KR102245298B1 - 증가된 edc 활성을 갖고 락테이트 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포, 그를 제조하는 방법, 그를 제조하는 방법, 및 그를 사용하여 락테이트를 생산하는 방법 - Google Patents
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Abstract
모세포에 비하여 EDC 효소의 활성이 증가되어 있는, 락테이트 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포, 그를 제조하는 방법, 및 그를 이용하여 락테이트를 생산하는 방법을 제공한다.
Description
락테이트를 생산할 수 있는 유전적으로 조작된 효모 세포, 그를 제조하는 방법 및 상기 세포를 이용하여 락테이트를 생산하는 방법에 관한 것이다.
락테이트는 식품, 제약, 화학, 전자 등 다양한 산업 분야에서 폭넓게 사용되는 유기산이다. 락테이트는 무색, 무취이고 물에 잘 용해되는 저휘발성 물질이다. 락테이트는 인체에 독성이 없어 향미제, 산미제, 보존제 등으로 활용되고 있고, 또한 환경친화적으로 대체 고분자 물질이고, 생분해성 플라스틱인 폴리락틱산 (polylactic acid: PLA)의 원료이다. PLA는 기술적으로는 고분자 중합을 위해 다이머인 락티드 (lactide)로 전환하여 개환 중합된 (ring-open polymerization) 폴리에스터계 수지이며, 필름, 시트, 섬유, 사출 등의 다양한 가공이 가능하다. 따라서, PLA는 폴리에틸렌 (PE), 폴리프로필렌 (PP), 폴리에틸렌 테레프탈레이트 (PET), 폴리스틸렌 (PS) 등 기존 범용 석유화학 플라스틱을 광범위하게 대체할 수 있는 바이오 플라스틱으로서 최근 수요가 크게 증가하고 있다. 또한, 락테이트는 수산기와 카르복실기를 동시에 갖고 있어 반응성이 크고, 그에 따라 락테이트 에스테르, 아세트알데이드, 프로필렌글리콜 등 공업적으로 중요한 화합물로의 전환이 용이하여, 화학공업 분야에 있어서도 차세대 대체 화학 원료로서 주목받고 있다.
현재, 락테이트는 산업적으로 석유화학적 합성 공정과 생물공학적 발효 공정에 의해 생산되고 있다. 석유화학적 합성 공정은, 원유에서 유래된 에틸렌을 산화시키고, 아세트알데히드를 거쳐 시안화수소 첨가 반응에 의해 락토니트릴을 만든 후, 증류시켜 정제하고, 염산이나 황산을 사용하여 가수분해함으로써 제조된다. 또한, 생물공학적 발효 공정은 전분, 수크로스, 말토스, 글루코스, 프럭토스, 자일로스 등의 재생가능한 탄수화물을 기질로 하여 락테이트를 제조할 수 있다. 따라서, 이러한 종래 기술에 의하더라도, 락테이트를 효율적으로 생산할 수 있는 균주 및 그를 이용한 락테이트 생산 방법이 요구되고 있다. 이와 같은 니즈에 부합하여 최근 미생물을 이용하여 락테이트를 생산하는 방법이 개발되고 있다. 그러나, 미생물의 경우 항상성으로 인해 하나의 물질만을 대량으로 생산하는 것이 제한된다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여 연구하던 과정에서 본 발명을 완성하였다.
일 양상은 락테이트를 효과적으로 생산할 수 있는 유전적으로 조작된 효모 세포를 제공한다.
다른 양상은 락테이트를 효과적으로 생산할 수 있는 유전적으로 조작된 효모 세포를 제조하는 방법을 제공한다.
또 다른 양상은 유전적으로 조작된 효모 세포를 이용하여 락테이트를 생산하는 방법을 제공한다.
본 명세서에서 사용된 용어 "활성 증가 (increase in activity)", 또는 "증가된 활성 (increased activity)"은 세포, 단백질, 또는 효소의 활성의 검출가능한 증가를 나타낼 수 있다. "활성 증가 (increase in activity)", 또는 "증가된 활성 (increased activity)"은 주어진 유전적 변형 (genetic modification)을 갖지 않은 세포, 단백질, 또는 효소 (예, 본래 또는 "야생형 (wild-type)"의 세포, 단백질, 또는 효소)와 같은, 동일한 타입의 비교 세포, 단백질, 또는 효소의 수준 보다 더 높은 변형된 (예, 유전적으로 조작된) 세포, 단백질, 또는 효소의 활성을 나타낼 수 있다. "세포의 활성 (cell activity)"이란 세포의 특정 단백질 또는 효소의 활성을 나타낼 수 있다. 예를 들면, 상기 변형된 또는 조작된 세포, 단백질, 또는 효소의 활성은 동일 타입의 조작되지 않은 세포, 단백질, 또는 효소, 예를 들면, 야생형 세포, 단백질, 또는 효소의 활성보다 약 5% 이상, 약 10% 이상, 약 15% 이상, 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 또는 약 100% 이상 증가된 것일 수 있다. 세포 중 특정 단백질 또는 효소의 활성은 모세포, 예를 들면, 조작되지 않은 세포 중의 동일 단백질 또는 효소의 활성보다 약 5% 이상, 약 10% 이상, 약 15% 이상, 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 50% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 또는 약 100% 이상 증가된 것일 수 있다. 단백질 또는 효소의 증가된 활성을 갖는 세포는 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 확인될 수 있다. 상기 증가된 활성을 갖는 세포는, 유전적 변형을 갖지 않은 세포에 비하여 하나 이상의 효소 또는 폴리펩티드의 활성을 증가시키는 유전적 변형 (genetic modification)을 갖는 것일 수 있다.
용어 "카피 수 증가 (copy number increase)"는 유전자의 도입 또는 증폭에 의한 것일 수 있으며, 조작되지 않은 세포에 존재하지 않는 유전자를 유전적 조작에 의해 갖게 되는 경우도 포함한다. 상기 유전자의 도입은 벡터와 같은 비히클을 매개하여 이루어질 수 있다. 상기 도입은 상기 유전자가 게놈에 통합되지 않은 임시적 (transient) 도입이거나 게놈에 삽입되는 것일 수 있다. 상기 도입은 예를 들면, 목적하는 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 삽입된 벡터를 상기 세포로 도입한 후, 상기 벡터가 세포 내에서 복제되거나 상기 폴리뉴클레오티드가 게놈으로 통합됨으로써 이루어질 수 있다.
외부에서 도입되거나 또는 카피 수가 증가되는 폴리뉴클레오티드는 내인성 (endogenous) 또는 외인성 (exogenous)일 수 있다. 상기 내인성 유전자는 미생물 내부에 포함된 유전물질 상에 존재하던 유전자를 말한다. 외인성 유전자는 숙주 세포 게놈으로 도입 (integration)되는 등의 숙주 세포 내로 유전자가 도입되는 것을 의미하며, 도입되는 유전자는 도입되는 숙주세포에 대해 동종 (homologous) 또는 이종 (heterologous)일 수 있다.
"이종성 (heterologous)"은 천연 (native)이 아닌 외인성 (foreign)을 의미할 수 있다.
용어 "유전자"는 전사 및 번역 중 하나 이상에 의하여 발현 산물, 예를 들면, mRNA 또는 단백질을 생성할 수 있는 핵산 단편을 의미하며, 코딩영역 또는 코딩영역 외 5'-비코딩 서열 (5'-non coding sequence)과 3'-비코딩 서열(3'-non coding sequence) 등의 조절 (regulatory) 서열을 포함할 수 있다.
"세포 (cell)", "균주 (strain)", 또는 "미생물 (microorganism)"은 교체 사용이 가능한 것으로서, 효모, 박테리아, 또는 곰팡이 등을 포함할 수 있다.
반면, 본 명세서에서 사용된 용어 "활성 감소 (decrease in activity)" 또는 "감소된 활성 (decreased activity)"은 모세포 (예, 유전적으로 조작되지 않은 세포) 중에서 측정된 것보다 더 낮은 효소 또는 폴리펩티드의 활성을 갖는 세포를 나타낸다. 또한, "활성 감소 (decrease in activity)" 또는 "감소된 활성 (decreased activity)"은 본래의 (original) 또는 야생형 (wild-type)의 효소 또는 폴리펩티드보다 더 낮은 활성을 갖는 분리된 효소 또는 폴리펩티드를 나타낸다. 활성 감소 또는 감소된 활성은 활성이 없는 것 (no activity)을 포함한다. 예를 들면, 변형된 (예, 유전적으로 조작된) 세포 또는 효소에 대한 기질로부터 생성물로의 효소 전환 활성이 상기 변형을 갖지 않은 세포 또는 효소, 예를 들면, 모세포 또는 "야생형 (wild-type)"의 세포 또는 효소의 효소 전환활성에 비하여 약 20% 이상, 약 30% 이상, 약 40% 이상, 약 50% 이상, 약 55% 이상, 약 60% 이상, 약 70% 이상, 약 75% 이상, 약 80% 이상, 약 85% 이상, 약 90% 이상, 약 95% 이상, 또는 약 100% 감소된 것일 수 있다. 효소 또는 세포의 감소된 활성은 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 확인될 수 있다. 상기 활성 감소는 변형되지 않은 유전자를 갖는 세포, 예를 들면, 모세포 또는 야생형 세포에 비하여, 효소가 발현되더라도 효소의 활성이 없거나 감소된 경우, 효소를 코딩하는 유전자가 발현되지 않거나 발현되더라도 본래 유전자 조작이 되지 않은 유전자에 비하여 발현량이 감소된 경우를 포함한다. 상기 감소된 활성을 갖는 세포는, 유전적 변형을 갖지 않은 세포에 비하여 하나 이상의 효소 또는 폴리펩티드의 활성을 감소시키는 유전적 변형 (genetic modification)을 갖는 것일 수 있다.
용어 "모세포 (parent cell)"는 본래 세포 (original cell), 예를 들면, 조작된 효모 세포에 대하여 동일 타입의 유전적으로 조작되지 않은 세포를 나타낸다. 특정한 유전적 변형에 대하여, 상기 "모세포"는 상기 특정 유전적 변형 (genetic modification)을 갖지 않은 세포이지만, 다른 상항에 대하여는 동일한 것일 수 있다. 따라서, 상기 모세포는 주어진 단백질 (예를 들면, 아세트알데히드를 아세틸-CoA로 전환하는 것을 촉매하는 효소와 약 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 단백질)의 증가된 활성을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포를 생산하는데 출발 물질 (starting material)로 사용된 세포일 수 있다.
용어 “모세포(parent cell)” 또는 “모균주 (parent strain)”는 해당 유전적 변형(subject genetic modification)을 위해 사용된 것일 수 있다. 상기 모세포는 상기 유전적 변형을 제외하고는 해당 세포(subject cell)와 동일하기 때문에, 상기 유전적 변형에 대한 기준 세포(reference cell)일 수 있다. 상기 “유전적 변형(genetic modification)”은 세포의 유전물질의 구성 또는 구조가 인위적으로 변경된 것을 의미한다. 상기 모세포는 해당 유전적 변형, 예를 들면 EDC의 활성이 증가되도록 하는 유전적 변형을 갖지 않는 세포일 수 있다. 상기 모세포는 모 효모 세포(parent yeast cell)일 수 있다.
용어 “야생형(wild-type)” 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드는 특정 유전적 변형을 갖지 않는 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드일 수 있고, 상기 유전적 변형은 유전적으로 조작된 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드를 수득할 수 있게 하는 것일 수 있다.
용어 "파괴 (disruption)"는 언급된 유전자 (referenced gene)의 발현이 감소되도록 하는 유전적 변형을 나타낸다. 상기 파괴는 언급된 유전자의 발현이 없도록 하는 유전적 변형 (이하, 유전자의 "불활성화 (inactivation)"이라고 한다.) 또는 유전자의 발현은 있으나 감소된 수준으로 발현되도록 하는 유전적 변형 (이하, 유전자의 "감쇄 (attenuation)"이라고 한다.)을 포함한다. 상기 불활성화는 유전자의 기능적 산물 (functional product)이 발현되지 않는 것뿐만 아니라 발현은 되지만 기능적 산물이 발현되지 않는 것을 포함한다. 상기 감쇄는 유전자의 기능적 산물의 발현양 감소를 포함한다. 즉, 상기 감쇄는 유전자의 순 발현량은 증가하였더라도 기능적 산물의 발현량이 감소되는 것을 포함한다. 여기서 유전자의 기능적 산물이란 모세포 또는 야생형 세포에서 상기 유전자의 산물 (예, 효소)이 갖는 생화학적 또는 생리적 기능 (예, 효소 활성)을 보유하고 있는 것을 말한다. 따라서, 상기 파괴는 유전자의 기능적 파괴 (functional disruption)를 포함한다. 상기 유전적 변형은 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 도입하는 변형, 모세포의 유전물질에 대한 하나 이상의 뉴클레오티드의 치환, 부가, 삽입, 또는 결실, 또는 모세포의 유전물질에 대한 화학적 변이를 포함한다. 그러한 유전적 변형은 언급된 종 (referenced species)에 대한 이질성 (heterologous), 동질성 (homologous), 또는 이질성 및 동질성 폴리펩티드를 위한 코딩 영역 (coding region) 및 그의 기능적 단편 (functional fragments thereof)에 대한 것을 포함한다. 또한, 상기 유전적 변형은 유전자 또는 오페론의 발현을 변경시키는 비코딩 조절 영역 (non-coding regulatory regions)의 변형을 포함한다. 비코딩 영역은 5'-비코딩 서열(5'-non coding sequence) 및/또는 3'-비코딩 서열(3'-non coding sequence)을 포함한다.
