KR101989983B1 - Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same - Google Patents
Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same Download PDFInfo
- Publication number
- KR101989983B1 KR101989983B1 KR1020170144189A KR20170144189A KR101989983B1 KR 101989983 B1 KR101989983 B1 KR 101989983B1 KR 1020170144189 A KR1020170144189 A KR 1020170144189A KR 20170144189 A KR20170144189 A KR 20170144189A KR 101989983 B1 KR101989983 B1 KR 101989983B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- seq
- chicken
- nos
- present
- marker
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Abstract
본 발명은 재래닭의 개체식별을 위한 초위성체 마커 및 이를 이용한 재래닭의 개체식별 방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로는 ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330로 이루어지는 초위성체 마커 세트를 이용하여 멀리플렉스 PCR로 증폭하는 단계 및 상기 증폭된 산물을 이용하여 유전자형을 결정하는 단계를 포함하는 재래닭의 개체 식별방법에 대한 것이다.
본 발명에 따르면 종래 기술에서 사용된 것보다 높은 개체 식별력을 가진 초위성체 마커들로 인해, 더욱 정확한 개체 식별 결과를 제공할 수 있다. 더욱 구체적으로는, 본 발명의 12종의 초위성체 마커들은 동일개체 출현확률이 무작위 교배집단에서는 2.88 × 10-21, 반형매 교배집단에서는 1.72 × 10- 15으로, 국내에서 사육되는 재래닭에 대하여 동일개체 출현 가능성이 없어 재래닭의 개체 식별에 유용하게 사용될 수 있다. 이에 따라, 재래닭의 유통과정에서 닭의 원산지 또는 유입경로를 쉽게 판별하여 부정행위를 방지하는 수단으로 활용될 수 있으며, 재래닭에 대한 소비자의 신뢰도를 상승시켜 생산 농가의 소득 증대에 도움을 줄 수 있다.The present invention relates to a supersatellite marker for identifying an individual of a native chicken and a method for identifying an individual of a native chicken using the same. More particularly, the present invention relates to a marker of an ultra- The present invention relates to a method for identifying an individual of a conventional chicken including amplifying the amplified product with a multiplex PCR using a supersatellite marker set consisting of MCW0145 and MCW0330 and determining the genotype using the amplified product.
According to the present invention, more precise object identification results can be provided due to super satellites markers having higher individual discrimination than those used in the prior art. More specifically, the 12 kinds of satellites second marker of the invention are the same object appearance probability of a random mating population in 2.88 × 10 -21, half the breeding population hyeongmae 1.72 × 10 - 15, for the native chickens are bred in the country There is no possibility of occurrence of the same individual, so that it can be usefully used for identification of a native chicken. Therefore, it can be used as a means to prevent cheating by easily discriminating origin or route of chicken in the distribution process of traditional chicken, and it can be used as a means to increase the reliability of the consumer for the traditional chicken, .
Description
본 발명은 재래닭의 개체 식별을 위한 초위성체 마커 및 이를 이용한 재래닭의 개체 식별 방법에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 높은 수준의 검정력을 확보하면서 더욱 정확한 개체 식별이 가능한 초위성체 마커들의 조합을 형성하고, 이를 이용하여 재래닭의 개체를 식별하는 방법에 대한 것이다.TECHNICAL FIELD The present invention relates to a supersatellite marker for identifying an individual of a native chicken and a method for identifying an individual of a native chicken using the same. More particularly, the present invention relates to a method for identifying an individual of a conventional chicken using a combination of supersatellite markers capable of identifying a more accurate individual while securing a high level of power.
가금육은 우리나라 전체 육류 생산량의 20% 이상을 차지하고 있을 정도로 농가의 소득 및 농촌 경제에 중요한 역할을 담당하고 있다. 그 중에서 가장 높은 비율을 차지하는 닭의 경우 닭고기 소비시장의 대부분이 축산 선진국(미국, 영국, 프랑스, 독일, 덴마크 등)으로부터 수입한 수입닭이 차지하고 있으며, 국내 재래닭의 경우는 닭고기 소비시장의 10% 내외로서 상당히 낮은 비율을 차지하고 있는 실정이다.Poultry meat plays an important role in the income of the farm household and the rural economy to the extent that it accounts for more than 20% of the total meat production in our country. Most of the chickens consumed in the market are imported chickens imported from developed countries (US, UK, France, Germany, Denmark, etc.) and domestic chicken are dominant in the chicken market %, Which is quite low.
소, 돼지의 경우 생산이력제 사업이 추진되어 국내종과 수입종의 구분으로 신뢰성을 확보해 나가고 있는 반면, 재래닭의 경우 보존 및 개발이 많이 이루어져 있지 않은 상태에 있고 그 명칭이나 구분이 명확하지 않아 국내종으로서의 신뢰성 확보가 시급하다.In the case of cows and pigs, the production history system is promoted to ensure reliability by the distinction between domestic species and imported species. In contrast, conventional chickens do not have much preservation and development, It is urgent to secure reliability as a species.
따라서, 앞으로 개발될 재래닭의 종자의 경우 유전자형을 이용한 개체식별 방법을 확립하여 고급육을 브랜드육으로 발전시키고, 재래닭의 신뢰성을 증가시키기 위한 유전자 감식 기법의 활용이 필요하다. 그러나, 닭의 유전자 상에서 개체 식별이 가능한 도메인(domain)은 닭의 품종에 따라 다양하게 나타나기 때문에, 닭의 개체 식별을 위해서는 닭의 특이적인 유전양상에 근거한 표지 유전자를 선정하고, 이들을 활용한 유전자 감식기법을 설정하는 것이 중요하다.Therefore, in case of conventional chicken seeds to be developed in the future, it is necessary to establish a method for identifying individuals using genotypes, to develop high quality meat into branded meat, and to utilize gene detection techniques to increase the reliability of traditional chickens. However, since the domains that can be identified on the genome of chickens vary according to the breed of chicken, it is necessary to select marker genes based on specific genetic patterns of chickens to identify individual chickens, It is important to set up the technique.
한편, 국내에서 닭 유전자의 보존 측면과 품종 간 유전적 다양성 연구와 친자 확인용으로 개발된 유전자 표지(초위성체 마커: Microsatellite Marker)를 활용한 유전자 감식 기법이 사용되고 있긴 하지만, 아직 그 유용성 및 정확도가 떨어질 뿐만 아니라 상대적으로 검사 비용이 비싸고 분석 시간이 오래 걸리는 단점이 있다.In Korea, genetic diversity studies on genetic diversity between breeds and genetic markers (microsatellite markers) developed for paternity identification have been used in Korea. However, its usefulness and accuracy are still unknown. There is a disadvantage in that the inspection cost is relatively high and the analysis time is long.
본 발명의 목적은 정확하고 신속하며 경제적으로 개체 식별이 가능한 초위성체 마커 및 이를 이용한 재래닭의 개체 식별 방법을 제공하는 데 있다. It is an object of the present invention to provide an ultra-satellite marker capable of identifying an individual accurately, quickly and economically, and a method for identifying an individual of a conventional chicken using the same.
이에 본 발명은 바람직한 제1구현예로서, ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330으로 이루어지는 초위성체 마커 세트를 이용하는 재래닭의 개체 식별 방법을 제공하고자 한다.Accordingly, the present invention provides a method for identifying an individual of a conventional chicken using a supersatellite marker set consisting of ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 and MCW0330 I want to.
본 발명은 바람직한 제2구현예로서, 상기 각 초위성체 마커에 특이적인 서열번호 1 및 2, 서열번호 3 및 4, 서열번호 5 및 6, 서열번호 7 및 8, 서열번호 9 및 10, 서열번호 11 및 12, 서열번호 13 및 14, 서열번호 15 및 16, 서열번호 17 및 18, 서열번호 19 및 20, 서열번호 21 및 22, 서열번호 23 및 24의 정방향 프라이머 및 역방향 프라이머 쌍으로 구성되는 재래닭 개체 식별용 프라이머 세트를 제공하고자 한다.The present invention provides, as a second preferred embodiment, a nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 and 2, SEQ ID NO: 3 and 4, SEQ ID NO: 5 and 6, SEQ ID NO: 7 and 8, SEQ ID NO: 9 and 10, And a pair of reverse primers and reverse primers of SEQ ID NOs: 11 and 12, SEQ ID NOs: 13 and 14, SEQ ID NOs: 15 and 16, SEQ ID NOs: 17 and 18, SEQ ID NOs: 19 and 20, SEQ ID NOs: To provide a primer set for identification of a chicken.
