지육을 판단하는 객관적인 기준을 마련하려는 연구가 활발히 진행되고 있다.Recently, in order to improve the quality of pig meat, pigs are raised and scientifically managed under a certain standard, and the pork meat obtained therefrom is branded, and various brands of pork are already commercially sold. In this way, since it is very difficult even for an expert to distinguish branded and unbranded pork, research to establish an objective standard for judging genuine branded pork is being actively conducted.

이러한 연구의 일환으로서, 돼지육의 유전자를 분석하여 정품 브랜드의 돼지육을 판단하는 방법이 개발되었는데, 이처럼 유전자를 분석하는 방법은 PCR 기술을 이용하는 RAPD(random amplified polymorphic DNA), SSCP(single strand conformation polymorphisms) 기법 등의 다양한 DNA 분석기법을 이용한 연구가 활발히 이루어지고 있다.As part of this research, a method for judging genuine brand pork by analyzing the gene of pig meat was developed. As such, the method of analyzing the gene is RAPD (random amplified polymorphic DNA) using PCR technology, single strand conformation (SSCP) Research using various DNA analysis techniques such as polymorphisms) is being actively conducted.

그러나, 여전히 돼지의 등 지방 두께를 정확하게 판단하기 위한 방법에 대하여는 개발되지 않고 있다.However, a method for accurately determining the back fat thickness of pigs has not yet been developed.

이러한 배경하에서, 본 발명자는 돼지의 등 지방 두께에 관여하는 유전자에 포함된 SNP를 판별하여, 돼지육의 품질을 판단할 수 있음을 확인하고 본 발명을 완성하였다.Under this background, the present inventors confirmed that the quality of pig meat can be determined by determining the SNP contained in the gene involved in the thickness of the back fat of pigs, and completed the present invention.

본 발명은 얇은 등 지방 두께를 가진 우리흑돈 품종을 높은 정확도로 식별할 수 있는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 및 이를 이용한 등 지방 두께 식별 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.An object of the present invention is to provide a SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig, which can identify the breed of Woori heuk pig having a thin back fat with high accuracy, and a method for identifying the thickness of the back fat using the same.

또한, 본 발명은 우리흑돈의 식별 및 분류를 통해 얇은 등 지방 두께를 가지는 우리흑돈끼리 교배시켜 품종을 개량함으로써, 우수한 돼지육의 품질을 고정시킬 수 있는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 및 이를 이용한 등 지방 두께 식별 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.In addition, the present invention provides a SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig that can fix the quality of excellent pork meat by breeding them with a thin back fat thickness through the identification and classification of the heuk pig and improving the breed. An object of the present invention is to provide a method for identifying the thickness of the back using the same.

나아가, 상기와 같이 우리흑돈의 등 지방 두께의 개량을 가속화함에 따라, 우리흑돈 계조조성 선발 및 보급농가 자체 번식에 활용함으로써, 브랜드 차별성을 향상시키는 것을 목적으로 한다.Furthermore, as described above, as the improvement of the thickness of the back fat of Korean pigs is accelerated, the purpose of this is to improve the brand differentiation by selecting the gray scale of Korean pigs and using them for self-reproduction by supplying farms.

본 발명은 상기한 목적을 달성하기 위한 것으로, 서열번호 1 내지 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드 또는 그에 상보적인 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커이다.
서열번호 1 내지 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드는: 서열번호 1로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 2로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 3으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 4로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 5로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 6으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 7로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 8로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 9로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 10으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 11로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 12로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 13로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 14로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 15로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 16로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 17로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 서열번호 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드이다.The present invention is to achieve the above object, and is a SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk porcine comprising any one of the polynucleotides represented by SEQ ID NOs: 1 to 18 or polynucleotides complementary thereto.
The polynucleotides represented by SEQ ID NOs: 1 to 18 are: polynucleotides represented by SEQ ID NO: 1 comprising 10 to 100 consecutive nucleic acids comprising a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G nucleotides; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 2; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 3; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 4; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 5; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 6; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 7; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 8; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 9; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 10; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 11; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 12; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 13; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 14; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 15; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 16; a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 17; It is a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 18.

또한, 본 발명의 다른 실시형태는 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 조성물이다.In addition, another embodiment of the present invention is a composition for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig, comprising an agent capable of detecting or amplifying the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the guinea pig.

삭제delete

또한, 본 발명의 또 다른 실시형태는 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 조성물을 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 키트이다.In addition, another embodiment of the present invention is a kit for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pork comprising the composition for identifying the thickness of the back fat of the Woori heuk pig.

본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 DNA 칩 키트이다.In another embodiment of the present invention, the kit is an RT-PCR kit or a DNA chip kit.

또한, 본 발명의 또 다른 실시형태는 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 마이크로어레이이다.In addition, another embodiment of the present invention is a microarray for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig including the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the said pig.

나아가, 본 발명의 또 다른 실시형태는, 우리흑돈으로부터 시료를 추출하는 시료 추출 단계; 시료의 DNA로부터 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭시키는 다형성 증폭 단계; 및 증폭된 다형성 부위의 염기를 결정하는 염기 결정 단계를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법이다.Furthermore, another embodiment of the present invention, a sample extraction step of extracting a sample from our heukdon; a polymorphism amplification step of amplifying the polymorphic site of the SNP marker from the DNA of the sample; And it is a method for identifying the thickness of the back fat of our heuk pig, comprising a base determination step of determining the base of the amplified polymorphic site.

또한, 본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 상기 다형성 부위는 상기 우리흑돈의 14번 염색체에 존재한다.Further, in another embodiment of the present invention, the polymorphic site is present on chromosome 14 of the black pig.

본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 염기 결정 단계는, 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서 다형성 부위의 염기의 대립유전자를 식별하는 단계이다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 1로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 2로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 3으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 4로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 5로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 C/C인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 6으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 7로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 8로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 9로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 C/C인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 10으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 11로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 12로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 13으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 14로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 15로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 16으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 C/C인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 17로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.
본 발명의 또 다른 실시형태에 있어서, 서열번호 18로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별한다.In another embodiment of the present invention, the step of determining the base is a step of identifying the allele of the base of the polymorphic site in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the guinea pig.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 1, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 2, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 3, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 4, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is C/C in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 5, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 6, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st nucleotide, which is a polymorphic site, is A/A in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 7, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 8, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is C/C in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 9, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 10, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 11, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 12, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 13, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 14, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 15, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is C/C in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 16, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st nucleotide, which is a polymorphic site, is A/A in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 17, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.
In another embodiment of the present invention, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 18, the heukdon is thin, etc. identified as having a fat thickness.

기타 실시예들의 구체적인 사항들은 상세한 설명 및 도면에 포함되어 있다.The details of other embodiments are included in the detailed description and drawings.

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

본 발명의 일 실시예에 따른 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 및 이를 이용한 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법을 활용하면, 얇은 등 지방 두께를 가진 우리흑돈 품종을 높은 정확도로 식별할 수 있는 효과가 있다.By utilizing the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig according to an embodiment of the present invention and the method of identifying the thickness of the back fat of Woori heukd using the same, it is possible to identify the breed of Woori heuk pig with a thin back fat with high accuracy. It works.

또한, 우리흑돈의 식별 및 분류를 통해 얇은 등 지방 두께를 가지는 우리흑돈끼리 교배시켜 품종을 개량함으로써, 우수한 돼지육의 품질을 고정시킬 수 있는 효과가 있다.In addition, there is an effect of fixing the quality of excellent pork meat by breeding Korean black pigs with thin back fat through identification and classification to improve the breed.

나아가, 상기와 같이 우리흑돈의 등 지방 두께의 개량을 가속화함에 따라, 우리흑돈 계조조성 선발 및 보급농가 자체 번식에 활용함으로써, 브랜드 차별성을 향상시킬 수 있는 효과가 있다.Furthermore, as described above, as the improvement of the thickness of the back fat of Korean pigs is accelerated, it is possible to improve the brand differentiation by selecting the gray scale of Korean heuk pigs and utilizing them for self-reproduction by supplying farms.

도 1은 본 발명의 일 실시예에 있어서, SNP 윈도우별 유전분산 비율을 나타낸 그래프이다.1 is a graph showing a dielectric dispersion ratio for each SNP window according to an embodiment of the present invention.