상기 유전자의 파괴는 상동 재조합, 지향된 돌연변이유발 (directed mutagenesis), 또는 분자 진화 (molecular evolution)와 같은 유전적 조작법에 의해 달성될 수 있다. 세포가 복수 개의 동일 유전자, 또는 유전자의 2 이상의 파라로그 (paralogs)를 포함한 경우, 하나 이상의 유전자는 파괴될 수 있다. 예를 들면, 상기 유전적 변형은 유전자의 일부 서열을 포함하는 벡터를 세포에 형질전환하고, 세포를 배양하여 상기 서열이 세포의 내인성 유전자와 상동 재조합이 일어나도록 하여 상기 유전자를 파괴되도록 한 후, 상동 재조합이 일어난 세포를 선별 마커를 사용하여 선별함으로써 이루어질 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어 "유전자"는 특정 단백질을 발현하는 핵산 단편을 의미하며, 5'-비코딩 서열 (5'-non coding sequence) 및/또는 3'-비코딩 서열 (3'-non coding sequence)의 조절 서열 (regulatory sequence)을 포함하거나 포함하지 않을 수 있다.
본 발명에서 사용된 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드의 "서열 동일성 (sequence identity)"은 특정 비교 영역에서 양 서열을 최대한 일치되도록 얼라인시킨 후 서열간의 아미노산 잔기 또는 염기의 동일한 정도를 의미한다. 서열 동일성은 특정 비교 영역에서 2개의 서열을 최적으로 얼라인하여 비교함으로써 측정되는 값으로서, 비교 영역 내에서 서열의 일부는 대조 서열 (reference sequence)과 비교하여 부가, 삭제되어 있을 수 있다. 서열 동일성 백분율은 예를 들면, 비교 영역 전체에서 두 개의 최적으로 정렬된 서열을 비교하는 단계, 두 서열 모두에서 동일한 아미노산 또는 핵산이 나타나는 위치의 갯수를 결정하여 일치된 (matched) 위치의 갯수를 수득하는 단계, 상기 일치된 위치의 갯수를 비교 범위 내의 위치의 총 갯수 (즉, 범위 크기)로 나누는 단계, 및 상기 결과에 100을 곱하여 서열 동일성의 백분율을 수득하는 단계에 의해 계산될 수 있다. 상기 서열 동일성의 퍼센트는 공지의 서열 비교 프로그램을 사용하여 결정될 수 있으며, 일례로 BLASTN(NCBI), CLC Main Workbench (CLC bio), MegAlignTM(DNASTAR Inc) 등을 들 수 있다.
여러 종의 동일하거나 유사한 기능이나 활성을 가지는 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드를 확인하는데 있어 여러 수준의 서열 동일성을 사용할 수 있다. 예를 들어, 50%이상, 55%이상, 60%이상, 65%이상, 70%이상, 75%이상, 80%이상, 85%이상, 90%이상, 95%이상, 96%이상, 97%이상, 98%이상, 99%이상 또는 100% 등을 포함하는 서열 동일성이다.
본 명세서에 사용된 용어 "외인성 (exogenous)"은 언급된 분자 (referenced molecule) 또는 언급된 활성 (referenced activity)이 숙주 세포로 도입된 것을 의미한다. 분자는 예를 들면, 숙주 염색체 내로의 삽입에 의하는 것과 같은 코딩 핵산 (encoding nucleic acid)의 숙주 유전 물질 내로의 도입 또는 플라스미드와 같은 비염색체 유전물질로서 도입될 수 있다. 코딩 핵산의 발현과 관련하여, 상기 용어 "외인성"은 상기 코딩 핵산이 개체 내로 발현 가능한 형태로 도입된 것을 나타낸다. 생합성 활성과 관련하여, 상기 용어 "외인성"은 숙주 모세포에 도입된 활성을 나타낸다. 그 기원 (source)는 예를 들면, 숙주 모세포에 도입된 후 언급된 활성을 발현하는 동질성 (homologous) 또는 이질성 (heterologous) 코딩 핵산일 수 있다. 그러므로, 용어 "내인성 (endogenous)"은 상기 숙주 세포에 존재하는 언급된 분자 또는 활성을 나타낸다. 비슷하게, 코딩 핵산의 발현과 관련하여, 상기 용어 "내인성"은 개체 내에 포함된 코딩 핵산의 발현을 나타낸다. 용어 "이질성 (heterologous)"은 언급된 종 외의 다른 기원으로부터의 분자 또는 활성을 나타내고 용어 "동질성 (homologous)"은 숙주 모세포로부터의 분자 또는 활성을 나타낸다. 따라서, 코딩 핵산의 외인성 발현은 이질성 (heterologous) 또는 동질성 (homologous) 코딩 핵산 중 어느 하나 또는 둘 다를 이용할 수 있다.
또한, 본 명세서에서 사용된 용어 "유전적 조작 (genetic engineering)" 또는 "유전적으로 조작된 (genetically engineered)"은 세포에 대하여 하나 이상의 유전적 변형 (genetic modification)을 도입하는 행위 또는 그에 의하여 만들어진 세포를 나타낸다.
본 명세서에 사용된 용어 락테이트(lactate)는 젖산(lactic acid) 자체뿐만 아니라, 음이온 형태, 그의 염, 용매화물, 다형체 또는 그 조합을 포함하는 것으로 해석된다. 상기 염은 예를 들면 무기산염, 유기산염 또는 금속염일 수 있다. 무기산염은 염산염, 브롬산염, 인산염, 황산염 또는 이황산염일 수 있다. 유기산염은 포름산염, 초산염, 아세트산염, 프로피온산염, 젖산염, 옥살산염, 주석산염, 말산염, 말레인산염, 구연산염, 푸마르산염, 베실산염, 캠실산염, 에디실염, 트리플루오로아세트산염, 벤조산염, 글루콘산염, 메탄술폰산염, 글리콜산염, 숙신산염, 4-톨루엔술폰산염, 갈룩투론산염, 엠본산염, 글루탐산염 또는 아스파르트산염일 수 있다. 금속염은 칼슘염, 나트륨염, 마그네슘염, 스트론튬염 또는 칼륨염일 수 있다.
일 양상은 모세포에 비하여, EDC 효소의 활성이 증가되어 있는, 락테이트 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포를 제공한다.
상기 EDC 효소는 mRNA-디캡핑의 인헨서 단백질(Enhancer of mRNA-decapping protein)일 수 있다. 상기 EDC는 DCP1 및 DCP2에 의한 decapping하는 mRNA를 자극하는 mRNA-결합 단백질일 수 있다. 상기 EDC는 EDC1 또는 EDC2일 수 있다. EDC2는 서열번호 1의 아미노산 서열과 약 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 아미노산 서열 동일성을 가진 아미노산 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 EDC2는 일례로 NP_010652.3의 NCBI 참조 번호를 갖는 것일 수 있다. EDC2를 코딩하는 유전자는 서열번호 2의 폴리뉴클레오티드 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. EDC1은 서열번호 3의 아미노산 서열과 약 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 아미노산 서열 동일성을 가진 아미노산 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 EDC1은 일례로 NP_011293.1의 NCBI 참조 번호를 갖는 것일 수 있다. EDC1을 코딩하는 유전자는 서열번호 4의 폴리뉴클레오티드 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드을 갖는 것일 수 있다.
상기 효모 세포는 상기 EDC 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형을 갖는 것일 수 있다. 상기 유전자의 발현 조절 서열은 상기 유전자 발현을 위한 프로모터 서열 또는 전사 종결자 서열일 수 있다. 상기 발현 조절 서열은 유전자 발현에 영향을 줄 수 있는 모티프를 코딩하는 서열일 수 있다. 상기 모티프는 예를 들면, 이차 구조-안정화 모티프, RNA 불안정화 모티프, 스플라이스-활성화 모티프, 폴리아데닐화 모티프, 아데닌-풍부 서열 (adenine-rich sequence), 또는 엔도뉴클레아제 인식 부위일 수 있다. 상기 프로모터 서열은 상기 EDC 단백질을 코딩하는 유전자와 작동가능하게 연결된 외인성 프로모터일 수 있다. 상기 프로모터는 구성적 프로모터(constitutive promoter)일 수 있다. 상기 프로모터는 Covalently linked Cell Wall protein 12 (CCW12), Pyruvate DeCarboxylase 1(PDC1), phosphoglycerate kinase (PGK1), Transcription enhancer factor- 1(TEF-1), glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (TDH1, TDH2 또는 TDH3), triose phosphate isomerase (TPI1), purine-cytosine permease (PCPL3), 또는 alcohol dehydrogenase (ADH1) 유전자 유래의 프로모터일 수 있다. 또한, 상기 발현 조절 서열은 변역 효율을 향상시키는 서열일 수 있다. 상기 번역 효율을 향상시키는 서열은 예를 들면 코작 컨센서스 서열(Kozak consensus sequence)와 같은 번역 과정의 개시를 향상시키는 서열일 수 있다.
또한, 상기 효모 세포는 상기 EDC 단백질을 코딩하는 유전자의 카피수 증가를 갖는 것일 수 있다. 상기 효모 세포는 상기 EDC 단백질을 코딩하는 외인성(exogenous) 유전자를 포함하는 것일 수 있다. 상기 외인성 유전자는 유전자에 작동 가능하도록 연결된 외인성 프로모터에 의해 적절히 조절되는 것일 수 있다. 상기 프로모터에 관해서는 상술한 바와 같다.
상기 효모 세포는 사카로마이세스 (Saccharomyces), 클루이베로마이세스 (Kluyveromyces), 캔디다 (Candida), 피치아 (Pichia), 이사첸키아 (Issatchenkia), 데바리오마이세스 (Debaryomyces), 자이고사카로마이세스 (Zygosaccharomyces), 쉬조사카로마이스세 (Shizosaccharomyces) 또는 사카로마이콥시스 (Saccharomycopsis) 속에 속하는 것일 수 있다. 사카로마이세스 속은 예를 들면, 사카로마이세스 세레비지애 (S. cerevisiae), 사카로마이세스 바야누스 (S. bayanus), 사카로마이세스 보울라디 (S. boulardii), 사카로마이세스 불데리 (S. bulderi), 사카로마이세스 카리오카누스 (S. cariocanus), 사카로마이세스 카리오쿠스 (S. cariocus), 사카로마이세스 체발리에리 (S. chevalieri), 사카로마이세스 다이레넨시스 (S. dairenensis), 사카로마이세스 엘립소이데우스 (S. ellipsoideus), 사카로마이세스 유바야뉴스 (S. eubayanus), 사카로마이세스 엑시거스 (S. exiguus), 사카로마이세스 플로렌티누스 (S. florentinus), 사카로마이세스 클루이베리 (S. kluyveri), 사카로마이세스 마티니에 (S. martiniae), 사카로마이세스 모나센시스 (S. monacensis), 사카로마이세스 노르벤시스 (S. norbensis), 사카로마이세스 파라독서스 (S. paradoxus), 사카로마이세스 파스토리아누스 (S. pastorianus), 사카로마이세스 스펜서로룸 (S. spencerorum), 사카로마이세스 투리센시스 (S. turicensis), 사카로마이세스 우니스포루스 (S. unisporus), 사카로마이세스 우바룸 (S. uvarum), 또는 사카로마이세스 조나투스 (S. zonatus)일 수 있다.
상기 효모 세포는 L-락테이트 생산능을 갖는 것일 수 있다. 상기 효모 세포는 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드의 활성을 갖는 것일 수 있다. 상기 효모 세포는 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 포함할 수 있다. 상기 효모 세포는 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드의 활성이 증가되어 있는 것일 수 있다. 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드는 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 것을 촉매하는 효소일 수 있으며, 이는 L-락테이트 데히드로게나제 (LDH)일 수 있다. 상기 L-락테이트 데히드로게나제는 NAD(P)-의존성 효소일 수 있다. 또한 상기 L-락테이트 데히드로게나제는 스테레오-특이적 (specific)일 수 있다. 상기 NAD(P)-의존성 효소는 L-락테이트에 작용하는 것인 EC 1.1.1.27로 분류되는 효소일 수 있다.
상기 락테이트 생산능을 갖는 효모 세포는 락테이트 데히드로게나제의 활성이 증가되어 있는 것일 수 있다. 상기 효모 세포는 적어도 하나의 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하며, 상기 유전자는 외인성 (exogenous)일 수 있다. 상기 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 박테리아, 효모, 진균, 포유동물 또는 파충류로부터 유래한 것을 포함할 수 있다. 상기 폴리뉴클레오티드는 락토바실루스 헬베티쿠스 (Lactobacillus helveticus), L. 불가리쿠스 (L. bulgaricus), L. 존소니 (L. johnsonii), L. 플란타룸(L. plantarum), 일본자라 (Pelodiscus sinensis japonicus), 오리너구리 (Ornithorhynchus anatinus), 병코돌고래 (Tursiops truncatus), 노르웨이산집쥐 (Rattus norvegicus), 개구리 (Xenopus laevis), 및 보스 타우루스 (Bos taurus)로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상의 LDH를 코딩하는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 보스 타우루스로부터 유래한 락테이트 데히드로게나제, 일본자라로부터 유래한 락테이트 데히드로게나제, 오리너구리로부터 유래한 락테이트 데히드로게나제, 병코돌고래로부터 유래한 락테이트 데히드로게나제, 및 노르웨이산집쥐로부터 유래한 락테이트 데히드로게나제 는 각각 서열번호 13, 14, 15, 16, 및 17의 아미노산 서열과 60%이상, 또는 70%이상, 80%이상, 90%이상, 95%이상, 96%이상, 97%이상, 98%이상, 또는 99%이상의 서열 동일성을 가지는 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 일례로, 상기 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 유전자는 서열번호 13, 15, 17, 19, 및 21의 아미노산 서열과 95%이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 또는 상기 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 유전자는 서열번호 18의 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 유전자는 벡터 내 포함될 수 있다. 상기 벡터는 복제개시점, 프로모터, 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 및 터미네이터를 포함할 수 있다. 상기 복제 개시점은 효모 자가복제 서열 (autonomous replication sequence, ARS)을 포함할 수 있다. 상기 효모 자가복제서열은 효모 동원체 서열 (centrometric sequence, CEN)에 의해 안정화될 수 있다. 상기 프로모터는 CYC (cytochrome c), TEF (transcription elongation factor), GPD, ADH, 및 CCW12 유전자의 프로모터로 이루어진 군에서 선택되는 것일 수 있다. 있다. 상기 CYC (cytochrome c), TEF (transcription elongation factor), GPD, ADH, 및 CCW12 유전자의 프로모터는 각각 서열번호 23, 24, 25, 26, 및 27의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 터미네이터는 PGK1 (phosphoglycerate kinase 1), CYC1 (cytochrome c 1), GAL1 (galactokinase 1), 및 TPS1 (trehalose-6-phosphate synthase 1) 유전자의 터미네이터로 이루어진 군으로부터 선택되는 것일 수 있다. CYC1 터미네이터는 서열번호 28의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 벡터는 선별 마커를 더 포함할 수 있다. 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드는 효모 세포의 특정 위치에 게놈에 포함될 수 있다. 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 세포 내에서 활성 단백질을 생산하기 위해 기능하는 경우, 상기 폴리뉴클레오티드는 세포 내에서 "기능성 (functional)"인 것으로 고려된다.