본 발명은 바람직한 제3구현예로서, 상기의 프라이머 세트를 포함하는 재래닭 개체 식별용 키트를 제공하고자 한다. As a third preferred embodiment of the present invention, there is provided a kit for identifying a chicken of the present invention comprising the aforementioned primer set.
또한, 본 발명은 바람직한 제4구현예로서, (S1) 식별하고자 하는 재래닭 개체에서 핵산 시료를 얻는 단계; (S2) 상기 (S1) 단계의 핵산 시료를 상기 프라이머 세트를 이용하여 멀티플렉스 PCR로 증폭하는 단계; 및 (S3) 상기 (S2) 단계의 증폭된 산물을 이용하여 유전자형을 결정하는 단계;를 포함하는 재래닭의 개체 식별 방법을 제공하고자 한다.Further, the present invention provides, as a fourth preferred embodiment, (S1) a step of obtaining a nucleic acid sample from a native chicken subject to be identified; (S2) amplifying the nucleic acid sample of step (S1) by multiplex PCR using the primer set; And (S3) determining the genotype using the amplified products of step (S2).
상기 구현예에 의한 재래닭의 개체 식별 방법에서, 상기 (S2) 단계에서 상기 증폭을 위한 멀티플렉스 PCR 반응액의 조성은 주형 DNA 2 내지 10 ng/㎕, 상기 프라이머 세트 8 내지 15 ㎕, DNA 중합효소 0.3 내지 1.0 ㎕, 버퍼 1.5 내지 2.5 ㎕, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs) 1 내지 2 ㎕ 및 증류수 0.1 내지 1 ㎕를 포함하는 것일 수 있다.The composition of the multiplex PCR reaction solution for amplification in step (S2) is 2 to 10 ng / 쨉 l of template DNA, 8 to 15 상기 of the primer set, DNA polymerisation 0.3 to 1.0 μl of enzyme, 1.5 to 2.5 μl of buffer, 1 to 2 μl of deoxynucleotides (dNTPs) and 0.1 to 1 μl of distilled water.
상기 구현예에 의한 재래닭의 개체 식별 방법에서, 상기 각 초위성체 마커는 대립유전자 수가 5~15개이고, 기대이형접합율은 60% 보다 높게 나타나며, 유전자의 크기는 80 bp~300 bp인 것일 수 있다.In the individual identification method of conventional chicken according to this embodiment, the number of alleles is 5-15, the expected heterozygosity is higher than 60%, and the size of the gene is 80 bp to 300 bp have.
또한, 상기 (S2) 단계에서 멀티플렉스 PCR 증폭은 95℃에서 10분간 반응하고, 95℃에서 30초, 54~56℃에서 25~35초 및 72℃에서 1분간 반응시키는 것을 한 사이클로 하여 25~35회 반복하고, 72℃에서 30분간 반응시키는 것일 수 있다.In step (S2), the multiplex PCR amplification was carried out at 95 ° C for 10 minutes, followed by reaction at 95 ° C for 30 seconds, 54 to 56 ° C for 25 to 35 seconds and 72 ° C for 1 minute, 35 times, and reacting at 72 캜 for 30 minutes.
본 발명에 따른 재래닭의 개체 식별 방법은 종래 기술에서 사용된 것보다 높은 개체 식별력을 가진 초위성체 마커들의 조합을 이용하고 있어, 보다 정확한 식별 결과를 제공할 수 있다. 더욱 구체적으로는, 본 발명의 12종의 초위성체 마커들은 동일개체 출현확률이 무작위 교배집단에서는 2.88 × 10-21, 반형매 교배집단에서는 1.72 × 10- 15으로, 국내에서 사육되는 재래닭에 대하여 동일개체 출현 가능성이 없어 재래닭의 개체 식별에 유용하게 사용될 수 있다.The method of identifying an individual of a conventional chicken according to the present invention uses a combination of supersize satellite markers having higher individuality than that used in the prior art, thereby providing more accurate identification results. More specifically, the 12 kinds of satellites second marker of the invention are the same object appearance probability of a random mating population in 2.88 × 10 -21, half the breeding population hyeongmae 1.72 × 10 - 15, for the native chickens are bred in the country There is no possibility of occurrence of the same individual, so that it can be usefully used for identification of a native chicken.
이에 따라, 재래닭의 유통과정에서 닭의 원산지 또는 유입경로를 쉽게 판별하여 부정행위를 방지하는 수단으로 활용될 수 있으며, 재래닭에 대한 소비자의 신뢰도를 상승시켜 생산 농가의 소득 증대에 도움을 줄 수 있다.Therefore, it can be used as a means to prevent cheating by easily discriminating origin or route of chicken in the distribution process of traditional chicken, and it can be used as a means to increase the reliability of the consumer for the traditional chicken, .
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 초위성체 마커 세트에 특이적인 프라이머를 이용하여 수득한 PCR 산물의 전기영동 결과를 나타낸 사진이다.
도 2는 PCoA 분석을 통해 얻은 결과로 가로축(제 1분산치)과 세로축(제 2분산치)에 의해 각 집단이 분포한 결과를 나타내는 것이다.
도 3은 PCoA 분석을 통해 얻은 결과로 가로축(제 2분산치)과 세로축(제 3분산치)에 의해 각 집단이 분포한 결과를 나타내는 것이다. FIG. 1 is a photograph showing the result of electrophoresis of a PCR product obtained using a primer specific to a supersatellite marker set according to an embodiment of the present invention.
Fig. 2 shows the results obtained by PCoA analysis, in which the respective groups are distributed by the horizontal axis (first dispersion value) and the vertical axis (second dispersion value).
Fig. 3 shows the results obtained by PCoA analysis, in which the respective groups are distributed by the horizontal axis (second dispersion value) and the vertical axis (third dispersion value).
이하, 본 발명을 보다 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.
본 발명은 정확하고 신속하며 경제적으로 개체 식별이 가능한 초위성체 마커 및 이를 이용한 재래닭의 개체 식별 방법을 제공하고자 한다. The present invention is to provide an ultra-satellite marker capable of identifying an individual accurately, quickly and economically, and a method for identifying an individual of a conventional chicken using the same.
이를 위하여 본 발명은 ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330로 이루어지는 초위성체 마커 세트를 이용하는 재래닭의 개체 식별 방법을 제공한다.
To this end, the present invention provides an individual identification method of a conventional chicken using a supersatellite marker set consisting of ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 and MCW0330.
본 발명에서 용어, "초위성체(microsatellite)"는 2 내지 6개의 염기서열이 반복되는 구조를 가지는 STR(short tandem repeat)을 의미한다. 이러한 초위성체는 대부분의 진핵생물 게놈에 골고루 분포되어 있는 것으로 알려져 있으며, 특히 non-coding DNA에 주로 존재한다. The term "microsatellite " in the present invention means STR (short tandem repeat) having a structure in which 2 to 6 nucleotide sequences are repeated. These supersatellites are known to be uniformly distributed in most eukaryotic genomes, and are mainly present in non-coding DNA.
본 발명에서 용어, "초위성체 마커"는 상기 초위성체 반복 단위의 반복수에 변이가 존재하여 발생하는 다형성을 의미한다. In the present invention, the term "supersatellite marker" means a polymorphism generated by a variation in the number of repeats of the supersatellite repeating unit.
이와 같은 초위성체 마커는, 개체 또는 종에 따라 초위성체 반복 단위의 반복수가 다양할 수 있으므로, 초위성체가 반복되는 부분의 양쪽 염기쌍 중에 유전자상에서 독특한 서열을 프라이머 서열로 디자인하고 PCR 증폭을 수행한 다음, 수득하는 산물의 크기를 비교하여 개체 또는 종을 식별할 수 있다.
Since the number of repetition units of supersatellite repeating units may vary depending on the species or species, such a supersatellite marker may design a primer sequence as a primer sequence in both base pairs of repeating regions of the supersatellite and perform PCR amplification , The size of the resulting product can be compared to identify the individual or species.
