KR100257117B1

KR100257117B1 - 세포막 결합 글루코네이트 탈수소 효소 및 그 유전자와 형질전환된 재조합 대장균을 이용한 2-케토-d-글루코네이트로의 생산

Info

Publication number: KR100257117B1
Application number: KR1019970048802A
Authority: KR
Inventors: 반재구; 이홍원; 염도영
Original assignee: 박호군; 한국과학기술연구원
Priority date: 1997-09-25
Filing date: 1997-09-25
Publication date: 2000-05-15
Also published as: US6337199B1; WO1999015673A1; KR19990026601A

Abstract

본 발명은 어위니아 시프리페디(Erwinia Cypripedii)로 부터 글루코네이트를 2-케토-디-글루코네이트로 전환하는 세포막결합 글루코네이트 탈수소효소 (gluconate dehydrogenase), 글루코네이트탈수소 유전자 및 염기서열과 이 유전자를 함유하는 형질전환된 재조합 대장균을 이용하여 글루코네이트의 2-케토-디-글루코네이트로의 전환하는 방법을 제공한다.

Description

세포막 결합 글루코네이트 탈수소효소 및 그 유전자와 형질전환된 재조합 대장균을 이용한 2-케토-Ｄ-글루코네이트로의 생산 {Membrane-bound gluconate dehydrogenase, gene sequence coding therefor, and production of 2-keto-D-gluconate using transformed recombinant E-coli}

본 발명은 어위니아 시프리페디(Erwinia cypripedii) ATCC29267로 부터 글루코네이트를 2-케토-디-글루코네이트로 전환하는 세포막 결합(membrane-bound) 글루코네이트 탈수소효소(gluconate dehydrogenase), 글루코네이트 탈수소효소를 코드하는 유전자 및 염기 서열과 이 유전자를 함유하는 형질전환된 재조합 대장균을 이용한 글루코네이트의 2-케토-디-글루코네이트(2-keto-D-gluconate)로의 전환에 관한 것이다.

어위니아(Erwinia), 글루코노박터(Gluconobacter), 아세토박터(Acetobacter)같은 초산균은 알코올, 알데하이드 이외에 포도당, 글라이세롤, 솔비톨 같은 당 또는 당알코홀을 산화시키며 발효과정중에는 그 산화산물을 상당량 축적한다. 이러한 산화는 세포막의 호흡사슬(respiratory chain)과 연결되어 있는 알코올 탈수소 효소(alcohol dehydrogenase) 혹은 알데하이드 탈수소 효소(aldehyde dehydrogenase) 같은 세포막 결합(membrane bound) 탈수소 효소에 의하여 수행된다. 세포막 결합(membrane bound) 탈수소 효소는 피롤로퀴놀린 퀴논(pyrroloquinoline quinon [PQQ]) 혹은 플라보 아데닌 디뉴클레오타이드(flavin adenine dinucleotide [FAD])를 보족그룹으로 갖는 퀴노단백질(quinoprotein)과 플라보단백질(flavoprotein)으로 나뉘는데 세포막의 호흡사슬과 연결되어 있으며, 여기서 전자가 마지막 전자수용체인 산소분자까지 전달되고 에너지가 발생된다. 세포막 결합(membrane bound) 탈수소 효소는 기질에 대한 활성이 높을뿐만 아니라 세포밖에서 기질을 전환시킬 수 있다는 점에서 기질 전환속도와 전환율이 상대적으로 높다는 장점이 있다.

미생물에의한 생물전환기술은 전통적인 화학적방법에 비하여 경제적 생태학적 잇점때문에 주목되고 있다. 또한 생물전환기술은 유전자 재조합기술과 대사공학기술이 발전하면서 기존의 기술적 문제점을 해결하여 복잡한 화학공정을 대체하고 있다. 그대표적인 예로서 Vitamin C의 생산을 들수 있는데 현재 비타민C의 전구체인 2-케토-엘-굴로네이트(2-keto-L-gulonate)를 솔비톨 경로를 이용한 1단계 발효, 포도당 경로를 이용한 2단 발효 등이 실용화되거나 생산공정이 확립된 단계이다. 어위니아(Erwinia), 글루코노박터(Gluconobacter), 아세토박터(Acetobacter) 같은 미생물은 원형질막에 결합되어 있고 사이토크롬(cytochrome) c와 연결되어 있는 글루코스, 글루코네이트, 2-케토-D-글루코네이트 탈수소효소의 작용에 의하여 포도당을 글루코네이트, 2-케토-디-글루코네이트, 2, 5-다이케토-디-글루코네이트(2,5-diketo-D-gluconate)로 전환한다(Ameyama, M. 등, Agric. Biol. Chem. 51:2943-2950, 1987, Sonoyama, T.등, Agric. Biol. Chem. 52:667-674, 1988). 2, 5-다이케토-디-글루코네이트는 2, 5-다이케토-디-글루코네이트 환원효소(25DKG reductase)에 의해 비타민C의 전구체인 2-케토-엘-굴로네이트(2-keto-L-gulonate)로 전환시킬 수 있다. 그러나 상기 미생물들은 포도당(glucose)으로부터의 산화적 대사과정(oxidative metabolism) 뿐만아니라 중간대사물을 세포내로 전송하는 세포내 대사과정을 거치기 때문에 포도당 경로를 이용한 비타민C 전구체 생산 수율이 저하되는 문제를 야기시킨다.