상기 효모 세포는 단일의 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드, 또는 2 내지 10 카피수의 복수의 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 상기 효모 세포는 예를 들면 1 내지 8, 1 내지 7, 1 내지 6, 1 내지 5, 1 내지 4, 또는 1 내지 3 카피의 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 상기 효모 세포가 복수의 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 경우, 각각의 폴리뉴클레오티드는 동일하거나 둘 이상의 상이한 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 조합일 수 있다. 외인성 락테이트 데히드로게나제를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 복수의 카피는 숙주 세포의 게놈 내에 동일한 유전자좌 (locus) 또는 여러 유전자좌에 포함될 수 있고, 각 카피의 프로모터나 터미네이터가 동일하거나 상이할 수 있다.
상기 효모 세포는 락테이트로의 대사 산물의 흐름을 방해하는 경로의 활성이 감소된 것일 수 있다. 또한 상기 효모 세포는 락테이트로의 대사 산물의 흐름을 촉진하거나 도와주는 경로의 활성이 증가된 것일 수 있다.
상기 효모 세포는 모세포에 비하여, 추가적으로 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드, 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드, 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드, 아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드, 알데히드 데히드로게나제, 또는 그의 조합의 활성이 감소되도록 하는 유전적 변형을 갖는 것일 수 있다.
상기 효모 세포는 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자가 파괴된 변이를 갖는 것일 수 있다. 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드는 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 것을 촉매하는 효소일 수 있으며, EC 4.1.1.1로 분류되는 효소일 수 있다. 상기 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드는 예를 들면, 피루베이트 데카르복실라제 (pyruvate decarboxylase)일 수 있으며, PDC1일 수 있다. 상기 피루베이트로부터 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드는 서열번호 5의 아미노산 서열과 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다. 상기 피루베이트로부터 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 5의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열, 또는 서열번호 6의 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 유전자는 pdc1일 수 있다.
상기 효모 세포는 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자가 파괴된 변이를 갖는 것일 수 있다. 상기 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드는 시토크롬 c-의존성 효소일 수 있다. 상기 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드는 D-락테이트에 작용하는 것인 EC 1.1.2.4, 또는 L-락테이트에 작용하는 것인 EC 1.1.2.3으로 분류되는 효소일 수 있다. 상기 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드는 락테이트 시토크롬-c 옥시도리덕타제일 수 있고, CYB2 (CAA86721.1), CYB2A, 또는 CYB2B일 수 있다. 상기 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드는 서열번호 7의 아미노산 서열과 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다. 상기 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 7의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열, 또는 서열번호 8의 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 효모 세포는 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자가 파괴된 변이를 갖는 것일 수 있다. 상기 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드는 시토졸성 글리세롤-3-포스페이트 데히드로게나제일 수 있으며, NADH 또는 NADP의 NAD+ 또는 NADP+로의 산화를 이용하여 디히록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로의 환원을 촉매하는 효소일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 EC 1.1.1.8에 속하는 것일 수 있다. 상기 시토졸성 글리세롤-3-포스페이트 데히드로게나제는 GPD1일 수 있다. 상기 시토졸성 글리세롤-3-포스페이트 데히드로게나제는 서열번호 9의 아미노산 서열과 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 시토졸성 글리세롤-3-포스페이트 데히드로게나제를 코딩하는 유전자는 서열번호 9의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열, 또는 서열번호 10의 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 효모 세포는 피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자가 파괴된 변이를 갖는 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 EC. 1.1.2.4에 속하는 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 D-락테이트 데히드로게나제(D-lactate dehydrogenase, DLD) 일 수 있다. 상기 D-락테이트 데히드로게나제는 D-락테이트 페리시토크롬 C 옥시도리덕타제(D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)로 지칭될 수 있다. 상기 폴리펩티드는 DLD1일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 서열번호 11의 아미노산 서열과 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다. 상기 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 11의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열일 수 있다. 일례로 상기 유전자는 서열번호 12의 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 효모 세포는 아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자가 파괴된 변이를 갖는 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 아세트알데히드에서 에탄올로 전환을 촉매하는 효소일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 EC. 1.1.1.1에 속하는 것일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 NADH로부터 NAD+로의 전환을 이용하여, 아세트알데히드에서 에탄올로의 전환을 촉매하는 효소일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 알코올 데히드로게나제 (alcohol dehydrogenase; Adh)일 수 있으며, Adh1, Adh2, Adh3, Adh4, Adh5, 또는 Adh6일 수 있다. 상기 폴리펩티드는 서열번호 16의 아미노산 서열과 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상, 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 또는 99% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다. 상기 폴리펩티드를 코딩하는 유전자는 서열번호 16의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열, 또는 서열번호 17의 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있다. 상기 유전자는 일례로 adh1, adh2, adh3, adh4, adh5, 또는 adh6일 수 있다.
또한 일례로 효모 세포는 그 모세포에 비하여 EDC의 활성이 증가되어 있고; 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 또는 그 조합이 파괴된 변이를 갖고; 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 갖는 효모 세포일 수 있다. 상기 효모 세포는 사카로마이세스 세레비지애일 수 있다.
다른 양상은 상기한 효모 세포를 포함하는, 락테이트를 생산하는데 사용하기 위한 조성물을 제공한다. 상기 효모 세포에 관해서는 상술한 바와 같다.
다른 양상은 효모 세포에 EDC 효소를 코딩하는 유전자를 과발현시키는 단계; 및 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 도입하는 단계;를 포함하는 락테이트를 생산하는 효모 세포를 제조하는 방법을 제공한다.
상기 락테이트를 생산하는 효모 세포를 제조하는 방법은 효모 세포에 EDC 효소를 코딩하는 유전자를 과발현시키는 단계를 포함할 수 있다. 상기 단계에 있어서, “효모 세포”, “EDC 효소”, 및 “EDC 효소를 코딩하는 유전자”에 대하여는 상술한 바와 같다.
EDC 효소를 코딩하는 유전자를 과발현시키는 단계는 EDC 효소를 과발현시킬 수 있다. EDC 효소의 과발현은 상기 EDC 효소를 코딩하는 유전자를 과발현시킨 효모 세포가 그 모세포에 비해 상기 EDC 효소 활성이 동일한 조건 하에서 모세포에 비해 더 많은 양으로 또는 다소 더 높은 정상 상태 수준으로 생산됨을 의미한다. 또한 이는 상기 EDC 효소를 코딩하는 mRNA가 동일한 조건 하에서 모세포에 비해 더 많은 양으로 또는 다시 다소 더 높은 정상 상태 수준으로 생산됨을 의미한다. 따라서 EDC 효소의 과발현은 적합한 효소 분석을 사용하여 상기 숙주 세포에서 상기 효소의 비활성 수준을 측정함으로써 측정될 수 있다. 상기 과발현시키는 단계는 활성을 증가시키는 유전적 변형을 갖는 것일 수 있다.
상기 락테이트를 생산하는 효모 세포를 제조하는 방법은 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 도입하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 단계에 있어서, “락테이트로 전환하는 폴리펩티드”, 및 “락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자”에 대하여는 상술한 바와 같다. 상기 유전자의 도입은 벡터와 같은 비히클을 매개하여 이루어질 수 있다. 상기 도입은 상기 유전자가 게놈에 통합되지 않은 임시적 도입이거나 게놈에 삽입되는 것일 수 있다. 상기 도입은 예를 들면, 목적하는 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 삽입된 벡터를 상기 세포로 도입한 후, 상기 벡터가 세포 내에서 복제되거나 상기 폴리뉴클레오티드가 게놈으로 통합됨으로써 이루어질 수 있다.
또한, 상기 락테이트를 생산하는 효모 세포를 제조하는 방법은 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 또는 그 조합을 파괴하는 단계를 더 포함할 수 있다. 상기 단계에 있어서, “피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드”, “피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자”, “락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드”, “락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자”, “디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드”, “디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자”, “피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드”, “피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자”, “아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드”, “아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자”, 및 “파괴”에 대하여는 상술한 바와 같다.
다른 양상은 상기한 효모 세포를 배양하는 단계를 포함하는, 락테이트를 생산하는 방법을 제공한다. 상기 효모 세포에 관해서는 상술한 바와 같다.
상기 배양은 탄소원, 예를 들면, 글루코스를 함유하는 배지에서 수행될 수 있다. 효모 세포 배양에 사용되는 배지는 적절한 보충물을 함유한 최소 또는 복합 배지와 같은, 숙주 세포의 성장에 적합한 임의의 통상적인 배지일 수 있다. 적합한 배지는 상업적인 판매자로부터 입수 가능하고 또는 공지된 제조법에 따라 제조될 수 있다. 상기 배양에 사용되는 배지는 특정한 효모 세포의 요구조건을 만족시킬 수 있는 배지일 수 있다. 상기 배지는 탄소원, 질소원, 염, 미량 원소, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 배지일 수 있다.
상기 유전적으로 조작된 효모 세포에서 락테이트를 수득하기 위하여 배양 조건을 적절히 조절할 수 있다. 상기 세포는 증식을 위하여 호기성 조건에서 배양할 수 있다. 그 후 락테이트를 생산하기 위하여 상기 세포를 미세호기 조건 또는 혐기 조건에서 배양할 수 있다. 용어 "혐기 조건 (anaerobic conditions)"은 산소가 없는 환경을 나타낸다. 용어 "미세호기 조건 (microaerobic conditions)"은 배양 또는 성장 조건에 참조되어 사용되는 경우, 배지 중의 용존산소 (dissolved oxygen: DO) 농도가 액체 배지 중의 용존 산소에 대한 포화 (saturation)의 0% 보다 크고 약 10%이하로 유지되는 것을 의미한다. 미세호기 조건은 또한, 1% 미만의 산소를 가진 분위기 (atmosphere)로 유지된 봉인된 챔버 (sealed chamber) 내에 액체 배지 중 또는 고체 아가 플레이트 상에서 세포를 성장시키거나 유지시키는 (resting) 것을 포함한다. 산소의 농도는 예를 들면, 배양물을 N2/CO2 혼합물 또는 다른 적당한 비산소 기체로 스파징함으로써 유지될 수 있다. 상기 산소 조건은 용존산소 (dissolved oxygen: DO) 농도가 0% 내지 10%, 예를 들면 0 내지 8%, 0 내지 6%, 0 내지 4%, 또는 0 내지 2%로 유지하는 것을 포함한다.
용어 "배양 조건"은 효모 세포를 배양하기 위한 조건을 의미한다. 이러한 배양 조건은 예를 들어, 효모 세포가 이용하는 탄소원, 질소원 또는 산소 조건일 수 있다. 효모 세포가 이용할 수 있는 탄소원은 단당류, 이당류 또는 다당류가 포함된다. 상기 탄소원은 글루코오즈, 프럭토오즈, 만노오즈, 또는 갈락토오즈일 수 있다. 효모 세포가 이용할 수 있는 질소원은 유기 질소 화합물, 또는 무기 질소 화합물일 수 있다. 질소원의 예는 아미노산, 아미드, 아민, 질산염, 또는 암모늄염일 수 있다.
상기 락테이트를 생산하는 방법은 배양물로부터 락테이트를 회수하는 단계를 더 포함할 수 있다.
배양물로부터의 락테이트의 회수는 당해 기술분야에서 알려진 통상적인 방법에 의하여 분리될 수 있다. 이러한 분리 방법은 원심분리, 여과, 이온교환크로마토그래피 또는 결정화일 수 있다. 예를 들면, 배양물을 저속 원심분리하여 바이오매스를 제거하고 얻어진 상등액을, 이온교환크로마토그래피를 통하여 분리할 수 있다.
일 양상에 따른 효모 세포에 의하면, 락테이트를 효율적으로 생산하는데 사용될 수 있다.
일 양상에 따른 락테이트를 생산하는 효모 세포를 제조하는 방법에 의하면, 락테이트를 생산하는 효모 세포를 효율적으로 제조할 수 있다.
일 양상에 따른 락테이트를 생산하는 방법에 의하면, 락테이트를 효율적으로 생산할 수 있다.
도 1은 pCtB1 벡터를 나타내는 도면이다.
도 2는 pCS-Ex1.1 벡터를 나타내는 도면이다.
도 3은 pCS-Ex1 벡터를 나타내는 도면이다.
도 2는 pCS-Ex1.1 벡터를 나타내는 도면이다.
도 3은 pCS-Ex1 벡터를 나타내는 도면이다.
이하 본 발명을 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1. L-
락테이트
생산 균주의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주(MATαura3-52; trp1-289; leu2-3,112; his3Δ1; MAL2-8C; SUC2, EUROSCARF accession number: 30000B)를 락테이트 생산 균주로 만들기 위해, 알코올 발효의 주요 효소인 피루베이트 데카르복실라제 (pyruvate decarboxylase: pdc1) 유전자와 알코올 데히드로게나제 (alcohol dehydrogenase: adh1) 유전자, 글리세롤 생합성의 주요 효소인 NAD-의존성 글리세롤-3-포스페이트 데히드로게나제 (NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase: gpd1) 유전자, 및 락테이트 분해 효소인 L-락테이트 시토크롬-c 옥시도리덕타제 (L-lactate cytochrome-c oxidoreductase 2: cyb2) 유전자와 D-락테이트 데히드로게나제 (D-lactate dehydrogenase: dld1) 유전자를 결실시키고, adh1 유전자 위치에 보스 타우루스(Bos Taurus) 유래의 락테이트 데히드로게나제 (lactate dehydrogenase: BtLDH) 유전자를 삽입하여 락테이트 생산 균주인 MD1304 균주를 제작하였다. 각 과정은 다음과 같다.
