KR101942813B1 - 전복의 살균침투성증가단백질로부터 유래한 항균 펩타이드 및 그의 용도 - Google Patents

전복의 살균침투성증가단백질로부터 유래한 항균 펩타이드 및 그의 용도 Download PDF

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Abstract

본 발명은 전복(abalone) 유래의 항균활성 및 항충활성이 우수한 펩타이드를 제공한다.

Description

전복의 살균침투성증가단백질로부터 유래한 항균 펩타이드 및 그의 용도{Antimicrobial Peptides derived from abalone bactericidal??permeability-increasing protein and uses thereof}
본 발명은 항균 펩타이드에 관한 것으로서, 더 상세하게는 전복의 살균침투성증가단백질로부터 유래한 항균 펩타이드 및 그의 용도에 관한 것이다.
항균 펩타이드(antimicrobial peptide, AMP)는 원핵생물부터 포유동물까지 모든 유형의 살아있는 생물체에 존재하는 선천적 면역체계(innate immune system)의 최전방 생체 방어인자이다. 항미생물성 펩타이드는 특정 미생물이나 항원에 반응하는 후천면역과는 달리 미생물의 종류에 크게 상관없이 작용하며 반응시간도 바로 혹은 몇 시간 내로 매우 빠르다. 내성균의 문제를 항상 내포하고 있는 기존의 항생제와 구분되어 내성의 문제 또는 면역문제나 거부반응의 문제없이 광범위한 생물계에서 미생물로부터 숙주를 보호하기 위해 자연적으로 생성되는 천연물로 기존의 항생제 대체 가능성이 기대되는 잠재적 약물 후보군이다(Hancock et al,, Curr Drug Targets Infect Disord. Mar;2(1):79-83. 2002). 최근에는 유전체(genomic)/전사체(transcriptome) 데이터베이스 정보에서 항박테리아 또는 살균 활성을 가지는 단백질의 아미노산 서열에 기반하여 신규한 AMP를 설계해 왔다(He et al., Insect Biochem Mol Biol. Feb;37(2):135-46. 2007). 특히, 살균투과성증진단백질(Bactericidal permeability-increasing protein, BPI)은 다른 LPS 결합단백질로 알려진 LBP(LPS-binding protein)의 단백질 서열과 높은 상동성을 가지나 두 단백질의 생물학적 역할은 상이한 것으로 알려져 있고 LBP는 LPS에 응답하는 염증성 플라스마 단백질(plasma protein)인 반면, BPI은 폴리모르포뉴클리어 뉴트로필(polymorphonuclear neutrophils)의 라이소좀의 그래뉼(lysosomal granules)에서 발견되며, 살균력을 갖고, LPS의 독성효과를 중화시킨다. 이러한 LBP 및 BPI의 기능 및 기능적 측면은 포유동물에서 잘 연구되어 있는데, 하등 척추동물 및 무척추동물을 포함한 비포유동물에서 상기 단백질들의 기능적 성질은 잘 알려져 있지 않다. 이와 관련하여 대한민국 등록특허 제1384578호는 전복 유래의 새로운 항미생물성 펩타이드 및 이의 용도에 대해 개시하고 있다.
그러나, 상기 선행기술의 경우, 펩타이드의 분리 시 수율이 높지 않아 충분한 항균활성을 나타내지 않고 잠재적인 독성 등의 요인으로 균일한 효과를 기대하기 어렵다.
본 발명은 상기와 같은 문제점을 포함하여 여러 문제점들을 해결하기 위한 것으로서, 항균 활성 및 항충 활성이 우수한 전복 유래의 항균 펩타이드를 제공하는 것을 목적으로 한다. 그러나 이러한 과제는 예시적인 것으로, 이에 의해 본 발명의 범위가 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 일 관점에 따르면, 서열번호 1로 표기되는 아미노산 서열로 구성되는, 항균 펩타이드가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드의 폴리뉴클레오티드가 삽입된 재조합 벡터가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 재조합 벡터로 숙주세포를 형질전환시킨, 형질전환 숙주세포가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균 조성물이 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균성 화장료 조성물이 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균성 식품 첨가제가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균 사료 첨가제가 제공된다.