따라서, 본 발명은 이와같은 종래의 문제점을 해결하고자 안출한 것으로서 본 발명의 목적은 그루코네이트 탈수소유전자를 세포내 대사과정이 없는 다른 균주에 도입하여 발현시키므로서 고수율의 2-케톤-디-글루코네이트로 전환함에 있다. 본 발명의 다른 목적은 상기 목적을 위하여 어위니아 사프리페디 균주의 원형질막에 존재하는 글루코네이트 탈수소 효소를 코드하는 유전자의 DNA 염기서열을 결정함에 있다.

상기 목적을 달성하기 위하여 본 발명자들은 이와 같이 포도당 경로에 관련된 세포막 결합효소중 현재까지 유전자 분리가 보고된 바 없는 글루코네이트 탈수소 유전자를 어위니아 시프리페디 ATCC29267로부터 클로닝하고 케토글루코네이트의 세포내 대사과정이 없는 대장균에 도입한 다음 유전자를 발현하여 높은 전환율과 수율로 글루코네이트로 부터 2-케토-디-글루코네이트로의 전환을 실현하였다. 또한 대장균의 세포막결합 포도당탈수소의 조효소인 피롤로퀴놀린 퀴논(PQQ)를 배양액에 첨가 효소를 활성화 시켜 포도당으로 부터 2-케토-디-글루코네이트로의 전환도 실현하였다.

이하 본 발명을 하기 단계별 실시예에 의해 더욱 상세히 설명하고자 한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 권리범위가 이들만으로 제한되는 것은 아니다.

도 1은 어위니아 시프리페디 글루코네이트 탈수소 효소 제 1, 제 2 그리고 제 3 서브유니트를 포함한 재조합 플라스미드 pGA301의 제한효소 지도 및 제한효소를 지도를 바탕으로 제조한 서브클론을 나타낸 그림이다

도 2는 제한효소 StuI과 SspI으로 절단한 4.6kb DNA 절편의 염기서열을 나타낸 그림이다.

제1단계: 어위니아 시프리페디로 부터 글루코네이트 탈수소 효소의 분리정제 및 아미노 말단 아미노산 서열의 결정

어위니아 시프리페디를(NH4)₂SO₄10g/l, 효모엑기스 3g/l, KH₂PO₄0.2 g/l, NaH2PO4 0.8g/l Trisodium citrate 0.5g/l, Trace metal 1 ml/, 포도당 50 g/l, MgSO₄.7H₂O 0.7g/l, 30^oC, pH 6.0-6.5인 배지에서 배양하고 배양한 세포들을 연속원심분리기로 회수한 후 호모게나이저를 사용하여 세포를 파쇄하였고, 원심분리에 의해 파쇄되지 않은 세포를 제거한후 초고속원심분리에 의해 세포막 부분을 분획하였다. 세포막을 2% Tween80과 0.1 M KCl을 포함하는 50mM 초산완충액(pH 5.0)에서 현탁하여 8시간동안 교반한 후 초고속 원심분리하여 상징액으로부터 글루코네이트 탈수소효소 조효소액을 분획하였다. 세포막에서 용해된 글루코네이트 탈수소효소 조효소액을 0.2% Tween80을 함유한 20mM 초산 완충액으로 평형화된 CM-Sepharose 이온교환 크로마토그라피 컬럼에 통과 시킨 후 같은 완충액에 0.1M 소금이 첨가된 용매로 단백질을 추출하고 활성분획을 0.2% Tween80이 함유된 10mM 인산 완충액(pH6.0)에서 투석하였다. 활성 투석액을 DEAE-Toyopearl 이온교환 크로마토그라피 컬럼에 통과 시킨 후 효소를 0-300mM 농도구배의 소금용액으로 용출하고 활성분획에서 글루코네이트 탈수소효소를 얻었다. SDS-PAGE 결과 효소는 분자량이 65kDa, 45kDa, 20kDa 인 3개의 서브유니트로 구성되어 있는 것으로 나타났는데 분자량이 큰 순서데로 제 1 서브유니트, 제 2 서브유니트 및 제 3 서브유니트로 명명하였다. SDS-PAGE에서의 세 단백질밴드들에 대한 아미노 말단 아미노산 서열을 결정한 결과 다음과 같았다.