1.1
피루베이트
데카르복실라제
(
pdc1
) 결실 균주의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 27 및 28의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 260 bp의 DNA 조각(이하 '조각 1'이라고 지칭)을 얻었다. 또한 상기 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 29 및 30의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 257 bp의 DNA 조각(이하 '조각 2'라고 지칭)을 얻었다. 또한 pCtB1 벡터 (GenBank Accession Number KJ922019)를 주형으로 하고 T7 프라이머 및 T3 프라이머의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 1,955 bp의 DNA 조각(이하 '조각 3'이라고 지칭)을 얻었다. 도 1은 pCtB1 벡터 (GenBank Accession Number KJ922019)를 나타내는 도면이다. 상기 pCtB1 벡터는 서열번호 67의 폴리뉴클레오티드를 갖는다. 이렇게 얻어진 DNA 조각들, 즉 조각 1, 2, 및 3을 모두 섞어 서열번호 27 및 30의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 2,414 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 PDC1 유전자를 URA3 terminator BLAST로 치환하는 DNA 조각이다.
얻어진 DNA 조각을 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 야생형 균주에서는 2,904 bp의 DNA 조각이 확인되는 서열번호 31 및 32의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 2,947 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주를 수득하였다.
수득된 균주를 YPD (Yeast Extract 10g, Bacto Peptone 20g, D-glucose 20g /L) 배지에서 하루동안 종균 배양한 후, 5-FOA 배지 (Yeast Nitrogen Base 6.7g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92g, uracil 0.1g, D-glucose 20g, 5-fluoroorotic acid 1g, Bacto Agar 20g /L)에 도말하여 생장하는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 다시 서열번호 31 및 32의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 1,553 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주, 즉 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1) 균주 (이하 'MD1002 균주'로 지칭)를 수득하였다.
1.2
NAD
-의존성 글리세롤-3-
포스페이트
데히드로게나제
(
gpd1
) 결실 균주의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA을 주형으로 하고 서열번호 33 및 34의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 278 bp의 DNA 조각(이하 '조각 4'라고 지칭)을 얻었다. 또한 상기 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 35 및 36의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 446 bp의 DNA 조각(이하 '조각 5'라고 지칭)을 얻었다. 또한 pCtB1 벡터 (GenBank Accession Number KJ922019)를 주형으로 하고 T7 프라이머 및 T3 프라이머의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 1,955 bp의 DNA 조각(이하 '조각 6'이라고 지칭)을 얻었다. 이렇게 얻어진 DNA 조각들, 즉 조각 4, 5, 및 6을 모두 섞어 서열번호 33 및 36의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 2,621 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 GPD1 유전자를 URA3 terminator BLAST로 치환하는 DNA 조각이다.
얻어진 DNA 조각을 상기 MD1002 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서, 야생형 균주 또는 MD1002 균주에서는 2,160 bp의 DNA 조각이 확인되는 서열번호 37 및 38의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 2,860 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주를 확보하였다. 확보된 균주를 YPD (Yeast Extract 10g, Bacto Peptone 20g, D-glucose 20g /L) 배지에서 하루 동안 종균 배양한 후, 5-FOA 배지 (Yeast Nitrogen Base 6.7g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92g, uracil 0.1g, D-glucose 20g, 5-fluoroorotic acid 1g, Bacto Agar 20g /L)에 도말하여 생장하는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 다시 서열번호 37 및 38을 이용한 PCR을 수행하여 1,466 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주, 즉 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1 Δgpd1) 균주(이하 'MD1228 균주'로 지칭)를 수득하였다.
1.3 L-
락테이트
시토크롬
-c
옥시도리덕타제
(
cyb2
) 결실 균주의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 39 및 40의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 355 bp의 DNA 조각(이하 '조각 7'이라고 지칭)을 얻었다. 또한 상기 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 41 및 42의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 378 bp의 DNA 조각(이하 '조각 8'이라고 지칭)을 얻었다. 또한 pCtB1 벡터 (GenBank Accession Number KJ922019)를 주형으로 하고 T7 프라이머 및 T3 프라이머의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 1,955 bp의 DNA 조각(이하 '조각 9'라고 지칭)을 얻었다. 이렇게 얻어진 DNA 조각들, 즉 조각 7, 8, 및 9를 모두 섞어 서열번호 39 및 42의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 2,630 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 CYB2 유전자를 URA3 terminator BLAST로 치환하는 DNA 조각이다.
얻어진 DNA 조각을 MD1128 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 야생형 균주, MD1002 균주, 또는 MD1228 균주에서는 2,676 bp의 DNA 조각이 확인되는 서열번호 43 및 44의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 2,891 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주를 확보하였다. 확보된 균주를 YPD (Yeast Extract 10g, Bacto Peptone 20g, D-glucose 20g /L) 배지에서 하루 동안 종균 배양한 후, 5-FOA 배지 (Yeast Nitrogen Base 6.7g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92g, uracil 0.1g, D-glucose 20g, 5-fluoroorotic acid 1g, Bacto Agar 20g /L)에 도말하여 생장하는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 다시 서열번호 43 및 44의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 1,497 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주 즉, 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1, Δgpd1, Δcyb2) 균주(이하 'MD1258 균주'라고 지칭)를 수득하였다.
1.4 D-
락테이트
데히드로게나제
(
dld1
) 결실 균주의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA을 주형으로 하고 서열번호 45 및 46의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 366 bp의 DNA 조각(이하 '조각 10'이라고 지칭)을 얻었다. 또한 같은 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 47 및 48의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 365 bp의 DNA 조각(이하 '조각 11'이라고 지칭)을 얻었다. 또한 pCtB1 벡터 (GenBank Accession Number KJ922019)를 주형으로 하고 T7 프라이머 및 T3 프라이머의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 1,955 bp의 DNA 조각(이하 '조각 12'라고 지칭)을 얻었다. 이렇게 얻어진 DNA 조각들, 즉 조각 10, 11, 및 12를 모두 섞어 서열번호 45 및 48의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 2,628 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 DLD1 유전자를 URA3 terminator BLAST로 치환하는 DNA 조각이다.
얻어진 DNA 조각을 MD1258 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 야생형 균주, MD1002 균주, MD1228 균주, 또는 MD1258 균주에서는 2,998 bp의 DNA 조각이 확인되는 서열번호 49 및 50의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 3,209 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주를 확보하였다. 확보된 균주를 YPD (Yeast Extract 10g, Bacto Peptone 20g, D-glucose 20g /L) 배지에서 하루동안 종균 배양한 후, 5-FOA 배지 (Yeast Nitrogen Base 6.7g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92g, uracil 0.1g, D-glucose 20g, 5-fluoroorotic acid 1g, Bacto Agar 20g /L)에 도말하여 생장하는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 다시 서열번호 49 및 50의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 1,815 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주 즉, 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1, Δgpd1, Δcyb2, Δdld1) 균주 (이하 'MD1257 균주'라고 지칭)를 수득하였다.
1.5
락테이트
데히드로게나제
(
LDH
) 과발현 벡터의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 51 및 52의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 CCW12 프로모터를 포함하는 1,605 bp의 DNA 조각을 얻었다. 이 DNA 조각을 KpnI 으로 처리한 pCtB1 벡터와 섞어 In-fusion 키트를 이용하여 클로닝하여 효모 이목적 과발현 벡터인 pCtB1-CCW12 벡터 (이하 'MD0922 벡터'라고 지칭)를 얻었다. 얻어진 MD0922 벡터를 KpnI과 SacI으로 처리한 후, 서열번호 18로 합성된 보스 타우루스 유래의 락테이트 데히드로게나제 유전자 DNA 조각(이하 'BtLDH'라고 지칭)과 섞어 In-fusion 키트를 이용하여 pCS-Ex1.1 벡터에 클로닝하여 효모에서 락테이트 데히드로게나제 유전자를 과발현하는 양목적 벡터인 pCS-Ex1.1 BtLDH 벡터(이하 'MD1188' 벡터라고 지칭)를 얻었다. 상기 BtLDH 유전자는 CCW12 프로모터 하에서 전사되도록 하였다. 도 2는 pCS-Ex1.1 벡터를 나타내는 도면이다.
1.6 알코올
데히드로게나제
(
adh1
) 결실 및
락테이트
생산 균주의 제작
사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 53 및 54의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 333 bp의 DNA 조각 (이하 '조각 13'이라고 지칭)을 얻었다. 또한 같은 게놈 DNA를 주형으로 하고 서열번호 55 및 56의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 397 bp의 DNA 조각(이하 '조각 14'라고 지칭)을 얻었다. 또한 상기 MD1188 벡터를 주형으로 하고 T7 프라이머 및 T3 프라이머의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 4,422 bp의 DNA 조각(이하 '조각 15'라고 지칭)을 얻었다. 이렇게 얻어진 DNA 조각들, 즉 조각 13, 14, 및 15를 모두 섞어 서열번호 53 및 56의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 5,094 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 ADH1 유전자를 CCW12 프로모터-BtLDH 유전자-TPS1 터미네이터-URA3 terminator BLAST로 치환하는 DNA 조각이다.
얻어진 DNA 조각을 MD1257 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 야생형 균주, MD1002 균주, MD1228 균주, MD1258 균주, 또는 MD1257 균주에서는 1,918 bp의 DNA 조각이 확인되는 서열번호 57 및 58의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 5276 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주를 확보하였다. 확보된 균주를 YPD (Yeast Extract 10g, Bacto Peptone 20g, D-glucose 20g /L) 배지에서 하루동안 종균 배양한 후, 5-FOA 배지 (Yeast Nitrogen Base 6.7g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92g, uracil 0.1g, D-glucose 20g, 5-fluoroorotic acid 1g, Bacto Agar 20g /L)에 도말하여 생장하는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 다시 서열번호 57 및 58의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 3,882 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주, 즉 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1, Δgpd1, Δcyb2, Δdld1, Δadh1::Btldh) 균주 (이하 'MD1304 균주'라고 지칭)를 수득하였다.
실시예
2.
EDC2
과발현 균주의 제작
2.1
EDC2
과발현 벡터의 제작
락테이트 생산균주인 MD1304 균주에서 EDC2 유전자를 과발현하기 위하여 EDC2 과발현 벡터를 제작하였다. 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주의 게놈 DNA을 주형으로 하고 서열번호 59 및 60의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 EDC2 유전자를 포함하는 479 bp의 DNA 조각을 얻었다. 이 DNA 조각을 pRS426GPD 벡터에 클로닝하기 위해 XbaI과 XhoI으로 처리한 pRS426GPD 벡터 DNA와 섞어 In-fusion 키트를 이용하여 클로닝하여 효모 EDC2 과발현 벡터인 pRS426GPD EDC2 벡터를 얻었다. 그 후 얻어진 pRS426GPD EDC2 벡터로부터 서열번호 61 및 62의 프라이머 조합을 이용한 PCR을 수행하여 1,168 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 GPD 프로모터-EDC2 유전자를 pCtB1으로 클로닝하기 위한 DNA 조각이다. 이 DNA 조각을 KpnI과 SacI으로 처리한 pCtB1 벡터 DNA와 섞어 In-fusion 키트를 이용하여 pCS-Ex1에 클로닝하여 효모 이목적 EDC2 과발현 벡터인 MD1152 벡터(pCS-Ex1 EDC2 벡터)를 얻었다. 도 3은 pCS-Ex1 벡터를 나타내는 도면이다. 상기 EDC2 유전자는 GPD 프로모터 하에서 전사되도록 하였다.
2.2
EDC2
과발현 균주, 및 대조군 균주의 제작
락테이트 생산균주인 MD1304 균주에서 EDC2 유전자를 과발현하기 위하여 EDC2 과발현 유전자 카세트를 유전자 기능이 없는 것으로 알려져 있는 PDC6 유전자와 대체하여 삽입하였다. 효모 이목적 EDC2 과발현 벡터인 MD1152 벡터를 주형으로 하고 서열번호 63 및 64의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 3,057 bp의 DNA 조각을 얻었고, 이는 PDC6 유전자를 GPD 프로모터-EDC2-TPS1 터미네이터-URA3 terminator BLAST로 치환하기 위한 DNA이다.
얻어진 DNA 조각을 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 야생형 균주에서는 2,300 bp의 DNA 조각이 확인되는, 서열번호 65 및 66의 프라이머를 이용한 PCR을 수행하여 3,429 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주, 즉 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1, Δgpd1, Δcyb2, Δdld1, Δadh1::Btldh, Δpdc6::EDC2) 균주 (이하 'MD1304/EDC2 균주'라고 지칭)를 수득하였다.
대조군 균주를 제작하기 위하여, 빈 pCtB1 벡터를 주형으로 하고 서열번호 63 및 64의 프라이머 세트를 프라이머로 한 PCR을 수행하여 증폭 산물로 2,029 bp의 DNA 조각을 얻었다. 얻어진 DNA 조각을 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D 야생형 균주에 형질도입한 후, 우라실이 포함되어 있지 않은 최소 배지 (SD-URA; Yeast Nitrogen Base 6.7 g, Synthetic Drop-out without uracil 1.92 g, D-glucose 20 g, Bacto Agar 20 g /L)에서 자라는 균주를 선별하였다. 선별된 균주 중에서 야생형 균주에서는 2,300 bp의 DNA 조각이 확인되는 서열번호 65 및 66의 프라이머를 이용한 PCR을 수행하여 2,401 bp의 DNA 조각이 확인되는 균주, 즉 사카로마이세스 세레비지애 CEN.PK2-1D (Δpdc1, Δgpd1, Δcyb2, Δdld1, Δadh1::Btldh, Δpdc6) 균주(이하 'MD1304/Δpdc6 균주'라고 지칭)를 수득하였다.
실시예
3.
