JPWO2019173773A5

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Publication number: JPWO2019173773A5
Application number: JP2020571337A
Authority: JP
Publication date: 2022-03-16

Claims

（ｉ）天然ヒトＣＤ１２２への大幅に低減された結合を有し、かつ（ｉｉ）残基Ｔ５１、Ｒ８１において天然タンパク質以外のアミノ酸による少なくとも１つのアミノ酸置換を含むか、またはアミノ酸置換Ｍ２３Ａを含み、かつ（ｉｉｉ）Ｅ１５、Ｈ１６、Ｌ１９、Ｄ２０のそれぞれにおいてアミノ酸置換を含む、操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
［Ｅ１５Ｄ、Ｅ１５Ｔ、Ｅ１５Ａ、Ｅ１５Ｓ］、［Ｈ１６Ｎ、Ｈ１６Ｑ］、［Ｌ１９Ｖ、Ｌ１９Ｉ、Ｌ１９Ａ］、［Ｄ２０Ｌ、Ｄ２０Ｍ］、［Ｑ２２Ｓ、Ｑ２２Ｔ、Ｑ２２Ｅ、Ｑ２２Ｋ、Ｑ２２Ｅ］、［Ｍ２３Ａ、Ｍ２３Ｗ、Ｍ２３Ｈ、Ｍ２３Ｙ、Ｍ２３Ｆ、Ｍ２３Ｑ、Ｍ２３Ｙ］、［Ｇ２７Ｋ、Ｇ２７Ｓ］、［Ｒ８１Ｄ、Ｒ８１Ｙ］、［Ｎ８８Ｅ、Ｎ８８Ｑ］、［Ｔ５１Ｉ］から選択される１つ以上のアミノ酸置換を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換Ｅ１５Ｓ；Ｈ１６Ｑ；Ｌ１９ＶおよびＤ２０Ｌを含む、請求項１または請求項２に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換Ｑ２２Ｋをさらに含む、請求項１～３のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換Ｔ５１Ｉを含む、請求項１～４のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換Ｒ８１ＤまたはＲ８１Ｙを含む、請求項１～５のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｄ、Ｈ１６Ｎ、Ｌ１９Ｖ、Ｄ２０Ｌ、Ｑ２２Ｔ、Ｍ２３Ａ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｄ、Ｈ１６Ｎ、Ｌ１９Ｖ、Ｄ２０Ｌ、Ｑ２２Ｋ、Ｍ２３Ａ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｓ、Ｈ１６Ｑ、Ｌ１９Ｖ、Ｄ２０Ｌ、Ｍ２３Ｑ、Ｒ８１Ｄ、Ｔ５１Ｉ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｓ、Ｈ１６Ｑ、Ｌ１９Ｖ、Ｄ２０Ｌ、Ｍ２３Ｑ、Ｒ８１Ｙ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｓ；Ｈ１６Ｑ；Ｌ１９Ｖ；Ｄ２０Ｌ；Ｍ２３Ａ；およびＱ２２Ｋ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｓ；Ｈ１６Ｑ；Ｌ１９Ｖ；Ｄ２０Ｌ；Ｍ２３Ｑ；Ｒ８１Ｄ；およびＴ５１Ｉ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｓ；Ｈ１６Ｑ；Ｌ１９Ｖ；Ｄ２０Ｌ；Ｍ２３Ｑ；およびＲ８１Ｙ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
アミノ酸置換のセット［Ｅ１５Ｓ；Ｈ１６Ｑ；Ｌ１９Ｖ；Ｄ２０Ｌ；およびＭ２３Ａ］を含む、請求項１に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチドが、ペグ化（ＰＥＧ化）される、請求項１～１４のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記ＰＥＧが、約５ｋＤ～約８０ｋＤの分子量を有する、請求項１５に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記ＰＥＧが、約５ｋＤ～約４０ｋＤの分子量を有する、請求項１５に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記ＰＥＧが、約４０ｋＤの分子量を有する、請求項１５に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記ＰＥＧが、分岐状ＰＥＧである、請求項１５～１８のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記ＰＥＧが、直鎖状ペグである、請求項１５～１８のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記ＰＥＧが、リンカーを介して前記ヒトＩＬ－２ポリペプチドのアミノ末端に結合される、請求項１５～１８のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチドが、ＩｇＧのＦｃドメインまたはアルブミンに融合される、請求項１～１４のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチドが、直交ヒトＣＤ１２２タンパク質に結合し、それを活性化する、請求項１～２２のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記直交ヒトＣＤ１２２タンパク質が、Ｒ４１、Ｒ４２、Ｑ７０、Ｋ７１、Ｔ７３、Ｔ７４、Ｖ７５、Ｓ１３２、Ｈ１３３、Ｙ１３４、Ｆ１３５、Ｅ１３６、およびＱ２１４から選択される１つ以上の残基で修飾される、請求項２３に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記直交ヒトＣＤ１２２タンパク質が、Ｈ１３３およびＹ１３４で修飾される、請求項２４に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
前記直交ヒトＣＤ１２２タンパク質が、アミノ酸置換Ｈ１３３ＤおよびＹ１３４Ｆを含む、請求項２５に記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド。
請求項１～２２のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチドと、薬学的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
請求項１～１４のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチドをコードする、核酸。
請求項２７に記載の医薬組成物を含む、予め充填されたシリンジ。
請求項２８に記載の核酸を含む、発現ベクター。
前記ベクターが、ウイルスベクターである、請求項３０に記載の発現ベクター。
前記ベクターが、非ウイルスベクターである、請求項３０に記載の発現ベクター。
請求項３０～３２のいずれかに記載のベクターを含むように遺伝子操作された、細胞。
哺乳類細胞を活性化するための方法であって、
（ａ）直交ヒトＣＤ１２２受容体をコードする核酸配列を含むベクターで哺乳類細胞をトランスフェクションすることであって、前記直交ヒトＣＤ１２２受容体が、Ｈ１３３およびＹ１３４においてアミノ酸置換を含み、前記核酸が、前記直交ヒトＣＤ１２２受容体がそのような細胞において発現されるように、そのような哺乳類細胞において機能する発現制御配列に作動可能に連結される、トランスフェクションすることと、前記哺乳類細胞を、請求項１～２２のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチドと接触させることと、を含む、方法。
前記哺乳類細胞が、免疫細胞または幹細胞である、請求項３４に記載の方法。
前記細胞が免疫細胞である、請求項３５に記載の方法。
前記免疫細胞が、Ｔ細胞である、請求項３６に記載の方法。
前記Ｔ細胞が、ＣＡＲ－Ｔ細胞である、請求項３７に記載の方法。
疾患、障害、または状態に罹患している哺乳類対象を治療する方法であって、
前記個体に治療有効量の免疫エフェクター細胞を投与することであって、前記免疫エフェクター細胞が、Ｈ１３３およびＹ１３４においてアミノ酸置換を含む直交ヒトＣＤ１２２受容体を発現する、投与することと、
前記個体に、治療有効量の、請求項１～２２のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド、または請求項３０～３２のいずれかに記載の組換えベクターを投与することと、を含む、方法。
前記免疫エフェクター細胞が、Ｔ細胞である、請求項３９に記載の方法。
前記Ｔ細胞が、ＣＡＲ－Ｔ細胞である、請求項４０に記載の方法。
前記ＣＡＲ－Ｔ細胞のキメラ抗原受容体の抗原結合ドメインが、標的細胞の表面上で発現される１つ以上の抗原に特異的に結合する、請求項３８に記載の方法。
前記ＣＡＲ－Ｔ細胞の前記キメラ抗原受容体の前記抗原結合ドメインが、ｓｃＦｖを含む、請求項４２に記載の方法。
前記ＣＡＲ－Ｔ細胞の前記キメラ抗原受容体の前記抗原結合ドメインが、ＶＨＨを含む、請求項４２に記載の方法。
前記１つ以上の抗原のうちの少なくとも１つが、腫瘍抗原である、請求項４２～４４のいずれかに記載の方法。
前記腫瘍抗原が、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＨＥＲ２、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＭＵＣ１、ＣＤ１２３、ＦＬＴ３、Ｂ７－Ｈ３、ＣＤ３３、ＩＬ１ＲＡＰ、ＣＬＬ１（ＣＬＥＣ１２Ａ）、ＰＳＡ、ＣＥＡ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦ－Ｒ２、ＣＤ２２、ＲＯＲ１、メソテリン、ｃ－Ｍｅｔ、糖脂質Ｆ７７、ＦＡＰ、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＭＡＧＥＡ３、５Ｔ４、ＷＴ１、ＫＧ２Ｄリガンド、葉酸受容体（ＦＲａ）、およびＷｎｔ１抗原からなる群から選択される、請求項４５に記載の方法。