제1서브유니트: Ala-Asn-Glu-Leu-Lys-Lys-Val-Asp-Ala-Val-Val-Val-Gly-Phe-Gly

제2서브유니트: Asp-Asp-Gln-Ala-Asn-Asp-Ala-Leu-Val

제3서브유니트: Ala-Glu-Gln-Ser-Ser-Gly-Ser-Gln-Thr-Ala-Arg-Asp-Tyr-Gln-Pro

제2단계: 글루코네이트 탈수소 효소을 코딩하는 유전자의 클로닝

어위니아 시프리페디의 게놈 DNA를 제한효소 EcoRI으로 부분 절단하고 10Kb 이상인 DNA 단편만을 회수하여 같은 제한효소로 절단한 벡터 플라스미드 pUC19와 연결하였다. 연결된 DNA를 대장균 JM109에 형질전환시킨 후 엠피실린 100μg/ml이 첨가된 LB 배지에서 배양하였다. 생성된 콜로니들을 나이트로셀룰로스 필터(nitrocellulose filter)에 옮긴 후 필터를 50mM 아세테이트 완충액(pH5.0), 1mM 페나진 메쏘설페이트(phenazine methosulfate), 1.5mM 2,6-디클로로페놀 인도페놀(2,6-dichlorophenol indophenol), 0.5% 트라이톤 엑스-100(Triton X-100), 0.2M 디-글루코네이트 용액으로 적신 3MM 종이에 올려 놓고 콜로니 주위에 투명환이 형성되는 균주를 선별하였다. 투명환 형성은 세포막 결합 탈수소 효소가 글루코네이트를 기질로 하여 2,6-디클로로페놀 인도페놀를 환원시키는 것으로 간주 하였다. 이상의 직접 클로닝 방법으로 총 4,000여주의 형질전환체로 부터 1주의 투명환을 형성하는 클론을 분리할 수 있었다. 이 재조합 균주가 실제로 글루코네이트를 2-케토-디-글루코네이트로 전환시키는지를 확인하기 위하여 글루코네이트가 첨가된 LB배지에 배양하여 생성된 물질을 HPLC로 분석하였다. 분석결과 재조합균주가 글루코네이트를 2-케토-디-글루코네이트로 전환시켜 재조합 플라스미드를 pGA301로 명명하였다. 재조합 균주로부터 프라스미드 DNA를 알칼리법(Sambrook, J. 등, Molecular Cloning, CSH Press, p.1.25, 1989)으로 분리하고 게놈 라이브러리 제조시 사용한 EcoRI 제한효소로 절단한 결과 10.5 Kb의 외래 DNA가 삽입되 있음을 확인하였다. 여러가지 제한효소를 이용 도 1과 같은 제한효소 지도를 작성하였다.

제3단계: 글루코네이트 탈수소 유전자를 함유하는 DNA 단편의 서브클로닝

제2단계에서 작성된 제한효소 지도를 바탕으로 글루코네이트 탈수소 효소 유전자를 함유하는 최소 DNA 단편을 확인하기 위하여 서브클로닝을 하여 pGA303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312 그리고 pGA313을 제조 하였다. 제 1 도에 나타난바와 같이 각 플라스미드를 함유하는 서브클론들의 효소 활성 및 전환율을 측정한 결과, 4.6kb StuI-SspI가 글루코네이트를 2-케토-디-글루코네이트로 전환시키는 최소 DNA 단편으로 확인되었다. pBlueskript SK+(Stratagene사)의 SmaI 제한효소 인식부위에 4.6kb StuI-SspI 단편이 삽입된 pGA313 재조합 플라스미드를 함유한 대장균 JM109(pGA313)을 1997년 8월 18일 한국과학기술원 생명공학연구소 유전자은행에 기탁하여 수탁번호 KCTC 8823P를 부여 받았다.

제4단계: 4.6 kb StuI-SspI DNA 단편의 DNA 염기서열의 해독

결정된 DNA 염기서열을 DNASIS 프로그렘을 사용하여 분석한 결과 3개의 Open reading frame(ORF)이 확인 되었으며 제 3 서브유니트, 제 1 서브유니트인 탈수소효소 서브유니트, 제 2 서브유니트인 사이토크롬 c(cytochrome c) 서브유니트의 순서대로 위치해 있었다. 3개의 서브유니트는 같은 전사방향으로 구성되어 있었으며 제 2 서브유니트 아래부분에 두개의 역 반복(inverted repeat) 전사종결 부위가 존재하였다. 이러한 유전자 구성은 3개의 서브유니트를 코드하는 유전자가 한개의 오페론(operon)으로 구성되어 있고 함께 전사됨을 나타낸다. 제 3 서브유니트에 해당하는 ORF는 뉴클레오타이드 258-260번에 해당하는 ATG, 뉴클레오타이드 327-329번에 해당하는 ATG, 뉴클레오타이드 348-350번에 해당하는 ATG 혹은 뉴클레오타이드 369-371번에 해당하는 ATG에서 시작해서 뉴클레오타이드 918-920번에서 종결될 수 있으나 GAGG 라이보좀 결합 서열(ribsome-binding sequence)이 뉴클레오타이드 247-250dp 존재 하므로 뉴클레오타이드 258-260번에 해당하는 ATG에서 시작되는 것으로 예상되었다. 이 제 3 서브유니트를 코드하는 유전자는 660bp로 구성되어 있고 분자량 24,471에 해당하는 220개의 아미노산을 코드한다. 정제된 제 3 서브유니트의 아미노 말단 아미노산 서열과 43-56번 아미노산 서열과 일치하여 42개의 아미노 말단 아미노산이 단백질 분비 신호로 작용하는 것으로 추정되었으며 분비 단백질의 분자량이 SDS-PAGE에 나타난 20kDa과 일치하였다. 제 1 탈수소효소 서브유니트는 ATGGA 샤인달가노 서열(SD sequence) 다음의 뉴클레오타이드 934-936번의 GTG에서 시작되고 총 1,845bp로 구성 분자량 67,238에 해당하는 615개의 아미노산을 코딩하였다. 정제된 제 1 서브유니트의 아미노 말단 아미노산 서열과 23-37번 아미노산 서열과 일치하여 22개의 아미노 말단 아미노산이 단백질 분비 신호로 작용하는 것으로 추정되었으며 분비 단백질의 분자량이 SDS-PAGE에 나타난 65kDa과 일치하였다. 사이토크롬 c에 해당하는 제 2 서브유니트 유전자는 제 1 탈수소 효소 서브유니트 유전자에서 11bp아래에 존재하였으며 분자량 47,094에 해당하는 441개의 아미노산을 코딩하였다. 정제된 제 2 서브유니트의 아미노 말단 아미노산 서열과 20-28번 아미노산 서열과 일치하여 19개의 아미노 말단 아미노산이 단백질 분비 신호로 작용하는 것으로 추정되었으며 분비 단백질의 분자량이 SDS-PAGE에 나타난 45kDa과 일치하였다.