본 발명은 다양한 변환을 가할 수 있고 여러 가지 실시 예를 가질 수 있는 바, 특정 실시 예들을 도면에 예시하고 상세한 설명에서 상세하게 설명하고자 한다. 그러나, 이는 본 발명을 특정한 실시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니며, 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변환, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다.Since the present invention can apply various transformations and can have various embodiments, specific embodiments are illustrated in the drawings and described in detail in the detailed description. However, this is not intended to limit the present invention to specific embodiments, and it should be understood to include all modifications, equivalents and substitutes included in the spirit and scope of the present invention.

본 발명의 이점 및 특징, 그리고 그것들을 달성하는 방법은 첨부되는 도면과 함께 상세하게 후술되어 있는 실시예들을 참조하면 명확해질 것이다. 그러나, 본 발명은 이하에서 개시되는 실시예들에 한정되는 것이 아니라 서로 다른 다양한 형태로 구현될 것이며, 단지 본 실시예들은 본 발명의 개시가 완전하도록 하며, 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 발명의 범주를 완전하게 알려주기 위해 제공되는 것이며, 본 발명은 청구항의 범주에 의해 정의될 뿐이다.Advantages and features of the present invention and methods of achieving them will become apparent with reference to the embodiments described below in detail in conjunction with the accompanying drawings. However, the present invention is not limited to the embodiments disclosed below, but will be implemented in various different forms, and only these embodiments allow the disclosure of the present invention to be complete, and common knowledge in the art to which the present invention pertains It is provided to fully inform those who have the scope of the invention, and the present invention is only defined by the scope of the claims.

본 출원에서 사용한 용어는 단지 특정한 실시예를 설명하기 위해 사용된 것으로, 본 발명을 한정하려는 의도가 아니다. 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 뜻하지 않는 한, 복수의 표현을 포함한다. 본 출원에서, "포함하다" 또는 "가지다" 등의 용어는 명세서상에 기재된 특징, 숫자, 단계, 동작, 구성요소, 부품 또는 이들을 조합한 것이 존재함을 지정하려는 것이지, 하나 또는 그 이상의 다른 특징들이나 숫자, 단계, 동작, 구성요소, 부품 또는 이들을 조합한 것들의 존재 또는 부가 가능성을 미리 배제하지 않는 것으로 이해되어야 한다.The terms used in the present application are only used to describe specific embodiments, and are not intended to limit the present invention. The singular expression includes the plural expression unless the context clearly dictates otherwise. In the present application, terms such as “comprise” or “have” are intended to designate that a feature, number, step, operation, component, part, or combination thereof described in the specification exists, but one or more other features It should be understood that this does not preclude the existence or addition of numbers, steps, operations, components, parts, or combinations thereof.

본 발명의 일 구현예에 따른 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커는 돼지의 등 지방 두께의 형질 특성을 식별하고자 하는 발명으로, 특히 우리흑돈을 대상으로 한다. The SNP marker for identifying the thickness of the back fat of a pig according to an embodiment of the present invention is an invention for identifying the characteristics of the thickness of the back fat of a pig, particularly, it is targeted to a Woori heuk pig.

본 명세서에서, “우리흑돈”이라 함은 두록(Duroc)과 한국재래돼지(Korean native pig)의 교배에 의하여 생산된 합성돈이다. 구체적으로는, 두록 암컷과 한국재래돼지 수컷을 교배시켜서 얻은 잡종1세대 암컷과, 두록 수컷을 퇴교배하여 잡종2세대 암컷을 얻고, 상기 얻은 잡종2세대 암컷과 상기 잡종1세대 수컷을 퇴교배하여 얻은 합성돈이다. 우리흑돈은 두록의 장점(성장형질이 우수)과 한국재래돼지의 장점(육질형질이 우수)만을 가지는 합성돈이다. 우리흑돈은 MC4R 유전자 내의 Asp298Asn 단일염기변이로서 A(Asn) 대립유전자를 가질 수 있고, PRKAG3 유전자에서 ATG 시작코돈을 기준으로 1846번째 염기로서 G를 가지고 있는 것일 수 있으며, KIT 유전자에서 586번째 염기로서 T를 가지고 있는 것이 가능하다. 우리흑돈의 더욱 상세한 정의 및 생산방법은 대한민국 특허출원 10-2015-0058980에 기재된 바와 같다. 우리흑돈은 두록의 우수한 성장형질과 한국재래돼지의 우수한 육질형질을 모두 보유하는 합성돈으로, FAO에서 운영하는 가축 다양성 정보시스템(http://dad.fao.org)에서 국제적으로 하나의 품종으로 인정받은바 있다.As used herein, the term “Korean heukdon” refers to synthetic pigs produced by crossing Duroc and Korean native pigs. Specifically, a hybrid first-generation female obtained by crossing a Duroc female with a male native pig, and a second-generation hybrid female obtained by outcrossing a Duroc male, and the obtained second-generation female and the first hybrid male are outcrossed. Synthetic money obtained Woori Heuk Pork is a synthetic pig that has only the advantages of Duroc (excellent growth characteristics) and the advantages of traditional Korean pigs (excellent meat quality). Our heukdon may have the A (Asn) allele as the Asp298Asn single nucleotide mutation in the MC4R gene, and may have G as the 1846th base based on the ATG start codon in the PRKAG3 gene, and as the 586th nucleotide in the KIT gene. It is possible to have T. A more detailed definition and production method of Korean black pig is as described in Korean Patent Application No. 10-2015-0058980. Woori Heuk Pork is a synthetic pig that possesses both the excellent growth characteristics of Duroc and the excellent meat quality of Korean native pigs. has been acknowledged

본 명세서에서 "두록"이라 함은 돼지의 두록(Duroc) 또는 두록 종을 의미하는 것으로, 두록저어지(Durocjersey) 종 또는 한국의 축진듀록을 포함하는 개념이다. 상기 두록저어지는 원산지가 미국이고 모색이 담홍색에서 농적색에 이르기까지 다양하며 대형종에 속하는 돼지의 한 종이다. 머리는 비교적 작고 안면이 약간 오목하나 직선에 가까우며, 귀는 앞쪽으로 직립되어 있지만 그 끝이 아래로 처져 있는 것이 특징이다. 상기 축진듀록은 국립축산과학원이 자체 개발한 두록 품목의 상표명으로서 축산업을 진흥시킨다는 의미를 갖고 있다. 상기 축진듀록은 소비자의 수요 및 수입 돈육과의 차별화를 위한 씨돼지 개발 요구에 따라 개발되었다. 상기 축진듀록은 1997년 완성되었으며 1998년부터 계통 조성을 시작해 2008년 특허청 상표 등록을 마쳤고, 이후 전국 우수돼지인공수정센터에 보급돼 돼지고기를 생산하는 데 주로 활용되고 있다. 일반 두록종은 다른 종과 비교하여 성장률, 성장속도 등이 우수하고, 축진듀록은 일반 두록종과 비교했을 때 육질이 더욱 우수한 특징을 가지고 있다.As used herein, the term "Durok" means Duroc or Duroc species of pigs, and is a concept including Durocjersey species or Korean Chukjin Duroc species. The durok jersey is a species of pig belonging to a large species, having a country of origin in the United States and a color ranging from pink to dark red. The head is relatively small and the face is slightly concave but close to a straight line. The above-mentioned Chukjin Duroc is a brand name of the Duroc item developed by the National Institute of Livestock Science and has the meaning of promoting the livestock industry. The Chukjin Duroc was developed in response to consumer demand and the demand for development of seed pork for differentiation from imported pork. The above-mentioned Chukjin Duroc was completed in 1997, and the system was established in 1998 and trademark registration was completed in 2008. Compared to other species, general Duroc species have superior growth rate and growth rate, and Chukjin Duroc species have superior meat quality compared to general Duroc species.

또한, 본 명세서에서 "한국재래돼지"라 함은 한반도에서 서식하는 돼지의 한 품종으로서, 소목 멧돼짓과의 포유류이다. 일반적으로 모색은 흑모, 지체가 흑색이고, 머리는 길고 뾰족하며, 이마에 산 모양의 주름이 있고, 코는 길고 곧으며 세로 줄음이 있고, 턱은 곧으며, 귀는 직립전향인 개체로 정의되고 있다. 상기 한국재래돼지는 일반적인 재래돼지, 흑돼지, 제주재래흑돼지 등을 포함할 수 있다.In addition, as used herein, the term "Korean native pig" is a breed of pigs inhabiting the Korean Peninsula, and is a mammal of the Somok family. Generally, it is defined as an individual with black hair, black body parts, long and sharp head, with mountain-shaped wrinkles on the forehead, long and straight nose, straight chin, and upright ears. have. The Korean traditional pig may include general conventional pigs, black pigs, Jeju native black pigs, and the like.

