JPWO2020028327A5 - - Google Patents
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以下に、本願の当初の特許請求の範囲に記載の発明を列挙する。
[発明1]
HAO1遺伝子内で二本鎖切断(DSB)または一本鎖切断(SSB)を誘導する方法であって、組成物を細胞に送達することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含む、方法。
[発明2]
HAO1遺伝子の発現を低減する方法であって、組成物を細胞に送達することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含む、方法。
[発明3]
原発性高シュウ酸尿症1型(PH1)を治療または予防する方法であって、それを必要とする対象に組成物を投与することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含み、それによってPH1を治療または予防する、方法。
[発明4]
PH1によって引き起こされる末期腎疾患(ESRD)を治療または予防する方法であって、それを必要とする対象に組成物を投与することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含み、それによって、PH1によって引き起こされる(ESRD)を治療または予防する、方法。
[発明5]
シュウ酸カルシウム産生および沈着、高シュウ酸尿症、シュウ酸症、ならびに血尿のうちのいずれか1つを治療または予防する方法であって、それを必要とする対象に組成物を投与することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含み、それによって、シュウ酸カルシウム産生および沈着、高シュウ酸尿症、シュウ酸症、ならびに血尿のうちのいずれか1つを治療または予防する、方法。
[発明6]
血清グリコレート濃度を高める方法であって、それを必要とする対象に組成物を投与することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含み、それによって血清グリコレート濃度を高める、方法。
[発明7]
対象において尿内のオキシレートを低減する方法であって、それを必要とする対象に組成物を投与することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含み、それによって対象の尿内のオキサレートを低減する、方法。
[発明8]
RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸が投与される、発明1~7のいずれか一つに記載の方法。
[発明9]
組成物であって、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号1~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含む、組成物。
[発明10]
短いシングルガイドRNA(短いsgRNA)を含む組成物であって、
a.ガイド配列であって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列のいずれか1つ、または
ii.配列番号1~146から選択されるガイド配列のいずれか1つの少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるか、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つ、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含む、ガイド配列と、
b.ヘアピン領域を含むsgRNAの保存部分であって、前記ヘアピン領域が、少なくとも5~10個のヌクレオチドを欠失しており、任意選択で、前記短いsgRNAが、5’末端修飾および3’末端修飾のうちの1つ以上を含む、保存部分と、を含む、組成物。
[発明11]
配列番号202の配列を含む、発明10に記載の組成物。
[発明12]
5’末端修飾を含む、発明10または発明11に記載の組成物。
[発明13]
前記短いsgRNAが、3’末端修飾を含む、発明10~12のいずれか一つに記載の組成物。
[発明14]
前記短いsgRNAが、5’末端修飾および3’末端修飾を含む、発明10~13のいずれか一つに記載の組成物。
[発明15]
前記短いsgRNAが、3’テールをさらに含む、発明10~14のいずれか一つに記載の組成物。
[発明16]
前記3’テールが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のヌクレオチドを含む、発明15に記載の組成物。
[発明17]
前記3’テールが、約1~2、1~3、1~4、1~5、1~7、1~10、少なくとも1~2、少なくとも1~3、少なくとも1~4、少なくとも1~5、少なくとも1~7、または少なくとも1~10個のヌクレオチドを含む、発明15に記載の組成物。
[発明18]
前記短いsgRNAが、3’テールを含まない、発明10~17のいずれか一つに記載の組成物。
[発明19]
前記ヘアピン領域内に修飾を含む、発明10~18のいずれか一つに記載の組成物。
[発明20]
3’末端修飾と、前記ヘアピン領域内の修飾と、を含む、発明10~19のいずれか一つに記載の組成物。
[発明21]
3’末端修飾と、前記ヘアピン領域内の修飾と、5’末端修飾と、を含む、発明10~20のいずれか一つに記載の組成物。
[発明22]
5’末端修飾と、前記ヘアピン領域内の修飾と、を含む、発明10~21のいずれか一つに記載の組成物。
[発明23]
前記ヘアピン領域が、少なくとも5個の連続ヌクレオチドを欠失している、発明10~22のいずれか一つに記載の組成物。
[発明24]
前記少なくとも5~10個の欠失しているヌクレオチドが、
a.ヘアピン1内にある、
b.ヘアピン1およびヘアピン1とヘアピン2との間の「N」内にある、
c.ヘアピン1およびヘアピン1の直ぐ3’側の2個のヌクレオチド内にある、
d.ヘアピン1の少なくとも一部を含む、
e.ヘアピン2内にある、
f.ヘアピン2の少なくとも一部を含む、
g.ヘアピン1およびヘアピン2内にある、
h.ヘアピン1の少なくとも一部を含み、ヘアピン1とヘアピン2との間の「N」を含む、
i.ヘアピン2の少なくとも一部を含み、ヘアピン1とヘアピン2との間の「N」を含む、
j.ヘアピン1の少なくとも一部を含み、ヘアピン1とヘアピン2との間の「N」を含み、ヘアピン2の少なくとも一部を含む、
k.ヘアピン1もしくはヘアピン2内にあり、任意選択で、ヘアピン1とヘアピン2との間の「N」を含む、
l.連続している、
m.連続しており、ヘアピン1とヘアピン2との間の「N」を含む、
n.連続しており、少なくともヘアピン1の一部およびヘアピン2の一部に及ぶ、
o.連続しており、ヘアピン1の少なくとも一部およびヘアピン1とヘアピン2との間の「N」に及ぶ、
p.連続しており、ヘアピン1の少なくとも一部およびヘアピン1の直ぐ3’側の2個のヌクレオチドに及ぶ、
q.5~10個のヌクレオチドからなる、
r.6~10個のヌクレオチドからなる、
s.5~10個の連続ヌクレオチドからなる、
t.6~10個の連続ヌクレオチドからなる、または
u.配列番号400のヌクレオチド54~58からなる、発明10~23のいずれか一つに記載の組成物。
[発明25]
ネクサス領域を含むsgRNAの保存部分を含み、前記ネクサス領域が、少なくとも1個のヌクレオチドを欠失している、発明10~24のいずれか一つに記載の組成物。
[発明26]
前記ネクサス領域内で欠失している前記ヌクレオチドが、
a.前記ネクサス領域内の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のヌクレオチド、
b.前記ネクサス領域内の少なくともまたは正確に1~2個のヌクレオチド、1~3個のヌクレオチド、1~4個のヌクレオチド、1~5個のヌクレオチド、1~6個のヌクレオチド、1~10個のヌクレオチド、または1~15個のヌクレオチド、および
c.前記ネクサス領域内の各ヌクレオチドのうちのいずれか1つ以上を含む、発明25に記載の組成物。
[発明27]
修飾シングルガイドRNA(sgRNA)を含む組成物であって、
a.ガイド配列であって、
i.配列番号1~146から選択されるガイド配列のいずれか1つ、または
ii.配列番号1~146から選択されるガイド配列のいずれか1つの少なくとも17、18、19、または20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、または90%同一であるか、または
iv.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つ、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含む、ガイド配列を含み、さらに、
b.以下
1.1つ以上のガイド領域YA部位におけるYA修飾、
2.1つ以上の保存領域YA部位におけるYA修飾、
3.1つ以上のガイド領域YA部位および1つ以上の保存領域YA部位におけるYA修飾、
4.i)2つ以上のガイド領域YA部位におけるYA修飾、
ii)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに
iii)保存領域YA部位1および8のうちの1つ以上におけるYA修飾、または
5.i)1つ以上のガイド領域YA部位におけるYA修飾であって、前記ガイド領域YA部位が、5’末端部の5’末端から8番目のヌクレオチド、またはその後にある、YA修飾、
ii)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに任意選択で、
iii)保存領域YA部位1および8のうちの1つ以上におけるYA修飾、または
6.i)1つ以上のガイド領域YA部位におけるYA修飾であって、前記ガイド領域YA部位が、前記ガイド領域の3’末端部ヌクレオチドの13個のヌクレオチド内にある、YA修飾、
ii)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに
iii)保存領域YA部位1および8のうちの1つ以上におけるYA修飾、または
7.i)5’末端修飾および3’末端修飾、
ii)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに
iii)保存領域YA部位1および8のうちの1つ以上におけるYA修飾、または
8.i)ガイド領域YA部位におけるYA修飾であって、前記ガイド領域YA部位の前記修飾が、前記ガイド領域YA部位の5’に位置する少なくとも1個のヌクレオチドが含まない修飾を含む、YA修飾
ii)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに
iii)保存領域YA部位1および8のうちの1つ以上におけるYA修飾、または
