KR101300410B1 - 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물 - Google Patents

엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물 Download PDF

Info

Publication number
KR101300410B1
KR101300410B1 KR1020100004560A KR20100004560A KR101300410B1 KR 101300410 B1 KR101300410 B1 KR 101300410B1 KR 1020100004560 A KR1020100004560 A KR 1020100004560A KR 20100004560 A KR20100004560 A KR 20100004560A KR 101300410 B1 KR101300410 B1 KR 101300410B1
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
sirna
coxsackievirus
enterovirus
pharmaceutical composition
virus
Prior art date
Application number
KR1020100004560A
Other languages
English (en)
Other versions
KR20110085011A (ko
Inventor
이희란
전은정
고아라
김유겸
차흥원
안정현
원민아
Original Assignee
울산대학교 산학협력단
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 울산대학교 산학협력단 filed Critical 울산대학교 산학협력단
Priority to KR1020100004560A priority Critical patent/KR101300410B1/ko
Priority to PCT/KR2011/000372 priority patent/WO2011090307A2/ko
Publication of KR20110085011A publication Critical patent/KR20110085011A/ko
Application granted granted Critical
Publication of KR101300410B1 publication Critical patent/KR101300410B1/ko

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1131Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/11Antisense

Abstract

본 발명은 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA에 관한 것으로, 상기 siRNA는 급성 출혈성 결막염의 주요 원인인 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두에서 세포독성을 현저히 저해하고 바이러스 복제를 억제함으로써 매우 우수한 항바이러스 활성을 나타내므로 항바이러스 제제, 특히 급성 출혈성 결막염의 치료제로서 매우 유용하게 사용될 수 있다.