상기 우리흑돈으로부터 얻어진 검체를 이용하여, 상기 SNP 마커의 유전자형을 분석함으로써 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 특성을 식별할 수 있다. 상기 검체로는 털, 뇨, 혈액, 각종 체액, 분리된 조직, 분리된 세포 또는 타액과 같은 시료 등이 될 수 있으나, 이에 특별히 제한되지는 않는다.By analyzing the genotype of the SNP marker using the sample obtained from the guinea pig, the back fat thickness characteristics of the guinea pig can be identified. The sample may be a sample such as hair, urine, blood, various body fluids, isolated tissue, isolated cells, or saliva, but is not particularly limited thereto.

본 발명의 일 구현 예에 따르면, 서열번호 1 내지 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드 또는 그에 상보적인 폴리뉴클레오티드 중 어느 하나를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커가 제공된다.
서열번호 1 내지 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드는: 서열번호 1로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 2로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 3으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 4로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
55서열번호 5로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 6으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
57서열번호 7로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 8로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 9로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 10으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
61서열번호 11로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 12로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 13로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 14로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 15로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 16로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 17로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 및
서열번호 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드이다.According to one embodiment of the present invention, there is provided a SNP marker for identifying the thickness of the back fat of a guinea pig comprising any one of the polynucleotides represented by SEQ ID NOs: 1 to 18 or polynucleotides complementary thereto.
The polynucleotides represented by SEQ ID NOs: 1 to 18 are: polynucleotides represented by SEQ ID NO: 1 comprising 10 to 100 consecutive nucleic acids comprising a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G nucleotides;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 2;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 3;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 4;
55 A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 5;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 6;
57 A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 7;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 8;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 9;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 10;
61 A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 11;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 12;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 13;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 14;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 15;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 16;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 17; and
It is a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 18.

본 발명의 용어 "다형성(polymorphism)"이란, 하나의 유전자 좌위(locus)에 두 가지 이상의 대립유전자(allele)가 존재하는 경우를 의미하며 다형성 부위 중에서, 사람에 따라 단일 염기만이 다른 것을 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism, SNP)이라 한다. 바람직한 다형성 마커는 선택된 집단에서 1% 이상, 더욱 바람직하게는 5% 또는 10% 이상의 발생빈도를 나타내는 두 가지 이상의 대립유전자를 가진다.As used herein, the term "polymorphism" refers to a case in which two or more alleles exist at one locus, and among polymorphic sites, only a single base differs from one person to another. It is called a single nucleotide polymorphism (SNP). Preferred polymorphic markers have two or more alleles that exhibit an incidence of at least 1%, more preferably at least 5% or 10% in a selected population.

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

삭제delete

본 발명의 용어 "대립유전자(allele)"란, 상동염색체의 동일한 유전자좌위에 존재하는 한 유전자의 여러 타입을 의미한다. 대립유전자는 다형성을 나타내는데 사용되기도 하며, 예컨대, SNP는 두 종류의 대립인자(biallele)를 갖는다.As used herein, the term “allele” refers to several types of one gene present at the same locus on homologous chromosomes. Alleles are also used to indicate polymorphisms, for example, SNPs have two types of alleles.

상기 "서열번호 1 내지 18"은 다형성 부위를 포함하는 다형성 서열(polymorphic sequence)이며, 다형성 서열은 서열번호 1 내지 18에서 y로 나타내었다. 다형성 서열이란 폴리뉴클레오티드 서열 중에 SNP를 포함하는 다형성 부위(polymorphic site)를 포함하는 서열을 의미한다. 상기 폴리뉴클레오티드 서열은 DNA 또는 RNA가 될 수 있다.The "SEQ ID NOs: 1 to 18" is a polymorphic sequence including a polymorphic site, and the polymorphic sequence is represented by y in SEQ ID NOs: 1 to 18. The polymorphic sequence refers to a sequence including a polymorphic site including a SNP in a polynucleotide sequence. The polynucleotide sequence may be DNA or RNA.

또한, 본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 조성물이 제공된다.In addition, in another embodiment of the present invention, there is provided a composition for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig, comprising an agent capable of detecting or amplifying the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the pig.

본 발명의 용어 "SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제"란, 상기와 같은 유전자의 다형성 부위를 증폭을 통해 확인하여 우리흑돈의 등 지방 두께 특성을 판단할 수 있는 조성물을 의미하며, 바람직하게는 상기 SNP 마커의 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머를 의미한다.As used herein, the term "agent capable of detecting or amplifying a SNP marker" refers to a composition capable of determining the fat thickness characteristics of the back fat of Korean pigs by confirming the polymorphic region of the gene as described above through amplification, preferably means a primer capable of specifically amplifying the polynucleotide of the SNP marker.

본 발명의 용어 "프라이머"란, 짧은 자유 3' 말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 염기 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 서열을 의미한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 폴리머레이즈 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. 이때, PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 것을 기초로 변형할 수 있다.As used herein, the term "primer" refers to a base sequence having a short free 3' hydroxyl group, which can form a base pair with a complementary template and is a start for template strand copying. A short sequence that functions as a branch. Primers are capable of initiating DNA synthesis in the presence of reagents for polymerization (ie, DNA polymerase or reverse transcriptase) and four different nucleoside triphosphates in appropriate buffers and temperatures. In this case, PCR conditions, the length of the sense and antisense primers can be modified based on those known in the art.

또한, 본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 조성물을 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 키트가 제공된다. 상기 키트는 RT-PCR(Rotational Polymerase Chain Reaction) 키트 또는 DNA 칩 키트로 제공될 수 있다.Further, in another embodiment of the present invention, there is provided a kit for identifying the thickness of the back fat of woori heukdon comprising the composition for identifying the thickness of the back fat of the woori heukdon. The kit may be provided as a rotational polymerase chain reaction (RT-PCR) kit or a DNA chip kit.

본 발명의 키트는 우리흑돈의 등 지방 두께 특성 판단용 마커인 SNP 마커를 증폭을 통해 확인하거나, SNP 마커의 발현 수준을 mRNA의 발현 수준을 확인함으로써 우리흑돈의 등 지방 두께 특성을 판단할 수 있다.The kit of the present invention can determine the thickness characteristics of the back fat of Woori heuk pig by amplifying the SNP marker, which is a marker for determining the back fat thickness characteristics, or by checking the mRNA expression level by checking the expression level of the SNP marker. .

구체적인 일례로서, 본 발명에서 우리흑돈의 등 지방 두께 특성 판단용 SNP 마커의 mRNA 발현 수준을 측정하기 위한 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는, 상기 SNP 마커의 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 RT-PCR 키트는 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.As a specific example, in the present invention, the kit for measuring the mRNA expression level of the SNP marker for judging the back fat thickness characteristics of guinea pigs may be a kit including essential elements necessary for performing RT-PCR. The RT-PCR kit contains, in addition to each primer pair specific for the gene of the SNP marker, a test tube or other suitable container, reaction buffer (pH and magnesium concentration vary), deoxynucleotides (dNTPs), enzymes such as Taq-polymerase and reverse transcriptase, DNase, RNAse inhibitors, DEPC-water, sterile water, and the like. It may also include a pair of primers specific for a gene used as a quantitative control.

또한 바람직하게는, 본 발명의 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 우리흑돈 등 지방 두께 특성 판단용 키트일 수 있다. 본 발명의 용어 "DNA 칩"이란, 수십만 개의 DNA의 각 염기를 한번에 확인할 수 있는 DNA 마이크로어레이의 하나를 의미한다. DNA 칩 키트는, 일반적으로 편평한 고체 지지판, 전형적으로는 현미경용 슬라이드보다 크지 않은 유리 표면에 핵산 종을 격자형 배열(gridded array)로 부착한 것으로, 칩 표면에 핵산이 일정하게 배열되어, DNA 칩 상의 핵산과 칩 표면에 처리된 용액 내에 포함된 상보적인 핵산 간에 다중 혼성화(hybridization) 반응이 일어나 대량 병렬 분석이 가능하도록 하는 도구이다.Also preferably, the kit of the present invention may be a kit for determining the characteristics of fat thickness, such as guinea pig including essential elements necessary for performing a DNA chip. As used herein, the term "DNA chip" refers to one of the DNA microarrays capable of confirming each base of hundreds of thousands of DNA at once. A DNA chip kit is a method in which nucleic acid species are attached in a gridd array to a generally flat solid support plate, typically a glass surface no larger than a microscope slide, and the nucleic acids are uniformly arranged on the chip surface, so that the DNA chip It is a tool that allows multiple hybridization reactions between the nucleic acids on the chip surface and the complementary nucleic acids contained in the solution treated on the chip surface to enable massively parallel analysis.