상기한 바와 같이 이루어진 본 발명의 일 실시예에 따르면, 다양한 균주에 대한 항균활성 및 스쿠티카 충에 대한 항충활성을 나타내는 전복 유래의 항균 펩타이드 생산효과를 구현할 수 있다. 물론 이러한 효과에 의해 본 발명의 범위가 한정되는 것은 아니다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따라 HDH-BPI 단백질 서열 일부에 대한 2차 구조의 예측 결과이다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따라 HDH-BPI의 모체 펩타이드와 유사체의 N-말단이 α-헬릭스 (α-helix) 구조를 취함을 보여주는 개요도이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체의 항균활성을 보여주는 사진이다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체의 열 안정성을 보여주는 사진이다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체의 염(salt) 민감성을 보여주는 사진이다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체의 스쿠티카충 증식 저해능력을 보여주는 사진이다.
도 7은 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체 첨가에 의해 스쿠티카충 활성저해도를 분석한 그래프이다.
도 8은 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체의 DNA 결합력(DNA-binding ability) 측정결과를 보여주는 겔 사진이다.
도 9는 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드와 유사체의 DNA 폴리머라제에 대한 결합능력을 보여주는 겔 사진이다.
도 10은 본 발명의 일 실시예에 따른 HDH-BPI 모체 펩타이드의 암피실린 항생제 내성균에 대한 항균활성을 보여주는 사진이다.
용어의 정의:
본 문서에서 사용되는 용어 "살균투과성증진단백질(Bactericidal permeability-increasing protein, BPI)"은 사람의 호중구에 존재하는 단백질의 일종으로 그람 음성균에 대한 생장저해작용과 그람 음성균이 생산하는 외독소에 대한 중화작용 효과를 나타낸다.
본 문서에서 사용되는 용어 "전복(abalone)"은 껍데기 길이 10cm 이상으로 크고 타원형의 연체동물문 복족류로 간조선에서 수심 5∼50m 되는 외양의 섬 지방이나 암초에 서식한다.
발명의 상세한 설명:
본 발명의 일 관점에 따르면, 서열번호 1로 표기되는 아미노산 서열로 구성되는, 항균 펩타이드가 제공된다.
상기 항균 펩타이드에 있어서, 10번째 아미노산은 리신(K), 아르기닌(R) 및 히스티딘(H)으로 구성되는 군에서 선택되는 염기성 아미노산, 세린(S), 트레오닌(T), 아스파라진(N) 및 글루타민(Q)로 구성되는 군에서 선택되는 극성 아미노산 또는 글리신(G)일 수 있다.
상기 항균 펩타이드에 있어서, 서열번호 2 또는 3으로 표기되는 아미노산 서열로 구성될 수 있고 C-말단이 아미드화될 수 있다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드의 폴리뉴클레오티드가 삽입된 재조합 벡터가 제공된다.
상기 재조합 벡터에 있어서, 상기 폴리뉴클레오티드가 프로모터에 작동가능하게 연결된 발현 벡터일 수 있다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 재조합 벡터로 숙주세포를 형질전환시킨, 형질전환 숙주세포가 제공된다.
상기 형질전환 숙주세포에 있어서, 상기 숙주세포는 프로바이오틱스 균주일 수 있다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균 조성물이 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 화장료 조성물이 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균성 식품 첨가제가 제공된다.
본 발명의 다른 일 관점에 따르면, 상기 항균 펩타이드 또는 상기 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균 사료 첨가제가 제공된다.