Description

엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물{siRNA having antiviral activity against both enterovirus 70 and coxsackievirus A24 and pharmaceutical composition for treating and preventing acute hemorrhagic conjunctivitis comprising the same}
본 발명은 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물에 관한 것이다.
급성 출혈성 결막염(Acute hemorrhagic conjunctivitis, AHC)은 인간 장내바이러스 중 엔테로바이러스 70(Enterovirus 70) 및 콕싸키바이러스 A24 (Coxsackievirus A24)가 주요 원인바이러스로 알려져 있다. 1969년 처음 가나에서 확인되었고 발생시기가 아폴로의 달 착륙 시기와 일치해서 일명 아폴로눈병이라고 불리운다. 8~48시간의 짧은 잠복기와 경과기간이 5~7일이 특징이다. 자각증상은 갑작스런 동통, 이물감, 눈부심, 다량의 눈물흘림이며 타각증상으로는 결막충혈, 눈꺼풀종창을 볼 수 있고 결막 부종도 나타난다. 환자의 25%에서는 열, 무력감, 전신근육통을 보이며 드물게는 하지가 마비되기도 한다.
급성 출혈성 결막염의 예방 백신이나 제제는 현재까지 개발된 바 없으며, 점안액 투여 등 대증적 안과 치료로 증상을 완화시킬 수 있는 것으로 알려져 있다.
한편, RNA 간섭 (RNA interference, 이하 「RNAi」라 칭한다)은 표적 유전자의 mRNA와 상동인 서열을 가지는 센스 RNA와 이것과 상보적인 서열을 가지는 안티센스 RNA로 구성되는 이중사슬 RNA (이하, 「dsRNA」라 칭한다)를 세포 등에 도입하는 것에 의하여 표적유전자 mRNA의 분해를 유도하고 표적유전자의 발현을 억제할 수 있는 현상이다. 이와 같이 RNAi는 표적유전자의 발현을 억제할 수 있기 때문에 유전자치료 (gene therapy)의 방법으로서 상당한 관심을 모으고 있다.
최근, 긴 이중사슬 RNA 대신 21-25 뉴클레오티드의 짧은 dsRNA (이하, siRNA이라 함)를 포유동물 세포에 도입함으로써 포유동물 세포에서도 RNAi를 유도할 수 있음이 보고 되었다 (Elbashir, S. M. et al., Nature 411, 494-498, 2001; Caplen, N. J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 9742-9747, 2001). 또한, 화학적으로 합성된 siRNA와 shRNA (short hairpin RNA)를 발현하는 벡터들이 시험관 내 (in vitro) 및 생체 내 (in vivo)에서 RNAi를 유도할 수 있다는 것이 입증되었다 (Bernstein, E. et al., Rna, 7:1509-1521, 2001; Hasuwa, H. et al., FEBS Lett, 532:227-230, 2002). 더욱이, 최근 연구에서는 RNAi가 효과적인 항바이러스 제제의 개발을 위한 신규한 기반 기술로서 제시되었다 (Dave, R. S. et al., Rev Med Virol, 13:373-385, 2003; tevenson, M., Nat Rev Immunol, 3:851-858, 2003). 이러한 연구에서는 siRNA가 다양한 실험 조건에서 간염 바이러스 (hepatitis virus), 폴리오바이러스 (poliovirus) 또는 인플루엔자 바이러스 (influenza virus)와 같은 다양한 바이러스들의 복제를 효과적으로 억제할 수 있음을 확인하였다. 또한, 콕사키바이러스 B3 (coxsackievirus B3; CVB3)를 표적으로 하는 siRNA가 심근세포 등 각종 허용 (permissive) 세포에서 극적인 항바이러스 효과를 나타냄도 확인되었다(Ahn J. et al., J Virol, 79:2151-2159, 2005; Merl, S. et al., Circulation, 111:1583-1592, 2005; Schubert, S. et al., J Mol Biol, 346:457-465, 2005; Yuan).
그러나, 아직까지 급성 출혈성 결막염(Acute hemorrhagic conjunctivitis, AHC)의 주요 원인균인 엔테로바이러스 70(Enterovirus 70)과 콕싸키바이러스 A24에 대해 동시에 항바이러스 활성을 나타내는 제제에 대한 개발은 전무하며, 효과적인 급성 출혈성 결막염 치료를 위해서는 이러한 제제에 대한 개발이 시급한 실정이다.
상기 종래기술의 문제점을 해결하기 위하여, 본 발명의 목적은 급성 출혈성 결막염(Acute hemorrhagic conjunctivitis, AHC)의 주요 원인균인 엔테로바이러스 70(Enterovirus 70)과 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 나타내는 siRNA를 제공하는 데에 있다.