본 발명에서는 이형접합률 및 PCR 증폭 산물의 크기를 모두 고려하여, 동일 개체 출현 가능성 없이 재래닭의 개체 식별을 가져올 수 있는 초위성체 마커 세트를 규명하였다. 이러한 본 발명의 초위성체 마커 세트는 ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330로 이루어지는 초위성체 마커 세트를 포함하며, 상기 초위성체에 대한 정보는 미국 국립 생물정보센터(NCBI) 데이터 베이스(www.NCBI.nlm.nih.gov) 등에서 그 정보를 얻을 수 있다. 또한, 상기 본 발명의 초위성체 마커 세트는 신품종 개발의 수집모본과 교배계군을 대상으로 고려하여 조합한 것이므로 향후 국내 유통되는 재래닭의 개체 식별에 유용하다.
In the present invention, a set of supersampling markers capable of identifying an individual of a conventional chicken without the possibility of occurrence of the same individual has been identified by considering both the heterozygosity and the size of the PCR amplification product. The super satellites marker set of the present invention includes a super satellites marker set consisting of ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 and MCW0330, Information is available from the National Center for Biological Information (NCBI) database (www.NCBI.nlm.nih.gov). In addition, since the supersatellite marker set of the present invention is a combination of collected samples of the development of a new variety and a crossbreeding group, it is useful for identification of an individual of a domestic chicken distributed in the future.
본 발명에서 용어, "프라이머 (primer)"는 짧은 자유 3' 말단 수산화기를 가지는 핵산 서열로 상보적인 주형(template)과 염기쌍을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 핵산 서열을 의미한다. The term "primer " as used herein refers to a nucleic acid sequence having a short free 3 'terminal hydroxyl group, a short nucleic acid sequence capable of forming base pairs with a complementary template and serving as a starting point for template strand copy .
본 발명에서 MCW0145에 대한 프라이머쌍은 서열번호 1의 정방향 프라이머 및 서열번호 2의 역방향 프라이머 쌍, MCW0087에 대한 프라이머쌍은 서열번호 3의 정방향 프라이머 및 서열번호 4의 역방향 프라이머쌍, MCW0127에 대한 프라이머쌍은 서열번호 5의 정방향 프라이머 및 서열번호 6의 역방향 프라이머 쌍, LEI0094에 대한 프라이머쌍은 서열번호 7의 정방향 프라이머 및 서열번호 8의 역방향 프라이머 쌍, ADL0317에 대한 프라이머쌍은 서열번호 9의 정방향 프라이머 및 서열번호 10의 역방향 프라이머 쌍, MCW0029에 대한 프라이머쌍은 서열번호 11의 정방향 프라이머 및 서열번호 12의 역방향 프라이머 쌍 및 GCT0016에 대한 프라이머쌍은 서열번호 13의 정방향 프라이머 및 서열번호 14의 역방향 프라이머 쌍, MCW0104에 대한 프라이머쌍은 서열번호 15의 정방향 프라이머 및 서열번호 16의 역방향 프라이머 쌍, MCW0123에 대한 프라이머쌍은 서열번호 17의 정방향 프라이머 및 서열번호 18의 역방향 프라이머 쌍, MCW0330에 대한 프라이머쌍은 서열번호 19의 정방향 프라이머 및 서열번호 20의 역방향 프라이머쌍, ADL0293에 대한 프라이머쌍은 서열번호 21의 정방향 프라이머 및 서열번호 22의 역방향 프라이머 쌍, ADL0304에 대한 프라이머쌍은 서열번호 23의 정방향 프라이머 및 서열번호 24의 역방향 프라이머 쌍인 것일 수 있으나 이에 제한되지 않으며, 상기 초위성체 마커에 특이적으로 결합하여 증폭 산물을 생산할 수 있는 프라이머라면 본 발명의 범주에 모두 포함된다.
In the present invention, the primer pair for MCW0145 is a forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer pair of SEQ ID NO: 2, the primer pair for MCW0087 is a forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer pair of SEQ ID NO: 4, the primer pair for MCW0127 The primer pair of SEQ ID NO: 5 and the reverse primer of SEQ ID NO: 6, the primer pair of LEI0094 is the forward primer of SEQ ID NO: 7, the reverse primer pair of SEQ ID NO: 8, the primer pair of ADL0317 is the forward primer of SEQ ID NO: The reverse primer pair of SEQ ID NO: 10, the reverse primer pair of SEQ ID NO: 12, the reverse primer pair of SEQ ID NO: 12 and the reverse primer pair of GCT0016, the reverse primer pair of SEQ ID NO: 13 and the reverse primer pair of SEQ ID NO: The primer pair for MCW0104 is a forward primer of SEQ ID NO: The primer pair of SEQ ID NO: 16, the primer pair of MCW0123, the reverse primer of SEQ ID NO: 17, the reverse primer of SEQ ID NO: 18, the primer pair of MCW0330 is the forward primer of SEQ ID NO: 19 and the reverse primer pair of SEQ ID NO: The primer pair for ADL0293 may be a forward primer of SEQ ID NO: 21, the reverse primer pair of SEQ ID NO: 22, the primer pair for ADL0304 may be a forward primer of SEQ ID NO: 23 and a pair of reverse primers of SEQ ID NO: Any primer that can specifically bind to a supersatellite marker to produce an amplification product is included in the scope of the present invention.
본 발명에서 용어, "PCR(polymerase chain reaction)"은 DNA의 원하는 부분을 복제 및 증폭시키는 분자생물학적 기술이다. 구체적으로, PCR은 일련의 세 개의 단계를 포함한다. PCR의 첫 번째 단계는 DNA를 변성(Denaturation)시키는 것으로, 두 가닥의 DNA를 가열함으로써 분리시킬 수 있다. 분리된 각각의 DNA는 주형(Template)으로서 역할을 하게 된다. PCR의 두 번째 단계는 결합(Annealing)으로, 이 단계에서 초위성체 마커에 대한 프라이머들이 주형 DNA에 결합을 하게 된다. 결합(Annealing) 온도는 반응의 정확성을 결정하는 중요한 요소인데 만약 온도를 너무 높게 하면 프라이머가 주형 DNA에 너무 약하게 결합되어서 증폭된 DNA의 산물이 매우 적어진다. 또 만약 온도를 너무 낮게 하면 프라이머가 비특이적으로 결합하기 때문에 원하지 않는 DNA가 증폭될 수 있어, 사용하는 프라이머들의 종류 등에 따라 온도는 적절히 조절되어야 한다. PCR의 세 번째 단계는 신장(Extension) 단계이다. 이 단계에서 주형에 프라이머가 결합한 경우에는 열에 강한 DNA 중합효소가 주형 DNA에서 새로운 DNA를 만들게 된다.The term "PCR (polymerase chain reaction)" in the present invention is a molecular biological technique for replicating and amplifying a desired portion of DNA. Specifically, PCR involves a series of three steps. The first step in PCR is denaturation of the DNA, which can be separated by heating two strands of DNA. Each separated DNA serves as a template. The second step in the PCR is annealing, in which primers for the supersatellite marker bind to the template DNA. Annealing temperature is an important factor in determining the accuracy of the reaction. If the temperature is too high, the primer will bind too weakly to the template DNA, resulting in very little amplified DNA product. If the temperature is too low, undesired DNA can be amplified because the primer binds nonspecifically, and the temperature should be appropriately controlled depending on the kind of primers used. The third step of the PCR is the Extension step. At this stage, when the primer binds to the template, a heat-resistant DNA polymerase will make a new DNA from the template DNA.
본 발명과 같이 수개의 초위성체 마커에 대하여 분석을 수행하는 경우에는 멀티플렉스 PCR을 사용할 수 있다.
Multiplex PCR may be used when analysis is performed on several supersatellite markers as in the present invention.
본 발명에서 용어, "멀티플렉스 PCR(multiplex PCR)"은, 하나의 주형 DNA에 대한 한 개의 유전자을 증폭하는 단일 PCR과 달리 여러 개의 유전자를 동시에 증폭하는 PCR 기법을 의미한다. 멀티플렉스 PCR에서는 단일 PCR 혼합물에 여러 프라이머쌍이 포함시키는 데, 이때 서로 다른 DNA 서열에 대해서는 각각에 특이적인 증폭 산물의 크기 범위를 나타내어 크기가 서로 중첩되지 않도록 하는 것이 바람직하다. 멀티플레스 PCR 기법에서는 여러 종류의 다른 프라이머 쌍을 한 튜브에 넣고 반응시키기 때문에, 프라이머 간에 억제 (inhibition)가 발생할 수 있으므로, 멀티플렉스 PCR에 적용할 때에는 증폭하고자 하는 유전자들에 대한 프라이머들의 선정이 중요하다. 또한 포함되는 여러 프라이머마다 적합한 결합 온도가 다를 수 있으므로, 멀티플렉스 PCR 적용시에는 단일 PCR 반응에서 포함되는 PCR 프라이머 쌍 모두가 효과적으로 결합할 수 있도록 멀티플렉스 PCR에 적합한 결합 온도의 최적화가 요구된다.