EDC2
과발현 균주의
락테이트
생산능
평가
EDC2 유전자의 과발현이 락테이트 생산능에 미치는 영향을 평가하기 위하여 통상적으로 실시되는 배치 플라스크 테스트를 진행하였다. 배치 플라스크 테스트를 수행하기 위하여 지수적 생장 단계에 있는 MD1304/Δpdc6 균주와 MD1304/EDC2 균주를 회수하여 배치 플라스크 테스트용 배지인 YPD8 배지 (Yeast Extract 10g, Bacto Peptone 20g, D-Glucose 80g / 1L)에 세포 농도가 600 nm에서 흡광도 4.0이 되도록 접종하였다. 이 세포-배지 혼합액을 공기 중 습도가 95% 이상이고 산소 농도가 2.5%로 유지되고 있는 미호기 상태의 배양기에 넣고 충분히 교반하면서 30 ℃에서 배양하였다.
그 결과 표 1에 나타낸 바와 같이, EDC2가 과발현된 MD1304/EDC2 균주가 대조군인 MD1304/Δpdc6 균주에 비해 더 높은 락테이트 생산능 및 수율을 갖는 것을 확인하였다.
균주 | O 시간 | 20 시간 | 40 시간 | 71 시간 | |
MD1304/ㅿpdc6 | OD600 | 3.97 ± 0.01 | 7.85 ± 0.27 | 10.96 ± 0.25 | 11.64 ± 0.18 |
D-글루코스 (g/L) | 84.8 ± 2.7 | 52.9 ± 1.2 | 40.5 ± 1.6 | 38.9 ± 0.8 | |
L-락테이트 (g/L) | 0.2 ± 0.1 | 17.7 ± 0.5 | 25.2 ± 0.6 | 25.5 ± 0.7 | |
수율 (g/g%) | - | 55 ± 3.7 | 56.6 ± 3.0 | 55.2 ± 1.4 | |
MD1304/EDC2 | OD600 | 4.04 ± 0.10 | 6.89 ± 0.23 | 9.17 ± 0.98 | 10.91 ± 0.48 |
D-글루코스 (g/L) | 84.8 ± 2.7 | 50.8 ± 1.5 | 35.9 ± 1.6 | 25.2 ± 0.3 | |
L-락테이트 (g/L) | 0.2 ± 0.1 | 21.3 ± 0.3 | 31.2 ± 0.9 | 35.4 ± 0.2 | |
수율 (g/g%) | - | 62.1 ± 2.0 | 63.5 ± 3.1 | 59.1 ± 0.6 | |
ㅿ(EDC2) | OD600 | - | - 12.2% | -16.3% | -6.3% |
D-글루코스 (g/L) | - | + 6.6% | + 10.6% | +29.7 % | |
L-락테이트 (g/L) | - | + 20.4 % | + 24.1% | + 38.8% | |
수율 (g/g%) | - | + 12.9% | + 12.2% | + 7.1% |
* Average ± S.D (n=3)
상기 표 1에서 ㅿ(EDC2)의 OD600, D-글루코스, L-락테이트, 및 수율의 값은 MD1304/ㅿpdc6에 비하여, EDC2의 활성이 증가된 MD1304/EDC2의 증가분을 나타낸 것이다.
<110> Samsung Electronic Co.Ltd
<120> Genetically engineered yeast cell having enhanced EDC activity
and producing lactate, method for producing yeast cell, and
method for producing lactate using the same
<130> PN106329KR
<160> 67
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 145
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 1
Met Gly Ser Glu Thr Lys His Ser Ala Lys Val Lys Ile Val Thr Arg
1 5 10 15
Glu Ser Pro Pro Ser Ala Lys Glu His Met Arg Pro Thr Lys Thr Gln
20 25 30
Ile Leu Val Pro Pro Thr Gln Ser Leu Pro Asn Gly Lys Lys Pro Asn
35 40 45
Phe Gly Lys Ser Thr Lys Gln Arg Arg Glu Pro Arg Glu Arg Thr Ser
50 55 60
Lys Thr Gly His Glu Asp Asp Lys Ala Thr Met Val Thr Val Asn Ile
65 70 75 80
Asp Ala Phe Leu His Asp Lys Ala Pro Lys Lys Lys Ser Cys Lys Tyr
85 90 95
Lys Lys Lys Lys Thr Arg Gln Tyr Gln Asp Arg Ala Ala Ala Ser Ile
100 105 110
Asp Ser Lys Pro His Val Ala Gly His Thr Ala Phe Ala Gly Ala Ser
115 120 125
Phe Thr Thr Asp Ile Pro His Glu Ala Ala Leu Pro Lys Pro Ser Phe
130 135 140
Val
145
<210> 2
<211> 438
<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 2
atgggttccg agacaaaaca ttctgcaaaa gtcaagattg tcacaaggga aagtcctcct 60
tccgccaagg agcacatgcg ccccactaaa actcaaatat tagttccacc gacgcagagt 120
ttgcccaatg gcaagaaacc aaacttcggt aagtctacaa aacagcggcg agaacctagg 180
gaacgcacct cgaagacggg acacgaggac gataaggcaa cgatggtcac tgttaacata 240
gatgccttcc tacatgataa ggcccctaaa aaaaaatcgt gcaaatacaa gaagaagaaa 300
acgagacagt accaggatag ggcggcggcg tcgatcgatt cgaaaccgca cgtagctggt 360
catacggcct ttgccggtgc ttcgttcaca acagatatcc cacatgaggc agcgctaccc 420
aaacctagtt ttgtttga 438
<210> 3
<211> 175
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 3
Met Ser Thr Asp Thr Met Tyr Phe Asn Ser Ser Arg Leu Leu Pro Ser
1 5 10 15
Ala Gly Arg Asn Lys Thr Asn Asn Leu Ile Lys Gln Lys Thr Arg Asn
20 25 30
Asn Arg Ala Arg Gly Asn Ala Ala Lys Asn Ala Asn Asn Asn Asn Tyr
35 40 45
Ile Thr Asp Ile Pro Pro Pro Gln Thr Leu Pro Asn Gly Gln Lys Pro
50 55 60
Asn Phe Gly His Ser Ser Asn Lys Lys Pro Ser Phe Asn Gln Lys Lys
65 70 75 80
His Ser Pro Pro Ser Ser Pro Ser Ser Thr Thr Thr Leu Gly Lys Lys
85 90 95
Asn Arg Gln Asn Asn Lys Glu Thr Pro Arg Gln Asn Asn Lys Asp Asp
100 105 110
Thr Arg Leu Leu Ser Gln Asn Leu Lys Asn Leu Leu Leu Asn Gln Lys
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Gln Ser Pro His Gly Ser Gln Gly Ile Ile Pro Met Gly Cys Asn Gly
130 135 140
Ser Ala Lys Lys Leu Ser His Ser Tyr Ala Gly Ser Thr Phe Ala Thr
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Asn Gly Pro Arg Glu Ala Lys Asn Leu Pro Lys Pro Ser Phe Leu
165 170 175
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<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
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aagacaaata atctaatcaa acaaaaaact agaaataatc gtgcgagggg aaatgctgct 120
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aatggtccaa gggaggctaa aaacttgccc aaaccaagtt ttttataa 528
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<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
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1 5 10 15
Val Asn Val Asn Thr Val Phe Gly Leu Pro Gly Asp Phe Asn Leu Ser
20 25 30
Leu Leu Asp Lys Ile Tyr Glu Val Glu Gly Met Arg Trp Ala Gly Asn
35 40 45
Ala Asn Glu Leu Asn Ala Ala Tyr Ala Ala Asp Gly Tyr Ala Arg Ile
50 55 60
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65 70 75 80
Ala Leu Asn Gly Ile Ala Gly Ser Tyr Ala Glu His Val Gly Val Leu
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His Val Val Gly Val Pro Ser Ile Ser Ala Gln Ala Lys Gln Leu Leu
100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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210 215 220
His Asp Val Lys Ala Glu Thr Lys Lys Leu Ile Asp Leu Thr Gln Phe
225 230 235 240
Pro Ala Phe Val Thr Pro Met Gly Lys Gly Ser Ile Asp Glu Gln His
245 250 255
Pro Arg Tyr Gly Gly Val Tyr Val Gly Thr Leu Ser Lys Pro Glu Val
260 265 270
Lys Glu Ala Val Glu Ser Ala Asp Leu Ile Leu Ser Val Gly Ala Leu
275 280 285
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325 330 335
Ile Ala Asp Ala Ala Lys Gly Tyr Lys Pro Val Ala Val Pro Ala Arg
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Pro Asn Asn Thr Tyr Gly Ile Ser Gln Val Leu Trp Gly Ser Ile Gly
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Asp Pro Lys Lys Arg Val Ile Leu Phe Ile Gly Asp Gly Ser Leu Gln
435 440 445
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<213> Saccharomyces cerevisiae
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<213> Saccharomyces cerevisiae
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<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
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195 200 205
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Glu Lys Pro Thr Met Phe Phe Lys Ile Gly Gly Arg Ser Pro Asn Ile
385 390 395 400
Val Asn Ala Leu Val Asp Glu Val Lys Ala Val Ala Gln Leu Asn His
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<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 12
atgttgtgga agcgtacttg cacaaggcta ataaagccta ttgcacaacc tagaggaagg 60
ctggtgagaa gatcatgcta cagatacgcc tcaacaggca caggcagcac cgacagcagc 120
agccagtggt taaaatactc tgtcatcgcc tcttcagcta ctctattcgg ttatttgttc 180
gctaagaacc tctattctag ggagactaag gaagatttga tagagaagct ggaaatggtc 240
aaaaagatcg acccagtaaa ttctacgtta aagctgtcct cattggactc accagactat 300
ttgcacgacc cggttaagat cgataaggtt gttgaggacc tgaagcaggt gctgggaaac 360
aagcctgaaa actactctga tgcgaaatcc gatttggacg cccattcaga tacctacttc 420
aacacgcatc acccctctcc cgagcaaaga cctaggatta tattattccc tcatactacc 480
gaagaagttt ccaaaatttt gaaaatatgt cacgataaca acatgccagt tgtacccttc 540
tcgggcggaa cgtccttgga ggggcacttc ctgcctacaa gaattggaga taccataacc 600
gtagacctgt ccaagtttat gaataacgtc gtaaaatttg acaagctgga cctggacatc 660
accgtgcagg ccggtctacc ctgggaggat ttgaatgact atttgagcga ccacggtttg 720
atgtttggct gtgaccctgg tccaggtgca cagattggtg gttgcattgc taattcttgt 780
tcaggaacca acgcctaccg ttacggtacc atgaaggaga atattataaa catgactata 840
gtgttgccgg acgggaccat tgtcaagacg aagaaaagac ccagaaagtc gagcgctggc 900
tataacttaa atggtttatt tgtgggaagt gaaggtacct taggtattgt tactgaagct 960
actgtcaagt gtcatgtcaa gcccaaagct gaaactgttg cggtggtatc ctttgatact 1020
atcaaggatg cggccgcatg tgcttctaat ctgactcaga gtggtattca tttgaacgcc 1080
atggagttac tggatgaaaa tatgatgaag ttgatcaacg catctgaatc cacggacaga 1140
tgtgattggg tagagaaacc aactatgttt ttcaagattg gtgggagatc tcccaacatt 1200
gtcaatgctc ttgtggatga agttaaggct gtcgcccagt taaatcactg caacagtttt 1260
cagtttgcta aagatgatga cgaaaaattg gaattatggg aagctagaaa ggtcgcgcta 1320
tggtctgtgc tagacgctga taagagcaaa gacaaatcag ctaaaatttg gacaactgat 1380
gtagctgttc ctgtgtcgca gttcgacaag gttattcacg aaactaaaaa ggacatgcaa 1440
gctagtaagc tgatcaacgc cattgttggt catgcaggtg atggtaactt ccatgcattc 1500
atcgtctaca gaacccctga agaacacgaa acctgtagcc aacttgttga cagaatggtc 1560
aagagagcac tgaacgcaga aggcacttgc acgggtgaac acggtgttgg tattggtaaa 1620
agagagtact tgctcgaaga attaggtgaa gcacccgtcg atttgatgag aaagattaag 1680
ctagctattg acccaaagag aatcatgaac ccggacaaaa tctttaaaac tgatccaaac 1740
gagcccgcta atgattacag gtga 1764
<210> 13
<211> 332
<212> PRT
<213> Bos Taurus
<400> 13
Met Ala Thr Leu Lys Asp Gln Leu Ile Gln Asn Leu Leu Lys Glu Glu
1 5 10 15
His Val Pro Gln Asn Lys Ile Thr Ile Val Gly Val Gly Ala Val Gly
20 25 30
Met Ala Cys Ala Ile Ser Ile Leu Met Lys Asp Leu Ala Asp Glu Val
35 40 45
Ala Leu Val Asp Val Met Glu Asp Lys Leu Lys Gly Glu Met Met Asp
50 55 60
Leu Gln His Gly Ser Leu Phe Leu Arg Thr Pro Lys Ile Val Ser Gly
65 70 75 80
Lys Asp Tyr Asn Val Thr Ala Asn Ser Arg Leu Val Ile Ile Thr Ala
85 90 95
Gly Ala Arg Gln Gln Glu Gly Glu Ser Arg Leu Asn Leu Val Gln Arg
100 105 110
Asn Val Asn Ile Phe Lys Phe Ile Ile Pro Asn Ile Val Lys Tyr Ser
115 120 125
Pro Asn Cys Lys Leu Leu Val Val Ser Asn Pro Val Asp Ile Leu Thr
130 135 140
Tyr Val Ala Trp Lys Ile Ser Gly Phe Pro Lys Asn Arg Val Ile Gly
145 150 155 160
Ser Gly Cys Asn Leu Asp Ser Ala Arg Phe Arg Tyr Leu Met Gly Glu
165 170 175
Arg Leu Gly Val His Pro Leu Ser Cys His Gly Trp Ile Leu Gly Glu
180 185 190
His Gly Asp Ser Ser Val Pro Val Trp Ser Gly Val Asn Val Ala Gly
195 200 205
Val Ser Leu Lys Asn Leu His Pro Glu Leu Gly Thr Asp Ala Asp Lys
210 215 220
Glu Gln Trp Lys Ala Val His Lys Gln Val Val Asp Ser Ala Tyr Glu
225 230 235 240
Val Ile Lys Leu Lys Gly Tyr Thr Ser Trp Ala Ile Gly Leu Ser Val
245 250 255
Ala Asp Leu Ala Glu Ser Ile Met Lys Asn Leu Arg Arg Val His Pro