또한, 본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 마이크로어레이가 제공될 수 있다.In addition, in another embodiment of the present invention, a microarray for identifying the thickness of the back fat of woori heuk pig including the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the guinea pig may be provided.

상기 마이크로어레이는 DNA 또는 RNA 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것일 수 있으며, 통상적인 마이크로어레이로 이루어질 수 있다. 프로브 폴리뉴클레오티드를 기판상에 고정화하여 마이크로어레이를 제조하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다. 상기 프로브 폴리뉴클레오티드는 혼성화할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 의미하는 것으로, 핵산의 상보성 가닥에 서열 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오티드를 의미한다.The microarray may include a DNA or RNA polynucleotide, and may consist of a conventional microarray. Methods for preparing microarrays by immobilizing probe polynucleotides on a substrate are well known in the art. The probe polynucleotide refers to a hybridizable polynucleotide, and refers to an oligonucleotide capable of sequence-specific binding to a complementary strand of a nucleic acid.

나아가, 본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 우리흑돈으로부터 시료를 추출하는 시료 추출 단계; 시료의 DNA로부터 제2 항의 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭시키는 다형성 증폭 단계; 및 증폭된 다형성 부위의 염기를 결정하는 염기 결정 단계를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법이 제공된다.Furthermore, in another embodiment of the present invention, a sample extraction step of extracting a sample from our heukdon; a polymorphic amplification step of amplifying the polymorphic site of the SNP marker of claim 2 from the DNA of the sample; And there is provided a method for identifying the thickness of the back fat of our heuk pig, comprising a base determination step of determining the base of the amplified polymorphic site.

상기 다형성 부위는 상기 우리흑돈의 14번 염색체에 존재한다.The polymorphic site is present on chromosome 14 of the guinea pig.

상기 염기 결정 단계는, 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서 다형성 부위의 염기의 대립유전자를 식별하는 단계이다.
상기 염기 결정 단계에서는, 서열번호 1로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,623,011번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별할 수 있다.
이외에도, 서열번호 2로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,672,980번째 염기)의 대립유전자가 A/A인 경우, 서열번호 3으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,687,456번째 염기)의 대립유전자가 A/A인 경우, 서열번호 4로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,688,828번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 5로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,700,663번째 염기)의 대립유전자가 C/C인 경우, 서열번호 6으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,701,698번째 염기)의 대립유전자가 A/A인 경우, 서열번호 7로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,743,724번째 염기)의 대립유전자가 A/A인 경우, 서열번호 8로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,791,136번째 염기)의 대립유전자가 A/A인 경우, 서열번호 9로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,796,200번째 염기)의 대립유전자가 C/C인 경우, 서열번호 10으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,797,369번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 11로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,805,058번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 12로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,821,759번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 13으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,834,835번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 14로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,909,953번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 15로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,924,075번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 서열번호 16으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,928,942번째 염기)의 대립유전자가 C/C인 경우, 서열번호 17로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,933,286번째 염기)의 대립유전자가 A/A인 경우, 서열번호 18로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기(14번 염색체의 14,984,025번째 염기)의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별할 수 있다.The step of determining the base is a step of identifying the allele of the base of the polymorphic site in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the guinea pig.
In the base determination step, if the allele of the 51st base (the 14,623,011th base of chromosome 14), which is the polymorphic site in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 1, is G/G, the cage Black pigs can be identified as having back fat thickness.
In addition, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of our heuk swine represented by SEQ ID NO: 2, when the allele of the 51st base (base 14,672,980 of chromosome 14), which is a polymorphic site, is A/A, it is represented by SEQ ID NO: 3 In the case of the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs, when the allele of the 51st base (base 14,687,456 of chromosome 14), which is the polymorphic site, is A/A, the thickness of the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 4 In the SNP marker for identification, when the allele of the 51st base (base 14,688,828 of chromosome 14), which is the polymorphic site, is G/G, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 5, polymorphism If the allele of the 51st base (base 14,700,663 of chromosome 14), which is the site, is C/C, the polymorphic site 51th base (14 If the allele of the 14,701,698 base of chromosome No. 14,701,698) is A/A, the polymorphic site 51st base (14,743,724th base of chromosome 14) in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of a guinea pig represented by SEQ ID NO: 7 When the allele of is A / A, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 8, the allele of the 51st base (base 14,791,136 of chromosome 14), which is the polymorphic site, is A / A In the case of SEQ ID NO: 9, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs, the allele of the 51st base (the 14,796,200th base of chromosome 14), which is the polymorphic site, is C/C, as SEQ ID NO: 10 If the allele of the 51st base (the 14,797,369th base of chromosome 14), which is a polymorphic site, is G/G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs displayed as shown in SEQ ID NO: 11, the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 11 In the SNP marker for thickness identification, the polymorphic site, the 51st base (14,805,058th of chromosome 14) If the allele of the base) is G/G, the allele of the 51st base (the 14,821,759th base of chromosome 14), which is the polymorphic site, is G in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 12 In the case of /G, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 13, the allele of the 51st base (base 14,834,835 of chromosome 14), which is a polymorphic site, is G/G, SEQ ID NO: In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by 14, when the allele of the 51st base (base 14,909,953 of chromosome 14), which is the polymorphic site, is G/G, the In the SNP marker for identifying back fat thickness, when the allele of the 51st base (base 14,924,075 of chromosome 14), which is a polymorphic site, is G/G, SNP marker for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs represented by SEQ ID NO: 16 In the case where the allele of the 51st base (base 14,928,942 of chromosome 14), which is the polymorphic site, is C/C, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 17, the polymorphic site at the 51st When the allele of the base (base 14,933,286 of chromosome 14) is A/A, in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of the guinea pig represented by SEQ ID NO: 18, the polymorphic site at the 51st base (14,984,025 of chromosome 14) If the allele of the second base) is G/G, it can be identified as having the thickness of the back fat of the black pig.

이 때, 서열번호 1로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 2로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 AA가 되며, 서열번호 3으로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 AA가 되며, 서열번호 4로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 5로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 CC가 되며, 서열번호 6으로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 AA가 되며, 서열번호 7로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 AA가 되며, 서열번호 8로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 AA가 되며, 서열번호 9로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 CC가 되며, 서열번호 10으로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 11로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 12로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 13으로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 14로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 15로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 16으로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 CC가 되며, 서열번호 17로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 AA가 되며, 서열번호 18로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 되며, 서열번호 로 표시되는 상기 SNP 마커의 우성 유전자형은 GG가 된다.At this time, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 1 is GG, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 2 is AA, and the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 3 is AA, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 4 is GG, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 5 is CC, and the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 6 is AA, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 7 is AA, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 8 is AA, and the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 9 The genotype is CC, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 10 is GG, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 11 is GG, and the SNP marker represented by SEQ ID NO: 12 The dominant genotype is GG, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 13 is GG, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 14 is GG, and the SNP marker represented by SEQ ID NO: 15 The dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 16 is CC, the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: 17 is AA, and the SNP represented by SEQ ID NO: 18 The dominant genotype of the marker is GG, and the dominant genotype of the SNP marker represented by SEQ ID NO: is GG.

삭제delete

삭제delete

상기 시료 추출 단계에서는, 우리흑돈으로부터 얻어진 검체를 시료로 이용한다. 시료는 돼지의 털, 뇨, 혈액, 각종 체액, 분리된 조직, 분리된 세포 또는 타액 등을 사용할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the sample extraction step, a sample obtained from guinea pig is used as a sample. The sample may include, but is not limited to, pig hair, urine, blood, various body fluids, isolated tissues, isolated cells, or saliva.