또한, 본 발명의 다른 목적은 엔테로바이러스 70(Enterovirus 70)과 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 나타내는 siRNA 및 이를 유효성분으로 함유하는 약학조성물을 제공하는 데에 있다.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1로 표시되는 siRNA(small interfering RNA)를 제공한다.
본 발명의 일 실시 예에서는 본 발명에 따른 siRNA의 항바이러스 활성을 표준형 바이러스 및 야생형 바이러스(환자의 검체로부터 분리된 것임)를 대상으로 조사한 결과, 탁월하게 상기 바이러스에 대한 세포독성을 억제함을 확인할 수 있었고, 바이러스 특이 단백의 생산을 저해하였으며, 자손 바이러스의 생산을 저해함을 확인할 수 있었다(도 3a, 도 3b, 도 4a 및 도 4b 참조).
또한, 본 발명의 siRNA가 공격하는 게놈 부위의 RNA 이차구조를 분석한 결과, 커다란 루프가 내제되어 있어 이 부분의 자유 에너지(free energy)가 상당히 높을 것으로 예상되었으며, 이러한 표적부위는 본 발명인 AHCe-3D-3 siRNA에 의한 접근이 용이할 것으로 추정되었고 결과적으로 항바이러스 활성이 극대화될 수 있음을 예상할 수 있었다(도 5 참조).
본 발명에서 사용된 용어, "siRNA"는 표적 유전자의 mRNA의 절단(cleavage)을 통하여 RNA 간섭 (RNAi: RNA interference) 현상을 유도할 수 있는 이중사슬 RNA를 의미한다.
본 발명에 따른 siRNA 말단 구조는 표적유전자의 발현을 RNAi 효과에 의하여 억제할 수 있는 것이면 평활 (blunt) 말단 혹은 점착 (cohesive) 말단 모두 가능하다. 점착 말단 구조는 3 말단 돌출한 구조와 5 말단 쪽이 돌출한 구조 모두 가능하다. 돌출하는 염기 수는 한정되지 않는다. 예를 들어, 염기 수로는 1 내지 8 염기, 바람직하게는 2 내지 6 염기로 할 수 있다. 또한, siRNA는 표적유전자의 발현억제 효과를 유지할 수 있는 범위에서 예를 들어, 한쪽 말단의 돌출 부분에 저분자 RNA (예를 들어, tRNA, rRNA, 바이러스 RNA와 같은 천연의 RNA 분자 또는 인공의 RNA 분자)를 포함할 수 있다. siRNA 말단구조는 양측 모두 절단 구조를 가질 필요는 없고, 이중사슬 RNA의 일방의 말단 부위가 링커 RNA에 의하여 접속된 스템 루프형 구조일 수도 있다. 링커의 길이는 스템 부분의 쌍을 이루는 데 지장이 없는 길이면 특별히 한정되지 않는다.
바람직하게는, 본 발명의 siRNA는 19개의 염기를 갖는 이중가닥 RNA로서, 3D 바이러스 폴리머레이즈 영역(CVA24: 6985, EV70: 6903)에 위치하며(도 1 참조), 서열번호 1과 같은 염기서열을 갖는다.
본 발명의 siRNA는 이의 활성을 저하시키지 않는 변화를 갖는, 즉 기능적 등가물인, 하나 이상의 치환, 삽입, 결실 및 이들의 조합을 갖는 변형체를 포함한다. 이러한 변형체는 상기한 siRNA 서열(서열번호 1)과 70% 이상의 상동성을 나타낼 수 있으며, 바람직하게는 80%, 보다 바람직하게는 90%, 가장 바람직하게는 95% 이상의 상동성을 나타낸다. 이러한 상동성은 당 분야에 널리 공지된 컴퓨터 알고리즘, 예를 들어 Align 또는 BLAST 알고리즘 (Altschul, S. F. J. Mol. Biol. 219, 555-565, 1991; Henikoff, S. and Henikoff, J. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 10915-10919, 1992)을 이용하여 폴리뉴클레오타이드의 서열을 표적 폴리뉴클레오타이드의 상응하는 부분과 비교하여 용이하게 결정할 수 있다.
siRNA의 제조방법으로는 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 공지된 방법을 사용할 수 있다. 예를 들면, siRNA를 직접 화학적으로 합성하는 방법(Sui G et al., Proc Natl Acad Sci USA 99:5515-5520, 2002), 시험관 내(in vitro) 전사를 이용한 siRNA의 합성법(Brummelkamp TR et al., Science 296:550-553, 2002), 시험관 내(in vitro) 전사에 의해 합성된 긴 이중-가닥 RNA를 효소를 이용하여 절단하는 방법(Paul CP et al., Nature Biotechnology 20:505-508, 2002), siRNA 발현 플라스미드나 바이러스성 벡터의 세포내 전달을 통한 발현법 (Lee NS et al., Nature Biotechnology 20:500-505, 2002) 및 PCR(polymerase chain reaction) 유도 siRNA 발현 카세트(cassette)의 세포 내 전달을 통한 발현법(Castanotto D et al., RNA 8:1454-1460, 2002) 등이 있으나 이에 한정되는 것은 아니다. siRNA를 제조하는 방법의 결정은 실험의 목적 및 표적 유전자 산물의 세포 생물학적 기능에 따라 달라질 수 있다.