In the present invention, the term "multiplex PCR" means a PCR technique in which multiple genes are simultaneously amplified, unlike a single PCR that amplifies one gene for one template DNA. In multiplex PCR, it is desirable to include multiple pairs of primers in a single PCR mixture, each of which has a specific amplification product size range for the different DNA sequences so that the sizes do not overlap with each other. In multiplex PCR, multiple primer pairs are inserted into one tube and reacted, so that inhibition may occur between primers. Therefore, when applying to multiplex PCR, selection of primers for the genes to be amplified is important Do. In addition, since the appropriate binding temperature may be different for each of the included primers, it is necessary to optimize the binding temperature suitable for multiplex PCR so that all pairs of PCR primers included in a single PCR reaction can be effectively combined when multiplex PCR is applied.
이와 같은 PCR 수행 후에는, PCR 증폭 산물은 SDS-PAGE나 모세관 전기영동(capillary electrophoresis)과 같은, PCR 증폭 산물의 크기에 따른 분류가 가능한 기법으로 개체 식별을 할 수 있다.
After such PCR, the PCR amplification product can be identified by a technique that can be classified according to the size of the PCR amplification product, such as SDS-PAGE or capillary electrophoresis.
구체적으로, 전기영동법 등으로 PCR 증폭 산물을 크기별로 분류하여 이의 크기 결정을 통하여 각 대립유전자에 얼마나 많은 반복단위가 포함되어 있는지 알 수 있다. 따라서, 상기와 같은 유전자형 데이터와 검증한 재래닭의 데이터를 기록하는 데이터 베이스를 별도로 구축하거나 규명된 정보를 이용하여, 이러한 정보와 실험을 통해 확인된 자료를 서로 비교하여 개체를 식별할 수 있다. Specifically, it is possible to determine how many repeating units are contained in each allele by classifying the PCR amplification products by size and determining their sizes by electrophoresis or the like. Accordingly, the genotype data as described above and the database for recording the authentic native chicken data can be separately constructed or the authenticated information can be used to identify the individual by comparing the information confirmed through experiment with the data.
특히, 본 발명의 12개의 초위성체 마커를 이용할 경우, 동일 개체 출현 확률이 무작위 교배집단에서는 2.88 × 10-21, 반형매 교배집단에서 1.72 × 10-15, 전형매 교배집단에서 1.38×10-7로 나타난 결과에 비추어, 12개의 초위성체 마커에 대하여 PCR 반응을 수행한 다음, 12개의 초위성체 마커에 대한 정보를 모두 종합하는 경우 높은 정확도로 개체를 식별할 수 있다.
In particular, when using the 12 satellites markers of the present invention, the probability of appearance of the same individual was 2.88 × 10 -21 in the random mated group, 1.72 × 10 -15 in the semi-mated group, 1.38 × 10 -7 , It is possible to identify the object with high accuracy when the PCR reaction is performed on the 12 satellites 'markers and then all the information on the 12 satellites' markers are synthesized.
하기 본 발명의 실시예에서는, 이형접합률, 증폭산물의 크기를 고려하여, 재래닭 개체식별에 효과적으로 사용할 수 있는 두 세트의 초위성체 마커의 조합을 규명하였고, 이러한 각각의 초위성체 마커 조합에 대한 프라이머 쌍을 사용하여 멀티플렉스 PCR을 수행하였을 때, 상기 초위성체 마커들을 효과적으로 증폭시킬 뿐 아니라 보다 정확하고 신속하며 경제적인 식별이 가능함을 나타내었다. In the following embodiments of the present invention, the combination of two sets of supersatellite markers that can be effectively used for identification of a conventional chicken is identified in consideration of heterozygosity and amplification product size. When multiplex PCR was performed using primer pairs, it was shown that not only amplification of the supersatellite markers but also more accurate, quick and economical identification was possible.
또한, 상기 본 발명에 따른 12종의 초위성체 마커들은 동일 개체 출현 확률이 무작위 교배집단에서는 2.88 × 10-21, 반형매 교배집단에서 1.72 × 10-15, 전형매 교배집단에서 1.38×10-7로 나타난 결과로부터, 국내에서 사육 유통되고 있는 재래닭의 두수를 고려하여도 동일개체 출현 가능성이 없는 것으로 판단되었다.
In addition, the 12 species of supersatellite markers according to the present invention showed a 2.88 × 10 -21 , 1.72 × 10 -15 , and 1.38 × 10 -7 , respectively, probability of occurrence in the same mating group, , It was concluded that the same species did not appear even considering the number of domestic chickens in Korea.
본 발명은 또 다른 하나의 구체예로서, 본 발명은 상기의 프라이머 세트를 포함하는 재래닭 개체 식별용 키트를 제공한다. As another embodiment of the present invention, the present invention provides a kit for identifying a conventional chicken comprising the above-described primer set.
상기 재래닭 개체 식별용 키트는, 초위성체 PCR 키트 형태일 수 있으며, 바람직하게는 멀티플렉스 PCR 키트이다.The conventional chicken identification kit may be in the form of a supersatellite PCR kit, preferably a multiplex PCR kit.
상기 PCR 키트는 상기 초위성체 마커들을 포함하는 폴리뉴클레오티드에 대해 특이적인 프라이머 쌍들로 구성되는 프라이머 세트, DNA 중합효소, 중합효소 반응을 도와주는 버퍼, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), 3차 증류수(Distilled-water), 테스트 튜브 및 적절한 컨테이너 등을 포함할 수 있다.The PCR kit comprises a primer set consisting of primer pairs specific for a polynucleotide comprising the supersatellite markers, a DNA polymerase, a buffer to aid the polymerase reaction, deoxynucleotides (dNTPs), a distilled- water, test tubes and suitable containers, and the like.
상기 PCR 키트에는 구체적으로 식별을 하기 위한 개체의 주형 DNA 2 내지 10 ng/㎕, 상기 프라이머 세트 8 내지 15 ㎕, DNA 중합효소 0.3 내지 1.0 ㎕, 버퍼 1.5 내지 2.5 ㎕, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs) 1 내지 2 ㎕ 및 증류수 0.1 내지 1 ㎕를 포함할 수 있다.
In the PCR kit, 2 to 10 ng / μl of the template DNA of the individual to be specifically identified, 8 to 15 μl of the primer set, 0.3 to 1.0 μl of DNA polymerase, 1.5 to 2.5 μl of buffer, 1 μl of deoxynucleotide (dNTPs) To 2 [mu] l of distilled water and 0.1 to 1 [mu] l of distilled water.
본 발명은 또 다른 하나의 구체예로서, 분석하고자 하는 재래닭 개체로부터 분리한 핵산 시료와 ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330로 이루어지는 초위성체 마커 세트 각각에 특이적인 프라이머 쌍들로 구성되는 프라이머 세트를 이용하여 멀티플렉스 PCR 증폭하는 단계를 포함하는 재래닭의 개체 식별 방법을 제공한다.
In another embodiment, the present invention provides a nucleic acid sample isolated from a native chicken subject to be analyzed and a supersatellite consisting of ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 and MCW0330 And multiplex PCR amplification using a primer set consisting of primer pairs specific to each marker set.
본 발명에서 용어, "핵산 시료"는 본 발명의 초위성체 마커를 증폭할 수 있는, 재래닭의 DNA와 같은 시료를 의미한다. 상기 핵산 시료는 재래닭의 모근, 혈액, 각종 체액, 분리된 조직, 분리된 세포 또는 타액과 같은 샘플로부터 얻은 것을 포함하나, 이에 제한되지 않는다.
In the present invention, the term "nucleic acid sample" means a sample such as a DNA of a conventional chicken capable of amplifying supersatellite markers of the present invention. Such nucleic acid samples include, but are not limited to, those obtained from samples such as hair follicles, blood, various body fluids, isolated tissues, isolated cells or saliva of native chicken.