260 265 270
Ile Ser Thr Met Ile Lys Gly Leu Tyr Gly Ile Lys Glu Asp Val Phe
275 280 285
Leu Ser Val Pro Cys Ile Leu Gly Gln Asn Gly Ile Ser Asp Val Val
290 295 300
Lys Val Thr Leu Thr His Glu Glu Glu Ala Cys Leu Lys Lys Ser Ala
305 310 315 320
Asp Thr Leu Trp Gly Ile Gln Lys Glu Leu Gln Phe
325 330
<210> 14
<211> 332
<212> PRT
<213> Pelodiscus sinensis japonicus
<400> 14
Met Ser Val Lys Glu Leu Leu Ile Gln Asn Val His Lys Glu Glu His
1 5 10 15
Ser His Ala His Asn Lys Ile Thr Val Val Gly Val Gly Ala Val Gly
20 25 30
Met Ala Cys Ala Ile Ser Ile Leu Met Lys Asp Leu Ala Asp Glu Leu
35 40 45
Ala Leu Val Asp Val Ile Glu Asp Lys Leu Arg Gly Glu Met Leu Asp
50 55 60
Leu Gln His Gly Ser Leu Phe Leu Arg Thr Pro Lys Ile Val Ser Gly
65 70 75 80
Lys Asp Tyr Ser Val Thr Ala His Ser Lys Leu Val Ile Ile Thr Ala
85 90 95
Gly Ala Arg Gln Gln Glu Gly Glu Ser Arg Leu Asn Leu Val Gln Arg
100 105 110
Asn Val Asn Ile Phe Lys Phe Ile Ile Pro Asn Val Val Lys Tyr Ser
115 120 125
Pro Asp Cys Met Leu Leu Val Val Ser Asn Pro Val Asp Ile Leu Thr
130 135 140
Tyr Val Ala Trp Lys Ile Ser Gly Phe Pro Lys His Arg Val Ile Gly
145 150 155 160
Ser Gly Cys Asn Leu Asp Ser Ala Arg Phe Arg Tyr Leu Met Gly Glu
165 170 175
Lys Leu Gly Ile His Ser Leu Ser Cys His Gly Trp Ile Ile Gly Glu
180 185 190
His Gly Asp Ser Ser Val Pro Val Trp Ser Gly Val Asn Val Ala Gly
195 200 205
Val Ser Leu Lys Ala Leu Tyr Pro Asp Leu Gly Thr Asp Ala Asp Lys
210 215 220
Glu His Trp Lys Glu Val His Lys Gln Val Val Asp Ser Ala Tyr Glu
225 230 235 240
Val Ile Lys Leu Lys Gly Tyr Thr Ser Trp Ala Ile Gly Leu Ser Val
245 250 255
Ala Asp Leu Ala Glu Thr Val Met Lys Asn Leu Arg Arg Val His Pro
260 265 270
Ile Ser Thr Met Val Lys Gly Met Tyr Gly Val Ser Ser Asp Val Phe
275 280 285
Leu Ser Val Pro Cys Val Leu Gly Tyr Ala Gly Ile Thr Asp Val Val
290 295 300
Lys Met Thr Leu Lys Ser Glu Glu Glu Glu Lys Leu Arg Lys Ser Ala
305 310 315 320
Asp Thr Leu Trp Gly Ile Gln Lys Glu Leu Gln Phe
325 330
<210> 15
<211> 332
<212> PRT
<213> Ornithorhynchus anatinus
<400> 15
Met Ala Gly Val Lys Glu Gln Leu Ile Gln Asn Leu Leu Lys Glu Glu
1 5 10 15
Tyr Ala Pro Gln Asn Lys Ile Thr Val Val Gly Val Gly Ala Val Gly
20 25 30
Met Ala Cys Ala Ile Ser Ile Leu Met Lys Asp Leu Ala Asp Glu Leu
35 40 45
Ala Leu Val Asp Val Ile Glu Asp Lys Leu Lys Gly Glu Met Met Asp
50 55 60
Leu Gln His Gly Ser Leu Phe Leu Arg Thr Pro Lys Ile Val Ser Gly
65 70 75 80
Lys Asp Tyr Ser Val Thr Ala Asn Ser Lys Leu Val Ile Ile Thr Ala
85 90 95
Gly Ala Arg Gln Gln Glu Gly Glu Ser Arg Leu Asn Leu Val Gln Arg
100 105 110
Asn Val Asn Ile Phe Lys Phe Ile Ile Pro Asn Val Val Lys Tyr Ser
115 120 125
Pro Asn Cys Lys Leu Leu Val Val Ser Asn Pro Val Asp Ile Leu Thr
130 135 140
Tyr Val Ala Trp Lys Ile Ser Gly Phe Pro Lys Asn Arg Val Ile Gly
145 150 155 160
Ser Gly Cys Asn Leu Asp Ser Ala Arg Phe Arg Tyr Leu Met Gly Glu
165 170 175
Arg Leu Gly Ile His Ser Thr Ser Cys His Gly Trp Val Ile Gly Glu
180 185 190
His Gly Asp Ser Ser Val Pro Val Trp Ser Gly Val Asn Val Ala Gly
195 200 205
Val Ser Leu Lys Asn Leu His Pro Asp Leu Gly Thr Asp Ala Asp Lys
210 215 220
Glu Gln Trp Lys Asp Val His Lys Gln Val Val Asp Ser Ala Tyr Glu
225 230 235 240
Val Ile Lys Leu Lys Gly Tyr Thr Ser Trp Ala Ile Gly Leu Ser Val
245 250 255
Ala Asp Leu Ala Glu Ser Ile Val Lys Asn Leu Arg Arg Val His Pro
260 265 270
Ile Ser Thr Met Ile Lys Gly Leu Tyr Gly Ile Lys Asp Glu Val Phe
275 280 285
Leu Ser Val Pro Cys Val Leu Gly Gln Asn Gly Ile Ser Asp Val Val
290 295 300
Lys Ile Thr Leu Lys Ser Glu Glu Glu Ala His Leu Lys Lys Ser Ala
305 310 315 320
Asp Thr Leu Trp Gly Ile Gln Lys Glu Leu Gln Phe
325 330
<210> 16
<211> 332
<212> PRT
<213> Tursiops truncatus
<400> 16
Met Ala Thr Val Lys Asp Gln Leu Ile Gln Asn Leu Leu Lys Glu Glu
1 5 10 15
His Val Pro Gln Asn Lys Ile Thr Val Val Gly Val Gly Ala Val Gly
20 25 30
Met Ala Cys Ala Ile Ser Ile Leu Met Lys Asp Leu Ala Asp Glu Leu
35 40 45
Ala Leu Val Asp Val Ile Glu Asp Lys Leu Lys Gly Glu Met Met Asp
50 55 60
Leu Gln His Gly Ser Leu Phe Leu Arg Thr Pro Lys Ile Val Ser Gly
65 70 75 80
Lys Asp Tyr Ser Val Thr Ala Asn Ser Lys Leu Val Ile Ile Thr Ala
85 90 95
Gly Ala Arg Gln Gln Glu Gly Glu Ser Arg Leu Asn Leu Val Gln Arg
100 105 110
Asn Val Asn Ile Phe Lys Phe Ile Val Pro Asn Ile Val Lys Tyr Ser
115 120 125
Pro His Cys Lys Leu Leu Val Val Ser Asn Pro Val Asp Ile Leu Thr
130 135 140
Tyr Val Ala Trp Lys Ile Ser Gly Phe Pro Lys Asn Arg Val Ile Gly
145 150 155 160
Ser Gly Cys Asn Leu Asp Ser Ala Arg Phe Arg Tyr Leu Met Gly Glu
165 170 175
Arg Leu Gly Val His Pro Leu Ser Cys His Gly Trp Ile Leu Gly Glu
180 185 190
His Gly Asp Ser Ser Val Pro Val Trp Ser Gly Val Asn Val Ala Gly
195 200 205
Val Ser Leu Lys Asn Leu His Pro Glu Leu Gly Thr Asp Ala Asp Lys
210 215 220
Glu His Trp Lys Ala Ile His Lys Gln Val Val Asp Ser Ala Tyr Glu
225 230 235 240
Val Ile Lys Leu Lys Gly Tyr Thr Ser Trp Ala Val Gly Leu Ser Val
245 250 255
Ala Asp Leu Ala Glu Ser Ile Met Lys Asn Leu Arg Arg Val His Pro
260 265 270
Ile Ser Thr Met Ile Lys Gly Leu Tyr Gly Ile Lys Glu Asp Val Phe
275 280 285
Leu Ser Val Pro Cys Ile Leu Gly Gln Asn Gly Ile Ser Asp Val Val
290 295 300
Lys Val Thr Leu Thr Pro Glu Glu Gln Ala Cys Leu Lys Lys Ser Ala
305 310 315 320
Asp Thr Leu Trp Gly Ile Gln Lys Glu Leu Gln Phe
325 330
<210> 17
<211> 332
<212> PRT
<213> Rattus norvegicus
<400> 17
Met Ala Ala Leu Lys Asp Gln Leu Ile Val Asn Leu Leu Lys Glu Glu
1 5 10 15
Gln Val Pro Gln Asn Lys Ile Thr Val Val Gly Val Gly Ala Val Gly
20 25 30
Met Ala Cys Ala Ile Ser Ile Leu Met Lys Asp Leu Ala Asp Glu Leu
35 40 45
Ala Leu Val Asp Val Ile Glu Asp Lys Leu Lys Gly Glu Met Met Asp
50 55 60
Leu Gln His Gly Ser Leu Phe Leu Lys Thr Pro Lys Ile Val Ser Ser
65 70 75 80
Lys Asp Tyr Ser Val Thr Ala Asn Ser Lys Leu Val Ile Ile Thr Ala
85 90 95
Gly Ala Arg Gln Gln Glu Gly Glu Ser Arg Leu Asn Leu Val Gln Arg
100 105 110
Asn Val Asn Ile Phe Lys Phe Ile Ile Pro Asn Val Val Lys Tyr Ser
115 120 125
Pro Gln Cys Lys Leu Leu Ile Val Ser Asn Pro Val Asp Ile Leu Thr
130 135 140
Tyr Val Ala Trp Lys Ile Ser Gly Phe Pro Lys Asn Arg Val Ile Gly
145 150 155 160
Ser Gly Cys Asn Leu Asp Ser Ala Arg Phe Arg Tyr Leu Met Gly Glu
165 170 175
Arg Leu Gly Val His Pro Leu Ser Cys His Gly Trp Val Leu Gly Glu
180 185 190
His Gly Asp Ser Ser Val Pro Val Trp Ser Gly Val Asn Val Ala Gly
195 200 205
Val Ser Leu Lys Ser Leu Asn Pro Gln Leu Gly Thr Asp Ala Asp Lys
210 215 220
Glu Gln Trp Lys Asp Val His Lys Gln Val Val Asp Ser Ala Tyr Glu
225 230 235 240
Val Ile Lys Leu Lys Gly Tyr Thr Ser Trp Ala Ile Gly Leu Ser Val
245 250 255
Ala Asp Leu Ala Glu Ser Ile Met Lys Asn Leu Arg Arg Val His Pro
260 265 270
Ile Ser Thr Met Ile Lys Gly Leu Tyr Gly Ile Lys Glu Asp Val Phe
275 280 285
Leu Ser Val Pro Cys Ile Leu Gly Gln Asn Gly Ile Ser Asp Val Val
290 295 300
Lys Val Thr Leu Thr Pro Asp Glu Glu Ala Arg Leu Lys Lys Ser Ala
305 310 315 320
Asp Thr Leu Trp Gly Ile Gln Lys Glu Leu Gln Phe
325 330
<210> 18
<211> 999
<212> DNA
<213> Bos Taurus
<400> 18
atggcaacat taaaagatca actaatccag aatttgttga aagaggagca tgttccacaa 60
aacaaaatca caatcgtcgg cgtaggtgca gtaggtatgg cttgtgccat atccatcttg 120
atgaaagact tagctgatga ggtcgcgctg gttgatgtaa tggaggacaa acttaaagga 180
gaaatgatgg atcttcaaca tggttcactc tttttgagaa ctcctaaaat tgtatccggg 240
aaagattata acgttaccgc caattctaga cttgttataa tcacggctgg tgcaagacaa 300
caggaaggcg aatcaagact taacttagtt cagagaaacg taaacatttt caagtttatc 360
atcccaaata ttgtaaaata ctccccaaat tgcaagttgc tggttgtttc aaatcctgtt 420
gacatattga cttacgttgc ttggaagatt tcaggtttcc caaagaatag agtaatcgga 480
tctggttgca atctcgattc tgctcgtttt aggtatctga tgggtgaaag attaggggtt 540
catccattga gttgtcacgg atggattcta ggtgaacatg gagatagttc tgtgcctgtt 600
tggtcaggtg tcaacgtagc aggtgtctct ttgaaaaatc tacacccaga actaggaaca 660
gatgccgaca aggaacaatg gaaggccgtc cacaaacaag tggtggattc tgcctacgaa 720
gtcatcaaat tgaagggcta cacatcttgg gcaattggct tatccgtcgc tgatctggct 780
gaatcaataa tgaaaaacct ccgtagagtg catcctataa gtactatgat taagggttta 840
tacgggatca aggaagatgt ttttctatct gtgccatgta ttttgggcca aaatggaatt 900
tctgacgttg ttaaagtgac acttactcat gaagaggaag cgtgtttgaa aaagagcgca 960
gacaccttat ggggcatcca aaaggaatta caattctaa 999
<210> 19
<211> 348
<212> PRT
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 19
Met Ser Ile Pro Glu Thr Gln Lys Gly Val Ile Phe Tyr Glu Ser His
1 5 10 15
Gly Lys Leu Glu Tyr Lys Asp Ile Pro Val Pro Lys Pro Lys Ala Asn
20 25 30
Glu Leu Leu Ile Asn Val Lys Tyr Ser Gly Val Cys His Thr Asp Leu
35 40 45
His Ala Trp His Gly Asp Trp Pro Leu Pro Val Lys Leu Pro Leu Val
50 55 60
Gly Gly His Glu Gly Ala Gly Val Val Val Gly Met Gly Glu Asn Val
65 70 75 80
Lys Gly Trp Lys Ile Gly Asp Tyr Ala Gly Ile Lys Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Ser Cys Met Ala Cys Glu Tyr Cys Glu Leu Gly Asn Glu Ser Asn Cys
100 105 110
Pro His Ala Asp Leu Ser Gly Tyr Thr His Asp Gly Ser Phe Gln Gln
115 120 125
Tyr Ala Thr Ala Asp Ala Val Gln Ala Ala His Ile Pro Gln Gly Thr
130 135 140
Asp Leu Ala Gln Val Ala Pro Ile Leu Cys Ala Gly Ile Thr Val Tyr
145 150 155 160
Lys Ala Leu Lys Ser Ala Asn Leu Met Ala Gly His Trp Val Ala Ile
165 170 175
Ser Gly Ala Ala Gly Gly Leu Gly Ser Leu Ala Val Gln Tyr Ala Lys
180 185 190
Ala Met Gly Tyr Arg Val Leu Gly Ile Asp Gly Gly Glu Gly Lys Glu
195 200 205
Glu Leu Phe Arg Ser Ile Gly Gly Glu Val Phe Ile Asp Phe Thr Lys
210 215 220
Glu Lys Asp Ile Val Gly Ala Val Leu Lys Ala Thr Asp Gly Gly Ala
225 230 235 240
His Gly Val Ile Asn Val Ser Val Ser Glu Ala Ala Ile Glu Ala Ser
245 250 255
Thr Arg Tyr Val Arg Ala Asn Gly Thr Thr Val Leu Val Gly Met Pro
260 265 270
Ala Gly Ala Lys Cys Cys Ser Asp Val Phe Asn Gln Val Val Lys Ser
275 280 285
Ile Ser Ile Val Gly Ser Tyr Val Gly Asn Arg Ala Asp Thr Arg Glu
290 295 300
Ala Leu Asp Phe Phe Ala Arg Gly Leu Val Lys Ser Pro Ile Lys Val
305 310 315 320
Val Gly Leu Ser Thr Leu Pro Glu Ile Tyr Glu Lys Met Glu Lys Gly