일반적으로 항균활성을 갖는 LPS-결합 단백질(LBP) 및 살균투과성증진단백질(BPI)의 기능 및 기능적 측면은 포유동물에서 잘 연구되어 있는데, 하등 척추동물 및 무척추동물을 포함한 비포유동물에서 상기 단백질들의 기능적 성질은 잘 알려져 있지 않다. LBP 및 BPI는 N- 및 C-말단 도메인으로 구성되어 있고, 대략 200개의 아미노산을 갖는 거의 두 개의 동등한 단편(fragment)으로 절단될 수 있으나 각각의 서열은 약간 상이하다. LBP에 있는 N-말단 도메인은 LPS에 결합하는 반면, C-말단 도메인은 LPS-신호전달에 중요한 구성요소인 CD14에 LPS를 운반하는데 필요하다(Fenton 및 Golenbock, 1998). BPI의 항 박테리아 및 LPS 중성화 활성은 N-말단 도메인에 의해 완전히 발현된다. BPI의 재조합 23-kDa N-말단 단편은 살균 및 LPS 결합 분석에서 홀로단백질(holoprotein)보다 동등하거나 큰 활성을 가진다. 추가적으로, BPI의 펩타이드 23-kDa N-말단 단편을 중복하도록 설계된 3개의 절단 단편 및 합성 펩타이드를 각각 생물 활성에 대하여 분석하였고, 단지 하나의 합성 펩타이드(아미노산 85-99)가 살균(bactericidal) 활성을 나타내었다. 그러나, C-말단 부분의 기능은 아직 밝혀지지 않았다(Iovine et al., J Cell Biol. May 19;137(4):797-811. 1997). 이에, 본 발명자들은 신규한 항균 펩타이드를 개발하기 위해, 전복(Haliotis discus hannai)의 살균침투성증가단백질의 C-말단 도메인의 아미노산 서열상의 기반한 일련의 펩타이드(HDH-BPI 펩타이드 유사체)를 디자인한 후, 상기 펩타이드가 그램-양성 및 그램-음성 박테리아 균에 대한 항균 활성이 있음을 확인하여 천연 항생제로 사용가능한 본 발명의 항균 펩타이드를 완성하였다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더 상세히 설명한다. 그러나 본 발명은 이하에서 개시되는 실시예에 한정되는 것이 아니라 서로 다른 다양한 형태로 구현될 수 있는 것으로, 이하의 실시예는 본 발명의 개시가 완전하도록 하며, 통상의 지식을 가진 자에게 발명의 범주를 완전하게 알려주기 위해 제공되는 것이다.
실시예 1: 시약 및 재료
본 발명에서 사용한 항균활성 측정을 위한 트립틱 소이 브로스(tryptic soy broth, TSB)와 아가로스 타입 I(Low EEO Agar)은 Merck사(Merk, Darmstadt, Germany)와 Sigma사(St. Louis, MO, USA)에서 각각 구입하여 사용하였으며, 이외의 모든 시약은 특급을 사용하였다.
실시예 2: 항균펩타이드의 디자인
본 발명의 일 실시예에 따라 새로운 항균 펩타이드를 개발하기 위하여 전복 (Haliotis discus hannai, HDH)의 항균성 단백질인 살균침투성증가단백질(BPI)을 클로닝하였고 유전체 데이터베이스에서 확보한 살균침투성증가단백질(BPI) 서열(HDSC002806)을 토대로 HDH-BPI C-말단에 위치하는 α-헬릭스(helix) 구조 단편의 아미노산 서열에 근거한 2차 구조예측 프로그램을 사용하여 HDH-BPI 유사체의 2차 구조를 예측하였다(도 1). 상기 예측된 2차 구조를 바탕으로 유사체 디자인을 위한 가장 이상적인 부위를 선택하였고 모체 펩타이드(HDH-BPI-2N, 서열번호 2)로 선택된 부분의 구조적 특성을 확인하였고 C-말단의 아미드화(amidation) 및 아미노산 치환(amino acid substitution) 방법으로 유사체(HDH-BPI-2A, 서열번호3)를 디자인하였다(도 2). 상기 디자인한 펩타이드에 대한 정보를 하기 표 1에 표시하였다.