또한, 본 발명에 따른 siRNA를 포함하는 재조합 벡터를 제공한다. 예를 들어 염색체, 에피솜 및 유도된 바이러스와 같은 수많은 발현 시스템이 사용될 수 있다. 보다 구체적으로 사용할 수 있는 재조합 벡터로는 세균성 플라즈미드, 트랜스포숀, 효모 에피솜, 삽입 인자, 효모 염색체 인자, 바큘로바이러스와 같은 바이러스, SV40과 같은 유두종바이러스, 백신 바이러스, 아데노바이러스, 계두 바이러스, 가성광견병 바이러스, 레트로바이러스로부터 유래한 것이 사용될 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다. 이들 재조합 벡터는 또한 코스미드 또는 파지미드 유도체일 수 있다.
siRNA 서열은 예를 들어 문헌(Molecular cloning: A laboratory manual, Sambrook 등, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 2001)에 기재된 바와 같이 본 발명이 속한 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 익히 공지되어 있는 방법들에 의해 재조합 발현 벡터에 삽입될 수 있다.
재조합 벡터는 본 발명의 siRNA 발현의 조절을 제어하는 염기서열을 포함할 수 있고, 이들 서열은 사용된 숙주세포에 따라서 선택된다.
본 발명은 또한 본 발명에 따른 재조합 벡터를 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 숙주 세포에 재조합 벡터의 도입은 인산칼슘를 이용한 형질감염(Graham, F.L. 등, Virology, 52:456(1973)), DEAE 덱스트란에 의한 형질감염, 미세주사에 의한 형질감염(Capecchi, M.R., Cell, 22:479(1980)), 양이온성 지질에 의한 형질감염 (Wong, T.K. 등, Gene, 10:87(1980)), 전기천공법(Neumann E. 등, EMBO J., 1:841(1982)), 형질도입 또는 트랜스펙션과 같이 문헌(Basic methods in molecular biology, Davis 등, 1986 및 Molecular cloning: A laboratory manual, Davis 등, 1986)에 기재된 바와 같이 본 발명이 속한 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 익히 공지되어 있는 방법들에 따라 제조될 수 있다.
숙주 세포는 예를 들어 스트렙토코커스(streptococci), 스타필로코커스( staphylococci), 대장균(E.coli) 또는 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)와 같은 세균 세포, 효모 세포 및 아스페르질러스(Aspergillus), 스트렙토마이세스( Streptomyces)의 세포와 같은 진균류의 세포, 드로소필리아(Drosophilia) S2 및 스포도프테라(Spodoptera) Sf9 세포와 같은 곤충 세포 및 치료 대상이 되는 포유 동물의 세포 또는 식물세포가 될 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
또한, 본 발명은 상기 siRNA를 유효성분으로 함유하는 항바이러스용 약학조성물을 제공한다. 상기 siRNA는 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 가지며, 상기 항바이러스용 약학조성물은 급성 출혈성 결막염 또는 급성 이완성 마비를 치료하거나 예방할 수 있다.
또한, 본 발명은 서열번호 1로 표시되는 siRNA를 유효성분으로 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물을 제공한다.
본 발명의 약학조성물은 상기 siRNA와 약학적으로 허용되는 담체를 균일 또는 균질하게 혼합하여 제조된다. 수성 담체로는 물, 식염수 및 약학적으로 허용되는 완충액이 포함되나 이에 한정되는 것은 아니며, 또 바람직한 비수성 담체로는 광유 및 중성 오일과 이들의 혼합물이 포함되나 이에 한정되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 약학조성물은 상술한 담체 외에도 부형제 및 희석제를 추가로 포함할 수 있다. 그 예로는, 락토즈, 덱스트로즈, 수크로즈, 솔비톨, 만니톨, 칼슘 실리케이트, 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 미정질 셀룰로즈, 폴리비닐피롤리돈, 물, 메틸하이드록시벤조에이트, 프로필하이드록시벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트를 들 수 있다. 이외에 본 발명의 약학조성물은 활성성분의 안정화, 삼투압조절 및 pH 조절 등의 목적으로 적절한 첨가제를 함유할 수도 있다. 상기 첨가제에는 안정화제, 삼투압조절제, pH 조절제, 습윤제, 유화제, 분산제, 방부제 등이 포함되나 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 약학조성물의 제형은 예를 들어 고형상, 현탁상 또는 액상일 수 있으나 바람직하게는 주사투여가 가능한 현탁상 또는 액상 제제 또는 투여 전에 적당한 용매에 녹여 사용하는 주사용 분말 제제이다. 이들 제제는 본 발명이 속한 분야에 공지된 방법에 의해 제조될 수 있다.