한편, 조효소로서 플라보 아데닌 디뉴클레오타이드(flavin adenine dinucleotide [FAD])를 보족그룹으로 갖는 플라보단백질(flavoprotein)은 플라보 아데닌 디뉴클레오타이드의 ADP 부위가 결합하는 특징적인 β1-αA-β2 부위를 갖는데 이 부위는 소위 글라이신 박스(glycine box : GXGXXG, X는 임의의 아미노산을 나타냄)를 갖고 있다(Wierenga, R.등, J. Mol. Biol. 187:101-107, 1986). 제 1 탈수소 효소 서브유니트에는 세개의 예상되는 글라이신 박스가 뉴클레오타이드 1036-1053번(GFGWAG), 뉴클레오타이드 1282-1299번(GTGTGG), 그리고 뉴클레오타이드 2104-2121번(GAGGAG) 존재하는데 유사 아미노산배열을 단백질 데이타 베이스에서 검색한 결과 첫번째 글라이신 박스를 포함하는 부위가 파네로케이트 크리소스포리움(Phanerochaete chrysosporium)의 셀로비오스 탈수소 효소(cellobiose dehydrogenase)(Raices, M.등, FEBS Lett. 369:233-238, 1995), 글루코노박터 옥시단스(Gluconobacter oxydans) 솔보스 탈수소 효소(sorbose dehydrogenase)(Saito, Y.등, Appl. Environ. Microbiol. 63:454-460, 1987), 라이조비움 멜리로티(Rhizobium meliloti) 콜린 탈수소 효소(choline dehydrogenase), 초파리(Drosophila melanogaster)(Whetten, R.등, Genetics 120:475-484, 1988)와 인간 모노아민 산화 효소 B(human monoamine oxidase B)(Grimsby, J.등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:3637-3641, 1991) 포도당 탈수소 효소(glucose dehydrogenase)의 플라보 아데닌 디뉴클레오타이드 결합부위와 유사성을 보여 제 1 서브유니트의 글루코네이트 탈수소 효소 서브유니트가 조효소로서 플라보 아데닌 디뉴클레오타이드를 포함하고 있는 증거라고 할 수 있다.

아미노 말단 부위에 존재하는 특징적인 플라보 아데닌 디뉴클레오타이드 결합부위:Asp-X-X-X-X-Gly-X-Gly-X-X-Gly-X-X-X-Ala-X-X-Leu-X-Glu-X-X-X-X-X-Val-X-X-Glu-X-Gly

이밖에 'Cys-X-Y-Cys-His' 서열을 특징하로 하는 헴(heme) 결합서열이 제 2 서브유니트내에 3개가 존재하였고 아미노산 서열 유사성은 글루코노박터 옥시단스(Gluconobacter oxydans)의 사이토크롬 c-553(Takeda, Y.등, J. Ferment. Eng. 72:1-6, 1991)와 34.1%, 아세토박터 폴리옥소게네스(Acetobacter polyoxogenes) 알코올 탈수소 효소의 사이토크롬 c(Tamaki, T.등, Biochim. Biophys. Acta. 1088:292-300, 1991)와는 39.3%, 아세토박터 파스페리아누스(A. pasteurianus) 알코올 탈수소효소 사이토크롬 c(Takemura, H.등, J. Bacteriol. 175:6857-6866, 1993)와 37.2%, 아세토박터 아세티(A. aceti) 알코올 탈수소효소 사이토크롬 c(Inoue, T.등, J. Ferment. Eng. 73:419-424, 1992)와는 38.9%을 보였다.

이상에서 어위니아 시프리페디 ATCC29267의 세포막 결합(membrane-bound) 글루코네이트 탈수소효소 유전자의 탈수소 효소 유전자는 660bp에 의해 코드되는 제 3 서브유니트, 1,845bp에 의해 코드되는 제 1 서브유니트, 1,323bp로 코드되는 제 2 서브유니트를 포함하며, 이들 서브유니트는 제한효소 StuI와 SspI로 절단되는 4.5kb 크기의 DNA 단편내에 연결되어 있음을 알 수 있다. 이들 염기서열은 GeneBank에 제 U97665호로서 1997년 4월 16일에 등록되어 있다.