펩타이드
명칭
아미노산 서열 길이
(mer)
M.W.
(Da)
pI 전하 Boman Index
(kcal/mol)
서열번호
HDH-BPI-2N MALQLVMNGALKL-NH2 13 mer 1401.8 9.9 +1 -1.17 2
HDH-BPI-2A MALQLVMNKALKL-NH2 13 mer 1472.9 10.55 +2 -0.67 3
실시예 3: 펩타이드 합성 및 정제
본 발명의 일 실시예에 따라 상기 실시예 2에서 디자인한 펩타이드는 95%의 순도로 Peptron Inc.(대전, 대한민국)에 의뢰하여 설계하였고 상업적으로 합성하였다. 구체적으로, 상기 펩타이드는 ASP48S(Peptron Inc. 대전, 대한민국)의 FmoC solid phase 펩타이드 합성(SPPS) 방법을 사용하여 합성하였으며, Vydac Everest C18 컬럼(250 ㎜ × 22 ㎜, 10 ㎛; Grace, Deerfield, IL, USA)을 이용한 역상 고성능 액상 크로마토그래피(HPLC)를 통해 정제하였다. 그 후, 0.1%(v/v) 트리플루오로아세트산을 함유하는 물-아세토니트릴 직선 구배(아세토니트릴 3%-40% (v/v))로 용리(elution)하였다. 상기 정제된 펩타이드의 분자량은 액상 크로마토그래피/질량 분석기(LC/MS; HP100 series; Agilent, Santa Clara, CA, USA)을 사용하여 확인하였고 상기 합성된 모든 펩타이드를 0.01% 아세트산에 용해시켜 1000 ㎍/mL의 저장 용액을 수득하였다.
실시예 4: 고감도 방사확산 분석(Ultrasensitive Radial Diffusion Assay)
본 발명의 일 실시예에 따라 상기 정제한 HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 펩타이드의 항균 활성을 측정하였다.
구체적으로, 항균활성 측정을 위한 고감도 방사확산 분석을 종래의 방법(Seo et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 338;1998-2004, 2005)에 따라 Bacillus cereus, Staphylococus aureus RM4220, Streptococcus iniae FP5229S. mutans를 포함하는 그람-양성 세균; Pseudomonas aeruginosa KCTC204, Vibrio anguillarum, Vibrio harveyi을 포함하는 그람-음성 세균; 및 효모 Candida albicans KCTC7965를 사용하였다. 상기 실험 대상 균주를 적절한 온도(P. aeruginosa S. iniae는 25℃; 나머지 균주는 37℃)에서 뇌심장-침출액 배지(BHI, BD Bioscience, USA)에서 배양하였고 효모 균주인 C. albicans KCTC7965는 25℃의 효모 배지(YM)에서 배양하였다. 그 후 상기 균주 및 효모의 서스펜션(suspension)은 ~106 CFU/mL, C. albicans에 상응하는 맥팔랜드 0.5 탁도 기준(McFarland turbidity standard of 0.5, Vitek Colorimeter #52-1210; Hach, Loveland, CO, USA)으로 희석하였고 상기 희석된 세균 또는 C. albicans 서스펜션 1/2 mL를, 0.03% TSB 또는 0.03% SDB 및 1% Type Ⅰ(low EEO) 아가로오스가 구비된 10 mM 인산 버퍼(PB; pH 6.6)에 용해된 5 × 106 CFU/mL 또는 5 × 104 CFU/mL를 함유하는 언더레이 겔(underlay gel) 9.5 mL에 첨가하였다. 그 후 정제된 펩타이드를 산성화 물(0.01% HAc) 5 ㎕에서 2개로 연속 희석시키고, 각각의 희석액을 1-㎜ 두께의 언더레이 겔로 제조된 2.5-㎜ 직경의 웰(well)에 첨가하였다. 