본 발명의 조성물의 투여경로로는 핵산을 시험관 내 및 생체 내의 세포로 도입시키는 종래 알려진 방법에 의해 투여될 수 있으며, 통상적인 방법으로는 칼슘 포스페이트, DEAE-덱스트란, 전기천공 및 미세주입법, 바이러스법, 및 양이온성 리포좀을 사용하는 방법 등이 있다(Graham, F. L. et al., Virol. 52, 456, 1973; McCutchan, J. H. et al., J. Natl. Cancer Inst. 41, 351, 1968; Chu, G. et al., Nucl. Acids Res. 15, 1311, 1987; Fraley, R. et al., J. Biol. Chem. 255, 10431, 1980; Capecchi, M. R. et al., Cell, 22, 479, 1980; 및 Felgner, P. L. et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 84, 7413, 1987). 바람직하게는 양이온성 리포좀을 사용하며, 상업적으로 구입하여 사용할 수 있다.
또한, 본 발명의 조성물의 투여경로로는 경구, 국소, 피하, 경피, 진피하, 근육내, 복막내, 방광내, 관절내, 동맥내, 정맥내, 피내, 두개내, 병소내, 안내, 폐내, 척수강내 및 전립선내 투여가 있으나 이에 한정되는 것은 아니다. 또한 본 발명의 조성물은 비 흡입, 폐 흡입, 피부에의 압인을 포함하나 이에 한정되는 것은 아니다.
사람의 경우, 활성 화합물의 통상적인 1일 투여량은 1 내지 10 ㎎/㎏ 체중, 바람직하게는 1 내지 5 ㎎/㎏ 체중의 범위일 수 있고, 1회 또는 수회로 나누어 투여할 수 있다. 그러나 활성 성분의 실제 투여량은 치료할 질환, 투여 경로, 투여 시간, 환자의 연령, 성별 및 체중, 배설 속도, 질환의 중증도, 반응 감응성 등의 여러 요인들에 의해 다양하게 변할 수 있다.
본 발명에 따른 siRNA는 급성 출혈성 결막염의 주요 원인 바이러스인 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24를 포함한 표준형 바이러스 또는 환자의 검체로부터 분리된 야생형 바이러스에 의한 세포독성을 현저히 저해하고 바이러스 복제를 억제함으로써 매우 우수한 항바이러스 활성을 나타내므로 항바이러스 제제, 특히 급성 출혈성 결막염의 치료제로서 매우 유용하게 사용될 수 있다.
도 1은 바이러스 게놈 전체 구조와 본 발명에 따른 siRNA의 상보적 위치 및 서열 정보를 나타낸 것이고,
도 2a 및 도 2b는 바이러스 감염(5 MOI) 후 MRC5 세포의 특성에 관한 것으로, 도 2a는 TCID50에 의한 시간 별 자손 바이러스 생산능을 분석한 것이고, 도 2b는 Hoechst 33342 염색 후 광학/형광 현미경 하에서 세포변화를 관찰한 것이고(○: CVA24, ●: EV70),
도 3a 및 도 3b는 감염된 MRC5 세포에서 본 발명에 따른 siRNA의 항바이러스 효과에 관한 것으로, 도 3a는 광학현미경에 의한 형태적 변화와 바이러스 단백질용 면역 염색 후 형광현미경에 의한 바이러스 단백질 생산능 변화를 나타낸 것이고, 도 3b는 자손 바이러스 생산능을 분석한 것이고,
도 4a 및 도 4b는 감염된 프라이머리 결막 세포에서 본 발명에 따른 siRNA의 보호 효과를 각각 바이러스 단백질 합성 억제 효과 및 바이러스 생산 억제 효과로 나타낸 것이고,
도 5a 및 도 5b는 본 발명에 따른 siRNA가 공격하는 게놈 부위의 RNA 이차구조를 분석한 결과이다.
이하, 하기 실시예를 통해 본 발명을 보다 상세하게 설명한다. 다만, 이러한 실시예에 의해 본 발명이 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> siRNA의 합성
CAPSID 프로그램을 이용하여 콕사키바이러스 A24(CVA24)(Genebank Acc. No: D90457) 및 엔테로바이러스 70(EV70)(Genebank Acc. No: D00820)를 기초로 하여 dTdT3'-오버행을 지닌 21-염기의 이중가닥 siRNA를 설계하였다.
상기 siRNA는 DHARMACON사(미국, www.dharmacon.com)에 의뢰하여 합성하였고, 적색-형광 염료 Cy-3으로 태그된 대조군 siRNA도 동일 회사로부터 구매하였다. 유사하게, 5'단일 포스페이트를 함유하는 변형 siRNA도 동일 회사로부터 구매하였다.
그 결과, 도 1과 같이 전체 바이러스 게놈 7.3kb로부터 5개의 siRNA 후보를 선별하였다. 이들 중 2개는 5'-비번역 영역(NTR)에 위치하는 반면, 나머지 3개는 3D 바이러스 폴리머레이즈 영역에 위치하였다.
siRNA 핵산 서열 및 바이러스 게놈에서 이들의 정확한 표적 부위는 하기 표 1과 같다.
Figure 112010003331768-pat00001