前記腫瘍抗原が、ＣＤ１９である、請求項４６に記載の方法。
前記ＣＡＲ－Ｔ細胞が、アキシカブタゲンシロロイセルまたはチサゲンレクロイセルである、請求項４７に記載の方法。
請求項１～１４のいずれかに記載の実質的に純粋なポリペプチドを含む組成物の組換え調製のための方法であって、
請求項３３に記載の組換え宿主細胞を、前記組換えヒトＩＬ２ポリペプチドの発現をもたらすような条件下で培養することと、
前記組換えＩＬ２ポリペプチドを単離することと、を含む、方法。
請求項１５～２１のいずれかに記載のＰＥＧ化ＩＬ２ポリペプチドを調製する方法であって、
請求項３３に記載の組換え宿主細胞を、前記組換えヒトＩＬ２ポリペプチドの発現をもたらすような条件下で培養することと、
前記組換えＩＬ２ポリペプチドを単離することと、
前記単離された組換えＩＬ２ポリペプチドを、モル過剰のＰＥＧ分子の存在下で、前記ＰＥＧ分子を前記ＩＬ２ポリペプチドに化学的にコンジュゲートするような条件下で反応させることと、
前記ＰＥＧ化ＩＬ２ポリペプチドを単離することと、を含む、方法。
前記Ｔ細胞が、ナイーブＣＤ８ ^＋Ｔ細胞、細胞傷害性ＣＤ８ ^＋Ｔ細胞、ナイーブＣＤ４ ^＋Ｔ細胞、ヘルパーＴ細胞、制御性Ｔ細胞、メモリーＴ細胞、ＮＫＴ細胞、γδＴ細胞、ＣＡＲ－Ｔ細胞、ＴＩＬ、およびＴＣＲαβ受容体ノックアウト細胞からなる群から選択される、請求項４０に記載の方法。
前記ＣＡＲ－Ｔ細胞の前記キメラ抗原受容体の前記抗原結合ドメインが、標的細胞の表面上で発現される１つ以上の抗原に特異的に結合する、請求項４１に記載の方法。
前記疾患、障害、または状態が、腫瘍性疾患である、請求項３９～４１、５１、または５２のいずれかに記載の方法。
前記疾患、障害、または状態が、自己免疫疾患である、請求項３９～４１、５１、または５２のいずれかに記載の方法。
前記疾患、障害、または状態が、感染である、請求項３９～４１、５１、または５２のいずれかに記載の方法。
前記疾患、障害、または状態が、腫瘍性疾患であり、前記１つ以上の抗原のうちの少なくとも１つが、腫瘍抗原である、請求項５３に記載の方法。
前記腫瘍抗原が、ＣＤ１９である、請求項５６に記載の方法。
前記腫瘍抗原が、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＨＥＲ２、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＭＵＣ１、ＣＤ１２３、ＦＬＴ３、Ｂ７－Ｈ３、ＣＤ３３、ＩＬ１ＲＡＰ、ＣＬＬ１（ＣＬＥＣ１２Ａ）、ＰＳＡ、ＣＥＡ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦ－Ｒ２、ＣＤ２２、ＲＯＲ１、メソテリン、ｃ－Ｍｅｔ、糖脂質Ｆ７７、ＦＡＰ、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＭＡＧＥＡ３、５Ｔ４、ＷＴ１、ＫＧ２Ｄリガンド、葉酸受容体（ＦＲａ）、およびＷｎｔ１抗原からなる群から選択される、請求項５６に記載の方法。
腫瘍性疾患、障害、または状態に罹患している哺乳類対象を治療する方法であって、
（ａ）前記対象からある量の血液を得るステップと、
（ｂ）前記ある量の血液からＴ細胞集団を単離するステップと、
（ｃ）前記単離されたＴ細胞集団を、
Ｈ１３３およびＹ１３４においてアミノ酸置換を含む直交ヒトＣＤ１２２受容体をコードする核酸配列、ならびにキメラ抗原受容体をコードする核酸配列を含む組換えウイルスベクターと接触させるステップであって、前記キメラ抗原受容体の細胞外ドメインが、前記単離されたＴ細胞集団の一部が前記ウイルスベクターによって形質導入され、前記キメラ抗原受容体および前記直交ヒトＣＤ１２２受容体の両方を発現するように、腫瘍抗原に特異的な結合を示す、接触させるステップと、
（ｄ）任意選択的に、請求項１～２２のいずれかに記載の直交ＩＬ２ポリペプチドの存在下で、ステップ（ｃ）からの前記単離された細胞集団をＴ細胞活性化条件下で培養するステップと、
（ｅ）治療有効量の、請求項１～２２のいずれかに記載の操作されたヒトＩＬ－２ポリペプチド、または請求項３０～３２のいずれかに記載の組換えベクターと組み合わせて、前記個体に、治療有効量の、ステップ（ｄ）に記載のＴ細胞集団を投与するステップと、を含む、方法。
ステップ（ｅ）の前に前記対象をリンパ球枯渇するステップをさらに含む、請求項５９に記載の方法。
前記方法が、１つ以上の追加の治療剤の投与をさらに含む、請求項３９～４１、５１～５３、または５６～６０のいずれかに記載の方法。