제5단계: 재조합 대장균을 이용한 포도당 혹은 글루코네이트로부터 2-케토-디-글루코네이트로의 전환

대장균은 포도당 탈수소 효소를 아포(apo) 형태로 합성하고 배양액상에 조효소인 피놀로퀴놀로 퀴논(PQQ)를 첨가하면 아포 효소가 활성 홀로(holo) 효소로 재구성되는 것으로 알려져 있다(Biville, F.등, J. Gen. Microbiol. 137:1775-1782, 1991, Goosen, N.등, J. Bacteriol. 171:447-455, 1989, Hommes, R.등, FEMS Microbiol. Lett. 24:2-3, 1984). 이러한 대장균의 포도당 탈수소 효소 기능을 배양액에 피놀로퀴놀로 퀴논(PQQ)를 첨가 재구성한 후 포도당으로 부터 글루코네이트를 거쳐 2-케토-디-글루코네이트로의 전환을 시도하였다. 재조합 플라스미드 pGA313으로 형질전환된 대장균 JM109를 2.5% 포도당, 엠피실린(100μg/ml) 그리고 10μM 피놀로퀴놀로 퀴논(PQQ)을 첨가한 LB배지에서 배양하였다. 기준균주로는 플라스미드 벡터 pUC18이 형질전환된 대장균 JM109를 사용하였다. 표 1에 나타난 바와 같이 pGA313으로 형질전환된 대장균 JM109이 포도당을 12시간 내에 29.2 mg/ml의 2-케토-디-글루코네이트로 전환시켰다. 글루코네이트를 탄소원으로 배양하였을때는 30mg/ml의 글루코네이트를 29.2mg/ml의 2-케토-디-글루코네이트로 전환시켰다. 포도당과 글루코네이트에 대한 전환 수율은 각각 0.86mole 2-케토-디-글루코네이트/mole 포도당과 0.95mole 2-케토-디-글루코네이트/mole 글루코네이트, 포도당은 16시간 후 0.95mole 2-케토-디-글루코네이트/mole 포도당의 전환 수율로 2-케토-디-글루코네이트로 전환되었다.

재조합 대장균에 의한 포도당 혹은 글루코네이트로(GA)부터 2-케토-디-글루코네이트(2KDG)의 생산^*

재조합균주	기 질	조효소PQQ	생성량(㎎/㎖)	GA생산수율^**	2KDG생산수율^**
재조합균주	기 질	조효소PQQ	포도당	GA생산수율^**	2KDG생산수율^**	GANa	2KDGNa
대장균JM109(pUC18)	포도당	첨가않음	23.5	0	0	0	0
대장균JM109(pUC18)	포도당	첨가	0	29.9	0	0.99	0
대장균JM109(pGA313)	포도당	첨가않음	235.5	0	0	0	0
대장균JM109(pGA313)	포도당	첨가	0	2.4	25.9	0.08	0.86(0.95)^***
대장균JM109(pUC18)	GA	첨가않음	측정않음	29.8	0	측정않음	0
대장균JM109(pGA313)	GA	첨가않음	측정않음	0	29.2	측정않음	0.95

주:^*재조합균주들은 2.5% 포도당 혹은 글루코네이트(GA)가 함유된 LB 배지에

접종되어 37℃에서 12시간 배양되었다.

^**글루코네이트(GA)와 2-케토-디-글루코네이트(2KDG)의 몰 수율(molar yield)은

초기 기질로부터 계산되었다.

^***16시간 배양했을 경우의 값

이상 실시예와 실험결과를 통하여 알수 있는 바와같이 글루코네이트 탈수소 효소 유전자가 삽입된 재조합 플라스미드 PGA313을 함유하는 재조합대장균은 글루코네이트 탈수소 효소 유전자가 잘 발현되어 높은 속도와 수율로 글루코네이트를 2-케토-디-글루코네이트로 전환할 뿐만 아니라 대장균에 존재하는 아포 포도당 탈수소효소를 조효소인 피놀로퀴놀로 퀴논(PQQ)를 배양액에 첨가, 효소를 재구성 활성화 시킴으로서 포도당으로부터 직접 2-케토-디-글루코네이트로 전환할 수 있으므로 유전자공학 및 식품산업상 매우 유용한 발명인 것이다.

Claims

하기와 같은 물리적 특성 및 효소 특성을 갖는 어위니아 시프리페디(Erwinia cypripedii) 균주로부터 유래한 글루코네이트 탈수소 효소.

(a)구성 및 분자량 : SDS-폴리아크릴아마이드 젤 전기영동에 의한 분자량 측정시 분자량이 각각 65kDa(제1서브유니트), 45kDa(제2서브유니트) 및 20kDa(제3서브유니트)인 3 개의 서브유니트로 구성되고,

(b)특징적인 아미노산 서열 : 제1서브유니트의 아미노말단 아미노산 서열이 하기 식(I)으로 도시되고, 제2서브유니트의 아미노말단 아미노산 서열이 하기 식(II)으로 도시되고, 제3서브유니트의 아미노말단 아미노산 서열이 하기 식(III)으로 도시되고, 제1서브유니트에 플라보 아데닌 디뉴클레오티드 결합 부위 아미노산 서열이 하기 식(IV)으로 도시되고, 제2서브유니트내 3군데 존재하는 헴(heme) 결합 아미노산 서열이 하기 식(V)으로 도시되고,

Ala-Asn-Glu-Leu-Lys-Lys-Val-Asp-Ala-Val-Val-Val-Gly-Phe-Gly (I)

Asp-Asp-Gln-Ala-Asn-Asp-Ala-Leu-Val (II)

Ala-Glu-Gln-Ser-Ser-Gly-Ser-Gln-Thr-Ala-Arg-Asp-Tyr-Gln-Pro (III)

Asp-X-X-X-X-Gly-X-Gly-X-X-Gly-X-X-X-Ala-X-X-Leu-X-Glu-X-

X-X-X-X-Val-X-X-Glu-X-Gly (IV)

Cys-X-Y-Cys-His (V)

(여기서, X 및 Y는 임의의 아미노산을 나타냄)

(c)기질특이성 및 활성 : 글루코네이트(gluconate)를 2-케토-디-클루코네이트(2-keto-D-gluconate)로 전환시키고,

(d)조효소 : FAD이다.
어위니아 시프리페디 ATCC29267 게놈으로부터 유래한 4.6kb StuI/SspI 단편상에 위치하고, 도 2a, 도 2b 및 도 2c에 나타낸 바와 같은 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 글루코네이트 탈수소 효소 암호화 유전자
상기 제1항 글루코네이트 탈수소 효소의 제3서브유니트를 암호화하는, 하기와 같은 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 글루코네이트 탈수소 효소 제3서브유니트 암호화 유전자.