<실시예 2> 항바이러스 활성 평가
실시예 1에 따른 siRNA의 엔테로바이러스 70(EV70) 및 콕싸키바이러스 A24(CVA24)와 같은 바이러스 균주에 대한 항바이러스 활성을 알아보기 위하여 다음과 같은 실험을 수행하였다.
<2-1> 세포 배양
MRC5 및 HeLa 세포를 미국세포주은행(ATCC)에서 구입하였고, 인간 결막섬유아세포를 다른 도너들의 인간 조직으로부터 분리하고, 종래 알려진 방법에 따라 배양하였다(Biochem Biophys Res Commun 2008; 376: 389-94). 본 실험은 서울아산병원의 임상시험심사위원회의 승인을 받았으며, 모든 환자에게 서명동의서를 받았다.
상기 세포는 10% 우태아혈청, L-글루타민(2mM), 페니실린(100IU/㎖) 및 스트렙토마이신(50㎍/㎖)을 함유하는 DMEM(Dulbecco's modified Eagle's medium) 배양 배지에서 37℃의 5% CO2 배양기를 이용하여 배양하였다.
<2-2> 바이러스의 적정
엔테로바이러스 70(EV70-J670/71; #VR836)을 ATCC로부터 구매하였다. 콕사키바이러스 A24 야생형 바이러스는 한국질병관리본부 또는 한국화학연구원으로부터 제공받았고, 한국에서 임상 샘플로부터 분리된 것을 사용하였다. 바이러스들은 HeLa(CVA24) 또는 MRC5(EV70)에서 각각 번식되었고, TCID50을 이용하여 적정하였다.
<2-3> 바이러스 감염된 MRC5 세포에 대한 AHCe-3D-3 siRNA의 세포보호 효과
세포를 OPTI-MEM 배지에서 리포펙타민 2000 시약(Invitrogen)과 복합화된 100nM siRNA으로 4시간 동안 형질감염 시켰다. 4시간 후, 형질감염 배지를 제거하지 않은 채 10% 혈청을 함유한 성장 배지를 첨가하였다. 추가로 8시간 동안 세포를 배양한 후, MOI 5로 바이러스를 감염시켰다. 세척 후, 세포를 신선한 배지에서 배양하였고, 배지와 세포 모두를 회수하여 바이러스 정량을 위해 TCID50을 수행하였다.
또한, 세포를 4% 파라포름알데히드로 고정하고, 0.1M 인산 완충액(pH 7.4)에 용해된 0.05% TritonX-100에 투과시키고 바이러스 VP1 단백질에 특이적인 제1항체(CVA24; K-MAB898 & EV70; MAB843, Chemicon, Billerica, MA)와 배양하였다. 면역 양성 시그널을 FITC-접합 제2항체를 이용하여 가시화 하였다.
그리고, Hoechst 33342 염색을 위하여 PBS로 3회 세정하였다. 세포를 37℃에서 30분 동안 1㎍/ml Hoechst 33342 염료(Invitrogen)와 반응시킨 후, 세포의 핵 형상을 가시화 하였다. 그후, UV 필터를 지닌 형광현미경(FM)으로 세포를 관찰하여 핵에서의 형태적 변화를 분석하였다.
도 2a 및 도 2b와 같이, MRC5 세포는 효과적으로 두 개의 바이러스를 복제하였고, 15-20 h p.i. 이내에 비가역적 세포사를 초래하였으며, 이는 초기 세포 라운딩, 핵 응축(도의 화살표 참조) 및 종국적 세포용해로 나타났다.
한편, 도 3a 및 도 3b와 같이, AHCe-siRNA 중 AHCe-3D-3 siRNA의 전처리에 의해 이러한 세포변화에 대한 보호 효과 즉, 바이러스 복제가 억제되었고, 바이러스 단백질 합성이 극적으로 감소되었다.
<2-4> 바이러스 감염된 인간 결막 세포에 대한 AHCe-3D-3 siRNA의 세포보호 효과
야생형 바이러스 감염에 대한 AHCe-3D-3 siRNA의 치료효과를 검증하기 위하여, 인간 결막조직으로부터 유래한 프라이머리 배양물을 준비하여 앞서와 동일한 방법으로 검토하였다. 앞서와 같이, 콕사키바이러스 A24(CVA24) 및 엔테로바이러스 70(EV70) 모두 동시에 이러한 세포에서 잘 복제되었고, 이는 MRC5 세포에서 관찰된 비가역적 세포변성효과와 유사한 패턴으로 나타났다.
한편, 도 4a 및 도 4b와 같이 AHCe-3D-3 siRNA 처리군에서는 대조군 siRNA와 달리 인간 결막 세포에서 바이러스 복제를 방해하고 세포독성을 유의성있게 억제하였다. 이러한 보호효과는 바이러스 유형과 프라이머리 세포 배치와 상관없이 일관되게 나타났다.
이러한 결과로부터 AHCe-3D-3 siRNA는 바이러스 복제에서 직접적 간섭을 통해 천연 인간 호스트 세포의 바이러스 유도성 세포사를 방지할 수 있을 것으로 판단되었다.
<2-5> siRNA 표적 영역 구조 예측
AHCe-3D-3 siRNA이 공격하는 게놈 부위의 RNA 이차구조를 Mfold web server(http://frontend.bioinfo.rpi.edu/applications/mfold)를 이용하여 분석하였다.
그 결과, AHCe-3D-3의 표적 영역은 siRNA에 쉽게 접근가능하도록 siRNA에 의해 인식되는 인식 부위의 영역에서 2차 루프 구조를 나타내는 반면, 항바이러스 활성이 없는 AHCe-siRNA는 많은 수소결합으로 밀착되어 정렬된 구조로 이루어져 있다. 이때, 도 5a 및 도 5b에서 붉은 원 서열은 바이러스 표적 영역의 염기서열 5'말단, 파란 원 서열은 siRNA의 핵심 염기서열, 선은 수소결합을 의미한다.
서열목록 전자파일 첨부