다형성 증폭 단계에서, DNA로부터 상기 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭시키는 방법은 당업자에게 알려진 어떠한 방법이든 사용 가능하다. 예를 들면, 표적 핵산을 PCR을 통하여 증폭하고 이를 정제하여 얻을 수 있다.In the polymorphism amplification step, any method known to those skilled in the art for amplifying the polymorphic site of the SNP marker from DNA may be used. For example, it can be obtained by amplifying a target nucleic acid through PCR and purifying it.

염기 결정 단계에서, 다형성 부위의 염기를 결정하는 방법은 서열 분석, 마이크로어레이(microarray)에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립유전자 혼성화 기법(Dynamic Allelespecifichybridization, DASH), PCR 연장 분석, PCR-SSCP, PCR-RFLP 분석 또는 TaqMan 기법, SNPlex 플랫폼(Applied Biosystems), 질량 분석법(예를 들면, Sequenom의 MassARRAY 시스템), 미니-시퀀싱(Mini-Sequencing) 방법, Bio-Plex 시스템(BioRad), CEQ and SNPstream 시스템(Beckman), Molecular Inversion Probe 어레이 기술(예를 들면, Affymetrix GeneChip), 및 BeadArray Technologies(예를 들면, Illumina GoldenGate 및 Infinium 분석법) 등을 이용하여 수행될 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.In the nucleotide determination step, methods for determining the base of the polymorphic site include sequence analysis, microarray hybridization, allele specific PCR (allele specific PCR), dynamic allele specific hybridization (DASH), PCR Extension analysis, PCR-SSCP, PCR-RFLP analysis or TaqMan technique, SNPlex platform (Applied Biosystems), mass spectrometry (eg Sequenom's MassARRAY system), Mini-Sequencing method, Bio-Plex system ( BioRad), CEQ and SNPstream systems (Beckman), Molecular Inversion Probe array technology (eg, Affymetrix GeneChip), and BeadArray Technologies (eg, Illumina GoldenGate and Infinium assays). Not limited.

상기 방법들 또는 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자에게 이용 가능한 다른 방법에 의해, 상기 다형성 부위를 포함하는 SNP 마커에서의 하나 이상의 대립유전자를 확인할 수 있다. 이와 같은 다형성 부위의 염기를 결정하는 것은 바람직하게는 DNA 칩을 통해 수행할 수 있다.One or more alleles in the SNP marker comprising the polymorphic site may be identified by the above methods or other methods available to those skilled in the art to which the present invention pertains. Determination of the base of such a polymorphic site can be preferably performed through a DNA chip.

상술한 본 발명의 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 및 등 지방 두께 식별 방법을 사용하면, 우리흑돈의 등 지방 두께에 대한 형질 특성을 높은 정확도로 식별해낼 수 있다.By using the above-described SNP marker for back fat thickness identification and back fat thickness identification method of the present invention, it is possible to identify the trait characteristics for the back fat thickness of Korean heuk pigs with high accuracy.

이에 따라, 얇은 등 지방 두께를 갖는 품종의 개량을 강화하는 것이 가능해지며, 일반 농가에서 규격돈의 출하 비율을 향상시킬 수 있는 이점이 있다.Accordingly, it is possible to strengthen the improvement of the breed having a thin back fat thickness, there is an advantage that can improve the shipment rate of standard pigs in general farms.

본 발명은 하기의 실시예에 의하여 보다 더 잘 이해 될 수 있으며, 하기의 실시예는 본 발명의 예시 목적을 위한 것이며, 첨부된 특허청구범위에 의하여 한정되는 보호범위를 제한하고자 하는 것은 아니다.The present invention may be better understood by the following examples, which are for illustrative purposes of the present invention and are not intended to limit the scope of protection defined by the appended claims.

실시예 : 전장유전체분석 시험Example: Full-length genome analysis test

1. 시험 목적1. Test purpose

두록과 재래돼지 교잡으로 개발된 우리흑돈은 일반비육돈 보다 상대적으로 지방량이 많아 등 지방 또한 비교적 두껍게 형성되는 것으로 나타났다.It was found that Korean black pig developed by hybridization of durok and conventional pigs has a relatively large amount of fat compared to general fattening pigs, so the back fat is also relatively thick.

이에, 본 발명은 우리흑돈의 등 지방 두께를 개량하기 위한 유전자의 검증 및 선발을 위해 전장유전체분석(Whole-Genome Sequencing, WGS) 시험을 수행하였다.Therefore, in the present invention, a Whole-Genome Sequencing (WGS) test was performed for the verification and selection of genes for improving the thickness of the back fat of Korean pigs.

전장유전체분석은 질환 및 약물 반응성에 대한 유전적 요인을 총체적으로 연구하여, 개개인의 SNP 유전자형을 결정하고, 결정되어진 유전자형들 중에서 질병이나 특정 표현형과 동시에 존재하는 확률을 계산해서, 가장 유의성이 높은 유전자형-표현형의 SNP를 발굴하는 시험이다.Whole genome analysis comprehensively studies the genetic factors for disease and drug responsiveness, determines the individual SNP genotype, and calculates the probability of coexistence with a disease or specific phenotype among the determined genotypes, and the most significant genotype -This is a test to discover SNPs of the phenotype.

2. 시험 방법2. Test method

(1) 등 지방 두께 통계량 분석(1) Statistical analysis of back fat thickness

품종kind 등 지방 두께 표현형back fat thickness phenotype 유전체(SNP chip)
분석두수Dielectric (SNP chip)
number of analysis 두수head number 평균±표준편차mean ± standard deviation 두록Duroc 12,29212,292 12.5±1.912.5±1.9 878878 재래돼지traditional pig 1,4131,413 20.6±4.120.6±4.1 195195 우리흑돈our black money 2,0362,036 16.6±3.716.6±3.7 697697

표 1은 두록, 재래돼지, 우리흑돈 각각에 대한 등 지방 두께 표현형의 기초 통계량을 나타낸 것이다.우리흑돈은 두록과 재래돼지의 교잡을 통해 개발된 것으로, 상기 표 1을 참조하면, 재래돼지에 비해 평균 등 지방 두께가 얇고, 두록에 비해 평균 등 지방 두께가 두꺼운 것으로 확인되었다.Table 1 shows the basic statistics of the phenotype of back fat thickness for Duroc, conventional pigs, and Korean heuk pigs respectively. Woori heukdon was developed through hybridization of Duroc and conventional pigs. Referring to Table 1 above, compared to conventional pigs, It was confirmed that the average back fat thickness was thin and the average back fat thickness was thicker than that of Durok.

(2) 유전력 추정(2) Estimation of heritability

유전력 추정을 위해 시즌(검정연도-2개월)을 임의효과로 설정하였으며, 범주형 데이터를 single step gibbs sampling 방식으로 분석 하기 위해 BLUPF90 Family 프로그램을 이용하였다.The season (test year - 2 months) was set as a random effect for estimating heritability, and the BLUPF90 Family program was used to analyze categorical data using a single step gibbs sampling method.

160,000개 샘플 중 20번째 단위로 샘플링하여 최종 8,000개의 샘플로 유전모수(모집단의 유전적 속성)를 추정하였다. The genetic parameters (genetic attributes of the population) were estimated with the final 8,000 samples sampled at the 20th unit out of 160,000 samples.

품종kind 유전력 평균±표준편차Heritability mean ± standard deviation 두록Duroc 0.29±0.0010.29±0.001 재래돼지traditional pig 0.76±0.0040.76±0.004 우리흑돈our black money 0.36±0.0040.36±0.004

표 2는 얇은 등 지방 두께의 형질 발현에 대한 유전모수를 추정한 결과를 나타낸 것이다.상기 유전모수란, 유전적 수량 형질을 해석할 때 표본에서 실측에 의하여 얻어진 수치는 통계량을 통해 추측되는 모집단의 유전적 속성을 말한다.Table 2 shows the results of estimating the genetic parameters for the expression of the trait of thin back fat. The genetic parameter is the numerical value obtained by actual measurement in the sample when interpreting the genetic quantity trait of the population estimated through statistics. refers to genetic properties.