본 발명의 다른 방법은 상기와 같은 재래닭 개체로부터 유래한 주형 DNA에 본 발명의 상기 초위성체 마커 세트에 특이적인 프라이머쌍들을 포함하는 프라이머 세트를 혼합한 다음, multiplex PCR 로 증폭하여 수행할 수 있다. 그리고, 상기 증폭된 산물을 이용하여 유전자형을 결정함으로써 더욱 경제적이고 신속한 식별 결과를 용이하게 얻을 수 있다.In another method of the present invention, primer sets containing primer pairs specific to the supersatellite marker set of the present invention may be mixed with template DNA derived from the conventional chicken, and amplified by multiplex PCR . By determining the genotype using the amplified product, a more economical and quick identification result can be obtained easily.
구체적으로 본 발명은, (S1) 식별하고자 하는 재래닭 개체에서 핵산 시료를 얻는 단계; (S2) 상기 (S1) 단계의 핵산 시료를 상기 제2항의 프라이머 세트를 이용하여 멀티플렉스 PCR로 증폭하는 단계; 및 (S3) 상기 (S2) 단계의 증폭된 산물을 이용하여 유전자형을 결정하는 단계;를 포함하는 재래닭의 개체 식별 방법을 제공한다.Specifically, the present invention provides a method for producing a nucleic acid comprising the steps of: (S1) obtaining a nucleic acid sample from a native chicken subject to be identified; (S2) amplifying the nucleic acid sample of step (S1) by multiplex PCR using the primer set of the second aspect; And (S3) determining the genotype using the amplified product of step (S2).
본 발명의 일 실시예에 의한 개체 식별 방법에서, 상기 증폭을 위한 멀티플렉스 PCR 반응액의 조성은 주형 DNA 2 내지 10 ng/㎕, 상기 프라이머 세트 8 내지 15 ㎕, DNA 중합효소 0.3 내지 1.0 ㎕, 버퍼 1.5 내지 2.5 ㎕, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs) 1 내지 2 ㎕ 및 증류수 0.1 내지 1 ㎕를 포함할 수 있다. 상기와 같은 상기 초위성체 마커 세트를 이용한 멀티플렉스 PCR 반응액의 조성은 10 ng/㎕ 이하의 극소량의 DNA로도 충분히 분석 가능한 결과를 얻을 수 있는 장점이 있다. 또한, 상기 초위성체 마커 세트는 유전적 다형성이 매우 높은 마커들로 조합되어 있어 정확하고 신속한 개체 식별이 가능하다.In the method for identifying an individual according to an embodiment of the present invention, the composition of the multiplex PCR reaction solution for amplification is 2 to 10 ng / μl of template DNA, 8 to 15 μl of the primer set, 0.3 to 1.0 μl of DNA polymerase, 1.5 to 2.5 μl of buffer, 1 to 2 μl of deoxynucleotides (dNTPs) and 0.1 to 1 μl of distilled water. The composition of the multiplex PCR reaction solution using the supersatellite marker set as described above is advantageous in that a sufficient analysis result can be obtained even with a very small amount of DNA of 10 ng / μl or less. In addition, the superscalar marker sets are combined with highly genetic polymorphic markers, enabling accurate and rapid individual identification.
상기 멀티플렉스 PCR 반응액의 최적의 조성은 주형 DNA 5 ng/㎕, 상기 프라이머 세트 9.6 ㎕, DNA 중합효소 0.6 ㎕, 버퍼 1.8 ㎕, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs) 1.5 ㎕ 및 증류수 0.5 ㎕를 포함하는 것이다.
The optimum composition of the multiplex PCR reaction solution was 5 ng / 주 of template DNA, 9.6 ㎕ of the primer set, 0.6 DNA of DNA polymerase, 1.8 버퍼 of buffer, 1.5 데 of deoxynucleotides (dNTPs) and 0.5 증 of distilled water .
여기서, PCR 증폭 과정은 변성, 결합 및 신장 단계가 반복되면서 특정 부위를 증폭시키게 된다. 이때, 본 발명의 방법에서는 멀티플렉스 PCR 기법으로 수행하는 것이 보다 바람직하며, 이 경우, 단일 튜브에 여러 프라이머 쌍이 포함되므로 결합 온도를 최적화할 필요가 있다.Here, the PCR amplification process amplifies a specific site by repeating denaturation, binding, and elongation steps. In this case, it is more preferable to perform multiplex PCR in the method of the present invention. In this case, since a plurality of primer pairs are included in a single tube, it is necessary to optimize the binding temperature.
구체적으로, 상기 (S2) 단계에서의 멀티플렉스 PCR 증폭 조건은 95℃에서 10분간 반응하고, 95℃에서 30초, 54~56℃에서 25~35초 및 72℃에서 1분간 반응시키는 것을 한 사이클로 하여 25~35회 반복하고, 72℃에서 30분간 반응시키는 것일 수 있다.Specifically, the multiplex PCR amplification conditions in step (S2) were 10 min at 95 ° C, 30 sec at 95 ° C, 25-35 sec at 54-56 ° C, and 1 min at 72 ° C Followed by repeating 25 to 35 times, and reacting at 72 DEG C for 30 minutes.
이와 같은 PCR 과정을 수행한 후에는, 전기영동 등의 방법을 이용하여 증폭된 산물의 크기를 분석하고, 분석된 증폭 산물의 크기 등을 바탕으로 대립유전자를 결정하여 개체 식별을 할 수 있다.After performing the PCR, the size of the amplified product can be analyzed by electrophoresis, and the allele can be determined based on the size of the amplified product.
상기 개체 식별 방법에서, 각 초위성체 마커는 대립유전자 수가 5~15개이고, 기대이형접합율은 60% 보다 높게 나타나며, 유전자의 크기는 80bp~300bp일 수 있다.
In this method, the number of alleles is 5 to 15, the expected heterozygosity is higher than 60%, and the size of the gene may be 80 bp to 300 bp.
이하, 바람직한 실시예를 들어 본 발명을 더욱 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이에 의하여 제한되지 않는다는 것은 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 자명할 것이다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to preferred embodiments. It will be apparent, however, to those skilled in the art that these embodiments are for further explanation of the present invention and that the scope of the present invention is not limited thereby.
실시예Example
실시예Example 1: One: 재래닭의Traditional chicken 개체식별을 위한 For object identification 초위성체Super satellites 마커Marker 선발 Selection
재래닭 개체 식별에 효과적으로 사용될 수 있는 초위성체 마커를 선발하기 위해, Seo 등(2013, Discrimination of Korean native chicken lines using fifteen selected microsatellite markers)에 의해 보고된 닭의 크로모좀 전 영역에 위치한 닭 다형성 분석용 초위성체 마커 150종을 검토하였다. 상기 150종의 마커를 토대로 하여 대립유전자의 크기, 다형지수, 형광물질의 색상 등을 고려하였고, 최종적으로 개체 식별 및 생산이력 시스템 활용에 유용한 12종의 초위성체 마커를 선발하였다. 상기 선발된 초위성체 마커의 대립유전자의 수는 5개부터 14개까지 평균 9.33개였고, 이형접합률은 평균 77% 이상으로서 높은 개체 식별의 정확도를 가지고 있다. 상기 초위성체 마커 조합을 하기 표 1에 구체적으로 나타내었다.In order to select the supersatellite markers that can be effectively used for identification of the native chicken, Seo et al. (2013, Discrimination of Korean native chicken lines using fifteen selected microsatellite markers) 150 satellites were examined. Based on the above 150 markers, allele size, polymorphism, and color of fluorescent material were considered. Finally, 12 kinds of supersatellite markers useful for individual identification and production history system were selected. The number of alleles of the selected supersatellite markers ranged from 5 to 14 on average of 9.33, and the heterozygosity rate was more than 77% on average and had high individual identification accuracy. The combination of the supersatellite markers is specifically shown in Table 1 below.
실시예Example 2: 공시 재료 및 2: Disclosure materials and DNADNA 시료 sample
한협의 실용계 PL 7계통(A, F, H, S, W, Y, Z) 국내 가금종자와 국립축산과학원 가금과에서 보존하고 있는 토종 실용계 한협 3호, 우리맛닭 1호, 2호, 그리고 실용육계로 널리 알려진 로스(Ross), 코브(Cobb), 아바에이커(Arbor Acres)의 익하정맥에서 채혈하였으며, 총 566수를 공시재료로 사용하였다. 상기 공시재료의 종 및 개체 수를 정리하여 하기 표 2에 나타내었다.(A, F, H, S, W, Y, and Z) of the practical system of the consultation, the domestic poultry seeds and the national poultry academy, And blood was collected from the subcutaneous veins of Ross, Cobb and Arbor Acres which are widely known as practical broilers. Table 2 summarizes the species and the number of individuals of the above-mentioned disclosure materials.