이어서 P. aeruginosa, S. iniae, 및 C. albicans균주는 25℃, 나머지 균주는 37℃에서 각각 3시간 항온 배양한 뒤, 인산 완충 식염수 완충액(PBS, pH 6.6) 10 mM을 사용하여 6% BHI 또는 6% YM을 함유하는 이중 강 오버레이 겔(double-strength overlay gel) 10 ㎖로 1% 아가로스에서 균주 또는 효모 서스펜션을 덮었다. 그 후, 플레이트를 추가하여 18-24 시간 더 항온 배양을 수행하였고 투명 부위(clearing zone)의 직경을 측정하였으며 웰의 직경을 제외한 뒤, 투명 부위 직경을 유닛(0.1 ㎜ = 1 U)으로 표시하였다. 또한 HDH-BPI 유래 변이체의 최소 유효 농도는 펩타이드 농도의 log10 값에 대한 유닛 도표의 x-절편으로서 합성 펩타이드의 최소 유효 농도(minimal effective concentration, MEC, ㎍/㎖)를 계산하였고 상기 항균 분석을 3회 수행한 결과를 평균하였다.
그 결과, 도 3에 나타난 바와 같이, HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 펩타이드 모두 그램양성균, 그램음성균 및 효모에 대하여 강한 항균활성을 나타내었다.
실시예 5: 항균 활성에 대한 온도 및 염의 영향
본 발명의 일 실시예에 따라 HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 펩타이드에 대한 온도 및 염(salt)의 영향에 따른 항균활성을 관찰하기 위해, 균주 B. cereus, E. coli, 및 효모 C. albicans를 대상으로 상기 실시예 4와 동일한 고감도 방사확산 분석(URDA)을 수행하였다. 먼저, HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 펩타이드의 열적 안정성을 관찰하기 위하여 100℃에서 10분동안 항온 배양을 통해 열처리 하였고 염 안전성을 관찰하기 위해 HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 펩타이드에 각각 다른 농도의 염(0.5, 1 및 2%)을 처리하고 30분 동안 항온 배양하였으며 상기 처리된 펩타이드를 냉각 후 분석에 이용하였다.
그 결과, 도 4에 나타난 바와 같이, HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 펩타이드는 열에 대한 안정성을 가지고 있으나, 도 5에 나타난 바와 같이, 염의 농도가 증가할 경우 항균활성이 떨어져 고염 조건에서는 일부 균주(C. albicansS. mutans 등)에 대한 항균활성이 낮아지는 것으로 확인되어, 내염성은 다소 떨어지는 것으로 파았되었다.
실시예 6: 항스쿠티카충 활성 확인
본 발명에 일 실시예에 따라 HDH-LGBP 변이체를 대상으로 스쿠티카충(Philasterides dicentrarchi)에 대한 항균활성을 확인하였다.
구체적으로, 항스쿠티카충의 인비트로(in vitro) 항균활성 실험을 위하여 스쿠티카충이 감염된 넙치로부터 분리하여 순수 배양한 스쿠티카충을 사용하였고 배양 및 증식을 위한 먹이로 넙치의 배아세포주(HINAE cell line)를 사용하였다. HINAE 세포는 L15 배지에 10% FBS와 1% 페니실린/스트렙토마이신(penicillin/streptomycin)을 처리하여 20℃에서 배양하였고 스쿠티카충 증식억제 실험을 위해 스쿠티카충을 96-well plate에 1×104/mL 농도로 100 ㎕씩 분주하고 HDH-LGBP 변이체를 각각 1, 5, 10, 25, 50 ug/mL 농도로 4시간 처리한 후 광학현미경을 이용하여 세포를 관찰하였다. 또한 살아있는 스쿠티카충의 활성을 측정하기 위하여 HDH-LGBP 변이체 처리 후 24간이 경과된 시점에서 WST-1 assay 시약을 10ul씩 첨가하였고 1시간 후에 450nm에서 흡광도를 측정하였다.