258 ATGTCAGAAC ACAAAAATGG TCACACACGC AGGGATTTTC TGCTGAGAAC CATCACCCTG

318 GCGCCAGCAA TGGCGGTGGG TTCAACAGCG ATGGGTGCAC TGGTTGCGCC AATGGCTGCC

378 GGAGCAGCAG AACAAAGCAG CGGGTCACAA ACCGCCCGCG ACTATCAGCC GACCTGGTTT

438 ACGGCGGAAG AGTTTGCCTT TATCACCGCA GCGGTGGCAC GTCTGATCCC CAACGATGAA

489 CGTGGTCCTG GCGCACTGGA AGCCGGGGTG CCGGAGTTTA TCGATCGCCA GATGAACACC

558 CCGTACGCCC TCGGCAGCAA CTGGTACATG CAGGGGCCGT TCAATCCCGA TCTGCCGAAA

618 GAGCTGGGTT ATCAGCTGCC GCTGGTGCCG CAGCAGATCT ACCGTCTGGG CCTCGCCGAT

678 GCTGATAGCT GGAGCAAACA CCAGCACGGC AAAGTGTTTG CTGAGCTGAG CGGCGACCAG

738 CAGGATGCCC TGCTGAGCGA CTTCGAAAGT GGCAAAGCGG AGTTCACCCA GCTCCCGGCC

798 AAAACCTTCT TCTCCTTCCT GCTGCAAAAC ACCCGCGAGG GTTACTTCAC GCGATCCGAT

858 CCACGGTGGC AATCAGGGCA TGGTGGGCTG GAAGCTGATT GGCTTCCCCG GCGCACGCGC
상기 제1항 글루코네이트 탈수소 효소의 제1서브유니트를 암호화하는, 하기와 같은 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 글루코네이트 탈수소 효소 제1서브유니트 암호화 유전자.