상기 채혈한 혈액 샘플은 SSC 버퍼로 처리하여 혈구를 분리하였으며, 각 20㎕의 혈구샘플은 Genomic DNA isolation kit from blood(Genetbio, Korea)를 이용하여 제조사가 권장하는 방법에 따라 Genomic DNA를 추출하여 -20℃에서 보관하였다.The collected blood samples were treated with SSC buffer to separate the blood cells. Each 20 μl of the blood sample was subjected to extraction with genomic DNA isolation kit from blood (Genetbio, Korea) according to a method recommended by the manufacturer, And stored at 20 ° C.
실시예Example 3: 3: 초위성체Super satellites 마커에On the marker 특이적인 유전자 증폭 Specific gene amplification 프라이머primer 제작 making
실시예 1을 통해 선발된 초위성체 마커 세트에 특이적인 프라이머는 써모피셔사이언티픽사에 의뢰하여 주문 제작하였다. 각 프라이머 중 정방향 프라이머 끝에 FAM, NED, VIC, PET으로 이루어진 표지 형광물질을 부착하였으며, 각각의 서열번호, 마커 명칭, 염색체 위치, 염기서열, 증폭산물의 크기(Product size) 및 부착된 형광물질(Dye) 등을 하기 표 3에 나타내었다.A primer specific to the supersatellite marker set selected in Example 1 was customized by Thermofisher Scientific Corporation. A tagged fluorescent material consisting of FAM, NED, VIC and PET was attached to the end of the forward primer of each primer, and the sequence number, the marker name, the chromosome position, the base sequence, the product size and the attached fluorescent material Dye) and the like are shown in Table 3 below.
번호order
number
F: 정방향(5’~3’)
R: 역방향(3’~5’)primer
F: Forward (5 'to 3')
R: reverse direction (3 'to 5')
크기Amplification product
size
물질Neon
matter
실시예Example 4: 멀티플렉스 4: Multiplex PCRPCR 증폭 Amplification
상기 실시예 2에서 수집된 DNA 시료를 주형으로 하고, 실시예 3을 통해 제작된 12쌍의 프라이머를 사용하여 다중 중합효소연쇄반응(multiplex PCR)을 다음과 같은 조건으로 각각 수행하였다.Using the DNA samples collected in Example 2 as a template, multiplex PCR using 12 pairs of primers prepared in Example 3 was carried out under the following conditions.
멀티플렉스 PCR 반응액은 주형 DNA 5 ng/㎕, 각각의 프라이머(10 pmole)는 형광물질의 감도를 고려하여 약 0.4 ㎕씩으로 프라이머 조합은 총 9.6 ㎕, 250 U의 Hot Start Taq DNA 중합효소(GENETBIO, Korea) 0.6㎕, 10× Buffer 1.8 ㎕, 2.5 mM의 dNTP 1.5 ㎕를 첨가한 후, 증류수 0.5 ㎕를 첨가하여 총 15 ㎕로 제조하였다. 상기 PCR 반응액의 조성을 하기 표 4에 나타내었다.For the multiplex PCR reaction, 5 μg / μl of template DNA and 10 μl of each primer were mixed with about 0.4 μl of each primer in consideration of the sensitivity of the fluorescent material. Total primer combination was 9.6 μl, 250 U of Hot Start Taq DNA polymerase (GENETBIO , Korea), 1.8 占 퐇 of 10 占 buffer and 1.5 占 퐇 of 2.5 mM dNTP were added, and then 0.5 占 퐇 of distilled water was added to make 15 占 퐇 in total. The composition of the PCR reaction solution is shown in Table 4 below.
그리고, 95 ℃에서 30 분간 pre-denaturation 후 95 ℃에서 30 초간 denaturation, 55 ℃에서 30 초간 annealing, 72 ℃에서 30 초간 extension을 30회 반복한 후 30 분간 72 ℃에서 final-extension을 수행하여 최적의 Muliplex PCR 조건을 확립하였다. 상기 PCR 반응 수행 조건을 하기 표 5에 나타내었다.After pre-denaturation at 95 ° C for 30 minutes, denaturation at 95 ° C for 30 seconds, annealing at 55 ° C for 30 seconds, extension at 72 ° C for 30 seconds, and final extension at 72 ° C for 30 minutes, Muliplex PCR conditions were established. The PCR reaction conditions are shown in Table 5 below.
30
30
상기 멀티플렉스 PCR로 증폭된 산물들은 결과에 따라 Hi-DiTMformamide와 GeneScanTM-500LIZTMsizestandard로 희석하고, Genetic Analyzer 3130xl 자동 염기서열 분석장치(Applied Biosystems, USA)를 사용하여 크기 및 형광물질별로 분류되도록 전기영동을 실시하여 Fragment analysis를 수행하였다. 상기 초위성체 마커 세트에 특이적인 프라이머를 이용하여 수득한 PCR 산물의 전기영동 결과를 도 1에 나타내었다. The products amplified by the multiplex PCR were diluted with Hi-DiTformamide and GeneScan (TM) 500LIZTMsizestandard according to the result, and electrophoresis was performed using a Genetic Analyzer 3130xl automatic sequencing apparatus (Applied Biosystems, USA) Fragment analysis was performed. The result of the electrophoresis of the PCR product obtained using the primer specific to the supersatellite marker set is shown in FIG.
초위성체 마커 종류별 대립유전자형의 정확한 크기 및 대립유전자 수 등은 GeneMapper ver 4.1(Applied Biosystems, USA)을 이용하여 결정하였다.
The exact size of the allele genotype and the number of alleles were determined by GeneMapper ver. 4.1 (Applied Biosystems, USA).
실시예Example 5: 5: 초위성체Super satellites 마커의Marker 다형지수Polymorphism index 분석 analysis
실시예 4에서 확인된 각 마커의 대립유전자를 이용하여, 전체 집단에 대한 집단의 관측이형접합율(observed heterozygosity, Hobs), 기대이형접합율(expected heterozygosity, Hexp), 다형성정보지수(Polymorphism information content, PIC)를 Cervus 3.0 program(version 3.0.3 The University of Edinburgh)을 이용하여 계산하였다(Marshall et al(1998) Mol. Ecol. 7:639-655).Using the alleles of each marker identified in Example 4, the observed heterozygosity (Hobs), expected heterozygosity (Hexp), polymorphism information content , PIC) were calculated using the Cervus 3.0 program (version 3.0.3 The University of Edinburgh) (Marshall et al (1998) Mol. Ecol. 7: 639-655).
그 결과 각 초위성체 마커의 다형지수는 하기 표 6에 나타낸 바와 같다.As a result, the polymorphism index of each supersatellite marker is as shown in Table 6 below.
유전자수Opposition
Number of genes
전체집단을 대상으로 12종의 초위성체 마커를 분석한 결과, 5개(MCW0123)부터 14개(MCW0104)까지 평균 9.33개의 대립유전자가 확인되었다. 또한, 본 발명의 초위성체 마커는 기대이형접합율(Hexp)값과 다형성정보지수(PIC)의 값이 각각 평균 0.775, 0.740로 상당히 높게 나타나 개체식별 마커로써의 우수성을 증명하였다. 참고로, 초위성체 마커의 다형성 정도를 판단하는 기준인 기대이형접합율(Hexp)값이 0.6 이상이고, 다형성정보지수(PIC)의 값이 0.5 이상인 마커는 높은 다형성을 나타내는 것이라고 보고된 바 있다(Botstein, D., et al., 1980).
A total of 9 species of alleles were identified from 5 (MCW0123) to 14 (MCW0104). In addition, supersatellite markers of the present invention showed high values of expected heterozygosity (Hexp) value and polymorphism information index (PIC) of 0.775 and 0.740, respectively, and proved superiority as an individual identification marker. For reference, it has been reported that a marker with a predicted heterozygosity (Hexp) value of 0.6 or more and a polymorphism information index (PIC) value of 0.5 or more, which is a criterion for determining the polymorphism of a supersatellite marker, exhibits high polymorphism Botstein, D., et al., 1980).