9.i)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに
ii)保存領域YA部位1および8におけるYA修飾、または
10.i)1つ以上のガイド領域YA部位におけるYA修飾であって、前記YA部位が、前記5’末端部の8番目のヌクレオチド、またはその後にある、YA修飾、
ii)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびに
iii)H1-1およびH2-1のうちの1つ以上における修飾、または
11.i)保存領域YA部位2、3、4、および10のうちの1つ以上におけるYA修飾、ii)保存領域YA部位1、5、6、7、8、および9のうちの1つ以上におけるYA修飾、ならびにiii)H1-1およびH2-1のうちの1つ以上における修飾、または
12.i)YA修飾などの、前記5’末端部から6番目のヌクレオチド、またはその後に位置する1つ以上のヌクレオチドにおける修飾、
ii)1つ以上のガイド配列YA部位におけるYA修飾、
iii)B3、B4、およびB5のうちの1つ以上における修飾であって、B6が、2’-OMe修飾を含まないか、もしくは2’-OMe以外の修飾を含む、修飾、
iv)LS10における修飾であって、LS10が、2’-フルオロ以外の修飾を含む、修飾、ならびに/または
v)N2、N3、N4、N5、N6、N7、N10、もしくはN11における修飾、から選択される1つ以上の修飾を含み、
以下
i.1つ以上のガイド領域YA部位におけるYA修飾、
ii.1つ以上の保存領域YA部位におけるYA修飾、
iii.1つ以上のガイド領域YA部位および1つ以上の保存領域YA部位におけるYA修飾、
iv.前記5’末端部の前記5’末端からのヌクレオチド8~11、13、14、17、または18のうちの少なくとも1つが、2’-フルオロ修飾を含まない、
v.前記5’末端部の前記5’末端からのヌクレオチド6~10のうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエート連結を含まない、
vi.B2、B3、B4、もしくはB5のうちの少なくとも1つが、2’-OMe修飾を含まない、
vii.LS1、LS8、もしくはLS10のうちの少なくとも1つが、2’-OMe修飾を含まない、
viii.N2、N3、N4、N5、N6、N7、N10、N11、N16、もしくはN17のうちの少なくとも1つが、2’-OMe修飾を含まない、
ix.H1-1が、修飾を含む、
x.H2-1が、修飾を含む、または
xi.H1-2、H1-3、H1-4、H1-5、H1-6、H1-7、H1-8、H1-9、H1-10、H2-1、H2-2、H2-3、H2-4、H2-5、H2-6、H2-7、H2-8、H2-9、H2-10、H2-11、H2-12、H2-13、H2-14、もしくはH2-15のうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエート連結を含まない、のうちの少なくとも1つが真である、組成物。
[発明28]
配列番号450を含む、発明27に記載の組成物。
[発明29]
細胞または対象において前記HAO1遺伝子内で二本鎖切断(DSB)または一本鎖切断を誘導する際に使用するための、発明9~28のいずれか一つに記載の組成物。
[発明30]
細胞または対象において前記HAO1遺伝子の発現を低減する際に使用するための、発明9~28のいずれか一つに記載の組成物。
[発明31]
対象においてPH1を治療または予防する際に使用するための、発明9~28のいずれか一つに記載の組成物。
[発明32]
対象において血清および/または血漿グリコレート濃度を高める際に使用するための、発明9~28のいずれか一つに記載の組成物。
[発明33]
対象において尿オキサレート濃度を低減する際に使用するための、発明9~28のいずれか一つに記載の組成物。
[発明34]
オキサレート産生、臓器におけるシュウ酸カルシウム沈着、高シュウ酸尿症、全身性シュウ酸症を含むシュウ酸症、血尿、末期腎疾患(ESRD)を治療もしくは予防する、および/または腎臓もしくは肝臓移植の必要性を遅らせるか、もしくは改善する際に使用するための、発明9~28のいずれか一つに記載の組成物。
[発明35]
さらに、
a.細胞または対象において前記HAO1遺伝子内で二本鎖切断(DSB)を誘導すること、
b.細胞または対象において前記HAO1遺伝子の発現を低減すること、
c.対象においてPH1を治療または予防すること、
d.対象において血清および/または血漿グリコレート濃度を高めること、
e.対象において尿オキサレート濃度を低減すること、
f.オキサレート産生を低減すること、
g.臓器におけるシュウ酸カルシウム沈着を低減すること、
h.高シュウ酸尿症を低減すること、
i.全身性シュウ酸症を含むシュウ酸症を治療または予防すること、
j.血尿を治療または予防すること、
k.末期腎疾患(ESRD)を予防すること、および/または
l.腎臓または肝臓移植の必要性を遅らせるか、または改善すること、を含む、発明1~8のいずれか一つに記載の方法。
[発明36]
前記組成物が、血清および/または血漿グリコレートレベルを高める、発明1~8または発明29~35のいずれか一つに記載の方法または使用するための組成物。
[発明37]
前記組成物が、前記HAO1遺伝子の編集を引き起こす、発明1~8または発明29~35のいずれか一つに記載の方法または使用するための組成物。
[発明38]
前記編集が、編集される集団の割合(編集率)として計算される、発明37に記載の方法または使用するための組成物。
[発明39]
前記編集率が、前記集団の30~99%である、発明38に記載の方法または使用するための組成物。
[発明40]
前記編集率が、前記集団の30~35%、35~40%、40~45%、45~50%、50~55%、55~60%、60~65%、65~70%、70~75%、75~80%、80~85%、85~90%、90~95%、または95~99%である、発明38に記載の方法または使用するための組成物。
[発明41]
前記組成物が、尿オキサレート濃度を低減する、発明1~8または発明29~35のいずれか一つに記載の方法または使用するための組成物。
[発明42]
尿オキサレートの減少が、腎臓結石および/または腎臓、肝臓、膀胱、心臓、皮膚、または眼におけるシュウ酸カルシウム沈着を減少させる、発明41に記載の方法または使用するための組成物。
[発明43]
前記ガイド配列が、
a.配列番号1~146、
b.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145、および
c.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145から選択される、発明1~42のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明44]
前記組成物が、
a.配列番号151~168のうちのいずれか1つ、または
b.配列番号251~268のうちのいずれか1つ、または
c.配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145から選択されるガイド配列、または
d.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145から選択されるガイド配列、を含むsgRNAを含む、発明1~43のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明45]
前記標的配列が、前記ヒトHAO1遺伝子のエクソン1、3、4、5、6、または8の中にある、発明1~44のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明46]
前記標的配列が、前記ヒトHAO1遺伝子のエクソン1の中にある、発明45に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明47]
前記標的配列が、前記ヒトHAO1遺伝子のエクソン3の中にある、発明45に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明48]
前記標的配列が、前記ヒトHAO1遺伝子のエクソン4の中にある、発明45に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明49]
前記標的配列が、前記ヒトHAO1遺伝子のエクソン6の中にある、発明45に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明50]
前記標的配列が、前記ヒトHAO1遺伝子のエクソン8の中にある、発明45に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明51]
前記ガイド配列が、HAO1のプラス鎖内の標的配列に対して相補的である、発明1~50のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明52]
前記ガイド配列が、HAO1のマイナス鎖内の標的配列に対して相補的である、発明1~50のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明53]
前記第1のガイド配列が、前記HAO1遺伝子の前記プラス鎖内の第1の標的配列に対して相補的であり、前記組成物が、前記HAO1遺伝子の前記マイナス鎖内の第2の標的配列に対して相補的である第2のガイド配列をさらに含む、発明1~50のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明54]
前記ガイドRNAが、配列番号1~146のうちのいずれか1つから選択されるガイド配列を含み、配列番号200のヌクレオチド配列をさらに含み、前記配列番号200のヌクレオチドが、その3’末端にある前記ガイド配列の後にある、発明1~53のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明55]
前記ガイドRNAが、配列番号1~146のうちのいずれか1つから選択されるガイド配列を含み、配列番号201、配列番号202、配列番号203、または配列番号400~450のうちのいずれか1つのヌクレオチド配列をさらに含み、前記配列番号201、配列番号202、配列番号203、または配列番号400~450のうちのいずれか1つのヌクレオチドが、その3’末端にある前記ガイド配列の後にある、発明1~54のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明56]
前記ガイドRNAが、シングルガイド(sgRNA)である、発明1~55のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明57]