Claims (5)

  1. 삭제
  2. 삭제
  3. 서열번호 1로 표시되는 siRNA(small interfering RNA)를 유효성분으로 함유하며, 상기 siRNA는 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 것을 특징으로 하는 항바이러스용 약학조성물.
  4. 청구항 3에 있어서, 상기 항바이러스용 약학조성물은 급성 출혈성 결막염 또는 급성 이완성 마비를 치료하거나 예방하는 항바이러스용 약학조성물.
  5. 삭제
KR1020100004560A 2010-01-19 2010-01-19 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물 KR101300410B1 (ko)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020100004560A KR101300410B1 (ko) 2010-01-19 2010-01-19 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물
PCT/KR2011/000372 WO2011090307A2 (ko) 2010-01-19 2011-01-19 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020100004560A KR101300410B1 (ko) 2010-01-19 2010-01-19 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20110085011A KR20110085011A (ko) 2011-07-27
KR101300410B1 true KR101300410B1 (ko) 2013-08-26

Family

ID=44307383

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020100004560A KR101300410B1 (ko) 2010-01-19 2010-01-19 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물

Country Status (2)

Country Link
KR (1) KR101300410B1 (ko)
WO (1) WO2011090307A2 (ko)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SG11201507496UA (en) 2013-04-17 2015-11-27 Pfizer N-piperidin-3-ylbenzamide derivatives for treating cardiovascular diseases