실시예Example 6: 통계 분석 6: Statistical analysis
본 연구에서 사용된 12 종의 초위성체 마커(ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330)를 이용하여, 국내 재래닭의 동일개체 출현빈도를 API-CALC ver 1.0(Ayres and Overall, 2004) 프로그램을 통해 산출하여 하기 표 7에 제시하였다. 무작위 교배집단(Random)으로 가정하였을 경우 동일개체 출현빈도(Probability of identity; PI)는 12개의 마커를 사용하였을 때, 2.88 × 10-21 빈도로 출현하는 것을 확인 할 수 있었으며, 반형매 교배집단(Half-sib)과 전형매 교배집단(sib)으로 가정했을 경우에는 1.72 × 10-15, 1.38 × 10-07으로 각각 확인되었다. Using the 12 satellites (ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 and MCW0330) used in this study, Calc ver 1.0 (Ayres and Overall, 2004) program and presented in Table 7 below. The probability of identity (PI) in the case of the random mating group (Random) was found to be 2.88 × 10 -21 frequency when 12 markers were used, Half-sib and sib were 1.72 × 10 -15 and 1.38 × 10 -07 , respectively.
즉, 모든 집단에서 0에 수렴하는 동일 개체 출현빈도를 나타내기 때문에 개체식별률이 매우 높아 국내 재래닭의 개체식별 및 친지확인을 위한 마커로서 본 발명에 따른 12종의 초위성체 마커가 충분히 활용 가능할 것으로 판단된다.In other words, since all the groups show the frequency of occurrence of the same individuals converging to zero, the identification rate of the individuals is very high. Therefore, 12 kinds of superglue markers according to the present invention can be sufficiently utilized .
실시예Example 7: 주성분 분석( 7: Principal component analysis PrincipalPrincipal CoordinatesCoordinates AnalysisAnalysis ))
본 발명의 12종 초위성체 마커의 대립유전자의 빈도를 기반으로 닭 집단별 주성분 분석(Principal Coordinates Analysis, PCoA)을 수행하고, 상기 수행 결과를 도 2 및 도 3에 나타내었다. 도 2는 PCoA 분석을 통해 얻은 결과로 가로축(제 1분산치)과 세로축(제 2분산치)에 의해 각 집단이 분포한 결과를 나타내는 것이고, 도 3은 PCoA 분석을 통해 얻은 결과로 가로축(제 2분산치)과 세로축(제 3분산치)에 의해 각 집단이 분포한 결과를 나타내는 것이다. 상기 도 2 및 도 3에서, 각각의 코드는 한협 A 계통(HA), 한협 F 계통(HF), 한협 H 계통(HH), 한협 S 계통(HS), 한협 W 계통(HW), 한협 Y 계통(HY), 한협 Z 계통(HZ), 한협 3호(HCC), 우리맛닭 1호(WM), 우리맛닭 2호(WMT), 로스(RS), 코브(CB), 아바에이커(AB)를 의미한다.Principal Coordinates Analysis (PCoA) was performed on the basis of the frequency of the alleles of the 12 species of supersatellite markers of the present invention, and the results of the above procedures are shown in FIG. 2 and FIG. FIG. 2 shows the result obtained by PCoA analysis, in which the respective groups are distributed by the horizontal axis (first dispersion value) and the vertical axis (second dispersion value), and FIG. 3 shows the results obtained by PCoA analysis. 2 dispersion value) and the vertical axis (third dispersion value). In FIG. 2 and FIG. 3, each code is composed of the following information: HA, HF, HH, HS, HW, (WM), Woori chicken (WMT), Ross (RS), Cob (CB), and ABAACA (AB) in the HJ, HJ, HCC, HCC, it means.
PCoA 분석 결과, 제 1성분의 분산치는 33.94%, 제 2성분의 분산치는 22.42%, 제 3성분의 분산치는 14.78%로 확인되었으며, 제 2성분의 분산치에 의해 한협 순계 라인, 한협 3호 및 우리맛닭 등의 국내품종과 로스, 코브, 아바에이커 등의 외래품종이 명확히 구분되는 것을 확인 할 수 있었다.
As a result of the PCoA analysis, the dispersion value of the first component was 33.94%, the dispersion value of the second component was 22.42%, and the dispersion value of the third component was 14.78% We could confirm that the foreign cultivars such as roast, cob, and aca acre were clearly distinguished.
상기에서 본 발명의 바람직한 실시예에 대하여 설명하였지만, 본 발명은 이에 한정되는 것은 아니고, 본 발명의 기술 사상 범위 내에서 여러 가지로 변형하여 실시하는 것이 가능하며, 이 또한 첨부된 특허 청구 범위에 속하는 것은 당연하다.
While the present invention has been particularly shown and described with reference to exemplary embodiments thereof, it is to be understood that the invention is not limited to the disclosed embodiments, but, on the contrary, is intended to cover various modifications and equivalent arrangements included within the spirit and scope of the appended claims. It is natural.
<110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Hankyong National University <120> Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same <130> HPC7664 <160> 24 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0145_F <400> 1 actttattct ccaaatttgg ct 22 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0145_R <400> 2 aaacacaatg gcaacggaaa c 21 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0087_F <400> 3 atttctgcag ccaacttgga g 21 <210> 4 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0087_R <400> 4 ctcaggcagt tctcaagaac a 21 <210> 5 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0127_F <400> 5 gagttcagca ggaatgggat g 21 <210> 6 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0127_R <400> 6 tgcaataaga gaaggtaagg tc 22 <210> 7 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LEI0094_F <400> 7 gatctcacca gtatgagctg c 21 <210> 8 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LEI0094_R <400> 8 tctcacactg taacacagtg c 21 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0317_F <400> 9 agttggtttc agccatccat 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0317_R <400> 10 cccagagcac actgtcactg 20 <210> 11 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0029_F <400> 11 gtggacaccc atttgtaccc tatg 24 <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0029_R <400> 12 catgcaattc aggaccgtgc a 21 <210> 13 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GCT0016_F <400> 13 tccaaggttc tccagttc 18 <210> 14 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GCT0016_R <400> 14 ggcataagga tagcaacag 19 <210> 15 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0104_F <400> 15 tagcacaact caagctgtga g 21 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0104_R <400> 16 agacttgcac agctgtgtac c 21 <210> 17 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0123_F <400> 17 ccactagaaa agaacatcct c 21 <210> 18 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0123_R <400> 18 ggctgatgta agaagggatg a 21 <210> 19 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0330_F <400> 19 tggacctcat cagtctgaca g 21 <210> 20 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0330_R <400> 20 aatgttctca tagagttcct gc 22 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0293_F <400> 21 gtaatctaga aaccccatct 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0293_R <400> 22 acataccgca gtctttgttc 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0304_F <400> 23 ggggaggaac tctggaaatg 20 <210> 24 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0304_R <400> 24 cctcatgctt cgtgcttttt 20 <110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Hankyong National University <120> Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same <130> HPC7664 <160> 24 <170> KoPatentin 3.0 <210> 1 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0145_F <400> 1 actttattct ccaaatttgg ct 22 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0145_R <400> 2 aaacacaatg gcaacggaaa c 21 <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0087_F <400> 3 atttctgcag ccaacttgga g 21 <210> 4 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0087_R <400> 4 ctcaggcagt tctcaagaac a 21 <210> 5 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0127_F <400> 5 gagttcagca ggaatgggat g 21 <210> 6 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0127_R <400> 6 tgcaataaga gaaggtaagg tc 22 <210> 7 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LEI0094_F <400> 7 gatctcacca gtatgagctg c 21 <210> 8 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> LEI0094_R <400> 8 tctcacactg taacacagtg c 21 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0317_F <400> 9 agttggtttc agccatccat 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0317_R <400> 10 cccagagcac actgtcactg 20 <210> 11 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0029_F <400> 11 gtggacaccc atttgtaccc tatg 24 <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0029_R <400> 12 catgcaattc aggaccgtgc a 21 <210> 13 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GCT0016_F <400> 13 tccaaggttc tccagttc 18 <210> 14 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GCT0016_R <400> 14 ggcataagga tagcaacag 19 <210> 15 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0104_F <400> 15 tagcacaact caagctgtga g 21 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0104_R <400> 16 agacttgcac agctgtgtac c 21 <210> 17 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0123_F <400> 17 ccactagaaa agaacatcct c 21 <210> 18 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0123_R <400> 18 ggctgatgta agaagggatg a 21 <210> 19 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0330_F <400> 19 tggacctcat cagtctgaca g 21 <210> 20 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MCW0330_R <400> 20 aatgttctca tagagttcct gc 22 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0293_F <400> 21 gtaatctaga aaccccatct 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0293_R <400> 22 acataccgca gtctttgttc 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0304_F <400> 23 ggggaggaac tctggaaatg 20 <210> 24 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ADL0304_R <400> 24 cctcatgctt cgtgcttttt 20