前記sgRNAが、配列番号4、5、6、8、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、または145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、発明56に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明58]
前記sgRNAが、配列番号151~168または251~268のうちのいずれか1つを含む、発明56に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明59]
前記ガイドRNAが、配列番号300のパターンに従って修飾され、前記Nが、まとめて、表1のガイド配列(配列番号1~146)のうちのいずれか1つである、発明1~58のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明60]
配列番号300の各Nが、任意の天然または非天然ヌクレオチドであり、前記Nが、前記ガイド配列を形成し、前記ガイド配列が、前記HAO1遺伝子に対してCas9を標的とする、発明59に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明61]
前記sgRNAが、配列番号1~146の前記ガイド配列、および配列番号201、配列番号202、もしくは配列番号203の前記ヌクレオチドのうちのいずれか1つを含む、発明1~60のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明62]
前記sgRNAが、配列番号1~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列を含む、発明1~61のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明63]
前記sgRNAが、配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145、151~168、および251~268から選択される配列を含む、発明62に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明64]
前記ガイドRNAが、少なくとも1つの修飾を含む、発明1~63のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明65]
前記少なくとも1つの修飾が、2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオチドを含む、発明64に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明66]
ヌクレオチドの間にホスホロチオエート(PS)結合を含む、発明63~65のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明67]
2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオチドを含む、発明63~66のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明68]
前記ガイドRNAの5’末端での最初の5個のヌクレオチドのうちの1つ以上における修飾を含む、発明63~67のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明69]
前記ガイドRNAの3’末端での最後の5個のヌクレオチドのうちの1つ以上における修飾を含む、発明63~68のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明70]
前記ガイドRNAの最初の4個のヌクレオチドの間にPS結合を含む、発明63~69のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明71]
前記ガイドRNAの最後の4個のヌクレオチドの間にPS結合を含む、発明63~70のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明72]
前記ガイドRNAの5’末端での最初の3個のヌクレオチドに2’-O-Me修飾ヌクレオチドを含む、発明63~71のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明73]
前記ガイドRNAの3’末端での最後の3個のヌクレオチドに2’-O-Me修飾ヌクレオチドを含む、発明63~72のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明74]
前記ガイドRNAが、配列番号300の修飾ヌクレオチドを含む、発明63~73のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明75]
前記組成物が、薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含む、発明1~74のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明76]
前記ガイドRNAが、脂質ナノ粒子(LNP)と会合している、発明1~75のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明77]
前記LNPが、陽イオン性脂質を含む、発明76に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明78]
前記陽イオン性脂質が、(9Z,12Z)-3-((4,4-ビス(オクチルオキシ)ブタノイル)オキシ)-2-((((3-(ジエチルアミノ)プロポキシ)カルボニル)オキシ)メチル)プロピルオクタデカ-9,12-ジエノエートであり、3-((4,4-ビス(オクチルオキシ)ブタノイル)オキシ)-2-((((3-(ジエチルアミノ)プロポキシ)カルボニル)オキシ)メチル)プロピル(9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエノエートとも呼ばれる、発明77に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明79]
前記LNPが、中性脂質を含む、発明76~78のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明80]
前記中性脂質が、DSPCである、発明79に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明81]
前記LNPが、ヘルパー脂質を含む、発明76~80のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明82]
前記ヘルパー脂質が、コレステロールである、発明81に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明83]
前記LNPが、ステルス脂質を含む、発明76~82のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明84]
前記ステルス脂質が、PEG2k-DMGである、発明83に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明85]
前記組成物が、RNAガイドDNA結合剤をさらに含む、発明1~84のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明86]
前記組成物が、RNAガイドDNA結合剤をコードするmRNAをさらに含む、発明1~85のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明87]
前記RNAガイドDNA結合剤が、Cas9である、発明85または86に記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明88]
前記組成物が、薬学的製剤であり、薬学的に許容可能な担体をさらに含む、発明1~87のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明89]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号1である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明90]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号2である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明91]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号3である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明92]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号4である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明93]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号5である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明94]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号6である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明95]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号7である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明96]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号8である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明97]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号9である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明98]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号10である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明99]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