(3) 등 지방 두께 형질 발현에 대한 전장 유전체 분석(3) Whole-genome analysis for dorsal fat thickness trait expression

유전체 맵 정보는 Sus crofa 11.1로 성염색체 SNP는 분석에서 제외하였다. 샘플 및 SNP QC는 Minimum Allele Frequencies (<0.9), Genotype Call Rate (<0.9), Animal Missing Rate (>0.9), Hardy-Weinberg Equilibrium (0.15)로 설정하여 최종적으로 33,892개 SNP, 1,730두가 전장유전체 분석에 활용되었다.The genome map information was Sus crofa 11.1, and sex chromosome SNPs were excluded from the analysis. Sample and SNP QC were set as Minimum Allele Frequencies (<0.9), Genotype Call Rate (<0.9), Animal Missing Rate (>0.9), Hardy-Weinberg Equilibrium (0.15), and finally 33,892 SNPs, 1,730 heads were all genomes. was used for analysis.

전장 유전체 연관 분석(Single Step Genome-Wide Association Study, Single Step GWAS) 방식을 활용하기 위해 BLUPF90 Family 프로그램을 이용하여 0.4Mbp 단위로 SNP 윈도우를 설정하다.To utilize the Single Step Genome-Wide Association Study (Single Step GWAS) method, the SNP window is set in units of 0.4Mbp using the BLUPF90 Family program.

윈도우별 유전분산(하나의 집단에 있어서의 표현형 분산 중에서 개체의 유전적 변이에 의하여 생긴 부분) 비율을 추정하였다. The ratio of the genetic variance (the portion caused by the genetic variation of an individual among the phenotypic variance in one population) was estimated for each window.

유전분산(Vg)은 상가적 효과에 의한 분산(Va)과 우성효과에 의한 분산(Vd), 그리고 상위유전자 효과에 의한 분산(Vi)의 합으로 산출하였다. (Vg=Va+Vd+Vi)The genetic variance (Vg) was calculated as the sum of the variance (Va) due to the additive effect, the variance (Vd) due to the dominant effect, and the variance (Vi) due to the upper gene effect. (Vg=Va+Vd+Vi)

유전분산 비율 1% 이상의 윈도우(0.4Mbp 단위)를 스크린하였다.A window (in units of 0.4 Mbp) greater than or equal to 1% of the dielectric dissipation ratio was screened.

3. 시험 결과3. Test results

(1) SNP의 유전분산 비율 분석(1) Analysis of the genetic variance ratio of SNPs

도 1은 본 발명의 일 실시예에 있어서, SNP 윈도우별 유전분산 비율을 나타낸 그래프이다.1 is a graph showing a dielectric dispersion ratio for each SNP window according to an embodiment of the present invention.

그래프의 X축은 염색체를, Y축은 유전분산 비율을 나타내며, 유전분산 비율이 높게 나타날수록 유전력이 큰 것으로 볼 수 있다.In the graph, the X-axis represents chromosomes and the Y-axis represents the genetic variance ratio, and it can be seen that the higher the genetic variance ratio, the greater the heritability.

도 1에 개시된 바와 같이, 14번과 18번 염색체의 경우 다른 염색체들 대비 유전분산 값이 두드러지게 큰 값을 갖는 것으로 나타났다. 즉, 얇은 등 지방 두께 특성에 관여하는 다형성 부위는 14번 염색체와 18번 염색체 내 존재하는 것으로 확인되었다.As shown in FIG. 1 , in the case of chromosomes 14 and 18, it was found that the genetic variance value was significantly larger than that of other chromosomes. That is, polymorphisms involved in thin back fat thickness characteristics were confirmed to exist in chromosomes 14 and 18.

(2) SNP 마커 후보 선발(2) SNP marker candidate selection

하기 표 3은 유전분산 비율 1% 이상인 윈도우 스크린 결과를 나타낸 것이다.Table 3 below shows the results of the window screen with a dielectric dispersion ratio of 1% or more.

순번turn 염색체chromosome SNPSNP 위치(bp)position (bp) 윈도우
분산비율window
dispersion ratio 1One 1414 MARC0083431MARC0083431 14,602,388 14,602,388 TOP1
(1.77%)TOP1
(1.77%) 22 1414 ASGA0104452ASGA0104452 14,623,011 14,623,011 33 1414 ALGA0110555ALGA0110555 14,626,687 14,626,687 44 1414 ALGA0121300ALGA0121300 14,639,861 14,639,861 55 1414 ASGA0105306ASGA0105306 14,672,980 14,672,980 66 1414 ALGA0123084ALGA0123084 14,687,456 14,687,456 77 1414 ASGA0101001ASGA0101001 14,688,828 14,688,828 88 1414 ASGA0106376ASGA0106376 14,700,663 14,700,663 99 1414 MARC0043274MARC0043274 14,701,698 14,701,698 1010 1414 ALGA0103590ALGA0103590 14,743,724 14,743,724 1111 1414 MARC0105374MARC0105374 14,791,136 14,791,136 1212 1414 MARC0021708MARC0021708 14,796,200 14,796,200 1313 1414 ASGA0102704ASGA0102704 14,797,369 14,797,369 1414 1414 MARC0114177MARC0114177 14,805,058 14,805,058 1515 1414 ASGA0093857ASGA0093857 14,821,759 14,821,759 1616 1414 H3GA0056395H3GA0056395 14,834,835 14,834,835 1717 1414 ASGA0092792ASGA0092792 14,909,953 14,909,953 1818 1414 MARC0001440MARC0001440 14,924,075 14,924,075 1919 1414 DIAS0001469DIAS0001469 14,928,942 14,928,942 2020 1414 MARC0086217MARC0086217 14,933,286 14,933,286 2121 1414 MARC0002417MARC0002417 14,984,025 14,984,025 2222 1818 H3GA0050595H3GA0050595 23,809,561 23,809,561 TOP2
(1.38%)TOP2
(1.38%) 2323 1818 INRA0055474INRA0055474 23,838,486 23,838,486 2424 1818 ALGA0097499ALGA0097499 23,850,297 23,850,297 2525 1818 ALGA0097504ALGA0097504 23,886,195 23,886,195 2626 1818 ASGA0079256ASGA0079256 23,902,757 23,902,757 2727 1818 ASGA0079259ASGA0079259 23,920,931 23,920,931 2828 1818 H3GA0050603H3GA0050603 23,933,285 23,933,285 2929 1818 MARC0001905MARC0001905 23,959,479 23,959,479 3030 1818 ASGA0079261ASGA0079261 23,980,984 23,980,984 3131 1818 MARC0058303MARC0058303 24,002,131 24,002,131 3232 1818 MARC0036835MARC0036835 24,031,742 24,031,742 3333 1818 H3GA0050605H3GA0050605 24,097,505 24,097,505 3434 1818 ASGA0079268ASGA0079268 24,134,625 24,134,625 3535 1818 ASGA0079269ASGA0079269 24,151,664 24,151,664 3636 1818 ALGA0097522ALGA0097522 24,173,139 24,173,139 3737 1818 ASGA0079277ASGA0079277 24,201,686 24,201,686

(3) 최종 SNP 마커 선발(3) Final SNP marker selection

14번과 18번 염색체 내 등 지방 두께 관련 37개의 후보 SNP 마커를 스크리닝하여, 유전자형에 따라 등 지방 두께의 통계적(P<0.05) 차이를 나타내는 14번 염색체 18개의 SNP 마커를 최종 선발하였다.37 candidate SNP markers related to back fat thickness in chromosomes 14 and 18 were screened, and 18 SNP markers on chromosome 14 showing statistical (P<0.05) differences in back fat thickness according to genotype were finally selected.