325 330 335
Gln Ile Val Gly Arg Tyr Val Val Asp Thr Ser Lys
340 345
<210> 20
<211> 1047
<212> DNA
<213> Saccharomyces cerevisiae
<400> 20
atgtctatcc cagaaactca aaaaggtgtt atcttctacg aatcccacgg taagttggaa 60
tacaaagata ttccagttcc aaagccaaag gccaacgaat tgttgatcaa cgttaaatac 120
tctggtgtct gtcacactga cttgcacgct tggcacggtg actggccatt gccagttaag 180
ctaccattag tcggtggtca cgaaggtgcc ggtgtcgttg tcggcatggg tgaaaacgtt 240
aagggctgga agatcggtga ctacgccggt atcaaatggt tgaacggttc ttgtatggcc 300
tgtgaatact gtgaattggg taacgaatcc aactgtcctc acgctgactt gtctggttac 360
acccacgacg gttctttcca acaatacgct accgctgacg ctgttcaagc cgctcacatt 420
cctcaaggta ccgacttggc ccaagtcgcc cccatcttgt gtgctggtat caccgtctac 480
aaggctttga agtctgctaa cttgatggcc ggtcactggg ttgctatctc cggtgctgct 540
ggtggtctag gttctttggc tgttcaatac gccaaggcta tgggttacag agtcttgggt 600
attgacggtg gtgaaggtaa ggaagaatta ttcagatcca tcggtggtga agtcttcatt 660
gacttcacta aggaaaagga cattgtcggt gctgttctaa aggccactga cggtggtgct 720
cacggtgtca tcaacgtttc cgtttccgaa gccgctattg aagcttctac cagatacgtt 780
agagctaacg gtaccaccgt tttggtcggt atgccagctg gtgccaagtg ttgttctgat 840
gtcttcaacc aagtcgtcaa gtccatctct attgttggtt cttacgtcgg taacagagct 900
gacaccagag aagctttgga cttcttcgcc agaggtttgg tcaagtctcc aatcaaggtt 960
gtcggcttgt ctaccttgcc agaaatttac gaaaagatgg aaaagggtca aatcgttggt 1020
agatacgttg ttgacacttc taaataa 1047
<210> 21
<211> 292
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CCW12 promoter
<400> 21
ttcgcggcca cctacgccgc tatctttgca acaactatct gcgataactc agcaaatttt 60
gcatattcgt gttgcagtat tgcgataatg ggagtcttac ttccaacata acggcagaaa 120
gaaatgtgag aaaattttgc atcctttgcc tccgttcaag tatataaagt cggcatgctt 180
gataatcttt ctttccatcc tacattgttc taattattct tattctcctt tattctttcc 240
taacatacca agaaattaat cttctgtcat tcgcttaaac actatatcaa ta 292
<210> 22
<211> 655
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GPD promoter
<400> 22
agtttatcat tatcaatact cgccatttca aagaatacgt aaataattaa tagtagtgat 60
tttcctaact ttatttagtc aaaaaattag ccttttaatt ctgctgtaac ccgtacatgc 120
ccaaaatagg gggcgggtta cacagaatat ataacatcgt aggtgtctgg gtgaacagtt 180
tattcctggc atccactaaa tataatggag cccgcttttt aagctggcat ccagaaaaaa 240
aaagaatccc agcaccaaaa tattgttttc ttcaccaacc atcagttcat aggtccattc 300
tcttagcgca actacagaga acaggggcac aaacaggcaa aaaacgggca caacctcaat 360
ggagtgatgc aacctgcctg gagtaaatga tgacacaagg caattgaccc acgcatgtat 420
ctatctcatt ttcttacacc ttctattacc ttctgctctc tctgatttgg aaaaagctga 480
aaaaaaaggt tgaaaccagt tccctgaaat tattccccta cttgactaat aagtatataa 540
agacggtagg tattgattgt aattctgtaa atctatttct taaacttctt aaattctact 600
tttatagtta gtcttttttt tagttttaaa acaccagaac ttagtttcga cggat 655
<210> 23
<211> 289
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CYC promoter
<400> 23
atttggcgag cgttggttgg tggatcaagc ccacgcgtag gcaatcctcg agcagatccg 60
ccaggcgtgt atatatagcg tggatggcca ggcaacttta gtgctgacac atacaggcat 120
atatatatgt gtgcgacgac acatgatcat atggcatgca tgtgctctgt atgtatataa 180
aactcttgtt ttcttctttt ctctaaatat tctttcctta tacattagga cctttgcagc 240
ataaattact atacttctat agacacgcaa acacaaatac acacactaa 289
<210> 24
<211> 401
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TEF promoter
<400> 24
atagcttcaa aatgtttcta ctcctttttt actcttccag attttctcgg actccgcgca 60
tcgccgtacc acttcaaaac acccaagcac agcatactaa atttcccctc tttcttcctc 120
tagggtgtcg ttaattaccc gtactaaagg tttggaaaag aaaaaagaga ccgcctcgtt 180
tctttttctt cgtcgaaaaa ggcaataaaa atttttatca cgtttctttt tcttgaaaat 240
tttttttttg atttttttct ctttcgatga cctcccattg atatttaagt taataaacgg 300
tcttcaattt ctcaagtttc agtttcattt ttcttgttct attacaactt tttttacttc 360
ttgctcatta gaaagaaagc atagcaatct aatctaagtt t 401
<210> 25
<211> 1468
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ADH promoter
<400> 25
gccgggatcg aagaaatgat ggtaaatgaa ataggaaatc aaggagcatg aaggcaaaag 60
acaaatataa gggtcgaacg aaaaataaag tgaaaagtgt tgatatgatg tatttggctt 120
tgcggcgccg aaaaaacgag tttacgcaat tgcacaatca tgctgactct gtggcggacc 180
cgcgctcttg ccggcccggc gataacgctg ggcgtgaggc tgtgcccggc ggagtttttt 240
gcgcctgcat tttccaaggt ttaccctgcg ctaaggggcg agattggaga agcaataaga 300
atgccggttg gggttgcgat gatgacgacc acgacaactg gtgtcattat ttaagttgcc 360
gaaagaacct gagtgcattt gcaacatgag tatactagaa gaatgagcca agacttgcga 420
gacgcgagtt tgccggtggt gcgaacaata gagcgaccat gaccttgaag gtgagacgcg 480
cataaccgct agagtacttt gaagaggaaa cagcaatagg gttgctacca gtataaatag 540
acaggtacat acaacactgg aaatggttgt ctgtttgagt acgctttcaa ttcatttggg 600
tgtgcacttt attatgttac aatatggaag ggaactttac acttctccta tgcacatata 660
ttaattaaag tccaatgcta gtagagaagg ggggtaacac ccctccgcgc tcttttccga 720
tttttttcta aaccgtggaa tatttcggat atccttttgt tgtttccggg tgtacaatat 780
ggacttcctc ttttctggca accaaaccca tacatcggga ttcctataat accttcgttg 840
gtctccctaa catgtaggtg gcggagggga gatatacaat agaacagata ccagacaaga 900
cataatgggc taaacaagac tacaccaatt acactgcctc attgatggtg gtacataacg 960
aactaatact gtagccctag acttgatagc catcatcata tcgaagtttc actacccttt 1020
ttccatttgc catctattga agtaataata ggcgcatgca acttcttttc tttttttttc 1080
ttttctctct cccccgttgt tgtctcacca tatccgcaat gacaaaaaaa tgatggaaga 1140
cactaaagga aaaaattaac gacaaagaca gcaccaacag atgtcgttgt tccagagctg 1200
atgaggggta tctcgaagca cacgaaactt tttccttcct tcattcacgc acactactct 1260
ctaatgagca acggtatacg gccttccttc cagttacttg aatttgaaat aaaaaaaagt 1320
ttgctgtctt gctatcaagt ataaatagac ctgcaattat taatcttttg tttcctcgtc 1380
attgttctcg ttccctttct tccttgtttc tttttctgca caatatttca agctatacca 1440
agcatacaat caactccaag ctggccgc 1468
<210> 26
<211> 252
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CYC1 terminator
<400> 26
tcatgtaatt agttatgtca cgcttacatt cacgccctcc ccccacatcc gctctaaccg 60
aaaaggaagg agttagacaa cctgaagtct aggtccctat ttattttttt atagttatgt 120
tagtattaag aacgttattt atatttcaaa tttttctttt ttttctgtac agacgcgtgt 180
acgcatgtaa cattatactg aaaaccttgc ttgagaaggt tttgggacgc tcgaaggctt 240
taatttgcgg cc 252
<210> 27
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 27
ttgcataata ttgtccgctg 20
<210> 28
<211> 61
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 28
ccaattcgcc ctatagtgag tcgtattaca gggaacaaac ccaaatctga ttccaaggag 60
a 61
<210> 29
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 29
agcttttgtt ccctttagtg agggttaatt ctgttgaatt ggcttaagtc tgggtcc 57
<210> 30
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 30
gtgtctagtc ttctattacg ct 22
<210> 31
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 31
ttgagataag cacactgca 19
<210> 32
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 32
caacatcacc caattcatcg 20
<210> 33
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 33
aacaaatcaa acacccacac c 21
<210> 34
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 34
ccaattcgcc ctatagtgag tcgtattact ataactacga aactgccaat accaagcca 59
<210> 35
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 35
agcttttgtt ccctttagtg agggttaatt tcgtttacaa caactaccca atgaagaacc 60
60
<210> 36
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 36
aaatacaccc atacatacgg ac 22
<210> 37
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 37
gtcctcggta gatcaggtc 19
<210> 38
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 38
aagtacatcc ttgtcgagcc 20
<210> 39
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 39
tctctataat gaagaccctt gtgc 24
<210> 40
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 40
ccaattcgcc ctatagtgag tcgtattact atgcgggaac tgtattagcg acatagg 57
<210> 41
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 41
agcttttgtt ccctttagtg agggttaatt cgacgtgctg tataatgaag tttatgaggg 60
60
<210> 42
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 42
gtggatattt acagaacgat gc 22
<210> 43
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 43
gcacaacacg agatctttca c 21
<210> 44
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 44
aaagagaaga ggtacaaagg agg 23
<210> 45
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 45
gtacggctcc tcaactctc 19
<210> 46
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 46
ccaattcgcc ctatagtgag tcgtattaca cggaagctca agaaatcttt ccagc 55
<210> 47
<211> 57
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 47
agcttttgtt ccctttagtg agggttaatt gctattgacc caaagagaat catgaac 57
<210> 48
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 48
tctctgatgc tgccaatagt c 21
<210> 49
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 49
cgtagccata ctaacttggt 20
<210> 50
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 50
tcatcacact ttgaacactg g 21
<210> 51
<211> 44
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 51
ctatagggcg aattggactg taccgaatat ctgtgtccta atga 44
<210> 52
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 52
ctcgaggggg ggcccggtac ctattgatat agtgtttaag cgaatgacag aag 53
<210> 53
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 53
tctcaccata tccgcaatga 20
<210> 54
<211> 61
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 54
ccaattcgcc ctatagtgag tcgtattacc aaggaagaaa gggaacgaga acaatgacga 60
g 61
<210> 55
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 55
agcttttgtt ccctttagtg agggttaatt gggtcaaatc gttggtagat acgttgttga 60
60
<210> 56
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 56
gtggaagaac gattacaaca gg 22
<210> 57
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 57
gtagccctag acttgatagc c 21
<210> 58
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 58
tgaatgacga tgaagataga gcc 23
<210> 59
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 59
gtttcgacgg attctagaaa acaatgggtt ccgagacaaa acattctgca 50
<210> 60
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 60
ctaattacat gactcgagtc aaacaaaact aggtttgggt agcgct 46
<210> 61
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 61
ctatagggcg aattggctag cttatcatta tcaatactcg ccatttcaaa gaata 55
<210> 62
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 62