Claims (7)
(S2) 상기 (S1) 단계의 핵산 시료를 ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 및 MCW0330로 이루어지는 초위성체 마커 각각에 특이적으로 결합하는, 서열번호 1 및 2, 서열번호 3 및 4, 서열번호 5 및 6, 서열번호 7 및 8, 서열번호 9 및 10, 서열번호 11 및 12, 서열번호 13 및 15, 서열번호 15 및 16, 서열번호 17 및 18, 서열번호 19 및 20, 서열번호 21 및 22, 서열번호 23 및 24의 정방향 프라이머 및 역방향 프라이머 쌍으로 구성되는 프라이머 세트를 이용하여 멀티플렉스 PCR로 증폭하는 단계; 및
(S3) 상기 (S2) 단계의 증폭된 산물을 이용하여 유전자형을 결정하는 단계;를 포함하고,
상기 (S2) 단계에서의 상기 멀티플렉스 PCR을 위한 반응액의 조성은 주형 DNA 2 내지 10 ng/㎕, 상기 프라이머 세트 8 내지 15 ㎕, DNA 중합효소 0.3 내지 1.0 ㎕, 버퍼 1.5 내지 2.5 ㎕, 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs) 1 내지 2 ㎕ 및 증류수 0.1 내지 1 ㎕를 포함하는 것을 특징으로 하는 재래닭의 개체 식별 방법.(S1) obtaining a nucleic acid sample from a native chicken subject to be identified;
(S2) a nucleic acid sample that specifically binds to a supersaturate marker consisting of ADL0293, ADL0304, ADL0317, GCT0016, LEI0092, MCW0029, MCW0087, MCW0104, MCW0123, MCW0127, MCW0145 and MCW0330, 1 and 2, SEQ ID NOs: 3 and 4, SEQ ID NOs: 5 and 6, SEQ ID NOs: 7 and 8, SEQ ID NOs: 9 and 10, SEQ ID NOs: 11 and 12, SEQ ID NOs: 13 and 15, SEQ ID NOs: 18, SEQ ID NOs: 19 and 20, SEQ ID NOs: 21 and 22, SEQ ID NOs: 23 and 24, and primer set consisting of a pair of reverse primers; And
(S3) determining a genotype using the amplified product of step (S2)
The composition of the reaction solution for the multiplex PCR in the step (S2) is 2 to 10 ng / μl of template DNA, 8 to 15 μl of the primer set, 0.3 to 1.0 μl of DNA polymerase, 1.5 to 2.5 μl of buffer, 1 ~ 2 [mu] l of oxynucleotides (dNTPs) and 0.1 ~ 1 [mu] l of distilled water.
상기 각 초위성체 마커는 대립유전자 수가 5~15개이고, 기대이형접합율은 60% 보다 높게 나타나며, 유전자의 크기는 80bp~300bp인 재래닭의 개체 식별 방법.5. The method of claim 4,
Wherein each of said supersatellite markers has an allelic number of 5 to 15, an expected heterozygosity of more than 60%, and a gene size of 80 to 300 bp.
상기 (S2) 단계에서 멀티플렉스 PCR 증폭은 95℃에서 10분간 반응하고, 95℃에서 30초, 54~56℃에서 25~35초 및 72℃에서 1분간 반응시키는 것을 한 사이클로 하여 25~35회 반복하고, 72℃에서 30분간 반응시키는 것을 특징으로 하는 재래닭의 개체 식별 방법.5. The method of claim 4,
In step (S2), multiplex PCR amplification was performed at 95 ° C. for 10 minutes, followed by reaction at 95 ° C. for 30 seconds, 54 to 56 ° C. for 25 to 35 seconds, and 72 ° C. for 1 minute, And repeating the reaction for 30 minutes at 72 ° C.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170144189A KR101989983B1 (en) | 2017-10-31 | 2017-10-31 | Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170144189A KR101989983B1 (en) | 2017-10-31 | 2017-10-31 | Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20190048898A KR20190048898A (en) | 2019-05-09 |
KR101989983B1 true KR101989983B1 (en) | 2019-06-17 |
Family
ID=66546485
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020170144189A KR101989983B1 (en) | 2017-10-31 | 2017-10-31 | Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR101989983B1 (en) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR102319859B1 (en) * | 2021-04-08 | 2021-11-01 | 한경대학교 산학협력단 | Multiplex primer sets based on microsatellite markers for identification of Korean native chicken and uses thereof |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101118342B1 (en) | 2004-10-30 | 2012-03-09 | 한경대학교 산학협력단 | Method discrimination for product traceability and identification of chicken using Microsatellite DNA |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101474284B1 (en) * | 2012-10-17 | 2014-12-24 | 충남대학교산학협력단 | Microsatellite Marker for individualization in Korean native chicken and individualizing Method Using the Same |
-
2017
- 2017-10-31 KR KR1020170144189A patent/KR101989983B1/en active IP Right Grant
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101118342B1 (en) | 2004-10-30 | 2012-03-09 | 한경대학교 산학협력단 | Method discrimination for product traceability and identification of chicken using Microsatellite DNA |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR20190048898A (en) | 2019-05-09 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN107164468B (en) | Polymorphic microsatellite DNA molecular marker for deer and application thereof | |
KR102039309B1 (en) | Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same | |
KR101796306B1 (en) | Mircrosatellite marker for detecting Haliotis gigantean and method of detecting Haliotis gigantean using the same | |
KR100753676B1 (en) | TRIM-Br1 and TRIM-Br2 DNA marker system using the same and classification method using the same | |
KR101474284B1 (en) | Microsatellite Marker for individualization in Korean native chicken and individualizing Method Using the Same | |
KR100842432B1 (en) | Ssr primer derived from mandarin and use thereof | |
KR101989983B1 (en) | Microsatellite Marker For Identification of Korean Native Chicken And Method For Identification Using The Same | |
KR102064039B1 (en) | Method for identification and parentage using marker in Ephinephelus akaara | |
KR101395344B1 (en) | Peptide nucleic acids set for identifying raja kenojei mueller et henle species and identifying method of raja kenojei mueller et henle species using the same | |
KR100842434B1 (en) | Ssr primer derived from ginseng and use thereof | |
Rukavina et al. | Genetic diversity of Thoroughbred horse population from Bosnia and Herzegovina based on 17 microsatellite markers | |
CN103710427B (en) | Single nucleotide polymorphism, detection method and application of chicken gene | |
KR20090088492A (en) | Development of sequence-based microsatellite markers in brassica rapa and construction of genetic map | |
KR101677127B1 (en) | Primer set for genotyping of horse | |
KR101624342B1 (en) | Single Nucleotide Polymorphism Markers for Detecting Black Pig Pork From Nonblack Pig Pork and Use of the Same | |
KR101535925B1 (en) | Microsatellite markers for identification of goats | |
KR101219546B1 (en) | Development of grain weevils resistive molecular markers in mung beans and uses thereof | |
KR102083306B1 (en) | Genetic markers and methods for identifying species belong to Myxinidae | |
KR20130091434A (en) | Primer for selecting variety resistant to rice stripe disease containing stv-bi gene and the selecting method thereof | |
KR100913941B1 (en) | Korean native pig specific DNA markers and method for detecting Korean native pig using the markers | |
KR100842429B1 (en) | Ssr primer derived from lawn grass and use thereof | |
KR102382857B1 (en) | Microsatellite marker for indentification and paternity verification of native black goat | |
KR102527604B1 (en) | Genetic marker for parentage and thereof in Tribolodon hakonensis. | |
KR101821554B1 (en) | Method for identification of Chikso breed genotype using microsatellite markers | |
CN107988386A (en) | A kind of SSR fluorescent dye primers and application for Mandarin fish paternity test |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
AMND | Amendment | ||
E601 | Decision to refuse application | ||
AMND | Amendment | ||
X701 | Decision to grant (after re-examination) | ||
GRNT | Written decision to grant |