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20050084693A (ko) * 2002-09-13 2005-08-26 레플리코르 인코포레이티드 비서열 상보적 항바이러스 올리고뉴클레오티드
KR20090020244A (ko) * 2007-08-23 2009-02-26 울산대학교 산학협력단 콕싸키바이러스 A24에 대한 항바이러스 활성을 가지는siRNA 및 이를 포함한 급성 출혈성 결막염 치료용조성물

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20050084693A (ko) * 2002-09-13 2005-08-26 레플리코르 인코포레이티드 비서열 상보적 항바이러스 올리고뉴클레오티드
KR20090020244A (ko) * 2007-08-23 2009-02-26 울산대학교 산학협력단 콕싸키바이러스 A24에 대한 항바이러스 활성을 가지는siRNA 및 이를 포함한 급성 출혈성 결막염 치료용조성물

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Biochem. Biophys. Res. Commun. 376(2): 389-394(2008. 11. 14.) *
Lancet. 357(9256): 605(2001. 2. 24.) *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2011090307A3 (ko) 2011-12-29
WO2011090307A2 (ko) 2011-07-28
KR20110085011A (ko) 2011-07-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Shi et al. Inhibition of genes expression of SARS coronavirus by synthetic small interfering RNAs
Xie et al. Inhibition of reporter gene and Iridovirus-tiger frog virus in fish cell by RNA interference
CN102203254B (zh) 有效抑制病毒感染的siRNA组合物及方法
AU2003290586A1 (en) Allele-specific rna interference
KR101585036B1 (ko) 눈 상태의 예방 및/또는 치료를 위한 siRNA 및 방법에 있어서 이의 용도 및 조성물
Murakami et al. Inhibitory effect of RNAi on Japanese encephalitis virus replication in vitro and in vivo
US20070093435A1 (en) Modulation of cell phenotype by inhibitory rna
Tan et al. Development of potential antiviral strategy against coxsackievirus B4
AU2004211949A1 (en) RNAi targeting of viruses
Otaki et al. Inhibition of measles virus and subacute sclerosing panencephalitis virus by RNA interference
KR101300410B1 (ko) 엔테로바이러스 70 및 콕싸키바이러스 A24 모두 동시에 항바이러스 활성을 갖는 siRNA 및 이를 함유하는 급성 출혈성 결막염 치료 및 예방용 약학조성물
Ma et al. Significant inhibition of two different genotypes of grass carp reovirus in vitro using multiple shRNAs expression vectors
Lv et al. Transient inhibition of foot-and-mouth disease virus replication by siRNAs silencing VP1 protein coding region
KR100941452B1 (ko) 콕싸키바이러스 A24에 대한 항바이러스 활성을 가지는siRNA 및 이를 포함한 급성 출혈성 결막염 치료용조성물
US20210348167A1 (en) siNA MOLECULES, METHODS OF PRODUCTION AND USES THEREOF
CA2880777C (en) Composition for treating cancer associated with hpv infection
US20230416754A1 (en) Sina molecules, methods of production and uses thereof
US20070218551A1 (en) Novel Sirna-Based Approach to Target the Hif-Alpha Factor for Gene Therapy
CN101348512A (zh) 一种抗肿瘤的腺病毒制剂
JP4672654B2 (ja) JCウイルスのVP−1に対するsiRNA、及びそれを含有してなる医薬組成物
US20210332364A1 (en) siNA MOLECULES, METHODS OF PRODUCTION AND USES THEREOF
KR100637557B1 (ko) 비폴리오 엔테로바이러스에 대해 항바이러스 활성을 갖는siRNA
KR101834841B1 (ko) 줄기세포의 고활성 유도 방법
KR100741378B1 (ko) 콕사키바이러스 b rna에 특이적인 작은 간섭 rna 및이를 유효성분으로 포함하는 치료제
Shi et al. Antisense downregulation of SARS‐CoV gene expression in Vero E6 cells

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant
FPAY Annual fee payment

Payment date: 20160711

Year of fee payment: 4

FPAY Annual fee payment

Payment date: 20170628

Year of fee payment: 5

FPAY Annual fee payment

Payment date: 20181010

Year of fee payment: 6