taaggataag cagaaccgcg tgacataact aattacatga ctcgag 46
<210> 63
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 63
aatcttgtgc tattgcagtc ctcttttata tacagtataa tacgactcac tatagggcg 59
<210> 64
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 64
atgcgaattg cgtaattcac ggcgataacg tagtattaat taaccctcac taaagggaac 60
60
<210> 65
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 65
gcccacaact tatcaagtg 19
<210> 66
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 66
ttataagaca agcgcaggg 19
<210> 67
<211> 5457
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pCtB1 vector
<400> 67
ctaaattgta agcgttaata ttttgttaaa attcgcgtta aatttttgtt aaatcagctc 60
attttttaac caataggccg aaatcggcaa aatcccttat aaatcaaaag aatagaccga 120
gatagggttg agtacgcatt taagcataaa cacgcactat gccgttcttc tcatgtatat 180
atatatacag gcaacacgca gatataggtg cgacgtgaac agtgagctgt atgtgcgcag 240
ctcgcgttgc attttcggaa gcgctcgttt tcggaaacgc tttgaagttc ctattccgaa 300
gttcctattc tctagctaga aagtatagga acttcagagc gcttttgaaa accaaaagcg 360
ctctgaagac gcactttcaa aaaaccaaaa acgcaccgga ctgtaacgag ctactaaaat 420
attgcgaata ccgcttccac aaacattgct caaaagtatc tctttgctat atatctctgt 480
gctatatccc tatataacct acccatccac ctttcgctcc ttgaacttgc atctaaactc 540
gacctctaca ttttttatgt ttatctctag tattactctt tagacaaaaa aattgtagta 600
agaactattc atagagtgaa tcgaaaacaa tacgaaaatg taaacatttc ctatacgtag 660
tatatagaga caaaatagaa gaaaccgttc ataattttct gaccaatgaa gaatcatcaa 720
cgctatcact ttctgttcac aaagtatgcg caatccacat cggtatagaa tataatcggg 780
gatgccttta tcttgaaaaa atgcacccgc agcttcgcta gtaatcagta aacgcgggaa 840
gtggagtcag gcttttttta tggaagagaa aatagacacc aaagtagcct tcttctaacc 900
ttaacggacc tacagtgcaa aaagttatca agagactgca ttatagagcg cacaaaggag 960
aaaaaaagta atctaagatg ctttgttaga aaaatagcgc tctcgggatg catttttgta 1020
gaacaaaaaa gaagtataga ttctttgttg gtaaaatagc gctctcgcgt tgcatttctg 1080
ttctgtaaaa atgcagctca gattctttgt ttgaaaaatt agcgctctcg cgttgcattt 1140
ttgttttaca aaaatgaagc acagattctt cgttggtaaa atagcgcttt cgcgttgcat 1200
ttctgttctg taaaaatgca gctcagattc tttgtttgaa aaattagcgc tctcgcgttg 1260
catttttgtt ctacaaaatg aagcacagat gcttcgttaa tgtgctgcaa ggcgattaag 1320
ttgggtaacg ccagggtttt cccagtcacg acgttgtaaa acgacggcca gtgaattgta 1380
atacgactca ctatagggcg aattgggtac cgggcccccc ctcgaggtcg acggtatcga 1440
taagcttgat atcgaattcc tgcagcccgg gggatccact agttctagag cggccgccac 1500
cgcggtggag ctcggttctg cttatcctta cgacgtgcct gactacgcct gaacccgatg 1560
caaatgagac gatcgtctat tcctggtccg gttttctctg ccctctcttc tattcacttt 1620
ttttatactt tatataaaat tatataaatg acataactga aacgccacac gtcctctcct 1680
attcgttaac gcctgtctgt agcgctgtta ctgaagctgc gcaagtagtt ttttcaccgt 1740
ataggccctc tttttctctc tctttctttc tctcccgcgc tgatctcttc ttcgaaacac 1800
agagtgcacc ataccacctt ttcaattcat catttttttt ttattctttt ttttgatttc 1860
ggtttccttg aaattttttt gattcggtaa tctccgaaca gaaggaagaa cgaaggaagg 1920
agcacagact tagattggta tatatacgca tatgtagtgt tgaagaaaca tgaaattgcc 1980
cagtattctt aacccaactg cacagaacaa aaacctccag gaaacgaaga taaatcatgt 2040
cgaaagctac atataaggaa cgtgctgcta ctcatcctag tcctgttgct gccaagctat 2100
ttaatatcat gcacgaaaag caaacaaact tgtgtgcttc attggatgtt cgtaccacca 2160
aggaattact ggagttagtt gaagcattag gtcccaaaat ttgtttacta aaaacacatg 2220
tggatatctt gactgatttt tccatggagg gcacagttaa gccgctaaag gcattatccg 2280
ccaagtacaa ttttttactc ttcgaagaca gaaaatttgc tgacattggt aatacagtca 2340
aattgcagta ctctgcgggt gtatacagaa tagcagaatg ggcagacatt acgaatgcac 2400
acggtgtggt gggcccaggt attgttagcg gtttgaagca ggcggcagaa gaagtaacaa 2460
aggaacctag aggccttttg atgttagcag aattgtcatg caagggctcc ctatctactg 2520
gagaatatac taagggtact gttgacattg cgaagagcga caaagatttt gttatcggct 2580
ttattgctca aagagacatg ggtggaagag atgaaggtta cgattggttg attatgacac 2640
ccggtgtggg tttagatgac aagggagacg cattgggtca acagtataga accgtggatg 2700
atgtggtctc tacaggatct gacattatta ttgttggaag aggactattt gcaaagggaa 2760
gggatgctaa ggtagagggt gaacgttaca gaaaagcagg ctgggaagca tatttgagaa 2820
gatgcggcca gcaaaactaa tcatgtaatt agttatgtca cgcttacatt cacgccctcc 2880
ccccacatcc gctctaaccg aaaaggaagg agttagacaa cctgaagtct aggtccctat 2940
ttattttttt atagttatgt tagtattaag aacgttattt atatttcaaa tttttctttt 3000
ttttctgtac agacgcgtgt acgcatgtaa cattatactg aaaaccttgc ttgagaaggt 3060
tttgggacgc tcgaaggctt taatttgcgt ctgtagcgct gttactgaag ctgcgcaagt 3120
agttttttca ccgtataggc cctctttttc tctctctttc tttctctccc gcgctgatct 3180
cttcttcgaa acatcatgaa taaaaagaaa aaggaaatca agaaaaaaaa gccataattt 3240
atcccacatt tttttttatt gtcgctgttc acaccgcata acgaagatat tggctagcta 3300
accagctttt gttcccttta gtgagggtta atttcgagct tggcgtaatc atggtcatag 3360
ctgtttcctg tgtgaaattg ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccggaagc 3420
ataaagtgta aagcctgggg tgcctaatga gtgagctaac tcacattaat tgcgttgcgc 3480
tcactgcccg ctttccagtc gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg aatcggccaa 3540
cgcgcgggga gaggcggttt gcgtattggg cgctcttccg cttcctcgct cactgactcg 3600
ctgcgctcgg tcgttcggct gcggcgagcg gtatcagctc actcaaaggc ggtaatacgg 3660
ttatccacag aatcagggga taacgcagga aagaacatgt gagcaaaagg ccagcaaaag 3720
gccaggaacc gtaaaaaggc cgcgttgctg gcgtttttcc ataggctccg cccccctgac 3780
gagcatcaca aaaatcgacg ctcaagtcag aggtggcgaa acccgacagg actataaaga 3840
taccaggcgt ttccccctgg aagctccctc gtgcgctctc ctgttccgac cctgccgctt 3900
accggatacc tgtccgcctt tctcccttcg ggaagcgtgg cgctttctca tagctcacgc 3960
tgtaggtatc tcagttcggt gtaggtcgtt cgctccaagc tgggctgtgt gcacgaaccc 4020
cccgttcagc ccgaccgctg cgccttatcc ggtaactatc gtcttgagtc caacccggta 4080
agacacgact tatcgccact ggcagcagcc actggtaaca ggattagcag agcgaggtat 4140
gtaggcggtg ctacagagtt cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaaggaca 4200
gtatttggta tctgcgctct gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt tggtagctct 4260
tgatccggca aacaaaccac cgctggtagc ggtggttttt ttgtttgcaa gcagcagatt 4320
acgcgcagaa aaaaaggatc tcaagaagat cctttgatct tttctacggg gtctgacgct 4380
cagtggaacg aaaactcacg ttaagggatt ttggtcatga gattatcaaa aaggatcttc 4440
acctagatcc ttttaaatta aaaatgaagt tttaaatcaa tctaaagtat atatgagtaa 4500
acttggtctg acatcagaag aactcgtcaa gaaggcgata gaaggcgatg cgctgcgaat 4560
cgggagcggc gataccgtaa agcacgagga agcggtcagc ccattcgccg ccaagctctt 4620
cagcaatatc acgggtagcc aacgctatgt cctgatagcg gtccgccaca cccagccggc 4680
cacagtcgat gaatccagaa aagcggccat tttccaccat gatattcggc aagcaggcat 4740
cgccatgggt cacgacgaga tcctcgccgt cgggcatgct cgccttgagc ctggcgaaca 4800
gttcggctgg cgcgagcccc tgatgctctt cgtccagatc atcctgatcg acaagaccgg 4860
cttccatccg agtacgtgct cgctcgatgc gatgtttcgc ttggtggtcg aatgggcagg 4920
tagccggatc aagcgtatgc agccgccgca ttgcatcagc catgatggat actttctcgg 4980
caggagcaag gtgagatgac aggagatcct gccccggcac ttcgcccaat agcagccagt 5040
cccttcccgc ttcagtgaca acgtcgagca cagctgcgca aggaacgccc gtcgtggcca 5100
gccacgatag ccgcgctgcc tcgtcttgca gttcattcag ggcaccggac aggtcggtct 5160
tgacaaaaag aaccgggcgc ccctgcgctg acagccggaa cacggcggca tcagagcagc 5220
cgattgtctg ttgtgcccag tcatagccga atagcctctc cacccaagcg gccggagaac 5280
ctgcgtgcaa tccatcttgt tcaattcgag tgcattcaac atcagccata ctcttccttt 5340
ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt attgtctcat gagcggatac atatttgaat 5400
gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccac 5457
Claims (20)
- 모세포에 비하여, EDC 효소의 활성이 증가되어 있는, 락테이트 생산능을 갖는 유전적으로 조작된 효모 세포로서,
상기 효모 세포는 EDC를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 발현이 증가되어 있는 것이고,
피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것이고,
추가로 피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 및 아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자가 파괴된 변이를 갖는 것인 효모 세포. - 삭제
- 청구항 1에 있어서, 상기 효모 세포는 상기 EDC을 코딩하는 유전자의 카피 수 증가 또는 상기 EDC을 코딩하는 유전자의 발현 조절 서열의 변형을 갖는 것인 효모 세포.
- 청구항 1에 있어서, 상기 효모 세포는 EDC를 코딩하는 외인성 유전자를 갖는 것인 효모 세포.
- 청구항 1에 있어서, 상기 EDC 효소는 EDC1 효소 또는 EDC2 효소인 것인 효모 세포.
- 청구항 5에 있어서, 상기 EDC2 효소는 서열번호 1의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 것인 효모 세포.
- 청구항 5에 있어서, 상기 EDC2 효소를 코딩하는 유전자는 서열번호 1의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 아미노산을 코딩하는 것인 효모 세포.
- 청구항 1에 있어서, 사카로마이세스 (Saccharomyces), 클루이베로마이세스 (Kluyveromyces), 캔디다 (Candida), 피치아 (Pichia), 이사첸키아 (Issatchenkia), 데바리오마이세스 (Debaryomyces), 자이고사카로마이세스 (Zygosaccharomyces), 쉬조사카로마이세스 (Shizosaccharomyces) 또는 사카로마이콥시스 (Saccharomycopsis) 속인 것인 효모 세포.
- 청구항 1에 있어서, 사카로마이세스 세레비지애인 것인 효모 세포.
- 청구항 1에 있어서, 미호기성 또는 혐기성 조건에서 락테이트 생산능을 갖는 것인 효모 세포.
- 삭제
- 청구항 1에 있어서, 피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드는 서열번호 3의 아미노산 서열과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 것인 효모 세포.
- 삭제
- 삭제
- 효모 세포에 EDC 효소를 코딩하는 유전자를 과발현시키는 단계;
피루베이트를 L-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 도입하는 단계; 및
피루베이트를 아세트알데히드로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 락테이트를 피루베이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 디히드록시아세톤 포스페이트 (DHAP)를 글리세롤-3-포스페이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 피루베이트를 D-락테이트로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자, 및 아세트알데히드를 에탄올로 전환하는 폴리펩티드를 코딩하는 유전자를 파괴하는 단계를 포함하는 락테이트를 생산하는 효모 세포를 제조하는 방법. - 삭제
- 청구항 15에 있어서, 사카로마이세스 세레비지애인 것인 방법.
- 청구항 1의 효모 세포를 배양하여 락테이트를 생산하는 단계를 포함하는 락테이트를 생산하는 방법.
- 청구항 18에 있어서, 배양물로부터 락테이트를 회수하는 단계를 더 포함하는 것인 방법.
- 청구항 18에 있어서, 상기 배양은 미세호기 (microaerobic) 조건에서 수행되는 것인 방법.
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US14/845,009 US9771604B2 (en) | 2014-09-05 | 2015-09-03 | Genetically engineered yeast cell with enhanced EDC activity and capability of producing lactate, method of producing the yeast cell, and method of producing lactate by using the yeast cell |
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KR20130001103A (ko) * | 2011-06-24 | 2013-01-03 | 삼성전자주식회사 | 젖산의 고효율 생산을 위한 변형 미생물 |
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---|---|---|---|---|
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Mol. Microbiol.,제73권,6호,1032-1042면 (2009.09.) 1부.* |
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