그 결과, 도 6 및 7에 나타난 바와 같이, HDH-BPI-2A 펩타이드가 스쿠티카충의 증식을 억제하는 항충효과를 나타내었다.
실시예 7: DNA-결합 분석
본 발명에 일 실시예에 따라 제조한 HDH-BPI-2N와 HDH-BPI-2A 펩타이드의 미생물의 세포내 분자와의 상호작용을 조사하기 위하여 DNA 결합 분석(DNA binding assay)을 수행하였다.
구체적으로, DNA 결합 분석은 종래의 방법(Nam et al., Marine Drugs, 5240-5257, 2014)을 일부 수정하여 아가로스 겔을 통과하는 DNA 밴드의 이동 속도(rate of migration) 억제를 측정하여 수행하였고 상업적인 분자량 마커인 λ-HindⅢ-분해 DNA(50 ng; Roche, Basel, Switzerland)를 0.01% 아세트산에 용해된 다양한 농도의 펩타이드(0, 0.157, 0.313, 0.625, 1.25, 2.5 ㎍)와 혼합하고, 상온에서 5분 동안 항온 배양한 뒤에, 0.5 ㎍/㎖의 ethidium bromide(EtBr)을 함유하는 1.0% 아가로스 겔에서 전기영동하였다.
그 결과, 도 8에 나타난 바와 같이, HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 모두 DNA 결합력을 나타내었다.
실시예 8: DNA 중합효소 억제 분석
본 발명에 일 실시예에 따라 제조한 HDH-BPI-2N와 HDH-BPI-2A 펩타이드의 DNA 중합효소 활성 억제를 평가하기 위하여, PCR 증폭을 수행하였다.
구체적으로, 다양한 농도(2.5, 1.25, 0.625, 0.313 ㎍/㎖)의 HDH-BPI 유사체를 각각의 반응 혼합물에 첨가한 후 E. coli 제노믹 DNA(genomic DNA, 100ng)에 대하여 포워드 프라이머(서열번호 4), 리버스 프라이머(서열번호 5)를 이용하여 PCR을 수행하였다. 또한 PCR 조건은 90℃에서 30초, 55℃에서 30초, 72℃에서 1분씩의 30 사이클로 구성되었고 PCR 증폭후에 모든 증폭산물(amplicon)은 EtBr을 함유하는 1.5% 아가로스 겔에서 전기영동하였다. 상기 PCR 증폭에 사용된 프라이머에 대한 정보를 하기 표 2에 표시하였다.
그 결과, 도 9에 나타난 바와 같이, HDH-BPI-2N 및 HDH-BPI-2A 모두 DNA 폴리머라제 억제 효과를 나타내었다.
프라이머 핵산서열(5'->3') 서열번호
16S-F1 CTCCTACGGGAGGCAGCAG 4
16S-R3 CCAGGGTATCTAATCCTG 5
실시예 9: 항생제 내성균에 대한 항균활성 확인
본 발명의 일 실시예에 따라 항생제 내성균에 대한 항균활성을 확인하기 위하여 항생제내성균주은행으로부터 분양받은 항생제 내성균주 5종(Escherichia coli CCARM0238, Enterobacter cloacae CCARM 0252, Pseudomonas aeruginosa CCARM 0225, Klebsiella oxytoca CCARM 0248, Staphylococcus aureus CCARM 0203)에 대하여 고감도 방사확산 분석을 수행하였다. 음성대조군(negative control)으로 0.01% 아세트산을 사용하였으며, 양성대조군(positive control)으로 0.5 ㎍과 5 ㎍의 암피실린(Ampicillin) 항생제를 사용하여 5 ㎍의 HDH-BPI-2N의 항균활성과 비교하였다.