号11である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明100]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号12である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明101]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号13である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明102]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号14である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明103]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号15である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明104]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号16である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明105]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号17である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明106]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号18である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明107]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号19である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明108]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号20である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明109]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号21である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明110]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号22である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明111]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号23である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明112]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号24である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明113]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号25である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明114]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号26である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明115]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号27である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明116]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号28である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明117]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号29である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明118]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号30である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明119]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号31である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明120]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号32である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明121]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号33である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明122]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号34である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明123]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号35である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明124]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号36である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明125]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号37である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明126]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号38である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明127]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号39である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明128]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号40である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明129]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号41である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明130]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号42である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明131]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号43である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明132]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号44である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明133]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号45である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明134]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号46である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明135]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号47である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明136]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号48である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明137]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号49である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明138]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号50である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明139]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号51である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明140]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号52である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明141]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号53である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明142]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号54である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明143]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号55である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明144]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号56である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明145]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号57である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明146]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号58である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明147]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号59である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明148]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号60である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明149]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号61である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明150]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号62である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明151]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号63である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明152]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号64である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明153]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号65である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明154]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号66である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明155]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号67である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明156]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号68である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明157]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号69である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明158]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号70である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明159]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号71である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明160]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号72である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明161]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号73である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明162]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号74である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明163]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号75である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明164]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号76である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明165]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号77である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明166]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号78である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明167]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号79である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明168]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号80である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明169]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号81である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明170]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号82である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明171]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号83である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明172]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号84である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明173]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号85である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明174]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号86である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明175]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号87である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明176]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号88である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明177]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号89である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明178]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号90である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明179]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号91である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明180]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号92である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明181]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号93である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明182]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