순번turn 염색체chromosome SNPSNP 위치(bp)position (bp) 지방저감
유전자형fat reduction
genotype 등 지방 두께 (%) *Back Fat Thickness (%) * 저감호모low homo 헤테로hetero 증가호모increase homo 1One 1414 ASGA0104452ASGA0104452 1462301114623011 GGGG 15.9b 15.9 b 16.4ab 16.4 ab 16.7a 16.7 a 22 1414 ASGA0105306ASGA0105306 1467298014672980 AAAA 15.8b 15.8 b 16.6ab 16.6 ab 16.8a 16.8 a 33 1414 ALGA0123084ALGA0123084 1468745614687456 AAAA 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.7a 16.7 a 44 1414 ASGA0101001ASGA0101001 1468882814688828 GGGG 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 55 1414 ASGA0106376ASGA0106376 1470066314700663 CCCC 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 66 1414 MARC0043274MARC0043274 1470169814701698 AAAA 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 77 1414 ALGA0103590ALGA0103590 1474372414743724 AAAA 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 88 1414 MARC0105374MARC0105374 1479113614791136 AAAA 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 99 1414 MARC0021708MARC0021708 1479620014796200 CCCC 15.9b 15.9 b 16.5ab 16.5 ab 16.8a 16.8 a 1010 1414 ASGA0102704ASGA0102704 1479736914797369 GGGG 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 1111 1414 MARC0114177MARC0114177 1480505814805058 GGGG 15.9b 15.9 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 1212 1414 ASGA0093857ASGA0093857 1482175914821759 GGGG 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 1313 1414 H3GA0056395H3GA0056395 1483483514834835 GGGG 15.8b 15.8 b 16.6a 16.6 a 16.8a 16.8 a 1414 1414 ASGA0092792ASGA0092792 1490995314909953 GGGG 15.6b 15.6 b 16.2b 16.2 b 16.9a 16.9 a 1515 1414 MARC0001440MARC0001440 1492407514924075 GGGG 16.3b 16.3 b 16.4b 16.4 b 18.9a 18.9 a 1616 1414 DIAS0001469DIAS0001469 1492894214928942 CCCC 15.6b 15.6 b 16.2b 16.2 b 16.9a 16.9 a 1717 1414 MARC0086217MARC0086217 1493328614933286 AAAA 15.6b 15.6 b 16.2b 16.2 b 16.9a 16.9 a 1818 1414 MARC0002417MARC0002417 1498402514984025 GGGG 15.6b 15.6 b 16.2b 16.2 b 16.9a 16.9 a

표 4는 SNP 마커 후보 중 등 지방 두께의 형질 특성에 따라 최종 선발된 SNP 마커를 나타낸 것이다.표 4에서 a, ab, b는 Tukey 방식에 따른 그룹핑(P<0.05)을 나타낸 것이다.Table 4 shows the SNP markers finally selected according to the characteristics of back fat thickness among the SNP marker candidates. In Table 4, a, ab, and b show the grouping (P<0.05) according to the Tukey method.

상기 18 종의 SNP의 우성 유전자형은 우리흑돈의 등 지방 두께에 관여하는 마커로서, 상기 고정 유전자형의 조합을 가지는 돼지 개체는 얇은 등 지방 두께를 가진 우리흑돈 품종임을 높은 정확도로 판별할 수 있는 효과가 있다.The dominant genotype of the 18 SNPs is a marker involved in the thickness of the back fat of Woori heuk pig, and the effect of discriminating with high accuracy that the pig individual having the combination of the fixed genotype is a Woori heuk pig breed with a thin back fat thickness. have.

이상에서 살펴본 본 발명의 등 지방 두께 SNP 마커는 유전체 분석 개체만 활용하는 기존의 전장 유전체 연관 분석 방법(Genome-wide association study, GWAS) 보다 정확도가 높은 유전체 선발 방법(single step genomic BLUP, ssGBLUP) 을 활용하여 밝혀낸 것이다.The back fat thickness SNP marker of the present invention as described above is a genome selection method (single step genomic BLUP, ssGBLUP) with higher accuracy than the existing genome-wide association study (GWAS) that utilizes only genome analysis individuals. It was discovered using

또한, 본 발명의 등 지방 두께 SNP 마커는 유전체 분석 개체(1,770두)뿐만 아니라 선/후대 및 동기집단의 표현형 정보(15,741두)를 모두 활용하였으며, 우리흑돈의 근간이 되는 재래돼지, 두록을 통합 분석하여 근간 품종으로부터의 유전효과도 고려된 것이다.In addition, the back fat thickness SNP marker of the present invention utilized not only genome analysis individuals (1,770 heads) but also phenotypic information (15,741 heads) of ancestors/progenitors and contemporaneous groups. In the analysis, the genetic effect from the root cultivar was also considered.

전술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다.The above description of the present invention is for illustration, and those of ordinary skill in the art to which the present invention pertains can understand that it can be easily modified into other specific forms without changing the technical spirit or essential features of the present invention. will be. Therefore, it should be understood that the embodiments described above are illustrative in all respects and not restrictive.

<110> REPUBLIC OF KOREA, REPUBLIC OF KOREA <120> SNP MAKERS OF IDENTIFICATION OF DORSAL FAT THICKNESS IN WOORI <130> FP-1910116-KR <160> 18 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 1 agggccccct gtttgacaaa gtggtttagg aaagaaatac actctggttc y 51 <210> 2 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 2 tcacagccat cattagtggc atcatttctg ctttccttcc agcaccatgc y 51 <210> 3 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 3 ttctctctac cagaccccct tcccagcctc tttaggctga gcccctccaa y 51 <210> 4 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 4 ttgaaagctt ccgtgggctt actgggtcca ggaaaagcct atgaagaagg y 51 <210> 5 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 5 ttctgaatac cagtgggtct tttctcttta aacagatgtt tttattaaca y 51 <210> 6 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 6 tgtctttccg acaatccaca tccctgttgg ataactgatg catcatcaga y 51 <210> 7 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 7 tgagtgcctg tggagacttt cattcaggta ttaggttttg ctgctcatac y 51 <210> 8 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 8 aaattacgct ctgagatcat caaagcttaa ggagcctaag tgcttggtta y 51 <210> 9 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 9 tcccctgtgg gaaggggaag gaaaaacagg agggattgga agtgacacgc y 51 <210> 10 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 10 cctacattca ttcccactgt gtccgaagcc cacacaagcc cactgggaaa y 51 <210> 11 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 11 ctgtgggtct ggacaagact gcacagtggg aagaaaaacc tcgacctgag y 51 <210> 12 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 12 atactggaag cagagttgga cctgccaaag ccacctgagt tagccctgag y 51 <210> 13 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 13 ttcactttgg agaagtaaag gcgagggggg tgcagttgag gggatggtgc y 51 <210> 14 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 14 ctctgagtgt ctattgggtg tcaaagccac caccaaatgt cacaacttct y 51 <210> 15 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 15 catacatata tttcccccct tggactgaag aaaggagaga atgttcagac y 51 <210> 16 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 16 gtgagtaatt gggcaaaacc attagatttg ctgtctcctg cagcttagcc y 51 <210> 17 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 17 gttccttcac aaatgttatc tcactgatcc ttaaagactc ccatgagacc y 51 <210> 18 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 18 gttctgtcta aacattgggt ctgttggtct ttctacagtt gttctgcatt y 51 <110> REPUBLIC OF KOREA, REPUBLIC OF KOREA <120> SNP MAKERS OF IDENTIFICATION OF DORSAL FAT THICKNESS IN WOORI <130> FP-1910116-EN <160> 18 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 1 agggccccct gtttgacaaa gtggtttagg aaagaaatac actctggttc y 51 <210> 2 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 2 tcacagccat cattagtggc atcatttctg ctttccttcc agcaccatgc y 51 <210> 3 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 3 ttctctctac cagaccccct tcccagcctc tttaggctga gcccctccaa y 51 <210> 4 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 4 ttgaaagctt ccgtgggctt actgggtcca ggaaaagcct atgaagaagg y 51 <210> 5 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 5 ttctgaatac cagtgggtct tttctcttta aacagatgtt tttattaaca y 51 <210> 6 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 6 tgtctttccg acaatccaca tccctgttgg ataactgatg catcatcaga y 51 <210> 7 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 7 tgagtgcctg tggagacttt cattcaggta ttaggttttg ctgctcatac y 51 <210> 8 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 8 aaattacgct ctgagatcat caaagcttaa ggagcctaag tgcttggtta y 51 <210> 9 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 9 tcccctgtgg gaaggggaag gaaaaacagg aggattgga agtgacacgc y 51 <210> 10 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 10 cctacattca ttcccactgt gtccgaagcc cacacaagcc cactgggaaa y 51 <210> 11 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 11 ctgtgggtct ggacaagact gcacagtggg aagaaaaacc tcgacctgag y 51 <210> 12 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 12 atactggaag cagagttgga cctgccaaag ccacctgagt tagccctgag y 51 <210> 13 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 13 ttcactttgg agaagtaaag gcgagggggg tgcagttgag gggatggtgc y 51 <210> 14 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 14 ctctgagtgt ctattgggtg tcaaagccac caccaaatgt cacaacttct y 51 <210> 15 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 15 catacatata tttcccccct tggactgaag aaaggagaga atgttcagac y 51 <210> 16 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 16 gtgagtaatt gggcaaaacc attagatttg ctgtctcctg cagcttagcc y 51 <210> 17 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 17 gttccttcac aaatgttatc tcactgatcc ttaaagactc ccatgagacc y 51 <210> 18 <211> 51 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> WOORI BLACK PORCINE <400> 18 gttctgtcta aacattgggt ctgttggtct ttctacagtt gttctgcatt y 51