그 결과, 도 10에 나타난 바와 같이 0.5 ㎍과 5 ㎍의 암피실린을 첨가한 웰 부위에서는 암피실린 내성을 가진 균주가 증식하였으나 HDH-BPI-2N 펩타이드를 첨가한 웰 주위에는 모든 시험 대상균의 증식이 억제된 것을 확인할 수 있었다.
결론적으로, 본 발명의 전복(Haliotis discus hannai) 살균침투성증가단백질로부터 유래한 펩타이드(HDH-BPI 펩타이드 유사체)는 강력한 누출 능력 및 멤브린 교란 능력이 있고 열 안정적이며 DNA 또는 DNA 폴리머라제에 결합력을 나타내고 그램-양성, 그램-음성 박테리아 균, 어류 병원균 및 효모에 대한 유의적인 항균 활성을 나타내었으므로 기존의 항생제를 대체할 수 있는 항생제 대체재 개발이나 항충제 개발을 위한 후보물질로 활용 가능할 것으로 판단된다.
본 발명은 상술한 실시예를 참고로 설명되었으나 이는 예시적인 것에 불과하며, 당해 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 이로부터 다양한 변형 및 균등한 다른 실시예가 가능하다는 점을 이해할 것이다. 따라서 본 발명의 진정한 기술적 보호 범위는 첨부된 특허청구범위의 기술적 사상에 의하여 정해져야 할 것이다.
<110> Republic of Korea represented by National Fisheries Research & Development Institute <120> Antimicrobial Peptides derived from abalone bactericidal?permeability-increasing protein and uses thereof <130> PD16-5434 <160> 5 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Antimicrobial Peptide <400> 1 Met Ala Leu Gln Leu Val Met Asn Xaa Ala Leu Lys Leu 1 5 10 <210> 2 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> HDH-BPI-2N <400> 2 Met Ala Leu Gln Leu Val Met Asn Gly Ala Leu Lys Leu 1 5 10 <210> 3 <211> 13 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> HDH-BPI-2A <400> 3 Met Ala Leu Gln Leu Val Met Asn Lys Ala Leu Lys Leu 1 5 10 <210> 4 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 16S-F1 <400> 4 ctcctacggg aggcagcag 19 <210> 5 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 16S-R3 <400> 5 ccagggtatc taatcctg 18

Claims (14)

  1. 서열번호 2 또는 3으로 표기되는 아미노산 서열로 구성되는, 항균 펩타이드.
  2. 삭제
  3. 삭제
  4. 제1항에 있어서,
    C-말단이 아미드화된, 항균 펩타이드.
  5. 제1항의 항균 펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드.
  6. 제5항의 폴리뉴클레오티드가 삽입된 재조합 벡터.
  7. 제6항에 있어서,
    상기 폴리뉴클레오티드가 프로모터에 작동가능하게 연결된 발현 벡터인, 재조합 벡터.
  8. 제6항의 재조합 벡터로 숙주세포를 형질전환시킨, 형질전환 숙주세포.
  9. 제7항의 재조합 벡터로 숙주세포를 형질전환시킨, 형질전환 숙주세포.
  10. 제9항에 있어서,
    상기 숙주세포는 프로바이오틱스 균주인, 형질전환 숙주세포.
  11. 제1항 또는 제4항의 항균 펩타이드 또는 제10항의 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균 조성물.
  12. 제1항 또는 제4항의 항균 펩타이드 또는 제10항의 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균성 화장료 조성물.
  13. 제1항 또는 제4항의 항균 펩타이드 또는 제10항의 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균성 식품 첨가제.
  14. 제1항 또는 제4항의 항균 펩타이드 또는 제10항의 형질전환 숙주세포를 유효 성분으로 함유하는 항균 사료 첨가제.
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Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
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Developmental and Comparative Immunology, Vol. 52, pp. 88-97(2015.05.05.)
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