号94である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明183]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号95である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明184]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号96である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明185]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号97である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明186]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号98である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明187]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号99である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明188]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号100である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明189]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号101である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明190]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号102である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明191]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号103である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明192]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号104である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明193]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号105である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明194]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号106である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明195]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号107である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明196]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号108である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明197]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号109である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明198]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号110である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明199]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号111である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明200]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号112である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明201]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号113である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明202]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号114である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明203]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号115である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明204]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号116である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明205]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号117である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明206]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号118である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明207]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号119である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明208]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号120である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明209]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号121である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明210]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号122である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明211]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号123である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明212]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号124である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明213]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号125である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明214]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号126である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明215]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号127である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明216]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号128である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明217]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号129である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明218]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号130である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明219]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号131である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明220]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号132である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明221]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号133である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明222]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号134である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明223]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号135である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明224]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号136である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明225]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号137である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明226]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号138である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明227]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号139である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明228]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号140である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明229]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号141である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明230]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号142である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明231]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号143である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明232]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号144である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明233]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号145である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明234]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号146である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明235]
配列番号1~146から選択される前記配列が、配列番号146である、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明236]
前記ガイドRNAが、配列番号251を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明237]
前記ガイドRNAが、配列番号252を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明238]
前記ガイドRNAが、配列番号253を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明239]
前記ガイドRNAが、配列番号254を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明240]
前記ガイドRNAが、配列番号255を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明241]
前記ガイドRNAが、配列番号256を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明242]
前記ガイドRNAが、配列番号257を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明243]
前記ガイドRNAが、配列番号258を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明244]
前記ガイドRNAが、配列番号259を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明245]
前記ガイドRNAが、配列番号260を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明246]
前記ガイドRNAが、配列番号261を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明247]
前記ガイドRNAが、配列番号262を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明248]
前記ガイドRNAが、配列番号263を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明249]
前記ガイドRNAが、配列番号264を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明250]
前記ガイドRNAが、配列番号265を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明251]
前記ガイドRNAが、配列番号266を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明252]
前記ガイドRNAが、配列番号267を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明253]
前記ガイドRNAが、配列番号268を含むsgRNAである、発明1~88のいずれか一つに記載の方法、使用するための組成物、または組成物。
[発明254]
前記組成物が、単回用量として投与される、発明1~253のいずれか一つに記載の方法または組成物。
[発明255]
前記組成物が、一度投与される、発明1~254のいずれか一つに記載の方法または組成物。
[発明256]
前記単回用量または一度投与が、
a.DSBを誘導する、および/または
b.HAO1遺伝子の発現を低減する、および/または
c.PH1を治療もしくは予防する、および/または
d.PH1によって引き起こされるESRDを治療もしくは予防する、および/または
e.シュウ酸カルシウム産生および沈着を治療もしくは予防する、および/または
f.高シュウ酸尿症を治療もしくは予防する、および/または
g.シュウ酸症を治療もしくは予防する、および/または
h.血尿を治療もしくは予防する、および/または
i.血清グリコレート濃度を高める、および/または
J.尿内のオキシレートを低減する、発明254または255に記載の方法または組成物。
[発明257]
前記単回用量または一度投与が、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15週間にわたって、a)~j)のうちのいずれか1つ以上を達成する、発明256に記載の方法または組成物。
[発明258]
前記単回用量または一度投与が、永続的な効果を達成する、発明256または257に記載の方法または組成物。
[発明259]
永続的な効果を達成することをさらに含む、発明1~258のいずれか一つに記載の方法または組成物。
[発明260]
前記永続的な効果が、少なくとも1ヶ月、少なくとも3ヶ月、少なくとも6ヶ月、少なくとも1年、または少なくとも5年持続する、発明259に記載の方法または組成物。
[発明261]
前記組成物の投与によって、尿内のオキサレートの治療的に関連する減少がもたらされる、発明1~260のいずれか一つ一項に記載の方法または組成物。
[発明262]
前記組成物の投与によって、治療範囲内の尿オキサレートレベルがもたらされる、発明1~261のいずれか一つに記載の方法または組成物。
[発明263]
前記組成物の投与によって、正常範囲の100、120、または150%以内のオキサレートレベルがもたらされる、発明1~262のいずれか一つに記載の方法または組成物。
[発明264]
PH1を有するヒト対象を治療するための医薬の調製のための、発明9~263のいずれかに記載の組成物または製剤の使用。
Claims (34)
- 対象における、原発性高シュウ酸尿症1型(PH1)若しくはPH1によって引き起こされる末期腎疾患(ESRD)を治療または予防するために用いられる組成物であって、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号8、1~7、9~146から選択されるガイド配列、
ii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、
iii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列に対して少なくとも99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、もしくは90%同一であるガイド配列、
iv.配列番号8,4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と
を含む、前記組成物。 - HAO1遺伝子内で二本鎖切断(DSB)または一本鎖切断(SSB)を誘導する、またはHAO1遺伝子の発現を低減する方法であって、組成物を細胞に送達することを含み、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号8、1~7、9~146から選択されるガイド配列、
ii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、
iii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列に対して少なくとも95%もしくは90%同一であるガイド配列、
iv.配列番号8、4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含む、方法。 - シュウ酸カルシウム産生および沈着、高シュウ酸尿症、シュウ酸症、ならびに血尿のうちのいずれか1つを治療または予防する、血清グリコレート濃度を高める、あるいは対象において尿内のオキシレートを低減するために用いられる組成物であって、前記組成物が、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号8、1~7、9~146から選択されるガイド配列、