934 GTGGAACGCG GTGAACGCGT ATCCGTTCCC GTCAGTGGAT ATTCGCGGGG AGAGGGCGTA

994 ACCGTGGCAA ATGAATTGAA GAAAGTGGAT GCGGTGGTGG TGGGTTTCGG CTGGGCCGGT

1054 GCCATCATGG CAAAAGAACT ACCGAAGCCG GGCTGAATGT GGTGGCGCTG GAGCGTGGTC

1114 CGCATCGTGA CACCTACCCG GATGGCGCGT ATCCGCAATC CATTGATGAG ACTGACCTAC

1174 AACATCCGTA AAAAGCTGTT CCAGGACCTG TCAAAAAGCA CCGTCACCAT TCGTCACGAC

1234 GCGTCACAGA CGGCAGTGCC GTATCGTCAG CTGGCGGCGT TTCTGCCCGG CACCGGTACC

1294 GGCGGCGCGG GCCTGCACTG GTCAGGCGTA CATTTCCGTG TCGACCCGGT CGAGCTGAAT

1354 CTGCGCAGCC ATTATGAAGC GCGTTACGGC AAAAACTTTA TCCCGGAAGG CATGACGATT

1414 CAGGATTTCG GCGTCAGCTA TAACGAACTG GAACCCTTCT TCGATCAGGC GGAGAAAGTC

1474 TTTGGTACCT CGGGCAGTGC CTGGACCATC AAAGGCAAGA TGATCGGCAA GGAGAAAGGC

1534 GGCAACTTTT ACGCGCCGGA CCGCTCCAGC GACTTCCCGC TGCCCGCACA GAAGCGGACT

1594 TACTCGGCGC AGCTGTTTGC CCAGGCGGCA GAGTCGGTGG GCTATCATCC GTACGATATG

1654 CCATCGGCCA ACACCTCAGG TCCGTACACC AACACCTACG GCGCACAGAT GGGCCCGTGC

1714 AACTTCTGCG GCTATTGCAG CGGCTACGCC TGCTACATGT ATTCCAAAGC GTCGCCTAAC

1774 GTGAACATCC TGCCCGCGCT GCGTCAGGAG CCGAAGTTTG AGCTGCGTAA CAACGCATAT

1834 GTGTTGCGCG TCAATCTGAC CGGCGACAAA AAACGCGCCA CTGGCGTGAC CTATCTCGAT

1894 GGTCAGGGTC GTGAAGTGGT GCAGCCTGCG GATCTGGTGA TCCTGTCAGC GTTCCAGTTC

1954 CACAACGTGC ACCTGATGCT GCTGTCCGGT ATCGGCCAGC CGTATAACCC GATCACTAAC

2014 GAAGGTGTGG TCGGCCGTAA CTTCGCTTAT CAGAACATCT CGACGCTGAA AGCGCTGTTC

2074 GACAAAAACA CCACCACTAA CCCGTTTATC GGTGCGGGTG GCGCAGGGGT GGCGGTGGAT

2134 GATTTCAACG CCGACAACTT CGACCACGGC CCGTACGGCT TCGTCGGTGG CTCGCCATTC

2194 TGGGTGAACC AGGCGGGTAC CAAACCGGTT TCCGGTCTGC CGACCCCCAA AGGCACGCCG

2254 AACTGGGGCA GCCAGTGGAA AGCGGCGGTG GCGGATACCT ACAACCACCA TATTTCGATG

2314 GATGCCCACG GTGCGCACCA GTCATACCGC GCTAACTACC TCGATCTCGA TCCGAACTAC

2374 AAAAATGTCT ACGGCCAGCC GCTGCTGCGT ATGACCTTTG ACTGGCAGGA CAACGACATC

2434 AGGATGGCGC AGTTTATGGT CGGCAAGATG CGCAAAATCA CCGAGGCCAT GAATCCGAAG

2494 ATGATCATCG GCGGCGCTAA GGGACCGGGT ACCCACTTCG ATACCACCGT GTATCAAACC

2554 ACGCATATGA GCGGCGGGGC GATCATGGGT GAAGATCCGA AAACCAGCGC AGTGAACCGT

2614 TATTTGCAGA GCTGGGATGT GCCGAACGTG TTTGTGCCGG GTGCGTCCGC GTTCCCGCAG

2674 GGTCTGGGCT ACAACCCGAC CGGCATGGTG GCGGCACTGA CCTACTGGTC GGCGAAAGCC

2734 ATCCGTGAAC AGTATCTGAA GAACCCAGGT CCACTGGTGC AGGCA
상기 제1항 글루코네이트 탈수소 효소의 제2서브유니트 단백질을 암호화하는 하기와 같은 염기서열을 갖는 것을 특징으로 하는 글루코네이트 탈수소 효소 제2서브유니트 암호화 유전자.

2793 ATGATGAAAAGCATTCTGGCCCTGGTTTTGGGCACGCTGTCGTTCGCCGCGCTGGCGGAC

2853 GATCAGGCAAATGACGCCCTGGTAAAACGGGGTGAATATCTGGCGCGCGCCGGTGACTGC

2913 GTGGCCTGCCACAGCGTCAAAGGTGGGCAGCCTTTTGCCGGTGGGTTGCCGATGGCGACG

2973 CCGATTGGCACCATTTATTCCACCAACATCACCCCGGATAAAACCACCGGGATTGGTGAC

3033 TATAGCTACGACGACTTCCAGAAAGCGGTGCGTCATGGCGTGGCGAAAAACGGTGACACG

3093 CTGTATCCGGCGATGCCGTATCCGTCTTACGCAGTGGTGAGCGACGAGGACATGAAGGCG

3153 CTGTACGCGTACTTTATGCACGGCGTGGCCCCGGTGGCGCAGGCTAACAAAGACAGCGAC

3213 ATTCCGTGGCCGCTGTCGATGCGCTGGCCTTTAGCTATCTGGCGCGGCGTGTTTGCGCCG

3273 GACGTGAAAGCGTTCCAGCCTGCCGCCCAGGAAGATCCGGTGCTGGCACGGGGTCGTTAT

3333 CTGGTGGAAGGTCTGGGTCACTGTGGCGCCTGCCATACGCCGCGCAGCATCACCATGCAG

3393 GAGAAAGCGCTCAGCAATGATGGCGCGCATGATTATCTCTCCGGCAGCAGCGCACCGATT

3453 GATGGCTGGACCGCAAGCAACCTGCGTGGTGACAACCGCGACGGCCTGGGACGCTGGAGC

3513 GAGGACGATCTGCGCCAGTTCCTGCGCTATGGCCGCAACGATCACACCGCCGCGTTTGGT

3573 GGTATGACTGATGTGGTGGAGCACAGCCTGCAACACCTGAGCGATGACGATATCACGGCA

3633 ATTGCCCGTTATCTGAAGTCGCTGGGGGCGAAGGACGCCAGCCAGACGGTGTTTACCCAG

3693 GATGACCAGGTGGCGAAAGCGTTGTGGAAAGGTGATGACAGCCAGACTGGCGCGTCGGTG

3753 TATGTCGACAGCTGTGCGGCCTGCCATAAAACCGACGGCAGCAGGTTATCAGCGCTTCTT

3813 CCCGGCGCTGCGTGGCAACCCGGTGGTGCTGGCGAACCCGATCCGACGTCGCTGATCCAC

3873 ATCGTGCTGACTGGCGGAACGCTGCCAGGCGTGCAGGGTGCACCGACGGCGATCACCATG

3933 CCGGCATTCGGCTGGCGCCTGAATGACCAGCAGGTGGCGGATGTTGTGAACTTTATTCGC

3993 GGCAGCTGGGGCAACGGTGCCAAAGCCACGGTGACGGCGAAAGATGTCGCATCCTTACGT

4053 AAGGATGAAACCGTGCAGGCGCACCAGGGTAATGCGGATATTAAGGTGCTGGAGCAACAG

4113 CAG
상기 제2항의 글루코네이트 탈수소효소 유전자를 포함하는 재조합 벡터 pGA313으로 형질전환된 재조합 대장균 JM109(pGA313)(수탁번호 KCTC 8823P).
상기 제3항의 제3서브유니트 암호화 유전자에 의해 암호화되는 하기와 같은 아미노산 서열을 가지는 글루코네이트 탈수소 효소의 제3서브유니트 단백질