Claims (26)

서열번호 1로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 2로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 3으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 5로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 6으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 7로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 8로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 9로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 10으로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 11로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 12로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 13로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 14로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 15로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 16로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 C인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드;
서열번호 17로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드; 및
서열번호 18로 표시되는 폴리뉴클레오티드에서 51 번째 염기가 A 또는 G인 단일염기다형(SNP) 부위를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 핵산으로 구성되는 폴리뉴클레오티드로 이루어진 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 조성물.a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 1;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 2;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 3;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 5;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 6;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 7;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 8;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 9;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 10;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 11;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 12;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 13;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 14;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 15;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or C in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 16;
a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a single nucleotide polymorphism (SNP) site in which the 51st base is A or G in the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 17; and
In the polynucleotide represented by SEQ ID NO: 18, the 51st base is A or G single nucleotide polymorphism (SNP) comprising a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive nucleic acids including a SNP for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs marker composition. 제1 항의 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 조성물을 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 조성물.A composition for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig, comprising an agent capable of detecting or amplifying the SNP marker composition for identifying the thickness of the back fat of claim 1 . 제2 항의 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 조성물을 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 키트.A kit for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig comprising the composition for identifying the thickness of the fat on the back of claim 2. 제3 항에 있어서,
상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 DNA 칩 키트인 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 키트.4. The method of claim 3,
The kit is an RT-PCR kit or a DNA chip kit, a kit for identifying the thickness of the back fat of Korean black pigs. 제1 항의 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 조성물을 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 마이크로어레이.A microarray for identifying the thickness of the back fat of Woori heuk pig comprising the SNP marker composition for identifying the thickness of the back fat of claim 1 . 우리흑돈으로부터 시료를 추출하는 시료 추출 단계;
상기 시료의 DNA로부터 제1 항의 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커 조성물의 다형성 부위를 증폭시키는 다형성 증폭 단계; 및
증폭된 다형성 부위의 염기를 결정하는 염기 결정 단계를 포함하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.A sample extraction step of extracting a sample from Woori Heukdon;
A polymorphic amplification step of amplifying the polymorphic site of the SNP marker composition for identifying the thickness of the back fat of claim 1 from the DNA of the sample; and
A method for identifying the thickness of the back fat of guinea pigs, including a base determination step of determining the base of the amplified polymorphic site. 제6 항에 있어서,
상기 다형성 부위는 상기 우리흑돈의 14번 염색체에 존재하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.7. The method of claim 6,
The polymorphic region is a method of identifying the thickness of the back fat of woori heukdon present on chromosome 14 of the woori heukdon. 제7 항에 있어서,
상기 염기 결정 단계는, 상기 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서 다형성 부위의 염기의 대립유전자를 식별하는 단계인 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.8. The method of claim 7,
The step of determining the base is a step of identifying the allele of the base of the polymorphic site in the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon. 제8 항에 있어서,
서열번호 1로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 1, when the allele of the 51st base, which is the polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 2로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 2, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 3으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 3, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 삭제delete 제8 항에 있어서,
서열번호 5로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 C/C인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 5, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is C/C, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 6으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 6, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 7로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 7, when the allele of the 51st base, which is the polymorphic site, is A/A, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 8로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 8, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 9로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 C/C인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 9, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is C/C, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 10으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 10, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 11로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 11, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 12로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 12, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 13으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 13, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 14로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 14, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 15로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 15, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 16으로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 C/C인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 16, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is C/C, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 17로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 A/A인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 17, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is A/A, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness. 제8 항에 있어서,
서열번호 18로 표시되는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별용 SNP 마커에서, 다형성 부위인 51 번째 염기의 대립유전자가 G/G인 경우, 상기 우리흑돈이 얇은 등 지방 두께를 갖는 것으로 식별하는 우리흑돈의 등 지방 두께 식별 방법.
9. The method of claim 8,
In the SNP marker for identifying the thickness of the back fat of Woori heukdon represented by SEQ ID NO: 18, when the allele of the 51st base, which is a polymorphic site, is G/G, the Woori heukdon identified as having a thin back fat thickness How to identify back fat thickness.
KR1020190164070A 2019-12-10 2019-12-10 Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same KR102305034B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020190164070A KR102305034B1 (en) 2019-12-10 2019-12-10 Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020190164070A KR102305034B1 (en) 2019-12-10 2019-12-10 Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20210073339A KR20210073339A (en) 2021-06-18
KR102305034B1 true KR102305034B1 (en) 2021-09-27

Family

ID=76623505

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020190164070A KR102305034B1 (en) 2019-12-10 2019-12-10 Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same

Country Status (1)

Country Link
KR (1) KR102305034B1 (en)

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR101595017B1 (en) * 2013-12-24 2016-02-18 대한민국 Genetic composition of porcine MICU1 for predicting meat quality of pork and predicting method of meat quality using thereof
KR101677517B1 (en) * 2014-06-27 2016-11-21 대한민국 Novel SNP marker for discriminating level of meat quality and Black Coat Color of pig and use thereof

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GenBank Accession No. XM021072720 (2017.05.13.)*

Also Published As

Publication number Publication date
KR20210073339A (en) 2021-06-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101823368B1 (en) SNP marker regulating polyunsaturated fatty acid level in the pork and uses thereof
KR101432164B1 (en) Novel haplotype marker for discriminating level of meat quality of Pig and use thereof
KR101213217B1 (en) SNP Markers Associated with Meat Quantity and Beef Quality in Hanwoo
KR101929391B1 (en) Novel SNP marker for discriminating increasedthe number of nipples of pigs and use thereof
KR101418402B1 (en) Novel SNP marker for discriminating level of loinmuscle area of Pig and use thereof
KR101450792B1 (en) Novel SNP marker for discriminating Black Coat Colour of Pig and use thereof
KR101312480B1 (en) Novel snp marker for discriminating number of rib of pig and use thereof
KR101796158B1 (en) SNP markers of NAT9 gene for prediction of pigs litter size and methods for selection of fecund pigs using the same
KR101761801B1 (en) Composition for determining nose phenotype
KR101784163B1 (en) Novel SNP marker for discriminating reduction of backfat thickness and use thereof
KR102305034B1 (en) Snp makers of identification of dorsal fat thickness in woori black porcine and method for identifying dorsal fat thickness using the same
KR102304998B1 (en) Snp makers of identification of whole black hair in woori black porcine and method for identifying whole black hair using the same
KR101985659B1 (en) Method for identification of Baekwoo breed using single nucleotide polymorphism markers
KR102043119B1 (en) The composition comprising SNP marker for identifying breed of jejuwoo, a kit containing the same, and a discriminant method using the same
KR101928887B1 (en) Single nucleotide polymorphism markers for determining Jeju black cattle and the uses thereof
KR101929381B1 (en) Novel gene marker for discriminating the composition of fatty acid of pigs and use thereof
KR101960420B1 (en) Novel SNP maker for discriminating the meningoencephalocele of pigs and use thereof
KR101823376B1 (en) SNP marker regulating stearic acid level in the pork and uses thereof
KR101929374B1 (en) Novel gene marker for discriminating the shear force of pigs and use thereof
KR102083675B1 (en) Method for identification of Chikso breed using single nucleotide polymorphism markers
KR101821541B1 (en) SNP marker regulating palmitoleic acid level in the pork and uses thereof
KR101929385B1 (en) Novel gene marker for discriminating the water holding capacity and water content of pigs and use thereof
KR101821542B1 (en) SNP marker regulating palmitic acid level in the pork and uses thereof
KR101796170B1 (en) SNP markers of IGFBP gene for prediction of pigs litter size and methods for selection of fecund pigs using the same
KR101796167B1 (en) SNP markers of MAP3K3 gene for prediction of pigs litter size and methods for selection of fecund pigs using the same

Legal Events

Date Code Title Description
AMND Amendment
E601 Decision to refuse application
AMND Amendment
X701 Decision to grant (after re-examination)
GRNT Written decision to grant