ii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、
iii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列に対して少なくとも95%もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号8、4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸とを含む、前記組成物。 - RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸が含まれる、あるいは投与または送達される、請求項1~3のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 組成物であって、
a.ガイドRNAであって、
i.配列番号8、1~7、9~146から選択されるガイド配列、または
ii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列の少なくとも17、18、19、もしくは20個の連続ヌクレオチド、または
iii.配列番号8、1~7、9~146から選択される配列に対して少なくとも95%もしくは90%同一であるガイド配列、または
iv.配列番号8、4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列、または
v.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、ガイドRNAと、任意選択で、
b.RNAガイドDNA結合剤、またはRNAガイドDNA結合剤をコードする核酸と、を含む、組成物。 - 前記‘ガイドRNAがシングルガイドRNA(sgRNA)であり、該sgRNAの保存部分がヘアピン領域及び上部ステム領域を含む、請求項5に記載の組成物。
- 前記sgRNAが、(i)5’末端修飾、(ii)3’末端修飾、(iii)前記上部ステム領域における修飾、(iv)前記ヘアピン領域における修飾、または(v)(i)~(iv)の1以上の組合せを含む、請求項6に記載の組成物。
- a.細胞または対象において前記HAO1遺伝子内で二本鎖切断(DSB)を誘導する、
b.細胞または対象において前記HAO1遺伝子の発現を低減する、
c.対象においてPH1を治療または予防する、
d.対象において血清または血漿グリコレート濃度を高める、
e.対象において尿オキサレート濃度を低減する、
f.オキサレート産生を低減する、
g.臓器におけるシュウ酸カルシウム沈着を低減する、
h.高シュウ酸尿症を低減する、
i.全身性シュウ酸症を含むシュウ酸症を治療または予防する、
j.血尿を治療または予防する、
k.末期腎疾患(ESRD)を予防する、または
l.腎臓または肝臓移植の必要性を遅らせるか、または改善する
ために用いられる、請求項5~7のいずれか一項に記載の組成物。 - 前記組成物が、血清および/または血漿グリコレートレベルを高める、請求項1~4および8のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記組成物が、前記HAO1遺伝子の編集を引き起こすものであり、任意選択で、前記編集が、編集される集団の割合(編集率)として計算され、任意選択で、前記編集率が、前記集団の30~99%である、請求項1~4、8および9のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記組成物が、尿オキサレート濃度を低減する、請求項1~4および8~10のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記ガイド配列が、
a.配列番号8、1~7、9~146、
b.配列番号8、4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145、および
c.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145から選択される、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物または方法。 - 前記組成物が、
a.配列番号151~168のうちのいずれか1つ、または
b.配列番号251~268のうちのいずれか1つ、または
c.配列番号8、4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、145から選択されるガイド配列、または
d.配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145から選択されるガイド配列、を含むシングルガイドRNA(sgRNA)を含む、請求項1~12のいずれか一項に記載の組成物または方法。 - 前記ガイドRNAが、配列番号8、1~7、9~146のうちのいずれか1つから選択されるガイド配列を含み、配列番号200のヌクレオチド配列をさらに含み、前記配列番号200のヌクレオチドが、その3’末端にある前記ガイド配列の後にある、請求項1~12のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記ガイドRNAが、配列番号8、1~7、9~146のうちのいずれか1つから選択されるガイド配列を含み、配列番号201、配列番号202、配列番号203、または配列番号400~450のうちのいずれか1つのヌクレオチド配列をさらに含み、前記配列番号201、配列番号202、配列番号203、または配列番号400~450のうちのいずれか1つのヌクレオチドが、その3’末端にある前記ガイド配列の後にある、請求項1~12のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記ガイドRNAが、シングルガイド(sgRNA)である、請求項1~15のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記sgRNAが、配列番号8、4、5、6、22、35、38、39、56、73、84、100、105、113、117、129、または145のうちのいずれか1つを含むガイド配列を含む、請求項16に記載の組成物または方法。
- 前記sgRNAが、配列番号151~168または251~268のうちのいずれか1つを含む、請求項17に記載の組成物または方法。
- 前記ガイドRNAが、配列番号300のパターンに従って修飾され、前記Nが、まとめて、配列番号8、1~7、9~146ガイド配列のうちのいずれか1つであり、任意選択で、配列番号300の各Nが、任意の天然または非天然ヌクレオチドであり、前記Nが、前記ガイド配列を形成し、前記ガイド配列が、前記HAO1遺伝子に対してCas9を標的とする、請求項1~18のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記sgRNAが、配列番号8、1~7、9~146から選択される配列に対して少なくとも95%もしくは90%同一であるガイド配列を含む、請求項1~19のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記sgRNAが、配列番号8、22、35、39、73、84、100、105、113、145、151~168、および251~268から選択される配列を含む、請求項20に記載の組成物または方法。
- 前記ガイドRNAが、少なくとも1つの修飾を含み、前記修飾が、下記:
a)2’-O-メチル(2’-O-Me)修飾ヌクレオチド、
b)ヌクレオチドの間におけるホスホロチオエート(PS)結合、
c)2’-フルオロ(2’-F)修飾ヌクレオチド、
d)5’末端での最初の5個のヌクレオチドのうちの1つ以上における修飾、
e)3’末端での最後の5個のヌクレオチドのうちの1つ以上における修飾、
f)最初の4個のヌクレオチドの間におけるPS結合、
g)最後の4個のヌクレオチドの間におけるPS結合、
h)5’末端での最初の3個のヌクレオチドにおける2’-O-Me修飾ヌクレオチド、
i)3’末端での最後の3個のヌクレオチドにおける2’-O-Me修飾ヌクレオチド、または
j)前記a)~i)のうちの2つ以上の組合せ
のうちの少なくとも1つを含む、請求項1~21のいずれか一項に記載の組成物または方法。 - 前記ガイドRNAが、脂質ナノ粒子(LNP)と会合している、請求項1~22のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記LNPが、イオン性脂質、中性脂質、ヘルパー脂質、および/またはステルス脂質を含む、請求項23に記載の組成物または方法。
- 前記イオン性脂質が、(9Z,12Z)-3-((4,4-ビス(オクチルオキシ)ブタノイル)オキシ)-2-((((3-(ジエチルアミノ)プロポキシ)カルボニル)オキシ)メチル)プロピルオクタデカ-9,12-ジエノエートであり、3-((4,4-ビス(オクチルオキシ)ブタノイル)オキシ)-2-((((3-(ジエチルアミノ)プロポキシ)カルボニル)オキシ)メチル)プロピル(9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエノエートとも呼ばれる、請求項24に記載の組成物または方法。
- 前記中性脂質が、DSPCである、請求項24または25に記載の組成物または方法。
- 前記ヘルパー脂質が、コレステロールである、請求項24~26のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記ステルス脂質が、PEG2k-DMGである、請求項24~27のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記組成物が、RNAガイドDNA結合剤をさらに含む、請求項1~28のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記組成物が、RNAガイドDNA結合剤をコードするmRNAをさらに含む、請求項1~28のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記RNAガイドDNA結合剤が、Cas9である、請求項29または30に記載の組成物または方法。
- 前記組成物が、薬学的製剤であり、薬学的に許容可能な担体をさらに含む、請求項1~31のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記組成物が、単回用量として送達または投与される、請求項1~4および8~32のいずれか一項に記載の組成物または方法。
- 前記細胞が肝細胞である、請求項2、4および8~32のいずれか一項に記載の方法または組成物。
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