M S E H K N G H T R R D F L L R T I T L 20

A P A M A V G S T A M G A L V A P M A A 40

G A A E Q S S G S Q T A R D Y Q P T W F 60

T A E E F A F I T A A V A R L I P N D E 80

R G P G A L E A G V P E F I D R Q M N T 100

P Y A L G S N W Y M Q G P F N P D L P K 120

E L G Y Q L P L V P Q Q I Y R L G L A D 140

A D S W S K H Q H G K V F A E L S G D Q 160

Q D A L L S D F E S G K A E F T Q L P A 180

K T F F S F L L Q N T R E G Y F T R S D 200

P R W Q S G H G G L E A D W L P R R T R 220
상기 제4항의 제1서브유니트 암호화 유전자에 의해 암호화되는 하기와 같은 아미노산 서열을 가지는 글루코네이트 탈수소 효소 제1서브유니트 단백질

V E R G E R V S V P V S G Y S R G E G V 20

T V A N E L K K V D A V V V G F G W A G 40

A I M A K E L T E A G L N V V A L E R G 60

P H R D T Y P D G A Y P Q S I D E L T Y 80

N I R K K L F Q D L S K S T V T I R H D 100

A S Q T A V P Y R Q L A A F L P G T G T 120

G G A G L H W S G V H F R V D P V E L N 140

L R S H Y E A R Y G K N F I P E G M T I 160

Q D F G V S Y N E L E P F F D Q A E K V 180

F G T S G S A W T I K G K M I G K E K G 200

G N F Y A P D R S S D F P L P A Q K R T 220

Y S A Q L F A Q A A E S V G Y H P Y D M 240

P S A N T S G P Y T N T Y G A Q M G P C 260

N F C G Y C S G Y A C Y M Y S K A S P N 280

V N I L P A L R Q E P K F E L R N N A Y 300

V L R V N L T G D K K R A T G V T Y L D 320

G Q G R E V V Q P A D L V I L S A F Q F 340

H N V H L M L L S G I G Q P Y N P I T N 360

E G V V G R N F A Y Q N I S T L K A L F 380

D K N T T T N P F I G A G G A G V A V D 400

D F N A D N F D H G P Y G F V G G S P F 420

W V N Q A G T K P V S G L P T P K G T P 440

N W G S Q W K A A V A D T Y N H H I S M 460

D A H G A H Q S Y R A N Y L D L D P N Y 480

K N V Y G Q P L L R M T F D W Q D N D I 500

R M A Q F M V G K M R K I T E A M N P K 520

M I I G G A K G P G T H F D T T V Y Q T 540

T H M S G G A I M G E D P K T S A V N R 560

Y L Q S W D V P N V F V P G A S A F P Q 580

G L G Y N P T G M V A A L T Y W S A K A 600

I R E Q Y L K N P G P L V Q A 615
상기 제4항의 제2서브유니트 암호화 유전자에 의해 암호화되는 하기와 같은 아미노산 서열을 가지는 글루코네이트 탈수소 효소 제2서브유니트 단백질

M M K S I L A L V L G T L S F A A L A D 20

D Q A N D A L V K R G E Y L A R A G D C 40

V A C H S V K G G Q P F A G G L P M A T 60

P I G T I Y S T N I T P D K T T G I G D 80

Y S Y D D F Q K A V R H G V A K N G D T 100

L Y P A M P Y P S Y A V V S D E D M K A 120

L Y A Y F M H G V A P V A Q A N K D S D 140

I P W P L S M R W P L A I W R G V F A P 160

D V K A F Q P A A Q E D P V L A R G R Y 180

L V E G L G H C G A C H T P R S I T M Q 200

E K A L S N D G A H D Y L S G S S A P I 220

D G W T A S N L R G D N R D G L G R W S 240

E D D L R Q F L R Y G R N D H T A A F G 260

G M T D V V E H S L Q H L S D D D I T A 280

I A R Y L K S L G A K D A S Q T V F T Q 300

D D Q V A K A L W K G D D S Q T G A S V 320

Y V D S C A A C H K T D G S R L S A L L 340

P G A A W Q P G G A G E P D P T S L I H 360

I V L T G G T L P G V Q G A P T A I T M 380

P A F G W R L N D Q Q V A D V V N F I R 400

G S W G N G A K A T V T A K D V A S L R 420

K D E T V Q A H Q G N A D I K V L E Q Q 440

Q 441
제2항의 유전자를 포함하는 재조합 발현벡터.
제3항, 제4항 또는 제5항중의 어느 한 항의 유전자를 포함하는 재조합 발현벡터.
제10항 또는 제11항의 재조합 발현벡터로 형질전환된 대장균속 세균.
상기 제6항의 형질전환된 재조합 대장균 JM109(수탁번호 KCTC 8823P)을 배양하는 것을 포함하는 재조합 글루코네이트 탈수소 효소의 제조 방법.
제12항의 형질전환된 대장균속 세균을 배양하는 것을 포함하는 재조합 글루코네이트 탈수소 효소의 제조 방법.